SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012708601.1 NCBI__GCF_000018545.1:WP_012708601.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 16 hits to proteins with known functional sites (download)

8f9xA Cyclase-phosphotriesterase from ruegeria pomeroyi dss-3
67% identity, 84% coverage: 45:273/273 of query aligns to 2:230/230 of 8f9xA

query
sites
8f9xA
A
 
A
G
 
G
H
 
I
A
 
G
G
 
E
V
 
V
T
 
R
D
 
D
L
 
M
T
 
T
H
 
H
E
 
V
L
 
Y
H
 
D
E
 
A
E
 
D
F
 
F
P
 
P
T
 
T
F
 
Y
F
 
F
G
 
G
Q
 
A
Q
 
P
Q
 
G
F
 
I
F
 
E
R
 
A
E
 
V
Q
 
Q
K
 
N
F
 
F
N
 
N
F
 
F
A
 
K
E
 
E
H
 
H
T
 
G
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
F
E
 
T
L
 
L
R
 
T
V
 
L
N
 
N
E
 
E
H
|
H
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
|
H
V
 
V
D
|
D
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
 
H
F
 
F
S
 
S
A
 
A
D
 
D
G
 
G
L
 
Q
S
 
S
V
 
V
A
 
D
E
 
E
L
 
I
P
 
P
V
 
V
E
 
G
K
 
N
L
 
L
V
 
V
V
 
C
P
 
P
L
 
L
C
 
C
V
 
V
V
 
V
D
x
H
I
 
I
R
x
H
E
 
E
R
 
K
A
 
A
S
 
A
A
 
A
D
 
D
P
 
A
D
 
D
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
T
 
T
P
 
P
D
 
D
D
 
D
I
 
L
K
 
K
A
 
A
W
 
W
I
 
I
A
 
S
A
 
A
N
 
H
G
 
G
D
 
P
I
 
I
P
 
P
E
 
D
N
 
G
A
 
A
C
 
C
V
 
V
A
 
A
M
 
M
L
 
H
S
 
S
G
 
G
W
 
W
A
 
A
E
 
G
H
 
K
I
 
T
G
 
G
T
 
G
D
 
A
K
 
G
F
 
Y
R
 
R
N
 
N
A
 
A
D
 
D
S
 
S
A
 
E
G
 
G
K
 
K
L
 
M
H
 
H
F
 
F
P
 
P
G
 
G
F
 
F
H
 
H
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
A
K
 
Q
Y
 
M
L
 
L
L
 
I
E
 
E
E
 
E
T
 
T
K
 
G
T
 
A
A
 
V
G
 
A
I
 
M
A
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
T
L
 
L
S
 
S
L
 
L
D
 
D
H
 
H
G
 
G
I
 
P
S
 
S
P
 
A
D
 
D
F
 
F
A
 
A
T
 
T
H
|
H
R
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
P
 
P
E
 
T
G
 
N
R
 
R
W
 
Y
G
 
G
L
 
I
E
|
E
A
 
N
A
 
L
A
 
A
N
 
N
L
 
L
D
 
D
K
 
K
L
 
V
P
 
P
A
 
A
K
 
S
G
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
L
V
 
I
L
 
V
G
 
G
A
 
A
P
 
P
K
 
N
H
 
H
R
 
R
G
 
G
G
 
G
T
 
S
G
 
G
G
 
G
P
 
P
A
 
A
R
 
R
V
 
I
F
 
F
A
 
A
L
 
M
V
 
V

5nnbA Isatin hydrolase a (iha) from labrenzia aggregata with isatinate bound (see paper)
36% identity, 85% coverage: 41:273/273 of query aligns to 8:254/255 of 5nnbA

query
sites
5nnbA
A
 
S
A
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
S
G
 
G
H
 
A
A
 
V
G
 
R
V
 
I
T
 
V
D
 
D
L
 
L
T
 
T
H
 
H
E
 
T
L
 
L
H
 
D
E
 
P
E
 
D
F
 
F
P
 
P
T
 
V
F
x
I
-
 
V
-
x
L
-
 
P
-
 
P
-
 
E
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
C
Q
 
A
F
 
R
F
 
F
R
 
R
E
 
M
Q
 
E
K
 
E
F
 
I
N
 
S
F
 
A
A
 
Y
E
 
D
H
 
H
-
 
R
-
 
G
-
 
P
T
 
A
F
x
W
N
 
K
L
x
W
F
 
H
E
 
N
L
 
I
R
 
S
V
 
M
N
 
S
E
 
E
H
|
H
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
|
H
V
 
F
D
|
D
A
 
A
P
 
P
L
 
S
H
|
H
F
x
W
-
 
I
-
 
S
-
 
G
-
 
K
S
 
D
A
 
V
D
 
P
G
 
N
L
 
G
S
 
S
V
 
V
A
 
D
E
 
E
L
 
I
P
 
P
V
 
A
E
 
E
K
 
A
L
 
F
V
 
V
V
 
G
P
 
P
L
 
V
C
 
V
V
 
V
V
 
I
D
 
D
I
 
C
R
 
S
E
 
K
R
 
G
A
 
A
S
 
A
A
 
E
D
 
N
P
 
D
D
 
D
A
 
F
Q
 
E
V
 
L
T
 
T
P
 
P
D
 
E
D
 
I
I
 
I
K
 
A
A
 
G
W
 
W
I
 
E
A
 
S
A
 
E
N
 
H
G
 
G
D
 
R
I
 
I
P
 
P
E
 
E
N
 
D
A
 
A
C
 
W
V
 
V
A
 
L
M
 
M
L
 
R
S
 
T
G
 
D
W
 
W
A
 
S
E
 
K
H
 
R
I
 
R
G
 
G
T
 
A
D
 
D
K
 
-
F
 
Y
R
 
L
N
 
N
A
 
M
D
 
R
S
 
A
A
 
D
G
 
G
K
 
P
L
 
-
H
 
H
F
 
S
P
 
P
G
 
G
F
 
P
H
 
T
V
 
P
E
 
E
A
 
A
A
 
I
K
 
R
Y
 
F
L
 
L
L
 
I
E
 
E
E
 
E
T
 
R
K
 
N
T
 
I
A
 
R
G
 
G
I
 
F
A
 
G
V
 
T
D
 
E
T
 
T
L
 
V
S
 
G
L
 
T
D
 
D
H
 
A
G
 
G
-
 
Q
-
 
G
-
 
A
-
 
H
I
 
Y
S
 
V
P
 
P
D
 
P
F
x
Y
A
 
P
T
 
A
H
|
H
R
 
Y
A
 
L
W
 
L
L
 
H
P
 
G
E
 
A
G
 
G
R
 
K
W
 
Y
G
 
G
L
 
L
E
x
Q
A
 
C
A
 
L
A
 
A
N
 
N
L
 
L
D
 
D
K
 
Q
L
 
L
P
 
P
A
 
A
K
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
V
L
 
L
V
 
I
L
 
A
G
 
A
A
 
P
P
 
L
K
 
K
H
 
I
R
 
K
G
 
N
G
 
G
T
 
T
G
 
G
G
 
S
P
 
P
A
 
L
R
 
R
V
 
V
F
 
L
A
 
A
L
 
M
V
 
V

5nnaD Isatin hydrolase a (iha) from labrenzia aggregata bound to benzyl benzoate (see paper)
36% identity, 85% coverage: 41:273/273 of query aligns to 16:262/264 of 5nnaD

query
sites
5nnaD
A
 
S
A
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
S
G
 
G
H
 
A
A
 
V
G
 
R
V
 
I
T
 
V
D
 
D
L
 
L
T
 
T
H
 
H
E
 
T
L
 
L
H
 
D
E
 
P
E
 
D
F
 
F
P
 
P
T
 
V
F
x
I
-
 
V
-
x
L
-
 
P
-
 
P
-
 
E
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
C
Q
 
A
F
 
R
F
 
F
R
 
R
E
 
M
Q
 
E
K
 
E
F
 
I
N
 
S
F
 
A
A
 
Y
E
 
D
H
 
H
-
 
R
-
 
G
-
 
P
T
 
A
F
 
W
N
 
K
L
 
W
F
 
H
E
 
N
L
 
I
R
 
S
V
 
M
N
 
S
E
 
E
H
|
H
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
|
H
V
 
F
D
|
D
A
 
A
P
 
P
L
 
S
H
 
H
F
x
W
-
 
I
-
 
S
-
 
G
-
 
K
S
 
D
A
 
V
D
 
P
G
 
N
L
 
G
S
 
S
V
 
V
A
 
D
E
 
E
L
 
I
P
 
P
V
 
A
E
 
E
K
 
A
L
 
F
V
 
V
V
 
G
P
 
P
L
 
V
C
 
V
V
 
V
V
 
I
D
 
D
I
 
C
R
 
S
E
 
K
R
 
G
A
 
A
S
 
A
A
 
E
D
 
N
P
 
D
D
 
D
A
 
F
Q
 
E
V
 
L
T
 
T
P
 
P
D
 
E
D
 
I
I
 
I
K
 
A
A
 
G
W
 
W
I
 
E
A
 
S
A
 
E
N
 
H
G
 
G
D
 
R
I
 
I
P
 
P
E
 
E
N
 
D
A
 
A
C
 
W
V
 
V
A
 
L
M
 
M
L
 
R
S
 
T
G
 
D
W
 
W
A
 
S
E
 
K
H
 
R
I
 
R
G
 
G
T
 
A
D
 
D
K
 
-
F
 
Y
R
 
L
N
 
N
A
 
M
D
 
R
S
 
A
A
 
D
G
 
G
K
x
P
L
 
-
H
 
H
F
 
S
P
 
P
G
 
G
F
 
P
H
 
T
V
 
P
E
 
E
A
 
A
A
 
I
K
 
R
Y
 
F
L
 
L
L
 
I
E
 
E
E
 
E
T
 
R
K
 
N
T
 
I
A
 
R
G
 
G
I
 
F
A
 
G
V
 
T
D
 
E
T
 
T
L
x
V
S
x
G
L
 
T
D
|
D
H
 
A
G
 
G
-
 
Q
-
 
G
-
 
A
-
 
H
I
 
Y
S
 
V
P
 
P
D
 
P
F
x
Y
A
 
P
T
 
A
H
|
H
R
 
Y
A
 
L
W
 
L
L
 
H
P
 
G
E
 
A
G
 
G
R
 
K
W
 
Y
G
 
G
L
 
L
E
x
Q
A
 
C
A
 
L
A
 
A
N
 
N
L
 
L
D
 
D
K
 
Q
L
 
L
P
 
P
A
 
A
K
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
V
L
 
L
V
 
I
L
 
A
G
 
A
A
 
P
P
 
L
K
 
K
H
 
I
R
 
K
G
 
N
G
 
G
T
 
T
G
 
G
G
 
S
P
 
P
A
 
L
R
 
R
V
 
V
F
 
L
A
 
A
L
 
M
V
 
V

5nmpA Isatin hydrolase a (iha) from ralstonia solanacearum (see paper)
34% identity, 85% coverage: 41:273/273 of query aligns to 16:264/265 of 5nmpA

query
sites
5nmpA
A
 
A
A
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
R
G
 
G
H
 
N
A
 
I
G
 
R
V
 
V
T
 
V
D
 
D
L
 
L
T
 
T
H
 
Q
E
 
T
L
 
L
H
 
S
E
 
P
E
 
S
F
 
F
P
 
P
T
 
T
F
 
L
-
 
Q
-
 
L
-
 
P
-
 
S
-
 
Q
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
V
Q
 
Q
F
 
P
F
 
F
R
 
K
E
 
I
Q
 
E
K
 
R
F
 
I
N
 
S
F
 
H
A
 
Y
E
 
D
H
 
A
T
 
S
-
 
G
-
 
P
-
 
A
F
 
W
N
 
Y
L
 
W
F
 
N
E
 
N
L
 
F
R
 
S
V
 
C
N
 
G
E
 
E
H
|
H
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
|
H
V
 
F
D
|
D
A
 
A
P
 
P
L
 
A
H
 
H
F
 
W
-
 
I
-
 
T
-
 
G
-
 
R
S
 
D
A
 
Y
D
 
P
G
 
G
L
 
N
S
 
S
V
 
V
A
 
D
E
 
T
L
 
I
P
 
A
V
 
P
E
 
E
K
 
N
L
 
F
V
 
V
V
 
A
P
 
P
L
 
A
C
 
V
V
 
V
V
 
I
D
 
D
I
 
A
R
 
S
E
 
A
R
 
Q
A
 
V
S
 
R
A
 
E
D
 
N
P
 
E
D
 
D
A
 
W
Q
 
L
V
 
L
T
 
T
P
 
V
D
 
D
D
 
F
I
 
L
K
 
Q
A
 
A
W
 
W
I
 
E
A
 
Q
A
 
R
N
 
H
G
 
G
D
 
R
I
 
I
P
 
P
E
 
A
N
 
G
A
 
A
C
 
W
V
 
V
A
 
L
M
 
F
L
 
R
S
 
T
G
 
D
W
 
W
A
 
S
E
 
L
H
 
R
I
 
V
G
 
G
-
 
D
T
 
A
D
 
A
K
 
A
F
 
F
R
 
L
N
 
N
A
 
I
D
 
R
S
 
E
A
 
D
G
 
G
K
 
A
L
 
-
H
 
H
F
 
T
P
 
P
G
 
G
F
 
P
H
 
T
V
 
Q
E
 
E
A
 
A
A
 
V
K
 
E
Y
 
W
L
 
L
L
 
I
E
 
G
E
 
E
T
 
R
K
 
N
T
 
V
A
 
H
G
 
G
I
 
F
A
 
G
V
 
V
D
 
E
T
 
T
L
 
I
S
 
N
L
 
T
D
 
D
H
 
A
G
 
G
I
 
Q
S
 
S
P
 
Y
D
 
A
-
 
W
-
 
P
-
 
L
-
 
A
F
 
Y
A
 
P
T
 
C
H
 
H
R
 
T
A
 
L
W
 
M
L
 
H
P
 
G
E
 
A
G
 
N
R
 
R
W
 
Y
G
 
G
L
 
L
E
x
Q
A
 
C
A
 
L
A
 
K
N
 
N
L
 
L
D
 
D
K
 
Q
L
 
L
P
 
P
A
 
P
K
 
R
G
 
G
A
 
A
T
 
F
L
 
I
V
 
L
L
 
A
G
 
A
A
 
P
P
 
L
K
 
K
H
 
I
R
 
E
G
 
G
G
 
G
T
 
S
G
 
G
G
 
S
P
 
P
A
 
L
R
 
R
V
 
V
F
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
V

4m8dD Crystal structure of an isatin hydrolase bound to product analogue thioisatinate (see paper)
34% identity, 90% coverage: 28:273/273 of query aligns to 2:260/263 of 4m8dD

query
sites
4m8dD
T
 
S
A
 
A
G
 
Q
V
 
S
A
 
A
A
 
L
A
 
S
G
 
G
M
 
L
G
 
G
I
 
-
A
 
-
P
 
-
A
 
A
A
 
K
L
 
L
A
 
L
A
 
S
G
 
G
H
 
E
A
 
V
G
 
E
V
 
V
T
 
V
D
 
D
L
 
C
T
 
T
H
 
G
-
 
V
-
 
L
-
 
G
-
 
P
-
 
N
-
 
T
-
 
P
-
 
I
-
x
L
E
 
Q
L
 
L
H
 
P
E
 
P
E
 
D
F
 
F
P
 
A
T
 
K
F
 
N
F
 
T
G
 
P
Q
 
K
Q
 
V
Q
 
E
F
 
I
F
 
H
R
 
K
E
 
I
Q
 
S
K
 
E
F
 
Y
N
 
D
F
 
S
A
 
D
E
 
G
H
 
P
T
 
F
F
|
F
N
 
A
L
x
W
F
 
N
E
 
W
L
 
M
R
 
V
V
 
L
N
 
G
E
 
E
H
|
H
T
 
S
G
 
G
T
 
T
H
|
H
V
 
F
D
|
D
A
 
A
P
 
P
L
 
H
H
|
H
F
 
W
-
 
I
-
 
T
-
 
G
-
 
K
-
 
D
S
 
Y
A
 
S
D
 
D
G
 
G
L
 
F
S
 
T
V
 
-
A
 
D
E
 
T
L
 
L
P
 
D
V
 
V
E
 
Q
K
 
R
L
 
L
V
 
I
V
 
A
P
 
P
L
 
V
C
 
N
V
 
V
V
 
I
D
 
D
I
 
C
R
 
S
E
 
K
R
 
E
A
 
S
S
 
A
A
 
A
D
 
D
P
 
P
D
 
D
A
 
F
Q
 
L
V
 
L
T
 
T
P
 
A
D
 
D
D
 
L
I
 
I
K
 
K
A
 
A
W
 
W
I
 
E
A
 
A
A
 
E
N
 
H
G
 
G
D
 
E
I
 
I
P
 
G
E
 
A
N
 
G
A
 
E
C
 
W
V
 
V
A
 
V
M
 
M
L
 
R
S
 
T
G
 
D
W
 
W
A
 
D
E
 
K
H
 
R
I
 
A
G
 
G
T
 
D
D
 
E
K
 
A
-
 
A
F
 
F
R
 
L
N
 
N
A
 
A
D
 
D
S
 
E
A
 
T
G
 
G
K
 
P
L
 
-
H
 
H
F
 
S
P
 
P
G
 
G
F
 
P
H
 
T
V
 
P
E
 
D
A
 
A
A
 
I
K
 
E
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
E
 
S
E
 
K
T
 
-
K
 
K
T
 
I
A
 
V
G
 
G
I
 
W
A
 
G
V
 
S
D
 
Q
T
 
C
L
 
I
S
 
G
L
 
T
D
 
D
-
 
A
-
 
G
-
 
Q
-
 
A
H
 
G
G
 
G
I
 
M
S
 
E
P
 
P
D
 
P
F
 
F
A
 
P
T
 
A
H
|
H
R
 
N
A
 
L
W
 
L
L
 
H
P
 
R
E
 
D
G
 
N
R
 
C
W
 
F
G
 
G
L
 
L
E
 
A
A
 
S
A
 
L
A
 
A
N
 
N
L
 
L
D
 
D
K
 
K
L
 
L
P
 
P
A
 
A
K
 
K
G
 
G
A
 
A
T
 
I
L
 
L
V
 
I
L
 
A
G
 
A
A
 
P
P
 
L
K
 
K
H
 
I
R
 
E
G
 
R
G
 
G
T
 
T
G
 
G
G
 
S
P
 
P
A
 
I
R
 
R
V
 
A
F
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
V

A0NLY7 Isatin hydrolase; Isatin amidohydrolase; Isatin hydrolase isoform b; IH-b; EC 3.5.2.20 from Roseibium aggregatum (strain ATCC 25650 / DSM 13394 / JCM 20685 / NBRC 16684 / NCIMB 2208 / IAM 12614 / B1) (Stappia aggregata) (see paper)
34% identity, 90% coverage: 28:273/273 of query aligns to 2:260/263 of A0NLY7

query
sites
A0NLY7
T
 
S
A
 
A
G
 
Q
V
 
S
A
 
A
A
 
L
A
 
S
G
 
G
M
 
L
G
 
G
I
 
-
A
 
-
P
 
-
A
 
A
A
 
K
L
 
L
A
 
L
A
 
S
G
 
G
H
 
E
A
 
V
G
 
E
V
 
V
T
 
V
D
 
D
L
 
C
T
 
T
H
 
G
-
 
V
-
 
L
-
 
G
-
 
P
-
 
N
-
 
T
-
 
P
-
 
I
-
 
L
E
 
Q
L
 
L
H
 
P
E
 
P
E
 
D
F
 
F
P
 
A
T
 
K
F
 
N
F
 
T
G
 
P
Q
 
K
Q
 
V
Q
 
E
F
 
I
F
 
H
R
 
K
E
 
I
Q
 
S
K
 
E
F
 
Y
N
 
D
F
 
S
A
 
D
E
 
G
H
 
P
T
 
F
F
 
F
N
 
A
L
 
W
F
 
N
E
 
W
L
 
M
R
 
V
V
 
L
N
 
G
E
 
E
H
|
H
T
 
S
G
 
G
T
 
T
H
|
H
V
 
F
D
|
D
A
 
A
P
 
P
L
 
H
H
 
H
F
 
W
-
 
I
-
 
T
-
 
G
-
 
K
-
 
D
S
 
Y
A
 
S
D
 
D
G
 
G
L
 
F
S
 
T
V
 
-
A
 
D
E
 
T
L
 
L
P
 
D
V
 
V
E
 
Q
K
 
R
L
 
L
V
 
I
V
 
A
P
 
P
L
 
V
C
 
N
V
 
V
V
 
I
D
 
D
I
 
C
R
 
S
E
 
K
R
 
E
A
 
S
S
 
A
A
 
A
D
 
D
P
 
P
D
 
D
A
 
F
Q
 
L
V
 
L
T
 
T
P
 
A
D
 
D
D
 
L
I
 
I
K
 
K
A
 
A
W
 
W
I
 
E
A
 
A
A
 
E
N
 
H
G
 
G
D
 
E
I
 
I
P
 
G
E
 
A
N
 
G
A
 
E
C
 
W
V
 
V
A
 
V
M
 
M
L
 
R
S
 
T
G
 
D
W
 
W
A
 
D
E
 
K
H
 
R
I
 
A
G
 
G
T
 
D
D
 
E
K
 
A
-
 
A
F
 
F
R
 
L
N
 
N
A
 
A
D
 
D
S
 
E
A
 
T
G
 
G
K
 
P
L
 
-
H
 
H
F
 
S
P
 
P
G
 
G
F
 
P
H
 
T
V
 
P
E
 
D
A
 
A
A
 
I
K
 
E
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
E
 
S
E
 
K
T
 
-
K
 
K
T
 
I
A
 
V
G
 
G
I
 
W
A
 
G
V
 
S
D
 
Q
T
 
C
L
 
I
S
 
G
L
 
T
D
 
D
-
 
A
-
 
G
-
 
Q
-
 
A
H
 
G
G
 
G
I
 
M
S
 
E
P
 
P
D
 
P
F
 
F
A
 
P
T
 
A
H
|
H
R
 
N
A
 
L
W
 
L
L
 
H
P
 
R
E
 
D
G
 
N
R
 
C
W
 
F
G
 
G
L
 
L
E
 
A
A
x
S
A
 
L
A
 
A
N
 
N
L
 
L
D
 
D
K
 
K
L
 
L
P
 
P
A
 
A
K
 
K
G
 
G
A
 
A
T
 
I
L
 
L
V
 
I
L
 
A
G
 
A
A
 
P
P
 
L
K
 
K
H
 
I
R
 
E
G
 
R
G
 
G
T
 
T
G
 
G
G
 
S
P
 
P
A
 
I
R
 
R
V
 
A
F
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
V

4m8dB Crystal structure of an isatin hydrolase bound to product analogue thioisatinate (see paper)
34% identity, 90% coverage: 28:273/273 of query aligns to 1:259/262 of 4m8dB

query
sites
4m8dB
T
 
S
A
 
A
G
 
Q
V
 
S
A
 
A
A
 
L
A
 
S
G
 
G
M
 
L
G
 
G
I
 
-
A
 
-
P
 
-
A
 
A
A
 
K
L
 
L
A
 
L
A
 
S
G
 
G
H
 
E
A
 
V
G
 
E
V
 
V
T
 
V
D
 
D
L
 
C
T
 
T
H
 
G
-
 
V
-
 
L
-
 
G
-
 
P
-
 
N
-
 
T
-
 
P
-
 
I
-
x
L
E
 
Q
L
 
L
H
 
P
E
 
P
E
 
D
F
 
F
P
 
A
T
 
K
F
 
N
F
 
T
G
 
P
Q
 
K
Q
 
V
Q
 
E
F
 
I
F
 
H
R
 
K
E
 
I
Q
 
S
K
 
E
F
 
Y
N
 
D
F
 
S
A
 
D
E
 
G
H
 
P
T
 
F
F
|
F
N
 
A
L
x
W
F
 
N
E
 
W
L
 
M
R
 
V
V
 
L
N
 
G
E
 
E
H
|
H
T
 
S
G
 
G
T
 
T
H
|
H
V
 
F
D
|
D
A
 
A
P
 
P
L
 
H
H
|
H
F
 
W
-
 
I
-
 
T
-
 
G
-
 
K
-
 
D
S
 
Y
A
 
S
D
 
D
G
 
G
L
 
F
S
 
T
V
 
-
A
 
D
E
 
T
L
 
L
P
 
D
V
 
V
E
 
Q
K
 
R
L
 
L
V
 
I
V
 
A
P
 
P
L
 
V
C
 
N
V
 
V
V
 
I
D
 
D
I
 
C
R
 
S
E
 
K
R
 
E
A
 
S
S
 
A
A
 
A
D
 
D
P
 
P
D
 
D
A
 
F
Q
 
L
V
 
L
T
 
T
P
 
A
D
 
D
D
 
L
I
 
I
K
 
K
A
 
A
W
 
W
I
 
E
A
 
A
A
 
E
N
 
H
G
 
G
D
 
E
I
 
I
P
 
G
E
 
A
N
 
G
A
 
E
C
 
W
V
 
V
A
 
V
M
 
M
L
 
R
S
 
T
G
 
D
W
 
W
A
 
D
E
 
K
H
 
R
I
 
A
G
 
G
T
 
D
D
 
E
K
 
A
-
 
A
F
 
F
R
 
L
N
 
N
A
 
A
D
 
D
S
 
E
A
 
T
G
 
G
K
 
P
L
 
-
H
 
H
F
 
S
P
 
P
G
 
G
F
 
P
H
 
T
V
 
P
E
 
D
A
 
A
A
 
I
K
 
E
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
E
 
S
E
 
K
T
 
-
K
 
K
T
 
I
A
 
V
G
 
G
I
 
W
A
 
G
V
 
S
D
 
Q
T
 
C
L
 
I
S
 
G
L
 
T
D
 
D
-
 
A
-
 
G
-
 
Q
-
 
A
H
 
G
G
 
G
I
 
M
S
 
E
P
 
P
D
 
P
F
|
F
A
 
P
T
 
A
H
|
H
R
 
N
A
 
L
W
 
L
L
 
H
P
 
R
E
 
D
G
 
N
R
 
C
W
 
F
G
 
G
L
 
L
E
 
A
A
 
S
A
 
L
A
 
A
N
|
N
L
 
L
D
|
D
K
|
K
L
 
L
P
 
P
A
 
A
K
 
K
G
 
G
A
 
A
T
 
I
L
 
L
V
 
I
L
 
A
G
 
A
A
 
P
P
 
L
K
 
K
H
 
I
R
 
E
G
 
R
G
 
G
T
 
T
G
 
G
G
 
S
P
 
P
A
 
I
R
 
R
V
 
A
F
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
V

8hmoA Crystal structure of metal-dependent hydrolase complexed with manganese from bacillus smithii
27% identity, 82% coverage: 50:272/273 of query aligns to 3:201/205 of 8hmoA

query
sites
8hmoA
V
 
I
T
 
I
D
 
D
L
 
I
T
 
T
H
 
A
E
 
P
L
 
I
H
 
Y
E
 
E
E
 
G
F
 
M
P
 
P
T
 
V
F
 
Y
F
 
K
G
 
N
Q
 
K
Q
 
P
Q
 
E
F
 
-
F
 
-
R
 
-
E
 
K
Q
 
Q
K
 
P
F
 
S
N
 
I
F
 
T
A
 
T
E
 
Q
H
 
T
T
 
N
F
 
G
N
 
H
L
 
V
F
 
T
E
 
E
L
 
S
R
 
R
V
 
I
-
 
C
-
 
M
N
 
D
E
 
V
H
|
H
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
|
H
V
 
V
D
|
D
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
|
H
F
 
M
S
 
M
A
 
N
D
 
D
G
 
G
L
 
K
S
 
T
V
 
I
A
 
E
E
 
T
L
 
I
P
 
S
V
 
I
E
 
E
K
 
K
L
 
L
V
 
V
V
 
R
P
 
P
L
 
C
C
 
K
V
 
V
V
 
I
D
 
D
I
 
L
R
 
T
E
 
H
R
 
V
A
 
H
S
 
E
A
 
-
D
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
-
Q
 
K
V
 
I
T
 
T
P
 
K
D
 
S
D
 
D
I
 
V
K
 
E
A
 
-
W
 
-
I
 
-
A
 
-
A
 
-
N
 
N
G
 
A
D
 
D
I
 
I
P
 
Q
E
 
K
N
 
D
A
 
D
C
 
F
V
 
I
A
 
L
M
 
L
L
 
-
S
 
-
G
 
-
W
 
-
A
 
-
E
 
-
H
 
-
I
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
K
 
K
F
 
T
R
 
K
N
 
N
A
 
S
-
 
F
D
 
D
S
 
K
A
 
E
G
 
F
K
 
N
L
 
F
H
 
D
F
 
F
P
 
I
G
 
Y
F
 
L
H
 
A
V
 
E
E
 
D
A
 
A
A
 
A
K
 
R
Y
 
Y
L
 
-
L
 
L
E
 
A
E
 
E
T
 
I
K
 
G
T
 
I
A
 
A
G
 
G
I
 
V
A
 
G
V
 
I
D
 
D
T
 
S
L
 
L
S
 
G
L
 
I
D
 
E
H
 
R
G
 
A
I
 
-
S
 
Q
P
 
P
D
 
E
F
 
H
A
 
P
T
 
T
H
|
H
R
 
R
A
 
A
W
 
L
L
 
M
P
 
D
E
 
K
G
 
D
R
 
I
W
 
V
G
 
V
L
 
I
E
|
E
A
 
G
A
 
L
A
 
Q
N
 
L
L
 
A
D
 
D
K
 
V
L
 
-
P
 
-
A
 
E
K
 
E
G
 
G
A
 
S
T
 
Y
L
 
F
V
 
M
L
 
I
G
 
A
A
 
A
P
 
P
K
 
L
H
 
N
R
 
I
G
 
Q
G
 
G
T
 
T
-
 
D
G
 
A
G
 
S
P
 
P
A
 
A
R
 
R
V
 
V
F
 
L
A
 
L
L
 
L

4cobA Crystal structure kynurenine formamidase from pseudomonas aeruginosa (see paper)
33% identity, 27% coverage: 52:126/273 of query aligns to 4:79/206 of 4cobA

query
sites
4cobA
D
 
D
L
 
I
T
 
S
H
 
P
E
 
A
L
 
L
H
 
D
E
 
P
E
 
N
F
 
T
P
 
P
T
 
T
F
 
W
F
 
P
G
 
G
Q
 
D
Q
 
T
Q
 
P
F
 
F
F
 
Q
R
 
Q
E
 
E
Q
 
W
K
 
A
F
 
A
N
 
R
F
 
L
A
 
D
E
 
E
H
 
Q
T
 
C
-
 
P
F
 
V
N
 
N
L
 
V
F
 
G
E
 
R
L
 
I
R
 
T
V
 
L
N
 
S
E
 
P
H
|
H
T
 
T
G
 
G
T
 
A
H
|
H
V
 
V
D
|
D
A
 
G
P
 
P
L
 
L
H
 
H
F
 
Y
S
 
R
A
 
A
D
 
D
G
 
G
L
 
L
S
 
P
V
 
I
A
 
G
E
 
Q
L
 
V
P
 
P
V
 
L
E
 
D
K
 
V
L
 
Y
V
 
M
V
 
G
P
 
P
L
 
C
C
 
R
V
 
V
V
 
I

Sites not aligning to the query:

Q9I234 Kynurenine formamidase; KFA; KFase; Arylformamidase; N-formylkynurenine formamidase; FKF; EC 3.5.1.9 from Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) (see paper)
33% identity, 27% coverage: 52:126/273 of query aligns to 8:83/213 of Q9I234

query
sites
Q9I234
D
 
D
L
 
I
T
 
S
H
 
P
E
 
A
L
 
L
H
 
D
E
 
P
E
 
N
F
 
T
P
 
P
T
 
T
F
 
W
F
 
P
G
 
G
Q
 
D
Q
 
T
Q
 
P
F
 
F
F
 
Q
R
 
Q
E
 
E
Q
 
W
K
 
A
F
 
A
N
 
R
F
 
L
A
 
D
E
 
E
H
 
Q
T
 
C
-
 
P
F
 
V
N
 
N
L
 
V
F
 
G
E
 
R
L
 
I
R
 
T
V
 
L
N
 
S
E
 
P
H
|
H
T
 
T
G
 
G
T
 
A
H
|
H
V
 
V
D
|
D
A
 
G
P
 
P
L
 
L
H
 
H
F
 
Y
S
 
R
A
 
A
D
 
D
G
 
G
L
 
L
S
 
P
V
 
I
A
 
G
E
 
Q
L
 
V
P
 
P
V
 
L
E
 
D
K
 
I
L
 
Y
V
 
M
V
 
G
P
 
P
L
 
C
C
 
R
V
 
V
V
 
I

Sites not aligning to the query:

4cz1A Crystal structure of kynurenine formamidase from bacillus anthracis complexed with 2-aminoacetophenone. (see paper)
33% identity, 30% coverage: 52:133/273 of query aligns to 6:88/207 of 4cz1A

query
sites
4cz1A
D
 
D
L
 
I
T
 
S
H
 
Q
E
 
P
L
 
L
H
 
N
E
 
N
E
 
D
F
 
I
P
 
A
T
 
T
F
x
W
F
 
P
G
 
G
Q
 
D
Q
 
T
Q
 
P
F
 
F
F
 
S
R
 
Y
E
 
E
Q
 
V
K
 
L
F
 
W
N
 
S
F
 
K
A
 
E
E
 
E
H
 
S
-
 
G
T
 
S
F
 
V
N
 
N
L
 
V
F
 
G
E
 
K
L
 
L
R
 
T
V
 
M
N
 
S
E
 
I
H
|
H
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
|
H
V
 
I
D
|
D
A
 
A
P
 
P
L
 
F
H
|
H
F
 
F
S
 
D
A
 
N
D
 
D
G
 
G
L
 
K
S
 
K
V
 
V
A
 
L
E
 
D
L
 
L
P
 
D
V
 
I
E
 
Q
K
 
V
L
 
Y
V
 
V
V
 
G
P
 
P
L
 
T
C
 
R
V
 
I
V
 
I
D
 
D
I
 
V
R
 
S
E
 
N
R
 
L
A
 
E
S
 
S

Sites not aligning to the query:

4co9A Crystal structure of kynurenine formamidase from bacillus anthracis (see paper)
33% identity, 30% coverage: 52:133/273 of query aligns to 6:88/207 of 4co9A

query
sites
4co9A
D
 
D
L
 
I
T
 
S
H
 
Q
E
 
P
L
 
L
H
 
N
E
 
N
E
 
D
F
 
I
P
 
A
T
 
T
F
 
W
F
 
P
G
 
G
Q
 
D
Q
 
T
Q
 
P
F
 
F
F
 
S
R
 
Y
E
 
E
Q
 
V
K
 
L
F
 
W
N
 
S
F
 
K
A
 
E
E
 
E
H
 
S
-
 
G
T
 
S
F
 
V
N
 
N
L
 
V
F
 
G
E
 
K
L
 
L
R
 
T
V
 
M
N
 
S
E
 
I
H
|
H
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
|
H
V
 
I
D
|
D
A
 
A
P
 
P
L
 
F
H
 
H
F
 
F
S
 
D
A
 
N
D
 
D
G
 
G
L
 
K
S
 
K
V
 
V
A
 
L
E
 
D
L
 
L
P
 
D
V
 
I
E
 
Q
K
 
V
L
 
Y
V
 
V
V
 
G
P
 
P
L
 
T
C
 
R
V
 
I
V
 
I
D
 
D
I
 
V
R
 
S
E
 
N
R
 
L
A
 
E
S
 
S

Sites not aligning to the query:

Q81PP9 Kynurenine formamidase; KFA; KFase; Arylformamidase; N-formylkynurenine formamidase; FKF; EC 3.5.1.9 from Bacillus anthracis (see paper)
33% identity, 30% coverage: 52:133/273 of query aligns to 8:90/209 of Q81PP9

query
sites
Q81PP9
D
 
D
L
 
I
T
 
S
H
 
Q
E
 
P
L
 
L
H
 
N
E
 
N
E
 
D
F
 
I
P
 
A
T
 
T
F
x
W
F
 
P
G
 
G
Q
 
D
Q
 
T
Q
 
P
F
 
F
F
 
S
R
 
Y
E
 
E
Q
 
V
K
 
L
F
 
W
N
 
S
F
 
K
A
 
E
E
 
E
H
 
S
-
 
G
T
 
S
F
 
V
N
 
N
L
 
V
F
 
G
E
 
K
L
 
L
R
 
T
V
 
M
N
 
S
E
 
I
H
|
H
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
|
H
V
 
I
D
|
D
A
 
A
P
 
P
L
 
F
H
 
H
F
 
F
S
 
D
A
 
N
D
 
D
G
 
G
L
 
K
S
 
K
V
 
V
A
 
L
E
 
D
L
 
L
P
 
D
V
 
I
E
 
Q
K
 
V
L
 
Y
V
 
V
V
 
G
P
 
P
L
 
T
C
 
R
V
 
I
V
 
I
D
 
D
I
 
V
R
 
S
E
 
N
R
 
L
A
 
E
S
 
S

Sites not aligning to the query:

1r61A The structure of predicted metal-dependent hydrolase from bacillus stearothermophilus
25% identity, 81% coverage: 50:270/273 of query aligns to 5:201/205 of 1r61A

query
sites
1r61A
V
 
V
T
 
Y
D
 
D
L
 
V
T
 
T
H
 
A
E
 
P
L
 
I
H
 
Y
E
 
E
E
 
G
F
 
M
P
 
P
T
 
V
F
 
Y
F
 
K
G
 
N
Q
 
K
Q
 
P
Q
 
E
F
 
K
F
 
-
R
 
Q
E
 
P
Q
 
K
K
 
R
F
 
T
N
 
T
F
 
I
A
 
T
E
 
N
H
 
G
T
 
Y
F
 
V
N
 
T
L
 
E
F
 
S
E
 
R
L
 
I
R
 
D
V
 
M
N
 
D
E
 
V
H
 
H
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
V
 
I
D
|
D
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
 
H
F
 
M
S
 
V
A
 
E
D
 
G
G
 
G
L
 
A
S
 
T
V
 
F
A
 
E
E
 
T
L
 
I
P
 
P
V
 
L
E
 
N
K
 
D
L
 
L
V
 
V
V
 
G
P
 
P
L
 
C
C
 
K
V
 
L
V
 
F
D
 
D
I
 
L
R
 
T
E
 
H
R
 
V
A
 
-
S
 
-
A
 
-
D
 
-
P
 
-
D
 
N
A
 
D
Q
 
R
V
 
I
T
 
T
P
 
K
D
 
D
D
 
D
I
 
I
K
 
-
A
 
-
W
 
-
I
 
-
A
 
-
A
 
A
N
 
H
G
 
L
D
 
D
I
 
I
P
 
Q
E
 
E
N
 
G
A
 
D
C
 
F
V
 
V
A
 
L
M
 
F
L
 
K
S
 
T
G
 
-
W
 
-
A
 
-
E
 
-
H
 
-
I
 
-
G
 
-
T
 
K
D
 
N
K
 
S
F
 
F
R
 
E
N
 
D
A
 
A
D
 
-
S
 
-
A
 
-
G
 
-
K
 
-
L
 
F
H
 
H
F
 
F
P
 
E
G
 
F
F
 
I
H
 
F
V
 
V
-
 
A
-
 
E
E
 
D
A
 
A
A
 
A
K
 
R
Y
 
Y
L
 
L
L
 
A
E
 
D
E
 
K
T
 
-
K
 
Q
T
 
I
A
 
R
G
 
G
I
 
V
A
 
G
V
 
I
D
 
D
T
 
A
L
 
L
S
 
G
L
 
I
D
 
E
H
 
R
G
 
A
I
 
-
S
 
Q
P
 
E
D
 
G
F
 
H
A
 
P
T
 
T
H
|
H
R
 
K
A
 
T
W
 
L
L
 
F
P
 
S
E
 
A
G
 
G
R
 
V
W
 
I
G
 
I
L
 
I
E
|
E
A
 
-
A
 
G
A
 
L
N
 
R
L
 
L
D
 
K
K
 
D
L
 
V
P
 
P
A
 
-
K
 
E
G
 
G
A
 
R
T
 
Y
L
 
F
V
 
M
L
 
V
G
 
A
A
 
A
P
 
P
-
 
L
K
 
K
H
 
L
R
 
V
G
 
G
G
 
T
T
 
D
G
 
A
G
 
A
P
 
P
A
 
A
R
 
R
V
 
V
F
 
L

B4E9I9 Kynurenine formamidase; KFA; KFase; Arylformamidase; N-formylkynurenine formamidase; FKF; EC 3.5.1.9 from Burkholderia cenocepacia (strain ATCC BAA-245 / DSM 16553 / LMG 16656 / NCTC 13227 / J2315 / CF5610) (Burkholderia cepacia (strain J2315)) (see paper)
29% identity, 27% coverage: 52:126/273 of query aligns to 6:81/213 of B4E9I9

query
sites
B4E9I9
D
 
D
L
 
I
T
 
S
H
 
P
E
 
P
L
 
V
H
 
S
E
 
P
E
 
A
F
 
T
P
 
P
T
 
V
F
 
W
F
 
P
G
 
G
Q
 
D
Q
 
T
Q
 
P
F
 
V
F
 
A
R
 
V
E
 
E
Q
 
R
K
 
V
F
 
W
N
 
R
F
 
M
-
 
E
A
 
A
E
 
G
H
 
S
T
 
P
F
 
V
N
 
N
L
 
V
F
 
A
E
 
R
L
 
L
R
 
T
V
 
L
N
 
S
E
 
P
H
|
H
T
 
T
G
 
G
T
 
A
H
|
H
V
 
C
D
|
D
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
 
H
F
 
Y
S
 
D
A
 
A
D
 
D
G
 
G
L
 
A
S
 
P
V
 
I
A
 
G
E
 
A
L
 
V
P
 
P
V
 
L
E
 
D
K
 
T
L
 
Y
V
 
L
V
 
G
P
 
P
L
 
C
C
 
R
V
 
V
V
 
I

Sites not aligning to the query:

4cogA Crystal structure of kynurenine formamidase from burkholderia cenocepacia (see paper)
29% identity, 27% coverage: 52:126/273 of query aligns to 4:79/207 of 4cogA

query
sites
4cogA
D
 
D
L
 
I
T
 
S
H
 
P
E
 
P
L
 
V
H
 
S
E
 
P
E
 
A
F
 
T
P
 
P
T
 
V
F
 
W
F
 
P
G
 
G
Q
 
D
Q
 
T
Q
 
P
F
 
V
F
 
A
R
 
V
E
 
E
Q
 
R
K
 
V
F
 
W
N
 
R
F
 
M
-
 
E
A
 
A
E
 
G
H
 
S
T
 
P
F
 
V
N
 
N
L
 
V
F
 
A
E
 
R
L
 
L
R
 
T
V
 
L
N
 
S
E
 
P
H
 
H
T
 
T
G
 
G
T
 
A
H
 
H
V
 
C
D
|
D
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
 
H
F
 
Y
S
x
D
A
 
A
D
|
D
G
 
G
L
 
A
S
 
P
V
 
I
A
 
G
E
 
A
L
 
V
P
 
P
V
 
L
E
 
D
K
 
T
L
 
Y
V
 
L
V
 
G
P
 
P
L
 
C
C
 
R
V
 
V
V
 
I

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_012708601.1 NCBI__GCF_000018545.1:WP_012708601.1
MCDACVIESVKQQMLSRRSFFRAAAVGTAGVAAAGMGIAPAALAAGHAGVTDLTHELHEE
FPTFFGQQQFFREQKFNFAEHTFNLFELRVNEHTGTHVDAPLHFSADGLSVAELPVEKLV
VPLCVVDIRERASADPDAQVTPDDIKAWIAANGDIPENACVAMLSGWAEHIGTDKFRNAD
SAGKLHFPGFHVEAAKYLLEETKTAGIAVDTLSLDHGISPDFATHRAWLPEGRWGLEAAA
NLDKLPAKGATLVLGAPKHRGGTGGPARVFALV

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory