SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012589209.1 NCBI__GCF_000021745.1:WP_012589209.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6mjpA Lptb(e163q)fgc from vibrio cholerae (see paper)
56% identity, 74% coverage: 84:321/321 of query aligns to 2:240/240 of 6mjpA

query
sites
6mjpA
V
 
I
L
 
L
S
 
K
V
 
A
M
 
Q
R
 
H
L
 
L
R
 
A
K
 
K
S
 
S
Y
 
Y
K
 
K
M
 
K
R
 
R
R
 
K
I
 
V
I
 
V
E
 
S
D
 
D
V
 
V
S
 
S
L
 
L
T
 
Q
V
 
V
R
 
E
R
 
S
G
 
G
E
 
Q
A
 
I
V
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
L
 
S
F
 
F
Y
 
Y
M
 
M
I
 
I
S
 
V
G
 
G
L
 
L
I
 
V
R
 
A
P
 
R
D
 
D
A
 
E
G
 
G
R
 
T
I
 
I
E
 
T
L
 
I
D
 
D
G
 
D
H
 
N
D
 
D
V
 
I
T
 
S
R
 
I
L
 
L
P
 
P
M
 
M
Y
 
H
R
 
S
R
 
R
A
 
S
R
 
R
L
 
M
G
 
G
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
E
 
E
P
 
A
S
 
S
I
 
I
F
 
F
R
 
R
G
 
K
L
 
L
T
 
S
V
 
V
E
 
E
D
 
D
N
 
N
I
 
I
R
 
M
A
 
A
V
 
V
L
 
L
E
 
Q
I
 
T
T
 
R
Q
 
E
S
 
E
-
 
L
D
 
T
K
 
H
Q
x
E
K
 
E
R
 
R
E
 
Q
R
x
D
E
 
K
L
 
L
D
 
E
A
 
D
L
 
L
L
 
L
E
 
E
E
 
E
F
 
F
D
 
H
I
 
I
A
 
Q
A
 
H
L
 
I
R
 
R
R
 
K
S
 
S
P
 
A
S
 
G
V
 
M
A
 
A
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
R
R
 
R
R
 
R
C
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
C
 
A
R
 
N
P
 
P
S
 
Q
F
 
F
I
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
F
 
F
A
 
A
G
 
G
I
 
V
D
 
D
P
 
P
I
 
I
A
 
S
V
 
V
A
 
I
D
 
D
I
 
I
Q
 
K
T
 
K
L
 
I
V
 
I
Q
 
E
H
 
H
L
 
L
K
 
R
T
 
D
R
 
R
G
 
G
I
 
L
G
 
G
V
 
V
L
 
L
V
 
I
T
 
T
D
 
D
H
 
H
N
 
N
V
 
V
R
 
R
E
 
E
T
 
T
L
 
L
G
 
D
L
 
V
I
 
C
D
 
E
R
 
K
A
 
A
Y
 
Y
I
 
I
I
 
V
H
 
S
A
 
Q
G
 
G
R
 
R
V
 
L
L
 
I
T
 
A
Q
 
E
G
 
G
T
 
T
P
 
P
A
 
Q
D
 
D
I
 
V
V
 
L
A
 
N
D
 
N
A
 
E
E
 
Q
A
 
V
R
 
K
R
 
Q
F
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
D
 
E
D
 
Q
F
 
F
V
 
R
L
 
L

6s8nB Cryo-em structure of lptb2fgc in complex with lipopolysaccharide (see paper)
58% identity, 73% coverage: 85:319/321 of query aligns to 3:238/238 of 6s8nB

query
sites
6s8nB
L
 
L
S
 
T
V
 
A
M
 
K
R
 
N
L
 
L
R
 
A
K
 
K
S
 
A
Y
 
Y
K
 
K
M
 
G
R
 
R
R
 
R
I
 
V
I
 
V
E
 
E
D
 
D
V
 
V
S
 
S
L
 
L
T
 
T
V
 
V
R
 
N
R
 
S
G
 
G
E
 
E
A
 
I
V
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
L
 
T
F
 
F
Y
 
Y
M
 
M
I
 
V
S
 
V
G
 
G
L
 
I
I
 
V
R
 
P
P
 
R
D
 
D
A
 
A
G
 
G
R
 
N
I
 
I
E
 
I
L
 
I
D
 
D
G
 
D
H
 
D
D
 
D
V
 
I
T
 
S
R
 
L
L
 
L
P
 
P
M
 
L
Y
 
H
R
 
A
R
 
R
A
 
A
R
 
R
L
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
E
 
E
P
 
A
S
 
S
I
 
I
F
 
F
R
|
R
G
 
R
L
 
L
T
 
S
V
 
V
E
 
Y
D
 
D
N
 
N
I
 
L
R
 
M
A
 
A
V
 
V
L
 
L
E
 
Q
I
 
I
T
 
R
Q
 
D
S
 
D
-
 
L
D
 
S
K
 
A
Q
 
E
K
 
Q
R
 
R
E
 
E
R
 
D
E
 
R
L
 
A
D
 
N
A
 
E
L
 
L
L
 
M
E
 
E
E
 
E
F
 
F
D
 
H
I
 
I
A
 
E
A
 
H
L
 
L
R
 
R
R
 
D
S
 
S
P
x
M
S
x
G
V
x
Q
A
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
R
R
 
R
R
 
R
C
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
C
 
A
R
 
N
P
 
P
S
 
K
F
 
F
I
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
F
 
F
A
 
A
G
 
G
I
 
V
D
 
D
P
 
P
I
 
I
A
 
S
V
 
V
A
 
I
D
 
D
I
 
I
Q
 
K
T
 
R
L
 
I
V
 
I
Q
 
E
H
 
H
L
 
L
K
 
R
T
 
D
R
 
S
G
 
G
I
 
L
G
 
G
V
 
V
L
 
L
V
 
I
T
 
T
D
 
D
H
 
H
N
 
N
V
 
V
R
 
R
E
 
E
T
 
T
L
 
L
G
 
A
L
 
V
I
 
C
D
 
E
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
I
 
I
I
 
V
H
 
S
A
 
Q
G
 
G
R
 
H
V
 
L
L
 
I
T
 
A
Q
 
H
G
 
G
T
 
T
P
 
P
A
 
T
D
 
E
I
 
I
V
 
L
A
 
Q
D
 
D
A
 
E
E
 
H
A
 
V
R
 
K
R
 
R
F
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
D
 
E
D
 
D
F
 
F

6s8gA Cryo-em structure of lptb2fgc in complex with amp-pnp (see paper)
58% identity, 73% coverage: 85:319/321 of query aligns to 3:238/238 of 6s8gA

query
sites
6s8gA
L
 
L
S
 
T
V
 
A
M
 
K
R
 
N
L
 
L
R
 
A
K
 
K
S
 
A
Y
|
Y
K
 
K
M
 
G
R
|
R
R
 
R
I
 
V
I
 
V
E
 
E
D
 
D
V
 
V
S
 
S
L
 
L
T
 
T
V
 
V
R
 
N
R
 
S
G
 
G
E
 
E
A
 
I
V
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
 
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
T
F
 
F
Y
 
Y
M
 
M
I
 
V
S
 
V
G
 
G
L
 
I
I
 
V
R
 
P
P
 
R
D
 
D
A
 
A
G
 
G
R
 
N
I
 
I
E
 
I
L
 
I
D
 
D
G
 
D
H
 
D
D
 
D
V
 
I
T
 
S
R
 
L
L
 
L
P
 
P
M
 
L
Y
 
H
R
 
A
R
 
R
A
 
A
R
 
R
L
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
Q
|
Q
E
 
E
P
 
A
S
 
S
I
 
I
F
 
F
R
 
R
G
 
R
L
 
L
T
 
S
V
 
V
E
 
Y
D
 
D
N
 
N
I
 
L
R
 
M
A
 
A
V
 
V
L
 
L
E
 
Q
I
 
I
T
 
R
Q
 
D
S
 
D
-
 
L
D
 
S
K
 
A
Q
 
E
K
 
Q
R
 
R
E
 
E
R
 
D
E
 
R
L
 
A
D
 
N
A
 
E
L
 
L
L
 
M
E
 
E
E
 
E
F
 
F
D
 
H
I
 
I
A
 
E
A
 
H
L
 
L
R
 
R
R
 
D
S
 
S
P
 
M
S
 
G
V
 
Q
A
x
S
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
E
|
E
R
 
R
R
 
R
R
 
R
C
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
C
 
A
R
 
N
P
 
P
S
 
K
F
 
F
I
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
F
 
F
A
 
A
G
 
G
I
 
V
D
 
D
P
 
P
I
 
I
A
 
S
V
 
V
A
 
I
D
 
D
I
 
I
Q
 
K
T
 
R
L
 
I
V
 
I
Q
 
E
H
 
H
L
 
L
K
 
R
T
 
D
R
 
S
G
 
G
I
 
L
G
 
G
V
 
V
L
 
L
V
 
I
T
 
T
D
 
D
H
 
H
N
 
N
V
 
V
R
 
R
E
 
E
T
 
T
L
 
L
G
 
A
L
 
V
I
 
C
D
 
E
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
I
 
I
I
 
V
H
 
S
A
 
Q
G
 
G
R
 
H
V
 
L
L
 
I
T
 
A
Q
 
H
G
 
G
T
 
T
P
 
P
A
 
T
D
 
E
I
 
I
V
 
L
A
 
Q
D
 
D
A
 
E
E
 
H
A
 
V
R
 
K
R
 
R
F
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
D
 
E
D
 
D
F
 
F

6mbnA Lptb e163q in complex with atp (see paper)
58% identity, 74% coverage: 85:321/321 of query aligns to 4:241/241 of 6mbnA

query
sites
6mbnA
L
 
L
S
 
T
V
 
A
M
 
K
R
 
N
L
 
L
R
 
A
K
 
K
S
 
A
Y
|
Y
K
 
K
M
 
G
R
|
R
R
 
R
I
x
V
I
 
V
E
 
E
D
 
D
V
 
V
S
 
S
L
 
L
T
 
T
V
 
V
R
 
N
R
 
S
G
 
G
E
 
E
A
 
I
V
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
T
F
 
F
Y
 
Y
M
 
M
I
 
V
S
 
V
G
 
G
L
 
I
I
 
V
R
 
P
P
 
R
D
 
D
A
 
A
G
 
G
R
 
N
I
 
I
E
 
I
L
 
I
D
 
D
G
 
D
H
 
D
D
 
D
V
 
I
T
 
S
R
 
L
L
 
L
P
 
P
M
 
L
Y
 
H
R
 
A
R
 
R
A
 
A
R
 
R
L
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
E
 
E
P
 
A
S
 
S
I
 
I
F
 
F
R
 
R
G
 
R
L
 
L
T
 
S
V
 
V
E
 
Y
D
 
D
N
 
N
I
 
L
R
 
M
A
 
A
V
 
V
L
 
L
E
 
Q
I
 
I
T
 
R
Q
 
D
S
 
D
-
 
L
D
 
S
K
 
A
Q
 
E
K
 
Q
R
 
R
E
 
E
R
 
D
E
 
R
L
 
A
D
 
N
A
 
E
L
 
L
L
 
M
E
 
E
E
 
E
F
 
F
D
 
H
I
 
I
A
 
E
A
 
H
L
 
L
R
 
R
R
 
D
S
 
S
P
 
M
S
 
G
V
 
Q
A
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
R
R
 
R
R
 
R
C
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
C
 
A
R
 
N
P
 
P
S
 
K
F
 
F
I
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
F
 
F
A
 
A
G
 
G
I
 
V
D
 
D
P
 
P
I
 
I
A
 
S
V
 
V
A
 
I
D
 
D
I
 
I
Q
 
K
T
 
R
L
 
I
V
 
I
Q
 
E
H
 
H
L
 
L
K
 
R
T
 
D
R
 
S
G
 
G
I
 
L
G
 
G
V
 
V
L
 
L
V
 
I
T
 
T
D
 
D
H
|
H
N
 
N
V
 
V
R
 
R
E
 
E
T
 
T
L
 
L
G
 
A
L
 
V
I
 
C
D
 
E
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
I
 
I
I
 
V
H
 
S
A
 
Q
G
 
G
R
 
H
V
 
L
L
 
I
T
 
A
Q
 
H
G
 
G
T
 
T
P
 
P
A
 
T
D
 
E
I
 
I
V
 
L
A
 
Q
D
 
D
A
 
E
E
 
H
A
 
V
R
 
K
R
 
R
F
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
D
 
E
D
 
D
F
 
F
V
 
R
L
 
L

6mhzA Vanadate trapped cryo-em structure of e.Coli lptb2fg transporter (see paper)
58% identity, 72% coverage: 85:316/321 of query aligns to 3:235/235 of 6mhzA

query
sites
6mhzA
L
 
L
S
 
T
V
 
A
M
 
K
R
 
N
L
 
L
R
 
A
K
 
K
S
 
A
Y
|
Y
K
 
K
M
 
G
R
 
R
R
 
R
I
 
V
I
 
V
E
 
E
D
 
D
V
 
V
S
 
S
L
 
L
T
 
T
V
 
V
R
 
N
R
 
S
G
 
G
E
 
E
A
 
I
V
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
T
F
 
F
Y
 
Y
M
 
M
I
 
V
S
 
V
G
 
G
L
 
I
I
 
V
R
 
P
P
 
R
D
 
D
A
 
A
G
 
G
R
 
N
I
 
I
E
 
I
L
 
I
D
 
D
G
 
D
H
 
D
D
 
D
V
 
I
T
 
S
R
 
L
L
 
L
P
 
P
M
 
L
Y
 
H
R
 
A
R
 
R
A
 
A
R
 
R
L
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
Q
|
Q
E
 
E
P
 
A
S
 
S
I
 
I
F
 
F
R
 
R
G
 
R
L
 
L
T
 
S
V
 
V
E
 
Y
D
 
D
N
 
N
I
 
L
R
 
M
A
 
A
V
 
V
L
 
L
E
 
Q
I
 
I
T
 
R
Q
 
D
S
 
D
-
 
L
D
 
S
K
 
A
Q
 
E
K
 
Q
R
 
R
E
 
E
R
 
D
E
 
R
L
 
A
D
 
N
A
 
E
L
 
L
L
 
M
E
 
E
E
 
E
F
 
F
D
 
H
I
 
I
A
 
E
A
 
H
L
 
L
R
 
R
R
 
D
S
 
S
P
 
M
S
 
G
V
 
Q
A
x
S
L
 
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
E
 
E
R
 
R
R
 
R
R
 
R
C
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
C
 
A
R
 
N
P
 
P
S
 
K
F
 
F
I
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
F
 
F
A
 
A
G
|
G
I
 
V
D
 
D
P
 
P
I
 
I
A
 
S
V
 
V
A
 
I
D
 
D
I
 
I
Q
 
K
T
 
R
L
 
I
V
 
I
Q
 
E
H
 
H
L
 
L
K
 
R
T
 
D
R
 
S
G
 
G
I
 
L
G
 
G
V
 
V
L
 
L
V
 
I
T
 
T
D
 
D
H
|
H
N
 
N
V
 
V
R
 
R
E
 
E
T
 
T
L
 
L
G
 
A
L
 
V
I
 
C
D
 
E
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
I
 
I
I
 
V
H
 
S
A
 
Q
G
 
G
R
 
H
V
 
L
L
 
I
T
 
A
Q
 
H
G
 
G
T
 
T
P
 
P
A
 
T
D
 
E
I
 
I
V
 
L
A
 
Q
D
 
D
A
 
E
E
 
H
A
 
V
R
 
K
R
 
R
F
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G

6b89A E. Coli lptb in complex with adp and novobiocin (see paper)
58% identity, 72% coverage: 85:315/321 of query aligns to 3:234/234 of 6b89A

query
sites
6b89A
L
 
L
S
 
T
V
 
A
M
 
K
R
 
N
L
 
L
R
 
A
K
 
K
S
 
A
Y
|
Y
K
 
K
M
 
G
R
|
R
R
 
R
I
x
V
I
 
V
E
 
E
D
 
D
V
 
V
S
 
S
L
 
L
T
 
T
V
 
V
R
 
N
R
 
S
G
 
G
E
 
E
A
 
I
V
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
T
F
 
F
Y
 
Y
M
 
M
I
 
V
S
 
V
G
 
G
L
 
I
I
 
V
R
 
P
P
 
R
D
 
D
A
 
A
G
 
G
R
 
N
I
 
I
E
 
I
L
 
I
D
 
D
G
 
D
H
 
D
D
 
D
V
 
I
T
 
S
R
 
L
L
 
L
P
 
P
M
x
L
Y
x
H
R
 
A
R
 
R
A
 
A
R
 
R
L
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
P
|
P
Q
|
Q
E
 
E
P
x
A
S
|
S
I
 
I
F
|
F
R
|
R
G
x
R
L
|
L
T
 
S
V
 
V
E
 
Y
D
 
D
N
 
N
I
 
L
R
 
M
A
 
A
V
|
V
L
 
L
E
 
Q
I
 
I
T
 
R
Q
 
D
S
 
D
-
 
L
D
 
S
K
 
A
Q
 
E
K
 
Q
R
 
R
E
 
E
R
 
D
E
 
R
L
 
A
D
 
N
A
 
E
L
 
L
L
 
M
E
 
E
E
 
E
F
 
F
D
 
H
I
 
I
A
 
E
A
 
H
L
 
L
R
 
R
R
 
D
S
 
S
P
 
M
S
 
G
V
x
Q
A
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
R
R
 
R
R
 
R
C
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
|
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
C
 
A
R
 
N
P
 
P
S
 
K
F
 
F
I
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
F
 
F
A
 
A
G
 
G
I
 
V
D
 
D
P
 
P
I
 
I
A
 
S
V
 
V
A
 
I
D
 
D
I
 
I
Q
 
K
T
 
R
L
 
I
V
 
I
Q
 
E
H
 
H
L
 
L
K
 
R
T
 
D
R
 
S
G
 
G
I
 
L
G
 
G
V
 
V
L
 
L
V
 
I
T
 
T
D
 
D
H
 
H
N
 
N
V
 
V
R
 
R
E
 
E
T
 
T
L
 
L
G
 
A
L
 
V
I
 
C
D
 
E
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
I
 
I
I
 
V
H
 
S
A
 
Q
G
 
G
R
 
H
V
 
L
L
 
I
T
 
A
Q
 
H
G
 
G
T
 
T
P
 
P
A
 
T
D
 
E
I
 
I
V
 
L
A
 
Q
D
 
D
A
 
E
E
 
H
A
 
V
R
 
K
R
 
R
F
 
V
Y
 
Y
L
 
L

4p31A Crystal structure of a selenomethionine derivative of e. Coli lptb in complex with adp-magensium (see paper)
58% identity, 72% coverage: 85:315/321 of query aligns to 3:234/234 of 4p31A

query
sites
4p31A
L
 
L
S
 
T
V
 
A
M
 
K
R
 
N
L
 
L
R
 
A
K
 
K
S
 
A
Y
|
Y
K
 
K
M
 
G
R
|
R
R
 
R
I
x
V
I
 
V
E
 
E
D
 
D
V
 
V
S
 
S
L
 
L
T
 
T
V
 
V
R
 
N
R
 
S
G
 
G
E
 
E
A
 
I
V
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
T
F
 
F
Y
 
Y
M
 
M
I
 
V
S
 
V
G
 
G
L
 
I
I
 
V
R
 
P
P
 
R
D
 
D
A
 
A
G
 
G
R
 
N
I
 
I
E
 
I
L
 
I
D
 
D
G
 
D
H
 
D
D
 
D
V
 
I
T
 
S
R
 
L
L
 
L
P
 
P
M
 
L
Y
 
H
R
 
A
R
 
R
A
 
A
R
 
R
L
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
Q
|
Q
E
 
E
P
 
A
S
 
S
I
 
I
F
 
F
R
 
R
G
 
R
L
 
L
T
 
S
V
 
V
E
 
Y
D
 
D
N
 
N
I
 
L
R
 
M
A
 
A
V
 
V
L
 
L
E
 
Q
I
 
I
T
 
R
Q
 
D
S
 
D
-
 
L
D
 
S
K
 
A
Q
 
E
K
 
Q
R
 
R
E
 
E
R
 
D
E
 
R
L
 
A
D
 
N
A
 
E
L
 
L
L
 
M
E
 
E
E
 
E
F
 
F
D
 
H
I
 
I
A
 
E
A
 
H
L
 
L
R
 
R
R
 
D
S
 
S
P
 
M
S
 
G
V
 
Q
A
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
R
R
 
R
R
 
R
C
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
C
 
A
R
 
N
P
 
P
S
 
K
F
 
F
I
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
F
 
F
A
 
A
G
 
G
I
 
V
D
 
D
P
 
P
I
 
I
A
 
S
V
 
V
A
 
I
D
 
D
I
 
I
Q
 
K
T
 
R
L
 
I
V
 
I
Q
 
E
H
 
H
L
 
L
K
 
R
T
 
D
R
 
S
G
 
G
I
 
L
G
 
G
V
 
V
L
 
L
V
 
I
T
 
T
D
 
D
H
 
H
N
 
N
V
 
V
R
 
R
E
 
E
T
 
T
L
 
L
G
 
A
L
 
V
I
 
C
D
 
E
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
I
 
I
I
 
V
H
 
S
A
 
Q
G
 
G
R
 
H
V
 
L
L
 
I
T
 
A
Q
 
H
G
 
G
T
 
T
P
 
P
A
 
T
D
 
E
I
 
I
V
 
L
A
 
Q
D
 
D
A
 
E
E
 
H
A
 
V
R
 
K
R
 
R
F
 
V
Y
 
Y
L
 
L

6b8bA E. Coli lptb in complex with adp and a novobiocin derivative (see paper)
58% identity, 72% coverage: 85:314/321 of query aligns to 3:233/233 of 6b8bA

query
sites
6b8bA
L
 
L
S
 
T
V
 
A
M
 
K
R
 
N
L
 
L
R
 
A
K
 
K
S
 
A
Y
|
Y
K
 
K
M
 
G
R
|
R
R
 
R
I
x
V
I
 
V
E
 
E
D
 
D
V
 
V
S
 
S
L
 
L
T
 
T
V
 
V
R
 
N
R
 
S
G
 
G
E
 
E
A
 
I
V
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
T
F
 
F
Y
 
Y
M
 
M
I
 
V
S
 
V
G
 
G
L
 
I
I
 
V
R
 
P
P
 
R
D
 
D
A
 
A
G
 
G
R
 
N
I
 
I
E
 
I
L
 
I
D
 
D
G
 
D
H
 
D
D
 
D
V
 
I
T
 
S
R
 
L
L
 
L
P
 
P
M
 
L
Y
 
H
R
 
A
R
 
R
A
 
A
R
 
R
L
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
E
 
E
P
 
A
S
 
S
I
 
I
F
|
F
R
|
R
G
x
R
L
 
L
T
 
S
V
 
V
E
 
Y
D
 
D
N
 
N
I
 
L
R
 
M
A
 
A
V
 
V
L
 
L
E
 
Q
I
 
I
T
 
R
Q
 
D
S
 
D
-
 
L
D
 
S
K
 
A
Q
 
E
K
 
Q
R
 
R
E
 
E
R
 
D
E
 
R
L
 
A
D
 
N
A
 
E
L
 
L
L
 
M
E
 
E
E
 
E
F
 
F
D
 
H
I
 
I
A
 
E
A
 
H
L
 
L
R
 
R
R
 
D
S
 
S
P
 
M
S
 
G
V
 
Q
A
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
R
R
 
R
R
 
R
C
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
C
 
A
R
 
N
P
 
P
S
 
K
F
 
F
I
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
F
 
F
A
 
A
G
 
G
I
 
V
D
 
D
P
 
P
I
 
I
A
 
S
V
 
V
A
 
I
D
 
D
I
 
I
Q
 
K
T
 
R
L
 
I
V
 
I
Q
 
E
H
 
H
L
 
L
K
 
R
T
 
D
R
 
S
G
 
G
I
 
L
G
 
G
V
 
V
L
 
L
V
 
I
T
 
T
D
 
D
H
 
H
N
 
N
V
 
V
R
 
R
E
 
E
T
 
T
L
 
L
G
 
A
L
 
V
I
 
C
D
 
E
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
I
 
I
I
 
V
H
 
S
A
 
Q
G
 
G
R
 
H
V
 
L
L
 
I
T
 
A
Q
 
H
G
 
G
T
 
T
P
 
P
A
 
T
D
 
E
I
 
I
V
 
L
A
 
Q
D
 
D
A
 
E
E
 
H
A
 
V
R
 
K
R
 
R
F
 
V
Y
 
Y

1ji0A Crystal structure analysis of the abc transporter from thermotoga maritima
32% identity, 74% coverage: 81:316/321 of query aligns to 3:238/240 of 1ji0A

query
sites
1ji0A
S
 
S
E
 
D
G
 
I
V
 
V
L
 
L
S
 
E
V
 
V
M
 
Q
R
 
S
L
 
L
R
 
H
K
 
V
S
 
Y
Y
|
Y
K
 
G
M
 
A
R
 
I
R
 
H
I
 
A
I
 
I
E
 
K
D
 
G
V
 
I
S
 
D
L
 
L
T
 
K
V
 
V
R
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
Q
A
 
I
V
 
V
G
 
T
L
 
L
L
 
I
G
 
G
P
 
A
N
 
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
T
F
 
L
Y
 
S
M
 
A
I
 
I
S
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
V
R
 
R
P
 
A
D
 
Q
A
 
K
G
 
G
R
 
K
I
 
I
E
 
I
L
 
F
D
 
N
G
 
G
H
 
Q
D
 
D
V
 
I
T
 
T
R
 
N
L
 
K
P
 
P
M
 
A
Y
 
H
R
 
V
R
 
I
A
 
N
R
 
R
L
 
M
G
 
G
I
 
I
G
 
A
Y
 
L
L
 
V
P
 
P
Q
x
E
E
 
G
P
 
R
S
 
R
I
 
I
F
 
F
R
 
P
G
 
E
L
 
L
T
 
T
V
 
V
E
 
Y
D
 
E
N
 
N
I
 
L
R
 
-
A
 
M
V
 
M
L
 
G
E
 
A
I
 
Y
T
 
N
Q
 
R
S
 
K
D
 
D
K
 
K
Q
 
E
K
 
G
R
 
I
E
 
K
R
 
R
E
 
D
L
 
L
D
 
E
A
 
W
L
 
I
L
 
F
E
 
S
E
 
L
F
 
F
D
 
P
I
 
R
A
 
L
A
 
K
L
 
E
R
 
R
-
 
L
R
 
K
S
 
Q
P
 
L
S
 
G
V
 
G
A
 
T
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
Q
R
 
Q
R
 
M
C
 
L
E
 
A
I
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
M
C
 
S
R
 
R
P
 
P
S
 
K
F
 
L
I
 
L
L
 
M
L
 
M
D
 
D
E
|
E
P
 
P
F
 
S
A
 
L
G
 
G
I
 
L
D
 
A
P
 
P
I
 
I
A
 
L
V
 
V
A
 
S
D
 
E
I
 
V
Q
 
F
T
 
E
L
 
V
V
 
I
Q
 
Q
H
 
K
L
 
I
K
 
N
T
 
Q
R
 
E
G
 
G
I
 
T
G
 
T
V
 
I
L
 
L
V
 
L
T
 
V
D
 
E
H
 
Q
N
 
N
V
 
A
R
 
L
E
 
G
T
 
A
L
 
L
G
 
K
L
 
V
I
 
A
D
 
H
R
 
Y
A
 
G
Y
 
Y
I
 
V
I
 
L
H
 
E
A
 
T
G
 
G
R
 
Q
V
 
I
L
 
V
T
 
L
Q
 
E
G
 
G
T
 
K
P
 
A
A
 
S
D
 
E
I
 
L
V
 
L
A
 
D
D
 
N
A
 
E
E
 
M
A
 
V
R
 
R
R
 
K
F
 
A
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G

5x40A Structure of a cbio dimer bound with amppcp (see paper)
36% identity, 65% coverage: 98:307/321 of query aligns to 19:230/280 of 5x40A

query
sites
5x40A
R
 
K
I
x
A
I
 
L
E
 
D
D
 
D
V
 
L
S
 
S
L
 
L
T
 
A
V
 
V
R
 
P
R
 
K
G
 
G
E
 
E
A
 
S
V
 
L
G
 
A
L
 
I
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
F
 
L
Y
 
L
M
 
H
I
 
L
S
 
N
G
 
G
L
 
T
I
 
L
R
 
R
P
 
P
D
 
Q
A
 
S
G
 
G
R
 
R
I
 
V
E
 
L
L
 
L
-
 
G
-
 
G
-
 
T
-
 
A
D
 
T
G
 
G
H
 
H
D
 
S
V
 
R
T
 
K
R
 
D
L
 
L
P
 
T
M
 
G
Y
 
W
R
 
R
R
 
R
A
 
-
R
 
R
L
 
V
G
 
G
I
 
L
G
 
V
Y
 
L
L
x
Q
P
 
D
Q
 
A
E
 
D
P
 
D
S
 
Q
I
 
L
F
 
F
R
 
A
G
 
T
L
 
T
T
 
V
V
 
F
E
 
E
D
 
D
N
 
V
I
 
S
R
 
F
A
 
G
V
 
P
L
 
L
E
 
N
I
 
L
T
 
G
Q
 
L
S
 
S
D
 
E
K
 
A
Q
 
E
K
 
A
R
 
R
E
 
A
R
 
R
E
 
V
L
 
E
D
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
-
E
 
A
E
 
A
F
 
L
D
 
S
I
 
I
A
 
S
A
 
D
L
 
L
R
 
R
R
 
D
S
 
R
P
 
P
S
 
T
V
x
H
A
x
M
L
|
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
E
x
Q
R
 
K
R
 
R
R
 
R
C
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
G
A
 
A
L
 
V
A
 
A
C
 
M
R
 
R
P
 
P
S
 
E
F
 
V
I
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
x
Q
P
 
P
F
 
T
A
 
A
G
 
G
I
 
L
D
 
D
P
 
L
I
 
A
A
 
G
V
 
T
A
 
E
D
 
Q
I
 
L
Q
 
L
T
 
T
L
 
L
V
 
L
Q
 
R
H
 
G
L
 
L
K
 
R
T
 
A
R
 
A
G
 
G
I
 
M
G
 
T
V
 
L
L
 
V
V
 
F
T
 
S
D
 
T
H
|
H
N
 
D
V
 
V
R
 
E
E
 
L
T
 
A
L
 
A
G
 
A
L
 
L
I
 
A
D
 
D
R
 
R
A
 
V
Y
 
A
I
 
L
I
 
F
H
 
R
A
 
T
G
 
G
R
 
R
V
 
V
L
 
L
T
 
A
Q
 
E
G
 
G
T
 
A
P
 
A
A
 
E
D
 
A
I
 
V
V
 
L
A
 
S
D
 
D

Sites not aligning to the query:

7d0aB Acinetobacter mlafedb complex in adp-vanadate trapped vclose conformation (see paper)
32% identity, 74% coverage: 81:316/321 of query aligns to 1:242/263 of 7d0aB

query
sites
7d0aB
S
 
T
E
 
Q
G
 
S
V
 
L
L
 
I
S
 
E
V
 
V
M
 
K
R
 
N
L
 
L
R
 
S
K
 
F
S
 
N
Y
 
R
K
 
G
M
 
E
R
 
R
R
 
V
I
 
I
I
 
Y
E
 
D
D
 
N
V
 
I
S
 
S
L
 
L
T
 
N
V
 
I
R
 
R
R
 
R
G
 
G
E
 
Q
A
 
I
V
 
T
G
 
A
L
 
I
L
 
M
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
 
G
A
x
T
G
|
G
K
|
K
T
 
T
T
 
T
L
 
L
F
 
L
Y
 
R
M
 
L
I
 
I
S
 
G
G
 
G
L
 
Q
I
 
L
R
 
V
P
 
P
D
 
D
A
 
Q
G
 
G
R
 
E
I
 
V
E
 
L
L
 
L
D
 
D
G
 
G
H
 
K
D
 
D
V
 
I
T
 
A
R
 
Q
L
 
M
P
 
S
-
 
R
-
 
Q
-
 
E
-
 
L
M
 
F
Y
 
A
R
 
A
R
 
R
A
 
A
R
 
R
L
 
M
G
 
G
I
 
M
G
 
-
Y
 
-
L
 
L
P
 
F
Q
 
Q
E
 
S
P
 
G
S
 
A
I
 
L
F
 
F
R
 
T
G
 
D
L
 
M
T
 
S
V
 
V
E
 
Y
D
 
E
N
 
N
I
 
V
R
 
A
A
 
F
V
 
P
L
 
I
E
 
R
I
 
A
T
 
H
Q
 
T
S
 
K
D
 
L
K
 
S
Q
 
E
K
 
N
R
 
L
E
 
I
R
 
A
E
 
E
L
 
L
D
 
V
A
 
A
L
 
L
-
 
K
L
 
L
E
 
E
E
 
S
F
 
V
D
 
G
I
 
L
A
 
R
A
 
G
L
 
T
R
 
E
R
 
Q
S
 
L
P
 
M
S
 
P
V
 
T
A
x
E
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
E
x
M
R
 
N
R
 
R
R
 
R
C
 
V
E
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
A
C
 
L
R
 
D
P
 
P
S
 
D
F
 
L
I
 
I
L
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
 
E
P
 
P
F
 
F
A
 
A
G
 
G
I
 
Q
D
 
D
P
 
P
I
 
I
A
 
V
V
 
K
A
 
G
D
 
V
I
 
L
Q
 
T
T
 
R
L
 
L
V
 
I
Q
 
R
H
 
S
L
 
L
K
 
R
-
 
E
T
 
A
R
 
L
G
 
D
I
 
L
G
 
T
V
 
T
L
 
I
V
 
I
T
 
V
D
 
S
H
 
H
N
 
D
V
 
V
R
 
P
E
 
E
T
 
T
L
 
L
G
 
S
L
 
I
I
 
A
D
 
D
R
 
Y
A
 
I
Y
 
Y
I
 
V
I
 
V
H
 
A
A
 
E
G
 
G
R
 
K
V
 
I
L
 
Q
T
 
G
Q
 
E
G
 
G
T
 
T
P
 
P
A
 
E
D
 
E
I
 
L
V
 
Q
A
 
A
D
 
Y
A
 
A
E
 
S
-
 
P
-
 
F
A
 
V
R
 
K
R
 
Q
F
 
F
Y
 
L
L
 
T
G
 
G

7d08B Acinetobacter mlafedb complex in atp-bound vtrans1 conformation (see paper)
32% identity, 74% coverage: 81:316/321 of query aligns to 1:242/263 of 7d08B

query
sites
7d08B
S
 
T
E
 
Q
G
 
S
V
 
L
L
 
I
S
 
E
V
 
V
M
 
K
R
 
N
L
 
L
R
 
S
K
 
F
S
 
N
Y
x
R
K
 
G
M
 
E
R
|
R
R
 
V
I
 
I
I
 
Y
E
 
D
D
 
N
V
 
I
S
 
S
L
 
L
T
 
N
V
 
I
R
 
R
R
 
R
G
 
G
E
 
Q
A
 
I
V
 
T
G
 
A
L
 
I
L
 
M
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
|
G
A
x
T
G
 
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
L
F
 
L
Y
 
R
M
 
L
I
 
I
S
 
G
G
 
G
L
 
Q
I
 
L
R
 
V
P
 
P
D
 
D
A
 
Q
G
 
G
R
 
E
I
 
V
E
 
L
L
 
L
D
 
D
G
 
G
H
 
K
D
 
D
V
 
I
T
 
A
R
 
Q
L
 
M
P
 
S
-
 
R
-
 
Q
-
 
E
-
 
L
M
 
F
Y
 
A
R
 
A
R
 
R
A
 
A
R
 
R
L
 
M
G
 
G
I
 
M
G
 
-
Y
 
-
L
 
L
P
 
F
Q
 
Q
E
 
S
P
 
G
S
 
A
I
 
L
F
 
F
R
 
T
G
 
D
L
 
M
T
 
S
V
 
V
E
 
Y
D
 
E
N
 
N
I
 
V
R
 
A
A
 
F
V
 
P
L
 
I
E
 
R
I
 
A
T
 
H
Q
 
T
S
 
K
D
 
L
K
 
S
Q
 
E
K
 
N
R
 
L
E
 
I
R
 
A
E
 
E
L
 
L
D
 
V
A
 
A
L
 
L
-
 
K
L
 
L
E
 
E
E
 
S
F
 
V
D
 
G
I
 
L
A
 
R
A
 
G
L
 
T
R
 
E
R
 
Q
S
 
L
P
 
M
S
 
P
V
 
T
A
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
M
R
 
N
R
 
R
R
 
R
C
 
V
E
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
A
C
 
L
R
 
D
P
 
P
S
 
D
F
 
L
I
 
I
L
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
|
E
P
 
P
F
 
F
A
 
A
G
 
G
I
 
Q
D
 
D
P
 
P
I
 
I
A
 
V
V
 
K
A
 
G
D
 
V
I
 
L
Q
 
T
T
 
R
L
 
L
V
 
I
Q
 
R
H
 
S
L
 
L
K
 
R
-
 
E
T
 
A
R
 
L
G
 
D
I
 
L
G
 
T
V
 
T
L
 
I
V
 
I
T
 
V
D
 
S
H
 
H
N
 
D
V
 
V
R
 
P
E
 
E
T
 
T
L
 
L
G
 
S
L
 
I
I
 
A
D
 
D
R
 
Y
A
 
I
Y
 
Y
I
 
V
I
 
V
H
 
A
A
 
E
G
 
G
R
 
K
V
 
I
L
 
Q
T
 
G
Q
 
E
G
 
G
T
 
T
P
 
P
A
 
E
D
 
E
I
 
L
V
 
Q
A
 
A
D
 
Y
A
 
A
E
 
S
-
 
P
-
 
F
A
 
V
R
 
K
R
 
Q
F
 
F
Y
 
L
L
 
T
G
 
G

6z5uK Cryo-em structure of the a. Baumannii mlabdef complex bound to appnhp (see paper)
34% identity, 69% coverage: 97:316/321 of query aligns to 15:240/253 of 6z5uK

query
sites
6z5uK
R
 
R
R
 
V
I
 
I
I
 
Y
E
 
D
D
 
N
V
 
I
S
 
S
L
 
L
T
 
N
V
 
I
R
 
R
R
 
R
G
 
G
E
 
Q
A
 
I
V
 
T
G
 
A
L
 
I
L
 
M
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
T
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
L
F
 
L
Y
 
R
M
 
L
I
 
I
S
 
G
G
 
G
L
 
Q
I
 
L
R
 
V
P
 
P
D
 
D
A
 
Q
G
 
G
R
 
E
I
 
V
E
 
L
L
 
L
D
 
D
G
 
G
H
 
K
D
 
D
V
 
I
T
 
A
R
 
Q
L
 
M
P
 
S
-
 
R
-
 
Q
-
 
E
-
 
L
M
 
F
Y
 
A
R
 
A
R
 
R
A
 
A
R
 
R
L
 
M
G
 
G
I
 
M
G
 
-
Y
 
-
L
 
L
P
 
F
Q
|
Q
E
 
S
P
 
G
S
 
A
I
 
L
F
 
F
R
 
T
G
 
D
L
 
M
T
 
S
V
 
V
E
 
Y
D
 
E
N
 
N
I
 
V
R
 
A
A
 
F
V
 
P
L
 
I
E
 
R
I
 
A
T
 
H
Q
 
T
S
 
K
D
 
L
K
 
S
Q
 
E
K
 
N
R
 
L
E
 
I
R
 
A
E
 
E
L
 
L
D
 
V
A
 
A
L
 
L
-
 
K
L
 
L
E
 
E
E
 
S
F
 
V
D
 
G
I
 
L
A
 
R
A
 
G
L
 
T
R
 
E
R
 
Q
S
 
L
P
 
M
S
 
P
V
 
T
A
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
M
R
 
N
R
 
R
R
 
R
C
 
V
E
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
A
C
 
L
R
 
D
P
 
P
S
 
D
F
 
L
I
 
I
L
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
|
E
P
 
P
F
 
F
A
 
A
G
 
G
I
 
Q
D
 
D
P
 
P
I
 
I
A
 
V
V
 
K
A
 
G
D
 
V
I
 
L
Q
 
T
T
 
R
L
 
L
V
 
I
Q
 
R
H
 
S
L
 
L
K
 
R
-
 
E
T
 
A
R
 
L
G
 
D
I
 
L
G
 
T
V
 
T
L
 
I
V
 
I
T
 
V
D
 
S
H
|
H
N
 
D
V
 
V
R
 
P
E
 
E
T
 
T
L
 
L
G
 
S
L
 
I
I
 
A
D
 
D
R
 
Y
A
 
I
Y
 
Y
I
 
V
I
 
V
H
 
A
A
 
E
G
 
G
R
 
K
V
 
I
L
 
Q
T
 
G
Q
 
E
G
 
G
T
 
T
P
 
P
A
 
E
D
 
E
I
 
L
V
 
Q
A
 
A
D
 
Y
A
 
A
E
 
S
-
 
P
-
 
F
A
 
V
R
 
K
R
 
Q
F
 
F
Y
 
L
L
 
T
G
 
G

Sites not aligning to the query:

4yerA Crystal structure of an abc transporter atp-binding protein (tm_1403) from thermotoga maritima msb8 at 2.35 a resolution
34% identity, 69% coverage: 82:304/321 of query aligns to 2:223/285 of 4yerA

query
sites
4yerA
E
 
E
G
 
D
V
 
I
L
 
I
S
 
V
V
 
V
M
 
E
R
 
N
L
 
L
R
 
V
K
 
K
S
 
K
Y
x
F
K
 
G
M
 
D
R
x
F
R
 
E
I
 
A
I
 
V
E
 
K
D
 
G
V
 
V
S
 
S
L
 
F
T
 
S
V
 
V
R
 
K
R
 
K
G
 
G
E
 
E
A
 
I
V
 
F
G
 
A
L
 
F
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
T
F
 
I
Y
 
H
M
 
M
I
 
L
S
 
T
G
 
T
L
 
L
I
 
L
R
 
K
P
 
P
D
 
T
A
 
S
G
 
G
R
 
K
I
 
A
E
 
W
L
 
V
D
 
A
G
 
G
H
 
H
D
 
D
V
 
V
T
 
L
R
 
K
L
 
E
P
 
P
M
 
-
Y
 
-
R
 
R
R
 
E
A
 
V
R
 
R
L
 
R
G
 
K
I
 
I
G
 
G
Y
 
I
L
 
V
P
 
F
Q
 
Q
E
 
D
P
 
Q
S
 
S
I
 
L
F
 
D
R
 
R
G
 
E
L
 
L
T
 
T
V
 
A
E
 
Y
D
 
E
N
 
N
I
 
M
R
 
Y
A
 
I
V
 
H
L
 
G
E
 
K
I
 
I
T
 
Y
Q
 
G
S
 
Y
D
 
G
K
 
G
Q
 
E
K
 
K
R
 
L
E
 
K
R
 
K
E
 
R
L
 
I
D
 
L
A
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
E
E
 
F
F
 
V
D
 
E
I
 
L
A
 
L
A
 
E
L
 
F
R
 
K
R
 
D
S
 
K
P
 
P
S
 
V
V
 
K
A
x
T
L
x
F
S
|
S
G
 
G
G
 
G
E
 
M
R
 
A
R
 
R
R
 
R
C
 
L
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
S
L
 
L
A
 
I
C
 
H
R
 
E
P
 
P
S
 
E
F
 
V
I
 
L
L
 
F
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
F
 
T
A
 
I
G
 
G
I
 
L
D
 
D
P
 
P
I
 
H
A
 
T
V
 
R
A
 
A
D
 
H
I
 
M
Q
 
W
T
 
E
L
 
Y
V
 
I
Q
 
S
H
 
K
L
 
M
K
 
K
T
 
K
-
 
E
R
 
H
G
 
N
I
 
M
G
 
T
V
 
I
L
 
F
V
 
L
T
 
T
D
 
T
H
 
H
N
 
Y
V
 
M
R
 
D
E
 
E
T
 
A
L
 
E
G
 
Q
L
 
L
I
 
A
D
 
D
R
 
R
A
 
V
Y
 
A
I
 
I
I
 
I
H
 
D
A
 
H
G
 
G
R
 
K
V
 
I
L
 
I
T
 
A
Q
 
L
G
 
G
T
 
T
P
 
P
A
 
T
D
 
E
I
 
L

P34358 ABC transporter ced-7; Cell death protein 7 from Caenorhabditis elegans (see 2 papers)
33% identity, 73% coverage: 66:300/321 of query aligns to 527:760/1704 of P34358

query
sites
P34358
S
 
S
F
 
L
A
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
S
Q
 
T
D
 
E
H
 
A
A
 
D
A
 
G
A
 
A
A
 
R
A
 
D
D
 
T
S
 
A
E
 
R
G
 
A
V
 
D
L
 
I
S
 
I
V
 
V
M
 
R
R
 
N
L
 
L
R
 
V
K
 
K
-
 
I
-
 
W
S
 
S
Y
 
T
K
 
T
M
 
G
R
 
E
R
 
R
I
 
A
I
 
V
E
 
D
D
 
G
V
 
L
S
 
S
L
 
L
T
 
R
V
 
A
R
 
V
R
 
R
G
 
G
E
 
Q
A
 
C
V
 
S
G
 
I
L
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
H
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
|
K
T
 
S
T
 
T
L
 
T
F
 
F
Y
 
S
M
 
S
I
 
I
S
 
A
G
 
G
L
 
I
I
 
I
R
 
R
P
 
P
D
 
T
A
 
N
G
 
G
R
 
R
I
 
I
E
 
T
L
 
I
D
 
C
G
 
G
H
 
Y
D
 
D
V
 
V
T
 
G
R
 
N
L
 
E
P
 
P
M
 
-
Y
 
-
R
 
G
R
 
E
A
 
T
R
 
R
L
 
R
G
 
H
I
 
I
G
 
G
Y
 
M
L
 
C
P
 
P
Q
 
Q
E
 
Y
P
 
N
S
 
P
I
 
L
F
 
Y
R
 
D
G
 
Q
L
 
L
T
 
T
V
 
V
E
 
S
D
x
E
N
 
H
I
 
L
R
 
K
A
 
L
V
 
V
L
 
Y
E
 
G
I
 
L
T
 
K
Q
 
G
S
 
A
D
 
R
K
 
E
Q
 
K
K
 
D
R
 
F
E
 
K
R
 
Q
E
 
D
L
 
M
D
 
K
A
 
R
L
 
L
L
 
L
E
 
S
E
 
D
F
 
V
D
 
K
I
 
L
A
 
D
A
 
F
L
 
K
R
 
E
R
 
N
S
 
E
P
 
K
S
 
A
V
 
V
A
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
M
R
 
K
R
 
R
R
 
K
C
 
L
E
 
C
I
 
V
A
 
C
R
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
I
C
 
G
R
 
D
P
 
S
S
 
E
F
 
V
I
 
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
F
 
T
A
 
A
G
 
G
I
 
M
D
 
D
P
 
P
I
 
G
A
 
A
V
 
R
A
 
Q
D
 
D
I
 
V
Q
 
Q
T
 
K
L
 
L
V
 
V
Q
 
E
H
 
R
L
 
E
K
 
K
T
 
A
R
 
N
G
 
R
I
 
T
G
 
-
V
 
I
L
 
L
V
 
L
T
 
T
D
 
T
H
 
H
N
 
Y
V
 
M
R
 
D
E
 
E
T
 
A
L
 
E
G
 
R
L
 
L
I
 
G
D
 
D
R
 
W
A
 
V
Y
 
F
I
 
I
I
 
M
H
 
S
A
 
H
G
 
G
R
 
K
V
 
L
L
 
V
T
 
A
Q
 
S
G
 
G
T
 
T

Sites not aligning to the query:

7chaI Cryo-em structure of p.Aeruginosa mlafebd with amppnp (see paper)
34% identity, 69% coverage: 97:316/321 of query aligns to 16:241/262 of 7chaI

query
sites
7chaI
R
 
R
R
 
A
I
 
I
I
 
F
E
 
D
D
 
N
V
 
I
S
 
D
L
 
V
T
 
R
V
 
I
R
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
K
A
 
V
V
 
T
G
 
G
L
 
I
L
 
M
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
L
F
 
L
Y
 
R
M
 
L
I
 
I
S
 
A
G
 
S
L
 
Q
I
 
L
R
 
R
P
 
P
D
 
S
A
 
K
G
 
G
R
 
E
I
 
V
E
 
W
L
 
V
D
 
N
G
 
G
H
 
Q
D
 
N
V
 
-
T
 
-
R
 
-
L
 
L
P
 
P
M
 
Q
Y
 
L
R
 
S
R
 
R
A
 
G
-
 
D
-
 
L
-
 
F
-
 
D
-
 
M
R
 
R
L
 
K
G
 
Q
I
 
F
G
 
G
Y
 
V
L
 
L
P
 
F
Q
 
Q
E
 
S
P
 
G
S
 
A
I
 
L
F
 
F
R
 
T
G
 
D
L
 
L
T
 
D
V
 
V
E
 
F
D
 
E
N
 
N
I
 
V
R
 
A
A
 
F
V
 
P
L
 
L
E
 
R
I
 
V
T
 
H
Q
 
T
S
 
Q
D
 
L
K
 
P
Q
 
E
K
 
E
R
 
M
E
 
I
R
 
R
E
 
-
L
 
-
D
 
D
A
 
I
L
 
V
L
 
L
E
 
M
E
 
K
F
 
L
D
 
Q
I
 
A
A
 
V
A
 
G
L
 
L
R
 
R
R
 
G
S
 
A
P
 
V
S
 
E
V
 
L
A
 
M
-
 
P
-
 
D
-
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
M
R
 
K
R
 
R
R
 
R
C
 
V
E
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
A
C
 
L
R
 
D
P
 
P
S
 
Q
F
 
I
I
 
L
L
 
L
L
 
Y
D
 
D
E
 
E
P
 
P
F
 
F
A
 
V
G
 
G
I
 
Q
D
 
D
P
 
P
I
 
I
A
 
A
V
 
M
A
 
G
D
 
V
I
 
L
Q
 
V
T
 
R
L
 
L
V
 
I
Q
 
R
H
 
L
L
 
L
K
 
N
-
 
D
T
 
A
R
 
L
G
 
G
I
 
I
G
 
T
V
 
S
L
 
I
V
 
V
T
 
V
D
 
S
H
 
H
N
 
D
V
 
L
R
 
A
E
 
E
T
 
T
L
 
A
G
 
S
L
 
I
I
 
A
D
 
D
R
 
Y
A
 
I
Y
 
Y
I
 
I
I
 
V
H
 
G
A
 
D
G
 
G
R
 
R
V
 
V
L
 
L
T
 
G
Q
 
H
G
 
G
T
 
T
P
 
P
A
 
-
D
 
D
I
 
V
V
 
L
A
 
K
-
 
E
-
 
T
-
 
D
D
 
D
A
 
P
E
 
R
A
 
I
R
 
R
R
 
Q
F
 
F
Y
 
V
L
 
K
G
 
G

Sites not aligning to the query:

1g6hA Crystal structure of the adp conformation of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
28% identity, 73% coverage: 84:317/321 of query aligns to 4:254/254 of 1g6hA

query
sites
1g6hA
V
 
I
L
 
L
S
 
R
V
 
T
M
 
E
R
 
N
L
 
I
R
 
V
K
 
K
S
 
Y
Y
x
F
K
 
G
M
 
E
R
x
F
R
 
K
I
 
A
I
 
L
E
 
D
D
 
G
V
 
V
S
 
S
L
 
I
T
 
S
V
 
V
R
 
N
R
 
K
G
 
G
E
 
D
A
 
V
V
 
T
G
 
L
L
 
I
L
 
I
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
F
 
I
Y
 
N
M
 
V
I
 
I
S
 
T
G
 
G
L
 
F
I
 
L
R
 
K
P
 
A
D
 
D
A
 
E
G
 
G
R
 
R
I
 
V
E
 
Y
L
 
F
D
 
E
G
 
N
H
 
K
D
 
D
V
 
I
T
 
T
R
 
N
L
 
K
P
 
E
M
 
P
Y
 
A
R
 
E
R
 
L
A
 
Y
R
 
H
L
 
Y
G
 
G
I
 
I
G
 
V
Y
 
R
L
 
T
P
 
F
Q
 
Q
E
 
T
P
 
P
S
 
Q
I
 
P
F
 
L
R
 
K
G
 
E
L
 
M
T
 
T
V
 
V
E
 
L
D
 
E
N
 
N
I
 
L
R
 
-
A
 
L
V
 
I
L
 
G
E
 
E
I
 
I
T
 
C
Q
 
P
S
 
G
D
 
E
K
 
S
Q
 
P
-
 
L
-
 
N
-
 
S
-
 
L
-
 
F
-
 
Y
-
 
K
-
 
K
-
 
W
-
 
I
-
 
P
K
 
K
R
 
E
E
 
E
R
 
E
E
 
M
L
 
V
D
 
E
A
 
K
-
 
A
-
 
F
-
 
K
L
 
I
L
 
L
E
 
E
E
 
F
F
 
L
D
 
K
I
 
L
A
 
S
A
 
H
L
 
L
R
 
Y
R
 
D
S
 
R
P
 
K
S
 
A
V
 
G
A
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
M
R
 
K
R
 
L
C
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
M
C
 
T
R
 
N
P
 
P
S
 
K
F
 
M
I
 
I
L
 
V
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
F
 
I
A
 
A
G
 
G
I
 
V
D
 
A
P
 
P
I
 
G
A
 
L
V
 
A
A
 
H
D
 
D
I
 
I
Q
 
F
T
 
N
L
 
H
V
 
V
Q
 
L
H
 
E
L
 
L
K
 
K
T
 
A
R
 
K
G
 
G
I
 
I
G
 
T
V
 
F
L
 
L
V
 
I
T
 
I
D
 
E
H
 
H
N
 
R
V
 
L
R
 
D
E
 
I
T
 
V
L
 
L
G
 
N
L
 
Y
I
 
I
D
 
D
R
 
H
A
 
L
Y
 
Y
I
 
V
I
 
M
H
 
F
A
 
N
G
 
G
R
 
Q
V
 
I
L
 
I
T
 
A
Q
 
E
G
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
E
-
 
E
T
 
E
P
 
I
A
 
K
D
 
N
I
 
V
V
 
L
A
 
S
D
 
D
A
 
P
E
 
K
A
 
V
R
 
V
R
 
E
F
 
I
Y
 
Y
L
 
I
G
 
G
D
 
E

1g9xB Characterization of the twinning structure of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
28% identity, 73% coverage: 84:316/321 of query aligns to 4:253/253 of 1g9xB

query
sites
1g9xB
V
 
I
L
 
L
S
 
R
V
 
T
M
 
E
R
 
N
L
 
I
R
 
V
K
 
K
S
 
Y
Y
x
F
K
 
G
M
 
E
R
x
F
R
 
K
I
 
A
I
 
L
E
 
D
D
 
G
V
 
V
S
 
S
L
 
I
T
 
S
V
 
V
R
 
C
R
 
K
G
 
G
E
 
D
A
 
V
V
 
T
G
 
L
L
 
I
L
 
I
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
F
 
I
Y
 
N
M
 
V
I
 
I
S
 
T
G
 
G
L
 
F
I
 
L
R
 
K
P
 
A
D
 
D
A
 
E
G
 
G
R
 
R
I
 
V
E
 
Y
L
 
F
D
 
E
G
 
N
H
 
K
D
 
D
V
 
I
T
 
T
R
 
N
L
 
K
P
 
E
M
 
P
Y
 
A
R
 
E
R
 
L
A
 
Y
R
 
H
L
 
Y
G
 
G
I
 
I
G
 
V
Y
 
R
L
 
T
P
 
F
Q
 
Q
E
 
T
P
 
P
S
 
Q
I
 
P
F
 
L
R
 
K
G
 
E
L
 
M
T
 
T
V
 
V
E
 
L
D
 
E
N
 
N
I
 
L
R
 
-
A
 
L
V
 
I
L
 
G
E
 
E
I
 
I
T
 
N
Q
 
P
S
 
G
D
 
E
K
 
S
Q
 
P
-
 
L
-
 
N
-
 
S
-
 
L
-
 
F
-
 
Y
-
 
K
-
 
K
-
 
W
-
 
I
-
 
P
K
 
K
R
 
E
E
 
E
R
 
E
E
 
M
L
 
V
D
 
E
A
 
K
-
 
A
-
 
F
-
 
K
L
 
I
L
 
L
E
 
E
E
 
F
F
 
L
D
 
K
I
 
L
A
 
S
A
 
H
L
 
L
R
 
Y
R
 
D
S
 
R
P
 
K
S
 
A
V
 
G
A
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
M
R
 
K
R
 
L
C
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
M
C
 
T
R
 
N
P
 
P
S
 
K
F
 
M
I
 
I
L
 
V
L
 
M
D
 
D
E
|
E
P
 
P
F
 
I
A
 
A
G
 
G
I
 
V
D
 
A
P
 
P
I
 
G
A
 
L
V
 
A
A
 
H
D
 
D
I
 
I
Q
 
F
T
 
N
L
 
H
V
 
V
Q
 
L
H
 
E
L
 
L
K
 
K
T
 
A
R
 
K
G
 
G
I
 
I
G
 
T
V
 
F
L
 
L
V
 
I
T
 
I
D
 
E
H
 
H
N
 
R
V
 
L
R
 
D
E
 
I
T
 
V
L
 
L
G
 
N
L
 
Y
I
 
I
D
 
D
R
 
H
A
 
L
Y
 
Y
I
 
V
I
 
M
H
 
F
A
 
N
G
 
G
R
 
Q
V
 
I
L
 
I
T
 
A
Q
 
E
G
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
E
-
 
E
T
 
E
P
 
I
A
 
K
D
 
N
I
 
V
V
 
L
A
 
S
D
 
D
A
 
P
E
 
K
A
 
V
R
 
V
R
 
E
F
 
I
Y
 
Y
L
 
I
G
 
G

Q9BZC7 ATP-binding cassette sub-family A member 2; ATP-binding cassette transporter 2; ATP-binding cassette 2; EC 7.6.2.- from Homo sapiens (Human) (see paper)
34% identity, 68% coverage: 84:301/321 of query aligns to 989:1205/2435 of Q9BZC7

query
sites
Q9BZC7
V
 
V
L
 
V
S
 
C
V
 
V
M
 
D
R
 
K
L
 
L
R
 
T
K
 
K
S
 
V
Y
 
Y
K
 
K
-
 
D
-
 
D
M
 
K
R
 
K
R
 
L
I
 
A
I
 
L
E
 
N
D
 
K
V
 
L
S
 
S
L
 
L
T
 
N
V
 
L
R
 
Y
R
 
E
G
 
N
E
 
Q
A
 
V
V
 
V
G
 
S
L
 
F
L
 
L
G
 
G
P
 
H
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
L
 
T
F
 
M
Y
 
S
M
 
I
I
 
L
S
 
T
G
 
G
L
 
L
I
 
F
R
 
P
P
 
P
D
 
T
A
 
S
G
 
G
R
 
S
I
 
A
E
 
T
L
 
I
D
 
Y
G
 
G
H
 
H
D
 
D
V
 
I
T
 
-
R
 
R
L
 
T
P
 
E
M
 
M
Y
 
-
R
 
D
R
 
E
A
 
I
R
 
R
L
 
K
G
 
N
I
 
L
G
 
G
Y
 
M
L
 
C
P
 
P
Q
 
Q
E
 
H
P
 
N
S
 
V
I
 
L
F
 
F
R
 
D
G
 
R
L
 
L
T
 
T
V
 
V
E
 
E
D
 
E
N
 
H
I
 
L
R
 
W
A
 
F
V
 
Y
L
 
S
E
 
R
I
 
L
T
 
K
Q
 
S
S
 
M
D
 
A
K
 
Q
Q
 
E
K
 
E
R
 
I
E
 
R
R
 
R
E
 
E
L
 
M
D
 
D
A
 
K
L
 
M
L
 
I
E
 
E
E
 
D
F
 
L
D
 
E
I
 
L
A
 
S
A
 
N
L
 
K
R
 
R
R
 
H
S
 
S
P
 
L
S
 
V
V
 
Q
A
 
T
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
M
R
 
K
R
 
R
R
 
K
C
 
L
E
 
S
I
 
V
A
 
A
R
 
I
A
 
A
L
 
F
A
 
V
C
 
G
R
 
G
P
 
S
S
 
R
F
 
A
I
 
I
L
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
F
 
T
A
 
A
G
 
G
I
 
V
D
 
D
P
 
P
I
 
Y
A
 
A
V
 
R
A
 
R
D
 
A
I
 
I
Q
 
W
T
 
D
L
 
L
V
 
I
Q
 
L
H
 
K
L
 
Y
K
 
K
T
 
P
R
 
-
G
 
G
I
 
R
G
 
T
V
 
I
L
 
L
V
 
L
T
 
S
D
 
T
H
 
H
N
 
H
V
 
M
R
 
D
E
 
E
T
 
A
L
 
D
G
 
L
L
 
L
I
 
G
D
 
D
R
 
R
A
 
I
Y
 
A
I
 
I
I
 
I
H
 
S
A
 
H
G
 
G
R
 
K
V
 
L
L
 
K
T
 
C
Q
 
C
G
 
G
T
 
S
P
 
P

Sites not aligning to the query:

P69874 Spermidine/putrescine import ATP-binding protein PotA; EC 7.6.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
33% identity, 68% coverage: 90:307/321 of query aligns to 23:238/378 of P69874

query
sites
P69874
L
 
I
R
 
R
K
 
K
S
x
C
Y
x
F
K
 
D
M
 
G
R
 
K
R
 
E
I
 
V
I
 
I
E
 
P
D
 
Q
V
 
L
S
 
D
L
 
L
T
 
T
V
 
I
R
 
N
R
 
N
G
 
G
E
 
E
A
x
F
V
 
L
G
 
T
L
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
 
G
A
x
C
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
L
 
V
F
x
L
Y
 
R
M
 
L
I
 
I
S
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
E
R
 
T
P
 
V
D
 
D
A
 
S
G
 
G
R
 
R
I
 
I
E
 
M
L
|
L
D
 
D
G
 
N
H
 
E
D
 
D
V
 
I
T
 
T
R
 
H
L
 
V
P
 
P
M
 
A
Y
 
E
R
 
N
R
 
R
A
 
Y
R
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
V
G
 
N
Y
 
T
L
 
V
P
 
F
Q
 
Q
E
 
S
P
 
Y
S
 
A
I
 
L
F
 
F
R
 
P
G
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
E
 
F
D
 
E
N
 
N
I
 
V
R
 
A
A
 
F
V
 
G
L
 
L
E
 
R
I
 
M
T
 
Q
Q
 
K
S
 
T
D
 
P
K
 
A
Q
 
A
K
 
E
-
 
I
R
 
T
E
 
P
R
 
R
E
 
V
L
 
M
D
 
E
A
 
A
L
 
L
-
 
R
-
 
M
-
x
V
-
 
Q
L
 
L
E
 
E
E
 
T
F
 
F
D
 
-
I
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
A
R
 
Q
R
 
R
S
 
K
P
 
P
S
 
H
V
 
-
A
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
Q
R
 
Q
R
 
R
C
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
V
A
 
V
C
 
N
R
 
K
P
 
P
S
 
R
F
 
L
I
 
L
L
 
L
L
 
L
D
|
D
E
 
E
P
 
S
F
 
L
A
 
S
G
 
A
I
 
L
D
 
D
P
 
Y
I
 
K
A
 
L
V
 
R
A
 
K
D
 
Q
I
 
M
Q
 
Q
T
 
N
L
 
E
V
 
L
Q
 
K
H
 
A
L
 
L
K
 
Q
T
 
R
R
 
K
-
 
L
G
 
G
I
 
I
G
 
T
V
 
F
L
 
V
V
 
F
T
 
V
D
 
T
H
 
H
N
 
D
V
 
Q
R
 
E
E
 
E
T
 
A
L
 
L
G
 
T
L
 
M
I
 
S
D
 
D
R
 
R
A
 
I
Y
 
V
I
 
V
I
 
M
H
 
R
A
 
D
G
 
G
R
 
R
V
 
I
L
 
E
T
 
Q
Q
 
D
G
 
G
T
 
T
P
 
P
A
 
R
D
 
E
I
 
I
V
 
Y
A
 
E
D
 
E

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_012589209.1 NCBI__GCF_000021745.1:WP_012589209.1
MLLRLLPDFTCAVALMGFGGRGAPRALRRRPKADQIAGASRSEASAASAAPTARMTSAAD
AFGDRSFAEGGQDHAAAAADSEGVLSVMRLRKSYKMRRIIEDVSLTVRRGEAVGLLGPNG
AGKTTLFYMISGLIRPDAGRIELDGHDVTRLPMYRRARLGIGYLPQEPSIFRGLTVEDNI
RAVLEITQSDKQKRERELDALLEEFDIAALRRSPSVALSGGERRRCEIARALACRPSFIL
LDEPFAGIDPIAVADIQTLVQHLKTRGIGVLVTDHNVRETLGLIDRAYIIHAGRVLTQGT
PADIVADAEARRFYLGDDFVL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory