SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012976339.1 NCBI__GCF_000010725.1:WP_012976339.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1wwkA Crystal structure of phosphoglycerate dehydrogenase from pyrococcus horikoshii ot3
42% identity, 84% coverage: 37:310/327 of query aligns to 30:304/304 of 1wwkA

query
sites
1wwkA
P
 
P
E
 
D
E
 
E
L
 
D
A
 
R
T
 
L
V
 
V
A
 
E
A
 
L
K
 
V
E
 
K
A
 
D
I
 
V
D
 
E
G
 
A
I
 
I
I
 
I
V
 
V
R
 
R
-
 
S
Q
 
K
G
 
P
K
 
K
I
 
V
T
 
T
E
 
R
Q
 
R
V
 
V
I
 
I
A
 
E
A
 
S
S
 
A
P
 
P
K
 
K
L
 
L
R
 
K
A
 
V
I
 
I
A
 
A
K
 
R
H
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
Y
 
L
D
 
D
N
 
N
I
 
I
D
 
D
A
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
K
R
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
I
P
 
E
V
 
V
L
 
V
V
 
N
A
 
A
R
 
P
G
 
A
A
 
A
N
x
S
S
 
S
Q
 
R
S
 
S
V
|
V
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
A
F
 
V
A
 
G
L
 
L
M
 
M
F
 
F
G
 
S
V
 
V
A
 
A
R
 
R
H
 
K
L
 
I
A
 
A
H
 
F
L
 
A
H
 
D
E
 
R
R
 
K
M
 
M
K
 
R
A
 
E
G
 
G
F
 
V
W
 
W
D
 
A
K
 
K
A
 
K
T
 
E
T
 
A
S
 
M
G
 
G
L
 
I
Q
 
E
L
 
L
R
 
E
G
 
G
R
 
K
S
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
|
G
F
|
F
G
|
G
E
x
R
I
|
I
G
 
G
R
 
Y
I
 
Q
L
 
V
V
 
A
G
 
K
L
 
I
V
 
A
Q
 
N
P
 
A
L
 
L
H
 
G
M
 
M
T
 
N
V
 
I
R
 
L
V
 
L
F
x
Y
D
|
D
P
|
P
Y
 
Y
M
 
P
P
 
N
A
 
E
D
 
E
I
 
R
R
 
A
I
 
K
E
 
E
G
 
V
A
 
N
E
 
G
R
 
K
V
 
F
A
 
V
N
 
D
L
 
L
D
 
E
E
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
K
T
 
E
S
 
S
D
 
D
V
 
V
I
 
V
S
 
T
L
 
I
H
 
H
C
x
V
P
|
P
L
 
L
T
 
V
P
 
E
Q
 
S
T
|
T
R
 
Y
N
 
H
M
 
L
I
 
I
G
 
N
R
 
E
E
 
E
Q
 
R
I
 
L
A
 
K
A
 
L
M
 
M
R
 
K
P
 
K
G
 
T
G
 
A
I
 
I
L
 
L
I
 
I
N
 
N
T
|
T
A
x
S
R
|
R
G
 
G
G
 
P
L
 
V
I
 
V
D
 
D
E
 
T
A
 
N
A
 
A
L
 
L
F
 
V
E
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
K
D
 
E
G
 
G
R
 
W
I
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
T
 
V
F
 
F
A
 
E
E
 
E
E
|
E
P
 
P
V
 
L
N
 
P
P
 
K
A
 
D
N
 
H
P
 
P
L
 
L
L
 
T
T
 
K
L
 
F
P
 
D
N
 
N
L
 
V
I
 
V
A
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
A
 
I
G
|
G
A
 
A
S
 
S
T
 
T
Q
 
V
A
 
E
A
 
A
R
 
Q
D
 
E
A
 
R
M
 
A
G
 
G
L
 
V
I
 
E
A
 
V
L
 
A
D
 
E
H
 
K
V
 
V
M
 
V
N
 
K
V
 
I
L
 
L
E
 
K
G
 
G

3ddnB Crystal structure of hydroxypyruvic acid phosphate bound d-3- phosphoglycerate dehydrogenase in mycobacterium tuberculosis (see paper)
39% identity, 84% coverage: 37:311/327 of query aligns to 31:305/525 of 3ddnB

query
sites
3ddnB
P
 
P
E
 
D
E
 
R
L
 
D
A
 
K
T
 
L
V
 
L
A
 
A
A
 
A
K
 
V
E
 
P
A
 
E
I
 
A
D
 
D
G
 
A
I
 
L
I
 
L
V
 
V
R
 
R
Q
 
S
G
 
A
K
 
T
I
 
T
T
 
V
E
 
D
-
 
A
Q
 
E
V
 
V
I
 
L
A
 
A
A
 
A
S
 
A
P
 
P
K
 
K
L
 
L
R
 
K
A
 
I
I
 
V
A
 
A
K
x
R
H
 
A
G
 
G
V
|
V
G
 
G
Y
 
L
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
A
 
V
E
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
T
R
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
V
P
 
L
V
 
V
L
 
V
V
 
N
A
 
A
R
 
P
G
 
T
A
 
S
N
|
N
S
 
I
Q
 
H
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
H
A
 
A
F
 
L
A
 
A
L
 
L
M
 
L
F
 
L
G
 
A
V
 
A
A
 
S
R
 
R
H
 
Q
L
 
I
A
 
P
H
 
A
L
 
A
H
 
D
E
 
A
R
 
S
M
 
L
K
 
R
A
 
E
G
 
H
F
 
T
W
 
W
D
 
K
K
 
R
A
 
S
T
 
S
T
 
F
S
 
S
G
 
G
L
 
T
Q
 
E
L
 
I
R
 
F
G
 
G
R
 
K
S
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
L
G
 
G
E
 
R
I
 
I
G
 
G
R
 
Q
I
 
L
L
 
V
V
 
A
G
 
Q
L
 
R
V
 
I
Q
 
A
P
 
A
L
 
F
H
 
G
M
 
A
T
 
Y
V
 
V
R
 
V
V
 
A
F
 
Y
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
M
 
V
-
 
S
P
 
P
A
 
A
D
 
R
I
 
A
R
 
A
I
 
Q
E
 
L
G
 
G
A
 
I
E
 
E
R
 
L
V
 
L
A
 
-
N
 
S
L
 
L
D
 
D
E
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
A
T
 
R
S
 
A
D
 
D
V
 
F
I
 
I
S
 
S
L
 
V
H
 
H
C
 
L
P
 
P
L
 
K
T
 
T
P
 
P
Q
 
E
T
 
T
R
 
A
N
 
G
M
 
L
I
 
I
G
 
D
R
 
K
E
 
E
Q
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
K
M
 
T
R
 
K
P
 
P
G
 
G
G
 
V
I
 
I
L
 
I
I
 
V
N
 
N
T
 
A
A
 
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
F
 
A
E
 
D
A
 
A
L
 
I
R
 
T
D
 
G
G
 
G
R
 
H
I
 
V
G
 
R
G
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
T
 
V
F
 
F
A
 
A
E
 
T
E
|
E
P
 
P
V
 
C
N
 
T
P
 
D
A
 
-
N
 
S
P
 
P
L
 
L
L
 
F
T
 
E
L
 
L
P
 
A
N
 
Q
L
 
V
I
 
V
A
 
V
T
 
T
P
 
P
H
|
H
A
 
L
G
 
G
A
|
A
S
 
S
T
 
T
Q
 
A
A
 
E
A
 
A
R
x
Q
D
 
D
A
 
R
M
 
A
G
 
G
L
 
T
I
 
D
A
 
V
L
 
A
D
 
E
H
 
S
V
 
V
M
 
R
N
 
L
V
 
A
L
 
L
E
 
A
G
 
G
K
 
E

3dc2A Crystal structure of serine bound d-3-phosphoglycerate dehydrogenase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
39% identity, 84% coverage: 37:311/327 of query aligns to 30:304/526 of 3dc2A

query
sites
3dc2A
P
 
P
E
 
D
E
 
R
L
 
D
A
 
K
T
 
L
V
 
L
A
 
A
A
 
A
K
 
V
E
 
P
A
 
E
I
 
A
D
 
D
G
 
A
I
 
L
I
 
L
V
 
V
R
 
R
Q
 
S
G
 
A
K
 
T
I
 
T
T
 
V
E
 
D
-
 
A
Q
 
E
V
 
V
I
 
L
A
 
A
A
 
A
S
 
A
P
 
P
K
 
K
L
 
L
R
 
K
A
 
I
I
 
V
A
 
A
K
 
R
H
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
Y
 
L
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
A
 
V
E
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
T
R
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
V
P
 
L
V
 
V
L
 
V
V
 
N
A
 
A
R
 
P
G
 
T
A
 
S
N
|
N
S
 
I
Q
 
H
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
H
A
 
A
F
 
L
A
 
A
L
 
L
M
 
L
F
 
L
G
 
A
V
 
A
A
 
S
R
 
R
H
 
Q
L
 
I
A
 
P
H
 
A
L
 
A
H
 
D
E
 
A
R
 
S
M
 
L
K
 
R
A
 
E
G
 
H
F
 
T
W
 
W
D
 
K
K
 
R
A
 
S
T
 
S
T
 
F
S
 
S
G
 
G
L
 
T
Q
 
E
L
 
I
R
 
F
G
 
G
R
 
K
S
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
L
G
 
G
E
 
R
I
 
I
G
 
G
R
 
Q
I
 
L
L
 
V
V
 
A
G
 
Q
L
 
R
V
 
I
Q
 
A
P
 
A
L
 
F
H
 
G
M
 
A
T
 
Y
V
 
V
R
 
V
V
 
A
F
 
Y
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
M
 
V
-
 
S
P
 
P
A
 
A
D
 
R
I
 
A
R
 
A
I
 
Q
E
 
L
G
 
G
A
 
I
E
 
E
R
 
L
V
 
L
A
 
-
N
 
S
L
 
L
D
 
D
E
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
A
T
 
R
S
 
A
D
 
D
V
 
F
I
 
I
S
 
S
L
 
V
H
 
H
C
 
L
P
 
P
L
 
K
T
 
T
P
 
P
Q
 
E
T
 
T
R
 
A
N
 
G
M
 
L
I
 
I
G
 
D
R
 
K
E
 
E
Q
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
K
M
 
T
R
 
K
P
 
P
G
 
G
G
 
V
I
 
I
L
 
I
I
 
V
N
 
N
T
 
A
A
 
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
F
 
A
E
 
D
A
 
A
L
 
I
R
 
T
D
 
G
G
 
G
R
 
H
I
 
V
G
 
R
G
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
T
 
V
F
 
F
A
 
A
E
 
T
E
|
E
P
 
P
V
 
C
N
 
T
P
 
D
A
 
-
N
 
S
P
 
P
L
 
L
L
 
F
T
 
E
L
 
L
P
 
A
N
 
Q
L
 
V
I
 
V
A
 
V
T
 
T
P
 
P
H
|
H
A
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
T
 
T
Q
 
A
A
 
E
A
 
A
R
 
Q
D
 
D
A
 
R
M
 
A
G
 
G
L
 
T
I
 
D
A
 
V
L
 
A
D
 
E
H
 
S
V
 
V
M
 
R
N
 
L
V
 
A
L
 
L
E
 
A
G
 
G
K
 
E

Sites not aligning to the query:

O43175 D-3-phosphoglycerate dehydrogenase; 3-PGDH; 2-oxoglutarate reductase; Malate dehydrogenase; EC 1.1.1.95; EC 1.1.1.399; EC 1.1.1.37 from Homo sapiens (Human) (see 3 papers)
37% identity, 89% coverage: 36:327/327 of query aligns to 37:324/533 of O43175

query
sites
O43175
S
 
S
P
 
K
E
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
-
T
 
-
V
 
I
A
 
A
A
 
E
K
 
L
E
 
Q
A
 
D
I
 
C
D
 
E
G
 
G
I
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
Q
 
S
G
 
A
-
 
T
K
 
K
I
 
V
T
 
T
E
 
A
Q
 
D
V
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
S
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
R
 
Q
A
 
V
I
 
V
A
 
G
K
 
R
H
 
A
G
 
G
V
x
T
G
 
G
Y
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
A
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
T
R
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
P
 
L
V
 
V
L
 
M
V
 
N
A
 
T
R
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
S
 
S
Q
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
T
F
 
C
A
 
G
L
 
M
M
 
I
F
 
M
G
 
C
V
 
L
A
 
A
R
 
R
H
 
Q
L
 
I
A
 
P
H
 
Q
L
 
A
H
 
T
E
 
A
R
 
S
M
 
M
K
 
K
A
 
D
G
 
G
F
 
K
W
 
W
D
 
E
K
x
R
A
 
K
T
 
K
T
 
F
S
 
M
G
 
G
L
 
T
Q
 
E
L
 
L
R
 
N
G
 
G
R
 
K
S
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
L
G
 
G
F
 
L
G
 
G
E
x
R
I
|
I
G
 
G
R
 
R
I
 
E
L
 
V
V
 
A
G
 
T
L
 
R
V
 
M
Q
 
Q
P
 
S
L
 
F
H
 
G
M
 
M
T
 
K
V
 
T
R
 
I
V
 
G
F
 
Y
D
|
D
P
 
P
Y
 
I
M
 
I
P
 
S
A
 
P
D
 
E
I
 
V
R
 
S
I
 
A
E
 
S
G
 
F
A
 
G
E
 
V
R
 
Q
V
 
Q
A
 
L
N
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
T
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
I
 
I
S
 
T
L
 
V
H
 
H
C
x
T
P
 
P
L
 
L
T
 
L
P
 
P
Q
 
S
T
 
T
R
 
T
N
 
G
M
 
L
I
 
L
G
 
N
R
 
D
E
 
N
Q
 
T
I
 
F
A
 
A
A
 
Q
M
 
C
R
 
K
P
 
K
G
 
G
G
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
x
C
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
I
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
D
 
S
G
 
G
R
 
Q
I
 
C
G
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
|
D
T
x
V
F
 
F
A
 
T
E
 
E
E
 
E
P
 
P
V
 
-
N
 
-
P
 
P
A
 
R
N
 
D
-
 
R
P
 
A
L
 
L
L
 
V
T
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
L
 
V
I
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
A
x
L
G
|
G
A
|
A
S
 
S
T
 
T
Q
 
K
A
 
E
A
 
A
R
 
Q
D
 
S
A
 
R
M
 
C
G
 
G
-
 
E
L
 
E
I
 
I
A
 
A
L
 
V
D
 
Q
H
 
F
V
 
V
M
 
D
N
 
M
V
 
V
L
 
-
E
 
-
G
 
-
K
 
K
G
 
G
A
 
K
D
 
S
P
 
L
R
 
T
A
 
G
M
 
V
V
 
V
N
 
N
A
 
A
P
 
Q
Q
 
A
L
 
L
R
 
T
V
 
S
A
 
A

Sites not aligning to the query:

1psdA The allosteric ligand site in the vmax-type cooperative enzyme phosphoglycerate dehydrogenase (see paper)
39% identity, 73% coverage: 59:298/327 of query aligns to 59:300/404 of 1psdA

query
sites
1psdA
I
 
L
T
 
T
E
 
E
Q
 
D
V
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
S
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
R
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
G
K
 
C
H
 
F
G
 
C
V
 
I
G
 
G
Y
 
T
D
 
N
N
 
Q
I
 
V
D
 
D
A
 
L
E
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
F
V
 
N
A
 
A
R
 
P
G
 
F
A
 
S
N
|
N
S
 
T
Q
 
R
S
 
S
V
 
V
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
V
F
 
I
A
 
G
L
 
E
M
 
L
F
 
L
G
 
L
V
 
L
A
 
L
R
 
R
H
 
G
L
 
V
A
 
P
H
 
E
L
 
A
H
 
N
E
 
A
R
 
K
M
 
A
K
 
H
A
 
R
G
 
G
F
 
V
W
 
W
D
 
N
K
 
K
A
 
L
T
 
A
T
 
A
S
 
G
G
 
S
L
 
F
Q
 
E
L
 
A
R
 
R
G
 
G
R
 
K
S
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
 
G
F
 
Y
G
 
G
E
x
H
I
|
I
G
 
G
R
 
T
I
 
Q
L
 
L
V
 
G
G
 
I
L
 
L
V
 
A
Q
 
E
P
 
S
L
 
L
H
 
G
M
 
M
T
 
Y
V
 
V
R
 
Y
V
 
F
F
 
Y
D
|
D
P
 
-
Y
 
-
M
x
I
P
 
E
A
 
N
D
x
K
I
 
L
R
 
P
I
 
L
E
 
G
G
 
N
A
 
A
E
 
T
R
 
Q
V
 
V
A
 
Q
N
 
H
L
 
L
D
 
S
E
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
N
T
 
M
S
 
S
D
 
D
V
 
V
I
 
V
S
 
S
L
 
L
H
|
H
C
x
V
P
|
P
L
 
E
T
 
N
P
 
P
Q
 
S
T
 
T
R
 
K
N
 
N
M
 
M
I
 
M
G
 
G
R
 
A
E
 
K
Q
 
E
I
 
I
A
 
S
A
 
L
M
 
M
R
 
K
P
 
P
G
 
G
G
 
S
I
 
L
L
 
L
I
 
I
N
 
N
T
x
A
A
x
S
R
|
R
G
 
G
G
 
T
L
 
V
I
 
V
D
 
D
E
 
I
A
 
P
A
 
A
L
 
L
F
 
C
E
 
D
A
 
A
L
 
L
R
 
A
D
 
S
G
 
K
R
 
H
I
 
L
G
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
I
D
|
D
T
 
V
F
 
F
A
 
P
E
 
T
E
|
E
P
 
P
V
 
A
N
 
T
P
 
N
A
 
S
N
 
D
-
 
P
-
 
F
-
 
T
-
 
S
P
 
P
L
 
L
L
 
C
T
 
E
L
 
F
P
 
D
N
 
N
L
 
V
I
 
L
A
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
A
 
I
G
 
G
A
 
G
S
 
S
T
 
T
Q
 
Q
A
 
E
A
 
A
R
 
Q
D
 
E
A
 
N
M
 
I
G
 
G
L
 
L

Sites not aligning to the query:

P0A9T0 D-3-phosphoglycerate dehydrogenase; PGDH; 2-oxoglutarate reductase; EC 1.1.1.95; EC 1.1.1.399 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
39% identity, 73% coverage: 59:298/327 of query aligns to 65:306/410 of P0A9T0

query
sites
P0A9T0
I
 
L
T
 
T
E
 
E
Q
 
D
V
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
S
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
R
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
G
K
 
C
H
 
F
G
 
C
V
 
I
G
 
G
Y
 
T
D
 
N
N
 
Q
I
 
V
D
 
D
A
 
L
E
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
F
V
 
N
A
 
A
R
 
P
G
 
F
A
 
S
N
 
N
S
 
T
Q
 
R
S
 
S
V
 
V
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
V
F
 
I
A
 
G
L
 
E
M
 
L
F
 
L
G
 
L
V
 
L
A
 
L
R
 
R
H
 
G
L
 
V
A
 
P
H
 
E
L
 
A
H
 
N
E
 
A
R
 
K
M
 
A
K
 
H
A
 
R
G
 
G
F
 
V
W
 
W
D
 
N
K
 
K
A
 
L
T
 
A
T
 
A
S
 
G
G
 
S
L
 
F
Q
 
E
L
 
A
R
 
R
G
 
G
R
 
K
S
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
 
G
F
 
Y
G
 
G
E
x
H
I
|
I
G
 
G
R
 
T
I
 
Q
L
 
L
V
 
G
G
 
I
L
 
L
V
 
A
Q
 
E
P
 
S
L
 
L
H
 
G
M
 
M
T
 
Y
V
 
V
R
 
Y
V
 
F
F
 
Y
D
|
D
P
 
-
Y
 
-
M
 
I
P
 
E
A
 
N
D
 
K
I
 
L
R
 
P
I
 
L
E
 
G
G
 
N
A
 
A
E
 
T
R
 
Q
V
 
V
A
 
Q
N
 
H
L
 
L
D
 
S
E
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
N
T
 
M
S
 
S
D
 
D
V
 
V
I
 
V
S
 
S
L
 
L
H
 
H
C
 
V
P
 
P
L
 
E
T
 
N
P
 
P
Q
 
S
T
 
T
R
 
K
N
 
N
M
 
M
I
 
M
G
 
G
R
 
A
E
 
K
Q
 
E
I
 
I
A
 
S
A
 
L
M
 
M
R
 
K
P
 
P
G
 
G
G
 
S
I
 
L
L
 
L
I
 
I
N
 
N
T
x
A
A
x
S
R
|
R
G
 
G
G
 
T
L
 
V
I
 
V
D
 
D
E
 
I
A
 
P
A
 
A
L
 
L
F
 
C
E
 
D
A
 
A
L
 
L
R
 
A
D
 
S
G
 
K
R
 
H
I
 
L
G
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
I
D
|
D
T
 
V
F
 
F
A
 
P
E
 
T
E
 
E
P
 
P
V
 
A
N
 
T
P
 
N
A
 
S
N
 
D
-
 
P
-
 
F
-
 
T
-
 
S
P
 
P
L
 
L
L
 
C
T
 
E
L
 
F
P
 
D
N
 
N
L
 
V
I
 
L
A
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
A
x
I
G
|
G
A
x
G
S
 
S
T
 
T
Q
 
Q
A
 
E
A
 
A
R
 
Q
D
 
E
A
 
N
M
 
I
G
 
G
L
 
L

Sites not aligning to the query:

1ybaA The active form of phosphoglycerate dehydrogenase (see paper)
39% identity, 73% coverage: 59:298/327 of query aligns to 61:302/406 of 1ybaA

query
sites
1ybaA
I
 
L
T
 
T
E
 
E
Q
 
D
V
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
S
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
R
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
G
K
 
C
H
 
F
G
x
C
V
x
I
G
|
G
Y
 
T
D
x
N
N
 
Q
I
 
V
D
 
D
A
 
L
E
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
F
V
 
N
A
 
A
R
 
P
G
x
F
A
 
S
N
|
N
S
 
T
Q
 
R
S
 
S
V
|
V
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
V
F
 
I
A
 
G
L
 
E
M
 
L
F
 
L
G
 
L
V
 
L
A
 
L
R
 
R
H
 
G
L
 
V
A
 
P
H
 
E
L
 
A
H
 
N
E
 
A
R
 
K
M
 
A
K
 
H
A
 
R
G
 
G
F
 
V
W
 
W
D
 
N
K
 
K
A
 
L
T
 
A
T
 
A
S
 
G
G
 
S
L
 
F
Q
 
E
L
 
A
R
 
R
G
 
G
R
 
K
S
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
|
G
F
 
Y
G
|
G
E
x
H
I
|
I
G
 
G
R
 
T
I
 
Q
L
 
L
V
 
G
G
 
I
L
 
L
V
 
A
Q
 
E
P
 
S
L
 
L
H
 
G
M
 
M
T
 
Y
V
 
V
R
 
Y
V
 
F
F
x
Y
D
|
D
P
 
-
Y
 
-
M
x
I
P
 
E
A
 
N
D
x
K
I
 
L
R
 
P
I
 
L
E
 
G
G
 
N
A
 
A
E
 
T
R
 
Q
V
 
V
A
 
Q
N
 
H
L
 
L
D
 
S
E
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
N
T
 
M
S
 
S
D
 
D
V
 
V
I
 
V
S
 
S
L
 
L
H
|
H
C
x
V
P
|
P
L
 
E
T
 
N
P
 
P
Q
 
S
T
 
T
R
 
K
N
 
N
M
 
M
I
 
M
G
 
G
R
 
A
E
 
K
Q
 
E
I
 
I
A
 
S
A
 
L
M
 
M
R
 
K
P
 
P
G
 
G
G
 
S
I
 
L
L
 
L
I
 
I
N
 
N
T
x
A
A
x
S
R
|
R
G
 
G
G
 
T
L
 
V
I
 
V
D
 
D
E
 
I
A
 
P
A
 
A
L
 
L
F
 
C
E
 
D
A
 
A
L
 
L
R
 
A
D
 
S
G
 
K
R
 
H
I
 
L
G
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
I
D
|
D
T
 
V
F
 
F
A
 
P
E
 
T
E
|
E
P
 
P
V
 
A
N
 
T
P
 
N
A
 
S
N
 
D
-
 
P
-
 
F
-
 
T
-
 
S
P
 
P
L
 
L
L
 
C
T
 
E
L
 
F
P
 
D
N
 
N
L
 
V
I
 
L
A
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
A
 
I
G
|
G
A
 
G
S
 
S
T
 
T
Q
 
Q
A
 
E
A
 
A
R
 
Q
D
 
E
A
 
N
M
 
I
G
 
G
L
 
L

Sites not aligning to the query:

5aovA Ternary crystal structure of pyrococcus furiosus glyoxylate hydroxypyruvate reductase in presence of glyoxylate (see paper)
35% identity, 82% coverage: 58:326/327 of query aligns to 56:328/334 of 5aovA

query
sites
5aovA
K
 
R
I
 
I
T
 
D
E
 
Q
Q
 
E
V
 
V
I
 
F
A
 
E
A
 
N
S
 
A
P
 
P
K
 
R
L
 
L
R
 
R
A
 
I
I
 
V
A
 
A
K
 
N
H
x
Y
G
x
A
V
|
V
G
|
G
Y
 
Y
D
 
D
N
 
N
I
 
I
D
 
D
A
 
V
E
 
E
A
 
E
A
 
A
A
 
T
R
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
I
P
 
Y
V
 
V
L
 
T
V
 
N
A
 
T
R
 
P
G
 
D
A
 
V
N
x
L
S
 
T
Q
 
N
S
 
A
V
x
T
A
 
A
E
 
D
L
 
H
A
 
A
F
 
F
A
 
A
L
 
L
M
 
L
F
 
L
G
 
A
V
 
T
A
 
A
R
 
R
H
 
H
L
 
V
A
 
V
H
 
K
L
 
G
H
 
D
E
 
K
R
 
F
M
 
V
K
 
R
A
 
S
G
 
G
F
 
E
W
 
W
D
 
K
K
 
R
A
 
K
T
 
G
T
 
I
S
 
A
-
 
W
-
 
H
-
 
P
-
 
K
-
 
W
-
 
F
-
 
L
G
 
G
L
 
Y
Q
 
E
L
 
L
R
 
Y
G
 
G
R
 
K
S
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
V
 
V
G
 
G
F
|
F
G
|
G
E
x
R
I
|
I
G
 
G
R
 
Q
I
 
A
L
 
I
V
 
A
G
 
R
L
 
R
V
 
A
Q
 
K
P
 
G
L
 
F
H
 
N
M
 
M
T
 
R
V
 
I
R
 
L
V
 
Y
F
 
Y
D
x
S
P
x
R
Y
 
T
M
 
R
P
 
K
A
 
S
D
 
Q
I
 
A
R
 
E
I
 
K
E
 
E
G
 
L
A
 
G
E
 
A
R
 
E
V
 
Y
A
 
R
N
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
L
 
V
L
 
L
A
 
K
T
 
E
S
 
S
D
 
D
V
 
F
I
 
V
S
 
I
L
 
L
H
x
A
C
x
V
P
|
P
L
 
L
T
 
T
P
 
K
Q
 
E
T
|
T
R
 
M
N
 
Y
M
 
M
I
 
I
G
 
N
R
 
E
E
 
E
Q
 
R
I
 
L
A
 
K
A
 
L
M
 
M
R
 
K
P
 
P
G
 
T
G
 
A
I
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
T
x
I
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
K
L
 
V
I
 
V
D
 
D
E
 
T
A
 
K
A
 
A
L
 
L
F
 
I
E
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
K
D
 
E
G
 
G
R
 
W
I
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
T
 
V
F
 
F
A
 
E
E
 
E
E
|
E
P
 
P
V
 
Y
N
 
Y
P
 
-
A
 
N
N
 
E
P
 
E
L
 
L
L
 
F
T
 
S
L
 
L
P
 
D
N
 
N
L
 
V
I
 
V
A
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
A
 
I
G
|
G
A
 
S
S
 
A
T
 
T
Q
 
F
A
 
E
A
 
A
R
 
R
D
 
E
A
 
A
M
 
M
G
 
A
L
 
E
I
 
L
A
 
V
L
 
A
D
 
R
H
 
N
V
 
L
M
 
I
N
 
A
V
 
F
L
 
-
E
 
-
G
 
K
K
 
R
G
 
G
A
 
E
D
 
I
P
 
P
R
 
P
A
 
T
M
 
L
V
 
V
N
 
N
A
 
K
P
 
E
Q
 
V
L
 
I
R
 
K
V
 
I

Sites not aligning to the query:

2p9eA Crystal structure of g336v mutant of e.Coli phosphoglycerate dehydrogenase (see paper)
39% identity, 73% coverage: 59:298/327 of query aligns to 61:302/406 of 2p9eA

query
sites
2p9eA
I
 
L
T
 
T
E
 
E
Q
 
D
V
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
S
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
R
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
G
K
 
A
H
 
F
G
 
A
V
 
I
G
 
G
Y
 
T
D
 
N
N
 
Q
I
 
V
D
 
D
A
 
L
E
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
F
V
 
N
A
 
A
R
 
P
G
 
F
A
 
S
N
|
N
S
 
T
Q
 
R
S
 
S
V
 
V
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
V
F
 
I
A
 
G
L
 
E
M
 
L
F
 
L
G
 
L
V
 
L
A
 
L
R
 
R
H
 
G
L
 
V
A
 
P
H
 
E
L
 
A
H
 
N
E
 
A
R
 
K
M
 
A
K
 
H
A
 
R
G
 
G
F
 
V
W
 
W
D
 
N
K
 
K
A
 
L
T
 
A
T
 
A
S
 
G
G
 
S
L
 
F
Q
 
E
L
 
A
R
 
R
G
 
G
R
 
K
S
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
 
G
F
 
Y
G
|
G
E
x
H
I
|
I
G
 
G
R
 
T
I
 
Q
L
 
L
V
 
G
G
 
I
L
 
L
V
 
A
Q
 
E
P
 
S
L
 
L
H
 
G
M
 
M
T
 
Y
V
 
V
R
 
Y
V
 
F
F
x
Y
D
|
D
P
 
-
Y
 
-
M
x
I
P
 
E
A
 
N
D
 
K
I
 
L
R
 
P
I
 
L
E
 
G
G
 
N
A
 
A
E
 
T
R
 
Q
V
 
V
A
 
Q
N
 
H
L
 
L
D
 
S
E
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
N
T
 
M
S
 
S
D
 
D
V
 
V
I
 
V
S
 
S
L
 
L
H
|
H
C
x
V
P
|
P
L
 
E
T
 
N
P
 
P
Q
x
S
T
 
T
R
 
K
N
 
N
M
 
M
I
 
M
G
 
G
R
 
A
E
 
K
Q
 
E
I
 
I
A
 
S
A
 
L
M
 
M
R
 
K
P
 
P
G
 
G
G
 
S
I
 
L
L
 
L
I
 
I
N
 
N
T
x
A
A
x
S
R
|
R
G
 
G
G
 
T
L
 
V
I
 
V
D
 
D
E
 
I
A
 
P
A
 
A
L
 
L
F
 
A
E
 
D
A
 
A
L
 
L
R
 
A
D
 
S
G
 
K
R
 
H
I
 
L
G
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
I
D
|
D
T
 
V
F
 
F
A
 
P
E
 
T
E
|
E
P
 
P
V
 
A
N
 
T
P
 
N
A
 
S
N
 
D
P
 
P
L
 
F
L
 
T
T
 
S
-
 
P
-
 
L
-
 
A
-
 
E
L
 
F
P
 
D
N
 
N
L
 
V
I
 
L
A
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
A
 
I
G
|
G
A
 
G
S
 
S
T
 
T
Q
 
Q
A
 
E
A
 
A
R
 
Q
D
 
E
A
 
N
M
 
I
G
 
G
L
 
L

6plfA Crystal structure of human phgdh complexed with compound 1 (see paper)
35% identity, 88% coverage: 11:297/327 of query aligns to 10:292/305 of 6plfA

query
sites
6plfA
A
 
S
L
 
L
T
 
D
P
 
P
E
 
C
A
 
C
A
 
R
E
 
K
V
 
I
A
 
L
E
 
Q
R
 
D
R
 
G
G
 
G
A
 
L
R
 
Q
L
 
V
V
 
V
S
 
E
I
 
-
G
 
-
A
 
K
A
 
Q
Y
 
N
A
 
L
S
 
S
P
 
K
E
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
-
T
 
-
V
 
I
A
 
A
A
 
E
K
 
L
E
 
Q
A
 
D
I
 
C
D
 
E
G
 
G
I
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
Q
 
S
G
 
A
-
 
T
K
 
K
I
 
V
T
 
T
E
 
A
Q
 
D
V
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
S
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
R
 
Q
A
 
V
I
 
V
A
 
G
K
 
R
H
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
Y
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
A
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
T
R
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
P
 
L
V
 
V
L
 
M
V
 
N
A
 
T
R
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
S
 
S
Q
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
T
F
 
C
A
 
G
L
 
M
M
 
I
F
 
M
G
 
C
V
 
L
A
 
A
R
 
R
H
 
Q
L
 
I
A
 
P
H
 
Q
L
 
A
H
 
T
E
 
A
R
 
S
M
 
M
K
 
K
A
 
D
G
 
G
F
 
K
W
 
W
D
 
E
K
 
R
A
 
K
T
 
K
T
 
F
S
 
M
G
 
G
L
 
T
Q
 
E
L
 
L
R
 
N
G
 
G
R
 
K
S
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
L
G
 
G
F
 
L
G
 
G
E
 
R
I
 
I
G
 
G
R
 
R
I
 
E
L
 
V
V
 
A
G
 
T
L
 
R
V
 
M
Q
 
Q
P
 
S
L
 
F
H
 
G
M
 
M
T
 
K
V
 
T
R
 
I
V
 
G
F
x
Y
D
|
D
P
|
P
Y
 
I
M
 
I
P
 
S
A
 
P
D
 
E
I
 
V
R
 
S
I
 
A
E
 
S
G
 
F
A
 
G
E
 
V
R
 
Q
V
 
Q
A
 
L
N
 
P
L
|
L
D
 
E
E
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
T
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
I
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
C
x
T
P
|
P
L
 
L
T
 
L
P
 
P
Q
 
S
T
 
T
R
 
T
N
 
G
M
x
L
I
 
L
G
 
N
R
 
D
E
 
N
Q
 
T
I
 
F
A
 
A
A
 
Q
M
 
C
R
 
K
P
 
K
G
 
G
G
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
I
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
D
 
S
G
 
G
R
 
Q
I
 
C
G
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
V
F
 
F
A
 
T
E
 
E
E
 
E
P
 
P
V
 
-
N
 
-
P
 
P
A
 
R
N
 
D
-
 
R
P
 
A
L
 
L
L
 
V
T
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
L
 
V
I
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
A
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
T
 
T
Q
 
K
A
 
E
A
 
A
R
 
Q
D
 
S
A
 
R
M
 
C
G
 
G

6plgA Crystal structure of human phgdh complexed with compound 15 (see paper)
35% identity, 88% coverage: 11:297/327 of query aligns to 9:291/303 of 6plgA

query
sites
6plgA
A
 
S
L
 
L
T
 
D
P
 
P
E
 
C
A
 
C
A
 
R
E
 
K
V
 
I
A
 
L
E
 
Q
R
 
D
R
 
G
G
 
G
A
 
L
R
 
Q
L
 
V
V
 
V
S
 
E
I
 
-
G
 
-
A
 
K
A
 
Q
Y
 
N
A
 
L
S
 
S
P
 
K
E
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
-
T
 
-
V
 
I
A
 
A
A
 
E
K
 
L
E
 
Q
A
 
D
I
 
C
D
 
E
G
 
G
I
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
Q
 
S
G
 
A
-
 
T
K
 
K
I
 
V
T
 
T
E
 
A
Q
 
D
V
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
S
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
R
 
Q
A
 
V
I
 
V
A
 
G
K
 
R
H
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
Y
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
A
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
T
R
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
P
 
L
V
 
V
L
 
M
V
 
N
A
 
T
R
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
S
 
S
Q
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
T
F
 
C
A
 
G
L
 
M
M
 
I
F
 
M
G
 
C
V
 
L
A
 
A
R
 
R
H
 
Q
L
 
I
A
 
P
H
 
Q
L
 
A
H
 
T
E
 
A
R
 
S
M
 
M
K
 
K
A
 
D
G
 
G
F
 
K
W
 
W
D
 
E
K
 
R
A
 
K
T
 
K
T
 
F
S
 
M
G
 
G
L
 
T
Q
 
E
L
 
L
R
 
N
G
 
G
R
 
K
S
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
L
G
 
G
F
 
L
G
|
G
E
x
R
I
 
I
G
 
G
R
 
R
I
 
E
L
 
V
V
 
A
G
 
T
L
 
R
V
 
M
Q
 
Q
P
 
S
L
 
F
H
 
G
M
 
M
T
 
K
V
 
T
R
 
I
V
 
G
F
 
Y
D
|
D
P
|
P
Y
x
I
M
x
I
P
 
S
A
 
P
D
 
E
I
 
V
R
 
S
I
 
A
E
 
S
G
 
F
A
 
G
E
 
V
R
 
Q
V
 
Q
A
 
L
N
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
T
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
I
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
C
x
T
P
 
P
L
 
L
T
x
L
P
 
P
Q
 
S
T
 
T
R
 
T
N
 
G
M
 
L
I
 
L
G
 
N
R
 
D
E
 
N
Q
 
T
I
 
F
A
 
A
A
 
Q
M
 
C
R
 
K
P
 
K
G
 
G
G
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
I
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
D
 
S
G
 
G
R
 
Q
I
 
C
G
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
V
F
 
F
A
 
T
E
 
E
E
 
E
P
 
P
V
 
-
N
 
-
P
 
P
A
 
R
N
 
D
-
 
R
P
 
A
L
 
L
L
 
V
T
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
L
 
V
I
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
A
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
T
 
T
Q
 
K
A
 
E
A
 
A
R
 
Q
D
 
S
A
 
R
M
 
C
G
 
G

6rj5A Crystal structure of phgdh in complex with compound 39 (see paper)
35% identity, 88% coverage: 11:297/327 of query aligns to 9:291/301 of 6rj5A

query
sites
6rj5A
A
 
S
L
 
L
T
 
D
P
 
P
E
 
C
A
 
C
A
 
R
E
 
K
V
 
I
A
 
L
E
 
Q
R
 
D
R
 
G
G
 
G
A
 
L
R
 
Q
L
 
V
V
 
V
S
 
E
I
 
-
G
 
-
A
 
K
A
 
Q
Y
 
N
A
 
L
S
 
S
P
 
K
E
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
-
T
 
-
V
 
I
A
 
A
A
 
E
K
 
L
E
 
Q
A
 
D
I
 
C
D
 
E
G
 
G
I
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
Q
 
S
G
 
A
-
 
T
K
 
K
I
 
V
T
 
T
E
 
A
Q
 
D
V
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
S
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
R
 
Q
A
 
V
I
 
V
A
 
G
K
 
R
H
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
Y
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
A
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
T
R
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
P
 
L
V
 
V
L
 
M
V
 
N
A
 
T
R
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
S
 
S
Q
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
T
F
 
C
A
 
G
L
 
M
M
 
I
F
 
M
G
 
C
V
 
L
A
 
A
R
 
R
H
 
Q
L
 
I
A
 
P
H
 
Q
L
 
A
H
 
T
E
 
A
R
 
S
M
 
M
K
 
K
A
 
D
G
 
G
F
 
K
W
 
W
D
 
E
K
 
R
A
 
K
T
 
K
T
 
F
S
 
M
G
 
G
L
 
T
Q
 
E
L
 
L
R
 
N
G
 
G
R
 
K
S
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
V
x
L
G
 
G
F
 
L
G
 
G
E
 
R
I
 
I
G
 
G
R
 
R
I
 
E
L
 
V
V
 
A
G
 
T
L
 
R
V
 
M
Q
 
Q
P
 
S
L
 
F
H
 
G
M
 
M
T
 
K
V
 
T
R
 
I
V
 
G
F
x
Y
D
|
D
P
|
P
Y
 
I
M
x
I
P
 
S
A
 
P
D
 
E
I
 
V
R
 
S
I
 
A
E
 
S
G
 
F
A
 
G
E
 
V
R
 
Q
V
 
Q
A
 
L
N
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
T
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
I
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
C
x
T
P
|
P
L
 
L
T
 
L
P
 
P
Q
 
S
T
 
T
R
 
T
N
 
G
M
x
L
I
 
L
G
 
N
R
 
D
E
 
N
Q
 
T
I
 
F
A
 
A
A
 
Q
M
 
C
R
 
K
P
 
K
G
 
G
G
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
I
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
D
 
S
G
 
G
R
 
Q
I
 
C
G
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
V
F
 
F
A
 
T
E
 
E
E
 
E
P
 
P
V
 
-
N
 
-
P
 
P
A
 
R
N
 
D
-
 
R
P
 
A
L
 
L
L
 
V
T
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
L
 
V
I
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
A
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
T
 
T
Q
 
K
A
 
E
A
 
A
R
 
Q
D
 
S
A
 
R
M
 
C
G
 
G

6rj2A Crystal structure of phgdh in complex with compound 40 (see paper)
35% identity, 88% coverage: 11:297/327 of query aligns to 6:288/299 of 6rj2A

query
sites
6rj2A
A
 
S
L
 
L
T
 
D
P
 
P
E
 
C
A
 
C
A
 
R
E
 
K
V
 
I
A
 
L
E
 
Q
R
 
D
R
 
G
G
 
G
A
 
L
R
 
Q
L
 
V
V
 
V
S
 
E
I
 
-
G
 
-
A
 
K
A
 
Q
Y
 
N
A
 
L
S
 
S
P
 
K
E
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
-
T
 
-
V
 
I
A
 
A
A
 
E
K
 
L
E
 
Q
A
 
D
I
 
C
D
 
E
G
 
G
I
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
Q
 
S
G
 
A
-
 
T
K
 
K
I
 
V
T
 
T
E
 
A
Q
 
D
V
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
S
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
R
 
Q
A
 
V
I
 
V
A
 
G
K
 
R
H
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
Y
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
A
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
T
R
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
P
 
L
V
 
V
L
 
M
V
 
N
A
 
T
R
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
S
 
S
Q
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
T
F
 
C
A
 
G
L
 
M
M
 
I
F
 
M
G
 
C
V
 
L
A
 
A
R
 
R
H
 
Q
L
 
I
A
 
P
H
 
Q
L
 
A
H
 
T
E
 
A
R
 
S
M
 
M
K
 
K
A
 
D
G
 
G
F
 
K
W
 
W
D
 
E
K
 
R
A
 
K
T
 
K
T
 
F
S
 
M
G
 
G
L
 
T
Q
 
E
L
 
L
R
 
N
G
 
G
R
 
K
S
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
L
G
 
G
F
 
L
G
|
G
E
 
R
I
|
I
G
 
G
R
 
R
I
 
E
L
 
V
V
 
A
G
 
T
L
 
R
V
 
M
Q
 
Q
P
 
S
L
 
F
H
 
G
M
 
M
T
 
K
V
 
T
R
 
I
V
 
G
F
x
Y
D
|
D
P
|
P
Y
x
I
M
x
I
P
 
S
A
 
P
D
 
E
I
 
V
R
 
S
I
 
A
E
 
S
G
 
F
A
 
G
E
 
V
R
 
Q
V
 
Q
A
 
L
N
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
T
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
I
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
C
x
T
P
 
P
L
 
L
T
 
L
P
 
P
Q
 
S
T
 
T
R
 
T
N
 
G
M
x
L
I
 
L
G
 
N
R
 
D
E
 
N
Q
 
T
I
 
F
A
 
A
A
 
Q
M
 
C
R
 
K
P
 
K
G
 
G
G
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
I
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
D
 
S
G
 
G
R
 
Q
I
 
C
G
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
V
F
 
F
A
 
T
E
 
E
E
 
E
P
 
P
V
 
-
N
 
-
P
 
P
A
 
R
N
 
D
-
 
R
P
 
A
L
 
L
L
 
V
T
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
L
 
V
I
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
A
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
T
 
T
Q
 
K
A
 
E
A
 
A
R
 
Q
D
 
S
A
 
R
M
 
C
G
 
G

7ewhA Crystal structure of human phgdh in complex with homoharringtonine (see paper)
35% identity, 88% coverage: 11:297/327 of query aligns to 9:291/302 of 7ewhA

query
sites
7ewhA
A
 
S
L
 
L
T
 
D
P
 
P
E
 
C
A
 
C
A
 
R
E
 
K
V
 
I
A
 
L
E
 
Q
R
 
D
R
 
G
G
 
G
A
 
L
R
 
Q
L
 
V
V
 
V
S
 
E
I
 
-
G
 
-
A
 
K
A
 
Q
Y
 
N
A
 
L
S
 
S
P
 
K
E
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
-
T
 
-
V
 
I
A
 
A
A
 
E
K
 
L
E
 
Q
A
 
D
I
 
C
D
 
E
G
 
G
I
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
Q
 
S
G
 
A
-
 
T
K
 
K
I
 
V
T
 
T
E
 
A
Q
 
D
V
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
S
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
R
 
Q
A
 
V
I
 
V
A
 
G
K
 
R
H
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
Y
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
A
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
T
R
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
P
 
L
V
 
V
L
 
M
V
 
N
A
 
T
R
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
S
 
S
Q
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
T
F
 
C
A
 
G
L
 
M
M
 
I
F
 
M
G
 
C
V
 
L
A
 
A
R
 
R
H
 
Q
L
 
I
A
 
P
H
 
Q
L
 
A
H
 
T
E
 
A
R
 
S
M
 
M
K
 
K
A
 
D
G
 
G
F
 
K
W
 
W
D
 
E
K
 
R
A
 
K
T
 
K
T
 
F
S
 
M
G
 
G
L
 
T
Q
 
E
L
 
L
R
 
N
G
 
G
R
 
K
S
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
V
x
L
G
|
G
F
x
L
G
|
G
E
x
R
I
|
I
G
|
G
R
 
R
I
 
E
L
 
V
V
 
A
G
 
T
L
 
R
V
 
M
Q
 
Q
P
 
S
L
 
F
H
 
G
M
 
M
T
 
K
V
 
T
R
 
I
V
 
G
F
 
Y
D
|
D
P
 
P
Y
 
I
M
 
I
P
 
S
A
 
P
D
 
E
I
 
V
R
 
S
I
 
A
E
 
S
G
 
F
A
 
G
E
 
V
R
 
Q
V
 
Q
A
 
L
N
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
T
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
I
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
C
x
T
P
|
P
L
 
L
T
 
L
P
 
P
Q
 
S
T
 
T
R
 
T
N
 
G
M
 
L
I
 
L
G
 
N
R
 
D
E
 
N
Q
 
T
I
 
F
A
 
A
A
 
Q
M
 
C
R
 
K
P
 
K
G
 
G
G
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
I
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
D
 
S
G
 
G
R
 
Q
I
 
C
G
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
V
F
 
F
A
 
T
E
 
E
E
 
E
P
 
P
V
 
-
N
 
-
P
 
P
A
 
R
N
 
D
-
 
R
P
 
A
L
 
L
L
 
V
T
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
L
 
V
I
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
A
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
T
 
T
Q
 
K
A
 
E
A
 
A
R
 
Q
D
 
S
A
 
R
M
 
C
G
 
G

6rihA Crystal structure of phgdh in complex with compound 9 (see paper)
35% identity, 88% coverage: 11:297/327 of query aligns to 9:291/302 of 6rihA

query
sites
6rihA
A
 
S
L
 
L
T
 
D
P
 
P
E
 
C
A
 
C
A
 
R
E
 
K
V
 
I
A
 
L
E
 
Q
R
 
D
R
 
G
G
 
G
A
 
L
R
 
Q
L
 
V
V
 
V
S
 
E
I
 
-
G
 
-
A
 
K
A
 
Q
Y
 
N
A
 
L
S
 
S
P
 
K
E
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
-
T
 
-
V
 
I
A
 
A
A
 
E
K
 
L
E
 
Q
A
 
D
I
 
C
D
 
E
G
 
G
I
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
Q
 
S
G
 
A
-
 
T
K
 
K
I
 
V
T
 
T
E
 
A
Q
 
D
V
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
S
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
R
 
Q
A
 
V
I
 
V
A
 
G
K
 
R
H
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
Y
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
A
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
T
R
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
P
 
L
V
 
V
L
 
M
V
 
N
A
 
T
R
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
S
 
S
Q
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
T
F
 
C
A
 
G
L
 
M
M
 
I
F
 
M
G
 
C
V
 
L
A
 
A
R
 
R
H
 
Q
L
 
I
A
 
P
H
 
Q
L
 
A
H
 
T
E
 
A
R
 
S
M
 
M
K
 
K
A
 
D
G
 
G
F
 
K
W
 
W
D
 
E
K
 
R
A
 
K
T
 
K
T
 
F
S
 
M
G
 
G
L
 
T
Q
 
E
L
 
L
R
 
N
G
 
G
R
 
K
S
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
L
G
 
G
F
 
L
G
|
G
E
 
R
I
 
I
G
 
G
R
 
R
I
 
E
L
 
V
V
 
A
G
 
T
L
 
R
V
 
M
Q
 
Q
P
 
S
L
 
F
H
 
G
M
 
M
T
 
K
V
 
T
R
 
I
V
 
G
F
x
Y
D
|
D
P
|
P
Y
x
I
M
x
I
P
 
S
A
 
P
D
 
E
I
 
V
R
 
S
I
 
A
E
 
S
G
 
F
A
 
G
E
 
V
R
 
Q
V
 
Q
A
 
L
N
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
T
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
I
 
I
S
 
T
L
 
V
H
 
H
C
x
T
P
|
P
L
 
L
T
 
L
P
 
P
Q
 
S
T
 
T
R
 
T
N
 
G
M
x
L
I
 
L
G
 
N
R
 
D
E
 
N
Q
 
T
I
 
F
A
 
A
A
 
Q
M
 
C
R
 
K
P
 
K
G
 
G
G
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
I
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
D
 
S
G
 
G
R
 
Q
I
 
C
G
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
V
F
 
F
A
 
T
E
 
E
E
 
E
P
 
P
V
 
-
N
 
-
P
 
P
A
 
R
N
 
D
-
 
R
P
 
A
L
 
L
L
 
V
T
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
L
 
V
I
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
A
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
T
 
T
Q
 
K
A
 
E
A
 
A
R
 
Q
D
 
S
A
 
R
M
 
C
G
 
G

6rj3A Crystal structure of phgdh in complex with compound 15 (see paper)
35% identity, 88% coverage: 11:297/327 of query aligns to 8:290/297 of 6rj3A

query
sites
6rj3A
A
 
S
L
 
L
T
 
D
P
 
P
E
 
C
A
 
C
A
 
R
E
 
K
V
 
I
A
 
L
E
 
Q
R
 
D
R
 
G
G
 
G
A
 
L
R
 
Q
L
 
V
V
 
V
S
 
E
I
 
-
G
 
-
A
 
K
A
 
Q
Y
 
N
A
 
L
S
 
S
P
 
K
E
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
-
T
 
-
V
 
I
A
 
A
A
 
E
K
 
L
E
 
Q
A
 
D
I
 
C
D
 
E
G
 
G
I
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
Q
 
S
G
 
A
-
 
T
K
 
K
I
 
V
T
 
T
E
 
A
Q
 
D
V
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
S
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
R
 
Q
A
 
V
I
 
V
A
 
G
K
 
R
H
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
Y
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
A
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
T
R
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
P
 
L
V
 
V
L
 
M
V
 
N
A
 
T
R
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
S
 
S
Q
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
T
F
 
C
A
 
G
L
 
M
M
 
I
F
 
M
G
 
C
V
 
L
A
 
A
R
 
R
H
 
Q
L
 
I
A
 
P
H
 
Q
L
 
A
H
 
T
E
 
A
R
 
S
M
 
M
K
 
K
A
 
D
G
 
G
F
 
K
W
 
W
D
 
E
K
 
R
A
 
K
T
 
K
T
 
F
S
 
M
G
 
G
L
 
T
Q
 
E
L
 
L
R
 
N
G
 
G
R
 
K
S
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
V
x
L
G
 
G
F
 
L
G
 
G
E
 
R
I
 
I
G
 
G
R
 
R
I
 
E
L
 
V
V
 
A
G
 
T
L
 
R
V
 
M
Q
 
Q
P
 
S
L
 
F
H
 
G
M
 
M
T
 
K
V
 
T
R
 
I
V
 
G
F
x
Y
D
|
D
P
|
P
Y
x
I
M
x
I
P
 
S
A
 
P
D
 
E
I
 
V
R
 
S
I
 
A
E
 
S
G
 
F
A
 
G
E
 
V
R
 
Q
V
 
Q
A
 
L
N
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
T
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
I
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
C
x
T
P
|
P
L
 
L
T
 
L
P
 
P
Q
 
S
T
 
T
R
 
T
N
 
G
M
x
L
I
 
L
G
 
N
R
 
D
E
 
N
Q
 
T
I
 
F
A
 
A
A
 
Q
M
 
C
R
 
K
P
 
K
G
 
G
G
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
I
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
D
 
S
G
 
G
R
 
Q
I
 
C
G
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
V
F
 
F
A
 
T
E
 
E
E
 
E
P
 
P
V
 
-
N
 
-
P
 
P
A
 
R
N
 
D
-
 
R
P
 
A
L
 
L
L
 
V
T
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
L
 
V
I
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
A
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
T
 
T
Q
 
K
A
 
E
A
 
A
R
 
Q
D
 
S
A
 
R
M
 
C
G
 
G

7dkmA Phgdh covalently linked to oridonin (see paper)
35% identity, 88% coverage: 11:297/327 of query aligns to 10:292/306 of 7dkmA

query
sites
7dkmA
A
 
S
L
 
L
T
 
D
P
 
P
E
x
C
A
 
C
A
 
R
E
x
K
V
x
I
A
 
L
E
 
Q
R
 
D
R
 
G
G
 
G
A
 
L
R
 
Q
L
 
V
V
 
V
S
 
E
I
 
-
G
 
-
A
 
K
A
 
Q
Y
 
N
A
 
L
S
 
S
P
 
K
E
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
-
T
 
-
V
 
I
A
 
A
A
 
E
K
 
L
E
 
Q
A
 
D
I
 
C
D
 
E
G
 
G
I
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
Q
 
S
G
 
A
-
 
T
K
 
K
I
 
V
T
 
T
E
 
A
Q
 
D
V
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
S
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
R
 
Q
A
 
V
I
 
V
A
 
G
K
 
R
H
 
A
G
 
G
V
x
T
G
 
G
Y
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
A
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
T
R
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
P
 
L
V
 
V
L
 
M
V
 
N
A
 
T
R
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
S
 
S
Q
 
L
S
 
S
V
x
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
T
F
 
C
A
 
G
L
 
M
M
 
I
F
 
M
G
 
C
V
 
L
A
 
A
R
 
R
H
 
Q
L
 
I
A
 
P
H
 
Q
L
 
A
H
 
T
E
 
A
R
 
S
M
 
M
K
 
K
A
 
D
G
 
G
F
 
K
W
 
W
D
 
E
K
 
R
A
 
K
T
 
K
T
 
F
S
 
M
G
 
G
L
 
T
Q
 
E
L
 
L
R
 
N
G
 
G
R
 
K
S
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
L
G
|
G
F
 
L
G
 
G
E
x
R
I
|
I
G
 
G
R
 
R
I
 
E
L
 
V
V
 
A
G
 
T
L
 
R
V
 
M
Q
 
Q
P
 
S
L
 
F
H
 
G
M
 
M
T
 
K
V
 
T
R
 
I
V
 
G
F
x
Y
D
|
D
P
|
P
Y
x
I
M
 
I
P
 
S
A
 
P
D
 
E
I
 
V
R
 
S
I
 
A
E
 
S
G
 
F
A
 
G
E
 
V
R
 
Q
V
 
Q
A
 
L
N
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
T
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
I
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
C
x
T
P
|
P
L
 
L
T
 
L
P
 
P
Q
 
S
T
|
T
R
 
T
N
 
G
M
 
L
I
 
L
G
 
N
R
 
D
E
 
N
Q
 
T
I
 
F
A
 
A
A
 
Q
M
 
C
R
 
K
P
 
K
G
 
G
G
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
x
C
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
I
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
D
 
S
G
 
G
R
 
Q
I
 
C
G
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
V
F
 
F
A
 
T
E
 
E
E
 
E
P
 
P
V
 
-
N
 
-
P
 
P
A
 
R
N
 
D
-
 
R
P
 
A
L
 
L
L
 
V
T
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
L
 
V
I
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
A
 
L
G
|
G
A
 
A
S
 
S
T
 
T
Q
 
K
A
 
E
A
 
A
R
 
Q
D
 
S
A
 
R
M
 
C
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6cwaA Crystal structure phgdh in complex with nadh and 3-phosphoglycerate at 1.77 a resolution (see paper)
35% identity, 88% coverage: 11:297/327 of query aligns to 8:290/299 of 6cwaA

query
sites
6cwaA
A
 
S
L
 
L
T
 
D
P
 
P
E
 
C
A
 
C
A
 
R
E
 
K
V
 
I
A
 
L
E
 
Q
R
 
D
R
 
G
G
 
G
A
 
L
R
 
Q
L
 
V
V
 
V
S
 
E
I
 
-
G
 
-
A
 
K
A
 
Q
Y
 
N
A
 
L
S
 
S
P
 
K
E
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
-
T
 
-
V
 
I
A
 
A
A
 
E
K
 
L
E
 
Q
A
 
D
I
 
C
D
 
E
G
 
G
I
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
Q
 
S
G
 
A
-
 
T
K
 
K
I
 
V
T
 
T
E
 
A
Q
 
D
V
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
S
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
R
 
Q
A
 
V
I
 
V
A
 
G
K
 
R
H
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
Y
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
A
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
T
R
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
P
 
L
V
 
V
L
 
M
V
 
N
A
 
T
R
 
P
G
 
N
A
 
G
N
|
N
S
 
S
Q
 
L
S
 
S
V
x
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
T
F
 
C
A
 
G
L
 
M
M
 
I
F
 
M
G
 
C
V
 
L
A
 
A
R
 
R
H
 
Q
L
 
I
A
 
P
H
 
Q
L
 
A
H
 
T
E
 
A
R
 
S
M
 
M
K
 
K
A
 
D
G
 
G
F
 
K
W
 
W
D
 
E
K
 
R
A
 
K
T
 
K
T
 
F
S
 
M
G
 
G
L
 
T
Q
 
E
L
 
L
R
 
N
G
 
G
R
 
K
S
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
L
G
 
G
F
 
L
G
 
G
E
x
R
I
|
I
G
 
G
R
 
R
I
 
E
L
 
V
V
 
A
G
 
T
L
 
R
V
 
M
Q
 
Q
P
 
S
L
 
F
H
 
G
M
 
M
T
 
K
V
 
T
R
 
I
V
 
G
F
x
Y
D
|
D
P
|
P
Y
x
I
M
 
I
P
 
S
A
 
P
D
 
E
I
 
V
R
 
S
I
 
A
E
 
S
G
 
F
A
 
G
E
 
V
R
 
Q
V
 
Q
A
 
L
N
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
T
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
I
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
C
x
T
P
|
P
L
 
L
T
 
L
P
 
P
Q
 
S
T
|
T
R
 
T
N
 
G
M
 
L
I
 
L
G
 
N
R
 
D
E
 
N
Q
 
T
I
 
F
A
 
A
A
 
Q
M
 
C
R
 
K
P
 
K
G
 
G
G
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
x
C
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
I
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
D
 
S
G
 
G
R
 
Q
I
 
C
G
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
V
F
 
F
A
 
T
E
 
E
E
 
E
P
 
P
V
 
-
N
 
-
P
 
P
A
 
R
N
 
D
-
 
R
P
 
A
L
 
L
L
 
V
T
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
L
 
V
I
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
A
 
L
G
|
G
A
 
A
S
 
S
T
 
T
Q
 
K
A
 
E
A
 
A
R
 
Q
D
 
S
A
 
R
M
 
C
G
 
G

6plfB Crystal structure of human phgdh complexed with compound 1 (see paper)
36% identity, 78% coverage: 43:297/327 of query aligns to 32:282/292 of 6plfB

query
sites
6plfB
V
 
I
A
 
A
A
 
E
K
 
L
E
 
Q
A
 
D
I
 
C
D
 
E
G
 
G
I
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
Q
 
S
G
 
A
K
 
A
I
 
-
T
 
-
E
 
-
Q
 
D
V
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
S
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
R
 
Q
A
 
V
I
 
V
A
 
G
K
 
R
H
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
Y
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
A
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
T
R
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
P
 
L
V
 
V
L
 
M
V
 
N
A
 
T
R
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
S
 
S
Q
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
T
F
 
C
A
 
G
L
 
M
M
 
I
F
 
M
G
 
C
V
 
L
A
 
A
R
 
R
H
 
Q
L
 
I
A
 
P
H
 
Q
L
 
A
H
 
T
E
 
A
R
 
S
M
 
M
K
 
K
A
 
D
G
 
G
F
 
K
W
 
W
D
 
E
K
 
R
A
 
K
T
 
K
T
 
F
S
 
M
G
 
G
L
 
T
Q
 
E
L
 
L
R
 
N
G
 
G
R
 
K
S
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
L
G
 
G
F
 
L
G
 
G
E
x
R
I
 
I
G
 
G
R
 
R
I
 
E
L
 
V
V
 
A
G
 
T
L
 
R
V
 
M
Q
 
Q
P
 
S
L
 
F
H
 
G
M
 
M
T
 
K
V
 
T
R
 
I
V
 
G
F
x
Y
D
|
D
P
|
P
Y
 
I
M
x
I
P
 
S
A
 
P
D
 
E
I
 
V
R
 
S
I
 
A
E
 
S
G
 
F
A
 
G
E
 
V
R
 
Q
V
 
Q
A
 
L
N
 
P
L
|
L
D
 
E
E
 
E
L
 
I
L
 
W
A
 
P
T
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
I
 
I
S
 
T
L
 
V
H
 
H
C
x
T
P
|
P
L
 
L
T
 
L
P
 
P
Q
x
S
T
 
T
R
 
T
N
 
G
M
x
L
I
 
L
G
 
N
R
 
D
E
 
N
Q
 
T
I
 
F
A
 
A
A
 
Q
M
 
C
R
 
K
P
 
K
G
 
G
G
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
I
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
D
 
S
G
 
G
R
 
Q
I
 
C
G
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
V
F
 
F
A
 
T
E
 
E
E
 
E
P
 
P
V
 
-
N
 
-
P
 
P
A
 
R
N
 
D
-
 
R
P
 
A
L
 
L
L
 
V
T
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
L
 
V
I
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
A
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
T
 
T
Q
 
K
A
 
E
A
 
A
R
 
Q
D
 
S
A
 
R
M
 
C
G
 
G

P87228 Putative D-3-phosphoglycerate dehydrogenase; 3-PGDH; 2-oxoglutarate reductase; EC 1.1.1.95; EC 1.1.1.399 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
35% identity, 77% coverage: 47:298/327 of query aligns to 93:358/466 of P87228

query
sites
P87228
E
 
E
A
 
K
I
 
I
D
 
K
G
 
G
I
 
V
-
 
H
-
 
A
-
 
I
-
 
G
I
 
I
V
 
R
R
 
S
Q
 
K
G
 
T
K
 
R
I
 
L
T
 
T
E
 
R
Q
 
R
V
 
V
I
 
L
A
 
E
A
 
A
S
 
A
P
 
D
K
 
S
L
 
L
R
 
I
A
 
V
I
 
I
A
 
G
K
 
C
H
 
F
G
 
C
V
 
I
G
 
G
Y
 
T
D
 
N
N
 
Q
I
 
V
D
 
D
A
 
L
E
 
D
A
 
F
A
 
A
A
 
A
R
 
E
R
 
R
G
 
G
I
 
I
P
 
A
V
 
V
L
 
F
V
 
N
A
 
S
R
 
P
G
 
Y
A
 
A
N
 
N
S
 
S
Q
 
R
S
 
S
V
 
V
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
V
F
 
I
A
 
G
L
 
Y
M
 
I
F
 
I
G
 
S
V
 
L
A
 
A
R
 
R
H
 
Q
L
 
V
A
 
G
H
 
D
L
 
R
H
 
S
E
 
L
R
 
E
M
 
L
K
 
H
A
 
R
G
 
G
F
 
E
W
 
W
D
 
N
K
 
K
A
 
V
T
 
S
T
 
S
S
 
G
G
 
C
L
 
W
Q
 
E
L
 
I
R
 
R
G
 
G
R
 
K
S
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
 
G
F
 
Y
G
 
G
E
 
H
I
 
I
G
 
G
R
 
S
I
 
Q
L
 
L
V
 
S
G
 
V
L
 
L
V
 
A
Q
 
E
P
 
A
L
 
M
H
 
G
M
 
L
T
 
H
V
 
V
R
 
V
V
 
Y
F
 
Y
D
 
D
-
 
I
-
 
L
P
 
P
Y
 
I
M
 
M
P
 
P
A
 
-
D
 
-
I
 
-
R
 
-
I
 
L
E
 
G
G
 
S
A
 
A
E
 
K
R
 
Q
V
 
L
A
 
S
N
 
S
L
 
L
D
 
P
E
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
H
T
 
R
S
 
A
D
 
D
V
 
F
I
 
V
S
 
S
L
 
L
H
 
H
C
 
V
P
 
P
L
 
A
T
x
S
P
 
P
Q
 
E
T
 
T
R
 
K
N
 
N
M
 
M
I
 
I
G
 
S
R
 
S
E
 
K
Q
 
E
I
 
F
A
 
A
A
 
A
M
 
M
R
 
K
P
 
E
G
 
G
G
 
S
I
 
Y
L
 
L
I
 
I
N
 
N
T
 
A
A
 
S
R
 
R
G
 
G
G
 
T
L
 
V
I
 
V
D
 
D
E
 
I
A
 
P
A
 
A
L
 
L
F
 
V
E
 
D
A
 
A
L
 
S
R
 
K
D
 
S
G
 
G
R
 
K
I
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
I
D
 
D
T
 
V
F
 
Y
A
 
P
E
 
S
E
 
E
P
 
P
-
 
A
-
 
G
-
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
D
-
 
K
-
 
F
-
 
V
-
 
D
-
 
S
V
 
L
N
 
N
P
 
S
A
 
W
N
 
T
P
 
S
L
 
E
L
 
L
T
 
T
-
 
H
L
 
C
P
 
K
N
 
N
L
 
I
I
 
I
A
 
L
T
 
T
P
 
P
H
 
H
A
 
I
G
 
G
A
 
G
S
 
S
T
 
T
Q
 
E
A
 
E
A
 
A
R
 
Q
D
 
Y
A
 
N
M
 
I
G
 
G
L
 
I

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_012976339.1 NCBI__GCF_000010725.1:WP_012976339.1
MPYTILVTGPALTPEAAEVAERRGARLVSIGAAYASPEELATVAAKEAIDGIIVRQGKIT
EQVIAASPKLRAIAKHGVGYDNIDAEAAARRGIPVLVARGANSQSVAELAFALMFGVARH
LAHLHERMKAGFWDKATTSGLQLRGRSLGIVGFGEIGRILVGLVQPLHMTVRVFDPYMPA
DIRIEGAERVANLDELLATSDVISLHCPLTPQTRNMIGREQIAAMRPGGILINTARGGLI
DEAALFEALRDGRIGGAGLDTFAEEPVNPANPLLTLPNLIATPHAGASTQAARDAMGLIA
LDHVMNVLEGKGADPRAMVNAPQLRVA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory