SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012537708.1 NCBI__GCF_000021485.1:WP_012537708.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1w4zA Structure of actinorhodin polyketide (actiii) reductase (see paper)
36% identity, 81% coverage: 6:216/261 of query aligns to 8:223/259 of 1w4zA

query
sites
1w4zA
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
x
T
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
E
L
 
I
A
 
A
L
 
R
A
 
R
Y
 
L
A
 
G
E
 
K
P
 
E
G
 
G
R
 
L
V
 
R
V
 
V
L
 
F
L
 
V
L
 
C
G
 
A
R
|
R
R
x
G
R
 
E
T
 
E
A
 
G
L
 
L
Q
 
R
E
 
T
T
 
T
A
 
L
V
 
K
Q
 
E
V
 
L
R
 
R
A
 
E
R
 
A
G
 
G
A
 
V
R
 
E
A
 
A
E
 
D
L
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
C
D
|
D
V
|
V
C
 
R
D
 
S
G
 
V
A
 
P
A
 
E
L
 
I
D
 
E
R
 
A
I
 
L
A
 
V
A
 
A
D
 
A
F
 
V
A
 
V
G
 
E
G
 
R
F
 
Y
G
 
G
S
 
P
V
 
V
A
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
V
A
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
R
S
 
P
H
 
G
G
 
G
T
 
G
L
 
A
T
 
T
A
 
A
E
 
E
P
 
L
A
 
A
D
 
D
R
 
E
T
 
-
V
 
L
F
 
W
A
 
L
E
 
D
I
 
V
V
 
V
A
 
E
T
 
T
N
|
N
L
 
L
I
 
T
G
 
G
V
 
V
-
 
F
-
 
R
-
 
V
-
 
T
-
 
K
-
 
Q
E
 
V
L
 
L
T
 
K
C
 
A
G
 
G
A
 
G
F
 
M
L
 
L
P
 
E
Y
 
R
L
 
-
A
 
-
P
 
G
Q
 
T
A
 
G
R
 
R
I
 
I
A
 
V
G
 
N
I
 
I
A
 
A
S
|
S
V
 
T
A
 
G
G
 
G
F
 
K
R
 
Q
G
 
G
L
 
V
P
 
V
G
 
H
A
 
A
A
 
A
A
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
H
G
 
G
A
 
V
I
 
V
A
 
G
Y
 
F
L
 
T
E
 
K
S
 
A
L
 
L
R
 
G
L
 
L
E
 
E
L
 
L
R
 
A
D
 
R
R
 
T
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
C
 
N
S
 
A
I
 
V
A
 
C
P
|
P
G
|
G
Y
 
F
V
|
V
A
 
E
T
|
T
P
 
P
M
 
M
T
 
A
A
 
A
E
 
S
-
 
V
-
 
R
N
 
E
H
 
H
Y
|
Y
P
 
S
M
 
D
P
 
I
W
 
W
L
 
E
M
 
V
P
 
S
V
 
T
D
 
E
Q
 
E
A
 
A
A
 
F
A
 
D
K
 
R
M
 
I
R
 
T
R
 
A
A
 
R
I
 
V
D
 
P
R
 
I
G
 
G
R
 
R

P16544 Putative ketoacyl reductase; EC 1.3.1.- from Streptomyces coelicolor (strain ATCC BAA-471 / A3(2) / M145) (see 2 papers)
36% identity, 81% coverage: 6:216/261 of query aligns to 10:225/261 of P16544

query
sites
P16544
V
 
L
I
x
V
T
|
T
G
|
G
A
|
A
G
x
T
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
|
G
R
x
L
A
x
E
L
x
I
A
|
A
L
x
R
A
x
R
Y
x
L
A
x
G
E
x
K
P
x
E
G
|
G
R
x
L
V
x
R
V
|
V
L
x
F
L
x
V
L
x
C
G
x
A
R
|
R
R
x
G
R
 
E
T
 
E
A
 
G
L
 
L
Q
 
R
E
 
T
T
 
T
A
 
L
V
 
K
Q
 
E
V
 
L
R
 
R
A
 
E
R
 
A
G
 
G
A
 
V
R
 
E
A
 
A
E
 
D
L
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
C
D
|
D
V
 
V
C
 
R
D
 
S
G
 
V
A
 
P
A
 
E
L
 
I
D
 
E
R
 
A
I
 
L
A
 
V
A
 
A
D
 
A
F
 
V
A
 
V
G
 
E
G
 
R
F
 
Y
G
 
G
S
 
P
V
 
V
A
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
V
A
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
R
S
 
P
H
 
G
G
 
G
T
 
G
L
 
A
T
 
T
A
 
A
E
 
E
P
 
L
A
 
A
D
 
D
R
 
E
T
 
-
V
 
L
F
 
W
A
 
L
E
 
D
I
 
V
V
 
V
A
 
E
T
 
T
N
 
N
L
 
L
I
 
T
G
 
G
V
 
V
-
 
F
-
 
R
-
 
V
-
 
T
-
 
K
-
 
Q
E
 
V
L
 
L
T
 
K
C
 
A
G
 
G
A
 
G
F
 
M
L
 
L
P
 
E
Y
 
R
L
 
-
A
 
-
P
 
G
Q
 
T
A
 
G
R
 
R
I
 
I
A
 
V
G
 
N
I
 
I
A
 
A
S
 
S
V
 
T
A
 
G
G
 
G
F
 
K
R
 
Q
G
 
G
L
 
V
P
 
V
G
 
H
A
 
A
A
 
A
A
 
P
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
H
G
 
G
A
 
V
I
 
V
A
 
G
Y
 
F
L
 
T
E
 
K
S
 
A
L
 
L
R
 
G
L
 
L
E
 
E
L
 
L
R
 
A
D
 
R
R
 
T
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
C
 
N
S
 
A
I
 
V
A
 
C
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
V
 
V
A
 
E
T
 
T
P
 
P
M
 
M
T
 
A
A
 
A
E
 
S
-
 
V
-
 
R
N
 
E
H
 
H
Y
 
Y
P
 
S
M
 
D
P
 
I
W
 
W
L
 
E
M
 
V
P
 
S
V
 
T
D
 
E
Q
 
E
A
 
A
A
 
F
A
 
D
K
 
R
M
 
I
R
 
T
R
 
A
A
 
R
I
 
V
D
 
P
R
 
I
G
 
G
R
 
R

2rh4B Actinorhodin ketoreductase, actkr, with NADPH and inhibitor emodin (see paper)
36% identity, 81% coverage: 6:216/261 of query aligns to 17:232/268 of 2rh4B

query
sites
2rh4B
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
x
T
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
E
L
 
I
A
 
A
L
 
R
A
 
R
Y
 
L
A
 
G
E
 
K
P
 
E
G
 
G
R
 
L
V
 
R
V
 
V
L
 
F
L
 
V
L
 
C
G
x
A
R
|
R
R
x
G
R
 
E
T
 
E
A
 
G
L
 
L
Q
 
R
E
 
T
T
 
T
A
 
L
V
 
K
Q
 
E
V
 
L
R
 
R
A
 
E
R
 
A
G
 
G
A
 
V
R
 
E
A
 
A
E
 
D
L
 
G
R
 
R
T
 
T
V
x
C
D
|
D
V
|
V
C
 
R
D
 
S
G
 
V
A
 
P
A
 
E
L
 
I
D
 
E
R
 
A
I
 
L
A
 
V
A
 
A
D
 
A
F
 
V
A
 
V
G
 
E
G
 
R
F
 
Y
G
 
G
S
 
P
V
 
V
A
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
V
A
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
R
S
 
P
H
 
G
G
 
G
T
 
G
L
 
A
T
 
T
A
 
A
E
 
E
P
 
L
A
 
A
D
 
D
R
 
E
T
 
-
V
 
L
F
 
W
A
 
L
E
 
D
I
 
V
V
 
V
A
 
E
T
 
T
N
|
N
L
 
L
I
 
T
G
 
G
V
 
V
-
 
F
-
 
R
-
 
V
-
 
T
-
 
K
-
 
Q
E
 
V
L
 
L
T
 
K
C
 
A
G
 
G
A
 
G
F
 
M
L
 
L
P
 
E
Y
 
R
L
 
-
A
 
-
P
 
G
Q
 
T
A
 
G
R
 
R
I
 
I
A
 
V
G
 
N
I
 
I
A
 
A
S
|
S
V
 
T
A
 
G
G
 
G
F
 
K
R
 
Q
G
 
G
L
 
V
P
 
V
G
 
H
A
 
A
A
 
A
A
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
H
G
 
G
A
 
V
I
 
V
A
 
G
Y
 
F
L
 
T
E
 
K
S
 
A
L
 
L
R
 
G
L
 
L
E
 
E
L
 
L
R
 
A
D
 
R
R
 
T
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
C
 
N
S
 
A
I
 
V
A
 
C
P
 
P
G
|
G
Y
 
F
V
|
V
A
 
E
T
|
T
P
 
P
M
|
M
T
 
A
A
 
A
E
 
S
-
 
V
-
 
R
N
 
E
H
 
H
Y
|
Y
P
 
S
M
 
D
P
 
I
W
 
W
L
 
E
M
 
V
P
 
S
V
 
T
D
 
E
Q
 
E
A
 
A
A
 
F
A
 
D
K
 
R
M
 
I
R
 
T
R
 
A
A
 
R
I
 
V
D
 
P
R
 
I
G
 
G
R
 
R

2rh4A Actinorhodin ketoreductase, actkr, with NADPH and inhibitor emodin (see paper)
36% identity, 81% coverage: 6:216/261 of query aligns to 6:221/257 of 2rh4A

query
sites
2rh4A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
x
T
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
E
L
 
I
A
 
A
L
 
R
A
 
R
Y
 
L
A
 
G
E
 
K
P
 
E
G
 
G
R
 
L
V
 
R
V
 
V
L
 
F
L
 
V
L
 
C
G
x
A
R
|
R
R
x
G
R
 
E
T
 
E
A
 
G
L
 
L
Q
 
R
E
 
T
T
 
T
A
 
L
V
 
K
Q
 
E
V
 
L
R
 
R
A
 
E
R
 
A
G
 
G
A
 
V
R
 
E
A
 
A
E
 
D
L
 
G
R
 
R
T
 
T
V
x
C
D
|
D
V
|
V
C
 
R
D
 
S
G
 
V
A
 
P
A
 
E
L
 
I
D
 
E
R
 
A
I
 
L
A
 
V
A
 
A
D
 
A
F
 
V
A
 
V
G
 
E
G
 
R
F
 
Y
G
 
G
S
 
P
V
 
V
A
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
V
A
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
R
S
 
P
H
 
G
G
 
G
T
 
G
L
 
A
T
 
T
A
 
A
E
 
E
P
 
L
A
 
A
D
 
D
R
 
E
T
 
-
V
 
L
F
 
W
A
 
L
E
 
D
I
 
V
V
 
V
A
 
E
T
 
T
N
|
N
L
 
L
I
 
T
G
 
G
V
 
V
-
 
F
-
 
R
-
 
V
-
 
T
-
 
K
-
 
Q
E
 
V
L
 
L
T
 
K
C
 
A
G
 
G
A
 
G
F
 
M
L
 
L
P
 
E
Y
 
R
L
 
-
A
 
-
P
 
G
Q
 
T
A
 
G
R
 
R
I
 
I
A
 
V
G
 
N
I
 
I
A
 
A
S
|
S
V
x
T
A
 
G
G
 
G
F
 
K
R
x
Q
G
 
G
L
x
V
P
 
V
G
 
H
A
 
A
A
 
A
A
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
H
G
 
G
A
 
V
I
 
V
A
 
G
Y
 
F
L
 
T
E
 
K
S
 
A
L
 
L
R
 
G
L
 
L
E
 
E
L
 
L
R
 
A
D
 
R
R
 
T
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
C
 
N
S
 
A
I
 
V
A
 
C
P
|
P
G
|
G
Y
x
F
V
|
V
A
 
E
T
|
T
P
 
P
M
|
M
T
 
A
A
 
A
E
 
S
-
 
V
-
 
R
N
 
E
H
 
H
Y
|
Y
P
 
S
M
 
D
P
 
I
W
 
W
L
 
E
M
 
V
P
 
S
V
 
T
D
 
E
Q
 
E
A
 
A
A
 
F
A
 
D
K
 
R
M
 
I
R
 
T
R
 
A
A
 
R
I
 
V
D
 
P
R
 
I
G
 
G
R
 
R

Sites not aligning to the query:

1xr3A Actinorhodin polyketide ketoreductase with NADP and the inhibitor isoniazid bound (see paper)
36% identity, 81% coverage: 6:216/261 of query aligns to 5:220/256 of 1xr3A

query
sites
1xr3A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
x
T
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
E
L
 
I
A
 
A
L
 
R
A
 
R
Y
 
L
A
 
G
E
 
K
P
 
E
G
 
G
R
 
L
V
 
R
V
 
V
L
 
F
L
 
V
L
 
C
G
x
A
R
|
R
R
x
G
R
 
E
T
 
E
A
 
G
L
 
L
Q
 
R
E
 
T
T
 
T
A
 
L
V
 
K
Q
 
E
V
 
L
R
 
R
A
 
E
R
 
A
G
 
G
A
 
V
R
 
E
A
 
A
E
 
D
L
 
G
R
 
R
T
 
T
V
x
C
D
|
D
V
|
V
C
 
R
D
 
S
G
 
V
A
 
P
A
 
E
L
 
I
D
 
E
R
 
A
I
 
L
A
 
V
A
 
A
D
 
A
F
 
V
A
 
V
G
 
E
G
 
R
F
 
Y
G
 
G
S
 
P
V
 
V
A
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
R
S
 
P
H
 
G
G
 
G
T
 
G
L
 
A
T
 
T
A
 
A
E
 
E
P
 
L
A
 
A
D
 
D
R
 
E
T
 
-
V
 
L
F
 
W
A
 
L
E
 
D
I
 
V
V
 
V
A
 
E
T
 
T
N
|
N
L
 
L
I
 
T
G
 
G
V
 
V
-
 
F
-
 
R
-
 
V
-
 
T
-
 
K
-
 
Q
E
 
V
L
 
L
T
 
K
C
 
A
G
 
G
A
 
G
F
 
M
L
 
L
P
 
E
Y
 
R
L
 
-
A
 
-
P
 
G
Q
 
T
A
 
G
R
 
R
I
 
I
A
 
V
G
 
N
I
 
I
A
 
A
S
|
S
V
x
T
A
x
G
G
 
G
F
 
K
R
 
Q
G
 
G
L
x
V
P
 
V
G
 
H
A
 
A
A
 
A
A
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
H
G
 
G
A
 
V
I
 
V
A
 
G
Y
 
F
L
 
T
E
 
K
S
 
A
L
 
L
R
 
G
L
 
L
E
 
E
L
 
L
R
 
A
D
 
R
R
 
T
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
C
 
N
S
 
A
I
 
V
A
 
C
P
 
P
G
|
G
Y
 
F
V
|
V
A
 
E
T
|
T
P
|
P
M
 
M
T
 
A
A
 
A
E
 
S
-
 
V
-
 
R
N
 
E
H
 
H
Y
|
Y
P
 
S
M
 
D
P
 
I
W
 
W
L
 
E
M
 
V
P
 
S
V
 
T
D
 
E
Q
 
E
A
 
A
A
 
F
A
 
D
K
 
R
M
 
I
R
 
T
R
 
A
A
 
R
I
 
V
D
 
P
R
 
I
G
 
G
R
 
R

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
35% identity, 71% coverage: 6:190/261 of query aligns to 11:192/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
V
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
A
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
E
L
 
A
A
 
A
L
 
R
A
 
V
Y
 
F
A
 
M
E
 
K
P
 
E
G
 
G
R
 
A
V
 
K
V
 
V
L
 
V
L
 
I
L
 
A
G
x
D
R
x
F
R
 
N
R
 
E
T
 
A
A
 
A
L
 
G
Q
 
K
E
 
E
T
 
A
A
 
-
V
 
-
Q
 
-
V
 
V
R
 
E
A
 
A
R
 
N
G
 
P
A
 
G
R
 
V
A
 
V
E
 
F
L
 
I
R
 
R
T
 
-
V
|
V
D
|
D
V
|
V
C
 
S
D
 
D
G
 
R
A
 
E
A
 
S
L
 
V
D
 
H
R
 
R
I
 
L
A
 
V
A
 
E
D
 
N
F
 
V
A
 
A
G
 
E
G
 
R
F
 
F
G
 
G
S
 
K
V
 
I
A
 
D
V
 
I
L
 
L
I
 
I
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
S
 
T
H
 
R
G
x
D
T
 
S
L
 
M
T
 
L
A
 
S
E
x
K
-
 
M
P
 
T
A
 
V
D
 
D
R
 
Q
T
 
-
V
 
-
F
 
F
A
 
Q
E
 
Q
I
 
V
V
 
I
A
 
N
T
 
V
N
|
N
L
 
L
I
 
T
G
 
G
V
 
V
E
 
F
L
 
H
T
 
C
C
 
T
G
 
Q
A
 
A
F
 
V
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
L
 
M
A
 
A
P
 
E
Q
 
Q
A
 
G
R
 
K
-
 
G
-
 
K
I
 
I
A
 
I
G
 
N
I
x
T
A
 
S
S
|
S
V
 
V
A
 
T
G
 
G
F
 
T
R
 
Y
G
 
G
L
x
N
P
x
V
G
 
G
A
x
Q
A
 
T
A
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
A
 
V
I
 
I
A
 
G
Y
 
M
L
 
T
E
 
K
S
 
T
L
 
W
R
 
A
L
 
K
E
 
E
L
 
L
R
 
A
D
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
C
 
N
S
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
Y
x
F
V
x
T
A
 
E
T
|
T
P
 
A
M
|
M
T
 
V
A
 
A
E
 
E

Sites not aligning to the query:

Q8KES3 Sepiapterin reductase; SPR; cSR; EC 1.1.1.325 from Chlorobaculum tepidum (strain ATCC 49652 / DSM 12025 / NBRC 103806 / TLS) (Chlorobium tepidum) (see 2 papers)
31% identity, 79% coverage: 1:205/261 of query aligns to 1:215/244 of Q8KES3

query
sites
Q8KES3
M
 
M
M
 
K
G
 
H
A
 
I
V
 
L
V
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
S
x
K
G
|
G
I
|
I
G
|
G
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
E
Y
 
F
A
 
A
E
 
R
P
 
A
G
 
A
R
 
R
-
 
H
-
 
H
-
 
P
-
 
D
-
 
F
-
 
E
-
 
P
V
 
V
V
 
L
L
 
V
L
 
L
L
 
S
G
x
S
R
|
R
R
x
T
R
 
A
T
 
A
A
 
D
L
 
L
Q
 
E
E
 
K
T
 
I
A
 
S
V
 
L
Q
 
E
V
 
C
R
 
R
A
 
A
R
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
L
A
 
T
E
 
D
L
 
T
R
 
I
T
 
T
V
 
A
D
|
D
V
x
I
C
 
S
D
 
D
G
 
M
A
 
A
A
 
D
L
 
V
D
 
R
R
 
R
I
 
L
A
 
T
A
 
T
D
 
H
F
 
I
A
 
V
G
 
E
G
 
R
F
 
Y
G
 
G
S
 
H
V
 
I
A
 
D
V
 
C
L
 
L
I
 
V
A
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
V
S
 
G
H
 
R
-
x
F
-
 
G
-
 
A
-
 
L
G
 
S
T
 
D
L
 
L
T
 
T
A
 
E
E
 
E
P
 
D
A
 
F
D
 
D
R
 
Y
T
 
T
V
 
M
F
 
-
A
 
-
E
 
-
I
 
-
V
 
-
A
 
N
T
|
T
N
 
N
L
 
L
I
 
K
G
 
G
V
 
T
E
 
F
L
 
F
T
 
L
C
 
T
G
 
Q
A
 
A
F
 
L
L
 
F
P
 
A
Y
 
L
L
 
M
A
 
E
P
 
R
Q
 
Q
-
 
H
-
 
S
A
 
G
R
 
H
I
 
I
A
 
F
G
 
F
I
 
I
A
 
T
S
|
S
V
 
V
A
 
A
G
 
A
F
 
T
R
 
K
G
 
A
L
 
F
P
 
R
G
 
H
A
 
S
A
 
S
A
 
I
Y
|
Y
S
 
C
A
 
M
S
 
S
K
|
K
A
 
F
G
 
G
A
 
Q
I
 
R
A
 
G
Y
 
L
L
 
V
E
 
E
S
 
T
L
 
M
R
 
R
L
 
L
E
 
Y
L
 
A
R
 
R
D
 
K
R
 
C
G
 
N
I
 
V
R
 
R
V
 
I
C
 
T
S
 
D
I
 
V
A
 
Q
P
 
P
G
 
G
Y
 
A
V
|
V
A
x
Y
T
|
T
P
|
P
M
|
M
-
x
W
-
 
G
T
 
K
A
 
V
E
 
D
N
 
D
H
 
E
Y
 
M
P
 
Q
M
 
A
P
 
L
W
 
M
L
 
M
M
 
M
P
 
P
V
 
E
D
 
D
Q
 
I
A
 
A
A
 
A

P73574 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; EC 1.1.1.100 from Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) (see paper)
35% identity, 75% coverage: 6:201/261 of query aligns to 10:208/247 of P73574

query
sites
P73574
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
|
A
G
 
S
S
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
K
A
 
A
L
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Y
 
L
A
 
A
E
 
A
P
 
T
G
 
G
-
 
M
R
 
K
V
 
V
V
 
V
L
 
V
L
 
N
L
 
Y
G
 
A
R
 
Q
R
 
S
R
 
S
T
 
T
A
 
A
L
 
A
Q
 
D
E
 
A
T
 
V
A
 
V
V
 
A
Q
 
E
V
 
I
R
 
I
A
 
A
R
 
N
G
 
G
A
 
G
R
 
E
A
 
A
E
 
I
L
 
A
R
 
V
T
 
Q
V
 
A
D
 
N
V
 
V
C
 
A
D
 
N
G
 
A
A
 
D
A
 
E
L
 
V
D
 
D
R
 
Q
I
 
L
A
 
I
A
 
K
D
 
T
F
 
T
A
 
L
G
 
D
G
 
K
F
 
F
G
 
S
S
 
R
V
 
I
A
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
V
A
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
S
 
T
H
 
R
G
 
D
T
 
T
L
 
L
T
 
L
A
 
L
E
 
R
P
 
M
A
 
K
D
 
L
R
 
E
T
 
D
V
 
-
F
 
W
A
 
Q
E
 
A
I
 
V
V
 
I
A
 
D
T
 
L
N
 
N
L
 
L
I
 
T
G
 
G
V
 
V
E
 
F
L
 
L
T
 
C
C
 
T
G
 
K
A
 
A
F
 
V
L
 
S
P
 
K
Y
 
L
L
 
M
A
 
L
P
 
K
Q
 
Q
-
 
K
-
 
S
A
 
G
R
 
R
I
 
I
A
 
I
G
 
N
I
 
I
A
 
T
S
 
S
V
 
V
A
 
A
G
 
G
F
 
M
R
 
M
G
 
G
L
 
N
P
|
P
G
 
G
A
 
Q
A
 
A
A
 
N
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
A
 
V
I
 
I
A
 
G
Y
 
F
L
 
T
E
 
K
S
 
T
L
 
V
R
 
A
L
 
K
E
 
E
L
 
L
R
 
A
D
 
S
R
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
C
 
N
S
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
x
F
V
 
I
A
 
A
T
 
T
P
 
D
M
 
M
T
 
T
A
 
E
E
 
N
-
 
L
N
|
N
H
 
A
Y
 
E
P
 
P
M
 
I
P
 
L
W
 
Q
L
 
F
M
 
I
P
 
P
V
 
L

2bd0D Chlorobium tepidum sepiapterin reductase complexed with NADP and sepiapterin (see paper)
31% identity, 77% coverage: 5:205/261 of query aligns to 4:214/240 of 2bd0D

query
sites
2bd0D
V
 
L
V
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
G
S
x
K
G
 
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
E
Y
 
F
A
 
A
E
 
R
P
 
A
G
 
A
R
 
R
-
 
H
-
 
H
-
 
P
-
 
D
-
 
F
-
 
E
-
 
P
V
 
V
V
 
L
L
 
V
L
 
L
L
 
S
G
x
S
R
|
R
R
x
T
R
 
A
T
 
A
A
 
D
L
 
L
Q
 
E
E
 
K
T
 
I
A
 
S
V
 
L
Q
 
E
V
 
C
R
 
R
A
 
A
R
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
L
A
 
T
E
 
D
L
 
T
R
 
I
T
 
T
V
 
A
D
|
D
V
x
I
C
 
S
D
 
D
G
 
M
A
 
A
A
 
D
L
 
V
D
 
R
R
 
R
I
 
L
A
 
T
A
 
T
D
 
H
F
 
I
A
 
V
G
 
E
G
 
R
F
 
Y
G
 
G
S
 
H
V
 
I
A
 
D
V
 
C
L
 
L
I
 
V
A
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
x
V
S
 
G
H
 
R
-
x
F
-
 
G
-
 
A
-
 
L
G
 
S
T
 
D
L
 
L
T
 
T
A
 
E
E
 
E
P
 
D
A
 
F
D
 
D
R
 
Y
T
 
T
V
 
M
F
 
-
A
 
-
E
 
-
I
 
-
V
 
-
A
 
N
T
|
T
N
 
N
L
 
L
I
 
K
G
 
G
V
 
T
E
 
F
L
 
F
T
 
L
C
 
T
G
 
Q
A
 
A
F
 
L
L
 
F
P
 
A
Y
 
L
L
 
M
A
 
E
P
 
R
Q
 
Q
-
 
H
-
 
S
A
 
G
R
 
H
I
 
I
A
 
F
G
 
F
I
 
I
A
 
T
S
|
S
V
 
V
A
 
A
G
 
A
F
 
T
R
 
K
G
 
A
L
 
F
P
 
R
G
 
H
A
 
S
A
 
S
A
 
I
Y
|
Y
S
 
C
A
 
M
S
 
S
K
|
K
A
 
F
G
 
G
A
 
Q
I
 
R
A
 
G
Y
 
L
L
 
V
E
 
E
S
 
T
L
 
M
R
 
R
L
 
L
E
 
Y
L
 
A
R
 
R
D
 
K
R
 
C
G
 
N
I
 
V
R
 
R
V
 
I
C
 
T
S
 
D
I
 
V
A
 
Q
P
|
P
G
 
G
Y
x
A
V
|
V
A
 
Y
T
|
T
P
|
P
M
|
M
-
x
W
-
 
G
T
 
K
A
 
V
E
 
D
N
 
D
H
 
E
Y
 
M
P
 
Q
M
 
A
P
 
L
W
 
M
L
 
M
M
 
M
P
 
P
V
 
E
D
 
D
Q
 
I
A
 
A
A
 
A

2bd0A Chlorobium tepidum sepiapterin reductase complexed with NADP and sepiapterin (see paper)
31% identity, 77% coverage: 5:205/261 of query aligns to 4:214/240 of 2bd0A

query
sites
2bd0A
V
 
L
V
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
G
S
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
E
Y
 
F
A
 
A
E
 
R
P
 
A
G
 
A
R
 
R
-
 
H
-
 
H
-
 
P
-
 
D
-
 
F
-
 
E
-
 
P
V
 
V
V
 
L
L
 
V
L
 
L
L
 
S
G
 
S
R
|
R
R
x
T
R
 
A
T
 
A
A
 
D
L
 
L
Q
 
E
E
 
K
T
 
I
A
 
S
V
 
L
Q
 
E
V
 
C
R
 
R
A
 
A
R
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
L
A
 
T
E
 
D
L
 
T
R
 
I
T
 
T
V
 
A
D
|
D
V
x
I
C
 
S
D
 
D
G
 
M
A
 
A
A
 
D
L
 
V
D
 
R
R
 
R
I
 
L
A
 
T
A
 
T
D
 
H
F
 
I
A
 
V
G
 
E
G
 
R
F
 
Y
G
 
G
S
 
H
V
 
I
A
 
D
V
 
C
L
 
L
I
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
x
V
S
 
G
H
 
R
-
 
F
-
 
G
-
 
A
-
 
L
G
 
S
T
 
D
L
 
L
T
 
T
A
 
E
E
 
E
P
 
D
A
 
F
D
 
D
R
 
Y
T
 
T
V
 
M
F
 
-
A
 
-
E
 
-
I
 
-
V
 
-
A
 
N
T
|
T
N
 
N
L
 
L
I
 
K
G
 
G
V
 
T
E
 
F
L
 
F
T
 
L
C
 
T
G
 
Q
A
 
A
F
 
L
L
 
F
P
 
A
Y
 
L
L
 
M
A
 
E
P
 
R
Q
 
Q
-
 
H
-
 
S
A
 
G
R
 
H
I
 
I
A
 
F
G
 
F
I
|
I
A
 
T
S
|
S
V
 
V
A
 
A
G
 
A
F
 
T
R
 
K
G
 
A
L
 
F
P
 
R
G
 
H
A
 
S
A
 
S
A
 
I
Y
|
Y
S
 
C
A
 
M
S
 
S
K
|
K
A
 
F
G
 
G
A
 
Q
I
 
R
A
 
G
Y
 
L
L
 
V
E
 
E
S
 
T
L
 
M
R
 
R
L
 
L
E
 
Y
L
 
A
R
 
R
D
 
K
R
 
C
G
 
N
I
 
V
R
 
R
V
 
I
C
 
T
S
 
D
I
 
V
A
 
Q
P
|
P
G
 
G
Y
x
A
V
|
V
A
 
Y
T
|
T
P
|
P
M
|
M
-
x
W
-
 
G
T
 
K
A
 
V
E
 
D
N
 
D
H
 
E
Y
 
M
P
 
Q
M
 
A
P
 
L
W
 
M
L
 
M
M
 
M
P
 
P
V
 
E
D
 
D
Q
 
I
A
 
A
A
 
A

3sj7A Structure of beta-ketoacetyl-coa reductase (fabg) from staphylococcus aureus complex with NADPH (see paper)
32% identity, 75% coverage: 6:201/261 of query aligns to 5:202/239 of 3sj7A

query
sites
3sj7A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
S
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
Q
Y
 
L
A
 
A
E
 
E
P
 
E
G
 
G
-
 
Y
R
 
N
V
 
V
V
 
A
L
 
V
L
x
N
L
x
Y
G
x
A
R
x
G
R
x
S
R
 
K
T
 
E
A
 
K
L
 
A
Q
 
E
E
 
A
T
 
V
A
 
V
V
 
E
Q
 
E
V
 
I
R
 
K
A
 
A
R
 
K
G
 
G
A
 
V
R
 
D
A
 
S
E
 
F
L
 
A
R
 
I
T
 
Q
V
x
A
D
x
N
V
|
V
C
 
A
D
 
D
G
 
A
A
 
D
A
 
E
L
 
V
D
 
K
R
 
A
I
 
M
A
 
I
A
 
K
D
 
E
F
 
V
A
 
V
G
 
S
G
 
Q
F
 
F
G
 
G
S
 
S
V
 
L
A
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
S
 
T
H
 
R
G
 
D
T
 
N
L
 
L
T
 
L
A
 
M
E
 
R
P
 
M
A
 
K
D
 
E
R
 
Q
T
 
E
V
 
-
F
 
W
A
 
D
E
 
D
I
 
V
V
 
I
A
 
D
T
|
T
N
 
N
L
 
L
I
 
K
G
 
G
V
 
V
E
 
F
L
 
N
T
 
C
C
 
I
G
 
Q
A
 
K
F
 
A
L
 
T
P
 
P
Y
 
Q
L
 
M
A
 
L
P
 
R
Q
 
Q
-
 
R
-
 
S
A
 
G
R
 
A
I
 
I
A
 
I
G
 
N
I
 
L
A
 
S
S
|
S
V
 
V
A
 
V
G
 
G
F
 
A
R
 
V
G
 
G
L
 
N
P
 
P
G
 
G
A
x
Q
A
 
A
A
 
N
Y
|
Y
S
 
V
A
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
A
 
V
I
 
I
A
 
G
Y
 
L
L
 
T
E
 
K
S
 
S
L
 
A
R
 
A
L
 
R
E
 
E
L
 
L
R
 
A
D
 
S
R
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
C
 
N
S
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
Y
 
F
V
 
I
A
 
V
T
 
S
P
 
D
M
 
M
T
 
T
A
 
D
E
 
E
N
 
L
H
 
K
Y
 
E
P
 
Q
M
 
M
P
 
L
W
 
T
L
 
Q
M
 
I
P
 
P
V
 
L

1edoA The x-ray structure of beta-keto acyl carrier protein reductase from brassica napus complexed with NADP+ (see paper)
34% identity, 71% coverage: 5:190/261 of query aligns to 4:191/244 of 1edoA

query
sites
1edoA
V
 
V
V
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
K
A
 
A
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
S
Y
 
L
A
 
G
E
 
K
P
 
A
G
 
G
-
 
C
R
 
K
V
 
V
V
 
L
L
 
V
L
x
N
L
x
Y
G
x
A
R
|
R
R
x
S
R
 
A
T
 
K
A
 
A
L
 
A
Q
 
E
E
 
E
T
 
V
A
 
S
V
 
K
Q
 
Q
V
 
I
R
 
E
A
 
A
R
 
Y
G
 
G
A
 
G
R
 
Q
A
 
A
E
 
I
L
 
T
R
 
F
T
 
G
V
 
G
D
|
D
V
|
V
C
 
S
D
 
K
G
 
E
A
 
A
A
 
D
L
 
V
D
 
E
R
 
A
I
 
M
A
 
M
A
 
K
D
 
T
F
 
A
A
 
I
G
 
D
G
 
A
F
 
W
G
 
G
S
 
T
V
 
I
A
 
D
V
 
V
L
 
V
I
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
S
 
T
H
 
R
G
 
D
T
 
T
L
 
L
T
 
L
A
 
I
E
 
R
P
 
-
A
 
M
D
 
K
R
 
K
T
 
S
V
 
Q
F
 
W
A
 
D
E
 
E
I
 
V
V
 
I
A
 
D
T
 
L
N
 
N
L
 
L
I
 
T
G
 
G
V
 
V
E
 
F
L
 
L
T
 
C
C
 
T
G
 
Q
A
 
A
F
 
A
L
 
T
P
 
K
Y
 
I
L
 
M
A
 
M
P
 
K
Q
 
K
-
 
R
-
 
K
A
 
G
R
 
R
I
 
I
A
 
I
G
 
N
I
 
I
A
 
A
S
|
S
V
 
V
A
 
V
G
 
G
F
 
L
R
 
I
G
 
G
L
 
N
P
 
I
G
 
G
A
 
Q
A
 
A
A
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
A
 
V
I
 
I
A
 
G
Y
 
F
L
 
S
E
 
K
S
 
T
L
 
A
R
 
A
L
 
R
E
 
E
L
 
G
R
 
A
D
 
S
R
 
R
G
 
N
I
 
I
R
 
N
V
 
V
C
 
N
S
 
V
I
 
V
A
 
C
P
|
P
G
|
G
Y
 
F
V
x
I
A
 
A
T
x
S
P
 
D
M
|
M
T
 
T
A
 
A
E
 
K

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
32% identity, 72% coverage: 1:188/261 of query aligns to 3:192/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
M
 
M
M
 
T
G
 
K
A
 
S
V
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
S
S
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
S
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
Q
Y
 
L
A
 
A
E
 
E
P
 
E
G
 
G
-
 
Y
R
 
N
V
 
V
V
 
A
L
 
V
L
 
N
L
 
Y
G
 
A
R
 
G
R
 
S
R
 
K
T
 
E
A
 
K
L
 
A
Q
 
E
E
 
A
T
 
V
A
 
V
V
 
E
Q
 
E
V
 
I
R
 
K
A
 
A
R
 
K
G
 
G
A
 
V
R
 
D
A
 
S
E
 
F
L
 
A
R
 
I
T
 
Q
V
 
A
D
 
N
V
 
V
C
 
A
D
 
D
G
 
A
A
 
D
A
 
E
L
 
V
D
 
K
R
 
A
I
 
M
A
 
I
A
 
K
D
 
E
F
 
V
A
 
V
G
 
S
G
 
Q
F
 
F
G
 
G
S
 
S
V
 
L
A
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
V
A
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
S
 
T
H
 
R
G
 
D
T
 
N
L
 
L
T
 
L
A
 
M
E
 
R
P
 
M
A
 
K
D
 
E
R
 
Q
T
 
E
V
 
-
F
 
W
A
 
D
E
 
D
I
 
V
V
 
I
A
 
D
T
 
T
N
 
N
L
 
L
I
 
K
G
 
G
V
 
V
E
 
F
L
 
N
T
 
C
C
 
I
G
 
Q
A
 
K
F
 
A
L
 
T
P
 
P
Y
 
Q
L
 
M
A
 
L
P
 
R
Q
 
Q
-
 
R
-
 
S
A
 
G
R
 
A
I
 
I
A
 
I
G
 
N
I
 
L
A
 
S
S
|
S
V
 
V
A
 
V
G
 
G
F
 
A
R
 
V
G
 
G
L
 
N
P
 
P
G
 
G
A
x
Q
A
 
A
A
 
N
Y
|
Y
S
 
V
A
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
A
 
V
I
 
I
A
 
G
Y
 
L
L
 
T
E
 
K
S
 
S
L
 
A
R
 
A
L
 
R
E
 
E
L
 
L
R
 
A
D
 
S
R
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
C
 
N
S
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
V
 
I
A
 
V
T
 
S
P
 
D
M
 
M
T
 
T

6zzsD Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii complexed with NAD+ and 3-oxovalerate (see paper)
34% identity, 69% coverage: 7:187/261 of query aligns to 12:193/261 of 6zzsD

query
sites
6zzsD
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
S
G
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
E
L
 
I
A
 
A
L
 
K
A
 
K
Y
 
F
A
 
A
E
 
Q
P
 
E
G
 
G
R
 
A
V
 
K
V
 
V
L
 
V
L
 
I
L
 
S
G
x
D
R
x
M
R
 
N
R
 
A
T
 
E
A
 
K
L
 
C
Q
 
Q
E
 
E
T
 
T
A
 
A
V
 
N
Q
 
S
V
 
L
R
 
K
A
 
E
R
 
Q
G
 
G
A
 
F
R
 
D
A
 
A
E
 
L
L
 
S
R
 
A
T
 
P
V
 
C
D
|
D
V
|
V
C
 
T
D
 
D
G
 
E
A
 
D
A
 
A
L
 
Y
D
 
K
R
 
Q
I
 
A
A
 
I
A
 
E
D
 
L
F
 
T
A
 
Q
G
 
K
G
 
T
F
 
F
G
 
G
S
 
T
V
 
V
A
 
D
V
 
I
L
 
L
I
 
I
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
F
S
x
Q
H
 
H
G
 
-
T
 
V
L
 
A
T
 
P
A
 
I
E
 
E
P
 
E
A
 
F
D
 
P
R
 
T
T
 
A
V
 
V
F
 
F
A
 
Q
E
 
K
I
 
L
V
 
V
A
 
Q
T
 
V
N
 
M
L
 
L
I
 
T
G
 
G
V
 
A
E
 
F
L
 
I
T
 
G
C
 
I
G
 
K
A
 
H
F
 
V
L
 
L
P
 
P
Y
 
I
L
 
M
A
 
K
P
 
A
Q
 
Q
-
 
K
-
 
Y
A
 
G
R
 
R
I
 
I
A
 
I
G
 
N
I
x
M
A
|
A
S
|
S
V
 
I
A
x
N
G
 
G
F
 
L
R
 
I
G
 
G
L
 
F
P
 
A
G
 
G
A
x
K
A
 
A
A
 
G
Y
|
Y
S
 
N
A
 
S
S
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
G
A
 
V
I
 
I
A
 
G
Y
 
L
L
 
T
E
 
K
S
 
V
L
 
A
R
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
C
R
 
A
D
 
R
R
 
D
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
C
 
N
S
 
A
I
 
L
A
 
C
P
|
P
G
|
G
Y
 
Y
V
|
V
A
 
D
T
|
T
P
 
P
M
x
L

Sites not aligning to the query:

6zzqA Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii complexed with NAD+ and acetoacetate (see paper)
34% identity, 69% coverage: 7:187/261 of query aligns to 11:192/260 of 6zzqA

query
sites
6zzqA
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
S
G
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
E
L
 
I
A
 
A
L
 
K
A
 
K
Y
 
F
A
 
A
E
 
Q
P
 
E
G
 
G
R
 
A
V
 
K
V
 
V
L
 
V
L
 
I
L
 
S
G
x
D
R
x
M
R
 
N
R
 
A
T
 
E
A
 
K
L
 
C
Q
 
Q
E
 
E
T
 
T
A
 
A
V
 
N
Q
 
S
V
 
L
R
 
K
A
 
E
R
 
Q
G
 
G
A
 
F
R
 
D
A
 
A
E
 
L
L
 
S
R
 
A
T
 
P
V
 
C
D
|
D
V
|
V
C
 
T
D
 
D
G
 
E
A
 
D
A
 
A
L
 
Y
D
 
K
R
 
Q
I
 
A
A
 
I
A
 
E
D
 
L
F
 
T
A
 
Q
G
 
K
G
 
T
F
 
F
G
 
G
S
 
T
V
 
V
A
 
D
V
 
I
L
 
L
I
 
I
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
F
S
x
Q
H
 
H
G
 
-
T
 
V
L
 
A
T
 
P
A
 
I
E
 
E
P
 
E
A
 
F
D
 
P
R
 
T
T
 
A
V
 
V
F
 
F
A
 
Q
E
 
K
I
 
L
V
 
V
A
 
Q
T
 
V
N
 
M
L
 
L
I
 
T
G
 
G
V
 
A
E
 
F
L
 
I
T
 
G
C
 
I
G
 
K
A
 
H
F
 
V
L
 
L
P
 
P
Y
 
I
L
 
M
A
 
K
P
 
A
Q
 
Q
-
 
K
-
 
Y
A
 
G
R
 
R
I
 
I
A
 
I
G
 
N
I
x
M
A
|
A
S
|
S
V
 
I
A
 
N
G
 
G
F
 
L
R
 
I
G
 
G
L
 
F
P
 
A
G
 
G
A
x
K
A
 
A
A
 
G
Y
|
Y
S
 
N
A
 
S
S
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
G
A
 
V
I
 
I
A
 
G
Y
 
L
L
 
T
E
 
K
S
 
V
L
 
A
R
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
C
R
 
A
D
 
R
R
 
D
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
C
 
N
S
 
A
I
 
L
A
 
C
P
 
P
G
 
G
Y
|
Y
V
|
V
A
 
D
T
|
T
P
 
P
M
 
L

Sites not aligning to the query:

7emgB Carbonyl reductase variant 4 (r123c/l209p/f183y/v61k) from serratia marcescens complexed with NADP+ (see paper)
35% identity, 70% coverage: 5:188/261 of query aligns to 7:188/243 of 7emgB

query
sites
7emgB
V
 
V
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
x
S
S
x
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
A
L
 
E
A
 
T
Y
 
F
A
 
V
E
 
A
P
 
R
G
 
G
R
 
A
V
 
K
V
 
V
L
 
I
L
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
R
 
-
R
 
G
T
 
T
A
 
A
L
x
T
Q
 
S
E
 
E
T
 
S
A
 
G
V
 
A
Q
 
E
V
 
A
R
 
I
A
 
S
-
 
G
-
 
Y
R
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
N
A
 
G
E
 
K
L
 
G
R
 
F
T
 
M
V
 
L
D
x
N
V
|
V
C
 
K
D
 
D
G
 
A
A
 
Q
A
 
S
L
 
I
D
 
D
R
 
S
I
 
V
A
 
L
A
 
A
D
 
S
F
 
I
A
 
R
G
 
A
G
 
E
F
 
F
G
 
G
S
 
E
V
 
I
A
 
D
V
 
I
L
 
L
I
 
V
A
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
|
I
S
 
T
H
 
R
G
 
D
T
 
N
L
 
L
T
 
L
A
 
M
E
 
R
P
 
M
A
 
K
D
 
D
R
 
D
T
 
E
V
 
-
F
 
W
A
 
E
E
 
D
I
 
I
V
 
L
A
 
D
T
 
T
N
 
N
L
 
L
I
 
T
G
 
S
V
 
V
E
 
F
L
 
R
T
 
L
C
 
S
G
 
K
A
 
A
F
 
V
L
 
M
P
 
C
Y
 
A
L
 
M
A
 
M
P
 
K
Q
 
K
-
 
R
-
 
F
A
 
G
R
 
R
I
 
I
A
 
I
G
 
T
I
 
I
A
 
G
S
 
S
V
 
V
A
 
V
G
 
G
F
 
T
R
 
M
G
 
G
L
 
N
P
 
A
G
 
G
A
 
Q
A
 
A
A
 
N
Y
 
Y
S
 
A
A
 
A
S
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
L
I
 
I
A
 
G
Y
 
F
L
 
S
E
 
K
S
 
S
L
 
L
R
 
A
L
 
R
E
 
E
L
 
V
R
 
A
D
 
S
R
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
C
 
N
S
 
V
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
V
 
I
A
 
E
T
 
T
P
 
D
M
 
M
T
 
T

4bmsF Short chain alcohol dehydrogenase from ralstonia sp. Dsm 6428 in complex with NADPH
36% identity, 72% coverage: 6:192/261 of query aligns to 10:191/249 of 4bmsF

query
sites
4bmsF
V
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
G
x
N
S
|
S
G
 
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
A
L
 
T
A
 
A
L
 
K
A
 
R
Y
 
F
A
 
V
E
 
A
P
 
E
G
 
G
R
 
A
V
 
Y
V
 
V
L
 
F
L
 
I
L
 
V
G
 
G
R
|
R
R
|
R
R
 
R
T
 
K
A
 
E
L
 
L
Q
 
E
E
 
Q
T
 
A
A
 
A
V
 
A
Q
 
E
V
 
I
R
 
-
A
 
-
R
 
-
G
 
G
A
 
R
R
 
N
A
 
V
E
 
T
L
 
A
R
 
V
T
 
K
V
x
A
D
|
D
V
|
V
C
 
T
D
 
K
G
 
L
A
 
E
A
 
D
L
 
L
D
 
D
R
 
R
I
 
L
A
 
Y
A
 
A
D
 
I
F
 
V
A
 
R
G
 
E
G
 
Q
F
 
R
G
 
G
S
 
S
V
 
I
A
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
F
A
 
A
N
|
N
A
x
S
G
|
G
-
 
A
I
 
I
S
 
E
H
 
Q
G
 
K
T
 
T
L
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
I
T
 
T
A
 
P
E
 
E
P
 
H
A
 
Y
D
 
D
R
 
R
T
 
T
V
 
F
F
 
-
A
 
-
E
 
-
I
 
-
V
 
-
A
 
D
T
x
V
N
 
N
L
 
V
I
 
R
G
 
G
V
 
L
E
 
I
L
 
F
T
 
T
C
 
V
G
 
Q
A
 
K
F
 
A
L
 
L
P
 
P
Y
 
L
L
 
L
A
 
R
P
 
D
Q
 
G
A
 
G
R
 
S
I
 
V
A
 
I
G
 
L
I
 
T
A
 
S
S
|
S
V
 
V
A
 
A
G
 
G
F
 
V
R
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
Q
G
 
A
A
x
H
A
 
D
A
 
T
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
A
A
 
V
I
 
R
A
 
S
Y
 
L
L
 
A
E
 
R
S
 
T
L
 
W
R
 
T
L
 
T
E
 
E
L
 
L
R
 
K
D
 
G
R
 
R
G
 
S
I
 
I
R
 
R
V
 
V
C
 
N
S
 
A
I
 
V
A
 
S
P
 
P
G
|
G
Y
 
A
V
x
I
A
 
D
T
|
T
P
 
P
M
x
I
T
 
I
A
 
-
E
 
E
N
 
N
H
 
Q

Sites not aligning to the query:

2cfcA Structural basis for stereo selectivity in the (r)- and (s)- hydroxypropylethane thiosulfonate dehydrogenases (see paper)
34% identity, 70% coverage: 6:188/261 of query aligns to 6:193/250 of 2cfcA

query
sites
2cfcA
V
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
S
S
|
S
G
|
G
I
x
N
G
 
G
R
 
L
A
 
A
L
 
I
A
 
A
L
 
T
A
 
R
Y
 
F
A
 
L
E
 
A
P
 
R
G
 
G
R
 
D
V
 
R
V
 
V
L
 
A
L
 
A
L
 
L
G
x
D
R
x
L
R
 
S
R
 
A
T
 
E
A
 
T
L
 
L
Q
 
E
E
 
E
T
 
T
A
 
A
V
 
R
Q
 
T
V
 
H
R
 
W
A
 
H
R
 
A
G
 
Y
A
 
A
R
 
D
A
 
K
E
 
V
L
 
L
R
 
R
T
 
V
-
 
R
V
x
A
D
|
D
V
|
V
C
 
A
D
 
D
G
 
E
A
 
G
A
 
D
L
 
V
D
 
N
R
 
A
I
 
A
A
 
I
A
 
A
D
 
A
F
 
T
A
 
M
G
 
E
G
 
Q
F
 
F
G
 
G
S
 
A
V
 
I
A
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
S
 
T
-
 
G
-
 
N
-
 
S
-
 
E
H
 
A
G
 
G
T
 
V
L
 
L
T
 
H
A
 
T
E
 
T
P
 
P
A
 
V
D
 
E
R
 
Q
T
 
-
V
 
-
F
 
F
A
 
D
E
 
K
I
 
V
V
 
M
A
 
A
T
 
V
N
 
N
L
 
V
I
 
R
G
 
G
V
 
I
E
 
F
L
 
L
T
 
G
C
 
C
G
 
R
A
 
A
F
 
V
L
 
L
P
 
P
Y
 
H
L
 
M
A
 
L
P
 
L
Q
 
Q
A
 
G
R
 
A
-
 
G
-
 
V
I
 
I
A
 
V
G
 
N
I
|
I
A
 
A
S
|
S
V
 
V
A
 
A
G
 
S
F
 
L
R
 
V
G
 
A
L
x
F
P
 
P
G
 
G
A
x
R
A
 
S
A
 
A
Y
|
Y
S
 
T
A
 
T
S
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
A
A
 
V
I
 
L
A
 
Q
Y
 
L
L
 
T
E
 
K
S
 
S
L
 
V
R
 
A
L
 
V
E
 
D
L
 
Y
R
 
A
D
 
G
R
 
S
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
C
C
 
N
S
 
A
I
 
V
A
 
C
P
|
P
G
|
G
Y
x
M
V
x
I
A
 
E
T
|
T
P
|
P
M
|
M
T
|
T

Sites not aligning to the query:

Q56840 2-(R)-hydroxypropyl-CoM dehydrogenase; R-HPCDH; 2-[(R)-2-hydroxypropylthio]ethanesulfonate dehydrogenase; Aliphatic epoxide carboxylation component III; Epoxide carboxylase component III; RHPCDH1; EC 1.1.1.268 from Xanthobacter autotrophicus (strain ATCC BAA-1158 / Py2) (see 4 papers)
34% identity, 70% coverage: 6:188/261 of query aligns to 6:193/250 of Q56840

query
sites
Q56840
V
 
I
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
S
S
|
S
G
|
G
I
x
N
G
 
G
R
 
L
A
 
A
L
 
I
A
 
A
L
 
T
A
 
R
Y
 
F
A
 
L
E
 
A
P
 
R
G
 
G
R
 
D
V
 
R
V
 
V
L
 
A
L
 
A
L
 
L
G
x
D
R
 
L
R
 
S
R
 
A
T
 
E
A
 
T
L
 
L
Q
 
E
E
 
E
T
 
T
A
 
A
V
 
R
Q
 
T
V
 
H
R
 
W
A
 
H
R
 
A
G
 
Y
A
 
A
R
 
D
A
 
K
E
 
V
L
 
L
R
 
R
T
 
V
-
 
R
V
 
A
D
|
D
V
|
V
C
 
A
D
 
D
G
 
E
A
 
G
A
 
D
L
 
V
D
 
N
R
 
A
I
 
A
A
 
I
A
 
A
D
 
A
F
 
T
A
 
M
G
 
E
G
 
Q
F
 
F
G
 
G
S
 
A
V
 
I
A
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
V
A
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
S
 
T
-
 
G
-
 
N
-
 
S
-
 
E
H
 
A
G
 
G
T
 
V
L
 
L
T
 
H
A
 
T
E
 
T
P
 
P
A
 
V
D
 
E
R
 
Q
T
 
-
V
 
-
F
 
F
A
 
D
E
 
K
I
 
V
V
 
M
A
 
A
T
 
V
N
 
N
L
 
V
I
 
R
G
 
G
V
 
I
E
 
F
L
 
L
T
 
G
C
 
C
G
 
R
A
 
A
F
 
V
L
 
L
P
 
P
Y
 
H
L
 
M
A
 
L
P
 
L
Q
 
Q
A
 
G
R
 
A
-
 
G
-
 
V
I
 
I
A
 
V
G
 
N
I
 
I
A
 
A
S
|
S
V
 
V
A
 
A
G
 
S
F
 
L
R
 
V
G
 
A
L
 
F
P
 
P
G
 
G
A
x
R
A
 
S
A
 
A
Y
|
Y
S
 
T
A
 
T
S
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
A
A
 
V
I
 
L
A
 
Q
Y
 
L
L
 
T
E
 
K
S
 
S
L
 
V
R
 
A
L
 
V
E
 
D
L
 
Y
R
 
A
D
 
G
R
 
S
G
 
G
I
 
I
R
|
R
V
 
C
C
 
N
S
 
A
I
 
V
A
 
C
P
 
P
G
 
G
Y
 
M
V
x
I
A
x
E
T
|
T
P
|
P
M
|
M
T
 
T

Sites not aligning to the query:

6ihhA Crystal structure of rasadh f12 from ralstonia.Sp in complex with NADPH and a6o
35% identity, 71% coverage: 6:191/261 of query aligns to 10:191/249 of 6ihhA

query
sites
6ihhA
V
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
G
x
N
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
A
L
 
T
A
 
A
L
 
K
A
 
R
Y
 
F
A
 
V
E
 
A
P
 
E
G
 
G
R
 
A
V
 
Y
V
 
V
L
 
F
L
 
I
L
 
V
G
 
G
R
|
R
R
|
R
R
 
R
T
 
K
A
 
E
L
 
L
Q
 
E
E
 
Q
T
 
A
A
 
A
V
 
A
Q
 
E
V
 
I
R
 
-
A
 
-
R
 
-
G
 
G
A
 
R
R
 
N
A
 
V
E
 
T
L
 
A
R
 
V
T
 
K
V
 
A
D
|
D
V
|
V
C
 
T
D
 
K
G
 
L
A
 
E
A
 
D
L
 
L
D
 
D
R
 
R
I
 
L
A
 
Y
A
 
A
D
 
I
F
 
V
A
 
R
G
 
E
G
 
Q
F
 
R
G
 
G
S
 
S
V
 
I
A
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
F
A
 
A
N
|
N
A
x
S
G
|
G
-
 
A
I
 
V
S
 
E
H
 
Q
G
 
K
T
 
T
L
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
I
T
 
T
A
 
P
E
 
E
P
 
H
A
 
Y
D
 
D
R
 
R
T
 
T
V
 
F
F
 
-
A
 
-
E
 
-
I
 
-
V
 
-
A
 
D
T
x
V
N
 
N
L
 
V
I
 
R
G
 
G
V
 
L
E
 
I
L
 
F
T
 
T
C
 
V
G
 
Q
A
 
K
F
 
A
L
 
L
P
 
P
Y
 
L
L
 
L
A
 
R
P
 
D
Q
 
G
A
 
G
R
 
S
I
 
V
A
 
I
G
 
L
I
x
T
A
 
S
S
|
S
V
 
V
A
 
A
G
 
G
F
 
V
R
 
L
G
 
G
L
 
L
P
 
Q
G
 
A
A
x
H
A
 
D
A
 
T
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
A
A
 
V
I
 
R
A
 
S
Y
 
L
L
 
A
E
 
R
S
 
T
L
 
W
R
 
T
L
 
T
E
 
E
L
 
L
R
 
K
D
 
G
R
 
R
G
 
S
I
 
I
R
 
R
V
 
V
C
 
N
S
 
A
I
 
V
A
 
S
P
|
P
G
|
G
Y
x
A
V
x
I
A
 
D
T
|
T
P
 
P
M
x
S
T
x
L
A
 
E
E
 
N
N
 
N

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_012537708.1 NCBI__GCF_000021485.1:WP_012537708.1
MMGAVVITGAGSGIGRALALAYAEPGRVVLLLGRRRTALQETAVQVRARGARAELRTVDV
CDGAALDRIAADFAGGFGSVAVLIANAGISHGTLTAEPADRTVFAEIVATNLIGVELTCG
AFLPYLAPQARIAGIASVAGFRGLPGAAAYSASKAGAIAYLESLRLELRDRGIRVCSIAP
GYVATPMTAENHYPMPWLMPVDQAAAKMRRAIDRGRPWCVLPWQMAVLGTLLRHLPIAIY
DPIFARVAGKRRRTGDDAAES

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory