SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012967296.1 NCBI__GCF_000025465.1:WP_012967296.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q9XDN1 Propanal dehydrogenase (CoA-propanoylating); Coenzyme-A-acylating propionaldehyde dehydrogenase; Propanediol utilization protein PduP; EC 1.2.1.87 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see 2 papers)
86% identity, 100% coverage: 1:461/461 of query aligns to 1:464/464 of Q9XDN1

query
sites
Q9XDN1
M
|
M
N
|
N
T
|
T
A
x
S
E
|
E
L
|
L
E
|
E
T
|
T
L
|
L
I
|
I
R
|
R
T
|
T
I
|
I
L
|
L
S
|
S
E
|
E
K
x
Q
L
|
L
-
 
T
-
 
T
-
 
P
A
 
A
P
 
Q
A
 
T
P
 
P
V
 
V
S
 
Q
Q
 
P
E
 
Q
Q
 
G
Q
 
K
G
 
G
I
 
I
F
 
F
R
 
Q
D
 
S
V
 
V
G
 
S
S
 
E
A
 
A
I
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
H
 
H
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
L
 
L
R
 
R
Y
 
Y
Q
 
Q
Q
 
Q
C
 
C
P
 
P
L
 
L
K
 
K
T
 
T
R
 
R
S
 
S
A
 
A
I
 
I
I
 
I
S
 
S
A
 
A
L
 
M
R
 
R
E
 
Q
T
 
E
L
 
L
A
 
T
P
 
P
E
 
L
L
 
L
V
 
A
T
 
P
L
 
L
A
 
A
E
 
E
E
 
E
S
 
S
A
 
A
T
 
N
E
 
E
T
 
T
G
 
G
M
 
M
G
 
G
N
 
N
K
 
K
E
 
E
D
 
D
K
 
K
Y
 
F
L
 
L
K
 
K
N
 
N
K
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
D
N
 
N
T
 
T
P
 
P
G
 
G
I
 
V
E
 
E
D
 
D
L
 
L
T
 
T
T
 
T
S
 
T
A
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
M
V
 
V
L
 
L
F
 
F
E
 
E
Y
 
Y
S
 
S
P
 
P
F
 
F
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
S
V
 
V
A
 
A
P
 
P
S
 
S
T
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
T
E
 
E
T
 
T
I
 
I
I
 
I
N
 
N
N
 
N
S
 
S
I
 
I
S
 
S
M
 
M
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
N
S
 
S
V
 
I
Y
 
Y
F
 
F
S
 
S
P
 
P
H
 
H
P
 
P
G
 
G
A
 
A
K
 
K
K
 
K
V
 
V
S
 
S
L
 
L
T
 
K
L
 
L
I
 
I
A
 
S
R
 
L
I
 
I
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
Y
 
F
R
 
R
C
 
C
S
 
C
G
 
G
I
 
I
R
 
R
N
 
N
L
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
T
V
 
V
A
 
A
E
 
E
P
 
P
T
 
T
F
 
F
E
 
E
A
 
A
T
 
T
Q
 
Q
Q
 
Q
M
 
M
M
 
M
A
 
A
H
 
H
P
 
P
L
 
R
I
 
I
A
 
A
V
 
V
L
 
L
A
 
A
I
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
G
P
 
P
G
 
G
I
 
I
V
 
V
A
 
A
M
 
M
G
 
G
M
 
M
K
 
K
S
 
S
G
 
G
K
 
K
K
 
K
V
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
N
 
N
P
 
P
P
 
P
C
 
C
I
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
T
 
T
A
 
A
D
 
D
L
 
L
V
 
V
K
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
E
D
 
D
I
 
I
I
 
I
S
 
N
G
 
G
A
 
A
A
 
S
F
 
F
D
 
D
Y
 
Y
N
 
N
L
 
L
P
 
P
C
 
C
I
 
I
A
 
A
E
 
E
K
 
K
S
 
S
L
 
L
I
 
I
V
 
V
V
 
V
A
 
E
S
 
S
V
 
V
A
 
A
D
 
E
R
 
R
L
 
L
I
 
V
Q
 
Q
Q
 
Q
M
 
M
Q
 
Q
D
 
T
F
 
F
D
 
G
A
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
S
P
 
P
Q
 
A
E
 
D
T
 
T
D
 
D
T
 
K
L
 
L
R
 
R
A
 
A
V
 
V
C
 
C
L
 
L
P
 
P
D
 
E
G
 
G
A
 
Q
A
 
A
N
 
N
K
 
K
K
 
K
L
 
L
V
 
V
G
 
G
K
 
K
S
 
S
P
 
P
A
 
S
E
 
A
L
 
M
L
 
L
A
 
E
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
I
A
 
A
V
 
V
P
 
P
S
 
A
R
 
K
P
 
A
P
 
P
R
 
R
L
 
L
L
 
L
I
 
I
A
 
A
E
 
L
V
 
V
Q
 
N
A
 
A
N
 
D
D
 
D
P
 
P
W
 
W
V
 
V
T
 
T
C
 
S
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
M
 
M
P
 
P
V
 
M
L
 
L
P
 
P
I
 
V
V
 
V
R
 
K
V
 
V
A
 
S
D
 
D
F
 
F
D
 
D
S
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
R
 
K
V
 
V
E
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
L
H
 
H
H
 
H
T
 
T
A
 
A
I
 
I
M
 
M
H
 
H
S
 
S
Q
 
Q
N
 
N
V
 
V
S
 
S
R
 
R
L
 
L
N
 
N
L
 
L
A
 
A
A
 
A
R
 
R
T
 
T
L
 
L
Q
 
Q
T
 
T
S
 
S
I
 
I
F
 
F
V
 
V
K
 
K
N
 
N
G
 
G
P
 
P
S
 
S
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
I
 
I
G
 
G
V
 
V
G
 
G
G
 
G
E
 
E
G
 
G
F
 
F
T
 
T
T
 
T
F
 
F
T
 
T
I
 
I
A
 
A
T
 
T
P
 
P
T
 
T
G
 
G
E
 
E
G
 
G
T
 
T
T
 
T
S
 
S
A
 
A
R
 
R
T
 
T
F
 
F
A
 
A
R
 
R
L
 
S
R
 
R
R
 
R
C
 
C
V
 
V
L
 
L
T
 
T
N
 
N
G
 
G
F
 
F
S
 
S
I
 
I
R
 
R

5jfmB Crystal structure of rhodopseudomonas palustris propionaldehyde dehydrogenase with bound propionyl-coa (see paper)
50% identity, 94% coverage: 28:461/461 of query aligns to 16:452/452 of 5jfmB

query
sites
5jfmB
Q
 
D
G
 
G
I
 
V
F
 
F
R
 
E
D
 
T
V
 
M
G
 
D
S
 
A
A
 
A
I
 
V
D
 
E
A
 
A
A
 
A
H
 
A
Q
 
L
A
 
A
F
 
Q
L
 
Q
R
 
Q
Y
 
Y
Q
 
L
Q
 
L
C
 
C
P
 
S
L
 
M
K
 
S
T
 
D
R
 
R
S
 
A
A
 
R
I
 
F
I
 
V
S
 
Q
A
 
G
L
 
I
R
 
R
E
 
D
T
 
V
L
 
I
A
 
L
P
 
N
E
 
Q
-
 
D
-
 
T
L
 
L
V
 
E
T
 
K
L
 
M
A
 
S
E
 
R
E
 
M
S
 
A
A
 
V
T
 
E
E
 
E
T
 
T
G
 
G
M
 
M
G
 
G
N
 
N
K
 
Y
E
 
E
D
 
H
K
 
K
Y
 
L
L
 
I
K
 
K
N
 
N
K
 
R
A
 
L
A
 
A
L
 
G
E
 
E
N
 
K
T
 
T
P
 
P
G
 
G
I
 
I
E
 
E
D
 
D
L
 
L
T
 
T
T
 
T
S
 
D
A
 
A
L
 
F
T
 
S
G
 
G
D
 
D
G
 
N
G
 
G
M
 
L
V
 
T
L
 
L
F
 
V
E
 
E
Y
 
Y
S
 
S
P
 
P
F
 
F
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
A
V
x
I
A
 
T
P
|
P
S
x
T
T
|
T
N
|
N
P
 
P
T
 
T
E
 
E
T
 
T
I
 
I
I
 
V
N
 
C
N
 
N
S
 
S
I
 
I
S
 
G
M
 
M
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
N
S
 
S
V
 
V
Y
 
V
F
 
F
S
 
S
P
|
P
H
|
H
P
 
P
G
 
R
A
 
A
K
 
R
K
 
Q
V
 
V
S
 
S
L
 
L
T
 
L
L
 
L
I
 
V
A
 
R
R
 
L
I
 
I
E
 
N
E
 
Q
I
 
K
A
 
L
Y
 
A
R
 
A
C
 
L
S
 
G
G
 
A
I
 
P
R
 
E
N
 
N
L
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
T
V
 
V
A
 
E
E
 
K
P
 
P
T
x
S
F
x
I
E
 
E
A
 
N
T
|
T
Q
 
N
Q
 
A
M
 
M
M
 
M
A
 
A
H
 
H
P
 
P
L
 
K
I
 
V
A
 
R
V
 
M
L
 
L
A
 
V
I
 
A
T
|
T
G
|
G
G
|
G
P
 
P
G
 
A
I
 
I
V
 
V
A
 
K
M
 
A
G
 
V
M
 
L
K
 
S
S
 
T
G
 
G
K
 
K
K
 
K
V
 
A
I
 
I
G
 
G
A
|
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
N
 
N
P
 
P
P
 
P
C
 
V
I
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
E
T
 
T
A
 
A
D
 
N
L
 
I
V
 
E
K
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
C
D
 
D
I
 
I
I
 
V
S
 
N
G
 
G
A
 
C
A
 
S
F
 
F
D
 
D
Y
 
N
N
 
N
L
 
L
P
 
P
C
|
C
I
 
V
A
 
A
E
 
E
K
 
K
S
 
E
L
 
I
I
 
I
V
 
A
V
 
V
A
 
A
S
 
Q
V
 
I
A
 
A
D
 
D
R
 
Y
L
 
L
I
 
I
Q
 
F
Q
 
N
M
 
L
Q
 
K
D
 
K
F
 
N
D
 
G
A
 
A
L
 
Y
-
 
E
L
 
I
L
 
K
S
 
D
P
 
P
Q
 
A
E
 
V
T
 
L
D
 
Q
T
 
Q
L
 
L
R
 
Q
A
 
D
V
 
L
C
 
V
L
 
L
-
 
T
P
 
A
D
 
K
G
 
G
A
 
G
A
 
P
N
 
Q
K
x
T
K
 
K
L
 
C
V
 
V
G
 
G
K
 
K
S
 
S
P
 
A
A
 
V
E
 
W
L
 
L
L
 
L
A
 
S
A
 
Q
A
 
I
G
 
G
L
 
I
A
 
S
V
 
V
P
 
D
S
 
A
R
 
S
P
 
-
P
 
I
R
 
K
L
 
I
L
 
I
I
 
L
A
 
M
E
 
E
V
 
V
Q
 
P
A
 
R
N
 
E
D
 
H
P
 
P
W
 
F
V
 
V
T
 
Q
C
 
E
E
 
E
Q
 
L
L
 
M
M
 
M
P
 
P
V
 
I
L
 
L
P
 
P
I
 
L
V
 
V
R
 
R
V
 
V
A
 
E
D
 
T
F
 
V
D
 
D
S
 
D
A
 
A
L
 
I
A
 
D
L
 
L
A
 
A
L
 
I
R
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
H
G
 
D
L
 
N
H
 
R
H
 
H
T
 
T
A
 
A
I
 
I
M
 
M
H
 
H
S
 
S
Q
 
T
N
 
D
V
 
V
S
 
R
R
 
K
L
 
L
N
 
T
L
 
K
A
 
M
A
 
A
R
 
K
T
 
L
L
 
I
Q
 
Q
T
 
T
S
 
T
I
 
I
F
 
F
V
 
V
K
 
K
N
 
N
G
 
G
P
 
P
S
 
S
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
I
 
L
G
 
G
V
 
A
G
 
G
G
 
G
E
 
E
G
 
G
F
 
Y
T
 
S
T
 
T
F
 
F
T
 
T
I
 
I
A
 
A
T
 
G
P
 
P
T
 
T
G
 
G
E
 
E
G
 
G
T
 
L
T
 
T
S
 
S
A
 
A
R
 
K
T
 
S
F
 
F
A
 
A
R
 
R
L
 
R
R
 
R
R
 
K
C
 
C
V
 
V
L
 
M
T
 
V
N
 
E
G
 
A
F
 
L
S
 
N
I
 
I
R
 
R

5jfmA Crystal structure of rhodopseudomonas palustris propionaldehyde dehydrogenase with bound propionyl-coa (see paper)
50% identity, 94% coverage: 28:461/461 of query aligns to 3:439/439 of 5jfmA

query
sites
5jfmA
Q
 
D
G
 
G
I
 
V
F
 
F
R
 
E
D
 
T
V
 
M
G
 
D
S
 
A
A
 
A
I
 
V
D
 
E
A
 
A
A
 
A
H
 
A
Q
 
L
A
 
A
F
 
Q
L
 
Q
R
 
Q
Y
 
Y
Q
 
L
Q
 
L
C
 
C
P
 
S
L
 
M
K
 
S
T
 
D
R
 
R
S
 
A
A
 
R
I
 
F
I
 
V
S
 
Q
A
 
G
L
 
I
R
 
R
E
 
D
T
 
V
L
 
I
A
 
L
P
 
N
E
 
Q
-
 
D
-
 
T
L
 
L
V
 
E
T
 
K
L
 
M
A
 
S
E
 
R
E
 
M
S
 
A
A
 
V
T
 
E
E
 
E
T
 
T
G
 
G
M
 
M
G
 
G
N
 
N
K
 
Y
E
 
E
D
 
H
K
 
K
Y
 
L
L
 
I
K
 
K
N
 
N
K
 
R
A
 
L
A
 
A
L
 
G
E
 
E
N
 
K
T
 
T
P
 
P
G
 
G
I
 
I
E
 
E
D
 
D
L
 
L
T
 
T
T
 
T
S
 
D
A
 
A
L
 
F
T
 
S
G
 
G
D
 
D
G
 
N
G
 
G
M
 
L
V
 
T
L
 
L
F
 
V
E
 
E
Y
 
Y
S
 
S
P
 
P
F
 
F
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
A
V
x
I
A
x
T
P
 
P
S
 
T
T
|
T
N
|
N
P
 
P
T
 
T
E
 
E
T
 
T
I
 
I
I
 
V
N
 
C
N
 
N
S
 
S
I
 
I
S
 
G
M
 
M
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
N
S
 
S
V
 
V
Y
 
V
F
 
F
S
|
S
P
|
P
H
|
H
P
 
P
G
 
R
A
 
A
K
 
R
K
 
Q
V
 
V
S
 
S
L
 
L
T
 
L
L
 
L
I
 
V
A
 
R
R
 
L
I
 
I
E
 
N
E
 
Q
I
 
K
A
 
L
Y
 
A
R
 
A
C
 
L
S
 
G
G
 
A
I
 
P
R
 
E
N
 
N
L
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
T
V
 
V
A
 
E
E
 
K
P
 
P
T
 
S
F
x
I
E
 
E
A
 
N
T
 
T
Q
 
N
Q
 
A
M
 
M
M
 
M
A
 
A
H
 
H
P
 
P
L
 
K
I
 
V
A
 
R
V
 
M
L
 
L
A
 
V
I
 
A
T
|
T
G
|
G
G
|
G
P
 
P
G
 
A
I
 
I
V
 
V
A
 
K
M
 
A
G
 
V
M
 
L
K
 
S
S
 
T
G
 
G
K
 
K
K
 
K
V
 
A
I
 
I
G
 
G
A
|
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
N
 
N
P
 
P
P
 
P
C
 
V
I
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
E
T
 
T
A
 
A
D
 
N
L
 
I
V
 
E
K
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
C
D
 
D
I
 
I
I
 
V
S
 
N
G
 
G
A
 
C
A
 
S
F
 
F
D
 
D
Y
 
N
N
 
N
L
 
L
P
|
P
C
|
C
I
 
V
A
 
A
E
 
E
K
 
K
S
 
E
L
 
I
I
 
I
V
 
A
V
 
V
A
 
A
S
 
Q
V
 
I
A
 
A
D
 
D
R
 
Y
L
 
L
I
 
I
Q
 
F
Q
 
N
M
 
L
Q
 
K
D
 
K
F
 
N
D
 
G
A
 
A
L
 
Y
-
 
E
L
 
I
L
 
K
S
 
D
P
 
P
Q
 
A
E
 
V
T
 
L
D
 
Q
T
 
Q
L
 
L
R
 
Q
A
 
D
V
 
L
C
 
V
L
 
L
-
 
T
P
 
A
D
 
K
G
 
G
A
 
G
A
 
P
N
 
Q
K
 
T
K
 
K
L
 
C
V
 
V
G
 
G
K
 
K
S
 
S
P
 
A
A
 
V
E
 
W
L
 
L
L
 
L
A
 
S
A
 
Q
A
 
I
G
 
G
L
 
I
A
 
S
V
 
V
P
 
D
S
 
A
R
 
S
P
 
-
P
 
I
R
 
K
L
 
I
L
 
I
I
 
L
A
 
M
E
 
E
V
 
V
Q
 
P
A
 
R
N
 
E
D
 
H
P
 
P
W
 
F
V
 
V
T
 
Q
C
 
E
E
 
E
Q
 
L
L
 
M
M
 
M
P
 
P
V
 
I
L
 
L
P
 
P
I
 
L
V
 
V
R
 
R
V
 
V
A
 
E
D
 
T
F
 
V
D
 
D
S
 
D
A
 
A
L
 
I
A
 
D
L
 
L
A
 
A
L
 
I
R
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
H
G
 
D
L
 
N
H
 
R
H
 
H
T
 
T
A
 
A
I
 
I
M
 
M
H
 
H
S
 
S
Q
 
T
N
 
D
V
 
V
S
 
R
R
 
K
L
 
L
N
 
T
L
 
K
A
 
M
A
 
A
R
 
K
T
 
L
L
 
I
Q
 
Q
T
 
T
S
 
T
I
 
I
F
 
F
V
 
V
K
 
K
N
 
N
G
 
G
P
 
P
S
 
S
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
I
 
L
G
 
G
V
 
A
G
 
G
G
 
G
E
 
E
G
 
G
F
 
Y
T
 
S
T
 
T
F
 
F
T
 
T
I
 
I
A
 
A
T
 
G
P
 
P
T
 
T
G
 
G
E
 
E
G
 
G
T
 
L
T
 
T
S
 
S
A
 
A
R
 
K
T
 
S
F
 
F
A
 
A
R
 
R
L
 
R
R
 
R
R
 
K
C
 
C
V
 
V
L
 
M
T
 
V
N
 
E
G
 
A
F
 
L
S
 
N
I
 
I
R
 
R

5jflA Crystal structure of rhodopseudomonas palustris propionaldehyde dehydrogenase with bound NAD+ (see paper)
50% identity, 94% coverage: 28:461/461 of query aligns to 4:440/440 of 5jflA

query
sites
5jflA
Q
 
D
G
 
G
I
 
V
F
 
F
R
 
E
D
 
T
V
 
M
G
 
D
S
 
A
A
 
A
I
 
V
D
 
E
A
 
A
A
 
A
H
 
A
Q
 
L
A
 
A
F
 
Q
L
 
Q
R
 
Q
Y
 
Y
Q
 
L
Q
 
L
C
 
C
P
 
S
L
 
M
K
 
S
T
 
D
R
 
R
S
 
A
A
 
R
I
 
F
I
 
V
S
 
Q
A
 
G
L
 
I
R
 
R
E
 
D
T
 
V
L
 
I
A
 
L
P
 
N
E
 
Q
-
 
D
-
 
T
L
 
L
V
 
E
T
 
K
L
 
M
A
 
S
E
 
R
E
 
M
S
 
A
A
 
V
T
 
E
E
 
E
T
 
T
G
 
G
M
 
M
G
 
G
N
 
N
K
 
Y
E
 
E
D
 
H
K
 
K
Y
 
L
L
 
I
K
 
K
N
 
N
K
 
R
A
 
L
A
 
A
L
 
G
E
 
E
N
 
K
T
 
T
P
 
P
G
 
G
I
 
I
E
 
E
D
 
D
L
 
L
T
 
T
T
 
T
S
 
D
A
 
A
L
 
F
T
 
S
G
 
G
D
 
D
G
 
N
G
 
G
M
 
L
V
 
T
L
 
L
F
 
V
E
 
E
Y
 
Y
S
 
S
P
 
P
F
 
F
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
A
V
x
I
A
x
T
P
|
P
S
x
T
T
|
T
N
 
N
P
 
P
T
 
T
E
 
E
T
 
T
I
 
I
I
 
V
N
 
C
N
 
N
S
 
S
I
 
I
S
 
G
M
 
M
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
N
S
 
S
V
 
V
Y
 
V
F
 
F
S
 
S
P
 
P
H
|
H
P
 
P
G
 
R
A
 
A
K
 
R
K
 
Q
V
 
V
S
 
S
L
 
L
T
 
L
L
 
L
I
 
V
A
 
R
R
 
L
I
 
I
E
 
N
E
 
Q
I
 
K
A
 
L
Y
 
A
R
 
A
C
 
L
S
 
G
G
 
A
I
 
P
R
 
E
N
 
N
L
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
T
V
 
V
A
 
E
E
 
K
P
 
P
T
 
S
F
x
I
E
 
E
A
 
N
T
 
T
Q
 
N
Q
 
A
M
 
M
M
 
M
A
 
A
H
 
H
P
 
P
L
 
K
I
 
V
A
 
R
V
 
M
L
 
L
A
 
V
I
 
A
T
|
T
G
|
G
G
 
G
P
 
P
G
 
A
I
|
I
V
 
V
A
 
K
M
 
A
G
 
V
M
 
L
K
 
S
S
 
T
G
 
G
K
 
K
K
 
K
V
 
A
I
 
I
G
 
G
A
|
A
G
|
G
A
|
A
G
 
G
N
 
N
P
 
P
P
 
P
C
 
V
I
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
E
T
 
T
A
 
A
D
 
N
L
 
I
V
 
E
K
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
C
D
 
D
I
 
I
I
 
V
S
 
N
G
 
G
A
 
C
A
 
S
F
 
F
D
 
D
Y
 
N
N
 
N
L
 
L
P
 
P
C
|
C
I
 
V
A
 
A
E
 
E
K
 
K
S
 
E
L
 
I
I
 
I
V
 
A
V
 
V
A
 
A
S
 
Q
V
 
I
A
 
A
D
 
D
R
 
Y
L
 
L
I
 
I
Q
 
F
Q
 
N
M
 
L
Q
 
K
D
 
K
F
 
N
D
 
G
A
 
A
L
 
Y
-
 
E
L
 
I
L
 
K
S
 
D
P
 
P
Q
 
A
E
 
V
T
 
L
D
 
Q
T
 
Q
L
 
L
R
 
Q
A
 
D
V
 
L
C
 
V
L
 
L
-
 
T
P
 
A
D
 
K
G
 
G
A
 
G
A
 
P
N
 
Q
K
 
T
K
 
K
L
 
C
V
 
V
G
 
G
K
 
K
S
 
S
P
 
A
A
 
V
E
 
W
L
 
L
L
 
L
A
 
S
A
 
Q
A
 
I
G
 
G
L
 
I
A
 
S
V
 
V
P
 
D
S
 
A
R
 
S
P
 
-
P
 
I
R
 
K
L
 
I
L
 
I
I
 
L
A
 
M
E
 
E
V
 
V
Q
 
P
A
 
R
N
 
E
D
 
H
P
 
P
W
 
F
V
 
V
T
 
Q
C
 
E
E
|
E
Q
 
L
L
 
M
M
 
M
P
 
P
V
 
I
L
 
L
P
 
P
I
 
L
V
 
V
R
 
R
V
 
V
A
 
E
D
 
T
F
 
V
D
 
D
S
 
D
A
 
A
L
 
I
A
 
D
L
 
L
A
 
A
L
 
I
R
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
H
G
 
D
L
 
N
H
 
R
H
|
H
T
 
T
A
 
A
I
 
I
M
 
M
H
 
H
S
 
S
Q
 
T
N
 
D
V
 
V
S
 
R
R
 
K
L
 
L
N
 
T
L
 
K
A
 
M
A
 
A
R
 
K
T
 
L
L
 
I
Q
 
Q
T
 
T
S
 
T
I
 
I
F
 
F
V
 
V
K
 
K
N
 
N
G
 
G
P
 
P
S
 
S
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
I
 
L
G
 
G
V
 
A
G
 
G
G
 
G
E
 
E
G
 
G
F
 
Y
T
 
S
T
 
T
F
|
F
T
|
T
I
|
I
A
 
A
T
 
G
P
 
P
T
 
T
G
 
G
E
 
E
G
 
G
T
 
L
T
 
T
S
 
S
A
 
A
R
 
K
T
 
S
F
 
F
A
 
A
R
 
R
L
 
R
R
 
R
R
 
K
C
 
C
V
 
V
L
 
M
T
 
V
N
 
E
G
 
A
F
 
L
S
 
N
I
 
I
R
 
R

6gvsA Engineered glycolyl-coa reductase comprising 8 mutations with bound NADP+ (see paper)
49% identity, 94% coverage: 28:461/461 of query aligns to 5:441/441 of 6gvsA

query
sites
6gvsA
Q
 
D
G
 
G
I
 
V
F
 
F
R
 
E
D
 
T
V
 
M
G
 
D
S
 
A
A
 
A
I
 
V
D
 
E
A
 
A
A
 
A
H
 
A
Q
 
L
A
 
A
F
 
Q
L
 
Q
R
 
Q
Y
 
Y
Q
 
L
Q
 
L
C
 
C
P
 
S
L
 
M
K
 
S
T
 
D
R
 
R
S
 
A
A
 
R
I
 
F
I
 
V
S
 
Q
A
 
G
L
 
I
R
 
R
E
 
D
T
 
V
L
 
I
A
 
L
P
 
N
E
 
Q
-
 
D
-
 
T
L
 
L
V
 
E
T
 
K
L
 
M
A
 
S
E
 
R
E
 
M
S
 
A
A
 
V
T
 
E
E
 
E
T
 
T
G
 
G
M
 
M
G
 
G
N
 
N
K
 
Y
E
 
E
D
 
H
K
 
K
Y
 
L
L
 
I
K
 
K
N
 
N
K
 
R
A
 
L
A
 
A
L
 
G
E
 
E
N
 
K
T
 
T
P
 
P
G
 
G
I
 
I
E
 
E
D
 
D
L
 
L
T
 
T
T
 
T
S
 
D
A
 
A
L
 
F
T
 
S
G
 
G
D
 
D
G
 
N
G
 
G
M
 
L
V
 
T
L
 
L
F
 
V
E
 
E
Y
 
Y
S
 
S
P
 
P
F
 
F
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
A
V
 
I
A
 
T
P
|
P
S
x
T
T
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
T
E
 
E
T
 
T
I
 
I
I
 
V
N
 
C
N
 
N
S
 
S
I
 
I
S
 
G
M
 
M
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
N
S
 
S
V
 
V
Y
 
V
F
 
F
S
 
S
P
 
P
H
|
H
P
 
G
G
 
R
A
 
A
K
 
R
K
 
Q
V
 
V
S
 
S
L
 
L
T
 
L
L
 
L
I
 
V
A
 
R
R
 
L
I
 
I
E
 
N
E
 
Q
I
 
K
A
 
L
Y
 
A
R
 
A
C
 
L
S
 
G
G
 
A
I
 
P
R
 
E
N
 
N
L
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
T
V
 
V
A
 
E
E
 
K
P
 
P
T
 
S
F
x
R
E
 
E
A
 
N
T
 
T
Q
 
L
Q
 
A
M
 
M
M
 
M
A
 
A
H
 
H
P
 
P
L
 
K
I
 
V
A
 
R
V
 
M
L
 
L
A
 
V
I
 
A
T
|
T
G
|
G
G
|
G
P
 
P
G
 
A
I
x
L
V
 
V
A
 
K
M
 
A
G
 
V
M
 
L
K
 
S
S
 
T
G
 
G
K
 
K
K
 
K
V
 
A
I
 
I
G
 
G
A
|
A
G
|
G
A
|
A
G
 
G
N
 
N
P
 
P
P
 
P
C
 
V
I
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
E
T
 
T
A
 
A
D
 
N
L
 
I
V
 
E
K
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
C
D
 
D
I
 
I
I
 
V
S
 
N
G
 
G
A
 
C
A
 
S
F
 
F
D
 
D
Y
 
N
N
 
N
L
 
I
P
 
T
C
|
C
I
 
T
A
 
A
E
 
E
K
 
K
S
 
E
L
 
I
I
 
I
V
 
A
V
 
V
A
 
A
S
 
Q
V
 
I
A
 
A
D
 
D
R
 
Y
L
 
L
I
 
I
Q
 
F
Q
 
N
M
 
L
Q
 
K
D
 
K
F
 
N
D
 
G
A
 
A
L
 
Y
-
 
E
L
 
I
L
 
K
S
 
D
P
 
P
Q
 
A
E
 
V
T
 
L
D
 
Q
T
 
Q
L
 
L
R
 
Q
A
 
D
V
 
L
C
 
V
L
 
L
-
 
T
P
 
A
D
 
K
G
 
G
A
 
G
A
 
P
N
 
Q
K
 
T
K
 
K
L
 
C
V
 
V
G
 
G
K
 
K
S
 
S
P
 
A
A
 
V
E
 
W
L
 
L
L
 
L
A
 
S
A
 
Q
A
 
I
G
 
G
L
 
I
A
 
S
V
 
V
P
 
D
S
 
A
R
 
-
P
 
S
P
 
I
R
 
K
L
 
I
L
 
I
I
 
L
A
 
M
E
 
E
V
 
V
Q
 
P
A
 
R
N
 
E
D
 
H
P
 
P
W
 
F
V
 
V
T
 
Q
C
 
E
E
|
E
Q
 
L
L
 
M
M
 
M
P
 
P
V
 
I
L
 
L
P
 
P
I
 
L
V
 
V
R
 
R
V
 
V
A
 
E
D
 
T
F
 
V
D
 
D
S
 
D
A
 
A
L
 
I
A
 
D
L
 
L
A
 
A
L
 
I
R
 
E
V
 
V
E
 
E
E
 
H
G
 
D
L
 
N
H
 
R
H
|
H
T
 
T
A
 
A
I
 
I
M
 
M
H
 
H
S
 
S
Q
 
T
N
 
D
V
 
V
S
 
R
R
 
K
L
 
L
N
 
T
L
 
K
A
 
M
A
 
A
R
 
K
T
 
L
L
 
I
Q
 
Q
T
 
T
S
 
T
I
 
I
F
 
F
V
 
V
K
 
K
N
 
N
G
 
G
P
 
P
S
 
S
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
I
 
H
G
 
G
V
 
A
G
 
G
G
 
G
E
 
E
G
 
G
F
 
Y
T
 
S
T
 
T
F
 
F
T
 
T
I
|
I
A
 
A
T
 
G
P
 
P
T
 
T
G
 
G
E
 
E
G
 
G
T
 
L
T
 
T
S
 
S
A
 
A
R
 
K
T
 
S
F
 
F
A
 
A
R
 
R
L
 
R
R
 
R
R
 
K
C
 
C
V
 
V
L
 
M
T
 
V
N
 
E
G
 
A
F
 
L
S
 
N
I
 
I
R
 
R

4c3sA Structure of a propionaldehyde dehydrogenase from the clostridium phytofermentans fucose utilisation bacterial microcompartment (see paper)
46% identity, 94% coverage: 29:461/461 of query aligns to 3:435/435 of 4c3sA

query
sites
4c3sA
G
 
G
I
 
V
F
 
F
R
 
D
D
 
D
V
 
M
G
 
N
S
 
Q
A
 
A
I
 
I
D
 
E
A
 
A
A
 
A
H
 
K
Q
 
E
A
 
A
F
 
Q
L
 
L
R
 
V
Y
 
V
Q
 
K
Q
 
K
C
 
M
P
 
S
L
 
M
K
 
D
T
 
Q
R
 
R
S
 
E
A
 
K
I
 
I
I
 
I
S
 
S
A
 
A
L
 
I
R
 
R
E
 
K
T
 
K
L
 
T
A
 
I
P
 
E
E
 
H
L
 
A
V
 
E
T
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
R
E
 
M
S
 
A
A
 
V
T
 
E
E
 
E
T
 
T
G
 
G
M
 
M
G
 
G
N
 
N
K
 
V
E
 
G
D
 
H
K
 
K
Y
 
I
L
 
L
K
 
K
N
 
H
K
 
Q
A
 
L
A
 
V
L
 
A
E
 
E
N
 
K
T
 
T
P
 
P
G
 
G
I
 
T
E
 
E
D
 
D
L
 
I
T
 
T
T
 
T
S
 
T
A
 
A
L
 
W
T
 
S
G
 
G
D
 
D
G
 
R
G
 
G
M
 
L
V
 
T
L
 
L
F
 
V
E
 
E
Y
 
M
S
 
G
P
 
P
F
 
F
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
A
V
x
I
A
x
T
P
|
P
S
x
C
T
|
T
N
 
N
P
 
P
T
 
S
E
 
E
T
 
T
I
 
I
I
 
I
N
 
C
N
 
N
S
 
T
I
 
I
S
 
G
M
 
M
L
 
L
A
 
A
A
 
G
G
 
G
N
 
N
S
 
T
V
 
V
Y
 
V
F
 
F
S
 
N
P
 
P
H
|
H
P
 
P
G
 
A
A
 
A
K
 
I
K
 
K
V
 
T
S
 
S
L
 
N
T
 
F
L
 
A
I
 
V
A
 
Q
R
 
L
I
 
I
E
 
N
E
 
E
I
 
A
A
 
S
Y
 
L
R
 
S
C
 
A
S
 
G
G
 
G
I
 
P
R
 
V
N
 
N
L
 
I
V
 
A
V
 
C
T
 
S
V
 
V
A
 
R
E
 
K
P
 
P
T
 
T
F
x
L
E
 
D
A
 
S
T
 
S
Q
 
K
Q
 
I
M
 
M
M
 
M
A
 
S
H
 
H
P
 
Q
L
 
D
I
 
I
A
 
P
V
 
L
L
 
I
A
 
A
I
 
A
T
|
T
G
|
G
G
|
G
P
 
P
G
 
G
I
x
V
V
 
V
A
 
T
M
 
A
G
 
V
M
 
L
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
K
 
K
K
 
R
V
 
G
I
 
I
G
 
G
A
|
A
G
|
G
A
 
A
G
 
G
N
 
N
P
 
P
P
 
P
C
 
V
I
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
T
 
T
A
 
A
D
 
D
L
 
I
V
 
R
K
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
E
D
 
D
I
 
I
I
 
I
S
 
N
G
 
G
A
 
C
A
 
T
F
 
F
D
 
D
Y
 
N
N
 
N
L
 
L
P
 
P
C
|
C
I
 
I
A
 
A
E
 
E
K
 
K
S
 
E
L
 
V
I
 
V
V
 
A
V
 
I
A
 
D
S
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
N
R
 
E
L
 
L
I
 
M
Q
 
N
Q
 
Y
M
 
M
-
 
V
Q
 
K
D
 
E
F
 
Q
D
 
G
A
 
C
L
 
Y
L
 
A
L
 
I
S
 
T
P
 
K
Q
 
E
E
 
Q
T
 
Q
D
 
E
T
 
K
L
 
L
R
 
T
A
 
N
V
 
L
C
 
V
L
 
I
P
 
T
D
 
P
G
 
K
A
 
G
A
 
L
N
 
N
K
 
R
K
 
N
L
 
C
V
 
V
G
 
G
K
 
K
S
 
D
P
 
A
A
 
R
E
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
G
A
 
M
A
 
I
G
 
G
L
 
I
A
 
D
V
 
V
P
 
P
S
 
S
R
 
N
P
 
-
P
 
I
R
 
R
L
 
C
L
 
I
I
 
I
A
 
F
E
 
E
V
 
G
Q
 
E
A
 
K
N
 
E
D
 
H
P
 
P
W
 
L
V
 
I
T
 
S
C
 
E
E
|
E
Q
 
L
L
x
M
M
 
M
P
 
P
V
 
I
L
 
L
P
 
G
I
 
I
V
 
V
R
 
R
V
 
A
A
 
K
D
 
S
F
 
F
D
 
D
S
 
D
A
 
A
L
 
V
A
 
E
L
 
K
A
 
A
L
 
V
R
 
W
V
 
L
E
 
E
E
 
H
G
 
G
L
 
N
H
 
R
H
|
H
T
 
S
A
 
A
I
 
H
M
 
I
H
 
H
S
 
S
Q
 
K
N
 
N
V
 
V
S
 
D
R
 
R
L
 
I
N
 
T
L
 
T
A
 
Y
A
 
A
R
 
K
T
 
A
L
 
I
Q
 
D
T
 
T
S
 
A
I
 
I
F
 
L
V
 
V
K
 
K
N
 
N
G
 
A
P
 
P
S
 
S
Y
 
Y
A
 
A
G
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
F
G
 
G
G
 
G
E
 
E
G
 
G
F
 
F
T
 
C
T
 
T
F
 
F
T
|
T
I
|
I
A
 
A
T
 
S
P
 
R
T
 
T
G
 
G
E
 
E
G
 
G
T
 
L
T
 
T
S
 
S
A
 
A
R
 
S
T
 
T
F
 
F
A
 
T
R
 
K
L
 
R
R
 
R
R
 
R
C
 
C
V
 
V
L
 
M
T
 
S
N
 
D
G
 
S
F
 
L
S
 
C
I
 
I
R
 
R

5dbvA Structure of a c269a mutant of propionaldehyde dehydrogenase from the clostridium phytofermentans fucose utilisation bacterial microcompartment (see paper)
45% identity, 94% coverage: 29:461/461 of query aligns to 2:431/431 of 5dbvA

query
sites
5dbvA
G
 
G
I
 
V
F
 
F
R
 
D
D
 
D
V
 
M
G
 
N
S
 
Q
A
 
A
I
 
I
D
 
E
A
 
A
A
 
A
H
 
K
Q
 
E
A
 
A
F
 
Q
L
 
L
R
 
V
Y
 
V
Q
 
K
Q
 
K
C
 
M
P
 
S
L
 
M
K
 
D
T
 
Q
R
 
R
S
 
E
A
 
K
I
 
I
I
 
I
S
 
S
A
 
A
L
 
I
R
 
R
E
 
K
T
 
K
L
 
T
A
 
I
P
 
E
E
 
H
L
 
A
V
 
E
T
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
R
E
 
M
S
 
A
A
 
V
T
 
E
E
 
E
T
 
T
G
 
G
M
 
M
G
 
G
N
 
N
K
 
V
E
 
G
D
 
H
K
 
K
Y
 
I
L
 
L
K
 
K
N
 
H
K
 
Q
A
 
L
A
 
V
L
 
A
E
 
E
N
 
K
T
 
T
P
 
P
G
 
G
I
 
T
E
 
E
D
 
D
L
 
I
T
 
T
T
 
T
S
 
T
A
 
A
L
 
W
T
 
S
G
 
G
D
 
D
G
 
R
G
 
G
M
 
L
V
 
T
L
 
L
F
 
V
E
 
E
Y
 
M
S
 
G
P
 
P
F
 
F
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
A
V
x
I
A
 
T
P
 
P
S
x
C
T
|
T
N
 
N
P
 
P
T
 
S
E
 
E
T
 
T
I
 
I
I
 
I
N
 
C
N
 
N
S
 
T
I
 
I
S
 
G
M
 
M
L
 
L
A
 
A
A
 
G
G
 
G
N
 
N
S
 
T
V
 
V
Y
 
V
F
 
F
S
x
N
P
|
P
H
|
H
P
 
P
G
 
A
A
 
A
K
 
I
K
 
K
V
 
T
S
 
S
L
 
N
T
 
F
L
 
A
I
 
V
A
 
Q
R
 
L
I
 
I
E
 
N
E
 
E
I
 
A
A
 
S
Y
 
L
R
 
S
C
 
A
S
 
G
G
 
G
I
 
P
R
 
V
N
 
N
L
 
I
V
 
A
V
 
C
T
 
S
V
 
V
A
 
R
E
 
K
P
 
P
T
 
T
F
 
L
E
 
D
A
 
S
T
 
S
Q
 
K
Q
 
I
M
 
M
M
 
M
A
 
S
H
 
H
P
 
Q
L
 
D
I
 
I
A
 
P
V
 
L
L
 
I
A
 
A
I
 
A
T
 
T
G
|
G
G
|
G
P
 
P
G
 
G
I
x
V
V
 
V
A
 
T
M
 
A
G
 
V
M
 
L
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
K
 
K
K
 
R
V
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
|
G
A
 
A
G
 
G
N
 
N
P
 
P
P
 
P
C
 
V
I
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
T
 
T
A
 
A
D
 
D
L
 
I
V
 
R
K
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
E
D
 
D
I
 
I
I
 
I
S
 
N
G
 
G
A
 
C
A
 
T
F
 
F
D
 
D
Y
 
N
N
 
N
L
 
L
P
 
P
C
x
A
I
 
I
A
 
A
E
 
E
K
|
K
S
 
E
L
 
V
I
 
V
V
 
A
V
 
I
A
 
D
S
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
N
R
 
E
L
 
L
I
 
M
Q
 
N
Q
 
Y
M
 
M
-
 
V
Q
 
K
D
 
E
F
 
Q
D
 
G
A
 
C
L
 
Y
L
 
A
L
 
I
S
 
T
P
 
K
Q
 
E
E
 
Q
T
 
Q
D
 
E
T
 
K
L
 
L
R
 
T
A
 
N
V
 
L
C
 
V
L
 
I
P
 
T
D
 
P
G
 
K
A
 
G
A
 
L
N
 
N
K
x
R
K
 
N
L
 
C
V
 
V
G
 
G
K
 
K
S
 
D
P
 
A
A
 
R
E
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
G
A
 
M
A
 
I
G
 
G
L
 
I
A
 
-
V
 
-
P
 
-
S
 
-
R
 
D
P
 
N
P
 
I
R
 
R
L
 
C
L
 
I
I
 
I
A
 
F
E
 
E
V
 
G
Q
 
E
A
 
K
N
 
E
D
 
H
P
 
P
W
 
L
V
 
I
T
 
S
C
 
E
E
|
E
Q
 
L
L
x
M
M
 
M
P
 
P
V
 
I
L
 
L
P
 
G
I
 
I
V
 
V
R
 
R
V
 
A
A
 
K
D
 
S
F
 
F
D
 
D
S
 
D
A
 
A
L
 
V
A
 
E
L
 
K
A
 
A
L
 
V
R
 
W
V
 
L
E
 
E
E
 
H
G
 
G
L
 
N
H
 
R
H
 
H
T
 
S
A
 
A
I
 
H
M
 
I
H
 
H
S
 
S
Q
 
K
N
 
N
V
 
V
S
 
D
R
 
R
L
 
I
N
 
T
L
 
T
A
 
Y
A
 
A
R
 
K
T
 
A
L
 
I
Q
 
D
T
 
T
S
 
A
I
 
I
F
 
L
V
 
V
K
 
K
N
 
N
G
 
A
P
 
P
S
 
S
Y
 
Y
A
 
A
G
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
F
G
 
G
G
 
G
E
 
E
G
 
G
F
 
F
T
 
C
T
 
T
F
 
F
T
 
T
I
 
I
A
 
A
T
 
S
P
 
R
T
 
T
G
 
G
E
 
E
G
 
G
T
 
L
T
 
T
S
 
S
A
 
A
R
 
S
T
 
T
F
 
F
A
 
T
R
 
K
L
 
R
R
 
R
R
 
R
C
 
C
V
 
V
L
 
M
T
 
S
N
 
D
G
 
S
F
 
L
S
 
C
I
 
I
R
 
R

5j7iC Crystal structure of a geobacillus thermoglucosidasius acetylating aldehyde dehydrogenase in complex with adp (see paper)
32% identity, 79% coverage: 59:421/461 of query aligns to 39:408/455 of 5j7iC

query
sites
5j7iC
I
 
I
I
 
V
S
 
E
A
 
S
L
 
M
R
 
A
E
 
N
T
 
A
L
 
A
A
 
R
P
 
E
E
 
E
L
 
A
V
 
G
T
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
A
E
 
M
S
 
A
A
 
V
T
 
E
E
 
E
T
 
T
G
 
G
M
 
F
G
 
G
N
 
N
K
 
V
E
 
E
D
 
D
K
 
K
Y
 
T
L
 
L
K
 
K
N
 
N
K
 
L
-
 
F
A
 
A
A
 
A
L
 
N
E
 
D
N
 
V
T
 
Y
P
 
N
G
 
S
I
 
I
E
 
K
D
 
D
L
 
V
T
 
K
T
 
T
S
 
V
A
 
G
L
 
I
T
 
I
G
 
R
-
 
R
D
 
D
G
 
E
G
 
E
M
 
N
V
 
R
L
 
V
F
 
W
E
 
E
Y
 
I
S
 
A
-
 
Q
P
 
P
F
 
V
G
 
G
V
 
I
I
 
V
G
 
A
A
 
G
V
 
I
A
 
I
P
 
P
S
 
S
T
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
T
E
 
S
T
 
T
I
 
V
I
 
I
N
 
F
N
 
K
S
 
A
I
 
L
S
 
I
M
 
A
L
 
V
A
 
K
A
 
A
G
 
R
N
 
N
S
 
A
V
 
I
Y
 
V
F
 
F
S
 
S
P
 
P
H
|
H
P
|
P
G
 
S
A
 
A
K
 
A
K
 
K
V
 
C
S
 
T
L
 
A
T
 
E
L
 
A
I
 
A
A
 
R
R
 
I
I
 
M
E
 
Q
E
 
E
I
 
A
A
 
A
Y
 
E
R
 
R
C
 
A
S
 
G
G
 
A
I
 
P
R
 
K
N
 
G
L
 
L
V
 
I
V
 
S
T
 
C
V
 
I
A
 
T
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
F
 
M
E
 
A
A
 
A
T
 
T
Q
 
N
Q
 
E
M
 
L
M
 
M
A
 
K
H
 
H
P
 
K
L
 
L
I
 
T
A
 
D
V
 
V
L
 
I
A
 
L
I
 
A
T
 
T
G
 
G
G
 
G
P
 
P
G
 
G
I
x
L
V
 
V
A
 
K
M
 
A
G
 
A
M
 
Y
K
 
S
S
 
S
G
 
G
K
 
K
K
 
P
V
 
A
I
 
Y
G
 
G
A
 
V
G
 
G
A
 
P
G
 
G
N
 
N
P
 
V
P
 
P
C
 
V
I
 
Y
V
 
I
D
 
H
E
 
E
T
 
S
A
 
A
D
 
N
L
 
I
V
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
V
E
 
Q
D
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
Q
G
 
S
A
 
K
A
 
T
F
 
F
D
 
D
Y
 
Y
N
 
G
L
 
T
P
 
I
C
 
C
I
 
A
A
 
S
E
 
E
K
 
Q
S
 
A
L
 
L
I
 
L
V
 
V
V
 
D
A
 
E
S
 
S
V
 
I
A
 
K
D
 
E
R
 
K
L
 
V
I
 
V
Q
 
A
Q
 
E
M
 
L
Q
 
K
D
 
Q
F
 
Q
D
 
G
A
 
A
L
 
Y
L
 
F
L
 
L
S
 
N
P
 
E
Q
 
E
E
 
E
T
 
K
D
 
Q
T
 
K
L
 
V
R
 
A
A
 
S
V
 
I
C
 
I
L
 
M
P
 
V
D
 
N
G
 
G
A
 
S
A
 
L
N
 
N
K
 
A
K
 
K
L
 
I
V
 
V
G
 
G
K
 
K
S
 
A
P
 
P
A
 
Q
E
 
V
L
 
I
L
 
A
A
 
E
A
 
M
A
 
A
G
 
G
L
 
I
A
 
E
V
 
I
P
 
P
S
 
S
R
 
D
P
 
V
P
 
K
R
 
L
L
 
L
L
 
V
I
 
A
A
 
E
E
 
E
V
 
T
Q
 
E
A
 
V
N
 
G
D
 
K
P
 
E
W
 
Y
-
 
P
V
 
F
T
 
S
C
 
I
E
 
E
Q
 
K
L
 
L
M
 
S
P
 
P
V
 
I
L
 
L
P
 
A
I
 
F
V
 
Y
R
 
I
V
 
V
A
 
K
D
 
G
F
 
M
D
 
E
S
 
E
A
 
A
L
 
S
A
 
E
L
 
L
A
 
A
L
 
Q
R
 
K
V
 
L
E
 
L
E
 
E
-
 
V
-
 
G
G
 
G
L
 
L
H
 
G
H
 
H
T
 
T
A
 
V
I
 
G
M
 
I
H
 
H
S
 
A
Q
 
E
N
 
D
V
 
E
S
 
K
R
 
V
L
 
I
N
 
E
L
 
-
A
 
-
A
 
A
R
 
Y
T
 
T
L
 
I
Q
 
D
T
 
K
-
 
P
-
 
A
-
 
G
S
 
R
I
 
I
F
 
V
V
 
V
K
 
N
N
 
A
G
 
G
P
 
T
S
 
T
Y
 
F
A
 
G
G
 
G
I
 
I
G
 
G

5j7iB Crystal structure of a geobacillus thermoglucosidasius acetylating aldehyde dehydrogenase in complex with adp (see paper)
32% identity, 79% coverage: 59:421/461 of query aligns to 40:409/456 of 5j7iB

query
sites
5j7iB
I
 
I
I
 
V
S
 
E
A
 
S
L
 
M
R
 
A
E
 
N
T
 
A
L
 
A
A
 
R
P
 
E
E
 
E
L
 
A
V
 
G
T
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
A
E
 
M
S
 
A
A
 
V
T
 
E
E
 
E
T
 
T
G
 
G
M
 
F
G
 
G
N
 
N
K
 
V
E
 
E
D
 
D
K
 
K
Y
 
T
L
 
L
K
 
K
N
 
N
K
 
L
-
 
F
A
 
A
A
 
A
L
 
N
E
 
D
N
 
V
T
 
Y
P
 
N
G
 
S
I
 
I
E
 
K
D
 
D
L
 
V
T
 
K
T
 
T
S
 
V
A
 
G
L
 
I
T
 
I
G
 
R
-
 
R
D
 
D
G
 
E
G
 
E
M
 
N
V
 
R
L
 
V
F
 
W
E
 
E
Y
 
I
S
 
A
-
 
Q
P
 
P
F
 
V
G
 
G
V
 
I
I
 
V
G
 
A
A
 
G
V
 
I
A
 
I
P
 
P
S
 
S
T
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
T
E
 
S
T
 
T
I
 
V
I
 
I
N
 
F
N
 
K
S
 
A
I
 
L
S
 
I
M
 
A
L
 
V
A
 
K
A
 
A
G
 
R
N
 
N
S
 
A
V
 
I
Y
 
V
F
 
F
S
 
S
P
 
P
H
 
H
P
 
P
G
 
S
A
 
A
K
 
A
K
 
K
V
 
C
S
 
T
L
 
A
T
 
E
L
 
A
I
 
A
A
 
R
R
 
I
I
 
M
E
 
Q
E
 
E
I
 
A
A
 
A
Y
 
E
R
 
R
C
 
A
S
 
G
G
 
A
I
 
P
R
 
K
N
 
G
L
 
L
V
 
I
V
 
S
T
 
C
V
 
I
A
 
T
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
F
 
M
E
 
A
A
 
A
T
 
T
Q
 
N
Q
 
E
M
 
L
M
 
M
A
 
K
H
 
H
P
 
K
L
 
L
I
 
T
A
 
D
V
 
V
L
 
I
A
 
L
I
 
A
T
 
T
G
 
G
G
 
G
P
 
P
G
 
G
I
x
L
V
 
V
A
 
K
M
 
A
G
 
A
M
 
Y
K
 
S
S
 
S
G
 
G
K
 
K
K
 
P
V
 
A
I
 
Y
G
 
G
A
 
V
G
 
G
A
 
P
G
 
G
N
 
N
P
 
V
P
 
P
C
 
V
I
 
Y
V
 
I
D
 
H
E
 
E
T
 
S
A
 
A
D
 
N
L
 
I
V
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
V
E
 
Q
D
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
Q
G
 
S
A
 
K
A
 
T
F
 
F
D
 
D
Y
 
Y
N
 
G
L
 
T
P
 
I
C
 
C
I
 
A
A
 
S
E
 
E
K
 
Q
S
 
A
L
 
L
I
 
L
V
 
V
V
 
D
A
 
E
S
 
S
V
 
I
A
 
K
D
 
E
R
 
K
L
 
V
I
 
V
Q
 
A
Q
 
E
M
 
L
Q
 
K
D
 
Q
F
 
Q
D
 
G
A
 
A
L
 
Y
L
 
F
L
 
L
S
 
N
P
 
E
Q
 
E
E
 
E
T
 
K
D
 
Q
T
 
K
L
 
V
R
 
A
A
 
S
V
 
I
C
 
I
L
 
M
P
 
V
D
 
N
G
 
G
A
 
S
A
 
L
N
 
N
K
x
A
K
 
K
L
 
I
V
 
V
G
 
G
K
 
K
S
 
A
P
 
P
A
 
Q
E
 
V
L
 
I
L
 
A
A
 
E
A
 
M
A
 
A
G
 
G
L
 
I
A
 
E
V
 
I
P
 
P
S
 
S
R
 
D
P
 
V
P
 
K
R
 
L
L
 
L
L
 
V
I
 
A
A
 
E
E
 
E
V
 
T
Q
 
E
A
 
V
N
 
G
D
 
K
P
 
E
W
 
Y
-
 
P
V
 
F
T
 
S
C
 
I
E
 
E
Q
 
K
L
 
L
M
 
S
P
 
P
V
 
I
L
 
L
P
 
A
I
 
F
V
 
Y
R
 
I
V
 
V
A
 
K
D
 
G
F
 
M
D
 
E
S
 
E
A
 
A
L
 
S
A
 
E
L
 
L
A
 
A
L
 
Q
R
 
K
V
 
L
E
 
L
E
 
E
-
 
V
-
 
G
G
 
G
L
 
L
H
 
G
H
 
H
T
 
T
A
 
V
I
 
G
M
 
I
H
 
H
S
 
A
Q
 
E
N
 
D
V
 
E
S
 
K
R
 
V
L
 
I
N
 
E
L
 
-
A
 
-
A
 
A
R
 
Y
T
 
T
L
 
I
Q
 
D
T
 
K
-
 
P
-
 
A
-
 
G
S
 
R
I
 
I
F
 
V
V
 
V
K
 
N
N
 
A
G
 
G
P
 
T
S
 
T
Y
 
F
A
 
G
G
 
G
I
 
I
G
 
G

8uhwB The structure of the clostridium thermocellum adhe spirosome
33% identity, 76% coverage: 72:423/461 of query aligns to 45:402/859 of 8uhwB

query
sites
8uhwB
V
 
I
T
 
P
L
 
L
A
 
A
E
 
K
E
 
M
S
 
A
A
 
V
T
 
E
E
 
E
T
 
T
G
 
G
M
 
M
G
 
G
N
 
V
K
 
V
E
 
E
D
 
D
K
 
K
Y
 
V
L
 
I
K
 
K
N
 
N
K
 
H
A
 
Y
A
 
A
L
 
S
E
 
E
N
 
Y
T
 
I
P
 
Y
G
 
N
I
 
A
E
 
Y
D
 
K
L
 
N
T
 
T
T
 
K
S
 
T
-
 
C
-
 
G
A
 
V
L
 
I
T
 
E
G
 
E
D
 
D
G
 
P
G
 
A
M
 
F
V
 
G
L
 
I
F
 
K
E
 
K
Y
 
I
S
 
A
-
 
E
P
 
P
F
 
L
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
I
P
 
P
S
 
T
T
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
T
E
 
S
T
 
T
I
 
A
I
 
I
N
 
F
N
 
K
S
 
T
I
 
L
S
 
I
M
 
A
L
 
L
A
 
K
A
 
T
G
 
R
N
 
N
S
 
A
V
 
I
Y
 
I
F
 
I
S
 
S
P
 
P
H
 
H
P
 
P
G
 
R
A
 
A
K
 
K
K
 
N
V
 
S
S
 
T
L
 
I
T
 
E
L
 
A
I
 
A
A
 
K
R
 
I
I
 
V
E
 
L
E
 
E
I
 
A
A
 
A
Y
 
V
R
 
K
C
 
A
S
 
G
G
 
A
I
 
P
R
 
E
N
 
G
L
 
I
V
 
I
V
 
G
T
 
W
V
 
I
A
 
D
E
 
V
P
 
P
T
 
S
F
 
L
E
 
E
A
 
L
T
 
T
Q
 
N
Q
 
L
M
 
V
M
 
M
A
 
R
H
 
E
P
 
A
L
 
-
I
 
-
A
 
D
V
 
V
L
 
I
A
 
L
I
 
A
T
 
T
G
 
G
G
 
G
P
 
P
G
 
G
I
 
L
V
 
V
A
 
K
M
 
A
G
 
A
M
 
Y
K
 
S
S
 
S
G
 
G
K
 
K
K
 
P
V
 
A
I
 
I
G
 
G
A
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
N
 
N
P
 
T
P
 
P
C
 
A
I
 
I
V
 
I
D
 
D
E
 
D
T
 
S
A
 
A
D
 
D
L
 
I
V
 
V
K
 
L
A
 
A
A
 
V
E
 
N
D
 
S
I
 
I
I
 
I
S
 
H
G
 
S
A
 
K
A
 
T
F
 
F
D
 
D
Y
 
N
N
 
G
L
 
M
P
 
I
C
 
C
I
 
A
A
 
S
E
 
E
K
 
Q
S
 
S
L
 
V
I
 
I
V
 
V
V
 
L
A
 
D
S
 
G
V
 
V
A
 
Y
D
 
K
R
 
E
L
 
V
I
 
K
Q
 
K
Q
 
E
M
 
F
Q
 
E
D
 
K
F
 
R
D
 
G
A
 
C
L
 
Y
L
 
F
L
 
L
S
 
N
P
 
E
Q
 
D
E
 
E
T
 
T
D
 
E
T
 
K
L
 
V
R
 
R
A
 
K
V
 
T
C
 
I
L
 
I
P
 
I
D
 
N
G
 
G
A
 
A
A
 
L
N
 
N
K
 
A
K
 
K
L
 
I
V
 
V
G
 
G
K
 
Q
S
 
K
P
 
A
A
 
H
E
 
T
L
 
I
L
 
A
A
 
N
A
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
F
A
 
E
V
 
V
P
 
P
S
 
-
R
 
E
P
 
T
P
 
T
R
 
K
L
 
I
L
 
L
I
 
I
A
 
G
E
 
E
V
 
V
Q
 
T
A
 
S
N
 
V
D
 
D
-
 
I
-
 
S
P
 
E
W
 
E
V
 
F
T
 
A
C
 
H
E
 
E
Q
 
K
L
 
L
M
 
C
P
 
P
V
 
V
L
 
L
P
 
A
I
 
M
V
 
Y
R
 
R
V
 
A
A
 
K
D
 
D
F
 
F
D
 
D
S
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
D
L
 
K
A
 
A
L
 
E
R
 
R
V
 
L
-
 
V
-
 
A
E
 
D
E
 
G
G
 
G
L
 
F
H
 
G
H
 
H
T
 
T
A
 
S
I
 
S
M
 
L
H
 
Y
S
 
I
Q
 
D
N
 
T
V
 
V
S
 
T
-
 
Q
-
 
K
-
 
E
R
 
K
L
 
L
N
 
Q
L
 
K
A
 
F
A
 
S
R
 
E
T
 
R
L
 
M
Q
 
K
T
 
T
S
 
C
I
 
R
F
 
I
V
 
L
K
 
V
N
 
N
G
 
T
P
 
P
S
 
S
Y
 
S
A
 
Q
G
 
G
I
 
-
G
 
G
V
 
I
G
 
G

Sites not aligning to the query:

P0A9Q7 Bifunctional aldehyde-alcohol dehydrogenase AdhE; Alcohol dehydrogenase E; EC 1.2.1.10; EC 1.1.1.1 from Escherichia coli (strain K12) (see 8 papers)
32% identity, 76% coverage: 72:421/461 of query aligns to 47:406/891 of P0A9Q7

query
sites
P0A9Q7
V
 
I
T
 
P
L
 
L
A
 
A
E
 
K
E
 
M
S
 
A
A
 
V
T
 
A
E
 
E
T
 
S
G
 
G
M
 
M
G
 
G
N
 
I
K
 
V
E
 
E
D
 
D
K
 
K
Y
 
V
L
 
I
K
 
K
N
 
N
K
 
H
A
 
F
A
 
A
L
 
S
E
 
E
N
 
Y
T
 
I
P
 
Y
G
 
N
I
 
A
-
 
Y
-
 
K
E
 
D
D
 
E
L
 
K
T
 
T
T
 
C
S
 
G
A
 
V
L
 
L
T
 
S
G
 
E
D
 
D
-
 
D
-
 
T
-
 
F
G
 
G
G
 
T
M
 
I
V
 
T
L
 
I
F
 
A
E
 
E
Y
 
-
S
 
-
P
 
P
F
 
I
G
 
G
V
 
I
I
 
I
G
 
C
A
 
G
V
x
I
A
x
V
P
|
P
S
x
T
T
|
T
N
|
N
P
 
P
T
 
T
E
 
S
T
 
T
I
 
A
I
 
I
N
 
F
N
 
K
S
 
S
I
 
L
S
 
I
M
 
S
L
 
L
A
 
K
A
 
T
G
 
R
N
 
N
S
 
A
V
 
I
Y
 
I
F
 
F
S
 
S
P
 
P
H
 
H
P
 
P
G
 
R
A
 
A
K
 
K
K
 
D
V
 
A
S
 
T
L
 
N
T
 
K
L
 
A
I
 
A
A
 
D
R
 
I
I
 
V
E
 
L
E
 
Q
I
 
A
A
 
A
Y
 
I
R
 
A
C
 
A
S
 
G
G
 
A
I
 
P
R
 
K
N
 
D
L
 
L
V
 
I
V
 
G
T
 
W
V
 
I
A
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
S
F
 
V
E
 
E
A
 
L
T
 
S
Q
 
N
Q
 
A
M
 
L
M
 
M
A
 
H
H
 
H
P
 
P
L
 
D
I
 
I
A
 
N
V
 
L
L
 
I
A
 
L
I
 
A
T
 
T
G
 
G
G
|
G
P
 
P
G
 
G
I
 
M
V
 
V
A
 
K
M
 
A
G
 
A
M
 
Y
K
 
S
S
 
S
G
 
G
K
 
K
K
 
P
V
 
A
I
 
I
G
 
G
A
 
V
G
|
G
A
 
A
G
 
G
N
 
N
P
 
T
P
 
P
C
 
V
I
 
V
V
 
I
D
 
D
E
 
E
T
 
T
A
 
A
D
 
D
L
 
I
V
 
K
K
 
R
A
 
A
A
 
V
E
 
A
D
 
S
I
 
V
I
 
L
S
 
M
G
 
S
A
 
K
A
 
T
F
 
F
D
 
D
Y
 
N
N
 
G
L
 
V
P
 
I
C
 
C
I
 
A
A
 
S
E
 
E
K
 
Q
S
 
S
L
 
V
I
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
D
S
 
S
V
 
V
A
 
Y
D
 
D
R
 
A
L
 
V
I
 
R
Q
 
E
Q
 
R
M
 
F
Q
x
A
D
 
T
F
 
H
D
 
G
A
 
G
L
 
Y
L
 
L
L
 
L
S
 
Q
P
 
G
Q
 
K
E
 
E
T
 
L
D
 
K
T
 
A
L
 
V
R
 
Q
A
 
D
V
 
V
C
 
I
L
 
L
P
 
K
D
 
N
G
 
G
A
 
A
A
 
L
N
 
N
K
 
A
K
 
A
L
 
I
V
 
V
G
 
G
K
 
Q
S
 
P
P
 
A
A
 
Y
E
 
K
L
 
I
L
 
A
A
 
E
A
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
F
A
 
S
V
 
V
P
 
P
S
 
E
R
 
N
P
 
-
P
 
T
R
 
K
L
 
I
L
 
L
I
 
I
A
 
G
E
 
E
V
 
V
Q
 
T
A
 
V
N
 
V
D
 
D
-
 
E
-
 
S
-
 
E
P
 
P
W
 
F
V
 
A
T
 
H
C
 
-
E
|
E
Q
 
K
L
 
L
M
 
S
P
 
P
V
 
T
L
 
L
P
 
A
I
 
M
V
 
Y
R
 
R
V
 
A
A
 
K
D
 
D
F
 
F
D
 
E
S
 
D
A
 
A
L
 
V
A
 
E
L
 
K
A
 
A
L
 
E
R
x
K
V
 
L
E
 
V
E
 
A
-
 
M
-
 
G
G
 
G
L
 
I
H
 
G
H
 
H
T
 
T
A
 
S
I
 
C
M
 
L
H
 
Y
S
 
T
Q
 
D
N
 
Q
V
 
D
S
 
N
-
 
Q
-
 
P
-
 
A
R
 
R
L
 
V
N
 
S
L
 
Y
A
 
F
A
 
G
R
 
Q
T
 
K
L
 
M
Q
 
K
T
 
T
S
 
A
I
 
R
F
 
I
V
 
L
K
 
I
N
 
N
G
 
T
P
 
P
-
 
A
S
 
S
Y
 
Q
A
 
G
G
 
G
I
 
I
G
 
G

Sites not aligning to the query:

P0A9Q8 Bifunctional aldehyde-alcohol dehydrogenase AdhE; Alcohol dehydrogenase E; EC 1.2.1.10; EC 1.1.1.1 from Escherichia coli O157:H7 (see paper)
32% identity, 76% coverage: 72:421/461 of query aligns to 47:406/891 of P0A9Q8

query
sites
P0A9Q8
V
 
I
T
 
P
L
 
L
A
 
A
E
 
K
E
 
M
S
 
A
A
 
V
T
 
A
E
 
E
T
 
S
G
 
G
M
 
M
G
 
G
N
 
I
K
 
V
E
 
E
D
 
D
K
 
K
Y
 
V
L
 
I
K
 
K
N
 
N
K
 
H
A
 
F
A
 
A
L
 
S
E
 
E
N
 
Y
T
 
I
P
 
Y
G
 
N
I
 
A
-
 
Y
-
 
K
E
 
D
D
 
E
L
 
K
T
 
T
T
 
C
S
 
G
A
 
V
L
 
L
T
 
S
G
 
E
D
 
D
-
 
D
-
 
T
-
 
F
G
 
G
G
 
T
M
 
I
V
 
T
L
 
I
F
 
A
E
 
E
Y
 
-
S
 
-
P
 
P
F
 
I
G
 
G
V
 
I
I
 
I
G
 
C
A
 
G
V
 
I
A
 
V
P
 
P
S
 
T
T
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
T
E
 
S
T
 
T
I
 
A
I
 
I
N
 
F
N
 
K
S
 
S
I
 
L
S
 
I
M
 
S
L
 
L
A
 
K
A
 
T
G
 
R
N
 
N
S
 
A
V
 
I
Y
 
I
F
 
F
S
 
S
P
 
P
H
 
H
P
 
P
G
 
R
A
 
A
K
 
K
K
 
D
V
 
A
S
 
T
L
 
N
T
 
K
L
 
A
I
 
A
A
 
D
R
 
I
I
 
V
E
 
L
E
 
Q
I
 
A
A
 
A
Y
 
I
R
 
A
C
 
A
S
 
G
G
 
A
I
 
P
R
 
K
N
 
D
L
 
L
V
 
I
V
 
G
T
 
W
V
 
I
A
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
S
F
 
V
E
 
E
A
 
L
T
 
S
Q
 
N
Q
 
A
M
 
L
M
 
M
A
 
H
H
 
H
P
 
P
L
 
D
I
 
I
A
 
N
V
 
L
L
 
I
A
 
L
I
 
A
T
 
T
G
 
G
G
 
G
P
 
P
G
 
G
I
 
M
V
 
V
A
 
K
M
 
A
G
 
A
M
 
Y
K
 
S
S
 
S
G
 
G
K
 
K
K
 
P
V
 
A
I
 
I
G
 
G
A
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
N
 
N
P
 
T
P
 
P
C
 
V
I
 
V
V
 
I
D
 
D
E
 
E
T
 
T
A
 
A
D
 
D
L
 
I
V
 
K
K
 
R
A
 
A
A
 
V
E
 
A
D
 
S
I
 
V
I
 
L
S
 
M
G
 
S
A
 
K
A
 
T
F
 
F
D
 
D
Y
 
N
N
 
G
L
 
V
P
 
I
C
 
C
I
 
A
A
 
S
E
 
E
K
 
Q
S
 
S
L
 
V
I
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
D
S
 
S
V
 
V
A
 
Y
D
 
D
R
 
A
L
 
V
I
 
R
Q
 
E
Q
 
R
M
 
F
Q
 
A
D
 
T
F
 
H
D
 
G
A
 
G
L
 
Y
L
 
L
L
 
L
S
 
Q
P
 
G
Q
 
K
E
 
E
T
 
L
D
 
K
T
 
A
L
 
V
R
 
Q
A
 
D
V
 
V
C
 
I
L
 
L
P
 
K
D
 
N
G
 
G
A
 
A
A
 
L
N
 
N
K
 
A
K
 
A
L
 
I
V
 
V
G
 
G
K
 
Q
S
 
P
P
 
A
A
 
Y
E
 
K
L
 
I
L
 
A
A
 
E
A
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
F
A
 
S
V
 
V
P
 
P
S
 
E
R
 
N
P
 
-
P
 
T
R
 
K
L
 
I
L
 
L
I
 
I
A
 
G
E
 
E
V
 
V
Q
 
T
A
 
V
N
 
V
D
 
D
-
 
E
-
 
S
-
 
E
P
 
P
W
 
F
V
 
A
T
 
H
C
 
-
E
 
E
Q
 
K
L
 
L
M
 
S
P
 
P
V
 
T
L
 
L
P
 
A
I
 
M
V
 
Y
R
 
R
V
 
A
A
 
K
D
 
D
F
 
F
D
 
E
S
 
D
A
 
A
L
 
V
A
 
E
L
 
K
A
 
A
L
 
E
R
 
K
V
 
L
E
 
V
E
 
A
-
 
M
-
 
G
G
 
G
L
 
I
H
 
G
H
 
H
T
 
T
A
 
S
I
 
C
M
 
L
H
 
Y
S
 
T
Q
 
D
N
 
Q
V
 
D
S
 
N
-
 
Q
-
 
P
-
 
A
R
 
R
L
 
V
N
 
S
L
 
Y
A
 
F
A
 
G
R
 
Q
T
 
K
L
 
M
Q
 
K
T
 
T
S
 
A
I
 
R
F
 
I
V
 
L
K
 
I
N
 
N
G
 
T
P
 
P
-
 
A
S
 
S
Y
 
Q
A
 
G
G
 
G
I
 
I
G
 
G

Sites not aligning to the query:

7bvpA Adhe spirosome in extended conformation (see paper)
32% identity, 76% coverage: 72:421/461 of query aligns to 47:406/869 of 7bvpA

query
sites
7bvpA
V
 
I
T
 
P
L
 
L
A
 
A
E
 
K
E
 
M
S
 
A
A
 
V
T
 
A
E
 
E
T
 
S
G
 
G
M
 
M
G
 
G
N
 
I
K
 
V
E
 
E
D
 
D
K
 
K
Y
 
V
L
 
I
K
 
K
N
 
N
K
 
H
A
 
F
A
 
A
L
 
S
E
 
E
N
 
Y
T
 
I
P
 
Y
G
 
N
I
 
A
-
 
Y
-
 
K
E
 
D
D
 
E
L
 
K
T
 
T
T
 
C
S
 
G
A
 
V
L
 
L
T
 
S
G
 
E
D
 
D
-
 
D
-
 
T
-
 
F
G
 
G
G
 
T
M
 
I
V
 
T
L
 
I
F
 
A
E
 
E
Y
 
-
S
 
-
P
 
P
F
 
I
G
 
G
V
 
I
I
 
I
G
 
C
A
 
G
V
 
I
A
 
V
P
|
P
S
x
T
T
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
T
E
 
S
T
 
T
I
 
A
I
 
I
N
 
F
N
 
K
S
 
S
I
 
L
S
 
I
M
 
S
L
 
L
A
 
K
A
 
T
G
 
R
N
 
N
S
 
A
V
 
I
Y
 
I
F
 
F
S
 
S
P
 
P
H
|
H
P
 
P
G
 
R
A
 
A
K
 
K
K
 
D
V
 
A
S
 
T
L
 
N
T
 
K
L
 
A
I
 
A
A
 
D
R
 
I
I
 
V
E
 
L
E
 
Q
I
 
A
A
 
A
Y
 
I
R
 
A
C
 
A
S
 
G
G
 
A
I
 
P
R
 
K
N
 
D
L
 
L
V
 
I
V
 
G
T
 
W
V
 
I
A
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
S
F
 
V
E
 
E
A
 
L
T
 
S
Q
 
N
Q
 
A
M
 
L
M
 
M
A
 
H
H
 
H
P
 
P
L
 
D
I
 
I
A
 
N
V
 
L
L
 
I
A
 
L
I
 
A
T
 
T
G
|
G
G
|
G
P
 
P
G
 
G
I
x
M
V
 
V
A
 
K
M
 
A
G
 
A
M
 
Y
K
 
S
S
 
S
G
 
G
K
 
K
K
 
P
V
 
A
I
 
I
G
 
G
A
x
V
G
|
G
A
|
A
G
 
G
N
 
N
P
 
T
P
 
P
C
 
V
I
 
V
V
 
I
D
 
D
E
 
E
T
 
T
A
 
A
D
 
D
L
 
I
V
 
K
K
 
R
A
 
A
A
 
V
E
 
A
D
 
S
I
 
V
I
 
L
S
 
M
G
 
S
A
 
K
A
 
T
F
 
F
D
 
D
Y
 
N
N
 
G
L
 
V
P
 
I
C
|
C
I
 
A
A
 
S
E
 
E
K
 
Q
S
 
S
L
 
V
I
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
D
S
 
S
V
 
V
A
 
Y
D
 
D
R
 
A
L
 
V
I
 
R
Q
 
E
Q
 
R
M
 
F
Q
 
A
D
 
T
F
 
H
D
 
G
A
 
G
L
 
Y
L
 
L
L
 
L
S
 
Q
P
 
G
Q
 
K
E
 
E
T
 
L
D
 
K
T
 
A
L
 
V
R
 
Q
A
 
D
V
 
V
C
 
I
L
 
L
P
 
K
D
 
N
G
 
G
A
 
A
A
 
L
N
 
N
K
 
A
K
 
A
L
 
I
V
 
V
G
 
G
K
 
Q
S
 
P
P
 
A
A
 
Y
E
 
K
L
 
I
L
 
A
A
 
E
A
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
F
A
 
S
V
 
V
P
 
P
S
 
E
R
 
N
P
 
-
P
 
T
R
 
K
L
 
I
L
 
L
I
 
I
A
 
G
E
 
E
V
 
V
Q
 
T
A
 
V
N
 
V
D
 
D
-
 
E
-
 
S
-
 
E
P
 
P
W
 
F
V
 
A
T
 
H
C
 
-
E
|
E
Q
 
K
L
|
L
M
 
S
P
 
P
V
 
T
L
 
L
P
 
A
I
 
M
V
 
Y
R
 
R
V
 
A
A
 
K
D
 
D
F
 
F
D
 
E
S
 
D
A
 
A
L
 
V
A
 
E
L
 
K
A
 
A
L
 
E
R
 
K
V
 
L
E
 
V
E
 
A
-
 
M
-
 
G
G
 
G
L
 
I
H
 
G
H
|
H
T
 
T
A
 
S
I
 
C
M
 
L
H
 
Y
S
 
T
Q
 
D
N
 
Q
V
 
D
S
 
N
-
 
Q
-
 
P
-
 
A
R
 
R
L
 
V
N
 
S
L
 
Y
A
 
F
A
 
G
R
 
Q
T
 
K
L
 
M
Q
 
K
T
 
T
S
 
A
I
 
R
F
 
I
V
 
L
K
 
I
N
 
N
G
 
T
P
 
P
-
 
A
S
 
S
Y
 
Q
A
 
G
G
 
G
I
 
I
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6tqmA Escherichia coli adhe structure in its compact conformation (see paper)
32% identity, 76% coverage: 72:421/461 of query aligns to 47:406/869 of 6tqmA

query
sites
6tqmA
V
 
I
T
 
P
L
 
L
A
 
A
E
 
K
E
 
M
S
 
A
A
 
V
T
 
A
E
 
E
T
 
S
G
 
G
M
 
M
G
 
G
N
 
I
K
 
V
E
 
E
D
 
D
K
 
K
Y
 
V
L
 
I
K
 
K
N
 
N
K
 
H
A
 
F
A
 
A
L
 
S
E
 
E
N
 
Y
T
 
I
P
 
Y
G
 
N
I
 
A
-
 
Y
-
 
K
E
 
D
D
 
E
L
 
K
T
 
T
T
 
C
S
 
G
A
 
V
L
 
L
T
 
S
G
 
E
D
 
D
-
 
D
-
 
T
-
 
F
G
 
G
G
 
T
M
 
I
V
 
T
L
 
I
F
 
A
E
 
E
Y
 
-
S
 
-
P
 
P
F
 
I
G
 
G
V
 
I
I
 
I
G
 
C
A
 
G
V
 
I
A
 
V
P
 
P
S
 
T
T
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
T
E
 
S
T
 
T
I
 
A
I
 
I
N
 
F
N
 
K
S
 
S
I
 
L
S
 
I
M
 
S
L
 
L
A
 
K
A
 
T
G
 
R
N
 
N
S
 
A
V
 
I
Y
 
I
F
 
F
S
 
S
P
 
P
H
 
H
P
 
P
G
 
R
A
 
A
K
 
K
K
 
D
V
 
A
S
 
T
L
 
N
T
 
K
L
 
A
I
 
A
A
 
D
R
 
I
I
 
V
E
 
L
E
 
Q
I
 
A
A
 
A
Y
 
I
R
 
A
C
 
A
S
 
G
G
 
A
I
 
P
R
 
K
N
 
D
L
 
L
V
 
I
V
 
G
T
 
W
V
 
I
A
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
S
F
 
V
E
 
E
A
 
L
T
 
S
Q
 
N
Q
 
A
M
 
L
M
 
M
A
 
H
H
 
H
P
 
P
L
 
D
I
 
I
A
 
N
V
 
L
L
 
I
A
 
L
I
 
A
T
 
T
G
 
G
G
 
G
P
 
P
G
 
G
I
 
M
V
 
V
A
 
K
M
 
A
G
 
A
M
 
Y
K
 
S
S
 
S
G
 
G
K
 
K
K
 
P
V
 
A
I
 
I
G
 
G
A
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
N
 
N
P
 
T
P
 
P
C
 
V
I
 
V
V
 
I
D
 
D
E
 
E
T
 
T
A
 
A
D
 
D
L
 
I
V
 
K
K
 
R
A
 
A
A
 
V
E
 
A
D
 
S
I
 
V
I
 
L
S
 
M
G
 
S
A
 
K
A
 
T
F
 
F
D
 
D
Y
 
N
N
 
G
L
 
V
P
 
I
C
 
C
I
 
A
A
 
S
E
 
E
K
 
Q
S
 
S
L
 
V
I
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
D
S
 
S
V
 
V
A
 
Y
D
 
D
R
 
A
L
 
V
I
 
R
Q
 
E
Q
 
R
M
 
F
Q
 
A
D
 
T
F
 
H
D
 
G
A
 
G
L
 
Y
L
 
L
L
 
L
S
 
Q
P
 
G
Q
 
K
E
 
E
T
 
L
D
 
K
T
 
A
L
 
V
R
 
Q
A
 
D
V
 
V
C
 
I
L
 
L
P
 
K
D
 
N
G
 
G
A
 
A
A
 
L
N
 
N
K
 
A
K
 
A
L
 
I
V
 
V
G
 
G
K
 
Q
S
 
P
P
 
A
A
 
Y
E
 
K
L
 
I
L
 
A
A
 
E
A
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
F
A
 
S
V
 
V
P
 
P
S
 
E
R
 
N
P
 
-
P
 
T
R
 
K
L
 
I
L
 
L
I
 
I
A
 
G
E
 
E
V
 
V
Q
 
T
A
 
V
N
 
V
D
 
D
-
 
E
-
 
S
-
 
E
P
 
P
W
 
F
V
 
A
T
 
H
C
 
-
E
 
E
Q
 
K
L
 
L
M
 
S
P
 
P
V
 
T
L
 
L
P
 
A
I
 
M
V
 
Y
R
 
R
V
 
A
A
 
K
D
 
D
F
 
F
D
 
E
S
 
D
A
 
A
L
 
V
A
 
E
L
 
K
A
 
A
L
 
E
R
 
K
V
 
L
E
 
V
E
 
A
-
 
M
-
 
G
G
 
G
L
 
I
H
 
G
H
 
H
T
 
T
A
 
S
I
 
C
M
 
L
H
 
Y
S
 
T
Q
 
D
N
 
Q
V
 
D
S
 
N
-
 
Q
-
 
P
-
 
A
R
 
R
L
 
V
N
 
S
L
 
Y
A
 
F
A
 
G
R
 
Q
T
 
K
L
 
M
Q
 
K
T
 
T
S
 
A
I
 
R
F
 
I
V
 
L
K
 
I
N
 
N
G
 
T
P
 
P
-
 
A
S
 
S
Y
 
Q
A
 
G
G
 
G
I
 
I
G
 
G

Sites not aligning to the query:

8cekA Succinyl-coa reductase from clostridium kluyveri (sucd) with NADPH (see paper)
30% identity, 81% coverage: 59:431/461 of query aligns to 28:405/449 of 8cekA

query
sites
8cekA
I
 
L
I
 
V
S
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
G
E
 
K
T
 
V
L
 
V
A
 
Y
P
 
D
E
 
N
L
 
A
V
 
E
T
 
M
L
 
F
A
 
A
E
 
K
E
 
E
S
 
A
A
 
V
T
 
E
E
 
E
T
 
T
G
 
E
M
 
M
G
 
G
N
 
V
K
 
Y
E
 
E
D
 
D
K
 
K
-
 
V
-
 
A
-
 
K
-
 
C
Y
 
H
L
 
L
K
 
K
N
 
S
K
 
G
A
 
A
A
 
I
L
 
W
E
 
N
N
 
H
T
 
-
P
 
-
G
 
-
I
 
I
E
 
K
D
 
D
L
 
K
T
 
K
T
 
T
S
 
V
A
 
G
L
 
I
T
 
I
G
 
K
D
 
E
G
 
E
-
 
P
-
 
E
G
 
R
M
 
A
V
 
L
L
 
V
F
 
Y
E
 
V
Y
 
A
S
 
K
P
 
P
F
 
K
G
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
A
A
 
A
V
 
T
A
 
T
P
|
P
S
x
I
T
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
V
E
 
V
T
 
T
I
 
P
I
 
M
N
 
C
N
 
N
S
 
A
I
 
M
S
 
A
M
 
A
L
 
I
A
 
K
A
 
G
G
 
R
N
 
N
S
 
T
V
 
I
Y
 
I
F
 
V
S
 
A
P
 
P
H
|
H
P
|
P
G
 
K
A
 
A
K
 
K
K
 
K
V
 
V
S
 
S
L
 
A
T
 
H
L
 
T
I
 
V
A
 
E
R
 
L
I
 
M
E
 
N
E
 
A
I
 
E
A
 
L
Y
 
K
R
 
K
C
 
L
S
 
G
G
 
A
I
 
P
R
 
E
N
 
N
L
 
I
V
 
I
V
 
Q
T
 
I
V
 
V
A
 
E
E
 
A
P
 
P
T
 
S
F
 
R
E
 
E
A
 
A
T
 
A
Q
 
K
Q
 
E
M
 
L
M
 
M
A
 
E
H
 
S
P
 
A
L
 
D
I
 
V
A
 
V
V
 
I
L
 
A
A
 
-
I
 
-
T
|
T
G
|
G
G
|
G
P
 
A
G
 
G
I
x
R
V
 
V
A
 
K
M
 
A
G
 
A
M
 
Y
K
 
S
S
 
S
G
 
G
K
 
R
K
 
P
V
 
A
I
 
Y
G
 
G
A
x
V
G
 
G
A
 
P
G
 
G
N
 
N
P
 
S
P
 
Q
C
 
V
I
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
K
T
 
G
A
 
Y
D
 
D
L
 
Y
V
 
N
K
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
Q
D
 
D
I
 
I
I
 
I
S
 
T
G
 
G
A
 
R
A
 
K
F
 
Y
D
 
D
Y
 
N
N
 
G
L
 
I
P
 
I
C
|
C
I
 
S
A
 
S
E
 
E
K
 
Q
S
 
S
L
 
V
I
 
I
V
 
A
V
 
P
A
 
A
S
 
E
V
 
D
A
 
Y
D
 
D
R
 
K
L
 
V
I
 
I
Q
 
A
Q
 
A
M
 
F
Q
 
V
D
 
E
F
 
N
D
 
G
A
 
A
L
 
F
L
 
Y
L
 
V
S
 
E
P
 
D
Q
 
E
E
 
E
T
 
T
-
 
V
D
 
E
T
 
K
L
 
F
R
 
R
A
 
S
V
 
T
C
 
L
L
 
F
P
 
K
D
 
D
G
 
G
A
 
K
A
 
I
N
 
N
K
 
S
K
 
K
L
 
I
V
 
I
G
 
G
K
 
K
S
 
S
P
 
V
A
 
Q
E
 
I
L
 
I
L
 
A
A
 
D
A
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
K
V
 
V
P
 
P
S
 
E
R
 
G
P
 
T
P
 
K
R
 
V
L
 
I
L
 
V
I
 
L
A
 
K
E
 
G
V
 
K
Q
 
G
A
 
A
N
 
G
D
 
E
P
 
K
W
 
D
V
 
V
T
 
L
C
 
C
-
 
K
E
|
E
Q
 
K
L
 
M
M
 
C
P
 
P
V
 
V
L
 
L
P
 
V
I
 
A
V
 
L
R
 
K
V
 
Y
A
 
D
D
 
T
F
 
F
D
 
E
S
 
E
A
 
A
-
 
V
-
 
E
L
 
I
A
 
A
L
 
M
A
 
A
L
 
N
R
 
Y
V
 
M
E
 
Y
E
 
E
G
 
G
L
 
A
H
 
G
H
 
H
T
 
T
A
 
A
I
 
G
M
 
I
H
 
H
S
 
S
Q
 
D
N
 
N
V
 
D
S
 
E
R
 
N
L
 
I
N
 
R
L
 
Y
A
 
A
A
 
G
R
 
T
T
 
V
L
 
L
Q
 
P
T
 
I
S
 
S
I
 
R
F
 
L
V
 
V
K
 
V
N
 
N
G
 
Q
P
 
P
S
 
A
Y
 
T
A
 
T
G
 
A
I
 
G
G
 
G
V
 
S
G
 
F
G
 
N
E
 
N
G
 
G
F
 
F
T
 
N
T
 
P
F
 
T
T
 
T

Sites not aligning to the query:

8cejC Succinyl-coa reductase from clostridium kluyveri (sucd) with mesaconyl-c1-coa (see paper)
30% identity, 81% coverage: 59:431/461 of query aligns to 28:405/449 of 8cejC

query
sites
8cejC
I
 
L
I
 
V
S
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
G
E
 
K
T
 
V
L
 
V
A
 
Y
P
 
D
E
 
N
L
 
A
V
 
E
T
 
M
L
 
F
A
 
A
E
 
K
E
 
E
S
 
A
A
 
V
T
 
E
E
 
E
T
 
T
G
 
E
M
 
M
G
 
G
N
 
V
K
 
Y
E
 
E
D
 
D
K
 
K
-
 
V
-
 
A
-
 
K
-
 
C
Y
 
H
L
 
L
K
|
K
N
 
S
K
 
G
A
 
A
A
 
I
L
 
W
E
 
N
N
 
H
T
 
-
P
 
-
G
 
-
I
 
I
E
 
K
D
 
D
L
 
K
T
 
K
T
 
T
S
 
V
A
 
G
L
 
I
T
 
I
G
 
K
D
 
E
G
 
E
-
 
P
-
 
E
G
 
R
M
 
A
V
 
L
L
 
V
F
 
Y
E
 
V
Y
 
A
S
 
K
P
 
P
F
 
K
G
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
A
A
 
A
V
 
T
A
 
T
P
|
P
S
 
I
T
|
T
N
|
N
P
 
P
T
 
V
E
 
V
T
 
T
I
 
P
I
 
M
N
 
C
N
 
N
S
 
A
I
 
M
S
 
A
M
 
A
L
 
I
A
 
K
A
 
G
G
 
R
N
 
N
S
 
T
V
 
I
Y
 
I
F
 
V
S
x
A
P
|
P
H
|
H
P
|
P
G
 
K
A
 
A
K
 
K
K
 
K
V
 
V
S
 
S
L
 
A
T
 
H
L
 
T
I
 
V
A
 
E
R
 
L
I
 
M
E
 
N
E
 
A
I
 
E
A
 
L
Y
 
K
R
 
K
C
 
L
S
 
G
G
 
A
I
 
P
R
 
E
N
 
N
L
 
I
V
 
I
V
 
Q
T
 
I
V
 
V
A
 
E
E
 
A
P
 
P
T
 
S
F
x
R
E
 
E
A
 
A
T
 
A
Q
 
K
Q
 
E
M
 
L
M
 
M
A
 
E
H
 
S
P
 
A
L
 
D
I
 
V
A
 
V
V
 
I
L
 
A
A
 
-
I
 
-
T
 
T
G
 
G
G
 
G
P
 
A
G
|
G
I
x
R
V
 
V
A
 
K
M
 
A
G
 
A
M
 
Y
K
 
S
S
 
S
G
 
G
K
 
R
K
 
P
V
 
A
I
 
Y
G
 
G
A
 
V
G
 
G
A
 
P
G
 
G
N
 
N
P
 
S
P
 
Q
C
 
V
I
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
K
T
 
G
A
 
Y
D
 
D
L
 
Y
V
 
N
K
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
Q
D
 
D
I
 
I
I
 
I
S
 
T
G
 
G
A
 
R
A
 
K
F
 
Y
D
 
D
Y
 
N
N
 
G
L
 
I
P
x
I
C
|
C
I
x
S
A
 
S
E
 
E
K
 
Q
S
 
S
L
 
V
I
 
I
V
 
A
V
 
P
A
 
A
S
 
E
V
 
D
A
 
Y
D
 
D
R
 
K
L
 
V
I
 
I
Q
 
A
Q
 
A
M
 
F
Q
 
V
D
 
E
F
 
N
D
 
G
A
 
A
L
 
F
L
 
Y
L
 
V
S
 
E
P
 
D
Q
 
E
E
 
E
T
 
T
-
 
V
D
 
E
T
 
K
L
 
F
R
 
R
A
 
S
V
 
T
C
 
L
L
 
F
P
 
K
D
 
D
G
 
G
A
 
K
A
 
I
N
 
N
K
 
S
K
 
K
L
 
I
V
 
I
G
 
G
K
 
K
S
 
S
P
 
V
A
 
Q
E
 
I
L
 
I
L
 
A
A
 
D
A
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
K
V
 
V
P
 
P
S
 
E
R
 
G
P
 
T
P
 
K
R
 
V
L
 
I
L
 
V
I
 
L
A
 
K
E
 
G
V
 
K
Q
 
G
A
 
A
N
 
G
D
 
E
P
 
K
W
 
D
V
 
V
T
 
L
C
 
C
-
 
K
E
 
E
Q
 
K
L
 
M
M
 
C
P
 
P
V
 
V
L
 
L
P
 
V
I
 
A
V
 
L
R
 
K
V
 
Y
A
 
D
D
 
T
F
 
F
D
 
E
S
 
E
A
 
A
-
 
V
-
 
E
L
 
I
A
 
A
L
 
M
A
 
A
L
 
N
R
 
Y
V
 
M
E
 
Y
E
 
E
G
 
G
L
 
A
H
 
G
H
 
H
T
 
T
A
 
A
I
 
G
M
 
I
H
 
H
S
 
S
Q
 
D
N
 
N
V
 
D
S
 
E
R
 
N
L
 
I
N
 
R
L
 
Y
A
 
A
A
 
G
R
 
T
T
 
V
L
 
L
Q
 
P
T
 
I
S
 
S
I
 
R
F
 
L
V
 
V
K
 
V
N
 
N
G
 
Q
P
 
P
S
 
A
Y
x
T
A
 
T
G
 
A
I
x
G
G
 
G
V
 
S
G
 
F
G
 
N
E
 
N
G
 
G
F
 
F
T
 
N
T
 
P
F
 
T
T
|
T

Sites not aligning to the query:

8cejA Succinyl-coa reductase from clostridium kluyveri (sucd) with mesaconyl-c1-coa (see paper)
30% identity, 81% coverage: 59:431/461 of query aligns to 28:405/449 of 8cejA

query
sites
8cejA
I
 
L
I
 
V
S
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
G
E
 
K
T
 
V
L
 
V
A
 
Y
P
 
D
E
 
N
L
 
A
V
 
E
T
 
M
L
 
F
A
 
A
E
 
K
E
 
E
S
 
A
A
 
V
T
 
E
E
 
E
T
 
T
G
 
E
M
 
M
G
 
G
N
 
V
K
 
Y
E
 
E
D
 
D
K
 
K
-
 
V
-
 
A
-
 
K
-
 
C
Y
 
H
L
 
L
K
|
K
N
 
S
K
 
G
A
 
A
A
 
I
L
 
W
E
 
N
N
 
H
T
 
-
P
 
-
G
 
-
I
 
I
E
 
K
D
 
D
L
 
K
T
 
K
T
 
T
S
 
V
A
 
G
L
 
I
T
 
I
G
 
K
D
 
E
G
 
E
-
 
P
-
 
E
G
 
R
M
 
A
V
 
L
L
 
V
F
 
Y
E
 
V
Y
 
A
S
 
K
P
 
P
F
 
K
G
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
A
A
 
A
V
 
T
A
 
T
P
 
P
S
 
I
T
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
V
E
 
V
T
 
T
I
 
P
I
 
M
N
 
C
N
 
N
S
 
A
I
 
M
S
 
A
M
 
A
L
 
I
A
 
K
A
 
G
G
 
R
N
 
N
S
 
T
V
 
I
Y
 
I
F
 
V
S
 
A
P
 
P
H
 
H
P
 
P
G
 
K
A
 
A
K
 
K
K
 
K
V
 
V
S
 
S
L
 
A
T
 
H
L
 
T
I
 
V
A
 
E
R
 
L
I
 
M
E
 
N
E
 
A
I
 
E
A
 
L
Y
 
K
R
 
K
C
 
L
S
 
G
G
 
A
I
 
P
R
 
E
N
 
N
L
 
I
V
 
I
V
 
Q
T
 
I
V
 
V
A
 
E
E
 
A
P
 
P
T
 
S
F
 
R
E
 
E
A
 
A
T
 
A
Q
 
K
Q
 
E
M
 
L
M
 
M
A
 
E
H
 
S
P
 
A
L
 
D
I
 
V
A
 
V
V
 
I
L
 
A
A
 
-
I
 
-
T
 
T
G
 
G
G
 
G
P
 
A
G
 
G
I
 
R
V
 
V
A
 
K
M
 
A
G
 
A
M
 
Y
K
 
S
S
 
S
G
 
G
K
 
R
K
 
P
V
 
A
I
 
Y
G
 
G
A
 
V
G
 
G
A
 
P
G
 
G
N
 
N
P
 
S
P
 
Q
C
 
V
I
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
K
T
 
G
A
 
Y
D
 
D
L
 
Y
V
 
N
K
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
Q
D
 
D
I
 
I
I
 
I
S
 
T
G
 
G
A
 
R
A
 
K
F
 
Y
D
 
D
Y
 
N
N
 
G
L
 
I
P
 
I
C
|
C
I
x
S
A
 
S
E
 
E
K
 
Q
S
 
S
L
 
V
I
 
I
V
 
A
V
 
P
A
 
A
S
 
E
V
 
D
A
 
Y
D
 
D
R
 
K
L
 
V
I
 
I
Q
 
A
Q
 
A
M
 
F
Q
 
V
D
 
E
F
 
N
D
 
G
A
 
A
L
 
F
L
 
Y
L
 
V
S
 
E
P
 
D
Q
 
E
E
 
E
T
 
T
-
 
V
D
 
E
T
 
K
L
 
F
R
 
R
A
 
S
V
 
T
C
 
L
L
 
F
P
 
K
D
 
D
G
 
G
A
 
K
A
 
I
N
 
N
K
 
S
K
 
K
L
 
I
V
 
I
G
 
G
K
 
K
S
 
S
P
 
V
A
 
Q
E
 
I
L
 
I
L
 
A
A
 
D
A
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
K
V
 
V
P
 
P
S
 
E
R
 
G
P
 
T
P
 
K
R
 
V
L
 
I
L
 
V
I
 
L
A
 
K
E
 
G
V
 
K
Q
 
G
A
 
A
N
 
G
D
 
E
P
 
K
W
 
D
V
 
V
T
 
L
C
 
C
-
 
K
E
 
E
Q
 
K
L
 
M
M
 
C
P
 
P
V
 
V
L
 
L
P
 
V
I
 
A
V
 
L
R
 
K
V
 
Y
A
 
D
D
 
T
F
 
F
D
 
E
S
 
E
A
 
A
-
 
V
-
 
E
L
 
I
A
 
A
L
 
M
A
 
A
L
 
N
R
 
Y
V
 
M
E
 
Y
E
 
E
G
 
G
L
 
A
H
 
G
H
 
H
T
 
T
A
 
A
I
 
G
M
 
I
H
 
H
S
 
S
Q
 
D
N
 
N
V
 
D
S
 
E
R
 
N
L
 
I
N
 
R
L
 
Y
A
 
A
A
 
G
R
 
T
T
 
V
L
 
L
Q
 
P
T
 
I
S
 
S
I
 
R
F
 
L
V
 
V
K
 
V
N
 
N
G
 
Q
P
 
P
S
 
A
Y
 
T
A
 
T
G
 
A
I
x
G
G
 
G
V
 
S
G
 
F
G
 
N
E
 
N
G
 
G
F
 
F
T
 
N
T
 
P
F
 
T
T
|
T

Sites not aligning to the query:

P43353 Aldehyde dehydrogenase family 3 member B1; Aldehyde dehydrogenase 7; Long-chain fatty aldehyde dehydrogenase; Medium-chain fatty aldehyde dehydrogenase; EC 1.2.1.28; EC 1.2.1.5; EC 1.2.1.7; EC 1.2.1.48 from Homo sapiens (Human) (see paper)
25% identity, 72% coverage: 125:454/461 of query aligns to 104:430/468 of P43353

query
sites
P43353
P
 
P
F
 
F
G
 
G
V
 
L
I
 
V
G
 
L
A
 
I
V
 
I
A
 
A
P
 
P
S
 
W
T
 
N
N
 
Y
P
 
P
T
 
L
E
 
N
T
 
L
I
 
T
I
 
L
N
 
V
N
 
P
S
 
L
I
 
V
S
 
G
M
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
N
S
 
C
V
 
V
Y
 
V
F
 
L
S
 
K
P
 
P
H
 
S
P
 
E
G
 
I
A
 
S
K
 
K
K
 
N
V
 
V
S
 
E
L
 
K
T
 
I
L
 
L
I
 
A
A
 
E
R
 
V
I
 
L
-
 
P
E
 
Q
E
 
Y
I
 
V
A
 
D
Y
 
Q
R
 
S
C
 
C
S
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
-
N
 
-
L
 
F
V
 
A
V
 
V
T
 
V
V
 
L
A
 
G
E
 
G
P
 
P
T
 
-
F
 
-
E
 
Q
A
 
E
T
 
T
Q
 
G
Q
 
Q
M
 
L
M
 
L
A
 
E
H
 
H
P
 
R
L
 
F
I
 
D
A
 
Y
V
 
I
L
 
F
A
 
-
I
 
F
T
 
T
G
 
G
G
 
S
P
 
P
G
 
R
I
 
V
V
 
G
A
 
K
M
 
I
G
 
V
M
 
M
K
 
T
S
 
A
G
 
A
K
 
A
K
 
K
-
 
H
-
 
L
-
 
T
-
 
P
V
 
V
I
 
T
G
 
L
A
 
E
G
 
L
A
 
G
G
 
G
N
 
K
P
 
N
P
 
P
C
 
C
I
 
Y
V
 
V
D
 
D
E
 
D
T
 
N
A
 
C
D
 
D
L
 
P
V
 
Q
K
 
T
A
 
V
A
 
A
E
 
N
D
 
R
I
 
V
I
 
A
S
 
W
G
 
F
A
 
R
A
 
Y
F
 
F
D
 
N
Y
 
A
N
 
G
L
 
Q
P
 
T
C
 
C
I
 
V
A
 
A
E
 
P
K
 
D
S
 
Y
L
 
V
I
 
L
V
 
C
V
 
S
A
 
P
S
 
E
V
 
M
A
 
Q
D
 
E
R
 
R
L
 
L
I
 
L
Q
 
P
Q
 
A
M
 
L
Q
 
Q
D
 
S
F
 
T
D
 
I
A
 
T
L
 
R
L
 
F
L
 
Y
-
 
G
-
 
D
S
 
D
P
 
P
Q
 
Q
E
 
S
T
 
S
D
 
P
T
 
N
L
 
L
R
 
G
A
 
R
V
 
I
C
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
I
N
 
N
K
 
Q
K
 
K
L
 
Q
V
 
F
G
 
Q
K
 
R
S
 
L
P
 
R
A
 
A
E
 
-
L
 
L
L
 
L
A
 
G
A
 
C
A
 
G
G
 
R
L
 
V
A
 
A
V
 
I
P
 
G
S
 
G
R
 
Q
P
 
S
-
 
D
-
 
E
-
 
S
-
 
D
-
 
R
-
 
Y
-
 
I
-
 
A
P
 
P
R
 
T
L
 
V
L
 
L
I
 
V
A
 
-
E
 
D
V
 
V
Q
 
Q
A
 
E
N
 
M
D
 
E
P
 
P
W
 
V
V
 
M
T
 
Q
C
 
E
E
 
E
Q
 
I
L
 
F
M
 
G
P
 
P
V
 
I
L
 
L
P
 
P
I
 
I
V
 
V
R
 
N
V
 
V
A
 
Q
D
 
S
F
 
L
D
 
D
S
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
E
L
 
F
A
 
I
L
 
N
R
 
R
V
 
R
E
 
E
E
 
K
G
 
P
L
 
L
H
 
A
H
 
L
T
 
Y
A
 
A
I
 
F
M
 
S
H
 
N
S
 
S
Q
 
S
N
 
Q
V
 
V
S
 
V
R
 
K
L
 
R
N
 
V
L
 
L
A
 
T
A
 
-
R
 
-
T
 
-
L
 
-
Q
 
Q
T
 
T
S
 
S
I
 
-
F
 
-
V
 
-
K
 
-
N
 
-
G
 
-
P
 
-
S
 
-
Y
 
-
A
 
S
G
 
G
I
 
G
G
 
F
V
 
C
G
 
G
G
 
N
E
 
D
G
 
G
F
 
F
T
 
M
T
 
H
F
 
M
T
 
T
I
 
L
A
 
A
T
 
S
-
 
L
P
 
P
T
 
F
G
 
G
-
 
G
-
 
V
-
 
G
-
 
A
-
 
S
-
 
G
-
 
M
-
 
G
-
 
R
-
 
Y
E
 
H
G
 
G
T
 
K
T
 
F
S
 
S
A
 
F
R
 
D
T
 
T
F
 
F
A
 
S
R
 
H
L
 
H
R
 
R
R
 
A
C
 
C
V
 
L
L
 
L

Sites not aligning to the query:

J3QMK6 Aldehyde dehydrogenase family 3 member B3; EC 1.2.1.3 from Mus musculus (Mouse) (see paper)
23% identity, 80% coverage: 86:455/461 of query aligns to 82:444/479 of J3QMK6

query
sites
J3QMK6
N
 
N
K
 
E
E
 
V
D
 
D
K
 
L
Y
 
A
L
 
L
K
 
K
N
 
N
-
 
L
K
 
Q
A
 
T
A
 
W
L
 
M
E
 
K
N
 
D
T
 
E
P
 
P
G
 
V
I
 
S
E
 
T
D
 
N
L
 
L
T
 
L
T
 
T
S
 
K
A
 
L
L
 
S
T
 
T
G
 
-
D
 
-
G
 
-
G
 
-
M
 
-
V
 
A
L
 
F
F
 
I
E
 
R
Y
 
K
S
 
E
P
 
P
F
 
F
G
 
G
V
 
L
I
 
V
G
 
L
A
 
I
V
 
I
A
 
A
P
 
P
S
 
W
T
 
N
N
 
Y
P
 
P
T
 
V
E
 
N
T
 
L
I
 
M
I
 
I
N
 
I
N
 
P
S
 
L
I
 
V
S
 
G
M
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
N
S
 
C
V
 
V
Y
 
V
F
 
L
S
 
K
P
 
P
H
 
S
P
 
E
G
 
I
A
 
S
K
 
K
K
 
N
V
 
T
S
 
E
L
 
K
T
 
V
L
 
L
I
 
A
A
 
E
R
 
L
I
 
L
-
 
P
E
 
Q
E
 
Y
I
 
L
A
 
D
Y
 
Q
R
 
S
C
 
C
S
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
-
N
 
-
L
 
F
V
 
A
V
 
V
T
 
M
V
 
L
A
 
G
E
 
G
P
 
P
T
 
-
F
 
-
E
 
E
A
 
E
T
 
T
Q
 
G
Q
 
Q
M
 
L
M
 
L
A
 
E
H
 
H
P
 
K
L
 
F
I
 
D
A
 
Y
V
 
I
L
 
F
A
 
-
I
 
F
T
 
T
G
 
G
G
 
S
P
 
P
G
 
R
I
 
V
V
 
G
A
 
K
M
 
I
G
 
V
M
 
M
K
 
T
S
 
A
G
 
A
K
 
A
K
 
K
-
 
H
-
 
L
-
 
T
-
 
P
V
 
I
I
 
T
G
 
L
A
 
E
G
 
L
A
 
G
G
 
G
N
 
K
P
 
N
P
 
P
C
 
C
I
 
Y
V
 
V
D
 
D
E
 
D
T
 
N
A
 
C
D
 
D
L
 
P
V
 
Q
K
 
T
A
 
V
A
 
A
E
 
N
D
 
R
I
 
V
I
 
A
S
 
W
G
 
F
A
 
R
A
 
Y
F
 
F
D
 
N
Y
 
A
N
 
G
L
 
Q
P
 
T
C
 
C
I
 
V
A
 
A
E
 
P
K
 
D
S
 
Y
L
 
I
I
 
L
V
 
C
V
 
S
A
 
Q
S
 
E
V
 
M
A
 
Q
D
 
E
R
 
Q
L
 
L
I
 
V
Q
 
P
Q
 
A
M
 
L
Q
 
Q
D
 
N
F
 
A
D
 
I
A
 
T
L
 
R
L
 
F
L
 
Y
-
 
G
-
 
D
S
 
N
P
 
P
Q
 
Q
E
 
T
T
 
S
D
 
P
T
 
N
L
 
L
R
 
G
A
 
R
V
 
I
C
 
I
L
 
-
P
 
-
D
 
N
G
 
Q
A
 
K
A
 
H
N
 
F
K
 
K
K
 
R
L
 
L
V
 
Q
G
 
G
K
 
-
S
 
-
P
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
L
L
 
L
A
 
G
A
 
C
A
 
G
G
 
R
L
 
V
A
 
A
V
 
I
P
 
G
S
 
G
R
 
Q
P
 
S
-
 
D
-
 
E
-
 
G
-
 
E
-
 
R
-
 
Y
-
 
I
-
 
A
P
 
P
R
 
T
L
 
V
L
 
L
I
 
V
A
 
-
E
 
D
V
 
V
Q
 
Q
A
 
E
N
 
T
D
 
E
P
 
P
W
 
V
V
 
M
T
 
Q
C
 
E
E
 
E
Q
 
I
L
 
F
M
 
G
P
 
P
V
 
I
L
 
L
P
 
P
I
 
L
V
 
V
R
 
T
V
 
V
A
 
R
D
 
S
F
 
L
D
 
D
S
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
E
L
 
F
A
 
M
L
 
N
R
 
Q
V
 
R
E
 
E
E
 
K
G
 
P
L
 
L
H
 
A
H
 
L
T
 
Y
A
 
A
I
 
Y
M
 
S
H
 
N
S
 
N
Q
 
A
N
 
E
V
 
V
S
 
I
R
 
K
L
 
-
N
 
Q
L
 
V
A
 
L
A
 
A
R
 
R
T
 
T
L
 
S
Q
 
S
T
 
G
S
 
G
I
 
F
F
 
C
V
 
G
K
 
N
N
 
D
G
 
G
P
 
F
S
 
M
Y
 
Y
A
 
M
G
 
T
I
 
L
-
 
S
-
 
S
-
 
L
-
 
P
-
 
F
-
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
G
 
S
E
 
S
G
 
G
F
 
M
T
 
G
T
 
R
F
 
Y
T
 
-
I
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
-
T
 
-
G
 
-
E
 
H
G
 
G
T
 
K
T
 
F
S
 
S
A
 
F
R
 
D
T
 
T
F
 
F
A
 
S
R
 
N
L
 
Q
R
 
R
R
 
A
C
 
C
V
 
L
L
 
L
T
 
S

Sites not aligning to the query:

7uyyA The crystal structure of the pseudomonas aeruginosa aldehyde dehydrogenase encoded by the pa4189 gene in complex with nadh (see paper)
26% identity, 63% coverage: 109:397/461 of query aligns to 142:443/496 of 7uyyA

query
sites
7uyyA
T
 
S
S
 
T
A
 
A
L
 
P
T
 
V
G
 
G
D
 
S
G
 
A
G
 
A
M
 
L
V
 
A
L
 
M
F
 
V
E
 
V
Y
 
R
S
 
E
P
 
P
F
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
A
 
L
V
|
V
A
x
L
P
|
P
S
x
W
T
 
N
N
 
F
P
 
P
T
 
L
E
 
L
T
 
M
I
 
L
I
 
A
N
 
W
N
 
K
S
 
I
I
 
G
S
 
P
M
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
C
S
 
S
V
 
V
Y
 
V
F
 
V
S
x
K
P
 
P
H
 
A
P
 
P
G
 
-
A
 
-
K
 
-
K
 
E
V
 
T
S
 
S
L
 
L
T
 
T
L
 
A
I
 
L
A
 
-
R
 
R
I
 
V
E
 
A
E
 
E
I
 
L
A
 
A
Y
 
S
R
 
Q
C
 
A
-
 
G
-
 
I
-
 
P
S
 
A
G
 
G
I
 
V
R
 
F
N
 
N
L
 
V
V
 
V
V
 
P
T
 
G
V
 
G
A
x
G
E
 
R
P
 
-
T
 
-
F
 
-
E
 
E
A
 
A
T
x
G
Q
 
E
Q
 
P
M
 
L
M
 
G
A
 
R
H
 
H
P
 
P
L
 
D
I
 
V
A
 
A
V
 
M
L
 
V
A
 
S
I
x
F
T
 
T
G
|
G
G
x
S
P
 
T
G
 
A
I
x
T
V
 
G
A
 
R
M
x
L
G
x
F
M
 
L
K
 
K
S
x
Y
G
 
A
-
 
A
-
 
E
-
 
S
-
 
N
-
 
L
-
 
K
K
 
R
K
 
V
V
 
V
I
 
L
G
 
E
A
x
C
G
|
G
A
 
G
G
 
K
N
 
N
P
 
P
P
 
A
C
 
V
I
 
V
V
 
M
D
 
N
E
 
D
T
 
V
A
 
E
D
 
D
L
 
L
V
 
D
K
 
L
A
 
V
A
 
A
E
 
Q
D
 
H
I
 
V
I
 
V
S
 
N
G
 
G
A
 
A
A
 
F
F
 
W
D
 
N
Y
 
M
N
 
G
L
 
E
P
 
N
C
|
C
I
 
S
A
 
A
E
 
S
K
 
S
S
 
R
L
 
L
I
 
I
V
 
V
V
 
H
A
 
A
S
 
E
V
 
V
A
 
R
D
 
E
R
 
A
L
 
L
I
 
L
Q
 
E
-
 
R
-
 
I
-
 
G
-
 
A
Q
 
Q
M
 
L
Q
 
R
D
 
E
F
 
W
-
 
R
-
 
M
-
 
G
D
 
D
A
 
P
L
 
L
-
 
D
-
 
P
-
 
R
-
 
N
-
 
R
-
 
L
-
 
G
-
 
A
L
 
L
L
 
V
S
 
S
P
 
P
Q
 
A
E
x
H
T
 
F
D
 
E
T
x
K
L
 
V
R
 
R
A
 
A
V
 
Y
C
 
L
L
 
-
P
 
-
D
 
D
G
 
Q
A
 
A
A
 
R
N
 
T
K
 
E
K
 
R
L
 
L
V
 
A
-
 
V
-
 
R
-
 
F
-
 
G
G
 
G
K
 
A
S
 
T
P
 
E
A
 
A
E
 
G
L
 
I
L
 
F
A
 
V
A
 
E
A
 
P
G
 
T
L
 
V
A
 
V
V
 
D
P
 
G
S
 
V
R
 
S
P
 
P
P
 
H
R
 
S
L
 
R
L
 
L
I
 
F
A
 
R
E
 
E
V
 
-
Q
 
-
A
 
-
N
 
-
D
 
-
P
 
-
W
 
-
V
 
-
T
 
-
C
 
-
E
 
E
Q
 
I
L
x
F
M
 
G
P
 
P
V
 
L
L
 
L
P
 
S
I
 
V
V
 
T
R
 
S
V
 
F
A
 
D
D
 
D
F
 
I
D
 
D
S
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
N
R
 
D
V
 
T
E
 
V
E
 
Y
G
 
G
L
 
L
H
 
A
H
 
A
T
 
S
A
 
A
-
 
Y
-
 
T
-
 
G
-
 
S
I
 
L
M
 
R
H
 
H
S
 
A
Q
 
L
N
 
R
V
 
L
S
 
S
R
 
R

Query Sequence

>WP_012967296.1 NCBI__GCF_000025465.1:WP_012967296.1
MNTAELETLIRTILSEKLAPAPVSQEQQGIFRDVGSAIDAAHQAFLRYQQCPLKTRSAII
SALRETLAPELVTLAEESATETGMGNKEDKYLKNKAALENTPGIEDLTTSALTGDGGMVL
FEYSPFGVIGAVAPSTNPTETIINNSISMLAAGNSVYFSPHPGAKKVSLTLIARIEEIAY
RCSGIRNLVVTVAEPTFEATQQMMAHPLIAVLAITGGPGIVAMGMKSGKKVIGAGAGNPP
CIVDETADLVKAAEDIISGAAFDYNLPCIAEKSLIVVASVADRLIQQMQDFDALLLSPQE
TDTLRAVCLPDGAANKKLVGKSPAELLAAAGLAVPSRPPRLLIAEVQANDPWVTCEQLMP
VLPIVRVADFDSALALALRVEEGLHHTAIMHSQNVSRLNLAARTLQTSIFVKNGPSYAGI
GVGGEGFTTFTIATPTGEGTTSARTFARLRRCVLTNGFSIR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory