SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012706539.1 NCBI__GCF_000018545.1:WP_012706539.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5y6qA Crystal structure of an aldehyde oxidase from methylobacillus sp. Ky4400 (see paper)
61% identity, 75% coverage: 49:197/200 of query aligns to 3:152/157 of 5y6qA

query
sites
5y6qA
V
 
I
T
 
S
L
 
L
T
 
T
L
 
M
T
 
Q
V
 
V
N
 
N
G
 
G
R
 
Q
G
 
P
H
 
Y
T
 
P
L
 
M
T
 
E
V
 
I
D
 
D
P
 
P
R
 
R
Q
 
V
S
 
T
V
 
L
L
 
L
D
 
D
V
 
A
L
 
L
R
 
R
E
 
E
T
 
H
L
 
L
D
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
T
K
 
K
K
 
K
G
|
G
C
|
C
N
x
D
Q
 
Q
G
|
G
A
 
Q
C
|
C
G
|
G
A
 
A
C
|
C
T
 
T
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
G
 
G
K
 
Q
R
 
R
I
 
V
V
 
L
S
 
S
C
|
C
L
 
L
T
 
T
L
 
L
A
 
A
S
 
A
M
 
Q
Y
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
A
R
 
E
I
 
V
E
 
T
T
 
S
I
 
I
E
 
E
G
 
G
V
 
L
E
 
Q
K
 
S
-
 
A
D
 
S
G
 
G
A
 
E
L
 
L
H
 
H
P
 
P
L
 
V
Q
 
Q
E
 
R
A
 
C
F
 
F
V
 
V
E
 
E
H
 
N
D
 
D
G
 
A
L
 
F
Q
|
Q
C
|
C
G
|
G
F
 
Y
C
|
C
T
 
T
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
M
 
M
S
 
S
G
 
A
L
 
V
G
 
A
C
 
C
I
 
I
A
 
K
E
 
E
G
 
G
H
 
H
A
 
A
G
 
G
S
 
S
P
 
D
E
 
D
E
 
E
I
 
I
Q
 
R
F
 
E
W
 
Y
M
 
M
S
 
S
G
 
G
N
 
N
I
 
L
C
|
C
R
 
R
C
|
C
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
P
 
P
G
 
H
I
 
I
V
 
I
A
 
D
A
 
A
V
 
I
A
 
K
D
 
Q
A
 
A
A
 
A

P77165 Aldehyde oxidoreductase iron-sulfur-binding subunit PaoA; EC 1.2.99.6 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
50% identity, 93% coverage: 15:199/200 of query aligns to 23:226/229 of P77165

query
sites
P77165
I
 
L
S
 
T
R
 
R
R
 
R
E
 
D
A
 
L
L
 
I
Q
 
K
A
 
V
T
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
T
A
 
A
A
 
V
L
 
V
P
 
Y
P
 
P
G
 
H
S
 
S
A
 
T
A
 
L
A
 
A
T
 
A
N
 
S
A
 
V
P
 
P
A
 
A
A
 
A
A
 
T
A
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
E
-
 
I
V
 
M
T
 
P
L
 
L
T
 
T
L
 
L
T
 
K
V
 
V
N
 
N
G
 
G
R
 
K
G
 
T
H
 
E
T
 
Q
L
 
L
T
 
E
V
 
V
D
 
D
P
 
T
R
 
R
Q
 
T
S
 
T
V
 
L
L
 
L
D
 
D
V
 
T
L
 
L
R
 
R
E
 
E
T
 
N
L
 
L
D
 
H
L
 
L
T
 
I
G
 
G
T
 
T
K
 
K
K
 
K
G
 
G
C
|
C
N
 
D
Q
 
H
G
 
G
A
 
Q
C
|
C
G
|
G
A
 
A
C
|
C
T
 
T
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
G
 
G
K
 
R
R
 
R
I
 
L
V
 
N
S
 
A
C
|
C
L
 
L
T
 
T
L
 
L
A
 
A
S
 
V
M
 
M
Y
 
H
D
 
Q
G
 
G
A
 
A
R
 
E
I
 
I
E
 
T
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
V
 
L
E
 
G
K
 
S
D
 
P
G
 
D
A
 
N
L
 
L
H
 
H
P
 
P
L
 
M
Q
 
Q
E
 
A
A
 
A
F
 
F
V
 
I
E
 
K
H
 
H
D
 
D
G
 
G
L
 
F
Q
 
Q
C
|
C
G
 
G
F
 
Y
C
|
C
T
 
T
P
 
S
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
M
 
C
S
 
S
G
 
S
L
 
V
G
 
A
C
 
V
I
 
L
A
 
K
E
 
E
G
 
I
H
 
Q
A
 
D
G
 
G
S
 
I
P
 
P
-
 
S
-
 
H
-
 
V
-
 
T
-
 
V
-
 
D
-
 
L
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
P
-
 
E
-
 
T
-
 
T
-
 
A
E
 
D
E
 
E
I
 
I
Q
 
R
F
 
E
W
 
R
M
 
M
S
 
S
G
 
G
N
 
N
I
 
I
C
|
C
R
 
R
C
|
C
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
P
 
A
G
 
N
I
 
I
V
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
I
A
 
E
D
 
D
A
 
A
A
 
A
G
 
G
R
 
E

5g5gA Escherichia coli periplasmic aldehyde oxidase (see paper)
53% identity, 78% coverage: 44:199/200 of query aligns to 5:175/175 of 5g5gA

query
sites
5g5gA
P
 
P
A
 
A
A
 
P
A
 
E
A
 
I
V
 
M
T
 
P
L
 
L
T
 
T
L
 
L
T
 
K
V
 
V
N
 
N
G
 
G
R
 
K
G
 
T
H
 
E
T
 
Q
L
 
L
T
 
E
V
 
V
D
 
D
P
 
T
R
 
R
Q
 
T
S
 
T
V
 
L
L
 
L
D
 
D
V
 
T
L
 
L
R
 
R
E
 
E
T
 
N
L
 
L
D
 
H
L
 
L
T
 
I
G
 
G
T
 
T
K
 
K
K
 
K
G
|
G
C
|
C
N
x
D
Q
 
H
G
|
G
A
 
Q
C
|
C
G
|
G
A
 
A
C
|
C
T
 
T
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
G
 
G
K
 
R
R
 
R
I
 
L
V
 
N
S
 
A
C
|
C
L
 
L
T
 
T
L
 
L
A
 
A
S
 
V
M
 
M
Y
 
H
D
 
Q
G
 
G
A
 
A
R
 
E
I
 
I
E
 
T
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
V
 
L
E
 
G
K
 
S
D
 
P
G
 
D
A
 
N
L
 
L
H
 
H
P
 
P
L
 
M
Q
 
Q
E
 
A
A
 
A
F
 
F
V
 
I
E
 
K
H
 
H
D
 
D
G
 
G
L
 
F
Q
 
Q
C
|
C
G
|
G
F
 
Y
C
|
C
T
 
T
P
 
S
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
M
 
C
S
 
S
G
 
S
L
 
V
G
 
A
C
 
V
I
 
L
A
 
K
E
 
E
G
 
I
H
 
Q
A
 
D
G
 
G
S
 
I
P
 
P
-
 
S
-
 
H
-
 
V
-
 
T
-
 
V
-
 
D
-
 
L
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
P
-
 
E
-
 
T
-
 
T
-
 
A
E
 
D
E
 
E
I
 
I
Q
 
R
F
 
E
W
 
R
M
 
M
S
 
S
G
 
G
N
 
N
I
 
I
C
|
C
R
 
R
C
|
C
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
P
 
A
G
 
N
I
 
I
V
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
I
A
 
E
D
 
D
A
 
A
A
 
A
G
 
G
R
 
E

4zohC Crystal structure of glyceraldehyde oxidoreductase (see paper)
49% identity, 76% coverage: 49:199/200 of query aligns to 10:159/161 of 4zohC

query
sites
4zohC
V
 
V
T
 
K
L
 
I
T
 
T
L
 
L
T
 
K
V
 
I
N
 
N
G
 
G
R
 
E
G
 
K
H
 
Y
T
 
E
L
 
T
T
 
E
V
 
V
D
 
E
P
 
P
R
 
R
Q
 
R
S
 
L
V
 
L
L
 
V
D
 
H
V
 
V
L
 
L
R
 
R
E
 
E
T
 
-
L
 
L
D
 
G
L
 
F
T
 
T
G
 
G
T
 
V
K
 
H
K
 
I
G
 
G
C
|
C
N
 
D
Q
 
T
G
x
S
A
 
N
C
|
C
G
|
G
A
 
A
C
|
C
T
 
T
V
 
V
L
 
I
V
 
M
N
 
N
G
 
G
K
 
K
R
 
S
I
 
V
V
 
K
S
 
S
C
|
C
L
 
T
T
 
V
L
 
L
A
 
A
S
 
V
M
 
E
Y
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
A
R
 
E
I
 
I
E
 
L
T
 
T
I
 
V
E
 
E
G
 
G
V
 
L
E
 
A
K
 
K
D
 
D
G
 
G
A
 
K
L
 
L
H
 
H
P
 
P
L
 
I
Q
 
Q
E
 
E
A
 
A
F
 
F
V
 
W
E
 
E
H
 
N
D
 
H
G
 
A
L
 
L
Q
|
Q
C
|
C
G
|
G
F
 
Y
C
|
C
T
 
T
P
 
P
G
 
G
Q
 
M
I
 
I
M
 
M
S
 
E
G
 
A
L
 
Y
G
 
W
C
 
L
I
 
L
A
 
R
E
 
E
G
 
K
H
 
P
A
 
N
G
 
P
S
 
T
P
 
E
E
 
E
E
 
E
I
 
I
Q
 
R
F
 
E
W
 
G
M
 
I
S
 
S
G
 
G
N
 
N
I
 
L
C
|
C
R
 
R
C
|
C
G
 
T
A
 
G
Y
 
Y
P
 
Q
G
 
N
I
 
I
V
 
V
A
 
K
A
 
A
V
 
I
A
 
K
D
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
E
R
 
K

1t3qA Crystal structure of quinoline 2-oxidoreductase from pseudomonas putida 86 (see paper)
46% identity, 74% coverage: 51:197/200 of query aligns to 6:152/162 of 1t3qA

query
sites
1t3qA
L
 
I
T
 
S
L
 
A
T
 
T
V
 
I
N
 
N
G
 
G
R
 
K
G
 
P
H
 
R
T
 
V
L
 
F
T
 
Y
V
 
V
D
 
E
P
 
P
R
 
R
Q
 
M
S
 
H
V
 
L
L
 
A
D
 
D
V
 
A
L
 
L
R
 
R
E
 
E
T
 
V
L
 
V
D
 
G
L
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
T
K
 
K
K
x
I
G
 
G
C
|
C
N
x
E
Q
 
Q
G
|
G
A
 
V
C
|
C
G
|
G
A
 
S
C
|
C
T
 
T
V
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
D
G
 
G
K
 
A
R
 
P
I
 
M
V
x
R
S
 
S
C
|
C
L
 
L
T
 
T
L
 
L
A
 
A
S
 
V
M
 
Q
Y
 
A
D
 
E
G
 
G
A
 
C
R
 
S
I
 
I
E
 
E
T
 
T
I
 
V
E
 
E
G
 
G
V
 
L
E
 
S
K
 
Q
D
 
G
G
 
E
A
 
K
L
 
L
H
 
N
P
 
A
L
 
L
Q
 
Q
E
 
D
A
 
S
F
 
F
V
 
R
E
 
R
H
 
H
D
 
H
G
 
A
L
 
L
Q
|
Q
C
|
C
G
|
G
F
 
F
C
|
C
T
 
T
P
 
A
G
 
G
Q
 
M
I
 
L
M
 
A
S
 
T
G
 
A
L
 
R
G
 
S
C
 
I
I
 
L
A
 
A
E
 
E
G
 
N
H
 
P
A
 
A
G
 
P
S
 
S
P
 
R
E
 
D
E
 
E
I
 
V
Q
 
R
F
 
E
W
 
V
M
 
M
S
 
S
G
 
G
N
 
N
I
 
L
C
|
C
R
 
R
C
|
C
G
 
T
A
 
G
Y
 
Y
P
 
E
G
 
T
I
 
I
V
 
I
A
 
D
A
 
A
V
 
I
A
 
T
D
 
D
A
 
P
A
 
A

1ffuD Carbon monoxide dehydrogenase from hydrogenophaga pseudoflava which lacks the mo-pyranopterin moiety of the molybdenum cofactor (see paper)
43% identity, 77% coverage: 47:199/200 of query aligns to 1:153/156 of 1ffuD

query
sites
1ffuD
A
 
A
A
 
K
V
 
K
T
 
I
L
 
I
T
 
T
L
 
V
T
 
N
V
 
V
N
 
N
G
 
G
R
 
K
G
 
A
H
 
Q
T
 
E
L
 
K
T
 
A
V
 
V
D
 
E
P
 
P
R
 
R
Q
 
T
S
 
L
V
 
L
L
 
I
D
 
H
V
 
F
L
 
L
R
 
R
E
 
E
T
 
E
L
 
L
D
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
A
K
 
H
K
 
I
G
 
G
C
|
C
N
 
E
Q
 
T
G
x
S
A
x
H
C
|
C
G
|
G
A
 
A
C
|
C
T
 
T
V
 
V
L
 
D
V
 
I
N
 
D
G
 
G
K
 
R
R
 
S
I
 
V
V
 
K
S
 
S
C
|
C
L
 
T
T
 
H
L
 
L
A
 
A
S
 
V
M
 
Q
Y
 
C
D
 
D
G
 
G
A
 
S
R
 
E
I
 
V
E
 
L
T
 
T
I
 
V
E
 
E
G
 
G
V
 
L
E
 
A
K
 
N
D
 
K
G
 
G
A
 
V
L
 
L
H
 
H
P
 
A
L
 
V
Q
 
Q
E
 
E
A
 
G
F
 
F
V
 
Y
E
 
K
H
 
E
D
 
H
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
C
|
C
G
|
G
F
 
F
C
|
C
T
 
T
P
 
P
G
 
G
Q
 
M
I
 
L
M
 
M
S
 
R
G
 
A
L
 
Y
G
 
R
C
 
F
I
 
L
A
 
Q
E
 
E
G
 
N
H
 
P
A
 
N
G
 
P
S
 
T
P
 
E
E
 
A
E
 
E
I
 
I
Q
 
R
F
 
M
W
 
G
M
 
M
S
 
T
G
 
G
N
 
N
I
 
L
C
|
C
R
 
R
C
|
C
G
 
T
A
 
G
Y
 
Y
P
 
Q
G
 
N
I
 
I
V
 
V
A
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
Q
D
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
 
R
R
 
K

1ffvA Carbon monoxide dehydrogenase from hydrogenophaga pseudoflava (see paper)
44% identity, 75% coverage: 51:199/200 of query aligns to 4:152/155 of 1ffvA

query
sites
1ffvA
L
 
I
T
 
T
L
 
V
T
 
N
V
 
V
N
 
N
G
 
G
R
 
K
G
 
A
H
 
Q
T
 
E
L
 
K
T
 
A
V
 
V
D
 
E
P
 
P
R
 
R
Q
 
T
S
 
L
V
 
L
L
 
I
D
 
H
V
 
F
L
 
L
R
 
R
E
 
E
T
 
E
L
 
L
D
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
A
K
 
H
K
x
I
G
 
G
C
|
C
N
 
E
Q
 
T
G
x
S
A
 
H
C
|
C
G
|
G
A
 
A
C
|
C
T
 
T
V
 
V
L
 
D
V
 
I
N
 
D
G
 
G
K
 
R
R
 
S
I
 
V
V
 
K
S
 
S
C
|
C
L
 
T
T
 
H
L
 
L
A
 
A
S
 
V
M
 
Q
Y
 
C
D
 
D
G
 
G
A
 
S
R
 
E
I
 
V
E
 
L
T
 
T
I
 
V
E
 
E
G
 
G
V
 
L
E
 
A
K
 
N
D
 
K
G
 
G
A
 
V
L
 
L
H
 
H
P
 
A
L
 
V
Q
 
Q
E
 
E
A
 
G
F
 
F
V
 
Y
E
 
K
H
 
E
D
 
H
G
 
G
L
 
L
Q
|
Q
C
|
C
G
|
G
F
 
F
C
|
C
T
 
T
P
 
P
G
 
G
Q
 
M
I
 
L
M
 
M
S
 
R
G
 
A
L
 
Y
G
 
R
C
 
F
I
 
L
A
 
Q
E
 
E
G
 
N
H
 
P
A
 
N
G
 
P
S
 
T
P
 
E
E
 
A
E
 
E
I
 
I
Q
 
R
F
 
M
W
 
G
M
 
M
S
 
T
G
 
G
N
 
N
I
 
L
C
|
C
R
 
R
C
|
C
G
 
T
A
 
G
Y
 
Y
P
 
Q
G
 
N
I
 
I
V
 
V
A
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
Q
D
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
 
R
R
 
K

4usaA Aldehyde oxidoreductase from desulfovibrio gigas (mop), soaked with trans-cinnamaldehyde (see paper)
47% identity, 75% coverage: 49:197/200 of query aligns to 2:153/907 of 4usaA

query
sites
4usaA
V
 
I
T
 
Q
L
 
K
T
 
V
L
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
G
R
 
I
G
 
E
H
 
Q
T
 
N
L
 
L
T
 
F
V
 
V
D
 
D
P
 
A
R
 
E
Q
 
A
S
 
L
V
 
L
L
 
S
D
 
D
V
 
V
L
 
L
R
 
R
E
 
Q
T
 
Q
L
 
L
D
 
G
L
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
V
K
 
K
K
x
V
G
 
G
C
|
C
N
x
E
Q
 
Q
G
|
G
A
 
Q
C
|
C
G
|
G
A
 
A
C
|
C
T
 
S
V
 
V
L
 
I
V
 
L
N
 
D
G
 
G
K
 
K
R
 
V
I
 
V
V
x
R
S
 
A
C
|
C
L
 
V
T
 
T
-
 
K
L
 
M
A
 
K
S
 
R
M
 
V
Y
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
I
 
I
E
 
T
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
V
 
V
E
 
G
K
 
Q
D
 
P
G
 
E
A
 
N
L
 
L
H
 
H
P
 
P
L
 
L
Q
 
Q
E
 
K
A
 
A
F
 
W
V
 
V
E
 
L
H
 
H
D
 
G
G
 
G
L
 
A
Q
|
Q
C
|
C
G
|
G
F
 
F
C
|
C
T
 
S
P
 
P
G
 
G
Q
 
F
I
 
I
M
 
V
S
 
S
G
 
A
L
 
K
G
 
G
C
 
L
I
 
L
A
 
D
E
 
T
G
 
N
H
 
A
A
 
D
G
 
P
S
 
S
P
 
R
E
 
E
E
 
D
I
 
V
Q
 
R
F
 
D
W
 
W
M
 
F
S
 
Q
G
 
K
-
 
H
-
 
R
N
 
N
I
 
A
C
|
C
R
 
R
C
|
C
G
 
T
A
 
G
Y
 
Y
P
 
K
G
 
P
I
 
L
V
 
V
A
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
M
D
 
D
A
 
A
A
 
A

Sites not aligning to the query:

4us9A Aldehyde oxidoreductase from desulfovibrio gigas (mop), soaked with 3- phenylpropionaldehyde (see paper)
47% identity, 75% coverage: 49:197/200 of query aligns to 2:153/907 of 4us9A

query
sites
4us9A
V
 
I
T
 
Q
L
 
K
T
 
V
L
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
G
R
 
I
G
 
E
H
 
Q
T
 
N
L
 
L
T
 
F
V
 
V
D
 
D
P
 
A
R
 
E
Q
 
A
S
 
L
V
 
L
L
 
S
D
 
D
V
 
V
L
 
L
R
 
R
E
 
Q
T
 
Q
L
 
L
D
 
G
L
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
V
K
 
K
K
x
V
G
 
G
C
|
C
N
x
E
Q
 
Q
G
|
G
A
 
Q
C
|
C
G
|
G
A
 
A
C
|
C
T
 
S
V
 
V
L
 
I
V
 
L
N
 
D
G
 
G
K
 
K
R
 
V
I
 
V
V
x
R
S
 
A
C
|
C
L
 
V
T
 
T
-
 
K
L
 
M
A
 
K
S
 
R
M
 
V
Y
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
I
 
I
E
 
T
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
V
 
V
E
 
G
K
 
Q
D
 
P
G
 
E
A
 
N
L
 
L
H
 
H
P
 
P
L
 
L
Q
 
Q
E
 
K
A
 
A
F
 
W
V
 
V
E
 
L
H
 
H
D
 
G
G
 
G
L
 
A
Q
|
Q
C
|
C
G
|
G
F
 
F
C
|
C
T
 
S
P
 
P
G
 
G
Q
 
F
I
 
I
M
 
V
S
 
S
G
 
A
L
 
K
G
 
G
C
 
L
I
 
L
A
 
D
E
 
T
G
 
N
H
 
A
A
 
D
G
 
P
S
 
S
P
 
R
E
 
E
E
 
D
I
 
V
Q
 
R
F
 
D
W
 
W
M
 
F
S
 
Q
G
 
K
-
 
H
-
 
R
N
 
N
I
 
A
C
|
C
R
 
R
C
|
C
G
 
T
A
 
G
Y
 
Y
P
 
K
G
 
P
I
 
L
V
 
V
A
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
M
D
 
D
A
 
A
A
 
A

Sites not aligning to the query:

4us8A Aldehyde oxidoreductase from desulfovibrio gigas (mop), soaked with benzaldehyde (see paper)
47% identity, 75% coverage: 49:197/200 of query aligns to 2:153/907 of 4us8A

query
sites
4us8A
V
 
I
T
 
Q
L
 
K
T
 
V
L
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
G
R
 
I
G
 
E
H
 
Q
T
 
N
L
 
L
T
 
F
V
 
V
D
 
D
P
 
A
R
 
E
Q
 
A
S
 
L
V
 
L
L
 
S
D
 
D
V
 
V
L
 
L
R
 
R
E
 
Q
T
 
Q
L
 
L
D
 
G
L
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
V
K
 
K
K
x
V
G
 
G
C
|
C
N
x
E
Q
 
Q
G
|
G
A
 
Q
C
|
C
G
|
G
A
 
A
C
|
C
T
 
S
V
 
V
L
 
I
V
 
L
N
 
D
G
 
G
K
 
K
R
 
V
I
 
V
V
x
R
S
 
A
C
|
C
L
 
V
T
 
T
-
 
K
L
 
M
A
 
K
S
 
R
M
 
V
Y
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
I
 
I
E
 
T
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
V
 
V
E
 
G
K
 
Q
D
 
P
G
 
E
A
 
N
L
 
L
H
 
H
P
 
P
L
 
L
Q
 
Q
E
 
K
A
 
A
F
 
W
V
 
V
E
 
L
H
 
H
D
 
G
G
 
G
L
 
A
Q
|
Q
C
|
C
G
|
G
F
 
F
C
|
C
T
 
S
P
 
P
G
 
G
Q
 
F
I
 
I
M
 
V
S
 
S
G
 
A
L
 
K
G
 
G
C
 
L
I
 
L
A
 
D
E
 
T
G
 
N
H
 
A
A
 
D
G
 
P
S
 
S
P
 
R
E
 
E
E
 
D
I
 
V
Q
 
R
F
 
D
W
 
W
M
 
F
S
 
Q
G
 
K
-
 
H
-
 
R
N
 
N
I
 
A
C
|
C
R
 
R
C
|
C
G
 
T
A
 
G
Y
 
Y
P
 
K
G
 
P
I
 
L
V
 
V
A
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
M
D
 
D
A
 
A
A
 
A

Sites not aligning to the query:

4c7yA Aldehyde oxidoreductase from desulfovibrio gigas (mop), soaked with sodium dithionite and sodium sulfide (see paper)
47% identity, 75% coverage: 49:197/200 of query aligns to 2:153/907 of 4c7yA

query
sites
4c7yA
V
 
I
T
 
Q
L
 
K
T
 
V
L
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
G
R
 
I
G
 
E
H
 
Q
T
 
N
L
 
L
T
 
F
V
 
V
D
 
D
P
 
A
R
 
E
Q
 
A
S
 
L
V
 
L
L
 
S
D
 
D
V
 
V
L
 
L
R
 
R
E
 
Q
T
 
Q
L
 
L
D
 
G
L
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
V
K
 
K
K
 
V
G
 
G
C
|
C
N
x
E
Q
 
Q
G
|
G
A
 
Q
C
|
C
G
|
G
A
 
A
C
|
C
T
 
S
V
 
V
L
 
I
V
 
L
N
 
D
G
 
G
K
 
K
R
 
V
I
 
V
V
x
R
S
 
A
C
|
C
L
 
V
T
 
T
-
 
K
L
 
M
A
 
K
S
 
R
M
 
V
Y
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
I
 
I
E
 
T
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
V
 
V
E
 
G
K
 
Q
D
 
P
G
 
E
A
 
N
L
 
L
H
 
H
P
 
P
L
 
L
Q
 
Q
E
 
K
A
 
A
F
 
W
V
 
V
E
 
L
H
 
H
D
 
G
G
 
G
L
 
A
Q
|
Q
C
|
C
G
|
G
F
 
F
C
|
C
T
 
S
P
 
P
G
 
G
Q
 
F
I
 
I
M
 
V
S
 
S
G
 
A
L
 
K
G
 
G
C
 
L
I
 
L
A
 
D
E
 
T
G
 
N
H
 
A
A
 
D
G
 
P
S
 
S
P
 
R
E
 
E
E
 
D
I
 
V
Q
 
R
F
 
D
W
 
W
M
 
F
S
 
Q
G
 
K
-
 
H
-
 
R
N
 
N
I
 
A
C
|
C
R
 
R
C
|
C
G
 
T
A
 
G
Y
 
Y
P
 
K
G
 
P
I
 
L
V
 
V
A
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
M
D
 
D
A
 
A
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3fc4A Ethylene glycol inhibited form of aldehyde oxidoreductase from desulfovibrio gigas (see paper)
47% identity, 75% coverage: 49:197/200 of query aligns to 2:153/907 of 3fc4A

query
sites
3fc4A
V
 
I
T
 
Q
L
 
K
T
 
V
L
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
G
R
 
I
G
 
E
H
 
Q
T
 
N
L
 
L
T
 
F
V
 
V
D
 
D
P
 
A
R
 
E
Q
 
A
S
 
L
V
 
L
L
 
S
D
 
D
V
 
V
L
 
L
R
 
R
E
 
Q
T
 
Q
L
 
L
D
 
G
L
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
V
K
 
K
K
x
V
G
 
G
C
|
C
N
x
E
Q
 
Q
G
|
G
A
 
Q
C
|
C
G
|
G
A
 
A
C
|
C
T
 
S
V
 
V
L
 
I
V
 
L
N
 
D
G
 
G
K
 
K
R
 
V
I
 
V
V
x
R
S
 
A
C
|
C
L
 
V
T
 
T
-
 
K
L
 
M
A
 
K
S
 
R
M
 
V
Y
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
I
 
I
E
 
T
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
V
 
V
E
 
G
K
 
Q
D
 
P
G
 
E
A
 
N
L
 
L
H
 
H
P
 
P
L
 
L
Q
 
Q
E
 
K
A
 
A
F
 
W
V
 
V
E
 
L
H
 
H
D
 
G
G
 
G
L
 
A
Q
|
Q
C
|
C
G
|
G
F
 
F
C
|
C
T
 
S
P
 
P
G
 
G
Q
 
F
I
 
I
M
 
V
S
 
S
G
 
A
L
 
K
G
 
G
C
 
L
I
 
L
A
 
D
E
 
T
G
 
N
H
 
A
A
 
D
G
 
P
S
 
S
P
 
R
E
 
E
E
 
D
I
 
V
Q
 
R
F
 
D
W
 
W
M
 
F
S
 
Q
G
 
K
-
 
H
-
 
R
N
 
N
I
 
A
C
|
C
R
 
R
C
|
C
G
 
T
A
 
G
Y
 
Y
P
 
K
G
 
P
I
 
L
V
 
V
A
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
M
D
 
D
A
 
A
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3fahA Glycerol inhibited form of aldehyde oxidoreductase from desulfovibrio gigas (see paper)
47% identity, 75% coverage: 49:197/200 of query aligns to 2:153/907 of 3fahA

query
sites
3fahA
V
 
I
T
 
Q
L
 
K
T
 
V
L
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
G
R
 
I
G
 
E
H
 
Q
T
 
N
L
 
L
T
 
F
V
 
V
D
 
D
P
 
A
R
 
E
Q
 
A
S
 
L
V
 
L
L
 
S
D
 
D
V
 
V
L
 
L
R
 
R
E
 
Q
T
 
Q
L
 
L
D
 
G
L
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
V
K
 
K
K
x
V
G
 
G
C
|
C
N
x
E
Q
 
Q
G
|
G
A
 
Q
C
|
C
G
|
G
A
 
A
C
|
C
T
 
S
V
 
V
L
 
I
V
 
L
N
 
D
G
 
G
K
 
K
R
 
V
I
 
V
V
x
R
S
 
A
C
|
C
L
 
V
T
 
T
-
 
K
L
 
M
A
 
K
S
 
R
M
 
V
Y
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
I
 
I
E
 
T
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
V
 
V
E
 
G
K
 
Q
D
 
P
G
 
E
A
 
N
L
 
L
H
 
H
P
 
P
L
 
L
Q
 
Q
E
 
K
A
 
A
F
 
W
V
 
V
E
 
L
H
 
H
D
 
G
G
 
G
L
 
A
Q
|
Q
C
|
C
G
|
G
F
 
F
C
|
C
T
 
S
P
 
P
G
 
G
Q
 
F
I
 
I
M
 
V
S
 
S
G
 
A
L
 
K
G
 
G
C
 
L
I
 
L
A
 
D
E
 
T
G
 
N
H
 
A
A
 
D
G
 
P
S
 
S
P
 
R
E
 
E
E
 
D
I
 
V
Q
 
R
F
 
D
W
 
W
M
 
F
S
 
Q
G
 
K
-
 
H
-
 
R
N
 
N
I
 
A
C
|
C
R
 
R
C
|
C
G
 
T
A
 
G
Y
 
Y
P
 
K
G
 
P
I
 
L
V
 
V
A
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
M
D
 
D
A
 
A
A
 
A

Sites not aligning to the query:

1sijA Crystal structure of the aldehyde dehydrogenase (a.K.A. Aor or mop) of desulfovibrio gigas covalently bound to [aso3]- (see paper)
47% identity, 75% coverage: 49:197/200 of query aligns to 2:153/907 of 1sijA

query
sites
1sijA
V
 
I
T
 
Q
L
 
K
T
 
V
L
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
G
R
 
I
G
 
E
H
 
Q
T
 
N
L
 
L
T
 
F
V
 
V
D
 
D
P
 
A
R
 
E
Q
 
A
S
 
L
V
 
L
L
 
S
D
 
D
V
 
V
L
 
L
R
 
R
E
 
Q
T
 
Q
L
 
L
D
 
G
L
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
V
K
 
K
K
x
V
G
 
G
C
|
C
N
x
E
Q
 
Q
G
|
G
A
 
Q
C
|
C
G
|
G
A
 
A
C
|
C
T
 
S
V
 
V
L
 
I
V
 
L
N
 
D
G
 
G
K
 
K
R
 
V
I
 
V
V
x
R
S
 
A
C
|
C
L
 
V
T
 
T
-
 
K
L
 
M
A
 
K
S
 
R
M
 
V
Y
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
I
 
I
E
 
T
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
V
 
V
E
 
G
K
 
Q
D
 
P
G
 
E
A
 
N
L
 
L
H
 
H
P
 
P
L
 
L
Q
 
Q
E
 
K
A
 
A
F
 
W
V
 
V
E
 
L
H
 
H
D
 
G
G
 
G
L
 
A
Q
|
Q
C
|
C
G
|
G
F
 
F
C
|
C
T
 
S
P
 
P
G
 
G
Q
 
F
I
 
I
M
 
V
S
 
S
G
 
A
L
 
K
G
 
G
C
 
L
I
 
L
A
 
D
E
 
T
G
 
N
H
 
A
A
 
D
G
 
P
S
 
S
P
 
R
E
 
E
E
 
D
I
 
V
Q
 
R
F
 
D
W
 
W
M
 
F
S
 
Q
G
 
K
-
 
H
-
 
R
N
 
N
I
 
A
C
|
C
R
 
R
C
|
C
G
 
T
A
 
G
Y
 
Y
P
 
K
G
 
P
I
 
L
V
 
V
A
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
M
D
 
D
A
 
A
A
 
A

Sites not aligning to the query:

Q46509 Aldehyde oxidoreductase; Molybdenum iron sulfur protein; EC 1.2.99.7 from Megalodesulfovibrio gigas (Desulfovibrio gigas) (see paper)
47% identity, 75% coverage: 49:197/200 of query aligns to 2:153/907 of Q46509

query
sites
Q46509
V
 
I
T
 
Q
L
 
K
T
 
V
L
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
G
R
 
I
G
 
E
H
 
Q
T
 
N
L
 
L
T
 
F
V
 
V
D
 
D
P
 
A
R
 
E
Q
 
A
S
 
L
V
 
L
L
 
S
D
 
D
V
 
V
L
 
L
R
 
R
E
 
Q
T
 
Q
L
 
L
D
 
G
L
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
V
K
 
K
K
 
V
G
 
G
C
|
C
N
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
Q
C
|
C
G
 
G
A
 
A
C
|
C
T
 
S
V
 
V
L
 
I
V
 
L
N
 
D
G
 
G
K
 
K
R
 
V
I
 
V
V
 
R
S
 
A
C
|
C
L
 
V
T
 
T
-
 
K
L
 
M
A
 
K
S
 
R
M
 
V
Y
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
I
 
I
E
 
T
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
V
 
V
E
 
G
K
 
Q
D
 
P
G
 
E
A
 
N
L
 
L
H
 
H
P
 
P
L
 
L
Q
 
Q
E
 
K
A
 
A
F
 
W
V
 
V
E
 
L
H
 
H
D
 
G
G
 
G
L
 
A
Q
 
Q
C
|
C
G
 
G
F
 
F
C
|
C
T
 
S
P
 
P
G
 
G
Q
 
F
I
 
I
M
 
V
S
 
S
G
 
A
L
 
K
G
 
G
C
 
L
I
 
L
A
 
D
E
 
T
G
 
N
H
 
A
A
 
D
G
 
P
S
 
S
P
 
R
E
 
E
E
 
D
I
 
V
Q
 
R
F
 
D
W
 
W
M
 
F
S
 
Q
G
 
K
-
 
H
-
 
R
N
 
N
I
 
A
C
|
C
R
 
R
C
|
C
G
 
T
A
 
G
Y
 
Y
P
 
K
G
 
P
I
 
L
V
 
V
A
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
M
D
 
D
A
 
A
A
 
A

3hrdD Crystal structure of nicotinate dehydrogenase (see paper)
42% identity, 76% coverage: 49:199/200 of query aligns to 4:154/160 of 3hrdD

query
sites
3hrdD
V
 
I
T
 
T
L
 
I
T
 
N
L
 
L
T
 
N
V
 
L
N
 
N
G
 
G
R
 
E
G
 
A
H
 
R
T
 
S
L
 
I
T
 
V
V
 
T
D
 
E
P
 
P
R
 
N
Q
 
K
S
 
R
V
 
L
L
 
L
D
 
D
V
 
L
L
 
L
R
 
R
E
 
E
T
 
D
L
 
F
D
 
G
L
 
L
T
 
T
G
 
S
T
 
V
K
 
K
K
x
E
G
 
G
C
|
C
N
x
S
Q
x
E
G
|
G
A
x
E
C
|
C
G
|
G
A
 
A
C
|
C
T
 
T
V
 
V
L
 
I
V
 
F
N
 
N
G
 
G
K
 
D
R
 
P
I
 
V
V
 
T
S
 
T
C
|
C
L
 
C
T
 
M
L
 
L
A
 
A
S
 
G
M
 
Q
Y
 
A
D
 
D
G
 
E
A
 
S
R
 
T
I
 
I
E
 
I
T
 
T
I
 
L
E
 
E
G
 
G
V
 
V
E
 
A
K
 
E
D
 
D
G
 
G
A
 
K
L
 
P
H
 
S
P
 
L
L
 
L
Q
 
Q
E
 
Q
A
 
C
F
 
F
V
 
L
E
 
E
H
 
A
D
 
G
G
 
A
L
 
V
Q
|
Q
C
|
C
G
|
G
F
 
Y
C
|
C
T
 
T
P
 
P
G
 
G
Q
 
M
I
 
I
M
 
L
S
 
T
G
 
A
L
 
K
G
 
A
C
 
L
I
 
L
A
 
D
E
 
K
G
 
N
H
 
P
A
 
D
G
 
P
S
 
T
P
 
D
E
 
E
E
 
E
I
 
I
Q
 
T
F
 
V
W
 
A
M
 
M
S
 
S
G
 
G
N
 
N
I
 
L
C
|
C
R
 
R
C
|
C
G
 
T
A
 
G
Y
 
Y
P
 
I
G
 
K
I
 
I
V
 
H
A
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
R
D
 
Y
A
 
A
A
 
V
G
 
E
R
 
R

Q0QLF3 Nicotinate dehydrogenase small FeS subunit; NDH; Nicotinic acid hydroxylase small FeS subunit; NAH; EC 1.17.1.5 from Eubacterium barkeri (Clostridium barkeri) (see paper)
42% identity, 76% coverage: 49:199/200 of query aligns to 4:154/157 of Q0QLF3

query
sites
Q0QLF3
V
 
I
T
 
T
L
 
I
T
 
N
L
 
L
T
 
N
V
 
L
N
 
N
G
 
G
R
 
E
G
 
A
H
 
R
T
 
S
L
 
I
T
 
V
V
 
T
D
 
E
P
 
P
R
 
N
Q
 
K
S
 
R
V
 
L
L
 
L
D
 
D
V
 
L
L
 
L
R
 
R
E
 
E
T
 
D
L
 
F
D
 
G
L
 
L
T
 
T
G
 
S
T
 
V
K
 
K
K
 
E
G
 
G
C
|
C
N
 
S
Q
 
E
G
 
G
A
 
E
C
|
C
G
 
G
A
 
A
C
|
C
T
 
T
V
 
V
L
 
I
V
 
F
N
 
N
G
 
G
K
 
D
R
 
P
I
 
V
V
 
T
S
 
T
C
|
C
L
 
C
T
 
M
L
 
L
A
 
A
S
 
G
M
 
Q
Y
 
A
D
 
D
G
 
E
A
 
S
R
 
T
I
 
I
E
 
I
T
 
T
I
 
L
E
 
E
G
 
G
V
 
V
E
 
A
K
 
E
D
 
D
G
 
G
A
 
K
L
 
P
H
 
S
P
 
L
L
 
L
Q
 
Q
E
 
Q
A
 
C
F
 
F
V
 
L
E
 
E
H
 
A
D
 
G
G
 
A
L
 
V
Q
 
Q
C
|
C
G
 
G
F
 
Y
C
|
C
T
 
T
P
 
P
G
 
G
Q
 
M
I
 
I
M
 
L
S
 
T
G
 
A
L
 
K
G
 
A
C
 
L
I
 
L
A
 
D
E
 
K
G
 
N
H
 
P
A
 
D
G
 
P
S
 
T
P
 
D
E
 
E
E
 
E
I
 
I
Q
 
T
F
 
V
W
 
A
M
 
M
S
 
S
G
 
G
N
 
N
I
 
L
C
|
C
R
 
R
C
|
C
G
 
T
A
 
G
Y
 
Y
P
 
I
G
 
K
I
 
I
V
 
H
A
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
R
D
 
Y
A
 
A
A
 
V
G
 
E
R
 
R

1sb3C Structure of 4-hydroxybenzoyl-coa reductase from thauera aromatica (see paper)
46% identity, 74% coverage: 51:197/200 of query aligns to 5:151/161 of 1sb3C

query
sites
1sb3C
L
 
L
T
 
R
L
 
L
T
 
T
V
 
L
N
 
N
G
 
G
R
 
R
G
 
A
H
 
R
T
 
E
L
 
D
T
 
L
V
 
V
D
 
P
P
 
D
R
 
N
Q
 
M
S
 
L
V
 
L
L
 
L
D
 
D
V
 
Y
L
 
L
R
 
R
E
 
E
T
 
T
L
 
V
D
 
G
L
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
T
K
 
K
K
x
Q
G
 
G
C
|
C
N
 
D
Q
 
G
G
|
G
A
 
E
C
|
C
G
|
G
A
 
A
C
|
C
T
 
T
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
D
G
 
D
K
 
R
R
 
P
I
 
R
V
 
L
S
 
A
C
|
C
L
 
S
T
 
T
L
 
L
A
 
A
S
 
H
M
 
Q
Y
 
V
D
 
A
G
 
G
A
 
K
R
 
K
I
 
V
E
 
E
T
 
T
I
 
V
E
 
E
G
 
S
V
 
L
E
 
A
K
 
T
D
 
Q
G
 
G
A
 
T
L
 
L
H
 
S
P
 
K
L
 
L
Q
 
Q
E
 
A
A
 
A
F
 
F
V
 
H
E
 
E
H
 
K
D
 
L
G
 
G
L
 
T
Q
|
Q
C
|
C
G
|
G
F
 
F
C
|
C
T
 
T
P
 
P
G
 
G
Q
 
M
I
 
I
M
 
M
S
 
A
G
 
S
L
 
E
G
 
A
C
 
L
I
 
L
A
 
R
E
 
K
G
 
N
H
 
P
A
 
S
G
 
P
S
 
S
P
 
R
E
 
D
E
 
E
I
 
I
Q
 
K
F
 
A
W
 
A
M
 
L
S
 
A
G
 
G
N
 
N
I
 
L
C
|
C
R
 
R
C
|
C
G
 
T
A
 
G
Y
 
Y
P
 
V
G
 
K
I
 
I
V
 
I
A
 
K
A
 
S
V
 
V
A
 
E
D
 
T
A
 
A
A
 
A

8uemC The cryoem structure of the high affinity carbon monoxide dehydrogenase from mycobacterium smegmatis (see paper)
45% identity, 74% coverage: 51:197/200 of query aligns to 3:149/153 of 8uemC

query
sites
8uemC
L
 
V
T
 
T
L
 
M
T
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
G
R
 
E
G
 
A
H
 
V
T
 
T
L
 
A
T
 
D
V
 
V
D
 
E
P
 
P
R
 
R
Q
 
M
S
 
L
V
 
L
L
 
V
D
 
H
V
 
F
L
 
L
R
 
R
E
 
D
T
 
Q
L
 
L
D
 
G
L
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
T
K
 
H
K
x
W
G
|
G
C
|
C
N
 
D
Q
 
T
G
x
S
A
x
N
C
|
C
G
|
G
A
 
T
C
|
C
T
 
V
V
 
V
L
 
E
V
 
V
N
 
D
G
 
G
K
 
E
R
 
P
I
 
V
V
x
K
S
 
S
C
|
C
L
 
T
T
 
M
L
 
L
A
 
A
S
 
A
M
 
M
Y
 
A
D
 
S
G
 
G
A
 
H
R
 
S
I
 
V
E
 
N
T
 
T
I
 
V
E
 
E
G
 
G
V
 
M
E
 
E
K
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
K
L
 
L
H
 
D
P
 
P
L
 
V
Q
 
Q
E
 
E
A
 
G
F
 
F
V
 
M
E
 
Q
H
 
C
D
 
H
G
 
G
L
 
L
Q
|
Q
C
|
C
G
|
G
F
 
F
C
|
C
T
 
T
P
 
P
G
 
G
Q
 
M
I
 
M
M
 
I
S
 
T
G
 
A
L
 
R
G
 
A
C
 
L
I
 
L
A
 
R
E
 
Q
G
 
N
H
 
P
A
 
D
G
 
P
S
 
T
P
 
E
E
 
E
E
 
E
I
 
I
Q
 
R
F
 
E
W
 
A
M
 
I
S
 
S
G
 
G
N
 
Q
I
 
I
C
|
C
R
 
R
C
|
C
G
 
T
A
 
G
Y
 
Y
P
 
T
G
 
T
I
 
I
V
 
V
A
 
R
A
 
S
V
 
V
A
 
Q
D
 
W
A
 
A
A
 
A

1dgjA Crystal structure of the aldehyde oxidoreductase from desulfovibrio desulfuricans atcc 27774 (see paper)
44% identity, 74% coverage: 50:197/200 of query aligns to 3:153/906 of 1dgjA

query
sites
1dgjA
T
 
T
L
 
K
T
 
T
L
 
L
T
 
I
V
 
V
N
 
N
G
 
G
R
 
M
G
 
A
H
 
R
T
 
R
L
 
L
T
 
L
V
 
V
D
 
S
P
 
P
R
 
N
Q
 
D
S
 
L
V
 
L
L
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
R
 
R
E
 
S
T
 
Q
L
 
L
D
 
Q
L
 
L
T
 
T
G
 
S
T
 
V
K
 
K
K
x
V
G
|
G
C
|
C
N
x
G
Q
 
K
G
|
G
A
x
Q
C
|
C
G
|
G
A
 
A
C
|
C
T
 
T
V
 
V
L
 
I
V
 
L
N
 
D
G
 
G
K
 
K
R
 
V
I
 
V
V
x
R
S
 
A
C
|
C
-
 
I
L
 
I
T
 
K
L
 
M
A
 
S
S
 
R
M
 
V
Y
 
A
D
 
E
G
 
N
A
 
A
R
 
S
I
 
V
E
 
T
T
 
T
I
 
L
E
 
E
G
 
G
V
 
I
E
 
G
K
 
A
D
 
P
G
 
D
A
 
C
L
 
L
H
 
H
P
 
P
L
 
L
Q
 
Q
E
 
H
A
 
A
F
 
W
V
 
I
E
 
Q
H
 
H
D
 
G
G
 
A
L
 
A
Q
|
Q
C
|
C
G
|
G
F
 
F
C
|
C
T
 
T
P
 
P
G
 
G
Q
 
F
I
 
I
M
 
V
S
 
S
G
 
A
L
 
K
G
 
A
C
 
L
I
 
L
A
 
D
E
 
E
G
 
N
H
 
V
A
 
A
G
 
P
S
 
S
P
 
R
E
 
E
E
 
D
I
 
V
Q
 
R
F
 
D
W
 
W
M
 
F
S
 
Q
G
 
K
-
 
H
-
 
H
N
 
N
I
 
I
C
|
C
R
 
R
C
|
C
G
 
T
A
 
G
Y
 
Y
P
 
K
G
 
P
I
 
L
V
 
V
A
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
M
D
 
D
A
 
A
A
 
A

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_012706539.1 NCBI__GCF_000018545.1:WP_012706539.1
MAENPSALHLSGPRISRREALQATAAAAALAALPPGSAAATNAPAAAAVTLTLTVNGRGH
TLTVDPRQSVLDVLRETLDLTGTKKGCNQGACGACTVLVNGKRIVSCLTLASMYDGARIE
TIEGVEKDGALHPLQEAFVEHDGLQCGFCTPGQIMSGLGCIAEGHAGSPEEIQFWMSGNI
CRCGAYPGIVAAVADAAGRS

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory