SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012706479.1 NCBI__GCF_000018545.1:WP_012706479.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6j5xB Crystal structure of fumarylpyruvate hydrolase from corynebacterium glutamicum in complex with mn2+ and pyruvate (see paper)
42% identity, 77% coverage: 60:284/291 of query aligns to 53:279/280 of 6j5xB

query
sites
6j5xB
V
 
V
D
 
T
L
 
F
A
 
E
N
 
N
V
 
K
D
 
E
L
 
L
L
 
D
P
 
A
P
 
V
I
 
V
L
 
P
R
 
A
P
 
P
G
 
K
K
 
K
I
 
I
V
 
V
C
 
C
V
|
V
G
|
G
L
 
L
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
D
 
N
H
|
H
T
 
I
E
 
K
E
 
E
S
 
M
G
 
G
Y
 
R
K
 
D
Q
 
L
P
 
P
D
 
D
H
 
T
P
 
P
T
 
T
L
 
L
F
|
F
P
 
V
R
 
K
F
 
F
T
 
P
S
 
D
S
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
G
A
 
P
G
 
F
E
 
D
P
 
D
I
 
V
V
 
V
R
 
V
P
 
P
-
 
E
F
 
W
V
 
A
S
 
N
E
 
K
T
 
A
L
 
L
D
 
D
F
 
W
E
|
E
G
 
G
E
|
E
L
 
M
V
 
A
A
 
V
V
 
I
I
 
I
G
 
G
R
 
K
R
 
R
G
 
A
R
 
R
H
 
R
I
 
V
S
 
K
K
 
Q
H
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
A
D
 
E
H
 
Y
V
 
I
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
S
 
A
I
 
V
F
 
M
N
 
N
D
|
D
A
 
Y
S
 
T
I
 
T
R
 
R
E
 
D
F
 
F
Q
 
Q
H
 
Y
-
 
A
-
 
A
-
 
P
-
 
A
R
 
K
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
W
|
W
T
 
H
L
 
Q
G
 
G
K
|
K
N
 
S
F
 
L
D
 
E
G
 
K
T
 
S
G
 
A
S
 
G
F
 
F
G
 
G
P
 
P
W
 
W
F
 
M
V
 
T
T
 
T
A
 
P
D
 
D
E
 
S
L
 
F
P
 
E
R
 
F
G
 
G
A
 
G
A
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
E
I
 
L
E
 
A
T
 
T
R
 
Y
L
 
L
N
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
K
V
 
V
Q
 
Q
A
 
S
S
 
T
N
 
P
T
 
T
D
 
N
Q
 
D
L
 
L
I
 
V
F
 
F
D
 
S
V
 
P
A
 
E
T
 
K
L
 
L
V
 
I
S
 
E
T
 
Y
I
 
I
S
 
T
E
 
H
A
 
I
I
 
Y
T
 
P
L
 
L
E
 
D
P
 
A
G
 
G
D
 
D
L
 
V
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
T
|
T
P
 
P
S
 
G
G
 
G
I
 
V
G
 
G
H
 
H
A
 
A
R
 
R
N
 
N
P
 
P
R
 
Q
L
 
R
Y
 
Y
M
 
I
R
 
G
A
 
D
G
 
G
D
 
E
V
 
T
V
 
V
E
 
K
V
 
V
E
 
E
I
 
I
Q
 
A
S
 
G
I
 
L
G
 
G
T
 
F
L
 
I
R
 
E
N
 
N
P
 
K
V
 
T
V
 
V
D
 
F
E
 
E

6j5xA Crystal structure of fumarylpyruvate hydrolase from corynebacterium glutamicum in complex with mn2+ and pyruvate (see paper)
42% identity, 77% coverage: 60:284/291 of query aligns to 53:279/280 of 6j5xA

query
sites
6j5xA
V
 
V
D
 
T
L
 
F
A
 
E
N
 
N
V
 
K
D
 
E
L
 
L
L
 
D
P
 
A
P
 
V
I
 
V
L
 
P
R
 
A
P
 
P
G
 
K
K
 
K
I
 
I
V
 
V
C
 
C
V
 
V
G
 
G
L
 
L
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
D
 
N
H
 
H
T
 
I
E
 
K
E
 
E
S
 
M
G
 
G
Y
 
R
K
 
D
Q
 
L
P
 
P
D
 
D
H
 
T
P
 
P
T
 
T
L
 
L
F
 
F
P
 
V
R
 
K
F
 
F
T
 
P
S
 
D
S
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
G
A
 
P
G
 
F
E
 
D
P
 
D
I
 
V
V
 
V
R
 
V
P
 
P
-
 
E
F
 
W
V
 
A
S
 
N
E
 
K
T
 
A
L
 
L
D
 
D
F
 
W
E
|
E
G
 
G
E
|
E
L
 
M
V
 
A
A
 
V
V
 
I
I
 
I
G
 
G
R
 
K
R
 
R
G
 
A
R
 
R
H
 
R
I
 
V
S
 
K
K
 
Q
H
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
A
D
 
E
H
 
Y
V
 
I
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
S
 
A
I
 
V
F
 
M
N
 
N
D
|
D
A
 
Y
S
 
T
I
 
T
R
 
R
E
 
D
F
 
F
Q
 
Q
H
 
Y
-
 
A
-
 
A
-
 
P
-
 
A
R
 
K
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
W
 
W
T
 
H
L
 
Q
G
 
G
K
 
K
N
 
S
F
 
L
D
 
E
G
 
K
T
 
S
G
 
A
S
 
G
F
 
F
G
 
G
P
 
P
W
 
W
F
 
M
V
 
T
T
 
T
A
 
P
D
 
D
E
 
S
L
 
F
P
 
E
R
 
F
G
 
G
A
 
G
A
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
E
I
 
L
E
 
A
T
 
T
R
 
Y
L
 
L
N
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
K
V
 
V
Q
 
Q
A
 
S
S
 
T
N
 
P
T
 
T
D
 
N
Q
 
D
L
 
L
I
 
V
F
 
F
D
 
S
V
 
P
A
 
E
T
 
K
L
 
L
V
 
I
S
 
E
T
 
Y
I
 
I
S
 
T
E
 
H
A
 
I
I
 
Y
T
 
P
L
 
L
E
 
D
P
 
A
G
 
G
D
 
D
L
 
V
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
S
 
G
G
 
G
I
 
V
G
 
G
H
 
H
A
 
A
R
 
R
N
 
N
P
 
P
R
 
Q
L
 
R
Y
 
Y
M
 
I
R
 
G
A
 
D
G
 
G
D
 
E
V
 
T
V
 
V
E
 
K
V
 
V
E
 
E
I
 
I
Q
 
A
S
 
G
I
 
L
G
 
G
T
 
F
L
 
I
R
 
E
N
 
N
P
 
K
V
 
T
V
 
V
D
 
F
E
 
E

6iymA Fumarylacetoacetate hydrolase (eafah) from psychrophilic exiguobacterium antarcticum (see paper)
42% identity, 75% coverage: 64:281/291 of query aligns to 58:274/277 of 6iymA

query
sites
6iymA
N
 
H
V
 
V
D
 
R
L
 
L
L
 
L
P
 
A
P
 
P
I
 
Y
L
 
L
R
 
P
P
 
P
G
 
R
K
 
N
I
 
V
V
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
L
 
K
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
H
 
H
T
 
I
E
 
K
E
 
E
S
 
M
G
 
D
Y
 
T
K
 
A
Q
 
G
P
 
A
D
 
G
H
 
K
P
 
F
T
 
V
L
 
L
F
 
F
P
 
T
R
 
K
F
 
A
T
 
P
S
 
S
S
 
S
L
 
I
I
 
V
A
 
G
A
 
P
G
 
F
E
 
D
P
 
P
I
 
I
V
 
E
R
 
R
P
 
H
F
 
A
-
 
D
V
 
L
S
 
T
E
 
Q
T
 
Q
L
 
L
D
 
D
F
 
Y
E
|
E
G
 
G
E
|
E
L
 
L
V
 
A
A
 
I
V
 
I
I
 
I
G
 
G
R
 
T
R
 
T
G
 
G
R
 
R
H
 
D
I
 
L
S
 
T
K
 
P
H
 
E
D
 
N
A
 
A
L
 
L
D
 
E
H
 
H
V
 
V
A
 
F
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
I
 
I
F
 
I
N
 
N
D
|
D
A
 
V
S
 
T
I
 
A
R
 
R
E
 
D
F
 
L
Q
 
Q
H
 
K
R
 
E
T
 
H
P
 
V
Q
 
Q
W
 
F
T
 
F
L
 
R
G
 
G
K
 
K
N
 
S
F
 
L
D
 
D
G
 
G
T
 
F
G
 
C
S
 
P
F
 
F
G
 
G
P
 
P
W
 
V
F
 
I
V
 
V
T
 
T
A
 
E
D
 
D
E
 
A
L
 
F
P
 
-
R
 
-
G
 
D
A
 
P
A
 
A
G
 
D
L
 
V
R
 
L
I
 
V
E
 
E
T
 
T
R
 
R
L
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
L
V
 
R
Q
 
Q
A
 
S
S
 
G
N
 
S
T
 
T
D
 
K
Q
 
L
L
 
M
I
 
L
F
 
R
D
 
D
V
 
V
A
 
V
T
 
T
L
 
I
V
 
L
S
 
T
T
 
E
I
 
V
S
 
S
E
 
R
A
 
G
I
 
M
T
 
T
L
 
L
E
 
E
P
 
A
G
 
G
D
 
D
L
 
V
I
 
I
V
 
A
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
S
 
A
G
 
G
I
 
V
G
 
G
H
 
H
A
 
G
R
 
M
N
 
K
P
 
P
R
 
P
L
 
V
Y
 
Y
M
 
L
R
 
Q
A
 
D
G
 
G
D
 
D
V
 
V
V
 
I
E
 
D
V
 
V
E
 
S
I
 
I
Q
 
E
S
 
G
I
 
I
G
 
G
T
 
H
L
 
L
R
 
Q
N
 
N
P
 
Q
V
 
V

O06724 Oxaloacetate tautomerase YisK; Oxaloacetate decarboxylase YisK; EC 5.3.2.2; EC 4.1.1.112 from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
42% identity, 76% coverage: 62:281/291 of query aligns to 78:300/301 of O06724

query
sites
O06724
L
 
L
A
 
S
N
 
E
V
 
V
D
 
K
L
 
L
L
 
H
P
 
A
P
 
P
I
 
I
L
 
P
R
 
K
P
 
P
G
 
S
K
 
K
-
 
N
I
 
I
V
 
I
C
 
C
V
 
I
G
 
G
L
x
K
N
 
N
Y
 
Y
A
 
R
D
 
D
H
 
H
T
 
A
E
 
I
E
 
E
S
 
M
G
 
G
Y
 
S
K
 
E
Q
 
A
-
 
D
-
 
I
P
 
P
D
 
E
H
 
H
P
 
P
T
 
M
L
 
V
F
 
F
P
 
T
R
 
K
F
 
S
T
 
P
S
 
V
S
 
T
L
 
V
I
 
T
A
 
G
A
 
H
G
 
G
E
 
D
P
 
-
I
 
I
V
 
V
R
 
K
P
 
S
F
 
H
-
 
E
-
 
E
V
 
V
S
 
T
E
 
S
T
 
Q
L
 
L
D
 
D
F
 
Y
E
|
E
G
|
G
E
|
E
L
 
L
V
 
A
A
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
K
R
 
S
G
 
G
R
 
T
H
 
R
I
 
I
S
 
S
K
 
K
H
 
E
D
 
D
A
 
A
L
 
Y
D
 
D
H
 
H
V
 
V
A
 
F
G
 
G
Y
 
Y
S
 
T
I
 
I
F
 
V
N
 
N
D
|
D
A
 
I
S
 
T
I
 
A
R
 
R
E
 
D
F
 
L
Q
 
Q
H
 
K
R
 
R
T
 
H
P
 
K
Q
 
Q
W
 
F
T
 
F
L
 
I
G
 
G
K
|
K
N
 
S
F
 
L
D
 
D
G
 
T
T
 
T
G
 
C
S
 
P
F
 
M
G
 
G
P
 
P
W
 
V
F
 
L
V
 
V
T
 
H
A
 
K
D
 
S
E
 
S
L
 
I
P
 
-
R
 
Q
G
 
E
A
 
P
A
 
E
G
 
R
L
 
L
R
 
K
I
 
V
E
 
E
T
 
T
R
 
R
L
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
L
V
 
R
Q
 
Q
A
 
S
S
 
G
N
 
S
T
 
A
D
 
S
Q
 
D
L
 
M
I
 
I
F
 
F
D
 
S
V
 
I
A
 
P
T
 
E
L
 
L
V
 
I
S
 
E
T
 
T
I
 
L
S
 
S
E
 
K
A
 
G
I
 
M
T
 
T
L
 
L
E
 
E
P
 
A
G
 
G
D
 
D
L
 
I
I
 
I
V
 
A
T
 
T
G
 
G
T
|
T
P
 
P
S
 
S
G
 
G
I
 
V
G
 
G
H
 
K
A
 
G
R
 
F
N
 
T
P
 
P
R
 
P
L
 
K
Y
 
F
M
 
L
R
 
R
A
 
S
G
 
G
D
 
D
V
 
K
V
 
I
E
 
D
V
 
I
E
 
T
I
 
I
Q
 
D
S
 
P
I
 
I
G
 
G
T
 
T
L
 
L
R
 
S
N
 
N
P
 
Q
V
 
I

Sites not aligning to the query:

8sutA Crystal structure of yisk from bacillus subtilis in complex with reaction product 4-hydroxy-2-oxoglutaric acid (see paper)
42% identity, 76% coverage: 62:281/291 of query aligns to 79:301/303 of 8sutA

query
sites
8sutA
L
 
L
A
 
S
N
 
E
V
 
V
D
 
K
L
 
L
L
 
H
P
 
A
P
 
P
I
 
I
L
 
P
R
 
K
P
 
P
G
 
S
K
 
K
-
 
N
I
 
I
V
 
I
C
 
C
V
x
I
G
|
G
L
x
K
N
 
N
Y
 
Y
A
 
R
D
 
D
H
|
H
T
 
A
E
 
I
E
 
E
S
 
M
G
 
G
Y
 
S
K
 
E
Q
 
A
-
 
D
-
 
I
P
 
P
D
 
E
H
 
H
P
 
P
T
 
M
L
 
V
F
|
F
P
 
T
R
 
K
F
 
S
T
 
P
S
 
V
S
 
T
L
 
V
I
 
T
A
 
G
A
 
H
G
 
G
E
 
D
P
 
-
I
 
I
V
 
V
R
 
K
P
 
S
F
 
H
-
 
E
-
 
E
V
 
V
S
 
T
E
 
S
T
 
Q
L
 
L
D
 
D
F
 
Y
E
|
E
G
 
G
E
|
E
L
 
L
V
 
A
A
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
K
R
 
S
G
 
G
R
 
T
H
 
R
I
 
I
S
 
S
K
 
K
H
 
E
D
 
D
A
 
A
L
 
Y
D
 
D
H
 
H
V
 
V
A
 
F
G
 
G
Y
 
Y
S
 
T
I
 
I
F
 
V
N
 
N
D
|
D
A
 
I
S
 
T
I
 
A
R
|
R
E
 
D
F
 
L
Q
|
Q
H
 
K
R
 
R
T
 
H
P
 
K
Q
 
Q
W
 
F
T
 
F
L
 
I
G
 
G
K
|
K
N
 
S
F
 
L
D
 
D
G
 
T
T
 
T
G
 
C
S
 
P
F
 
M
G
 
G
P
 
P
W
 
V
F
 
L
V
 
V
T
 
H
A
 
K
D
 
S
E
 
S
L
 
I
P
 
-
R
 
Q
G
 
E
A
 
P
A
 
E
G
 
R
L
 
L
R
 
K
I
 
V
E
 
E
T
 
T
R
 
R
L
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
L
V
 
R
Q
 
Q
A
 
S
S
 
G
N
 
S
T
 
A
D
 
S
Q
 
D
L
 
M
I
 
I
F
 
F
D
 
S
V
 
I
A
 
P
T
 
E
L
 
L
V
 
I
S
 
E
T
 
T
I
 
L
S
 
S
E
 
K
A
 
G
I
 
M
T
 
T
L
 
L
E
 
E
P
 
A
G
 
G
D
 
D
L
 
I
I
 
I
V
 
A
T
 
T
G
|
G
T
|
T
P
 
P
S
 
S
G
 
G
I
 
V
G
 
G
H
 
K
A
 
G
R
 
F
N
 
T
P
 
P
R
 
P
L
 
K
Y
 
F
M
 
L
R
 
R
A
 
S
G
 
G
D
 
D
V
 
K
V
 
I
E
 
D
V
 
I
E
 
T
I
 
I
Q
 
D
S
 
P
I
 
I
G
 
G
T
 
T
L
 
L
R
 
S
N
 
N
P
 
Q
V
 
I

8skyB Crystal structure of yisk from bacillus subtilis in complex with oxalate (see paper)
42% identity, 76% coverage: 62:281/291 of query aligns to 78:300/303 of 8skyB

query
sites
8skyB
L
 
L
A
 
S
N
 
E
V
 
V
D
 
K
L
 
L
L
 
H
P
 
A
P
 
P
I
 
I
L
 
P
R
 
K
P
 
P
G
 
S
K
 
K
-
 
N
I
 
I
V
 
I
C
 
C
V
x
I
G
|
G
L
 
K
N
 
N
Y
 
Y
A
 
R
D
 
D
H
|
H
T
 
A
E
 
I
E
 
E
S
 
M
G
 
G
Y
 
S
K
 
E
Q
 
A
-
 
D
-
 
I
P
 
P
D
 
E
H
 
H
P
 
P
T
 
M
L
 
V
F
 
F
P
 
T
R
 
K
F
 
S
T
 
P
S
 
V
S
 
T
L
 
V
I
 
T
A
 
G
A
 
H
G
 
G
E
 
D
P
 
-
I
 
I
V
 
V
R
 
K
P
 
S
F
 
H
-
 
E
-
 
E
V
 
V
S
 
T
E
 
S
T
 
Q
L
 
L
D
 
D
F
 
Y
E
|
E
G
 
G
E
|
E
L
 
L
V
 
A
A
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
K
R
 
S
G
 
G
R
 
T
H
 
R
I
 
I
S
 
S
K
 
K
H
 
E
D
 
D
A
 
A
L
 
Y
D
 
D
H
 
H
V
 
V
A
 
F
G
 
G
Y
 
Y
S
 
T
I
 
I
F
 
V
N
 
N
D
|
D
A
 
I
S
 
T
I
 
A
R
 
R
E
 
D
F
 
L
Q
 
Q
H
 
K
R
 
R
T
 
H
P
 
K
Q
 
Q
W
 
F
T
 
F
L
 
I
G
 
G
K
|
K
N
 
S
F
 
L
D
 
D
G
 
T
T
 
T
G
 
C
S
 
P
F
 
M
G
 
G
P
 
P
W
 
V
F
 
L
V
 
V
T
 
H
A
 
K
D
 
S
E
 
S
L
 
I
P
 
-
R
 
Q
G
 
E
A
 
P
A
 
E
G
 
R
L
 
L
R
 
K
I
 
V
E
 
E
T
 
T
R
 
R
L
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
L
V
 
R
Q
 
Q
A
 
S
S
 
G
N
 
S
T
 
A
D
 
S
Q
 
D
L
 
M
I
 
I
F
 
F
D
 
S
V
 
I
A
 
P
T
 
E
L
 
L
V
 
I
S
 
E
T
 
T
I
 
L
S
 
S
E
 
K
A
 
G
I
 
M
T
 
T
L
 
L
E
 
E
P
 
A
G
 
G
D
 
D
L
 
I
I
 
I
V
 
A
T
 
T
G
|
G
T
|
T
P
 
P
S
 
S
G
 
G
I
 
V
G
 
G
H
 
K
A
 
G
R
 
F
N
 
T
P
 
P
R
 
P
L
 
K
Y
 
F
M
 
L
R
 
R
A
 
S
G
 
G
D
 
D
V
 
K
V
 
I
E
 
D
V
 
I
E
 
T
I
 
I
Q
 
D
S
 
P
I
 
I
G
 
G
T
 
T
L
 
L
R
 
S
N
 
N
P
 
Q
V
 
I

8gstC Crystal structure of l-2,4-diketo-3-deoxyrhamnonate hydrolase from sphingomonas sp. (Pyruvate bound-form) (see paper)
43% identity, 75% coverage: 63:281/291 of query aligns to 49:278/290 of 8gstC

query
sites
8gstC
A
 
A
N
 
D
V
 
I
D
 
A
L
 
L
L
 
L
P
 
P
-
 
L
-
 
V
-
 
E
-
 
G
-
 
E
-
 
P
-
 
R
-
 
Y
-
 
G
-
 
V
P
 
P
I
 
V
L
 
K
R
 
G
P
 
I
G
 
G
K
 
K
I
 
I
V
 
V
C
 
A
V
x
I
G
|
G
L
 
L
N
 
N
Y
 
Y
A
 
E
D
 
D
H
|
H
T
 
A
E
 
I
E
 
E
S
 
S
G
 
N
Y
 
L
K
 
P
Q
 
I
P
 
P
D
 
T
H
 
E
P
 
P
T
 
M
L
 
M
F
 
F
P
 
M
R
 
K
F
 
A
T
 
L
S
 
S
S
 
S
L
 
L
I
 
N
A
 
G
A
 
P
G
 
N
E
 
D
P
 
E
I
 
V
V
 
V
R
 
L
P
 
P
F
 
K
V
 
N
S
 
S
E
 
T
T
 
H
L
 
G
D
 
D
F
 
W
E
|
E
G
 
V
E
|
E
L
 
L
V
 
G
A
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
E
R
 
T
G
 
C
R
 
R
H
 
F
I
 
V
S
 
S
K
 
E
H
 
D
D
 
E
A
 
A
L
 
L
D
 
S
H
 
K
V
 
V
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
S
 
V
I
 
L
F
 
V
N
 
N
D
|
D
A
 
V
S
 
S
I
 
E
R
 
R
E
 
F
F
 
N
Q
 
Q
-
 
K
H
 
Q
R
 
R
T
 
G
P
 
T
Q
 
Q
W
 
W
T
 
S
L
 
K
G
 
G
K
|
K
N
 
G
F
 
H
D
 
D
G
 
T
T
 
F
G
 
C
S
 
P
F
 
V
G
 
G
P
 
P
W
 
W
F
 
L
V
 
V
T
 
T
A
 
P
D
 
D
E
 
E
L
 
V
P
 
-
R
 
G
G
 
D
A
 
P
A
 
Q
G
 
D
L
 
L
R
 
D
I
 
V
E
 
H
T
 
L
R
 
D
L
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
R
V
 
M
Q
 
Q
A
 
T
S
 
G
N
 
N
T
 
T
D
 
K
Q
 
T
L
 
M
I
 
I
F
 
F
D
 
N
V
 
V
A
 
A
T
 
Q
L
 
L
V
 
I
S
 
S
T
 
Y
I
 
V
S
 
S
E
 
E
A
 
Y
I
 
I
T
 
T
L
 
L
E
 
Y
P
 
P
G
 
G
D
 
D
L
 
L
I
 
M
V
 
I
T
 
T
G
|
G
T
 
T
P
 
P
S
 
P
G
 
G
I
 
V
G
 
G
H
 
E
A
 
G
R
 
K
N
 
K
P
 
P
R
 
Q
-
 
A
L
 
I
Y
 
Y
M
 
L
R
 
K
A
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
V
V
 
M
E
 
E
V
 
L
E
 
G
I
 
I
Q
 
E
S
 
K
I
 
L
G
 
G
T
 
T
L
 
Q
R
 
R
N
 
Q
P
 
Q
V
 
V

8gsrA Crystal structure of l-2,4-diketo-3-deoxyrhamnonate hydrolase from sphingomonas sp. (Apo-form) (see paper)
43% identity, 75% coverage: 63:281/291 of query aligns to 49:278/290 of 8gsrA

query
sites
8gsrA
A
 
A
N
 
D
V
 
I
D
 
A
L
 
L
L
 
L
P
 
P
-
 
L
-
 
V
-
 
E
-
 
G
-
 
E
-
 
P
-
 
R
-
 
Y
-
 
G
-
 
V
P
 
P
I
 
V
L
 
K
R
 
G
P
 
I
G
 
G
K
 
K
I
 
I
V
 
V
C
 
A
V
 
I
G
 
G
L
 
L
N
 
N
Y
 
Y
A
 
E
D
 
D
H
 
H
T
 
A
E
 
I
E
 
E
S
 
S
G
 
N
Y
 
L
K
 
P
Q
 
I
P
 
P
D
 
T
H
 
E
P
 
P
T
 
M
L
 
M
F
 
F
P
 
M
R
 
K
F
 
A
T
 
L
S
 
S
S
 
S
L
 
L
I
 
N
A
 
G
A
 
P
G
 
N
E
 
D
P
 
E
I
 
V
V
 
V
R
 
L
P
 
P
F
 
K
V
 
N
S
 
S
E
 
T
T
 
H
L
 
G
D
 
D
F
 
W
E
|
E
G
 
V
E
|
E
L
 
L
V
 
G
A
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
E
R
 
T
G
 
C
R
 
R
H
 
F
I
 
V
S
 
S
K
 
E
H
 
D
D
 
E
A
 
A
L
 
L
D
 
S
H
 
K
V
 
V
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
S
 
V
I
 
L
F
 
V
N
 
N
D
|
D
A
 
V
S
 
S
I
 
E
R
 
R
E
 
F
F
 
N
Q
 
Q
-
 
K
H
 
Q
R
 
R
T
 
G
P
 
T
Q
 
Q
W
 
W
T
 
S
L
 
K
G
 
G
K
 
K
N
 
G
F
 
H
D
 
D
G
 
T
T
 
F
G
 
C
S
 
P
F
 
V
G
 
G
P
 
P
W
 
W
F
 
L
V
 
V
T
 
T
A
 
P
D
 
D
E
 
E
L
 
V
P
 
-
R
 
G
G
 
D
A
 
P
A
 
Q
G
 
D
L
 
L
R
 
D
I
 
V
E
 
H
T
 
L
R
 
D
L
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
R
V
 
M
Q
 
Q
A
 
T
S
 
G
N
 
N
T
 
T
D
 
K
Q
 
T
L
 
M
I
 
I
F
 
F
D
 
N
V
 
V
A
 
A
T
 
Q
L
 
L
V
 
I
S
 
S
T
 
Y
I
 
V
S
 
S
E
 
E
A
 
Y
I
 
I
T
 
T
L
 
L
E
 
Y
P
 
P
G
 
G
D
 
D
L
 
L
I
 
M
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
S
 
P
G
 
G
I
 
V
G
 
G
H
 
E
A
 
G
R
 
K
N
 
K
P
 
P
R
 
Q
-
 
A
L
 
I
Y
 
Y
M
 
L
R
 
K
A
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
V
V
 
M
E
 
E
V
 
L
E
 
G
I
 
I
Q
 
E
S
 
K
I
 
L
G
 
G
T
 
T
L
 
Q
R
 
R
N
 
Q
P
 
Q
V
 
V

Q1NEI7 2,4-didehydro-3-deoxy-L-rhamnonate hydrolase; L-2,4-diketo-3-deoxyrhamnonate hydrolase; L-DKDR hydrolase; SpLRA6; EC 3.7.1.26 from Sphingomonas sp. (strain SKA58) (see paper)
44% identity, 73% coverage: 70:281/291 of query aligns to 61:273/285 of Q1NEI7

query
sites
Q1NEI7
P
 
P
I
 
V
L
 
K
R
 
G
P
 
I
G
 
G
K
 
K
I
 
I
V
 
V
C
 
A
V
 
I
G
 
G
L
|
L
N
 
N
Y
 
Y
A
 
E
D
 
D
H
|
H
T
 
A
E
 
I
E
|
E
S
|
S
G
 
N
Y
 
L
K
 
P
Q
 
I
P
 
P
D
 
T
H
 
E
P
 
P
T
x
M
L
 
M
F
 
F
P
 
M
R
 
K
F
 
A
T
 
L
S
 
S
S
 
S
L
 
L
I
 
N
A
 
G
A
 
P
G
 
N
E
 
D
P
 
E
I
 
V
V
 
V
R
 
L
P
 
P
F
 
K
V
 
N
S
 
S
E
 
T
T
 
H
L
 
G
D
 
D
F
 
W
E
|
E
G
 
V
E
|
E
L
 
L
V
 
G
A
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
E
R
 
T
G
 
C
R
 
R
H
 
F
I
 
V
S
 
S
K
 
E
H
 
D
D
 
E
A
 
A
L
 
L
D
 
S
H
 
K
V
 
V
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
S
 
V
I
 
L
F
 
V
N
 
N
D
|
D
A
 
V
S
 
S
I
 
E
R
|
R
E
 
F
F
 
N
Q
|
Q
-
x
K
H
 
Q
R
 
R
T
 
G
P
 
T
Q
 
Q
W
 
W
T
 
S
L
 
K
G
 
G
K
|
K
N
 
G
F
 
H
D
 
D
G
 
T
T
 
F
G
 
C
S
 
P
F
 
V
G
 
G
P
 
P
W
 
W
F
 
L
V
 
V
T
 
T
A
 
P
D
 
D
E
 
E
L
 
V
P
 
-
R
 
G
G
 
D
A
 
P
A
 
Q
G
 
D
L
 
L
R
 
D
I
 
M
E
 
H
T
 
L
R
 
N
L
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
T
V
 
R
V
 
M
Q
 
Q
A
 
T
S
 
G
N
 
N
T
 
T
D
 
K
Q
 
T
L
 
M
I
 
I
F
 
F
D
 
N
V
 
V
A
 
A
T
 
Q
L
 
L
V
 
I
S
 
S
T
 
Y
I
 
V
S
 
S
E
 
E
A
 
Y
I
 
I
T
 
T
L
 
L
E
 
Y
P
 
P
G
 
G
D
 
D
L
 
L
I
 
M
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
|
T
P
 
P
S
 
P
G
 
G
I
 
V
G
 
G
H
 
E
A
 
G
R
 
K
N
 
K
P
 
P
R
 
Q
-
 
A
L
 
I
Y
 
Y
M
 
L
R
 
K
A
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
V
V
 
M
E
 
E
V
 
L
E
 
G
I
 
I
Q
 
E
S
 
K
I
 
L
G
 
G
T
 
T
L
 
Q
R
 
R
N
 
Q
P
 
Q
V
 
V

6v77B Crystal structure of a putative hpce protein from mycobacterium smegmatis
42% identity, 71% coverage: 70:275/291 of query aligns to 65:269/279 of 6v77B

query
sites
6v77B
P
 
P
I
 
A
L
 
P
R
 
L
P
 
P
G
 
R
K
 
Q
I
 
V
V
 
F
C
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
N
 
N
Y
 
Y
A
 
D
D
 
D
H
 
H
T
 
A
E
 
T
E
 
E
S
 
S
G
 
G
Y
 
L
K
 
S
Q
 
K
P
 
P
D
 
E
H
 
H
P
 
P
T
 
V
L
 
I
F
 
F
P
 
T
R
 
K
F
 
F
T
 
V
S
 
S
S
 
S
L
 
I
I
 
T
A
 
G
A
 
P
G
 
V
E
 
E
P
 
T
I
 
V
V
 
Q
R
 
L
P
 
P
F
 
-
V
 
-
S
 
A
E
 
G
T
 
S
L
 
V
D
 
D
F
 
W
E
|
E
G
 
V
E
|
E
L
 
L
V
 
V
A
 
V
V
 
V
I
 
M
G
 
G
R
 
R
R
 
G
G
 
G
R
 
R
H
 
N
I
 
I
S
 
P
K
 
E
H
 
D
D
 
R
A
 
A
L
 
W
D
 
E
H
 
F
V
 
V
A
 
A
G
 
G
Y
 
V
S
 
S
I
 
V
F
 
G
N
 
Q
D
|
D
A
 
L
S
 
S
I
 
E
R
 
R
E
 
D
F
 
L
Q
 
Q
H
 
L
R
 
A
-
 
G
-
 
P
T
 
A
P
 
P
Q
 
Q
W
 
F
T
 
S
L
 
L
G
 
A
K
 
K
N
 
S
F
 
H
D
 
A
G
 
G
T
 
F
G
 
S
S
 
P
F
 
I
G
 
G
P
 
P
W
 
E
F
 
L
V
 
V
T
 
T
A
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
L
P
 
P
R
 
D
G
 
-
A
 
P
A
 
D
G
 
D
L
 
L
R
 
E
I
 
L
E
 
G
T
 
A
R
 
E
L
 
I
N
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
T
V
 
V
Q
 
Q
A
 
H
S
 
S
N
 
R
T
 
T
D
 
S
Q
 
Q
L
 
L
I
 
I
F
 
F
D
 
P
V
 
V
A
 
S
T
 
N
L
 
L
V
 
I
S
 
A
T
 
Y
I
 
L
S
 
S
E
 
D
A
 
T
I
 
V
T
 
E
L
 
L
E
 
Y
P
 
P
G
 
G
D
 
D
L
 
V
I
 
I
V
 
F
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
S
 
S
G
 
G
I
 
V
G
 
G
H
 
M
A
 
G
R
 
R
N
 
N
P
 
P
R
 
K
L
 
R
Y
 
F
M
 
L
R
 
A
A
 
P
G
 
G
D
 
D
V
 
E
V
 
L
E
 
R
V
 
T
E
 
Y
I
 
I
Q
 
T
S
 
G
I
 
V
G
 
G

3qdfA Crystal structure of 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase from mycobacterium marinum (see paper)
42% identity, 76% coverage: 62:282/291 of query aligns to 50:248/252 of 3qdfA

query
sites
3qdfA
L
 
L
A
 
A
N
 
D
V
 
V
D
 
R
L
 
L
L
 
L
P
 
A
P
 
P
I
 
I
L
 
L
R
 
A
P
 
-
G
 
S
K
 
K
I
 
V
V
 
V
C
 
C
V
 
V
G
 
G
L
 
K
N
 
N
Y
 
Y
A
 
T
D
 
-
H
 
-
T
 
-
E
 
-
E
 
-
S
 
-
G
 
-
Y
 
-
K
 
-
Q
 
-
P
 
P
D
 
A
H
 
D
P
 
P
T
 
V
L
 
I
F
 
F
P
 
L
R
 
K
F
 
P
T
 
N
S
 
T
S
 
A
L
 
I
I
 
V
A
 
G
A
 
P
G
 
N
E
 
V
P
 
P
I
 
I
V
 
R
R
 
L
P
 
P
F
 
A
V
 
N
S
 
A
E
 
S
T
 
P
L
 
V
D
 
H
F
 
F
E
|
E
G
 
G
E
|
E
L
 
L
V
 
A
A
 
I
V
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
R
R
 
P
G
 
C
R
 
K
H
 
D
I
 
V
S
 
S
K
 
A
H
 
A
D
 
Q
A
 
A
L
 
V
D
 
D
H
 
N
V
 
I
A
 
L
G
 
G
Y
 
Y
S
 
T
I
 
I
F
 
G
N
 
N
D
|
D
A
 
V
S
 
S
I
 
A
R
 
R
E
 
D
F
 
Q
Q
 
Q
H
 
K
R
 
S
T
 
D
P
 
G
Q
 
Q
W
 
W
T
 
T
L
 
R
G
 
A
K
 
K
N
 
G
F
 
H
D
 
D
G
 
T
T
 
F
G
 
C
S
 
P
F
 
V
G
 
G
P
 
P
W
 
W
F
 
I
V
 
V
T
 
T
A
 
-
D
 
D
E
 
V
L
 
D
P
 
P
R
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
A
G
 
D
L
 
L
R
x
E
I
 
L
E
 
R
T
 
T
R
 
E
L
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
A
V
 
V
V
 
K
Q
 
Q
A
x
H
S
 
A
N
 
R
T
 
T
D
 
S
Q
 
L
L
 
M
I
 
I
F
 
H
D
 
D
V
 
V
A
 
G
T
 
A
L
 
I
V
 
V
S
 
E
T
 
W
I
 
I
S
 
S
E
 
A
A
 
V
I
 
M
T
 
T
L
 
L
E
 
L
P
 
P
G
 
G
D
 
D
L
 
L
I
 
I
V
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
S
 
A
G
 
G
I
 
V
G
 
G
H
 
P
A
 
I
R
 
E
N
 
D
P
 
-
R
 
-
L
 
-
Y
 
-
M
 
-
R
 
-
A
 
-
G
 
G
D
 
D
V
 
T
V
 
V
E
 
S
V
 
I
E
 
T
I
 
I
Q
 
E
S
 
G
I
 
I
G
 
G
T
 
T
L
 
L
R
 
T
N
 
N
P
 
P
V
 
V
V
 
V

4dbhA Crystal structure of cg1458 with inhibitor (see paper)
37% identity, 76% coverage: 62:283/291 of query aligns to 50:268/269 of 4dbhA

query
sites
4dbhA
L
 
L
A
 
K
N
 
D
V
 
V
D
 
R
L
 
L
L
 
L
P
 
A
P
 
P
I
 
M
L
 
L
R
 
-
P
 
P
G
 
S
K
 
K
I
 
V
V
 
V
C
 
A
V
 
I
G
|
G
L
x
R
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
H
|
H
T
 
V
E
 
A
E
 
E
S
 
V
G
 
F
Y
 
K
K
 
K
Q
 
S
P
 
A
D
 
E
H
 
S
-
 
L
-
 
P
P
 
P
T
 
T
L
 
L
F
|
F
P
 
L
R
 
K
F
 
P
T
 
P
S
 
T
S
 
A
L
 
V
I
 
T
A
 
G
A
 
P
G
 
E
E
 
S
P
 
P
I
 
I
V
 
R
R
 
I
P
 
P
F
 
S
V
 
F
S
 
A
E
 
T
T
 
K
L
 
V
D
 
E
F
 
F
E
|
E
G
 
G
E
|
E
L
 
L
V
 
A
A
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
K
R
 
P
G
 
C
R
 
K
H
 
N
I
 
V
S
 
K
K
 
A
H
 
D
D
 
D
A
 
W
L
 
K
D
 
S
H
 
V
V
 
V
A
 
L
G
 
G
Y
 
F
S
 
T
I
 
I
F
 
I
N
 
N
D
|
D
A
 
V
S
 
S
I
 
S
R
 
R
E
 
D
F
 
L
Q
 
Q
H
 
F
R
 
A
T
 
D
P
 
G
Q
 
Q
W
 
W
T
 
A
L
 
R
G
 
A
K
|
K
N
 
G
F
 
I
D
 
D
G
 
T
T
 
F
G
 
G
S
 
P
F
 
I
G
 
G
P
 
P
W
 
W
F
 
I
V
 
E
T
 
T
-
 
D
-
 
I
-
 
N
-
 
S
-
 
I
-
 
D
A
 
L
D
 
D
E
 
N
L
 
L
P
 
P
R
 
I
G
 
K
A
 
A
A
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
R
I
 
L
E
 
T
T
 
H
R
 
D
L
 
G
N
 
E
G
 
T
E
 
Q
V
 
L
V
 
K
Q
 
Q
A
 
D
S
 
S
N
 
N
T
 
S
D
 
N
Q
 
Q
L
 
M
I
 
I
F
 
M
D
 
K
V
 
M
A
 
G
T
 
E
L
 
I
V
 
I
S
 
E
T
 
F
I
 
I
S
 
T
E
 
A
A
 
S
I
 
M
T
 
T
L
 
L
E
 
L
P
 
P
G
 
G
D
 
D
L
 
V
I
 
I
V
 
A
T
 
T
G
 
G
T
x
S
P
 
P
S
 
A
G
 
G
I
 
T
G
 
E
H
 
A
A
 
-
R
 
-
N
 
-
P
 
-
R
 
-
L
 
-
Y
 
-
M
 
M
R
 
V
A
 
D
G
 
G
D
 
D
V
 
Y
V
 
I
E
 
E
V
 
I
E
 
E
I
 
I
Q
 
P
S
 
G
I
 
I
G
 
G
T
 
K
L
 
L
R
 
G
N
 
N
P
 
P
V
 
V
V
 
V
D
 
D

3r6oA Crystal structure of a probable 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1, 7- dioateisomerase from mycobacterium abscessus (see paper)
33% identity, 79% coverage: 54:284/291 of query aligns to 42:263/265 of 3r6oA

query
sites
3r6oA
L
 
L
S
 
I
R
 
S
E
 
D
P
 
E
I
 
L
V
 
V
D
 
P
L
 
L
A
 
D
N
 
S
V
 
V
D
 
A
L
 
L
L
 
G
P
 
A
P
 
P
I
 
I
L
 
P
R
 
E
P
 
P
G
 
G
K
 
Q
I
 
V
V
 
I
C
 
A
V
 
L
G
 
G
L
 
F
N
 
N
Y
 
Y
A
 
P
D
 
T
H
 
H
T
 
-
E
 
-
E
 
-
S
 
-
G
 
-
Y
 
-
K
 
-
Q
 
-
P
 
-
D
 
-
H
 
D
P
 
P
T
 
V
L
 
V
F
 
F
P
 
M
R
 
K
F
 
S
T
 
P
S
 
T
S
 
S
L
 
I
I
 
S
A
 
G
A
 
P
G
 
R
E
 
D
P
 
A
I
 
V
V
 
I
R
 
A
P
 
P
F
 
R
V
 
T
S
 
S
E
 
H
T
 
A
L
 
L
D
 
D
F
 
Y
E
|
E
G
 
I
E
|
E
L
 
I
V
 
A
A
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
K
R
 
P
G
 
G
R
 
Y
H
 
R
I
 
I
S
 
E
K
 
R
H
 
S
D
 
Q
A
 
A
L
 
I
D
 
K
H
 
H
V
 
V
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
S
 
M
I
 
L
F
 
A
N
 
N
D
|
D
A
 
I
S
 
T
I
 
A
R
 
R
E
 
D
-
 
V
-
 
A
F
 
L
Q
 
P
H
 
F
R
 
G
T
 
Q
P
 
A
Q
 
Q
W
 
V
T
 
V
L
 
R
G
 
G
K
 
K
N
 
G
F
 
Y
D
 
P
G
 
T
T
 
F
G
 
C
S
 
P
F
 
T
G
 
G
P
 
P
W
 
W
F
 
L
V
 
F
T
 
T
A
 
T
D
 
G
E
 
S
L
 
-
P
 
D
R
 
T
G
 
T
A
 
F
A
 
E
G
 
T
L
 
F
R
 
D
I
 
F
E
 
E
T
 
L
R
 
R
L
 
I
N
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
L
V
 
R
Q
 
Q
A
 
S
S
 
G
N
 
S
T
 
T
D
 
V
Q
 
D
L
 
M
I
 
T
F
 
L
D
 
G
V
 
F
A
 
A
T
 
E
L
 
V
V
 
V
S
 
E
T
 
T
I
 
V
S
 
S
E
 
A
A
 
T
I
 
I
T
 
A
L
 
L
E
 
R
P
 
A
G
 
G
D
 
D
L
 
I
I
 
I
V
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
S
 
G
G
 
G
I
 
C
G
 
G
H
 
F
A
 
Q
R
 
F
N
 
D
P
 
P
R
 
P
L
 
R
Y
 
Y
M
 
L
R
 
R
A
 
P
G
 
G
D
 
D
V
 
V
V
 
I
E
 
E
V
 
A
E
 
H
I
 
S
Q
 
A
S
 
K
I
 
L
G
 
G
T
 
K
L
 
M
R
 
R
N
 
L
P
 
P
V
 
V
V
 
H
D
 
D
E
 
E

Q8R0F8 Oxaloacetate tautomerase FAHD1, mitochondrial; Acylpyruvase FAHD1; Acylpyruvate hydrolase; ApH; Fumarylacetoacetate hydrolase domain-containing protein 1; Oxaloacetate decarboxylase; OAA decarboxylase; ODx; EC 5.3.2.2; EC 3.7.1.5; EC 4.1.1.112 from Mus musculus (Mouse) (see paper)
35% identity, 70% coverage: 77:281/291 of query aligns to 17:216/221 of Q8R0F8

query
sites
Q8R0F8
I
 
I
V
 
V
C
 
C
V
 
V
G
 
G
L
x
R
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
H
 
H
T
 
V
E
 
K
E
 
E
S
 
M
G
 
R
Y
 
S
K
 
T
Q
 
V
P
 
L
D
 
S
H
 
E
P
 
P
T
 
V
L
 
L
F
 
F
P
 
L
R
 
K
F
 
P
T
 
S
S
 
T
S
 
A
L
 
Y
I
 
A
A
 
P
A
 
E
G
 
G
E
 
S
P
 
P
I
 
V
V
 
L
R
 
M
P
 
P
F
 
A
V
 
Y
S
 
C
E
 
R
T
 
N
L
 
L
D
 
H
F
 
H
E
|
E
G
 
V
E
|
E
L
 
L
V
 
G
A
 
V
V
 
L
I
 
L
G
 
G
R
 
K
R
 
R
G
 
G
R
 
E
H
 
A
I
 
I
S
 
P
K
 
E
H
 
A
D
 
A
A
 
A
L
 
M
D
 
D
H
 
Y
V
 
V
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
S
 
A
I
 
L
F
 
C
N
 
L
D
|
D
A
 
M
S
 
T
I
 
A
R
 
R
E
 
D
F
 
V
Q
 
Q
H
 
E
R
 
E
T
 
C
P
 
K
Q
 
K
-
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
P
W
 
W
T
 
T
L
 
L
G
 
A
K
|
K
N
 
S
F
 
F
D
 
T
G
 
S
T
 
S
G
 
C
S
 
P
F
 
V
G
 
S
P
 
A
W
 
-
F
 
F
V
 
V
T
 
P
A
 
K
D
 
E
E
 
K
L
 
I
P
 
P
R
 
D
G
 
P
A
 
H
A
 
A
G
 
-
L
 
L
R
 
R
I
 
L
E
 
W
T
 
L
R
 
K
L
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
L
V
 
R
Q
 
Q
A
 
E
S
 
G
N
 
K
T
 
T
D
 
S
Q
 
S
L
 
M
I
 
I
F
 
F
D
 
S
V
 
I
A
 
P
T
 
Y
L
 
I
V
 
I
S
 
S
T
 
Y
I
 
V
S
 
S
E
 
K
A
 
I
I
 
I
T
 
T
L
 
L
E
 
E
P
 
E
G
 
G
D
 
D
L
 
L
I
 
I
V
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
S
 
K
G
 
G
I
 
V
G
 
G
H
 
P
A
 
-
R
 
-
N
 
-
P
 
-
R
 
-
L
 
-
Y
 
-
M
 
I
R
 
K
A
 
E
G
 
N
D
 
D
V
 
E
V
 
I
E
 
E
V
 
A
E
 
G
I
 
I
Q
 
D
S
 
G
I
 
V
G
 
V
T
 
S
L
 
M
R
 
R
N
 
F
P
 
K
V
 
V

6sbiA X-ray structure of murine fumarylacetoacetate hydrolase domain containing protein 1 (fahd1) in complex with inhibitor oxalate (see paper)
35% identity, 70% coverage: 77:281/291 of query aligns to 14:213/216 of 6sbiA

query
sites
6sbiA
I
 
I
V
 
V
C
 
C
V
 
V
G
|
G
L
x
R
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
H
|
H
T
 
V
E
 
K
E
 
E
S
 
M
G
 
R
Y
 
S
K
 
T
Q
 
V
P
 
L
D
 
S
H
 
E
P
 
P
T
 
V
L
 
L
F
 
F
P
 
L
R
 
K
F
 
P
T
x
S
S
 
T
S
 
A
L
 
Y
I
 
A
A
 
P
A
 
E
G
 
G
E
 
S
P
 
P
I
 
V
V
 
L
R
 
M
P
 
P
F
 
A
V
 
Y
S
 
C
E
 
R
T
 
N
L
 
L
D
 
H
F
 
H
E
|
E
G
 
V
E
|
E
L
 
L
V
 
G
A
 
V
V
 
L
I
 
L
G
 
G
R
 
K
R
 
R
G
 
G
R
 
E
H
 
A
I
 
I
S
 
P
K
 
E
H
 
A
D
 
A
A
 
A
L
 
M
D
 
D
H
 
Y
V
 
V
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
S
 
A
I
 
L
F
 
C
N
 
L
D
|
D
A
 
M
S
 
T
I
 
A
R
 
R
E
 
D
F
 
V
Q
 
Q
H
 
E
R
 
E
T
 
C
P
 
K
Q
 
K
-
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
P
W
 
W
T
 
T
L
 
L
G
 
A
K
|
K
N
 
S
F
 
F
D
 
T
G
 
S
T
 
S
G
 
C
S
 
P
F
 
V
G
 
S
P
 
A
W
 
-
F
 
F
V
 
V
T
 
P
A
 
K
D
 
E
E
 
K
L
 
I
P
 
P
R
 
D
G
 
P
A
 
H
A
 
A
G
 
-
L
 
L
R
 
R
I
 
L
E
 
W
T
 
L
R
 
K
L
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
L
V
 
R
Q
 
Q
A
 
E
S
 
G
N
 
K
T
 
T
D
 
S
Q
 
S
L
 
M
I
 
I
F
 
F
D
 
S
V
 
I
A
 
P
T
 
Y
L
 
I
V
 
I
S
 
S
T
 
Y
I
 
V
S
 
S
E
 
K
A
 
I
I
 
I
T
|
T
L
 
L
E
 
E
P
 
E
G
 
G
D
 
D
L
 
L
I
 
I
V
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
S
 
K
G
 
G
I
x
V
G
 
G
H
 
P
A
 
-
R
 
-
N
 
-
P
 
-
R
 
-
L
 
-
Y
 
-
M
 
I
R
 
K
A
 
E
G
 
N
D
 
D
V
 
E
V
 
I
E
 
E
V
 
A
E
 
G
I
 
I
Q
 
D
S
 
G
I
 
V
G
 
V
T
 
S
L
 
M
R
 
R
N
 
F
P
 
K
V
 
V

Q6P587 Oxaloacetate tautomerase FAHD1, mitochondrial; Acylpyruvase FAHD1; Fumarylacetoacetate hydrolase domain-containing protein 1; FAH domain-containing protein 1; Oxaloacetate decarboxylase; OAA decarboxylase; ODx; YisK-like protein; EC 5.3.2.2; EC 3.7.1.5; EC 4.1.1.112 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
35% identity, 62% coverage: 77:256/291 of query aligns to 17:198/221 of Q6P587

query
sites
Q6P587
I
 
I
V
 
V
C
 
C
V
 
V
G
 
G
L
x
R
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
H
|
H
T
 
V
E
 
R
E
|
E
S
 
M
G
 
R
Y
 
S
K
 
A
Q
 
V
P
 
L
D
 
S
H
 
E
P
 
P
T
 
V
L
 
L
F
 
F
P
 
L
R
 
K
F
 
P
T
 
S
S
 
T
S
 
A
L
 
Y
I
 
A
A
 
P
A
 
E
G
 
G
E
 
S
P
 
P
I
 
I
V
 
L
R
 
M
P
 
P
F
 
A
V
 
Y
S
 
T
E
 
R
T
 
N
L
 
L
D
 
H
F
 
H
E
|
E
G
 
L
E
|
E
L
 
L
V
 
G
A
 
V
V
 
V
I
 
M
G
 
G
R
 
K
R
 
R
G
 
C
R
 
R
H
 
A
I
 
V
S
 
P
K
 
E
H
 
A
D
 
A
A
 
A
L
 
M
D
 
D
H
 
Y
V
 
V
A
 
G
G
 
G
Y
 
Y
S
 
A
I
 
L
F
 
C
N
 
L
D
|
D
A
x
M
S
x
T
I
x
A
R
|
R
E
 
D
F
 
V
Q
 
Q
H
 
D
R
 
E
T
 
C
P
 
K
Q
 
K
-
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
P
W
 
W
T
 
T
L
 
L
G
 
A
K
|
K
N
 
S
F
 
F
D
 
T
G
 
A
T
 
S
G
 
C
S
 
P
F
 
V
G
 
S
P
 
A
W
 
-
F
 
F
V
 
V
T
 
P
A
 
K
D
 
E
E
 
K
L
 
I
P
 
P
R
 
-
G
 
D
A
 
P
A
 
H
G
 
K
L
 
L
R
 
K
I
 
L
E
 
W
T
 
L
R
 
K
L
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
L
V
 
R
Q
 
Q
A
 
E
S
 
G
N
 
E
T
 
T
D
 
S
Q
 
S
L
 
M
I
 
I
F
 
F
D
 
S
V
 
I
A
 
P
T
 
Y
L
 
I
V
 
I
S
 
S
T
 
Y
I
 
V
S
 
S
E
 
K
A
 
I
I
 
I
T
 
T
L
 
L
E
 
E
P
 
E
G
 
G
D
 
D
L
 
I
I
 
I
V
 
L
T
 
T
G
 
G
T
|
T
P
 
P
S
 
K
G
 
G
I
 
V
G
 
G
H
 
P
A
 
V
R
 
K
N
 
E

6fogA X-ray structure of homo sapiens fumarylacetoacetate hydrolase domain containing protein 1 (fahd1) in complex with inhibitor oxalate at 1.94a resolution. (see paper)
35% identity, 62% coverage: 77:256/291 of query aligns to 15:196/218 of 6fogA

query
sites
6fogA
I
 
I
V
 
V
C
 
C
V
 
V
G
|
G
L
 
R
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
H
 
H
T
 
V
E
 
R
E
 
E
S
 
M
G
 
R
Y
 
S
K
 
A
Q
 
V
P
 
L
D
 
S
H
 
E
P
 
P
T
 
V
L
 
L
F
 
F
P
 
L
R
 
K
F
 
P
T
 
S
S
 
T
S
 
A
L
 
Y
I
 
A
A
 
P
A
 
E
G
 
G
E
 
S
P
 
P
I
 
I
V
 
L
R
 
M
P
 
P
F
 
A
V
 
Y
S
 
T
E
 
R
T
 
N
L
 
L
D
 
H
F
 
H
E
|
E
G
 
L
E
|
E
L
 
L
V
 
G
A
 
V
V
 
V
I
 
M
G
 
G
R
 
K
R
 
R
G
 
C
R
 
R
H
 
A
I
 
V
S
 
P
K
 
E
H
 
A
D
 
A
A
 
A
L
 
M
D
 
D
H
 
Y
V
 
V
A
 
G
G
 
G
Y
 
Y
S
 
A
I
 
L
F
 
C
N
 
L
D
|
D
A
 
M
S
 
T
I
 
A
R
 
R
E
 
D
F
 
V
Q
 
Q
H
 
D
R
 
E
T
 
C
P
 
K
Q
 
K
-
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
P
W
 
W
T
 
T
L
 
L
G
 
A
K
 
K
N
 
S
F
 
F
D
 
T
G
 
A
T
 
S
G
 
C
S
 
P
F
 
V
G
 
S
P
 
A
W
 
-
F
 
F
V
 
V
T
 
P
A
 
K
D
 
E
E
 
K
L
 
I
P
 
P
R
 
-
G
 
D
A
 
P
A
 
H
G
 
K
L
 
L
R
 
K
I
 
L
E
 
W
T
 
L
R
 
K
L
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
L
V
 
R
Q
 
Q
A
 
E
S
 
G
N
 
E
T
 
T
D
 
S
Q
 
S
L
 
M
I
 
I
F
 
F
D
 
S
V
 
I
A
 
P
T
 
Y
L
 
I
V
 
I
S
 
S
T
 
Y
I
 
V
S
 
S
E
 
K
A
 
I
I
 
I
T
 
T
L
 
L
E
 
E
P
 
E
G
 
G
D
 
D
L
 
I
I
 
I
V
 
L
T
 
T
G
 
G
T
|
T
P
 
P
S
 
K
G
 
G
I
 
V
G
 
G
H
 
P
A
 
V
R
 
K
N
 
E

Sites not aligning to the query:

1gttA Crystal structure of hpce (see paper)
35% identity, 75% coverage: 34:252/291 of query aligns to 175:392/421 of 1gttA

query
sites
1gttA
G
 
G
S
 
T
I
 
P
Q
 
Q
A
 
A
W
 
R
I
 
V
E
 
E
-
 
I
Q
 
Q
G
 
P
G
 
G
E
 
D
A
 
R
L
 
V
W
 
R
L
 
V
A
 
L
G
 
A
D
 
E
R
 
G
L
 
F
S
 
P
-
 
P
-
 
L
R
 
E
E
 
N
P
 
P
I
 
V
V
 
V
D
 
D
L
 
E
A
 
R
N
 
E
V
 
V
D
 
T
L
 
T
-
 
R
-
 
K
-
 
S
L
 
F
P
 
P
P
 
T
I
 
L
L
 
P
R
 
H
P
 
P
-
 
H
G
 
G
K
 
T
I
 
L
V
 
F
C
 
A
V
 
L
G
 
G
L
 
L
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
H
 
H
T
 
P
E
 
E
E
 
E
S
 
-
G
 
-
Y
 
-
K
 
-
Q
 
-
P
 
-
D
 
-
H
 
-
P
 
P
T
 
L
L
 
V
F
 
F
P
 
L
R
 
K
F
 
A
T
 
P
S
 
N
S
 
T
L
 
L
I
 
T
A
 
G
A
 
D
G
 
N
E
 
Q
P
 
T
I
 
S
V
 
V
R
 
R
P
 
P
F
 
N
V
 
N
S
 
I
E
 
E
T
 
Y
L
 
M
D
 
H
F
 
Y
E
|
E
G
 
A
E
|
E
L
 
L
V
 
V
A
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
K
R
 
Q
G
 
A
R
 
R
H
 
N
I
 
V
S
 
S
K
 
E
H
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
M
D
 
D
H
 
Y
V
 
V
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
S
 
T
I
 
V
F
 
C
N
 
N
D
|
D
A
 
Y
S
 
A
I
 
I
R
 
R
E
 
D
F
 
Y
Q
 
L
H
 
E
R
 
N
T
 
Y
P
 
Y
Q
 
R
W
 
P
T
 
N
L
 
L
G
 
R
-
 
V
K
 
K
N
 
S
F
 
R
D
 
D
G
 
G
T
 
L
G
 
T
S
 
P
F
 
M
G
 
L
P
 
S
W
 
T
F
 
I
V
 
V
T
 
P
A
 
K
D
 
E
E
 
A
L
 
I
P
 
P
R
 
-
G
 
D
A
 
P
A
 
H
G
 
N
L
 
L
R
 
T
I
 
L
E
 
R
T
 
T
R
 
F
L
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
L
V
 
R
Q
 
Q
A
 
Q
S
 
G
N
 
T
T
 
T
D
 
A
Q
 
D
L
 
L
I
 
I
F
 
F
D
 
S
V
 
V
A
 
P
T
 
F
L
 
L
V
 
I
S
 
A
T
 
Y
I
 
L
S
 
S
E
 
E
A
 
F
I
 
M
T
 
T
L
 
L
E
 
N
P
 
P
G
 
G
D
 
D
L
 
M
I
 
I
V
 
A
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
S
 
K
G
 
G
I
 
L
G
 
S

6j5yA Crystal structure of fumarylpyruvate hydrolase from pseudomonas aeruginosa in complex with mn2+ and pyruvate (see paper)
38% identity, 61% coverage: 76:252/291 of query aligns to 25:208/233 of 6j5yA

query
sites
6j5yA
K
 
R
I
 
V
V
 
Y
C
 
C
V
 
V
G
|
G
L
x
R
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
D
 
A
H
|
H
T
 
A
E
 
R
E
 
E
S
 
M
G
 
G
Y
 
F
K
 
D
Q
 
P
P
 
E
D
 
R
H
 
E
P
 
P
T
 
P
L
 
F
F
 
F
-
x
F
-
 
C
-
 
K
P
 
P
R
 
A
F
 
D
T
 
A
S
 
V
S
 
V
L
 
P
I
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
E
 
S
P
 
T
I
 
L
V
 
E
R
 
L
P
 
A
F
 
Y
V
 
P
S
 
S
E
 
Q
T
 
T
-
 
G
-
 
N
L
 
Y
D
 
H
F
 
Y
E
|
E
G
 
I
E
|
E
L
 
L
V
 
V
A
 
A
V
 
A
I
 
I
G
 
G
R
 
K
R
 
G
G
 
G
R
 
C
H
 
D
I
 
I
S
 
P
K
 
L
H
 
E
D
 
Q
A
 
A
L
 
E
D
 
E
H
 
H
V
 
V
A
 
W
G
 
G
Y
 
Y
S
 
A
I
 
V
F
 
G
N
 
L
D
|
D
A
 
M
S
 
T
I
 
R
R
 
R
E
 
D
F
 
L
Q
 
Q
H
 
M
R
 
R
T
 
M
P
 
R
Q
 
E
-
 
M
-
 
G
-
 
R
-
 
P
W
 
W
T
 
E
L
 
I
G
 
G
K
|
K
N
 
A
F
 
F
D
 
D
G
 
R
T
 
S
G
 
A
S
 
P
F
 
I
G
 
G
P
 
P
W
 
L
F
 
Y
V
 
P
T
 
A
A
 
S
D
 
Q
E
 
V
-
 
G
L
 
H
P
 
P
R
 
R
G
 
H
A
 
A
A
 
A
G
 
-
L
 
-
R
 
-
I
 
I
E
 
S
T
 
L
R
 
Q
L
 
V
N
 
D
G
 
G
E
 
E
V
 
D
V
 
R
Q
 
Q
A
 
R
S
 
S
N
 
D
T
 
I
D
 
D
Q
 
Q
L
 
L
I
 
I
F
 
W
D
 
S
V
 
V
A
 
A
T
 
E
L
 
T
V
 
V
S
 
S
T
 
Y
I
 
L
S
 
S
E
 
R
A
 
F
I
 
F
T
 
E
L
 
L
E
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
L
 
L
I
 
V
V
 
F
T
 
T
G
 
G
T
|
T
P
 
P
S
 
E
G
 
G
I
 
V
G
 
G

6jvwB Crystal structure of maleylpyruvate hydrolase from sphingobium sp. Syk-6 in complex with manganese (ii) ion and pyruvate (see paper)
31% identity, 79% coverage: 54:282/291 of query aligns to 59:261/264 of 6jvwB

query
sites
6jvwB
L
 
L
S
 
A
R
 
R
E
 
I
P
 
P
I
 
-
V
 
-
D
 
-
L
 
L
A
 
A
N
 
Q
V
 
V
D
 
S
L
 
L
L
 
E
P
 
T
P
 
P
I
 
V
L
 
P
R
 
W
P
 
P
G
 
N
K
 
K
I
 
I
V
 
I
C
 
A
V
 
Y
G
 
P
L
x
V
N
 
N
Y
 
Y
A
 
H
D
 
A
H
 
H
T
 
G
E
 
N
E
 
Q
S
 
G
G
 
F
Y
x
F
K
 
L
Q
 
K
P
 
P
D
 
-
H
 
-
P
 
-
T
 
-
L
 
-
F
 
-
P
 
-
R
 
-
F
 
-
T
 
G
S
 
S
S
 
A
L
 
L
I
 
S
A
 
G
A
 
P
G
 
T
E
 
D
P
 
P
I
 
V
V
 
V
R
 
L
P
 
P
F
 
A
V
 
V
-
 
P
S
 
G
E
 
R
T
 
E
L
 
V
D
 
H
F
 
H
E
|
E
G
 
S
E
|
E
L
 
L
V
 
A
A
 
I
V
 
I
I
 
I
G
 
G
R
 
K
R
 
T
G
 
C
R
 
R
H
 
S
I
 
V
S
 
A
K
 
R
H
 
E
D
 
D
A
 
W
L
 
K
D
 
D
H
 
V
V
 
V
A
 
F
G
 
G
Y
 
Y
S
 
A
I
 
C
F
 
L
N
 
L
D
|
D
A
 
M
S
 
V
I
 
V
R
 
R
E
 
G
F
 
R
Q
 
V
H
 
F
R
 
R
T
 
-
P
 
-
Q
 
-
W
 
-
T
 
-
L
 
-
G
 
-
K
|
K
N
 
A
F
 
Y
D
 
D
G
 
T
T
 
F
G
 
C
S
 
P
F
 
V
G
 
G
P
 
P
W
 
W
F
 
I
V
 
T
T
 
T
A
 
A
D
 
D
E
 
A
L
 
V
P
 
-
R
 
N
G
 
D
A
 
P
A
 
A
G
 
T
L
 
L
R
 
D
I
 
M
E
 
K
T
 
L
R
 
W
L
 
V
N
 
N
G
 
D
E
 
D
V
 
L
V
 
R
Q
 
Q
A
 
K
S
 
A
N
 
N
T
 
T
D
 
R
Q
 
D
L
 
L
I
 
V
F
 
L
D
 
D
V
 
I
A
 
P
T
 
G
L
 
M
V
 
I
S
 
A
T
 
T
I
 
A
S
 
S
E
 
A
A
 
V
I
 
M
T
 
T
L
 
L
E
 
Q
P
 
P
G
 
G
D
 
D
L
 
I
I
 
I
V
 
A
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
S
 
E
G
 
G
I
 
V
G
 
G
H
 
P
A
 
V
R
 
V
N
 
D
P
 
-
R
 
-
L
 
-
Y
 
-
M
 
-
R
 
-
A
 
-
G
 
G
D
 
D
V
 
R
V
 
I
E
 
R
V
 
I
E
 
V
I
 
I
Q
 
D
S
 
Q
I
 
V
G
 
G
T
 
E
L
 
M
R
 
A
N
 
V
P
 
D
V
 
V
V
 
V

Query Sequence

>WP_012706479.1 NCBI__GCF_000018545.1:WP_012706479.1
MRFLAYTQGNQTGVAVLSNGEWRGAADAGTTYAGSIQAWIEQGGEALWLAGDRLSREPIV
DLANVDLLPPILRPGKIVCVGLNYADHTEESGYKQPDHPTLFPRFTSSLIAAGEPIVRPF
VSETLDFEGELVAVIGRRGRHISKHDALDHVAGYSIFNDASIREFQHRTPQWTLGKNFDG
TGSFGPWFVTADELPRGAAGLRIETRLNGEVVQASNTDQLIFDVATLVSTISEAITLEPG
DLIVTGTPSGIGHARNPRLYMRAGDVVEVEIQSIGTLRNPVVDEPLQRAAS

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory