SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012709948.1 NCBI__GCF_000018545.1:WP_012709948.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4z0pA Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc02828 (smghra) from sinorhizobium meliloti in complex with NADPH and oxalate (see paper)
91% identity, 99% coverage: 4:319/319 of query aligns to 1:316/316 of 4z0pA

query
sites
4z0pA
K
 
K
S
 
S
P
 
P
V
 
V
I
 
I
V
 
V
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
F
I
 
I
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
V
D
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
N
 
A
G
 
G
A
 
A
F
 
F
P
 
P
G
 
G
R
 
R
E
 
E
V
 
V
I
 
I
N
 
D
L
 
L
A
 
A
D
 
D
P
 
P
V
 
A
H
 
H
K
 
Q
G
 
E
R
 
R
D
 
D
L
 
L
S
 
S
G
 
G
I
 
I
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
V
 
V
W
|
W
K
 
K
S
 
S
A
 
A
P
 
P
D
 
D
L
 
L
F
 
F
S
 
S
R
 
R
A
 
A
P
 
P
D
 
D
L
 
L
K
 
K
V
 
V
V
 
V
F
 
F
S
 
S
G
 
G
G
|
G
A
|
A
G
|
G
V
 
V
D
 
D
H
 
H
V
 
V
L
 
L
K
 
T
L
 
L
P
 
P
G
 
G
L
 
L
P
 
P
D
 
D
V
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
V
R
|
R
F
 
F
V
 
V
D
 
D
R
 
R
T
 
T
L
|
L
T
 
T
T
 
T
R
 
R
M
|
M
S
 
S
E
 
E
W
 
W
V
 
V
V
 
M
M
 
M
Q
 
Q
C
 
C
L
 
L
L
 
L
H
 
H
L
 
L
R
 
R
Q
 
Q
H
|
H
R
|
R
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
A
 
A
L
 
L
V
 
A
K
 
K
K
 
K
H
 
H
E
 
E
W
 
W
R
 
R
D
 
D
L
 
L
S
 
S
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
A
 
A
A
 
A
D
 
D
I
 
V
T
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
I
M
 
M
G
 
G
M
|
M
G
|
G
V
|
V
L
|
L
G
 
G
Q
 
Q
D
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
R
K
 
K
L
 
L
A
 
A
V
 
A
M
 
M
G
 
G
F
 
F
K
 
K
V
 
V
I
 
I
G
 
G
W
|
W
S
|
S
R
|
R
S
|
S
K
 
K
R
|
R
A
 
V
V
 
I
E
 
E
G
 
G
I
 
V
E
 
E
T
 
T
F
 
Y
D
 
D
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
G
R
 
R
T
 
T
D
 
D
F
 
F
L
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
L
|
L
P
|
P
L
 
L
T
 
T
A
 
P
D
 
D
T
 
T
K
 
R
G
 
G
I
 
I
F
 
F
N
 
N
A
 
A
T
 
A
L
 
L
F
 
F
K
 
A
K
 
K
L
 
L
S
 
S
R
 
R
K
 
N
G
 
G
P
 
P
F
 
F
G
 
G
A
 
A
P
 
P
V
 
V
F
 
F
I
 
I
N
 
N
A
|
A
G
|
G
R
|
R
G
 
G
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
V
 
V
E
 
E
A
 
A
D
 
D
I
 
I
L
 
L
E
 
E
C
 
C
L
 
L
D
 
D
S
 
S
G
 
G
V
 
V
L
 
L
G
|
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
K
 
R
E
|
E
P
 
P
L
 
L
S
 
S
R
 
P
E
 
E
S
 
S
R
 
R
F
 
F
W
 
W
D
 
D
I
 
M
P
 
P
N
 
N
V
 
V
Y
 
Y
V
 
V
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
V
A
|
A
A
|
A
S
 
S
S
 
S
D
 
D
V
 
V
K
 
R
A
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
V
H
 
H
V
 
V
E
 
E
E
 
H
Q
 
Q
I
 
I
E
 
A
R
 
R
F
 
F
E
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
A
 
P
L
 
L
E
 
E
H
 
H
V
 
V
V
 
V
D
 
D
K
 
K
V
 
V
A
 
A
G
 
G
Y
|
Y

4weqA Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc02828 (smghra) from sinorhizobium meliloti in complex with NADP and sulfate (see paper)
91% identity, 99% coverage: 4:319/319 of query aligns to 1:316/316 of 4weqA

query
sites
4weqA
K
 
K
S
 
S
P
 
P
V
 
V
I
 
I
V
 
V
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
F
I
 
I
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
V
D
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
N
 
A
G
 
G
A
 
A
F
 
F
P
 
P
G
 
G
R
 
R
E
 
E
V
 
V
I
 
I
N
 
D
L
 
L
A
 
A
D
 
D
P
 
P
V
 
A
H
 
H
K
 
Q
G
 
E
R
 
R
D
 
D
L
 
L
S
 
S
G
 
G
I
 
I
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
V
 
V
W
 
W
K
 
K
S
 
S
A
 
A
P
 
P
D
 
D
L
 
L
F
 
F
S
 
S
R
 
R
A
 
A
P
 
P
D
 
D
L
 
L
K
 
K
V
 
V
V
 
V
F
 
F
S
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
D
H
 
H
V
 
V
L
 
L
K
 
T
L
 
L
P
 
P
G
 
G
L
 
L
P
 
P
D
 
D
V
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
V
R
|
R
F
 
F
V
 
V
D
 
D
R
 
R
T
 
T
L
|
L
T
 
T
T
 
T
R
 
R
M
|
M
S
 
S
E
 
E
W
 
W
V
 
V
V
 
M
M
 
M
Q
 
Q
C
 
C
L
 
L
L
 
L
H
 
H
L
 
L
R
 
R
Q
 
Q
H
 
H
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
A
 
A
L
 
L
V
 
A
K
 
K
K
 
K
H
 
H
E
 
E
W
 
W
R
 
R
D
 
D
L
 
L
S
 
S
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
A
 
A
A
 
A
D
 
D
I
 
V
T
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
I
M
 
M
G
 
G
M
|
M
G
|
G
V
|
V
L
|
L
G
 
G
Q
 
Q
D
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
R
K
 
K
L
 
L
A
 
A
V
 
A
M
 
M
G
 
G
F
 
F
K
 
K
V
 
V
I
 
I
G
 
G
W
|
W
S
|
S
R
|
R
S
|
S
K
 
K
R
|
R
A
 
V
V
 
I
E
 
E
G
 
G
I
 
V
E
 
E
T
 
T
F
 
Y
D
 
D
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
G
R
 
R
T
 
T
D
 
D
F
 
F
L
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
L
|
L
P
|
P
L
 
L
T
 
T
A
 
P
D
 
D
T
 
T
K
 
R
G
 
G
I
 
I
F
 
F
N
 
N
A
 
A
T
 
A
L
 
L
F
 
F
K
 
A
K
 
K
L
 
L
S
 
S
R
 
R
K
 
N
G
 
G
P
 
P
F
 
F
G
 
G
A
 
A
P
 
P
V
 
V
F
 
F
I
 
I
N
 
N
A
|
A
G
|
G
R
|
R
G
 
G
G
 
G
S
 
S
Q
 
Q
V
 
V
E
 
E
A
 
A
D
 
D
I
 
I
L
 
L
E
 
E
C
 
C
L
 
L
D
 
D
S
 
S
G
 
G
V
 
V
L
 
L
G
|
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
K
 
R
E
|
E
P
 
P
L
 
L
S
 
S
R
 
P
E
 
E
S
 
S
R
 
R
F
 
F
W
 
W
D
 
D
I
 
M
P
 
P
N
 
N
V
 
V
Y
 
Y
V
 
V
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
V
A
|
A
A
 
A
S
 
S
S
 
S
D
 
D
V
 
V
K
 
R
A
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
V
H
 
H
V
 
V
E
 
E
E
 
H
Q
 
Q
I
 
I
E
 
A
R
 
R
F
 
F
E
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
L
A
 
P
L
 
L
E
 
E
H
 
H
V
 
V
V
 
V
D
 
D
K
 
K
V
 
V
A
 
A
G
 
G
Y
|
Y

5bqfA Probable 2-hydroxyacid dehydrogenase from rhizobium etli cfn 42 in complex with NADP, hepes and l(+)-tartaric acid
60% identity, 99% coverage: 4:319/319 of query aligns to 2:317/317 of 5bqfA

query
sites
5bqfA
K
 
R
S
 
P
P
 
P
V
 
V
I
 
L
V
 
V
D
 
D
L
 
I
K
 
K
F
 
F
I
 
N
P
 
P
E
 
E
E
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
R
A
 
V
L
 
L
N
 
K
G
 
T
A
 
A
F
 
F
P
 
A
G
 
D
R
 
R
E
 
G
V
 
S
I
 
I
N
 
N
L
 
L
A
 
A
D
 
D
P
 
P
V
 
A
H
 
N
K
 
R
G
 
E
R
 
R
D
 
D
L
 
F
S
 
S
G
 
E
I
 
T
D
 
E
Y
 
Y
A
 
A
V
 
L
V
 
L
W
 
W
K
 
K
S
 
P
A
 
D
P
 
A
D
 
D
L
 
L
F
 
F
S
 
R
R
 
R
A
 
A
P
 
P
D
 
N
L
 
L
K
 
K
V
 
V
V
 
I
F
 
F
S
 
S
G
 
G
G
 
G
A
|
A
G
 
G
V
 
V
D
 
D
H
 
H
V
 
I
L
 
I
K
 
G
L
 
M
P
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
D
 
D
V
 
I
P
 
P
L
 
I
V
 
V
R
|
R
F
 
F
V
 
V
D
 
D
R
 
R
T
 
S
L
 
L
T
 
T
T
 
T
R
 
R
M
|
M
S
 
S
E
 
E
W
 
W
V
 
V
V
 
V
M
 
M
Q
 
Q
C
 
C
L
 
L
L
 
M
H
 
H
L
 
L
R
 
R
Q
 
G
H
 
Q
R
 
Y
A
 
G
Y
 
H
E
 
D
A
 
S
L
 
H
V
 
Q
K
 
R
K
 
R
H
 
R
E
 
E
W
 
W
R
 
A
D
 
K
L
 
L
S
 
I
Q
 
A
P
 
P
E
 
E
A
 
A
A
 
A
D
 
E
I
 
V
T
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
V
M
 
M
G
|
G
M
x
L
G
|
G
V
x
I
L
|
L
G
 
G
Q
 
Q
D
 
D
A
 
A
A
 
V
R
 
A
K
 
K
L
 
L
A
 
K
V
 
V
M
 
M
G
 
G
F
 
F
K
 
N
V
 
V
I
 
I
G
 
G
W
|
W
S
|
S
R
|
R
S
x
T
K
 
R
R
 
K
A
 
T
V
 
I
E
 
E
G
 
G
I
 
V
E
 
E
T
 
T
F
 
F
D
 
D
A
 
A
A
 
G
G
 
E
L
 
L
D
 
D
A
 
R
F
 
F
L
 
L
A
 
A
R
 
K
T
 
T
D
 
D
F
 
I
L
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
L
|
L
P
|
P
L
 
L
T
 
T
A
 
P
D
 
E
T
 
T
K
 
T
G
 
G
I
 
F
F
 
Y
N
 
D
A
 
S
T
 
E
L
 
L
F
 
F
K
 
K
K
 
K
L
 
L
S
 
R
R
 
R
K
 
D
G
 
G
P
 
A
F
 
L
G
 
G
A
 
Q
P
 
P
V
 
V
F
 
F
I
 
I
N
 
N
A
|
A
G
|
G
R
|
R
G
 
G
G
 
K
S
 
S
Q
 
Q
V
 
I
E
 
E
A
 
T
D
 
D
I
 
I
L
 
V
E
 
S
C
 
A
L
 
V
D
 
R
S
 
E
G
 
G
V
 
T
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
K
 
V
E
|
E
P
 
P
L
 
L
S
 
A
R
 
T
E
 
D
S
 
S
R
 
P
F
 
L
W
 
W
D
 
E
I
 
L
P
 
E
N
 
N
V
 
V
Y
 
F
V
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
D
A
 
A
A
|
A
S
 
V
S
 
S
D
 
E
V
 
E
K
 
N
A
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
R
H
 
H
V
 
V
E
 
E
E
 
M
Q
 
Q
I
 
I
E
 
A
R
 
R
F
 
F
E
 
E
S
 
R
G
 
G
L
 
E
A
 
P
L
 
L
E
 
Q
H
 
F
V
 
V
V
 
I
D
 
D
K
 
R
V
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
|
Y

4xcvA Probable 2-hydroxyacid dehydrogenase from rhizobium etli cfn 42 in complex with NADPH
60% identity, 99% coverage: 4:319/319 of query aligns to 2:317/317 of 4xcvA

query
sites
4xcvA
K
 
R
S
 
P
P
 
P
V
 
V
I
 
L
V
 
V
D
 
D
L
 
I
K
 
K
F
 
F
I
 
N
P
 
P
E
 
E
E
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
R
A
 
V
L
 
L
N
 
K
G
 
T
A
 
A
F
 
F
P
 
A
G
 
D
R
 
R
E
 
G
V
 
S
I
 
I
N
 
N
L
 
L
A
 
A
D
 
D
P
 
P
V
 
A
H
 
N
K
 
R
G
 
E
R
 
R
D
 
D
L
 
F
S
 
S
G
 
E
I
 
T
D
 
E
Y
 
Y
A
 
A
V
 
L
V
 
L
W
 
W
K
 
K
S
 
P
A
 
D
P
 
A
D
 
D
L
 
L
F
 
F
S
 
R
R
 
R
A
 
A
P
 
P
D
 
N
L
 
L
K
 
K
V
 
V
V
 
I
F
 
F
S
 
S
G
 
G
G
 
G
A
|
A
G
 
G
V
 
V
D
 
D
H
 
H
V
 
I
L
 
I
K
 
G
L
 
M
P
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
D
 
D
V
 
I
P
 
P
L
 
I
V
 
V
R
|
R
F
 
F
V
 
V
D
 
D
R
 
R
T
 
S
L
 
L
T
 
T
T
 
T
R
 
R
M
|
M
S
 
S
E
 
E
W
 
W
V
 
V
V
 
V
M
 
M
Q
 
Q
C
 
C
L
 
L
L
 
M
H
 
H
L
 
L
R
 
R
Q
 
G
H
 
Q
R
 
Y
A
 
G
Y
 
H
E
 
D
A
 
S
L
 
H
V
 
Q
K
 
R
K
 
R
H
 
R
E
 
E
W
 
W
R
 
A
D
 
K
L
 
L
S
 
I
Q
 
A
P
 
P
E
 
E
A
 
A
A
 
A
D
 
E
I
 
V
T
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
V
M
 
M
G
|
G
M
x
L
G
|
G
V
x
I
L
|
L
G
 
G
Q
 
Q
D
 
D
A
 
A
A
 
V
R
 
A
K
 
K
L
 
L
A
 
K
V
 
V
M
 
M
G
 
G
F
 
F
K
 
N
V
 
V
I
 
I
G
 
G
W
|
W
S
|
S
R
|
R
S
x
T
K
 
R
R
x
K
A
 
T
V
 
I
E
 
E
G
 
G
I
 
V
E
 
E
T
 
T
F
 
F
D
 
D
A
 
A
A
 
G
G
 
E
L
 
L
D
 
D
A
 
R
F
 
F
L
 
L
A
 
A
R
 
K
T
 
T
D
 
D
F
 
I
L
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
L
|
L
P
|
P
L
 
L
T
 
T
A
 
P
D
 
E
T
 
T
K
 
T
G
 
G
I
 
F
F
 
Y
N
 
D
A
 
S
T
 
E
L
 
L
F
 
F
K
 
K
K
 
K
L
 
L
S
 
R
R
 
R
K
 
D
G
 
G
P
 
A
F
 
L
G
 
G
A
 
Q
P
 
P
V
 
V
F
 
F
I
 
I
N
 
N
A
|
A
G
|
G
R
|
R
G
 
G
G
 
K
S
 
S
Q
 
Q
V
 
I
E
 
E
A
 
T
D
 
D
I
 
I
L
 
V
E
 
S
C
 
A
L
 
V
D
 
R
S
 
E
G
 
G
V
 
T
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
K
 
V
E
|
E
P
 
P
L
 
L
S
 
A
R
 
T
E
 
D
S
 
S
R
 
P
F
 
L
W
 
W
D
 
E
I
 
L
P
 
E
N
 
N
V
 
V
Y
 
F
V
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
D
A
 
A
A
|
A
S
 
V
S
 
S
D
 
E
V
 
E
K
 
N
A
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
R
H
 
H
V
 
V
E
 
E
E
 
M
Q
 
Q
I
 
I
E
 
A
R
 
R
F
 
F
E
 
E
S
 
R
G
 
G
L
 
E
A
 
P
L
 
L
E
 
Q
H
 
F
V
 
V
V
 
I
D
 
D
K
 
R
V
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
|
Y

5tsdA Crystal structure of NADPH-dependent 2-hydroxyacid dehydrogenase from rhizobium etli cfn 42 in complex with NADPH and oxalate
60% identity, 99% coverage: 4:319/319 of query aligns to 1:316/316 of 5tsdA

query
sites
5tsdA
K
 
R
S
 
P
P
 
P
V
 
V
I
 
L
V
 
V
D
 
D
L
 
I
K
 
K
F
 
F
I
 
N
P
 
P
E
 
E
E
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
R
A
 
V
L
 
L
N
 
K
G
 
T
A
 
A
F
 
F
P
 
A
G
 
D
R
 
R
E
 
G
V
 
S
I
 
I
N
 
N
L
 
L
A
 
A
D
 
D
P
 
P
V
 
A
H
 
N
K
 
R
G
 
E
R
 
R
D
 
D
L
 
F
S
 
S
G
 
E
I
 
T
D
 
E
Y
 
Y
A
 
A
V
 
L
V
 
L
W
|
W
K
 
K
S
 
P
A
 
D
P
 
A
D
 
D
L
 
L
F
 
F
S
 
R
R
 
R
A
 
A
P
 
P
D
 
N
L
 
L
K
 
K
V
 
V
V
 
I
F
 
F
S
 
S
G
 
G
G
|
G
A
|
A
G
|
G
V
 
V
D
 
D
H
 
H
V
 
I
L
 
I
K
 
G
L
 
M
P
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
D
 
D
V
 
I
P
 
P
L
 
I
V
 
V
R
|
R
F
 
F
V
 
V
D
 
D
R
 
R
T
 
S
L
 
L
T
 
T
T
 
T
R
 
R
M
|
M
S
 
S
E
 
E
W
 
W
V
 
V
V
 
V
M
 
M
Q
 
Q
C
 
C
L
 
L
L
 
M
H
 
H
L
 
L
R
 
R
Q
 
G
H
 
Q
R
 
Y
A
 
G
Y
 
H
E
 
D
A
 
S
L
 
H
V
 
Q
K
 
R
K
 
R
H
 
R
E
 
E
W
 
W
R
 
A
D
 
K
L
 
L
S
 
I
Q
 
A
P
 
P
E
 
E
A
 
A
A
 
A
D
 
E
I
 
V
T
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
V
M
 
M
G
|
G
M
x
L
G
|
G
V
x
I
L
|
L
G
 
G
Q
 
Q
D
 
D
A
 
A
A
 
V
R
 
A
K
 
K
L
 
L
A
 
K
V
 
V
M
 
M
G
 
G
F
 
F
K
 
N
V
 
V
I
 
I
G
 
G
W
|
W
S
|
S
R
|
R
S
x
T
K
 
R
R
x
K
A
 
T
V
 
I
E
 
E
G
 
G
I
 
V
E
 
E
T
 
T
F
 
F
D
 
D
A
 
A
A
 
G
G
 
E
L
 
L
D
 
D
A
 
R
F
 
F
L
 
L
A
 
A
R
 
K
T
 
T
D
 
D
F
 
I
L
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
L
|
L
P
|
P
L
 
L
T
 
T
A
 
P
D
 
E
T
 
T
K
 
T
G
 
G
I
 
F
F
 
Y
N
 
D
A
 
S
T
 
E
L
 
L
F
 
F
K
 
K
K
 
K
L
 
L
S
 
R
R
 
R
K
 
D
G
 
G
P
 
A
F
 
L
G
 
G
A
 
Q
P
 
P
V
 
V
F
 
F
I
 
I
N
 
N
A
|
A
G
|
G
R
|
R
G
 
G
G
 
K
S
 
S
Q
 
Q
V
 
I
E
 
E
A
 
T
D
 
D
I
 
I
L
 
V
E
 
S
C
 
A
L
 
V
D
 
R
S
 
E
G
 
G
V
 
T
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
K
 
V
E
|
E
P
 
P
L
 
L
S
 
A
R
 
T
E
 
D
S
 
S
R
 
P
F
 
L
W
 
W
D
 
E
I
 
L
P
 
E
N
 
N
V
 
V
Y
 
F
V
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
D
A
 
A
A
 
A
S
 
V
S
 
S
D
 
E
V
 
E
K
 
N
A
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
R
H
 
H
V
 
V
E
 
E
E
 
M
Q
 
Q
I
 
I
E
 
A
R
 
R
F
 
F
E
 
E
S
 
R
G
 
G
L
 
E
A
 
P
L
 
L
E
 
Q
H
 
F
V
 
V
V
 
I
D
 
D
K
 
R
V
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
|
Y

5vg6B Crystal structure of d-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase from xanthobacter autotrophicus py2 in complex with NADPH and mes.
38% identity, 96% coverage: 14:319/319 of query aligns to 13:315/315 of 5vg6B

query
sites
5vg6B
I
 
I
P
 
G
E
 
Q
E
 
D
V
 
W
D
 
K
A
 
S
A
 
A
L
 
L
N
 
Q
G
 
A
A
 
A
F
 
H
P
 
P
G
 
G
R
 
L
E
 
D
V
 
V
-
 
R
I
 
I
N
 
A
L
 
R
A
 
A
D
 
G
P
 
D
V
 
G
H
 
H
K
 
V
G
 
E
R
 
G
D
 
D
L
 
P
S
 
E
G
 
E
I
 
V
D
 
R
Y
 
Y
A
 
A
V
 
L
V
 
V
W
 
W
K
 
K
S
 
P
A
 
P
P
 
H
D
 
G
L
 
F
F
 
F
S
 
A
R
 
R
A
 
F
P
 
P
D
 
N
L
 
L
K
 
K
V
 
L
V
 
V
F
 
I
S
 
N
G
 
L
G
 
G
A
|
A
G
 
G
V
 
V
D
 
D
H
 
A
V
 
L
L
 
V
K
 
A
L
 
R
P
 
D
G
 
D
L
 
L
P
 
P
D
 
D
V
 
V
P
 
P
L
 
V
V
 
T
R
|
R
F
 
L
V
 
S
D
 
D
R
 
P
T
 
N
L
x
M
T
 
S
T
 
Q
R
 
M
M
|
M
S
 
A
E
 
S
W
 
F
V
 
V
V
 
L
M
 
F
Q
 
C
C
 
V
L
 
L
L
 
R
H
 
H
L
 
A
R
 
R
Q
 
D
H
 
I
R
 
P
A
 
T
Y
 
F
E
 
E
A
 
R
L
 
A
V
 
Q
K
 
R
K
 
E
H
 
G
E
 
R
W
 
W
R
 
H
D
 
Y
L
 
V
S
 
H
Q
 
P
P
 
R
E
 
T
A
 
A
A
 
A
D
 
E
I
 
I
T
 
R
V
 
V
G
 
G
I
 
V
M
 
L
G
 
G
M
x
L
G
|
G
V
x
D
L
|
L
G
 
G
Q
 
A
D
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
L
K
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
R
M
 
H
G
 
G
F
 
F
K
 
D
V
 
V
I
 
R
G
 
G
W
|
W
S
|
S
R
|
R
S
x
T
K
 
P
R
x
K
A
 
A
V
 
L
E
 
E
G
 
G
I
 
V
E
 
S
T
 
C
F
 
F
D
 
H
A
 
G
-
 
L
A
 
E
G
 
A
L
 
L
D
 
P
A
 
G
F
 
F
L
 
L
A
 
A
R
 
G
T
 
S
D
 
E
F
 
I
L
 
V
V
 
V
G
 
V
L
 
M
L
|
L
P
|
P
L
 
L
T
 
T
A
 
P
D
 
E
T
|
T
K
 
R
G
 
G
I
 
L
F
 
M
N
 
N
A
 
A
T
 
E
L
 
R
F
 
L
K
 
A
K
 
H
L
 
L
S
 
P
R
 
R
K
 
G
G
 
A
P
 
K
F
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
F
 
F
I
 
I
N
 
N
A
x
V
G
 
A
R
|
R
G
 
G
G
 
P
S
 
V
Q
 
V
V
 
D
E
 
E
A
 
A
D
 
A
I
 
L
L
 
I
E
 
A
C
 
A
L
 
L
D
 
R
S
 
S
G
 
G
V
 
H
L
 
I
G
 
A
G
 
E
A
 
A
S
 
T
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
K
 
V
E
|
E
P
 
P
L
 
L
S
 
P
R
 
V
E
 
G
S
 
S
R
 
P
F
 
L
W
 
W
D
 
A
I
 
M
P
 
D
N
 
N
V
 
V
Y
 
L
V
 
V
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
L
A
|
A
A
x
S
S
 
I
S
 
A
D
 
I
V
 
P
K
 
R
A
 
T
L
 
A
F
 
A
A
 
P
H
 
Q
V
 
I
E
 
V
E
 
E
Q
 
N
I
 
I
E
 
R
R
 
R
F
 
I
E
 
E
S
 
A
G
 
G
L
 
E
A
 
P
L
 
V
E
 
L
H
 
N
V
 
Q
V
 
V
D
 
D
K
 
P
V
 
R
A
 
R
G
 
G
Y
|
Y

3kboA 2.14 angstrom crystal structure of putative oxidoreductase (ycdw) from salmonella typhimurium in complex with NADP
39% identity, 87% coverage: 43:319/319 of query aligns to 35:312/312 of 3kboA

query
sites
3kboA
D
 
D
L
x
N
S
 
N
G
 
P
I
 
A
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
V
 
L
V
 
V
W
 
W
K
 
Q
S
 
P
A
 
P
P
 
V
D
 
E
L
 
M
F
 
L
S
x
A
R
 
-
A
 
G
P
x
R
D
x
R
L
 
L
K
 
K
V
 
A
V
 
V
F
 
F
S
 
V
G
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
D
H
 
A
V
 
I
L
 
L
-
 
S
K
 
K
L
 
L
P
 
N
G
 
A
L
 
H
P
 
P
D
 
E
-
 
M
-
 
L
-
 
D
-
 
A
-
 
S
V
 
I
P
 
P
L
 
L
V
 
F
R
|
R
F
 
L
V
 
E
D
 
D
R
 
T
T
 
G
L
x
M
T
 
G
T
 
L
R
 
Q
M
|
M
S
 
Q
E
 
E
W
 
Y
V
 
A
V
 
V
M
 
S
Q
 
Q
C
 
V
L
 
L
L
 
H
H
 
W
L
 
F
R
 
R
Q
 
R
H
 
F
R
 
D
A
 
D
Y
 
Y
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
V
 
K
K
 
N
K
 
Q
H
 
A
E
 
L
W
 
W
R
 
K
D
 
P
L
 
L
S
 
P
Q
 
E
P
 
Y
E
 
T
A
 
R
A
 
E
D
 
E
I
 
F
T
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
I
M
 
M
G
|
G
M
x
A
G
|
G
V
|
V
L
|
L
G
 
G
Q
 
A
D
 
K
A
 
V
A
 
A
R
 
E
K
 
S
L
 
L
A
 
Q
V
 
A
M
 
W
G
 
G
F
 
F
K
 
P
V
 
L
I
 
R
G
 
C
W
|
W
S
|
S
R
|
R
S
|
S
K
 
R
R
x
K
A
 
S
V
 
W
E
 
P
G
 
G
I
 
V
E
 
E
T
 
S
F
 
Y
-
 
V
D
 
G
A
 
R
A
 
E
G
 
E
L
 
L
D
 
R
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
N
R
 
Q
T
 
T
D
 
R
F
 
V
L
 
L
V
 
I
G
 
N
L
|
L
L
 
L
P
|
P
L
 
N
T
 
T
A
 
A
D
 
Q
T
 
T
K
 
V
G
 
G
I
 
I
F
 
I
N
 
N
A
 
S
T
 
E
L
 
L
F
 
L
K
 
D
K
 
Q
L
 
L
S
 
-
R
 
-
K
 
-
G
 
-
P
 
P
F
 
D
G
 
G
A
 
A
P
 
Y
V
 
V
F
 
-
I
 
L
N
 
N
A
x
L
G
x
A
R
|
R
G
 
G
G
 
V
S
 
H
Q
 
V
V
 
Q
E
 
E
A
 
A
D
 
D
I
 
L
L
 
L
E
 
A
C
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
S
G
 
G
V
 
K
L
 
L
G
 
K
G
 
G
A
 
A
S
 
M
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
S
K
 
Q
E
|
E
P
 
P
L
 
L
S
 
P
R
 
Q
E
 
E
S
 
S
R
 
P
F
 
L
W
 
W
D
 
R
I
 
H
P
 
P
N
 
R
V
 
V
Y
 
A
V
 
M
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
I
A
 
A
A
|
A
S
 
V
S
 
T
D
 
R
V
 
P
K
 
A
A
 
E
L
 
A
F
 
I
A
 
D
H
 
Y
V
 
I
E
 
S
E
 
R
Q
 
T
I
 
I
E
 
T
R
 
Q
F
 
L
E
 
E
S
 
K
G
 
G
L
 
E
A
 
P
L
 
V
E
 
T
H
 
G
V
 
Q
V
 
V
D
 
D
K
 
R
V
 
A
A
 
R
G
 
G
Y
|
Y

7jqiA Structure of wild type glyoxylate/hydroxypyruvate reductase a from escherichia coli in complex with alpha-ketoglutarate and NADP+
38% identity, 88% coverage: 40:319/319 of query aligns to 32:312/312 of 7jqiA

query
sites
7jqiA
K
 
K
G
 
S
R
 
G
D
 
D
L
 
N
S
 
D
G
 
S
I
 
A
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
V
 
L
V
 
V
W
 
W
K
 
H
S
 
P
A
 
P
P
 
V
D
 
E
L
 
M
F
 
L
S
 
A
R
 
-
A
 
G
P
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
K
V
 
A
V
 
V
F
 
F
S
 
A
G
 
L
G
|
G
A
|
A
G
|
G
V
 
V
D
 
D
H
 
S
V
 
I
L
 
L
-
 
S
K
 
K
L
 
L
P
 
Q
G
 
A
L
 
H
P
 
P
D
 
E
-
 
M
-
 
L
-
 
N
-
 
P
-
 
S
V
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
F
R
|
R
F
 
L
V
 
E
D
 
D
R
 
T
T
 
G
L
 
M
T
 
G
T
 
E
R
 
Q
M
|
M
S
 
Q
E
 
E
W
 
Y
V
 
A
V
 
V
M
 
S
Q
 
Q
C
 
V
L
 
L
L
 
H
H
 
W
L
 
F
R
 
R
Q
 
R
H
 
F
R
 
D
A
 
D
Y
 
Y
E
 
R
A
 
I
L
 
Q
V
 
Q
K
 
N
K
 
S
H
 
S
E
 
H
W
 
W
R
 
Q
D
 
P
L
 
L
S
 
P
Q
 
E
P
 
Y
E
 
H
A
 
R
A
 
E
D
 
D
I
 
F
T
 
T
V
 
I
G
 
G
I
 
I
M
 
L
G
 
G
M
x
A
G
|
G
V
|
V
L
|
L
G
 
G
Q
 
S
D
 
K
A
 
V
A
 
A
R
 
Q
K
 
S
L
 
L
A
 
Q
V
 
T
M
 
W
G
 
R
F
 
F
K
 
P
V
 
L
I
 
R
G
 
C
W
|
W
S
|
S
R
|
R
S
x
T
K
 
R
R
x
K
A
 
S
V
 
W
E
 
P
G
 
G
I
 
V
E
 
Q
T
 
S
F
 
F
D
 
A
A
 
G
-
 
R
A
 
E
G
 
E
L
 
L
D
 
S
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
S
R
 
Q
T
 
C
D
 
R
F
 
V
L
 
L
V
 
I
G
 
N
L
 
L
L
|
L
P
|
P
L
 
N
T
 
T
A
 
P
D
 
E
T
 
T
K
 
V
G
 
G
I
 
I
F
 
I
N
 
N
A
 
Q
T
 
Q
L
 
L
F
 
L
K
 
E
K
 
K
L
 
L
S
 
-
R
 
-
K
 
-
G
 
-
P
 
P
F
 
D
G
 
G
A
 
A
P
 
-
V
 
Y
F
 
L
I
 
L
N
 
N
A
x
L
G
 
A
R
|
R
G
 
G
G
 
V
S
 
H
Q
 
V
V
 
V
E
 
E
A
 
D
D
 
D
I
 
L
L
 
L
E
 
A
C
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
S
G
 
G
V
 
K
L
 
V
G
 
K
G
 
G
A
 
A
S
 
M
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
N
K
 
R
E
 
E
P
 
P
L
 
L
S
 
P
R
 
P
E
 
E
S
 
S
R
 
P
F
 
L
W
 
W
D
 
Q
I
 
H
P
 
P
N
 
R
V
 
V
Y
 
T
V
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
V
A
 
A
A
|
A
S
 
I
S
 
T
D
 
R
V
 
P
K
 
A
A
 
E
L
 
A
F
 
V
A
 
E
H
 
Y
V
 
I
E
 
S
E
 
R
Q
 
T
I
 
I
E
 
A
R
 
Q
F
 
L
E
 
E
S
 
K
G
 
G
L
 
E
A
 
K
L
 
V
E
 
C
H
 
G
V
 
Q
V
 
V
D
 
D
K
 
R
V
 
A
A
 
R
G
 
G
Y
|
Y

6p35A 2.5 angstrom structure of wild type glyoxylate/hydroxypyruvate reductase a from escherichia coli in complex with 2-keto arginine and NADP
38% identity, 88% coverage: 40:319/319 of query aligns to 32:312/312 of 6p35A

query
sites
6p35A
K
 
K
G
 
S
R
 
G
D
 
D
L
 
N
S
 
D
G
 
S
I
 
A
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
V
 
L
V
 
V
W
 
W
K
 
H
S
 
P
A
 
P
P
 
V
D
 
E
L
 
M
F
 
L
S
 
A
R
 
-
A
 
G
P
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
K
V
 
A
V
 
V
F
 
F
S
 
A
G
 
L
G
 
G
A
|
A
G
 
G
V
 
V
D
 
D
H
 
S
V
 
I
L
 
L
-
 
S
K
 
K
L
 
L
P
 
Q
G
 
A
L
 
H
P
 
P
D
 
E
-
 
M
-
 
L
-
 
N
-
 
P
-
 
S
V
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
F
R
|
R
F
 
L
V
 
E
D
 
D
R
 
T
T
 
G
L
 
M
T
 
G
T
 
E
R
 
Q
M
|
M
S
 
Q
E
 
E
W
 
Y
V
 
A
V
 
V
M
 
S
Q
 
Q
C
 
V
L
 
L
L
 
H
H
 
W
L
 
F
R
 
R
Q
 
R
H
 
F
R
 
D
A
 
D
Y
 
Y
E
 
R
A
 
I
L
 
Q
V
 
Q
K
 
N
K
 
S
H
 
S
E
 
H
W
 
W
R
 
Q
D
 
P
L
 
L
S
 
P
Q
 
E
P
 
Y
E
 
H
A
 
R
A
 
E
D
 
D
I
 
F
T
 
T
V
 
I
G
 
G
I
 
I
M
 
L
G
 
G
M
x
A
G
|
G
V
|
V
L
|
L
G
 
G
Q
 
S
D
 
K
A
 
V
A
 
A
R
 
Q
K
 
S
L
 
L
A
 
Q
V
 
T
M
 
W
G
 
R
F
 
F
K
 
P
V
 
L
I
 
R
G
 
C
W
|
W
S
|
S
R
|
R
S
x
T
K
 
R
R
x
K
A
 
S
V
 
W
E
 
P
G
 
G
I
 
V
E
 
Q
T
 
S
F
 
F
D
 
A
A
 
G
-
 
R
A
 
E
G
 
E
L
 
L
D
 
S
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
S
R
 
Q
T
 
C
D
 
R
F
 
V
L
 
L
V
 
I
G
 
N
L
 
L
L
|
L
P
|
P
L
 
N
T
 
T
A
 
P
D
 
E
T
 
T
K
 
V
G
 
G
I
 
I
F
 
I
N
 
N
A
 
Q
T
 
Q
L
 
L
F
 
L
K
 
E
K
 
K
L
 
L
S
 
-
R
 
-
K
 
-
G
 
-
P
 
P
F
 
D
G
 
G
A
 
A
P
 
-
V
 
Y
F
 
L
I
 
L
N
 
N
A
x
L
G
 
A
R
|
R
G
 
G
G
 
V
S
 
H
Q
 
V
V
 
V
E
 
E
A
 
D
D
 
D
I
 
L
L
 
L
E
 
A
C
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
S
G
 
G
V
 
K
L
 
V
G
 
K
G
 
G
A
 
A
S
 
M
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
N
K
 
R
E
 
E
P
 
P
L
 
L
S
 
P
R
 
P
E
 
E
S
 
S
R
 
P
F
 
L
W
 
W
D
 
Q
I
 
H
P
 
P
N
 
R
V
 
V
Y
 
T
V
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
V
A
|
A
A
|
A
S
 
I
S
x
T
D
 
R
V
 
P
K
 
A
A
 
E
L
 
A
F
 
V
A
 
E
H
 
Y
V
 
I
E
 
S
E
 
R
Q
 
T
I
 
I
E
 
A
R
 
Q
F
 
L
E
 
E
S
 
K
G
 
G
L
 
E
A
 
K
L
 
V
E
 
C
H
 
G
V
 
Q
V
 
V
D
 
D
K
 
R
V
 
A
A
 
R
G
 
G
Y
|
Y

Sites not aligning to the query:

7jqhA Structure of wild type glyoxylate/hydroxypyruvate reductase a from escherichia coli in complex with phosphate and NADP+
38% identity, 88% coverage: 40:319/319 of query aligns to 33:313/313 of 7jqhA

query
sites
7jqhA
K
 
K
G
 
S
R
 
G
D
 
D
L
 
N
S
 
D
G
 
S
I
 
A
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
V
 
L
V
 
V
W
 
W
K
 
H
S
 
P
A
 
P
P
 
V
D
 
E
L
 
M
F
 
L
S
 
A
R
 
-
A
 
G
P
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
K
V
 
A
V
 
V
F
 
F
S
 
A
G
 
L
G
 
G
A
|
A
G
 
G
V
 
V
D
 
D
H
 
S
V
 
I
L
 
L
-
 
S
K
 
K
L
 
L
P
 
Q
G
 
A
L
 
H
P
 
P
D
 
E
-
 
M
-
 
L
-
 
N
-
 
P
-
 
S
V
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
F
R
|
R
F
 
L
V
 
E
D
 
D
R
 
T
T
 
G
L
 
M
T
 
G
T
 
E
R
 
Q
M
|
M
S
 
Q
E
 
E
W
 
Y
V
 
A
V
 
V
M
 
S
Q
 
Q
C
 
V
L
 
L
L
 
H
H
 
W
L
 
F
R
 
R
Q
 
R
H
 
F
R
 
D
A
 
D
Y
 
Y
E
 
R
A
 
I
L
 
Q
V
 
Q
K
 
N
K
 
S
H
 
S
E
 
H
W
 
W
R
 
Q
D
 
P
L
 
L
S
 
P
Q
 
E
P
 
Y
E
 
H
A
 
R
A
 
E
D
 
D
I
 
F
T
 
T
V
 
I
G
 
G
I
 
I
M
 
L
G
 
G
M
x
A
G
|
G
V
|
V
L
|
L
G
 
G
Q
 
S
D
 
K
A
 
V
A
 
A
R
 
Q
K
 
S
L
 
L
A
 
Q
V
 
T
M
 
W
G
 
R
F
 
F
K
 
P
V
 
L
I
 
R
G
 
C
W
|
W
S
|
S
R
|
R
S
x
T
K
 
R
R
x
K
A
 
S
V
 
W
E
 
P
G
 
G
I
 
V
E
 
Q
T
 
S
F
 
F
D
 
A
A
 
G
-
 
R
A
 
E
G
 
E
L
 
L
D
 
S
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
S
R
 
Q
T
 
C
D
 
R
F
 
V
L
 
L
V
 
I
G
 
N
L
 
L
L
|
L
P
|
P
L
 
N
T
 
T
A
 
P
D
 
E
T
 
T
K
 
V
G
 
G
I
 
I
F
 
I
N
 
N
A
 
Q
T
 
Q
L
 
L
F
 
L
K
 
E
K
 
K
L
 
L
S
 
-
R
 
-
K
 
-
G
 
-
P
 
P
F
 
D
G
 
G
A
 
A
P
 
-
V
 
Y
F
 
L
I
 
L
N
 
N
A
x
L
G
x
A
R
|
R
G
 
G
G
 
V
S
 
H
Q
 
V
V
 
V
E
 
E
A
 
D
D
 
D
I
 
L
L
 
L
E
 
A
C
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
S
G
 
G
V
 
K
L
 
V
G
 
K
G
 
G
A
 
A
S
 
M
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
N
K
 
R
E
 
E
P
 
P
L
 
L
S
 
P
R
 
P
E
 
E
S
 
S
R
 
P
F
 
L
W
 
W
D
 
Q
I
 
H
P
 
P
N
 
R
V
 
V
Y
 
T
V
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
V
A
 
A
A
|
A
S
 
I
S
 
T
D
 
R
V
 
P
K
 
A
A
 
E
L
 
A
F
 
V
A
 
E
H
 
Y
V
 
I
E
 
S
E
 
R
Q
 
T
I
 
I
E
 
A
R
 
Q
F
 
L
E
 
E
S
 
K
G
 
G
L
 
E
A
 
K
L
 
V
E
 
C
H
 
G
V
 
Q
V
 
V
D
 
D
K
 
R
V
 
A
A
 
R
G
 
G
Y
|
Y

4zqbB Crystal structure of NADP-dependent dehydrogenase from rhodobactersphaeroides in complex with NADP and sulfate
35% identity, 86% coverage: 47:319/319 of query aligns to 48:316/316 of 4zqbB

query
sites
4zqbB
I
 
V
D
 
D
Y
 
I
A
 
A
V
 
I
V
 
V
W
 
A
K
 
N
S
 
P
A
 
D
P
 
P
D
 
A
L
 
D
F
 
L
S
 
A
R
 
E
A
 
L
P
 
P
D
 
N
L
 
L
K
 
V
V
 
W
V
 
I
F
 
H
S
 
S
G
 
L
G
 
W
A
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
E
H
 
R
V
 
L
L
 
V
K
 
A
L
 
E
P
 
L
G
 
G
L
 
H
P
 
L
D
 
A
V
 
R
P
 
P
L
 
I
V
 
V
R
|
R
F
 
L
V
 
V
D
 
D
R
 
P
T
 
E
L
|
L
T
 
A
T
 
R
R
 
T
M
|
M
S
 
A
E
 
E
W
 
A
V
 
A
V
 
L
M
 
A
Q
 
W
C
 
T
L
 
Y
L
 
Y
H
 
L
L
 
F
R
 
R
Q
 
D
H
 
M
R
 
P
A
 
A
Y
 
Y
E
 
A
A
 
A
L
 
Q
V
 
Q
K
 
R
K
 
A
H
 
R
E
 
V
W
 
W
R
 
K
D
 
G
L
 
L
S
 
P
Q
 
Y
P
 
K
E
 
R
A
 
P
A
 
E
D
 
R
I
 
T
T
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
V
M
 
L
G
|
G
M
x
L
G
|
G
V
x
E
L
|
L
G
 
G
Q
 
A
D
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
L
K
 
R
L
 
L
A
 
R
V
 
D
M
 
A
G
 
G
F
 
F
K
 
D
V
 
V
I
 
H
G
 
G
W
|
W
S
|
S
R
|
R
S
|
S
K
 
P
R
x
K
A
 
E
V
 
I
E
 
A
G
 
G
I
 
V
E
 
T
T
 
C
F
 
H
D
 
A
A
 
G
-
 
E
A
 
E
G
 
T
L
 
L
D
 
E
A
 
R
F
 
M
L
 
L
A
 
G
R
 
Q
T
 
V
D
 
E
F
 
I
L
 
L
V
 
V
G
 
C
L
 
L
L
|
L
P
|
P
L
 
L
T
 
T
A
 
G
D
 
E
T
 
T
K
 
R
G
 
G
I
 
L
F
 
L
N
 
D
A
 
A
T
 
R
L
 
R
F
 
L
K
 
A
K
 
C
L
 
L
S
 
-
R
 
-
K
 
-
G
 
-
P
 
P
F
 
E
G
 
G
A
 
A
P
 
Q
V
 
I
F
 
-
I
 
V
N
 
N
A
x
F
G
 
A
R
|
R
G
 
G
G
 
P
S
 
I
Q
 
L
V
 
D
E
 
S
A
 
A
D
 
A
I
 
L
L
 
I
E
 
E
C
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
S
G
 
G
V
 
R
L
 
I
G
 
G
G
 
H
A
 
A
S
 
V
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
K
 
V
E
|
E
P
 
P
L
 
L
S
 
P
R
 
E
E
 
A
S
 
S
R
 
P
F
 
F
W
 
W
D
 
G
I
 
H
P
 
P
N
 
K
V
 
V
Y
 
T
V
 
V
T
 
L
P
 
P
H
|
H
V
 
I
A
x
S
A
|
A
S
 
A
S
 
T
D
 
D
V
 
P
K
 
E
A
 
T
L
 
A
F
 
S
A
 
A
H
 
I
V
 
V
E
 
G
E
 
A
Q
 
H
I
 
V
E
 
A
R
 
D
F
 
Y
E
 
R
S
 
A
G
 
T
L
 
G
A
 
R
L
 
I
E
 
P
H
 
P
V
 
S
V
 
V
D
 
D
K
 
L
V
 
T
A
 
R
G
 
G
Y
|
Y

5mhaB D-2-hydroxyacid dehydrogenases (d2-hdh) from haloferax mediterranei in complex with a mixture of 2-ketohexanoic acid and 2-hydroxyhexanoic acid, and NADPH (1.57 a resolution)
33% identity, 67% coverage: 100:313/319 of query aligns to 93:307/308 of 5mhaB

query
sites
5mhaB
T
 
T
R
 
T
M
 
V
S
 
G
E
 
E
W
 
T
V
 
V
V
 
A
M
 
G
Q
 
Y
C
 
M
L
 
L
L
 
T
H
 
F
L
 
A
R
 
R
Q
 
R
H
 
L
R
 
H
A
 
A
Y
 
Y
E
 
R
A
 
D
L
 
A
V
 
Q
K
 
H
K
 
D
H
 
H
E
 
A
W
 
W
R
 
-
D
 
D
L
 
L
S
 
P
Q
 
R
P
 
Y
E
 
E
A
 
E
-
 
P
-
 
F
-
 
T
-
 
L
A
 
A
D
 
G
I
 
E
T
 
R
V
 
V
G
 
C
I
 
V
M
 
V
G
 
G
M
x
L
G
|
G
V
x
T
L
|
L
G
 
G
Q
 
R
D
 
G
A
 
V
A
 
V
R
 
D
K
 
R
L
 
A
A
 
A
V
 
A
M
 
L
G
 
G
F
 
M
K
 
E
V
 
V
I
 
V
G
 
G
W
 
V
S
x
R
R
|
R
S
|
S
K
 
G
R
 
D
A
 
P
V
 
V
E
 
D
G
 
N
I
 
V
E
 
S
T
 
T
-
 
V
F
 
Y
D
 
T
A
x
P
A
 
D
G
 
R
L
 
L
D
 
H
A
 
E
F
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
D
T
 
A
D
 
R
F
 
F
L
 
V
V
 
V
G
 
L
L
 
A
L
x
T
P
|
P
L
 
L
T
 
T
A
 
D
D
 
E
T
|
T
K
 
E
G
 
G
I
 
M
F
 
V
N
 
A
A
 
A
T
 
P
L
 
E
F
|
F
K
x
E
K
 
T
L
x
M
S
 
R
R
 
E
K
 
D
G
 
A
P
 
S
F
 
L
G
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
F
 
-
I
 
V
N
 
N
A
x
V
G
x
A
R
|
R
G
 
G
G
 
P
S
 
V
Q
 
V
V
 
V
E
 
E
A
 
S
D
 
D
I
 
L
L
 
V
E
 
A
C
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
S
G
 
G
V
x
D
L
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
S
K
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
L
S
 
P
R
 
E
E
 
D
S
 
S
R
 
P
F
 
L
W
 
W
D
 
D
I
 
F
P
 
E
N
 
D
V
 
V
Y
 
L
V
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
V
A
x
S
A
 
A
S
 
A
S
 
T
-
 
S
-
 
K
-
x
Y
-
 
H
-
 
E
D
 
D
V
 
V
K
 
A
A
 
A
L
 
L
F
 
-
A
 
-
H
 
-
V
 
I
E
 
R
E
 
E
Q
 
N
I
 
I
E
 
E
R
 
K
F
 
I
E
 
A
S
 
T
G
 
G
L
 
D
A
 
E
L
 
L
E
 
T
H
 
N
V
 
R
V
 
V

Sites not aligning to the query:

5mhaA D-2-hydroxyacid dehydrogenases (d2-hdh) from haloferax mediterranei in complex with a mixture of 2-ketohexanoic acid and 2-hydroxyhexanoic acid, and NADPH (1.57 a resolution)
33% identity, 67% coverage: 100:313/319 of query aligns to 93:307/308 of 5mhaA

query
sites
5mhaA
T
 
T
R
 
T
M
 
V
S
 
G
E
 
E
W
 
T
V
 
V
V
 
A
M
 
G
Q
 
Y
C
 
M
L
 
L
L
 
T
H
 
F
L
 
A
R
 
R
Q
 
R
H
 
L
R
 
H
A
 
A
Y
 
Y
E
 
R
A
 
D
L
 
A
V
 
Q
K
 
H
K
 
D
H
 
H
E
 
A
W
 
W
R
 
-
D
 
D
L
 
L
S
 
P
Q
 
R
P
 
Y
E
 
E
A
 
E
-
 
P
-
 
F
-
x
T
-
 
L
A
|
A
D
 
G
I
 
E
T
 
R
V
 
V
G
 
C
I
 
V
M
 
V
G
 
G
M
x
L
G
|
G
V
x
T
L
|
L
G
 
G
Q
 
R
D
 
G
A
 
V
A
 
V
R
 
D
K
 
R
L
 
A
A
 
A
V
 
A
M
 
L
G
 
G
F
 
M
K
 
E
V
 
V
I
 
V
G
 
G
W
 
V
S
x
R
R
|
R
S
|
S
K
 
G
R
 
D
A
 
P
V
 
V
E
 
D
G
 
N
I
 
V
E
 
S
T
 
T
-
 
V
F
 
Y
D
 
T
A
x
P
A
 
D
G
 
R
L
 
L
D
 
H
A
 
E
F
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
D
T
 
A
D
 
R
F
 
F
L
 
V
V
 
V
G
 
L
L
 
A
L
x
T
P
|
P
L
 
L
T
 
T
A
 
D
D
 
E
T
|
T
K
 
E
G
 
G
I
 
M
F
 
V
N
 
A
A
 
A
T
 
P
L
 
E
F
 
F
K
 
E
K
 
T
L
 
M
S
 
R
R
 
E
K
 
D
G
 
A
P
 
S
F
 
L
G
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
F
 
-
I
 
V
N
 
N
A
x
V
G
x
A
R
|
R
G
 
G
G
 
P
S
 
V
Q
 
V
V
 
V
E
 
E
A
 
S
D
 
D
I
 
L
L
 
V
E
 
A
C
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
S
G
 
G
V
 
D
L
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
S
K
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
L
S
 
P
R
 
E
E
 
D
S
 
S
R
 
P
F
 
L
W
 
W
D
 
D
I
 
F
P
 
E
N
 
D
V
 
V
Y
 
L
V
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
V
A
x
S
A
 
A
S
 
A
S
 
T
-
 
S
-
 
K
-
x
Y
-
 
H
-
 
E
D
 
D
V
 
V
K
 
A
A
 
A
L
 
L
F
 
-
A
 
-
H
 
-
V
 
I
E
 
R
E
 
E
Q
 
N
I
 
I
E
 
E
R
 
K
F
 
I
E
 
A
S
 
T
G
 
G
L
 
D
A
 
E
L
 
L
E
 
T
H
 
N
V
 
R
V
 
V

Sites not aligning to the query:

5mh5A D-2-hydroxyacid dehydrogenases (d2-hdh) from haloferax mediterranei in complex with 2-keto-hexanoic acid and NADP+ (1.4 a resolution)
33% identity, 67% coverage: 100:313/319 of query aligns to 93:307/308 of 5mh5A

query
sites
5mh5A
T
 
T
R
 
T
M
 
V
S
 
G
E
 
E
W
 
T
V
 
V
V
 
A
M
 
G
Q
 
Y
C
 
M
L
 
L
L
 
T
H
 
F
L
 
A
R
 
R
Q
 
R
H
 
L
R
 
H
A
 
A
Y
 
Y
E
 
R
A
 
D
L
 
A
V
 
Q
K
 
H
K
 
D
H
 
H
E
 
A
W
 
W
R
 
-
D
 
D
L
 
L
S
 
P
Q
 
R
P
 
Y
E
 
E
A
 
E
-
 
P
-
 
F
-
x
T
-
 
L
A
|
A
D
 
G
I
 
E
T
 
R
V
 
V
G
 
C
I
 
V
M
 
V
G
|
G
M
x
L
G
|
G
V
x
T
L
|
L
G
 
G
Q
 
R
D
 
G
A
 
V
A
 
V
R
 
D
K
 
R
L
 
A
A
 
A
V
 
A
M
 
L
G
 
G
F
 
M
K
 
E
V
 
V
I
 
V
G
 
G
W
 
V
S
x
R
R
|
R
S
|
S
K
 
G
R
 
D
A
 
P
V
 
V
E
 
D
G
 
N
I
 
V
E
 
S
T
 
T
-
 
V
F
 
Y
D
 
T
A
 
P
A
 
D
G
 
R
L
 
L
D
 
H
A
 
E
F
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
D
T
 
A
D
 
R
F
 
F
L
 
V
V
 
V
G
 
L
L
 
A
L
x
T
P
|
P
L
 
L
T
 
T
A
 
D
D
 
E
T
|
T
K
 
E
G
 
G
I
 
M
F
 
V
N
 
A
A
 
A
T
 
P
L
 
E
F
|
F
K
x
E
K
 
T
L
x
M
S
 
R
R
 
E
K
 
D
G
 
A
P
 
S
F
 
L
G
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
F
 
-
I
 
V
N
 
N
A
x
V
G
x
A
R
|
R
G
 
G
G
 
P
S
 
V
Q
 
V
V
 
V
E
 
E
A
 
S
D
 
D
I
 
L
L
 
V
E
 
A
C
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
S
G
 
G
V
x
D
L
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
S
K
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
L
S
 
P
R
 
E
E
 
D
S
 
S
R
 
P
F
 
L
W
 
W
D
 
D
I
 
F
P
 
E
N
 
D
V
 
V
Y
 
L
V
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
V
A
x
S
A
 
A
S
 
A
S
 
T
-
 
S
-
 
K
-
x
Y
-
 
H
-
 
E
D
 
D
V
 
V
K
 
A
A
 
A
L
 
L
F
 
-
A
 
-
H
 
-
V
 
I
E
 
R
E
 
E
Q
 
N
I
 
I
E
 
E
R
 
K
F
 
I
E
 
A
S
 
T
G
 
G
L
 
D
A
 
E
L
 
L
E
 
T
H
 
N
V
 
R
V
 
V

Sites not aligning to the query:

5mh6A D-2-hydroxyacid dehydrogenases (d2-hdh) from haloferax mediterranei in complex with 2-ketohexanoic acid and NAD+ (1.35 a resolution)
33% identity, 67% coverage: 100:313/319 of query aligns to 91:305/306 of 5mh6A

query
sites
5mh6A
T
 
T
R
 
T
M
 
V
S
 
G
E
 
E
W
 
T
V
 
V
V
 
A
M
 
G
Q
 
Y
C
 
M
L
 
L
L
 
T
H
 
F
L
 
A
R
 
R
Q
 
R
H
 
L
R
 
H
A
 
A
Y
 
Y
E
 
R
A
 
D
L
 
A
V
 
Q
K
 
H
K
 
D
H
 
H
E
 
A
W
 
W
R
 
-
D
 
D
L
 
L
S
 
P
Q
 
R
P
 
Y
E
 
E
A
 
E
-
 
P
-
 
F
-
x
T
-
 
L
A
|
A
D
 
G
I
 
E
T
 
R
V
 
V
G
 
C
I
 
V
M
 
V
G
 
G
M
 
L
G
|
G
V
x
T
L
|
L
G
 
G
Q
 
R
D
 
G
A
 
V
A
 
V
R
 
D
K
 
R
L
 
A
A
 
A
V
 
A
M
 
L
G
 
G
F
 
M
K
 
E
V
 
V
I
 
V
G
 
G
W
 
V
S
 
R
R
|
R
S
 
S
K
 
G
R
 
D
A
 
P
V
 
V
E
 
D
G
 
N
I
 
V
E
 
S
T
 
T
-
 
V
F
 
Y
D
 
T
A
 
P
A
 
D
G
 
R
L
 
L
D
 
H
A
 
E
F
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
D
T
 
A
D
 
R
F
 
F
L
 
V
V
 
V
G
 
L
L
 
A
L
 
T
P
|
P
L
 
L
T
 
T
A
 
D
D
 
E
T
|
T
K
 
E
G
 
G
I
 
M
F
 
V
N
 
A
A
 
A
T
 
P
L
 
E
F
|
F
K
x
E
K
 
T
L
x
M
S
 
R
R
 
E
K
 
D
G
 
A
P
 
S
F
 
L
G
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
F
 
-
I
 
V
N
 
N
A
x
V
G
x
A
R
|
R
G
|
G
G
x
P
S
 
V
Q
x
V
V
 
V
E
|
E
A
 
S
D
 
D
I
 
L
L
 
V
E
 
A
C
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
S
G
 
G
V
x
D
L
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
x
S
K
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
L
S
 
P
R
 
E
E
 
D
S
 
S
R
 
P
F
 
L
W
 
W
D
 
D
I
 
F
P
 
E
N
 
D
V
 
V
Y
 
L
V
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
V
A
x
S
A
 
A
S
 
A
S
 
T
-
 
S
-
 
K
-
x
Y
-
 
H
-
 
E
D
 
D
V
 
V
K
 
A
A
 
A
L
 
L
F
 
-
A
 
-
H
 
-
V
 
I
E
 
R
E
 
E
Q
 
N
I
 
I
E
 
E
R
 
K
F
 
I
E
 
A
S
 
T
G
 
G
L
 
D
A
 
E
L
 
L
E
 
T
H
 
N
V
 
R
V
 
V

Sites not aligning to the query:

3dc2A Crystal structure of serine bound d-3-phosphoglycerate dehydrogenase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
31% identity, 72% coverage: 58:287/319 of query aligns to 56:282/526 of 3dc2A

query
sites
3dc2A
D
 
E
L
 
V
F
 
L
S
 
A
R
 
A
A
 
A
P
 
P
D
 
K
L
 
L
K
 
K
V
 
I
V
 
V
F
 
A
S
 
R
G
 
A
G
 
G
A
 
V
G
 
G
V
 
L
D
 
D
H
 
N
V
 
V
L
 
D
K
 
V
L
 
D
P
 
A
G
 
A
L
 
T
P
 
A
D
 
R
V
 
G
P
 
V
L
 
L
V
 
V
R
 
V
F
 
N
V
 
A
D
 
P
R
 
T
T
 
S
L
x
N
T
 
I
T
 
H
R
 
S
M
 
A
S
 
A
E
 
E
W
 
H
V
 
A
V
 
L
M
 
A
Q
 
L
C
 
L
L
 
L
L
 
A
H
 
A
L
 
S
R
 
R
Q
 
Q
H
 
I
R
 
P
A
 
A
Y
 
A
E
 
D
A
 
A
L
 
S
V
 
L
K
 
R
K
 
E
H
 
H
E
 
T
W
 
W
R
 
K
-
 
R
-
 
S
D
 
S
L
 
F
S
 
S
Q
 
G
P
 
T
E
 
E
A
 
I
A
 
F
D
 
G
I
 
K
T
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
V
M
 
V
G
 
G
M
 
L
G
 
G
V
 
R
L
 
I
G
 
G
Q
 
Q
D
 
L
A
 
V
A
 
A
R
 
Q
K
 
R
L
 
I
A
 
A
V
 
A
M
 
F
G
 
G
F
 
A
K
 
Y
V
 
V
I
 
V
G
 
A
W
 
Y
-
 
D
-
 
P
-
 
Y
-
 
V
S
 
S
R
 
P
S
 
A
K
 
R
R
 
A
A
 
A
V
 
Q
E
 
L
G
 
G
I
 
I
E
 
E
T
 
L
F
 
L
D
 
S
A
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
L
D
 
D
A
 
D
F
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
R
T
 
A
D
 
D
F
 
F
L
 
I
V
 
S
G
 
V
L
 
H
L
 
L
P
 
P
L
 
K
T
 
T
A
 
P
D
 
E
T
 
T
K
 
A
G
 
G
I
 
L
F
 
I
N
 
D
A
 
K
T
 
-
L
 
-
F
 
-
K
 
E
K
 
A
L
 
L
S
 
A
R
 
K
K
 
T
G
 
K
P
 
P
F
 
-
G
 
-
A
 
G
P
 
V
V
 
I
F
 
I
I
 
V
N
 
N
A
 
A
G
 
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
S
 
L
Q
 
V
V
 
D
E
 
E
A
 
A
D
 
A
I
 
L
L
 
A
E
 
D
C
 
A
L
 
I
D
 
T
S
 
G
G
 
G
V
 
H
L
 
V
G
 
R
G
 
A
A
 
A
S
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
A
K
 
T
E
|
E
P
 
P
L
 
C
S
 
T
R
 
-
E
 
D
S
 
S
R
 
P
F
 
L
W
 
F
D
 
E
I
 
L
P
 
A
N
 
Q
V
 
V
Y
 
V
V
 
V
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
L
A
 
G
A
 
A
S
 
S
S
 
T

Sites not aligning to the query:

3ddnB Crystal structure of hydroxypyruvic acid phosphate bound d-3- phosphoglycerate dehydrogenase in mycobacterium tuberculosis (see paper)
31% identity, 72% coverage: 58:287/319 of query aligns to 57:283/525 of 3ddnB

query
sites
3ddnB
D
 
E
L
 
V
F
 
L
S
 
A
R
 
A
A
 
A
P
 
P
D
 
K
L
 
L
K
 
K
V
 
I
V
 
V
F
 
A
S
x
R
G
 
A
G
 
G
A
x
V
G
 
G
V
 
L
D
 
D
H
 
N
V
 
V
L
 
D
K
 
V
L
 
D
P
 
A
G
 
A
L
 
T
P
 
A
D
 
R
V
 
G
P
 
V
L
 
L
V
 
V
R
 
V
F
 
N
V
 
A
D
 
P
R
 
T
T
 
S
L
x
N
T
 
I
T
 
H
R
 
S
M
 
A
S
 
A
E
 
E
W
 
H
V
 
A
V
 
L
M
 
A
Q
 
L
C
 
L
L
 
L
L
 
A
H
 
A
L
 
S
R
 
R
Q
 
Q
H
 
I
R
 
P
A
 
A
Y
 
A
E
 
D
A
 
A
L
 
S
V
 
L
K
 
R
K
 
E
H
 
H
E
 
T
W
 
W
R
 
K
-
 
R
-
 
S
D
 
S
L
 
F
S
 
S
Q
 
G
P
 
T
E
 
E
A
 
I
A
 
F
D
 
G
I
 
K
T
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
V
M
 
V
G
 
G
M
 
L
G
 
G
V
 
R
L
 
I
G
 
G
Q
 
Q
D
 
L
A
 
V
A
 
A
R
 
Q
K
 
R
L
 
I
A
 
A
V
 
A
M
 
F
G
 
G
F
 
A
K
 
Y
V
 
V
I
 
V
G
 
A
W
 
Y
-
 
D
-
 
P
-
 
Y
-
 
V
S
 
S
R
 
P
S
 
A
K
 
R
R
 
A
A
 
A
V
 
Q
E
 
L
G
 
G
I
 
I
E
 
E
T
 
L
F
 
L
D
 
S
A
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
L
D
 
D
A
 
D
F
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
R
T
 
A
D
 
D
F
 
F
L
 
I
V
 
S
G
 
V
L
 
H
L
 
L
P
 
P
L
 
K
T
 
T
A
 
P
D
 
E
T
 
T
K
 
A
G
 
G
I
 
L
F
 
I
N
 
D
A
 
K
T
 
-
L
 
-
F
 
-
K
 
E
K
 
A
L
 
L
S
 
A
R
 
K
K
 
T
G
 
K
P
 
P
F
 
-
G
 
-
A
 
G
P
 
V
V
 
I
F
 
I
I
 
V
N
 
N
A
 
A
G
 
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
S
 
L
Q
 
V
V
 
D
E
 
E
A
 
A
D
 
A
I
 
L
L
 
A
E
 
D
C
 
A
L
 
I
D
 
T
S
 
G
G
 
G
V
 
H
L
 
V
G
 
R
G
 
A
A
 
A
S
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
A
K
 
T
E
|
E
P
 
P
L
 
C
S
 
T
R
 
-
E
 
D
S
 
S
R
 
P
F
 
L
W
 
F
D
 
E
I
 
L
P
 
A
N
 
Q
V
 
V
Y
 
V
V
 
V
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
L
A
 
G
A
|
A
S
 
S
S
 
T

Sites not aligning to the query:

5j23A Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with 2'-phospho-adp-ribose (see paper)
31% identity, 86% coverage: 42:315/319 of query aligns to 40:311/318 of 5j23A

query
sites
5j23A
R
 
R
D
 
D
L
 
V
S
 
S
G
 
G
I
 
I
D
 
-
Y
 
-
A
 
A
V
 
V
V
 
S
W
 
G
K
 
K
S
 
L
A
 
P
P
 
V
D
 
P
L
 
L
F
 
M
S
 
D
R
 
A
A
 
F
P
 
P
D
 
S
L
 
L
K
 
E
V
 
I
V
 
V
F
 
A
S
 
N
G
 
F
G
 
G
A
x
V
G
 
G
V
 
Y
D
 
D
H
 
G
V
 
V
-
 
D
-
 
V
-
 
S
-
 
R
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
R
-
 
G
L
 
I
K
 
V
L
 
V
P
 
T
G
 
N
L
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
P
 
-
L
 
-
V
 
-
R
 
-
F
 
-
V
 
-
D
 
-
R
 
-
T
 
-
L
|
L
T
 
T
T
 
E
R
 
E
M
 
V
S
 
A
E
 
D
W
 
T
V
 
A
V
 
I
M
 
G
Q
 
L
C
 
L
L
 
L
L
 
N
H
 
T
L
 
L
R
 
R
Q
 
L
H
 
L
R
 
P
A
 
Q
Y
 
A
E
 
E
A
 
Q
L
 
W
V
 
L
K
 
R
K
 
Q
H
 
G
E
 
R
W
 
W
-
 
V
R
 
R
D
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
F
-
 
P
L
 
L
S
 
S
Q
 
P
P
 
L
E
 
S
A
 
L
A
 
R
D
 
G
I
 
R
T
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
L
M
 
F
G
 
G
M
x
L
G
|
G
V
x
R
L
x
I
G
 
G
Q
 
L
D
 
A
A
 
I
A
 
A
R
 
R
K
 
R
L
 
L
A
 
E
V
 
A
M
 
F
G
 
G
F
 
V
K
 
S
V
 
I
I
 
A
G
 
Y
W
 
H
S
x
T
R
|
R
S
 
T
K
 
P
R
 
R
A
 
-
V
 
-
E
 
E
G
 
G
I
 
L
E
 
G
T
 
F
F
 
T
D
 
Y
A
 
H
A
 
P
G
 
T
L
 
L
D
 
V
A
 
G
F
 
M
L
 
A
A
 
E
R
 
A
T
 
V
D
 
D
F
 
T
L
 
L
V
 
I
G
 
V
L
 
I
L
 
V
P
|
P
L
 
G
T
 
T
A
 
A
D
x
S
T
|
T
K
 
L
G
 
K
I
 
A
F
 
V
N
 
N
A
 
A
T
 
D
L
 
V
F
 
L
K
 
S
K
 
A
L
 
L
S
 
G
R
 
P
K
 
K
G
 
G
P
 
-
F
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
V
F
 
L
I
 
I
N
 
N
A
 
V
G
 
G
R
|
R
G
 
G
G
 
S
S
 
T
Q
 
V
V
 
D
E
 
E
A
 
A
D
 
A
I
 
L
L
 
V
E
 
T
C
 
A
L
 
L
D
 
Q
S
 
N
G
 
G
V
 
T
L
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
K
 
N
E
|
E
P
 
P
L
 
N
S
 
V
R
 
P
E
 
E
S
 
A
R
 
-
F
 
L
W
 
L
D
 
S
I
 
F
P
 
P
N
 
N
V
 
V
Y
 
S
V
 
L
T
 
L
P
 
P
H
|
H
V
 
V
A
 
A
A
 
S
S
 
A
S
 
S
D
 
V
V
 
V
-
 
T
-
 
R
K
 
N
A
 
A
L
 
M
F
 
S
A
 
D
H
 
L
V
 
V
E
 
V
E
 
D
Q
 
N
I
 
L
E
 
K
R
 
A
-
 
W
F
 
F
E
 
S
S
 
T
G
 
G
L
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
T
H
 
P
V
 
V
V
 
A
D
 
E
K
 
T

5v7gA Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with NADPH and oxalate (see paper)
31% identity, 86% coverage: 42:315/319 of query aligns to 40:311/317 of 5v7gA

query
sites
5v7gA
R
 
R
D
 
D
L
 
V
S
 
S
G
 
G
I
 
I
D
 
-
Y
 
-
A
 
A
V
 
V
V
 
S
W
 
G
K
 
K
S
 
L
A
 
P
P
 
V
D
 
P
L
 
L
F
 
M
S
 
D
R
 
A
A
 
F
P
 
P
D
 
S
L
 
L
K
 
E
V
 
I
V
 
V
F
 
A
S
 
N
G
 
F
G
|
G
A
x
V
G
|
G
V
 
Y
D
 
D
H
 
G
V
 
V
-
 
D
-
 
V
-
 
S
-
 
R
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
R
-
 
G
L
 
I
K
 
V
L
 
V
P
 
T
G
 
N
L
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
P
 
-
L
 
-
V
 
-
R
 
-
F
 
-
V
 
-
D
 
-
R
 
-
T
 
-
L
|
L
T
 
T
T
 
E
R
 
E
M
x
V
S
 
A
E
 
D
W
 
T
V
 
A
V
 
I
M
 
G
Q
 
L
C
 
L
L
 
L
L
 
N
H
 
T
L
 
L
R
 
R
Q
 
L
H
 
L
R
 
P
A
 
Q
Y
 
A
E
 
E
A
 
Q
L
 
W
V
 
L
K
 
R
K
 
Q
H
 
G
E
 
R
W
 
W
-
 
V
R
 
R
D
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
F
-
 
P
L
 
L
S
 
S
Q
 
P
P
 
L
E
 
S
A
 
L
A
 
R
D
 
G
I
 
R
T
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
L
M
x
F
G
 
G
M
x
L
G
|
G
V
x
R
L
x
I
G
 
G
Q
 
L
D
 
A
A
 
I
A
 
A
R
 
R
K
 
R
L
 
L
A
 
E
V
 
A
M
 
F
G
 
G
F
 
V
K
 
S
V
 
I
I
 
A
G
 
Y
W
 
H
S
x
T
R
|
R
S
 
T
K
 
P
R
 
R
A
 
-
V
 
-
E
 
E
G
 
G
I
 
L
E
 
G
T
 
F
F
 
T
D
 
Y
A
 
H
A
 
P
G
 
T
L
 
L
D
 
V
A
 
G
F
 
M
L
 
A
A
 
E
R
 
A
T
 
V
D
 
D
F
 
T
L
 
L
V
 
I
G
 
V
L
 
I
L
x
V
P
|
P
L
 
G
T
 
T
A
 
A
D
x
S
T
|
T
K
 
L
G
 
K
I
 
A
F
 
V
N
 
N
A
 
A
T
 
D
L
 
V
F
 
L
K
 
S
K
 
A
L
 
L
S
 
G
R
 
P
K
 
K
G
 
G
P
 
-
F
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
V
F
 
L
I
 
I
N
 
N
A
x
V
G
|
G
R
|
R
G
 
G
G
 
S
S
 
T
Q
 
V
V
 
D
E
 
E
A
 
A
D
 
A
I
 
L
L
 
V
E
 
T
C
 
A
L
 
L
D
 
Q
S
 
N
G
 
G
V
 
T
L
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
K
 
N
E
|
E
P
 
P
L
 
N
S
 
V
R
 
P
E
 
E
S
 
A
R
 
-
F
 
L
W
 
L
D
 
S
I
 
F
P
 
P
N
 
N
V
 
V
Y
 
S
V
 
L
T
 
L
P
 
P
H
|
H
V
 
V
A
|
A
A
 
S
S
 
A
S
 
S
D
 
V
V
 
V
-
 
T
-
 
R
K
 
N
A
 
A
L
 
M
F
 
S
A
 
D
H
 
L
V
 
V
E
 
V
E
 
D
Q
 
N
I
 
L
E
 
K
R
 
A
-
 
W
F
 
F
E
 
S
S
 
T
G
 
G
L
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
T
H
 
P
V
 
V
V
 
A
D
 
E
K
 
T

5v7nA Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with NADP and 2-keto-d-gluconic acid (see paper)
31% identity, 86% coverage: 42:315/319 of query aligns to 41:312/319 of 5v7nA

query
sites
5v7nA
R
 
R
D
 
D
L
 
V
S
 
S
G
 
G
I
 
I
D
 
-
Y
 
-
A
 
A
V
 
V
V
 
S
W
 
G
K
 
K
S
 
L
A
 
P
P
 
V
D
 
P
L
 
L
F
 
M
S
 
D
R
 
A
A
 
F
P
 
P
D
 
S
L
 
L
K
 
E
V
 
I
V
 
V
F
 
A
S
 
N
G
 
F
G
|
G
A
x
V
G
|
G
V
 
Y
D
 
D
H
 
G
V
 
V
-
 
D
-
 
V
-
 
S
-
 
R
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
R
-
 
G
L
 
I
K
 
V
L
 
V
P
 
T
G
 
N
L
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
P
 
-
L
 
-
V
 
-
R
 
-
F
 
-
V
 
-
D
 
-
R
 
-
T
 
-
L
|
L
T
 
T
T
 
E
R
 
E
M
x
V
S
 
A
E
 
D
W
 
T
V
 
A
V
 
I
M
 
G
Q
 
L
C
 
L
L
 
L
L
 
N
H
 
T
L
 
L
R
 
R
Q
 
L
H
 
L
R
 
P
A
 
Q
Y
 
A
E
 
E
A
 
Q
L
 
W
V
 
L
K
 
R
K
 
Q
H
 
G
E
 
R
W
 
W
-
 
V
R
 
R
D
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
F
-
 
P
L
 
L
S
 
S
Q
 
P
P
 
L
E
 
S
A
 
L
A
 
R
D
 
G
I
 
R
T
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
L
M
 
F
G
 
G
M
x
L
G
|
G
V
x
R
L
x
I
G
 
G
Q
 
L
D
 
A
A
 
I
A
 
A
R
 
R
K
 
R
L
 
L
A
 
E
V
 
A
M
 
F
G
 
G
F
 
V
K
 
S
V
 
I
I
 
A
G
 
Y
W
 
H
S
x
T
R
|
R
S
 
T
K
 
P
R
 
R
A
 
-
V
 
-
E
 
E
G
 
G
I
 
L
E
 
G
T
 
F
F
 
T
D
 
Y
A
 
H
A
 
P
G
 
T
L
 
L
D
 
V
A
 
G
F
 
M
L
 
A
A
 
E
R
 
A
T
 
V
D
 
D
F
 
T
L
 
L
V
 
I
G
 
V
L
 
I
L
x
V
P
|
P
L
 
G
T
 
T
A
 
A
D
x
S
T
|
T
K
 
L
G
 
K
I
 
A
F
 
V
N
 
N
A
 
A
T
 
D
L
 
V
F
 
L
K
 
S
K
 
A
L
 
L
S
 
G
R
 
P
K
 
K
G
 
G
P
 
-
F
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
V
F
 
L
I
 
I
N
 
N
A
x
V
G
|
G
R
|
R
G
 
G
G
 
S
S
 
T
Q
 
V
V
 
D
E
 
E
A
 
A
D
 
A
I
 
L
L
 
V
E
 
T
C
 
A
L
 
L
D
 
Q
S
 
N
G
 
G
V
 
T
L
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
K
 
N
E
|
E
P
 
P
L
 
N
S
 
V
R
 
P
E
 
E
S
 
A
R
 
-
F
 
L
W
 
L
D
 
S
I
 
F
P
 
P
N
 
N
V
 
V
Y
 
S
V
 
L
T
 
L
P
 
P
H
|
H
V
 
V
A
|
A
A
x
S
S
 
A
S
 
S
D
 
V
V
 
V
-
 
T
-
x
R
K
 
N
A
 
A
L
 
M
F
 
S
A
 
D
H
 
L
V
 
V
E
 
V
E
 
D
Q
 
N
I
 
L
E
 
K
R
 
A
-
 
W
F
 
F
E
 
S
S
 
T
G
 
G
L
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
T
H
 
P
V
 
V
V
 
A
D
 
E
K
 
T

Query Sequence

>WP_012709948.1 NCBI__GCF_000018545.1:WP_012709948.1
MPAKSPVIVDLKFIPEEVDAALNGAFPGREVINLADPVHKGRDLSGIDYAVVWKSAPDLF
SRAPDLKVVFSGGAGVDHVLKLPGLPDVPLVRFVDRTLTTRMSEWVVMQCLLHLRQHRAY
EALVKKHEWRDLSQPEAADITVGIMGMGVLGQDAARKLAVMGFKVIGWSRSKRAVEGIET
FDAAGLDAFLARTDFLVGLLPLTADTKGIFNATLFKKLSRKGPFGAPVFINAGRGGSQVE
ADILECLDSGVLGGASLDVFEKEPLSRESRFWDIPNVYVTPHVAASSDVKALFAHVEEQI
ERFESGLALEHVVDKVAGY

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory