SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012674077.1 NCBI__GCF_000021545.1:WP_012674077.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6pnzA The structure of the aspartate transcarbamoylase trimer from staphylococcus aureus complexed with pala at 2.27 resolution.
44% identity, 100% coverage: 1:300/301 of query aligns to 1:292/293 of 6pnzA

query
sites
6pnzA
M
 
M
K
 
N
D
 
H
L
 
L
Y
 
L
S
 
S
V
 
M
N
 
E
Q
 
H
L
 
L
E
 
S
K
 
T
E
 
D
D
 
Q
I
 
I
Q
 
Y
K
 
K
I
 
L
F
 
I
Q
 
Q
L
 
K
A
 
A
K
 
S
E
 
Q
Y
 
F
K
 
K
E
 
-
R
 
-
F
 
-
L
 
-
K
 
S
G
 
G
E
 
E
K
 
R
K
 
Q
F
 
L
N
 
P
D
 
N
L
 
F
R
 
E
R
 
G
C
 
K
S
 
Y
I
 
V
L
 
A
L
 
N
V
 
L
F
 
F
F
 
F
E
 
E
N
 
N
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
K
T
 
C
S
 
S
F
 
F
E
 
E
L
 
M
A
 
A
G
 
E
K
 
L
I
 
K
L
 
L
G
 
G
A
 
L
D
 
K
T
 
T
I
 
I
N
 
S
I
 
F
S
 
E
A
 
T
S
 
S
S
 
T
S
 
S
S
|
S
V
 
V
K
 
S
K
|
K
G
 
G
E
 
E
T
 
S
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
T
 
T
V
 
C
K
 
K
T
 
T
L
 
L
E
 
E
A
 
S
L
 
I
N
 
G
S
 
C
D
 
D
F
 
L
I
 
L
V
 
V
I
 
I
R
|
R
H
 
H
N
 
P
M
 
F
S
 
N
G
 
N
A
 
Y
A
 
Y
K
 
E
I
 
K
V
 
L
A
 
A
N
 
N
S
 
-
V
 
I
K
 
N
S
 
I
H
 
P
V
 
I
V
 
A
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
S
N
 
G
E
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
S
L
 
L
L
 
L
D
 
D
G
 
L
F
 
M
T
 
T
I
 
I
L
 
Y
E
 
E
K
 
E
K
 
Y
G
 
G
S
 
Y
L
 
F
E
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
N
I
 
V
A
 
L
I
 
I
V
 
C
G
 
G
D
 
D
I
 
I
L
 
K
H
 
N
S
 
S
R
|
R
V
 
V
A
 
A
R
 
R
S
 
S
D
 
N
I
 
Y
K
 
H
L
 
S
F
 
L
K
 
K
K
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
N
V
 
V
T
 
M
L
 
F
C
 
N
G
 
S
P
 
P
M
 
N
T
 
A
M
 
W
L
 
I
P
 
D
R
 
-
H
 
-
Y
 
-
E
 
D
A
 
S
L
 
L
G
 
E
A
 
A
D
 
P
Y
 
Y
I
 
V
T
 
N
T
 
I
D
 
D
I
 
-
K
 
-
E
 
D
A
 
V
V
 
I
K
 
E
N
 
T
K
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
V
I
 
M
F
 
L
L
 
L
R
|
R
I
 
I
Q
|
Q
L
 
H
E
 
E
R
 
R
Q
 
H
-
 
G
-
 
L
-
 
A
D
 
E
K
 
E
P
 
T
F
 
R
F
 
F
S
 
A
T
 
A
L
 
-
R
 
D
E
 
D
Y
 
Y
S
 
H
I
 
Q
K
 
K
Y
 
H
G
 
G
L
 
L
N
 
N
Q
 
E
E
 
V
L
 
R
L
 
Y
K
 
N
I
 
K
L
 
L
K
 
Q
P
 
E
D
 
H
T
 
A
V
 
I
I
 
V
M
 
M
H
 
H
P
 
P
G
x
A
P
 
P
V
 
V
N
 
N
R
 
R
G
 
G
V
 
V
E
 
E
I
 
I
Q
 
Q
S
 
S
E
 
D
L
 
L
V
 
V
Y
 
E
S
 
A
S
 
S
K
 
K
S
 
S
L
 
R
I
 
I
L
 
F
N
 
K
Q
 
Q
V
 
M
E
 
E
N
 
N
G
 
G
L
 
V
F
 
Y
I
 
L
R
 
R
M
 
M
A
 
A
V
 
V
Y
 
I
K
 
D
Y
 
E
L
 
L
L
 
L

3r7fA Crystal structure of cp-bound aspartate transcarbamoylase from bacillus subtilis (see paper)
45% identity, 100% coverage: 1:300/301 of query aligns to 1:289/291 of 3r7fA

query
sites
3r7fA
M
 
M
K
 
K
D
 
H
L
 
L
Y
 
T
S
 
T
V
 
M
N
 
S
Q
 
E
L
 
L
E
x
S
K
x
T
E
 
E
D
 
E
I
 
I
Q
 
K
K
 
D
I
 
L
F
 
L
Q
 
Q
L
 
T
A
 
A
K
x
Q
E
 
E
Y
 
-
K
 
-
E
 
-
R
 
-
F
 
-
L
 
L
K
|
K
G
 
S
E
 
G
K
 
K
K
 
T
F
 
D
N
 
N
D
 
Q
L
 
L
R
 
T
R
 
G
C
 
K
S
 
F
I
 
A
L
 
A
L
 
N
V
 
L
F
 
F
F
 
F
E
 
E
N
 
P
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
T
 
F
S
 
S
F
 
F
E
 
E
L
 
V
A
 
A
G
 
E
K
 
K
I
 
K
L
 
L
G
 
G
A
 
M
D
 
N
T
 
V
I
 
L
N
 
N
I
 
L
S
 
D
A
 
G
S
 
T
S
 
S
S
 
T
S
 
S
V
 
V
K
 
Q
K
|
K
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
T
 
T
V
 
I
K
 
R
T
 
T
L
 
L
E
 
E
A
 
S
L
 
I
N
 
G
S
 
V
D
 
D
F
 
V
I
 
C
V
 
V
I
 
I
R
|
R
H
 
H
N
 
S
M
 
E
S
 
D
G
 
E
A
 
Y
A
 
Y
K
 
E
I
 
E
V
 
L
A
 
V
N
 
S
S
 
Q
V
 
V
K
 
N
S
 
I
H
 
P
V
 
I
V
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
C
N
 
G
E
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
A
 
S
L
 
L
L
 
L
D
 
D
G
 
L
F
 
M
T
 
T
I
 
I
L
 
Y
E
|
E
K
 
E
K
 
F
G
 
N
S
 
T
L
 
F
E
 
K
G
 
G
L
 
L
K
 
T
I
 
V
A
 
S
I
 
I
V
 
H
G
 
G
D
 
D
I
 
I
L
 
K
H
 
H
S
 
S
R
 
R
V
 
V
A
 
A
R
 
R
S
 
S
D
 
N
I
 
A
K
 
E
L
 
V
F
 
L
K
 
T
K
x
R
L
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
R
V
 
V
T
 
L
L
 
F
C
 
S
G
 
G
P
 
P
M
 
S
T
 
E
M
 
W
L
 
-
P
 
-
R
 
Q
H
 
D
Y
 
E
E
 
E
A
 
N
L
 
T
G
 
F
A
 
G
D
 
T
Y
 
Y
I
 
V
T
 
S
T
 
M
D
 
D
I
 
-
K
 
-
E
 
E
A
 
A
V
 
V
K
 
E
N
 
S
K
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
V
I
 
M
F
 
L
L
|
L
R
 
R
I
 
I
Q
 
Q
L
 
N
E
 
E
R
 
R
Q
 
H
D
 
Q
K
 
S
P
 
A
F
 
V
F
 
-
S
 
-
T
 
S
L
 
Q
R
 
E
E
 
G
Y
 
Y
S
 
L
I
 
N
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
N
 
T
Q
 
V
E
 
E
L
 
R
L
 
A
K
 
E
I
 
R
L
 
M
K
|
K
P
 
R
D
x
H
T
 
A
V
 
I
I
 
I
M
 
M
H
 
H
P
|
P
G
x
A
P
 
P
V
 
V
N
 
N
R
 
R
G
 
G
V
 
V
E
 
E
I
 
I
Q
 
D
S
 
D
E
 
S
L
 
L
V
 
V
Y
 
E
S
 
S
S
 
E
K
 
K
S
 
S
L
 
R
I
 
I
L
 
F
N
x
K
Q
 
Q
V
 
M
E
x
K
N
 
N
G
|
G
L
 
V
F
 
F
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
V
 
V
Y
 
I
K
 
Q
Y
 
R
L
 
A
L
 
L

3r7dA Crystal structure of unliganded aspartate transcarbamoylase from bacillus subtilis (see paper)
45% identity, 100% coverage: 1:300/301 of query aligns to 1:289/291 of 3r7dA

query
sites
3r7dA
M
 
M
K
 
K
D
 
H
L
 
L
Y
 
T
S
 
T
V
 
M
N
 
S
Q
 
E
L
 
L
E
x
S
K
x
T
E
 
E
D
 
E
I
 
I
Q
 
K
K
 
D
I
 
L
F
 
L
Q
 
Q
L
 
T
A
 
A
K
 
Q
E
 
E
Y
 
-
K
 
-
E
 
-
R
 
-
F
 
-
L
 
L
K
 
K
G
 
S
E
 
G
K
 
K
K
 
T
F
 
D
N
 
N
D
 
Q
L
 
L
R
 
T
R
 
G
C
 
K
S
 
F
I
 
A
L
 
A
L
 
N
V
 
L
F
 
F
F
 
F
E
 
E
N
 
P
S
 
S
T
 
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
T
 
F
S
 
S
F
 
F
E
 
E
L
 
V
A
 
A
G
 
E
K
 
K
I
 
K
L
 
L
G
 
G
A
 
M
D
 
N
T
 
V
I
 
L
N
 
N
I
 
L
S
 
D
A
 
G
S
 
T
S
 
S
S
x
T
S
|
S
V
 
V
K
 
Q
K
|
K
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
T
 
T
V
 
I
K
 
R
T
 
T
L
 
L
E
 
E
A
 
S
L
 
I
N
 
G
S
 
V
D
 
D
F
 
V
I
 
C
V
 
V
I
 
I
R
|
R
H
 
H
N
 
S
M
 
E
S
 
D
G
 
E
A
 
Y
A
 
Y
K
 
E
I
 
E
V
 
L
A
 
V
N
 
S
S
 
Q
V
 
V
K
 
N
S
 
I
H
 
P
V
 
I
V
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
C
N
 
G
E
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
A
 
S
L
 
L
L
 
L
D
 
D
G
 
L
F
 
M
T
 
T
I
 
I
L
 
Y
E
 
E
K
 
E
K
 
F
G
 
N
S
 
T
L
 
F
E
 
K
G
 
G
L
 
L
K
 
T
I
 
V
A
 
S
I
 
I
V
 
H
G
 
G
D
 
D
I
 
I
L
 
K
H
 
H
S
 
S
R
 
R
V
 
V
A
 
A
R
 
R
S
 
S
D
 
N
I
 
A
K
 
E
L
 
V
F
 
L
K
 
T
K
x
R
L
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
R
V
 
V
T
 
L
L
 
F
C
 
S
G
 
G
P
 
P
M
 
S
T
 
E
M
 
W
L
 
-
P
 
-
R
 
Q
H
 
D
Y
 
E
E
 
E
A
 
N
L
 
T
G
 
F
A
 
G
D
 
T
Y
 
Y
I
 
V
T
 
S
T
 
M
D
 
D
I
 
-
K
 
-
E
 
E
A
 
A
V
 
V
K
 
E
N
 
S
K
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
V
I
 
M
F
 
L
L
|
L
R
 
R
I
 
I
Q
 
Q
L
 
N
E
 
E
R
 
R
Q
 
H
D
 
Q
K
 
S
P
 
A
F
 
V
F
 
-
S
 
-
T
 
S
L
 
Q
R
 
E
E
 
G
Y
 
Y
S
 
L
I
 
N
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
N
 
T
Q
 
V
E
 
E
L
 
R
L
 
A
K
 
E
I
 
R
L
 
M
K
 
K
P
 
R
D
 
H
T
 
A
V
 
I
I
 
I
M
 
M
H
 
H
P
|
P
G
 
A
P
 
P
V
 
V
N
 
N
R
 
R
G
 
G
V
 
V
E
 
E
I
 
I
Q
 
D
S
 
D
E
 
S
L
 
L
V
 
V
Y
 
E
S
 
S
S
 
E
K
 
K
S
 
S
L
 
R
I
 
I
L
 
F
N
 
K
Q
 
Q
V
 
M
E
 
K
N
 
N
G
|
G
L
 
V
F
 
F
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
V
 
V
Y
 
I
K
 
Q
Y
 
R
L
 
A
L
 
L

3r7lA Crystal structure of pala-bound aspartate transcarbamoylase from bacillus subtilis (see paper)
45% identity, 100% coverage: 1:300/301 of query aligns to 1:289/290 of 3r7lA

query
sites
3r7lA
M
 
M
K
 
K
D
 
H
L
 
L
Y
 
T
S
 
T
V
 
M
N
 
S
Q
 
E
L
 
L
E
 
S
K
 
T
E
 
E
D
 
E
I
 
I
Q
 
K
K
 
D
I
 
L
F
 
L
Q
 
Q
L
 
T
A
 
A
K
 
Q
E
 
E
Y
 
-
K
 
-
E
 
-
R
 
-
F
 
-
L
 
L
K
 
K
G
 
S
E
 
G
K
 
K
K
 
T
F
 
D
N
 
N
D
 
Q
L
 
L
R
 
T
R
 
G
C
 
K
S
 
F
I
 
A
L
 
A
L
 
N
V
 
L
F
 
F
F
 
F
E
 
E
N
 
P
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
T
 
F
S
 
S
F
 
F
E
 
E
L
 
V
A
 
A
G
 
E
K
 
K
I
 
K
L
 
L
G
 
G
A
 
M
D
 
N
T
 
V
I
 
L
N
 
N
I
 
L
S
 
D
A
 
G
S
 
T
S
 
S
S
 
T
S
|
S
V
 
V
K
 
Q
K
|
K
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
T
 
T
V
 
I
K
 
R
T
 
T
L
 
L
E
 
E
A
 
S
L
 
I
N
 
G
S
 
V
D
 
D
F
 
V
I
 
C
V
 
V
I
 
I
R
|
R
H
 
H
N
 
S
M
 
E
S
 
D
G
 
E
A
 
Y
A
 
Y
K
 
E
I
 
E
V
 
L
A
 
V
N
 
S
S
 
Q
V
 
V
K
 
N
S
 
I
H
 
P
V
 
I
V
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
C
N
 
G
E
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
A
 
S
L
 
L
L
 
L
D
 
D
G
 
L
F
 
M
T
 
T
I
 
I
L
 
Y
E
 
E
K
 
E
K
 
F
G
 
N
S
 
T
L
 
F
E
 
K
G
 
G
L
 
L
K
 
T
I
 
V
A
 
S
I
 
I
V
 
H
G
 
G
D
 
D
I
 
I
L
 
K
H
 
H
S
 
S
R
|
R
V
 
V
A
 
A
R
 
R
S
 
S
D
 
N
I
 
A
K
 
E
L
 
V
F
 
L
K
 
T
K
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
R
V
 
V
T
 
L
L
 
F
C
 
S
G
 
G
P
 
P
M
 
S
T
 
E
M
 
W
L
 
-
P
 
-
R
 
Q
H
 
D
Y
 
E
E
 
E
A
 
N
L
 
T
G
 
F
A
 
G
D
 
T
Y
 
Y
I
 
V
T
 
S
T
 
M
D
 
D
I
 
-
K
 
-
E
 
E
A
 
A
V
 
V
K
 
E
N
 
S
K
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
V
I
 
M
F
 
L
L
|
L
R
|
R
I
 
I
Q
|
Q
L
 
N
E
 
E
R
 
R
Q
 
H
D
 
Q
K
 
S
P
 
A
F
 
V
F
 
-
S
 
-
T
 
S
L
 
Q
R
 
E
E
 
G
Y
 
Y
S
 
L
I
 
N
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
N
 
T
Q
 
V
E
 
E
L
 
R
L
 
A
K
 
E
I
 
R
L
 
M
K
 
K
P
 
R
D
 
H
T
 
A
V
 
I
I
 
I
M
 
M
H
 
H
P
|
P
G
x
A
P
 
P
V
 
V
N
 
N
R
 
R
G
 
G
V
 
V
E
 
E
I
 
I
Q
 
D
S
 
D
E
 
S
L
 
L
V
 
V
Y
 
E
S
 
S
S
 
E
K
 
K
S
 
S
L
 
R
I
 
I
L
 
F
N
 
K
Q
 
Q
V
 
M
E
 
K
N
 
N
G
|
G
L
 
V
F
 
F
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
V
 
V
Y
 
I
K
 
Q
Y
 
R
L
 
A
L
 
L

P05654 Aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit; Aspartate transcarbamylase; ATCase; EC 2.1.3.2 from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
45% identity, 100% coverage: 1:300/301 of query aligns to 1:289/304 of P05654

query
sites
P05654
M
 
M
K
 
K
D
 
H
L
 
L
Y
 
T
S
 
T
V
 
M
N
 
S
Q
 
E
L
 
L
E
 
S
K
 
T
E
 
E
D
 
E
I
 
I
Q
 
K
K
 
D
I
 
L
F
 
L
Q
 
Q
L
 
T
A
 
A
K
 
Q
E
 
E
Y
 
-
K
 
-
E
 
-
R
 
-
F
 
-
L
 
L
K
 
K
G
 
S
E
 
G
K
 
K
K
 
T
F
 
D
N
 
N
D
 
Q
L
 
L
R
 
T
R
 
G
C
 
K
S
 
F
I
 
A
L
 
A
L
 
N
V
 
L
F
 
F
F
 
F
E
 
E
N
 
P
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
R
 
R
T
 
F
S
 
S
F
 
F
E
 
E
L
 
V
A
 
A
G
 
E
K
 
K
I
 
K
L
 
L
G
 
G
A
 
M
D
 
N
T
 
V
I
 
L
N
 
N
I
 
L
S
 
D
A
 
G
S
 
T
S
 
S
S
 
T
S
 
S
V
 
V
K
 
Q
K
 
K
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
T
 
T
V
 
I
K
 
R
T
 
T
L
 
L
E
 
E
A
 
S
L
 
I
N
 
G
S
 
V
D
 
D
F
 
V
I
 
C
V
 
V
I
 
I
R
 
R
H
 
H
N
 
S
M
 
E
S
 
D
G
 
E
A
 
Y
A
 
Y
K
 
E
I
 
E
V
 
L
A
 
V
N
 
S
S
 
Q
V
 
V
K
 
N
S
 
I
H
 
P
V
 
I
V
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
C
N
 
G
E
 
Q
H
 
H
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
S
L
 
L
L
 
L
D
 
D
G
 
L
F
 
M
T
 
T
I
 
I
L
 
Y
E
 
E
K
 
E
K
 
F
G
 
N
S
 
T
L
 
F
E
 
K
G
 
G
L
 
L
K
 
T
I
 
V
A
 
S
I
 
I
V
 
H
G
 
G
D
 
D
I
 
I
L
 
K
H
 
H
S
 
S
R
 
R
V
 
V
A
 
A
R
 
R
S
 
S
D
 
N
I
 
A
K
 
E
L
 
V
F
 
L
K
 
T
K
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
R
V
 
V
T
 
L
L
 
F
C
 
S
G
 
G
P
 
P
M
 
S
T
 
E
M
 
W
L
 
-
P
 
-
R
 
Q
H
 
D
Y
 
E
E
 
E
A
 
N
L
 
T
G
 
F
A
 
G
D
 
T
Y
 
Y
I
 
V
T
 
S
T
 
M
D
 
D
I
 
-
K
 
-
E
 
E
A
 
A
V
 
V
K
 
E
N
 
S
K
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
V
I
 
M
F
 
L
L
 
L
R
 
R
I
 
I
Q
 
Q
L
 
N
E
 
E
R
 
R
Q
 
H
D
 
Q
K
 
S
P
 
A
F
 
V
F
 
-
S
 
-
T
 
S
L
 
Q
R
 
E
E
 
G
Y
 
Y
S
 
L
I
 
N
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
N
 
T
Q
 
V
E
 
E
L
 
R
L
 
A
K
 
E
I
 
R
L
 
M
K
 
K
P
 
R
D
 
H
T
 
A
V
 
I
I
 
I
M
 
M
H
 
H
P
 
P
G
 
A
P
 
P
V
 
V
N
 
N
R
 
R
G
 
G
V
 
V
E
 
E
I
 
I
Q
 
D
S
 
D
E
 
S
L
 
L
V
 
V
Y
 
E
S
 
S
S
 
E
K
 
K
S
 
S
L
 
R
I
 
I
L
 
F
N
 
K
Q
 
Q
V
 
M
E
 
K
N
 
N
G
 
G
L
 
V
F
 
F
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
V
 
V
Y
 
I
K
 
Q
Y
 
R
L
 
A
L
 
L

Sites not aligning to the query:

4bjhB Crystal structure of the aquifex reactor complex formed by dihydroorotase (h180a, h232a) with dihydroorotate and aspartate transcarbamoylase with n-(phosphonacetyl)-l-aspartate (pala) (see paper)
42% identity, 100% coverage: 1:301/301 of query aligns to 1:291/291 of 4bjhB

query
sites
4bjhB
M
 
M
K
 
R
D
 
S
L
 
L
Y
 
I
S
 
S
V
 
S
N
 
L
Q
 
D
L
 
L
E
 
T
K
 
R
E
 
E
D
 
E
I
 
V
Q
 
E
K
 
E
I
 
I
F
 
L
Q
 
K
L
 
Y
A
 
A
K
 
K
E
 
E
Y
 
F
K
 
K
E
 
E
R
 
-
F
 
-
L
 
-
K
 
-
G
 
G
E
 
K
K
 
E
K
 
-
F
 
-
N
 
-
D
 
E
L
 
T
R
 
I
R
 
K
C
 
A
S
 
S
I
 
A
L
 
V
L
 
L
V
 
F
F
 
F
F
 
S
E
 
E
N
 
P
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
T
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
E
L
 
K
A
 
A
G
 
A
K
 
R
I
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
I
D
 
E
T
 
T
I
 
Y
N
 
L
I
 
V
S
 
S
A
 
G
S
 
S
S
 
E
S
 
S
S
 
S
V
 
T
K
 
V
K
|
K
G
 
G
E
 
E
T
 
S
L
 
F
Y
 
F
D
 
D
T
 
T
V
 
L
K
 
K
T
 
T
L
 
F
E
 
E
A
 
G
L
 
L
N
 
G
S
 
F
D
 
D
F
 
Y
I
 
V
V
 
V
I
 
F
R
|
R
H
 
V
N
 
P
M
 
F
S
 
V
G
 
F
A
 
F
A
 
P
-
 
Y
K
 
K
I
 
E
V
 
I
A
 
V
N
 
K
S
 
S
V
 
L
K
 
N
S
 
L
H
 
R
V
 
L
V
 
V
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
T
N
 
H
E
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
S
Q
|
Q
A
 
G
L
 
L
L
 
I
D
 
D
G
 
F
F
 
F
T
 
T
I
 
I
L
 
K
E
 
E
K
 
H
K
 
F
G
 
G
S
 
E
L
 
V
E
 
K
G
 
D
L
 
L
K
 
R
I
 
V
A
 
L
I
 
Y
V
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
I
L
 
K
H
 
H
S
 
S
R
|
R
V
|
V
A
 
F
R
 
R
S
 
S
D
 
G
I
 
A
K
 
P
L
 
L
F
 
L
K
 
N
K
 
M
L
 
F
G
 
G
A
 
A
E
 
K
V
 
I
T
 
G
L
 
V
C
 
C
G
 
G
P
 
P
M
 
K
T
 
T
M
 
L
L
 
I
P
 
P
R
 
R
H
 
D
Y
 
V
E
 
E
A
 
V
L
 
F
G
 
K
A
 
V
D
 
D
Y
 
-
I
 
V
T
 
F
T
 
D
D
 
D
I
 
V
K
 
D
E
 
K
A
 
G
V
 
I
K
 
D
N
 
W
K
 
A
D
 
D
V
 
V
V
 
V
I
 
I
F
 
W
L
 
L
R
|
R
I
 
L
Q
|
Q
L
 
K
E
 
E
R
 
R
Q
 
Q
D
 
K
K
 
E
P
 
N
F
 
Y
F
 
I
S
 
P
T
 
S
L
 
E
R
 
S
E
 
S
Y
 
Y
S
 
F
I
 
K
K
 
Q
Y
 
F
G
 
G
L
 
L
N
 
T
Q
 
K
E
 
E
L
 
R
L
 
F
K
 
E
I
 
K
L
 
V
K
 
K
P
 
-
D
 
-
T
 
-
V
 
L
I
 
Y
M
 
M
H
 
H
P
 
P
G
|
G
P
 
P
V
 
V
N
 
N
R
 
R
G
 
N
V
 
V
E
 
D
I
 
I
Q
 
D
S
 
H
E
 
E
L
 
L
V
 
V
Y
 
Y
S
 
T
S
 
E
K
 
K
S
 
S
L
 
L
I
 
I
L
 
Q
N
 
E
Q
 
Q
V
 
V
E
 
K
N
 
N
G
 
G
L
 
I
F
 
P
I
 
V
R
 
R
M
 
K
A
 
A
V
 
I
Y
 
Y
K
 
K
Y
 
F
L
 
L
L
 
W
S
 
T

3d6nB Crystal structure of aquifex dihydroorotase activated by aspartate transcarbamoylase (see paper)
42% identity, 100% coverage: 1:301/301 of query aligns to 1:291/291 of 3d6nB

query
sites
3d6nB
M
 
M
K
 
R
D
 
S
L
 
L
Y
 
I
S
 
S
V
 
S
N
 
L
Q
 
D
L
 
L
E
 
T
K
 
R
E
 
E
D
 
E
I
 
V
Q
 
E
K
 
E
I
 
I
F
 
L
Q
 
K
L
 
Y
A
 
A
K
 
K
E
 
E
Y
 
F
K
 
K
E
 
E
R
 
-
F
 
-
L
 
-
K
 
-
G
 
G
E
 
K
K
 
E
K
 
-
F
 
-
N
 
-
D
 
E
L
 
T
R
 
I
R
 
K
C
 
A
S
 
S
I
 
A
L
 
V
L
 
L
V
 
F
F
 
F
F
 
S
E
 
E
N
 
P
S
 
S
T
 
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
T
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
E
L
 
K
A
 
A
G
 
A
K
 
R
I
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
I
D
 
E
T
 
T
I
 
Y
N
 
L
I
 
V
S
 
S
A
 
G
S
 
S
S
 
E
S
 
S
S
 
S
V
 
T
K
 
V
K
|
K
G
 
G
E
 
E
T
 
S
L
 
F
Y
 
F
D
 
D
T
 
T
V
 
L
K
 
K
T
 
T
L
 
F
E
 
E
A
 
G
L
 
L
N
 
G
S
 
F
D
 
D
F
 
Y
I
 
V
V
 
V
I
 
F
R
|
R
H
 
V
N
 
P
M
 
F
S
 
V
G
 
F
A
 
F
A
 
P
-
 
Y
K
 
K
I
 
E
V
 
I
A
 
V
N
 
K
S
 
S
V
 
L
K
 
N
S
 
L
H
 
R
V
 
L
V
 
V
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
T
N
 
H
E
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
S
Q
|
Q
A
 
G
L
 
L
L
 
I
D
 
D
G
 
F
F
 
F
T
 
T
I
 
I
L
 
K
E
 
E
K
 
H
K
 
F
G
 
G
S
 
E
L
 
V
E
 
K
G
 
D
L
 
L
K
 
R
I
 
V
A
 
L
I
 
Y
V
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
I
L
 
K
H
 
H
S
 
S
R
|
R
V
|
V
A
 
F
R
 
R
S
 
S
D
 
G
I
 
A
K
 
P
L
 
L
F
 
L
K
 
N
K
 
M
L
 
F
G
 
G
A
 
A
E
 
K
V
 
I
T
 
G
L
 
V
C
 
C
G
 
G
P
 
P
M
 
K
T
 
T
M
 
L
L
 
I
P
 
P
R
 
R
H
 
D
Y
 
V
E
 
E
A
 
V
L
 
F
G
 
K
A
 
V
D
 
D
Y
 
-
I
 
V
T
 
F
T
 
D
D
 
D
I
 
V
K
 
D
E
 
K
A
 
G
V
 
I
K
 
D
N
 
W
K
 
A
D
 
D
V
 
V
V
 
V
I
 
I
F
 
W
L
 
L
R
|
R
I
 
L
Q
 
Q
L
 
K
E
 
E
R
 
R
Q
 
Q
D
 
K
K
 
E
P
 
N
F
 
Y
F
 
I
S
 
P
T
 
S
L
 
E
R
 
S
E
 
S
Y
 
Y
S
 
F
I
 
K
K
 
Q
Y
 
F
G
 
G
L
 
L
N
 
T
Q
 
K
E
 
E
L
 
R
L
 
F
K
 
E
I
 
K
L
 
V
K
 
K
P
 
-
D
 
-
T
 
-
V
 
L
I
 
Y
M
 
M
H
 
H
P
 
P
G
|
G
P
 
P
V
 
V
N
 
N
R
 
R
G
 
N
V
 
V
E
 
D
I
 
I
Q
 
D
S
 
H
E
 
E
L
 
L
V
 
V
Y
 
Y
S
 
T
S
 
E
K
 
K
S
 
S
L
 
L
I
 
I
L
 
Q
N
 
E
Q
 
Q
V
 
V
E
 
K
N
 
N
G
 
G
L
 
I
F
 
P
I
 
V
R
 
R
M
 
K
A
 
A
V
 
I
Y
 
Y
K
 
K
Y
 
F
L
 
L
L
 
W
S
 
T

8bplA Aspartate transcarbamoylase mutant (n2045c, r2238c) from chaetomium thermophilum cad-like bound to carbamoyl phosphate (see paper)
36% identity, 98% coverage: 6:301/301 of query aligns to 20:316/316 of 8bplA

query
sites
8bplA
S
 
S
V
 
V
N
 
T
Q
 
Q
L
 
F
E
 
T
K
 
R
E
 
A
D
 
D
I
 
L
Q
 
H
K
 
L
I
 
L
F
 
F
Q
 
Q
L
 
I
A
 
A
K
 
Q
E
 
E
Y
 
M
K
 
R
E
 
-
R
 
L
F
 
G
L
 
V
K
 
Q
G
 
R
E
 
E
K
 
G
K
 
V
F
 
L
N
 
D
D
 
I
L
 
L
R
 
R
R
 
G
C
 
K
S
 
V
I
 
L
L
 
C
L
 
T
V
 
L
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
N
 
P
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
S
T
 
A
S
 
S
F
 
F
E
 
D
L
 
A
A
 
A
G
 
M
K
 
Q
I
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
G
D
 
R
T
 
T
I
 
I
N
 
P
I
 
I
S
 
Q
A
 
T
S
 
S
S
 
T
S
 
S
S
 
S
V
 
V
K
 
Q
K
 
K
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
Y
 
Q
D
 
D
T
 
T
V
 
L
K
 
R
T
 
T
L
 
L
E
 
-
A
 
A
L
 
C
N
 
Y
S
 
S
D
 
D
F
 
A
I
 
I
V
 
V
I
 
L
R
|
R
H
 
H
N
 
P
M
 
D
S
 
E
G
 
K
A
 
C
A
 
V
K
 
D
I
 
V
V
 
A
A
 
K
N
 
K
S
 
Y
V
 
C
K
 
P
S
 
V
H
 
P
V
 
V
V
 
I
N
 
N
A
 
G
G
 
G
D
 
N
G
 
G
T
 
S
N
 
K
E
 
E
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
A
 
A
L
 
F
L
 
L
D
 
D
G
 
L
F
 
F
T
 
T
I
 
I
L
 
R
E
 
E
K
 
E
K
 
L
G
 
G
S
 
T
L
 
M
E
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
T
I
 
I
A
 
T
I
 
F
V
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
L
L
 
L
H
 
Y
S
 
G
R
 
R
V
 
P
A
 
V
R
 
H
S
 
S
D
 
L
I
 
V
K
 
Y
L
 
L
F
 
L
K
 
R
K
 
H
L
 
Y
G
 
Q
A
 
V
E
 
K
V
 
V
T
 
Q
L
 
L
C
 
V
G
 
S
P
 
P
M
 
K
T
 
A
M
 
L
-
 
R
L
 
L
P
 
P
R
 
P
-
 
A
-
 
V
H
 
R
Y
 
Q
E
 
Q
A
 
L
L
 
V
G
 
D
A
 
A
D
 
G
Y
 
Q
I
 
L
T
 
L
T
 
C
D
 
E
-
 
S
-
 
E
-
 
A
-
 
L
I
 
T
K
 
P
E
 
E
A
 
I
V
 
L
K
 
G
N
 
R
K
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
L
I
 
Y
F
 
C
L
 
T
R
 
R
I
 
V
Q
 
Q
L
 
K
E
 
E
R
 
R
Q
 
-
D
 
-
K
 
-
P
 
-
F
 
-
F
 
F
S
 
P
T
 
S
L
 
L
R
 
A
E
 
E
Y
 
F
S
 
E
I
 
A
-
 
V
-
 
K
-
 
D
K
 
S
Y
 
Y
G
 
R
L
 
I
N
 
D
Q
 
Y
E
 
S
L
 
T
L
 
L
K
 
K
I
 
Y
L
 
A
K
 
K
P
 
P
D
 
T
T
 
T
V
 
V
I
 
V
M
 
M
H
 
H
P
 
P
G
x
L
P
 
P
V
 
R
N
 
N
R
 
E
G
 
-
V
 
-
E
 
E
I
 
V
Q
 
A
S
 
E
E
 
E
L
 
V
V
 
D
Y
 
F
S
 
D
S
 
Q
K
 
R
S
 
A
L
 
A
I
 
Y
L
 
F
N
 
R
Q
 
Q
V
 
M
E
 
C
N
 
Y
G
 
G
L
 
L
F
 
Y
I
 
C
R
 
R
M
 
M
A
 
A
V
 
L
Y
 
L
K
 
A
Y
 
L
L
 
V
L
 
M
S
 
S

5g1nE Aspartate transcarbamoylase domain of human cad bound to pala (see paper)
34% identity, 99% coverage: 2:300/301 of query aligns to 6:304/307 of 5g1nE

query
sites
5g1nE
K
 
Q
D
 
H
L
 
I
Y
 
L
S
 
S
V
 
V
N
 
Q
Q
 
Q
L
 
F
E
 
T
K
 
K
E
 
D
D
 
Q
I
 
M
Q
 
S
K
 
H
I
 
L
F
 
F
Q
 
N
L
 
V
A
 
A
K
 
H
E
 
T
Y
 
L
K
 
R
E
 
-
R
 
M
F
 
M
L
 
V
K
 
Q
G
 
K
E
 
E
K
 
R
K
 
S
F
 
L
N
 
D
D
 
I
L
 
L
R
 
K
R
 
G
C
 
K
S
 
V
I
 
M
L
 
A
L
 
S
V
 
M
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
N
 
V
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
S
T
 
S
S
 
S
F
 
F
E
 
A
L
 
A
A
 
A
G
 
M
K
 
A
I
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
G
D
 
A
T
 
V
I
 
L
N
 
S
I
 
F
S
 
S
A
 
E
S
 
A
S
 
T
S
 
S
S
|
S
V
 
V
K
 
Q
K
|
K
G
 
G
E
 
E
T
 
S
L
 
L
Y
 
A
D
 
D
T
 
S
V
 
V
K
 
Q
T
 
T
L
 
M
E
 
S
A
 
C
L
 
Y
N
 
-
S
 
A
D
 
D
F
 
V
I
 
V
V
 
V
I
 
L
R
|
R
H
 
H
N
 
P
M
 
Q
S
 
P
G
 
G
A
 
A
A
 
V
K
 
E
I
 
L
V
 
A
A
 
A
N
 
K
S
 
H
V
 
C
K
 
R
S
 
R
H
 
P
V
 
V
V
 
I
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
V
N
 
G
E
 
E
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
G
 
I
F
 
F
T
 
T
I
 
I
L
 
R
E
 
E
K
 
E
K
 
L
G
 
G
S
 
T
L
 
V
E
 
N
G
 
G
L
 
M
K
 
T
I
 
I
A
 
T
I
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
L
L
 
K
H
 
H
S
 
G
R
|
R
V
 
T
A
 
V
R
 
H
S
 
S
D
 
L
I
 
A
K
 
C
L
 
L
F
 
L
K
 
T
K
 
Q
L
 
Y
G
 
R
A
 
V
E
 
S
V
 
L
T
 
R
L
 
Y
C
 
V
G
 
A
P
 
P
M
 
P
T
 
S
M
 
L
-
 
R
L
 
M
P
 
P
R
 
P
H
 
T
Y
 
V
E
 
R
A
 
A
L
 
F
G
 
V
A
 
A
D
 
S
Y
 
R
I
 
G
T
 
T
-
 
K
-
 
Q
-
 
E
-
 
E
-
 
F
T
 
E
D
 
S
I
 
I
K
 
E
E
 
E
A
 
A
V
 
L
K
 
P
N
 
D
K
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
L
I
 
Y
F
 
M
L
x
T
R
|
R
I
 
I
Q
|
Q
L
 
K
E
 
E
R
 
R
Q
 
-
D
 
-
K
 
-
P
 
-
F
 
-
F
 
F
S
 
G
T
 
S
L
 
T
R
 
Q
E
 
E
Y
 
Y
S
 
E
I
 
A
K
 
C
Y
 
F
G
 
G
-
 
Q
-
 
F
-
 
I
L
 
L
N
 
T
Q
 
P
E
 
H
L
 
I
L
 
M
K
 
T
I
 
R
L
 
A
K
 
K
P
 
K
D
 
K
T
 
M
V
 
V
I
 
V
M
 
M
H
 
H
P
|
P
G
x
M
P
 
P
V
 
-
N
 
-
R
 
R
G
 
V
V
 
N
E
 
E
I
 
I
Q
 
S
S
 
V
E
 
E
L
 
V
V
 
D
Y
 
S
S
 
D
S
 
P
K
 
R
S
 
A
L
 
A
I
 
Y
L
 
F
N
 
R
Q
 
Q
V
 
A
E
 
E
N
 
N
G
|
G
L
 
M
F
 
Y
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
V
 
L
Y
 
L
K
 
A
Y
 
T
L
 
V
L
 
L

1ml4A The pala-liganded aspartate transcarbamoylase catalytic subunit from pyrococcus abyssi (see paper)
39% identity, 100% coverage: 2:301/301 of query aligns to 5:305/307 of 1ml4A

query
sites
1ml4A
K
 
R
D
 
D
L
 
V
Y
 
I
S
 
S
V
 
I
N
 
R
Q
 
D
L
 
F
E
 
S
K
 
K
E
 
E
D
 
D
I
 
I
Q
 
E
K
 
T
I
 
V
F
 
L
Q
 
A
L
 
T
A
 
A
K
 
-
E
 
E
Y
 
R
K
 
L
E
 
E
R
 
R
F
 
E
L
 
L
K
 
K
G
 
E
E
 
K
K
 
G
K
 
Q
F
 
L
N
 
E
D
 
Y
L
 
A
R
 
K
R
 
G
C
 
K
S
 
I
I
 
L
L
 
A
L
 
T
V
 
L
F
 
F
F
 
F
E
 
E
N
 
P
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
T
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
E
L
 
S
A
 
A
G
 
M
K
 
H
I
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
G
D
 
A
T
 
V
I
 
I
N
 
G
I
 
F
S
 
A
-
 
E
A
 
A
S
 
S
S
 
T
S
 
S
S
 
S
V
 
V
K
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
T
 
S
L
 
L
Y
 
R
D
 
D
T
 
T
V
 
I
K
 
K
T
 
T
L
 
V
E
 
E
A
 
Q
L
 
Y
N
 
-
S
 
C
D
 
D
F
 
V
I
 
I
V
 
V
I
 
I
R
|
R
H
 
H
N
 
P
M
 
K
S
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
K
 
R
I
 
L
V
 
A
A
 
A
N
 
E
S
 
V
V
 
A
K
 
E
S
 
V
H
 
P
V
 
V
V
 
I
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
S
N
 
N
E
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
A
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
G
 
L
F
 
Y
T
 
T
I
 
I
L
 
K
E
 
K
K
 
E
K
 
F
G
 
G
S
 
R
L
 
I
E
 
D
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
 
I
A
 
G
I
 
L
V
 
L
G
 
G
D
 
D
I
 
L
L
 
K
H
 
Y
S
 
G
R
|
R
V
x
T
A
 
V
R
 
H
S
 
S
D
 
L
I
 
A
K
 
E
L
 
A
F
 
L
K
 
T
K
 
F
L
 
Y
G
 
D
A
 
V
E
 
E
V
 
L
T
 
Y
L
 
L
C
 
I
G
 
S
P
 
P
-
 
E
M
 
L
T
 
L
M
 
R
L
 
M
P
 
P
R
 
R
H
 
H
-
 
I
Y
 
V
E
 
E
A
 
E
L
 
L
-
 
R
-
 
E
-
 
K
G
 
G
A
 
M
D
 
K
Y
 
V
I
 
V
-
 
E
T
 
T
T
 
T
D
 
T
I
 
L
K
 
E
E
 
D
A
 
V
V
 
I
K
 
G
N
 
K
K
 
L
D
 
D
V
 
V
V
 
L
I
 
Y
F
 
V
L
x
T
R
|
R
I
 
I
Q
 
Q
L
 
K
E
 
E
R
 
R
Q
 
-
D
 
-
K
 
-
P
 
-
F
 
-
F
 
F
S
 
P
T
 
D
L
 
E
R
 
Q
E
 
E
Y
 
Y
-
 
L
S
 
K
I
 
V
K
 
K
-
 
G
-
 
S
Y
 
Y
G
 
Q
L
 
V
N
 
N
Q
 
L
E
 
K
L
 
V
L
 
L
K
 
E
I
 
K
L
 
A
K
 
K
P
 
D
D
 
E
T
 
L
V
 
R
I
 
I
M
 
M
H
 
H
P
|
P
G
x
L
P
 
P
V
 
-
N
 
-
R
 
R
G
 
V
V
 
D
E
 
E
I
 
I
Q
 
H
S
 
P
E
 
E
L
 
V
V
 
D
Y
 
N
S
 
T
S
 
K
K
 
H
S
 
A
L
 
I
I
 
Y
L
 
F
N
 
R
Q
 
Q
V
 
V
E
 
F
N
 
N
G
|
G
L
 
V
F
 
P
I
 
V
R
 
R
M
 
M
A
 
A
V
 
L
Y
 
L
K
 
A
Y
 
L
L
 
V
L
 
L
S
 
G

P27708 Multifunctional protein CAD; Carbamoyl phosphate synthetase 2-aspartate transcarbamylase-dihydroorotase; EC 6.3.5.5; EC 3.5.1.2; EC 6.3.4.16; EC 2.1.3.2; EC 3.5.2.3 from Homo sapiens (Human) (see 7 papers)
34% identity, 99% coverage: 2:300/301 of query aligns to 1924:2222/2225 of P27708

query
sites
P27708
K
x
Q
D
x
H
L
x
I
Y
x
L
S
|
S
V
|
V
N
x
Q
Q
|
Q
L
x
F
E
x
T
K
|
K
E
x
D
D
x
Q
I
x
M
Q
x
S
K
x
H
I
x
L
F
|
F
Q
x
N
L
x
V
A
|
A
K
x
H
E
x
T
Y
x
L
K
x
R
E
 
-
R
x
M
F
x
M
L
x
V
K
x
Q
G
x
K
E
|
E
K
x
R
K
x
S
F
x
L
N
x
D
D
x
I
L
|
L
R
x
K
R
x
G
C
x
K
S
x
V
I
x
M
L
x
A
L
x
S
V
x
M
F
|
F
F
x
Y
E
|
E
N
x
V
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
x
S
T
x
S
S
|
S
F
|
F
E
x
A
L
x
A
A
|
A
G
x
M
K
x
A
I
x
R
L
|
L
G
|
G
A
x
G
D
x
A
T
x
V
I
x
L
N
x
S
I
x
F
S
|
S
A
x
E
S
x
A
S
x
T
S
|
S
S
|
S
V
|
V
K
x
Q
K
|
K
G
|
G
E
|
E
T
x
S
L
|
L
Y
x
A
D
|
D
T
x
S
V
|
V
K
x
Q
T
|
T
L
x
M
E
x
S
A
x
C
L
x
Y
N
 
-
S
x
A
D
|
D
F
x
V
I
x
V
V
|
V
I
x
L
R
|
R
H
|
H
N
x
P
M
x
Q
S
x
P
G
|
G
A
|
A
A
x
V
K
x
E
I
x
L
V
x
A
A
|
A
N
x
K
S
x
H
V
x
C
K
x
R
S
x
R
H
x
P
V
|
V
V
x
I
N
|
N
A
|
A
G
|
G
D
|
D
G
|
G
T
x
V
N
x
G
E
|
E
H
|
H
P
|
P
T
|
T
Q
|
Q
A
|
A
L
|
L
L
|
L
D
|
D
G
x
I
F
|
F
T
|
T
I
|
I
L
x
R
E
|
E
K
x
E
K
x
L
G
|
G
S
x
T
L
x
V
E
x
N
G
|
G
L
x
M
K
x
T
I
|
I
A
x
T
I
x
M
V
|
V
G
|
G
D
|
D
I
x
L
L
x
K
H
|
H
S
x
G
R
|
R
V
x
T
A
x
V
R
x
H
S
|
S
D
x
L
I
x
A
K
x
C
L
|
L
F
x
L
K
x
T
K
x
Q
L
x
Y
G
x
R
A
x
V
E
x
S
V
x
L
T
x
R
L
x
Y
C
x
V
G
x
A
P
|
P
M
x
P
T
x
S
M
x
L
-
x
R
L
x
M
P
|
P
R
x
P
H
x
T
Y
x
V
E
x
R
A
|
A
L
x
F
G
x
V
A
|
A
D
x
S
Y
x
R
I
x
G
T
|
T
T
x
K
-
x
Q
-
x
E
-
x
E
-
x
F
-
x
E
D
x
S
I
|
I
K
x
E
E
|
E
A
|
A
V
x
L
K
x
P
N
x
D
K
x
T
D
|
D
V
|
V
V
x
L
I
x
Y
F
x
M
L
x
T
R
|
R
I
|
I
Q
|
Q
L
x
K
E
|
E
R
|
R
Q
 
-
D
 
-
K
 
-
P
 
-
F
 
-
F
|
F
S
x
G
T
x
S
L
x
T
R
x
Q
E
|
E
Y
|
Y
S
x
E
I
x
A
K
x
C
Y
x
F
G
|
G
-
x
Q
-
x
F
-
x
I
L
|
L
N
x
T
Q
x
P
E
x
H
L
x
I
L
x
M
K
x
T
I
x
R
L
x
A
K
|
K
P
x
K
D
x
K
T
x
M
V
|
V
I
x
V
M
|
M
H
|
H
P
|
P
G
x
M
P
|
P
V
 
-
N
 
-
R
|
R
G
x
V
V
x
N
E
|
E
I
|
I
Q
x
S
S
x
V
E
|
E
L
x
V
V
x
D
Y
x
S
S
x
D
S
x
P
K
x
R
S
x
A
L
x
A
I
x
Y
L
x
F
N
x
R
Q
|
Q
V
x
A
E
|
E
N
|
N
G
|
G
L
x
M
F
x
Y
I
|
I
R
|
R
M
|
M
A
|
A
V
x
L
Y
x
L
K
x
A
Y
x
T
L
x
V
L
|
L

Sites not aligning to the query:

P08955 Multifunctional protein CAD; Carbamoyl phosphate synthetase 2-aspartate transcarbamylase-dihydroorotase; EC 6.3.5.5; EC 3.5.1.2; EC 6.3.4.16; EC 2.1.3.2; EC 3.5.2.3 from Mesocricetus auratus (Golden hamster) (see paper)
33% identity, 99% coverage: 2:300/301 of query aligns to 1924:2222/2225 of P08955

query
sites
P08955
K
 
Q
D
 
H
L
 
I
Y
 
L
S
 
S
V
 
V
N
 
K
Q
 
Q
L
 
F
E
 
T
K
 
K
E
 
D
D
 
Q
I
 
M
Q
 
S
K
 
H
I
 
L
F
 
F
Q
 
N
L
 
V
A
 
A
K
 
H
E
 
T
Y
 
L
K
 
R
E
 
-
R
 
M
F
 
M
L
 
V
K
 
Q
G
 
K
E
 
E
K
 
R
K
 
S
F
 
L
N
 
D
D
 
I
L
 
L
R
 
K
R
 
G
C
 
K
S
 
V
I
 
M
L
 
A
L
 
S
V
 
M
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
N
 
V
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
R
 
S
T
 
S
S
 
S
F
 
F
E
 
A
L
 
A
A
 
A
G
 
M
K
 
A
I
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
G
D
 
A
T
 
V
I
 
L
N
 
S
I
 
F
S
 
S
A
 
E
S
 
A
S
 
T
S
 
S
S
 
S
V
 
V
K
 
Q
K
 
K
G
 
G
E
 
E
T
 
S
L
 
L
Y
 
A
D
 
D
T
 
S
V
 
V
K
 
Q
T
 
T
L
 
M
E
 
S
A
 
C
L
 
Y
N
 
-
S
 
A
D
 
D
F
 
V
I
 
V
V
 
V
I
 
L
R
 
R
H
 
H
N
 
P
M
 
Q
S
 
P
G
 
G
A
 
A
A
 
V
K
 
E
I
 
L
V
 
A
A
 
A
N
 
K
S
 
H
V
 
C
K
 
R
S
 
R
H
 
P
V
 
V
V
 
I
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
V
N
 
G
E
 
E
H
 
H
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
G
 
I
F
 
F
T
 
T
I
 
I
L
 
R
E
 
E
K
 
E
K
 
L
G
 
G
S
 
T
L
 
V
E
 
N
G
 
G
L
 
M
K
 
T
I
 
I
A
 
T
I
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
L
L
 
K
H
 
H
S
 
G
R
 
R
V
 
T
A
 
V
R
 
H
S
 
S
D
 
L
I
 
A
K
 
C
L
 
L
F
 
L
K
 
T
K
 
Q
L
 
Y
G
 
R
A
 
V
E
 
S
V
 
L
T
 
R
L
 
Y
C
 
V
G
 
A
P
 
P
-
 
P
-
 
S
M
 
L
T
 
R
M
 
M
L
 
P
P
 
P
R
 
S
H
 
V
Y
 
W
E
 
D
A
 
F
L
 
V
G
 
A
A
 
S
D
 
R
Y
 
G
I
 
T
T
 
K
T
 
Q
D
 
E
-
 
E
-
 
F
-
 
E
-
 
S
I
 
I
K
 
E
E
 
E
A
 
A
V
 
L
K
 
P
N
 
D
K
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
L
I
 
Y
F
 
M
L
 
T
R
 
R
I
 
I
Q
 
Q
L
 
K
E
 
E
R
 
R
Q
 
-
D
 
-
K
 
-
P
 
-
F
 
-
F
 
F
S
 
G
T
 
S
L
 
T
R
 
Q
E
 
E
Y
 
Y
S
 
E
I
 
A
K
 
C
Y
 
F
G
 
G
-
 
Q
-
 
F
-
 
I
L
 
L
N
 
T
Q
 
P
E
 
H
L
 
I
L
 
M
K
 
T
I
 
R
L
 
A
K
 
K
P
 
K
D
 
K
T
 
M
V
 
V
I
 
V
M
 
M
H
 
H
P
 
P
G
 
M
P
 
P
V
 
-
N
 
-
R
 
R
G
 
V
V
 
N
E
 
E
I
 
I
Q
 
S
S
 
V
E
 
E
L
 
V
V
 
D
Y
 
S
S
 
D
S
 
P
K
 
R
S
 
A
L
 
A
I
 
Y
L
 
F
N
 
R
Q
 
Q
V
 
A
E
 
E
N
 
N
G
 
G
L
 
M
F
 
Y
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
V
 
L
Y
 
L
K
 
A
Y
 
T
L
 
V
L
 
L

Sites not aligning to the query:

5g1pA Aspartate transcarbamoylase domain of human cad bound to carbamoyl phosphate (see paper)
33% identity, 99% coverage: 2:300/301 of query aligns to 3:289/292 of 5g1pA

query
sites
5g1pA
K
 
Q
D
 
H
L
 
I
Y
 
L
S
 
S
V
 
V
N
 
Q
Q
 
Q
L
 
F
E
 
T
K
 
K
E
 
D
D
 
Q
I
 
M
Q
 
S
K
 
H
I
 
L
F
 
F
Q
 
N
L
 
V
A
 
A
K
 
H
E
 
T
Y
 
L
K
 
R
E
 
-
R
 
M
F
 
M
L
 
V
K
 
Q
G
 
K
E
 
E
K
 
R
K
 
S
F
 
L
N
 
D
D
 
I
L
 
L
R
 
K
R
 
G
C
 
K
S
 
V
I
 
M
L
 
A
L
 
S
V
 
M
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
N
 
V
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
S
T
 
S
S
 
S
F
 
F
E
 
A
L
 
A
A
 
A
G
 
M
K
 
A
I
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
G
D
 
A
T
 
V
I
 
L
N
 
S
I
 
F
S
 
S
A
 
E
S
 
A
S
 
T
S
 
S
S
 
S
V
 
V
K
 
Q
K
|
K
G
 
G
E
 
E
T
 
S
L
 
L
Y
 
A
D
 
D
T
 
S
V
 
V
K
 
Q
T
 
T
L
 
M
E
 
S
A
 
C
L
 
Y
N
 
-
S
 
A
D
 
D
F
 
V
I
 
V
V
 
V
I
 
L
R
|
R
H
 
H
N
 
P
M
 
Q
S
 
P
G
 
G
A
 
A
A
 
V
K
 
E
I
 
L
V
 
A
A
 
A
N
 
K
S
 
H
V
 
C
K
 
R
S
 
R
H
 
P
V
 
V
V
 
I
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
V
N
 
G
E
 
E
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
G
 
I
F
 
F
T
 
T
I
 
I
L
 
R
E
 
E
K
 
E
K
 
L
G
 
G
S
 
T
L
 
V
E
 
N
G
 
G
L
 
M
K
 
T
I
 
I
A
 
T
I
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
L
L
 
K
H
 
H
S
 
G
R
 
R
V
 
T
A
 
V
R
 
H
S
 
S
D
 
L
I
 
A
K
 
C
L
 
L
F
 
L
K
 
T
K
 
Q
L
 
Y
G
 
R
A
 
V
E
 
S
V
 
L
T
 
R
L
 
Y
C
 
V
G
 
A
P
 
P
M
 
P
T
 
S
M
 
L
-
 
R
L
 
M
P
 
P
R
 
P
H
 
T
Y
 
V
E
 
R
A
 
A
L
 
F
G
 
V
A
 
A
D
 
S
Y
 
G
I
 
T
T
 
K
T
 
Q
D
 
E
-
 
E
-
 
F
-
 
E
-
 
S
I
 
I
K
 
E
E
 
E
A
 
A
V
 
L
K
 
P
N
 
D
K
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
L
I
 
Y
F
 
M
L
x
T
R
 
R
I
 
I
Q
 
Q
L
 
K
E
 
E
R
 
R
Q
 
-
D
 
-
K
 
-
P
 
-
F
 
-
F
 
-
S
 
-
T
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
-
Y
 
-
S
 
-
I
 
F
K
 
Q
Y
 
F
G
 
I
L
 
L
N
 
T
Q
 
P
E
 
H
L
 
I
L
 
M
K
 
T
I
 
R
L
 
A
K
 
K
P
 
K
D
 
K
T
 
M
V
 
V
I
 
V
M
 
M
H
 
H
P
|
P
G
x
M
P
 
P
V
 
-
N
 
-
R
 
R
G
 
V
V
 
N
E
 
E
I
 
I
Q
 
S
S
 
V
E
 
E
L
 
V
V
 
D
Y
 
S
S
 
D
S
 
P
K
 
R
S
 
A
L
 
A
I
 
Y
L
 
F
N
 
R
Q
 
Q
V
 
A
E
 
E
N
 
N
G
|
G
L
 
M
F
 
Y
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
V
 
L
Y
 
L
K
 
A
Y
 
T
L
 
V
L
 
L

P49077 Aspartate carbamoyltransferase, chloroplastic; Aspartate transcarbamylase; ATCase; EC 2.1.3.2 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
37% identity, 100% coverage: 1:300/301 of query aligns to 84:387/390 of P49077

query
sites
P49077
M
 
L
K
 
S
D
 
D
L
 
V
Y
 
I
S
 
E
V
 
G
N
 
K
Q
 
Q
L
 
F
E
 
D
K
 
R
E
 
E
D
 
M
I
 
L
Q
 
S
K
 
A
I
 
I
F
 
F
Q
 
D
L
 
V
A
 
A
K
 
R
E
 
E
Y
 
M
K
 
-
E
 
E
R
 
K
F
 
I
L
 
E
K
 
K
G
 
S
E
 
S
K
 
S
K
 
Q
F
 
S
N
 
E
D
 
I
L
 
L
R
 
K
R
 
G
C
 
Y
S
 
L
I
 
M
L
 
A
L
 
T
V
 
L
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
N
 
P
S
 
S
T
 
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
T
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
E
L
 
S
A
 
A
G
 
M
K
 
K
I
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
G
D
 
E
T
 
V
I
 
L
N
 
T
I
 
T
S
 
E
A
 
N
S
 
A
S
 
R
-
 
E
-
 
F
S
 
S
S
 
S
V
 
A
K
 
A
K
 
K
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
Y
 
E
D
 
D
T
 
T
V
 
I
K
 
R
T
 
T
L
 
V
E
 
E
A
 
G
L
 
Y
N
 
-
S
 
S
D
 
D
F
 
I
I
 
I
V
 
V
I
 
M
R
|
R
H
 
H
N
 
F
M
 
E
S
 
S
G
 
G
A
 
A
A
 
A
K
 
R
I
 
K
V
 
A
A
 
A
N
 
A
S
 
T
V
 
A
K
 
N
S
 
I
H
 
P
V
 
V
V
 
I
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
P
N
 
G
E
 
E
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
G
 
V
F
 
Y
T
 
T
I
 
I
L
 
Q
E
 
S
K
 
E
K
 
I
G
 
G
S
 
K
L
 
L
E
 
D
G
 
G
L
 
I
K
 
S
I
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
L
L
 
A
H
 
N
S
 
G
R
|
R
V
 
T
A
 
V
R
 
R
S
 
S
D
 
L
I
 
A
K
 
Y
L
 
L
F
 
L
K
 
A
K
 
K
L
 
F
-
 
K
G
 
D
A
 
V
E
 
K
V
 
I
T
 
Y
L
 
F
C
 
V
G
 
S
P
 
P
M
 
E
T
 
I
M
 
V
-
 
K
-
 
M
-
 
K
-
 
D
-
 
D
L
 
I
P
 
K
R
 
D
H
 
Y
Y
 
L
E
 
T
A
 
S
L
 
S
G
 
G
A
 
V
D
 
E
Y
 
W
-
 
E
I
 
E
T
 
S
T
 
S
D
 
D
I
 
L
K
 
M
E
 
E
A
 
V
V
 
A
K
 
S
N
 
K
K
 
C
D
 
D
V
 
V
V
 
V
I
 
Y
F
 
Q
L
 
T
R
|
R
I
 
I
Q
 
Q
L
 
R
E
 
E
R
 
R
Q
 
-
D
 
-
K
 
-
P
 
-
F
 
F
F
 
G
S
 
E
T
 
R
L
 
L
R
 
D
E
 
L
Y
 
Y
S
 
E
I
 
A
-
 
A
-
 
R
-
 
G
K
 
K
Y
 
Y
G
 
I
L
 
V
N
 
D
Q
 
K
E
 
D
L
 
L
L
 
L
K
 
G
I
 
V
L
 
M
K
 
Q
P
 
K
D
 
K
T
 
A
V
 
I
I
 
I
M
 
M
H
 
H
P
 
P
G
 
L
P
 
P
V
 
-
N
 
-
R
 
R
G
 
L
V
 
D
E
 
E
I
 
I
Q
 
T
S
 
A
E
 
D
L
 
V
V
 
D
Y
 
A
S
 
D
S
 
P
K
 
R
S
 
A
L
 
A
I
 
Y
L
 
F
N
 
R
Q
 
Q
V
 
A
E
 
K
N
 
N
G
 
G
L
 
L
F
 
F
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
V
 
L
Y
 
L
K
 
K
Y
 
L
L
 
L
L
 
L

Q18990 Multifunctional protein pyr-1; EC 6.3.5.5; EC 3.5.1.2; EC 6.3.4.16; EC 2.1.3.2; EC 3.5.2.3 from Caenorhabditis elegans (see 3 papers)
37% identity, 99% coverage: 2:300/301 of query aligns to 1877:2193/2198 of Q18990

query
sites
Q18990
K
 
K
D
 
N
L
 
C
Y
 
I
S
 
S
V
 
V
N
 
K
Q
 
H
L
 
L
E
 
D
K
 
K
E
 
G
D
 
Q
I
 
I
Q
 
N
K
 
R
I
 
I
F
 
F
Q
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
D
E
 
R
Y
 
Y
K
 
K
E
 
H
R
 
D
F
 
V
L
 
E
K
 
K
G
 
G
E
 
H
K
 
P
K
 
L
F
 
T
N
 
H
D
 
I
L
 
L
R
 
N
R
 
G
C
 
K
S
 
V
I
 
L
L
 
V
L
 
N
V
 
L
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
N
 
V
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
R
 
S
T
 
C
S
 
S
F
 
F
E
 
S
L
 
A
A
 
A
G
 
M
K
 
Q
I
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
G
D
 
S
T
 
V
I
 
I
N
 
S
I
 
V
S
 
D
A
 
S
S
 
Q
S
 
S
S
 
S
S
 
S
V
 
V
K
 
Q
K
 
K
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
Y
 
E
D
 
D
T
 
T
V
 
V
K
 
Q
T
 
V
L
 
L
E
 
G
A
 
S
L
 
Y
N
 
-
S
 
G
D
 
D
F
 
I
I
 
L
V
 
V
I
 
L
R
 
R
H
 
S
N
 
N
M
 
E
S
 
N
G
 
G
A
 
A
A
 
A
K
 
D
I
 
R
V
 
A
A
 
A
N
 
R
S
 
V
V
 
C
K
 
D
S
 
Q
H
 
P
V
 
V
V
 
I
N
 
N
A
 
G
G
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
T
N
 
G
E
 
E
H
 
H
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
G
 
V
F
 
Y
T
 
T
I
 
I
L
 
R
E
 
Q
K
 
E
K
 
M
G
 
G
S
 
T
L
 
V
E
 
N
G
 
G
L
 
L
K
 
T
I
 
I
A
 
A
I
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
L
L
 
K
H
 
N
S
 
G
R
 
R
V
 
T
A
 
V
R
 
H
S
 
S
D
 
L
I
 
A
K
 
K
L
 
L
F
 
L
K
 
-
K
 
C
L
 
L
G
 
Y
A
 
K
E
 
D
V
 
I
T
 
T
L
 
L
-
 
H
-
 
Y
C
 
V
G
 
A
P
 
P
M
 
S
T
 
T
M
 
E
L
 
L
P
 
E
R
 
M
H
 
P
Y
 
Q
E
 
E
A
 
V
L
 
L
G
 
-
A
 
-
D
 
D
Y
 
Y
I
 
V
T
 
S
-
 
S
-
 
K
-
 
S
-
 
N
-
 
F
-
 
V
-
 
Q
-
 
K
-
 
K
-
 
F
T
 
T
D
 
S
I
 
L
K
 
A
E
 
E
A
 
G
V
 
I
K
 
N
N
 
H
K
 
V
D
 
D
V
 
V
V
 
V
I
 
Y
F
 
V
L
 
T
R
 
R
I
 
I
Q
 
Q
L
 
K
E
 
E
R
 
R
Q
 
-
D
 
-
K
 
-
P
 
-
F
 
-
F
 
F
S
 
S
T
 
S
L
 
P
R
 
D
E
 
E
Y
 
Y
S
 
N
I
 
K
K
 
V
Y
 
K
G
 
G
-
 
S
-
 
Y
-
 
V
-
 
I
-
 
N
-
 
A
-
 
K
-
 
L
L
 
L
N
 
N
Q
 
E
E
 
A
L
 
A
L
 
R
K
 
D
I
 
V
L
 
E
K
 
E
P
 
P
D
 
S
T
 
S
-
 
L
-
 
L
-
 
V
-
 
P
-
 
A
-
 
R
-
 
S
-
 
L
-
 
P
V
 
I
I
 
V
M
 
M
H
 
H
P
 
P
G
 
L
P
 
P
V
 
-
N
 
-
R
 
R
G
 
V
V
 
D
E
 
E
I
 
I
Q
 
A
S
 
V
E
 
E
L
 
L
V
 
D
Y
 
H
S
 
D
S
 
E
K
 
R
S
 
A
L
 
A
I
 
Y
L
 
F
N
 
R
Q
 
Q
V
 
A
E
 
K
N
 
N
G
 
G
L
 
V
F
 
F
I
 
V
R
 
R
M
 
M
A
 
S
V
 
I
Y
 
L
K
 
S
Y
 
L
L
 
L
L
 
L

Sites not aligning to the query:

6ys6B Arabidopsis aspartate transcarbamoylase complex with pala (see paper)
36% identity, 100% coverage: 1:300/301 of query aligns to 6:309/312 of 6ys6B

query
sites
6ys6B
M
 
L
K
 
S
D
 
D
L
 
V
Y
 
I
S
 
E
V
 
G
N
 
K
Q
 
Q
L
 
F
E
 
D
K
 
R
E
 
E
D
 
M
I
 
L
Q
 
S
K
 
A
I
 
I
F
 
F
Q
 
D
L
 
V
A
 
A
K
 
R
E
 
E
Y
 
M
K
 
-
E
 
E
R
 
K
F
 
I
L
 
E
K
 
K
G
 
S
E
 
S
K
 
S
K
 
Q
F
 
S
N
 
E
D
 
I
L
 
L
R
 
K
R
 
G
C
 
Y
S
 
L
I
 
M
L
 
A
L
 
T
V
 
L
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
N
 
P
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
R
 
R
T
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
E
L
 
S
A
 
A
G
 
M
K
 
K
I
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
G
D
 
E
T
 
V
I
 
L
N
 
T
I
 
T
S
 
E
A
 
N
S
 
A
S
 
R
-
 
E
-
 
F
S
 
S
S
|
S
V
 
A
K
 
A
K
|
K
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
Y
 
E
D
 
D
T
 
T
V
 
I
K
 
R
T
 
T
L
 
V
E
 
E
A
 
G
L
 
Y
N
 
-
S
 
S
D
 
D
F
 
I
I
 
I
V
 
V
I
 
M
R
|
R
H
 
H
N
 
F
M
 
E
S
 
S
G
 
G
A
 
A
A
 
A
K
 
R
I
 
K
V
 
A
A
 
A
N
 
A
S
 
T
V
 
A
K
 
N
S
 
I
H
 
P
V
 
V
V
 
I
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
P
N
 
G
E
 
E
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
G
 
V
F
 
Y
T
 
T
I
 
I
L
 
Q
E
 
S
K
 
E
K
 
I
G
 
G
S
 
K
L
 
L
E
 
D
G
 
G
L
 
I
K
 
S
I
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
L
L
 
A
H
 
N
S
 
G
R
 
R
V
 
T
A
 
V
R
 
R
S
 
S
D
 
L
I
 
A
K
 
Y
L
 
L
F
 
L
K
 
A
K
 
K
L
 
F
-
 
K
G
 
D
A
 
V
E
 
K
V
 
I
T
 
Y
L
 
F
C
 
V
G
 
S
P
 
P
M
 
E
T
 
I
M
 
V
-
 
K
-
 
M
-
 
K
-
 
D
-
 
D
L
 
I
P
 
K
R
 
D
H
 
Y
Y
 
L
E
 
T
A
 
S
L
 
S
G
 
G
A
 
V
D
 
E
Y
 
W
-
 
E
I
 
E
T
 
S
T
 
S
D
 
D
I
 
L
K
 
M
E
 
E
A
 
V
V
 
A
K
 
S
N
 
K
K
 
C
D
 
D
V
 
V
V
 
V
I
 
Y
F
 
Q
L
x
T
R
 
R
I
 
I
Q
 
Q
L
 
R
E
 
E
R
 
R
Q
 
-
D
 
-
K
 
-
P
 
-
F
 
F
F
 
G
S
 
E
T
 
R
L
 
L
R
 
D
E
 
L
Y
 
Y
S
 
E
I
 
A
K
 
A
Y
 
R
G
 
G
-
 
K
-
 
F
-
 
I
L
 
V
N
 
D
Q
 
K
E
 
D
L
 
L
L
 
L
K
 
G
I
 
V
L
 
M
K
 
Q
P
 
K
D
 
K
T
 
A
V
 
I
I
 
I
M
 
M
H
 
H
P
|
P
G
 
L
P
 
P
V
 
-
N
 
-
R
 
R
G
 
L
V
 
D
E
 
E
I
 
I
Q
 
T
S
 
A
E
 
D
L
 
V
V
 
D
Y
 
A
S
 
D
S
 
P
K
 
R
S
 
A
L
 
A
I
 
Y
L
 
F
N
 
R
Q
 
Q
V
 
A
E
 
K
N
 
N
G
|
G
L
 
L
F
 
F
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
V
 
L
Y
 
L
K
 
K
Y
 
L
L
 
L
L
 
L

6ypoA Arabidopsis aspartate transcarbamoylase bound to ump (see paper)
36% identity, 100% coverage: 1:300/301 of query aligns to 6:309/312 of 6ypoA

query
sites
6ypoA
M
 
L
K
 
S
D
 
D
L
 
V
Y
 
I
S
 
E
V
 
G
N
 
K
Q
 
Q
L
 
F
E
 
D
K
 
R
E
 
E
D
 
M
I
 
L
Q
 
S
K
 
A
I
 
I
F
 
F
Q
 
D
L
 
V
A
 
A
K
 
R
E
 
E
Y
 
M
K
 
-
E
 
E
R
 
K
F
 
I
L
 
E
K
 
K
G
 
S
E
 
S
K
 
S
K
 
Q
F
 
S
N
 
E
D
 
I
L
 
L
R
 
K
R
 
G
C
 
Y
S
 
L
I
 
M
L
 
A
L
 
T
V
 
L
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
N
 
P
S
 
S
T
 
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
T
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
E
L
 
S
A
 
A
G
 
M
K
 
K
I
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
G
D
 
E
T
 
V
I
 
L
N
 
T
I
 
T
S
 
E
A
 
N
S
 
A
S
 
R
-
 
E
-
 
F
S
 
S
S
 
S
V
 
A
K
 
A
K
 
K
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
Y
 
E
D
 
D
T
 
T
V
 
I
K
 
R
T
 
T
L
 
V
E
 
E
A
 
G
L
 
Y
N
 
-
S
 
S
D
 
D
F
 
I
I
 
I
V
 
V
I
 
M
R
|
R
H
 
H
N
 
F
M
 
E
S
 
S
G
 
G
A
 
A
A
 
A
K
 
R
I
 
K
V
 
A
A
 
A
N
 
A
S
 
T
V
 
A
K
 
N
S
 
I
H
 
P
V
 
V
V
 
I
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
P
N
 
G
E
 
E
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
G
 
V
F
 
Y
T
 
T
I
 
I
L
 
Q
E
 
S
K
 
E
K
 
I
G
 
G
S
 
K
L
 
L
E
 
D
G
 
G
L
 
I
K
 
S
I
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
L
L
 
A
H
 
N
S
 
G
R
|
R
V
x
T
A
 
V
R
 
R
S
 
S
D
 
L
I
 
A
K
 
Y
L
 
L
F
 
L
K
 
A
K
 
K
L
 
F
-
 
K
G
 
D
A
 
V
E
 
K
V
 
I
T
 
Y
L
 
F
C
 
V
G
 
S
P
 
P
M
 
E
T
 
I
M
 
V
-
 
K
-
 
M
-
 
K
-
 
D
-
 
D
L
 
I
P
 
K
R
 
D
H
 
Y
Y
 
L
E
 
T
A
 
S
L
 
S
G
 
G
A
 
V
D
 
E
Y
 
W
-
 
E
I
 
E
T
 
S
T
 
S
D
 
D
I
 
L
K
 
M
E
 
E
A
 
V
V
 
A
K
 
S
N
 
K
K
 
C
D
 
D
V
 
V
V
 
V
I
 
Y
F
 
Q
L
x
T
R
|
R
I
 
I
Q
 
Q
L
 
R
E
 
E
R
 
R
Q
 
-
D
 
-
K
 
-
P
 
-
F
 
F
F
 
G
S
 
E
T
 
R
L
 
L
R
 
D
E
 
L
Y
 
Y
S
 
E
I
 
A
K
 
A
Y
 
R
G
 
G
-
 
K
-
 
F
-
 
I
L
 
V
N
 
D
Q
 
K
E
 
D
L
 
L
L
 
L
K
 
G
I
 
V
L
 
M
K
 
Q
P
 
K
D
 
K
T
 
A
V
 
I
I
 
I
M
 
M
H
|
H
P
|
P
G
x
L
P
 
P
V
 
-
N
 
-
R
 
R
G
 
L
V
 
D
E
 
E
I
 
I
Q
 
T
S
 
A
E
 
D
L
 
V
V
 
D
Y
 
A
S
 
D
S
 
P
K
 
R
S
 
A
L
 
A
I
 
Y
L
 
F
N
 
R
Q
 
Q
V
 
A
E
 
K
N
 
N
G
|
G
L
 
L
F
 
F
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
V
 
L
Y
 
L
K
 
K
Y
 
L
L
 
L
L
 
L

6yvbC Arabidopsis aspartate transcarbamoylase complex with carbamoyl phosphate (see paper)
36% identity, 100% coverage: 1:300/301 of query aligns to 18:321/324 of 6yvbC

query
sites
6yvbC
M
 
L
K
 
S
D
 
D
L
 
V
Y
 
I
S
 
E
V
 
G
N
 
K
Q
 
Q
L
 
F
E
 
D
K
 
R
E
 
E
D
 
M
I
 
L
Q
 
S
K
 
A
I
 
I
F
 
F
Q
 
D
L
 
V
A
 
A
K
 
R
E
 
E
Y
 
M
K
 
-
E
 
E
R
 
K
F
 
I
L
 
E
K
 
K
G
 
S
E
 
S
K
 
S
K
 
Q
F
 
S
N
 
E
D
 
I
L
 
L
R
 
K
R
 
G
C
 
Y
S
 
L
I
 
M
L
 
A
L
 
T
V
 
L
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
N
 
P
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
T
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
E
L
 
S
A
 
A
G
 
M
K
 
K
I
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
G
D
 
E
T
 
V
I
 
L
N
 
T
I
 
T
S
 
E
A
 
N
S
 
A
S
 
R
-
 
E
-
 
F
S
 
S
S
 
S
V
 
A
K
 
A
K
 
K
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
Y
 
E
D
 
D
T
 
T
V
 
I
K
 
R
T
 
T
L
 
V
E
 
E
A
 
G
L
 
Y
N
 
-
S
 
S
D
 
D
F
 
I
I
 
I
V
 
V
I
 
M
R
|
R
H
 
H
N
 
F
M
 
E
S
 
S
G
 
G
A
 
A
A
 
A
K
 
R
I
 
K
V
 
A
A
 
A
N
 
A
S
 
T
V
 
A
K
 
N
S
 
I
H
 
P
V
 
V
V
 
I
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
P
N
 
G
E
 
E
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
G
 
V
F
 
Y
T
 
T
I
 
I
L
 
Q
E
 
S
K
 
E
K
 
I
G
 
G
S
 
K
L
 
L
E
 
D
G
 
G
L
 
I
K
 
S
I
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
L
L
 
A
H
 
N
S
 
G
R
 
R
V
 
T
A
 
V
R
 
R
S
 
S
D
 
L
I
 
A
K
 
Y
L
 
L
F
 
L
K
 
A
K
 
K
L
 
F
-
 
K
G
 
D
A
 
V
E
 
K
V
 
I
T
 
Y
L
 
F
C
 
V
G
 
S
P
 
P
M
 
E
T
 
I
M
 
V
-
 
K
-
 
M
-
 
K
-
 
D
-
 
D
L
 
I
P
 
K
R
 
D
H
 
Y
Y
 
L
E
 
T
A
 
S
L
 
S
G
 
G
A
 
V
D
 
E
Y
 
W
-
 
E
I
 
E
T
 
S
T
 
S
D
 
D
I
 
L
K
 
M
E
 
E
A
 
V
V
 
A
K
 
S
N
 
K
K
 
C
D
 
D
V
 
V
V
 
V
I
 
Y
F
 
Q
L
x
T
R
 
R
I
 
I
Q
 
Q
L
 
R
E
 
E
R
 
R
Q
 
-
D
 
-
K
 
-
P
 
-
F
 
F
F
 
G
S
 
E
T
 
R
L
 
L
R
 
D
E
 
L
Y
 
Y
S
 
E
I
 
A
K
 
A
Y
 
R
G
 
G
-
 
K
-
 
F
-
 
I
L
 
V
N
 
D
Q
 
K
E
 
D
L
 
L
L
 
L
K
 
G
I
 
V
L
 
M
K
 
Q
P
 
K
D
 
K
T
 
A
V
 
I
I
 
I
M
 
M
H
 
H
P
|
P
G
 
L
P
 
P
V
 
-
N
 
-
R
 
R
G
 
L
V
 
D
E
 
E
I
 
I
Q
 
T
S
 
A
E
 
D
L
 
V
V
 
D
Y
 
A
S
 
D
S
 
P
K
 
R
S
 
A
L
 
A
I
 
Y
L
 
F
N
 
R
Q
 
Q
V
 
A
E
 
K
N
 
N
G
|
G
L
 
L
F
 
F
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
V
 
L
Y
 
L
K
 
K
Y
 
L
L
 
L
L
 
L

Q09794 Multifunctional protein ura1; Pyrimidine-specific carbamoyl phosphate synthase-aspartate carbamoyl transferase; CPSase-ATCase; EC 6.3.5.5; EC 3.5.1.2; EC 6.3.4.16; EC 2.1.3.2 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
35% identity, 98% coverage: 2:295/301 of query aligns to 1937:2232/2244 of Q09794

query
sites
Q09794
K
 
K
D
 
H
L
 
I
Y
 
I
S
 
S
V
 
V
N
 
H
Q
 
Q
L
 
V
E
 
T
K
 
R
E
 
S
D
 
D
I
 
L
Q
 
H
K
 
V
I
 
L
F
 
F
Q
 
A
L
 
I
A
 
A
K
 
-
E
 
-
Y
 
H
K
 
Q
E
 
M
R
 
R
F
 
I
L
 
I
K
 
V
G
 
E
E
 
R
K
 
Q
K
 
G
F
 
V
N
 
I
D
 
D
L
 
L
R
 
C
R
 
Y
C
 
G
S
 
K
I
 
L
L
 
L
L
 
C
-
 
T
V
 
M
F
 
F
F
 
F
E
 
E
N
 
P
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
R
 
S
T
 
S
S
 
S
F
 
F
E
 
D
L
 
A
A
 
A
G
 
M
K
 
Q
I
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
G
D
 
K
T
 
V
I
 
V
N
 
A
I
 
V
S
 
T
A
 
A
S
 
S
S
 
A
S
 
S
S
 
S
V
 
V
K
 
N
K
 
K
G
 
G
E
 
E
T
 
S
L
 
L
Y
 
A
D
 
D
T
 
T
V
 
I
K
 
R
T
 
T
L
 
L
E
 
-
A
 
G
L
 
C
N
 
Y
S
 
G
D
 
D
F
 
A
I
 
I
V
 
V
I
 
L
R
 
R
H
 
H
N
 
P
M
 
S
S
 
I
G
 
E
A
 
S
A
 
A
K
 
R
I
 
I
V
 
A
A
 
A
N
 
N
S
 
F
V
 
S
K
 
P
S
 
V
H
 
P
V
 
I
V
 
I
N
 
N
A
 
G
G
 
G
D
 
N
G
 
G
T
 
S
N
 
K
E
 
E
H
 
H
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
L
 
F
L
 
L
D
 
D
G
 
L
F
 
Y
T
 
T
I
 
I
L
 
R
E
 
E
K
 
E
K
 
L
G
 
G
S
 
S
L
 
V
E
 
N
G
 
G
L
 
L
K
 
T
I
 
I
A
 
T
I
 
F
V
 
I
G
 
G
D
 
D
I
 
L
L
 
K
H
 
Y
S
 
G
R
 
R
V
 
T
A
 
V
R
 
H
S
 
S
D
 
L
I
 
A
K
 
R
L
 
L
F
 
L
K
 
A
K
 
F
L
 
W
G
 
H
A
 
V
E
 
E
V
 
L
T
 
H
L
 
L
C
 
V
G
 
S
P
 
P
M
 
E
T
 
Q
M
 
L
-
 
A
L
 
L
P
 
P
R
 
D
H
 
D
Y
 
V
E
 
K
-
 
D
-
 
D
-
 
I
-
 
R
A
 
A
L
 
N
G
 
G
A
 
L
D
 
N
Y
 
F
I
 
I
T
 
E
T
 
H
D
 
R
-
 
E
-
 
L
I
 
T
K
 
K
E
 
E
A
 
V
V
 
V
K
 
A
N
 
Q
K
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
L
I
 
Y
F
 
C
L
 
T
R
 
R
I
 
V
Q
 
Q
L
 
K
E
 
E
R
 
R
Q
 
-
D
 
-
K
 
-
P
 
-
F
 
-
F
 
F
S
 
A
T
 
S
L
 
V
R
 
D
E
 
E
Y
 
Y
S
 
E
-
 
K
-
 
L
-
 
K
I
 
D
K
 
S
Y
 
F
G
 
I
L
 
V
N
 
D
Q
 
N
E
 
S
L
 
V
L
 
L
K
 
A
I
 
S
L
 
A
K
 
K
P
 
S
D
 
H
T
 
C
V
 
I
I
 
V
M
 
M
H
 
H
P
 
P
G
 
L
P
 
P
V
 
R
N
 
N
R
 
R
G
 
-
V
 
-
E
 
E
I
 
I
Q
 
S
S
 
E
E
 
E
L
 
V
V
 
D
Y
 
F
S
 
D
S
 
Q
-
 
R
K
 
R
S
 
A
L
 
A
I
 
Y
L
 
F
N
 
R
Q
 
Q
V
 
M
E
 
R
N
 
Y
G
 
G
L
 
L
F
 
Y
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
V
 
L

Sites not aligning to the query:

P07259 Multifunctional protein URA2; Pyrimidine-specific carbamoyl phosphate synthase-aspartate carbamoyl transferase; CPSase-ATCase; EC 6.3.5.5; EC 3.5.1.2; EC 6.3.4.16; EC 2.1.3.2 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see paper)
34% identity, 98% coverage: 2:295/301 of query aligns to 1911:2205/2214 of P07259

query
sites
P07259
K
 
R
D
 
H
L
 
I
Y
 
L
S
 
S
V
 
I
N
 
K
Q
 
Q
L
 
F
E
 
K
K
 
R
E
 
S
D
 
D
I
 
F
Q
 
H
K
 
V
I
 
L
F
 
F
Q
 
A
L
 
V
A
 
A
K
 
Q
E
 
E
Y
 
L
K
 
R
E
 
A
R
 
A
F
 
V
L
 
A
K
 
R
G
 
-
E
 
E
K
 
G
K
 
V
F
 
L
N
 
D
D
 
L
L
 
M
R
 
K
R
 
G
C
 
H
S
 
V
I
 
I
L
 
T
L
 
T
V
 
I
F
 
F
F
 
F
E
 
E
N
 
P
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
R
 
C
T
 
S
S
 
S
F
 
F
E
 
I
L
 
A
A
 
A
G
 
M
K
 
E
I
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
G
D
 
R
T
 
I
I
 
V
N
 
N
I
 
V
S
 
N
A
 
P
S
 
L
S
 
V
S
 
S
S
 
S
V
 
V
K
 
K
K
 
K
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
Y
 
Q
D
 
D
T
 
T
V
 
I
K
 
R
T
 
T
L
 
L
E
 
-
A
 
A
L
 
C
N
 
Y
S
 
S
D
 
D
F
 
A
I
 
I
V
 
V
I
 
M
R
 
R
H
 
H
N
 
S
M
 
E
S
 
E
G
 
M
A
 
S
A
 
V
K
 
H
I
 
I
V
 
A
A
 
A
N
 
K
S
 
Y
V
 
S
K
 
P
S
 
V
H
 
P
V
 
I
V
 
I
N
 
N
A
 
G
G
 
G
D
 
N
G
 
G
T
 
S
N
 
R
E
 
E
H
 
H
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
L
 
F
L
 
L
D
 
D
G
 
L
F
 
F
T
 
T
I
 
I
L
 
R
E
 
E
K
 
E
K
 
I
G
 
G
S
 
T
L
 
V
E
 
N
G
 
G
L
 
I
K
 
T
I
 
V
A
 
T
I
 
F
V
 
M
G
 
G
D
 
D
I
 
L
L
 
K
H
 
H
S
 
G
R
 
R
V
 
T
A
 
V
R
 
H
S
 
S
D
 
L
I
 
C
K
 
R
L
 
L
F
 
L
K
 
M
K
 
H
L
 
Y
G
 
Q
A
 
V
E
 
R
V
 
I
T
 
N
L
 
L
C
 
V
G
 
S
P
 
P
M
 
P
T
 
E
M
 
L
-
 
R
L
 
L
P
 
P
-
 
E
-
 
G
-
 
L
-
 
R
-
 
E
-
 
E
-
 
L
R
 
R
H
 
K
Y
 
A
E
 
G
A
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
V
D
 
E
Y
 
S
I
 
I
T
 
E
T
 
L
D
 
-
I
 
T
K
 
P
E
 
H
A
 
I
V
 
I
K
 
S
N
 
K
K
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
L
I
 
Y
F
 
C
L
 
T
R
 
R
I
 
V
Q
 
Q
L
 
E
E
 
E
R
 
R
Q
 
F
D
 
N
K
 
S
P
 
P
-
 
E
F
 
E
F
 
Y
S
 
A
T
 
R
L
 
L
R
 
K
E
 
D
Y
 
-
S
 
-
I
 
-
K
 
T
Y
 
Y
G
 
I
L
 
V
N
 
D
Q
 
N
E
 
K
L
 
I
L
 
L
K
 
A
I
 
H
L
 
A
K
 
K
P
 
E
D
 
N
T
 
M
V
 
A
I
 
I
M
 
M
H
 
H
P
 
P
G
 
L
P
 
P
V
 
-
N
 
-
R
 
R
G
 
V
V
 
N
E
 
E
I
 
I
Q
 
K
S
 
E
E
 
E
L
 
V
V
 
D
Y
 
Y
S
 
D
S
 
H
K
 
R
S
 
A
L
 
A
I
 
Y
L
 
F
N
 
R
Q
 
Q
V
 
M
E
 
K
N
 
Y
G
 
G
L
 
L
F
 
F
I
 
V
R
 
R
M
 
M
A
 
A
V
 
L

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_012674077.1 NCBI__GCF_000021545.1:WP_012674077.1
MKDLYSVNQLEKEDIQKIFQLAKEYKERFLKGEKKFNDLRRCSILLVFFENSTRTRTSFE
LAGKILGADTINISASSSSVKKGETLYDTVKTLEALNSDFIVIRHNMSGAAKIVANSVKS
HVVNAGDGTNEHPTQALLDGFTILEKKGSLEGLKIAIVGDILHSRVARSDIKLFKKLGAE
VTLCGPMTMLPRHYEALGADYITTDIKEAVKNKDVVIFLRIQLERQDKPFFSTLREYSIK
YGLNQELLKILKPDTVIMHPGPVNRGVEIQSELVYSSKSLILNQVENGLFIRMAVYKYLL
S

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory