SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012968216.1 NCBI__GCF_000025465.1:WP_012968216.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7uoiA Crystallographic structure of dape from enterococcus faecium (see paper)
29% identity, 96% coverage: 5:370/380 of query aligns to 11:383/383 of 7uoiA

query
sites
7uoiA
L
 
I
E
 
A
L
 
I
A
 
L
R
 
Q
Q
 
E
L
 
I
L
 
I
G
 
R
F
 
I
N
 
K
T
 
S
I
 
V
N
 
N
P
 
-
P
 
-
G
 
G
S
 
N
E
 
E
A
 
G
D
 
E
C
 
V
M
 
A
R
 
A
F
 
Y
F
 
L
A
 
N
D
 
K
W
 
L
L
 
L
D
 
A
E
 
R
S
 
H
G
 
D
F
 
I
E
 
T
V
 
G
S
 
E
L
 
I
S
 
V
S
 
S
F
 
Y
G
 
R
E
 
D
G
 
G
R
 
R
C
 
D
N
 
N
L
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
R
L
 
Y
P
 
Q
G
 
K
A
 
G
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
K
 
K
P
 
V
L
 
L
A
 
G
F
 
L
T
 
S
G
 
G
H
|
H
L
 
M
D
 
D
T
 
V
V
 
V
P
 
A
L
 
A
G
 
G
N
 
D
-
 
E
A
 
S
R
 
S
W
 
W
Q
 
T
Y
 
Y
D
 
A
P
 
P
F
 
F
G
 
A
S
 
A
Q
 
E
M
 
I
E
 
H
D
 
G
G
 
N
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
A
S
 
T
D
|
D
M
 
M
K
 
K
A
 
S
A
 
G
I
 
L
A
 
A
A
 
A
F
 
M
A
 
V
V
 
I
A
 
A
C
 
M
V
 
I
H
 
E
Q
 
L
R
 
K
E
 
E
A
 
S
I
 
G
L
 
K
A
 
P
G
 
F
R
 
N
G
 
G
A
 
T
V
 
V
-
 
K
L
 
L
L
 
L
I
 
A
T
 
T
G
 
V
G
 
G
E
 
E
E
 
E
T
 
V
G
 
G
C
 
E
D
 
L
G
 
G
A
 
G
R
 
E
A
 
Q
L
 
L
I
 
T
A
 
K
S
 
A
A
 
G
T
 
Y
L
 
V
P
 
D
E
 
D
V
 
L
G
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
I
V
 
I
G
 
G
E
|
E
P
 
P
T
 
T
A
 
N
N
 
Y
Y
 
S
P
 
L
V
 
M
I
 
Y
G
 
T
H
 
H
K
 
M
G
 
G
A
 
S
L
 
I
W
 
N
L
 
Y
R
 
T
C
 
V
E
 
T
T
 
S
R
 
H
G
 
G
K
 
K
T
 
E
A
 
A
H
 
H
G
 
S
A
 
S
M
 
M
P
 
P
E
 
D
L
 
Q
G
 
G
I
 
Y
N
 
N
A
 
A
I
 
I
Y
 
N
-
 
H
-
 
L
-
 
N
-
 
E
L
 
F
A
 
I
A
 
T
D
 
K
A
 
A
L
 
N
G
 
A
K
 
E
I
 
M
Q
 
N
H
 
H
F
 
L
S
 
A
P
 
E
G
 
T
A
 
I
P
 
E
H
 
N
P
 
P
L
 
V
M
 
L
K
 
G
Q
 
K
P
 
T
T
 
I
L
 
H
N
 
N
V
 
V
G
 
T
R
 
L
I
 
I
E
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
N
N
 
Q
I
 
V
N
 
N
S
 
S
V
 
I
P
 
P
D
 
S
R
 
H
T
 
A
R
 
Q
F
 
L
D
 
Q
V
 
G
D
 
N
I
 
I
R
 
R
S
 
S
A
 
I
P
 
P
N
 
E
L
 
Y
Q
 
P
H
 
N
A
 
D
T
 
K
I
 
I
R
 
I
E
 
A
R
 
L
L
 
L
T
 
Q
T
 
S
L
 
I
L
 
V
G
 
N
E
 
E
-
 
L
-
 
N
-
 
Q
-
 
E
-
 
T
S
 
D
V
 
Y
T
 
H
V
 
L
S
 
E
T
 
L
L
 
M
V
 
I
D
 
D
L
 
Y
P
 
N
A
 
K
-
 
I
-
 
P
V
 
V
L
 
K
S
 
A
R
 
D
E
 
P
D
 
D
H
 
S
A
 
P
W
 
L
I
 
I
K
 
H
Q
 
S
V
 
I
Y
 
Q
Q
 
Q
R
 
Q
-
 
F
C
 
S
Q
 
Q
P
 
P
L
 
L
H
 
-
A
 
-
E
 
-
P
 
P
I
 
L
A
 
V
P
 
G
R
 
A
V
 
A
V
 
A
P
 
T
Y
 
-
F
 
-
T
 
T
D
 
D
A
 
A
S
 
A
L
 
E
L
 
F
L
 
T
P
 
K
A
 
A
L
 
N
G
 
H
D
 
S
P
 
F
P
 
D
C
 
F
I
 
V
I
 
V
L
 
F
G
 
G
P
 
P
G
 
G
E
 
V
P
 
V
S
 
T
M
 
L
A
 
P
H
 
H
Q
 
Q
T
 
V
D
 
D
E
 
E
Y
 
Y
C
 
V
L
 
E
L
 
I
S
 
D
R
 
N
L
 
Y
A
 
L
E
 
D
A
 
M
E
 
I
Q
 
E
L
 
K
Y
 
Y
G
 
Q
D
 
G
I
 
I
I
 
I
R
 
L
D
 
S
W
 
Y
M
 
L
A
 
A

8uw6B Acetylornithine deacetylase from escherichia coli, di-zinc form. (see paper)
30% identity, 91% coverage: 22:368/380 of query aligns to 29:378/381 of 8uw6B

query
sites
8uw6B
S
 
S
E
 
N
A
 
A
D
 
D
C
 
L
M
 
I
R
 
T
F
 
L
F
 
L
A
 
A
D
 
D
W
 
W
L
 
F
D
 
K
E
 
D
S
 
L
G
 
G
F
 
F
E
 
N
V
 
V
S
 
E
L
 
V
S
 
Q
S
 
P
F
 
V
-
 
P
-
 
G
G
 
T
E
 
R
G
 
N
R
 
K
C
 
F
N
 
N
L
 
M
I
 
L
A
 
A
S
 
S
L
 
T
P
 
G
G
 
Q
A
 
G
K
 
A
S
 
G
G
 
G
K
 
-
P
 
-
L
 
L
A
 
L
F
 
L
T
 
A
G
 
G
H
|
H
L
 
T
D
 
D
T
 
T
V
 
V
P
 
P
L
 
F
G
 
D
N
 
D
A
 
G
R
 
R
W
 
W
Q
 
T
Y
 
R
D
 
D
P
 
P
F
 
F
G
 
T
S
 
L
Q
 
T
M
 
E
E
 
H
D
 
D
G
 
G
R
 
K
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
R
 
L
G
 
G
S
 
T
S
 
A
D
|
D
M
 
M
K
 
K
A
 
-
A
 
G
I
 
F
A
 
F
A
 
A
F
 
F
A
 
I
V
 
L
A
 
D
C
 
A
V
 
L
H
 
R
Q
 
D
R
 
V
E
 
D
A
 
V
I
 
T
L
 
K
A
 
L
G
 
K
R
 
K
G
 
P
A
 
L
V
 
Y
L
 
I
L
 
L
I
 
A
T
 
T
G
 
A
G
 
D
E
 
E
E
|
E
T
 
T
G
 
S
C
 
M
D
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
R
A
 
Y
L
 
F
I
 
A
A
 
E
S
 
T
A
 
T
T
 
A
L
 
L
-
 
R
P
 
P
E
 
D
V
 
C
G
 
A
A
 
-
L
 
-
I
 
I
V
 
I
G
 
G
E
|
E
P
 
P
T
 
T
A
 
S
N
 
L
Y
 
Q
P
 
P
V
 
V
I
 
R
G
 
A
H
 
H
K
 
K
G
 
G
A
 
H
L
 
I
W
 
S
L
 
N
R
 
A
C
 
I
E
 
R
T
 
I
R
 
Q
G
 
G
K
 
Q
T
 
S
A
 
G
H
 
H
G
 
S
A
 
S
M
 
D
P
 
P
E
 
A
L
 
R
G
 
G
I
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
Y
 
E
L
 
L
A
 
M
A
 
H
D
 
D
A
 
A
L
 
I
G
 
G
K
 
H
I
 
I
Q
 
L
H
 
Q
F
 
L
S
 
R
P
 
D
G
 
N
A
 
L
P
 
K
H
 
E
P
 
R
L
 
Y
M
 
H
K
 
Y
Q
 
E
-
 
A
-
 
F
-
 
T
-
 
V
-
 
P
-
 
Y
P
 
P
T
 
T
L
 
L
N
 
N
V
 
L
G
 
G
R
 
H
I
 
I
E
 
H
G
 
G
G
 
G
L
 
D
N
 
A
I
 
S
N
 
N
S
 
R
V
 
I
P
 
C
D
 
A
R
 
W
T
 
C
R
 
E
F
 
L
D
 
H
V
 
M
D
 
D
I
 
I
R
 
R
S
 
P
A
 
L
P
 
P
N
 
G
L
 
M
Q
 
-
H
 
-
A
 
-
T
 
T
I
 
L
R
 
N
E
 
E
R
 
-
L
 
L
T
 
N
T
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
N
E
 
D
S
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
P
-
 
V
-
 
S
-
 
E
-
 
R
-
 
W
-
 
P
-
 
G
-
 
R
V
 
L
T
 
T
V
 
V
S
 
D
T
 
E
L
 
L
V
 
H
-
 
P
D
 
P
L
 
I
P
 
P
A
 
G
V
 
Y
L
 
E
S
 
C
R
 
P
E
 
P
D
 
N
H
 
H
A
 
Q
W
 
L
I
 
V
K
 
-
Q
 
E
V
 
V
Y
 
V
Q
 
E
R
 
K
C
 
L
Q
 
L
P
 
G
L
 
A
H
 
K
A
 
T
E
 
E
P
 
-
I
 
-
A
 
-
P
 
-
R
 
-
V
 
V
V
 
V
P
 
N
Y
 
Y
F
 
C
T
 
T
D
 
E
A
 
A
S
 
P
L
 
F
L
 
I
L
 
Q
P
 
T
A
 
L
L
 
C
G
 
-
D
 
-
P
 
-
P
 
P
C
 
T
I
 
L
I
 
V
L
 
L
G
 
G
P
 
P
G
 
G
E
 
S
P
 
I
S
 
N
M
 
Q
A
 
A
H
|
H
Q
 
Q
T
 
P
D
 
D
E
 
E
Y
 
Y
C
 
L
L
 
E
L
 
T
S
 
R
R
 
F
L
 
I
A
 
K
E
 
P
A
 
T
E
 
R
Q
 
E
L
 
L
Y
 
I
G
 
T
D
 
Q
I
 
V
I
 
I
R
x
H
D
 
H
W
 
F

Sites not aligning to the query:

4pqaA Crystal structure of succinyl-diaminopimelate desuccinylase from neisseria meningitidis mc58 in complex with the inhibitor captopril (see paper)
30% identity, 71% coverage: 2:269/380 of query aligns to 3:276/375 of 4pqaA

query
sites
4pqaA
T
 
T
T
 
Q
T
 
S
L
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
K
Q
 
E
L
 
L
L
 
I
G
 
S
F
 
R
N
 
P
T
 
S
I
 
V
N
 
T
P
 
P
P
 
-
G
 
-
S
 
D
E
 
D
A
 
R
D
 
D
C
 
C
M
 
Q
R
 
K
F
 
L
F
 
L
A
 
A
D
 
E
W
 
R
L
 
L
D
 
H
E
 
K
S
 
I
G
 
G
F
 
F
E
 
A
V
 
A
S
 
E
L
 
E
S
 
L
S
 
H
F
 
F
G
 
G
E
 
D
G
 
T
R
 
K
C
 
-
N
 
N
L
 
I
I
 
W
A
 
-
S
 
-
L
 
L
P
 
R
G
 
R
A
 
G
K
 
T
S
 
K
G
 
A
K
 
P
P
 
V
L
 
V
A
 
C
F
 
F
T
 
A
G
 
G
H
|
H
L
 
T
D
 
D
T
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
T
G
 
G
N
 
P
A
 
V
-
 
E
R
 
K
W
 
W
Q
 
D
Y
 
S
D
 
P
P
 
P
F
 
F
G
 
E
S
 
P
Q
 
A
M
 
E
E
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
A
S
 
A
D
|
D
M
 
M
K
 
K
A
 
T
A
 
S
I
 
I
A
 
A
A
 
C
F
 
F
A
 
V
V
 
T
A
 
A
C
 
C
V
 
E
H
 
R
Q
 
F
R
 
V
E
 
A
A
 
K
I
 
H
L
 
P
A
 
N
G
 
H
R
 
Q
G
 
G
A
 
S
V
 
I
-
 
A
L
 
L
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
S
G
 
D
E
|
E
E
|
E
-
 
G
T
 
D
G
 
A
C
 
L
D
 
D
G
 
G
A
 
T
R
 
T
A
 
K
L
 
V
I
 
V
A
 
D
-
 
V
-
 
L
S
 
K
A
 
A
T
 
R
L
 
D
P
 
E
E
 
L
V
 
I
G
 
D
A
 
Y
L
 
C
I
 
I
V
 
V
G
 
G
E
|
E
P
 
P
T
 
T
A
 
A
-
 
V
-
 
D
-
 
K
-
 
L
-
 
G
N
 
D
Y
 
M
P
 
I
V
 
K
I
 
N
G
 
G
H
 
R
K
 
R
G
 
G
A
 
S
L
 
L
W
 
S
L
 
G
R
 
N
C
 
L
E
 
T
T
 
V
R
 
K
G
 
G
K
 
K
T
 
Q
A
 
G
H
 
H
G
 
I
A
 
A
M
 
Y
P
 
P
E
 
H
L
 
L
G
 
A
I
 
I
N
 
N
A
 
P
I
 
V
Y
 
H
L
 
T
A
 
F
A
 
A
D
 
P
A
 
A
L
 
L
G
 
L
K
 
E
I
 
L
Q
 
T
H
 
Q
F
 
E
S
 
V
P
 
W
G
 
D
A
 
E
P
 
G
H
 
N
P
 
E
L
 
Y
M
 
F
K
 
P
Q
 
P
P
 
T
T
 
S
L
 
F
N
 
Q
V
 
I
G
 
S
R
 
N
I
 
I
E
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
T
N
 
G
-
 
A
I
 
T
N
 
N
S
 
V
V
 
I
P
 
P
D
 
G
R
 
E
T
 
L
R
 
N
F
 
V
D
 
K
V
 
F
D
 
N
I
 
F
R
 
R
S
 
F
A
 
S
P
 
T
N
 
E
L
 
S
Q
 
T
H
 
E
A
 
A
T
 
G
I
 
L
R
 
K
E
 
Q
R
 
R
L
 
V
T
 
H
T
 
A
L
 
I
L
 
L

Sites not aligning to the query:

4o23A Crystal structure of mono-zinc form of succinyl diaminopimelate desuccinylase from neisseria meningitidis mc58 (see paper)
30% identity, 71% coverage: 2:269/380 of query aligns to 3:276/376 of 4o23A

query
sites
4o23A
T
 
T
T
 
Q
T
 
S
L
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
K
Q
 
E
L
 
L
L
 
I
G
 
S
F
 
R
N
 
P
T
 
S
I
 
V
N
 
T
P
 
P
P
 
-
G
 
-
S
 
D
E
 
D
A
 
R
D
 
D
C
 
C
M
 
Q
R
 
K
F
 
L
F
 
L
A
 
A
D
 
E
W
 
R
L
 
L
D
 
H
E
 
K
S
 
I
G
 
G
F
 
F
E
 
A
V
 
A
S
 
E
L
 
E
S
 
L
S
 
H
F
 
F
G
 
G
E
 
D
G
 
T
R
 
K
C
 
-
N
 
N
L
 
I
I
 
W
A
 
-
S
 
-
L
 
L
P
 
R
G
 
R
A
 
G
K
 
T
S
 
K
G
 
A
K
 
P
P
 
V
L
 
V
A
 
C
F
 
F
T
 
A
G
 
G
H
|
H
L
 
T
D
 
D
T
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
T
G
 
G
N
 
P
A
 
V
-
 
E
R
 
K
W
 
W
Q
 
D
Y
 
S
D
 
P
P
 
P
F
 
F
G
 
E
S
 
P
Q
 
A
M
 
E
E
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
A
S
 
A
D
|
D
M
 
M
K
 
K
A
 
T
A
 
S
I
 
I
A
 
A
A
 
C
F
 
F
A
 
V
V
 
T
A
 
A
C
 
C
V
 
E
H
 
R
Q
 
F
R
 
V
E
 
A
A
 
K
I
 
H
L
 
P
A
 
N
G
 
H
R
 
Q
G
 
G
A
 
S
V
 
I
-
 
A
L
 
L
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
S
G
 
D
E
 
E
E
 
E
-
 
G
T
 
D
G
 
A
C
 
L
D
 
D
G
 
G
A
 
T
R
 
T
A
 
K
L
 
V
I
 
V
A
 
D
-
 
V
-
 
L
S
 
K
A
 
A
T
 
R
L
 
D
P
 
E
E
 
L
V
 
I
G
 
D
A
 
Y
L
 
C
I
 
I
V
 
V
G
 
G
E
|
E
P
 
P
T
 
T
A
 
A
-
 
V
-
 
D
-
 
K
-
 
L
-
 
G
N
 
D
Y
 
M
P
 
I
V
 
K
I
 
N
G
 
G
H
 
R
K
 
R
G
 
G
A
 
S
L
 
L
W
 
S
L
 
G
R
 
N
C
 
L
E
 
T
T
 
V
R
 
K
G
 
G
K
 
K
T
 
Q
A
 
G
H
 
H
G
 
I
A
 
A
M
 
Y
P
 
P
E
 
H
L
 
L
G
 
A
I
 
I
N
 
N
A
 
P
I
 
V
Y
 
H
L
 
T
A
 
F
A
 
A
D
 
P
A
 
A
L
 
L
G
 
L
K
 
E
I
 
L
Q
 
T
H
 
Q
F
 
E
S
 
V
P
 
W
G
 
D
A
 
E
P
 
G
H
 
N
P
 
E
L
 
Y
M
 
F
K
 
P
Q
 
P
P
 
T
T
 
S
L
 
F
N
 
Q
V
 
I
G
 
S
R
 
N
I
 
I
E
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
T
N
 
G
-
 
A
I
 
T
N
 
N
S
 
V
V
 
I
P
 
P
D
 
G
R
 
E
T
 
L
R
 
N
F
 
V
D
 
K
V
 
F
D
 
N
I
 
F
R
 
R
S
 
F
A
 
S
P
 
T
N
 
E
L
 
S
Q
 
T
H
 
E
A
 
A
T
 
G
I
 
L
R
 
K
E
 
Q
R
 
R
L
 
V
T
 
H
T
 
A
L
 
I
L
 
L

P44514 Succinyl-diaminopimelate desuccinylase; SDAP desuccinylase; N-succinyl-LL-2,6-diaminoheptanedioate amidohydrolase; EC 3.5.1.18 from Haemophilus influenzae (strain ATCC 51907 / DSM 11121 / KW20 / Rd) (see 3 papers)
28% identity, 70% coverage: 5:269/380 of query aligns to 6:276/377 of P44514

query
sites
P44514
L
 
V
E
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
Q
Q
 
D
L
 
L
L
 
I
G
 
R
F
 
R
N
 
P
T
 
S
I
 
I
N
 
S
P
 
P
P
 
-
G
 
-
S
 
N
E
 
D
A
 
E
D
 
G
C
 
C
M
 
Q
R
 
Q
F
 
I
F
 
I
A
 
A
D
 
E
W
 
R
L
 
L
D
 
E
E
 
K
S
 
L
G
 
G
F
 
F
E
 
Q
V
 
I
S
 
E
L
 
W
S
 
M
S
 
P
F
 
F
G
 
N
E
 
D
G
 
-
R
 
T
C
 
L
N
 
N
L
 
L
I
 
W
A
 
A
S
 
K
L
 
-
P
 
-
G
 
H
A
 
G
K
 
T
S
 
S
G
 
E
K
 
P
P
 
V
L
 
I
A
 
A
F
 
F
T
 
A
G
 
G
H
|
H
L
 
T
D
 
D
T
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
T
G
 
G
N
 
D
A
 
E
-
 
N
R
 
Q
W
 
W
Q
 
S
Y
 
S
D
 
P
P
 
P
F
 
F
G
 
S
S
 
A
Q
 
E
M
 
I
E
 
I
D
 
D
G
 
G
R
 
M
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
A
S
 
A
D
|
D
M
 
M
K
 
K
A
 
G
A
 
S
I
 
L
A
 
A
A
 
A
F
 
M
A
 
I
V
 
V
A
 
A
C
 
A
V
 
E
H
 
E
Q
 
Y
R
 
V
E
 
K
A
 
A
I
 
N
L
 
P
A
 
N
G
 
H
R
 
K
G
 
G
A
 
T
V
 
I
-
 
A
L
 
L
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
S
G
 
D
E
|
E
E
|
E
-
 
A
T
 
T
G
 
A
C
 
K
D
 
D
G
 
G
A
 
T
R
 
I
A
 
H
L
 
V
I
 
V
A
 
E
S
 
T
-
 
L
-
 
M
A
 
A
T
 
R
L
 
D
P
 
E
E
 
K
V
 
I
G
 
T
A
 
Y
L
 
C
I
 
M
V
 
V
G
 
G
E
|
E
P
 
P
T
 
S
A
 
S
-
 
A
-
 
K
-
 
N
-
 
L
-
 
G
N
 
D
Y
 
V
P
 
V
V
 
K
I
 
N
G
 
G
H
 
R
K
 
R
G
 
G
A
 
S
L
 
I
W
 
T
L
 
G
R
 
N
C
 
L
E
 
Y
T
 
I
R
 
Q
G
 
G
K
 
I
T
 
Q
A
 
G
H
 
H
G
 
V
A
 
A
M
 
Y
P
 
P
E
 
H
L
 
L
G
 
A
I
 
E
N
 
N
A
 
P
I
 
I
Y
 
H
L
 
K
A
 
A
A
 
A
D
 
L
A
 
F
L
 
L
G
 
Q
K
 
E
I
 
L
Q
 
T
H
 
T
F
 
Y
S
 
Q
P
 
W
G
 
D
A
 
K
P
 
G
H
 
N
P
 
E
L
 
F
M
 
F
K
 
P
Q
 
P
P
 
T
T
 
S
L
 
L
N
 
Q
V
 
I
G
 
A
R
 
N
I
 
I
E
 
H
G
 
A
G
 
G
L
 
T
N
 
G
I
 
S
N
 
N
S
 
N
V
 
V
-
 
I
P
 
P
D
 
A
R
 
E
T
 
L
R
 
Y
F
 
I
D
 
Q
V
 
F
D
 
N
I
 
L
R
 
R
S
 
Y
A
 
C
P
 
T
N
 
E
L
 
V
Q
 
T
H
 
D
A
 
E
T
 
I
I
 
I
R
 
K
E
 
Q
R
 
K
L
 
V
T
 
A
T
 
E
L
 
M
L
 
L

Sites not aligning to the query:

5vo3A Crystal structure of dape in complex with the products (succinic acid and diaminopimelic acid) (see paper)
28% identity, 70% coverage: 5:269/380 of query aligns to 10:280/380 of 5vo3A

query
sites
5vo3A
L
 
V
E
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
Q
Q
 
D
L
 
L
L
 
I
G
 
R
F
 
R
N
 
P
T
 
S
I
 
I
N
 
S
P
 
P
P
 
-
G
 
-
S
 
N
E
 
D
A
 
E
D
 
G
C
 
C
M
 
Q
R
 
Q
F
 
I
F
 
I
A
 
A
D
 
E
W
 
R
L
 
L
D
 
E
E
 
K
S
 
L
G
 
G
F
 
F
E
 
Q
V
 
I
S
 
E
L
 
W
S
 
M
S
 
P
F
 
F
G
 
N
E
 
D
G
 
-
R
 
T
C
 
L
N
 
N
L
 
L
I
 
W
A
 
A
S
 
K
L
 
-
P
 
-
G
 
H
A
 
G
K
 
T
S
 
S
G
 
E
K
 
P
P
 
V
L
 
I
A
 
A
F
 
F
T
 
A
G
 
G
H
|
H
L
 
T
D
 
D
T
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
T
G
 
G
N
 
D
A
 
E
-
 
N
R
 
Q
W
 
W
Q
 
S
Y
 
S
D
 
P
P
 
P
F
 
F
G
 
S
S
 
A
Q
 
E
M
 
I
E
 
I
D
 
D
G
 
G
R
 
M
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
A
S
 
A
D
|
D
M
 
M
K
 
K
A
 
G
A
 
S
I
 
L
A
 
A
A
 
A
F
 
M
A
 
I
V
 
V
A
 
A
C
 
A
V
 
E
H
 
E
Q
 
Y
R
 
V
E
 
K
A
 
A
I
 
N
L
 
P
A
 
N
G
 
H
R
 
K
G
 
G
A
 
T
V
 
I
-
 
A
L
 
L
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
S
G
 
D
E
|
E
E
|
E
-
x
A
T
 
T
G
 
A
C
 
K
D
 
D
G
 
G
A
 
T
R
 
I
A
 
H
L
 
V
I
 
V
A
 
E
S
 
T
-
 
L
-
 
M
A
 
A
T
 
R
L
 
D
P
 
E
E
 
K
V
 
I
G
 
T
A
 
Y
L
 
C
I
 
M
V
 
V
G
 
G
E
|
E
P
 
P
T
 
S
A
 
S
-
 
A
-
 
K
-
 
N
-
 
L
-
 
G
N
 
D
Y
 
V
P
 
V
V
 
K
I
 
N
G
 
G
H
x
R
K
 
R
G
 
G
A
x
S
L
 
I
W
 
T
L
 
G
R
 
N
C
 
L
E
 
Y
T
 
I
R
 
Q
G
 
G
K
 
I
T
 
Q
A
 
G
H
 
H
G
 
V
A
 
A
M
 
Y
P
 
P
E
 
H
L
 
L
G
 
A
I
 
E
N
 
N
A
 
P
I
 
I
Y
 
H
L
 
K
A
 
A
A
 
A
D
 
L
A
 
F
L
 
L
G
 
Q
K
 
E
I
 
L
Q
 
T
H
 
T
F
 
Y
S
 
Q
P
 
W
G
 
D
A
 
K
P
 
G
H
 
N
P
 
E
L
 
F
M
 
F
K
 
P
Q
 
P
P
 
T
T
 
S
L
 
L
N
 
Q
V
 
I
G
 
A
R
 
N
I
 
I
E
 
H
G
 
A
G
 
G
L
 
T
N
 
G
I
 
S
N
 
N
S
 
N
V
 
V
-
 
I
P
 
P
D
 
A
R
 
E
T
 
L
R
 
Y
F
 
I
D
 
Q
V
 
F
D
 
N
I
 
L
R
|
R
S
 
Y
A
 
C
P
 
T
N
 
E
L
 
V
Q
 
T
H
 
D
A
 
E
T
 
I
I
 
I
R
 
K
E
 
Q
R
 
K
L
 
V
T
 
A
T
 
E
L
 
M
L
 
L

Sites not aligning to the query:

7t1qA Crystal structure of the succinyl-diaminopimelate desuccinylase (dape) from acinetobacter baumannii in complex with succinic acid
28% identity, 64% coverage: 26:269/380 of query aligns to 25:276/377 of 7t1qA

query
sites
7t1qA
C
 
C
M
 
Q
R
 
T
F
 
I
F
 
M
A
 
A
D
 
D
W
 
R
L
 
L
D
 
A
E
 
K
S
 
V
G
 
G
F
 
F
E
 
H
V
 
I
S
 
E
L
 
P
S
 
M
S
 
R
F
 
F
G
 
G
E
 
D
G
 
V
R
 
D
C
 
-
N
 
N
L
 
L
I
 
W
A
 
A
S
 
R
L
 
R
P
 
-
G
 
-
A
 
G
K
 
T
S
 
E
G
 
G
K
 
P
P
 
V
L
 
F
A
 
C
F
 
F
T
 
A
G
 
G
H
|
H
L
 
T
D
 
D
T
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
T
G
 
G
N
 
R
A
 
L
R
 
D
-
 
A
W
 
W
Q
 
N
Y
 
S
D
 
D
P
 
P
F
 
F
G
 
A
S
 
P
Q
 
E
M
 
I
E
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
K
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
S
S
 
A
D
|
D
M
 
M
K
 
K
A
 
T
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
A
F
 
M
A
 
V
V
 
V
A
 
A
C
 
S
V
 
E
H
 
R
Q
 
F
R
 
V
E
 
A
A
 
K
I
 
H
L
 
P
A
 
N
G
 
H
R
 
K
G
 
G
A
 
S
V
 
I
-
 
A
L
 
F
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
S
G
 
D
E
 
E
E
|
E
T
 
G
-
 
P
G
 
A
C
 
V
D
 
N
G
 
G
A
 
T
R
 
V
A
 
K
L
 
V
I
 
I
A
 
E
S
 
T
A
 
L
T
 
E
L
 
K
-
 
R
-
 
N
P
 
E
E
 
K
V
 
I
G
 
T
A
 
W
L
 
C
I
 
L
V
 
V
G
 
G
E
|
E
P
 
P
T
 
S
A
 
S
N
 
T
Y
 
H
P
 
K
V
 
L
-
 
G
-
 
D
-
 
I
-
 
V
-
 
K
I
 
N
G
 
G
H
 
R
K
 
R
G
 
G
A
 
S
L
 
L
W
 
N
L
 
A
R
 
V
C
 
L
E
 
K
T
 
V
R
 
Q
G
 
G
K
 
K
T
 
Q
A
 
G
H
 
H
G
 
V
A
 
A
M
 
Y
P
 
P
E
 
H
L
 
L
G
 
A
I
 
R
N
 
N
A
 
P
I
 
I
Y
 
H
L
 
E
A
 
A
A
 
S
D
 
P
A
 
A
L
 
L
G
 
A
K
 
E
I
 
L
Q
 
C
H
 
Q
F
 
T
S
 
V
P
 
W
G
 
D
A
 
N
P
 
G
H
 
N
P
 
E
L
 
Y
M
 
F
K
 
P
Q
 
A
P
 
T
T
 
S
L
 
F
N
 
Q
V
 
I
G
 
S
R
 
N
I
 
I
E
 
H
G
 
A
G
 
G
L
 
T
N
 
G
-
 
A
I
 
T
N
 
N
S
 
V
V
 
I
P
 
P
D
 
G
R
 
A
T
 
L
R
 
E
F
 
V
D
 
T
V
 
F
D
 
N
I
 
F
R
 
R
S
 
Y
A
 
S
P
 
T
N
 
E
L
 
V
Q
 
T
H
 
A
A
 
E
T
 
Q
I
 
L
R
 
K
E
 
Q
R
 
R
L
 
V
T
 
H
T
 
E
L
 
I
L
 
L

Sites not aligning to the query:

7lgpB Dape enzyme from shigella flexneri
28% identity, 70% coverage: 4:269/380 of query aligns to 7:277/377 of 7lgpB

query
sites
7lgpB
T
 
V
L
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
T
R
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
I
G
 
R
F
 
R
N
 
P
T
 
S
I
 
L
N
 
S
P
 
P
P
 
-
G
 
-
S
 
D
E
 
D
A
 
A
D
 
G
C
 
C
M
 
Q
R
 
A
F
 
L
F
 
L
A
 
I
D
 
E
W
 
R
L
 
L
D
 
Q
E
 
A
S
 
I
G
 
G
F
 
F
E
 
T
V
 
V
S
 
E
L
 
R
S
 
M
S
 
D
F
 
F
G
 
A
E
 
D
G
 
T
R
 
Q
C
 
-
N
 
N
L
 
F
I
 
W
A
 
A
S
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
W
A
 
R
K
 
G
S
 
Q
G
 
G
K
 
E
P
 
T
L
 
L
A
 
A
F
 
F
T
 
A
G
 
G
H
|
H
L
 
T
D
 
D
T
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
P
G
 
G
N
 
D
A
 
A
-
 
D
R
 
R
W
 
W
Q
 
I
Y
 
N
D
 
P
P
 
P
F
 
F
G
 
E
S
 
P
Q
 
T
M
 
I
E
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
M
L
 
L
Y
 
F
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
A
S
 
A
D
|
D
M
 
M
K
 
K
A
 
G
A
 
S
I
 
L
A
 
A
A
 
A
F
 
M
A
 
V
V
 
V
A
 
A
C
 
A
V
 
-
H
 
-
Q
 
-
R
 
-
E
 
E
A
 
R
I
 
F
L
 
V
A
 
A
-
 
Q
-
 
H
-
 
P
-
 
N
-
 
H
-
 
T
G
 
G
R
 
R
G
 
L
A
 
A
V
 
F
L
 
L
L
 
I
I
 
T
T
 
S
G
 
D
G
 
E
E
 
E
E
 
A
T
 
S
G
 
A
C
 
H
D
 
N
G
 
G
A
 
T
R
 
V
A
 
K
L
 
V
I
 
V
A
 
E
S
 
A
-
 
L
-
 
M
A
 
A
T
 
R
L
 
N
P
 
E
E
 
R
V
 
L
G
 
D
A
 
Y
L
 
C
I
 
L
V
 
V
G
 
G
E
|
E
P
 
P
T
 
S
A
 
S
N
 
I
Y
 
E
P
 
V
V
 
V
-
 
G
-
 
D
-
 
V
-
 
V
-
 
K
I
 
N
G
 
G
H
 
R
K
 
R
G
 
G
A
 
S
L
 
L
W
 
T
L
 
C
R
 
N
C
 
L
E
 
T
T
 
I
R
 
H
G
 
G
K
 
V
T
 
Q
A
 
G
H
 
H
G
 
V
A
 
A
M
 
Y
P
 
P
E
 
H
L
 
L
G
 
A
I
 
D
N
 
N
A
 
P
I
 
V
Y
 
H
L
 
R
A
 
A
A
 
A
D
 
P
A
 
F
L
 
L
G
 
N
K
 
E
I
 
L
Q
 
V
H
 
A
F
 
I
S
 
E
P
 
W
G
 
D
A
 
Q
P
 
G
H
 
N
P
 
E
L
 
F
M
 
F
K
 
P
Q
 
A
P
 
T
T
 
S
L
 
M
N
 
Q
V
 
I
G
 
A
R
 
N
I
 
I
E
 
Q
G
 
A
G
 
G
L
 
T
N
 
G
I
 
S
N
 
N
S
 
N
V
 
V
-
 
I
P
 
P
D
 
G
R
 
E
T
 
L
R
 
F
F
 
V
D
 
Q
V
 
F
D
 
N
I
 
F
R
 
R
S
 
F
A
 
S
P
 
T
N
 
E
L
 
L
Q
 
T
H
 
D
A
 
E
T
 
M
I
 
I
R
 
K
E
 
A
R
 
Q
L
 
V
T
 
L
T
 
A
L
 
L
L
 
L

Q03154 Aminoacylase-1; ACY-1; N-acyl-L-amino-acid amidohydrolase; EC 3.5.1.14 from Homo sapiens (Human) (see 6 papers)
23% identity, 94% coverage: 4:362/380 of query aligns to 12:387/408 of Q03154

query
sites
Q03154
T
 
S
L
 
V
E
 
T
L
 
L
A
 
F
R
 
R
Q
 
Q
L
 
Y
L
 
L
G
 
R
F
 
I
N
 
R
T
 
T
I
 
V
N
 
Q
P
 
P
P
 
K
G
 
P
S
 
D
E
 
Y
A
 
G
D
 
A
C
 
A
M
 
V
R
 
A
F
 
F
F
 
F
A
 
E
D
 
E
W
 
T
L
 
A
D
 
R
E
 
Q
S
 
L
G
 
G
F
 
L
E
 
G
V
 
C
S
 
Q
L
 
K
S
 
V
S
 
E
F
 
V
G
 
A
E
 
P
G
 
G
R
 
Y
C
 
V
N
 
V
L
 
T
I
 
V
A
 
L
S
 
T
L
 
W
P
 
P
G
 
G
A
 
T
K
 
N
-
 
P
S
 
T
G
 
L
K
 
S
P
 
S
L
 
I
A
 
L
F
 
L
T
 
N
G
 
S
H
|
H
L
 
T
D
 
D
T
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
V
G
 
F
N
 
K
A
 
E
R
 
H
W
 
W
Q
 
S
Y
 
H
D
 
D
P
 
P
F
 
F
G
 
E
S
 
A
-
 
F
Q
 
K
M
 
D
E
 
S
D
 
E
G
 
G
R
 
Y
L
 
I
Y
 
Y
G
 
A
R
 
R
G
 
G
S
 
A
S
 
Q
D
|
D
M
 
M
K
 
K
A
 
C
A
 
V
I
 
S
A
 
I
A
 
Q
F
 
Y
A
 
L
V
 
E
A
 
A
C
 
V
V
 
R
H
 
R
Q
 
L
R
 
K
-
 
V
E
 
E
A
 
G
I
 
H
L
 
R
A
 
F
G
 
P
R
 
R
G
 
T
A
 
I
V
 
H
L
 
M
L
 
T
I
 
F
T
 
V
G
 
P
G
 
D
E
|
E
E
|
E
T
 
V
G
 
G
C
 
-
D
 
-
G
 
G
A
 
H
R
 
Q
A
 
G
L
 
M
I
 
E
A
 
L
S
 
F
A
 
V
T
 
Q
L
 
R
P
 
P
E
 
E
V
 
F
G
 
H
A
 
A
L
 
L
I
 
R
V
 
A
G
 
G
-
 
F
-
 
A
-
 
L
-
 
D
-
x
E
-
 
G
-
 
I
-
 
A
E
 
N
P
 
P
T
 
T
A
 
D
N
 
A
Y
 
F
P
 
T
V
 
V
I
 
F
-
 
Y
G
 
S
H
 
E
K
 
R
G
 
S
A
 
P
L
 
W
W
 
W
L
 
V
R
|
R
C
 
V
E
 
T
T
 
S
R
 
T
G
 
G
K
 
R
T
 
P
A
 
G
H
|
H
G
 
A
A
 
S
-
 
R
-
 
F
M
 
M
P
 
E
E
 
D
L
 
T
G
 
A
I
 
A
N
 
E
A
 
K
I
 
L
Y
 
H
L
 
K
A
 
V
A
 
V
D
 
N
A
 
S
L
 
I
-
 
L
-
 
A
G
 
F
K
 
R
I
 
E
Q
 
K
H
x
E
F
 
W
S
 
Q
P
 
R
G
 
L
A
 
Q
P
 
S
H
 
N
P
 
P
L
 
H
M
 
L
K
 
K
Q
 
E
-
 
G
-
 
S
-
 
V
P
 
T
T
 
S
L
 
V
N
 
N
V
 
L
G
 
T
R
 
K
I
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
L
 
V
N
 
A
I
 
Y
N
 
N
S
 
V
V
 
I
P
 
P
D
 
A
R
 
T
T
 
M
R
 
S
F
 
A
D
 
S
V
 
F
D
 
D
I
 
F
R
 
R
S
 
V
A
 
A
P
 
P
N
 
D
L
 
V
Q
 
D
H
 
F
A
 
K
T
 
A
I
 
F
R
 
E
E
 
E
R
 
Q
L
 
L
T
 
Q
T
 
S
L
 
W
L
 
C
-
 
Q
-
 
A
-
 
A
G
 
G
E
 
E
S
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
L
S
 
E
T
 
F
L
 
A
V
 
Q
D
 
K
L
 
W
-
 
M
-
 
H
P
 
P
A
 
Q
V
 
V
L
 
T
S
 
P
R
 
T
E
 
D
D
 
D
-
 
S
H
 
N
A
 
P
W
 
W
I
 
W
K
 
A
Q
 
A
V
 
F
Y
 
S
Q
 
R
R
 
V
C
 
C
Q
 
K
P
 
D
L
 
M
H
 
N
A
 
L
E
 
T
P
 
-
I
 
L
A
 
E
P
 
P
R
 
E
V
 
I
V
 
M
P
 
P
Y
 
A
F
 
A
T
 
T
D
 
D
A
 
N
S
 
R
L
 
Y
L
 
I
-
x
R
-
 
A
-
 
V
-
 
G
L
 
V
P
 
P
A
 
A
L
 
L
G
 
G
D
 
F
P
 
S
P
 
P
C
 
M
I
 
-
I
 
-
L
 
-
G
 
-
P
 
N
G
 
R
E
 
T
P
 
P
S
 
V
M
 
L
A
 
L
H
|
H
Q
 
D
T
 
H
D
 
D
E
 
E
Y
 
-
C
 
-
L
 
-
L
 
-
S
 
-
R
|
R
L
 
L
A
 
H
E
|
E
A
 
A
E
 
V
Q
 
F
L
 
L
Y
x
R
G
 
G

4h2kA Crystal structure of the catalytic domain of succinyl-diaminopimelate desuccinylase from haemophilus influenzae (see paper)
34% identity, 42% coverage: 5:165/380 of query aligns to 8:168/258 of 4h2kA

query
sites
4h2kA
L
 
V
E
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
Q
Q
 
D
L
 
L
L
 
I
G
 
R
F
 
R
N
 
P
T
 
S
I
 
I
N
 
S
P
 
P
P
 
-
G
 
-
S
 
N
E
 
D
A
 
E
D
 
G
C
 
C
M
 
Q
R
 
Q
F
 
I
F
 
I
A
 
A
D
 
E
W
 
R
L
 
L
D
 
E
E
 
K
S
 
L
G
 
G
F
 
F
E
 
Q
V
 
I
S
 
E
L
 
W
S
 
M
S
 
P
F
 
F
G
 
N
E
 
D
G
 
-
R
 
T
C
 
L
N
 
N
L
 
L
I
 
W
A
 
A
S
 
K
L
 
-
P
 
-
G
 
H
A
 
G
K
 
T
S
 
S
G
 
E
K
 
P
P
 
V
L
 
I
A
 
A
F
 
F
T
 
A
G
 
G
H
|
H
L
 
T
D
 
D
T
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
T
G
 
G
N
 
D
A
 
E
-
 
N
R
 
Q
W
 
W
Q
 
S
Y
 
S
D
 
P
P
 
P
F
 
F
G
 
S
S
 
A
Q
 
E
M
 
I
E
 
I
D
 
D
G
 
G
R
 
M
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
A
S
 
A
D
|
D
M
 
M
K
 
K
A
 
G
A
 
S
I
 
L
A
 
A
A
 
A
F
 
M
A
 
I
V
 
V
A
 
A
C
 
A
V
 
E
H
 
E
Q
 
Y
R
 
V
E
 
K
A
 
A
I
 
N
L
 
P
A
 
N
G
 
H
R
 
K
G
 
G
A
 
T
V
 
I
-
 
A
L
 
L
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
S
G
 
D
E
 
E
E
|
E
-
 
A
T
 
T
G
 
A
C
 
K
D
 
D
G
 
G
A
 
T
R
 
I
A
 
H
L
 
V
I
 
V
A
 
E
S
 
T
-
 
L
-
 
M
A
 
A
T
 
R
L
 
D
P
 
E
E
 
K
V
 
I
G
 
T
A
 
Y
L
 
C
I
 
M
V
 
V
G
 
G
E
|
E
P
 
P
T
 
S
A
 
S

Sites not aligning to the query:

3pfoA Crystal structure of a putative acetylornithine deacetylase (rpa2325) from rhodopseudomonas palustris cga009 at 1.90 a resolution
25% identity, 59% coverage: 9:234/380 of query aligns to 26:276/426 of 3pfoA

query
sites
3pfoA
R
 
Q
Q
 
R
L
 
M
L
 
V
G
 
Q
F
 
F
N
 
R
T
 
S
I
 
V
N
 
R
P
 
-
P
 
-
G
 
G
S
 
E
E
 
E
A
 
A
D
 
P
C
 
Q
M
 
Q
R
 
E
F
 
W
F
 
L
A
 
A
D
 
Q
W
 
Q
L
 
F
D
 
A
E
 
D
S
 
R
G
 
G
F
 
Y
E
 
K
V
 
V
S
 
D
L
 
T
S
 
F
S
 
S
F
 
L
G
 
A
E
 
D
-
 
V
-
 
D
-
 
I
-
 
A
-
 
S
-
 
H
-
 
P
-
 
K
-
 
A
-
 
A
-
 
P
-
 
M
-
 
D
-
 
T
-
 
I
-
 
D
-
 
P
-
 
A
G
 
G
R
 
S
C
 
M
N
 
Q
L
 
V
I
 
V
A
 
A
S
 
T
L
 
A
P
 
D
G
 
S
A
 
D
K
 
G
S
 
K
G
 
G
K
 
R
P
 
S
L
 
L
A
 
I
F
 
L
T
 
Q
G
 
G
H
|
H
L
 
I
D
 
D
T
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
E
G
 
G
N
 
P
A
 
V
R
 
D
-
 
L
W
 
W
Q
 
S
Y
 
D
D
 
P
P
 
P
F
 
Y
G
 
E
S
 
A
Q
 
K
M
 
V
E
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
W
L
 
M
Y
 
I
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
A
S
 
Q
D
|
D
M
 
M
K
 
K
A
 
G
A
 
G
I
 
V
A
 
S
A
 
A
F
 
M
A
 
I
V
 
F
A
 
A
C
 
L
V
 
D
H
 
A
Q
 
I
R
 
R
E
 
T
A
 
A
I
 
G
L
 
Y
A
 
A
-
 
P
-
 
D
G
 
A
R
 
R
G
 
V
A
 
H
V
 
V
L
 
Q
L
 
T
I
 
V
T
 
T
G
 
E
G
 
E
E
|
E
E
 
S
T
 
T
G
 
G
C
 
-
D
 
N
G
 
G
A
 
A
R
 
L
A
 
S
L
 
T
I
 
L
A
 
M
S
 
R
A
 
G
T
 
Y
L
 
R
P
 
A
E
 
D
V
 
-
G
 
-
A
 
A
L
 
C
I
 
L
V
 
I
G
 
P
E
|
E
P
 
P
T
 
T
A
 
G
N
 
H
Y
 
T
P
 
L
V
 
T
I
 
R
G
 
A
H
 
Q
K
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
V
W
 
W
L
 
F
R
 
R
C
 
L
E
 
R
T
 
V
R
 
R
G
 
G
K
 
T
T
 
P
A
 
V
H
 
H
G
 
V
A
 
A
M
 
Y
P
 
S
E
 
E
L
 
T
G
 
G
I
 
T
N
 
S
A
 
A
I
 
I
Y
 
L
L
 
S
A
 
A
A
 
M
D
 
H
A
 
L
L
 
I
G
 
R
K
 
A
I
 
F
Q
 
E
H
 
E
F
 
Y
S
 
T
P
 
K
G
 
E
A
 
L
P
 
N
H
 
A
P
 
Q
L
 
A
M
 
V
K
 
R
Q
 
D
P
 
P
-
 
W
-
 
F
-
 
G
-
 
Q
-
 
V
-
 
K
-
 
N
-
 
P
-
 
I
T
 
K
L
 
F
N
 
N
V
 
V
G
 
G
R
 
I
I
 
I
E
 
K
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

P37111 Aminoacylase-1; ACY-1; N-acyl-L-amino-acid amidohydrolase; EC 3.5.1.14 from Sus scrofa (Pig) (see paper)
23% identity, 94% coverage: 4:362/380 of query aligns to 12:386/407 of P37111

query
sites
P37111
T
 
S
L
 
V
E
 
T
L
 
L
A
 
F
R
 
R
Q
 
Q
L
 
Y
L
 
L
G
 
R
F
 
I
N
 
R
T
 
T
I
 
V
N
 
Q
P
 
P
P
 
E
G
 
P
S
 
D
E
 
Y
A
 
G
D
 
A
C
 
A
M
 
V
R
 
A
F
 
F
F
 
L
A
 
E
D
 
E
W
 
R
L
 
A
D
 
R
E
 
Q
S
 
L
G
 
G
F
 
L
E
 
G
V
 
C
S
 
Q
L
 
K
S
 
V
S
 
E
F
 
V
G
 
V
E
 
P
G
 
G
R
 
H
C
 
V
N
 
V
L
 
T
I
 
V
A
 
L
S
 
T
L
 
W
P
 
P
G
 
G
A
 
T
K
 
N
-
 
P
S
 
T
G
 
L
K
 
S
P
 
S
L
 
I
A
 
L
F
 
L
T
 
N
G
 
S
H
 
H
L
 
T
D
 
D
T
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
V
G
 
F
N
 
K
A
 
E
R
 
H
W
 
W
Q
 
S
Y
 
H
D
 
D
P
 
P
F
 
F
-
 
E
G
 
G
S
 
F
Q
 
K
M
 
D
E
 
A
D
 
D
G
 
G
R
 
Y
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
A
S
 
Q
D
 
D
M
 
M
K
 
K
A
 
C
A
 
V
I
 
S
A
 
I
A
 
Q
F
 
Y
A
 
L
V
 
E
A
 
A
C
 
V
V
 
R
H
 
R
Q
 
L
R
 
K
-
 
V
E
 
E
A
 
G
I
 
H
L
 
H
A
 
F
G
 
P
R
 
R
G
 
T
A
 
I
V
 
H
L
 
M
L
 
T
I
 
F
T
 
V
G
 
P
G
 
D
E
 
E
E
 
E
T
 
V
G
 
G
C
 
-
D
 
-
G
 
G
A
 
H
R
 
Q
A
 
G
L
 
M
I
 
E
A
 
L
S
 
F
A
 
V
T
 
K
L
 
R
P
 
P
E
 
E
V
 
F
G
 
Q
A
 
A
L
 
L
I
 
R
V
 
A
G
 
G
-
 
F
-
 
A
-
 
L
-
 
D
-
 
E
-
 
G
-
 
L
-
 
A
E
 
S
P
 
P
T
 
T
A
 
D
N
 
A
Y
 
F
P
 
T
V
 
V
I
 
F
-
 
Y
G
 
S
H
 
E
K
 
R
G
 
S
A
 
P
L
 
W
W
 
W
L
 
L
R
 
R
C
 
V
E
 
T
T
 
S
R
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
P
A
 
G
H
 
H
G
 
G
A
 
S
-
 
R
-
 
F
M
 
I
P
 
E
E
 
D
L
 
T
G
 
A
I
 
A
N
 
E
A
 
K
I
 
L
Y
 
H
L
 
K
A
 
V
A
 
I
D
 
N
A
 
S
L
 
I
G
 
L
K
 
A
I
 
F
Q
 
R
H
 
E
F
 
K
S
 
E
P
 
K
G
 
Q
A
 
R
P
 
L
H
 
Q
P
 
S
L
 
N
M
 
Q
K
 
L
Q
 
K
P
 
P
-
 
G
-
 
A
-
 
V
-
 
T
T
 
S
L
 
V
N
 
N
V
 
L
G
 
T
R
 
M
I
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
L
 
V
N
 
A
I
 
Y
N
 
N
S
 
V
V
 
V
P
 
P
D
 
A
R
 
T
T
 
M
R
 
S
F
 
A
D
 
C
V
 
F
D
 
D
I
 
F
R
 
R
S
 
V
A
 
A
P
 
P
N
 
D
L
 
V
Q
 
D
H
 
L
A
 
K
T
 
A
I
 
F
R
 
E
E
 
E
R
 
Q
L
 
L
T
 
Q
T
 
S
L
 
W
L
 
C
-
 
Q
-
 
A
-
 
A
G
 
G
E
 
E
S
 
G
V
 
V
T
 
T
-
 
F
-
 
E
-
 
F
V
 
V
S
 
Q
T
 
K
L
 
W
V
 
M
D
 
E
L
 
T
P
 
Q
A
 
V
V
 
T
L
 
S
S
 
T
R
 
D
E
 
D
D
 
S
H
 
D
A
 
P
W
 
W
I
 
W
K
 
A
Q
 
A
V
 
F
Y
 
S
Q
 
G
R
 
V
C
 
F
Q
 
K
P
 
D
L
 
M
H
 
K
A
 
L
E
 
-
P
 
A
I
 
L
A
 
E
P
 
L
R
 
E
V
 
I
V
 
C
P
 
P
Y
 
A
F
 
S
T
 
T
D
 
D
A
 
A
S
 
R
L
 
Y
L
 
I
-
 
R
-
 
A
-
 
A
-
 
G
L
 
V
P
 
P
A
 
A
L
 
L
G
 
G
D
 
F
P
 
S
P
 
P
C
 
M
I
 
-
I
 
-
L
 
-
G
 
-
P
 
N
G
 
H
E
 
T
P
 
P
S
 
V
M
 
L
A
 
L
H
 
H
Q
 
D
T
 
H
D
 
D
E
 
E
Y
 
-
C
 
-
L
 
-
L
 
-
S
 
-
R
 
R
L
 
L
A
 
H
E
 
E
A
 
A
E
 
V
Q
 
F
L
 
L
Y
 
R
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Q8P8J5 N-acetyl-L-citrulline deacetylase; ACDase; Acetylcitrulline deacetylase; EC 3.5.1.- from Xanthomonas campestris pv. campestris (strain ATCC 33913 / DSM 3586 / NCPPB 528 / LMG 568 / P 25) (see paper)
25% identity, 96% coverage: 1:365/380 of query aligns to 5:362/366 of Q8P8J5

query
sites
Q8P8J5
M
 
L
T
 
A
T
 
S
T
 
T
L
 
L
E
 
E
L
 
H
A
 
L
R
 
E
Q
 
T
L
 
L
L
 
V
G
 
S
F
 
F
N
 
D
T
 
T
I
 
R
N
 
N
P
 
P
P
 
P
G
 
R
S
 
A
E
 
I
A
 
A
D
 
A
C
 
E
M
 
G
R
 
G
F
 
I
F
 
F
A
 
-
D
 
D
W
 
Y
L
 
L
D
 
R
E
 
A
S
 
Q
-
 
L
-
 
P
G
 
G
F
 
F
E
 
Q
V
 
V
S
 
E
L
 
V
S
 
I
S
 
D
F
 
H
G
 
G
E
 
D
G
 
G
R
 
A
C
 
V
N
 
S
L
 
L
I
 
Y
A
 
A
S
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
V
K
 
R
S
 
G
G
 
T
K
 
P
P
 
K
L
 
Y
A
 
L
F
 
F
T
 
N
G
 
V
H
|
H
L
 
L
D
 
D
T
 
T
V
 
V
P
 
P
L
 
-
G
 
D
N
 
S
A
 
P
R
 
H
W
 
W
Q
 
S
Y
 
A
D
 
D
P
 
P
F
 
H
G
 
V
S
 
M
Q
 
R
M
 
R
E
 
T
D
 
E
G
 
D
R
 
R
L
 
V
Y
 
I
G
 
G
R
 
L
G
 
G
S
 
V
S
 
C
D
|
D
M
 
I
K
 
K
A
 
G
A
 
A
I
 
A
A
 
A
A
 
A
F
 
L
A
 
V
V
 
A
A
 
A
C
 
A
V
 
N
H
 
A
Q
 
G
R
 
D
E
 
G
A
 
D
I
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
-
A
 
A
V
 
A
L
 
F
L
 
L
I
 
F
T
 
S
G
 
S
G
 
D
E
 
E
E
 
E
T
 
A
G
 
N
C
 
D
D
 
P
G
 
R
A
 
C
R
 
I
A
 
A
L
 
A
I
 
F
A
 
L
S
 
A
A
 
R
T
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
-
V
 
Y
G
 
D
A
 
A
L
 
V
I
 
L
V
 
V
G
 
A
E
|
E
P
 
P
T
 
T
A
 
M
N
 
S
Y
 
E
P
 
A
V
 
V
I
 
L
G
 
A
H
 
H
K
 
R
G
 
G
A
 
I
L
 
S
W
 
S
L
 
V
R
 
L
C
 
M
E
 
R
T
 
F
R
 
A
G
 
G
K
 
R
T
 
A
A
 
G
H
 
H
G
 
A
A
 
S
-
 
G
M
 
K
P
 
Q
E
 
D
L
 
P
G
 
A
I
 
A
N
 
S
A
 
A
I
 
L
Y
 
H
L
 
Q
A
 
A
A
 
M
D
 
R
A
 
W
L
 
G
G
 
G
K
 
K
I
 
A
Q
 
L
H
 
D
F
 
H
S
 
V
P
 
E
G
 
S
A
 
L
P
 
A
H
 
H
P
 
A
L
 
R
M
 
F
K
 
G
Q
 
G
P
 
L
T
 
T
-
 
G
-
 
L
-
 
R
L
 
F
N
 
N
V
 
I
G
 
G
R
 
R
I
 
V
E
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
I
N
 
K
I
 
A
N
 
N
S
 
M
V
 
I
P
 
A
D
 
P
R
 
A
T
 
A
R
 
E
F
 
L
D
 
R
V
 
F
D
 
G
I
 
F
R
 
R
S
 
P
A
 
L
P
 
P
N
 
S
L
 
M
Q
 
D
H
 
-
A
 
-
T
 
-
I
 
V
R
 
D
E
 
G
R
 
L
L
 
L
T
 
A
T
 
T
L
 
F
L
 
A
G
 
G
-
 
F
-
 
A
-
 
D
-
 
P
E
 
A
S
 
A
V
 
A
T
 
H
V
 
F
S
 
E
T
 
E
L
 
T
V
 
F
D
 
R
L
 
G
P
 
P
A
 
S
V
 
L
L
 
P
S
 
S
R
 
G
E
 
D
D
 
-
H
 
-
A
 
-
W
 
-
I
 
I
K
 
A
Q
 
R
V
 
A
Y
 
E
Q
 
E
R
 
R
C
 
-
Q
 
-
P
 
R
L
 
L
H
 
A
A
 
A
E
 
R
P
 
D
I
 
V
A
 
A
P
 
D
-
 
A
-
 
L
-
 
D
-
 
L
-
 
P
-
 
I
-
 
G
R
 
N
V
 
A
V
 
V
P
 
D
Y
 
F
F
 
W
T
 
T
D
 
E
A
 
A
S
 
S
L
 
L
L
 
F
L
 
-
P
 
-
A
 
S
L
 
A
G
 
G
D
 
G
P
 
Y
P
 
T
C
 
A
I
 
L
I
 
V
L
 
Y
G
 
G
P
 
P
G
 
G
E
 
D
P
 
I
S
 
A
M
 
Q
A
 
A
H
 
H
Q
 
T
T
 
A
D
 
D
E
 
E
Y
 
F
C
 
V
L
 
T
L
 
L
S
 
A
R
 
Q
L
 
L
A
 
Q
E
 
R
A
 
Y
E
 
V
Q
 
E
L
 
S
Y
 
V
G
 
N
D
 
R
I
 
I
I
 
I

3rzaA Crystal structure of a tripeptidase (sav1512) from staphylococcus aureus subsp. Aureus mu50 at 2.10 a resolution
27% identity, 79% coverage: 49:347/380 of query aligns to 55:349/373 of 3rzaA

query
sites
3rzaA
G
 
G
R
 
A
C
 
N
N
 
N
L
 
L
I
 
V
A
 
C
S
 
T
L
 
M
P
 
N
G
 
S
A
 
T
K
 
I
S
 
E
G
 
V
K
 
P
P
 
K
L
 
L
A
 
Y
F
 
L
T
 
T
G
 
S
H
|
H
L
 
M
D
 
D
T
 
T
V
 
V
-
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
I
N
 
N
A
 
V
R
 
K
W
 
-
Q
 
-
Y
 
-
D
 
-
P
 
P
F
 
I
G
 
V
S
 
K
Q
 
-
M
 
-
E
 
D
D
 
D
G
 
G
R
 
Y
L
 
I
Y
 
Y
G
 
S
R
 
D
G
 
G
S
 
T
S
 
T
-
 
I
-
 
L
-
 
G
-
 
A
D
|
D
M
 
D
K
 
K
A
 
A
A
 
G
I
 
L
A
 
A
A
 
A
-
 
M
F
 
L
A
 
E
V
 
V
A
 
L
C
 
Q
V
 
V
H
 
I
Q
 
K
R
 
E
E
 
Q
A
 
Q
I
 
I
L
 
P
A
 
H
G
 
G
R
 
Q
G
 
-
A
 
I
V
 
Q
L
 
F
L
 
V
I
 
I
T
 
T
G
 
V
G
 
G
E
 
E
E
|
E
T
 
S
G
 
G
C
 
L
D
 
I
G
 
G
A
 
A
R
 
K
A
 
E
L
 
L
I
 
N
A
 
S
S
 
E
A
 
L
T
 
L
L
 
D
P
 
A
E
 
D
V
 
F
G
 
G
A
 
Y
L
 
A
I
 
I
V
x
D
G
 
A
E
 
S
P
 
A
T
 
D
A
 
V
N
 
G
Y
 
T
P
 
T
V
 
V
I
 
V
G
 
G
H
 
A
K
 
P
G
 
T
A
 
Q
L
 
M
W
 
L
L
 
I
R
 
S
C
 
A
E
 
K
T
 
I
R
 
I
G
 
G
K
 
K
T
 
T
A
 
A
H
 
H
G
 
A
A
 
S
M
 
T
P
 
P
E
 
K
L
 
E
G
 
G
I
 
V
N
 
S
A
 
A
I
 
I
Y
 
N
L
 
I
A
 
A
A
 
A
D
 
K
A
 
A
L
 
I
G
 
S
K
 
R
I
 
M
Q
 
K
H
 
-
F
 
-
S
 
-
P
 
L
G
 
G
A
 
Q
P
 
V
H
 
D
P
 
E
L
 
I
M
 
-
K
 
-
Q
 
-
P
 
T
T
 
T
L
 
A
N
 
N
V
 
I
G
 
G
R
 
K
I
 
F
E
 
H
G
 
G
G
 
G
L
 
S
N
 
A
I
 
T
N
 
N
S
 
I
V
 
V
P
 
A
D
 
D
R
 
E
T
 
V
R
 
I
F
 
L
D
 
E
V
 
A
D
 
E
I
 
A
R
 
R
S
 
S
-
 
H
-
 
D
-
 
P
-
 
E
-
 
R
-
 
I
A
 
K
P
 
T
N
 
Q
L
 
V
Q
 
K
H
 
H
A
 
M
T
 
T
-
 
D
I
 
V
R
 
F
E
 
E
R
 
T
L
 
T
T
 
A
T
 
S
L
 
E
L
 
L
G
 
G
E
 
G
S
 
K
V
 
A
T
 
E
V
 
V
S
 
T
T
 
V
L
 
E
V
 
Q
D
 
S
L
 
Y
P
 
P
A
 
G
V
 
F
L
 
K
S
 
I
R
 
N
E
 
D
D
 
N
H
 
E
A
 
A
W
 
V
I
 
V
K
 
K
-
 
I
-
 
A
Q
 
Q
V
 
E
Y
 
S
Q
 
A
R
 
R
C
 
N
Q
 
L
P
 
G
L
 
L
H
 
S
A
 
A
E
 
N
P
 
T
I
 
I
A
 
-
P
 
-
R
 
-
V
 
I
V
 
S
P
 
G
Y
 
G
F
 
G
T
 
S
D
 
D
A
 
G
S
 
S
L
 
-
L
 
I
L
 
I
P
 
N
A
 
T
L
 
F
G
 
G
D
 
-
P
 
I
P
 
P
C
 
S
I
 
V
I
 
I
L
 
L
G
 
G
P
 
V
G
 
G
E
 
Y
P
 
E
S
 
K
M
 
I
A
 
-
H
|
H
Q
 
T
T
 
T
D
 
N
E
 
E

Sites not aligning to the query:

2f7vA Structure of acetylcitrulline deacetylase complexed with one co (see paper)
25% identity, 96% coverage: 1:365/380 of query aligns to 6:357/360 of 2f7vA

query
sites
2f7vA
M
 
L
T
 
A
T
 
S
T
 
T
L
 
L
E
 
E
L
 
H
A
 
L
R
 
E
Q
 
T
L
 
L
L
 
V
G
 
S
F
 
F
N
 
D
T
 
T
I
 
R
N
 
N
P
 
P
P
 
P
G
 
R
S
 
A
E
 
I
A
 
A
D
 
A
C
 
E
M
 
G
R
 
G
F
 
I
F
 
F
A
 
-
D
 
D
W
 
Y
L
 
L
D
 
R
E
 
A
S
 
Q
-
 
L
-
 
P
G
 
G
F
 
F
E
 
Q
V
 
V
S
 
E
L
 
V
S
 
I
S
 
D
F
 
H
G
 
G
E
 
D
G
 
G
R
 
A
C
 
V
N
 
S
L
 
L
I
 
Y
A
 
A
S
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
V
K
 
R
S
 
G
G
 
T
K
 
P
P
 
K
L
 
Y
A
 
L
F
 
F
T
 
N
G
 
V
H
|
H
L
 
L
D
 
D
T
 
T
V
 
V
P
 
P
L
 
-
G
 
D
N
 
S
A
 
P
R
 
H
W
 
W
Q
 
S
Y
 
A
D
 
D
P
 
P
F
 
H
G
 
V
S
 
M
Q
 
R
M
 
R
E
 
T
D
 
E
G
 
D
R
 
R
L
 
V
Y
 
I
G
 
G
R
 
L
G
 
G
S
 
V
S
 
C
D
|
D
M
 
I
K
 
K
A
 
G
A
 
A
I
 
A
A
 
A
A
 
A
F
 
L
A
 
V
V
 
A
A
 
A
C
 
A
V
 
N
H
 
A
Q
 
G
R
 
D
E
 
G
A
 
D
I
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
-
A
 
A
V
 
A
L
 
F
L
 
L
I
 
F
T
 
S
G
 
S
G
 
D
E
|
E
E
 
E
T
 
A
G
 
N
C
 
D
D
 
P
G
 
R
A
 
C
R
 
I
A
 
A
L
 
A
I
 
F
A
 
L
S
 
A
A
 
R
T
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
-
V
 
Y
G
 
D
A
 
A
L
 
V
I
 
L
V
 
V
G
 
A
E
|
E
P
 
P
T
 
T
A
 
M
N
 
S
Y
 
E
P
 
A
V
 
V
I
 
L
G
 
A
H
 
H
K
 
R
G
 
G
A
 
I
L
 
S
W
 
S
L
 
V
R
 
L
C
 
M
E
 
R
T
 
F
R
 
A
G
 
G
K
 
R
T
 
A
A
 
G
H
 
D
G
 
P
A
 
A
M
 
A
P
 
S
E
 
A
L
 
L
G
 
H
I
 
-
N
 
Q
A
 
A
I
 
M
Y
 
R
L
 
W
A
 
G
A
 
G
D
 
K
A
 
A
L
 
L
G
 
D
K
 
H
I
 
V
Q
 
E
H
 
S
F
 
L
S
 
A
P
 
H
G
 
-
A
 
A
P
 
R
H
 
F
P
 
G
L
 
G
M
 
L
K
 
T
Q
 
G
P
 
L
T
 
R
L
 
F
N
 
N
V
 
I
G
 
G
R
 
R
I
 
V
E
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
I
N
 
K
I
 
A
N
 
N
S
 
M
V
 
I
P
 
A
D
 
P
R
 
A
T
 
A
R
 
E
F
 
L
D
 
R
V
 
F
D
 
G
I
 
F
R
 
R
S
 
P
A
 
L
P
 
P
N
 
S
L
 
M
Q
 
D
H
 
-
A
 
-
T
 
-
I
 
V
R
 
D
E
 
G
R
 
L
L
 
L
T
 
A
T
 
T
L
 
F
L
 
A
G
 
G
-
 
F
-
 
A
-
 
D
-
 
P
E
 
A
S
 
A
V
 
A
T
 
H
V
 
F
S
 
E
T
 
E
L
 
T
V
 
F
D
 
R
L
 
G
P
 
P
A
 
S
V
 
L
L
 
P
S
 
S
R
 
G
E
 
D
D
 
-
H
 
-
A
 
-
W
 
-
I
 
I
K
 
A
Q
 
R
V
 
A
Y
 
E
Q
 
E
R
 
R
C
 
-
Q
 
-
P
 
R
L
 
L
H
 
A
A
 
A
E
 
R
P
 
D
I
 
V
A
 
A
P
 
D
-
 
A
-
 
L
-
 
D
-
 
L
-
 
P
-
 
I
-
 
G
R
 
N
V
 
A
V
 
V
P
 
D
Y
 
F
F
 
W
T
 
T
D
 
E
A
 
A
S
 
S
L
 
L
L
 
F
L
 
-
P
 
-
A
 
S
L
 
A
G
 
G
D
 
G
P
 
Y
P
 
T
C
 
A
I
 
L
I
 
V
L
 
Y
G
 
G
P
 
P
G
 
G
E
 
D
P
 
I
S
 
A
M
 
Q
A
 
A
H
 
H
Q
 
T
T
 
A
D
 
D
E
 
E
Y
 
F
C
 
V
L
 
T
L
 
L
S
 
A
R
 
Q
L
 
L
A
 
Q
E
 
R
A
 
Y
E
 
V
Q
 
E
L
 
S
Y
 
V
G
 
N
D
 
R
I
 
I
I
 
I

P45494 Beta-Ala-Xaa dipeptidase; Beta-Ala-His dipeptidase; Peptidase V; EC 3.4.13.- from Lactobacillus delbrueckii subsp. lactis (see paper)
30% identity, 43% coverage: 25:189/380 of query aligns to 47:203/470 of P45494

query
sites
P45494
D
 
D
C
 
A
M
 
M
R
 
T
F
 
K
F
 
F
A
 
L
D
 
S
W
 
F
L
 
A
D
 
K
E
 
R
S
 
D
G
 
G
F
 
F
E
 
D
V
 
T
S
 
E
L
 
N
S
 
F
S
 
A
F
 
N
G
 
Y
E
 
A
G
 
G
R
 
R
C
 
V
N
 
N
L
 
F
I
 
G
A
 
A
S
 
G
L
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
D
K
 
K
P
 
R
L
 
L
A
 
G
F
 
I
T
 
I
G
 
G
H
|
H
L
 
M
D
 
D
T
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
N
 
E
A
 
G
R
 
-
W
 
W
Q
 
T
Y
 
R
D
 
D
P
 
P
F
 
F
G
 
K
S
 
M
Q
 
E
M
 
I
-
 
D
E
 
E
D
 
E
G
 
G
R
 
R
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
S
S
 
A
D
|
D
M
 
D
K
 
K
A
 
G
A
 
P
I
 
S
A
 
L
A
 
T
F
 
A
A
 
Y
V
 
Y
A
 
G
C
 
M
V
 
L
H
 
L
Q
 
L
R
 
K
E
 
E
A
 
A
I
 
G
L
 
F
A
 
K
G
 
P
R
 
K
G
 
K
A
 
K
V
 
I
L
 
D
L
 
F
I
 
V
T
 
L
G
 
G
-
 
T
G
 
N
E
 
E
E
|
E
T
 
T
G
 
N
C
 
W
D
 
V
G
 
G
A
 
I
R
 
D
A
 
Y
L
 
Y
I
 
L
A
 
K
S
 
H
A
 
E
T
 
P
L
 
T
P
 
P
E
 
D
V
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
I
 
I
V
 
V
G
 
F
E
 
S
P
 
P
T
x
D
A
 
A
N
 
E
Y
 
Y
P
 
P
V
 
I
I
 
I
-
 
N
G
 
G
H
 
E
K
 
Q
G
 
G
A
 
I
L
 
F
W
 
T
L
 
L
R
 
E
C
 
F
E
 
S
T
 
F
R
 
K
G
 
N
K
 
D
T
 
D
A
 
T
H
 
K
G
 
G

Sites not aligning to the query:

1lfwA Crystal structure of pepv (see paper)
30% identity, 43% coverage: 25:189/380 of query aligns to 47:203/468 of 1lfwA

query
sites
1lfwA
D
 
D
C
 
A
M
 
M
R
 
T
F
 
K
F
 
F
A
 
L
D
 
S
W
 
F
L
 
A
D
 
K
E
 
R
S
 
D
G
 
G
F
 
F
E
 
D
V
 
T
S
 
E
L
 
N
S
 
F
S
 
A
F
 
N
G
 
Y
E
 
A
G
 
G
R
 
R
C
 
V
N
 
N
L
 
F
I
 
G
A
 
A
S
 
G
L
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
K
 
-
S
 
-
G
 
D
K
 
K
P
 
R
L
 
L
A
 
G
F
 
I
T
 
I
G
 
G
H
|
H
L
 
M
D
 
D
T
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
N
 
E
A
 
G
R
 
-
W
 
W
Q
 
T
Y
 
R
D
 
D
P
 
P
F
 
F
G
 
K
S
 
M
Q
 
E
M
 
I
-
 
D
E
 
E
D
 
E
G
 
G
R
 
R
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
S
S
 
A
D
|
D
M
 
D
K
 
K
A
 
G
A
 
P
I
 
S
A
 
L
A
 
T
F
 
A
A
 
Y
V
 
Y
A
 
G
C
 
M
V
 
L
H
 
L
Q
 
L
R
 
K
E
 
E
A
 
A
I
 
G
L
 
F
A
 
K
G
 
P
R
 
K
G
 
K
A
 
K
V
 
I
L
 
D
L
 
F
I
 
V
T
 
L
G
 
G
-
 
T
G
 
N
E
|
E
E
|
E
T
 
T
G
 
N
C
 
W
D
 
V
G
 
G
A
 
I
R
 
D
A
 
Y
L
 
Y
I
 
L
A
 
K
S
 
H
A
 
E
T
 
P
L
 
T
P
 
P
E
 
D
V
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
I
 
I
V
 
V
G
 
F
E
 
S
P
 
P
T
x
D
A
 
A
N
 
E
Y
 
Y
P
 
P
V
 
I
I
 
I
-
 
N
G
 
G
H
 
E
K
 
Q
G
 
G
A
 
I
L
 
F
W
 
T
L
 
L
R
 
E
C
 
F
E
 
S
T
 
F
R
 
K
G
 
N
K
 
D
T
 
D
A
 
T
H
 
K
G
 
G

Sites not aligning to the query:

4op4B Crystal structure of the catalytic domain of dape protein from v.Cholerea in the zn bound form (see paper)
31% identity, 43% coverage: 5:169/380 of query aligns to 6:170/265 of 4op4B

query
sites
4op4B
L
 
L
E
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
K
Q
 
E
L
 
L
L
 
I
G
 
S
F
 
R
N
 
Q
T
 
S
I
 
V
N
 
T
P
 
P
P
 
-
G
 
-
S
 
A
E
 
D
A
 
A
D
 
G
C
 
C
M
 
Q
R
 
D
F
 
L
F
 
M
A
 
I
D
 
E
W
 
R
L
 
L
D
 
K
E
 
A
S
 
L
G
 
G
F
 
F
E
 
E
V
 
I
S
 
E
L
 
S
S
 
M
S
 
V
F
 
F
G
 
-
E
 
E
G
 
D
R
 
T
C
 
T
N
 
N
L
 
F
I
 
W
A
 
A
S
 
R
L
 
-
P
 
R
G
 
G
A
 
T
K
 
Q
S
 
S
G
 
-
K
 
-
P
 
P
L
 
L
-
 
F
A
 
V
F
 
F
T
 
A
G
 
G
H
|
H
L
 
T
D
 
D
T
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
N
 
P
-
 
L
A
 
S
R
 
Q
W
 
W
Q
 
H
Y
 
T
D
 
P
P
 
P
F
 
F
G
 
E
S
 
P
Q
 
T
M
 
V
E
 
I
D
 
D
G
 
G
R
 
F
L
 
L
Y
 
H
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
A
S
 
A
D
|
D
M
 
M
K
 
K
A
 
G
A
 
S
I
 
L
A
 
A
A
 
C
F
 
M
A
 
I
V
 
V
A
 
A
C
 
V
V
 
E
H
 
R
Q
 
F
R
 
I
E
 
A
A
 
E
I
 
H
L
 
P
A
 
D
G
 
H
R
 
Q
G
 
G
A
 
S
V
 
I
-
 
G
L
 
F
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
S
G
 
D
E
 
E
E
|
E
T
 
G
G
 
P
C
 
F
D
 
I
G
 
N
A
 
G
R
 
T
A
 
V
L
 
R
I
 
V
A
 
V
S
 
E
A
 
T
T
 
L
L
 
M
P
 
A
E
 
R
-
 
N
-
 
E
-
 
L
V
 
I
G
 
D
A
 
M
L
 
C
I
 
I
V
 
V
G
 
G
E
|
E
P
 
P
T
 
S
A
 
S
N
 
T
Y
 
L
P
 
A
V
 
V

Sites not aligning to the query:

O04373 IAA-amino acid hydrolase ILR1-like 4; jasmonoyl-L-amino acid hydrolase; EC 3.5.1.-; EC 3.5.1.127 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
24% identity, 47% coverage: 126:303/380 of query aligns to 158:363/440 of O04373

query
sites
O04373
R
 
Q
G
 
G
A
 
T
V
 
V
L
 
V
L
 
L
I
 
V
T
 
F
G
 
Q
G
 
P
E
 
A
E
 
E
T
 
E
G
 
G
C
 
G
D
 
G
G
 
G
A
 
A
R
 
K
A
 
K
L
 
I
I
 
V
A
 
E
S
 
A
A
 
G
T
 
V
L
 
L
P
 
E
E
 
N
V
 
V
G
 
S
A
 
A
L
 
-
I
 
I
V
 
F
G
 
G
E
 
L
P
 
H
T
 
V
A
 
T
N
 
N
Y
 
Q
P
 
L
V
 
A
I
 
L
G
 
G
H
 
Q
-
 
V
-
 
S
-
x
S
-
 
R
-
 
E
-
 
G
-
 
P
-
 
M
-
 
L
K
 
A
G
 
G
A
 
S
L
 
G
W
 
F
L
 
F
R
 
K
C
 
A
E
 
K
T
 
I
R
 
S
G
|
G
K
 
K
T
x
G
A
 
G
H
 
H
G
 
A
A
|
A
M
 
L
P
 
P
E
 
Q
L
 
H
G
 
T
I
 
I
N
 
D
A
 
P
I
 
I
Y
 
L
L
 
A
A
 
A
A
 
S
D
 
N
A
 
V
L
 
I
G
 
V
K
 
S
I
 
L
Q
 
Q
H
 
H
F
 
L
S
 
V
P
 
S
G
 
R
A
 
E
P
 
A
H
 
D
P
 
P
L
 
L
M
 
D
K
 
S
Q
 
Q
P
 
-
T
 
V
L
 
V
N
 
T
V
 
V
G
 
A
R
 
K
I
 
F
E
 
E
G
 
G
G
 
G
L
 
G
N
 
A
I
 
F
N
 
N
S
 
V
V
 
I
P
 
P
D
 
D
R
 
S
T
 
V
R
 
T
F
 
I
D
 
G
V
 
G
D
 
T
I
 
F
R
 
R
S
 
A
A
 
F
P
 
S
N
 
T
L
 
K
Q
 
S
H
 
F
A
 
M
T
 
Q
I
 
L
R
 
K
E
 
K
R
 
R
L
 
I
T
 
E
T
 
Q
L
 
V
L
 
I
G
 
T
E
 
R
S
 
Q
V
 
A
T
 
S
V
 
V
-
 
N
-
 
M
-
 
C
S
 
N
T
 
A
L
 
T
V
 
V
D
 
D
L
 
F
-
 
I
-
 
E
-
 
E
-
 
E
-
 
K
-
 
P
-
 
F
-
 
F
-
 
P
P
 
P
A
 
T
V
 
V
L
 
N
S
 
D
R
 
K
E
 
A
D
 
L
H
 
H
A
 
Q
W
 
F
I
 
F
K
 
K
Q
 
N
V
 
V
-
 
S
-
 
G
-
 
D
-
 
M
-
 
L
-
 
G
-
 
I
-
 
E
-
 
N
Y
 
Y
Q
 
V
R
 
E
C
 
M
Q
 
Q
P
 
P
L
 
L

5k8pA Zn2+/tetrahedral intermediate-bound r289a 5-nitroanthranilate aminohydrolase (see paper)
21% identity, 67% coverage: 19:271/380 of query aligns to 30:317/421 of 5k8pA

query
sites
5k8pA
P
 
P
P
 
T
G
 
G
S
 
R
E
 
E
A
 
G
D
 
A
C
 
A
M
 
G
R
 
D
F
 
Y
F
 
V
A
 
Y
D
 
E
W
 
W
L
 
M
D
 
A
E
 
R
S
 
N
G
 
G
F
 
F
E
 
G
V
 
P
S
 
E
L
 
R
S
 
V
S
 
G
F
 
V
G
 
F
E
 
D
G
 
D
R
 
R
C
 
F
N
 
N
L
 
V
I
 
V
A
 
G
S
 
R
L
 
L
P
 
R
G
 
G
A
 
T
K
 
G
S
 
G
G
 
G
K
 
A
P
 
S
L
 
L
A
 
S
F
 
F
T
 
N
G
 
S
H
|
H
L
 
L
D
 
D
T
 
T
V
x
I
P
 
M
L
 
A
G
 
R
N
 
E
A
 
D
R
 
T
W
 
A
Q
 
R
Y
 
F
D
 
A
P
 
D
F
 
A
G
 
N
S
 
D
Q
 
R
M
 
I
-
 
Y
-
 
H
-
 
E
-
 
A
-
 
W
-
 
H
E
 
E
D
 
E
G
 
G
R
 
R
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
R
 
Y
G
 
S
S
 
V
S
 
V
D
x
N
M
 
C
K
 
K
A
 
G
A
 
P
I
 
M
A
 
A
A
 
C
F
 
W
A
 
L
V
 
I
A
 
A
C
 
A
V
 
K
H
 
A
Q
 
L
R
 
K
E
 
E
A
 
A
I
 
G
L
 
A
A
 
A
G
 
L
R
 
K
G
 
G
A
 
D
V
 
V
L
 
V
L
 
L
I
 
T
T
 
A
G
 
V
G
 
C
E
 
G
E
|
E
T
 
I
G
 
D
C
 
C
D
 
E
-
 
P
-
 
V
-
 
D
-
 
E
-
 
F
-
 
Q
-
 
G
-
 
H
-
 
D
-
 
Y
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
D
-
 
I
G
 
G
A
 
A
R
 
R
A
 
Y
L
 
A
I
 
I
A
 
S
S
 
H
A
 
G
T
 
A
L
 
I
P
 
S
E
 
D
V
 
Y
G
 
A
A
 
-
L
 
-
I
 
L
V
 
V
G
 
A
E
|
E
P
 
A
T
 
T
A
 
N
N
 
F
Y
 
K
P
 
P
V
 
A
I
 
W
G
 
V
H
 
E
K
 
A
G
 
G
A
 
K
L
 
V
W
 
F
L
 
L
R
 
K
C
 
V
E
 
T
T
 
V
R
 
F
G
 
A
-
 
G
-
 
P
-
 
S
-
 
R
K
 
Y
T
 
T
A
 
P
H
 
Y
G
 
V
A
 
P
M
 
R
P
 
P
E
 
V
L
 
A
G
 
A
I
 
L
-
 
D
-
 
S
-
 
P
N
 
N
A
 
A
I
 
I
Y
 
V
L
 
R
A
 
M
A
 
A
D
 
K
A
 
L
L
 
V
G
 
E
K
 
A
I
 
L
Q
 
E
H
 
E
F
 
W
S
 
A
P
 
D
G
 
N
A
 
Y
P
 
E
H
 
K
P
 
R
L
 
Y
M
 
T
K
 
R
Q
 
E
-
 
Y
-
 
G
-
 
G
-
 
G
-
 
T
-
 
V
-
 
V
P
 
P
T
 
K
L
 
V
N
 
A
V
 
I
G
 
G
R
 
A
I
 
I
E
 
R
G
 
G
G
 
G
L
 
V
-
 
P
-
 
Y
N
 
K
I
 
I
N
 
Y
S
 
A
V
 
F
P
 
P
D
 
E
R
 
L
T
 
C
R
 
S
F
 
I
D
 
Y
V
 
M
D
 
D
I
 
I
R
 
R
S
 
L
A
 
N
P
 
P
N
 
D
L
 
T
Q
 
N
H
 
P
A
 
L
T
 
V
I
 
V
R
 
Q
E
 
R
R
 
E
L
 
V
T
 
E
T
 
A
L
 
V
L
 
V
G
 
S
E
 
K

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_012968216.1 NCBI__GCF_000025465.1:WP_012968216.1
MTTTLELARQLLGFNTINPPGSEADCMRFFADWLDESGFEVSLSSFGEGRCNLIASLPGA
KSGKPLAFTGHLDTVPLGNARWQYDPFGSQMEDGRLYGRGSSDMKAAIAAFAVACVHQRE
AILAGRGAVLLITGGEETGCDGARALIASATLPEVGALIVGEPTANYPVIGHKGALWLRC
ETRGKTAHGAMPELGINAIYLAADALGKIQHFSPGAPHPLMKQPTLNVGRIEGGLNINSV
PDRTRFDVDIRSAPNLQHATIRERLTTLLGESVTVSTLVDLPAVLSREDHAWIKQVYQRC
QPLHAEPIAPRVVPYFTDASLLLPALGDPPCIILGPGEPSMAHQTDEYCLLSRLAEAEQL
YGDIIRDWMASPPATKVKNE

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory