SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012676449.1 NCBI__GCF_000021565.1:WP_012676449.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6cgqA Threonine synthase from bacillus subtilis atcc 6633 with plp and plp- ala (see paper)
41% identity, 78% coverage: 56:379/415 of query aligns to 3:310/339 of 6cgqA

query
sites
6cgqA
L
 
I
W
 
H
R
 
Q
Y
 
Y
V
 
K
D
 
E
L
 
F
L
 
L
P
 
P
V
 
V
D
 
T
N
 
D
-
 
Q
-
 
T
P
 
P
K
 
A
V
 
L
G
 
T
L
 
L
S
 
H
A
 
E
G
 
G
F
 
N
T
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
I
K
 
H
A
 
L
E
 
P
K
 
K
L
 
L
G
 
S
K
 
E
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
I
K
 
E
N
 
-
L
 
L
Y
 
H
I
 
V
K
 
K
D
 
T
D
 
E
S
 
G
V
 
V
N
 
N
H
 
-
P
 
P
T
 
T
L
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
D
 
D
R
 
R
V
 
G
V
 
M
A
 
V
V
 
M
A
 
A
L
 
V
S
 
A
K
 
K
A
 
A
K
 
K
E
 
E
F
 
E
G
 
G
F
 
N
D
 
D
T
 
T
A
 
I
A
 
M
C
 
C
A
 
A
S
 
S
T
|
T
G
 
G
N
|
N
L
 
T
A
 
S
N
 
A
S
 
A
V
 
A
A
 
A
A
 
A
N
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
R
S
 
A
G
 
N
M
 
M
K
 
K
C
 
C
Y
 
I
V
 
V
F
 
I
I
 
I
P
 
P
S
 
-
N
 
-
L
 
-
E
 
-
T
 
-
N
 
N
K
 
K
I
 
L
I
 
A
G
 
Q
S
 
A
L
 
V
V
 
M
F
 
Y
N
 
G
P
 
A
T
 
E
V
 
I
V
 
I
A
 
A
V
 
I
D
 
D
G
 
G
N
 
N
Y
 
F
D
 
D
D
 
D
V
 
A
N
 
L
R
 
K
L
 
I
S
 
V
S
 
R
E
 
S
I
 
I
A
 
C
N
 
E
E
 
K
F
 
S
G
 
P
W
 
I
A
 
A
F
 
L
V
 
V
N
 
N
I
 
-
N
 
S
V
 
V
R
 
N
P
 
P
F
 
Y
Y
 
R
S
 
L
E
 
E
G
 
G
S
 
Q
K
 
K
T
 
T
L
 
A
A
 
A
F
 
F
E
 
E
V
 
V
A
 
C
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
W
 
-
K
 
E
A
 
A
P
 
P
D
 
D
A
 
V
V
 
L
V
 
A
A
 
I
P
 
P
L
x
V
A
x
G
S
x
N
G
x
A
S
x
G
L
x
N
Y
 
I
T
 
S
K
 
A
I
 
Y
W
 
W
K
 
K
G
 
G
F
 
F
N
 
K
E
 
E
L
 
Y
K
 
H
E
 
E
V
 
K
G
 
N
L
 
G
I
 
T
S
 
S
D
 
-
N
 
-
P
 
L
P
 
P
R
 
K
M
 
M
Y
 
R
G
 
G
A
 
F
Q
x
E
A
 
A
E
 
E
G
 
G
C
x
S
S
 
A
P
 
A
I
 
I
Y
 
V
K
 
-
A
 
-
F
 
-
K
 
-
E
 
-
N
 
-
R
 
R
D
 
N
W
 
E
I
 
V
V
 
I
P
 
-
E
 
E
K
 
N
P
 
P
D
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
K
 
T
S
x
A
I
 
I
A
 
R
I
 
I
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
A
D
 
S
G
 
W
P
 
D
Y
 
K
A
 
A
V
 
V
K
 
K
V
 
A
G
 
A
K
 
E
E
 
E
S
 
S
S
 
N
G
 
G
D
 
K
M
 
I
E
 
D
I
 
E
A
 
V
S
 
T
D
 
D
Q
 
D
E
 
E
I
 
I
I
 
L
E
 
H
G
 
A
I
 
Y
K
 
Q
L
 
L
L
 
I
A
 
A
R
 
R
T
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
V
F
 
F
T
 
A
E
|
E
T
 
P
A
 
G
G
 
S
G
 
C
T
 
A
T
 
S
I
 
I
A
 
A
V
 
G
L
 
V
K
 
L
K
 
K
L
 
Q
A
 
V
E
 
K
K
 
S
G
 
G
A
 
E
F
 
I
D
 
P
P
 
K
E
 
G
E
 
S
T
 
K
V
 
V
V
 
V
V
 
A
Y
 
V
I
 
L
T
|
T
G
|
G
N
 
N
G
 
G
Y
 
L
K
 
K

6nmxA Threonine synthase from bacillus subtilis atcc 6633 with plp and appa (see paper)
40% identity, 78% coverage: 56:379/415 of query aligns to 7:320/350 of 6nmxA

query
sites
6nmxA
L
 
I
W
 
H
R
 
Q
Y
 
Y
V
 
K
D
 
E
L
 
F
L
 
L
P
 
P
V
 
V
D
 
T
N
 
D
-
 
Q
-
 
T
P
 
P
K
 
A
V
 
L
G
 
T
L
 
L
S
 
H
A
 
E
G
 
G
F
 
N
T
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
I
K
 
H
A
 
L
E
 
P
K
 
K
L
 
L
G
 
S
K
 
E
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
I
K
 
E
N
 
-
L
 
L
Y
 
H
I
 
V
K
 
K
D
 
T
D
 
E
S
 
G
V
 
V
N
 
N
H
 
-
P
 
P
T
 
T
L
 
G
S
 
S
F
 
F
K
|
K
D
 
D
R
 
R
V
 
G
V
 
M
A
 
V
V
 
M
A
 
A
L
 
V
S
 
A
K
 
K
A
 
A
K
 
K
E
 
E
F
 
E
G
 
G
F
 
N
D
 
D
T
 
T
A
 
I
A
 
M
C
 
C
A
 
A
S
|
S
T
|
T
G
 
G
N
|
N
L
x
T
A
 
S
N
 
A
S
 
A
V
 
A
A
 
A
A
 
A
N
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
R
S
 
A
G
 
N
M
 
M
K
 
K
C
 
C
Y
 
I
V
 
V
F
 
I
I
 
I
P
 
P
S
 
N
N
 
G
-
 
K
L
 
I
E
 
A
T
 
F
N
 
G
K
 
K
I
 
L
I
 
A
G
 
Q
S
 
A
L
 
V
V
 
M
F
 
Y
N
 
G
P
 
A
T
 
E
V
 
I
V
 
I
A
 
A
V
 
I
D
 
D
G
 
G
N
 
N
Y
x
F
D
 
D
D
 
D
V
 
A
N
 
L
R
 
K
L
 
I
S
 
V
S
 
R
E
 
S
I
 
I
A
 
C
N
 
E
E
 
K
F
 
S
G
 
P
W
 
I
A
 
A
F
 
L
V
 
V
N
|
N
I
 
-
N
x
S
V
 
V
R
 
N
P
 
P
F
 
Y
Y
x
R
S
 
L
E
 
E
G
 
G
S
 
Q
K
 
K
T
 
T
L
 
A
A
 
A
F
 
F
E
 
E
V
 
V
A
 
C
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
W
 
-
K
 
E
A
 
A
P
 
P
D
 
D
A
 
V
V
 
L
V
 
A
A
 
I
P
 
P
L
x
V
A
x
G
S
x
N
G
x
A
S
x
G
L
x
N
Y
 
I
T
 
S
K
 
A
I
 
Y
W
 
W
K
 
K
G
 
G
F
 
F
N
 
K
E
 
E
L
 
Y
K
 
H
E
 
E
V
 
K
G
 
N
L
 
G
I
 
T
S
 
S
D
 
-
N
 
-
P
 
L
P
 
P
R
 
K
M
 
M
Y
 
R
G
 
G
A
 
F
Q
x
E
A
 
A
E
 
E
G
 
G
C
x
S
S
 
A
P
 
A
I
 
I
Y
 
V
K
 
-
A
 
-
F
 
-
K
 
-
E
 
-
N
 
-
R
 
R
D
 
N
W
 
E
I
 
V
V
 
I
P
 
-
E
 
E
K
 
N
P
 
P
D
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
K
 
T
S
x
A
I
|
I
A
 
R
I
 
I
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
A
D
 
S
G
 
W
P
 
D
Y
 
K
A
 
A
V
 
V
K
 
K
V
 
A
G
 
A
K
 
E
E
 
E
S
 
S
S
 
N
G
 
G
D
 
K
M
 
I
E
 
D
I
 
E
A
 
V
S
 
T
D
 
D
Q
 
D
E
 
E
I
 
I
I
 
L
E
 
H
G
 
A
I
 
Y
K
 
Q
L
 
L
L
 
I
A
 
A
R
 
R
T
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
V
F
 
F
T
 
A
E
|
E
T
 
P
A
 
G
G
 
S
G
 
C
T
 
A
T
 
S
I
 
I
A
 
A
V
 
G
L
 
V
K
 
L
K
 
K
L
 
Q
A
 
V
E
 
K
K
 
S
G
 
G
A
 
E
F
 
I
D
 
P
P
 
K
E
 
G
E
 
S
T
 
K
V
 
V
V
 
V
V
 
A
Y
 
V
I
 
L
T
|
T
G
 
G
N
 
N
G
 
G
Y
 
L
K
 
K

6cgqB Threonine synthase from bacillus subtilis atcc 6633 with plp and plp- ala (see paper)
40% identity, 78% coverage: 56:379/415 of query aligns to 5:318/345 of 6cgqB

query
sites
6cgqB
L
 
I
W
 
H
R
 
Q
Y
 
Y
V
 
K
D
 
E
L
 
F
L
 
L
P
 
P
V
 
V
D
 
T
N
 
D
-
 
Q
-
 
T
P
 
P
K
 
A
V
 
L
G
 
T
L
 
L
S
 
H
A
 
E
G
 
G
F
 
N
T
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
I
K
 
H
A
 
L
E
 
P
K
 
K
L
 
L
G
 
S
K
 
E
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
I
K
 
E
N
 
-
L
 
L
Y
 
H
I
 
V
K
 
K
D
 
T
D
 
E
S
 
G
V
 
V
N
 
N
H
 
-
P
 
P
T
 
T
L
 
G
S
 
S
F
 
F
K
|
K
D
 
D
R
 
R
V
 
G
V
 
M
A
 
V
V
 
M
A
 
A
L
 
V
S
 
A
K
 
K
A
 
A
K
 
K
E
 
E
F
 
E
G
 
G
F
 
N
D
 
D
T
 
T
A
 
I
A
 
M
C
 
C
A
 
A
S
|
S
T
|
T
G
 
G
N
|
N
L
x
T
A
 
S
N
 
A
S
 
A
V
 
A
A
 
A
A
 
A
N
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
R
S
 
A
G
 
N
M
 
M
K
 
K
C
 
C
Y
 
I
V
 
V
F
 
I
I
 
I
P
 
P
S
 
N
N
 
G
-
 
K
L
 
I
E
 
A
T
 
F
N
 
G
K
 
K
I
 
L
I
 
A
G
 
Q
S
 
A
L
 
V
V
 
M
F
 
Y
N
 
G
P
 
A
T
 
E
V
 
I
V
 
I
A
 
A
V
 
I
D
 
D
G
 
G
N
 
N
Y
 
F
D
 
D
D
 
D
V
 
A
N
 
L
R
 
K
L
 
I
S
 
V
S
 
R
E
 
S
I
 
I
A
 
C
N
 
E
E
 
K
F
 
S
G
 
P
W
 
I
A
 
A
F
 
L
V
 
V
N
|
N
I
 
-
N
x
S
V
 
V
R
 
N
P
 
P
F
 
Y
Y
x
R
S
 
L
E
 
E
G
 
G
S
 
Q
K
 
K
T
 
T
L
 
A
A
 
A
F
 
F
E
 
E
V
 
V
A
 
C
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
W
 
-
K
 
E
A
 
A
P
 
P
D
 
D
A
 
V
V
 
L
V
 
A
A
 
I
P
 
P
L
x
V
A
x
G
S
x
N
G
x
A
S
 
G
L
x
N
Y
 
I
T
 
S
K
 
A
I
 
Y
W
 
W
K
 
K
G
 
G
F
 
F
N
 
K
E
 
E
L
 
Y
K
 
H
E
 
E
V
 
K
G
 
N
L
 
G
I
 
T
S
 
S
D
 
-
N
 
-
P
 
L
P
 
P
R
 
K
M
 
M
Y
 
R
G
 
G
A
 
F
Q
x
E
A
 
A
E
 
E
G
 
G
C
x
S
S
 
A
P
 
A
I
 
I
Y
 
V
K
 
-
A
 
-
F
 
-
K
 
-
E
 
-
N
 
-
R
 
R
D
 
N
W
 
E
I
 
V
V
 
I
P
 
-
E
 
E
K
 
N
P
 
P
D
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
K
 
T
S
x
A
I
|
I
A
 
R
I
 
I
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
A
D
 
S
G
 
W
P
 
D
Y
 
K
A
 
A
V
 
V
K
 
K
V
 
A
G
 
A
K
 
E
E
 
E
S
 
S
S
 
N
G
 
G
D
 
K
M
 
I
E
 
D
I
 
E
A
 
V
S
 
T
D
 
D
Q
 
D
E
 
E
I
 
I
I
 
L
E
 
H
G
 
A
I
 
Y
K
 
Q
L
 
L
L
 
I
A
 
A
R
 
R
T
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
V
F
 
F
T
 
A
E
|
E
T
 
P
A
 
G
G
 
S
G
 
C
T
 
A
T
 
S
I
 
I
A
 
A
V
 
G
L
 
V
K
 
L
K
 
K
L
 
Q
A
 
V
E
 
K
K
 
S
G
 
G
A
 
E
F
 
I
D
 
P
P
 
K
E
 
G
E
 
S
T
 
K
V
 
V
V
 
V
V
 
A
Y
 
V
I
 
L
T
|
T
G
 
G
N
 
N
G
 
G
Y
 
L
K
 
K

2zsjA Crystal structure of threonine synthase from aquifex aeolicus vf5
39% identity, 84% coverage: 58:407/415 of query aligns to 8:349/350 of 2zsjA

query
sites
2zsjA
R
 
Q
Y
 
Y
V
 
K
D
 
K
L
 
Y
L
 
L
P
 
P
V
 
V
D
 
D
-
 
E
-
 
N
N
 
T
P
 
P
K
 
I
V
 
V
G
 
T
L
 
L
S
 
Y
A
 
E
G
 
G
F
 
N
T
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
I
K
 
E
A
 
A
E
 
D
K
 
N
L
 
L
G
 
A
K
 
R
E
 
A
L
 
I
G
 
G
L
 
F
K
 
K
N
 
G
-
 
K
L
 
I
Y
 
Y
I
 
L
K
 
K
D
 
Y
D
 
E
S
 
G
V
 
L
N
 
N
H
 
-
P
 
P
T
 
T
L
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
D
 
D
R
 
R
V
 
G
V
 
M
A
 
T
V
 
L
A
 
A
L
 
I
S
 
S
K
 
K
A
 
A
K
 
V
E
 
E
F
 
A
G
 
G
F
 
K
D
 
R
T
 
A
A
 
V
A
 
I
C
 
C
A
 
A
S
 
S
T
|
T
G
 
G
N
|
N
L
 
T
A
 
S
N
 
A
S
 
S
V
 
A
A
 
A
A
 
A
N
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
R
S
 
A
G
 
G
M
 
L
K
 
R
C
 
A
Y
 
Y
V
 
V
F
 
L
I
 
L
P
 
P
S
 
K
N
 
G
-
 
A
L
 
V
E
 
A
T
 
I
N
 
G
K
 
K
I
 
L
I
 
S
G
 
Q
S
 
A
L
 
M
V
 
I
F
 
Y
N
 
G
P
 
A
T
 
K
V
 
V
V
 
L
A
 
A
V
 
I
D
 
Q
G
 
G
N
 
T
Y
 
F
D
 
D
D
 
D
V
 
A
N
 
L
R
 
N
L
 
I
S
 
V
S
 
R
E
 
K
I
 
I
A
 
G
N
 
E
E
 
N
F
 
F
G
 
P
W
 
V
A
 
E
F
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
-
N
 
S
V
 
V
R
 
N
P
 
P
F
 
Y
Y
 
R
S
 
I
E
 
E
G
 
G
S
 
Q
K
 
K
T
 
T
L
 
A
A
 
A
F
 
F
E
 
E
V
 
I
A
 
C
E
 
D
Q
 
T
L
 
L
G
 
G
W
 
-
K
 
E
A
 
A
P
 
P
D
 
D
A
 
Y
V
 
H
V
 
F
A
 
I
P
 
P
L
x
V
A
x
G
S
x
N
G
x
A
S
x
G
L
x
N
Y
 
I
T
 
T
K
 
A
I
 
Y
W
 
W
K
 
K
G
 
G
F
 
F
N
 
K
E
 
I
L
 
Y
K
 
Y
E
 
E
V
 
E
G
 
G
L
 
K
I
 
I
S
 
T
D
 
-
N
 
K
P
 
L
P
 
P
R
 
R
M
 
M
Y
 
M
G
 
G
A
 
W
Q
|
Q
A
 
A
E
 
E
G
 
G
C
x
A
S
 
A
P
 
P
I
 
I
Y
 
V
K
 
K
A
 
G
F
 
Y
K
 
P
E
 
-
N
 
-
R
 
-
D
 
-
W
 
-
I
 
-
V
 
-
P
 
I
E
 
K
K
 
N
P
 
P
D
 
Q
T
 
T
I
 
I
A
 
A
K
 
T
S
x
A
I
 
I
A
 
K
I
 
I
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
Y
D
 
S
G
 
W
P
 
K
Y
 
S
A
 
A
V
 
L
K
 
K
V
 
A
G
 
A
K
 
Q
E
 
E
S
 
S
S
 
G
G
 
G
D
 
K
M
 
I
E
 
D
I
 
A
A
 
V
S
 
S
D
 
D
Q
 
S
E
 
E
I
 
I
I
 
L
E
 
Y
G
 
A
I
 
Y
K
 
K
L
 
L
L
 
I
A
 
A
R
 
S
T
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
V
F
 
F
T
 
C
E
 
E
T
 
P
A
 
A
G
 
S
G
 
A
T
 
A
T
 
S
I
 
V
A
 
A
V
 
G
L
 
L
K
 
I
K
 
K
L
 
L
A
 
V
E
 
R
K
 
E
G
 
G
A
 
F
F
 
F
D
 
K
P
 
G
E
 
G
E
 
E
T
 
V
V
 
V
V
 
T
V
 
C
Y
 
T
I
 
L
T
|
T
G
|
G
N
 
N
G
 
G
Y
 
L
K
 
K
T
 
D
M
 
P
E
 
D
V
 
T
L
 
A
E
 
I
G
 
K
Q
 
V
L
 
C
K
 
E
K
 
E
P
 
P
V
 
I
H
 
T
I
 
V
K
 
P
P
 
P
S
 
D
L
 
F
T
 
D
E
 
E
F
 
V
K
 
-
E
 
V
K
 
K
V
 
V
I
 
L
G
 
G

3aexA Catalytic intermediate analogue of threonine synthase from thermus thermophilus hb8 (see paper)
40% identity, 79% coverage: 53:379/415 of query aligns to 3:322/351 of 3aexA

query
sites
3aexA
P
 
P
K
 
P
S
 
L
L
 
I
W
 
E
R
 
R
Y
 
Y
V
 
R
D
 
N
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
D
 
S
-
 
E
-
 
K
N
 
T
P
 
P
K
 
V
V
 
I
G
 
S
L
 
L
S
 
L
A
 
E
G
 
G
F
 
S
T
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
I
-
 
P
-
 
L
K
 
K
A
 
G
E
 
P
K
 
E
L
 
E
G
 
A
K
 
R
E
 
K
L
 
K
G
 
G
L
 
I
K
 
R
N
 
-
L
 
L
Y
 
Y
I
 
A
K
 
K
D
 
Y
D
 
E
S
 
G
V
 
L
N
 
N
H
 
-
P
 
P
T
 
T
L
 
G
S
 
S
F
 
F
K
|
K
D
 
D
R
 
R
V
 
G
V
 
M
A
 
T
V
 
L
A
 
A
L
 
V
S
 
S
K
 
K
A
 
A
K
 
V
E
 
E
F
 
G
G
 
G
F
 
A
D
 
Q
T
 
A
A
 
V
A
 
A
C
 
C
A
 
A
S
|
S
T
|
T
G
 
G
N
|
N
L
x
T
A
 
A
N
 
A
S
 
S
V
 
A
A
 
A
A
 
A
N
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
R
S
 
A
G
 
G
M
 
I
K
 
L
C
 
A
Y
 
I
V
 
V
F
 
V
I
 
L
P
 
P
S
 
A
N
 
G
-
 
Y
L
 
V
E
 
A
T
 
L
N
 
G
K
 
K
I
 
V
I
 
A
G
 
Q
S
 
S
L
 
L
V
 
V
F
 
H
N
 
G
P
 
A
T
 
R
V
 
I
V
 
V
A
 
Q
V
 
V
D
 
E
G
 
G
N
 
N
Y
 
F
D
 
D
D
 
D
V
 
A
N
 
L
R
 
R
L
 
L
S
 
T
S
 
Q
E
 
K
I
 
L
A
 
T
N
 
E
E
 
A
F
 
F
G
 
P
W
 
V
A
 
A
F
 
L
V
 
V
N
|
N
I
 
-
N
x
S
V
 
V
R
 
N
P
 
P
F
 
H
Y
x
R
S
 
L
E
 
E
G
 
G
S
 
Q
K
 
K
T
 
T
L
 
L
A
 
A
F
 
F
E
 
E
V
 
V
A
 
V
E
 
D
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
W
 
-
K
 
D
A
 
A
P
 
P
D
 
H
A
 
Y
V
 
H
V
 
A
A
 
L
P
 
P
L
x
V
A
x
G
S
x
N
G
x
A
S
x
G
L
x
N
Y
 
I
T
 
T
K
 
A
I
 
H
W
 
W
K
 
M
G
 
G
F
 
Y
N
 
K
E
 
A
L
 
Y
K
 
H
E
 
A
V
 
L
G
 
G
L
 
-
I
 
K
S
 
A
D
 
K
N
 
R
P
 
L
P
|
P
R
 
R
M
 
M
Y
 
L
G
|
G
A
 
F
Q
|
Q
A
 
A
E
 
A
G
 
G
C
 
A
S
 
A
P
 
P
I
 
L
Y
 
V
K
 
L
A
 
G
F
 
R
K
 
P
E
 
V
N
 
-
R
 
-
D
 
-
W
 
-
I
 
-
V
 
-
P
 
-
E
 
E
K
 
R
P
 
P
D
 
E
T
 
T
I
 
L
A
 
A
K
 
T
S
x
A
I
|
I
A
 
R
I
 
I
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
A
D
 
S
G
 
W
P
 
Q
Y
 
G
A
 
A
V
 
V
K
 
R
V
 
A
G
 
K
K
 
E
E
 
E
S
 
S
S
 
G
G
 
G
D
 
V
M
 
I
E
 
E
I
 
A
A
 
V
S
 
T
D
 
D
Q
 
E
E
 
E
I
 
I
I
 
L
E
 
F
G
 
A
I
 
Y
K
 
R
L
 
Y
L
 
L
A
 
A
R
 
R
T
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
I
F
 
F
T
 
C
E
|
E
T
 
P
A
 
A
G
 
S
G
 
A
T
 
A
T
 
A
I
 
M
A
 
A
V
 
G
L
 
V
K
 
F
K
 
K
L
 
L
A
 
L
E
 
R
K
 
E
G
 
G
A
 
R
F
 
L
D
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
S
T
 
T
V
 
V
V
 
V
V
 
L
Y
 
T
I
 
L
T
|
T
G
 
G
N
 
H
G
 
G
Y
 
L
K
 
K

1v7cA Crystal structure of threonine synthase from thermus thermophilus hb8 in complex with a substrate analogue (see paper)
40% identity, 79% coverage: 53:379/415 of query aligns to 3:322/351 of 1v7cA

query
sites
1v7cA
P
 
P
K
 
P
S
 
L
L
 
I
W
 
E
R
 
R
Y
 
Y
V
 
R
D
 
N
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
D
 
S
-
 
E
-
 
K
N
 
T
P
 
P
K
 
V
V
 
I
G
 
S
L
 
L
S
 
L
A
 
E
G
 
G
F
 
S
T
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
I
-
 
P
-
 
L
K
 
K
A
 
G
E
 
P
K
 
E
L
 
E
G
 
A
K
 
R
E
 
K
L
 
K
G
 
G
L
 
I
K
 
R
N
 
-
L
 
L
Y
 
Y
I
 
A
K
 
K
D
 
Y
D
 
E
S
 
G
V
 
L
N
 
N
H
 
-
P
 
P
T
 
T
L
 
G
S
 
S
F
 
F
K
|
K
D
 
D
R
 
R
V
 
G
V
 
M
A
 
T
V
 
L
A
 
A
L
 
V
S
 
S
K
 
K
A
 
A
K
 
V
E
 
E
F
 
G
G
 
G
F
 
A
D
 
Q
T
 
A
A
 
V
A
 
A
C
 
C
A
 
A
S
|
S
T
|
T
G
 
G
N
|
N
L
x
T
A
 
A
N
 
A
S
 
S
V
 
A
A
 
A
A
 
A
N
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
R
S
 
A
G
 
G
M
 
I
K
 
L
C
 
A
Y
 
I
V
 
V
F
 
V
I
 
L
P
 
P
S
 
A
N
 
G
-
 
Y
L
 
V
E
 
A
T
 
L
N
 
G
K
 
K
I
 
V
I
 
A
G
 
Q
S
 
S
L
 
L
V
 
V
F
 
H
N
 
G
P
 
A
T
 
R
V
 
I
V
 
V
A
 
Q
V
 
V
D
 
E
G
 
G
N
 
N
Y
x
F
D
 
D
D
 
D
V
 
A
N
 
L
R
 
R
L
 
L
S
 
T
S
 
Q
E
 
K
I
 
L
A
 
T
N
 
E
E
 
A
F
 
F
G
 
P
W
 
V
A
 
A
F
 
L
V
 
V
N
|
N
I
 
-
N
x
S
V
 
V
R
 
N
P
 
P
F
 
H
Y
x
R
S
 
L
E
 
E
G
 
G
S
 
Q
K
 
K
T
 
T
L
 
L
A
 
A
F
 
F
E
 
E
V
 
V
A
 
V
E
 
D
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
W
 
-
K
 
D
A
 
A
P
 
P
D
 
H
A
 
Y
V
 
H
V
 
A
A
 
L
P
 
P
L
x
V
A
x
G
S
x
N
G
x
A
S
x
G
L
x
N
Y
 
I
T
 
T
K
 
A
I
 
H
W
 
W
K
 
M
G
 
G
F
 
Y
N
 
K
E
 
A
L
 
Y
K
 
H
E
 
A
V
 
L
G
 
G
L
 
-
I
 
K
S
 
A
D
 
K
N
 
R
P
 
L
P
|
P
R
 
R
M
 
M
Y
 
L
G
|
G
A
 
F
Q
|
Q
A
 
A
E
 
A
G
 
G
C
 
A
S
 
A
P
 
P
I
 
L
Y
 
V
K
 
L
A
 
G
F
 
R
K
 
P
E
 
V
N
 
-
R
 
-
D
 
-
W
 
-
I
 
-
V
 
-
P
 
-
E
 
E
K
 
R
P
 
P
D
 
E
T
 
T
I
 
L
A
 
A
K
 
T
S
x
A
I
|
I
A
 
R
I
 
I
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
A
D
 
S
G
 
W
P
 
Q
Y
 
G
A
 
A
V
 
V
K
 
R
V
 
A
G
 
K
K
 
E
E
 
E
S
 
S
S
 
G
G
 
G
D
 
V
M
 
I
E
 
E
I
 
A
A
 
V
S
 
T
D
 
D
Q
 
E
E
 
E
I
 
I
I
 
L
E
 
F
G
 
A
I
 
Y
K
 
R
L
 
Y
L
 
L
A
 
A
R
 
R
T
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
I
F
 
F
T
 
C
E
|
E
T
 
P
A
 
A
G
 
S
G
 
A
T
 
A
T
 
A
I
 
M
A
 
A
V
 
G
L
 
V
K
 
F
K
 
K
L
 
L
A
 
L
E
 
R
K
 
E
G
 
G
A
 
R
F
 
L
D
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
S
T
 
T
V
 
V
V
 
V
V
 
L
Y
 
T
I
 
L
T
|
T
G
 
G
N
 
H
G
 
G
Y
 
L
K
 
K

1uimA Crystal structure of threonine synthase from thermus thermophilus hb8, orthorhombic crystal form (see paper)
40% identity, 79% coverage: 53:379/415 of query aligns to 3:322/350 of 1uimA

query
sites
1uimA
P
 
P
K
 
P
S
 
L
L
 
I
W
 
E
R
 
R
Y
 
Y
V
 
R
D
 
N
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
D
 
S
-
 
E
-
 
K
N
 
T
P
 
P
K
 
V
V
 
I
G
 
S
L
 
L
S
 
L
A
 
E
G
 
G
F
 
S
T
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
I
-
 
P
-
 
L
K
 
K
A
 
G
E
 
P
K
 
E
L
 
E
G
 
A
K
 
R
E
 
K
L
 
K
G
 
G
L
 
I
K
 
R
N
 
-
L
 
L
Y
 
Y
I
 
A
K
 
K
D
 
Y
D
 
E
S
 
G
V
 
L
N
 
N
H
 
-
P
 
P
T
 
T
L
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
D
 
D
R
 
R
V
 
G
V
 
M
A
 
T
V
 
L
A
 
A
L
 
V
S
 
S
K
 
K
A
 
A
K
 
V
E
 
E
F
 
G
G
 
G
F
 
A
D
 
Q
T
 
A
A
 
V
A
 
A
C
 
C
A
 
A
S
 
S
T
|
T
G
 
G
N
|
N
L
 
T
A
 
A
N
 
A
S
 
S
V
 
A
A
 
A
A
 
A
N
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
R
S
 
A
G
 
G
M
 
I
K
 
L
C
 
A
Y
 
I
V
 
V
F
 
V
I
 
L
P
 
P
S
 
A
N
 
G
-
 
Y
L
 
V
E
 
A
T
 
L
N
 
G
K
 
K
I
 
V
I
 
A
G
 
Q
S
 
S
L
 
L
V
 
V
F
 
H
N
 
G
P
 
A
T
 
R
V
 
I
V
 
V
A
 
Q
V
 
V
D
 
E
G
 
G
N
 
N
Y
 
F
D
 
D
D
 
D
V
 
A
N
 
L
R
 
R
L
 
L
S
 
T
S
 
Q
E
 
K
I
 
L
A
 
T
N
 
E
E
 
A
F
 
F
G
 
P
W
 
V
A
 
A
F
 
L
V
 
V
N
 
N
I
 
-
N
 
S
V
 
V
R
 
N
P
 
P
F
 
H
Y
 
R
S
 
L
E
 
E
G
 
G
S
 
Q
K
 
K
T
 
T
L
 
L
A
 
A
F
 
F
E
 
E
V
 
V
A
 
V
E
 
D
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
W
 
-
K
 
D
A
 
A
P
 
P
D
 
H
A
 
Y
V
 
H
V
 
A
A
 
L
P
 
P
L
 
V
A
x
G
S
x
N
G
x
A
S
x
G
L
x
N
Y
 
I
T
 
T
K
 
A
I
 
H
W
 
W
K
 
M
G
 
G
F
 
Y
N
 
K
E
 
A
L
 
Y
K
 
H
E
 
A
V
 
L
G
 
G
L
 
-
I
 
K
S
 
A
D
 
K
N
 
R
P
 
L
P
|
P
R
 
R
M
 
M
Y
 
L
G
|
G
A
 
F
Q
|
Q
A
 
A
E
 
A
G
 
G
C
 
A
S
 
A
P
 
P
I
 
L
Y
 
V
K
 
L
A
 
G
F
 
R
K
 
P
E
 
V
N
 
-
R
 
-
D
 
-
W
 
-
I
 
-
V
 
-
P
 
-
E
 
E
K
 
R
P
 
P
D
 
E
T
 
T
I
 
L
A
 
A
K
 
T
S
x
A
I
 
I
A
 
R
I
 
I
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
A
D
 
S
G
 
W
P
 
Q
Y
 
G
A
 
A
V
 
V
K
 
R
V
 
A
G
 
K
K
 
E
E
 
E
S
 
S
S
 
G
G
 
G
D
 
V
M
 
I
E
 
E
I
 
A
A
 
V
S
 
T
D
 
D
Q
 
E
E
 
E
I
 
I
I
 
L
E
 
F
G
 
A
I
 
Y
K
 
R
L
 
Y
L
 
L
A
 
A
R
 
R
T
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
I
F
 
F
T
 
C
E
|
E
T
 
P
A
 
A
G
 
S
G
 
A
T
 
A
T
 
A
I
 
M
A
 
A
V
 
G
L
 
V
K
 
F
K
 
K
L
 
L
A
 
L
E
 
R
K
 
E
G
 
G
A
 
R
F
 
L
D
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
S
T
 
T
V
 
V
V
 
V
V
 
L
Y
 
T
I
 
L
T
|
T
G
|
G
N
 
H
G
 
G
Y
 
L
K
 
K

3aeyA Apo form of threonine synthase from thermus thermophilus hb8 (see paper)
40% identity, 79% coverage: 53:379/415 of query aligns to 2:321/350 of 3aeyA

query
sites
3aeyA
P
 
P
K
 
P
S
 
L
L
 
I
W
 
E
R
 
R
Y
 
Y
V
 
R
D
 
N
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
D
 
S
-
 
E
-
 
K
N
 
T
P
 
P
K
 
V
V
 
I
G
 
S
L
 
L
S
 
L
A
 
E
G
 
G
F
 
S
T
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
I
-
 
P
-
 
L
K
 
K
A
 
G
E
 
P
K
 
E
L
 
E
G
 
A
K
 
R
E
 
K
L
 
K
G
 
G
L
 
I
K
 
R
N
 
-
L
 
L
Y
 
Y
I
 
A
K
 
K
D
 
Y
D
 
E
S
 
G
V
 
L
N
 
N
H
 
-
P
 
P
T
 
T
L
 
G
S
 
S
F
 
F
K
|
K
D
 
D
R
 
R
V
 
G
V
 
M
A
 
T
V
 
L
A
 
A
L
 
V
S
 
S
K
 
K
A
 
A
K
 
V
E
 
E
F
 
G
G
 
G
F
 
A
D
 
Q
T
 
A
A
 
V
A
 
A
C
 
C
A
 
A
S
 
S
T
|
T
G
|
G
N
|
N
L
x
T
A
 
A
N
 
A
S
 
S
V
 
A
A
 
A
A
 
A
N
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
R
S
 
A
G
 
G
M
 
I
K
 
L
C
 
A
Y
 
I
V
 
V
F
 
V
I
 
L
P
 
P
S
 
A
N
 
G
-
 
Y
L
 
V
E
 
A
T
 
L
N
 
G
K
 
K
I
 
V
I
 
A
G
 
Q
S
 
S
L
 
L
V
 
V
F
 
H
N
 
G
P
 
A
T
 
R
V
 
I
V
 
V
A
 
Q
V
 
V
D
 
E
G
 
G
N
 
N
Y
 
F
D
 
D
D
 
D
V
 
A
N
 
L
R
 
R
L
 
L
S
 
T
S
 
Q
E
 
K
I
 
L
A
 
T
N
 
E
E
 
A
F
 
F
G
 
P
W
 
V
A
 
A
F
 
L
V
 
V
N
 
N
I
 
-
N
x
S
V
 
V
R
 
N
P
 
P
F
 
H
Y
x
R
S
 
L
E
 
E
G
 
G
S
 
Q
K
 
K
T
 
T
L
 
L
A
 
A
F
 
F
E
 
E
V
 
V
A
 
V
E
 
D
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
W
 
-
K
 
D
A
 
A
P
 
P
D
 
H
A
 
Y
V
 
H
V
 
A
A
 
L
P
 
P
L
 
V
A
 
G
S
x
N
G
 
A
S
 
G
L
 
N
Y
 
I
T
 
T
K
 
A
I
 
H
W
 
W
K
 
M
G
 
G
F
 
Y
N
 
K
E
 
A
L
 
Y
K
 
H
E
 
A
V
 
L
G
 
G
L
 
-
I
 
K
S
 
A
D
 
K
N
 
R
P
 
L
P
|
P
R
 
R
M
 
M
Y
 
L
G
|
G
A
 
F
Q
|
Q
A
 
A
E
 
A
G
 
G
C
 
A
S
 
A
P
 
P
I
 
L
Y
 
V
K
 
L
A
 
G
F
x
R
K
 
P
E
x
V
N
 
-
R
 
-
D
 
-
W
 
-
I
 
-
V
 
-
P
 
-
E
|
E
K
x
R
P
 
P
D
 
E
T
 
T
I
 
L
A
 
A
K
 
T
S
x
A
I
 
I
A
 
R
I
 
I
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
A
D
 
S
G
 
W
P
 
Q
Y
 
G
A
 
A
V
 
V
K
 
R
V
 
A
G
 
K
K
 
E
E
 
E
S
 
S
S
 
G
G
 
G
D
 
V
M
 
I
E
 
E
I
 
A
A
 
V
S
 
T
D
 
D
Q
 
E
E
 
E
I
 
I
I
 
L
E
 
F
G
 
A
I
 
Y
K
 
R
L
 
Y
L
 
L
A
 
A
R
 
R
T
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
I
F
 
F
T
 
C
E
 
E
T
 
P
A
 
A
G
 
S
G
 
A
T
 
A
T
 
A
I
 
M
A
 
A
V
 
G
L
 
V
K
 
F
K
 
K
L
 
L
A
 
L
E
 
R
K
 
E
G
 
G
A
 
R
F
 
L
D
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
S
T
 
T
V
 
V
V
 
V
V
 
L
Y
 
T
I
 
L
T
|
T
G
 
G
N
 
H
G
 
G
Y
 
L
K
 
K

A0R220 Threonine synthase; TS; EC 4.2.3.1 from Mycolicibacterium smegmatis (strain ATCC 700084 / mc(2)155) (Mycobacterium smegmatis) (see paper)
38% identity, 83% coverage: 53:397/415 of query aligns to 13:351/360 of A0R220

query
sites
A0R220
P
 
P
K
 
G
S
 
L
L
 
I
W
 
E
R
 
A
Y
 
Y
V
 
R
D
 
D
L
 
R
L
 
L
P
 
P
V
 
I
-
 
G
-
 
D
D
 
D
N
 
W
P
 
T
K
 
T
V
 
V
G
 
T
L
 
L
S
 
L
A
 
E
G
 
G
F
 
G
T
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
I
K
 
H
A
 
A
E
 
K
K
 
R
L
 
I
G
 
-
K
 
S
E
 
E
L
 
L
G
 
T
L
 
G
K
 
C
N
 
T
L
 
V
Y
 
H
I
 
L
K
 
K
D
 
V
D
 
E
S
 
G
V
 
L
N
 
N
H
 
-
P
 
P
T
 
T
L
 
G
S
 
S
F
 
F
K
 
K
D
 
D
R
 
R
V
 
G
V
 
M
A
 
T
V
 
V
A
 
A
L
 
V
S
 
T
K
 
E
A
 
S
K
 
L
E
 
A
F
 
R
G
 
G
F
 
Q
D
 
Q
T
 
A
A
 
V
A
 
L
C
 
C
A
 
A
S
 
S
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
T
A
 
S
N
 
A
S
 
S
V
 
A
A
 
A
A
 
A
N
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
R
S
 
A
G
 
G
M
 
I
K
 
T
C
 
C
Y
 
A
V
 
V
F
 
L
I
 
I
P
 
P
S
 
Q
N
 
G
-
 
K
L
 
I
E
 
A
T
 
M
N
 
G
K
 
K
I
 
L
I
 
A
G
 
Q
S
 
A
L
 
V
V
 
M
F
 
H
N
 
G
P
 
A
T
 
K
V
 
I
V
 
I
A
 
Q
V
 
V
D
 
D
G
 
G
N
 
N
Y
 
F
D
 
D
D
 
D
V
 
C
N
 
L
R
 
E
L
 
L
S
 
A
S
 
R
E
x
K
I
 
L
A
 
T
N
 
A
E
 
D
F
 
F
-
 
P
G
 
T
W
 
I
A
 
A
F
 
L
V
 
V
N
 
N
I
 
-
N
 
S
V
 
V
R
 
N
P
 
P
F
 
Y
Y
 
R
S
 
I
E
 
E
G
 
G
S
 
Q
K
 
K
T
 
T
L
 
A
A
 
A
F
 
F
E
 
E
V
 
I
A
 
V
E
 
D
Q
 
A
L
 
L
G
 
G
W
 
-
K
 
T
A
 
A
P
 
P
D
 
D
A
 
V
V
 
H
V
 
A
A
 
L
P
 
P
L
 
V
A
 
G
S
 
N
G
 
A
S
 
G
L
 
N
Y
 
I
T
 
T
K
 
A
I
 
Y
W
 
W
K
 
K
G
 
G
F
 
Y
N
 
S
E
 
E
L
 
Y
K
 
H
E
 
R
V
 
D
G
 
G
L
 
-
I
 
V
S
 
S
D
 
D
N
 
R
P
 
L
P
 
P
R
 
R
M
 
M
Y
 
L
G
 
G
A
 
T
Q
 
Q
A
 
A
E
 
A
G
 
G
C
 
A
S
 
A
P
 
P
I
 
L
Y
 
V
K
 
T
A
 
G
F
 
-
K
 
-
E
 
-
N
 
-
R
 
-
D
 
-
W
 
-
I
 
-
V
 
A
P
 
P
E
 
V
K
 
K
-
 
D
P
 
P
D
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
K
 
T
S
 
A
I
 
I
A
 
R
I
 
I
G
 
G
N
 
S
P
 
P
A
 
A
D
 
S
G
 
W
P
 
N
Y
 
S
A
 
A
V
 
V
K
 
E
V
 
A
G
 
Q
K
 
Q
E
 
Q
S
 
S
S
 
D
G
 
G
D
 
R
M
 
F
E
 
L
I
 
A
A
 
A
S
 
T
D
 
D
Q
 
E
E
 
E
I
 
I
I
 
L
E
 
A
G
 
A
I
 
Y
K
 
H
L
 
L
L
 
V
A
 
A
R
 
R
T
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
V
F
 
F
T
 
V
E
 
E
T
 
P
A
 
A
G
 
S
G
 
A
T
 
A
T
 
S
I
 
I
A
 
A
V
 
G
L
 
L
K
 
L
K
 
K
L
 
S
A
 
V
E
 
E
K
 
D
G
 
G
A
 
W
F
 
V
D
 
K
P
 
R
E
 
G
E
 
S
T
 
T
V
 
V
V
 
V
V
 
C
Y
 
T
I
 
V
T
 
T
G
 
G
N
 
N
G
 
G
Y
 
L
K
 
K
T
 
D
M
 
P
E
 
D
V
 
T
-
 
A
L
 
L
E
 
K
G
 
G
Q
 
M
L
 
P
K
 
Q
-
 
V
K
 
T
P
 
P
V
 
V
H
 
P
I
 
V
K
 
D
P
 
P
S
 
S

2d1fA Structure of mycobacterium tuberculosis threonine synthase (see paper)
38% identity, 79% coverage: 53:379/415 of query aligns to 4:322/349 of 2d1fA

query
sites
2d1fA
P
 
P
K
 
G
S
 
V
L
 
I
W
 
A
R
 
A
Y
 
Y
V
 
R
D
 
D
L
 
R
L
 
L
P
 
P
V
 
V
-
 
G
-
 
D
D
 
D
N
 
W
P
 
T
K
 
P
V
 
V
G
 
T
L
 
L
S
 
L
A
 
E
G
 
G
F
 
G
T
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
I
K
 
A
A
 
A
E
 
T
K
 
N
L
 
L
G
 
S
K
 
K
E
 
Q
L
 
T
G
 
G
L
 
C
K
 
-
N
 
T
L
 
I
Y
 
H
I
 
L
K
 
K
D
 
V
D
 
E
S
 
G
V
 
L
N
 
N
H
 
-
P
 
P
T
 
T
L
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
D
 
D
R
 
R
V
 
G
V
 
M
A
 
T
V
 
M
A
 
A
L
 
V
S
 
T
K
 
D
A
 
A
K
 
L
E
 
A
F
 
H
G
 
G
F
 
Q
D
 
R
T
 
A
A
 
V
A
 
L
C
 
C
A
 
A
S
 
S
T
|
T
G
 
G
N
|
N
L
 
T
A
 
S
N
 
A
S
 
S
V
 
A
A
 
A
A
 
A
N
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
R
S
 
A
G
 
G
M
 
I
K
 
T
C
 
C
Y
 
A
V
 
V
F
 
L
I
 
I
P
 
P
S
 
Q
N
 
G
-
 
K
L
 
I
E
 
A
T
 
M
N
 
G
K
 
K
I
 
L
I
 
A
G
 
Q
S
 
A
L
 
V
V
 
M
F
 
H
N
 
G
P
 
A
T
 
K
V
 
I
V
 
I
A
 
Q
V
 
I
D
 
D
G
 
G
N
 
N
Y
 
F
D
 
D
D
 
D
V
 
C
N
 
L
R
 
E
L
 
L
S
 
A
S
 
R
E
 
K
I
 
M
A
 
A
N
 
A
E
 
D
F
 
F
G
 
P
W
 
T
A
 
I
F
 
S
V
 
L
N
 
V
I
 
N
N
 
S
V
 
V
R
 
N
P
 
P
F
 
V
Y
 
R
S
 
I
E
 
E
G
 
G
S
 
Q
K
 
K
T
 
T
L
 
A
A
 
A
F
 
F
E
 
E
V
 
I
A
 
V
E
 
D
Q
 
V
L
 
L
G
 
G
W
 
-
K
 
T
A
 
A
P
 
P
D
 
D
A
 
V
V
 
H
V
 
A
A
 
L
P
 
P
L
x
V
A
x
G
S
x
N
G
x
A
S
x
G
L
x
N
Y
 
I
T
 
T
K
 
A
I
 
Y
W
 
W
K
 
K
G
 
G
F
 
Y
N
 
T
E
 
E
L
 
Y
K
 
H
E
 
Q
V
 
L
G
 
G
L
 
L
I
 
I
S
 
-
D
|
D
N
 
K
P
 
L
P
 
P
R
|
R
M
 
M
Y
x
L
G
 
G
A
 
T
Q
 
Q
A
 
A
E
 
A
G
 
G
C
 
A
S
 
A
P
 
P
I
 
L
Y
 
V
K
 
L
A
 
G
F
 
E
K
 
P
E
 
V
N
 
S
R
 
H
D
 
-
W
 
-
I
 
-
V
 
-
P
 
-
E
 
-
K
 
-
P
 
P
D
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
K
 
T
S
x
A
I
 
I
A
 
R
I
 
I
G
 
G
N
 
S
P
 
P
A
 
A
D
 
S
G
 
W
P
 
T
Y
 
S
A
 
A
V
 
V
K
 
E
V
 
A
G
 
Q
K
 
Q
E
 
Q
S
 
S
S
 
K
G
 
G
D
 
R
M
 
F
E
 
L
I
 
A
A
 
A
S
 
S
D
 
D
Q
 
E
E
 
E
I
 
I
I
 
L
E
 
A
G
 
A
I
 
Y
K
 
H
L
 
L
L
 
V
A
 
A
R
 
R
T
 
V
E
 
E
G
 
G
I
 
V
F
 
F
T
 
V
E
 
E
T
 
P
A
 
A
G
 
S
G
 
A
T
 
A
T
 
S
I
 
I
A
 
A
V
 
G
L
 
L
K
 
L
K
 
K
L
 
A
A
 
I
E
 
D
K
 
D
G
 
G
A
 
W
F
 
V
D
 
A
P
 
R
E
 
G
E
 
S
T
 
T
V
 
V
V
 
V
V
 
C
Y
 
T
I
 
V
T
|
T
G
 
G
N
 
N
G
 
G
Y
 
L
K
 
K

P9WG59 Threonine synthase; TS; EC 4.2.3.1 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 2 papers)
38% identity, 79% coverage: 53:379/415 of query aligns to 13:331/360 of P9WG59

query
sites
P9WG59
P
 
P
K
 
G
S
 
V
L
 
I
W
 
A
R
 
A
Y
 
Y
V
 
R
D
 
D
L
 
R
L
 
L
P
 
P
V
 
V
-
 
G
-
 
D
D
 
D
N
 
W
P
 
T
K
 
P
V
 
V
G
 
T
L
 
L
S
 
L
A
 
E
G
 
G
F
 
G
T
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
I
K
 
A
A
 
A
E
 
T
K
 
N
L
 
L
G
 
S
K
 
K
E
 
Q
L
 
T
G
 
G
L
 
C
K
 
-
N
 
T
L
 
I
Y
 
H
I
 
L
K
 
K
D
 
V
D
 
E
S
 
G
V
 
L
N
 
N
H
 
-
P
 
P
T
 
T
L
 
G
S
 
S
F
 
F
K
|
K
D
 
D
R
 
R
V
 
G
V
 
M
A
 
T
V
 
M
A
 
A
L
 
V
S
 
T
K
 
D
A
 
A
K
 
L
E
 
A
F
 
H
G
 
G
F
 
Q
D
 
R
T
 
A
A
 
V
A
 
L
C
 
C
A
 
A
S
 
S
T
 
T
G
 
G
N
|
N
L
 
T
A
 
S
N
 
A
S
 
S
V
 
A
A
 
A
A
 
A
N
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
R
S
 
A
G
 
G
M
 
I
K
 
T
C
 
C
Y
 
A
V
 
V
F
 
L
I
 
I
P
 
P
S
 
Q
N
 
G
-
 
K
L
 
I
E
 
A
T
 
M
N
 
G
K
 
K
I
 
L
I
 
A
G
 
Q
S
 
A
L
 
V
V
 
M
F
 
H
N
 
G
P
 
A
T
 
K
V
 
I
V
 
I
A
 
Q
V
 
I
D
 
D
G
 
G
N
 
N
Y
 
F
D
 
D
D
 
D
V
 
C
N
 
L
R
 
E
L
 
L
S
 
A
S
 
R
E
x
K
I
 
M
A
 
A
N
 
A
E
 
D
F
 
F
G
 
P
W
 
T
A
 
I
F
 
S
V
 
L
N
 
V
I
 
N
N
 
S
V
 
V
R
 
N
P
 
P
F
 
V
Y
 
R
S
 
I
E
 
E
G
 
G
S
 
Q
K
 
K
T
 
T
L
 
A
A
 
A
F
 
F
E
 
E
V
 
I
A
 
V
E
 
D
Q
 
V
L
 
L
G
 
G
W
 
-
K
 
T
A
 
A
P
 
P
D
 
D
A
 
V
V
 
H
V
 
A
A
 
L
P
 
P
L
 
V
A
x
G
S
x
N
G
x
A
S
x
G
L
x
N
Y
 
I
T
 
T
K
 
A
I
 
Y
W
 
W
K
 
K
G
 
G
F
 
Y
N
 
T
E
 
E
L
 
Y
K
 
H
E
 
Q
V
 
L
G
 
G
L
 
L
I
 
I
S
 
-
D
 
D
N
 
K
P
 
L
P
 
P
R
 
R
M
 
M
Y
 
L
G
 
G
A
 
T
Q
 
Q
A
 
A
E
 
A
G
 
G
C
 
A
S
 
A
P
 
P
I
 
L
Y
 
V
K
 
L
A
 
G
F
 
E
K
 
P
E
 
V
N
 
S
R
 
H
D
 
-
W
 
-
I
 
-
V
 
-
P
 
-
E
 
-
K
 
-
P
 
P
D
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
K
 
T
S
 
A
I
 
I
A
 
R
I
 
I
G
 
G
N
 
S
P
 
P
A
 
A
D
 
S
G
 
W
P
 
T
Y
 
S
A
 
A
V
 
V
K
 
E
V
 
A
G
 
Q
K
 
Q
E
 
Q
S
 
S
S
 
K
G
 
G
D
 
R
M
 
F
E
 
L
I
 
A
A
 
A
S
 
S
D
 
D
Q
 
E
E
 
E
I
 
I
I
 
L
E
 
A
G
 
A
I
 
Y
K
 
H
L
 
L
L
 
V
A
 
A
R
 
R
T
 
V
E
 
E
G
 
G
I
 
V
F
 
F
T
 
V
E
 
E
T
 
P
A
 
A
G
 
S
G
 
A
T
 
A
T
 
S
I
 
I
A
 
A
V
 
G
L
 
L
K
 
L
K
 
K
L
 
A
A
 
I
E
 
D
K
 
D
G
 
G
A
 
W
F
 
V
D
 
A
P
 
R
E
 
G
E
 
S
T
 
T
V
 
V
V
 
V
V
 
C
Y
 
T
I
 
V
T
|
T
G
 
G
N
 
N
G
 
G
Y
 
L
K
 
K

Q9S7B5 Threonine synthase 1, chloroplastic; Protein METHIONINE OVER-ACCUMULATOR 2; EC 4.2.3.1 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 2 papers)
29% identity, 85% coverage: 29:379/415 of query aligns to 109:477/526 of Q9S7B5

query
sites
Q9S7B5
G
 
G
P
 
L
L
 
L
E
 
D
I
 
V
E
 
E
Y
 
H
D
 
D
Y
 
M
D
 
E
E
 
A
I
 
L
K
 
K
K
 
R
-
 
F
-
 
D
-
 
G
-
 
A
-
 
Y
-
 
W
-
 
R
N
 
D
I
 
L
S
 
F
K
 
D
E
 
S
K
 
R
I
 
V
E
 
G
N
 
-
G
 
-
P
 
-
K
 
K
S
 
S
L
 
T
W
 
W
R
 
P
Y
 
Y
V
 
G
D
 
S
-
 
G
-
 
V
-
 
W
-
 
S
-
 
K
-
 
K
-
 
E
-
 
W
L
 
V
L
 
L
P
 
P
V
 
E
-
 
I
-
 
D
D
 
D
N
 
D
P
 
D
K
 
I
V
 
V
G
 
S
L
 
A
S
 
F
A
 
E
G
 
G
F
 
N
T
 
S
P
x
N
L
|
L
I
 
F
K
 
W
A
 
A
E
 
E
K
 
R
L
 
F
G
 
G
K
|
K
E
 
Q
-
 
F
L
 
L
G
 
G
L
 
M
K
x
N
N
 
D
L
 
L
Y
 
W
I
 
V
K
 
K
D
 
H
D
 
C
S
 
G
V
 
I
N
 
S
H
 
H
P
 
-
T
 
T
L
 
G
S
 
S
F
 
F
K
 
K
D
 
D
R
x
L
V
 
G
V
 
M
A
 
T
V
 
V
A
 
L
L
 
V
S
 
S
K
 
Q
A
 
V
K
 
N
E
 
R
F
 
L
G
 
R
-
 
K
-
 
M
-
 
K
-
 
R
-
 
P
F
 
V
D
 
V
T
 
G
A
 
V
A
 
G
C
 
C
A
 
A
S
 
S
T
 
T
G
 
G
N
 
D
L
 
T
A
 
S
N
 
A
S
 
A
V
 
L
A
 
S
A
 
A
N
 
Y
A
 
C
A
 
A
A
 
S
S
 
A
G
 
G
M
 
I
K
 
P
C
 
S
Y
 
I
V
 
V
F
 
F
I
 
L
P
 
P
S
 
A
N
 
N
-
 
K
L
 
I
E
 
S
T
 
M
N
 
A
K
 
Q
I
 
L
I
 
V
G
 
Q
S
 
P
L
 
I
V
 
A
F
 
N
N
 
G
P
 
A
T
 
F
V
 
V
V
 
L
A
 
S
V
 
I
D
 
D
G
 
T
N
 
D
Y
 
F
D
 
D
D
 
G
V
 
C
N
 
M
R
 
K
L
 
L
S
 
I
S
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
T
N
 
A
E
 
E
F
 
L
G
 
P
W
 
I
A
 
Y
F
 
L
V
 
A
N
 
N
I
 
-
N
 
S
V
 
L
R
 
N
P
 
S
F
 
L
Y
 
R
S
 
L
E
 
E
G
 
G
S
 
Q
K
 
K
T
 
T
L
 
A
A
 
A
F
 
I
E
 
E
V
 
I
A
 
L
E
 
Q
Q
 
Q
L
 
F
G
 
D
W
 
W
K
 
Q
A
 
V
P
 
P
D
 
D
A
 
W
V
 
V
V
 
I
A
 
V
P
 
P
L
 
G
A
 
G
S
 
N
-
 
L
G
 
G
S
 
N
L
 
I
Y
 
Y
T
 
A
K
 
-
I
 
F
W
 
Y
K
 
K
G
 
G
F
 
F
N
 
K
E
 
M
L
 
C
K
 
Q
E
 
E
V
 
L
G
 
G
L
 
L
I
 
V
S
 
-
D
 
D
N
 
R
P
 
I
P
 
P
R
 
R
M
 
M
Y
 
V
G
 
C
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
E
 
A
G
 
N
C
 
A
S
 
N
P
 
P
I
 
L
Y
 
Y
K
 
L
A
 
H
F
 
Y
K
 
K
E
 
S
N
 
G
-
 
W
R
 
K
D
 
D
W
 
F
I
 
K
V
 
P
P
 
M
E
 
T
K
 
A
P
 
S
D
 
T
T
 
T
I
 
F
A
 
A
K
 
S
S
 
A
I
 
I
A
 
Q
I
 
I
G
 
G
N
 
D
P
 
P
A
 
V
D
 
S
G
 
I
P
 
D
Y
 
R
A
 
A
V
 
V
K
 
Y
V
 
A
G
 
L
K
 
K
E
 
K
S
 
C
S
 
N
G
 
G
D
 
I
M
 
V
E
 
E
I
 
E
A
 
A
S
 
T
D
 
E
Q
 
E
E
 
E
I
 
L
I
 
M
E
 
D
G
 
A
I
 
M
K
 
A
L
 
-
L
 
Q
A
 
A
R
 
D
T
 
S
E
 
T
G
 
G
I
 
M
F
 
F
T
 
I
E
 
C
T
 
P
A
 
H
G
 
T
G
 
G
T
 
V
T
 
A
I
 
L
A
 
T
V
 
A
L
 
L
K
 
F
K
 
K
L
 
L
A
 
R
E
 
N
K
 
Q
G
 
G
A
 
V
F
 
I
D
 
A
P
 
P
E
 
T
E
 
D
T
 
R
V
 
T
V
 
V
V
 
V
Y
 
V
I
 
S
T
 
T
G
 
A
N
 
H
G
 
G
Y
 
L
K
 
K

2c2bA Crystallographic structure of arabidopsis thaliana threonine synthase complexed with pyridoxal phosphate and s-adenosylmethionine (see paper)
29% identity, 85% coverage: 29:379/415 of query aligns to 34:402/444 of 2c2bA

query
sites
2c2bA
G
 
G
P
 
L
L
 
L
E
 
D
I
 
V
E
 
E
Y
 
H
D
 
D
Y
 
M
D
 
E
E
 
A
I
 
L
K
 
K
K
 
R
-
 
F
-
 
D
-
 
G
-
 
A
-
 
Y
-
 
W
-
 
R
N
 
D
I
 
L
S
 
F
K
 
D
E
 
S
K
 
R
I
 
V
E
 
G
N
 
-
G
 
-
P
 
-
K
 
K
S
|
S
L
x
T
W
|
W
R
x
P
Y
 
Y
V
x
G
D
 
S
-
 
G
-
 
V
-
 
W
-
 
S
-
 
K
-
 
K
-
 
E
-
 
W
L
 
V
L
 
L
P
 
P
V
 
E
-
 
I
-
 
D
D
 
D
N
 
D
P
 
D
K
 
I
V
 
V
G
x
S
L
 
A
S
x
F
A
 
E
G
 
G
F
 
N
T
 
S
P
x
N
L
|
L
I
 
F
K
x
W
A
 
A
E
 
E
K
 
R
L
 
F
G
 
G
K
 
K
E
 
Q
-
 
F
L
 
L
G
 
G
L
 
M
K
 
N
N
 
D
L
 
L
Y
x
W
I
 
V
K
 
K
D
 
H
D
 
C
S
 
G
V
 
I
N
 
S
H
 
H
P
 
-
T
 
T
L
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
D
 
D
R
 
L
V
 
G
V
 
M
A
 
T
V
 
V
A
 
L
L
 
V
S
 
S
K
 
Q
A
 
V
K
 
N
E
 
R
F
 
L
G
 
R
-
 
K
-
 
M
-
 
K
-
 
R
-
 
P
F
 
V
D
 
V
T
 
G
A
 
V
A
 
G
C
 
C
A
 
A
S
 
S
T
 
T
G
 
G
N
x
D
L
 
T
A
 
S
N
 
A
S
 
A
V
 
L
A
 
S
A
 
A
N
 
Y
A
 
C
A
 
A
A
 
S
S
 
A
G
 
G
M
 
I
K
 
P
C
 
S
Y
 
I
V
 
V
F
 
F
I
 
L
P
 
P
S
 
A
N
 
N
-
 
K
L
 
I
E
 
S
T
 
M
N
 
A
K
 
Q
I
 
L
I
 
V
G
 
Q
S
 
P
L
 
I
V
 
A
F
 
N
N
 
G
P
 
A
T
 
F
V
 
V
V
 
L
A
 
S
V
 
I
D
 
D
G
 
T
N
 
D
Y
 
F
D
 
D
D
 
G
V
 
C
N
 
M
R
 
K
L
 
L
S
 
I
S
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
T
N
 
A
E
 
E
F
 
L
G
 
P
W
 
I
A
 
Y
F
 
L
V
 
A
N
 
N
I
 
-
N
 
S
V
 
L
R
 
N
P
 
S
F
 
L
Y
 
R
S
 
L
E
 
E
G
 
G
S
 
Q
K
 
K
T
 
T
L
 
A
A
 
A
F
 
I
E
 
E
V
 
I
A
 
L
E
 
Q
Q
|
Q
L
x
F
G
 
D
W
 
W
K
 
Q
A
 
V
P
 
P
D
 
D
A
 
W
V
 
V
V
 
I
A
 
V
P
 
P
L
x
G
A
x
G
S
x
N
-
x
L
G
|
G
S
x
N
L
 
I
Y
 
Y
T
 
A
K
 
-
I
 
F
W
 
Y
K
 
K
G
 
G
F
 
F
N
 
K
E
 
M
L
 
C
K
 
Q
E
 
E
V
 
L
G
 
G
L
 
L
I
 
V
S
 
-
D
 
D
N
 
R
P
 
I
P
 
P
R
 
R
M
 
M
Y
 
V
G
 
C
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
E
 
A
G
 
N
C
 
A
S
 
N
P
 
P
I
 
L
Y
 
Y
K
 
L
A
 
H
F
 
Y
K
 
K
E
 
S
N
 
G
-
 
W
R
 
K
D
 
D
W
 
F
I
 
K
V
 
P
P
 
M
E
 
T
K
 
A
P
 
S
D
 
T
T
 
T
I
 
F
A
 
A
K
 
S
S
x
A
I
 
I
A
 
Q
I
 
I
G
 
G
N
 
D
P
 
P
A
 
V
D
 
S
G
 
I
P
 
D
Y
 
R
A
 
A
V
 
V
K
 
Y
V
 
A
G
 
L
K
 
K
E
 
K
S
 
C
S
 
N
G
 
G
D
 
I
M
 
V
E
 
E
I
 
E
A
 
A
S
 
T
D
 
E
Q
 
E
E
 
E
I
 
L
I
 
M
E
 
D
G
 
A
I
 
M
K
 
A
L
 
-
L
 
Q
A
 
A
R
 
D
T
 
S
E
 
T
G
 
G
I
 
M
F
 
F
T
 
I
E
 
C
T
 
P
A
x
H
G
 
T
G
 
G
T
 
V
T
 
A
I
 
L
A
 
T
V
 
A
L
 
L
K
 
F
K
 
K
L
 
L
A
 
R
E
 
N
K
 
Q
G
 
G
A
 
V
F
 
I
D
 
A
P
 
P
E
 
T
E
 
D
T
 
R
V
 
T
V
 
V
V
 
V
Y
 
V
I
 
S
T
|
T
G
 
A
N
 
H
G
 
G
Y
 
L
K
 
K

2c2gA Crystal structure of threonine synthase from arabidopsis thaliana in complex with its cofactor pyridoxal phosphate (see paper)
28% identity, 85% coverage: 29:379/415 of query aligns to 52:404/448 of 2c2gA

query
sites
2c2gA
G
 
G
P
 
L
L
 
L
E
 
D
I
 
V
E
 
E
Y
 
H
D
 
D
Y
 
M
D
 
E
E
 
A
I
 
L
K
 
K
K
 
R
-
 
F
-
 
D
-
 
G
-
 
A
-
 
Y
-
 
W
-
 
R
N
 
D
I
 
L
S
 
F
K
 
D
E
 
S
K
 
R
I
 
V
E
 
G
N
 
-
G
 
-
P
 
-
K
 
K
S
 
S
L
 
T
W
 
W
R
 
P
Y
 
Y
V
 
G
D
 
S
-
 
G
-
 
V
-
 
W
-
 
S
-
 
K
-
 
K
-
 
E
-
 
W
L
 
V
L
 
L
P
 
P
V
 
E
-
 
I
-
 
D
D
 
D
N
 
D
P
 
D
K
 
I
V
 
V
G
 
S
L
 
A
S
 
F
A
 
E
G
 
G
F
 
N
T
 
S
P
 
N
L
 
L
I
 
F
K
 
W
A
 
A
E
 
E
K
 
R
L
 
F
G
 
G
K
 
K
E
 
Q
-
 
F
L
 
L
G
 
G
L
 
M
K
 
N
N
 
D
L
 
L
Y
 
W
I
 
V
K
 
K
D
 
H
D
 
C
S
 
G
V
 
I
N
 
S
H
 
H
P
 
-
T
 
T
L
 
G
S
 
S
F
 
F
K
|
K
D
 
D
R
 
L
V
 
G
V
 
M
A
 
T
V
 
V
A
 
L
L
 
V
S
 
S
K
 
Q
A
 
V
K
 
N
E
 
R
F
 
L
G
 
R
-
 
K
-
 
M
-
 
K
-
 
R
-
 
P
F
 
V
D
 
V
T
 
G
A
 
V
A
 
G
C
 
C
A
 
A
S
|
S
T
 
T
G
 
G
N
 
D
L
x
T
A
 
S
N
 
A
S
 
A
V
 
L
A
 
S
A
 
A
N
 
Y
A
 
C
A
 
A
A
 
S
S
 
A
G
 
G
M
 
I
K
 
P
C
 
S
Y
 
I
V
 
V
F
 
F
I
 
L
P
 
P
S
 
A
N
 
N
-
 
K
L
 
I
E
 
S
T
 
M
N
 
A
K
 
Q
I
 
L
I
 
V
G
 
Q
S
 
P
L
 
I
V
 
A
F
 
N
N
 
G
P
 
A
T
 
F
V
 
V
V
 
L
A
 
S
V
 
I
D
 
D
G
 
T
N
 
D
Y
 
F
D
 
D
D
 
G
V
 
C
N
 
M
R
 
K
L
 
L
S
 
I
S
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
T
N
 
A
E
 
E
F
 
L
G
 
P
W
 
I
A
 
Y
F
 
L
V
 
A
N
 
N
I
 
-
N
x
S
V
 
L
R
 
N
P
 
S
F
 
L
Y
x
R
S
 
L
E
 
E
G
 
G
S
 
Q
K
 
K
T
 
T
L
 
A
A
 
A
F
 
I
E
 
E
V
 
I
A
 
L
E
 
Q
Q
 
Q
L
 
F
G
 
D
W
 
W
K
 
Q
A
 
V
P
 
P
D
 
D
A
 
W
V
 
V
V
 
I
A
 
V
P
 
P
L
 
G
A
 
G
S
x
N
-
 
L
G
 
G
S
 
N
L
 
I
Y
 
Y
T
 
A
K
 
-
I
 
F
W
 
Y
K
 
K
G
 
G
F
 
F
N
 
K
E
 
M
L
 
C
K
 
Q
E
 
E
V
 
L
G
 
G
L
 
L
I
 
V
S
 
-
D
 
D
N
 
R
P
 
I
P
 
P
R
 
R
M
 
M
Y
 
V
G
 
C
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
E
 
A
G
 
N
C
 
A
S
 
N
P
 
P
I
 
L
Y
 
Y
K
 
L
A
 
H
F
 
Y
K
 
K
E
 
S
N
 
G
-
 
W
R
 
K
D
 
D
W
 
F
I
 
-
V
 
-
P
 
-
E
 
-
K
 
K
P
 
P
D
 
V
T
 
S
I
 
I
A
 
D
K
 
R
S
 
A
I
 
V
A
 
-
I
 
-
G
 
-
N
 
-
P
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
P
 
-
Y
 
Y
A
 
A
V
 
L
K
 
-
V
 
-
G
 
-
K
 
K
E
 
K
S
 
C
S
 
N
G
 
G
D
 
I
M
 
V
E
 
E
I
 
E
A
 
A
S
 
T
D
 
E
Q
 
E
E
 
E
I
 
L
I
 
M
E
 
D
G
 
A
I
 
M
K
 
A
L
 
-
L
 
Q
A
 
A
R
 
D
T
 
S
E
 
T
G
 
G
I
 
M
F
 
F
T
 
I
E
 
C
T
 
P
A
 
H
G
 
T
G
 
G
T
 
V
T
 
A
I
 
L
A
 
T
V
 
A
L
 
L
K
 
F
K
 
K
L
 
L
A
 
R
E
 
N
K
 
Q
G
 
G
A
 
V
F
 
I
D
 
A
P
 
P
E
 
T
E
 
D
T
 
R
V
 
T
V
 
V
V
 
V
Y
 
V
I
 
S
T
 
T
G
 
A
N
 
H
G
 
G
Y
 
L
K
 
K

1pwhA Rat liver l-serine dehydratase- complex with pyridoxyl-(o-methyl- serine)-5-monophosphate (see paper)
27% identity, 75% coverage: 77:388/415 of query aligns to 11:320/327 of 1pwhA

query
sites
1pwhA
T
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
R
K
 
D
A
 
S
E
 
M
K
 
A
L
 
L
G
 
S
K
 
K
E
 
V
L
 
A
G
 
G
L
 
-
K
 
T
N
 
S
L
 
V
Y
 
F
I
 
L
K
 
K
D
 
M
D
 
D
S
 
S
V
 
-
N
 
S
H
 
Q
P
 
P
T
 
S
L
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
D
 
I
R
 
R
V
 
G
V
 
I
A
 
G
V
 
H
A
 
L
L
 
C
S
 
K
K
 
M
A
 
K
K
 
A
E
 
K
F
 
Q
G
 
G
F
 
C
D
 
K
T
 
H
A
 
F
A
 
V
C
 
C
A
 
S
S
|
S
T
x
A
G
 
G
N
|
N
L
x
A
A
 
G
N
 
M
S
 
A
V
 
T
A
 
A
A
 
Y
N
 
A
A
 
A
A
 
R
A
 
R
S
 
L
G
 
G
M
 
L
K
 
P
C
 
A
Y
 
T
V
 
I
F
 
V
I
 
V
P
 
P
S
 
S
N
 
T
L
 
T
E
 
P
T
 
A
N
 
L
K
 
T
I
 
I
I
 
E
G
 
R
S
 
L
L
 
K
V
 
N
F
 
E
N
 
G
P
 
A
T
 
T
V
 
V
V
 
E
A
 
V
V
 
V
D
 
G
G
 
E
N
 
M
Y
 
L
D
 
D
D
 
E
V
 
A
N
 
I
R
 
Q
L
 
L
S
 
A
S
 
K
E
 
A
I
 
L
-
 
E
A
 
K
N
 
N
E
 
N
F
 
P
G
 
G
W
 
W
A
 
V
F
 
Y
V
 
I
N
 
S
I
 
P
N
x
F
V
 
D
R
 
D
P
 
P
F
 
L
Y
 
I
S
 
W
E
 
E
G
 
G
S
 
H
K
 
T
T
 
S
L
 
L
A
 
V
F
 
K
E
 
E
V
 
L
A
 
K
E
 
E
Q
 
T
L
 
L
G
 
S
W
 
A
K
 
K
A
 
-
P
 
P
D
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
V
A
 
L
P
 
S
L
 
V
A
x
G
S
x
G
G
|
G
S
x
G
L
 
L
Y
 
L
T
 
C
K
 
G
I
 
V
W
 
V
K
 
Q
G
 
G
F
 
-
N
 
-
E
 
-
L
 
L
K
 
R
E
 
E
V
 
V
G
 
G
L
 
W
I
 
-
S
 
E
D
 
D
N
 
V
P
 
P
P
 
-
R
 
-
M
 
I
Y
 
I
G
 
A
A
 
M
Q
x
E
A
 
T
E
 
F
G
 
G
C
x
A
S
 
H
P
x
S
I
 
F
Y
 
H
K
 
A
A
 
A
F
 
V
K
 
K
E
 
E
N
 
G
R
 
K
D
 
L
W
 
V
I
 
T
V
 
L
P
 
P
E
 
-
K
 
K
P
 
I
D
 
T
T
 
S
I
 
V
A
 
A
K
 
K
S
 
-
I
 
-
A
|
A
I
 
L
G
|
G
N
 
V
P
 
N
A
 
T
D
 
V
G
 
G
P
 
A
Y
 
Q
A
 
T
V
 
L
K
 
K
V
 
L
G
 
F
K
 
Y
E
 
E
S
 
H
S
 
P
G
 
I
D
 
F
M
 
S
E
 
E
I
 
V
A
 
I
S
 
S
D
 
D
Q
 
Q
E
 
E
I
 
A
I
 
V
E
 
T
G
 
A
I
 
I
K
 
E
L
 
K
L
 
F
A
 
V
R
 
D
T
 
D
E
 
E
G
 
K
I
 
I
F
 
L
T
 
V
E
 
E
T
 
P
A
|
A
G
 
C
G
 
G
T
 
A
T
 
A
I
 
L
A
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
Y
-
 
S
-
 
G
-
 
V
V
 
V
L
 
C
K
 
R
K
 
L
L
 
Q
A
 
A
E
 
E
K
 
A
G
 
R
A
 
L
F
 
Q
D
 
T
P
 
P
E
 
L
E
 
A
T
 
S
V
 
L
V
 
V
V
 
V
Y
 
I
I
 
V
T
x
C
G
|
G
N
 
G
-
 
S
-
 
N
-
 
I
G
 
S
Y
 
L
K
 
A
T
 
Q
M
 
L
E
 
Q
V
 
A
L
 
L
E
 
K
G
 
A
Q
 
Q
L
 
L

Q8VBT2 L-serine dehydratase/L-threonine deaminase; SDH; L-serine deaminase; L-threonine dehydratase; TDH; EC 4.3.1.17; EC 4.3.1.19 from Mus musculus (Mouse)
26% identity, 74% coverage: 77:385/415 of query aligns to 11:314/327 of Q8VBT2

query
sites
Q8VBT2
T
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
R
K
 
D
A
 
S
E
 
M
K
 
A
L
 
L
G
 
S
K
 
K
E
 
L
L
 
A
G
 
G
L
 
-
K
 
T
N
 
S
L
 
V
Y
 
F
I
 
L
K
 
K
D
 
M
D
 
D
S
 
S
V
 
-
N
 
S
H
 
Q
P
 
P
T
 
S
L
 
G
S
 
S
F
 
F
K
 
K
D
 
I
R
 
R
V
 
G
V
 
I
A
 
G
V
 
H
A
 
L
L
 
C
S
 
K
K
 
M
A
 
K
K
 
A
E
 
K
F
 
Q
G
 
G
F
 
C
D
 
R
T
 
H
A
 
F
A
 
V
C
 
C
A
 
S
S
 
S
T
 
A
G
 
G
N
 
N
L
 
A
A
 
G
N
 
M
S
 
A
V
 
T
A
 
A
A
 
Y
N
 
A
A
 
A
A
 
R
A
 
R
S
 
L
G
 
G
M
 
I
K
 
P
C
 
A
Y
 
T
V
 
I
F
 
V
I
 
V
P
 
P
S
 
N
N
 
T
L
 
T
E
 
P
T
 
A
N
 
L
K
 
T
I
 
I
I
 
E
G
 
R
S
 
L
L
 
K
V
 
N
F
 
E
N
 
G
P
 
A
T
 
T
V
 
V
V
 
E
A
 
V
V
 
V
D
 
G
G
 
E
N
 
M
Y
 
L
D
 
D
D
 
E
V
 
A
N
 
I
R
 
Q
L
 
V
S
 
A
S
 
K
E
 
A
I
 
L
-
 
E
A
 
K
N
 
N
E
 
N
F
 
P
G
 
G
W
 
W
A
 
V
F
 
Y
V
 
I
N
 
S
I
 
P
N
 
F
V
 
D
R
 
D
P
 
P
F
 
L
Y
 
I
S
 
W
E
 
E
G
 
G
S
 
H
K
 
T
T
 
S
L
 
L
A
 
V
F
 
K
E
 
E
V
 
L
A
 
K
E
 
E
Q
 
T
L
 
L
G
 
S
W
 
A
K
 
K
A
 
-
P
 
P
D
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
V
A
 
L
P
 
S
L
 
V
A
 
G
S
 
G
G
 
G
S
 
G
L
 
L
Y
 
L
T
 
C
K
 
G
I
 
V
W
 
V
K
 
Q
G
 
G
F
 
-
N
 
-
E
 
-
L
 
L
K
 
R
E
 
E
V
 
V
G
 
G
L
 
W
I
 
-
S
 
E
D
 
D
N
 
V
P
 
P
P
 
-
R
 
-
M
 
I
Y
 
I
G
 
A
A
 
M
Q
 
E
A
 
T
E
 
F
G
 
G
C
 
A
S
 
H
P
 
S
I
 
F
Y
 
H
K
 
A
A
 
A
F
 
I
K
 
K
E
 
E
N
 
G
R
 
K
D
 
L
W
 
V
I
 
T
V
 
L
P
 
P
E
 
-
K
 
K
P
 
I
D
 
T
T
 
S
I
 
V
A
 
A
K
 
K
S
 
-
I
 
-
A
 
A
I
 
L
G
 
G
N
 
V
P
 
N
A
 
T
D
 
V
G
 
G
P
 
A
Y
 
Q
A
 
T
V
 
L
K
 
K
V
 
L
G
 
F
K
 
Y
E
 
E
S
 
H
S
 
P
G
 
I
D
 
F
M
 
S
E
 
E
I
 
V
A
 
I
S
 
S
D
 
D
Q
 
Q
E
 
E
I
 
A
I
 
V
E
 
S
G
 
A
I
 
L
K
 
E
L
 
K
L
 
F
A
 
V
R
 
D
T
 
D
E
 
E
G
 
K
I
 
I
F
 
L
T
 
V
E
 
E
T
 
P
A
 
A
G
 
C
G
 
G
T
 
A
T
 
A
I
 
L
A
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
Y
-
 
S
-
 
R
V
 
V
L
 
V
K
 
C
K
 
R
L
 
L
A
 
Q
E
 
D
K
 
E
G
 
G
A
 
R
F
 
L
D
 
Q
-
 
T
P
 
P
E
 
L
E
 
A
T
 
S
V
 
L
V
 
V
V
 
V
Y
 
I
I
 
V
T
 
C
G
 
G
N
 
G
G
 
S
Y
 
N
K
 
I
T
 
S
M
 
L
E
 
A
V
 
Q
L
 
L
E
 
Q

Sites not aligning to the query:

4d9mA Crystal structure of diaminopropionate ammonia lyase from escherichia coli in complex with aminoacrylate-plp azomethine reaction intermediate (see paper)
27% identity, 36% coverage: 74:223/415 of query aligns to 39:206/378 of 4d9mA

query
sites
4d9mA
A
 
A
G
 
G
F
 
Y
-
 
R
-
 
P
T
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
C
K
 
A
A
 
L
E
 
D
K
 
D
L
 
L
G
 
A
K
 
N
E
 
L
L
 
F
G
 
G
L
 
V
K
 
K
N
 
K
L
 
I
Y
 
L
I
 
V
K
 
K
D
 
D
D
 
E
S
 
S
V
 
K
N
 
R
H
 
F
P
 
G
T
 
L
L
 
N
S
 
A
F
 
F
K
|
K
D
 
M
R
 
L
V
 
G
V
 
G
A
 
A
V
 
Y
A
 
A
L
 
I
S
 
A
K
 
Q
A
 
L
-
 
L
-
 
C
-
 
E
-
 
K
-
 
Y
-
 
H
-
 
L
-
 
D
-
 
I
K
 
E
E
 
T
F
 
L
G
 
S
F
 
F
D
 
M
T
 
T
A
 
F
A
 
A
C
 
T
A
 
T
S
x
T
T
x
D
G
 
G
N
|
N
L
x
H
A
 
G
N
 
R
S
 
G
V
 
V
A
 
A
A
 
W
N
 
A
A
 
A
A
 
Q
A
 
Q
S
 
L
G
 
G
M
 
Q
K
 
N
C
 
A
Y
 
V
V
 
I
F
 
Y
I
 
M
P
 
P
S
 
K
N
 
G
L
 
S
E
 
A
T
 
Q
N
 
E
K
 
R
I
 
V
I
 
D
G
 
A
S
 
I
L
 
L
V
 
N
F
 
L
N
 
G
P
 
A
T
 
E
V
 
C
V
 
I
A
 
V
V
 
T
D
 
D
G
 
M
N
 
N
Y
 
Y
D
 
D
D
 
D
V
 
T
N
 
V
R
 
R
L
 
L
S
 
T
S
 
M
E
 
Q
I
 
H
A
 
A
N
 
Q
E
 
Q
F
 
H
G
 
G
W
 
W
A
 
E
F
 
V
V
 
V
N
 
Q
I
 
D
N
 
T
V
 
A
R
 
W
P
 
E
F
 
G
Y
 
Y
S
 
T
-
 
K
-
 
I
-
 
P
-
 
T
-
 
W
-
 
I
-
 
M
E
 
Q
G
 
G
S
 
Y
K
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
F
 
D
E
 
E
V
 
A
A
 
V
E
 
E
Q
 
Q
L
 
M

Sites not aligning to the query:

4d9kA Crystal structure of escherichia coli diaminopropionate ammonia lyase in apo form (see paper)
25% identity, 36% coverage: 74:223/415 of query aligns to 40:216/366 of 4d9kA

query
sites
4d9kA
A
 
A
G
 
G
F
 
Y
-
 
R
-
 
P
T
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
C
K
 
A
A
 
L
E
 
D
K
 
D
L
 
L
G
 
A
K
 
N
E
 
L
L
 
F
G
 
G
L
 
V
K
 
K
N
 
K
L
 
I
Y
 
L
I
 
V
K
 
K
D
 
D
D
 
E
S
 
S
V
 
K
N
 
R
H
 
F
P
 
G
T
 
L
L
 
N
S
 
A
F
 
F
K
|
K
D
 
M
R
 
L
V
 
G
V
 
G
A
 
A
V
 
Y
A
 
A
L
 
I
S
 
A
K
 
Q
-
 
L
-
 
L
A
 
C
K
 
E
E
 
K
F
 
Y
G
 
H
F
 
L
D
 
D
-
 
I
-
 
E
-
 
T
-
 
L
-
 
S
-
 
F
-
 
E
-
 
H
-
 
L
-
 
K
-
 
N
-
 
A
-
 
G
-
 
E
-
 
K
-
 
M
T
 
T
A
 
F
A
 
A
C
 
T
A
 
T
S
 
T
T
 
D
G
 
G
N
 
N
L
 
H
A
 
G
N
 
R
S
 
G
V
 
V
A
 
A
A
 
W
N
 
A
A
 
A
A
 
Q
A
 
Q
S
 
L
G
 
G
M
 
Q
K
 
N
C
 
A
Y
 
V
V
 
I
F
 
Y
I
 
M
P
 
P
S
 
K
N
 
G
L
 
S
E
 
A
T
 
Q
N
 
E
K
 
R
I
 
V
I
 
D
G
 
A
S
 
I
L
 
L
V
 
N
F
 
L
N
 
G
P
 
A
T
 
E
V
 
C
V
 
I
A
 
V
V
 
T
D
 
D
G
 
M
N
 
N
Y
 
Y
D
 
D
D
 
D
V
 
T
N
 
V
R
 
R
L
 
L
S
 
T
S
 
M
E
 
Q
I
 
H
A
 
A
N
 
Q
E
 
Q
F
 
H
G
 
G
W
 
W
A
 
E
F
 
V
V
 
V
N
 
Q
I
 
D
N
 
T
V
 
A
R
 
W
P
 
E
F
 
G
Y
 
Y
S
 
T
-
 
K
-
 
I
-
 
P
-
 
T
-
 
W
-
 
I
-
 
M
E
 
Q
G
 
G
S
 
Y
K
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
F
 
D
E
 
E
V
 
A
A
 
V
E
 
E
Q
 
Q
L
 
M

Sites not aligning to the query:

P66899 Diaminopropionate ammonia-lyase; DAPAL; 2,3-diaminopropionate ammonia-lyase; Alpha,beta-diaminopropionate ammonia-lyase; Diaminopropionatase; EC 4.3.1.15 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
25% identity, 36% coverage: 74:223/415 of query aligns to 40:217/398 of P66899

query
sites
P66899
A
 
A
G
 
G
F
 
Y
-
 
R
-
 
P
T
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
C
K
 
A
A
 
L
E
 
D
K
 
D
L
 
L
G
 
A
K
 
N
E
 
L
L
 
F
G
 
G
L
 
V
K
 
K
N
 
K
L
 
I
Y
 
L
I
 
V
K
 
K
D
 
D
D
 
E
S
 
S
V
 
K
N
 
R
H
 
F
P
 
G
T
 
L
L
 
N
S
 
A
F
 
F
K
|
K
D
 
M
R
 
L
V
 
G
V
 
G
A
 
A
V
 
Y
A
 
A
L
 
I
S
 
A
K
 
Q
-
 
L
-
 
L
A
 
C
K
 
E
E
 
K
F
 
Y
G
 
H
F
 
L
D
 
D
-
 
I
-
 
E
-
 
T
-
 
L
-
 
S
-
 
F
-
 
E
-
 
H
-
 
L
-
 
K
-
 
N
-
 
A
-
 
I
-
 
G
-
 
E
-
 
K
-
 
M
T
 
T
A
 
F
A
 
A
C
 
T
A
 
T
S
 
T
T
x
D
G
 
G
N
 
N
L
 
H
A
 
G
N
 
R
S
 
G
V
 
V
A
 
A
A
 
W
N
 
A
A
 
A
A
 
Q
A
 
Q
S
 
L
G
 
G
M
 
Q
K
 
N
C
 
A
Y
 
V
V
 
I
F
 
Y
I
 
M
P
 
P
S
 
K
N
 
G
L
 
S
E
 
A
T
 
Q
N
 
E
K
 
R
I
 
V
I
 
D
G
 
A
S
 
I
L
 
L
V
 
N
F
 
L
N
 
G
P
 
A
T
 
E
V
 
C
V
 
I
A
 
V
V
 
T
D
 
D
G
 
M
N
 
N
Y
 
Y
D
 
D
D
 
D
V
 
T
N
 
V
R
 
R
L
 
L
S
 
T
S
 
M
E
 
Q
I
 
H
A
 
A
N
 
Q
E
 
Q
F
 
H
G
 
G
W
 
W
A
 
E
F
 
V
V
 
V
N
 
Q
I
x
D
N
 
T
V
 
A
R
 
W
P
 
E
F
 
G
Y
 
Y
S
 
T
-
 
K
-
 
I
-
 
P
-
 
T
-
 
W
-
 
I
-
 
M
E
 
Q
G
 
G
S
 
Y
K
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
F
 
D
E
 
E
V
 
A
A
 
V
E
 
E
Q
 
Q
L
 
M

Sites not aligning to the query:

4d9nA Crystal structure of diaminopropionate ammonia lyase from escherichia coli in complex with d-serine (see paper)
25% identity, 36% coverage: 74:223/415 of query aligns to 39:216/391 of 4d9nA

query
sites
4d9nA
A
 
A
G
 
G
F
 
Y
-
 
R
-
 
P
T
 
T
P
 
P
L
 
L
I
 
C
K
 
A
A
 
L
E
 
D
K
 
D
L
 
L
G
 
A
K
 
N
E
 
L
L
 
F
G
 
G
L
 
V
K
 
K
N
 
K
L
 
I
Y
 
L
I
 
V
K
 
K
D
 
D
D
 
E
S
 
S
V
 
K
N
 
R
H
 
F
P
 
G
T
 
L
L
 
N
S
 
A
F
 
F
K
|
K
D
 
M
R
 
L
V
 
G
V
 
G
A
 
A
V
 
Y
A
 
A
L
 
I
S
 
A
K
 
Q
-
 
L
-
 
L
A
 
C
K
 
E
E
 
K
F
 
Y
G
 
H
F
 
L
D
 
D
-
 
I
-
 
E
-
 
T
-
 
L
-
 
S
-
 
F
-
 
E
-
 
H
-
 
L
-
 
K
-
 
N
-
 
A
-
 
I
-
 
G
-
 
E
-
 
K
-
 
M
T
 
T
A
 
F
A
 
A
C
 
T
A
 
T
S
x
T
T
x
D
G
 
G
N
 
N
L
x
H
A
 
G
N
 
R
S
 
G
V
 
V
A
 
A
A
 
W
N
 
A
A
 
A
A
 
Q
A
 
Q
S
 
L
G
 
G
M
 
Q
K
 
N
C
 
A
Y
 
V
V
 
I
F
 
Y
I
 
M
P
 
P
S
 
K
N
 
G
L
 
S
E
 
A
T
 
Q
N
 
E
K
 
R
I
 
V
I
 
D
G
 
A
S
 
I
L
 
L
V
 
N
F
 
L
N
 
G
P
 
A
T
 
E
V
 
C
V
 
I
A
 
V
V
 
T
D
 
D
G
 
M
N
 
N
Y
 
Y
D
 
D
D
 
D
V
 
T
N
 
V
R
 
R
L
 
L
S
 
T
S
 
M
E
 
Q
I
 
H
A
 
A
N
 
Q
E
 
Q
F
 
H
G
 
G
W
 
W
A
 
E
F
 
V
V
 
V
N
 
Q
I
x
D
N
 
T
V
 
A
R
 
W
P
 
E
F
 
G
Y
 
Y
S
 
T
-
 
K
-
 
I
-
 
P
-
 
T
-
 
W
-
 
I
-
 
M
E
 
Q
G
 
G
S
 
Y
K
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
F
 
D
E
 
E
V
 
A
A
 
V
E
 
E
Q
 
Q
L
 
M

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_012676449.1 NCBI__GCF_000021565.1:WP_012676449.1
MPKVKALKCKECGKEYPVEPIHVCEFCFGPLEIEYDYDEIKKNISKEKIENGPKSLWRYV
DLLPVDNPKVGLSAGFTPLIKAEKLGKELGLKNLYIKDDSVNHPTLSFKDRVVAVALSKA
KEFGFDTAACASTGNLANSVAANAAASGMKCYVFIPSNLETNKIIGSLVFNPTVVAVDGN
YDDVNRLSSEIANEFGWAFVNINVRPFYSEGSKTLAFEVAEQLGWKAPDAVVAPLASGSL
YTKIWKGFNELKEVGLISDNPPRMYGAQAEGCSPIYKAFKENRDWIVPEKPDTIAKSIAI
GNPADGPYAVKVGKESSGDMEIASDQEIIEGIKLLARTEGIFTETAGGTTIAVLKKLAEK
GAFDPEETVVVYITGNGYKTMEVLEGQLKKPVHIKPSLTEFKEKVIGQTVKAEEK

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory