SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012973235.1 NCBI__GCF_000010725.1:WP_012973235.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7kb1C Complex of o-acety-l-homoserine aminocarboxypropyltransferase (mety) from thermotoga maritima and a key reaction intermediate (see paper)
52% identity, 98% coverage: 9:440/441 of query aligns to 7:428/428 of 7kb1C

query
sites
7kb1C
F
 
Y
D
 
N
T
 
T
Q
 
R
S
 
A
L
 
L
H
 
H
A
 
A
G
 
G
-
 
Y
Q
 
E
R
 
P
P
 
P
D
 
E
P
 
Q
A
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
S
R
 
R
A
 
A
V
 
V
P
 
P
I
 
I
H
 
Y
L
 
Q
T
 
T
S
 
T
S
 
S
Y
 
Y
V
 
V
F
 
F
D
 
R
D
 
D
V
 
S
D
 
D
Q
 
H
A
 
A
A
 
A
A
 
R
L
 
L
F
 
F
N
 
A
L
 
L
E
 
E
R
 
E
P
 
P
G
 
G
H
 
F
I
 
I
Y
|
Y
S
 
T
R
|
R
I
 
I
S
 
G
N
 
N
P
 
P
T
 
T
V
 
V
A
 
S
V
 
V
L
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
R
L
 
I
A
 
A
T
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
E
G
 
G
V
 
V
G
 
G
A
 
A
V
 
L
C
 
A
T
 
V
A
 
A
S
 
S
G
|
G
Q
|
Q
A
 
A
A
 
A
L
 
I
T
 
T
L
 
Y
A
 
A
I
 
I
M
 
L
T
 
N
L
 
I
M
 
A
G
 
G
A
 
P
G
 
G
G
 
D
H
 
E
I
 
I
V
 
V
A
 
S
S
 
G
S
 
S
S
 
A
I
 
L
Y
|
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
T
R
 
Y
N
 
N
L
 
L
L
 
F
A
 
R
Y
 
H
T
 
T
L
 
L
-
 
Y
P
 
K
R
 
K
F
 
S
G
 
G
I
 
I
T
 
I
T
 
V
S
 
K
F
 
F
V
 
V
H
 
D
P
 
E
R
 
T
D
 
D
F
 
P
D
 
K
G
 
N
I
 
I
R
 
E
A
 
E
A
 
A
I
 
I
R
 
T
P
 
E
E
 
K
T
 
T
R
 
K
L
 
A
V
 
V
F
 
Y
G
 
L
E
 
E
V
 
T
L
 
I
G
 
G
N
|
N
P
 
P
G
 
G
L
 
L
E
 
T
V
 
V
L
 
P
D
 
D
L
 
F
P
 
E
K
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
E
I
 
I
A
 
A
H
 
H
E
 
R
A
 
H
G
 
G
I
 
V
P
 
P
L
 
L
L
 
I
I
 
V
D
|
D
S
 
N
T
 
T
F
 
-
T
 
V
T
 
A
P
 
P
Y
 
Y
L
 
I
C
 
F
R
 
R
P
 
P
F
 
F
E
 
E
H
 
H
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
I
V
 
V
M
 
V
H
 
Y
S
|
S
C
 
A
T
|
T
K
|
K
W
 
F
L
 
I
G
 
G
G
 
G
H
 
H
G
 
G
T
 
T
V
 
S
I
 
I
G
 
G
G
 
G
V
 
L
V
 
I
I
 
V
D
 
D
G
 
S
G
 
G
R
 
K
F
 
F
D
 
D
W
 
W
E
 
-
A
 
T
S
 
N
G
 
G
G
 
K
F
 
F
P
 
P
T
 
E
L
 
L
T
 
V
E
 
E
P
 
P
Y
 
D
A
 
P
G
 
S
Y
 
Y
H
 
H
G
 
G
I
 
V
D
 
S
F
 
Y
A
 
V
E
 
E
E
 
T
Y
 
F
G
 
K
P
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
Y
I
 
I
A
 
A
R
 
K
A
 
C
R
 
R
A
 
T
E
 
Q
G
 
L
L
 
L
R
 
R
D
 
D
F
 
L
G
 
G
A
 
S
C
 
C
M
 
M
S
 
S
P
 
P
M
 
F
N
 
N
A
 
A
F
 
F
Q
 
L
I
 
F
L
 
I
Q
 
L
G
 
G
V
 
L
E
 
E
T
 
T
L
 
L
P
 
S
L
 
L
R
 
R
M
 
M
K
 
K
G
 
K
H
 
H
I
 
C
H
 
E
N
 
N
T
 
A
R
 
L
K
 
K
I
 
I
V
 
V
G
 
E
F
 
F
L
 
L
E
 
K
G
 
S
E
 
H
L
 
-
Y
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
G
 
P
A
 
A
V
 
V
A
 
S
W
 
W
V
 
V
S
 
N
Y
 
Y
P
 
P
E
 
I
L
 
A
V
 
E
D
 
G
H
 
N
P
 
K
D
 
T
H
 
R
A
 
E
L
 
N
A
 
A
A
 
L
R
 
K
L
 
Y
L
 
L
P
 
K
Q
 
E
G
 
G
A
 
Y
G
 
G
S
 
A
I
 
I
I
 
V
S
 
T
F
 
F
G
 
G
I
 
V
R
 
K
P
 
-
G
 
-
A
 
-
Q
 
-
G
 
-
G
 
G
G
 
G
R
 
K
E
 
E
A
 
A
G
 
G
R
 
K
R
 
K
F
 
F
I
 
I
E
 
D
S
 
S
L
 
L
S
 
T
L
 
L
F
 
I
S
 
S
H
 
H
L
 
L
A
 
A
N
|
N
V
x
I
G
 
G
D
 
D
A
 
A
K
 
R
S
 
T
L
 
L
V
 
A
I
 
I
H
 
H
P
 
P
A
 
A
S
 
S
T
 
T
T
 
T
H
 
H
A
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
D
 
T
A
 
E
E
 
E
A
 
E
L
 
Q
A
 
L
A
 
K
A
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
T
E
 
P
D
 
D
M
 
M
I
 
I
R
|
R
L
 
L
S
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
I
E
 
E
D
 
D
C
 
V
D
 
E
D
 
D
L
 
I
I
 
I
D
 
A
D
 
D
L
 
L
K
 
D
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
K
A
 
S
T
 
Q
K
 
E

7kb1A Complex of o-acety-l-homoserine aminocarboxypropyltransferase (mety) from thermotoga maritima and a key reaction intermediate (see paper)
52% identity, 98% coverage: 9:440/441 of query aligns to 7:428/428 of 7kb1A

query
sites
7kb1A
F
 
Y
D
 
N
T
 
T
Q
 
R
S
 
A
L
 
L
H
 
H
A
 
A
G
 
G
-
 
Y
Q
 
E
R
 
P
P
 
P
D
 
E
P
 
Q
A
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
S
R
 
R
A
 
A
V
 
V
P
 
P
I
 
I
H
 
Y
L
 
Q
T
 
T
S
 
T
S
 
S
Y
 
Y
V
 
V
F
 
F
D
 
R
D
 
D
V
 
S
D
 
D
Q
 
H
A
 
A
A
 
A
A
 
R
L
 
L
F
 
F
N
 
A
L
 
L
E
 
E
R
 
E
P
 
P
G
 
G
H
 
F
I
 
I
Y
|
Y
S
 
T
R
|
R
I
 
I
S
 
G
N
 
N
P
 
P
T
 
T
V
 
V
A
 
S
V
 
V
L
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
R
L
 
I
A
 
A
T
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
E
G
 
G
V
 
V
G
 
G
A
 
A
V
 
L
C
 
A
T
 
V
A
 
A
S
 
S
G
|
G
Q
|
Q
A
 
A
A
 
A
L
 
I
T
 
T
L
 
Y
A
 
A
I
 
I
M
 
L
T
 
N
L
 
I
M
 
A
G
 
G
A
 
P
G
 
G
G
 
D
H
 
E
I
 
I
V
 
V
A
 
S
S
 
G
S
 
S
S
 
A
I
 
L
Y
|
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
T
R
 
Y
N
 
N
L
 
L
L
 
F
A
 
R
Y
 
H
T
 
T
L
 
L
-
 
Y
P
 
K
R
 
K
F
 
S
G
 
G
I
 
I
T
 
I
T
 
V
S
 
K
F
 
F
V
 
V
H
 
D
P
 
E
R
 
T
D
 
D
F
 
P
D
 
K
G
 
N
I
 
I
R
 
E
A
 
E
A
 
A
I
 
I
R
 
T
P
 
E
E
 
K
T
 
T
R
 
K
L
 
A
V
 
V
F
 
Y
G
 
L
E
 
E
V
 
T
L
 
I
G
 
G
N
|
N
P
 
P
G
 
G
L
 
L
E
 
T
V
 
V
L
 
P
D
 
D
L
 
F
P
 
E
K
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
E
I
 
I
A
 
A
H
 
H
E
 
R
A
 
H
G
 
G
I
 
V
P
 
P
L
 
L
L
 
I
I
 
V
D
|
D
S
 
N
T
 
T
F
 
-
T
 
V
T
 
A
P
 
P
Y
 
Y
L
 
I
C
 
F
R
 
R
P
 
P
F
 
F
E
 
E
H
 
H
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
I
V
 
V
M
 
V
H
 
Y
S
|
S
C
 
A
T
|
T
K
|
K
W
 
F
L
 
I
G
 
G
G
 
G
H
 
H
G
 
G
T
 
T
V
 
S
I
 
I
G
 
G
G
 
G
V
 
L
V
 
I
I
 
V
D
 
D
G
 
S
G
 
G
R
 
K
F
 
F
D
 
D
W
 
W
E
 
-
A
 
T
S
 
N
G
 
G
G
 
K
F
 
F
P
 
P
T
 
E
L
 
L
T
 
V
E
 
E
P
 
P
Y
 
D
A
 
P
G
 
S
Y
 
Y
H
 
H
G
 
G
I
 
V
D
 
S
F
 
Y
A
 
V
E
 
E
E
 
T
Y
 
F
G
 
K
P
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
Y
I
 
I
A
 
A
R
 
K
A
 
C
R
 
R
A
 
T
E
 
Q
G
 
L
L
 
L
R
 
R
D
 
D
F
 
L
G
 
G
A
 
S
C
 
C
M
 
M
S
 
S
P
 
P
M
 
F
N
 
N
A
 
A
F
 
F
Q
 
L
I
 
F
L
 
I
Q
 
L
G
 
G
V
 
L
E
 
E
T
 
T
L
 
L
P
 
S
L
 
L
R
 
R
M
 
M
K
 
K
G
 
K
H
 
H
I
 
C
H
 
E
N
 
N
T
 
A
R
 
L
K
 
K
I
 
I
V
 
V
G
 
E
F
 
F
L
 
L
E
 
K
G
 
S
E
 
H
L
 
-
Y
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
G
 
P
A
 
A
V
 
V
A
 
S
W
 
W
V
 
V
S
 
N
Y
 
Y
P
 
P
E
 
I
L
 
A
V
 
E
D
 
G
H
 
N
P
 
K
D
 
T
H
 
R
A
 
E
L
 
N
A
 
A
A
 
L
R
 
K
L
 
Y
L
 
L
P
 
K
Q
 
E
G
 
G
A
 
Y
G
 
G
S
 
A
I
 
I
I
 
V
S
 
T
F
 
F
G
 
G
I
 
V
R
 
K
P
 
-
G
 
-
A
 
-
Q
 
-
G
 
-
G
 
G
G
 
G
R
 
K
E
 
E
A
 
A
G
 
G
R
 
K
R
 
K
F
 
F
I
 
I
E
 
D
S
 
S
L
 
L
S
 
T
L
 
L
F
 
I
S
 
S
H
 
H
L
 
L
A
 
A
N
|
N
V
x
I
G
 
G
D
 
D
A
 
A
K
 
R
S
 
T
L
 
L
V
 
A
I
 
I
H
 
H
P
 
P
A
 
A
S
 
S
T
 
T
T
 
T
H
 
H
A
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
D
 
T
A
 
E
E
 
E
A
 
E
L
 
Q
A
 
L
A
 
K
A
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
T
E
 
P
D
 
D
M
 
M
I
 
I
R
|
R
L
 
L
S
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
I
E
 
E
D
 
D
C
 
V
D
 
E
D
 
D
L
 
I
I
 
I
D
 
A
D
 
D
L
 
L
K
 
D
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
K
A
 
S
T
 
Q
K
 
E

8wkoA Crystal structure of o-acetylhomoserine sulfhydrylase from lactobacillus plantarum in the closed form (see paper)
51% identity, 97% coverage: 9:435/441 of query aligns to 9:422/425 of 8wkoA

query
sites
8wkoA
F
 
F
D
 
E
T
 
T
Q
 
L
S
 
Q
L
 
V
H
 
H
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
R
 
T
P
 
V
D
 
D
P
 
E
A
 
-
T
 
T
G
 
G
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
V
P
 
P
I
 
I
H
 
Y
L
 
Q
T
 
T
S
 
T
S
 
S
Y
 
Y
V
 
V
F
 
F
D
 
K
D
 
D
V
 
A
D
 
K
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
R
F
 
F
N
 
A
L
 
L
E
 
T
R
 
D
P
 
A
G
 
G
H
 
N
I
 
I
Y
 
Y
S
 
T
R
 
R
I
 
L
S
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
T
V
 
T
A
 
D
V
 
V
L
 
V
E
 
D
E
 
K
R
 
R
L
 
V
A
 
A
T
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
H
G
 
G
V
 
T
G
 
A
A
 
G
V
 
V
C
 
T
T
 
L
A
 
A
S
 
T
G
|
G
Q
x
S
A
 
A
A
 
A
L
 
I
T
 
T
L
 
A
A
 
A
I
 
I
M
 
L
T
 
N
L
 
I
M
 
A
G
 
Q
A
 
Q
G
 
G
G
 
D
H
 
E
I
 
I
V
 
V
A
 
A
S
 
A
S
 
N
S
 
T
I
 
L
Y
|
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
T
R
 
Y
N
 
D
L
 
L
L
 
F
A
 
S
Y
 
V
T
 
T
L
 
L
P
 
K
R
 
K
F
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
T
T
 
T
S
 
H
F
 
F
V
 
V
H
 
D
P
 
P
R
 
D
D
 
E
F
 
P
D
 
A
G
 
N
I
 
F
R
 
E
A
 
T
A
 
A
I
 
I
R
 
N
P
 
D
E
 
H
T
 
T
R
 
K
L
 
A
V
 
L
F
 
Y
G
 
V
E
|
E
V
 
S
L
 
I
G
 
G
N
 
N
P
 
P
G
 
G
L
 
I
E
 
N
V
 
L
L
 
V
D
 
D
L
 
F
P
 
E
K
 
A
V
 
I
A
 
G
A
 
K
I
 
I
A
 
A
H
 
H
E
 
D
A
 
H
G
 
G
I
 
I
P
 
I
L
 
F
L
 
I
I
 
V
D
|
D
S
 
N
T
|
T
F
 
F
T
 
G
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
C
 
V
R
 
R
P
 
P
F
 
L
E
 
E
H
 
H
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
V
V
 
V
M
 
V
H
 
H
S
|
S
C
x
A
T
|
T
K
 
-
W
x
F
L
 
I
G
 
G
G
|
G
H
|
H
G
 
G
T
 
T
V
 
T
I
x
M
G
 
G
G
 
G
V
 
V
V
 
I
I
 
V
D
 
E
G
 
G
G
 
G
R
 
Q
F
 
F
D
 
D
W
 
W
E
 
R
A
 
A
S
 
S
G
 
G
G
 
K
F
 
Y
P
 
P
T
 
D
L
 
F
T
 
T
E
 
T
P
 
P
Y
 
D
A
 
P
G
 
Q
Y
 
Y
H
 
N
G
 
G
I
 
L
D
 
V
F
 
F
A
 
A
E
 
-
E
 
D
Y
 
L
G
 
G
P
 
G
A
 
A
A
 
A
F
 
F
I
 
T
A
 
T
R
 
K
A
 
V
R
 
R
A
 
A
E
 
E
G
 
T
L
 
L
R
 
R
D
 
D
F
 
T
G
 
G
A
 
A
C
 
T
M
 
I
S
 
S
P
 
P
M
 
F
N
 
N
A
 
S
F
 
F
Q
 
L
I
 
L
L
 
L
Q
|
Q
G
 
G
V
 
L
E
 
E
T
x
S
L
 
L
P
 
S
L
 
L
R
 
R
M
 
V
K
 
E
G
 
R
H
 
H
I
 
V
H
 
T
N
 
N
T
 
T
R
 
R
K
 
K
I
 
I
V
 
V
G
 
A
F
 
F
L
 
L
E
 
K
G
 
A
E
 
H
L
 
-
Y
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
G
 
P
A
 
K
V
 
V
A
 
A
W
 
W
V
 
I
S
 
N
Y
 
Y
P
 
P
E
 
E
L
 
L
V
 
E
D
 
D
H
 
S
P
 
P
D
 
Y
H
 
H
A
 
D
L
 
L
A
 
A
A
 
T
R
 
K
L
 
Y
L
 
F
P
 
P
Q
 
N
G
 
G
A
 
V
G
 
G
S
 
S
I
 
I
I
 
F
S
 
T
F
 
L
G
 
G
I
 
L
R
 
T
P
 
-
G
 
-
A
 
-
Q
 
-
G
 
-
G
 
G
G
 
G
R
 
E
E
 
A
A
 
A
G
 
G
R
 
K
R
 
A
F
 
L
I
 
I
E
 
E
S
 
H
L
 
L
S
 
Q
L
 
L
F
 
F
S
 
S
H
 
L
L
 
L
A
 
A
N
 
N
V
|
V
G
x
A
D
 
D
A
 
A
K
 
K
S
 
S
L
 
L
V
 
I
I
 
I
H
 
H
P
 
P
A
 
A
S
 
S
T
 
T
T
 
T
H
 
H
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
D
 
N
A
 
E
E
 
Q
A
 
E
L
 
L
A
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
T
E
 
P
D
 
D
M
 
L
I
 
I
R
 
R
L
 
I
S
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
V
E
 
E
D
 
N
C
 
A
D
 
D
D
 
D
L
 
L
I
 
I
D
 
A
D
 
D
L
 
L
K
 
D
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L

8erbK Crystal structure of fub7 in complex with vinylglycine ketimine (see paper)
50% identity, 98% coverage: 6:438/441 of query aligns to 3:427/429 of 8erbK

query
sites
8erbK
F
 
F
L
 
Q
K
 
N
F
 
F
D
 
E
T
 
T
Q
 
L
S
 
Q
L
 
L
H
 
H
A
 
A
G
 
G
Q
 
Y
R
 
T
P
 
P
D
 
D
P
 
P
A
 
H
T
 
T
G
 
R
A
 
S
R
 
T
A
 
A
V
 
V
P
 
P
I
 
I
H
 
Y
L
 
A
T
 
T
S
 
S
S
 
S
Y
 
Y
V
 
T
F
 
F
D
 
N
D
 
D
V
 
S
D
 
A
Q
 
H
A
 
G
A
 
A
A
 
R
L
 
L
F
 
F
N
 
G
L
 
L
E
 
K
R
 
E
P
 
L
G
 
G
H
 
N
I
 
I
Y
|
Y
S
 
S
R
|
R
I
 
L
S
 
M
N
 
N
P
 
P
T
 
T
V
 
V
A
 
D
V
 
V
L
 
F
E
 
E
E
 
K
R
 
R
L
 
I
A
 
A
T
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
V
 
I
G
 
A
A
 
A
V
 
A
C
 
A
T
 
T
A
 
S
S
 
S
G
|
G
Q
|
Q
A
 
A
A
 
A
L
x
Q
T
 
F
L
 
L
A
 
T
I
 
I
M
 
A
T
 
T
L
 
L
M
 
A
G
 
K
A
 
A
G
 
G
G
 
D
H
 
N
I
 
I
V
 
V
A
 
A
S
 
S
S
 
S
S
 
H
I
 
L
Y
|
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
T
R
 
Y
N
 
N
L
 
Q
L
 
L
A
 
N
Y
 
V
T
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
R
F
 
F
G
 
G
I
 
I
T
 
K
T
 
T
S
 
K
F
 
F
V
 
V
H
 
R
P
 
S
R
 
G
D
 
K
F
 
L
D
 
E
G
 
D
I
 
Y
R
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
D
P
 
D
E
 
Q
T
 
T
R
 
R
L
 
A
V
 
I
F
 
Y
G
 
V
E
 
E
V
 
S
L
 
M
G
 
S
N
|
N
P
 
P
G
 
D
L
 
Y
E
 
V
V
 
V
L
 
P
D
 
D
L
 
F
P
 
E
K
 
G
V
 
I
A
 
A
A
 
K
I
 
I
A
 
A
H
 
H
E
 
E
A
 
H
G
 
G
I
 
I
P
 
P
L
 
L
L
 
V
I
 
V
D
|
D
S
 
N
T
 
T
F
 
L
-
 
G
T
 
A
T
 
G
P
 
G
Y
 
Y
L
 
Y
C
 
I
R
 
R
P
 
P
F
 
I
E
 
E
H
 
H
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
I
V
 
V
M
 
V
H
 
H
S
|
S
C
 
A
T
|
T
K
|
K
W
 
W
L
 
I
G
 
G
G
 
G
H
 
H
G
 
G
T
 
T
V
 
T
I
 
I
G
 
G
G
 
G
V
 
V
V
 
I
I
 
V
D
 
D
G
 
S
G
 
G
R
 
R
F
 
F
D
 
N
W
 
W
E
 
N
A
 
K
-
 
H
S
 
S
G
 
D
G
 
R
F
 
F
P
 
P
T
 
E
L
 
M
T
 
V
E
 
E
P
 
P
Y
 
S
A
 
P
G
 
S
Y
 
Y
H
 
H
G
 
G
I
 
L
D
 
K
F
 
Y
A
 
W
E
 
E
E
 
A
Y
 
F
G
 
G
P
 
P
A
 
A
A
 
T
F
 
F
I
 
I
A
 
T
R
 
R
A
 
I
R
 
R
A
 
V
E
 
E
G
 
M
L
 
L
R
 
R
D
 
D
F
 
I
G
 
G
A
 
A
C
 
C
M
 
L
S
 
S
P
 
P
M
 
F
N
 
S
A
 
A
F
 
Q
Q
 
Q
I
 
L
L
 
L
Q
 
L
G
 
G
V
 
I
E
 
E
T
 
T
L
 
L
P
 
G
L
 
L
R
 
R
M
 
A
K
 
E
G
 
R
H
 
H
I
 
A
H
 
Q
N
 
N
T
 
T
R
 
E
K
 
K
I
 
L
V
 
S
G
 
K
F
 
Y
L
 
F
E
 
E
G
 
S
E
 
-
L
 
-
Y
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
S
G
 
P
A
 
N
V
 
V
A
 
S
W
 
W
V
 
V
S
 
L
Y
 
W
P
 
P
E
 
G
L
 
S
V
 
E
D
 
S
H
 
H
P
 
P
D
 
T
H
 
Y
A
 
S
L
 
Q
A
 
A
A
 
K
R
 
K
L
 
Y
L
 
L
P
 
T
Q
 
R
G
 
G
A
 
F
G
 
G
S
 
A
I
 
M
I
 
L
S
 
S
F
 
I
G
 
G
I
 
V
R
 
K
P
 
-
G
 
-
A
 
-
Q
 
-
G
 
-
G
 
G
G
 
D
R
 
A
E
 
S
A
 
A
G
 
G
R
 
S
R
 
K
F
 
V
I
 
V
E
 
D
S
 
G
L
 
L
S
 
K
L
 
L
F
 
V
S
 
S
H
 
N
L
 
L
A
 
A
N
 
N
V
 
V
G
 
G
D
 
D
A
 
A
K
 
K
S
 
S
L
 
L
V
 
A
I
 
I
H
 
H
P
 
P
A
 
W
S
 
S
T
 
T
T
|
T
H
 
H
A
 
E
Q
 
Q
L
 
L
D
 
S
A
 
E
E
 
D
A
 
E
L
 
R
A
 
L
A
 
A
A
 
S
G
 
G
V
 
V
G
 
T
E
 
E
D
 
D
M
 
M
I
 
I
R
|
R
L
 
I
S
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
I
E
 
E
D
 
H
C
 
V
D
 
D
D
 
D
L
 
I
I
 
I
D
 
A
D
 
D
L
 
F
K
 
E
Q
 
Q
A
 
S
L
 
F
R
 
Q
A
 
K
A
 
A

8erjB Crystal structure of fub7 in complex with e-2-aminocrotonate (see paper)
50% identity, 98% coverage: 6:438/441 of query aligns to 2:426/428 of 8erjB

query
sites
8erjB
F
 
F
L
 
Q
K
 
N
F
 
F
D
 
E
T
 
T
Q
 
L
S
 
Q
L
 
L
H
 
H
A
 
A
G
 
G
Q
 
Y
R
 
T
P
 
P
D
 
D
P
 
P
A
 
H
T
 
T
G
 
R
A
 
S
R
 
T
A
 
A
V
 
V
P
 
P
I
 
I
H
 
Y
L
 
A
T
 
T
S
 
S
S
 
S
Y
 
Y
V
 
T
F
 
F
D
 
N
D
 
D
V
 
S
D
 
A
Q
 
H
A
 
G
A
 
A
A
 
R
L
 
L
F
 
F
N
 
G
L
 
L
E
 
K
R
 
E
P
 
L
G
 
G
H
 
N
I
 
I
Y
 
Y
S
 
S
R
 
R
I
 
L
S
 
M
N
 
N
P
 
P
T
 
T
V
 
V
A
 
D
V
 
V
L
 
F
E
 
E
E
 
K
R
 
R
L
 
I
A
 
A
T
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
V
 
I
G
 
A
A
 
A
V
 
A
C
 
A
T
 
T
A
 
S
S
 
S
G
|
G
Q
|
Q
A
 
A
A
 
A
L
x
Q
T
 
F
L
 
L
A
 
T
I
 
I
M
 
A
T
 
T
L
 
L
M
 
A
G
 
K
A
 
A
G
 
G
G
 
D
H
 
N
I
 
I
V
 
V
A
 
A
S
 
S
S
 
S
S
 
H
I
 
L
Y
|
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
T
R
 
Y
N
 
N
L
 
Q
L
 
L
A
 
N
Y
 
V
T
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
R
F
 
F
G
 
G
I
 
I
T
 
K
T
 
T
S
 
K
F
 
F
V
 
V
H
 
R
P
 
S
R
 
G
D
 
K
F
 
L
D
 
E
G
 
D
I
 
Y
R
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
D
P
 
D
E
 
Q
T
 
T
R
 
R
L
 
A
V
 
I
F
 
Y
G
 
V
E
 
E
V
 
S
L
 
M
G
 
S
N
 
N
P
 
P
G
 
D
L
 
Y
E
 
V
V
 
V
L
 
P
D
 
D
L
 
F
P
 
E
K
 
G
V
 
I
A
 
A
A
 
K
I
 
I
A
 
A
H
 
H
E
 
E
A
 
H
G
 
G
I
 
I
P
 
P
L
 
L
L
 
V
I
 
V
D
|
D
S
 
N
T
 
T
F
 
L
-
 
G
T
 
A
T
 
G
P
 
G
Y
 
Y
L
 
Y
C
 
I
R
 
R
P
 
P
F
 
I
E
 
E
H
 
H
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
I
V
 
V
M
 
V
H
 
H
S
|
S
C
 
A
T
 
T
K
|
K
W
 
W
L
 
I
G
 
G
G
 
G
H
 
H
G
 
G
T
 
T
V
 
T
I
 
I
G
 
G
G
 
G
V
 
V
V
 
I
I
 
V
D
 
D
G
 
S
G
 
G
R
 
R
F
 
F
D
 
N
W
 
W
E
 
N
A
 
K
-
 
H
S
 
S
G
 
D
G
 
R
F
 
F
P
 
P
T
 
E
L
 
M
T
 
V
E
 
E
P
 
P
Y
 
S
A
 
P
G
 
S
Y
 
Y
H
 
H
G
 
G
I
 
L
D
 
K
F
 
Y
A
 
W
E
 
E
E
 
A
Y
 
F
G
 
G
P
 
P
A
 
A
A
 
T
F
 
F
I
 
I
A
 
T
R
 
R
A
 
I
R
 
R
A
 
V
E
 
E
G
 
M
L
 
L
R
 
R
D
 
D
F
 
I
G
 
G
A
 
A
C
 
C
M
 
L
S
 
S
P
 
P
M
 
F
N
 
S
A
 
A
F
 
Q
Q
 
Q
I
 
L
L
 
L
Q
 
L
G
 
G
V
 
I
E
 
E
T
 
T
L
 
L
P
 
G
L
 
L
R
 
R
M
 
A
K
 
E
G
 
R
H
 
H
I
 
A
H
 
Q
N
 
N
T
 
T
R
 
E
K
 
K
I
 
L
V
 
S
G
 
K
F
 
Y
L
 
F
E
 
E
G
 
S
E
 
-
L
 
-
Y
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
S
G
 
P
A
 
N
V
 
V
A
 
S
W
 
W
V
 
V
S
 
L
Y
 
W
P
 
P
E
 
G
L
 
S
V
 
E
D
 
S
H
 
H
P
 
P
D
 
T
H
 
Y
A
 
S
L
 
Q
A
 
A
A
 
K
R
 
K
L
 
Y
L
 
L
P
 
T
Q
 
R
G
 
G
A
 
F
G
 
G
S
 
A
I
 
M
I
 
L
S
 
S
F
 
I
G
 
G
I
 
V
R
 
K
P
 
-
G
 
-
A
 
-
Q
 
-
G
 
-
G
 
G
G
 
D
R
 
A
E
 
S
A
 
A
G
 
G
R
 
S
R
 
K
F
 
V
I
 
V
E
 
D
S
 
G
L
 
L
S
 
K
L
 
L
F
 
V
S
 
S
H
 
N
L
 
L
A
|
A
N
|
N
V
 
V
G
 
G
D
 
D
A
 
A
K
 
K
S
 
S
L
 
L
V
 
A
I
 
I
H
 
H
P
 
P
A
 
W
S
 
S
T
 
T
T
|
T
H
 
H
A
 
E
Q
 
Q
L
 
L
D
 
S
A
 
E
E
 
D
A
 
E
L
 
R
A
 
L
A
 
A
A
 
S
G
 
G
V
 
V
G
 
T
E
 
E
D
 
D
M
 
M
I
 
I
R
|
R
L
 
I
S
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
I
E
 
E
D
 
H
C
 
V
D
 
D
D
 
D
L
 
I
I
 
I
D
 
A
D
 
D
L
 
F
K
 
E
Q
 
Q
A
 
S
L
 
F
R
 
Q
A
 
K
A
 
A

8erjA Crystal structure of fub7 in complex with e-2-aminocrotonate (see paper)
50% identity, 98% coverage: 6:438/441 of query aligns to 2:426/428 of 8erjA

query
sites
8erjA
F
 
F
L
 
Q
K
 
N
F
 
F
D
 
E
T
 
T
Q
 
L
S
 
Q
L
 
L
H
 
H
A
 
A
G
 
G
Q
 
Y
R
 
T
P
 
P
D
 
D
P
 
P
A
 
H
T
 
T
G
 
R
A
 
S
R
 
T
A
 
A
V
 
V
P
 
P
I
 
I
H
 
Y
L
 
A
T
 
T
S
 
S
S
 
S
Y
 
Y
V
 
T
F
 
F
D
 
N
D
 
D
V
 
S
D
 
A
Q
 
H
A
 
G
A
 
A
A
 
R
L
 
L
F
 
F
N
 
G
L
 
L
E
 
K
R
 
E
P
 
L
G
 
G
H
 
N
I
 
I
Y
 
Y
S
 
S
R
 
R
I
 
L
S
 
M
N
 
N
P
 
P
T
 
T
V
 
V
A
 
D
V
 
V
L
 
F
E
 
E
E
 
K
R
 
R
L
 
I
A
 
A
T
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
V
 
I
G
 
A
A
 
A
V
 
A
C
 
A
T
 
T
A
 
S
S
|
S
G
|
G
Q
|
Q
A
 
A
A
 
A
L
x
Q
T
 
F
L
 
L
A
 
T
I
 
I
M
 
A
T
 
T
L
 
L
M
 
A
G
 
K
A
 
A
G
 
G
G
 
D
H
 
N
I
 
I
V
 
V
A
 
A
S
 
S
S
 
S
S
 
H
I
 
L
Y
|
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
T
R
 
Y
N
 
N
L
 
Q
L
 
L
A
 
N
Y
 
V
T
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
R
F
 
F
G
 
G
I
 
I
T
 
K
T
 
T
S
 
K
F
 
F
V
 
V
H
 
R
P
 
S
R
 
G
D
 
K
F
 
L
D
 
E
G
 
D
I
 
Y
R
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
I
R
 
D
P
 
D
E
 
Q
T
 
T
R
 
R
L
 
A
V
 
I
F
 
Y
G
 
V
E
 
E
V
 
S
L
 
M
G
 
S
N
|
N
P
 
P
G
 
D
L
 
Y
E
 
V
V
 
V
L
 
P
D
 
D
L
 
F
P
 
E
K
 
G
V
 
I
A
 
A
A
 
K
I
 
I
A
 
A
H
 
H
E
 
E
A
 
H
G
 
G
I
 
I
P
 
P
L
 
L
L
 
V
I
 
V
D
|
D
S
 
N
T
 
T
F
 
L
-
 
G
T
 
A
T
 
G
P
 
G
Y
 
Y
L
 
Y
C
 
I
R
 
R
P
 
P
F
 
I
E
 
E
H
 
H
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
I
V
 
V
M
 
V
H
 
H
S
|
S
C
 
A
T
|
T
K
|
K
W
 
W
L
 
I
G
 
G
G
 
G
H
 
H
G
 
G
T
 
T
V
 
T
I
 
I
G
 
G
G
 
G
V
 
V
V
 
I
I
 
V
D
 
D
G
 
S
G
 
G
R
 
R
F
 
F
D
 
N
W
 
W
E
 
N
A
 
K
-
 
H
S
 
S
G
 
D
G
 
R
F
 
F
P
 
P
T
 
E
L
 
M
T
 
V
E
 
E
P
 
P
Y
 
S
A
 
P
G
 
S
Y
 
Y
H
 
H
G
 
G
I
 
L
D
 
K
F
 
Y
A
 
W
E
 
E
E
 
A
Y
 
F
G
 
G
P
 
P
A
 
A
A
 
T
F
 
F
I
 
I
A
 
T
R
 
R
A
 
I
R
 
R
A
 
V
E
 
E
G
 
M
L
 
L
R
 
R
D
 
D
F
 
I
G
 
G
A
 
A
C
 
C
M
 
L
S
 
S
P
 
P
M
 
F
N
 
S
A
 
A
F
 
Q
Q
 
Q
I
 
L
L
 
L
Q
 
L
G
 
G
V
 
I
E
 
E
T
 
T
L
 
L
P
 
G
L
 
L
R
 
R
M
 
A
K
 
E
G
 
R
H
 
H
I
 
A
H
 
Q
N
 
N
T
 
T
R
 
E
K
 
K
I
 
L
V
 
S
G
 
K
F
 
Y
L
 
F
E
 
E
G
 
S
E
 
-
L
 
-
Y
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
S
G
 
P
A
 
N
V
 
V
A
 
S
W
 
W
V
 
V
S
 
L
Y
 
W
P
 
P
E
 
G
L
 
S
V
 
E
D
 
S
H
 
H
P
 
P
D
 
T
H
 
Y
A
 
S
L
 
Q
A
 
A
A
 
K
R
 
K
L
 
Y
L
 
L
P
 
T
Q
 
R
G
 
G
A
 
F
G
 
G
S
 
A
I
 
M
I
 
L
S
 
S
F
 
I
G
 
G
I
 
V
R
 
K
P
 
-
G
 
-
A
 
-
Q
 
-
G
 
-
G
 
G
G
 
D
R
 
A
E
 
S
A
 
A
G
 
G
R
 
S
R
 
K
F
 
V
I
 
V
E
 
D
S
 
G
L
 
L
S
 
K
L
 
L
F
 
V
S
 
S
H
 
N
L
 
L
A
 
A
N
 
N
V
 
V
G
 
G
D
 
D
A
 
A
K
 
K
S
 
S
L
 
L
V
 
A
I
 
I
H
 
H
P
 
P
A
 
W
S
 
S
T
 
T
T
 
T
H
 
H
A
 
E
Q
 
Q
L
 
L
D
 
S
A
 
E
E
 
D
A
 
E
L
 
R
A
 
L
A
 
A
A
 
S
G
 
G
V
 
V
G
 
T
E
 
E
D
 
D
M
 
M
I
 
I
R
|
R
L
 
I
S
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
I
E
 
E
D
 
H
C
 
V
D
 
D
D
 
D
L
 
I
I
 
I
D
 
A
D
 
D
L
 
F
K
 
E
Q
 
Q
A
 
S
L
 
F
R
 
Q
A
 
K
A
 
A

O13326 Homocysteine synthase; O-acetylhomoserine sulfhydrylase; OAH SHL; OAH sulfhydrylase; EC 2.5.1.49 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
49% identity, 98% coverage: 9:438/441 of query aligns to 8:429/429 of O13326

query
sites
O13326
F
 
F
D
 
E
T
 
T
Q
 
L
S
 
Q
L
 
L
H
 
H
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
R
 
E
P
 
P
D
 
D
P
 
A
A
 
A
T
 
T
G
 
S
A
 
S
R
 
R
A
 
A
V
 
V
P
 
P
I
 
I
H
 
Y
L
 
A
T
 
T
S
 
T
S
 
S
Y
 
Y
V
 
V
F
 
F
D
 
R
D
 
D
V
 
C
D
 
D
Q
 
H
A
 
G
A
 
G
A
 
R
L
 
L
F
 
F
N
 
G
L
 
L
E
 
Q
R
 
E
P
 
P
G
 
G
H
 
Y
I
 
I
Y
 
Y
S
 
S
R
 
R
I
 
M
S
 
M
N
 
N
P
 
P
T
 
T
V
 
A
A
 
D
V
 
V
L
 
F
E
 
E
E
 
K
R
 
R
L
 
I
A
 
A
T
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
H
G
 
G
V
 
A
G
 
A
A
 
A
V
 
I
C
 
A
T
 
T
A
 
S
S
 
S
G
 
G
Q
 
T
A
 
S
A
 
A
L
 
L
T
 
F
L
 
M
A
 
A
I
 
L
M
 
T
T
 
T
L
 
L
M
 
A
G
 
K
A
 
A
G
 
G
G
 
D
H
 
N
I
 
I
V
 
V
A
 
S
S
 
T
S
 
S
S
 
Y
I
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
T
R
 
Y
N
 
N
L
 
L
L
 
F
A
 
K
Y
 
V
T
 
T
L
 
L
P
 
P
R
 
R
F
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
T
T
 
T
S
 
K
F
 
F
V
 
V
H
 
N
P
 
G
R
 
D
D
 
D
F
 
P
D
 
N
G
 
D
I
 
L
R
 
A
A
 
A
A
 
Q
I
 
I
R
 
D
P
 
E
E
 
N
T
 
T
R
 
K
L
 
A
V
 
V
F
 
Y
G
 
V
E
 
E
V
 
S
L
 
I
G
 
G
N
 
N
P
 
P
G
 
M
L
 
Y
E
 
N
V
 
V
L
 
P
D
 
D
L
 
F
P
 
E
K
 
R
V
 
I
A
 
A
A
 
E
I
 
V
A
 
A
H
 
H
E
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
V
P
 
P
L
 
L
L
 
M
I
 
V
D
 
D
S
 
N
T
 
T
F
 
F
-
 
G
T
 
G
T
 
G
P
 
G
Y
 
Y
L
 
L
C
 
V
R
 
R
P
 
P
F
 
I
E
 
D
H
 
H
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
I
V
 
V
M
 
T
H
 
H
S
 
S
C
 
A
T
 
T
K
 
K
W
 
W
L
 
I
G
 
G
G
 
G
H
 
H
G
 
G
T
 
T
V
 
T
I
 
I
G
 
G
G
 
G
V
 
V
V
 
I
I
 
V
D
 
D
G
 
S
G
 
G
R
 
K
F
 
F
D
 
D
W
 
W
E
 
K
A
 
K
-
 
N
S
 
S
G
 
K
G
 
R
F
 
F
P
 
P
T
 
E
L
 
F
T
 
N
E
 
E
P
 
P
Y
 
H
A
 
P
G
 
G
Y
 
Y
H
 
H
G
 
G
I
 
M
D
 
V
F
 
F
A
 
T
E
 
E
E
 
T
Y
 
F
G
 
G
P
 
N
A
 
L
A
 
A
F
 
Y
I
 
A
A
 
F
R
 
A
A
 
C
R
 
R
A
 
T
E
 
Q
G
 
T
L
 
L
R
 
R
D
 
D
F
 
V
G
 
G
A
 
G
C
 
N
M
 
A
S
 
N
P
 
P
M
 
F
N
 
G
A
 
V
F
 
F
Q
 
L
I
 
L
L
 
L
Q
 
Q
G
 
G
V
 
L
E
 
E
T
 
T
L
 
L
P
 
S
L
 
L
R
 
R
M
 
M
K
 
E
G
 
R
H
 
H
I
 
V
H
 
Q
N
 
N
T
 
A
R
 
F
K
 
A
I
 
L
V
 
A
G
 
K
F
 
Y
L
 
L
E
 
E
G
 
-
E
 
-
L
 
-
Y
 
-
A
 
-
E
 
K
K
 
H
G
 
P
A
 
K
V
 
V
A
 
N
W
 
W
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
P
 
P
E
 
G
L
 
L
V
 
E
D
 
S
H
 
H
P
 
V
D
 
S
H
 
H
A
 
K
L
 
L
A
 
A
A
 
K
R
 
K
L
 
Y
L
 
L
P
 
K
Q
 
N
G
 
G
A
 
Y
G
 
G
S
 
A
I
 
V
I
 
L
S
 
S
F
 
F
G
 
G
I
 
A
R
 
K
P
 
-
G
 
-
A
 
-
Q
 
-
G
 
-
G
 
G
G
 
G
R
 
P
E
 
D
A
 
Q
G
 
S
R
 
R
R
 
K
F
 
V
I
 
V
E
 
N
S
 
A
L
 
L
S
 
K
L
 
L
F
 
A
S
 
S
H
 
Q
L
 
L
A
 
A
N
 
N
V
 
V
G
 
G
D
 
D
A
 
A
K
 
K
S
 
T
L
 
L
V
 
V
I
 
I
H
 
A
P
 
P
A
 
A
S
 
Y
T
 
T
T
 
T
H
 
H
A
 
L
Q
 
Q
L
 
L
D
 
T
A
 
D
E
 
E
A
 
E
L
 
Q
A
 
I
A
 
S
A
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
T
E
 
K
D
 
D
M
 
L
I
 
I
R
 
R
L
 
V
S
 
A
I
 
V
G
|
G
L
 
I
E
 
E
D
 
H
C
 
I
D
 
D
D
 
D
L
 
I
I
 
I
D
 
A
D
 
D
L
 
F
K
 
A
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
E
A
 
V
A
 
A

2ctzA Crystal structure of o-acetyl homoserine sulfhydrylase from thermus thermophilus hb8
48% identity, 97% coverage: 7:435/441 of query aligns to 1:420/421 of 2ctzA

query
sites
2ctzA
L
 
M
K
 
R
F
 
F
D
 
E
T
 
T
Q
 
L
S
 
Q
L
 
L
H
 
H
A
 
A
G
 
G
Q
 
Y
R
 
E
P
 
P
D
 
E
P
 
P
A
 
T
T
 
T
G
 
L
A
 
S
R
 
R
A
 
Q
V
 
V
P
 
P
I
 
I
H
 
Y
L
 
P
T
 
T
S
 
T
S
 
S
Y
 
Y
V
 
V
F
 
F
D
 
K
D
 
S
V
 
P
D
 
E
Q
 
H
A
 
A
A
 
A
A
 
N
L
 
L
F
 
F
N
 
A
L
 
L
E
 
K
R
 
E
P
 
F
G
 
G
H
 
N
I
 
I
Y
 
Y
S
 
S
R
|
R
I
 
I
S
 
M
N
 
N
P
 
P
T
 
T
V
 
V
A
 
D
V
 
V
L
 
L
E
 
E
E
 
K
R
 
R
L
 
L
A
 
A
T
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
V
 
K
G
 
A
A
 
A
V
 
L
C
 
A
T
 
T
A
 
A
S
|
S
G
|
G
Q
x
H
A
 
A
A
 
A
L
x
Q
T
 
F
L
 
L
A
 
A
I
 
L
M
 
T
T
 
T
L
 
L
M
 
A
G
 
Q
A
 
A
G
 
G
G
 
D
H
 
N
I
 
I
V
 
V
A
 
S
S
 
T
S
 
P
S
 
N
I
 
L
Y
|
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
T
R
 
F
N
 
N
L
 
Q
L
 
F
A
 
K
Y
 
V
T
 
T
L
 
L
P
 
K
R
 
R
F
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
E
T
 
V
S
 
R
F
 
F
V
 
T
-
 
S
-
 
R
-
 
E
-
 
E
H
 
R
P
 
P
R
 
E
D
 
E
F
 
F
D
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
L
A
 
A
A
 
L
I
 
T
R
 
D
P
 
E
E
 
K
T
 
T
R
 
R
L
 
A
V
 
W
F
 
W
G
 
V
E
 
E
V
 
S
L
 
I
G
 
G
N
 
N
P
 
P
G
 
A
L
 
L
E
 
N
V
 
I
L
 
P
D
 
D
L
 
L
P
 
E
K
 
A
V
 
L
A
 
A
A
 
Q
I
 
A
A
 
A
H
 
R
E
 
E
A
 
K
G
 
G
I
 
V
P
 
A
L
 
L
L
 
I
I
 
V
D
|
D
S
 
N
T
|
T
F
 
F
-
 
G
T
 
M
T
 
G
P
 
G
Y
 
Y
L
 
L
C
 
L
R
 
R
P
 
P
F
 
L
E
 
A
H
 
W
G
 
G
A
 
A
D
 
A
L
 
L
V
 
V
M
 
T
H
 
H
S
|
S
C
 
L
T
|
T
K
|
K
W
 
W
L
 
V
G
 
G
G
 
G
H
 
H
G
 
G
T
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
A
G
 
G
V
 
A
V
 
I
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
N
F
 
F
D
 
P
W
 
W
E
 
E
A
 
G
S
 
-
G
 
G
G
 
R
F
 
Y
P
 
P
T
 
L
L
 
L
T
 
T
E
 
E
P
 
P
Y
 
Q
A
 
P
G
 
G
Y
 
Y
H
 
H
G
 
G
I
 
L
D
 
R
F
 
L
A
 
T
E
 
E
E
 
A
Y
 
F
G
 
G
P
 
E
A
 
L
A
 
A
F
 
F
I
 
I
A
 
V
R
 
K
A
 
A
R
 
R
A
 
V
E
 
D
G
 
G
L
 
L
R
 
R
D
 
D
F
 
Q
G
 
G
A
 
Q
C
 
A
M
 
L
S
 
G
P
 
P
M
 
F
N
 
E
A
 
A
F
 
W
Q
 
V
I
 
V
L
 
L
Q
 
L
G
 
G
V
 
M
E
 
E
T
 
T
L
 
L
P
 
S
L
 
L
R
 
R
M
 
A
K
 
E
G
 
R
H
 
H
I
 
V
H
 
E
N
 
N
T
 
T
R
 
L
K
 
H
I
 
L
V
 
A
G
 
H
F
 
W
L
 
L
E
 
-
G
 
-
E
 
-
L
 
-
Y
 
-
A
 
L
E
 
E
K
 
Q
G
 
P
A
 
Q
V
 
V
A
 
A
W
 
W
V
 
V
S
 
N
Y
 
Y
P
 
P
E
 
G
L
 
L
V
 
P
D
 
H
H
 
H
P
 
P
D
 
H
H
 
H
A
 
D
L
 
R
A
 
A
A
 
Q
R
 
K
L
 
Y
L
 
F
P
 
K
Q
 
G
G
 
K
A
 
P
G
 
G
S
 
A
I
 
V
I
 
L
S
 
T
F
 
F
G
 
G
I
 
L
R
 
K
P
 
-
G
 
-
A
 
-
Q
 
-
G
 
-
G
 
G
G
 
G
R
 
Y
E
 
E
A
 
A
G
 
A
R
 
K
R
 
R
F
 
F
I
 
I
E
 
S
S
 
R
L
 
L
S
 
K
L
 
L
F
 
I
S
 
S
H
 
H
L
 
L
A
 
A
N
 
N
V
 
V
G
 
G
D
 
D
A
 
T
K
 
R
S
 
T
L
 
L
V
 
A
I
 
I
H
 
H
P
 
P
A
 
A
S
 
S
T
 
T
T
 
T
H
 
H
A
 
S
Q
 
Q
L
 
L
D
 
S
A
 
P
E
 
E
A
 
E
L
 
Q
A
 
A
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
S
E
 
P
D
 
E
M
 
M
I
 
V
R
 
R
L
 
L
S
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
E
D
 
H
C
 
V
D
 
E
D
 
D
L
 
L
I
 
K
D
 
A
D
 
E
L
 
L
K
 
K
Q
 
E
A
 
A
L
 
L

Q5SK88 O-acetyl-L-homoserine sulfhydrylase 1; OAH-sulfhydrylase 1; EC 2.5.1.- from Thermus thermophilus (strain ATCC 27634 / DSM 579 / HB8)
48% identity, 97% coverage: 7:435/441 of query aligns to 1:420/421 of Q5SK88

query
sites
Q5SK88
L
 
M
K
 
R
F
 
F
D
 
E
T
 
T
Q
 
L
S
 
Q
L
 
L
H
 
H
A
 
A
G
 
G
Q
 
Y
R
 
E
P
 
P
D
 
E
P
 
P
A
 
T
T
 
T
G
 
L
A
 
S
R
 
R
A
 
Q
V
 
V
P
 
P
I
 
I
H
 
Y
L
 
P
T
 
T
S
 
T
S
 
S
Y
 
Y
V
 
V
F
 
F
D
 
K
D
 
S
V
 
P
D
 
E
Q
 
H
A
 
A
A
 
A
A
 
N
L
 
L
F
 
F
N
 
A
L
 
L
E
 
K
R
 
E
P
 
F
G
 
G
H
 
N
I
 
I
Y
 
Y
S
 
S
R
 
R
I
 
I
S
 
M
N
 
N
P
 
P
T
 
T
V
 
V
A
 
D
V
 
V
L
 
L
E
 
E
E
 
K
R
 
R
L
 
L
A
 
A
T
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
V
 
K
G
 
A
A
 
A
V
 
L
C
 
A
T
 
T
A
 
A
S
 
S
G
 
G
Q
 
H
A
 
A
A
 
A
L
 
Q
T
 
F
L
 
L
A
 
A
I
 
L
M
 
T
T
 
T
L
 
L
M
 
A
G
 
Q
A
 
A
G
 
G
G
 
D
H
 
N
I
 
I
V
 
V
A
 
S
S
 
T
S
 
P
S
 
N
I
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
T
R
 
F
N
 
N
L
 
Q
L
 
F
A
 
K
Y
 
V
T
 
T
L
 
L
P
 
K
R
 
R
F
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
E
T
 
V
S
 
R
F
 
F
V
 
T
-
 
S
-
 
R
-
 
E
-
 
E
H
 
R
P
 
P
R
 
E
D
 
E
F
 
F
D
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
L
A
 
A
A
 
L
I
 
T
R
 
D
P
 
E
E
 
K
T
 
T
R
 
R
L
 
A
V
 
W
F
 
W
G
 
V
E
 
E
V
 
S
L
 
I
G
 
G
N
 
N
P
 
P
G
 
A
L
 
L
E
 
N
V
 
I
L
 
P
D
 
D
L
 
L
P
 
E
K
 
A
V
 
L
A
 
A
A
 
Q
I
 
A
A
 
A
H
 
R
E
 
E
A
 
K
G
 
G
I
 
V
P
 
A
L
 
L
L
 
I
I
 
V
D
 
D
S
 
N
T
 
T
F
 
F
-
 
G
T
 
M
T
 
G
P
 
G
Y
 
Y
L
 
L
C
 
L
R
 
R
P
 
P
F
 
L
E
 
A
H
 
W
G
 
G
A
 
A
D
 
A
L
 
L
V
 
V
M
 
T
H
 
H
S
 
S
C
 
L
T
 
T
K
|
K
W
 
W
L
 
V
G
 
G
G
 
G
H
 
H
G
 
G
T
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
A
G
 
G
V
 
A
V
 
I
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
N
F
 
F
D
 
P
W
 
W
E
 
E
A
 
G
S
 
-
G
 
G
G
 
R
F
 
Y
P
 
P
T
 
L
L
 
L
T
 
T
E
 
E
P
 
P
Y
 
Q
A
 
P
G
 
G
Y
 
Y
H
 
H
G
 
G
I
 
L
D
 
R
F
 
L
A
 
T
E
 
E
E
 
A
Y
 
F
G
 
G
P
 
E
A
 
L
A
 
A
F
 
F
I
 
I
A
 
V
R
 
K
A
 
A
R
 
R
A
 
V
E
 
D
G
 
G
L
 
L
R
 
R
D
 
D
F
 
Q
G
 
G
A
 
Q
C
 
A
M
 
L
S
 
G
P
 
P
M
 
F
N
 
E
A
 
A
F
 
W
Q
 
V
I
 
V
L
 
L
Q
 
L
G
 
G
V
 
M
E
 
E
T
 
T
L
 
L
P
 
S
L
 
L
R
 
R
M
 
A
K
 
E
G
 
R
H
 
H
I
 
V
H
 
E
N
 
N
T
 
T
R
 
L
K
 
H
I
 
L
V
 
A
G
 
H
F
 
W
L
 
L
E
 
-
G
 
-
E
 
-
L
 
-
Y
 
-
A
 
L
E
 
E
K
 
Q
G
 
P
A
 
Q
V
 
V
A
 
A
W
 
W
V
 
V
S
 
N
Y
 
Y
P
 
P
E
 
G
L
 
L
V
 
P
D
 
H
H
 
H
P
 
P
D
 
H
H
 
H
A
 
D
L
 
R
A
 
A
A
 
Q
R
 
K
L
 
Y
L
 
F
P
 
K
Q
 
G
G
 
K
A
 
P
G
 
G
S
 
A
I
 
V
I
 
L
S
 
T
F
 
F
G
 
G
I
 
L
R
 
K
P
 
-
G
 
-
A
 
-
Q
 
-
G
 
-
G
 
G
G
 
G
R
 
Y
E
 
E
A
 
A
G
 
A
R
 
K
R
 
R
F
 
F
I
 
I
E
 
S
S
 
R
L
 
L
S
 
K
L
 
L
F
 
I
S
 
S
H
 
H
L
 
L
A
 
A
N
 
N
V
 
V
G
 
G
D
 
D
A
 
T
K
 
R
S
 
T
L
 
L
V
 
A
I
 
I
H
 
H
P
 
P
A
 
A
S
 
S
T
 
T
T
 
T
H
 
H
A
 
S
Q
 
Q
L
 
L
D
 
S
A
 
P
E
 
E
A
 
E
L
 
Q
A
 
A
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
S
E
 
P
D
 
E
M
 
M
I
 
V
R
 
R
L
 
L
S
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
E
D
 
H
C
 
V
D
 
E
D
 
D
L
 
L
I
 
K
D
 
A
D
 
E
L
 
L
K
 
K
Q
 
E
A
 
A
L
 
L

4omaA The crystal structure of methionine gamma-lyase from citrobacter freundii in complex with l-cycloserine pyridoxal-5'-phosphate (see paper)
44% identity, 98% coverage: 9:439/441 of query aligns to 8:396/396 of 4omaA

query
sites
4omaA
F
 
F
D
 
N
T
 
T
Q
 
Q
S
 
I
L
 
V
H
 
H
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
R
 
Q
P
 
P
D
 
D
P
 
P
A
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
R
 
L
A
 
S
V
 
T
P
 
P
I
 
I
H
 
F
L
 
Q
T
 
T
S
 
S
S
 
T
Y
 
F
V
 
V
F
 
F
D
 
D
D
 
S
V
 
A
D
 
E
Q
 
Q
A
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
R
F
 
F
N
 
A
L
 
L
E
 
E
R
 
E
P
 
S
G
 
G
H
 
Y
I
 
I
Y
 
Y
S
 
T
R
|
R
I
 
L
S
 
G
N
 
N
P
 
P
T
 
T
V
 
T
A
 
D
V
 
A
L
 
L
E
 
E
E
 
K
R
 
K
L
 
L
A
 
A
T
 
V
L
 
L
E
 
E
G
 
R
G
 
G
V
 
E
G
 
A
A
 
G
V
 
L
C
 
A
T
 
T
A
 
A
S
 
S
G
|
G
Q
x
I
A
 
S
A
 
A
L
 
I
T
 
T
L
 
T
A
 
T
I
 
L
M
 
L
T
 
T
L
 
L
M
 
C
G
 
Q
A
 
Q
G
 
G
G
 
D
H
 
H
I
 
I
V
 
V
A
 
S
S
 
A
S
 
S
S
 
A
I
 
I
Y
|
Y
G
 
G
G
 
C
S
 
T
R
 
H
N
 
A
L
 
F
L
 
L
A
 
S
Y
 
H
T
 
S
L
 
M
P
 
P
R
 
K
F
 
F
G
 
G
I
 
I
T
 
N
T
 
V
S
 
S
F
 
F
V
 
V
H
 
D
P
 
A
R
 
A
D
 
K
F
 
P
D
 
E
G
 
E
I
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
A
I
 
M
R
 
R
P
 
P
E
 
E
T
 
T
R
 
K
L
 
V
V
 
V
F
 
Y
G
 
I
E
 
E
V
 
T
L
 
P
G
 
A
N
 
N
P
 
P
G
 
T
L
 
L
E
 
S
V
 
L
L
 
V
D
 
D
L
 
I
P
 
E
K
 
T
V
 
V
A
 
A
A
 
G
I
 
I
A
 
A
H
 
H
E
 
Q
A
 
Q
G
 
G
I
 
A
P
 
L
L
 
L
L
 
V
I
 
V
D
|
D
S
 
N
T
 
T
F
 
F
T
 
M
T
 
S
P
 
P
Y
 
Y
L
 
C
C
 
Q
R
 
Q
P
 
P
F
 
L
E
 
Q
H
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
I
V
 
V
M
 
V
H
 
H
S
|
S
C
 
V
T
|
T
K
|
K
W
 
Y
L
 
I
G
 
N
G
 
G
H
 
H
G
 
G
T
 
D
V
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
V
 
I
V
 
I
I
 
V
D
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
D
 
-
W
 
-
E
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
F
 
-
P
 
-
T
 
-
L
 
-
T
 
-
E
 
-
P
 
-
Y
 
-
A
 
-
G
 
-
Y
 
-
H
 
-
G
 
-
I
 
-
D
 
-
F
 
-
A
 
-
E
 
-
E
 
-
Y
 
-
G
 
G
P
 
K
A
 
Q
A
 
E
F
 
F
I
 
I
A
 
D
R
 
Q
A
 
A
R
 
R
A
 
F
E
 
V
G
 
G
L
 
L
R
 
K
D
 
D
F
 
I
-
 
T
G
 
G
A
 
G
C
 
C
M
 
M
S
 
S
P
 
P
M
 
F
N
 
N
A
 
A
F
 
W
Q
 
L
I
 
T
L
 
L
Q
 
R
G
 
G
V
 
V
E
 
K
T
 
T
L
 
L
P
 
G
L
 
I
R
 
R
M
 
M
K
 
E
G
 
R
H
 
H
I
 
C
H
 
E
N
 
N
T
 
A
R
 
L
K
 
K
I
 
I
V
 
A
G
 
R
F
 
F
L
 
L
E
 
E
G
 
G
E
 
H
L
 
-
Y
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
G
 
P
A
 
S
V
 
I
A
 
T
W
 
R
V
 
V
S
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
E
 
G
L
 
L
V
 
S
D
 
S
H
 
H
P
 
P
D
 
Q
H
 
Y
A
 
E
L
 
L
A
 
G
A
 
Q
R
 
R
L
 
Q
L
 
M
P
 
S
Q
 
L
G
 
-
A
 
P
G
 
G
S
 
G
I
 
I
I
 
I
S
 
S
F
 
F
G
 
E
I
 
I
R
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
Q
 
-
G
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
R
 
R
R
 
R
F
 
M
I
 
I
E
 
N
S
 
S
L
 
V
S
 
E
L
 
L
F
 
C
S
 
L
H
 
L
L
 
A
A
x
V
N
x
S
V
 
L
G
 
G
D
 
D
A
 
T
K
 
E
S
 
T
L
 
L
V
 
I
I
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
A
S
 
S
T
 
M
T
 
T
H
 
H
A
 
S
Q
 
P
L
 
V
D
 
A
A
 
P
E
 
E
A
 
E
L
 
R
A
 
L
A
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
I
G
 
T
E
 
D
D
 
G
M
 
L
I
 
I
R
|
R
L
 
L
S
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
E
D
 
D
C
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
I
I
 
I
D
 
N
D
 
D
L
 
L
K
 
E
Q
 
H
A
 
A
L
 
I
R
 
R
A
 
K
A
 
A
T
 
T

3jwbA Crystal structure of l-methionine gamma-lyase from citrobacter freundii with norleucine (see paper)
44% identity, 98% coverage: 9:439/441 of query aligns to 8:396/396 of 3jwbA

query
sites
3jwbA
F
 
F
D
 
N
T
 
T
Q
 
Q
S
 
I
L
 
V
H
 
H
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
R
 
Q
P
 
P
D
 
D
P
 
P
A
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
R
 
L
A
 
S
V
 
T
P
 
P
I
 
I
H
 
F
L
 
Q
T
 
T
S
 
S
S
 
T
Y
 
F
V
 
V
F
 
F
D
 
D
D
 
S
V
 
A
D
 
E
Q
 
Q
A
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
R
F
 
F
N
 
A
L
 
L
E
 
E
R
 
E
P
 
S
G
 
G
H
 
Y
I
 
I
Y
 
Y
S
 
T
R
|
R
I
 
L
S
 
G
N
 
N
P
 
P
T
 
T
V
 
T
A
 
D
V
 
A
L
 
L
E
 
E
E
 
K
R
 
K
L
 
L
A
 
A
T
 
V
L
 
L
E
 
E
G
 
R
G
 
G
V
 
E
G
 
A
A
 
G
V
 
L
C
 
A
T
 
T
A
 
A
S
 
S
G
 
G
Q
 
I
A
 
S
A
 
A
L
 
I
T
 
T
L
 
T
A
 
T
I
 
L
M
 
L
T
 
T
L
 
L
M
 
C
G
 
Q
A
 
Q
G
 
G
G
 
D
H
 
H
I
 
I
V
 
V
A
 
S
S
 
A
S
 
S
S
 
A
I
 
I
Y
|
Y
G
 
G
G
 
C
S
 
T
R
 
H
N
 
A
L
 
F
L
 
L
A
 
S
Y
 
H
T
 
S
L
 
M
P
 
P
R
 
K
F
 
F
G
 
G
I
 
I
T
 
N
T
 
V
S
 
S
F
 
F
V
 
V
H
 
D
P
 
A
R
 
A
D
 
K
F
 
P
D
 
E
G
 
E
I
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
A
I
 
M
R
 
R
P
 
P
E
 
E
T
 
T
R
 
K
L
 
V
V
 
V
F
 
Y
G
 
I
E
 
E
V
 
T
L
 
P
G
 
A
N
 
N
P
 
P
G
 
T
L
 
L
E
 
S
V
 
L
L
 
V
D
 
D
L
 
I
P
 
E
K
 
T
V
 
V
A
 
A
A
 
G
I
 
I
A
 
A
H
 
H
E
 
Q
A
 
Q
G
 
G
I
 
A
P
 
L
L
 
L
L
 
V
I
 
V
D
|
D
S
 
N
T
 
T
F
 
F
T
 
M
T
 
S
P
 
P
Y
 
Y
L
 
C
C
 
Q
R
 
Q
P
 
P
F
 
L
E
 
Q
H
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
I
V
 
V
M
 
V
H
 
H
S
 
S
C
 
V
T
 
T
K
|
K
W
 
Y
L
 
I
G
 
N
G
 
G
H
 
H
G
 
G
T
 
D
V
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
V
 
I
V
 
I
I
 
V
D
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
D
 
-
W
 
-
E
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
F
 
-
P
 
-
T
 
-
L
 
-
T
 
-
E
 
-
P
 
-
Y
 
-
A
 
-
G
 
-
Y
 
-
H
 
-
G
 
-
I
 
-
D
 
-
F
 
-
A
 
-
E
 
-
E
 
-
Y
 
-
G
 
G
P
 
K
A
 
Q
A
 
E
F
 
F
I
 
I
A
 
D
R
 
Q
A
 
A
R
 
R
A
 
F
E
 
V
G
 
G
L
 
L
R
 
K
D
 
D
F
 
I
-
 
T
G
 
G
A
 
G
C
 
C
M
 
M
S
 
S
P
 
P
M
 
F
N
 
N
A
 
A
F
 
W
Q
 
L
I
 
T
L
 
L
Q
 
R
G
 
G
V
 
V
E
 
K
T
 
T
L
 
L
P
 
G
L
 
I
R
 
R
M
 
M
K
 
E
G
 
R
H
 
H
I
 
C
H
 
E
N
 
N
T
 
A
R
 
L
K
 
K
I
 
I
V
 
A
G
 
R
F
 
F
L
 
L
E
 
E
G
 
G
E
 
H
L
 
-
Y
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
G
 
P
A
 
S
V
 
I
A
 
T
W
 
R
V
 
V
S
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
E
 
G
L
 
L
V
 
S
D
 
S
H
 
H
P
 
P
D
 
Q
H
 
Y
A
 
E
L
 
L
A
 
G
A
 
Q
R
 
R
L
 
Q
L
 
M
P
 
S
Q
 
L
G
 
-
A
 
P
G
 
G
S
 
G
I
 
I
I
 
I
S
 
S
F
 
F
G
 
E
I
 
I
R
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
Q
 
-
G
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
R
 
R
R
 
R
F
 
M
I
 
I
E
 
N
S
 
S
L
 
V
S
 
E
L
 
L
F
 
C
S
 
L
H
 
L
L
 
A
A
 
V
N
x
S
V
 
L
G
 
G
D
 
D
A
 
T
K
 
E
S
 
T
L
 
L
V
 
I
I
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
A
S
 
S
T
 
M
T
 
T
H
 
H
A
 
S
Q
 
P
L
 
V
D
 
A
A
 
P
E
 
E
A
 
E
L
 
R
A
 
L
A
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
I
G
 
T
E
 
D
D
 
G
M
 
L
I
 
I
R
|
R
L
 
L
S
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
E
D
 
D
C
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
I
I
 
I
D
 
N
D
 
D
L
 
L
K
 
E
Q
 
H
A
 
A
L
 
I
R
 
R
A
 
K
A
 
A
T
 
T

3jwaA Crystal structure of l-methionine gamma-lyase from citrobacter freundii with methionine phosphinate (see paper)
44% identity, 98% coverage: 9:439/441 of query aligns to 8:396/396 of 3jwaA

query
sites
3jwaA
F
 
F
D
 
N
T
 
T
Q
 
Q
S
 
I
L
 
V
H
 
H
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
R
 
Q
P
 
P
D
 
D
P
 
P
A
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
R
 
L
A
 
S
V
 
T
P
 
P
I
 
I
H
 
F
L
 
Q
T
 
T
S
 
S
S
 
T
Y
 
F
V
 
V
F
 
F
D
 
D
D
 
S
V
 
A
D
 
E
Q
 
Q
A
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
R
F
 
F
N
 
A
L
 
L
E
 
E
R
 
E
P
 
S
G
 
G
H
 
Y
I
 
I
Y
 
Y
S
 
T
R
|
R
I
 
L
S
 
G
N
 
N
P
 
P
T
 
T
V
 
T
A
 
D
V
 
A
L
 
L
E
 
E
E
 
K
R
 
K
L
 
L
A
 
A
T
 
V
L
 
L
E
 
E
G
 
R
G
 
G
V
 
E
G
 
A
A
 
G
V
 
L
C
 
A
T
 
T
A
 
A
S
 
S
G
 
G
Q
 
I
A
 
S
A
 
A
L
 
I
T
 
T
L
 
T
A
 
T
I
 
L
M
 
L
T
 
T
L
 
L
M
 
C
G
 
Q
A
 
Q
G
 
G
G
 
D
H
 
H
I
 
I
V
 
V
A
 
S
S
 
A
S
 
S
S
 
A
I
 
I
Y
|
Y
G
 
G
G
 
C
S
 
T
R
 
H
N
 
A
L
 
F
L
 
L
A
 
S
Y
 
H
T
 
S
L
 
M
P
 
P
R
 
K
F
 
F
G
 
G
I
 
I
T
 
N
T
 
V
S
 
S
F
 
F
V
 
V
H
 
D
P
 
A
R
 
A
D
 
K
F
 
P
D
 
E
G
 
E
I
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
A
I
 
M
R
 
R
P
 
P
E
 
E
T
 
T
R
 
K
L
 
V
V
 
V
F
 
Y
G
 
I
E
 
E
V
 
T
L
 
P
G
 
A
N
 
N
P
 
P
G
 
T
L
 
L
E
 
S
V
 
L
L
 
V
D
 
D
L
 
I
P
 
E
K
 
T
V
 
V
A
 
A
A
 
G
I
 
I
A
 
A
H
 
H
E
 
Q
A
 
Q
G
 
G
I
 
A
P
 
L
L
 
L
L
 
V
I
 
V
D
|
D
S
 
N
T
 
T
F
 
F
T
 
M
T
 
S
P
 
P
Y
 
Y
L
 
C
C
 
Q
R
 
Q
P
 
P
F
 
L
E
 
Q
H
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
I
V
 
V
M
 
V
H
 
H
S
 
S
C
 
V
T
 
T
K
|
K
W
 
Y
L
 
I
G
 
N
G
 
G
H
 
H
G
 
G
T
 
D
V
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
V
 
I
V
 
I
I
 
V
D
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
D
 
-
W
 
-
E
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
F
 
-
P
 
-
T
 
-
L
 
-
T
 
-
E
 
-
P
 
-
Y
 
-
A
 
-
G
 
-
Y
 
-
H
 
-
G
 
-
I
 
-
D
 
-
F
 
-
A
 
-
E
 
-
E
 
-
Y
 
-
G
 
G
P
 
K
A
 
Q
A
 
E
F
 
F
I
 
I
A
 
D
R
 
Q
A
 
A
R
 
R
A
 
F
E
 
V
G
 
G
L
 
L
R
 
K
D
 
D
F
 
I
-
 
T
G
 
G
A
 
G
C
 
C
M
 
M
S
 
S
P
 
P
M
 
F
N
 
N
A
 
A
F
 
W
Q
 
L
I
 
T
L
 
L
Q
 
R
G
 
G
V
 
V
E
 
K
T
 
T
L
 
L
P
 
G
L
 
I
R
 
R
M
 
M
K
 
E
G
 
R
H
 
H
I
 
C
H
 
E
N
 
N
T
 
A
R
 
L
K
 
K
I
 
I
V
 
A
G
 
R
F
 
F
L
 
L
E
 
E
G
 
G
E
 
H
L
 
-
Y
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
G
 
P
A
 
S
V
 
I
A
 
T
W
 
R
V
 
V
S
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
E
 
G
L
 
L
V
 
S
D
 
S
H
 
H
P
 
P
D
 
Q
H
 
Y
A
 
E
L
 
L
A
 
G
A
 
Q
R
 
R
L
 
Q
L
 
M
P
 
S
Q
 
L
G
 
-
A
 
P
G
 
G
S
 
G
I
 
I
I
 
I
S
 
S
F
 
F
G
 
E
I
 
I
R
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
Q
 
-
G
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
R
 
R
R
 
R
F
 
M
I
 
I
E
 
N
S
 
S
L
 
V
S
 
E
L
 
L
F
 
C
S
 
L
H
 
L
L
 
A
A
x
V
N
x
S
V
 
L
G
 
G
D
 
D
A
 
T
K
 
E
S
 
T
L
 
L
V
 
I
I
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
A
S
 
S
T
 
M
T
 
T
H
 
H
A
 
S
Q
 
P
L
 
V
D
 
A
A
 
P
E
 
E
A
 
E
L
 
R
A
 
L
A
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
I
G
 
T
E
 
D
D
 
G
M
 
L
I
 
I
R
|
R
L
 
L
S
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
E
D
 
D
C
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
I
I
 
I
D
 
N
D
 
D
L
 
L
K
 
E
Q
 
H
A
 
A
L
 
I
R
 
R
A
 
K
A
 
A
T
 
T

3jw9A Crystal structure of l-methionine gamma-lyase from citrobacter freundii with s-ethyl-cysteine (see paper)
44% identity, 98% coverage: 9:439/441 of query aligns to 8:396/396 of 3jw9A

query
sites
3jw9A
F
 
F
D
 
N
T
 
T
Q
 
Q
S
 
I
L
 
V
H
 
H
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
R
 
Q
P
 
P
D
 
D
P
 
P
A
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
R
 
L
A
 
S
V
 
T
P
 
P
I
 
I
H
 
F
L
 
Q
T
 
T
S
 
S
S
 
T
Y
 
F
V
 
V
F
 
F
D
 
D
D
 
S
V
 
A
D
 
E
Q
 
Q
A
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
R
F
 
F
N
 
A
L
 
L
E
 
E
R
 
E
P
 
S
G
 
G
H
 
Y
I
 
I
Y
 
Y
S
 
T
R
|
R
I
 
L
S
 
G
N
 
N
P
 
P
T
 
T
V
 
T
A
 
D
V
 
A
L
 
L
E
 
E
E
 
K
R
 
K
L
 
L
A
 
A
T
 
V
L
 
L
E
 
E
G
 
R
G
 
G
V
 
E
G
 
A
A
 
G
V
 
L
C
 
A
T
 
T
A
 
A
S
 
S
G
 
G
Q
 
I
A
 
S
A
 
A
L
 
I
T
 
T
L
 
T
A
 
T
I
 
L
M
 
L
T
 
T
L
 
L
M
 
C
G
 
Q
A
 
Q
G
 
G
G
 
D
H
 
H
I
 
I
V
 
V
A
 
S
S
 
A
S
 
S
S
 
A
I
 
I
Y
|
Y
G
 
G
G
 
C
S
 
T
R
 
H
N
 
A
L
 
F
L
 
L
A
 
S
Y
 
H
T
 
S
L
 
M
P
 
P
R
 
K
F
 
F
G
 
G
I
 
I
T
 
N
T
 
V
S
 
S
F
 
F
V
 
V
H
 
D
P
 
A
R
 
A
D
 
K
F
 
P
D
 
E
G
 
E
I
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
A
I
 
M
R
 
R
P
 
P
E
 
E
T
 
T
R
 
K
L
 
V
V
 
V
F
 
Y
G
 
I
E
 
E
V
 
T
L
 
P
G
 
A
N
 
N
P
 
P
G
 
T
L
 
L
E
 
S
V
 
L
L
 
V
D
 
D
L
 
I
P
 
E
K
 
T
V
 
V
A
 
A
A
 
G
I
 
I
A
 
A
H
 
H
E
 
Q
A
 
Q
G
 
G
I
 
A
P
 
L
L
 
L
L
 
V
I
 
V
D
|
D
S
 
N
T
 
T
F
 
F
T
 
M
T
 
S
P
 
P
Y
 
Y
L
 
C
C
 
Q
R
 
Q
P
 
P
F
 
L
E
 
Q
H
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
I
V
 
V
M
 
V
H
 
H
S
 
S
C
 
V
T
 
T
K
|
K
W
 
Y
L
 
I
G
 
N
G
 
G
H
 
H
G
 
G
T
 
D
V
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
V
 
I
V
 
I
I
 
V
D
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
D
 
-
W
 
-
E
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
F
 
-
P
 
-
T
 
-
L
 
-
T
 
-
E
 
-
P
 
-
Y
 
-
A
 
-
G
 
-
Y
 
-
H
 
-
G
 
-
I
 
-
D
 
-
F
 
-
A
 
-
E
 
-
E
 
-
Y
 
-
G
 
G
P
 
K
A
 
Q
A
 
E
F
 
F
I
 
I
A
 
D
R
 
Q
A
 
A
R
 
R
A
 
F
E
 
V
G
 
G
L
 
L
R
 
K
D
 
D
F
 
I
-
 
T
G
 
G
A
 
G
C
 
C
M
 
M
S
 
S
P
 
P
M
 
F
N
 
N
A
 
A
F
 
W
Q
 
L
I
 
T
L
 
L
Q
 
R
G
 
G
V
 
V
E
 
K
T
 
T
L
 
L
P
 
G
L
 
I
R
 
R
M
 
M
K
 
E
G
 
R
H
 
H
I
 
C
H
 
E
N
 
N
T
 
A
R
 
L
K
 
K
I
 
I
V
 
A
G
 
R
F
 
F
L
 
L
E
 
E
G
 
G
E
 
H
L
 
-
Y
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
G
 
P
A
 
S
V
 
I
A
 
T
W
 
R
V
 
V
S
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
E
 
G
L
 
L
V
 
S
D
 
S
H
 
H
P
 
P
D
 
Q
H
 
Y
A
 
E
L
 
L
A
 
G
A
 
Q
R
 
R
L
 
Q
L
 
M
P
 
S
Q
 
L
G
 
-
A
 
P
G
 
G
S
 
G
I
 
I
I
 
I
S
 
S
F
 
F
G
 
E
I
 
I
R
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
Q
 
-
G
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
R
 
R
R
 
R
F
 
M
I
 
I
E
 
N
S
 
S
L
 
V
S
 
E
L
 
L
F
 
C
S
 
L
H
 
L
L
 
A
A
x
V
N
x
S
V
 
L
G
 
G
D
 
D
A
 
T
K
 
E
S
 
T
L
 
L
V
 
I
I
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
A
S
 
S
T
 
M
T
 
T
H
 
H
A
 
S
Q
 
P
L
 
V
D
 
A
A
 
P
E
 
E
A
 
E
L
 
R
A
 
L
A
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
I
G
 
T
E
 
D
D
 
G
M
 
L
I
 
I
R
 
R
L
 
L
S
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
E
D
 
D
C
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
I
I
 
I
D
 
N
D
 
D
L
 
L
K
 
E
Q
 
H
A
 
A
L
 
I
R
 
R
A
 
K
A
 
A
T
 
T

6egrA Crystal structure of citrobacter freundii methionine gamma-lyase with v358y replacement (see paper)
44% identity, 98% coverage: 9:439/441 of query aligns to 8:396/396 of 6egrA

query
sites
6egrA
F
 
F
D
 
N
T
 
T
Q
 
Q
S
 
I
L
 
V
H
 
H
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
R
 
Q
P
 
P
D
 
D
P
 
P
A
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
R
 
L
A
 
S
V
 
T
P
 
P
I
 
I
H
 
F
L
 
Q
T
 
T
S
 
S
S
 
T
Y
 
F
V
 
V
F
 
F
D
 
D
D
 
S
V
 
A
D
 
E
Q
 
Q
A
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
R
F
 
F
N
 
A
L
 
L
E
 
E
R
 
E
P
 
S
G
 
G
H
 
Y
I
 
I
Y
 
Y
S
 
T
R
 
R
I
 
L
S
 
G
N
 
N
P
 
P
T
 
T
V
 
T
A
 
D
V
 
A
L
 
L
E
 
E
E
 
K
R
 
K
L
 
L
A
 
A
T
 
V
L
 
L
E
 
E
G
 
R
G
 
G
V
 
E
G
 
A
A
 
G
V
 
L
C
 
A
T
 
T
A
 
A
S
 
S
G
|
G
Q
x
I
A
 
S
A
 
A
L
 
I
T
 
T
L
 
T
A
 
T
I
 
L
M
 
L
T
 
T
L
 
L
M
 
C
G
 
Q
A
 
Q
G
 
G
G
 
D
H
 
H
I
 
I
V
 
V
A
 
S
S
 
A
S
 
S
S
 
A
I
 
I
Y
|
Y
G
 
G
G
 
C
S
 
T
R
 
H
N
 
A
L
 
F
L
 
L
A
 
S
Y
 
H
T
 
S
L
 
M
P
 
P
R
 
K
F
 
F
G
 
G
I
 
I
T
 
N
T
 
V
S
 
S
F
 
F
V
 
V
H
 
D
P
 
A
R
 
A
D
 
K
F
 
P
D
 
E
G
 
E
I
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
A
I
 
M
R
 
R
P
 
P
E
 
E
T
 
T
R
 
K
L
 
V
V
 
V
F
 
Y
G
 
I
E
|
E
V
 
T
L
 
P
G
 
A
N
 
N
P
 
P
G
 
T
L
 
L
E
 
S
V
 
L
L
 
V
D
 
D
L
 
I
P
 
E
K
 
T
V
 
V
A
 
A
A
 
G
I
 
I
A
 
A
H
 
H
E
 
Q
A
 
Q
G
 
G
I
 
A
P
 
L
L
 
L
L
 
V
I
 
V
D
|
D
S
 
N
T
|
T
F
|
F
T
 
M
T
 
S
P
 
P
Y
 
Y
L
 
C
C
 
Q
R
 
Q
P
 
P
F
 
L
E
 
Q
H
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
I
V
 
V
M
 
V
H
 
H
S
|
S
C
 
V
T
|
T
K
|
K
W
 
Y
L
 
I
G
 
N
G
 
G
H
 
H
G
 
G
T
 
D
V
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
V
 
I
V
 
I
I
 
V
D
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
D
 
-
W
 
-
E
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
F
 
-
P
 
-
T
 
-
L
 
-
T
 
-
E
 
-
P
 
-
Y
 
-
A
 
-
G
 
-
Y
 
-
H
 
-
G
 
-
I
 
-
D
 
-
F
 
-
A
 
-
E
 
-
E
 
-
Y
 
-
G
 
G
P
 
K
A
 
Q
A
 
E
F
 
F
I
 
I
A
 
D
R
 
Q
A
 
A
R
 
R
A
 
F
E
 
V
G
 
G
L
 
L
R
 
K
D
 
D
F
 
I
-
 
T
G
 
G
A
 
G
C
 
C
M
 
M
S
 
S
P
 
P
M
 
F
N
 
N
A
 
A
F
 
W
Q
 
L
I
 
T
L
 
L
Q
 
R
G
 
G
V
 
V
E
 
K
T
 
T
L
 
L
P
 
G
L
 
I
R
 
R
M
 
M
K
 
E
G
 
R
H
 
H
I
 
C
H
 
E
N
 
N
T
 
A
R
 
L
K
 
K
I
 
I
V
 
A
G
 
R
F
 
F
L
 
L
E
 
E
G
 
G
E
 
H
L
 
-
Y
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
G
 
P
A
 
S
V
 
I
A
 
T
W
 
R
V
 
V
S
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
E
 
G
L
 
L
V
 
S
D
 
S
H
 
H
P
 
P
D
 
Q
H
 
Y
A
 
E
L
 
L
A
 
G
A
 
Q
R
 
R
L
 
Q
L
 
M
P
 
S
Q
 
L
G
 
-
A
 
P
G
 
G
S
 
G
I
 
I
I
 
I
S
 
S
F
 
F
G
 
E
I
 
I
R
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
Q
 
-
G
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
R
 
R
R
 
R
F
 
M
I
 
I
E
 
N
S
 
S
L
 
V
S
 
E
L
 
L
F
 
C
S
 
L
H
 
L
L
 
A
A
 
V
N
 
S
V
 
L
G
 
G
D
 
D
A
 
T
K
 
E
S
 
T
L
 
L
V
 
I
I
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
A
S
 
S
T
 
M
T
 
T
H
 
H
A
 
S
Q
 
P
L
 
Y
D
 
A
A
 
P
E
 
E
A
 
E
L
 
R
A
 
L
A
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
I
G
 
T
E
 
D
D
 
G
M
 
L
I
 
I
R
 
R
L
 
L
S
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
E
D
 
D
C
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
I
I
 
I
D
 
N
D
 
D
L
 
L
K
 
E
Q
 
H
A
 
A
L
 
I
R
 
R
A
 
K
A
 
A
T
 
T

5m3zA Crystal structure of citrobacter freundii methionine gamma-lyase with c115h replacement in the complex with l-norleucine (see paper)
44% identity, 98% coverage: 9:439/441 of query aligns to 7:395/395 of 5m3zA

query
sites
5m3zA
F
 
F
D
 
N
T
 
T
Q
 
Q
S
 
I
L
 
V
H
 
H
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
R
 
Q
P
 
P
D
 
D
P
 
P
A
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
R
 
L
A
 
S
V
 
T
P
 
P
I
 
I
H
 
F
L
 
Q
T
 
T
S
 
S
S
 
T
Y
 
F
V
 
V
F
 
F
D
 
D
D
 
S
V
 
A
D
 
E
Q
 
Q
A
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
R
F
 
F
N
 
A
L
 
L
E
 
E
R
 
E
P
 
S
G
 
G
H
 
Y
I
 
I
Y
 
Y
S
 
T
R
|
R
I
 
L
S
 
G
N
 
N
P
 
P
T
 
T
V
 
T
A
 
D
V
 
A
L
 
L
E
 
E
E
 
K
R
 
K
L
 
L
A
 
A
T
 
V
L
 
L
E
 
E
G
 
R
G
 
G
V
 
E
G
 
A
A
 
G
V
 
L
C
 
A
T
 
T
A
 
A
S
 
S
G
|
G
Q
x
I
A
 
S
A
 
A
L
 
I
T
 
T
L
 
T
A
 
T
I
 
L
M
 
L
T
 
T
L
 
L
M
 
C
G
 
Q
A
 
Q
G
 
G
G
 
D
H
 
H
I
 
I
V
 
V
A
 
S
S
 
A
S
 
S
S
 
A
I
 
I
Y
|
Y
G
 
G
G
x
H
S
 
T
R
 
H
N
 
A
L
 
F
L
 
L
A
 
S
Y
 
H
T
 
S
L
 
M
P
 
P
R
 
K
F
 
F
G
 
G
I
 
I
T
 
N
T
 
V
S
 
S
F
 
F
V
 
V
H
 
D
P
 
A
R
 
A
D
 
K
F
 
P
D
 
E
G
 
E
I
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
A
I
 
M
R
 
R
P
 
P
E
 
E
T
 
T
R
 
K
L
 
V
V
 
V
F
 
Y
G
 
I
E
|
E
V
 
T
L
 
P
G
 
A
N
 
N
P
 
P
G
 
T
L
 
L
E
 
S
V
 
L
L
 
V
D
 
D
L
 
I
P
 
E
K
 
T
V
 
V
A
 
A
A
 
G
I
 
I
A
 
A
H
 
H
E
 
Q
A
 
Q
G
 
G
I
 
A
P
 
L
L
 
L
L
 
V
I
 
V
D
|
D
S
 
N
T
|
T
F
 
F
T
 
M
T
 
S
P
 
P
Y
 
Y
L
 
C
C
 
Q
R
 
Q
P
 
P
F
 
L
E
 
Q
H
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
I
V
 
V
M
 
V
H
 
H
S
|
S
C
 
V
T
|
T
K
|
K
W
 
Y
L
 
I
G
 
N
G
 
G
H
 
H
G
 
G
T
 
D
V
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
V
 
I
V
 
I
I
 
V
D
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
D
 
-
W
 
-
E
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
F
 
-
P
 
-
T
 
-
L
 
-
T
 
-
E
 
-
P
 
-
Y
 
-
A
 
-
G
 
-
Y
 
-
H
 
-
G
 
-
I
 
-
D
 
-
F
 
-
A
 
-
E
 
-
E
 
-
Y
 
-
G
 
G
P
 
K
A
 
Q
A
 
E
F
 
F
I
 
I
A
 
D
R
 
Q
A
 
A
R
 
R
A
 
F
E
 
V
G
 
G
L
 
L
R
 
K
D
 
D
F
 
I
-
 
T
G
 
G
A
 
G
C
 
C
M
 
M
S
 
S
P
 
P
M
 
F
N
 
N
A
 
A
F
 
W
Q
 
L
I
 
T
L
 
L
Q
 
R
G
 
G
V
 
V
E
 
K
T
 
T
L
 
L
P
 
G
L
 
I
R
 
R
M
 
M
K
 
E
G
 
R
H
 
H
I
 
C
H
 
E
N
 
N
T
 
A
R
 
L
K
 
K
I
 
I
V
 
A
G
 
R
F
 
F
L
 
L
E
 
E
G
 
G
E
 
H
L
 
-
Y
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
G
 
P
A
 
S
V
 
I
A
 
T
W
 
R
V
 
V
S
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
E
 
G
L
 
L
V
 
S
D
 
S
H
 
H
P
 
P
D
 
Q
H
 
Y
A
 
E
L
 
L
A
 
G
A
 
Q
R
 
R
L
 
Q
L
 
M
P
 
S
Q
 
L
G
 
-
A
 
P
G
 
G
S
 
G
I
 
I
I
 
I
S
 
S
F
 
F
G
 
E
I
 
I
R
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
Q
 
-
G
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
R
 
R
R
 
R
F
 
M
I
 
I
E
 
N
S
 
S
L
 
V
S
 
E
L
 
L
F
 
C
S
 
L
H
 
L
L
 
A
A
x
V
N
x
S
V
 
L
G
 
G
D
 
D
A
 
T
K
 
E
S
 
T
L
 
L
V
 
I
I
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
A
S
 
S
T
 
M
T
 
T
H
 
H
A
 
S
Q
 
P
L
 
V
D
 
A
A
 
P
E
 
E
A
 
E
L
 
R
A
 
L
A
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
I
G
 
T
E
 
D
D
 
G
M
 
L
I
 
I
R
|
R
L
 
L
S
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
E
D
 
D
C
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
I
I
 
I
D
 
N
D
 
D
L
 
L
K
 
E
Q
 
H
A
 
A
L
 
I
R
 
R
A
 
K
A
 
A
T
 
T

4hf8A Crystal structure of l-methionine gamma-lyase from citrobacter freundii with glycine (see paper)
43% identity, 98% coverage: 9:439/441 of query aligns to 8:396/396 of 4hf8A

query
sites
4hf8A
F
 
F
D
 
N
T
 
T
Q
 
Q
S
 
I
L
 
V
H
 
H
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
R
 
Q
P
 
P
D
 
D
P
 
P
A
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
R
 
L
A
 
S
V
 
T
P
 
P
I
 
I
H
 
F
L
 
Q
T
 
T
S
 
S
S
 
T
Y
 
F
V
 
V
F
 
F
D
 
D
D
 
S
V
 
A
D
 
E
Q
 
Q
A
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
R
F
 
F
N
 
A
L
 
L
E
 
E
R
 
E
P
 
S
G
 
G
H
 
Y
I
 
I
Y
 
Y
S
 
T
R
|
R
I
 
L
S
 
G
N
 
N
P
 
P
T
 
T
V
 
T
A
 
D
V
 
A
L
 
L
E
 
E
E
 
K
R
 
K
L
 
L
A
 
A
T
 
V
L
 
L
E
 
E
G
 
R
G
 
G
V
 
E
G
 
A
A
 
G
V
 
L
C
 
A
T
 
T
A
 
A
S
 
S
G
|
G
Q
x
I
A
 
S
A
 
A
L
 
I
T
 
T
L
 
T
A
 
T
I
 
L
M
 
L
T
 
T
L
 
L
M
 
C
G
 
Q
A
 
Q
G
 
G
G
 
D
H
 
H
I
 
I
V
 
V
A
 
S
S
 
A
S
 
S
S
 
A
I
 
I
Y
|
Y
G
 
G
G
 
C
S
 
T
R
 
H
N
 
A
L
 
F
L
 
L
A
 
S
Y
 
H
T
 
S
L
 
M
P
 
P
R
 
K
F
 
F
G
 
G
I
 
I
T
 
N
T
 
V
S
 
R
F
 
F
V
 
V
H
 
D
P
 
A
R
 
A
D
 
K
F
 
P
D
 
E
G
 
E
I
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
A
I
 
M
R
 
R
P
 
P
E
 
E
T
 
T
R
 
K
L
 
V
V
 
V
F
 
Y
G
 
I
E
|
E
V
 
T
L
 
P
G
 
A
N
|
N
P
 
P
G
 
T
L
 
L
E
 
S
V
 
L
L
 
V
D
 
D
L
 
I
P
 
E
K
 
T
V
 
V
A
 
A
A
 
G
I
 
I
A
 
A
H
 
H
E
 
Q
A
 
Q
G
 
G
I
 
A
P
 
L
L
 
L
L
 
V
I
 
V
D
|
D
S
 
N
T
 
T
F
 
F
T
 
M
T
 
S
P
 
P
Y
 
Y
L
 
C
C
 
Q
R
 
Q
P
 
P
F
 
L
E
 
Q
H
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
I
V
 
V
M
 
V
H
 
H
S
|
S
C
 
V
T
 
T
K
|
K
W
 
Y
L
 
I
G
 
N
G
 
G
H
 
H
G
 
G
T
 
D
V
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
V
 
I
V
 
I
I
 
V
D
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
D
 
-
W
 
-
E
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
F
 
-
P
 
-
T
 
-
L
 
-
T
 
-
E
 
-
P
 
-
Y
 
-
A
 
-
G
 
-
Y
 
-
H
 
-
G
 
-
I
 
-
D
 
-
F
 
-
A
 
-
E
 
-
E
 
-
Y
 
-
G
 
G
P
 
K
A
 
Q
A
 
E
F
 
F
I
 
I
A
 
D
R
 
Q
A
 
A
R
 
R
A
 
F
E
 
V
G
 
G
L
 
L
R
 
K
D
 
D
F
 
I
-
 
T
G
 
G
A
 
G
C
 
C
M
 
M
S
 
S
P
 
P
M
 
F
N
 
N
A
 
A
F
 
W
Q
 
L
I
 
T
L
 
L
Q
 
R
G
 
G
V
 
V
E
 
K
T
 
T
L
 
L
P
 
G
L
 
I
R
 
R
M
 
M
K
 
E
G
 
R
H
 
H
I
 
C
H
 
E
N
 
N
T
 
A
R
 
L
K
 
K
I
 
I
V
 
A
G
 
R
F
 
F
L
 
L
E
 
E
G
 
G
E
 
H
L
 
-
Y
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
G
 
P
A
 
S
V
 
I
A
 
T
W
 
R
V
 
V
S
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
E
 
G
L
 
L
V
 
S
D
 
S
H
 
H
P
 
P
D
 
Q
H
 
Y
A
 
E
L
 
L
A
 
G
A
 
Q
R
 
R
L
 
Q
L
 
M
P
 
S
Q
 
L
G
 
-
A
 
P
G
 
G
S
 
G
I
 
I
I
 
I
S
 
S
F
 
F
G
 
E
I
 
I
R
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
Q
 
-
G
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
R
 
R
R
 
R
F
 
M
I
 
I
E
 
N
S
 
S
L
 
V
S
 
E
L
 
L
F
 
C
S
 
L
H
 
L
L
 
A
A
 
V
N
x
S
V
 
L
G
 
G
D
 
D
A
 
T
K
 
E
S
 
T
L
 
L
V
 
I
I
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
A
S
 
S
T
 
M
T
 
T
H
 
H
A
 
S
Q
 
P
L
 
V
D
 
A
A
 
P
E
 
E
A
 
E
L
 
R
A
 
L
A
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
I
G
 
T
E
 
D
D
 
G
M
 
L
I
 
I
R
|
R
L
 
L
S
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
E
D
 
D
C
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
I
I
 
I
D
 
N
D
 
D
L
 
L
K
 
E
Q
 
H
A
 
A
L
 
I
R
 
R
A
 
K
A
 
A
T
 
T

3mkjA Methionine gamma-lyase from citrobacter freundii with pyridoximine-5'- phosphate (see paper)
42% identity, 98% coverage: 9:439/441 of query aligns to 8:385/386 of 3mkjA

query
sites
3mkjA
F
 
F
D
 
N
T
 
T
Q
 
Q
S
 
I
L
 
V
H
 
H
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
R
 
Q
P
 
P
D
 
D
P
 
P
A
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
R
 
L
A
 
S
V
 
T
P
 
P
I
 
I
H
 
F
L
 
Q
T
 
T
S
 
S
S
 
T
Y
 
F
V
 
V
F
 
F
D
 
D
D
 
S
V
 
A
D
 
E
Q
 
Q
A
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
R
F
 
F
N
 
-
L
 
-
E
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
H
 
-
I
 
-
Y
 
-
S
 
-
R
 
-
I
 
L
S
 
G
N
 
N
P
 
P
T
 
T
V
 
T
A
 
D
V
 
A
L
 
L
E
 
E
E
 
K
R
 
K
L
 
L
A
 
A
T
 
V
L
 
L
E
 
E
G
 
R
G
 
G
V
 
E
G
 
A
A
 
G
V
 
L
C
 
A
T
 
T
A
 
A
S
 
S
G
|
G
Q
x
I
A
 
S
A
 
A
L
 
I
T
 
T
L
 
T
A
 
T
I
 
L
M
 
L
T
 
T
L
 
L
M
 
C
G
 
Q
A
 
Q
G
 
G
G
 
D
H
 
H
I
 
I
V
 
V
A
 
S
S
 
A
S
 
S
S
 
A
I
 
I
Y
|
Y
G
 
G
G
 
C
S
 
T
R
 
H
N
 
A
L
 
F
L
 
L
A
 
S
Y
 
H
T
 
S
L
 
M
P
 
P
R
 
K
F
 
F
G
 
G
I
 
I
T
 
N
T
 
V
S
 
S
F
 
F
V
 
V
H
 
D
P
 
A
R
 
A
D
 
K
F
 
P
D
 
E
G
 
E
I
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
A
I
 
M
R
 
R
P
 
P
E
 
E
T
 
T
R
 
K
L
 
V
V
 
V
F
 
Y
G
 
I
E
|
E
V
 
T
L
 
P
G
 
A
N
 
N
P
 
P
G
 
T
L
 
L
E
 
S
V
 
L
L
 
V
D
 
D
L
 
I
P
 
E
K
 
T
V
 
V
A
 
A
A
 
G
I
 
I
A
 
A
H
 
H
E
 
Q
A
 
Q
G
 
G
I
 
A
P
 
L
L
 
L
L
 
V
I
 
V
D
|
D
S
 
N
T
 
T
F
|
F
T
 
M
T
 
S
P
 
P
Y
 
Y
L
 
C
C
 
Q
R
 
Q
P
 
P
F
 
L
E
 
Q
H
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
I
V
 
V
M
 
V
H
 
H
S
|
S
C
 
V
T
|
T
K
|
K
W
 
Y
L
 
I
G
 
N
G
 
G
H
 
H
G
 
G
T
 
D
V
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
V
 
I
V
 
I
I
 
V
D
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
D
 
-
W
 
-
E
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
F
 
-
P
 
-
T
 
-
L
 
-
T
 
-
E
 
-
P
 
-
Y
 
-
A
 
-
G
 
-
Y
 
-
H
 
-
G
 
-
I
 
-
D
 
-
F
 
-
A
 
-
E
 
-
E
 
-
Y
 
-
G
 
G
P
 
K
A
 
Q
A
 
E
F
 
F
I
 
I
A
 
D
R
 
Q
A
 
A
R
 
R
A
 
F
E
 
V
G
 
G
L
 
L
R
 
K
D
 
D
F
 
I
-
 
T
G
 
G
A
 
G
C
 
C
M
 
M
S
 
S
P
 
P
M
 
F
N
 
N
A
 
A
F
 
W
Q
 
L
I
 
T
L
 
L
Q
 
R
G
 
G
V
 
V
E
 
K
T
 
T
L
 
L
P
 
G
L
 
I
R
 
R
M
 
M
K
 
E
G
 
R
H
 
H
I
 
C
H
 
E
N
 
N
T
 
A
R
 
L
K
 
K
I
 
I
V
 
A
G
 
R
F
 
F
L
 
L
E
 
E
G
 
G
E
 
H
L
 
-
Y
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
G
 
P
A
 
S
V
 
I
A
 
T
W
 
R
V
 
V
S
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
E
 
G
L
 
L
V
 
S
D
 
S
H
 
H
P
 
P
D
 
Q
H
 
Y
A
 
E
L
 
L
A
 
G
A
 
Q
R
 
R
L
 
Q
L
 
M
P
 
S
Q
 
L
G
 
-
A
 
P
G
 
G
S
 
G
I
 
I
I
 
I
S
 
S
F
 
F
G
 
E
I
 
I
R
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
Q
 
-
G
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
R
 
R
R
 
R
F
 
M
I
 
I
E
 
N
S
 
S
L
 
V
S
 
E
L
 
L
F
 
C
S
 
L
H
 
L
L
 
A
A
 
V
N
 
S
V
 
L
G
 
G
D
 
D
A
 
T
K
 
E
S
 
T
L
 
L
V
 
I
I
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
A
S
 
S
T
 
M
T
 
T
H
 
H
A
 
S
Q
 
P
L
 
V
D
 
A
A
 
P
E
 
E
A
 
E
L
 
R
A
 
L
A
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
I
G
 
T
E
 
D
D
 
G
M
 
L
I
 
I
R
 
R
L
 
L
S
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
E
D
 
D
C
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
I
I
 
I
D
 
N
D
 
D
L
 
L
K
 
E
Q
 
H
A
 
A
L
 
I
R
 
R
A
 
K
A
 
A
T
 
T

8ovhA Crystal structure of o-acetyl-l-homoserine sulfhydrolase from saccharomyces cerevisiae in complex with pyridoxal-5'-phosphate (see paper)
42% identity, 98% coverage: 9:441/441 of query aligns to 5:397/400 of 8ovhA

query
sites
8ovhA
F
 
F
D
 
D
T
 
T
Q
 
V
S
 
Q
L
 
L
H
 
H
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
R
 
E
P
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
T
 
-
G
 
N
A
 
S
R
 
R
A
 
A
V
 
V
P
 
P
I
 
I
H
 
Y
L
 
A
T
 
T
S
 
T
S
 
S
Y
 
Y
V
 
-
F
 
-
D
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
Q
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
F
 
-
N
 
-
L
 
-
E
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
H
 
-
I
 
-
Y
 
-
S
 
-
R
 
-
I
 
-
S
 
-
N
 
N
P
 
P
T
 
T
V
 
S
A
 
N
V
 
V
L
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
R
L
 
I
A
 
A
T
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
V
 
A
G
 
A
A
 
A
V
 
L
C
 
A
T
 
V
A
 
S
S
 
S
G
|
G
Q
|
Q
A
 
A
A
 
A
L
x
Q
T
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
I
M
 
Q
T
 
G
L
 
L
M
 
A
G
 
H
A
 
T
G
 
G
G
 
D
H
 
N
I
 
I
V
 
V
A
 
S
S
 
T
S
 
S
S
 
Y
I
 
L
Y
|
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
T
R
 
Y
N
 
N
L
 
Q
L
 
F
A
 
K
Y
 
I
T
 
S
L
 
F
P
 
K
R
 
R
F
 
F
G
 
G
I
 
I
T
 
E
T
 
A
S
 
R
F
 
F
V
 
V
H
 
E
P
 
G
R
 
D
D
 
N
F
 
P
D
 
E
G
 
E
I
 
F
R
 
E
A
 
K
A
 
V
I
 
F
R
 
D
P
 
E
E
 
R
T
 
T
R
 
K
L
 
A
V
 
V
F
 
Y
G
 
L
E
 
E
V
 
T
L
 
I
G
 
G
N
 
N
P
 
P
G
 
K
L
 
Y
E
 
N
V
 
V
L
 
P
D
 
D
L
 
F
P
 
E
K
 
K
V
 
I
A
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
H
 
H
E
 
K
A
 
H
G
 
G
I
 
I
P
 
P
L
 
V
L
 
V
I
 
V
D
|
D
S
 
N
T
|
T
F
 
F
-
 
G
T
 
A
T
 
G
P
 
G
Y
 
Y
L
 
F
C
 
C
R
 
Q
P
 
P
F
 
I
E
 
K
H
 
Y
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
I
V
 
V
M
 
T
H
 
H
S
|
S
C
 
A
T
|
T
K
|
K
W
 
W
L
 
I
G
 
G
G
 
G
H
 
H
G
 
G
T
 
T
V
 
T
I
 
I
G
 
G
G
 
G
V
 
I
V
 
I
I
 
V
D
 
D
G
 
S
G
 
G
R
 
K
F
 
F
D
 
P
W
 
W
-
 
K
E
 
D
A
 
Y
S
 
P
G
 
E
G
 
K
F
 
F
P
 
P
T
 
Q
L
 
F
T
 
S
E
 
Q
P
 
P
Y
 
A
A
 
E
G
 
G
Y
 
Y
H
 
H
G
 
G
I
 
T
D
 
I
F
 
Y
A
 
N
E
 
E
E
 
A
Y
 
Y
G
 
G
P
 
N
A
 
L
A
 
A
F
 
Y
I
 
I
A
 
V
R
 
H
A
 
V
R
 
R
A
 
T
E
 
E
G
 
L
L
 
L
R
 
R
D
 
D
F
 
L
G
 
G
A
 
P
C
 
L
M
 
M
S
 
N
P
 
P
M
 
F
N
 
A
A
 
S
F
 
F
Q
 
L
I
 
L
L
 
L
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
E
 
E
T
 
T
L
 
L
P
 
S
L
 
L
R
 
R
M
 
A
K
 
E
G
 
R
H
 
H
I
 
G
H
 
E
N
 
N
T
 
A
R
 
L
K
 
K
I
 
L
V
 
A
G
 
K
F
 
W
L
 
L
E
 
E
G
 
Q
E
 
S
L
 
P
Y
 
Y
A
 
-
E
 
-
K
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
V
A
 
S
W
 
W
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
P
 
P
E
 
G
L
 
L
V
 
A
D
 
S
H
 
H
P
 
S
D
 
H
H
 
H
A
 
E
L
 
N
A
 
A
A
 
K
R
 
K
L
 
Y
L
 
L
P
 
S
Q
 
N
G
 
G
A
 
F
G
 
G
S
 
G
I
 
V
I
 
L
S
 
S
F
 
F
G
 
G
I
 
V
R
 
K
-
 
D
-
 
L
P
 
P
G
 
N
A
 
A
Q
 
D
G
 
K
G
 
E
G
 
T
-
 
D
-
 
P
-
 
F
R
 
K
E
 
L
A
 
S
G
 
G
R
 
A
R
 
Q
F
 
V
I
 
V
E
 
D
S
 
N
L
 
L
S
 
K
L
 
L
F
 
A
S
 
S
H
 
N
L
 
L
A
 
A
N
 
N
V
 
V
G
 
G
D
 
D
A
 
A
K
 
K
S
 
T
L
 
L
V
 
V
I
 
I
H
 
A
P
 
P
A
 
Y
S
 
F
T
 
T
T
 
T
H
 
-
A
 
-
Q
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
G
V
 
V
G
 
T
E
 
K
D
 
D
M
 
L
I
 
I
R
 
R
L
 
V
S
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
I
E
 
E
D
 
F
C
 
I
D
 
D
D
 
D
L
 
I
I
 
I
D
 
A
D
 
D
L
 
F
K
 
Q
Q
 
Q
A
 
S
L
 
F
R
 
E
A
 
T
A
 
V
T
 
F
K
 
A
G
 
G

5dx5A Crystal structure of methionine gamma-lyase from clostridium sporogenes (see paper)
36% identity, 99% coverage: 5:440/441 of query aligns to 4:399/399 of 5dx5A

query
sites
5dx5A
K
 
K
F
 
K
L
 
M
K
 
G
F
 
F
D
 
A
T
 
T
Q
 
K
S
 
A
L
 
I
H
 
H
A
 
G
G
 
G
Q
 
H
R
 
I
P
 
G
D
 
D
P
 
K
A
 
Q
T
 
F
G
 
G
A
 
S
R
 
L
A
 
A
V
 
T
P
 
P
I
 
I
H
 
Y
L
 
Q
T
 
T
S
 
S
S
 
T
Y
 
F
V
 
I
F
 
F
D
 
D
D
 
S
V
 
A
D
 
E
Q
 
Q
A
 
G
A
 
G
A
 
R
L
 
R
F
 
F
N
 
A
L
 
G
E
 
E
R
 
E
P
 
S
G
 
G
H
 
Y
I
 
I
Y
|
Y
S
 
S
R
|
R
I
 
L
S
 
G
N
 
N
P
 
P
T
 
T
V
 
S
A
 
T
V
 
E
L
 
V
E
 
E
E
 
N
R
 
K
L
 
L
A
 
A
T
 
L
L
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
V
 
E
G
 
A
A
 
A
V
 
V
C
 
V
T
 
A
A
 
A
S
|
S
G
|
G
Q
x
M
A
 
G
A
 
A
L
 
I
T
 
A
L
 
A
A
 
S
I
 
L
M
 
W
T
 
S
L
 
A
M
 
L
G
 
K
A
 
S
G
 
G
G
 
D
H
 
H
I
 
V
V
 
V
A
 
A
S
 
S
S
 
D
S
 
T
I
 
L
Y
|
Y
G
 
G
G
 
C
S
 
T
R
 
F
N
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
N
Y
 
H
T
 
G
L
 
L
P
 
T
R
 
R
F
 
Y
G
 
G
I
 
V
T
 
E
T
 
V
S
 
T
F
 
F
V
 
V
H
 
D
P
 
V
R
 
S
D
 
N
F
 
L
D
 
D
G
 
E
I
 
V
R
 
K
A
 
N
A
 
A
I
 
L
R
 
K
P
 
P
E
 
N
T
 
T
R
 
K
L
 
V
V
 
V
F
 
Y
G
 
L
E
 
E
V
 
T
L
 
P
G
 
A
N
 
N
P
 
P
G
 
T
L
 
L
E
 
K
V
 
V
L
 
T
D
 
D
L
 
I
P
 
R
K
 
K
V
 
I
A
 
S
A
 
N
I
 
M
A
 
V
H
 
H
E
 
E
A
 
S
G
 
N
I
 
K
P
 
E
-
 
C
-
 
F
L
 
V
L
 
F
I
 
V
D
|
D
S
 
N
T
 
T
F
|
F
T
 
C
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
L
 
I
C
 
Q
R
 
R
P
 
P
F
 
L
E
 
E
H
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
V
V
 
V
M
 
V
H
 
H
S
|
S
C
 
A
T
|
T
K
|
K
W
 
Y
L
 
L
G
 
N
G
 
G
H
 
H
G
 
G
T
 
D
V
 
V
I
 
I
G
 
A
G
 
G
V
 
F
V
 
A
I
 
V
D
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
D
 
-
W
 
-
E
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
F
 
-
P
 
-
T
 
-
L
 
-
T
 
-
E
 
-
P
 
-
Y
 
-
A
 
-
G
 
-
Y
 
-
H
 
-
G
 
-
I
 
-
D
 
-
F
 
-
A
 
-
E
 
-
E
 
-
Y
 
-
G
 
G
P
 
K
A
 
E
A
 
E
F
 
F
I
 
I
A
 
N
R
 
Q
A
 
V
R
 
K
A
 
L
E
 
F
G
 
G
L
 
I
R
 
K
D
 
D
F
 
M
-
 
T
G
 
G
A
 
S
C
 
V
M
 
T
S
 
G
P
 
P
M
 
F
N
 
E
A
 
S
F
 
F
Q
 
L
I
 
I
L
 
I
Q
 
R
G
 
G
V
 
M
E
 
K
T
 
T
L
 
L
P
 
Q
L
 
L
R
 
R
M
 
M
K
 
E
G
 
K
H
 
H
I
 
C
H
 
K
N
 
N
T
 
A
R
 
M
K
 
E
I
 
V
V
 
A
G
 
K
F
 
F
L
 
L
E
 
E
G
 
S
E
 
H
L
 
P
Y
 
A
A
 
V
E
 
E
K
 
K
G
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
W
 
-
V
 
V
S
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
E
 
G
L
 
L
V
 
E
D
 
S
H
 
F
P
 
K
D
 
Y
H
 
Y
A
 
Q
L
 
L
A
 
-
A
 
A
R
 
R
L
 
E
L
 
Q
P
 
M
Q
 
K
G
 
L
A
 
P
G
 
G
S
 
A
I
 
M
I
 
I
S
 
S
F
 
F
G
 
E
I
 
L
R
 
K
P
 
-
G
 
-
A
 
-
Q
 
-
G
 
-
G
 
G
G
 
G
R
 
V
E
 
E
A
 
E
G
 
G
R
 
K
R
 
I
F
 
V
I
 
M
E
 
N
S
 
N
L
 
V
S
 
K
L
 
L
F
 
A
S
 
T
H
 
L
L
 
A
A
 
V
N
 
S
V
 
L
G
 
G
D
 
D
A
 
S
K
 
E
S
 
T
L
 
L
V
 
I
I
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
A
S
 
S
T
 
M
T
 
T
H
 
H
A
 
S
Q
 
P
L
 
Y
D
 
T
A
 
A
E
 
E
A
 
E
L
 
R
A
 
K
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
I
G
 
S
E
 
D
D
 
G
M
 
L
I
 
V
R
 
R
L
 
L
S
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
E
D
 
D
C
 
A
D
 
E
D
 
D
L
 
I
I
 
I
D
 
D
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
D
A
 
L
A
 
I
T
 
V
K
 
K

1pg8A Crystal structure of l-methionine alpha-, gamma-lyase
37% identity, 98% coverage: 5:438/441 of query aligns to 6:397/398 of 1pg8A

query
sites
1pg8A
K
 
K
F
 
L
L
 
P
K
 
G
F
 
F
D
 
A
T
 
T
Q
 
R
S
 
A
L
 
I
H
 
H
A
 
H
G
 
G
Q
 
Y
R
 
D
P
 
P
D
 
Q
P
 
D
A
 
H
T
 
G
G
 
G
A
 
A
R
 
L
A
 
V
V
 
P
P
 
P
I
 
V
H
 
Y
L
 
Q
T
 
T
S
 
A
S
 
T
Y
 
F
V
 
T
F
 
F
D
 
P
D
 
T
V
 
V
D
 
E
Q
 
Y
A
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
C
F
 
F
N
 
A
L
 
G
E
 
E
R
 
Q
P
 
A
G
 
G
H
 
H
I
 
F
Y
|
Y
S
 
S
R
|
R
I
 
I
S
 
S
N
 
N
P
 
P
T
 
T
V
 
L
A
 
N
V
 
L
L
 
L
E
 
E
E
 
A
R
 
R
L
 
M
A
 
A
T
 
S
L
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
V
 
E
G
 
A
A
 
G
V
 
L
C
 
A
T
 
L
A
 
A
S
|
S
G
|
G
Q
x
M
A
 
G
A
 
A
L
 
I
T
 
T
L
 
S
A
 
T
I
 
L
M
 
W
T
 
T
L
 
L
M
 
L
G
 
R
A
 
P
G
 
G
G
 
D
H
 
E
I
 
V
V
 
L
A
 
L
S
 
G
S
 
N
S
 
T
I
 
L
Y
|
Y
G
 
G
G
 
C
S
 
T
R
 
F
N
 
A
L
 
F
L
 
L
A
 
H
Y
 
H
T
 
G
L
 
I
P
 
G
R
 
E
F
 
F
G
 
G
I
 
V
T
 
K
T
 
L
S
 
R
F
 
H
V
 
V
H
 
D
P
 
M
R
 
A
D
 
D
F
 
L
D
 
Q
G
 
A
I
 
L
R
 
E
A
 
A
A
 
A
I
 
M
R
 
T
P
 
P
E
 
A
T
 
T
R
 
R
L
 
V
V
 
I
F
 
Y
G
 
F
E
 
E
V
 
S
L
 
P
G
 
A
N
 
N
P
 
P
G
 
N
L
 
M
E
 
H
V
 
M
L
 
A
D
 
D
L
 
I
P
 
A
K
 
G
V
 
V
A
 
A
A
 
K
I
 
I
A
 
A
H
 
R
E
 
K
A
 
H
G
 
G
I
 
A
P
 
T
L
 
V
L
 
V
I
 
V
D
|
D
S
 
N
T
 
T
F
 
Y
T
 
C
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
C
 
Q
R
 
R
P
 
P
F
 
L
E
 
E
H
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
L
V
 
V
M
 
V
H
 
H
S
|
S
C
 
A
T
|
T
K
|
K
W
 
Y
L
 
L
G
 
S
G
 
G
H
 
H
G
 
G
T
 
D
V
 
I
I
 
T
G
 
A
G
 
G
V
 
I
V
 
V
I
 
V
D
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
D
 
-
W
 
-
E
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
F
 
-
P
 
-
T
 
-
L
 
-
T
 
-
E
 
-
P
 
-
Y
 
-
A
 
-
G
 
-
Y
 
-
H
 
-
G
 
-
I
 
-
D
 
-
F
 
-
A
 
-
E
 
-
E
 
-
Y
 
-
G
 
G
P
 
S
A
 
Q
A
 
A
F
 
L
I
 
V
A
 
D
R
 
R
A
 
I
R
 
R
A
 
L
E
 
Q
G
 
G
L
 
L
R
 
K
D
 
D
F
 
M
-
 
T
G
 
G
A
 
A
C
 
V
M
 
L
S
 
S
P
 
P
M
 
H
N
 
D
A
 
A
F
 
A
Q
 
L
I
 
L
L
 
M
Q
 
R
G
 
G
V
 
I
E
 
K
T
 
T
L
 
L
P
 
N
L
 
L
R
 
R
M
 
M
K
 
D
G
 
R
H
 
H
I
 
C
H
 
A
N
 
N
T
 
A
R
 
Q
K
 
V
I
 
L
V
 
A
G
 
E
F
 
F
L
 
L
E
 
-
G
 
-
E
 
-
L
 
-
Y
 
-
A
 
A
E
 
R
K
 
Q
G
 
P
A
 
Q
V
 
V
A
 
E
W
 
L
V
 
I
S
 
H
Y
 
Y
P
 
P
E
 
G
L
 
L
V
 
A
D
 
S
H
 
F
P
 
P
D
 
Q
H
 
Y
A
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
R
R
 
Q
L
 
Q
L
 
M
P
 
S
Q
 
Q
G
 
-
A
 
P
G
 
G
S
 
G
I
 
M
I
 
I
S
 
A
F
 
F
G
 
E
I
 
L
R
 
K
P
 
-
G
 
-
A
 
-
Q
 
-
G
 
-
G
 
G
G
 
G
R
 
I
E
 
G
A
 
A
G
 
G
R
 
R
R
 
R
F
 
F
I
 
M
E
 
N
S
 
A
L
 
L
S
 
Q
L
 
L
F
 
F
S
 
S
H
 
R
L
 
A
A
 
V
N
 
S
V
 
L
G
 
G
D
 
D
A
 
A
K
 
E
S
 
S
L
 
L
V
 
A
I
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
A
S
 
S
T
 
M
T
 
T
H
 
H
A
 
S
Q
 
S
L
 
Y
D
 
T
A
 
P
E
 
E
A
 
E
L
 
R
A
 
A
A
 
H
A
 
Y
G
 
G
V
 
I
G
 
S
E
 
E
D
 
G
M
 
L
I
 
V
R
 
R
L
 
L
S
 
S
I
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
E
D
 
D
C
 
I
D
 
D
D
 
D
L
 
L
I
 
L
D
 
A
D
 
D
L
 
V
K
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
K
A
 
A
A
 
S

Query Sequence

>WP_012973235.1 NCBI__GCF_000010725.1:WP_012973235.1
MAGAKFLKFDTQSLHAGQRPDPATGARAVPIHLTSSYVFDDVDQAAALFNLERPGHIYSR
ISNPTVAVLEERLATLEGGVGAVCTASGQAALTLAIMTLMGAGGHIVASSSIYGGSRNLL
AYTLPRFGITTSFVHPRDFDGIRAAIRPETRLVFGEVLGNPGLEVLDLPKVAAIAHEAGI
PLLIDSTFTTPYLCRPFEHGADLVMHSCTKWLGGHGTVIGGVVIDGGRFDWEASGGFPTL
TEPYAGYHGIDFAEEYGPAAFIARARAEGLRDFGACMSPMNAFQILQGVETLPLRMKGHI
HNTRKIVGFLEGELYAEKGAVAWVSYPELVDHPDHALAARLLPQGAGSIISFGIRPGAQG
GGREAGRRFIESLSLFSHLANVGDAKSLVIHPASTTHAQLDAEALAAAGVGEDMIRLSIG
LEDCDDLIDDLKQALRAATKG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory