SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012755652.1 NCBI__GCF_000023185.1:WP_012755652.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3bazA Structure of hydroxyphenylpyruvate reductase from coleus blumei in complex with NADP+ (see paper)
44% identity, 98% coverage: 5:314/315 of query aligns to 4:310/311 of 3bazA

query
sites
3bazA
V
 
V
I
 
L
V
 
M
A
 
M
Y
 
C
P
 
P
L
 
M
R
 
S
P
 
T
R
 
Y
Q
 
L
M
 
E
A
 
Q
M
 
E
L
 
L
E
 
D
E
 
K
T
 
R
Y
 
F
T
 
K
L
 
L
H
 
F
R
 
R
L
 
Y
D
 
-
L
 
W
A
 
T
K
 
Q
G
 
P
E
 
A
K
 
Q
R
 
R
D
 
D
A
 
F
L
 
L
L
 
A
R
 
L
Q
 
Q
A
 
A
G
 
E
P
 
S
I
 
I
A
 
-
S
 
R
A
 
A
L
 
V
V
 
V
C
 
G
N
 
N
G
 
S
H
 
N
V
 
A
T
 
G
I
 
A
D
 
D
E
 
A
A
 
E
L
 
L
L
 
I
S
 
D
K
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
K
L
 
L
K
 
E
L
 
I
A
 
V
A
 
S
C
 
S
S
 
F
S
 
S
A
x
V
G
 
G
Y
 
L
D
 
D
Q
 
K
M
 
V
D
 
D
V
 
L
E
 
I
A
 
K
M
 
C
T
 
E
R
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
V
K
 
R
L
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
T
S
 
P
E
 
D
V
 
V
L
|
L
C
 
T
D
 
D
D
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
D
M
 
L
A
 
A
L
 
I
L
 
G
L
 
L
M
 
I
L
 
L
A
 
A
A
 
V
R
 
L
R
 
R
R
 
R
L
 
I
P
 
C
E
 
E
G
 
C
D
 
D
R
 
K
Y
 
Y
V
 
V
R
 
R
S
 
R
G
 
G
D
 
A
W
 
W
G
 
-
Q
 
K
K
 
F
G
 
G
M
 
D
M
 
F
P
 
K
L
 
L
T
 
T
T
 
T
S
 
K
T
 
F
S
 
S
G
 
G
K
 
K
K
 
R
A
 
V
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
|
G
L
|
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
M
 
L
A
 
A
I
 
V
A
 
A
K
 
E
R
 
R
C
 
A
E
 
E
A
 
A
V
 
F
G
 
D
L
 
C
T
 
P
V
 
I
G
 
S
Y
 
Y
Y
 
F
G
x
S
R
|
R
T
x
S
K
 
K
K
 
K
D
 
P
G
 
N
N
 
T
D
 
N
F
 
Y
A
 
T
Y
 
Y
F
 
Y
D
 
G
T
 
S
P
 
V
A
 
V
K
 
E
L
 
L
A
 
A
D
 
S
W
 
N
A
 
S
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
V
V
 
V
A
 
A
T
x
C
P
|
P
G
 
L
G
 
T
P
 
P
S
 
E
T
|
T
E
 
T
G
 
H
L
 
I
I
 
I
S
 
N
A
 
R
D
 
E
V
 
V
L
 
I
N
 
D
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
T
 
K
G
 
G
S
 
V
F
 
L
I
 
I
N
 
N
I
|
I
A
x
G
R
|
R
G
 
G
T
 
P
V
 
H
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
E
L
 
L
I
 
V
K
 
S
A
 
A
L
 
L
Q
 
V
E
 
E
R
 
G
R
 
R
I
 
L
A
 
G
S
 
G
A
|
A
G
 
G
I
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
L
 
E
N
 
R
E
|
E
P
 
P
N
 
E
P
 
V
D
 
P
P
 
E
R
 
K
F
 
L
A
 
F
A
 
G
L
 
L
D
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
L
Y
 
L
P
 
P
H
|
H
H
 
V
A
x
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
E
 
V
E
 
E
T
 
T
R
 
R
D
 
K
R
 
V
M
 
M
A
 
A
Q
 
D
L
 
L
T
 
V
V
 
V
D
 
G
N
 
N
L
 
L
A
 
E
A
 
A
F
 
H
F
 
F
A
 
S
G
 
G
R
 
K
P
 
P
L
 
L
L
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V

Q65CJ7 Hydroxyphenylpyruvate reductase; HPPR; EC 1.1.1.237 from Plectranthus scutellarioides (Coleus) (Solenostemon scutellarioides) (see paper)
44% identity, 98% coverage: 5:314/315 of query aligns to 6:312/313 of Q65CJ7

query
sites
Q65CJ7
V
 
V
I
 
L
V
 
M
A
 
M
Y
 
C
P
 
P
L
 
M
R
 
S
P
 
T
R
 
Y
Q
 
L
M
 
E
A
 
Q
M
 
E
L
 
L
E
 
D
E
 
K
T
 
R
Y
 
F
T
 
K
L
 
L
H
 
F
R
 
R
L
 
Y
D
 
-
L
 
W
A
 
T
K
 
Q
G
 
P
E
 
A
K
 
Q
R
 
R
D
 
D
A
 
F
L
 
L
L
 
A
R
 
L
Q
 
Q
A
 
A
G
 
E
P
 
S
I
 
I
A
 
-
S
 
R
A
 
A
L
 
V
V
 
V
C
 
G
N
 
N
G
 
S
H
 
N
V
 
A
T
 
G
I
 
A
D
 
D
E
 
A
A
 
E
L
 
L
L
 
I
S
 
D
K
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
K
L
 
L
K
 
E
L
 
I
A
 
V
A
 
S
C
 
S
S
 
F
S
 
S
A
 
V
G
 
G
Y
 
L
D
 
D
Q
 
K
M
 
V
D
 
D
V
 
L
E
 
I
A
 
K
M
 
C
T
 
E
R
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
V
K
 
R
L
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
T
S
 
P
E
 
D
V
 
V
L
 
L
C
 
T
D
 
D
D
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
D
M
 
L
A
 
A
L
 
I
L
 
G
L
 
L
M
 
I
L
 
L
A
 
A
A
 
V
R
 
L
R
 
R
R
 
R
L
 
I
P
 
C
E
 
E
G
 
C
D
 
D
R
 
K
Y
 
Y
V
 
V
R
 
R
S
 
R
G
 
G
D
 
A
W
 
W
G
 
-
Q
 
K
K
 
F
G
 
G
M
 
D
M
 
F
P
 
K
L
 
L
T
 
T
T
 
T
S
 
K
T
 
F
S
 
S
G
 
G
K
 
K
K
 
R
A
 
V
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
 
G
L
|
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
M
 
L
A
 
A
I
 
V
A
 
A
K
 
E
R
 
R
C
 
A
E
 
E
A
 
A
V
 
F
G
 
D
L
 
C
T
 
P
V
 
I
G
 
S
Y
 
Y
Y
 
F
G
x
S
R
|
R
T
x
S
K
 
K
K
 
K
D
 
P
G
 
N
N
 
T
D
 
N
F
 
Y
A
 
T
Y
 
Y
F
 
Y
D
 
G
T
 
S
P
 
V
A
 
V
K
 
E
L
 
L
A
 
A
D
 
S
W
 
N
A
 
S
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
V
V
 
V
A
 
A
T
 
C
P
 
P
G
 
L
G
 
T
P
 
P
S
 
E
T
 
T
E
 
T
G
 
H
L
 
I
I
 
I
S
 
N
A
 
R
D
 
E
V
 
V
L
 
I
N
 
D
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
T
 
K
G
 
G
S
 
V
F
 
L
I
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
G
R
 
R
G
 
G
T
 
P
V
 
H
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
E
L
 
L
I
 
V
K
 
S
A
 
A
L
 
L
Q
 
V
E
 
E
R
 
G
R
 
R
I
 
L
A
 
G
S
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
L
 
E
N
 
R
E
 
E
P
 
P
N
 
E
P
 
V
D
 
P
P
 
E
R
 
K
F
 
L
A
 
F
A
 
G
L
 
L
D
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
L
Y
 
L
P
 
P
H
 
H
H
 
V
A
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
E
 
V
E
 
E
T
 
T
R
 
R
D
 
K
R
 
V
M
 
M
A
 
A
Q
 
D
L
 
L
T
 
V
V
 
V
D
 
G
N
 
N
L
 
L
A
 
E
A
 
A
F
 
H
F
 
F
A
 
S
G
 
G
R
 
K
P
 
P
L
 
L
L
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V

5v7nA Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with NADP and 2-keto-d-gluconic acid (see paper)
41% identity, 99% coverage: 2:314/315 of query aligns to 2:309/319 of 5v7nA

query
sites
5v7nA
K
 
R
P
 
P
D
 
R
V
 
I
I
 
L
V
 
V
A
 
P
Y
 
G
P
 
K
L
 
I
R
 
N
P
 
P
R
 
R
Q
 
V
M
 
L
A
 
E
M
 
R
L
 
L
E
 
P
E
 
E
T
 
M
Y
 
F
T
 
E
L
 
T
H
 
V
R
 
R
L
 
I
D
 
E
L
 
R
A
 
A
K
 
D
G
 
A
E
 
A
K
 
L
R
 
V
D
 
T
A
 
A
L
 
D
L
 
M
R
 
R
Q
 
D
A
 
V
G
 
-
P
 
-
I
 
-
A
 
-
S
 
S
A
 
G
L
 
I
V
 
A
C
 
V
N
 
S
G
 
G
H
 
K
V
 
L
T
 
P
I
 
V
D
 
P
E
 
-
A
 
-
L
 
L
L
 
M
S
 
D
K
 
A
L
 
F
P
 
P
A
 
S
L
 
L
K
 
E
L
 
I
A
 
V
A
 
A
C
 
N
S
 
F
S
x
G
A
x
V
G
|
G
Y
 
Y
D
 
D
Q
 
G
M
 
V
D
 
D
V
 
V
E
 
S
A
 
R
M
 
A
T
 
A
R
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
I
K
 
V
L
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
T
S
 
P
E
 
D
V
 
V
L
|
L
C
 
T
D
 
E
D
 
E
V
|
V
A
 
A
D
 
D
M
 
T
A
 
A
L
 
I
L
 
G
L
 
L
M
 
L
L
 
L
A
 
N
A
 
T
R
 
L
R
 
R
R
 
L
L
 
L
P
 
P
E
 
Q
G
 
A
D
 
E
R
 
Q
Y
 
W
V
 
L
R
 
R
S
 
Q
G
 
G
D
 
R
W
 
W
G
 
V
Q
 
R
K
 
E
G
 
G
M
 
A
M
 
F
P
 
P
L
 
L
T
 
S
-
 
P
T
 
L
S
 
S
T
 
L
S
 
R
G
 
G
K
 
R
K
 
T
A
 
V
G
 
G
I
 
L
V
 
F
G
 
G
L
|
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
M
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
R
R
 
R
C
 
L
E
 
E
A
 
A
V
 
F
G
 
G
L
 
V
T
 
S
V
 
I
G
 
A
Y
 
Y
Y
 
H
G
x
T
R
|
R
T
 
T
K
 
P
K
 
R
D
 
E
G
 
G
N
 
L
D
 
G
F
 
F
A
 
T
Y
 
Y
F
 
H
D
 
P
T
 
T
P
 
L
A
 
V
K
 
G
L
 
M
A
 
A
D
 
E
W
 
A
A
 
V
D
 
D
I
 
T
L
 
L
I
 
I
V
 
V
A
 
I
T
x
V
P
|
P
G
 
G
G
 
T
P
 
A
S
|
S
T
|
T
E
 
L
G
 
K
L
 
A
I
 
V
S
 
N
A
 
A
D
 
D
V
 
V
L
 
L
N
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
T
 
K
G
 
G
S
 
V
F
 
L
I
 
I
N
 
N
I
x
V
A
x
G
R
|
R
G
 
G
T
 
S
V
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
V
K
 
T
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
E
 
N
R
 
G
R
 
T
I
 
I
A
 
A
S
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
L
 
E
N
 
N
E
|
E
P
 
P
N
 
N
P
 
V
D
 
P
P
 
E
R
 
A
F
 
L
A
 
L
A
 
S
L
 
F
D
 
P
N
 
N
V
 
V
V
 
S
L
 
L
Y
 
L
P
 
P
H
|
H
H
 
V
A
|
A
S
|
S
G
 
A
T
 
S
E
 
V
E
 
V
T
 
T
R
|
R
D
 
N
R
 
A
M
 
M
A
 
S
Q
 
D
L
 
L
T
 
V
V
 
V
D
 
D
N
 
N
L
 
L
A
 
K
A
 
A
F
 
W
F
 
F
A
 
S
G
 
T
R
 
G
P
 
E
L
 
A
L
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V

5v7gA Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with NADPH and oxalate (see paper)
41% identity, 99% coverage: 2:314/315 of query aligns to 1:308/317 of 5v7gA

query
sites
5v7gA
K
 
R
P
 
P
D
 
R
V
 
I
I
 
L
V
 
V
A
 
P
Y
 
G
P
 
K
L
 
I
R
 
N
P
 
P
R
 
R
Q
 
V
M
 
L
A
 
E
M
 
R
L
 
L
E
 
P
E
 
E
T
 
M
Y
 
F
T
 
E
L
 
T
H
 
V
R
 
R
L
 
I
D
 
E
L
 
R
A
 
A
K
 
D
G
 
A
E
 
A
K
 
L
R
 
V
D
 
T
A
 
A
L
 
D
L
 
M
R
 
R
Q
 
D
A
 
V
G
 
-
P
 
-
I
 
-
A
 
-
S
 
S
A
 
G
L
 
I
V
 
A
C
 
V
N
 
S
G
 
G
H
 
K
V
 
L
T
 
P
I
 
V
D
 
P
E
 
-
A
 
-
L
 
L
L
 
M
S
 
D
K
 
A
L
 
F
P
 
P
A
 
S
L
 
L
K
 
E
L
 
I
A
 
V
A
 
A
C
 
N
S
 
F
S
x
G
A
x
V
G
|
G
Y
 
Y
D
 
D
Q
 
G
M
 
V
D
 
D
V
 
V
E
 
S
A
 
R
M
 
A
T
 
A
R
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
I
K
 
V
L
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
T
S
 
P
E
 
D
V
 
V
L
|
L
C
 
T
D
 
E
D
 
E
V
|
V
A
 
A
D
 
D
M
 
T
A
 
A
L
 
I
L
 
G
L
 
L
M
 
L
L
 
L
A
 
N
A
 
T
R
 
L
R
 
R
R
 
L
L
 
L
P
 
P
E
 
Q
G
 
A
D
 
E
R
 
Q
Y
 
W
V
 
L
R
 
R
S
 
Q
G
 
G
D
 
R
W
 
W
G
 
V
Q
 
R
K
 
E
G
 
G
M
 
A
M
 
F
P
 
P
L
 
L
T
 
S
-
 
P
T
 
L
S
 
S
T
 
L
S
 
R
G
 
G
K
 
R
K
 
T
A
 
V
G
 
G
I
 
L
V
x
F
G
 
G
L
|
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
M
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
R
R
 
R
C
 
L
E
 
E
A
 
A
V
 
F
G
 
G
L
 
V
T
 
S
V
 
I
G
 
A
Y
 
Y
Y
 
H
G
x
T
R
|
R
T
 
T
K
 
P
K
 
R
D
 
E
G
 
G
N
 
L
D
 
G
F
 
F
A
 
T
Y
 
Y
F
 
H
D
 
P
T
 
T
P
 
L
A
 
V
K
 
G
L
 
M
A
 
A
D
 
E
W
 
A
A
 
V
D
 
D
I
 
T
L
 
L
I
 
I
V
 
V
A
 
I
T
x
V
P
|
P
G
 
G
G
 
T
P
 
A
S
|
S
T
|
T
E
 
L
G
 
K
L
 
A
I
 
V
S
 
N
A
 
A
D
 
D
V
 
V
L
 
L
N
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
T
 
K
G
 
G
S
 
V
F
 
L
I
 
I
N
 
N
I
x
V
A
x
G
R
|
R
G
 
G
T
 
S
V
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
V
K
 
T
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
E
 
N
R
 
G
R
 
T
I
 
I
A
 
A
S
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
L
 
E
N
 
N
E
|
E
P
 
P
N
 
N
P
 
V
D
 
P
P
 
E
R
 
A
F
 
L
A
 
L
A
 
S
L
 
F
D
 
P
N
 
N
V
 
V
V
 
S
L
 
L
Y
 
L
P
 
P
H
|
H
H
 
V
A
|
A
S
 
S
G
 
A
T
 
S
E
 
V
E
 
V
T
 
T
R
 
R
D
 
N
R
 
A
M
 
M
A
 
S
Q
 
D
L
 
L
T
 
V
V
 
V
D
 
D
N
 
N
L
 
L
A
 
K
A
 
A
F
 
W
F
 
F
A
 
S
G
 
T
R
 
G
P
 
E
L
 
A
L
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V

5v6qB Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with NADP and malonate (see paper)
41% identity, 99% coverage: 2:314/315 of query aligns to 3:310/319 of 5v6qB

query
sites
5v6qB
K
 
R
P
 
P
D
 
R
V
 
I
I
 
L
V
 
V
A
 
P
Y
 
G
P
 
K
L
 
I
R
 
N
P
 
P
R
 
R
Q
 
V
M
 
L
A
 
E
M
 
R
L
 
L
E
 
P
E
 
E
T
 
M
Y
 
F
T
 
E
L
 
T
H
 
V
R
 
R
L
 
I
D
 
E
L
 
R
A
 
A
K
 
D
G
 
A
E
 
A
K
 
L
R
 
V
D
 
T
A
 
A
L
 
D
L
 
M
R
 
R
Q
 
D
A
 
V
G
 
-
P
 
-
I
 
-
A
 
-
S
 
S
A
 
G
L
 
I
V
 
A
C
 
V
N
 
S
G
 
G
H
 
K
V
 
L
T
 
P
I
 
V
D
 
P
E
 
-
A
 
-
L
 
L
L
 
M
S
 
D
K
 
A
L
 
F
P
 
P
A
 
S
L
 
L
K
 
E
L
 
I
A
 
V
A
 
A
C
 
N
S
 
F
S
 
G
A
x
V
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
Q
 
G
M
 
V
D
 
D
V
 
V
E
 
S
A
 
R
M
 
A
T
 
A
R
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
I
K
 
V
L
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
T
S
 
P
E
 
D
V
 
V
L
|
L
C
 
T
D
 
E
D
 
E
V
|
V
A
 
A
D
 
D
M
 
T
A
 
A
L
 
I
L
 
G
L
 
L
M
 
L
L
 
L
A
 
N
A
 
T
R
 
L
R
 
R
R
 
L
L
 
L
P
 
P
E
 
Q
G
 
A
D
 
E
R
 
Q
Y
 
W
V
 
L
R
 
R
S
 
Q
G
 
G
D
 
R
W
 
W
G
 
V
Q
 
R
K
 
E
G
 
G
M
 
A
M
 
F
P
 
P
L
 
L
T
 
S
-
 
P
T
 
L
S
 
S
T
 
L
S
 
R
G
 
G
K
 
R
K
 
T
A
 
V
G
 
G
I
 
L
V
x
F
G
 
G
L
|
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
M
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
R
R
 
R
C
 
L
E
 
E
A
 
A
V
 
F
G
 
G
L
 
V
T
 
S
V
 
I
G
 
A
Y
 
Y
Y
 
H
G
x
T
R
|
R
T
 
T
K
 
P
K
 
R
D
 
E
G
 
G
N
 
L
D
 
G
F
 
F
A
 
T
Y
 
Y
F
 
H
D
 
P
T
 
T
P
 
L
A
 
V
K
 
G
L
 
M
A
 
A
D
 
E
W
 
A
A
 
V
D
 
D
I
 
T
L
 
L
I
 
I
V
 
V
A
 
I
T
x
V
P
|
P
G
 
G
G
 
T
P
 
A
S
|
S
T
|
T
E
 
L
G
 
K
L
 
A
I
 
V
S
 
N
A
 
A
D
 
D
V
 
V
L
 
L
N
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
T
 
K
G
 
G
S
 
V
F
 
L
I
 
I
N
 
N
I
x
V
A
x
G
R
|
R
G
 
G
T
 
S
V
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
V
K
 
T
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
E
 
N
R
 
G
R
 
T
I
 
I
A
 
A
S
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
L
 
E
N
 
N
E
|
E
P
 
P
N
 
N
P
 
V
D
 
P
P
 
E
R
 
A
F
 
L
A
 
L
A
 
S
L
 
F
D
 
P
N
 
N
V
 
V
V
 
S
L
 
L
Y
 
L
P
 
P
H
|
H
H
 
V
A
|
A
S
 
S
G
 
A
T
 
S
E
 
V
E
 
V
T
 
T
R
 
R
D
 
N
R
 
A
M
 
M
A
 
S
Q
 
D
L
 
L
T
 
V
V
 
V
D
 
D
N
 
N
L
 
L
A
 
K
A
 
A
F
 
W
F
 
F
A
 
S
G
 
T
R
 
G
P
 
E
L
 
A
L
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V

5j23A Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with 2'-phospho-adp-ribose (see paper)
41% identity, 99% coverage: 2:314/315 of query aligns to 1:308/318 of 5j23A

query
sites
5j23A
K
 
R
P
 
P
D
 
R
V
 
I
I
 
L
V
 
V
A
 
P
Y
 
G
P
 
K
L
 
I
R
 
N
P
 
P
R
 
R
Q
 
V
M
 
L
A
 
E
M
 
R
L
 
L
E
 
P
E
 
E
T
 
M
Y
 
F
T
 
E
L
 
T
H
 
V
R
 
R
L
 
I
D
 
E
L
 
R
A
 
A
K
 
D
G
 
A
E
 
A
K
 
L
R
 
V
D
 
T
A
 
A
L
 
D
L
 
M
R
 
R
Q
 
D
A
 
V
G
 
-
P
 
-
I
 
-
A
 
-
S
 
S
A
 
G
L
 
I
V
 
A
C
 
V
N
 
S
G
 
G
H
 
K
V
 
L
T
 
P
I
 
V
D
 
P
E
 
-
A
 
-
L
 
L
L
 
M
S
 
D
K
 
A
L
 
F
P
 
P
A
 
S
L
 
L
K
 
E
L
 
I
A
 
V
A
 
A
C
 
N
S
 
F
S
 
G
A
x
V
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
Q
 
G
M
 
V
D
 
D
V
 
V
E
 
S
A
 
R
M
 
A
T
 
A
R
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
I
K
 
V
L
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
T
S
 
P
E
 
D
V
 
V
L
|
L
C
 
T
D
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
D
M
 
T
A
 
A
L
 
I
L
 
G
L
 
L
M
 
L
L
 
L
A
 
N
A
 
T
R
 
L
R
 
R
R
 
L
L
 
L
P
 
P
E
 
Q
G
 
A
D
 
E
R
 
Q
Y
 
W
V
 
L
R
 
R
S
 
Q
G
 
G
D
 
R
W
 
W
G
 
V
Q
 
R
K
 
E
G
 
G
M
 
A
M
 
F
P
 
P
L
 
L
T
 
S
-
 
P
T
 
L
S
 
S
T
 
L
S
 
R
G
 
G
K
 
R
K
 
T
A
 
V
G
 
G
I
 
L
V
 
F
G
 
G
L
|
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
M
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
R
R
 
R
C
 
L
E
 
E
A
 
A
V
 
F
G
 
G
L
 
V
T
 
S
V
 
I
G
 
A
Y
 
Y
Y
 
H
G
x
T
R
|
R
T
 
T
K
 
P
K
 
R
D
 
E
G
 
G
N
 
L
D
 
G
F
 
F
A
 
T
Y
 
Y
F
 
H
D
 
P
T
 
T
P
 
L
A
 
V
K
 
G
L
 
M
A
 
A
D
 
E
W
 
A
A
 
V
D
 
D
I
 
T
L
 
L
I
 
I
V
 
V
A
 
I
T
 
V
P
|
P
G
 
G
G
 
T
P
 
A
S
|
S
T
|
T
E
 
L
G
 
K
L
 
A
I
 
V
S
 
N
A
 
A
D
 
D
V
 
V
L
 
L
N
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
T
 
K
G
 
G
S
 
V
F
 
L
I
 
I
N
 
N
I
 
V
A
 
G
R
|
R
G
 
G
T
 
S
V
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
V
K
 
T
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
E
 
N
R
 
G
R
 
T
I
 
I
A
 
A
S
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
L
 
E
N
 
N
E
|
E
P
 
P
N
 
N
P
 
V
D
 
P
P
 
E
R
 
A
F
 
L
A
 
L
A
 
S
L
 
F
D
 
P
N
 
N
V
 
V
V
 
S
L
 
L
Y
 
L
P
 
P
H
|
H
H
 
V
A
 
A
S
 
S
G
 
A
T
 
S
E
 
V
E
 
V
T
 
T
R
 
R
D
 
N
R
 
A
M
 
M
A
 
S
Q
 
D
L
 
L
T
 
V
V
 
V
D
 
D
N
 
N
L
 
L
A
 
K
A
 
A
F
 
W
F
 
F
A
 
S
G
 
T
R
 
G
P
 
E
L
 
A
L
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V

5aovA Ternary crystal structure of pyrococcus furiosus glyoxylate hydroxypyruvate reductase in presence of glyoxylate (see paper)
39% identity, 100% coverage: 1:315/315 of query aligns to 1:322/334 of 5aovA

query
sites
5aovA
M
 
M
K
 
K
P
 
P
D
 
K
V
 
V
I
 
F
V
 
I
A
 
T
Y
 
R
P
 
A
L
 
I
R
 
P
P
 
E
R
 
N
Q
 
G
M
 
I
A
 
N
M
 
M
L
 
L
E
 
E
E
 
E
T
 
E
Y
 
F
T
 
E
L
 
V
H
 
E
R
 
V
L
 
W
D
 
E
L
 
E
A
 
E
K
 
R
G
 
E
E
 
I
K
 
P
R
 
R
D
 
E
A
 
K
L
 
L
L
 
L
R
 
E
Q
 
K
A
 
V
G
 
K
P
 
D
I
 
V
A
 
-
S
 
D
A
 
A
L
 
L
V
 
V
C
 
T
N
x
M
G
x
L
H
 
S
V
 
E
T
 
R
I
 
I
D
 
D
E
 
Q
A
 
E
L
 
V
L
 
F
S
 
E
K
 
N
L
 
A
P
 
P
A
 
R
L
 
L
K
 
R
L
 
I
A
 
V
A
 
A
C
 
N
S
x
Y
S
x
A
A
x
V
G
|
G
Y
 
Y
D
 
D
Q
 
N
M
 
I
D
 
D
V
 
V
E
 
E
A
 
E
M
 
A
T
 
T
R
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
I
K
 
Y
L
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
T
S
 
P
E
 
D
V
 
V
L
|
L
C
 
T
D
 
N
D
 
A
V
x
T
A
 
A
D
 
D
M
 
H
A
 
A
L
 
F
L
 
A
L
 
L
M
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
T
R
 
A
R
 
R
R
 
H
L
 
V
P
 
V
E
 
K
G
 
G
D
 
D
R
 
K
Y
 
F
V
 
V
R
 
R
S
 
S
G
 
G
D
 
E
W
 
W
G
 
K
Q
 
R
K
 
K
G
 
G
M
 
I
-
 
A
-
 
W
-
 
H
-
 
P
-
 
K
M
 
W
P
 
F
L
 
L
T
 
G
T
 
Y
S
 
E
T
 
L
S
 
Y
G
 
G
K
 
K
K
 
T
A
 
I
G
 
G
I
 
I
V
 
V
G
 
G
L
x
F
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
M
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
R
R
 
R
C
 
A
E
 
K
A
 
G
V
 
F
G
 
N
L
 
M
T
 
R
V
 
I
G
 
L
Y
 
Y
Y
 
Y
G
x
S
R
|
R
T
 
T
K
 
R
K
 
K
D
 
S
G
 
Q
N
 
A
D
 
E
F
 
K
-
 
E
-
 
L
-
 
G
A
 
A
Y
 
E
F
 
Y
D
 
R
T
 
P
P
 
L
A
 
E
K
 
E
L
 
V
A
 
L
D
 
K
W
 
E
A
 
S
D
 
D
I
 
F
L
 
V
I
 
I
V
 
L
A
|
A
T
x
V
P
|
P
G
 
L
G
 
T
P
 
K
S
 
E
T
|
T
E
 
M
G
 
Y
L
 
M
I
 
I
S
 
N
A
 
E
D
 
E
V
 
R
L
 
L
N
 
K
A
 
L
L
 
M
G
 
K
P
 
P
T
 
T
G
 
A
S
 
I
F
 
L
I
 
V
N
 
N
I
|
I
A
|
A
R
|
R
G
 
G
T
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
P
 
K
A
 
A
L
 
L
I
 
I
K
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
E
 
E
R
 
G
R
 
W
I
 
I
A
 
A
S
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
L
 
E
N
 
E
E
|
E
P
 
P
N
 
Y
P
 
Y
D
 
N
P
 
E
R
 
E
F
 
L
A
 
F
A
 
S
L
 
L
D
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
L
Y
 
T
P
 
P
H
|
H
H
 
I
A
x
G
S
 
S
G
 
A
T
 
T
E
 
F
E
 
E
T
 
A
R
 
R
D
 
E
R
 
A
M
 
M
A
 
A
Q
 
E
L
 
L
T
 
V
V
 
A
D
 
R
N
 
N
L
 
L
A
 
I
A
 
A
F
 
F
F
 
K
A
 
R
G
 
G
R
 
E
P
 
I
L
 
P
L
 
P
T
 
T
P
 
L
V
 
V
N
 
N

6biiA Crystal structure of pyrococcus yayanosii glyoxylate hydroxypyruvate reductase in complex with NADP and malonate (re-refinement of 5aow) (see paper)
39% identity, 100% coverage: 2:315/315 of query aligns to 1:321/332 of 6biiA

query
sites
6biiA
K
 
K
P
 
P
D
 
K
V
 
V
I
 
L
V
 
I
A
 
T
Y
 
R
P
 
A
L
 
I
R
 
P
P
 
E
R
 
N
Q
 
G
M
 
I
A
 
E
M
 
L
L
 
L
E
 
R
E
 
E
T
 
H
Y
 
F
T
 
E
L
 
V
H
 
E
R
 
V
L
 
W
D
 
E
L
 
H
A
 
E
K
 
H
G
 
E
E
 
I
K
 
P
R
 
R
D
 
E
A
 
V
L
 
L
L
 
L
R
 
E
Q
 
K
A
 
V
G
 
K
P
 
D
I
 
V
A
 
-
S
 
D
A
 
A
L
 
L
V
 
V
C
 
T
N
 
M
G
 
L
H
 
S
V
 
E
T
 
K
I
 
I
D
 
D
E
 
R
A
 
E
L
 
V
L
 
F
S
 
D
K
 
A
L
 
A
P
 
P
A
 
R
L
 
L
K
 
R
L
 
I
A
 
V
A
 
A
C
 
N
S
 
Y
S
 
A
A
x
V
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
Q
 
N
M
 
I
D
 
D
V
 
I
E
 
E
A
 
E
M
 
A
T
 
T
R
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
K
 
Y
L
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
T
S
 
P
E
 
D
V
 
V
L
|
L
C
 
T
D
 
D
D
 
A
V
x
T
A
 
A
D
 
D
M
 
L
A
 
A
L
 
W
L
 
A
L
 
L
M
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
R
 
A
R
 
R
R
 
H
L
 
V
P
 
V
E
 
K
G
 
G
D
 
D
R
 
K
Y
 
F
V
 
V
R
 
R
S
 
S
G
 
G
D
 
E
W
 
W
G
 
K
Q
 
R
K
 
R
G
 
G
M
 
I
-
 
A
-
 
W
-
 
H
-
 
P
-
 
K
M
 
M
P
 
F
L
 
L
T
 
G
T
 
Y
S
 
D
T
 
V
S
 
Y
G
 
G
K
 
K
K
 
T
A
 
I
G
 
G
I
 
I
V
 
V
G
|
G
L
x
F
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
M
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
K
R
 
R
C
 
A
E
 
K
A
 
G
V
 
F
G
 
G
L
 
M
T
 
R
V
 
I
G
 
L
Y
 
Y
Y
 
T
G
x
A
R
|
R
T
x
S
K
 
R
K
|
K
-
 
P
-
 
E
-
 
A
D
 
E
G
 
K
N
 
E
D
 
L
F
 
G
A
 
A
Y
 
E
F
 
F
D
 
K
T
 
P
P
 
L
A
 
E
K
 
E
L
 
L
A
 
L
D
 
R
W
 
E
A
 
S
D
 
D
I
 
F
L
 
V
I
 
V
V
 
L
A
 
A
T
x
V
P
|
P
G
 
L
G
 
T
P
 
K
S
x
E
T
|
T
E
 
Y
G
 
H
L
 
M
I
 
I
S
 
N
A
 
E
D
 
E
V
 
R
L
 
L
N
 
R
A
 
L
L
 
M
G
 
K
P
 
P
T
 
T
G
 
A
S
 
V
F
 
L
I
 
V
N
 
N
I
x
V
A
|
A
R
|
R
G
 
G
T
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
P
 
K
A
 
A
L
 
L
I
 
I
K
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
E
 
E
R
 
G
R
 
W
I
 
I
A
 
A
S
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
L
 
E
N
 
E
E
|
E
P
 
P
N
 
Y
P
 
Y
D
 
D
P
 
E
R
 
E
F
 
L
A
 
F
A
 
A
L
 
L
D
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
L
Y
 
T
P
 
P
H
|
H
H
 
I
A
x
G
S
 
S
G
 
A
T
 
T
E
 
F
E
 
G
T
 
A
R
 
R
D
 
E
R
 
G
M
 
M
A
 
A
Q
 
E
L
 
L
T
 
V
V
 
A
D
 
K
N
 
N
L
 
L
A
 
I
A
 
A
F
 
F
F
 
K
A
 
N
G
 
G
R
 
E
P
 
V
L
 
P
L
 
P
T
 
T
P
 
L
V
 
V
N
 
N

O58320 Glyoxylate reductase; EC 1.1.1.26 from Pyrococcus horikoshii (strain ATCC 700860 / DSM 12428 / JCM 9974 / NBRC 100139 / OT-3)
39% identity, 100% coverage: 1:315/315 of query aligns to 1:322/334 of O58320

query
sites
O58320
M
 
M
K
 
K
P
 
P
D
 
K
V
 
V
I
 
F
V
 
I
A
 
T
Y
 
R
P
 
E
L
 
I
R
 
P
P
 
E
R
 
V
Q
 
G
M
 
I
A
 
K
M
 
M
L
 
L
E
 
E
E
 
D
T
 
E
Y
 
F
T
 
E
L
 
V
H
 
E
R
 
V
L
 
W
D
 
G
L
 
D
A
 
E
K
 
K
G
 
E
E
 
I
K
 
P
R
 
R
D
 
E
A
 
I
L
 
L
L
 
L
R
 
K
Q
 
K
A
 
V
G
 
K
P
 
E
I
 
V
A
 
-
S
 
D
A
 
A
L
 
L
V
 
V
C
 
T
N
 
M
G
 
L
H
 
S
V
 
E
T
 
R
I
 
I
D
 
D
E
 
K
A
 
E
L
 
V
L
 
F
S
 
E
K
 
N
L
 
A
P
 
P
A
 
K
L
 
L
K
 
R
L
 
I
A
 
V
A
 
A
C
 
N
S
 
Y
S
 
A
A
 
V
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
Q
 
N
M
 
I
D
 
D
V
 
I
E
 
E
A
 
E
M
 
A
T
 
T
R
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
K
 
Y
L
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
T
S
 
P
E
 
D
V
 
V
L
 
L
C
 
T
D
 
D
D
 
A
V
 
T
A
 
A
D
 
D
M
 
L
A
 
A
L
 
F
L
 
A
L
 
L
M
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
T
R
 
A
R
 
R
R
 
H
L
 
V
P
 
V
E
 
K
G
 
G
D
 
D
R
 
R
Y
 
F
V
 
V
R
 
R
S
 
S
G
 
G
D
 
E
W
 
W
G
 
K
Q
 
K
K
 
R
G
 
G
M
 
V
-
 
A
-
 
W
-
 
H
-
 
P
-
 
K
M
 
W
P
 
F
L
 
L
T
 
G
T
 
Y
S
 
D
T
 
V
S
 
Y
G
 
G
K
 
K
K
 
T
A
 
I
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
 
G
L
|
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
M
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
K
R
 
R
C
 
A
E
 
K
A
 
G
V
 
F
G
 
N
L
 
M
T
 
R
V
 
I
G
 
L
Y
 
Y
Y
 
Y
G
x
S
R
|
R
T
|
T
K
 
R
K
 
K
D
 
E
G
 
E
N
 
V
D
 
E
F
 
R
-
 
E
-
 
L
-
 
N
A
 
A
Y
 
E
F
 
F
D
 
K
T
 
P
P
 
L
A
 
E
K
 
D
L
 
L
A
 
L
D
 
R
W
 
E
A
 
S
D
 
D
I
 
F
L
 
V
I
 
V
V
 
L
A
 
A
T
 
V
P
 
P
G
 
L
G
 
T
P
 
R
S
 
E
T
 
T
E
 
Y
G
 
H
L
 
L
I
 
I
S
 
N
A
 
E
D
 
E
V
 
R
L
 
L
N
 
K
A
 
L
L
 
M
G
 
K
P
 
K
T
 
T
G
 
A
S
 
I
F
 
L
I
 
I
N
 
N
I
|
I
A
|
A
R
|
R
G
 
G
T
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
P
 
N
A
 
A
L
 
L
I
 
V
K
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
E
 
E
R
 
G
R
 
W
I
 
I
A
 
A
S
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
L
D
 
D
V
 
V
Y
 
F
L
 
E
N
 
E
E
 
E
P
 
P
N
 
Y
P
 
Y
D
 
N
P
 
E
R
 
E
F
 
L
A
 
F
A
 
K
L
 
L
D
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
L
Y
 
T
P
 
P
H
|
H
H
x
I
A
x
G
S
 
S
G
 
A
T
 
S
E
 
F
E
 
G
T
 
A
R
 
R
D
 
E
R
 
G
M
 
M
A
 
A
Q
 
E
L
 
L
T
 
V
V
 
A
D
 
K
N
 
N
L
 
L
A
 
I
A
 
A
F
 
F
F
 
K
A
 
R
G
 
G
R
 
E
P
 
I
L
 
P
L
 
P
T
 
T
P
 
L
V
 
V
N
 
N

2dbqA Crystal structure of glyoxylate reductase (ph0597) from pyrococcus horikoshii ot3, complexed with NADP (i41) (see paper)
39% identity, 100% coverage: 1:315/315 of query aligns to 1:322/333 of 2dbqA

query
sites
2dbqA
M
 
M
K
 
K
P
 
P
D
 
K
V
 
V
I
 
F
V
 
I
A
 
T
Y
 
R
P
 
E
L
 
I
R
 
P
P
 
E
R
 
V
Q
 
G
M
 
I
A
 
K
M
 
M
L
 
L
E
 
E
E
 
D
T
 
E
Y
 
F
T
 
E
L
 
V
H
 
E
R
 
V
L
 
W
D
 
G
L
 
D
A
 
E
K
 
K
G
 
E
E
 
I
K
 
P
R
 
R
D
 
E
A
 
I
L
 
L
L
 
L
R
 
K
Q
 
K
A
 
V
G
 
K
P
 
E
I
 
V
A
 
-
S
 
D
A
 
A
L
 
L
V
 
V
C
 
T
N
 
M
G
 
L
H
 
S
V
 
E
T
 
R
I
 
I
D
 
D
E
 
K
A
 
E
L
 
V
L
 
F
S
 
E
K
 
N
L
 
A
P
 
P
A
 
K
L
 
L
K
 
R
L
 
I
A
 
V
A
 
A
C
 
N
S
 
Y
S
 
A
A
x
V
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
Q
 
N
M
 
I
D
 
D
V
 
I
E
 
E
A
 
E
M
 
A
T
 
T
R
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
K
 
Y
L
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
T
S
 
P
E
 
D
V
 
V
L
|
L
C
 
T
D
 
D
D
 
A
V
x
T
A
 
A
D
 
D
M
 
L
A
 
A
L
 
F
L
 
A
L
 
L
M
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
T
R
 
A
R
 
R
R
 
H
L
 
V
P
 
V
E
 
K
G
 
G
D
 
D
R
 
R
Y
 
F
V
 
V
R
 
R
S
 
S
G
 
G
D
 
E
W
 
W
G
 
K
Q
 
K
K
 
R
G
 
G
M
 
V
-
 
A
-
 
W
-
 
H
-
 
P
-
 
K
M
 
W
P
 
F
L
 
L
T
 
G
T
 
Y
S
 
D
T
 
V
S
 
Y
G
 
G
K
 
K
K
 
T
A
 
I
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
 
G
L
|
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
M
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
K
R
 
R
C
 
A
E
 
K
A
 
G
V
 
F
G
 
N
L
 
M
T
 
R
V
 
I
G
 
L
Y
 
Y
Y
 
Y
G
x
S
R
|
R
T
|
T
K
 
R
K
 
K
D
 
E
G
 
E
N
 
V
D
 
E
F
 
R
-
 
E
-
 
L
-
 
N
A
 
A
Y
 
E
F
 
F
D
 
K
T
 
P
P
 
L
A
 
E
K
 
D
L
 
L
A
 
L
D
 
R
W
 
E
A
 
S
D
 
D
I
 
F
L
 
V
I
 
V
V
 
L
A
|
A
T
x
V
P
|
P
G
 
L
G
 
T
P
 
R
S
 
E
T
|
T
E
 
Y
G
 
H
L
 
L
I
 
I
S
 
N
A
 
E
D
 
E
V
 
R
L
 
L
N
 
K
A
 
L
L
 
M
G
 
K
P
 
K
T
 
T
G
 
A
S
 
I
F
 
L
I
 
I
N
 
N
I
|
I
A
|
A
R
|
R
G
 
G
T
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
P
 
N
A
 
A
L
 
L
I
 
V
K
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
E
 
E
R
 
G
R
 
W
I
 
I
A
 
A
S
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
L
 
E
N
 
E
E
|
E
P
 
P
N
 
Y
P
 
Y
D
 
N
P
 
E
R
 
E
F
 
L
A
 
F
A
 
K
L
 
L
D
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
L
Y
 
T
P
 
P
H
|
H
H
 
I
A
x
G
S
 
S
G
 
A
T
 
S
E
 
F
E
 
G
T
 
A
R
 
R
D
 
E
R
 
G
M
 
M
A
 
A
Q
 
E
L
 
L
T
 
V
V
 
A
D
 
K
N
 
N
L
 
L
A
 
I
A
 
A
F
 
F
F
 
K
A
 
R
G
 
G
R
 
E
P
 
I
L
 
P
L
 
P
T
 
T
P
 
L
V
 
V
N
 
N

Q9UBQ7 Glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase; EC 1.1.1.79; EC 1.1.1.81 from Homo sapiens (Human) (see paper)
36% identity, 84% coverage: 47:310/315 of query aligns to 52:322/328 of Q9UBQ7

query
sites
Q9UBQ7
A
 
A
S
 
H
A
 
G
L
 
L
V
 
L
C
 
C
N
 
L
G
 
L
H
 
S
V
 
D
T
 
H
I
 
V
D
 
D
E
 
K
A
 
R
L
 
I
L
 
L
S
 
D
K
 
A
L
 
A
P
 
G
A
 
A
-
 
N
L
 
L
K
 
K
L
 
V
A
 
I
A
 
S
C
 
T
S
 
M
S
 
S
A
x
V
G
|
G
Y
 
I
D
 
D
Q
 
H
M
 
L
D
 
A
V
 
L
E
 
D
A
 
E
M
 
I
T
 
K
R
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
K
 
R
L
 
V
T
 
G
N
 
Y
T
 
T
S
 
P
E
 
D
V
 
V
L
 
L
C
 
T
D
 
D
D
 
T
V
 
T
A
 
A
D
 
E
M
 
L
A
 
A
L
 
V
L
 
S
L
 
L
M
 
L
L
 
L
A
 
T
A
 
T
R
 
C
R
 
R
R
 
R
L
 
L
P
 
P
E
 
E
G
 
A
D
 
I
R
 
E
Y
 
E
V
 
V
R
 
K
S
 
N
G
 
G
D
 
G
W
 
W
-
 
T
G
 
S
Q
 
W
K
 
K
G
 
P
M
 
L
M
 
W
P
 
L
L
 
C
T
 
G
T
 
Y
S
 
G
T
 
L
S
 
T
G
 
Q
K
 
S
K
 
T
A
 
V
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
 
G
L
 
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
M
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
R
R
 
R
C
 
L
E
 
K
A
 
P
V
 
F
G
 
G
L
 
V
T
 
Q
-
 
R
V
 
F
G
 
L
Y
 
Y
Y
 
T
G
 
G
R
|
R
T
x
Q
K
x
P
K
x
R
-
 
P
-
 
E
D
 
E
G
 
A
N
 
A
D
 
E
F
 
F
-
 
Q
A
 
A
Y
 
E
F
 
F
D
 
V
T
 
S
P
 
T
A
 
P
K
 
E
L
 
L
A
 
A
D
 
A
W
 
Q
A
 
S
D
 
D
I
 
F
L
 
I
I
 
V
V
 
V
A
 
A
T
 
C
P
x
S
G
 
L
G
 
T
P
 
P
S
 
A
T
 
T
E
 
E
G
 
G
L
 
L
I
 
C
S
 
N
A
 
K
D
 
D
V
 
F
L
 
F
N
 
Q
A
 
K
L
 
M
G
 
K
P
 
E
T
 
T
G
 
A
S
 
V
F
 
F
I
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
S
R
|
R
G
 
G
T
 
D
V
 
V
V
 
V
D
 
N
E
 
Q
P
 
D
A
 
D
L
 
L
I
 
Y
K
 
Q
A
 
A
L
 
L
Q
 
A
E
 
S
R
 
G
R
 
K
I
 
I
A
 
A
S
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
T
L
 
S
N
 
P
E
 
E
P
 
P
N
 
L
P
 
P
-
 
T
D
 
N
P
 
H
R
 
P
F
 
L
A
 
L
A
 
T
L
 
L
D
 
K
N
 
N
V
 
C
V
 
V
L
 
I
Y
 
L
P
 
P
H
|
H
H
x
I
A
x
G
S
|
S
G
 
A
T
 
T
E
 
H
E
 
R
T
 
T
R
 
R
D
 
N
R
 
T
M
 
M
A
 
S
Q
 
L
L
 
L
T
 
A
V
 
A
D
 
N
N
 
N
L
 
L
A
 
L
A
 
A
F
 
G
F
 
L
A
 
R
G
 
G
R
 
E
P
 
P
L
 
M

2gcgA Ternary crystal structure of human glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase (see paper)
36% identity, 84% coverage: 47:310/315 of query aligns to 48:318/324 of 2gcgA

query
sites
2gcgA
A
 
A
S
 
H
A
 
G
L
 
L
V
 
L
C
 
C
N
 
L
G
x
L
H
 
S
V
 
D
T
 
H
I
 
V
D
 
D
E
 
K
A
 
R
L
 
I
L
 
L
S
 
D
K
 
A
L
 
A
P
 
G
A
 
A
-
 
N
L
 
L
K
 
K
L
 
V
A
 
I
A
 
S
C
 
T
S
 
M
S
|
S
A
x
V
G
|
G
Y
 
I
D
 
D
Q
 
H
M
 
L
D
 
A
V
 
L
E
 
D
A
 
E
M
 
I
T
 
K
R
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
K
 
R
L
 
V
T
 
G
N
 
Y
T
 
T
S
 
P
E
 
D
V
 
V
L
|
L
C
 
T
D
 
D
D
 
T
V
x
T
A
 
A
D
 
E
M
 
L
A
 
A
L
 
V
L
 
S
L
 
L
M
 
L
L
 
L
A
 
T
A
 
T
R
 
C
R
 
R
R
 
R
L
 
L
P
 
P
E
 
E
G
 
A
D
 
I
R
 
E
Y
 
E
V
 
V
R
 
K
S
 
N
G
 
G
D
 
G
W
 
W
-
 
T
G
 
S
Q
 
W
K
 
K
G
 
P
M
 
L
M
 
W
P
 
L
L
 
C
T
 
G
T
 
Y
S
 
G
T
 
L
S
 
T
G
 
Q
K
 
S
K
 
T
A
 
V
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
|
G
L
 
L
G
|
G
R
 
R
I
|
I
G
 
G
M
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
R
R
 
R
C
 
L
E
 
K
A
 
P
V
 
F
G
 
G
L
 
V
T
 
Q
-
 
R
V
 
F
G
 
L
Y
 
Y
Y
 
T
G
|
G
R
|
R
T
 
Q
K
 
P
K
x
R
-
 
P
-
 
E
D
 
E
G
 
A
N
 
A
D
 
E
F
 
F
-
 
Q
A
 
A
Y
 
E
F
 
F
D
 
V
T
 
S
P
 
T
A
 
P
K
 
E
L
 
L
A
 
A
D
 
A
W
 
Q
A
 
S
D
 
D
I
 
F
L
 
I
I
 
V
V
 
V
A
 
A
T
x
C
P
x
S
G
 
L
G
 
T
P
 
P
S
 
A
T
|
T
E
 
E
G
 
G
L
 
L
I
 
C
S
 
N
A
 
K
D
 
D
V
 
F
L
 
F
N
 
Q
A
 
K
L
 
M
G
 
K
P
 
E
T
 
T
G
 
A
S
 
V
F
 
F
I
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
S
R
|
R
G
 
G
T
 
D
V
 
V
V
 
V
D
 
N
E
 
Q
P
 
D
A
 
D
L
 
L
I
 
Y
K
 
Q
A
 
A
L
 
L
Q
 
A
E
 
S
R
 
G
R
 
K
I
 
I
A
 
A
S
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
T
L
 
S
N
 
P
E
|
E
P
 
P
N
 
L
P
 
P
D
 
T
P
 
N
R
 
H
-
 
P
F
 
L
A
 
L
A
 
T
L
 
L
D
 
K
N
 
N
V
 
C
V
 
V
L
 
I
Y
 
L
P
 
P
H
|
H
H
 
I
A
x
G
S
 
S
G
 
A
T
 
T
E
 
H
E
 
R
T
 
T
R
 
R
D
 
N
R
 
T
M
 
M
A
 
S
Q
 
L
L
 
L
T
 
A
V
 
A
D
 
N
N
 
N
L
 
L
A
 
L
A
 
A
F
 
G
F
 
L
A
 
R
G
 
G
R
 
E
P
 
P
L
 
M

3ddnB Crystal structure of hydroxypyruvic acid phosphate bound d-3- phosphoglycerate dehydrogenase in mycobacterium tuberculosis (see paper)
34% identity, 99% coverage: 3:315/315 of query aligns to 3:312/525 of 3ddnB

query
sites
3ddnB
P
 
P
D
 
V
V
 
V
I
 
L
V
 
I
A
 
A
Y
 
D
P
 
K
L
 
L
R
 
A
P
 
P
R
 
S
Q
 
T
M
 
V
A
 
A
M
 
A
L
 
L
E
 
G
E
 
D
T
 
Q
Y
 
V
T
 
E
L
 
V
H
 
R
R
 
W
L
 
V
D
 
D
L
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
G
E
 
P
K
 
D
R
 
R
D
 
D
A
 
K
L
 
L
L
 
L
R
 
-
Q
 
A
A
 
A
G
 
V
P
 
P
I
 
E
A
 
A
S
 
D
A
 
A
L
 
L
V
 
L
C
 
V
N
 
R
G
 
S
H
 
A
V
 
T
T
 
T
I
 
V
D
 
D
E
 
A
A
 
E
L
 
V
L
 
L
S
 
A
K
 
A
L
 
A
P
 
P
A
 
K
L
 
L
K
 
K
L
 
I
A
 
V
A
 
A
C
x
R
S
 
A
S
 
G
A
x
V
G
 
G
Y
 
L
D
 
D
Q
 
N
M
 
V
D
 
D
V
 
V
E
 
D
A
 
A
M
 
A
T
 
T
R
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
V
K
 
L
L
 
V
T
 
V
N
 
N
T
 
A
S
 
P
E
 
T
V
 
S
L
x
N
C
 
I
D
 
H
D
 
S
V
 
A
A
 
A
D
 
E
M
 
H
A
 
A
L
 
L
L
 
A
L
 
L
M
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
R
 
S
R
 
R
R
 
Q
L
 
I
P
 
P
E
 
A
G
 
A
D
 
D
R
 
A
Y
 
S
V
 
L
R
 
R
S
 
E
G
 
H
D
 
T
W
 
W
G
 
K
Q
 
R
K
 
S
G
 
S
M
 
F
M
 
S
P
 
-
L
 
-
T
 
G
T
 
T
S
 
E
T
 
I
S
 
F
G
 
G
K
 
K
K
 
T
A
 
V
G
 
G
I
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
I
G
 
G
M
 
Q
A
 
L
I
 
V
A
 
A
K
 
Q
R
 
R
C
 
I
E
 
A
A
 
A
V
 
F
G
 
G
L
 
A
T
 
Y
V
 
V
G
 
V
Y
 
A
Y
 
Y
-
 
D
-
 
P
-
 
Y
-
 
V
-
 
S
-
 
P
G
 
A
R
 
R
T
 
A
K
 
A
K
 
Q
D
 
L
G
 
G
N
 
I
D
 
E
F
 
L
A
 
L
Y
 
S
F
 
L
D
 
D
T
 
-
P
 
-
A
 
-
K
 
D
L
 
L
A
 
L
D
 
A
W
 
R
A
 
A
D
 
D
I
 
F
L
 
I
I
 
S
V
 
V
A
 
H
T
 
L
P
 
P
G
 
K
G
 
T
P
 
P
S
 
E
T
 
T
E
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
I
S
 
D
A
 
K
D
 
E
V
 
A
L
 
L
N
 
A
A
 
K
L
 
T
G
 
K
P
 
P
T
 
G
G
 
V
S
 
I
F
 
I
I
 
V
N
 
N
I
 
A
A
 
A
R
|
R
G
 
G
T
 
G
V
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
A
K
 
D
A
 
A
L
 
I
Q
 
T
E
 
G
R
 
G
R
 
H
I
 
V
A
 
R
S
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
L
 
A
N
 
T
E
|
E
P
 
P
N
 
C
P
 
T
D
 
D
P
 
S
R
 
P
F
 
L
A
 
F
A
 
E
L
 
L
D
 
A
N
 
Q
V
 
V
V
 
V
L
 
V
Y
 
T
P
 
P
H
|
H
H
 
L
A
 
G
S
x
A
G
 
S
T
 
T
E
 
A
E
 
E
T
 
A
R
x
Q
D
 
D
R
 
R
M
 
A
A
 
G
Q
 
T
L
 
D
T
 
V
V
 
A
D
 
E
N
 
S
L
 
V
A
 
R
A
 
L
F
 
A
F
 
L
A
 
A
G
 
G
R
 
E
P
 
F
L
 
V
L
 
P
T
 
D
P
 
A
V
 
V
N
 
N

3dc2A Crystal structure of serine bound d-3-phosphoglycerate dehydrogenase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
34% identity, 99% coverage: 3:315/315 of query aligns to 2:311/526 of 3dc2A

query
sites
3dc2A
P
 
P
D
 
V
V
 
V
I
 
L
V
 
I
A
 
A
Y
 
D
P
 
K
L
 
L
R
 
A
P
 
P
R
 
S
Q
 
T
M
 
V
A
 
A
M
 
A
L
 
L
E
 
G
E
 
D
T
 
Q
Y
 
V
T
 
E
L
 
V
H
 
R
R
 
W
L
 
V
D
 
D
L
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
G
E
 
P
K
 
D
R
 
R
D
 
D
A
 
K
L
 
L
L
 
L
R
 
-
Q
 
A
A
 
A
G
 
V
P
 
P
I
 
E
A
 
A
S
 
D
A
 
A
L
 
L
V
 
L
C
 
V
N
 
R
G
 
S
H
 
A
V
 
T
T
 
T
I
 
V
D
 
D
E
 
A
A
 
E
L
 
V
L
 
L
S
 
A
K
 
A
L
 
A
P
 
P
A
 
K
L
 
L
K
 
K
L
 
I
A
 
V
A
 
A
C
 
R
S
 
A
S
 
G
A
 
V
G
 
G
Y
 
L
D
 
D
Q
 
N
M
 
V
D
 
D
V
 
V
E
 
D
A
 
A
M
 
A
T
 
T
R
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
V
K
 
L
L
 
V
T
 
V
N
 
N
T
 
A
S
 
P
E
 
T
V
 
S
L
x
N
C
 
I
D
 
H
D
 
S
V
 
A
A
 
A
D
 
E
M
 
H
A
 
A
L
 
L
L
 
A
L
 
L
M
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
R
 
S
R
 
R
R
 
Q
L
 
I
P
 
P
E
 
A
G
 
A
D
 
D
R
 
A
Y
 
S
V
 
L
R
 
R
S
 
E
G
 
H
D
 
T
W
 
W
G
 
K
Q
 
R
K
 
S
G
 
S
M
 
F
M
 
S
P
 
-
L
 
-
T
 
G
T
 
T
S
 
E
T
 
I
S
 
F
G
 
G
K
 
K
K
 
T
A
 
V
G
 
G
I
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
I
G
 
G
M
 
Q
A
 
L
I
 
V
A
 
A
K
 
Q
R
 
R
C
 
I
E
 
A
A
 
A
V
 
F
G
 
G
L
 
A
T
 
Y
V
 
V
G
 
V
Y
 
A
Y
 
Y
-
 
D
-
 
P
-
 
Y
-
 
V
-
 
S
-
 
P
G
 
A
R
 
R
T
 
A
K
 
A
K
 
Q
D
 
L
G
 
G
N
 
I
D
 
E
F
 
L
A
 
L
Y
 
S
F
 
L
D
 
D
T
 
-
P
 
-
A
 
-
K
 
D
L
 
L
A
 
L
D
 
A
W
 
R
A
 
A
D
 
D
I
 
F
L
 
I
I
 
S
V
 
V
A
 
H
T
 
L
P
 
P
G
 
K
G
 
T
P
 
P
S
 
E
T
 
T
E
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
I
S
 
D
A
 
K
D
 
E
V
 
A
L
 
L
N
 
A
A
 
K
L
 
T
G
 
K
P
 
P
T
 
G
G
 
V
S
 
I
F
 
I
I
 
V
N
 
N
I
 
A
A
 
A
R
|
R
G
 
G
T
 
G
V
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
A
K
 
D
A
 
A
L
 
I
Q
 
T
E
 
G
R
 
G
R
 
H
I
 
V
A
 
R
S
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
L
 
A
N
 
T
E
|
E
P
 
P
N
 
C
P
 
T
D
 
D
P
 
S
R
 
P
F
 
L
A
 
F
A
 
E
L
 
L
D
 
A
N
 
Q
V
 
V
V
 
V
L
 
V
Y
 
T
P
 
P
H
|
H
H
 
L
A
 
G
S
 
A
G
 
S
T
 
T
E
 
A
E
 
E
T
 
A
R
 
Q
D
 
D
R
 
R
M
 
A
A
 
G
Q
 
T
L
 
D
T
 
V
V
 
A
D
 
E
N
 
S
L
 
V
A
 
R
A
 
L
F
 
A
F
 
L
A
 
A
G
 
G
R
 
E
P
 
F
L
 
V
L
 
P
T
 
D
P
 
A
V
 
V
N
 
N

Sites not aligning to the query:

1wwkA Crystal structure of phosphoglycerate dehydrogenase from pyrococcus horikoshii ot3
33% identity, 83% coverage: 48:307/315 of query aligns to 43:304/304 of 1wwkA

query
sites
1wwkA
S
 
E
A
 
A
L
 
I
V
 
I
C
 
V
N
 
R
G
 
S
H
 
K
V
 
P
T
 
K
I
 
V
D
 
T
E
 
R
A
 
R
L
 
V
L
 
I
S
 
E
K
 
S
L
 
A
P
 
P
A
 
K
L
 
L
K
 
K
L
 
V
A
 
I
A
 
A
C
 
R
S
 
A
S
 
G
A
 
V
G
 
G
Y
 
L
D
 
D
Q
 
N
M
 
I
D
 
D
V
 
V
E
 
E
A
 
A
M
 
A
T
 
K
R
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
I
K
 
E
L
 
V
T
 
V
N
 
N
T
 
A
S
 
P
E
 
A
V
 
A
L
x
S
C
 
S
D
 
R
D
 
S
V
|
V
A
 
A
D
 
E
M
 
L
A
 
A
L
 
V
L
 
G
L
 
L
M
 
M
L
 
F
A
 
S
A
 
V
R
 
A
R
 
R
R
 
K
L
 
I
P
 
A
E
 
F
G
 
A
D
 
D
R
 
R
Y
 
K
V
 
M
R
 
R
S
 
E
G
 
G
D
 
V
W
 
W
G
 
A
Q
 
K
K
 
K
G
 
E
M
 
A
M
 
M
P
 
G
L
 
I
T
 
-
T
 
-
S
 
E
T
 
L
S
 
E
G
 
G
K
 
K
K
 
T
A
 
I
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
|
G
L
x
F
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
M
 
Y
A
 
Q
I
 
V
A
 
A
K
 
K
R
 
I
C
 
A
E
 
N
A
 
A
V
 
L
G
 
G
L
 
M
T
 
N
V
 
I
G
 
L
Y
 
L
Y
|
Y
G
x
D
-
x
P
-
 
Y
-
 
P
-
 
N
-
 
E
-
 
E
R
 
R
T
 
A
K
 
K
K
 
E
D
 
V
G
 
N
N
 
G
D
 
K
F
 
F
A
 
V
Y
 
D
F
 
L
D
 
E
T
 
T
P
 
-
A
 
-
K
 
-
L
 
L
A
 
L
D
 
K
W
 
E
A
 
S
D
 
D
I
 
V
L
 
V
I
 
T
V
 
I
A
 
H
T
x
V
P
|
P
G
 
L
G
 
V
P
 
E
S
 
S
T
|
T
E
 
Y
G
 
H
L
 
L
I
 
I
S
 
N
A
 
E
D
 
E
V
 
R
L
 
L
N
 
K
A
 
L
L
 
M
G
 
K
P
 
K
T
 
T
G
 
A
S
 
I
F
 
L
I
 
I
N
 
N
I
x
T
A
x
S
R
|
R
G
 
G
T
 
P
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
P
 
N
A
 
A
L
 
L
I
 
V
K
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
E
 
E
R
 
G
R
 
W
I
 
I
A
 
A
S
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
L
 
E
N
 
E
E
|
E
P
 
P
N
 
L
P
 
P
-
 
K
D
 
D
P
 
H
R
 
P
F
 
L
A
 
T
A
 
K
L
 
F
D
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
L
Y
 
T
P
 
P
H
|
H
H
 
I
A
x
G
S
 
A
G
 
S
T
 
T
E
 
V
E
 
E
T
 
A
R
 
Q
D
 
E
R
 
R
M
 
A
A
 
G
Q
 
V
L
 
E
T
 
V
V
 
A
D
 
E
N
 
K
L
 
V
A
 
V
A
 
K
F
 
I
F
 
L
A
 
K
G
 
G

O43175 D-3-phosphoglycerate dehydrogenase; 3-PGDH; 2-oxoglutarate reductase; Malate dehydrogenase; EC 1.1.1.95; EC 1.1.1.399; EC 1.1.1.37 from Homo sapiens (Human) (see 3 papers)
31% identity, 78% coverage: 69:315/315 of query aligns to 70:317/533 of O43175

query
sites
O43175
L
 
L
K
 
Q
L
 
V
A
 
V
A
 
G
C
 
R
S
 
A
S
 
G
A
x
T
G
 
G
Y
 
V
D
 
D
Q
 
N
M
 
V
D
 
D
V
 
L
E
 
E
A
 
A
M
 
A
T
 
T
R
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
K
 
L
L
 
V
T
 
M
N
 
N
T
 
T
S
 
P
E
 
N
V
 
G
L
 
N
C
 
S
D
 
L
D
 
S
V
 
A
A
 
A
D
 
E
M
 
L
A
 
T
L
 
C
L
 
G
L
 
M
M
 
I
L
 
M
A
 
C
A
 
L
R
 
A
R
 
R
R
 
Q
L
 
I
P
 
P
E
 
Q
G
 
A
D
 
T
R
 
A
Y
 
S
V
 
M
R
 
K
S
 
D
G
 
G
D
 
K
W
 
W
G
 
E
Q
x
R
K
 
K
G
 
K
M
 
F
M
 
M
P
 
-
L
 
-
T
 
G
T
 
T
S
 
E
T
 
L
S
 
N
G
 
G
K
 
K
K
 
T
A
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
M
 
R
A
 
E
I
 
V
A
 
A
K
 
T
R
 
R
C
 
M
E
 
Q
A
 
S
V
 
F
G
 
G
L
 
M
-
 
K
T
 
T
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y
Y
x
D
G
 
P
R
 
I
T
 
I
K
 
S
K
 
P
D
 
E
-
 
V
G
 
S
N
 
A
D
 
S
F
 
F
A
 
G
Y
 
V
F
 
Q
D
 
Q
T
 
L
P
 
P
-
 
L
A
 
E
K
 
E
L
 
I
A
 
W
D
 
P
W
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
L
 
I
I
 
T
V
 
V
A
 
H
T
|
T
P
 
P
G
 
L
G
 
L
P
 
P
S
 
S
T
 
T
E
 
T
G
 
G
L
 
L
I
 
L
S
 
N
A
 
D
D
 
N
V
 
T
L
 
F
N
 
A
A
 
Q
L
 
C
G
 
K
P
 
K
T
 
G
G
 
V
S
 
R
F
 
V
I
 
V
N
 
N
I
x
C
A
|
A
R
|
R
G
 
G
T
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
K
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
E
 
S
R
 
G
R
 
Q
I
 
C
A
 
A
S
 
G
A
 
A
G
 
A
I
 
L
D
|
D
V
|
V
Y
 
F
L
 
T
N
 
E
E
 
E
P
 
P
N
 
P
P
 
R
D
 
D
P
 
R
R
 
A
F
 
L
A
 
V
A
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
S
Y
 
C
P
 
P
H
|
H
H
x
L
A
x
G
S
x
A
G
 
S
T
 
T
E
 
K
E
 
E
T
 
A
R
 
Q
D
 
S
R
 
R
M
 
C
A
 
G
Q
 
E
L
 
E
T
 
I
V
 
A
D
 
V
N
 
Q
L
 
F
A
 
V
A
 
D
F
 
M
F
 
V
A
 
K
G
 
G
R
 
K
P
 
S
L
 
L
L
 
T
T
 
G
P
 
V
V
 
V
N
 
N

Sites not aligning to the query:

6plfB Crystal structure of human phgdh complexed with compound 1 (see paper)
31% identity, 79% coverage: 46:295/315 of query aligns to 32:283/292 of 6plfB

query
sites
6plfB
I
 
I
A
 
A
S
 
E
A
 
L
L
 
Q
V
 
D
C
 
C
N
 
E
G
 
G
H
 
L
V
 
I
T
 
V
I
 
R
D
 
S
E
 
A
A
 
A
-
 
D
L
 
V
L
 
I
S
 
N
K
 
A
L
 
A
P
 
E
A
 
K
L
 
L
K
 
Q
L
 
V
A
 
V
A
 
G
C
 
R
S
 
A
S
 
G
A
 
T
G
 
G
Y
 
V
D
 
D
Q
 
N
M
 
V
D
 
D
V
 
L
E
 
E
A
 
A
M
 
A
T
 
T
R
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
K
 
L
L
 
V
T
 
M
N
 
N
T
 
T
S
 
P
E
 
N
V
 
G
L
 
N
C
 
S
D
 
L
D
 
S
V
 
A
A
 
A
D
 
E
M
 
L
A
 
T
L
 
C
L
 
G
L
 
M
M
 
I
L
 
M
A
 
C
A
 
L
R
 
A
R
 
R
R
 
Q
L
 
I
P
 
P
E
 
Q
G
 
A
D
 
T
R
 
A
Y
 
S
V
 
M
R
 
K
S
 
D
G
 
G
D
 
K
W
 
W
G
 
E
Q
 
R
K
 
K
G
 
K
M
 
F
M
 
M
P
 
-
L
 
-
T
 
G
T
 
T
S
 
E
T
 
L
S
 
N
G
 
G
K
 
K
K
 
T
A
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
|
R
I
 
I
G
 
G
M
 
R
A
 
E
I
 
V
A
 
A
K
 
T
R
 
R
C
 
M
E
 
Q
A
 
S
V
 
F
G
 
G
L
 
M
-
 
K
T
 
T
V
 
I
G
 
G
Y
|
Y
Y
x
D
G
x
P
R
 
I
T
x
I
K
 
S
K
 
P
D
 
E
-
 
V
G
 
S
N
 
A
D
 
S
F
 
F
A
 
G
Y
 
V
F
 
Q
D
 
Q
T
 
L
P
 
P
-
x
L
A
 
E
K
 
E
L
 
I
A
 
W
D
 
P
W
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
L
 
I
I
 
T
V
 
V
A
 
H
T
|
T
P
|
P
G
 
L
G
 
L
P
 
P
S
|
S
T
 
T
E
 
T
G
 
G
L
|
L
I
 
L
S
 
N
A
 
D
D
 
N
V
 
T
L
 
F
N
 
A
A
 
Q
L
 
C
G
 
K
P
 
K
T
 
G
G
 
V
S
 
R
F
 
V
I
 
V
N
 
N
I
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
T
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
K
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
E
 
S
R
 
G
R
 
Q
I
 
C
A
 
A
S
 
G
A
 
A
G
 
A
I
 
L
D
 
D
V
 
V
Y
 
F
L
 
T
N
 
E
E
 
E
P
 
P
N
 
P
P
 
R
D
 
D
P
 
R
R
 
A
F
 
L
A
 
V
A
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
S
Y
 
C
P
 
P
H
 
H
H
 
L
A
 
G
S
 
A
G
 
S
T
 
T
E
 
K
E
 
E
T
 
A
R
 
Q
D
 
S
R
 
R
M
 
C
A
 
G
Q
 
E

6rj5A Crystal structure of phgdh in complex with compound 39 (see paper)
32% identity, 72% coverage: 69:295/315 of query aligns to 65:292/301 of 6rj5A

query
sites
6rj5A
L
 
L
K
 
Q
L
 
V
A
 
V
A
 
G
C
 
R
S
 
A
S
 
G
A
 
T
G
 
G
Y
 
V
D
 
D
Q
 
N
M
 
V
D
 
D
V
 
L
E
 
E
A
 
A
M
 
A
T
 
T
R
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
K
 
L
L
 
V
T
 
M
N
 
N
T
 
T
S
 
P
E
 
N
V
 
G
L
 
N
C
 
S
D
 
L
D
 
S
V
 
A
A
 
A
D
 
E
M
 
L
A
 
T
L
 
C
L
 
G
L
 
M
M
 
I
L
 
M
A
 
C
A
 
L
R
 
A
R
 
R
R
 
Q
L
 
I
P
 
P
E
 
Q
G
 
A
D
 
T
R
 
A
Y
 
S
V
 
M
R
 
K
S
 
D
G
 
G
D
 
K
W
 
W
G
 
E
Q
 
R
K
 
K
G
 
K
M
 
F
M
 
M
P
 
-
L
 
-
T
 
G
T
 
T
S
 
E
T
 
L
S
 
N
G
 
G
K
 
K
K
 
T
A
 
L
G
 
G
I
 
I
V
x
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
I
G
 
G
M
 
R
A
 
E
I
 
V
A
 
A
K
 
T
R
 
R
C
 
M
E
 
Q
A
 
S
V
 
F
G
 
G
L
 
M
-
 
K
T
 
T
V
 
I
G
 
G
Y
|
Y
Y
x
D
G
x
P
R
 
I
T
x
I
K
 
S
K
 
P
D
 
E
-
 
V
G
 
S
N
 
A
D
 
S
F
 
F
A
 
G
Y
 
V
F
 
Q
D
 
Q
T
 
L
P
 
P
-
 
L
A
 
E
K
 
E
L
 
I
A
 
W
D
 
P
W
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
L
 
I
I
 
T
V
 
V
A
x
H
T
|
T
P
|
P
G
 
L
G
 
L
P
 
P
S
 
S
T
 
T
E
 
T
G
 
G
L
|
L
I
 
L
S
 
N
A
 
D
D
 
N
V
 
T
L
 
F
N
 
A
A
 
Q
L
 
C
G
 
K
P
 
K
T
 
G
G
 
V
S
 
R
F
 
V
I
 
V
N
 
N
I
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
T
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
K
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
E
 
S
R
 
G
R
 
Q
I
 
C
A
 
A
S
 
G
A
 
A
G
 
A
I
 
L
D
 
D
V
 
V
Y
 
F
L
 
T
N
 
E
E
 
E
P
 
P
N
 
P
P
 
R
D
 
D
P
 
R
R
 
A
F
 
L
A
 
V
A
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
S
Y
 
C
P
 
P
H
 
H
H
 
L
A
 
G
S
 
A
G
 
S
T
 
T
E
 
K
E
 
E
T
 
A
R
 
Q
D
 
S
R
 
R
M
 
C
A
 
G
Q
 
E

7ewhA Crystal structure of human phgdh in complex with homoharringtonine (see paper)
32% identity, 72% coverage: 69:295/315 of query aligns to 65:292/302 of 7ewhA

query
sites
7ewhA
L
 
L
K
 
Q
L
 
V
A
 
V
A
 
G
C
 
R
S
 
A
S
 
G
A
 
T
G
 
G
Y
 
V
D
 
D
Q
 
N
M
 
V
D
 
D
V
 
L
E
 
E
A
 
A
M
 
A
T
 
T
R
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
K
 
L
L
 
V
T
 
M
N
 
N
T
 
T
S
 
P
E
 
N
V
 
G
L
 
N
C
 
S
D
 
L
D
 
S
V
 
A
A
 
A
D
 
E
M
 
L
A
 
T
L
 
C
L
 
G
L
 
M
M
 
I
L
 
M
A
 
C
A
 
L
R
 
A
R
 
R
R
 
Q
L
 
I
P
 
P
E
 
Q
G
 
A
D
 
T
R
 
A
Y
 
S
V
 
M
R
 
K
S
 
D
G
 
G
D
 
K
W
 
W
G
 
E
Q
 
R
K
 
K
G
 
K
M
 
F
M
 
M
P
 
-
L
 
-
T
 
G
T
 
T
S
 
E
T
 
L
S
 
N
G
 
G
K
 
K
K
 
T
A
 
L
G
 
G
I
 
I
V
x
L
G
|
G
L
|
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
|
G
M
 
R
A
 
E
I
 
V
A
 
A
K
 
T
R
 
R
C
 
M
E
 
Q
A
 
S
V
 
F
G
 
G
L
 
M
-
 
K
T
 
T
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y
Y
x
D
G
 
P
R
 
I
T
 
I
K
 
S
K
 
P
D
 
E
-
 
V
G
 
S
N
 
A
D
 
S
F
 
F
A
 
G
Y
 
V
F
 
Q
D
 
Q
T
 
L
P
 
P
-
 
L
A
 
E
K
 
E
L
 
I
A
 
W
D
 
P
W
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
L
 
I
I
 
T
V
 
V
A
x
H
T
|
T
P
|
P
G
 
L
G
 
L
P
 
P
S
 
S
T
 
T
E
 
T
G
 
G
L
 
L
I
 
L
S
 
N
A
 
D
D
 
N
V
 
T
L
 
F
N
 
A
A
 
Q
L
 
C
G
 
K
P
 
K
T
 
G
G
 
V
S
 
R
F
 
V
I
 
V
N
 
N
I
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
T
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
K
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
E
 
S
R
 
G
R
 
Q
I
 
C
A
 
A
S
 
G
A
 
A
G
 
A
I
 
L
D
 
D
V
 
V
Y
 
F
L
 
T
N
 
E
E
 
E
P
 
P
N
 
P
P
 
R
D
 
D
P
 
R
R
 
A
F
 
L
A
 
V
A
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
S
Y
 
C
P
 
P
H
 
H
H
 
L
A
 
G
S
 
A
G
 
S
T
 
T
E
 
K
E
 
E
T
 
A
R
 
Q
D
 
S
R
 
R
M
 
C
A
 
G
Q
 
E

6rihA Crystal structure of phgdh in complex with compound 9 (see paper)
32% identity, 72% coverage: 69:295/315 of query aligns to 65:292/302 of 6rihA

query
sites
6rihA
L
 
L
K
 
Q
L
 
V
A
 
V
A
 
G
C
 
R
S
 
A
S
 
G
A
 
T
G
 
G
Y
 
V
D
 
D
Q
 
N
M
 
V
D
 
D
V
 
L
E
 
E
A
 
A
M
 
A
T
 
T
R
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
K
 
L
L
 
V
T
 
M
N
 
N
T
 
T
S
 
P
E
 
N
V
 
G
L
 
N
C
 
S
D
 
L
D
 
S
V
 
A
A
 
A
D
 
E
M
 
L
A
 
T
L
 
C
L
 
G
L
 
M
M
 
I
L
 
M
A
 
C
A
 
L
R
 
A
R
 
R
R
 
Q
L
 
I
P
 
P
E
 
Q
G
 
A
D
 
T
R
 
A
Y
 
S
V
 
M
R
 
K
S
 
D
G
 
G
D
 
K
W
 
W
G
 
E
Q
 
R
K
 
K
G
 
K
M
 
F
M
 
M
P
 
-
L
 
-
T
 
G
T
 
T
S
 
E
T
 
L
S
 
N
G
 
G
K
 
K
K
 
T
A
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
L
G
 
G
L
 
L
G
|
G
R
 
R
I
 
I
G
 
G
M
 
R
A
 
E
I
 
V
A
 
A
K
 
T
R
 
R
C
 
M
E
 
Q
A
 
S
V
 
F
G
 
G
L
 
M
-
 
K
T
 
T
V
 
I
G
 
G
Y
|
Y
Y
x
D
G
x
P
R
x
I
T
x
I
K
 
S
K
 
P
D
 
E
-
 
V
G
 
S
N
 
A
D
 
S
F
 
F
A
 
G
Y
 
V
F
 
Q
D
 
Q
T
 
L
P
 
P
-
 
L
A
 
E
K
 
E
L
 
I
A
 
W
D
 
P
W
 
L
A
 
C
D
 
D
I
 
F
L
 
I
I
 
T
V
 
V
A
 
H
T
|
T
P
|
P
G
 
L
G
 
L
P
 
P
S
 
S
T
 
T
E
 
T
G
 
G
L
|
L
I
 
L
S
 
N
A
 
D
D
 
N
V
 
T
L
 
F
N
 
A
A
 
Q
L
 
C
G
 
K
P
 
K
T
 
G
G
 
V
S
 
R
F
 
V
I
 
V
N
 
N
I
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
T
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
K
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
E
 
S
R
 
G
R
 
Q
I
 
C
A
 
A
S
 
G
A
 
A
G
 
A
I
 
L
D
 
D
V
 
V
Y
 
F
L
 
T
N
 
E
E
 
E
P
 
P
N
 
P
P
 
R
D
 
D
P
 
R
R
 
A
F
 
L
A
 
V
A
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
S
Y
 
C
P
 
P
H
 
H
H
 
L
A
 
G
S
 
A
G
 
S
T
 
T
E
 
K
E
 
E
T
 
A
R
 
Q
D
 
S
R
 
R
M
 
C
A
 
G
Q
 
E

Query Sequence

>WP_012755652.1 NCBI__GCF_000023185.1:WP_012755652.1
MKPDVIVAYPLRPRQMAMLEETYTLHRLDLAKGEKRDALLRQAGPIASALVCNGHVTIDE
ALLSKLPALKLAACSSAGYDQMDVEAMTRRGIKLTNTSEVLCDDVADMALLLMLAARRRL
PEGDRYVRSGDWGQKGMMPLTTSTSGKKAGIVGLGRIGMAIAKRCEAVGLTVGYYGRTKK
DGNDFAYFDTPAKLADWADILIVATPGGPSTEGLISADVLNALGPTGSFINIARGTVVDE
PALIKALQERRIASAGIDVYLNEPNPDPRFAALDNVVLYPHHASGTEETRDRMAQLTVDN
LAAFFAGRPLLTPVN

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory