SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012675024.1 NCBI__GCF_000021545.1:WP_012675024.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4tx9A Crystal structure of hisap from streptomyces sviceus with degraded profar (see paper)
33% identity, 97% coverage: 7:238/239 of query aligns to 11:239/246 of 4tx9A

query
sites
4tx9A
I
 
L
I
 
L
P
 
P
A
 
A
I
 
V
D
|
D
L
 
V
K
 
R
D
 
D
G
 
G
K
 
Q
V
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
L
Y
 
V
K
 
H
G
|
G
E
 
E
F
 
S
D
 
G
K
 
T
V
 
E
K
 
T
V
 
S
Y
 
Y
K
 
-
D
 
G
N
 
S
P
 
P
V
 
L
D
 
E
M
 
A
A
 
A
K
 
L
Y
 
S
F
 
W
Q
 
Q
D
 
R
C
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
E
H
 
W
I
 
L
H
 
H
V
 
L
V
|
V
D
 
D
L
|
L
D
 
D
G
 
A
A
 
A
L
 
F
E
 
-
G
 
G
K
 
T
P
 
G
K
 
D
N
 
N
Y
 
R
K
 
E
V
 
L
V
 
V
E
 
R
S
 
Q
I
 
V
V
 
T
K
 
E
S
 
A
V
 
M
D
 
D
I
 
I
L
 
K
V
 
V
E
 
E
F
 
L
G
x
S
G
 
G
G
|
G
L
 
I
R
|
R
S
 
D
Y
 
D
E
 
A
A
 
S
V
 
L
K
 
A
S
 
A
M
 
A
F
 
L
E
 
A
I
 
T
G
 
G
V
 
C
D
 
T
R
 
R
V
 
V
V
 
N
I
 
L
G
|
G
S
x
T
L
 
A
A
 
A
Y
 
L
E
 
E
N
 
S
Q
 
P
E
 
E
E
 
W
F
 
V
L
 
A
R
 
K
I
 
V
V
 
I
E
 
A
D
 
E
F
 
H
K
 
G
N
 
D
K
 
R
V
 
I
I
 
A
V
 
V
G
 
G
I
 
L
D
|
D
A
 
V
K
 
R
D
 
G
G
 
T
K
 
T
V
 
L
A
 
K
I
 
G
K
 
R
G
|
G
W
|
W
V
 
T
E
 
S
K
 
E
T
 
G
D
 
G
-
 
D
-
 
L
Y
 
Y
T
 
E
P
 
A
L
 
L
E
 
E
F
 
-
A
 
-
K
 
-
K
 
R
Y
 
L
D
 
D
D
 
K
L
 
E
D
 
G
I
 
C
F
 
A
G
 
R
F
 
Y
L
 
V
Y
 
V
T
 
T
D
 
D
V
 
I
N
 
A
R
 
K
D
 
D
G
 
G
A
 
T
M
 
L
V
 
Q
G
 
G
P
 
P
N
 
N
L
 
L
E
 
E
G
 
L
T
 
L
K
 
R
Y
 
N
L
 
V
A
 
C
E
 
A
N
 
A
L
 
T
K
 
D
H
 
R
F
 
P
V
 
V
I
 
V
A
 
A
S
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
S
S
 
S
L
 
L
Q
 
D
D
 
D
V
 
L
I
 
R
N
 
A
L
 
I
Y
 
A
K
 
E
L
 
L
K
 
V
D
 
P
Y
 
L
G
 
G
V
 
V
F
 
E
G
 
G
V
 
S
V
 
I
V
 
V
G
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
L
Y
 
Y
E
 
A
G
 
K
K
 
A
I
 
F
K
 
T
L
 
L
E
 
E
E
 
E

5dn1A Crystal structure of phosphoribosyl isomerase a from streptomyces coelicolor (see paper)
33% identity, 97% coverage: 7:238/239 of query aligns to 6:234/240 of 5dn1A

query
sites
5dn1A
I
 
L
I
 
L
P
 
P
A
 
A
I
 
V
D
|
D
L
 
V
K
 
R
D
 
D
G
 
G
K
 
Q
V
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
L
Y
 
V
K
 
H
G
|
G
E
 
E
F
 
S
D
 
G
K
 
T
V
 
E
K
 
T
V
 
S
Y
 
Y
K
 
G
D
 
-
N
 
S
P
 
P
V
 
L
D
 
E
M
 
A
A
 
A
K
 
L
Y
 
A
F
 
W
Q
 
Q
D
 
R
C
 
S
G
 
G
A
 
A
V
 
E
H
 
W
I
 
L
H
 
H
V
 
L
V
 
V
D
 
D
L
|
L
D
 
D
G
 
A
A
 
A
L
x
F
E
 
-
G
 
G
K
 
T
P
 
G
K
 
D
N
 
N
Y
 
R
K
 
A
V
 
L
V
 
I
E
 
A
S
 
E
I
 
V
V
 
A
K
 
Q
S
 
A
V
 
M
D
 
D
I
 
I
L
 
K
V
 
V
E
 
E
F
 
L
G
x
S
G
 
G
G
|
G
L
 
I
R
|
R
S
 
D
Y
 
D
E
 
D
A
 
T
V
 
L
K
 
A
S
 
A
M
 
A
F
 
L
E
 
A
I
 
T
G
 
G
V
 
C
D
 
T
R
 
R
V
 
V
V
 
N
I
 
L
G
|
G
S
x
T
L
 
A
A
 
A
Y
 
L
E
 
E
N
 
T
Q
 
P
E
 
E
E
 
W
F
 
V
L
 
A
R
 
K
I
 
V
V
 
I
E
 
A
D
 
E
F
 
H
K
 
G
N
 
D
K
 
K
V
 
I
I
 
A
V
 
V
G
 
G
I
 
L
D
|
D
A
 
V
K
 
R
D
 
G
G
 
T
K
 
T
V
 
L
A
 
R
I
 
G
K
 
R
G
|
G
W
|
W
V
 
T
E
 
R
K
 
-
T
 
-
D
 
-
Y
 
-
T
 
-
P
 
-
L
 
-
E
 
D
F
 
G
A
 
G
K
 
D
K
 
L
Y
 
Y
D
 
E
D
 
T
L
 
L
D
 
D
I
 
R
F
 
L
G
 
N
-
 
K
-
 
E
-
 
G
-
 
C
-
 
A
-
 
R
F
 
Y
L
 
V
Y
 
V
T
 
T
D
 
D
V
 
I
N
 
A
R
 
K
D
 
D
G
 
G
A
 
T
M
 
L
V
 
Q
G
 
G
P
 
P
N
 
N
L
 
L
E
 
E
G
 
L
T
 
L
K
 
K
Y
 
N
L
 
V
A
 
C
E
 
A
N
 
A
L
 
T
K
 
D
H
 
R
F
 
P
V
 
V
I
 
V
A
 
A
S
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
S
S
 
S
L
 
L
Q
 
D
D
 
D
V
 
L
I
 
R
N
 
A
L
 
I
Y
 
A
K
 
G
L
 
L
K
 
V
D
 
P
Y
 
A
G
 
G
V
 
V
F
 
E
G
 
G
V
 
A
V
 
I
V
 
V
G
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
L
Y
 
Y
E
 
A
G
 
K
K
 
A
I
 
F
K
 
T
L
 
L
E
 
E
E
 
E

P16250 Phosphoribosyl isomerase A; 1-(5-phosphoribosyl)-5-[(5-phosphoribosylamino)methylideneamino] imidazole-4-carboxamide isomerase; N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase; PRAI; Phosphoribosylformimino-5-aminoimidazole carboxamide ribotide isomerase; EC 5.3.1.16; EC 5.3.1.24 from Streptomyces coelicolor (strain ATCC BAA-471 / A3(2) / M145) (see paper)
33% identity, 97% coverage: 7:238/239 of query aligns to 6:234/240 of P16250

query
sites
P16250
I
 
L
I
 
L
P
 
P
A
 
A
I
 
V
D
|
D
L
 
V
K
 
R
D
 
D
G
 
G
K
 
Q
V
 
A
V
 
V
R
|
R
L
 
L
Y
 
V
K
 
H
G
 
G
E
 
E
F
 
S
D
 
G
K
 
T
V
 
E
K
 
T
V
 
S
Y
 
Y
K
 
G
D
 
-
N
 
S
P
 
P
V
 
L
D
 
E
M
 
A
A
 
A
K
 
L
Y
 
A
F
 
W
Q
 
Q
D
 
R
C
 
S
G
 
G
A
 
A
V
 
E
H
 
W
I
 
L
H
 
H
V
 
L
V
 
V
D
 
D
L
 
L
D
 
D
G
 
A
A
 
A
L
 
F
E
 
-
G
 
G
K
 
T
P
 
G
K
 
D
N
 
N
Y
 
R
K
 
A
V
 
L
V
 
I
E
 
A
S
 
E
I
 
V
V
 
A
K
 
Q
S
 
A
V
 
M
D
 
D
I
 
I
L
 
K
V
 
V
E
 
E
F
 
L
G
x
S
G
 
G
G
 
G
L
 
I
R
 
R
S
 
D
Y
 
D
E
 
D
A
 
T
V
 
L
K
 
A
S
 
A
M
 
A
F
 
L
E
 
A
I
 
T
G
 
G
V
 
C
D
 
T
R
 
R
V
 
V
V
 
N
I
 
L
G
 
G
S
 
T
L
 
A
A
 
A
Y
 
L
E
 
E
N
 
T
Q
 
P
E
 
E
E
 
W
F
 
V
L
 
A
R
 
K
I
 
V
V
 
I
E
 
A
D
 
E
F
 
H
K
 
G
N
 
D
K
 
K
V
 
I
I
 
A
V
 
V
G
 
G
I
 
L
D
|
D
A
 
V
K
 
R
D
 
G
G
 
T
K
 
T
V
 
L
A
 
R
I
 
G
K
 
R
G
 
G
W
 
W
V
 
T
E
 
R
K
 
-
T
 
-
D
 
-
Y
 
-
T
 
-
P
 
-
L
 
-
E
 
D
F
 
G
A
 
G
K
 
D
K
 
L
Y
 
Y
D
 
E
D
 
T
L
 
L
D
 
D
I
 
R
F
 
L
G
 
N
-
 
K
-
 
E
-
 
G
-
 
C
-
 
A
-
 
R
F
 
Y
L
 
V
Y
 
V
T
|
T
D
 
D
V
 
I
N
 
A
R
 
K
D
|
D
G
 
G
A
 
T
M
 
L
V
 
Q
G
 
G
P
 
P
N
 
N
L
 
L
E
 
E
G
 
L
T
 
L
K
 
K
Y
 
N
L
 
V
A
 
C
E
 
A
N
 
A
L
 
T
K
 
D
H
 
R
F
 
P
V
 
V
I
 
V
A
 
A
S
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
S
S
 
S
L
 
L
Q
 
D
D
 
D
V
 
L
I
 
R
N
 
A
L
 
I
Y
 
A
K
 
G
L
 
L
K
 
V
D
 
P
Y
 
A
G
 
G
V
 
V
F
 
E
G
 
G
V
 
A
V
 
I
V
 
V
G
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
L
Y
 
Y
E
 
A
G
 
K
K
 
A
I
 
F
K
 
T
L
 
L
E
 
E
E
 
E

3zs4A Crystal structure of mycobacterium tuberculosis phosphoribosyl isomerase with bound prfar
34% identity, 97% coverage: 6:238/239 of query aligns to 4:237/244 of 3zs4A

query
sites
3zs4A
F
 
I
I
 
L
I
 
L
P
 
P
A
|
A
I
 
V
D
|
D
L
 
V
K
 
V
D
 
E
G
 
G
K
 
R
V
 
A
V
 
V
R
|
R
L
 
L
Y
 
V
K
 
Q
G
 
G
E
 
K
F
 
A
D
 
G
K
 
S
V
 
Q
K
 
T
V
 
E
Y
 
Y
K
 
G
D
 
-
N
 
S
P
 
A
V
 
V
D
 
D
M
 
A
A
 
A
K
 
L
Y
 
G
F
 
W
Q
 
Q
D
 
R
C
 
D
G
 
G
A
 
A
V
 
E
H
 
W
I
 
I
H
 
H
V
 
L
V
 
V
D
 
D
L
 
L
D
 
D
G
 
A
A
|
A
L
x
F
E
 
-
G
 
G
K
 
R
P
 
G
K
 
S
N
 
N
Y
 
H
K
 
E
V
 
L
V
 
L
E
 
A
S
 
E
I
 
V
V
 
V
K
 
G
S
 
K
V
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
Q
V
 
V
E
 
E
F
 
L
G
x
S
G
 
G
G
|
G
L
 
I
R
|
R
S
 
D
Y
 
D
E
 
E
A
 
S
V
 
L
K
 
A
S
 
A
M
 
A
F
 
L
E
 
A
I
 
T
G
 
G
V
 
C
D
 
A
R
 
R
V
 
V
V
 
N
I
 
V
G
|
G
S
x
T
L
 
A
A
 
A
Y
 
L
E
 
E
N
 
N
Q
 
P
E
 
Q
E
 
W
F
 
C
L
 
A
R
 
R
I
 
V
V
 
I
E
 
G
D
 
E
F
 
H
K
 
G
N
 
D
K
 
Q
V
 
V
I
 
A
V
 
V
G
 
G
I
 
L
D
|
D
A
 
V
K
 
Q
-
 
I
-
 
I
D
 
D
G
 
G
K
 
E
V
 
H
A
 
R
I
 
L
K
 
R
G
 
G
W
 
R
V
x
G
E
x
W
K
 
E
T
 
T
D
 
D
Y
 
G
T
 
G
P
 
D
L
 
L
-
 
W
E
 
D
F
 
V
A
 
L
K
 
E
K
 
R
Y
 
L
D
 
D
D
 
S
L
 
E
D
 
G
I
 
C
F
 
S
G
 
R
F
 
F
L
 
V
Y
 
V
T
 
T
D
 
D
V
 
I
N
 
T
R
 
K
D
|
D
G
|
G
A
 
T
M
 
L
V
 
G
G
 
G
P
 
P
N
 
N
L
 
L
E
 
D
G
 
L
T
 
L
K
 
A
Y
 
G
L
 
V
A
 
A
E
 
D
N
 
R
L
 
T
K
 
D
H
 
A
F
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
S
 
S
G
|
G
G
|
G
V
 
V
G
 
S
S
 
S
L
 
L
Q
 
D
D
 
D
V
 
L
I
 
R
N
 
A
L
 
I
Y
 
A
K
 
T
L
 
L
K
 
T
D
 
H
Y
 
R
G
 
G
V
 
V
F
 
E
G
 
G
V
 
A
V
x
I
V
 
V
G
|
G
K
|
K
A
 
A
I
 
L
Y
 
Y
E
 
A
G
 
R
K
 
R
I
 
F
K
 
T
L
 
L
E
 
P
E
 
Q

2y88A Crystal structure of mycobacterium tuberculosis phosphoribosyl isomerase (variant d11n) with bound prfar (see paper)
34% identity, 97% coverage: 6:238/239 of query aligns to 4:237/244 of 2y88A

query
sites
2y88A
F
 
I
I
 
L
I
 
L
P
 
P
A
|
A
I
 
V
D
x
N
L
 
V
K
 
V
D
 
E
G
 
G
K
 
R
V
 
A
V
 
V
R
|
R
L
 
L
Y
 
V
K
 
Q
G
|
G
E
 
K
F
 
A
D
 
G
K
 
S
V
 
Q
K
 
T
V
 
E
Y
 
Y
K
 
G
D
 
-
N
 
S
P
 
A
V
 
V
D
 
D
M
 
A
A
 
A
K
 
L
Y
 
G
F
 
W
Q
 
Q
D
 
R
C
 
D
G
 
G
A
 
A
V
 
E
H
 
W
I
 
I
H
 
H
V
 
L
V
 
V
D
 
D
L
|
L
D
 
D
G
 
A
A
|
A
L
 
F
E
 
-
G
 
G
K
 
R
P
 
G
K
 
S
N
 
N
Y
 
H
K
 
E
V
 
L
V
 
L
E
 
A
S
 
E
I
 
V
V
 
V
K
 
G
S
 
K
V
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
Q
V
 
V
E
 
E
F
 
L
G
x
S
G
|
G
G
|
G
L
 
I
R
|
R
S
 
D
Y
 
D
E
 
E
A
 
S
V
 
L
K
 
A
S
 
A
M
 
A
F
 
L
E
 
A
I
 
T
G
 
G
V
 
C
D
 
A
R
 
R
V
 
V
V
 
N
I
 
V
G
|
G
S
x
T
L
 
A
A
 
A
Y
 
L
E
 
E
N
 
N
Q
 
P
E
 
Q
E
 
W
F
 
C
L
 
A
R
 
R
I
 
V
V
 
I
E
 
G
D
 
E
F
 
H
K
 
G
N
 
D
K
 
Q
V
 
V
I
 
A
V
 
V
G
 
G
I
 
L
D
|
D
A
 
V
K
 
Q
-
 
I
-
 
I
D
 
D
G
 
G
K
 
E
V
 
H
A
 
R
I
 
L
K
 
R
G
 
G
W
 
R
V
x
G
E
x
W
K
 
E
T
 
T
D
 
D
Y
 
G
T
 
G
P
 
D
L
 
L
-
 
W
E
 
D
F
 
V
A
 
L
K
 
E
K
 
R
Y
 
L
D
 
D
D
 
S
L
 
E
D
 
G
I
 
C
F
 
S
G
 
R
F
 
F
L
 
V
Y
 
V
T
 
T
D
 
D
V
 
I
N
 
T
R
 
K
D
|
D
G
|
G
A
 
T
M
 
L
V
 
G
G
 
G
P
 
P
N
 
N
L
 
L
E
 
D
G
 
L
T
 
L
K
 
A
Y
 
G
L
 
V
A
 
A
E
 
D
N
 
R
L
 
T
K
 
D
H
 
A
F
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
S
|
S
G
|
G
G
 
G
V
 
V
G
 
S
S
 
S
L
 
L
Q
 
D
D
 
D
V
 
L
I
 
R
N
 
A
L
 
I
Y
 
A
K
 
T
L
 
L
K
 
T
D
 
H
Y
 
R
G
 
G
V
 
V
F
 
E
G
 
G
V
 
A
V
 
I
V
 
V
G
|
G
K
|
K
A
 
A
I
 
L
Y
 
Y
E
 
A
G
 
R
K
 
R
I
 
F
K
 
T
L
 
L
E
 
P
E
 
Q

2y85A Crystal structure of mycobacterium tuberculosis phosphoribosyl isomerase with bound rcdrp (see paper)
33% identity, 97% coverage: 6:238/239 of query aligns to 4:228/234 of 2y85A

query
sites
2y85A
F
 
I
I
 
L
I
 
L
P
 
P
A
 
A
I
 
V
D
|
D
L
 
V
K
 
V
D
 
E
G
 
G
K
 
R
V
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
T
Y
 
E
K
 
Y
G
 
G
E
 
-
F
 
-
D
 
-
K
 
-
V
 
-
K
 
-
V
 
-
Y
 
-
K
 
-
D
 
-
N
 
S
P
 
A
V
 
V
D
 
D
M
 
A
A
 
A
K
 
L
Y
 
G
F
 
W
Q
 
Q
D
 
R
C
 
D
G
 
G
A
 
A
V
 
E
H
 
W
I
 
I
H
|
H
V
 
L
V
|
V
D
 
D
L
|
L
D
 
D
G
 
A
A
|
A
L
 
F
E
 
-
G
 
G
K
 
R
P
 
G
K
 
S
N
 
N
Y
 
H
K
 
E
V
 
L
V
 
L
E
 
A
S
 
E
I
 
V
V
 
V
K
 
G
S
 
K
V
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
Q
V
 
V
E
 
E
F
 
L
G
x
S
G
 
G
G
 
G
L
 
I
R
 
R
S
 
D
Y
 
D
E
 
E
A
 
S
V
 
L
K
 
A
S
 
A
M
 
A
F
 
L
E
 
A
I
 
T
G
 
G
V
 
C
D
 
A
R
 
R
V
 
V
V
 
N
I
 
V
G
 
G
S
 
T
L
 
A
A
 
A
Y
 
L
E
 
E
N
 
N
Q
 
P
E
 
Q
E
 
W
F
 
C
L
 
A
R
 
R
I
 
V
V
 
I
E
 
G
D
 
E
F
 
H
K
 
G
N
 
D
K
 
Q
V
 
V
I
 
A
V
 
V
G
 
G
I
 
L
D
|
D
A
 
V
K
 
Q
-
 
I
-
 
I
D
 
D
G
 
G
K
 
E
V
 
H
A
 
R
I
 
L
K
 
R
G
 
G
W
x
R
V
 
G
E
 
W
K
 
E
T
 
T
D
 
D
Y
 
G
T
 
G
P
 
D
L
 
L
-
 
W
E
 
D
F
 
V
A
 
L
K
 
E
K
 
R
Y
 
L
D
 
D
D
 
S
L
 
E
D
 
G
I
 
C
F
 
S
G
 
R
F
 
F
L
 
V
Y
 
V
T
 
T
D
 
D
V
 
I
N
 
T
R
 
K
D
|
D
G
|
G
A
 
T
M
 
L
V
 
G
G
 
G
P
 
P
N
 
N
L
 
L
E
 
D
G
 
L
T
 
L
K
 
A
Y
 
G
L
 
V
A
 
A
E
 
D
N
 
R
L
 
T
K
 
D
H
 
A
F
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
S
|
S
G
|
G
G
|
G
V
 
V
G
 
S
S
 
S
L
 
L
Q
 
D
D
 
D
V
 
L
I
 
R
N
 
A
L
 
I
Y
 
A
K
 
T
L
 
L
K
 
T
D
 
H
Y
 
R
G
 
G
V
 
V
F
 
E
G
 
G
V
 
A
V
 
I
V
 
V
G
|
G
K
|
K
A
 
A
I
 
L
Y
 
Y
E
 
A
G
 
R
K
 
R
I
 
F
K
 
T
L
 
L
E
 
P
E
 
Q

5abtA S.Enterica hisa mutant d7n, g102a, v106m, d176a
30% identity, 97% coverage: 6:238/239 of query aligns to 1:237/246 of 5abtA

query
sites
5abtA
F
 
M
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
I
 
L
D
x
N
L
 
L
K
 
I
D
 
D
G
 
G
K
 
T
V
 
V
V
 
V
R
 
R
L
 
L
Y
 
H
K
 
Q
G
|
G
E
 
D
F
 
Y
D
 
A
K
 
R
V
 
Q
K
 
R
V
 
D
Y
 
Y
K
 
G
D
 
N
N
 
D
P
 
P
V
 
L
D
 
P
M
 
R
A
 
L
K
 
Q
Y
 
D
F
 
Y
Q
 
A
D
 
A
C
 
Q
G
 
G
A
 
A
V
 
G
H
 
V
I
 
L
H
 
H
V
 
L
V
|
V
D
 
D
L
|
L
D
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
K
E
 
D
G
 
P
K
 
A
P
 
K
K
 
R
N
 
Q
Y
 
I
K
 
P
V
 
L
V
 
I
E
 
K
S
 
T
I
 
L
V
 
V
K
 
A
S
 
G
V
 
V
D
 
N
I
 
V
L
 
P
V
 
V
E
 
Q
F
 
V
G
 
G
G
 
G
G
|
G
L
 
V
R
|
R
S
 
T
Y
 
E
E
 
E
A
 
D
V
 
V
K
 
A
S
 
A
M
 
L
F
 
L
E
 
K
I
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
A
R
 
R
V
 
V
V
|
V
I
 
I
G
x
A
S
|
S
L
 
T
A
 
A
Y
 
M
E
 
K
N
 
S
Q
 
P
E
 
D
E
 
V
F
 
V
L
 
K
R
 
G
I
 
W
V
 
F
E
 
E
D
 
R
F
 
F
K
 
G
N
 
A
K
 
Q
V
 
A
I
 
L
V
 
V
-
 
L
G
 
A
I
 
L
D
|
D
A
 
V
K
 
R
-
 
I
-
 
D
-
 
E
-
 
H
-
 
G
D
 
T
G
 
K
K
 
Q
V
 
V
A
 
A
I
 
V
K
 
S
G
|
G
W
|
W
V
 
Q
E
 
E
K
 
N
T
 
S
D
 
G
Y
 
V
T
 
S
P
 
L
L
 
E
E
 
Q
F
 
L
A
 
V
K
 
E
K
 
T
Y
 
Y
D
 
L
D
 
P
L
 
V
D
 
G
I
 
L
F
 
K
G
 
H
F
 
V
L
 
L
Y
 
C
T
 
T
D
 
D
V
 
I
N
 
S
R
 
R
D
 
A
G
|
G
A
 
T
M
 
L
V
 
A
G
 
G
P
 
S
N
 
N
L
 
V
E
 
S
G
 
L
T
 
Y
K
 
E
Y
 
E
L
 
V
A
 
C
E
 
A
N
 
R
L
 
Y
K
 
P
H
 
Q
F
 
I
V
 
A
I
 
F
-
 
Q
A
 
S
S
|
S
G
|
G
G
 
G
V
 
I
G
 
G
S
 
D
L
 
I
Q
 
D
D
 
D
V
 
I
I
 
-
N
 
-
L
 
-
Y
 
A
K
 
A
L
 
L
K
 
R
D
 
G
Y
 
T
G
 
G
V
 
V
F
 
R
G
 
G
V
 
V
V
x
I
V
 
V
G
|
G
K
x
R
A
 
A
I
 
L
Y
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
I
 
F
K
 
T
L
 
V
E
 
K
E
 
E

Q9X0C7 1-(5-phosphoribosyl)-5-[(5-phosphoribosylamino)methylideneamino] imidazole-4-carboxamide isomerase; Phosphoribosylformimino-5-aminoimidazole carboxamide ribotide isomerase; EC 5.3.1.16 from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) (see paper)
28% identity, 97% coverage: 6:237/239 of query aligns to 2:234/241 of Q9X0C7

query
sites
Q9X0C7
F
 
L
I
 
V
I
 
V
P
 
P
A
 
A
I
 
I
D
|
D
L
 
L
K
 
F
D
 
R
G
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
A
R
 
R
L
 
M
Y
 
I
K
 
K
G
 
G
E
 
R
F
 
K
D
 
E
K
 
N
V
 
T
K
 
I
V
 
F
Y
 
Y
K
 
E
D
 
K
N
 
D
P
 
P
V
 
V
D
 
E
M
 
L
A
 
V
K
 
E
Y
 
K
F
 
L
Q
 
I
D
 
E
C
 
E
G
 
G
A
 
F
V
 
T
H
 
L
I
 
I
H
|
H
V
 
V
V
 
V
D
|
D
L
 
L
D
 
S
G
 
N
A
 
A
L
 
I
E
 
E
G
 
N
K
 
S
P
 
G
K
 
E
N
 
N
Y
 
L
K
 
P
V
 
V
V
 
L
E
 
E
S
 
K
I
 
L
V
 
S
K
 
E
S
 
F
V
 
A
D
 
E
I
 
-
L
 
H
V
 
I
E
 
Q
F
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
I
R
|
R
S
 
S
Y
 
L
E
 
D
A
 
Y
V
 
A
K
 
E
S
 
K
M
 
L
F
 
R
E
 
K
I
 
L
G
 
G
V
 
Y
D
 
R
R
 
R
V
 
Q
V
 
I
I
 
V
G
 
S
S
 
S
L
 
K
A
 
V
Y
 
L
E
 
E
N
 
D
Q
 
P
E
 
-
E
 
S
F
 
F
L
 
L
R
 
K
I
 
S
V
 
L
E
 
R
D
 
E
F
 
I
K
 
D
N
 
V
K
 
E
V
 
P
I
 
V
V
 
F
G
 
S
I
 
L
D
|
D
A
 
T
K
 
R
D
 
G
G
 
G
K
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
F
K
 
K
G
 
G
W
 
W
V
 
L
E
 
A
K
 
E
T
 
E
D
 
E
Y
 
I
T
 
D
P
 
P
L
 
V
E
 
S
F
 
L
A
 
L
K
 
K
K
 
R
Y
 
L
D
 
K
D
 
E
L
 
Y
D
 
G
I
 
L
F
 
E
G
 
E
F
 
I
L
 
V
Y
 
H
T
|
T
D
 
E
V
 
I
N
 
E
R
 
K
D
 
D
G
 
G
A
 
T
M
 
L
V
 
Q
G
 
E
P
 
H
N
 
D
L
 
F
E
 
S
G
 
L
T
 
T
K
 
K
Y
 
K
L
 
I
A
 
A
E
 
I
N
 
E
L
 
A
K
 
E
H
 
V
F
 
K
V
 
V
I
 
L
A
 
A
S
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
I
G
 
S
-
 
S
-
 
E
-
 
N
S
 
S
L
 
L
Q
 
K
D
 
T
V
 
A
I
 
Q
N
 
K
L
 
V
Y
 
H
K
 
T
L
 
E
K
 
T
D
 
N
Y
 
G
G
 
L
V
 
L
F
 
K
G
 
G
V
 
V
V
 
I
V
 
V
G
 
G
K
 
R
A
 
A
I
 
F
Y
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
I
I
 
L
K
 
T
L
 
V
E
 
E

5ab3A S.Enterica hisa mutant d7n, d10g, dup13-15, q24l, g102a (see paper)
29% identity, 97% coverage: 6:238/239 of query aligns to 1:234/241 of 5ab3A

query
sites
5ab3A
F
 
M
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
A
I
 
L
D
x
N
L
 
L
K
 
I
D
 
G
G
 
G
-
 
T
-
 
V
-
 
V
K
 
R
V
 
V
V
 
V
R
|
R
L
 
L
Y
 
H
K
 
Q
G
 
G
E
 
D
F
x
Y
D
 
A
K
 
R
V
 
L
K
 
R
V
 
D
Y
 
Y
K
 
G
D
 
N
N
 
D
P
 
P
V
 
L
D
 
P
M
 
R
A
 
L
K
 
Q
Y
 
D
F
 
Y
Q
 
A
D
 
A
C
 
Q
G
 
G
A
 
A
V
 
G
H
 
V
I
 
L
H
 
H
V
 
L
V
|
V
D
 
D
L
 
L
D
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
K
E
 
D
G
 
P
K
 
A
P
 
K
K
 
R
N
 
Q
Y
 
I
K
 
P
V
 
L
V
 
I
E
 
K
S
 
T
I
 
L
V
 
V
K
 
A
S
 
G
V
 
V
D
 
N
I
 
V
L
 
P
V
 
V
E
 
Q
F
 
V
G
 
G
G
 
G
G
|
G
L
 
V
R
 
R
S
 
T
Y
 
E
E
 
E
A
 
D
V
 
V
K
 
A
S
 
A
M
 
L
F
 
L
E
 
K
I
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
A
R
 
R
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
x
A
S
|
S
L
 
T
A
 
A
Y
 
V
E
 
K
N
 
S
Q
 
P
E
 
D
E
 
V
F
 
V
L
 
K
R
 
G
I
 
W
V
 
F
E
 
E
D
 
R
F
 
F
K
 
G
N
 
A
K
 
Q
V
 
A
I
 
L
V
 
V
-
 
L
G
x
A
I
 
L
D
|
D
A
 
V
K
 
R
D
 
I
G
 
D
K
 
E
V
 
H
A
 
G
I
 
T
K
 
K
G
 
-
W
 
Q
V
 
V
E
 
A
K
 
V
T
 
S
D
 
G
Y
 
V
T
 
S
P
 
L
L
 
E
E
 
Q
F
 
L
A
 
V
K
 
E
K
 
T
Y
 
Y
D
 
L
D
 
P
L
 
V
D
 
G
I
 
L
F
 
K
G
 
H
F
 
V
L
 
L
Y
 
C
T
 
T
D
 
D
V
 
I
N
 
S
R
 
R
D
 
D
G
|
G
A
 
T
M
 
L
V
 
A
G
 
G
P
 
S
N
 
N
L
 
V
E
 
S
G
 
L
T
 
Y
K
 
E
Y
 
E
L
 
V
A
 
C
E
 
A
N
 
R
L
 
Y
K
 
P
H
 
Q
F
 
I
V
 
A
I
 
F
-
 
Q
A
 
S
S
|
S
G
|
G
G
|
G
V
 
I
G
 
G
S
 
D
L
 
I
Q
 
D
D
 
D
V
 
I
I
 
-
N
 
-
L
 
-
Y
 
A
K
 
A
L
 
L
K
 
R
D
 
G
Y
 
T
G
 
G
V
 
V
F
 
R
G
 
G
V
 
V
V
 
I
V
 
V
G
|
G
K
x
R
A
 
A
I
 
L
Y
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
I
 
F
K
 
T
L
 
V
E
 
K
E
 
E

1h5yB Hisf protein from pyrobaculum aerophilum (see paper)
32% identity, 87% coverage: 1:207/239 of query aligns to 3:211/253 of 1h5yB

query
sites
1h5yB
M
 
M
S
 
A
L
 
L
K
 
R
E
 
-
F
 
-
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
C
I
 
L
D
|
D
L
 
I
K
 
D
D
 
G
G
 
G
K
 
A
V
 
K
V
 
V
R
 
V
L
 
V
Y
x
K
K
 
G
G
 
V
E
 
N
F
 
F
D
 
Q
K
 
G
V
 
I
K
 
R
V
 
E
Y
 
V
K
 
G
D
 
D
N
 
-
P
 
P
V
 
V
D
 
E
M
 
M
A
 
A
K
 
V
Y
 
R
F
 
Y
Q
 
E
D
 
E
C
 
E
G
 
G
A
 
A
V
 
D
H
 
E
I
 
I
H
 
A
V
 
I
V
 
L
D
 
D
L
 
I
D
 
T
G
 
A
A
 
A
L
 
P
E
 
E
G
 
G
K
 
R
P
 
A
K
 
T
N
 
F
Y
 
I
K
 
D
V
 
S
V
 
V
E
 
K
S
 
R
I
 
V
V
 
A
K
 
E
S
 
A
V
 
V
D
 
S
I
 
I
L
 
P
V
 
V
E
 
L
F
 
V
G
 
G
G
|
G
G
|
G
L
 
V
R
 
R
S
 
S
Y
 
L
E
 
E
A
 
D
V
 
A
K
 
T
S
 
T
M
 
L
F
 
F
E
 
R
I
 
A
G
 
G
V
 
A
D
 
D
R
 
K
V
 
V
V
 
S
I
 
V
G
x
N
S
x
T
L
 
A
A
 
A
Y
 
V
E
 
R
N
 
N
Q
 
P
E
 
Q
E
 
L
F
 
V
L
 
A
R
 
L
I
 
L
V
 
A
E
 
R
D
 
E
F
 
F
K
 
G
N
 
S
K
 
Q
-
 
S
V
 
T
I
 
V
V
 
V
G
x
A
I
 
I
D
|
D
A
 
A
K
 
K
-
 
W
D
 
N
G
 
G
-
 
E
-
 
Y
-
 
Y
K
 
E
V
 
V
A
 
Y
I
 
V
K
 
K
G
|
G
W
 
G
V
 
R
E
 
E
K
 
A
T
 
T
D
 
G
Y
 
L
T
 
D
P
 
A
L
 
V
E
 
K
F
 
W
A
 
A
K
 
K
K
 
E
Y
 
V
D
 
E
D
 
E
L
 
L
D
 
G
I
 
A
F
 
G
G
 
E
F
 
I
L
 
L
Y
 
L
T
|
T
D
 
S
V
 
I
N
 
D
R
 
R
D
|
D
G
|
G
A
 
T
M
 
G
V
 
L
G
 
G
P
 
Y
N
 
D
L
 
V
E
 
E
G
 
L
T
 
I
K
 
R
Y
 
R
L
 
V
A
 
A
E
 
D
N
 
S
L
 
V
K
 
R
H
 
I
F
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
S
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
A
G
 
G
S
 
R
L
 
V
Q
 
E

Sites not aligning to the query:

Q9X0C6 Imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF; IGP synthase cyclase subunit; IGP synthase subunit HisF; ImGP synthase subunit HisF; IGPS subunit HisF; EC 4.3.2.10 from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) (see paper)
27% identity, 86% coverage: 3:207/239 of query aligns to 2:208/253 of Q9X0C6

query
sites
Q9X0C6
L
 
L
K
 
A
E
 
K
F
 
R
I
 
I
I
 
I
P
 
A
A
x
C
I
 
L
D
|
D
L
 
V
K
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
R
V
 
V
V
 
V
R
x
K
L
 
-
Y
 
-
K
 
G
G
 
T
E
 
N
F
 
F
D
 
E
K
 
N
V
 
L
K
 
R
V
 
D
Y
 
S
K
 
G
D
 
D
N
 
-
P
 
P
V
 
V
D
 
E
M
 
L
A
 
G
K
 
K
Y
 
F
F
 
Y
Q
 
S
D
 
E
C
 
I
G
 
G
A
 
I
V
 
D
H
 
E
I
 
L
H
 
V
V
 
F
V
 
L
D
|
D
L
 
I
D
 
T
G
 
A
A
 
S
L
 
V
E
 
E
G
 
K
K
 
R
P
 
K
K
 
T
N
 
M
Y
 
L
K
 
E
V
 
L
V
 
V
E
 
E
S
 
K
I
 
V
V
 
A
K
 
E
S
 
Q
V
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
P
V
 
F
E
 
T
F
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
I
R
 
H
S
 
D
Y
 
F
E
 
E
A
 
T
V
 
A
K
 
S
S
 
E
M
 
L
F
 
I
E
 
L
I
 
R
G
 
G
V
 
A
D
 
D
R
 
K
V
 
V
V
 
S
I
 
I
G
x
N
S
 
T
L
 
A
A
 
A
Y
 
V
E
 
E
N
 
N
Q
 
P
E
 
S
E
 
L
F
 
I
L
 
T
R
 
Q
I
 
I
V
 
A
E
 
Q
D
 
T
F
 
F
K
 
G
N
 
S
K
 
Q
-
 
A
V
 
V
I
 
V
V
 
V
G
 
A
I
 
I
D
|
D
A
 
A
K
 
K
-
 
R
-
 
V
D
 
D
G
 
G
K
 
E
V
 
F
A
 
M
I
 
V
K
 
F
G
 
T
W
 
Y
V
 
S
E
 
G
K
 
K
T
 
K
D
 
N
Y
 
T
T
 
G
P
 
I
L
 
L
-
 
L
-
 
R
E
 
D
F
 
W
A
 
V
K
 
V
K
 
E
Y
 
V
D
 
E
D
 
K
L
 
R
D
 
G
I
 
A
F
 
G
G
 
E
F
 
I
L
 
L
Y
 
L
T
 
T
D
 
S
V
 
I
N
 
D
R
 
R
D
|
D
G
 
G
A
 
T
M
 
K
V
 
S
G
 
G
P
 
Y
N
x
D
L
 
T
E
 
E
G
 
M
T
 
I
K
 
R
Y
 
F
L
 
V
A
 
R
E
 
P
N
 
L
L
 
T
K
 
T
H
 
L
F
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
S
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
A
G
 
G
S
 
K
L
 
M
Q
 
E

7ac8A Molecular basis for the unique allosteric activation mechanism of the heterodimeric imidazole glycerol phosphate synthase complex. (see paper)
27% identity, 86% coverage: 3:207/239 of query aligns to 2:208/252 of 7ac8A

query
sites
7ac8A
L
 
L
K
 
A
E
 
K
F
 
R
I
 
I
I
 
I
P
 
A
A
 
C
I
 
L
D
|
D
L
 
V
K
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
R
V
 
V
V
 
V
R
 
K
L
 
-
Y
 
-
K
 
G
G
 
T
E
 
N
F
 
F
D
 
E
K
 
N
V
 
L
K
 
R
V
 
D
Y
 
S
K
 
G
D
 
D
N
 
-
P
 
P
V
 
V
D
 
E
M
 
L
A
 
G
K
 
K
Y
 
F
F
 
Y
Q
 
S
D
 
E
C
 
I
G
 
G
A
 
I
V
 
D
H
 
E
I
 
L
H
 
V
V
 
F
V
x
L
D
 
D
L
x
I
D
 
T
G
 
A
A
 
S
L
 
V
E
 
E
G
 
K
K
 
R
P
 
K
K
 
T
N
 
M
Y
 
L
K
 
E
V
 
L
V
 
V
E
 
E
S
 
K
I
 
V
V
 
A
K
 
E
S
 
Q
V
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
P
V
 
F
E
 
T
F
 
V
G
 
G
G
 
G
G
|
G
L
 
I
R
 
H
S
 
D
Y
 
F
E
 
E
A
 
T
V
 
A
K
 
S
S
 
E
M
 
L
F
 
I
E
 
L
I
 
R
G
 
G
V
 
A
D
 
D
R
 
K
V
 
V
V
 
S
I
 
I
G
x
N
S
x
T
L
 
A
A
 
A
Y
 
V
E
 
E
N
 
N
Q
 
P
E
 
S
E
 
L
F
 
I
L
 
T
R
 
Q
I
 
I
V
 
A
E
 
Q
D
 
T
F
 
F
K
 
G
N
 
S
K
 
Q
-
 
A
V
 
V
I
 
V
V
 
V
G
 
A
I
 
I
D
|
D
A
 
A
K
 
K
-
 
R
-
 
V
D
 
D
G
 
G
K
 
E
V
 
F
A
 
M
I
 
V
K
 
F
G
 
T
W
 
Y
V
x
S
E
 
G
K
 
K
T
 
K
D
 
N
Y
 
T
T
 
G
P
 
I
L
 
L
-
 
L
-
 
R
E
 
D
F
 
W
A
 
V
K
 
V
K
 
E
Y
 
V
D
 
E
D
 
K
L
 
R
D
 
G
I
 
A
F
 
G
G
 
E
F
 
I
L
 
L
Y
 
L
T
 
T
D
 
S
V
 
I
N
 
D
R
 
R
D
|
D
G
|
G
A
 
T
M
 
K
V
 
S
G
 
G
P
 
Y
N
 
D
L
 
T
E
 
E
G
 
M
T
 
I
K
 
R
Y
 
F
L
 
V
A
 
R
E
 
P
N
 
L
L
 
T
K
 
T
H
 
L
F
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
S
|
S
G
 
G
G
 
G
V
 
A
G
 
G
S
 
K
L
 
M
Q
 
E

Sites not aligning to the query:

1gpwC Structural evidence for ammonia tunneling across the (beta/alpha)8 barrel of the imidazole glycerol phosphate synthase bienzyme complex. (see paper)
27% identity, 86% coverage: 3:207/239 of query aligns to 2:208/253 of 1gpwC

query
sites
1gpwC
L
 
L
K
 
A
E
 
K
F
 
R
I
 
I
I
 
I
P
 
A
A
 
C
I
 
L
D
x
N
L
 
V
K
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
R
V
 
V
V
 
V
R
 
K
L
 
-
Y
 
-
K
 
G
G
 
T
E
 
N
F
 
F
D
 
E
K
 
N
V
 
L
K
 
R
V
 
D
Y
 
S
K
 
G
D
 
D
N
 
-
P
 
P
V
 
V
D
 
E
M
 
L
A
 
G
K
 
K
Y
 
F
F
 
Y
Q
 
S
D
 
E
C
 
I
G
 
G
A
 
I
V
 
D
H
 
E
I
 
L
H
 
V
V
 
F
V
 
L
D
 
D
L
 
I
D
 
T
G
 
A
A
 
S
L
 
V
E
 
E
G
 
K
K
 
R
P
 
K
K
 
T
N
 
M
Y
 
L
K
 
E
V
 
L
V
 
V
E
 
E
S
 
K
I
 
V
V
 
A
K
 
E
S
 
Q
V
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
P
V
 
F
E
 
T
F
 
V
G
 
G
G
 
G
G
|
G
L
 
I
R
 
H
S
 
D
Y
 
F
E
 
E
A
 
T
V
 
A
K
 
S
S
 
E
M
 
L
F
 
I
E
 
L
I
 
R
G
 
G
V
 
A
D
 
D
R
 
K
V
 
V
V
 
S
I
 
I
G
x
N
S
x
T
L
 
A
A
 
A
Y
 
V
E
 
E
N
 
N
Q
 
P
E
 
S
E
 
L
F
 
I
L
 
T
R
 
Q
I
 
I
V
 
A
E
 
Q
D
 
T
F
 
F
K
 
G
N
 
S
K
 
Q
-
 
A
V
 
V
I
 
V
V
 
V
G
 
A
I
 
I
D
|
D
A
 
A
K
 
K
-
 
R
-
 
V
D
 
D
G
 
G
K
 
E
V
 
F
A
 
M
I
 
V
K
 
F
G
 
T
W
 
Y
V
 
S
E
 
G
K
 
K
T
 
K
D
 
N
Y
 
T
T
 
G
P
 
I
L
 
L
-
 
L
-
 
R
E
 
D
F
 
W
A
 
V
K
 
V
K
 
E
Y
 
V
D
 
E
D
 
K
L
 
R
D
 
G
I
 
A
F
 
G
G
 
E
F
 
I
L
 
L
Y
 
L
T
 
T
D
 
S
V
 
I
N
 
D
R
 
R
D
|
D
G
|
G
A
 
T
M
 
K
V
 
S
G
 
G
P
 
Y
N
 
D
L
 
T
E
 
E
G
 
M
T
 
I
K
 
R
Y
 
F
L
 
V
A
 
R
E
 
P
N
 
L
L
 
T
K
 
T
H
 
L
F
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
S
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
A
G
 
G
S
 
K
L
 
M
Q
 
E

Sites not aligning to the query:

3zr4E Structural evidence for ammonia tunneling across the (beta-alpha)8 barrel of the imidazole glycerol phosphate synthase bienzyme complex (see paper)
26% identity, 86% coverage: 3:207/239 of query aligns to 2:199/244 of 3zr4E

query
sites
3zr4E
L
 
L
K
 
A
E
 
K
F
 
R
I
 
I
I
 
I
P
 
A
A
 
C
I
 
L
D
|
D
L
 
V
K
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
R
V
 
V
V
 
V
R
 
K
L
 
-
Y
 
-
K
 
-
G
 
-
E
 
-
F
 
-
D
 
-
K
 
-
V
 
-
K
 
-
V
 
-
Y
 
-
K
 
S
D
 
G
N
 
D
P
 
P
V
 
V
D
 
E
M
 
L
A
 
G
K
 
K
Y
 
F
F
 
Y
Q
 
S
D
 
E
C
 
I
G
 
G
A
 
I
V
 
D
H
 
E
I
 
L
H
 
V
V
 
F
V
 
L
D
 
D
L
 
I
D
 
T
G
 
A
A
 
S
L
 
V
E
 
E
G
 
K
K
 
R
P
 
K
K
 
T
N
 
M
Y
 
L
K
 
E
V
 
L
V
 
V
E
 
E
S
 
K
I
 
V
V
 
A
K
 
E
S
 
Q
V
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
P
V
 
F
E
 
T
F
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
I
R
 
H
S
 
D
Y
 
F
E
 
E
A
 
T
V
 
A
K
 
S
S
 
E
M
 
L
F
 
I
E
 
L
I
 
R
G
 
G
V
 
A
D
 
D
R
 
K
V
 
V
V
 
S
I
 
I
G
 
N
S
 
T
L
 
A
A
 
A
Y
 
V
E
 
E
N
 
N
Q
 
P
E
 
S
E
 
L
F
 
I
L
 
T
R
 
Q
I
 
I
V
 
A
E
 
Q
D
 
T
F
 
F
K
 
G
N
 
S
K
 
Q
-
 
A
V
 
V
I
 
V
V
 
V
G
 
A
I
 
I
D
|
D
A
 
A
K
 
K
-
 
R
-
 
V
D
 
D
G
 
G
K
 
E
V
 
F
A
 
M
I
 
V
K
 
F
G
 
T
W
 
Y
V
 
S
E
 
G
K
 
K
T
 
K
D
 
N
Y
 
T
T
 
G
P
 
I
L
 
L
-
 
L
-
 
R
E
 
D
F
 
W
A
 
V
K
 
V
K
 
E
Y
 
V
D
 
E
D
 
K
L
 
R
D
 
G
I
 
A
F
 
G
G
 
E
F
 
I
L
 
L
Y
 
L
T
 
T
D
 
S
V
 
I
N
 
D
R
 
R
D
 
D
G
 
G
A
 
T
M
 
K
V
 
S
G
 
G
P
 
Y
N
 
D
L
 
T
E
 
E
G
 
M
T
 
I
K
x
R
Y
 
F
L
 
V
A
 
R
E
 
P
N
 
L
L
 
T
K
 
T
H
 
L
F
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
S
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
A
G
 
G
S
 
K
L
 
M
Q
 
E

Sites not aligning to the query:

7qc8A Imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF (see paper)
27% identity, 86% coverage: 2:207/239 of query aligns to 1:208/250 of 7qc8A

query
sites
7qc8A
S
 
S
L
 
L
K
 
A
E
 
K
F
 
R
I
 
I
I
 
I
P
 
A
A
 
A
I
 
L
D
x
E
L
 
V
K
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
R
V
 
V
V
 
V
R
 
K
L
 
-
Y
 
-
K
 
G
G
 
T
E
 
N
F
 
F
D
 
E
K
 
N
V
 
L
K
 
R
V
 
D
Y
 
S
K
 
G
D
 
D
N
 
-
P
 
P
V
 
A
D
 
E
M
 
L
A
 
G
K
 
K
Y
 
F
F
 
Y
Q
 
S
D
 
E
C
 
I
G
 
G
A
 
I
V
 
D
H
 
E
I
 
L
H
 
V
V
 
F
V
x
H
D
 
D
L
x
H
D
 
T
G
 
A
A
 
S
L
 
V
E
 
E
G
 
K
K
 
R
P
 
K
K
 
T
N
 
M
Y
 
L
K
 
E
V
 
L
V
 
V
E
 
E
S
 
K
I
 
V
V
 
A
K
 
E
S
 
Q
V
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
P
V
 
F
E
 
T
F
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
I
R
 
H
S
 
D
Y
 
F
E
 
E
A
 
T
V
 
A
K
 
S
S
 
E
M
 
L
F
 
I
E
 
L
I
 
R
G
 
G
V
 
A
D
 
D
R
 
K
V
 
V
V
 
S
I
 
I
G
 
N
S
 
T
L
 
A
A
 
A
Y
 
V
E
 
E
N
 
N
Q
 
P
E
 
S
E
 
L
F
 
I
L
 
T
R
 
Q
I
 
I
V
 
A
E
 
Q
D
 
T
F
 
F
K
 
G
N
 
S
K
 
Q
-
 
A
V
 
V
I
 
V
V
 
V
G
 
A
I
 
I
D
 
D
A
 
A
K
 
K
-
 
R
-
 
V
D
 
D
G
 
G
K
 
E
V
 
F
A
 
M
I
 
V
K
 
F
G
 
T
W
 
Y
V
 
S
E
 
G
K
 
K
T
 
K
D
 
N
Y
 
T
T
 
G
P
 
I
L
 
L
-
 
L
-
 
R
E
 
D
F
 
W
A
 
V
K
 
V
K
 
E
Y
 
V
D
 
E
D
 
K
L
 
R
D
 
G
I
 
A
F
 
G
G
 
E
F
 
I
L
 
L
Y
 
L
T
 
T
D
 
S
V
 
I
N
 
D
R
 
R
D
 
D
G
 
G
A
 
T
M
 
K
V
 
S
G
 
G
P
 
Y
N
 
D
L
 
T
E
 
E
G
 
M
T
 
I
K
 
R
Y
 
F
L
 
V
A
 
R
E
 
P
N
 
L
L
 
T
K
 
T
H
 
L
F
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
S
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
A
G
 
G
S
 
K
L
 
M
Q
 
E

2wjzE Crystal structure of (hish) k181a y138a mutant of imidazoleglycerolphosphate synthase (hish hisf) which displays constitutive glutaminase activity (see paper)
26% identity, 86% coverage: 3:207/239 of query aligns to 2:194/237 of 2wjzE

query
sites
2wjzE
L
 
L
K
 
A
E
 
K
F
 
R
I
 
I
I
 
I
P
 
A
A
 
C
I
 
L
D
|
D
L
 
V
K
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
R
V
 
V
V
 
V
R
 
-
L
 
-
Y
 
-
K
 
-
G
 
-
E
 
-
F
 
-
D
 
-
K
 
-
V
 
-
K
 
-
V
 
-
Y
 
-
K
 
-
D
 
G
N
 
D
P
 
P
V
 
V
D
 
E
M
 
L
A
 
G
K
 
K
Y
 
F
F
 
Y
Q
 
S
D
 
E
C
 
I
G
 
G
A
 
I
V
 
D
H
 
E
I
 
L
H
 
V
V
 
F
V
 
L
D
 
D
L
 
I
D
 
T
G
 
A
A
 
K
L
 
-
E
 
-
G
 
-
K
 
R
P
 
K
K
 
T
N
 
M
Y
 
L
K
 
E
V
 
L
V
 
V
E
 
E
S
 
K
I
 
V
V
 
A
K
 
E
S
 
Q
V
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
P
V
 
F
E
 
T
F
 
V
G
 
G
G
 
G
G
|
G
L
 
I
R
 
H
S
 
D
Y
 
F
E
 
E
A
 
T
V
 
A
K
 
S
S
 
E
M
 
L
F
 
I
E
 
L
I
 
R
G
 
G
V
 
A
D
 
D
R
 
K
V
 
V
V
 
S
I
 
I
G
x
N
S
x
T
L
 
A
A
 
A
Y
 
V
E
 
E
N
 
N
Q
 
P
E
 
S
E
 
L
F
 
I
L
 
T
R
 
Q
I
 
I
V
 
A
E
 
Q
D
 
T
F
 
F
K
 
G
N
 
S
K
 
Q
-
 
A
V
 
V
I
 
V
V
 
V
G
 
A
I
 
I
D
|
D
A
 
A
K
 
K
-
 
R
-
 
V
D
 
D
G
 
G
K
 
E
V
 
F
A
 
M
I
 
V
K
 
F
G
 
T
W
 
Y
V
 
S
E
 
G
K
 
K
T
 
K
D
 
N
Y
 
T
T
 
G
P
 
I
L
 
L
-
 
L
-
 
R
E
 
D
F
 
W
A
 
V
K
 
V
K
 
E
Y
 
V
D
 
E
D
 
K
L
 
R
D
 
G
I
 
A
F
 
G
G
 
E
F
 
I
L
 
L
Y
 
L
T
 
T
D
 
S
V
 
I
N
 
D
R
 
R
D
 
D
G
 
G
A
 
T
M
 
K
V
 
S
G
 
G
P
 
Y
N
 
D
L
 
T
E
 
E
G
 
M
T
 
I
K
 
R
Y
 
F
L
 
V
A
 
R
E
 
P
N
 
L
L
 
T
K
 
T
H
 
L
F
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
S
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
A
G
 
G
S
 
K
L
 
M
Q
 
E

P60664 Imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF; IGP synthase cyclase subunit; IGP synthase subunit HisF; ImGP synthase subunit HisF; IGPS subunit HisF; EC 4.3.2.10 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
25% identity, 99% coverage: 3:239/239 of query aligns to 2:244/258 of P60664

query
sites
P60664
L
 
L
K
 
A
E
 
K
F
x
R
I
 
I
I
 
I
P
 
P
A
 
C
I
 
L
D
 
D
L
 
V
K
 
R
D
 
D
G
 
G
K
 
Q
V
 
V
V
 
V
R
 
-
L
 
-
Y
 
-
K
 
K
G
 
G
-
 
V
E
 
Q
F
 
F
D
 
R
K
 
N
V
 
H
K
 
E
V
 
I
Y
 
I
K
 
G
D
 
D
N
 
-
P
 
I
V
 
V
D
 
P
M
 
L
A
 
A
K
 
K
Y
 
R
F
 
Y
Q
 
A
D
 
E
C
 
E
G
 
G
A
 
A
V
 
D
H
x
E
I
 
L
H
 
V
V
 
F
V
 
Y
D
 
D
L
 
I
D
 
T
G
 
A
A
 
S
L
 
S
E
 
D
G
 
G
K
 
R
P
 
V
K
 
V
N
 
D
Y
 
K
K
 
S
V
 
W
V
 
V
E
 
S
S
 
R
I
 
V
V
 
A
K
 
E
S
 
V
V
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
P
V
 
F
E
 
C
F
 
V
G
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
I
R
 
K
S
 
S
Y
 
L
E
 
E
A
 
D
V
 
A
K
 
A
S
 
K
M
 
I
F
 
L
E
 
S
I
 
F
G
 
G
V
 
A
D
 
D
R
 
K
V
 
I
V
 
S
I
 
I
G
 
N
S
 
S
L
 
P
A
 
A
Y
 
L
E
 
A
N
 
D
Q
 
P
E
 
T
E
 
L
F
 
I
L
 
T
R
 
R
I
 
L
V
 
A
E
 
D
D
 
R
F
 
F
K
 
G
-
 
V
N
x
Q
K
x
C
V
 
I
I
 
V
V
 
V
G
 
G
I
 
I
-
 
D
-
 
T
-
 
W
-
 
Y
D
 
D
A
 
A
K
 
E
D
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
Y
A
 
H
I
 
V
K
 
N
G
 
Q
W
 
Y
-
 
T
-
 
G
-
 
D
-
 
E
-
 
S
-
 
R
V
 
T
E
 
R
K
 
V
T
 
T
D
 
Q
Y
 
W
T
 
E
P
 
T
L
 
L
E
 
D
F
 
W
A
 
V
K
 
Q
K
 
E
Y
 
V
D
 
Q
D
 
K
L
 
R
D
 
G
I
 
A
F
 
G
G
 
E
F
 
I
L
 
V
Y
 
L
T
 
N
D
 
M
V
 
M
N
 
N
R
 
Q
D
 
D
G
 
G
A
 
V
M
 
R
V
 
N
G
 
G
P
 
Y
N
 
D
L
 
L
E
 
E
G
 
Q
T
 
L
K
 
K
Y
 
K
L
 
V
A
 
R
E
 
E
N
 
V
L
 
C
K
 
H
H
 
V
F
 
P
V
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
A
G
 
G
S
 
T
L
 
M
Q
 
E
D
 
H
V
 
F
I
 
L
N
 
E
L
 
A
Y
 
F
K
 
-
L
 
-
K
 
R
D
 
D
Y
 
A
G
 
D
V
 
V
F
 
D
G
 
G
V
 
A
V
 
L
V
 
A
G
 
A
K
 
S
A
 
V
I
 
F
Y
 
H
E
 
K
G
 
Q
K
 
I
I
 
I
K
 
N
L
 
I
E
 
G
E
 
E
L
 
L

4ewnD Structure of hisf-d130v+d176v with bound rcdrp (see paper)
26% identity, 86% coverage: 3:207/239 of query aligns to 1:201/243 of 4ewnD

query
sites
4ewnD
L
 
L
K
 
A
E
 
K
F
 
R
I
 
I
I
 
I
P
 
A
A
 
C
I
 
L
D
 
D
L
 
V
K
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
R
V
 
V
V
 
V
R
 
K
L
 
-
Y
 
-
K
 
G
G
 
T
E
 
N
F
 
F
D
 
E
K
 
N
V
 
L
K
 
R
V
 
D
Y
 
S
K
 
G
D
 
D
N
 
-
P
 
P
V
 
V
D
 
E
M
 
L
A
 
G
K
 
K
Y
 
F
F
 
Y
Q
 
S
D
 
E
C
 
I
G
 
G
A
 
I
V
 
D
H
 
E
I
 
L
H
 
V
V
 
F
V
 
L
D
 
D
L
 
I
D
 
T
G
 
K
A
 
T
L
 
M
E
 
-
G
 
-
K
 
-
P
 
-
K
 
-
N
 
-
Y
 
L
K
 
E
V
 
L
V
 
V
E
 
E
S
 
K
I
 
V
V
 
A
K
 
E
S
 
Q
V
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
P
V
 
F
E
 
T
F
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
I
R
 
H
S
 
D
Y
 
F
E
 
E
A
 
T
V
 
A
K
 
S
S
 
E
M
 
L
F
 
I
E
 
L
I
 
R
G
 
G
V
 
A
D
 
D
R
 
K
V
 
V
V
 
S
I
 
I
G
 
N
S
 
T
L
 
A
A
 
A
Y
 
V
E
 
E
N
 
N
Q
 
P
E
 
S
E
 
L
F
 
I
L
 
T
R
 
Q
I
 
I
V
 
A
E
 
Q
D
 
T
F
 
F
K
 
G
N
 
S
K
 
Q
-
 
A
V
 
V
I
 
V
V
 
V
G
 
A
I
 
I
D
x
V
A
 
A
K
 
K
-
 
R
-
 
V
D
 
D
G
 
G
K
 
E
V
 
F
A
 
M
I
 
V
K
 
F
G
 
T
W
 
Y
V
 
S
E
 
G
K
 
K
T
 
K
D
 
N
Y
 
T
T
 
G
P
 
I
L
 
L
-
 
L
-
 
R
E
 
D
F
 
W
A
 
V
K
 
V
K
 
E
Y
 
V
D
 
E
D
 
K
L
 
R
D
 
G
I
 
A
F
 
G
G
 
E
F
 
I
L
 
L
Y
 
L
T
 
T
D
 
S
V
 
I
N
 
D
R
 
R
D
 
V
G
|
G
A
 
T
M
 
K
V
 
S
G
 
G
P
 
Y
N
 
D
L
 
T
E
 
E
G
 
M
T
 
I
K
 
R
Y
 
F
L
 
V
A
 
R
E
 
P
N
 
L
L
 
T
K
 
T
H
 
L
F
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
S
|
S
G
|
G
G
|
G
V
 
A
G
 
G
S
 
K
L
 
M
Q
 
E

Sites not aligning to the query:

5d2tA Directed evolutionary changes in kemp eliminase ke07 - crystal 3 wild type
25% identity, 87% coverage: 7:213/239 of query aligns to 4:212/251 of 5d2tA

query
sites
5d2tA
I
 
I
I
 
I
P
 
A
A
 
A
I
 
L
D
 
I
L
 
V
K
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
R
V
 
V
V
 
V
R
 
K
L
 
-
Y
 
-
K
 
G
G
 
S
E
 
N
F
 
F
D
 
E
K
 
N
V
 
L
K
 
R
V
 
D
Y
 
S
K
 
G
D
 
D
N
 
-
P
 
P
V
 
V
D
 
E
M
 
L
A
 
G
K
 
K
Y
 
F
F
 
Y
Q
 
S
D
 
E
C
 
I
G
 
G
A
 
I
V
 
D
H
 
E
I
 
L
H
 
S
V
 
F
V
x
W
D
 
D
L
 
I
D
 
T
G
 
A
A
 
S
L
 
V
E
 
E
G
 
K
K
 
R
P
 
K
K
 
T
N
 
M
Y
 
L
K
 
E
V
 
L
V
 
V
E
 
E
S
 
K
I
 
V
V
 
A
K
 
E
S
 
Q
V
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
P
V
 
F
E
 
T
F
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
I
R
 
H
S
 
D
Y
 
F
E
 
E
A
 
T
V
 
A
K
 
S
S
 
E
M
 
L
F
 
I
E
 
L
I
 
R
G
 
G
V
 
A
D
 
D
R
 
K
V
 
V
V
x
E
I
 
I
G
 
N
S
 
T
L
 
A
A
 
A
Y
 
V
E
 
E
N
 
N
Q
 
P
E
 
S
E
 
L
F
 
I
L
 
T
R
 
Q
I
 
I
V
 
A
E
 
Q
D
 
T
F
 
F
K
 
G
N
 
S
K
 
Q
-
 
A
V
 
V
I
 
V
V
 
V
G
x
Y
I
 
I
D
 
A
A
 
A
K
 
K
-
 
R
-
 
V
D
 
D
G
 
G
K
 
E
V
 
F
A
 
M
I
 
V
K
 
F
G
 
T
W
 
Y
V
 
S
E
 
G
K
 
K
T
 
K
D
 
N
Y
 
T
T
 
G
P
 
I
L
 
L
-
 
L
-
 
R
-
 
D
-
 
W
-
 
V
-
 
V
E
 
E
F
 
V
A
 
E
K
 
K
K
 
R
Y
 
G
D
 
A
D
 
G
L
 
E
D
 
I
I
 
V
F
 
L
G
 
G
F
 
-
L
 
-
Y
 
-
T
 
-
D
 
S
V
 
I
N
 
D
R
 
R
D
 
L
G
 
G
A
 
T
M
 
K
V
 
S
G
 
G
P
 
Y
N
 
D
L
 
T
E
 
E
G
 
M
T
 
I
K
 
R
Y
 
F
L
 
V
A
 
R
E
 
P
N
 
L
L
 
T
K
 
T
H
 
L
F
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
S
 
H
G
 
G
G
 
G
V
 
A
G
 
G
S
 
K
L
 
M
Q
 
E
D
 
H
V
 
F
I
 
L
N
 
E
L
 
A
Y
 
F

Sites not aligning to the query:

6dnjA Directed evolutionary changes in kemp eliminase ke07 - crystal 28 round 5 (see paper)
27% identity, 54% coverage: 3:130/239 of query aligns to 1:125/250 of 6dnjA

query
sites
6dnjA
L
 
L
K
 
A
E
 
K
F
 
R
I
 
I
I
 
D
P
 
A
A
 
A
I
 
L
D
 
I
L
 
M
K
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
R
V
 
V
V
 
V
R
 
K
L
 
-
Y
 
-
K
 
G
G
 
S
E
 
N
F
 
F
D
 
E
K
 
N
V
 
L
K
 
R
V
 
D
Y
 
S
K
 
G
D
 
D
N
 
-
P
 
P
V
 
V
D
 
E
M
 
L
A
 
G
K
 
K
Y
 
F
F
 
Y
Q
 
S
D
 
E
C
 
I
G
 
G
A
 
I
V
 
D
H
 
E
I
 
L
H
 
S
V
 
F
V
x
W
D
 
D
L
 
I
D
 
T
G
 
A
A
 
S
L
 
V
E
 
E
G
 
K
K
 
R
P
 
K
K
 
T
N
 
M
Y
 
L
K
 
E
V
 
L
V
 
V
E
 
E
S
 
K
I
 
V
V
 
A
K
 
E
S
 
Q
V
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
P
V
 
F
E
 
T
F
 
V
G
|
G
G
|
G
G
 
G
L
 
I
R
 
H
S
 
D
Y
 
F
E
 
E
A
 
T
V
 
A
K
 
S
S
 
E
M
 
L
F
 
I
E
 
L
I
 
R
G
 
G
V
 
A
D
 
D
R
 
K
V
 
V
V
 
E
I
 
I
G
x
N
S
 
T
L
 
A
A
 
A
Y
 
V
E
 
E
N
 
N
Q
 
P
E
 
S
E
 
L
F
 
I
L
 
T
R
 
Q
I
 
I
V
 
A
E
 
Q
D
 
T
F
 
F
K
 
G
N
 
S
K
 
Q
V
 
A
I
 
V
V
 
V

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_012675024.1 NCBI__GCF_000021545.1:WP_012675024.1
MSLKEFIIPAIDLKDGKVVRLYKGEFDKVKVYKDNPVDMAKYFQDCGAVHIHVVDLDGAL
EGKPKNYKVVESIVKSVDILVEFGGGLRSYEAVKSMFEIGVDRVVIGSLAYENQEEFLRI
VEDFKNKVIVGIDAKDGKVAIKGWVEKTDYTPLEFAKKYDDLDIFGFLYTDVNRDGAMVG
PNLEGTKYLAENLKHFVIASGGVGSLQDVINLYKLKDYGVFGVVVGKAIYEGKIKLEEL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory