SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012568157.1 NCBI__GCF_000016185.1:WP_012568157.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

O50657 Lysine/ornithine decarboxylase; LDC; EC 4.1.1.17; EC 4.1.1.18 from Selenomonas ruminantium (see paper)
37% identity, 98% coverage: 1:368/376 of query aligns to 6:363/393 of O50657

query
sites
O50657
M
 
L
T
 
S
E
 
E
K
 
K
I
 
E
A
 
V
R
 
K
F
 
T
F
 
L
A
 
A
E
 
K
N
 
R
R
 
I
P
 
P
A
 
-
T
 
T
P
 
P
C
 
F
L
 
L
V
 
V
V
 
A
D
 
S
L
 
L
D
 
D
V
 
K
V
 
V
A
 
E
R
 
E
N
 
N
Y
 
Y
D
 
Q
R
 
F
L
 
M
S
 
R
G
 
R
A
 
H
L
 
L
P
 
P
D
 
R
A
|
A
K
x
G
I
x
V
Y
 
F
Y
 
Y
A
 
A
V
 
M
K
 
K
A
 
A
N
 
N
P
|
P
A
 
T
P
 
P
E
 
E
I
 
I
L
 
L
R
 
S
L
 
L
L
 
L
T
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
S
S
 
H
F
 
F
D
 
D
T
 
V
A
 
A
S
 
S
V
 
A
P
 
G
E
 
E
I
 
M
E
 
E
D
 
I
C
 
L
L
 
H
A
 
E
A
 
L
G
 
G
A
 
V
T
 
D
P
 
G
D
 
S
R
 
Q
I
 
M
S
 
I
Y
 
Y
G
 
A
N
 
N
T
 
P
I
 
V
K
 
K
K
 
D
A
 
A
A
 
R
D
 
G
I
 
L
R
 
K
R
 
A
A
 
A
Y
 
A
E
 
D
L
 
Y
G
 
N
V
 
V
R
 
R
L
 
R
F
 
F
A
 
T
F
 
F
D
 
D
S
 
D
E
 
P
A
 
S
E
 
E
L
 
I
E
 
D
K
 
K
I
 
M
A
 
A
A
 
K
N
 
A
A
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
A
R
 
D
V
 
V
F
 
L
C
 
V
R
 
R
I
 
I
L
 
A
T
 
V
S
 
R
G
 
N
E
 
N
G
 
K
A
 
A
D
 
L
W
 
V
P
 
D
L
 
L
S
 
N
R
 
T
K
 
K
F
 
F
G
 
G
C
 
A
D
 
P
P
 
V
E
 
E
M
 
E
A
 
A
R
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
L
L
 
K
R
 
A
A
 
A
A
 
Q
A
 
D
L
 
A
D
 
G
V
 
L
V
 
H
P
 
A
Y
 
M
G
 
G
V
 
I
S
 
C
F
 
F
H
 
H
V
 
V
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
S
R
 
L
D
 
S
L
 
T
A
 
A
Q
 
A
W
 
Y
D
 
E
A
 
E
A
 
A
L
 
L
S
 
L
T
 
V
T
 
A
A
 
R
A
 
R
I
 
L
F
 
F
R
 
D
D
 
E
L
 
A
E
 
E
E
 
E
K
 
M
G
 
G
V
 
M
A
 
H
L
 
L
R
 
T
M
 
D
V
 
L
N
 
D
M
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
F
 
F
P
 
P
T
 
V
R
 
-
Y
 
-
R
 
-
T
 
P
D
 
D
V
 
A
P
 
K
G
 
G
T
 
L
D
 
N
E
 
V
Y
 
D
G
 
L
F
 
A
A
 
A
I
 
M
D
 
M
E
 
E
A
 
A
L
 
I
R
 
N
R
 
K
H
 
Q
F
 
I
G
 
D
N
 
R
R
 
L
I
 
F
P
 
P
E
 
D
T
 
T
I
 
A
V
 
V
-
 
W
-
 
T
E
 
E
P
 
P
G
 
G
R
 
R
G
 
Y
M
 
M
V
 
C
G
 
G
D
 
T
A
 
A
G
 
V
I
 
N
I
 
L
Q
 
V
S
 
T
E
 
S
V
 
V
V
 
I
L
 
G
I
 
T
S
 
K
R
 
T
K
 
R
S
 
G
A
 
E
N
 
-
D
 
-
L
 
-
R
 
Q
R
 
P
W
 
W
V
 
Y
Y
 
I
L
 
L
D
 
D
I
 
E
G
 
G
K
 
I
F
 
Y
G
 
G
G
 
C
L
 
F
A
 
S
E
 
G
T
 
I
M
 
M
D
 
Y
E
 
D
A
 
H
I
 
W
Q
 
T
Y
 
Y
P
 
P
I
 
L
E
 
H
T
 
C
E
 
F
R
 
G
D
 
K
G
 
G
G
 
N
P
 
-
A
 
K
E
 
K
P
 
P
V
 
S
I
 
T
L
 
F
A
x
G
G
 
G
P
 
P
T
x
S
C
 
C
D
 
D
S
 
G
A
x
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
Y
 
Y
E
 
R
R
 
-
A
 
-
E
 
D
Y
 
F
R
 
M
L
 
A
P
 
P
V
 
-
D
 
E
L
 
L
R
 
K
I
 
I
G
 
G
D
 
D
R
 
K
V
 
V
A
 
L
I
 
V
R
 
T
A
 
E
T
 
M
G
|
G
A
 
S
Y
 
Y
T
 
-
T
 
T
S
 
S
Y
 
V
S
 
S
A
 
A
V
 
T
N
 
R
F
 
F
N
 
N
G
 
G
F
 
F

5gjoA Crystal structure of srldc mutant (a225c/t302c) in complex with plp (see paper)
37% identity, 98% coverage: 1:368/376 of query aligns to 7:364/385 of 5gjoA

query
sites
5gjoA
M
 
L
T
 
S
E
 
E
K
 
K
I
 
E
A
 
V
R
 
K
F
 
T
F
 
L
A
 
A
E
 
K
N
 
R
R
 
I
P
 
P
A
 
-
T
 
T
P
 
P
C
 
F
L
 
L
V
 
V
V
 
A
D
 
S
L
 
L
D
 
D
V
 
K
V
 
V
A
 
E
R
 
E
N
 
N
Y
 
Y
D
 
Q
R
 
F
L
 
M
S
 
R
G
 
R
A
 
H
L
 
L
P
 
P
D
 
R
A
 
A
K
 
G
I
 
V
Y
 
F
Y
 
Y
A
|
A
V
 
M
K
|
K
A
 
A
N
 
N
P
 
P
A
 
T
P
 
P
E
 
E
I
 
I
L
 
L
R
 
S
L
 
L
L
 
L
T
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
S
S
 
H
F
 
F
D
|
D
T
 
V
A
 
A
S
 
S
V
 
A
P
 
G
E
 
E
I
 
M
E
 
E
D
 
I
C
 
L
L
 
H
A
 
E
A
 
L
G
 
G
A
 
V
T
 
D
P
 
G
D
 
S
R
 
Q
I
 
M
S
 
I
Y
 
Y
G
 
A
N
 
N
T
 
P
I
 
V
K
 
K
K
 
D
A
 
A
A
 
R
D
 
G
I
 
L
R
 
K
R
 
A
A
 
A
Y
 
A
E
 
D
L
 
Y
G
 
N
V
 
V
R
 
R
L
 
R
F
 
F
A
 
T
F
 
F
D
 
D
S
 
D
E
 
P
A
 
S
E
 
E
L
 
I
E
 
D
K
 
K
I
 
M
A
 
A
A
 
K
N
 
A
A
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
A
R
 
D
V
 
V
F
 
L
C
 
V
R
 
R
I
 
I
L
 
A
T
 
V
S
 
R
G
 
N
E
 
N
G
 
K
A
 
A
D
 
L
W
 
V
P
 
D
L
 
L
S
 
N
R
 
T
K
 
K
F
 
F
G
 
G
C
 
A
D
 
P
P
 
V
E
 
E
M
 
E
A
 
A
R
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
L
L
 
K
R
 
A
A
 
A
A
 
Q
A
 
D
L
 
A
D
 
G
V
 
L
V
 
H
P
 
A
Y
 
M
G
 
G
V
 
I
S
 
C
F
 
F
H
|
H
V
 
V
G
 
G
S
|
S
Q
 
Q
Q
 
S
R
 
L
D
 
S
L
 
T
A
 
A
Q
 
A
W
 
Y
D
 
E
A
 
E
A
 
A
L
 
L
S
 
L
T
 
V
T
 
A
A
 
R
A
 
R
I
 
L
F
 
F
R
 
D
D
 
E
L
 
A
E
 
E
E
 
E
K
 
M
G
 
G
V
 
M
A
 
H
L
 
L
R
 
T
M
 
D
V
 
L
N
 
D
M
 
I
G
 
G
G
|
G
G
|
G
F
 
F
P
 
P
T
 
V
R
 
-
Y
 
-
R
 
-
T
 
P
D
 
D
V
 
C
P
 
K
G
 
G
T
 
L
D
 
N
E
 
V
Y
 
D
G
 
L
F
 
A
A
 
A
I
 
M
D
 
M
E
 
E
A
 
A
L
 
I
R
 
N
R
 
K
H
 
Q
F
 
I
G
 
D
N
 
R
R
 
L
I
 
F
P
 
P
E
 
D
T
 
T
I
 
A
V
 
V
-
 
W
-
 
T
E
|
E
P
 
P
G
|
G
R
|
R
G
 
Y
M
 
M
V
 
C
G
 
G
D
 
T
A
 
A
G
 
V
I
 
N
I
 
L
Q
 
V
S
 
T
E
 
S
V
 
V
V
 
I
L
 
G
I
 
T
S
 
K
R
 
T
K
 
R
S
 
G
A
 
E
N
 
-
D
 
-
L
 
-
R
 
Q
R
 
P
W
 
W
V
 
Y
Y
 
I
L
 
L
D
 
D
I
 
E
G
 
G
K
 
I
F
 
Y
G
 
G
G
 
C
L
 
F
A
 
S
E
 
G
T
 
I
M
 
M
D
 
Y
E
 
D
A
 
H
I
 
W
Q
 
C
Y
 
Y
P
 
P
I
 
L
E
 
H
T
 
C
E
 
F
R
 
G
D
 
K
G
 
G
G
 
N
P
 
-
A
 
K
E
 
K
P
 
P
V
 
S
I
 
T
L
 
F
A
 
G
G
 
G
P
 
P
T
 
S
C
 
C
D
 
D
S
 
G
A
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
Y
 
Y
E
 
R
R
 
-
A
 
-
E
 
D
Y
 
F
R
 
M
L
 
A
P
 
P
V
 
-
D
 
E
L
 
L
R
 
K
I
 
I
G
 
G
D
 
D
R
 
K
V
 
V
A
 
L
I
 
V
R
 
T
A
 
E
T
 
M
G
 
G
A
 
S
Y
|
Y
T
 
-
T
 
T
S
 
S
Y
 
V
S
 
S
A
 
A
V
 
T
N
 
R
F
 
F
N
 
N
G
 
G
F
 
F

5gjpA Crystal structure of srldc in complex with plp and cadaverine (see paper)
37% identity, 98% coverage: 1:368/376 of query aligns to 6:355/381 of 5gjpA

query
sites
5gjpA
M
 
L
T
 
S
E
 
E
K
 
K
I
 
E
A
 
V
R
 
K
F
 
T
F
 
L
A
 
A
E
 
K
N
 
R
R
 
I
P
 
P
A
 
-
T
 
T
P
 
P
C
 
F
L
 
L
V
 
V
V
 
A
D
 
S
L
 
L
D
 
D
V
 
K
V
 
V
A
 
E
R
 
E
N
 
N
Y
 
Y
D
 
Q
R
 
F
L
 
M
S
 
R
G
 
R
A
 
H
L
 
L
P
 
P
D
 
R
A
 
A
K
 
G
I
 
V
Y
 
F
Y
 
Y
A
|
A
V
 
M
K
|
K
A
 
A
N
 
N
P
 
P
A
 
T
P
 
P
E
 
E
I
 
I
L
 
L
R
 
S
L
 
L
L
 
L
T
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
S
S
 
H
F
 
F
D
 
D
T
 
V
A
 
A
S
 
S
V
 
A
P
 
G
E
 
E
I
 
M
E
 
E
D
 
I
C
 
L
L
 
H
A
 
E
A
 
L
G
 
G
A
 
V
T
 
D
P
 
G
D
 
S
R
 
Q
I
 
M
S
 
I
Y
 
Y
G
 
A
N
 
N
T
 
P
I
 
V
K
 
K
K
 
D
A
 
A
A
 
R
D
 
G
I
 
L
R
 
K
R
 
A
A
 
A
Y
 
A
E
 
D
L
 
Y
G
 
N
V
 
V
R
 
R
L
 
R
F
 
F
A
 
T
F
 
F
D
 
D
S
 
D
E
 
P
A
 
S
E
 
E
L
 
I
E
 
D
K
 
K
I
 
M
A
 
A
A
 
K
N
 
A
A
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
A
R
 
D
V
 
V
F
 
L
C
 
V
R
 
R
I
 
I
L
 
A
T
 
V
S
 
R
G
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
-
W
 
-
P
 
-
L
 
-
S
 
N
R
 
T
K
 
K
F
 
F
G
 
G
C
 
A
D
 
P
P
 
V
E
 
E
M
 
E
A
 
A
R
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
L
L
 
K
R
 
A
A
 
A
A
 
Q
A
 
D
L
 
A
D
 
G
V
 
L
V
 
H
P
 
A
Y
 
M
G
 
G
V
 
I
S
 
C
F
 
F
H
|
H
V
 
V
G
 
G
S
|
S
Q
 
Q
Q
 
S
R
 
L
D
 
S
L
 
T
A
 
A
Q
 
A
W
 
Y
D
 
E
A
 
E
A
 
A
L
 
L
S
 
L
T
 
V
T
 
A
A
 
R
A
 
R
I
 
L
F
 
F
R
 
D
D
 
E
L
 
A
E
 
E
E
 
E
K
 
M
G
 
G
V
 
M
A
 
H
L
 
L
R
 
T
M
 
D
V
 
L
N
 
D
M
 
I
G
 
G
G
 
G
G
|
G
F
 
F
P
 
P
T
 
V
R
 
-
Y
 
-
R
 
-
T
 
P
D
 
D
V
 
A
P
 
K
G
 
G
T
 
L
D
 
N
E
 
V
Y
 
D
G
 
L
F
 
A
A
 
A
I
 
M
D
 
M
E
 
E
A
 
A
L
 
I
R
 
N
R
 
K
H
 
Q
F
 
I
G
 
D
N
 
R
R
 
L
I
 
F
P
 
P
E
 
D
T
 
T
I
 
A
V
 
V
-
 
W
-
 
T
E
|
E
P
 
P
G
|
G
R
|
R
G
 
Y
M
 
M
V
 
C
G
 
G
D
 
T
A
 
A
G
 
V
I
 
N
I
 
L
Q
 
V
S
 
T
E
 
S
V
 
V
V
 
I
L
 
G
I
 
T
S
 
K
R
 
T
K
 
R
S
 
G
A
 
E
N
 
-
D
 
-
L
 
-
R
 
Q
R
 
P
W
 
W
V
 
Y
Y
 
I
L
 
L
D
 
D
I
 
E
G
 
G
K
 
I
F
 
Y
G
 
G
G
 
C
L
 
F
A
 
S
E
 
G
T
 
I
M
 
M
D
x
Y
E
x
D
A
 
H
I
 
W
Q
 
T
Y
 
Y
P
 
P
I
 
L
E
 
H
T
 
C
E
 
F
R
 
G
D
 
K
G
 
G
G
 
N
P
 
-
A
 
K
E
 
K
P
 
P
V
 
S
I
 
T
L
 
F
A
 
G
G
 
G
P
 
P
T
 
S
C
 
C
D
 
D
S
 
G
A
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
Y
 
Y
E
 
R
R
 
-
A
 
-
E
 
D
Y
 
F
R
 
M
L
 
A
P
 
P
V
 
-
D
 
E
L
 
L
R
 
K
I
 
I
G
 
G
D
 
D
R
 
K
V
 
V
A
 
L
I
 
V
R
 
T
A
 
E
T
 
M
G
 
G
A
 
S
Y
|
Y
T
 
-
T
 
T
S
 
S
Y
 
V
S
 
S
A
 
A
V
 
T
N
 
R
F
 
F
N
 
N
G
 
G
F
 
F

5gjnA Crystal structure of lysine decarboxylase from selenomonas ruminantium in p43212 space group (see paper)
37% identity, 98% coverage: 1:368/376 of query aligns to 6:352/369 of 5gjnA

query
sites
5gjnA
M
 
L
T
 
S
E
 
E
K
 
K
I
 
E
A
 
V
R
 
K
F
 
T
F
 
L
A
 
A
E
 
K
N
 
R
R
 
I
P
 
P
A
 
-
T
 
T
P
 
P
C
 
F
L
 
L
V
 
V
V
 
A
D
 
S
L
 
L
D
 
D
V
 
K
V
 
V
A
 
E
R
 
E
N
 
N
Y
 
Y
D
 
Q
R
 
F
L
 
M
S
 
R
G
 
R
A
 
H
L
 
L
P
 
P
D
 
R
A
 
A
K
 
G
I
 
V
Y
 
F
Y
 
Y
A
 
A
V
 
M
K
|
K
A
 
A
N
 
N
P
 
P
A
 
T
P
 
P
E
 
E
I
 
I
L
 
L
R
 
S
L
 
L
L
 
L
T
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
S
S
 
H
F
 
F
D
 
D
T
 
V
A
 
A
S
 
S
V
 
A
P
 
G
E
 
E
I
 
M
E
 
E
D
 
I
C
 
L
L
 
H
A
 
E
A
 
L
G
 
G
A
 
V
T
 
D
P
 
G
D
 
S
R
 
Q
I
 
M
S
 
I
Y
 
Y
G
 
A
N
 
N
T
 
P
I
 
V
K
 
K
K
 
D
A
 
A
A
 
R
D
 
G
I
 
L
R
 
K
R
 
A
A
 
A
Y
 
A
E
 
D
L
 
Y
G
 
N
V
 
V
R
 
R
L
 
R
F
 
F
A
 
T
F
 
F
D
 
D
S
 
D
E
 
P
A
 
S
E
 
E
L
 
I
E
 
D
K
 
K
I
 
M
A
 
A
A
 
K
N
 
A
A
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
A
R
 
D
V
 
V
F
 
L
C
 
V
R
 
R
I
 
I
L
 
-
T
 
-
S
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
-
W
 
-
P
 
A
L
 
V
S
 
R
R
 
T
K
 
K
F
 
F
G
 
G
C
 
A
D
 
P
P
 
V
E
 
E
M
 
E
A
 
A
R
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
L
L
 
K
R
 
A
A
 
A
A
 
Q
A
 
D
L
 
A
D
 
G
V
 
L
V
 
H
P
 
A
Y
 
M
G
 
G
V
 
I
S
 
C
F
 
F
H
|
H
V
 
V
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
S
R
 
L
D
 
S
L
 
T
A
 
A
Q
 
A
W
 
Y
D
 
E
A
 
E
A
 
A
L
 
L
S
 
L
T
 
V
T
 
A
A
 
R
A
 
R
I
 
L
F
 
F
R
 
D
D
 
E
L
 
A
E
 
E
E
 
E
K
 
M
G
 
G
V
 
M
A
 
H
L
 
L
R
 
T
M
 
D
V
 
L
N
 
D
M
 
I
G
 
G
G
 
G
G
|
G
F
 
F
P
 
P
T
 
V
R
 
P
Y
 
D
R
 
A
T
 
L
D
 
N
V
 
V
P
 
D
G
 
L
T
 
A
D
 
-
E
 
-
Y
 
-
G
 
-
F
 
-
A
 
A
I
 
M
D
 
M
E
 
E
A
 
A
L
 
I
R
 
N
R
 
K
H
 
Q
F
 
I
G
 
D
N
 
R
R
 
L
I
x
F
P
|
P
E
x
D
T
|
T
I
 
A
V
 
V
-
 
W
-
 
T
E
|
E
P
 
P
G
 
G
R
 
R
G
x
Y
M
 
M
V
 
C
G
 
G
D
 
T
A
 
A
G
 
V
I
 
N
I
 
L
Q
 
V
S
 
T
E
 
S
V
 
V
V
 
-
L
 
-
I
 
I
S
 
G
R
 
T
K
 
K
S
 
T
A
 
R
N
 
G
D
 
E
L
 
-
R
 
Q
R
 
P
W
 
W
V
 
Y
Y
 
I
L
 
L
D
 
D
I
 
E
G
 
G
K
 
I
F
 
Y
G
 
G
G
 
C
L
 
F
A
 
S
E
 
G
T
 
I
M
 
M
D
 
Y
E
 
D
A
 
H
I
 
W
Q
 
T
Y
 
Y
P
 
P
I
 
L
E
 
H
T
 
C
E
 
F
R
 
G
D
 
K
G
 
G
G
 
N
P
 
-
A
 
K
E
 
K
P
 
P
V
 
S
I
 
T
L
 
F
A
 
G
G
 
G
P
 
P
T
 
S
C
 
C
D
 
D
S
 
G
A
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
Y
 
Y
E
 
R
R
 
-
A
 
-
E
 
D
Y
 
F
R
 
M
L
 
A
P
 
P
V
 
-
D
 
E
L
 
L
R
 
K
I
 
I
G
 
G
D
 
D
R
 
K
V
 
V
A
 
L
I
 
V
R
 
T
A
 
E
T
 
M
G
 
G
A
 
S
Y
 
Y
T
 
-
T
 
T
S
 
S
Y
 
V
S
 
S
A
 
A
V
 
T
N
 
R
F
 
F
N
 
N
G
 
G
F
 
F

2pljA Crystal structure of lysine/ornithine decarboxylase complexed with putrescine from vibrio vulnificus (see paper)
35% identity, 94% coverage: 17:368/376 of query aligns to 30:364/376 of 2pljA

query
sites
2pljA
P
 
P
C
 
L
L
 
L
V
 
L
V
 
L
D
 
D
L
 
C
D
 
D
V
 
V
V
 
I
A
 
R
R
 
Q
N
 
Q
Y
 
Y
D
 
R
R
 
A
L
 
L
S
 
K
G
 
N
A
 
A
L
 
L
P
 
P
D
 
N
A
 
V
K
 
T
I
 
L
Y
 
H
Y
 
Y
A
 
A
V
 
L
K
|
K
A
 
P
N
 
L
P
 
P
A
 
H
P
 
P
E
 
V
I
 
V
L
 
V
R
 
R
L
 
T
L
 
L
T
 
L
G
 
A
L
 
E
G
 
G
S
 
A
S
 
S
F
 
F
D
 
D
T
 
L
A
 
A
S
 
T
V
 
T
P
 
G
E
 
E
I
 
V
E
 
E
D
 
L
C
 
V
L
 
A
A
 
S
A
 
E
G
 
G
A
 
V
T
 
P
P
 
A
D
 
D
R
 
L
I
 
T
S
 
I
Y
 
H
G
 
T
N
 
H
T
 
P
I
 
I
K
 
K
K
 
R
A
 
D
A
 
A
D
 
D
I
 
I
R
 
R
R
 
D
A
 
A
Y
 
L
E
 
A
L
 
Y
G
 
G
V
 
C
R
 
N
L
 
V
F
 
F
A
 
V
F
 
V
D
 
D
S
 
N
E
 
L
A
 
N
E
 
E
L
 
L
E
 
E
K
 
K
I
 
F
A
 
K
A
 
A
N
 
Y
A
 
R
P
 
D
G
 
D
S
 
V
R
 
E
V
 
L
F
 
L
C
 
V
R
 
R
I
 
L
L
 
-
T
 
-
S
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
-
W
 
-
P
 
S
L
 
F
S
 
S
R
 
K
K
 
K
F
 
F
G
 
G
C
 
C
D
 
S
P
 
P
E
 
E
M
 
Q
A
 
A
R
 
L
D
 
V
L
 
I
L
 
I
L
 
E
R
 
T
A
 
A
A
 
K
A
 
E
L
 
W
D
 
N
V
 
I
V
 
R
P
 
I
Y
 
K
G
 
G
V
 
L
S
 
S
F
 
F
H
|
H
V
 
V
G
 
G
S
|
S
Q
 
Q
Q
 
T
R
 
T
D
 
N
L
 
P
A
 
N
Q
 
K
W
 
Y
D
 
V
A
 
E
A
 
A
L
 
I
S
 
H
T
 
T
T
 
C
A
 
R
A
 
H
I
 
V
F
 
M
R
 
E
D
 
Q
L
 
V
E
 
V
E
 
E
K
 
R
G
 
G
V
 
L
-
 
P
A
 
A
L
 
L
R
 
S
M
 
T
V
 
L
N
 
D
M
 
I
G
 
G
G
 
G
G
|
G
F
 
F
P
 
P
T
 
V
R
 
N
Y
 
Y
R
 
T
T
 
Q
D
 
Q
V
 
V
P
 
M
G
 
P
T
 
I
D
 
D
E
 
Q
Y
 
F
G
 
C
F
 
A
A
 
P
I
 
I
D
 
N
E
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
-
R
 
-
H
 
-
F
 
-
G
 
-
N
 
S
R
 
L
I
 
L
P
 
P
E
 
E
T
 
T
I
 
V
-
 
H
-
 
V
-
 
L
V
 
A
E
|
E
P
 
P
G
|
G
R
|
R
G
 
F
M
 
I
V
 
C
G
 
A
D
 
P
A
 
A
G
 
-
I
 
-
I
 
-
Q
 
V
S
 
T
E
 
S
V
 
V
V
 
A
L
 
S
I
 
V
S
 
M
R
 
G
K
 
Q
S
 
A
A
 
E
N
 
R
D
 
E
L
 
G
R
 
Q
R
 
I
W
 
W
V
 
Y
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
I
 
D
G
 
G
K
 
I
F
 
Y
G
 
G
G
 
S
L
 
F
A
 
S
E
 
G
T
 
L
M
 
M
D
 
F
E
x
D
A
 
D
I
 
A
Q
 
R
Y
 
Y
P
 
P
I
 
L
E
 
T
T
 
T
E
 
I
R
 
K
D
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
E
A
 
L
E
 
I
P
 
P
V
 
S
I
 
V
L
 
L
A
 
S
G
 
G
P
 
P
T
 
T
C
 
C
D
 
D
S
 
S
A
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
I
Y
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
A
E
 
E
Y
 
N
R
 
I
L
 
L
P
 
L
V
 
P
D
 
K
L
 
L
R
 
N
I
 
N
G
 
G
D
 
D
R
 
L
V
 
V
A
 
I
I
 
G
R
 
R
A
 
T
T
 
M
G
 
G
A
 
A
Y
|
Y
T
 
T
T
 
S
S
 
A
Y
 
-
S
 
T
A
 
A
V
 
T
N
 
D
F
 
F
N
 
N
G
 
F
F
 
F

2plkA Crystal structure of lysine/ornithine decarboxylase complexed with cadaverine from vibrio vulnificus (see paper)
35% identity, 94% coverage: 17:368/376 of query aligns to 26:359/370 of 2plkA

query
sites
2plkA
P
 
P
C
 
L
L
 
L
V
 
L
V
 
L
D
 
D
L
 
C
D
 
D
V
 
V
V
 
I
A
 
R
R
 
Q
N
 
Q
Y
 
Y
D
 
R
R
 
A
L
 
L
S
 
K
G
 
N
A
 
A
L
 
L
P
 
P
D
 
N
A
 
V
K
 
T
I
 
L
Y
 
H
Y
 
Y
A
 
A
V
 
L
K
|
K
A
 
P
N
 
L
P
 
P
A
 
H
P
 
P
E
 
V
I
 
V
L
 
V
R
 
R
L
 
T
L
 
L
T
 
L
G
 
A
L
 
E
G
 
G
S
 
A
S
 
S
F
 
F
D
 
D
T
 
L
A
 
A
S
 
T
V
 
T
P
 
G
E
 
E
I
 
V
E
 
E
D
 
L
C
 
V
L
 
A
A
 
S
A
 
E
G
 
G
A
 
V
T
 
P
P
 
A
D
 
D
R
 
L
I
 
T
S
 
I
Y
 
H
G
 
T
N
 
H
T
 
P
I
 
I
K
 
K
K
 
R
A
 
D
A
 
A
D
 
D
I
 
I
R
 
R
R
 
D
A
 
A
Y
 
L
E
 
A
L
 
Y
G
 
G
V
 
C
R
 
N
L
 
V
F
 
F
A
 
V
F
 
V
D
 
D
S
 
N
E
 
L
A
 
N
E
 
E
L
 
L
E
 
E
K
 
K
I
 
F
A
 
K
A
 
A
N
 
Y
A
 
R
P
 
D
G
 
D
S
 
V
R
 
E
V
 
L
F
 
L
C
 
V
R
 
R
I
 
L
L
 
S
T
 
F
S
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
-
W
 
-
P
 
-
L
 
-
S
 
-
R
 
K
K
 
K
F
 
F
G
 
G
C
 
C
D
 
S
P
 
P
E
 
E
M
 
Q
A
 
A
R
 
L
D
 
V
L
 
I
L
 
I
L
 
E
R
 
T
A
 
A
A
 
K
A
 
E
L
 
W
D
 
N
V
 
I
V
 
R
P
 
I
Y
 
K
G
 
G
V
 
L
S
 
S
F
 
F
H
|
H
V
 
V
G
 
G
S
|
S
Q
 
Q
Q
 
T
R
 
T
D
 
N
L
 
P
A
 
N
Q
 
K
W
 
Y
D
 
V
A
 
E
A
 
A
L
 
I
S
 
H
T
 
T
T
 
C
A
 
R
A
 
H
I
 
V
F
 
M
R
 
E
D
 
Q
L
 
V
E
 
V
E
 
E
K
 
R
G
 
G
V
 
L
-
 
P
A
 
A
L
 
L
R
 
S
M
 
T
V
 
L
N
 
D
M
 
I
G
 
G
G
 
G
G
|
G
F
 
F
P
 
P
T
 
V
R
 
N
Y
 
Y
R
 
T
T
 
Q
D
 
Q
V
 
V
P
 
M
G
 
P
T
 
I
D
 
D
E
 
Q
Y
 
F
G
 
C
F
 
A
A
 
P
I
 
I
D
 
N
E
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
-
R
 
-
H
 
-
F
 
-
G
 
-
N
 
S
R
 
L
I
 
L
P
 
P
E
 
E
T
 
T
I
 
V
-
 
H
-
 
V
-
 
L
V
 
A
E
|
E
P
 
P
G
|
G
R
|
R
G
 
F
M
 
I
V
 
C
G
 
A
D
 
P
A
 
A
G
 
-
I
 
-
I
 
-
Q
 
V
S
 
T
E
 
S
V
 
V
V
 
A
L
 
S
I
 
V
S
 
M
R
 
G
K
 
Q
S
 
A
A
 
E
N
 
R
D
 
E
L
 
G
R
 
Q
R
 
I
W
 
W
V
 
Y
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
I
 
D
G
 
G
K
 
I
F
 
Y
G
 
G
G
 
S
L
 
F
A
 
S
E
 
G
T
 
L
M
 
M
D
 
F
E
x
D
A
 
D
I
 
A
Q
 
R
Y
 
Y
P
 
P
I
 
L
E
 
T
T
 
T
E
 
I
R
 
K
D
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
E
A
 
L
E
 
I
P
 
P
V
 
S
I
 
V
L
 
L
A
 
S
G
 
G
P
 
P
T
 
T
C
 
C
D
 
D
S
 
S
A
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
I
Y
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
A
E
 
E
Y
 
N
R
 
I
L
 
L
P
 
L
V
 
P
D
 
K
L
 
L
R
 
N
I
 
N
G
 
G
D
 
D
R
 
L
V
 
V
A
 
I
I
 
G
R
 
R
A
 
T
T
 
M
G
 
G
A
 
A
Y
|
Y
T
 
T
T
 
S
S
 
A
Y
 
-
S
 
T
A
 
A
V
 
T
N
 
D
F
 
F
N
 
N
G
 
F
F
 
F

P07805 Ornithine decarboxylase; ODC; EC 4.1.1.17 from Trypanosoma brucei brucei (see 3 papers)
34% identity, 96% coverage: 17:376/376 of query aligns to 37:406/423 of P07805

query
sites
P07805
P
 
P
C
 
F
L
 
F
V
 
V
V
 
A
D
 
D
L
 
L
D
 
G
V
 
D
V
 
I
A
 
V
R
 
R
N
 
K
Y
 
H
D
 
E
R
 
T
L
 
W
S
 
K
G
 
K
A
 
C
L
 
L
P
 
P
D
 
R
A
 
V
K
 
T
I
 
P
Y
 
F
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
K
|
K
A
 
C
N
 
N
P
 
D
A
 
D
P
 
W
E
 
R
I
 
V
L
 
L
R
 
G
L
 
T
L
 
L
T
 
A
G
 
A
L
 
L
G
 
G
S
 
T
S
 
G
F
 
F
D
 
D
T
 
C
A
 
A
S
 
S
V
 
N
P
 
T
E
 
E
I
 
I
E
 
Q
D
 
R
C
 
V
L
 
R
A
 
G
A
 
I
G
 
G
A
 
V
T
 
P
P
 
P
D
 
E
R
 
K
I
 
I
S
 
I
Y
 
Y
G
 
A
N
 
N
T
 
P
I
 
C
K
 
K
K
 
Q
A
 
I
A
 
S
D
 
H
I
 
I
R
 
R
R
 
Y
A
 
A
Y
 
R
E
 
D
L
 
S
G
 
G
V
 
V
R
 
D
L
 
V
F
 
M
A
 
T
F
 
F
D
 
D
S
 
C
E
 
V
A
 
D
E
 
E
L
 
L
E
 
E
K
 
K
I
 
V
A
 
A
A
 
K
N
 
T
A
 
H
P
 
P
G
 
K
S
 
A
R
 
K
V
 
M
F
 
V
C
 
L
R
 
R
I
 
I
L
 
S
T
 
T
S
 
D
G
 
D
E
 
S
G
 
L
A
 
A
D
 
R
W
 
C
P
 
R
L
 
L
S
 
S
R
 
V
K
 
K
F
 
F
G
 
G
C
 
A
D
 
K
P
 
V
E
 
E
M
 
D
A
 
C
R
 
R
D
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
E
R
 
Q
A
 
A
A
 
K
A
 
K
L
 
L
D
 
N
V
 
I
V
 
D
P
 
V
Y
 
T
G
 
G
V
 
V
S
 
S
F
 
F
H
 
H
V
 
V
G
 
G
S
|
S
Q
 
G
Q
 
S
R
 
T
D
 
D
L
 
A
A
 
S
Q
 
T
W
 
F
D
 
A
A
 
Q
A
 
A
L
 
I
S
 
S
T
 
D
T
 
S
A
 
R
A
 
F
I
 
V
F
 
F
R
 
D
D
 
M
L
 
G
E
 
T
E
 
E
K
 
L
G
 
G
V
 
F
A
 
N
L
 
M
R
 
H
M
 
I
V
 
L
N
 
D
M
 
I
G
 
G
G
 
G
G
|
G
F
 
F
P
 
P
-
 
G
T
 
T
R
 
R
Y
 
-
R
 
-
T
 
-
D
 
D
V
 
A
P
 
P
-
 
L
G
 
K
T
 
F
D
 
E
E
 
E
Y
 
I
G
 
A
F
 
G
A
 
V
I
 
I
D
 
N
E
 
N
A
 
A
L
 
L
R
 
E
R
 
K
H
 
H
F
 
F
G
 
P
N
 
P
R
 
D
I
 
L
P
 
K
E
 
L
T
 
T
I
 
I
V
 
V
-
 
A
E
|
E
P
|
P
G
|
G
R
|
R
G
 
Y
M
 
Y
V
 
V
G
 
A
D
 
S
A
 
A
G
 
F
I
 
T
I
 
L
Q
 
A
S
 
V
E
 
N
V
 
V
V
 
I
-
 
A
-
 
K
-
 
K
-
 
V
-
 
T
-
 
P
-
 
G
-
 
V
-
 
Q
-
 
T
-
 
D
L
 
V
I
 
G
S
 
A
R
 
H
K
 
A
S
 
E
A
 
S
N
 
N
D
 
A
L
 
Q
R
 
S
R
 
F
W
 
M
V
 
Y
Y
 
Y
L
 
V
D
 
N
I
 
D
G
 
G
K
 
V
F
 
Y
G
 
G
G
 
S
L
 
F
A
 
N
E
 
C
T
 
I
M
 
L
-
x
Y
D
|
D
E
 
H
A
 
A
I
 
V
Q
 
V
Y
 
R
P
 
P
I
 
L
E
 
P
T
 
-
E
 
Q
R
 
R
D
 
E
G
 
P
G
 
I
P
 
P
A
 
N
E
 
E
-
 
K
-
 
L
-
 
Y
P
 
P
V
 
S
I
 
S
L
 
V
A
 
W
G
 
G
P
 
P
T
 
T
C
|
C
D
|
D
S
 
G
A
 
L
D
 
D
V
 
Q
L
 
I
Y
 
V
E
 
E
R
 
R
A
 
-
E
 
-
Y
 
Y
R
 
Y
L
 
L
P
 
P
V
 
-
D
 
E
L
 
M
R
 
Q
I
 
V
G
 
G
D
 
E
R
 
W
V
 
L
A
 
L
I
 
F
R
 
E
A
 
D
T
 
M
G
 
G
A
 
A
Y
|
Y
T
 
T
T
 
V
S
 
V
Y
 
G
S
 
T
A
 
S
V
 
-
N
 
S
F
 
F
N
 
N
G
 
G
F
 
F
A
 
Q
P
 
S
L
 
P
Q
 
T
A
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
I
 
V

Q9FPK5 Ornithine decarboxylase, chloroplastic; Lysine decarboxylase; EC 4.1.1.17; EC 4.1.1.18 from Nicotiana glutinosa (Tobacco) (see paper)
33% identity, 94% coverage: 17:368/376 of query aligns to 65:417/432 of Q9FPK5

query
sites
Q9FPK5
P
 
P
C
 
F
L
 
Y
V
 
V
V
 
L
D
 
D
L
 
L
D
 
G
V
 
E
V
 
V
A
 
V
R
 
S
N
 
L
Y
 
M
D
 
D
R
 
Q
L
 
W
S
 
K
G
 
S
A
 
S
L
 
L
P
 
P
D
 
N
A
 
I
K
 
R
I
 
P
Y
 
F
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
K
|
K
A
x
C
N
 
N
P
 
P
A
 
E
P
 
P
E
 
S
I
 
F
L
 
L
R
 
S
L
 
I
L
 
L
T
 
S
G
 
A
L
 
M
G
 
G
S
 
S
S
 
N
F
 
F
D
 
D
T
 
C
A
 
A
S
 
S
V
 
R
P
 
A
E
 
E
I
 
I
E
 
E
D
 
Y
C
 
V
L
 
L
A
 
A
A
 
L
G
 
G
A
 
I
T
 
S
P
 
P
D
 
D
R
 
R
I
 
I
S
 
V
Y
 
F
G
 
A
N
 
N
T
 
P
I
 
C
K
 
K
K
 
P
A
 
E
A
 
S
D
 
D
I
 
I
R
 
I
R
 
F
A
 
A
Y
 
A
E
 
K
L
 
V
G
 
G
V
 
V
R
 
N
L
 
L
F
 
T
A
 
T
F
 
Y
D
 
D
S
 
S
E
 
E
A
 
D
E
 
E
L
 
V
E
 
Y
K
 
K
I
 
I
A
 
R
A
 
K
N
 
H
A
 
H
P
 
P
G
 
K
S
 
S
R
 
E
V
 
L
F
 
L
C
 
P
R
 
R
I
 
I
L
 
K
T
 
P
S
 
M
G
 
F
E
 
D
G
 
G
-
 
N
A
 
A
D
 
R
W
 
C
P
 
P
L
 
M
S
 
G
R
 
P
K
 
K
F
 
Y
G
 
G
C
 
A
D
 
L
P
 
P
E
 
E
M
 
E
A
 
V
R
 
E
D
 
P
L
 
L
L
 
L
L
 
R
R
 
A
A
 
A
A
 
Q
A
 
A
L
 
A
D
 
R
V
 
L
V
 
T
P
 
V
Y
 
S
G
 
G
V
 
V
S
 
S
F
 
F
H
 
H
V
 
I
G
 
G
S
 
S
Q
 
G
Q
 
D
R
 
A
D
 
D
L
 
S
A
 
N
Q
 
A
W
 
Y
D
 
L
A
 
G
A
 
A
L
 
I
S
 
A
T
 
A
T
 
A
A
 
K
A
 
E
I
 
V
F
 
F
R
 
E
D
 
T
L
 
A
E
 
A
E
 
K
K
 
L
G
 
G
V
 
M
A
 
S
-
 
K
L
 
M
R
 
T
M
 
V
V
 
L
N
 
D
M
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
F
 
F
P
 
T
T
 
S
R
 
G
Y
 
H
R
 
Q
T
 
F
D
 
T
V
 
T
P
 
A
G
 
A
T
 
V
D
 
-
E
 
-
Y
 
-
G
 
-
F
 
-
A
 
A
I
 
V
D
 
K
E
 
S
A
 
A
L
 
L
R
 
K
R
 
Q
H
 
H
F
 
F
G
 
D
N
 
D
R
 
E
I
 
P
P
 
E
E
 
L
T
 
T
I
 
I
V
 
I
-
 
A
E
 
E
P
 
P
G
 
G
R
 
R
G
 
F
M
 
F
V
 
A
G
 
E
D
 
T
A
 
A
G
 
F
I
 
T
I
 
L
Q
 
A
S
 
T
E
 
T
V
 
V
V
 
-
L
 
-
I
 
I
S
 
G
R
 
K
K
 
R
S
 
V
A
 
R
N
 
G
D
 
E
L
 
L
R
 
R
R
 
E
W
 
Y
V
 
-
Y
 
W
L
 
I
D
 
N
I
 
D
G
 
G
K
 
L
F
 
Y
G
 
G
G
 
S
L
 
M
A
 
N
E
x
C
T
 
V
M
 
L
D
 
Y
E
 
D
-
 
H
-
 
A
-
 
T
-
 
V
-
 
N
A
 
A
I
 
T
Q
 
P
Y
 
L
P
 
A
I
 
V
E
 
L
T
 
S
E
 
N
R
 
R
D
 
T
-
 
N
-
 
V
-
 
T
-
 
C
-
 
G
G
 
G
G
 
S
P
 
K
A
 
T
E
 
F
P
 
P
V
 
T
I
 
T
L
 
V
A
 
F
G
 
G
P
 
P
T
 
T
C
|
C
D
 
D
S
 
A
A
 
L
D
 
D
V
 
T
L
 
V
Y
 
L
E
 
R
R
 
-
A
 
-
E
 
D
Y
 
Y
R
 
Q
L
 
L
P
 
P
V
 
-
D
 
E
L
 
L
R
 
Q
I
 
V
G
 
N
D
 
D
R
 
W
V
 
L
A
 
V
I
 
F
R
 
P
A
 
N
T
 
M
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
T
 
T
T
 
K
S
 
A
Y
 
-
S
 
A
A
 
G
V
 
S
N
 
N
F
 
F
N
 
N
G
 
G
F
 
F

1f3tB Crystal structure of trypanosoma brucei ornithine decarboxylase (odc) complexed with putrescine, odc's reaction product. (see paper)
35% identity, 96% coverage: 17:376/376 of query aligns to 20:367/381 of 1f3tB

query
sites
1f3tB
P
 
P
C
 
F
L
 
F
V
 
V
V
 
A
D
 
D
L
 
L
D
 
G
V
 
D
V
 
I
A
 
V
R
 
R
N
 
K
Y
 
H
D
 
E
R
 
T
L
 
W
S
 
K
G
 
K
A
 
C
L
 
L
P
 
P
D
 
R
A
 
V
K
 
T
I
 
P
Y
 
F
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
K
|
K
A
 
C
N
 
N
P
 
D
A
 
D
P
 
W
E
 
R
I
 
V
L
 
L
R
 
G
L
 
T
L
 
L
T
 
A
G
 
A
L
 
L
G
 
G
S
 
T
S
 
G
F
 
F
D
 
D
T
 
C
A
 
A
S
 
S
V
 
N
P
 
T
E
 
E
I
 
I
E
 
Q
D
 
R
C
 
V
L
 
R
A
 
G
A
 
I
G
 
G
A
 
V
T
 
P
P
 
P
D
 
E
R
 
K
I
 
I
S
 
I
Y
 
Y
G
 
A
N
 
N
T
 
P
I
 
C
K
 
K
K
 
Q
A
 
I
A
 
S
D
 
H
I
 
I
R
 
R
R
 
Y
A
 
A
Y
 
R
E
 
D
L
 
S
G
 
G
V
 
V
R
 
D
L
 
V
F
 
M
A
 
T
F
 
F
D
 
D
S
 
C
E
 
V
A
 
D
E
 
E
L
 
L
E
 
E
K
 
K
I
 
V
A
 
A
A
 
K
N
 
T
A
 
H
P
 
P
G
 
K
S
 
A
R
 
K
V
 
M
F
 
V
C
 
L
R
|
R
I
 
I
L
 
S
T
 
T
S
 
D
G
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
-
W
 
-
P
 
-
L
 
L
S
 
S
R
 
V
K
 
K
F
 
F
G
 
G
C
 
A
D
 
K
P
 
V
E
 
E
M
 
D
A
 
C
R
 
R
D
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
E
R
 
Q
A
 
A
A
 
K
A
 
K
L
 
L
D
 
N
V
 
I
V
 
D
P
 
V
Y
 
T
G
 
G
V
 
V
S
 
S
F
 
F
H
|
H
V
 
V
G
 
G
S
 
S
Q
 
G
Q
 
S
R
 
T
D
 
D
L
 
A
A
 
S
Q
 
T
W
 
F
D
 
A
A
 
Q
A
 
A
L
 
I
S
 
S
T
 
D
T
 
S
A
 
R
A
 
F
I
 
V
F
 
F
R
 
D
D
 
M
L
 
G
E
 
T
E
 
E
K
 
L
G
 
G
V
 
F
A
 
N
L
 
M
R
 
H
M
 
I
V
 
L
N
 
D
M
 
I
G
 
G
G
|
G
G
|
G
F
 
F
P
 
P
-
 
G
T
 
T
R
 
R
Y
 
-
R
 
-
T
 
-
D
 
D
V
 
A
P
 
P
-
 
L
G
 
K
T
 
F
D
 
E
E
 
E
Y
 
I
G
 
A
F
 
G
A
 
V
I
 
I
D
 
N
E
 
N
A
 
A
L
 
L
R
 
E
R
 
K
H
 
H
F
 
F
G
 
P
N
 
P
R
 
D
I
 
L
P
 
K
E
 
L
T
 
T
I
 
I
V
 
V
-
 
A
E
|
E
P
 
P
G
|
G
R
|
R
G
 
Y
M
 
Y
V
 
V
G
 
A
D
 
S
A
 
A
G
 
F
I
 
T
I
 
L
Q
 
A
S
 
V
E
 
N
V
 
V
V
 
-
L
 
-
I
 
I
S
 
A
R
 
K
K
 
K
S
 
V
A
 
T
N
 
Q
D
 
S
L
 
F
R
 
M
R
 
-
W
 
-
V
 
Y
Y
 
Y
L
 
V
D
 
N
I
 
D
G
 
G
K
 
V
F
 
Y
G
 
G
G
 
S
L
 
F
A
 
N
E
 
C
T
 
I
M
 
L
-
 
Y
D
|
D
E
 
H
A
 
A
I
 
V
Q
 
V
Y
 
R
P
 
P
I
 
L
E
 
P
T
 
-
E
 
Q
R
 
R
D
 
E
G
 
P
G
 
I
P
 
P
A
 
N
E
 
E
-
 
K
-
 
L
-
 
Y
P
 
P
V
 
S
I
 
S
L
 
V
A
 
W
G
 
G
P
 
P
T
 
T
C
 
C
D
 
D
S
 
G
A
 
L
D
 
D
V
 
Q
L
 
I
Y
 
V
E
 
E
R
 
R
A
 
-
E
 
-
Y
 
Y
R
 
Y
L
 
L
P
 
P
V
 
-
D
 
E
L
 
M
R
 
Q
I
 
V
G
 
G
D
 
E
R
 
W
V
 
L
A
 
L
I
 
F
R
 
E
A
 
D
T
 
M
G
 
G
A
 
A
Y
|
Y
T
 
T
T
 
V
S
 
V
Y
 
G
S
 
T
A
 
S
V
 
-
N
 
S
F
 
F
N
 
N
G
 
G
F
 
F
A
 
Q
P
 
S
L
 
P
Q
 
T
A
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
I
 
V

2todA Ornithine decarboxylase from trypanosoma brucei k69a mutant in complex with alpha-difluoromethylornithine (see paper)
34% identity, 96% coverage: 17:376/376 of query aligns to 3:351/353 of 2todA

query
sites
2todA
P
 
P
C
 
F
L
 
F
V
 
V
V
 
A
D
 
D
L
 
L
D
 
G
V
 
D
V
 
I
A
 
V
R
 
R
N
 
K
Y
 
H
D
 
E
R
 
T
L
 
W
S
 
K
G
 
K
A
 
C
L
 
L
P
 
P
D
 
R
A
 
V
K
 
T
I
 
P
Y
 
F
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
K
x
A
A
 
C
N
 
N
P
 
D
A
 
D
P
 
W
E
 
R
I
 
V
L
 
L
R
 
G
L
 
T
L
 
L
T
 
A
G
 
A
L
 
L
G
 
G
S
 
T
S
 
G
F
 
F
D
 
D
T
 
C
A
 
A
S
 
S
V
 
N
P
 
T
E
 
E
I
 
I
E
 
Q
D
 
R
C
 
V
L
 
R
A
 
G
A
 
I
G
 
G
A
 
V
T
 
P
P
 
P
D
 
E
R
 
K
I
 
I
S
 
I
Y
 
Y
G
 
A
N
 
N
T
 
P
I
 
C
K
 
K
K
 
Q
A
 
I
A
 
S
D
 
H
I
 
I
R
 
R
R
 
Y
A
 
A
Y
 
R
E
 
D
L
 
S
G
 
G
V
 
V
R
 
D
L
 
V
F
 
M
A
 
T
F
 
F
D
 
D
S
 
C
E
 
V
A
 
D
E
 
E
L
 
L
E
 
E
K
 
K
I
 
V
A
 
A
A
 
K
N
 
T
A
 
H
P
 
P
G
 
K
S
 
A
R
 
K
V
 
M
F
 
V
C
 
L
R
 
R
I
 
I
L
 
S
T
 
T
S
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
-
W
 
-
P
 
-
L
 
L
S
 
S
R
 
V
K
 
K
F
 
F
G
 
G
C
 
A
D
 
K
P
 
V
E
 
E
M
 
D
A
 
C
R
 
R
D
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
E
R
 
Q
A
 
A
A
 
K
A
 
K
L
 
L
D
 
N
V
 
I
V
 
D
P
 
V
Y
 
T
G
 
G
V
 
V
S
 
S
F
 
F
H
|
H
V
 
V
G
 
G
S
|
S
Q
 
G
Q
 
S
R
 
T
D
 
D
L
 
A
A
 
S
Q
 
T
W
 
F
D
 
A
A
 
Q
A
 
A
L
 
I
S
 
S
T
 
D
T
 
S
A
 
R
A
 
F
I
 
V
F
 
F
R
 
D
D
 
M
L
 
G
E
 
T
E
 
E
K
 
L
G
 
G
V
 
F
A
 
N
L
 
M
R
 
H
M
 
I
V
 
L
N
 
D
M
 
I
G
 
G
G
|
G
G
|
G
F
 
F
P
 
P
-
 
G
T
 
T
R
 
R
Y
 
-
R
 
-
T
 
-
D
 
D
V
 
A
P
 
P
-
 
L
G
 
K
T
 
F
D
 
E
E
 
E
Y
 
I
G
 
A
F
 
G
A
 
V
I
 
I
D
 
N
E
 
N
A
 
A
L
 
L
R
 
E
R
 
K
H
 
H
F
 
F
G
 
P
N
 
P
R
 
D
I
 
L
P
 
K
E
 
L
T
 
T
I
 
I
V
 
V
-
 
A
E
|
E
P
 
P
G
|
G
R
|
R
G
 
Y
M
 
Y
V
 
V
G
 
A
D
 
S
A
 
A
G
 
F
I
 
T
I
 
L
Q
 
A
S
 
V
E
 
N
V
 
V
V
 
-
L
 
-
I
 
I
S
 
A
R
 
K
K
 
K
S
 
V
A
 
T
N
 
P
D
 
A
L
 
Q
R
 
S
R
 
F
W
 
M
V
 
Y
Y
 
Y
L
 
V
D
 
N
I
 
D
G
 
G
K
 
V
F
 
Y
G
 
G
G
 
S
L
 
F
A
 
N
E
 
C
T
 
I
M
 
L
-
 
Y
D
|
D
E
 
H
A
 
A
I
 
V
Q
 
V
Y
 
R
P
 
P
I
 
L
E
 
P
T
 
-
E
 
Q
R
 
R
D
 
E
G
 
P
G
 
I
P
 
P
A
 
N
E
 
E
-
 
K
-
 
L
-
 
Y
P
 
P
V
 
S
I
 
S
L
 
V
A
 
W
G
 
G
P
 
P
T
 
T
C
|
C
D
|
D
S
 
G
A
 
L
D
 
D
V
 
Q
L
 
I
Y
 
V
E
 
E
R
 
R
A
 
-
E
 
-
Y
 
Y
R
 
Y
L
 
L
P
 
P
V
 
-
D
 
E
L
 
M
R
 
Q
I
 
V
G
 
G
D
 
E
R
 
W
V
 
L
A
 
L
I
 
F
R
 
E
A
 
D
T
 
M
G
 
G
A
 
A
Y
|
Y
T
 
T
T
 
V
S
 
V
Y
 
G
S
 
T
A
 
S
V
 
-
N
 
S
F
|
F
N
 
N
G
 
G
F
 
F
A
 
Q
P
 
S
L
 
P
Q
 
T
A
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
I
 
V

2oo0A A structural insight into the inhibition of human and leishmania donovani ornithine decarboxylases by 3-aminooxy-1-aminopropane (see paper)
34% identity, 95% coverage: 20:376/376 of query aligns to 52:405/419 of 2oo0A

query
sites
2oo0A
V
 
V
V
 
A
D
 
D
L
 
L
D
 
G
V
 
D
V
 
I
A
 
L
R
 
K
N
 
K
Y
 
H
D
 
L
R
 
R
L
 
W
S
 
L
G
 
K
A
 
A
L
 
L
P
 
P
D
 
R
A
 
V
K
 
T
I
 
P
Y
 
F
Y
 
Y
A
|
A
V
 
V
K
|
K
A
 
C
N
 
N
P
 
D
A
 
S
P
 
K
E
 
A
I
 
I
L
 
V
R
 
K
L
 
T
L
 
L
T
 
A
G
 
A
L
 
T
G
 
G
S
 
T
S
 
G
F
 
F
D
|
D
T
 
C
A
 
A
S
 
S
V
 
K
P
 
T
E
 
E
I
 
I
E
 
Q
D
 
L
C
 
V
L
 
Q
A
 
S
A
 
L
G
 
G
A
 
V
T
 
P
P
 
P
D
 
E
R
 
R
I
 
I
S
 
I
Y
 
Y
G
 
A
N
 
N
T
 
P
I
 
C
K
 
K
K
 
Q
A
 
V
A
 
S
D
 
Q
I
 
I
R
 
K
R
 
Y
A
 
A
Y
 
A
E
 
N
L
 
N
G
 
G
V
 
V
R
 
Q
L
 
M
F
 
M
A
 
T
F
 
F
D
 
D
S
 
S
E
 
E
A
 
V
E
 
E
L
 
L
E
 
M
K
 
K
I
 
V
A
 
A
A
 
R
N
 
A
A
 
H
P
 
P
G
 
K
S
 
A
R
 
K
V
 
L
F
 
V
C
 
L
R
 
R
I
 
I
L
 
A
T
 
T
S
 
D
G
 
D
E
 
S
G
 
K
A
 
A
D
 
V
W
x
C
P
 
R
L
 
L
S
 
S
R
 
V
K
 
K
F
 
F
G
 
G
C
 
A
D
 
T
P
 
L
E
 
R
M
 
T
A
 
S
R
 
R
D
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
E
R
 
R
A
 
A
A
 
K
A
 
E
L
 
L
D
 
N
V
 
I
V
 
D
P
 
V
Y
 
V
G
 
G
V
 
V
S
 
S
F
 
F
H
|
H
V
 
V
G
 
G
S
|
S
Q
 
G
Q
 
C
R
 
T
D
 
D
L
 
P
A
 
E
Q
 
T
W
 
F
D
 
V
A
 
Q
A
 
A
L
 
I
S
 
S
T
 
D
T
 
A
A
 
R
A
 
C
I
 
V
F
 
F
R
 
D
D
 
M
L
 
G
E
 
A
E
 
E
K
 
V
G
 
G
V
 
F
A
 
S
L
 
M
R
 
Y
M
 
L
V
 
L
N
 
D
M
 
I
G
 
G
G
 
G
G
|
G
F
 
F
P
|
P
T
x
G
R
x
S
Y
 
E
R
 
D
T
x
V
D
 
K
V
 
L
P
 
K
G
 
F
T
 
E
D
 
E
E
 
I
Y
 
T
G
 
G
F
 
-
A
 
V
I
 
I
D
 
N
E
 
P
A
 
A
L
 
L
R
 
D
R
 
K
H
 
Y
F
 
F
-
 
P
-
 
S
-
 
D
-
 
S
G
 
G
N
 
V
R
 
R
I
 
I
P
 
-
E
 
-
T
 
-
I
 
I
V
 
A
E
|
E
P
 
P
G
|
G
R
|
R
G
 
Y
M
 
Y
V
 
V
G
 
A
D
 
S
A
 
A
G
 
F
I
 
T
I
 
L
Q
 
-
S
 
-
E
 
A
V
 
V
V
 
N
L
 
I
I
 
I
S
 
A
R
 
K
K
 
K
S
 
I
A
 
V
N
 
L
D
 
E
L
 
Q
R
 
T
R
 
F
W
 
M
V
 
Y
Y
 
Y
L
 
V
D
 
N
I
 
D
G
 
G
K
 
V
F
 
Y
G
 
G
G
 
S
L
 
F
A
 
N
E
 
C
T
 
I
M
 
L
-
 
Y
D
|
D
E
 
H
A
 
A
I
 
H
Q
 
V
Y
 
K
P
 
P
I
 
L
E
 
L
T
 
Q
E
 
K
R
 
R
D
 
P
G
 
-
G
 
K
P
 
P
A
 
D
E
 
E
P
 
K
V
 
Y
I
 
Y
-
 
S
-
 
S
-
 
S
L
 
I
A
 
W
G
 
G
P
 
P
T
 
T
C
 
C
D
 
D
S
 
G
A
 
L
D
 
D
V
 
R
L
 
I
Y
 
V
E
 
E
R
 
R
A
 
C
E
 
D
Y
 
-
R
 
-
L
 
L
P
 
P
V
 
-
D
 
E
L
 
M
R
 
H
I
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
W
V
 
M
A
 
L
I
 
F
R
 
E
A
x
N
T
 
M
G
 
G
A
 
A
Y
|
Y
T
 
T
T
 
V
S
 
A
Y
 
-
S
 
A
A
 
A
V
 
S
N
 
T
F
 
F
N
 
N
G
 
G
F
 
F
A
 
Q
P
 
R
L
 
P
Q
 
T
A
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
I
 
V

P11926 Ornithine decarboxylase; ODC; EC 4.1.1.17 from Homo sapiens (Human) (see 5 papers)
34% identity, 95% coverage: 20:376/376 of query aligns to 42:408/461 of P11926

query
sites
P11926
V
 
V
V
 
A
D
 
D
L
 
L
D
 
G
V
 
D
V
 
I
A
 
L
R
 
K
N
 
K
Y
 
H
D
 
L
R
 
R
L
 
W
S
 
L
G
 
K
A
 
A
L
 
L
P
 
P
D
 
R
A
 
V
K
 
T
I
 
P
Y
 
F
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
K
|
K
A
 
C
N
 
N
P
 
D
A
 
S
P
 
K
E
 
A
I
 
I
L
 
V
R
 
K
L
 
T
L
 
L
T
 
A
G
 
A
L
 
T
G
 
G
S
 
T
S
 
G
F
 
F
D
 
D
T
 
C
A
 
A
S
 
S
V
 
K
P
 
T
E
 
E
I
 
I
E
 
Q
D
 
L
C
 
V
L
 
Q
A
 
S
A
 
L
G
 
G
A
 
V
T
 
P
P
 
P
D
 
E
R
 
R
I
 
I
S
 
I
Y
 
Y
G
 
A
N
 
N
T
 
P
I
 
C
K
 
K
K
 
Q
A
 
V
A
 
S
D
 
Q
I
 
I
R
 
K
R
 
Y
A
 
A
Y
 
A
E
 
N
L
 
N
G
 
G
V
 
V
R
 
Q
L
 
M
F
 
M
A
 
T
F
 
F
D
 
D
S
 
S
E
 
E
A
 
V
E
 
E
L
 
L
E
 
M
K
 
K
I
 
V
A
 
A
A
 
R
N
 
A
A
 
H
P
 
P
G
 
K
S
 
A
R
 
K
V
 
L
F
 
V
C
 
L
R
 
R
I
 
I
L
 
A
T
 
T
S
 
D
G
 
D
E
 
S
G
 
K
A
 
A
D
 
V
W
 
C
P
 
R
L
 
L
S
 
S
R
 
V
K
 
K
F
 
F
G
 
G
C
 
A
D
 
T
P
 
L
E
 
R
M
 
T
A
 
S
R
 
R
D
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
E
R
 
R
A
 
A
A
 
K
A
 
E
L
 
L
D
 
N
V
 
I
V
 
D
P
 
V
Y
 
V
G
 
G
V
 
V
S
 
S
F
 
F
H
 
H
V
 
V
G
 
G
S
|
S
Q
 
G
Q
 
C
R
 
T
D
 
D
L
 
P
A
 
E
Q
 
T
W
 
F
D
 
V
A
 
Q
A
 
A
L
 
I
S
 
S
T
 
D
T
 
A
A
 
R
A
 
C
I
 
V
F
 
F
R
 
D
D
 
M
L
 
G
E
 
A
E
 
E
K
 
V
G
 
G
V
 
F
A
 
S
L
 
M
R
 
Y
M
 
L
V
 
L
N
 
D
M
 
I
G
 
G
G
 
G
G
|
G
F
 
F
P
 
P
T
 
G
R
 
S
Y
 
E
R
 
D
T
 
V
D
 
K
V
 
L
P
 
K
G
 
F
T
 
E
D
 
E
E
 
I
Y
 
T
G
 
G
F
 
-
A
 
V
I
 
I
D
 
N
E
 
P
A
 
A
L
 
L
R
 
D
R
 
K
H
 
Y
F
 
F
-
 
P
-
 
S
-
 
D
-
 
S
G
 
G
N
 
V
R
 
R
I
 
I
P
 
-
E
 
-
T
 
-
I
 
I
V
 
A
E
|
E
P
|
P
G
|
G
R
|
R
G
 
Y
M
 
Y
V
 
V
G
 
A
D
 
S
A
 
A
-
 
F
-
 
T
-
 
L
-
 
A
-
 
V
G
 
N
I
 
I
I
 
I
Q
 
A
S
 
K
E
 
K
V
 
I
V
 
V
L
 
L
I
 
K
S
 
E
R
 
Q
K
 
T
S
 
G
A
 
S
N
 
D
D
 
D
L
 
E
R
 
D
R
 
E
-
 
S
-
 
S
-
 
E
-
 
Q
-
 
T
-
 
F
W
 
M
V
 
Y
Y
 
Y
L
 
V
D
 
N
I
 
D
G
 
G
K
 
V
F
 
Y
G
 
G
G
 
S
L
 
F
A
 
N
E
 
C
T
 
I
M
 
L
-
 
Y
D
 
D
E
 
H
A
 
A
I
 
H
Q
 
V
Y
 
K
P
 
P
I
 
L
E
 
L
T
 
Q
E
 
K
R
 
R
D
 
P
G
 
-
G
 
K
P
 
P
A
 
D
E
 
E
P
 
K
V
 
Y
I
 
Y
-
 
S
-
 
S
-
 
S
L
 
I
A
 
W
G
 
G
P
 
P
T
 
T
C
|
C
D
 
D
S
 
G
A
 
L
D
 
D
V
 
R
L
 
I
Y
 
V
E
 
E
R
 
R
A
 
C
E
 
D
Y
 
-
R
 
-
L
 
L
P
 
P
V
 
-
D
 
E
L
 
M
R
 
H
I
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
W
V
 
M
A
 
L
I
 
F
R
 
E
A
 
N
T
 
M
G
 
G
A
 
A
Y
|
Y
T
 
T
T
 
V
S
 
A
Y
 
-
S
 
A
A
 
A
V
 
S
N
 
T
F
 
F
N
 
N
G
 
G
F
 
F
A
 
Q
P
 
R
L
 
P
Q
 
T
A
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
I
 
V

Sites not aligning to the query:

1szrC A dimer interface mutant of ornithine decarboxylase reveals structure of gem diamine intermediate (see paper)
34% identity, 96% coverage: 17:376/376 of query aligns to 3:347/347 of 1szrC

query
sites
1szrC
P
 
P
C
 
F
L
 
F
V
 
V
V
 
A
D
 
D
L
 
L
D
 
G
V
 
D
V
 
I
A
 
V
R
 
R
N
 
K
Y
 
H
D
 
E
R
 
T
L
 
W
S
 
K
G
 
K
A
 
C
L
 
L
P
 
P
D
 
R
A
 
V
K
 
T
I
 
P
Y
 
F
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
K
|
K
A
 
C
N
 
N
P
 
D
A
 
D
P
 
W
E
 
R
I
 
V
L
 
L
R
 
G
L
 
T
L
 
L
T
 
A
G
 
A
L
 
L
G
 
G
S
 
T
S
 
G
F
 
F
D
 
D
T
 
C
A
 
A
S
 
S
V
 
N
P
 
T
E
 
E
I
 
I
E
 
Q
D
 
R
C
 
V
L
 
R
A
 
G
A
 
I
G
 
G
A
 
V
T
 
P
P
 
P
D
 
E
R
 
K
I
 
I
S
 
I
Y
 
Y
G
 
A
N
 
N
T
 
P
I
 
C
K
 
K
K
 
Q
A
 
I
A
 
S
D
 
H
I
 
I
R
 
R
R
 
Y
A
 
A
Y
 
R
E
 
D
L
 
S
G
 
G
V
 
V
R
 
D
L
 
V
F
 
M
A
 
T
F
 
F
D
 
D
S
 
C
E
 
V
A
 
D
E
 
E
L
 
L
E
 
E
K
 
K
I
 
V
A
 
A
A
 
K
N
 
T
A
 
H
P
 
P
G
 
K
S
 
A
R
 
K
V
 
M
F
 
V
C
 
L
R
 
R
I
 
I
L
 
S
T
 
T
S
 
V
G
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
-
W
 
-
P
 
-
L
 
-
S
 
-
R
 
-
K
 
K
F
 
F
G
 
G
C
 
A
D
 
K
P
 
V
E
 
E
M
 
D
A
 
C
R
 
R
D
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
E
R
 
Q
A
 
A
A
 
K
A
 
K
L
 
L
D
 
N
V
 
I
V
 
D
P
 
V
Y
 
T
G
 
G
V
 
V
S
 
S
F
 
F
H
|
H
V
 
V
G
 
G
S
 
S
Q
 
G
Q
 
S
R
 
T
D
 
D
L
 
A
A
 
S
Q
 
T
W
 
F
D
 
A
A
 
Q
A
 
A
L
 
I
S
 
S
T
 
D
T
 
S
A
 
R
A
 
F
I
 
V
F
 
F
R
 
D
D
 
M
L
 
G
E
 
T
E
 
E
K
 
L
G
 
G
V
 
F
A
 
N
L
 
M
R
 
H
M
 
I
V
 
L
N
 
D
M
 
I
G
 
G
G
 
G
G
|
G
F
 
F
P
 
P
-
 
G
T
 
T
R
 
R
Y
 
-
R
 
-
T
 
-
D
 
D
V
 
A
P
 
P
-
 
L
G
 
K
T
 
F
D
 
E
E
 
E
Y
 
I
G
 
A
F
 
G
A
 
V
I
 
I
D
 
N
E
 
N
A
 
A
L
 
L
R
 
E
R
 
K
H
 
H
F
 
F
G
 
P
N
 
P
R
 
D
I
 
L
P
 
K
E
 
L
T
 
T
I
 
I
V
 
V
-
 
A
E
|
E
P
 
P
G
|
G
R
|
R
G
 
Y
M
 
Y
V
 
V
G
 
A
D
 
S
A
 
A
G
 
F
I
 
T
I
 
L
Q
 
A
S
 
V
E
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
-
I
 
-
S
 
-
R
 
-
K
 
A
S
 
K
A
 
A
N
 
V
D
 
T
L
 
Q
R
 
S
R
 
F
W
 
M
V
 
Y
Y
 
Y
L
 
V
D
 
N
I
 
D
G
 
G
K
 
V
F
 
Y
G
 
G
G
 
S
L
 
F
A
 
N
E
 
C
T
 
I
M
 
L
-
 
Y
D
 
D
E
 
H
A
 
A
I
 
V
Q
 
V
Y
 
R
P
 
P
I
 
L
E
 
P
T
 
-
E
 
Q
R
 
R
D
 
E
G
 
P
G
 
I
P
 
P
A
 
N
E
 
E
-
 
K
-
 
L
-
 
Y
P
 
P
V
 
S
I
 
S
L
 
V
A
 
W
G
 
G
P
 
P
T
 
T
C
 
C
D
 
D
S
 
G
A
 
L
D
 
D
V
 
Q
L
 
I
Y
 
V
E
 
E
R
 
R
A
 
-
E
 
-
Y
 
Y
R
 
Y
L
 
L
P
 
P
V
 
-
D
 
E
L
 
M
R
 
Q
I
 
V
G
 
G
D
 
E
R
 
W
V
 
L
A
 
L
I
 
F
R
 
E
A
 
D
T
 
M
G
 
G
A
 
A
Y
|
Y
T
 
T
T
 
V
S
 
V
Y
 
G
S
 
T
A
 
S
V
 
-
N
 
S
F
 
F
N
 
N
G
 
G
F
 
F
A
 
Q
P
 
S
L
 
P
Q
 
T
A
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
I
 
V

4zgyA Structure of human ornithine decarboxylase in complex with a c- terminal fragment of antizyme (see paper)
34% identity, 95% coverage: 20:376/376 of query aligns to 18:370/383 of 4zgyA

query
sites
4zgyA
V
 
V
V
 
A
D
 
D
L
 
L
D
 
G
V
 
D
V
 
I
A
 
L
R
 
K
N
 
K
Y
 
H
D
 
L
R
 
R
L
 
W
S
 
L
G
 
K
A
 
A
L
 
L
P
 
P
D
 
R
A
 
V
K
 
T
I
 
P
Y
 
F
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
K
|
K
A
 
C
N
 
N
P
 
D
A
 
S
P
 
K
E
 
A
I
 
I
L
 
V
R
 
K
L
 
T
L
 
L
T
 
A
G
 
A
L
 
T
G
 
G
S
 
T
S
 
G
F
 
F
D
|
D
T
 
C
A
 
A
S
 
S
V
 
K
P
 
T
E
 
E
I
 
I
E
 
Q
D
 
L
C
 
V
L
 
Q
A
 
S
A
 
L
G
 
G
A
 
V
T
 
P
P
 
P
D
 
E
R
 
R
I
 
I
S
 
I
Y
 
Y
G
 
A
N
 
N
T
 
P
I
 
C
K
 
K
K
 
Q
A
 
V
A
 
S
D
 
Q
I
 
I
R
 
K
R
 
Y
A
 
A
Y
 
A
E
 
N
L
 
N
G
 
G
V
 
V
R
 
Q
L
 
M
F
 
M
A
 
T
F
 
F
D
 
D
S
 
S
E
 
E
A
 
V
E
 
E
L
 
L
E
 
M
K
 
K
I
 
V
A
 
A
A
 
R
N
 
A
A
 
H
P
 
P
G
 
K
S
 
A
R
 
K
V
 
L
F
 
V
C
 
L
R
 
R
I
 
I
L
 
A
T
 
T
S
 
D
G
 
D
E
 
S
G
 
C
A
 
R
D
 
-
W
 
-
P
 
-
L
 
L
S
 
S
R
 
V
K
 
K
F
 
F
G
 
G
C
 
A
D
 
T
P
 
L
E
 
R
M
 
T
A
 
S
R
 
R
D
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
E
R
 
R
A
 
A
A
 
K
A
 
E
L
 
L
D
 
N
V
 
I
V
 
D
P
 
V
Y
 
V
G
 
G
V
 
V
S
 
S
F
 
F
H
|
H
V
 
V
G
 
G
S
 
S
Q
 
G
Q
 
C
R
 
T
D
 
D
L
 
P
A
 
E
Q
 
T
W
 
F
D
 
V
A
 
Q
A
 
A
L
 
I
S
 
S
T
 
D
T
 
A
A
 
R
A
 
C
I
 
V
F
 
F
R
 
D
D
 
M
L
 
G
E
 
A
E
 
E
K
 
V
G
 
G
V
 
F
A
 
S
L
 
M
R
 
Y
M
 
L
V
 
L
N
 
D
M
 
I
G
 
G
G
 
G
G
|
G
F
|
F
P
 
P
T
 
G
R
 
S
Y
 
E
R
 
D
T
 
V
D
 
K
V
 
L
P
 
K
G
 
F
T
 
E
D
 
E
E
 
I
Y
 
T
G
 
G
F
 
-
A
 
V
I
 
I
D
 
N
E
 
P
A
 
A
L
 
L
R
 
D
R
 
K
H
 
Y
F
 
F
-
 
P
-
 
S
-
 
D
-
 
S
G
 
G
N
 
V
R
 
R
I
 
I
P
 
-
E
 
-
T
 
-
I
 
I
V
 
A
E
|
E
P
 
P
G
|
G
R
|
R
G
x
Y
M
 
Y
V
 
V
G
 
A
D
 
S
A
 
A
-
 
F
-
 
T
-
 
L
-
 
A
-
 
V
G
 
N
I
 
I
I
 
I
Q
 
A
S
 
K
E
 
K
V
 
I
V
 
V
L
 
L
I
 
K
S
 
E
R
 
Q
K
 
T
S
 
G
A
 
S
N
 
S
D
 
E
L
 
Q
R
 
T
R
 
F
W
 
M
V
 
Y
Y
 
Y
L
 
V
D
 
N
I
 
D
G
 
G
K
 
V
F
 
Y
G
 
G
G
 
S
L
 
F
A
 
N
E
 
C
T
 
I
M
 
L
-
 
Y
D
 
D
E
 
H
A
 
A
I
 
H
Q
 
V
Y
 
K
P
 
P
I
 
L
E
 
L
T
 
Q
E
 
K
R
 
R
D
 
P
G
 
E
G
 
K
P
 
Y
A
 
Y
E
 
S
P
 
S
V
 
S
I
 
I
L
 
W
A
 
-
G
 
G
P
 
P
T
 
T
C
 
C
D
 
D
S
 
G
A
 
L
D
 
D
V
 
R
L
 
I
Y
 
V
E
 
E
R
 
R
A
 
C
E
 
D
Y
 
-
R
 
-
L
 
L
P
 
P
V
 
-
D
 
E
L
 
M
R
 
H
I
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
W
V
 
M
A
 
L
I
 
F
R
 
E
A
 
N
T
 
M
G
 
G
A
 
A
Y
|
Y
T
 
T
T
 
V
S
 
-
Y
 
-
S
 
-
A
 
A
V
 
S
N
 
T
F
 
F
N
 
N
G
 
G
F
 
F
A
 
Q
P
 
R
L
 
P
Q
 
T
A
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
I
 
V

7u6pA Structure of an intellectual disability-associated ornithine decarboxylase variant g84r (see paper)
34% identity, 95% coverage: 20:376/376 of query aligns to 42:395/409 of 7u6pA

query
sites
7u6pA
V
 
V
V
 
A
D
 
D
L
 
L
D
 
G
V
 
D
V
 
I
A
 
L
R
 
K
N
 
K
Y
 
H
D
 
L
R
 
R
L
 
W
S
 
L
G
 
K
A
 
A
L
 
L
P
 
P
D
 
R
A
 
V
K
 
T
I
 
P
Y
 
F
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
K
 
K
A
 
C
N
 
N
P
 
D
A
 
S
P
 
K
E
 
A
I
 
I
L
 
V
R
 
K
L
 
T
L
 
L
T
 
A
G
 
A
L
 
T
G
 
R
S
 
T
S
 
G
F
 
F
D
 
D
T
 
C
A
 
A
S
 
S
V
 
K
P
 
T
E
 
E
I
 
I
E
 
Q
D
 
L
C
 
V
L
 
Q
A
 
S
A
 
L
G
 
G
A
 
V
T
 
P
P
 
P
D
 
E
R
 
R
I
 
I
S
 
I
Y
 
Y
G
 
A
N
 
N
T
 
P
I
 
C
K
 
K
K
 
Q
A
 
V
A
 
S
D
 
Q
I
 
I
R
 
K
R
 
Y
A
 
A
Y
 
A
E
 
N
L
 
N
G
 
G
V
 
V
R
 
Q
L
 
M
F
 
M
A
 
T
F
 
F
D
 
D
S
 
S
E
 
E
A
 
V
E
 
E
L
 
L
E
 
M
K
 
K
I
 
V
A
 
A
A
 
R
N
 
A
A
 
H
P
 
P
G
 
K
S
 
A
R
 
K
V
 
L
F
 
V
C
 
L
R
 
R
I
 
I
L
 
A
T
 
T
S
 
D
G
 
D
E
 
S
G
 
K
A
 
A
D
 
V
W
 
C
P
 
R
L
 
L
S
 
S
R
 
V
K
 
K
F
 
F
G
 
G
C
 
A
D
 
T
P
 
L
E
 
R
M
 
T
A
 
S
R
 
R
D
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
E
R
 
R
A
 
A
A
 
K
A
 
E
L
 
L
D
 
N
V
 
I
V
 
D
P
 
V
Y
 
V
G
 
G
V
 
V
S
 
S
F
 
F
H
|
H
V
 
V
G
 
G
S
|
S
Q
 
G
Q
 
C
R
 
T
D
 
D
L
 
P
A
 
E
Q
 
T
W
 
F
D
 
V
A
 
Q
A
 
A
L
 
I
S
 
S
T
 
D
T
 
A
A
 
R
A
 
C
I
 
V
F
 
F
R
 
D
D
 
M
L
 
G
E
 
A
E
 
E
K
 
V
G
 
G
V
 
F
A
 
S
L
 
M
R
 
Y
M
 
L
V
 
L
N
 
D
M
 
I
G
 
G
G
|
G
G
|
G
F
 
F
P
 
P
T
 
G
R
 
S
Y
 
E
R
 
D
T
 
V
D
 
K
V
 
L
P
 
K
G
 
F
T
 
E
D
 
E
E
 
I
Y
 
T
G
 
G
F
 
-
A
 
V
I
 
I
D
 
N
E
 
P
A
 
A
L
 
L
R
 
D
R
 
K
H
 
Y
F
 
F
-
 
P
-
 
S
-
 
D
-
 
S
G
 
G
N
 
V
R
 
R
I
 
I
P
 
-
E
 
-
T
 
-
I
 
I
V
 
A
E
 
E
P
 
P
G
|
G
R
|
R
G
 
Y
M
 
Y
V
 
V
G
 
A
D
 
S
A
 
A
G
 
F
I
 
T
I
 
L
Q
 
-
S
 
-
E
 
A
V
 
V
V
 
N
L
 
I
I
 
I
S
 
A
R
 
K
K
 
K
S
 
I
A
 
V
N
 
L
D
 
E
L
 
Q
R
 
T
R
 
F
W
 
M
V
 
Y
Y
 
Y
L
 
V
D
 
N
I
 
D
G
 
G
K
 
V
F
 
Y
G
 
G
G
 
S
L
 
F
A
 
N
E
 
C
T
 
I
M
 
L
-
 
Y
D
 
D
E
 
H
A
 
A
I
 
H
Q
 
V
Y
 
K
P
 
P
I
 
L
E
 
L
T
 
Q
E
 
K
R
 
R
D
 
P
G
 
-
G
 
K
P
 
P
A
 
D
E
 
E
P
 
K
V
 
Y
I
 
Y
-
 
S
-
 
S
-
 
S
L
 
I
A
 
W
G
 
G
P
 
P
T
 
T
C
 
C
D
 
D
S
 
G
A
 
L
D
 
D
V
 
R
L
 
I
Y
 
V
E
 
E
R
 
R
A
 
C
E
 
D
Y
 
-
R
 
-
L
 
L
P
 
P
V
 
-
D
 
E
L
 
M
R
 
H
I
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
W
V
 
M
A
 
L
I
 
F
R
 
E
A
 
N
T
 
M
G
 
G
A
 
A
Y
|
Y
T
 
T
T
 
V
S
 
A
Y
 
-
S
 
A
A
 
A
V
 
S
N
 
T
F
 
F
N
 
N
G
 
G
F
 
F
A
 
Q
P
 
R
L
 
P
Q
 
T
A
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
I
 
V

P00860 Ornithine decarboxylase; ODC; EC 4.1.1.17 from Mus musculus (Mouse) (see 5 papers)
32% identity, 95% coverage: 20:376/376 of query aligns to 42:408/461 of P00860

query
sites
P00860
V
 
V
V
 
A
D
 
D
L
 
L
D
 
G
V
 
D
V
 
I
A
 
L
R
 
K
N
 
K
Y
 
H
D
 
L
R
 
R
L
 
W
S
 
L
G
 
K
A
 
A
L
 
L
P
 
P
D
 
R
A
 
V
K
 
T
I
 
P
Y
 
F
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
K
|
K
A
 
C
N
 
N
P
 
D
A
 
S
P
 
R
E
 
A
I
 
I
L
 
V
R
 
S
L
 
T
L
 
L
T
 
A
G
 
A
L
 
I
G
 
G
S
 
T
S
 
G
F
 
F
D
 
D
T
 
C
A
 
A
S
 
S
V
 
K
P
 
T
E
 
E
I
 
I
E
 
Q
D
 
L
C
 
V
L
 
Q
A
 
G
A
 
L
G
 
G
A
 
V
T
 
P
P
 
A
D
 
E
R
 
R
I
 
V
S
 
I
Y
 
Y
G
 
A
N
 
N
T
 
P
I
 
C
K
 
K
K
 
Q
A
 
V
A
 
S
D
 
Q
I
 
I
R
 
K
R
 
Y
A
 
A
Y
 
A
E
 
S
L
 
N
G
 
G
V
 
V
R
 
Q
L
 
M
F
 
M
A
 
T
F
 
F
D
 
D
S
 
S
E
 
E
A
 
I
E
 
E
L
 
L
E
 
M
K
 
K
I
 
V
A
 
A
A
 
R
N
 
A
A
 
H
P
 
P
G
 
K
S
 
A
R
 
K
V
 
L
F
 
V
C
 
L
R
 
R
I
 
I
L
 
A
T
 
T
S
 
D
G
 
D
E
 
S
G
 
K
A
 
A
D
 
V
W
 
C
P
 
R
L
 
L
S
 
S
R
 
V
K
 
K
F
 
F
G
 
G
C
 
A
D
 
T
P
 
L
E
 
K
M
 
T
A
 
S
R
 
R
D
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
E
R
 
R
A
 
A
A
 
K
A
 
E
L
 
L
D
 
N
V
 
I
V
 
D
P
 
V
Y
 
I
G
 
G
V
 
V
S
 
S
F
 
F
H
 
H
V
 
V
G
 
G
S
 
S
Q
 
G
Q
 
C
R
 
T
D
 
D
L
 
P
A
 
E
Q
 
T
W
 
F
D
 
V
A
 
Q
A
 
A
L
 
V
S
 
S
T
 
D
T
 
A
A
 
R
A
 
C
I
 
V
F
 
F
R
 
D
D
 
M
L
 
A
E
 
T
E
 
E
K
 
V
G
 
G
V
 
F
A
 
S
L
 
M
R
 
H
M
 
L
V
 
L
N
 
D
M
 
I
G
 
G
G
 
G
G
|
G
F
 
F
P
 
P
T
 
G
R
 
S
Y
 
E
R
 
D
T
 
T
D
 
K
V
 
L
P
 
K
G
 
-
T
 
F
D
 
E
E
 
E
Y
 
I
G
 
T
F
 
S
A
 
V
I
 
I
D
 
N
E
 
P
A
 
A
L
 
L
R
 
D
R
 
K
H
 
Y
F
 
F
-
 
P
-
 
S
-
 
D
-
 
S
G
 
G
N
 
V
R
 
R
I
 
I
P
 
-
E
 
-
T
 
-
I
 
I
V
 
A
E
|
E
P
|
P
G
|
G
R
|
R
G
 
Y
M
 
Y
V
 
V
G
 
A
D
 
S
A
 
A
G
 
F
I
 
T
I
 
L
Q
 
A
S
 
-
E
 
-
V
 
V
V
 
N
L
 
I
I
 
I
S
 
A
R
 
K
K
 
K
S
 
T
-
 
V
-
 
W
-
 
K
-
 
E
-
 
Q
-
 
P
-
 
G
-
x
S
-
 
D
-
 
D
-
 
E
-
 
D
-
 
E
A
 
S
N
 
N
D
 
E
L
 
Q
R
 
T
R
 
F
W
 
M
V
 
Y
Y
 
Y
L
 
V
D
 
N
I
 
D
G
 
G
K
 
V
F
 
Y
G
 
G
G
 
S
L
 
F
A
 
N
E
 
C
T
 
I
M
 
L
D
 
Y
E
 
D
A
 
H
I
 
A
Q
 
H
Y
 
V
P
 
K
I
 
A
E
 
L
T
 
L
E
 
Q
R
 
K
D
 
R
G
 
P
G
 
K
P
 
P
A
 
D
E
 
E
P
 
K
V
 
Y
I
 
Y
-
 
S
-
 
S
-
 
S
L
 
I
A
 
W
G
 
G
P
 
P
T
 
T
C
|
C
D
 
D
S
 
G
A
 
L
D
 
D
V
 
R
L
 
I
Y
 
V
E
 
E
R
 
R
A
 
C
E
 
-
Y
 
-
R
 
N
L
 
L
P
 
P
V
 
-
D
 
E
L
 
M
R
 
H
I
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
W
V
 
M
A
 
L
I
 
F
R
 
E
A
 
N
T
 
M
G
|
G
A
 
A
Y
|
Y
T
 
T
T
 
V
S
 
A
Y
 
-
S
 
A
A
 
A
V
 
S
N
 
T
F
 
F
N
 
N
G
 
G
F
 
F
A
 
Q
P
 
R
L
 
P
Q
 
N
A
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
I
 
V

1szrA A dimer interface mutant of ornithine decarboxylase reveals structure of gem diamine intermediate (see paper)
33% identity, 96% coverage: 17:376/376 of query aligns to 3:344/345 of 1szrA

query
sites
1szrA
P
 
P
C
 
F
L
 
F
V
 
V
V
 
A
D
 
D
L
 
L
D
 
G
V
 
D
V
 
I
A
 
V
R
 
R
N
 
K
Y
 
H
D
 
E
R
 
T
L
 
W
S
 
K
G
 
K
A
 
C
L
 
L
P
 
P
D
 
R
A
 
V
K
 
T
I
 
P
Y
 
F
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
K
|
K
A
 
C
N
 
N
P
 
D
A
 
D
P
 
W
E
 
R
I
 
V
L
 
L
R
 
G
L
 
T
L
 
L
T
 
A
G
 
A
L
 
L
G
 
G
S
 
T
S
 
G
F
 
F
D
 
D
T
 
C
A
 
A
S
 
S
V
 
N
P
 
T
E
 
E
I
 
I
E
 
Q
D
 
R
C
 
V
L
 
R
A
 
G
A
 
I
G
 
G
A
 
V
T
 
P
P
 
P
D
 
E
R
 
K
I
 
I
S
 
I
Y
 
Y
G
 
A
N
 
N
T
 
P
I
 
C
K
 
K
K
 
Q
A
 
I
A
 
S
D
 
H
I
 
I
R
 
R
R
 
Y
A
 
A
Y
 
R
E
 
D
L
 
S
G
 
G
V
 
V
R
 
D
L
 
V
F
 
M
A
 
T
F
 
F
D
 
D
S
 
C
E
 
V
A
 
D
E
 
E
L
 
L
E
 
E
K
 
K
I
 
V
A
 
A
A
 
K
N
 
T
A
 
H
P
 
P
G
 
K
S
 
A
R
 
K
V
 
M
F
 
V
C
 
L
R
 
R
I
 
I
L
 
S
T
 
T
S
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
-
W
 
-
P
 
-
L
 
-
S
 
-
R
 
-
K
 
-
F
 
-
G
 
G
C
 
A
D
 
K
P
 
V
E
 
E
M
 
D
A
 
C
R
 
R
D
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
E
R
 
Q
A
 
A
A
 
K
A
 
K
L
 
L
D
 
N
V
 
I
V
 
D
P
 
V
Y
 
T
G
 
G
V
 
V
S
 
S
F
 
F
H
|
H
V
 
V
G
 
G
S
 
S
Q
 
G
Q
 
S
R
 
T
D
 
D
L
 
A
A
 
S
Q
 
T
W
 
F
D
 
A
A
 
Q
A
 
A
L
 
I
S
 
S
T
 
D
T
 
S
A
 
R
A
 
F
I
 
V
F
 
F
R
 
D
D
 
M
L
 
G
E
 
T
E
 
E
K
 
L
G
 
G
V
 
F
A
 
N
L
 
M
R
 
H
M
 
I
V
 
L
N
 
D
M
 
I
G
 
G
G
 
G
G
|
G
F
 
F
P
 
P
-
 
G
T
 
T
R
 
R
Y
 
-
R
 
-
T
 
-
D
 
D
V
 
A
P
 
P
-
 
L
G
 
K
T
 
F
D
 
E
E
 
E
Y
 
I
G
 
A
F
 
G
A
 
V
I
 
I
D
 
N
E
 
N
A
 
A
L
 
L
R
 
E
R
 
K
H
 
H
F
 
F
G
 
P
N
 
P
R
 
D
I
 
L
P
 
K
E
 
L
T
 
T
I
 
I
V
 
V
-
 
A
E
|
E
P
 
P
G
|
G
R
|
R
G
 
Y
M
 
Y
V
 
V
G
 
A
D
 
S
A
 
A
G
 
F
I
 
T
I
 
L
Q
 
A
S
 
V
E
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
-
I
 
-
S
 
-
R
 
-
K
 
A
S
 
K
A
 
A
N
 
V
D
 
T
L
 
Q
R
 
S
R
 
F
W
 
M
V
 
Y
Y
 
Y
L
 
V
D
 
N
I
 
D
G
 
G
K
 
V
F
 
Y
G
 
G
G
 
S
L
 
F
A
 
N
E
 
C
T
 
I
M
 
L
-
 
Y
D
 
D
E
 
H
A
 
A
I
 
V
Q
 
V
Y
 
R
P
 
P
I
 
L
E
 
P
T
 
-
E
 
Q
R
 
R
D
 
E
G
 
P
G
 
I
P
 
P
A
 
N
E
 
E
-
 
K
-
 
L
-
 
Y
P
 
P
V
 
S
I
 
S
L
 
V
A
 
W
G
 
G
P
 
P
T
 
T
C
|
C
D
|
D
S
 
G
A
 
L
D
 
D
V
 
Q
L
 
I
Y
 
V
E
 
E
R
 
R
A
 
-
E
 
-
Y
 
Y
R
 
Y
L
 
L
P
 
P
V
 
-
D
 
E
L
 
M
R
 
Q
I
 
V
G
 
G
D
 
E
R
 
W
V
 
L
A
 
L
I
 
F
R
 
E
A
 
D
T
 
M
G
 
G
A
 
A
Y
|
Y
T
 
T
T
 
V
S
 
V
Y
 
G
S
 
T
A
 
S
V
 
-
N
 
S
F
 
F
N
 
N
G
 
G
F
 
F
A
 
Q
P
 
S
L
 
P
Q
 
T
A
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
I
 
V

1njjA Crystal structure determination of t. Brucei ornithine decarboxylase bound to d-ornithine and to g418 (see paper)
34% identity, 92% coverage: 13:359/376 of query aligns to 8:337/349 of 1njjA

query
sites
1njjA
R
 
K
P
 
K
A
 
G
T
 
D
P
 
P
C
 
F
L
 
F
V
 
V
V
 
A
D
 
D
L
 
L
D
 
G
V
 
D
V
 
I
A
 
V
R
 
R
N
 
K
Y
 
H
D
 
E
R
 
T
L
 
W
S
 
K
G
 
K
A
 
C
L
 
L
P
 
P
D
 
R
A
 
V
K
 
T
I
 
P
Y
 
F
Y
 
Y
A
|
A
V
 
V
K
|
K
A
 
C
N
 
N
P
 
D
A
 
D
P
 
W
E
 
R
I
 
V
L
 
L
R
 
G
L
 
T
L
 
L
T
 
A
G
 
A
L
 
L
G
 
G
S
 
T
S
 
G
F
 
F
D
 
D
T
 
C
A
 
A
S
 
S
V
 
N
P
 
T
E
 
E
I
 
I
E
 
Q
D
 
R
C
 
V
L
 
R
A
 
G
A
 
I
G
 
G
A
 
V
T
 
P
P
 
P
D
 
E
R
 
K
I
 
I
S
 
I
Y
 
Y
G
 
A
N
 
N
T
 
P
I
 
C
K
 
K
K
 
Q
A
 
I
A
 
S
D
 
H
I
 
I
R
 
R
R
 
Y
A
 
A
Y
 
R
E
 
D
L
 
S
G
 
G
V
 
V
R
 
D
L
 
V
F
 
M
A
 
T
F
 
F
D
 
D
S
 
C
E
 
V
A
 
D
E
 
E
L
 
L
E
 
E
K
 
K
I
 
V
A
 
A
A
 
K
N
 
T
A
 
H
P
 
P
G
 
K
S
 
A
R
 
K
V
 
M
F
 
V
C
 
L
R
 
R
I
 
I
L
 
S
T
 
T
S
 
V
G
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
-
W
 
-
P
 
-
L
 
-
S
 
-
R
 
-
K
 
K
F
 
F
G
 
G
C
 
A
D
 
K
P
 
V
E
 
E
M
 
D
A
 
C
R
 
R
D
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
E
R
 
Q
A
 
A
A
 
K
A
 
K
L
 
L
D
 
N
V
 
I
V
 
D
P
 
V
Y
 
T
G
 
G
V
 
V
S
 
S
F
 
F
H
|
H
V
 
V
G
 
G
S
 
S
Q
 
G
Q
 
S
R
 
T
D
 
D
L
 
A
A
 
S
Q
 
T
W
 
F
D
 
A
A
 
Q
A
 
A
L
 
I
S
 
S
T
 
D
T
 
S
A
 
R
A
 
F
I
 
V
F
 
F
R
 
D
D
 
M
L
 
G
E
 
T
E
 
E
K
 
L
G
 
G
V
 
F
A
 
N
L
 
M
R
 
H
M
 
I
V
 
L
N
 
D
M
 
I
G
 
G
G
|
G
G
|
G
F
 
F
P
 
P
-
 
G
T
 
T
R
 
R
Y
 
-
R
 
-
T
 
-
D
|
D
V
 
A
P
 
P
-
 
L
G
 
K
T
 
F
D
 
E
E
 
E
Y
 
I
G
 
A
F
 
G
A
 
V
I
 
I
D
 
N
E
 
N
A
 
A
L
 
L
R
 
E
R
 
K
H
 
H
F
 
F
G
 
P
N
 
P
R
 
D
I
 
L
P
 
K
E
 
L
T
 
T
I
 
I
V
 
V
-
 
A
E
|
E
P
 
P
G
|
G
R
|
R
G
 
Y
M
 
Y
V
 
V
G
 
A
D
 
S
A
 
A
G
 
F
I
 
T
I
 
L
Q
 
A
S
 
V
E
 
N
V
 
V
V
 
-
L
 
-
I
 
I
S
 
A
R
 
K
K
 
K
S
 
V
A
 
T
N
 
Q
D
 
S
L
 
F
R
 
M
R
 
-
W
 
-
V
 
Y
Y
 
Y
L
 
V
D
 
N
I
 
D
G
 
G
K
 
V
F
 
Y
G
 
G
G
 
S
L
 
F
A
 
N
E
 
C
T
 
I
M
 
L
-
x
Y
D
|
D
E
 
H
A
 
A
I
 
V
Q
 
V
Y
 
R
P
 
P
I
x
L
E
 
P
T
 
-
E
 
Q
R
 
R
D
 
E
G
 
P
G
 
E
P
 
K
A
 
L
E
 
Y
P
 
P
V
 
S
I
 
S
L
 
V
A
 
W
G
 
G
P
 
P
T
 
T
C
 
C
D
 
D
S
 
G
A
 
L
D
 
D
V
 
Q
L
 
I
Y
 
V
E
 
E
R
 
R
A
 
-
E
 
-
Y
 
Y
R
 
Y
L
 
L
P
 
P
V
 
-
D
 
E
L
 
M
R
 
Q
I
 
V
G
 
G
D
 
E
R
 
W
V
 
L
A
x
L
I
 
F
R
x
E
A
x
D
T
 
M
G
 
G
A
 
A
Y
|
Y
T
 
T
T
 
V
S
 
S

Sites not aligning to the query:

2nvaA The x-ray crystal structure of the paramecium bursaria chlorella virus arginine decarboxylase bound to agmatine (see paper)
29% identity, 96% coverage: 15:376/376 of query aligns to 22:369/369 of 2nvaA

query
sites
2nvaA
A
 
S
T
 
S
P
 
P
C
 
K
L
 
I
V
 
V
V
 
E
D
 
D
L
 
L
D
 
-
V
 
-
V
 
-
A
 
-
R
 
-
N
 
-
Y
 
I
D
 
D
R
 
Q
L
 
W
S
 
T
G
 
I
A
 
L
L
 
F
P
 
P
D
 
R
A
 
V
K
 
T
I
 
P
Y
 
H
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
K
|
K
A
 
C
N
 
N
P
 
N
A
 
D
P
 
E
E
 
V
I
 
L
L
 
L
R
 
K
L
 
T
L
 
M
T
 
C
G
 
D
L
 
K
G
 
N
S
 
V
S
 
N
F
 
F
D
|
D
T
 
C
A
 
A
S
 
S
V
 
S
P
 
S
E
 
E
I
 
I
E
 
K
D
 
K
C
 
V
L
 
I
A
 
Q
A
 
I
G
 
G
A
 
V
T
 
S
P
 
P
D
 
S
R
 
R
I
 
I
S
 
I
Y
 
F
G
 
A
N
 
H
T
 
T
I
 
M
K
 
K
K
 
T
A
 
I
A
 
D
D
 
D
I
 
L
R
 
I
R
 
F
A
 
A
Y
 
K
E
 
D
L
 
Q
G
 
G
V
 
V
R
 
D
L
 
I
F
 
A
A
 
T
F
 
F
D
 
D
S
 
S
E
 
S
A
 
F
E
 
E
L
 
L
E
 
D
K
 
K
I
 
I
A
 
H
A
 
T
N
 
Y
A
 
H
P
 
P
G
 
N
S
 
C
R
 
K
V
 
M
F
 
I
C
 
L
R
 
R
I
 
I
L
 
R
T
 
C
S
 
D
G
 
D
E
 
P
G
 
N
A
 
A
D
 
T
W
 
V
P
 
Q
L
|
L
S
 
G
R
 
N
K
 
K
F
 
F
G
 
G
C
 
A
D
 
N
P
 
E
E
 
D
M
 
E
A
 
I
R
 
R
D
 
H
L
 
L
L
 
L
L
 
E
R
 
Y
A
 
A
A
 
K
A
 
Q
L
 
L
D
 
D
V
 
I
V
 
E
P
 
V
Y
 
I
G
 
G
V
 
I
S
 
S
F
 
F
H
|
H
V
 
V
G
 
G
S
|
S
Q
 
G
Q
 
S
R
 
R
D
 
N
L
 
P
A
 
E
Q
 
A
W
 
Y
D
 
Y
A
 
R
A
 
A
L
 
I
S
 
K
T
 
S
T
 
S
A
 
K
A
 
E
I
 
A
F
 
F
R
 
N
D
 
E
L
 
A
E
 
I
E
 
S
K
 
V
G
 
G
V
 
H
A
 
K
L
 
P
R
 
Y
M
 
I
V
 
L
N
 
D
M
 
I
G
 
G
G
|
G
G
|
G
F
 
L
P
 
-
T
 
-
R
 
-
Y
 
-
R
 
H
T
 
A
D
 
D
V
 
I
P
 
D
G
 
L
T
 
S
D
 
T
E
 
Y
Y
 
M
G
 
S
F
 
D
A
 
Y
I
 
I
D
 
N
E
 
D
A
 
A
L
 
I
R
 
K
R
 
D
H
 
F
F
 
F
G
 
P
N
 
E
R
 
D
I
 
T
P
 
V
E
 
T
T
 
I
I
 
V
V
 
A
E
|
E
P
 
P
G
|
G
R
|
R
G
 
F
M
 
F
V
 
A
G
 
E
D
 
H
A
 
Y
G
 
S
I
 
V
I
 
L
Q
 
A
S
 
T
E
 
Q
V
 
V
V
 
-
L
 
-
I
 
I
S
 
G
R
 
K
K
 
R
S
 
V
A
 
R
N
 
D
D
 
G
L
 
L
R
 
Y
R
 
E
W
 
Y
V
 
-
Y
 
F
L
 
F
D
 
N
I
 
E
G
 
S
K
 
T
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
L
 
F
A
 
S
E
 
N
T
 
V
M
 
I
D
 
F
E
|
E
A
 
K
I
 
S
Q
 
V
Y
 
P
P
 
T
I
 
P
E
 
Q
T
 
L
E
 
L
R
 
R
D
 
D
G
 
V
G
 
P
P
 
D
A
 
D
E
 
E
-
 
E
-
 
Y
-
 
V
P
 
P
V
 
S
I
 
V
L
 
L
A
 
Y
G
 
G
P
 
C
T
 
T
C
|
C
D
|
D
S
 
G
A
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
I
Y
 
N
E
 
H
R
 
N
A
 
V
E
 
A
Y
 
-
R
 
-
L
 
L
P
 
P
V
 
-
D
 
E
L
 
L
R
 
H
I
 
I
G
 
G
D
 
D
R
 
W
V
 
V
A
 
Y
I
 
F
R
 
P
A
 
S
T
 
W
G
 
G
A
 
A
Y
|
Y
T
 
T
T
 
N
S
 
V
Y
 
L
S
 
T
A
 
T
V
 
-
N
 
S
F
 
F
N
 
N
G
 
G
F
 
F
A
 
G
P
 
E
L
 
Y
Q
 
D
A
 
V
Y
 
Y
Y
 
Y
I
 
I

2nv9B The x-ray crystal structure of the paramecium bursaria chlorella virus arginine decarboxylase (see paper)
29% identity, 96% coverage: 15:376/376 of query aligns to 22:372/372 of 2nv9B

query
sites
2nv9B
A
 
S
T
 
S
P
 
P
C
 
K
L
 
I
V
 
V
V
 
E
D
 
D
L
 
L
D
 
-
V
 
-
V
 
-
A
 
-
R
 
-
N
 
-
Y
 
I
D
 
D
R
 
Q
L
 
W
S
 
T
G
 
I
A
 
L
L
 
F
P
 
P
D
 
R
A
 
V
K
 
T
I
 
P
Y
 
H
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
K
|
K
A
 
C
N
 
N
P
 
N
A
 
D
P
 
E
E
 
V
I
 
L
L
 
L
R
 
K
L
 
T
L
 
M
T
 
C
G
 
D
L
 
K
G
 
N
S
 
V
S
 
N
F
 
F
D
|
D
T
 
C
A
 
A
S
 
S
V
 
S
P
 
S
E
 
E
I
 
I
E
 
K
D
 
K
C
 
V
L
 
I
A
 
Q
A
 
I
G
 
G
A
 
V
T
 
S
P
 
P
D
 
S
R
 
R
I
 
I
S
 
I
Y
 
F
G
 
A
N
 
H
T
 
T
I
 
M
K
 
K
K
 
T
A
 
I
A
 
D
D
 
D
I
 
L
R
 
I
R
 
F
A
 
A
Y
 
K
E
 
D
L
 
Q
G
 
G
V
 
V
R
 
D
L
 
I
F
 
A
A
 
T
F
 
F
D
 
D
S
 
S
E
 
S
A
 
F
E
 
E
L
 
L
E
 
D
K
 
K
I
 
I
A
 
H
A
 
T
N
 
Y
A
 
H
P
 
P
G
 
N
S
 
C
R
 
K
V
 
M
F
 
I
C
 
L
R
 
R
I
 
I
L
 
R
T
 
C
S
 
D
G
 
D
E
 
P
G
 
N
A
 
A
D
 
A
W
 
V
P
 
Q
L
 
L
S
 
G
R
 
N
K
 
K
F
 
F
G
 
G
C
 
A
D
 
N
P
 
E
E
 
D
M
 
E
A
 
I
R
 
R
D
 
H
L
 
L
L
 
L
L
 
E
R
 
Y
A
 
A
A
 
K
A
 
Q
L
 
L
D
 
D
V
 
I
V
 
E
P
 
V
Y
 
I
G
 
G
V
 
I
S
 
S
F
 
F
H
|
H
V
 
V
G
 
G
S
|
S
Q
 
G
Q
 
S
R
 
R
D
 
N
L
 
P
A
 
E
Q
 
A
W
 
Y
D
 
Y
A
 
R
A
 
A
L
 
I
S
 
K
T
 
S
T
 
S
A
 
K
A
 
E
I
 
A
F
 
F
R
 
N
D
 
E
L
 
A
E
 
I
E
 
S
K
 
V
G
 
G
V
 
H
A
 
K
L
 
P
R
 
Y
M
 
I
V
 
L
N
 
D
M
 
I
G
 
G
G
|
G
G
|
G
F
 
L
P
 
H
-
 
A
-
 
D
-
 
I
-
 
D
-
 
E
-
 
G
-
 
E
-
 
L
T
 
S
R
 
T
Y
 
Y
R
 
M
T
 
S
D
 
D
V
 
Y
P
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
E
 
-
Y
 
-
G
 
-
F
 
-
A
 
-
I
 
I
D
 
N
E
 
D
A
 
A
L
 
I
R
 
K
R
 
D
H
 
F
F
 
F
G
 
P
N
 
E
R
 
D
I
 
T
P
 
V
E
 
T
T
 
I
I
 
V
V
 
A
E
|
E
P
 
P
G
|
G
R
|
R
G
 
F
M
 
F
V
 
A
G
 
E
D
 
H
A
 
Y
G
 
S
I
 
V
I
 
L
Q
 
A
S
 
T
E
 
Q
V
 
V
V
 
-
L
 
-
I
 
I
S
 
G
R
 
K
K
 
R
S
 
V
A
 
R
N
 
D
D
 
G
L
 
L
R
 
Y
R
 
E
W
 
Y
V
 
-
Y
 
F
L
 
F
D
 
N
I
 
E
G
 
S
K
 
T
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
L
 
F
A
 
S
E
 
N
T
 
V
M
 
I
D
 
F
E
 
E
A
 
K
I
 
S
Q
 
V
Y
 
P
P
 
T
I
 
P
E
 
Q
T
 
L
E
 
L
R
 
R
D
 
D
G
 
V
G
 
P
P
 
D
A
 
D
E
 
E
-
 
E
-
 
Y
-
 
V
P
 
P
V
 
S
I
 
V
L
 
L
A
 
Y
G
 
G
P
 
C
T
 
T
C
 
C
D
 
D
S
 
G
A
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
I
Y
 
N
E
 
H
R
 
N
A
 
V
E
 
-
Y
 
-
R
 
A
L
 
L
P
 
P
V
 
-
D
 
E
L
 
L
R
 
H
I
 
I
G
 
G
D
 
D
R
 
W
V
 
V
A
 
Y
I
 
F
R
 
P
A
 
S
T
 
W
G
 
G
A
 
A
Y
|
Y
T
 
T
T
 
N
S
 
V
Y
 
L
S
 
T
A
 
T
V
 
-
N
 
S
F
 
F
N
 
N
G
 
G
F
 
F
A
 
G
P
 
E
L
 
Y
Q
 
D
A
 
V
Y
 
Y
Y
 
Y
I
 
I

Query Sequence

>WP_012568157.1 NCBI__GCF_000016185.1:WP_012568157.1
MTEKIARFFAENRPATPCLVVDLDVVARNYDRLSGALPDAKIYYAVKANPAPEILRLLTG
LGSSFDTASVPEIEDCLAAGATPDRISYGNTIKKAADIRRAYELGVRLFAFDSEAELEKI
AANAPGSRVFCRILTSGEGADWPLSRKFGCDPEMARDLLLRAAALDVVPYGVSFHVGSQQ
RDLAQWDAALSTTAAIFRDLEEKGVALRMVNMGGGFPTRYRTDVPGTDEYGFAIDEALRR
HFGNRIPETIVEPGRGMVGDAGIIQSEVVLISRKSANDLRRWVYLDIGKFGGLAETMDEA
IQYPIETERDGGPAEPVILAGPTCDSADVLYERAEYRLPVDLRIGDRVAIRATGAYTTSY
SAVNFNGFAPLQAYYI

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory