SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012609327.1 NCBI__GCF_000429905.1:WP_012609327.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

8bj3A Crystal structure of medicago truncatula histidinol-phosphate aminotransferase (hisn6) in complex with histidinol-phosphate (see paper)
31% identity, 96% coverage: 10:369/376 of query aligns to 1:359/360 of 8bj3A

query
sites
8bj3A
D
 
D
R
 
S
L
 
F
V
 
I
P
 
R
P
 
Q
H
 
H
I
 
L
K
 
R
C
 
K
F
 
L
E
 
A
A
 
P
Y
|
Y
V
 
Q
P
 
P
S
 
I
K
 
L
P
 
P
D
 
F
D
 
E
V
 
V
L
 
L
M
 
S
Q
 
S
Y
 
R
Y
 
L
G
 
G
-
 
R
-
 
K
C
 
P
S
 
E
S
 
D
L
 
I
L
 
V
R
 
K
L
 
L
N
 
D
N
 
A
N
 
N
E
 
E
N
 
N
P
 
P
L
 
Y
G
 
G
P
 
P
P
 
P
G
 
P
E
 
E
S
 
V
R
 
M
Q
 
E
A
 
A
I
 
L
-
 
G
-
 
S
L
 
I
D
 
R
F
 
F
P
 
P
P
 
-
N
 
-
K
 
-
A
 
-
S
 
Y
V
 
V
Y
|
Y
P
 
P
S
 
D
G
 
P
D
 
E
A
 
S
Y
 
R
H
 
R
L
 
L
R
 
R
R
 
A
K
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
R
 
D
F
 
S
G
 
G
M
 
L
G
 
E
P
 
S
D
 
E
Q
 
Y
F
 
I
L
 
L
V
 
V
G
 
G
N
 
C
G
|
G
A
|
A
N
x
D
E
 
E
V
 
L
I
 
I
A
 
D
F
 
L
V
 
I
I
 
M
K
 
R
A
 
C
F
 
V
C
 
L
Q
 
D
E
 
P
G
 
G
D
 
D
N
 
K
I
 
I
V
 
V
T
 
D
A
 
C
D
 
P
K
 
P
T
 
T
F
|
F
A
 
T
V
x
M
Y
 
Y
E
 
E
W
 
F
V
 
D
A
 
A
Q
 
A
F
 
V
S
 
N
G
 
G
F
 
A
E
 
L
A
 
V
R
 
I
T
 
K
V
 
V
P
 
P
L
 
R
K
 
R
-
 
P
D
 
D
Y
 
F
G
 
S
F
 
L
N
 
N
D
 
V
E
 
E
A
 
Q
M
 
I
L
 
I
-
 
E
A
 
V
A
 
V
A
 
K
D
 
Q
E
 
E
R
 
K
T
 
P
K
 
K
I
 
C
F
 
I
F
 
F
V
 
L
C
 
T
N
 
S
P
 
P
N
 
N
N
|
N
P
 
P
T
 
D
G
 
G
T
 
S
Y
 
I
W
 
I
D
 
D
R
 
D
N
 
D
K
 
D
L
 
L
L
 
L
N
 
K
F
 
I
L
 
L
N
 
E
R
 
L
V
 
-
G
 
-
N
 
-
K
 
P
S
 
I
I
 
L
V
 
V
V
 
V
V
 
L
D
|
D
E
 
E
A
|
A
Y
|
Y
C
 
I
E
 
E
F
 
F
V
 
S
E
 
T
K
 
-
P
 
-
D
 
-
F
 
I
P
 
E
D
 
S
A
 
K
M
 
M
E
 
S
L
 
W
L
 
V
S
 
K
Q
 
K
Y
 
H
P
 
D
N
 
N
L
 
L
V
 
I
T
 
V
F
 
L
R
 
R
T
|
T
F
 
F
S
|
S
K
|
K
M
 
R
F
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
G
L
 
L
R
|
R
I
 
V
G
 
G
Y
 
Y
L
 
G
A
 
A
G
 
F
S
 
P
P
 
L
E
 
S
V
 
I
V
 
I
D
 
K
I
 
Y
I
 
L
R
 
W
R
 
R
T
 
A
C
 
K
V
 
Q
V
 
P
Y
|
Y
S
 
N
V
 
V
N
 
S
A
 
V
L
 
A
A
 
A
Q
 
E
A
 
I
A
 
S
A
 
A
L
 
C
A
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
S
 
N
K
 
P
H
 
T
H
 
Y
I
 
L
E
 
E
N
 
N
T
 
V
R
 
K
-
 
D
A
 
A
L
 
L
V
 
V
R
 
K
E
 
E
A
 
R
K
 
G
E
 
R
Y
 
L
L
 
F
N
 
D
-
 
L
-
 
L
H
 
K
E
 
A
M
 
V
N
 
P
S
 
F
L
 
L
G
 
K
L
 
P
F
 
F
T
 
P
V
 
S
G
 
H
E
 
S
E
 
N
G
 
F
C
 
I
Y
 
L
L
 
C
M
 
E
V
 
V
R
 
T
L
 
S
P
 
G
M
 
V
S
 
D
D
 
P
S
 
K
L
 
K
A
 
L
Y
 
K
R
 
E
K
 
D
L
 
L
M
 
A
S
 
E
Q
 
M
G
 
G
V
 
V
M
 
M
I
 
I
R
|
R
T
 
H
M
 
Y
T
 
S
G
 
N
F
 
K
R
 
E
F
 
L
P
 
K
N
 
G
F
 
Y
I
 
V
R
|
R
V
 
V
S
 
S
V
 
V
G
 
G
E
 
K
M
 
P
P
 
E
A
 
H
M
 
T
Q
 
D
R
 
V
F
 
L
V
 
M
H
 
N
C
 
C
L
 
I
K
 
S
N
 
R
I
 
L

4r5zA Crystal structure of rv3772 encoded aminotransferase (see paper)
32% identity, 68% coverage: 15:269/376 of query aligns to 7:253/353 of 4r5zA

query
sites
4r5zA
P
 
P
H
 
E
I
 
L
K
 
A
C
 
G
F
 
L
E
 
P
A
 
V
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
S
 
G
K
 
K
P
 
-
D
 
-
D
 
-
V
 
-
L
 
-
M
 
-
Q
 
-
Y
 
-
Y
 
-
G
 
T
C
 
V
S
 
P
S
 
G
L
 
A
L
 
I
R
 
K
L
 
L
N
 
A
N
 
S
N
 
N
E
 
E
N
 
T
P
 
V
L
 
F
G
 
G
P
 
P
P
 
L
G
 
P
E
 
S
S
 
V
R
 
R
Q
 
A
A
 
A
I
 
I
L
 
-
D
 
D
F
 
R
P
 
A
P
 
T
N
 
D
K
 
T
A
 
V
S
 
N
V
 
R
Y
 
Y
P
 
P
S
 
D
G
 
N
D
 
G
A
 
C
Y
 
V
H
 
Q
L
 
L
R
 
K
R
 
A
K
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
R
R
 
H
F
 
L
G
 
G
-
 
P
-
 
D
M
 
F
G
 
A
P
 
P
D
 
E
Q
 
H
F
 
V
L
 
A
V
 
V
G
 
G
N
 
C
G
|
G
A
x
S
N
x
V
E
 
S
V
 
L
I
 
C
A
 
Q
F
 
Q
V
 
L
I
 
V
K
 
Q
A
 
V
F
 
T
C
 
A
Q
 
S
E
 
V
G
 
G
D
 
D
N
 
E
I
 
V
V
 
V
T
 
F
A
 
G
D
 
W
K
 
R
T
 
S
F
|
F
A
 
E
V
 
L
Y
 
Y
E
 
P
W
 
P
V
 
Q
A
 
V
Q
 
R
F
 
V
S
 
A
G
 
G
F
 
A
E
 
I
A
 
P
R
 
I
T
 
Q
V
 
V
P
 
P
L
 
L
K
 
T
D
 
D
Y
 
H
G
 
T
F
 
F
N
 
D
D
 
L
E
 
Y
A
 
A
M
 
M
L
 
L
A
 
A
A
 
T
A
 
V
D
 
T
E
 
D
R
 
R
T
 
T
K
 
R
I
 
L
F
 
I
F
 
F
V
 
V
C
 
C
N
 
N
P
 
P
N
 
N
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
S
T
 
T
Y
 
V
W
 
V
D
 
G
R
 
P
N
 
D
K
 
A
L
 
L
L
 
A
N
 
R
F
 
F
L
 
V
N
 
E
R
 
A
V
 
V
G
 
P
N
 
A
K
 
H
S
 
I
I
 
L
V
 
I
V
 
A
V
 
I
D
|
D
E
 
E
A
|
A
Y
|
Y
C
 
V
E
 
E
F
 
Y
V
 
I
E
 
R
K
 
D
P
 
G
D
 
M
F
 
R
P
 
P
D
 
D
A
 
S
M
 
L
E
 
G
L
 
L
L
 
V
S
 
R
Q
 
A
Y
 
H
P
 
N
N
 
N
L
 
V
V
 
V
T
 
V
F
 
L
R
 
R
T
|
T
F
 
F
S
|
S
K
|
K
M
 
A
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
G
L
 
L
R
|
R
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
L
 
A
A
 
I
G
 
G
S
 
H
P
 
P
E
 
D
V
 
V
V
 
I
D
 
T
I
 
A
I
 
L
R
 
D
R
 
K
T
 
V
C
 
Y
V
 
V
V
 
P
Y
 
F
S
 
T
V
 
V
N
 
S
A
 
S
L
 
I
A
 
G
Q
 
Q

4r2nA Crystal structure of rv3772 in complex with its substrate (see paper)
32% identity, 68% coverage: 15:269/376 of query aligns to 7:253/353 of 4r2nA

query
sites
4r2nA
P
 
P
H
 
E
I
 
L
K
 
A
C
 
G
F
 
L
E
 
P
A
 
V
Y
|
Y
V
 
V
P
 
P
S
 
G
K
 
K
P
 
-
D
 
-
D
 
-
V
 
-
L
 
-
M
 
-
Q
 
-
Y
 
-
Y
 
-
G
 
T
C
 
V
S
 
P
S
 
G
L
 
A
L
 
I
R
 
K
L
 
L
N
 
A
N
 
S
N
 
N
E
 
E
N
 
T
P
 
V
L
 
F
G
 
G
P
 
P
P
 
L
G
 
P
E
 
S
S
 
V
R
 
R
Q
 
A
A
 
A
I
 
I
L
 
-
D
 
D
F
 
R
P
 
A
P
 
T
N
 
D
K
 
T
A
 
V
S
 
N
V
 
R
Y
 
Y
P
 
P
S
 
D
G
 
N
D
 
G
A
 
C
Y
 
V
H
 
Q
L
 
L
R
 
K
R
 
A
K
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
R
R
 
H
F
 
L
G
 
G
-
 
P
-
 
D
M
 
F
G
 
A
P
 
P
D
 
E
Q
 
H
F
 
V
L
 
A
V
 
V
G
 
G
N
 
C
G
|
G
A
x
S
N
x
V
E
 
S
V
 
L
I
 
C
A
 
Q
F
 
Q
V
 
L
I
 
V
K
 
Q
A
 
V
F
 
T
C
 
A
Q
 
S
E
 
V
G
 
G
D
 
D
N
 
E
I
 
V
V
 
V
T
 
F
A
 
G
D
 
W
K
 
R
T
 
S
F
|
F
A
 
E
V
x
L
Y
 
Y
E
 
P
W
 
P
V
 
Q
A
 
V
Q
 
R
F
 
V
S
 
A
G
 
G
F
 
A
E
 
I
A
 
P
R
 
I
T
 
Q
V
 
V
P
 
P
L
 
L
K
 
T
D
 
D
Y
 
H
G
 
T
F
 
F
N
 
D
D
 
L
E
 
Y
A
 
A
M
 
M
L
 
L
A
 
A
A
 
T
A
 
V
D
 
T
E
 
D
R
 
R
T
 
T
K
 
R
I
 
L
F
 
I
F
 
F
V
 
V
C
 
C
N
 
N
P
 
P
N
 
N
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
S
T
 
T
Y
 
V
W
 
V
D
 
G
R
 
P
N
 
D
K
 
A
L
 
L
L
 
A
N
 
R
F
 
F
L
 
V
N
 
E
R
 
A
V
 
V
G
 
P
N
 
A
K
 
H
S
 
I
I
 
L
V
 
I
V
 
A
V
 
I
D
|
D
E
 
E
A
|
A
Y
|
Y
C
 
V
E
 
E
F
 
Y
V
 
I
E
 
R
K
 
D
P
 
G
D
 
M
F
 
R
P
 
P
D
 
D
A
 
S
M
 
L
E
 
G
L
 
L
L
 
V
S
 
R
Q
 
A
Y
 
H
P
 
N
N
 
N
L
 
V
V
 
V
T
 
V
F
 
L
R
 
R
T
|
T
F
 
F
S
|
S
K
|
K
M
 
A
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
G
L
 
L
R
|
R
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
L
 
A
A
 
I
G
 
G
S
 
H
P
 
P
E
 
D
V
 
V
V
 
I
D
 
T
I
 
A
I
 
L
R
 
D
R
 
K
T
 
V
C
 
Y
V
 
V
V
x
P
Y
x
F
S
 
T
V
 
V
N
 
S
A
 
S
L
 
I
A
 
G
Q
 
Q

Sites not aligning to the query:

7szpA Crystal structure of histidinol-phosphate aminotransferase from klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae (strain hs11286)
31% identity, 78% coverage: 72:366/376 of query aligns to 53:349/353 of 7szpA

query
sites
7szpA
Y
 
Y
P
 
P
S
 
E
G
 
P
D
 
Q
A
 
P
Y
 
K
H
 
A
L
 
V
R
 
I
R
 
E
K
 
S
L
 
Y
A
 
A
E
 
R
R
 
Y
F
 
A
G
 
E
M
 
V
G
 
K
P
 
P
D
 
E
Q
 
Q
F
 
V
L
 
L
V
 
V
G
 
S
N
 
R
G
|
G
A
|
A
N
x
D
E
 
E
V
 
G
I
 
I
A
 
E
F
 
L
V
 
L
I
 
I
K
 
R
A
 
A
F
 
F
C
 
C
Q
 
E
E
 
P
G
 
G
-
 
E
D
 
D
N
 
A
I
 
V
V
 
L
T
 
Y
A
 
C
D
 
P
K
 
P
T
 
T
F
x
Y
A
 
G
V
 
M
Y
 
Y
E
 
S
W
 
V
V
 
S
A
 
A
Q
 
E
F
 
T
S
 
I
G
 
G
F
 
V
E
 
E
A
 
C
R
 
R
T
 
T
V
 
V
P
 
P
-
 
T
L
 
L
K
 
A
D
 
D
Y
 
W
G
 
Q
F
 
L
N
 
D
D
 
L
E
 
P
A
 
G
M
 
I
L
 
E
A
 
A
A
 
R
A
 
L
D
 
D
E
 
G
R
 
-
T
 
V
K
 
K
I
 
V
F
 
V
F
 
F
V
 
V
C
 
C
N
 
S
P
 
P
N
 
N
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
Y
 
I
W
 
I
D
 
D
R
 
P
N
 
Q
K
 
S
L
 
M
L
 
R
N
 
D
F
 
L
L
 
L
N
 
E
R
 
M
V
 
T
G
 
R
N
 
G
K
 
K
S
 
A
I
 
I
V
 
V
V
 
V
V
 
A
D
|
D
E
 
E
A
|
A
Y
|
Y
C
 
I
E
 
E
F
 
F
V
 
C
E
 
P
K
 
Q
P
 
A
D
 
T
F
 
L
P
 
A
D
 
G
A
 
-
M
 
-
E
 
-
L
 
W
L
 
L
S
 
S
Q
 
D
Y
 
Y
P
 
P
N
 
H
L
 
L
V
 
V
T
 
V
F
 
L
R
 
R
T
|
T
F
 
L
S
|
S
K
|
K
M
 
A
F
 
F
G
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
G
L
 
L
R
|
R
I
 
C
G
 
G
Y
 
F
L
 
T
A
 
L
G
 
A
S
 
N
P
 
A
E
 
E
V
 
V
V
 
I
D
 
N
I
 
V
I
 
L
R
 
L
R
 
K
T
 
V
C
 
I
V
 
A
V
 
P
Y
 
Y
S
 
P
V
 
L
N
 
S
A
 
T
L
 
P
A
 
V
Q
 
A
A
 
D
A
 
I
A
 
A
L
 
A
A
 
Q
A
 
A
L
 
L
-
 
S
-
 
P
E
 
E
S
 
G
K
 
I
H
 
A
H
 
A
I
 
M
E
 
R
N
 
Q
T
 
R
R
 
V
A
 
A
L
 
Q
V
 
I
R
 
L
E
 
D
A
 
E
K
 
R
E
 
R
Y
 
Y
L
 
L
N
 
V
H
 
E
E
 
Q
M
 
L
N
 
R
S
 
G
L
 
I
G
 
A
L
 
C
F
 
V
-
 
E
-
 
Q
T
 
V
V
 
F
G
 
D
E
 
S
E
 
E
G
 
T
C
 
N
Y
 
Y
L
 
V
M
 
L
V
 
A
R
 
R
L
 
I
P
 
T
M
 
A
S
 
S
D
 
-
S
 
S
L
 
A
A
 
V
Y
 
F
R
 
K
K
 
S
L
 
L
M
 
W
S
 
D
Q
 
Q
G
 
G
V
 
I
M
 
I
I
 
L
R
 
R
T
 
D
M
 
Q
T
 
N
G
 
-
F
 
-
R
 
K
F
 
Q
P
 
P
N
 
S
F
 
L
-
 
S
-
 
G
-
 
C
I
 
L
R
 
R
V
 
I
S
 
T
V
 
I
G
 
G
E
 
T
M
 
R
P
 
A
A
 
E
M
 
S
Q
 
Q
R
 
R
F
 
V
V
 
I
H
 
D
C
 
A
L
 
L

1fg7A Crystal structure of l-histidinol phosphate aminotransferase with pyridoxal-5'-phosphate (see paper)
29% identity, 86% coverage: 44:367/376 of query aligns to 32:350/354 of 1fg7A

query
sites
1fg7A
L
 
L
N
 
N
N
 
A
N
 
N
E
 
E
N
 
Y
P
 
P
L
 
T
G
 
A
P
 
V
P
 
E
G
 
F
E
 
Q
S
 
L
R
 
T
Q
 
Q
A
 
Q
I
 
T
L
 
L
D
 
N
F
 
R
P
 
-
P
 
-
N
 
-
K
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
-
Y
 
Y
P
 
P
S
 
E
G
 
C
D
 
Q
A
 
P
Y
 
K
H
 
A
L
 
V
R
 
I
R
 
E
K
 
N
L
 
Y
A
 
A
E
 
Q
R
 
Y
F
 
A
G
 
G
M
 
V
G
 
K
P
 
P
D
 
E
Q
 
Q
F
 
V
L
 
L
V
 
V
G
 
S
N
 
R
G
|
G
A
|
A
N
x
D
E
 
E
V
 
G
I
 
I
A
 
E
F
 
L
V
 
L
I
 
I
K
 
R
A
 
A
F
 
F
C
 
C
Q
 
E
E
 
P
G
 
G
-
 
K
D
 
D
N
 
A
I
 
I
V
 
L
T
 
Y
A
 
C
D
 
P
K
 
P
T
 
T
F
x
Y
A
 
G
V
 
M
Y
 
Y
E
 
S
W
 
V
V
 
S
A
 
A
Q
 
E
F
 
T
S
 
I
G
 
G
F
 
V
E
 
E
A
 
C
R
 
R
T
 
T
V
 
V
P
 
P
L
 
T
K
 
L
D
 
D
Y
 
N
G
 
W
F
 
Q
N
 
L
D
 
D
E
 
L
A
 
Q
M
 
G
L
 
I
A
 
S
A
 
D
A
 
K
D
 
L
E
 
D
R
 
G
T
 
V
K
 
K
I
 
V
F
 
V
F
 
Y
V
 
V
C
 
C
N
 
S
P
 
P
N
 
N
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
Y
 
L
W
 
I
D
 
N
R
 
P
N
 
Q
K
 
D
L
 
F
L
 
R
N
 
T
F
 
L
L
 
L
N
 
E
R
 
L
V
 
T
G
 
R
N
 
G
K
 
K
S
 
A
I
 
I
V
 
V
V
 
V
V
 
A
D
|
D
E
 
E
A
|
A
Y
|
Y
C
 
I
E
 
E
F
 
F
V
 
C
E
 
P
K
 
Q
P
 
A
D
 
S
F
 
L
P
 
A
D
 
G
A
 
-
M
 
-
E
 
-
L
 
W
L
 
L
S
 
A
Q
 
E
Y
 
Y
P
 
P
N
 
H
L
 
L
V
 
A
T
 
I
F
 
L
R
 
R
T
|
T
F
 
L
S
|
S
K
|
K
M
 
A
F
 
F
G
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
G
L
 
L
R
|
R
I
 
C
G
 
G
Y
 
F
L
 
T
A
 
L
G
 
A
S
 
N
P
 
E
E
 
E
V
 
V
V
 
I
D
 
N
I
 
L
I
 
L
R
 
M
R
 
K
T
 
V
C
 
I
V
 
A
V
 
P
Y
 
Y
S
 
P
V
 
L
N
 
S
A
 
T
L
 
P
A
 
V
Q
 
A
A
 
D
A
 
I
A
 
A
L
 
A
A
 
Q
A
 
A
L
 
L
E
 
S
S
 
P
K
 
Q
H
 
G
H
 
I
I
 
V
-
 
A
-
 
M
-
 
R
E
 
E
N
 
R
T
 
V
R
 
A
A
 
Q
L
 
I
V
 
I
R
 
A
E
 
E
A
 
-
K
 
R
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
N
 
I
H
 
A
E
 
A
M
 
L
N
 
K
S
 
E
L
 
I
G
 
P
L
 
C
F
 
V
-
 
E
-
 
Q
T
 
V
V
 
F
G
 
D
E
 
S
E
 
E
G
 
T
C
 
N
Y
 
Y
L
 
I
M
 
L
V
 
A
R
 
R
L
 
F
P
 
K
M
 
A
S
 
S
D
 
-
S
 
S
L
 
A
A
 
V
Y
 
F
R
 
K
K
 
S
L
 
L
M
 
W
S
 
D
Q
 
Q
G
 
G
V
 
I
M
 
I
I
 
L
R
 
R
T
 
D
M
 
Q
T
 
N
G
 
-
F
 
-
R
 
K
F
 
Q
P
 
P
N
 
S
F
 
L
-
 
S
-
 
G
-
 
C
I
 
L
R
 
R
V
 
I
S
 
T
V
 
V
G
 
G
E
 
T
M
 
R
P
 
E
A
 
E
M
 
S
Q
 
Q
R
 
R
F
 
V
V
 
I
H
 
D
C
 
A
L
 
L
K
 
R

1fg3A Crystal structure of l-histidinol phosphate aminotransferase complexed with l-histidinol (see paper)
29% identity, 86% coverage: 44:367/376 of query aligns to 32:350/354 of 1fg3A

query
sites
1fg3A
L
 
L
N
 
N
N
x
A
N
 
N
E
 
E
N
 
Y
P
 
P
L
 
T
G
 
A
P
 
V
P
 
E
G
 
F
E
 
Q
S
 
L
R
 
T
Q
 
Q
A
 
Q
I
 
T
L
 
L
D
 
N
F
 
R
P
 
-
P
 
-
N
 
-
K
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
-
Y
 
Y
P
 
P
S
 
E
G
 
C
D
 
Q
A
 
P
Y
 
K
H
 
A
L
 
V
R
 
I
R
 
E
K
 
N
L
 
Y
A
 
A
E
 
Q
R
 
Y
F
 
A
G
 
G
M
 
V
G
 
K
P
 
P
D
 
E
Q
 
Q
F
 
V
L
 
L
V
 
V
G
 
S
N
 
R
G
|
G
A
|
A
N
x
D
E
 
E
V
 
G
I
 
I
A
 
E
F
 
L
V
 
L
I
 
I
K
 
R
A
 
A
F
 
F
C
 
C
Q
 
E
E
 
P
G
 
G
-
 
K
D
 
D
N
 
A
I
 
I
V
 
L
T
 
Y
A
 
C
D
 
P
K
 
P
T
 
T
F
x
Y
A
 
G
V
 
M
Y
 
Y
E
 
S
W
 
V
V
 
S
A
 
A
Q
 
E
F
 
T
S
 
I
G
 
G
F
 
V
E
 
E
A
 
C
R
 
R
T
 
T
V
 
V
P
 
P
L
 
T
K
 
L
D
 
D
Y
 
N
G
 
W
F
 
Q
N
 
L
D
 
D
E
 
L
A
 
Q
M
 
G
L
 
I
A
 
S
A
 
D
A
 
K
D
 
L
E
 
D
R
 
G
T
 
V
K
 
K
I
 
V
F
 
V
F
 
Y
V
 
V
C
 
C
N
 
S
P
 
P
N
 
N
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
Y
 
L
W
 
I
D
 
N
R
 
P
N
 
Q
K
 
D
L
 
F
L
 
R
N
 
T
F
 
L
L
 
L
N
 
E
R
 
L
V
 
T
G
 
R
N
 
G
K
 
K
S
 
A
I
 
I
V
 
V
V
 
V
V
 
A
D
|
D
E
 
E
A
|
A
Y
|
Y
C
 
I
E
 
E
F
 
F
V
 
C
E
 
P
K
 
Q
P
 
A
D
 
S
F
 
L
P
 
A
D
 
G
A
 
-
M
 
-
E
 
-
L
 
W
L
 
L
S
 
A
Q
 
E
Y
 
Y
P
 
P
N
 
H
L
 
L
V
 
A
T
 
I
F
 
L
R
 
R
T
|
T
F
 
L
S
|
S
K
|
K
M
 
A
F
 
F
G
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
G
L
 
L
R
|
R
I
 
C
G
 
G
Y
 
F
L
 
T
A
 
L
G
 
A
S
 
N
P
 
E
E
 
E
V
 
V
V
 
I
D
 
N
I
 
L
I
 
L
R
 
M
R
 
K
T
 
V
C
 
I
V
 
A
V
 
P
Y
 
Y
S
 
P
V
 
L
N
 
S
A
 
T
L
 
P
A
 
V
Q
 
A
A
 
D
A
 
I
A
 
A
L
 
A
A
 
Q
A
 
A
L
 
L
E
 
S
S
 
P
K
 
Q
H
 
G
H
 
I
I
 
V
-
 
A
-
 
M
-
 
R
E
 
E
N
 
R
T
 
V
R
 
A
A
 
Q
L
 
I
V
 
I
R
 
A
E
 
E
A
 
-
K
 
R
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
N
 
I
H
 
A
E
 
A
M
 
L
N
 
K
S
 
E
L
 
I
G
 
P
L
 
C
F
 
V
-
 
E
-
 
Q
T
 
V
V
 
F
G
 
D
E
 
S
E
 
E
G
 
T
C
 
N
Y
 
Y
L
 
I
M
 
L
V
 
A
R
 
R
L
 
F
P
 
K
M
 
A
S
 
S
D
 
-
S
 
S
L
 
A
A
 
V
Y
 
F
R
 
K
K
 
S
L
 
L
M
 
W
S
 
D
Q
 
Q
G
 
G
V
 
I
M
 
I
I
 
L
R
|
R
T
 
D
M
 
Q
T
 
N
G
 
-
F
 
-
R
 
K
F
 
Q
P
 
P
N
 
S
F
 
L
-
 
S
-
 
G
-
 
C
I
 
L
R
|
R
V
 
I
S
 
T
V
 
V
G
 
G
E
 
T
M
 
R
P
 
E
A
 
E
M
 
S
Q
 
Q
R
 
R
F
 
V
V
 
I
H
 
D
C
 
A
L
 
L
K
 
R

Sites not aligning to the query:

1geyA Crystal structure of histidinol-phosphate aminotransferase complexed with n-(5'-phosphopyridoxyl)-l-glutamate (see paper)
30% identity, 86% coverage: 44:366/376 of query aligns to 18:335/335 of 1geyA

query
sites
1geyA
L
 
L
N
 
N
N
x
A
N
 
N
E
 
E
N
 
Y
P
 
P
L
 
T
G
 
A
P
 
V
P
 
E
G
 
F
E
 
Q
S
 
L
R
 
T
Q
 
Q
A
 
Q
I
 
T
L
 
L
D
 
N
F
 
R
P
 
-
P
 
-
N
 
-
K
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
-
Y
 
Y
P
 
P
S
 
E
G
 
C
D
 
Q
A
 
P
Y
 
K
H
 
A
L
 
V
R
 
I
R
 
E
K
 
N
L
 
Y
A
 
A
E
 
Q
R
 
Y
F
 
A
G
 
G
M
 
V
G
 
K
P
 
P
D
 
E
Q
 
Q
F
 
V
L
 
L
V
 
V
G
 
S
N
 
R
G
|
G
A
|
A
N
x
D
E
 
E
V
 
G
I
 
I
A
 
E
F
 
L
V
 
L
I
 
I
K
 
R
A
 
A
F
 
F
C
 
C
Q
 
E
E
 
P
G
 
G
-
 
K
D
 
D
N
 
A
I
 
I
V
 
L
T
 
Y
A
 
C
D
 
P
K
 
P
T
 
T
F
x
Y
A
 
G
V
 
M
Y
 
Y
E
 
S
W
 
V
V
 
S
A
 
A
Q
 
E
F
 
T
S
 
I
G
 
G
F
 
V
E
 
E
A
 
C
R
 
R
T
 
T
V
 
V
P
 
P
L
 
T
K
 
L
D
 
D
Y
 
N
G
 
W
F
 
Q
N
 
L
D
 
D
E
 
L
A
 
Q
M
 
G
L
 
I
A
 
S
A
 
D
A
 
K
D
 
L
E
 
D
R
 
G
T
 
V
K
 
K
I
 
V
F
 
V
F
 
Y
V
 
V
C
 
C
N
 
S
P
 
P
N
 
N
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
Y
 
L
W
 
I
D
 
N
R
 
P
N
 
Q
K
 
D
L
 
F
L
 
R
N
 
T
F
 
L
L
 
L
N
 
E
R
 
L
V
 
T
G
 
R
N
 
G
K
 
K
S
 
A
I
 
I
V
 
V
V
 
V
V
 
A
D
|
D
E
 
E
A
|
A
Y
|
Y
C
 
I
E
 
E
F
 
F
V
 
C
E
 
P
K
 
Q
P
 
A
D
 
S
F
 
L
P
 
A
D
 
G
A
 
-
M
 
-
E
 
-
L
 
W
L
 
L
S
 
A
Q
 
E
Y
 
Y
P
 
P
N
 
H
L
 
L
V
 
A
T
 
I
F
 
L
R
 
R
T
|
T
F
 
L
S
|
S
K
|
K
M
 
A
F
 
F
G
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
G
L
 
L
R
|
R
I
 
C
G
 
G
Y
 
F
L
 
T
A
 
L
G
 
A
S
 
N
P
 
E
E
 
E
V
 
V
V
 
I
D
 
N
I
 
L
I
 
L
R
 
M
R
 
K
T
 
V
C
 
I
V
 
A
V
 
P
Y
 
Y
S
 
P
V
 
L
N
 
S
A
 
T
L
 
P
A
 
V
Q
 
A
A
 
D
A
 
I
A
 
A
L
 
A
A
 
Q
A
 
A
L
 
L
E
 
S
S
 
P
K
 
Q
H
 
G
H
 
I
I
 
V
-
 
A
-
 
M
-
 
R
E
 
E
N
 
R
T
 
V
R
 
A
A
 
Q
L
 
I
V
 
I
R
 
A
E
 
E
A
 
-
K
 
R
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
N
 
I
H
 
A
E
 
A
M
 
L
N
 
K
S
 
E
L
 
I
G
 
P
L
 
C
F
 
V
-
 
E
-
 
Q
T
 
V
V
 
F
G
 
D
E
 
S
E
 
E
G
 
T
C
 
N
Y
 
Y
L
 
I
M
 
L
V
 
A
R
 
R
L
 
F
P
 
K
M
 
A
S
 
S
D
 
-
S
 
S
L
 
A
A
 
V
Y
 
F
R
 
K
K
 
S
L
 
L
M
 
W
S
 
D
Q
 
Q
G
 
G
V
 
I
M
 
I
I
 
L
R
 
R
T
 
D
M
 
Q
T
 
N
G
 
-
F
 
-
R
 
K
F
 
Q
P
 
P
N
 
S
F
 
L
-
 
S
-
 
G
-
 
C
I
 
L
R
|
R
V
 
I
S
 
T
V
 
V
G
 
G
E
 
T
M
 
R
P
 
E
A
 
E
M
 
S
Q
 
Q
R
 
R
F
 
V
V
 
I
H
 
D
C
 
A
L
 
L

1lkcA Crystal structure of l-threonine-o-3-phosphate decarboxylase from salmonella enterica (see paper)
29% identity, 88% coverage: 40:370/376 of query aligns to 18:350/355 of 1lkcA

query
sites
1lkcA
S
 
Q
L
 
L
L
 
L
R
 
D
L
 
F
N
 
S
N
 
A
N
 
N
E
 
I
N
 
N
P
 
P
L
 
L
G
 
G
P
 
M
P
 
P
G
 
V
E
 
S
S
 
V
R
 
K
Q
 
R
A
 
A
I
 
L
L
 
I
D
 
D
F
 
-
P
 
-
P
 
-
N
 
N
K
 
L
A
 
D
S
 
C
V
 
I
-
 
E
-
 
R
Y
 
Y
P
 
P
S
 
D
G
 
A
D
 
D
A
 
Y
Y
 
F
H
 
H
L
 
L
R
 
H
R
 
Q
K
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
R
R
 
H
F
 
H
G
 
Q
M
 
V
G
 
P
P
 
A
D
 
S
Q
 
W
F
 
I
L
 
L
V
 
A
G
 
G
N
 
N
G
|
G
A
x
E
N
x
T
E
 
E
V
 
S
I
 
I
A
 
F
F
 
T
V
 
V
I
 
A
K
 
S
A
 
G
F
 
L
C
 
K
Q
 
P
E
 
R
G
 
R
D
 
A
N
 
M
I
 
I
V
 
V
T
 
T
A
 
-
D
 
-
K
 
P
T
 
G
F
|
F
A
 
A
V
 
E
Y
 
Y
E
 
G
W
 
R
V
 
A
A
 
L
Q
 
A
F
 
Q
S
 
S
G
 
G
F
 
C
E
 
E
A
 
I
R
 
R
T
 
R
V
 
W
P
 
S
L
 
L
K
 
R
D
 
E
Y
 
A
-
 
D
G
 
G
F
 
W
N
 
Q
-
 
L
D
 
T
E
 
D
A
 
A
M
 
I
L
 
L
A
 
E
A
 
A
A
 
L
D
 
T
E
 
P
R
 
D
T
 
L
K
 
D
I
 
C
F
 
L
F
 
F
V
 
L
C
 
C
N
 
T
P
 
P
N
 
N
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
T
 
L
Y
 
L
W
 
P
D
 
E
R
 
R
N
 
P
K
 
L
L
 
L
L
 
Q
N
 
A
F
 
I
L
 
A
N
 
D
R
 
R
V
 
C
G
 
K
N
 
S
K
 
L
S
 
N
I
 
I
-
 
N
V
 
L
V
 
I
V
 
L
D
|
D
E
 
E
A
|
A
Y
x
F
C
 
I
E
 
D
F
 
F
V
 
I
E
 
-
K
 
-
P
 
P
D
 
H
F
 
E
P
 
T
D
 
G
A
 
F
M
 
I
E
 
P
L
 
A
L
 
L
S
 
K
Q
 
D
Y
 
N
P
 
P
N
 
H
L
 
I
V
 
W
T
 
V
F
 
L
R
 
R
T
x
S
F
 
L
S
x
T
K
|
K
M
 
F
F
 
Y
G
 
A
L
 
I
A
 
P
S
 
G
L
 
L
R
|
R
I
 
L
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
A
 
V
G
 
N
S
 
S
P
 
D
E
 
D
-
 
A
V
 
A
V
 
M
D
 
A
I
 
R
I
 
M
R
 
R
R
 
R
T
 
Q
C
 
Q
V
 
M
V
 
P
Y
 
W
S
 
S
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
A
 
L
A
 
A
A
 
G
L
 
E
A
 
V
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
S
 
D
K
 
S
H
 
A
H
 
W
I
 
Q
E
 
Q
N
 
A
T
 
T
R
 
W
A
 
H
L
 
W
V
 
L
R
 
R
E
 
E
A
 
E
K
 
G
E
 
A
Y
 
R
L
 
F
N
 
Y
H
 
Q
E
 
A
M
 
L
N
 
C
S
 
Q
L
 
L
G
 
P
L
 
L
F
 
L
T
 
T
V
 
V
-
 
Y
G
 
P
E
 
G
E
 
R
G
 
A
C
 
N
Y
 
Y
L
 
L
M
 
L
V
 
L
R
 
R
L
 
C
P
 
E
M
 
R
S
 
E
D
 
D
S
 
I
L
 
D
A
 
L
Y
 
Q
R
 
R
K
 
R
L
 
L
M
 
L
S
 
T
Q
 
Q
G
 
R
V
 
I
M
 
L
I
 
I
R
|
R
T
 
S
M
 
C
T
 
A
G
 
N
F
 
Y
R
 
P
F
 
G
-
 
L
-
 
D
P
 
S
N
 
R
F
 
Y
I
 
Y
R
|
R
V
 
V
S
 
A
V
 
I
G
 
R
E
 
S
M
 
A
P
 
A
A
 
Q
M
 
N
Q
 
E
R
 
R
F
 
L
V
 
L
H
 
A
C
 
A
L
 
L
K
 
R
N
 
N
I
 
V
L
 
L

Sites not aligning to the query:

1lc7A Crystal structure of l-threonine-o-3-phosphate decarboxylase from s. Enterica complexed with a substrate (see paper)
29% identity, 88% coverage: 40:370/376 of query aligns to 22:354/358 of 1lc7A

query
sites
1lc7A
S
 
Q
L
 
L
L
 
L
R
 
D
L
 
F
N
 
S
N
x
A
N
|
N
E
 
I
N
 
N
P
 
P
L
 
L
G
 
G
P
 
M
P
 
P
G
 
V
E
 
S
S
 
V
R
 
K
Q
 
R
A
 
A
I
 
L
L
 
I
D
 
D
F
 
-
P
 
-
P
 
-
N
 
N
K
 
L
A
 
D
S
 
C
V
 
I
-
 
E
-
 
R
Y
 
Y
P
 
P
S
 
D
G
 
A
D
 
D
A
 
Y
Y
 
F
H
 
H
L
 
L
R
 
H
R
 
Q
K
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
R
R
 
H
F
 
H
G
 
Q
M
 
V
G
 
P
P
 
A
D
 
S
Q
 
W
F
 
I
L
 
L
V
 
A
G
 
G
N
 
N
G
|
G
A
x
E
N
x
T
E
 
E
V
 
S
I
 
I
A
 
F
F
 
T
V
 
V
I
 
A
K
 
S
A
 
G
F
 
L
C
 
K
Q
 
P
E
 
R
G
 
R
D
 
A
N
 
M
I
 
I
V
 
V
T
 
T
A
 
-
D
 
-
K
 
P
T
 
G
F
|
F
A
 
A
V
 
E
Y
 
Y
E
 
G
W
 
R
V
 
A
A
 
L
Q
 
A
F
 
Q
S
 
S
G
 
G
F
 
C
E
 
E
A
 
I
R
 
R
T
 
R
V
 
W
P
 
S
L
 
L
K
 
R
D
 
E
Y
 
A
-
 
D
G
 
G
F
 
W
N
 
Q
-
 
L
D
 
T
E
 
D
A
 
A
M
 
I
L
 
L
A
 
E
A
 
A
A
 
L
D
 
T
E
 
P
R
 
D
T
 
L
K
 
D
I
 
C
F
 
L
F
 
F
V
 
L
C
 
C
N
 
T
P
 
P
N
 
N
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
T
 
L
Y
 
L
W
 
P
D
 
E
R
 
R
N
 
P
K
 
L
L
 
L
L
 
Q
N
 
A
F
 
I
L
 
A
N
 
D
R
 
R
V
 
C
G
 
K
N
 
S
K
 
L
S
 
N
I
 
I
-
 
N
V
 
L
V
 
I
V
 
L
D
 
D
E
 
E
A
 
A
Y
 
F
C
 
I
E
 
D
F
 
F
V
 
I
E
 
-
K
 
-
P
 
P
D
 
H
F
 
E
P
 
T
D
 
G
A
 
F
M
 
I
E
 
P
L
 
A
L
 
L
S
 
K
Q
 
D
Y
 
N
P
 
P
N
 
H
L
 
I
V
 
W
T
 
V
F
 
L
R
 
R
T
x
S
F
 
L
S
x
T
K
|
K
M
 
F
F
 
Y
G
 
A
L
 
I
A
 
P
S
 
G
L
 
L
R
|
R
I
 
L
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
A
 
V
G
 
N
S
 
S
P
 
D
E
 
D
-
 
A
V
 
A
V
 
M
D
 
A
I
 
R
I
 
M
R
 
R
R
 
R
T
 
Q
C
 
Q
V
 
M
V
 
P
Y
 
W
S
 
S
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
A
 
L
A
 
A
A
 
G
L
 
E
A
 
V
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
S
 
D
K
 
S
H
 
A
H
 
W
I
 
Q
E
 
Q
N
 
A
T
 
T
R
 
W
A
 
H
L
 
W
V
 
L
R
 
R
E
 
E
A
 
E
K
 
G
E
 
A
Y
 
R
L
 
F
N
 
Y
H
 
Q
E
 
A
M
 
L
N
 
C
S
 
Q
L
 
L
G
 
P
L
 
L
F
 
L
T
 
T
V
 
V
-
 
Y
G
 
P
E
 
G
E
 
R
G
 
A
C
 
N
Y
 
Y
L
 
L
M
 
L
V
 
L
R
 
R
L
 
C
P
 
E
M
 
R
S
 
E
D
 
D
S
 
I
L
 
D
A
 
L
Y
 
Q
R
 
R
K
 
R
L
 
L
M
 
L
S
 
T
Q
 
Q
G
 
R
V
 
I
M
 
L
I
 
I
R
|
R
T
 
S
M
 
C
T
 
A
G
 
N
F
 
Y
R
 
P
F
 
G
-
 
L
-
 
D
P
 
S
N
 
R
F
 
Y
I
 
Y
R
|
R
V
 
V
S
 
A
V
 
I
G
 
R
E
 
S
M
 
A
P
 
A
A
 
Q
M
 
N
Q
 
E
R
 
R
F
 
L
V
 
L
H
 
A
C
 
A
L
 
L
K
 
R
N
 
N
I
 
V
L
 
L

Sites not aligning to the query:

1lc8A Crystal structure of l-threonine-o-3-phosphate decarboxylase from s. Enterica complexed with its reaction intermediate (see paper)
29% identity, 88% coverage: 40:370/376 of query aligns to 19:351/356 of 1lc8A

query
sites
1lc8A
S
 
Q
L
 
L
L
 
L
R
 
D
L
 
F
N
 
S
N
 
A
N
 
N
E
 
I
N
 
N
P
 
P
L
 
L
G
 
G
P
 
M
P
 
P
G
 
V
E
 
S
S
 
V
R
 
K
Q
 
R
A
 
A
I
 
L
L
 
I
D
 
D
F
 
-
P
 
-
P
 
-
N
 
N
K
 
L
A
 
D
S
 
C
V
 
I
-
 
E
-
 
R
Y
 
Y
P
 
P
S
 
D
G
 
A
D
 
D
A
 
Y
Y
 
F
H
 
H
L
 
L
R
 
H
R
 
Q
K
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
R
R
 
H
F
 
H
G
 
Q
M
 
V
G
 
P
P
 
A
D
 
S
Q
 
W
F
 
I
L
 
L
V
 
A
G
 
G
N
 
N
G
|
G
A
x
E
N
x
T
E
 
E
V
 
S
I
 
I
A
 
F
F
 
T
V
 
V
I
 
A
K
 
S
A
 
G
F
 
L
C
 
K
Q
 
P
E
 
R
G
 
R
D
 
A
N
 
M
I
 
I
V
 
V
T
 
T
A
 
-
D
 
-
K
 
P
T
 
G
F
|
F
A
 
A
V
 
E
Y
 
Y
E
 
G
W
 
R
V
 
A
A
 
L
Q
 
A
F
 
Q
S
 
S
G
 
G
F
 
C
E
 
E
A
 
I
R
 
R
T
 
R
V
 
W
P
 
S
L
 
L
K
 
R
D
 
E
Y
 
A
-
 
D
G
 
G
F
 
W
N
 
Q
-
 
L
D
 
T
E
 
D
A
 
A
M
 
I
L
 
L
A
 
E
A
 
A
A
 
L
D
 
T
E
 
P
R
 
D
T
 
L
K
 
D
I
 
C
F
 
L
F
 
F
V
 
L
C
 
C
N
 
T
P
 
P
N
 
N
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
T
 
L
Y
 
L
W
 
P
D
 
E
R
 
R
N
 
P
K
 
L
L
 
L
L
 
Q
N
 
A
F
 
I
L
 
A
N
 
D
R
 
R
V
 
C
G
 
K
N
 
S
K
 
L
S
 
N
I
 
I
-
 
N
V
 
L
V
 
I
V
 
L
D
|
D
E
 
E
A
|
A
Y
 
F
C
 
I
E
 
D
F
 
F
V
 
I
E
 
-
K
 
-
P
 
P
D
 
H
F
 
E
P
 
T
D
 
G
A
 
F
M
 
I
E
 
P
L
 
A
L
 
L
S
 
K
Q
 
D
Y
 
N
P
 
P
N
 
H
L
 
I
V
 
W
T
 
V
F
 
L
R
 
R
T
x
S
F
 
L
S
x
T
K
|
K
M
 
F
F
 
Y
G
 
A
L
 
I
A
 
P
S
 
G
L
 
L
R
|
R
I
 
L
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
A
 
V
G
 
N
S
 
S
P
 
D
E
 
D
-
 
A
V
 
A
V
 
M
D
 
A
I
 
R
I
 
M
R
 
R
R
 
R
T
 
Q
C
 
Q
V
 
M
V
 
P
Y
 
W
S
 
S
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
A
 
L
A
 
A
A
 
G
L
 
E
A
 
V
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
S
 
D
K
 
S
H
 
A
H
 
W
I
 
Q
E
 
Q
N
 
A
T
 
T
R
 
W
A
 
H
L
 
W
V
 
L
R
 
R
E
 
E
A
 
E
K
 
G
E
 
A
Y
 
R
L
 
F
N
 
Y
H
 
Q
E
 
A
M
 
L
N
 
C
S
 
Q
L
 
L
G
 
P
L
 
L
F
 
L
T
 
T
V
 
V
-
 
Y
G
 
P
E
 
G
E
 
R
G
 
A
C
 
N
Y
 
Y
L
 
L
M
 
L
V
 
L
R
 
R
L
 
C
P
 
E
M
 
R
S
 
E
D
 
D
S
 
I
L
 
D
A
 
L
Y
 
Q
R
 
R
K
 
R
L
 
L
M
 
L
S
 
T
Q
 
Q
G
 
R
V
 
I
M
 
L
I
 
I
R
|
R
T
 
S
M
 
C
T
 
A
G
 
N
F
 
Y
R
 
P
F
 
G
-
 
L
-
 
D
P
 
S
N
 
R
F
 
Y
I
 
Y
R
|
R
V
 
V
S
 
A
V
 
I
G
 
R
E
 
S
M
 
A
P
 
A
A
 
Q
M
 
N
Q
 
E
R
 
R
F
 
L
V
 
L
H
 
A
C
 
A
L
 
L
K
 
R
N
 
N
I
 
V
L
 
L

Sites not aligning to the query:

P97084 Threonine-phosphate decarboxylase; L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase; EC 4.1.1.81 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see 2 papers)
29% identity, 88% coverage: 40:370/376 of query aligns to 25:357/364 of P97084

query
sites
P97084
S
 
Q
L
 
L
L
 
L
R
 
D
L
 
F
N
 
S
N
 
A
N
|
N
E
 
I
N
 
N
P
 
P
L
 
L
G
 
G
P
 
M
P
 
P
G
 
V
E
 
S
S
 
V
R
 
K
Q
 
R
A
 
A
I
 
L
L
 
I
D
 
D
F
 
-
P
 
-
P
 
-
N
 
N
K
 
L
A
 
D
S
 
C
V
 
I
-
 
E
-
 
R
Y
 
Y
P
 
P
S
 
D
G
 
A
D
 
D
A
 
Y
Y
 
F
H
 
H
L
 
L
R
 
H
R
 
Q
K
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
R
R
 
H
F
 
H
G
 
Q
M
 
V
G
 
P
P
 
A
D
 
S
Q
 
W
F
 
I
L
 
L
V
 
A
G
 
G
N
 
N
G
 
G
A
 
E
N
 
T
E
 
E
V
 
S
I
 
I
A
 
F
F
 
T
V
 
V
I
 
A
K
 
S
A
 
G
F
 
L
C
 
K
Q
 
P
E
 
R
G
 
R
D
 
A
N
 
M
I
 
I
V
 
V
T
 
T
A
 
-
D
 
-
K
 
P
T
 
G
F
 
F
A
 
A
V
 
E
Y
 
Y
E
 
G
W
 
R
V
 
A
A
 
L
Q
 
A
F
 
Q
S
 
S
G
 
G
F
 
C
E
 
E
A
 
I
R
 
R
T
 
R
V
 
W
P
 
S
L
 
L
K
 
R
D
 
E
Y
 
A
-
 
D
G
 
G
F
 
W
N
 
Q
-
 
L
D
 
T
E
 
D
A
 
A
M
 
I
L
 
L
A
 
E
A
 
A
A
 
L
D
 
T
E
 
P
R
 
D
T
 
L
K
 
D
I
 
C
F
 
L
F
 
F
V
 
L
C
 
C
N
 
T
P
 
P
N
 
N
N
|
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
T
 
L
Y
 
L
W
 
P
D
 
E
R
 
R
N
 
P
K
 
L
L
 
L
L
 
Q
N
 
A
F
 
I
L
 
A
N
 
D
R
 
R
V
 
C
G
 
K
N
 
S
K
 
L
S
 
N
I
 
I
-
 
N
V
 
L
V
 
I
V
 
L
D
 
D
E
 
E
A
 
A
Y
 
F
C
 
I
E
 
D
F
 
F
V
 
I
E
 
-
K
 
-
P
 
P
D
 
H
F
 
E
P
 
T
D
 
G
A
 
F
M
 
I
E
 
P
L
 
A
L
 
L
S
 
K
Q
 
D
Y
 
N
P
 
P
N
 
H
L
 
I
V
 
W
T
 
V
F
 
L
R
 
R
T
 
S
F
 
L
S
 
T
K
|
K
M
 
F
F
 
Y
G
 
A
L
 
I
A
 
P
S
 
G
L
 
L
R
 
R
I
 
L
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
A
 
V
G
 
N
S
 
S
P
 
D
E
 
D
-
 
A
V
 
A
V
 
M
D
 
A
I
 
R
I
 
M
R
 
R
R
 
R
T
 
Q
C
 
Q
V
 
M
V
 
P
Y
 
W
S
 
S
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
A
 
L
A
 
A
A
 
G
L
 
E
A
 
V
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
S
 
D
K
 
S
H
 
A
H
 
W
I
 
Q
E
 
Q
N
 
A
T
 
T
R
 
W
A
 
H
L
 
W
V
 
L
R
 
R
E
 
E
A
 
E
K
 
G
E
 
A
Y
 
R
L
 
F
N
 
Y
H
 
Q
E
 
A
M
 
L
N
 
C
S
 
Q
L
 
L
G
 
P
L
 
L
F
 
L
T
 
T
V
 
V
-
 
Y
G
 
P
E
 
G
E
 
R
G
 
A
C
 
N
Y
 
Y
L
 
L
M
 
L
V
 
L
R
 
R
L
 
C
P
 
E
M
 
R
S
 
E
D
 
D
S
 
I
L
 
D
A
 
L
Y
 
Q
R
 
R
K
 
R
L
 
L
M
 
L
S
 
T
Q
 
Q
G
 
R
V
 
I
M
 
L
I
 
I
R
|
R
T
 
S
M
 
C
T
 
A
G
 
N
F
 
Y
R
 
P
F
 
G
-
 
L
-
 
D
P
 
S
N
 
R
F
 
Y
I
 
Y
R
|
R
V
 
V
S
 
A
V
 
I
G
 
R
E
 
S
M
 
A
P
 
A
A
 
Q
M
 
N
Q
 
E
R
 
R
F
 
L
V
 
L
H
 
A
C
 
A
L
 
L
K
 
R
N
 
N
I
 
V
L
 
L

Sites not aligning to the query:

3ly1D Crystal structure of putative histidinol-phosphate aminotransferase (yp_050345.1) from erwinia carotovora atroseptica scri1043 at 1.80 a resolution
27% identity, 93% coverage: 26:373/376 of query aligns to 3:352/354 of 3ly1D

query
sites
3ly1D
S
 
T
K
 
Q
P
 
P
D
 
E
D
 
S
V
 
A
L
 
A
M
 
F
Q
 
T
Y
 
A
Y
 
P
G
 
S
C
 
T
S
 
D
S
 
N
L
 
P
L
 
I
R
 
R
L
 
I
N
 
N
N
 
F
N
 
N
E
 
E
N
 
N
P
 
P
L
 
L
G
 
G
P
 
M
P
 
S
G
 
P
E
 
K
S
 
A
R
 
Q
Q
 
A
A
 
A
I
 
A
L
 
R
D
 
D
F
 
-
P
 
A
P
 
V
N
 
V
K
 
K
A
 
A
S
 
N
V
 
R
Y
 
Y
P
 
A
S
 
K
G
 
N
D
 
E
A
 
I
Y
 
L
H
 
M
L
 
L
R
 
G
R
 
N
K
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
A
R
 
H
F
 
H
G
 
Q
M
 
V
G
 
E
P
 
A
D
 
P
Q
 
S
F
 
I
L
 
L
V
 
L
G
 
T
N
 
A
G
|
G
A
x
S
N
x
S
E
 
E
V
 
G
I
 
I
A
 
R
F
 
A
V
 
A
I
 
I
K
 
E
A
 
A
F
 
Y
C
 
A
Q
 
S
E
 
L
G
 
E
D
 
A
N
 
Q
I
 
L
V
 
V
T
 
I
A
 
P
D
 
E
K
 
L
T
 
T
F
x
Y
A
 
G
V
 
D
Y
 
G
E
 
E
W
 
H
V
 
F
A
 
A
Q
 
K
F
 
I
S
 
A
G
 
G
F
 
M
E
 
K
A
 
V
R
 
T
T
 
K
V
 
V
P
 
K
L
 
M
K
 
L
D
 
D
-
 
N
Y
 
W
G
 
A
F
 
F
N
 
D
D
 
I
E
 
E
A
 
G
M
 
L
L
 
K
A
 
A
A
 
A
-
 
V
-
 
A
A
 
A
D
 
Y
E
 
S
R
 
G
T
 
P
K
 
S
I
 
I
F
 
V
F
 
Y
V
 
L
C
 
V
N
 
N
P
 
P
N
 
N
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
T
 
T
Y
 
I
W
 
T
D
 
P
R
 
A
N
 
D
K
 
V
L
 
I
L
 
E
N
 
P
F
 
W
L
 
I
N
 
A
R
 
S
V
 
K
G
 
P
N
 
A
K
 
N
S
 
T
I
 
M
V
 
F
V
 
I
V
 
V
D
|
D
E
 
E
A
 
A
Y
|
Y
C
 
A
E
 
E
F
 
F
V
 
V
E
 
N
K
 
D
P
 
P
D
 
R
F
 
F
P
 
R
D
 
S
A
 
I
M
 
S
E
 
P
L
 
M
L
 
I
S
 
T
Q
 
Q
-
 
G
Y
 
A
P
 
E
N
 
N
L
 
I
V
 
I
T
 
L
F
 
L
R
 
K
T
|
T
F
 
F
S
|
S
K
|
K
M
 
I
F
 
H
G
 
A
L
 
M
A
 
A
S
 
G
L
 
M
R
|
R
I
 
V
G
 
G
Y
 
Y
L
 
A
A
 
V
G
 
A
S
 
H
P
 
P
E
 
T
V
 
V
V
 
I
D
 
A
I
 
L
I
 
M
R
 
G
R
 
R
T
 
Y
C
 
V
V
 
A
V
 
G
Y
 
E
S
 
K
V
 
I
N
 
N
A
 
F
L
 
S
A
 
G
Q
 
V
A
 
D
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
S
L
 
M
E
 
N
S
 
D
K
 
S
H
 
A
H
 
F
I
 
I
E
 
T
N
 
Y
T
 
S
R
 
K
A
 
K
L
 
S
V
 
N
R
 
D
E
 
V
A
 
S
K
 
R
E
 
Q
Y
 
I
L
 
L
N
 
L
H
 
K
E
 
A
M
 
L
N
 
E
S
 
D
L
 
L
G
 
K
L
 
L
F
 
P
T
 
Y
V
 
L
G
 
P
E
 
S
E
 
E
G
 
G
C
 
N
Y
 
F
L
 
V
M
 
F
V
 
H
R
 
Q
L
 
L
-
 
V
-
 
V
P
 
P
M
 
L
S
 
K
D
 
D
S
 
-
L
 
-
A
 
-
Y
 
Y
R
 
Q
K
 
T
L
 
H
M
 
M
S
 
A
Q
 
D
-
 
A
G
 
G
V
 
V
M
 
L
I
 
I
R
 
-
T
 
-
M
 
-
T
 
-
G
 
G
F
 
R
R
 
A
F
 
F
P
 
P
-
 
P
-
 
A
-
 
D
N
 
N
F
 
W
I
 
C
R
 
R
V
 
I
S
 
S
V
 
L
G
 
G
E
 
T
M
 
P
P
 
Q
A
 
E
M
 
M
Q
 
Q
R
 
W
F
 
V
V
 
A
H
 
D
C
 
T
L
 
M
K
 
R
N
 
E
I
 
F
L
 
R
R
 
K
E
 
K
S
 
S

4r8dA Crystal structure of rv1600 encoded aminotransferase in complex with plp-mes from mycobacterium tuberculosis
28% identity, 85% coverage: 36:354/376 of query aligns to 21:346/369 of 4r8dA

query
sites
4r8dA
Y
 
Y
G
 
G
C
 
A
S
 
P
S
 
Q
L
 
L
-
 
A
-
 
V
-
 
P
L
 
V
R
 
R
L
 
L
N
 
N
N
 
T
N
 
N
E
 
E
N
 
N
P
 
P
L
 
-
G
 
H
P
 
P
P
 
P
G
 
T
E
 
R
S
 
A
-
 
L
-
 
V
-
 
D
-
 
D
-
 
V
-
 
V
-
 
R
-
 
S
-
 
V
R
 
R
Q
 
E
A
 
A
I
 
A
L
 
I
D
 
D
F
 
L
P
 
-
P
 
-
N
 
-
K
 
-
A
 
-
S
 
H
V
 
R
Y
 
Y
P
 
P
S
 
D
G
 
R
D
 
D
A
 
A
Y
 
V
H
 
A
L
 
L
R
 
R
R
 
A
K
 
D
L
 
L
A
 
A
-
 
G
-
 
Y
-
 
L
-
 
T
-
 
A
-
 
Q
E
 
T
R
 
G
F
 
I
G
 
Q
M
 
L
G
 
G
P
 
V
D
 
E
Q
 
N
F
 
I
L
 
W
V
 
A
G
 
A
N
 
N
G
|
G
A
x
S
N
|
N
E
 
E
V
 
I
I
 
L
A
 
Q
F
 
Q
V
 
L
I
 
L
K
 
Q
A
 
A
F
 
F
C
 
G
Q
 
G
E
 
P
G
 
G
D
 
R
N
 
S
I
 
A
V
 
I
T
 
G
A
 
F
D
 
V
K
 
P
T
 
S
F
x
Y
A
 
S
V
 
M
Y
 
H
E
 
P
W
 
I
V
 
I
A
 
S
Q
 
D
F
 
G
S
 
T
G
 
H
F
 
T
E
 
E
-
 
W
A
 
I
R
 
E
T
 
A
V
 
S
P
 
R
L
 
A
K
 
N
D
 
D
Y
 
F
G
 
G
F
 
L
N
 
D
D
 
V
E
 
D
A
 
V
M
 
A
L
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
V
D
 
V
E
 
D
R
 
R
T
 
K
-
 
P
K
 
D
I
 
V
F
 
V
F
 
F
V
 
I
C
 
A
N
 
S
P
 
P
N
 
N
N
|
N
P
 
P
T
 
S
G
 
G
T
 
Q
Y
 
S
W
 
V
D
 
S
R
 
L
N
 
P
K
 
D
L
 
L
L
 
C
N
 
K
F
 
L
L
 
L
N
 
D
R
 
V
V
 
A
G
 
-
N
 
-
K
 
P
S
 
G
I
 
I
V
 
A
V
 
I
V
 
V
D
|
D
E
 
E
A
|
A
Y
|
Y
C
 
G
E
 
E
F
 
F
V
 
S
E
 
S
K
 
Q
P
 
P
D
 
S
F
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
A
M
 
V
E
 
S
L
 
L
L
 
V
S
 
E
Q
 
E
Y
 
Y
P
 
P
N
 
S
-
 
K
L
 
L
V
 
V
T
 
V
F
 
T
R
 
R
T
|
T
F
 
M
S
|
S
K
|
K
M
 
A
F
 
F
G
 
A
L
 
F
A
 
A
S
 
G
L
 
G
R
|
R
I
 
L
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
A
 
I
G
 
A
S
 
T
P
 
P
E
 
A
V
 
V
V
 
I
D
 
D
I
 
A
I
 
M
R
 
L
R
 
L
T
 
V
C
 
R
V
 
L
V
 
P
Y
 
Y
S
 
H
V
 
L
N
 
S
A
 
S
L
 
V
A
 
T
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
R
A
 
A
A
 
A
L
 
L
-
 
R
E
 
H
S
 
S
K
 
D
H
 
D
H
 
T
I
 
L
E
 
S
N
 
S
T
 
V
R
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
I
R
 
A
E
 
E
A
 
-
K
 
R
E
 
E
Y
 
R
L
 
V
N
 
T
H
 
T
E
 
S
M
 
L
N
 
N
S
 
D
L
 
M
G
 
G
L
 
F
F
 
R
T
 
V
V
 
I
G
 
P
E
 
S
E
 
D
G
 
A
C
 
N
Y
 
F
L
 
V
M
 
L
V
 
F
R
 
G
L
 
E
P
 
F
M
 
A
S
 
D
D
 
A
S
 
P
L
 
A
A
 
A
Y
 
W
R
 
R
K
 
R
L
 
Y
M
 
L
S
 
E
Q
 
A
G
 
G
V
 
I
M
 
L
I
 
I
R
 
R
T
 
D
M
 
V
T
 
G
G
 
-
F
 
-
R
 
-
F
 
I
P
 
P
N
 
G
F
 
Y
I
 
L
R
 
R
V
 
A
S
 
T
V
 
T
G
 
G

3cq6A Histidinol-phosphate aminotransferase from corynebacterium glutamicum holo-form (plp covalently bound ) (see paper)
28% identity, 89% coverage: 36:371/376 of query aligns to 19:361/364 of 3cq6A

query
sites
3cq6A
Y
|
Y
G
 
G
C
 
A
S
x
P
S
 
Q
L
 
L
-
 
N
-
 
V
-
 
D
L
 
I
R
 
R
L
 
L
N
 
N
N
 
T
N
 
N
E
 
E
N
 
N
P
 
P
L
 
Y
G
 
-
P
 
P
P
 
P
G
 
S
E
 
E
S
 
A
R
 
L
Q
 
V
A
 
A
I
 
D
L
 
L
D
 
V
F
 
A
P
 
T
P
 
V
N
 
D
K
 
K
A
 
I
S
 
A
V
 
T
-
 
E
-
 
L
-
 
N
-
 
R
Y
 
Y
P
 
P
S
 
E
G
 
R
D
 
D
A
 
A
Y
 
V
H
 
E
L
 
L
R
 
R
R
 
D
K
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
A
R
 
Y
F
 
I
-
 
T
-
 
K
-
 
Q
-
 
T
-
 
G
-
 
V
G
 
A
M
 
V
G
 
T
P
 
R
D
 
D
Q
 
N
F
 
L
L
 
W
V
 
A
G
 
A
N
 
N
G
 
G
A
 
S
N
 
N
E
 
E
V
 
I
I
 
L
A
 
Q
F
 
Q
V
 
L
I
 
L
K
 
Q
A
 
A
F
 
F
C
 
G
Q
 
G
E
 
P
G
 
G
D
 
R
N
 
T
I
 
A
V
 
L
T
 
G
A
 
F
D
 
Q
K
 
P
T
 
S
F
 
Y
A
 
S
V
 
M
Y
 
H
E
 
P
W
 
I
V
 
L
A
 
A
Q
 
K
F
 
G
S
 
T
G
 
H
F
 
T
E
 
E
A
 
F
R
 
I
T
 
A
V
 
V
P
 
S
L
 
-
K
 
R
D
 
G
Y
 
A
G
 
D
F
 
F
N
 
R
D
 
I
E
 
D
A
 
M
M
 
D
L
 
V
A
 
A
A
 
L
A
 
E
D
 
E
E
 
I
R
 
R
T
 
A
K
 
K
-
 
Q
-
 
P
-
 
D
I
 
I
F
 
V
F
 
F
V
 
V
C
 
T
N
 
T
P
 
P
N
 
N
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
T
 
D
Y
 
V
W
 
T
D
 
S
R
 
L
N
 
D
K
 
D
L
 
V
L
 
E
N
 
R
F
 
I
L
 
I
N
 
N
R
 
V
V
 
A
G
 
-
N
 
-
K
 
P
S
 
G
I
 
I
V
 
V
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
C
 
A
E
 
E
F
 
F
V
 
S
E
 
P
K
 
S
P
 
-
D
 
-
F
 
-
P
 
P
D
 
S
A
 
A
M
 
T
E
 
T
L
 
L
L
 
L
S
 
E
Q
 
K
Y
 
Y
P
 
P
N
 
T
-
 
K
L
 
L
V
 
V
T
 
V
F