SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012973906.1 NCBI__GCF_000010725.1:WP_012973906.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P06721 Cystathionine beta-lyase MetC; CBL; CL; Beta-cystathionase MetC; Cysteine desulfhydrase MetC; CD; Cysteine lyase MetC; Cysteine-S-conjugate beta-lyase MetC; EC 4.4.1.13; EC 4.4.1.28 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
47% identity, 99% coverage: 1:388/392 of query aligns to 1:394/395 of P06721

query
sites
P06721
M
 
M
K
 
A
D
 
D
V
 
K
T
 
K
K
 
L
D
 
D
T
 
T
I
 
Q
L
 
L
V
 
V
H
 
N
A
 
A
G
 
G
R
 
R
D
 
S
P
 
K
R
 
K
N
 
Y
N
 
T
H
 
L
G
 
G
I
 
A
V
 
V
N
 
N
P
 
S
P
 
V
V
 
I
Y
 
Q
H
 
R
C
 
A
S
 
S
T
 
S
V
 
L
L
 
V
F
 
F
P
 
D
T
 
S
L
 
V
D
 
E
A
 
A
L
 
K
E
 
K
E
 
H
A
 
A
D
 
T
R
 
R
N
 
N
M
 
R
L
 
A
T
 
N
-
 
G
S
 
E
V
 
L
N
 
F
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
M
 
R
G
 
G
T
 
T
P
 
L
T
 
T
T
 
H
F
 
F
A
 
S
F
 
L
E
 
Q
E
 
Q
A
 
A
A
 
M
A
 
C
A
 
E
L
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
Y
 
A
R
 
G
S
 
C
V
 
V
N
 
L
T
 
F
G
 
P
S
 
C
G
 
G
L
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
V
A
 
A
V
 
N
A
 
S
L
 
I
S
 
L
A
 
A
F
 
F
T
 
I
K
 
E
A
 
Q
G
 
G
D
 
D
H
 
H
V
 
V
L
 
L
I
 
M
T
 
T
D
 
N
S
 
T
A
 
A
Y
 
Y
G
 
E
P
 
P
T
 
S
R
 
Q
R
 
D
F
 
F
A
 
C
R
 
S
E
 
K
T
 
I
L
 
L
A
 
S
P
 
K
Y
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
T
V
 
T
E
 
S
F
 
W
Y
 
F
D
 
D
P
 
P
C
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
D
I
 
I
A
 
V
A
 
K
L
 
H
L
 
L
R
 
Q
P
 
P
N
 
N
T
 
T
S
 
K
V
 
I
V
 
V
F
 
F
L
 
L
E
 
E
S
 
S
P
 
P
G
 
G
S
 
S
L
 
I
T
 
T
F
 
M
E
 
E
I
 
V
Q
 
H
D
 
D
V
 
V
P
 
P
A
 
A
I
 
I
A
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
V
K
 
R
T
 
S
V
 
V
-
 
V
-
 
P
G
 
D
A
 
A
T
 
I
V
 
I
M
 
M
I
 
I
D
 
D
N
 
N
T
 
T
W
 
W
A
 
A
T
 
A
P
 
G
L
 
V
F
 
L
F
 
F
R
 
K
P
 
A
F
 
L
D
 
D
H
 
F
G
 
G
V
 
I
D
 
D
L
 
V
S
 
S
I
 
I
H
 
Q
A
 
A
A
 
A
T
 
T
K
|
K
Y
 
Y
M
 
L
V
 
V
G
 
G
H
 
H
A
 
S
D
 
D
A
 
A
M
 
M
L
 
I
G
 
G
V
 
T
I
 
A
T
 
V
C
 
C
R
 
-
D
 
N
E
 
A
A
 
R
S
 
C
W
 
W
T
 
E
V
 
Q
V
 
L
K
 
R
K
 
E
T
 
N
A
 
A
T
 
Y
R
 
L
F
 
M
G
 
G
V
 
Q
C
 
M
G
 
V
G
 
D
P
 
A
D
 
D
D
 
T
L
 
A
Y
 
Y
L
 
I
G
 
T
L
 
S
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
R
S
 
T
M
 
L
A
 
G
V
 
V
R
 
R
M
 
L
R
 
R
Q
 
Q
H
 
H
Q
 
H
D
 
E
S
 
S
A
 
S
L
 
L
A
 
K
L
 
V
A
 
A
D
 
E
W
 
W
L
 
L
A
 
A
A
 
E
R
 
H
P
 
P
E
 
Q
V
 
V
T
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
N
H
 
H
P
 
P
A
 
A
R
 
L
P
 
P
D
 
G
F
 
S
P
 
K
G
 
G
H
 
H
A
 
E
L
 
F
W
 
W
K
 
K
R
 
R
D
 
D
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
S
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
F
S
 
S
I
 
F
I
 
V
V
 
L
-
 
K
N
 
K
P
 
K
V
 
L
P
 
N
R
 
N
K
 
E
A
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
N
M
 
Y
L
 
L
D
 
D
G
 
N
M
 
F
E
 
S
L
 
L
F
 
F
G
 
S
M
 
M
G
 
A
Y
 
Y
S
 
S
W
 
W
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
E
 
E
S
 
S
L
 
L
I
 
I
L
 
L
P
 
A
A
 
N
R
 
Q
P
 
P
-
 
E
-
 
H
-
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
I
R
 
R
S
 
P
A
 
Q
T
 
G
R
 
E
W
 
I
S
 
D
D
 
F
P
 
S
G
 
G
Q
 
T
L
 
L
L
 
I
R
 
R
L
 
L
H
 
H
A
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
S
 
D
P
 
V
D
 
D
D
 
D
L
 
L
I
 
I
R
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
D
A
 
A
G
 
G
F
 
F
R
 
A
R
 
R
M
 
I

1cl1B Cystathionine beta-lyase (cbl) from escherichia coli (see paper)
48% identity, 97% coverage: 7:388/392 of query aligns to 4:391/392 of 1cl1B

query
sites
1cl1B
D
 
D
T
 
T
I
 
Q
L
 
L
V
 
V
H
 
N
A
 
A
G
 
G
R
 
R
D
 
S
P
 
K
R
 
K
N
 
Y
N
 
T
H
 
L
G
 
G
I
 
A
V
 
V
N
 
N
P
 
S
P
 
V
V
 
I
Y
 
Q
H
 
R
C
 
A
S
 
S
T
 
S
V
 
L
L
 
V
F
 
F
P
 
D
T
 
S
L
 
V
D
 
E
A
 
A
L
 
K
E
 
K
E
 
H
A
 
A
D
 
T
R
 
R
N
 
N
M
 
R
L
 
A
T
 
N
-
 
G
S
 
E
V
 
L
N
 
F
Y
 
Y
G
 
G
R
|
R
M
 
R
G
 
G
T
 
T
P
 
L
T
 
T
T
 
H
F
 
F
A
 
S
F
 
L
E
 
Q
E
 
Q
A
 
A
A
 
M
A
 
C
A
 
E
L
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
Y
 
A
R
 
G
S
 
C
V
 
V
N
 
L
T
 
F
G
 
P
S
 
C
G
 
G
L
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
V
A
 
A
V
 
N
A
 
S
L
 
I
S
 
L
A
 
A
F
 
F
T
 
I
K
 
E
A
 
Q
G
 
G
D
 
D
H
 
H
V
 
V
L
 
L
I
 
M
T
 
T
D
 
N
S
 
T
A
 
A
Y
|
Y
G
 
E
P
 
P
T
 
S
R
 
Q
R
 
D
F
 
F
A
 
C
R
 
S
E
 
K
T
 
I
L
 
L
A
 
S
P
 
K
Y
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
T
V
 
T
E
 
S
F
 
W
Y
 
F
D
 
D
P
 
P
C
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
D
I
 
I
A
 
V
A
 
K
L
 
H
L
 
L
R
 
Q
P
 
P
N
 
N
T
 
T
S
 
K
V
 
I
V
 
V
F
 
F
L
 
L
E
 
E
S
 
S
P
 
P
G
 
G
S
 
S
L
 
I
T
 
T
F
 
M
E
 
E
I
 
V
Q
 
H
D
 
D
V
 
V
P
 
P
A
 
A
I
 
I
A
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
V
K
 
R
T
 
S
V
 
V
-
 
V
-
 
P
G
 
D
A
 
A
T
 
I
V
 
I
M
 
M
I
 
I
D
|
D
N
 
N
T
 
T
W
 
W
A
 
A
T
 
A
P
 
G
L
 
V
F
 
L
F
 
F
R
 
K
P
 
A
F
 
L
D
 
D
H
 
F
G
 
G
V
 
I
D
 
D
L
 
V
S
 
S
I
 
I
H
 
Q
A
 
A
A
 
A
T
 
T
K
|
K
Y
 
Y
M
 
L
V
 
V
G
 
G
H
 
H
A
 
S
D
 
D
A
 
A
M
 
M
L
 
I
G
 
G
V
 
T
I
 
A
T
 
V
C
 
C
R
 
-
D
 
N
E
 
A
A
 
R
S
 
C
W
 
W
T
 
E
V
 
Q
V
 
L
K
 
R
K
 
E
T
 
N
A
 
A
T
 
Y
R
 
L
F
 
M
G
 
G
V
 
Q
C
 
M
G
 
V
G
 
D
P
 
A
D
 
D
D
 
T
L
 
A
Y
 
Y
L
 
I
G
 
T
L
 
S
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
R
S
 
T
M
 
L
A
 
G
V
 
V
R
 
R
M
 
L
R
 
R
Q
 
Q
H
 
H
Q
 
H
D
 
E
S
 
S
A
 
S
L
 
L
A
 
K
L
 
V
A
 
A
D
 
E
W
 
W
L
 
L
A
 
A
A
 
E
R
 
H
P
 
P
E
 
Q
V
 
V
T
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
N
H
 
H
P
 
P
A
 
A
R
 
L
P
 
P
D
 
G
F
 
S
P
 
K
G
 
G
H
 
H
A
 
E
L
 
F
W
 
W
K
 
K
R
 
R
D
 
D
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
S
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
F
S
 
S
I
 
F
I
 
V
V
 
L
-
 
K
N
 
K
P
 
K
V
 
L
P
 
N
R
 
N
K
 
E
A
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
N
M
 
Y
L
 
L
D
 
D
G
 
N
M
 
F
E
 
S
L
 
L
F
 
F
G
 
S
M
 
M
G
 
A
Y
 
Y
S
|
S
W
|
W
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
E
 
E
S
 
S
L
 
L
I
 
I
L
 
L
P
 
A
A
 
N
R
 
Q
P
 
P
-
 
E
-
 
H
-
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
I
R
 
R
S
 
P
A
 
Q
T
 
G
R
 
E
W
 
I
S
 
D
D
 
F
P
 
S
G
 
G
Q
 
T
L
 
L
L
 
I
R
|
R
L
 
L
H
 
H
A
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
S
 
D
P
 
V
D
 
D
D
 
D
L
 
L
I
 
I
R
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
D
A
 
A
G
 
G
F
 
F
R
 
A
R
 
R
M
 
I

2gqnA Cystathionine beta-lyase (cbl) from escherichia coli in complex with n-hydrazinocarbonylmethyl-2-nitro-benzamide (see paper)
48% identity, 97% coverage: 7:388/392 of query aligns to 3:390/391 of 2gqnA

query
sites
2gqnA
D
 
D
T
 
T
I
 
Q
L
 
L
V
 
V
H
 
N
A
 
A
G
 
G
R
 
R
D
 
S
P
 
K
R
 
K
N
 
Y
N
 
T
H
 
L
G
 
G
I
 
A
V
 
V
N
 
N
P
 
S
P
 
V
V
 
I
Y
 
Q
H
 
R
C
 
A
S
 
S
T
 
S
V
 
L
L
 
V
F
 
F
P
 
D
T
 
S
L
 
V
D
 
E
A
 
A
L
 
K
E
 
K
E
 
H
A
 
A
D
 
T
R
 
R
N
 
N
M
 
R
L
 
A
T
 
N
-
 
G
S
 
E
V
 
L
N
 
F
Y
 
Y
G
 
G
R
|
R
M
 
R
G
 
G
T
 
T
P
 
L
T
 
T
T
 
H
F
 
F
A
 
S
F
 
L
E
 
Q
E
 
Q
A
 
A
A
 
M
A
 
C
A
 
E
L
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
Y
 
A
R
 
G
S
 
C
V
 
V
N
 
L
T
 
F
G
 
P
S
x
C
G
|
G
L
x
A
A
 
A
A
 
A
I
 
V
A
 
A
V
 
N
A
 
S
L
 
I
S
 
L
A
 
A
F
 
F
T
 
I
K
 
E
A
 
Q
G
 
G
D
 
D
H
 
H
V
 
V
L
 
L
I
 
M
T
 
T
D
 
N
S
 
T
A
 
A
Y
|
Y
G
x
E
P
 
P
T
 
S
R
 
Q
R
 
D
F
 
F
A
 
C
R
 
S
E
 
K
T
 
I
L
 
L
A
 
S
P
 
K
Y
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
T
V
 
T
E
 
S
F
 
W
Y
 
F
D
 
D
P
 
P
C
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
D
I
 
I
A
 
V
A
 
K
L
 
H
L
 
L
R
 
Q
P
 
P
N
 
N
T
 
T
S
 
K
V
 
I
V
 
V
F
 
F
L
 
L
E
 
E
S
 
S
P
 
P
G
 
G
S
 
S
L
 
I
T
 
T
F
 
M
E
 
E
I
 
V
Q
 
H
D
 
D
V
 
V
P
 
P
A
 
A
I
 
I
A
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
V
K
 
R
T
 
S
V
 
V
-
 
V
-
 
P
G
 
D
A
 
A
T
 
I
V
 
I
M
 
M
I
 
I
D
|
D
N
 
N
T
 
T
W
 
W
A
 
A
T
 
A
P
 
G
L
 
V
F
 
L
F
 
F
R
 
K
P
 
A
F
 
L
D
 
D
H
 
F
G
 
G
V
 
I
D
 
D
L
 
V
S
 
S
I
 
I
H
 
Q
A
|
A
A
 
A
T
|
T
K
|
K
Y
 
Y
M
 
L
V
 
V
G
 
G
H
 
H
A
 
S
D
 
D
A
 
A
M
|
M
L
 
I
G
 
G
V
 
T
I
 
A
T
 
V
C
 
C
R
 
-
D
 
N
E
 
A
A
 
R
S
 
C
W
 
W
T
 
E
V
 
Q
V
 
L
K
 
R
K
 
E
T
 
N
A
 
A
T
 
Y
R
 
L
F
 
M
G
 
G
V
 
Q
C
 
M
G
 
V
G
 
D
P
 
A
D
 
D
D
 
T
L
 
A
Y
 
Y
L
 
I
G
 
T
L
 
S
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
R
S
 
T
M
 
L
A
 
G
V
 
V
R
 
R
M
 
L
R
 
R
Q
 
Q
H
 
H
Q
 
H
D
 
E
S
 
S
A
 
S
L
 
L
A
 
K
L
 
V
A
 
A
D
 
E
W
 
W
L
 
L
A
 
A
A
 
E
R
 
H
P
 
P
E
 
Q
V
 
V
T
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
N
H
 
H
P
 
P
A
 
A
R
 
L
P
 
P
D
 
G
F
 
S
P
 
K
G
 
G
H
 
H
A
 
E
L
 
F
W
 
W
K
 
K
R
 
R
D
 
D
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
S
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
F
S
 
S
I
 
F
I
 
V
V
 
L
-
 
K
N
 
K
P
 
K
V
 
L
P
 
N
R
 
N
K
 
E
A
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
N
M
 
Y
L
 
L
D
 
D
G
 
N
M
 
F
E
 
S
L
 
L
F
 
F
G
 
S
M
 
M
G
 
A
Y
|
Y
S
|
S
W
|
W
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
E
 
E
S
 
S
L
 
L
I
 
I
L
 
L
P
 
A
A
 
N
R
 
Q
P
 
P
-
 
E
-
 
H
-
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
I
R
 
R
S
 
P
A
 
Q
T
 
G
R
 
E
W
 
I
S
 
D
D
 
F
P
 
S
G
 
G
Q
 
T
L
 
L
L
 
I
R
|
R
L
 
L
H
 
H
A
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
S
 
D
P
 
V
D
 
D
D
 
D
L
 
L
I
 
I
R
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
D
A
 
A
G
 
G
F
 
F
R
 
A
R
 
R
M
 
I

2fq6A Cystathionine beta-lyase (cbl) from escherichia coli in complex with n-hydrazinocarbonylmethyl-2-trifluoromethyl-benzamide (see paper)
48% identity, 97% coverage: 7:388/392 of query aligns to 3:390/391 of 2fq6A

query
sites
2fq6A
D
 
D
T
 
T
I
 
Q
L
 
L
V
 
V
H
 
N
A
 
A
G
 
G
R
 
R
D
 
S
P
 
K
R
 
K
N
 
Y
N
 
T
H
 
L
G
 
G
I
 
A
V
 
V
N
 
N
P
 
S
P
 
V
V
 
I
Y
 
Q
H
 
R
C
 
A
S
 
S
T
 
S
V
 
L
L
 
V
F
 
F
P
 
D
T
 
S
L
 
V
D
 
E
A
 
A
L
 
K
E
 
K
E
 
H
A
 
A
D
 
T
R
 
R
N
 
N
M
 
R
L
 
A
T
 
N
-
 
G
S
 
E
V
 
L
N
 
F
Y
 
Y
G
 
G
R
|
R
M
 
R
G
 
G
T
 
T
P
 
L
T
 
T
T
 
H
F
 
F
A
 
S
F
 
L
E
 
Q
E
 
Q
A
 
A
A
 
M
A
 
C
A
 
E
L
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
Y
 
A
R
 
G
S
 
C
V
 
V
N
 
L
T
 
F
G
 
P
S
x
C
G
|
G
L
x
A
A
 
A
A
 
A
I
 
V
A
 
A
V
 
N
A
 
S
L
 
I
S
 
L
A
 
A
F
 
F
T
 
I
K
 
E
A
 
Q
G
 
G
D
 
D
H
 
H
V
 
V
L
 
L
I
 
M
T
 
T
D
 
N
S
 
T
A
 
A
Y
|
Y
G
 
E
P
|
P
T
 
S
R
 
Q
R
 
D
F
 
F
A
 
C
R
 
S
E
 
K
T
 
I
L
 
L
A
 
S
P
 
K
Y
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
T
V
 
T
E
 
S
F
 
W
Y
 
F
D
 
D
P
 
P
C
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
D
I
 
I
A
 
V
A
 
K
L
 
H
L
 
L
R
 
Q
P
 
P
N
 
N
T
 
T
S
 
K
V
 
I
V
 
V
F
 
F
L
 
L
E
 
E
S
 
S
P
 
P
G
 
G
S
 
S
L
 
I
T
 
T
F
 
M
E
 
E
I
 
V
Q
 
H
D
 
D
V
 
V
P
 
P
A
 
A
I
 
I
A
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
V
K
 
R
T
 
S
V
 
V
-
 
V
-
 
P
G
 
D
A
 
A
T
 
I
V
 
I
M
 
M
I
 
I
D
|
D
N
 
N
T
 
T
W
 
W
A
 
A
T
 
A
P
 
G
L
 
V
F
 
L
F
 
F
R
 
K
P
 
A
F
 
L
D
 
D
H
 
F
G
 
G
V
 
I
D
 
D
L
 
V
S
 
S
I
 
I
H
 
Q
A
|
A
A
 
A
T
|
T
K
|
K
Y
 
Y
M
 
L
V
 
V
G
 
G
H
 
H
A
 
S
D
 
D
A
 
A
M
|
M
L
 
I
G
 
G
V
 
T
I
 
A
T
 
V
C
 
C
R
 
-
D
 
N
E
 
A
A
 
R
S
 
C
W
 
W
T
 
E
V
 
Q
V
 
L
K
 
R
K
 
E
T
 
N
A
 
A
T
 
Y
R
 
L
F
 
M
G
 
G
V
 
Q
C
 
M
G
 
V
G
 
D
P
 
A
D
 
D
D
 
T
L
 
A
Y
 
Y
L
 
I
G
 
T
L
 
S
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
R
S
 
T
M
 
L
A
 
G
V
 
V
R
 
R
M
 
L
R
 
R
Q
 
Q
H
 
H
Q
 
H
D
 
E
S
 
S
A
 
S
L
 
L
A
 
K
L
 
V
A
 
A
D
 
E
W
 
W
L
 
L
A
 
A
A
 
E
R
 
H
P
 
P
E
 
Q
V
 
V
T
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
N
H
 
H
P
 
P
A
 
A
R
 
L
P
 
P
D
 
G
F
 
S
P
 
K
G
 
G
H
 
H
A
 
E
L
 
F
W
 
W
K
 
K
R
 
R
D
 
D
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
S
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
F
S
 
S
I
 
F
I
 
V
V
 
L
-
 
K
N
 
K
P
 
K
V
 
L
P
 
N
R
 
N
K
 
E
A
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
N
M
 
Y
L
 
L
D
 
D
G
 
N
M
 
F
E
 
S
L
 
L
F
 
F
G
 
S
M
 
M
G
 
A
Y
|
Y
S
|
S
W
|
W
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
E
 
E
S
 
S
L
 
L
I
 
I
L
 
L
P
 
A
A
 
N
R
 
Q
P
 
P
-
 
E
-
 
H
-
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
I
R
 
R
S
 
P
A
 
Q
T
 
G
R
 
E
W
 
I
S
 
D
D
 
F
P
 
S
G
 
G
Q
 
T
L
 
L
L
 
I
R
|
R
L
 
L
H
 
H
A
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
S
 
D
P
 
V
D
 
D
D
 
D
L
 
L
I
 
I
R
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
D
A
 
A
G
 
G
F
 
F
R
 
A
R
 
R
M
 
I

1cl2A Cystathionine beta-lyase (cbl) from escherichia coli in complex with aminoethoxyvinylglycine (see paper)
48% identity, 97% coverage: 7:388/392 of query aligns to 3:390/391 of 1cl2A

query
sites
1cl2A
D
 
D
T
 
T
I
 
Q
L
 
L
V
 
V
H
 
N
A
 
A
G
 
G
R
 
R
D
 
S
P
 
K
R
 
K
N
 
Y
N
 
T
H
 
L
G
 
G
I
 
A
V
 
V
N
 
N
P
 
S
P
 
V
V
 
I
Y
 
Q
H
 
R
C
 
A
S
 
S
T
 
S
V
 
L
L
 
V
F
 
F
P
 
D
T
 
S
L
 
V
D
 
E
A
 
A
L
 
K
E
 
K
E
 
H
A
 
A
D
 
T
R
 
R
N
 
N
M
 
R
L
 
A
T
 
N
-
 
G
S
 
E
V
 
L
N
 
F
Y
 
Y
G
 
G
R
|
R
M
 
R
G
 
G
T
 
T
P
 
L
T
 
T
T
 
H
F
 
F
A
 
S
F
 
L
E
 
Q
E
 
Q
A
 
A
A
 
M
A
 
C
A
 
E
L
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
Y
 
A
R
 
G
S
 
C
V
 
V
N
 
L
T
 
F
G
 
P
S
x
C
G
|
G
L
x
A
A
 
A
A
 
A
I
 
V
A
 
A
V
 
N
A
 
S
L
 
I
S
 
L
A
 
A
F
 
F
T
 
I
K
 
E
A
 
Q
G
 
G
D
 
D
H
 
H
V
 
V
L
 
L
I
 
M
T
 
T
D
 
N
S
 
T
A
 
A
Y
|
Y
G
 
E
P
 
P
T
 
S
R
 
Q
R
 
D
F
 
F
A
 
C
R
 
S
E
 
K
T
 
I
L
 
L
A
 
S
P
 
K
Y
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
T
V
 
T
E
 
S
F
 
W
Y
 
F
D
 
D
P
 
P
C
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
D
I
 
I
A
 
V
A
 
K
L
 
H
L
 
L
R
 
Q
P
 
P
N
 
N
T
 
T
S
 
K
V
 
I
V
 
V
F
 
F
L
 
L
E
 
E
S
 
S
P
 
P
G
 
G
S
 
S
L
 
I
T
 
T
F
 
M
E
 
E
I
 
V
Q
 
H
D
 
D
V
 
V
P
 
P
A
 
A
I
 
I
A
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
V
K
 
R
T
 
S
V
 
V
-
 
V
-
 
P
G
 
D
A
 
A
T
 
I
V
 
I
M
 
M
I
 
I
D
|
D
N
 
N
T
 
T
W
 
W
A
 
A
T
 
A
P
 
G
L
 
V
F
 
L
F
 
F
R
 
K
P
 
A
F
 
L
D
 
D
H
 
F
G
 
G
V
 
I
D
 
D
L
 
V
S
 
S
I
 
I
H
 
Q
A
|
A
A
 
A
T
|
T
K
|
K
Y
 
Y
M
 
L
V
 
V
G
 
G
H
 
H
A
 
S
D
 
D
A
 
A
M
|
M
L
 
I
G
 
G
V
 
T
I
 
A
T
 
V
C
 
C
R
 
-
D
 
N
E
 
A
A
 
R
S
 
C
W
 
W
T
 
E
V
 
Q
V
 
L
K
 
R
K
 
E
T
 
N
A
 
A
T
 
Y
R
 
L
F
 
M
G
 
G
V
 
Q
C
 
M
G
 
V
G
 
D
P
 
A
D
 
D
D
 
T
L
 
A
Y
 
Y
L
 
I
G
 
T
L
 
S
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
R
S
 
T
M
 
L
A
 
G
V
 
V
R
 
R
M
 
L
R
 
R
Q
 
Q
H
 
H
Q
 
H
D
 
E
S
 
S
A
 
S
L
 
L
A
 
K
L
 
V
A
 
A
D
 
E
W
 
W
L
 
L
A
 
A
A
 
E
R
 
H
P
 
P
E
 
Q
V
 
V
T
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
N
H
 
H
P
 
P
A
 
A
R
 
L
P
 
P
D
 
G
F
 
S
P
 
K
G
 
G
H
 
H
A
 
E
L
 
F
W
 
W
K
 
K
R
 
R
D
 
D
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
S
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
F
S
 
S
I
 
F
I
 
V
V
 
L
-
 
K
N
 
K
P
 
K
V
 
L
P
 
N
R
 
N
K
 
E
A
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
N
M
 
Y
L
 
L
D
 
D
G
 
N
M
 
F
E
 
S
L
 
L
F
 
F
G
 
S
M
 
M
G
 
A
Y
|
Y
S
|
S
W
|
W
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
E
 
E
S
 
S
L
 
L
I
 
I
L
 
L
P
 
A
A
 
N
R
 
Q
P
 
P
-
 
E
-
 
H
-
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
I
R
 
R
S
 
P
A
 
Q
T
 
G
R
 
E
W
 
I
S
 
D
D
 
F
P
 
S
G
 
G
Q
 
T
L
 
L
L
 
I
R
|
R
L
 
L
H
 
H
A
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
S
 
D
P
 
V
D
 
D
D
 
D
L
 
L
I
 
I
R
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
D
A
 
A
G
 
G
F
 
F
R
 
A
R
 
R
M
 
I

8sadA Crystal structure of cystathionine beta lyase from klebsiella aerogenes, plp/malonate complex (c2 form)
48% identity, 99% coverage: 1:388/392 of query aligns to 4:397/398 of 8sadA

query
sites
8sadA
M
 
M
K
 
A
D
 
D
V
 
K
T
 
H
K
 
L
D
 
D
T
 
T
I
 
A
L
 
L
V
 
V
H
 
N
A
 
A
G
 
G
R
 
R
D
 
R
P
 
K
R
 
K
N
 
Y
N
 
T
H
 
Q
G
 
G
I
 
S
V
 
V
N
 
N
P
 
S
P
 
V
V
 
I
Y
 
Q
H
 
R
C
 
A
S
 
S
T
 
S
V
 
L
L
 
V
F
 
F
P
 
D
T
 
T
L
 
V
D
 
E
A
 
A
L
 
K
E
 
K
E
 
H
A
 
A
D
 
T
R
 
R
N
 
N
M
 
R
L
 
A
T
 
K
-
 
G
S
 
E
V
 
L
N
 
F
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
M
 
R
G
 
G
T
 
T
P
 
L
T
 
T
T
 
H
F
 
F
A
 
S
F
 
L
E
 
Q
E
 
E
A
 
A
A
 
M
A
 
C
A
 
E
L
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
Y
 
A
R
 
G
S
 
C
V
 
A
N
 
L
T
 
F
G
 
P
S
x
C
G
|
G
L
x
A
A
 
A
A
 
A
I
 
V
A
 
A
V
 
N
A
 
T
L
 
I
S
 
L
A
 
A
F
 
F
T
 
V
K
 
E
A
 
Q
G
 
G
D
 
D
H
 
H
V
 
V
L
 
L
I
 
M
T
 
T
D
 
N
S
 
T
A
 
A
Y
|
Y
G
 
E
P
 
P
T
 
S
R
 
Q
R
 
D
F
 
F
A
 
C
R
 
T
E
 
K
T
 
I
L
 
L
A
 
A
P
 
K
Y
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
T
V
 
T
E
 
G
F
 
W
Y
 
F
D
 
D
P
 
P
C
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
N
L
 
L
L
 
I
R
 
Q
P
 
P
N
 
N
T
 
T
S
 
K
V
 
V
V
 
V
F
 
F
L
 
L
E
 
E
S
 
S
P
 
P
G
 
G
S
 
S
L
 
I
T
 
T
F
 
M
E
 
E
I
 
V
Q
 
H
D
 
D
V
 
V
P
 
P
A
 
A
I
 
I
A
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
V
K
 
R
T
 
R
V
 
V
G
 
A
-
 
P
-
 
E
A
 
A
T
 
I
V
 
I
M
 
M
I
 
I
D
|
D
N
 
N
T
 
T
W
 
W
A
 
A
T
 
A
P
 
G
L
 
V
F
 
L
F
 
F
R
 
K
P
 
A
F
 
L
D
 
D
H
 
F
G
 
G
V
 
I
D
 
D
L
 
I
S
 
S
I
 
I
H
 
Q
A
|
A
A
 
A
T
|
T
K
|
K
Y
 
Y
M
 
L
V
 
I
G
 
G
H
 
H
A
 
S
D
 
D
A
 
G
M
|
M
L
 
I
G
 
G
V
 
T
I
 
A
T
 
V
C
 
A
R
 
-
D
 
N
E
 
A
A
 
R
S
 
C
W
 
W
T
 
E
V
 
Q
V
 
L
K
 
C
K
 
E
T
 
N
A
 
A
T
 
Y
R
 
L
F
 
M
G
 
G
V
 
Q
C
 
M
G
 
I
G
 
D
P
 
A
D
 
D
D
 
T
L
 
A
Y
 
Y
L
 
M
G
 
T
L
 
S
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
R
S
 
T
M
 
L
A
 
G
V
 
V
R
 
R
M
 
L
R
 
R
Q
 
Q
H
 
H
Q
 
H
D
 
E
S
 
S
A
 
S
L
 
L
A
 
R
L
 
V
A
 
A
D
 
E
W
 
W
L
 
L
A
 
A
A
 
Q
R
 
H
P
 
P
E
 
Q
V
 
V
T
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
N
H
 
H
P
 
P
A
 
A
R
 
L
P
 
P
D
 
G
F
 
S
P
 
K
G
 
G
H
 
H
A
 
E
L
 
F
W
 
W
K
 
K
R
 
R
D
 
D
F
 
F
T
 
S
G
 
G
S
 
S
S
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
F
S
 
S
I
 
F
I
 
V
V
 
L
N
 
N
P
 
K
-
 
R
V
 
L
P
 
T
R
 
D
K
 
A
A
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
M
 
Y
L
 
L
D
 
D
G
 
N
M
 
F
E
 
S
L
 
L
F
 
F
G
 
S
M
 
M
G
 
A
Y
 
Y
S
 
S
W
|
W
G
 
G
G
 
G
F
 
F
E
 
E
S
 
S
L
 
L
I
 
I
L
 
L
P
 
A
A
 
N
R
 
Q
P
 
P
-
 
E
-
 
H
-
 
I
A
|
A
A
 
A
V
 
I
R
|
R
S
 
P
A
 
E
T
x
A
R
 
E
W
 
V
S
 
D
D
 
F
P
 
S
G
 
G
Q
 
T
L
 
L
L
 
I
R
 
R
L
 
L
H
 
H
A
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
S
 
N
P
 
V
D
 
D
D
 
D
L
 
L
I
 
L
R
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
F
R
 
A
R
 
R
M
 
I

4itxA P113s mutant of e. Coli cystathionine beta-lyase metc inhibited by reaction with l-ala-p (see paper)
47% identity, 97% coverage: 7:388/392 of query aligns to 3:390/391 of 4itxA

query
sites
4itxA
D
 
D
T
 
T
I
 
Q
L
 
L
V
 
V
H
 
N
A
 
A
G
 
G
R
 
R
D
 
S
P
 
K
R
 
K
N
 
Y
N
 
T
H
 
L
G
 
G
I
 
A
V
 
V
N
 
N
P
 
S
P
 
V
V
 
I
Y
 
Q
H
 
R
C
 
A
S
 
S
T
 
S
V
 
L
L
 
V
F
 
F
P
 
D
T
 
S
L
 
V
D
 
E
A
 
A
L
 
K
E
 
K
E
 
H
A
 
A
D
 
T
R
 
R
N
 
N
M
 
R
L
 
A
T
 
N
-
 
G
S
 
E
V
 
L
N
 
F
Y
 
Y
G
 
G
R
|
R
M
 
R
G
 
G
T
 
T
P
 
L
T
 
T
T
 
H
F
 
F
A
 
S
F
 
L
E
 
Q
E
 
Q
A
 
A
A
 
M
A
 
C
A
 
E
L
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
Y
 
A
R
 
G
S
 
C
V
 
V
N
 
L
T
 
F
G
 
P
S
x
C
G
|
G
L
x
A
A
 
A
A
 
A
I
 
V
A
 
A
V
 
N
A
 
S
L
 
I
S
 
L
A
 
A
F
 
F
T
 
I
K
 
E
A
 
Q
G
 
G
D
 
D
H
 
H
V
 
V
L
 
L
I
 
M
T
 
T
D
 
N
S
 
T
A
 
A
Y
|
Y
G
 
E
P
 
S
T
 
S
R
 
Q
R
 
D
F
 
F
A
 
C
R
 
S
E
 
K
T
 
I
L
 
L
A
 
S
P
 
K
Y
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
T
V
 
T
E
 
S
F
 
W
Y
 
F
D
 
D
P
 
P
C
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
D
I
 
I
A
 
V
A
 
K
L
 
H
L
 
L
R
 
Q
P
 
P
N
 
N
T
 
T
S
 
K
V
 
I
V
 
V
F
 
F
L
 
L
E
 
E
S
 
S
P
 
P
G
 
G
S
 
S
L
 
I
T
 
T
F
 
M
E
 
E
I
 
V
Q
 
H
D
 
D
V
 
V
P
 
P
A
 
A
I
 
I
A
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
V
K
 
R
T
 
S
V
 
V
-
 
V
-
 
P
G
 
D
A
 
A
T
 
I
V
 
I
M
 
M
I
 
I
D
|
D
N
 
N
T
 
T
W
 
W
A
 
A
T
 
A
P
 
G
L
 
V
F
 
L
F
 
F
R
 
K
P
 
A
F
 
L
D
 
D
H
 
F
G
 
G
V
 
I
D
 
D
L
 
V
S
 
S
I
 
I
H
 
Q
A
|
A
A
 
A
T
|
T
K
|
K
Y
 
Y
M
 
L
V
 
V
G
 
G
H
 
H
A
 
S
D
 
D
A
 
A
M
|
M
L
 
I
G
 
G
V
 
T
I
 
A
T
 
V
C
 
C
R
 
-
D
 
N
E
 
A
A
 
R
S
 
C
W
 
W
T
 
E
V
 
Q
V
 
L
K
 
R
K
 
E
T
 
N
A
 
A
T
 
Y
R
 
L
F
 
M
G
 
G
V
 
Q
C
 
M
G
 
V
G
 
D
P
 
A
D
 
D
D
 
T
L
 
A
Y
 
Y
L
 
I
G
 
T
L
 
S
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
R
S
 
T
M
 
L
A
 
G
V
 
V
R
 
R
M
 
L
R
 
R
Q
 
Q
H
 
H
Q
 
H
D
 
E
S
 
S
A
 
S
L
 
L
A
 
K
L
 
V
A
 
A
D
 
E
W
 
W
L
 
L
A
 
A
A
 
E
R
 
H
P
 
P
E
 
Q
V
 
V
T
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
N
H
 
H
P
 
P
A
 
A
R
 
L
P
 
P
D
 
G
F
 
S
P
 
K
G
 
G
H
 
H
A
 
E
L
 
F
W
 
W
K
 
K
R
 
R
D
 
D
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
S
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
F
S
 
S
I
 
F
I
 
V
V
 
L
-
 
K
N
 
K
P
 
K
V
 
L
P
 
N
R
 
N
K
 
E
A
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
N
M
 
Y
L
 
L
D
 
D
G
 
N
M
 
F
E
 
S
L
 
L
F
 
F
G
 
S
M
 
M
G
 
A
Y
|
Y
S
|
S
W
|
W
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
E
 
E
S
 
S
L
 
L
I
 
I
L
 
L
P
 
A
A
 
N
R
 
Q
P
 
P
-
 
E
-
 
H
-
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
I
R
 
R
S
 
P
A
 
Q
T
 
G
R
 
E
W
 
I
S
 
D
D
 
F
P
 
S
G
 
G
Q
 
T
L
 
L
L
 
I
R
|
R
L
 
L
H
 
H
A
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
S
 
D
P
 
V
D
 
D
D
 
D
L
 
L
I
 
I
R
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
D
A
 
A
G
 
G
F
 
F
R
 
A
R
 
R
M
 
I

8sabA Crystal structure of cystathionine beta lyase from klebsiella aerogenes, plp adduct with alanine (c2 form)
48% identity, 97% coverage: 7:388/392 of query aligns to 4:391/392 of 8sabA

query
sites
8sabA
D
 
D
T
 
T
I
 
A
L
 
L
V
 
V
H
x
N
A
 
A
G
 
G
R
|
R
D
x
R
P
x
K
R
 
K
N
 
Y
N
x
T
H
 
Q
G
 
G
I
 
S
V
 
V
N
 
N
P
 
S
P
 
V
V
 
I
Y
 
Q
H
 
R
C
 
A
S
 
S
T
 
S
V
 
L
L
 
V
F
 
F
P
 
D
T
 
T
L
 
V
D
 
E
A
 
A
L
 
K
E
 
K
E
 
H
A
 
A
D
 
T
R
 
R
N
 
N
M
 
R
L
 
A
T
 
K
-
 
G
S
 
E
V
 
L
N
 
F
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
M
 
R
G
 
G
T
 
T
P
 
L
T
 
T
T
 
H
F
 
F
A
 
S
F
 
L
E
 
Q
E
 
E
A
 
A
A
 
M
A
 
C
A
 
E
L
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
Y
 
A
R
 
G
S
 
C
V
 
A
N
 
L
T
 
F
G
 
P
S
x
C
G
|
G
L
x
A
A
 
A
A
 
A
I
 
V
A
 
A
V
 
N
A
 
T
L
 
I
S
 
L
A
 
A
F
 
F
T
 
V
K
 
E
A
 
Q
G
 
G
D
 
D
H
 
H
V
 
V
L
 
L
I
 
M
T
 
T
D
 
N
S
 
T
A
 
A
Y
|
Y
G
 
E
P
 
P
T
 
S
R
 
Q
R
 
D
F
 
F
A
 
C
R
 
T
E
 
K
T
 
I
L
 
L
A
 
A
P
 
K
Y
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
T
V
 
T
E
 
G
F
 
W
Y
 
F
D
 
D
P
 
P
C
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
N
L
 
L
L
 
I
R
 
Q
P
 
P
N
 
N
T
 
T
S
 
K
V
 
V
V
 
V
F
 
F
L
 
L
E
 
E
S
 
S
P
 
P
G
 
G
S
 
S
L
 
I
T
 
T
F
 
M
E
 
E
I
 
V
Q
 
H
D
 
D
V
 
V
P
 
P
A
 
A
I
 
I
A
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
V
K
 
R
T
 
R
V
 
V
G
 
A
-
 
P
-
 
E
A
 
A
T
 
I
V
 
I
M
 
M
I
 
I
D
|
D
N
 
N
T
 
T
W
 
W
A
 
A
T
 
A
P
 
G
L
 
V
F
 
L
F
 
F
R
 
K
P
 
A
F
 
L
D
 
D
H
 
F
G
 
G
V
 
I
D
 
D
L
 
I
S
 
S
I
 
I
H
 
Q
A
|
A
A
 
A
T
|
T
K
|
K
Y
 
Y
M
 
L
V
 
I
G
 
G
H
 
H
A
 
S
D
 
D
A
 
G
M
|
M
L
 
I
G
 
G
V
 
T
I
 
A
T
 
V
C
 
A
R
 
-
D
 
N
E
 
A
A
 
R
S
 
C
W
 
W
T
 
E
V
 
Q
V
 
L
K
 
C
K
 
E
T
 
N
A
 
A
T
 
Y
R
 
L
F
 
M
G
 
G
V
 
Q
C
 
M
G
 
I
G
 
D
P
 
A
D
 
D
D
 
T
L
 
A
Y
 
Y
L
 
M
G
 
T
L
 
S
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
R
S
 
T
M
 
L
A
 
G
V
 
V
R
 
R
M
 
L
R
 
R
Q
 
Q
H
 
H
Q
 
H
D
 
E
S
 
S
A
 
S
L
 
L
A
 
R
L
 
V
A
 
A
D
 
E
W
 
W
L
 
L
A
 
A
A
 
Q
R
 
H
P
 
P
E
 
Q
V
 
V
T
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
N
H
 
H
P
 
P
A
 
A
R
 
L
P
 
P
D
 
G
F
 
S
P
 
K
G
 
G
H
 
H
A
 
E
L
 
F
W
 
W
K
 
K
R
 
R
D
 
D
F
 
F
T
 
S
G
 
G
S
 
S
S
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
F
S
 
S
I
 
F
I
 
V
V
 
L
N
 
N
P
 
K
-
 
R
V
 
L
P
 
T
R
 
D
K
 
A
A
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
M
 
Y
L
 
L
D
 
D
G
 
N
M
 
F
E
 
S
L
|
L
F
 
F
G
 
S
M
 
M
G
 
A
Y
|
Y
S
|
S
W
|
W
G
 
G
G
 
G
F
 
F
E
|
E
S
 
S
L
 
L
I
 
I
L
 
L
P
 
A
A
 
N
R
 
Q
P
 
P
-
 
E
-
 
H
-
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
I
R
 
R
S
 
P
A
 
E
T
 
A
R
 
E
W
 
V
S
 
D
D
 
F
P
 
S
G
 
G
Q
 
T
L
 
L
L
 
I
R
|
R
L
 
L
H
 
H
A
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
S
 
N
P
 
V
D
 
D
D
 
D
L
 
L
I
 
L
R
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
F
R
 
A
R
 
R
M
 
I

8u99A Crystal structure of cystathionine beta lyase from klebsiella aerogenes (plp-serine adduct)
48% identity, 97% coverage: 7:388/392 of query aligns to 3:390/391 of 8u99A

query
sites
8u99A
D
 
D
T
 
T
I
 
A
L
 
L
V
 
V
H
 
N
A
 
A
G
 
G
R
 
R
D
 
R
P
 
K
R
 
K
N
 
Y
N
 
T
H
 
Q
G
 
G
I
 
S
V
 
V
N
 
N
P
 
S
P
 
V
V
 
I
Y
 
Q
H
 
R
C
 
A
S
 
S
T
 
S
V
 
L
L
 
V
F
 
F
P
 
D
T
 
T
L
 
V
D
 
E
A
 
A
L
 
K
E
 
K
E
 
H
A
 
A
D
 
T
R
 
R
N
 
N
M
 
R
L
 
A
T
 
K
-
 
G
S
 
E
V
 
L
N
 
F
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
M
 
R
G
 
G
T
 
T
P
 
L
T
 
T
T
 
H
F
 
F
A
 
S
F
 
L
E
 
Q
E
 
E
A
 
A
A
 
M
A
 
C
A
 
E
L
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
Y
 
A
R
 
G
S
 
C
V
 
A
N
 
L
T
 
F
G
 
P
S
x
C
G
|
G
L
x
A
A
 
A
A
 
A
I
 
V
A
 
A
V
 
N
A
 
T
L
 
I
S
 
L
A
 
A
F
 
F
T
 
V
K
 
E
A
 
Q
G
 
G
D
 
D
H
 
H
V
 
V
L
 
L
I
 
M
T
 
T
D
 
N
S
 
T
A
 
A
Y
|
Y
G
 
E
P
 
P
T
 
S
R
 
Q
R
 
D
F
 
F
A
 
C
R
 
T
E
 
K
T
 
I
L
 
L
A
 
A
P
 
K
Y
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
T
V
 
T
E
 
G
F
 
W
Y
 
F
D
 
D
P
 
P
C
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
N
L
 
L
L
 
I
R
 
Q
P
 
P
N
 
N
T
 
T
S
 
K
V
 
V
V
 
V
F
 
F
L
 
L
E
 
E
S
 
S
P
 
P
G
 
G
S
 
S
L
 
I
T
 
T
F
 
M
E
 
E
I
 
V
Q
 
H
D
 
D
V
 
V
P
 
P
A
 
A
I
 
I
A
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
V
K
 
R
T
 
R
V
 
V
G
 
A
-
 
P
-
 
E
A
 
A
T
 
I
V
 
I
M
 
M
I
 
I
D
|
D
N
 
N
T
 
T
W
 
W
A
 
A
T
 
A
P
 
G
L
 
V
F
 
L
F
 
F
R
 
K
P
 
A
F
 
L
D
 
D
H
 
F
G
 
G
V
 
I
D
 
D
L
 
I
S
 
S
I
 
I
H
 
Q
A
 
A
A
 
A
T
|
T
K
|
K
Y
 
Y
M
 
L
V
 
I
G
 
G
H
 
H
A
 
S
D
 
D
A
 
G
M
|
M
L
 
I
G
 
G
V
 
T
I
 
A
T
 
V
C
 
A
R
 
-
D
 
N
E
 
A
A
 
R
S
 
C
W
 
W
T
 
E
V
 
Q
V
 
L
K
 
C
K
 
E
T
 
N
A
 
A
T
 
Y
R
 
L
F
 
M
G
 
G
V
 
Q
C
 
M
G
 
I
G
 
D
P
 
A
D
 
D
D
 
T
L
 
A
Y
 
Y
L
 
M
G
 
T
L
 
S
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
R
S
 
T
M
 
L
A
 
G
V
 
V
R
 
R
M
 
L
R
 
R
Q
 
Q
H
 
H
Q
 
H
D
 
E
S
 
S
A
 
S
L
 
L
A
 
R
L
 
V
A
 
A
D
 
E
W
 
W
L
 
L
A
 
A
A
 
Q
R
 
H
P
 
P
E
 
Q
V
 
V
T
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
N
H
 
H
P
 
P
A
 
A
R
 
L
P
 
P
D
 
G
F
 
S
P
 
K
G
 
G
H
 
H
A
 
E
L
 
F
W
 
W
K
 
K
R
 
R
D
 
D
F
 
F
T
 
S
G
 
G
S
 
S
S
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
F
S
 
S
I
 
F
I
 
V
V
 
L
N
 
N
P
 
K
-
 
R
V
 
L
P
 
T
R
 
D
K
 
A
A
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
M
 
Y
L
 
L
D
 
D
G
 
N
M
 
F
E
 
S
L
 
L
F
 
F
G
 
S
M
 
M
G
 
A
Y
|
Y
S
|
S
W
|
W
G
 
G
G
 
G
F
 
F
E
 
E
S
 
S
L
 
L
I
 
I
L
 
L
P
 
A
A
 
N
R
 
Q
P
 
P
-
 
E
-
 
H
-
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
I
R
 
R
S
 
P
A
 
E
T
 
A
R
 
E
W
 
V
S
 
D
D
 
F
P
 
S
G
 
G
Q
 
T
L
 
L
L
 
I
R
|
R
L
 
L
H
 
H
A
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
S
 
N
P
 
V
D
 
D
D
 
D
L
 
L
I
 
L
R
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
F
R
 
A
R
 
R
M
 
I

8u98A Crystal structure of cystathionine beta lyase from klebsiella aerogenes (plp-glycine adduct)
48% identity, 97% coverage: 7:388/392 of query aligns to 3:390/391 of 8u98A

query
sites
8u98A
D
 
D
T
 
T
I
 
A
L
 
L
V
 
V
H
 
N
A
 
A
G
 
G
R
 
R
D
 
R
P
 
K
R
 
K
N
 
Y
N
 
T
H
 
Q
G
 
G
I
 
S
V
 
V
N
 
N
P
 
S
P
 
V
V
 
I
Y
 
Q
H
 
R
C
 
A
S
 
S
T
 
S
V
 
L
L
 
V
F
 
F
P
 
D
T
 
T
L
 
V
D
 
E
A
 
A
L
 
K
E
 
K
E
 
H
A
 
A
D
 
T
R
 
R
N
 
N
M
 
R
L
 
A
T
 
K
-
 
G
S
 
E
V
 
L
N
 
F
Y
|
Y
G
 
G
R
|
R
M
 
R
G
 
G
T
 
T
P
 
L
T
 
T
T
 
H
F
 
F
A
 
S
F
 
L
E
 
Q
E
 
E
A
 
A
A
 
M
A
 
C
A
 
E
L
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
Y
 
A
R
 
G
S
 
C
V
 
A
N
 
L
T
 
F
G
 
P
S
x
C
G
|
G
L
x
A
A
 
A
A
 
A
I
 
V
A
 
A
V
 
N
A
 
T
L
 
I
S
 
L
A
 
A
F
 
F
T
 
V
K
 
E
A
 
Q
G
 
G
D
 
D
H
 
H
V
 
V
L
 
L
I
 
M
T
 
T
D
 
N
S
 
T
A
 
A
Y
|
Y
G
 
E
P
 
P
T
 
S
R
 
Q
R
 
D
F
 
F
A
 
C
R
 
T
E
 
K
T
 
I
L
 
L
A
 
A
P
 
K
Y
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
T
V
 
T
E
 
G
F
 
W
Y
 
F
D
 
D
P
 
P
C
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
N
L
 
L
L
 
I
R
 
Q
P
 
P
N
 
N
T
 
T
S
 
K
V
 
V
V
 
V
F
 
F
L
 
L
E
 
E
S
 
S
P
 
P
G
 
G
S
 
S
L
 
I
T
 
T
F
 
M
E
 
E
I
 
V
Q
 
H
D
 
D
V
 
V
P
 
P
A
 
A
I
 
I
A
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
V
K
 
R
T
 
R
V
 
V
G
 
A
-
 
P
-
 
E
A
 
A
T
 
I
V
 
I
M
 
M
I
 
I
D
|
D
N
 
N
T
 
T
W
 
W
A
 
A
T
 
A
P
 
G
L
 
V
F
 
L
F
 
F
R
 
K
P
 
A
F
 
L
D
 
D
H
 
F
G
 
G
V
 
I
D
 
D
L
 
I
S
 
S
I
 
I
H
 
Q
A
|
A
A
 
A
T
|
T
K
|
K
Y
 
Y
M
 
L
V
 
I
G
 
G
H
 
H
A
 
S
D
 
D
A
 
G
M
|
M
L
 
I
G
 
G
V
 
T
I
 
A
T
 
V
C
 
A
R
 
-
D
 
N
E
 
A
A
 
R
S
 
C
W
 
W
T
 
E
V
 
Q
V
 
L
K
 
C
K
 
E
T
 
N
A
 
A
T
 
Y
R
 
L
F
 
M
G
 
G
V
 
Q
C
 
M
G
 
I
G
 
D
P
 
A
D
 
D
D
 
T
L
 
A
Y
 
Y
L
 
M
G
 
T
L
 
S
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
R
S
 
T
M
 
L
A
 
G
V
 
V
R
 
R
M
 
L
R
 
R
Q
 
Q
H
 
H
Q
 
H
D
 
E
S
 
S
A
 
S
L
 
L
A
 
R
L
 
V
A
 
A
D
 
E
W
 
W
L
 
L
A
 
A
A
 
Q
R
 
H
P
 
P
E
 
Q
V
 
V
T
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
N
H
 
H
P
 
P
A
 
A
R
 
L
P
 
P
D
 
G
F
 
S
P
 
K
G
 
G
H
 
H
A
 
E
L
 
F
W
 
W
K
 
K
R
 
R
D
 
D
F
 
F
T
 
S
G
 
G
S
 
S
S
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
F
S
 
S
I
 
F
I
 
V
V
 
L
N
 
N
P
 
K
-
 
R
V
 
L
P
 
T
R
 
D
K
 
A
A
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
M
 
Y
L
 
L
D
 
D
G
 
N
M
 
F
E
 
S
L
 
L
F
 
F
G
 
S
M
 
M
G
 
A
Y
|
Y
S
|
S
W
|
W
G
 
G
G
 
G
F
 
F
E
 
E
S
 
S
L
 
L
I
 
I
L
 
L
P
 
A
A
 
N
R
 
Q
P
 
P
-
 
E
-
 
H
-
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
I
R
 
R
S
 
P
A
 
E
T
 
A
R
 
E
W
 
V
S
 
D
D
 
F
P
 
S
G
 
G
Q
 
T
L
 
L
L
 
I
R
|
R
L
 
L
H
 
H
A
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
S
 
N
P
 
V
D
 
D
D
 
D
L
 
L
I
 
L
R
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
F
R
 
A
R
 
R
M
 
I

8sa9A Crystal structure of cystathionine beta lyase from klebsiella aerogenes, plp-oxamate adduct (c2 form)
48% identity, 97% coverage: 7:388/392 of query aligns to 3:390/391 of 8sa9A

query
sites
8sa9A
D
 
D
T
 
T
I
 
A
L
 
L
V
 
V
H
 
N
A
 
A
G
 
G
R
 
R
D
 
R
P
 
K
R
 
K
N
 
Y
N
 
T
H
 
Q
G
 
G
I
 
S
V
 
V
N
 
N
P
 
S
P
 
V
V
 
I
Y
 
Q
H
 
R
C
 
A
S
 
S
T
 
S
V
 
L
L
 
V
F
 
F
P
 
D
T
 
T
L
 
V
D
 
E
A
 
A
L
 
K
E
 
K
E
 
H
A
 
A
D
 
T
R
 
R
N
 
N
M
 
R
L
 
A
T
 
K
-
 
G
S
 
E
V
 
L
N
 
F
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
M
 
R
G
 
G
T
 
T
P
 
L
T
 
T
T
 
H
F
 
F
A
 
S
F
 
L
E
 
Q
E
 
E
A
 
A
A
 
M
A
 
C
A
 
E
L
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
Y
 
A
R
 
G
S
 
C
V
 
A
N
 
L
T
 
F
G
 
P
S
x
C
G
|
G
L
x
A
A
 
A
A
 
A
I
 
V
A
 
A
V
 
N
A
 
T
L
 
I
S
 
L
A
 
A
F
 
F
T
 
V
K
 
E
A
 
Q
G
 
G
D
 
D
H
 
H
V
 
V
L
 
L
I
 
M
T
 
T
D
 
N
S
 
T
A
 
A
Y
|
Y
G
 
E
P
 
P
T
 
S
R
 
Q
R
 
D
F
 
F
A
 
C
R
 
T
E
 
K
T
 
I
L
 
L
A
 
A
P
 
K
Y
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
T
V
 
T
E
 
G
F
 
W
Y
 
F
D
 
D
P
 
P
C
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
N
L
 
L
L
 
I
R
 
Q
P
 
P
N
 
N
T
 
T
S
 
K
V
 
V
V
 
V
F
 
F
L
 
L
E
 
E
S
 
S
P
 
P
G
 
G
S
 
S
L
 
I
T
 
T
F
 
M
E
 
E
I
 
V
Q
 
H
D
 
D
V
 
V
P
 
P
A
 
A
I
 
I
A
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
V
K
 
R
T
 
R
V
 
V
G
 
A
-
 
P
-
 
E
A
 
A
T
 
I
V
 
I
M
 
M
I
 
I
D
|
D
N
 
N
T
 
T
W
 
W
A
 
A
T
 
A
P
 
G
L
 
V
F
 
L
F
 
F
R
 
K
P
 
A
F
 
L
D
 
D
H
 
F
G
 
G
V
 
I
D
 
D
L
 
I
S
 
S
I
 
I
H
 
Q
A
|
A
A
 
A
T
|
T
K
|
K
Y
 
Y
M
 
L
V
 
I
G
 
G
H
 
H
A
 
S
D
 
D
A
 
G
M
|
M
L
 
I
G
 
G
V
 
T
I
 
A
T
 
V
C
 
A
R
 
-
D
 
N
E
 
A
A
 
R
S
 
C
W
 
W
T
 
E
V
 
Q
V
 
L
K
 
C
K
 
E
T
 
N
A
 
A
T
 
Y
R
 
L
F
 
M
G
 
G
V
 
Q
C
 
M
G
 
I
G
 
D
P
 
A
D
 
D
D
 
T
L
 
A
Y
 
Y
L
 
M
G
 
T
L
 
S
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
R
S
 
T
M
 
L
A
 
G
V
 
V
R
 
R
M
 
L
R
 
R
Q
 
Q
H
 
H
Q
 
H
D
 
E
S
 
S
A
 
S
L
 
L
A
 
R
L
 
V
A
 
A
D
 
E
W
 
W
L
 
L
A
 
A
A
 
Q
R
 
H
P
 
P
E
 
Q
V
 
V
T
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
N
H
 
H
P
 
P
A
 
A
R
 
L
P
 
P
D
 
G
F
 
S
P
 
K
G
 
G
H
 
H
A
 
E
L
 
F
W
 
W
K
 
K
R
 
R
D
 
D
F
 
F
T
 
S
G
 
G
S
 
S
S
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
F
S
 
S
I
 
F
I
 
V
V
 
L
N
 
N
P
 
K
-
 
R
V
 
L
P
 
T
R
 
D
K
 
A
A
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
M
 
Y
L
 
L
D
 
D
G
 
N
M
 
F
E
 
S
L
 
L
F
 
F
G
 
S
M
 
M
G
 
A
Y
 
Y
S
|
S
W
|
W
G
 
G
G
 
G
F
 
F
E
 
E
S
 
S
L
 
L
I
 
I
L
 
L
P
 
A
A
 
N
R
 
Q
P
 
P
-
 
E
-
 
H
-
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
I
R
 
R
S
 
P
A
 
E
T
 
A
R
 
E
W
 
V
S
 
D
D
 
F
P
 
S
G
 
G
Q
 
T
L
 
L
L
 
I
R
|
R
L
 
L
H
 
H
A
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
S
 
N
P
 
V
D
 
D
D
 
D
L
 
L
I
 
L
R
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
F
R
 
A
R
 
R
M
 
I

4l0oH Structure determination of cystathionine gamma-synthase from helicobacter pylori
34% identity, 97% coverage: 7:388/392 of query aligns to 4:373/373 of 4l0oH

query
sites
4l0oH
D
 
Q
T
 
T
I
 
K
L
 
L
V
 
I
H
 
H
A
 
G
G
 
G
R
 
I
D
 
S
P
 
E
R
 
D
N
 
A
N
 
T
H
 
T
G
 
G
I
 
A
V
 
V
N
 
S
P
 
V
P
 
P
V
 
I
Y
 
Y
H
 
Q
C
 
T
S
 
S
T
 
T
V
 
Y
L
 
-
F
 
-
P
 
-
T
 
R
L
 
Q
D
 
D
A
 
G
L
 
Y
E
 
E
E
 
-
A
 
-
D
 
-
R
 
-
N
 
-
M
 
-
L
 
-
T
 
-
S
 
-
V
 
-
N
 
-
Y
|
Y
G
 
S
R
|
R
M
 
S
G
 
G
T
 
N
P
 
P
T
 
T
T
 
R
F
 
F
A
 
A
F
 
L
E
 
E
E
 
E
A
 
L
A
 
I
A
 
A
A
 
D
L
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
Y
 
V
R
 
K
S
 
G
V
 
F
N
 
A
T
 
F
G
 
A
S
|
S
G
|
G
L
|
L
A
 
A
A
 
G
I
 
I
A
 
H
V
 
A
A
 
V
L
 
F
S
 
S
A
 
-
F
 
L
T
 
L
K
 
Q
A
 
S
G
 
G
D
 
D
H
 
H
V
 
V
L
 
L
I
 
L
T
 
G
D
 
D
S
 
D
A
 
V
Y
|
Y
G
 
G
P
 
G
T
 
T
R
 
F
R
 
R
F
 
L
A
 
F
R
 
N
E
 
Q
T
 
V
L
 
L
A
 
V
P
 
K
Y
 
N
G
 
G
V
 
L
E
 
S
V
 
C
E
 
T
F
 
I
Y
 
I
D
 
D
P
 
T
C
 
S
I
 
D
G
 
I
A
 
S
G
 
Q
I
 
I
A
 
K
A
 
K
L
 
A
L
 
I
R
 
K
P
 
P
N
 
N
T
 
T
S
 
K
V
 
A
V
 
L
F
 
Y
L
 
L
E
 
E
S
 
T
P
 
P
G
 
S
S
 
N
L
 
P
T
 
L
F
 
L
E
 
K
I
 
I
Q
 
T
D
 
D
V
 
L
P
 
A
A
 
Q
I
 
C
A
 
A
A
 
S
A
 
V
A
 
A
K
 
K
T
 
D
V
 
H
G
 
G
A
 
L
T
 
L
V
 
T
M
 
I
I
 
V
D
|
D
N
 
N
T
 
T
W
 
F
A
 
A
T
 
T
P
 
P
L
 
Y
F
 
Y
F
 
Q
R
 
N
P
 
P
F
 
L
D
 
L
H
 
L
G
 
G
V
 
A
D
 
D
L
 
I
S
 
V
I
 
A
H
 
H
A
x
S
A
 
G
T
|
T
K
|
K
Y
 
Y
M
 
L
V
 
G
G
 
G
H
 
H
A
 
S
D
 
D
A
 
V
M
 
V
L
 
A
G
 
G
V
 
L
I
 
V
T
 
T
C
 
T
R
 
N
D
 
N
E
 
E
A
 
A
S
 
L
W
 
A
T
 
Q
V
 
E
V
 
I
K
 
A
K
 
F
T
 
F
A
 
Q
T
 
N
R
 
A
F
 
I
G
 
G
V
 
G
C
 
V
G
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
Q
D
 
D
L
 
S
Y
 
W
L
 
L
G
 
L
L
 
Q
R
 
R
G
 
G
L
 
I
R
 
K
S
 
T
M
 
L
A
 
G
V
 
L
R
 
R
M
 
M
R
 
E
Q
 
A
H
 
H
Q
 
Q
D
 
K
S
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
C
L
 
V
A
 
A
D
 
E
W
 
F
L
 
L
A
 
E
A
 
K
R
 
H
P
 
P
E
 
K
V
 
V
T
 
E
R
 
R
V
 
V
L
 
Y
H
 
Y
P
 
P
A
 
G
R
 
L
P
 
P
D
 
T
F
 
H
P
 
P
G
 
N
H
 
Y
A
 
E
L
 
L
W
 
A
K
 
K
R
 
K
D
 
Q
F
 
M
T
 
R
G
 
G
S
 
F
S
 
S
G
 
G
L
 
M
F
 
L
S
 
S
I
 
F
I
 
T
V
 
L
N
 
K
P
 
-
V
 
-
P
 
N
R
 
D
K
 
S
A
 
E
L
 
A
A
 
V
A
 
A
M
 
F
L
 
V
D
 
E
G
 
S
M
 
L
E
 
K
L
 
L
F
 
F
G
 
I
M
 
L
G
 
G
Y
 
E
S
 
S
W
 
L
G
 
G
G
 
G
F
 
V
E
 
E
S
 
S
L
 
L
I
 
V
-
 
G
L
 
I
P
 
P
A
 
A
R
 
F
-
 
M
-
 
T
-
 
H
-
 
A
-
 
C
-
 
I
P
 
P
A
 
K
A
 
T
V
 
Q
R
 
R
S
 
E
A
 
A
T
 
A
R
 
G
W
 
I
S
 
R
D
 
D
P
 
G
G
 
-
Q
 
-
L
 
L
L
 
V
R
 
R
L
 
L
H
 
S
A
 
V
G
 
G
L
 
I
E
 
E
S
 
H
P
 
E
D
 
Q
D
 
D
L
 
L
I
 
L
R
 
E
D
 
D
L
 
L
E
 
E
A
 
Q
G
 
A
F
 
F
R
 
A
R
 
K
M
 
I

4omaA The crystal structure of methionine gamma-lyase from citrobacter freundii in complex with l-cycloserine pyridoxal-5'-phosphate (see paper)
32% identity, 97% coverage: 7:387/392 of query aligns to 9:394/396 of 4omaA

query
sites
4omaA
D
 
N
T
 
T
I
 
Q
L
 
I
V
 
V
H
 
H
A
 
A
G
 
G
R
 
Q
D
 
Q
P
 
P
R
 
D
N
 
P
N
 
S
H
 
T
G
 
G
I
 
A
V
 
L
N
 
S
P
 
T
P
 
P
V
 
I
Y
 
F
H
 
Q
C
 
T
S
 
S
T
 
T
V
 
F
L
 
V
F
 
F
P
 
D
T
 
S
L
 
A
D
 
E
-
 
Q
-
 
G
-
 
A
-
 
A
-
 
R
-
 
F
A
 
A
L
 
L
E
 
E
E
 
E
A
 
-
D
 
-
R
 
-
N
 
-
M
 
-
L
 
-
T
 
S
S
 
G
V
 
Y
N
 
I
Y
 
Y
G
 
T
R
|
R
M
 
L
G
 
G
T
 
N
P
 
P
T
 
T
T
 
T
F
 
D
A
 
A
F
 
L
E
 
E
E
 
K
A
 
K
A
 
L
A
 
A
A
 
V
L
 
L
E
 
E
G
 
R
G
 
G
Y
 
E
R
 
A
S
 
G
V
 
L
N
 
A
T
 
T
G
 
A
S
 
S
G
|
G
L
x
I
A
 
S
A
 
A
I
 
I
A
 
T
V
 
T
A
 
T
L
 
L
S
 
L
A
 
T
F
 
L
T
 
C
K
 
Q
A
 
Q
G
 
G
D
 
D
H
 
H
V
 
I
L
 
V
I
 
S
T
 
A
D
 
S
S
 
A
A
 
I
Y
|
Y
G
 
G
P
 
C
T
 
T
R
 
H
R
 
A
F
 
F
A
 
L
R
 
S
E
 
H
T
 
S
L
 
M
A
 
P
P
 
K
Y
 
F
G
 
G
V
 
I
E
 
N
V
 
V
E
 
S
F
 
F
Y
 
V
D
 
D
P
 
A
C
 
A
I
 
K
G
 
P
A
 
E
G
 
E
I
 
I
A
 
R
A
 
A
L
 
A
L
 
M
R
 
R
P
 
P
N
 
E
T
 
T
S
 
K
V
 
V
V
 
V
F
 
Y
L
 
I
E
 
E
S
 
T
P
 
P
G
 
A
S
 
N
L
 
P
T
 
T
F
 
L
E
 
S
I
 
L
Q
 
V
D
 
D
V
 
I
P
 
E
A
 
T
I
 
V
A
 
A
A
 
G
A
 
I
A
 
A
K
 
H
T
 
Q
V
 
Q
G
 
G
A
 
A
T
 
L
V
 
L
M
 
V
I
 
V
D
|
D
N
 
N
T
 
T
W
 
F
A
 
M
T
 
S
P
 
P
L
 
Y
F
 
C
F
 
Q
R
 
Q
P
 
P
F
 
L
D
 
Q
H
 
L
G
 
G
V
 
A
D
 
D
L
 
I
S
 
V
I
 
V
H
 
H
A
x
S
A
 
V
T
|
T
K
|
K
Y
 
Y
M
 
I
V
 
N
G
 
G
H
 
H
A
 
G
D
 
D
A
 
V
M
 
I
L
 
G
G
 
G
V
 
I
I
 
I
T
 
V
C
 
G
R
 
K
-
 
Q
-
 
E
-
 
F
-
 
I
D
 
D
E
 
Q
A
 
A
S
 
R
W
 
F
T
 
V
V
 
G
V
 
L
K
 
K
K
 
D
T
 
I
A
 
T
T
 
-
R
 
-
F
 
-
G
 
G
V
 
G
C
 
C
G
 
M
G
 
S
P
 
P
D
 
F
D
 
N
L
 
A
Y
 
W
L
 
L
G
 
T
L
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
V
R
 
K
S
 
T
M
 
L
A
 
G
V
 
I
R
 
R
M
 
M
R
 
E
Q
 
R
H
 
H
Q
 
C
D
 
E
S
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
K
L
 
I
A
 
A
D
 
R
W
 
F
L
 
L
A
 
E
A
 
G
R
 
H
P
 
P
E
 
S
V
 
I
T
 
T
R
 
R
V
 
V
L
 
Y
H
 
Y
P
 
P
A
 
G
R
 
L
P
 
S
D
 
S
F
 
H
P
 
P
G
 
Q
H
 
Y
A
 
E
L
 
L
W
 
G
K
 
Q
R
 
R
D
 
Q
F
 
M
T
 
S
G
 
L
S
 
P
S
 
G
G
 
G
L
 
I
F
 
I
S
 
S
I
 
F
I
 
E
V
 
I
N
 
A
P
 
G
V
 
-
P
 
G
R
 
L
K
 
E
A
 
A
L
 
G
A
 
R
A
 
R
M
 
M
L
 
I
D
 
N
G
 
S
M
 
V
E
 
E
L
 
L
F
 
C
G
 
L
M
 
L
G
 
A
Y
x
V
S
|
S
W
 
L
G
 
G
G
 
D
F
 
T
E
 
E
S
 
T
L
 
L
I
 
I
-
 
Q
-
 
H
-
 
P
-
 
A
-
 
S
L
 
M
P
 
T
A
 
H
R
 
S
P
 
P
A
 
V
A
 
A
V
 
P
R
 
E
S
 
E
A
 
R
T
 
L
R
 
K
W
 
A
S
 
G
D
 
I
P
 
T
G
 
D
Q
 
G
L
 
L
L
 
I
R
|
R
L
 
L
H
 
S
A
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
E
S
 
D
P
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
I
I
 
I
R
 
N
D
 
D
L
 
L
E
 
E
A
 
H
G
 
A
F
 
I
R
 
R
R
 
K

3jwbA Crystal structure of l-methionine gamma-lyase from citrobacter freundii with norleucine (see paper)
32% identity, 97% coverage: 7:387/392 of query aligns to 9:394/396 of 3jwbA

query
sites
3jwbA
D
 
N
T
 
T
I
 
Q
L
 
I
V
 
V
H
 
H
A
 
A
G
 
G
R
 
Q
D
 
Q
P
 
P
R
 
D
N
 
P
N
 
S
H
 
T
G
 
G
I
 
A
V
 
L
N
 
S
P
 
T
P
 
P
V
 
I
Y
 
F
H
 
Q
C
 
T
S
 
S
T
 
T
V
 
F
L
 
V
F
 
F
P
 
D
T
 
S
L
 
A
D
 
E
-
 
Q
-
 
G
-
 
A
-
 
A
-
 
R
-
 
F
A
 
A
L
 
L
E
 
E
E
 
E
A
 
-
D
 
-
R
 
-
N
 
-
M
 
-
L
 
-
T
 
S
S
 
G
V
 
Y
N
 
I
Y
 
Y
G
 
T
R
|
R
M
 
L
G
 
G
T
 
N
P
 
P
T
 
T
T
 
T
F
 
D
A
 
A
F
 
L
E
 
E
E
 
K
A
 
K
A
 
L
A
 
A
A
 
V
L
 
L
E
 
E
G
 
R
G
 
G
Y
 
E
R
 
A
S
 
G
V
 
L
N
 
A
T
 
T
G
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
I
A
 
S
A
 
A
I
 
I
A
 
T
V
 
T
A
 
T
L
 
L
S
 
L
A
 
T
F
 
L
T
 
C
K
 
Q
A
 
Q
G
 
G
D
 
D
H
 
H
V
 
I
L
 
V
I
 
S
T
 
A
D
 
S
S
 
A
A
 
I
Y
|
Y
G
 
G
P
 
C
T
 
T
R
 
H
R
 
A
F
 
F
A
 
L
R
 
S
E
 
H
T
 
S
L
 
M
A
 
P
P
 
K
Y
 
F
G
 
G
V
 
I
E
 
N
V
 
V
E
 
S
F
 
F
Y
 
V
D
 
D
P
 
A
C
 
A
I
 
K
G
 
P
A
 
E
G
 
E
I
 
I
A
 
R
A
 
A
L
 
A
L
 
M
R
 
R
P
 
P
N
 
E
T
 
T
S
 
K
V
 
V
V
 
V
F
 
Y
L
 
I
E
 
E
S
 
T
P
 
P
G
 
A
S
 
N
L
 
P
T
 
T
F
 
L
E
 
S
I
 
L
Q
 
V
D
 
D
V
 
I
P
 
E
A
 
T
I
 
V
A
 
A
A
 
G
A
 
I
A
 
A
K
 
H
T
 
Q
V
 
Q
G
 
G
A
 
A
T
 
L
V
 
L
M
 
V
I
 
V
D
|
D
N
 
N
T
 
T
W
 
F
A
 
M
T
 
S
P
 
P
L
 
Y
F
 
C
F
 
Q
R
 
Q
P
 
P
F
 
L
D
 
Q
H
 
L
G
 
G
V
 
A
D
 
D
L
 
I
S
 
V
I
 
V
H
 
H
A
 
S
A
 
V
T
 
T
K
|
K
Y
 
Y
M
 
I
V
 
N
G
 
G
H
 
H
A
 
G
D
 
D
A
 
V
M
 
I
L
 
G
G
 
G
V
 
I
I
 
I
T
 
V
C
 
G
R
 
K
-
 
Q
-
 
E
-
 
F
-
 
I
D
 
D
E
 
Q
A
 
A
S
 
R
W
 
F
T
 
V
V
 
G
V
 
L
K
 
K
K
 
D
T
 
I
A
 
T
T
 
-
R
 
-
F
 
-
G
 
G
V
 
G
C
 
C
G
 
M
G
 
S
P
 
P
D
 
F
D
 
N
L
 
A
Y
 
W
L
 
L
G
 
T
L
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
V
R
 
K
S
 
T
M
 
L
A
 
G
V
 
I
R
 
R
M
 
M
R
 
E
Q
 
R
H
 
H
Q
 
C
D
 
E
S
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
K
L
 
I
A
 
A
D
 
R
W
 
F
L
 
L
A
 
E
A
 
G
R
 
H
P
 
P
E
 
S
V
 
I
T
 
T
R
 
R
V
 
V
L
 
Y
H
 
Y
P
 
P
A
 
G
R
 
L
P
 
S
D
 
S
F
 
H
P
 
P
G
 
Q
H
 
Y
A
 
E
L
 
L
W
 
G
K
 
Q
R
 
R
D
 
Q
F
 
M
T
 
S
G
 
L
S
 
P
S
 
G
G
 
G
L
 
I
F
 
I
S
 
S
I
 
F
I
 
E
V
 
I
N
 
A
P
 
G
V
 
-
P
 
G
R
 
L
K
 
E
A
 
A
L
 
G
A
 
R
A
 
R
M
 
M
L
 
I
D
 
N
G
 
S
M
 
V
E
 
E
L
 
L
F
 
C
G
 
L
M
 
L
G
 
A
Y
 
V
S
|
S
W
 
L
G
 
G
G
 
D
F
 
T
E
 
E
S
 
T
L
 
L
I
 
I
-
 
Q
-
 
H
-
 
P
-
 
A
-
 
S
L
 
M
P
 
T
A
 
H
R
 
S
P
 
P
A
 
V
A
 
A
V
 
P
R
 
E
S
 
E
A
 
R
T
 
L
R
 
K
W
 
A
S
 
G
D
 
I
P
 
T
G
 
D
Q
 
G
L
 
L
L
 
I
R
|
R
L
 
L
H
 
S
A
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
E
S
 
D
P
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
I
I
 
I
R
 
N
D
 
D
L
 
L
E
 
E
A
 
H
G
 
A
F
 
I
R
 
R
R
 
K

3jwaA Crystal structure of l-methionine gamma-lyase from citrobacter freundii with methionine phosphinate (see paper)
32% identity, 97% coverage: 7:387/392 of query aligns to 9:394/396 of 3jwaA

query
sites
3jwaA
D
 
N
T
 
T
I
 
Q
L
 
I
V
 
V
H
 
H
A
 
A
G
 
G
R
 
Q
D
 
Q
P
 
P
R
 
D
N
 
P
N
 
S
H
 
T
G
 
G
I
 
A
V
 
L
N
 
S
P
 
T
P
 
P
V
 
I
Y
 
F
H
 
Q
C
 
T
S
 
S
T
 
T
V
 
F
L
 
V
F
 
F
P
 
D
T
 
S
L
 
A
D
 
E
-
 
Q
-
 
G
-
 
A
-
 
A
-
 
R
-
 
F
A
 
A
L
 
L
E
 
E
E
 
E
A
 
-
D
 
-
R
 
-
N
 
-
M
 
-
L
 
-
T
 
S
S
 
G
V
 
Y
N
 
I
Y
 
Y
G
 
T
R
|
R
M
 
L
G
 
G
T
 
N
P
 
P
T
 
T
T
 
T
F
 
D
A
 
A
F
 
L
E
 
E
E
 
K
A
 
K
A
 
L
A
 
A
A
 
V
L
 
L
E
 
E
G
 
R
G
 
G
Y
 
E
R
 
A
S
 
G
V
 
L
N
 
A
T
 
T
G
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
I
A
 
S
A
 
A
I
 
I
A
 
T
V
 
T
A
 
T
L
 
L
S
 
L
A
 
T
F
 
L
T
 
C
K
 
Q
A
 
Q
G
 
G
D
 
D
H
 
H
V
 
I
L
 
V
I
 
S
T
 
A
D
 
S
S
 
A
A
 
I
Y
|
Y
G
 
G
P
 
C
T
 
T
R
 
H
R
 
A
F
 
F
A
 
L
R
 
S
E
 
H
T
 
S
L
 
M
A
 
P
P
 
K
Y
 
F
G
 
G
V
 
I
E
 
N
V
 
V
E
 
S
F
 
F
Y
 
V
D
 
D
P
 
A
C
 
A
I
 
K
G
 
P
A
 
E
G
 
E
I
 
I
A
 
R
A
 
A
L
 
A
L
 
M
R
 
R
P
 
P
N
 
E
T
 
T
S
 
K
V
 
V
V
 
V
F
 
Y
L
 
I
E
 
E
S
 
T
P
 
P
G
 
A
S
 
N
L
 
P
T
 
T
F
 
L
E
 
S
I
 
L
Q
 
V
D
 
D
V
 
I
P
 
E
A
 
T
I
 
V
A
 
A
A
 
G
A
 
I
A
 
A
K
 
H
T
 
Q
V
 
Q
G
 
G
A
 
A
T
 
L
V
 
L
M
 
V
I
 
V
D
|
D
N
 
N
T
 
T
W
 
F
A
 
M
T
 
S
P
 
P
L
 
Y
F
 
C
F
 
Q
R
 
Q
P
 
P
F
 
L
D
 
Q
H
 
L
G
 
G
V
 
A
D
 
D
L
 
I
S
 
V
I
 
V
H
 
H
A
 
S
A
 
V
T
 
T
K
|
K
Y
 
Y
M
 
I
V
 
N
G
 
G
H
 
H
A
 
G
D
 
D
A
 
V
M
 
I
L
 
G
G
 
G
V
 
I
I
 
I
T
 
V
C
 
G
R
 
K
-
 
Q
-
 
E
-
 
F
-
 
I
D
 
D
E
 
Q
A
 
A
S
 
R
W
 
F
T
 
V
V
 
G
V
 
L
K
 
K
K
 
D
T
 
I
A
 
T
T
 
-
R
 
-
F
 
-
G
 
G
V
 
G
C
 
C
G
 
M
G
 
S
P
 
P
D
 
F
D
 
N
L
 
A
Y
 
W
L
 
L
G
 
T
L
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
V
R
 
K
S
 
T
M
 
L
A
 
G
V
 
I
R
 
R
M
 
M
R
 
E
Q
 
R
H
 
H
Q
 
C
D
 
E
S
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
K
L
 
I
A
 
A
D
 
R
W
 
F
L
 
L
A
 
E
A
 
G
R
 
H
P
 
P
E
 
S
V
 
I
T
 
T
R
 
R
V
 
V
L
 
Y
H
 
Y
P
 
P
A
 
G
R
 
L
P
 
S
D
 
S
F
 
H
P
 
P
G
 
Q
H
 
Y
A
 
E
L
 
L
W
 
G
K
 
Q
R
 
R
D
 
Q
F
 
M
T
 
S
G
 
L
S
 
P
S
 
G
G
 
G
L
 
I
F
 
I
S
 
S
I
 
F
I
 
E
V
 
I
N
 
A
P
 
G
V
 
-
P
 
G
R
 
L
K
 
E
A
 
A
L
 
G
A
 
R
A
 
R
M
 
M
L
 
I
D
 
N
G
 
S
M
 
V
E
 
E
L
 
L
F
 
C
G
 
L
M
 
L
G
 
A
Y
x
V
S
|
S
W
 
L
G
 
G
G
 
D
F
 
T
E
 
E
S
 
T
L
 
L
I
 
I
-
 
Q
-
 
H
-
 
P
-
 
A
-
 
S
L
 
M
P
 
T
A
 
H
R
 
S
P
 
P
A
 
V
A
 
A
V
 
P
R
 
E
S
 
E
A
 
R
T
 
L
R
 
K
W
 
A
S
 
G
D
 
I
P
 
T
G
 
D
Q
 
G
L
 
L
L
 
I
R
|
R
L
 
L
H
 
S
A
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
E
S
 
D
P
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
I
I
 
I
R
 
N
D
 
D
L
 
L
E
 
E
A
 
H
G
 
A
F
 
I
R
 
R
R
 
K

3jw9A Crystal structure of l-methionine gamma-lyase from citrobacter freundii with s-ethyl-cysteine (see paper)
32% identity, 97% coverage: 7:387/392 of query aligns to 9:394/396 of 3jw9A

query
sites
3jw9A
D
 
N
T
 
T
I
 
Q
L
 
I
V
 
V
H
 
H
A
 
A
G
 
G
R
 
Q
D
 
Q
P
 
P
R
 
D
N
 
P
N
 
S
H
 
T
G
 
G
I
 
A
V
 
L
N
 
S
P
 
T
P
 
P
V
 
I
Y
 
F
H
 
Q
C
 
T
S
 
S
T
 
T
V
 
F
L
 
V
F
 
F
P
 
D
T
 
S
L
 
A
D
 
E
-
 
Q
-
 
G
-
 
A
-
 
A
-
 
R
-
 
F
A
 
A
L
 
L
E
 
E
E
 
E
A
 
-
D
 
-
R
 
-
N
 
-
M
 
-
L
 
-
T
 
S
S
 
G
V
 
Y
N
 
I
Y
 
Y
G
 
T
R
|
R
M
 
L
G
 
G
T
 
N
P
 
P
T
 
T
T
 
T
F
 
D
A
 
A
F
 
L
E
 
E
E
 
K
A
 
K
A
 
L
A
 
A
A
 
V
L
 
L
E
 
E
G
 
R
G
 
G
Y
 
E
R
 
A
S
 
G
V
 
L
N
 
A
T
 
T
G
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
I
A
 
S
A
 
A
I
 
I
A
 
T
V
 
T
A
 
T
L
 
L
S
 
L
A
 
T
F
 
L
T
 
C
K
 
Q
A
 
Q
G
 
G
D
 
D
H
 
H
V
 
I
L
 
V
I
 
S
T
 
A
D
 
S
S
 
A
A
 
I
Y
|
Y
G
 
G
P
 
C
T
 
T
R
 
H
R
 
A
F
 
F
A
 
L
R
 
S
E
 
H
T
 
S
L
 
M
A
 
P
P
 
K
Y
 
F
G
 
G
V
 
I
E
 
N
V
 
V
E
 
S
F
 
F
Y
 
V
D
 
D
P
 
A
C
 
A
I
 
K
G
 
P
A
 
E
G
 
E
I
 
I
A
 
R
A
 
A
L
 
A
L
 
M
R
 
R
P
 
P
N
 
E
T
 
T
S
 
K
V
 
V
V
 
V
F
 
Y
L
 
I
E
 
E
S
 
T
P
 
P
G
 
A
S
 
N
L
 
P
T
 
T
F
 
L
E
 
S
I
 
L
Q
 
V
D
 
D
V
 
I
P
 
E
A
 
T
I
 
V
A
 
A
A
 
G
A
 
I
A
 
A
K
 
H
T
 
Q
V
 
Q
G
 
G
A
 
A
T
 
L
V
 
L
M
 
V
I
 
V
D
|
D
N
 
N
T
 
T
W
 
F
A
 
M
T
 
S
P
 
P
L
 
Y
F
 
C
F
 
Q
R
 
Q
P
 
P
F
 
L
D
 
Q
H
 
L
G
 
G
V
 
A
D
 
D
L
 
I
S
 
V
I
 
V
H
 
H
A
 
S
A
 
V
T
 
T
K
|
K
Y
 
Y
M
 
I
V
 
N
G
 
G
H
 
H
A
 
G
D
 
D
A
 
V
M
 
I
L
 
G
G
 
G
V
 
I
I
 
I
T
 
V
C
 
G
R
 
K
-
 
Q
-
 
E
-
 
F
-
 
I
D
 
D
E
 
Q
A
 
A
S
 
R
W
 
F
T
 
V
V
 
G
V
 
L
K
 
K
K
 
D
T
 
I
A
 
T
T
 
-
R
 
-
F
 
-
G
 
G
V
 
G
C
 
C
G
 
M
G
 
S
P
 
P
D
 
F
D
 
N
L
 
A
Y
 
W
L
 
L
G
 
T
L
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
V
R
 
K
S
 
T
M
 
L
A
 
G
V
 
I
R
 
R
M
 
M
R
 
E
Q
 
R
H
 
H
Q
 
C
D
 
E
S
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
K
L
 
I
A
 
A
D
 
R
W
 
F
L
 
L
A
 
E
A
 
G
R
 
H
P
 
P
E
 
S
V
 
I
T
 
T
R
 
R
V
 
V
L
 
Y
H
 
Y
P
 
P
A
 
G
R
 
L
P
 
S
D
 
S
F
 
H
P
 
P
G
 
Q
H
 
Y
A
 
E
L
 
L
W
 
G
K
 
Q
R
 
R
D
 
Q
F
 
M
T
 
S
G
 
L
S
 
P
S
 
G
G
 
G
L
 
I
F
 
I
S
 
S
I
 
F
I
 
E
V
 
I
N
 
A
P
 
G
V
 
-
P
 
G
R
 
L
K
 
E
A
 
A
L
 
G
A
 
R
A
 
R
M
 
M
L
 
I
D
 
N
G
 
S
M
 
V
E
 
E
L
 
L
F
 
C
G
 
L
M
 
L
G
 
A
Y
x
V
S
|
S
W
 
L
G
 
G
G
 
D
F
 
T
E
 
E
S
 
T
L
 
L
I
 
I
-
 
Q
-
 
H
-
 
P
-
 
A
-
 
S
L
 
M
P
 
T
A
 
H
R
 
S
P
 
P
A
 
V
A
 
A
V
 
P
R
 
E
S
 
E
A
 
R
T
 
L
R
 
K
W
 
A
S
 
G
D
 
I
P
 
T
G
 
D
Q
 
G
L
 
L
L
 
I
R
 
R
L
 
L
H
 
S
A
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
E
S
 
D
P
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
I
I
 
I
R
 
N
D
 
D
L
 
L
E
 
E
A
 
H
G
 
A
F
 
I
R
 
R
R
 
K

4hf8A Crystal structure of l-methionine gamma-lyase from citrobacter freundii with glycine (see paper)
32% identity, 97% coverage: 7:387/392 of query aligns to 9:394/396 of 4hf8A

query
sites
4hf8A
D
 
N
T
 
T
I
 
Q
L
 
I
V
 
V
H
 
H
A
 
A
G
 
G
R
 
Q
D
 
Q
P
 
P
R
 
D
N
 
P
N
 
S
H
 
T
G
 
G
I
 
A
V
 
L
N
 
S
P
 
T
P
 
P
V
 
I
Y
 
F
H
 
Q
C
 
T
S
 
S
T
 
T
V
 
F
L
 
V
F
 
F
P
 
D
T
 
S
L
 
A
D
 
E
-
 
Q
-
 
G
-
 
A
-
 
A
-
 
R
-
 
F
A
 
A
L
 
L
E
 
E
E
 
E
A
 
-
D
 
-
R
 
-
N
 
-
M
 
-
L
 
-
T
 
S
S
 
G
V
 
Y
N
 
I
Y
 
Y
G
 
T
R
|
R
M
 
L
G
 
G
T
 
N
P
 
P
T
 
T
T
 
T
F
 
D
A
 
A
F
 
L
E
 
E
E
 
K
A
 
K
A
 
L
A
 
A
A
 
V
L
 
L
E
 
E
G
 
R
G
 
G
Y
 
E
R
 
A
S
 
G
V
 
L
N
 
A
T
 
T
G
 
A
S
 
S
G
|
G
L
x
I
A
 
S
A
 
A
I
 
I
A
 
T
V
 
T
A
 
T
L
 
L
S
 
L
A
 
T
F
 
L
T
 
C
K
 
Q
A
 
Q
G
 
G
D
 
D
H
 
H
V
 
I
L
 
V
I
 
S
T
 
A
D
 
S
S
 
A
A
 
I
Y
|
Y
G
 
G
P
 
C
T
 
T
R
 
H
R
 
A
F
 
F
A
 
L
R
 
S
E
 
H
T
 
S
L
 
M
A
 
P
P
 
K
Y
 
F
G
 
G
V
 
I
E
 
N
V
 
V
E
 
R
F
 
F
Y
 
V
D
 
D
P
 
A
C
 
A
I
 
K
G
 
P
A
 
E
G
 
E
I
 
I
A
 
R
A
 
A
L
 
A
L
 
M
R
 
R
P
 
P
N
 
E
T
 
T
S
 
K
V
 
V
V
 
V
F
 
Y
L
 
I
E
|
E
S
 
T
P
 
P
G
 
A
S
x
N
L
 
P
T
 
T
F
 
L
E
 
S
I
 
L
Q
 
V
D
 
D
V
 
I
P
 
E
A
 
T
I
 
V
A
 
A
A
 
G
A
 
I
A
 
A
K
 
H
T
 
Q
V
 
Q
G
 
G
A
 
A
T
 
L
V
 
L
M
 
V
I
 
V
D
|
D
N
 
N
T
 
T
W
 
F
A
 
M
T
 
S
P
 
P
L
 
Y
F
 
C
F
 
Q
R
 
Q
P
 
P
F
 
L
D
 
Q
H
 
L
G
 
G
V
 
A
D
 
D
L
 
I
S
 
V
I
 
V
H
 
H
A
x
S
A
 
V
T
 
T
K
|
K
Y
 
Y
M
 
I
V
 
N
G
 
G
H
 
H
A
 
G
D
 
D
A
 
V
M
 
I
L
 
G
G
 
G
V
 
I
I
 
I
T
 
V
C
 
G
R
 
K
-
 
Q
-
 
E
-
 
F
-
 
I
D
 
D
E
 
Q
A
 
A
S
 
R
W
 
F
T
 
V
V
 
G
V
 
L
K
 
K
K
 
D
T
 
I
A
 
T
T
 
-
R
 
-
F
 
-
G
 
G
V
 
G
C
 
C
G
 
M
G
 
S
P
 
P
D
 
F
D
 
N
L
 
A
Y
 
W
L
 
L
G
 
T
L
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
V
R
 
K
S
 
T
M
 
L
A
 
G
V
 
I
R
 
R
M
 
M
R
 
E
Q
 
R
H
 
H
Q
 
C
D
 
E
S
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
K
L
 
I
A
 
A
D
 
R
W
 
F
L
 
L
A
 
E
A
 
G
R
 
H
P
 
P
E
 
S
V
 
I
T
 
T
R
 
R
V
 
V
L
 
Y
H
 
Y
P
 
P
A
 
G
R
 
L
P
 
S
D
 
S
F
 
H
P
 
P
G
 
Q
H
 
Y
A
 
E
L
 
L
W
 
G
K
 
Q
R
 
R
D
 
Q
F
 
M
T
 
S
G
 
L
S
 
P
S
 
G
G
 
G
L
 
I
F
 
I
S
 
S
I
 
F
I
 
E
V
 
I
N
 
A
P
 
G
V
 
-
P
 
G
R
 
L
K
 
E
A
 
A
L
 
G
A
 
R
A
 
R
M
 
M
L
 
I
D
 
N
G
 
S
M
 
V
E
 
E
L
 
L
F
 
C
G
 
L
M
 
L
G
 
A
Y
 
V
S
|
S
W
 
L
G
 
G
G
 
D
F
 
T
E
 
E
S
 
T
L
 
L
I
 
I
-
 
Q
-
 
H
-
 
P
-
 
A
-
 
S
L
 
M
P
 
T
A
 
H
R
 
S
P
 
P
A
 
V
A
 
A
V
 
P
R
 
E
S
 
E
A
 
R
T
 
L
R
 
K
W
 
A
S
 
G
D
 
I
P
 
T
G
 
D
Q
 
G
L
 
L
L
 
I
R
|
R
L
 
L
H
 
S
A
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
E
S
 
D
P
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
I
I
 
I
R
 
N
D
 
D
L
 
L
E
 
E
A
 
H
G
 
A
F
 
I
R
 
R
R
 
K

5m3zA Crystal structure of citrobacter freundii methionine gamma-lyase with c115h replacement in the complex with l-norleucine (see paper)
32% identity, 97% coverage: 7:387/392 of query aligns to 8:393/395 of 5m3zA

query
sites
5m3zA
D
 
N
T
 
T
I
 
Q
L
 
I
V
 
V
H
 
H
A
 
A
G
 
G
R
 
Q
D
 
Q
P
 
P
R
 
D
N
 
P
N
 
S
H
 
T
G
 
G
I
 
A
V
 
L
N
 
S
P
 
T
P
 
P
V
 
I
Y
 
F
H
 
Q
C
 
T
S
 
S
T
 
T
V
 
F
L
 
V
F
 
F
P
 
D
T
 
S
L
 
A
D
 
E
-
 
Q
-
 
G
-
 
A
-
 
A
-
 
R
-
 
F
A
 
A
L
 
L
E
 
E
E
 
E
A
 
-
D
 
-
R
 
-
N
 
-
M
 
-
L
 
-
T
 
S
S
 
G
V
 
Y
N
 
I
Y
 
Y
G
 
T
R
|
R
M
 
L
G
 
G
T
 
N
P
 
P
T
 
T
T
 
T
F
 
D
A
 
A
F
 
L
E
 
E
E
 
K
A
 
K
A
 
L
A
 
A
A
 
V
L
 
L
E
 
E
G
 
R
G
 
G
Y
 
E
R
 
A
S
 
G
V
 
L
N
 
A
T
 
T
G
 
A
S
 
S
G
|
G
L
x
I
A
 
S
A
 
A
I
 
I
A
 
T
V
 
T
A
 
T
L
 
L
S
 
L
A
 
T
F
 
L
T
 
C
K
 
Q
A
 
Q
G
 
G
D
 
D
H
 
H
V
 
I
L
 
V
I
 
S
T
 
A
D
 
S
S
 
A
A
 
I
Y
|
Y
G
 
G
P
x
H
T
 
T
R
 
H
R
 
A
F
 
F
A
 
L
R
 
S
E
 
H
T
 
S
L
 
M
A
 
P
P
 
K
Y
 
F
G
 
G
V
 
I
E
 
N
V
 
V
E
 
S
F
 
F
Y
 
V
D
 
D
P
 
A
C
 
A
I
 
K
G
 
P
A
 
E
G
 
E
I
 
I
A
 
R
A
 
A
L
 
A
L
 
M
R
 
R
P
 
P
N
 
E
T
 
T
S
 
K
V
 
V
V
 
V
F
 
Y
L
 
I
E
|
E
S
 
T
P
 
P
G
 
A
S
 
N
L
 
P
T
 
T
F
 
L
E
 
S
I
 
L
Q
 
V
D
 
D
V
 
I
P
 
E
A
 
T
I
 
V
A
 
A
A
 
G
A
 
I
A
 
A
K
 
H
T
 
Q
V
 
Q
G
 
G
A
 
A
T
 
L
V
 
L
M
 
V
I
 
V
D
|
D
N
 
N
T
|
T
W
 
F
A
 
M
T
 
S
P
 
P
L
 
Y
F
 
C
F
 
Q
R
 
Q
P
 
P
F
 
L
D
 
Q
H
 
L
G
 
G
V
 
A
D
 
D
L
 
I
S
 
V
I
 
V
H
 
H
A
x
S
A
 
V
T
|
T
K
|
K
Y
 
Y
M
 
I
V
 
N
G
 
G
H
 
H
A
 
G
D
 
D
A
 
V
M
 
I
L
 
G
G
 
G
V
 
I
I
 
I
T
 
V
C
 
G
R
 
K
-
 
Q
-
 
E
-
 
F
-
 
I
D
 
D
E
 
Q
A
 
A
S
 
R
W
 
F
T
 
V
V
 
G
V
 
L
K
 
K
K
 
D
T
 
I
A
 
T
T
 
-
R
 
-
F
 
-
G
 
G
V
 
G
C
 
C
G
 
M
G
 
S
P
 
P
D
 
F
D
 
N
L
 
A
Y
 
W
L
 
L
G
 
T
L
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
V
R
 
K
S
 
T
M
 
L
A
 
G
V
 
I
R
 
R
M
 
M
R
 
E
Q
 
R
H
 
H
Q
 
C
D
 
E
S
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
K
L
 
I
A
 
A
D
 
R
W
 
F
L
 
L
A
 
E
A
 
G
R
 
H
P
 
P
E
 
S
V
 
I
T
 
T
R
 
R
V
 
V
L
 
Y
H
 
Y
P
 
P
A
 
G
R
 
L
P
 
S
D
 
S
F
 
H
P
 
P
G
 
Q
H
 
Y
A
 
E
L
 
L
W
 
G
K
 
Q
R
 
R
D
 
Q
F
 
M
T
 
S
G
 
L
S
 
P
S
 
G
G
 
G
L
 
I
F
 
I
S
 
S
I
 
F
I
 
E
V
 
I
N
 
A
P
 
G
V
 
-
P
 
G
R
 
L
K
 
E
A
 
A
L
 
G
A
 
R
A
 
R
M
 
M
L
 
I
D
 
N
G
 
S
M
 
V
E
 
E
L
 
L
F
 
C
G
 
L
M
 
L
G
 
A
Y
x
V
S
|
S
W
 
L
G
 
G
G
 
D
F
 
T
E
 
E
S
 
T
L
 
L
I
 
I
-
 
Q
-
 
H
-
 
P
-
 
A
-
 
S
L
 
M
P
 
T
A
 
H
R
 
S
P
 
P
A
 
V
A
 
A
V
 
P
R
 
E
S
 
E
A
 
R
T
 
L
R
 
K
W
 
A
S
 
G
D
 
I
P
 
T
G
 
D
Q
 
G
L
 
L
L
 
I
R
|
R
L
 
L
H
 
S
A
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
E
S
 
D
P
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
I
I
 
I
R
 
N
D
 
D
L
 
L
E
 
E
A
 
H
G
 
A
F
 
I
R
 
R
R
 
K

6egrA Crystal structure of citrobacter freundii methionine gamma-lyase with v358y replacement (see paper)
32% identity, 97% coverage: 7:387/392 of query aligns to 9:394/396 of 6egrA

query
sites
6egrA
D
 
N
T
 
T
I
 
Q
L
 
I
V
 
V
H
 
H
A
 
A
G
 
G
R
 
Q
D
 
Q
P
 
P
R
 
D
N
 
P
N
 
S
H
 
T
G
 
G
I
 
A
V
 
L
N
 
S
P
 
T
P
 
P
V
 
I
Y
 
F
H
 
Q
C
 
T
S
 
S
T
 
T
V
 
F
L
 
V
F
 
F
P
 
D
T
 
S
L
 
A
D
 
E
-
 
Q
-
 
G
-
 
A
-
 
A
-
 
R
-
 
F
A
 
A
L
 
L
E
 
E
E
 
E
A
 
-
D
 
-
R
 
-
N
 
-
M
 
-
L
 
-
T
 
S
S
 
G
V
 
Y
N
 
I
Y
 
Y
G
 
T
R
 
R
M
 
L
G
 
G
T
 
N
P
 
P
T
 
T
T
 
T
F
 
D
A
 
A
F
 
L
E
 
E
E
 
K
A
 
K
A
 
L
A
 
A
A
 
V
L
 
L
E
 
E
G
 
R
G
 
G
Y
 
E
R
 
A
S
 
G
V
 
L
N
 
A
T
 
T
G
 
A
S
 
S
G
|
G
L
x
I
A
 
S
A
 
A
I
 
I
A
 
T
V
 
T
A
 
T
L
 
L
S
 
L
A
 
T
F
 
L
T
 
C
K
 
Q
A
 
Q
G
 
G
D
 
D
H
 
H
V
 
I
L
 
V
I
 
S
T
 
A
D
 
S
S
 
A
A
 
I
Y
|
Y
G
 
G
P
 
C
T
 
T
R
 
H
R
 
A
F
 
F
A
 
L
R
 
S
E
 
H
T
 
S
L
 
M
A
 
P
P
 
K
Y
 
F
G
 
G
V
 
I
E
 
N
V
 
V
E
 
S
F
 
F
Y
 
V
D
 
D
P
 
A
C
 
A
I
 
K
G
 
P
A
 
E
G
 
E
I
 
I
A
 
R
A
 
A
L
 
A
L
 
M
R
 
R
P
 
P
N
 
E
T
 
T
S
 
K
V
 
V
V
 
V
F
 
Y
L
 
I
E
|
E
S
 
T
P
 
P
G
 
A
S
 
N
L
 
P
T
 
T
F
 
L
E
 
S
I
 
L
Q
 
V
D
 
D
V
 
I
P
 
E
A
 
T
I
 
V
A
 
A
A
 
G
A
 
I
A
 
A
K
 
H
T
 
Q
V
 
Q
G
 
G
A
 
A
T
 
L
V
 
L
M
 
V
I
 
V
D
|
D
N
 
N
T
|
T
W
x
F
A
 
M
T
 
S
P
 
P
L
 
Y
F
 
C
F
 
Q
R
 
Q
P
 
P
F
 
L
D
 
Q
H
 
L
G
 
G
V
 
A
D
 
D
L
 
I
S
 
V
I
 
V
H
 
H
A
x
S
A
 
V
T
|
T
K
|
K
Y
 
Y
M
 
I
V
 
N
G
 
G
H
 
H
A
 
G
D
 
D
A
 
V
M
 
I
L
 
G
G
 
G
V
 
I
I
 
I
T
 
V
C
 
G
R
 
K
-
 
Q
-
 
E
-
 
F
-
 
I
D
 
D
E
 
Q
A
 
A
S
 
R
W
 
F
T
 
V
V
 
G
V
 
L
K
 
K
K
 
D
T
 
I
A
 
T
T
 
-
R
 
-
F
 
-
G
 
G
V
 
G
C
 
C
G
 
M
G
 
S
P
 
P
D
 
F
D
 
N
L
 
A
Y
 
W
L
 
L
G
 
T
L
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
V
R
 
K
S
 
T
M
 
L
A
 
G
V
 
I
R
 
R
M
 
M
R
 
E
Q
 
R
H
 
H
Q
 
C
D
 
E
S
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
K
L
 
I
A
 
A
D
 
R
W
 
F
L
 
L
A
 
E
A
 
G
R
 
H
P
 
P
E
 
S
V
 
I
T
 
T
R
 
R
V
 
V
L
 
Y
H
 
Y
P
 
P
A
 
G
R
 
L
P
 
S
D
 
S
F
 
H
P
 
P
G
 
Q
H
 
Y
A
 
E
L
 
L
W
 
G
K
 
Q
R
 
R
D
 
Q
F
 
M
T
 
S
G
 
L
S
 
P
S
 
G
G
 
G
L
 
I
F
 
I
S
 
S
I
 
F
I
 
E
V
 
I
N
 
A
P
 
G
V
 
-
P
 
G
R
 
L
K
 
E
A
 
A
L
 
G
A
 
R
A
 
R
M
 
M
L
 
I
D
 
N
G
 
S
M
 
V
E
 
E
L
 
L
F
 
C
G
 
L
M
 
L
G
 
A
Y
 
V
S
 
S
W
 
L
G
 
G
G
 
D
F
 
T
E
 
E
S
 
T
L
 
L
I
 
I
-
 
Q
-
 
H
-
 
P
-
 
A
-
 
S
L
 
M
P
 
T
A
 
H
R
 
S
P
 
P
A
 
Y
A
 
A
V
 
P
R
 
E
S
 
E
A
 
R
T
 
L
R
 
K
W
 
A
S
 
G
D
 
I
P
 
T
G
 
D
Q
 
G
L
 
L
L
 
I
R
 
R
L
 
L
H
 
S
A
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
E
S
 
D
P
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
I
I
 
I
R
 
N
D
 
D
L
 
L
E
 
E
A
 
H
G
 
A
F
 
I
R
 
R
R
 
K

3mkjA Methionine gamma-lyase from citrobacter freundii with pyridoximine-5'- phosphate (see paper)
32% identity, 97% coverage: 7:387/392 of query aligns to 9:383/386 of 3mkjA

query
sites
3mkjA
D
 
N
T
 
T
I
 
Q
L
 
I
V
 
V
H
 
H
A
 
A
G
 
G
R
 
Q
D
 
Q
P
 
P
R
 
D
N
 
P
N
 
S
H
 
T
G
 
G
I
 
A
V
 
L
N
 
S
P
 
T
P
 
P
V
 
I
Y
 
F
H
 
Q
C
 
T
S
 
S
T
 
T
V
 
F
L
 
V
F
 
F
P
 
-
T
 
-
L
 
-
D
 
D
A
 
S
L
 
A
E
 
E
E
 
Q
A
 
G
D
 
A
R
 
A
N
 
R
M
 
F
L
 
L
T
 
-
S
 
-
V
 
-
N
 
-
Y
 
-
G
 
-
R
 
-
M
 
-
G
 
G
T
 
N
P
 
P
T
 
T
T
 
T
F
 
D
A
 
A
F
 
L
E
 
E
E
 
K
A
 
K
A
 
L
A
 
A
A
 
V
L
 
L
E
 
E
G
 
R
G
 
G
Y
 
E
R
 
A
S
 
G
V
 
L
N
 
A
T
 
T
G
 
A
S
 
S
G
|
G
L
x
I
A
 
S
A
 
A
I
 
I
A
 
T
V
 
T
A
 
T
L
 
L
S
 
L
A
 
T
F
 
L
T
 
C
K
 
Q
A
 
Q
G
 
G
D
 
D
H
 
H
V
 
I
L
 
V
I
 
S
T
 
A
D
 
S
S
 
A
A
 
I
Y
|
Y
G
 
G
P
 
C
T
 
T
R
 
H
R
 
A
F
 
F
A
 
L
R
 
S
E
 
H
T
 
S
L
 
M
A
 
P
P
 
K
Y
 
F
G
 
G
V
 
I
E
 
N
V
 
V
E
 
S
F
 
F
Y
 
V
D
 
D
P
 
A
C
 
A
I
 
K
G
 
P
A
 
E
G
 
E
I
 
I
A
 
R
A
 
A
L
 
A
L
 
M
R
 
R
P
 
P
N
 
E
T
 
T
S
 
K
V
 
V
V
 
V
F
 
Y
L
 
I
E
|
E
S
 
T
P
 
P
G
 
A
S
 
N
L
 
P
T
 
T
F
 
L
E
 
S
I
 
L
Q
 
V
D
 
D
V
 
I
P
 
E
A
 
T
I
 
V
A
 
A
A
 
G
A
 
I
A
 
A
K
 
H
T
 
Q
V
 
Q
G
 
G
A
 
A
T
 
L
V
 
L
M
 
V
I
 
V
D
|
D
N
 
N
T
 
T
W
x
F
A
 
M
T
 
S
P
 
P
L
 
Y
F
 
C
F
 
Q
R
 
Q
P
 
P
F
 
L
D
 
Q
H
 
L
G
 
G
V
 
A
D
 
D
L
 
I
S
 
V
I
 
V
H
 
H
A
x
S
A
 
V
T
|
T
K
|
K
Y
 
Y
M
 
I
V
 
N
G
 
G
H
 
H
A
 
G
D
 
D
A
 
V
M
 
I
L
 
G
G
 
G
V
 
I
I
 
I
T
 
V
C
 
G
R
 
K
-
 
Q
-
 
E
-
 
F
-
 
I
D
 
D
E
 
Q
A
 
A
S
 
R
W
 
F
T
 
V
V
 
G
V
 
L
K
 
K
K
 
D
T
 
I
A
 
T
T
 
-
R
 
-
F
 
-
G
 
G
V
 
G
C
 
C
G
 
M
G
 
S
P
 
P
D
 
F
D
 
N
L
 
A
Y
 
W
L
 
L
G
 
T
L
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
V
R
 
K
S
 
T
M
 
L
A
 
G
V
 
I
R
 
R
M
 
M
R
 
E
Q
 
R
H
 
H
Q
 
C
D
 
E
S
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
K
L
 
I
A
 
A
D
 
R
W
 
F
L
 
L
A
 
E
A
 
G
R
 
H
P
 
P
E
 
S
V
 
I
T
 
T
R
 
R
V
 
V
L
 
Y
H
 
Y
P
 
P
A
 
G
R
 
L
P
 
S
D
 
S
F
 
H
P
 
P
G
 
Q
H
 
Y
A
 
E
L
 
L
W
 
G
K
 
Q
R
 
R
D
 
Q
F
 
M
T
 
S
G
 
L
S
 
P
S
 
G
G
 
G
L
 
I
F
 
I
S
 
S
I
 
F
I
 
E
V
 
I
N
 
A
P
 
G
V
 
-
P
 
G
R
 
L
K
 
E
A
 
A
L
 
G
A
 
R
A
 
R
M
 
M
L
 
I
D
 
N
G
 
S
M
 
V
E
 
E
L
 
L
F
 
C
G
 
L
M
 
L
G
 
A
Y
 
V
S
 
S
W
 
L
G
 
G
G
 
D
F
 
T
E
 
E
S
 
T
L
 
L
I
 
I
-
 
Q
-
 
H
-
 
P
-
 
A
-
 
S
L
 
M
P
 
T
A
 
H
R
 
S
P
 
P
A
 
V
A
 
A
V
 
P
R
 
E
S
 
E
A
 
R
T
 
L
R
 
K
W
 
A
S
 
G
D
 
I
P
 
T
G
 
D
Q
 
G
L
 
L
L
 
I
R
 
R
L
 
L
H
 
S
A
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
E
S
 
D
P
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
I
I
 
I
R
 
N
D
 
D
L
 
L
E
 
E
A
 
H
G
 
A
F
 
I
R
 
R
R
 
K

Query Sequence

>WP_012973906.1 NCBI__GCF_000010725.1:WP_012973906.1
MKDVTKDTILVHAGRDPRNNHGIVNPPVYHCSTVLFPTLDALEEADRNMLTSVNYGRMGT
PTTFAFEEAAAALEGGYRSVNTGSGLAAIAVALSAFTKAGDHVLITDSAYGPTRRFARET
LAPYGVEVEFYDPCIGAGIAALLRPNTSVVFLESPGSLTFEIQDVPAIAAAAKTVGATVM
IDNTWATPLFFRPFDHGVDLSIHAATKYMVGHADAMLGVITCRDEASWTVVKKTATRFGV
CGGPDDLYLGLRGLRSMAVRMRQHQDSALALADWLAARPEVTRVLHPARPDFPGHALWKR
DFTGSSGLFSIIVNPVPRKALAAMLDGMELFGMGYSWGGFESLILPARPAAVRSATRWSD
PGQLLRLHAGLESPDDLIRDLEAGFRRMAAAL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory