SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012706984.1 NCBI__GCF_000018545.1:WP_012706984.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6czmE Crystal structure of medicago truncatula atp-phosphoribosyltransferase in tense form (see paper)
32% identity, 90% coverage: 3:211/231 of query aligns to 10:215/342 of 6czmE

query
sites
6czmE
I
 
I
T
 
R
I
 
L
A
 
G
L
 
L
P
 
P
S
 
S
K
 
K
G
 
G
R
 
R
M
 
M
K
 
S
D
 
S
D
 
D
A
 
T
S
 
L
A
 
D
I
 
L
F
 
L
E
 
K
R
 
D
A
 
C
G
 
Q
M
 
L
K
 
S
I
 
V
V
 
K
A
 
Q
V
 
V
G
 
-
N
 
N
D
 
P
R
 
R
S
 
Q
Y
 
Y
R
 
V
G
 
A
R
 
Q
V
 
I
E
 
P
G
 
Q
W
 
I
D
 
S
D
 
N
V
 
L
E
 
E
V
 
V
A
 
W
F
 
F
L
 
Q
S
 
R
A
 
P
S
 
K
E
 
D
I
 
I
S
 
V
R
 
R
E
 
K
V
 
L
G
 
L
S
 
S
G
 
G
A
 
D
V
 
L
D
 
D
F
 
L
G
 
G
V
 
I
T
 
V
G
 
G
E
 
L
D
 
D
L
 
V
V
 
L
R
 
T
E
 
E
-
 
F
G
 
G
I
 
Q
A
 
G
D
 
N
V
 
E
D
 
D
A
 
L
R
 
I
V
 
V
E
 
V
F
 
H
A
 
E
A
 
A
R
 
-
L
 
L
G
 
E
F
 
Y
G
 
G
H
 
D
A
x
C
D
 
R
V
 
L
V
 
S
V
 
I
A
 
A
V
 
I
P
 
P
E
 
Q
-
 
Y
-
 
G
V
 
I
W
 
F
Y
 
E
D
 
N
V
 
V
D
 
N
T
 
S
M
 
L
A
 
E
D
 
E
L
 
L
G
 
A
D
 
K
V
 
M
A
 
P
A
 
-
D
 
-
F
 
-
R
 
Q
A
 
W
R
 
T
H
 
E
G
 
D
R
 
K
R
 
P
L
 
L
A
 
R
I
 
V
A
 
A
T
 
T
K
 
G
Y
 
F
W
 
T
R
 
Y
L
 
L
T
 
G
Q
 
P
Q
 
K
F
 
F
F
 
M
S
 
K
G
 
-
S
 
D
H
 
N
G
 
G
I
 
I
Q
 
K
L
 
H
Y
 
V
R
 
A
I
 
F
V
 
S
E
 
T
S
 
A
L
 
D
G
 
G
A
 
A
T
 
L
E
 
E
G
 
A
A
 
A
P
 
P
A
 
A
S
 
M
G
 
G
S
 
I
A
 
A
D
 
D
I
 
A
I
 
I
V
 
L
D
|
D
I
x
L
T
 
V
S
|
S
T
x
S
G
|
G
S
 
T
T
|
T
L
 
L
K
 
K
A
 
E
N
 
N
H
 
N
L
 
L
K
 
K
I
 
E
L
 
I
S
 
E
D
 
G
G
 
G
V
 
T
I
 
V
L
 
L
R
 
E
S
 
S
E
 
Q
A
 
A
C
 
A
L
 
L
V
 
V
R
 
A
A
 
S
R
 
R
K
 
R

Sites not aligning to the query:

2vd3A The structure of histidine inhibited hisg from methanobacterium thermoautotrophicum
33% identity, 99% coverage: 3:231/231 of query aligns to 5:211/289 of 2vd3A

query
sites
2vd3A
I
 
I
T
 
R
I
 
I
A
 
A
L
 
V
P
 
P
S
 
S
K
 
K
G
 
G
R
 
R
M
 
I
K
 
S
D
 
E
D
 
P
A
 
A
S
 
I
A
 
R
I
 
L
F
 
L
E
|
E
R
 
N
A
 
A
G
 
G
M
 
V
K
 
G
I
 
L
V
 
K
A
 
D
V
 
T
G
 
V
N
 
N
D
 
R
R
 
K
S
 
L
Y
 
F
R
 
S
G
 
K
R
 
-
V
 
-
E
 
T
G
x
Q
W
 
H
D
 
P
D
 
Q
V
 
I
E
 
E
V
 
V
A
 
M
F
 
F
L
 
S
S
 
R
A
 
A
S
 
A
E
 
D
I
 
I
S
 
P
R
 
E
E
 
F
V
 
V
G
 
A
S
 
D
G
 
G
A
 
A
V
 
A
D
 
D
F
 
L
G
 
G
V
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
Y
D
 
D
L
 
L
V
 
I
R
 
V
E
 
E
G
 
R
I
 
G
A
 
S
D
 
D
V
 
V
D
 
-
A
 
-
R
 
-
V
 
-
E
 
E
F
 
I
A
 
L
A
 
E
R
 
D
L
 
L
G
 
K
F
 
Y
G
 
G
H
 
R
A
 
A
D
 
S
V
 
L
V
 
V
V
 
L
A
 
A
V
 
A
P
 
P
E
 
E
V
 
D
W
 
-
Y
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
S
T
 
T
M
 
I
A
 
R
D
 
G
L
 
P
G
 
E
D
 
D
V
 
I
A
 
P
A
 
-
D
 
-
F
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
H
 
-
G
 
-
R
 
R
R
 
G
L
 
A
A
 
V
I
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
E
Y
 
F
W
 
P
R
 
G
L
 
I
T
 
T
Q
 
E
Q
 
N
F
 
Y
F
 
L
S
 
R
G
 
-
S
 
E
H
 
H
G
 
G
I
 
I
Q
 
D
L
 
-
Y
 
A
R
 
E
I
 
V
V
 
V
E
 
E
S
 
L
L
 
T
G
 
G
A
 
S
T
 
T
E
 
E
G
 
I
A
 
A
P
 
P
A
 
F
S
 
I
G
 
G
S
 
V
A
 
A
D
 
D
I
 
L
I
 
I
V
 
T
D
|
D
I
x
L
T
 
S
S
 
S
T
 
T
G
 
G
S
 
T
T
 
T
L
 
L
K
 
R
A
 
M
N
 
N
H
 
H
L
 
L
K
 
R
I
 
V
L
 
I
S
 
D
D
 
-
G
 
-
V
 
T
I
 
I
L
 
L
R
 
E
S
 
S
E
 
S
A
 
V
C
 
K
L
 
L
V
 
I
R
 
A
A
 
N
R
 
R
K
 
E
P
 
S
A
 
Y
H
 
A
D
 
T
G
 
K
Y
 
S
P
 
G
M
 
I
I
 
I
D
 
E
R
 
E
I
 
L
I
 
R
S
 
T
S
 
G
V
 
I
R
 
R
S
 
G
V
 
V
L
 
I

Sites not aligning to the query:

1q1kA Structure of atp-phosphoribosyltransferase from e. Coli complexed with pr-atp (see paper)
29% identity, 99% coverage: 3:231/231 of query aligns to 3:217/288 of 1q1kA

query
sites
1q1kA
I
 
L
T
 
R
I
 
I
A
 
A
L
 
M
P
 
Q
S
 
K
K
 
S
G
 
G
R
|
R
M
 
L
K
 
S
D
 
D
D
 
D
A
 
S
S
 
R
A
 
E
I
 
L
F
 
L
E
 
A
R
 
R
A
 
C
G
 
G
M
 
I
K
 
K
I
 
I
V
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
-
N
 
N
D
 
L
R
 
H
S
 
T
Y
 
Q
R
 
R
G
 
L
R
 
I
V
 
A
E
 
M
G
 
A
W
 
E
D
 
N
-
 
M
D
 
P
V
 
I
E
 
D
V
 
I
A
 
L
F
 
R
L
 
V
S
 
R
A
x
D
S
x
D
E
 
D
I
 
I
S
 
P
R
 
G
E
 
L
V
 
V
G
 
M
S
 
D
G
 
G
A
 
V
V
 
V
D
 
D
F
 
L
G
 
G
V
 
I
T
 
I
G
 
G
E
 
E
D
x
N
L
x
V
V
 
L
R
 
E
E
 
E
G
 
E
I
 
L
A
 
L
D
 
N
-
 
R
-
 
R
-
 
A
-
 
Q
-
 
G
V
 
E
D
 
D
A
 
P
R
 
R
V
 
Y
E
 
F
F
 
T
A
 
L
A
 
R
R
 
R
L
 
L
G
 
D
F
 
F
G
 
G
H
 
G
A
x
C
D
 
R
V
 
L
V
 
S
V
 
L
A
 
A
V
 
T
P
 
P
-
 
V
-
 
D
E
 
E
V
 
A
W
 
W
Y
 
D
D
 
G
V
 
P
D
 
L
T
 
S
M
 
L
A
 
-
D
 
-
L
 
-
G
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
-
F
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
H
 
N
G
 
G
R
 
K
R
 
R
L
 
-
A
 
-
I
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
S
Y
|
Y
W
 
P
R
 
H
L
 
L
T
 
L
Q
 
K
Q
 
R
F
 
Y
F
 
L
S
 
D
G
 
-
S
 
Q
H
 
K
G
 
G
I
 
I
Q
 
S
L
 
F
Y
 
K
R
 
S
I
 
C
V
 
L
E
 
L
S
 
N
L
 
-
G
 
G
A
 
S
T
 
V
E
|
E
G
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
R
S
 
A
G
 
G
S
 
L
A
 
A
D
 
D
I
 
A
I
 
I
V
 
C
D
 
D
I
x
L
T
 
V
S
|
S
T
|
T
G
|
G
S
x
A
T
|
T
L
 
L
K
 
E
A
 
A
N
 
N
H
 
G
L
 
L
K
 
R
I
 
E
L
 
V
S
 
E
D
 
-
G
 
-
V
 
V
I
 
I
L
 
Y
R
 
R
S
 
S
E
 
K
A
 
A
C
 
C
L
 
L
V
 
I
-
 
Q
R
 
R
A
 
D
R
 
G
K
 
E
P
 
M
A
 
E
H
 
E
D
 
S
G
 
K
Y
 
Q
P
 
Q
M
 
L
I
 
I
D
 
D
R
 
K
I
 
L
I
 
L
S
 
T
S
 
R
V
 
I
R
 
Q
S
 
G
V
 
V
L
 
I

1h3dA Structure of the e.Coli atp-phosphoribosyltransferase (see paper)
29% identity, 99% coverage: 3:231/231 of query aligns to 3:217/288 of 1h3dA

query
sites
1h3dA
I
 
L
T
 
R
I
 
I
A
 
A
L
 
M
P
 
Q
S
 
K
K
 
S
G
 
G
R
|
R
M
 
L
K
 
S
D
 
D
D
 
D
A
 
S
S
 
R
A
 
E
I
 
L
F
 
L
E
 
A
R
 
R
A
 
C
G
 
G
M
 
I
K
 
K
I
 
I
V
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
-
N
 
N
D
 
L
R
 
H
S
 
T
Y
 
Q
R
 
R
G
 
L
R
 
I
V
 
A
E
 
M
G
 
A
W
 
E
D
 
N
-
 
M
D
 
P
V
 
I
E
 
D
V
 
I
A
 
L
F
 
R
L
 
V
S
 
R
A
 
D
S
 
D
E
 
D
I
 
I
S
 
P
R
 
G
E
 
L
V
 
V
G
 
M
S
 
D
G
 
G
A
 
V
V
 
V
D
 
D
F
 
L
G
 
G
V
 
I
T
 
I
G
 
G
E
 
E
D
 
N
L
 
V
V
 
L
R
 
E
E
 
E
G
 
E
I
 
L
A
 
L
D
 
N
-
 
R
-
 
R
-
 
A
-
 
Q
-
 
G
V
 
E
D
 
D
A
 
P
R
 
R
V
 
Y
E
 
F
F
 
T
A
 
L
A
 
R
R
 
R
L
 
L
G
 
D
F
 
F
G
 
G
H
 
G
A
 
C
D
 
R
V
 
L
V
 
S
V
 
L
A
 
A
V
 
T
P
 
P
-
 
V
-
 
D
E
 
E
V
 
A
W
 
W
Y
 
D
D
 
G
V
 
P
D
 
L
T
 
S
M
 
L
A
 
-
D
 
-
L
 
-
G
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
-
F
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
H
 
N
G
 
G
R
 
K
R
 
R
L
 
-
A
 
-
I
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
S
Y
 
Y
W
 
P
R
 
H
L
 
L
T
 
L
Q
 
K
Q
 
R
F
 
Y
F
 
L
S
 
D
G
 
-
S
 
Q
H
 
K
G
 
G
I
 
I
Q
 
S
L
 
F
Y
 
K
R
 
S
I
 
C
V
 
L
E
 
L
S
 
N
L
 
-
G
 
G
A
 
S
T
 
V
E
|
E
G
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
R
S
 
A
G
 
G
S
 
L
A
 
A
D
 
D
I
 
A
I
 
I
V
 
C
D
|
D
I
x
L
T
 
V
S
|
S
T
|
T
G
|
G
S
x
A
T
|
T
L
 
L
K
 
E
A
 
A
N
 
N
H
 
G
L
 
L
K
 
R
I
 
E
L
 
V
S
 
E
D
 
-
G
 
-
V
 
V
I
 
I
L
 
Y
R
 
R
S
 
S
E
 
K
A
 
A
C
 
C
L
 
L
V
 
I
-
 
Q
R
 
R
A
 
D
R
 
G
K
 
E
P
 
M
A
 
E
H
 
E
D
 
S
G
 
K
Y
 
Q
P
 
Q
M
 
L
I
 
I
D
 
D
R
 
K
I
 
L
I
 
L
S
 
T
S
 
R
V
 
I
R
 
Q
S
 
G
V
 
V
L
 
I

6czmF Crystal structure of medicago truncatula atp-phosphoribosyltransferase in tense form (see paper)
30% identity, 90% coverage: 3:211/231 of query aligns to 3:188/315 of 6czmF

query
sites
6czmF
I
 
I
T
 
R
I
 
L
A
 
G
L
 
L
P
 
P
S
 
S
K
 
K
G
 
G
R
 
R
M
 
M
K
 
S
D
 
S
D
 
D
A
 
T
S
 
L
A
 
D
I
 
L
F
 
L
E
 
K
R
 
D
A
 
C
G
 
Q
M
 
L
K
 
S
I
 
V
V
 
K
A
 
Q
V
 
V
G
 
-
N
 
N
D
 
P
R
 
R
S
 
Q
Y
 
Y
R
 
V
G
 
A
R
 
Q
V
 
I
E
 
P
G
 
Q
W
 
I
D
 
S
D
 
N
V
 
L
E
 
E
V
 
V
A
 
W
F
 
F
L
 
Q
S
 
R
A
 
P
S
 
K
E
 
D
I
 
I
S
 
V
R
 
R
E
 
K
V
 
L
G
 
L
S
 
S
G
 
-
A
 
-
V
 
L
D
 
D
F
 
L
G
 
G
V
 
I
T
 
V
G
 
G
E
 
L
D
 
D
L
 
V
V
 
L
R
 
T
E
 
E
-
 
F
G
 
G
I
 
Q
A
 
G
D
 
N
V
 
E
D
 
D
A
 
L
R
 
I
V
 
V
E
 
V
F
 
H
A
 
E
A
 
A
R
 
-
L
 
L
G
 
E
F
 
Y
G
 
G
H
 
D
A
 
C
D
 
R
V
 
L
V
 
S
V
 
I
A
 
A
V
 
I
P
 
P
E
 
-
V
 
-
W
 
F
Y
 
E
D
 
N
V
 
V
D
 
N
T
 
S
M
 
L
A
 
E
D
 
E
L
 
L
G
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
-
F
 
-
R
 
Q
A
 
W
R
 
T
H
 
E
G
 
D
R
 
K
R
 
P
L
 
L
A
 
R
I
 
V
A
 
A
T
 
T
K
 
G
Y
 
F
W
 
T
R
 
Y
L
 
L
T
 
G
Q
 
P
Q
 
K
F
 
F
F
 
M
S
 
K
G
 
-
S
 
D
H
 
N
G
 
G
I
 
I
Q
 
-
L
 
-
Y
 
-
R
 
K
I
 
H
V
 
V
E
 
A
S
 
F
L
 
S
G
 
G
A
 
A
T
 
L
E
 
E
G
 
A
A
 
A
P
 
P
A
 
A
S
 
M
G
 
G
S
 
A
A
 
-
D
 
-
I
 
-
I
 
I
V
 
L
D
 
D
I
 
L
T
 
V
S
|
S
T
x
S
G
|
G
S
 
T
T
|
T
L
 
L
K
 
K
A
 
E
N
 
N
H
 
-
L
 
-
K
 
-
I
 
-
L
 
I
S
 
E
D
 
G
G
 
G
V
 
T
I
 
V
L
 
L
R
 
E
S
 
S
E
 
Q
A
 
A
C
 
A
L
 
L
V
 
V
R
 
A
A
 
S
R
 
R
K
 
R

Sites not aligning to the query:

5lhtA Atp phosphoribosyltransferase from mycobacterium tuberculosis in complex with the allosteric activator 3-(2-thienyl)-l-alanine (see paper)
31% identity, 99% coverage: 3:231/231 of query aligns to 2:207/284 of 5lhtA

query
sites
5lhtA
I
 
L
T
 
R
I
 
V
A
 
A
L
 
V
P
 
P
S
 
N
K
 
K
G
 
G
R
 
A
M
 
L
K
 
S
D
 
E
D
 
P
A
 
A
S
 
T
A
 
E
I
 
I
F
 
L
E
 
A
R
 
E
A
 
A
G
 
G
M
 
Y
K
 
R
I
 
R
V
 
R
A
 
T
V
 
D
G
 
S
N
 
K
D
 
D
R
 
L
S
 
T
Y
 
V
R
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
I
E
 
D
G
 
P
W
 
V
D
 
N
D
 
N
V
 
V
E
 
E
V
 
F
A
 
F
F
 
F
L
 
L
S
 
R
A
 
P
S
 
K
E
 
D
I
 
I
S
 
A
R
 
I
E
 
Y
V
 
V
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
E
V
 
L
D
 
D
F
 
F
G
 
G
V
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
R
D
 
D
L
 
L
V
 
V
R
 
C
E
 
D
G
 
S
I
 
G
A
 
A
D
 
Q
V
 
V
D
 
R
A
 
E
R
 
R
V
 
L
E
 
A
F
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
L
G
 
G
F
 
F
G
 
G
H
 
S
A
 
S
D
 
S
V
 
F
V
 
R
V
 
Y
A
 
A
V
 
A
P
 
P
-
 
A
-
 
G
E
 
R
V
 
N
W
 
W
Y
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
T
 
T
M
 
T
A
 
A
D
 
D
L
 
L
G
 
A
D
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
-
F
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
H
 
-
G
 
G
R
 
M
R
 
R
L
 
-
A
 
-
I
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
A
Y
 
Y
W
 
P
R
 
N
L
 
L
T
 
V
Q
 
R
Q
 
K
F
 
D
F
 
L
S
 
A
G
 
-
S
 
T
H
 
K
G
 
G
I
 
I
Q
 
E
L
 
A
Y
 
T
R
 
-
I
 
V
V
 
I
E
 
R
S
 
L
L
 
D
G
 
G
A
 
A
T
 
V
E
 
E
G
 
I
A
 
S
P
 
V
A
 
Q
S
 
L
G
 
G
S
 
V
A
 
A
D
 
D
I
 
A
I
 
I
V
 
A
D
 
D
I
 
V
T
 
V
S
 
G
T
 
S
G
 
G
S
 
R
T
 
T
L
 
L
K
 
S
A
 
Q
N
 
H
H
 
D
L
 
L
K
 
V
I
 
A
L
 
F
S
 
G
D
 
E
G
 
P
V
 
-
I
 
L
L
 
C
R
 
D
S
 
S
E
 
E
A
 
A
C
 
V
L
 
L
V
 
I
-
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
G
K
 
T
P
 
D
A
 
G
H
 
Q
D
 
D
G
 
Q
Y
 
T
P
 
E
M
 
A
I
 
R
D
 
D
R
 
Q
I
 
L
I
 
V
S
 
A
S
 
R
V
 
V
R
 
Q
S
 
G
V
 
V
L
 
V

Sites not aligning to the query:

5u99A Transition state analysis of adenosine triphosphate phosphoribosyltransferase (see paper)
32% identity, 92% coverage: 3:215/231 of query aligns to 4:193/278 of 5u99A

query
sites
5u99A
I
 
L
T
 
R
I
 
V
A
 
A
L
 
V
P
 
P
S
 
N
K
 
K
G
 
G
R
 
A
M
 
L
K
 
S
D
 
E
D
 
P
A
 
A
S
 
T
A
 
E
I
 
I
F
 
L
E
 
A
R
 
E
A
 
A
G
 
G
M
 
Y
K
 
R
I
 
R
V
 
R
A
 
T
V
 
D
G
 
S
N
 
K
D
 
D
R
 
L
S
 
T
Y
 
V
R
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
I
E
 
D
G
 
P
W
 
V
D
 
N
D
 
N
V
 
V
E
 
E
V
 
F
A
 
F
F
 
F
L
 
L
S
 
R
A
 
P
S
 
K
E
 
D
I
 
I
S
 
A
R
 
I
E
 
Y
V
 
V
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
E
V
 
L
D
 
D
F
 
F
G
 
G
V
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
R
D
|
D
L
 
L
V
 
V
R
 
C
E
 
D
G
 
S
I
 
G
A
 
A
D
 
Q
V
 
V
D
 
R
A
 
E
R
 
R
V
 
L
E
 
A
F
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
L
G
 
G
F
 
F
G
 
G
H
 
S
A
x
S
D
 
S
V
 
F
V
 
R
V
 
Y
A
 
A
V
 
A
P
 
P
-
 
A
-
 
G
E
 
R
V
 
N
W
 
W
Y
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
T
 
T
M
 
T
A
 
A
D
 
D
L
 
L
G
 
A
D
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
-
F
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
H
 
-
G
 
G
R
 
M
R
 
R
L
 
-
A
 
-
I
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
A
Y
 
Y
W
 
P
R
 
N
L
 
L
T
 
V
Q
 
R
Q
 
K
F
 
D
F
 
L
S
 
A
G
 
-
S
 
T
H
 
K
G
 
G
I
 
I
Q
 
E
L
 
A
Y
 
T
R
 
-
I
 
V
V
 
I
E
 
R
S
 
L
L
 
D
G
 
G
A
 
A
T
 
V
E
 
E
G
 
I
A
 
S
P
 
V
A
 
Q
S
 
L
G
 
G
S
 
V
A
 
A
D
 
D
I
 
A
I
 
I
V
 
A
D
 
D
I
x
V
T
 
V
S
 
G
T
 
S
G
 
G
S
 
R
T
 
T
L
 
L
K
 
S
A
 
Q
N
 
H
H
 
D
L
 
L
K
 
V
I
 
A
L
 
F
S
 
G
D
 
E
G
 
P
V
 
-
I
 
L
L
 
C
R
 
D
S
 
S
E
 
E
A
 
A
C
 
V
L
 
L
V
 
I
-
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
Q
K
 
T
P
 
E
A
 
A
H
 
R
D
 
D

7dahC Adenosine triphosphate phosphoribosyltransferase from vibrio cholerae in complex with atp and prpp
27% identity, 99% coverage: 3:230/231 of query aligns to 4:217/288 of 7dahC

query
sites
7dahC
I
 
L
T
 
R
I
 
I
A
 
A
L
 
I
P
x
Q
S
 
K
K
 
K
G
 
G
R
|
R
M
 
L
K
 
S
D
 
Q
D
 
E
A
 
C
S
 
Q
A
 
E
I
 
L
F
 
L
E
 
K
R
 
K
A
 
C
G
 
G
M
 
V
K
 
K
I
 
F
V
 
N
A
 
I
V
 
M
G
 
G
N
 
E
D
 
-
R
 
-
S
 
-
Y
 
-
R
 
R
G
 
L
R
 
V
V
 
V
E
 
H
G
 
S
W
 
L
D
 
N
-
 
M
D
 
P
V
 
I
E
 
D
V
 
L
A
 
L
F
 
L
L
 
V
S
x
R
A
x
D
S
x
D
E
 
D
I
 
I
S
 
P
R
 
G
E
 
L
V
 
I
G
 
M
S
 
D
G
 
G
A
 
V
V
 
V
D
 
D
F
 
L
G
 
G
V
 
F
T
 
V
G
 
G
E
 
E
D
x
N
L
 
V
V
 
L
R
 
E
E
 
E
G
 
T
I
 
R
A
 
L
D
 
D
-
 
R
-
 
L
-
 
A
V
 
L
D
 
N
A
 
Q
R
 
R
V
 
N
E
 
E
F
 
F
A
 
T
A
 
T
-
 
L
-
 
R
R
 
R
L
 
M
G
 
D
F
 
F
G
 
G
H
x
G
A
x
C
D
 
R
V
 
L
V
 
S
V
 
I
A
 
A
V
 
I
P
 
-
E
 
-
V
 
-
W
 
-
Y
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
T
 
-
M
 
-
A
 
-
D
 
-
L
 
-
G
 
-
D
 
E
V
 
K
A
 
D
A
 
A
D
 
E
F
 
Y
R
 
R
A
 
G
R
 
P
-
 
Q
-
 
D
-
 
L
H
 
N
G
 
G
R
 
K
R
 
R
L
 
-
A
 
-
I
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
T
Y
 
Y
W
 
P
R
 
Q
L
 
L
T
 
L
Q
 
K
Q
 
A
F
 
Y
F
 
M
S
 
D
G
 
-
S
 
R
H
 
Q
G
 
G
I
 
V
Q
 
D
L
 
F
Y
 
S
R
 
T
I
 
C
V
 
M
E
 
L
S
 
T
L
 
-
G
|
G
A
x
S
T
 
V
E
|
E
G
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
R
S
 
A
G
 
G
S
 
L
A
 
A
D
 
D
I
 
A
I
 
I
V
 
A
D
 
D
I
x
L
T
 
V
S
|
S
T
|
T
G
|
G
S
x
A
T
|
T
L
 
L
K
 
E
A
 
A
N
 
N
H
 
G
L
 
L
K
 
K
I
 
E
L
 
V
S
 
E
D
 
-
G
 
-
V
 
V
I
 
I
L
 
F
R
 
E
S
 
S
E
 
K
A
 
A
C
 
T
L
 
L
V
 
I
R
 
-
A
 
-
R
 
Q
K
 
R
P
 
P
-
 
G
-
 
A
-
 
F
A
 
A
H
 
A
D
 
D
G
 
K
Y
 
A
P
 
A
M
 
L
I
 
I
D
 
D
R
 
K
I
 
L
I
 
L
S
 
T
S
 
R
V
 
M
R
 
H
S
 
G
V
 
V

6fcyA Catalytic subunit hisg from psychrobacter arcticus atp phosphoribosyltransferase (hiszg atpprt) in complex with prpp and adp
30% identity, 83% coverage: 1:192/231 of query aligns to 2:170/208 of 6fcyA

query
sites
6fcyA
M
 
L
T
 
G
I
 
L
T
 
T
I
 
L
A
 
A
L
 
L
P
 
-
S
 
S
K
 
K
G
 
G
R
|
R
M
 
I
K
 
L
D
 
E
D
 
E
A
 
T
S
 
M
A
 
P
I
 
L
F
 
L
E
 
R
R
 
A
A
 
A
G
 
G
M
 
V
K
 
E
I
 
L
V
 
L
A
 
E
V
 
-
G
 
-
N
 
D
D
 
P
R
 
E
S
 
A
Y
 
S
R
 
R
G
 
K
R
 
L
V
 
I
-
 
F
-
 
P
E
 
T
G
 
S
W
 
N
D
 
P
D
 
N
V
 
V
E
 
R
V
 
V
A
 
L
F
 
I
L
 
L
S
 
R
A
 
A
S
 
S
E
 
D
I
 
V
S
 
P
R
 
T
E
 
Y
V
 
V
G
 
E
S
 
H
G
 
G
A
 
A
V
 
A
D
 
D
F
 
F
G
 
G
V
 
V
T
 
A
G
 
G
E
 
K
D
|
D
L
 
V
V
 
L
R
 
-
E
 
-
G
 
-
I
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
V
 
L
E
 
E
F
 
H
A
 
G
A
 
A
R
 
N
L
 
H
G
 
V
F
 
Y
G
 
E
H
 
L
A
 
L
D
 
D
V
 
L
V
 
K
V
 
I
A
|
A
V
 
Q
P
x
C
E
 
K
V
 
L
W
 
M
Y
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
T
 
-
M
 
T
A
 
A
D
 
G
L
 
V
G
 
K
D
 
D
V
 
A
A
 
P
A
 
L
D
 
P
F
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
H
 
-
G
 
N
R
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
R
I
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
K
Y
 
Y
W
 
V
R
 
N
L
 
V
T
 
A
Q
 
R
Q
 
A
F
 
Y
F
 
F
S
 
A
G
 
-
S
 
S
H
 
Q
G
 
G
I
 
Q
Q
 
Q
L
 
V
Y
 
-
R
 
D
I
 
V
V
 
I
E
 
K
S
 
L
L
 
Y
G
 
G
A
 
S
T
 
M
E
 
E
G
 
L
A
 
A
P
 
P
A
 
L
S
 
V
G
 
G
S
 
L
A
 
G
D
 
D
I
 
L
I
 
I
V
 
V
D
 
D
I
x
V
T
 
V
S
x
D
T
|
T
G
|
G
S
 
N
T
|
T
L
 
L
K
 
R
A
 
A
N
 
N
H
 
G
L
 
L
K
 
E

6fd9A Catalytic subunit hisg from psychrobacter arcticus atp phosphoribosyltransferase (hiszg atpprt) in complex with amp
30% identity, 83% coverage: 1:192/231 of query aligns to 2:170/209 of 6fd9A

query
sites
6fd9A
M
 
L
T
 
G
I
 
L
T
 
T
I
 
L
A
 
A
L
 
L
P
 
-
S
 
S
K
 
K
G
 
G
R
|
R
M
 
I
K
 
L
D
 
E
D
 
E
A
 
T
S
 
M
A
 
P
I
 
L
F
 
L
E
 
R
R
 
A
A
 
A
G
 
G
M
 
V
K
 
E
I
 
L
V
 
L
A
 
E
V
 
-
G
 
-
N
 
D
D
 
P
R
 
E
S
 
A
Y
 
S
R
 
R
G
 
K
R
 
L
V
 
I
-
 
F
-
 
P
E
 
T
G
 
S
W
 
N
D
 
P
D
 
N
V
 
V
E
 
R
V
 
V
A
 
L
F
 
I
L
 
L
S
 
R
A
 
A
S
 
S
E
 
D
I
 
V
S
 
P
R
 
T
E
 
Y
V
 
V
G
 
E
S
 
H
G
 
G
A
 
A
V
 
A
D
 
D
F
 
F
G
 
G
V
 
V
T
 
A
G
 
G
E
 
K
D
 
D
L
 
V
V
 
L
R
 
-
E
 
-
G
 
-
I
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
V
 
L
E
 
E
F
 
H
A
 
G
A
 
A
R
 
N
L
 
H
G
 
V
F
 
Y
G
 
E
H
 
L
A
 
L
D
 
D
V
 
L
V
 
K
V
 
I
A
|
A
V
 
Q
P
x
C
E
 
K
V
 
L
W
 
M
Y
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
T
 
-
M
 
T
A
 
A
D
 
G
L
 
V
G
 
K
D
 
D
V
 
A
A
 
P
A
 
L
D
 
P
F
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
H
 
-
G
 
N
R
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
R
I
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
K
Y
 
Y
W
 
V
R
 
N
L
 
V
T
 
A
Q
 
R
Q
 
A
F
 
Y
F
 
F
S
 
A
G
 
-
S
 
S
H
 
Q
G
 
G
I
 
Q
Q
 
Q
L
 
V
Y
 
-
R
 
D
I
 
V
V
 
I
E
 
K
S
 
L
L
 
Y
G
 
G
A
 
S
T
 
M
E
 
E
G
 
L
A
 
A
P
 
P
A
 
L
S
 
V
G
 
G
S
 
L
A
 
G
D
 
D
I
 
L
I
 
I
V
 
V
D
 
D
I
x
V
T
x
V
S
x
D
T
|
T
G
 
G
S
 
N
T
|
T
L
 
L
K
 
R
A
 
A
N
 
N
H
 
G
L
 
L
K
 
E

6fcwA Catalytic subunit hisg from psychrobacter arcticus atp phosphoribosyltransferase (hiszg atpprt) in complex with pratp
30% identity, 83% coverage: 1:192/231 of query aligns to 2:170/209 of 6fcwA

query
sites
6fcwA
M
 
L
T
 
G
I
 
L
T
 
T
I
 
L
A
 
A
L
 
L
P
 
-
S
 
S
K
 
K
G
 
G
R
|
R
M
x
I
K
 
L
D
 
E
D
 
E
A
 
T
S
 
M
A
 
P
I
 
L
F
 
L
E
 
R
R
 
A
A
 
A
G
 
G
M
 
V
K
 
E
I
 
L
V
 
L
A
 
E
V
 
-
G
 
-
N
 
D
D
 
P
R
 
E
S
 
A
Y
 
S
R
 
R
G
 
K
R
 
L
V
 
I
-
 
F
-
 
P
E
 
T
G
 
S
W
 
N
D
 
P
D
 
N
V
 
V
E
 
R
V
 
V
A
 
L
F
 
I
L
 
L
S
 
R
A
 
A
S
 
S
E
 
D
I
 
V
S
 
P
R
 
T
E
 
Y
V
 
V
G
 
E
S
 
H
G
 
G
A
 
A
V
 
A
D
 
D
F
 
F
G
 
G
V
 
V
T
 
A
G
 
G
E
 
K
D
|
D
L
 
V
V
 
L
R
 
-
E
 
-
G
 
-
I
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
V
 
L
E
 
E
F
 
H
A
 
G
A
 
A
R
 
N
L
 
H
G
 
V
F
 
Y
G
 
E
H
 
L
A
 
L
D
 
D
V
 
L
V
 
K
V
 
I
A
 
A
V
 
Q
P
x
C
E
 
K
V
 
L
W
 
M
Y
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
T
 
-
M
 
T
A
 
A
D
 
G
L
 
V
G
 
K
D
 
D
V
 
A
A
 
P
A
 
L
D
 
P
F
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
H
 
-
G
 
N
R
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
R
I
 
I
A
 
A
T
 
T
K
|
K
Y
 
Y
W
 
V
R
 
N
L
 
V
T
 
A
Q
 
R
Q
 
A
F
 
Y
F
 
F
S
 
A
G
 
-
S
 
S
H
 
Q
G
 
G
I
 
Q
Q
 
Q
L
 
V
Y
 
-
R
 
D
I
 
V
V
 
I
E
 
K
S
 
L
L
 
Y
G
 
G
A
 
S
T
 
M
E
 
E
G
 
L
A
 
A
P
 
P
A
 
L
S
 
V
G
 
G
S
 
L
A
 
G
D
 
D
I
 
L
I
 
I
V
 
V
D
|
D
I
x
V
T
 
V
S
x
D
T
|
T
G
|
G
S
 
N
T
|
T
L
 
L
K
 
R
A
 
A
N
 
N
H
 
G
L
 
L
K
 
E

6fctA Catalytic subunit hisg from psychrobacter arcticus atp phosphoribosyltransferase (hiszg atpprt) in complex with prpp and atp
30% identity, 83% coverage: 1:192/231 of query aligns to 2:170/209 of 6fctA

query
sites
6fctA
M
 
L
T
 
G
I
 
L
T
 
T
I
 
L
A
 
A
L
 
L
P
 
-
S
 
S
K
 
K
G
 
G
R
|
R
M
 
I
K
 
L
D
 
E
D
 
E
A
 
T
S
 
M
A
 
P
I
 
L
F
 
L
E
 
R
R
 
A
A
 
A
G
 
G
M
 
V
K
 
E
I
 
L
V
 
L
A
 
E
V
 
-
G
 
-
N
 
D
D
 
P
R
 
E
S
 
A
Y
 
S
R
 
R
G
 
K
R
 
L
V
 
I
-
 
F
-
 
P
E
 
T
G
 
S
W
 
N
D
 
P
D
 
N
V
 
V
E
 
R
V
 
V
A
 
L
F
 
I
L
 
L
S
 
R
A
 
A
S
 
S
E
 
D
I
 
V
S
 
P
R
 
T
E
 
Y
V
 
V
G
 
E
S
 
H
G
 
G
A
 
A
V
 
A
D
 
D
F
 
F
G
 
G
V
 
V
T
 
A
G
 
G
E
 
K
D
|
D
L
 
V
V
 
L
R
 
-
E
 
-
G
 
-
I
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
V
 
L
E
 
E
F
 
H
A
 
G
A
 
A
R
 
N
L
 
H
G
 
V
F
 
Y
G
 
E
H
 
L
A
 
L
D
 
D
V
 
L
V
 
K
V
 
I
A
|
A
V
 
Q
P
x
C
E
 
K
V
 
L
W
 
M
Y
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
T
 
-
M
 
T
A
 
A
D
 
G
L
 
V
G
 
K
D
 
D
V
 
A
A
 
P
A
 
L
D
 
P
F
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
H
 
-
G
 
N
R
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
R
I
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
K
Y
 
Y
W
 
V
R
 
N
L
 
V
T
 
A
Q
 
R
Q
 
A
F
 
Y
F
 
F
S
 
A
G
 
-
S
 
S
H
 
Q
G
 
G
I
 
Q
Q
 
Q
L
 
V
Y
 
-
R
 
D
I
 
V
V
 
I
E
 
K
S
 
L
L
 
Y
G
 
G
A
 
S
T
 
M
E
 
E
G
 
L
A
 
A
P
 
P
A
 
L
S
 
V
G
 
G
S
 
L
A
 
G
D
 
D
I
 
L
I
 
I
V
 
V
D
 
D
I
x
V
T
x
V
S
x
D
T
|
T
G
|
G
S
 
N
T
|
T
L
 
L
K
 
R
A
 
A
N
 
N
H
 
G
L
 
L
K
 
E

6fcaA Catalytic subunit hisg from psychrobacter arcticus atp phosphoribosyltransferase (hiszg atpprt) in complex with prpp
30% identity, 83% coverage: 1:192/231 of query aligns to 2:170/209 of 6fcaA

query
sites
6fcaA
M
 
L
T
 
G
I
 
L
T
 
T
I
 
L
A
 
A
L
 
L
P
 
-
S
 
S
K
 
K
G
 
G
R
 
R
M
 
I
K
 
L
D
 
E
D
 
E
A
 
T
S
 
M
A
 
P
I
 
L
F
 
L
E
 
R
R
 
A
A
 
A
G
 
G
M
 
V
K
 
E
I
 
L
V
 
L
A
 
E
V
 
-
G
 
-
N
 
D
D
 
P
R
 
E
S
 
A
Y
 
S
R
 
R
G
 
K
R
 
L
V
 
I
-
 
F
-
 
P
E
 
T
G
 
S
W
 
N
D
 
P
D
 
N
V
 
V
E
 
R
V
 
V
A
 
L
F
 
I
L
 
L
S
 
R
A
 
A
S
 
S
E
 
D
I
 
V
S
 
P
R
 
T
E
 
Y
V
 
V
G
 
E
S
 
H
G
 
G
A
 
A
V
 
A
D
 
D
F
 
F
G
 
G
V
 
V
T
 
A
G
 
G
E
 
K
D
 
D
L
 
V
V
 
L
R
 
-
E
 
-
G
 
-
I
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
V
 
L
E
 
E
F
 
H
A
 
G
A
 
A
R
 
N
L
 
H
G
 
V
F
 
Y
G
 
E
H
 
L
A
 
L
D
 
D
V
 
L
V
 
K
V
 
I
A
 
A
V
 
Q
P
 
C
E
 
K
V
 
L
W
 
M
Y
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
T
 
-
M
 
T
A
 
A
D
 
G
L
 
V
G
 
K
D
 
D
V
 
A
A
 
P
A
 
L
D
 
P
F
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
H
 
-
G
 
N
R
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
R
I
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
K
Y
 
Y
W
 
V
R
 
N
L
 
V
T
 
A
Q
 
R
Q
 
A
F
 
Y
F
 
F
S
 
A
G
 
-
S
 
S
H
 
Q
G
 
G
I
 
Q
Q
 
Q
L
 
V
Y
 
-
R
 
D
I
 
V
V
 
I
E
 
K
S
 
L
L
 
Y
G
 
G
A
 
S
T
 
M
E
 
E
G
 
L
A
 
A
P
 
P
A
 
L
S
 
V
G
 
G
S
 
L
A
 
G
D
 
D
I
 
L
I
 
I
V
 
V
D
|
D
I
x
V
T
x
V
S
x
D
T
|
T
G
|
G
S
 
N
T
|
T
L
 
L
K
 
R
A
 
A
N
 
N
H
 
G
L
 
L
K
 
E

1z7nF Atp phosphoribosyl transferase (hiszg atp-prtase) from lactococcus lactis with bound prpp substrate (see paper)
28% identity, 84% coverage: 3:195/231 of query aligns to 2:172/205 of 1z7nF

query
sites
1z7nF
I
 
I
T
 
K
I
 
I
A
 
A
L
 
I
P
 
-
S
 
T
K
 
K
G
 
G
R
 
R
M
 
I
K
 
Q
D
 
K
D
 
Q
A
 
V
S
 
T
A
 
K
I
 
L
F
 
L
E
 
E
R
 
N
A
 
A
G
 
D
M
 
Y
K
 
D
I
 
V
V
 
E
A
 
P
V
 
I
G
 
L
N
 
N
D
 
-
R
 
L
S
 
G
Y
 
R
R
 
E
G
 
L
R
 
Q
V
 
I
E
 
K
G
 
T
W
 
K
D
 
D
D
 
D
V
 
L
E
 
Q
V
 
I
A
 
I
F
 
F
L
 
G
S
 
K
A
 
P
S
 
N
E
 
D
I
 
V
S
 
I
R
 
T
E
 
F
V
 
L
G
 
E
S
 
H
G
 
G
A
 
I
V
 
V
D
 
D
F
 
I
G
 
G
V
 
F
T
 
V
G
 
G
E
 
K
D
 
D
L
 
T
V
 
L
R
 
D
E
 
E
G
 
N
I
 
-
A
 
-
D
 
D
V
 
F
D
 
D
A
 
D
R
 
Y
V
 
Y
E
 
E
F
 
L
A
 
L
A
 
Y
R
 
-
L
 
L
G
 
K
F
 
I
G
 
G
H
 
Q
A
 
C
D
 
-
V
 
-
V
 
-
V
 
-
A
 
-
V
 
-
P
 
-
E
 
-
V
 
-
W
 
-
Y
 
-
D
 
-
V
 
I
D
 
F
T
 
A
M
 
L
A
 
A
D
 
S
L
 
Y
G
 
P
D
 
D
V
 
F
A
 
S
A
 
N
D
 
K
F
 
N
R
 
F
A
 
Q
R
 
R
H
 
H
G
 
K
R
 
R
R
 
-
L
 
-
A
 
-
I
 
I
A
 
A
T
 
S
K
 
K
Y
 
Y
W
 
P
R
 
R
L
 
V
T
 
T
Q
 
K
Q
 
K
F
 
Y
F
 
F
S
 
A
G
 
Q
S
 
K
H
 
Q
G
 
-
I
 
-
Q
 
E
L
 
D
Y
 
I
R
 
E
I
 
I
V
 
I
E
 
K
S
 
L
L
 
E
G
|
G
A
x
S
T
 
V
E
 
E
G
 
L
A
 
G
P
 
P
A
 
V
S
 
V
G
 
G
S
 
L
A
 
A
D
 
D
I
 
A
I
 
I
V
 
V
D
|
D
I
 
I
T
x
V
S
x
E
T
|
T
G
|
G
S
 
N
T
|
T
L
 
L
K
 
S
A
 
A
N
 
N
H
 
G
L
 
L
K
 
E
I
 
V
L
 
I
S
 
E

1nh8A Atp phosphoribosyltransferase (atp-prtase) from mycobacterium tuberculosis in complex with amp and histidine (see paper)
31% identity, 89% coverage: 3:207/231 of query aligns to 2:182/276 of 1nh8A

query
sites
1nh8A
I
 
L
T
 
R
I
 
V
A
 
A
L
 
V
P
 
P
S
 
N
K
 
K
G
 
G
R
 
A
M
 
L
K
 
S
D
 
E
D
 
P
A
 
A
S
 
T
A
 
E
I
 
I
F
 
L
E
 
A
R
 
E
A
 
A
G
 
G
M
 
Y
K
 
R
I
 
R
V
 
R
A
 
T
V
 
D
G
 
S
N
 
K
D
 
D
R
 
L
S
 
T
Y
 
V
R
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
I
E
 
D
G
 
P
W
 
V
D
 
N
D
 
N
V
 
V
E
 
E
V
 
F
A
 
F
F
 
F
L
 
L
S
 
R
A
 
P
S
 
K
E
 
D
I
 
I
S
 
A
R
 
I
E
 
Y
V
 
V
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
E
V
 
L
D
 
D
F
 
F
G
 
G
V
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
R
D
 
D
L
 
L
V
 
V
R
 
C
E
 
D
G
 
S
I
 
G
A
 
A
D
 
Q
V
 
V
D
 
R
A
 
E
R
 
R
V
 
L
E
 
A
F
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
L
G
 
G
F
 
F
G
 
G
H
 
S
A
 
S
D
 
S
V
 
F
V
 
R
V
 
Y
A
 
A
V
 
A
P
 
P
-
 
A
-
 
G
E
 
R
V
 
N
W
 
W
Y
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
T
 
T
M
 
T
A
 
A
D
 
D
L
 
L
G
 
A
D
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
-
F
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
H
 
-
G
 
G
R
 
M
R
 
R
L
 
-
A
 
-
I
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
A
Y
 
Y
W
 
P
R
 
N
L
 
L
T
 
V
Q
 
R
Q
 
K
F
 
D
F
 
L
S
 
A
G
 
-
S
 
T
H
 
K
G
 
G
I
 
I
Q
 
E
L
 
-
Y
 
A
R
 
T
I
 
V
V
 
I
E
 
R
S
 
L
L
 
D
G
 
G
A
 
A
T
 
V
E
 
E
G
 
I
A
 
S
P
 
V
A
 
Q
S
 
L
G
 
G
S
 
V
A
 
A
D
 
D
I
 
A
I
 
I
V
 
A
D
 
D
I
x
V
T
 
V
S
x
G
T
x
S
G
|
G
S
x
R
T
|
T
L
 
L
K
 
S
A
 
Q
N
 
H
H
 
D
L
 
L
K
 
V
I
 
A
L
 
F
S
 
G
D
 
E
G
 
P
V
 
-
I
 
L
L
 
C
R
 
D
S
 
S
E
 
E
A
 
A
C
 
V
L
 
L
V
 
I

Sites not aligning to the query:

1z7mE Atp phosphoribosyl transferase (hiszg atp-prtase) from lactococcus lactis (see paper)
27% identity, 84% coverage: 3:195/231 of query aligns to 2:168/200 of 1z7mE

query
sites
1z7mE
I
 
I
T
 
K
I
 
I
A
 
A
L
 
I
P
 
-
S
 
T
K
 
K
G
 
G
R
 
R
M
 
I
K
 
Q
D
 
K
D
 
Q
A
 
V
S
 
T
A
 
K
I
 
L
F
 
L
E
 
E
R
 
N
A
 
A
G
 
D
M
 
Y
K
 
D
I
 
V
V
 
E
A
 
P
V
 
I
G
 
R
N
 
-
D
 
-
R
 
-
S
 
-
Y
 
-
R
 
E
G
 
L
R
 
Q
V
 
I
E
 
K
G
 
T
W
 
K
D
 
D
D
 
D
V
 
L
E
 
Q
V
 
I
A
 
I
F
 
F
L
 
G
S
 
K
A
 
P
S
 
N
E
 
D
I
 
V
S
 
I
R
 
T
E
 
F
V
 
L
G
 
E
S
 
H
G
 
G
A
 
I
V
 
V
D
 
D
F
 
I
G
 
G
V
 
F
T
 
V
G
 
G
E
 
K
D
 
D
L
 
T
V
 
L
R
 
D
E
 
E
G
 
N
I
 
-
A
 
-
D
 
D
V
 
F
D
 
D
A
 
D
R
 
Y
V
 
Y
E
 
E
F
 
L
A
 
L
A
 
Y
R
 
-
L
 
L
G
 
K
F
 
I
G
 
G
H
 
Q
A
 
C
D
 
-
V
 
-
V
 
-
V
 
-
A
 
-
V
 
-
P
 
-
E
 
-
V
 
-
W
 
-
Y
 
-
D
 
-
V
 
I
D
 
F
T
 
A
M
 
L
A
 
A
D
 
S
L
 
Y
G
 
P
D
 
D
V
 
F
A
 
S
A
 
N
D
 
K
F
 
N
R
 
F
A
 
Q
R
 
R
H
 
H
G
 
K
R
 
R
R
 
-
L
 
-
A
 
-
I
 
I
A
 
A
T
 
S
K
 
K
Y
 
Y
W
 
P
R
 
R
L
 
V
T
 
T
Q
 
K
Q
 
K
F
 
Y
F
 
F
S
 
A
G
 
Q
S
 
K
H
 
Q
G
 
-
I
 
-
Q
 
E
L
 
D
Y
 
I
R
 
E
I
 
I
V
 
I
E
 
K
S
 
L
L
 
E
G
 
G
A
 
S
T
 
V
E
 
E
G
 
L
A
 
G
P
 
P
A
 
V
S
 
V
G
 
G
S
 
L
A
 
A
D
 
D
I
 
A
I
 
I
V
 
V
D
 
D
I
 
I
T
 
V
S
x
E
T
|
T
G
|
G
S
 
N
T
|
T
L
 
L
K
 
S
A
 
A
N
 
N
H
 
G
L
 
L
K
 
E
I
 
V
L
 
I
S
 
E

5ubgA Catalytic core domain of adenosine triphosphate phosphoribosyltransferase from campylobacter jejuni with bound phosphoribosyl-atp (see paper)
29% identity, 73% coverage: 64:231/231 of query aligns to 62:218/222 of 5ubgA

query
sites
5ubgA
G
 
G
A
 
V
V
 
V
D
 
D
F
 
L
G
 
G
V
 
I
T
 
I
G
 
G
E
 
E
D
x
N
L
 
V
V
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
N
-
 
E
-
 
L
-
 
E
R
 
R
E
 
Q
G
 
S
I
 
L
A
 
G
D
 
E
V
 
-
D
 
N
A
 
P
R
 
S
V
 
Y
E
 
K
F
 
L
A
 
L
A
 
K
R
 
K
L
 
L
G
 
D
F
 
F
G
 
G
H
 
Y
A
x
C
D
 
R
V
 
L
V
 
S
V
 
L
A
 
A
V
 
L
P
 
P
E
 
Q
V
 
E
W
 
-
Y
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
N
T
 
K
M
 
F
A
 
Q
D
 
N
L
 
L
G
 
K
D
 
D
V
 
F
A
 
E
A
 
G
D
 
-
F
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
H
 
-
G
 
-
R
 
-
R
 
-
L
 
L
A
 
R
I
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
S
Y
 
Y
W
 
P
R
 
Q
L
 
L
T
 
L
Q
 
K
Q
 
R
F
 
F
F
 
M
S
 
K
G
 
-
S
 
E
H
 
N
G
 
G
I
 
I
Q
 
N
L
 
-
Y
 
Y
R
 
K
I
 
N
V
 
C
E
 
T
S
 
L
L
 
T
G
 
G
A
 
S
T
 
V
E
 
E
G
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
R
S
 
A
G
 
N
S
 
L
A
 
A
D
 
D
I
 
A
I
 
I
V
 
C
D
 
D
I
x
L
T
 
V
S
|
S
T
x
S
G
|
G
S
x
A
T
|
T
L
 
L
K
 
Q
A
 
A
N
 
N
H
 
N
L
 
L
K
 
K
I
 
E
L
 
V
S
 
K
D
 
-
G
 
-
V
 
V
I
 
I
L
 
Y
R
 
E
S
 
S
E
 
R
A
 
A
C
 
C
L
 
L
V
 
I
R
 
Q
A
 
K
R
 
E
K
 
N
P
 
A
-
 
L
A
 
S
H
 
K
D
 
E
G
 
K
Y
 
Q
P
 
A
M
 
L
I
 
V
D
 
D
R
 
K
I
 
I
I
 
M
S
 
L
S
 
R
V
 
V
R
 
A
S
 
G
V
 
V
L
 
M

Sites not aligning to the query:

5ubiA Catalytic core domain of adenosine triphosphate phosphoribosyltransferase from campylobacter jejuni with bound prpp (see paper)
29% identity, 73% coverage: 64:231/231 of query aligns to 62:218/218 of 5ubiA

query
sites
5ubiA
G
 
G
A
 
V
V
 
V
D
 
D
F
 
L
G
 
G
V
 
I
T
 
I
G
 
G
E
 
E
D
 
N
L
 
V
V
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
N
-
 
E
-
 
L
-
 
E
R
 
R
E
 
Q
G
 
S
I
 
L
A
 
G
D
 
E
V
 
-
D
 
N
A
 
P
R
 
S
V
 
Y
E
 
K
F
 
L
A
 
L
A
 
K
R
 
K
L
 
L
G
 
D
F
 
F
G
 
G
H
 
Y
A
 
C
D
 
R
V
 
L
V
 
S
V
 
L
A
 
A
V
 
L
P
 
P
E
 
Q
V
 
E
W
 
-
Y
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
N
T
 
K
M
 
F
A
 
Q
D
 
N
L
 
L
G
 
K
D
 
D
V
 
F
A
 
E
A
 
G
D
 
-
F
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
H
 
-
G
 
-
R
 
-
R
 
-
L
 
L
A
 
R
I
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
S
Y
 
Y
W
 
P
R
 
Q
L
 
L
T
 
L
Q
 
K
Q
 
R
F
 
F
F
 
M
S
 
K
G
 
-
S
 
E
H
 
N
G
 
G
I
 
I
Q
 
N
L
 
-
Y
 
Y
R
 
K
I
 
N
V
 
C
E
 
T
S
 
L
L
 
T
G
 
G
A
 
S
T
 
V
E
 
E
G
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
R
S
 
A
G
 
N
S
 
L
A
 
A
D
 
D
I
 
A
I
 
I
V
 
C
D
 
D
I
x
L
T
x
V
S
|
S
T
x
S
G
|
G
S
 
A
T
|
T
L
 
L
K
 
Q
A
 
A
N
 
N
H
 
N
L
 
L
K
 
K
I
 
E
L
 
V
S
 
K
D
 
-
G
 
-
V
 
V
I
 
I
L
 
Y
R
 
E
S
 
S
E
 
R
A
 
A
C
 
C
L
 
L
V
 
I
R
 
Q
A
 
K
R
 
E
K
 
N
P
 
A
-
 
L
A
 
S
H
 
K
D
 
E
G
 
K
Y
 
Q
P
 
A
M
 
L
I
 
V
D
 
D
R
 
K
I
 
I
I
 
M
S
 
L
S
 
R
V
 
V
R
 
A
S
 
G
V
 
V
L
 
M

Sites not aligning to the query:

5ub9A Catalytic core domain of adenosine triphosphate phosphoribosyltransferase from campylobacter jejuni (see paper)
28% identity, 73% coverage: 64:231/231 of query aligns to 61:216/220 of 5ub9A

query
sites
5ub9A
G
 
G
A
 
V
V
 
V
D
 
D
F
 
L
G
 
G
V
 
I
T
 
I
G
 
G
E
 
E
D
 
N
L
 
V
V
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
N
-
 
E
-
 
L
-
 
E
R
 
R
E
 
Q
G
 
S
I
 
L
A
 
G
D
 
E
V
 
-
D
 
N
A
 
P
R
 
S
V
 
Y
E
 
K
F
 
L
A
 
L
A
 
K
R
 
K
L
 
L
G
 
D
F
 
F
G
 
G
H
 
Y
A
 
C
D
 
R
V
 
L
V
 
S
V
 
L
A
 
A
V
 
L
P
 
P
E
 
Q
V
 
-
W
 
-
Y
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
T
 
-
M
 
-
A
 
-
D
 
-
L
 
-
G
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
E
A
 
N
D
 
K
F
 
F
R
 
N
A
 
L
R
 
K
H
 
D
G
 
F
R
 
E
R
 
G
L
 
L
A
 
R
I
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
S
Y
 
Y
W
 
P
R
 
Q
L
 
L
T
 
L
Q
 
K
Q
 
R
F
 
F
F
 
M
S
 
K
G
 
-
S
 
E
H
 
N
G
 
G
I
 
I
Q
 
N
L
 
-
Y
 
Y
R
 
K
I
 
N
V
 
C
E
 
T
S
 
L
L
 
T
G
 
G
A
 
S
T
 
V
E
 
E
G
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
R
S
 
A
G
 
N
S
 
L
A
 
A
D
 
D
I
 
A
I
 
I
V
 
C
D
 
D
I
 
L
T
 
V
S
 
S
T
 
S
G
 
G
S
 
A
T
 
T
L
 
L
K
 
Q
A
 
A
N
 
N
H
 
N
L
 
L
K
 
K
I
 
E
L
 
V
S
 
K
D
 
-
G
 
-
V
 
V
I
 
I
L
 
Y
R
 
E
S
 
S
E
 
R
A
 
A
C
 
C
L
 
L
V
 
I
R
 
Q
A
 
K
R
 
E
K
 
N
P
 
A
-
 
L
A
 
S
H
 
K
D
 
E
G
 
K
Y
 
Q
P
 
A
M
 
L
I
 
V
D
 
D
R
 
K
I
 
I
I
 
M
S
 
L
S
 
R
V
 
V
R
 
A
S
 
G
V
 
V
L
 
M

Sites not aligning to the query:

4yb7C Adenosine triphosphate phosphoribosyltransferase from campylobacter jejuni in complex with atp (see paper)
29% identity, 73% coverage: 64:231/231 of query aligns to 62:218/294 of 4yb7C

query
sites
4yb7C
G
 
G
A
 
V
V
 
V
D
 
D
F
 
L
G
 
G
V
 
I
T
 
I
G
 
G
E
 
E
D
x
N
L
 
V
V
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
N
-
 
E
-
 
L
-
 
E
R
 
R
E
 
Q
G
 
S
I
 
L
A
 
G
D
 
E
V
 
-
D
 
N
A
 
P
R
 
S
V
 
Y
E
 
K
F
 
L
A
 
L
A
 
K
R
 
K
L
 
L
G
 
D
F
 
F
G
 
G
H
 
Y
A
x
C
D
 
R
V
 
L
V
 
S
V
 
L
A
 
A
V
 
L
P
 
P
E
 
Q
V
 
E
W
 
-
Y
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
N
T
 
K
M
 
F
A
 
Q
D
 
N
L
 
L
G
 
K
D
 
D
V
 
F
A
 
E
A
 
G
D
 
-
F
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
H
 
-
G
 
-
R
 
-
R
 
-
L
 
L
A
 
R
I
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
S
Y
 
Y
W
 
P
R
 
Q
L
 
L
T
 
L
Q
 
K
Q
 
R
F
 
F
F
 
M
S
 
K
G
 
-
S
 
E
H
 
N
G
 
G
I
 
I
Q
 
N
L
 
-
Y
 
Y
R
 
K
I
 
N
V
 
C
E
 
T
S
 
L
L
 
T
G
 
G
A
 
S
T
 
V
E
 
E
G
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
R
S
 
A
G
 
N
S
 
L
A
 
A
D
 
D
I
 
A
I
 
I
V
 
C
D
 
D
I
x
L
T
x
V
S
|
S
T
x
S
G
|
G
S
 
A
T
|
T
L
 
L
K
 
Q
A
 
A
N
 
N
H
 
N
L
 
L
K
 
K
I
 
E
L
 
V
S
 
K
D
 
-
G
 
-
V
 
V
I
 
I
L
 
Y
R
 
E
S
 
S
E
 
R
A
 
A
C
 
C
L
 
L
V
 
I
R
 
Q
A
 
K
R
 
E
K
 
N
P
 
A
-
 
L
A
 
S
H
 
K
D
 
E
G
 
K
Y
 
Q
P
 
A
M
 
L
I
 
V
D
 
D
R
 
K
I
 
I
I
 
M
S
 
L
S
 
R
V
 
V
R
 
A
S
 
G
V
 
V
L
 
M

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_012706984.1 NCBI__GCF_000018545.1:WP_012706984.1
MTITIALPSKGRMKDDASAIFERAGMKIVAVGNDRSYRGRVEGWDDVEVAFLSASEISRE
VGSGAVDFGVTGEDLVREGIADVDARVEFAARLGFGHADVVVAVPEVWYDVDTMADLGDV
AADFRARHGRRLAIATKYWRLTQQFFSGSHGIQLYRIVESLGATEGAPASGSADIIVDIT
STGSTLKANHLKILSDGVILRSEACLVRARKPAHDGYPMIDRIISSVRSVL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory