SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012966597.1 NCBI__GCF_000025505.1:WP_012966597.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 19 hits to proteins with known functional sites (download)

1hg3A Crystal structure of tetrameric tim from pyrococcus woesei. (see paper)
56% identity, 99% coverage: 1:219/222 of query aligns to 3:221/224 of 1hg3A

query
sites
1hg3A
M
 
L
E
 
K
K
 
E
K
 
P
V
 
I
V
 
I
I
 
A
I
 
I
N
|
N
F
 
F
K
|
K
A
 
T
Y
 
Y
R
 
I
E
 
E
G
 
A
A
 
T
G
 
G
K
 
K
N
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
I
A
 
A
K
 
K
A
 
A
V
 
A
E
 
E
K
 
K
V
 
V
A
 
Y
E
 
K
K
 
E
S
 
T
D
 
G
F
 
V
Y
 
T
F
 
I
G
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
N
 
Q
F
 
L
L
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
R
E
 
M
I
 
I
V
 
A
K
 
E
S
 
S
V
 
V
G
 
E
I
 
I
D
 
P
V
 
V
Y
 
F
A
 
A
Q
 
Q
H
 
H
V
 
I
D
 
D
A
 
P
V
 
I
E
 
K
F
 
P
G
 
G
S
 
S
H
 
H
T
 
T
G
 
G
R
 
H
I
 
V
T
 
L
A
 
P
E
 
E
M
 
A
I
 
V
K
 
K
E
 
E
K
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
V
G
 
G
S
 
T
L
 
L
I
 
L
N
 
N
H
|
H
S
 
S
E
 
E
R
 
N
R
 
R
L
 
M
R
 
I
L
 
L
A
 
A
D
 
D
I
 
L
D
 
E
F
 
A
L
 
A
V
 
I
S
 
R
K
 
R
F
 
A
K
 
E
E
 
E
L
 
V
G
 
G
L
 
L
I
 
M
S
 
T
V
 
M
V
 
V
C
 
C
T
 
S
N
 
N
N
 
N
V
 
P
S
 
A
T
 
V
T
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
L
S
 
N
P
 
P
D
 
D
F
 
Y
V
 
V
A
 
A
V
 
V
E
|
E
P
 
P
P
 
P
E
 
E
L
 
L
I
|
I
G
 
G
S
 
T
G
 
G
I
 
I
P
 
P
V
 
V
S
 
S
K
 
K
A
 
A
E
 
K
P
 
P
E
 
E
V
 
V
V
 
I
E
 
T
N
 
N
S
 
T
V
 
V
R
 
E
A
 
L
A
 
V
K
 
K
N
 
K
V
 
V
N
 
N
E
 
P
E
 
E
V
 
V
K
 
K
V
 
V
L
 
L
C
 
C
G
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
S
K
 
T
Y
 
G
E
 
E
D
 
D
V
 
V
V
 
K
A
 
K
A
 
A
I
 
I
D
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
T
D
 
V
G
 
G
V
 
V
L
 
L
L
|
L
A
|
A
S
|
S
G
 
G
V
 
V
V
 
T
K
 
K
A
 
A
S
 
K
D
 
D
P
 
P
R
 
E
K
 
K
A
 
A
L
 
I
E
 
W
E
 
D
L
 
L
V
 
V

P62003 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Pyrococcus woesei (see 2 papers)
56% identity, 99% coverage: 1:219/222 of query aligns to 4:222/228 of P62003

query
sites
P62003
M
 
L
E
 
K
K
 
E
K
 
P
V
 
I
V
 
I
I
 
A
I
 
I
N
|
N
F
|
F
K
|
K
A
 
T
Y
 
Y
R
 
I
E
 
E
G
 
A
A
 
T
G
 
G
K
 
K
N
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
I
A
 
A
K
 
K
A
 
A
V
 
A
E
 
E
K
 
K
V
 
V
A
 
Y
E
 
K
K
 
E
S
 
T
D
 
G
F
 
V
Y
 
T
F
 
I
G
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
N
 
Q
F
 
L
L
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
R
E
 
M
I
 
I
V
 
A
K
 
E
S
 
S
V
 
V
G
 
E
I
 
I
D
 
P
V
 
V
Y
 
F
A
 
A
Q
 
Q
H
 
H
V
 
I
D
 
D
A
 
P
V
 
I
E
 
K
F
 
P
G
 
G
S
 
S
H
 
H
T
 
T
G
 
G
R
 
H
I
 
V
T
 
L
A
 
P
E
 
E
M
 
A
I
 
V
K
 
K
E
 
E
K
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
V
G
 
G
S
 
T
L
 
L
I
 
L
N
 
N
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
N
R
 
R
L
 
M
R
 
I
L
 
L
A
 
A
D
 
D
I
 
L
D
 
E
F
 
A
L
 
A
V
 
I
S
 
R
K
 
R
F
 
A
K
 
E
E
 
E
L
 
V
G
 
G
L
 
L
I
 
M
S
 
T
V
 
M
V
 
V
C
 
C
T
 
S
N
 
N
N
 
N
V
 
P
S
 
A
T
 
V
T
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
L
S
 
N
P
 
P
D
 
D
F
 
Y
V
 
V
A
 
A
V
 
V
E
 
E
P
 
P
P
 
P
E
 
E
L
 
L
I
|
I
G
 
G
S
 
T
G
 
G
I
 
I
P
 
P
V
 
V
S
 
S
K
 
K
A
 
A
E
 
K
P
 
P
E
 
E
V
 
V
V
 
I
E
 
T
N
 
N
S
 
T
V
 
V
R
 
E
A
 
L
A
 
V
K
 
K
N
 
K
V
 
V
N
 
N
E
 
P
E
 
E
V
 
V
K
 
K
V
 
V
L
 
L
C
 
C
G
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
S
K
 
T
Y
 
G
E
 
E
D
 
D
V
 
V
V
 
K
A
 
K
A
 
A
I
 
I
D
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
T
D
 
V
G
 
G
V
 
V
L
 
L
L
 
L
A
|
A
S
|
S
G
 
G
V
 
V
V
 
T
K
 
K
A
 
A
S
 
K
D
 
D
P
 
P
R
 
E
K
 
K
A
 
A
L
 
I
E
 
W
E
 
D
L
 
L
V
 
V

Sites not aligning to the query:

1w0mA Triosephosphate isomerase from thermoproteus tenax (see paper)
50% identity, 98% coverage: 1:218/222 of query aligns to 1:218/225 of 1w0mA

query
sites
1w0mA
M
 
M
E
 
R
K
 
L
K
 
P
V
 
I
V
 
L
I
 
I
I
 
I
N
 
N
F
 
F
K
 
K
A
 
A
Y
 
Y
R
 
G
E
 
E
G
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
K
N
 
R
A
 
A
L
 
V
E
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
A
V
 
A
E
 
E
K
 
R
V
 
A
A
 
A
E
 
R
K
 
E
S
 
L
D
 
G
F
 
V
Y
 
N
F
 
I
G
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
N
 
N
F
 
H
L
 
L
D
 
E
L
 
L
A
 
G
E
 
L
I
 
V
V
 
S
K
 
Q
S
 
S
V
 
V
G
 
D
I
 
I
D
 
P
V
 
V
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
Q
H
 
G
V
 
A
D
 
D
A
 
V
V
 
E
E
 
A
F
 
G
G
 
G
S
 
A
H
 
H
T
 
T
G
 
A
R
 
H
I
 
V
T
 
S
A
 
L
E
 
E
M
 
N
I
 
I
K
 
K
E
 
E
K
 
A
G
 
G
A
 
G
K
 
S
G
 
G
S
 
V
L
 
I
I
 
L
N
 
N
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
A
R
 
P
L
 
L
R
 
K
L
 
L
A
 
N
D
 
D
I
 
L
D
 
A
F
 
R
L
 
L
V
 
V
S
 
A
K
 
K
F
 
A
K
 
K
E
 
S
L
 
L
G
 
G
L
 
L
I
 
D
S
 
V
V
 
V
V
 
V
C
 
C
T
 
A
N
 
P
N
 
D
V
 
P
S
 
R
T
 
T
T
 
S
A
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
S
 
G
P
 
P
D
 
H
F
 
A
V
 
V
A
 
A
V
 
V
E
 
E
P
 
P
P
 
P
E
 
E
L
 
L
I
|
I
G
|
G
S
 
T
G
 
G
I
 
R
P
 
A
V
 
V
S
 
S
K
 
R
A
 
Y
E
 
K
P
 
P
E
 
E
V
 
A
V
 
I
E
 
V
N
 
E
S
 
T
V
 
V
R
 
G
A
 
L
A
 
V
K
 
S
N
 
R
V
 
H
N
 
F
E
 
P
E
 
E
V
 
V
K
 
S
V
 
V
L
 
I
C
 
T
G
 
G
A
|
A
G
|
G
I
 
I
T
 
E
K
 
S
Y
 
G
E
 
D
D
 
D
V
 
V
V
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
L
D
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
T
D
 
R
G
 
G
V
 
V
L
 
L
L
|
L
A
|
A
S
|
S
G
 
A
V
 
A
V
 
V
K
 
K
A
 
A
S
 
K
D
 
D
P
 
P
R
 
Y
K
 
A
A
 
K
L
 
I
E
 
V
E
 
E
L
 
L

Q8NKN9 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Thermoproteus tenax (strain ATCC 35583 / DSM 2078 / JCM 9277 / NBRC 100435 / Kra 1) (see paper)
50% identity, 98% coverage: 1:218/222 of query aligns to 1:218/226 of Q8NKN9

query
sites
Q8NKN9
M
 
M
E
 
R
K
 
L
K
 
P
V
 
I
V
 
L
I
 
I
I
 
I
N
 
N
F
 
F
K
 
K
A
 
A
Y
 
Y
R
 
G
E
 
E
G
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
K
N
 
R
A
 
A
L
 
V
E
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
A
V
 
A
E
 
E
K
 
R
V
 
A
A
 
A
E
 
R
K
 
E
S
 
L
D
 
G
F
 
V
Y
 
N
F
 
I
G
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
N
 
N
F
 
H
L
 
L
D
 
E
L
 
L
A
 
G
E
 
L
I
 
V
V
 
S
K
 
Q
S
 
S
V
 
V
G
 
D
I
 
I
D
 
P
V
 
V
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
Q
H
 
G
V
 
A
D
 
D
A
 
V
V
 
E
E
 
A
F
 
G
G
 
G
S
 
A
H
 
H
T
 
T
G
 
A
R
 
H
I
 
V
T
 
S
A
 
L
E
 
E
M
 
N
I
 
I
K
 
K
E
 
E
K
 
A
G
 
G
A
 
G
K
 
S
G
 
G
S
 
V
L
 
I
I
 
L
N
 
N
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
A
R
 
P
L
 
L
R
 
K
L
 
L
A
 
N
D
 
D
I
 
L
D
 
A
F
 
R
L
 
L
V
 
V
S
 
A
K
 
K
F
 
A
K
 
K
E
 
S
L
 
L
G
 
G
L
 
L
I
 
D
S
 
V
V
 
V
V
 
V
C
 
C
T
 
A
N
 
P
N
 
D
V
 
P
S
 
R
T
 
T
T
 
S
A
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
S
 
G
P
 
P
D
 
H
F
 
A
V
 
V
A
 
A
V
 
V
E
 
E
P
 
P
P
 
P
E
 
E
L
 
L
I
 
I
G
 
G
S
 
T
G
 
G
I
 
R
P
 
A
V
 
V
S
 
S
K
 
R
A
 
Y
E
 
K
P
 
P
E
 
E
V
 
A
V
 
I
E
 
V
N
 
E
S
 
T
V
 
V
R
 
G
A
 
L
A
 
V
K
 
S
N
 
R
V
 
H
N
 
F
E
 
P
E
 
E
V
 
V
K
 
S
V
 
V
L
 
I
C
 
T
G
 
G
A
 
A
G
|
G
I
 
I
T
 
E
K
 
S
Y
 
G
E
 
D
D
 
D
V
 
V
V
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
L
D
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
T
D
 
R
G
 
G
V
 
V
L
 
L
L
 
L
A
|
A
S
|
S
G
 
A
V
 
A
V
 
V
K
 
K
A
 
A
S
 
K
D
 
D
P
 
P
R
 
Y
K
 
A
A
 
K
L
 
I
E
 
V
E
 
E
L
 
L

5csrC Crystal structure of triosephosphate isomerase from thermoplasma acidophilium (see paper)
40% identity, 97% coverage: 7:222/222 of query aligns to 5:216/220 of 5csrC

query
sites
5csrC
I
 
I
I
 
V
N
 
N
F
 
L
K
 
K
A
 
T
Y
 
Y
R
 
R
E
 
E
G
 
A
A
 
T
G
 
G
K
 
A
N
 
N
A
 
F
L
 
T
E
 
R
L
 
F
A
 
M
K
 
E
A
 
K
V
 
F
E
 
E
K
 
P
V
 
V
A
 
Q
E
 
G
K
 
K
S
 
F
D
 
E
F
 
L
Y
 
I
F
 
F
G
 
-
V
 
-
A
 
S
P
 
P
N
 
S
F
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
A
 
E
E
 
K
I
 
A
V
 
A
K
 
K
S
 
C
V
 
G
G
 
K
I
 
F
D
 
R
V
 
F
Y
 
F
A
 
A
Q
 
Q
H
 
H
V
 
V
D
|
D
A
 
A
V
 
E
E
 
P
F
 
Y
G
 
G
S
 
A
H
 
Y
T
 
T
G
 
G
R
 
H
I
 
V
T
 
P
A
 
M
E
 
D
M
 
M
I
 
M
K
 
I
E
 
D
K
 
L
G
 
G
A
 
I
K
 
T
G
 
G
S
 
S
L
 
I
I
 
L
N
 
N
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
|
R
R
 
R
L
 
L
R
 
P
L
 
R
A
 
D
D
 
T
I
 
I
D
 
I
F
 
N
L
 
T
V
 
L
S
 
K
K
 
K
F
 
A
K
 
S
E
 
K
L
 
L
G
 
D
L
 
F
I
 
T
S
 
I
V
 
V
V
 
L
C
 
C
T
 
V
N
 
E
N
 
N
V
 
A
S
 
E
T
 
E
T
 
A
A
 
K
A
 
Y
A
 
F
A
 
R
A
 
E
L
 
Y
S
 
E
P
 
P
D
 
D
F
 
F
V
 
I
A
 
A
V
 
Y
E
 
E
P
 
P
P
 
R
E
 
D
L
 
L
I
 
I
G
 
G
S
 
G
G
 
D
I
 
V
P
 
S
V
 
V
S
 
S
K
 
T
A
 
A
E
 
K
P
 
P
E
 
E
V
 
I
V
 
I
E
 
E
N
 
D
S
 
I
V
 
V
R
 
K
A
 
I
A
 
Y
K
 
E
N
 
G
V
 
T
N
 
G
E
 
-
E
 
-
V
 
T
K
 
S
V
 
V
L
 
L
C
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
K
K
 
T
Y
 
G
E
 
E
D
 
D
V
 
V
V
 
R
A
 
R
A
 
S
I
 
I
D
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
R
G
 
G
V
 
I
L
 
L
L
 
V
A
 
A
S
 
S
G
 
G
V
 
V
V
 
V
K
 
K
A
 
S
S
 
A
D
 
D
P
 
P
R
 
T
K
 
K
A
 
S
L
 
L
E
 
N
E
 
S
L
 
L
V
 
I
G
 
E
L
 
L
R
 
K

5cssA Crystal structure of triosephosphate isomerase from thermoplasma acidophilum with glycerol 3-phosphate (see paper)
40% identity, 96% coverage: 7:219/222 of query aligns to 5:213/214 of 5cssA

query
sites
5cssA
I
 
I
I
 
V
N
 
N
F
 
L
K
|
K
A
 
T
Y
 
Y
R
 
R
E
 
E
G
 
A
A
 
T
G
 
G
K
 
A
N
 
N
A
 
F
L
 
T
E
 
R
L
 
F
A
 
M
K
 
E
A
 
K
V
 
F
E
 
E
K
 
P
V
 
V
A
 
Q
E
 
G
K
 
K
S
 
F
D
 
E
F
 
L
Y
 
I
F
 
F
G
 
-
V
 
-
A
 
S
P
 
P
N
 
S
F
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
A
 
E
E
 
K
I
 
A
V
 
A
K
 
K
S
 
C
V
 
G
G
 
K
I
 
F
D
 
R
V
 
F
Y
 
F
A
 
A
Q
 
Q
H
 
H
V
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
E
E
 
P
F
 
Y
G
 
G
S
 
A
H
 
Y
T
 
T
G
 
G
R
 
H
I
 
V
T
 
P
A
 
M
E
 
D
M
 
M
I
 
M
K
 
I
E
 
D
K
 
L
G
 
G
A
 
I
K
 
T
G
 
G
S
 
S
L
 
I
I
 
L
N
 
N
H
|
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
L
 
L
R
 
P
L
 
R
A
 
D
D
 
T
I
 
I
D
 
I
F
 
N
L
 
T
V
 
L
S
 
K
K
 
K
F
 
A
K
 
S
E
 
K
L
 
L
G
 
D
L
 
F
I
 
T
S
 
I
V
 
V
V
 
L
C
 
C
T
 
V
N
 
E
N
 
N
V
 
A
S
 
E
T
 
E
T
 
A
A
 
K
A
 
Y
A
 
F
A
 
R
A
 
E
L
 
Y
S
 
E
P
 
P
D
 
D
F
 
F
V
 
I
A
 
A
V
 
Y
E
|
E
P
 
P
P
 
R
E
 
D
L
 
L
I
|
I
G
|
G
S
 
G
G
 
D
I
 
V
P
 
S
V
 
V
S
 
S
K
 
T
A
 
A
E
 
K
P
 
P
E
 
E
V
 
I
V
 
I
E
 
E
N
 
D
S
 
I
V
 
V
R
 
K
A
 
I
A
 
Y
K
 
E
N
 
G
V
 
T
N
 
G
E
 
-
E
 
-
V
 
T
K
 
S
V
 
V
L
 
L
C
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
K
K
 
T
Y
 
G
E
 
E
D
 
D
V
 
V
V
 
R
A
 
R
A
 
S
I
 
I
D
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
R
G
 
G
V
 
I
L
 
L
L
 
V
A
|
A
S
|
S
G
 
G
V
 
V
V
 
V
K
 
K
A
 
S
S
 
A
D
 
D
P
 
P
R
 
T
K
 
K
A
 
S
L
 
L
E
 
N
E
 
S
L
 
L
V
 
I

4mvaA 1.43 angstrom resolution crystal structure of triosephosphate isomerase (tpia) from escherichia coli in complex with acetyl phosphate. (see paper)
30% identity, 67% coverage: 61:208/222 of query aligns to 63:239/255 of 4mvaA

query
sites
4mvaA
A
 
A
Q
 
Q
H
 
N
V
 
V
D
 
D
A
 
L
V
 
N
E
 
L
F
 
S
G
 
G
S
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
R
 
E
I
 
T
T
 
S
A
 
A
E
 
A
M
 
M
I
 
L
K
 
K
E
 
D
K
 
I
G
 
G
A
 
A
K
 
Q
G
 
Y
S
 
I
L
 
I
I
 
I
N
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
L
 
T
R
 
Y
L
 
H
A
 
K
D
 
E
I
 
S
D
 
D
F
 
E
L
 
L
V
 
I
S
 
A
K
 
K
-
 
K
-
 
F
-
 
A
-
 
V
F
 
L
K
 
K
E
 
E
L
 
Q
G
 
G
L
 
L
I
 
T
S
 
P
V
 
V
V
 
L
C
 
C
-
 
I
-
 
G
-
 
E
-
 
T
-
 
E
-
 
A
-
 
E
-
 
N
-
 
E
-
 
A
-
 
G
-
 
K
-
 
T
-
 
E
-
 
E
-
 
V
-
 
C
-
 
A
-
 
R
-
 
Q
T
 
I
N
 
D
N
 
A
V
 
V
S
 
L
T
 
K
T
 
T
A
 
Q
A
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
F
S
 
E
P
 
G
D
 
A
F
 
V
V
 
I
A
 
A
V
 
Y
E
 
E
P
 
P
P
 
V
E
 
W
L
 
A
I
 
I
G
 
G
S
 
T
G
 
G
I
 
K
P
 
S
V
 
A
S
 
T
K
 
P
A
 
A
E
 
Q
P
 
A
E
 
Q
V
 
A
V
 
V
E
 
H
N
 
K
S
 
F
V
 
I
R
 
R
-
 
D
-
 
H
A
 
I
A
 
A
K
 
K
-
 
V
-
 
D
-
 
A
N
 
N
V
 
I
N
 
A
E
 
E
E
 
Q
V
 
V
K
 
I
V
 
I
L
 
Q
C
 
Y
G
 
G
A
 
G
G
x
S
I
 
V
-
 
N
-
 
A
T
 
S
K
 
N
Y
 
A
E
 
A
D
 
E
V
 
L
V
 
F
A
 
A
A
 
Q
I
 
P
D
 
D
L
 
I
G
 
-
A
 
-
D
 
D
G
 
G
V
 
A
L
 
L
L
 
V
A
x
G
S
x
G
G
 
A
V
 
S
V
 
L
K
 
K
A
 
A

B1XB85 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Escherichia coli (strain K12 / DH10B) (see paper)
30% identity, 67% coverage: 61:208/222 of query aligns to 63:239/255 of B1XB85

query
sites
B1XB85
A
 
A
Q
 
Q
H
 
N
V
 
V
D
 
D
A
 
L
V
 
N
E
 
L
F
 
S
G
 
G
S
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
R
 
E
I
 
T
T
 
S
A
 
A
E
 
A
M
 
M
I
 
L
K
 
K
E
 
D
K
 
I
G
 
G
A
 
A
K
 
Q
G
 
Y
S
 
I
L
 
I
I
 
I
N
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
L
 
T
R
 
Y
L
 
H
A
 
K
D
 
E
I
 
S
D
 
D
F
 
E
L
 
L
V
 
I
S
 
A
K
 
K
-
 
K
-
 
F
-
 
A
-
 
V
F
 
L
K
 
K
E
 
E
L
 
Q
G
 
G
L
 
L
I
 
T
S
 
P
V
 
V
V
 
L
C
 
C
-
 
I
-
 
G
-
 
E
-
 
T
-
 
E
-
 
A
-
 
E
-
 
N
-
 
E
-
 
A
-
 
G
-
 
K
-
 
T
-
 
E
-
 
E
-
 
V
-
 
C
-
 
A
-
 
R
-
 
Q
T
 
I
N
 
D
N
 
A
V
 
V
S
 
L
T
 
K
T
 
T
A
 
Q
A
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
F
S
 
E
P
 
G
D
 
A
F
 
V
V
 
I
A
 
A
V
 
Y
E
 
E
P
 
P
P
 
V
E
 
W
L
 
A
I
 
I
G
 
G
S
 
T
G
 
G
I
 
K
P
 
S
V
 
A
S
 
T
K
 
P
A
 
A
E
 
Q
P
 
A
E
 
Q
V
 
A
V
 
V
E
 
H
N
 
K
S
 
F
V
 
I
R
 
R
-
 
D
-
 
H
A
 
I
A
 
A
K
 
K
-
 
V
-
 
D
-
 
A
N
 
N
V
 
I
N
 
A
E
 
E
E
 
Q
V
 
V
K
 
I
V
 
I
L
 
Q
C
 
Y
G
 
G
A
 
G
G
x
S
I
 
V
-
 
N
-
 
A
T
 
S
K
 
N
Y
 
A
E
 
A
D
 
E
V
 
L
V
 
F
A
 
A
A
 
Q
I
 
P
D
 
D
L
 
I
G
 
-
A
 
-
D
 
D
G
 
G
V
 
A
L
 
L
L
 
V
A
x
G
S
x
G
G
 
A
V
 
S
V
 
L
K
 
K
A
 
A

P50921 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Moritella marina (Vibrio marinus) (see paper)
32% identity, 57% coverage: 41:166/222 of query aligns to 40:194/256 of P50921

query
sites
P50921
V
 
V
A
 
A
P
 
P
N
 
P
-
 
A
-
 
L
F
 
F
L
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
E
-
 
R
I
 
T
V
 
L
K
 
T
S
 
E
V
 
A
G
 
G
-
 
S
-
 
A
I
 
I
D
 
I
V
 
L
Y
 
G
A
 
A
Q
 
Q
H
 
N
V
 
T
D
 
D
A
 
L
V
 
N
E
 
N
F
 
S
G
 
G
S
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
R
 
D
I
 
M
T
 
S
A
 
P
E
 
A
M
 
M
I
 
L
K
 
K
E
 
E
K
 
F
G
 
G
A
 
A
K
 
T
G
 
H
S
 
I
L
 
I
I
 
I
N
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
L
 
E
R
 
Y
L
 
H
A
 
A
D
 
E
I
 
S
D
 
D
-
 
E
F
 
F
L
 
V
V
 
A
S
 
K
K
 
K
F
 
F
-
 
A
-
 
F
-
 
L
K
 
K
E
 
E
L
 
N
G
 
G
L
 
L
I
 
T
S
 
P
V
 
V
V
 
L
C
 
C
T
 
I
-
 
G
-
 
E
-
 
S
-
 
D
-
 
A
-
 
Q
-
 
N
-
 
E
-
 
A
-
 
G
-
 
E
-
 
T
-
 
M
-
 
A
-
 
V
-
 
C
-
 
A
-
 
R
-
 
Q
-
 
L
N
 
D
N
 
A
V
 
V
S
 
I
T
 
N
T
 
T
A
 
Q
A
 
G
A
 
V
A
 
E
A
 
A
L
 
L
S
 
E
P
 
G
D
 
A
F
 
I
V
 
I
A
 
A
V
 
Y
E
 
E
P
 
P
P
 
I
E
 
W
L
 
A
I
 
I
G
|
G
S
 
T
G
 
G
I
 
K
P
 
A
V
 
A
S
 
T
K
 
A
A
 
E
E
 
D
P
 
A
E
 
Q
V
 
R
V
 
I
E
 
H
N
 
A
S
 
Q
V
 
I
R
 
R
A
 
A

Sites not aligning to the query:

1aw1A Triosephosphate isomerase of vibrio marinus complexed with 2- phosphoglycolate (see paper)
32% identity, 57% coverage: 41:166/222 of query aligns to 39:193/255 of 1aw1A

query
sites
1aw1A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
N
 
P
-
 
A
-
 
L
F
 
F
L
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
E
-
 
R
I
 
T
V
 
L
K
 
T
S
 
E
V
 
A
G
 
G
-
 
S
-
 
A
I
 
I
D
 
I
V
 
L
Y
 
G
A
 
A
Q
 
Q
H
 
N
V
 
T
D
 
D
A
 
L
V
 
N
E
 
N
F
 
S
G
 
G
S
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
R
 
D
I
 
M
T
 
S
A
 
P
E
 
A
M
 
M
I
 
L
K
 
K
E
 
E
K
 
F
G
 
G
A
 
A
K
 
T
G
 
H
S
 
I
L
 
I
I
 
I
N
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
L
 
E
R
 
Y
L
 
H
A
 
A
D
 
E
I
 
S
D
 
D
-
 
E
F
 
F
L
 
V
V
 
A
S
 
K
K
 
K
F
 
F
-
 
A
-
 
F
-
 
L
K
 
K
E
 
E
L
 
N
G
 
G
L
 
L
I
 
T
S
 
P
V
 
V
V
 
L
C
 
C
T
 
I
-
 
G
-
 
E
-
 
S
-
 
D
-
 
A
-
 
Q
-
 
N
-
 
E
-
 
A
-
 
G
-
 
E
-
 
T
-
 
M
-
 
A
-
 
V
-
 
C
-
 
A
-
 
R
-
 
Q
-
 
L
N
 
D
N
 
A
V
 
V
S
 
I
T
 
N
T
 
T
A
 
Q
A
 
G
A
 
V
A
 
E
A
 
A
L
 
L
S
 
E
P
 
G
D
 
A
F
 
I
V
 
I
A
 
A
V
 
Y
E
|
E
P
 
P
P
 
I
E
 
W
L
 
A
I
 
I
G
|
G
S
 
T
G
 
G
I
 
K
P
 
A
V
 
A
S
 
T
K
 
A
A
 
E
E
 
D
P
 
A
E
 
Q
V
 
R
V
 
I
E
 
H
N
 
A
S
 
Q
V
 
I
R
 
R
A
 
A

Sites not aligning to the query:

6oogA Crystal structure of triosephosphate isomerase from taenia solium in complex with 2pg (see paper)
28% identity, 78% coverage: 35:207/222 of query aligns to 38:241/252 of 6oogA

query
sites
6oogA
S
 
A
D
 
D
F
 
I
Y
 
V
F
 
I
G
 
G
V
 
V
A
 
P
P
 
A
N
 
C
F
 
Y
L
 
L
D
 
K
L
 
Y
A
 
A
E
 
Q
I
 
D
V
 
K
K
 
A
S
 
P
V
 
K
G
 
G
I
 
I
D
 
K
V
 
I
Y
 
A
A
 
A
Q
 
E
H
 
N
V
 
C
D
 
Y
A
 
K
V
 
V
E
 
G
F
 
S
G
 
G
S
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
R
 
E
I
 
I
T
 
S
A
 
T
E
 
E
M
 
M
I
 
I
K
 
K
E
 
D
K
 
C
G
 
G
A
 
C
K
 
E
G
 
W
S
 
V
L
 
I
I
 
L
N
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
L
 
H
R
 
I
L
 
F
A
 
G
D
 
E
I
 
S
D
 
N
F
 
E
L
 
L
V
 
I
S
 
G
-
 
E
K
 
K
F
 
V
K
 
K
-
 
H
-
 
A
-
 
L
E
 
D
L
 
S
G
 
G
L
 
L
I
 
N
S
 
V
V
 
I
V
 
P
C
 
C
-
 
I
-
 
G
-
 
E
-
 
L
-
 
L
-
 
S
-
 
E
-
 
R
-
 
E
-
 
A
-
 
G
-
 
K
T
 
T
N
 
N
N
 
D
V
 
V
S
 
C
T
 
F
T
 
A
A
 
Q
A
 
M
A
 
D
A
 
A
-
 
I
-
 
A
-
 
K
-
 
N
-
 
V
-
 
P
-
 
S
-
 
K
-
 
E
A
 
A
L
 
W
S
 
D
P
 
K
D
 
V
F
 
V
V
 
I
A
 
A
V
 
Y
E
|
E
P
 
P
P
 
V
E
 
W
L
 
A
I
|
I
G
|
G
S
 
T
G
 
G
I
 
K
P
 
T
V
 
A
S
 
T
K
 
P
A
 
A
E
 
Q
P
 
A
E
 
Q
V
 
E
V
 
V
E
 
H
N
 
K
S
 
V
V
 
V
R
 
R
A
 
D
A
 
W
-
 
I
-
 
R
K
 
K
N
 
H
V
 
V
N
 
D
-
 
A
-
 
G
-
 
I
-
 
A
E
 
D
E
 
K
V
 
V
K
 
R
V
 
I
L
 
L
C
 
Y
G
 
G
A
 
G
G
x
S
I
 
V
T
 
T
K
 
A
Y
 
S
E
 
N
D
 
-
V
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
A
I
 
K
D
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
T
-
 
Q
-
 
P
-
 
D
-
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
F
L
 
L
L
 
V
A
x
G
S
x
G
G
 
A
V
 
S
V
 
L
K
 
K

Sites not aligning to the query:

6ooiC Crystal structure of triosephosphate isomerase from schistosoma mansoni in complex with 2pg (see paper)
26% identity, 75% coverage: 41:207/222 of query aligns to 45:244/255 of 6ooiC

query
sites
6ooiC
V
 
I
A
 
A
P
 
P
N
 
P
F
 
S
L
 
V
D
 
F
L
 
L
A
 
H
E
 
E
I
 
I
V
 
R
K
 
K
S
 
S
V
 
L
G
 
K
-
 
K
-
 
E
I
 
I
D
 
H
V
 
V
Y
 
A
A
 
A
Q
 
Q
H
 
N
V
 
C
D
 
Y
A
 
K
V
 
V
E
 
S
F
 
K
G
 
G
S
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
R
 
E
I
 
I
T
 
S
A
 
P
E
 
A
M
 
M
I
 
I
K
 
R
E
 
D
K
 
I
G
 
G
A
 
C
K
 
D
G
 
W
S
 
V
L
 
I
I
 
L
N
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
L
 
N
R
 
I
L
 
F
A
 
G
D
 
E
I
 
S
D
 
D
F
 
E
L
 
L
V
 
I
S
 
A
K
 
E
F
 
K
K
 
V
E
 
Q
L
 
H
G
 
A
L
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
G
I
 
L
S
 
S
V
 
V
-
 
I
-
 
A
-
 
C
-
 
I
-
 
G
-
 
E
-
 
T
-
 
L
-
 
S
-
 
E
-
 
R
-
 
E
-
 
S
-
 
N
-
 
K
-
 
T
-
 
E
-
 
E
V
 
V
C
 
C
T
 
V
N
 
R
N
 
Q
V
 
L
S
 
K
T
 
A
T
 
I
A
 
A
A
 
N
A
 
K
A
 
I
A
 
K
L
 
S
S
 
A
P
 
D
D
 
E
F
 
W
-
 
K
-
 
R
-
 
V
-
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
Y
E
|
E
P
 
P
P
 
V
E
 
W
L
 
A
I
|
I
G
|
G
S
 
T
G
 
G
I
 
K
P
 
V
V
 
A
S
 
T
K
 
P
A
 
Q
E
 
Q
P
 
A
E
 
Q
V
 
E
V
 
V
E
 
H
N
 
N
S
 
F
V
 
L
R
 
R
-
 
K
-
 
W
-
 
F
-
 
K
-
 
T
-
 
N
A
 
A
A
 
P
K
 
N
N
 
G
V
 
V
N
 
D
E
 
E
E
 
K
V
 
I
K
 
R
V
 
I
L
 
I
C
 
Y
G
 
G
A
x
G
G
x
S
I
 
V
T
 
T
K
 
A
Y
 
A
E
 
N
D
 
C
V
 
K
V
 
E
A
 
L
A
 
A
I
 
Q
D
 
Q
L
 
H
G
 
D
A
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
F
L
|
L
L
 
V
A
x
G
S
x
G
G
 
A
V
 
S
V
 
L
K
 
K

Sites not aligning to the query:

P00943 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Geobacillus stearothermophilus (Bacillus stearothermophilus) (see 2 papers)
28% identity, 67% coverage: 1:149/222 of query aligns to 1:175/253 of P00943

query
sites
P00943
M
 
M
E
 
R
K
 
K
K
 
P
V
 
I
V
 
I
I
 
A
I
 
G
N
|
N
F
x
W
K
|
K
A
 
M
Y
x
H
R
x
K
E
 
T
G
 
L
A
 
A
G
 
-
K
 
-
N
 
E
A
 
A
L
 
V
E
 
Q
L
 
F
A
 
V
K
 
E
A
 
D
V
 
V
E
 
K
K
 
G
V
 
H
A
 
V
E
 
P
K
 
P
S
 
A
D
 
D
F
 
E
Y
 
V
F
 
I
G
 
S
V
 
V
-
 
V
-
 
C
A
 
A
P
 
P
N
 
F
-
 
L
F
 
F
L
 
L
D
 
D
-
 
R
L
 
L
A
 
V
E
 
Q
I
 
A
V
 
A
K
 
D
S
 
G
V
 
T
G
 
D
I
 
L
D
 
K
V
 
I
Y
 
G
A
 
A
Q
 
Q
H
 
T
V
 
M
D
 
H
A
 
F
V
 
A
E
 
D
F
 
Q
G
 
G
S
 
A
H
 
Y
T
 
T
G
 
G
R
 
E
I
 
V
T
 
S
A
 
P
E
 
V
M
 
M
I
 
L
K
 
K
E
 
D
K
 
L
G
 
G
A
 
V
K
 
T
G
 
Y
S
 
V
L
 
I
I
 
L
N
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
L
 
Q
R
 
M
L
 
F
A
 
A
D
 
E
I
 
T
D
 
D
F
 
E
L
 
T
V
 
V
S
 
N
K
 
K
-
 
K
-
 
V
-
 
L
-
 
A
-
 
A
F
 
F
K
 
T
E
 
R
L
 
-
G
 
G
L
 
L
I
 
I
S
 
P
V
 
I
V
 
I
C
 
C
-
 
C
-
 
G
-
 
E
-
 
S
-
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
R
-
 
E
-
 
A
-
 
G
-
 
Q
T
 
T
N
 
N
N
 
A
V
 
V
S
 
V
T
 
A
T
 
S
A
 
Q
-
 
V
-
 
E
-
 
K
A
 
A
A
 
L
A
 
A
A
 
G
L
 
L
S
 
T
P
 
P
D
 
E
-
 
Q
-
 
V
-
 
K
-
 
Q
-
 
A
F
 
V
V
 
I
A
 
A
V
 
Y
E
 
E
P
 
P
P
 
I
E
 
W
L
 
A
I
 
I
G
|
G
S
 
T
G
 
G

Sites not aligning to the query:

4y90A Crystal structure of triosephosphate isomerase from deinococcus radiodurans (see paper)
36% identity, 34% coverage: 46:120/222 of query aligns to 44:124/244 of 4y90A

query
sites
4y90A
L
 
L
D
 
D
L
 
L
A
 
S
E
 
A
I
 
L
V
 
A
K
 
A
S
 
N
V
 
L
-
 
P
-
 
A
G
 
G
I
 
I
D
 
A
V
 
F
Y
 
G
A
 
G
Q
 
Q
H
 
D
V
 
V
D
 
S
A
 
A
V
 
H
E
 
E
F
 
S
G
 
G
S
 
A
H
 
Y
T
 
T
G
 
G
R
 
E
I
 
I
T
 
S
A
 
A
E
 
A
M
 
M
I
 
L
K
 
K
E
 
D
K
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
S
G
 
C
S
 
V
L
 
V
I
 
V
N
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
L
 
E
R
 
Y
L
 
H
A
 
D
D
 
E
I
 
S
D
 
D
F
 
A
L
 
T
V
 
V
S
 
A
-
 
A
-
 
K
-
 
A
-
 
R
K
 
Q
F
 
A
K
 
Q
E
 
A
L
 
N
G
 
G
L
 
L
I
 
L
S
 
P
V
 
I
V
 
V
C
 
C

Sites not aligning to the query:

P27876 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
31% identity, 54% coverage: 1:120/222 of query aligns to 1:126/253 of P27876

query
sites
P27876
M
 
M
E
 
R
K
 
K
K
 
P
V
 
I
V
 
I
I
 
A
I
 
G
N
 
N
F
 
W
K
 
K
A
 
M
Y
 
N
R
 
K
E
 
T
-
 
L
G
 
G
A
 
E
G
 
A
K
 
V
N
 
S
A
 
F
L
 
V
E
 
E
L
 
E
A
 
V
K
 
K
A
 
S
V
 
S
E
 
I
K
 
P
V
 
A
A
 
A
E
 
D
K
 
K
S
 
A
D
 
E
F
 
A
Y
 
V
F
 
V
G
 
C
V
 
A
A
 
P
P
 
A
N
 
L
F
 
F
L
 
L
D
 
E
-
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
S
I
 
A
V
 
V
K
 
K
S
 
G
V
 
T
G
 
D
I
 
L
D
 
K
V
 
V
Y
 
G
A
 
A
Q
 
Q
H
 
N
V
 
M
D
 
H
A
 
F
V
 
E
E
 
E
F
 
S
G
 
G
S
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
R
 
E
I
 
I
T
 
S
A
 
P
E
 
V
M
 
A
I
 
L
K
 
K
E
 
D
K
 
L
G
 
G
A
 
V
K
 
D
G
 
Y
S
 
C
L
 
V
I
 
I
N
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
L
 
E
R
 
M
L
 
F
A
 
A
D
 
E
I
 
T
D
 
D
F
 
E
L
 
T
V
 
V
S
 
N
K
 
K
-
 
K
-
 
A
-
 
H
-
 
A
-
 
A
F
 
F
K
 
K
E
 
H
L
 
-
G
 
G
L
 
I
I
 
V
S
 
P
V
 
I
V
 
I
C
 
C

Sites not aligning to the query:

1btmA Triosephosphate isomerase (tim) complexed with 2-phosphoglycolic acid (see paper)
30% identity, 47% coverage: 45:149/222 of query aligns to 45:174/251 of 1btmA

query
sites
1btmA
F
 
F
L
 
L
D
 
D
-
 
R
L
 
L
A
 
V
E
 
Q
I
 
A
V
 
A
K
 
D
S
 
G
V
 
T
G
 
D
I
 
L
D
 
K
V
 
I
Y
 
G
A
 
A
Q
 
Q
H
 
T
V
 
M
D
 
H
A
 
F
V
 
A
E
 
D
F
 
Q
G
 
G
S
 
A
H
 
Y
T
 
T
G
 
G
R
 
E
I
 
V
T
 
S
A
 
P
E
 
V
M
 
M
I
 
L
K
 
K
E
 
D
K
 
L
G
 
G
A
 
V
K
 
T
G
 
Y
S
 
V
L
 
I
I
 
L
N
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
L
 
Q
R
 
M
L
 
F
A
 
A
D
 
E
I
 
T
D
 
D
F
 
E
L
 
T
V
 
V
S
 
N
K
 
K
-
 
K
-
 
V
-
 
L
-
 
A
-
 
A
F
 
F
K
 
T
E
 
R
L
 
-
G
 
G
L
 
L
I
 
I
S
 
P
V
 
I
V
 
I
C
 
C
-
 
C
-
 
G
-
 
E
-
 
S
-
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
R
-
 
E
-
 
A
-
 
G
-
 
Q
T
 
T
N
 
N
N
 
A
V
 
V
S
 
V
T
 
A
T
 
S
A
 
Q
-
 
V
-
 
E
-
 
K
A
 
A
A
 
L
A
 
A
A
 
G
L
 
L
S
 
T
P
 
P
D
 
E
-
 
Q
-
 
V
-
 
K
-
 
Q
-
 
A
F
 
V
V
 
I
A
 
A
V
 
Y
E
|
E
P
 
P
P
 
I
E
 
W
L
 
A
I
|
I
G
|
G
S
 
T
G
 
G

Sites not aligning to the query:

1ssgA Understanding protein lids: structural analysis of active hinge mutants in triosephosphate isomerase (see paper)
25% identity, 69% coverage: 30:183/222 of query aligns to 31:212/247 of 1ssgA

query
sites
1ssgA
K
 
K
V
 
L
A
 
S
E
 
A
K
 
D
S
 
T
D
 
E
F
 
V
Y
 
V
F
 
C
G
 
G
V
 
A
A
 
P
P
 
S
N
 
I
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
L
 
F
A
 
A
E
 
R
I
 
Q
V
 
K
K
 
L
S
 
D
V
 
A
G
 
K
I
 
I
D
 
G
V
 
V
Y
 
A
A
 
A
Q
 
Q
H
 
N
V
 
C
D
 
Y
A
 
K
V
 
V
E
 
P
F
 
K
G
 
G
S
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
R
 
E
I
 
I
T
 
S
A
 
P
E
 
A
M
 
M
I
 
I
K
 
K
E
 
D
K
 
I
G
 
G
A
 
A
K
 
A
G
 
W
S
 
V
L
 
I
I
 
L
N
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
L
 
H
R
 
V
L
 
F
A
 
G
D
 
E
I
 
S
D
 
D
F
 
E
L
 
L
V
 
I
S
 
G
K
 
Q
-
 
K
-
 
V
-
 
A
-
 
H
-
 
A
-
 
L
F
 
A
K
 
E
E
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
V
I
 
I
S
 
A
V
 
C
V
 
I
-
 
G
-
 
E
-
 
K
-
 
L
-
 
D
-
 
E
-
 
R
-
 
E
-
 
A
-
 
G
C
 
I
T
 
T
N
 
E
N
 
K
V
 
V
-
 
V
-
 
F
S
 
E
T
 
Q
T
 
T
A
 
K
A
 
A
A
 
I
A
 
A
A
 
D
L
 
N
S
 
V
P
 
K
D
 
D
F
 
W
-
 
S
-
 
K
-
 
V
-
 
V
V
 
L
A
 
A
V
 
Y
E
|
E
P
 
P
P
 
V
E
 
W
L
 
A
I
|
I
G
|
G
S
 
T
G
 
G
I
 
Y
P
 
S
V
 
L
S
 
T
K
 
P
A
 
Q
E
 
Q
P
 
A
E
 
Q
V
 
E
V
 
V
E
 
H
N
 
E
S
 
K
V
 
L
R
 
R
A
 
G
-
 
W
-
 
L
-
 
K
-
 
S
-
 
H
-
 
V
A
 
S
K
 
D
N
 
A
V
 
V
N
 
A
E
 
Q
E
 
S
V
 
T
K
 
R
V
 
I
L
 
I
C
 
Y
G
 
G
A
x
G
G
x
S
I
 
V
T
 
T

Sites not aligning to the query:

4y96A Crystal structure of triosephosphate isomerase from gemmata obscuriglobus (see paper)
24% identity, 77% coverage: 39:208/222 of query aligns to 40:239/250 of 4y96A

query
sites
4y96A
F
 
F
G
 
P
V
 
P
A
 
Y
P
 
P
N
 
W
F
 
L
L
 
T
D
 
A
L
 
V
A
 
G
E
 
E
I
 
V
V
 
L
K
 
K
S
 
G
V
 
S
G
 
P
I
 
V
D
 
A
V
 
L
Y
 
G
A
 
A
Q
 
Q
H
 
D
V
 
V
D
 
S
A
 
S
V
 
E
E
 
K
F
 
K
G
 
G
S
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
R
 
E
I
 
V
T
 
S
A
 
P
E
 
A
M
 
M
I
 
L
K
 
L
E
 
E
K
 
T
G
 
G
A
 
C
K
 
K
G
 
Y
S
 
A
L
 
L
I
 
I
N
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
L
 
H
R
 
I
L
 
I
A
 
G
D
 
E
-
 
S
-
 
E
-
 
T
-
 
F
I
 
I
D
 
N
F
 
H
L
 
K
V
 
V
S
 
H
K
 
T
F
 
A
K
 
L
E
 
E
L
 
E
G
 
G
L
 
L
I
 
S
S
 
V
V
 
V
V
 
L
C
 
C
T
 
M
N
 
G
N
 
E
V
 
T
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
R
-
 
E
-
 
R
-
 
G
-
 
L
-
 
Q
-
 
E
-
 
R
-
 
V
-
 
F
-
 
Q
-
 
R
S
 
Q
T
 
V
T
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
C
A
 
A
A
 
G
L
 
L
S
 
T
P
 
D
D
 
E
-
 
Q
-
 
F
-
 
G
-
 
R
-
 
I
F
 
V
V
 
I
A
 
A
V
 
Y
E
|
E
P
 
P
P
 
V
E
 
W
L
 
A
I
|
I
G
|
G
S
 
T
G
 
G
I
 
K
P
 
V
V
 
A
S
 
T
K
 
P
A
 
E
E
 
Q
P
 
A
E
 
Q
V
 
E
V
 
A
E
 
H
N
 
A
S
 
F
V
 
V
R
 
R
A
 
S
-
 
K
-
 
L
-
 
R
-
 
L
-
 
L
-
 
Y
A
 
G
K
 
D
N
 
K
V
 
I
N
 
A
E
 
D
E
 
S
V
 
T
K
 
P
V
 
I
L
 
V
C
 
Y
G
 
G
A
 
G
G
x
S
I
 
V
T
 
T
K
 
P
Y
 
D
E
 
N
D
 
T
V
 
V
V
 
G
A
 
L
A
 
M
I
 
S
D
 
Q
L
 
P
G
 
D
A
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
A
L
 
L
L
 
V
A
x
G
S
x
G
G
 
A
V
 
S
V
 
L
K
 
K
A
 
A

Sites not aligning to the query:

P00940 Triosephosphate isomerase; TIM; Methylglyoxal synthase; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1; EC 4.2.3.3 from Gallus gallus (Chicken) (see 3 papers)
25% identity, 69% coverage: 30:183/222 of query aligns to 32:213/248 of P00940

query
sites
P00940
K
 
K
V
 
L
A
 
S
E
 
A
K
 
D
S
 
T
D
 
E
F
 
V
Y
 
V
F
 
C
G
 
G
V
 
A
A
 
P
P
 
S
N
 
I
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
L
 
F
A
 
A
E
 
R
I
 
Q
V
 
K
K
 
L
S
 
D
V
 
A
G
 
K
I
 
I
D
 
G
V
 
V
Y
 
A
A
 
A
Q
 
Q
H
 
N
V
 
C
D
 
Y
A
 
K
V
 
V
E
 
P
F
 
K
G
 
G
S
 
A
H
 
F
T
 
T
G
 
G
R
 
E
I
 
I
T
 
S
A
 
P
E
 
A
M
 
M
I
 
I
K
 
K
E
 
D
K
 
I
G
 
G
A
 
A
K
 
A
G
 
W
S
 
V
L
 
I
I
 
L
N
 
G
H
|
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
L
 
H
R
 
V
L
 
F
A
 
G
D
 
E
I
 
S
D
 
D
F
 
E
L
 
L
V
 
I
S
 
G
K
 
Q
-
 
K
-
 
V
-
 
A
-
 
H
-
 
A
-
 
L
F
 
A
K
 
E
E
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
V
I
 
I
S
 
A
V
 
C
V
 
I
-
 
G
-
 
E
-
 
K
-
 
L
-
 
D
-
 
E
-
 
R
-
 
E
-
 
A
-
 
G
C
 
I
T
 
T
N
 
E
N
 
K
V
 
V
-
 
V
-
 
F
S
 
E
T
 
Q
T
 
T
A
 
K
A
 
A
A
 
I
A
 
A
A
 
D
L
 
N
S
 
V
P
 
K
D
 
D
F
 
W
-
 
S
-
 
K
-
 
V
-
 
V
V
 
L
A
 
A
V
 
Y
E
|
E
P
 
P
P
 
V
E
 
W
L
 
A
I
 
I
G
 
G
S
 
T
G
 
G
I
 
K
P
 
T
V
 
A
S
 
T
K
 
P
A
 
Q
E
 
Q
P
 
A
E
 
Q
V
 
E
V
 
V
E
 
H
N
 
E
S
 
K
V
 
L
R
 
R
A
 
G
-
 
W
-
 
L
-
 
K
-
 
S
-
 
H
-
 
V
A
 
S
K
 
D
N
 
A
V
 
V
N
 
A
E
 
Q
E
 
S
V
 
T
K
 
R
V
 
I
L
 
I
C
 
Y
G
 
G
A
 
G
G
 
S
I
 
V
T
 
T

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_012966597.1 NCBI__GCF_000025505.1:WP_012966597.1
MEKKVVIINFKAYREGAGKNALELAKAVEKVAEKSDFYFGVAPNFLDLAEIVKSVGIDVY
AQHVDAVEFGSHTGRITAEMIKEKGAKGSLINHSERRLRLADIDFLVSKFKELGLISVVC
TNNVSTTAAAAALSPDFVAVEPPELIGSGIPVSKAEPEVVENSVRAAKNVNEEVKVLCGA
GITKYEDVVAAIDLGADGVLLASGVVKASDPRKALEELVGLR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory