SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012763304.1 NCBI__GCF_000023185.1:WP_012763304.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4l0oH Structure determination of cystathionine gamma-synthase from helicobacter pylori
38% identity, 93% coverage: 25:385/390 of query aligns to 20:371/373 of 4l0oH

query
sites
4l0oH
A
 
A
V
 
V
V
 
S
P
 
V
P
 
P
I
 
I
F
 
Y
Q
 
Q
T
 
T
S
 
S
L
 
T
F
 
Y
T
 
R
F
 
Q
S
 
D
D
 
G
Y
 
Y
D
 
E
D
 
-
M
 
-
I
 
-
A
 
-
S
 
-
Y
 
-
R
 
-
G
 
-
E
 
-
R
 
-
V
 
-
R
 
-
P
 
-
I
 
-
Y
|
Y
T
 
S
R
|
R
G
 
S
L
 
G
N
 
N
P
 
P
T
 
T
V
 
R
R
 
F
A
 
A
F
 
L
E
 
E
E
 
E
M
 
L
L
 
I
A
 
A
K
 
D
L
 
L
E
 
E
G
 
G
A
 
G
E
 
V
D
 
K
A
 
G
L
 
F
G
 
A
F
 
F
A
 
A
S
|
S
G
|
G
M
x
L
A
 
A
A
 
G
I
 
I
S
 
H
S
 
-
A
 
A
V
 
V
L
 
F
S
 
S
F
 
L
V
 
L
E
 
Q
P
 
S
G
 
G
D
 
D
R
 
H
I
 
V
V
 
L
A
 
L
V
 
G
K
 
D
H
 
D
V
 
V
Y
|
Y
P
 
G
D
 
G
A
 
T
F
 
F
R
 
R
L
 
L
F
 
F
G
 
N
T
 
Q
I
 
V
L
 
L
K
 
V
R
 
K
M
 
N
K
 
G
I
 
L
E
 
S
V
 
C
T
 
T
Y
 
I
V
 
I
D
 
D
G
 
T
R
 
S
D
 
D
E
 
I
E
 
S
A
 
Q
V
 
I
A
 
K
K
 
K
A
 
A
L
 
I
-
 
K
P
 
P
G
 
N
A
 
T
K
 
K
L
 
A
F
 
L
Y
 
Y
M
 
L
E
 
E
S
 
T
P
 
P
T
 
S
S
 
N
W
 
P
V
 
L
M
 
L
E
 
K
A
 
I
H
 
T
D
 
D
V
 
L
G
 
A
A
 
Q
L
 
C
A
 
A
A
 
S
L
 
V
A
 
A
Q
 
K
Q
 
D
H
 
H
G
 
G
A
 
L
I
 
L
S
 
T
M
 
I
I
 
V
D
|
D
N
 
N
S
 
T
W
 
F
A
 
A
S
 
T
P
 
P
F
 
Y
F
 
Y
Q
 
Q
R
 
N
P
 
P
L
 
L
T
 
L
L
 
L
G
 
G
V
 
A
D
 
D
L
 
I
V
 
V
I
 
A
H
 
H
S
|
S
A
 
G
S
x
T
K
|
K
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
G
 
G
H
 
H
S
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
V
A
 
A
G
 
G
V
 
L
I
 
V
A
 
T
G
 
T
S
 
N
T
 
N
A
 
E
M
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
Q
V
 
E
K
 
I
A
 
A
E
 
F
A
 
F
Y
 
Q
P
 
N
Y
 
A
L
 
I
G
 
G
G
 
G
K
 
V
L
 
L
S
 
G
P
 
P
F
 
Q
D
 
D
A
 
S
W
 
W
L
 
L
L
 
L
I
 
Q
R
 
R
G
 
G
L
 
I
R
 
K
T
 
T
L
 
L
P
 
G
L
 
L
R
 
R
M
 
M
K
 
E
A
 
A
H
 
H
E
 
Q
A
 
K
S
 
N
A
 
A
L
 
L
E
 
C
I
 
V
A
 
A
R
 
E
R
 
F
L
 
L
Q
 
E
K
 
K
L
 
H
G
 
P
V
 
K
V
 
V
E
 
E
T
 
R
V
 
V
C
 
Y
H
 
Y
P
 
P
G
 
G
L
 
L
A
 
P
N
 
T
R
 
H
-
 
P
-
 
N
-
 
Y
-
 
E
-
 
L
L
 
A
P
 
K
T
 
K
G
 
Q
L
 
M
I
 
R
G
 
G
T
 
F
S
 
S
G
 
G
L
 
M
F
 
L
S
 
S
F
 
F
I
 
T
F
 
L
R
 
K
D
 
N
G
 
D
V
 
S
D
 
E
I
 
A
R
 
V
A
 
A
F
 
F
A
 
V
D
 
E
H
 
S
L
 
L
K
 
K
L
 
L
F
 
F
K
 
I
L
 
L
G
 
G
V
 
E
S
 
S
W
 
L
G
 
G
G
 
G
H
 
V
E
 
E
S
 
S
L
 
L
I
 
V
V
 
G
P
 
I
G
 
P
E
 
A
V
 
F
V
 
M
L
 
T
Q
 
H
Q
 
A
K
 
C
A
 
I
Q
 
P
P
 
K
N
 
T
S
 
Q
A
 
R
H
 
E
A
 
A
F
 
A
G
 
G
I
 
I
H
 
R
A
 
D
R
 
G
S
 
L
V
 
V
R
 
R
L
 
L
H
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
I
E
 
E
G
 
H
T
 
E
E
 
Q
A
 
D
L
 
L
W
 
L
R
 
E
D
 
D
I
 
L
E
 
E
E
 
Q
A
 
A
L
 
F
A
 
A

3vk3A Crystal structure of l-methionine gamma-lyase from pseudomonas putida c116h mutant complexed with l-methionine (see paper)
35% identity, 99% coverage: 2:388/390 of query aligns to 3:397/397 of 3vk3A

query
sites
3vk3A
S
 
S
N
 
N
G
 
K
S
 
L
E
 
P
P
 
G
F
 
F
D
 
A
L
 
T
A
 
R
S
 
A
L
 
I
I
 
H
T
 
H
A
 
G
H
 
Y
D
 
D
E
 
P
G
 
Q
N
 
D
F
 
H
A
 
G
D
 
G
A
 
A
V
 
L
V
 
V
P
 
P
P
 
P
I
 
V
F
 
Y
Q
 
Q
T
 
T
S
 
A
L
 
T
F
 
F
T
 
T
F
 
F
S
 
P
D
 
T
Y
 
V
D
 
E
D
 
Y
M
 
G
I
 
A
A
 
A
S
 
C
Y
 
F
R
 
A
G
 
G
E
 
E
R
 
Q
V
 
A
R
 
G
P
 
H
I
 
F
Y
 
Y
T
 
S
R
|
R
G
 
I
L
 
S
N
 
N
P
 
P
T
 
T
V
 
L
R
 
N
A
 
L
F
 
L
E
 
E
E
 
A
M
 
R
L
 
M
A
 
A
K
 
S
L
 
L
E
 
E
G
 
G
A
 
G
E
 
E
D
 
A
A
 
G
L
 
L
G
 
A
F
 
L
A
 
A
S
 
S
G
 
G
M
 
M
A
 
G
A
 
A
I
 
I
S
 
T
S
 
S
A
 
T
V
 
L
L
 
W
S
 
T
F
 
L
V
 
L
E
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
R
 
E
I
 
V
V
 
L
A
 
L
V
 
G
K
 
N
H
 
T
V
 
L
Y
|
Y
P
 
G
D
 
H
A
 
T
F
 
F
R
 
A
L
 
F
F
 
L
G
 
H
T
 
H
I
 
G
L
 
I
K
 
G
R
 
E
M
 
F
K
 
G
I
 
V
E
 
K
V
 
L
T
 
R
Y
 
H
V
 
V
D
 
D
G
 
M
R
 
A
D
 
D
E
 
L
E
 
Q
A
 
A
V
 
L
A
 
E
K
 
A
A
 
A
L
 
M
-
 
T
P
 
P
G
 
A
A
 
T
K
 
R
L
 
V
F
 
I
Y
 
Y
M
 
F
E
 
E
S
 
S
P
 
P
T
 
A
S
 
N
W
 
P
V
 
N
M
 
M
E
 
H
A
 
M
H
 
A
D
 
D
V
 
I
G
 
A
A
 
G
L
 
V
A
 
A
A
 
K
L
 
I
A
 
A
Q
 
R
Q
 
K
H
 
H
G
 
G
A
 
A
I
 
T
S
 
V
M
 
V
I
 
V
D
|
D
N
 
N
S
 
T
W
 
Y
A
 
C
S
 
T
P
 
P
F
 
Y
F
 
L
Q
 
Q
R
 
R
P
 
P
L
 
L
T
 
E
L
 
L
G
 
G
V
 
A
D
 
D
L
 
L
V
 
V
I
 
V
H
 
H
S
 
S
A
 
A
S
 
T
K
|
K
Y
 
Y
L
 
L
G
 
S
G
 
G
H
 
H
S
 
G
D
 
D
V
 
I
V
 
T
A
 
A
G
 
G
V
 
I
I
 
V
A
 
V
G
 
G
S
 
S
T
 
Q
A
 
A
M
 
L
I
 
V
A
 
D
R
 
R
V
 
I
K
 
R
A
 
L
E
 
Q
A
 
G
Y
 
L
P
 
K
Y
 
D
L
 
M
-
 
T
G
 
G
G
 
A
K
 
V
L
 
L
S
 
S
P
 
P
F
 
H
D
 
D
A
 
A
W
 
A
L
 
L
L
 
L
I
 
M
R
 
R
G
 
G
L
 
I
R
 
K
T
 
T
L
 
L
P
 
N
L
 
L
R
 
R
M
 
M
K
 
D
A
 
R
H
 
H
E
 
C
A
 
A
S
 
N
A
 
A
L
 
Q
E
 
V
I
 
L
A
 
A
R
 
E
R
 
F
L
 
L
Q
 
A
K
 
R
L
 
Q
G
 
P
V
 
Q
V
 
V
E
 
E
T
 
L
V
 
I
C
 
H
H
 
Y
P
 
P
G
 
G
L
 
L
A
 
A
N
 
S
R
 
-
L
 
F
P
 
P
T
 
Q
G
 
Y
L
 
T
I
 
L
G
 
A
T
 
R
S
 
Q
-
 
Q
-
 
M
-
 
S
-
 
Q
-
 
P
-
 
G
G
 
G
L
 
M
F
 
I
S
 
A
F
 
F
I
 
E
F
 
L
R
 
K
D
 
G
G
 
G
V
 
I
D
 
G
I
 
A
-
 
G
R
 
R
A
 
R
F
 
F
A
 
M
D
 
N
H
 
A
L
 
L
K
 
Q
L
 
L
F
 
F
K
 
S
L
 
R
G
 
A
V
|
V
S
|
S
W
x
L
G
 
G
G
 
D
H
 
A
E
 
E
S
 
S
L
 
L
I
 
A
V
 
Q
P
 
H
G
 
P
E
 
A
V
 
S
V
 
M
L
 
T
Q
 
H
Q
 
S
K
 
S
A
 
Y
Q
 
T
P
 
P
N
 
E
S
 
E
A
 
R
H
 
A
A
 
H
F
 
Y
G
 
G
I
 
I
H
 
S
A
 
E
R
 
G
S
 
L
V
 
V
R
|
R
L
 
L
H
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
E
G
 
D
T
 
I
E
 
D
A
 
D
L
 
L
W
 
L
R
 
A
D
 
D
I
 
V
E
 
Q
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
K
A
 
A
A
 
S
S
 
A

1pg8A Crystal structure of l-methionine alpha-, gamma-lyase
35% identity, 99% coverage: 2:388/390 of query aligns to 4:398/398 of 1pg8A

query
sites
1pg8A
S
 
S
N
 
N
G
 
K
S
 
L
E
 
P
P
 
G
F
 
F
D
 
A
L
 
T
A
 
R
S
 
A
L
 
I
I
 
H
T
 
H
A
 
G
H
 
Y
D
 
D
E
 
P
G
 
Q
N
 
D
F
 
H
A
 
G
D
 
G
A
 
A
V
 
L
V
 
V
P
 
P
P
 
P
I
 
V
F
 
Y
Q
 
Q
T
 
T
S
 
A
L
 
T
F
 
F
T
 
T
F
 
F
S
 
P
D
 
T
Y
 
V
D
 
E
D
 
Y
M
 
G
I
 
A
A
 
A
S
 
C
Y
 
F
R
 
A
G
 
G
E
 
E
R
 
Q
V
 
A
R
 
G
P
 
H
I
 
F
Y
|
Y
T
 
S
R
|
R
G
 
I
L
 
S
N
 
N
P
 
P
T
 
T
V
 
L
R
 
N
A
 
L
F
 
L
E
 
E
E
 
A
M
 
R
L
 
M
A
 
A
K
 
S
L
 
L
E
 
E
G
 
G
A
 
G
E
 
E
D
 
A
A
 
G
L
 
L
G
 
A
F
 
L
A
 
A
S
|
S
G
|
G
M
|
M
A
 
G
A
 
A
I
 
I
S
 
T
S
 
S
A
 
T
V
 
L
L
 
W
S
 
T
F
 
L
V
 
L
E
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
R
 
E
I
 
V
V
 
L
A
 
L
V
 
G
K
 
N
H
 
T
V
 
L
Y
|
Y
P
 
G
D
 
C
A
 
T
F
 
F
R
 
A
L
 
F
F
 
L
G
 
H
T
 
H
I
 
G
L
 
I
K
 
G
R
 
E
M
 
F
K
 
G
I
 
V
E
 
K
V
 
L
T
 
R
Y
 
H
V
 
V
D
 
D
G
 
M
R
 
A
D
 
D
E
 
L
E
 
Q
A
 
A
V
 
L
A
 
E
K
 
A
A
 
A
L
 
M
-
 
T
P
 
P
G
 
A
A
 
T
K
 
R
L
 
V
F
 
I
Y
 
Y
M
 
F
E
 
E
S
 
S
P
 
P
T
 
A
S
 
N
W
 
P
V
 
N
M
 
M
E
 
H
A
 
M
H
 
A
D
 
D
V
 
I
G
 
A
A
 
G
L
 
V
A
 
A
A
 
K
L
 
I
A
 
A
Q
 
R
Q
 
K
H
 
H
G
 
G
A
 
A
I
 
T
S
 
V
M
 
V
I
 
V
D
|
D
N
 
N
S
 
T
W
 
Y
A
 
C
S
 
T
P
 
P
F
 
Y
F
 
L
Q
 
Q
R
 
R
P
 
P
L
 
L
T
 
E
L
 
L
G
 
G
V
 
A
D
 
D
L
 
L
V
 
V
I
 
V
H
 
H
S
|
S
A
 
A
S
x
T
K
|
K
Y
 
Y
L
 
L
G
 
S
G
 
G
H
 
H
S
 
G
D
 
D
V
 
I
V
 
T
A
 
A
G
 
G
V
 
I
I
 
V
A
 
V
G
 
G
S
 
S
T
 
Q
A
 
A
M
 
L
I
 
V
A
 
D
R
 
R
V
 
I
K
 
R
A
 
L
E
 
Q
A
 
G
Y
 
L
P
 
K
Y
 
D
L
 
M
-
 
T
G
 
G
G
 
A
K
 
V
L
 
L
S
 
S
P
 
P
F
 
H
D
 
D
A
 
A
W
 
A
L
 
L
L
 
L
I
 
M
R
 
R
G
 
G
L
 
I
R
 
K
T
 
T
L
 
L
P
 
N
L
 
L
R
 
R
M
 
M
K
 
D
A
 
R
H
 
H
E
 
C
A
 
A
S
 
N
A
 
A
L
 
Q
E
 
V
I
 
L
A
 
A
R
 
E
R
 
F
L
 
L
Q
 
A
K
 
R
L
 
Q
G
 
P
V
 
Q
V
 
V
E
 
E
T
 
L
V
 
I
C
 
H
H
 
Y
P
 
P
G
 
G
L
 
L
A
 
A
N
 
S
R
 
-
L
 
F
P
 
P
T
 
Q
G
 
Y
L
 
T
I
 
L
G
 
A
T
 
R
S
 
Q
-
 
Q
-
 
M
-
 
S
-
 
Q
-
 
P
-
 
G
G
 
G
L
 
M
F
 
I
S
 
A
F
 
F
I
 
E
F
 
L
R
 
K
D
 
G
G
 
G
V
 
I
D
 
G
I
 
A
-
 
G
R
 
R
A
 
R
F
 
F
A
 
M
D
 
N
H
 
A
L
 
L
K
 
Q
L
 
L
F
 
F
K
 
S
L
 
R
G
 
A
V
 
V
S
 
S
W
 
L
G
 
G
G
 
D
H
 
A
E
 
E
S
 
S
L
 
L
I
 
A
V
 
Q
P
 
H
G
 
P
E
 
A
V
 
S
V
 
M
L
 
T
Q
 
H
Q
 
S
K
 
S
A
 
Y
Q
 
T
P
 
P
N
 
E
S
 
E
A
 
R
H
 
A
A
 
H
F
 
Y
G
 
G
I
 
I
H
 
S
A
 
E
R
 
G
S
 
L
V
 
V
R
 
R
L
 
L
H
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
E
G
 
D
T
 
I
E
 
D
A
 
D
L
 
L
W
 
L
R
 
A
D
 
D
I
 
V
E
 
Q
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
K
A
 
A
A
 
S
S
 
A

P13254 L-methionine gamma-lyase; MGL; Homocysteine desulfhydrase; L-methioninase; EC 4.4.1.11; EC 4.4.1.2 from Pseudomonas putida (Arthrobacter siderocapsulatus) (see 3 papers)
35% identity, 99% coverage: 2:388/390 of query aligns to 4:398/398 of P13254

query
sites
P13254
S
 
S
N
 
N
G
 
K
S
 
L
E
 
P
P
 
G
F
 
F
D
 
A
L
 
T
A
 
R
S
 
A
L
 
I
I
 
H
T
 
H
A
 
G
H
 
Y
D
 
D
E
 
P
G
 
Q
N
 
D
F
 
H
A
 
G
D
 
G
A
 
A
V
 
L
V
 
V
P
 
P
P
 
P
I
 
V
F
 
Y
Q
 
Q
T
 
T
S
 
A
L
 
T
F
 
F
T
 
T
F
 
F
S
 
P
D
 
T
Y
 
V
D
 
E
D
 
Y
M
 
G
I
 
A
A
 
A
S
 
C
Y
 
F
R
 
A
G
 
G
E
 
E
R
 
Q
V
 
A
R
 
G
P
 
H
I
 
F
Y
|
Y
T
x
S
R
|
R
G
 
I
L
 
S
N
 
N
P
 
P
T
 
T
V
 
L
R
 
N
A
 
L
F
 
L
E
 
E
E
 
A
M
 
R
L
 
M
A
 
A
K
 
S
L
 
L
E
 
E
G
 
G
A
 
G
E
 
E
D
 
A
A
 
G
L
 
L
G
 
A
F
 
L
A
 
A
S
 
S
G
|
G
M
|
M
A
 
G
A
 
A
I
 
I
S
 
T
S
 
S
A
 
T
V
 
L
L
 
W
S
 
T
F
 
L
V
 
L
E
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
R
 
E
I
 
V
V
 
L
A
 
L
V
 
G
K
 
N
H
 
T
V
 
L
Y
|
Y
P
 
G
D
x
C
A
 
T
F
 
F
R
 
A
L
 
F
F
 
L
G
 
H
T
 
H
I
 
G
L
 
I
K
 
G
R
 
E
M
 
F
K
 
G
I
 
V
E
 
K
V
 
L
T
 
R
Y
 
H
V
 
V
D
 
D
G
 
M
R
 
A
D
 
D
E
 
L
E
 
Q
A
 
A
V
 
L
A
 
E
K
 
A
A
 
A
L
 
M
-
 
T
P
 
P
G
 
A
A
 
T
K
 
R
L
 
V
F
 
I
Y
 
Y
M
 
F
E
 
E
S
 
S
P
 
P
T
 
A
S
 
N
W
 
P
V
 
N
M
 
M
E
 
H
A
 
M
H
 
A
D
 
D
V
 
I
G
 
A
A
 
G
L
 
V
A
 
A
A
 
K
L
 
I
A
 
A
Q
 
R
Q
 
K
H
 
H
G
 
G
A
 
A
I
 
T
S
 
V
M
 
V
I
 
V
D
 
D
N
 
N
S
 
T
W
 
Y
A
 
C
S
 
T
P
 
P
F
 
Y
F
 
L
Q
 
Q
R
 
R
P
 
P
L
 
L
T
 
E
L
 
L
G
 
G
V
 
A
D
 
D
L
 
L
V
 
V
I
 
V
H
 
H
S
|
S
A
|
A
S
x
T
K
|
K
Y
 
Y
L
 
L
G
 
S
G
 
G
H
 
H
S
 
G
D
 
D
V
 
I
V
 
T
A
 
A
G
 
G
V
 
I
I
 
V
A
 
V
G
 
G
S
 
S
T
 
Q
A
 
A
M
 
L
I
 
V
A
 
D
R
 
R
V
 
I
K
 
R
A
 
L
E
 
Q
A
 
G
Y
 
L
P
x
K
Y
x
D
L
 
M
-
 
T
G
 
G
G
 
A
K
 
V
L
 
L
S
 
S
P
 
P
F
 
H
D
 
D
A
 
A
W
 
A
L
 
L
L
 
L
I
 
M
R
 
R
G
 
G
L
 
I
R
 
K
T
 
T
L
 
L
P
 
N
L
 
L
R
 
R
M
 
M
K
 
D
A
 
R
H
 
H
E
 
C
A
 
A
S
 
N
A
 
A
L
 
Q
E
 
V
I
 
L
A
 
A
R
 
E
R
 
F
L
 
L
Q
 
A
K
 
R
L
 
Q
G
 
P
V
 
Q
V
 
V
E
 
E
T
 
L
V
 
I
C
 
H
H
 
Y
P
 
P
G
 
G
L
 
L
A
 
A
N
 
S
R
 
-
L
 
F
P
 
P
T
 
Q
G
 
Y
L
 
T
I
 
L
G
 
A
T
 
R
S
 
Q
-
 
Q
-
 
M
-
 
S
-
 
Q
-
 
P
-
 
G
G
 
G
L
 
M
F
 
I
S
 
A
F
 
F
I
 
E
F
 
L
R
 
K
D
 
G
G
 
G
V
 
I
D
 
G
I
 
A
-
 
G
R
 
R
A
 
R
F
 
F
A
 
M
D
 
N
H
 
A
L
 
L
K
 
Q
L
 
L
F
 
F
K
 
S
L
 
R
G
 
A
V
 
V
S
 
S
W
 
L
G
 
G
G
 
D
H
 
A
E
 
E
S
 
S
L
 
L
I
 
A
V
 
Q
P
 
H
G
 
P
E
 
A
V
 
S
V
 
M
L
 
T
Q
 
H
Q
 
S
K
 
S
A
 
Y
Q
 
T
P
 
P
N
 
E
S
 
E
A
 
R
H
 
A
A
 
H
F
 
Y
G
 
G
I
 
I
H
 
S
A
 
E
R
 
G
S
 
L
V
 
V
R
|
R
L
 
L
H
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
E
G
 
D
T
 
I
E
 
D
A
 
D
L
 
L
W
 
L
R
 
A
D
 
D
I
 
V
E
 
Q
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
K
A
 
A
A
 
S
S
 
A

5x30C Crystal structure of pseudomonas putida methionine gamma-lyase c116h mutant with l-homocysteine intermediates. (see paper)
36% identity, 95% coverage: 17:388/390 of query aligns to 14:393/393 of 5x30C

query
sites
5x30C
H
 
Y
D
 
D
E
 
P
G
 
Q
N
 
D
F
 
H
A
 
G
D
 
G
A
 
A
V
 
L
V
 
V
P
 
P
P
 
P
I
 
V
F
 
Y
Q
 
Q
T
 
T
S
 
A
L
 
T
F
 
F
T
 
T
F
 
F
S
 
P
D
 
T
Y
 
V
D
 
E
D
 
Y
M
 
G
I
 
A
A
 
A
S
 
C
Y
 
F
R
 
A
G
 
G
E
 
E
R
 
Q
V
 
A
R
 
G
P
 
H
I
 
F
Y
|
Y
T
 
S
R
|
R
G
 
I
L
 
S
N
 
N
P
 
P
T
 
T
V
 
L
R
 
N
A
 
L
F
 
L
E
 
E
E
 
A
M
 
R
L
 
M
A
 
A
K
 
S
L
 
L
E
 
E
G
 
G
A
 
G
E
 
E
D
 
A
A
 
G
L
 
L
G
 
A
F
 
L
A
 
A
S
 
S
G
 
G
M
 
M
A
 
G
A
 
A
I
 
I
S
 
T
S
 
S
A
 
T
V
 
L
L
 
W
S
 
T
F
 
L
V
 
L
E
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
R
 
E
I
 
V
V
 
L
A
 
L
V
 
G
K
 
N
H
 
T
V
 
L
Y
|
Y
P
 
G
D
 
H
A
 
T
F
 
F
R
 
A
L
 
F
F
 
L
G
 
H
T
 
H
I
 
G
L
 
I
K
 
G
R
 
E
M
 
F
K
 
G
I
 
V
E
 
K
V
 
L
T
 
R
Y
 
H
V
 
V
D
 
D
G
 
M
R
 
A
D
 
D
E
 
L
E
 
Q
A
 
A
V
 
L
A
 
E
K
 
A
A
 
A
L
 
M
-
 
T
P
 
P
G
 
A
A
 
T
K
 
R
L
 
V
F
 
I
Y
 
Y
M
 
F
E
 
E
S
 
S
P
 
P
T
 
A
S
 
N
W
 
P
V
 
N
M
 
M
E
 
H
A
 
M
H
 
A
D
 
D
V
 
I
G
 
A
A
 
G
L
 
V
A
 
A
A
 
K
L
 
I
A
 
A
Q
 
R
Q
 
K
H
 
H
G
 
G
A
 
A
I
 
T
S
 
V
M
 
V
I
 
V
D
|
D
N
 
N
S
 
T
W
 
Y
A
 
C
S
 
T
P
 
P
F
 
Y
F
 
L
Q
 
Q
R
 
R
P
 
P
L
 
L
T
 
E
L
 
L
G
 
G
V
 
A
D
 
D
L
 
L
V
 
V
I
 
V
H
 
H
S
 
S
A
 
A
S
 
T
K
|
K
Y
 
Y
L
 
L
G
 
S
G
 
G
H
 
H
S
 
G
D
 
D
V
 
I
V
 
T
A
 
A
G
 
G
V
 
I
I
 
V
A
 
V
G
 
G
S
 
S
T
 
Q
A
 
A
M
 
L
I
 
V
A
 
D
R
 
R
V
 
I
K
 
R
A
 
L
E
 
Q
A
 
G
Y
 
L
P
 
K
Y
 
D
L
 
M
-
 
T
G
 
G
G
 
A
K
 
V
L
 
L
S
 
S
P
 
P
F
 
H
D
 
D
A
 
A
W
 
A
L
 
L
L
 
L
I
 
M
R
 
R
G
 
G
L
 
I
R
 
K
T
 
T
L
 
L
P
 
N
L
 
L
R
 
R
M
 
M
K
 
D
A
 
R
H
 
H
E
 
C
A
 
A
S
 
N
A
 
A
L
 
Q
E
 
V
I
 
L
A
 
A
R
 
E
R
 
F
L
 
L
Q
 
A
K
 
R
L
 
Q
G
 
P
V
 
Q
V
 
V
E
 
E
T
 
L
V
 
I
C
 
H
H
 
Y
P
 
P
G
 
G
L
 
L
A
 
A
N
 
S
R
 
-
L
 
F
P
 
P
T
 
Q
G
 
Y
L
 
T
I
 
L
G
 
A
T
 
R
S
 
Q
-
 
Q
-
 
M
-
 
S
-
 
Q
-
 
P
-
 
G
G
 
G
L
 
M
F
 
I
S
 
A
F
 
F
I
 
E
F
 
L
R
 
K
D
 
G
G
 
G
V
 
I
D
 
G
I
 
A
-
 
G
R
 
R
A
 
R
F
 
F
A
 
M
D
 
N
H
 
A
L
 
L
K
 
Q
L
 
L
F
 
F
K
 
S
L
 
R
G
 
A
V
 
V
S
 
S
W
 
L
G
 
G
G
 
D
H
 
A
E
 
E
S
 
S
L
 
L
I
 
A
V
 
Q
P
 
H
G
 
P
E
 
A
V
 
S
V
 
M
L
 
T
Q
 
H
Q
 
S
K
 
S
A
 
Y
Q
 
T
P
 
P
N
 
E
S
 
E
A
 
R
H
 
A
A
 
H
F
 
Y
G
 
G
I
 
I
H
 
S
A
 
E
R
 
G
S
 
L
V
 
V
R
 
R
L
 
L
H
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
E
G
 
D
T
 
I
E
 
D
A
 
D
L
 
L
W
 
L
R
 
A
D
 
D
I
 
V
E
 
Q
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
K
A
 
A
A
 
S
S
 
A

5x2xA Crystal structure of pseudomonas putida methionine gamma-lyase wild type with l-homocysteine intermediates (see paper)
36% identity, 95% coverage: 17:388/390 of query aligns to 13:392/392 of 5x2xA

query
sites
5x2xA
H
 
Y
D
 
D
E
 
P
G
 
Q
N
 
D
F
 
H
A
 
G
D
 
G
A
 
A
V
 
L
V
 
V
P
 
P
P
 
P
I
 
V
F
 
Y
Q
 
Q
T
 
T
S
 
A
L
 
T
F
 
F
T
 
T
F
 
F
S
 
P
D
 
T
Y
 
V
D
 
E
D
 
Y
M
 
G
I
 
A
A
 
A
S
 
C
Y
 
F
R
 
A
G
 
G
E
 
E
R
 
Q
V
 
A
R
 
G
P
 
H
I
 
F
Y
|
Y
T
 
S
R
|
R
G
 
I
L
 
S
N
 
N
P
 
P
T
 
T
V
 
L
R
 
N
A
 
L
F
 
L
E
 
E
E
 
A
M
 
R
L
 
M
A
 
A
K
 
S
L
 
L
E
 
E
G
 
G
A
 
G
E
 
E
D
 
A
A
 
G
L
 
L
G
 
A
F
 
L
A
 
A
S
 
S
G
|
G
M
|
M
A
 
G
A
 
A
I
 
I
S
 
T
S
 
S
A
 
T
V
 
L
L
 
W
S
 
T
F
 
L
V
 
L
E
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
R
 
E
I
 
V
V
 
L
A
 
L
V
 
G
K
 
N
H
 
T
V
 
L
Y
|
Y
P
 
G
D
 
C
A
 
T
F
 
F
R
 
A
L
 
F
F
 
L
G
 
H
T
 
H
I
 
G
L
 
I
K
 
G
R
 
E
M
 
F
K
 
G
I
 
V
E
 
K
V
 
L
T
 
R
Y
 
H
V
 
V
D
 
D
G
 
M
R
 
A
D
 
D
E
 
L
E
 
Q
A
 
A
V
 
L
A
 
E
K
 
A
A
 
A
L
 
M
-
 
T
P
 
P
G
 
A
A
 
T
K
 
R
L
 
V
F
 
I
Y
 
Y
M
 
F
E
 
E
S
 
S
P
 
P
T
 
A
S
x
N
W
 
P
V
 
N
M
 
M
E
 
H
A
 
M
H
 
A
D
 
D
V
 
I
G
 
A
A
 
G
L
 
V
A
 
A
A
 
K
L
 
I
A
 
A
Q
 
R
Q
 
K
H
 
H
G
 
G
A
 
A
I
 
T
S
 
V
M
 
V
I
 
V
D
|
D
N
 
N
S
 
T
W
 
Y
A
 
C
S
 
T
P
 
P
F
 
Y
F
 
L
Q
 
Q
R
 
R
P
 
P
L
 
L
T
 
E
L
 
L
G
 
G
V
 
A
D
 
D
L
 
L
V
 
V
I
 
V
H
 
H
S
|
S
A
 
A
S
x
T
K
|
K
Y
 
Y
L
 
L
G
 
S
G
 
G
H
 
H
S
 
G
D
 
D
V
 
I
V
 
T
A
 
A
G
 
G
V
 
I
I
 
V
A
 
V
G
 
G
S
 
S
T
 
Q
A
 
A
M
 
L
I
 
V
A
 
D
R
 
R
V
 
I
K
 
R
A
 
L
E
 
Q
A
 
G
Y
 
L
P
 
K
Y
 
D
L
 
M
-
 
T
G
 
G
G
 
A
K
 
V
L
 
L
S
 
S
P
 
P
F
 
H
D
 
D
A
 
A
W
 
A
L
 
L
L
 
L
I
 
M
R
 
R
G
 
G
L
 
I
R
 
K
T
 
T
L
 
L
P
 
N
L
 
L
R
 
R
M
 
M
K
 
D
A
 
R
H
 
H
E
 
C
A
 
A
S
 
N
A
 
A
L
 
Q
E
 
V
I
 
L
A
 
A
R
 
E
R
 
F
L
 
L
Q
 
A
K
 
R
L
 
Q
G
 
P
V
 
Q
V
 
V
E
 
E
T
 
L
V
 
I
C
 
H
H
 
Y
P
 
P
G
 
G
L
 
L
A
 
A
N
 
S
R
 
-
L
 
F
P
 
P
T
 
Q
G
 
Y
L
 
T
I
 
L
G
 
A
T
 
R
S
 
Q
-
 
Q
-
 
M
-
 
S
-
 
Q
-
 
P
-
 
G
G
 
G
L
 
M
F
 
I
S
 
A
F
 
F
I
 
E
F
 
L
R
 
K
D
 
G
G
 
G
V
 
I
D
 
G
I
 
A
-
 
G
R
 
R
A
 
R
F
 
F
A
 
M
D
 
N
H
 
A
L
 
L
K
 
Q
L
 
L
F
 
F
K
 
S
L
 
R
G
 
A
V
|
V
S
|
S
W
 
L
G
 
G
G
 
D
H
 
A
E
 
E
S
 
S
L
 
L
I
 
A
V
 
Q
P
 
H
G
 
P
E
 
A
V
 
S
V
 
M
L
 
T
Q
 
H
Q
 
S
K
 
S
A
 
Y
Q
 
T
P
 
P
N
 
E
S
 
E
A
 
R
H
 
A
A
 
H
F
 
Y
G
 
G
I
 
I
H
 
S
A
 
E
R
 
G
S
 
L
V
 
V
R
|
R
L
 
L
H
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
E
G
 
D
T
 
I
E
 
D
A
 
D
L
 
L
W
 
L
R
 
A
D
 
D
I
 
V
E
 
Q
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
K
A
 
A
A
 
S
S
 
A

5x2wA Crystal structure of pseudomonas putida methionine gamma-lyase wild type with l-methionine intermediates (see paper)
36% identity, 95% coverage: 17:388/390 of query aligns to 13:392/392 of 5x2wA

query
sites
5x2wA
H
 
Y
D
 
D
E
 
P
G
 
Q
N
 
D
F
 
H
A
 
G
D
 
G
A
 
A
V
 
L
V
 
V
P
 
P
P
 
P
I
 
V
F
 
Y
Q
 
Q
T
 
T
S
 
A
L
 
T
F
 
F
T
 
T
F
 
F
S
 
P
D
 
T
Y
 
V
D
 
E
D
 
Y
M
 
G
I
 
A
A
 
A
S
 
C
Y
 
F
R
 
A
G
 
G
E
 
E
R
 
Q
V
 
A
R
 
G
P
 
H
I
 
F
Y
|
Y
T
 
S
R
|
R
G
 
I
L
 
S
N
 
N
P
 
P
T
 
T
V
 
L
R
 
N
A
 
L
F
 
L
E
 
E
E
 
A
M
 
R
L
 
M
A
 
A
K
 
S
L
 
L
E
 
E
G
 
G
A
 
G
E
 
E
D
 
A
A
 
G
L
 
L
G
 
A
F
 
L
A
 
A
S
|
S
G
|
G
M
|
M
A
 
G
A
 
A
I
 
I
S
 
T
S
 
S
A
 
T
V
 
L
L
 
W
S
 
T
F
 
L
V
 
L
E
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
R
 
E
I
 
V
V
 
L
A
 
L
V
 
G
K
 
N
H
 
T
V
 
L
Y
|
Y
P
 
G
D
 
C
A
 
T
F
 
F
R
 
A
L
 
F
F
 
L
G
 
H
T
 
H
I
 
G
L
 
I
K
 
G
R
 
E
M
 
F
K
 
G
I
 
V
E
 
K
V
 
L
T
 
R
Y
 
H
V
 
V
D
 
D
G
 
M
R
 
A
D
 
D
E
 
L
E
 
Q
A
 
A
V
 
L
A
 
E
K
 
A
A
 
A
L
 
M
-
 
T
P
 
P
G
 
A
A
 
T
K
 
R
L
 
V
F
 
I
Y
 
Y
M
 
F
E
 
E
S
 
S
P
 
P
T
 
A
S
 
N
W
 
P
V
 
N
M
 
M
E
 
H
A
 
M
H
 
A
D
 
D
V
 
I
G
 
A
A
 
G
L
 
V
A
 
A
A
 
K
L
 
I
A
 
A
Q
 
R
Q
 
K
H
 
H
G
 
G
A
 
A
I
 
T
S
 
V
M
 
V
I
 
V
D
|
D
N
 
N
S
 
T
W
 
Y
A
 
C
S
 
T
P
 
P
F
 
Y
F
 
L
Q
 
Q
R
 
R
P
 
P
L
 
L
T
 
E
L
 
L
G
 
G
V
 
A
D
 
D
L
 
L
V
 
V
I
 
V
H
 
H
S
|
S
A
 
A
S
 
T
K
|
K
Y
 
Y
L
 
L
G
 
S
G
 
G
H
 
H
S
 
G
D
 
D
V
 
I
V
 
T
A
 
A
G
 
G
V
 
I
I
 
V
A
 
V
G
 
G
S
 
S
T
 
Q
A
 
A
M
 
L
I
 
V
A
 
D
R
 
R
V
 
I
K
 
R
A
 
L
E
 
Q
A
 
G
Y
 
L
P
 
K
Y
 
D
L
 
M
-
 
T
G
 
G
G
 
A
K
 
V
L
 
L
S
 
S
P
 
P
F
 
H
D
 
D
A
 
A
W
 
A
L
 
L
L
 
L
I
 
M
R
 
R
G
 
G
L
 
I
R
 
K
T
 
T
L
 
L
P
 
N
L
 
L
R
 
R
M
 
M
K
 
D
A
 
R
H
 
H
E
 
C
A
 
A
S
 
N
A
 
A
L
 
Q
E
 
V
I
 
L
A
 
A
R
 
E
R
 
F
L
 
L
Q
 
A
K
 
R
L
 
Q
G
 
P
V
 
Q
V
 
V
E
 
E
T
 
L
V
 
I
C
 
H
H
 
Y
P
 
P
G
 
G
L
 
L
A
 
A
N
 
S
R
 
-
L
 
F
P
 
P
T
 
Q
G
 
Y
L
 
T
I
 
L
G
 
A
T
 
R
S
 
Q
-
 
Q
-
 
M
-
 
S
-
 
Q
-
 
P
-
 
G
G
 
G
L
 
M
F
 
I
S
 
A
F
 
F
I
 
E
F
 
L
R
 
K
D
 
G
G
 
G
V
 
I
D
 
G
I
 
A
-
 
G
R
 
R
A
 
R
F
 
F
A
 
M
D
 
N
H
 
A
L
 
L
K
 
Q
L
 
L
F
 
F
K
 
S
L
 
R
G
 
A
V
|
V
S
|
S
W
 
L
G
 
G
G
 
D
H
 
A
E
 
E
S
 
S
L
 
L
I
 
A
V
 
Q
P
 
H
G
 
P
E
 
A
V
 
S
V
 
M
L
 
T
Q
 
H
Q
 
S
K
 
S
A
 
Y
Q
 
T
P
 
P
N
 
E
S
 
E
A
 
R
H
 
A
A
 
H
F
 
Y
G
 
G
I
 
I
H
 
S
A
 
E
R
 
G
S
 
L
V
 
V
R
|
R
L
 
L
H
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
E
G
 
D
T
 
I
E
 
D
A
 
D
L
 
L
W
 
L
R
 
A
D
 
D
I
 
V
E
 
Q
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
K
A
 
A
A
 
S
S
 
A

4iyoD Crystal structure of cystathionine gamma lyase from xanthomonas oryzae pv. Oryzae (xometc) in complex with e-site serine, a-site serine, a- site external aldimine structure with aminoacrylate and a-site iminopropionate intermediates (see paper)
38% identity, 92% coverage: 25:384/390 of query aligns to 21:380/384 of 4iyoD

query
sites
4iyoD
A
 
A
V
 
V
V
 
M
P
 
P
P
 
P
I
 
I
F
 
Y
Q
 
A
T
 
T
S
 
S
L
 
T
F
 
Y
T
 
A
F
 
-
S
 
-
D
 
-
Y
 
-
D
 
-
D
 
-
M
 
-
I
 
-
A
 
Q
S
 
S
Y
 
S
R
 
P
G
 
G
E
 
E
R
 
H
V
 
Q
R
 
G
P
 
F
I
 
E
Y
|
Y
T
 
S
R
|
R
G
x
T
L
 
H
N
 
N
P
 
P
T
 
T
V
 
R
R
 
F
A
 
A
F
 
Y
E
 
E
E
 
R
M
 
C
L
 
V
A
 
A
K
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
A
 
G
E
 
T
D
 
R
A
 
A
L
 
F
G
 
A
F
 
F
A
 
A
S
 
S
G
 
G
M
 
M
A
 
A
A
 
A
I
 
-
S
 
T
S
 
S
A
 
T
V
 
V
L
 
M
S
 
E
F
 
L
V
 
L
E
 
D
P
 
A
G
 
G
D
 
S
R
 
H
I
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
M
K
 
D
H
 
D
V
 
L
Y
|
Y
P
 
G
D
 
G
A
 
T
F
 
F
R
|
R
L
 
L
F
 
F
G
 
E
T
 
R
I
 
V
L
 
R
K
 
R
R
 
R
M
 
T
K
 
A
-
 
G
I
 
L
E
 
D
V
 
F
T
 
S
Y
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
L
R
 
T
D
 
D
E
 
P
E
 
A
A
 
A
V
 
F
A
 
K
K
 
A
A
 
A
L
 
I
P
 
R
G
 
A
-
 
D
A
 
T
K
 
K
L
 
M
F
 
V
Y
 
W
M
 
I
E
 
E
S
 
T
P
 
P
T
 
T
S
 
N
W
 
P
V
 
M
M
 
L
E
 
K
A
 
L
H
 
V
D
 
D
V
 
I
G
 
A
A
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
V
L
 
I
A
 
A
Q
 
R
Q
 
K
H
 
H
G
 
G
A
 
L
I
 
L
S
 
T
M
 
V
I
 
V
D
|
D
N
 
N
S
 
T
W
 
F
A
 
A
S
 
S
P
 
P
F
 
M
F
 
L
Q
 
Q
R
 
R
P
 
P
L
 
L
T
 
S
L
 
L
G
 
G
V
 
A
D
 
D
L
 
L
V
 
V
I
 
V
H
 
H
S
 
S
A
 
A
S
 
T
K
|
K
Y
 
Y
L
 
L
G
 
N
G
 
G
H
 
H
S
 
S
D
 
D
V
 
M
V
 
V
A
 
G
G
 
G
V
 
I
-
 
A
I
 
V
A
 
V
G
 
G
S
 
D
T
 
N
A
 
A
M
 
E
I
 
L
A
 
A
R
 
E
V
 
Q
K
 
M
A
 
A
E
 
F
A
 
L
Y
 
Q
P
x
N
Y
 
S
L
 
I
G
 
G
G
 
G
K
 
V
L
 
Q
S
 
G
P
 
P
F
 
F
D
 
D
A
 
S
W
 
F
L
 
L
L
 
A
I
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
K
T
 
T
L
 
L
P
 
P
L
 
L
R
 
R
M
 
M
K
 
R
A
 
A
H
 
H
E
 
C
A
 
E
S
 
N
A
 
A
L
 
L
E
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
Q
R
 
W
L
 
L
Q
 
E
K
 
T
L
 
H
G
 
P
V
 
A
V
 
I
E
 
E
T
 
K
V
 
V
C
 
I
H
 
Y
P
 
P
G
 
G
L
 
L
A
 
A
N
 
S
R
 
H
L
 
-
P
 
P
T
 
Q
G
 
H
L
 
V
I
 
L
-
 
A
-
 
K
-
 
R
-
 
Q
-
 
M
-
 
S
G
 
G
T
 
F
S
 
G
G
 
G
L
 
I
F
 
V
S
 
S
F
 
I
I
 
V
F
 
L
R
 
K
D
 
G
G
 
G
V
 
F
D
 
D
-
 
A
I
 
A
R
 
K
A
 
R
F
 
F
A
 
C
D
 
E
H
 
K
L
 
T
K
 
E
L
 
L
F
 
F
K
 
T
L
 
L
G
 
A
V
x
E
S
|
S
W
 
L
G
 
G
G
 
G
H
 
V
E
 
E
S
 
S
L
 
L
I
 
V
V
 
N
P
 
H
G
 
P
E
 
A
V
 
V
V
 
M
L
x
T
Q
 
H
Q
 
A
K
 
S
A
 
I
Q
 
P
P
 
V
N
 
A
S
 
R
A
 
R
H
 
E
A
 
Q
F
 
L
G
 
G
I
 
I
H
 
S
A
 
D
R
 
A
S
 
L
V
 
V
R
|
R
L
 
L
H
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
I
E
 
E
G
 
D
T
 
L
E
 
G
A
 
D
L
 
L
W
 
R
R
 
G
D
 
D
I
 
L
E
 
E
E
 
R
A
 
A
L
 
L

4iyoB Crystal structure of cystathionine gamma lyase from xanthomonas oryzae pv. Oryzae (xometc) in complex with e-site serine, a-site serine, a- site external aldimine structure with aminoacrylate and a-site iminopropionate intermediates (see paper)
38% identity, 92% coverage: 25:384/390 of query aligns to 21:380/381 of 4iyoB

query
sites
4iyoB
A
 
A
V
 
V
V
 
M
P
 
P
P
 
P
I
 
I
F
 
Y
Q
 
A
T
 
T
S
 
S
L
 
T
F
 
Y
T
 
A
F
 
-
S
 
-
D
 
-
Y
 
-
D
 
-
D
 
-
M
 
-
I
 
-
A
 
Q
S
 
S
Y
 
S
R
 
P
G
 
G
E
 
E
R
 
H
V
 
Q
R
 
G
P
 
F
I
 
E
Y
|
Y
T
 
S
R
|
R
G
x
T
L
 
H
N
 
N
P
 
P
T
 
T
V
 
R
R
 
F
A
 
A
F
 
Y
E
 
E
E
 
R
M
 
C
L
 
V
A
 
A
K
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
A
 
G
E
 
T
D
 
R
A
 
A
L
 
F
G
 
A
F
 
F
A
 
A
S
 
S
G
 
G
M
 
M
A
 
A
A
 
A
I
 
-
S
 
T
S
 
S
A
 
T
V
 
V
L
 
M
S
 
E
F
 
L
V
 
L
E
 
D
P
 
A
G
 
G
D
 
S
R
 
H
I
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
M
K
 
D
H
 
D
V
 
L
Y
|
Y
P
 
G
D
 
G
A
 
T
F
 
F
R
|
R
L
 
L
F
 
F
G
 
E
T
 
R
I
 
V
L
 
R
K
 
R
R
 
R
M
 
T
K
 
A
-
 
G
I
 
L
E
 
D
V
 
F
T
 
S
Y
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
L
R
 
T
D
 
D
E
 
P
E
 
A
A
 
A
V
 
F
A
 
K
K
 
A
A
 
A
L
 
I
P
 
R
G
 
A
-
 
D
A
 
T
K
 
K
L
 
M
F
 
V
Y
 
W
M
 
I
E
 
E
S
 
T
P
 
P
T
 
T
S
 
N
W
 
P
V
 
M
M
 
L
E
 
K
A
 
L
H
 
V
D
 
D
V
 
I
G
 
A
A
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
V
L
 
I
A
 
A
Q
 
R
Q
 
K
H
 
H
G
 
G
A
 
L
I
 
L
S
 
T
M
 
V
I
 
V
D
|
D
N
 
N
S
 
T
W
 
F
A
 
A
S
 
S
P
 
P
F
 
M
F
 
L
Q
 
Q
R
 
R
P
 
P
L
 
L
T
 
S
L
 
L
G
 
G
V
 
A
D
 
D
L
 
L
V
 
V
I
 
V
H
 
H
S
 
S
A
 
A
S
 
T
K
|
K
Y
 
Y
L
 
L
G
 
N
G
 
G
H
 
H
S
 
S
D
 
D
V
 
M
V
 
V
A
 
G
G
 
G
V
 
I
-
 
A
I
 
V
A
 
V
G
 
G
S
 
D
T
 
N
A
 
A
M
 
E
I
 
L
A
 
A
R
 
E
V
x
Q
K
 
M
A
 
A
E
x
F
A
 
L
Y
 
Q
P
x
N
Y
 
S
L
 
I
G
 
G
G
 
G
K
 
V
L
 
Q
S
 
G
P
 
P
F
 
F
D
 
D
A
 
S
W
 
F
L
 
L
L
 
A
I
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
K
T
 
T
L
 
L
P
 
P
L
 
L
R
 
R
M
 
M
K
 
R
A
 
A
H
 
H
E
 
C
A
 
E
S
 
N
A
 
A
L
 
L
E
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
Q
R
 
W
L
 
L
Q
 
E
K
 
T
L
 
H
G
 
P
V
 
A
V
 
I
E
 
E
T
 
K
V
 
V
C
 
I
H
 
Y
P
 
P
G
 
G
L
 
L
A
 
A
N
 
S
R
 
H
L
 
-
P
 
P
T
 
Q
G
 
H
L
 
V
I
 
L
-
 
A
-
 
K
-
 
R
-
 
Q
-
 
M
-
 
S
G
 
G
T
 
F
S
 
G
G
 
G
L
 
I
F
 
V
S
 
S
F
 
I
I
 
V
F
 
L
R
 
K
D
 
G
G
 
G
V
 
F
D
 
D
-
 
A
I
 
A
R
 
K
A
 
R
F
 
F
A
 
C
D
 
E
H
 
K
L
 
T
K
 
E
L
 
L
F
 
F
K
 
T
L
 
L
G
 
A
V
x
E
S
|
S
W
 
L
G
 
G
G
 
G
H
 
V
E
 
E
S
 
S
L
 
L
I
 
V
V
 
N
P
 
H
G
 
P
E
 
A
V
 
V
V
 
M
L
x
T
Q
 
H
Q
 
A
K
 
S
A
 
I
Q
 
P
P
 
V
N
 
A
S
 
R
A
 
R
H
 
E
A
 
Q
F
 
L
G
 
G
I
 
I
H
 
S
A
 
D
R
 
A
S
 
L
V
 
V
R
|
R
L
 
L
H
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
I
E
 
E
G
 
D
T
 
L
E
 
G
A
 
D
L
 
L
W
 
R
R
 
G
D
 
D
I
 
L
E
 
E
E
 
R
A
 
A
L
 
L

4iy7B Crystal structure of cystathionine gamma lyase (xometc) from xanthomonas oryzae pv. Oryzae in complex with e-site serine, a-site external aldimine structure with serine and a-site external aldimine structure with aminoacrylate intermediates (see paper)
38% identity, 92% coverage: 25:384/390 of query aligns to 21:380/381 of 4iy7B

query
sites
4iy7B
A
 
A
V
 
V
V
 
M
P
 
P
P
 
P
I
 
I
F
 
Y
Q
 
A
T
 
T
S
 
S
L
 
T
F
 
Y
T
 
A
F
 
-
S
 
-
D
 
-
Y
 
-
D
 
-
D
 
-
M
 
-
I
 
-
A
 
Q
S
 
S
Y
 
S
R
 
P
G
 
G
E
 
E
R
 
H
V
 
Q
R
 
G
P
 
F
I
 
E
Y
|
Y
T
 
S
R
|
R
G
x
T
L
 
H
N
 
N
P
 
P
T
 
T
V
 
R
R
 
F
A
 
A
F
 
Y
E
 
E
E
 
R
M
 
C
L
 
V
A
 
A
K
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
A
 
G
E
 
T
D
 
R
A
 
A
L
 
F
G
 
A
F
 
F
A
 
A
S
 
S
G
|
G
M
|
M
A
 
A
A
 
A
I
 
-
S
 
T
S
 
S
A
 
T
V
 
V
L
 
M
S
 
E
F
 
L
V
 
L
E
 
D
P
 
A
G
 
G
D
 
S
R
 
H
I
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
M
K
 
D
H
 
D
V
 
L
Y
|
Y
P
 
G
D
 
G
A
 
T
F
 
F
R
|
R
L
 
L
F
 
F
G
 
E
T
 
R
I
 
V
L
 
R
K
 
R
R
 
R
M
 
T
K
 
A
-
 
G
I
 
L
E
 
D
V
 
F
T
 
S
Y
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
L
R
 
T
D
 
D
E
 
P
E
 
A
A
 
A
V
 
F
A
 
K
K
 
A
A
 
A
L
 
I
P
 
R
G
 
A
-
 
D
A
 
T
K
 
K
L
 
M
F
 
V
Y
 
W
M
 
I
E
|
E
S
 
T
P
 
P
T
 
T
S
x
N
W
 
P
V
 
M
M
 
L
E
 
K
A
 
L
H
 
V
D
 
D
V
 
I
G
 
A
A
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
V
L
 
I
A
 
A
Q
 
R
Q
 
K
H
 
H
G
 
G
A
 
L
I
 
L
S
 
T
M
 
V
I
 
V
D
|
D
N
 
N
S
 
T
W
 
F
A
 
A
S
 
S
P
 
P
F
 
M
F
 
L
Q
 
Q
R
 
R
P
 
P
L
 
L
T
 
S
L
 
L
G
 
G
V
 
A
D
 
D
L
 
L
V
 
V
I
 
V
H
 
H
S
|
S
A
 
A
S
 
T
K
|
K
Y
 
Y
L
 
L
G
 
N
G
 
G
H
 
H
S
 
S
D
 
D
V
 
M
V
 
V
A
 
G
G
 
G
V
 
I
-
 
A
I
 
V
A
 
V
G
 
G
S
 
D
T
 
N
A
 
A
M
 
E
I
 
L
A
 
A
R
 
E
V
x
Q
K
 
M
A
 
A
E
x
F
A
 
L
Y
 
Q
P
x
N
Y
 
S
L
 
I
G
 
G
G
 
G
K
 
V
L
 
Q
S
 
G
P
 
P
F
 
F
D
 
D
A
 
S
W
 
F
L
 
L
L
 
A
I
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
K
T
 
T
L
 
L
P
 
P
L
 
L
R
 
R
M
 
M
K
 
R
A
 
A
H
 
H
E
 
C
A
 
E
S
 
N
A
 
A
L
 
L
E
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
Q
R
 
W
L
 
L
Q
 
E
K
 
T
L
 
H
G
 
P
V
 
A
V
 
I
E
 
E
T
 
K
V
 
V
C
 
I
H
 
Y
P
 
P
G
 
G
L
 
L
A
 
A
N
 
S
R
 
H
L
 
-
P
 
P
T
 
Q
G
 
H
L
 
V
I
 
L
-
 
A
-
 
K
-
 
R
-
 
Q
-
 
M
-
 
S
G
 
G
T
 
F
S
 
G
G
 
G
L
 
I
F
 
V
S
 
S
F
 
I
I
 
V
F
 
L
R
 
K
D
 
G
G
 
G
V
 
F
D
 
D
-
 
A
I
 
A
R
 
K
A
 
R
F
 
F
A
 
C
D
 
E
H
 
K
L
 
T
K
 
E
L
 
L
F
 
F
K
 
T
L
 
L
G
 
A
V
x
E
S
|
S
W
x
L
G
 
G
G
 
G
H
 
V
E
 
E
S
 
S
L
 
L
I
 
V
V
 
N
P
 
H
G
 
P
E
 
A
V
 
V
V
 
M
L
x
T
Q
 
H
Q
 
A
K
 
S
A
 
I
Q
 
P
P
 
V
N
 
A
S
 
R
A
 
R
H
 
E
A
 
Q
F
 
L
G
 
G
I
 
I
H
 
S
A
 
D
R
 
A
S
 
L
V
 
V
R
|
R
L
 
L
H
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
I
E
 
E
G
 
D
T
 
L
E
 
G
A
 
D
L
 
L
W
 
R
R
 
G
D
 
D
I
 
L
E
 
E
E
 
R
A
 
A
L
 
L

4iy7A Crystal structure of cystathionine gamma lyase (xometc) from xanthomonas oryzae pv. Oryzae in complex with e-site serine, a-site external aldimine structure with serine and a-site external aldimine structure with aminoacrylate intermediates (see paper)
38% identity, 92% coverage: 25:384/390 of query aligns to 21:380/381 of 4iy7A

query
sites
4iy7A
A
 
A
V
 
V
V
 
M
P
 
P
P
 
P
I
 
I
F
 
Y
Q
 
A
T
 
T
S
 
S
L
 
T
F
 
Y
T
 
A
F
 
-
S
 
-
D
 
-
Y
 
-
D
 
-
D
 
-
M
 
-
I
 
-
A
 
Q
S
 
S
Y
 
S
R
 
P
G
 
G
E
 
E
R
 
H
V
 
Q
R
 
G
P
 
F
I
 
E
Y
|
Y
T
 
S
R
|
R
G
x
T
L
 
H
N
 
N
P
 
P
T
 
T
V
 
R
R
 
F
A
 
A
F
 
Y
E
 
E
E
 
R
M
 
C
L
 
V
A
 
A
K
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
A
 
G
E
 
T
D
 
R
A
 
A
L
 
F
G
 
A
F
 
F
A
 
A
S
 
S
G
|
G
M
|
M
A
 
A
A
 
A
I
 
-
S
 
T
S
 
S
A
 
T
V
 
V
L
 
M
S
 
E
F
 
L
V
 
L
E
 
D
P
 
A
G
 
G
D
 
S
R
 
H
I
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
M
K
 
D
H
 
D
V
 
L
Y
|
Y
P
 
G
D
 
G
A
 
T
F
 
F
R
|
R
L
 
L
F
 
F
G
 
E
T
 
R
I
 
V
L
 
R
K
 
R
R
 
R
M
 
T
K
 
A
-
 
G
I
 
L
E
 
D
V
 
F
T
 
S
Y
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
L
R
 
T
D
 
D
E
 
P
E
 
A
A
 
A
V
 
F
A
 
K
K
 
A
A
 
A
L
 
I
P
 
R
G
 
A
-
 
D
A
 
T
K
 
K
L
 
M
F
 
V
Y
 
W
M
 
I
E
|
E
S
 
T
P
 
P
T
 
T
S
x
N
W
 
P
V
 
M
M
 
L
E
 
K
A
 
L
H
 
V
D
 
D
V
 
I
G
 
A
A
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
V
L
 
I
A
 
A
Q
 
R
Q
 
K
H
 
H
G
 
G
A
 
L
I
 
L
S
 
T
M
 
V
I
 
V
D
|
D
N
 
N
S
 
T
W
 
F
A
 
A
S
 
S
P
 
P
F
 
M
F
 
L
Q
 
Q
R
 
R
P
 
P
L
 
L
T
 
S
L
 
L
G
 
G
V
 
A
D
 
D
L
 
L
V
 
V
I
 
V
H
 
H
S
|
S
A
 
A
S
 
T
K
|
K
Y
 
Y
L
 
L
G
 
N
G
 
G
H
 
H
S
 
S
D
 
D
V
 
M
V
 
V
A
 
G
G
 
G
V
 
I
-
 
A
I
 
V
A
 
V
G
 
G
S
 
D
T
 
N
A
 
A
M
 
E
I
 
L
A
 
A
R
 
E
V
 
Q
K
 
M
A
 
A
E
 
F
A
 
L
Y
 
Q
P
x
N
Y
 
S
L
 
I
G
 
G
G
 
G
K
 
V
L
 
Q
S
 
G
P
 
P
F
 
F
D
 
D
A
 
S
W
 
F
L
 
L
L
 
A
I
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
K
T
 
T
L
 
L
P
 
P
L
 
L
R
 
R
M
 
M
K
 
R
A
 
A
H
 
H
E
 
C
A
 
E
S
 
N
A
 
A
L
 
L
E
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
Q
R
 
W
L
 
L
Q
 
E
K
 
T
L
 
H
G
 
P
V
 
A
V
 
I
E
 
E
T
 
K
V
 
V
C
 
I
H
 
Y
P
 
P
G
 
G
L
 
L
A
 
A
N
 
S
R
 
H
L
 
-
P
 
P
T
 
Q
G
 
H
L
 
V
I
 
L
-
 
A
-
 
K
-
 
R
-
 
Q
-
 
M
-
 
S
G
 
G
T
 
F
S
 
G
G
 
G
L
 
I
F
 
V
S
 
S
F
 
I
I
 
V
F
 
L
R
 
K
D
 
G
G
 
G
V
 
F
D
 
D
-
 
A
I
 
A
R
 
K
A
 
R
F
 
F
A
 
C
D
 
E
H
 
K
L
 
T
K
 
E
L
 
L
F
 
F
K
 
T
L
 
L
G
 
A
V
x
E
S
|
S
W
x
L
G
 
G
G
 
G
H
 
V
E
 
E
S
 
S
L
 
L
I
 
V
V
 
N
P
 
H
G
 
P
E
 
A
V
 
V
V
 
M
L
x
T
Q
 
H
Q
 
A
K
 
S
A
 
I
Q
 
P
P
 
V
N
 
A
S
 
R
A
 
R
H
 
E
A
 
Q
F
 
L
G
 
G
I
 
I
H
 
S
A
 
D
R
 
A
S
 
L
V
 
V
R
|
R
L
 
L
H
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
I
E
 
E
G
 
D
T
 
L
E
 
G
A
 
D
L
 
L
W
 
R
R
 
G
D
 
D
I
 
L
E
 
E
E
 
R
A
 
A
L
 
L

4ixzA Native structure of cystathionine gamma lyase (xometc) from xanthomonas oryzae pv. Oryzae at ph 9.0 (see paper)
38% identity, 92% coverage: 25:384/390 of query aligns to 21:380/381 of 4ixzA

query
sites
4ixzA
A
 
A
V
 
V
V
 
M
P
 
P
P
 
P
I
 
I
F
 
Y
Q
 
A
T
 
T
S
 
S
L
 
T
F
 
Y
T
 
A
F
 
-
S
 
-
D
 
-
Y
 
-
D
 
-
D
 
-
M
 
-
I
 
-
A
 
Q
S
 
S
Y
 
S
R
 
P
G
 
G
E
 
E
R
 
H
V
 
Q
R
 
G
P
 
F
I
 
E
Y
 
Y
T
 
S
R
|
R
G
 
T
L
 
H
N
 
N
P
 
P
T
 
T
V
 
R
R
 
F
A
 
A
F
 
Y
E
 
E
E
 
R
M
 
C
L
 
V
A
 
A
K
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
A
 
G
E
 
T
D
 
R
A
 
A
L
 
F
G
 
A
F
 
F
A
 
A
S
 
S
G
 
G
M
 
M
A
 
A
A
 
A
I
 
-
S
 
T
S
 
S
A
 
T
V
 
V
L
 
M
S
 
E
F
 
L
V
 
L
E
 
D
P
 
A
G
 
G
D
 
S
R
 
H
I
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
M
K
 
D
H
 
D
V
 
L
Y
|
Y
P
 
G
D
 
G
A
 
T
F
 
F
R
 
R
L
 
L
F
 
F
G
 
E
T
 
R
I
 
V
L
 
R
K
 
R
R
 
R
M
 
T
K
 
A
-
 
G
I
 
L
E
 
D
V
 
F
T
 
S
Y
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
L
R
 
T
D
 
D
E
 
P
E
 
A
A
 
A
V
 
F
A
 
K
K
 
A
A
 
A
L
 
I
P
 
R
G
 
A
-
 
D
A
 
T
K
 
K
L
 
M
F
 
V
Y
 
W
M
 
I
E
 
E
S
 
T
P
 
P
T
 
T
S
 
N
W
 
P
V
 
M
M
 
L
E
 
K
A
 
L
H
 
V
D
 
D
V
 
I
G
 
A
A
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
V
L
 
I
A
 
A
Q
 
R
Q
 
K
H
 
H
G
 
G
A
 
L
I
 
L
S
 
T
M
 
V
I
 
V
D
|
D
N
 
N
S
 
T
W
 
F
A
 
A
S
 
S
P
 
P
F
 
M
F
 
L
Q
 
Q
R
 
R
P
 
P
L
 
L
T
 
S
L
 
L
G
 
G
V
 
A
D
 
D
L
 
L
V
 
V
I
 
V
H
 
H
S
 
S
A
 
A
S
 
T
K
|
K
Y
 
Y
L
 
L
G
 
N
G
 
G
H
 
H
S
 
S
D
 
D
V
 
M
V
 
V
A
 
G
G
 
G
V
 
I
-
 
A
I
 
V
A
 
V
G
 
G
S
 
D
T
 
N
A
 
A
M
 
E
I
 
L
A
 
A
R
 
E
V
 
Q
K
 
M
A
 
A
E
 
F
A
 
L
Y
 
Q
P
 
N
Y
 
S
L
 
I
G
 
G
G
 
G
K
 
V
L
 
Q
S
 
G
P
 
P
F
 
F
D
 
D
A
 
S
W
 
F
L
 
L
L
 
A
I
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
K
T
 
T
L
 
L
P
 
P
L
 
L
R
 
R
M
 
M
K
 
R
A
 
A
H
 
H
E
 
C
A
 
E
S
 
N
A
 
A
L
 
L
E
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
Q
R
 
W
L
 
L
Q
 
E
K
 
T
L
 
H
G
 <