SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012971900.1 NCBI__GCF_000025485.1:WP_012971900.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 11 hits to proteins with known functional sites (download)

P22106 Asparagine synthetase B [glutamine-hydrolyzing]; AS-B; EC 6.3.5.4 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
27% identity, 88% coverage: 1:530/605 of query aligns to 1:462/554 of P22106

query
sites
P22106
M
|
M
C
|
C
G
 
S
I
 
I
A
 
F
G
 
G
F
 
V
M
 
F
L
 
D
A
 
I
R
 
K
G
 
T
R
 
D
R
 
A
P
 
V
E
 
E
P
 
-
E
 
-
W
 
-
L
 
L
D
 
R
R
 
K
M
 
K
A
 
A
E
 
L
R
 
E
L
 
L
A
 
S
-
 
R
-
 
L
-
 
M
-
 
R
H
|
H
R
 
R
G
 
G
P
 
P
D
|
D
D
 
W
R
 
S
G
 
G
R
 
I
Y
 
Y
C
 
A
A
 
S
G
 
D
P
 
N
V
 
A
G
 
I
L
 
L
V
 
A
Q
 
H
T
 
E
R
 
R
L
 
L
S
 
S
I
 
I
I
 
V
G
 
D
L
 
V
E
 
N
S
 
A
G
 
G
H
 
A
Q
 
Q
P
 
P
L
 
L
L
 
Y
S
 
N
A
 
Q
D
 
Q
G
 
K
Q
 
T
L
 
H
A
 
V
L
 
L
V
 
A
A
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
I
Y
 
Y
N
 
N
Y
x
H
I
 
Q
E
 
A
L
 
L
N
 
R
A
 
A
E
 
E
L
 
Y
R
 
G
A
 
D
L
 
R
G
 
Y
Q
 
Q
P
 
F
P
 
-
R
 
Q
T
 
T
G
 
G
S
 
S
D
 
D
S
 
C
E
 
E
T
 
V
I
 
I
L
 
L
N
x
A
A
 
L
Y
 
Y
A
 
Q
A
 
E
H
 
K
G
 
G
L
 
P
D
 
E
A
 
F
L
 
L
D
 
D
R
 
D
L
 
L
R
 
Q
G
 
G
M
 
M
Y
 
F
A
 
A
F
 
F
A
 
A
L
 
L
H
 
Y
D
 
D
A
 
S
R
 
E
A
 
K
G
 
D
R
 
A
L
 
Y
I
 
L
L
 
I
G
 
G
R
 
R
D
 
D
R
 
H
L
 
L
G
 
G
I
 
I
K
 
I
P
 
P
L
 
L
F
 
Y
Y
 
M
-
 
G
V
 
Y
R
 
D
L
 
E
P
 
H
D
 
G
R
 
Q
I
 
L
A
 
Y
F
 
V
A
 
A
S
 
S
E
 
E
I
 
M
K
 
K
A
 
A
L
 
L
L
 
V
A
 
P
L
 
V
L
 
C
P
 
R
E
 
-
S
 
-
P
 
-
R
 
-
I
 
-
Q
 
-
P
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
Q
 
-
F
 
-
L
 
-
Q
 
-
N
 
-
Q
 
-
F
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
I
 
-
D
 
-
G
 
T
I
 
I
R
 
K
R
 
E
V
 
F
P
 
P
P
 
A
G
 
G
T
 
S
A
 
Y
L
 
L
L
 
W
I
 
S
-
 
Q
D
 
D
A
 
G
D
 
E
L
 
I
N
 
R
I
 
S
R
 
Y
P
 
Y
H
 
H
R
 
R
Y
 
D
W
 
W
L
 
F
A
 
D
L
 
Y
D
 
D
V
 
A
E
 
V
P
 
K
R
 
D
R
 
N
I
 
V
G
 
T
F
 
-
E
 
-
E
 
-
A
 
D
R
 
K
A
 
N
E
 
E
L
 
L
D
 
R
A
 
Q
L
 
A
M
 
L
D
 
E
D
 
D
A
 
S
M
 
V
R
 
K
E
 
S
H
 
H
Q
 
L
R
 
M
S
 
S
D
 
D
V
 
V
P
 
P
F
 
Y
G
 
G
L
 
V
F
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
S
 
S
A
 
S
V
 
I
L
 
I
A
 
S
A
 
A
K
 
I
L
 
T
A
 
K
E
 
K
Q
 
Y
G
 
A
A
 
A
G
 
R
R
 
R
I
 
V
K
 
E
-
 
D
-
 
Q
-
 
E
-
 
R
-
 
S
-
 
E
-
 
A
-
 
W
-
 
W
-
 
P
-
 
Q
-
 
L
-
 
H
S
 
S
Y
 
F
S
 
A
V
 
V
G
 
G
Y
 
L
R
 
P
G
 
G
T
 
S
A
 
P
M
 
-
A
 
-
H
 
-
E
 
D
L
 
L
D
 
K
E
 
A
A
 
A
A
 
Q
R
 
E
V
 
V
A
 
A
T
 
N
H
 
H
F
 
L
G
 
G
F
 
T
D
 
V
H
 
H
R
 
H
P
 
E
L
 
I
E
 
H
L
 
F
E
 
T
L
 
V
P
 
Q
R
 
E
V
 
G
F
 
L
G
 
D
R
 
A
L
 
I
P
 
R
H
 
D
T
 
V
V
 
I
W
 
Y
C
 
H
A
 
I
D
 
E
-
 
T
-
 
Y
E
 
D
L
 
V
M
 
T
R
 
T
D
 
I
Y
 
R
A
 
A
C
 
S
L
 
T
P
 
P
T
 
M
S
 
Y
I
 
L
L
 
M
A
 
S
E
 
R
T
 
K
A
 
I
G
 
K
A
 
A
E
 
M
-
 
G
L
 
I
K
 
K
V
 
M
V
 
V
F
 
L
S
 
S
G
 
G
E
|
E
G
 
G
G
 
S
D
 
D
E
 
E
A
 
V
F
 
F
A
 
G
G
 
G
Y
 
Y
G
 
L
R
 
Y
Y
 
F
-
 
H
R
 
K
P
 
A
P
 
P
L
 
N
A
 
A
E
 
K
R
 
E
L
 
L
L
 
H
K
 
E
S
 
E
L
 
T
L
 
V
H
 
-
P
 
-
G
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
F
 
-
R
 
-
T
 
-
R
 
-
G
 
-
Q
 
-
W
 
-
A
 
-
G
 
-
R
 
-
W
 
-
T
 
-
R
 
R
R
 
K
L
 
L
M
 
L
G
 
A
P
 
L
A
 
H
L
 
M
R
 
Y
A
 
D
V
 
C
A
 
A
D
 
R
A
 
A
D
 
N
R
 
K
A
 
A
P
 
-
V
 
-
R
 
-
R
 
-
A
 
-
W
 
-
S
 
-
E
 
-
T
 
-
P
 
-
R
 
-
H
 
-
W
 
-
S
 
-
D
 
-
M
 
-
Q
 
-
R
 
-
R
 
-
Q
 
-
Y
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
-
V
 
-
T
 
-
A
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
-
N
 
-
L
 
-
L
 
-
V
 
-
K
 
-
T
 
-
D
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
M
M
 
S
G
 
A
F
 
W
G
 
G
L
 
V
E
 
E
G
 
A
R
 
R
V
 
V
P
 
P
F
 
F
L
 
L
D
 
D
H
 
K
R
 
K
I
 
F
V
 
L
E
 
D
F
 
V
G
 
A
L
 
M
S
 
R
L
 
I
-
 
N
-
 
P
P
 
Q
D
 
D
A
 
K
L
 
M
K
 
C
V
 
G
Q
 
N
G
 
G
H
 
K
Q
 
M
G
 
E
K
 
K
W
 
H
L
 
I
V
 
L
R
 
R
R
 
E
W
 
C
A
 
F
E
 
E
P
 
A
K
 
Y
L
 
L
P
 
P
P
 
A
G
 
S
H
 
V
L
 
A
E
 
W
R
 
R
P
 
Q
K
 
K
R
 
E
G
 
Q
F
 
F
H
 
S
V
 
D
P
 
G
V
 
V
G
 
G
-
 
Y
D
 
S
W
 
W
L
 
I

1ct9A Crystal structure of asparagine synthetase b from escherichia coli (see paper)
27% identity, 84% coverage: 29:539/605 of query aligns to 29:454/497 of 1ct9A

query
sites
1ct9A
H
 
H
R
 
R
G
 
G
P
 
P
D
 
D
D
 
W
R
 
S
G
 
G
R
 
I
Y
 
Y
C
 
A
A
 
S
G
 
D
P
 
N
V
 
A
G
 
I
L
 
L
V
 
A
Q
 
H
T
 
E
R
|
R
L
|
L
S
 
S
I
|
I
I
x
V
G
 
D
L
 
V
E
 
N
S
 
A
G
 
G
H
 
A
Q
 
Q
P
 
P
L
 
L
L
 
Y
S
 
N
A
 
Q
D
 
Q
G
 
K
Q
 
T
L
 
H
A
 
V
L
 
L
V
 
A
A
 
V
N
|
N
G
|
G
E
|
E
V
 
I
Y
 
Y
N
 
N
Y
 
H
I
 
Q
E
 
A
L
 
L
N
 
R
A
 
A
E
 
E
L
 
Y
R
 
G
A
 
D
L
 
R
G
 
Y
Q
 
Q
P
 
F
P
 
-
R
 
Q
T
 
T
G
 
G
S
 
S
D
|
D
S
 
C
E
 
E
T
 
V
I
 
I
L
 
L
N
 
A
A
 
L
Y
 
Y
A
 
Q
A
 
E
H
 
K
G
 
G
L
 
P
D
 
E
A
 
F
L
 
L
D
 
D
R
 
D
L
 
L
R
 
Q
G
 
G
M
 
M
Y
 
F
A
 
A
F
 
F
A
 
A
L
 
L
H
 
Y
D
 
D
A
 
S
R
 
E
A
 
K
G
 
D
R
 
A
L
 
Y
I
 
L
L
 
I
G
 
G
R
 
R
D
 
D
R
 
H
L
 
L
G
 
G
I
 
I
K
 
I
P
 
P
L
 
L
F
 
Y
Y
 
M
-
 
G
V
 
Y
R
 
D
L
 
E
P
 
H
D
 
G
R
 
Q
I
 
L
A
 
Y
F
 
V
A
 
A
S
 
S
E
 
E
I
 
M
K
 
K
A
 
A
L
 
L
L
 
V
A
 
P
L
 
V
L
 
C
P
 
R
E
 
-
S
 
-
P
 
-
R
 
-
I
 
-
Q
 
-
P
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
Q
 
-
F
 
-
L
 
-
Q
 
-
N
 
-
Q
 
-
F
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
I
 
-
D
 
-
G
 
T
I
 
I
R
 
K
R
 
E
V
 
F
P
 
P
P
 
A
G
 
G
T
 
S
A
 
Y
L
 
L
L
 
W
I
 
S
-
 
Q
D
 
D
A
 
G
D
 
E
L
 
I
N
 
R
I
 
S
R
 
Y
P
 
Y
H
 
H
R
 
R
Y
 
D
W
 
W
L
 
F
A
 
D
L
 
Y
D
 
D
V
 
A
E
 
V
P
 
K
R
 
D
R
 
N
I
 
V
G
 
T
F
 
-
E
 
-
E
 
-
A
 
D
R
 
K
A
 
N
E
 
E
L
 
L
D
 
R
A
 
Q
L
 
A
M
 
L
D
 
E
D
 
D
A
 
S
M
 
V
R
 
K
E
 
S
H
 
H
Q
 
L
R
 
M
S
 
S
D
 
D
V
 
V
P
 
P
F
 
Y
G
 
G
L
 
V
F
x
L
L
|
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
S
|
S
A
 
S
V
 
I
L
 
I
A
 
S
A
 
A
K
 
I
L
 
T
A
 
K
E
 
K
Q
 
Y
G
 
A
A
 
-
G
 
-
R
 
-
I
 
L
K
 
H
S
 
S
Y
 
F
S
x
A
V
|
V
G
 
G
Y
 
L
R
 
P
G
 
G
T
 
S
A
 
P
M
 
-
A
 
-
H
 
-
E
x
D
L
 
L
D
 
K
E
 
A
A
 
A
A
 
Q
R
 
E
V
 
V
A
 
A
T
 
N
H
 
H
F
 
L
G
 
G
F
 
T
D
 
V
H
 
H
R
 
H
P
 
E
L
 
I
E
 
H
L
 
F
E
 
T
L
 
V
P
 
Q
R
 
E
V
 
G
F
 
L
G
 
D
R
 
A
L
 
I
P
 
R
H
 
D
T
 
V
V
 
I
W
 
Y
C
 
H
A
 
I
D
 
E
-
 
T
-
 
Y
E
 
D
L
 
V
M
x
T
R
 
T
D
 
I
Y
x
R
A
 
A
C
 
S
L
 
T
P
 
P
T
 
M
S
 
Y
I
 
L
L
x
M
A
 
S
E
 
R
T
 
K
A
 
I
G
 
K
A
 
A
E
 
M
-
 
G
L
 
I
K
 
K
V
 
M
V
 
V
F
 
L
S
|
S
G
|
G
E
|
E
G
 
G
G
 
S
D
 
D
E
 
E
A
 
V
F
 
F
A
 
G
G
 
G
Y
 
Y
G
 
L
R
 
Y
Y
 
F
-
 
H
R
 
K
P
 
A
P
 
P
L
 
N
A
 
A
E
 
K
R
 
E
L
 
L
L
 
H
K
 
E
S
 
E
L
 
T
L
 
V
H
 
-
P
 
-
G
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
F
 
-
R
 
-
T
 
-
R
 
-
G
 
-
Q
 
-
W
 
-
A
 
-
G
 
-
R
 
-
W
 
-
T
 
-
R
 
R
R
 
K
L
 
L
M
 
L
G
 
A
P
 
L
A
 
H
L
x
M
R
 
Y
A
 
D
V
 
C
A
 
A
D
 
R
A
 
A
D
 
N
R
 
K
A
 
A
P
 
-
V
 
-
R
 
M
R
 
S
A
 
A
W
 
W
S
 
-
E
 
-
T
 
-
P
 
-
R
 
-
H
 
-
W
 
-
S
 
-
D
 
-
M
 
-
Q
 
-
R
 
-
R
 
-
Q
 
-
Y
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
-
V
 
-
T
 
-
A
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
-
N
 
-
L
 
-
L
 
-
V
 
-
K
 
-
T
 
-
D
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
M
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
G
L
 
V
E
 
E
G
 
A
R
 
R
V
 
V
P
 
P
F
 
F
L
 
L
D
 
D
H
 
K
R
 
K
I
 
F
V
 
L
E
 
D
F
 
V
G
 
A
L
 
M
S
 
R
L
 
I
P
 
N
D
 
P
A
 
Q
L
 
D
K
 
K
V
 
M
Q
 
C
G
 
K
H
 
M
Q
 
E
G
 
-
K
 
K
W
 
H
L
 
I
V
 
L
R
 
R
R
 
E
W
 
C
A
 
F
E
 
E
P
 
A
K
 
Y
L
 
L
P
 
P
P
 
A
G
 
S
H
 
V
L
 
A
E
 
W
R
 
R
P
 
Q
K
 
K
R
 
E
G
 
Q
F
 
F
H
 
S
V
 
D
P
 
G
V
 
V
G
 
G
-
 
Y
-
 
S
-
 
W
-
 
I
D
 
D
W
 
T
L
 
L
R
 
K
G
 
E
S
 
V
L
 
A
A
 
A
T
 
Q
E
 
Q
V
 
V
G
 
S

Sites not aligning to the query:

P78753 Probable asparagine synthetase [glutamine-hydrolyzing]; Glutamine-dependent asparagine synthetase; EC 6.3.5.4 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
26% identity, 84% coverage: 22:527/605 of query aligns to 23:473/557 of P78753

query
sites
P78753
R
 
H
M
 
L
A
 
S
E
 
K
R
 
Q
L
 
L
A
 
R
H
 
H
R
 
R
G
 
G
P
 
P
D
 
D
D
 
W
R
 
S
G
 
G
R
 
K
Y
 
A
C
 
I
A
 
R
G
 
N
P
 
Q
V
 
T
G
 
I
L
 
L
V
 
C
Q
 
H
T
 
E
R
 
R
L
 
L
S
 
A
I
 
I
I
 
V
G
 
G
L
 
V
E
 
E
S
 
S
G
 
G
H
 
A
Q
 
Q
P
 
P
L
 
L
L
 
V
S
 
S
A
 
D
D
 
D
G
 
G
Q
 
K
L
 
L
A
 
V
L
 
L
V
 
T
A
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
I
Y
 
Y
N
 
N
Y
 
H
I
 
L
E
 
K
L
 
L
N
 
R
A
 
E
E
 
N
L
 
L
R
 
K
A
 
G
L
 
-
G
 
N
Q
 
Y
P
 
K
P
 
F
R
 
K
T
 
T
G
 
Y
S
 
S
D
 
D
S
 
C
E
 
E
T
 
V
I
 
I
L
 
L
N
 
Y
A
 
L
Y
 
Y
A
 
R
A
 
E
H
 
H
G
 
G
L
 
P
D
 
A
A
 
C
L
 
A
D
 
N
R
 
M
L
 
L
R
 
D
G
 
G
M
 
M
Y
 
F
A
 
S
F
 
W
A
 
V
L
 
L
H
 
Y
D
 
D
A
 
Q
R
 
D
A
 
K
G
 
D
R
 
K
L
 
V
I
 
V
L
 
A
G
 
A
R
 
R
D
 
D
R
 
P
L
 
I
G
 
G
I
 
I
K
 
T
P
 
T
L
 
L
-
 
Y
-
 
Q
-
 
G
F
 
F
Y
 
S
V
 
S
R
 
D
L
 
S
P
 
P
D
 
D
R
 
T
I
 
A
A
 
Y
F
 
F
A
 
A
S
 
S
E
 
E
I
 
L
K
 
K
A
 
A
L
 
L
L
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
P
 
-
E
 
-
S
 
-
P
 
-
R
 
-
I
 
-
Q
 
-
P
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
Q
 
-
F
 
-
L
 
-
Q
 
-
N
 
-
Q
 
-
F
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
-
E
 
H
T
 
P
L
 
V
I
 
C
D
 
D
G
 
K
I
 
I
R
 
I
R
 
A
V
 
F
P
 
P
P
 
P
G
 
G
T
 
H
A
 
Y
L
 
Y
L
 
D
I
 
S
D
 
E
A
 
T
D
 
K
L
 
Q
N
 
T
I
 
V
R
 
R
P
 
Y
H
 
F
R
 
K
-
 
P
-
 
S
Y
 
W
W
 
W
L
 
D
A
 
E
L
 
N
D
 
K
V
 
I
E
 
P
P
 
S
R
 
N
R
 
P
I
 
V
G
 
D
F
 
Y
E
 
K
E
 
L
A
 
L
R
 
R
A
 
E
E
 
T
L
 
L
D
 
E
A
 
A
L
 
-
M
 
-
D
 
-
D
 
-
A
 
S
M
 
V
R
 
R
E
 
K
H
 
R
Q
 
L
R
 
M
S
 
A
D
 
E
V
 
V
P
 
P
F
 
Y
G
 
G
L
 
V
F
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
S
 
S
A
 
S
V
 
L
L
 
I
A
 
A
A
 
S
-
 
I
-
 
A
-
 
A
-
 
R
-
 
E
-
 
T
-
 
E
K
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
N
Q
 
S
G
 
T
A
 
S
G
 
Q
-
 
S
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
R
-
 
T
-
 
I
-
 
T
-
 
A
-
 
W
-
 
P
R
 
K
I
 
L
K
 
H
S
 
S
Y
 
F
S
 
A
V
 
I
G
 
G
Y
 
L
R
 
P
G
 
G
T
 
S
A
 
P
M
 
-
A
 
-
H
 
-
E
 
D
L
 
L
D
 
L
E
 
A
A
 
A
A
 
R
R
 
K
V
 
V
A
 
A
T
 
D
H
 
F
F
 
L
G
 
H
F
 
T
D
 
F
H
 
H
R
 
H
P
 
E
L
 
H
E
 
T
L
 
F
E
 
T
L
 
I
P
 
D
R
 
E
V
 
G
F
 
L
G
 
D
R
 
A
L
 
L
P
 
R
H
 
D
T
 
V
V
 
I
W
 
Y
C
 
H
A
 
L
D
 
E
-
 
T
-
 
Y
E
 
D
L
 
V
M
 
T
R
 
T
D
 
I
Y
 
R
A
 
A
C
 
S
L
 
T
P
 
P
T
 
M
S
 
Y
I
 
L
L
 
L
A
 
S
E
 
R
T
 
K
A
 
I
G
 
K
A
 
A
E
 
Q
-
 
G
L
 
V
K
 
K
V
 
M
V
 
V
F
 
L
S
 
S
G
 
G
E
 
E
G
 
G
G
 
S
D
 
D
E
 
E
A
 
I
F
 
F
A
 
G
G
 
G
Y
 
Y
G
 
-
R
 
-
Y
 
-
R
 
-
P
 
-
P
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
K
 
-
S
 
-
L
 
-
L
 
L
H
 
Y
P
 
F
G
 
G
S
 
N
G
 
-
G
 
-
F
 
-
R
 
-
T
 
-
R
 
-
G
 
-
Q
 
-
W
 
-
A
 
-
G
 
-
R
 
-
W
 
-
T
 
-
R
 
-
R
 
-
L
 
-
M
 
-
G
 
-
P
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
D
 
-
R
 
-
A
 
A
P
 
P
V
 
S
R
 
R
R
 
E
A
 
A
W
 
F
S
 
H
E
 
-
T
 
-
P
 
-
R
 
-
H
 
-
W
 
-
S
 
S
D
 
E
M
 
C
Q
 
V
R
 
R
R
 
R
Q
 
-
Y
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
-
V
 
V
T
 
K
A
 
N
L
 
L
P
 
H
D
 
L
N
x
S
L
 
D
L
 
C
V
 
L
K
 
R
T
 
A
D
 
N
R
 
K
L
 
S
L
 
T
M
 
M
G
 
A
F
 
W
G
 
G
L
 
L
E
 
E
G
 
A
R
 
R
V
 
V
P
 
P
F
 
F
L
 
L
D
 
D
H
 
K
R
 
D
I
 
F
V
 
L
E
 
E
F
 
V
G
 
A
L
 
L
S
 
N
L
 
I
-
 
D
-
 
P
P
 
E
D
 
E
A
 
K
L
 
M
K
 
Y
V
 
I
Q
 
N
G
 
G
H
 
R
Q
 
K
G
 
E
K
 
K
W
 
Y
L
 
I
V
 
L
R
 
R
R
 
K
-
 
A
-
 
F
-
 
D
-
 
T
-
 
T
-
 
H
-
 
D
-
 
S
W
 
S
A
 
L
E
 
Q
P
 
P
K
 
Y
L
 
L
P
 
P
P
 
Q
G
 
D
H
 
I
L
 
L
E
 
W
R
 
R
P
 
Q
K
 
K
R
 
E
G
 
Q
F
 
F
H
 
S
V
 
D
P
 
G
V
 
V
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6gq3A Human asparagine synthetase (asns) in complex with 6-diazo-5-oxo-l- norleucine (don) at 1.85 a resolution (see paper)
28% identity, 58% coverage: 24:373/605 of query aligns to 20:361/509 of 6gq3A

query
sites
6gq3A
A
 
A
E
 
M
R
 
K
L
 
I
A
 
A
H
 
H
R
 
R
G
 
G
P
 
P
D
 
D
-
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
F
-
 
E
D
 
N
R
 
V
G
 
N
R
 
G
Y
 
Y
C
 
T
A
 
N
G
 
C
P
 
C
V
 
F
G
 
G
L
 
F
V
 
-
Q
 
-
T
 
H
R
|
R
L
|
L
S
 
A
I
x
V
I
x
V
G
 
D
L
 
P
E
 
L
S
 
F
G
 
G
H
 
M
Q
 
Q
P
 
P
L
 
I
-
 
R
L
 
V
S
 
K
A
 
K
D
 
Y
G
 
P
Q
 
Y
L
 
L
A
 
W
L
 
L
V
 
C
A
x
Y
N
|
N
G
|
G
E
|
E
V
 
I
Y
 
Y
N
 
N
Y
 
H
I
 
K
E
 
K
L
 
M
N
 
Q
A
 
Q
E
 
H
L
 
F
R
 
E
A
 
F
L
 
E
G
 
Y
Q
 
Q
P
 
-
P
 
-
R
 
-
T
 
T
G
 
K
S
x
V
D
|
D
S
 
G
E
 
E
T
 
I
I
 
I
L
 
L
N
 
H
A
 
L
Y
 
Y
A
 
D
A
 
K
H
 
G
G
 
G
L
 
I
D
 
E
-
 
Q
A
 
T
L
 
I
D
 
C
R
 
M
L
 
L
R
 
D
G
 
G
M
 
V
Y
 
F
A
 
A
F
 
F
A
 
V
L
 
L
H
 
L
D
 
D
A
 
T
R
 
A
A
 
N
G
 
K
R
 
K
L
 
V
I
 
F
L
 
L
G
 
G
R
 
R
D
 
D
R
 
T
L
 
Y
G
 
G
I
 
V
K
 
R
P
 
P
L
 
L
F
 
F
Y
 
K
V
 
A
R
 
M
L
 
T
P
 
E
D
 
D
-
 
G
R
 
F
I
 
L
A
 
A
F
 
V
A
 
C
S
 
S
E
 
E
I
 
A
K
 
K
A
 
G
L
 
L
L
 
V
A
 
T
L
 
L
L
 
-
P
 
-
E
 
-
S
 
-
P
 
-
R
 
-
I
 
-
Q
 
K
P
 
H
S
 
S
A
 
A
L
 
T
R
 
P
Q
 
F
F
 
L
L
 
K
Q
 
V
N
 
E
Q
 
P
F
 
F
A
 
L
G
 
P
G
 
G
E
 
H
E
 
Y
T
 
E
L
 
V
I
 
L
D
 
D
G
 
-
I
 
-
R
 
-
R
 
L
V
 
K
P
 
P
P
 
N
G
 
G
T
 
K
A
 
V
L
 
A
L
 
S
I
 
V
D
 
E
A
 
M
D
 
V
L
 
-
N
 
-
I
 
-
R
 
-
P
 
-
H
 
-
R
 
K
Y
 
Y
W
 
H
L
 
H
A
 
C
L
 
R
D
 
D
V
 
V
E
 
F
P
 
P
R
 
-
R
 
-
I
 
-
G
 
G
F
 
F
E
 
E
-
 
I
-
 
E
E
 
T
A
 
V
R
 
K
A
 
N
E
 
N
L
 
L
D
 
R
A
 
I
L
 
L
M
 
F
D
 
N
D
 
N
A
 
A
M
 
V
R
 
K
E
 
K
H
 
R
Q
 
L
R
 
M
S
 
T
D
 
D
V
 
R
P
 
R
F
 
I
G
 
G
L
 
C
F
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
S
 
S
A
 
S
V
 
L
L
 
V
A
 
A
A
 
A
K
 
T
L
 
L
A
 
L
E
 
K
Q
 
Q
G
 
L
A
 
K
G
 
E
R
 
A
I
 
Q
K
 
V
S
 
Q
Y
 
Y
S
 
P
V
 
L
G
 
Q
Y
 
T
R
 
F
G
 
A
T
 
I
A
 
G
M
 
M
-
 
E
-
 
D
A
 
S
H
 
P
E
 
D
L
 
L
D
 
L
E
 
A
A
 
A
A
 
R
R
 
K
V
 
V
A
 
A
T
 
D
H
 
H
F
 
I
G
 
G
F
 
S
D
 
E
H
 
H
R
 
Y
P
 
-
L
 
-
E
 
-
L
 
-
E
 
-
L
 
-
P
 
-
R
 
E
V
 
V
F
 
L
G
 
F
R
 
N
L
 
S
P
 
E
H
 
E
T
 
G
V
 
I
W
 
Q
C
 
A
A
 
L
D
 
D
E
 
E
L
 
V
M
 
I
R
 
F
D
 
S
Y
 
L
A
 
E
C
 
T
L
 
Y
P
 
D
T
 
I
S
x
T
I
 
T
L
 
V
A
x
R
E
 
A
T
 
S
A
 
V
G
 
G
A
 
M
E
 
Y
L
 
L
-
 
I
-
 
S
-
 
K
-
 
Y
-
 
I
-
 
R
-
 
K
-
 
N
-
 
T
-
 
D
-
 
S
K
 
V
V
 
V
V
 
I
F
 
F
S
 
S
G
 
G
E
 
E
G
 
G
G
 
S
D
 
D
E
 
E
A
 
L
F
 
T
A
 
Q
G
 
G
Y
 
Y

Sites not aligning to the query:

P08243 Asparagine synthetase [glutamine-hydrolyzing]; Cell cycle control protein TS11; Glutamine-dependent asparagine synthetase; EC 6.3.5.4 from Homo sapiens (Human) (see 7 papers)
27% identity, 58% coverage: 24:373/605 of query aligns to 21:374/561 of P08243

query
sites
P08243
A
 
A
E
 
M
R
 
K
L
 
I
A
 
A
H
 
H
R
 
R
G
 
G
P
 
P
D
 
D
-
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
F
-
 
E
D
 
N
R
 
V
G
 
N
R
 
G
Y
 
Y
C
 
T
A
 
N
G
 
C
P
 
C
V
 
F
G
 
G
L
 
F
V
 
-
Q
 
-
T
 
H
R
 
R
L
 
L
S
 
A
I
 
V
I
 
V
G
 
D
L
 
P
E
 
L
S
 
F
G
 
G
H
 
M
Q
 
Q
P
 
P
L
 
I
-
 
R
L
 
V
S
 
K
A
 
K
D
 
Y
G
 
P
Q
 
Y
L
 
L
A
 
W
L
 
L
V
 
C
A
 
Y
N
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
I
Y
 
Y
N
 
N
Y
 
H
I
 
K
E
 
K
L
 
M
N
 
Q
A
 
Q
E
 
H
L
 
F
R
 
E
A
 
F
L
 
E
G
 
Y
Q
 
Q
P
 
-
P
 
-
R
 
-
T
 
T
G
 
K
S
 
V
D
 
D
S
 
G
E
 
E
T
 
I
I
 
I
L
 
L
N
 
H
A
 
L
Y
 
Y
A
 
D
A
 
K
H
 
G
G
 
G
L
 
I
D
 
E
-
 
Q
A
 
T
L
 
I
D
 
C
R
 
M
L
 
L
R
 
D
G
 
G
M
 
V
Y
 
F
A
 
A
F
 
F
A
 
V
L
 
L
H
 
L
D
 
D
A
 
T
R
 
A
A
 
N
G
 
K
R
 
K
L
 
V
I
 
F
L
 
L
G
 
G
R
 
R
D
 
D
R
 
T
L
 
Y
G
 
G
I
 
V
K
 
R
P
 
P
L
 
L
F
 
F
Y
 
K
V
 
A
R
 
M
L
 
T
P
 
E
D
 
D
-
 
G
R
 
F
I
 
L
A
 
A
F
 
V
A
 
C
S
 
S
E
 
E
I
 
A
K
 
K
A
 
G
L
 
L
L
 
V
A
 
T
L
 
L
L
 
-
P
 
-
E
 
-
S
 
-
P
 
-
R
 
-
I
 
-
Q
 
K
P
 
H
S
 
S
A
 
A
L
 
T
R
 
P
Q
 
F
F
 
L
L
 
K
Q
 
V
N
 
E
Q
 
P
F
 
F
A
 
L
G
 
P
G
 
G
E
 
H
E
 
Y
T
 
E
L
 
V
I
 
L
D
 
D
G
 
-
I
 
-
R
 
-
R
 
L
V
 
K
P
 
P
P
 
N
G
 
G
T
 
K
A
 
V
L
 
A
L
 
S
I
 
V
D
 
E
A
 
M
D
 
-
L
 
-
N
 
-
I
 
V
R
 
K
P
 
Y
H
 
H
R
 
H
-
 
C
-
 
R
-
 
D
-
x
V
-
 
P
-
 
L
Y
 
H
W
 
A
L
 
L
A
 
Y
L
 
D
D
 
N
V
 
V
E
 
E
P
 
K
R
 
L
R
 
F
I
 
P
G
 
G
F
 
F
E
 
E
-
 
I
-
 
E
E
 
T
A
 
V
R
 
K
A
 
N
E
 
N
L
 
L
D
 
R
A
 
I
L
 
L
M
 
F
D
 
N
D
 
N
A
 
A
M
 
V
R
 
K
E
 
K
H
 
R
Q
 
L
R
 
M
S
 
T
D
 
D
V
 
R
P
 
R
F
 
I
G
 
G
L
 
C
F
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
S
 
S
A
 
S
V
 
L
L
 
V
A
 
A
A
 
A
K
 
T
L
 
L
A
 
L
E
 
K
Q
 
Q
G
 
L
A
 
K
G
 
E
R
 
A
I
 
Q
K
 
V
S
 
Q
Y
 
Y
S
 
P
V
 
L
G
 
Q
Y
 
T
R
 
F
G
 
A
T
 
I
A
 
G
M
 
M
A
 
E
H
 
D
E
 
S
L
 
P
D
 
D
-
 
L
-
 
L
E
 
A
A
 
A
A
 
R
R
 
K
V
 
V
A
 
A
T
 
D
H
 
H
F
 
I
G
 
G
F
 
S
D
 
E
H
 
H
R
 
Y
P
 
-
L
 
-
E
 
-
L
 
-
E
 
-
L
 
-
P
 
-
R
 
E
V
 
V
F
 
L
G
 
F
R
 
N
L
 
S
P
 
E
H
 
E
T
 
G
V
 
I
W
 
Q
C
 
A
A
 
L
D
 
D
E
 
E
L
 
V
M
 
I
R
 
F
D
 
S
Y
 
L
A
 
E
C
 
T
L
 
Y
P
 
D
T
 
I
S
 
T
I
 
T
L
 
V
A
 
R
E
 
A
T
 
S
A
 
V
G
 
G
A
 
M
E
 
Y
L
 
L
-
 
I
-
 
S
-
 
K
-
 
Y
-
 
I
-
 
R
-
 
K
-
 
N
-
 
T
-
 
D
-
 
S
K
 
V
V
 
V
V
 
I
F
|
F
S
 
S
G
 
G
E
 
E
G
 
G
G
 
S
D
 
D
E
 
E
A
 
L
F
 
T
A
 
Q
G
 
G
Y
 
Y

Sites not aligning to the query:

1jgtB Crystal structure of beta-lactam synthetase (see paper)
28% identity, 50% coverage: 72:375/605 of query aligns to 71:356/500 of 1jgtB

query
sites
1jgtB
V
 
V
A
 
L
N
x
A
G
|
G
E
 
E
V
 
I
Y
 
Y
N
 
N
Y
 
R
I
 
D
E
 
E
L
 
L
N
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
L
R
 
S
A
 
V
L
 
L
G
 
P
Q
 
A
P
 
G
P
 
P
R
 
A
T
 
P
G
 
E
S
 
G
D
 
D
S
 
A
E
 
E
T
 
L
I
 
V
L
 
L
N
 
R
A
 
L
Y
 
L
A
 
E
A
 
R
H
 
Y
G
 
D
L
 
L
D
 
H
A
 
A
L
 
F
D
 
R
R
 
L
L
 
V
R
 
N
G
 
G
M
 
R
Y
 
F
A
 
A
F
 
T
A
 
V
L
 
V
H
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
R
A
 
T
G
 
G
-
 
D
R
 
R
L
 
V
I
 
L
L
 
L
G
 
A
R
 
T
D
 
D
R
 
H
L
 
A
G
 
G
I
 
S
K
 
V
P
 
P
L
 
L
F
 
Y
Y
 
T
V
 
C
R
 
V
L
 
A
P
 
P
D
 
G
R
 
E
I
 
V
A
 
R
F
 
A
A
 
S
S
 
T
E
 
E
I
 
A
K
 
K
A
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
A
L
 
-
L
 
-
P
 
-
E
 
-
S
 
-
P
 
-
R
 
H
I
 
R
Q
 
D
P
 
P
S
 
K
A
 
G
L
 
F
R
 
P
Q
 
L
F
 
A
L
 
D
Q
 
A
N
 
R
Q
 
R
F
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
-
E
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
I
 
L
D
 
T
G
 
G
I
 
V
R
 
Y
R
 
Q
V
 
V
P
 
P
P
 
A
G
 
G
T
 
A
A
 
V
L
 
M
L
 
D
I
 
I
D
 
D
-
 
L
A
 
G
D
 
S
L
 
G
N
 
T
I
 
A
R
 
V
P
 
T
H
 
H
R
 
R
Y
 
T
W
 
W
L
 
T
A
 
P
L
 
-
D
 
G
V
 
L
E
 
S
P
 
R
R
 
R
R
 
I
I
 
L
G
 
P
F
 
E
E
 
G
E
 
E
A
 
A
R
 
V
A
 
A
E
 
A
L
 
V
D
 
R
A
 
A
L
 
A
M
 
L
D
 
E
D
 
K
A
 
A
M
 
V
R
 
A
E
 
Q
H
 
R
Q
 
V
R
 
T
-
 
P
S
 
G
D
 
D
V
 
T
P
 
P
F
 
L
G
 
-
L
 
V
F
x
V
L
|
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
L
x
I
D
|
D
S
|
S
A
 
S
V
 
G
L
 
V
A
 
A
A
 
A
K
 
-
L
 
C
A
 
A
E
 
H
Q
 
R
G
 
A
A
 
A
G
 
G
R
 
E
I
 
L
K
 
D
S
 
T
Y
 
V
S
|
S
V
x
M
G
 
G
Y
 
-
R
 
-
G
 
-
T
 
T
A
 
D
M
 
T
A
 
S
H
 
N
E
 
E
L
 
F
D
 
R
E
 
E
A
 
A
A
 
R
R
 
A
V
 
V
A
 
V
T
 
D
H
 
H
F
 
L
G
 
R
F
 
T
D
 
R
H
 
H
R
 
R
P
 
E
L
 
I
E
 
T
L
 
I
E
 
P
L
 
T
P
 
T
R
 
E
V
 
L
F
 
L
G
 
A
R
 
Q
L
 
L
P
 
P
H
 
Y
T
 
A
V
 
V
W
 
W
C
 
A
A
 
S
D
 
E
E
 
S
L
 
V
M
 
D
R
 
P
D
|
D
Y
 
I
A
 
I
-
 
E
-
x
Y
C
 
L
L
 
L
P
 
P
T
x
L
S
 
T
I
 
A
L
 
L
A
 
Y
E
 
R
T
 
A
A
 
L
G
 
D
A
 
G
E
 
P
L
 
E
K
 
R
V
 
R
V
 
I
F
 
L
S
 
T
G
|
G
E
x
Y
G
|
G
G
 
A
D
|
D
E
x
I
A
 
P
F
 
L
A
 
G
G
 
G
Y
x
M
G
 
H
R
 
R

Sites not aligning to the query:

1mc1A Beta-lactam synthetase with product (dgpc), amp and ppi (see paper)
28% identity, 50% coverage: 72:375/605 of query aligns to 63:343/491 of 1mc1A

query
sites
1mc1A
V
 
V
A
 
L
N
x
A
G
|
G
E
 
E
V
 
I
Y
 
Y
N
 
N
Y
 
R
I
 
D
E
 
E
L
 
L
N
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
L
R
 
S
A
 
V
L
 
L
G
 
P
Q
 
A
P
 
G
P
 
P
R
 
A
T
 
P
G
 
E
S
 
G
D
 
D
S
 
A
E
 
E
T
 
L
I
 
V
L
 
L
N
 
R
A
 
L
Y
 
L
A
 
E
A
 
R
H
 
Y
G
 
D
L
 
L
D
 
H
A
 
A
L
 
F
D
 
R
R
 
L
L
 
V
R
 
N
G
 
G
M
 
R
Y
 
F
A
 
A
F
 
T
A
 
V
L
 
V
H
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
R
A
 
T
G
 
G
-
 
D
R
 
R
L
 
V
I
 
L
L
 
L
G
 
A
R
 
T
D
 
D
R
 
H
L
 
A
G
 
G
I
 
S
K
 
V
P
 
P
L
 
L
F
 
Y
Y
 
T
V
 
C
R
 
V
L
 
A
P
 
P
D
 
G
R
 
E
I
 
V
A
 
R
F
 
A
A
 
S
S
 
T
E
 
E
I
 
A
K
 
K
A
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
A
L
 
G
L
 
F
P
 
P
E
 
L
S
 
A
P
 
D
R
 
-
I
 
-
Q
 
-
P
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
Q
 
-
F
 
-
L
 
-
Q
 
A
N
 
R
Q
 
R
F
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
-
E
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
I
 
L
D
 
T
G
 
G
I
 
V
R
 
Y
R
 
Q
V
 
V
P
 
P
P
 
A
G
 
G
T
 
A
A
 
V
L
 
M
L
 
D
I
 
I
D
 
D
-
 
L
A
 
G
D
 
S
L
 
G
N
 
T
I
 
A
R
 
V
P
 
T
H
 
H
R
 
R
Y
 
T
W
 
W
L
 
T
A
 
P
L
 
-
D
 
-
V
 
G
E
 
L
P
 
S
R
 
R
R
 
R
I
 
I
G
 
L
F
 
P
E
 
E
-
 
G
E
 
E
A
 
A
R
 
V
A
 
A
E
 
A
L
 
V
D
 
R
A
 
A
L
 
A
M
 
L
D
 
E
D
 
K
A
 
A
M
 
V
R
 
A
E
 
Q
H
 
R
Q
 
V
R
 
T
-
 
P
S
 
G
D
 
D
V
 
T
P
 
P
F
 
L
G
 
-
L
 
V
F
x
V
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
L
 
I
D
|
D
S
|
S
A
 
S
V
 
G
L
 
V
A
 
A
A
 
A
K
 
-
L
 
C
A
 
A
E
 
H
Q
 
R
G
 
A
A
 
A
G
 
G
R
 
E
I
 
L
K
 
D
S
 
T
Y
 
V
S
|
S
V
x
M
G
 
G
Y
 
-
R
 
-
G
 
-
T
 
T
A
 
D
M
 
T
A
 
S
H
 
N
E
 
E
L
 
F
D
 
R
E
 
E
A
 
A
A
 
R
R
 
A
V
 
V
A
 
V
T
 
D
H
 
H
F
 
L
G
 
R
F
 
T
D
 
R
H
 
H
R
 
R
P
 
E
L
 
I
E
 
T
L
 
I
E
 
P
L
 
T
P
 
T
R
 
E
V
 
L
F
 
L
G
 
A
R
 
Q
L
 
L
P
 
P
H
 
Y
T
 
A
V
 
V
W
 
W
C
 
A
A
 
S
D
 
E
E
 
S
L
 
V
M
 
D
R
 
P
D
|
D
Y
 
I
A
 
I
-
 
E
-
x
Y
C
 
L
L
 
L
P
 
P
T
 
L
S
 
T
I
 
A
L
 
L
A
 
Y
E
 
R
T
 
A
A
 
L
G
 
D
A
 
G
E
 
P
L
 
E
K
 
R
V
 
R
V
 
I
F
 
L
S
 
T
G
|
G
E
x
Y
G
|
G
G
 
A
D
|
D
E
x
I
A
 
P
F
 
L
A
 
G
G
 
G
Y
 
M
G
 
H
R
 
R

Sites not aligning to the query:

1mb9A Beta-lactam synthetase complexed with atp (see paper)
29% identity, 50% coverage: 72:375/605 of query aligns to 68:347/485 of 1mb9A

query
sites
1mb9A
V
 
V
A
 
L
N
x
A
G
|
G
E
 
E
V
 
I
Y
 
Y
N
 
N
Y
 
R
I
 
D
E
 
E
L
 
L
N
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
L
R
 
S
A
 
V
L
 
L
G
 
P
Q
 
A
P
 
G
P
 
P
R
 
A
T
 
P
G
 
E
S
 
G
D
 
D
S
 
A
E
 
E
T
 
L
I
 
V
L
 
L
N
 
R
A
 
L
Y
 
L
A
 
E
A
 
R
H
 
Y
G
 
D
L
 
L
D
 
H
A
 
A
L
 
F
D
 
R
R
 
L
L
 
V
R
 
N
G
 
G
M
 
R
Y
 
F
A
 
A
F
 
T
A
 
V
L
 
V
H
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
R
A
 
T
G
 
G
-
 
D
R
 
R
L
 
V
I
 
L
L
 
L
G
 
A
R
 
T
D
 
D
R
 
H
L
 
A
G
 
G
I
 
S
K
 
V
P
 
P
L
 
L
F
 
Y
Y
 
T
V
 
C
R
 
V
L
 
A
P
 
P
D
 
G
R
 
E
I
 
V
A
 
R
F
 
A
A
 
S
S
 
T
E
 
E
I
 
A
K
 
K
A
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
A
L
 
F
-
 
P
L
 
L
P
 
A
E
 
D
S
 
A
P
 
R
R
 
R
I
 
V
Q
 
-
P
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
Q
 
-
F
 
-
L
 
-
Q
 
-
N
 
-
Q
 
-
F
 
-
A
 
A
G
 
G
G
 
-
E
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
I
 
L
D
 
T
G
 
G
I
 
V
R
 
Y
R
 
Q
V
 
V
P
 
P
P
 
A
G
 
G
T
 
A
A
 
V
L
 
M
L
 
D
I
 
I
D
 
D
-
 
L
A
 
G
D
 
S
L
 
G
N
 
T
I
 
A
R
 
V
P
 
T
H
 
H
R
 
R
Y
 
T
W
 
W
L
 
T
A
 
P
L
 
-
D
 
-
V
 
G
E
 
L
P
 
S
R
 
R
R
 
R
I
 
I
G
 
L
F
 
P
E
 
E
-
 
G
E
 
E
A
 
A
R
 
V
A
 
A
E
 
A
L
 
V
D
 
R
A
 
A
L
 
A
M
 
L
D
 
E
D
 
K
A
 
A
M
 
V
R
 
A
E
 
Q
H
 
R
Q
 
V
R
 
T
-
 
P
S
 
G
D
 
D
V
 
T
P
 
P
F
 
L
G
 
-
L
 
V
F
x
V
L
|
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
L
 
I
D
|
D
S
|
S
A
 
S
V
 
G
L
 
V
A
 
A
A
 
A
K
 
-
L
 
C
A
 
A
E
 
H
Q
 
R
G
 
A
A
 
A
G
 
G
R
 
E
I
 
L
K
 
D
S
 
T
Y
 
V
S
|
S
V
x
M
G
 
G
Y
 
-
R
 
-
G
 
-
T
 
T
A
 
D
M
 
T
A
 
S
H
 
N
E
 
E
L
 
F
D
 
R
E
 
E
A
 
A
A
 
R
R
 
A
V
 
V
A
 
V
T
 
D
H
 
H
F
 
L
G
 
R
F
 
T
D
 
R
H
 
H
R
 
R
P
 
E
L
 
I
E
 
T
L
 
I
E
 
P
L
 
T
P
 
T
R
 
E
V
 
L
F
 
L
G
 
A
R
 
Q
L
 
L
P
 
P
H
 
Y
T
 
A
V
 
V
W
 
W
C
 
A
A
 
S
D
 
E
E
 
S
L
 
V
M
 
D
R
 
P
D
|
D
Y
 
I
A
 
I
-
 
E
-
x
Y
C
 
L
L
 
L
P
 
P
T
x
L
S
 
T
I
 
A
L
 
L
A
 
Y
E
 
R
T
 
A
A
 
L
G
 
D
A
 
G
E
 
P
L
 
E
K
 
R
V
 
R
V
 
I
F
 
L
S
 
T
G
|
G
E
x
Y
G
 
G
G
 
A
D
|
D
E
 
I
A
 
P
F
 
L
A
 
G
G
 
G
Y
 
M
G
 
H
R
 
R

Sites not aligning to the query:

1mbzA Beta-lactam synthetase with trapped intermediate (see paper)
28% identity, 50% coverage: 72:375/605 of query aligns to 67:348/496 of 1mbzA

query
sites
1mbzA
V
 
V
A
 
L
N
x
A
G
|
G
E
 
E
V
 
I
Y
 
Y
N
 
N
Y
 
R
I
 
D
E
 
E
L
 
L
N
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
L
R
 
S
A
 
V
L
 
L
G
 
P
Q
 
A
P
 
G
P
 
P
R
 
A
T
 
P
G
 
E
S
 
G
D
 
D
S
 
A
E
 
E
T
 
L
I
 
V
L
 
L
N
 
R
A
 
L
Y
 
L
A
 
E
A
 
R
H
 
Y
G
 
D
L
 
L
D
 
H
A
 
A
L
 
F
D
 
R
R
 
L
L
 
V
R
 
N
G
 
G
M
 
R
Y
 
F
A
 
A
F
 
T
A
 
V
L
 
V
H
 
-
D
 
-
A
 
-
R
 
R
A
 
T
G
 
G
-
 
D
R
 
R
L
 
V
I
 
L
L
 
L
G
 
A
R
 
T
D
 
D
R
 
H
L
 
A
G
 
G
I
 
S
K
 
V
P
 
P
L
 
L
F
 
Y
Y
 
T
V
 
C
R
 
V
L
 
A
P
 
P
D
 
G
R
 
E
I
 
V
A
 
R
F
 
A
A
 
S
S
 
T
E
 
E
I
 
A
K
 
K
A
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
A
L
 
H
-
 
G
-
 
F
-
 
P
L
 
L
P
 
A
E
 
D
S
 
A
P
 
R
R
 
R
I
 
V
Q
 
-
P
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
Q
 
-
F
 
-
L
 
-
Q
 
-
N
 
-
Q
 
-
F
 
-
A
 
A
G
 
G
G
 
-
E
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
I
 
L
D
 
T
G
 
G
I
 
V
R
 
Y
R
 
Q
V
 
V
P
 
P
P
 
A
G
 
G
T
 
A
A
 
V
L
 
M
L
 
D
I
 
I
D
 
D
-
 
L
A
 
G
D
 
S
L
 
G
N
 
T
I
 
A
R
 
V
P
 
T
H
 
H
R
 
R
Y
 
T
W
 
W
L
 
T
A
 
P
L
 
-
D
 
-
V
 
G
E
 
L
P
 
S
R
 
R
R
 
R
I
 
I
G
 
L
F
 
P
E
 
E
-
 
G
E
 
E
A
 
A
R
 
V
A
 
A
E
 
A
L
 
V
D
 
R
A
 
A
L
 
A
M
 
L
D
 
E
D
 
K
A
 
A
M
 
V
R
 
A
E
 
Q
H
 
R
Q
 
V
R
 
T
-
 
P
S
 
G
D
 
D
V
 
T
P
 
P
F
 
L
G
 
-
L
 
V
F
x
V
L
|
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
L
 
I
D
|
D
S
|
S
A
 
S
V
 
G
L
 
V
A
 
A
A
 
A
K
 
-
L
 
C
A
 
A
E
 
H
Q
 
R
G
 
A
A
 
A
G
 
G
R
 
E
I
 
L
K
 
D
S
 
T
Y
 
V
S
|
S
V
x
M
G
 
G
Y
 
-
R
 
-
G
 
-
T
 
T
A
 
D
M
 
T
A
 
S
H
 
N
E
 
E
L
 
F
D
 
R
E
 
E
A
 
A
A
 
R
R
 
A
V
 
V
A
 
V
T
 
D
H
 
H
F
 
L
G
 
R
F
 
T
D
 
R
H
 
H
R
 
R
P
 
E
L
 
I
E
 
T
L
 
I
E
 
P
L
 
T
P
 
T
R
 
E
V
 
L
F
 
L
G
 
A
R
 
Q
L
 
L
P
 
P
H
 
Y
T
 
A
V
 
V
W
 
W
C
 
A
A
 
S
D
 
E
E
 
S
L
 
V
M
 
D
R
 
P
D
|
D
Y
 
I
A
 
I
-
 
E
-
x
Y
C
 
L
L
 
L
P
 
P
T
x
L
S
 
T
I
 
A
L
 
L
A
 
Y
E
 
R
T
 
A
A
 
L
G
 
D
A
 
G
E
 
P
L
 
E
K
 
R
V
 
R
V
 
I
F
 
L
S
 
T
G
|
G
E
x
Y
G
|
G
G
 
A
D
|
D
E
x
I
A
 
P
F
 
L
A
 
G
G
 
G
Y
 
M
G
 
H
R
 
R

Sites not aligning to the query:

Q9STG9 Amidophosphoribosyltransferase 2, chloroplastic; AtATase2; AtPURF2; PRPP2; Glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase 2; AtGPRAT2; Protein CHLOROPLAST IMPORT APPARATUS 1; Protein DIFFERENTIAL DEVELOPMENT OF VASCULAR ASSOCIATED CELLS; EC 2.4.2.14 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 2 papers)
28% identity, 20% coverage: 41:164/605 of query aligns to 151:285/561 of Q9STG9

query
sites
Q9STG9
G
 
G
P
 
D
V
 
I
G
 
A
L
 
I
V
 
G
Q
 
H
T
 
V
R
 
R
L
 
Y
S
 
S
I
 
T
I
 
A
G
 
G
-
 
S
-
 
S
L
 
M
E
 
L
S
 
K
G
 
N
H
 
V
Q
 
Q
P
 
P
L
 
F
L
 
V
S
 
A
A
 
G
D
 
Y
-
 
R
-
 
F
G
 
G
Q
 
S
L
 
V
A
 
G
L
 
V
V
 
A
A
x
H
N
 
N
G
 
G
E
 
N
V
 
L
Y
 
V
N
 
N
Y
 
Y
I
 
T
E
 
K
L
 
L
N
 
R
A
 
A
E
 
D
L
 
L
R
 
E
A
 
E
L
 
N
G
 
G
Q
 
S
P
 
I
P
 
F
R
 
N
T
 
T
G
 
S
S
 
S
D
 
D
S
 
T
E
 
E
T
 
V
I
 
V
L
 
L
N
 
H
A
 
L
Y
 
I
A
 
A
A
 
I
H
 
S
G
 
K
-
 
A
-
 
R
-
 
P
-
 
F
-
 
F
-
 
M
-
 
R
-
 
I
L
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
C
D
 
E
R
 
K
L
 
L
R
 
Q
G
 
G
M
 
A
Y
 
Y
A
 
S
F
 
M
A
 
V
L
 
F
H
 
-
D
 
-
A
 
V
R
 
T
A
 
E
G
 
D
R
 
K
L
 
L
I
 
V
L
 
A
G
 
V
R
 
R
D
 
D
R
 
P
L
 
H
G
 
G
I
 
F
K
x
R
P
|
P
L
 
L
F
 
V
Y
 
M
V
 
G
R
 
R
L
 
R
P
 
S
D
 
N
-
 
G
R
 
A
I
 
V
A
 
V
F
 
F
A
 
A
S
 
S
E
 
E
I
 
T
K
 
C
A
 
A
L
 
L

Sites not aligning to the query:

6lbpA Structure of the glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase from arabidopsis thaliana (see paper)
31% identity, 16% coverage: 67:164/605 of query aligns to 95:199/460 of 6lbpA

query
sites
6lbpA
G
 
G
Q
 
S
L
 
V
A
 
G
L
 
V
V
 
A
A
 
H
N
|
N
G
|
G
E
 
N
V
 
L
Y
 
V
N
 
N
Y
 
Y
I
 
T
E
 
K
L
 
L
N
 
R
A
 
A
E
 
D
L
 
L
R
 
E
A
 
E
L
 
N
G
 
G
Q
 
S
P
 
I
P
 
F
R
 
N
T
 
T
G
 
S
S
 
S
D
 
D
S
 
T
E
 
E
T
 
V
I
 
V
L
 
L
N
 
H
A
 
L
Y
 
I
A
 
A
A
 
I
H
 
S
G
 
K
-
 
A
-
 
R
-
 
P
-
 
F
-
 
F
-
 
M
-
 
R
-
 
I
L
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
C
D
 
E
R
 
K
L
 
L
R
 
Q
G
 
G
M
 
A
Y
 
Y
A
 
S
F
 
M
A
 
V
L
 
F
H
 
-
D
 
-
A
 
V
R
 
T
A
 
E
G
 
D
R
 
K
L
 
L
I
 
V
L
 
A
G
 
V
R
 
R
D
 
D
R
 
P
L
 
H
G
 
G
I
 
F
K
 
R
P
 
P
L
 
L
F
 
V
Y
 
M
V
 
G
R
 
R
L
 
R
P
 
S
D
 
N
-
 
G
R
 
A
I
 
V
A
 
V
F
 
F
A
 
A
S
 
S
E
 
E
I
 
T
K
 
C
A
 
A
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_012971900.1 NCBI__GCF_000025485.1:WP_012971900.1
MCGIAGFMLARGRRPEPEWLDRMAERLAHRGPDDRGRYCAGPVGLVQTRLSIIGLESGHQ
PLLSADGQLALVANGEVYNYIELNAELRALGQPPRTGSDSETILNAYAAHGLDALDRLRG
MYAFALHDARAGRLILGRDRLGIKPLFYVRLPDRIAFASEIKALLALLPESPRIQPSALR
QFLQNQFAGGEETLIDGIRRVPPGTALLIDADLNIRPHRYWLALDVEPRRIGFEEARAEL
DALMDDAMREHQRSDVPFGLFLSGGLDSAVLAAKLAEQGAGRIKSYSVGYRGTAMAHELD
EAARVATHFGFDHRPLELELPRVFGRLPHTVWCADELMRDYACLPTSILAETAGAELKVV
FSGEGGDEAFAGYGRYRPPLAERLLKSLLHPGSGGFRTRGQWAGRWTRRLMGPALRAVAD
ADRAPVRRAWSETPRHWSDMQRRQYTDLVTALPDNLLVKTDRLLMGFGLEGRVPFLDHRI
VEFGLSLPDALKVQGHQGKWLVRRWAEPKLPPGHLERPKRGFHVPVGDWLRGSLATEVGR
RLALNPGVRDWFEVTAIPELVAARQAGRGGGRELFGLMQFAIWHRLFIERPGLRPTPDED
PLDWI

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory