SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012536914.1 NCBI__GCF_000021485.1:WP_012536914.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P33221 Formate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase; 5'-phosphoribosylglycinamide transformylase 2; Formate-dependent GAR transformylase; GAR transformylase 2; GART 2; GAR transformylase T; Non-folate glycinamide ribonucleotide transformylase; Phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2; EC 6.3.1.21 from Escherichia coli (strain K12) (see 5 papers)
60% identity, 98% coverage: 3:390/394 of query aligns to 4:390/392 of P33221

query
sites
P33221
L
 
L
G
 
G
T
 
T
P
 
A
L
 
L
S
 
R
A
 
P
S
 
A
A
 
A
T
 
T
R
 
R
L
 
V
L
 
M
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
S
G
 
G
E
|
E
L
|
L
G
 
G
K
 
K
E
 
E
L
 
V
L
 
A
I
 
I
A
 
E
A
 
C
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
E
T
 
V
I
 
I
A
 
A
V
 
V
D
 
D
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
A
 
A
P
 
P
A
 
A
M
 
M
Q
 
H
V
 
V
A
 
A
H
 
H
R
 
R
S
 
S
H
 
H
V
 
V
L
 
I
D
 
N
M
 
M
T
 
L
D
 
D
P
 
G
E
 
D
A
 
A
I
 
L
L
 
R
A
 
R
I
 
V
V
 
V
K
 
E
H
 
L
E
 
E
R
 
K
P
 
P
H
 
H
Y
 
Y
V
 
I
V
 
V
P
 
P
E
|
E
I
 
I
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
T
 
T
S
 
D
A
 
M
L
 
L
A
 
I
E
 
Q
I
 
L
E
 
E
A
 
E
K
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
-
T
 
N
V
 
V
V
 
V
P
 
P
S
 
C
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
T
Q
 
K
L
 
L
T
 
T
M
 
M
D
 
N
R
|
R
E
 
E
G
 
G
I
 
I
R
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
E
E
 
E
L
 
L
G
 
Q
L
 
L
P
 
P
T
 
T
S
 
S
P
 
T
Y
 
Y
R
 
R
F
 
F
A
 
A
G
 
D
T
 
S
L
 
E
A
 
S
E
 
L
L
 
F
E
 
R
D
 
E
A
 
A
A
 
V
A
 
A
A
 
D
L
 
I
G
 
G
F
 
Y
P
 
P
C
 
C
V
 
I
I
 
V
K
|
K
P
 
P
V
 
V
M
 
M
S
 
S
S
|
S
S
|
S
G
|
G
K
|
K
G
|
G
Q
|
Q
S
 
T
V
 
F
V
 
I
R
 
R
G
 
S
A
 
A
A
 
E
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
L
 
Q
A
 
A
W
 
W
Q
x
K
E
 
Y
A
 
A
Q
 
Q
T
 
Q
A
 
G
G
 
G
R
 
R
V
 
A
G
 
G
G
 
A
Q
 
G
R
 
R
I
 
V
I
 
I
V
 
V
E
|
E
G
|
G
F
x
V
V
|
V
D
 
K
F
 
F
D
 
D
F
 
F
E
|
E
I
 
I
T
 
T
L
 
L
L
 
L
T
 
T
V
 
V
R
 
S
S
 
A
A
 
V
F
 
D
G
 
G
T
 
V
T
 
H
F
 
F
C
 
C
A
 
A
P
 
P
V
 
V
G
 
G
H
 
H
R
 
R
Q
 
Q
E
 
E
A
 
D
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
V
 
R
E
 
E
S
 
S
W
 
W
Q
 
Q
P
 
P
Q
 
Q
P
 
Q
M
 
M
S
 
S
D
 
P
T
 
L
A
 
A
L
 
L
R
 
E
E
 
R
A
 
A
E
 
Q
K
 
E
M
 
I
A
 
A
Q
 
R
R
 
K
V
 
V
T
 
V
D
 
L
N
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
Y
G
 
G
L
 
L
Y
 
F
G
 
G
V
 
V
E
|
E
F
 
L
F
 
F
V
 
V
R
 
C
G
 
G
T
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
I
F
 
F
S
 
S
E
|
E
L
 
V
S
 
S
P
 
P
R
 
R
P
 
P
H
 
H
D
|
D
T
 
T
G
 
G
L
 
M
V
 
V
T
 
T
L
 
L
A
 
I
S
 
S
Q
 
Q
R
 
D
Q
 
L
S
 
S
E
 
E
F
 
F
D
 
A
L
 
L
H
 
H
L
 
V
R
 
R
A
 
A
I
 
F
L
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
V
E
 
-
P
 
G
G
 
G
F
 
I
R
 
R
R
 
Q
-
 
Y
-
 
G
P
 
P
A
 
A
A
 
A
S
 
S
A
 
A
V
 
V
V
 
I
R
 
L
G
 
P
K
 
Q
R
 
L
L
 
T
G
 
S
W
 
Q
G
 
N
P
 
V
V
 
T
Y
 
F
S
 
D
G
 
N
L
 
V
E
 
Q
V
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
G
V
 
A
P
 
-
E
 
D
S
 
L
D
 
Q
L
 
I
R
 
R
L
 
L
F
 
F
G
 
G
K
|
K
P
 
P
T
 
E
A
 
I
S
 
D
K
 
G
L
 
S
R
|
R
R
|
R
L
 
L
G
 
G
V
 
V
G
 
A
I
 
L
A
 
A
C
 
T
A
 
A
D
 
E
N
 
S
V
 
V
E
 
V
E
 
D
A
 
A
R
 
I
E
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
K
R
 
H
I
 
A
A
 
A
A
 
G
A
 
Q
V
 
V
G
 
K
I
 
V

Sites not aligning to the query:

1kjiA Crystal structure of glycinamide ribonucleotide transformylase in complex with mg-amppcp (see paper)
60% identity, 98% coverage: 3:390/394 of query aligns to 3:387/389 of 1kjiA

query
sites
1kjiA
L
 
L
G
 
G
T
 
T
P
 
A
L
 
L
S
 
R
A
 
P
S
 
A
A
 
A
T
 
T
R
 
R
L
 
V
L
 
M
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
S
G
 
G
E
 
E
L
 
L
G
 
G
K
 
K
E
 
E
L
 
V
L
 
A
I
 
I
A
 
E
A
 
C
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
E
T
 
V
I
 
I
A
 
A
V
 
V
D
 
D
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
A
 
A
P
 
P
A
 
A
M
 
M
Q
 
H
V
 
V
A
 
A
H
 
H
R
 
R
S
 
S
H
 
H
V
 
V
L
 
I
D
 
N
M
 
M
T
 
L
D
 
D
P
 
G
E
 
D
A
 
A
I
 
L
L
 
R
A
 
R
I
 
V
V
 
V
K
 
E
H
 
L
E
 
E
R
 
K
P
 
P
H
 
H
Y
 
Y
V
 
I
V
 
V
P
 
P
E
 
E
I
 
I
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
T
 
T
S
 
D
A
 
M
L
 
L
A
 
I
E
 
Q
I
 
L
E
 
E
A
 
E
K
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
-
T
 
N
V
 
V
V
 
V
P
 
P
S
 
C
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
T
Q
 
K
L
 
L
T
 
T
M
 
M
D
 
N
R
|
R
E
|
E
G
 
G
I
 
I
R
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
E
E
 
E
L
 
L
G
 
Q
L
 
L
P
 
P
T
 
T
S
 
S
P
 
T
Y
 
Y
R
 
R
F
 
F
A
 
A
G
 
D
T
 
S
L
 
E
A
 
S
E
 
L
L
 
F
E
 
R
D
 
E
A
 
A
A
 
V
A
 
A
A
 
D
L
 
I
G
 
G
F
 
Y
P
 
P
C
 
C
V
x
I
I
 
V
K
|
K
P
 
P
V
 
V
M
 
M
S
 
S
S
|
S
S
|
S
G
|
G
K
 
K
G
 
G
Q
|
Q
S
 
T
V
 
F
V
 
I
R
 
R
G
 
S
A
 
A
A
 
E
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
L
 
Q
A
 
A
W
 
W
Q
 
K
E
 
Y
A
 
A
Q
 
Q
T
 
Q
A
 
G
G
 
G
R
 
R
V
 
A
G
 
G
G
 
-
Q
 
-
R
 
R
I
 
V
I
 
I
V
 
V
E
|
E
G
 
G
F
 
V
V
|
V
D
 
K
F
 
F
D
 
D
F
 
F
E
|
E
I
 
I
T
 
T
L
 
L
L
 
L
T
 
T
V
 
V
R
 
S
S
 
A
A
 
V
F
 
D
G
 
G
T
 
V
T
 
H
F
 
F
C
 
C
A
 
A
P
 
P
V
 
V
G
 
G
H
 
H
R
 
R
Q
|
Q
E
 
E
A
 
D
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
V
 
R
E
 
E
S
 
S
W
 
W
Q
 
Q
P
 
P
Q
 
Q
P
 
Q
M
 
M
S
 
S
D
 
P
T
 
L
A
 
A
L
 
L
R
 
E
E
 
R
A
 
A
E
 
Q
K
 
E
M
 
I
A
 
A
Q
 
R
R
 
K
V
 
V
T
 
V
D
 
L
N
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
Y
G
 
G
L
 
L
Y
 
F
G
 
G
V
 
V
E
|
E
F
 
L
F
|
F
V
 
V
R
 
C
G
 
G
T
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
I
F
 
F
S
 
S
E
|
E
L
 
V
S
 
S
P
 
P
R
 
R
P
 
P
H
 
H
D
|
D
T
|
T
G
 
G
L
 
M
V
 
V
T
 
T
L
 
L
A
 
I
S
 
S
Q
 
Q
R
 
D
Q
 
L
S
 
S
E
 
E
F
 
F
D
 
A
L
 
L
H
 
H
L
 
V
R
 
R
A
 
A
I
 
F
L
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
V
E
 
-
P
 
G
G
 
G
F
 
I
R
 
R
R
 
Q
-
 
Y
-
 
G
P
 
P
A
 
A
A
 
A
S
 
S
A
 
A
V
 
V
V
 
I
R
 
L
G
 
P
K
 
Q
R
 
L
L
 
T
G
 
S
W
 
Q
G
 
N
P
 
V
V
 
T
Y
 
F
S
 
D
G
 
N
L
 
V
E
 
Q
V
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
G
V
 
A
P
 
-
E
 
D
S
 
L
D
 
Q
L
 
I
R
 
R
L
 
L
F
 
F
G
 
G
K
 
K
P
 
P
T
 
E
A
 
I
S
 
D
K
 
G
L
 
S
R
 
R
R
|
R
L
 
L
G
 
G
V
 
V
G
 
A
I
 
L
A
 
A
C
 
T
A
 
A
D
 
E
N
 
S
V
 
V
E
 
V
E
 
D
A
 
A
R
 
I
E
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
K
R
 
H
I
 
A
A
 
A
A
 
G
A
 
Q
V
 
V
G
 
K
I
 
V

1ez1A Structure of escherichia coli purt-encoded glycinamide ribonucleotide transformylase complexed with mg, amppnp, and gar (see paper)
60% identity, 98% coverage: 3:390/394 of query aligns to 3:387/389 of 1ez1A

query
sites
1ez1A
L
 
L
G
 
G
T
 
T
P
 
A
L
 
L
S
 
R
A
 
P
S
 
A
A
 
A
T
 
T
R
 
R
L
 
V
L
 
M
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
S
G
|
G
E
|
E
L
|
L
G
 
G
K
 
K
E
 
E
L
 
V
L
 
A
I
 
I
A
 
E
A
 
C
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
E
T
 
V
I
 
I
A
 
A
V
 
V
D
 
D
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
A
 
A
P
 
P
A
 
A
M
 
M
Q
 
H
V
 
V
A
 
A
H
 
H
R
 
R
S
 
S
H
 
H
V
 
V
L
 
I
D
 
N
M
 
M
T
 
L
D
 
D
P
 
G
E
 
D
A
 
A
I
 
L
L
 
R
A
 
R
I
 
V
V
 
V
K
 
E
H
 
L
E
 
E
R
 
K
P
 
P
H
 
H
Y
 
Y
V
 
I
V
 
V
P
 
P
E
|
E
I
|
I
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
T
 
T
S
 
D
A
 
M
L
 
L
A
 
I
E
 
Q
I
 
L
E
 
E
A
 
E
K
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
-
T
 
N
V
 
V
V
 
V
P
 
P
S
 
C
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
T
Q
 
K
L
 
L
T
 
T
M
 
M
D
 
N
R
|
R
E
|
E
G
 
G
I
 
I
R
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
E
E
 
E
L
 
L
G
 
Q
L
 
L
P
 
P
T
 
T
S
 
S
P
 
T
Y
 
Y
R
 
R
F
 
F
A
 
A
G
 
D
T
 
S
L
 
E
A
 
S
E
 
L
L
 
F
E
 
R
D
 
E
A
 
A
A
 
V
A
 
A
A
 
D
L
 
I
G
 
G
F
 
Y
P
 
P
C
 
C
V
x
I
I
 
V
K
|
K
P
 
P
V
 
V
M
 
M
S
 
S
S
|
S
S
|
S
G
|
G
K
 
K
G
 
G
Q
 
Q
S
 
T
V
 
F
V
 
I
R
 
R
G
 
S
A
 
A
A
 
E
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
L
 
Q
A
 
A
W
 
W
Q
 
K
E
 
Y
A
 
A
Q
 
Q
T
 
Q
A
 
G
G
 
G
R
 
R
V
 
A
G
 
G
G
 
-
Q
 
-
R
 
R
I
 
V
I
 
I
V
 
V
E
|
E
G
 
G
F
x
V
V
|
V
D
 
K
F
|
F
D
 
D
F
 
F
E
|
E
I
 
I
T
 
T
L
 
L
L
 
L
T
 
T
V
 
V
R
 
S
S
 
A
A
 
V
F
 
D
G
 
G
T
 
V
T
 
H
F
 
F
C
 
C
A
 
A
P
 
P
V
 
V
G
 
G
H
 
H
R
 
R
Q
|
Q
E
 
E
A
 
D
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
V
 
R
E
 
E
S
 
S
W
 
W
Q
 
Q
P
 
P
Q
 
Q
P
 
Q
M
 
M
S
 
S
D
 
P
T
 
L
A
 
A
L
 
L
R
 
E
E
 
R
A
 
A
E
 
Q
K
 
E
M
 
I
A
 
A
Q
 
R
R
 
K
V
 
V
T
 
V
D
 
L
N
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
Y
G
 
G
L
 
L
Y
 
F
G
 
G
V
 
V
E
|
E
F
 
L
F
|
F
V
 
V
R
 
C
G
 
G
T
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
I
F
 
F
S
 
S
E
|
E
L
 
V
S
 
S
P
 
P
R
 
R
P
 
P
H
 
H
D
|
D
T
|
T
G
 
G
L
 
M
V
 
V
T
 
T
L
 
L
A
 
I
S
 
S
Q
 
Q
R
 
D
Q
 
L
S
 
S
E
 
E
F
 
F
D
 
A
L
 
L
H
 
H
L
 
V
R
 
R
A
 
A
I
 
F
L
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
V
E
 
-
P
 
G
G
 
G
F
 
I
R
 
R
R
 
Q
-
 
Y
-
 
G
P
 
P
A
 
A
A
 
A
S
 
S
A
 
A
V
 
V
V
 
I
R
 
L
G
 
P
K
 
Q
R
 
L
L
 
T
G
 
S
W
 
Q
G
 
N
P
 
V
V
 
T
Y
 
F
S
 
D
G
 
N
L
 
V
E
 
Q
V
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
G
V
 
A
P
 
-
E
 
D
S
 
L
D
 
Q
L
 
I
R
 
R
L
 
L
F
 
F
G
 
G
K
|
K
P
 
P
T
 
E
A
 
I
S
 
D
K
 
G
L
 
S
R
|
R
R
|
R
L
 
L
G
 
G
V
 
V
G
 
A
I
 
L
A
 
A
C
 
T
A
 
A
D
 
E
N
 
S
V
 
V
E
 
V
E
 
D
A
 
A
R
 
I
E
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
K
R
 
H
I
 
A
A
 
A
A
 
G
A
 
Q
V
 
V
G
 
K
I
 
V

1eyzA Structure of escherichia coli purt-encoded glycinamide ribonucleotide transformylase complexed with mg and amppnp (see paper)
60% identity, 98% coverage: 3:390/394 of query aligns to 3:387/389 of 1eyzA

query
sites
1eyzA
L
 
L
G
 
G
T
 
T
P
 
A
L
 
L
S
 
R
A
 
P
S
 
A
A
 
A
T
 
T
R
 
R
L
 
V
L
 
M
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
S
G
 
G
E
 
E
L
 
L
G
 
G
K
 
K
E
 
E
L
 
V
L
 
A
I
 
I
A
 
E
A
 
C
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
E
T
 
V
I
 
I
A
 
A
V
 
V
D
 
D
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
A
 
A
P
 
P
A
 
A
M
 
M
Q
 
H
V
 
V
A
 
A
H
 
H
R
 
R
S
 
S
H
 
H
V
 
V
L
 
I
D
 
N
M
 
M
T
 
L
D
 
D
P
 
G
E
 
D
A
 
A
I
 
L
L
 
R
A
 
R
I
 
V
V
 
V
K
 
E
H
 
L
E
 
E
R
 
K
P
 
P
H
 
H
Y
 
Y
V
 
I
V
 
V
P
 
P
E
 
E
I
 
I
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
T
 
T
S
 
D
A
 
M
L
 
L
A
 
I
E
 
Q
I
 
L
E
 
E
A
 
E
K
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
-
T
 
N
V
 
V
V
 
V
P
 
P
S
 
C
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
T
Q
 
K
L
 
L
T
 
T
M
 
M
D
 
N
R
|
R
E
|
E
G
 
G
I
 
I
R
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
E
E
 
E
L
 
L
G
 
Q
L
 
L
P
 
P
T
 
T
S
 
S
P
 
T
Y
 
Y
R
 
R
F
 
F
A
 
A
G
 
D
T
 
S
L
 
E
A
 
S
E
 
L
L
 
F
E
 
R
D
 
E
A
 
A
A
 
V
A
 
A
A
 
D
L
 
I
G
 
G
F
 
Y
P
 
P
C
 
C
V
x
I
I
 
V
K
|
K
P
 
P
V
 
V
M
 
M
S
 
S
S
|
S
S
|
S
G
|
G
K
 
K
G
 
G
Q
|
Q
S
 
T
V
 
F
V
 
I
R
 
R
G
 
S
A
 
A
A
 
E
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
L
 
Q
A
 
A
W
 
W
Q
 
K
E
 
Y
A
 
A
Q
 
Q
T
 
Q
A
 
G
G
 
G
R
 
R
V
 
A
G
 
G
G
 
-
Q
 
-
R
 
R
I
 
V
I
 
I
V
 
V
E
|
E
G
 
G
F
 
V
V
|
V
D
 
K
F
|
F
D
 
D
F
 
F
E
|
E
I
 
I
T
 
T
L
 
L
L
 
L
T
 
T
V
 
V
R
 
S
S
 
A
A
 
V
F
 
D
G
 
G
T
 
V
T
 
H
F
 
F
C
 
C
A
 
A
P
 
P
V
 
V
G
 
G
H
 
H
R
 
R
Q
 
Q
E
 
E
A
 
D
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
V
 
R
E
 
E
S
 
S
W
 
W
Q
 
Q
P
 
P
Q
 
Q
P
 
Q
M
 
M
S
 
S
D
 
P
T
 
L
A
 
A
L
 
L
R
 
E
E
 
R
A
 
A
E
 
Q
K
 
E
M
 
I
A
 
A
Q
 
R
R
 
K
V
 
V
T
 
V
D
 
L
N
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
Y
G
 
G
L
 
L
Y
 
F
G
 
G
V
 
V
E
|
E
F
 
L
F
|
F
V
 
V
R
 
C
G
 
G
T
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
I
F
 
F
S
 
S
E
|
E
L
 
V
S
 
S
P
 
P
R
 
R
P
 
P
H
 
H
D
|
D
T
|
T
G
 
G
L
 
M
V
 
V
T
 
T
L
 
L
A
 
I
S
 
S
Q
 
Q
R
 
D
Q
 
L
S
 
S
E
 
E
F
 
F
D
 
A
L
 
L
H
 
H
L
 
V
R
 
R
A
 
A
I
 
F
L
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
V
E
 
-
P
 
G
G
 
G
F
 
I
R
 
R
R
 
Q
-
 
Y
-
 
G
P
 
P
A
 
A
A
 
A
S
 
S
A
 
A
V
 
V
V
 
I
R
 
L
G
 
P
K
 
Q
R
 
L
L
 
T
G
 
S
W
 
Q
G
 
N
P
 
V
V
 
T
Y
 
F
S
 
D
G
 
N
L
 
V
E
 
Q
V
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
G
V
 
A
P
 
-
E
 
D
S
 
L
D
 
Q
L
 
I
R
 
R
L
 
L
F
 
F
G
 
G
K
 
K
P
 
P
T
 
E
A
 
I
S
 
D
K
 
G
L
 
S
R
 
R
R
|
R
L
 
L
G
 
G
V
 
V
G
 
A
I
 
L
A
 
A
C
 
T
A
 
A
D
 
E
N
 
S
V
 
V
E
 
V
E
 
D
A
 
A
R
 
I
E
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
K
R
 
H
I
 
A
A
 
A
A
 
G
A
 
Q
V
 
V
G
 
K
I
 
V

1kjjA Crystal structure of glycniamide ribonucleotide transformylase in complex with mg-atp-gamma-s (see paper)
59% identity, 98% coverage: 3:390/394 of query aligns to 3:384/386 of 1kjjA

query
sites
1kjjA
L
 
L
G
 
G
T
 
T
P
 
A
L
 
L
S
 
R
A
 
P
S
 
A
A
 
A
T
 
T
R
 
R
L
 
V
L
 
M
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
S
G
 
G
E
 
E
L
 
L
G
 
G
K
 
K
E
 
E
L
 
V
L
 
A
I
 
I
A
 
E
A
 
C
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
E
T
 
V
I
 
I
A
 
A
V
 
V
D
 
D
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
A
 
A
P
 
P
A
 
A
M
 
M
Q
 
H
V
 
V
A
 
A
H
 
H
R
 
R
S
 
S
H
 
H
V
 
V
L
 
I
D
 
N
M
 
M
T
 
L
D
 
D
P
 
G
E
 
D
A
 
A
I
 
L
L
 
R
A
 
R
I
 
V
V
 
V
K
 
E
H
 
L
E
 
E
R
 
K
P
 
P
H
 
H
Y
 
Y
V
 
I
V
 
V
P
 
P
E
 
E
I
 
I
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
T
 
T
S
 
D
A
 
M
L
 
L
A
 
I
E
 
Q
I
 
L
E
 
E
A
 
E
K
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
-
T
 
N
V
 
V
V
 
V
P
 
P
S
 
C
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
T
Q
 
K
L
 
L
T
 
T
M
 
M
D
 
N
R
|
R
E
|
E
G
 
G
I
 
I
R
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
E
E
 
E
L
 
L
G
 
Q
L
 
L
P
 
P
T
 
T
S
 
S
P
 
T
Y
 
Y
R
 
R
F
 
F
A
 
A
G
 
D
T
 
S
L
 
E
A
 
S
E
 
L
L
 
F
E
 
R
D
 
E
A
 
A
A
 
V
A
 
A
A
 
D
L
 
I
G
 
G
F
 
Y
P
 
P
C
 
C
V
x
I
I
 
V
K
|
K
P
 
P
V
 
V
M
 
M
S
 
S
S
|
S
S
|
S
G
|
G
K
 
K
G
 
G
Q
|
Q
S
 
T
V
 
F
V
 
I
R
 
R
G
 
S
A
 
A
A
 
E
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
L
 
Q
A
 
A
W
 
W
Q
 
K
E
 
Y
A
 
A
Q
 
Q
T
 
Q
A
 
G
G
 
G
R
 
R
V
 
V
G
 
-
G
 
-
Q
 
-
R
 
-
I
 
-
I
 
I
V
 
V
E
|
E
G
 
G
F
 
V
V
|
V
D
 
K
F
 
F
D
 
D
F
 
F
E
|
E
I
 
I
T
 
T
L
 
L
L
 
L
T
 
T
V
 
V
R
 
S
S
 
A
A
 
V
F
 
D
G
 
G
T
 
V
T
 
H
F
 
F
C
 
C
A
 
A
P
 
P
V
 
V
G
 
G
H
 
H
R
 
R
Q
|
Q
E
 
E
A
 
D
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
V
 
R
E
 
E
S
 
S
W
 
W
Q
 
Q
P
 
P
Q
 
Q
P
 
Q
M
 
M
S
 
S
D
 
P
T
 
L
A
 
A
L
 
L
R
 
E
E
 
R
A
 
A
E
 
Q
K
 
E
M
 
I
A
 
A
Q
 
R
R
 
K
V
 
V
T
 
V
D
 
L
N
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
Y
G
 
G
L
 
L
Y
 
F
G
 
G
V
 
V
E
|
E
F
 
L
F
|
F
V
 
V
R
 
C
G
 
G
T
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
I
F
 
F
S
 
S
E
|
E
L
 
V
S
 
S
P
 
P
R
 
R
P
 
P
H
 
H
D
|
D
T
|
T
G
 
G
L
 
M
V
 
V
T
 
T
L
 
L
A
 
I
S
 
S
Q
 
Q
R
 
D
Q
 
L
S
 
S
E
 
E
F
 
F
D
 
A
L
 
L
H
 
H
L
 
V
R
 
R
A
 
A
I
 
F
L
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
V
E
 
-
P
 
G
G
 
G
F
 
I
R
 
R
R
 
Q
-
 
Y
-
 
G
P
 
P
A
 
A
A
 
A
S
 
S
A
 
A
V
 
V
V
 
I
R
 
L
G
 
P
K
 
Q
R
 
L
L
 
T
G
 
S
W
 
Q
G
 
N
P
 
V
V
 
T
Y
 
F
S
 
D
G
 
N
L
 
V
E
 
Q
V
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
G
V
 
A
P
 
-
E
 
D
S
 
L
D
 
Q
L
 
I
R
 
R
L
 
L
F
 
F
G
 
G
K
 
K
P
 
P
T
 
E
A
 
I
S
 
D
K
 
G
L
 
S
R
 
R
R
|
R
L
 
L
G
 
G
V
 
V
G
 
A
I
 
L
A
 
A
C
 
T
A
 
A
D
 
E
N
 
S
V
 
V
E
 
V
E
 
D
A
 
A
R
 
I
E
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
K
R
 
H
I
 
A
A
 
A
A
 
G
A
 
Q
V
 
V
G
 
K
I
 
V

1kj8A Crystal structure of purt-encoded glycinamide ribonucleotide transformylase in complex with mg-atp and gar (see paper)
59% identity, 98% coverage: 3:390/394 of query aligns to 3:384/386 of 1kj8A

query
sites
1kj8A
L
 
L
G
 
G
T
 
T
P
 
A
L
 
L
S
 
R
A
 
P
S
 
A
A
 
A
T
 
T
R
 
R
L
 
V
L
 
M
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
S
G
|
G
E
|
E
L
|
L
G
 
G
K
 
K
E
 
E
L
 
V
L
 
A
I
 
I
A
 
E
A
 
C
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
E
T
 
V
I
 
I
A
 
A
V
 
V
D
 
D
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
A
 
A
P
 
P
A
 
A
M
 
M
Q
 
H
V
 
V
A
 
A
H
 
H
R
 
R
S
 
S
H
 
H
V
 
V
L
 
I
D
 
N
M
 
M
T
 
L
D
 
D
P
 
G
E
 
D
A
 
A
I
 
L
L
 
R
A
 
R
I
 
V
V
 
V
K
 
E
H
 
L
E
 
E
R
 
K
P
 
P
H
 
H
Y
 
Y
V
 
I
V
 
V
P
 
P
E
|
E
I
|
I
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
T
 
T
S
 
D
A
 
M
L
 
L
A
 
I
E
 
Q
I
 
L
E
 
E
A
 
E
K
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
-
T
 
N
V
 
V
V
 
V
P
 
P
S
 
C
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
T
Q
 
K
L
 
L
T
 
T
M
 
M
D
 
N
R
|
R
E
|
E
G
 
G
I
 
I
R
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
E
E
 
E
L
 
L
G
 
Q
L
 
L
P
 
P
T
 
T
S
 
S
P
 
T
Y
 
Y
R
 
R
F
 
F
A
 
A
G
 
D
T
 
S
L
 
E
A
 
S
E
 
L
L
 
F
E
 
R
D
 
E
A
 
A
A
 
V
A
 
A
A
 
D
L
 
I
G
 
G
F
 
Y
P
 
P
C
 
C
V
x
I
I
 
V
K
|
K
P
 
P
V
 
V
M
 
M
S
 
S
S
|
S
S
|
S
G
|
G
K
 
K
G
 
G
Q
|
Q
S
 
T
V
 
F
V
 
I
R
 
R
G
 
S
A
 
A
A
 
E
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
L
 
Q
A
 
A
W
 
W
Q
 
K
E
 
Y
A
 
A
Q
 
Q
T
 
Q
A
 
G
G
 
G
R
 
R
V
 
V
G
 
-
G
 
-
Q
 
-
R
 
-
I
 
-
I
 
I
V
 
V
E
|
E
G
 
G
F
 
V
V
|
V
D
 
K
F
|
F
D
 
D
F
 
F
E
|
E
I
 
I
T
 
T
L
 
L
L
 
L
T
 
T
V
 
V
R
 
S
S
 
A
A
 
V
F
 
D
G
 
G
T
 
V
T
 
H
F
 
F
C
 
C
A
 
A
P
 
P
V
 
V
G
 
G
H
 
H
R
 
R
Q
|
Q
E
 
E
A
 
D
G
|
G
D
 
D
Y
 
Y
V
 
R
E
 
E
S
 
S
W
 
W
Q
 
Q
P
 
P
Q
 
Q
P
 
Q
M
 
M
S
 
S
D
 
P
T
 
L
A
 
A
L
 
L
R
 
E
E
 
R
A
 
A
E
 
Q
K
 
E
M
 
I
A
 
A
Q
 
R
R
 
K
V
 
V
T
 
V
D
 
L
N
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
Y
G
 
G
L
 
L
Y
 
F
G
 
G
V
 
V
E
|
E
F
 
L
F
|
F
V
 
V
R
 
C
G
 
G
T
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
I
F
 
F
S
 
S
E
|
E
L
 
V
S
 
S
P
 
P
R
 
R
P
 
P
H
 
H
D
|
D
T
|
T
G
 
G
L
 
M
V
 
V
T
 
T
L
 
L
A
 
I
S
 
S
Q
 
Q
R
 
D
Q
 
L
S
 
S
E
 
E
F
 
F
D
 
A
L
 
L
H
 
H
L
 
V
R
 
R
A
 
A
I
 
F
L
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
V
E
 
-
P
 
G
G
 
G
F
 
I
R
 
R
R
 
Q
-
 
Y
-
 
G
P
 
P
A
 
A
A
 
A
S
 
S
A
 
A
V
 
V
V
 
I
R
 
L
G
 
P
K
 
Q
R
 
L
L
 
T
G
 
S
W
 
Q
G
 
N
P
 
V
V
 
T
Y
 
F
S
 
D
G
 
N
L
 
V
E
 
Q
V
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
G
V
 
A
P
 
-
E
 
D
S
 
L
D
 
Q
L
 
I
R
 
R
L
 
L
F
 
F
G
 
G
K
|
K
P
 
P
T
 
E
A
 
I
S
 
D
K
 
G
L
 
S
R
|
R
R
|
R
L
 
L
G
 
G
V
 
V
G
 
A
I
 
L
A
 
A
C
 
T
A
 
A
D
 
E
N
 
S
V
 
V
E
 
V
E
 
D
A
 
A
R
 
I
E
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
K
R
 
H
I
 
A
A
 
A
A
 
G
A
 
Q
V
 
V
G
 
K
I
 
V

1kjqA Crystal structure of glycinamide ribonucleotide transformylase in complex with mg-adp (see paper)
59% identity, 99% coverage: 3:391/394 of query aligns to 3:387/388 of 1kjqA

query
sites
1kjqA
L
 
L
G
 
G
T
 
T
P
 
A
L
 
L
S
 
R
A
 
P
S
 
A
A
 
A
T
 
T
R
 
R
L
 
V
L
 
M
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
S
G
 
G
E
 
E
L
 
L
G
 
G
K
 
K
E
 
E
L
 
V
L
 
A
I
 
I
A
 
E
A
 
C
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
E
T
 
V
I
 
I
A
 
A
V
 
V
D
 
D
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
A
 
A
P
 
P
A
 
A
M
 
M
Q
 
H
V
 
V
A
 
A
H
 
H
R
 
R
S
 
S
H
 
H
V
 
V
L
 
I
D
 
N
M
 
M
T
 
L
D
 
D
P
 
G
E
 
D
A
 
A
I
 
L
L
 
R
A
 
R
I
 
V
V
 
V
K
 
E
H
 
L
E
 
E
R
 
K
P
 
P
H
 
H
Y
 
Y
V
 
I
V
 
V
P
 
P
E
 
E
I
 
I
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
T
 
T
S
 
D
A
 
M
L
 
L
A
 
I
E
 
Q
I
 
L
E
 
E
A
 
E
K
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
-
T
 
N
V
 
V
V
 
V
P
 
P
S
 
C
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
T
Q
 
K
L
 
L
T
 
T
M
 
M
D
 
N
R
|
R
E
|
E
G
 
G
I
 
I
R
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
E
E
 
E
L
 
L
G
 
Q
L
 
L
P
 
P
T
 
T
S
 
S
P
 
T
Y
 
Y
R
 
R
F
 
F
A
 
A
G
 
D
T
 
S
L
 
E
A
 
S
E
 
L
L
 
F
E
 
R
D
 
E
A
 
A
A
 
V
A
 
A
A
 
D
L
 
I
G
 
G
F
 
Y
P
 
P
C
 
C
V
x
I
I
 
V
K
|
K
P
 
P
V
 
V
M
 
M
S
 
S
S
 
-
S
 
-
G
 
-
K
 
K
G
 
G
Q
 
Q
S
 
T
V
 
F
V
 
I
R
 
R
G
 
S
A
 
A
A
 
E
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
L
 
Q
A
 
A
W
 
W
Q
 
K
E
 
Y
A
 
A
Q
 
Q
T
 
Q
A
 
G
G
 
G
R
 
R
V
 
A
G
 
G
G
 
A
Q
 
G
R
 
R
I
 
V
I
 
I
V
 
V
E
|
E
G
 
G
F
x
V
V
|
V
D
 
K
F
|
F
D
 
D
F
 
F
E
|
E
I
 
I
T
 
T
L
 
L
L
 
L
T
 
T
V
 
V
R
 
S
S
 
A
A
 
V
F
 
D
G
 
G
T
 
V
T
 
H
F
 
F
C
 
C
A
 
A
P
 
P
V
 
V
G
 
G
H
 
H
R
 
R
Q
|
Q
E
 
E
A
 
D
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
V
 
R
E
 
E
S
 
S
W
 
W
Q
 
Q
P
 
P
Q
 
Q
P
 
Q
M
 
M
S
 
S
D
 
P
T
 
L
A
 
A
L
 
L
R
 
E
E
 
R
A
 
A
E
 
Q
K
 
E
M
 
I
A
 
A
Q
 
R
R
 
K
V
 
V
T
 
V
D
 
L
N
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
Y
G
 
G
L
 
L
Y
 
F
G
 
G
V
 
V
E
|
E
F
 
L
F
|
F
V
 
V
R
 
C
G
 
G
T
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
I
F
 
F
S
 
S
E
|
E
L
 
V
S
 
S
P
 
P
R
 
R
P
 
P
H
 
H
D
|
D
T
|
T
G
 
G
L
 
M
V
 
V
T
 
T
L
 
L
A
 
I
S
 
S
Q
 
Q
R
 
D
Q
 
L
S
 
S
E
 
E
F
 
F
D
 
A
L
 
L
H
 
H
L
 
V
R
 
R
A
 
A
I
 
F
L
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
V
E
 
-
P
 
G
G
 
G
F
 
I
R
 
R
R
 
Q
-
 
Y
-
 
G
P
 
P
A
 
A
A
 
A
S
 
S
A
 
A
V
 
V
V
 
I
R
 
L
G
 
P
K
 
Q
R
 
L
L
 
T
G
 
S
W
 
Q
G
 
N
P
 
V
V
 
T
Y
 
F
S
 
D
G
 
N
L
 
V
E
 
Q
V
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
G
V
 
A
P
 
-
E
 
D
S
 
L
D
 
Q
L
 
I
R
 
R
L
 
L
F
 
F
G
 
G
K
 
K
P
 
P
T
 
E
A
 
I
S
 
D
K
 
G
L
 
S
R
 
R
R
|
R
L
 
L
G
 
G
V
 
V
G
 
A
I
 
L
A
 
A
C
 
T
A
 
A
D
 
E
N
 
S
V
 
V
E
 
V
E
 
D
A
 
A
R
 
I
E
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
K
R
 
H
I
 
A
A
 
A
A
 
G
A
 
Q
V
 
V
G
 
K
I
 
V
S
 
Q

O58056 Formate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase; 5'-phosphoribosylglycinamide transformylase 2; Formate-dependent GAR transformylase; GAR transformylase 2; GART 2; Non-folate glycinamide ribonucleotide transformylase; Phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2; EC 6.3.1.21 from Pyrococcus horikoshii (strain ATCC 700860 / DSM 12428 / JCM 9974 / NBRC 100139 / OT-3)
50% identity, 98% coverage: 2:388/394 of query aligns to 7:408/430 of O58056

query
sites
O58056
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
T
 
T
P
 
A
L
 
T
S
 
T
A
 
D
S
 
S
A
 
A
T
 
Q
R
 
K
L
 
I
L
 
L
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
S
G
 
G
E
 
E
L
 
L
G
 
G
K
 
K
E
 
E
L
 
I
L
 
A
I
 
I
A
 
E
A
 
A
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
E
T
 
V
I
 
V
A
 
A
V
 
V
D
 
D
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
D
 
N
A
 
A
P
 
P
A
 
A
M
 
M
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
H
 
H
R
 
R
S
 
S
H
 
Y
V
 
V
L
 
G
D
 
N
M
 
M
T
 
M
D
 
D
P
 
K
E
 
D
A
 
F
I
 
L
L
 
W
A
 
S
I
 
V
V
 
V
K
 
E
H
 
R
E
 
E
R
 
K
P
 
P
H
 
D
Y
 
A
V
 
I
V
 
I
P
 
P
E
 
E
I
 
I
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
N
T
 
L
S
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
F
E
 
E
I
 
F
E
 
E
A
 
K
K
 
D
G
 
G
L
 
Y
A
 
-
T
 
F
V
 
V
V
 
V
P
 
P
S
 
N
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
T
Q
 
W
L
 
I
T
 
A
M
 
M
D
 
H
R
|
R
E
 
E
G
 
R
I
 
L
R
 
R
R
 
E
L
 
T
A
 
L
A
 
V
E
 
K
E
 
E
L
 
A
G
 
K
L
 
V
P
 
P
T
 
T
S
 
S
P
 
R
Y
 
Y
R
 
M
F
 
Y
A
 
A
G
 
T
T
 
T
L
 
L
A
 
D
E
 
E
L
 
L
E
 
Y
D
 
E
A
 
A
A
 
C
A
 
E
A
 
K
L
 
I
G
 
G
F
 
Y
P
 
P
C
 
C
V
 
H
I
 
T
K
|
K
P
 
A
V
 
I
M
 
M
S
 
S
S
 
S
S
 
S
G
 
G
K
 
K
G
 
G
Q
 
S
S
 
Y
V
 
F
V
 
V
R
 
K
G
 
G
A
 
P
A
 
E
E
 
D
L
 
I
A
 
P
L
 
K
A
 
A
W
 
W
Q
 
E
E
 
E
A
 
A
Q
 
K
T
 
T
A
 
K
G
 
A
R
 
R
V
 
G
G
 
S
G
 
A
Q
 
E
R
 
K
I
 
I
I
 
I
V
 
V
E
|
E
G
x
E
F
x
H
V
x
I
D
 
D
F
 
F
D
 
D
F
 
V
E
|
E
I
 
V
T
 
T
L
 
E
L
 
L
T
 
A
V
 
V
R
 
R
S
 
H
-
 
F
-
 
D
-
 
E
-
 
N
-
 
G
A
 
E
F
 
I
G
 
V
T
 
T
T
 
T
F
 
F
C
 
P
A
 
K
P
 
P
V
 
V
G
 
G
H
 
H
R
 
Y
Q
 
Q
E
 
I
A
 
D
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
V
 
H
E
 
A
S
 
S
W
 
W
Q
 
Q
P
 
P
Q
 
A
P
 
E
M
 
I
S
 
S
D
 
E
T
 
K
A
 
A
L
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
V
E
 
Y
K
 
R
M
 
I
A
 
A
Q
 
K
R
 
R
V
 
I
T
 
T
D
 
D
N
 
V
L
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
L
G
 
G
L
 
I
Y
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
E
F
 
M
F
 
F
V
 
V
R
 
K
G
 
G
T
 
D
E
 
K
V
 
V
I
 
W
F
 
A
S
 
N
E
 
E
L
 
V
S
 
S
P
 
P
R
 
R
P
 
P
H
 
H
D
 
D
T
 
T
G
 
G
L
 
M
V
 
V
T
 
T
L
 
L
A
 
A
S
 
S
Q
 
H
R
 
P
Q
 
P
-
 
G
-
 
F
S
 
S
E
 
E
F
 
F
D
 
A
L
 
L
H
 
H
L
 
L
R
 
R
A
 
A
I
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
I
E
 
P
-
 
G
-
 
E
-
 
W
-
 
V
P
 
D
G
 
G
F
 
Y
R
 
R
R
 
L
-
 
F
-
 
P
-
 
M
-
 
L
-
 
I
P
 
P
A
 
A
A
 
A
S
 
T
A
 
H
V
 
V
V
 
I
R
 
K
G
 
A
K
 
K
R
 
V
L
 
S
G
 
G
W
 
Y
G
 
S
P
 
P
V
 
R
Y
 
F
S
 
R
G
 
G
L
 
L
E
 
V
V
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
S
V
 
V
P
 
P
E
 
N
S
 
A
D
 
T
L
 
V
R
 
R
L
 
L
F
 
F
G
 
G
K
 
K
P
 
P
T
 
E
A
 
A
S
 
Y
K
 
V
L
 
G
R
 
R
R
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
I
G
 
A
I
 
L
A
 
A
C
 
W
A
 
D
D
 
K
N
 
D
V
 
V
E
 
E
E
 
V
A
 
A
R
 
K
E
 
R
R
 
K
A
 
A
R
 
E
R
 
M
I
 
V
A
 
A
A
 
H
A
 
M
V
 
I

2dwcB Crystal structure of probable phosphoribosylglycinamide formyl transferase from pyrococcus horikoshii ot3 complexed with adp
48% identity, 98% coverage: 2:388/394 of query aligns to 9:397/409 of 2dwcB

query
sites
2dwcB
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
T
 
T
P
 
A
L
 
T
S
 
T
A
 
D
S
 
S
A
 
A
T
 
Q
R
 
K
L
 
I
L
 
L
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
S
G
 
G
E
 
E
L
 
L
G
 
G
K
 
K
E
 
E
L
 
I
L
 
A
I
 
I
A
 
E
A
 
A
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
E
T
 
V
I
 
V
A
 
A
V
 
V
D
 
D
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
D
 
N
A
 
A
P
 
P
A
 
A
M
 
M
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
H
 
H
R
 
R
S
 
S
H
 
Y
V
 
V
L
 
G
D
 
N
M
 
M
T
 
M
D
 
D
P
 
K
E
 
D
A
 
F
I
 
L
L
 
W
A
 
S
I
 
V
V
 
V
K
 
E
H
 
R
E
 
E
R
 
K
P
 
P
H
 
D
Y
 
A
V
 
I
V
 
I
P
 
P
E
 
E
I
 
I
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
N
T
 
L
S
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
F
E
 
E
I
 
F
E
 
E
A
 
K
K
 
D
G
 
G
L
 
Y
A
 
-
T
 
F
V
 
V
V
 
V
P
 
P
S
 
N
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
T
Q
 
W
L
 
I
T
 
A
M
 
M
D
 
H
R
|
R
E
 
E
G
 
R
I
 
L
R
 
R
R
 
E
L
 
T
A
 
L
A
 
V
E
 
K
E
 
E
L
 
A
G
 
K
L
 
V
P
 
P
T
 
T
S
 
S
P
 
R
Y
 
Y
R
 
M
F
 
Y
A
 
A
G
 
T
T
 
T
L
 
L
A
 
D
E
 
E
L
 
L
E
 
Y
D
 
E
A
 
A
A
 
C
A
 
E
A
 
K
L
 
I
G
 
G
F
 
Y
P
 
P
C
 
C
V
x
H
I
 
T
K
|
K
P
 
A
V
 
I
M
 
M
S
 
S
S
 
-
S
 
-
G
 
-
K
 
-
G
 
G
Q
 
S
S
 
Y
V
 
F
V
 
V
R
 
K
G
 
G
A
 
P
A
 
E
E
 
D
L
 
I
A
 
P
L
 
K
A
 
A
W
 
W
Q
 
E
E
 
E
A
 
-
Q
 
-
T
 
-
A
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
-
G
 
-
G
 
-
Q
 
E
R
 
K
I
 
I
I
 
I
V
 
V
E
 
E
G
 
E
F
x
H
V
x
I
D
 
D
F
|
F
D
 
D
F
 
V
E
|
E
I
 
V
T
 
T
L
 
E
L
 
L
T
 
A
V
 
V
R
 
R
S
 
H
-
 
F
-
 
D
-
 
E
-
 
N
-
 
G
A
 
E
F
 
I
G
 
V
T
 
T
T
 
T
F
 
F
C
 
P
A
 
K
P
 
P
V
 
V
G
 
G
H
 
H
R
 
Y
Q
 
Q
E
 
I
A
 
D
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
V
 
H
E
 
A
S
 
S
W
 
W
Q
 
Q
P
 
P
Q
 
A
P
 
E
M
 
I
S
 
S
D
 
E
T
 
K
A
 
A
L
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
V
E
 
Y
K
 
R
M
 
I
A
 
A
Q
 
K
R
 
R
V
 
I
T
 
T
D
 
D
N
 
V
L
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
L
G
 
G
L
 
I
Y
 
F
G
 
G
V
 
V
E
|
E
F
 
M
F
|
F
V
 
V
R
 
K
G
 
G
T
 
D
E
 
K
V
 
V
I
 
W
F
 
A
S
 
N
E
|
E
L
 
V
S
 
S
P
 
P
R
 
R
P
 
P
H
 
H
D
|
D
T
|
T
G
 
G
L
 
M
V
 
V
T
 
T
L
 
L
A
 
A
S
 
S
Q
 
H
R
 
P
Q
 
P
-
 
G
-
 
F
S
 
S
E
 
E
F
 
F
D
 
A
L
 
L
H
 
H
L
 
L
R
 
R
A
 
A
I
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
I
E
 
P
-
 
G
-
 
E
-
 
W
-
 
V
P
 
D
G
 
G
F
 
Y
R
 
R
R
 
L
-
 
F
-
 
P
-
 
M
-
 
L
-
 
I
P
 
P
A
 
A
A
 
A
S
 
T
A
 
H
V
 
V
V
 
I
R
 
K
G
 
A
K
 
K
R
 
V
L
 
S
G
 
G
W
 
Y
G
 
S
P
 
P
V
 
R
Y
 
F
S
 
R
G
 
G
L
 
L
E
 
V
V
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
S
V
 
V
P
 
P
E
 
N
S
 
A
D
 
T
L
 
V
R
 
R
L
 
L
F
 
F
G
 
G
K
 
K
P
 
P
T
 
E
A
 
A
S
 
Y
K
 
V
L
 
G
R
 
R
R
|
R
L
 
L
G
 
G
V
 
I
G
 
A
I
 
L
A
 
A
C
 
W
A
 
D
D
 
K
N
 
D
V
 
V
E
 
E
E
 
V
A
 
A
R
 
K
E
 
R
R
 
K
A
 
A
R
 
E
R
 
M
I
 
V
A
 
A
A
 
H
A
 
M
V
 
I

3r5hA Crystal structure of adp-air complex of purk: n5-carboxyaminoimidazole ribonucleotide synthetase (see paper)
28% identity, 95% coverage: 12:384/394 of query aligns to 2:369/383 of 3r5hA

query
sites
3r5hA
T
 
T
R
 
R
L
 
I
L
 
I
L
 
L
L
 
P
G
 
G
A
 
K
G
 
T
-
 
I
-
 
G
-
 
I
-
 
I
-
 
G
-
 
G
-
x
G
E
x
Q
L
|
L
G
 
G
K
 
R
E
 
M
L
 
M
L
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
R
 
E
L
 
M
G
 
G
V
 
Y
E
 
K
T
 
I
I
 
A
A
 
V
V
 
L
D
 
D
R
 
P
Y
 
T
A
 
K
D
 
N
A
 
S
P
 
P
A
 
C
M
 
A
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
H
 
D
R
 
I
S
 
E
H
 
I
V
 
V
L
 
A
D
 
S
M
 
Y
T
 
D
D
 
D
P
 
L
E
 
K
A
 
A
I
 
I
L
 
Q
A
 
H
I
 
L
V
 
A
K
 
-
H
 
-
E
 
E
R
 
I
P
 
S
H
 
D
Y
 
V
V
 
V
V
 
T
P
 
Y
E
|
E
I
 
F
E
 
E
A
 
N
I
 
I
A
 
D
T
 
Y
S
 
R
A
 
C
L
 
L
A
 
Q
E
 
W
I
 
L
E
 
E
A
 
K
K
 
H
G
 
A
L
 
Y
A
 
-
T
 
-
V
 
-
V
 
L
P
 
P
S
 
Q
A
 
G
R
 
S
A
 
Q
V
 
L
Q
 
L
L
 
S
T
 
K
M
 
T
D
 
Q
R
 
N
E
x
R
G
 
F
I
 
T
R
 
E
R
 
K
L
 
N
A
 
A
A
 
I
E
 
E
E
 
K
L
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
T
 
V
S
 
A
P
 
T
Y
 
Y
R
 
R
F
 
L
A
 
V
G
 
Q
T
 
N
L
 
Q
A
 
E
E
 
Q
L
 
L
E
 
T
D
 
E
A
 
A
A
 
I
A
 
A
A
 
E
L
 
L
G
 
S
F
 
Y
P
 
P
C
 
S
V
 
V
I
 
L
K
|
K
P
 
T
V
 
T
M
 
T
S
 
G
S
 
G
-
x
Y
S
 
D
G
 
G
K
 
K
G
 
G
Q
|
Q
S
 
V
V
 
V
V
 
L
R
 
R
G
 
S
A
 
E
A
 
A
E
 
D
L
 
V
A
 
D
L
 
E
A
 
A
W
 
R
Q
 
K
E
 
L
A
 
A
Q
 
N
T
 
A
A
 
A
G
 
-
R
 
-
V
 
-
G
 
-
G
 
-
Q
 
-
R
 
E
I
 
C
I
 
I
V
 
L
E
 
E
G
 
K
F
x
W
V
|
V
D
 
P
F
|
F
D
 
E
F
 
K
E
|
E
I
 
V
T
 
S
L
 
V
L
 
I
T
 
V
V
 
I
R
 
R
S
 
S
A
 
V
F
 
S
G
 
G
T
 
E
T
 
T
F
 
K
C
 
V
A
 
F
P
 
P
V
 
V
G
 
A
H
 
E
R
 
N
Q
 
I
E
 
H
A
 
V
G
 
N
D
x
N
Y
 
I
V
 
L
-
 
H
E
 
E
S
 
S
W
 
I
Q
 
V
P
 
P
Q
 
A
P
 
R
M
 
I
S
 
T
D
 
E
T
 
E
A
 
L
L
 
S
R
 
Q
E
 
K
A
 
A
E
 
I
K
 
A
M
 
Y
A
 
A
Q
 
K
R
 
V
V
 
L
T
 
A
D
 
D
N
 
E
L
 
L
G
 
E
G
 
L
R
 
V
G
 
G
L
 
T
Y
 
L
G
 
A
V
 
V
E
 
E
F
 
M
F
|
F
V
 
A
R
 
T
G
 
A
T
 
D
-
 
G
E
 
E
V
 
I
I
 
Y
F
 
I
S
x
N
E
|
E
L
 
L
S
 
A
P
 
P
R
|
R
P
 
P
H
 
H
D
 
N
T
 
S
G
 
G
L
 
H
V
 
Y
T
 
T
L
 
Q
A
 
D
S
 
A
Q
 
C
R
 
E
Q
 
T
S
 
S
E
 
Q
F
 
F
D
 
G
L
 
Q
H
 
H
L
 
I
R
 
R
A
 
A
I
 
I
L
 
C
G
 
N
L
 
L
P
 
P
V
 
L
-
 
G
E
 
E
P
 
T
G
 
N
F
 
L
R
 
L
R
 
K
P
 
P
A
 
V
A
 
V
S
 
M
A
 
V
V
 
N
V
 
I
R
 
L
G
 
G
K
 
E
R
 
H
L
 
-
G
 
-
W
 
-
G
 
-
P
 
-
V
 
I
Y
 
E
S
 
G
G
 
V
L
 
L
E
 
R
V
 
Q
A
 
V
L
 
N
A
 
R
V
 
L
P
 
T
E
 
G
S
 
C
D
 
Y
L
 
L
R
 
H
L
 
L
F
 
Y
G
 
G
K
|
K
P
 
E
T
 
E
A
 
A
S
 
K
K
 
A
L
 
Q
R
|
R
R
 
K
L
 
M
G
 
G
V
 
H
G
 
V
I
 
N
A
 
I
C
 
L
A
 
N
D
 
D
N
 
N
V
 
I
E
 
E
E
 
V
A
 
A
R
 
L
E
 
E
R
 
K
A
 
A
R
 
K
R
 
S
I
 
L

3q2oB Crystal structure of purk: n5-carboxyaminoimidazole ribonucleotide synthetase (see paper)
28% identity, 95% coverage: 12:384/394 of query aligns to 2:369/377 of 3q2oB

query
sites
3q2oB
T
 
T
R
 
R
L
 
I
L
 
I
L
 
L
L
 
P
G
 
G
A
 
K
G
 
T
-
 
I
-
 
G
-
 
I
-
 
I
-
 
G
-
 
G
-
 
G
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
K
 
R
E
 
M
L
 
M
L
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
R
 
E
L
 
M
G
 
G
V
 
Y
E
 
K
T
 
I
I
 
A
A
 
V
V
 
L
D
 
D
R
 
P
Y
 
T
A
 
K
D
 
N
A
 
S
P
 
P
A
 
C
M
 
A
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
H
 
D
R
 
I
S
 
E
H
 
I
V
 
V
L
 
A
D
 
S
M
 
Y
T
 
D
D
 
D
P
 
L
E
 
K
A
 
A
I
 
I
L
 
Q
A
 
H
I
 
L
V
 
A
K
 
-
H
 
-
E
 
E
R
 
I
P
 
S
H
 
D
Y
 
V
V
 
V
V
 
T
P
 
Y
E
 
E
I
 
F
E
 
E
A
 
N
I
 
I
A
 
D
T
 
Y
S
 
R
A
 
C
L
 
L
A
 
Q
E
 
W
I
 
L
E
 
E
A
 
K
K
 
H
G
 
A
L
 
Y
A
 
-
T
 
-
V
 
-
V
 
L
P
 
P
S
 
Q
A
 
G
R
 
S
A
 
Q
V
 
L
Q
 
L
L
 
S
T
 
K
M
x
T
D
 
Q
R
 
N
E
 
R
G
 
F
I
 
T
R
x
E
R
 
K
L
 
N
A
 
A
A
 
I
E
 
E
E
 
K
L
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
T
 
V
S
 
A
P
 
T
Y
 
Y
R
 
R
F
 
L
A
 
V
G
 
Q
T
 
N
L
 
Q
A
 
E
E
 
Q
L
 
L
E
 
T
D
 
E
A
 
A
A
 
I
A
 
A
A
 
E
L
 
L
G
 
S
F
 
Y
P
 
P
C
 
S
V
 
V
I
 
L
K
 
K
P
 
T
V
 
T
M
 
T
S
 
G
S
 
G
-
 
Y
S
 
D
G
 
G
K
 
K
G
 
G
Q
 
Q
S
 
V
V
 
V
V
 
L
R
 
R
G
 
S
A
 
E
A
 
A
E
 
D
L
 
V
A
 
D
L
 
E
A
 
A
W
 
R
Q
 
K
E
 
L
A
 
A
Q
 
N
T
 
A
A
 
A
G
 
-
R
 
-
V
 
-
G
 
-
G
 
-
Q
 
-
R
 
E
I
 
C
I
 
I
V
 
L
E
 
E
G
 
K
F
 
W
V
 
V
D
 
P
F
 
F
D
 
E
F
 
K
E
 
E
I
 
V
T
 
S
L
 
V
L
 
I
T
 
V
V
 
I
R
 
R
S
 
S
A
 
V
F
 
S
G
 
G
T
 
E
T
 
T
F
 
K
C
 
V
A
 
F
P
 
P
V
 
V
G
 
A
H
 
E
R
 
N
Q
 
I
E
 
H
A
 
V
G
 
N
D
 
N
Y
 
I
V
 
L
-
 
H
E
 
E
S
 
S
W
 
I
Q
 
V
P
 
P
Q
 
A
P
 
R
M
 
I
S
 
T
D
 
E
T
 
E
A
 
L
L
 
S
R
 
Q
E
 
K
A
 
A
E
 
I
K
 
A
M
 
Y
A
 
A
Q
 
K
R
 
V
V
 
L
T
 
A
D
 
D
N
 
E
L
 
L
G
 
E
G
 
L
R
 
V
G
 
G
L
 
T
Y
 
L
G
 
A
V
 
V
E
 
E
F
 
M
F
 
F
V
 
A
R
 
T
G
 
A
T
 
D
-
 
G
E
 
E
V
 
I
I
 
Y
F
 
I
S
 
N
E
 
E
L
|
L
S
 
A
P
 
P
R
 
R
P
 
P
H
 
H
D
 
N
T
 
S
G
 
G
L
 
H
V
 
Y
T
 
T
L
 
Q
A
 
D
S
 
A
Q
 
C
R
 
E
Q
 
T
S
 
S
E
 
Q
F
 
F
D
 
G
L
 
Q
H
 
H
L
 
I
R
 
R
A
 
A
I
 
I
L
 
C
G
 
N
L
 
L
P
 
P
V
 
L
-
 
G
E
 
E
P
 
T
G
 
N
F
 
L
R
 
L
R
 
K
P
 
P
A
 
V
A
 
V
S
 
M
A
 
V
V
 
N
V
 
I
R
 
L
G
 
G
K
 
E
R
 
H
L
 
-
G
 
-
W
 
-
G
 
-
P
 
-
V
 
I
Y
 
E
S
 
G
G
 
V
L
 
L
E
 
R
V
 
Q
A
 
V
L
 
N
A
 
R
V
 
L
P
 
T
E
 
G
S
 
C
D
 
Y
L
 
L
R
 
H
L
 
L
F
 
Y
G
 
G
K
 
K
P
 
E
T
 
E
A
 
A
S
 
K
K
 
A
L
 
Q
R
 
R
R
 
K
L
 
M
G
 
G
V
 
H
G
 
V
I
 
N
A
 
I
C
 
L
A
 
N
D
 
D
N
 
N
V
 
I
E
 
E
E
 
V
A
 
A
R
 
L
E
 
E
R
 
K
A
 
A
R
 
K
R
 
S
I
 
L

3v4sA Crystal structure of adp-atp complex of purk: n5-carboxyaminoimidazole ribonucleotide synthetase (see paper)
28% identity, 95% coverage: 12:384/394 of query aligns to 1:368/380 of 3v4sA

query
sites
3v4sA
T
 
T
R
 
R
L
 
I
L
 
I
L
 
L
L
 
P
G
 
G
-
 
K
-
 
T
-
 
I
-
 
G
-
 
I
-
 
I
-
 
G
A
 
G
G
 
G
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
K
 
R
E
 
M
L
 
M
L
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
R
 
E
L
 
M
G
 
G
V
 
Y
E
 
K
T
 
I
I
 
A
A
 
V
V
 
L
D
 
D
R
 
P
Y
 
T
A
 
K
D
 
N
A
 
S
P
 
P
A
 
C
M
 
A
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
H
 
D
R
 
I
S
 
E
H
 
I
V
 
V
L
 
A
D
 
S
M
 
Y
T
 
D
D
 
D
P
 
L
E
 
K
A
 
A
I
 
I
L
 
Q
A
 
H
I
 
L
V
 
A
K
 
-
H
 
-
E
 
E
R
 
I
P
 
S
H
 
D
Y
 
V
V
 
V
V
 
T
P
 
Y
E
 
E
I
 
F
E
 
E
A
 
N
I
 
I
A
 
D
T
 
Y
S
 
R
A
 
C
L
 
L
A
 
Q
E
 
W
I
 
L
E
 
E
A
 
K
K
 
H
G
 
A
L
 
Y
A
 
-
T
 
-
V
 
-
V
 
L
P
 
P
S
 
Q
A
 
G
R
 
S
A
 
Q
V
 
L
Q
 
L
L
 
S
T
 
K
M
 
T
D
 
Q
R
 
N
E
x
R
G
 
F
I
 
T
R
 
E
R
 
K
L
 
N
A
 
A
A
 
I
E
 
E
E
 
K
L
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
T
 
V
S
 
A
P
 
T
Y
 
Y
R
 
R
F
 
L
A
 
V
G
 
Q
T
 
N
L
 
Q
A
 
E
E
 
Q
L
 
L
E
 
T
D
 
E
A
 
A
A
 
I
A
 
A
A
 
E
L
 
L
G
 
S
F
 
Y
P
 
P
C
 
S
V
 
V
I
 
L
K
|
K
P
 
T
V
 
T
M
 
T
S
 
G
S
 
G
-
x
Y
S
 
D
G
|
G
K
 
K
G
 
G
Q
|
Q
S
 
V
V
 
V
V
 
L
R
 
R
G
 
S
A
 
E
A
 
A
E
 
D
L
 
V
A
 
D
L
 
E
A
 
A
W
 
R
Q
 
K
E
 
L
A
 
A
Q
 
N
T
 
A
A
 
A
G
 
-
R
 
-
V
 
-
G
 
-
G
 
-
Q
 
-
R
 
E
I
 
C
I
 
I
V
 
L
E
 
E
G
 
K
F
x
W
V
|
V
D
 
P
F
 
F
D
 
E
F
 
K
E
|
E
I
 
V
T
 
S
L
 
V
L
 
I
T
 
V
V
 
I
R
 
R
S
 
S
A
 
V
F
 
S
G
 
G
T
 
E
T
 
T
F
 
K
C
 
V
A
 
F
P
 
P
V
 
V
G
 
A
H
 
E
R
 
N
Q
 
I
E
 
H
A
 
V
G
 
N
D
x
N
Y
 
I
V
 
L
-
 
H
E
 
E
S
 
S
W
 
I
Q
 
V
P
 
P
Q
 
A
P
 
R
M
 
I
S
 
T
D
 
E
T
 
E
A
 
L
L
 
S
R
 
Q
E
 
K
A
 
A
E
 
I
K
 
A
M
 
Y
A
 
A
Q
 
K
R
 
V
V
 
L
T
 
A
D
 
D
N
 
E
L
 
L
G
 
E
G
 
L
R
 
V
G
 
G
L
 
T
Y
 
L
G
 
A
V
 
V
E
 
E
F
 
M
F
|
F
V
 
A
R
 
T
G
 
A
T
 
D
-
 
G
E
 
E
V
 
I
I
 
Y
F
 
I
S
x
N
E
|
E
L
 
L
S
 
A
P
 
P
R
|
R
P
 
P
H
|
H
D
x
N
T
 
S
G
 
G
L
 
H
V
 
Y
T
 
T
L
 
Q
A
 
D
S
 
A
Q
 
C
R
 
E
Q
 
T
S
 
S
E
 
Q
F
 
F
D
 
G
L
 
Q
H
 
H
L
 
I
R
 
R
A
 
A
I
 
I
L
 
C
G
 
N
L
 
L
P
 
P
V
 
L
-
 
G
E
 
E
P
 
T
G
 
N
F
 
L
R
 
L
R
 
K
P
 
P
A
 
V
A
 
V
S
 
M
A
 
V
V
 
N
V
 
I
R
 
L
G
 
G
K
 
E
R
 
H
L
 
-
G
 
-
W
 
-
G
 
-
P
 
-
V
 
I
Y
 
E
S
 
G
G
 
V
L
 
L
E
 
R
V
 
Q
A
 
V
L
 
N
A
 
R
V
 
L
P
 
T
E
 
G
S
 
C
D
 
Y
L
 
L
R
 
H
L
 
L
F
 
Y
G
 
G
K
 
K
P
 
E
T
 
E
A
 
A
S
 
K
K
 
A
L
 
Q
R
 
R
R
 
K
L
 
M
G
 
G
V
 
H
G
 
V
I
 
N
A
 
I
C
 
L
A
 
N
D
 
D
N
 
N
V
 
I
E
 
E
E
 
V
A
 
A
R
 
L
E
 
E
R
 
K
A
 
A
R
 
K
R
 
S
I
 
L

4dlkA Crystal structure of atp-ca++ complex of purk: n5- carboxyaminoimidazole ribonucleotide synthetase (see paper)
28% identity, 95% coverage: 12:384/394 of query aligns to 2:369/380 of 4dlkA

query
sites
4dlkA
T
 
T
R
 
R
L
 
I
L
 
I
L
 
L
L
 
P
G
 
G
A
 
K
G
 
T
-
 
I
-
 
G
-
 
I
-
 
I
-
 
G
-
 
G
-
 
G
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
K
 
R
E
 
M
L
 
M
L
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
R
 
E
L
 
M
G
 
G
V
 
Y
E
 
K
T
 
I
I
 
A
A
 
V
V
 
L
D
 
D
R
 
P
Y
 
T
A
 
K
D
 
N
A
 
S
P
 
P
A
 
C
M
 
A
Q
|
Q
V
 
V
A
|
A
H
 
D
R
 
I
S
 
E
H
 
I
V
 
V
L
 
A
D
 
S
M
 
Y
T
 
D
D
 
D
P
 
L
E
 
K
A
 
A
I
 
I
L
 
Q
A
 
H
I
 
L
V
 
A
K
 
-
H
 
-
E
 
E
R
 
I
P
 
S
H
 
D
Y
 
V
V
 
V
V
 
T
P
 
Y
E
|
E
I
x
F
E
 
E
A
 
N
I
 
I
A
 
D
T
 
Y
S
 
R
A
 
C
L
 
L
A
 
Q
E
 
W
I
 
L
E
 
E
A
 
K
K
 
H
G
 
A
L
 
Y
A
 
-
T
 
-
V
 
-
V
 
L
P
 
P
S
 
Q
A
 
G
R
 
S
A
 
Q
V
 
L
Q
 
L
L
 
S
T
 
K
M
 
T
D
 
Q
R
 
N
E
x
R
G
 
F
I
 
T
R
 
E
R
 
K
L
 
N
A
 
A
A
 
I
E
 
E
E
 
K
L
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
T
 
V
S
 
A
P
 
T
Y
 
Y
R
 
R
F
 
L
A
 
V
G
 
Q
T
 
N
L
 
Q
A
 
E
E
 
Q
L
 
L
E
 
T
D
 
E
A
 
A
A
 
I
A
 
A
A
 
E
L
 
L
G
 
S
F
 
Y
P
 
P
C
 
S
V
 
V
I
 
L
K
|
K
P
 
T
V
 
T
M
 
T
S
 
G
S
 
G
-
x
Y
S
x
D
G
|
G
K
 
K
G
 
G
Q
|
Q
S
 
V
V
 
V
V
 
L
R
 
R
G
 
S
A
 
E
A
 
A
E
 
D
L
 
V
A
 
D
L
 
E
A
 
A
W
 
R
Q
 
K
E
 
L
A
 
A
Q
 
N
T
 
A
A
 
A
G
 
-
R
 
-
V
 
-
G
 
-
G
 
-
Q
 
-
R
 
E
I
 
C
I
 
I
V
 
L
E
 
E
G
 
K
F
x
W
V
|
V
D
 
P
F
|
F
D
 
E
F
 
K
E
|
E
I
 
V
T
 
S
L
 
V
L
 
I
T
 
V
V
 
I
R
 
R
S
 
S
A
 
V
F
 
S
G
 
G
T
 
E
T
 
T
F
 
K
C
 
V
A
 
F
P
 
P
V
 
V
G
 
A
H
 
E
R
 
N
Q
 
I
E
 
H
A
 
V
G
 
N
D
 
N
Y
 
I
V
 
L
-
 
H
E
 
E
S
 
S
W
 
I
Q
 
V
P
 
P
Q
 
A
P
 
R
M
 
I
S
 
T
D
 
E
T
 
E
A
 
L
L
 
S
R
 
Q
E
 
K
A
 
A
E
 
I
K
 
A
M
 
Y
A
 
A
Q
 
K
R
 
V
V
 
L
T
 
A
D
 
D
N
 
E
L
 
L
G
 
E
G
 
L
R
 
V
G
 
G
L
 
T
Y
 
L
G
 
A
V
 
V
E
|
E
F
 
M
F
|
F
V
 
A
R
 
T
G
 
A
T
 
D
-
 
G
E
 
E
V
 
I
I
 
Y
F
 
I
S
x
N
E
|
E
L
 
L
S
 
A
P
 
P
R
|
R
P
 
P
H
|
H
D
x
N
T
x
S
G
 
G
L
 
H
V
 
Y
T
 
T
L
 
Q
A
 
D
S
 
A
Q
 
C
R
 
E
Q
 
T
S
 
S
E
 
Q
F
 
F
D
 
G
L
 
Q
H
 
H
L
 
I
R
 
R
A
 
A
I
 
I
L
 
C
G
 
N
L
 
L
P
 
P
V
 
L
-
 
G
E
 
E
P
 
T
G
 
N
F
 
L
R
 
L
R
 
K
P
 
P
A
 
V
A
 
V
S
 
M
A
 
V
V
 
N
V
 
I
R
 
L
G
 
G
K
 
E
R
 
H
L
 
-
G
 
-
W
 
-
G
 
-
P
 
-
V
 
I
Y
 
E
S
 
G
G
 
V
L
 
L
E
 
R
V
 
Q
A
 
V
L
 
N
A
 
R
V
 
L
P
 
T
E
 
G
S
 
C
D
 
Y
L
 
L
R
 
H
L
 
L
F
 
Y
G
 
G
K
|
K
P
 
E
T
 
E
A
 
A
S
 
K
K
 
A
L
 
Q
R
|
R
R
x
K
L
 
M
G
 
G
V
 
H
G
 
V
I
 
N
A
 
I
C
 
L
A
 
N
D
 
D
N
 
N
V
 
I
E
 
E
E
 
V
A
 
A
R
 
L
E
 
E
R
 
K
A
 
A
R
 
K
R
 
S
I
 
L

3v4sB Crystal structure of adp-atp complex of purk: n5-carboxyaminoimidazole ribonucleotide synthetase (see paper)
28% identity, 95% coverage: 12:384/394 of query aligns to 3:370/381 of 3v4sB

query
sites
3v4sB
T
 
T
R
 
R
L
 
I
L
 
I
L
 
L
L
 
P
G
 
G
A
 
K
G
 
T
-
 
I
-
 
G
-
 
I
-
 
I
-
 
G
-
 
G
-
 
G
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
K
 
R
E
 
M
L
 
M
L
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
R
 
E
L
 
M
G
 
G
V
 
Y
E
 
K
T
 
I
I
 
A
A
 
V
V
 
L
D
 
D
R
 
P
Y
 
T
A
 
K
D
 
N
A
 
S
P
 
P
A
 
C
M
 
A
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
H
 
D
R
 
I
S
 
E
H
 
I
V
 
V
L
 
A
D
 
S
M
 
Y
T
 
D
D
 
D
P
 
L
E
 
K
A
 
A
I
 
I
L
 
Q
A
 
H
I
 
L
V
 
A
K
 
-
H
 
-
E
 
E
R
 
I
P
 
S
H
 
D
Y
 
V
V
 
V
V
 
T
P
 
Y
E
 
E
I
 
F
E
 
E
A
 
N
I
 
I
A
 
D
T
 
Y
S
 
R
A
 
C
L
 
L
A
 
Q
E
 
W
I
 
L
E
 
E
A
 
K
K
 
H
G
 
A
L
 
Y
A
 
-
T
 
-
V
 
-
V
 
L
P
 
P
S
 
Q
A
 
G
R
 
S
A
 
Q
V
 
L
Q
 
L
L
 
S
T
 
K
M
x
T
D
 
Q
R
 
N
E
x
R
G
 
F
I
 
T
R
x
E
R
 
K
L
 
N
A
 
A
A
 
I
E
 
E
E
 
K
L
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
T
 
V
S
 
A
P
 
T
Y
 
Y
R
 
R
F
 
L
A
 
V
G
 
Q
T
 
N
L
 
Q
A
 
E
E
 
Q
L
 
L
E
 
T
D
 
E
A
 
A
A
 
I
A
 
A
A
 
E
L
 
L
G
 
S
F
 
Y
P
 
P
C
 
S
V
 
V
I
 
L
K
|
K
P
 
T
V
 
T
M
 
T
S
 
G
S
 
G
-
x
Y
S
x
D
G
|
G
K
 
K
G
 
G
Q
|
Q
S
 
V
V
 
V
V
 
L
R
 
R
G
 
S
A
 
E
A
 
A
E
 
D
L
 
V
A
 
D
L
 
E
A
 
A
W
 
R
Q
 
K
E
 
L
A
 
A
Q
 
N
T
 
A
A
 
A
G
 
-
R
 
-
V
 
-
G
 
-
G
 
-
Q
 
-
R
 
E
I
 
C
I
 
I
V
 
L
E
|
E
G
 
K
F
x
W
V
|
V
D
 
P
F
|
F
D
 
E
F
 
K
E
|
E
I
 
V
T
 
S
L
 
V
L
 
I
T
 
V
V
 
I
R
 
R
S
 
S
A
 
V
F
 
S
G
 
G
T
 
E
T
 
T
F
 
K
C
 
V
A
 
F
P
 
P
V
 
V
G
 
A
H
 
E
R
 
N
Q
 
I
E
x
H
A
 
V
G
 
N
D
x
N
Y
 
I
V
 
L
-
 
H
E
 
E
S
 
S
W
 
I
Q
 
V
P
 
P
Q
 
A
P
 
R
M
 
I
S
 
T
D
 
E
T
 
E
A
 
L
L
 
S
R
 
Q
E
 
K
A
 
A
E
 
I
K
 
A
M
 
Y
A
 
A
Q
 
K
R
 
V
V
 
L
T
 
A
D
 
D
N
 
E
L
 
L
G
 
E
G
 
L
R
 
V
G
 
G
L
 
T
Y
 
L
G
 
A
V
 
V
E
|
E
F
 
M
F
|
F
V
 
A
R
 
T
G
 
A
T
 
D
-
 
G
E
 
E
V
 
I
I
 
Y
F
 
I
S
 
N
E
|
E
L
|
L
S
 
A
P
 
P
R
|
R
P
 
P
H
|
H
D
x
N
T
 
S
G
 
G
L
 
H
V
 
Y
T
 
T
L
 
Q
A
 
D
S
 
A
Q
 
C
R
 
E
Q
 
T
S
 
S
E
 
Q
F
 
F
D
 
G
L
 
Q
H
 
H
L
 
I
R
 
R
A
 
A
I
 
I
L
 
C
G
 
N
L
 
L
P
 
P
V
 
L
-
 
G
E
 
E
P
 
T
G
 
N
F
 
L
R
 
L
R
 
K
P
 
P
A
 
V
A
 
V
S
 
M
A
 
V
V
 
N
V
 
I
R
 
L
G
 
G
K
 
E
R
 
H
L
 
-
G
 
-
W
 
-
G
 
-
P
 
-
V
 
I
Y
 
E
S
 
G
G
 
V
L
 
L
E
 
R
V
 
Q
A
 
V
L
 
N
A
 
R
V
 
L
P
 
T
E
 
G
S
 
C
D
 
Y
L
 
L
R
 
H
L
 
L
F
 
Y
G
 
G
K
 
K
P
 
E
T
 
E
A
 
A
S
 
K
K
 
A
L
 
Q
R
 
R
R
 
K
L
 
M
G
 
G
V
 
H
G
 
V
I
 
N
A
 
I
C
 
L
A
 
N
D
 
D
N
 
N
V
 
I
E
 
E
E
 
V
A
 
A
R
 
L
E
 
E
R
 
K
A
 
A
R
 
K
R
 
S
I
 
L

5jqwA The crystal structure of phosphoribosylaminoimidazole carboxylase atpase subunit of francisella tularensis subsp. Tularensis schu s4 in complex with adp
28% identity, 76% coverage: 13:310/394 of query aligns to 2:290/365 of 5jqwA

query
sites
5jqwA
R
 
K
L
 
I
L
 
G
L
 
I
L
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
Q
L
 
L
G
 
A
K
 
R
E
 
M
L
 
L
L
 
S
I
 
L
A
 
A
A
 
G
Q
 
T
R
 
P
L
 
L
G
 
G
V
 
L
E
 
E
T
 
F
I
 
H
A
 
C
V
 
L
D
 
G
R
 
K
Y
 
N
A
 
G
D
 
D
A
 
C
P
 
-
A
 
A
M
 
E
Q
 
E
V
 
V
A
 
V
H
 
K
R
 
T
S
 
V
H
 
T
V
 
D
L
 
I
D
 
E
M
 
L
T
 
T
D
 
K
P
 
V
E
 
N
A
 
D
I
 
V
L
 
V
A
 
A
I
 
W
V
 
A
K
 
K
H
 
-
E
 
-
R
 
Q
P
 
F
H
 
D
Y
 
V
V
 
I
V
 
T
P
 
F
E
 
E
I
 
N
E
 
E
A
 
N
I
 
I
A
 
S
T
 
H
S
 
E
A
 
L
L
 
I
A
 
K
E
 
A
I
 
I
E
 
N
A
 
H
K
 
E
G
 
-
L
 
-
A
 
V
T
 
S
V
 
V
V
 
Y
P
 
P
S
 
S
A
 
A
R
 
K
A
 
A
V
 
I
Q
 
A
L
 
I
T
 
S
M
 
Q
D
 
D
R
|
R
E
 
L
G
 
-
I
 
L
R
 
E
R
 
K
L
 
S
A
 
F
A
 
M
E
 
Q
E
 
D
L
 
H
G
 
G
L
 
I
P
 
A
T
 
T
S
 
A
P
 
K
Y
 
F
R
 
V
F
 
N
A
 
I
G
 
D
T
 
S
L
 
L
A
 
A
E
 
K
L
 
L
E
 
Q
D
 
S
A
 
A
A
 
V
A
 
D
A
 
D
L
 
H
G
 
G
F
 
L
P
 
P
C
 
A
V
 
I
I
 
L
K
|
K
P
 
T
V
 
R
-
 
R
M
 
F
S
x
G
S
x
Y
S
x
D
G
|
G
K
 
K
G
 
G
Q
 
Q
S
 
F
V
 
V
V
 
I
R
 
R
G
 
S
A
 
Q
A
 
E
E
 
D
L
 
I
A
 
T
L
 
K
A
 
A
W
 
W
Q
 
D
E
 
V
A
 
L
Q
 
K
T
 
D
A
 
A
G
 
P
R
 
-
V
 
-
G
 
-
G
 
-
Q
 
D
R
 
G
I
 
L
I
 
I
V
 
Y
E
 
E
G
 
A
F
 
F
V
|
V
D
 
D
F
 
F
D
 
D
F
 
Y
E
|
E
I
 
V
T
 
S
L
 
Q
L
 
I
T
 
C
V
 
T
R
 
A
S
 
D
A
 
L
F
 
K
G
 
G
T
 
N
T
 
I
F
 
A
C
 
F
A
 
Y
P
 
P
V
 
L
G
 
A
-
 
R
-
 
N
-
 
T
H
|
H
R
 
K
Q
 
Q
E
 
-
A
 
-
G
 
G
D
 
I
Y
 
I
V
 
V
E
 
E
S
 
S
W
 
-
Q
 
-
P
 
E
Q
 
A
P
 
P
M
 
F
S
 
E
D
 
N
T
 
V
A
 
V
L
 
L
R
 
A
E
 
E
-
 
K
A
 
A
E
 
Q
K
 
Q
M
 
I
A
 
A
Q
 
K
R
 
I
V
 
L
T
 
V
D
 
K
N
 
E
L
 
F
G
 
A
G
 
Y
R
 
V
G
 
G
L
 
T
Y
 
L
G
 
A
V
 
I
E
|
E
F
 
F
F
|
F
V
 
V
R
 
K
G
 
G
T
 
D
E
 
E
V
 
L
I
 
I
F
 
V
S
 
N
E
|
E
L
 
I
S
 
A
P
 
P
R
 
R
P
 
V
H
 
H
D
x
N
T
x
S
G
 
G
L
 
H
V
 
W
T
 
S
L
 
I
A
 
D
S
 
G
Q
 
A
R
 
V
Q
 
T
S
 
S
E
 
Q
F
 
F
D
 
E
L
 
N
H
 
H
L
 
V
R
 
R
A
 
A
I
 
I
L
 
A
G
 
G
L
 
L

Sites not aligning to the query:

4ma0A The crystal structure of phosphoribosylaminoimidazole carboxylase atpase subunit of francisella tularensis subsp. Tularensis schu s4 in complex with partially hydrolysed atp
28% identity, 76% coverage: 13:310/394 of query aligns to 2:290/366 of 4ma0A

query
sites
4ma0A
R
 
K
L
 
I
L
 
G
L
 
I
L
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
Q
L
 
L
G
 
A
K
 
R
E
 
M
L
 
L
L
 
S
I
 
L
A
 
A
A
 
G
Q
 
T
R
 
P
L
 
L
G
 
G
V
 
L
E
 
E
T
 
F
I
 
H
A
 
C
V
 
L
D
 
G
R
 
K
Y
 
N
A
 
G
D
 
D
A
 
C
P
 
-
A
 
A
M
 
E
Q
 
E
V
 
V
A
 
V
H
 
K
R
 
T
S
 
V
H
 
T
V
 
D
L
 
I
D
 
E
M
 
L
T
 
T
D
 
K
P
 
V
E
 
N
A
 
D
I
 
V
L
 
V
A
 
A
I
 
W
V
 
A
K
 
K
H
 
-
E
 
-
R
 
Q
P
 
F
H
 
D
Y
 
V
V
 
I
V
 
T
P
 
F
E
 
E
I
 
N
E
 
E
A
 
N
I
 
I
A
 
S
T
 
H
S
 
E
A
 
L
L
 
I
A
 
K
E
 
A
I
 
I
E
 
N
A
 
H
K
 
E
G
 
-
L
 
-
A
 
V
T
 
S
V
 
V
V
 
Y
P
 
P
S
 
S
A
 
A
R
 
K
A
 
A
V
 
I
Q
 
A
L
 
I
T
 
S
M
 
Q
D
 
D
R
 
R
E
 
L
G
 
-
I
 
L
R
 
E
R
 
K
L
 
S
A
 
F
A
 
M
E
 
Q
E
 
D
L
 
H
G
 
G
L
 
I
P
 
A
T
 
T
S
 
A
P
 
K
Y
 
F
R
 
V
F
 
N
A
 
I
G
 
D
T
 
S
L
 
L
A
 
A
E
 
K
L
 
L
E
 
Q
D
 
S
A
 
A
A
 
V
A
 
D
A
 
D
L
 
H
G
 
G
F
 
L
P
 
P
C
 
A
V
x
I
I
 
L
K
|
K
P
 
T
V
 
R
-
 
R
M
 
F
S
 
G
S
x
Y
S
 
D
G
|
G
K
 
K
G
 
G
Q
 
Q
S
 
F
V
 
V
V
 
I
R
 
R
G
 
S
A
 
Q
A
 
E
E
 
D
L
 
I
A
 
T
L
 
K
A
 
A
W
 
W
Q
 
D
E
 
V
A
 
L
Q
 
K
T
 
D
A
 
A
G
 
P
R
 
-
V
 
-
G
 
-
G
 
-
Q
 
D
R
 
G
I
 
L
I
 
I
V
 
Y
E
|
E
G
x
A
F
|
F
V
|
V
D
 
D
F
 
F
D
 
D
F
 
Y
E
|
E
I
 
V
T
 
S
L
 
Q
L
 
I
T
 
C
V
 
T
R
 
A
S
 
D
A
 
L
F
 
K
G
 
G
T
 
N
T
 
I
F
 
A
C
 
F
A
 
Y
P
 
P
V
 
L
G
 
A
-
 
R
-
 
N
-
 
T
H
|
H
R
 
K
Q
 
Q
E
 
-
A
 
-
G
 
G
D
 
I
Y
 
I
V
 
V
E
 
E
S
 
S
W
 
-
Q
 
-
P
 
E
Q
 
A
P
 
P
M
 
F
S
 
E
D
 
N
T
 
V
A
 
V
L
 
L
R
 
A
E
 
E
-
 
K
A
 
A
E
 
Q
K
 
Q
M
 
I
A
 
A
Q
 
K
R
 
I
V
 
L
T
 
V
D
 
K
N
 
E
L
 
F
G
 
A
G
 
Y
R
 
V
G
 
G
L
 
T
Y
 
L
G
 
A
V
 
I
E
|
E
F
 
F
F
|
F
V
 
V
R
 
K
G
 
G
T
 
D
E
 
E
V
 
L
I
 
I
F
 
V
S
 
N
E
|
E
L
 
I
S
 
A
P
 
P
R
 
R
P
 
V
H
 
H
D
x
N
T
x
S
G
 
G
L
 
H
V
 
W
T
 
S
L
 
I
A
 
D
S
 
G
Q
 
A
R
 
V
Q
 
T
S
 
S
E
 
Q
F
 
F
D
 
E
L
 
N
H
 
H
L
 
V
R
 
R
A
 
A
I
 
I
L
 
A
G
 
G
L
 
L

Sites not aligning to the query:

4mamA The crystal structure of phosphoribosylaminoimidazole carboxylase atpase subunit of francisella tularensis subsp. Tularensis schu s4 in complex with an adp analog, amp-cp
28% identity, 76% coverage: 13:310/394 of query aligns to 2:290/373 of 4mamA

query
sites
4mamA
R
 
K
L
 
I
L
 
G
L
 
I
L
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
Q
L
 
L
G
 
A
K
 
R
E
 
M
L
 
L
L
 
S
I
 
L
A
 
A
A
 
G
Q
 
T
R
 
P
L
 
L
G
 
G
V
 
L
E
 
E
T
 
F
I
 
H
A
 
C
V
 
L
D
 
G
R
 
K
Y
 
N
A
 
G
D
 
D
A
 
C
P
 
-
A
 
A
M
 
E
Q
 
E
V
 
V
A
 
V
H
 
K
R
 
T
S
 
V
H
 
T
V
 
D
L
 
I
D
 
E
M
 
L
T
 
T
D
 
K
P
 
V
E
 
N
A
 
D
I
 
V
L
 
V
A
 
A
I
 
W
V
 
A
K
 
K
H
 
-
E
 
-
R
 
Q
P
 
F
H
 
D
Y
 
V
V
 
I
V
 
T
P
 
F
E
 
E
I
 
N
E
 
E
A
 
N
I
 
I
A
 
S
T
 
H
S
 
E
A
 
L
L
 
I
A
 
K
E
 
A
I
 
I
E
 
N
A
 
H
K
 
E
G
 
-
L
 
-
A
 
V
T
 
S
V
 
V
V
 
Y
P
 
P
S
 
S
A
 
A
R
 
K
A
 
A
V
 
I
Q
 
A
L
 
I
T
 
S
M
 
Q
D
 
D
R
|
R
E
 
L
G
 
-
I
 
L
R
 
E
R
 
K
L
 
S
A
 
F
A
 
M
E
 
Q
E
 
D
L
 
H
G
 
G
L
 
I
P
 
A
T
 
T
S
 
A
P
 
K
Y
 
F
R
 
V
F
 
N
A
 
I
G
 
D
T
 
S
L
 
L
A
 
A
E
 
K
L
 
L
E
 
Q
D
 
S
A
 
A
A
 
V
A
 
D
A
 
D
L
 
H
G
 
G
F
 
L
P
 
P
C
 
A
V
x
I
I
 
L
K
|
K
P
 
T
V
 
R
-
 
R
M
 
F
S
 
G
S
x
Y
S
 
D
G
|
G
K
 
K
G
 
G
Q
|
Q
S
 
F
V
 
V
V
 
I
R
 
R
G
 
S
A
 
Q
A
 
E
E
 
D
L
 
I
A
 
T
L
 
K
A
 
A
W
 
W
Q
 
D
E
 
V
A
 
L
Q
 
K
T
 
D
A
 
A
G
 
P
R
 
-
V
 
-
G
 
-
G
 
-
Q
 
D
R
 
G
I
 
L
I
 
I
V
 
Y
E
|
E
G
 
A
F
|
F
V
|
V
D
 
D
F
|
F
D
 
D
F
 
Y
E
|
E
I
 
V
T
 
S
L
 
Q
L
 
I
T
 
C
V
 
T
R
 
A
S
 
D
A
 
L
F
 
K
G
 
G
T
 
N
T
 
I
F
 
A
C
 
F
A
 
Y
P
 
P
V
 
L
G
 
A
-
 
R
-
 
N
-
 
T
H
|
H
R
 
K
Q
 
Q
E
 
-
A
 
-
G
 
G
D
 
I
Y
 
I
V
 
V
E
 
E
S
 
S
W
 
-
Q
 
-
P
 
E
Q
 
A
P
 
P
M
 
F
S
 
E
D
 
N
T
 
V
A
 
V
L
 
L
R
 
A
E
 
E
-
 
K
A
 
A
E
 
Q
K
 
Q
M
 
I
A
 
A
Q
 
K
R
 
I
V
 
L
T
 
V
D
 
K
N
 
E
L
 
F
G
 
A
G
 
Y
R
 
V
G
 
G
L
 
T
Y
 
L
G
 
A
V
 
I
E
|
E
F
 
F
F
|
F
V
 
V
R
 
K
G
 
G
T
 
D
E
 
E
V
 
L
I
 
I
F
 
V
S
 
N
E
|
E
L
 
I
S
 
A
P
 
P
R
 
R
P
 
V
H
 
H
D
x
N
T
x
S
G
 
G
L
 
H
V
 
W
T
 
S
L
 
I
A
 
D
S
 
G
Q
 
A
R
 
V
Q
 
T
S
 
S
E
 
Q
F
 
F
D
 
E
L
 
N
H
 
H
L
 
V
R
 
R
A
 
A
I
 
I
L
 
A
G
 
G
L
 
L

Sites not aligning to the query:

3aw8A Crystal structure of n5-carboxyaminoimidazole ribonucleotide synthetase from thermus thermophilus hb8
34% identity, 73% coverage: 26:312/394 of query aligns to 14:285/360 of 3aw8A

query
sites
3aw8A
L
 
L
L
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
G
Q
 
Y
R
 
P
L
 
L
G
 
G
V
 
L
E
 
S
T
 
F
I
 
R
A
 
F
V
 
L
D
 
D
R
 
P
Y
 
S
A
 
P
D
 
E
A
 
A
P
 
C
A
 
A
M
 
G
Q
 
Q
V
 
V
A
 
G
H
 
E
R
 
L
S
 
V
H
 
-
V
 
V
L
 
G
D
 
E
M
 
F
T
 
L
D
 
D
P
 
E
E
 
G
A
 
A
I
 
L
L
 
L
A
 
R
I
 
F
V
 
A
K
 
-
H
 
-
E
 
E
R
 
G
P
 
L
H
 
A
Y
 
L
V
 
V
V
 
T
P
 
Y
E
 
E
I
 
F
E
 
E
A
 
N
I
 
V
A
 
P
T
 
V
S
 
E
A
 
A
L
 
A
A
 
R
E
 
R
I
 
L
E
 
E
A
 
-
K
 
-
G
 
G
L
 
R
A
 
L
T
 
P
V
 
L
V
 
Y
P
 
P
S
 
P
A
 
A
R
 
K
A
 
A
V
 
L
Q
 
E
L
 
V
T
 
A
M
 
Q
D
 
D
R
 
R
E
 
-
G
 
-
I
 
L
R
 
R
-
 
E
R
 
K
L
 
T
A
 
F
A
 
F
E
 
Q
E
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
V
P
 
P
T
 
T
S
 
P
P
 
P
Y
 
F
R
 
H
F
 
P
A
 
V
G
 
D
T
 
G
L
 
P
A
 
E
E
 
D
L
 
L
E
 
E
D
 
E
A
 
G
A
 
L
A
 
K
A
 
R
L
 
V
G
 
G
F
 
L
P
 
P
C
 
A
V
x
L
I
 
L
K
|
K
P
 
-
V
 
-
M
 
-
S
 
-
S
 
-
S
 
T
G
 
R
K
 
R
G
 
G
Q
|
Q
S
 
A
V
 
L
V
 
V
R
 
R
G
 
T
A
 
E
A
 
E
E
 
E
L
 
-
A
 
A
L
 
L
A
 
-
W
 
-
Q
 
-
E
 
E
A
 
A
Q
 
L
T
 
K
A
 
A
G
 
-
R
 
-
V
 
L
G
 
G
G
 
G
Q
 
R
R
 
G
I
 
L
I
 
I
V
 
L
E
 
E
G
 
G
F
|
F
V
|
V
D
 
P
F
 
F
D
 
D
F
 
R
E
|
E
I
 
V
T
 
S
L
 
L
L
 
L
T
 
A
V
 
V
R
 
R
S
 
G
A
 
R
F
 
T
G
 
G
-
 
E
T
 
V
T
 
A
F
 
F
C
 
Y
A
 
P
P
 
L
V
 
V
G
 
E
H
 
N
R
 
R
Q
x
H
E
 
W
A
 
G
G
 
G
D
 
I
Y
 
L
V
 
R
E
 
L
S
 
S
W
 
L
Q
 
A
P
 
P
Q
 
A
P
 
P
M
 
G
S
 
A
D
 
S
T
 
E
A
 
A
L
 
L
-
 
Q
R
 
K
E
 
K
A
 
A
E
 
E
K
 
A
M
 
Y
A
 
A
Q
 
L
R
 
R
V
 
A
T
 
M
D
 
E
N
 
A
L
 
L
G
 
D
G
 
Y
R
 
V
G
 
G
L
 
V
Y
 
L
G
 
A
V
 
L
E
|
E
F
 
F
F
|
F
V
 
Q
R
 
V
G
 
G
T
 
E
E
 
E
V
 
L
I
 
L
F
 
F
S
 
N
E
|
E
L
 
M
S
 
A
P
 
P
R
 
R
P
 
V
H
 
H
D
x
N
T
x
S
G
 
G
L
 
H
V
 
W
T
 
T
L
 
I
A
 
E
S
 
G
Q
 
A
R
 
E
Q
 
T
S
 
S
E
 
Q
F
 
F
D
 
E
L
 
N
H
 
H
L
 
L
R
 
R
A
 
A
I
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
L

Sites not aligning to the query:

3ax6A Crystal structure of n5-carboxyaminoimidazole ribonucleotide synthetase from thermotoga maritima
27% identity, 91% coverage: 26:383/394 of query aligns to 16:350/360 of 3ax6A

query
sites
3ax6A
L
 
M
L
 
T
I
 
L
A
 
E
A
 
A
Q
 
K
R
 
K
L
 
M
G
 
G
V
 
F
E
 
Y
T
 
V
I
 
I
A
 
V
V
 
L
D
 
D
R
 
P
Y
 
T
A
 
P
D
 
R
A
 
S
P
 
P
A
 
A
M
 
G
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
H
 
D
R
 
E
S
 
Q
H
 
I
V
 
V
L
 
A
D
 
G
M
 
F
T
 
F
D
 
D
P
 
S
E
 
E
A
 
R
I
 
I
L
 
E
A
 
D
I
 
L
V
 
V
K
 
K
H
 
G
E
 
-
R
 
-
P
 
S
H
 
D
Y
 
V
V
 
T
V
 
T
P
 
Y
E
 
D
I
 
L
E
 
E
A
 
H
I
 
I
A
 
D
T
 
V
S
 
Q
A
 
T
L
 
L
A
 
K
E
 
K
I
 
L
E
 
Y
A
 
N
K
 
E
G
 
G
L
 
Y
A
 
K
T
 
-
V
 
I
V
 
H
P
 
P
S
 
S
A
 
P
R
 
Y
A
 
T
V
 
L
Q
 
E
L
 
I
T
 
I
M
 
Q
D
 
D
R
x
K
E
 
-
G
 
F
I
 
V
R
 
Q
R
 
K
L
 
E
A
 
F
A
 
L
E
 
K
E
 
K
L
 
N
G
 
G
L
 
I
P
 
P
T
 
V
S
 
P
P
 
E
Y
 
Y
R
 
K
F
 
L
A
 
-
G
 
-
T
 
-
L
 
V
A
 
K
E
 
D
L
 
L
E
 
E
D
 
S
A
 
D
A
 
V
A
 
R
A
 
E
L
 
F
G
 
G
F
 
F
P
 
P
C
 
V
V
|
V
I
 
Q
K
|
K
P
 
-
V
 
-
M
 
-
S
 
-
S
 
A
S
 
R
G
 
K
K
 
G
G
 
G
Q
 
V
S
 
F
V
 
I
V
 
I
R
 
K
G
 
N
A
 
E
A
 
K
E
 
D
L
 
L
A
 
E
L
 
N
A
 
A
W
 
-
Q
 
-
E
 
-
A
 
-
Q
 
-
T
 
-
A
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
I
G
 
K
G
 
G
Q
 
E
R
 
T
I
 
Y
I
 
L
V
 
-
E
|
E
G
 
E
F
|
F
V
|
V
D
 
E
F
 
I
D
 
E
F
 
K
E
|
E
I
 
L
T
 
A
L
 
V
L
 
M
T
 
V
V
 
A
R
 
R
S
 
N
A
 
E
F
 
K
G
 
G
T
 
E
T
 
I
F
 
A
C
 
C
A
 
Y
P
 
P
V
 
V
G
 
-
H
 
-
R
 
-
Q
 
V
E
 
E
A
 
M
G
 
Y
D
 
D
Y
 
T
V
 
V
E
 
-
S
 
-
W
 
I
Q
 
A
P
 
P
Q
 
A
P
 
R
M
 
I
S
 
E
D
 
E
T
 
K
A
 
Y
L
 
S
R
 
K
E
 
I
A
 
A
E
 
R
K
 
E
M
 
I
A
 
A
Q
 
T
R
 
S
V
 
V
T
 
V
D
 
E
N
 
A
L
 
L
G
 
E
G
 
G
R
 
V
G
 
G
L
 
I
Y
 
F
G
 
G
V
 
I
E
|
E
F
 
M
F
|
F
V
 
L
-
 
T
R
 
K
G
 
Q
T
 
G
E
 
E
V
 
I
I
 
L
F
 
V
S
x
N
E
|
E
L
 
I
S
 
A
P
 
P
R
 
R
P
 
P
H
 
H
D
x
N
T
x
S
G
 
G
L
 
H
V
 
Y
T
 
T
L
 
I
A
 
E
S
 
A
Q
 
C
R
 
V
Q
 
T
S
 
S
E
 
Q
F
 
F
D
 
E
L
 
Q
H
 
H
L
 
I
R
 
R
A
 
A
I
 
I
L
 
M
G
 
N
L
 
L
P
 
P
V
 
L
-
 
G
E
 
S
P
 
T
G
 
E
F
 
L
R
 
L
R
 
I
P
 
P
A
 
A
A
 
V
S
 
M
A
 
V
V
 
N
V
 
L
R
 
L
G
 
G
K
 
E
R
 
E
L
 
G
G
 
Y
W
 
Y
G
 
G
-
 
K
P
 
P
V
 
A
Y
 
L
S
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
V
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
I
P
 
E
E
 
G
S
 
L
D
 
S
L
 
L
R
 
H
L
 
F
F
 
Y
G
 
G
K
 
K
P
 
K
T
 
E
A
 
T
S
 
R
K
 
P
L
 
Y
R
 
R
R
x
K
L
 
M
G
 
G
V
 
H
G
 
F
I
 
T
A
 
V
C
 
V
A
 
D
D
 
R
N
 
D
V
 
V
E
 
E
E
 
R
A
 
A
R
 
L
E
 
E
R
 
K
A
 
A
R
 
L
R
 
R

4ma5A The crystal structure of phosphoribosylaminoimidazole carboxylase atpase subunit of francisella tularensis subsp. Tularensis schu s4 in complex with an atp analog, amp-pnp.
28% identity, 75% coverage: 16:310/394 of query aligns to 5:288/363 of 4ma5A

query
sites
4ma5A
L
 
I
L
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
Q
L
 
L
G
 
A
K
 
R
E
 
M
L
 
L
L
 
S
I
 
L
A
 
A
A
 
G
Q
 
T
R
 
P
L
 
L
G
 
G
V
 
L
E
 
E
T
 
F
I
 
H
A
 
C
V
 
L
D
 
G
R
 
K
Y
 
N
A
 
G
D
 
D
A
 
C
P
 
-
A
 
A
M
 
E
Q
 
E
V
 
V
A
 
V
H
 
K
R
 
T
S
 
V
H
 
T
V
 
D
L
 
I
D
 
E
M
 
L
T
 
T
D
 
K
P
 
V
E
 
N
A
 
D
I
 
V
L
 
V
A
 
A
I
 
W
V
 
A
K
 
K
H
 
-
E
 
-
R
 
Q
P
 
F
H
 
D
Y
 
V
V
 
I
V
 
T
P
 
F
E
 
E
I
 
N
E
 
E
A
 
N
I
 
I
A
 
S
T
 
H
S
 
E
A
 
L
L
 
I
A
 
K
E
 
A
I
 
I
E
 
N
A
 
H
K
 
E
G
 
-
L
 
-
A
 
V
T
 
S
V
 
V
V
 
Y
P
 
P
S
 
S
A
 
A
R
 
K
A
 
A
V
 
I
Q
 
A
L
 
I
T
 
S
M
 
Q
D
 
D
R
 
R
E
 
L
G
 
-
I
 
L
R
 
E
R
 
K
L
 
S
A
 
F
A
 
M
E
 
Q
E
 
D
L
 
H
G
 
G
L
 
I
P
 
A
T
 
T
S
 
A
P
 
K
Y
 
F
R
 
V
F
 
N
A
 
I
G
 
D
T
 
S
L
 
L
A
 
A
E
 
K
L
 
L
E
 
Q
D
 
S
A
 
A
A
 
V
A
 
D
A
 
D
L
 
H
G
 
G
F
 
L
P
 
P
C
 
A
V
x
I
I
 
L
K
|
K
P
 
T
V
 
R
-
 
R
M
 
F
S
 
G
S
x
Y
S
x
D
G
|
G
K
 
K
G
 
G
Q
 
Q
S
 
F
V
 
V
V
 
I
R
 
R
G
 
S
A
 
Q
A
 
E
E
 
D
L
 
I
A
 
T
L
 
K
A
 
A
W
 
W
Q
 
D
E
 
V
A
 
L
Q
 
K
T
 
D
A
 
A
G
 
P
R
 
-
V
 
-
G
 
-
G
 
-
Q
 
D
R
 
G
I
 
L
I
 
I
V
 
Y
E
 
E
G
 
A
F
|
F
V
|
V
D
 
D
F
 
F
D
 
D
F
 
Y
E
|
E
I
 
V
T
 
S
L
 
Q
L
 
I
T
 
C
V
 
T
R
 
A
S
 
D
A
 
L
F
 
K
G
 
G
T
 
N
T
 
I
F
 
A
C
 
F
A
 
Y
P
 
P
V
 
L
G
 
A
-
 
R
-
 
N
-
 
T
H
|
H
R
 
K
Q
 
Q
E
 
-
A
 
-
G
 
G
D
 
I
Y
 
I
V
 
V
E
 
E
S
 
S
W
 
-
Q
 
-
P
 
E
Q
 
A
P
 
P
M
 
F
S
 
E
D
 
N
T
 
V
A
 
V
L
 
L
R
 
A
E
 
E
-
 
K
A
 
A
E
 
Q
K
 
Q
M
 
I
A
 
A
Q
 
K
R
 
I
V
 
L
T
 
V
D
 
K
N
 
E
L
 
F
G
 
A
G
 
Y
R
 
V
G
 
G
L
 
T
Y
 
L
G
 
A
V
 
I
E
|
E
F
 
F
F
|
F
V
 
V
R
 
K
G
 
-
T
 
-
E
 
E
V
 
L
I
 
I
F
 
V
S
x
N
E
|
E
L
 
I
S
 
A
P
 
P
R
 
R
P
 
V
H
|
H
D
x
N
T
x
S
G
 
G
L
 
H
V
 
W
T
 
S
L
 
I
A
 
D
S
 
G
Q
 
A
R
 
V
Q
 
T
S
 
S
E
 
Q
F
 
F
D
 
E
L
 
N
H
 
H
L
 
V
R
 
R
A
 
A
I
 
I
L
 
A
G
 
G
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_012536914.1 NCBI__GCF_000021485.1:WP_012536914.1
MQLGTPLSASATRLLLLGAGELGKELLIAAQRLGVETIAVDRYADAPAMQVAHRSHVLDM
TDPEAILAIVKHERPHYVVPEIEAIATSALAEIEAKGLATVVPSARAVQLTMDREGIRRL
AAEELGLPTSPYRFAGTLAELEDAAAALGFPCVIKPVMSSSGKGQSVVRGAAELALAWQE
AQTAGRVGGQRIIVEGFVDFDFEITLLTVRSAFGTTFCAPVGHRQEAGDYVESWQPQPMS
DTALREAEKMAQRVTDNLGGRGLYGVEFFVRGTEVIFSELSPRPHDTGLVTLASQRQSEF
DLHLRAILGLPVEPGFRRPAASAVVRGKRLGWGPVYSGLEVALAVPESDLRLFGKPTASK
LRRLGVGIACADNVEEARERARRIAAAVGISPAP

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory