SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012708729.1 NCBI__GCF_000018545.1:WP_012708729.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6tg9A Cryo-em structure of nadh reduced form of NAD+-dependent formate dehydrogenase from rhodobacter capsulatus (see paper)
32% identity, 95% coverage: 2:826/870 of query aligns to 19:902/949 of 6tg9A

query
sites
6tg9A
V
 
V
R
 
H
I
 
L
T
 
T
I
 
I
D
 
D
A
 
G
Q
 
V
S
 
E
L
 
V
E
 
T
V
 
V
E
 
P
A
 
A
G
 
G
S
 
T
T
 
S
V
 
V
L
 
L
Q
 
R
A
 
A
A
 
A
Q
 
A
R
 
E
L
 
A
G
 
G
I
 
I
D
 
S
V
 
I
P
 
P
T
 
K
F
 
L
C
|
C
Y
 
A
L
 
T
E
 
D
R
 
N
L
 
V
P
 
E
P
 
P
L
x
V
A
x
G
S
 
S
C
|
C
R
 
R
M
 
L
C
|
C
L
 
M
V
 
V
E
 
E
I
 
I
E
 
E
G
 
G
L
 
M
R
 
R
R
 
G
L
 
T
Q
 
P
P
 
T
S
 
S
C
|
C
A
 
T
T
 
T
A
 
P
V
 
V
T
 
A
D
 
P
G
 
G
M
 
M
V
 
R
V
 
V
R
 
H
T
 
T
N
 
Q
T
 
T
P
 
P
L
 
Q
I
 
L
D
 
Q
E
 
K
T
 
L
R
 
R
S
 
R
S
 
G
M
 
V
L
 
M
D
 
E
M
 
L
L
 
Y
L
 
I
A
 
S
N
 
D
H
|
H
P
 
P
L
 
L
D
 
D
C
|
C
P
 
L
I
 
T
C
|
C
D
 
A
K
x
A
G
 
N
G
 
G
E
 
D
C
|
C
E
 
E
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
M
 
M
V
 
A
M
 
G
D
 
A
Y
 
V
G
 
G
P
 
L
R
 
R
R
 
E
S
 
V
E
 
R
F
 
Y
R
 
Q
D
 
A
P
 
K
K
 
D
R
 
T
V
 
H
F
 
F
H
 
A
S
 
R
R
 
R
D
 
D
I
 
A
-
 
T
-
 
G
-
 
P
-
 
N
-
 
P
-
 
R
-
 
Y
-
 
I
-
 
P
-
 
K
-
 
D
R
 
N
L
 
S
S
 
N
P
 
P
V
 
Y
I
 
F
I
 
S
M
 
Y
N
 
D
V
 
P
N
 
A
R
 
K
C
|
C
I
|
I
Q
x
V
C
|
C
Q
x
M
R
 
R
C
|
C
V
 
V
R
 
R
M
 
A
C
|
C
E
 
E
E
 
E
V
 
V
V
 
Q
G
 
G
A
 
T
V
 
F
A
 
A
L
 
L
G
 
T
T
 
V
V
 
M
E
 
G
K
 
R
G
 
G
M
 
F
D
 
D
T
 
A
A
 
R
V
x
I
T
 
S
G
 
P
F
 
A
E
 
A
G
 
P
S
 
D
L
 
F
A
 
L
S
 
S
-
 
S
-
 
D
C
|
C
D
 
V
Q
x
S
C
|
C
G
|
G
N
 
A
C
|
C
V
 
V
Q
 
Q
V
 
A
C
|
C
P
 
P
V
x
T
G
x
A
A
 
T
L
 
L
M
 
V
S
 
E
F
 
K
P
 
S
Y
 
V
R
 
E
Y
 
R
K
 
I
A
 
G
R
 
T
P
 
P
W
 
-
D
 
-
L
 
E
A
 
R
E
 
K
T
 
V
D
 
V
T
 
T
I
 
T
C
|
C
P
 
A
H
x
Y
C
|
C
G
 
G
T
x
V
G
 
G
C
|
C
Q
 
S
L
x
F
T
 
E
V
 
A
G
 
H
A
 
M
R
 
L
K
 
G
G
 
D
E
 
Q
F
 
L
M
 
V
R
 
R
V
 
M
R
 
V
S
 
P
K
 
W
P
 
K
E
 
G
H
 
G
G
 
A
V
 
A
N
 
N
R
 
R
E
 
G
T
 
H
L
 
S
C
|
C
V
 
V
R
x
K
G
 
G
R
 
R
F
 
F
G
 
A
L
 
Y
D
 
G
F
 
Y
V
 
A
E
 
T
S
 
H
R
 
Q
D
 
D
R
 
R
I
 
I
K
 
L
R
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
R
 
-
R
 
R
D
 
D
G
 
K
V
 
I
L
 
T
V
 
D
P
 
P
-
 
W
-
 
R
-
 
E
V
 
V
S
 
N
W
 
W
S
 
T
E
 
E
A
 
A
G
 
L
D
 
D
H
 
F
L
 
T
R
 
A
R
 
T
R
 
R
L
 
L
A
 
R
A
 
A
V
 
L
E
 
R
N
 
D
K
 
S
-
 
H
-
 
G
-
 
A
-
 
D
A
 
A
A
 
L
G
 
G
G
 
V
L
 
I
A
 
T
S
 
S
A
 
S
R
|
R
L
x
C
P
 
T
N
 
N
E
 
E
V
 
E
L
 
T
Y
 
Y
Q
 
L
F
 
V
Q
 
Q
K
 
K
L
 
L
M
 
A
R
 
R
T
 
A
V
 
V
F
 
F
R
 
G
T
 
T
N
 
N
N
 
N
I
 
T
D
 
D
C
 
T
S
 
C
S
 
A
R
 
R
W
 
V
S
x
C
A
x
H
P
 
S
F
 
P
D
 
T
T
 
G
L
 
Y
G
 
G
P
 
-
L
 
L
L
 
K
G
 
Q
G
 
T
F
 
F
Y
 
G
T
 
T
R
 
S
A
 
A
P
 
G
L
 
T
Q
 
Q
E
 
D
-
 
F
-
 
D
-
 
S
V
 
V
I
 
E
D
 
E
K
 
T
D
 
D
C
 
L
V
 
A
L
 
L
V
 
V
I
 
I
G
|
G
G
x
A
N
 
N
V
 
P
T
 
T
E
x
D
E
x
G
N
x
H
P
 
P
V
|
V
T
 
F
E
 
A
Y
 
S
L
 
R
L
 
L
R
 
R
D
 
K
A
 
R
V
 
L
R
 
R
Q
 
-
R
 
-
Q
 
-
A
 
A
G
 
G
L
 
A
L
 
K
L
 
L
L
 
I
S
 
V
A
 
V
R
 
D
P
|
P
S
x
R
R
 
R
L
 
I
D
 
D
A
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
V
 
-
V
 
L
L
 
L
R
 
N
V
 
T
P
 
P
P
 
H
G
 
R
G
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
W
S
 
H
L
 
L
-
 
Q
-
 
L
-
 
K
-
x
P
A
 
G
A
 
T
V
x
N
V
 
V
A
 
A
G
 
V
L
 
M
A
 
T
A
 
A
A
 
M
A
 
A
G
 
H
E
 
V
N
 
I
L
 
V
S
 
T
G
 
E
E
 
Q
T
 
I
I
 
F
D
 
D
A
 
K
-
 
R
-
 
F
-
 
I
-
 
G
-
 
D
-
 
R
-
 
C
-
 
D
-
 
W
-
 
D
-
 
E
-
 
W
-
 
A
-
 
D
V
 
Y
G
 
A
A
 
E
T
 
F
I
 
V
G
 
A
R
 
N
P
 
P
S
 
E
E
 
Y
S
 
A
A
 
P
G
 
E
S
 
A
E
 
V
E
 
E
S
 
S
D
 
L
R
 
T
L
 
G
V
 
V
-
 
P
A
 
A
G
 
G
L
 
L
-
 
L
-
 
R
-
 
Q
-
 
A
-
 
A
-
 
R
-
 
A
-
 
Y
R
 
A
D
 
A
S
 
A
R
 
P
G
 
N
V
 
A
T
 
A
V
 
I
L
 
Y
V
 
Y
S
 
G
V
x
L
G
|
G
L
 
V
L
 
T
R
 
E
S
x
H
P
 
S
E
 
Q
A
 
G
R
 
S
A
 
T
M
 
T
L
 
V
Q
 
I
Q
 
A
V
 
I
S
 
A
N
 
N
L
 
L
L
 
A
Q
 
M
A
 
M
L
 
T
R
 
G
M
 
N
L
 
I
G
 
G
K
 
R
-
 
P
D
 
G
P
 
V
A
 
G
M
 
V
Q
 
N
F
 
P
L
 
L
F
 
R
D
x
G
R
x
Q
A
 
N
N
 
N
Q
 
V
M
 
Q
G
 
G
A
 
S
W
 
C
D
 
D
M
 
M
G
 
G
V
 
S
L
 
F
P
 
P
A
 
H
T
 
E
L
 
F
P
 
P
G
 
G
L
 
Y
R
 
R
A
 
H
V
 
V
T
 
S
D
 
D
D
 
D
S
 
A
A
 
T
R
 
R
A
 
G
T
 
L
H
 
F
E
 
E
G
 
R
A
 
T
W
 
W
D
 
G
A
 
V
E
 
T
I
 
L
P
 
S
S
 
S
E
 
E
P
 
P
G
 
G
A
 
L
N
 
R
L
 
I
D
 
P
A
 
N
I
 
M
L
 
L
D
 
D
L
 
A
C
 
A
V
 
V
D
 
E
G
 
G
R
 
R
M
 
F
G
 
K
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
A
 
Q
G
|
G
T
x
E
D
 
D
P
 
I
L
 
L
L
 
Q
A
x
S
Y
 
D
P
 
P
D
 
D
R
 
T
D
 
R
F
 
H
V
 
V
K
 
S
R
 
A
A
 
G
L
 
L
G
 
A
A
 
A
A
 
M
D
 
D
L
 
L
L
 
V
I
 
I
V
 
V
Q
 
H
D
 
D
T
 
L
F
 
F
L
 
L
T
x
N
D
 
E
T
 
T
A
 
A
G
 
N
L
 
Y
A
 
A
E
 
H
V
 
V
V
 
F
L
 
L
P
 
P
A
 
G
A
x
S
G
 
T
Y
 
F
G
 
L
E
 
E
E
x
K
A
 
D
G
 
G
T
 
T
F
 
F
T
 
T
N
 
N
N
 
A
E
 
E
G
 
R
R
 
R
I
 
I
Q
 
N
T
 
R
L
 
V
R
 
R
K
 
R
F
 
V
R
 
M
A
 
A
P
 
P
A
 
K
F
 
-
E
 
A
A
 
G
R
 
F
G
 
A
N
x
D
L
 
W
E
 
E
V
 
V
F
 
T
E
 
Q
F
 
M
V
 
L
A
 
A
A
 
N
L
 
A
R
 
L
R
 
G
Q
 
A
V
 
G
L
 
W
K
 
H
P
 
Y
S
 
T
M
 
H
Q
 
P
G
 
S
E
 
E
I
 
I
F
 
M
D
 
A
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
A
L
 
T
V
 
T
P
 
P
A
 
G
Y
 
F
Q
 
A
G
 
A
L
 
V
T
 
T
P
 
Y
D
 
E
G
 
M
L
 
L
G
 
D
A
 
A
D
 
R
G
 
G
A
 
S
F
 
V
T
 
Q
-
 
W
-
 
P
-
 
C
-
 
N
-
 
E
-
 
K
-
 
A
-
 
P
Q
 
E
A
 
G
D
 
S
P
 
P
T
 
I
P
 
M
P
 
H
A
 
V
S
 
E
G
 
G
F
 
F
Y
 
V
P
 
R
A
 
G
P
 
K
-
 
G
-
 
R
-
 
F
-
 
I
-
 
R
-
 
T
-
 
A
-
 
Y
-
 
L
P
 
P
T
 
T
F
 
D
E
 
E
V
 
K
-
 
T
-
 
G
-
 
P
R
 
R
D
 
F
G
 
P
L
 
L
M
 
L
L
 
L
V
x
T
T
|
T
G
 
G
D
x
R
C
x
I
L
|
L
-
 
S
-
 
Q
F
 
Y
H
x
N
N
x
V
G
 
G
Y
 
A
L
x
Q
S
 
T
E
 
R
R
 
R
S
 
T
E
 
E
I
 
-
L
 
-
N
 
N
T
 
T
V
 
V
A
 
W
D
 
H
-
 
G
D
 
E
P
 
D
Y
 
R
V
 
L
E
 
E
M
 
I
N
 
H
A
 
P
Q
 
T
E
 
D
A
 
A
Q
 
E
Q
 
T
L
 
R
G
 
G
I
 
I
S
 
R
D
 
D
G
 
G
D
 
D
Q
 
W
V
 
V
V
 
R
V
 
L
R
 
A
S
 
S
A
 
R
Q
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
T
T
 
T
A
 
L
K
 
R
L
 
A
K
 
T
V
 
V
N
 
T
R
 
D
R
 
R
F
 
V
P
 
S
R
 
P
G
 
G
L
 
V
V
 
V
F
 
Y
V
 
T
P
 
T
E
 
F
N
 
H
Y
 
H
R
 
P
A
 
D
L
 
T
R
 
Q
L
 
A
N
|
N

Sites not aligning to the query:

7vw6A Cryo-em structure of formate dehydrogenase 1 from methylorubrum extorquens am1 (see paper)
30% identity, 94% coverage: 2:820/870 of query aligns to 2:881/913 of 7vw6A

query
sites
7vw6A
V
 
I
R
 
A
I
 
F
T
 
E
I
 
F
D
 
D
A
 
G
Q
 
Q
S
 
Q
L
 
V
E
 
E
V
 
A
E
 
Q
A
 
P
G
 
G
S
 
E
T
 
T
V
 
I
L
 
W
Q
 
A
A
 
V
A
 
A
Q
 
K
R
 
R
L
 
L
G
 
G
I
 
T
D
 
H
V
 
I
P
 
P
T
x
H
F
 
L
C
|
C
Y
x
H
L
 
K
E
 
P
R
 
D
-
 
P
-
 
G
L
 
Y
P
 
R
P
 
P
L
 
D
A
x
G
S
 
N
C
|
C
R
|
R
M
 
A
C
|
C
L
 
M
V
 
V
E
 
E
I
 
I
E
 
E
G
 
G
L
 
E
R
 
R
R
 
V
L
 
L
Q
 
A
P
 
A
S
 
S
C
|
C
A
 
K
T
 
R
A
 
T
V
 
P
T
 
A
D
 
I
G
 
G
M
 
M
V
 
K
V
 
V
R
 
K
T
 
S
N
 
A
T
 
T
P
 
E
L
 
R
I
 
A
D
 
T
E
 
K
T
 
A
R
 
R
S
 
A
S
 
M
M
 
V
L
 
L
D
 
E
M
 
L
L
 
L
L
 
V
A
 
A
N
 
D
H
 
Q
P
 
P
L
 
E
D
 
R
C
 
A
P
 
T
I
 
S
C
 
H
D
 
D
K
 
P
G
 
S
G
 
S
E
 
H
C
 
F
E
 
W
L
 
V
Q
 
Q
D
 
A
M
 
D
V
 
V
M
 
L
D
 
D
Y
 
V
G
 
-
P
 
-
R
 
-
R
 
-
S
 
T
E
 
E
F
 
S
R
 
R
D
 
F
P
 
P
K
 
A
R
 
A
V
 
E
F
 
R
H
 
W
S
 
T
R
 
S
D
 
D
I
 
V
R
 
S
L
 
-
S
 
H
P
 
P
V
 
A
I
 
M
I
 
S
M
 
V
N
 
N
V
 
L
N
 
D
R
 
A
C
|
C
I
|
I
Q
|
Q
C
|
C
Q
x
N
R
 
L
C
|
C
V
 
V
R
 
R
M
 
A
C
|
C
E
 
R
E
 
E
V
 
V
V
 
Q
G
 
V
A
x
N
V
 
D
A
x
V
L
x
I
G
 
G
T
 
M
V
 
A
E
 
Y
K
 
R
G
 
A
M
 
A
D
 
G
T
 
S
A
 
K
V
|
V
T
 
V
-
 
F
G
 
D
F
 
F
E
 
D
G
 
D
S
 
P
L
 
M
-
 
G
-
 
G
A
 
S
S
 
T
C
|
C
D
x
V
Q
x
A
C
|
C
G
|
G
N
 
E
C
|
C
V
 
V
Q
 
Q
V
 
A
C
|
C
P
|
P
V
x
T
G
 
G
A
|
A
L
|
L
M
 
M
S
 
P
F
 
A
P
 
A
Y
 
Y
-
 
L
-
 
D
-
 
A
R
 
N
Y
 
Q
K
 
T
A
 
R
R
 
T
P
 
V
W
 
Y
D
 
P
L
 
D
A
 
R
E
 
E
T
 
V
D
 
K
T
 
S
I
 
L
C
|
C
P
 
P
H
 
Y
C
|
C
G
 
G
T
 
V
G
 
G
C
|
C
Q
 
Q
L
 
V
T
 
S
V
 
Y
G
 
K
A
 
V
R
 
-
K
 
K
G
 
D
E
 
E
F
 
R
M
 
I
R
 
V
V
 
Y
R
 
A
S
 
E
K
 
G
P
 
V
E
 
N
H
 
G
G
 
P
V
 
A
N
 
N
R
 
Q
E
 
N
T
 
R
L
 
L
C
|
C
V
 
V
R
x
K
G
|
G
R
 
R
F
 
F
G
 
G
L
 
F
D
 
D
F
 
Y
V
 
V
E
 
H
S
 
H
R
 
P
D
 
H
R
 
R
I
 
L
K
 
T
R
 
V
P
 
P
M
 
L
I
 
I
R
 
R
R
 
L
D
 
E
G
 
N
V
 
V
-
 
P
-
 
K
-
 
D
-
 
A
-
 
N
-
 
D
-
 
Q
-
 
V
-
 
D
-
 
P
-
 
A
-
 
N
-
 
P
-
 
W
-
 
T
-
 
H
L
 
F
V
 
R
P
 
E
V
 
A
S
 
T
W
 
W
S
 
E
E
 
E
A
 
A
G
 
L
D
 
D
H
 
R
L
 
A
R
 
A
R
 
G
R
 
G
L
 
L
A
 
K
A
 
A
V
 
I
E
 
R
N
 
D
-
 
T
-
 
N
-
 
G
-
 
R
K
 
K
A
 
A
A
 
L
G
 
A
G
 
G
L
 
F
A
 
G
S
 
S
A
 
A
R
x
K
L
 
G
P
 
S
N
 
N
E
 
E
V
 
E
L
 
A
Y
 
Y
Q
 
L
F
 
F
Q
 
Q
K
 
K
L
 
L
M
 
V
R
 
R
T
 
L
V
 
G
F
 
F
R
 
G
T
 
T
N
 
N
N
 
N
I
 
V
D
 
D
C
 
H
S
x
C
S
 
T
R
 
R
W
 
L
S
x
C
A
 
H
P
 
A
F
 
-
D
 
S
T
 
S
L
 
V
G
 
A
P
 
A
L
 
L
L
 
M
G
 
E
G
 
G
F
 
L
Y
 
N
T
 
S
-
 
G
-
 
A
-
 
V
R
 
T
A
 
A
P
 
P
L
 
F
Q
 
S
E
 
A
V
 
A
I
 
L
D
 
D
K
 
A
D
 
E
C
 
V
V
 
I
L
 
V
V
 
V
I
 
I
G
|
G
G
 
A
N
|
N
V
 
P
T
 
T
E
 
V
E
x
N
N
 
H
P
 
P
V
|
V
T
 
A
E
 
A
Y
 
T
L
 
F
L
 
L
R
 
K
D
 
N
A
 
A
V
 
V
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
Q
 
G
A
 
A
G
 
K
L
 
L
L
 
I
L
 
I
L
 
M
S
x
D
A
x
P
R
|
R
P
 
R
S
 
Q
R
 
T
L
 
L
D
 
S
A
 
R
D
 
H
A
 
A
R
 
Y
V
 
R
V
 
H
L
 
L
R
 
A
V
x
F
P
 
R
P
 
P
G
|
G
G
 
S
E
x
D
A
 
V
A
 
A
S
 
M
L
 
L
A
 
N
A
 
A
-
 
M
-
 
L
-
 
N
-
 
V
-
 
I
V
 
V
V
 
T
A
 
E
G
 
G
L
 
L
-
 
Y
-
 
D
-
 
E
-
 
Q
-
 
Y
A
 
I
A
 
A
A
 
G
A
 
Y
G
 
T
E
 
E
N
 
N
L
 
F
S
 
E
G
 
A
E
 
L
T
 
R
I
 
E
D
 
K
A
 
I
V
 
V
G
 
D
A
 
F
T
 
T
I
 
P
G
 
E
R
 
K
P
 
M
S
 
A
E
 
S
S
 
V
A
 
C
G
 
G
S
 
I
E
 
D
-
 
A
E
 
E
S
 
T
D
 
L
R
 
R
L
 
E
V
 
V
A
 
A
G
 
R
L
 
L
R
 
Y
D
 
-
S
 
A
R
 
R
G
 
A
V
 
K
T
 
S
V
 
S
L
 
L
V
 
I
S
 
F
V
 
W
G
|
G
L
x
M
L
x
G
R
 
V
S
 
S
P
x
Q
E
x
H
A
 
V
R
 
H
A
 
G
M
 
T
L
 
-
Q
 
-
Q
 
D
V
 
N
S
 
S
N
 
R
L
 
C
L
 
L
Q
 
I
A
 
A
L
 
L
R
 
A
M
 
L
L
 
I
G
 
T
K
 
G
D
 
Q
-
 
I
-
 
G
-
 
R
-
 
P
-
 
G
P
 
T
A
 
G
M
 
L
Q
 
H
F
 
P
L
 
L
F
 
R
D
x
G
R
x
Q
A
 
N
N
 
N
Q
 
V
M
 
Q
G
 
G
A
 
A
W
 
S
D
 
D
M
 
A
G
 
G
V
 
L
L
 
I
P
 
P
A
 
M
T
 
V
L
 
Y
P
 
P
G
 
D
L
 
Y
R
 
Q
A
 
S
V
 
V
T
 
E
D
 
K
D
 
D
S
 
A
A
 
V
R
 
R
A
 
E
T
 
L
H
 
F
E
 
E
G
 
E
A
 
F
W
 
W
D
 
G
A
 
Q
E
 
S
I
 
L
P
 
D
S
 
P
E
 
Q
P
 
K
G
 
G
A
 
L
N
 
T
L
 
V
D
 
V
A
 
E
I
 
I
L
 
M
D
 
R
L
 
A
C
 
I
V
 
H
D
 
A
G
 
G
R
 
E
M
 
I
G
 
R
A
 
G
L
 
M
Y
 
F
V
 
V
A
 
E
G
|
G
T
 
E
D
x
N
P
 
P
L
 
A
L
 
M
A
x
S
Y
 
D
P
 
P
D
 
D
R
 
L
D
 
N
F
 
H
V
 
A
K
 
R
R
 
H
A
 
A
L
 
L
G
 
A
A
 
M
A
 
L
D
 
D
L
 
H
L
 
L
I
 
V
V
 
V
Q
|
Q
D
|
D
T
x
L
F
 
F
L
 
L
T
 
T
D
 
E
T
 
T
A
 
A
G
 
F
L
 
H
A
 
A
E
 
D
V
 
V
V
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
A
A
 
S
G
 
A
Y
 
F
G
 
A
E
 
E
E
 
K
A
 
A
G
 
G
T
 
T
F
 
F
T
 
T
N
 
N
N
 
T
E
 
D
G
 
R
R
 
R
I
 
V
Q
 
Q
T
 
I
L
 
A
R
 
Q
K
 
P
F
 
V
R
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
P
F
 
G
E
 
D
A
 
A
R
 
R
G
 
Q
N
 
D
L
 
W
E
 
W
V
 
I
F
 
I
E
 
Q
F
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
-
L
 
-
R
 
R
R
 
R
Q
 
L
V
 
D
L
 
L
K
 
D
P
 
W
S
 
N
M
 
Y
Q
 
G
G
 
G
-
 
P
-
 
A
E
 
D
I
 
I
F
 
F
D
 
A
E
 
E
I
 
M
A
 
A
R
 
Q
L
 
V
V
 
M
P
 
P
A
 
S
Y
 
L
Q
 
N
G
 
N
L
 
I
T
 
T
P
 
W
D
 
E
G
 
R
L
 
L
G
 
E
A
 
R
D
 
E
G
 
G
A
 
A
F
 
V
T
 
T
Q
 
Y
A
 
P
D
 
V
P
 
D
T
 
A
P
 
P
P
 
D
A
 
Q
S
 
P
G
 
G
-
 
N
-
 
E
-
 
I
-
 
I
F
 
F
Y
 
Y
P
 
A
A
 
G
P
 
F
P
 
P
T
 
T
F
 
E
-
 
S
-
 
G
-
 
R
-
 
A
-
 
K
-
 
I
-
 
V
-
 
P
-
 
A
-
 
A
-
 
I
-
 
V
-
 
P
-
 
P
-
 
D
E
 
E
V
 
V
R
 
P
D
 
D
G
 
D
-
 
E
-
 
F
-
 
P
L
 
M
M
 
V
L
 
L
V
 
S
T
|
T
G
 
G
D
x
R
C
x
V
L
|
L
-
 
E
-
x
H
F
x
W
H
|
H
N
x
T
G
 
G
Y
 
S
L
x
M
S
 
T
E
 
R
R
 
R
S
 
A
E
 
G
I
 
V
L
 
L
N
 
D
T
 
A
V
 
L
A
 
E
D
 
P
D
 
E
P
 
A
Y
 
V
V
 
A
E
 
F
M
 
M
N
 
A
A
 
P
Q
 
K
E
 
E
A
 
L
Q
 
Y
Q
 
R
L
 
L
G
 
G
I
 
L
S
 
R
D
 
P
G
 
G
D
 
G
Q
 
S
V
 
M
V
 
R
V
 
L
R
 
E
S
 
T
A
 
R
Q
 
R
G
 
G
E
 
A
L
 
V
T
 
V
A
 
L
K
 
K
L
 
V
K
 
R
V
 
S
N
 
D
R
 
R
R
 
D
F
 
V
P
 
P
R
 
I
G
 
G
L
 
M
V
 
I
F
 
F
V
 
M
P
 
P
E
x
F
N
 
C
Y
 
Y

Sites not aligning to the query:

8e9hG Mycobacterial respiratory complex i, fully-inserted quinone (see paper)
31% identity, 94% coverage: 1:819/870 of query aligns to 4:759/782 of 8e9hG

query
sites
8e9hG
M
 
M
V
 
V
R
 
S
I
 
L
T
 
T
I
 
I
D
 
D
A
 
D
Q
 
H
S
 
E
L
 
I
E
 
S
V
 
V
E
 
P
A
 
K
G
 
G
S
 
T
T
 
L
V
 
L
L
 
I
Q
 
R
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
R
 
L
L
 
M
G
 
G
I
 
I
D
 
Q
V
 
I
P
 
P
T
x
R
F
 
F
C
|
C
Y
x
D
L
 
H
E
 
P
R
 
L
L
 
L
P
 
D
P
 
P
L
 
V
A
x
G
S
 
A
C
|
C
R
|
R
M
 
Q
C
|
C
L
 
L
V
 
V
E
 
E
I
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
Q
R
 
R
R
 
K
L
 
P
Q
 
M
P
x
A
S
 
S
C
|
C
A
 
T
T
 
T
A
 
T
V
 
V
T
 
M
D
 
P
G
 
D
M
 
M
V
 
V
V
 
V
R
 
R
T
 
T
-
 
Q
-
 
F
N
 
T
T
 
S
P
 
E
L
 
A
I
 
A
D
 
D
E
 
K
T
 
A
R
 
Q
S
 
R
S
 
G
M
 
V
L
 
M
D
 
E
M
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
I
N
 
N
H
|
H
P
 
P
L
 
L
D
|
D
C
|
C
P
 
P
I
 
I
C
|
C
D
 
D
K
 
K
G
|
G
G
 
G
E
 
E
C
|
C
E
 
P
L
 
L
Q
|
Q
D
 
N
M
 
Q
V
 
A
M
 
M
D
 
S
Y
 
N
G
 
G
P
 
R
R
 
P
R
 
E
S
 
T
E
 
R
F
 
F
R
 
E
D
 
D
P
 
V
K
 
K
R
 
R
V
 
T
F
 
F
H
 
-
S
 
P
R
 
K
D
 
P
I
 
I
R
 
S
L
 
I
S
 
S
P
 
S
V
 
Q
I
 
V
I
 
L
M
 
L
N
 
D
V
 
R
N
 
E
R
 
R
C
|
C
I
x
V
Q
x
L
C
|
C
Q
x
A
R
|
R
C
|
C
V
 
T
R
 
R
M
 
F
C
 
S
E
 
S
E
 
Q
V
 
I
V
 
A
G
 
G
A
 
D
V
 
P
A
 
F
L
 
I
G
 
D
T
 
L
V
 
M
E
 
E
K
 
R
G
 
G
M
 
A
D
 
L
T
 
Q
A
 
Q
V
 
V
T
 
G
G
 
I
F
 
G
E
 
Q
G
 
D
S
 
K
L
 
P
A
 
F
S
 
Q
C
 
S
D
 
Y
Q
 
F
C
 
S
G
 
G
N
 
N
C
 
T
V
 
V
Q
 
Q
V
 
I
C
|
C
P
|
P
V
|
V
G
 
G
A
|
A
L
|
L
M
 
T
S
 
G
F
 
T
P
 
A
Y
 
Y
R
 
R
Y
 
F
K
 
R
A
 
A
R
 
R
P
 
P
W
 
F
D
 
D
L
 
L
A
 
V
E
 
S
T
 
S
D
 
P
T
 
S
I
 
V
C
|
C
P
 
E
H
 
H
C
|
C
G
 
A
T
x
S
G
 
G
C
|
C
Q
 
A
L
 
Q
T
 
R
V
 
T
G
 
D
A
 
H
R
 
R
K
 
R
G
 
G
E
 
K
F
 
V
M
 
L
R
 
R
V
 
R
R
 
L
S
 
A
K
 
G
P
 
D
E
 
E
H
 
P
G
 
E
V
 
V
N
 
N
R
 
E
E
 
E
T
 
W
L
x
N
C
|
C
V
 
D
R
 
K
G
|
G
R
 
R
F
 
W
G
 
A
L
 
F
D
 
T
F
 
Y
V
 
A
E
 
T
S
 
V
R
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
I
K
 
T
R
 
T
P
 
P
M
 
M
I
 
L
R
 
R
R
 
D
D
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
L
V
 
R
P
 
P
V
 
A
S
 
S
W
 
W
S
 
S
E
 
E
A
 
A
G
 
-
D
 
L
H
 
T
L
 
V
R
 
A
R
 
A
R
 
A
L
 
G
A
 
L
A
 
L
V
 
T
E
 
A
N
 
A
K
 
G
A
 
S
A
 
T
G
 
G
G
 
V
L
 
L
A
 
V
S
 
G
A
 
G
R
|
R
L
 
C
P
 
T
N
 
V
E
 
E
V
 
D
L
 
A
Y
 
Y
Q
 
A
F
 
Y
Q
 
A
K
 
K
L
 
F
M
 
A
R
 
R
T
 
M
V
 
V
F
 
L
R
 
N
T
 
T
N
 
N
N
 
D
I
 
V
D
 
D
C
 
F
S
 
R
S
 
A
R
 
R
W
 
P
S
 
H
A
 
S
P
 
A
F
 
E
D
 
E
T
 
A
-
 
E
-
 
F
L
 
L
G
 
A
P
 
A
L
 
H
L
 
V
G
 
A
G
 
G
F
 
Q
Y
 
T
T
 
M
R
 
G
A
 
L
P
 
R
L
 
Y
Q
 
A
E
 
E
V
 
L
I
 
E
D
 
N
K
 
A
D
 
P
C
 
T
V
 
V
L
 
L
V
 
L
I
 
A
G
 
G
G
 
F
N
 
E
V
 
P
T
 
E
E
 
E
E
 
E
N
 
S
P
|
P
V
x
I
T
 
V
E
 
F
Y
 
L
L
 
R
L
 
L
R
 
R
D
 
K
A
 
G
V
 
V
R
 
R
Q
 
K
R
 
N
Q
 
G
A
 
V
G
 
Q
L
 
V
L
 
V
L
 
A
L
 
V
S
 
A
A
 
P
R
 
W
P
 
A
S
 
S
R
 
R
-
 
G
L
 
L
D
 
T
A
 
K
D
 
L
A
 
A
R
 
G
V
 
T
V
 
V
L
 
V
R
 
P
V
 
T
P
 
V
P
 
P
G
 
G
G
 
D
E
 
E
A
 
P
A
 
A
S
 
A
L
 
L
A
 
-
A
 
-
V
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
-
N
 
-
L
 
-
S
 
-
G
 
-
E
 
-
T
 
-
I
 
-
D
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
-
A
 
-
T
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
S
 
-
E
 
-
S
 
-
A
 
D
G
 
G
S
 
M
E
 
H
E
 
D
S
 
D
D
 
D
R
 
R
L
 
L
V
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
-
D
 
R
S
 
R
R
 
P
G
 
G
V
 
A
T
 
V
V
 
I
L
 
L
V
 
V
S
 
G
V
 
E
G
 
R
L
 
L
L
 
A
R
 
T
S
 
S
P
 
P
E
 
G
A
 
A
R
 
-
A
 
-
M
 
-
L
 
-
Q
 
-
Q
 
-
V
 
-
S
 
-
N
 
-
L
 
L
L
 
S
Q
 
A
A
 
A
L
 
V
R
 
R
M
 
L
L
 
A
G
 
A
K
 
A
D
 
T
P
 
G
A
 
A
-
 
R
M
 
L
Q
 
A
F
 
W
L
 
I
F
 
P
D
x
R
R
|
R
A
 
A
N
 
G
Q
 
E
M
 
R
G
 
G
A
 
A
W
 
I
D
 
E
M
 
A
G
 
G
V
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
N
T
 
L
L
 
L
P
 
P
G
 
G
L
 
G
R
 
R
A
 
P
V
 
V
T
 
D
D
 
D
D
 
A
S
 
D
A
 
A
R
 
R
A
 
A
T
 
E
H
 
V
E
 
A
G
 
R
A
 
A
W
 
W
D
 
Y
-
 
I
A
 
S
E
 
A
I
 
L
P
 
P
S
 
E
E
 
A
P
 
P
G
 
G
A
 
R
N
 
D
L
 
T
D
 
A
A
 
A
I
 
I
L
 
L
D
 
S
L
 
T
C
 
A
V
 
A
D
 
S
G
 
G
R
 
H
M
 
L
G
 
A
A
 
A
L
 
L
Y
 
L
V
 
V
A
 
G
G
|
G
T
 
V
D
x
E
P
 
-
L
 
L
L
 
G
A
x
D
Y
 
L
P
 
P
D
 
D
R
 
P
D
 
E
F
 
L
V
 
A
K
 
V
R
 
A
A
 
A
L
 
V
G
 
R
A
 
T
A
 
T
D
 
P
L
 
F
L
 
V
I
 
V
V
 
S
Q
x
L
D
x
E
T
 
L
F
x
R
L
 
E
T
 
S
D
 
A
T
 
V
A
 
T
G
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
D
V
 
V
V
 
V
L
 
F
P
 
P
A
 
V
A
 
A
G
 
P
Y
 
V
G
 
V
E
 
E
E
 
K
A
 
A
G
 
G
T
 
S
F
 
F
T
 
L
N
 
N
N
 
W
E
 
E
G
 
G
R
 
R
I
 
P
Q
 
-
T
 
-
L
 
-
R
 
R
K
 
P
F
 
F
R
 
-
A
 
A
P
 
P
A
 
S
F
 
L
E
 
K
A
 
T
R
 
N
G
 
A
-
 
I
-
 
P
N
x
D
L
 
L
E
 
R
V
 
V
F
 
L
E
 
H
F
 
Y
V
 
L
A
 
A
A
 
-
L
 
-
R
 
-
R
 
-
Q
 
-
V
 
-
L
 
-
K
 
-
P
 
-
S
 
-
M
 
-
Q
 
-
G
 
-
E
 
-
I
 
-
F
 
-
D
 
D
E
 
E
I
 
I
A
 
-
R
 
-
L
 
-
V
 
-
P
 
-
A
 
G
Y
 
V
Q
 
D
G
 
L
L
 
A
T
 
L
P
 
P
D
 
T
G
 
A
L
 
E
G
 
A
A
 
A
D
 
D
G
 
A
A
 
E
F
 
L
T
 
A
Q
 
Q
A
 
L
D
 
G
P
 
T
-
 
W
-
 
G
-
 
G
T
 
A
P
 
R
P
 
P
A
 
P
S
 
A
G
 
P
F
 
T
Y
 
A
P
 
P
A
 
P
P
 
T
P
 
A
T
 
R
F
 
P
E
 
E
V
 
A
R
 
G
D
 
S
G
 
G
-
 
Q
L
 
A
M
 
V
L
 
L
V
 
A
T
 
S
G
 
W
D
x
R
C
 
M
L
 
L
F
 
L
H
 
D
N
 
A
G
|
G
Y
x
R
L
|
L
S
 
Q
E
 
D
R
 
G
S
 
E
E
 
P
I
 
H
L
 
L
N
 
A
T
 
G
V
 
T
A
 
A
D
 
V
D
 
R
P
 
P
Y
 
V
V
 
A
E
 
R
M
 
M
N
 
S
A
 
A
Q
 
A
E
 
T
A
 
A
Q
 
A
Q
 
G
L
 
I
G
 
G
I
 
A
S
 
S
D
 
D
G
 
G
D
 
A
Q
 
P
V
 
V
V
 
T
V
 
V
R
 
S
S
 
T
A
 
E
Q
 
R
G
 
G
E
 
A
L
 
V
T
 
T
A
 
L
K
 
P
L
 
L
K
 
A
V
 
V
N
 
T
R
 
-
R
 
D
F
 
M
P
 
P
R
 
D
G
 
G
L
 
V
V
 
V
F
 
W
V
 
L
P
 
P
E
 
M
N
 
N

7arcG Cryo-em structure of polytomella complex-i (peripheral arm) (see paper)
29% identity, 81% coverage: 2:703/870 of query aligns to 6:619/682 of 7arcG

query
sites
7arcG
V
 
M
R
 
E
I
 
V
T
 
F
I
 
V
D
 
N
A
 
G
Q
 
E
S
 
A
L
 
V
E
 
V
V
 
V
E
 
P
A
 
K
G
 
N
S
 
F
T
 
T
V
 
V
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
A
 
C
Q
 
D
R
 
A
L
 
A
G
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
V
P
 
P
T
x
R
F
 
F
C
|
C
Y
|
Y
L
 
H
E
 
Q
R
 
R
L
 
L
P
 
S
P
 
I
L
 
A
A
x
G
S
 
N
C
|
C
R
|
R
M
 
M
C
|
C
L
 
L
V
 
V
E
 
E
I
 
I
E
 
E
G
 
K
L
 
A
R
 
P
R
 
K
L
 
P
Q
 
V
P
 
A
S
 
S
C
|
C
A
 
A
T
 
F
A
 
P
V
 
A
T
 
G
D
 
P
G
 
G
M
 
M
V
 
K
V
 
I
R
 
K
T
 
T
N
 
D
T
 
T
P
 
P
L
 
V
I
 
I
D
 
K
E
 
K
T
 
A
R
 
R
S
 
E
S
 
G
M
 
V
L
 
M
D
 
E
M
 
F
L
 
L
L
 
L
A
 
I
N
 
N
H
|
H
P
 
P
L
 
L
D
|
D
C
|
C
P
 
P
I
 
I
C
|
C
D
 
D
K
x
Q
G
 
G
G
 
G
E
 
E
C
|
C
E
 
D
L
 
L
Q
|
Q
D
 
D
M
 
Q
V
 
A
M
 
M
D
 
I
Y
 
F
G
 
G
P
 
S
R
 
D
R
 
R
S
 
S
E
 
R
F
 
F
R
 
I
D
 
E
P
 
Y
K
 
K
R
 
R
V
 
A
F
 
V
H
 
A
S
 
D
R
 
K
D
 
N
I
 
-
R
 
-
L
 
L
S
 
G
P
 
P
V
 
L
I
 
I
I
 
K
M
 
T
N
 
S
V
 
M
N
 
N
R
 
R
C
|
C
I
|
I
Q
 
H
C
|
C
Q
 
T
R
 
R
C
|
C
V
 
V
R
 
R
M
 
F
C
 
T
E
 
H
E
 
E
V
 
V
V
 
A
G
 
G
A
 
T
V
 
S
A
 
E
L
 
L
G
 
G
T
 
I
V
 
T
E
 
G
K
 
R
G
 
G
M
 
R
D
 
D
T
 
S
A
 
E
V
 
V
T
 
G
G
 
T
F
 
Y
E
 
I
G
 
E
S
 
K
L
 
L
A
 
H
S
 
S
C
 
S
D
 
E
Q
 
L
C
 
S
G
 
G
N
 
N
C
 
V
V
 
I
Q
 
D
V
 
L
C
|
C
P
 
P
V
|
V
G
 
G
A
|
A
L
|
L
M
 
L
S
 
S
F
 
K
P
 
P
Y
 
Y
R
 
A
Y
 
F
K
 
T
A
 
A
R
 
R
P
 
S
W
 
W
D
 
E
L
 
L
A
 
K
E
 
G
T
 
T
D
 
E
T
 
T
I
 
I
C
 
D
P
 
V
H
 
S
C
 
D
G
 
A
T
 
L
G
 
G
C
 
S
Q
 
N
L
 
I
T
 
K
V
 
V
G
 
D
A
 
C
R
 
R
K
 
G
G
 
T
E
 
E
F
 
V
M
 
M
R
 
R
V
 
I
R
 
T
S
 
P
K
 
R
P
 
L
E
 
N
H
 
D
G
 
A
V
 
I
N
 
N
R
 
E
E
 
E
T
 
W
L
 
L
C
 
S
V
 
D
R
 
K
G
 
G
R
 
R
F
 
F
G
 
Q
L
 
Y
D
 
D
F
 
G
V
 
L
E
x
K
S
 
-
R
 
R
D
x
Q
R
|
R
I
 
L
K
x
N
R
 
T
P
 
P
M
 
L
I
 
V
R
 
K
R
 
G
D
 
A
G
 
K
V
 
G
L
 
L
V
 
E
P
 
N
V
 
A
S
 
T
W
 
W
S
 
S
E
 
A
A
 
A
G
 
F
D
 
D
H
 
A
L
 
I
R
 
R
R
 
T
R
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
G
V
 
A
E
 
K
N
 
G
K
 
N
A
 
E
A
 
L
G
 
K
G
 
A
L
 
I
A
 
A
S
 
G
A
 
K
R
 
L
L
 
A
P
 
D
N
 
A
E
 
E
V
 
S
L
 
M
Y
 
I
Q
 
A
F
 
L
Q
 
K
K
 
D
L
 
L
M
 
F
R
 
N
T
 
K
V
 
L
F
 
G
R
 
S
T
 
G
N
 
N
N
 
L
I
 
I
-
 
H
-
 
E
D
 
D
C
 
G
S
 
S
S
 
A
R
 
T
W
 
L
S
 
S
A
 
A
P
 
D
F
 
V
D
 
R
T
 
S
L
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
S
F
 
Y
Y
 
I
T
 
A
R
 
N
A
 
T
P
 
T
L
 
I
Q
 
A
E
 
S
V
 
I
I
 
E
D
 
K
K
 
A
D
 
D
C
 
V
V
 
I
L
 
L
V
 
L
I
 
V
G
 
G
G
 
T
N
 
N
V
 
P
T
 
R
E
 
F
E
 
E
N
 
S
P
 
P
V
 
V
T
 
F
E
 
N
Y
 
A
L
 
R
L
 
L
R
 
R
D
 
K
A
 
-
V
 
V
R
 
F
Q
 
L
R
 
D
Q
 
G
A
 
A
G
 
K
L
 
V
L
 
G
L
 
L
L
 
V
S
 
G
A
 
E
R
 
K
P
 
V
S
 
D
R
 
L
L
 
T
D
 
Y
A
 
A
D
 
Y
A
 
Q
R
 
H
V
 
L
V
 
-
L
 
-
R
 
-
V
 
-
P
 
-
P
 
-
G
 
G
G
 
A
E
 
D
A
 
V
A
 
A
S
 
A
L
 
L
A
 
E
A
 
S
V
 
L
V
 
A
A
 
S
G
 
G
L
 
K
A
 
G
A
 
A
A
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
-
N
 
-
L
 
-
S
 
-
G
 
-
E
 
-
T
 
-
I
 
-
D
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
-
A
 
-
T
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
S
 
-
E
 
-
S
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
-
E
 
-
E
 
-
S
 
-
D
 
-
R
 
-
L
 
F
V
 
F
A
 
E
G
 
A
L
 
L
R
 
K
D
 
G
S
 
A
R
 
K
G
 
N
V
 
P
T
 
V
V
 
V
L
 
I
V
 
V
S
 
G
V
 
S
G
 
S
L
 
V
L
 
L
R
 
R
S
 
R
P
 
D
E
 
D
A
 
R
R
 
E
A
 
A
M
 
V
L
 
L
Q
 
K
Q
 
T
V
 
V
S
 
N
N
 
D
L
 
L
L
 
V
Q
 
D
A
 
A
L
 
A
R
 
G
M
 
V
L
 
V
G
 
K
K
 
E
D
 
G
-
 
W
P
 
N
A
 
G
M
 
F
Q
 
N
F
 
V
L
 
L
F
 
H
D
 
D
R
 
N
A
 
A
N
 
S
Q
 
R
M
 
V
G
 
A
A
 
A
W
 
L
D
 
D
M
 
I
G
 
G
V
 
F
L
 
V
P
 
P
A
 
S
T
 
A
L
 
-
P
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
D
 
-
S
 
S
A
 
A
R
 
R
A
 
T
T
 
N
H
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
W
 
-
D
 
-
A
 
-
E
 
P
I
 
V
P
 
P
S
 
A
E
 
K
P
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
C
 
-
V
 
-
D
 
-
G
 
-
R
 
-
M
 
-
G
 
-
A
 
V
L
 
V
Y
 
Y
V
 
L
A
 
L
G
 
G
T
 
S
D
 
D
P
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
Y
 
-
P
 
-
D
 
-
R
 
-
D
 
D
F
 
F
V
 
K
K
 
D
R
 
E
A
 
E
L
 
I
G
 
P
A
 
A
A
 
D
D
 
A
L
 
F
L
 
V
I
 
I
V
 
Y
Q
 
Q
D
 
G
T
 
H
F
 
H
L
x
G
T
 
D
D
 
K
T
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
R
A
 
A
E
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
G
A
 
A
G
 
A
Y
 
Y
G
 
T
E
 
E
E
 
K
A
 
A
G
 
S
T
 
L
F
 
F
T
 
A
N
 
N
N
 
T
E
 
E
G
 
G
R
 
R
I
 
V
Q
 
Q
T
 
T
L
 
T
R
 
R
K
 
T
F
 
A
R
 
V
A
 
P
P
 
V
A
x
L
F
 
G
E
 
D
A
 
A
R
 
R
G
 
E
N
 
D
L
 
W
E
 
K
V
 
I
F
 
I
E
 
R
F
 
A
V
 
L
A
 
S
A
 
E
L
 
V
R
 
V
R
 
G
Q
 
Q
V
 
Q
L
 
L
K
 
P
P
 
Y
S
 
D
M
 
S
Q
 
Q
G
 
P
E
 
Q
I
 
V
F
 
R
D
 
A
E
 
R
I
 
L
A
 
A
R
 
E
L
 
V
V
 
A
P
 
P
A
 
H
Y
 
F

Q91VD9 NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial; Complex I-75kD; CI-75kD; EC 7.1.1.2 from Mus musculus (Mouse) (see paper)
29% identity, 78% coverage: 1:679/870 of query aligns to 31:629/727 of Q91VD9

query
sites
Q91VD9
M
 
L
V
 
I
R
 
E
I
 
V
T
 
F
I
 
V
D
 
D
A
 
G
Q
 
Q
S
 
S
L
 
V
E
 
M
V
 
V
E
 
E
A
 
P
G
 
G
S
 
T
T
 
T
V
 
V
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
A
 
C
Q
 
E
R
 
K
L
 
V
G
 
G
I
 
M
D
 
Q
V
 
I
P
 
P
T
 
R
F
 
F
C
|
C
Y
 
Y
L
 
H
E
 
E
R
 
R
L
 
L
P
 
S
P
 
V
L
 
A
A
 
G
S
 
N
C
|
C
R
 
R
M
 
M
C
|
C
L
 
L
V
 
V
E
 
E
I
 
I
E
 
E
G
 
K
L
 
A
R
 
P
R
 
K
L
 
V
Q
 
V
P
 
A
S
 
A
C
|
C
A
 
A
T
 
M
A
 
P
V
 
V
T
 
M
D
 
K
G
 
G
M
 
W
V
 
N
V
 
I
R
 
L
T
 
T
N
 
N
T
 
S
P
 
E
L
 
K
I
 
S
D
 
K
E
 
K
T
 
A
R
 
R
S
 
E
S
 
G
M
 
V
L
 
M
D
 
E
M
 
F
L
 
L
L
 
L
A
 
A
N
 
N
H
|
H
P
 
P
L
 
L
D
 
D
C
|
C
P
 
P
I
 
I
C
|
C
D
 
D
K
 
Q
G
 
G
G
 
G
E
 
E
C
|
C
E
 
D
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
M
 
Q
V
 
S
M
 
M
D
 
M
Y
 
F
G
 
G
P
 
S
R
 
D
R
 
R
S
 
S
E
 
R
F
 
F
R
 
L
D
 
E
P
 
G
K
 
K
R
 
R
V
 
A
F
 
V
H
 
E
S
 
D
R
 
K
D
 
N
I
 
I
R
 
-
L
 
-
S
 
G
P
 
P
V
 
L
I
 
V
I
 
K
M
 
T
N
 
I
V
 
M
N
 
T
R
 
R
C
|
C
I
 
I
Q
 
Q
C
|
C
Q
 
T
R
 
R
C
|
C
V
 
I
R
 
R
M
 
F
C
 
A
E
 
S
E
 
E
V
 
I
V
 
A
G
 
G
A
 
V
V
 
D
A
 
D
L
 
L
G
 
G
T
 
T
V
 
T
E
 
G
K
 
R
G
 
G
M
 
N
D
 
D
T
 
M
A
 
Q
V
 
V
T
 
G
G
 
T
F
 
Y
E
 
I
G
 
E
S
 
K
L
 
M
A
 
F
S
 
M
C
 
S
D
 
E
Q
 
L
C
 
S
G
 
G
N
 
N
C
 
V
V
 
I
Q
 
D
V
 
I
C
|
C
P
 
P
V
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
L
M
 
T
S
 
S
F
 
K
P
 
P
Y
 
Y
R
 
A
Y
 
F
K
 
T
A
 
A
R
 
R
P
 
P
W
 
W
D
 
E
L
 
T
A
 
R
E
 
K
T
 
T
D
 
E
T
 
S
I
 
I
C
 
D
P
 
V
H
 
M
C
 
D
G
 
A
T
 
V
G
 
G
C
 
S
Q
 
N
L
 
I
T
 
V
V
 
V
G
 
S
A
 
T
R
 
R
K
 
T
G
 
G
E
 
E
F
 
V
M
 
M
R
 
R
V
 
I
R
 
L
S
 
P
K
 
R
P
 
M
E
 
H
H
 
E
G
 
D
V
 
I
N
 
N
R
 
E
E
 
E
T
 
W
L
 
I
C
 
S
V
 
D
R
 
K
G
 
T
R
 
R
F
 
F
G
 
A
L
 
Y
D
 
D
F
 
G
V
 
L
E
 
K
S
 
-
R
 
R
D
 
Q
R
 
R
I
 
L
K
 
T
R
 
E
P
 
P
M
 
M
I
 
V
R
 
R
R
 
N
D
 
E
-
 
K
G
 
G
V
 
L
L
 
L
V
 
T
P
 
Y
V
 
T
S
 
S
W
 
W
S
 
E
E
 
D
A
 
A
G
 
L
D
 
S
H
 
R
L
 
V
R
 
A
R
 
G
R
 
M
L
 
L
A
 
Q
A
 
N
V
 
F
E
 
E
N
 
G
K
 
N
A
 
A
A
 
V
G
 
A
G
 
A
L
 
I
A
 
A
S
 
G
A
 
G
R
 
L
L
 
V
P
 
D
N
 
A
E
 
E
V
 
A
L
 
L
Y
 
V
Q
 
A
F
 
L
Q
 
K
K
 
D
L
 
L
M
 
L
R
 
N
T
 
K
V
 
V
F
 
-
R
 
D
T
 
S
N
 
D
N
 
N
I
 
L
D
 
-
C
 
C
S
 
T
S
 
E
R
 
E
W
 
I
S
 
-
A
 
-
P
 
-
F
 
F
D
 
P
T
 
T
L
 
E
G
 
G
P
 
A
-
 
G
-
 
T
-
 
D
L
 
L
L
 
R
G
 
S
G
 
N
F
 
Y
Y
 
L
T
 
L
R
 
N
A
 
T
P
 
T
L
 
I
Q
 
A
E
 
G
V
 
V
I
 
E
D
 
E
K
 
A
D
 
D
C
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
L
I
 
V
G
 
G
G
 
T
N
 
N
V
 
P
T
 
R
E
 
F
E
 
E
N
 
A
P
 
P
V
 
L
T
 
F
E
 
N
Y
 
A
L
 
R
L
 
I
R
 
R
D
 
K
A
 
S
V
 
W
R
 
L
Q
 
H
R
 
N
Q
 
D
A
 
L
G
 
K
L
 
V
L
 
A
L
 
L
L
 
I
S
 
G
A
 
S
R
 
-
P
 
P
S
 
V
R
 
D
L
 
L
D
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
V
 
-
V
 
T
L
 
Y
R
 
R
V
 
Y
P
 
D
P
 
H
G
 
L
G
 
G
E
 
D
A
 
S
A
 
P
S
 
K
L
 
I
A
 
L
A
 
Q
V
 
D
V
 
I
A
 
A
G
 
S
L
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
-
N
 
-
L
 
-
S
 
-
G
 
-
E
 
-
T
 
-
I
 
-
D
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
-
A
 
-
T
 
-
I
 
-
G
 
G
R
 
R
P
 
H
S
 
S
E
 
-
S
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
-
E
 
-
E
 
-
S
 
-
D
 
-
R
 
-
L
 
F
V
 
C
A
 
E
G
 
V
L
 
L
R
 
K
D
 
D
S
 
A
R
 
K
G
 
K
V
 
P
T
 
M
V
 
V
L
 
V
V
 
L
S
 
G
V
 
S
G
 
S
L
 
A
L
 
L
R
 
Q
S
 
R
P
 
D
E
 
D
A
 
G
R
 
A
A
 
A
M
 
I
L
 
L
Q
 
V
Q
 
A
V
 
V
S
 
S
N
 
N
L
 
M
L
 
V
Q
 
Q
A
 
K
L
 
I
R
 
R
M
 
V
L
 
T
-
 
T
-
 
G
-
 
V
-
 
A
G
 
A
K
 
E
D
 
W
P
 
K
A
 
V
M
 
M
Q
 
N
F
 
I
L
 
L
F
 
H
D
 
R
R
 
I
A
 
A
N
 
S
Q
 
Q
M
 
V
G
 
A
A
 
A
W
 
L
D
 
D
M
 
L
G
 
G
V
 
Y
L
 
-
P
 
-
A
 
-
T
 
-
L
 
K
P
 
P
G
 
G
L
 
V
R
 
E
A
 
A
V
 
I
T
 
R
D
 
K
D
 
N
S
 
P
A
 
P
R
 
K
A
 
-
T
 
-
H
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
W
 
-
D
 
-
A
 
-
E
 
-
I
 
-
P
 
-
S
 
-
E
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
C
 
-
V
 
-
D
 
-
G
 
-
R
 
-
M
 
-
G
 
-
A
 
M
L
 
L
Y
 
F
V
 
L
A
 
L
G
 
G
T
 
A
D
 
D
P
 
G
L
 
-
L
 
-
A
 
-
Y
 
-
P
 
-
D
 
-
R
 
-
D
 
G
F
 
C
V
 
I
K
 
T
R
 
R
A
 
Q
L
 
D
G
 
L
A
 
P
A
 
K
D
 
D
L
 
C
L
 
F
I
 
I
V
 
V
Q
 
Y
D
 
Q
T
 
G
F
 
H
L
 
H
T
 
G
D
 
D
T
 
V
-
 
G
A
 
A
G
 
P
L
 
M
A
 
A
E
 
D
V
 
V
V
 
I
L
 
L
P
 
P
A
 
G
A
 
A
G
 
A
Y
 
Y
G
 
T
E
 
E
E
 
K
A
 
S
G
 
A
T
 
T
F
 
Y
T
 
V
N
 
N
N
 
T
E
 
E
G
 
G
R
 
R
I
 
A
Q
 
Q
T
 
Q
L
 
T
R
 
K
K
 
V
F
 
A
R
 
V
A
 
T
P
 
P
A
 
P
F
 
G
E
 
L
A
 
A
R
 
R
G
 
E
N
 
D
L
 
W
E
 
K
V
 
I
F
 
I
E
 
R
F
 
A
V
 
L
A
 
S
A
 
E
L
 
I

7b0nG 3.7-angstrom structure of Yarrowia lipolytica complex I with an R121M mutation in NUCM. (see paper)
28% identity, 81% coverage: 2:702/870 of query aligns to 3:621/694 of 7b0nG

query
sites
7b0nG
V
 
I
R
 
E
I
 
L
T
 
T
I
 
I
D
 
D
A
 
G
Q
 
H
S
 
K
L
 
V
E
 
S
V
 
I
E
 
E
A
 
A
G
 
G
S
 
S
T
 
A
V
 
L
L
 
I
Q
 
Q
A
 
A
A
 
C
Q
 
E
R
 
K
L
 
A
G
 
G
I
 
V
D
 
T
V
 
V
P
 
P
T
 
R
F
 
Y
C
|
C
Y
 
Y
L
 
H
E
 
D
R
 
K
L
 
L
P
 
A
P
 
I
L
 
A
A
x
G
S
 
N
C
|
C
R
|
R
M
 
M
C
|
C
L
 
L
V
 
V
E
 
D
I
 
V
E
 
E
G
 
R
L
 
A
R
 
P
R
 
K
L
 
P
Q
 
V
P
 
A
S
 
S
C
|
C
A
 
A
T
 
Y
A
 
P
V
 
V
T
 
A
D
 
P
G
 
G
M
 
M
V
 
V
V
 
V
R
 
R
T
 
T
N
 
D
T
 
T
P
 
E
L
 
R
I
 
V
D
 
K
E
 
Q
T
 
A
R
 
R
S
 
E
S
 
N
M
 
V
L
 
M
D
 
E
M
 
M
L
 
M
L
 
L
A
 
Q
N
 
N
H
|
H
P
 
P
L
 
L
D
 
D
C
|
C
P
 
P
I
 
V
C
|
C
D
 
D
K
 
Q
G
 
G
G
 
G
E
 
E
C
|
C
E
 
D
L
 
L
Q
|
Q
D
 
D
M
 
Q
V
 
S
M
 
M
D
 
R
Y
 
Y
G
 
G
P
 
R
R
 
D
R
 
R
S
 
G
E
 
R
F
 
F
R
 
T
D
 
E
P
 
I
K
 
T
R
 
G
V
 
K
F
 
R
H
 
S
S
 
T
R
 
E
D
 
D
I
 
K
R
 
N
L
 
I
S
 
G
P
 
P
V
 
L
I
 
V
I
 
K
M
 
T
N
 
S
V
 
M
N
 
N
R
 
R
C
|
C
I
 
I
Q
x
H
C
|
C
Q
x
T
R
 
R
C
|
C
V
 
V
R
 
R
M
 
F
C
 
A
E
 
N
E
 
D
V
 
I
V
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
P
A
 
E
L
 
L
G
 
G
T
 
S
V
 
S
E
 
G
K
 
R
G
 
G
M
 
N
D
 
D
T
 
M
A
 
Q
V
 
I
T
 
G
G
 
T
F
 
Y
E
 
L
G
 
E
S
 
K
L
 
N
A
 
L
S
 
N
C
 
T
D
 
E
Q
 
L
C
 
S
G
 
G
N
 
N
C
 
V
V
 
I
Q
 
D
V
 
L
C
|
C
P
 
P
V
|
V
G
 
G
A
 
A
L
 
L
M
 
T
S
 
N
F
 
K
P
 
P
Y
 
Y
R
 
A
Y
 
F
K
 
R
A
 
A
R
 
R
P
 
P
W
 
W
D
 
E
L
 
L
A
 
K
E
 
K
T
 
T
D
 
E
T
 
S
I
 
I
C
 
D
P
 
V
H
 
M
C
 
D
G
 
A
T
 
V
G
 
G
C
 
S
Q
 
N
L
 
I
T
 
R
V
 
I
G
 
D
A
 
S
R
 
K
K
 
G
G
 
V
E
 
E
F
 
V
M
 
M
R
 
R
V
 
V
R
 
I
S
 
P
K
 
R
P
 
V
E
 
H
H
 
E
G
 
D
V
 
V
N
 
N
R
 
E
E
 
E
T
 
W
L
 
I
C
 
N
V
 
D
R
 
K
G
 
S
R
 
R
F
 
F
G
 
A
L
 
C
D
 
D
F
 
G
V
 
L
E
 
K
S
 
T
R
 
Q
D
 
-
R
 
R
I
 
L
K
 
T
R
 
T
P
 
P
M
 
L
I
 
I
R
 
R
R
 
V
D
 
G
G
 
D
V
 
K
L
 
F
V
 
V
P
 
N
V
 
A
S
 
T
W
 
W
S
 
D
E
 
D
A
 
A
G
 
-
D
 
-
H
 
-
L
 
L
R
 
S
R
 
T
R
 
I
L
 
A
A
 
K
A
 
A
V
 
Y
E
 
Q
N
 
Q
K
 
K
A
 
A
A
 
P
G
 
K
G
 
G
-
 
D
-
 
E
-
 
F
-
 
K
-
 
A
L
 
V
A
 
A
S
 
G
A
 
A
R
 
L
L
 
V
P
 
E
N
 
V
E
 
E
V
 
S
L
 
M
Y
 
V
Q
 
A
F
 
L
Q
 
K
K
 
D
L
 
M
M
 
T
R
 
N
T
 
A
V
 
L
F
 
G
R
 
S
T
 
E
N
 
N
-
 
T
N
 
T
I
 
T
D
 
D
C
 
T
S
 
P
S
 
N
R
 
G
W
 
N
S
 
S
A
 
A
P
 
P
F
 
A
D
 
H
T
 
G
L
 
I
G
 
-
P
 
T
L
 
F
L
 
R
G
 
S
G
 
N
F
 
Y
Y
 
L
T
 
F
R
 
N
A
 
S
P
 
S
L
 
I
Q
 
A
E
 
G
V
 
I
I
 
E
D
 
D
K
 
A
D
 
D
C
 
A
V
 
I
L
 
L
V
 
L
I
 
V
G
 
G
G
 
T
N
 
N
V
 
P
T
 
R
E
 
R
E
 
E
N
 
A
P
 
A
V
 
V
T
 
M
E
 
N
Y
 
A
L
 
R
L
 
I
R
 
R
D
 
K
A
 
A
V
 
W
R
 
L
Q
 
R
R
 
Q
Q
 
E
A
 
-
G
 
-
L
 
L
L
 
E
L
 
I
L
 
A
S
 
S
A
 
V
R
 
G
P
 
P
S
 
T
R
 
-
L
 
L
D
 
D
A
 
A
D
 
T
A
 
F
R
 
D
V
 
V
V
 
-
L
 
-
R
 
-
V
 
-
P
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
A
S
 
E
L
 
L
A
 
G
A
 
N
V
 
T
V
 
H
A
 
A
G
 
D
L
 
L
A
 
E
A
 
K
A
 
A
A
 
-
G
 
-
E
 
-
N
 
-
L
 
L
S
 
S
G
 
G
E
 
E
T
 
F
I
 
G
D
 
E
A
 
V
V
 
-
G
 
-
A
 
-
T
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
S
 
-
E
 
-
S
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
-
E
 
-
E
 
-
S
 
-
D
 
-
R
 
-
L
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
L
R
 
K
D
 
N
S
 
A
R
 
K
G
 
N
V
 
P
T
 
L
V
 
I
L
 
I
V
 
V
S
 
G
V
 
S
G
 
G
L
 
I
L
 
T
R
 
D
S
 
R
P
 
E
E
 
D
A
 
A
R
 
G
A
 
A
M
 
F
L
 
F
Q
 
N
Q
 
T
V
 
I
S
 
G
N
 
K
L
 
F
L
 
V
Q
 
E
A
 
S
L
 
T
-
 
P
R
 
S
M
 
V
L
 
L
G
 
N
K
 
E
D
 
N
P
 
W
A
 
N
M
 
G
Q
 
Y
F
 
N
L
 
V
F
 
L
D
 
Q
R
 
R
-
 
S
A
 
A
N
 
S
Q
 
R
M
 
A
G
 
G
A
 
A
W
 
Y
D
 
D
M
 
I
G
 
G
V
 
F
L
 
T
P
 
P
A
 
-
T
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
T
 
S
D
 
D
D
 
E
S
 
A
A
 
S
R
 
K
A
 
T
T
 
T
H
 
P
E
 
K
G
 
M
A
 
V
W
 
W
D
 
-
A
 
-
E
 
-
I
 
-
P
 
-
S
 
-
E
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
C
 
-
V
 
-
D
 
-
G
 
-
R
 
L
M
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
D
Y
 
E
V
 
V
A
 
A
G
 
A
T
 
S
D
 
D
P
 
I
L
 
-
L
 
-
A
 
-
Y
 
-
P
 
-
D
 
-
R
 
-
D
 
-
F
 
-
V
 
-
K
 
-
R
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
A
 
P
A
 
A
D
 
D
L
 
A
L
 
F
I
 
V
V
 
V
Q
 
Y
D
 
Q
T
 
G
F
 
H
L
 
N
T
 
G
D
 
D
T
 
V
-
 
G
A
 
A
G
 
Q
L
 
F
A
 
A
E
 
D
V
 
V
V
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
G
A
 
A
G
 
A
Y
 
Y
G
 
T
E
 
E
E
 
K
A
 
A
G
 
G
T
 
T
F
 
Y
T
 
V
N
 
N
N
 
T
E
 
E
G
 
G
R
 
R
I
 
S
Q
 
Q
T
 
I
L
 
S
R
 
R
K
 
A
F
 
A
R
 
T
A
 
G
P
 
P
A
 
P
F
 
G
E
 
G
A
 
A
R
 
R
G
 
E
N
 
D
L
 
W
E
 
K
V
 
I
F
 
L
E
 
R
F
 
A
V
 
V
A
 
S
A
 
E
L
 
Y
R
 
L
R
 
G
Q
 
V
V
 
A
L
 
L
K
 
P
P
 
Y
S
 
E
M
 
D
Q
 
A
G
 
Y
E
 
E
I
 
V
F
 
R
D
 
D
E
 
R
I
 
L
A
 
A
R
 
E
L
 
I
V
 
S
P
 
P
A
 
S

8qbyG Respiratory complex i from paracoccus denitrificans in msp2n2 nanodiscs
30% identity, 78% coverage: 3:678/870 of query aligns to 5:585/666 of 8qbyG

query
sites
8qbyG
R
 
K
I
 
I
T
 
K
I
 
I
D
 
D
A
 
D
Q
 
T
S
 
I
L
 
I
E
 
E
V
 
V
E
 
D
A
 
P
G
 
N
S
 
M
T
 
T
V
 
L
L
 
I
Q
 
Q
A
 
A
A
 
C
Q
 
E
R
 
M
L
 
A
G
 
G
I
 
I
D
 
E
V
 
V
P
 
P
T
 
R
F
 
F
C
|
C
Y
|
Y
L
 
H
E
 
E
R
 
R
L
 
L
P
 
S
P
 
I
L
 
A
A
x
G
S
 
N
C
|
C
R
|
R
M
 
M
C
|
C
L
 
L
V
 
V
E
 
E
I
 
V
-
 
V
E
 
G
G
 
G
L
 
P
R
 
P
R
 
K
L
 
P
Q
 
A
P
 
A
S
 
S
C
|
C
A
 
A
T
 
M
A
 
Q
V
 
V
T
 
K
D
 
D
-
 
L
-
 
R
-
 
P
-
 
G
-
 
P
-
 
E
-
 
G
-
 
A
G
 
P
M
 
S
V
 
E
V
 
I
R
 
R
T
 
T
N
 
N
T
 
S
P
 
P
L
 
M
I
 
V
D
 
K
E
 
K
T
 
A
R
 
R
S
 
E
S
 
G
M
 
V
L
 
M
D
 
E
M
 
F
L
 
L
L
 
L
A
 
I
N
 
N
H
|
H
P
 
P
L
 
L
D
|
D
C
|
C
P
 
P
I
 
I
C
|
C
D
 
D
K
 
Q
G
|
G
G
 
G
E
 
E
C
|
C
E
 
D
L
|
L
Q
|
Q
D
 
D
M
 
Q
V
 
A
M
 
M
D
 
A
Y
 
Y
G
 
G
P
 
V
R
 
D
R
 
F
S
 
S
E
 
R
F
 
Y
R
 
R
D
 
E
P
 
P
K
 
K
R
 
R
V
 
A
F
 
-
H
 
-
S
 
T
R
 
E
D
 
D
I
 
L
R
 
N
L
 
L
S
 
G
P
 
P
V
 
L
I
 
V
I
 
E
M
 
T
N
 
H
V
 
M
N
 
T
R
 
R
C
|
C
I
|
I
Q
x
S
C
|
C
Q
x
T
R
|
R
C
|
C
V
 
V
R
 
R
M
 
F
C
 
T
E
 
T
E
 
E
V
 
V
V
 
A
G
 
G
A
 
I
V
 
T
A
 
Q
L
 
M
G
 
G
T
 
Q
V
 
T
E
 
G
K
 
R
G
 
G
M
 
E
D
 
D
T
 
S
A
 
E
V
x
I
T
 
T
G
 
S
F
 
Y
E
 
L
G
 
N
S
 
Q
L
 
T
A
 
L
S
 
E
C
 
S
D
 
N
Q
 
M
C
 
Q
G
 
G
N
 
N
C
 
I
V
 
I
Q
 
D
V
 
L
C
|
C
P
|
P
V
|
V
G
 
G
A
|
A
L
|
L
M
 
V
S
 
S
F
 
K
P
 
P
Y
 
Y
R
 
A
Y
 
F
K
 
T
A
 
A
R
 
R
P
 
P
W
 
W
D
 
E
L
 
L
A
 
T
E
 
K
T
 
T
D
 
E
T
 
S
I
 
I
C
 
D
P
 
V
H
 
M
C
 
D
G
 
A
T
 
L
G
 
G
C
 
S
Q
 
S
L
 
I
T
 
R
V
 
I
G
 
D
A
 
T
R
 
K
K
 
G
G
 
R
E
 
E
F
 
V
M
 
M
R
 
R
V
 
I
R
 
L
S
 
P
K
 
R
P
 
N
E
 
H
H
 
D
G
 
G
V
 
V
N
 
N
R
 
E
E
 
E
T
 
W
L
 
I
C
 
S
V
 
D
R
 
K
G
 
T
R
 
R
F
 
F
G
 
V
L
 
W
D
 
D
F
 
G
V
 
L
E
 
R
S
 
-
R
 
R
D
 
Q
R
 
R
I
 
L
K
 
D
R
 
R
P
 
P
M
 
Y
I
 
I
R
 
R
R
 
E
D
 
N
G
 
G
V
 
R
L
 
L
V
 
R
P
 
P
V
 
A
S
 
S
W
 
W
S
 
P
E
 
E
A
 
A
G
 
L
D
 
E
H
 
A
L
 
A
R
 
A
R
 
R
R
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
A
V
 
M
E
 
K
N
 
G
K
 
K
A
 
K
A
 
I
G
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
I
S
 
G
A
 
D
R
 
L
L
 
V
P
 
P
N
 
A
E
 
E
V
 
A
L
 
A
Y
 
F
Q
 
S
F
 
L
Q
 
K
K
 
Q
L
 
L
M
 
V
R
 
E
T
 
G
V
 
L
F
 
-
R
 
-
T
 
G
N
 
G
N
 
K
I
 
V
D
 
E
C
 
C
-
 
R
-
 
V
-
 
D
S
 
G
S
 
A
R
 
R
W
 
L
S
 
P
A
 
A
P
 
G
F
 
N
D
 
R
T
 
S
L
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
A
F
 
Y
Y
 
V
T
 
G
R
 
T
A
 
A
P
 
R
L
 
I
Q
 
E
E
 
D
V
 
I
I
 
D
D
 
D
K
 
A
D
 
E
C
 
M
V
 
I
L
 
Q
V
 
L
I
 
I
G
 
G
G
 
T
N
 
N
V
 
P
T
 
R
E
 
D
E
 
E
N
 
A
P
 
P
V
 
V
T
 
L
E
 
N
Y
 
A
L
 
R
L
 
I
R
 
R
D
 
K
A
 
A
V
 
-
R
 
-
Q
 
W
R
 
S
Q
 
K
A
 
G
G
 
A
L
 
K
L
 
V
L
 
G
L
 
L
S
 
V
A
 
G
R
 
E
P
 
P
S
 
V
R
 
D
L
 
L
D
 
T
A
 
Y
D
 
D
A
 
Y
R
 
A
V
 
H
V
 
V
L
 
-
R
 
-
V
 
-
P
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
V
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
G
L
 
T
A
 
D
A
 
R
A
 
A
A
 
A
G
 
L
E
 
E
N
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
S
E
 
R
T
 
E
I
 
I
D
 
S
A
 
-
V
 
-
G
 
D
A
 
E
T
 
T
I
 
K
G
 
A
R
 
R
P
 
P
S
 
S
E
 
-
S
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
-
E
 
-
E
 
-
S
 
-
D
 
-
R
 
-
L
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
-
D
 
-
S
 
-
R
 
-
G
 
-
V
 
-
T
 
I
V
 
V
L
 
I
V
 
V
S
 
G
V
 
Q
G
 
G
L
 
A
L
 
I
R
 
R
S
 
E
P
 
A
E
 
D
A
 
G
R
 
E
A
 
A
M
 
V
L
 
L
Q
 
A
Q
 
H
V
 
A
S
 
M
N
 
K
L
 
L
L
 
A
Q
 
E
A
 
-
L
 
-
R
 
-
M
 
-
L
 
-
G
 
N
K
 
S
D
 
N
P
 
S
A
 
G
M
 
L
Q
 
L
F
 
I
L
 
L
F
 
H
D
 
T
R
 
A
A
 
A
N
 
G
Q
 
R
M
 
V
G
 
G
A
 
A
W
 
M
D
 
D
M
 
V
G
 
G
V
 
A
L
 
V
P
 
-
A
 
-
T
 
T
L
 
E
P
 
G
G
 
G
L
 
L
R
 
L
A
 
A
V
 
A
T
 
I
D
 
D
D
 
G
S
 
A
A
 
E
R
 
V
A
 
V
T
 
Y
H
 
N
E
 
L
G
 
G
A
 
A
W
 
D
D
 
E
A
 
V
E
 
D
I
 
I
P
 
D
S
 
Q
E
 
G
P
 
P
G
 
-
A
 
-
N
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
C
 
-
V
 
-
D
 
-
G
 
-
R
 
-
M
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
Y
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
Y
 
-
P
 
-
D
 
-
R
 
-
D
 
-
F
 
-
V
 
-
K
 
-
R
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
-
L
 
F
L
 
V
I
 
I
V
 
Y
Q
 
Q
D
 
G
T
 
S
F
 
H
L
 
G
T
 
D
D
 
R
T
 
G
A
 
A
G
 
H
L
 
R
A
 
A
E
 
D
V
 
I
V
 
I
L
 
L
P
 
P
A
 
G
A
 
A
G
 
C
Y
 
Y
G
 
T
E
 
E
E
 
E
A
 
S
G
 
G
T
 
L
F
 
F
T
 
V
N
 
N
N
 
T
E
 
E
G
 
G
R
 
R
I
 
P
Q
 
Q
-
 
L
T
 
A
L
 
M
R
 
R
K
 
A
F
 
N
R
 
F
A
 
A
P
 
P
A
 
G
F
 
-
E
 
E
A
 
G
R
 
K
G
 
E
N
 
N
L
 
W
E
 
A
V
 
I
F
 
L
E
 
R
F
 
A
V
 
L
A
 
S
A
 
A

7v2cM Active state complex i from q10 dataset (see paper)
28% identity, 78% coverage: 1:679/870 of query aligns to 3:601/690 of 7v2cM

query
sites
7v2cM
M
 
L
V
 
I
R
 
E
I
 
V
T
 
F
I
 
V
D
 
D
A
 
G
Q
 
Q
S
 
S
L
 
V
E
 
M
V
 
V
E
 
E
A
 
P
G
 
G
S
 
T
T
 
T
V
 
V
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
A
 
C
Q
 
E
R
 
K
L
 
V
G
 
G
I
 
M
D
 
Q
V
 
I
P
 
P
T
 
R
F
 
F
C
|
C
Y
|
Y
L
 
H
E
 
E
R
 
R
L
 
L
P
 
S
P
 
V
L
 
A
A
x
G
S
 
N
C
|
C
R
|
R
M
 
M
C
|
C
L
 
L
V
 
V
E
 
E
I
 
I
E
 
E
G
 
K
L
 
A
R
 
P
R
 
K
L
 
V
Q
 
V
P
 
A
S
 
A
C
|
C
A
 
A
T
 
M
A
 
P
V
 
V
T
 
M
D
 
K
G
 
G
M
 
W
V
 
N
V
 
I
R
 
L
T
 
T
N
 
N
T
 
S
P
 
E
L
 
K
I
 
S
D
 
K
E
 
K
T
 
A
R
 
R
S
 
E
S
 
G
M
 
V
L
 
M
D
 
E
M
 
F
L
 
L
L
 
L
A
 
A
N
 
N
H
|
H
P
 
P
L
 
L
D
|
D
C
|
C
P
 
P
I
 
I
C
|
C
D
 
D
K
x
Q
G
 
G
G
 
G
E
 
E
C
|
C
E
 
D
L
 
L
Q
|
Q
D
 
D
M
 
Q
V
 
S
M
 
M
D
 
M
Y
 
F
G
 
G
P
 
S
R
 
D
R
 
R
S
 
S
E
 
R
F
 
F
R
 
L
D
 
E
P
 
G
K
 
K
R
 
R
V
 
A
F
 
V
H
 
E
S
 
D
R
 
K
D
 
N
I
 
I
R
 
-
L
 
-
S
 
G
P
 
P
V
 
L
I
 
V
I
 
K
M
 
T
N
 
I
V
 
M
N
 
T
R
 
R
C
|
C
I
 
I
Q
 
Q
C
|
C
Q
x
T
R
|
R
C
|
C
V
 
I
R
 
R
M
 
F
C
 
A
E
 
S
E
 
E
V
 
I
V
 
A
G
 
G
A
 
V
V
 
D
A
 
D
L
 
L
G
 
G
T
 
T
V
 
T
E
 
G
K
 
R
G
 
G
M
 
N
D
 
D
T
 
M
A
 
Q
V
 
V
T
 
G
G
 
T
F
 
Y
E
 
I
G
 
E
S
 
K
L
 
M
A
 
F
S
 
M
C
 
S
D
 
E
Q
 
L
C
 
S
G
 
G
N
 
N
C
 
I
V
 
I
Q
 
D
V
 
I
C
|
C
P
 
P
V
|
V
G
 
G
A
|
A
L
|
L
M
 
T
S
 
S
F
 
K
P
 
P
Y
 
Y
R
 
A
Y
 
F
K
 
T
A
 
A
R
 
R
P
 
P
W
 
W
D
 
E
L
 
T
A
 
R
E
 
K
T
 
T
D
 
E
T
 
S
I
 
I
C
 
D
P
 
V
H
 
M
C
 
D
G
 
A
T
 
V
G
 
G
C
 
S
Q
 
N
L
 
I
T
 
V
V
 
V
G
 
S
A
 
T
R
 
R
K
 
T
G
 
G
E
 
E
F
 
V
M
 
M
R
 
R
V
 
I
R
 
L
S
 
P
K
 
R
P
 
M
E
 
H
H
 
E
G
 
D
V
 
I
N
 
N
R
 
E
E
 
E
T
 
W
L
 
I
C
 
S
V
 
D
R
 
K
G
 
T
R
 
R
F
 
F
G
 
A
L
 
Y
D
 
D
F
 
G
V
 
L
E
 
K
S
 
-
R
 
R
D
 
Q
R
 
R
I
 
L
K
 
T
R
 
Q
P
 
P
M
 
M
I
 
I
R
 
R
R
 
N
D
 
E
-
 
K
G
 
G
V
 
L
L
 
L
V
 
T
P
 
Y
V
 
T
S
 
T
W
 
W
S
 
E
E
 
D
A
 
A
G
 
L
D
 
S
H
 
R
L
 
V
R
 
A
R
 
G
R
 
M
L
 
L
A
 
Q
A
 
S
V
 
F
E
 
Q
N
 
G
K
 
N
A
 
D
A
 
V
G
 
A
G
 
A
L
 
I
A
 
A
S
 
G
A
 
G
R
 
L
L
 
V
P
 
D
N
 
A
E
 
E
V
 
A
L
 
L
Y
 
V
Q
 
A
F
 
L
Q
 
K
K
 
D
L
 
L
M
 
L
R
 
-
T
 
-
V
 
-
F
 
-
R
 
-
T
 
-
N
 
N
N
 
R
I
 
V
D
 
D
C
 
S
S
 
D
S
 
S
R
 
L
W
 
C
S
 
T
A
 
E
P
 
E
-
 
V
F
 
F
D
 
P
T
 
T
L
 
A
G
 
G
P
 
A
-
 
G
-
 
T
-
 
D
L
 
L
L
 
R
G
 
S
G
 
N
F
 
Y
Y
 
L
T
 
L
R
 
N
A
 
T
P
 
T
L
 
I
Q
 
A
E
 
G
V
 
V
I
 
E
D
 
E
K
 
A
D
 
D
C
 
V
V
 
I
L
 
L
V
 
L
I
 
V
G
 
G
G
 
T
N
 
N
V
 
P
T
 
R
E
 
F
E
 
E
N
 
A
P
 
P
V
 
L
T
 
F
E
 
N
Y
 
A
L
 
R
L
 
I
R
 
R
D
 
K
A
 
S
V
 
W
R
 
L
Q
 
H
R
 
N
Q
 
D
A
 
L
G
 
K
L
 
V
L
 
A
L
 
L
L
 
I
S
 
G
A
 
S
R
 
-
P
 
P
S
 
V
R
 
D
L
 
L
D
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
V
 
-
V
 
T
L
 
Y
R
 
R
V
 
Y
P
 
D
P
 
H
G
 
L
G
 
G
E
 
D
A
 
S
A
 
P
S
 
K
L
 
I
A
 
L
A
 
Q
V
 
D
V
 
I
A
 
A
G
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
-
N
 
-
L
 
-
S
 
-
G
 
-
E
 
-
T
 
-
I
 
-
D
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
-
A
 
-
T
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
S
 
-
E
 
-
S
 
-
A
 
S
G
 
G
S
 
N
E
 
H
E
 
P
S
 
F
D
 
S
R
 
Q
L
 
I
V
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
L
R
 
K
D
 
E
S
 
A
R
 
K
G
 
K
V
 
P
T
 
M
V
 
V
L
 
V
V
 
L
S
 
G
V
 
S
G
 
S
L
 
A
L
 
L
R
 
Q
S
 
R
P
 
S
E
 
D
A
 
G
R
 
T
A
 
A
M
 
I
L
 
L
Q
 
A
Q
 
A
V
 
V
S
 
S
N
 
N
L
 
I
L
 
A
Q
 
Q
A
 
N
L
 
I
R
 
R
M
 
L
-
 
S
-
 
S
-
 
G
-
 
V
L
 
T
G
 
G
K
 
D
D
 
W
P
 
K
A
 
V
M
 
M
Q
 
N
F
 
I
L
 
L
F
 
H
D
 
R
R
 
I
A
 
A
N
 
S
Q
 
Q
M
 
V
G
 
A
A
 
A
W
 
L
D
 
D
M
 
L
G
 
G
V
 
Y
L
 
-
P
 
-
A
 
-
T
 
-
L
 
K
P
 
P
G
 
G
L
 
V
R
 
E
A
 
A
V
 
I
T
 
R
D
 
K
D
 
N
S
 
P
A
 
P
R
 
K
A
 
-
T
 
-
H
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
W
 
-
D
 
-
A
 
-
E
 
-
I
 
-
P
 
-
S
 
-
E
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
C
 
-
V
 
-
D
 
-
G
 
-
R
 
-
M
 
-
G
 
-
A
 
V
L
 
L
Y
 
F
V
 
L
A
 
L
G
 
G
T
 
A
D
 
D
P
 
G
L
 
-
L
 
-
A
 
-
Y
 
-
P
 
-
D
 
-
R
 
-
D
 
G
F
 
C
V
 
I
K
 
T
R
 
R
A
 
Q
L
 
D
G
 
L
A
 
P
A
 
K
D
 
D
L
 
C
L
 
F
I
 
I
V
 
I
Q
 
Y
D
 
Q
T
 
G
F
 
H
L
 
H
T
 
G
D
 
D
T
 
V
-
 
G
A
 
A
G
 
P
L
 
M
A
 
A
E
 
D
V
 
V
V
 
I
L
 
L
P
 
P
A
 
G
A
 
A
G
 
A
Y
 
Y
G
 
T
E
 
E
E
 
K
A
 
S
G
 
A
T
 
T
F
 
Y
T
 
V
N
 
N
N
 
T
E
 
E
G
 
G
R
 
R
I
 
A
Q
 
Q
T
 
Q
L
 
T
R
 
K
K
 
V
F
 
A
R
 
V
A
 
T
P
 
P
A
 
P
F
 
G
E
 
L
A
 
A
R
 
R
G
 
E
N
 
D
L
 
W
E
 
K
V
 
I
F
 
I
E
 
R
F
 
A
V
 
L
A
 
S
A
 
E
L
 
I

3i9vC Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex i from thermus thermophilus, oxidized, 2 mol/asu (see paper)
31% identity, 78% coverage: 1:677/870 of query aligns to 1:622/754 of 3i9vC

query
sites
3i9vC
M
 
M
V
 
V
R
 
R
I
 
V
T
 
K
I
 
V
D
 
N
A
 
D
Q
 
R
S
 
I
L
 
V
E
 
E
V
 
V
E
 
P
A
 
P
G
 
G
S
 
T
T
 
S
V
 
V
L
 
M
Q
 
D
A
 
A
A
 
V
Q
 
F
R
 
H
L
 
A
G
 
G
I
 
Y
D
 
D
V
 
V
P
 
P
T
 
L
F
 
F
C
|
C
Y
x
S
L
 
E
E
 
K
R
 
H
L
 
L
P
 
S
P
 
P
L
 
I
A
x
G
S
x
A
C
|
C
R
|
R
M
 
M
C
|
C
L
 
L
V
 
V
E
 
R
I
 
I
E
 
G
G
 
L
L
 
P
R
 
I
R
 
Q
L
 
W
Q
 
Q
P
 
P
-
 
K
-
 
L
-
 
A
-
 
A
S
 
S
C
|
C
A
 
V
T
 
T
A
 
A
V
 
V
T
 
A
D
 
D
G
 
G
M
 
M
V
 
V
V
 
V
R
 
D
T
 
T
N
 
L
T
 
S
P
 
D
L
 
V
I
 
V
D
 
R
E
 
E
T
 
A
R
 
Q
S
 
A
S
 
G
M
 
M
L
 
V
D
 
E
M
 
F
L
 
T
L
 
L
A
 
L
N
 
N
H
|
H
P
 
P
L
 
L
D
|
D
C
|
C
P
 
P
I
 
T
C
|
C
D
 
D
K
|
K
G
 
G
G
 
G
E
 
A
C
|
C
E
 
E
L
|
L
Q
|
Q
D
 
D
M
 
R
V
 
T
M
 
V
D
 
E
Y
 
Y
G
 
G
-
 
L
-
 
Y
-
 
E
-
 
K
-
 
Y
-
 
E
-
 
L
P
 
P
R
 
V
R
 
Y
S
 
T
E
 
R
F
 
F
R
 
E
D
 
F
P
 
T
K
 
R
R
 
R
V
 
H
F
 
V
H
 
-
S
x
D
R
 
K
D
 
H
I
x
H
R
 
P
L
 
L
S
 
S
P
 
P
V
 
F
I
 
V
I
 
I
M
 
L
N
 
D
V
 
R
N
 
E
R
 
R
C
|
C
I
|
I
Q
 
H
C
|
C
Q
 
K
R
 
R
C
|
C
V
 
V
R
 
R
M
 
Y
C
 
F
E
 
E
E
 
E
V
 
V
V
 
P
G
 
G
A
 
D
V
 
E
A
 
V
L
 
L
G
 
D
T
x
F
V
 
I
E
 
E
K
 
R
G
 
G
M
 
V
D
 
H
T
 
T
A
 
F
V
x
I
T
 
G
G
 
T
F
 
M
E
 
D
G
 
F
S
 
G
L
 
L
A
 
P
S
 
S
C
 
-
D
 
G
Q
 
F
C
 
S
G
 
G
N
 
N
C
 
I
V
 
T
Q
 
D
V
 
I
C
|
C
P
|
P
V
|
V
G
 
G
A
|
A
L
 
L
M
 
L
S
 
D
F
 
L
P
 
T
Y
 
A
R
 
R
Y
 
F
K
 
R
A
 
A
R
 
R
P
 
N
W
 
W
D
 
E
L
 
M
A
 
E
E
 
E
T
 
T
D
 
P
T
 
T
I
 
T
C
|
C
P
 
A
H
x
L
C
|
C
G
 
P
T
x
V
G
|
G
C
|
C
Q
 
G
L
 
I
T
 
T
V
 
A
G
 
D
A
 
T
R
 
R
K
 
S
G
 
G
E
 
E
F
x
L
M
 
L
R
 
R
V
 
I
R
 
R
S
 
A
K
 
R
P
 
E
E
 
V
H
 
P
G
 
E
V
 
V
N
 
N
R
 
E
E
 
I
T
 
W
L
 
I
C
|
C
V
 
D
R
x
A
G
|
G
R
 
R
F
 
F
G
 
G
L
 
H
D
 
E
F
 
W
V
 
A
E
x
D
S
 
-
R
 
Q
D
 
N
R
 
R
I
 
L
K
 
K
R
 
T
P
 
P
M
 
L
I
 
V
R
 
R
R
 
K
D
 
E
G
 
G
V
 
R
L
 
L
V
 
V
P
 
E
V
 
A
S
 
T
W
 
W
S
 
E
E
 
E
A
 
A
G
 
F
D
 
L
H
 
A
L
 
L
R
 
K
R
 
E
R
 
G
L
 
L
A
 
K
A
 
E
V
 
A
E
 
R
N
 
G
K
 
E
A
 
E
A
 
V
G
 
G
-
 
L
G
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
H
A
 
D
R
 
A
L
 
T
P
 
L
N
 
E
E
 
E
V
 
G
L
 
L
Y
 
L
Q
 
A
F
 
S
Q
 
E
K
 
-
L
 
-
M
 
L
R
 
A
T
 
K
V
 
A
F
 
L
R
 
K
T
 
T
N
 
P
N
 
H
I
 
L
D
 
D
C
 
F
S
 
Q
S
 
G
R
 
R
W
 
T
S
x
A
A
|
A
P
 
P
F
 
A
D
 
S
T
 
L
L
 
F
G
 
P
P
 
P
L
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
F
 
-
Y
 
-
T
 
-
R
 
-
A
 
A
P
 
S
L
 
L
Q
 
E
E
 
D
V
 
L
I
 
L
D
 
Q
K
 
A
D
 
D
C
 
F
V
 
A
L
 
L
V
 
V
I
 
L
G
 
-
G
 
G
N
 
D
V
 
P
T
 
T
E
 
E
E
 
E
N
 
A
P
|
P
V
 
I
T
 
L
E
 
H
Y
 
L
L
 
R
L
 
L
R
 
S
D
 
E
A
 
F
V
 
V
R
 
R
Q
 
D
R
 
L
Q
 
K
A
 
P
G
 
P
L
 
H
L
 
R
L
 
Y
L
 
N
S
 
H
A
 
G
R
 
T
P
 
P
S
 
F
R
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
A
D
 
D
A
 
L
R
 
Q
V
 
I
V
 
K
L
 
E
R
 
R
V
 
M
P
 
P
P
 
R
G
 
R
G
 
T
E
 
D
A
 
K
A
 
M
S
 
A
L
 
L
-
 
F
-
 
A
-
 
P
-
 
Y
A
 
R
A
 
A
V
 
P
V
 
L
A
 
M
G
 
K
L
 
W
A
 
A
A
 
A
A
 
I
A
 
H
G
 
E
E
 
V
N
 
H
L
 
R
S
 
P
G
 
G
E
 
E
T
 
E
I
 
R
D
 
E
A
 
I
V
 
L
G
 
L
A
 
A
T
 
L
I
 
L
G
 
G
R
 
-
P
 
-
S
 
-
E
 
D
S
 
K
A
 
E
G
 
G
S
 
S
E
 
E
E
 
M
S
 
V
D
 
A
R
 
K
L
 
A
V
 
K
A
 
E
G
 
A
L
 
W
R
 
E
D
 
K
S
 
A
R
 
K
G
 
N
V
 
P
T
 
V
V
 
L
L
 
I
V
 
L
S
 
G
V
x
A
G
 
G
L
 
V
L
 
L
R
 
Q
S
 
D
P
 
T
E
 
V
A
 
A
R
 
A
A
 
E
M
 
R
L
 
A
Q
 
R
Q
 
L
V
 
L
S
 
A
N
 
E
L
 
-
L
 
R
Q
 
K
A
 
G
L
 
A
R
 
K
M
 
V
L
 
L
G
 
A
K
 
M
D
 
T
P
|
P
A
|
A
M
 
-
Q
 
-
F
 
-
L
 
-
F
 
-
D
 
-
R
 
-
A
 
A
N
 
N
Q
 
A
M
 
R
G
 
G
A
 
L
W
 
E
D
 
A
M
 
M
G
 
G
V
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
G
T
 
A
L
 
-
P
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
D
 
-
S
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
T
 
-
H
 
-
E
 
K
G
 
G
A
 
A
-
 
S
W
 
W
D
 
D
A
 
-
E
 
-
I
 
-
P
 
-
S
 
-
E
 
E
P
 
P
G
 
G
A
 
A
N
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
C
 
-
V
 
-
D
 
-
G
 
-
R
 
-
M
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
Y
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
P
 
-
L
 
L
L
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
P
 
Y
D
 
G
R
 
F
D
 
V
F
 
P
V
 
P
K
 
E
R
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
K
A
 
G
A
 
K
D
 
R
L
 
F
L
 
V
I
 
V
V
 
M
Q
 
H
D
 
L
T
 
S
F
 
H
L
 
L
T
 
H
D
 
P
T
 
L
A
 
A
G
 
E
-
 
R
L
 
Y
A
 
A
E
 
H
V
 
V
V
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
A
A
 
P
G
 
T
Y
 
F
G
 
Y
E
 
E
E
 
K
A
 
R
G
 
G
T
 
H
F
 
L
T
 
V
N
 
N
N
 
L
E
 
E
G
 
G
R
 
R
I
 
V
Q
 
L
T
 
P
L
 
L
R
 
S
K
 
P
F
 
A
R
 
P
A
 
I
P
 
E
A
 
N
F
 
G
E
 
E
A
 
A
R
 
E
G
 
G
N
 
A
L
 
L
E
 
Q
V
 
V
F
 
L
E
 
A
F
 
L
V
 
L
A
 
A

3i9v3 Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex i from thermus thermophilus, oxidized, 2 mol/asu (see paper)
31% identity, 78% coverage: 1:677/870 of query aligns to 1:622/754 of 3i9v3

query
sites
3i9v3
M
 
M
V
 
V
R
 
R
I
 
V
T
 
K
I
 
V
D
 
N
A
 
D
Q
 
R
S
 
I
L
 
V
E
 
E
V
 
V
E
 
P
A
 
P
G
 
G
S
 
T
T
 
S
V
 
V
L
 
M
Q
 
D
A
 
A
A
 
V
Q
 
F
R
 
H
L
 
A
G
 
G
I
 
Y
D
 
D
V
 
V
P
 
P
T
 
L
F
 
F
C
|
C
Y
x
S
L
 
E
E
 
K
R
 
H
L
 
L
P
 
S
P
 
P
L
 
I
A
x
G
S
 
A
C
|
C
R
|
R
M
 
M
C
|
C
L
 
L
V
 
V
E
 
R
I
 
I
E
 
G
G
 
L
L
 
P
R
 
I
R
 
Q
L
 
W
Q
 
Q
P
 
P
-
 
K
-
 
L
-
 
A
-
 
A
S
 
S
C
|
C
A
 
V
T
 
T
A
 
A
V
 
V
T
 
A
D
 
D
G
 
G
M
 
M
V
 
V
V
 
V
R
 
D
T
 
T
N
 
L
T
 
S
P
 
D
L
 
V
I
 
V
D
 
R
E
 
E
T
 
A
R
 
Q
S
 
A
S
 
G
M
 
M
L
 
V
D
 
E
M
 
F
L
 
T
L
 
L
A
 
L
N
 
N
H
|
H
P
 
P
L
 
L
D
|
D
C
|
C
P
 
P
I
 
T
C
|
C
D
 
D
K
 
K
G
 
G
G
 
G
E
 
A
C
|
C
E
 
E
L
 
L
Q
|
Q
D
 
D
M
 
R
V
 
T
M
 
V
D
 
E
Y
 
Y
G
 
G
-
 
L
-
 
Y
-
 
E
-
 
K
-
 
Y
-
 
E
-
 
L
P
 
P
R
 
V
R
 
Y
S
 
T
E
 
R
F
 
F
R
 
E
D
 
F
P
 
T
K
 
R
R
 
R
V
 
H
F
 
V
H
 
-
S
 
D
R
 
K
D
 
H
I
 
H
R
 
P
L
 
L
S
 
S
P
 
P
V
 
F
I
 
V
I
 
I
M
 
L
N
 
D
V
 
R
N
 
E
R
 
R
C
|
C
I
|
I
Q
 
H
C
|
C
Q
 
K
R
 
R
C
|
C
V
 
V
R
 
R
M
 
Y
C
 
F
E
 
E
E
 
E
V
 
V
V
 
P
G
 
G
A
 
D
V
 
E
A
 
V
L
 
L
G
 
D
T
x
F
V
 
I
E
 
E
K
 
R
G
 
G
M
 
V
D
 
H
T
 
T
A
 
F
V
x
I
T
 
G
G
 
T
F
 
M
E
 
D
G
 
F
S
 
G
L
 
L
A
 
P
S
 
S
C
 
-
D
 
G
Q
 
F
C
 
S
G
 
G
N
 
N
C
 
I
V
 
T
Q
 
D
V
 
I
C
|
C
P
|
P
V
|
V
G
 
G
A
|
A
L
 
L
M
 
L
S
 
D
F
 
L
P
 
T
Y
 
A
R
 
R
Y
 
F
K
 
R
A
 
A
R
 
R
P
 
N
W
 
W
D
 
E
L
 
M
A
 
E
E
 
E
T
 
T
D
 
P
T
 
T
I
 
T
C
|
C
P
 
A
H
 
L
C
|
C
G
 
P
T
x
V
G
|
G
C
|
C
Q
 
G
L
 
I
T
 
T
V
 
A
G
 
D
A
 
T
R
 
R
K
 
S
G
 
G
E
 
E
F
x
L
M
 
L
R
 
R
V
 
I
R
 
R
S
 
A
K
 
R
P
 
E
E
 
V
H
 
P
G
 
E
V
 
V
N
 
N
R
 
E
E
 
I
T
 
W
L
 
I
C
|
C
V
 
D
R
 
A
G
|
G
R
 
R
F
 
F
G
 
G
L
 
H
D
 
E
F
 
W
V
 
A
E
x
D
S
 
-
R
 
Q
D
 
N
R
 
R
I
 
L
K
 
K
R
 
T
P
 
P
M
 
L
I
 
V
R
 
R
R
 
K
D
 
E
G
 
G
V
 
R
L
 
L
V
 
V
P
 
E
V
 
A
S
 
T
W
 
W
S
 
E
E
 
E
A
 
A
G
 
F
D
 
L
H
 
A
L
 
L
R
 
K
R
 
E
R
 
G
L
 
L
A
 
K
A
 
E
V
 
A
E
 
R
N
 
G
K
 
E
A
 
E
A
 
V
G
 
G
-
 
L
G
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
H
A
 
D
R
 
A
L
 
T
P
 
L
N
 
E
E
 
E
V
 
G
L
 
L
Y
 
L
Q
 
A
F
 
S
Q
 
E
K
 
-
L
 
-
M
 
L
R
 
A
T
 
K
V
 
A
F
 
L
R
 
K
T
 
T
N
 
P
N
 
H
I
 
L
D
 
D
C
 
F
S
 
Q
S
 
G
R
 
R
W
 
T
S
x
A
A
|
A
P
 
P
F
 
A
D
 
S
T
 
L
L
 
F
G
 
P
P
 
P
L
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
F
 
-
Y
 
-
T
 
-
R
 
-
A
 
A
P
 
S
L
 
L
Q
 
E
E
 
D
V
 
L
I
 
L
D
 
Q
K
 
A
D
 
D
C
 
F
V
 
A
L
 
L
V
 
V
I
 
L
G
 
-
G
 
G
N
 
D
V
 
P
T
 
T
E
 
E
E
 
E
N
 
A
P
|
P
V
 
I
T
 
L
E
 
H
Y
 
L
L
 
R
L
 
L
R
 
S
D
 
E
A
 
F
V
 
V
R
 
R
Q
 
D
R
 
L
Q
 
K
A
 
P
G
 
P
L
 
H
L
 
R
L
 
Y
L
 
N
S
 
H
A
 
G
R
 
T
P
 
P
S
 
F
R
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
A
D
 
D
A
 
L
R
 
Q
V
 
I
V
 
K
L
 
E
R
 
R
V
 
M
P
 
P
P
 
R
G
 
R
G
 
T
E
 
D
A
 
K
A
 
M
S
 
A
L
 
L
-
 
F
-
 
A
-
 
P
-
 
Y
A
 
R
A
 
A
V
 
P
V
 
L
A
 
M
G
 
K
L
 
W
A
 
A
A
 
A
A
 
I
A
 
H
G
 
E
E
 
V
N
 
H
L
 
R
S
 
P
G
 
G
E
 
E
T
 
E
I
 
R
D
 
E
A
 
I
V
 
L
G
 
L
A
 
A
T
 
L
I
 
L
G
 
G
R
 
-
P
 
-
S
 
-
E
 
D
S
 
K
A
 
E
G
 
G
S
 
S
E
 
E
E
 
M
S
 
V
D
 
A
R
 
K
L
 
A
V
 
K
A
 
E
G
 
A
L
 
W
R
 
E
D
 
K
S
 
A
R
 
K
G
 
N
V
 
P
T
 
V
V
 
L
L
 
I
V
 
L
S
 
G
V
x
A
G
 
G
L
 
V
L
 
L
R
 
Q
S
 
D
P
 
T
E
 
V
A
 
A
R
 
A
A
 
E
M
 
R
L
 
A
Q
 
R
Q
 
L
V
 
L
S
 
A
N
 
E
L
 
-
L
 
R
Q
 
K
A
 
G
L
 
A
R
 
K
M
 
V
L
 
L
G
 
A
K
 
M
D
 
T
P
|
P
A
|
A
M
 
-
Q
 
-
F
 
-
L
 
-
F
 
-
D
 
-
R
 
-
A
 
A
N
 
N
Q
 
A
M
 
R
G
 
G
A
 
L
W
 
E
D
 
A
M
 
M
G
 
G
V
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
G
T
 
A
L
 
-
P
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
D
 
-
S
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
T
 
-
H
 
-
E
 
K
G
 
G
A
 
A
-
 
S
W
 
W
D
 
D
A
 
-
E
 
-
I
 
-
P
 
-
S
 
-
E
 
E
P
 
P
G
 
G
A
 
A
N
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
C
 
-
V
 
-
D
 
-
G
 
-
R
 
-
M
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
Y
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
P
 
-
L
 
L
L
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
P
 
Y
D
 
G
R
 
F
D
 
V
F
 
P
V
 
P
K
 
E
R
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
K
A
 
G
A
 
K
D
 
R
L
 
F
L
 
V
I
 
V
V
 
M
Q
 
H
D
 
L
T
 
S
F
 
H
L
 
L
T
 
H
D
 
P
T
 
L
A
 
A
G
 
E
-
 
R
L
 
Y
A
 
A
E
 
H
V
 
V
V
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
A
A
 
P
G
 
T
Y
 
F
G
 
Y
E
 
E
E
 
K
A
 
R
G
 
G
T
 
H
F
 
L
T
 
V
N
 
N
N
 
L
E
 
E
G
 
G
R
 
R
I
 
V
Q
 
L
T
 
P
L
 
L
R
 
S
K
 
P
F
 
A
R
 
P
A
 
I
P
 
E
A
 
N
F
 
G
E
 
E
A
 
A
R
 
E
G
 
G
N
 
A
L
 
L
E
 
Q
V
 
V
F
 
L
E
 
A
F
 
L
V
 
L
A
 
A

2ybb3 Fitted model for bovine mitochondrial supercomplex i1iii2iv1 by single particle cryo-em (emd-1876) (see paper)
31% identity, 78% coverage: 1:677/870 of query aligns to 1:622/754 of 2ybb3

query
sites
2ybb3
M
 
M
V
 
V
R
 
R
I
 
V
T
 
K
I
 
V
D
 
N
A
 
D
Q
 
R
S
 
I
L
 
V
E
 
E
V
 
V
E
 
P
A
 
P
G
 
G
S
 
T
T
 
S
V
 
V
L
 
M
Q
 
D
A
 
A
A
 
V
Q
 
F
R
 
H
L
 
A
G
 
G
I
 
Y
D
 
D
V
 
V
P
 
P
T
 
L
F
 
F
C
|
C
Y
x
S
L
 
E
E
 
K
R
 
H
L
 
L
P
 
S
P
 
P
L
 
I
A
x
G
S
 
A
C
|
C
R
|
R
M
 
M
C
|
C
L
 
L
V
 
V
E
 
R
I
 
I
E
 
G
G
 
L
L
 
P
R
 
I
R
 
Q
L
 
W
Q
 
Q
P
 
P
-
 
K
-
 
L
-
 
A
-
 
A
S
 
S
C
|
C
A
 
V
T
 
T
A
 
A
V
 
V
T
 
A
D
 
D
G
 
G
M
 
M
V
 
V
V
 
V
R
 
D
T
 
T
N
 
L
T
 
S
P
 
D
L
 
V
I
 
V
D
 
R
E
 
E
T
 
A
R
 
Q
S
 
A
S
 
G
M
 
M
L
 
V
D
 
E
M
 
F
L
 
T
L
 
L
A
 
L
N
 
N
H
|
H
P
 
P
L
 
L
D
 
D
C
|
C
P
 
P
I
 
T
C
|
C
D
 
D
K
|
K
G
 
G
G
 
G
E
 
A
C
|
C
E
 
E
L
 
L
Q
|
Q
D
 
D
M
 
R
V
 
T
M
 
V
D
 
E
Y
 
Y
G
 
G
-
 
L
-
 
Y
-
 
E
-
 
K
-
 
Y
-
 
E
-
 
L
P
 
P
R
 
V
R
 
Y
S
 
T
E
 
R
F
 
F
R
 
E
D
 
F
P
 
T
K
 
R
R
 
R
V
 
H
F
 
V
H
 
-
S
 
D
R
 
K
D
 
H
I
 
H
R
 
P
L
 
L
S
 
S
P
 
P
V
 
F
I
 
V
I
 
I
M
 
L
N
 
D
V
 
R
N
 
E
R
 
R
C
|
C
I
 
I
Q
x
H
C
|
C
Q
 
K
R
 
R
C
|
C
V
 
V
R
 
R
M
 
Y
C
 
F
E
 
E
E
 
E
V
 
V
V
 
P
G
 
G
A
 
D
V
 
E
A
 
V
L
 
L
G
 
D
T
 
F
V
 
I
E
 
E
K
 
R
G
 
G
M
 
V
D
 
H
T
 
T
A
 
F
V
 
I
T
 
G
G
 
T
F
 
M
E
 
D
G
 
F
S
 
G
L
 
L
A
 
P
S
 
S
C
 
-
D
 
G
Q
 
F
C
 
S
G
 
G
N
 
N
C
 
I
V
 
T
Q
 
D
V
 
I
C
|
C
P
|
P
V
|
V
G
 
G
A
 
A
L
|
L
M
 
L
S
 
D
F
 
L
P
 
T
Y
 
A
R
 
R
Y
 
F
K
 
R
A
 
A
R
 
R
P
 
N
W
 
W
D
 
E
L
 
M
A
 
E
E
 
E
T
 
T
D
 
P
T
 
T
I
 
T
C
|
C
P
 
A
H
 
L
C
|
C
G
 
P
T
x
V
G
 
G
C
|
C
Q
 
G
L
 
I
T
 
T
V
 
A
G
 
D
A
 
T
R
 
R
K
 
S
G
 
G
E
 
E
F
x
L
M
 
L
R
 
R
V
 
I
R
 
R
S
 
A
K
 
R
P
 
E
E
 
V
H
 
P
G
 
E
V
 
V
N
 
N
R
 
E
E
 
I
T
 
W
L
x
I
C
|
C
V
 
D
R
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
F
G
 
G
L
 
H
D
 
E
F
 
W
V
 
A
E
x
D
S
 
-
R
 
Q
D
 
N
R
 
R
I
 
L
K
 
K
R
 
T
P
 
P
M
 
L
I
 
V
R
 
R
R
 
K
D
 
E
G
 
G
V
 
R
L
 
L
V
 
V
P
 
E
V
 
A
S
 
T
W
 
W
S
 
E
E
 
E
A
 
A
G
 
F
D
 
L
H
 
A
L
 
L
R
 
K
R
 
E
R
 
G
L
 
L
A
 
K
A
 
E
V
 
A
E
 
R
N
 
G
K
 
E
A
 
E
A
 
V
G
 
G
-
 
L
G
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
H
A
 
D
R
 
A
L
 
T
P
 
L
N
 
E
E
 
E
V
 
G
L
 
L
Y
 
L
Q
 
A
F
 
S
Q
 
E
K
 
-
L
 
-
M
 
L
R
 
A
T
 
K
V
 
A
F
 
L
R
 
K
T
 
T
N
 
P
N
 
H
I
 
L
D
 
D
C
 
F
S
 
Q
S
 
G
R
 
R
W
 
T
S
x
A
A
|
A
P
 
P
F
 
A
D
 
S
T
 
L
L
 
F
G
 
P
P
 
P
L
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
F
 
-
Y
 
-
T
 
-
R
 
-
A
 
A
P
 
S
L
 
L
Q
 
E
E
 
D
V
 
L
I
 
L
D
 
Q
K
 
A
D
 
D
C
 
F
V
 
A
L
 
L
V
 
V
I
 
L
G
 
-
G
 
G
N
 
D
V
 
P
T
 
T
E
 
E
E
 
E
N
 
A
P
|
P
V
x
I
T
 
L
E
 
H
Y
 
L
L
 
R
L
 
L
R
 
S
D
 
E
A
 
F
V
 
V
R
 
R
Q
 
D
R
 
L
Q
 
K
A
 
P
G
 
P
L
 
H
L
 
R
L
 
Y
L
 
N
S
 
H
A
 
G
R
 
T
P
 
P
S
 
F
R
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
A
D
 
D
A
 
L
R
 
Q
V
 
I
V
 
K
L
 
E
R
 
R
V
 
M
P
 
P
P
 
R
G
 
R
G
 
T
E
 
D
A
 
K
A
 
M
S
 
A
L
 
L
-
 
F
-
 
A
-
 
P
-
 
Y
A
 
R
A
 
A
V
 
P
V
 
L
A
 
M
G
 
K
L
 
W
A
 
A
A
 
A
A
 
I
A
 
H
G
 
E
E
 
V
N
 
H
L
 
R
S
 
P
G
 
G
E
 
E
T
 
E
I
 
R
D
 
E
A
 
I
V
 
L
G
 
L
A
 
A
T
 
L
I
 
L
G
 
G
R
 
-
P
 
-
S
 
-
E
 
D
S
 
K
A
 
E
G
 
G
S
 
S
E
 
E
E
 
M
S
 
V
D
 
A
R
 
K
L
 
A
V
 
K
A
 
E
G
 
A
L
 
W
R
 
E
D
 
K
S
 
A
R
 
K
G
 
N
V
 
P
T
 
V
V
 
L
L
 
I
V
 
L
S
 
G
V
x
A
G
 
G
L
 
V
L
 
L
R
 
Q
S
 
D
P
 
T
E
 
V
A
 
A
R
 
A
A
 
E
M
 
R
L
 
A
Q
 
R
Q
 
L
V
 
L
S
 
A
N
 
E
L
 
-
L
 
R
Q
 
K
A
 
G
L
 
A
R
 
K
M
 
V
L
 
L
G
 
A
K
 
M
D
 
T
P
|
P
A
|
A
M
 
-
Q
 
-
F
 
-
L
 
-
F
 
-
D
 
-
R
 
-
A
 
A
N
 
N
Q
 
A
M
 
R
G
 
G
A
 
L
W
 
E
D
 
A
M
 
M
G
 
G
V
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
G
T
 
A
L
 
-
P
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
D
 
-
S
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
T
 
-
H
 
-
E
 
K
G
 
G
A
 
A
-
 
S
W
 
W
D
 
D
A
 
-
E
 
-
I
 
-
P
 
-
S
 
-
E
 
E
P
 
P
G
 
G
A
 
A
N
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
C
 
-
V
 
-
D
 
-
G
 
-
R
 
-
M
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
Y
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
P
 
-
L
 
L
L
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
P
 
Y
D
 
G
R
 
F
D
 
V
F
 
P
V
 
P
K
 
E
R
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
K
A
 
G
A
 
K
D
 
R
L
 
F
L
 
V
I
 
V
V
 
M
Q
 
H
D
 
L
T
 
S
F
 
H
L
 
L
T
 
H
D
 
P
T
 
L
A
 
A
G
 
E
-
 
R
L
 
Y
A
 
A
E
 
H
V
 
V
V
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
A
A
 
P
G
 
T
Y
 
F
G
 
Y
E
 
E
E
 
K
A
 
R
G
 
G
T
 
H
F
 
L
T
 
V
N
 
N
N
 
L
E
 
E
G
 
G
R
 
R
I
 
V
Q
 
L
T
 
P
L
 
L
R
 
S
K
 
P
F
 
A
R
 
P
A
 
I
P
 
E
A
 
N
F
 
G
E
 
E
A
 
A
R
 
E
G
 
G
N
 
A
L
 
L
E
 
Q
V
 
V
F
 
L
E
 
A
F
 
L
V
 
L
A
 
A

7qsoG Bovine complex i in lipid nanodisc, state 3 (slack) (see paper)
28% identity, 78% coverage: 1:679/870 of query aligns to 4:602/700 of 7qsoG

query
sites
7qsoG
M
 
L
V
 
I
R
 
E
I
 
V
T
 
F
I
 
V
D
 
D
A
 
G
Q
 
Q
S
 
S
L
 
V
E
 
M
V
 
V
E
 
E
A
 
P
G
 
G
S
 
T
T
 
T
V
 
V
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
A
 
C
Q
 
E
R
 
K
L
 
V
G
 
G
I
 
M
D
 
Q
V
 
I
P
 
P
T
x
R
F
 
F
C
|
C
Y
|
Y
L
 
H
E
 
E
R
 
R
L
 
L
P
 
S
P
 
V
L
 
A
A
x
G
S
 
N
C
|
C
R
|
R
M
 
M
C
|
C
L
 
L
V
 
V
E
 
E
I
 
I
E
 
E
G
 
K
L
 
A
R
 
P
R
 
K
L
 
V
Q
 
V
P
 
A
S
 
A
C
|
C
A
 
A
T
 
M
A
 
P
V
 
V
T
 
M
D
 
K
G
 
G
M
 
W
V
 
N
V
 
I
R
 
L
T
 
T
N
 
N
T
 
S
P
 
E
L
 
K
I
 
T
D
 
K
E
 
K
T
 
A
R
 
R
S
 
E
S
 
G
M
 
V
L
 
M
D
 
E
M
 
F
L
 
L
L
 
L
A
 
A
N
 
N
H
|
H
P
 
P
L
 
L
D
|
D
C
|
C
P
 
P
I
 
I
C
|
C
D
 
D
K
x
Q
G
|
G
G
 
G
E
 
E
C
|
C
E
 
D
L
 
L
Q
|
Q
D
 
D
M
 
Q
V
 
S
M
 
M
D
 
M
Y
 
F
G
 
G
P
 
S
R
 
D
R
 
R
S
 
S
E
 
R
F
 
F
R
 
L
D
 
E
P
 
G
K
 
K
R
 
R
V
 
A
F
 
V
H
 
E
S
 
D
R
 
K
D
 
N
I
 
I
R
 
-
L
 
-
S
 
G
P
 
P
V
 
L
I
 
V
I
 
K
M
 
T
N
 
I
V
 
M
N
 
T
R
 
R
C
|
C
I
|
I
Q
|
Q
C
|
C
Q
x
T
R
|
R
C
|
C
V
 
I
R
 
R
M
 
F
C
 
A
E
 
S
E
 
E
V
 
I
V
 
A
G
 
G
A
 
V
V
 
D
A
 
D
L
 
L
G
 
G
T
 
T
V
 
T
E
 
G
K
 
R
G
 
G
M
 
N
D
 
D
T
 
M
A
 
Q
V
 
V
T
 
G
G
 
T
F
 
Y
E
 
I
G
 
E
S
 
K
L
 
M
A
 
F
S
 
M
C
 
S
D
 
E
Q
 
L
C
 
S
G
 
G
N
 
N
C
 
I
V
 
I
Q
 
D
V
 
I
C
|
C
P
|
P
V
|
V
G
|
G
A
|
A
L
 
L
M
 
T
S
 
S
F
 
K
P
 
P
Y
 
Y
R
 
A
Y
 
F
K
 
T
A
 
A
R
 
R
P
 
P
W
 
W
D
 
E
L
 
T
A
 
R
E
 
K
T
 
T
D
 
E
T
 
S
I
 
I
C
 
D
P
 
V
H
 
M
C
 
D
G
 
A
T
 
V
G
 
G
C
 
S
Q
 
N
L
 
I
T
 
V
V
 
V
G
 
S
A
 
T
R
 
R
K
 
T
G
 
G
E
 
E
F
 
V
M
 
M
R
 
R
V
 
I
R
 
L
S
 
P
K
 
R
P
 
M
E
 
H
H
 
E
G
 
D
V
 
I
N
 
N
R
 
E
E
 
E
T
 
W
L
 
I
C
 
S
V
 
D
R
 
K
G
 
T
R
 
R
F
 
F
G
 
A
L
 
Y
D
 
D
F
 
G
V
 
L
E
 
K
S
 
-
R
 
R
D
 
Q
R
 
R
I
 
L
K
 
T
R
 
E
P
 
P
M
 
M
I
 
V
R
 
R
R
 
N
D
 
E
-
 
K
G
 
G
V
 
L
L
 
L
V
 
T
P
 
H
V
 
T
S
 
T
W
 
W
S
 
E
E
 
D
A
 
A
G
 
L
D
 
S
H
 
R
L
 
V
R
 
A
R
 
G
R
 
M
L
 
L
A
 
Q
A
 
S
V
 
F
E
 
Q
N
 
G
K
 
N
A
 
D
A
 
V
G
 
A
G
 
A
L
 
I
A
 
A
S
 
G
A
 
G
R
 
L
L
 
V
P
 
D
N
 
A
E
 
E
V
 
A
L
 
L
Y
 
I
Q
 
A
F
 
L
Q
 
K
K
 
D
L
 
L
M
 
L
R
 
-
T
 
-
V
 
-
F
 
-
R
 
-
T
 
-
N
 
N
N
 
R
I
 
V
D
 
D
C
 
S
S
 
D
S
 
T
R
 
L
W
 
C
S
 
T
A
 
E
P
 
E
-
 
V
F
 
F
D
 
P
T
 
T
L
 
A
G
 
G
P
 
A
-
 
G
-
 
T
-
 
D
L
 
L
L
 
R
G
 
S
G
 
N
F
 
Y
Y
 
L
T
 
L
R
 
N
A
 
T
P
 
T
L
 
I
Q
 
A
E
 
G
V
 
V
I
 
E
D
 
E
K
 
A
D
 
D
C
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
L
I
 
V
G
 
G
G
 
T
N
 
N
V
 
P
T
 
R
E
 
F
E
 
E
N
 
A
P
 
P
V
 
L
T
 
F
E
 
N
Y
 
A
L
 
R
L
 
I
R
 
R
D
 
K
A
 
S
V
 
W
R
 
L
Q
 
H
R
 
N
Q
 
D
A
 
L
G
 
K
L
 
V
L
 
A
L
 
L
L
 
I
S
 
G
A
 
S
R
 
-
P
 
P
S
 
V
R
 
D
L
 
L
D
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
V
 
-
V
 
T
L
 
Y
R
 
R
V
 
Y
P
 
D
P
 
H
G
 
L
G
 
G
E
 
D
A
 
S
A
 
P
S
 
K
L
 
I
A
 
L
A
 
Q
V
 
D
V
 
I
A
 
A
G
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
-
N
 
-
L
 
-
S
 
-
G
 
-
E
 
-
T
 
-
I
 
-
D
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
-
A
 
-
T
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
S
 
-
E
 
-
S
 
-
A
 
S
G
 
G
S
 
S
E
 
H
E
 
P
S
 
F
D
 
S
R
 
Q
L
 
V
V
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
L
R
 
Q
D
 
E
S
 
A
R
 
K
G
 
K
V
 
P
T
 
M
V
 
V
L
 
I
V
 
L
S
 
G
V
 
S
G
 
S
L
 
A
L
 
L
R
 
Q
S
 
R
P
 
N
E
 
D
A
 
G
R
 
A
A
 
A
M
 
I
L
 
L
Q
 
A
Q
 
A
V
 
V
S
 
S
N
 
N
L
 
I
L
 
A
Q
 
Q
A
 
K
L
 
I
R
 
R
-
 
T
-
 
S
-
 
S
-
 
G
M
 
V
L
 
T
G
 
G
K
 
D
D
 
W
P
 
K
A
 
V
M
 
M
Q
 
N
F
 
I
L
 
L
F
 
H
D
 
R
R
 
I
A
 
A
N
 
S
Q
 
Q
M
 
V
G
 
A
A
 
A
W
 
L
D
 
D
M
 
L
G
 
G
V
 
Y
L
 
-
P
 
-
A
 
-
T
 
-
L
 
K
P
 
P
G
 
G
L
 
V
R
 
E
A
 
A
V
 
I
T
 
Q
D
 
K
D
 
N
S
 
P
A
 
P
R
 
K
A
 
-
T
 
-
H
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
W
 
-
D
 
-
A
 
-
E
 
-
I
 
-
P
 
-
S
 
-
E
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
C
 
-
V
 
-
D
 
-
G
 
-
R
 
-
M
 
-
G
 
-
A
 
M
L
 
L
Y
 
F
V
 
L
A
 
L
G
 
G
T
 
A
D
 
D
P
 
G
L
 
-
L
 
-
A
 
-
Y
 
-
P
 
-
D
 
-
R
 
-
D
 
G
F
 
C
V
 
I
K
 
T
R
 
R
A
 
Q
L
 
D
G
 
L
A
 
P
A
 
K
D
 
D
L
 
C
L
 
F
I
 
I
V
 
V
Q
 
Y
D
 
Q
T
 
G
F
 
H
L
 
H
T
 
G
D
 
D
T
 
V
-
 
G
A
 
A
G
 
P
L
 
I
A
 
A
E
 
D
V
 
V
V
 
I
L
 
L
P
 
P
A
 
G
A
 
A
G
 
A
Y
 
Y
G
 
T
E
 
E
E
 
K
A
 
S
G
 
A
T
 
T
F
 
Y
T
 
V
N
 
N
N
 
T
E
 
E
G
 
G
R
 
R
I
 
A
Q
 
Q
T
 
Q
L
 
T
R
 
K
K
 
V
F
 
A
R
 
V
A
 
T
P
 
P
A
 
P
F
 
G
E
 
L
A
 
A
R
 
R
G
 
E
N
 
D
L
 
W
E
 
K
V
 
I
F
 
I
E
 
R
F
 
A
V
 
L
A
 
S
A
 
E
L
 
I

4hea3 Crystal structure of the entire respiratory complex i from thermus thermophilus (see paper)
31% identity, 78% coverage: 1:677/870 of query aligns to 1:624/756 of 4hea3

query
sites
4hea3
M
 
M
V
 
V
R
 
R
I
 
V
T
 
K
I
 
V
D
 
N
A
 
D
Q
 
R
S
 
I
L
 
V
E
 
E
V
 
V
E
 
P
A
 
P
G
 
G
S
 
T
T
 
S
V
 
V
L
 
M
Q
 
D
A
 
A
A
 
V
Q
 
F
R
 
H
L
 
A
G
 
G
I
 
Y
D
 
D
V
 
V
P
 
P
T
 
L
F
 
F
C
|
C
Y
x
S
L
 
E
E
 
K
R
 
H
L
 
L
P
 
S
P
 
P
L
 
I
A
x
G
S
 
A
C
|
C
R
|
R
M
 
M
C
|
C
L
 
L
V
 
V
E
 
R
I
 
I
E
 
G
G
 
L
L
 
P
R
 
I
R
 
Q
L
 
W
Q
 
Q
P
 
P
-
 
K
-
 
L
-
 
A
-
 
A
S
 
S
C
|
C
A
 
V
T
 
T
A
 
A
V
 
V
T
 
A
D
 
D
G
 
G
M
 
M
V
 
V
V
 
V
R
 
D
T
 
T
N
 
L
T
 
S
P
 
D
L
 
V
I
 
V
D
 
R
E
 
E
T
 
A
R
 
Q
S
 
A
S
 
G
M
 
M
L
 
V
D
 
E
M
 
F
L
 
T
L
 
L
A
 
L
N
 
N
H
|
H
P
 
P
L
 
L
D
|
D
C
|
C
P
 
P
I
 
T
C
|
C
D
 
D
K
 
K
G
 
G
G
 
G
E
 
A
C
|
C
E
 
E
L
 
L
Q
|
Q
D
 
D
M
 
R
V
 
T
M
 
V
D
 
E
Y
 
Y
G
 
G
-
 
L
-
 
Y
-
 
E
-
 
K
-
 
Y
-
 
P
-
 
L
-
 
E
-
 
L
P
 
P
R
 
V
R
 
Y
S
 
T
E
 
R
F
 
F
R
 
E
D
 
F
P
 
T
K
 
R
R
 
R
V
 
H
F
 
V
H
 
-
S
 
D
R
 
K
D
 
H
I
 
H
R
 
P
L
 
L
S
 
S
P
 
P
V
 
F
I
 
V
I
 
I
M
 
L
N
 
D
V
 
R
N
 
E
R
|
R
C
|
C
I
|
I
Q
 
H
C
|
C
Q
 
K
R
|
R
C
|
C
V
 
V
R
 
R
M
 
Y
C
 
F
E
 
E
E
 
E
V
 
V
V
 
P
G
 
G
A
 
D
V
 
E
A
 
V
L
 
L
G
 
D
T
x
F
V
 
I
E
 
E
K
 
R
G
 
G
M
 
V
D
 
H
T
 
T
A
 
F
V
 
I
T
 
G
G
 
T
F
 
M
E
 
D
G
 
F
S
 
G
L
 
L
A
 
P
S
 
S
C
 
-
D
 
G
Q
 
F
C
 
S
G
 
G
N
 
N
C
 
I
V
 
T
Q
 
D
V
 
I
C
|
C
P
|
P
V
|
V
G
 
G
A
|
A
L
|
L
M
 
L
S
 
D
F
 
L
P
 
T
Y
 
A
R
 
R
Y
 
F
K
 
R
A
 
A
R
 
R
P
 
N
W
 
W
D
 
E
L
 
M
A
 
E
E
 
E
T
 
T
D
 
P
T
 
T
I
 
T
C
|
C
P
 
A
H
x
L
C
|
C
G
 
P
T
x
V
G
|
G
C
|
C
Q
 
G
L
 
I
T
 
T
V
 
A
G
 
D
A
 
T
R
 
R
K
 
S
G
 
G
E
 
E
F
 
L
M
 
L
R
 
R
V
 
I
R
 
R
S
 
A
K
 
R
P
 
E
E
 
V
H
 
P
G
 
E
V
 
V
N
 
N
R
 
E
E
 
I
T
 
W
L
 
I
C
|
C
V
 
D
R
 
A
G
|
G
R
 
R
F
 
F
G
 
G
L
 
H
D
 
E
F
 
W
V
 
A
E
 
D
S
 
-
R
 
Q
D
 
N
R
 
R
I
 
L
K
 
K
R
 
T
P
 
P
M
 
L
I
 
V
R
 
R
R
 
K
D
 
E
G
 
G
V
 
R
L
 
L
V
 
V
P
 
E
V
 
A
S
 
T
W
 
W
S
 
E
E
 
E
A
 
A
G
 
F
D
 
L
H
 
A
L
 
L
R
 
K
R
 
E
R
 
G
L
 
L
A
 
K
A
 
E
V
 
A
E
 
R
N
 
G
K
 
E
A
 
E
A
 
V
G
 
G
-
 
L
G
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
H
A
 
D
R
 
A
L
 
T
P
 
L
N
 
E
E
 
E
V
 
G
L
 
L
Y
 
L
Q
 
A
F
 
S
Q
 
E
K
 
-
L
 
-
M
 
L
R
 
A
T
 
K
V
 
A
F
 
L
R
 
K
T
 
T
N
 
P
N
 
H
I
 
L
D
 
D
C
 
F
S
 
Q
S
 
G
R
 
R
W
 
T
S
x
A
A
|
A
P
 
P
F
 
A
D
 
S
T
 
L
L
 
F
G
 
P
P
 
P
L
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
F
 
-
Y
 
-
T
 
-
R
 
-
A
 
A
P
 
S
L
 
L
Q
 
E
E
 
D
V
 
L
I
 
L
D
 
Q
K
 
A
D
 
D
C
 
F
V
 
A
L
 
L
V
 
V
I
 
L
G
 
-
G
 
G
N
 
D
V
 
P
T
 
T
E
 
E
E
 
E
N
 
A
P
 
P
V
x
I
T
 
L
E
 
H
Y
 
L
L
 
R
L
 
L
R
 
S
D
 
E
A
 
F
V
 
V
R
 
R
Q
 
D
R
 
L
Q
 
K
A
 
P
G
 
P
L
 
H
L
 
R
L
 
Y
L
 
N
S
 
H
A
 
G
R
 
T
P
 
P
S
 
F
R
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
A
D
 
D
A
 
L
R
 
Q
V
 
I
V
 
K
L
 
E
R
 
R
V
 
M
P
 
P
P
 
R
G
 
R
G
 
T
E
 
D
A
 
K
A
 
M
S
 
A
L
 
L
-
 
F
-
 
A
-
 
P
-
 
Y
A
 
R
A
 
A
V
 
P
V
 
L
A
 
M
G
 
K
L
 
W
A
 
A
A
 
A
A
 
I
A
 
H
G
 
E
E
 
V
N
 
H
L
 
R
S
 
P
G
 
G
E
 
E
T
 
E
I
 
R
D
 
E
A
 
I
V
 
L
G
 
L
A
 
A
T
 
L
I
 
L
G
 
G
R
 
-
P
 
-
S
 
-
E
 
D
S
 
K
A
 
E
G
 
G
S
 
S
E
 
E
E
 
M
S
 
V
D
 
A
R
 
K
L
 
A
V
 
K
A
 
E
G
 
A
L
 
W
R
 
E
D
 
K
S
 
A
R
 
K
G
 
N
V
 
P
T
 
V
V
 
L
L
 
I
V
 
L
S
 
G
V
x
A
G
 
G
L
 
V
L
 
L
R
 
Q
S
 
D
P
 
T
E
 
V
A
 
A
R
 
A
A
 
E
M
 
R
L
 
A
Q
 
R
Q
 
L
V
 
L
S
 
A
N
 
E
L
 
-
L
 
R
Q
 
K
A
 
G
L
 
A
R
 
K
M
 
V
L
 
L
G
 
A
K
 
M
D
 
T
P
|
P
A
|
A
M
 
-
Q
 
-
F
 
-
L
 
-
F
 
-
D
 
-
R
 
-
A
 
A
N
 
N
Q
 
A
M
 
R
G
 
G
A
 
L
W
 
E
D
 
A
M
 
M
G
 
G
V
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
-
T
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
D
 
-
S
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
G
T
 
A
H
 
K
E
 
G
G
 
A
A
 
S
W
 
W
D
 
D
A
 
-
E
 
-
I
 
-
P
 
-
S
 
-
E
 
E
P
 
P
G
 
G
A
 
A
N
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
C
 
-
V
 
-
D
 
-
G
 
-
R
 
-
M
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
Y
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
P
 
-
L
 
L
L
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
P
 
Y
D
 
G
R
 
F
D
 
V
F
 
P
V
 
P
K
 
E
R
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
K
A
 
G
A
 
K
D
 
R
L
 
F
L
 
V
I
 
V
V
 
M
Q
 
H
D
 
L
T
 
S
F
 
H
L
 
L
T
 
H
D
 
P
T
 
L
A
 
A
G
 
E
-
 
R
L
 
Y
A
 
A
E
 
H
V
 
V
V
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
A
A
 
P
G
 
T
Y
 
F
G
 
Y
E
 
E
E
 
K
A
 
R
G
 
G
T
 
H
F
 
L
T
 
V
N
 
N
N
 
L
E
 
E
G
 
G
R
 
R
I
 
V
Q
 
L
T
 
P
L
 
L
R
 
S
K
 
P
F
 
A
R
 
P
A
 
I
P
 
E
A
 
N
F
 
G
E
 
E
A
 
A
R
 
E
G
 
G
N
 
A
L
 
L
E
 
Q
V
 
V
F
 
L
E
 
A
F
 
L
V
 
L
A
 
A

5gupG structure of mammalian respiratory supercomplex I1III2IV1 (see paper)
28% identity, 78% coverage: 1:679/870 of query aligns to 2:586/673 of 5gupG

query
sites
5gupG
M
 
L
V
 
I
R
 
E
I
 
V
T
 
F
I
 
V
D
 
D
A
 
G
Q
 
Q
S
 
S
L
 
V
E
 
M
V
 
V
E
 
E
A
 
P
G
 
G
S
 
T
T
 
T
V
 
V
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
A
 
C
Q
 
E
R
 
K
L
 
V
G
 
G
I
 
M
D
 
Q
V
 
I
P
 
P
T
 
R
F
 
F
C
|
C
Y
|
Y
L
 
H
E
 
E
R
 
R
L
 
L
P
 
S
P
 
V
L
 
A
A
 
G
S
x
N
C
|
C
R
 
R
M
 
M
C
|
C
L
 
L
V
 
V
E
 
E
I
 
I
E
 
E
G
 
K
L
 
A
R
 
P
R
 
K
L
 
V
Q
 
V
P
 
A
S
 
A
C
|
C
A
 
A
T
 
M
A
 
P
V
 
V
T
 
M
D
 
K
G
 
G
M
 
W
V
 
N
V
 
I
R
 
L
T
 
T
N
 
N
T
 
S
P
 
E
L
 
K
I
 
S
D
 
K
E
 
K
T
 
A
R
 
R
S
 
E
S
 
G
M
 
V
L
 
M
D
 
E
M
 
F
L
 
L
L
 
L
A
 
A
N
 
N
H
|
H
P
 
P
L
 
L
D
 
D
C
|
C
P
 
P
I
 
I
C
|
C
D
 
D
K
x
Q
G
 
G
G
 
G
E
 
E
C
|
C
E
 
D
L
 
L
Q
|
Q
D
 
D
M
 
Q
V
 
S
M
 
M
D
 
M
Y
 
F
G
 
G
P
 
S
R
 
D
R
 
R
S
 
S
E
 
R
F
 
F
R
 
L
D
 
E
P
 
G
K
 
K
R
 
R
V
 
A
F
 
V
H
 
E
S
 
D
R
 
K
D
 
N
I
 
I
R
 
-
L
 
-
S
 
G
P
 
P
V
 
L
I
 
V
I
 
K
M
 
T
N
 
I
V
 
M
N
 
T
R
|
R
C
|
C
I
|
I
Q
 
Q
C
|
C
Q
x
T
R
 
R
C
|
C
V
 
I
R
 
R
M
 
F
C
 
A
E
 
S
E
 
E
V
 
I
V
 
A
G
 
G
A
 
V
V
 
D
A
 
D
L
 
L
G
 
G
T
 
T
V
 
T
E
 
G
K
 
R
G
 
G
M
 
N
D
 
D
T
 
M
A
 
Q
V
|
V
T
 
G
G
 
T
F
 
Y
E
 
I
G
 
E
S
 
K
L
 
M
A
 
F
S
 
M
C
 
S
D
 
E
Q
 
L
C
 
S
G
 
G
N
 
N
C
 
I
V
 
I
Q
 
D
V
 
I
C
|
C
P
|
P
V
 
V
G
 
G
A
|
A
L
|
L
M
 
T
S
 
S
F
 
K
P
 
P
Y
 
Y
R
 
A
Y
 
F
K
 
T
A
 
A
R
 
R
P
 
P
W
 
W
D
 
E
L
 
T
A
 
R
E
 
K
T
 
T
D
 
E
T
 
S
I
 
I
C
 
D
P
 
V
H
 
M
C
 
D
G
 
A
T
 
V
G
 
G
C
 
S
Q
 
N
L
 
I
T
 
V
V
 
V
G
 
S
A
 
T
R
 
R
K
 
T
G
 
G
E
 
E
F
 
V
M
 
M
R
 
R
V
 
I
R
 
L
S
 
P
K
 
R
P
 
M
E
 
H
H
 
E
G
 
D
V
 
I
N
 
N
R
 
E
E
 
E
T
 
W
L
 
I
C
 
S
V
 
D
R
 
K
G
 
T
R
 
R
F
 
F
G
 
A
L
 
Y
D
 
D
F
 
G
V
 
L
E
x
K
S
 
-
R
|
R
D
x
Q
R
|
R
I
 
L
K
 
T
R
 
Q
P
 
P
M
 
M
I
 
I
R
|
R
R
 
N
D
 
E
-
 
K
G
 
G
V
x
L
L
|
L
V
 
T
P
x
Y
V
 
T
S
 
T
W
 
W
S
 
E
E
 
D
A
 
A
G
 
L
D
 
S
H
 
R
L
 
V
R
 
A
R
 
G
R
 
M
L
 
L
A
 
Q
A
 
S
V
 
F
E
 
Q
N
 
G
K
 
N
A
 
D
A
 
V
G
 
A
G
 
A
L
 
I
A
 
A
S
 
G
A
 
G
R
 
L
L
 
V
P
 
D
N
 
A
E
 
E
V
 
A
L
 
L
Y
 
V
Q
 
A
F
 
L
Q
 
K
K
 
D
L
 
L
M
 
L
R
 
-
T
 
-
V
 
-
F
 
-
R
 
-
T
 
-
N
 
N
N
 
R
I
 
V
D
 
D
C
 
S
S
 
D
S
 
S
R
 
L
W
 
C
S
 
T
A
 
E
P
 
E
-
 
V
F
 
F
D
 
P
T
 
T
L
 
A
G
 
G
P
 
A
-
 
G
-
 
T
-
 
D
L
 
L
L
 
R
G
 
S
G
 
N
F
 
Y
Y
 
L
T
 
L
R
 
N
A
 
T
P
 
T
L
 
I
Q
 
A
E
 
G
V
 
V
I
 
E
D
 
E
K
 
A
D
 
D
C
 
V
V
 
I
L
 
L
V
 
L
I
 
V
G
 
G
G
 
T
N
 
N
V
 
P
T
 
R
E
 
F
E
 
E
N
 
A
P
 
P
V
 
L
T
 
F
E
 
N
Y
 
A
L
 
R
L
 
I
R
 
R
D
 
K
A
 
S
V
 
W
R
 
L
Q
 
H
R
 
N
Q
 
D
A
 
L
G
 
K
L
 
V
L
 
A
L
 
L
L
 
I
S
 
G
A
 
S
R
 
-
P
 
P
S
 
V
R
 
D
L
 
L
D
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
-
V
 
-
V
 
T
L
 
Y
R
 
R
V
 
Y
P
 
D
P
 
H
G
 
L
G
 
G
E
 
D
A
 
S
A
 
P
S
 
K
L
 
I
A
 
L
A
 
Q
V
 
D
V
 
I
A
 
A
G
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
-
N
 
-
L
 
-
S
 
-
G
 
-
E
 
-
T
 
-
I
 
-
D
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
-
A
 
-
T
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
S
 
-
E
 
-
S
 
-
A
 
S
G
 
G
S
 
N
E
 
H
E
 
P
S
 
F
D
 
S
R
 
Q
L
 
I
V
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
L
R
 
K
D
 
E
S
 
A
R
 
K
G
 
K
V
 
P
T
 
M
V
 
V
L
 
V
V
 
L
S
 
G
V
 
S
G
 
S
L
 
A
L
 
L
R
 
Q
S
 
R
P
 
S
E
 
D
A
 
G
R
 
T
A
 
A
M
 
I
L
 
L
Q
 
A
Q
 
A
V
 
V
S
 
S
N
 
N
L
 
I
L
 
A
Q
 
Q
A
 
N
L
 
I
R
 
R
M
 
-
L
 
-
G
 
-
K
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
M
 
-
Q
 
-
F
 
-
L
 
L
F
 
S
D
 
S
R
 
G
A
 
A
N
 
S
Q
 
Q
M
 
V
G
 
A
A
 
A
W
 
L
D
 
D
M
 
L
G
 
G
V
 
Y
L
 
-
P
 
-
A
 
-
T
 
-
L
 
K
P
 
P
G
 
G
L
 
V
R
 
E
A
 
A
V
 
I
T
 
R
D
 
K
D
 
N
S
 
P
A
 
P
R
 
K
A
 
-
T
 
-
H
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
W
 
-
D
 
-
A
 
-
E
 
-
I
 
-
P
 
-
S
 
-
E
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
C
 
-
V
 
-
D
 
-
G
 
-
R
 
-
M
 
-
G
 
-
A
 
V
L
 
L
Y
 
F
V
 
L
A
 
L
G
 
G
T
 
A
D
 
D
P
 
G
L
 
-
L
 
-
A
 
-
Y
 
-
P
 
-
D
 
-
R
 
-
D
 
G
F
 
C
V
 
I
K
 
T
R
 
R
A
 
Q
L
 
D
G
 
L
A
 
P
A
 
K
D
 
D
L
 
C
L
 
F
I
 
I
V
 
I
Q
 
Y
D
 
Q
T
 
G
F
 
H
L
 
H
T
 
G
D
 
D
T
 
V
-
 
G
A
 
A
G
 
P
L
 
M
A
 
A
E
 
D
V
 
V
V
 
I
L
 
L
P
 
P
A
 
G
A
 
A
G
 
A
Y
 
Y
G
 
T
E
 
E
E
 
K
A
 
S
G
 
A
T
 
T
F
 
Y
T
 
V
N
 
N
N
 
T
E
 
E
G
 
G
R
 
R
I
 
A
Q
 
Q
T
 
Q
L
 
T
R
 
K
K
 
V
F
 
A
R
 
V
A
 
T
P
 
P
A
 
P
F
 
G
E
 
L
A
 
A
R
 
R
G
 
E
N
 
D
L
 
W
E
 
K
V
 
I
F
 
I
E
 
R
F
 
A
V
 
L
A
 
S
A
 
E
L
 
I

Q56223 NADH-quinone oxidoreductase subunit 3; NADH dehydrogenase I chain 3; NDH-1 subunit 3; EC 7.1.1.- from Thermus thermophilus (strain ATCC 27634 / DSM 579 / HB8) (see 2 papers)
30% identity, 78% coverage: 1:677/870 of query aligns to 1:645/783 of Q56223

query
sites
Q56223
M
 
M
V
 
V
R
 
R
I
 
V
T
 
K
I
 
V
D
 
N
A
 
D
Q
 
R
S
 
I
L
 
V
E
 
E
V
 
V
E
 
P
A
 
P
G
 
G
S
 
T
T
 
S
V
 
V
L
 
M
Q
 
D
A
 
A
A
 
V
Q
 
F
R
 
H
L
 
A
G
 
G
I
 
Y
D
 
D
V
 
V
P
 
P
T
 
L
F
 
F
C
|
C
Y
 
S
L
 
E
E
 
K
R
 
H
L
 
L
P
 
S
P
 
P
L
 
I
A
 
G
S
 
A
C
|
C
R
 
R
M
 
M
C
|
C
L
 
L
V
 
V
-
 
R
-
 
I
-
 
G
-
 
L
-
 
P
-
 
K
-
 
K
-
 
G
-
 
P
-
 
D
-
 
G
-
 
K
-
 
P
-
 
L
-
 
L
-
 
N
-
 
E
-
 
K
-
 
G
-
 
E
-
 
P
E
 
E
I
 
I
E
 
Q
G
 
W
L
 
Q
R
 
P
R
 
K
L
 
L
Q
 
A
P
 
A
S
 
S
C
|
C
A
 
V
T
 
T
A
 
A
V
 
V
T
 
A
D
 
D
G
 
G
M
 
M
V
 
V
V
 
V
R
 
D
T
 
T
N
 
L
T
 
S
P
 
D
L
 
V
I
 
V
D
 
R
E
 
E
T
 
A
R
 
Q
S
 
A
S
 
G
M
 
M
L
 
V
D
 
E
M
 
F
L
 
T
L
 
L
A
 
L
N
 
N
H
|
H
P
 
P
L
 
L
D
 
D
C
 
C
P
 
P
I
 
T
C
 
C
D
 
D
K
 
K
G
 
G
G
 
G
E
 
A
C
 
C
E
 
E
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
M
 
R
V
 
T
M
 
V
D
 
E
Y
 
Y
G
 
G
-
 
L
-
 
Y
-
 
E
-
 
K
-
 
Y
-
 
Y
-
 
Q
-
 
K
-
 
G
-
 
P
-
 
L
-
 
E
-
 
L
P
 
P
R
 
V
R
 
Y
S
 
T
E
 
R
F
 
F
R
 
E
D
 
F
P
 
T
K
 
R
R
 
R
V
 
H
F
 
V
H
 
-
S
 
D
R
 
K
D
 
H
I
 
H
R
 
P
L
 
L
S
 
S
P
 
P
V
 
F
I
 
V
I
 
I
M
 
L
N
 
D
V
 
R
N
 
E
R
 
R
C
|
C
I
 
I
Q
 
H
C
|
C
Q
 
K
R
 
R
C
|
C
V
 
V
R
 
R
M
 
Y
C
 
F
E
 
E
E
 
E
V
 
V
V
 
P
G
 
G
A
 
D
V
 
E
A
 
V
L
 
L
G
 
D
T
 
F
V
 
I
E
 
E
K
 
R
G
 
G
M
 
V
D
 
H
T
 
T
A
 
F
V
 
I
T
 
G
G
 
T
F
 
M
E
 
D
G
 
F
S
 
G
L
 
L
A
 
P
S
 
S
C
 
-
D
 
G
Q
 
F
C
 
S
G
 
G
N
 
N
C
 
I
V
 
T
Q
 
D
V
 
I
C
|
C
P
 
P
V
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
L
M
 
L
S
 
D
F
 
L
P
 
T
Y
 
A
R
 
R
Y
 
F
K
 
R
A
 
A
R
 
R
P
 
N
W
 
W
D
 
E
L
 
M
A
 
E
E
 
E
T
 
T
D
 
P
T
 
T
I
 
T
C
|
C
P
 
A
H
 
L
C
|
C
G
 
P
T
 
V
G
 
G
C
|
C
Q
 
G
L
 
I
T
 
T
V
 
A
G
 
D
A
 
T
R
 
R
K
 
S
G
 
G
E
 
E
F
 
L
M
 
L
R
 
R
V
 
I
R
 
R
S
 
A
K
 
R
P
 
E
E
 
V
H
 
P
G
 
E
V
 
V
N
 
N
R
 
E
E
 
I
T
 
W
L
 
I
C
|
C
V
 
D
R
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
F
G
 
G
L
 
H
D
 
E
F
 
W
V
 
A
E
 
D
S
 
-
R
 
Q
D
 
N
R
 
R
I
 
L
K
 
K
R
 
T
P
 
P
M
 
L
I
 
V
R
 
R
R
 
K
D
 
E
G
 
G
V
 
R
L
 
L
V
 
V
P
 
E
V
 
A
S
 
T
W
 
W
S
 
E
E
 
E
A
 
A
G
 
F
D
 
L
H
 
A
L
 
L
R
 
K
R
 
E
R
 
G
L
 
L
A
 
K
A
 
E
V
 
A
E
 
R
N
 
G
K
 
E
A
 
E
A
 
V
G
 
G
-
 
L
G
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
H
A
 
D
R
 
A
L
 
T
P
 
L
N
 
E
E
 
E
V
 
G
L
 
L
Y
 
L
Q
 
A
F
 
S
Q
 
E
K
 
-
L
 
-
M
 
L
R
 
A
T
 
K
V
 
A
F
 
L
R
 
K
T
 
T
N
 
P
N
 
H
I
 
L
D
 
D
C
 
F
S
 
Q
S
 
G
R
 
R
W
 
T
S
 
A
A
 
A
P
 
P
F
 
A
D
 
S
T
 
L
L
 
F
G
 
P
P
 
P
L
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
F
 
-
Y
 
-
T
 
-
R
 
-
A
 
A
P
 
S
L
 
L
Q
 
E
E
 
D
V
 
L
I
 
L
D
 
Q
K
 
A
D
 
D
C
 
F
V
 
A
L
 
L
V
 
V
I
 
L
G
 
-
G
 
G
N
 
D
V
 
P
T
 
T
E
 
E
E
 
E
N
 
A
P
 
P
V
 
I
T
 
L
E
 
H
Y
 
L
L
 
R
L
 
L
R
 
S
D
 
E
A
 
F
V
 
V
R
 
R
Q
 
D
R
 
L
Q
 
K
A
 
P
G
 
P
L
 
H
L
 
R
L
 
Y
L
 
N
S
 
H
A
 
G
R
 
T
P
 
P
S
 
F
R
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
A
D
 
D
A
 
L
R
 
Q
V
 
I
V
 
K
L
 
E
R
 
R
V
 
M
P
 
P
P
 
R
G
 
R
G
 
T
E
 
D
A
 
K
A
 
M
S
 
A
L
 
L
-
 
F
-
 
A
-
 
P
-
 
Y
A
 
R
A
 
A
V
 
P
V
 
L
A
 
M
G
 
K
L
 
W
A
 
A
A
 
A
A
 
I
A
 
H
G
 
E
E
 
V
N
 
H
L
 
R
S
 
P
G
 
G
E
 
E
T
 
E
I
 
R
D
 
E
A
 
I
V
 
L
G
 
L
A
 
A
T
 
L
I
 
L
G
 
G
R
 
-
P
 
-
S
 
-
E
 
D
S
 
K
A
 
E
G
 
G
S
 
S
E
 
E
E
 
M
S
 
V
D
 
A
R
 
K
L
 
A
V
 
K
A
 
E
G
 
A
L
 
W
R
 
E
D
 
K
S
 
A
R
 
K
G
 
N
V
 
P
T
 
V
V
 
L
L
 
I
V
 
L
S
 
G
V
 
A
G
 
G
L
 
V
L
 
L
R
 
Q
S
 
D
P
 
T
E
 
V
A
 
A
R
 
A
A
 
E
M
 
R
L
 
A
Q
 
R
Q
 
L
V
 
L
S
 
A
N
 
E
L
 
-
L
 
R
Q
 
K
A
 
G
L
 
A
R
 
K
M
 
V
L
 
L
G
 
A
K
 
M
D
 
T
P
 
P
A
 
A
M
 
-
Q
 
-
F
 
-
L
 
-
F
 
-
D
 
-
R
 
-
A
 
A
N
 
N
Q
 
A
M
 
R
G
 
G
A
 
L
W
 
E
D
 
A
M
 
M
G
 
G
V
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
-
T
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
D
 
-
S
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
G
T
 
A
H
 
K
E
 
G
G
 
A
A
 
S
W
 
W
D
 
D
A
 
-
E
 
-
I
 
-
P
 
-
S
 
-
E
 
E
P
 
P
G
 
G
A
 
A
N
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
C
 
-
V
 
-
D
 
-
G
 
-
R
 
-
M
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
Y
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
P
 
-
L
 
L
L
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
P
 
Y
D
 
G
R
 
F
D
 
V
F
 
P
V
 
P
K
 
E
R
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
K
A
 
G
A
 
K
D
 
R
L
 
F
L
 
V
I
 
V
V
 
M
Q
 
H
D
 
L
T
 
S
F
 
H
L
 
L
T
 
H
D
 
P
T
 
L
A
 
A
G
 
E
-
 
R
L
 
Y
A
 
A
E
 
H
V
 
V
V
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
A
A
 
P
G
 
T
Y
 
F
G
 
Y
E
 
E
E
 
K
A
 
R
G
 
G
T
 
H
F
 
L
T
 
V
N
 
N
N
 
L
E
 
E
G
 
G
R
 
R
I
 
V
Q
 
L
T
 
P
L
 
L
R
 
S
K
 
P
F
 
A
R
 
P
A
 
I
P
 
E
A
 
N
F
 
G
E
 
E
A
 
A
R
 
E
G
 
G
N
 
A
L
 
L
E
 
Q
V
 
V
F
 
L
E
 
A
F
 
L
V
 
L
A
 
A

P29915 NADH-quinone oxidoreductase chain 3; NADH dehydrogenase I, chain 3; NDH-1, chain 3; EC 7.1.1.- from Paracoccus denitrificans (see 2 papers)
29% identity, 78% coverage: 3:678/870 of query aligns to 6:585/673 of P29915

query
sites
P29915
R
 
K
I
 
I
T
 
K
I
 
I
D
 
D
A
 
D
Q
 
T
S
 
I
L
 
I
E
 
E
V
 
V
E
 
D
A
 
P
G
 
N
S
 
M
T
 
T
V
 
L
L
 
I
Q
 
Q
A
 
A
A
 
C
Q
 
E
R
 
M
L
 
A
G
 
G
I
 
I
D
 
E
V
 
V
P
 
P
T
 
R
F
 
F
C
 
C
Y
 
Y
L
 
H
E
 
E
R
 
R
L
 
L
P
 
S
P
 
I
L
 
A
A
 
G
S
 
N
C
 
C
R
 
R
M
 
M
C
 
C
L
 
L
V
 
V
E
 
E
I
 
V
-
 
V
E
 
G
G
 
G
L
 
P
R
 
P
R
 
K
L
 
P
Q
 
A
P
 
A
S
 
S
C
 
C
A
 
A
T
 
M
A
 
Q
V
 
V
T
 
K
D
 
D
-
 
L
-
 
R
-
 
P
-
 
G
-
 
P
-
 
E
-
 
G
-
 
A
G
 
P
M
 
S
V
 
E
V
 
I
R
 
R
T
 
T
N
 
N
T
 
S
P
 
P
L
 
M
I
 
V
D
 
K
E
 
K
T
 
A
R
 
R
S
 
E
S
 
G
M
 
V
L
 
M
D
 
E
M
 
F
L
 
L
L
 
L
A
 
I
N
 
N
H
|
H
P
 
P
L
 
L
D
 
D
C
 
C
P
 
P
I
 
I
C
 
C
D
 
D
K
 
Q
G
 
G
G
 
G
E
 
E
C
 
C
E
 
D
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
M
 
Q
V
 
A
M
 
M
D
 
A
Y
 
Y
G
 
G
P
 
V
R
 
D
R
 
F
S
 
S
E
 
R
F
 
Y
R
 
R
D
 
E
P
 
P
K
 
K
R
 
R
V
 
A
F
 
-
H
 
-
S
 
T
R
 
E
D
 
D
I
 
L
R
 
N
L
 
L
S
 
G
P
 
P
V
 
L
I
 
V
I
 
E
M
 
T
N
 
H
V
 
M
N
 
T
R
 
R
C
 
C
I
 
I
Q
 
S
C
 
C
Q
 
T
R
 
R
C
 
C
V
 
V
R
 
R
M
 
F
C
 
T
E
 
T
E
 
E
V
 
V
V
 
A
G
 
G
A
 
I
V
 
T
A
 
Q
L
 
M
G
 
G
T
 
Q
V
 
T
E
 
G
K
 
R
G
 
G
M
 
E
D
 
D
T
 
S
A
 
E
V
 
I
T
 
T
G
 
S
F
 
Y
E
 
L
G
 
N
S
 
Q
L
 
T
A
 
L
S
 
E
C
 
S
D
 
N
Q
 
M
C
 
Q
G
 
G
N
 
N
C
 
I
V
 
I
Q
 
D
V
 
L
C
 
C
P
 
P
V
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
L
M
 
V
S
 
S
F
 
K
P
 
P
Y
 
Y
R
 
A
Y
 
F
K
 
T
A
 
A
R
 
R
P
 
P
W
 
W
D
 
E
L
 
L
A
 
T
E
 
K
T
 
T
D
 
E
T
 
S
I
 
I
C
 
D
P
 
V
H
 
M
C
 
D
G
 
A
T
 
L
G
 
G
C
 
S
Q
 
S
L
 
I
T
 
R
V
 
I
G
 
D
A
 
T
R
 
K
K
 
G
G
 
R
E
 
E
F
 
V
M
 
M
R
 
R
V
 
I
R
 
L
S
 
P
K
 
R
P
 
N
E
 
H
H
 
D
G
 
G
V
 
V
N
 
N
R
 
E
E
 
E
T
 
W
L
 
I
C
 
S
V
 
D
R
 
K
G
 
T
R
 
R
F
 
F
G
 
V
L
 
W
D
 
D
F
 
G
V
 
L
E
 
R
S
 
-
R
 
R
D
 
Q
R
 
R
I
 
L
K
 
D
R
 
R
P
 
P
M
 
Y
I
 
I
R
 
R
R
 
E
D
 
N
G
 
G
V
 
R
L
 
L
V
 
R
P
 
P
V
 
A
S
 
S
W
 
W
S
 
P
E
 
E
A
 
A
G
 
L
D
 
E
H
 
A
L
 
A
R
 
A
R
 
R
R
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
A
V
 
M
E
 
K
N
 
G
K
 
K
A
 
K
A
 
I
G
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
I
S
 
G
A
 
D
R
 
L
L
 
V
P
 
P
N
 
A
E
 
E
V
 
A
L
 
A
Y
 
F
Q
 
S
F
 
L
Q
 
K
K
 
Q
L
 
L
M
 
V
R
 
E
T
 
G
V
 
L
F
 
-
R
 
-
T
 
G
N
 
G
N
 
K
I
 
V
D
 
E
C
 
C
-
 
R
-
 
V
-
 
D
S
 
G
S
 
A
R
 
R
W
 
L
S
 
P
A
 
A
P
 
G
F
 
N
D
 
R
T
 
S
L
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
A
F
 
Y
Y
 
V
T
 
G
R
 
T
A
 
A
P
 
R
L
 
I
Q
 
E
E
 
D
V
 
I
I
 
D
D
 
D
K
 
A
D
 
E
C
 
M
V
 
I
L
 
Q
V
 
L
I
 
I
G
 
G
G
 
T
N
 
N
V
 
P
T
 
R
E
 
D
E
 
E
N
 
A
P
 
P
V
 
V
T
 
L
E
 
N
Y
 
A
L
 
R
L
 
I
R
 
R
D
 
K
A
 
A
V
 
-
R
 
-
Q
 
W
R
 
S
Q
 
K
A
 
G
G
 
A
L
 
K
L
 
V
L
 
G
L
 
L
S
 
V
A
 
G
R
 
E
P
 
P
S
 
V
R
 
D
L
 
L
D
 
T
A
 
Y
D
 
D
A
 
Y
R
 
A
V
 
H
V
 
V
L
 
-
R
 
-
V
 
-
P
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
V
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
G
L
 
T
A
 
D
A
 
R
A
 
A
A
 
A
G
 
L
E
 
E
N
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
S
E
 
R
T
 
E
I
 
I
D
 
S
A
 
-
V
 
-
G
 
D
A
 
E
T
 
T
I
 
K
G
 
A
R
 
R
P
 
P
S
 
S
E
 
-
S
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
-
E
 
-
E
 
-
S
 
-
D
 
-
R
 
-
L
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
-
D
 
-
S
 
-
R
 
-
G
 
-
V
 
-
T
 
I
V
 
V
L
 
I
V
 
V
S
 
G
V
 
Q
G
 
G
L
 
A
L
 
I
R
 
A
S
 
R
P
 
R
E
 
D
A
 
G
R
 
E
A
 
A
M
 
V
L
 
L
Q
 
A
Q
 
H
V
 
A
S
 
M
N
 
K
L
 
L
L
 
A
Q
 
E
A
 
-
L
 
-
R
 
-
M
 
-
L
 
-
G
 
N
K
 
S
D
 
N
P
 
S
A
 
G
M
 
L
Q
 
L
F
 
I
L
 
L
F
 
H
D
 
T
R
 
A
A
 
A
N
 
G
Q
 
R
M
 
V
G
 
G
A
 
A
W
 
M
D
 
D
M
 
V
G
 
G
V
 
A
L
 
V
P
 
-
A
 
-
T
 
T
L
 
E
P
 
G
G
 
G
L
 
L
R
 
L
A
 
A
V
 
A
T
 
I
D
 
D
D
 
G
S
 
A
A
 
E
R
 
V
A
 
V
T
 
Y
H
 
N
E
 
L
G
 
G
A
 
A
W
 
D
D
 
E
A
 
V
E
 
D
I
 
I
P
 
D
S
 
Q
E
 
G
P
 
P
G
 
-
A
 
-
N
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
C
 
-
V
 
-
D
 
-
G
 
-
R
 
-
M
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
Y
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
Y
 
-
P
 
-
D
 
-
R
 
-
D
 
-
F
 
-
V
 
-
K
 
-
R
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
-
L
 
F
L
 
V
I
 
I
V
 
Y
Q
 
Q
D
 
G
T
 
S
F
 
H
L
 
-
T
 
G
D
 
D
T
 
R
A
 
G
G
 
A
L
 
H
A
 
R
E
 
D
V
 
I
V
 
I
L
 
L
P
 
P
A
 
G
A
 
A
G
 
C
Y
 
Y
G
 
T
E
 
E
E
 
E
A
 
S
G
 
G
T
 
L
F
 
F
T
 
V
N
 
N
N
 
T
E
 
E
G
 
G
R
 
R
I
 
P
Q
 
Q
-
 
L
T
 
A
L
 
M
R
 
R
K
 
A
F
 
N
R
 
F
A
 
A
P
 
P
A
 
G
F
 
-
E
 
E
A
 
G
R
 
K
G
 
E
N
 
N
L
 
W
E
 
A
V
 
I
F
 
L
E
 
R
F
 
A
V
 
L
A
 
S
A
 
A

Sites not aligning to the query:

7zm7A Cryoem structure of mitochondrial complex i from chaetomium thermophilum (inhibited by ddm) (see paper)
42% identity, 35% coverage: 2:308/870 of query aligns to 3:311/711 of 7zm7A

query
sites
7zm7A
V
 
V
R
 
E
I
 
L
T
 
T
I
 
I
D
 
D
A
 
G
Q
 
K
S
 
K
L
 
V
E
 
S
V
 
I
E
 
E
A
 
A
G
 
G
S
 
S
T
 
A
V
 
L
L
 
I
Q
 
Q
A
 
A
A
 
C
Q
 
E
R
 
K
L
 
A
G
 
G
I
 
V
D
 
V
V
 
V
P
 
P
T
x
R
F
 
Y
C
|
C
Y
|
Y
L
 
H
E
 
E
R
 
K
L
 
L
P
 
A
P
 
I
L
 
A
A
x
G
S
 
N
C
|
C
R
|
R
M
 
M
C
|
C
L
 
L
V
 
V
E
 
E
I
 
V
E
 
E
G
 
R
L
 
S
R
 
P
R
 
K
L
 
P
Q
 
V
P
 
A
S
 
S
C
|
C
A
 
A
T
 
W
A
 
P
V
 
V
T
 
Q
D
 
A
G
 
G
M
 
M
V
 
V
V
 
V
R
 
K
T
 
T
N
 
N
T
 
S
P
 
P
L
 
L
I
 
T
D
 
H
E
 
K
T
 
A
R
 
R
S
 
E
S
 
G
M
 
V
L
 
M
D
 
E
M
 
F
L
 
L
L
 
L
A
 
A
N
 
N
H
|
H
P
 
P
L
 
L
D
|
D
C
|
C
P
 
P
I
 
I
C
|
C
D
 
D
K
x
Q
G
|
G
G
 
G
E
 
E
C
|
C
E
 
D
L
 
L
Q
|
Q
D
 
D
M
 
Q
V
 
S
M
 
M
D
 
R
Y
 
Y
G
 
G
P
 
A
R
 
D
R
 
R
S
 
G
E
 
R
F
 
F
R
 
H
D
 
E
P
 
I
K
 
G
R
 
G
V
 
K
F
 
R
H
 
A
S
 
V
R
 
E
D
 
D
I
 
K
R
 
N
L
 
I
S
 
G
P
 
P
V
 
L
I
 
I
I
 
K
M
 
T
N
 
S
V
 
M
N
 
N
R
 
R
C
|
C
I
|
I
Q
 
H
C
|
C
Q
x
T
R
 
R
C
|
C
V
 
V
R
 
R
M
 
F
C
 
M
E
 
N
E
 
D
V
 
I
V
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
P
A
 
E
L
 
L
G
 
G
T
 
S
V
 
T
E
 
G
K
 
R
G
 
G
M
 
N
D
 
D
T
 
L
A
 
Q
V
x
I
-
 
G
T
 
T
G
 
Y
F
 
L
E
 
E
G
 
K
S
 
N
L
 
L
A
 
D
S
 
S
C
 
-
D
 
E
Q
 
L
C
 
S
G
 
G
N
 
N
C
 
V
V
 
I
Q
 
D
V
 
L
C
|
C
P
 
P
V
|
V
G
 
G
A
 
A
L
|
L
M
 
T
S
 
S
F
 
K
P
 
P
Y
 
Y
R
 
A
Y
 
F
K
 
R
A
 
A
R
 
R
P
 
P
W
 
W
D
 
E
L
 
L
A
 
K
E
 
R
T
 
T
D
 
E
T
 
S
I
 
I
C
 
D
P
 
V
H
 
L
C
 
D
G
 
G
T
 
L
G
 
G
C
 
S
Q
 
N
L
 
I
T
 
R
V
 
V
G
 
D
A
 
S
R
 
R
K
 
G
G
 
L
E
 
E
F
 
V
M
 
M
R
 
R
V
 
I
R
 
L
S
 
P
K
 
R
P
 
L
E
 
N
H
 
D
G
 
D
V
 
V
N
 
N
R
 
E
E
 
E
T
 
W
L
 
I
C
 
N
V
 
D
R
 
K
G
 
T
R
 
R
F
 
F
G
 
A
L
 
C
D
 
D
F
 
G
V
 
L
E
 
K
S
 
T
R
 
Q
D
 
-
R
 
R
I
 
L
K
 
T
R
 
M
P
 
P
M
 
L
I
 
V
R
 
R
R
 
R
D
 
D
G
 
G
V
 
K
L
 
F
V
 
E
P
 
P
V
 
A
S
 
T
W
 
W
S
 
E
E
 
Q
A
 
A
G
 
L
D
 
T
-
 
E
-
 
I
-
 
A
H
 
H
L
 
A
R
 
Y
R
 
Q
R
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
P
V
 
K
E
 
E
N
 
N
K
 
E

8bedG Cryo-em structure of the arabidopsis thaliana i+iii2 supercomplex (ci peripheral tip) (see paper)
40% identity, 34% coverage: 2:294/870 of query aligns to 18:308/687 of 8bedG

query
sites
8bedG
V
 
I
R
 
E
I
 
V
T
 
F
I
 
V
D
 
D
A
 
G
Q
 
Y
S
 
A
L
 
V
E
 
K
V
 
V
E
 
P
A
 
K
G
 
G
S
 
F
T
 
T
V
 
V
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
A
 
C
Q
 
E
R
 
V
L
 
A
G
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
I
P
 
P
T
x
R
F
 
F
C
|
C
Y
|
Y
L
 
H
E
 
S
R
 
R
L
 
L
P
 
S
P
 
I
L
 
A
A
x
G
S
 
N
C
|
C
R
|
R
M
 
M
C
|
C
L
 
L
V
 
V
E
 
E
I
 
V
E
 
E
G
 
K
L
 
S
R
 
P
R
 
K
L
 
P
Q
 
V
P
 
A
S
 
S
C
|
C
A
 
A
T
 
M
A
 
P
V
 
A
T
 
L
D
 
P
G
 
G
M
 
M
V
 
K
V
 
I
R
 
K
T
 
T
N
 
D
T
 
T
P
 
P
L
 
I
I
 
A
D
 
K
E
 
K
T
 
A
R
 
R
S
 
E
S
 
G
M
 
V
L
 
M
D
 
E
M
 
F
L
 
L
L
 
L
A
 
M
N
 
N
H
|
H
P
 
P
L
 
L
D
|
D
C
|
C
P
 
P
I
|
I
C
|
C
D
 
D
K
x
Q
G
|
G
G
 
G
E
 
E
C
|
C
E
 
D
L
|
L
Q
|
Q
D
 
D
M
 
Q
V
 
S
M
 
M
D
 
A
Y
 
F
G
 
G
P
 
S
R
 
D
R
 
R
S
 
G
E
 
R
F
 
F
R
 
T
D
 
E
P
 
M
K
 
K
R
 
R
V
 
-
F
 
-
H
 
S
S
 
V
R
 
V
D
 
D
I
 
K
R
 
N
L
 
L
S
 
G
P
 
P
V
 
L
I
 
V
I
 
K
M
 
T
N
 
V
V
 
M
N
 
T
R
 
R
C
|
C
I
|
I
Q
|
Q
C
|
C
Q
x
T
R
 
R
C
|
C
V
 
V
R
 
R
M
 
F
C
 
A
E
 
S
E
 
E
V
 
V
V
 
A
G
 
G
A
 
V
V
 
Q
A
 
D
L
 
L
G
 
G
T
 
I
V
 
L
E
 
G
K
 
R
G
 
G
M
 
S
D
 
G
T
 
E
A
 
E
V
x
I
T
 
G
G
 
T
F
 
Y
E
 
V
G
 
E
S
 
K
L
 
L
A
 
M
S
 
T
C
 
S
D
 
E
Q
 
L
C
 
S
G
 
G
N
 
N
C
 
V
V
 
I
Q
 
D
V
 
I
C
|
C
P
 
P
V
|
V
G
 
G
A
|
A
L
|
L
M
 
T
S
 
S
F
 
K
P
 
P
Y
 
F
R
 
A
Y
x
F
K
 
K
A
 
A
R
 
R
P
 
N
W
 
W
D
 
E
L
 
L
A
 
K
E
 
A
T
 
T
D
 
E
T
 
T
I
 
I
C
 
D
P
 
V
H
 
S
C
 
D
G
 
A
T
 
V
G
 
G
C
 
S
Q
 
N
L
 
I
T
 
R
V
 
V
G
 
D
A
 
S
R
 
R
K
 
G
G
 
P
E
 
E
F
 
V
M
 
M
R
 
R
V
 
I
R
 
I
S
 
P
K
 
R
P
 
L
E
 
N
H
 
E
G
 
D
V
 
I
N
 
N
R
 
E
E
 
E
T
 
W
L
 
I
C
 
S
V
 
D
R
 
K
G
 
T
R
 
R
F
 
F
G
 
C
L
 
Y
D
 
D
F
 
G
V
 
L
E
 
K
S
 
-
R
 
R
D
 
Q
R
 
R
I
 
L
K
 
S
R
 
D
P
 
P
M
 
M
I
 
I
R
 
R
-
 
D
R
 
S
D
 
D
G
 
G
V
 
R
L
 
F
V
 
K
P
 
A
V
 
V
S
 
S
W
|
W
S
x
R
E
 
D
A
 
A

Sites not aligning to the query:

7a23C Plant mitochondrial respiratory complex i (see paper)
40% identity, 34% coverage: 2:294/870 of query aligns to 25:315/693 of 7a23C

query
sites
7a23C
V
 
I
R
 
E
I
 
V
T
 
F
I
 
V
D
 
D
A
 
G
Q
 
Y
S
 
A
L
 
V
E
 
K
V
 
V
E
 
P
A
 
K
G
 
G
S
 
F
T
 
T
V
 
V
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
A
 
C
Q
 
E
R
 
V
L
 
A
G
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
I
P
 
P
T
x
R
F
 
F
C
|
C
Y
|
Y
L
 
H
E
 
S
R
 
R
L
 
L
P
 
S
P
 
I
L
 
A
A
 
G
S
 
N
C
|
C
R
 
R
M
 
M
C
|
C
L
 
L
V
 
V
E
 
E
I
 
V
E
 
E
G
 
K
L
 
S
R
 
P
R
 
K
L
 
P
Q
 
V
P
 
A
S
 
S
C
|
C
A
 
A
T
 
M
A
 
P
V
 
A
T
 
L
D
 
P
G
 
G
M
 
M
V
 
K
V
 
I
R
 
K
T
 
T
N
 
D
T
 
T
P
 
P
L
 
I
I
 
A
D
 
K
E
 
K
T
 
A
R
 
R
S
 
E
S
 
G
M
 
V
L
 
M
D
 
E
M
 
F
L
 
L
L
 
L
A
 
M
N
 
N
H
|
H
P
 
P
L
 
L
D
|
D
C
|
C
P
 
P
I
 
I
C
|
C
D
 
D
K
 
Q
G
|
G
G
 
G
E
 
E
C
|
C
E
 
D
L
|
L
Q
|
Q
D
 
D
M
 
Q
V
 
S
M
 
M
D
 
A
Y
 
F
G
 
G
P
 
S
R
 
D
R
 
R
S
 
G
E
 
R
F
 
F
R
 
T
D
 
E
P
 
M
K
 
K
R
 
R
V
 
-
F
 
-
H
 
S
S
 
V
R
 
V
D
 
D
I
 
K
R
 
N
L
 
L
S
 
G
P
 
P
V
 
L
I
 
V
I
 
K
M
 
T
N
 
V
V
 
M
N
 
T
R
 
R
C
|
C
I
|
I
Q
|
Q
C
|
C
Q
x
T
R
|
R
C
|
C
V
 
V
R
 
R
M
 
F
C
 
A
E
 
S
E
 
E
V
 
V
V
 
A
G
 
G
A
 
V
V
 
Q
A
 
D
L
 
L
G
 
G
T
 
I
V
 
L
E
 
G
K
 
R
G
 
G
M
 
S
D
 
G
T
 
E
A
 
E
V
x
I
T
 
G
G
 
T
F
 
Y
E
 
V
G
 
E
S
 
K
L
 
L
A
 
M
S
 
T
C
 
S
D
 
E
Q
 
L
C
 
S
G
 
G
N
 
N
C
 
V
V
 
I
Q
 
D
V
 
I
C
|
C
P
|
P
V
|
V
G
|
G
A
 
A
L
 
L
M
 
T
S
 
S
F
 
K
P
 
P
Y
 
F
R
 
A
Y
 
F
K
 
K
A
 
A
R
 
R
P
 
N
W
 
W
D
 
E
L
 
L
A
 
K
E
 
A
T
 
T
D
 
E
T
 
T
I
 
I
C
 
D
P
 
V
H
 
S
C
 
D
G
 
A
T
 
V
G
 
G
C
 
S
Q
 
N
L
 
I
T
 
R
V
 
V
G
 
D
A
 
S
R
 
R
K
 
G
G
 
P
E
 
E
F
 
V
M
 
M
R
 
R
V
 
I
R
 
I
S
 
P
K
 
R
P
 
L
E
 
N
H
 
E
G
 
D
V
 
I
N
 
N
R
 
E
E
 
E
T
 
W
L
 
I
C
 
S
V
 
D
R
 
K
G
 
T
R
 
R
F
 
F
G
 
C
L
 
Y
D
 
D
F
 
G
V
 
L
E
 
K
S
 
-
R
 
R
D
 
Q
R
 
R
I
 
L
K
 
S
R
 
D
P
 
P
M
 
M
I
 
I
R
 
R
-
 
D
R
 
S
D
 
D
G
 
G
V
 
R
L
 
F
V
 
K
P
 
A
V
 
V
S
 
S
W
 
W
S
 
R
E
 
D
A
 
A

6x89S1 radiata mitochondrial complex I* (see paper)
32% identity, 46% coverage: 2:403/870 of query aligns to 19:414/688 of 6x89S1

query
sites
6x89S1
V
 
I
R
 
E
I
 
V
T
 
F
I
 
V
D
 
D
A
 
G
Q
 
Y
S
 
P
L
 
V
E
 
K
V
 
I
E
 
P
A
 
K
G
 
G
S
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
A
 
C
Q
 
E
R
 
V
L
 
A
G
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
I
P
 
P
T
 
R
F
 
F
C
|
C
Y
 
Y
L
 
H
E
 
S
R
 
R
L
 
L
P
 
S
P
 
I
L
 
A
A
x
G
S
 
N
C
|
C
R
|
R
M
 
M
C
|
C
L
 
L
V
 
V
E
 
E
I
 
V
E
 
E
G
 
K
L
 
S
R
 
P
R
 
K
L
 
P
Q
 
V
P
 
A
S
 
S
C
|
C
A
 
A
T
 
M
A
 
P
V
 
A
T
 
L
D
 
P
G
 
G
M
 
M
V
 
K
V
 
I
R
 
K
T
 
T
N
 
D
T
 
T
P
 
P
L
 
V
I
 
A
D
 
K
E
 
K
T
 
A
R
 
R
S
 
E
S
 
G
M
 
V
L
 
M
D
 
E
M
 
F
L
 
L
L
 
L
A
 
M
N
 
N
H
|
H
P
 
P
L
 
L
D
 
D
C
|
C
P
 
P
I
 
I
C
|
C
D
 
D
K
 
Q
G
 
G
G
 
G
E
 
E
C
|
C
E
 
D
L
|
L
Q
 
Q
D
 
D
M
 
Q
V
 
S
M
 
M
D
 
A
Y
 
F
G
 
G
P
 
S
R
 
D
R
 
R
S
 
G
E
 
R
F
 
F
R
 
T
D
 
E
P
 
V
K
 
K
R
 
R
V
 
S
F
 
V
H
 
V
S
 
D
R
 
K
D
 
N
I
 
-
R
 
-
L
 
L
S
 
G
P
 
P
V
 
L
I
 
V
I
 
K
M
 
T
N
 
V
V
 
M
N
 
T
R
|
R
C
|
C
I
|
I
Q
|
Q
C
|
C
Q
 
T
R
 
R
C
|
C
V
 
V
R
 
R
M
 
F
C
 
A
E
 
T
E
 
E
V
 
V
V
 
A
G
 
G
A
 
V
V
 
Q
A
 
D
L
 
L
G
 
G
T
 
M
V
 
L
E
 
G
K
 
R
G
 
G
M
 
S
D
 
G
T
 
E
A
 
E
V
 
I
T
 
G
G
 
T
F
 
Y
E
 
V
G
 
E
S
 
K
L
 
L
A
 
L
S
 
T
C
 
S
D
 
E
Q
 
L
C
 
S
G
 
G
N
 
N
C
 
V
V
 
I
Q
 
D
V
 
I
C
|
C
P
|
P
V
|
V
G
|
G
A
 
A
L
 
L
M
 
T
S
 
S
F
 
K
P
 
P
Y
 
F
R
 
A
Y
 
F
K
 
K
A
 
A
R
 
R
P
 
N
W
 
W
D
 
E
L
 
L
A
 
K
E
 
G
T
 
T
D
 
E
T
 
T
I
 
I
C
 
D
P
 
V
H
 
T
C
 
D
G
 
A
T
 
V
G
 
G
C
 
S
Q
 
N
L
 
I
T
 
R
V
 
I
G
 
D
A
 
S
R
 
R
K
 
G
G
 
P
E
 
E
F
 
V
M
 
M
R
 
R
V
 
I
R
 
V
S
 
P
K
 
R
P
 
L
E
 
N
H
 
E
G
 
D
V
 
I
N
 
N
R
 
E
E
 
E
T
 
W
L
 
I
C
 
S
V
 
D
R
 
K
G
 
T
R
 
R
F
 
F
G
 
C
L
 
Y
D
 
D
F
 
G
V
 
L
E
 
K
S
 
-
R
 
R
D
 
Q
R
 
R
I
 
L
K
 
N
R
 
D
P
 
P
M
 
M
I
 
I
R
 
R
-
 
G
R
 
P
D
 
D
G
 
G
V
 
R
L
 
F
V
 
K
P
 
A
V
 
V
S
 
N
W
|
W
S
x
R
E
 
D
A
 
A
G
 
L
D
 
S
H
 
V
L
 
I
R
 
A
R
 
D
R
 
I
L
 
A
A
 
H
A
 
Q
V
 
V
E
 
K
N
 
P
K
 
E
A
 
E
A
 
I
G
 
V
G
 
G
L
 
V
A
 
A
S
 
G
A
 
K
R
 
L
L
 
S
P
 
D
N
 
A
E
 
E
V
 
S
L
 
M
Y
 
I
Q
 
A
F
 
L
Q
 
K
K
 
D
L
 
F
M
 
L
R
 
-
T
 
-
V
 
-
F
 
-
R
 
-
T
 
-
N
 
N
N
 
R
I
 
M
D
 
G
C
 
S
S
 
N
S
 
D
R
 
V
W
 
W
S
 
G
A
 
E
P
 
G
F
 
I
-
 
G
-
 
V
D
 
N
T
 
T
L
 
N
G
 
A
P
 
D
L
 
F
L
 
R
G
 
S
G
 
G
F
 
Y
Y
 
I
T
 
M
R
 
N
A
 
T
P
 
S
L
 
I
Q
 
A
E
 
G
V
 
L
I
 
E
D
 
K
K
 
A
D
 
D
C
 
V
V
 
F
L
 
L
V
 
L
I
 
V
G
 
G
G
 
T
N
 
Q
V
 
P
T
 
R
E
 
V
E
 
E
N
 
A
P
 
A
V
 
M
T
 
V
E
 
N
Y
 
A
L
 
R
L
 
I
R
 
R
D
 
K
A
 
T
V
 
V
R
 
R
Q
 
S
R
 
N
Q
 
Q
A
 
A
G
 
K
L
 
V

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_012708729.1 NCBI__GCF_000018545.1:WP_012708729.1
MVRITIDAQSLEVEAGSTVLQAAQRLGIDVPTFCYLERLPPLASCRMCLVEIEGLRRLQP
SCATAVTDGMVVRTNTPLIDETRSSMLDMLLANHPLDCPICDKGGECELQDMVMDYGPRR
SEFRDPKRVFHSRDIRLSPVIIMNVNRCIQCQRCVRMCEEVVGAVALGTVEKGMDTAVTG
FEGSLASCDQCGNCVQVCPVGALMSFPYRYKARPWDLAETDTICPHCGTGCQLTVGARKG
EFMRVRSKPEHGVNRETLCVRGRFGLDFVESRDRIKRPMIRRDGVLVPVSWSEAGDHLRR
RLAAVENKAAGGLASARLPNEVLYQFQKLMRTVFRTNNIDCSSRWSAPFDTLGPLLGGFY
TRAPLQEVIDKDCVLVIGGNVTEENPVTEYLLRDAVRQRQAGLLLLSARPSRLDADARVV
LRVPPGGEAASLAAVVAGLAAAAGENLSGETIDAVGATIGRPSESAGSEESDRLVAGLRD
SRGVTVLVSVGLLRSPEARAMLQQVSNLLQALRMLGKDPAMQFLFDRANQMGAWDMGVLP
ATLPGLRAVTDDSARATHEGAWDAEIPSEPGANLDAILDLCVDGRMGALYVAGTDPLLAY
PDRDFVKRALGAADLLIVQDTFLTDTAGLAEVVLPAAGYGEEAGTFTNNEGRIQTLRKFR
APAFEARGNLEVFEFVAALRRQVLKPSMQGEIFDEIARLVPAYQGLTPDGLGADGAFTQA
DPTPPASGFYPAPPTFEVRDGLMLVTGDCLFHNGYLSERSEILNTVADDPYVEMNAQEAQ
QLGISDGDQVVVRSAQGELTAKLKVNRRFPRGLVFVPENYRALRLNGLMRRGEYPCPVEV
QKAHAAFEIDAQAGPAANADDLGQGMAGSP

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory