SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012968101.1 NCBI__GCF_000025465.1:WP_012968101.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2azqA Crystal structure of catechol 1,2-dioxygenase from pseudomonas arvilla c-1 (see paper)
61% identity, 96% coverage: 11:306/308 of query aligns to 9:305/309 of 2azqA

query
sites
2azqA
V
 
I
Q
 
Q
K
 
A
L
 
F
L
 
F
R
 
N
E
 
Q
G
 
V
A
 
A
G
 
G
L
 
L
N
 
D
V
 
H
P
 
A
G
 
E
G
 
G
N
 
K
E
 
P
R
 
R
F
 
F
K
 
K
A
 
Q
I
 
I
V
 
I
H
 
L
R
 
R
L
 
V
L
 
L
E
 
Q
N
 
D
I
 
T
C
 
A
T
 
R
L
 
L
I
 
I
D
 
E
D
 
D
Y
 
L
N
 
E
V
 
I
T
 
T
E
 
E
E
 
D
E
 
E
F
 
F
W
 
W
H
 
H
A
 
A
V
 
V
N
 
D
Y
 
Y
L
 
L
H
 
N
E
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
R
Q
 
N
E
 
E
A
 
A
A
 
G
L
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
I
E
 
E
H
 
H
F
 
F
L
 
L
D
 
D
L
 
L
R
 
L
Q
 
Q
D
 
D
A
 
A
I
 
K
D
 
D
A
 
A
A
 
E
A
 
A
R
 
G
R
 
L
E
 
G
T
 
G
G
 
G
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
N
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
L
A
 
A
D
 
Q
S
 
G
H
 
E
A
 
V
R
 
R
M
 
M
D
 
D
D
 
D
G
 
G
T
 
T
D
 
D
A
 
P
G
 
G
E
 
V
V
 
V
M
 
M
W
 
F
L
 
L
H
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
K
 
F
D
 
D
N
 
A
Q
 
N
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
I
 
L
A
 
A
N
 
G
A
 
A
I
 
T
V
 
V
D
 
D
I
 
L
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
N
T
 
T
L
 
Q
G
 
G
N
 
T
Y
|
Y
S
 
S
F
 
Y
F
 
F
D
 
D
K
 
S
S
 
T
Q
 
Q
S
 
S
D
 
E
Y
 
F
N
 
N
L
 
L
R
 
R
R
 
R
R
 
R
I
 
I
R
 
I
T
 
T
G
 
D
A
 
A
D
 
E
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
S
 
R
V
 
A
R
 
R
S
 
S
I
 
I
M
 
V
P
 
P
S
 
S
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
C
 
C
P
 
D
P
 
P
D
 
Q
G
 
G
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
K
 
E
L
 
C
L
 
L
D
 
D
Q
 
L
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
G
N
 
Q
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
V
H
|
H
F
 
F
F
 
F
V
 
I
S
 
S
A
 
A
P
 
F
G
 
G
H
 
H
K
 
R
H
 
H
L
 
L
T
 
T
S
 
T
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
L
 
F
S
 
A
G
 
G
D
 
D
K
 
K
Y
 
Y
L
 
L
W
 
W
D
 
D
D
 
D
F
 
F
A
 
A
F
 
Y
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
G
L
 
L
I
 
I
A
 
G
D
 
E
P
 
L
V
 
R
K
 
F
V
 
V
T
 
E
D
 
D
R
 
A
E
 
A
T
 
A
I
 
A
A
 
R
Q
 
D
R
 
R
D
 
G
L
 
V
E
 
Q
G
 
G
E
 
E
H
 
R
-
 
F
T
 
A
E
 
E
V
 
L
C
 
S
F
 
F
D
 
D
F
 
F
T
 
R
L
 
L
C
 
Q
K
 
G
A
 
A
L
 
Q
N
 
S
A
 
P
D
 
D
E
 
A
E
 
E
H
 
A
R
 
R
G
 
S
T
 
H
R
 
R
L
 
P
R
 
R
A
 
A

P07773 Catechol 1,2-dioxygenase; 1,2-CTD; EC 1.13.11.1 from Acinetobacter baylyi (strain ATCC 33305 / BD413 / ADP1) (see paper)
54% identity, 96% coverage: 1:295/308 of query aligns to 1:298/311 of P07773

query
sites
P07773
M
 
M
S
 
E
N
 
V
A
 
K
F
 
I
V
 
F
Q
 
N
Q
 
T
E
 
Q
A
 
D
V
 
V
Q
 
Q
K
 
D
L
 
F
L
 
L
R
 
R
E
 
V
G
 
A
A
 
S
G
 
G
L
 
L
N
 
E
V
 
Q
P
 
E
G
 
G
G
 
G
N
 
N
E
 
P
R
 
R
F
 
V
K
 
K
A
 
Q
I
 
I
V
 
I
H
 
H
R
 
R
L
 
V
L
 
L
E
 
S
N
 
D
I
 
L
C
 
Y
T
 
K
L
 
A
I
 
I
D
 
E
D
 
D
Y
 
L
N
 
N
V
 
I
T
 
T
E
 
S
E
 
D
E
 
E
F
 
Y
W
 
W
H
 
A
A
 
G
V
 
V
N
 
A
Y
 
Y
L
 
L
H
 
N
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
G
 
A
R
 
N
Q
 
Q
E
 
E
A
 
A
A
 
G
L
 
L
L
 
L
A
 
S
A
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
F
E
 
D
H
 
H
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
L
 
M
R
 
R
Q
 
M
D
 
D
A
 
A
I
 
E
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
L
R
 
G
R
 
I
E
 
E
T
 
N
G
 
A
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
N
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
E
A
 
S
D
 
V
S
 
G
H
 
Y
A
 
A
R
 
R
M
 
M
D
 
D
D
 
D
G
 
G
T
 
S
D
 
D
A
 
P
-
 
N
G
 
G
E
 
H
V
 
T
M
 
L
W
 
I
L
 
L
H
 
H
G
 
G
Q
 
T
V
 
I
K
 
F
D
 
D
N
 
A
Q
 
D
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
I
 
L
A
 
P
N
 
N
A
 
A
I
 
K
V
 
V
D
 
E
I
 
I
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
N
T
 
T
L
 
K
G
 
G
N
 
F
Y
|
Y
S
 
S
F
 
H
F
 
F
D
 
D
K
 
P
S
 
T
-
 
G
-
 
E
Q
 
Q
S
 
Q
D
 
A
Y
 
F
N
 
N
L
 
M
R
 
R
R
 
R
R
 
S
I
 
I
R
 
I
T
 
T
G
 
D
A
 
E
D
 
N
G
 
G
R
 
Q
Y
 
Y
S
 
R
V
 
V
R
 
R
S
 
T
I
 
I
M
 
L
P
 
P
S
 
A
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
C
 
C
P
 
P
P
 
P
D
 
E
G
 
G
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
D
 
N
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
G
N
 
N
R
 
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
|
I
H
|
H
F
 
Y
F
 
F
V
 
V
S
 
S
A
 
A
P
 
D
G
 
G
H
 
H
K
 
R
H
 
K
L
 
L
T
 
T
S
 
T
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
L
 
V
S
 
A
G
 
G
D
 
D
K
 
P
Y
 
Y
L
 
T
W
 
Y
D
 
D
D
 
D
F
 
F
A
 
A
F
 
Y
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
E
G
 
G
L
 
L
I
 
V
A
 
V
D
 
D
P
 
A
V
 
V
K
 
E
V
 
H
T
 
T
D
 
D
R
 
P
E
 
E
T
 
A
I
 
I
A
 
K
Q
 
A
R
 
N
D
 
D
L
 
V
E
 
E
G
 
G
E
 
P
H
 
F
T
 
A
E
 
E
V
 
M
C
 
V
F
 
F
D
 
D
F
 
L
T
 
K
L
 
L
C
 
T
K
 
R
A
 
L
L
 
V
N
 
D
A
 
G

1dmhA Structure of catechol 1,2-dioxygenase from acinetobacter sp. Adp1 with bound 4-methylcatechol (see paper)
55% identity, 93% coverage: 11:295/308 of query aligns to 9:296/309 of 1dmhA

query
sites
1dmhA
V
 
V
Q
 
Q
K
 
D
L
 
F
L
 
L
R
 
R
E
 
V
G
 
A
A
 
S
G
 
G
L
 
L
N
 
E
V
 
Q
P
 
E
G
 
G
G
 
G
N
 
N
E
 
P
R
 
R
F
 
V
K
 
K
A
 
Q
I
 
I
V
 
I
H
 
H
R
 
R
L
 
V
L
 
L
E
 
S
N
 
D
I
 
L
C
 
Y
T
 
K
L
 
A
I
 
I
D
 
E
D
 
D
Y
 
L
N
 
N
V
 
I
T
 
T
E
 
S
E
 
D
E
 
E
F
 
Y
W
 
W
H
 
A
A
 
G
V
 
V
N
 
A
Y
 
Y
L
 
L
H
 
N
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
G
 
A
R
 
N
Q
 
Q
E
 
E
A
 
A
A
 
G
L
|
L
L
 
L
A
 
S
A
x
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
F
E
 
D
H
 
H
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
L
 
M
R
 
R
Q
 
M
D
 
D
A
 
A
I
 
E
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
L
R
 
G
R
 
I
E
 
E
T
 
N
G
 
A
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
|
P
L
|
L
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
N
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
E
A
 
S
D
 
V
S
 
G
H
 
Y
A
 
A
R
 
R
M
 
M
D
 
D
D
 
D
G
 
G
T
 
S
D
 
D
A
 
P
-
 
N
G
 
G
E
 
H
V
 
T
M
 
L
W
 
I
L
 
L
H
 
H
G
 
G
Q
 
T
V
 
I
K
 
F
D
 
D
N
 
A
Q
 
D
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
I
 
L
A
 
P
N
 
N
A
 
A
I
 
K
V
 
V
D
 
E
I
 
I
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
N
T
 
T
L
 
K
G
 
G
N
 
F
Y
|
Y
S
 
S
F
 
H
F
 
F
D
 
D
K
 
P
S
 
T
-
 
G
-
 
E
Q
 
Q
S
 
Q
D
 
A
Y
 
F
N
 
N
L
 
M
R
 
R
R
 
R
R
 
S
I
 
I
R
 
I
T
 
T
G
 
D
A
 
E
D
 
N
G
 
G
R
 
Q
Y
 
Y
S
 
R
V
 
V
R
 
R
S
 
T
I
 
I
M
 
L
P
 
P
S
 
A
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
C
 
C
P
 
P
P
 
P
D
 
E
G
 
G
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
D
 
N
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
G
N
 
N
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
I
H
|
H
F
 
Y
F
 
F
V
 
V
S
 
S
A
 
A
P
 
D
G
 
G
H
 
H
K
 
R
H
 
K
L
 
L
T
 
T
S
 
T
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
L
 
V
S
 
A
G
 
G
D
 
D
K
 
P
Y
 
Y
L
 
T
W
 
Y
D
 
D
D
 
D
F
 
F
A
 
A
F
 
Y
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
E
G
 
G
L
 
L
I
 
V
A
 
V
D
 
D
P
 
A
V
 
V
K
 
E
V
 
H
T
 
T
D
 
D
R
 
P
E
 
E
T
 
A
I
 
I
A
 
K
Q
 
A
R
 
N
D
 
D
L
 
V
E
 
E
G
 
G
E
 
P
H
 
F
T
 
A
E
 
E
V
 
M
C
 
V
F
 
F
D
 
D
F
 
L
T
 
K
L
 
L
C
 
T
K
 
R
A
 
L
L
 
V
N
 
D
A
 
G

1dltA Structure of catechol 1,2-dioxygenase from acinetobacter sp. Adp1 with bound catechol (see paper)
55% identity, 93% coverage: 11:295/308 of query aligns to 9:296/309 of 1dltA

query
sites
1dltA
V
 
V
Q
 
Q
K
 
D
L
 
F
L
 
L
R
 
R
E
 
V
G
 
A
A
 
S
G
 
G
L
 
L
N
 
E
V
 
Q
P
 
E
G
 
G
G
 
G
N
 
N
E
 
P
R
 
R
F
 
V
K
 
K
A
 
Q
I
 
I
V
 
I
H
 
H
R
 
R
L
 
V
L
 
L
E
 
S
N
 
D
I
 
L
C
 
Y
T
 
K
L
 
A
I
 
I
D
 
E
D
 
D
Y
 
L
N
 
N
V
 
I
T
 
T
E
 
S
E
 
D
E
 
E
F
 
Y
W
 
W
H
 
A
A
 
G
V
 
V
N
 
A
Y
 
Y
L
 
L
H
 
N
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
G
 
A
R
 
N
Q
 
Q
E
 
E
A
 
A
A
 
G
L
 
L
L
 
L
A
 
S
A
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
F
E
 
D
H
 
H
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
L
 
M
R
 
R
Q
 
M
D
 
D
A
 
A
I
 
E
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
L
R
 
G
R
 
I
E
 
E
T
 
N
G
 
A
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
|
P
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
N
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
E
A
 
S
D
 
V
S
 
G
H
 
Y
A
 
A
R
 
R
M
 
M
D
 
D
D
 
D
G
 
G
T
 
S
D
 
D
A
 
P
-
 
N
G
 
G
E
 
H
V
 
T
M
 
L
W
 
I
L
 
L
H
 
H
G
 
G
Q
 
T
V
 
I
K
 
F
D
 
D
N
 
A
Q
 
D
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
I
 
L
A
 
P
N
 
N
A
 
A
I
 
K
V
 
V
D
 
E
I
 
I
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
N
T
 
T
L
 
K
G
 
G
N
 
F
Y
|
Y
S
 
S
F
 
H
F
 
F
D
 
D
K
 
P
S
 
T
-
 
G
-
 
E
Q
 
Q
S
 
Q
D
 
A
Y
 
F
N
 
N
L
 
M
R
 
R
R
 
R
R
 
S
I
 
I
R
 
I
T
 
T
G
 
D
A
 
E
D
 
N
G
 
G
R
 
Q
Y
 
Y
S
 
R
V
 
V
R
 
R
S
 
T
I
 
I
M
 
L
P
 
P
S
 
A
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
C
 
C
P
 
P
P
 
P
D
 
E
G
 
G
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
D
 
N
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
G
N
 
N
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
I
H
|
H
F
 
Y
F
 
F
V
 
V
S
 
S
A
 
A
P
 
D
G
 
G
H
 
H
K
 
R
H
 
K
L
 
L
T
 
T
S
 
T
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
L
 
V
S
 
A
G
 
G
D
 
D
K
 
P
Y
 
Y
L
 
T
W
 
Y
D
 
D
D
 
D
F
 
F
A
 
A
F
 
Y
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
E
G
 
G
L
 
L
I
 
V
A
 
V
D
 
D
P
 
A
V
 
V
K
 
E
V
 
H
T
 
T
D
 
D
R
 
P
E
 
E
T
 
A
I
 
I
A
 
K
Q
 
A
R
 
N
D
 
D
L
 
V
E
 
E
G
 
G
E
 
P
H
 
F
T
 
A
E
 
E
V
 
M
C
 
V
F
 
F
D
 
D
F
 
L
T
 
K
L
 
L
C
 
T
K
 
R
A
 
L
L
 
V
N
 
D
A
 
G

1dlmA Structure of catechol 1,2-dioxygenase from acinetobacter calcoaceticus native data (see paper)
55% identity, 93% coverage: 11:295/308 of query aligns to 9:296/309 of 1dlmA

query
sites
1dlmA
V
 
V
Q
 
Q
K
 
D
L
 
F
L
 
L
R
 
R
E
 
V
G
 
A
A
 
S
G
 
G
L
 
L
N
 
E
V
 
Q
P
 
E
G
 
G
G
 
G
N
 
N
E
 
P
R
 
R
F
 
V
K
 
K
A
 
Q
I
 
I
V
 
I
H
 
H
R
 
R
L
 
V
L
 
L
E
 
S
N
 
D
I
 
L
C
 
Y
T
 
K
L
 
A
I
 
I
D
 
E
D
 
D
Y
 
L
N
 
N
V
 
I
T
 
T
E
 
S
E
 
D
E
 
E
F
 
Y
W
 
W
H
 
A
A
 
G
V
 
V
N
 
A
Y
 
Y
L
 
L
H
 
N
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
G
 
A
R
 
N
Q
 
Q
E
 
E
A
 
A
A
 
G
L
 
L
L
 
L
A
 
S
A
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
F
E
 
D
H
 
H
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
L
 
M
R
 
R
Q
 
M
D
 
D
A
 
A
I
 
E
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
L
R
 
G
R
 
I
E
 
E
T
 
N
G
 
A
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
N
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
E
A
 
S
D
 
V
S
 
G
H
 
Y
A
 
A
R
 
R
M
 
M
D
 
D
D
 
D
G
 
G
T
 
S
D
 
D
A
 
P
-
 
N
G
 
G
E
 
H
V
 
T
M
 
L
W
 
I
L
 
L
H
 
H
G
 
G
Q
 
T
V
 
I
K
 
F
D
 
D
N
 
A
Q
 
D
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
I
 
L
A
 
P
N
 
N
A
 
A
I
 
K
V
 
V
D
 
E
I
 
I
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
N
T
 
T
L
 
K
G
 
G
N
 
F
Y
|
Y
S
 
S
F
 
H
F
 
F
D
 
D
K
 
P
S
 
T
-
 
G
-
 
E
Q
 
Q
S
 
Q
D
 
A
Y
 
F
N
 
N
L
 
M
R
 
R
R
 
R
R
 
S
I
 
I
R
 
I
T
 
T
G
 
D
A
 
E
D
 
N
G
 
G
R
 
Q
Y
 
Y
S
 
R
V
 
V
R
 
R
S
 
T
I
 
I
M
 
L
P
 
P
S
 
A
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
C
 
C
P
 
P
P
 
P
D
 
E
G
 
G
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
D
 
N
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
G
N
 
N
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
I
H
|
H
F
 
Y
F
 
F
V
 
V
S
 
S
A
 
A
P
 
D
G
 
G
H
 
H
K
 
R
H
 
K
L
 
L
T
 
T
S
 
T
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
L
 
V
S
 
A
G
 
G
D
 
D
K
 
P
Y
 
Y
L
 
T
W
 
Y
D
 
D
D
 
D
F
 
F
A
 
A
F
 
Y
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
E
G
 
G
L
 
L
I
 
V
A
 
V
D
 
D
P
 
A
V
 
V
K
 
E
V
 
H
T
 
T
D
 
D
R
 
P
E
 
E
T
 
A
I
 
I
A
 
K
Q
 
A
R
 
N
D
 
D
L
 
V
E
 
E
G
 
G
E
 
P
H
 
F
T
 
A
E
 
E
V
 
M
C
 
V
F
 
F
D
 
D
F
 
L
T
 
K
L
 
L
C
 
T
K
 
R
A
 
L
L
 
V
N
 
D
A
 
G

9draA Catechol 1,2-dioxygenase
50% identity, 96% coverage: 11:307/308 of query aligns to 9:306/308 of 9draA

query
sites
9draA
V
 
V
Q
 
Q
K
 
D
L
 
L
L
 
L
R
 
K
E
 
A
G
 
A
A
 
A
G
 
N
L
 
L
N
 
N
V
 
G
P
 
D
G
 
A
G
 
G
N
 
N
E
 
A
R
 
R
F
 
F
K
 
R
A
 
Q
I
 
I
V
 
V
H
 
H
R
 
R
L
 
L
L
 
L
E
 
S
N
 
D
I
 
L
C
 
F
T
 
K
L
 
A
I
 
I
D
 
D
D
 
D
Y
 
L
N
 
D
V
 
I
T
 
T
E
 
P
E
 
D
E
 
E
F
 
V
W
 
W
H
 
A
A
 
G
V
 
V
N
 
N
Y
 
Y
L
 
L
H
 
N
E
 
K
L
 
L
G
 
G
G
 
Q
R
 
D
Q
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
|
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
H
 
K
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
L
 
I
R
 
R
Q
 
M
D
 
D
A
 
A
I
 
A
D
 
D
A
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
G
R
 
L
E
 
D
T
 
G
G
 
G
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
|
P
L
|
L
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
N
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
V
A
 
R
D
 
D
S
 
G
H
 
V
A
 
A
R
 
K
-
 
I
-
 
D
M
 
L
D
 
D
D
 
D
G
 
D
T
 
A
D
 
D
A
 
A
G
 
G
E
 
P
V
 
L
M
 
V
W
 
-
L
 
I
H
 
R
G
 
G
Q
 
T
V
 
V
K
 
T
D
 
G
N
 
T
Q
 
D
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
I
 
L
A
 
A
N
 
G
A
 
A
I
 
L
V
 
V
D
 
E
I
 
C
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
N
T
 
S
L
 
K
G
 
G
N
 
F
Y
|
Y
S
 
S
F
 
H
F
 
F
D
 
D
K
 
P
S
 
T
-
 
G
-
 
A
Q
 
Q
S
 
T
D
 
A
Y
 
F
N
 
N
L
 
L
R
 
R
R
 
G
R
 
A
I
 
V
R
 
R
T
 
T
G
 
D
A
 
A
D
 
N
G
 
G
R
 
K
Y
 
Y
S
 
E
V
 
F
R
 
R
S
 
T
I
 
L
M
 
M
P
 
P
S
 
V
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
C
 
C
P
 
P
P
 
P
D
 
Q
G
 
G
P
 
A
T
 
T
Q
 
Q
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
D
 
N
Q
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
G
N
 
N
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
V
H
|
H
F
 
F
F
 
F
V
 
V
S
 
S
A
 
G
P
 
D
G
 
G
H
 
H
K
 
R
H
 
K
L
 
L
T
 
T
S
 
T
Q
 
Q
I
 
F
N
 
N
L
 
I
S
 
E
G
 
G
D
 
D
K
 
P
Y
 
L
L
 
I
W
 
W
D
 
D
D
 
D
F
 
F
A
 
A
F
 
Y
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
E
G
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
P
D
 
H
P
 
V
V
 
V
K
 
D
V
 
K
T
 
T
D
 
G
R
 
G
E
 
A
T
 
A
I
 
L
A
 
G
Q
 
M
R
 
K
D
 
-
L
 
-
E
 
S
G
 
D
E
 
A
H
 
Y
T
 
K
E
 
E
V
 
I
C
 
E
F
 
F
D
 
D
F
 
I
T
 
V
L
 
L
C
 
T
K
 
P
A
 
L
L
 
L
N
 
D
A
 
G
D
 
R
E
 
D
E
 
N
H
 
Q
R
 
V
G
 
V
T
 
H
R
 
R
L
 
P
R
 
R
A
 
A
K
 
S

9dr8A Crystal structure of catechol 1,2-dioxygenase from burkholderia multivorans (iron bound)
50% identity, 96% coverage: 11:307/308 of query aligns to 9:306/308 of 9dr8A

query
sites
9dr8A
V
 
V
Q
 
Q
K
 
D
L
 
L
L
 
L
R
 
K
E
 
A
G
 
A
A
 
A
G
 
N
L
 
L
N
 
N
V
 
G
P
 
D
G
 
A
G
 
G
N
 
N
E
 
A
R
 
R
F
 
F
K
 
R
A
 
Q
I
 
I
V
 
V
H
 
H
R
 
R
L
 
L
L
 
L
E
 
S
N
 
D
I
 
L
C
 
F
T
 
K
L
 
A
I
 
I
D
 
D
D
 
D
Y
 
L
N
 
D
V
 
I
T
 
T
E
 
P
E
 
D
E
 
E
F
 
V
W
 
W
H
 
A
A
 
G
V
 
V
N
 
N
Y
 
Y
L
 
L
H
 
N
E
 
K
L
 
L
G
 
G
G
 
Q
R
 
D
Q
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
H
 
K
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
L
 
I
R
 
R
Q
 
M
D
 
D
A
 
A
I
 
A
D
 
D
A
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
G
R
 
L
E
 
D
T
 
G
G
 
G
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
N
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
V
A
 
R
D
 
D
S
 
G
H
 
V
A
 
A
R
 
K
-
 
I
-
 
D
M
 
L
D
 
D
D
 
D
G
 
D
T
 
A
D
 
D
A
 
A
G
 
G
E
 
P
V
 
L
M
 
V
W
 
-
L
 
I
H
 
R
G
 
G
Q
 
T
V
 
V
K
 
T
D
 
G
N
 
T
Q
 
D
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
I
 
L
A
 
A
N
 
G
A
 
A
I
 
L
V
 
V
D
 
E
I
 
C
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
N
T
 
S
L
 
K
G
 
G
N
 
F
Y
|
Y
S
 
S
F
 
H
F
 
F
D
 
D
K
 
P
S
 
T
-
 
G
-
 
A
Q
 
Q
S
 
T
D
 
A
Y
 
F
N
 
N
L
 
L
R
 
R
R
 
G
R
 
A
I
 
V
R
 
R
T
 
T
G
 
D
A
 
A
D
 
N
G
 
G
R
 
K
Y
 
Y
S
 
E
V
 
F
R
 
R
S
 
T
I
 
L
M
 
M
P
 
P
S
 
V
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
C
 
C
P
 
P
P
 
P
D
 
Q
G
 
G
P
 
A
T
 
T
Q
 
Q
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
D
 
N
Q
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
G
N
 
N
R
 
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
V
H
|
H
F
 
F
F
 
F
V
 
V
S
 
S
A
 
G
P
 
D
G
 
G
H
 
H
K
 
R
H
 
K
L
 
L
T
 
T
S
 
T
Q
 
Q
I
 
F
N
 
N
L
 
I
S
 
E
G
 
G
D
 
D
K
 
P
Y
 
L
L
 
I
W
 
W
D
 
D
D
 
D
F
 
F
A
 
A
F
 
Y
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
E
G
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
P
D
 
H
P
 
V
V
 
V
K
 
D
V
 
K
T
 
T
D
 
G
R
 
G
E
 
A
T
 
A
I
 
L
A
 
G
Q
 
M
R
 
K
D
 
-
L
 
-
E
 
S
G
 
D
E
 
A
H
 
Y
T
 
K
E
 
E
V
 
I
C
 
E
F
 
F
D
 
D
F
 
I
T
 
V
L
 
L
C
 
T
K
 
P
A
 
L
L
 
L
N
 
D
A
 
G
D
 
R
E
 
D
E
 
N
H
 
Q
R
 
V
G
 
V
T
 
H
R
 
R
L
 
P
R
 
R
A
 
A
K
 
S

9dr5A Crystal structure of catechol 1,2-dioxygenase from burkholderia multivorans (zinc bound, p1 form)
50% identity, 96% coverage: 11:307/308 of query aligns to 10:307/310 of 9dr5A

query
sites
9dr5A
V
 
V
Q
 
Q
K
 
D
L
 
L
L
 
L
R
 
K
E
 
A
G
 
A
A
 
A
G
 
N
L
 
L
N
 
N
V
 
G
P
 
D
G
 
A
G
 
G
N
 
N
E
 
A
R
 
R
F
 
F
K
 
R
A
 
Q
I
 
I
V
 
V
H
 
H
R
 
R
L
 
L
L
 
L
E
 
S
N
 
D
I
 
L
C
 
F
T
 
K
L
 
A
I
 
I
D
 
D
D
 
D
Y
 
L
N
 
D
V
 
I
T
 
T
E
 
P
E
 
D
E
 
E
F
 
V
W
 
W
H
 
A
A
 
G
V
 
V
N
 
N
Y
 
Y
L
 
L
H
 
N
E
 
K
L
 
L
G
 
G
G
 
Q
R
 
D
Q
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
H
 
K
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
L
 
I
R
 
R
Q
 
M
D
 
D
A
 
A
I
 
A
D
 
D
A
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
G
R
 
L
E
 
D
T
 
G
G
 
G
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
N
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
V
A
 
R
D
 
D
S
 
G
H
 
V
A
 
A
R
 
K
-
 
I
-
 
D
M
 
L
D
 
D
D
 
D
G
 
D
T
 
A
D
 
D
A
 
A
G
 
G
E
 
P
V
 
L
M
 
V
W
 
-
L
 
I
H
 
R
G
 
G
Q
 
T
V
 
V
K
 
T
D
 
G
N
 
T
Q
 
D
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
I
 
L
A
 
A
N
 
G
A
 
A
I
 
L
V
 
V
D
 
E
I
 
C
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
N
T
 
S
L
 
K
G
 
G
N
 
F
Y
|
Y
S
 
S
F
 
H
F
 
F
D
 
D
K
 
P
S
 
T
-
 
G
-
 
A
Q
 
Q
S
 
T
D
 
A
Y
 
F
N
 
N
L
 
L
R
 
R
R
 
G
R
 
A
I
 
V
R
 
R
T
 
T
G
 
D
A
 
A
D
 
N
G
 
G
R
 
K
Y
 
Y
S
 
E
V
 
F
R
 
R
S
 
T
I
 
L
M
 
M
P
 
P
S
 
V
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
C
 
C
P
 
P
P
 
P
D
 
Q
G
 
G
P
 
A
T
 
T
Q
 
Q
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
D
 
N
Q
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
G
N
 
N
R
 
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
V
H
|
H
F
 
F
F
 
F
V
 
V
S
 
S
A
 
G
P
 
D
G
 
G
H
 
H
K
 
R
H
 
K
L
 
L
T
 
T
S
 
T
Q
 
Q
I
 
F
N
 
N
L
 
I
S
 
E
G
 
G
D
 
D
K
 
P
Y
 
L
L
 
I
W
 
W
D
 
D
D
 
D
F
 
F
A
 
A
F
 
Y
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
E
G
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
P
D
 
H
P
 
V
V
 
V
K
 
D
V
 
K
T
 
T
D
 
G
R
 
G
E
 
A
T
 
A
I
 
L
A
 
G
Q
 
M
R
 
K
D
 
-
L
 
-
E
 
S
G
 
D
E
 
A
H
 
Y
T
 
K
E
 
E
V
 
I
C
 
E
F
 
F
D
 
D
F
 
I
T
 
V
L
 
L
C
 
T
K
 
P
A
 
L
L
 
L
N
 
D
A
 
G
D
 
R
E
 
D
E
 
N
H
 
Q
R
 
V
G
 
V
T
 
H
R
 
R
L
 
P
R
 
R
A
 
A
K
 
S

2xsrA Crystal structure of wild type acinetobacter radioresistens catechol 1,2 dioxygenase (see paper)
53% identity, 91% coverage: 27:306/308 of query aligns to 26:307/309 of 2xsrA

query
sites
2xsrA
N
 
D
E
 
E
R
 
R
F
 
I
K
 
Q
A
 
Q
I
 
V
V
 
V
H
 
V
R
 
R
L
 
L
L
 
L
E
 
G
N
 
D
I
 
L
C
 
F
T
 
Q
L
 
A
I
 
I
D
 
E
D
 
D
Y
 
L
N
 
D
V
 
I
T
 
Q
E
 
P
E
 
S
E
 
E
F
 
V
W
 
W
H
 
K
A
 
G
V
 
L
N
 
E
Y
|
Y
L
|
L
H
 
T
E
x
D
L
 
A
G
 
G
G
 
Q
R
 
A
Q
 
N
E
 
E
A
 
L
A
 
G
L
 
L
L
 
L
A
|
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
E
H
 
H
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
L
 
L
R
 
R
Q
 
A
D
 
D
A
 
E
I
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
K
A
 
A
R
 
G
R
 
I
E
 
T
T
 
G
G
 
G
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
N
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
E
A
 
S
D
 
V
S
 
G
H
 
F
A
 
A
R
 
R
M
 
M
D
 
D
D
 
D
G
 
G
T
 
S
D
 
E
A
 
S
G
 
D
E
 
K
V
 
V
-
 
D
-
 
T
M
 
L
W
 
I
L
 
I
H
 
E
G
 
G
Q
 
T
V
 
V
K
 
T
D
 
D
N
 
T
Q
 
E
G
 
G
Q
 
N
P
 
I
I
 
I
A
 
E
N
 
G
A
 
A
I
 
K
V
 
V
D
 
E
I
 
V
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
N
T
 
S
L
 
L
G
 
G
N
 
N
Y
|
Y
S
 
S
F
 
F
F
 
F
D
 
D
K
 
K
S
 
S
Q
 
Q
S
 
S
D
 
D
Y
 
F
N
 
N
L
 
L
R
 
R
R
 
R
R
 
T
I
 
I
R
 
L
T
 
T
G
 
D
A
 
V
D
 
N
G
 
G
R
 
K
Y
 
Y
S
 
V
V
 
A
R
 
L
S
 
T
I
 
T
M
 
M
P
 
P
S
 
V
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
C
 
C
P
 
P
P
 
P
D
 
E
G
 
G
P
x
T
T
 
T
Q
 
Q
K
x
A
L
 
L
L
 
L
D
 
N
Q
 
K
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
G
N
 
N
R
 
R
P
 
P
A
 
S
H
|
H
I
 
V
H
|
H
F
 
Y
F
 
F
V
 
V
S
 
S
A
 
A
P
 
P
G
 
G
H
 
Y
K
 
R
H
 
K
L
 
L
T
 
T
S
 
T
Q
 
Q
I
 
F
N
 
N
L
 
I
S
 
E
G
 
G
D
 
D
K
 
E
Y
 
Y
L
 
L
W
 
W
D
 
D
D
 
D
F
 
F
A
 
A
F
 
F
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
G
L
 
L
I
 
V
A
 
A
D
 
T
P
 
A
V
 
T
K
 
D
V
 
V
T
 
T
D
 
D
R
 
E
E
 
A
T
 
E
I
 
I
A
 
A
Q
 
R
R
 
R
D
 
E
L
 
L
E
 
D
G
 
K
E
 
P
H
 
F
T
 
K
E
 
H
V
 
I
C
 
T
F
 
F
D
 
N
F
 
V
T
 
E
L
 
L
C
 
V
K
 
K
A
 
E
L
 
A
N
 
E
A
 
A
D
 
A
E
 
P
E
 
S
H
 
S
R
 
E
G
 
V
T
 
E
R
 
R
L
 
R
R
 
R
A
 
A

5td3A Crystal structure of catechol 1,2-dioxygenase from burkholderia vietnamiensis
51% identity, 96% coverage: 11:307/308 of query aligns to 9:306/307 of 5td3A

query
sites
5td3A
V
 
V
Q
 
Q
K
 
D
L
 
L
L
 
L
R
 
K
E
 
A
G
 
A
A
 
S
G
 
S
L
 
A
N
 
N
V
 
A
P
 
S
G
 
T
G
 
G
N
 
D
E
 
A
R
 
R
F
 
T
K
 
Q
A
 
Q
I
 
I
V
 
V
H
 
L
R
 
R
L
 
L
L
 
L
E
 
G
N
 
D
I
 
L
C
 
F
T
 
K
L
 
A
I
 
I
D
 
D
D
 
D
Y
 
L
N
 
D
V
 
I
T
 
T
E
 
P
E
 
D
E
 
E
F
 
V
W
 
W
H
 
A
A
 
G
V
 
V
N
 
N
Y
 
Y
L
 
L
H
 
N
E
 
K
L
 
L
G
 
G
G
 
Q
R
 
D
Q
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
E
H
 
K
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
L
 
I
R
 
R
Q
 
M
D
 
D
A
 
A
I
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
L
R
 
G
R
 
L
E
 
D
T
 
G
G
 
G
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
N
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
V
A
 
R
D
 
D
S
 
G
H
 
V
A
 
A
R
 
K
M
 
I
D
 
D
D
 
L
G
 
D
T
 
A
D
 
D
A
 
A
G
 
G
E
 
A
-
 
G
V
 
P
M
 
L
W
 
V
L
 
I
H
 
H
G
 
G
Q
 
T
V
 
V
K
 
K
D
 
D
N
 
L
Q
 
D
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
I
 
V
A
 
A
N
 
G
A
 
A
I
 
L
V
 
V
D
 
E
I
 
C
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
N
T
 
S
L
 
H
G
 
G
N
 
F
Y
|
Y
S
 
S
F
 
H
F
 
F
D
 
D
K
 
P
S
 
T
-
 
G
-
 
A
Q
 
Q
S
 
R
D
 
D
Y
 
F
N
 
N
L
 
L
R
 
R
R
 
G
R
 
A
I
 
V
R
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
G
R
 
T
Y
 
Y
S
 
A
V
 
F
R
 
R
S
 
T
I
 
L
M
 
M
P
 
P
S
 
V
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
C
 
C
P
 
P
P
 
P
D
 
Q
G
 
G
P
 
A
T
 
T
Q
 
Q
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
D
 
D
Q
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
G
N
 
N
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
V
H
|
H
F
 
F
F
 
F
V
 
V
S
 
T
A
 
S
P
 
D
G
 
G
H
 
H
K
 
R
H
 
K
L
 
L
T
 
T
S
 
T
Q
 
Q
I
 
F
N
 
N
L
 
I
S
 
E
G
 
G
D
 
D
K
 
P
Y
 
L
L
 
I
W
 
W
D
 
D
D
 
D
F
 
F
A
 
A
F
 
Y
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
E
G
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
P
D
 
-
P
 
-
V
 
-
K
 
P
V
 
V
T
 
T
D
 
T
R
 
K
E
 
T
T
 
G
I
 
G
A
 
A
Q
 
A
R
 
L
D
 
G
L
 
L
E
 
K
G
 
A
E
 
D
-
 
A
H
 
Y
T
 
Q
E
 
D
V
 
I
C
 
T
F
 
F
D
 
D
F
 
F
T
 
V
L
 
L
C
 
T
K
 
P
A
 
R
L
 
V
N
 
G
A
 
G
D
 
A
E
 
D
E
 
N
H
 
Q
R
 
I
G
 
V
T
 
E
R
 
R
L
 
P
R
 
R
A
 
A
K
 
S

5vxtB Crystal structure of catechol 1,2-dioxygenase from burkholderia ambifaria
49% identity, 99% coverage: 1:306/308 of query aligns to 5:309/312 of 5vxtB

query
sites
5vxtB
M
 
M
S
 
S
N
 
V
A
 
K
F
 
V
V
 
F
Q
 
D
Q
 
T
E
 
K
A
 
E
V
 
V
Q
 
Q
K
 
D
L
 
L
L
 
L
R
 
K
E
 
A
G
 
A
A
 
S
G
 
N
L
 
A
N
 
G
V
 
A
P
 
-
G
 
-
G
 
G
N
 
N
E
 
A
R
 
R
F
 
T
K
 
Q
A
 
Q
I
 
I
V
 
V
H
 
H
R
 
R
L
 
L
L
 
L
E
 
G
N
 
D
I
 
L
C
 
F
T
 
K
L
 
A
I
 
I
D
 
D
D
 
D
Y
 
L
N
 
D
V
 
I
T
 
T
E
 
P
E
 
D
E
 
E
F
 
V
W
 
W
H
 
A
A
 
G
V
 
V
N
 
N
Y
 
Y
L
 
L
H
 
N
E
 
K
L
 
L
G
 
G
G
 
Q
R
 
D
Q
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
E
H
 
K
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
L
 
I
R
 
R
Q
 
M
D
 
D
A
 
A
I
 
E
D
 
D
A
 
E
A
 
A
A
 
I
R
 
G
R
 
L
E
 
D
T
 
G
G
 
G
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
|
P
L
|
L
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
N
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
V
A
 
R
D
 
D
S
 
G
H
 
V
A
 
A
R
 
K
M
 
I
D
 
D
D
 
L
G
 
D
T
 
A
D
 
D
A
 
E
G
 
G
E
 
A
-
 
G
V
 
P
M
 
L
W
 
V
L
 
I
H
 
H
G
 
G
Q
 
T
V
 
V
K
 
T
D
 
G
N
 
L
Q
 
D
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
I
 
V
A
 
A
N
 
G
A
 
A
I
 
L
V
 
V
D
 
E
I
 
C
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
N
T
 
S
L
 
H
G
 
G
N
 
F
Y
|
Y
S
 
S
F
 
H
F
 
F
D
 
D
K
 
P
S
 
T
-
 
G
-
 
K
Q
 
Q
S
 
S
D
 
D
Y
 
F
N
 
N
L
 
L
R
 
R
R
 
G
R
 
A
I
 
V
R
 
K
T
 
T
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
G
R
 
K
Y
 
Y
S
 
E
V
 
F
R
 
R
S
 
T
I
 
L
M
 
M
P
 
P
S
 
V
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
C
 
C
P
 
P
P
 
P
D
 
Q
G
 
G
P
 
A
T
 
T
Q
 
Q
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
D
 
D
Q
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
G
N
 
N
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
V
H
|
H
F
 
F
F
 
F
V
 
V
S
 
T
A
 
S
P
 
D
G
 
G
H
 
H
K
 
R
H
 
K
L
 
L
T
 
T
S
 
T
Q
 
Q
I
 
F
N
 
N
L
 
I
S
 
E
G
 
G
D
 
D
K
 
P
Y
 
L
L
 
I
W
 
W
D
 
D
D
 
D
F
 
F
A
 
A
F
 
Y
A
 
A
T
 
T
R
 
R
D
 
E
G
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
P
D
 
-
P
 
-
V
 
-
K
 
P
V
 
V
T
 
T
D
 
A
R
 
K
E
 
A
T
 
G
I
 
G
A
 
A
Q
 
A
R
 
L
D
 
G
L
 
L
E
 
K
G
 
A
E
 
D
-
 
A
H
 
Y
T
 
Q
E
 
D
V
 
I
C
 
E
F
 
F
D
 
N
F
 
F
T
 
V
L
 
L
C
 
T
K
 
P
A
 
R
L
 
V
N
 
E
A
 
G
D
 
K
E
 
D
E
 
N
H
 
Q
R
 
I
G
 
V
T
 
E
R
 
R
L
 
L
R
 
R
A
 
A

8r2xA Crystal structure of hydroxyquinol-1,2-dioxygenase from rhodococcus jostii rha1 (rjtsdc) (see paper)
38% identity, 76% coverage: 28:260/308 of query aligns to 22:254/277 of 8r2xA

query
sites
8r2xA
E
 
D
R
 
R
F
 
A
K
 
A
A
 
V
I
 
V
V
 
M
H
 
E
R
 
S
L
 
L
L
 
V
E
 
R
N
 
H
I
 
L
C
 
H
T
 
S
L
 
F
I
 
V
D
 
K
D
 
D
Y
 
V
N
 
G
V
 
I
T
 
T
E
 
Q
E
 
A
E
 
E
F
 
W
W
 
G
H
 
L
A
 
A
V
 
I
N
 
D
Y
 
F
L
 
L
H
 
T
E
 
R
L
 
T
G
 
G
G
 
Q
-
 
I
-
 
C
-
 
G
-
 
P
-
 
E
R
 
R
Q
 
Q
E
 
E
A
 
F
A
 
I
L
 
L
L
 
L
A
 
S
A
 
D
G
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
V
E
 
S
H
 
M
F
 
L
L
 
V
D
 
D
L
 
-
R
 
-
Q
 
-
D
 
-
A
 
A
I
 
I
D
 
N
A
 
H
A
 
-
A
 
-
R
 
R
R
 
R
E
 
P
T
 
T
G
 
G
-
 
A
T
 
T
P
 
E
R
 
N
T
 
T
I
 
V
E
 
F
G
 
G
P
 
P
L
 
F
Y
 
H
V
 
V
A
 
E
N
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
I
A
 
R
D
 
Q
S
 
M
H
 
G
A
 
D
R
 
D
M
 
I
D
 
S
-
 
L
D
 
D
G
 
G
T
 
-
D
 
-
A
 
K
G
 
G
E
 
E
V
 
S
M
 
C
W
 
L
L
 
F
H
 
A
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
K
 
R
D
 
D
N
 
L
Q
 
D
G
 
G
Q
 
H
P
 
P
I
 
I
A
 
E
N
 
G
A
 
A
I
 
C
V
 
V
D
 
D
I
 
V
W
 
W
H
 
S
A
 
D
N
 
N
T
 
A
L
 
D
G
 
G
N
 
Y
Y
|
Y
S
 
D
F
 
V
F
 
Q
D
 
Q
K
 
P
S
 
D
-
 
I
Q
 
Q
S
 
P
D
 
Q
Y
 
W
N
 
N
L
 
N
R
 
R
R
 
G
R
 
R
I
 
F
R
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
S
 
L
V
 
F
R
 
R
S
 
G
I
 
I
M
 
K
P
 
P
S
 
T
G
 
A
Y
|
Y
G
 
P
C
 
I
P
 
P
P
 
D
D
 
D
G
 
G
P
 
P
T
 
V
Q
 
G
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
D
 
D
Q
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
P
N
 
Y
R
 
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
M
H
|
H
F
 
F
F
 
L
V
 
V
S
 
T
A
 
A
P
 
E
G
 
G
H
 
C
K
 
E
H
 
R
L
 
L
T
 
V
S
 
T
Q
 
H
I
 
T
N
 
F
L
 
V
S
 
E
G
 
G
D
 
D
K
 
S
Y
 
Y
L
 
L
W
 
E
D
 
S
D
 
D
F
 
A
A
 
V
F
 
F
A
 
G
T
 
V
R
 
K
D
 
E
G
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
A

2boyA Crystal structure of 3-chlorocatechol 1,2-dioxygenase from rhodococcus opacus 1cp (see paper)
29% identity, 86% coverage: 27:292/308 of query aligns to 2:253/253 of 2boyA

query
sites
2boyA
N
 
T
E
 
D
R
 
R
F
 
T
K
 
G
A
 
N
I
 
I
V
 
V
H
 
G
R
 
K
L
 
M
L
 
I
E
 
A
N
 
A
I
 
I
C
 
N
T
 
A
L
 
V
I
 
I
D
 
K
D
 
D
Y
 
E
N
 
K
V
 
V
T
 
S
E
 
Y
E
 
S
E
 
E
F
 
Y
W
 
K
H
 
A
A
 
S
V
 
T
N
 
G
Y
 
W
L
 
L
H
 
I
E
 
S
L
 
V
G
 
G
G
 
E
R
 
K
Q
 
N
E
 
E
A
 
W
A
 
P
L
|
L
L
 
F
A
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
L
E
 
D
H
 
V
F
 
F
L
 
F
D
 
E
L
 
H
R
 
A
Q
 
I
D
 
E
A
 
S
I
 
V
D
 
A
A
 
A
A
 
E
A
 
S
R
 
N
R
 
R
E
 
-
T
 
-
G
 
G
T
 
S
P
 
Q
R
 
S
T
 
S
I
 
I
E
 
Q
G
 
G
P
|
P
L
x
Y
Y
 
F
V
 
I
A
 
P
N
 
G
A
 
A
P
 
P
-
 
E
L
 
L
A
 
S
D
 
I
S
 
P
H
 
Y
A
 
T
R
 
M
M
 
P
D
 
M
D
 
R
G
 
D
T
 
D
D
 
E
A
 
S
G
 
G
E
 
D
V
 
T
M
 
L
W
 
I
L
 
F
H
 
R
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
K
 
V
D
 
D
N
 
Q
Q
 
E
G
 
G
Q
 
A
P
 
P
I
 
L
A
 
A
N
 
D
A
 
V
I
 
L
V
 
L
D
 
D
I
 
M
W
 
W
H
 
Q
A
 
A
N
 
D
T
 
A
L
 
A
G
 
G
N
 
E
Y
|
Y
S
 
S
F
 
F
F
 
I
D
 
N
K
 
P
S
 
T
Q
 
L
S
 
P
D
 
D
Y
 
Y
N
 
L
L
 
F
R
 
R
R
 
G
R
 
K
I
 
I
R
 
R
T
 
T
G
 
D
A
 
E
D
 
N
G
 
G
R
 
R
Y
 
F
S
 
T
V
 
L
R
 
R
S
 
T
I
 
I
M
 
V
P
 
P
S
 
A
G
 
P
Y
|
Y
G
 
E
C
 
I
P
 
P
P
 
K
D
 
N
G
 
G
P
 
P
T
 
T
Q
 
G
K
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
A
Q
 
A
L
 
A
G
 
G
R
 
W
H
 
H
G
 
A
N
 
W
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
L
H
|
H
F
 
W
F
 
I
V
 
I
S
 
A
A
 
K
P
 
E
G
 
G
H
 
Y
K
 
E
H
 
S
L
 
L
T
 
T
S
 
T
Q
 
Q
I
 
L
N
 
Y
L
 
F
S
 
E
G
 
N
D
 
G
K
 
Q
Y
 
W
L
 
T
W
 
G
D
 
S
D
 
D
F
 
V
A
 
A
F
 
N
A
 
A
T
 
V
R
 
K
D
 
P
G
 
E
L
 
L
I
 
L
A
 
L
D
 
S
P
 
L
V
 
D
K
 
K
V
 
I
T
 
E
D
 
A
R
 
Q
E
 
-
T
 
-
I
 
-
A
 
-
Q
 
-
R
 
-
D
 
-
L
 
-
E
 
S
G
 
G
E
 
P
H
 
H
T
 
F
E
 
E
V
 
T
C
 
S
F
 
Y
D
 
K
F
 
F
T
 
T
L
 
L
C
 
G
K
 
K
A
 
V

3n9tA Cryatal structure of hydroxyquinol 1,2-dioxygenase from pseudomonas putida dll-e4
30% identity, 85% coverage: 27:289/308 of query aligns to 21:283/286 of 3n9tA

query
sites
3n9tA
N
 
N
E
 
P
R
 
R
F
 
F
K
 
K
A
 
Q
I
 
I
V
 
M
H
 
Q
R
 
S
L
 
L
L
 
V
E
 
R
N
 
H
I
 
L
C
 
H
T
 
D
L
 
F
I
 
V
D
 
S
D
 
E
Y
 
V
N
 
E
V
 
L
T
 
T
E
 
E
E
 
Q
E
 
E
F
 
W
W
 
F
H
 
E
A
 
G
V
 
I
N
 
R
Y
 
F
L
 
L
H
 
T
E
 
A
L
 
T
G
 
G
G
 
Q
-
 
K
-
 
C
-
 
D
-
 
G
-
 
K
-
 
V
R
 
R
Q
 
Q
E
 
E
A
 
F
A
 
I
L
 
L
L
 
L
A
 
S
A
 
D
G
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
V
E
 
S
H
 
M
F
 
L
L
 
-
D
 
-
L
 
-
R
 
-
Q
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
I
A
 
N
R
 
H
R
 
R
E
 
Q
T
 
S
-
 
T
-
 
N
G
 
A
T
 
T
P
 
E
R
 
T
T
 
T
I
 
V
E
 
F
G
 
G
P
 
P
L
 
F
Y
 
F
V
 
I
A
 
E
N
 
G
A
 
M
P
 
P
-
 
D
-
 
R
L
 
G
A
 
Y
D
 
G
S
 
E
H
 
N
A
 
M
R
 
A
M
 
L
D
 
T
D
 
D
G
 
G
T
 
V
D
 
P
A
 
A
G
 
-
E
 
-
V
 
-
M
 
-
W
 
L
L
 
V
H
 
Y
G
 
G
Q
 
R
V
 
V
K
 
L
D
 
D
N
 
V
Q
 
Q
G
 
G
Q
 
R
P
 
P
I
 
V
A
 
V
N
 
G
A
 
A
I
 
V
V
 
L
D
 
D
I
 
V
W
 
W
H
 
Q
A
 
T
N
 
A
T
 
D
L
 
N
G
 
G
N
 
M
Y
|
Y
S
 
S
F
 
G
F
 
Q
D
 
D
K
 
P
S
 
D
Q
 
Q
S
 
P
D
 
F
Y
 
G
N
 
N
L
 
L
R
 
R
R
 
G
R
 
R
I
 
Y
R
 
R
T
 
S
G
 
D
A
 
N
D
 
D
G
 
G
R
 
C
Y
 
F
S
 
A
V
 
I
R
 
Q
S
 
T
I
 
T
M
 
V
P
 
P
S
 
V
G
 
C
Y
|
Y
G
 
P
C
 
I
P
 
P
P
 
T
D
 
D
G
 
G
P
 
P
T
 
V
Q
 
G
K
 
E
L
 
M
L
 
L
D
 
D
Q
 
A
L
 
A
G
 
N
R
 
R
H
 
H
G
 
A
N
 
W
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
L
H
|
H
F
 
F
F
 
M
V
 
I
S
 
Q
A
 
A
P
 
P
G
 
G
H
 
Y
K
 
R
H
 
K
L
 
L
T
 
V
S
 
T
Q
 
H
I
 
L
N
 
F
L
 
N
S
 
S
G
 
D
D
 
D
K
 
P
Y
 
Y
L
 
L
W
 
D
D
 
S
D
 
D
F
 
A
A
 
V
F
 
F
A
 
G
T
 
V
R
 
K
D
 
G
G
 
S
L
 
L
I
 
-
A
 
-
D
 
-
P
 
Q
V
 
V
K
 
K
V
 
Y
T
 
E
D
 
D
R
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
H
-
 
D
E
 
E
T
 
D
I
 
A
A
 
G
Q
 
G
R
 
L
D
 
D
L
 
M
E
 
P
G
 
Y
E
 
P
H
 
Y
T
 
K
E
 
S
V
 
A
C
 
Y
F
 
Y
D
 
E
F
 
F
T
 
V
L
 
M

8r2vA Crystal structure of hydroxyquinol-1,2-dioxygenase from gelatoporia subvermispora (gshdx1) (see paper)
28% identity, 81% coverage: 27:274/308 of query aligns to 39:285/319 of 8r2vA

query
sites
8r2vA
N
 
N
E
 
P
R
 
R
F
 
H
K
 
R
A
 
F
I
 
L
V
 
A
H
 
K
R
 
T
L
 
L
L
 
I
E
 
T
N
 
H
I
 
L
C
 
H
T
 
D
L
 
F
I
 
V
D
 
K
D
 
E
Y
 
T
N
 
S
V
 
L
T
 
T
E
 
T
E
 
D
E
 
E
F
 
W
W
 
M
H
 
T
A
 
S
V
 
I
N
 
Q
Y
 
F
L
 
L
H
 
T
E
 
R
L
 
V
G
 
G
G
 
Q
-
 
I
-
 
C
-
 
T
-
 
P
-
 
V
R
 
R
Q
 
Q
E
 
E
A
 
F
A
 
I
L
 
L
L
 
L
A
 
S
A
 
D
G
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
V
E
 
S
H
 
A
F
 
L
L
 
V
D
 
D
-
 
A
L
 
I
R
 
N
Q
 
N
D
 
P
A
 
P
I
 
V
D
 
N
A
 
G
A
 
A
A
 
-
R
 
-
R
 
-
E
 
-
T
 
-
G
 
-
T
 
T
P
 
E
R
 
S
T
 
S
I
 
V
E
 
L
G
 
G
P
 
P
L
 
F
Y
 
F
V
 
T
A
 
D
N
 
D
A
 
A
P
 
P
-
 
D
L
 
V
A
 
A
D
 
N
S
 
G
H
 
E
A
 
S
R
 
I
M
 
A
D
 
S
D
 
E
G
 
G
T
 
-
D
 
-
A
 
K
G
 
G
E
 
D
V
 
Y
M
 
M
W
 
Y
L
 
V
H
 
E
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
K
 
L
D
 
S
N
 
T
Q
 
D
G
 
G
Q
 
T
P
 
P
I
 
V
A
 
P
N
 
D
A
 
A
I
 
V
V
 
I
D
 
E
I
 
T
W
 
W
H
 
E
A
 
T
N
 
D
T
 
A
L
 
K
G
 
G
N
 
F
Y
|
Y
S
 
D
F
 
N
F
 
Q
D
 
Y
K
 
K
S
 
N
Q
 
R
S
 
D
D
 
H
Y
 
P
N
 
E
L
 
C
R
 
R
R
 
G
R
 
R
I
 
L
R
 
R
T
 
S
G
 
D
A
 
K
D
 
D
G
 
G
R
 
K
Y
 
F
S
 
A
V
 
Y
R
 
R
S
 
A
I
 
V
M
 
V
P
 
P
S
 
V
G
 
A
Y
|
Y
G
 
P
C
 
I
P
 
P
P
 
G
D
 
D
G
 
G
P
 
P
T
 
V
Q
 
G
K
 
E
L
 
M
L
 
L
D
 
L
Q
 
Q
L
 
L
G
 
N
R
 
R
H
 
H
G
 
N
N
 
M
R
 
R
P
 
P
A
 
N
H
|
H
I
 
L
H
|
H
F
 
L
F
 
M
V
 
I
S
 
S
A
 
A
P
 
P
G
 
G
H
 
Y
K
 
N
H
 
T
L
 
L
T
 
V
S
 
T
Q
 
A
I
 
F
N
 
Y
L
 
P
S
 
E
G
 
G
D
 
D
K
 
E
Y
 
Y
L
 
L
W
 
S
D
 
S
D
 
D
F
 
A
A
 
V
F
 
F
A
 
G
T
 
V
R
 
K
D
 
K
G
 
S
L
 
L
I
 
V
A
 
V
D
 
G
P
 
L
V
 
E
K
 
E
V
 
V
T
 
K
D
 
D
R
 
D
E
 
S
T
 
E
I
 
A
A
 
R
Q
 
K
R
 
R

3th1A Crystal structure of chlorocatechol 1,2-dioxygenase from pseudomonas putida
32% identity, 81% coverage: 27:274/308 of query aligns to 2:246/246 of 3th1A

query
sites
3th1A
N
 
D
E
 
K
R
 
R
F
 
V
K
 
A
A
 
E
I
 
V
V
 
A
H
 
G
R
 
A
L
 
I
L
 
V
E
 
E
N
 
A
I
 
V
C
 
R
T
 
K
L
 
I
I
 
L
D
 
L
D
 
D
Y
 
K
N
 
R
V
 
V
T
 
T
E
 
E
E
 
A
E
 
E
F
 
Y
W
 
R
H
 
A
A
 
G
V
 
V
N
 
D
Y
 
Y
L
 
L
H
 
T
E
 
E
L
 
V
G
 
A
G
 
Q
R
 
T
Q
 
R
E
 
E
A
 
T
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
L
E
 
D
H
 
V
F
 
F
L
 
L
D
 
N
L
 
-
R
 
-
Q
 
S
D
 
T
A
 
I
I
 
I
D
 
E
A
 
G
A
 
K
A
 
A
R
 
Q
R
 
R
E
 
S
T
 
R
G
 
T
T
 
S
P
 
A
R
 
P
T
 
A
I
 
I
E
 
Q
G
 
G
P
 
P
L
 
Y
Y
 
F
V
 
L
A
 
E
N
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
V
A
 
V
D
 
E
S
 
G
H
 
V
A
 
L
R
 
K
M
 
T
D
 
Y
D
 
D
G
 
-
T
 
T
D
 
D
A
 
D
G
 
H
E
 
K
V
 
P
M
 
L
W
 
I
L
 
I
H
 
R
G
 
G
Q
 
T
V
 
V
K
 
R
D
 
S
N
 
D
Q
 
T
G
 
G
Q
 
E
P
 
L
I
 
L
A
 
A
N
 
G
A
 
A
I
 
V
V
 
I
D
 
D
I
 
V
W
 
W
H
 
H
A
 
S
N
 
T
T
 
P
L
 
D
G
 
G
N
 
L
Y
|
Y
S
 
S
-
 
G
F
 
I
F
 
H
D
 
D
K
 
N
S
 
I
Q
 
P
S
 
V
D
 
D
Y
 
Y
N
 
-
L
 
Y
R
 
R
R
 
G
R
 
K
I
 
L
R
 
V
T
 
T
G
 
D
A
 
S
D
 
Q
G
 
G
R
 
N
Y
 
Y
S
 
R
V
 
V
R
 
R
S
 
T
I
 
T
M
 
M
P
 
P
S
 
V
G
 
P
Y
|
Y
G
 
Q
C
 
I
P
 
P
P
 
Y
D
 
E
G
 
G
P
 
P
T
 
T
Q
 
G
K
 
R
L
 
L
L
 
L
D
 
G
Q
 
H
L
 
L
G
 
G
R
 
S
H
 
H
G
 
T
N
 
W
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
V
H
|
H
F
 
F
F
 
K
V
 
V
S
 
R
A
 
K
P
 
D
G
 
G
H
 
F
K
 
E
H
 
P
L
 
L
T
 
T
S
 
T
Q
 
Q
I
 
Y
N
 
Y
L
 
F
S
 
E
G
 
G
D
 
G
K
 
K
Y
 
W
L
 
V
W
 
D
D
 
D
D
 
D
F
 
C
A
 
C
F
 
H
A
 
G
T
 
V
R
 
T
D
 
P
G
 
D
L
 
L
I
 
I
A
 
T
-
 
P
-
 
E
-
 
T
-
 
I
-
 
E
D
 
D
P
 
G
V
 
V
K
 
R
V
 
V
T
 
M
D
 
T
R
 
L
E
 
D
T
 
F
I
 
V
A
 
I
Q
 
E
R
 
R

3hj8A Crystal structure determination of catechol 1,2-dioxygenase from rhodococcus opacus 1cp in complex with 4-chlorocatechol (see paper)
34% identity, 76% coverage: 28:262/308 of query aligns to 9:238/257 of 3hj8A

query
sites
3hj8A
E
 
E
R
 
R
F
 
L
K
 
A
A
 
A
I
 
I
V
 
A
H
 
K
R
 
D
L
 
A
L
 
L
E
 
G
N
 
A
I
 
L
C
 
N
T
 
D
L
 
V
I
 
I
D
 
L
D
 
K
Y
 
H
N
 
G
V
 
V
T
 
T
E
 
Y
E
 
P
E
 
E
F
 
Y
W
 
R
H
 
V
A
 
F
V
 
K
N
 
Q
Y
 
W
L
 
L
H
 
I
E
 
D
L
 
V
G
 
G
G
 
E
R
 
G
Q
 
G
E
 
E
A
 
W
A
 
P
L
 
L
L
 
F
A
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
L
E
x
D
H
x
V
F
 
F
L
 
I
D
 
E
L
 
H
R
 
S
Q
 
V
D
 
E
A
 
E
I
 
V
D
 
L
A
 
A
A
 
R
A
 
S
R
 
R
R
 
K
E
 
-
T
 
-
G
 
G
T
 
T
P
 
M
R
 
G
T
 
S
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
|
P
L
x
Y
Y
 
Y
V
 
I
A
 
E
N
 
N
A
 
S
P
 
P
L
 
E
A
 
L
D
 
P
S
 
S
H
 
K
A
 
C
R
 
T
-
 
L
-
 
P
M
 
M
D
 
R
D
 
E
G
 
E
T
 
D
D
 
E
A
 
K
G
 
I
E
 
T
V
 
P
M
 
L
W
 
V
L
 
F
H
 
S
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
K
 
T
D
 
D
N
 
L
Q
 
D
G
 
G
Q
 
N
P
 
G
I
 
L
A
 
A
N
 
G
A
 
A
I
 
K
V
 
V
D
 
E
I
 
L
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
D
T
 
N
L
 
D
G
 
G
N
 
Y
Y
|
Y
S
 
S
F
 
Q
F
 
F
D
 
A
K
 
P
S
 
H
Q
 
L
S
 
P
D
 
E
Y
 
W
N
 
N
L
 
L
R
 
R
R
 
G
R
 
T
I
 
I
R
 
I
T
 
A
G
 
D
A
 
E
D
 
E
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
S
 
E
V
 
I
R
 
T
S
 
T
I
 
I
M
 
Q
P
 
P
S
 
A
G
 
P
Y
|
Y
G
 
Q
C
 
I
P
 
P
P
 
T
D
 
D
G
 
G
P
 
P
T
 
T
Q
 
G
K
 
Q
L
 
F
L
 
I
D
 
E
Q
 
A
L
 
Q
G
 
N
R
 
G
H
 
H
G
 
P
N
 
W
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
L
H
|
H
F
 
L
F
 
I
V
 
V
S
 
S
A
 
A
P
 
P
G
 
G
H
 
K
K
 
E
H
 
S
L
 
V
T
 
T
S
 
T
Q
 
Q
I
 
L
N
 
Y
L
 
F
S
 
K
G
 
G
D
 
G
K
 
E
Y
 
W
L
 
I
W
 
D
D
 
S
D
 
D
F
 
V
A
 
A
F
 
S
A
 
A
T
 
T
R
 
K
D
 
P
G
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
L
D
 
D
P
 
P

3hgiA Crystal structure of catechol 1,2-dioxygenase from the gram-positive rhodococcus opacus 1cp (see paper)
34% identity, 76% coverage: 28:262/308 of query aligns to 10:239/258 of 3hgiA

query
sites
3hgiA
E
 
E
R
 
R
F
 
L
K
 
A
A
 
A
I
 
I
V
 
A
H
 
K
R
 
D
L
 
A
L
 
L
E
 
G
N
 
A
I
 
L
C
 
N
T
 
D
L
 
V
I
 
I
D
 
L
D
 
K
Y
 
H
N
 
G
V
 
V
T
 
T
E
 
Y
E
 
P
E
 
E
F
 
Y
W
 
R
H
 
V
A
 
F
V
 
K
N
 
Q
Y
 
W
L
 
L
H
 
I
E
 
D
L
 
V
G
 
G
G
 
E
R
 
G
Q
 
G
E
 
E
A
 
W
A
 
P
L
 
L
L
 
F
A
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
L
E
 
D
H
 
V
F
 
F
L
 
I
D
 
E
L
 
H
R
 
S
Q
 
V
D
 
E
A
 
E
I
 
V
D
 
L
A
 
A
A
 
R
A
 
S
R
 
R
R
 
K
E
 
-
T
 
-
G
 
G
T
 
T
P
 
M
R
 
G
T
 
S
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
 
P
L
 
Y
Y
 
Y
V
 
I
A
 
E
N
 
N
A
 
S
P
 
P
L
 
E
A
 
L
D
 
P
S
 
S
H
 
K
A
 
C
R
 
T
-
 
L
-
 
P
M
 
M
D
 
R
D
 
E
G
 
E
T
 
D
D
 
E
A
 
K
G
 
I
E
 
T
V
 
P
M
 
L
W
 
V
L
 
F
H
 
S
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
K
 
T
D
 
D
N
 
L
Q
 
D
G
 
G
Q
 
N
P
 
G
I
 
L
A
 
A
N
 
G
A
 
A
I
 
K
V
 
V
D
 
E
I
 
L
W
 
W
H
|
H
A
|
A
N
 
D
T
 
N
L
 
D
G
 
G
N
 
Y
Y
|
Y
S
 
S
F
 
Q
F
 
F
D
 
A
K
 
P
S
 
H
Q
 
L
S
 
P
D
 
E
Y
 
W
N
 
N
L
 
L
R
 
R
R
 
G
R
 
T
I
 
I
R
 
I
T
 
A
G
 
D
A
 
E
D
 
E
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
S
 
E
V
 
I
R
 
T
S
 
T
I
 
I
M
 
Q
P
 
P
S
 
A
G
 
P
Y
|
Y
G
 
Q
C
 
I
P
 
P
P
 
T
D
 
D
G
 
G
P
 
P
T
 
T
Q
 
G
K
 
Q
L
 
F
L
 
I
D
 
E
Q
 
A
L
 
Q
G
 
N
R
 
G
H
 
H
G
 
P
N
 
W
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
L
H
|
H
F
 
L
F
 
I
V
 
V
S
 
S
A
 
A
P
 
P
G
 
G
H
 
K
K
 
E
H
 
S
L
 
V
T
 
T
S
 
T
Q
 
Q
I
 
L
N
 
Y
L
 
F
S
 
K
G
 
G
D
 
G
K
 
E
Y
 
W
L
 
I
W
 
D
D
 
S
D
 
D
F
 
V
A
 
A
F
 
S
A
 
A
T
 
T
R
 
K
D
 
P
G
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
L
D
 
D
P
 
P

3i51A Crystal structure determination of catechol 1,2-dioxygenase from rhodococcus opacus 1cp in complex with 4,5-dichlorocatechol (see paper)
34% identity, 76% coverage: 28:262/308 of query aligns to 8:237/256 of 3i51A

query
sites
3i51A
E
 
E
R
 
R
F
 
L
K
 
A
A
 
A
I
 
I
V
 
A
H
 
K
R
 
D
L
 
A
L
 
L
E
 
G
N
 
A
I
 
L
C
 
N
T
 
D
L
 
V
I
 
I
D
 
L
D
 
K
Y
 
H
N
 
G
V
 
V
T
 
T
E
 
Y
E
 
P
E
 
E
F
 
Y
W
 
R
H
 
V
A
 
F
V
 
K
N
 
Q
Y
 
W
L
 
L
H
 
I
E
 
D
L
 
V
G
 
G
G
 
E
R
 
G
Q
 
G
E
 
E
A
 
W
A
 
P
L
 
L
L
 
F
A
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
L
E
x
D
H
x
V
F
 
F
L
 
I
D
 
E
L
 
H
R
 
S
Q
 
V
D
 
E
A
 
E
I
 
V
D
 
L
A
 
A
A
 
R
A
 
S
R
 
R
R
 
K
E
 
-
T
 
-
G
 
G
T
 
T
P
 
M
R
 
G
T
 
S
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
|
P
L
x
Y
Y
 
Y
V
 
I
A
 
E
N
 
N
A
 
S
P
 
P
L
 
E
A
 
L
D
 
P
S
 
S
H
 
K
A
 
C
R
 
T
-
 
L
-
 
P
M
 
M
D
 
R
D
 
E
G
 
E
T
 
D
D
 
E
A
 
K
G
 
I
E
 
T
V
 
P
M
 
L
W
 
V
L
 
F
H
 
S
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
K
 
T
D
 
D
N
 
L
Q
 
D
G
 
G
Q
 
N
P
 
G
I
 
L
A
 
A
N
 
G
A
 
A
I
 
K
V
 
V
D
 
E
I
 
L
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
D
T
 
N
L
 
D
G
 
G
N
 
Y
Y
|
Y
S
 
S
F
 
Q
F
 
F
D
 
A
K
 
P
S
 
H
Q
 
L
S
 
P
D
 
E
Y
 
W
N
 
N
L
 
L
R
 
R
R
 
G
R
 
T
I
 
I
R
 
I
T
 
A
G
 
D
A
 
E
D
 
E
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
S
 
E
V
 
I
R
 
T
S
 
T
I
 
I
M
 
Q
P
 
P
S
 
A
G
 
P
Y
|
Y
G
 
Q
C
 
I
P
 
P
P
 
T
D
 
D
G
 
G
P
 
P
T
 
T
Q
 
G
K
 
Q
L
 
F
L
 
I
D
 
E
Q
 
A
L
 
Q
G
 
N
R
 
G
H
 
H
G
 
P
N
 
W
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
L
H
|
H
F
 
L
F
 
I
V
 
V
S
 
S
A
 
A
P
 
P
G
 
G
H
 
K
K
 
E
H
 
S
L
 
V
T
 
T
S
 
T
Q
 
Q
I
 
L
N
 
Y
L
 
F
S
 
K
G
 
G
D
 
G
K
 
E
Y
 
W
L
 
I
W
 
D
D
 
S
D
 
D
F
 
V
A
 
A
F
 
S
A
 
A
T
 
T
R
 
K
D
 
P
G
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
L
D
 
D
P
 
P

3i4yA Crystal structure determination of catechol 1,2-dioxygenase from rhodococcus opacus 1cp in complex with 3,5-dichlorocatechol (see paper)
34% identity, 76% coverage: 28:262/308 of query aligns to 8:237/256 of 3i4yA

query
sites
3i4yA
E
 
E
R
 
R
F
 
L
K
 
A
A
 
A
I
 
I
V
 
A
H
 
K
R
 
D
L
 
A
L
 
L
E
 
G
N
 
A
I
 
L
C
 
N
T
 
D
L
 
V
I
 
I
D
 
L
D
 
K
Y
 
H
N
 
G
V
 
V
T
 
T
E
 
Y
E
 
P
E
 
E
F
 
Y
W
 
R
H
 
V
A
 
F
V
 
K
N
 
Q
Y
 
W
L
 
L
H
 
I
E
 
D
L
 
V
G
 
G
G
 
E
R
 
G
Q
 
G
E
 
E
A
 
W
A
 
P
L
|
L
L
 
F
A
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
L
E
 
D
H
x
V
F
 
F
L
 
I
D
 
E
L
 
H
R
 
S
Q
 
V
D
 
E
A
 
E
I
 
V
D
 
L
A
 
A
A
 
R
A
 
S
R
 
R
R
 
K
E
 
-
T
 
-
G
 
G
T
 
T
P
 
M
R
 
G
T
 
S
I
|
I
E
 
E
G
 
G
P
|
P
L
x
Y
Y
 
Y
V
 
I
A
 
E
N
 
N
A
 
S
P
 
P
L
 
E
A
 
L
D
 
P
S
 
S
H
 
K
A
 
C
R
 
T
-
 
L
-
 
P
M
 
M
D
 
R
D
 
E
G
 
E
T
 
D
D
 
E
A
 
K
G
 
I
E
 
T
V
 
P
M
 
L
W
 
V
L
 
F
H
 
S
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
K
 
T
D
 
D
N
 
L
Q
 
D
G
 
G
Q
 
N
P
 
G
I
 
L
A
 
A
N
 
G
A
 
A
I
 
K
V
 
V
D
 
E
I
 
L
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
D
T
 
N
L
 
D
G
 
G
N
 
Y
Y
|
Y
S
 
S
F
 
Q
F
 
F
D
 
A
K
 
P
S
 
H
Q
 
L
S
 
P
D
 
E
Y
 
W
N
 
N
L
 
L
R
 
R
R
 
G
R
 
T
I
 
I
R
 
I
T
 
A
G
 
D
A
 
E
D
 
E
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
S
 
E
V
 
I
R
 
T
S
 
T
I
 
I
M
 
Q
P
 
P
S
 
A
G
 
P
Y
|
Y
G
 
Q
C
 
I
P
 
P
P
 
T
D
 
D
G
 
G
P
 
P
T
 
T
Q
 
G
K
 
Q
L
 
F
L
 
I
D
 
E
Q
 
A
L
 
Q
G
 
N
R
 
G
H
 
H
G
 
P
N
 
W
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
L
H
|
H
F
 
L
F
 
I
V
 
V
S
 
S
A
 
A
P
 
P
G
 
G
H
 
K
K
 
E
H
 
S
L
 
V
T
 
T
S
 
T
Q
 
Q
I
 
L
N
 
Y
L
 
F
S
 
K
G
 
G
D
 
G
K
 
E
Y
 
W
L
 
I
W
 
D
D
 
S
D
 
D
F
 
V
A
 
A
F
 
S
A
 
A
T
 
T
R
 
K
D
 
P
G
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
L
D
 
D
P
 
P

Query Sequence

>WP_012968101.1 NCBI__GCF_000025465.1:WP_012968101.1
MSNAFVQQEAVQKLLREGAGLNVPGGNERFKAIVHRLLENICTLIDDYNVTEEEFWHAVN
YLHELGGRQEAALLAAGLGLEHFLDLRQDAIDAAARRETGTPRTIEGPLYVANAPLADSH
ARMDDGTDAGEVMWLHGQVKDNQGQPIANAIVDIWHANTLGNYSFFDKSQSDYNLRRRIR
TGADGRYSVRSIMPSGYGCPPDGPTQKLLDQLGRHGNRPAHIHFFVSAPGHKHLTSQINL
SGDKYLWDDFAFATRDGLIADPVKVTDRETIAQRDLEGEHTEVCFDFTLCKALNADEEHR
GTRLRAKE

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory