SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012709123.1 NCBI__GCF_000018545.1:WP_012709123.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6slbAAA Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase (see paper)
48% identity, 98% coverage: 7:263/263 of query aligns to 5:257/257 of 6slbAAA

query
sites
6slbAAA
V
 
I
L
 
L
S
 
K
A
 
E
L
 
R
E
 
Q
D
 
D
G
 
G
V
 
V
L
 
L
R
 
V
L
 
L
T
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
 
E
K
 
K
L
 
L
N
 
N
A
 
A
F
 
I
N
 
T
E
 
G
A
 
E
M
 
L
H
 
L
V
 
D
A
 
A
L
 
L
R
 
Y
A
 
A
G
 
A
F
 
L
E
 
K
R
 
E
A
 
G
H
 
E
S
 
E
D
 
D
D
 
R
H
 
E
V
 
V
R
 
R
A
 
A
V
 
L
L
 
L
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
R
|
R
G
 
A
F
 
F
S
 
S
A
|
A
G
 
G
Q
|
Q
D
|
D
L
|
L
G
 
T
D
 
E
R
x
F
D
 
G
P
 
D
R
 
R
K
 
K
G
 
-
G
 
-
T
 
-
P
 
P
D
 
D
L
x
Y
G
 
E
Q
 
A
T
 
H
I
x
L
E
 
R
T
 
R
F
 
-
Y
 
Y
N
|
N
P
 
R
L
 
V
L
 
V
R
 
E
L
 
A
I
 
L
R
 
S
N
 
G
L
 
L
E
 
E
K
 
K
P
 
P
V
 
L
V
 
V
C
 
V
A
 
A
V
 
V
N
 
N
G
 
G
V
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
|
A
G
 
G
A
 
M
N
x
S
I
 
L
A
 
A
F
 
L
A
 
W
C
 
G
D
 
D
I
 
L
T
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
A
R
 
V
S
 
G
A
 
A
R
 
S
F
 
F
I
 
T
Q
 
T
A
|
A
F
|
F
A
 
V
K
 
R
I
 
I
G
 
G
L
|
L
V
 
V
P
|
P
D
|
D
S
 
S
G
 
G
G
 
L
T
 
S
W
 
F
S
 
L
L
 
L
S
 
P
R
 
R
L
 
L
I
 
V
G
 
G
E
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
A
K
 
Q
A
 
E
L
 
L
A
 
L
L
 
L
T
 
L
A
 
S
E
 
P
P
 
R
L
 
L
D
 
S
A
 
A
E
 
E
T
 
E
A
 
A
A
 
L
S
 
A
W
 
L
G
 
G
L
 
L
I
 
V
W
 
H
R
 
R
A
 
V
I
 
V
D
 
P
D
 
A
A
 
E
A
 
K
L
 
L
L
 
M
D
 
E
E
 
E
A
 
A
T
 
L
A
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
K
R
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
Q
G
 
G
P
 
P
T
 
T
K
 
R
G
 
A
I
 
Y
G
 
A
L
 
L
T
 
T
K
 
K
R
 
K
A
 
L
I
 
L
Q
 
L
A
 
E
A
 
T
A
 
Y
N
 
R
N
 
L
A
 
S
F
 
L
D
 
T
E
 
E
Q
 
A
L
 
L
D
x
A
L
 
L
E
 
E
R
 
A
D
 
V
L
 
L
Q
 
Q
R
 
G
E
 
Q
A
 
A
G
|
G
R
 
Q
S
 
T
A
 
Q
D
 
D
Y
 
H
A
 
E
E
 
E
G
 
G
V
 
V
A
 
R
A
 
A
F
 
F
L
 
R
E
 
E
K
 
K
R
 
R
K
 
P
P
 
P
E
 
R
F
 
F
K
 
Q
G
 
G
R
 
R

6slaAAA Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase (see paper)
46% identity, 98% coverage: 7:263/263 of query aligns to 2:245/245 of 6slaAAA

query
sites
6slaAAA
V
 
I
L
 
L
S
 
K
A
 
E
L
 
R
E
 
Q
D
 
D
G
 
G
V
 
V
L
 
L
R
 
V
L
 
L
T
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
 
E
K
 
K
L
|
L
N
 
N
A
 
A
F
 
I
N
 
T
E
 
G
A
 
E
M
 
L
H
 
L
V
 
D
A
 
A
L
 
L
R
 
Y
A
 
A
G
 
A
F
 
L
E
 
K
R
 
E
A
 
G
H
 
E
S
 
E
D
 
D
D
 
R
H
 
E
V
 
V
R
 
R
A
 
A
V
 
L
L
 
L
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
R
 
R
G
 
A
F
 
F
S
 
S
A
|
A
G
 
G
Q
|
Q
D
|
D
L
|
L
G
 
T
D
 
E
R
 
A
D
 
H
P
x
L
R
 
R
K
 
R
G
 
-
G
 
-
T
 
-
P
 
-
D
 
-
L
 
-
G
 
-
Q
 
-
T
 
-
I
 
-
E
 
-
T
 
-
F
 
-
Y
|
Y
N
|
N
P
 
R
L
 
V
L
 
V
R
 
E
L
 
A
I
 
L
R
 
S
N
 
G
L
 
L
E
 
E
K
 
K
P
 
P
V
 
L
V
 
V
C
 
V
A
 
A
V
 
V
N
 
N
G
 
G
V
 
V
A
 
A
A
|
A
G
|
G
A
|
A
G
 
G
A
 
M
N
x
S
I
 
L
A
 
A
F
 
L
A
 
W
C
 
G
D
 
D
I
 
L
T
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
A
R
 
V
S
 
G
A
 
A
R
 
S
F
 
F
I
 
T
Q
 
T
A
|
A
F
|
F
A
 
V
K
 
R
I
|
I
G
 
G
L
|
L
V
 
V
P
|
P
D
x
N
S
 
S
G
 
G
G
 
L
T
 
S
W
 
F
S
 
L
L
 
L
S
 
P
R
 
R
L
 
L
I
 
V
G
 
G
E
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
A
K
 
Q
A
 
E
L
 
L
A
 
L
L
 
L
T
 
L
A
 
S
E
 
P
P
 
R
L
 
L
D
 
S
A
 
A
E
 
E
T
 
E
A
 
A
A
 
L
S
 
A
W
 
L
G
 
G
L
 
L
I
 
V
W
 
H
R
 
R
A
 
V
I
 
V
D
 
P
D
 
A
A
 
E
A
 
K
L
 
L
L
 
M
D
 
E
E
 
E
A
 
A
T
 
L
A
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
K
R
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
Q
G
 
G
P
 
P
T
 
T
K
 
R
G
 
A
I
 
Y
G
 
A
L
 
L
T
 
T
K
 
K
R
 
K
A
 
L
I
 
L
Q
 
L
A
 
E
A
 
T
A
 
Y
N
 
R
N
 
L
A
 
S
F
 
L
D
 
T
E
 
E
Q
 
A
L
 
L
D
x
A
L
 
L
E
 
E
R
 
A
D
 
V
L
 
L
Q
 
Q
R
 
G
E
 
Q
A
 
A
G
|
G
R
 
Q
S
 
T
A
 
Q
D
 
D
Y
 
H
A
 
E
E
 
E
G
 
G
V
 
V
A
 
R
A
 
A
F
|
F
L
 
R
E
 
E
K
|
K
R
 
R
K
 
P
P
 
P
E
 
R
F
 
F
K
 
Q
G
 
G
R
 
R

5zaiC Crystal structure of 3-hydroxypropionyl-coa dehydratase from metallosphaera sedula (see paper)
33% identity, 99% coverage: 3:263/263 of query aligns to 2:259/259 of 5zaiC

query
sites
5zaiC
E
 
E
S
 
F
E
 
E
T
 
T
V
 
I
L
 
E
S
 
T
A
 
K
L
 
K
E
 
E
D
 
G
G
 
N
V
 
L
L
 
F
R
 
W
L
 
I
T
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
 
D
K
|
K
L
|
L
N
 
N
A
 
A
F
 
L
N
 
N
E
 
A
A
 
K
M
 
L
H
 
L
V
 
E
A
 
E
L
 
L
R
 
D
A
 
R
G
 
A
F
 
V
E
 
S
R
 
Q
A
 
A
H
 
E
S
 
S
D
 
D
D
 
P
H
 
E
V
 
I
R
 
R
A
 
V
V
 
I
L
 
I
L
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
K
G
 
G
R
 
K
G
 
A
F
 
F
S
 
C
A
|
A
G
|
G
Q
x
A
D
|
D
L
x
I
G
 
T
D
 
Q
R
x
F
D
 
N
P
 
Q
R
 
L
K
 
-
G
 
-
G
 
-
T
 
T
P
 
P
D
 
A
L
 
E
G
 
A
Q
 
W
T
 
K
I
 
F
E
x
S
T
 
K
F
 
K
Y
 
G
N
x
R
P
 
E
L
 
I
L
 
M
R
 
D
L
 
K
I
 
I
R
 
E
N
 
A
L
 
L
E
 
S
K
 
K
P
 
P
V
 
T
V
 
I
C
 
A
A
 
M
V
 
I
N
 
N
G
 
G
V
 
Y
A
 
A
A
 
L
G
 
G
A
x
G
G
 
G
A
 
L
N
x
E
I
 
L
A
 
A
F
 
L
A
 
A
C
 
C
D
 
D
I
 
I
T
 
R
L
 
I
A
 
A
A
 
A
R
 
E
S
 
E
A
 
A
R
 
Q
F
 
L
I
 
G
Q
 
L
A
x
P
F
x
E
A
 
I
K
 
N
I
 
L
G
 
G
L
x
I
V
 
Y
P
|
P
D
x
G
S
 
Y
G
 
G
G
 
G
T
 
T
W
 
Q
S
 
R
L
 
L
S
 
T
R
 
R
L
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
K
A
 
G
R
 
R
A
 
A
K
 
L
A
 
E
L
 
M
A
 
M
L
 
M
T
 
T
A
 
G
E
 
D
P
x
R
L
 
I
D
 
P
A
 
G
E
 
K
T
 
D
A
 
A
A
 
E
S
 
K
W
 
Y
G
 
G
L
 
L
I
 
V
W
 
N
R
 
R
A
 
V
I
 
V
D
 
P
D
 
L
A
 
A
A
 
N
L
 
L
L
 
E
D
 
Q
E
 
E
A
 
T
T
 
R
A
 
K
L
 
L
A
 
A
A
 
E
R
 
K
L
 
I
A
 
A
A
 
K
G
 
K
P
 
S
T
 
P
K
 
I
G
 
S
I
 
L
G
 
A
L
 
L
T
 
I
K
 
K
R
 
E
A
 
V
I
 
V
Q
 
N
A
 
R
A
 
G
A
 
L
N
 
D
N
 
S
A
 
P
F
 
L
D
 
L
E
 
S
Q
 
G
L
 
L
D
x
A
L
 
L
E
 
E
R
 
S
D
 
V
L
 
G
Q
 
W
R
 
G
E
 
V
A
 
V
G
x
F
R
 
S
S
 
T
A
 
E
D
 
D
Y
 
K
A
 
K
E
 
E
G
 
G
V
 
V
A
 
S
A
 
A
F
|
F
L
 
L
E
 
E
K
|
K
R
 
R
K
 
E
P
 
P
E
 
T
F
 
F
K
 
K
G
 
G
R
 
K

3h81A Crystal structure of enoyl-coa hydratase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
34% identity, 98% coverage: 5:263/263 of query aligns to 3:256/256 of 3h81A

query
sites
3h81A
E
 
E
T
 
T
V
 
I
L
 
L
S
 
V
A
 
E
L
 
R
E
 
D
D
 
Q
G
 
R
V
 
V
L
 
G
R
 
I
L
 
I
T
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
 
Q
K
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
F
 
L
N
 
N
E
 
S
A
 
Q
M
 
V
H
 
M
V
 
N
A
 
E
L
 
V
R
 
T
A
 
S
G
 
A
F
 
A
E
 
T
R
 
E
A
 
L
H
 
D
S
 
D
D
 
D
D
 
P
H
 
D
V
 
I
R
 
G
A
 
A
V
 
I
L
 
I
L
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
G
 
A
R
 
K
G
 
A
F
 
F
S
 
A
A
 
A
G
 
G
Q
x
A
D
 
D
-
 
I
-
 
K
-
 
E
L
x
M
G
 
A
D
 
D
R
 
L
D
 
T
P
 
F
R
 
A
K
 
D
G
 
A
G
 
F
T
|
T
P
 
A
D
 
D
L
 
-
G
 
-
Q
 
-
T
 
-
I
 
-
E
 
-
T
 
-
F
 
F
Y
x
F
N
 
A
P
 
T
L
 
W
L
 
G
R
 
K
L
 
L
I
 
A
R
 
-
N
 
A
L
 
V
E
 
R
K
 
T
P
 
P
V
 
T
V
 
I
C
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
A
G
 
G
V
 
Y
A
 
A
A
 
L
G
 
G
A
x
G
G
 
G
A
 
C
N
x
E
I
 
L
A
 
A
F
 
M
A
 
M
C
 
C
D
 
D
I
 
V
T
 
L
L
 
I
A
 
A
A
 
A
R
 
D
S
 
T
A
 
A
R
 
K
F
 
F
I
 
G
Q
 
Q
A
x
P
F
x
E
A
 
I
K
 
K
I
 
L
G
 
G
L
x
V
V
 
L
P
|
P
D
x
G
S
 
M
G
 
G
G
 
G
T
 
S
W
 
Q
S
 
R
L
 
L
S
 
T
R
 
R
L
 
A
I
 
I
G
 
G
E
 
K
A
 
A
R
 
K
A
 
A
K
 
M
A
 
D
L
 
L
A
 
I
L
 
L
T
 
T
A
 
G
E
 
R
P
 
T
L
 
M
D
 
D
A
 
A
E
 
A
T
 
E
A
 
A
A
 
E
S
 
R
W
 
S
G
 
G
L
 
L
I
 
V
W
 
S
R
 
R
A
 
V
I
 
V
D
 
P
D
 
A
A
 
D
A
 
D
L
 
L
L
 
L
D
 
T
E
 
E
A
 
A
T
 
R
A
 
A
L
 
T
A
 
A
A
 
T
R
 
T
L
 
I
A
 
S
A
 
Q
G
 
M
P
 
S
T
 
A
K
 
S
G
 
A
I
 
A
G
 
R
L
 
M
T
 
A
K
 
K
R
 
E
A
 
A
I
 
V
Q
 
N
A
 
R
A
 
A
A
 
F
N
 
E
N
 
S
A
 
S
F
 
L
D
 
S
E
 
E
Q
 
G
L
 
L
D
x
L
L
 
Y
E
 
E
R
 
R
D
 
R
L
 
L
Q
 
F
R
 
H
E
 
S
A
 
A
G
x
F
R
 
A
S
 
T
A
 
E
D
 
D
Y
x
Q
A
 
S
E
 
E
G
 
G
V
 
M
A
 
A
A
 
A
F
 
F
L
 
I
E
 
E
K
 
K
R
 
R
K
 
A
P
 
P
E
 
Q
F
 
F
K
 
T
G
 
H
R
 
R

2dubA Enoyl-coa hydratase complexed with octanoyl-coa (see paper)
32% identity, 93% coverage: 18:261/263 of query aligns to 19:252/254 of 2dubA

query
sites
2dubA
L
 
I
T
 
Q
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
x
K
K
x
A
L
|
L
N
 
N
A
|
A
F
 
L
N
 
C
E
 
N
A
 
G
M
 
L
H
 
I
V
 
E
A
 
E
L
 
L
R
 
N
A
 
Q
G
 
A
F
 
L
E
 
E
R
 
T
A
 
F
H
 
E
S
 
E
D
 
D
D
 
P
H
 
A
V
 
V
R
 
G
A
 
A
V
 
I
L
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
G
G
 
E
R
 
K
G
 
A
F
 
F
S
 
A
A
|
A
G
 
G
Q
x
A
D
|
D
L
x
I
G
x
K
D
 
E
R
x
M
D
 
Q
P
 
N
R
 
R
K
 
-
G
 
-
G
 
-
T
 
-
P
 
-
D
 
-
L
 
-
G
 
-
Q
 
-
T
 
T
I
 
F
E
 
Q
T
 
D
F
 
C
Y
 
Y
N
x
S
P
 
H
L
 
W
L
 
D
R
 
H
L
 
I
I
 
T
R
 
R
N
 
-
L
 
I
E
 
K
K
 
K
P
 
P
V
 
V
V
 
I
C
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
N
G
 
G
V
 
Y
A
 
A
A
 
L
G
 
G
A
x
G
G
 
G
A
 
C
N
x
E
I
 
L
A
 
A
F
 
M
A
 
M
C
 
C
D
 
D
I
 
I
T
 
I
L
 
Y
A
 
A
A
 
G
R
 
E
S
 
K
A
 
A
R
 
Q
F
 
F
I
 
G
Q
 
Q
A
x
P
F
x
E
A
 
I
K
 
L
I
 
L
G
 
G
L
x
T
V
 
I
P
|
P
D
x
G
S
x
A
G
 
G
G
 
G
T
 
T
W
 
Q
S
 
R
L
 
L
S
 
T
R
 
R
L
 
A
I
 
V
G
 
G
E
 
K
A
 
S
R
 
L
A
 
A
K
 
M
A
 
E
L
 
M
A
 
V
L
 
L
T
 
T
A
 
G
E
 
D
P
 
R
L
 
I
D
 
S
A
 
A
E
 
Q
T
 
D
A
 
A
A
 
K
S
 
Q
W
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
V
W
 
S
R
 
K
A
 
I
I
 
F
D
 
P
D
 
V
A
 
E
A
 
T
L
 
L
L
 
V
D
 
E
E
 
E
A
 
A
T
 
I
A
 
Q
L
 
C
A
 
A
A
 
E
R
 
K
L
 
I
A
 
A
A
 
N
G
 
N
P
 
S
T
 
K
K
 
I
G
 
I
I
 
V
G
 
A
L
 
M
T
 
A
K
 
K
R
 
E
A
 
S
I
 
V
Q
 
N
A
 
A
A
 
A
A
 
F
N
 
E
N
 
M
A
 
T
F
 
L
D
 
T
E
 
E
Q
 
G
L
 
N
D
x
K
L
 
L
E
 
E
R
 
K
D
 
K
L
 
L
Q
 
F
R
 
Y
E
 
S
A
 
T
G
x
F
R
 
A
S
 
T
A
 
D
D
 
D
Y
 
R
A
 
R
E
 
E
G
 
G
V
 
M
A
 
S
A
 
A
F
 
F
L
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
K
 
K
P
 
A
E
 
N
F
 
F
K
 
K

3q0jC Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase in complex with the inhibitor acetoacetylcoa
34% identity, 97% coverage: 5:260/263 of query aligns to 4:254/255 of 3q0jC

query
sites
3q0jC
E
 
E
T
 
T
V
 
I
L
 
L
S
 
V
A
 
E
L
 
R
E
 
D
D
 
Q
G
 
R
V
 
V
L
 
G
R
 
I
L
 
I
T
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
x
Q
K
x
A
L
|
L
N
 
N
A
|
A
F
 
L
N
 
N
E
 
S
A
 
Q
M
 
V
H
 
M
V
 
N
A
 
E
L
 
V
R
 
T
A
 
S
G
 
A
F
 
A
E
 
T
R
 
E
A
 
L
H
 
D
S
 
D
D
 
D
D
 
P
H
 
D
V
 
I
R
 
G
A
 
A
V
 
I
L
 
I
L
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
G
 
A
R
 
K
G
 
A
F
 
F
S
 
A
A
|
A
G
|
G
Q
x
A
D
|
D
-
x
I
-
x
K
-
 
E
L
x
M
G
 
A
D
 
D
R
 
L
D
 
T
P
 
F
R
 
A
K
 
D
G
 
A
G
 
F
T
|
T
P
 
A
D
 
D
L
 
-
G
 
-
Q
 
-
T
 
-
I
 
-
E
 
-
T
 
-
F
 
F
Y
x
F
N
 
A
P
 
T
L
 
W
L
 
G
R
 
K
L
 
L
I
 
-
R
 
A
N
 
A
L
 
V
E
 
R
K
 
T
P
 
P
V
 
T
V
 
I
C
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
A
G
 
G
V
 
Y
A
 
A
A
 
L
G
|
G
A
x
G
G
 
G
A
 
C
N
x
E
I
 
L
A
 
A
F
 
M
A
 
M
C
 
C
D
 
D
I
 
V
T
 
L
L
 
I
A
 
A
A
 
A
R
 
D
S
 
T
A
 
A
R
 
K
F
 
F
I
 
G
Q
 
Q
A
x
P
F
x
E
A
 
I
K
 
K
I
 
L
G
 
G
L
x
V
V
 
L
P
|
P
D
x
G
S
x
M
G
 
G
G
 
G
T
 
S
W
 
Q
S
 
R
L
 
L
S
 
T
R
 
R
L
 
A
I
 
I
G
 
G
E
 
K
A
 
A
R
 
K
A
 
A
K
 
M
A
 
D
L
 
L
A
 
I
L
 
L
T
 
T
A
 
G
E
 
R
P
 
T
L
 
M
D
 
D
A
 
A
E
 
A
T
 
E
A
 
A
A
 
E
S
 
R
W
 
S
G
 
G
L
 
L
I
 
V
W
 
S
R
 
R
A
 
V
I
 
V
D
 
P
D
 
A
A
 
D
A
 
D
L
 
L
L
 
L
D
 
T
E
 
E
A
 
A
T
 
R
A
 
A
L
 
T
A
 
A
A
 
T
R
 
T
L
 
I
A
 
S
A
 
Q
G
 
M
P
 
S
T
 
A
K
 
S
G
 
A
I
 
A
G
 
R
L
 
M
T
 
A
K
 
K
R
 
E
A
 
A
I
 
V
Q
 
N
A
 
R
A
 
A
A
 
F
N
 
E
N
 
S
A
 
S
F
 
L
D
 
S
E
 
E
Q
 
G
L
 
L
D
x
L
L
 
Y
E
 
E
R
 
R
D
 
R
L
 
L
Q
 
F
R
 
H
E
 
S
A
 
A
G
x
F
R
 
A
S
 
T
A
 
E
D
 
D
Y
 
Q
A
 
S
E
 
E
G
 
G
V
 
M
A
 
A
A
 
A
F
 
F
L
 
I
E
 
E
K
 
K
R
 
R
K
 
A
P
 
P
E
 
Q
F
 
F

3q0gC Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase bound to a reaction intermediate derived from crotonyl coa
34% identity, 97% coverage: 5:260/263 of query aligns to 4:254/255 of 3q0gC

query
sites
3q0gC
E
 
E
T
 
T
V
 
I
L
 
L
S
 
V
A
 
E
L
 
R
E
 
D
D
 
Q
G
 
R
V
 
V
L
 
G
R
 
I
L
 
I
T
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
 
Q
K
 
A
L
|
L
N
 
N
A
 
A
F
 
L
N
 
N
E
 
S
A
 
Q
M
 
V
H
 
M
V
 
N
A
 
E
L
 
V
R
 
T
A
 
S
G
 
A
F
 
A
E
 
T
R
 
E
A
 
L
H
 
D
S
 
D
D
 
D
D
 
P
H
 
D
V
 
I
R
 
G
A
 
A
V
 
I
L
 
I
L
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
G
 
A
R
 
K
G
 
A
F
 
F
S
 
A
A
|
A
G
 
G
Q
x
A
D
 
D
-
x
I
-
x
K
-
 
E
L
x
M
G
 
A
D
 
D
R
 
L
D
 
T
P
 
F
R
 
A
K
 
D
G
 
A
G
 
F
T
|
T
P
 
A
D
 
D
L
 
-
G
 
-
Q
 
-
T
 
-
I
 
-
E
 
-
T
 
-
F
 
F
Y
x
F
N
 
A
P
 
T
L
 
W
L
 
G
R
 
K
L
 
L
I
 
-
R
 
A
N
 
A
L
 
V
E
 
R
K
 
T
P
 
P
V
 
T
V
 
I
C
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
A
G
 
G
V
x
Y
A
 
A
A
 
L
G
 
G
A
x
G
G
 
G
A
 
C
N
x
E
I
 
L
A
 
A
F
 
M
A
 
M
C
 
C
D
 
D
I
 
V
T
 
L
L
 
I
A
 
A
A
 
A
R
 
D
S
 
T
A
 
A
R
 
K
F
 
F
I
 
G
Q
 
Q
A
x
P
F
x
E
A
 
I
K
 
K
I
x
L
G
 
G
L
x
V
V
 
L
P
|
P
D
x
G
S
 
M
G
 
G
G
 
G
T
 
S
W
 
Q
S
 
R
L
 
L
S
 
T
R
 
R
L
 
A
I
 
I
G
 
G
E
 
K
A
 
A
R
 
K
A
 
A
K
 
M
A
 
D
L
 
L
A
 
I
L
 
L
T
 
T
A
 
G
E
 
R
P
 
T
L
 
M
D
 
D
A
 
A
E
 
A
T
 
E
A
 
A
A
 
E
S
 
R
W
 
S
G
 
G
L
 
L
I
 
V
W
 
S
R
 
R
A
 
V
I
 
V
D
 
P
D
 
A
A
 
D
A
 
D
L
 
L
L
 
L
D
 
T
E
 
E
A
 
A
T
 
R
A
 
A
L
 
T
A
 
A
A
 
T
R
 
T
L
 
I
A
 
S
A
 
Q
G
 
M
P
 
S
T
 
A
K
 
S
G
 
A
I
 
A
G
 
R
L
 
M
T
 
A
K
 
K
R
 
E
A
 
A
I
 
V
Q
 
N
A
 
R
A
 
A
A
 
F
N
 
E
N
 
S
A
 
S
F
 
L
D
 
S
E
 
E
Q
 
G
L
 
L
D
x
L
L
 
Y
E
 
E
R
 
R
D
 
R
L
 
L
Q
 
F
R
 
H
E
 
S
A
 
A
G
x
F
R
 
A
S
 
T
A
 
E
D
 
D
Y
 
Q
A
 
S
E
 
E
G
 
G
V
 
M
A
 
A
A
 
A
F
 
F
L
 
I
E
 
E
K
 
K
R
 
R
K
 
A
P
 
P
E
 
Q
F
 
F

1mj3A Crystal structure analysis of rat enoyl-coa hydratase in complex with hexadienoyl-coa (see paper)
33% identity, 93% coverage: 18:261/263 of query aligns to 20:256/258 of 1mj3A

query
sites
1mj3A
L
 
I
T
 
Q
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
x
K
K
x
A
L
|
L
N
 
N
A
|
A
F
 
L
N
 
C
E
 
N
A
 
G
M
 
L
H
 
I
V
 
E
A
 
E
L
 
L
R
 
N
A
 
Q
G
 
A
F
 
L
E
 
E
R
 
T
A
 
F
H
 
E
S
 
E
D
 
D
D
 
P
H
 
A
V
 
V
R
 
G
A
 
A
V
 
I
L
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
G
G
 
E
R
 
K
G
 
A
F
 
F
S
 
A
A
|
A
G
|
G
Q
x
A
D
|
D
L
x
I
G
 
K
D
 
E
R
x
M
D
 
Q
P
 
N
R
 
R
K
 
-
G
 
-
G
 
-
T
 
-
P
 
-
D
 
-
L
 
-
G
 
-
Q
 
-
T
 
T
I
 
F
E
 
Q
T
 
D
F
 
C
Y
 
Y
N
x
S
P
 
G
L
|
L
L
 
S
R
 
H
L
 
W
-
 
D
-
 
H
I
 
I
R
 
T
N
 
R
L
 
I
E
 
K
K
 
K
P
 
P
V
 
V
V
 
I
C
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
N
G
 
G
V
 
Y
A
 
A
A
 
L
G
 
G
A
x
G
G
 
G
A
 
C
N
x
E
I
 
L
A
 
A
F
 
M
A
 
M
C
 
C
D
 
D
I
 
I
T
 
I
L
 
Y
A
 
A
A
 
G
R
 
E
S
 
K
A
 
A
R
 
Q
F
 
F
I
 
G
Q
 
Q
A
x
P
F
x
E
A
 
I
K
 
L
I
x
L
G
 
G
L
x
T
V
 
I
P
|
P
D
x
G
S
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
T
W
 
Q
S
 
R
L
 
L
S
 
T
R
 
R
L
 
A
I
 
V
G
 
G
E
 
K
A
 
S
R
 
L
A
 
A
K
 
M
A
 
E
L
 
M
A
 
V
L
 
L
T
 
T
A
 
G
E
 
D
P
 
R
L
 
I
D
 
S
A
 
A
E
 
Q
T
 
D
A
 
A
A
 
K
S
 
Q
W
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
V
W
 
S
R
 
K
A
 
I
I
 
F
D
 
P
D
 
V
A
 
E
A
 
T
L
 
L
L
 
V
D
 
E
E
 
E
A
 
A
T
 
I
A
 
Q
L
 
C
A
 
A
A
 
E
R
 
K
L
 
I
A
 
A
A
 
N
G
 
N
P
 
S
T
 
K
K
 
I
G
 
I
I
 
V
G
 
A
L
 
M
T
 
A
K
 
K
R
 
E
A
 
S
I
 
V
Q
 
N
A
 
A
A
 
A
A
 
F
N
 
E
N
 
M
A
 
T
F
 
L
D
 
T
E
 
E
Q
 
G
L
 
N
D
x
K
L
 
L
E
 
E
R
 
K
D
 
K
L
 
L
Q
 
F
R
 
Y
E
 
S
A
 
T
G
x
F
R
 
A
S
 
T
A
 
D
D
 
D
Y
 
R
A
 
R
E
 
E
G
 
G
V
 
M
A
 
S
A
 
A
F
 
F
L
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
K
 
K
P
 
A
E
 
N
F
 
F
K
 
K

3q0gD Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase bound to a reaction intermediate derived from crotonyl coa
34% identity, 97% coverage: 5:260/263 of query aligns to 3:249/250 of 3q0gD

query
sites
3q0gD
E
 
E
T
 
T
V
 
I
L
 
L
S
 
V
A
 
E
L
 
R
E
 
D
D
 
Q
G
 
R
V
 
V
L
 
G
R
 
I
L
 
I
T
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
 
Q
K
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
F
 
L
N
 
N
E
 
S
A
 
Q
M
 
V
H
 
M
V
 
N
A
 
E
L
 
V
R
 
T
A
 
S
G
 
A
F
 
A
E
 
T
R
 
E
A
 
L
H
 
D
S
 
D
D
 
D
D
 
P
H
 
D
V
 
I
R
 
G
A
 
A
V
 
I
L
 
I
L
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
G
 
A
R
 
K
G
 
A
F
 
F
S
 
A
A
 
A
G
 
G
Q
x
A
D
 
D
L
 
I
G
 
K
D
 
E
R
x
M
D
 
F
P
 
A
R
 
-
K
 
D
G
 
A
G
 
F
T
|
T
P
 
A
D
 
D
L
 
-
G
 
-
Q
 
-
T
 
-
I
 
-
E
 
-
T
 
-
F
 
F
Y
x
F
N
 
A
P
 
T
L
 
W
L
 
G
R
 
K
L
 
L
I
 
-
R
 
A
N
 
A
L
 
V
E
 
R
K
 
T
P
 
P
V
 
T
V
 
I
C
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
A
G
 
G
V
 
Y
A
 
A
A
 
L
G
 
G
A
x
G
G
 
G
A
 
C
N
x
E
I
 
L
A
 
A
F
 
M
A
 
M
C
 
C
D
 
D
I
 
V
T
 
L
L
 
I
A
 
A
A
 
A
R
 
D
S
 
T
A
 
A
R
 
K
F
 
F
I
 
G
Q
 
Q
A
x
P
F
x
E
A
 
I
K
 
K
I
 
L
G
 
G
L
x
V
V
 
L
P
|
P
D
x
G
S
 
M
G
 
G
G
 
G
T
 
S
W
 
Q
S
 
R
L
 
L
S
 
T
R
 
R
L
 
A
I
 
I
G
 
G
E
 
K
A
 
A
R
 
K
A
 
A
K
 
M
A
 
D
L
 
L
A
 
I
L
 
L
T
 
T
A
 
G
E
 
R
P
 
T
L
 
M
D
 
D
A
 
A
E
 
A
T
 
E
A
 
A
A
 
E
S
 
R
W
 
S
G
 
G
L
 
L
I
 
V
W
 
S
R
 
R
A
 
V
I
 
V
D
 
P
D
 
A
A
 
D
A
 
D
L
 
L
L
 
L
D
 
T
E
 
E
A
 
A
T
 
R
A
 
A
L
 
T
A
 
A
A
 
T
R
 
T
L
 
I
A
 
S
A
 
Q
G
 
M
P
 
S
T
 
A
K
 
S
G
 
A
I
 
A
G
 
R
L
 
M
T
 
A
K
 
K
R
 
E
A
 
A
I
 
V
Q
 
N
A
 
R
A
 
A
A
 
F
N
 
E
N
 
S
A
 
S
F
 
L
D
 
S
E
 
E
Q
 
G
L
 
L
D
x
L
L
 
Y
E
 
E
R
 
R
D
 
R
L
 
L
Q
x
F
R
 
H
E
 
S
A
 
A
G
x
F
R
 
A
S
 
T
A
 
E
D
 
D
Y
 
Q
A
 
S
E
 
E
G
 
G
V
 
M
A
 
A
A
 
A
F
|
F
L
 
I
E
 
E
K
 
K
R
 
R
K
 
A
P
 
P
E
 
Q
F
 
F

1ey3A Structure of enoyl-coa hydratase complexed with the substrate dac-coa (see paper)
32% identity, 93% coverage: 18:261/263 of query aligns to 18:256/258 of 1ey3A

query
sites
1ey3A
L
 
I
T
 
Q
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
x
K
K
 
A
L
|
L
N
 
N
A
|
A
F
 
L
N
 
C
E
 
N
A
 
G
M
 
L
H
 
I
V
 
E
A
 
E
L
 
L
R
 
N
A
 
Q
G
 
A
F
 
L
E
 
E
R
 
T
A
 
F
H
 
E
S
 
E
D
 
D
D
 
P
H
 
A
V
 
V
R
 
G
A
 
A
V
 
I
L
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
G
G
 
E
R
 
K
G
 
A
F
 
F
S
 
A
A
|
A
G
|
G
Q
x
A
D
|
D
L
x
I
G
 
K
D
 
E
R
x
M
D
 
Q
P
 
N
R
 
R
K
 
T
G
 
F
G
 
Q
T
 
D
P
 
C
D
 
Y
L
x
S
G
 
G
Q
 
K
T
 
F
I
x
L
E
 
S
T
 
H
F
x
W
Y
 
D
N
 
H
P
 
-
L
 
-
L
 
-
R
 
-
L
 
-
I
 
I
R
 
T
N
 
R
L
 
I
E
 
K
K
 
K
P
 
P
V
 
V
V
 
I
C
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
N
G
 
G
V
 
Y
A
 
A
A
 
L
G
 
G
A
x
G
G
 
G
A
 
C
N
x
E
I
 
L
A
 
A
F
 
M
A
 
M
C
 
C
D
 
D
I
 
I
T
 
I
L
 
Y
A
 
A
A
 
G
R
 
E
S
 
K
A
 
A
R
 
Q
F
 
F
I
 
G
Q
 
Q
A
x
P
F
x
E
A
 
I
K
 
L
I
x
L
G
 
G
L
x
T
V
 
I
P
|
P
D
x
G
S
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
T
W
 
Q
S
 
R
L
 
L
S
 
T
R
 
R
L
 
A
I
 
V
G
 
G
E
 
K
A
 
S
R
 
L
A
 
A
K
 
M
A
 
E
L
 
M
A
 
V
L
 
L
T
 
T
A
 
G
E
 
D
P
 
R
L
 
I
D
 
S
A
 
A
E
 
Q
T
 
D
A
 
A
A
 
K
S
 
Q
W
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
V
W
 
S
R
 
K
A
 
I
I
 
F
D
 
P
D
 
V
A
 
E
A
 
T
L
 
L
L
 
V
D
 
E
E
 
E
A
 
A
T
 
I
A
 
Q
L
 
C
A
 
A
A
 
E
R
 
K
L
 
I
A
 
A
A
 
N
G
 
N
P
 
S
T
 
K
K
 
I
G
 
I
I
 
V
G
 
A
L
 
M
T
 
A
K
 
K
R
 
E
A
 
S
I
 
V
Q
 
N
A
 
A
A
 
A
A
 
F
N
 
E
N
 
M
A
 
T
F
 
L
D
 
T
E
 
E
Q
 
G
L
 
N
D
x
K
L
 
L
E
 
E
R
 
K
D
 
K
L
 
L
Q
 
F
R
 
Y
E
 
S
A
 
T
G
x
F
R
 
A
S
 
T
A
 
D
D
 
D
Y
 
R
A
 
R
E
 
E
G
 
G
V
 
M
A
 
S
A
 
A
F
 
F
L
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
K
 
K
P
 
A
E
 
N
F
 
F
K
 
K

P14604 Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial; mECH; mECH1; Enoyl-CoA hydratase 1; ECHS1; Short-chain enoyl-CoA hydratase; SCEH; EC 4.2.1.17; EC 5.3.3.8 from Rattus norvegicus (Rat) (see 3 papers)
32% identity, 93% coverage: 18:261/263 of query aligns to 50:288/290 of P14604

query
sites
P14604
L
 
I
T
 
Q
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
 
K
K
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
F
 
L
N
 
C
E
 
N
A
 
G
M
 
L
H
 
I
V
 
E
A
 
E
L
 
L
R
 
N
A
 
Q
G
 
A
F
 
L
E
 
E
R
 
T
A
 
F
H
 
E
S
 
E
D
 
D
D
 
P
H
 
A
V
 
V
R
 
G
A
 
A
V
 
I
L
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
G
G
 
E
R
 
K
G
 
A
F
 
F
S
 
A
A
 
A
G
 
G
Q
 
A
D
 
D
L
 
I
G
 
K
D
 
E
R
 
M
D
 
Q
P
 
N
R
 
R
K
 
T
G
 
F
G
 
Q
T
 
D
P
 
C
D
 
Y
L
 
S
G
 
G
Q
 
K
T
 
F
I
 
L
E
 
S
T
 
H
F
 
W
Y
 
D
N
 
H
P
 
-
L
 
-
L
 
-
R
 
-
L
 
-
I
 
I
R
 
T
N
 
R
L
 
I
E
 
K
K
 
K
P
 
P
V
 
V
V
 
I
C
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
N
G
 
G
V
 
Y
A
 
A
A
 
L
G
 
G
A
 
G
G
 
G
A
 
C
N
x
E
I
 
L
A
 
A
F
 
M
A
 
M
C
 
C
D
 
D
I
 
I
T
 
I
L
 
Y
A
 
A
A
 
G
R
 
E
S
 
K
A
 
A
R
 
Q
F
 
F
I
 
G
Q
 
Q
A
 
P
F
x
E
A
 
I
K
 
L
I
 
L
G
 
G
L
 
T
V
 
I
P
 
P
D
 
G
S
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
T
W
 
Q
S
 
R
L
 
L
S
 
T
R
 
R
L
 
A
I
 
V
G
 
G
E
 
K
A
 
S
R
 
L
A
 
A
K
 
M
A
 
E
L
 
M
A
 
V
L
 
L
T
 
T
A
 
G
E
 
D
P
 
R
L
 
I
D
 
S
A
 
A
E
 
Q
T
 
D
A
 
A
A
 
K
S
 
Q
W
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
V
W
 
S
R
 
K
A
 
I
I
 
F
D
 
P
D
 
V
A
 
E
A
 
T
L
 
L
L
 
V
D
 
E
E
 
E
A
 
A
T
 
I
A
 
Q
L
 
C
A
 
A
A
 
E
R
 
K
L
 
I
A
 
A
A
 
N
G
 
N
P
 
S
T
 
K
K
 
I
G
 
I
I
 
V
G
 
A
L
 
M
T
 
A
K
 
K
R
 
E
A
 
S
I
 
V
Q
 
N
A
 
A
A
 
A
A
 
F
N
 
E
N
 
M
A
 
T
F
 
L
D
 
T
E
 
E
Q
 
G
L
 
N
D
 
K
L
 
L
E
 
E
R
 
K
D
 
K
L
 
L
Q
 
F
R
 
Y
E
 
S
A
 
T
G
 
F
R
 
A
S
 
T
A
 
D
D
 
D
Y
 
R
A
 
R
E
 
E
G
 
G
V
 
M
A
 
S
A
 
A
F
 
F
L
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
K
 
K
P
 
A
E
 
N
F
 
F
K
 
K

Sites not aligning to the query:

1dubA 2-enoyl-coa hydratase, data collected at 100 k, ph 6.5 (see paper)
32% identity, 93% coverage: 18:261/263 of query aligns to 20:258/260 of 1dubA

query
sites
1dubA
L
 
I
T
 
Q
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
x
K
K
x
A
L
|
L
N
 
N
A
|
A
F
 
L
N
 
C
E
 
N
A
 
G
M
 
L
H
 
I
V
 
E
A
 
E
L
 
L
R
 
N
A
 
Q
G
 
A
F
 
L
E
 
E
R
 
T
A
 
F
H
 
E
S
 
E
D
 
D
D
 
P
H
 
A
V
 
V
R
 
G
A
 
A
V
 
I
L
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
G
G
 
E
R
 
K
G
 
A
F
 
F
S
 
A
A
|
A
G
 
G
Q
x
A
D
|
D
L
x
I
G
 
K
D
 
E
R
x
M
D
 
Q
P
 
N
R
 
R
K
 
T
G
 
F
G
 
Q
T
 
D
P
 
C
D
 
Y
L
x
S
G
 
G
Q
 
K
T
 
F
I
x
L
E
 
S
T
 
H
F
 
W
Y
 
D
N
 
H
P
 
-
L
 
-
L
 
-
R
 
-
L
 
-
I
 
I
R
 
T
N
 
R
L
 
I
E
 
K
K
 
K
P
 
P
V
 
V
V
 
I
C
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
N
G
 
G
V
x
Y
A
 
A
A
 
L
G
|
G
A
x
G
G
 
G
A
 
C
N
x
E
I
 
L
A
 
A
F
 
M
A
 
M
C
 
C
D
 
D
I
 
I
T
 
I
L
 
Y
A
 
A
A
 
G
R
 
E
S
 
K
A
 
A
R
 
Q
F
 
F
I
 
G
Q
 
Q
A
x
P
F
x
E
A
 
I
K
 
L
I
x
L
G
 
G
L
x
T
V
 
I
P
|
P
D
x
G
S
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
T
W
 
Q
S
 
R
L
 
L
S
 
T
R
 
R
L
 
A
I
 
V
G
 
G
E
 
K
A
 
S
R
 
L
A
 
A
K
 
M
A
 
E
L
 
M
A
 
V
L
 
L
T
 
T
A
 
G
E
 
D
P
 
R
L
 
I
D
 
S
A
 
A
E
 
Q
T
 
D
A
 
A
A
 
K
S
 
Q
W
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
V
W
 
S
R
 
K
A
 
I
I
 
F
D
 
P
D
 
V
A
 
E
A
 
T
L
 
L
L
 
V
D
 
E
E
 
E
A
 
A
T
 
I
A
 
Q
L
 
C
A
 
A
A
 
E
R
 
K
L
 
I
A
 
A
A
 
N
G
 
N
P
 
S
T
 
K
K
 
I
G
 
I
I
 
V
G
 
A
L
 
M
T
 
A
K
 
K
R
 
E
A
 
S
I
 
V
Q
 
N
A
 
A
A
 
A
A
 
F
N
 
E
N
 
M
A
 
T
F
 
L
D
 
T
E
 
E
Q
 
G
L
 
N
D
x
K
L
 
L
E
 
E
R
 
K
D
 
K
L
 
L
Q
x
F
R
 
Y
E
 
S
A
 
T
G
x
F
R
 
A
S
 
T
A
 
D
D
 
D
Y
 
R
A
 
R
E
 
E
G
 
G
V
 
M
A
 
S
A
 
A
F
|
F
L
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
K
 
K
P
 
A
E
 
N
F
 
F
K
 
K

2hw5C The crystal structure of human enoyl-coenzyme a (coa) hydratase short chain 1, echs1
31% identity, 93% coverage: 18:261/263 of query aligns to 20:258/260 of 2hw5C

query
sites
2hw5C
L
 
I
T
 
Q
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
x
K
K
x
A
L
|
L
N
 
N
A
|
A
F
 
L
N
 
C
E
 
D
A
 
G
M
 
L
H
 
I
V
 
D
A
 
E
L
 
L
R
 
N
A
 
Q
G
 
A
F
 
L
E
 
K
R
 
I
A
 
F
H
 
E
S
 
E
D
 
D
D
 
P
H
 
A
V
 
V
R
 
G
A
 
A
V
 
I
L
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
G
G
 
D
R
x
K
G
 
A
F
 
F
S
 
A
A
 
A
G
 
G
Q
x
A
D
 
D
L
x
I
G
 
-
D
 
-
R
 
K
D
 
E
P
x
M
R
 
Q
K
 
N
G
 
L
G
 
S
T
 
F
P
 
Q
D
 
D
L
 
-
G
 
-
Q
 
-
T
 
-
I
 
-
E
 
-
T
 
C
F
 
Y
Y
x
S
N
 
S
P
 
K
L
 
F
L
|
L
R
 
K
L
 
H
-
 
W
-
 
D
-
 
H
I
 
L
R
 
T
N
 
Q
L
 
V
E
 
K
K
 
K
P
 
P
V
 
V
V
 
I
C
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
N
G
 
G
V
 
Y
A
 
A
A
x
F
G
 
G
A
x
G
G
 
G
A
 
C
N
x
E
I
 
L
A
 
A
F
 
M
A
 
M
C
 
C
D
 
D
I
 
I
T
 
I
L
 
Y
A
 
A
A
 
G
R
 
E
S
 
K
A
 
A
R
 
Q
F
 
F
I
 
A
Q
 
Q
A
x
P
F
x
E
A
 
I
K
 
L
I
 
I
G
 
G
L
x
T
V
 
I
P
|
P
D
x
G
S
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
T
W
 
Q
S
 
R
L
 
L
S
 
T
R
 
R
L
 
A
I
 
V
G
 
G
E
 
K
A
 
S
R
 
L
A
 
A
K
 
M
A
 
E
L
 
M
A
 
V
L
 
L
T
 
T
A
 
G
E
 
D
P
 
R
L
 
I
D
 
S
A
 
A
E
 
Q
T
 
D
A
 
A
A
 
K
S
 
Q
W
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
V
W
 
S
R
 
K
A
 
I
I
 
C
D
 
P
D
 
V
A
 
E
A
 
T
L
 
L
L
 
V
D
 
E
E
 
E
A
 
A
T
 
I
A
 
Q
L
 
C
A
 
A
A
 
E
R
 
K
L
 
I
A
 
A
A
 
S
G
 
N
P
 
S
T
 
K
K
 
I
G
 
V
I
 
V
G
 
A
L
 
M
T
 
A
K
 
K
R
 
E
A
 
S
I
 
V
Q
 
N
A
 
A
A
 
A
A
 
F
N
 
E
N
 
M
A
 
T
F
 
L
D
 
T
E
 
E
Q
 
G
L
 
S
D
x
K
L
 
L
E
 
E
R
 
K
D
 
K
L
 
L
Q
 
F
R
 
Y
E
 
S
A
 
T
G
x
F
R
 
A
S
 
T
A
 
D
D
 
D
Y
 
R
A
 
K
E
 
E
G
 
G
V
 
M
A
 
T
A
 
A
F
 
F
L
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
K
 
K
P
 
A
E
 
N
F
 
F
K
 
K

5jbxB Crystal structure of liuc in complex with coenzyme a and malonic acid (see paper)
36% identity, 93% coverage: 19:263/263 of query aligns to 19:261/261 of 5jbxB

query
sites
5jbxB
T
 
T
L
 
I
N
 
D
R
 
G
P
 
E
D
x
S
K
x
R
L
x
R
N
 
N
A
|
A
F
 
I
N
 
S
E
 
R
A
 
A
M
 
M
H
 
L
V
 
K
A
 
E
L
 
L
R
 
G
A
 
E
G
 
L
F
 
V
E
 
T
R
 
R
A
 
V
H
 
S
S
 
S
D
 
S
D
 
R
H
 
D
V
 
V
R
 
R
A
 
A
V
 
V
L
 
V
L
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
-
 
D
R
 
K
G
 
A
F
 
F
S
 
C
A
|
A
G
 
G
Q
x
A
D
|
D
L
|
L
G
x
K
D
 
E
R
|
R
D
 
A
P
 
T
R
 
M
K
 
A
G
 
E
G
 
-
T
 
-
P
 
-
D
 
-
L
 
-
G
 
-
Q
 
D
T
 
E
I
 
V
E
 
R
T
 
A
F
 
F
Y
x
L
N
 
D
P
 
G
L
 
L
L
x
R
R
 
R
L
 
T
I
 
F
R
 
R
N
 
A
L
 
I
E
 
E
K
 
K
P
 
S
-
 
D
-
 
C
-
 
V
V
 
F
V
 
I
C
 
A
A
 
A
V
 
I
N
 
N
G
 
G
V
 
A
A
 
A
A
x
L
G
|
G
A
x
G
G
 
G
A
 
T
N
x
E
I
 
L
A
 
A
F
 
L
A
 
A
C
 
C
D
 
D
I
 
L
T
 
R
L
 
V
A
 
A
A
 
A
R
 
P
S
 
A
A
 
A
R
 
E
F
 
L
I
 
G
Q
 
L
A
x
T
F
x
E
A
 
V
K
 
K
I
x
L
G
 
G
L
x
I
V
 
I
P
|
P
D
x
G
S
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
T
W
 
Q
S
 
R
L
 
L
S
 
A
R
 
R
L
 
L
I
 
V
G
 
G
E
 
P
A
 
G
R
 
R
A
 
A
K
 
K
A
 
D
L
 
L
A
 
I
L
 
L
T
 
T
A
 
A
E
 
R
P
x
R
L
 
I
D
 
N
A
 
A
E
 
A
T
 
E
A
 
A
A
 
F
S
 
S
W
 
V
G
 
G
L
 
L
I
 
A
W
 
N
R
 
R
A
 
L
I
 
A
D
 
P
D
 
E
A
 
G
A
 
H
L
 
L
L
 
L
D
 
A
E
 
V
A
 
A
T
 
Y
A
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
E
R
 
S
L
 
V
A
 
V
A
 
E
G
 
N
P
 
A
T
 
P
K
 
I
G
 
A
I
 
V
G
 
A
L
 
T
T
 
A
K
 
K
R
 
H
A
 
A
I
 
I
Q
 
D
A
 
E
A
 
G
A
 
T
N
 
G
N
 
L
A
 
E
F
 
L
D
 
D
E
 
D
Q
 
A
L
 
L
D
x
A
L
 
L
E
 
E
R
 
L
D
 
R
L
 
K
Q
 
Y
R
 
E
E
 
E
A
 
I
G
x
L
R
 
K
S
 
T
A
 
E
D
 
D
Y
 
R
A
 
L
E
 
E
G
 
G
V
 
L
A
 
R
A
 
A
F
 
F
L
 
A
E
 
E
K
 
K
R
 
R
K
 
A
P
 
P
E
 
V
F
 
Y
K
 
K
G
 
G
R
 
R

1nzyB 4-chlorobenzoyl coenzyme a dehalogenase from pseudomonas sp. Strain cbs-3 (see paper)
33% identity, 87% coverage: 5:232/263 of query aligns to 3:232/269 of 1nzyB

query
sites
1nzyB
E
 
E
T
 
A
V
 
I
L
 
G
S
 
H
A
 
R
L
 
V
E
 
E
D
 
D
G
 
G
V
 
V
L
 
A
R
 
E
L
 
I
T
 
T
L
 
I
N
 
K
R
 
L
P
 
P
D
x
R
K
x
H
L
x
R
N
 
N
A
 
A
F
 
L
N
 
S
E
 
V
A
 
K
M
 
A
H
 
M
V
 
Q
A
 
E
L
 
V
R
 
T
A
 
D
G
 
A
F
 
L
E
 
N
R
 
R
A
 
A
H
 
E
S
 
E
D
 
D
D
 
D
H
 
S
V
 
V
R
x
G
A
 
A
V
 
V
L
 
M
L
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
x
E
R
 
D
G
 
A
F
 
F
S
x
C
A
|
A
G
 
G
Q
x
F
D
x
Y
L
|
L
G
x
R
D
 
E
R
x
I
D
 
P
P
 
L
R
 
D
K
 
K
G
 
G
-
 
V
-
 
A
G
 
G
T
 
V
P
 
R
D
 
D
L
 
H
G
 
F
Q
 
R
T
 
I
I
 
A
E
x
A
T
 
L
F
 
W
Y
x
W
N
x
H
P
 
Q
L
 
M
L
 
I
R
 
H
L
 
K
I
 
I
R
 
I
N
 
R
L
 
V
E
 
K
K
 
R
P
 
P
V
 
V
V
 
L
C
 
A
A
 
A
V
 
I
N
|
N
G
 
G
V
 
V
A
 
A
A
 
A
G
|
G
A
x
G
G
 
G
A
 
L
N
x
G
I
 
I
A
 
S
F
 
L
A
 
A
C
 
S
D
 
D
I
 
M
T
 
A
L
 
I
A
 
C
A
 
A
R
 
D
S
 
S
A
 
A
R
 
K
F
 
F
I
 
V
Q
 
C
A
|
A
F
x
W
A
 
H
K
 
T
I
 
I
G
 
G
L
x
I
V
 
G
P
x
N
D
|
D
S
x
T
G
 
A
G
 
T
T
 
S
W
 
Y
S
 
S
L
 
L
S
 
A
R
 
R
L
 
I
I
 
V
G
 
G
E
 
M
A
 
R
R
 
R
A
 
A
K
 
M
A
 
E
L
 
L
A
 
M
L
 
L
T
 
T
A
 
D
E
 
R
P
 
T
L
 
L
D
 
Y
A
 
P
E
 
E
T
 
E
A
 
A
A
 
K
S
 
D
W
 
W
G
 
G
L
 
L
I
 
V
W
 
S
R
 
R
A
 
V
I
 
Y
D
 
P
D
x
K
A
 
D
A
 
E
L
 
F
L
x
R
D
 
E
E
 
V
A
 
A
T
 
W
A
 
K
L
 
V
A
 
A
A
 
R
R
 
E
L
|
L
A
|
A
A
 
A
G
x
A
P
 
P
T
|
T
K
 
H
G
 
L
I
x
Q
G
 
V
L
 
M
T
 
A
K
 
K
R
 
E
A
 
R
I
 
F
Q
 
H
A
 
A
A
 
G
A
 
W
N
 
M
N
 
Q
A
 
P
F
 
V
D
 
E
E
 
E
Q
 
C
L
 
T
D
x
E
L
 
F
E
 
E

Sites not aligning to the query:

1jxzB Structure of the h90q mutant of 4-chlorobenzoyl-coenzyme a dehalogenase complexed with 4-hydroxybenzoyl-coenzyme a (product) (see paper)
33% identity, 87% coverage: 5:232/263 of query aligns to 3:232/269 of 1jxzB

query
sites
1jxzB
E
 
E
T
 
A
V
 
I
L
 
G
S
 
H
A
 
R
L
 
V
E
 
E
D
 
D
G
 
G
V
 
V
L
 
A
R
 
E
L
 
I
T
 
T
L
 
I
N
 
K
R
 
L
P
 
P
D
x
R
K
x
H
L
x
R
N
 
N
A
 
A
F
 
L
N
 
S
E
 
V
A
 
K
M
 
A
H
 
M
V
 
Q
A
 
E
L
 
V
R
 
T
A
 
D
G
 
A
F
 
L
E
 
N
R
 
R
A
 
A
H
 
E
S
 
E
D
 
D
D
 
D
H
 
S
V
 
V
R
x
G
A
 
A
V
 
V
L
 
M
L
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
E
R
 
D
G
 
A
F
 
F
S
x
C
A
|
A
G
 
G
Q
x
F
D
x
Y
L
|
L
G
x
R
D
 
E
R
x
I
D
 
P
P
 
L
R
 
D
K
 
K
G
 
G
-
 
V
-
 
A
G
 
G
T
 
V
P
 
R
D
 
D
L
 
H
G
 
F
Q
 
R
T
 
I
I
 
A
E
x
A
T
 
L
F
 
W
Y
x
W
N
x
Q
P
 
Q
L
 
M
L
 
I
R
 
H
L
 
K
I
 
I
R
 
I
N
 
R
L
 
V
E
 
K
K
 
R
P
 
P
V
 
V
V
 
L
C
 
A
A
 
A
V
 
I
N
 
N
G
 
G
V
 
V
A
 
A
A
 
A
G
|
G
A
x
G
G
 
G
A
 
L
N
x
G
I
 
I
A
 
S
F
 
L
A
 
A
C
 
S
D
 
D
I
 
M
T
 
A
L
 
I
A
 
C
A
 
A
R
 
D
S
 
S
A
 
A
R
 
K
F
 
F
I
 
V
Q
 
C
A
|
A
F
x
W
A
 
H
K
 
T
I
 
I
G
 
G
L
x
I
V
 
G
P
x
N
D
|
D
S
x
T
G
 
A
G
 
T
T
 
S
W
 
Y
S
 
S
L
 
L
S
 
A
R
 
R
L
 
I
I
 
V
G
 
G
E
 
M
A
 
R
R
 
R
A
 
A
K
 
M
A
 
E
L
 
L
A
 
M
L
 
L
T
 
T
A
 
N
E
 
R
P
 
T
L
 
L
D
 
Y
A
 
P
E
 
E
T
 
E
A
 
A
A
 
K
S
 
D
W
 
W
G
 
G
L
 
L
I
 
V
W
 
S
R
 
R
A
 
V
I
 
Y
D
 
P
D
 
K
A
 
D
A
 
E
L
 
F
L
 
R
D
 
E
E
 
V
A
 
A
T
 
W
A
 
K
L
 
V
A
 
A
A
 
R
R
 
E
L
|
L
A
|
A
A
 
A
G
x
A
P
 
P
T
|
T
K
 
H
G
 
L
I
x
Q
G
 
V
L
 
M
T
 
A
K
 
K
R
 
E
A
 
R
I
 
F
Q
 
H
A
 
A
A
 
G
A
 
W
N
 
M
N
 
Q
A
 
P
F
 
V
D
 
E
E
 
E
Q
 
C
L
 
T
D
x
E
L
 
F
E
 
E

Sites not aligning to the query:

A5JTM5 4-chlorobenzoyl coenzyme A dehalogenase; 4-CBA-CoA dehalogenase; 4-CBCoA dehalogenase; 4-chlorobenzoyl-CoA dehalogenase; EC 3.8.1.7 from Pseudomonas sp. (strain CBS-3) (see 7 papers)
33% identity, 87% coverage: 5:232/263 of query aligns to 3:232/269 of A5JTM5

query
sites
A5JTM5
E
 
E
T
 
A
V
 
I
L
 
G
S
 
H
A
 
R
L
 
V
E
 
E
D
 
D
G
 
G
V
 
V
L
 
A
R
 
E
L
 
I
T
 
T
L
 
I
N
 
K
R
 
L
P
 
P
D
 
R
K
 
H
L
x
R
N
 
N
A
 
A
F
 
L
N
 
S
E
 
V
A
 
K
M
 
A
H
 
M
V
 
Q
A
x
E
L
 
V
R
 
T
A
 
D
G
 
A
F
 
L
E
 
N
R
 
R
A
 
A
H
x
E
S
 
E
D
|
D
D
|
D
H
 
S
V
 
V
R
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
M
L
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
E
R
 
D
G
 
A
F
 
F
S
 
C
A
 
A
G
|
G
Q
x
F
D
x
Y
L
 
L
G
x
R
D
x
E
R
 
I
D
 
P
P
 
L
R
 
D
K
 
K
G
 
G
-
 
V
-
 
A
G
 
G
T
 
V
P
 
R
D
 
D
L
x
H
G
x
F
Q
 
R
T
 
I
I
 
G
E
 
A
T
 
L
F
 
W
Y
x
W
N
x
H
P
 
Q
L
 
M
L
 
I
R
x
H
L
 
K
I
 
I
R
 
I
N
 
R
L
 
V
E
 
K
K
 
R
P
 
P
V
 
V
V
 
L
C
 
A
A
 
A
V
 
I
N
 
N
G
 
G
V
 
V
A
 
A
A
|
A
G
|
G
A
x
G
G
|
G
A
 
L
N
 
G
I
 
I
A
 
S
F
 
L
A
 
A
C
 
S
D
|
D
I
 
M
T
 
A
L
 
I
A
 
C
A
 
A
R
x
D
S
 
S
A
 
A
R
 
K
F
 
F
I
 
V
Q
 
C
A
 
A
F
x
W
A
 
H
K
 
T
I
 
I
G
 
G
L
 
I
V
 
G
P
 
N
D
|
D
S
 
T
G
 
A
G
 
T
T
 
S
W
 
Y
S
 
S
L
 
L
S
 
A
R
 
R
L
 
I
I
 
V
G
 
G
E
 
M
A
 
R
R
 
R
A
 
A
K
 
M
A
x
E
L
 
L
A
 
M
L
 
L
T
 
T
A
 
N
E
 
R
P
 
T
L
 
L
D
 
Y
A
 
P
E
 
E
T
x
E
A
 
A
A
 
K
S
 
D
W
|
W
G
 
G
L
 
L
I
 
V
W
 
S
R
 
R
A
 
V
I
 
Y
D
 
P
D
 
K
A
 
D
A
 
D
L
 
F
L
 
R
D
 
E
E
 
V
A
 
A
T
 
W
A
 
K
L
 
V
A
 
A
A
 
R
R
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
A
P
 
P
T
 
T
K
x
H
G
 
L
I
 
Q
G
 
V
L
 
M
T
 
A
K
 
K
R
 
E
A
x
R
I
 
F
Q
 
H
A
 
A
A
 
G
A
 
W
N
 
M
N
 
Q
A
 
P
F
 
V
D
 
E
E
 
E
Q
 
C
L
 
T
D
 
E
L
 
F
E
|
E

Sites not aligning to the query:

Q62651 Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial; EC 5.3.3.- from Rattus norvegicus (Rat) (see paper)
30% identity, 97% coverage: 3:256/263 of query aligns to 55:317/327 of Q62651

query
sites
Q62651
E
 
E
S
 
S
E
 
I
T
 
Q
V
 
V
L
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
-
E
 
Q
D
 
K
G
 
H
V
 
V
L
 
L
R
 
H
L
 
V
T
 
Q
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
 
E
K
 
K
L
 
R
N
 
N
A
 
A
F
 
M
N
 
N
E
 
R
A
 
A
M
 
F
H
 
W
V
 
R
A
 
E
L
 
L
R
 
V
A
 
E
G
 
C
F
 
F
E
 
Q
R
 
K
A
 
I
H
 
S
S
 
K
D
 
D
D
 
S
H
 
D
V
 
C
R
 
R
A
 
A
V
 
V
L
 
V
L
 
V
T
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
R
 
K
G
 
M
F
 
F
S
 
T
A
 
S
G
 
G
Q
 
I
D
 
D
L
 
L
G
 
M
D
 
D
-
 
M
-
 
A
R
 
S
D
 
D
P
 
I
R
 
L
K
 
Q
G
 
P
G
 
P
T
 
G
P
 
D
D
 
D
L
 
V
G
 
A
Q
 
R
T
 
I
-
 
A
-
 
W
-
 
Y
-
 
L
-
 
R
-
 
D
I
 
L
E
 
I
T
 
S
F
 
R
Y
 
Y
N
 
Q
P
 
K
L
 
T
L
 
F
R
 
T
L
 
V
I
 
I
R
 
E
N
 
K
L
 
C
E
 
P
K
 
K
P
 
P
V
 
V
V
 
I
C
 
A
A
 
A
V
 
I
N
 
H
G
 
G
V
 
G
A
 
C
A
 
I
G
 
G
A
 
G
G
 
G
A
 
V
N
x
D
I
 
L
A
 
I
F
 
S
A
 
A
C
 
C
D
 
D
I
 
I
T
 
R
L
 
Y
A
 
C
A
 
T
R
 
Q
S
 
D
A
 
A
R
 
F
F
 
F
I
 
Q
Q
 
V
A
 
K
F
x
E
A
 
V
K
 
D
I
 
V
G
 
G
L
 
L
V
 
A
P
 
A
D
|
D
S
 
V
G
 
G
G
 
T
T
 
L
W
 
Q
S
 
R
L
 
L
S
 
P
R
 
K
L
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
N
-
 
R
A
 
S
R
 
L
A
 
V
K
 
N
A
 
E
L
 
L
A
 
T
L
 
F
T
 
T
A
 
A
E
 
R
P
 
K
L
 
M
D
 
M
A
 
A
E
 
D
T
 
E
A
 
A
A
 
L
S
 
D
W
 
S
G
 
G
L
 
L
I
 
V
W
 
S
R
 
R
A
 
V
I
 
F
D
 
P
D
 
D
A
 
K
-
 
D
A
 
V
L
 
M
L
 
L
D
 
N
E
 
A
A
 
A
T
 
F
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
R
 
D
L
 
I
A
 
S
A
 
S
G
 
K
P
 
S
T
 
P
K
 
V
G
 
A
I
 
V
G
 
Q
L
 
G
T
 
S
K
 
K
R
 
I
A
 
N
I
 
L
Q
 
I
A
 
Y
A
 
S
A
 
R
N
 
D
N
 
H
A
 
S
F
 
V
D
 
D
E
 
E
Q
 
S
L
 
L
D
 
D
L
 
Y
E
 
M
R
 
A
D
 
T
L
 
W
Q
 
N
R
 
M
E
 
S
A
 
M
G
 
L
R
 
Q
S
 
T
A
 
Q
D
 
D
Y
 
I
A
 
I
E
 
K
G
 
S
V
 
V
A
 
Q
A
 
A
F
 
A
L
 
M
E
 
E
K
 
K
R
 
K

3rrvB Crystal structure of an enoyl-coa hydratase/isomerase from mycobacterium paratuberculosis (see paper)
34% identity, 92% coverage: 13:255/263 of query aligns to 13:253/254 of 3rrvB

query
sites
3rrvB
D
 
D
G
 
G
V
 
A
L
 
L
R
 
R
L
 
I
-
 
I
T
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
 
D
K
 
S
L
 
L
N
 
N
A
 
S
F
 
V
N
 
N
E
 
D
A
 
D
M
 
L
H
 
H
V
 
V
A
 
G
L
 
L
R
 
A
A
 
R
G
 
L
F
 
W
E
 
Q
R
 
R
A
 
L
H
 
T
S
 
D
D
 
D
D
 
P
H
 
T
V
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
A
L
 
V
L
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
R
 
R
G
 
A
F
 
F
S
 
S
A
 
A
G
 
G
Q
x
G
D
 
D
L
 
F
G
 
G
D
 
Y
R
x
L
D
 
K
P
 
E
R
 
L
K
 
S
G
 
A
G
 
D
T
 
A
P
 
D
D
 
L
L
 
R
G
 
A
Q
 
K
T
 
T
I
 
I
E
 
R
T
 
D
F
x
G
Y
 
R
N
 
E
P
 
I
L
 
V
L
 
L
R
 
G
L
 
M
I
 
A
R
 
R
N
 
-
L
 
C
E
 
R
K
 
I
P
 
P
V
 
V
V
 
V
C
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
N
G
 
G
V
 
P
A
 
A
A
 
V
G
 
G
A
x
L
G
 
G
A
 
C
N
x
S
I
 
L
A
 
V
F
 
A
A
 
L
C
 
S
D
 
D
I
 
I
T
 
V
L
 
Y
A
 
I
A
 
A
R
 
E
S
 
N
A
 
A
R
 
Y
F
 
L
I
 
A
Q
 
D
A
 
P
F
x
H
A
 
V
K
 
Q
I
 
V
G
 
G
L
 
L
V
 
V
P
 
A
D
x
A
S
x
D
G
 
G
G
 
G
-
 
P
-
 
L
T
 
T
W
 
W
S
 
P
L
 
L
S
 
H
R
 
-
L
 
-
I
 
I
G
 
S
E
 
L
A
 
L
R
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
E
L
 
Y
A
 
A
L
 
L
T
 
T
A
 
G
E
 
T
P
 
R
L
 
I
D
 
S
A
 
A
E
 
Q
T
 
R
A
 
A
A
 
V
S
 
E
W
 
L
G
 
G
L
 
L
I
 
A
W
 
N
R
 
H
A
 
V
I
 
A
D
 
D
D
 
D
A
 
P
A
 
-
L
 
-
L
 
V
D
 
A
E
 
E
A
 
A
T
 
I
A
 
A
L
 
C
A
 
A
A
 
K
R
 
K
L
 
I
A
 
L
A
 
E
G
 
L
P
 
P
T
 
Q
K
 
Q
G
 
A
I
 
V
G
 
E
L
 
S
T
 
T
K
 
K
R
 
R
A
 
V
I
 
L
Q
 
N
A
 
I
A
 
H
A
 
L
N
 
E
N
 
R
A
 
A
F
 
V
D
 
L
E
 
A
Q
 
S
L
 
L
D
|
D
L
 
Y
E
 
A
R
 
L
D
 
S
L
 
A
Q
x
E
R
 
S
E
 
Q
A
 
S
G
 
F
R
 
V
S
 
T
A
 
E
D
 
D
Y
 
F
A
 
R
E
 
S
G
 
I
V
 
V
A
 
T
A
 
K
F
 
L
L
 
A
E
 
D
K
 
K

7borA Structure of pseudomonas aeruginosa coa-bound odaa (see paper)
31% identity, 96% coverage: 4:255/263 of query aligns to 1:247/247 of 7borA

query
sites
7borA
S
 
S
E
 
E
T
 
L
V
 
I
L
 
R
S
 
V
A
 
E
L
 
R
E
 
E
D
 
T
G
 
G
V
 
L
L
 
L
R
 
T
L
 
L
T
 
R
L
 
L
N
 
D
R
 
R
P
 
Q
D
|
D
K
|
K
L
 
K
N
 
N
A
|
A
F
 
L
N
 
T
E
 
R
A
 
A
M
 
M
H
 
Y
V
 
S
A
 
R
L
 
M
R
 
A
A
 
E
G
 
A
F
 
L
E
 
L
R
 
E
A
 
A
H
 
Q
S
 
A
D
 
D
D
 
T
H
 
A
V
 
V
R
 
R
A
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
G
G
 
D
R
 
A
G
 
C
F
 
F
S
 
T
A
x
S
G
 
G
Q
x
N
D
 
D
L
x
I
G
 
L
D
 
D
-
x
F
-
 
L
-
 
E
R
 
Q
D
 
P
P
 
P
R
 
S
K
 
L
G
 
R
G
x
D
T
 
S
P
 
P
D
 
-
L
 
-
G
 
-
Q
 
-
T
 
-
I
 
V
E
x
G
T
 
R
F
 
F
Y
 
M
N
 
S
P
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
-
L
 
-
I
 
-
R
 
-
N
 
E
L
 
F
E
 
P
K
 
K
P
 
P
V
 
V
V
 
I
C
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
N
G
 
G
V
 
P
A
 
A
A
x
V
G
 
G
A
x
I
G
 
G
A
 
T
N
x
T
I
 
L
A
 
L
F
 
L
A
 
H
C
 
C
D
 
D
I
 
L
T
 
V
L
 
F
A
 
V
A
 
G
R
 
R
S
 
N
A
 
A
R
 
R
F
 
L
I
 
K
Q
 
M
A
 
P
F
|
F
A
 
V
K
 
N
I
x
L
G
 
G
L
|
L
V
 
T
P
|
P
D
x
E
S
 
F
G
 
G
G
 
S
T
 
S
W
 
L
S
 
I
L
 
L
S
 
P
R
 
R
L
 
M
I
 
L
G
 
G
E
 
H
A
 
A
R
 
K
A
 
A
K
 
A
A
 
E
L
 
L
A
 
L
L
 
M
T
 
L
A
 
G
E
 
Q
P
 
D
L
 
F
D
 
S
A
 
G
E
 
E
T
 
Q
A
 
A
A
 
A
S
 
A
W
 
W
G
 
G
L
 
L
I
 
A
W
 
N
R
 
A
A
 
A
I
 
L
D
 
E
D
 
D
-
 
G
A
 
A
A
 
T
L
 
V
L
 
L
D
 
E
E
 
H
A
 
A
T
 
R
A
 
D
L
 
A
A
 
A
A
 
R
R
 
R
L
 
F
A
 
L
A
 
H
G
 
L
P
 
A
T
 
P
K
 
S
G
 
A
I
 
V
G
 
V
L
 
E
T
 
S
K
 
K
R
 
R
A
 
L
I
 
M
Q
 
K
A
 
A
A
 
P
A
 
F
N
 
I
N
 
E
A
 
E
F
 
L
D
 
R
E
 
R
Q
 
V
L
 
I
D
x
A
L
 
E
E
 
E
R
 
G
D
 
D
L
 
I
Q
 
F
R
 
S
E
 
T
A
 
R
G
x
L
R
 
R
S
 
S
A
 
P
D
 
E
Y
 
A
A
 
I
E
 
E
G
 
A
V
 
L
A
 
S
A
 
A
F
|
F
L
 
M
E
 
H
K
x
R

Query Sequence

>WP_012709123.1 NCBI__GCF_000018545.1:WP_012709123.1
MSESETVLSALEDGVLRLTLNRPDKLNAFNEAMHVALRAGFERAHSDDHVRAVLLTGAGR
GFSAGQDLGDRDPRKGGTPDLGQTIETFYNPLLRLIRNLEKPVVCAVNGVAAGAGANIAF
ACDITLAARSARFIQAFAKIGLVPDSGGTWSLSRLIGEARAKALALTAEPLDAETAASWG
LIWRAIDDAALLDEATALAARLAAGPTKGIGLTKRAIQAAANNAFDEQLDLERDLQREAG
RSADYAEGVAAFLEKRKPEFKGR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory