SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012566706.1 NCBI__GCF_000016185.1:WP_012566706.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2f2aA Structure of tRNA-dependent amidotransferase gatcab complexed with gln (see paper)
46% identity, 97% coverage: 2:508/521 of query aligns to 1:473/485 of 2f2aA

query
sites
2f2aA
M
 
M
S
 
S
L
 
I
N
 
R
H
 
Y
L
 
E
T
 
S
M
 
V
A
 
E
E
 
N
A
 
L
L
 
L
A
 
T
G
 
L
L
 
I
R
 
K
A
 
D
G
 
K
E
 
K
F
 
I
T
 
K
A
 
P
T
 
S
E
 
D
L
 
V
T
 
V
E
 
K
A
 
D
H
 
I
L
 
Y
R
 
D
A
 
A
V
 
I
E
 
E
A
 
E
T
 
T
R
 
D
-
 
P
G
 
T
L
 
I
N
 
K
I
 
S
F
 
F
I
 
L
T
 
A
E
 
L
T
 
D
A
 
K
D
 
E
I
 
N
A
 
A
L
 
I
R
 
K
Q
 
K
A
 
A
K
 
Q
A
 
E
A
 
L
D
 
D
E
 
E
R
 
L
Y
 
Q
A
 
A
A
 
K
G
 
D
T
 
Q
A
 
-
L
 
-
P
 
-
M
 
M
D
 
D
G
 
G
-
 
K
-
 
L
-
 
F
-
 
G
L
 
I
P
 
P
I
 
M
A
 
G
V
 
I
K
|
K
D
 
D
L
 
N
F
 
I
C
 
I
T
 
T
E
 
N
G
 
G
V
 
L
L
 
E
T
 
T
T
 
T
A
 
C
A
 
A
S
 
S
H
 
K
I
 
M
L
 
L
D
 
E
G
 
G
F
 
F
K
 
V
P
 
P
P
 
I
Y
 
Y
E
 
E
S
 
S
S
 
T
V
 
V
T
 
M
A
 
E
N
 
K
L
 
L
W
 
H
R
 
K
D
 
E
G
 
N
A
 
A
V
 
V
M
 
L
L
 
I
G
 
G
K
 
K
V
 
L
N
 
N
L
 
M
D
 
D
E
 
E
F
 
F
A
 
A
M
 
M
G
|
G
S
 
G
A
 
S
N
 
T
I
 
E
T
 
T
S
 
S
Y
 
Y
Y
 
F
G
 
K
P
 
K
V
 
T
I
 
V
S
 
N
P
 
P
W
 
-
S
 
-
K
 
-
G
 
-
R
 
-
R
 
-
V
 
-
Q
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
S
 
-
E
 
-
V
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
-
R
 
-
Q
 
-
P
 
-
Q
 
-
P
 
-
V
 
-
T
 
-
E
 
-
W
 
-
E
 
-
W
 
F
E
 
D
R
 
H
R
 
K
L
 
A
V
 
V
P
 
P
G
 
G
G
 
G
S
|
S
S
|
S
G
 
G
G
 
G
S
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
A
R
 
G
V
 
L
A
 
V
M
 
P
A
 
L
A
 
S
T
 
L
G
 
G
T
x
S
D
|
D
T
|
T
G
|
G
G
|
G
S
|
S
I
 
I
R
 
R
Q
|
Q
P
 
P
A
 
A
S
 
A
F
 
Y
V
 
C
G
 
G
I
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
M
K
 
K
P
 
P
T
 
T
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
C
 
V
S
 
S
R
 
R
W
 
F
G
 
G
I
 
L
V
 
V
A
 
A
F
|
F
A
 
A
S
 
S
S
 
S
L
 
L
D
 
D
Q
 
Q
A
 
I
G
 
G
P
 
P
M
 
L
T
 
T
R
 
R
T
 
N
V
 
V
R
 
K
D
 
D
A
 
N
A
 
A
I
 
I
M
 
V
L
 
L
R
 
E
S
 
A
M
 
I
A
 
S
G
 
G
F
 
A
D
 
D
P
 
V
K
 
N
D
 
D
S
 
S
T
 
T
S
 
S
A
 
A
D
 
P
V
 
V
P
 
D
V
 
D
P
 
V
D
 
D
Y
 
F
E
 
T
K
 
S
A
 
E
I
 
I
T
 
G
G
 
K
D
 
D
I
 
I
R
 
K
G
 
G
L
 
L
R
 
K
V
 
V
G
 
A
I
 
L
P
 
P
R
 
K
E
 
E
Y
 
Y
R
 
L
V
 
G
D
 
E
G
 
G
M
 
V
P
 
A
A
 
D
E
 
D
I
 
V
D
 
K
R
 
E
L
 
A
W
 
V
Q
 
Q
Q
 
N
G
 
A
V
 
V
E
 
E
W
 
T
L
 
L
K
 
K
A
 
S
A
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
P
 
V
V
 
E
E
 
E
I
 
V
S
 
S
L
 
L
P
 
P
H
 
N
T
 
T
K
 
K
Y
 
F
A
 
G
L
 
I
P
 
P
A
 
S
Y
|
Y
Y
|
Y
I
 
V
V
 
I
A
 
A
P
 
S
A
 
S
E
 
E
A
 
A
S
 
S
S
 
S
N
 
N
L
 
L
A
 
S
R
 
R
Y
 
F
D
 
D
G
 
G
V
 
I
R
 
R
F
 
Y
G
 
G
L
 
Y
R
 
H
V
 
S
-
 
K
E
 
E
G
 
A
K
 
H
D
 
S
L
 
L
K
 
E
E
 
E
M
 
L
Y
 
Y
E
 
K
N
 
M
T
 
S
R
 
R
G
 
S
E
 
E
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
K
E
 
E
V
 
V
R
 
K
R
 
R
R
|
R
I
 
I
L
 
F
I
 
L
G
 
G
T
 
T
Y
 
F
V
 
A
L
 
L
S
 
S
A
 
S
G
 
G
Y
 
Y
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
Y
L
 
K
K
 
K
A
 
S
Q
 
Q
K
 
K
V
 
V
R
 
R
A
 
T
R
 
L
I
 
I
A
 
K
E
 
N
D
 
D
F
 
F
T
 
D
K
 
K
A
 
V
W
 
F
E
 
E
Q
 
N
C
 
Y
D
 
D
V
 
V
I
 
V
L
 
V
T
 
G
P
 
P
T
 
T
A
 
A
P
 
P
N
 
T
T
 
T
A
 
A
F
 
F
G
 
N
I
 
L
G
 
G
E
 
E
K
 
E
M
 
I
D
 
D
D
 
D
P
 
P
I
 
L
A
 
T
M
 
M
Y
 
Y
L
 
A
N
 
N
D
|
D
V
 
L
F
 
L
T
 
T
V
 
T
P
 
P
A
 
V
N
 
N
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
G
 
G
L
 
I
S
 
S
V
 
V
P
 
P
A
 
C
G
 
G
L
 
-
A
 
Q
A
 
S
N
 
N
G
 
G
L
 
R
P
 
P
L
 
I
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
L
 
F
V
 
I
G
 
G
R
 
K
P
 
P
F
 
F
D
 
D
E
 
E
A
 
K
T
 
T
L
 
L
I
 
Y
R
 
R
T
 
V
A
 
A
A
 
Y
V
 
Q
L
 
Y
E
 
E

2dqnA Structure of tRNA-dependent amidotransferase gatcab complexed with asn (see paper)
46% identity, 97% coverage: 2:508/521 of query aligns to 1:473/485 of 2dqnA

query
sites
2dqnA
M
 
M
S
 
S
L
 
I
N
 
R
H
 
Y
L
 
E
T
 
S
M
 
V
A
 
E
E
 
N
A
 
L
L
 
L
A
 
T
G
 
L
L
 
I
R
 
K
A
 
D
G
 
K
E
 
K
F
 
I
T
 
K
A
 
P
T
 
S
E
 
D
L
 
V
T
 
V
E
 
K
A
 
D
H
 
I
L
 
Y
R
 
D
A
 
A
V
 
I
E
 
E
A
 
E
T
 
T
R
 
D
-
 
P
G
 
T
L
 
I
N
 
K
I
 
S
F
 
F
I
 
L
T
 
A
E
 
L
T
 
D
A
 
K
D
 
E
I
 
N
A
 
A
L
 
I
R
 
K
Q
 
K
A
 
A
K
 
Q
A
 
E
A
 
L
D
 
D
E
 
E
R
 
L
Y
 
Q
A
 
A
A
 
K
G
 
D
T
 
Q
A
 
-
L
 
-
P
 
-
M
 
M
D
 
D
G
 
G
-
 
K
-
 
L
-
 
F
-
 
G
L
 
I
P
 
P
I
 
M
A
 
G
V
 
I
K
|
K
D
 
D
L
 
N
F
 
I
C
 
I
T
 
T
E
 
N
G
 
G
V
 
L
L
 
E
T
 
T
T
 
T
A
 
C
A
 
A
S
 
S
H
 
K
I
 
M
L
 
L
D
 
E
G
 
G
F
 
F
K
 
V
P
 
P
P
 
I
Y
 
Y
E
 
E
S
 
S
S
 
T
V
 
V
T
 
M
A
 
E
N
 
K
L
 
L
W
 
H
R
 
K
D
 
E
G
 
N
A
 
A
V
 
V
M
 
L
L
 
I
G
 
G
K
 
K
V
 
L
N
 
N
L
 
M
D
 
D
E
 
E
F
 
F
A
 
A
M
|
M
G
|
G
S
 
G
A
 
S
N
 
T
I
 
E
T
 
T
S
 
S
Y
 
Y
Y
 
F
G
 
K
P
 
K
V
 
T
I
 
V
S
 
N
P
 
P
W
 
-
S
 
-
K
 
-
G
 
-
R
 
-
R
 
-
V
 
-
Q
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
S
 
-
E
 
-
V
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
-
R
 
-
Q
 
-
P
 
-
Q
 
-
P
 
-
V
 
-
T
 
-
E
 
-
W
 
-
E
 
-
W
 
F
E
 
D
R
 
H
R
 
K
L
 
A
V
 
V
P
 
P
G
 
G
G
 
G
S
|
S
S
|
S
G
 
G
G
 
G
S
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
A
R
 
G
V
 
L
A
 
V
M
 
P
A
 
L
A
 
S
T
 
L
G
 
G
T
x
S
D
 
D
T
|
T
G
|
G
G
|
G
S
|
S
I
 
I
R
 
R
Q
|
Q
P
 
P
A
 
A
S
 
A
F
 
Y
V
 
C
G
 
G
I
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
M
K
 
K
P
 
P
T
 
T
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
C
 
V
S
 
S
R
 
R
W
 
F
G
 
G
I
 
L
V
 
V
A
 
A
F
 
F
A
 
A
S
 
S
S
 
S
L
 
L
D
 
D
Q
 
Q
A
 
I
G
 
G
P
 
P
M
 
L
T
 
T
R
 
R
T
 
N
V
 
V
R
 
K
D
 
D
A
 
N
A
 
A
I
 
I
M
 
V
L
 
L
R
 
E
S
 
A
M
 
I
A
 
S
G
 
G
F
 
A
D
 
D
P
 
V
K
 
N
D
 
D
S
 
S
T
 
T
S
 
S
A
 
A
D
 
P
V
 
V
P
 
D
V
 
D
P
 
V
D
 
D
Y
 
F
E
 
T
K
 
S
A
 
E
I
 
I
T
 
G
G
 
K
D
 
D
I
 
I
R
 
K
G
 
G
L
 
L
R
 
K
V
 
V
G
 
A
I
 
L
P
 
P
R
 
K
E
 
E
Y
 
Y
R
 
L
V
 
G
D
 
E
G
 
G
M
 
V
P
 
A
A
 
D
E
 
D
I
 
V
D
 
K
R
 
E
L
 
A
W
 
V
Q
 
Q
Q
 
N
G
 
A
V
 
V
E
 
E
W
 
T
L
 
L
K
 
K
A
 
S
A
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
P
 
V
V
 
E
E
 
E
I
 
V
S
 
S
L
 
L
P
 
P
H
 
N
T
 
T
K
 
K
Y
 
F
A
 
G
L
 
I
P
 
P
A
 
S
Y
|
Y
Y
|
Y
I
 
V
V
 
I
A
 
A
P
 
S
A
 
S
E
 
E
A
 
A
S
 
S
S
 
S
N
 
N
L
 
L
A
 
S
R
 
R
Y
 
F
D
 
D
G
 
G
V
 
I
R
 
R
F
 
Y
G
 
G
L
 
Y
R
 
H
V
 
S
-
 
K
E
 
E
G
 
A
K
 
H
D
 
S
L
 
L
K
 
E
E
 
E
M
 
L
Y
 
Y
E
 
K
N
 
M
T
 
S
R
 
R
G
 
S
E
 
E
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
K
E
 
E
V
 
V
R
 
K
R
 
R
R
|
R
I
 
I
L
 
F
I
 
L
G
 
G
T
 
T
Y
 
F
V
 
A
L
 
L
S
 
S
A
 
S
G
 
G
Y
 
Y
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
Y
L
 
K
K
 
K
A
 
S
Q
 
Q
K
 
K
V
 
V
R
 
R
A
 
T
R
 
L
I
 
I
A
 
K
E
 
N
D
 
D
F
 
F
T
 
D
K
 
K
A
 
V
W
 
F
E
 
E
Q
 
N
C
 
Y
D
 
D
V
 
V
I
 
V
L
 
V
T
 
G
P
 
P
T
 
T
A
 
A
P
 
P
N
 
T
T
 
T
A
 
A
F
 
F
G
 
N
I
 
L
G
 
G
E
 
E
K
 
E
M
 
I
D
 
D
D
 
D
P
 
P
I
 
L
A
 
T
M
 
M
Y
 
Y
L
 
A
N
 
N
D
|
D
V
 
L
F
 
L
T
 
T
V
 
T
P
 
P
A
 
V
N
 
N
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
G
 
G
L
 
I
S
 
S
V
 
V
P
 
P
A
 
C
G
 
G
L
 
-
A
 
Q
A
 
S
N
 
N
G
 
G
L
 
R
P
 
P
L
 
I
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
L
 
F
V
 
I
G
 
G
R
 
K
P
 
P
F
 
F
D
 
D
E
 
E
A
 
K
T
 
T
L
 
L
I
 
Y
R
 
R
T
 
V
A
 
A
A
 
Y
V
 
Q
L
 
Y
E
 
E

3h0mA Structure of tRNA-dependent amidotransferase gatcab from aquifex aeolicus (see paper)
47% identity, 96% coverage: 8:509/521 of query aligns to 6:467/478 of 3h0mA

query
sites
3h0mA
T
 
S
M
 
L
A
 
S
E
 
E
A
 
L
L
 
R
A
 
E
G
 
L
L
 
L
R
 
K
A
 
R
G
 
G
E
 
E
F
 
V
T
 
S
A
 
P
T
 
K
E
 
E
L
 
V
T
 
V
E
 
E
A
 
S
H
 
F
L
 
Y
-
 
D
R
 
R
A
 
Y
V
 
N
E
 
Q
A
 
T
T
 
E
R
 
E
G
 
K
L
 
V
N
 
K
I
 
A
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
E
 
P
T
 
L
A
 
Y
D
 
G
I
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
K
Q
 
Q
A
 
A
K
 
E
A
 
S
A
 
L
D
 
K
E
 
E
R
 
R
Y
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
T
 
-
A
 
E
L
 
L
P
 
P
M
 
L
D
 
F
G
 
G
L
 
I
P
 
P
I
 
I
A
 
A
V
 
V
K
|
K
D
 
D
L
 
N
F
 
I
C
 
L
T
 
V
E
 
E
G
 
G
V
 
E
L
 
K
T
 
T
T
 
T
A
 
C
A
 
A
S
 
S
H
 
K
I
 
I
L
 
L
D
 
E
G
 
N
F
 
F
K
 
V
P
 
A
P
 
P
Y
 
Y
E
 
D
S
 
A
S
 
T
V
 
V
T
 
I
A
 
E
N
 
R
L
 
L
W
 
K
R
 
K
D
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
L
M
 
I
L
 
V
G
 
G
K
 
K
V
 
T
N
 
N
L
 
L
D
 
D
E
 
E
F
 
F
A
 
A
M
|
M
G
|
G
S
 
S
A
 
S
N
 
T
I
 
E
T
 
Y
S
 
S
Y
 
A
Y
 
F
G
 
F
P
 
P
V
 
T
I
 
K
S
 
N
P
 
P
W
 
W
S
 
D
K
 
L
G
 
E
R
 
R
R
 
-
V
 
-
Q
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
S
 
-
E
 
-
V
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
-
R
 
-
Q
 
-
P
 
-
Q
 
-
P
 
-
V
 
-
T
 
-
E
 
-
W
 
-
E
 
-
W
 
-
E
 
-
R
 
-
R
 
-
L
 
-
V
 
V
P
 
P
G
 
G
G
 
G
S
|
S
S
|
S
G
 
G
G
 
G
S
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
V
R
 
L
V
 
S
A
 
A
M
 
P
A
 
V
A
 
S
T
 
L
G
 
G
T
x
S
D
|
D
T
|
T
G
|
G
G
|
G
S
|
S
I
 
I
R
 
R
Q
|
Q
P
 
P
A
 
A
S
 
S
F
 
F
V
 
C
G
 
G
I
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
I
K
 
K
P
 
P
T
 
T
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
C
 
V
S
 
S
R
 
R
W
 
Y
G
 
G
I
 
L
V
 
V
A
 
A
F
|
F
A
 
A
S
 
S
S
 
S
L
 
L
D
 
D
Q
 
Q
A
 
I
G
 
G
P
 
V
M
 
F
T
 
G
R
 
R
T
 
R
V
 
T
R
 
E
D
 
D
A
 
V
A
 
A
I
 
L
M
 
V
L
 
L
R
 
E
S
 
V
M
 
I
A
 
S
G
 
G
F
 
W
D
 
D
P
 
E
K
 
K
D
 
D
S
 
S
T
 
T
S
 
S
A
 
A
D
 
K
V
 
V
P
 
P
V
 
V
P
 
P
D
 
E
Y
 
W
E
 
S
K
 
E
A
 
E
I
 
V
T
 
K
G
 
K
D
 
E
I
 
V
R
 
K
G
 
G
L
 
L
R
 
K
V
 
I
G
 
G
I
 
L
P
 
P
R
 
K
E
 
E
Y
 
F
R
 
F
V
 
E
D
 
Y
G
 
E
M
 
L
P
 
Q
A
 
P
E
 
Q
I
 
V
D
 
K
R
 
E
L
 
A
W
 
F
Q
 
E
Q
 
N
G
 
F
V
 
I
E
 
K
W
 
E
L
 
L
K
 
E
A
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
F
V
 
E
P
 
I
V
 
K
E
 
E
I
 
V
S
 
S
L
 
L
P
 
P
H
 
H
T
 
V
K
 
K
Y
 
Y
A
 
S
L
 
I
P
 
P
A
 
T
Y
|
Y
Y
 
Y
I
 
I
V
 
I
A
 
A
P
 
P
A
 
S
E
 
E
A
 
A
S
 
S
S
 
S
N
 
N
L
 
L
A
 
A
R
 
R
Y
 
Y
D
 
D
G
 
G
V
 
V
R
 
R
F
 
Y
G
 
G
L
 
Y
R
 
R
V
 
A
-
 
K
E
 
E
G
 
Y
K
 
K
D
 
D
L
 
I
K
 
F
E
 
E
M
 
M
Y
 
Y
E
 
A
N
 
R
T
 
T
R
 
R
G
 
D
E
 
E
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
P
E
 
E
V
 
V
R
 
K
R
 
R
R
|
R
I
 
I
L
 
M
I
 
L
G
 
G
T
 
T
Y
 
F
V
 
A
L
 
L
S
 
S
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
A
 
A
Q
 
Q
K
 
K
V
 
V
R
 
R
A
 
R
R
 
L
I
 
I
A
 
T
E
 
N
D
 
D
F
 
F
T
 
L
K
 
K
A
 
A
W
 
F
E
 
E
Q
 
E
C
 
V
D
 
D
V
 
V
I
 
I
L
 
A
T
 
S
P
 
P
T
 
T
A
 
T
P
 
P
N
 
T
T
 
L
A
 
P
F
 
F
G
 
K
I
 
F
G
 
G
E
 
E
K
 
R
M
 
L
D
 
E
D
 
N
P
 
P
I
 
I
A
 
E
M
 
M
Y
 
Y
L
 
L
N
 
S
D
|
D
V
 
I
F
 
L
T
 
T
V
 
V
P
 
P
A
 
A
N
 
N
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
G
 
A
L
 
I
S
 
S
V
 
I
P
 
P
A
 
I
G
 
A
L
 
W
A
 
-
A
 
K
N
 
D
G
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
V
G
 
G
L
 
G
Q
 
Q
L
 
L
V
 
I
G
 
G
R
 
K
P
 
H
F
 
W
D
 
D
E
 
E
A
 
T
T
 
T
L
 
L
I
 
L
R
 
Q
T
 
I
A
 
S
A
 
Y
V
 
L
L
 
W
E
 
E
Q
 
Q

3h0lA Structure of tRNA-dependent amidotransferase gatcab from aquifex aeolicus (see paper)
47% identity, 96% coverage: 8:509/521 of query aligns to 6:467/478 of 3h0lA

query
sites
3h0lA
T
 
S
M
 
L
A
 
S
E
 
E
A
 
L
L
 
R
A
 
E
G
 
L
L
 
L
R
 
K
A
 
R
G
 
G
E
 
E
F
 
V
T
 
S
A
 
P
T
 
K
E
 
E
L
 
V
T
 
V
E
 
E
A
 
S
H
 
F
L
 
Y
-
 
D
R
 
R
A
 
Y
V
 
N
E
 
Q
A
 
T
T
 
E
R
 
E
G
 
K
L
 
V
N
 
K
I
 
A
F
 
Y
I
 
I
T
 
T
E
 
P
T
 
L
A
 
Y
D
 
G
I
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
K
Q
 
Q
A
 
A
K
 
E
A
 
S
A
 
L
D
 
K
E
 
E
R
 
R
Y
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
T
 
-
A
 
E
L
 
L
P
 
P
M
 
L
D
 
F
G
 
G
L
 
I
P
 
P
I
 
I
A
 
A
V
 
V
K
|
K
D
 
D
L
 
N
F
 
I
C
 
L
T
 
V
E
 
E
G
 
G
V
 
E
L
 
K
T
 
T
T
 
T
A
 
C
A
 
A
S
 
S
H
 
K
I
 
I
L
 
L
D
 
E
G
 
N
F
 
F
K
 
V
P
 
A
P
 
P
Y
 
Y
E
 
D
S
 
A
S
 
T
V
 
V
T
 
I
A
 
E
N
 
R
L
 
L
W
 
K
R
 
K
D
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
L
M
 
I
L
 
V
G
 
G
K
 
K
V
 
T
N
 
N
L
 
L
D
 
D
E
 
E
F
 
F
A
 
A
M
 
M
G
|
G
S
 
S
A
 
S
N
 
T
I
 
E
T
 
Y
S
 
S
Y
 
A
Y
 
F
G
 
F
P
 
P
V
 
T
I
 
K
S
 
N
P
 
P
W
 
W
S
 
D
K
 
L
G
 
E
R
 
R
R
 
-
V
 
-
Q
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
S
 
-
E
 
-
V
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
-
R
 
-
Q
 
-
P
 
-
Q
 
-
P
 
-
V
 
-
T
 
-
E
 
-
W
 
-
E
 
-
W
 
-
E
 
-
R
 
-
R
 
-
L
 
-
V
 
V
P
 
P
G
 
G
G
 
G
S
|
S
S
|
S
G
 
G
G
 
G
S
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
V
R
 
L
V
 
S
A
 
A
M
 
P
A
 
V
A
 
S
T
 
L
G
 
G
T
x
S
D
 
D
T
|
T
G
|
G
G
|
G
S
|
S
I
 
I
R
 
R
Q
|
Q
P
 
P
A
 
A
S
 
S
F
 
F
V
 
C
G
 
G
I
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
I
K
 
K
P
 
P
T
 
T
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
C
 
V
S
 
S
R
 
R
W
 
Y
G
 
G
I
 
L
V
 
V
A
 
A
F
 
F
A
 
A
S
 
S
S
 
S
L
 
L
D
 
D
Q
 
Q
A
 
I
G
 
G
P
 
V
M
 
F
T
 
G
R
 
R
T
 
R
V
 
T
R
 
E
D
 
D
A
 
V
A
 
A
I
 
L
M
 
V
L
 
L
R
 
E
S
 
V
M
 
I
A
 
S
G
 
G
F
 
W
D
 
D
P
 
E
K
 
K
D
 
D
S
 
S
T
 
T
S
 
S
A
 
A
D
 
K
V
 
V
P
 
P
V
 
V
P
 
P
D
 
E
Y
 
W
E
 
S
K
 
E
A
 
E
I
 
V
T
 
K
G
 
K
D
 
E
I
 
V
R
 
K
G
 
G
L
 
L
R
 
K
V
 
I
G
 
G
I
 
L
P
 
P
R
 
K
E
 
E
Y
 
F
R
 
F
V
 
E
D
 
Y
G
 
E
M
 
L
P
 
Q
A
 
P
E
 
Q
I
 
V
D
 
K
R
 
E
L
 
A
W
 
F
Q
 
E
Q
 
N
G
 
F
V
 
I
E
 
K
W
 
E
L
 
L
K
 
E
A
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
F
V
 
E
P
 
I
V
 
K
E
 
E
I
 
V
S
 
S
L
 
L
P
 
P
H
 
H
T
 
V
K
 
K
Y
 
Y
A
 
S
L
 
I
P
 
P
A
 
T
Y
|
Y
Y
 
Y
I
 
I
V
 
I
A
 
A
P
 
P
A
 
S
E
 
E
A
 
A
S
 
S
S
 
S
N
 
N
L
 
L
A
 
A
R
 
R
Y
 
Y
D
 
D
G
 
G
V
 
V
R
 
R
F
 
Y
G
 
G
L
 
Y
R
 
R
V
 
A
-
 
K
E
 
E
G
 
Y
K
 
K
D
 
D
L
 
I
K
 
F
E
 
E
M
 
M
Y
 
Y
E
 
A
N
 
R
T
 
T
R
 
R
G
 
D
E
 
E
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
P
E
 
E
V
 
V
R
 
K
R
 
R
R
|
R
I
 
I
L
 
M
I
 
L
G
 
G
T
 
T
Y
 
F
V
 
A
L
 
L
S
 
S
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
A
 
A
Q
 
Q
K
 
K
V
 
V
R
 
R
A
 
R
R
 
L
I
 
I
A
 
T
E
 
N
D
 
D
F
 
F
T
 
L
K
 
K
A
 
A
W
 
F
E
 
E
Q
 
E
C
 
V
D
 
D
V
 
V
I
 
I
L
 
A
T
 
S
P
 
P
T
 
T
A
 
T
P
 
P
N
 
T
T
 
L
A
 
P
F
 
F
G
 
K
I
 
F
G
 
G
E
 
E
K
 
R
M
 
L
D
 
E
D
 
N
P
 
P
I
 
I
A
 
E
M
 
M
Y
 
Y
L
 
L
N
 
S
D
|
D
V
 
I
F
 
L
T
 
T
V
 
V
P
 
P
A
 
A
N
 
N
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
G
 
A
L
 
I
S
 
S
V
 
I
P
 
P
A
 
I
G
 
A
L
 
W
A
 
-
A
 
K
N
 
D
G
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
V
G
 
G
L
 
G
Q
 
Q
L
 
L
V
 
I
G
 
G
R
 
K
P
 
H
F
 
W
D
 
D
E
 
E
A
 
T
T
 
T
L
 
L
I
 
L
R
 
Q
T
 
I
A
 
S
A
 
Y
V
 
L
L
 
W
E
 
E
Q
 
Q

3kfuE Crystal structure of the transamidosome (see paper)
44% identity, 94% coverage: 19:510/521 of query aligns to 12:456/468 of 3kfuE

query
sites
3kfuE
G
 
G
E
 
E
F
 
V
T
 
S
A
 
P
T
 
L
E
 
E
L
 
V
T
 
A
E
 
Q
A
 
A
H
 
Y
L
 
L
R
 
K
A
 
R
V
 
V
-
 
Q
E
 
E
A
 
L
T
 
D
R
 
P
G
 
G
L
 
L
N
 
G
I
 
A
F
 
F
I
 
L
T
 
S
E
 
L
T
 
N
A
 
E
D
 
R
I
 
L
A
 
-
L
 
L
R
 
E
Q
 
E
A
 
A
K
 
E
A
 
A
A
 
V
D
 
D
E
 
-
R
 
-
Y
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
T
 
P
A
 
G
L
 
L
P
 
P
M
 
L
D
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
V
I
 
V
A
 
A
V
 
V
K
|
K
D
 
D
L
 
N
F
 
I
C
 
A
T
 
T
E
 
R
G
 
G
V
 
L
L
 
R
T
 
T
T
 
T
A
 
A
A
 
G
S
 
S
H
 
R
I
 
L
L
 
L
D
 
E
G
 
N
F
 
F
K
 
V
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
E
 
E
S
 
A
S
 
T
V
 
A
T
 
V
A
 
A
N
 
R
L
 
L
W
 
K
R
 
A
D
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
L
M
 
V
L
 
L
G
 
G
K
 
K
V
 
T
N
 
N
L
 
L
D
 
D
E
 
E
F
 
F
A
 
G
M
 
M
G
 
G
S
 
S
A
 
S
N
 
T
I
 
E
T
 
H
S
 
S
Y
 
A
Y
 
F
G
 
F
P
 
P
V
 
T
I
 
K
S
 
N
P
 
P
W
 
F
S
 
D
K
 
P
G
 
D
R
 
R
R
 
-
V
 
-
Q
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
S
 
-
E
 
-
V
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
-
R
 
-
Q
 
-
P
 
-
Q
 
-
P
 
-
V
 
-
T
 
-
E
 
-
W
 
-
E
 
-
W
 
-
E
 
-
R
 
-
R
 
-
L
 
-
V
 
V
P
 
P
G
 
G
G
 
G
S
|
S
S
|
S
G
 
G
G
 
G
S
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
A
V
 
L
A
 
A
A
 
A
R
 
D
V
 
L
A
 
A
M
 
P
A
 
L
A
 
A
T
 
L
G
 
G
T
x
S
D
 
D
T
|
T
G
|
G
G
|
G
S
|
S
I
 
V
R
 
R
Q
|
Q
P
 
P
A
 
A
S
 
A
F
 
F
V
 
C
G
 
G
I
 
V
V
 
Y
G
 
G
L
 
L
K
 
K
P
 
P
T
 
T
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
C
 
V
S
 
S
R
 
R
W
 
F
G
 
G
I
 
L
V
 
I
A
 
A
F
 
Y
A
 
A
S
 
S
S
 
S
L
 
L
D
 
D
Q
 
Q
A
 
I
G
 
G
P
 
P
M
 
M
T
 
A
R
 
R
T
 
S
V
 
V
R
 
R
D
 
D
A
 
L
A
 
A
I
 
L
M
 
L
L
 
M
R
 
D
S
 
A
M
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
P
D
 
D
P
 
P
K
 
L
D
 
D
S
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
L
D
 
D
V
 
L
P
 
P
V
 
-
P
 
P
D
 
R
Y
 
F
E
 
Q
K
 
E
A
 
A
I
 
L
T
 
E
G
 
G
D
 
P
I
 
L
R
 
P
G
 
P
L
 
L
R
 
R
V
 
L
G
 
G
I
 
V
P
 
V
R
 
R
E
 
E
Y
 
A
R
 
L
V
 
A
D
 
G
G
 
N
M
 
S
P
 
P
A
 
G
E
 
-
I
 
V
D
 
E
R
 
R
L
 
A
W
 
L
Q
 
E
Q
 
E
G
 
A
V
 
L
E
 
K
W
 
V
L
 
F
K
 
R
A
 
E
A
 
L
G
 
G
A
 
L
V
 
S
P
 
V
V
 
R
E
 
E
I
 
V
S
 
S
L
 
W
P
 
P
H
 
S
T
 
L
K
 
P
Y
 
Q
A
 
A
L
 
L
P
 
A
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
Y
I
 
I
V
 
L
A
 
A
P
 
P
A
 
A
E
 
E
A
 
A
S
 
S
S
 
S
N
 
N
L
 
L
A
 
A
R
 
R
Y
 
Y
D
 
D
G
 
G
V
 
T
R
 
L
F
 
Y
G
 
G
L
 
R
R
 
R
V
 
A
E
 
A
G
 
G
K
 
E
D
 
E
L
 
V
K
 
E
E
 
G
M
 
M
Y
 
M
E
 
E
N
 
A
T
 
T
R
 
R
G
 
A
E
 
L
G
 
-
F
 
F
G
 
G
R
 
L
E
 
E
V
 
V
R
 
K
R
 
R
R
 
R
I
 
V
L
 
L
I
 
V
G
 
G
T
 
T
Y
 
F
V
 
V
L
 
L
S
 
S
A
 
S
G
|
G
Y
 
Y
Y
|
Y
D
 
E
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
Y
L
 
G
K
 
R
A
 
A
Q
 
Q
K
 
A
V
 
F
R
 
R
A
 
R
R
 
R
I
 
L
A
 
K
E
 
A
D
 
E
F
 
A
T
 
Q
K
 
A
A
 
L
W
 
F
E
 
R
Q
 
E
C
 
V
D
 
D
V
 
L
I
 
L
L
 
L
T
 
L
P
 
P
T
 
T
A
 
T
P
 
P
N
 
H
T
 
P
A
 
A
F
 
F
G
 
P
I
 
F
G
 
G
E
 
A
K
 
R
M
 
-
D
 
R
D
 
D
P
 
P
I
 
L
A
 
A
M
 
M
Y
 
Y
L
 
R
N
 
E
D
 
D
V
 
L
F
 
Y
T
 
T
V
 
V
P
 
G
A
 
A
N
 
N
L
 
L
A
 
T
G
 
G
L
 
L
P
 
P
G
 
A
L
 
L
S
 
S
V
 
F
P
 
P
A
 
A
G
 
G
L
 
F
A
 
E
A
 
G
N
 
H
G
 
-
L
 
L
P
 
P
L
 
V
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
L
 
L
V
 
L
G
 
A
R
 
P
P
 
W
F
 
G
D
 
E
E
 
D
A
 
E
T
 
R
L
 
L
I
 
L
R
 
R
T
 
A
A
 
A
A
 
L
V
 
A
L
 
F
E
 
E
Q
 
E
A
 
A

4n0iA Crystal structure of s. Cerevisiae mitochondrial gatfab in complex with glutamine (see paper)
35% identity, 83% coverage: 70:501/521 of query aligns to 30:443/450 of 4n0iA

query
sites
4n0iA
M
 
L
D
 
T
G
 
G
L
 
C
P
 
V
I
 
A
A
 
S
V
 
I
K
|
K
D
 
D
L
 
N
F
 
I
C
 
V
T
 
T
E
 
K
G
 
D
V
 
F
L
 
P
T
 
T
T
 
T
A
 
C
A
 
A
S
 
S
H
 
H
I
 
I
L
 
L
D
 
E
G
 
N
F
 
F
K
 
K
P
 
S
P
 
P
Y
 
F
E
 
D
S
 
A
S
 
T
V
 
V
T
 
V
A
 
K
N
 
L
L
 
L
W
 
K
R
 
Q
D
 
A
G
 
G
A
 
V
V
 
H
M
 
I
L
 
L
G
 
G
K
 
K
V
 
T
N
 
N
L
 
L
D
 
D
E
 
E
F
 
F
A
 
G
M
 
M
G
|
G
S
 
S
A
 
G
N
 
G
I
 
V
T
 
H
S
 
S
Y
 
I
Y
 
R
G
 
G
P
 
P
V
 
V
I
 
I
S
 
N
P
 
P
W
 
L
S
 
-
K
 
-
G
 
-
R
 
-
R
 
-
V
 
-
Q
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
S
 
-
E
 
-
V
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
-
R
 
-
Q
 
-
P
 
-
Q
 
-
P
 
-
V
 
-
T
 
-
E
 
-
W
 
Y
E
 
P
W
 
H
E
 
E
R
 
D
R
 
K
L
 
K
V
 
I
P
 
M
G
 
G
G
 
G
S
|
S
S
|
S
G
 
S
G
 
G
S
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
C
R
 
D
V
 
L
A
 
V
M
 
D
A
 
F
A
 
A
T
 
L
G
 
G
T
|
T
D
 
D
T
|
T
G
|
G
G
|
G
S
|
S
I
 
V
R
 
R
Q
x
L
P
 
P
A
 
A
S
 
C
F
 
Y
V
 
G
G
 
S
I
 
V
V
 
L
G
 
G
L
 
F
K
 
K
P
 
P
T
 
S
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
C
 
L
S
 
S
R
 
R
W
 
F
G
 
G
I
 
V
V
 
I
A
 
A
F
x
Y
A
 
S
S
 
Q
S
 
S
L
 
L
D
 
D
Q
 
T
A
 
V
G
 
G
P
 
I
M
 
L
T
 
S
R
 
K
T
 
K
V
 
I
R
 
N
D
 
V
A
 
L
A
 
R
I
 
K
M
 
V
L
 
F
R
 
H
S
 
T
M
 
L
A
 
D
G
 
K
F
 
Y
D
 
D
P
 
M
K
 
K
D
 
D
S
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
L
D
 
S
V
 
V
P
 
E
V
 
L
P
 
R
D
 
E
Y
 
L
E
 
I
K
 
E
A
 
G
I
 
N
T
 
K
G
 
K
D
 
V
I
 
R
R
 
R
G
 
P
L
 
L
R
 
K
V
 
V
G
 
G
I
 
I
P
 
V
R
 
K
E
 
E
Y
 
F
R
 
S
V
 
H
D
 
E
G
 
S
M
 
M
P
 
P
A
 
I
E
 
G
I
 
F
D
 
H
R
 
R
L
 
L
W
 
Y
Q
 
L
Q
 
S
G
 
L
V
 
L
E
 
E
W
 
K
L
 
L
K
 
I
A
 
N
A
 
L
G
 
G
A
 
L
V
 
E
P
 
I
V
 
Y
E
 
P
I
 
V
S
 
S
L
 
I
P
 
P
H
 
S
T
 
V
K
 
K
Y
 
N
A
 
C
L
 
L
P
 
P
A
 
I
Y
|
Y
Y
|
Y
I
 
T
V
 
L
A
 
S
P
 
P
A
 
A
E
 
E
A
 
A
S
 
A
S
 
S
N
 
N
L
 
L
A
 
S
R
 
R
Y
 
Y
D
 
D
G
 
G
V
 
I
R
 
R
F
 
Y
G
 
G
L
 
Y
R
 
R
V
 
D
E
 
S
G
 
E
K
 
L
D
 
D
L
 
I
K
 
K
E
 
D
-
 
G
-
 
I
M
 
L
Y
 
F
E
 
A
N
 
P
T
 
T
R
 
R
G
 
S
E
 
K
G
 
-
F
 
F
G
 
G
R
 
T
E
 
E
V
 
V
R
 
K
R
 
N
R
|
R
I
 
I
L
 
I
I
 
L
G
 
G
T
 
N
Y
 
Y
V
 
N
L
 
L
S
 
C
A
 
S
G
 
D
Y
 
A
Y
 
F
D
 
K
A
 
N
Y
 
N
Y
 
F
L
 
I
K
 
K
A
 
A
Q
 
E
K
 
K
V
 
L
R
 
R
A
 
V
R
 
N
I
 
L
A
 
I
E
 
D
D
 
E
F
 
F
T
 
D
K
 
G
A
 
I
W
 
F
-
 
R
-
 
F
-
 
P
-
 
N
-
 
V
-
 
L
-
 
T
-
 
N
-
 
S
-
 
K
-
 
G
-
 
N
-
 
P
E
 
D
Q
 
G
C
 
L
D
 
D
V
 
L
I
 
L
L
 
I
T
 
V
P
 
P
T
 
T
A
 
S
P
 
S
N
 
K
T
 
L
A
 
P
F
 
G
G
 
S
I
 
I
-
 
R
-
 
D
-
 
F
-
 
E
G
 
E
E
 
E
K
 
E
M
 
A
D
 
K
D
 
S
P
 
P
I
 
A
A
 
N
M
 
S
Y
 
Y
L
 
I
N
 
N
D
|
D
V
 
V
F
 
F
T
 
T
V
 
V
P
 
P
A
 
M
N
 
S
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
G
 
S
L
 
L
S
 
S
V
 
M
P
 
P
A
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
L
A
 
K
N
 
E
G
 
K
L
 
T
P
 
P
L
 
I
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
L
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
Q
P
 
Y
F
 
G
D
 
D
E
 
D
A
 
S
T
 
T
L
 
V
I
 
L

3a1iA Crystal structure of rhodococcus sp. N-771 amidase complexed with benzamide (see paper)
29% identity, 86% coverage: 70:517/521 of query aligns to 87:506/508 of 3a1iA

query
sites
3a1iA
M
 
L
D
 
T
G
 
G
L
 
R
P
 
R
I
 
V
A
 
A
V
 
I
K
|
K
D
 
D
L
 
N
F
 
V
C
 
T
T
 
V
E
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
P
T
 
M
T
 
M
A
 
N
A
 
G
S
 
S
H
 
R
I
 
T
L
 
V
D
 
E
G
 
G
F
 
F
K
 
T
P
 
P
P
 
S
Y
 
R
E
 
D
S
 
A
S
 
T
V
 
V
T
 
V
A
 
T
N
 
R
L
 
L
W
 
L
R
 
A
D
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
T
M
 
V
L
 
A
G
 
G
K
 
K
V
 
A
N
 
V
L
 
C
D
 
E
E
 
D
F
 
L
A
 
C
M
x
F
G
x
S
S
x
G
A
 
S
N
 
S
I
 
F
T
 
T
S
 
P
Y
 
A
Y
 
S
G
 
G
P
 
P
V
 
V
I
 
R
S
 
N
P
 
P
W
 
W
S
 
D
K
 
-
G
 
-
R
 
-
R
 
-
V
 
-
Q
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
S
 
-
E
 
-
V
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
-
R
 
R
Q
 
Q
P
 
R
Q
 
E
P
 
A
V
 
G
T
 
G
E
x
S
W
x
S
E
 
G
W
 
G
E
 
S
R
 
A
R
 
A
L
 
L
V
 
V
P
 
A
G
 
N
G
 
G
S
 
D
S
 
V
G
 
D
G
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
V
 
-
A
 
-
M
 
-
A
 
F
A
 
A
T
 
I
G
 
G
T
x
G
D
 
D
T
x
Q
G
|
G
G
|
G
S
x
A
I
 
I
R
 
R
Q
x
I
P
 
P
A
 
A
S
 
A
F
 
F
V
 
C
G
 
G
I
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
H
K
 
K
P
 
P
T
 
T
Y
 
F
G
 
G
R
 
L
C
 
V
S
 
P
R
 
Y
W
 
T
G
 
G
I
 
A
V
 
F
A
 
P
F
 
I
A
 
E
S
 
R
S
 
T
L
 
I
D
 
D
Q
 
H
A
 
L
G
 
G
P
 
P
M
 
I
T
 
T
R
 
R
T
 
T
V
 
V
R
 
H
D
 
D
A
 
A
A
 
A
I
 
L
M
 
M
L
 
L
R
 
S
S
 
V
M
 
I
A
 
A
G
 
G
F
 
R
D
 
D
P
 
G
K
 
N
D
 
D
S
 
P
T
 
R
S
 
Q
A
 
A
D
 
D
-
 
S
V
 
V
P
 
E
V
 
A
P
 
G
D
 
D
Y
 
Y
E
 
L
K
 
S
A
 
T
I
 
L
T
 
D
G
 
S
D
 
D
I
 
V
R
 
D
G
 
G
L
 
L
R
 
R
V
 
I
G
 
G
I
 
I
P
 
V
R
 
R
E
 
E
Y
 
G
R
 
F
V
 
G
D
 
H
G
 
A
M
 
V
P
 
S
A
 
Q
-
 
P
E
 
E
I
 
V
D
 
D
R
 
D
L
 
A
W
 
V
Q
 
R
Q
 
A
G
 
A
V
 
A
E
 
H
W
 
S
L
 
L
K
 
T
A
 
E
A
 
I
G
 
G
A
 
C
V
 
T
P
 
V
V
 
E
E
 
E
I
 
V
S
 
N
L
 
I
P
 
P
H
 
W
T
 
H
K
 
L
Y
 
H
A
 
A
L
 
F
P
 
H
A
 
I
Y
x
W
Y
 
N
I
 
V
V
 
I
A
 
A
P
 
T
A
 
D
E
 
G
A
 
G
S
 
A
S
 
Y
N
 
Q
L
 
M
A
 
-
R
 
-
Y
 
L
D
 
D
G
 
G
V
 
N
R
 
G
F
 
Y
G
 
G
L
 
M
R
 
N
V
 
A
E
 
E
G
 
G
-
 
L
-
 
Y
-
 
D
K
 
P
D
 
E
L
 
L
K
 
M
E
 
A
M
 
H
Y
 
F
E
 
A
N
 
S
T
 
R
R
 
R
-
 
I
-
 
Q
-
 
H
G
 
A
E
 
D
G
 
A
F
 
L
G
 
S
R
 
E
E
 
T
V
 
V
R
 
K
R
 
L
R
 
V
I
 
A
L
 
L
I
 
T
G
 
G
T
 
H
Y
 
H
V
 
G
L
 
I
S
 
T
A
 
T
G
 
-
Y
 
L
Y
 
G
D
 
G
A
 
A
Y
 
S
Y
 
Y
L
 
G
K
 
K
A
 
A
Q
 
R
K
 
N
V
 
L
R
 
V
A
 
P
R
 
L
I
 
A
A
 
R
E
 
A
D
 
A
F
 
Y
T
 
D
K
 
T
A
 
A
W
 
L
E
 
R
Q
 
Q
C
 
F
D
 
D
V
 
V
I
 
L
L
 
V
T
 
M
P
 
P
T
 
T
A
 
L
P
 
P
N
 
Y
T
 
V
A
 
A
F
 
S
G
 
E
I
 
L
G
 
P
E
 
A
K
 
K
M
 
-
D
 
D
D
 
V
P
 
D
I
 
R
A
 
A
M
 
T
Y
 
F
L
 
I
N
 
T
D
 
K
V
 
A
F
 
L
-
 
G
-
 
M
-
 
I
-
 
A
-
 
N
T
 
T
V
 
A
P
 
P
A
 
F
N
 
D
L
 
V
A
 
T
G
 
G
L
 
H
P
 
P
G
 
S
L
 
L
S
 
S
V
 
V
P
 
P
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
-
A
 
V
N
 
N
G
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
V
G
 
G
L
 
M
Q
 
M
L
 
I
V
 
T
G
 
G
R
 
R
P
 
H
F
 
F
D
 
D
E
 
D
A
 
A
T
 
T
L
 
V
I
 
L
R
 
R
T
 
V
A
 
G
A
 
R
V
 
A
L
 
F
E
 
E
Q
 
K
A
 
L
A
 
R
G
 
G
P
 
A
Q
 
F
P
 
P
L
 
T
P
 
P

1m21A Crystal structure analysis of the peptide amidase pam in complex with the competitive inhibitor chymostatin (see paper)
33% identity, 96% coverage: 9:509/521 of query aligns to 8:477/487 of 1m21A

query
sites
1m21A
M
 
V
A
 
A
E
 
D
A
 
L
L
 
Q
A
 
A
G
 
R
L
 
M
R
 
T
A
 
A
G
 
G
E
 
E
F
 
L
T
 
D
A
 
S
T
 
T
E
 
T
L
 
L
T
 
T
E
 
Q
A
 
A
H
 
Y
L
 
L
R
 
Q
A
 
R
V
 
I
E
 
A
A
 
A
T
 
L
R
 
D
G
 
R
-
 
T
-
 
G
-
 
P
-
 
R
L
 
L
N
 
R
I
 
A
F
 
V
I
 
I
T
 
E
E
 
L
T
 
N
A
 
P
D
 
D
I
 
A
A
 
L
L
 
K
R
 
E
Q
 
A
A
 
A
K
 
E
A
 
R
A
 
D
D
 
R
E
 
E
R
 
R
Y
 
R
A
 
D
A
 
G
G
 
R
T
 
L
A
 
R
L
 
G
P
 
P
M
 
L
D
 
H
G
 
G
L
 
I
P
 
P
I
 
L
A
 
L
V
 
L
K
|
K
D
 
D
L
 
N
F
 
I
C
 
N
T
 
A
E
 
A
G
 
P
V
 
M
L
 
A
T
 
T
T
 
S
A
 
A
A
 
G
S
 
S
H
 
L
I
 
A
L
 
L
D
 
Q
G
 
G
F
 
F
K
 
R
P
 
P
P
 
D
Y
 
-
E
 
D
S
 
A
S
 
Y
V
 
L
T
 
V
A
 
R
N
 
R
L
 
L
W
 
R
R
 
D
D
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
V
M
 
V
L
 
L
G
 
G
K
 
K
V
 
T
N
 
N
L
 
L
D
 
S
E
 
E
F
 
W
A
|
A
M
x
N
G
x
F
S
 
R
A
 
G
N
 
N
I
 
D
T
 
S
S
 
-
Y
 
-
Y
 
-
G
 
-
P
 
-
V
 
-
I
 
I
S
 
S
P
 
G
W
 
W
S
 
S
-
 
A
K
 
R
G
 
G
R
 
G
R
 
Q
V
 
T
Q
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
S
 
-
E
 
-
V
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
-
R
 
R
Q
 
N
P
 
P
Q
 
Y
P
 
R
V
 
I
T
 
S
E
 
H
W
 
-
E
 
-
W
 
-
E
 
-
R
 
-
R
 
-
L
 
-
V
 
S
P
 
P
G
x
C
G
|
G
S
|
S
S
|
S
G
 
S
G
 
G
S
 
S
A
 
A
A
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
A
R
 
N
V
 
L
A
 
A
M
 
S
A
 
V
A
 
A
T
 
I
G
 
G
T
|
T
D
 
E
T
|
T
G
x
D
G
|
G
S
|
S
I
 
I
R
 
V
Q
x
C
P
 
P
A
 
A
S
 
A
F
 
I
V
 
N
G
 
G
I
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
K
 
K
P
 
P
T
 
T
Y
 
V
G
 
G
R
 
L
C
 
V
S
 
S
R
 
R
W
 
D
G
 
G
I
 
I
V
 
I
A
 
P
F
x
I
A
 
S
S
 
F
S
 
S
L
 
Q
D
 
D
Q
 
T
A
 
A
G
 
G
P
 
P
M
 
M
T
 
A
R
 
R
T
 
S
V
 
V
R
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
A
I
 
A
M
 
V
L
 
L
R
 
T
S
 
A
M
 
I
A
 
A
G
 
G
F
 
R
D
 
D
P
 
D
K
 
A
D
 
D
S
 
P
T
 
A
S
 
T
A
 
A
D
 
T
V
 
M
P
 
P
-
 
G
-
 
R
-
 
A
V
 
V
P
 
Y
D
 
D
Y
 
Y
E
 
T
K
 
A
A
 
R
I
 
L
T
 
D
G
 
P
D
 
Q
-
 
G
I
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
K
R
 
R
V
 
I
G
 
G
I
 
L
P
 
L
R
 
Q
-
 
T
-
 
P
-
 
L
-
 
L
E
 
K
Y
 
Y
R
 
R
V
 
-
D
 
-
G
 
G
M
 
M
P
 
P
A
 
P
E
 
-
I
 
-
D
 
-
R
 
-
L
 
L
W
 
I
Q
 
E
Q
 
Q
G
 
A
V
 
A
E
 
T
W
 
E
L
 
L
K
 
R
A
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
V
P
 
V
V
 
V
E
 
P
I
 
V
S
 
E
L
 
L
P
 
P
H
 
N
T
 
Q
K
 
G
Y
 
A
A
 
W
L
 
A
P
 
E
A
 
A
Y
 
E
Y
x
R
I
 
T
V
 
L
A
x
L
P
 
L
A
 
Y
E
 
E
A
 
F
S
 
K
S
 
A
N
 
G
L
 
L
A
 
E
R
 
R
Y
 
Y
-
 
F
D
 
N
G
 
T
V
 
H
R
 
R
F
 
A
G
 
P
L
 
L
R
 
R
V
 
S
E
 
L
G
 
A
K
 
D
D
 
L
L
 
I
K
 
A
E
 
F
M
 
N
Y
 
Q
E
 
A
N
 
H
T
 
S
R
 
K
G
 
Q
E
 
E
-
 
L
-
 
G
G
 
L
F
 
F
G
 
G
R
 
Q
E
 
E
V
 
-
R
 
-
R
 
-
R
 
-
I
 
-
L
|
L
I
 
L
G
 
V
T
 
E
Y
 
A
V
 
D
L
 
A
S
 
T
A
 
A
G
 
G
Y
 
L
Y
 
A
D
 
D
A
 
P
Y
 
A
Y
 
Y
L
 
I
K
 
R
A
 
A
Q
 
R
K
 
S
V
 
D
R
 
A
A
 
R
R
 
R
I
 
L
A
 
A
E
 
G
-
 
P
-
 
E
-
 
G
-
 
I
D
 
D
F
 
A
T
 
A
K
 
L
A
 
A
W
 
A
E
 
H
Q
 
Q
C
 
L
D
 
D
V
 
A
I
 
L
L
 
V
T
 
A
P
 
P
T
 
T
A
 
T
P
 
-
N
 
G
T
 
V
A
 
A
F
 
W
G
 
P
I
 
I
G
 
R
E
 
S
K
 
E
M
 
G
D
 
D
D
 
D
P
 
-
I
 
-
A
 
-
M
 
-
Y
x
F
L
 
P
N
 
G
D
 
E
V
 
S
F
 
Y
T
 
S
V
 
A
P
 
-
A
 
A
N
 
A
L
 
V
A
 
A
G
 
G
L
 
Y
P
 
P
G
 
S
L
 
L
S
 
T
V
 
V
P
 
P
A
 
M
G
 
G
L
 
-
A
 
Q
A
 
I
N
 
D
G
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
V
G
 
G
L
 
L
Q
 
L
L
 
F
V
 
M
G
 
G
R
 
T
P
 
A
F
 
W
D
 
S
E
 
E
A
 
P
T
 
K
L
 
L
I
 
I
R
 
E
T
 
M
A
 
A
A
 
Y
V
 
A
L
 
Y
E
 
E
Q
 
Q

Q84DC4 Mandelamide hydrolase; EC 3.5.1.86 from Pseudomonas putida (Arthrobacter siderocapsulatus) (see 2 papers)
30% identity, 98% coverage: 7:517/521 of query aligns to 28:496/507 of Q84DC4

query
sites
Q84DC4
L
 
L
T
 
T
M
 
L
A
x
T
E
 
E
A
 
A
L
 
S
A
 
A
G
 
L
L
 
V
R
 
R
A
 
H
G
 
R
E
 
R
F
 
I
T
 
T
A
 
S
T
 
R
E
 
Q
L
 
L
T
 
V
E
 
E
A
 
A
H
 
W
L
 
L
R
 
S
A
 
R
V
 
I
E
 
A
A
 
D
T
 
F
R
 
S
G
 
E
L
 
L
N
 
N
I
 
A
F
 
F
I
 
I
T
 
S
E
 
V
T
 
D
A
 
A
D
 
A
I
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
K
Q
 
Q
A
 
A
K
 
D
A
 
S
A
 
Y
D
 
D
E
 
H
R
 
Y
Y
 
L
-
 
E
A
 
A
A
 
G
G
 
G
T
 
D
A
 
P
L
 
L
P
 
P
M
 
L
D
 
G
G
 
G
L
 
V
P
 
P
I
 
I
A
 
A
V
 
V
K
|
K
D
 
D
L
 
N
F
 
I
C
 
Q
T
 
V
E
 
V
G
 
G
V
 
F
L
 
A
T
 
N
T
 
T
A
 
A
A
 
G
S
 
T
H
 
P
I
 
A
L
 
L
D
 
S
G
 
K
F
 
F
K
 
F
P
 
P
P
 
T
Y
 
C
E
 
N
S
 
A
S
 
R
V
 
V
T
 
I
A
 
E
N
 
P
L
 
L
W
 
L
R
 
K
D
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
I
M
 
V
L
 
V
G
 
G
K
 
K
V
 
T
N
 
N
L
 
M
D
 
H
E
 
E
F
 
L
A
 
A
M
 
F
G
 
G
S
 
T
A
 
S
N
 
G
I
 
Y
-
 
N
T
 
T
S
 
A
Y
 
Y
Y
 
H
G
 
I
P
 
P
V
 
-
I
 
-
S
 
-
P
 
-
W
 
-
S
 
-
K
 
-
G
 
-
R
 
-
R
 
-
V
 
-
Q
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
-
G
 
G
V
 
V
L
 
I
S
 
G
E
 
-
V
 
V
A
 
R
E
 
N
A
 
A
F
 
F
R
 
-
Q
 
-
P
 
-
Q
 
-
P
 
-
V
 
-
T
 
-
E
 
-
W
 
-
E
 
-
W
 
-
E
 
D
R
 
H
R
 
S
L
 
C
V
 
I
P
 
A
G
 
G
G
 
G
S
|
S
S
|
S
G
 
S
G
 
G
S
 
S
A
 
G
A
 
T
A
 
A
V
 
V
A
 
G
A
 
A
R
 
L
V
 
L
A
 
I
M
 
P
A
 
A
A
 
A
T
 
L
G
 
G
T
 
T
D
 
D
T
 
T
G
|
G
G
 
G
S
|
S
I
 
V
R
 
R
Q
|
Q
P
 
P
A
 
G
S
 
A
F
 
V
V
 
N
G
 
G
I
 
C
V
 
V
G
 
G
L
 
F
K
 
R
P
 
P
T
 
T
Y
 
V
G
 
G
R
 
R
C
 
Y
S
 
P
R
 
V
W
 
D
G
 
G
I
 
I
V
 
T
A
 
P
F
 
I
A
 
S
S
 
P
S
 
T
L
 
R
D
 
D
Q
 
T
A
 
P
G
 
G
P
 
P
M
 
I
T
 
A
R
 
R
T
 
S
V
 
V
R
 
E
D
 
D
A
 
I
A
 
V
I
 
L
M
 
L
L
 
D
R
 
S
S
 
I
M
 
I
A
 
T
G
 
G
F
 
A
D
 
L
P
 
P
K
 
A
D
 
E
S
 
-
T
 
-
S
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
-
P
 
-
V
 
V
P
 
P
D
 
A
Y
 
A
E
 
E
K
 
S
A
 
I
I
 
R
T
 
L
G
 
G
D
 
V
I
 
V
R
 
D
G
 
Q
L
 
L
R
 
W
V
 
A
G
 
D
I
 
L
P
 
S
R
 
E
E
 
P
Y
 
V
R
 
R
V
 
K
D
 
L
G
 
T
M
 
E
P
 
D
A
 
A
E
 
-
I
 
L
D
 
R
R
 
K
L
 
L
W
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
-
 
Q
-
 
I
-
 
V
-
 
R
-
 
V
-
 
S
-
 
M
-
 
S
E
 
E
W
 
I
L
 
F
K
 
E
A
 
M
A
x
S
G
 
H
A
 
A
V
 
V
P
 
S
V
 
M
E
 
P
I
 
L
S
 
A
L
 
L
P
 
H
H
 
E
T
 
C
K
 
R
Y
 
S
A
 
A
L
 
L
P
 
T
A
 
E
Y
 
Y
Y
 
L
I
 
-
V
 
-
A
 
-
P
 
-
A
 
-
E
 
S
A
 
A
S
 
N
S
 
E
N
 
T
L
 
G
A
 
V
R
 
S
Y
 
F
D
 
D
G
 
E
V
 
L
R
 
V
F
 
A
G
 
G
L
 
-
R
 
-
V
 
I
E
 
S
G
 
S
K
 
P
D
 
D
L
 
V
K
 
R
E
 
T
M
 
I
Y
 
F
E
 
E
N
 
D
T
 
Y
R
 
I
G
 
L
E
 
P
G
 
G
F
 
R
G
 
L
R
 
G
E
 
E
V
 
L
R
 
E
R
 
G
R
 
Q
I
 
-
L
 
-
I
 
-
G
 
-
T
 
-
Y
 
-
V
 
-
L
 
-
S
 
S
A
 
V
G
 
D
Y
 
L
Y
 
E
D
x
Q
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
A
L
 
T
K
 
A
A
 
M
Q
 
K
K
 
D
V
 
A
R
 
R
A
 
P
R
 
K
I
 
L
A
 
I
E
 
Q
D
 
S
F
 
F
T
 
E
K
 
F
A
 
L
W
 
F
E
 
K
-
 
E
-
 
H
Q
 
Q
C
 
L
D
 
D
V
 
A
I
 
I
L
 
I
T
 
H
P
 
P
T
 
T
A
 
T
P
 
P
N
 
D
T
 
L
A
 
A
F
 
I
G
 
-
I
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
-
M
 
K
D
 
S
D
 
N
P
 
P
I
 
A
A
 
A
M
 
T
Y
 
S
L
 
F
N
 
E
D
 
A
V
 
F
F
 
A
T
 
R
V
 
M
-
x
I
-
 
R
-
 
N
-
 
A
-
 
D
P
 
P
A
 
A
N
 
S
L
 
N
A
 
A
G
 
G
L
 
M
P
 
P
G
 
G
L
 
I
S
 
S
V
 
L
P
 
P
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
S
A
 
Q
N
 
Q
-
 
E
G
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
V
G
 
G
L
 
I
Q
 
E
L
 
I
V
 
E
G
 
G
R
 
L
P
 
P
F
 
G
D
 
S
E
 
D
A
 
A
T
 
R
L
 
L
I
 
L
R
 
S
T
 
I
A
 
A
A
 
N
V
 
F
L
 
I
E
 
E
Q
 
S
A
 
I
A
 
L
G
 
G
P
 
R
Q
 
G
P
 
P
L
 
T
P
 
P

6diiH Structure of arabidopsis fatty acid amide hydrolase in complex with methyl linolenyl fluorophosphonate (see paper)
28% identity, 89% coverage: 48:511/521 of query aligns to 174:591/616 of 6diiH

query
sites
6diiH
A
 
A
D
 
N
I
 
E
A
 
V
L
 
I
R
 
K
Q
 
Q
A
 
A
K
 
E
A
 
A
A
 
S
D
 
T
E
 
R
R
 
R
Y
 
F
A
 
E
A
 
Q
G
 
G
T
 
N
A
 
P
L
 
I
P
 
S
-
 
V
M
 
L
D
 
D
G
 
G
L
 
I
P
 
F
I
 
V
A
 
T
V
 
I
K
 
K
D
 
D
-
 
D
L
 
I
F
 
D
C
 
C
T
 
L
E
 
P
G
 
H
V
 
P
L
 
T
T
 
N
T
 
G
A
 
G
A
 
T
S
 
T
H
 
W
I
 
L
L
 
H
D
 
E
G
 
D
F
 
R
K
 
S
P
 
V
P
 
E
Y
 
K
E
 
D
S
 
S
S
 
A
V
 
V
T
 
V
A
 
S
N
 
K
L
 
L
W
 
R
R
 
S
D
 
C
G
 
G
A
 
A
V
 
I
M
 
L
L
 
L
G
 
G
K
 
K
V
 
A
N
 
N
L
 
M
D
 
H
E
 
E
F
 
L
A
x
G
M
 
M
G
 
G
S
x
T
A
 
T
N
 
G
I
 
N
T
 
N
S
 
S
Y
 
N
Y
 
Y
G
 
G
P
 
T
V
 
T
I
 
R
S
 
N
P
 
P
W
 
H
S
 
D
K
 
P
G
 
K
R
 
R
R
 
Y
V
 
T
Q
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
S
 
-
E
 
-
V