SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012975564.1 NCBI__GCF_000010725.1:WP_012975564.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1g6hA Crystal structure of the adp conformation of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
34% identity, 86% coverage: 14:275/305 of query aligns to 4:253/254 of 1g6hA

query
sites
1g6hA
L
 
I
L
 
L
E
 
R
I
 
T
T
 
E
G
 
N
L
 
I
T
 
V
R
 
K
R
 
Y
F
|
F
G
 
G
G
 
E
L
x
F
T
 
K
A
 
A
V
 
L
N
 
D
G
 
G
L
 
V
S
 
S
L
 
I
T
 
S
V
 
V
G
 
N
E
 
K
G
 
G
E
 
D
L
 
V
V
 
T
S
 
L
V
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
F
 
I
N
 
N
L
 
V
I
 
I
S
 
T
G
 
G
L
 
F
D
 
L
A
 
K
P
 
A
D
 
D
A
 
E
G
 
G
T
 
R
V
 
V
T
 
Y
F
 
F
E
 
E
G
 
N
R
 
K
D
 
D
V
 
I
T
 
T
G
 
N
L
 
K
S
 
E
A
 
P
E
 
A
R
 
E
L
 
L
A
 
Y
E
 
H
L
 
Y
G
 
G
L
 
I
A
 
V
R
 
R
S
 
T
F
 
F
Q
 
Q
H
 
T
G
 
P
R
 
Q
V
 
P
F
 
L
G
 
K
N
 
E
L
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
L
D
 
E
N
 
N
V
 
L
L
 
L
V
 
I
G
 
G
A
 
E
H
 
I
T
 
C
R
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
I
 
-
P
 
P
V
 
G
V
 
E
G
 
S
P
 
P
L
 
L
V
 
N
E
 
S
L
 
L
A
 
F
L
 
Y
A
 
K
L
 
K
I
 
W
R
 
I
P
 
P
A
 
-
S
 
-
V
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
K
D
 
E
E
 
E
R
 
E
L
 
M
R
 
V
A
 
E
E
 
K
A
 
A
K
 
F
E
 
K
I
 
I
V
 
L
A
 
E
L
 
F
F
 
L
G
 
-
E
 
-
R
 
K
L
 
L
T
 
S
L
 
H
R
 
L
L
 
Y
D
 
D
K
 
R
P
 
K
V
 
A
H
 
G
S
 
E
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
A
 
G
N
 
Q
R
 
M
R
 
K
R
 
L
V
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
M
L
 
T
H
 
N
P
 
P
R
 
K
L
 
M
L
 
I
L
 
V
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
A
P
 
P
T
 
G
E
 
L
T
 
A
A
 
H
E
 
D
M
 
I
L
 
F
E
 
N
I
 
H
I
 
V
R
 
L
G
 
E
L
 
L
K
 
K
A
 
A
R
 
K
G
 
G
L
 
I
T
 
T
I
 
F
L
 
L
L
 
I
I
 
I
E
 
E
H
 
H
K
 
R
L
 
L
D
 
D
L
 
I
V
 
V
M
 
L
K
 
N
L
 
Y
S
 
I
D
 
D
R
 
H
V
 
L
V
 
Y
V
 
V
M
 
M
D
 
F
H
 
N
G
 
G
A
 
Q
C
 
I
I
 
I
A
 
A
E
 
E
G
 
G
L
 
R
P
 
G
A
 
E
A
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
N
V
 
V
A
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
P
A
 
K
V
 
V
I
 
V
E
 
E
A
 
I
Y
 
Y
L
 
I
G
 
G

1g9xB Characterization of the twinning structure of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
34% identity, 86% coverage: 14:275/305 of query aligns to 4:253/253 of 1g9xB

query
sites
1g9xB
L
 
I
L
 
L
E
 
R
I
 
T
T
 
E
G
 
N
L
 
I
T
 
V
R
 
K
R
 
Y
F
|
F
G
 
G
G
 
E
L
x
F
T
 
K
A
 
A
V
 
L
N
 
D
G
 
G
L
 
V
S
 
S
L
 
I
T
 
S
V
 
V
G
 
C
E
 
K
G
 
G
E
 
D
L
 
V
V
 
T
S
 
L
V
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
F
 
I
N
 
N
L
 
V
I
 
I
S
 
T
G
 
G
L
 
F
D
 
L
A
 
K
P
 
A
D
 
D
A
 
E
G
 
G
T
 
R
V
 
V
T
 
Y
F
 
F
E
 
E
G
 
N
R
 
K
D
 
D
V
 
I
T
 
T
G
 
N
L
 
K
S
 
E
A
 
P
E
 
A
R
 
E
L
 
L
A
 
Y
E
 
H
L
 
Y
G
 
G
L
 
I
A
 
V
R
 
R
S
 
T
F
 
F
Q
 
Q
H
 
T
G
 
P
R
 
Q
V
 
P
F
 
L
G
 
K
N
 
E
L
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
L
D
 
E
N
 
N
V
 
L
L
 
L
V
 
I
G
 
G
A
 
E
H
 
I
T
 
N
R
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
I
 
-
P
 
P
V
 
G
V
 
E
G
 
S
P
 
P
L
 
L
V
 
N
E
 
S
L
 
L
A
 
F
L
 
Y
A
 
K
L
 
K
I
 
W
R
 
I
P
 
P
A
 
-
S
 
-
V
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
K
D
 
E
E
 
E
R
 
E
L
 
M
R
 
V
A
 
E
E
 
K
A
 
A
K
 
F
E
 
K
I
 
I
V
 
L
A
 
E
L
 
F
F
 
L
G
 
-
E
 
-
R
 
K
L
 
L
T
 
S
L
 
H
R
 
L
L
 
Y
D
 
D
K
 
R
P
 
K
V
 
A
H
 
G
S
 
E
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
A
 
G
N
 
Q
R
 
M
R
 
K
R
 
L
V
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
M
L
 
T
H
 
N
P
 
P
R
 
K
L
 
M
L
 
I
L
 
V
L
 
M
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
A
P
 
P
T
 
G
E
 
L
T
 
A
A
 
H
E
 
D
M
 
I
L
 
F
E
 
N
I
 
H
I
 
V
R
 
L
G
 
E
L
 
L
K
 
K
A
 
A
R
 
K
G
 
G
L
 
I
T
 
T
I
 
F
L
 
L
L
 
I
I
 
I
E
 
E
H
 
H
K
 
R
L
 
L
D
 
D
L
 
I
V
 
V
M
 
L
K
 
N
L
 
Y
S
 
I
D
 
D
R
 
H
V
 
L
V
 
Y
V
 
V
M
 
M
D
 
F
H
 
N
G
 
G
A
 
Q
C
 
I
I
 
I
A
 
A
E
 
E
G
 
G
L
 
R
P
 
G
A
 
E
A
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
N
V
 
V
A
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
P
A
 
K
V
 
V
I
 
V
E
 
E
A
 
I
Y
 
Y
L
 
I
G
 
G

4u00A Crystal structure of ttha1159 in complex with adp (see paper)
33% identity, 84% coverage: 13:267/305 of query aligns to 1:227/241 of 4u00A

query
sites
4u00A
P
 
P
L
 
I
L
 
I
E
 
R
I
 
I
T
 
R
G
 
N
L
 
L
T
 
H
R
 
K
R
 
W
F
|
F
G
 
G
G
 
P
L
 
L
T
 
H
A
x
V
V
 
L
N
 
K
G
 
G
L
 
I
S
 
H
L
 
L
T
 
E
V
 
V
G
 
A
E
 
P
G
 
G
E
 
E
L
 
K
V
 
L
S
 
V
V
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
F
 
I
N
 
R
L
 
T
I
 
I
S
 
N
G
 
R
L
 
L
D
 
E
A
 
D
P
 
F
D
 
Q
A
 
E
G
 
G
T
 
E
V
 
V
T
 
V
F
 
V
E
 
D
G
 
G
R
 
L
D
 
S
V
 
V
T
 
K
G
 
D
L
 
D
S
 
R
A
 
A
E
 
L
R
 
R
L
 
E
A
 
I
E
 
R
L
 
R
G
 
E
L
 
V
A
 
G
R
 
M
S
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
Q
G
 
F
R
 
N
V
 
L
F
 
F
G
 
P
N
 
H
L
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
L
D
 
E
N
 
N
V
 
V
L
 
T
V
 
L
G
 
-
A
 
A
H
 
P
T
 
M
R
 
R
L
 
V
R
 
R
A
 
-
V
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
R
I
 
W
P
 
P
V
 
-
V
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
-
V
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
I
 
-
R
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
R
L
 
E
R
 
K
A
 
A
E
 
E
A
 
K
K
 
K
E
 
A
I
 
L
V
 
E
A
 
L
L
 
L
F
 
-
G
 
-
E
 
E
R
 
R
L
 
V
T
 
G
L
 
I
R
 
-
L
 
L
D
 
D
-
 
Q
-
 
A
-
 
R
K
 
K
P
 
Y
V
 
P
H
 
A
S
 
Q
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
A
 
G
N
 
Q
R
 
Q
R
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
M
H
 
E
P
 
P
R
 
K
L
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
N
 
D
P
 
P
T
 
E
E
 
M
T
 
V
A
 
G
E
 
E
M
 
V
L
 
L
E
 
D
I
 
V
I
 
M
R
 
R
G
 
D
L
 
L
K
 
A
A
 
Q
R
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
T
I
 
M
L
 
V
L
 
V
I
 
V
E
 
T
H
 
H
K
 
E
L
 
M
D
 
G
L
 
F
V
 
A
M
 
R
K
 
E
L
 
V
S
 
A
D
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
V
V
 
F
M
 
M
D
 
D
H
 
G
G
 
G
A
 
Q
C
 
I
I
 
V
A
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
R
P
 
P
A
 
E
A
 
E
V
 
I
A
 
F
S
 
T
D
 
R
P
 
P

P69874 Spermidine/putrescine import ATP-binding protein PotA; EC 7.6.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
30% identity, 86% coverage: 5:267/305 of query aligns to 8:239/378 of P69874

query
sites
P69874
S
 
N
K
 
K
N
 
Q
P
 
P
L
 
S
P
 
S
K
 
L
K
 
S
P
 
P
L
 
L
L
 
V
E
 
Q
I
 
L
T
 
A
G
 
G
L
 
I
T
 
R
R
 
K
R
x
C
F
|
F
G
 
D
G
 
G
L
 
K
T
 
E
A
 
V
V
 
I
N
 
P
G
 
Q
L
 
L
S
 
D
L
 
L
T
 
T
V
 
I
G
 
N
E
 
N
G
 
G
E
 
E
L
x
F
V
 
L
S
 
T
V
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
 
G
A
x
C
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
L
 
V
F
x
L
N
 
R
L
 
L
I
 
I
S
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
E
A
 
T
P
 
V
D
 
D
A
 
S
G
 
G
T
 
R
V
 
I
T
 
M
F
x
L
E
 
D
G
 
N
R
 
E
D
 
D
V
 
I
T
 
T
G
 
H
L
 
V
S
 
P
A
 
A
E
 
E
R
 
N
L
 
R
A
 
Y
E
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
V
A
 
N
R
 
T
S
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
S
G
 
Y
R
 
A
V
 
L
F
 
F
G
 
P
N
 
H
L
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
F
D
 
E
N
 
N
V
 
V
L
 
A
V
 
F
G
 
G
A
 
-
H
 
-
T
 
-
R
 
-
L
 
L
R
 
R
A
 
M
V
 
Q
R
 
K
P
 
T
R
 
P
I
 
A
P
 
A
V
 
E
V
 
I
G
 
T
P
 
P
L
 
R
V
 
V
E
 
M
L
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
R
L
 
M
I
x
V
R
 
Q
P
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
K
 
-
E
 
-
I
 
-
V
 
L
A
 
E
L
 
T
F
 
F
G
 
A
E
 
Q
R
 
R
L
 
-
T
 
-
L
 
-
R
 
-
L
 
-
D
 
-
K
 
K
P
 
P
V
 
-
H
 
H
S
 
Q
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
A
 
G
N
 
Q
R
 
Q
R
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
V
A
 
V
L
 
N
H
 
K
P
 
P
R
 
R
L
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
|
D
E
 
E
P
 
S
T
 
L
A
 
S
G
 
A
M
 
L
N
 
D
P
 
Y
T
 
K
E
 
L
T
 
R
A
 
K
E
 
Q
M
 
M
L
 
Q
E
 
N
I
 
E
I
 
L
R
 
K
G
 
A
L
 
L
K
 
Q
A
 
R
R
 
K
-
 
L
G
 
G
L
 
I
T
 
T
I
 
F
L
 
V
L
 
F
I
 
V
E
 
T
H
 
H
K
 
D
L
 
Q
D
 
E
L
 
E
V
 
A
M
 
L
K
 
T
L
 
M
S
 
S
D
 
D
R
 
R
V
 
I
V
 
V
V
 
V
M
 
M
D
 
R
H
 
D
G
 
G
A
 
R
C
 
I
I
 
E
A
 
Q
E
 
D
G
 
G
L
 
T
P
 
P
A
 
R
A
 
E
V
 
I
A
 
Y
S
 
E
D
 
E
P
 
P

Sites not aligning to the query:

3c4jA Abc protein artp in complex with atp-gamma-s
30% identity, 83% coverage: 14:267/305 of query aligns to 3:229/242 of 3c4jA

query
sites
3c4jA
L
 
M
L
 
I
E
 
D
I
 
V
T
 
H
G
 
Q
L
 
L
T
 
K
R
 
K
R
 
S
F
|
F
G
 
G
G
 
S
L
 
L
T
 
E
A
x
V
V
 
L
N
 
K
G
 
G
L
 
I
S
 
N
L
 
V
T
 
H
V
 
I
G
 
R
E
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
V
V
 
V
S
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
F
F
 
L
N
 
R
L
 
C
I
 
L
S
 
N
G
 
L
L
 
L
D
 
E
A
 
D
P
 
F
D
 
D
A
 
E
G
 
G
T
 
E
V
 
I
T
 
I
F
 
I
E
 
D
G
 
G
R
 
I
D
 
N
V
 
L
-
 
K
-
 
A
-
 
K
-
 
D
T
 
T
G
 
N
L
 
L
S
 
N
A
 
K
E
 
V
R
 
R
L
 
-
A
 
E
E
 
E
L
 
V
G
 
G
L
 
M
A
 
V
R
 
-
S
 
-
F
 
F
Q
 
Q
H
 
R
G
 
F
R
 
N
V
 
L
F
 
F
G
 
P
N
 
H
L
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
L
D
 
N
N
 
N
V
 
I
L
 
T
V
 
L
G
 
A
A
 
-
H
 
-
T
 
-
R
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
I
 
-
P
 
-
V
 
-
V
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
-
V
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
I
 
-
R
 
-
P
 
P
A
 
M
S
 
K
V
 
V
R
 
R
A
 
K
E
 
W
D
 
-
E
 
P
R
 
R
L
 
E
R
 
K
A
 
A
E
 
E
A
 
A
K
 
K
E
 
A
I
 
M
V
 
E
A
 
L
L
 
L
F
 
D
G
 
K
E
 
V
R
 
G
L
 
L
T
 
K
L
 
D
R
 
K
L
 
A
D
 
H
K
 
A
P
 
Y
V
 
P
H
 
D
S
 
S
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
A
 
G
N
 
Q
R
 
A
R
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
M
H
 
E
P
 
P
R
 
K
L
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
N
 
D
P
 
P
T
 
E
E
 
M
T
 
V
A
 
G
E
 
E
M
 
V
L
 
L
E
 
S
I
 
V
I
 
M
R
 
K
G
 
Q
L
 
L
K
 
A
A
 
N
R
 
E
G
 
G
L
 
M
T
 
T
I
 
M
L
 
V
L
 
V
I
 
V
E
 
T
H
 
H
K
 
E
L
 
M
D
 
G
L
 
F
V
 
A
M
 
R
K
 
E
L
 
V
S
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
L
V
 
F
M
 
M
D
 
D
H
 
G
G
 
G
A
 
Y
C
 
I
I
 
I
A
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
K
P
 
P
A
 
E
A
 
D
V
 
L
A
 
F
S
 
D
D
 
R
P
 
P

3c41J Abc protein artp in complex with amp-pnp/mg2+
30% identity, 83% coverage: 14:267/305 of query aligns to 3:229/242 of 3c41J

query
sites
3c41J
L
 
M
L
 
I
E
 
D
I
 
V
T
 
H
G
 
Q
L
 
L
T
 
K
R
 
K
R
 
S
F
|
F
G
 
G
G
 
S
L
 
L
T
 
E
A
x
V
V
 
L
N
 
K
G
 
G
L
 
I
S
 
N
L
 
V
T
 
H
V
 
I
G
 
R
E
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
V
V
 
V
S
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
F
F
 
L
N
 
R
L
 
C
I
 
L
S
 
N
G
 
L
L
 
L
D
 
E
A
 
D
P
 
F
D
 
D
A
 
E
G
 
G
T
 
E
V
 
I
T
 
I
F
 
I
E
 
D
G
 
G
R
 
I
D
 
N
V
 
L
-
 
K
-
 
A
-
 
K
-
 
D
T
 
T
G
 
N
L
 
L
S
 
N
A
 
K
E
 
V
R
 
R
L
 
-
A
 
E
E
 
E
L
 
V
G
 
G
L
 
M
A
 
V
R
 
-
S
 
-
F
 
F
Q
 
Q
H
 
R
G
 
F
R
 
N
V
 
L
F
 
F
G
 
P
N
 
H
L
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
L
D
 
N
N
 
N
V
 
I
L
 
T
V
 
L
G
 
A
A
 
-
H
 
-
T
 
-
R
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
I
 
-
P
 
-
V
 
-
V
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
-
V
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
I
 
-
R
 
-
P
 
P
A
 
M
S
 
K
V
 
V
R
 
R
A
 
K
E
 
W
D
 
-
E
 
P
R
 
R
L
 
E
R
 
K
A
 
A
E
 
E
A
 
A
K
 
K
E
 
A
I
 
M
V
 
E
A
 
L
L
 
L
F
 
D
G
 
K
E
 
V
R
 
G
L
 
L
T
 
K
L
 
D
R
 
K
L
 
A
D
 
H
K
 
A
P
 
Y
V
 
P
H
 
D
S
 
S
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
A
 
G
N
 
Q
R
 
A
R
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
M
H
 
E
P
 
P
R
 
K
L
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
|
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
N
 
D
P
 
P
T
 
E
E
 
M
T
 
V
A
 
G
E
 
E
M
 
V
L
 
L
E
 
S
I
 
V
I
 
M
R
 
K
G
 
Q
L
 
L
K
 
A
A
 
N
R
 
E
G
 
G
L
 
M
T
 
T
I
 
M
L
 
V
L
 
V
I
 
V
E
 
T
H
 
H
K
 
E
L
 
M
D
 
G
L
 
F
V
 
A
M
 
R
K
 
E
L
 
V
S
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
L
V
 
F
M
 
M
D
 
D
H
 
G
G
 
G
A
 
Y
C
 
I
I
 
I
A
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
K
P
 
P
A
 
E
A
 
D
V
 
L
A
 
F
S
 
D
D
 
R
P
 
P

2olkA Abc protein artp in complex with adp-beta-s
30% identity, 83% coverage: 14:267/305 of query aligns to 3:229/242 of 2olkA

query
sites
2olkA
L
 
M
L
 
I
E
 
D
I
 
V
T
 
H
G
 
Q
L
 
L
T
 
K
R
 
K
R
 
S
F
|
F
G
 
G
G
 
S
L
 
L
T
 
E
A
x
V
V
 
L
N
 
K
G
 
G
L
 
I
S
 
N
L
 
V
T
 
H
V
 
I
G
 
R
E
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
V
V
 
V
S
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
F
F
 
L
N
 
R
L
 
C
I
 
L
S
 
N
G
 
L
L
 
L
D
 
E
A
 
D
P
 
F
D
 
D
A
 
E
G
 
G
T
 
E
V
 
I
T
 
I
F
 
I
E
 
D
G
 
G
R
 
I
D
 
N
V
 
L
-
 
K
-
 
A
-
 
K
-
 
D
T
 
T
G
 
N
L
 
L
S
 
N
A
 
K
E
 
V
R
 
R
L
 
-
A
 
E
E
 
E
L
 
V
G
 
G
L
 
M
A
 
V
R
 
-
S
 
-
F
 
F
Q
 
Q
H
 
R
G
 
F
R
 
N
V
 
L
F
 
F
G
 
P
N
 
H
L
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
L
D
 
N
N
 
N
V
 
I
L
 
T
V
 
L
G
 
A
A
 
-
H
 
-
T
 
-
R
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
I
 
-
P
 
-
V
 
-
V
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
-
V
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
I
 
-
R
 
-
P
 
P
A
 
M
S
 
K
V
 
V
R
 
R
A
 
K
E
 
W
D
 
-
E
 
P
R
 
R
L
 
E
R
 
K
A
 
A
E
 
E
A
 
A
K
 
K
E
 
A
I
 
M
V
 
E
A
 
L
L
 
L
F
 
D
G
 
K
E
 
V
R
 
G
L
 
L
T
 
K
L
 
D
R
 
K
L
 
A
D
 
H
K
 
A
P
 
Y
V
 
P
H
 
D
S
 
S
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
A
 
G
N
 
Q
R
 
A
R
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
M
H
 
E
P
 
P
R
 
K
L
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
N
 
D
P
 
P
T
 
E
E
 
M
T
 
V
A
 
G
E
 
E
M
 
V
L
 
L
E
 
S
I
 
V
I
 
M
R
 
K
G
 
Q
L
 
L
K
 
A
A
 
N
R
 
E
G
 
G
L
 
M
T
 
T
I
 
M
L
 
V
L
 
V
I
 
V
E
 
T
H
 
H
K
 
E
L
 
M
D
 
G
L
 
F
V
 
A
M
 
R
K
 
E
L
 
V
S
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
L
V
 
F
M
 
M
D
 
D
H
 
G
G
 
G
A
 
Y
C
 
I
I
 
I
A
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
K
P
 
P
A
 
E
A
 
D
V
 
L
A
 
F
S
 
D
D
 
R
P
 
P

2oljA Abc protein artp in complex with adp/mg2+
30% identity, 83% coverage: 14:267/305 of query aligns to 3:229/242 of 2oljA

query
sites
2oljA
L
 
M
L
 
I
E
 
D
I
 
V
T
 
H
G
 
Q
L
 
L
T
 
K
R
 
K
R
 
S
F
|
F
G
 
G
G
 
S
L
 
L
T
 
E
A
x
V
V
 
L
N
 
K
G
 
G
L
 
I
S
 
N
L
 
V
T
 
H
V
 
I
G
 
R
E
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
V
V
 
V
S
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
F
F
 
L
N
 
R
L
 
C
I
 
L
S
 
N
G
 
L
L
 
L
D
 
E
A
 
D
P
 
F
D
 
D
A
 
E
G
 
G
T
 
E
V
 
I
T
 
I
F
 
I
E
 
D
G
 
G
R
 
I
D
 
N
V
 
L
-
 
K
-
 
A
-
 
K
-
 
D
T
 
T
G
 
N
L
 
L
S
 
N
A
 
K
E
 
V
R
 
R
L
 
-
A
 
E
E
 
E
L
 
V
G
 
G
L
 
M
A
 
V
R
 
-
S
 
-
F
 
F
Q
 
Q
H
 
R
G
 
F
R
 
N
V
 
L
F
 
F
G
 
P
N
 
H
L
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
L
D
 
N
N
 
N
V
 
I
L
 
T
V
 
L
G
 
A
A
 
-
H
 
-
T
 
-
R
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
I
 
-
P
 
-
V
 
-
V
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
-
V
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
I
 
-
R
 
-
P
 
P
A
 
M
S
 
K
V
 
V
R
 
R
A
 
K
E
 
W
D
 
-
E
 
P
R
 
R
L
 
E
R
 
K
A
 
A
E
 
E
A
 
A
K
 
K
E
 
A
I
 
M
V
 
E
A
 
L
L
 
L
F
 
D
G
 
K
E
 
V
R
 
G
L
 
L
T
 
K
L
 
D
R
 
K
L
 
A
D
 
H
K
 
A
P
 
Y
V
 
P
H
 
D
S
 
S
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
A
 
G
N
 
Q
R
 
A
R
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
M
H
 
E
P
 
P
R
 
K
L
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
N
 
D
P
 
P
T
 
E
E
 
M
T
 
V
A
 
G
E
 
E
M
 
V
L
 
L
E
 
S
I
 
V
I
 
M
R
 
K
G
 
Q
L
 
L
K
 
A
A
 
N
R
 
E
G
 
G
L
 
M
T
 
T
I
 
M
L
 
V
L
 
V
I
 
V
E
 
T
H
 
H
K
 
E
L
 
M
D
 
G
L
 
F
V
 
A
M
 
R
K
 
E
L
 
V
S
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
L
V
 
F
M
 
M
D
 
D
H
 
G
G
 
G
A
 
Y
C
 
I
I
 
I
A
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
K
P
 
P
A
 
E
A
 
D
V
 
L
A
 
F
S
 
D
D
 
R
P
 
P

4ymuJ Crystal structure of an amino acid abc transporter complex with arginines and atps (see paper)
27% identity, 82% coverage: 14:263/305 of query aligns to 1:223/240 of 4ymuJ

query
sites
4ymuJ
L
 
M
L
 
I
E
 
F
I
 
V
T
 
N
G
 
D
L
 
V
T
 
Y
R
 
K
R
 
N
F
|
F
G
 
G
G
 
S
L
 
L
T
 
E
A
x
V
V
 
L
N
 
K
G
 
G
L
 
V
S
 
T
L
 
L
T
 
K
V
 
V
G
 
N
E
 
K
G
 
G
E
 
E
L
 
V
V
 
V
S
 
V
V
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
F
 
L
N
 
R
L
 
C
I
 
I
S
 
N
G
 
L
L
 
L
D
 
E
A
 
E
P
 
P
D
 
T
A
 
K
G
 
G
T
 
E
V
 
V
T
 
F
F
 
I
E
 
D
G
 
G
R
 
V
D
 
K
V
 
I
T
 
N
G
 
N
-
 
G
-
 
K
L
 
V
S
 
N
A
 
I
E
 
N
R
 
K
L
 
V
A
 
R
E
 
Q
L
 
-
G
 
K
L
 
V
A
 
G
R
 
M
S
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
H
G
 
F
R
 
N
V
 
L
F
 
F
G
 
P
N
 
H
L
 
L
S
 
T
V
 
A
L
 
I
D
 
E
N
 
N
V
 
I
L
 
T
V
 
L
G
 
A
A
 
-
H
 
-
T
 
-
R
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
I
 
-
P
 
-
V
 
-
V
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
-
V
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
I
 
-
R
 
-
P
 
P
A
 
V
S
 
K
V
 
V
R
 
K
A
 
K
E
 
M
D
 
N
E
 
K
R
 
K
L
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
E
A
 
A
K
 
E
E
 
E
I
 
L
V
 
A
A
 
V
L
 
D
F
 
L
G
 
L
E
 
A
R
 
K
L
 
V
T
 
G
L
 
L
R
 
-
L
 
L
D
 
D
K
 
K
-
 
K
-
 
D
-
 
Q
-
 
Y
P
 
P
V
 
I
H
 
-
S
 
K
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
A
 
G
N
 
Q
R
 
K
R
 
Q
R
 
R
V
 
L
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
M
H
 
Q
P
 
P
R
 
E
L
 
V
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
N
 
D
P
 
P
T
 
E
E
 
M
T
 
V
A
 
K
E
 
E
M
 
V
L
 
L
E
 
N
I
 
V
I
 
M
R
 
K
G
 
Q
L
 
L
K
 
A
A
 
N
R
 
E
G
 
G
L
 
M
T
 
T
I
 
M
L
 
V
L
 
V
I
 
V
E
 
T
H
|
H
K
 
E
L
 
M
D
 
G
L
 
F
V
 
A
M
 
R
K
 
E
L
 
V
S
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
I
V
 
F
M
 
M
D
 
D
H
 
D
G
 
G
A
 
V
C
 
I
I
 
V
A
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
T
P
 
P
A
 
E
A
 
E
V
 
I

5x40A Structure of a cbio dimer bound with amppcp (see paper)
32% identity, 85% coverage: 13:270/305 of query aligns to 3:234/280 of 5x40A

query
sites
5x40A
P
 
P
L
 
I
L
 
L
E
 
A
I
 
A
T
 
E
G
 
A
L
 
L
T
 
T
R
 
Y
R
 
A
F
|
F
-
 
P
G
 
G
G
 
G
L
x
V
T
 
K
A
|
A
V
 
L
N
 
D
G
 
D
L
 
L
S
 
S
L
 
L
T
 
A
V
 
V
G
 
P
E
 
K
G
 
G
E
 
E
L
 
S
V
 
L
S
 
A
V
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
F
 
L
N
 
L
L
 
H
I
 
L
S
 
N
G
 
G
L
 
T
D
 
L
A
 
R
P
 
P
D
 
Q
A
 
S
G
 
G
T
 
R
V
 
V
T
 
L
F
 
L
E
 
G
G
 
G
-
 
T
-
 
A
-
 
T
-
 
G
-
 
H
-
 
S
-
 
R
R
 
K
D
 
D
V
 
L
T
 
T
G
 
G
L
 
W
S
 
R
A
 
R
E
 
R
R
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
V
R
 
L
S
x
Q
F
 
D
Q
 
A
H
 
D
G
 
D
R
 
Q
V
 
L
F
 
F
G
 
A
N
 
T
L
 
-
S
 
T
V
 
V
L
 
F
D
 
E
N
 
D
V
 
V
L
 
S
V
 
F
G
 
G
A
 
-
H
 
-
T
 
-
R
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
I
 
-
P
 
-
V
 
-
V
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
-
V
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
I
 
-
R
 
-
P
 
P
A
 
L
S
 
N
V
 
L
R
 
G
A
 
L
E
 
S
D
 
E
E
 
A
R
 
E
L
 
A
R
 
R
A
 
A
E
 
R
A
 
V
K
 
E
E
 
E
I
 
A
V
 
L
A
 
A
L
 
A
F
 
L
G
 
S
E
 
-
R
 
-
L
 
I
T
 
S
L
 
D
R
 
L
L
 
R
D
 
D
K
 
R
P
 
P
V
 
T
H
|
H
S
x
M
L
|
L
S
|
S
Y
 
G
A
x
G
N
x
Q
R
 
K
R
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
G
A
 
A
L
 
V
A
 
A
L
 
M
H
 
R
P
 
P
R
 
E
L
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
x
Q
P
 
P
T
 
T
A
 
A
G
 
G
M
 
L
N
 
D
P
 
L
T
 
A
E
 
G
T
 
T
A
 
E
E
 
Q
M
 
L
L
 
L
E
 
T
I
 
L
I
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
L
K
 
R
A
 
A
R
 
A
G
 
G
L
 
M
T
 
T
I
 
L
L
 
V
L
 
F
I
 
S
E
 
T
H
|
H
K
 
D
L
 
V
D
 
E
L
 
L
V
 
A
M
 
A
K
 
A
L
 
L
S
 
A
D
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
A
V
 
L
M
 
F
D
 
R
H
 
T
G
 
G
A
 
R
C
 
V
I
 
L
A
 
A
E
 
E
G
 
G
L
 
A
P
 
A
A
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
R
A
 
A
V
 
T
I
 
L

P30750 Methionine import ATP-binding protein MetN; EC 7.4.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
31% identity, 83% coverage: 14:267/305 of query aligns to 1:232/343 of P30750

query
sites
P30750
L
 
M
L
 
I
E
 
K
I
 
L
T
 
S
G
 
N
L
 
I
T
 
T
R
 
K
R
 
V
F
 
F
G
 
H
G
 
Q
-
 
G
-
 
T
-
 
R
-
 
T
L
 
I
T
 
Q
A
 
A
V
 
L
N
 
N
G
 
N
L
 
V
S
 
S
L
 
L
T
 
H
V
 
V
G
 
P
E
 
A
G
 
G
E
 
Q
L
 
I
V
 
Y
S
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
A
N
x
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
F
 
I
N
 
R
L
 
C
I
 
V
S
 
N
G
 
L
L
 
L
D
 
E
A
 
R
P
 
P
D
 
T
A
 
E
G
 
G
T
 
S
V
 
V
T
 
L
F
 
V
E
 
D
G
 
G
R
 
Q
D
 
E
V
 
L
T
 
T
G
 
T
L
 
L
S
 
S
A
 
E
E
 
S
R
 
E
L
 
L
-
 
T
-
 
K
A
 
A
E
 
R
L
 
R
G
 
Q
L
 
I
A
 
G
R
 
M
S
 
I
F
 
F
Q
 
Q
H
 
H
G
 
F
R
 
N
V
 
L
F
 
L
G
 
S
N
 
S
L
 
R
S
 
T
V
 
V
L
 
F
D
 
G
N
 
N
V
 
V
L
 
-
V
 
-
G
 
-
A
 
-
H
 
-
T
 
-
R
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
I
 
-
P
 
-
V
 
-
V
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
-
V
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
A
L
 
L
A
 
P
L
 
L
I
 
E
R
 
L
P
 
D
A
 
N
S
 
T
V
 
P
R
 
K
A
 
D
E
 
E
D
 
V
E
 
K
R
 
R
L
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
R
A
 
V
K
 
T
E
 
E
I
 
L
V
 
L
A
 
S
L
 
L
F
 
V
G
 
G
E
 
-
R
 
-
L
 
L
T
 
G
L
 
D
R
 
K
L
 
H
D
 
D
K
 
S
P
 
Y
V
 
P
H
 
S
S
 
N
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
A
 
G
N
 
Q
R
 
K
R
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
S
H
 
N
P
 
P
R
 
K
L
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
|
E
P
 
A
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
N
 
D
P
 
P
T
 
A
E
 
T
T
 
T
A
 
R
E
 
S
M
 
I
L
 
L
E
 
E
I
 
L
I
 
L
R
 
K
G
 
D
L
 
I
K
 
N
A
 
R
R
 
R
-
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
T
I
 
I
L
 
L
L
 
L
I
 
I
E
 
T
H
 
H
K
 
E
L
 
M
D
 
D
L
 
V
V
 
V
M
 
K
K
 
R
L
 
I
S
 
C
D
 
D
R
 
C
V
 
V
V
 
A
V
 
V
M
 
I
D
 
S
H
 
N
G
 
G
A
 
E
C
 
L
I
 
I
A
 
E
E
 
Q
G
 
D
L
 
T
P
 
V
A
 
S
A
 
E
V
 
V
A
 
F
S
 
S
D
 
H
P
 
P

Sites not aligning to the query:

3tuzC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 semet soak crystal form (see paper)
31% identity, 83% coverage: 14:267/305 of query aligns to 2:233/344 of 3tuzC

query
sites
3tuzC
L
 
M
L
 
I
E
 
K
I
 
L
T
 
S
G
 
N
L
 
I
T
 
T
R
 
K
R
 
V
F
|
F
G
 
H
G
x
Q
-
 
G
-
 
T
-
 
R
-
 
T
L
 
I
T
 
Q
A
 
A
V
 
L
N
 
N
G
 
N
L
 
V
S
 
S
L
 
L
T
 
H
V
 
V
G
 
P
E
 
A
G
 
G
E
 
Q
L
 
I
V
 
Y
S
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
A
N
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
F
 
I
N
 
R
L
 
C
I
 
V
S
 
N
G
 
L
L
 
L
D
 
E
A
 
R
P
 
P
D
 
T
A
 
E
G
 
G
T
 
S
V
 
V
T
 
L
F
 
V
E
 
D
G
 
G
R
 
Q
D
 
E
V
 
L
T
 
T
G
 
T
L
 
L
S
 
S
A
 
E
E
 
S
R
 
E
L
 
L
-
 
T
-
 
K
A
 
A
E
 
R
L
 
R
G
 
Q
L
 
I
A
 
G
R
 
M
S
 
I
F
 
F
Q
 
Q
H
 
H
G
 
F
R
 
N
V
 
L
F
 
L
G
 
S
N
 
S
L
 
R
S
 
T
V
 
V
L
 
F
D
 
G
N
 
N
V
 
V
L
 
-
V
 
-
G
 
-
A
 
-
H
 
-
T
 
-
R
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
I
 
-
P
 
-
V
 
-
V
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
-
V
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
A
L
 
L
A
 
P
L
 
L
I
 
E
R
 
L
P
 
D
A
 
N
S
 
T
V
 
P
R
 
K
A
 
D
E
 
E
D
 
V
E
 
K
R
 
R
L
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
R
A
 
V
K
 
T
E
 
E
I
 
L
V
 
L
A
 
S
L
 
L
F
 
V
G
 
G
E
 
-
R
 
-
L
 
L
T
 
G
L
 
D
R
 
K
L
 
H
D
 
D
K
 
S
P
 
Y
V
 
P
H
 
S
S
 
N
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
A
 
G
N
 
Q
R
 
K
R
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
S
H
 
N
P
 
P
R
 
K
L
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
N
 
D
P
 
P
T
 
A
E
 
T
T
 
T
A
 
R
E
 
S
M
 
I
L
 
L
E
 
E
I
 
L
I
 
L
R
 
K
G
 
D
L
 
I
K
 
N
A
 
R
R
 
R
-
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
T
I
 
I
L
 
L
L
 
L
I
 
I
E
 
T
H
 
H
K
 
E
L
 
M
D
 
D
L
 
V
V
 
V
M
 
K
K
 
R
L
 
I
S
 
C
D
 
D
R
 
C
V
 
V
V
 
A
V
 
V
M
 
I
D
 
S
H
 
N
G
 
G
A
 
E
C
 
L
I
 
I
A
 
E
E
 
Q
G
 
D
L
 
T
P
 
V
A
 
S
A
 
E
V
 
V
A
 
F
S
 
S
D
 
H
P
 
P

Sites not aligning to the query:

3tuiC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 native crystal form (see paper)
31% identity, 83% coverage: 14:267/305 of query aligns to 2:233/344 of 3tuiC

query
sites
3tuiC
L
 
M
L
 
I
E
 
K
I
 
L
T
 
S
G
 
N
L
 
I
T
 
T
R
 
K
R
 
V
F
|
F
G
 
H
G
 
Q
-
 
G
-
 
T
-
 
R
-
 
T
L
 
I
T
 
Q
A
 
A
V
 
L
N
 
N
G
 
N
L
 
V
S
 
S
L
 
L
T
 
H
V
 
V
G
 
P
E
 
A
G
 
G
E
 
Q
L
 
I
V
 
Y
S
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
A
N
 
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
F
 
I
N
 
R
L
 
C
I
 
V
S
 
N
G
 
L
L
 
L
D
 
E
A
 
R
P
 
P
D
 
T
A
 
E
G
 
G
T
 
S
V
 
V
T
 
L
F
 
V
E
 
D
G
 
G
R
 
Q
D
 
E
V
 
L
T
 
T
G
 
T
L
 
L
S
 
S
A
 
E
E
 
S
R
 
E
L
 
L
-
 
T
-
 
K
A
 
A
E
 
R
L
 
R
G
 
Q
L
 
I
A
 
G
R
 
M
S
 
I
F
 
F
Q
 
Q
H
 
H
G
 
F
R
 
N
V
 
L
F
 
L
G
 
S
N
 
S
L
 
R
S
 
T
V
 
V
L
 
F
D
 
G
N
 
N
V
 
V
L
 
-
V
 
-
G
 
-
A
 
-
H
 
-
T
 
-
R
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
I
 
-
P
 
-
V
 
-
V
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
-
V
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
A
L
 
L
A
 
P
L
 
L
I
 
E
R
 
L
P
 
D
A
 
N
S
 
T
V
 
P
R
 
K
A
 
D
E
 
E
D
 
V
E
 
K
R
 
R
L
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
R
A
 
V
K
 
T
E
 
E
I
 
L
V
 
L
A
 
S
L
 
L
F
 
V
G
 
G
E
 
-
R
 
-
L
 
L
T
 
G
L
 
D
R
 
K
L
 
H
D
 
D
K
 
S
P
 
Y
V
 
P
H
 
S
S
 
N
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
A
 
G
N
 
Q
R
 
K
R
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
S
H
 
N
P
 
P
R
 
K
L
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
N
 
D
P
 
P
T
 
A
E
 
T
T
 
T
A
 
R
E
 
S
M
 
I
L
 
L
E
 
E
I
 
L
I
 
L
R
 
K
G
 
D
L
 
I
K
 
N
A
 
R
R
 
R
-
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
T
I
 
I
L
 
L
L
 
L
I
 
I
E
 
T
H
 
H
K
 
E
L
 
M
D
 
D
L
 
V
V
 
V
M
 
K
K
 
R
L
 
I
S
 
C
D
 
D
R
 
C
V
 
V
V
 
A
V
 
V
M
 
I
D
 
S
H
 
N
G
 
G
A
 
E
C
 
L
I
 
I
A
 
E
E
 
Q
G
 
D
L
 
T
P
 
V
A
 
S
A
 
E
V
 
V
A
 
F
S
 
S
D
 
H
P
 
P

6cvlD Crystal structure of the escherichia coli atpgs-bound metni methionine abc transporter in complex with its metq binding protein (see paper)
31% identity, 83% coverage: 14:267/305 of query aligns to 2:233/344 of 6cvlD

query
sites
6cvlD
L
 
M
L
 
I
E
 
K
I
 
L
T
 
S
G
 
N
L
 
I
T
 
T
R
 
K
R
 
V
F
|
F
G
 
H
G
x
Q
-
 
G
-
 
T
-
 
R
-
 
T
L
x
I
T
 
Q
A
 
A
V
 
L
N
 
N
G
 
N
L
 
V
S
 
S
L
 
L
T
 
H
V
 
V
G
 
P
E
 
A
G
 
G
E
 
Q
L
 
I
V
 
Y
S
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
A
N
x
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
F
 
I
N
 
R
L
 
C
I
 
V
S
 
N
G
 
L
L
 
L
D
 
E
A
 
R
P
 
P
D
 
T
A
 
E
G
 
G
T
 
S
V
 
V
T
 
L
F
 
V
E
 
D
G
 
G
R
 
Q
D
 
E
V
 
L
T
 
T
G
 
T
L
 
L
S
 
S
A
 
E
E
 
S
R
 
E
L
 
L
-
 
T
-
 
K
A
 
A
E
 
R
L
 
R
G
 
Q
L
 
I
A
 
G
R
 
M
S
 
I
F
 
F
Q
 
Q
H
 
H
G
 
F
R
 
N
V
 
L
F
 
L
G
 
S
N
 
S
L
 
R
S
 
T
V
 
V
L
 
F
D
 
G
N
 
N
V
 
V
L
 
-
V
 
-
G
 
-
A
 
-
H
 
-
T
 
-
R
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
I
 
-
P
 
-
V
 
-
V
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
-
V
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
A
L
 
L
A
 
P
L
 
L
I
 
E
R
 
L
P
 
D
A
 
N
S
 
T
V
 
P
R
 
K
A
 
D
E
 
E
D
 
V
E
 
K
R
 
R
L
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
R
A
 
V
K
 
T
E
 
E
I
 
L
V
 
L
A
 
S
L
 
L
F
 
V
G
 
G
E
 
-
R
 
-
L
 
L
T
 
G
L
 
D
R
 
K
L
 
H
D
 
D
K
 
S
P
 
Y
V
 
P
H
 
S
S
x
N
L
 
L
S
|
S
Y
 
G
A
 
G
N
x
Q
R
 
K
R
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
S
H
 
N
P
 
P
R
 
K
L
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
N
 
D
P
 
P
T
 
A
E
 
T
T
 
T
A
 
R
E
 
S
M
 
I
L
 
L
E
 
E
I
 
L
I
 
L
R
 
K
G
 
D
L
 
I
K
 
N
A
 
R
R
 
R
-
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
T
I
 
I
L
 
L
L
 
L
I
 
I
E
 
T
H
|
H
K
 
E
L
 
M
D
 
D
L
 
V
V
 
V
M
 
K
K
 
R
L
 
I
S
 
C
D
 
D
R
 
C
V
 
V
V
 
A
V
 
V
M
 
I
D
 
S
H
 
N
G
 
G
A
 
E
C
 
L
I
 
I
A
 
E
E
 
Q
G
 
D
L
 
T
P
 
V
A
 
S
A
 
E
V
 
V
A
 
F
S
 
S
D
 
H
P
 
P

7d0aB Acinetobacter mlafedb complex in adp-vanadate trapped vclose conformation (see paper)
30% identity, 93% coverage: 12:295/305 of query aligns to 2:261/263 of 7d0aB

query
sites
7d0aB
K
 
Q
P
 
S
L
 
L
L
 
I
E
 
E
I
 
V
T
 
K
G
 
N
L
 
L
T
 
S
R
 
F
R
 
N
F
 
R
G
 
G
G
 
E
L
 
R
T
 
V
A
 
I
V
 
Y
N
 
D
G
 
N
L
 
I
S
 
S
L
 
L
T
 
N
V
 
I
G
 
R
E
 
R
G
 
G
E
 
Q
L
 
I
V
 
T
S
 
A
V
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
 
G
A
x
T
G
|
G
K
|
K
T
 
T
T
 
T
L
 
L
F
 
L
N
 
R
L
 
L
I
 
I
S
 
G
G
 
G
L
 
Q
D
 
L
A
 
V
P
 
P
D
 
D
A
 
Q
G
 
G
T
 
E
V
 
V
T
 
L
F
 
L
E
 
D
G
 
G
R
 
K
D
 
D
V
 
I
T
 
A
G
 
Q
L
 
M
S
 
S
A
 
R
E
 
Q
R
 
E
L
 
L
-
 
F
-
 
A
-
 
A
-
 
R
A
 
A
E
 
R
L
 
M
G
 
G
L
 
M
A
 
L
R
 
-
S
 
-
F
 
F
Q
 
Q
H
 
S
G
 
G
R
 
A
V
 
L
F
 
F
G
 
T
N
 
D
L
 
M
S
 
S
V
 
V
L
 
Y
D
 
E
N
 
N
V
 
V
L
 
A
-
 
F
-
 
P
V
 
I
G
 
R
A
 
A
H
 
H
T
 
T
R
 
K
L
 
L
R
 
-
A
 
-
V
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
I
 
-
P
 
-
V
 
-
V
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
-
V
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
I
 
-
R
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
-
D
 
S
E
 
E
R
 
N
L
 
L
R
 
I
A
 
A
E
 
-
A
 
-
K
 
-
E
 
E
I
 
L
V
 
V
A
 
A
L
 
L
F
 
K
G
 
L
E
 
E
R
 
S
L
 
V
T
 
G
L
 
L
R
 
R
L
 
G
D
 
T
K
 
E
P
 
Q
V
 
L
H
 
M
-
 
P
-
 
T
S
x
E
L
 
L
S
|
S
Y
 
G
A
 
G
N
x
M
R
 
N
R
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
A
L
 
L
H
 
D
P
 
P
R
 
D
L
 
L
L
 
I
L
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
Q
N
 
D
P
 
P
T
 
I
E
 
V
T
 
K
A
 
G
E
 
V
M
 
L
L
 
T
E
 
R
I
 
L
I
 
I
R
 
R
G
 
S
L
 
L
K
 
R
-
 
E
A
 
A
R
 
L
G
 
D
L
 
L
T
 
T
I
 
T
L
 
I
L
 
I
I
 
V
E
 
S
H
 
H
K
 
D
L
 
V
D
 
P
L
 
E
V
 
T
M
 
L
K
 
S
L
 
I
S
 
A
D
 
D
R
 
Y
V
 
I
V
 
Y
V
 
V
M
 
V
D
 
A
H
 
E
G
 
G
A
 
K
C
 
I
I
 
Q
A
 
G
E
 
E
G
 
G
L
 
T
P
 
P
A
 
E
A
 
E
V
 
L
-
 
Q
A
 
A
S
 
Y
D
 
A
P
 
S
A
 
P
V
 
F
I
 
V
E
 
K
A
 
Q
Y
 
F
L
 
L
G
 
T
H
 
G
K
 
S
A
 
A
V
 
E
G
 
G
T
 
P
A
 
V
N
 
E
Q
 
Y
D
 
Q
A
 
F
G
 
S
Q
 
H
D
 
Q
A
 
A
G
 
Y
Q
 
L
D
 
D
V
 
N
E
 
E

7d08B Acinetobacter mlafedb complex in atp-bound vtrans1 conformation (see paper)
30% identity, 93% coverage: 12:295/305 of query aligns to 2:261/263 of 7d08B

query
sites
7d08B
K
 
Q
P
 
S
L
 
L
L
 
I
E
 
E
I
 
V
T
 
K
G
 
N
L
 
L
T
 
S
R
 
F
R
 
N
F
x
R
G
 
G
G
 
E
L
x
R
T
 
V
A
 
I
V
 
Y
N
 
D
G
 
N
L
 
I
S
 
S
L
 
L
T
 
N
V
 
I
G
 
R
E
 
R
G
 
G
E
 
Q
L
 
I
V
 
T
S
 
A
V
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
|
G
A
x
T
G
 
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
L
F
 
L
N
 
R
L
 
L
I
 
I
S
 
G
G
 
G
L
 
Q
D
 
L
A
 
V
P
 
P
D
 
D
A
 
Q
G
 
G
T
 
E
V
 
V
T
 
L
F
 
L
E
 
D
G
 
G
R
 
K
D
 
D
V
 
I
T
 
A
G
 
Q
L
 
M
S
 
S
A
 
R
E
 
Q
R
 
E
L
 
L
-
 
F
-
 
A
-
 
A
-
 
R
A
 
A
E
 
R
L
 
M
G
 
G
L
 
M
A
 
L
R
 
-
S
 
-
F
 
F
Q
 
Q
H
 
S
G
 
G
R
 
A
V
 
L
F
 
F
G
 
T
N
 
D
L
 
M
S
 
S
V
 
V
L
 
Y
D
 
E
N
 
N
V
 
V
L
 
A
-
 
F
-
 
P
V
 
I
G
 
R
A
 
A
H
 
H
T
 
T
R
 
K
L
 
L
R
 
-
A
 
-
V
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
I
 
-
P
 
-
V
 
-
V
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
-
V
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
I
 
-
R
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
-
D
 
S
E
 
E
R
 
N
L
 
L
R
 
I
A
 
A
E
 
-
A
 
-
K
 
-
E
 
E
I
 
L
V
 
V
A
 
A
L
 
L
F
 
K
G
 
L
E
 
E
R
 
S
L
 
V
T
 
G
L
 
L
R
 
R
L
 
G
D
 
T
K
 
E
P
 
Q
V
 
L
H
 
M
-
 
P
-
 
T
S
 
E
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
A
 
G
N
 
M
R
 
N
R
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
A
L
 
L
H
 
D
P
 
P
R
 
D
L
 
L
L
 
I
L
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
Q
N
 
D
P
 
P
T
 
I
E
 
V
T
 
K
A
 
G
E
 
V
M
 
L
L
 
T
E
 
R
I
 
L
I
 
I
R
 
R
G
 
S
L
 
L
K
 
R
-
 
E
A
 
A
R
 
L
G
 
D
L
 
L
T
 
T
I
 
T
L
 
I
L
 
I
I
 
V
E
 
S
H
 
H
K
 
D
L
 
V
D
 
P
L
 
E
V
 
T
M
 
L
K
 
S
L
 
I
S
 
A
D
 
D
R
 
Y
V
 
I
V
 
Y
V
 
V
M
 
V
D
 
A
H
 
E
G
 
G
A
 
K
C
 
I
I
 
Q
A
 
G
E
 
E
G
 
G
L
 
T
P
 
P
A
 
E
A
 
E
V
 
L
-
 
Q
A
 
A
S
 
Y
D
 
A
P
 
S
A
 
P
V
 
F
I
 
V
E
 
K
A
 
Q
Y
 
F
L
 
L
G
 
T
H
 
G
K
 
S
A
 
A
V
 
E
G
 
G
T
 
P
A
 
V
N
 
E
Q
 
Y
D
 
Q
A
 
F
G
 
S
Q
 
H
D
 
Q
A
 
A
G
 
Y
Q
 
L
D
 
D
V
 
N
E
 
E

6z5uK Cryo-em structure of the a. Baumannii mlabdef complex bound to appnhp (see paper)
32% identity, 81% coverage: 14:260/305 of query aligns to 2:223/253 of 6z5uK

query
sites
6z5uK
L
 
L
L
 
I
E
 
E
I
 
V
T
 
K
G
 
N
L
 
L
T
 
S
R
 
F
R
 
N
F
x
R
G
 
G
G
 
E
L
 
R
T
 
V
A
 
I
V
 
Y
N
 
D
G
 
N
L
 
I
S
 
S
L
 
L
T
 
N
V
 
I
G
 
R
E
 
R
G
 
G
E
 
Q
L
 
I
V
 
T
S
 
A
V
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
T
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
L
F
 
L
N
 
R
L
 
L
I
 
I
S
 
G
G
 
G
L
 
Q
D
 
L
A
 
V
P
 
P
D
 
D
A
 
Q
G
 
G
T
 
E
V
 
V
T
 
L
F
 
L
E
 
D
G
 
G
R
 
K
D
 
D
V
 
I
T
 
A
G
 
Q
L
 
M
S
 
S
A
 
R
E
 
Q
R
 
E
L
 
L
-
 
F
-
 
A
-
 
A
-
 
R
A
 
A
E
 
R
L
 
M
G
 
G
L
 
M
A
 
L
R
 
-
S
 
-
F
 
F
Q
|
Q
H
 
S
G
 
G
R
 
A
V
 
L
F
 
F
G
 
T
N
 
D
L
 
M
S
 
S
V
 
V
L
 
Y
D
 
E
N
 
N
V
 
V
L
 
A
-
 
F
-
 
P
V
 
I
G
 
R
A
 
A
H
 
H
T
 
T
R
 
K
L
 
L
R
 
-
A
 
-
V
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
I
 
-
P
 
-
V
 
-
V
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
-
V
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
I
 
-
R
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
-
D
 
S
E
 
E
R
 
N
L
 
L
R
 
I
A
 
A
E
 
-
A
 
-
K
 
-
E
 
E
I
 
L
V
 
V
A
 
A
L
 
L
F
 
K
G
 
L
E
 
E
R
 
S
L
 
V
T
 
G
L
 
L
R
 
R
L
 
G
D
 
T
K
 
E
P
 
Q
V
 
L
H
 
M
-
 
P
-
 
T
S
 
E
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
A
 
G
N
 
M
R
 
N
R
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
A
L
 
L
H
 
D
P
 
P
R
 
D
L
 
L
L
 
I
L
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
Q
N
 
D
P
 
P
T
 
I
E
 
V
T
 
K
A
 
G
E
 
V
M
 
L
L
 
T
E
 
R
I
 
L
I
 
I
R
 
R
G
 
S
L
 
L
K
 
R
-
 
E
A
 
A
R
 
L
G
 
D
L
 
L
T
 
T
I
 
T
L
 
I
L
 
I
I
 
V
E
 
S
H
|
H
K
 
D
L
 
V
D
 
P
L
 
E
V
 
T
M
 
L
K
 
S
L
 
I
S
 
A
D
 
D
R
 
Y
V
 
I
V
 
Y
V
 
V
M
 
V
D
 
A
H
 
E
G
 
G
A
 
K
C
 
I
I
 
Q
A
 
G
E
 
E
G
 
G
L
 
T
P
 
P

8wm7D Cryo-em structure of cyanobacterial nitrate/nitrite transporter nrtbcd in complex with signalling protein pii (see paper)
30% identity, 78% coverage: 14:252/305 of query aligns to 4:214/257 of 8wm7D

query
sites
8wm7D
L
 
F
L
 
L
E
 
V
I
 
V
T
 
E
G
 
G
L
 
V
T
 
S
R
 
K
R
 
I
F
x
Y
-
 
P
-
 
T
-
 
P
-
 
E
G
 
G
G
 
P
L
x
Y
T
 
T
A
x
V
V
 
L
N
 
D
G
 
G
L
 
I
S
 
D
L
 
L
T
 
K
V
 
V
G
 
R
E
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
F
V
 
V
S
 
C
V
 
L
I
 
I
G
 
G
P
 
H
N
x
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
F
 
L
N
 
N
L
 
M
I
 
I
S
 
S
G
 
G
L
 
F
D
 
N
A
 
T
P
 
P
D
 
S
A
 
E
G
 
G
T
 
V
V
 
V
T
 
L
F
 
L
E
 
Q
G
 
D
R
 
K
D
 
P
V
 
I
T
 
T
G
 
E
L
 
P
S
 
G
A
 
P
E
 
D
R
 
R
L
 
M
A
 
M
E
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
S
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
N
G
 
Y
R
 
C
V
 
L
F
 
L
G
 
P
N
 
W
L
 
L
S
 
N
V
 
V
L
 
F
D
 
E
N
 
N
V
 
V
L
 
Y
V
 
-
G
 
-
A
 
-
H
 
-
T
 
-
R
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
I
 
-
P
 
-
V
 
-
V
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
-
V
 
-
E
 
-
L
 
L
A
 
A
L
 
V
A
 
D
L
 
A
I
 
V
R
 
F
P
 
P
A
 
N
S
 
K
V
 
P
R
 
Q
A
 
A
E
 
E
D
 
K
E
 
-
R
 
-
L
 
-
R
 
R
A
 
A
E
 
I
A
 
V
K
 
R
E
 
E
I
 
H
V
 
L
A
 
A
L
 
M
F
 
V
G
 
G
E
 
-
R
 
-
L
 
L
T
 
T
L
 
E
R
 
A
L
 
A
D
 
E
K
 
K
P
 
K
V
 
P
H
 
S
S
 
Q
L
 
I
S
 
S
Y
 
G
A
 
G
N
 
M
R
 
K
R
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
S
L
 
I
H
 
R
P
 
P
R
 
Q
L
 
V
L
 
L
L
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
F
A
 
G
G
 
A
M
 
L
N
 
D
P
 
A
T
 
I
E
 
T
T
 
K
A
 
E
E
 
E
M
 
L
L
 
Q
-
 
E
E
 
E
I
 
L
I
 
L
R
 
Q
G
 
I
L
 
W
K
 
S
A
 
D
R
 
H
G
 
Q
L
 
V
T
 
T
I
 
V
L
 
L
L
 
M
I
 
I
E
 
T
H
 
H
K
 
D
L
 
I
D
 
D
L
 
E
V
 
A
M
 
L
K
 
F
L
 
L
S
 
A
D
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
V
V
 
M
M
 
M
D
 
T
H
 
N
G
 
G

8w9mD Cryo-em structure of the cyanobacterial nitrate transporter nrtbcd in complex with atp (see paper)
30% identity, 78% coverage: 14:252/305 of query aligns to 2:212/256 of 8w9mD

query
sites
8w9mD
L
 
F
L
 
L
E
 
V
I
 
V
T
 
E
G
 
G
L
 
V
T
 
S
R
 
K
R
 
I
F
x
Y
-
 
P
-
 
T
-
 
P
-
 
E
G
 
G
G
 
P
L
 
Y
T
 
T
A
 
V
V
 
L
N
 
D
G
 
G
L
 
I
S
 
D
L
 
L
T
 
K
V
 
V
G
 
R
E
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
F
V
 
V
S
 
C
V
 
L
I
 
I
G
 
G
P
x
H
N
x
S
G
|
G
A
 
C
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
F
 
L
N
 
N
L
 
M
I
 
I
S
 
S
G
 
G
L
 
F
D
 
N
A
 
T
P
 
P
D
 
S
A
 
E
G
 
G
T
 
V
V
 
V
T
 
L
F
 
L
E
 
Q
G
 
D
R
 
K
D
 
P
V
 
I
T
 
T
G
 
E
L
 
P
S
 
G
A
 
P
E
 
D
R
 
R
L
 
M
A
 
M
E
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
S
 
V
F
 
F
Q
|
Q
H
 
N
G
 
Y
R
 
C
V
 
L
F
 
L
G
 
P
N
 
W
L
 
L
S
 
N
V
 
V
L
 
F
D
 
E
N
 
N
V
 
V
L
 
Y
V
 
-
G
 
-
A
 
-
H
 
-
T
 
-
R
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
I
 
-
P
 
-
V
 
-
V
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
-
V
 
-
E
 
-
L
 
L
A
 
A
L
 
V
A
 
D
L
 
A
I
 
V
R
 
F
P
 
P
A
 
N
S
 
K
V
 
P
R
 
Q
A
 
A
E
 
E
D
 
K
E
 
-
R
 
-
L
 
-
R
 
R
A
 
A
E
 
I
A
 
V
K
 
R
E
 
E
I
 
H
V
 
L
A
 
A
L
 
M
F
 
V
G
 
G
E
 
-
R
 
-
L
 
L
T
 
T
L
 
E
R
 
A
L
 
A
D
 
E
K
 
K
P
 
K
V
 
P
H
 
S
S
x
Q
L
 
I
S
|
S
Y
 
G
A
x
G
N
x
M
R
 
K
R
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
S
L
 
I
H
 
R
P
 
P
R
 
Q
L
 
V
L
 
L
L
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
F
A
 
G
G
 
A
M
 
L
N
 
D
P
 
A
T
 
I
E
 
T
T
 
K
A
 
E
E
 
E
M
 
L
L
 
Q
-
 
E
E
 
E
I
 
L
I
 
L
R
 
Q
G
 
I
L
 
W
K
 
S
A
 
D
R
 
H
G
 
Q
L
 
V
T
 
T
I
 
V
L
 
L
L
 
M
I
 
I
E
 
T
H
|
H
K
 
D
L
 
I
D
 
D
L
 
E
V
 
A
M
 
L
K
 
F
L
 
L
S
 
A
D
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
V
V
 
M
M
 
M
D
 
T
H
 
N
G
 
G

5ws4A Crystal structure of tripartite-type abc transporter macb from acinetobacter baumannii (see paper)
31% identity, 81% coverage: 11:257/305 of query aligns to 1:224/650 of 5ws4A

query
sites
5ws4A
K
 
K
K
 
Q
P
 
A
L
 
L
L
 
L
E
 
E
I
 
V
T
 
S
G
 
N
L
 
L
T
 
V
R
 
R
R
 
E
F
 
F
-
 
P
-
 
A
-
 
G
-
 
E
G
 
S
G
 
T
L
 
I
T
 
Q
A
 
I
V
 
L
N
 
K
G
 
G
L
 
I
S
 
D
L
 
L
T
 
T
V
 
I
G
 
Y
E
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
L
V
 
V
S
 
A
V
 
I
I
 
V
G
 
G
P
 
Q
N
x
S
G
|
G
A
 
S
G
 
G
K
 
K
T
x
S
T
 
T
L
 
L
F
 
M
N
 
N
L
 
I
I
 
L
S
 
G
G
 
C
L
 
L
D
 
D
A
 
R
P
 
P
D
 
T
A
 
S
G
 
G
T
 
S
V
 
Y
T
 
K
F
 
V
E
 
N
G
 
G
R
 
Q
D
 
E
V
 
T
T
 
G
G
 
K
L
 
L
S
 
E
A
 
P
E
 
D
R
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
L
 
L
-
 
R
-
 
R
-
 
E
G
 
Y
L
 
F
A
 
G
R
 
F
S
 
I
F
 
F
Q
 
Q
H
 
R
G
 
Y
R
 
H
V
 
L
F
 
L
G
 
G
N
 
D
L
 
L
S
 
S
V
 
A
L
 
E
D
 
G
N
 
N
V
 
V
L
 
-
V
 
-
G
 
-
A
 
-
H
 
-
T
 
-
R
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
E
I
 
V
P
 
P
V
 
A
V
 
V
G
 
-
P
 
-
L
 
-
V
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
Y
A
 
A
L
 
G
I
 
V
R
 
T
P
 
P
A
 
A
S
 
-
V
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
-
D
 
D
E
 
R
R
 
K
L
 
Q
R
 
R
A
 
A
E
 
T
A
 
A
K
 
L
E
 
L
I
 
T
V
 
E
A
 
L
L
 
G
F
 
L
G
 
G
E
 
T
R
 
K
L
 
T
T
 
Q
L
 
-
R
 
-
L
 
-
D
 
N
K
 
R
P
 
P
V
 
-
H
 
S
S
 
Q
L
 
L
S
 
S
Y
 
G
A
 
G
N
 
Q
R
 
Q
R
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
M
L
 
N
H
 
G
P
 
G
R
 
D
L
 
V
L
 
I
L
 
L
L
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
G
G
 
A
M
 
L
N
 
D
P
 
S
T
 
H
E
 
S
T
 
G
A
 
V
E
 
E
M
 
V
L
 
M
E
 
R
I
 
I
I
 
L
R
 
R
G
 
E
L
 
L
K
 
N
A
 
A
R
 
A
G
 
G
L
 
H
T
 
T
I
 
I
L
 
I
L
 
L
I
 
V
E
 
T
H
 
H
K
 
D
L
 
M
D
 
Q
L
 
-
V
 
V
M
 
A
K
 
K
L
 
N
S
 
A
D
 
T
R
 
R
V
 
I
V
 
I
V
 
E
M
 
I
D
 
S
H
 
D
G
 
G
A
 
E
C
 
I
I
 
I
A
 
S
E
 
D

Query Sequence

>WP_012975564.1 NCBI__GCF_000010725.1:WP_012975564.1
MANPSKNPLPKKPLLEITGLTRRFGGLTAVNGLSLTVGEGELVSVIGPNGAGKTTLFNLI
SGLDAPDAGTVTFEGRDVTGLSAERLAELGLARSFQHGRVFGNLSVLDNVLVGAHTRLRA
VRPRIPVVGPLVELALALIRPASVRAEDERLRAEAKEIVALFGERLTLRLDKPVHSLSYA
NRRRVEIARALALHPRLLLLDEPTAGMNPTETAEMLEIIRGLKARGLTILLIEHKLDLVM
KLSDRVVVMDHGACIAEGLPAAVASDPAVIEAYLGHKAVGTANQDAGQDAGQDVERDAAR
IRVAH

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory