SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012645265.1 NCBI__GCF_000022265.1:WP_012645265.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5zaiC Crystal structure of 3-hydroxypropionyl-coa dehydratase from metallosphaera sedula (see paper)
42% identity, 99% coverage: 1:258/260 of query aligns to 1:257/259 of 5zaiC

query
sites
5zaiC
M
 
M
S
 
E
Y
 
F
E
 
E
F
 
T
I
 
I
T
 
E
L
 
T
K
 
K
K
 
K
D
 
E
D
 
G
R
 
N
V
 
L
L
 
F
T
 
W
I
 
I
S
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
P
 
D
T
x
K
-
x
L
N
 
N
P
 
A
L
 
L
N
 
N
G
 
A
V
 
K
F
 
L
G
 
L
Q
 
E
E
 
E
L
 
L
F
 
D
K
 
R
A
 
A
F
 
V
S
 
S
E
 
Q
A
 
A
E
 
E
Q
 
S
M
 
D
E
 
P
D
 
E
I
 
I
T
 
R
V
 
V
V
 
I
I
 
I
I
 
I
T
 
T
S
 
G
A
 
K
L
 
-
E
 
G
K
 
K
A
 
A
F
 
F
I
 
C
A
|
A
G
|
G
A
|
A
D
|
D
I
|
I
K
 
T
E
 
Q
M
x
F
A
 
N
A
 
Q
Q
 
L
D
 
T
A
 
P
A
 
A
E
 
E
A
 
A
E
 
W
Q
 
K
F
 
F
S
|
S
K
 
K
L
 
K
L
 
G
Q
x
R
G
 
E
A
 
I
N
 
M
N
 
D
I
 
K
L
 
I
N
 
E
R
 
A
M
 
L
K
 
S
K
 
K
I
 
P
V
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
M
I
 
I
N
 
N
G
 
G
H
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
C
 
L
E
|
E
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
A
C
 
C
D
 
D
Y
 
I
R
 
R
L
 
I
M
 
A
T
 
A
S
 
E
G
 
-
K
 
E
A
 
A
L
 
Q
I
 
L
G
 
G
L
 
L
P
|
P
E
|
E
A
 
I
G
 
N
L
 
L
G
 
G
I
|
I
I
 
Y
P
|
P
G
|
G
A
 
Y
G
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
L
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
K
S
 
G
K
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
E
I
 
M
L
 
M
L
 
M
R
 
T
G
 
G
R
 
D
T
x
R
M
 
I
S
 
P
P
 
G
Q
 
K
E
 
D
A
 
A
L
 
E
A
 
K
I
 
Y
G
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
N
K
 
R
L
 
V
I
 
V
E
 
P
P
 
L
E
 
A
N
 
N
F
 
L
Q
 
E
A
 
Q
E
 
E
V
 
T
M
 
R
Q
 
K
F
 
L
A
 
A
Q
 
E
E
 
K
L
 
I
A
 
A
A
 
K
G
 
K
A
 
S
G
 
P
K
 
I
A
 
S
L
 
L
G
 
A
Y
 
L
I
 
I
K
 
K
A
 
E
A
 
V
V
 
V
Y
 
N
E
 
R
G
 
G
I
 
L
D
 
D
F
 
S
P
 
P
L
 
L
E
 
L
Q
 
S
A
 
G
L
 
L
A
|
A
V
 
L
E
 
E
R
 
S
K
 
V
Y
 
G
S
 
W
A
 
G
E
 
V
N
 
V
S
x
F
K
 
S
T
 
T
H
 
E
D
 
D
A
 
K
K
 
K
E
 
E
G
 
G
L
 
V
T
 
S
A
 
A
F
|
F
V
 
L
E
 
E
K
|
K
R
 
R
R
 
E
P
 
P
E
 
T
F
 
F
K
 
K

3q0jC Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase in complex with the inhibitor acetoacetylcoa
40% identity, 99% coverage: 1:257/260 of query aligns to 1:254/255 of 3q0jC

query
sites
3q0jC
M
 
M
S
 
T
Y
 
Y
E
 
E
F
 
T
I
 
I
T
 
L
L
 
V
K
 
E
K
 
R
D
 
D
D
 
Q
R
 
R
V
 
V
L
 
G
T
 
I
I
 
I
S
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
P
x
Q
T
x
A
-
x
L
N
 
N
P
x
A
L
 
L
N
 
N
G
 
S
V
 
Q
F
 
V
G
 
M
Q
 
N
E
 
E
L
 
V
F
 
T
K
 
S
A
 
A
F
 
A
S
 
T
E
 
E
A
 
L
E
 
D
Q
 
D
M
 
D
E
 
P
D
 
D
I
 
I
T
 
G
V
 
A
V
 
I
I
 
I
I
 
I
T
 
T
S
 
G
A
 
S
L
 
-
E
 
A
K
 
K
A
 
A
F
 
F
I
 
A
A
|
A
G
|
G
A
|
A
D
|
D
I
|
I
K
|
K
E
 
E
M
|
M
A
 
A
A
 
-
Q
 
-
D
 
D
A
 
L
A
 
T
E
 
F
A
 
A
E
 
D
Q
 
A
F
 
F
S
x
T
K
 
A
L
 
D
L
 
F
Q
x
F
G
 
A
A
 
T
N
 
W
N
 
G
I
 
K
L
 
L
N
 
A
R
 
A
M
 
V
K
 
R
K
 
T
I
 
P
V
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
V
N
 
A
G
 
G
H
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
|
G
G
|
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
L
 
L
A
 
A
L
 
M
A
 
M
C
 
C
D
 
D
Y
 
V
R
 
-
L
 
L
M
 
I
T
 
A
S
 
A
G
 
D
K
 
T
A
 
A
L
 
K
I
 
F
G
 
G
L
 
Q
P
|
P
E
|
E
A
 
I
G
 
K
L
 
L
G
 
G
I
x
V
I
 
L
P
|
P
G
|
G
A
x
M
G
 
G
G
 
G
T
 
S
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
L
 
A
V
 
I
G
 
G
L
 
K
S
 
A
K
 
K
A
 
A
L
 
M
D
 
D
I
 
L
L
 
I
L
 
L
R
 
T
G
 
G
R
 
R
T
 
T
M
 
M
S
 
D
P
 
A
Q
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
E
A
 
R
I
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
S
K
 
R
L
 
V
I
 
V
E
 
P
P
 
A
E
 
D
N
 
D
F
 
L
Q
 
L
A
 
T
E
 
E
V
 
A
M
 
R
Q
 
A
F
 
T
A
 
A
Q
 
T
E
 
T
L
 
I
A
 
S
A
 
Q
G
 
M
A
 
S
G
 
A
K
 
S
A
 
A
L
 
A
G
 
R
Y
 
M
I
 
A
K
 
K
A
 
E
A
 
A
V
 
V
Y
 
N
E
 
R
G
 
A
I
 
F
D
 
E
F
 
S
P
 
S
L
 
L
E
 
S
Q
 
E
A
 
G
L
 
L
A
x
L
V
 
Y
E
 
E
R
 
R
K
 
R
Y
 
L
S
 
F
A
 
H
E
 
S
N
 
A
S
x
F
K
 
A
T
 
T
H
 
E
D
 
D
A
 
Q
K
 
S
E
 
E
G
 
G
L
 
M
T
 
A
A
 
A
F
 
F
V
 
I
E
 
E
K
 
K
R
 
R
R
 
A
P
 
P
E
 
Q
F
 
F

3q0gC Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase bound to a reaction intermediate derived from crotonyl coa
40% identity, 99% coverage: 1:257/260 of query aligns to 1:254/255 of 3q0gC

query
sites
3q0gC
M
 
M
S
 
T
Y
 
Y
E
 
E
F
 
T
I
 
I
T
 
L
L
 
V
K
 
E
K
 
R
D
 
D
D
 
Q
R
 
R
V
 
V
L
 
G
T
 
I
I
 
I
S
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
P
 
Q
T
 
A
-
x
L
N
 
N
P
 
A
L
 
L
N
 
N
G
 
S
V
 
Q
F
 
V
G
 
M
Q
 
N
E
 
E
L
 
V
F
 
T
K
 
S
A
 
A
F
 
A
S
 
T
E
 
E
A
 
L
E
 
D
Q
 
D
M
 
D
E
 
P
D
 
D
I
 
I
T
 
G
V
 
A
V
 
I
I
 
I
I
 
I
T
 
T
S
 
G
A
 
S
L
 
-
E
 
A
K
 
K
A
 
A
F
 
F
I
 
A
A
|
A
G
 
G
A
|
A
D
 
D
I
|
I
K
|
K
E
 
E
M
|
M
A
 
A
A
 
-
Q
 
-
D
 
D
A
 
L
A
 
T
E
 
F
A
 
A
E
 
D
Q
 
A
F
 
F
S
x
T
K
 
A
L
 
D
L
 
F
Q
x
F
G
 
A
A
 
T
N
 
W
N
 
G
I
 
K
L
 
L
N
 
A
R
 
A
M
 
V
K
 
R
K
 
T
I
 
P
V
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
V
N
 
A
G
 
G
H
x
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
L
 
L
A
 
A
L
 
M
A
 
M
C
 
C
D
 
D
Y
 
V
R
 
-
L
 
L
M
 
I
T
 
A
S
 
A
G
 
D
K
 
T
A
 
A
L
 
K
I
 
F
G
 
G
L
 
Q
P
|
P
E
|
E
A
 
I
G
 
K
L
|
L
G
 
G
I
x
V
I
 
L
P
|
P
G
|
G
A
 
M
G
 
G
G
 
G
T
 
S
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
L
 
A
V
 
I
G
 
G
L
 
K
S
 
A
K
 
K
A
 
A
L
 
M
D
 
D
I
 
L
L
 
I
L
 
L
R
 
T
G
 
G
R
 
R
T
 
T
M
 
M
S
 
D
P
 
A
Q
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
E
A
 
R
I
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
S
K
 
R
L
 
V
I
 
V
E
 
P
P
 
A
E
 
D
N
 
D
F
 
L
Q
 
L
A
 
T
E
 
E
V
 
A
M
 
R
Q
 
A
F
 
T
A
 
A
Q
 
T
E
 
T
L
 
I
A
 
S
A
 
Q
G
 
M
A
 
S
G
 
A
K
 
S
A
 
A
L
 
A
G
 
R
Y
 
M
I
 
A
K
 
K
A
 
E
A
 
A
V
 
V
Y
 
N
E
 
R
G
 
A
I
 
F
D
 
E
F
 
S
P
 
S
L
 
L
E
 
S
Q
 
E
A
 
G
L
 
L
A
x
L
V
 
Y
E
 
E
R
 
R
K
 
R
Y
 
L
S
 
F
A
 
H
E
 
S
N
 
A
S
x
F
K
 
A
T
 
T
H
 
E
D
 
D
A
 
Q
K
 
S
E
 
E
G
 
G
L
 
M
T
 
A
A
 
A
F
 
F
V
 
I
E
 
E
K
 
K
R
 
R
R
 
A
P
 
P
E
 
Q
F
 
F

3h81A Crystal structure of enoyl-coa hydratase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
40% identity, 99% coverage: 2:259/260 of query aligns to 1:255/256 of 3h81A

query
sites
3h81A
S
 
T
Y
 
Y
E
 
E
F
 
T
I
 
I
T
 
L
L
 
V
K
 
E
K
 
R
D
 
D
D
 
Q
R
 
R
V
 
V
L
 
G
T
 
I
I
 
I
S
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
P
 
Q
T
 
A
-
 
L
N
 
N
P
 
A
L
 
L
N
 
N
G
 
S
V
 
Q
F
 
V
G
 
M
Q
 
N
E
 
E
L
 
V
F
 
T
K
 
S
A
 
A
F
 
A
S
 
T
E
 
E
A
 
L
E
 
D
Q
 
D
M
 
D
E
 
P
D
 
D
I
 
I
T
 
G
V
 
A
V
 
I
I
 
I
I
 
I
T
 
T
S
 
G
A
 
S
L
 
-
E
 
A
K
 
K
A
 
A
F
 
F
I
 
A
A
 
A
G
 
G
A
|
A
D
 
D
I
 
I
K
 
K
E
 
E
M
|
M
A
 
A
A
 
-
Q
 
-
D
 
D
A
 
L
A
 
T
E
 
F
A
 
A
E
 
D
Q
 
A
F
 
F
S
x
T
K
 
A
L
 
D
L
 
F
Q
x
F
G
 
A
A
 
T
N
 
W
N
 
G
I
 
K
L
 
L
N
 
A
R
 
A
M
 
V
K
 
R
K
 
T
I
 
P
V
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
V
N
 
A
G
 
G
H
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
L
 
L
A
 
A
L
 
M
A
 
M
C
 
C
D
 
D
Y
 
V
R
 
-
L
 
L
M
 
I
T
 
A
S
 
A
G
 
D
K
 
T
A
 
A
L
 
K
I
 
F
G
 
G
L
 
Q
P
|
P
E
|
E
A
 
I
G
 
K
L
 
L
G
 
G
I
x
V
I
 
L
P
|
P
G
|
G
A
 
M
G
 
G
G
 
G
T
 
S
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
L
 
A
V
 
I
G
 
G
L
 
K
S
 
A
K
 
K
A
 
A
L
 
M
D
 
D
I
 
L
L
 
I
L
 
L
R
 
T
G
 
G
R
 
R
T
 
T
M
 
M
S
 
D
P
 
A
Q
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
E
A
 
R
I
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
S
K
 
R
L
 
V
I
 
V
E
 
P
P
 
A
E
 
D
N
 
D
F
 
L
Q
 
L
A
 
T
E
 
E
V
 
A
M
 
R
Q
 
A
F
 
T
A
 
A
Q
 
T
E
 
T
L
 
I
A
 
S
A
 
Q
G
 
M
A
 
S
G
 
A
K
 
S
A
 
A
L
 
A
G
 
R
Y
 
M
I
 
A
K
 
K
A
 
E
A
 
A
V
 
V
Y
 
N
E
 
R
G
 
A
I
 
F
D
 
E
F
 
S
P
 
S
L
 
L
E
 
S
Q
 
E
A
 
G
L
 
L
A
x
L
V
 
Y
E
 
E
R
 
R
K
 
R
Y
 
L
S
 
F
A
 
H
E
 
S
N
 
A
S
x
F
K
 
A
T
 
T
H
 
E
D
 
D
A
x
Q
K
 
S
E
 
E
G
 
G
L
 
M
T
 
A
A
 
A
F
 
F
V
 
I
E
 
E
K
 
K
R
 
R
R
 
A
P
 
P
E
 
Q
F
 
F
K
 
T
N
 
H

3q0gD Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase bound to a reaction intermediate derived from crotonyl coa
40% identity, 98% coverage: 2:257/260 of query aligns to 1:249/250 of 3q0gD

query
sites
3q0gD
S
 
T
Y
 
Y
E
 
E
F
 
T
I
 
I
T
 
L
L
 
V
K
 
E
K
 
R
D
 
D
D
 
Q
R
 
R
V
 
V
L
 
G
T
 
I
I
 
I
S
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
P
 
Q
T
 
A
-
 
L
N
 
N
P
 
A
L
 
L
N
 
N
G
 
S
V
 
Q
F
 
V
G
 
M
Q
 
N
E
 
E
L
 
V
F
 
T
K
 
S
A
 
A
F
 
A
S
 
T
E
 
E
A
 
L
E
 
D
Q
 
D
M
 
D
E
 
P
D
 
D
I
 
I
T
 
G
V
 
A
V
 
I
I
 
I
I
 
I
T
 
T
S
 
G
A
 
S
L
 
-
E
 
A
K
 
K
A
 
A
F
 
F
I
 
A
A
 
A
G
 
G
A
|
A
D
 
D
I
 
I
K
 
K
E
 
E
M
|
M
A
 
F
A
 
A
Q
 
-
D
 
D
A
 
A
A
 
F
E
x
T
A
 
A
E
 
D
Q
 
F
F
|
F
S
 
A
K
 
T
L
 
W
L
 
G
Q
 
K
G
 
-
A
 
-
N
 
-
N
 
-
I
 
-
L
 
L
N
 
A
R
 
A
M
 
V
K
 
R
K
 
T
I
 
P
V
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
V
N
 
A
G
 
G
H
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
L
 
L
A
 
A
L
 
M
A
 
M
C
 
C
D
 
D
Y
 
V
R
 
-
L
 
L
M
 
I
T
 
A
S
 
A
G
 
D
K
 
T
A
 
A
L
 
K
I
 
F
G
 
G
L
 
Q
P
|
P
E
|
E
A
 
I
G
 
K
L
 
L
G
 
G
I
x
V
I
 
L
P
|
P
G
|
G
A
 
M
G
 
G
G
 
G
T
 
S
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
L
 
A
V
 
I
G
 
G
L
 
K
S
 
A
K
 
K
A
 
A
L
 
M
D
 
D
I
 
L
L
 
I
L
 
L
R
 
T
G
 
G
R
 
R
T
 
T
M
 
M
S
 
D
P
 
A
Q
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
E
A
 
R
I
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
S
K
 
R
L
 
V
I
 
V
E
 
P
P
 
A
E
 
D
N
 
D
F
 
L
Q
 
L
A
 
T
E
 
E
V
 
A
M
 
R
Q
 
A
F
 
T
A
 
A
Q
 
T
E
 
T
L
 
I
A
 
S
A
 
Q
G
 
M
A
 
S
G
 
A
K
 
S
A
 
A
L
 
A
G
 
R
Y
 
M
I
 
A
K
 
K
A
 
E
A
 
A
V
 
V
Y
 
N
E
 
R
G
 
A
I
 
F
D
 
E
F
 
S
P
 
S
L
 
L
E
 
S
Q
 
E
A
 
G
L
 
L
A
x
L
V
 
Y
E
 
E
R
 
R
K
 
R
Y
 
L
S
x
F
A
 
H
E
 
S
N
 
A
S
x
F
K
 
A
T
 
T
H
 
E
D
 
D
A
 
Q
K
 
S
E
 
E
G
 
G
L
 
M
T
 
A
A
 
A
F
|
F
V
 
I
E
 
E
K
 
K
R
 
R
R
 
A
P
 
P
E
 
Q
F
 
F

P14604 Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial; mECH; mECH1; Enoyl-CoA hydratase 1; ECHS1; Short-chain enoyl-CoA hydratase; SCEH; EC 4.2.1.17; EC 5.3.3.8 from Rattus norvegicus (Rat) (see 3 papers)
40% identity, 97% coverage: 10:260/260 of query aligns to 43:290/290 of P14604

query
sites
P14604
K
 
K
D
 
N
D
 
S
R
 
S
V
 
V
L
 
G
T
 
L
I
 
I
S
 
Q
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
P
 
K
T
 
A
-
 
L
N
 
N
P
 
A
L
 
L
N
 
C
G
 
N
V
 
G
F
 
L
G
 
I
Q
 
E
E
 
E
L
 
L
F
 
N
K
 
Q
A
 
A
F
 
L
S
 
E
E
 
T
A
 
F
E
 
E
Q
 
E
M
 
D
E
 
P
D
 
A
I
 
V
T
 
G
V
 
A
V
 
I
I
 
V
I
 
L
T
 
T
S
 
G
A
 
G
L
 
-
E
 
E
K
 
K
A
 
A
F
 
F
I
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
K
 
K
E
 
E
M
 
M
A
 
-
A
 
-
Q
 
Q
D
 
N
A
 
R
A
 
T
E
 
F
A
 
Q
E
 
D
Q
 
C
F
 
Y
S
 
S
K
 
G
L
 
K
L
 
F
Q
 
L
G
 
S
A
 
H
N
 
W
N
 
D
I
 
H
L
 
I
N
 
T
R
 
R
M
 
I
K
 
K
K
 
K
I
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
V
N
 
N
G
 
G
H
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
L
 
L
A
 
A
L
 
M
A
 
M
C
 
C
D
 
D
Y
 
I
R
 
-
L
 
I
M
 
Y
T
 
A
S
 
G
G
 
E
K
 
K
A
 
A
L
 
Q
I
 
F
G
 
G
L
 
Q
P
 
P
E
|
E
A
 
I
G
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
T
I
 
I
P
 
P
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
L
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
K
S
 
S
K
 
L
A
 
A
L
 
M
D
 
E
I
 
M
L
 
V
L
 
L
R
 
T
G
 
G
R
 
D
T
 
R
M
 
I
S
 
S
P
 
A
Q
 
Q
E
 
D
A
 
A
L
 
K
A
 
Q
I
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
S
K
 
K
L
 
I
I
 
F
E
 
P
P
 
V
E
 
E
N
 
T
F
 
L
Q
 
V
A
 
E
E
 
E
V
 
A
M
 
I
Q
 
Q
F
 
C
A
 
A
Q
 
E
E
 
K
L
 
I
A
 
A
A
 
N
G
 
N
A
 
S
G
 
K
K
 
I
A
 
I
L
 
V
G
 
A
Y
 
M
I
 
A
K
 
K
A
 
E
A
 
S
V
 
V
Y
 
N
E
 
A
G
 
A
I
 
F
D
 
E
F
 
M
P
 
T
L
 
L
E
 
T
Q
 
E
A
 
G
L
 
N
A
 
K
V
 
L
E
 
E
R
 
K
K
 
K
Y
 
L
S
 
F
A
 
Y
E
 
S
N
 
T
S
 
F
K
 
A
T
 
T
H
 
D
D
 
D
A
 
R
K
 
R
E
 
E
G
 
G
L
 
M
T
 
S
A
 
A
F
 
F
V
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
R
 
K
P
 
A
E
 
N
F
 
F
K
 
K
N
 
D
E
 
H

Sites not aligning to the query:

1dubA 2-enoyl-coa hydratase, data collected at 100 k, ph 6.5 (see paper)
40% identity, 97% coverage: 10:260/260 of query aligns to 13:260/260 of 1dubA

query
sites
1dubA
K
 
K
D
 
N
D
 
S
R
 
S
V
 
V
L
 
G
T
 
L
I
 
I
S
 
Q
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
P
x
K
T
x
A
-
x
L
N
 
N
P
x
A
L
 
L
N
 
C
G
 
N
V
 
G
F
 
L
G
 
I
Q
 
E
E
 
E
L
 
L
F
 
N
K
 
Q
A
 
A
F
 
L
S
 
E
E
 
T
A
 
F
E
 
E
Q
 
E
M
 
D
E
 
P
D
 
A
I
 
V
T
 
G
V
 
A
V
 
I
I
 
V
I
 
L
T
 
T
S
 
G
A
 
G
L
 
-
E
 
E
K
 
K
A
 
A
F
 
F
I
 
A
A
|
A
G
 
G
A
|
A
D
|
D
I
|
I
K
 
K
E
 
E
M
|
M
A
 
-
A
 
-
Q
 
Q
D
 
N
A
 
R
A
 
T
E
 
F
A
 
Q
E
 
D
Q
 
C
F
 
Y
S
|
S
K
 
G
L
 
K
L
 
F
Q
x
L
G
 
S
A
 
H
N
 
W
N
 
D
I
 
H
L
 
I
N
 
T
R
 
R
M
 
I
K
 
K
K
 
K
I
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
V
N
 
N
G
 
G
H
x
Y
A
 
A
L
 
L
G
|
G
G
|
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
L
 
L
A
 
A
L
 
M
A
 
M
C
 
C
D
 
D
Y
 
I
R
 
-
L
 
I
M
 
Y
T
 
A
S
 
G
G
 
E
K
 
K
A
 
A
L
 
Q
I
 
F
G
 
G
L
 
Q
P
|
P
E
|
E
A
 
I
G
 
L
L
|
L
G
 
G
I
x
T
I
 
I
P
|
P
G
|
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
L
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
K
S
 
S
K
 
L
A
 
A
L
 
M
D
 
E
I
 
M
L
 
V
L
 
L
R
 
T
G
 
G
R
 
D
T
 
R
M
 
I
S
 
S
P
 
A
Q
 
Q
E
 
D
A
 
A
L
 
K
A
 
Q
I
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
S
K
 
K
L
 
I
I
 
F
E
 
P
P
 
V
E
 
E
N
 
T
F
 
L
Q
 
V
A
 
E
E
 
E
V
 
A
M
 
I
Q
 
Q
F
 
C
A
 
A
Q
 
E
E
 
K
L
 
I
A
 
A
A
 
N
G
 
N
A
 
S
G
 
K
K
 
I
A
 
I
L
 
V
G
 
A
Y
 
M
I
 
A
K
 
K
A
 
E
A
 
S
V
 
V
Y
 
N
E
 
A
G
 
A
I
 
F
D
 
E
F
 
M
P
 
T
L
 
L
E
 
T
Q
 
E
A
 
G
L
 
N
A
x
K
V
 
L
E
 
E
R
 
K
K
 
K
Y
 
L
S
x
F
A
 
Y
E
 
S
N
 
T
S
x
F
K
 
A
T
 
T
H
 
D
D
 
D
A
 
R
K
 
R
E
 
E
G
 
G
L
 
M
T
 
S
A
 
A
F
|
F
V
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
R
 
K
P
 
A
E
 
N
F
 
F
K
 
K
N
 
D
E
 
H

1ey3A Structure of enoyl-coa hydratase complexed with the substrate dac-coa (see paper)
40% identity, 97% coverage: 10:260/260 of query aligns to 11:258/258 of 1ey3A

query
sites
1ey3A
K
 
K
D
 
N
D
 
S
R
 
S
V
 
V
L
 
G
T
 
L
I
 
I
S
 
Q
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
P
x
K
T
 
A
-
x
L
N
 
N
P
x
A
L
 
L
N
 
C
G
 
N
V
 
G
F
 
L
G
 
I
Q
 
E
E
 
E
L
 
L
F
 
N
K
 
Q
A
 
A
F
 
L
S
 
E
E
 
T
A
 
F
E
 
E
Q
 
E
M
 
D
E
 
P
D
 
A
I
 
V
T
 
G
V
 
A
V
 
I
I
 
V
I
 
L
T
 
T
S
 
G
A
 
G
L
 
-
E
 
E
K
 
K
A
 
A
F
 
F
I
 
A
A
|
A
G
|
G
A
|
A
D
|
D
I
|
I
K
 
K
E
 
E
M
|
M
A
 
-
A
 
-
Q
 
Q
D
 
N
A
 
R
A
 
T
E
 
F
A
 
Q
E
 
D
Q
 
C
F
 
Y
S
|
S
K
 
G
L
 
K
L
 
F
Q
x
L
G
 
S
A
 
H
N
x
W
N
 
D
I
 
H
L
 
I
N
 
T
R
 
R
M
 
I
K
 
K
K
 
K
I
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
V
N
 
N
G
 
G
H
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
L
 
L
A
 
A
L
 
M
A
 
M
C
 
C
D
 
D
Y
 
I
R
 
-
L
 
I
M
 
Y
T
 
A
S
 
G
G
 
E
K
 
K
A
 
A
L
 
Q
I
 
F
G
 
G
L
 
Q
P
|
P
E
|
E
A
 
I
G
 
L
L
|
L
G
 
G
I
x
T
I
 
I
P
|
P
G
|
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
L
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
K
S
 
S
K
 
L
A
 
A
L
 
M
D
 
E
I
 
M
L
 
V
L
 
L
R
 
T
G
 
G
R
 
D
T
 
R
M
 
I
S
 
S
P
 
A
Q
 
Q
E
 
D
A
 
A
L
 
K
A
 
Q
I
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
S
K
 
K
L
 
I
I
 
F
E
 
P
P
 
V
E
 
E
N
 
T
F
 
L
Q
 
V
A
 
E
E
 
E
V
 
A
M
 
I
Q
 
Q
F
 
C
A
 
A
Q
 
E
E
 
K
L
 
I
A
 
A
A
 
N
G
 
N
A
 
S
G
 
K
K
 
I
A
 
I
L
 
V
G
 
A
Y
 
M
I
 
A
K
 
K
A
 
E
A
 
S
V
 
V
Y
 
N
E
 
A
G
 
A
I
 
F
D
 
E
F
 
M
P
 
T
L
 
L
E
 
T
Q
 
E
A
 
G
L
 
N
A
x
K
V
 
L
E
 
E
R
 
K
K
 
K
Y
 
L
S
 
F
A
 
Y
E
 
S
N
 
T
S
x
F
K
 
A
T
 
T
H
 
D
D
 
D
A
 
R
K
 
R
E
 
E
G
 
G
L
 
M
T
 
S
A
 
A
F
 
F
V
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
R
 
K
P
 
A
E
 
N
F
 
F
K
 
K
N
 
D
E
 
H

1mj3A Crystal structure analysis of rat enoyl-coa hydratase in complex with hexadienoyl-coa (see paper)
40% identity, 97% coverage: 10:260/260 of query aligns to 13:258/258 of 1mj3A

query
sites
1mj3A
K
 
K
D
 
N
D
 
S
R
 
S
V
 
V
L
 
G
T
 
L
I
 
I
S
 
Q
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
P
x
K
T
x
A
-
x
L
N
 
N
P
x
A
L
 
L
N
 
C
G
 
N
V
 
G
F
 
L
G
 
I
Q
 
E
E
 
E
L
 
L
F
 
N
K
 
Q
A
 
A
F
 
L
S
 
E
E
 
T
A
 
F
E
 
E
Q
 
E
M
 
D
E
 
P
D
 
A
I
 
V
T
 
G
V
 
A
V
 
I
I
 
V
I
 
L
T
 
T
S
 
G
A
 
G
L
 
-
E
 
E
K
 
K
A
 
A
F
 
F
I
 
A
A
|
A
G
|
G
A
|
A
D
|
D
I
|
I
K
 
K
E
 
E
M
|
M
A
 
-
A
 
-
Q
 
Q
D
 
N
A
 
R
A
 
T
E
 
F
A
 
Q
E
 
D
Q
 
C
F
 
Y
S
|
S
K
 
G
L
|
L
L
 
S
Q
 
H
G
 
W
A
 
D
N
 
H
N
 
-
I
 
-
L
 
I
N
 
T
R
 
R
M
 
I
K
 
K
K
 
K
I
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
V
N
 
N
G
 
G
H
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
L
 
L
A
 
A
L
 
M
A
 
M
C
 
C
D
 
D
Y
 
I
R
 
-
L
 
I
M
 
Y
T
 
A
S
 
G
G
 
E
K
 
K
A
 
A
L
 
Q
I
 
F
G
 
G
L
 
Q
P
|
P
E
|
E
A
 
I
G
 
L
L
|
L
G
 
G
I
x
T
I
 
I
P
|
P
G
|
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
L
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
K
S
 
S
K
 
L
A
 
A
L
 
M
D
 
E
I
 
M
L
 
V
L
 
L
R
 
T
G
 
G
R
 
D
T
 
R
M
 
I
S
 
S
P
 
A
Q
 
Q
E
 
D
A
 
A
L
 
K
A
 
Q
I
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
S
K
 
K
L
 
I
I
 
F
E
 
P
P
 
V
E
 
E
N
 
T
F
 
L
Q
 
V
A
 
E
E
 
E
V
 
A
M
 
I
Q
 
Q
F
 
C
A
 
A
Q
 
E
E
 
K
L
 
I
A
 
A
A
 
N
G
 
N
A
 
S
G
 
K
K
 
I
A
 
I
L
 
V
G
 
A
Y
 
M
I
 
A
K
 
K
A
 
E
A
 
S
V
 
V
Y
 
N
E
 
A
G
 
A
I
 
F
D
 
E
F
 
M
P
 
T
L
 
L
E
 
T
Q
 
E
A
 
G
L
 
N
A
x
K
V
 
L
E
 
E
R
 
K
K
 
K
Y
 
L
S
 
F
A
 
Y
E
 
S
N
 
T
S
x
F
K
 
A
T
 
T
H
 
D
D
 
D
A
 
R
K
 
R
E
 
E
G
 
G
L
 
M
T
 
S
A
 
A
F
 
F
V
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
R
 
K
P
 
A
E
 
N
F
 
F
K
 
K
N
 
D
E
 
H

2dubA Enoyl-coa hydratase complexed with octanoyl-coa (see paper)
40% identity, 97% coverage: 10:260/260 of query aligns to 12:254/254 of 2dubA

query
sites
2dubA
K
 
K
D
 
N
D
 
S
R
 
S
V
 
V
L
 
G
T
 
L
I
 
I
S
 
Q
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
P
x
K
T
x
A
-
x
L
N
 
N
P
x
A
L
 
L
N
 
C
G
 
N
V
 
G
F
 
L
G
 
I
Q
 
E
E
 
E
L
 
L
F
 
N
K
 
Q
A
 
A
F
 
L
S
 
E
E
 
T
A
 
F
E
 
E
Q
 
E
M
 
D
E
 
P
D
 
A
I
 
V
T
 
G
V
 
A
V
 
I
I
 
V
I
 
L
T
 
T
S
 
G
A
 
G
L
 
-
E
 
E
K
 
K
A
 
A
F
 
F
I
 
A
A
|
A
G
 
G
A
|
A
D
|
D
I
|
I
K
|
K
E
 
E
M
|
M
A
 
-
A
 
-
Q
 
Q
D
 
N
A
 
R
A
 
T
E
 
F
A
 
Q
E
 
D
Q
 
C
F
 
Y
S
|
S
K
 
H
L
 
W
L
 
-
Q
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
N
 
D
I
 
H
L
 
I
N
 
T
R
 
R
M
 
I
K
 
K
K
 
K
I
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
V
N
 
N
G
 
G
H
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
L
 
L
A
 
A
L
 
M
A
 
M
C
 
C
D
 
D
Y
 
I
R
 
-
L
 
I
M
 
Y
T
 
A
S
 
G
G
 
E
K
 
K
A
 
A
L
 
Q
I
 
F
G
 
G
L
 
Q
P
|
P
E
|
E
A
 
I
G
 
L
L
 
L
G
 
G
I
x
T
I
 
I
P
|
P
G
|
G
A
|
A
G
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
L
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
K
S
 
S
K
 
L
A
 
A
L
 
M
D
 
E
I
 
M
L
 
V
L
 
L
R
 
T
G
 
G
R
 
D
T
 
R
M
 
I
S
 
S
P
 
A
Q
 
Q
E
 
D
A
 
A
L
 
K
A
 
Q
I
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
S
K
 
K
L
 
I
I
 
F
E
 
P
P
 
V
E
 
E
N
 
T
F
 
L
Q
 
V
A
 
E
E
 
E
V
 
A
M
 
I
Q
 
Q
F
 
C
A
 
A
Q
 
E
E
 
K
L
 
I
A
 
A
A
 
N
G
 
N
A
 
S
G
 
K
K
 
I
A
 
I
L
 
V
G
 
A
Y
 
M
I
 
A
K
 
K
A
 
E
A
 
S
V
 
V
Y
 
N
E
 
A
G
 
A
I
 
F
D
 
E
F
 
M
P
 
T
L
 
L
E
 
T
Q
 
E
A
 
G
L
 
N
A
x
K
V
 
L
E
 
E
R
 
K
K
 
K
Y
 
L
S
 
F
A
 
Y
E
 
S
N
 
T
S
x
F
K
 
A
T
 
T
H
 
D
D
 
D
A
 
R
K
 
R
E
 
E
G
 
G
L
 
M
T
 
S
A
 
A
F
 
F
V
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
R
 
K
P
 
A
E
 
N
F
 
F
K
 
K
N
 
D
E
 
H

2hw5C The crystal structure of human enoyl-coenzyme a (coa) hydratase short chain 1, echs1
38% identity, 100% coverage: 2:260/260 of query aligns to 2:260/260 of 2hw5C

query
sites
2hw5C
S
 
N
Y
 
F
E
 
E
F
 
Y
I
 
I
T
 
I
L
 
A
K
 
E
K
 
K
-
 
R
-
 
G
-
 
K
D
 
N
D
 
N
R
 
T
V
 
V
L
 
G
T
 
L
I
 
I
S
 
Q
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
P
x
K
T
x
A
-
x
L
N
 
N
P
x
A
L
 
L
N
 
C
G
 
D
V
 
G
F
 
L
G
 
I
Q
 
D
E
 
E
L
 
L
F
 
N
K
 
Q
A
 
A
F
 
L
S
 
K
E
 
I
A
 
F
E
 
E
Q
 
E
M
 
D
E
 
P
D
 
A
I
 
V
T
 
G
V
 
A
V
 
I
I
 
V
I
 
L
T
 
T
S
 
G
A
 
G
L
 
-
E
 
D
K
|
K
A
 
A
F
 
F
I
 
A
A
 
A
G
 
G
A
|
A
D
 
D
I
|
I
K
 
K
E
 
E
M
|
M
A
 
-
A
 
-
Q
 
Q
D
 
N
A
 
L
A
 
S
E
 
F
A
 
Q
E
 
D
Q
 
C
F
 
Y
S
|
S
K
 
S
L
 
K
L
 
F
Q
x
L
G
 
K
A
 
H
N
 
W
N
 
D
I
 
H
L
 
L
N
 
T
R
 
Q
M
 
V
K
 
K
K
 
K
I
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
V
N
 
N
G
 
G
H
 
Y
A
 
A
L
x
F
G
 
G
G
|
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
L
 
L
A
 
A
L
 
M
A
 
M
C
 
C
D
 
D
Y
 
I
R
 
-
L
 
I
M
 
Y
T
 
A
S
 
G
G
 
E
K
 
K
A
 
A
L
 
Q
I
 
F
G
 
A
L
 
Q
P
|
P
E
|
E
A
 
I
G
 
L
L
 
I
G
 
G
I
x
T
I
 
I
P
|
P
G
|
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
R
L
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
K
S
 
S
K
 
L
A
 
A
L
 
M
D
 
E
I
 
M
L
 
V
L
 
L
R
 
T
G
 
G
R
 
D
T
 
R
M
 
I
S
 
S
P
 
A
Q
 
Q
E
 
D
A
 
A
L
 
K
A
 
Q
I
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
S
K
 
K
L
 
I
I
 
C
E
 
P
P
 
V
E
 
E
N
 
T
F
 
L
Q
 
V
A
 
E
E
 
E
V
 
A
M
 
I
Q
 
Q
F
 
C
A
 
A
Q
 
E
E
 
K
L
 
I
A
 
A
A
 
S
G
 
N
A
 
S
G
 
K
K
 
I
A
 
V
L
 
V
G
 
A
Y
 
M
I
 
A
K
 
K
A
 
E
A
 
S
V
 
V
Y
 
N
E
 
A
G
 
A
I
 
F
D
 
E
F
 
M
P
 
T
L
 
L
E
 
T
Q
 
E
A
 
G
L
 
S
A
x
K
V
 
L
E
 
E
R
 
K
K
 
K
Y
 
L
S
 
F
A
 
Y
E
 
S
N
 
T
S
x
F
K
 
A
T
 
T
H
 
D
D
 
D
A
 
R
K
 
K
E
 
E
G
 
G
L
 
M
T
 
T
A
 
A
F
 
F
V
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
R
 
K
P
 
A
E
 
N
F
 
F
K
 
K
N
 
D
E
 
Q

5jbxB Crystal structure of liuc in complex with coenzyme a and malonic acid (see paper)
41% identity, 90% coverage: 25:259/260 of query aligns to 27:260/261 of 5jbxB

query
sites
5jbxB
N
 
N
P
x
A
L
 
I
N
 
S
G
 
R
V
 
A
F
 
M
G
 
L
Q
 
K
E
 
E
L
 
L
F
 
G
K
 
E
A
 
L
F
 
V
S
 
T
E
 
R
A
 
V
E
 
S
Q
 
S
M
 
S
E
 
R
D
 
D
I
 
V
T
 
R
V
 
A
V
 
V
I
 
V
I
 
I
T
 
T
S
 
G
A
 
A
L
 
G
E
 
D
K
 
K
A
 
A
F
 
F
I
 
C
A
|
A
G
 
G
A
|
A
D
|
D
I
x
L
K
|
K
E
 
E
M
x
R
A
 
A
A
 
T
Q
 
M
D
 
A
A
 
E
A
 
D
E
 
E
A
 
V
E
 
R
Q
 
A
F
 
F
S
x
L
K
 
D
L
 
G
L
 
L
Q
x
R
G
 
R
A
 
T
N
 
F
N
 
R
I
 
A
L
 
I
N
 
E
R
 
K
M
 
S
K
 
D
K
 
C
I
 
V
V
 
F
I
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
I
N
 
N
G
 
G
H
 
A
A
 
A
L
|
L
G
|
G
G
|
G
G
 
G
C
 
T
E
|
E
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
A
C
 
C
D
 
D
Y
 
L
R
 
R
L
 
V
M
 
A
T
 
A
S
 
P
G
 
A
K
 
-
A
 
A
L
 
E
I
 
L
G
 
G
L
 
L
P
x
T
E
|
E
A
 
V
G
 
K
L
|
L
G
 
G
I
|
I
I
 
I
P
|
P
G
|
G
A
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
P
 
A
R
 
R
L
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
P
S
 
G
K
 
R
A
 
A
L
 
K
D
 
D
I
 
L
L
 
I
L
 
L
R
 
T
G
 
A
R
 
R
T
x
R
M
 
I
S
 
N
P
 
A
Q
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
F
A
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
L
V
 
A
D
 
N
K
 
R
L
 
L
I
 
A
E
 
P
P
 
E
E
 
G
N
 
H
F
 
L
Q
 
L
A
 
A
E
 
V
V
 
A
M
 
Y
Q
 
G
F
 
L
A
 
A
Q
 
E
E
 
S
L
 
V
A
 
V
A
 
E
G
 
N
A
 
A
G
 
P
K
 
I
A
 
A
L
 
V
G
 
A
Y
 
T
I
 
A
K
 
K
A
 
H
A
 
A
V
 
I
Y
 
D
E
 
E
G
 
G
I
 
T
D
 
G
F
 
L
P
 
E
L
 
L
E
 
D
Q
 
D
A
 
A
L
 
L
A
|
A
V
 
L
E
 
E
R
 
L
K
 
R
Y
 
K
S
 
Y
A
 
E
E
 
E
N
 
I
S
x
L
K
 
K
T
 
T
H
 
E
D
 
D
A
 
R
K
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
L
T
 
R
A
 
A
F
 
F
V
 
A
E
 
E
K
 
K
R
 
R
R
 
A
P
 
P
E
 
V
F
 
Y
K
 
K
N
 
G

Sites not aligning to the query:

6slaAAA Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase (see paper)
34% identity, 98% coverage: 5:258/260 of query aligns to 1:243/245 of 6slaAAA

query
sites
6slaAAA
F
 
M
I
 
I
T
 
L
L
 
K
K
 
E
K
 
R
D
 
Q
D
 
D
R
 
G
V
 
V
L
 
L
T
 
V
I
 
L
S
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
-
 
E
P
 
K
T
x
L
N
 
N
P
 
A
L
 
I
N
 
T
G
 
G
V
 
E
F
 
L
G
 
L
Q
 
D
E
 
A
L
 
L
F
 
Y
K
 
A
A
 
A
F
 
L
S
 
K
E
 
E
A
 
G
E
 
E
Q
 
E
M
 
D
E
 
R
D
 
E
I
 
V
T
 
R
V
 
A
V
 
L
I
 
L
I
 
L
T
 
T
S
 
G
A
 
A
L
 
-
E
 
G
K
 
R
A
 
A
F
 
F
I
 
S
A
|
A
G
 
G
A
x
Q
D
|
D
I
x
L
K
 
T
E
 
E
M
 
-
A
 
-
A
 
-
Q
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
A
E
 
H
A
x
L
E
 
R
Q
 
R
F
x
Y
S
x
N
K
 
R
L
 
V
L
 
V
Q
 
E
G
 
A
A
 
-
N
 
-
N
 
-
I
 
-
L
 
L
N
 
S
R
 
G
M
 
L
K
 
E
K
 
K
I
 
P
V
 
L
I
 
V
A
 
V
A
 
A
I
 
V
N
 
N
G
 
G
H
 
V
A
 
A
L
x
A
G
|
G
G
x
A
G
 
G
C
 
M
E
x
S
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
W
C
 
G
D
 
D
Y
 
L
R
 
R
L
 
L
M
 
A
T
 
A
S
 
V
G
 
G
K
 
A
A
 
S
L
 
F
I
 
T
G
 
T
L
 
-
P
x
A
E
x
F
A
 
V
G
 
R
L
x
I
G
 
G
I
x
L
I
 
V
P
|
P
G
x
N
A
 
S
G
 
G
G
 
L
T
 
S
Q
 
F
R
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
R
L
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
A
K
 
K
A
 
A
L
 
Q
D
 
E
I
 
L
L
 
L
L
 
L
R
 
L
G
 
S
R
 
P
T
 
R
M
 
L
S
 
S
P
 
A
Q
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
I
 
L
G
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
H
K
 
R
L
 
V
I
 
V
E
 
P
P
 
A
E
 
E
N
 
K
F
 
L
Q
 
M
A
 
E
E
 
E
V
 
A
M
 
L
Q
 
S
F
 
L
A
 
A
Q
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
Q
G
 
G
A
 
P
G
 
T
K
 
R
A
 
A
L
 
Y
G
 
A
Y
 
L
I
 
T
K
 
K
A
 
K
A
 
L
V
 
L
Y
 
L
E
 
E
G
 
T
I
 
Y
D
 
R
F
 
L
P
 
S
L
 
L
E
 
T
Q
 
E
A
 
A
L
 
L
A
|
A
V
 
L
E
 
E
R
 
A
K
 
V
Y
 
L
S
 
Q
A
 
G
E
 
Q
N
 
A
S
x
G
K
 
Q
T
 
T
H
 
Q
D
 
D
A
 
H
K
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
V
T
 
R
A
 
A
F
|
F
V
 
R
E
 
E
K
|
K
R
 
R
R
 
P
P
 
P
E
 
R
F
 
F
K
 
Q

6slbAAA Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase (see paper)
33% identity, 98% coverage: 5:258/260 of query aligns to 4:255/257 of 6slbAAA

query
sites
6slbAAA
F
 
M
I
 
I
T
 
L
L
 
K
K
 
E
K
 
R
D
 
Q
D
 
D
R
 
G
V
 
V
L
 
L
T
 
V
I
 
L
S
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
-
 
E
P
 
K
T
 
L
N
 
N
P
 
A
L
 
I
N
 
T
G
 
G
V
 
E
F
 
L
G
 
L
Q
 
D
E
 
A
L
 
L
F
 
Y
K
 
A
A
 
A
F
 
L
S
 
K
E
 
E
A
 
G
E
 
E
Q
 
E
M
 
D
E
 
R
D
 
E
I
 
V
T
 
R
V
 
A
V
 
L
I
 
L
I
 
L
T
 
T
S
 
G
A
 
A
L
 
-
E
 
G
K
x
R
A
 
A
F
 
F
I
 
S
A
|
A
G
 
G
A
x
Q
D
|
D
I
x
L
K
 
T
E
 
E
M
x
F
A
 
G
A
 
D
Q
 
R
D
 
K
A
 
P
-
 
D
-
x
Y
-
 
E
A
 
A
E
 
H
A
x
L
E
 
R
Q
 
R
F
 
Y
S
x
N
K
 
R
L
 
V
L
 
V
Q
 
E
G
 
A
A
 
-
N
 
-
N
 
-
I
 
-
L
 
L
N
 
S
R
 
G
M
 
L
K
 
E
K
 
K
I
 
P
V
 
L
I
 
V
A
 
V
A
 
A
I
 
V
N
 
N
G
 
G
H
 
V
A
 
A
L
 
A
G
 
G
G
x
A
G
 
G
C
 
M
E
x
S
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
W
C
 
G
D
 
D
Y
 
L
R
 
R
L
 
L
M
 
A
T
 
A
S
 
V
G
 
G
K
 
A
A
 
S
L
 
F
I
 
T
G
 
T
L
 
-
P
x
A
E
x
F
A
 
V
G
 
R
L
 
I
G
 
G
I
x
L
I
 
V
P
|
P
G
x
D
A
 
S
G
 
G
G
 
L
T
 
S
Q
 
F
R
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
R
L
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
A
K
 
K
A
 
A
L
 
Q
D
 
E
I
 
L
L
 
L
L
 
L
R
 
L
G
 
S
R
 
P
T
 
R
M
 
L
S
 
S
P
 
A
Q
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
I
 
L
G
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
H
K
 
R
L
 
V
I
 
V
E
 
P
P
 
A
E
 
E
N
 
K
F
 
L
Q
 
M
A
 
E
E
 
E
V
 
A
M
 
L
Q
 
S
F
 
L
A
 
A
Q
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
Q
G
 
G
A
 
P
G
 
T
K
 
R
A
 
A
L
 
Y
G
 
A
Y
 
L
I
 
T
K
 
K
A
 
K
A
 
L
V
 
L
Y
 
L
E
 
E
G
 
T
I
 
Y
D
 
R
F
 
L
P
 
S
L
 
L
E
 
T
Q
 
E
A
 
A
L
 
L
A
|
A
V
 
L
E
 
E
R
 
A
K
 
V
Y
 
L
S
 
Q
A
 
G
E
 
Q
N
 
A
S
x
G
K
 
Q
T
 
T
H
 
Q
D
 
D
A
 
H
K
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
V
T
 
R
A
 
A
F
 
F
V
 
R
E
 
E
K
 
K
R
 
R
R
 
P
P
 
P
E
 
R
F
 
F
K
 
Q

P40939 Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial; 78 kDa gastrin-binding protein; Monolysocardiolipin acyltransferase; TP-alpha; EC 2.3.1.-; EC 4.2.1.17; EC 1.1.1.211 from Homo sapiens (Human) (see 5 papers)
40% identity, 68% coverage: 8:185/260 of query aligns to 45:224/763 of P40939

query
sites
P40939
L
 
V
K
 
K
K
 
G
D
 
D
D
 
V
R
 
A
V
 
V
L
 
V
T
 
R
I
 
I
S
 
N
L
 
S
N
 
P
R
 
N
P
 
S
P
 
K
T
 
V
N
 
N
P
 
T
L
 
L
N
 
S
G
 
K
V
 
E
F
 
L
G
 
H
Q
 
S
E
 
E
L
 
F
F
 
S
K
 
E
A
 
V
F
 
M
S
 
N
E
 
E
A
 
I
E
 
W
Q
 
A
M
 
S
E
 
D
D
 
Q
I
 
I
T
 
R
V
 
S
V
 
A
I
 
V
I
 
L
T
 
I
S
 
S
A
 
S
L
 
K
E
 
P
K
 
G
A
 
C
F
 
F
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
K
 
N
E
 
M
M
 
L
A
 
A
A
 
A
-
 
C
Q
 
K
D
 
T
A
 
L
A
 
Q
E
 
E
A
 
V
E
 
T
Q
 
Q
F
 
L
S
 
S
K
 
Q
L
 
E
L
 
A
Q
 
Q
G
 
R
A
 
I
N
 
V
N
 
E
I
 
K
L
 
L
N
 
E
R
 
K
M
 
S
K
 
T
K
 
K
I
 
P
V
 
I
I
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
I
N
 
N
G
 
G
H
 
S
A
 
C
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
C
 
L
E
 
E
L
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
S
C
 
C
D
 
Q
Y
 
Y
R
 
R
L
 
I
M
 
A
T
 
T
S
 
K
G
 
D
-
 
R
K
 
K
A
 
T
L
 
V
I
 
L
G
 
G
L
 
T
P
 
P
E
 
E
A
 
V
G
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
A
I
 
L
P
 
P
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
P
 
P
R
 
K
L
 
M
V
 
V
G
 
G
L
 
V
S
 
P
K
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
M
L
 
M
L
 
L
R
 
T
G
 
G
R
 
R
T
 
S
M
 
I
S
 
R
P
 
A
Q
 
D
E
 
R
A
 
A
L
 
K
A
 
K
I
 
M
G
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
D
K
 
Q
L
 
L
I
 
V
E
 
E
P
 
P

Sites not aligning to the query:

6tnmA E. Coli aerobic trifunctional enzyme subunit-alpha (see paper)
40% identity, 72% coverage: 1:188/260 of query aligns to 1:193/719 of 6tnmA

query
sites
6tnmA
M
 
M
S
 
L
Y
 
Y
E
 
K
F
 
G
I
 
D
T
 
T
L
 
L
K
 
Y
K
 
L
D
 
D
-
 
W
-
 
L
-
 
E
D
 
D
R
 
G
V
 
I
L
 
A
T
 
E
I
 
L
S
 
V
L
 
F
N
 
D
R
 
A
P
 
P
-
 
G
P
 
S
T
 
V
N
 
N
P
 
K
L
 
L
N
 
D
G
 
T
V
 
A
F
 
T
G
 
V
Q
 
A
E
 
S
L
 
L
F
 
G
K
 
E
A
 
A
F
 
I
S
 
G
E
 
V
A
 
L
E
 
E
Q
 
Q
M
 
Q
E
 
S
D
 
D
I
 
L
T
 
K
V
 
G
V
 
L
I
 
L
I
 
L
T
 
R
S
 
S
A
 
N
L
 
-
E
 
K
K
 
A
A
 
A
F
 
F
I
 
I
A
 
V
G
 
G
A
|
A
D
 
D
I
 
I
K
 
T
E
 
E
M
x
F
A
 
L
A
 
S
Q
 
L
D
 
F
A
 
L
A
 
V
E
 
P
A
 
E
E
 
E
Q
 
Q
F
 
L
S
 
S
K
 
Q
L
 
W
L
 
L
Q
 
H
G
 
F
A
 
A
N
 
N
N
 
S
I
 
V
L
 
F
N
 
N
R
 
R
M
 
L
K
 
E
K
 
D
I
 
L
-
 
P
-
 
V
-
 
P
V
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
V
N
 
N
G
 
G
H
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
L
 
C
A
 
V
L
 
L
A
 
A
C
 
T
D
 
D
Y
 
Y
R
 
R
L
 
L
M
 
A
T
 
T
S
 
P
G
 
-
K
 
D
A
 
L
L
 
R
I
 
I
G
 
G
L
 
L
P
|
P
E
|
E
A
 
T
G
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
I
I
 
M
P
 
P
G
|
G
A
 
F
G
 
G
G
 
G
T
 
S
Q
 
V
R
 
R
L
 
M
P
 
P
R
 
R
L
 
M
V
 
L
G
 
G
L
 
A
S
 
D
K
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
E
I
 
I
L
 
I
L
 
A
R
 
A
G
 
G
R
 
K
T
 
D
M
 
V
S
 
G
P
 
A
Q
 
D
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
K
I
 
I
G
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
D
K
 
G
L
 
V
I
 
V
E
 
K
P
 
A
E
 
E
N
 
K
F
 
L

Sites not aligning to the query:

6eqoA Tri-functional propionyl-coa synthase of erythrobacter sp. Nap1 with bound NADP+ and phosphomethylphosphonic acid adenylate ester (see paper)
35% identity, 93% coverage: 3:244/260 of query aligns to 851:1086/1804 of 6eqoA

query
sites
6eqoA
Y
 
Y
E
 
R
F
 
F
I
 
F
T
 
T
L
 
I
K
 
Q
K
 
Y
D
 
N
-
 
L
-
 
V
-
 
A
-
 
P
-
 
G
D
 
K
R
 
R
V
 
V
L
 
A
T
 
T
I
 
V
S
 
T
L
 
V
N
 
K
R
 
N
P
 
P
P
 
P
T
 
V
N
 
N
P
 
A
L
 
L
N
 
N
G
 
E
V
 
R
F
 
A
G
 
L
Q
 
D
E
 
E
L
 
L
F
 
V
K
 
I
A
 
I
F
 
A
S
 
E
E
 
H
A
 
L
E
 
A
Q
 
R
M
 
K
E
 
D
D
 
D
I
 
V
T
 
A
V
 
A
V
 
V
I
 
V
I
 
F
T
 
T
S
 
G
A
 
S
L
 
G
E
 
T
K
 
A
A
 
S
F
 
F
I
 
V
A
 
A
G
 
G
A
|
A
D
 
D
I
 
I
K
 
R
E
 
Q
M
 
M
A
 
L
A
 
E
Q
 
E
-
 
V
-
 
N
D
 
S
A
 
V
A
 
E
E
 
E
A
 
A
E
 
K
Q
 
A
F
 
L
S
 
P
K
 
D
L
 
N
L
 
A
Q
 
Q
G
 
L
A
 
A
N
 
F
N
 
R
I
 
T
L
 
I
N
 
E
R
 
E
M
 
M
K
 
D
K
 
K
I
 
P
V
 
C
I
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
I
N
 
Q
G
 
G
H
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
C
 
M
E
|
E
L
 
F
A
 
A
L
 
L
A
 
A
C
 
C
D
 
H
Y