SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012969030.1 NCBI__GCF_000025465.1:WP_012969030.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5j7iC Crystal structure of a geobacillus thermoglucosidasius acetylating aldehyde dehydrogenase in complex with adp (see paper)
50% identity, 84% coverage: 5:452/533 of query aligns to 5:451/455 of 5j7iC

query
sites
5j7iC
D
 
D
N
 
I
D
 
D
L
 
L
Q
 
Q
S
 
S
R
 
I
Q
 
Q
N
 
E
A
 
V
R
 
R
E
 
N
L
 
Y
V
 
L
R
 
E
N
 
E
A
 
A
K
 
K
K
 
A
A
 
A
Q
 
Q
A
 
K
I
 
I
L
 
L
A
 
E
T
 
K
F
 
M
S
 
T
Q
 
Q
Q
 
S
Q
 
E
I
 
I
D
 
D
A
 
K
I
 
I
V
 
V
K
 
E
N
 
S
V
 
M
A
 
A
Q
 
N
E
 
A
A
 
A
A
 
R
H
 
E
H
 
E
A
 
A
E
 
G
A
 
R
L
 
L
A
 
A
K
 
A
M
 
M
A
 
A
A
 
V
E
 
E
E
 
E
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
N
 
N
W
 
V
Q
 
E
D
 
D
K
 
K
V
 
T
L
 
L
K
 
K
N
 
N
R
 
L
F
 
F
A
 
A
S
 
A
L
 
N
R
 
D
V
 
V
Y
 
Y
D
 
N
A
 
S
I
 
I
K
 
K
D
 
D
M
 
V
K
 
K
T
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
I
I
 
I
H
 
R
D
 
R
D
 
D
P
 
E
V
 
E
K
 
N
K
 
R
V
 
V
M
 
W
D
 
E
V
 
I
G
 
A
V
 
Q
P
 
P
L
 
V
G
 
G
V
 
I
I
 
V
C
 
A
A
 
G
L
 
I
V
 
I
P
 
P
S
 
S
T
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
T
S
 
S
T
 
T
V
 
V
I
 
I
Y
 
F
K
 
K
A
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
A
L
 
V
K
 
K
A
 
A
G
 
R
N
 
N
A
 
A
I
 
I
I
 
V
F
 
F
S
 
S
P
 
P
H
|
H
P
|
P
G
 
S
A
 
A
R
 
A
Q
 
K
C
 
C
S
 
T
W
 
A
K
 
E
A
 
A
I
 
A
E
 
R
I
 
I
V
 
M
K
 
Q
R
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
E
A
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
P
E
 
K
G
 
G
C
 
L
V
 
I
D
 
S
G
 
C
I
 
I
T
 
T
Q
 
Q
L
 
P
T
 
T
L
 
M
E
 
A
A
 
A
T
 
T
S
 
N
E
 
E
L
 
L
M
 
M
H
 
K
S
 
H
K
 
K
D
 
L
V
 
T
S
 
D
L
 
V
I
 
I
L
 
L
A
 
A
T
 
T
G
 
G
G
 
G
E
 
P
G
 
G
M
x
L
V
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
S
S
 
S
G
 
G
T
 
K
P
 
P
T
 
A
I
 
Y
S
 
G
G
 
V
G
 
G
P
 
P
G
 
G
N
 
N
G
 
V
P
 
P
A
 
V
F
 
Y
I
 
I
E
 
H
R
 
E
S
 
S
A
 
A
D
 
N
I
 
I
H
 
A
H
 
K
A
 
A
V
 
V
K
 
Q
D
 
L
I
 
I
I
 
I
T
 
Q
S
 
S
K
 
K
T
 
T
F
 
F
D
 
D
N
 
Y
G
 
G
V
 
T
I
 
I
C
 
C
A
 
A
S
 
S
E
 
E
Q
 
Q
S
 
A
I
 
L
I
 
L
V
 
V
E
 
D
G
 
E
C
 
S
I
 
I
Y
 
K
D
 
E
E
 
K
V
 
V
H
 
V
R
 
A
E
 
E
L
 
L
E
 
K
A
 
Q
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
F
 
F
M
 
L
N
 
N
E
 
E
D
 
E
E
 
E
A
 
K
A
 
Q
K
 
K
M
 
V
A
 
A
A
 
S
L
 
I
L
 
I
L
 
M
R
 
-
P
 
V
N
 
N
G
 
G
T
 
S
I
 
L
N
 
N
P
 
A
K
 
K
V
 
I
V
 
V
G
 
G
K
 
K
T
 
A
A
 
P
L
 
Q
Y
 
V
L
 
I
S
 
A
Q
 
E
M
 
M
A
 
A
G
 
G
F
 
I
C
 
E
V
 
I
P
 
P
A
 
S
S
 
D
T
 
V
K
 
K
V
 
L
L
 
L
I
 
V
A
 
A
E
 
E
Q
 
E
T
 
T
T
 
E
V
 
V
S
 
G
P
 
K
K
 
E
N
 
Y
P
 
P
Y
 
F
S
 
S
R
 
I
E
 
E
K
 
K
L
 
L
C
 
S
P
 
P
V
 
I
L
 
L
G
 
A
L
 
F
Y
 
Y
V
 
I
A
 
V
E
 
K
D
 
G
W
 
M
K
 
E
A
 
E
A
 
A
C
 
S
H
 
E
R
 
L
V
 
A
V
 
Q
E
 
K
L
 
L
L
 
L
T
 
E
N
 
V
E
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
H
 
H
T
 
T
L
 
V
V
 
G
I
 
I
H
 
H
T
 
A
R
 
E
N
 
D
Q
 
E
D
 
K
V
 
V
I
 
I
R
 
E
Q
 
A
F
 
Y
S
 
T
L
 
I
E
 
D
K
 
K
P
 
P
V
 
A
N
 
G
R
 
R
I
 
I
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
A
P
 
G
A
 
T
A
 
T
L
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
A
T
 
T
T
 
V
N
 
N
I
 
V
S
 
K
P
 
P
A
 
S
L
 
L
T
 
T
L
 
L
G
 
G
C
 
C
G
 
G
A
 
A
V
 
I
G
 
G
G
 
N
G
 
N
S
 
I
S
 
T
S
 
S
D
 
D
N
 
N
V
 
V
G
 
T
P
 
V
M
 
T
N
 
H
L
 
L
L
 
F
N
 
N
I
 
I
R
 
K
K
 
R
V
 
V
G
 
A
Y
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
R
S
 
E
I
 
M

5j7iB Crystal structure of a geobacillus thermoglucosidasius acetylating aldehyde dehydrogenase in complex with adp (see paper)
50% identity, 84% coverage: 5:452/533 of query aligns to 6:452/456 of 5j7iB

query
sites
5j7iB
D
 
D
N
 
I
D
 
D
L
 
L
Q
 
Q
S
 
S
R
 
I
Q
 
Q
N
 
E
A
 
V
R
 
R
E
 
N
L
 
Y
V
 
L
R
 
E
N
 
E
A
 
A
K
 
K
K
 
A
A
 
A
Q
 
Q
A
 
K
I
 
I
L
 
L
A
 
E
T
 
K
F
 
M
S
 
T
Q
 
Q
Q
 
S
Q
 
E
I
 
I
D
 
D
A
 
K
I
 
I
V
 
V
K
 
E
N
 
S
V
 
M
A
 
A
Q
 
N
E
 
A
A
 
A
A
 
R
H
 
E
H
 
E
A
 
A
E
 
G
A
 
R
L
 
L
A
 
A
K
 
A
M
 
M
A
 
A
A
 
V
E
 
E
E
 
E
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
N
 
N
W
 
V
Q
 
E
D
 
D
K
 
K
V
 
T
L
 
L
K
 
K
N
 
N
R
 
L
F
 
F
A
 
A
S
 
A
L
 
N
R
 
D
V
 
V
Y
 
Y
D
 
N
A
 
S
I
 
I
K
 
K
D
 
D
M
 
V
K
 
K
T
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
I
I
 
I
H
 
R
D
 
R
D
 
D
P
 
E
V
 
E
K
 
N
K
 
R
V
 
V
M
 
W
D
 
E
V
 
I
G
 
A
V
 
Q
P
 
P
L
 
V
G
 
G
V
 
I
I
 
V
C
 
A
A
 
G
L
 
I
V
 
I
P
 
P
S
 
S
T
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
T
S
 
S
T
 
T
V
 
V
I
 
I
Y
 
F
K
 
K
A
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
A
L
 
V
K
 
K
A
 
A
G
 
R
N
 
N
A
 
A
I
 
I
I
 
V
F
 
F
S
 
S
P
 
P
H
 
H
P
 
P
G
 
S
A
 
A
R
 
A
Q
 
K
C
 
C
S
 
T
W
 
A
K
 
E
A
 
A
I
 
A
E
 
R
I
 
I
V
 
M
K
 
Q
R
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
E
A
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
P
E
 
K
G
 
G
C
 
L
V
 
I
D
 
S
G
 
C
I
 
I
T
 
T
Q
 
Q
L
 
P
T
 
T
L
 
M
E
 
A
A
 
A
T
 
T
S
 
N
E
 
E
L
 
L
M
 
M
H
 
K
S
 
H
K
 
K
D
 
L
V
 
T
S
 
D
L
 
V
I
 
I
L
 
L
A
 
A
T
 
T
G
 
G
G
 
G
E
 
P
G
 
G
M
x
L
V
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
S
S
 
S
G
 
G
T
 
K
P
 
P
T
 
A
I
 
Y
S
 
G
G
 
V
G
 
G
P
 
P
G
 
G
N
 
N
G
 
V
P
 
P
A
 
V
F
 
Y
I
 
I
E
 
H
R
 
E
S
 
S
A
 
A
D
 
N
I
 
I
H
 
A
H
 
K
A
 
A
V
 
V
K
 
Q
D
 
L
I
 
I
I
 
I
T
 
Q
S
 
S
K
 
K
T
 
T
F
 
F
D
 
D
N
 
Y
G
 
G
V
 
T
I
 
I
C
 
C
A
 
A
S
 
S
E
 
E
Q
 
Q
S
 
A
I
 
L
I
 
L
V
 
V
E
 
D
G
 
E
C
 
S
I
 
I
Y
 
K
D
 
E
E
 
K
V
 
V
H
 
V
R
 
A
E
 
E
L
 
L
E
 
K
A
 
Q
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
F
 
F
M
 
L
N
 
N
E
 
E
D
 
E
E
 
E
A
 
K
A
 
Q
K
 
K
M
 
V
A
 
A
A
 
S
L
 
I
L
 
I
L
 
M
R
 
-
P
 
V
N
 
N
G
 
G
T
 
S
I
 
L
N
 
N
P
x
A
K
 
K
V
 
I
V
 
V
G
 
G
K
 
K
T
 
A
A
 
P
L
 
Q
Y
 
V
L
 
I
S
 
A
Q
 
E
M
 
M
A
 
A
G
 
G
F
 
I
C
 
E
V
 
I
P
 
P
A
 
S
S
 
D
T
 
V
K
 
K
V
 
L
L
 
L
I
 
V
A
 
A
E
 
E
Q
 
E
T
 
T
T
 
E
V
 
V
S
 
G
P
 
K
K
 
E
N
 
Y
P
 
P
Y
 
F
S
 
S
R
 
I
E
 
E
K
 
K
L
 
L
C
 
S
P
 
P
V
 
I
L
 
L
G
 
A
L
 
F
Y
 
Y
V
 
I
A
 
V
E
 
K
D
 
G
W
 
M
K
 
E
A
 
E
A
 
A
C
 
S
H
 
E
R
 
L
V
 
A
V
 
Q
E
 
K
L
 
L
L
 
L
T
 
E
N
 
V
E
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
H
 
H
T
 
T
L
 
V
V
 
G
I
 
I
H
 
H
T
 
A
R
 
E
N
 
D
Q
 
E
D
 
K
V
 
V
I
 
I
R
 
E
Q
 
A
F
 
Y
S
 
T
L
 
I
E
 
D
K
 
K
P
 
P
V
 
A
N
 
G
R
 
R
I
 
I
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
A
P
 
G
A
 
T
A
 
T
L
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
A
T
 
T
T
 
V
N
 
N
I
 
V
S
 
K
P
 
P
A
 
S
L
 
L
T
 
T
L
 
L
G
 
G
C
 
C
G
 
G
A
 
A
V
 
I
G
 
G
G
 
N
G
 
N
S
 
I
S
 
T
S
 
S
D
 
D
N
 
N
V
 
V
G
 
T
P
 
V
M
 
T
N
 
H
L
 
L
L
 
F
N
 
N
I
 
I
R
 
K
K
 
R
V
 
V
G
 
A
Y
 
F
G
 
G
V
 
V
R
 
R
S
 
E
I
 
M

8uhwB The structure of the clostridium thermocellum adhe spirosome
48% identity, 83% coverage: 18:458/533 of query aligns to 11:453/859 of 8uhwB

query
sites
8uhwB
V
 
L
R
 
K
N
 
R
A
 
L
K
 
R
K
 
E
A
 
A
Q
 
Q
A
 
S
I
 
V
L
 
Y
A
 
A
T
 
T
F
 
Y
S
 
T
Q
 
Q
Q
 
E
Q
 
Q
I
 
V
D
 
D
A
 
K
I
 
I
V
 
F
K
 
F
N
 
E
V
 
A
A
 
A
Q
 
M
E
 
A
A
 
A
A
 
N
H
 
K
H
 
M
A
 
R
E
 
I
A
 
P
L
 
L
A
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
A
A
 
V
E
 
E
E
 
E
T
 
T
G
 
G
F
 
M
G
 
G
N
 
V
W
 
V
Q
 
E
D
 
D
K
 
K
V
 
V
L
 
I
K
 
K
N
 
N
R
 
H
F
 
Y
A
 
A
S
 
S
L
 
E
R
 
Y
V
 
I
Y
 
Y
D
 
N
A
 
A
I
 
Y
K
 
K
D
 
N
M
 
T
K
 
K
T
 
T
V
 
C
G
 
G
I
 
V
I
 
I
H
 
E
D
 
E
D
 
D
P
 
P
V
 
A
K
 
F
K
 
G
V
 
I
M
 
K
D
 
K
V
 
I
G
 
A
V
 
E
P
 
P
L
 
L
G
 
G
V
 
V
I
 
I
C
 
A
A
 
A
L
 
V
V
 
I
P
 
P
S
 
T
T
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
T
S
 
S
T
 
T
V
 
A
I
 
I
Y
 
F
K
 
K
A
 
T
L
 
L
I
 
I
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
T
G
 
R
N
 
N
A
 
A
I
 
I
I
 
I
F
 
I
S
 
S
P
 
P
H
 
H
P
 
P
G
 
R
A
 
A
R
 
K
Q
 
N
C
 
S
S
 
T
W
 
I
K
 
E
A
 
A
I
 
A
E
 
K
I
 
I
V
 
V
K
 
L
R
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
V
A
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
P
E
 
E
G
 
G
C
 
I
V
 
I
D
 
G
G
 
W
I
 
I
T
 
D
Q
 
V
L
 
P
T
 
S
L
 
L
E
 
E
A
 
L
T
 
T
S
 
N
E
 
L
L
 
V
M
 
M
H
 
R
S
 
E
K
 
A
D
 
D
V
 
V
S
 
-
L
 
-
I
 
I
L
 
L
A
 
A
T
 
T
G
 
G
G
 
G
E
 
P
G
 
G
M
 
L
V
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
S
S
 
S
G
 
G
T
 
K
P
 
P
T
 
A
I
 
I
S
 
G
G
 
V
G
 
G
P
 
A
G
 
G
N
 
N
G
 
T
P
 
P
A
 
A
F
 
I
I
 
I
E
 
D
R
 
D
S
 
S
A
 
A
D
 
D
I
 
I
H
 
V
H
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
N
D
 
S
I
 
I
I
 
I
T
 
H
S
 
S
K
 
K
T
 
T
F
 
F
D
 
D
N
 
N
G
 
G
V
 
M
I
 
I
C
 
C
A
 
A
S
 
S
E
 
E
Q
 
Q
S
 
S
I
 
V
I
 
I
V
 
V
E
 
L
G
 
D
C
 
G
I
 
V
Y
 
Y
D
 
K
E
 
E
V
 
V
H
 
K
R
 
K
E
 
E
L
 
F
E
 
E
A
 
K
Q
 
R
G
 
G
A
 
C
Y
 
Y
F
 
F
M
 
L
N
 
N
E
 
E
D
 
D
E
 
E
A
 
T
A
 
E
K
 
K
M
 
V
A
 
R
A
 
K
L
 
T
L
 
I
L
 
I
R
 
-
P
 
I
N
 
N
G
 
G
T
 
A
I
 
L
N
 
N
P
 
A
K
 
K
V
 
I
V
 
V
G
 
G
K
 
Q
T
 
K
A
 
A
L
 
H
Y
 
T
L
 
I
S
 
A
Q
 
N
M
 
L
A
 
A
G
 
G
F
 
F
C
 
E
V
 
V
P
 
P
A
 
E
S
 
T
T
 
T
K
 
K
V
 
I
L
 
L
I
 
I
A
 
G
E
 
E
Q
 
V
T
 
T
T
 
S
V
 
V
S
 
D
P
 
I
K
 
S
N
 
E
P
 
E
Y
 
F
S
 
A
R
 
H
E
 
E
K
 
K
L
 
L
C
 
C
P
 
P
V
 
V
L
 
L
G
 
A
L
 
M
Y
 
Y
V
 
R
A
 
A
E
 
K
D
 
D
W
 
F
K
 
D
A
 
D
A
 
A
C
 
L
H
 
D
R
 
K
V
 
A
V
 
E
E
 
R
L
 
L
L
 
V
T
 
A
N
 
D
E
 
G
G
 
G
L
 
F
G
 
G
H
 
H
T
 
T
-
 
S
-
 
S
L
 
L
V
 
Y
I
 
I
H
 
D
T
 
T
R
 
V
N
 
T
Q
 
Q
-
 
K
D
 
E
V
 
K
I
 
L
R
 
Q
Q
 
K
F
 
F
S
 
S
L
 
E
E
 
R
K
 
M
P
 
K
V
 
T
N
 
C
R
 
R
I
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
S
A
 
S
L
 
Q
G
 
G
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
D
T
 
L
T
 
Y
N
 
N
-
 
F
-
 
K
I
 
L
S
 
A
P
 
P
A
 
S
L
 
L
T
 
T
L
 
L
G
 
G
C
 
C
G
 
G
A
 
S
V
 
W
G
 
G
G
 
G
G
 
N
S
 
S
S
 
V
S
 
S
D
 
D
N
 
N
V
 
V
G
 
G
P
 
V
M
 
K
N
 
H
L
 
L
L
 
L
N
 
N
I
 
I
R
 
K
K
 
T
V
 
V
G
 
A
Y
 
E
G
 
R
V
 
R
R
 
E
S
 
N
I
 
M
D
 
L
E
 
W
L
 
F
R
 
R
A
 
T
P
 
P

Sites not aligning to the query:

7bvpA Adhe spirosome in extended conformation (see paper)
47% identity, 80% coverage: 17:445/533 of query aligns to 12:444/869 of 7bvpA

query
sites
7bvpA
L
 
L
V
 
V
R
 
E
N
 
R
A
 
V
K
 
K
K
 
K
A
 
A
Q
 
Q
A
 
R
I
 
E
L
 
Y
A
 
A
T
 
S
F
 
F
S
 
T
Q
 
Q
Q
 
E
Q
 
Q
I
 
V
D
 
D
A
 
K
I
 
I
V
 
F
K
 
R
N
 
A
V
 
A
A
 
A
Q
 
L
E
 
A
A
 
A
A
 
A
H
 
D
H
 
A
A
 
R
E
 
I
A
 
P
L
 
L
A
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
A
A
 
V
E
 
A
E
 
E
T
 
S
G
 
G
F
 
M
G
 
G
N
 
I
W
 
V
Q
 
E
D
 
D
K
 
K
V
 
V
L
 
I
K
 
K
N
 
N
R
 
H
F
 
F
A
 
A
S
 
S
L
 
E
R
 
Y
V
 
I
Y
 
Y
D
 
N
A
 
A
I
 
Y
K
 
K
D
 
D
M
 
E
K
 
K
T
 
T
V
 
C
G
 
G
I
 
V
I
 
L
H
 
S
D
 
E
D
 
D
P
 
D
V
 
T
K
 
F
K
 
G
V
 
T
M
 
I
D
 
T
V
 
I
G
 
A
V
 
E
P
 
P
L
 
I
G
 
G
V
 
I
I
 
I
C
 
C
A
 
G
L
 
I
V
 
V
P
|
P
S
x
T
T
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
T
S
 
S
T
 
T
V
 
A
I
 
I
Y
 
F
K
 
K
A
 
S
L
 
L
I
 
I
A
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
T
G
 
R
N
 
N
A
 
A
I
 
I
I
 
I
F
 
F
S
 
S
P
 
P
H
|
H
P
 
P
G
 
R
A
 
A
R
 
K
Q
 
D
C
 
A
S
 
T
W
 
N
K
 
K
A
 
A
I
 
A
E
 
D
I
 
I
V
 
V
K
 
L
R
 
Q
A
 
A
A
 
A
E
 
I
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
P
E
 
K
G
 
D
C
 
L
V
 
I
D
 
G
G
 
W
I
 
I
T
 
D
Q
 
Q
L
 
P
T
 
S
L
 
V
E
 
E
A
 
L
T
 
S
S
 
N
E
 
A
L
 
L
M
 
M
H
 
H
S
 
H
K
 
P
D
 
D
V
 
I
S
 
N
L
 
L
I
 
I
L
 
L
A
 
A
T
 
T
G
|
G
G
|
G
E
 
P
G
 
G
M
|
M
V
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
S
S
 
S
G
 
G
T
 
K
P
 
P
T
 
A
I
 
I
S
 
G
G
x
V
G
|
G
P
x
A
G
 
G
N
 
N
G
 
T
P
 
P
A
 
V
F
 
V
I
 
I
E
 
D
R
 
E
S
 
T
A
 
A
D
 
D
I
 
I
H
 
K
H
 
R
A
 
A
V
 
V
K
 
A
D
 
S
I
 
V
I
 
L
T
 
M
S
 
S
K
 
K
T
 
T
F
 
F
D
 
D
N
 
N
G
 
G
V
 
V
I
 
I
C
|
C
A
 
A
S
 
S
E
 
E
Q
 
Q
S
 
S
I
 
V
I
 
V
V
 
V
E
 
V
G
 
D
C
 
S
I
 
V
Y
 
Y
D
 
D
E
 
A
V
 
V
H
 
R
R
 
E
E
 
R
L
 
F
E
 
A
A
 
T
Q
 
H
G
 
G
A
 
G
Y
 
Y
F
 
L
M
 
L
N
 
Q
E
 
G
D
 
K
E
 
E
A
 
L
A
 
K
K
 
A
M
 
V
A
 
Q
A
 
D
L
 
V
L
 
I
L
 
L
R
 
K
P
 
-
N
 
N
G
 
G
T
 
A
I
 
L
N
 
N
P
 
A
K
 
A
V
 
I
V
 
V
G
 
G
K
 
Q
T
 
P
A
 
A
L
 
Y
Y
 
K
L
 
I
S
 
A
Q
 
E
M
 
L
A
 
A
G
 
G
F
 
F
C
 
S
V
 
V
P
 
P
A
 
E
S
 
N
T
 
T
K
 
K
V
 
I
L
 
L
I
 
I
A
 
G
E
 
E
Q
 
V
T
 
T
T
 
V
V
 
V
S
 
D
P
 
E
K
 
S
N
 
E
P
 
P
Y
 
F
S
 
A
R
 
H
E
|
E
K
 
K
L
|
L
C
 
S
P
 
P
V
 
T
L
 
L
G
 
A
L
 
M
Y
 
Y
V
 
R
A
 
A
E
 
K
D
 
D
W
 
F
K
 
E
A
 
D
A
 
A
C
 
V
H
 
E
R
 
K
V
 
A
V
 
E
E
 
K
L
 
L
L
 
V
T
 
A
N
 
M
E
 
G
G
 
G
L
 
I
G
 
G
H
|
H
T
 
T
L
 
S
V
 
C
I
 
L
H
 
Y
T
 
T
R
 
-
N
 
D
Q
 
Q
D
 
D
-
 
N
-
 
Q
-
 
P
-
 
A
V
 
R
I
 
V
R
 
S
Q
 
Y
F
 
F
S
 
G
L
 
Q
E
 
K
K
 
M
P
 
K
V
 
T
N
 
A
R
 
R
I
 
I
L
 
L
I
 
I
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
A
A
 
S
L
 
Q
G
 
G
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
D
T
 
L
T
 
Y
N
 
N
-
 
F
-
 
K
I
 
L
S
 
A
P
 
P
A
 
S
L
 
L
T
|
T
L
|
L
G
 
G
C
 
C
G
 
G
A
 
S
V
 
W
G
 
G
G
 
G
G
 
N
S
 
S
S
 
I
S
 
S
D
 
E
N
 
N
V
 
V
G
 
G
P
 
P
M
 
K
N
 
H
L
 
L
L
 
I
N
 
N
I
 
K
R
 
K
K
 
T
V
 
V

Sites not aligning to the query:

6tqmA Escherichia coli adhe structure in its compact conformation (see paper)
47% identity, 80% coverage: 17:445/533 of query aligns to 12:444/869 of 6tqmA

query
sites
6tqmA
L
 
L
V
 
V
R
 
E
N
 
R
A
 
V
K
 
K
K
 
K
A
 
A
Q
 
Q
A
 
R
I
 
E
L
 
Y
A
 
A
T
 
S
F
 
F
S
 
T
Q
 
Q
Q
 
E
Q
 
Q
I
 
V
D
 
D
A
 
K
I
 
I
V
 
F
K
 
R
N
 
A
V
 
A
A
 
A
Q
 
L
E
 
A
A
 
A
A
 
A
H
 
D
H
 
A
A
 
R
E
 
I
A
 
P
L
 
L
A
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
A
A
 
V
E
 
A
E
 
E
T
 
S
G
 
G
F
 
M
G
 
G
N
 
I
W
 
V
Q
 
E
D
 
D
K
 
K
V
 
V
L
 
I
K
 
K
N
 
N
R
 
H
F
 
F
A
 
A
S
 
S
L
 
E
R
 
Y
V
 
I
Y
 
Y
D
 
N
A
 
A
I
 
Y
K
 
K
D
 
D
M
 
E
K
 
K
T
 
T
V
 
C
G
 
G
I
 
V
I
 
L
H
 
S
D
 
E
D
 
D
P
 
D
V
 
T
K
 
F
K
 
G
V
 
T
M
 
I
D
 
T
V
 
I
G
 
A
V
 
E
P
 
P
L
 
I
G
 
G
V
 
I
I
 
I
C
 
C
A
 
G
L
 
I
V
 
V
P
 
P
S
 
T
T
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
T
S
 
S
T
 
T
V
 
A
I
 
I
Y
 
F
K
 
K
A
 
S
L
 
L
I
 
I
A
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
T
G
 
R
N
 
N
A
 
A
I
 
I
I
 
I
F
 
F
S
 
S
P
 
P
H
 
H
P
 
P
G
 
R
A
 
A
R
 
K
Q
 
D
C
 
A
S
 
T
W
 
N
K
 
K
A
 
A
I
 
A
E
 
D
I
 
I
V
 
V
K
 
L
R
 
Q
A
 
A
A
 
A
E
 
I
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
P
E
 
K
G
 
D
C
 
L
V
 
I
D
 
G
G
 
W
I
 
I
T
 
D
Q
 
Q
L
 
P
T
 
S
L
 
V
E
 
E
A
 
L
T
 
S
S
 
N
E
 
A
L
 
L
M
 
M
H
 
H
S
 
H
K
 
P
D
 
D
V
 
I
S
 
N
L
 
L
I
 
I
L
 
L
A
 
A
T
 
T
G
 
G
G
 
G
E
 
P
G
 
G
M
 
M
V
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
S
S
 
S
G
 
G
T
 
K
P
 
P
T
 
A
I
 
I
S
 
G
G
 
V
G
 
G
P
 
A
G
 
G
N
 
N
G
 
T
P
 
P
A
 
V
F
 
V
I
 
I
E
 
D
R
 
E
S
 
T
A
 
A
D
 
D
I
 
I
H
 
K
H
 
R
A
 
A
V
 
V
K
 
A
D
 
S
I
 
V
I
 
L
T
 
M
S
 
S
K
 
K
T
 
T
F
 
F
D
 
D
N
 
N
G
 
G
V
 
V
I
 
I
C
 
C
A
 
A
S
 
S
E
 
E
Q
 
Q
S
 
S
I
 
V
I
 
V
V
 
V
E
 
V
G
 
D
C
 
S
I
 
V
Y
 
Y
D
 
D
E
 
A
V
 
V
H
 
R
R
 
E
E
 
R
L
 
F
E
 
A
A
 
T
Q
 
H
G
 
G
A
 
G
Y
 
Y
F
 
L
M
 
L
N
 
Q
E
 
G
D
 
K
E
 
E
A
 
L
A
 
K
K
 
A
M
 
V
A
 
Q
A
 
D
L
 
V
L
 
I
L
 
L
R
 
K
P
 
-
N
 
N
G
 
G
T
 
A
I
 
L
N
 
N
P
 
A
K
 
A
V
 
I
V
 
V
G
 
G
K
 
Q
T
 
P
A
 
A
L
 
Y
Y
 
K
L
 
I
S
 
A
Q
 
E
M
 
L
A
 
A
G
 
G
F
 
F
C
 
S
V
 
V
P
 
P
A
 
E
S
 
N
T
 
T
K
 
K
V
 
I
L
 
L
I
 
I
A
 
G
E
 
E
Q
 
V
T
 
T
T
 
V
V
 
V
S
 
D
P
 
E
K
 
S
N
 
E
P
 
P
Y
 
F
S
 
A
R
 
H
E
 
E
K
 
K
L
 
L
C
 
S
P
 
P
V
 
T
L
 
L
G
 
A
L
 
M
Y
 
Y
V
 
R
A
 
A
E
 
K
D
 
D
W
 
F
K
 
E
A
 
D
A
 
A
C
 
V
H
 
E
R
 
K
V
 
A
V
 
E
E
 
K
L
 
L
L
 
V
T
 
A
N
 
M
E
 
G
G
 
G
L
 
I
G
 
G
H
 
H
T
 
T
L
 
S
V
 
C
I
 
L
H
 
Y
T
 
T
R
 
-
N
 
D
Q
 
Q
D
 
D
-
 
N
-
 
Q
-
 
P
-
 
A
V
 
R
I
 
V
R
 
S
Q
 
Y
F
 
F
S
 
G
L
 
Q
E
 
K
K
 
M
P
 
K
V
 
T
N
 
A
R
 
R
I
 
I
L
 
L
I
 
I
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
A
A
 
S
L
 
Q
G
 
G
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
D
T
 
L
T
 
Y
N
 
N
-
 
F
-
 
K
I
 
L
S
 
A
P
 
P
A
 
S
L
 
L
T
 
T
L
 
L
G
 
G
C
 
C
G
 
G
A
 
S
V
 
W
G
 
G
G
 
G
G
 
N
S
 
S
S
 
I
S
 
S
D
 
E
N
 
N
V
 
V
G
 
G
P
 
P
M
 
K
N
 
H
L
 
L
L
 
I
N
 
N
I
 
K
R
 
K
K
 
T
V
 
V

Sites not aligning to the query:

P0A9Q7 Bifunctional aldehyde-alcohol dehydrogenase AdhE; Alcohol dehydrogenase E; EC 1.2.1.10; EC 1.1.1.1 from Escherichia coli (strain K12) (see 8 papers)
47% identity, 80% coverage: 17:445/533 of query aligns to 12:444/891 of P0A9Q7

query
sites
P0A9Q7
L
 
L
V
 
V
R
 
E
N
 
R
A
 
V
K
 
K
K
 
K
A
 
A
Q
 
Q
A
 
R
I
 
E
L
 
Y
A
 
A
T
 
S
F
 
F
S
 
T
Q
 
Q
Q
 
E
Q
 
Q
I
 
V
D
 
D
A
 
K
I
 
I
V
 
F
K
 
R
N
 
A
V
 
A
A
 
A
Q
 
L
E
 
A
A
 
A
A
 
A
H
 
D
H
 
A
A
 
R
E
 
I
A
 
P
L
 
L
A
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
A
A
 
V
E
 
A
E
 
E
T
 
S
G
 
G
F
 
M
G
 
G
N
 
I
W
 
V
Q
 
E
D
 
D
K
 
K
V
 
V
L
 
I
K
 
K
N
 
N
R
 
H
F
 
F
A
 
A
S
 
S
L
 
E
R
 
Y
V
 
I
Y
 
Y
D
 
N
A
 
A
I
 
Y
K
 
K
D
 
D
M
 
E
K
 
K
T
 
T
V
 
C
G
 
G
I
 
V
I
 
L
H
 
S
D
 
E
D
 
D
P
 
D
V
 
T
K
 
F
K
 
G
V
 
T
M
 
I
D
 
T
V
 
I
G
 
A
V
 
E
P
 
P
L
 
I
G
 
G
V
 
I
I
 
I
C
 
C
A
 
G
L
x
I
V
|
V
P
|
P
S
x
T
T
|
T
N
|
N
P
 
P
T
 
T
S
 
S
T
 
T
V
 
A
I
 
I
Y
 
F
K
 
K
A
 
S
L
 
L
I
 
I
A
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
T
G
 
R
N
 
N
A
 
A
I
 
I
I
 
I
F
 
F
S
 
S
P
 
P
H
 
H
P
 
P
G
 
R
A
 
A
R
 
K
Q
 
D
C
 
A
S
 
T
W
 
N
K
 
K
A
 
A
I
 
A
E
 
D
I
 
I
V
 
V
K
 
L
R
 
Q
A
 
A
A
 
A
E
 
I
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
P
E
 
K
G
 
D
C
 
L
V
 
I
D
 
G
G
 
W
I
 
I
T
 
D
Q
 
Q
L
 
P
T
 
S
L
 
V
E
 
E
A
 
L
T
 
S
S
 
N
E
 
A
L
 
L
M
 
M
H
 
H
S
 
H
K
 
P
D
 
D
V
 
I
S
 
N
L
 
L
I
 
I
L
 
L
A
 
A
T
 
T
G
 
G
G
|
G
E
 
P
G
 
G
M
 
M
V
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
S
S
 
S
G
 
G
T
 
K
P
 
P
T
 
A
I
 
I
S
 
G
G
 
V
G
|
G
P
 
A
G
 
G
N
 
N
G
 
T
P
 
P
A
 
V
F
 
V
I
 
I
E
 
D
R
 
E
S
 
T
A
 
A
D
 
D
I
 
I
H
 
K
H
 
R
A
 
A
V
 
V
K
 
A
D
 
S
I
 
V
I
 
L
T
 
M
S
 
S
K
 
K
T
 
T
F
 
F
D
 
D
N
 
N
G
 
G
V
 
V
I
 
I
C
 
C
A
 
A
S
 
S
E
 
E
Q
 
Q
S
 
S
I
 
V
I
 
V
V
 
V
E
 
V
G
 
D
C
 
S
I
 
V
Y
 
Y
D
 
D
E
 
A
V
 
V
H
 
R
R
 
E
E
 
R
L
 
F
E
x
A
A
 
T
Q
 
H
G
 
G
A
 
G
Y
 
Y
F
 
L
M
 
L
N
 
Q
E
 
G
D
 
K
E
 
E
A
 
L
A
 
K
K
 
A
M
 
V
A
 
Q
A
 
D
L
 
V
L
 
I
L
 
L
R
 
K
P
 
-
N
 
N
G
 
G
T
 
A
I
 
L
N
 
N
P
 
A
K
 
A
V
 
I
V
 
V
G
 
G
K
 
Q
T
 
P
A
 
A
L
 
Y
Y
 
K
L
 
I
S
 
A
Q
 
E
M
 
L
A
 
A
G
 
G
F
 
F
C
 
S
V
 
V
P
 
P
A
 
E
S
 
N
T
 
T
K
 
K
V
 
I
L
 
L
I
 
I
A
 
G
E
 
E
Q
 
V
T
 
T
T
 
V
V
 
V
S
 
D
P
 
E
K
 
S
N
 
E
P
 
P
Y
 
F
S
 
A
R
 
H
E
|
E
K
 
K
L
 
L
C
 
S
P
 
P
V
 
T
L
 
L
G
 
A
L
 
M
Y
 
Y
V
 
R
A
 
A
E
 
K
D
 
D
W
 
F
K
 
E
A
 
D
A
 
A
C
 
V
H
 
E
R
 
K
V
 
A
V
 
E
E
x
K
L
 
L
L
 
V
T
 
A
N
 
M
E
 
G
G
 
G
L
 
I
G
 
G
H
 
H
T
 
T
L
 
S
V
 
C
I
 
L
H
 
Y
T
 
T
R
 
-
N
 
D
Q
 
Q
D
 
D
-
 
N
-
 
Q
-
 
P
-
 
A
V
 
R
I
 
V
R
 
S
Q
 
Y
F
 
F
S
 
G
L
 
Q
E
 
K
K
 
M
P
 
K
V
 
T
N
 
A
R
 
R
I
 
I
L
 
L
I
 
I
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
A
A
 
S
L
 
Q
G
 
G
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
D
T
 
L
T
 
Y
N
 
N
-
 
F
-
 
K
I
 
L
S
 
A
P
 
P
A
 
S
L
 
L
T
 
T
L
|
L
G
 
G
C
 
C
G
 
G
A
 
S
V
 
W
G
 
G
G
 
G
G
 
N
S
 
S
S
 
I
S
 
S
D
 
E
N
 
N
V
 
V
G
 
G
P
 
P
M
 
K
N
 
H
L
 
L
L
 
I
N
 
N
I
 
K
R
 
K
K
 
T
V
 
V

Sites not aligning to the query:

P0A9Q8 Bifunctional aldehyde-alcohol dehydrogenase AdhE; Alcohol dehydrogenase E; EC 1.2.1.10; EC 1.1.1.1 from Escherichia coli O157:H7 (see paper)
47% identity, 80% coverage: 17:445/533 of query aligns to 12:444/891 of P0A9Q8

query
sites
P0A9Q8
L
 
L
V
 
V
R
 
E
N
 
R
A
 
V
K
 
K
K
 
K
A
 
A
Q
 
Q
A
 
R
I
 
E
L
 
Y
A
 
A
T
 
S
F
 
F
S
 
T
Q
 
Q
Q
 
E
Q
 
Q
I
 
V
D
 
D
A
 
K
I
 
I
V
 
F
K
 
R
N
 
A
V
 
A
A
 
A
Q
 
L
E
 
A
A
 
A
A
 
A
H
 
D
H
 
A
A
 
R
E
 
I
A
 
P
L
 
L
A
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
A
A
 
V
E
 
A
E
 
E
T
 
S
G
 
G
F
 
M
G
 
G
N
 
I
W
 
V
Q
 
E
D
 
D
K
 
K
V
 
V
L
 
I
K
 
K
N
 
N
R
 
H
F
 
F
A
 
A
S
 
S
L
 
E
R
 
Y
V
 
I
Y
 
Y
D
 
N
A
 
A
I
 
Y
K
 
K
D
 
D
M
 
E
K
 
K
T
 
T
V
 
C
G
 
G
I
 
V
I
 
L
H
 
S
D
 
E
D
 
D
P
 
D
V
 
T
K
 
F
K
 
G
V
 
T
M
 
I
D
 
T
V
 
I
G
 
A
V
 
E
P
 
P
L
 
I
G
 
G
V
 
I
I
 
I
C
 
C
A
 
G
L
 
I
V
 
V
P
 
P
S
 
T
T
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
T
S
 
S
T
 
T
V
 
A
I
 
I
Y
 
F
K
 
K
A
 
S
L
 
L
I
 
I
A
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
T
G
 
R
N
 
N
A
 
A
I
 
I
I
 
I
F
 
F
S
 
S
P
 
P
H
 
H
P
 
P
G
 
R
A
 
A
R
 
K
Q
 
D
C
 
A
S
 
T
W
 
N
K
 
K
A
 
A
I
 
A
E
 
D
I
 
I
V
 
V
K
 
L
R
 
Q
A
 
A
A
 
A
E
 
I
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
P
E
 
K
G
 
D
C
 
L
V
 
I
D
 
G
G
 
W
I
 
I
T
 
D
Q
 
Q
L
 
P
T
 
S
L
 
V
E
 
E
A
 
L
T
 
S
S
 
N
E
 
A
L
 
L
M
 
M
H
 
H
S
 
H
K
 
P
D
 
D
V
 
I
S
 
N
L
 
L
I
 
I
L
 
L
A
 
A
T
 
T
G
 
G
G
 
G
E
 
P
G
 
G
M
 
M
V
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
S
S
 
S
G
 
G
T
 
K
P
 
P
T
 
A
I
 
I
S
 
G
G
 
V
G
 
G
P
 
A
G
 
G
N
 
N
G
 
T
P
 
P
A
 
V
F
 
V
I
 
I
E
 
D
R
 
E
S
 
T
A
 
A
D
 
D
I
 
I
H
 
K
H
 
R
A
 
A
V
 
V
K
 
A
D
 
S
I
 
V
I
 
L
T
 
M
S
 
S
K
 
K
T
 
T
F
 
F
D
 
D
N
 
N
G
 
G
V
 
V
I
 
I
C
 
C
A
 
A
S
 
S
E
 
E
Q
 
Q
S
 
S
I
 
V
I
 
V
V
 
V
E
 
V
G
 
D
C
 
S
I
 
V
Y
 
Y
D
 
D
E
 
A
V
 
V
H
 
R
R
 
E
E
 
R
L
 
F
E
 
A
A
 
T
Q
 
H
G
 
G
A
 
G
Y
 
Y
F
 
L
M
 
L
N
 
Q
E
 
G
D
 
K
E
 
E
A
 
L
A
 
K
K
 
A
M
 
V
A
 
Q
A
 
D
L
 
V
L
 
I
L
 
L
R
 
K
P
 
-
N
 
N
G
 
G
T
 
A
I
 
L
N
 
N
P
 
A
K
 
A
V
 
I
V
 
V
G
 
G
K
 
Q
T
 
P
A
 
A
L
 
Y
Y
 
K
L
 
I
S
 
A
Q
 
E
M
 
L
A
 
A
G
 
G
F
 
F
C
 
S
V
 
V
P
 
P
A
 
E
S
 
N
T
 
T
K
 
K
V
 
I
L
 
L
I
 
I
A
 
G
E
 
E
Q
 
V
T
 
T
T
 
V
V
 
V
S
 
D
P
 
E
K
 
S
N
 
E
P
 
P
Y
 
F
S
 
A
R
 
H
E
 
E
K
 
K
L
 
L
C
 
S
P
 
P
V
 
T
L
 
L
G
 
A
L
 
M
Y
 
Y
V
 
R
A
 
A
E
 
K
D
 
D
W
 
F
K
 
E
A
 
D
A
 
A
C
 
V
H
 
E
R
 
K
V
 
A
V
 
E
E
 
K
L
 
L
L
 
V
T
 
A
N
 
M
E
 
G
G
 
G
L
 
I
G
 
G
H
 
H
T
 
T
L
 
S
V
 
C
I
 
L
H
 
Y
T
 
T
R
 
-
N
 
D
Q
 
Q
D
 
D
-
 
N
-
 
Q
-
 
P
-
 
A
V
 
R
I
 
V
R
 
S
Q
 
Y
F
 
F
S
 
G
L
 
Q
E
 
K
K
 
M
P
 
K
V
 
T
N
 
A
R
 
R
I
 
I
L
 
L
I
 
I
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
A
A
 
S
L
 
Q
G
 
G
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
D
T
 
L
T
 
Y
N
 
N
-
 
F
-
 
K
I
 
L
S
 
A
P
 
P
A
 
S
L
 
L
T
 
T
L
 
L
G
 
G
C
 
C
G
 
G
A
 
S
V
 
W
G
 
G
G
 
G
G
 
N
S
 
S
S
 
I
S
 
S
D
 
E
N
 
N
V
 
V
G
 
G
P
 
P
M
 
K
N
 
H
L
 
L
L
 
I
N
 
N
I
 
K
R
 
K
K
 
T
V
 
V

Sites not aligning to the query:

8cekA Succinyl-coa reductase from clostridium kluyveri (sucd) with NADPH (see paper)
37% identity, 81% coverage: 15:447/533 of query aligns to 4:434/449 of 8cekA

query
sites
8cekA
R
 
K
E
 
E
L
 
L
V
 
I
R
 
E
N
 
K
A
 
A
K
 
K
K
 
V
A
 
A
Q
 
Q
A
 
K
I
 
K
L
 
L
A
 
E
T
 
A
F
 
Y
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
E
Q
 
Q
I
 
V
D
 
D
A
 
V
I
 
L
V
 
V
K
 
K
N
 
A
V
 
L
A
 
G
Q
 
K
E
 
V
A
 
V
A
 
Y
H
 
D
H
 
N
A
 
A
E
 
E
A
 
M
L
 
F
A
 
A
K
 
K
M
 
E
A
 
A
A
 
V
E
 
E
E
 
E
T
 
T
G
 
E
F
 
M
G
 
G
N
 
V
W
 
Y
Q
 
E
D
 
D
K
 
K
V
 
V
L
 
A
K
 
K
N
 
C
R
 
H
F
 
L
A
 
K
S
 
S
L
 
G
R
 
A
V
 
I
Y
 
W
D
 
N
A
 
H
I
 
I
K
 
K
D
 
D
M
 
K
K
 
K
T
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
I
I
 
I
H
 
K
D
 
E
D
 
E
P
 
P
V
 
E
K
 
R
K
 
A
V
 
L
M
 
V
D
 
Y
V
 
V
G
 
A
V
 
K
P
 
P
L
 
K
G
 
G
V
 
V
I
 
V
C
 
A
A
 
A
L
 
T
V
 
T
P
|
P
S
x
I
T
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
V
S
 
V
T
 
T
V
 
P
I
 
M
Y
 
C
K
 
N
A
 
A
L
 
M
I
 
A
A
 
A
L
 
I
K
 
K
A
 
G
G
 
R
N
 
N
A
 
T
I
 
I
I
 
I
F
 
V
S
 
A
P
 
P
H
|
H
P
|
P
G
 
K
A
 
A
R
 
K
Q
 
K
C
 
V
S
 
S
W
 
A
K
 
H
A
 
T
I
 
V
E
 
E
I
 
L
V
 
M
K
 
N
R
 
A
A
 
E
A
 
L
E
 
K
A
 
K
A
 
L
G
 
G
A
 
A
P
 
P
E
 
E
G
 
N
C
 
I
V
 
I
D
 
Q
G
 
I
I
 
V
T
 
E
Q
 
A
L
 
P
T
 
S
L
 
R
E
 
E
A
 
A
T
 
A
S
 
K
E
 
E
L
 
L
M
 
M
H
 
E
S
 
S
K
 
A
D
 
D
V
 
V
S
 
-
L
 
-
I
 
V
L
 
I
A
 
A
T
|
T
G
|
G
G
|
G
E
 
A
G
 
G
M
x
R
V
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
S
S
 
S
G
 
G
T
 
R
P
 
P
T
 
A
I
 
Y
S
 
G
G
x
V
G
 
G
P
 
P
G
 
G
N
 
N
G
 
S
P
 
Q
A
 
V
F
 
I
I
 
V
E
 
D
R
 
K
S
 
G
A
 
Y
D
 
D
I
 
Y
H
 
N
H
 
K
A
 
A
V
 
A
K
 
Q
D
 
D
I
 
I
I
 
I
T
 
T
S
 
G
K
 
R
T
 
K
F
 
Y
D
 
D
N
 
N
G
 
G
V
 
I
I
 
I
C
|
C
A
 
S
S
 
S
E
 
E
Q
 
Q
S
 
S
I
 
V
I
 
I
V
 
A
E
 
P
G
 
A
C
 
E
I
 
D
Y
 
Y
D
 
D
E
 
K
V
 
V
H
 
I
R
 
A
E
 
A
L
 
F
E
 
V
A
 
E
Q
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
F
 
Y
M
 
V
N
 
E
E
 
D
D
 
E
E
 
E
A
 
T
A
 
V
K
 
E
M
 
K
A
 
F
A
 
R
L
 
S
L
 
T
L
 
L
R
 
F
P
 
K
N
 
D
G
 
G
T
 
K
I
 
I
N
 
N
P
 
S
K
 
K
V
 
I
V
 
I
G
 
G
K
 
K
T
 
S
A
 
V
L
 
Q
Y
 
I
L
 
I
S
 
A
Q
 
D
M
 
L
A
 
A
G
 
G
F
 
V
C
 
K
V
 
V
P
 
P
A
 
E
S
 
G
T
 
T
K
 
K
V
 
V
L
 
I
I
 
V
A
 
L
E
 
K
Q
 
G
T
 
K
T
 
G
V
 
A
S
 
G
P
 
E
K
 
K
N
 
D
P
 
V
Y
 
L
S
 
C
R
 
K
E
|
E
K
 
K
L
 
M
C
 
C
P
 
P
V
 
V
L
 
L
G
 
V
L
 
A
Y
 
L
V
 
K
A
 
Y
E
 
D
D
 
T
W
 
F
K
 
E
A
 
E
A
 
A
C
 
V
H
 
E
R
 
I
V
 
A
V
 
M
E
 
A
L
 
N
L
 
Y
T
 
M
N
 
Y
E
 
E
G
 
G
L
 
A
G
 
G
H
 
H
T
 
T
L
 
A
V
 
G
I
 
I
H
 
H
T
 
S
R
 
D
N
 
N
Q
 
D
D
 
E
V
 
N
I
 
I
R
 
R
Q
 
Y
F
 
A
S
 
G
L
 
T
E
 
V
K
 
L
P
 
P
V
 
I
N
 
S
R
 
R
I
 
L
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
Q
P
 
P
A
 
A
A
 
T
L
 
T
G
 
A
G
 
G
I
 
G
G
 
S
A
 
F
T
 
N
T
 
N
N
 
G
I
 
F
S
 
N
P
 
P
A
 
T
L
 
T
T
 
T
L
|
L
G
 
G
C
 
C
G
 
G
A
 
S
V
 
W
G
 
G
G
 
R
G
 
N
S
 
S
S
 
I
S
 
S
D
 
E
N
 
N
V
 
L
G
 
T
P
 
Y
M
 
E
N
 
H
L
 
L
L
 
I
N
 
N
I
 
V
R
 
S
K
 
R
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y

8cejC Succinyl-coa reductase from clostridium kluyveri (sucd) with mesaconyl-c1-coa (see paper)
37% identity, 81% coverage: 15:447/533 of query aligns to 4:434/449 of 8cejC

query
sites
8cejC
R
 
K
E
 
E
L
 
L
V
 
I
R
 
E
N
 
K
A
 
A
K
 
K
K
 
V
A
 
A
Q
 
Q
A
 
K
I
 
K
L
 
L
A
 
E
T
 
A
F
 
Y
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
E
Q
 
Q
I
 
V
D
 
D
A
 
V
I
 
L
V
 
V
K
 
K
N
 
A
V
 
L
A
 
G
Q
 
K
E
 
V
A
 
V
A
 
Y
H
 
D
H
 
N
A
 
A
E
 
E
A
 
M
L
 
F
A
 
A
K
 
K
M
 
E
A
 
A
A
 
V
E
 
E
E
 
E
T
 
T
G
 
E
F
 
M
G
 
G
N
 
V
W
 
Y
Q
 
E
D
 
D
K
 
K
V
 
V
L
 
A
K
 
K
N
 
C
R
 
H
F
 
L
A
x
K
S
 
S
L
 
G
R
 
A
V
 
I
Y
 
W
D
 
N
A
 
H
I
 
I
K
 
K
D
 
D
M
 
K
K
 
K
T
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
I
I
 
I
H
 
K
D
 
E
D
 
E
P
 
P
V
 
E
K
 
R
K
 
A
V
 
L
M
 
V
D
 
Y
V
 
V
G
 
A
V
 
K
P
 
P
L
 
K
G
 
G
V
 
V
I
 
V
C
 
A
A
 
A
L
 
T
V
 
T
P
|
P
S
 
I
T
|
T
N
|
N
P
 
P
T
 
V
S
 
V
T
 
T
V
 
P
I
 
M
Y
 
C
K
 
N
A
 
A
L
 
M
I
 
A
A
 
A
L
 
I
K
 
K
A
 
G
G
 
R
N
 
N
A
 
T
I
 
I
I
 
I
F
 
V
S
x
A
P
|
P
H
|
H
P
|
P
G
 
K
A
 
A
R
 
K
Q
 
K
C
 
V
S
 
S
W
 
A
K
 
H
A
 
T
I
 
V
E
 
E
I
 
L
V
 
M
K
 
N
R
 
A
A
 
E
A
 
L
E
 
K
A
 
K
A
 
L
G
 
G
A
 
A
P
 
P
E
 
E
G
 
N
C
 
I
V
 
I
D
 
Q
G
 
I
I
 
V
T
 
E
Q
 
A
L
 
P
T
 
S
L
x
R
E
 
E
A
 
A
T
 
A
S
 
K
E
 
E
L
 
L
M
 
M
H
 
E
S
 
S
K
 
A
D
 
D
V
 
V
S
 
-
L
 
-
I
 
V
L
 
I
A
 
A
T
 
T
G
 
G
G
 
G
E
 
A
G
|
G
M
x
R
V
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
S
S
 
S
G
 
G
T
 
R
P
 
P
T
 
A
I
 
Y
S
 
G
G
 
V
G
 
G
P
 
P
G
 
G
N
 
N
G
 
S
P
 
Q
A
 
V
F
 
I
I
 
V
E
 
D
R
 
K
S
 
G
A
 
Y
D
 
D
I
 
Y
H
 
N
H
 
K
A
 
A
V
 
A
K
 
Q
D
 
D
I
 
I
I
 
I
T
 
T
S
 
G
K
 
R
T
 
K
F
 
Y
D
 
D
N
 
N
G
 
G
V
 
I
I
|
I
C
|
C
A
x
S
S
 
S
E
 
E
Q
 
Q
S
 
S
I
 
V
I
 
I
V
 
A
E
 
P
G
 
A
C
 
E
I
 
D
Y
 
Y
D
 
D
E
 
K
V
 
V
H
 
I
R
 
A
E
 
A
L
 
F
E
 
V
A
 
E
Q
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
F
 
Y
M
 
V
N
 
E
E
 
D
D
 
E
E
 
E
A
 
T
A
 
V
K
 
E
M
 
K
A
 
F
A
 
R
L
 
S
L
 
T
L
 
L
R
 
F
P
 
K
N
 
D
G
 
G
T
 
K
I
 
I
N
 
N
P
 
S
K
 
K
V
 
I
V
 
I
G
 
G
K
 
K
T
 
S
A
 
V
L
 
Q
Y
 
I
L
 
I
S
 
A
Q
 
D
M
 
L
A
 
A
G
 
G
F
 
V
C
 
K
V
 
V
P
 
P
A
 
E
S
 
G
T
 
T
K
 
K
V
 
V
L
 
I
I
 
V
A
 
L
E
 
K
Q
 
G
T
 
K
T
 
G
V
 
A
S
 
G
P
 
E
K
 
K
N
 
D
P
 
V
Y
 
L
S
 
C
R
 
K
E
 
E
K
 
K
L
 
M
C
 
C
P
 
P
V
 
V
L
 
L
G
 
V
L
 
A
Y
 
L
V
 
K
A
 
Y
E
 
D
D
 
T
W
 
F
K
 
E
A
 
E
A
 
A
C
 
V
H
 
E
R
 
I
V
 
A
V
 
M
E
 
A
L
 
N
L
 
Y
T
 
M
N
 
Y
E
 
E
G
 
G
L
 
A
G
 
G
H
 
H
T
 
T
L
 
A
V
 
G
I
 
I
H
 
H
T
 
S
R
 
D
N
 
N
Q
 
D
D
 
E
V
 
N
I
 
I
R
 
R
Q
 
Y
F
 
A
S
 
G
L
 
T
E
 
V
K
 
L
P
 
P
V
 
I
N
 
S
R
 
R
I
 
L
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
Q
P
 
P
A
 
A
A
x
T
L
 
T
G
 
A
G
|
G
I
 
G
G
 
S
A
 
F
T
 
N
T
 
N
N
 
G
I
 
F
S
 
N
P
 
P
A
 
T
L
x
T
T
 
T
L
|
L
G
 
G
C
 
C
G
 
G
A
 
S
V
 
W
G
 
G
G
 
R
G
 
N
S
 
S
S
 
I
S
 
S
D
 
E
N
 
N
V
 
L
G
 
T
P
 
Y
M
 
E
N
 
H
L
 
L
L
 
I
N
 
N
I
 
V
R
 
S
K
 
R
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y

8cejA Succinyl-coa reductase from clostridium kluyveri (sucd) with mesaconyl-c1-coa (see paper)
37% identity, 81% coverage: 15:447/533 of query aligns to 4:434/449 of 8cejA

query
sites
8cejA
R
 
K
E
 
E
L
 
L
V
 
I
R
 
E
N
 
K
A
 
A
K
 
K
K
 
V
A
 
A
Q
 
Q
A
 
K
I
 
K
L
 
L
A
 
E
T
 
A
F
 
Y
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
E
Q
 
Q
I
 
V
D
 
D
A
 
V
I
 
L
V
 
V
K
 
K
N
 
A
V
 
L
A
 
G
Q
 
K
E
 
V
A
 
V
A
 
Y
H
 
D
H
 
N
A
 
A
E
 
E
A
 
M
L
 
F
A
 
A
K
 
K
M
 
E
A
 
A
A
 
V
E
 
E
E
 
E
T
 
T
G
 
E
F
 
M
G
 
G
N
 
V
W
 
Y
Q
 
E
D
 
D
K
 
K
V
 
V
L
 
A
K
 
K
N
 
C
R
 
H
F
 
L
A
x
K
S
 
S
L
 
G
R
 
A
V
 
I
Y
 
W
D
 
N
A
 
H
I
 
I
K
 
K
D
 
D
M
 
K
K
 
K
T
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
I
I
 
I
H
 
K
D
 
E
D
 
E
P
 
P
V
 
E
K
 
R
K
 
A
V
 
L
M
 
V
D
 
Y
V
 
V
G
 
A
V
 
K
P
 
P
L
 
K
G
 
G
V
 
V
I
 
V
C
 
A
A
 
A
L
 
T
V
 
T
P
 
P
S
 
I
T
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
V
S
 
V
T
 
T
V
 
P
I
 
M
Y
 
C
K
 
N
A
 
A
L
 
M
I
 
A
A
 
A
L
 
I
K
 
K
A
 
G
G
 
R
N
 
N
A
 
T
I
 
I
I
 
I
F
 
V
S
 
A
P
 
P
H
 
H
P
 
P
G
 
K
A
 
A
R
 
K
Q
 
K
C
 
V
S
 
S
W
 
A
K
 
H
A
 
T
I
 
V
E
 
E
I
 
L
V
 
M
K
 
N
R
 
A
A
 
E
A
 
L
E
 
K
A
 
K
A
 
L
G
 
G
A
 
A
P
 
P
E
 
E
G
 
N
C
 
I
V
 
I
D
 
Q
G
 
I
I
 
V
T
 
E
Q
 
A
L
 
P
T
 
S
L
 
R
E
 
E
A
 
A
T
 
A
S
 
K
E
 
E
L
 
L
M
 
M
H
 
E
S
 
S
K
 
A
D
 
D
V
 
V
S
 
-
L
 
-
I
 
V
L
 
I
A
 
A
T
 
T
G
 
G
G
 
G
E
 
A
G
 
G
M
 
R
V
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
S
S
 
S
G
 
G
T
 
R
P
 
P
T
 
A
I
 
Y
S
 
G
G
 
V
G
 
G
P
 
P
G
 
G
N
 
N
G
 
S
P
 
Q
A
 
V
F
 
I
I
 
V
E
 
D
R
 
K
S
 
G
A
 
Y
D
 
D
I
 
Y
H
 
N
H
 
K
A
 
A
V
 
A
K
 
Q
D
 
D
I
 
I
I
 
I
T
 
T
S
 
G
K
 
R
T
 
K
F
 
Y
D
 
D
N
 
N
G
 
G
V
 
I
I
 
I
C
|
C
A
x
S
S
 
S
E
 
E
Q
 
Q
S
 
S
I
 
V
I
 
I
V
 
A
E
 
P
G
 
A
C
 
E
I
 
D
Y
 
Y
D
 
D
E
 
K
V
 
V
H
 
I
R
 
A
E
 
A
L
 
F
E
 
V
A
 
E
Q
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
F
 
Y
M
 
V
N
 
E
E
 
D
D
 
E
E
 
E
A
 
T
A
 
V
K
 
E
M
 
K
A
 
F
A
 
R
L
 
S
L
 
T
L
 
L
R
 
F
P
 
K
N
 
D
G
 
G
T
 
K
I
 
I
N
 
N
P
 
S
K
 
K
V
 
I
V
 
I
G
 
G
K
 
K
T
 
S
A
 
V
L
 
Q
Y
 
I
L
 
I
S
 
A
Q
 
D
M
 
L
A
 
A
G
 
G
F
 
V
C
 
K
V
 
V
P
 
P
A
 
E
S
 
G
T
 
T
K
 
K
V
 
V
L
 
I
I
 
V
A
 
L
E
 
K
Q
 
G
T
 
K
T
 
G
V
 
A
S
 
G
P
 
E
K
 
K
N
 
D
P
 
V
Y
 
L
S
 
C
R
 
K
E
 
E
K
 
K
L
 
M
C
 
C
P
 
P
V
 
V
L
 
L
G
 
V
L
 
A
Y
 
L
V
 
K
A
 
Y
E
 
D
D
 
T
W
 
F
K
 
E
A
 
E
A
 
A
C
 
V
H
 
E
R
 
I
V
 
A
V
 
M
E
 
A
L
 
N
L
 
Y
T
 
M
N
 
Y
E
 
E
G
 
G
L
 
A
G
 
G
H
 
H
T
 
T
L
 
A
V
 
G
I
 
I
H
 
H
T
 
S
R
 
D
N
 
N
Q
 
D
D
 
E
V
 
N
I
 
I
R
 
R
Q
 
Y
F
 
A
S
 
G
L
 
T
E
 
V
K
 
L
P
 
P
V
 
I
N
 
S
R
 
R
I
 
L
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
Q
P
 
P
A
 
A
A
 
T
L
 
T
G
 
A
G
|
G
I
 
G
G
 
S
A
 
F
T
 
N
T
 
N
N
 
G
I
 
F
S
 
N
P
 
P
A
 
T
L
x
T
T
 
T
L
|
L
G
 
G
C
 
C
G
 
G
A
 
S
V
 
W
G
 
G
G
 
R
G
 
N
S
 
S
S
 
I
S
 
S
D
 
E
N
 
N
V
 
L
G
 
T
P
 
Y
M
 
E
N
 
H
L
 
L
L
 
I
N
 
N
I
 
V
R
 
S
K
 
R
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y

4c3sA Structure of a propionaldehyde dehydrogenase from the clostridium phytofermentans fucose utilisation bacterial microcompartment (see paper)
32% identity, 76% coverage: 7:412/533 of query aligns to 1:403/435 of 4c3sA

query
sites
4c3sA
D
 
E
L
 
L
Q
 
G
S
 
V
R
 
F
Q
 
D
N
 
D
A
 
M
R
 
N
E
 
Q
L
 
A
V
 
I
R
 
E
N
 
A
A
 
A
K
 
K
K
 
E
A
 
A
Q
 
Q
A
 
L
I
 
V
L
 
V
A
 
K
T
 
K
F
 
M
S
 
S
Q
 
M
Q
 
D
Q
 
Q
I
 
R
D
 
E
A
 
K
I
 
I
V
 
I
K
 
S
N
 
A
V
 
I
A
 
R
Q
 
K
E
 
K
A
 
T
A
 
I
H
 
E
H
 
H
A
 
A
E
 
E
A
 
T
L
 
L
A
 
A
K
 
R
M
 
M
A
 
A
A
 
V
E
 
E
E
 
E
T
 
T
G
 
G
F
 
M
G
 
G
N
 
N
W
 
V
Q
 
G
D
 
H
K
 
K
V
 
I
L
 
L
K
 
K
N
 
H
R
 
Q
F
 
L
A
 
V
S
 
A
L
 
E
R
 
K
V
 
T
Y
 
-
D
 
P
A
 
G
I
 
T
K
 
E
D
 
D
M
 
I
K
 
T
T
 
T
V
 
T
G
 
A
I
 
W
I
 
S
H
 
G
D
 
D
D
 
R
P
 
G
V
 
L
K
 
T
K
 
-
V
 
L
M
 
V
D
 
E
V
 
M
G
 
G
V
 
-
P
 
P
L
 
F
G
 
G
V
 
V
I
 
I
C
 
G
A
 
A
L
x
I
V
x
T
P
|
P
S
x
C
T
|
T
N
 
N
P
 
P
T
 
S
S
 
E
T
 
T
V
 
I
I
 
I
Y
 
C
K
 
N
A
 
T
L
 
I
I
 
G
A
 
M
L
 
L
K
 
A
A
 
G
G
 
G
N
 
N
A
 
T
I
 
V
I
 
V
F
 
F
S
 
N
P
 
P
H
|
H
P
 
P
G
 
A
A
 
A
R
 
I
Q
 
K
C
 
T
S
 
S
W
 
N
K
 
F
A
 
A
I
 
V
E
 
Q
I
 
L
V
 
I
K
 
N
R
 
E
A
 
A
A
 
S
E
 
L
A
 
S
A
 
A
G
 
G
A
 
G
P
 
P
E
 
V
G
 
N
C
 
I
V
 
A
D
 
C
G
 
S
I
 
V
T
 
R
Q
 
K
L
 
P
T
 
T
L
|
L
E
 
D
A
 
S
T
 
S
S
 
K
E
 
I
L
 
M
M
 
M
H
 
S
S
 
H
K
 
Q
D
 
D
V
 
I
S
 
P
L
 
L
I
 
I
L
 
A
A
 
A
T
|
T
G
|
G
G
|
G
E
 
P
G
 
G
M
x
V
V
 
V
R
 
T
A
 
A
A
 
V
Y
 
L
A
 
Q
S
 
S
G
 
G
T
 
K
P
 
R
T
 
G
I
 
I
S
 
G
G
x
A
G
|
G
P
 
A
G
 
G
N
 
N
G
 
P
P
 
P
A
 
V
F
 
L
I
 
V
E
 
D
R
 
E
S
 
T
A
 
A
D
 
D
I
 
I
H
 
R
H
 
K
A
 
A
V
 
A
K
 
E
D
 
D
I
 
I
I
 
I
T
 
N
S
 
G
K
 
C
T
 
T
F
 
F
D
 
D
N
 
N
G
 
N
V
 
L
I
 
P
C
|
C
A
 
I
S
 
A
E
 
E
Q
 
K
S
 
E
I
 
V
I
 
V
V
 
A
E
 
I
G
 
D
C
 
A
I
 
I
Y
 
A
D
 
N
E
 
E
V
 
L
H
 
M
R
 
N
E
 
Y
L
 
M
-
 
V
E
 
K
A
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
C
Y
 
Y
F
 
A
M
 
I
N
 
T
E
 
K
D
 
E
E
 
Q
A
 
Q
A
 
E
K
 
K
M
 
L
A
 
T
A
 
N
L
 
L
L
 
V
L
 
I
R
 
T
P
 
P
N
 
K
G
 
G
T
 
-
I
 
L
N
 
N
P
 
R
K
 
N
V
 
C
V
 
V
G
 
G
K
 
K
T
 
D
A
 
A
L
 
R
Y
 
T
L
 
L
S
 
L
Q
 
G
M
 
M
A
 
I
G
 
G
F
 
I
C
 
D
V
 
V
P
 
P
A
 
S
S
 
N
T
 
I
K
 
R
V
 
C
L
 
I
I
 
I
A
 
F
E
 
E
Q
 
G
T
 
E
T
 
K
V
 
E
S
 
H
P
 
P
K
 
L
N
 
-
P
 
-
Y
 
I
S
 
S
R
 
E
E
|
E
K
 
L
L
x
M
C
 
M
P
 
P
V
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
I
Y
 
V
V
 
R
A
 
A
E
 
K
D
 
S
W
 
F
K
 
D
A
 
D
A
 
A
C
 
V
H
 
E
R
 
K
V
 
A
V
 
V
E
 
W
L
 
L
L
 
-
T
 
-
N
 
E
E
 
H
G
 
G
L
 
N
G
 
R
H
|
H
T
 
S
L
 
A
V
 
H
I
 
I
H
 
H
T
 
S
R
 
K
N
 
N
Q
 
V
D
 
D
V
 
R
I
 
I
R
 
T
Q
 
T
F
 
Y
S
 
A
L
 
K
E
 
A
K
 
I
P
 
D
V
 
T
N
 
A
R
 
I
I
 
L
L
 
V
I
 
K
N
 
N
T
 
A
P
 
P
A
 
S
-
 
Y
-
 
A
-
 
A
-
 
I
A
 
G
L
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
E
G
 
G
A
 
F
T
 
C
T
 
T

Sites not aligning to the query:

5dbvA Structure of a c269a mutant of propionaldehyde dehydrogenase from the clostridium phytofermentans fucose utilisation bacterial microcompartment (see paper)
32% identity, 74% coverage: 18:412/533 of query aligns to 11:399/431 of 5dbvA

query
sites
5dbvA
V
 
I
R
 
E
N
 
A
A
 
A
K
 
K
K
 
E
A
 
A
Q
 
Q
A
 
L
I
 
V
L
 
V
A
 
K
T
 
K
F
 
M
S
 
S
Q
 
M
Q
 
D
Q
 
Q
I
 
R
D
 
E
A
 
K
I
 
I
V
 
I
K
 
S
N
 
A
V
 
I
A
 
R
Q
 
K
E
 
K
A
 
T
A
 
I
H
 
E
H
 
H
A
 
A
E
 
E
A
 
T
L
 
L
A
 
A
K
 
R
M
 
M
A
 
A
A
 
V
E
 
E
E
 
E
T
 
T
G
 
G
F
 
M
G
 
G
N
 
N
W
 
V
Q
 
G
D
 
H
K
 
K
V
 
I
L
 
L
K
 
K
N
 
H
R
 
Q
F
 
L
A
 
V
S
 
A
L
 
E
R
 
K
V
 
T
Y
 
-
D
 
P
A
 
G
I
 
T
K
 
E
D
 
D
M
 
I
K
 
T
T
 
T
V
 
T
G
 
A
I
 
W
I
 
S
H
 
G
D
 
D
D
 
R
P
 
G
V
 
L
K
 
T
K
 
-
V
 
L
M
 
V
D
 
E
V
 
M
G
 
G
V
 
-
P
 
P
L
 
F
G
 
G
V
 
V
I
 
I
C
 
G
A
 
A
L
x
I
V
 
T
P
 
P
S
x
C
T
|
T
N
 
N
P
 
P
T
 
S
S
 
E
T
 
T
V
 
I
I
 
I
Y
 
C
K
 
N
A
 
T
L
 
I
I
 
G
A
 
M
L
 
L
K
 
A
A
 
G
G
 
G
N
 
N
A
 
T
I
 
V
I
 
V
F
 
F
S
x
N
P
|
P
H
|
H
P
 
P
G
 
A
A
 
A
R
 
I
Q
 
K
C
 
T
S
 
S
W
 
N
K
 
F
A
 
A
I
 
V
E
 
Q
I
 
L
V
 
I
K
 
N
R
 
E
A
 
A
A
 
S
E
 
L
A
 
S
A
 
A
G
 
G
A
 
G
P
 
P
E
 
V
G
 
N
C
 
I
V
 
A
D
 
C
G
 
S
I
 
V
T
 
R
Q
 
K
L
 
P
T
 
T
L
 
L
E
 
D
A
 
S
T
 
S
S
 
K
E
 
I
L
 
M
M
 
M
H
 
S
S
 
H
K
 
Q
D
 
D
V
 
I
S
 
P
L
 
L
I
 
I
L
 
A
A
 
A
T
 
T
G
|
G
G
|
G
E
 
P
G
 
G
M
x
V
V
 
V
R
 
T
A
 
A
A
 
V
Y
 
L
A
 
Q
S
 
S
G
 
G
T
 
K
P
 
R
T
 
G
I
 
I
S
 
G
G
 
A
G
|
G
P
 
A
G
 
G
N
 
N
G
 
P
P
 
P
A
 
V
F
 
L
I
 
V
E
 
D
R
 
E
S
 
T
A
 
A
D
 
D
I
 
I
H
 
R
H
 
K
A
 
A
V
 
A
K
 
E
D
 
D
I
 
I
I
 
I
T
 
N
S
 
G
K
 
C
T
 
T
F
 
F
D
 
D
N
 
N
G
 
N
V
 
L
I
 
P
C
x
A
A
 
I
S
 
A
E
 
E
Q
x
K
S
 
E
I
 
V
I
 
V
V
 
A
E
 
I
G
 
D
C
 
A
I
 
I
Y
 
A
D
 
N
E
 
E
V
 
L
H
 
M
R
 
N
E
 
Y
L
 
M
-
 
V
E
 
K
A
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
C
Y
 
Y
F
 
A
M
 
I
N
 
T
E
 
K
D
 
E
E
 
Q
A
 
Q
A
 
E
K
 
K
M
 
L
A
 
T
A
 
N
L
 
L
L
 
V
L
 
I
R
 
T
P
 
P
N
 
K
G
 
G
T
 
-
I
 
L
N
 
N
P
x
R
K
 
N
V
 
C
V
 
V
G
 
G
K
 
K
T
 
D
A
 
A
L
 
R
Y
 
T
L
 
L
S
 
L
Q
 
G
M
 
M
A
 
I
G
 
G
F
 
I
C
 
-
V
 
-
P
 
-
A
 
D
S
 
N
T
 
I
K
 
R
V
 
C
L
 
I
I
 
I
A
 
F
E
 
E
Q
 
G
T
 
E
T
 
K
V
 
E
S
 
H
P
 
P
K
 
L
N
 
-
P
 
-
Y
 
I
S
 
S
R
 
E
E
|
E
K
 
L
L
x
M
C
 
M
P
 
P
V
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
I
Y
 
V
V
 
R
A
 
A
E
 
K
D
 
S
W
 
F
K
 
D
A
 
D
A
 
A
C
 
V
H
 
E
R
 
K
V
 
A
V
 
V
E
 
W
L
 
L
L
 
-
T
 
-
N
 
E
E
 
H
G
 
G
L
 
N
G
 
R
H
 
H
T
 
S
L
 
A
V
 
H
I
 
I
H
 
H
T
 
S
R
 
K
N
 
N
Q
 
V
D
 
D
V
 
R
I
 
I
R
 
T
Q
 
T
F
 
Y
S
 
A
L
 
K
E
 
A
K
 
I
P
 
D
V
 
T
N
 
A
R
 
I
I
 
L
L
 
V
I
 
K
N
 
N
T
 
A
P
 
P
A
 
S
-
 
Y
-
 
A
-
 
A
-
 
I
A
 
G
L
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
E
G
 
G
A
 
F
T
 
C
T
 
T

Q9XDN1 Propanal dehydrogenase (CoA-propanoylating); Coenzyme-A-acylating propionaldehyde dehydrogenase; Propanediol utilization protein PduP; EC 1.2.1.87 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see 2 papers)
34% identity, 65% coverage: 37:381/533 of query aligns to 60:397/464 of Q9XDN1

query
sites
Q9XDN1
D
 
S
A
 
A
I
 
I
V
 
I
K
 
S
N
 
A
V
 
M
A
 
R
Q
 
Q
E
 
E
A
 
L
A
 
T
H
 
P
H
 
L
A
 
L
E
 
A
A
 
P
L
 
L
A
 
A
K
 
E
M
 
E
A
 
S
A
 
A
E
 
N
E
 
E
T
 
T
G
 
G
F
 
M
G
 
G
N
 
N
W
 
K
Q
 
E
D
 
D
K
 
K
V
 
F
L
 
L
K
 
K
N
 
N
R
 
K
F
 
-
A
 
A
S
 
A
L
 
L
R
 
D
V
 
N
Y
 
T
D
 
P
A
 
G
I
 
V
K
 
E
D
 
D
M
 
L
K
 
T
T
 
T
V
 
T
G
 
A
I
 
L
I
 
T
H
 
G
D
 
D
D
 
G
P
 
G
V
 
M
K
 
-
K
 
-
V
 
V
M
 
L
D
 
F
V
 
E
G
 
Y
V
 
S
P
 
P
L
 
F
G
 
G
V
 
V
I
 
I
C
 
G
A
 
S
L
 
V
V
 
A
P
 
P
S
 
S
T
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
T
S
 
E
T
 
T
V
 
I
I
 
I
Y
 
N
K
 
N
A
 
S
L
 
I
I
 
S
A
 
M
L
 
L
K
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
S
I
 
I
I
 
Y
F
 
F
S
 
S
P
 
P
H
 
H
P
 
P
G
 
G
A
 
A
R
 
K
Q
 
K
C
 
V
S
 
S
W
 
L
K
 
K
A
 
L
I
 
I
E
 
S
I
 
L
V
 
I
K
 
E
R
 
E
A
 
I
A
 
A
E
 
F
A
 
R
A
 
C
G
 
C
A
 
G
P
 
I
E
 
R
G
 
N
C
 
L
V
 
V
D
 
V
G
 
T
I
 
V
T
 
A
Q
 
E
L
 
P
T
 
T
L
 
F
E
 
E
A
 
A
T
 
T
S
 
Q
E
 
Q
L
 
M
M
 
M
H
 
A
S
 
H
K
 
P
D
 
R
V
 
I
S
 
A
L
 
V
I
 
L
L
 
A
A
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
G
E
 
P
G
 
G
M
 
I
V
 
V
R
 
A
A
 
M
A
 
G
Y
 
M
A
 
K
S
 
S
G
 
G
T
 
K
P
 
K
T
 
V
I
 
I
S
 
G
G
 
A
G
 
G
P
 
A
G
 
G
N
 
N
G
 
P
P
 
P
A
 
C
F
 
I
I
 
V
E
 
D
R
 
E
S
 
T
A
 
A
D
 
D
I
 
L
H
 
V
H
 
K
A
 
A
V
 
A
K
 
E
D
 
D
I
 
I
I
 
I
T
 
N
S
 
G
K
 
A
T
 
S
F
 
F
D
 
D
N
 
Y
G
 
N
V
 
L
I
 
P
C
 
C
A
 
I
S
 
A
E
 
E
Q
 
K
S
 
S
I
 
L
I
 
I
V
 
V
E
 
V
G
 
E
C
 
S
I
 
V
Y
 
A
D
 
E
E
 
R
V
 
L
H
 
V
R
 
Q
E
 
Q
L
 
M
E
 
Q
A
 
T
Q
 
F
G
 
G
A
 
A
Y
 
L
F
 
L
M
 
L
N
 
S
E
 
P
D
 
A
E
 
D
A
 
T
A
 
D
K
 
K
M
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
V
L
 
C
L
 
L
R
 
-
P
 
P
N
 
E
G
 
G
T
 
Q
I
 
A
N
 
N
P
 
K
K
 
K
V
 
L
V
 
V
G
 
G
K
 
K
T
 
S
A
 
P
L
 
S
Y
 
A
L
 
M
S
 
L
Q
 
E
M
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
I
C
 
A
V
 
V
P
 
P
A
 
A
-
 
K
S
 
A
T
 
P
K
 
R
V
 
L
L
 
L
I
 
I
A
 
A
E
 
-
Q
 
-
T
 
-
T
 
L
V
 
V
S
 
N
P
 
A
K
 
D
N
 
D
P
 
P
Y
 
W
-
 
V
S
 
T
R
 
S
E
 
E
K
 
Q
L
 
L
C
 
M
P
 
P
V
 
M
L
 
L
G
 
P
L
 
V
Y
 
V
V
 
K
A
 
V
E
 
S
D
 
D
W
 
F
K
 
D
A
 
S
A
 
A
C
 
L
H
 
-
R
 
-
V
 
A
V
 
L
E
 
A
L
 
L
L
 
K
T
 
V
N
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
L
G
 
H
H
 
H
T
 
T
L
 
A
V
 
I
I
 
M
H
 
H
T
 
S
R
 
Q
N
 
N

Sites not aligning to the query:

5jfmB Crystal structure of rhodopseudomonas palustris propionaldehyde dehydrogenase with bound propionyl-coa (see paper)
33% identity, 67% coverage: 52:410/533 of query aligns to 62:413/452 of 5jfmB

query
sites
5jfmB
E
 
E
A
 
K
L
 
M
A
 
S
K
 
R
M
 
M
A
 
A
A
 
V
E
 
E
E
 
E
T
 
T
G
 
G
F
 
M
G
 
G
N
 
N
W
 
Y
Q
 
E
D
 
H
K
 
K
V
 
L
L
 
I
K
 
K
N
 
N
R
 
R
F
 
L
A
 
A
S
 
G
L
 
E
R
 
K
V
 
T
Y
 
-
D
 
P
A
 
G
I
 
I
K
 
E
D
 
D
M
 
L
K
 
T
T
 
T
V
 
D
G
 
A
I
 
F
I
 
S
H
 
G
D
 
D
D
 
N
P
 
G
V
 
L
K
 
T
K
 
L
V
 
V
M
 
E
D
 
Y
V
 
S
G
 
-
V
 
-
P
 
P
L
 
F
G
 
G
V
 
V
I
 
I
C
 
G
A
 
A
L
x
I
V
 
T
P
|
P
S
x
T
T
|
T
N
|
N
P
 
P
T
 
T
S
 
E
T
 
T
V
 
I
I
 
V
Y
 
C
K
 
N
A
 
S
L
 
I
I
 
G
A
 
M
L
 
L
K
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
S
I
 
V
I
 
V
F
 
F
S
 
S
P
|
P
H
|
H
P
 
P
G
 
R
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
C
 
V
S
 
S
W
 
L
K
 
L
A
 
L
I
 
V
E
 
R
I
 
L
V
 
I
K
 
N
R
 
Q
A
 
K
A
 
L
E
 
A
A
 
A
A
 
L
G
 
G
A
 
A
P
 
P
E
 
E
G
 
N
C
 
L
V
 
V
D
 
V
G
 
T
I
 
V
T
 
E
Q
 
K
L
 
P
T
x
S
L
x
I
E
 
E
A
 
N
T
|
T
S
 
N
E
 
A
L
 
M
M
 
M
H
 
A
S
 
H
K
 
P
D
 
K
V
 
V
S
 
R
L
 
M
I
 
L
L
 
V
A
 
A
T
|
T
G
|
G
G
|
G
E
 
P
G
 
A
M
 
I
V
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
V
Y
 
L
A
 
S
S
 
T
G
 
G
T
 
K
P
 
K
T
 
A
I
 
I
S
 
G
G
x
A
G
 
G
P
 
A
G
 
G
N
 
N
G
 
P
P
 
P
A
 
V
F
 
V
I
 
V
E
 
D
R
 
E
S
 
T
A
 
A
D
 
N
I
 
I
H
 
E
H
 
K
A
 
A
V
 
A
K
 
C
D
 
D
I
 
I
I
 
V
T
 
N
S
 
G
K
 
C
T
 
S
F
 
F
D
 
D
N
 
N
G
 
N
V
 
L
I
 
P
C
|
C
A
 
V
S
 
A
E
 
E
Q
 
K
S
 
E
I
 
I
I
 
I
V
 
A
E
 
V
G
 
A
C
 
Q
I
 
I
Y
 
A
D
 
D
E
 
Y
V
 
L
H
 
I
R
 
F
E
 
N
L
 
L
E
 
K
A
 
K
Q
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
F
 
E
M
 
I
N
 
K
E
 
D
D
 
P
E
 
A
A
 
V
-
 
L
A
 
Q
K
 
Q
M
 
L
A
 
Q
A
 
D
L
 
L
L
 
V
L
 
L
R
 
T
P
 
A
N
 
K
G
 
G
T
 
G
I
 
P
N
 
Q
P
x
T
K
 
K
V
 
C
V
 
V
G
 
G
K
 
K
T
 
S
A
 
A
L
 
V
Y
 
W
L
 
L
S
 
L
Q
 
S
M
 
Q
A
 
I
G
 
G
F
 
I
C
 
S
V
 
V
P
 
D
A
 
A
S
 
S
T
 
I
K
 
K
V
 
I
L
 
I
I
 
L
A
 
M
E
 
E
Q
 
-
T
 
-
T
 
-
V
 
V
S
 
P
P
 
R
K
 
E
N
 
H
P
 
P
Y
 
F
S
 
V
R
 
Q
E
 
E
K
 
E
L
 
L
-
 
M
C
 
M
P
 
P
V
 
I
L
 
L
G
 
P
L
 
L
Y
 
V
V
 
R
A
 
V
E
 
E
D
 
T
W
 
V
K
 
D
A
 
D
A
 
A
C
 
I
H
 
D
R
 
L
V
 
A
V
 
I
E
 
E
L
 
V
L
 
E
T
 
H
N
 
D
E
 
N
G
 
-
L
 
-
G
 
R
H
 
H
T
 
T
L
 
A
V
 
I
I
 
M
H
 
H
T
 
S
R
 
-
N
 
-
Q
 
T
D
 
D
V
 
V
I
 
R
R
 
K
Q
 
L
F
 
T
S
 
K
L
 
M
E
 
A
K
 
K
P
 
L
V
 
I
-
 
Q
N
 
T
R
 
T
I
 
I
L
 
F
I
 
V
N
 
K
T
 
N
P
 
G
A
 
P
A
 
S
L
 
Y
G
 
A
G
 
G
I
 
L
G
 
G
A
 
A

5jfmA Crystal structure of rhodopseudomonas palustris propionaldehyde dehydrogenase with bound propionyl-coa (see paper)
33% identity, 67% coverage: 52:410/533 of query aligns to 49:400/439 of 5jfmA

query
sites
5jfmA
E
 
E
A
 
K
L
 
M
A
 
S
K
 
R
M
 
M
A
 
A
A
 
V
E
 
E
E
 
E
T
 
T
G
 
G
F
 
M
G
 
G
N
 
N
W
 
Y
Q
 
E
D
 
H
K
 
K
V
 
L
L
 
I
K
 
K
N
 
N
R
 
R
F
 
L
A
 
A
S
 
G
L
 
E
R
 
K
V
 
T
Y
 
-
D
 
P
A
 
G
I
 
I
K
 
E
D
 
D
M
 
L
K
 
T
T
 
T
V
 
D
G
 
A
I
 
F
I
 
S
H
 
G
D
 
D
D
 
N
P
 
G
V
 
L
K
 
T
K
 
L
V
 
V
M
 
E
D
 
Y
V
 
S
G
 
-
V
 
-
P
 
P
L
 
F
G
 
G
V
 
V
I
 
I
C
 
G
A
 
A
L
x
I
V
x
T
P
 
P
S
 
T
T
|
T
N
|
N
P
 
P
T
 
T
S
 
E
T
 
T
V
 
I
I
 
V
Y
 
C
K
 
N
A
 
S
L
 
I
I
 
G
A
 
M
L
 
L
K
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
S
I
 
V
I
 
V
F
 
F
S
|
S
P
|
P
H
|
H
P
 
P
G
 
R
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
C
 
V
S
 
S
W
 
L
K
 
L
A
 
L
I
 
V
E
 
R
I
 
L
V
 
I
K
 
N
R
 
Q
A
 
K
A
 
L
E
 
A
A
 
A
A
 
L
G
 
G
A
 
A
P
 
P
E
 
E
G
 
N
C
 
L
V
 
V
D
 
V
G
 
T
I
 
V
T
 
E
Q
 
K
L
 
P
T
 
S
L
x
I
E
 
E
A
 
N
T
 
T
S
 
N
E
 
A
L
 
M
M
 
M
H
 
A
S
 
H
K
 
P
D
 
K
V
 
V
S
 
R
L
 
M
I
 
L
L
 
V
A
 
A
T
|
T
G
|
G
G
|
G
E
 
P
G
 
A
M
 
I
V
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
V
Y
 
L
A
 
S
S
 
T
G
 
G
T
 
K
P
 
K
T
 
A
I
 
I
S
 
G
G
x
A
G
 
G
P
 
A
G
 
G
N
 
N
G
 
P
P
 
P
A
 
V
F
 
V
I
 
V
E
 
D
R
 
E
S
 
T
A
 
A
D
 
N
I
 
I
H
 
E
H
 
K
A
 
A
V
 
A
K
 
C
D
 
D
I
 
I
I
 
V
T
 
N
S
 
G
K
 
C
T
 
S
F
 
F
D
 
D
N
 
N
G
 
N
V
 
L
I
x
P
C
|
C
A
 
V
S
 
A
E
 
E
Q
 
K
S
 
E
I
 
I
I
 
I
V
 
A
E
 
V
G
 
A
C
 
Q
I
 
I
Y
 
A
D
 
D
E
 
Y
V
 
L
H
 
I
R
 
F
E
 
N
L
 
L
E
 
K
A
 
K
Q
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
F
 
E
M
 
I
N
 
K
E
 
D
D
 
P
E
 
A
A
 
V
-
 
L
A
 
Q
K
 
Q
M
 
L
A
 
Q
A
 
D
L
 
L
L
 
V
L
 
L
R
 
T
P
 
A
N
 
K
G
 
G
T
 
G
I
 
P
N
 
Q
P
 
T
K
 
K
V
 
C
V
 
V
G
 
G
K
 
K
T
 
S
A
 
A
L
 
V
Y
 
W
L
 
L
S
 
L
Q
 
S
M
 
Q
A
 
I
G
 
G
F
 
I
C
 
S
V
 
V
P
 
D
A
 
A
S
 
S
T
 
I
K
 
K
V
 
I
L
 
I
I
 
L
A
 
M
E
 
E
Q
 
-
T
 
-
T
 
-
V
 
V
S
 
P
P
 
R
K
 
E
N
 
H
P
 
P
Y
 
F
S
 
V
R
 
Q
E
 
E
K
 
E
L
 
L
-
 
M
C
 
M
P
 
P
V
 
I
L
 
L
G
 
P
L
 
L
Y
 
V
V
 
R
A
 
V
E
 
E
D
 
T
W
 
V
K
 
D
A
 
D
A
 
A
C
 
I
H
 
D
R
 
L
V
 
A
V
 
I
E
 
E
L
 
V
L
 
E
T
 
H
N
 
D
E
 
N
G
 
-
L
 
-
G
 
R
H
 
H
T
 
T
L
 
A
V
 
I
I
 
M
H
 
H
T
 
S
R
 
-
N
 
-
Q
 
T
D
 
D
V
 
V
I
 
R
R
 
K
Q
 
L
F
 
T
S
 
K
L
 
M
E
 
A
K
 
K
P
 
L
V
 
I
-
 
Q
N
 
T
R
 
T
I
 
I
L
 
F
I
 
V
N
 
K
T
 
N
P
 
G
A
 
P
A
 
S
L
 
Y
G
 
A
G
 
G
I
 
L
G
 
G
A
 
A

5jflA Crystal structure of rhodopseudomonas palustris propionaldehyde dehydrogenase with bound NAD+ (see paper)
33% identity, 67% coverage: 52:410/533 of query aligns to 50:401/440 of 5jflA

query
sites
5jflA
E
 
E
A
 
K
L
 
M
A
 
S
K
 
R
M
 
M
A
 
A
A
 
V
E
 
E
E
 
E
T
 
T
G
 
G
F
 
M
G
 
G
N
 
N
W
 
Y
Q
 
E
D
 
H
K
 
K
V
 
L
L
 
I
K
 
K
N
 
N
R
 
R
F
 
L
A
 
A
S
 
G
L
 
E
R
 
K
V
 
T
Y
 
-
D
 
P
A
 
G
I
 
I
K
 
E
D
 
D
M
 
L
K
 
T
T
 
T
V
 
D
G
 
A
I
 
F
I
 
S
H
 
G
D
 
D
D
 
N
P
 
G
V
 
L
K
 
T
K
 
L
V
 
V
M
 
E
D
 
Y
V
 
S
G
 
-
V
 
-
P
 
P
L
 
F
G
 
G
V
 
V
I
 
I
C
 
G
A
 
A
L
x
I
V
x
T
P
|
P
S
x
T
T
|
T
N
 
N
P
 
P
T
 
T
S
 
E
T
 
T
V
 
I
I
 
V
Y
 
C
K
 
N
A
 
S
L
 
I
I
 
G
A
 
M
L
 
L
K
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
S
I
 
V
I
 
V
F
 
F
S
 
S
P
 
P
H
|
H
P
 
P
G
 
R
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
C
 
V
S
 
S
W
 
L
K
 
L
A
 
L
I
 
V
E
 
R
I
 
L
V
 
I
K
 
N
R
 
Q
A
 
K
A
 
L
E
 
A
A
 
A
A
 
L
G
 
G
A
 
A
P
 
P
E
 
E
G
 
N
C
 
L
V
 
V
D
 
V
G
 
T
I
 
V
T
 
E
Q
 
K
L
 
P
T
 
S
L
x
I
E
 
E
A
 
N
T
 
T
S
 
N
E
 
A
L
 
M
M
 
M
H
 
A
S
 
H
K
 
P
D
 
K
V
 
V
S
 
R
L
 
M
I
 
L
L
 
V
A
 
A
T
|
T
G
|
G
G
 
G
E
 
P
G
 
A
M
x
I
V
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
V
Y
 
L
A
 
S
S
 
T
G
 
G
T
 
K
P
 
K
T
 
A
I
 
I
S
 
G
G
x
A
G
|
G
P
x
A
G
 
G
N
 
N
G
 
P
P
 
P
A
 
V
F
 
V
I
 
V
E
 
D
R
 
E
S
 
T
A
 
A
D
 
N
I
 
I
H
 
E
H
 
K
A
 
A
V
 
A
K
 
C
D
 
D
I
 
I
I
 
V
T
 
N
S
 
G
K
 
C
T
 
S
F
 
F
D
 
D
N
 
N
G
 
N
V
 
L
I
 
P
C
|
C
A
 
V
S
 
A
E
 
E
Q
 
K
S
 
E
I
 
I
I
 
I
V
 
A
E
 
V
G
 
A
C
 
Q
I
 
I
Y
 
A
D
 
D
E
 
Y
V
 
L
H
 
I
R
 
F
E
 
N
L
 
L
E
 
K
A
 
K
Q
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
F
 
E
M
 
I
N
 
K
E
 
D
D
 
P
E
 
A
A
 
V
-
 
L
A
 
Q
K
 
Q
M
 
L
A
 
Q
A
 
D
L
 
L
L
 
V
L
 
L
R
 
T
P
 
A
N
 
K
G
 
G
T
 
G
I
 
P
N
 
Q
P
 
T
K
 
K
V
 
C
V
 
V
G
 
G
K
 
K
T
 
S
A
 
A
L
 
V
Y
 
W
L
 
L
S
 
L
Q
 
S
M
 
Q
A
 
I
G
 
G
F
 
I
C
 
S
V
 
V
P
 
D
A
 
A
S
 
S
T
 
I
K
 
K
V
 
I
L
 
I
I
 
L
A
 
M
E
 
E
Q
 
-
T
 
-
T
 
-
V
 
V
S
 
P
P
 
R
K
 
E
N
 
H
P
 
P
Y
 
F
S
 
V
R
 
Q
E
 
E
K
x
E
L
 
L
-
 
M
C
 
M
P
 
P
V
 
I
L
 
L
G
 
P
L
 
L
Y
 
V
V
 
R
A
 
V
E
 
E
D
 
T
W
 
V
K
 
D
A
 
D
A
 
A
C
 
I
H
 
D
R
 
L
V
 
A
V
 
I
E
 
E
L
 
V
L
 
E
T
 
H
N
 
D
E
 
N
G
 
-
L
 
-
G
 
R
H
|
H
T
 
T
L
 
A
V
 
I
I
 
M
H
 
H
T
 
S
R
 
-
N
 
-
Q
 
T
D
 
D
V
 
V
I
 
R
R
 
K
Q
 
L
F
 
T
S
 
K
L
 
M
E
 
A
K
 
K
P
 
L
V
 
I
-
 
Q
N
 
T
R
 
T
I
 
I
L
 
F
I
 
V
N
 
K
T
 
N
P
 
G
A
 
P
A
 
S
L
 
Y
G
 
A
G
 
G
I
 
L
G
 
G
A
 
A

Sites not aligning to the query:

6gvsA Engineered glycolyl-coa reductase comprising 8 mutations with bound NADP+ (see paper)
33% identity, 62% coverage: 52:381/533 of query aligns to 51:374/441 of 6gvsA

query
sites
6gvsA
E
 
E
A
 
K
L
 
M
A
 
S
K
 
R
M
 
M
A
 
A
A
 
V
E
 
E
E
 
E
T
 
T
G
 
G
F
 
M
G
 
G
N
 
N
W
 
Y
Q
 
E
D
 
H
K
 
K
V
 
L
L
 
I
K
 
K
N
 
N
R
 
R
F
 
L
A
 
A
S
 
G
L
 
E
R
 
K
V
 
T
Y
 
-
D
 
P
A
 
G
I
 
I
K
 
E
D
 
D
M
 
L
K
 
T
T
 
T
V
 
D
G
 
A
I
 
F
I
 
S
H
 
G
D
 
D
D
 
N
P
 
G
V
 
L
K
 
T
K
 
L
V
 
V
M
 
E
D
 
Y
V
 
S
G
 
-
V
 
-
P
 
P
L
 
F
G
 
G
V
 
V
I
 
I
C
 
G
A
 
A
L
 
I
V
 
T
P
|
P
S
x
T
T
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
T
S
 
E
T
 
T
V
 
I
I
 
V
Y
 
C
K
 
N
A
 
S
L
 
I
I
 
G
A
 
M
L
 
L
K
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
S
I
 
V
I
 
V
F
 
F
S
 
S
P
 
P
H
|
H
P
 
G
G
 
R
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
C
 
V
S
 
S
W
 
L
K
 
L
A
 
L
I
 
V
E
 
R
I
 
L
V
 
I
K
 
N
R
 
Q
A
 
K
A
 
L
E
 
A
A
 
A
A
 
L
G
 
G
A
 
A
P
 
P
E
 
E
G
 
N
C
 
L
V
 
V
D
 
V
G
 
T
I
 
V
T
 
E
Q
 
K
L
 
P
T
 
S
L
x
R
E
 
E
A
 
N
T
 
T
S
 
L
E
 
A
L
 
M
M
 
M
H
 
A
S
 
H
K
 
P
D
 
K
V
 
V
S
 
R
L
 
M
I
 
L
L
 
V
A
 
A
T
|
T
G
|
G
G
|
G
E
 
P
G
 
A
M
x
L
V
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
V
Y
 
L
A
 
S
S
 
T
G
 
G
T
 
K
P
 
K
T
 
A
I
 
I
S
 
G
G
x
A
G
|
G
P
x
A
G
 
G
N
 
N
G
 
P
P
 
P
A
 
V
F
 
V
I
 
V
E
 
D
R
 
E
S
 
T
A
 
A
D
 
N
I
 
I
H
 
E
H
 
K
A
 
A
V
 
A
K
 
C
D
 
D
I
 
I
I
 
V
T
 
N
S
 
G
K
 
C
T
 
S
F
 
F
D
 
D
N
 
N
G
 
N
V
 
I
I
 
T
C
|
C
A
 
T
S
 
A
E
 
E
Q
 
K
S
 
E
I
 
I
I
 
I
V
 
A
E
 
V
G
 
A
C
 
Q
I
 
I
Y
 
A
D
 
D
E
 
Y
V
 
L
H
 
I
R
 
F
E
 
N
L
 
L
E
 
K
A
 
K
Q
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
F
 
E
M
 
I
N
 
K
E
 
D
D
 
P
E
 
A
A
 
V
-
 
L
A
 
Q
K
 
Q
M
 
L
A
 
Q
A
 
D
L
 
L
L
 
V
L
 
L
R
 
T
P
 
A
N
 
K
G
 
G
T
 
G
I
 
P
N
 
Q
P
 
T
K
 
K
V
 
C
V
 
V
G
 
G
K
 
K
T
 
S
A
 
A
L
 
V
Y
 
W
L
 
L
S
 
L
Q
 
S
M
 
Q
A
 
I
G
 
G
F
 
I
C
 
S
V
 
V
P
 
D
A
 
A
S
 
S
T
 
I
K
 
K
V
 
I
L
 
I
I
 
L
A
 
M
E
 
E
Q
 
-
T
 
-
T
 
-
V
 
V
S
 
P
P
 
R
K
 
E
N
 
H
P
 
P
Y
 
F
S
 
V
R
 
Q
E
 
E
K
x
E
L
 
L
-
 
M
C
 
M
P
 
P
V
 
I
L
 
L
G
 
P
L
 
L
Y
 
V
V
 
R
A
 
V
E
 
E
D
 
T
W
 
V
K
 
D
A
 
D
A
 
A
C
 
I
H
 
D
R
 
L
V
 
A
V
 
I
E
 
E
L
 
V
L
 
E
T
 
H
N
 
D
E
 
N
G
 
-
L
 
-
G
 
R
H
|
H
T
 
T
L
 
A
V
 
I
I
 
M
H
 
H
T
 
S
R
 
T
N
 
D

Sites not aligning to the query:

5izdA Wild-type glyceraldehyde dehydrogenase from thermoplasma acidophilum in complex with NADP
29% identity, 31% coverage: 100:265/533 of query aligns to 130:295/494 of 5izdA

query
sites
5izdA
K
 
R
K
 
K
V
 
I
M
 
F
D
 
Q
V
 
Y
G
 
K
V
 
V
P
 
P
L
 
Y
G
 
G
V
 
I
I
 
V
C
 
V
A
 
A
L
|
L
V
x
T
P
 
P
S
x
W
T
x
N
N
 
F
P
 
P
T
 
A
S
 
G
T
 
M
V
 
V
I
 
A
Y
 
R
K
 
K
A
 
L
L
 
A
I
 
P
A
 
A
L
 
L
K
 
L
A
 
T
G
 
G
N
 
N
A
 
T
I
 
V
I
 
V
F
 
L
S
x
K
P
|
P
H
x
S
-
x
S
-
 
D
-
 
T
P
 
P
G
 
G
A
 
S
R
 
-
Q
 
-
C
 
A
S
 
E
W
 
W
K
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
-
I
 
I
V
 
V
K
 
R
R
 
K
A
 
F
A
 
V
E
 
E
A
 
-
A
 
A
G
 
G
A
 
V
P
 
P
E
 
K
G
 
G
C
 
V
V
 
L
D
 
N
G
 
F
I
 
I
T
 
T
Q
 
G
L
x
R
T
x
G
L
 
S
E
 
E
A
 
I
T
x
G
S
x
D
E
 
Y
L
 
I
M
 
V
H
 
E
S
 
H
K
 
K
D
 
K
V
 
V
S
 
N
L
 
L
I
 
I
L
 
T
A
 
M
T
 
T
G
|
G
-
x
S
-
 
T
-
 
A
-
x
T
G
 
G
E
 
Q
G
 
R
M
 
I
V
 
M
R
 
Q
A
 
K
A
 
A
Y
 
S
A
 
A
S
 
N
G
 
M
T
 
A
P
 
K
T
 
L
I
 
I
S
 
L
G
x
E
G
 
L
P
 
G
G
 
G
N
 
K
G
 
A
P
 
P
A
 
F
F
 
M
I
 
V
E
 
W
R
 
K
S
 
D
A
 
A
D
 
D
I
 
M
H
 
D
H
 
N
A
 
A
V
 
L
K
 
K
D
 
T
I
 
L
I
 
L
T
 
W
S
 
A
K
 
K
T
 
Y
F
 
W
D
 
N
N
 
A
G
 
G
V
 
Q
I
 
S
C
|
C
A
 
I
S
 
A
E
 
A
Q
 
E
S
 
R
I
 
L
I
 
Y
V
 
V
E
 
H
G
 
E
C
 
D
I
 
I
Y
 
Y
D
 
D

Sites not aligning to the query:

6j76A Structure of 3,6-anhydro-l-galactose dehydrogenase in complex with nap (see paper)
23% identity, 61% coverage: 13:335/533 of query aligns to 40:356/477 of 6j76A

query
sites
6j76A
N
 
D
A
 
A
R
 
E
E
 
R
L
 
V
V
 
L
R
 
A
N
 
V
A
 
A
K
 
T
K
 
T
A
 
A
Q
 
Q
A
 
K
I
 
E
L
 
W
A
 
A
T
 
K
F
 
Q
S
 
P
Q
 
A
Q
 
R
Q
 
Q
I
 
R
D
 
A
A
 
E
I
 
V
V
 
L
K
 
R
N
 
K
V
 
F
A
 
A
Q
 
Q
E
 
L
A
 
I
A
 
R
H
 
D
H
 
N
A
 
K
E
 
Q
A
 
Y
L
 
L
A
 
A
K
 
E
M
 
L
A
 
L
A
 
V
E
 
K
E
 
E
T
 
Q
G
 
G
F
 
-
G
 
-
N
 
-
W
 
-
Q
 
-
D
 
-
K
 
K
V
 
L
L
 
L
K
 
K
N
 
V
R
 
A
F
 
L
A
 
G
S
 
E
L
 
V
R
 
E
V
 
A
Y
 
T
-
 
S
-
 
T
-
 
F
-
 
I
-
 
E
-
 
Y
-
 
A
-
 
C
D
 
D
A
 
W
I
 
A
K
 
R
D
 
Q
M
 
M
K
 
D
T
 
G
V
 
D
G
 
I
I
 
V
I
 
K
H
 
S
D
 
D
D
 
N
P
 
A
V
 
N
K
 
E
K
 
Q
V
 
I
M
 
M
D
 
I
V
 
H
G
 
K
V
 
I
P
 
P
L
 
R
G
 
G
V
 
V
I
 
V
C
 
V
A
 
A
L
x
I
V
x
T
P
x
A
S
x
W
T
x
N
N
 
F
P
 
P
T
 
L
S
 
A
T
 
L
V
 
A
I
 
G
Y
 
R
K
 
K
A
 
I
L
 
G
I
 
P
A
 
A
L
 
L
K
 
V
A
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
S
I
 
I
I
 
V
F
 
V
S
x
K
P
 
P
H
 
-
P
 
-
G
 
-
A
x
T
R
x
S
Q
 
E
C
 
T
S
 
P
W
 
L
K
 
A
A
 
T
I
 
L
E
 
E
I
 
L
V
 
-
K
 
G
R
 
Y
A
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
A
 
I
P
 
P
E
 
A
G
 
G
C
 
V
V
 
L
D
 
N
G
 
I
I
 
V
T
 
T
Q
 
G
L
 
G
T
x
G
L
 
R
E
 
T
A
 
L
T
x
G
S
 
N
E
 
E
L
 
L
M
 
V
H
 
G
S
 
H
K
 
R
D
 
M
V
 
T
S
 
N
L
 
M
I
 
V
L
 
S
A
 
M
T
|
T
G
|
G
-
x
S
-
 
T
-
 
P
-
x
A
G
 
G
E
 
Q
G
x
S
M
x
I
V
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
S
Y
 
A
A
 
N
S
 
N
G
 
M
T
 
A
P
 
H
T
 
V
I
 
Q
S
 
L
G
x
E
G
x
L
P
 
G
G
 
G
N
 
K
G
 
A
P
 
P
A
 
F
F
 
I
I
 
V
E
 
M
R
 
E
S
 
D
A
 
A
D
 
D
I
 
L
H
 
E
H
 
Q
A
 
A
V
 
A
K
 
A
D
 
A
I
 
A
I
 
L
T
 
H
S
 
S
K
 
R
T
 
-
F
 
F
D
 
D
N
 
N
-
 
C
G
 
G
V
 
Q
I
 
V
C
|
C
A
 
T
S
 
C
E
 
N
Q
 
E
S
 
R
I
 
M
I
 
Y
V
 
V
E
 
H
G
 
G
C
 
A
I
 
V
Y
 
Y
D
 
D
E
 
E
V
 
F
H
 
M
R
 
R
E
 
-
L
 
-
E
 
-
A
 
-
Q
 
-
G
 
-
A
 
-
Y
 
I
F
 
F
M
 
M
N
 
G
E
 
K
D
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
I
K
 
K
M
 
V
A
 
G
A
 
D
L
 
-
L
 
P
L
 
M
R
 
D
P
 
P
N
 
A
G
 
S
T
 
D
I
 
M
N
 
G
P
 
P
K
 
K
V
 
V
V
 
N
G
 
A
K
 
N
T
 
E
A
 
L
L
 
A
Y
 
H
L
 
M
S
 
E
Q
 
E
M
 
L
A
 
V
G
 
A
F
 
E
C
 
A
V
 
V
P
 
D
A
 
E
S
 
G
T
 
A
K
 
T
V
 
V
L
 
L
I
 
F
A
 
G
E
 
G
Q
 
K
T
 
K
T
 
L
V
 
E
S
 
G
P
 
P
K
 
E

Sites not aligning to the query:

3rhdA Crystal structure of glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase gapn from methanocaldococcus jannaschii dsm 2661 complexed with NADP
24% identity, 48% coverage: 10:266/533 of query aligns to 24:282/456 of 3rhdA

query
sites
3rhdA
S
 
S
R
 
R
Q
 
E
N
 
E
A
 
A
R
 
K
E
 
E
L
 
A
V
 
I
R
 
D
N
 
T
A
 
A
K
 
E
K
 
K
A
 
Y
Q
 
K
A
 
E
I
 
V
L
 
M
A
 
K
T
 
N
F
 
L
S
 
P
Q
 
I
Q
 
T
Q
 
K
I
 
R
D
 
Y
A
 
N
I
 
I
V
 
L
K
 
M
N
 
N
V
 
I
A
 
A
Q
 
K
E
 
Q
A
 
I
A
 
K
H
 
E
H
 
K
A
 
K
E
 
E
A
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
K
M
 
I
A
 
L
A
 
A
E
 
I
E
 
D
T
 
A
G
 
G
F
 
K
G
 
P
N
 
I
W
 
K
Q
 
Q
D
 
A
K
 
R
V
 
V
L
 
E
K
 
V
N
 
E
R
 
R
-
 
S
-
 
I
-
 
G
-
 
T
F
 
F
A
 
K
S
 
L
L
 
A
R
 
A
V
 
F
Y
 
Y
D
 
-
A
 
-
I
 
V
K
 
K
D
 
E
M
 
H
K
 
R
T
 
D
V
 
E
G
 
V
I
 
I
I
 
P
H
 
S
D
 
D
D
 
D
P
 
-
V
 
-
K
 
R
K
 
L
V
 
I
M
 
F
D
 
T
V
 
R
G
 
R
V
 
E
P
 
P
L
 
V
G
 
G
V
 
I
I
 
V
C
 
G
A
 
A
L
x
I
V
x
T
P
 
P
S
x
F
T
x
N
N
 
F
P
 
P
T
 
L
S
 
N
T
 
L
V
 
S
I
 
A
Y
 
H
K
 
K
A
 
I
L
 
A
I
 
P
A
 
A
L
 
I
K
 
A
A
 
T
G
 
G
N
 
N
A
 
V
I
 
I
I
 
V
F
 
H
S
x
H
P
 
P
H
x
S
P
x
S
G
x
K
A
 
A
R
 
P
Q
 
L
C
 
V
S
 
C
W
 
I
K
 
E
A
 
L
I
 
A
E
 
K
I
 
I
V
 
I
K
 
E
R
 
N
A
 
A
A
 
L
E
 
K
A
 
K
A
 
Y
G
 
N
A
 
V
P
 
P
E
 
L
G
 
G
C
 
V
V
 
Y
D
 
N
G
 
L
I
 
L
T
 
T
Q
 
G
L
 
A
T
x
G
L
x
E
E
 
V
A
 
V
T
x
G
S
x
D
E
 
E
L
 
I
M
 
V
H
 
V
S
 
N
K
 
E
D
 
K
V
 
V
S
 
N
L
 
M
I
 
I
L
 
S
A
x
F
T
 
T
G
 
G
-
x
S
-
 
S
-
 
K
-
x
V
G
 
G
E
 
E
G
 
L
M
 
I
V
 
T
R
 
K
A
 
K
A
 
A
Y
 
G
A
 
F
S
 
K
G
 
K
T
 
I
P
 
A
T
 
L
I
x
E
S
 
L
G
 
G
G
 
G
P
 
V
G
 
-
N
 
-
G
 
N
P
 
P
A
 
N
F
 
I
I
 
V
E
 
L
R
 
K
S
 
D
A
 
A
D
 
D
I
 
L
H
 
N
H
 
K
A
 
A
V
 
V
K
 
N
D
 
A
I
 
L
I
 
I
T
 
K
S
 
G
K
 
S
T
 
F
F
 
I
D
 
Y
N
 
A
G
 
G
V
 
Q
I
 
V
C
|
C
A
 
I
S
 
S
E
 
V
Q
 
G
S
 
M
I
 
I
I
 
L
V
 
V
E
 
D
G
 
E
C
 
S
I
 
I
Y
 
A
D
 
D
E
 
K

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_012969030.1 NCBI__GCF_000025465.1:WP_012969030.1
MIELDNDLQSRQNARELVRNAKKAQAILATFSQQQIDAIVKNVAQEAAHHAEALAKMAAE
ETGFGNWQDKVLKNRFASLRVYDAIKDMKTVGIIHDDPVKKVMDVGVPLGVICALVPSTN
PTSTVIYKALIALKAGNAIIFSPHPGARQCSWKAIEIVKRAAEAAGAPEGCVDGITQLTL
EATSELMHSKDVSLILATGGEGMVRAAYASGTPTISGGPGNGPAFIERSADIHHAVKDII
TSKTFDNGVICASEQSIIVEGCIYDEVHRELEAQGAYFMNEDEAAKMAALLLRPNGTINP
KVVGKTALYLSQMAGFCVPASTKVLIAEQTTVSPKNPYSREKLCPVLGLYVAEDWKAACH
RVVELLTNEGLGHTLVIHTRNQDVIRQFSLEKPVNRILINTPAALGGIGATTNISPALTL
GCGAVGGGSSSDNVGPMNLLNIRKVGYGVRSIDELRAPGSRPEPQPTIVSPASDPQRSIL
DDLRFNAPANAAPARSAGSDDRFASAGAASMEGEINEQNVERVIRQVLERLAK

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory