SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012758842.1 NCBI__GCF_000023185.1:WP_012758842.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3dc2A Crystal structure of serine bound d-3-phosphoglycerate dehydrogenase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
42% identity, 97% coverage: 3:516/531 of query aligns to 2:513/526 of 3dc2A

query
sites
3dc2A
P
 
P
R
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
I
S
 
A
D
 
D
E
 
K
L
 
L
S
 
A
E
 
P
T
 
S
A
 
T
V
 
V
Q
 
A
I
 
A
F
 
L
R
 
G
D
 
D
R
 
Q
G
 
-
V
 
V
E
 
E
V
 
V
D
 
R
F
 
W
E
 
V
P
 
D
Q
 
-
L
 
-
G
 
G
K
 
P
D
 
D
K
 
R
D
 
D
R
 
K
L
 
L
L
 
L
E
 
A
V
 
A
I
 
V
G
 
P
K
 
E
Y
 
A
D
 
D
G
 
A
L
 
L
A
 
L
I
 
V
R
 
R
S
 
S
A
 
A
T
 
T
K
 
T
V
 
V
T
 
D
E
 
A
K
 
E
I
 
V
I
 
L
E
 
A
G
 
A
A
 
A
T
 
P
N
 
K
L
 
L
K
 
K
V
 
I
V
 
V
G
 
A
R
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
V
G
 
G
V
 
L
D
 
D
N
 
N
V
 
V
D
 
D
I
 
V
P
 
D
A
 
A
A
 
A
S
 
T
R
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
V
I
 
L
V
 
V
M
 
V
N
 
N
T
 
A
P
 
P
F
 
T
G
 
S
N
|
N
S
 
I
I
 
H
T
 
S
T
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
H
A
 
A
I
 
L
A
 
A
L
 
L
M
 
L
F
 
L
A
 
A
V
 
A
A
 
S
R
 
R
Q
 
Q
L
 
I
P
 
P
A
 
A
A
 
A
D
 
D
T
 
A
S
 
S
T
 
L
Q
 
R
A
 
E
G
 
H
K
 
T
W
 
W
E
 
K
K
 
R
S
 
S
K
 
S
F
 
F
M
 
S
G
 
G
V
 
T
E
 
E
I
 
I
T
 
F
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
V
G
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
A
 
L
G
 
G
N
 
R
I
 
I
G
 
G
S
 
Q
I
 
L
V
 
V
C
 
A
A
 
Q
R
 
R
A
 
I
I
 
A
G
 
A
L
 
F
K
 
G
M
 
A
H
 
Y
V
 
V
V
 
V
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
F
 
Y
L
 
V
S
 
S
K
 
P
E
 
A
R
 
R
A
 
A
E
 
A
E
 
Q
M
 
L
G
 
G
V
 
I
T
 
E
K
 
L
V
 
L
E
 
S
L
 
L
E
 
D
E
 
D
L
 
L
F
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
D
 
D
F
 
F
I
 
I
T
 
S
L
 
V
H
 
H
V
 
L
P
 
P
M
 
K
T
 
T
D
 
P
K
 
E
T
 
T
R
 
A
G
 
G
I
 
L
L
 
I
N
 
D
K
 
K
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
K
T
 
T
K
 
K
P
 
P
G
 
G
V
 
V
R
 
I
I
 
I
I
 
V
N
 
N
C
 
A
A
 
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
D
A
 
A
I
 
I
K
 
T
S
 
G
G
 
G
H
 
H
V
 
V
A
 
R
G
 
A
A
 
A
A
 
G
F
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
A
V
 
T
E
|
E
P
 
P
A
 
C
K
 
T
E
 
D
S
 
S
P
 
P
L
 
L
F
 
F
G
 
E
L
 
L
P
 
A
N
 
Q
V
 
V
V
 
V
C
 
V
T
 
T
P
 
P
H
|
H
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
T
 
T
T
 
A
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
E
 
D
N
 
R
V
 
A
A
 
G
L
 
T
Q
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
E
Q
 
S
M
 
V
A
 
R
D
 
L
Y
 
A
L
 
L
V
 
A
N
 
G
G
 
E
A
 
F
V
 
V
S
 
P
N
 
D
A
 
A
I
 
V
N
 
N
M
 
V
-
 
G
P
 
G
S
 
G
I
 
V
T
 
V
A
 
N
E
 
E
E
 
E
A
 
-
P
 
-
I
 
-
L
 
V
K
 
A
P
 
P
F
 
W
I
 
L
R
 
D
L
 
L
A
 
V
D
 
R
V
 
K
L
 
L
G
 
G
A
 
V
F
 
L
V
 
A
G
 
G
Q
 
V
V
 
L
T
 
S
E
 
D
E
 
E
P
 
L
I
 
P
K
 
V
E
 
S
I
 
L
E
 
S
I
 
V
L
 
Q
Y
 
V
D
 
R
G
 
G
I
 
E
T
 
L
A
 
A
N
 
A
M
 
E
N
 
E
T
 
V
R
 
E
A
 
V
L
 
L
T
 
R
S
 
L
A
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
R
G
 
G
L
 
L
I
 
F
R
 
S
P
 
A
Q
 
V
V
 
I
A
 
E
D
 
D
-
 
A
V
 
V
N
 
T
M
 
F
V
 
V
S
 
N
A
 
A
P
 
P
I
 
A
M
 
L
I
 
A
K
 
A
E
 
E
K
 
R
G
 
G
I
 
V
V
 
T
L
 
A
S
 
E
E
 
I
V
 
C
K
 
K
R
 
A
D
 
S
K
 
E
T
 
S
G
 
P
V
 
N
F
 
H
D
 
R
G
 
S
Y
 
V
I
 
V
K
 
D
L
 
V
-
 
R
T
 
A
V
 
V
T
 
G
T
 
A
E
 
D
S
 
G
M
 
S
T
 
V
R
 
V
S
 
T
V
 
V
A
 
S
G
 
G
T
 
T
V
 
L
F
 
Y
S
 
G
D
 
P
G
 
Q
-
 
L
K
 
S
P
 
Q
R
 
K
F
 
I
I
 
V
Q
 
Q
I
 
I
K
 
N
G
 
G
I
 
R
N
 
H
L
 
F
D
 
D
A
 
L
D
 
R
V
 
A
G
 
Q
S
 
G
H
 
I
M
 
N
I
 
L
Y
 
I
I
 
I
T
 
H
N
x
Y
T
 
V
D
|
D
V
x
R
P
|
P
G
|
G
M
x
A
I
x
L
G
 
G
F
 
K
I
 
I
G
 
G
T
 
T
T
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
T
A
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
Q
N
 
A
F
 
A
Q
 
Q
L
|
L
G
 
S
R
 
E
D
 
D
K
 
A
Q
 
E
G
 
G
G
 
P
D
 
G
A
 
A
I
 
T
A
 
I
L
 
L
L
 
L
Y
 
R
V
 
L
D
 
D
G
 
Q
K
 
D
V
 
V
D
 
P
D
 
D
A
 
D
V
 
V
L
 
R
A
 
T
E
 
A
L
 
I
T
 
A
A
 
A

3ddnB Crystal structure of hydroxypyruvic acid phosphate bound d-3- phosphoglycerate dehydrogenase in mycobacterium tuberculosis (see paper)
42% identity, 97% coverage: 3:516/531 of query aligns to 3:512/525 of 3ddnB

query
sites
3ddnB
P
 
P
R
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
I
S
 
A
D
 
D
E
 
K
L
 
L
S
 
A
E
 
P
T
 
S
A
 
T
V
 
V
Q
 
A
I
 
A
F
 
L
R
 
G
D
 
D
R
 
Q
G
 
-
V
 
V
E
 
E
V
 
V
D
 
R
F
 
W
E
 
V
P
 
D
Q
 
-
L
 
-
G
 
G
K
 
P
D
 
D
K
 
R
D
 
D
R
 
K
L
 
L
L
 
L
E
 
A
V
 
A
I
 
V
G
 
P
K
 
E
Y
 
A
D
 
D
G
 
A
L
 
L
A
 
L
I
 
V
R
 
R
S
 
S
A
 
A
T
 
T
K
 
T
V
 
V
T
 
D
E
 
A
K
 
E
I
 
V
I
 
L
E
 
A
G
 
A
A
 
A
T
 
P
N
 
K
L
 
L
K
 
K
V
 
I
V
 
V
G
 
A
R
|
R
A
 
A
G
 
G
I
x
V
G
 
G
V
 
L
D
 
D
N
 
N
V
 
V
D
 
D
I
 
V
P
 
D
A
 
A
A
 
A
S
 
T
R
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
V
I
 
L
V
 
V
M
 
V
N
 
N
T
 
A
P
 
P
F
 
T
G
 
S
N
|
N
S
 
I
I
 
H
T
 
S
T
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
H
A
 
A
I
 
L
A
 
A
L
 
L
M
 
L
F
 
L
A
 
A
V
 
A
A
 
S
R
 
R
Q
 
Q
L
 
I
P
 
P
A
 
A
A
 
A
D
 
D
T
 
A
S
 
S
T
 
L
Q
 
R
A
 
E
G
 
H
K
 
T
W
 
W
E
 
K
K
 
R
S
 
S
K
 
S
F
 
F
M
 
S
G
 
G
V
 
T
E
 
E
I
 
I
T
 
F
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
V
G
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
A
 
L
G
 
G
N
 
R
I
 
I
G
 
G
S
 
Q
I
 
L
V
 
V
C
 
A
A
 
Q
R
 
R
A
 
I
I
 
A
G
 
A
L
 
F
K
 
G
M
 
A
H
 
Y
V
 
V
V
 
V
A
 
A
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
F
 
Y
L
 
V
S
 
S
K
 
P
E
 
A
R
 
R
A
 
A
E
 
A
E
 
Q
M
 
L
G
 
G
V
 
I
T
 
E
K
 
L
V
 
L
E
 
S
L
 
L
E
 
D
E
 
D
L
 
L
F
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
D
 
D
F
 
F
I
 
I
T
 
S
L
 
V
H
 
H
V
 
L
P
 
P
M
 
K
T
 
T
D
 
P
K
 
E
T
 
T
R
 
A
G
 
G
I
 
L
L
 
I
N
 
D
K
 
K
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
K
T
 
T
K
 
K
P
 
P
G
 
G
V
 
V
R
 
I
I
 
I
I
 
V
N
 
N
C
 
A
A
 
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
D
A
 
A
I
 
I
K
 
T
S
 
G
G
 
G
H
 
H
V
 
V
A
 
R
G
 
A
A
 
A
A
 
G
F
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
A
V
 
T
E
|
E
P
 
P
A
 
C
K
 
T
E
 
D
S
 
S
P
 
P
L
 
L
F
 
F
G
 
E
L
 
L
P
 
A
N
 
Q
V
 
V
V
 
V
C
 
V
T
 
T
P
 
P
H
|
H
L
 
L
G
 
G
A
|
A
S
 
S
T
 
T
T
 
A
E
 
E
A
 
A
Q
|
Q
E
 
D
N
 
R
V
 
A
A
 
G
L
 
T
Q
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
E
Q
 
S
M
 
V
A
 
R
D
 
L
Y
 
A
L
 
L
V
 
A
N
 
G
G
 
E
A
 
F
V
 
V
S
 
P
N
 
D
A
 
A
I
 
V
N
 
N
M
 
V
-
 
G
P
 
G
S
 
G
I
 
V
T
 
V
A
 
N
E
 
E
E
 
E
A
 
-
P
 
-
I
 
-
L
 
V
K
 
A
P
 
P
F
 
W
I
 
L
R
 
D
L
 
L
A
 
V
D
 
R
V
 
K
L
 
L
G
 
G
A
 
V
F
 
L
V
 
A
G
 
G
Q
 
V
V
 
L
T
 
S
E
 
D
E
 
E
P
 
L
I
 
P
K
 
V
E
 
S
I
 
L
E
 
S
I
 
V
L
 
Q
Y
 
V
D
 
R
G
 
G
I
 
E
T
 
L
A
 
A
N
 
A
M
 
E
N
 
E
T
 
V
R
 
E
A
 
V
L
 
L
T
 
R
S
 
L
A
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
R
G
 
G
L
 
L
I
 
F
R
 
S
P
 
-
Q
 
A
V
 
V
A
 
I
D
 
E
V
 
V
N
 
T
M
 
F
V
 
V
S
 
N
A
 
A
P
 
P
I
 
A
M
 
L
I
 
A
K
 
A
E
 
E
K
 
R
G
 
G
I
 
V
V
 
T
L
 
A
S
 
E
E
 
I
V
 
C
K
 
K
R
 
A
D
 
S
K
 
E
T
 
S
G
 
P
V
 
N
F
 
H
D
 
R
G
 
S
Y
 
V
I
 
V
K
 
D
L
 
V
-
 
R
T
 
A
V
 
V
T
 
G
T
 
A
E
 
D
S
 
G
M
 
S
T
 
V
R
 
V
S
 
T
V
 
V
A
 
S
G
 
G
T
 
T
V
 
L
F
 
Y
S
 
G
D
 
P
G
 
Q
-
 
L
K
 
S
P
 
Q
R
 
K
F
 
I
I
 
V
Q
 
Q
I
 
I
K
 
N
G
 
G
I
 
R
N
 
H
L
 
F
D
 
D
A
 
L
D
 
R
V
 
A
G
 
Q
S
 
G
H
 
I
M
 
N
I
 
L
Y
 
I
I
 
I
T
 
H
N
 
Y
T
 
V
D
 
D
V
 
R
P
 
P
G
 
G
M
 
A
I
 
L
G
 
G
F
 
K
I
 
I
G
 
G
T
 
T
T
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
T
A
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
Q
N
 
A
F
 
A
Q
 
Q
L
 
L
G
 
S
R
 
E
D
 
D
K
 
A
Q
 
E
G
 
G
G
 
P
D
 
G
A
 
A
I
 
T
A
 
I
L
 
L
L
 
L
Y
 
R
V
 
L
D
 
D
G
 
Q
K
 
D
V
 
V
D
 
P
D
 
D
A
 
D
V
 
V
L
 
R
A
 
T
E
 
A
L
 
I
T
 
A
A
 
A

O43175 D-3-phosphoglycerate dehydrogenase; 3-PGDH; 2-oxoglutarate reductase; Malate dehydrogenase; EC 1.1.1.95; EC 1.1.1.399; EC 1.1.1.37 from Homo sapiens (Human) (see 3 papers)
42% identity, 74% coverage: 4:398/531 of query aligns to 8:402/533 of O43175

query
sites
O43175
R
 
K
V
 
V
L
 
L
V
 
I
S
 
S
D
 
D
E
 
S
L
 
L
S
 
D
E
 
P
T
 
C
A
 
C
V
 
R
Q
 
K
I
 
I
F
 
L
R
 
Q
D
 
D
R
 
G
G
 
G
V
 
L
E
 
Q
V
 
V
D
 
V
F
 
E
E
 
K
P
 
Q
Q
 
N
L
 
L
G
 
S
K
 
K
D
 
E
K
 
E
D
 
-
R
 
-
L
 
L
L
 
I
E
 
A
V
 
E
I
 
L
G
 
Q
K
 
D
Y
 
C
D
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
I
I
 
V
R
 
R
S
 
S
A
 
A
T
 
T
K
 
K
V
 
V
T
 
T
E
 
A
K
 
D
I
 
V
I
 
I
E
 
N
G
 
A
A
 
A
T
 
E
N
 
K
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
R
A
 
A
G
 
G
I
x
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
N
 
N
V
 
V
D
 
D
I
 
L
P
 
E
A
 
A
A
 
A
S
 
T
R
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
L
V
 
V
M
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
F
 
N
G
 
G
N
 
N
S
 
S
I
 
L
T
 
S
T
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
A
 
T
I
 
C
A
 
G
L
 
M
M
 
I
F
 
M
A
 
C
V
 
L
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
L
 
I
P
 
P
A
 
Q
A
 
A
D
 
T
T
 
A
S
 
S
T
 
M
Q
 
K
A
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
W
E
 
E
K
x
R
S
 
K
K
 
K
F
 
F
M
 
M
G
 
G
V
 
T
E
 
E
I
 
L
T
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
I
I
 
L
G
 
G
A
 
L
G
 
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
S
 
R
I
 
E
V
 
V
C
 
A
A
 
T
R
 
R
A
 
M
I
 
Q
G
 
S
L
 
F
K
 
G
M
 
M
H
 
K
V
 
T
V
 
I
A
 
G
Y
 
Y
D
|
D
P
 
P
F
 
I
L
 
I
S
 
S
K
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
E
 
A
E
 
S
M
 
F
G
 
G
V
 
V
T
 
Q
K
 
Q
V
 
L
E
 
P
L
 
L
E
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
A
 
P
R
 
L
A
 
C
D
 
D
F
 
F
I
 
I
T
 
T
L
 
V
H
 
H
V
x
T
P
 
P
M
 
L
T
 
L
D
 
P
K
 
S
T
 
T
R
 
T
G
 
G
I
 
L
L
 
L
N
 
N
K
 
D
E
 
N
A
 
T
L
 
F
A
 
A
K
 
Q
T
 
C
K
 
K
P
 
K
G
 
G
V
 
V
R
 
R
I
 
V
I
 
V
N
 
N
C
|
C
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
L
E
 
R
A
 
A
I
 
L
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
H
 
Q
V
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
L
D
|
D
V
|
V
F
 
F
E
 
T
V
 
E
E
 
E
P
 
P
A
 
P
K
 
R
E
 
D
S
 
R
P
 
A
L
 
L
F
 
V
G
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
C
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
L
|
L
G
|
G
A
|
A
S
 
S
T
 
T
T
 
K
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
E
 
S
N
 
R
V
 
C
A
 
G
L
 
E
Q
 
E
V
 
I
A
 
A
E
 
V
Q
 
Q
M
 
F
A
 
V
D
 
D
Y
 
M
L
 
V
V
 
K
N
 
G
G
 
K
A
 
S
V
 
L
S
 
T
N
 
G
A
 
V
I
 
V
N
 
N
M
 
A
P
 
Q
S
 
A
I
 
L
T
 
T
A
 
S
E
 
A
E
 
F
A
 
S
P
 
P
I
 
H
L
 
T
K
 
K
P
 
P
F
 
W
I
 
I
R
 
G
L
 
L
A
 
A
D
 
E
V
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
T
F
 
L
V
 
M
G
 
R
Q
 
A
V
 
W
T
 
A
E
 
G
E
 
S
P
 
P
I
 
K
K
 
G
E
 
T
I
 
I
E
 
Q
I
 
V
L
 
I
Y
 
T
D
 
Q
G
 
G
I
 
T
T
 
S
A
 
L
N
 
K
M
 
N
N
 
A
T
 
G
R
 
N
A
 
C
L
 
L
T
 
S
S
 
P
A
|
A
A
 
V
L
 
I
A
 
V
G
|
G
L
 
L
I
 
L
R
 
K
-
 
E
-
 
A
P
 
S
Q
 
K
V
 
Q
A
 
A
D
 
D
V
 
V
N
 
N
M
 
L
V
 
V
S
 
N
A
 
A
P
 
K
I
 
L
M
 
L
I
 
V
K
 
K
E
 
E
K
 
A
G
 
G
I
 
L

Sites not aligning to the query:

7ewhA Crystal structure of human phgdh in complex with homoharringtonine (see paper)
47% identity, 57% coverage: 4:305/531 of query aligns to 3:302/302 of 7ewhA

query
sites
7ewhA
R
 
K
V
 
V
L
 
L
V
 
I
S
 
S
D
 
D
E
 
S
L
 
L
S
 
D
E
 
P
T
 
C
A
 
C
V
 
R
Q
 
K
I
 
I
F
 
L
R
 
Q
D
 
D
R
 
G
G
 
G
V
 
L
E
 
Q
V
 
V
D
 
V
F
 
E
E
 
K
P
 
Q
Q
 
N
L
 
L
G
 
S
K
 
K
D
 
E
K
 
E
D
 
-
R
 
-
L
 
L
L
 
I
E
 
A
V
 
E
I
 
L
G
 
Q
K
 
D
Y
 
C
D
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
I
I
 
V
R
 
R
S
 
S
A
 
A
T
 
T
K
 
K
V
 
V
T
 
T
E
 
A
K
 
D
I
 
V
I
 
I
E
 
N
G
 
A
A
 
A
T
 
E
N
 
K
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
N
 
N
V
 
V
D
 
D
I
 
L
P
 
E
A
 
A
A
 
A
S
 
T
R
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
L
V
 
V
M
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
F
 
N
G
 
G
N
 
N
S
 
S
I
 
L
T
 
S
T
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
A
 
T
I
 
C
A
 
G
L
 
M
M
 
I
F
 
M
A
 
C
V
 
L
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
L
 
I
P
 
P
A
 
Q
A
 
A
D
 
T
T
 
A
S
 
S
T
 
M
Q
 
K
A
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
W
E
 
E
K
 
R
S
 
K
K
 
K
F
 
F
M
 
M
G
 
G
V
 
T
E
 
E
I
 
L
T
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
I
I
x
L
G
|
G
A
x
L
G
|
G
N
x
R
I
|
I
G
|
G
S
 
R
I
 
E
V
 
V
C
 
A
A
 
T
R
 
R
A
 
M
I
 
Q
G
 
S
L
 
F
K
 
G
M
 
M
H
 
K
V
 
T
V
 
I
A
 
G
Y
 
Y
D
|
D
P
 
P
F
 
I
L
 
I
S
 
S
K
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
E
 
A
E
 
S
M
 
F
G
 
G
V
 
V
T
 
Q
K
 
Q
V
 
L
E
 
P
L
 
L
E
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
A
 
P
R
 
L
A
 
C
D
 
D
F
 
F
I
 
I
T
 
T
L
 
V
H
|
H
V
x
T
P
|
P
M
 
L
T
 
L
D
 
P
K
 
S
T
 
T
R
 
T
G
 
G
I
 
L
L
 
L
N
 
N
K
 
D
E
 
N
A
 
T
L
 
F
A
 
A
K
 
Q
T
 
C
K
 
K
P
 
K
G
 
G
V
 
V
R
 
R
I
 
V
I
 
V
N
 
N
C
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
L
E
 
R
A
 
A
I
 
L
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
H
 
Q
V
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
V
 
E
E
 
E
P
 
P
A
 
P
K
 
R
E
 
D
S
 
R
P
 
A
L
 
L
F
 
V
G
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
C
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
T
 
T
T
 
K
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
E
 
S
N
 
R
V
 
C
A
 
G
L
 
E
Q
 
E
V
 
I
A
 
A
E
 
V
Q
 
Q
M
 
F
A
 
V
D
 
D
Y
 
M
L
 
V

6rihA Crystal structure of phgdh in complex with compound 9 (see paper)
47% identity, 57% coverage: 4:305/531 of query aligns to 3:302/302 of 6rihA

query
sites
6rihA
R
 
K
V
 
V
L
 
L
V
 
I
S
 
S
D
 
D
E
 
S
L
 
L
S
 
D
E
 
P
T
 
C
A
 
C
V
 
R
Q
 
K
I
 
I
F
 
L
R
 
Q
D
 
D
R
 
G
G
 
G
V
 
L
E
 
Q
V
 
V
D
 
V
F
 
E
E
 
K
P
 
Q
Q
 
N
L
 
L
G
 
S
K
 
K
D
 
E
K
 
E
D
 
-
R
 
-
L
 
L
L
 
I
E
 
A
V
 
E
I
 
L
G
 
Q
K
 
D
Y
 
C
D
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
I
I
 
V
R
 
R
S
 
S
A
 
A
T
 
T
K
 
K
V
 
V
T
 
T
E
 
A
K
 
D
I
 
V
I
 
I
E
 
N
G
 
A
A
 
A
T
 
E
N
 
K
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
N
 
N
V
 
V
D
 
D
I
 
L
P
 
E
A
 
A
A
 
A
S
 
T
R
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
L
V
 
V
M
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
F
 
N
G
 
G
N
 
N
S
 
S
I
 
L
T
 
S
T
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
A
 
T
I
 
C
A
 
G
L
 
M
M
 
I
F
 
M
A
 
C
V
 
L
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
L
 
I
P
 
P
A
 
Q
A
 
A
D
 
T
T
 
A
S
 
S
T
 
M
Q
 
K
A
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
W
E
 
E
K
 
R
S
 
K
K
 
K
F
 
F
M
 
M
G
 
G
V
 
T
E
 
E
I
 
L
T
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
I
I
 
L
G
 
G
A
 
L
G
|
G
N
 
R
I
 
I
G
 
G
S
 
R
I
 
E
V
 
V
C
 
A
A
 
T
R
 
R
A
 
M
I
 
Q
G
 
S
L
 
F
K
 
G
M
 
M
H
 
K
V
 
T
V
 
I
A
 
G
Y
|
Y
D
|
D
P
|
P
F
x
I
L
x
I
S
 
S
K
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
E
 
A
E
 
S
M
 
F
G
 
G
V
 
V
T
 
Q
K
 
Q
V
 
L
E
 
P
L
 
L
E
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
A
 
P
R
 
L
A
 
C
D
 
D
F
 
F
I
 
I
T
 
T
L
 
V
H
 
H
V
x
T
P
|
P
M
 
L
T
 
L
D
 
P
K
 
S
T
 
T
R
 
T
G
 
G
I
x
L
L
 
L
N
 
N
K
 
D
E
 
N
A
 
T
L
 
F
A
 
A
K
 
Q
T
 
C
K
 
K
P
 
K
G
 
G
V
 
V
R
 
R
I
 
V
I
 
V
N
 
N
C
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
L
E
 
R
A
 
A
I
 
L
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
H
 
Q
V
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
V
 
E
E
 
E
P
 
P
A
 
P
K
 
R
E
 
D
S
 
R
P
 
A
L
 
L
F
 
V
G
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
C
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
T
 
T
T
 
K
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
E
 
S
N
 
R
V
 
C
A
 
G
L
 
E
Q
 
E
V
 
I
A
 
A
E
 
V
Q
 
Q
M
 
F
A
 
V
D
 
D
Y
 
M
L
 
V

7dkmA Phgdh covalently linked to oridonin (see paper)
47% identity, 57% coverage: 4:305/531 of query aligns to 4:303/306 of 7dkmA

query
sites
7dkmA
R
 
K
V
 
V
L
 
L
V
 
I
S
 
S
D
 
D
E
 
S
L
 
L
S
 
D
E
 
P
T
x
C
A
 
C
V
 
R
Q
x
K
I
|
I
F
 
L
R
 
Q
D
 
D
R
 
G
G
 
G
V
 
L
E
 
Q
V
 
V
D
 
V
F
 
E
E
 
K
P
 
Q
Q
 
N
L
 
L
G
 
S
K
 
K
D
 
E
K
 
E
D
 
-
R
 
-
L
 
L
L
 
I
E
 
A
V
 
E
I
 
L
G
 
Q
K
 
D
Y
 
C
D
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
I
I
 
V
R
 
R
S
 
S
A
 
A
T
 
T
K
 
K
V
 
V
T
 
T
E
 
A
K
 
D
I
 
V
I
 
I
E
 
N
G
 
A
A
 
A
T
 
E
N
 
K
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
R
A
 
A
G
 
G
I
x
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
N
 
N
V
 
V
D
 
D
I
 
L
P
 
E
A
 
A
A
 
A
S
 
T
R
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
L
V
 
V
M
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
F
 
N
G
 
G
N
 
N
S
 
S
I
 
L
T
 
S
T
x
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
A
 
T
I
 
C
A
 
G
L
 
M
M
 
I
F
 
M
A
 
C
V
 
L
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
L
 
I
P
 
P
A
 
Q
A
 
A
D
 
T
T
 
A
S
 
S
T
 
M
Q
 
K
A
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
W
E
 
E
K
 
R
S
 
K
K
 
K
F
 
F
M
 
M
G
 
G
V
 
T
E
 
E
I
 
L
T
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
I
I
 
L
G
|
G
A
 
L
G
 
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
S
 
R
I
 
E
V
 
V
C
 
A
A
 
T
R
 
R
A
 
M
I
 
Q
G
 
S
L
 
F
K
 
G
M
 
M
H
 
K
V
 
T
V
 
I
A
 
G
Y
|
Y
D
|
D
P
|
P
F
x
I
L
 
I
S
 
S
K
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
E
 
A
E
 
S
M
 
F
G
 
G
V
 
V
T
 
Q
K
 
Q
V
 
L
E
 
P
L
 
L
E
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
A
 
P
R
 
L
A
 
C
D
 
D
F
 
F
I
 
I
T
 
T
L
 
V
H
|
H
V
x
T
P
|
P
M
 
L
T
 
L
D
 
P
K
 
S
T
|
T
R
 
T
G
 
G
I
 
L
L
 
L
N
 
N
K
 
D
E
 
N
A
 
T
L
 
F
A
 
A
K
 
Q
T
 
C
K
 
K
P
 
K
G
 
G
V
 
V
R
 
R
I
 
V
I
 
V
N
 
N
C
|
C
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
L
E
 
R
A
 
A
I
 
L
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
H
 
Q
V
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
V
 
E
E
 
E
P
 
P
A
 
P
K
 
R
E
 
D
S
 
R
P
 
A
L
 
L
F
 
V
G
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
C
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
L
 
L
G
|
G
A
 
A
S
 
S
T
 
T
T
 
K
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
E
 
S
N
 
R
V
 
C
A
 
G
L
x
E
Q
 
E
V
 
I
A
 
A
E
 
V
Q
 
Q
M
 
F
A
 
V
D
 
D
Y
 
M
L
 
V

6cwaA Crystal structure phgdh in complex with nadh and 3-phosphoglycerate at 1.77 a resolution (see paper)
47% identity, 56% coverage: 4:303/531 of query aligns to 2:299/299 of 6cwaA

query
sites
6cwaA
R
 
K
V
 
V
L
 
L
V
 
I
S
 
S
D
 
D
E
 
S
L
 
L
S
 
D
E
 
P
T
 
C
A
 
C
V
 
R
Q
 
K
I
 
I
F
 
L
R
 
Q
D
 
D
R
 
G
G
 
G
V
 
L
E
 
Q
V
 
V
D
 
V
F
 
E
E
 
K
P
 
Q
Q
 
N
L
 
L
G
 
S
K
 
K
D
 
E
K
 
E
D
 
-
R
 
-
L
 
L
L
 
I
E
 
A
V
 
E
I
 
L
G
 
Q
K
 
D
Y
 
C
D
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
I
I
 
V
R
 
R
S
 
S
A
 
A
T
 
T
K
 
K
V
 
V
T
 
T
E
 
A
K
 
D
I
 
V
I
 
I
E
 
N
G
 
A
A
 
A
T
 
E
N
 
K
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
N
 
N
V
 
V
D
 
D
I
 
L
P
 
E
A
 
A
A
 
A
S
 
T
R
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
L
V
 
V
M
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
F
 
N
G
 
G
N
|
N
S
 
S
I
 
L
T
 
S
T
x
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
A
 
T
I
 
C
A
 
G
L
 
M
M
 
I
F
 
M
A
 
C
V
 
L
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
L
 
I
P
 
P
A
 
Q
A
 
A
D
 
T
T
 
A
S
 
S
T
 
M
Q
 
K
A
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
W
E
 
E
K
 
R
S
 
K
K
 
K
F
 
F
M
 
M
G
 
G
V
 
T
E
 
E
I
 
L
T
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
I
I
 
L
G
 
G
A
 
L
G
 
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
S
 
R
I
 
E
V
 
V
C
 
A
A
 
T
R
 
R
A
 
M
I
 
Q
G
 
S
L
 
F
K
 
G
M
 
M
H
 
K
V
 
T
V
 
I
A
 
G
Y
|
Y
D
|
D
P
|
P
F
x
I
L
 
I
S
 
S
K
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
E
 
A
E
 
S
M
 
F
G
 
G
V
 
V
T
 
Q
K
 
Q
V
 
L
E
 
P
L
 
L
E
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
A
 
P
R
 
L
A
 
C
D
 
D
F
 
F
I
 
I
T
 
T
L
 
V
H
|
H
V
x
T
P
|
P
M
 
L
T
 
L
D
 
P
K
 
S
T
|
T
R
 
T
G
 
G
I
 
L
L
 
L
N
 
N
K
 
D
E
 
N
A
 
T
L
 
F
A
 
A
K
 
Q
T
 
C
K
 
K
P
 
K
G
 
G
V
 
V
R
 
R
I
 
V
I
 
V
N
 
N
C
|
C
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
L
E
 
R
A
 
A
I
 
L
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
H
 
Q
V
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
V
 
E
E
 
E
P
 
P
A
 
P
K
 
R
E
 
D
S
 
R
P
 
A
L
 
L
F
 
V
G
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
C
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
L
 
L
G
|
G
A
 
A
S
 
S
T
 
T
T
 
K
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
E
 
S
N
 
R
V
 
C
A
 
G
L
 
E
Q
 
E
V
 
I
A
 
A
E
 
V
Q
 
Q
M
 
F
A
 
V
D
 
D

6plgA Crystal structure of human phgdh complexed with compound 15 (see paper)
47% identity, 57% coverage: 4:305/531 of query aligns to 3:302/303 of 6plgA

query
sites
6plgA
R
 
K
V
 
V
L
 
L
V
 
I
S
 
S
D
 
D
E
 
S
L
 
L
S
 
D
E
 
P
T
 
C
A
 
C
V
 
R
Q
 
K
I
 
I
F
 
L
R
 
Q
D
 
D
R
 
G
G
 
G
V
 
L
E
 
Q
V
 
V
D
 
V
F
 
E
E
 
K
P
 
Q
Q
 
N
L
 
L
G
 
S
K
 
K
D
 
E
K
 
E
D
 
-
R
 
-
L
 
L
L
 
I
E
 
A
V
 
E
I
 
L
G
 
Q
K
 
D
Y
 
C
D
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
I
I
 
V
R
 
R
S
 
S
A
 
A
T
 
T
K
 
K
V
 
V
T
 
T
E
 
A
K
 
D
I
 
V
I
 
I
E
 
N
G
 
A
A
 
A
T
 
E
N
 
K
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
N
 
N
V
 
V
D
 
D
I
 
L
P
 
E
A
 
A
A
 
A
S
 
T
R
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
L
V
 
V
M
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
F
 
N
G
 
G
N
 
N
S
 
S
I
 
L
T
 
S
T
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
A
 
T
I
 
C
A
 
G
L
 
M
M
 
I
F
 
M
A
 
C
V
 
L
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
L
 
I
P
 
P
A
 
Q
A
 
A
D
 
T
T
 
A
S
 
S
T
 
M
Q
 
K
A
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
W
E
 
E
K
 
R
S
 
K
K
 
K
F
 
F
M
 
M
G
 
G
V
 
T
E
 
E
I
 
L
T
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
I
I
 
L
G
 
G
A
 
L
G
|
G
N
x
R
I
 
I
G
 
G
S
 
R
I
 
E
V
 
V
C
 
A
A
 
T
R
 
R
A
 
M
I
 
Q
G
 
S
L
 
F
K
 
G
M
 
M
H
 
K
V
 
T
V
 
I
A
 
G
Y
 
Y
D
|
D
P
|
P
F
x
I
L
x
I
S
 
S
K
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
E
 
A
E
 
S
M
 
F
G
 
G
V
 
V
T
 
Q
K
 
Q
V
 
L
E
 
P
L
 
L
E
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
A
 
P
R
 
L
A
 
C
D
 
D
F
 
F
I
 
I
T
 
T
L
 
V
H
|
H
V
x
T
P
 
P
M
 
L
T
x
L
D
 
P
K
 
S
T
 
T
R
 
T
G
 
G
I
 
L
L
 
L
N
 
N
K
 
D
E
 
N
A
 
T
L
 
F
A
 
A
K
 
Q
T
 
C
K
 
K
P
 
K
G
 
G
V
 
V
R
 
R
I
 
V
I
 
V
N
 
N
C
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
L
E
 
R
A
 
A
I
 
L
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
H
 
Q
V
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
V
 
E
E
 
E
P
 
P
A
 
P
K
 
R
E
 
D
S
 
R
P
 
A
L
 
L
F
 
V
G
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
C
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
T
 
T
T
 
K
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
E
 
S
N
 
R
V
 
C
A
 
G
L
 
E
Q
 
E
V
 
I
A
 
A
E
 
V
Q
 
Q
M
 
F
A
 
V
D
 
D
Y
 
M
L
 
V

6plfA Crystal structure of human phgdh complexed with compound 1 (see paper)
47% identity, 57% coverage: 4:305/531 of query aligns to 4:303/305 of 6plfA

query
sites
6plfA
R
 
K
V
 
V
L
 
L
V
 
I
S
 
S
D
 
D
E
 
S
L
 
L
S
 
D
E
 
P
T
 
C
A
 
C
V
 
R
Q
 
K
I
 
I
F
 
L
R
 
Q
D
 
D
R
 
G
G
 
G
V
 
L
E
 
Q
V
 
V
D
 
V
F
 
E
E
 
K
P
 
Q
Q
 
N
L
 
L
G
 
S
K
 
K
D
 
E
K
 
E
D
 
-
R
 
-
L
 
L
L
 
I
E
 
A
V
 
E
I
 
L
G
 
Q
K
 
D
Y
 
C
D
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
I
I
 
V
R
 
R
S
 
S
A
 
A
T
 
T
K
 
K
V
 
V
T
 
T
E
 
A
K
 
D
I
 
V
I
 
I
E
 
N
G
 
A
A
 
A
T
 
E
N
 
K
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
N
 
N
V
 
V
D
 
D
I
 
L
P
 
E
A
 
A
A
 
A
S
 
T
R
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
L
V
 
V
M
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
F
 
N
G
 
G
N
 
N
S
 
S
I
 
L
T
 
S
T
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
A
 
T
I
 
C
A
 
G
L
 
M
M
 
I
F
 
M
A
 
C
V
 
L
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
L
 
I
P
 
P
A
 
Q
A
 
A
D
 
T
T
 
A
S
 
S
T
 
M
Q
 
K
A
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
W
E
 
E
K
 
R
S
 
K
K
 
K
F
 
F
M
 
M
G
 
G
V
 
T
E
 
E
I
 
L
T
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
I
I
 
L
G
 
G
A
 
L
G
 
G
N
 
R
I
 
I
G
 
G
S
 
R
I
 
E
V
 
V
C
 
A
A
 
T
R
 
R
A
 
M
I
 
Q
G
 
S
L
 
F
K
 
G
M
 
M
H
 
K
V
 
T
V
 
I
A
 
G
Y
|
Y
D
|
D
P
|
P
F
 
I
L
 
I
S
 
S
K
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
E
 
A
E
 
S
M
 
F
G
 
G
V
 
V
T
 
Q
K
 
Q
V
 
L
E
 
P
L
|
L
E
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
A
 
P
R
 
L
A
 
C
D
 
D
F
 
F
I
 
I
T
 
T
L
 
V
H
|
H
V
x
T
P
|
P
M
 
L
T
 
L
D
 
P
K
 
S
T
 
T
R
 
T
G
 
G
I
x
L
L
 
L
N
 
N
K
 
D
E
 
N
A
 
T
L
 
F
A
 
A
K
 
Q
T
 
C
K
 
K
P
 
K
G
 
G
V
 
V
R
 
R
I
 
V
I
 
V
N
 
N
C
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
L
E
 
R
A
 
A
I
 
L
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
H
 
Q
V
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
V
 
E
E
 
E
P
 
P
A
 
P
K
 
R
E
 
D
S
 
R
P
 
A
L
 
L
F
 
V
G
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
C
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
T
 
T
T
 
K
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
E
 
S
N
 
R
V
 
C
A
 
G
L
 
E
Q
 
E
V
 
I
A
 
A
E
 
V
Q
 
Q
M
 
F
A
 
V
D
 
D
Y
 
M
L
 
V

6rj5A Crystal structure of phgdh in complex with compound 39 (see paper)
47% identity, 56% coverage: 4:303/531 of query aligns to 3:300/301 of 6rj5A

query
sites
6rj5A
R
 
K
V
 
V
L
 
L
V
 
I
S
 
S
D
 
D
E
 
S
L
 
L
S
 
D
E
 
P
T
 
C
A
 
C
V
 
R
Q
 
K
I
 
I
F
 
L
R
 
Q
D
 
D
R
 
G
G
 
G
V
 
L
E
 
Q
V
 
V
D
 
V
F
 
E
E
 
K
P
 
Q
Q
 
N
L
 
L
G
 
S
K
 
K
D
 
E
K
 
E
D
 
-
R
 
-
L
 
L
L
 
I
E
 
A
V
 
E
I
 
L
G
 
Q
K
 
D
Y
 
C
D
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
I
I
 
V
R
 
R
S
 
S
A
 
A
T
 
T
K
 
K
V
 
V
T
 
T
E
 
A
K
 
D
I
 
V
I
 
I
E
 
N
G
 
A
A
 
A
T
 
E
N
 
K
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
N
 
N
V
 
V
D
 
D
I
 
L
P
 
E
A
 
A
A
 
A
S
 
T
R
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
L
V
 
V
M
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
F
 
N
G
 
G
N
 
N
S
 
S
I
 
L
T
 
S
T
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
A
 
T
I
 
C
A
 
G
L
 
M
M
 
I
F
 
M
A
 
C
V
 
L
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
L
 
I
P
 
P
A
 
Q
A
 
A
D
 
T
T
 
A
S
 
S
T
 
M
Q
 
K
A
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
W
E
 
E
K
 
R
S
 
K
K
 
K
F
 
F
M
 
M
G
 
G
V
 
T
E
 
E
I
 
L
T
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
I
I
x
L
G
 
G
A
 
L
G
 
G
N
 
R
I
 
I
G
 
G
S
 
R
I
 
E
V
 
V
C
 
A
A
 
T
R
 
R
A
 
M
I
 
Q
G
 
S
L
 
F
K
 
G
M
 
M
H
 
K
V
 
T
V
 
I
A
 
G
Y
|
Y
D
|
D
P
|
P
F
 
I
L
x
I
S
 
S
K
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
E
 
A
E
 
S
M
 
F
G
 
G
V
 
V
T
 
Q
K
 
Q
V
 
L
E
 
P
L
 
L
E
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
A
 
P
R
 
L
A
 
C
D
 
D
F
 
F
I
 
I
T
 
T
L
 
V
H
|
H
V
x
T
P
|
P
M
 
L
T
 
L
D
 
P
K
 
S
T
 
T
R
 
T
G
 
G
I
x
L
L
 
L
N
 
N
K
 
D
E
 
N
A
 
T
L
 
F
A
 
A
K
 
Q
T
 
C
K
 
K
P
 
K
G
 
G
V
 
V
R
 
R
I
 
V
I
 
V
N
 
N
C
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
L
E
 
R
A
 
A
I
 
L
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
H
 
Q
V
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
V
 
E
E
 
E
P
 
P
A
 
P
K
 
R
E
 
D
S
 
R
P
 
A
L
 
L
F
 
V
G
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
C
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
T
 
T
T
 
K
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
E
 
S
N
 
R
V
 
C
A
 
G
L
 
E
Q
 
E
V
 
I
A
 
A
E
 
V
Q
 
Q
M
 
F
A
 
V
D
 
D

6rj2A Crystal structure of phgdh in complex with compound 40 (see paper)
47% identity, 57% coverage: 5:305/531 of query aligns to 1:299/299 of 6rj2A

query
sites
6rj2A
V
 
V
L
 
L
V
 
I
S
 
S
D
 
D
E
 
S
L
 
L
S
 
D
E
 
P
T
 
C
A
 
C
V
 
R
Q
 
K
I
 
I
F
 
L
R
 
Q
D
 
D
R
 
G
G
 
G
V
 
L
E
 
Q
V
 
V
D
 
V
F
 
E
E
 
K
P
 
Q
Q
 
N
L
 
L
G
 
S
K
 
K
D
 
E
K
 
E
D
 
-
R
 
-
L
 
L
L
 
I
E
 
A
V
 
E
I
 
L
G
 
Q
K
 
D
Y
 
C
D
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
I
I
 
V
R
 
R
S
 
S
A
 
A
T
 
T
K
 
K
V
 
V
T
 
T
E
 
A
K
 
D
I
 
V
I
 
I
E
 
N
G
 
A
A
 
A
T
 
E
N
 
K
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
N
 
N
V
 
V
D
 
D
I
 
L
P
 
E
A
 
A
A
 
A
S
 
T
R
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
L
V
 
V
M
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
F
 
N
G
 
G
N
 
N
S
 
S
I
 
L
T
 
S
T
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
A
 
T
I
 
C
A
 
G
L
 
M
M
 
I
F
 
M
A
 
C
V
 
L
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
L
 
I
P
 
P
A
 
Q
A
 
A
D
 
T
T
 
A
S
 
S
T
 
M
Q
 
K
A
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
W
E
 
E
K
 
R
S
 
K
K
 
K
F
 
F
M
 
M
G
 
G
V
 
T
E
 
E
I
 
L
T
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
I
I
 
L
G
 
G
A
 
L
G
|
G
N
 
R
I
|
I
G
 
G
S
 
R
I
 
E
V
 
V
C
 
A
A
 
T
R
 
R
A
 
M
I
 
Q
G
 
S
L
 
F
K
 
G
M
 
M
H
 
K
V
 
T
V
 
I
A
 
G
Y
|
Y
D
|
D
P
|
P
F
x
I
L
x
I
S
 
S
K
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
E
 
A
E
 
S
M
 
F
G
 
G
V
 
V
T
 
Q
K
 
Q
V
 
L
E
 
P
L
 
L
E
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
A
 
P
R
 
L
A
 
C
D
 
D
F
 
F
I
 
I
T
 
T
L
 
V
H
|
H
V
x
T
P
 
P
M
 
L
T
 
L
D
 
P
K
 
S
T
 
T
R
 
T
G
 
G
I
x
L
L
 
L
N
 
N
K
 
D
E
 
N
A
 
T
L
 
F
A
 
A
K
 
Q
T
 
C
K
 
K
P
 
K
G
 
G
V
 
V
R
 
R
I
 
V
I
 
V
N
 
N
C
 
C
A
 
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
L
E
 
R
A
 
A
I
 
L
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
H
 
Q
V
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
V
 
E
E
 
E
P
 
P
A
 
P
K
 
R
E
 
D
S
 
R
P
 
A
L
 
L
F
 
V
G
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
C
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
T
 
T
T
 
K
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
E
 
S
N
 
R
V
 
C
A
 
G
L
 
E
Q
 
E
V
 
I
A
 
A
E
 
V
Q
 
Q
M
 
F
A
 
V
D
 
D
Y
 
M
L
 
V

6rj3A Crystal structure of phgdh in complex with compound 15 (see paper)
47% identity, 56% coverage: 4:301/531 of query aligns to 2:297/297 of 6rj3A

query
sites
6rj3A
R
 
K
V
 
V
L
 
L
V
 
I
S
 
S
D
 
D
E
 
S
L
 
L
S
 
D
E
 
P
T
 
C
A
 
C
V
 
R
Q
 
K
I
 
I
F
 
L
R
 
Q
D
 
D
R
 
G
G
 
G
V
 
L
E
 
Q
V
 
V
D
 
V
F
 
E
E
 
K
P
 
Q
Q
 
N
L
 
L
G
 
S
K
 
K
D
 
E
K
 
E
D
 
-
R
 
-
L
 
L
L
 
I
E
 
A
V
 
E
I
 
L
G
 
Q
K
 
D
Y
 
C
D
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
I
I
 
V
R
 
R
S
 
S
A
 
A
T
 
T
K
 
K
V
 
V
T
 
T
E
 
A
K
 
D
I
 
V
I
 
I
E
 
N
G
 
A
A
 
A
T
 
E
N
 
K
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
N
 
N
V
 
V
D
 
D
I
 
L
P
 
E
A
 
A
A
 
A
S
 
T
R
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
L
V
 
V
M
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
F
 
N
G
 
G
N
 
N
S
 
S
I
 
L
T
 
S
T
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
A
 
T
I
 
C
A
 
G
L
 
M
M
 
I
F
 
M
A
 
C
V
 
L
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
L
 
I
P
 
P
A
 
Q
A
 
A
D
 
T
T
 
A
S
 
S
T
 
M
Q
 
K
A
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
W
E
 
E
K
 
R
S
 
K
K
 
K
F
 
F
M
 
M
G
 
G
V
 
T
E
 
E
I
 
L
T
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
I
I
x
L
G
 
G
A
 
L
G
 
G
N
 
R
I
 
I
G
 
G
S
 
R
I
 
E
V
 
V
C
 
A
A
 
T
R
 
R
A
 
M
I
 
Q
G
 
S
L
 
F
K
 
G
M
 
M
H
 
K
V
 
T
V
 
I
A
 
G
Y
|
Y
D
|
D
P
|
P
F
x
I
L
x
I
S
 
S
K
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
E
 
A
E
 
S
M
 
F
G
 
G
V
 
V
T
 
Q
K
 
Q
V
 
L
E
 
P
L
 
L
E
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
A
 
P
R
 
L
A
 
C
D
 
D
F
 
F
I
 
I
T
 
T
L
 
V
H
|
H
V
x
T
P
|
P
M
 
L
T
 
L
D
 
P
K
 
S
T
 
T
R
 
T
G
 
G
I
x
L
L
 
L
N
 
N
K
 
D
E
 
N
A
 
T
L
 
F
A
 
A
K
 
Q
T
 
C
K
 
K
P
 
K
G
 
G
V
 
V
R
 
R
I
 
V
I
 
V
N
 
N
C
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
L
E
 
R
A
 
A
I
 
L
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
H
 
Q
V
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
V
 
E
E
 
E
P
 
P
A
 
P
K
 
R
E
 
D
S
 
R
P
 
A
L
 
L
F
 
V
G
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
C
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
T
 
T
T
 
K
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
E
 
S
N
 
R
V
 
C
A
 
G
L
 
E
Q
 
E
V
 
I
A
 
A
E
 
V
Q
 
Q
M
 
F

6plfB Crystal structure of human phgdh complexed with compound 1 (see paper)
46% identity, 56% coverage: 4:303/531 of query aligns to 2:291/292 of 6plfB

query
sites
6plfB
R
 
K
V
 
V
L
 
L
V
 
I
S
 
S
D
 
D
E
 
S
L
 
L
S
 
D
E
 
P
T
 
C
A
 
C
V
 
R
Q
 
K
I
 
I
F
 
L
R
 
Q
D
 
D
R
 
G
G
 
G
V
 
L
E
 
Q
V
 
V
D
 
-
F
 
V
E
 
E
P
 
K
Q
 
Q
L
 
-
G
 
-
K
 
-
D
 
-
K
 
-
D
 
N
R
 
L
L
 
L
L
 
I
E
 
A
V
 
E
I
 
L
G
 
Q
K
 
D
Y
 
C
D
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
I
I
 
V
R
 
R
S
 
S
A
 
A
T
 
A
K
 
D
V
 
V
T
 
-
E
 
-
K
 
-
I
 
-
I
 
I
E
 
N
G
 
A
A
 
A
T
 
E
N
 
K
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
N
 
N
V
 
V
D
 
D
I
 
L
P
 
E
A
 
A
A
 
A
S
 
T
R
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
L
V
 
V
M
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
F
 
N
G
 
G
N
 
N
S
 
S
I
 
L
T
 
S
T
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
A
 
T
I
 
C
A
 
G
L
 
M
M
 
I
F
 
M
A
 
C
V
 
L
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
L
 
I
P
 
P
A
 
Q
A
 
A
D
 
T
T
 
A
S
 
S
T
 
M
Q
 
K
A
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
W
E
 
E
K
 
R
S
 
K
K
 
K
F
 
F
M
 
M
G
 
G
V
 
T
E
 
E
I
 
L
T
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
I
I
 
L
G
 
G
A
 
L
G
 
G
N
x
R
I
 
I
G
 
G
S
 
R
I
 
E
V
 
V
C
 
A
A
 
T
R
 
R
A
 
M
I
 
Q
G
 
S
L
 
F
K
 
G
M
 
M
H
 
K
V
 
T
V
 
I
A
 
G
Y
|
Y
D
|
D
P
|
P
F
 
I
L
x
I
S
 
S
K
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
E
 
A
E
 
S
M
 
F
G
 
G
V
 
V
T
 
Q
K
 
Q
V
 
L
E
 
P
L
|
L
E
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
A
 
P
R
 
L
A
 
C
D
 
D
F
 
F
I
 
I
T
 
T
L
 
V
H
 
H
V
x
T
P
|
P
M
 
L
T
 
L
D
 
P
K
x
S
T
 
T
R
 
T
G
 
G
I
x
L
L
 
L
N
 
N
K
 
D
E
 
N
A
 
T
L
 
F
A
 
A
K
 
Q
T
 
C
K
 
K
P
 
K
G
 
G
V
 
V
R
 
R
I
 
V
I
 
V
N
 
N
C
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
L
E
 
R
A
 
A
I
 
L
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
H
 
Q
V
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
V
 
E
E
 
E
P
 
P
A
 
P
K
 
R
E
 
D
S
 
R
P
 
A
L
 
L
F
 
V
G
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
C
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
T
 
T
T
 
K
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
E
 
S
N
 
R
V
 
C
A
 
G
L
 
E
Q
 
E
V
 
I
A
 
A
E
 
V
Q
 
Q
M
 
F
A
 
V
D
 
D

1wwkA Crystal structure of phosphoglycerate dehydrogenase from pyrococcus horikoshii ot3
45% identity, 57% coverage: 4:305/531 of query aligns to 2:302/304 of 1wwkA

query
sites
1wwkA
R
 
K
V
 
V
L
 
L
V
 
V
S
 
A
D
 
A
E
 
P
L
 
L
S
 
H
E
 
E
T
 
K
A
 
A
V
 
I
Q
 
Q
I
 
V
F
 
L
R
 
K
D
 
D
R
 
A
G
 
G
V
 
L
E
 
E
V
 
V
D
 
I
F
 
Y
E
 
E
P
 
E
Q
 
Y
L
 
-
G
 
-
K
 
P
D
 
D
K
 
E
D
 
D
R
 
R
L
 
L
L
 
V
E
 
E
V
 
L
I
 
V
G
 
K
K
 
D
Y
 
V
D
 
E
G
 
A
L
 
I
A
 
I
I
 
V
R
 
R
S
 
S
A
 
K
T
 
P
K
 
K
V
 
V
T
 
T
E
 
R
K
 
R
I
 
V
I
 
I
E
 
E
G
 
S
A
 
A
T
 
P
N
 
K
L
 
L
K
 
K
V
 
V
V
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
V
G
 
G
V
 
L
D
 
D
N
 
N
V
 
I
D
 
D
I
 
V
P
 
E
A
 
A
A
 
A
S
 
K
R
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
E
V
 
V
M
 
V
N
 
N
T
 
A
P
 
P
F
 
A
G
 
A
N
x
S
S
 
S
I
 
R
T
 
S
T
x
V
A
 
A
E
 
E
H
 
L
A
 
A
I
 
V
A
 
G
L
 
L
M
 
M
F
 
F
A
 
S
V
 
V
A
 
A
R
 
R
Q
 
K
L
 
I
P
 
A
A
 
F
A
 
A
D
 
D
T
 
R
S
 
K
T
 
M
Q
 
R
A
 
E
G
 
G
K
 
V
W
 
W
E
 
A
K
 
K
S
 
K
K
 
E
F
 
A
M
 
M
G
 
G
V
 
I
E
 
E
I
 
L
T
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
V
 
I
I
 
I
G
|
G
A
x
F
G
|
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
S
 
Y
I
 
Q
V
 
V
C
 
A
A
 
K
R
 
I
A
 
A
I
 
N
G
 
A
L
 
L
K
 
G
M
 
M
H
 
N
V
 
I
V
 
L
A
 
L
Y
|
Y
D
|
D
P
|
P
F
 
Y
L
 
P
S
 
N
K
 
E
E
 
E
R
 
R
A
 
A
E
 
K
E
 
E
M
 
V
G
 
N
V
 
G
T
 
K
K
 
F
V
 
V
E
 
D
L
 
L
E
 
E
E
 
T
L
 
L
F
 
L
A
 
K
R
 
E
A
 
S
D
 
D
F
 
V
I
 
V
T
 
T
L
 
I
H
 
H
V
|
V
P
|
P
M
 
L
T
 
V
D
 
E
K
 
S
T
|
T
R
 
Y
G
 
H
I
 
L
L
 
I
N
 
N
K
 
E
E
 
E
A
 
R
L
 
L
A
 
K
K
 
L
T
 
M
K
 
K
P
 
K
G
 
T
V
 
A
R
 
I
I
 
L
I
 
I
N
 
N
C
x
T
A
x
S
R
|
R
G
 
G
G
 
P
L
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
A
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
V
E
 
K
A
 
A
I
 
L
K
 
K
S
 
E
G
 
G
H
 
W
V
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
F
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
V
 
E
E
|
E
P
 
P
-
 
L
A
 
P
K
 
K
E
 
D
S
 
H
P
 
P
L
 
L
F
 
T
G
 
K
L
 
F
P
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
V
C
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
L
 
I
G
|
G
A
 
A
S
 
S
T
 
T
T
 
V
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
N
 
R
V
 
A
A
 
G
L
 
V
Q
 
E
V
 
V
A
 
A
E
 
E
Q
 
K
M
 
V
A
 
V
D
 
K
Y
 
I
L
 
L

7cvpA The crystal structure of human phgdh from biortus.
47% identity, 42% coverage: 82:303/531 of query aligns to 33:254/254 of 7cvpA

query
sites
7cvpA
D
 
D
I
 
V
P
 
I
A
 
V
A
 
V
S
 
G
R
 
R
R
 
A
G
 
G
I
 
T
I
 
L
V
 
V
M
 
M
N
 
N
T
 
T
P
 
P
F
 
N
G
 
G
N
 
N
S
 
S
I
 
L
T
 
S
T
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
A
 
T
I
 
C
A
 
G
L
 
M
M
 
I
F
 
M
A
 
C
V
 
L
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
L
 
I
P
 
P
A
 
Q
A
 
A
D
 
T
T
 
A
S
 
S
T
 
M
Q
 
K
A
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
W
E
 
E
K
 
R
S
 
K
K
 
K
F
 
F
M
 
M
G
 
G
V
 
T
E
 
E
I
 
L
T
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
I
I
 
L
G
|
G
A
 
L
G
|
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
S
 
R
I
 
E
V
 
V
C
 
A
A
 
T
R
 
R
A
 
M
I
 
Q
G
 
S
L
 
F
K
 
G
M
 
M
H
 
K
V
 
T
V
 
I
A
 
G
Y
|
Y
D
|
D
P
|
P
F
x
I
L
 
I
S
 
S
K
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
E
 
A
E
 
S
M
 
F
G
 
G
V
 
V
T
 
Q
K
 
Q
V
 
L
E
 
P
L
 
L
E
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
A
 
P
R
 
L
A
 
C
D
 
D
F
 
F
I
 
I
T
 
T
L
 
V
H
|
H
V
x
T
P
|
P
M
 
L
T
 
L
D
 
P
K
 
S
T
|
T
R
 
T
G
 
G
I
 
L
L
 
L
N
 
N
K
 
D
E
 
N
A
 
T
L
 
F
A
 
A
K
 
Q
T
 
C
K
 
K
P
 
K
G
 
G
V
 
V
R
 
R
I
 
V
I
 
V
N
 
N
C
|
C
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
L
E
 
R
A
 
A
I
 
L
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
H
 
Q
V
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
V
 
E
E
 
E
P
 
P
A
 
P
K
 
R
E
 
D
S
 
R
P
 
A
L
 
L
F
 
V
G
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
C
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
L
 
L
G
|
G
A
 
A
S
 
S
T
 
T
T
 
K
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
E
 
S
N
 
R
V
 
C
A
 
G
L
 
E
Q
 
E
V
 
I
A
 
A
E
 
V
Q
 
Q
M
 
F
A
 
V
D
 
D

P87228 Putative D-3-phosphoglycerate dehydrogenase; 3-PGDH; 2-oxoglutarate reductase; EC 1.1.1.95; EC 1.1.1.399 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
36% identity, 60% coverage: 4:320/531 of query aligns to 57:383/466 of P87228

query
sites
P87228
R
 
K
V
 
I
L
 
L
V
 
L
S
 
L
D
 
E
E
 
N
L
 
V
S
 
N
E
 
Q
T
 
S
A
 
A
V
 
L
Q
 
S
I
 
N
F
 
L
R
 
K
D
 
D
R
 
E
G
 
G
V
 
Y
E
 
Q
V
 
V
D
 
E
F
 
F
E
 
-
P
 
L
Q
 
K
L
 
T
G
 
S
K
 
M
D
x
S
K
 
E
D
 
D
R
 
D
L
 
L
L
 
V
E
 
E
V
 
K
I
 
I
G
 
K
K
 
G
Y
 
V
D
 
H
G
 
A
L
 
I
A
 
G
I
 
I
R
 
R
S
 
S
A
 
K
T
 
T
K
 
R
V
 
L
T
 
T
E
 
R
K
 
R
I
 
V
I
 
L
E
 
E
G
 
A
A
 
A
T
 
D
N
 
S
L
 
L
K
 
I
V
 
V
V
 
I
G
 
G
R
 
C
A
 
F
G
 
C
I
 
I
G
 
G
V
 
T
D
 
N
N
 
Q
V
 
V
D
 
D
I
 
L
P
 
D
A
 
F
A
 
A
S
 
A
R
 
E
R
 
R
G
 
G
I
 
I
I
 
A
V
 
V
M
 
F
N
 
N
T
 
S
P
 
P
F
 
Y
G
 
A
N
 
N
S
 
S
I
 
R
T
 
S
T
 
V
A
 
A
E
 
E
H
 
L
A
 
V
I
 
I
A
 
G
L
 
Y
M
 
I
F
 
I
A
 
S
V
 
L
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
L
 
V
P
 
G
A
 
D
A
 
R
D
 
S
T
 
L
S
 
E
T
 
L
Q
 
H
A
 
R
G
 
G
K
 
E
W
 
W
E
 
N
K
 
K
S
 
V
K
 
S
F
 
S
M
 
G
G
 
C
V
 
W
E
 
E
I
 
I
T
 
R
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
Y
G
 
G
N
 
H
I
 
I
G
 
G
S
 
S
I
 
Q
V
 
L
C
 
S
A
 
V
R
 
L
A
 
A
I
 
E
G
 
A
L
 
M
K
 
G
M
 
L
H
 
H
V
 
V
V
 
V
A
 
Y
Y
 
Y
D
 
D
-
 
I
-
 
L
P
 
P
F
 
I
L
 
M
S
 
P
K
 
L
E
 
G
R
 
S
A
 
A
E
 
K
E
 
Q
M
 
L
G
 
S
V
 
-
T
 
-
K
 
-
V
 
-
E
 
S
L
 
L
E
 
P
E
 
E
L
 
L
F
 
L
A
 
H
R
 
R
A
 
A
D
 
D
F
 
F
I
 
V
T
 
S
L
 
L
H
 
H
V
 
V
P
 
P
M
 
A
T
x
S
D
 
P
K
 
E
T
 
T
R
 
K
G
 
N
I
 
M
L
 
I
N
 
S
K
 
S
E
 
K
A
 
E
L
 
F
A
 
A
K
 
A
T
 
M
K
 
K
P
 
E
G
 
G
V
 
S
R
 
Y
I
 
L
I
 
I
N
 
N
C
 
A
A
 
S
R
 
R
G
 
G
G
 
T
L
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
I
A
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
V
E
 
D
A
 
A
I
 
S
K
 
K
S
 
S
G
 
G
H
 
K
V
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
I
D
 
D
V
 
V
F
 
Y
E
 
P
V
 
S
E
 
E
P
 
P
A
 
A
K
 
G
E
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
D
-
 
K
-
 
F
-
 
V
-
 
D
-
 
S
-
 
L
-
 
N
-
 
S
-
 
W
-
 
T
S
 
S
P
 
E
L
 
L
F
 
T
G
 
H
L
 
C
P
 
K
N
 
N
V
 
I
V
 
I
C
 
L
T
 
T
P
 
P
H
 
H
L
 
I
G
 
G
A
 
G
S
 
S
T
 
T
T
 
E
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
E
 
Y
N
 
N
V
 
I
A
 
G
L
 
I
Q
 
E
V
 
V
A
 
S
E
 
E
Q
 
A
M
 
L
A
 
T
D
 
R
Y
 
Y
L
 
I
V
 
N
N
 
E
G
 
G
A
 
N
V
 
S
S
 
I
N
 
G
A
 
A
I
 
V
N
 
N
M
 
F
P
 
P
S
 
E
I
 
V
T
 
S

5aovA Ternary crystal structure of pyrococcus furiosus glyoxylate hydroxypyruvate reductase in presence of glyoxylate (see paper)
35% identity, 57% coverage: 1:301/531 of query aligns to 1:308/334 of 5aovA

query
sites
5aovA
M
 
M
A
 
K
P
 
P
R
 
K
V
 
V
L
 
F
V
 
I
S
 
T
D
 
R
E
 
A
L
 
I
S
 
P
E
 
E
T
 
N
A
 
G
V
 
I
Q
 
N
I
 
M
F
 
L
R
 
E
D
 
E
R
 
E
G
 
F
V
 
E
E
 
V
V
 
E
D
 
V
F
 
W
E
 
E
P
 
E
Q
 
E
L
 
R
G
 
E
K
 
I
D
 
P
K
 
R
D
 
E
R
 
K
L
 
L
L
 
L
E
 
E
V
 
K
I
 
V
G
 
K
K
 
D
Y
 
V
D
 
D
G
 
A
L
 
L
A
 
V
I
 
T
R
x
M
S
x
L
A
 
S
T
 
E
K
 
R
V
 
I
T
 
D
E
 
Q
K
 
E
I
 
V
I
 
F
E
 
E
G
 
N
A
 
A
T
 
P
N
 
R
L
 
L
K
 
R
V
 
I
V
 
V
G
 
A
R
 
N
A
x
Y
G
x
A
I
x
V
G
|
G
V
 
Y
D
 
D
N
 
N
V
 
I
D
 
D
I
 
V
P
 
E
A
 
E
A
 
A
S
 
T
R
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
I
I
 
Y
V
 
V
M
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
F
 
D
G
 
V
N
x
L
S
 
T
I
 
N
T
 
A
T
|
T
A
 
A
E
 
D
H
 
H
A
 
A
I
 
F
A
 
A
L
 
L
M
 
L
F
 
L
A
 
A
V
 
T
A
 
A
R
 
R
Q
 
H
L
 
V
P
 
V
A
 
K
A
 
G
D
 
D
T
 
K
S
 
F
T
 
V
Q
 
R
A
 
S
G
 
G
K
 
E
W
 
W
E
 
K
K
 
R
S
 
K
-
 
G
-
 
I
-
 
A
-
 
W
-
 
H
-
 
P
-
 
K
K
 
W
F
 
F
M
 
L
G
 
G
V
 
Y
E
 
E
I
 
L
T
 
Y
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
V
 
I
I
 
V
G
 
G
A
x
F
G
|
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
S
 
Q
I
 
A
V
 
I
C
 
A
A
 
R
R
 
R
A
 
A
I
 
K
G
 
G
L
 
F
K
 
N
M
 
M
H
 
R
V
 
I
V
 
L
A
 
Y
Y
 
Y
D
x
S
P
x
R
F
 
T
L
 
R
S
 
K
K
 
S
E
 
Q
R
 
A
A
 
E
E
 
K
E
 
E
M
 
L
G
 
G
V
 
A
T
 
E
K
 
Y
V
 
R
E
 
P
L
 
L
E
 
E
E
 
E
L
 
V
F
 
L
A
 
K
R
 
E
A
 
S
D
 
D
F
 
F
I
 
V
T
 
I
L
 
L
H
x
A
V
|
V
P
|
P
M
 
L
T
 
T
D
 
K
K
 
E
T
|
T
R
 
M
G
 
Y
I
 
M
L
 
I
N
 
N
K
 
E
E
 
E
A
 
R
L
 
L
A
 
K
K
 
L
T
 
M
K
 
K
P
 
P
G
 
T
V
 
A
R
 
I
I
 
L
I
 
V
N
 
N
C
x
I
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
K
L
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
A
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
I
E
 
K
A
 
A
I
 
L
K
 
K
S
 
E
G
 
G
H
 
W
V
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
F
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
V
 
E
E
|
E
P
 
P
A
 
Y
K
 
Y
E
 
N
S
 
E
P
 
E
L
 
L
F
 
F
G
 
S
L
 
L
P
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
V
C
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
L
 
I
G
|
G
A
 
S
S
 
A
T
 
T
T
 
F
E
 
E
A
 
A
Q
 
R
E
 
E
N
 
A
V
 
M
A
 
A
L
 
E
Q
 
L
V
 
V
A
 
A
E
 
R
Q
 
N
M
 
L

5ofwA Crystal structure of human 3-phosphoglycerate dehydrogenase in complex with 3-chloro-4-fluorobenzamide (see paper)
48% identity, 36% coverage: 99:290/531 of query aligns to 2:193/195 of 5ofwA

query
sites
5ofwA
G
 
G
N
|
N
S
 
S
I
 
L
T
 
S
T
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
A
 
T
I
 
C
A
 
G
L
 
M
M
 
I
F
 
M
A
 
C
V
 
L
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
L
 
I
P
 
P
A
 
Q
A
 
A
D
 
T
T
 
A
S
 
S
T
 
M
Q
 
K
A
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
W
E
 
E
K
 
R
S
 
K
K
 
K
F
 
F
M
 
M
G
 
G
V
 
T
E
 
E
I
 
L
T
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
I
I
 
L
G
|
G
A
 
L
G
 
G
N
 
R
I
 
I
G
 
G
S
 
R
I
 
E
V
 
V
C
 
A
A
 
T
R
 
R
A
 
M
I
 
Q
G
 
S
L
 
F
K
 
G
M
 
M
H
 
K
V
 
T
V
 
I
A
 
G
Y
|
Y
D
 
D
P
|
P
F
 
I
L
 
I
S
 
S
K
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
E
 
A
E
 
S
M
 
F
G
 
G
V
 
V
T
 
Q
K
 
Q
V
 
L
E
 
P
L
 
L
E
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
A
 
P
R
 
L
A
 
C
D
 
D
F
 
F
I
 
I
T
 
T
L
 
V
H
 
H
V
x
T
P
 
P
M
 
L
T
 
L
D
 
P
K
x
S
T
|
T
R
 
T
G
 
G
I
x
L
L
 
L
N
 
N
K
 
D
E
 
N
A
 
T
L
 
F
A
 
A
K
 
Q
T
 
C
K
 
K
P
 
K
G
 
G
V
 
V
R
 
R
I
 
V
I
 
V
N
 
N
C
 
C
A
 
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
L
E
 
R
A
 
A
I
 
L
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
H
 
Q
V
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
V
 
E
E
|
E
P
 
P
A
 
P
K
 
R
E
 
D
S
 
R
P
 
A
L
 
L
F
 
V
G
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
C
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
T
 
T
T
 
K
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q

5ofvA Crystal structure of human 3-phosphoglycerate dehydrogenase in complex with 5-fluoro-2-methylbenzoic acid (see paper)
48% identity, 36% coverage: 99:290/531 of query aligns to 2:193/195 of 5ofvA

query
sites
5ofvA
G
 
G
N
|
N
S
 
S
I
 
L
T
 
S
T
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
A
 
T
I
 
C
A
 
G
L
 
M
M
 
I
F
 
M
A
 
C
V
 
L
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
L
 
I
P
 
P
A
 
Q
A
 
A
D
 
T
T
 
A
S
 
S
T
 
M
Q
 
K
A
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
W
E
 
E
K
 
R
S
 
K
K
 
K
F
 
F
M
 
M
G
 
G
V
 
T
E
 
E
I
 
L
T
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
I
I
 
L
G
 
G
A
 
L
G
 
G
N
 
R
I
 
I
G
 
G
S
 
R
I
 
E
V
 
V
C
 
A
A
 
T
R
 
R
A
 
M
I
 
Q
G
 
S
L
 
F
K
 
G
M
 
M
H
 
K
V
 
T
V
 
I
A
 
G
Y
|
Y
D
 
D
P
|
P
F
 
I
L
 
I
S
 
S
K
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
E
 
A
E
 
S
M
 
F
G
 
G
V
 
V
T
 
Q
K
 
Q
V
 
L
E
 
P
L
 
L
E
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
A
 
P
R
 
L
A
 
C
D
 
D
F
 
F
I
 
I
T
 
T
L
 
V
H
 
H
V
x
T
P
 
P
M
 
L
T
 
L
D
 
P
K
 
S
T
|
T
R
 
T
G
 
G
I
 
L
L
 
L
N
 
N
K
 
D
E
 
N
A
 
T
L
 
F
A
 
A
K
 
Q
T
 
C
K
 
K
P
 
K
G
 
G
V
 
V
R
 
R
I
 
V
I
 
V
N
 
N
C
 
C
A
 
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
L
E
 
R
A
 
A
I
 
L
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
H
 
Q
V
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
V
 
E
E
|
E
P
 
P
A
 
P
K
 
R
E
 
D
S
 
R
P
 
A
L
 
L
F
 
V
G
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
C
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
T
 
T
T
 
K
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q

5ofmA Crystal structure of human 3-phosphoglycerate dehydrogenase in complex with 5-amino-1-methyl-1h-indole
48% identity, 36% coverage: 99:290/531 of query aligns to 2:193/195 of 5ofmA

query
sites
5ofmA
G
 
G
N
|
N
S
 
S
I
 
L
T
 
S
T
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
A
 
T
I
 
C
A
 
G
L
 
M
M
 
I
F
 
M
A
 
C
V
 
L
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
L
 
I
P
 
P
A
 
Q
A
 
A
D
 
T
T
 
A
S
 
S
T
 
M
Q
 
K
A
 
D
G
 
G
K
 
K
W
 
W
E
 
E
K
 
R
S
 
K
K
 
K
F
 
F
M
 
M
G
 
G
V
 
T
E
 
E
I
 
L
T
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
I
I
 
L
G
 
G
A
 
L
G
 
G
N
 
R
I
 
I
G
 
G
S
 
R
I
 
E
V
 
V
C
 
A
A
 
T
R
 
R
A
 
M
I
 
Q
G
 
S
L
 
F
K
 
G
M
 
M
H
 
K
V
 
T
V
 
I
A
 
G
Y
|
Y
D
 
D
P
|
P
F
 
I
L
 
I
S
 
S
K
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
E
 
A
E
 
S
M
 
F
G
 
G
V
 
V
T
 
Q
K
 
Q
V
 
L
E
 
P
L
 
L
E
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
A
 
P
R
 
L
A
 
C
D
 
D
F
 
F
I
 
I
T
 
T
L
 
V
H
 
H
V
x
T
P
|
P
M
 
L
T
 
L
D
 
P
K
x
S
T
|
T
R
 
T
G
 
G
I
 
L
L
 
L
N
 
N
K
 
D
E
 
N
A
 
T
L
 
F
A
 
A
K
 
Q
T
 
C
K
 
K
P
 
K
G
 
G
V
 
V
R
 
R
I
 
V
I
 
V
N
 
N
C
 
C
A
 
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
L
E
 
R
A
 
A
I
 
L
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
H
 
Q
V
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
V
 
E
E
|
E
P
 
P
A
 
P
K
 
R
E
 
D
S
 
R
P
 
A
L
 
L
F
 
V
G
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
I
C
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
T
 
T
T
 
K
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q

Query Sequence

>WP_012758842.1 NCBI__GCF_000023185.1:WP_012758842.1
MAPRVLVSDELSETAVQIFRDRGVEVDFEPQLGKDKDRLLEVIGKYDGLAIRSATKVTEK
IIEGATNLKVVGRAGIGVDNVDIPAASRRGIIVMNTPFGNSITTAEHAIALMFAVARQLP
AADTSTQAGKWEKSKFMGVEITGKTLGVIGAGNIGSIVCARAIGLKMHVVAYDPFLSKER
AEEMGVTKVELEELFARADFITLHVPMTDKTRGILNKEALAKTKPGVRIINCARGGLVDE
AALAEAIKSGHVAGAAFDVFEVEPAKESPLFGLPNVVCTPHLGASTTEAQENVALQVAEQ
MADYLVNGAVSNAINMPSITAEEAPILKPFIRLADVLGAFVGQVTEEPIKEIEILYDGIT
ANMNTRALTSAALAGLIRPQVADVNMVSAPIMIKEKGIVLSEVKRDKTGVFDGYIKLTVT
TESMTRSVAGTVFSDGKPRFIQIKGINLDADVGSHMIYITNTDVPGMIGFIGTTLGAAGV
NIANFQLGRDKQGGDAIALLYVDGKVDDAVLAELTAHQAVRQAKPLTFNID

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory