SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012568784.1 NCBI__GCF_000016185.1:WP_012568784.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 8 hits to proteins with known functional sites (download)

1wyuB Crystal structure of glycine decarboxylase (p-protein) of the glycine cleavage system, in holo form (see paper)
49% identity, 90% coverage: 35:511/528 of query aligns to 3:469/473 of 1wyuB

query
sites
1wyuB
P
 
P
L
 
L
L
 
I
F
 
F
E
 
E
L
 
R
D
 
S
N
 
R
P
 
K
G
 
G
V
 
R
C
 
R
G
 
G
V
 
L
D
 
K
L
 
L
P
 
V
E
 
K
P
 
A
-
 
V
P
 
P
T
 
K
A
 
A
E
 
E
-
 
D
-
 
L
-
 
I
-
 
P
-
 
K
L
 
E
R
 
H
L
 
L
G
 
R
K
 
E
V
 
V
R
 
P
P
 
P
R
 
R
G
 
-
T
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
L
P
 
P
S
 
E
V
 
V
S
 
D
E
 
E
P
 
L
E
 
T
V
 
L
V
 
V
R
 
R
H
 
H
Y
 
Y
T
 
T
R
 
G
L
 
L
S
 
S
Q
 
R
K
 
R
N
 
Q
F
 
V
G
 
G
I
 
V
D
 
D
S
 
T
T
 
T
M
 
F
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
G
 
G
S
|
S
C
 
C
T
 
T
M
 
M
K
 
K
H
 
Y
N
 
N
P
 
P
R
 
K
L
 
L
N
 
H
E
 
E
K
 
E
M
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
L
P
 
-
G
 
-
F
 
F
S
 
A
D
 
D
I
 
L
H
 
H
P
 
P
L
 
Y
Q
 
Q
P
 
D
V
 
P
S
 
R
T
 
T
V
 
A
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
L
 
L
E
 
R
L
 
L
I
 
M
D
 
W
A
 
E
L
 
L
A
 
G
H
 
E
W
 
Y
L
 
L
K
 
K
T
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
M
 
M
P
 
D
A
 
A
V
 
I
A
 
T
M
 
L
S
 
E
P
 
P
A
 
A
A
|
A
G
|
G
A
|
A
H
 
H
G
 
G
E
 
E
L
 
L
C
 
T
G
 
G
L
 
I
M
 
L
A
 
I
I
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
Y
L
 
H
A
 
E
A
 
D
R
 
R
G
 
G
E
 
E
A
 
G
H
 
R
R
 
T
R
 
R
R
 
R
-
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
V
P
 
P
E
 
D
S
 
S
A
 
A
H
|
H
G
 
G
T
 
S
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
T
A
 
A
A
 
S
F
 
M
C
 
A
G
 
G
F
 
Y
A
 
Q
V
 
V
D
 
R
S
 
E
I
 
I
P
 
P
A
 
S
E
 
G
D
 
P
D
 
E
G
 
G
R
 
E
V
 
V
S
 
D
V
 
L
A
 
E
A
 
A
V
 
L
K
 
K
A
 
R
K
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
H
V
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
L
M
 
M
L
 
L
T
 
T
N
 
N
P
 
P
N
 
N
T
 
T
C
 
L
G
 
G
L
 
L
F
 
F
E
 
E
P
 
R
Q
 
R
I
 
I
R
 
L
E
 
E
I
 
I
A
 
S
D
 
R
A
 
L
V
 
C
H
 
K
A
 
E
A
 
A
G
 
G
G
 
V
Y
 
Q
F
 
L
Y
 
Y
C
 
Y
D
|
D
G
 
G
A
|
A
N
 
N
Y
 
L
N
 
N
A
 
A
I
 
I
V
 
M
G
 
G
R
 
W
V
 
A
R
 
R
P
 
P
A
 
G
D
 
D
L
 
M
G
 
G
V
 
F
D
 
D
A
 
V
M
 
V
H
 
H
I
 
L
N
|
N
L
 
L
H
|
H
K
|
K
T
 
T
F
 
F
S
 
T
T
 
V
P
 
P
H
 
H
G
 
G
G
 
G
G
 
G
G
 
G
P
 
P
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
V
 
V
V
 
G
L
 
V
S
 
K
A
 
A
A
 
H
L
 
L
A
 
A
P
 
P
F
 
Y
A
 
L
P
 
P
L
 
V
P
 
P
Y
 
L
V
 
V
V
 
E
H
 
R
G
 
G
E
 
E
D
 
E
G
 
G
F
 
F
R
 
Y
L
 
L
V
 
D
E
 
F
H
 
D
A
 
R
G
 
P
E
 
K
A
 
S
E
 
-
G
 
-
H
 
-
P
 
-
F
 
I
G
 
G
R
 
R
M
 
V
K
 
R
G
 
S
F
 
F
H
 
Y
G
 
G
Q
 
N
M
 
F
G
 
L
M
 
A
F
 
L
V
 
V
R
 
R
A
 
A
L
 
W
A
 
A
Y
 
Y
M
 
I
L
 
R
S
 
T
H
 
L
G
 
G
G
 
L
D
 
E
G
 
G
L
 
L
R
 
K
Q
 
K
A
 
A
A
 
A
S
 
A
D
 
L
A
 
A
V
 
V
L
 
L
N
 
N
A
 
A
N
 
R
Y
 
Y
V
 
L
L
 
K
A
 
E
S
 
L
L
 
L
K
 
K
D
 
E
V
 
K
-
 
G
M
 
Y
S
 
R
A
 
V
S
 
P
F
 
Y
E
 
D
G
 
G
P
 
P
C
 
S
M
 
M
H
 
H
E
 
E
A
 
F
L
 
V
F
 
A
D
 
Q
D
 
-
R
 
-
F
 
-
L
 
-
K
 
P
G
 
P
T
 
E
G
 
G
I
 
F
T
 
R
P
 
A
L
 
L
D
 
D
F
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
G
L
 
L
I
 
L
D
 
E
E
 
L
G
 
G
F
 
F
H
 
H
P
 
P
M
 
P
T
 
T
M
 
V
Y
 
Y
F
 
F
P
 
P
L
 
L
V
 
I
V
 
V
Q
 
K
G
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
M
I
 
V
E
 
E
P
 
P
T
 
T
E
 
E
T
 
T
E
 
E
S
 
A
K
 
K
Q
 
E
T
 
T
L
 
L
D
 
E
Q
 
A
F
 
F
I
 
A
G
 
E
T
 
A
L
 
M
R
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
L
E
 
K
R
 
K
A
 
P
K
 
K
T
 
-
G
 
-
D
 
-
E
 
-
E
 
E
Y
 
W
F
 
L
H
 
E
G
 
N
A
 
A
P
 
P
R
 
Y
L
 
S
T
 
T
P
 
P
R
 
V
R
 
R
R
 
R
L
 
L
D
 
D
E
 
E
T
 
L
A
 
R
A
 
A
A
 
N
R
 
K
K
 
H
P
 
P
V
 
K
L
 
L
R
 
T
W
 
Y

P15505 Glycine dehydrogenase (decarboxylating), mitochondrial; Glycine cleavage system P protein; Glycine decarboxylase; Glycine dehydrogenase (aminomethyl-transferring); EC 1.4.4.2 from Gallus gallus (Chicken) (see paper)
38% identity, 85% coverage: 75:521/528 of query aligns to 514:954/1004 of P15505

query
sites
P15505
S
 
S
E
 
E
P
 
T
E
 
N
V
 
I
V
 
V
R
 
R
H
 
Y
Y
 
M
T
 
K
R
 
R
L
 
L
S
 
E
Q
 
N
K
 
K
N
 
D
F
 
I
G
 
S
I
 
L
D
 
V
S
 
H
T
 
S
M
 
M
Y
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
S
 
S
C
 
C
T
 
T
M
 
M
K
 
K
H
 
L
N
 
N
P
 
S
R
 
S
L
 
A
N
 
E
E
 
L
K
 
A
M
 
P
A
 
I
R
 
S
L
 
W
P
 
K
G
 
E
F
 
F
S
 
A
D
 
N
I
 
I
H
 
H
P
 
P
L
 
F
Q
 
V
P
 
P
V
 
L
S
 
D
T
 
Q
V
 
A
Q
 
Q
G
 
G
A
 
Y
L
 
Q
E
 
Q
L
 
L
I
 
F
D
 
K
A
 
D
L
 
L
A
 
E
H
 
K
W
 
D
L
 
L
K
 
C
T
 
E
L
 
I
T
 
T
G
 
G
M
 
Y
P
 
D
A
 
K
V
 
I
A
 
S
M
 
F
S
 
Q
P
 
P
A
 
N
A
 
S
G
 
G
A
 
A
H
 
Q
G
 
G
E
 
E
L
 
Y
C
 
A
G
 
G
L
 
L
M
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
K
A
 
A
A
 
Y
L
 
L
A
 
N
A
 
A
R
 
K
G
 
G
E
 
E
A
 
R
H
 
H
R
 
R
R
 
S
R
 
V
V
 
C
L
 
L
V
 
I
P
 
P
E
 
R
S
 
S
A
 
A
H
 
H
G
 
G
T
 
T
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
S
A
 
A
A
 
Q
F
 
M
C
 
A
G
 
G
F
 
M
A
 
K
V
 
I
D
 
Q
S
 
P
I
 
I
P
 
E
A
 
V
E
 
D
D
 
K
D
 
N
G
 
G
R
 
S
V
 
I
S
 
D
V
 
I
A
 
S
A
 
H
V
 
L
K
 
K
A
 
A
-
 
M
-
 
V
-
 
D
K
 
K
L
 
H
G
 
K
P
 
E
D
 
N
V
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
I
M
 
M
L
 
I
T
 
T
N
 
Y
P
 
P
N
 
S
T
 
T
C
 
N
G
 
G
L
 
V
F
 
F
E
 
E
P
 
E
Q
 
E
I
 
I
R
 
G
E
 
D
I
 
V
A
 
C
D
 
D
A
 
L
V
 
I
H
 
H
A
 
K
A
 
H
G
 
G
G
 
G
Y
 
Q
F
 
V
Y
 
Y
C
 
L
D
 
D
G
 
G
A
 
A
N
 
N
Y
 
M
N
 
N
A
 
A
I
 
Q
V
 
V
G
 
G
R
 
L
V
 
C
R
 
R
P
 
P
A
 
G
D
 
D
L
 
Y
G
 
G
V
 
S
D
 
D
A
 
V
M
 
S
H
 
H
I
 
L
N
 
N
L
 
L
H
 
H
K
|
K
T
 
T
F
 
F
S
 
C
T
 
I
P
 
P
H
 
H
G
 
G
G
 
G
G
 
G
G
 
G
P
 
P
G
 
G
S
 
M
G
 
G
P
 
P
V
 
I
V
 
G
L
 
V
S
 
K
A
 
K
A
 
H
L
 
L
A
 
A
P
 
P
F
 
Y
A
 
L
P
 
P
L
 
T
P
 
H
Y
 
P
V
 
V
V
 
I
H
 
K
G
 
I
E
 
Q
D
 
T
G
 
-
F
 
-
R
 
-
L
 
-
V
 
-
E
 
-
H
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
D
A
 
K
E
 
D
G
 
A
H
 
C
P
 
P
F
 
L
G
 
G
R
 
T
M
 
V
K
 
S
G
 
A
F
 
A
-
 
P
H
 
W
G
 
G
Q
 
S
M
 
S
G
 
A
M
 
I
F
 
L
V
 
P
R
 
I
A
 
S
L
 
W
A
 
V
Y
 
Y
M
 
I
L
 
K
S
 
T
H
 
M
G
 
G
G
 
A
D
 
K
G
 
G
L
 
L
R
 
K
Q
 
H
A
 
A
A
 
S
S
 
E
D
 
I
A
 
A
V
 
I
L
 
L
N
 
N
A
 
A
N
 
N
Y
 
Y
V
 
M
L
 
A
A
 
K
S
 
R
L
 
L
K
 
E
-
 
K
-
 
H
-
 
Y
D
 
K
V
 
I
M
 
L
S
 
F
A
 
R
S
 
G
F
 
V
E
 
R
G
 
G
P
 
Y
C
 
V
M
 
A
H
 
H
E
 
E
A
 
F
L
 
I
F
 
L
D
 
D
D
 
T
R
 
R
-
 
P
F
 
F
L
 
K
K
 
K
G
 
T
T
 
A
G
 
N
I
 
I
T
 
E
P
 
A
L
 
V
D
 
D
F
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
R
L
 
L
I
 
Q
D
 
D
E
 
Y
G
 
G
F
 
F
H
 
H
P
 
A
M
 
P
T
 
T
M
 
M
Y
 
S
F
 
W
P
 
P
L
 
-
V
 
-
V
 
V
Q
 
A
G
 
G
A
 
T
L
 
L
L
 
M
I
 
I
E
 
E
P
 
P
T
 
T
E
 
E
T
 
S
E
 
E
S
 
D
K
 
K
Q
 
G
T
 
E
L
 
L
D
 
D
Q
 
R
F
 
F
I
 
C
G
 
D
T
 
A
L
 
M
R
 
I
A
 
S
L
 
I
A
 
-
E
 
-
R
 
R
A
 
Q
K
 
E
T
 
I
G
 
A
D
 
D
E
 
I
E
 
E
Y
 
E
F
 
G
H
 
R
G
 
M
A
 
D
P
 
P
R
 
Q
L
 
V
T
 
N
P
 
P
R
 
L
R
 
K
R
 
M
L
 
S
D
 
P
E
 
H
T
 
T
A
 
L
A
 
N
A
 
C
R
 
V
K
 
T
P
 
S
V
 
S
L
 
-
R
 
K
W
 
W
T
 
D
R
 
R
P
 
P
A
 
Y
P
 
S
A
 
R
A
 
E
Q
 
V
A
 
A
A
 
A

6i34B Crystal structure of neanderthal glycine decarboxylase (p-protein)
40% identity, 80% coverage: 75:496/528 of query aligns to 480:896/954 of 6i34B

query
sites
6i34B
S
 
S
E
 
E
P
 
T
E
 
N
V
 
I
V
 
V
R
 
R
H
 
Y
Y
 
M
T
 
K
R
 
K
L
 
L
S
 
E
Q
 
N
K
 
K
N
 
D
F
 
I
G
 
S
I
 
L
D
 
V
S
 
H
T
 
S
M
 
M
Y
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
S
|
S
C
 
C
T
 
T
M
 
M
K
 
K
H
 
L
N
 
N
P
 
S
R
 
S
L
 
S
N
 
E
E
 
L
K
 
A
M
 
P
A
 
I
R
 
T
L
 
W
P
 
K
G
 
E
F
 
F
S
 
A
D
 
N
I
 
I
H
 
H
P
 
P
L
 
F
Q
 
V
P
 
P
V
 
L
S
 
D
T
 
Q
V
 
A
Q
 
Q
G
 
G
A
 
Y
L
 
Q
E
 
Q
L
 
L
I
 
F
D
 
R
A
 
E
L
 
L
A
 
E
H
 
K
W
 
D
L
 
L
K
 
C
T
 
E
L
 
L
T
 
T
G
 
G
M
 
Y
P
 
D
A
 
Q
V
 
V
A
 
C
M
 
F
S
 
Q
P
 
P
A
 
N
A
 
S
G
|
G
A
|
A
H
 
Q
G
 
G
E
 
E
L
 
Y
C
 
A
G
 
G
L
 
L
M
 
A
A
 
T
I
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
Y
L
 
L
A
 
N
A
 
Q
R
 
K
G
 
G
E
 
E
A
 
G
H
 
H
R
 
R
R
 
T
R
 
V
V
 
C
L
 
L
V
 
I
P
 
P
E
 
K
S
 
S
A
 
A
H
|
H
G
 
G
T
 
T
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
S
A
 
A
A
 
H
F
 
M
C
 
A
G
 
G
F
 
M
A
 
K
V
 
I
D
 
Q
S
 
P
I
 
V
P
 
E
A
 
V
E
 
D
D
 
K
D
 
Y
G
 
G
R
 
N
V
 
I
S
 
D
V
 
A
A
 
V
A
 
H
V
 
L
K
 
K
A
 
A
-
 
M
-
 
V
-
 
D
K
 
K
L
 
H
G
 
K
P
 
E
D
 
N
V
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
I
M
 
M
L
 
I
T
 
T
N
 
Y
P
 
P
N
 
S
T
 
T
C
 
N
G
 
G
L
 
V
F
 
F
E
 
E
P
 
E
Q
 
N
I
 
I
R
 
S
E
 
D
I
 
V
A
 
C
D
 
D
A
 
L
V
 
I
H
 
H
A
 
Q
A
 
H
G
 
G
G
 
G
Y
 
Q
F
 
V
Y
 
Y
C
 
L
D
|
D
G
 
G
A
|
A
N
 
N
Y
 
M
N
 
N
A
 
A
I
 
Q
V
 
V
G
 
G
R
 
I
V
 
C
R
 
R
P
 
P
A
 
G
D
 
D
L
 
F
G
 
G
V
 
S
D
 
D
A
 
V
M
 
S
H
 
H
I
 
L
N
|
N
L
 
L
H
|
H
K
|
K
T
 
T
F
 
F
S
 
C
T
 
I
P
 
P
H
 
H
G
 
G
G
 
G
G
 
G
G
 
G
P
 
P
G
 
G
S
 
M
G
 
G
P
 
P
V
 
I
V
 
G
L
 
V
S
 
K
A
 
K
A
 
H
L
 
L
A
 
A
P
 
P
F
 
F
A
 
L
P
 
P
L
 
N
P
 
H
Y
 
P
V
 
V
V
 
I
-
 
S
-
 
L
-
 
K
H
 
R
G
 
N
E
 
E
D
 
D
G
 
A
F
 
C
R
 
P
L
 
V
V
 
-
E
 
-
H
 
-
A
 
-
G
 
G
E
 
T
A
 
V
E
 
S
G
 
A
H
 
A
P
 
P
F
 
W
G
 
-
R
 
-
M
 
-
K
 
-
G
 
-
F
 
-
H
 
-
G
 
G
Q
 
S
M
 
S
G
 
S
M
 
I
F
 
L
V
 
P
R
 
I
A
 
S
L
 
W
A
 
A
Y
 
Y
M
 
I
L
 
K
S
 
M
H
 
M
G
 
G
G
 
G
D
 
K
G
 
G
L
 
L
R
 
K
Q
 
Q
A
 
A
A
 
T
S
 
E
D
 
T
A
 
A
V
 
I
L
 
L
N
 
N
A
 
A
N
 
N
Y
 
Y
V
 
M
L
 
A
A
 
K
S
 
R
L
 
L
K
 
E
D
 
T
V
 
H
M
 
Y
S
 
R
A
 
I
S
 
L
F
 
F
E
 
R
G
 
G
P
 
A
-
 
R
-
 
G
-
 
Y
C
 
V
M
 
G
H
 
H
E
 
E
A
 
F
L
 
I
F
 
L
D
 
D
D
 
T
R
 
R
-
 
P
F
 
F
L
 
K
K
 
K
G
 
S
T
 
A
G
 
N
I
 
I
T
 
E
P
 
A
L
 
V
D
 
D
F
 
V
A
 
A
K
 
K
A
 
R
L
 
L
I
 
Q
D
 
D
E
 
Y
G
 
G
F
 
F
H
 
H
P
 
A
M
 
P
T
 
T
M
 
M
Y
 
S
F
 
W
P
 
P
L
 
-
V
 
-
V
 
V
Q
 
A
G
 
G
A
 
T
L
 
L
L
 
M
I
 
V
E
 
E
P
 
P
T
 
T
E
 
E
T
 
S
E
 
E
S
 
D
K
 
K
Q
 
A
T
 
E
L
 
L
D
 
D
Q
 
R
F
 
F
I
 
C
G
 
D
T
 
A
L
 
M
R
 
I
A
 
S
L
 
I
A
 
-
E
 
-
R
 
R
A
 
Q
K
 
E
T
 
I
G
 
A
D
 
D
E
 
I
E
 
E
Y
 
E
F
 
G
H
 
R
G
 
I
A
 
D
P
 
P
R
 
R
L
 
V
T
 
N
P
 
P
R
 
L
R
 
K

Sites not aligning to the query:

6i35A Crystal structure of human glycine decarboxylase (p-protein) bound with pyridoxyl-glycine-5'-monophosphate
40% identity, 80% coverage: 75:496/528 of query aligns to 478:894/953 of 6i35A

query
sites
6i35A
S
 
S
E
 
E
P
 
T
E
 
N
V
 
I
V
 
V
R
 
R
H
 
Y
Y
 
M
T
 
K
R
 
K
L
 
L
S
 
E
Q
 
N
K
 
K
N
 
D
F
 
I
G
 
S
I
 
L
D
 
V
S
 
H
T
 
S
M
 
M
Y
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
S
|
S
C
|
C
T
 
T
M
 
M
K
 
K
H
 
L
N
 
N
P
 
S
R
 
S
L
 
S
N
 
E
E
 
L
K
 
A
M
 
P
A
 
I
R
 
T
L
 
W
P
 
K
G
 
E
F
 
F
S
 
A
D
 
N
I
 
I
H
 
H
P
 
P
L
 
F
Q
 
V
P
 
P
V
 
L
S
 
D
T
 
Q
V
 
A
Q
 
Q
G
 
G
A
 
Y
L
 
Q
E
 
Q
L
 
L
I
 
F
D
 
R
A
 
E
L
 
L
A
 
E
H
 
K
W
 
D
L
 
L
K
 
C
T
 
E
L
 
L
T
 
T
G
 
G
M
 
Y
P
 
D
A
 
Q
V
 
V
A
 
C
M
 
F
S
 
Q
P
 
P
A
 
N
A
 
S
G
|
G
A
|
A
H
 
Q
G
 
G
E
 
E
L
 
Y
C
 
A
G
 
G
L
 
L
M
 
A
A
 
T
I
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
Y
L
 
L
A
 
N
A
 
Q
R
 
K
G
 
G
E
 
E
A
 
G
H
 
H
R
 
R
R
 
T
R
 
V
V
 
C
L
 
L
V
 
I
P
 
P
E
 
K
S
 
S
A
 
A
H
|
H
G
 
G
T
|
T
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
S
A
 
A
A
 
H
F
 
M
C
 
A
G
 
G
F
 
M
A
 
K
V
 
I
D
 
Q
S
 
P
I
 
V
P
 
E
A
 
V
E
 
D
D
 
K
D
 
Y
G
 
G
R
 
N
V
 
I
S
 
D
V
 
A
A
 
V
A
 
H
V
 
L
K
 
K
A
 
A
-
 
M
-
 
V
-
 
D
K
 
K
L
 
H
G
 
K
P
 
E
D
 
N
V
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
I
M
 
M
L
 
I
T
 
T
N
 
Y
P
 
P
N
 
S
T
 
T
C
 
N
G
 
G
L
 
V
F
 
F
E
 
E
P
 
E
Q
 
N
I
 
I
R
 
S
E
 
D
I
 
V
A
 
C
D
 
D
A
 
L
V
 
I
H
 
H
A
 
Q
A
 
H
G
 
G
G
 
G
Y
 
Q
F
 
V
Y
 
Y
C
 
L
D
|
D
G
 
G
A
|
A
N
 
N
Y
 
M
N
 
N
A
 
A
I
 
Q
V
 
V
G
 
G
R
 
I
V
 
C
R
 
R
P
 
P
A
 
G
D
 
D
L
 
F
G
 
G
V
 
S
D
 
D
A
 
V
M
 
S
H
 
H
I
 
L
N
|
N
L
 
L
H
|
H
K
 
K
T
 
T
F
 
F
S
 
C
T
 
I
P
 
P
H
 
H
G
 
G
G
 
G
G
 
G
G
 
G
P
 
P
G
 
G
S
 
M
G
 
G
P
 
P
V
 
I
V
 
G
L
 
V
S
 
K
A
 
K
A
 
H
L
 
L
A
 
A
P
 
P
F
 
F
A
 
L
P
 
P
L
 
N
P
 
H
Y
 
P
V
 
V
V
 
I
-
 
S
-
 
L
-
 
K
H
 
R
G
 
N
E
 
E
D
 
D
G
 
A
F
 
C
R
 
P
L
 
V
V
 
-
E
 
-
H
 
-
A
 
-
G
 
G
E
 
T
A
 
V
E
 
S
G
 
A
H
 
A
P
 
P
F
 
W
G
 
-
R
 
-
M
 
-
K
 
-
G
 
-
F
 
-
H
 
-
G
 
G
Q
 
S
M
 
S
G
 
S
M
 
I
F
 
L
V
 
P
R
 
I
A
 
S
L
 
W
A
 
A
Y
 
Y
M
 
I
L
 
K
S
 
M
H
 
M
G
 
G
G
 
G
D
 
K
G
 
G
L
 
L
R
 
K
Q
 
Q
A
 
A
A
 
T
S
 
E
D
 
T
A
 
A
V
 
I
L
 
L
N
 
N
A
 
A
N
 
N
Y
 
Y
V
 
M
L
 
A
A
 
K
S
 
R
L
 
L
K
 
E
D
 
T
V
 
H
M
 
Y
S
 
R
A
 
I
S
 
L
F
 
F
E
 
R
G
 
G
P
 
A
-
 
R
-
 
G
-
 
Y
C
 
V
M
 
G
H
 
H
E
 
E
A
 
F
L
 
I
F
 
L
D
 
D
D
 
T
R
 
R
-
 
P
F
 
F
L
 
K
K
 
K
G
 
S
T
 
A
G
 
N
I
 
I
T
 
E
P
 
A
L
 
V
D
 
D
F
 
V
A
 
A
K
 
K
A
 
R
L
 
L
I
 
Q
D
 
D
E
 
Y
G
 
G
F
 
F
H
 
H
P
 
A
M
 
P
T
 
T
M
 
M
Y
 
S
F
 
W
P
 
P
L
 
-
V
 
-
V
 
V
Q
 
A
G
 
G
A
 
T
L
 
L
L
 
M
I
 
V
E
 
E
P
 
P
T
 
T
E
 
E
T
 
S
E
 
E
S
 
D
K
 
K
Q
 
A
T
 
E
L
 
L
D
 
D
Q
 
R
F
 
F
I
 
C
G
 
D
T
 
A
L
 
M
R
 
I
A
 
S
L
 
I
A
 
-
E
 
-
R
 
R
A
 
Q
K
 
E
T
 
I
G
 
A
D
 
D
E
 
I
E
 
E
Y
 
E
F
 
G
H
 
R
G
 
I
A
 
D
P
 
P
R
 
R
L
 
V
T
 
N
P
 
P
R
 
L
R
 
K

Sites not aligning to the query:

6i33A Crystal structure of human glycine decarboxylase (p-protein)
39% identity, 80% coverage: 75:496/528 of query aligns to 479:891/950 of 6i33A

query
sites
6i33A
S
 
S
E
 
E
P
 
T
E
 
N
V
 
I
V
 
V
R
 
R
H
 
Y
Y
 
M
T
 
K
R
 
K
L
 
L
S
 
E
Q
 
N
K
 
K
N
 
D
F
 
I
G
 
S
I
 
L
D
 
V
S
 
H
T
 
S
M
 
M
Y
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
S
|
S
C
 
C
T
 
T
M
 
M
K
 
K
H
 
L
N
 
N
P
 
S
R
 
S
L
 
S
N
 
E
E
 
L
K
 
A
M
 
P
A
 
I
R
 
T
L
 
W
P
 
K
G
 
E
F
 
F
S
 
A
D
 
N
I
 
I
H
 
H
P
 
P
L
 
F
Q
 
V
P
 
P
V
 
L
S
 
D
T
 
Q
V
 
A
Q
 
Q
G
 
G
A
 
Y
L
 
Q
E
 
Q
L
 
L
I
 
F
D
 
R
A
 
E
L
 
L
A
 
E
H
 
K
W
 
D
L
 
L
K
 
C
T
 
E
L
 
L
T
 
T
G
 
G
M
 
Y
P
 
D
A
 
Q
V
 
V
A
 
C
M
 
F
S
 
Q
P
 
P
A
 
N
A
 
S
G
|
G
A
|
A
H
 
Q
G
 
G
E
 
E
L
 
Y
C
 
A
G
 
G
L
 
L
M
 
A
A
 
T
I
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
Y
L
 
L
A
 
N
A
 
Q
R
 
K
G
 
G
E
 
E
A
 
G
H
 
H
R
 
R
R
 
T
R
 
V
V
 
C
L
 
L
V
 
I
P
 
P
E
 
K
S
 
S
A
 
A
H
|
H
G
 
G
T
 
T
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
S
A
 
A
A
 
H
F
 
M
C
 
A
G
 
G
F
 
M
A
 
K
V
 
I
D
 
Q
S
 
P
I
 
V
P
 
E
A
 
V
E
 
D
D
 
K
D
 
Y
G
 
G
R
 
N
V
 
I
S
 
D
V
 
A
A
 
V
A
 
H
V
 
L
K
 
K
A
 
A
-
 
M
-
 
V
-
 
D
K
 
K
L
 
H
G
 
K
P
 
E
D
 
N
V
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
I
M
 
M
L
 
I
T
 
T
N
 
Y
P
 
P
N
 
S
T
 
T
C
 
N
G
 
G
L
 
V
F
 
F
E
 
E
P
 
E
Q
 
N
I
 
I
R
 
S
E
 
D
I
 
V
A
 
C
D
 
D
A
 
L
V
 
I
H
 
H
A
 
Q
A
 
H
G
 
G
G
 
G
Y
 
Q
F
 
V
Y
 
Y
C
 
L
D
|
D
G
 
G
A
|
A
N
 
N
Y
 
M
N
 
N
A
 
A
I
 
Q
V
 
V
G
 
G
R
 
I
V
 
C
R
 
R
P
 
P
A
 
G
D
 
D
L
 
F
G
 
G
V
 
S
D
 
D
A
 
V
M
 
S
H
 
H
I
 
L
N
|
N
L
 
L
H
|
H
K
|
K
T
 
T
F
 
F
S
 
C
T
 
I
P
 
P
H
 
H
G
 
G
G
 
G
G
 
G
G
 
G
P
 
P
G
 
G
S
 
M
G
 
G
P
 
P
V
 
I
V
 
G
L
 
V
S
 
K
A
 
K
A
 
H
L
 
L
A
 
A
P
 
P
F
 
F
A
 
L
P
 
P
L
 
N
P
 
H
Y
 
P
V
 
V
V
 
I
H
 
-
G
 
-
E
 
-
D
 
-
G
 
-
F
 
-
R
 
-
L
 
-
V
 
-
E
 
-
H
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
S
A
 
L
E
 
K
G
 
A
H
 
C
P
 
P
F
 
V
G
 
G
R
 
T
M
 
V
K
 
S
G
 
A
F
 
A
-
 
P
H
 
W
G
 
G
Q
 
S
M
 
S
G
 
S
M
 
I
F
 
L
V
 
P
R
 
I
A
 
S
L
 
W
A
 
A
Y
 
Y
M
 
I
L
 
K
S
 
M
H
 
M
G
 
G
G
 
G
D
 
K
G
 
G
L
 
L
R
 
K
Q
 
Q
A
 
A
A
 
T
S
 
E
D
 
T
A
 
A
V
 
I
L
 
L
N
 
N
A
 
A
N
 
N
Y
 
Y
V
 
M
L
 
A
A
 
K
S
 
R
L
 
L
K
 
E
D
 
T
V
 
H
M
 
Y
S
 
R
A
 
I
S
 
L
F
 
F
E
 
R
G
 
G
P
 
A
-
 
R
-
 
G
-
 
Y
C
 
V
M
 
G
H
 
H
E
 
E
A
 
F
L
 
I
F
 
L
D
 
D
D
 
T
R
 
R
-
 
P
F
 
F
L
 
K
K
 
K
G
 
S
T
 
A
G
 
N
I
 
I
T
 
E
P
 
A
L
 
V
D
 
D
F
 
V
A
 
A
K
 
K
A
 
R
L
 
L
I
 
Q
D
 
D
E
 
Y
G
 
G
F
 
F
H
 
H
P
 
A
M
 
P
T
 
T
M
 
M
Y
 
S
F
 
W
P
 
P
L
 
-
V
 
-
V
 
V
Q
 
A
G
 
G
A
 
T
L
 
L
L
 
M
I
 
V
E
 
E
P
 
P
T
 
T
E
 
E
T
 
S
E
 
E
S
 
D
K
 
K
Q
 
A
T
 
E
L
 
L
D
 
D
Q
 
R
F
 
F
I
 
C
G
 
D
T
 
A
L
 
M
R
 
I
A
 
S
L
 
I
A
 
-
E
 
-
R
 
R
A
 
Q
K
 
E
T
 
I
G
 
A
D
 
D
E
 
I
E
 
E
Y
 
E
F
 
G
H
 
R
G
 
I
A
 
D
P
 
P
R
 
R
L
 
V
T
 
N
P
 
P
R
 
L
R
 
K

Sites not aligning to the query:

Q94B78 Glycine dehydrogenase (decarboxylating) 1, mitochondrial; Glycine cleavage system P protein 1; Glycine decarboxylase 1; Glycine decarboxylase P-protein 1; AtGLDP1; Glycine dehydrogenase (aminomethyl-transferring) 1; EC 1.4.4.2 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
41% identity, 76% coverage: 75:477/528 of query aligns to 550:952/1037 of Q94B78

query
sites
Q94B78
S
 
T
E
 
E
P
 
H
E
 
E
V
 
L
V
 
L
R
 
R
H
 
Y
Y
 
I
T
 
H
R
 
K
L
 
L
S
 
Q
Q
 
S
K
 
K
N
 
D
F
 
L
G
 
S
I
 
L
D
 
C
S
 
H
T
 
S
M
 
M
Y
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
S
 
S
C
 
C
T
 
T
M
 
M
K
 
K
H
 
L
N
 
N
P
 
A
R
 
T
L
 
T
N
 
E
E
 
M
K
 
M
M
 
P
A
 
V
R
 
T
L
 
W
P
 
P
G
 
S
F
 
F
S
 
T
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
L
 
F
Q
 
A
P
 
P
V
 
V
S
 
E
T
 
Q
V
 
A
Q
 
Q
G
 
G
A
 
Y
L
 
Q
E
 
E
L
 
M
I
 
F
D
 
E
A
 
N
L
 
L
A
 
G
H
 
D
W
 
L
L
 
L
K
 
C
T
 
T
L
 
I
T
 
T
G
 
G
M
 
F
P
 
D
A
 
S
V
 
F
A
 
S
M
 
L
S
 
Q
P
 
P
A
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
A
H
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
Y
C
 
A
G
 
G
L
 
L
M
 
M
A
 
V
I
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
Y
L
 
H
A
 
M
A
 
S
R
 
R
G
 
G
E
 
D
A
 
H
H
 
H
R
 
R
R
 
N
R
 
V
V
 
C
L
 
I
V
 
I
P
 
P
E
 
V
S
 
S
A
 
A
H
 
H
G
 
G
T
 
T
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
S
A
 
A
A
 
A
F
 
M
C
 
C
G
 
G
F
 
M
A
 
K
V
 
I
D
 
I
S
 
T
I
 
V
P
 
G
A
 
T
E
 
D
D
 
A
D
 
K
G
 
G
R
 
N
V
 
I
S
 
N
V
 
I
A
 
E
A
 
E
V
 
V
K
 
R
-
 
K
-
 
A
A
 
A
K
 
E
L
 
A
G
 
N
P
 
K
D
 
D
-
 
N
V
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
L
M
 
M
L
 
V
T
 
T
N
 
Y
P
 
P
N
 
S
T
 
T
C
 
H
G
 
G
L
 
V
F
 
Y
E
 
E
P
 
E
Q
 
G
I
 
I
R
 
D
E
 
E
I
 
I
A
 
C
D
 
N
A
 
I
V
 
I
H
 
H
A
 
E
A
 
N
G
 
G
G
 
G
Y
 
Q
F
 
V
Y
 
Y
C
 
M
D
 
D
G
 
G
A
 
A
N
 
N
Y
 
M
N
 
N
A
 
A
I
 
Q
V
 
V
G
 
G
R
 
L
V
 
T
R
 
S
P
 
P
A
 
G
D
 
F
L
 
I
G
 
G
V
 
A
D
 
D
A
 
V
M
 
C
H
 
H
I
 
L
N
 
N
L
 
L
H
 
H
K
 
K
T
 
T
F
 
F
S
x
C
T
 
I
P
 
P
H
 
H
G
 
G
G
 
G
G
 
G
G
 
G
P
 
P
G
 
G
S
 
M
G
 
G
P
 
P
V
 
I
V
 
G
L
 
V
S
 
K
A
 
N
A
 
H
L
 
L
A
 
A
P
 
P
F
 
F
A
 
L
P
 
P
L
 
S
-
 
H
P
 
P
Y
 
V
V
 
I
V
 
P
H
 
T
G
 
G
E
 
-
D
 
-
G
 
G
F
 
I
R
 
P
L
 
Q
V
 
P
E
 
E
H
 
K
A
 
T
G
 
A
E
 
-
A
 
-
E
 
-
G
 
-
H
 
-
P
 
P
F
 
L
G
 
G
R
 
A
M
 
I
K
 
S
G
 
A
F
 
A
-
 
P
H
 
W
G
 
G
Q
 
S
M
 
A
G
 
L
M
 
I
F
 
L
V
 
P
R
 
I
A
 
S
L
 
Y
A
 
T
Y
 
Y
M
 
I
L
 
A
S
 
M
H
 
M
G
 
G
G
 
S
D
 
G
G
 
G
L
 
L
R
 
T
Q
 
D
A
 
A
A
 
S
S
 
K
D
 
I
A
 
A
V
 
I
L
 
L
N
 
N
A
 
A
N
 
N
Y
 
Y
V
 
M
L
 
A
A
 
K
S
 
R
L
 
L
K
 
E
D
 
K
-
 
H
-
 
Y
-
 
P
V
 
V
M
 
L
S
 
F
A
 
R
S
 
G
F
 
V
E
 
N
G
 
G
P
 
T
C
 
V
M
 
A
H
 
H
E
 
E
A
 
F
L
 
I
F
 
I
D
 
D
D
 
L
R
 
R
F
 
G
L
 
F
K
 
K
G
 
N
T
 
T
-
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
E
P
 
P
L
 
E
D
 
D
F
 
V
A
 
A
K
 
K
A
 
R
L
 
L
I
 
M
D
 
D
E
 
Y
G
 
G
F
 
F
H
 
H
P
 
G
M
 
P
T
 
T
M
 
M
Y
 
S
F
 
W
P
 
P
L
 
-
V
 
-
V
 
V
Q
 
P
G
 
G
A
 
T
L
 
L
L
 
M
I
 
I
E
 
E
P
 
P
T
 
T
E
 
E
T
 
S
E
 
E
S
 
S
K
 
K
Q
 
A
T
 
E
L
 
L
D
 
D
Q
 
R
F
 
F
I
x
C
G
 
D
T
 
A
L
 
L
R
 
I
A
 
S
L
 
I
A
 
R
E
 
E
R
 
E

Sites not aligning to the query:

4lhdA Crystal structure of synechocystis sp. Pcc 6803 glycine decarboxylase (p-protein), holo form with pyridoxal-5'-phosphate and glycine, closed flexible loop (see paper)
39% identity, 77% coverage: 75:479/528 of query aligns to 488:879/952 of 4lhdA

query
sites
4lhdA
S
 
S
E
 
E
P
 
T
E
 
E
V
 
L
V
 
L
R
 
R
H
 
Y
Y
 
L
T
 
H
R
 
Q
L
 
L
S
 
E
Q
 
S
K
 
K
N
 
D
F
 
L
G
 
A
I
 
L
D
 
N
S
 
T
T
 
S
M
 
M
Y
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
S
 
S
C
 
C
T
 
T
M
 
M
K
 
K
H
 
L
N
 
N
P
 
A
R
 
T
L
 
A
N
 
E
E
 
M
K
 
M
M
 
P
A
 
V
R
 
T
L
 
W
P
 
P
G
 
E
F
 
F
S
 
G
D
 
K
I
 
I
H
 
H
P
 
P
L
 
F
Q
 
A
P
 
P
V
 
A
S
 
G
T
 
Q
V
 
T
Q
 
E
G
 
G
A
 
Y
L
 
Q
E
 
I
L
 
L
I
 
F
D
 
A
A
 
Q
L
 
L
A
 
E
H
 
A
W
|
W
L
 
L
K
 
G
T
 
E
L
 
I
T
 
T
G
 
G
M
 
F
P
 
D
A
 
A
V
 
I
A
 
S
M
 
L
S
 
Q
P
 
P
A
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
S
H
 
Q
G
 
G
E
 
E
L
 
Y
C
 
A
G
 
G
L
 
L
M
 
Q
A
 
V
I
 
I
R
 
R
A
 
Q
A
 
Y
L
 
H
A
 
L
A
 
S
R
 
R
G
 
G
E
 
E
A
 
E
H
 
Q
R
 
R
R
 
N
R
 
I
V
 
C
L
 
L
V
 
I
P
 
P
E
 
E
S
 
S
A
 
A
H
|
H
G
 
G
T
 
T
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
S
A
 
A
A
 
V
F
 
M
C
 
C
G
 
G
F
 
M
A
 
Q
V
 
V
D
 
V
S
 
P
I
 
V
P
 
K
A
 
C
E
 
D
D
 
G
D
 
E
G
 
G
R
x
N
V
 
I
S
 
D
V
 
V
A
 
E
A
 
D
V
 
L
K
 
T
A
 
S
-
 
K
-
 
A
-
 
E
K
 
K
L
 
Y
G
 
G
P
 
D
D
 
R
V
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
L
M
 
M
L
 
V
T
 
T
N
 
Y
P
 
P
N
 
S
T
 
T
C
 
H
G
 
G
L
 
V
F
 
F
E
 
E
P
x
A
Q
 
T
I
 
I
R
 
G
E
 
T
I
 
I
A
 
C
D
 
D
A
 
I
V
 
V
H
 
H
A
 
R
A
 
F
G
 
G
G
 
G
Y
 
E
F
 
V
Y
 
Y
C
 
M
D
 
D
G
 
G
A
 
A
N
 
N
Y
 
M
N
 
N
A
 
A
I
 
Q
V
 
V
G
 
G
R
 
L
V
 
C
R
 
R
P
 
P
A
 
A
D
 
D
L
 
F
G
 
G
V
 
A
D
 
D
A
 
V
M
 
C
H
 
H
I
 
L
N
 
N
L
 
L
H
 
H
K
 
K
T
 
T
F
 
F
S
 
C
T
 
I
P
 
P
H
 
H
G
 
G
G
 
G
G
 
G
G
 
G
P
 
P
G
 
G
S
 
M
G
 
G
P
 
P
V
 
I
V
 
G
L
 
V
S
 
K
A
 
S
A
 
H
L
 
L
A
 
Q
P
 
A
F
 
F
A
 
L
P
 
P
L
 
-
P
 
-
Y
 
-
V
 
-
V
 
-
H
 
-
G
 
-
E
 
-
D
 
-
G
 
-
F
 
-
R
 
R
L
 
T
V
 
D
E
 
Q
H
 
S
A
 
I
G
 
G
E
 
M
A
 
I
E
 
S
G
 
A
H
 
A
P
 
P
F
 
Y
G
 
-
R
 
-
M
 
-
K
 
-
G
 
-
F
 
-
H
 
-
G
 
G
Q
 
S
M
 
A
G
 
S
M
 
I
F
 
L
V
 
V
R
 
I
A
 
S
L
 
W
A
 
M
Y
 
Y
M
 
I
L
 
A
S
 
M
H
 
M
G
 
G
G
 
P
D
 
Q
G
 
G
L
 
L
R
 
T
Q
 
K
A
 
A
A
 
T
S
 
E
D
 
V
A
 
A
V
 
I
L
 
L
N
 
S
A
 
A
N
 
N
Y
 
Y
V
 
M
L
 
A
A
 
K
S
 
R
L
 
L
K
 
E
D
 
N
V
 
Y
M
 
Y
S
 
P
A
 
I
S
 
L
F
 
F
E
 
R
G
 
G
P
x
N
-
 
N
-
 
E
-
 
L
C
 
V
M
 
A
H
 
H
E
 
E
A
 
C
L
 
I
F
 
L
D
 
D
D
 
L
R
 
R
F
 
P
L
 
L
K
 
K
G
 
K
-
 
Q
T
 
A
G
 
A
I
 
I
T
 
E
P
 
V
L
 
E
D
 
D
F
 
V
A
 
A
K
 
K
A
 
R
L
 
L
I
 
M
D
 
D
E
 
F
G
 
G
F
|
F
H
 
H
P
 
A
M
 
P
T
 
T
M
 
V
Y
 
S
F
x
W
P
 
P
L
 
V
V
 
L
V
 
-
Q
 
-
G
 
G
A
 
T
L
 
M
L
 
M
I
 
V
E
 
E
P
 
P
T
 
T
E
 
E
T
 
S
E
 
E
S
 
S
K
 
L
Q
 
G
T
x
E
L
 
L
D
 
D
Q
x
R
F
 
F
I
 
C
G
 
D
T
 
A
L
 
M
R
 
I
A
 
A
L
 
I
A
 
Y
E
 
Q
R
 
E
A
 
A
K
 
Q

Sites not aligning to the query:

6i33B Crystal structure of human glycine decarboxylase (p-protein)
38% identity, 80% coverage: 75:496/528 of query aligns to 480:867/925 of 6i33B

query
sites
6i33B
S
 
S
E
 
E
P
 
T
E
 
N
V
 
I
V
 
V
R
 
R
H
 
Y
Y
 
M
T
 
K
R
 
K
L
 
L
S
 
E
Q
 
N
K
 
K
N
 
D
F
 
I
G
 
S
I
 
L
D
 
V
S
 
H
T
 
S
M
 
M
Y
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
S
|
S
C
 
C
T
 
T
M
 
M
K
 
K
H
 
L
N
 
N
P
 
S
R
 
S
L
 
S
N
 
E
E
 
L
K
 
A
M
 
P
A
 
I
R
 
T
L
 
W
P
 
K
G
 
E
F
 
F
S
 
A
D
 
N
I
 
I
H
 
H
P
 
P
L
 
F
Q
 
V
P
 
P
V
 
L
S
 
D
T
 
Q
V
 
A
Q
 
Q
G
 
G
A
 
Y
L
 
Q
E
 
Q
L
 
L
I
 
F
D
 
R
A
 
E
L
 
L
A
 
E
H
 
K
W
 
D
L
 
L
K
 
C
T
 
E
L
 
L
T
 
T
G
 
G
M
 
Y
P
 
D
A
 
Q
V
 
V
A
 
C
M
 
F
S
 
Q
P
 
P
A
 
N
A
x
S
G
|
G
A
|
A
H
 
Q
G
 
G
E
|
E
L
 
Y
C
 
A
G
 
G
L
 
L
M
 
A
A
 
T
I
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
Y
L
 
L
A
 
T
A
 
V
R
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
H
 
-
R
 
-
R
 
-
R
 
-
V
 
C
L
 
L
V
 
I
P
 
P
E
 
K
S
 
S
A
 
A
H
|
H
G
 
G
T
|
T
N
 
N
P
 
P
A
 
A
T
 
S
A
 
A
A
 
H
F
 
M
C
 
A
G
 
G
F
 
M
A
 
K
V
 
I
D
 
Q
S
 
P
I
 
V
P
 
E
A
 
V
E
 
D
D
 
K
D
 
Y
G
 
G
R
 
-
V
 
-
S
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
-
V
 
-
K
 
-
A
 
-
K
 
-
L
 
-
G
 
-
P
 
-
D
 
N
V
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
I
M
 
M
L
 
I
T
 
T
N
 
Y
P
 
P
N
 
S
T
 
T
C
 
N
G
 
G
L
 
V
F
 
F
E
 
E
P
 
E
Q
 
N
I
 
I
R
 
S
E
 
D
I
 
V
A
 
C
D
 
D
A
 
L
V
 
I
H
 
H
A
 
Q
A
 
H
G
 
Q
G
 
V
Y
 
Y
F
 
L
Y
 
-
C
 
-
D
|
D
G
 
G
A
|
A
N
 
N
Y
 
M
N
 
N
A
 
A
I
 
Q
V
 
V
G
 
G
R
 
I
V
 
C
R
 
R
P
 
P
A
 
G
D
 
D
L
 
F
G
 
G
V
 
S
D
 
D
A
 
V
M
 
S
H
 
H
I
 
L
N
|
N
L
 
L
H
|
H
K
|
K
T
 
T
F
 
F
S
 
C
T
 
I
P
 
P
H
 
H
G
 
G
G
 
G
G
 
G
G
 
G
P
 
P
G
 
G
S
 
M
G
 
G
P
 
P
V
 
I
V
 
G
L
 
V
S
 
K
A
 
K
A
 
H
L
 
L
A
 
A
P
 
P
F
 
F
A
 
L
P
 
P
L
 
N
P
 
H
Y
 
P
V
 
V
V
 
I
H
 
S
G
 
L
E
 
K
D
 
D
G
 
A
F
 
C
R
 
P
L
 
V
V
 
-
E
 
-
H
 
-
A
 
-
G
 
G
E
 
T
A
 
V
E
 
S
G
 
A
H
 
A
P
 
P
F
 
W
G
 
-
R
 
-
M
 
-
K
 
-
G
 
-
F
 
-
H
 
-
G
 
G
Q
 
S
M
 
S
G
 
S
M
 
I
F
 
L
V
 
P
R
 
I
A
 
S
L
 
W
A
 
A
Y
 
Y
M
 
I
L
 
K
S
 
M
H
 
M
G
 
G
G
 
G
D
 
K
G
 
G
L
 
L
R
 
K
Q
 
Q
A
 
A
A
 
T
S
 
E
D
 
T
A
 
A
V
 
I
L
 
L
N
 
N
A
 
A
N
 
N
Y
 
Y
V
 
M
L
 
A
A
 
K
S
 
R
L
 
L
K
 
E
D
 
T
V
 
H
M
 
Y
S
 
R
A
 
I
S
 
L
F
 
F
E
 
R
G
 
G
P
 
A
-
 
R
-
 
G
-
 
Y
C
 
V
M
 
G
H
 
H
E
 
E
A
 
F
L
 
I
F
 
L
D
 
D
D
 
T
R
 
R
-
 
P
F
 
F
L
 
K
K
 
K
G
 
S
T
 
A
G
 
N
I
 
I
T
 
E
P
 
A
L
 
V
D
 
D
F
 
V
A
 
A
K
 
K
A
 
R
L
 
L
I
 
Q
D
 
D
E
 
Y
G
 
G
F
 
F
H
 
H
P
 
A
M
 
P
T
 
T
M
 
M
Y
 
S
F
 
W
P
 
P
L
 
-
V
 
-
V
 
V
Q
 
A
G
 
G
A
 
T
L
 
L
L
 
M
I
 
V
E
 
E
P
 
P
T
 
T
E
 
E
T
 
S
E
 
E
S
 
D
K
 
K
Q
 
A
T
 
E
L
 
L
D
 
D
Q
 
R
F
 
F
I
 
C
G
 
D
T
 
A
L
 
M
R
 
I
A
 
S
L
 
I
A
 
-
E
 
-
R
 
R
A
 
Q
K
 
E
T
 
I
G
 
A
D
 
D
E
 
I
E
 
E
Y
 
E
F
 
G
H
 
R
G
 
I
A
 
D
P
 
P
R
 
R
L
 
V
T
 
N
P
 
P
R
 
L
R
 
K

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_012568784.1 NCBI__GCF_000016185.1:WP_012568784.1
MSMNSQGRPTTPHVPSASEVAQTHTGNRALMQEEPLLFELDNPGVCGVDLPEPPTAELRL
GKVRPRGTLALPSVSEPEVVRHYTRLSQKNFGIDSTMYPLGSCTMKHNPRLNEKMARLPG
FSDIHPLQPVSTVQGALELIDALAHWLKTLTGMPAVAMSPAAGAHGELCGLMAIRAALAA
RGEAHRRRVLVPESAHGTNPATAAFCGFAVDSIPAEDDGRVSVAAVKAKLGPDVAAIMLT
NPNTCGLFEPQIREIADAVHAAGGYFYCDGANYNAIVGRVRPADLGVDAMHINLHKTFST
PHGGGGPGSGPVVLSAALAPFAPLPYVVHGEDGFRLVEHAGEAEGHPFGRMKGFHGQMGM
FVRALAYMLSHGGDGLRQAASDAVLNANYVLASLKDVMSASFEGPCMHEALFDDRFLKGT
GITPLDFAKALIDEGFHPMTMYFPLVVQGALLIEPTETESKQTLDQFIGTLRALAERAKT
GDEEYFHGAPRLTPRRRLDETAAARKPVLRWTRPAPAAQAAAAQAAAE

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory