SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012976362.1 NCBI__GCF_000010725.1:WP_012976362.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7cquA Gmas/adp/metsox-p complex (see paper)
65% identity, 99% coverage: 4:433/433 of query aligns to 2:429/429 of 7cquA

query
sites
7cquA
D
 
D
L
 
L
Q
 
A
Q
 
S
A
 
I
A
 
A
K
 
R
E
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
I
K
 
E
F
 
F
F
 
F
L
 
L
V
 
I
S
 
S
Y
 
F
T
 
T
D
 
D
L
 
L
F
 
L
G
 
G
A
 
V
Q
 
Q
R
 
R
A
 
A
K
 
K
L
 
L
V
 
V
P
 
P
A
 
A
A
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
E
 
D
M
 
M
V
 
A
E
 
V
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
F
 
F
A
 
A
G
 
G
F
 
F
A
 
A
T
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
L
 
M
S
 
S
P
 
P
A
 
A
D
 
D
S
 
A
D
 
D
L
 
I
L
 
L
A
 
A
M
 
I
P
 
P
D
 
D
P
 
P
D
 
E
S
 
S
M
 
L
I
 
I
Q
 
Q
L
 
L
P
 
P
W
 
W
K
 
K
P
 
P
E
 
S
V
 
V
A
 
G
W
 
W
V
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
D
L
 
V
W
 
H
M
 
F
D
 
E
G
 
G
Q
 
R
P
 
P
V
 
F
E
 
P
Q
 
K
G
 
A
P
 
P
R
 
R
N
 
V
T
 
A
L
 
L
K
 
K
R
 
S
M
 
V
I
 
L
A
 
A
A
 
R
A
 
A
A
 
A
E
 
G
Q
 
K
G
 
D
F
 
M
Q
 
H
L
 
L
K
 
K
T
 
H
G
 
G
V
 
V
E
|
E
C
 
C
E
|
E
F
 
F
F
 
F
L
 
L
T
 
I
T
 
Q
P
 
P
D
 
D
G
 
G
K
 
S
G
 
A
I
 
I
A
 
S
D
 
D
S
 
P
A
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
Q
T
 
A
K
 
K
P
 
P
C
 
C
Y
 
Y
D
 
D
Q
 
Q
Q
 
D
A
 
A
L
 
L
M
 
M
R
 
R
R
 
R
F
 
F
D
 
D
V
 
V
V
 
I
A
 
A
E
 
E
I
 
I
S
 
C
D
 
S
A
 
Y
M
 
M
S
 
V
A
 
D
L
 
L
G
 
G
W
 
W
K
 
G
P
 
P
Y
|
Y
Q
 
Q
S
 
N
D
 
D
H
 
H
E
|
E
D
 
D
A
 
A
I
 
N
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
E
|
E
M
 
M
N
|
N
W
|
W
E
x
D
Y
|
Y
D
 
A
D
 
D
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
A
 
A
D
 
D
R
 
R
H
 
H
A
 
A
F
 
F
F
 
F
K
 
K
Y
 
F
M
 
M
A
 
V
R
 
K
A
 
S
I
 
V
A
 
A
E
 
E
K
 
R
H
 
H
G
 
G
L
 
L
R
 
R
A
 
A
T
 
T
F
 
F
M
 
M
P
 
P
K
 
K
P
 
P
F
 
F
I
 
A
N
 
H
L
 
L
T
|
T
G
|
G
S
 
N
G
 
G
C
 
C
H
|
H
M
 
T
H
|
H
L
|
L
S
|
S
L
 
M
W
 
W
R
 
T
D
 
A
-
 
A
G
 
G
V
 
D
N
 
N
L
 
L
F
 
F
R
 
-
D
 
E
P
 
G
T
 
D
G
 
G
A
 
E
L
 
L
G
 
G
M
 
L
S
 
S
A
 
P
I
 
T
G
 
A
Y
 
Y
H
 
A
F
 
F
I
 
L
A
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
I
A
 
G
E
 
H
A
 
A
T
 
K
A
 
G
L
 
L
C
 
T
A
 
A
L
 
V
T
 
V
N
 
N
P
 
P
T
 
T
V
 
V
N
 
N
S
 
S
Y
 
Y
K
 
K
R
|
R
I
 
L
N
 
N
A
 
A
P
 
P
V
 
V
T
 
T
V
 
V
S
 
S
G
 
G
S
 
A
T
 
T
W
|
W
S
 
S
P
 
P
N
 
N
T
 
T
V
 
I
T
 
T
Y
 
Y
T
 
G
G
 
G
N
 
N
N
 
N
R
|
R
T
 
T
H
 
H
M
 
M
I
 
V
R
|
R
I
 
I
P
 
P
N
 
D
G
 
A
N
 
G
R
|
R
F
 
L
E
|
E
F
 
L
R
|
R
L
 
L
P
 
P
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
A
N
 
N
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
M
 
M
P
 
P
A
 
A
A
 
A
V
 
I
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
I
A
 
E
R
 
T
K
 
Q
A
 
A
D
 
D
P
 
P
G
 
G
P
 
Q
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
I
N
 
D
M
 
M
Y
 
Y
T
 
V
E
 
E
G
 
G
Y
 
H
K
 
S
V
 
V
T
 
-
D
 
E
G
 
A
R
 
E
K
 
Q
L
 
L
P
 
P
L
 
L
N
 
N
L
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
V
R
 
R
V
 
A
L
 
L
D
 
E
R
 
A
S
 
D
D
 
E
V
 
V
L
 
L
R
 
A
A
 
G
R
 
G
L
 
L
G
 
G
D
 
A
A
 
A
V
 
A
I
 
A
A
 
A
A
 
F
F
 
A
L
 
K
K
 
F
L
 
K
K
 
R
E
 
-
G
 
A
E
 
E
W
 
W
N
 
A
A
 
D
Y
 
Y
A
 
K
R
 
S
H
 
Q
L
 
L
T
 
T
Q
 
E
W
 
W
E
 
E
R
 
R
D
 
R
N
 
T
T
 
T
L
 
L
D
 
D
C
 
C

7cqqA Gmas in complex with amppnp and metsox (see paper)
65% identity, 99% coverage: 4:433/433 of query aligns to 2:429/429 of 7cqqA

query
sites
7cqqA
D
 
D
L
 
L
Q
 
A
Q
 
S
A
 
I
A
 
A
K
 
R
E
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
I
K
 
E
F
 
F
F
 
F
L
 
L
V
 
I
S
 
S
Y
 
F
T
 
T
D
 
D
L
 
L
F
 
L
G
 
G
A
 
V
Q
 
Q
R
 
R
A
 
A
K
 
K
L
 
L
V
 
V
P
 
P
A
 
A
A
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
E
 
D
M
 
M
V
 
A
E
 
V
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
F
 
F
A
 
A
G
 
G
F
 
F
A
 
A
T
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
L
 
M
S
 
S
P
 
P
A
 
A
D
 
D
S
 
A
D
 
D
L
 
I
L
 
L
A
 
A
M
 
I
P
 
P
D
 
D
P
 
P
D
 
E
S
 
S
M
 
L
I
 
I
Q
 
Q
L
 
L
P
 
P
W
 
W
K
 
K
P
 
P
E
 
S
V
 
V
A
 
G
W
 
W
V
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
D
L
 
V
W
 
H
M
 
F
D
 
E
G
 
G
Q
 
R
P
 
P
V
 
F
E
 
P
Q
 
K
G
 
A
P
 
P
R
 
R
N
 
V
T
 
A
L
 
L
K
 
K
R
 
S
M
 
V
I
 
L
A
 
A
A
 
R
A
 
A
A
 
A
E
 
G
Q
 
K
G
 
D
F
 
M
Q
 
H
L
 
L
K
 
K
T
 
H
G
 
G
V
 
V
E
|
E
C
 
C
E
|
E
F
 
F
F
 
F
L
 
L
T
 
I
T
 
Q
P
 
P
D
 
D
G
 
G
K
 
S
G
 
A
I
 
I
A
 
S
D
 
D
S
 
P
A
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
Q
T
 
A
K
 
K
P
 
P
C
 
C
Y
 
Y
D
 
D
Q
 
Q
Q
 
D
A
 
A
L
 
L
M
 
M
R
 
R
R
 
R
F
 
F
D
 
D
V
 
V
V
 
I
A
 
A
E
 
E
I
 
I
S
 
C
D
 
S
A
 
Y
M
 
M
S
 
V
A
 
D
L
 
L
G
 
G
W
 
W
K
 
G
P
 
P
Y
|
Y
Q
 
Q
S
 
N
D
 
D
H
 
H
E
|
E
D
 
D
A
 
A
I
 
N
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
E
|
E
M
 
M
N
|
N
W
 
W
E
x
D
Y
|
Y
D
 
A
D
 
D
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
A
 
A
D
 
D
R
 
R
H
 
H
A
 
A
F
 
F
F
 
F
K
 
K
Y
 
F
M
 
M
A
 
V
R
 
K
A
 
S
I
 
V
A
 
A
E
 
E
K
 
R
H
 
H
G
 
G
L
 
L
R
 
R
A
 
A
T
 
T
F
 
F
M
 
M
P
 
P
K
 
K
P
 
P
F
 
F
I
 
A
N
 
H
L
 
L
T
|
T
G
 
G
S
 
N
G
 
G
C
 
C
H
|
H
M
 
T
H
|
H
L
 
L
S
|
S
L
 
M
W
 
W
R
 
T
D
 
A
-
 
A
G
 
G
V
 
D
N
 
N
L
 
L
F
 
F
R
 
-
D
 
E
P
 
G
T
 
D
G
 
G
A
 
E
L
 
L
G
 
G
M
 
L
S
 
S
A
 
P
I
 
T
G
 
A
Y
 
Y
H
 
A
F
 
F
I
 
L
A
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
I
A
 
G
E
 
H
A
 
A
T
 
K
A
 
G
L
 
L
C
 
T
A
 
A
L
 
V
T
 
V
N
 
N
P
 
P
T
 
T
V
 
V
N
 
N
S
 
S
Y
 
Y
K
 
K
R
|
R
I
 
L
N
 
N
A
 
A
P
 
P
V
 
V
T
 
T
V
 
V
S
 
S
G
 
G
S
 
A
T
 
T
W
|
W
S
 
S
P
 
P
N
 
N
T
 
T
V
 
I
T
 
T
Y
 
Y
T
 
G
G
 
G
N
 
N
N
 
N
R
|
R
T
 
T
H
 
H
M
 
M
I
 
V
R
|
R
I
 
I
P
 
P
N
 
D
G
 
A
N
 
G
R
|
R
F
 
L
E
|
E
F
 
L
R
|
R
L
 
L
P
 
P
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
A
N
 
N
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
M
 
M
P
 
P
A
 
A
A
 
A
V
 
I
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
I
A
 
E
R
 
T
K
 
Q
A
 
A
D
 
D
P
 
P
G
 
G
P
 
Q
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
I
N
 
D
M
 
M
Y
 
Y
T
 
V
E
 
E
G
 
G
Y
 
H
K
 
S
V
 
V
T
 
-
D
 
E
G
 
A
R
 
E
K
 
Q
L
 
L
P
 
P
L
 
L
N
 
N
L
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
V
R
 
R
V
 
A
L
 
L
D
 
E
R
 
A
S
 
D
D
 
E
V
 
V
L
 
L
R
 
A
A
 
G
R
 
G
L
 
L
G
 
G
D
 
A
A
 
A
V
 
A
I
 
A
A
 
A
A
 
F
F
 
A
L
 
K
K
 
F
L
 
K
K
 
R
E
 
-
G
 
A
E
 
E
W
 
W
N
 
A
A
 
D
Y
 
Y
A
 
K
R
 
S
H
 
Q
L
 
L
T
 
T
Q
 
E
W
 
W
E
 
E
R
 
R
D
 
R
N
 
T
T
 
T
L
 
L
D
 
D
C
 
C

7cqnA Gmas in complex with amppcp (see paper)
65% identity, 99% coverage: 4:433/433 of query aligns to 2:429/429 of 7cqnA

query
sites
7cqnA
D
 
D
L
 
L
Q
 
A
Q
 
S
A
 
I
A
 
A
K
 
R
E
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
I
K
 
E
F
 
F
F
 
F
L
 
L
V
 
I
S
 
S
Y
 
F
T
 
T
D
 
D
L
 
L
F
 
L
G
 
G
A
 
V
Q
 
Q
R
 
R
A
 
A
K
 
K
L
 
L
V
 
V
P
 
P
A
 
A
A
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
E
 
D
M
 
M
V
 
A
E
 
V
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
|
G
F
 
F
A
 
A
G
 
G
F
 
F
A
 
A
T
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
L
 
M
S
 
S
P
 
P
A
 
A
D
 
D
S
 
A
D
|
D
L
 
I
L
 
L
A
 
A
M
 
I
P
 
P
D
 
D
P
 
P
D
 
E
S
 
S
M
 
L
I
 
I
Q
 
Q
L
 
L
P
 
P
W
 
W
K
 
K
P
 
P
E
 
S
V
 
V
A
 
G
W
 
W
V
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
D
L
 
V
W
 
H
M
 
F
D
 
E
G
 
G
Q
 
R
P
 
P
V
 
F
E
 
P
Q
 
K
G
 
A
P
 
P
R
 
R
N
 
V
T
 
A
L
 
L
K
 
K
R
 
S
M
 
V
I
 
L
A
 
A
A
 
R
A
 
A
A
 
A
E
 
G
Q
 
K
G
 
D
F
 
M
Q
 
H
L
 
L
K
 
K
T
 
H
G
 
G
V
 
V
E
|
E
C
 
C
E
 
E
F
 
F
F
 
F
L
 
L
T
 
I
T
 
Q
P
 
P
D
 
D
G
 
G
K
 
S
G
 
A
I
 
I
A
 
S
D
 
D
S
 
P
A
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
Q
T
 
A
K
 
K
P
 
P
C
 
C
Y
 
Y
D
 
D
Q
 
Q
Q
 
D
A
 
A
L
 
L
M
 
M
R
 
R
R
 
R
F
 
F
D
 
D
V
 
V
V
 
I
A
 
A
E
 
E
I
 
I
S
 
C
D
 
S
A
 
Y
M
 
M
S
 
V
A
 
D
L
 
L
G
 
G
W
 
W
K
 
G
P
 
P
Y
|
Y
Q
|
Q
S
 
N
D
 
D
H
 
H
E
 
E
D
 
D
A
 
A
I
 
N
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
E
 
E
M
 
M
N
 
N
W
|
W
E
x
D
Y
|
Y
D
 
A
D
 
D
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
A
 
A
D
 
D
R
 
R
H
 
H
A
 
A
F
 
F
F
 
F
K
 
K
Y
 
F
M
 
M
A
 
V
R
 
K
A
 
S
I
 
V
A
 
A
E
 
E
K
 
R
H
 
H
G
 
G
L
 
L
R
 
R
A
 
A
T
 
T
F
 
F
M
 
M
P
 
P
K
 
K
P
 
P
F
 
F
I
 
A
N
 
H
L
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
N
G
 
G
C
 
C
H
 
H
M
 
T
H
|
H
L
 
L
S
|
S
L
 
M
W
 
W
R
 
T
D
 
A
-
 
A
G
 
G
V
 
D
N
 
N
L
 
L
F
 
F
R
 
-
D
 
E
P
 
G
T
 
D
G
 
G
A
 
E
L
 
L
G
 
G
M
 
L
S
 
S
A
 
P
I
 
T
G
 
A
Y
 
Y
H
 
A
F
 
F
I
 
L
A
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
I
A
 
G
E
 
H
A
 
A
T
 
K
A
 
G
L
 
L
C
 
T
A
 
A
L
 
V
T
 
V
N
 
N
P
 
P
T
 
T
V
 
V
N
 
N
S
 
S
Y
 
Y
K
 
K
R
 
R
I
 
L
N
 
N
A
 
A
P
 
P
V
 
V
T
 
T
V
 
V
S
 
S
G
 
G
S
 
A
T
 
T
W
 
W
S
 
S
P
 
P
N
 
N
T
 
T
V
 
I
T
 
T
Y
 
Y
T
 
G
G
 
G
N
 
N
N
 
N
R
|
R
T
 
T
H
 
H
M
 
M
I
 
V
R
|
R
I
 
I
P
 
P
N
 
D
G
 
A
N
 
G
R
|
R
F
 
L
E
 
E
F
 
L
R
 
R
L
 
L
P
 
P
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
A
N
 
N
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
M
 
M
P
 
P
A
 
A
A
 
A
V
 
I
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
I
A
 
E
R
 
T
K
 
Q
A
 
A
D
 
D
P
 
P
G
 
G
P
 
Q
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
I
N
 
D
M
 
M
Y
 
Y
T
 
V
E
 
E
G
 
G
Y
 
H
K
 
S
V
 
V
T
 
-
D
 
E
G
 
A
R
 
E
K
 
Q
L
 
L
P
 
P
L
 
L
N
 
N
L
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
V
R
 
R
V
 
A
L
 
L
D
 
E
R
 
A
S
 
D
D
 
E
V
 
V
L
 
L
R
 
A
A
 
G
R
 
G
L
 
L
G
 
G
D
 
A
A
 
A
V
 
A
I
 
A
A
 
A
A
 
F
F
 
A
L
 
K
K
 
F
L
 
K
K
 
R
E
 
-
G
 
A
E
 
E
W
 
W
N
 
A
A
 
D
Y
 
Y
A
 
K
R
 
S
H
 
Q
L
 
L
T
 
T
Q
 
E
W
 
W
E
 
E
R
 
R
D
 
R
N
 
T
T
 
T
L
 
L
D
 
D
C
 
C

7cqwA Gmas/adp complex-conformation 1 (see paper)
65% identity, 99% coverage: 4:433/433 of query aligns to 3:430/430 of 7cqwA

query
sites
7cqwA
D
 
D
L
 
L
Q
 
A
Q
 
S
A
 
I
A
 
A
K
 
R
E
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
I
K
 
E
F
 
F
F
 
F
L
 
L
V
 
I
S
 
S
Y
 
F
T
 
T
D
 
D
L
 
L
F
 
L
G
 
G
A
 
V
Q
 
Q
R
 
R
A
 
A
K
 
K
L
 
L
V
 
V
P
 
P
A
 
A
A
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
E
 
D
M
 
M
V
 
A
E
 
V
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
F
 
F
A
 
A
G
 
G
F
 
F
A
 
A
T
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
L
 
M
S
 
S
P
 
P
A
 
A
D
 
D
S
 
A
D
 
D
L
 
I
L
 
L
A
 
A
M
 
I
P
 
P
D
 
D
P
 
P
D
 
E
S
 
S
M
 
L
I
 
I
Q
 
Q
L
 
L
P
 
P
W
 
W
K
 
K
P
 
P
E
 
S
V
 
V
A
 
G
W
 
W
V
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
D
L
 
V
W
 
H
M
 
F
D
 
E
G
 
G
Q
 
R
P
 
P
V
 
F
E
 
P
Q
 
K
G
 
A
P
 
P
R
 
R
N
 
V
T
 
A
L
 
L
K
 
K
R
 
S
M
 
V
I
 
L
A
 
A
A
 
R
A
 
A
A
 
A
E
 
G
Q
 
K
G
 
D
F
 
M
Q
 
H
L
 
L
K
 
K
T
 
H
G
 
G
V
 
V
E
 
E
C
 
C
E
 
E
F
 
F
F
 
F
L
 
L
T
 
I
T
 
Q
P
 
P
D
 
D
G
 
G
K
 
S
G
 
A
I
 
I
A
 
S
D
 
D
S
 
P
A
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
Q
T
 
A
K
 
K
P
 
P
C
 
C
Y
 
Y
D
 
D
Q
 
Q
Q
 
D
A
 
A
L
 
L
M
 
M
R
 
R
R
 
R
F
 
F
D
 
D
V
 
V
V
 
I
A
 
A
E
 
E
I
 
I
S
 
C
D
 
S
A
 
Y
M
 
M
S
 
V
A
 
D
L
 
L
G
 
G
W
 
W
K
 
G
P
 
P
Y
|
Y
Q
 
Q
S
 
N
D
 
D
H
 
H
E
 
E
D
 
D
A
 
A
I
 
N
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
E
 
E
M
 
M
N
 
N
W
 
W
E
 
D
Y
|
Y
D
 
A
D
 
D
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
A
 
A
D
 
D
R
 
R
H
 
H
A
 
A
F
 
F
F
 
F
K
 
K
Y
 
F
M
 
M
A
 
V
R
 
K
A
 
S
I
 
V
A
 
A
E
 
E
K
 
R
H
 
H
G
 
G
L
 
L
R
 
R
A
 
A
T
 
T
F
 
F
M
 
M
P
 
P
K
 
K
P
 
P
F
 
F
I
 
A
N
 
H
L
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
N
G
 
G
C
 
C
H
 
H
M
 
T
H
|
H
L
|
L
S
|
S
L
 
M
W
 
W
R
 
T
D
 
A
-
 
A
G
 
G
V
 
D
N
 
N
L
 
L
F
 
F
R
 
-
D
 
E
P
 
G
T
 
D
G
 
G
A
 
E
L
 
L
G
 
G
M
 
L
S
 
S
A
 
P
I
 
T
G
 
A
Y
 
Y
H
 
A
F
 
F
I
 
L
A
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
I
A
 
G
E
 
H
A
 
A
T
 
K
A
 
G
L
 
L
C
 
T
A
 
A
L
 
V
T
 
V
N
 
N
P
 
P
T
 
T
V
 
V
N
 
N
S
 
S
Y
 
Y
K
 
K
R
 
R
I
 
L
N
 
N
A
 
A
P
 
P
V
 
V
T
 
T
V
 
V
S
 
S
G
 
G
S
 
A
T
 
T
W
 
W
S
 
S
P
 
P
N
 
N
T
 
T
V
 
I
T
 
T
Y
 
Y
T
 
G
G
 
G
N
 
N
N
 
N
R
 
R
T
 
T
H
 
H
M
 
M
I
 
V
R
|
R
I
 
I
P
 
P
N
 
D
G
 
A
N
 
G
R
|
R
F
 
L
E
 
E
F
 
L
R
 
R
L
 
L
P
 
P
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
A
N
 
N
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
M
 
M
P
 
P
A
 
A
A
 
A
V
 
I
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
I
A
 
E
R
 
T
K
 
Q
A
 
A
D
 
D
P
 
P
G
 
G
P
 
Q
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
I
N
 
D
M
 
M
Y
 
Y
T
 
V
E
 
E
G
 
G
Y
 
H
K
 
S
V
 
V
T
 
-
D
 
E
G
 
A
R
 
E
K
 
Q
L
 
L
P
 
P
L
 
L
N
 
N
L
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
V
R
 
R
V
 
A
L
 
L
D
 
E
R
 
A
S
 
D
D
 
E
V
 
V
L
 
L
R
 
A
A
 
G
R
 
G
L
 
L
G
 
G
D
 
A
A
 
A
V
 
A
I
 
A
A
 
A
A
 
F
F
 
A
L
 
K
K
 
F
L
 
K
K
 
R
E
 
-
G
 
A
E
 
E
W
 
W
N
 
A
A
 
D
Y
 
Y
A
 
K
R
 
S
H
 
Q
L
 
L
T
 
T
Q
 
E
W
 
W
E
 
E
R
 
R
D
 
R
N
 
T
T
 
T
L
 
L
D
 
D
C
 
C

7tdpA Structure of paenibacillus polymyxa gs bound to met-sox-p-adp (transition state complex) to 1.98 angstom (see paper)
38% identity, 99% coverage: 4:431/433 of query aligns to 6:436/439 of 7tdpA

query
sites
7tdpA
D
 
D
L
 
I
Q
 
I
Q
 
R
A
 
I
A
 
A
K
 
E
E
 
E
R
 
E
G
 
N
I
 
V
K
 
R
F
 
F
F
 
I
L
 
R
V
 
L
S
 
Q
Y
 
F
T
 
T
D
 
D
L
 
L
F
 
L
G
 
G
A
 
T
Q
 
I
R
 
K
A
 
N
K
 
V
L
 
E
V
 
I
P
 
P
A
 
V
A
 
S
A
 
Q
I
 
L
A
 
E
E
 
K
M
 
A
V
 
L
E
 
D
N
 
N
G
 
K
A
 
M
G
 
M
F
 
F
A
 
D
G
 
G
F
 
S
A
 
S
T
 
I
W
 
E
L
 
G
D
 
Y
L
 
V
S
 
R
P
 
I
A
 
E
D
 
E
S
 
S
D
 
D
L
 
M
L
 
Y
A
 
L
M
 
Y
P
 
P
D
 
D
P
 
L
D
 
D
S
 
T
M
 
W
I
 
V
Q
 
V
L
 
F
P
 
P
W
 
W
K
 
S
P
 
D
E
 
R
V
 
V
A
 
A
W
 
R
V
 
L
A
 
I
A
 
C
D
 
D
L
 
I
W
 
Y
M
 
K
-
 
P
D
 
D
G
 
G
Q
 
S
P
 
P
V
 
F
E
 
A
Q
 
G
G
 
D
P
 
P
R
 
R
N
 
G
T
 
I
L
 
L
K
 
K
R
 
R
M
 
V
I
 
L
A
 
K
A
 
E
A
 
A
A
 
E
E
 
E
Q
 
L
G
 
G
F
 
Y
-
 
T
Q
 
S
L
 
M
K
x
N
T
 
V
G
|
G
V
 
P
E
|
E
C
 
P
E
|
E
F
 
F
F
 
F
L
 
L
T
 
F
T
 
K
P
 
T
D
 
D
G
 
E
K
 
K
G
 
G
I
 
D
A
 
P
D
 
T
S
 
T
A
 
E
D
 
L
T
 
N
A
 
D
T
 
Q
K
 
G
P
 
G
C
 
Y
Y
 
F
D
 
D
Q
 
L
Q
 
A
A
 
P
L
 
M
M
 
D
R
 
L
R
 
G
F
 
E
D
 
N
V
 
C
V
 
R
A
 
R
E
 
E
I
 
I
S
 
V
D
 
L
A
 
K
M
 
L
S
 
E
A
 
E
L
 
M
G
 
G
W
 
F
K
 
E
P
 
I
Y
x
E
Q
 
A
S
 
S
D
 
H
H
 
H
E
|
E
D
 
V
A
 
A
I
 
P
G
 
G
Q
 
Q
F
 
H
E
|
E
M
 
I
N
x
D
W
 
F
E
 
K
Y
|
Y
D
 
A
D
 
D
V
 
A
L
 
V
V
 
K
T
 
A
A
 
A
D
 
D
R
 
Q
H
 
I
A
 
Q
F
 
T
F
 
F
K
 
K
Y
 
L
M
 
V
A
 
V
R
 
K
A
 
T
I
 
I
A
 
A
E
 
R
K
 
Q
H
 
H
G
 
G
L
 
L
R
 
H
A
 
A
T
 
T
F
 
F
M
 
M
P
 
P
K
 
K
P
 
P
F
 
L
I
 
F
N
 
G
L
 
V
T
 
N
G
|
G
S
 
S
G
 
G
C
 
M
H
|
H
M
 
C
H
x
N
L
 
Q
S
|
S
L
 
L
W
 
F
R
 
K
D
 
D
G
 
N
V
 
E
N
 
N
L
 
V
F
 
F
R
 
Y
D
 
D
P
 
E
T
 
T
G
 
D
A
 
E
L
 
L
G
 
G
M
 
L
S
 
S
A
 
Q
I
 
T
G
 
A
Y
 
R
H
 
H
F
 
Y
I
 
M
A
 
A
G
 
G
L
 
I
L
 
L
A
 
K
E
 
H
A
 
A
T
 
R
A
 
A
L
 
M
C
 
A
A
 
A
L
 
I
T
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
T
V
 
V
N
 
N
S
 
S
Y
 
Y
K
 
K
R
|
R
I
 
L
N
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
T
 
-
V
 
V
S
 
P
G
 
G
S
 
Y
T
x
E
W
 
-
S
 
A
P
 
P
N
 
C
T
 
Y
V
 
V
T
 
A
Y
 
W
T
 
S
G
 
A
N
 
S
N
 
N
R
|
R
T
 
S
H
 
P
M
 
M
I
 
I
R
|
R
I
 
I
P
 
P
N
 
A
-
 
S
-
 
R
-
 
G
-
 
L
G
 
S
N
 
T
R
|
R
F
 
V
E
|
E
F
 
V
R
|
R
L
 
N
P
 
P
D
 
D
G
 
P
A
 
A
A
 
A
N
 
N
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
M
 
A
P
 
L
A
 
A
A
 
V
V
 
M
L
 
L
A
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
I
A
 
K
R
 
R
K
 
Q
-
 
M
A
 
A
D
 
L
P
 
P
G
 
A
P
 
P
R
 
-
L
 
I
D
 
D
I
 
R
N
 
N
M
 
I
Y
 
Y
-
 
V
-
 
M
T
 
S
E
 
E
G
 
E
Y
 
E
K
 
R
V
 
I
T
 
E
D
 
E
G
 
G
-
 
I
R
 
P
K
 
S
L
 
L
P
 
P
L
 
A
N
 
D
L
 
L
L
 
K
D
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
S
V
 
E
L
 
L
D
 
I
R
 
R
S
 
S
D
 
E
V
 
V
L
 
I
R
 
S
A
 
D
R
 
A
L
 
L
G
 
G
D
 
D
A
 
H
V
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
Y
F
 
F
L
 
Y
K
 
E
L
 
L
K
 
K
E
 
E
G
 
I
E
 
E
W
 
W
N
 
D
A
 
M
Y
 
Y
A
 
R
R
 
T
H
 
Q
L
 
V
T
 
H
Q
 
Q
W
 
W
E
 
E
R
 
R
D
 
D
N
 
Q
T
 
Y
L
 
L

7tfaB Glutamine synthetase (see paper)
38% identity, 99% coverage: 4:431/433 of query aligns to 6:438/441 of 7tfaB

query
sites
7tfaB
D
 
D
L
 
I
Q
 
I
Q
 
R
A
 
I
A
 
A
K
 
E
E
 
E
R
 
E
G
 
N
I
 
V
K
 
R
F
 
F
F
 
I
L
 
R
V
 
L
S
 
Q
Y
 
F
T
 
T
D
 
D
L
 
L
F
 
L
G
 
G
A
 
T
Q
 
I
R
 
K
A
 
N
K
 
V
L
 
E
V
 
I
P
 
P
A
 
V
A
 
S
A
 
Q
I
 
L
A
 
E
E
 
K
M
 
A
V
 
L
E
 
D
N
 
N
G
 
K
A
 
M
G
 
M
F
 
F
A
 
D
G
 
G
F
 
S
A
 
S
T
 
I
W
 
E
L
 
G
D
x
Y
L
 
V
S
x
R
P
 
I
A
 
E
D
 
E
S
 
S
D
 
D
L
 
M
L
 
Y
A
 
L
M
 
Y
P
 
P
D
 
D
P
 
L
D
 
D
S
 
T
M
 
W
I
 
V
Q
 
V
L
 
F
P
 
P
W
 
W
-
 
V
-
 
T
K
 
S
P
 
D
E
 
R
V
 
V
A
 
A
W
 
R
V
 
L
A
 
I
A
 
C
D
 
D
L
 
I
W
 
Y
M
 
K
-
 
P
D
 
D
G
 
G
Q
 
S
P
 
P
V
 
F
E
 
A
Q
 
G
G
 
D
P
 
P
R
 
R
N
 
G
T
 
I
L
 
L
K
 
K
R
 
R
M
 
V
I
 
L
A
 
K
A
 
E
A
 
A
A
 
E
E
 
E
Q
 
L
G
 
G
F
 
Y
-
 
T
Q
 
S
L
 
M
K
 
N
T
 
V
G
 
G
V
 
P
E
|
E
C
 
P
E
|
E
F
 
F
F
 
F
L
 
L
T
 
F
T
 
K
P
 
T
D
 
D
G
 
E
K
 
K
G
 
G
I
 
D
A
 
P
D
 
T
S
 
T
A
 
E
D
 
L
T
 
N
A
 
D
T
 
Q
K
 
G
P
 
G
C
x
Y
Y
 
F
D
 
D
Q
 
L
Q
 
A
A
 
P
L
 
M
M
 
D
R
 
L
R
 
G
F
 
E
D
 
N
V
 
C
V
 
R
A
 
R
E
 
E
I
 
I
S
 
V
D
 
L
A
 
K
M
 
L
S
 
E
A
 
E
L
 
M
G
 
G
W
 
F
K
 
E
P
 
I
Y
 
E
Q
 
A
S
 
S
D
 
H
H
 
H
E
|
E
D
x
V
A
 
A
I
 
P
G
 
G
Q
 
Q
F
 
H
E
|
E
M
 
I
N
 
D
W
 
F
E
 
K
Y
 
Y
D
 
A
D
 
D
V
 
A
L
 
V
V
 
K
T
 
A
A
 
A
D
 
D
R
 
Q
H
 
I
A
 
Q
F
 
T
F
 
F
K
 
K
Y
 
L
M
 
V
A
 
V
R
 
K
A
 
T
I
 
I
A
 
A
E
 
R
K
 
Q
H
 
H
G
 
G
L
 
L
R
 
H
A
 
A
T
 
T
F
 
F
M
 
M
P
 
P
K
 
K
P
 
P
F
 
L
I
 
F
N
 
G
L
 
V
T
x
N
G
|
G
S
 
S
G
 
G
C
 
M
H
|
H
M
 
C
H
 
N
L
 
Q
S
 
S
L
 
L
W
 
F
R
 
K
D
 
D
G
 
N
V
 
E
N
 
N
L
 
V
F
 
F
R
 
Y
D
 
D
P
 
E
T
 
T
G
 
D
A
 
E
L
 
L
G
 
G
M
 
L
S
 
S
A
 
Q
I
 
T
G
 
A
Y
 
R
H
 
H
F
 
Y
I
 
M
A
 
A
G
 
G
L
 
I
L
 
L
A
 
K
E
 
H
A
 
A
T
 
R
A
 
A
L
 
M
C
 
A
A
 
A
L
 
I
T
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
T
V
 
V
N
 
N
S
 
S
Y
 
Y
K
 
K
R
|
R
I
 
L
N
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
T
 
-
V
 
V
S
 
P
G
|
G
S
x
Y
T
x
E
W
 
-
S
 
A
P
 
P
N
 
C
T
 
Y
V
 
V
T
 
A
Y
 
W
T
 
S
G
 
A
N
 
S
N
 
N
R
|
R
T
 
S
H
 
P
M
 
M
I
 
I
R
 
R
I
 
I
P
 
P
N
 
A
-
 
S
-
 
R
-
 
G
-
 
L
G
 
S
N
 
T
R
 
R
F
 
V
E
|
E
F
 
V
R
 
R
L
 
N
P
 
P
D
 
D
G
 
P
A
 
A
A
 
A
N
 
N
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
M
 
A
P
 
L
A
 
A
A
 
V
V
 
M
L
 
L
A
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
I
A
 
K
R
 
R
K
 
Q
-
 
M
A
 
A
D
 
L
P
 
P
G
 
A
P
 
P
R
 
-
L
 
I
D
 
D
I
 
R
N
 
N
M
 
I
Y
 
Y
-
 
V
-
 
M
T
 
S
E
 
E
G
 
E
Y
 
E
K
 
R
V
 
I
T
 
E
D
 
E
G
 
G
-
 
I
R
 
P
K
 
S
L
 
L
P
 
P
L
 
A
N
 
D
L
 
L
L
 
K
D
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
S
V
 
E
L
 
L
D
 
I
R
 
R
S
 
S
D
 
E
V
 
V
L
 
I
R
 
S
A
 
D
R
 
A
L
 
L
G
 
G
D
 
D
A
 
H
V
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
Y
F
 
F
L
 
Y
K
 
E
L
 
L
K
 
K
E
 
E
G
 
I
E
 
E
W
 
W
N
 
D
A
x
M
Y
 
Y
A
 
R
R
 
T
H
 
Q
L
 
V
T
 
H
Q
 
Q
W
 
W
E
 
E
R
 
R
D
 
D
N
 
Q
T
 
Y
L
 
L

8tfkA Glutamine synthetase (see paper)
37% identity, 98% coverage: 4:426/433 of query aligns to 5:432/440 of 8tfkA

query
sites
8tfkA
D
 
D
L
 
V
Q
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
V
K
 
K
E
 
E
R
 
R
G
 
D
I
 
V
K
 
K
F
 
F
F
 
I
L
 
R
V
 
T
S
 
Q
Y
 
F
T
 
T
D
 
D
L
 
T
F
 
L
G
 
G
A
 
I
Q
 
I
R
 
K
A
 
S
K
 
W
L
 
A
V
 
I
P
 
P
A
 
A
A
 
E
A
 
Q
I
 
L
A
 
E
E
 
E
M
 
A
V
 
F
E
 
E
N
 
N
G
 
G
A
 
V
G
 
M
F
 
F
A
 
D
G
 
G
F
 
S
A
 
S
T
 
I
W
 
Q
L
 
G
D
 
F
L
 
T
S
 
R
P
 
I
A
 
E
D
 
E
S
 
S
D
 
D
L
 
M
L
 
K
A
 
L
M
 
A
P
 
L
D
 
D
P
 
P
D
 
S
S
 
T
M
 
F
I
 
R
Q
 
I
L
 
L
P
 
P
W
 
W
K
 
R
P
 
P
E
 
A
-
 
T
-
 
G
-
 
A
V
 
V
A
 
A
W
 
R
V
 
I
A
 
L
A
 
G
D
 
D
L
 
V
W
 
Y
M
 
L
-
 
P
D
 
D
G
 
G
Q
 
N
P
 
P
V
 
F
E
 
K
Q
 
G
G
 
D
P
 
P
R
 
R
N
 
Y
T
 
V
L
 
L
K
 
K
R
 
T
M
 
A
I
 
I
A
 
K
A
 
E
A
 
A
A
 
E
E
 
K
Q
 
M
G
 
G
F
 
F
Q
 
S
L
 
M
K
 
N
T
 
V
G
 
G
V
 
P
E
|
E
C
 
L
E
|
E
F
 
F
F
 
F
L
 
L
T
 
F
T
 
K
P
 
L
D
 
D
G
 
A
K
 
N
G
 
G
I
 
N
A
 
P
D
 
T
S
 
T
A
 
E
D
 
L
T
 
T
A
 
D
T
 
Q
K
 
G
P
 
G
C
 
Y
Y
 
F
D
 
D
Q
 
F
Q
 
A
A
 
P
L
 
L
M
 
D
R
 
R
R
 
A
F
 
Q
D
 
D
V
 
V
V
 
R
A
 
R
E
 
D
I
 
I
S
 
D
D
 
Y
A
 
A
M
 
L
S
 
E
A
 
H
L
 
M
G
 
G
W
 
F
K
 
Q
P
 
I
Y
 
E
Q
 
A
S
 
S
D
 
H
H
 
H
E
|
E
D
 
V
A
 
A
I
 
P
G
 
S
Q
 
Q
F
 
H
E
|
E
M
 
I
N
x
D
W
x
F
E
 
R
Y
x
F
D
 
G
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
C
T
 
T
A
 
A
D
 
D
R
 
N
H
 
V
A
 
V
F
 
T
F
 
F
K
 
K
Y
 
Y
M
 
V
A
 
V
R
 
K
A
 
S
I
 
I
A
 
A
E
 
Y
K
 
H
H
 
K
G
 
G
L
 
Y
R
 
Y
A
 
A
T
 
S
F
 
F
M
 
M
P
 
P
K
 
K
P
 
P
F
 
L
I
 
F
N
 
G
L
 
V
T
 
N
G
|
G
S
 
S
G
 
G
C
 
M
H
|
H
M
 
S
H
x
N
L
 
Q
S
 
S
L
 
L
W
 
F
R
 
K
D
 
D
G
 
G
V
 
K
N
 
N
L
 
V
F
 
F
R
 
Y
D
 
D
P
 
P
T
 
D
G
 
T
A
 
P
L
 
T
G
 
K
M
 
L
S
 
S
A
 
Q
I
 
D
G
 
A
Y
 
M
H
 
Y
F
 
Y
I
 
I
A
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
L
A
 
K
E
 
H
A
 
I
T
 
R
A
 
E
L
 
F
C
 
T
A
 
A
L
 
V
T
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
V
V
 
V
N
 
N
S
 
S
Y
 
Y
K
 
K
R
|
R
I
 
L
N
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
T
 
-
V
 
V
S
 
P
G
 
G
S
 
Y
T
x
E
W
 
-
S
 
A
P
 
P
N
 
V
T
 
Y
V
 
I
T
 
S
Y
 
W
T
 
S
G
 
A
N
 
Q
N
 
N
R
|
R
T
 
S
H
 
S
M
 
L
I
 
I
R
|
R
I
 
I
P
 
P
-
 
A
-
 
T
-
 
R
-
 
G
N
 
N
G
|
G
N
 
T
R
|
R
F
 
I
E
|
E
F
 
L
R
|
R
L
 
C
P
 
P
D
 
D
G
 
P
A
 
A
A
 
C
N
 
N
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
M
 
A
P
 
F
A
 
A
A
 
L
V
 
M
L
 
L
A
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
E
G
 
G
I
 
I
A
 
K
R
 
N
K
 
K
A
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
G
P
 
E
R
 
P
L
 
T
D
 
N
I
 
V
N
 
N
M
 
I
Y
 
F
T
 
H
E
 
L
G
 
S
Y
 
D
K
 
K
V
 
E
T
 
R
D
 
E
G
 
E
-
 
R
-
 
G
-
 
I
R
 
R
K
 
S
L
 
L
P
 
P
L
 
A
N
 
D
L
 
L
L
 
K
D
 
E
A
 
A
L
 
I
R
 
D
V
 
E
L
 
M
D
 
K
R
 
G
S
 
S
D
 
K
V
 
F
L
 
V
R
 
K
A
 
E
R
 
A
L
 
L
G
 
G
D
 
E
A
 
H
V
 
V
I
 
F
A
 
S
A
 
H
F
 
Y
L
 
L
K
 
C
L
 
A
K
 
K
E
 
E
G
 
M
E
 
E
W
 
W
N
 
D
A
 
E
Y
 
Y
A
 
K
R
 
A
H
 
V
L
 
V
T
 
H
Q
 
P
W
 
W
E
 
E

8ufjB Glutamine synthetase (see paper)
36% identity, 98% coverage: 4:426/433 of query aligns to 9:436/444 of 8ufjB

query
sites
8ufjB
D
 
D
L
 
V
Q
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
V
K
 
K
E
 
E
R
 
R
G
 
D
I
 
V
K
 
K
F
 
F
F
 
I
L
 
R
V
 
T
S
 
Q
Y
 
F
T
 
T
D
 
D
L
 
T
F
 
L
G
 
G
A
 
I
Q
 
I
R
 
K
A
 
S
K
 
W
L
 
A
V
 
I
P
 
P
A
 
A
A
 
E
A
 
Q
I
 
L
A
 
E
E
 
E
M
 
A
V
 
F
E
 
E
N
 
N
G
 
G
A
 
V
G
 
M
F
 
F
A
 
D
G
 
G
F
 
S
A
 
S
T
 
I
W
 
Q
L
 
G
D
 
F
L
 
T
S
 
R
P
 
I
A
 
E
D
 
E
S
 
S
D
 
D
L
 
M
L
 
K
A
 
L
M
 
A
P
 
L
D
 
D
P
 
P
D
 
S
S
 
T
M
 
F
I
 
R
Q
 
I
L
 
L
P
 
P
W
 
W
K
 
R
P
 
P
E
 
A
-
 
T
-
 
G
-
 
A
V
 
V
A
 
A
W
 
R
V
 
I
A
 
L
A
 
G
D
 
D
L
 
V
W
 
Y
M
 
L
-
 
P
D
 
D
G
 
G
Q
 
N
P
 
P
V
 
F
E
 
K
Q
 
G
G
 
D
P
 
P
R
 
R
N
 
Y
T
 
V
L
 
L
K
 
K
R
 
T
M
 
A
I
 
I
A
 
K
A
 
E
A
 
A
A
 
E
E
 
K
Q
 
M
G
 
G
F
 
F
Q
 
S
L
 
M
K
 
N
T
 
V
G
 
G
V
 
P
E
|
E
C
 
L
E
|
E
F
 
F
F
 
F
L
 
L
T
 
F
T
 
K
P
 
L
D
 
D
G
 
A
K
 
N
G
 
G
I
 
N
A
 
P
D
 
T
S
 
T
A
 
E
D
 
L
T
 
T
A
 
D
T
 
Q
K
 
G
P
 
G
C
 
Y
Y
 
F
D
 
D
Q
 
F
Q
 
A
A
 
P
L
 
L
M
 
D
R
 
L
R
 
G
F
 
Q
D
 
D
V
 
V
V
 
R
A
 
R
E
 
D
I
 
I
S
 
D
D
 
Y
A
 
A
M
 
L
S
 
E
A
 
H
L
 
M
G
 
G
W
 
F
K
 
Q
P
 
I
Y
 
E
Q
 
A
S
 
S
D
 
H
H
 
H
E
|
E
D
 
V
A
 
A
I
 
P
G
 
S
Q
 
Q
F
 
H
E
|
E
M
 
I
N
 
D
W
 
F
E
 
R
Y
 
F
D
 
G
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
C
T
 
T
A
 
A
D
 
D
R
 
N
H
 
V
A
 
V
F
 
T
F
 
F
K
 
K
Y
 
Y
M
 
V
A
 
V
R
 
K
A
 
S
I
 
I
A
 
A
E
 
Y
K
 
H
H
 
K
G
 
G
L
 
Y
R
 
Y
A
 
A
T
 
S
F
 
F
M
 
M
P
 
P
K
 
K
P
 
P
F
 
L
I
 
F
N
 
G
L
 
V
T
 
N
G
 
G
S
 
S
G
 
G
C
 
M
H
|
H
M
 
S
H
 
N
L
 
Q
S
 
S
L
 
L
W
 
F
R
 
K
D
 
D
G
 
G
V
 
K
N
 
N
L
 
V
F
 
F
R
 
Y
D
 
D
P
 
P
T
 
D
G
 
T
A
 
P
L
 
T
G
 
K
M
 
L
S
 
S
A
 
Q
I
 
D
G
 
A
Y
 
M
H
 
Y
F
 
Y
I
 
I
A
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
L
A
 
K
E
 
H
A
 
I
T
 
R
A
 
E
L
 
F
C
 
T
A
 
A
L
 
V
T
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
V
V
 
V
N
 
N
S
 
S
Y
 
Y
K
 
K
R
 
R
I
 
L
N
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
T
 
-
V
 
V
S
 
P
G
 
G
S
 
Y
T
 
E
W
 
-
S
 
A
P
 
P
N
 
V
T
 
Y
V
 
I
T
 
S
Y
 
W
T
 
S
G
 
A
N
 
Q
N
 
N
R
 
R
T
 
S
H
 
S
M
 
L
I
 
I
R
 
R
I
 
I
P
 
P
-
 
A
-
 
T
-
 
R
-
 
G
N
 
N
G
 
G
N
 
T
R
 
R
F
 
I
E
|
E
F
 
L
R
 
R
L
 
C
P
 
P
D
 
D
G
 
P
A
 
A
A
 
C
N
 
N
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
M
 
A
P
 
F
A
 
A
A
 
L
V
 
M
L
 
L
A
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
E
G
 
G
I
 
I
A
 
K
R
 
N
K
 
K
A
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
G
P
 
E
R
 
P
L
 
T
D
 
N
I
 
V
N
 
N
M
 
I
Y
 
F
T
 
H
E
 
L
G
 
S
Y
 
D
K
 
K
V
 
E
T
 
R
D
 
E
G
 
E
-
 
R
-
 
G
-
 
I
R
 
R
K
 
S
L
 
L
P
 
P
L
 
A
N
 
D
L
 
L
L
 
K
D
 
E
A
 
A
L
 
I
R
 
D
V
 
E
L
 
M
D
 
K
R
 
G
S
 
S
D
 
K
V
 
F
L
 
V
R
 
K
A
 
E
R
 
A
L
 
L
G
 
G
D
 
E
A
 
H
V
 
V
I
 
F
A
 
S
A
 
H
F
 
Y
L
 
L
K
 
C
L
 
A
K
 
K
E
 
E
G
 
M
E
 
E
W
 
W
N
 
D
A
 
E
Y
 
Y
A
 
K
R
 
A
H
 
V
L
 
V
T
 
H
Q
 
P
W
 
W
E
 
E

4s0rD Structure of gs-tnra complex (see paper)
35% identity, 99% coverage: 4:431/433 of query aligns to 11:444/447 of 4s0rD

query
sites
4s0rD
D
 
D
L
 
I
Q
 
E
Q
 
K
A
 
L
A
 
V
K
 
K
E
 
E
R
 
E
G
 
N
I
 
V
K
 
K
F
 
Y
F
 
I
L
 
R
V
 
L
S
 
Q
Y
 
F
T
 
T
D
 
D
L
 
I
F
 
L
G
 
G
A
 
T
Q
 
I
R
 
K
A
 
N
K
 
V
L
 
E
V
 
I
P
 
P
A
 
V
A
 
S
A
 
Q
I
 
L
A
 
G
E
 
K
M
 
A
V
 
L
E
 
D
N
 
N
G
 
K
A
 
V
G
 
M
F
 
F
A
x
D
G
 
G
F
 
S
A
 
S
T
 
I
W
 
E
L
 
G
D
x
F
L
x
V
S
x
R
P
x
I
A
 
E
D
 
E
S
 
S
D
 
D
L
 
M
L
 
Y
A
 
L
M
 
Y
P
 
P
D
 
D
P
 
L
D
 
N
S
 
T
M
 
F
I
 
V
Q
 
I
L
 
F
P
 
P
W
 
W
-
 
T
-
 
A
-
 
E
K
 
K
P
 
G
E
 
K
V
 
V
A
 
A
W
 
R
V
 
F
A
 
I
A
 
C
D
 
D
L
 
I
W
 
Y
M
 
N
-
 
P
D
 
D
G
 
G
Q
 
T
P
 
P
V
 
F
E
 
E
Q
 
G
G
 
D
P
 
P
R
 
R
N
 
N
T
 
N
L
 
L
K
 
K
R
 
R
M
 
I
I
 
L
A
 
K
A
 
E
A
 
M
A
 
E
E
 
D
Q
 
L
G
 
G
F
 
F
Q
 
S
-
 
D
L
 
F
K
 
N
T
 
L
G
 
G
V
 
P
E
|
E
C
 
P
E
|
E
F
 
F
F
 
F
L
 
L
T
 
F
T
 
K
P
 
L
D
 
D
G
 
E
K
 
K
G
 
G
-
 
E
-
 
P
-
 
T
-
 
L
-
 
E
I
 
L
A
 
N
D
 
D
S
 
K
A
 
G
D
 
G
T
 
Y
A
 
F
T
x
D
K
 
L
P
 
A
C
 
P
Y
 
T
D
 
D
Q
 
L
Q
 
G
A
 
E
L
 
N
M
 
C
R
 
R
R
 
R
F
 
-
D
 
D
V
 
I
V
 
V
A
 
L
E
 
E
I
 
L
S
 
E
D
 
E
A
 
-
M
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
M
G
 
G
W
 
F
K
 
E
P
 
I
Y
 
E
Q
 
A
S
 
S
D
 
H
H
 
H
E
|
E
D
 
V
A
 
A
I
 
P
G
 
G
Q
 
Q
F
 
H
E
|
E
M
 
I
N
 
D
W
 
F
E
 
K
Y
 
Y
D
 
A
D
 
G
V
 
A
L
 
V
V
 
R
T
 
S
A
 
C
D
 
D
R
 
D
H
 
I
A
 
Q
F
 
T
F
 
F
K
 
K
Y
 
L
M
 
V
A
 
V
R
 
K
A
 
T
I
 
I
A
 
A
E
 
R
K
 
K
H
 
H
G
 
G
L
 
L
R
 
H
A
 
A
T
 
T
F
 
F
M
 
M
P
 
P
K
 
K
P
 
P
F
 
L
I
 
F
N
x
G
L
x
V
T
x
N
G
 
G
S
 
S
G
 
G
C
 
M
H
|
H
M
 
C
H
 
N
L
 
L
S
 
S
L
 
L
W
 
F
R
 
K
D
 
N
G
 
G
V
 
V
N
 
N
L
 
A
F
 
F
R
 
F
D
 
D
P
 
E
T
 
N
G
 
A
A
 
D
L
 
L
G
 
Q
M
 
L
S
 
S
A
 
E
I
 
T
G
 
A
Y
 
K
H
 
H
F
 
F
I
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
I
L
 
V
A
 
K
E
 
H
A
 
A
T
 
T
A
 
S
L
 
F
C
 
T
A
 
A
L
 
V
T
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
T
V
 
V
N
 
N
S
 
S
Y
 
Y
K
 
K
R
|
R
I
 
L
N
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
T
 
-
V
 
V
S
 
P
G
|
G
S
x
Y
T
x
E
W
 
-
S
 
A
P
 
P
N
 
C
T
 
Y
V
 
V
T
 
A
Y
 
W
T
 
S
G
 
A
N
 
Q
N
 
N
R
|
R
T
 
S
H
 
P
M
 
L
I
 
I
R
 
R
I
 
I
P
 
P
N
 
A
-
 
S
-
 
R
-
 
G
-
 
I
G
 
S
N
 
T
R
 
R
F
 
V
E
|
E
F
 
V
R
|
R
L
 
S
P
 
V
D
 
D
G
 
P
A
 
A
A
 
A
N
 
N
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
M
 
A
P
 
L
A
 
S
A
 
V
V
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
I
A
 
K
R
 
N
K
 
K
A
 
L
D
 
E
P
 
A
G
 
P
P
 
A
R
 
P
L
 
I
D
 
D
I
 
R
N
 
N
M
 
I
Y
|
Y
-
 
V
-
 
M
T
 
S
E
 
K
G
 
E
Y
 
E
K
 
R
V
 
M
T
 
E
D
 
N
G
 
G
-
 
I
R
 
V
K
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
A
N
 
T
L
 
L
L
 
A
D
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
E
V
 
E
L
 
F
D
 
K
R
 
S
S
 
N
D
 
E
V
 
V
L
 
M
R
 
V
A
 
K
R
 
A
L
 
L
G
 
G
D
 
E
A
 
H
V
 
L
I
 
F
A
 
E
A
x
H
F
 
F
L
 
I
K
 
E
L
 
A
K
 
K
E
 
E
G
x
I
E
 
E
W
 
W
N
 
D
A
x
M
Y
 
F
A
 
R
R
 
T
H
 
Q
L
 
V
T
 
H
Q
 
P
W
 
W
E
 
E
R
 
R
D
 
E
N
 
Q
T
 
Y
L
 
M

8ooqB Glutamine synthetase from Methanothermococcus thermolithotrophicus (see paper)
35% identity, 97% coverage: 7:426/433 of query aligns to 7:439/446 of 8ooqB

query
sites
8ooqB
Q
 
E
A
 
Y
A
 
V
K
 
K
E
 
S
R
 
N
G
 
N
I
 
V
K
 
K
F
|
F
F
 
M
L
x
R
V
 
F
S
 
Q
Y
 
F
T
 
V
D
 
D
L
 
I
F
 
L
G
 
G
A
 
V
Q
 
P
R
 
K
A
 
N
K
 
V
L
x
A
V
 
F
P
 
P
A
 
I
A
 
K
A
 
A
-
 
G
-
 
E
-
 
K
-
 
G
-
 
I
-
 
E
-
 
E
I
 
L
A
 
R
E
 
D
M
 
V
V
 
L
E
 
E
N
 
N
G
 
G
A
 
L
G
 
Y
F
 
F
A
 
D
G
 
G
F
 
S
A
 
S
T
 
I
W
 
E
L
 
G
D
 
F
L
 
V
S
 
G
P
 
I
A
 
N
D
 
E
S
 
S
D
 
D
L
 
M
L
 
M
A
 
L
M
 
K
P
 
P
D
 
D
P
 
L
D
 
S
S
 
T
M
 
F
I
 
S
Q
 
V
L
 
L
P
 
P
W
 
W
K
x
R
P
 
P
E
 
S
-
 
E
-
 
K
-
 
S
V
|
V
A
 
A
W
 
R
V
 
V
A
 
I
A
 
C
D
 
D
L
 
V
W
 
Y
M
 
T
-
 
T
D
 
K
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
V
 
F
E
 
E
Q
 
G
G
 
D
P
 
P
R
 
R
N
 
G
T
 
C
L
 
L
K
 
K
R
 
R
M
 
V
I
 
M
A
 
E
A
 
E
-
 
F
A
 
K
A
 
K
E
 
E
Q
 
F
G
 
N
F
 
G
Q
 
E
L
 
Y
K
 
F
T
 
V
G
 
G
V
 
P
E
 
E
C
 
P
E
|
E
F
 
F
F
 
F
L
 
L
T
 
L
T
 
K
P
 
K
D
 
D
G
 
P
K
 
H
G
 
N
I
 
P
A
 
H
D
 
K
S
 
Y
A
 
I
D
 
P
T
 
A
A
 
D
T
 
D
K
 
G
P
 
G
C
 
Y
Y
 
F
D
 
D
Q
 
L
Q
 
E
A
 
P
L
 
M
M
 
D
R
 
E
R
 
A
F
x
P
D
 
D
V
 
I
V
x
R
A
x
R
E
 
D
I
 
I
S
 
V
D
 
F
A
 
A
M
 
L
S
 
E
A
 
N
L
 
L
G
 
G
W
 
F
K
 
H
P
 
V
Y
 
E
Q
 
A
S
|
S
D
 
H
H
 
H
E
|
E
D
 
V
A
 
A
I
 
P
G
 
G
Q
 
Q
F
 
H
E
|
E
M
 
V
N
 
D
W
 
F
E
 
K
Y
 
F
D
 
D
D
 
D
V
 
A
L
 
L
V
 
K
T
 
T
A
 
A
D
 
D
R
 
S
H
 
V
A
 
I
F
 
T
F
 
F
K
 
K
Y
 
T
M
 
T
A
 
I
R
 
K
A
 
T
I
 
I
A
 
A
E
 
E
K
 
Q
H
 
H
G
 
G
L
 
L
R
 
K
A
 
A
T
 
T
F
 
F
M
 
M
P
 
P
K
 
K
P
 
P
F
 
F
I
 
F
N
 
G
L
 
M
T
 
N
G
 
G
S
 
S
G
 
G
C
 
M
H
 
H
M
 
C
H
 
H
L
 
Q
S
 
S
L
 
I
W
 
W
R
 
L
D
 
N
G
 
G
V
 
E
N
 
P
L
 
S
F
 
F
R
 
Y
D
 
D
P
 
E
T
 
N
G
 
A
A
 
P
L
 
Y
G
 
Q
M
 
L
S
 
S
A
 
E
I
 
T
G
 
C
Y
 
M
H
 
N
F
 
Y
I
 
V
A
 
A
G
 
G
L
 
I
L
 
L
A
 
K
E
 
H
A
 
A
T
 
K
A
 
A
L
 
I
C
 
V
A
 
A
L
 
I
T
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
T
V
 
V
N
 
N
S
 
S
Y
 
Y
K
 
K
R
 
R
I
 
L
N
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
T
 
-
V
 
V
S
 
P
G
 
G
S
 
Y
T
 
E
W
 
-
S
 
A
P
 
P
N
 
V
T
 
N
V
 
I
T
 
A
Y
 
W
T
 
A
G
 
N
N
 
S
N
 
N
R
 
R
T
 
S
H
 
A
M
 
I
I
 
I
R
 
R
I
 
V
P
 
P
-
 
A
-
 
A
-
 
R
-
 
G
N
 
K
G
 
G
N
 
T
R
 
R
F
 
I
E
 
E
F
 
F
R
 
R
L
 
A
P
 
P
D
 
D
G
 
P
A
 
S
A
 
C
N
 
N
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
M
 
A
P
 
F
A
 
T
A
 
V
V
 
M
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
V
A
 
K
R
 
N
K
 
K
A
 
L
D
 
D
P
 
A
G
 
P
P
 
E
R
 
P
L
 
V
D
 
E
I
 
R
N
 
N
M
 
I
Y
 
F
-
 
A
-
 
M
T
 
S
E
 
E
G
 
A
Y
 
E
K
 
K
V
 
K
T
 
E
D
 
L
G
 
G
-
 
I
R
 
E
K
 
S
L
 
V
P
 
P
L
 
A
N
 
N
L
 
L
L
 
K
D
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
D
V
 
E
L
 
L
D
 
E
R
 
N
S
 
N
D
 
D
V
 
V
L
 
L
R
 
K
A
 
N
R
 
A
L
 
L
G
 
G
D
 
K
A
 
H
V
 
I
I
 
F
A
 
E
A
 
S
F
 
F
L
 
L
K
 
E
L
 
I
K
 
K
E
 
N
G
 
A
E
 
E
W
 
W
N
 
D
A
 
S
Y
 
F
A
 
R
R
 
T
H
 
S
L
 
V
T
 
T
Q
 
D
W
 
W
E
 
E

8oooA Glutamine synthetase from methanothermococcus thermolithotrophicus in complex with 2-oxoglutarate and mgatp at 2.15 a resolution (see paper)
35% identity, 97% coverage: 7:426/433 of query aligns to 8:440/447 of 8oooA

query
sites
8oooA
Q
 
E
A
 
Y
A
 
V
K
 
K
E
 
S
R
 
N
G
 
N
I
 
V
K
 
K
F
|
F
F
 
M
L
x
R
V
 
F
S
 
Q
Y
 
F
T
 
V
D
 
D
L
 
I
F
 
L
G
 
G
A
 
V
Q
 
P
R
 
K
A
 
N
K
 
V
L
x
A
V
 
F
P
 
P
A
 
I
A
 
K
A
 
A
-
 
G
-
 
E
-
 
K
-
 
G
-
 
I
-