SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012976790.1 NCBI__GCF_000010725.1:WP_012976790.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4ur8A Crystal structure of keto-deoxy-d-galactarate dehydratase complexed with 2-oxoadipic acid (see paper)
56% identity, 98% coverage: 1:297/303 of query aligns to 1:296/304 of 4ur8A

query
sites
4ur8A
M
 
M
E
 
D
P
 
P
Q
 
E
A
 
Q
L
 
I
K
 
K
A
 
T
V
 
A
V
 
L
S
 
G
E
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
S
 
S
F
|
F
P
 
P
L
 
V
T
 
T
D
 
H
F
 
F
T
 
D
A
 
A
D
 
E
G
 
G
G
 
R
F
 
F
E
 
A
P
 
A
G
 
D
G
 
S
Y
 
Y
A
 
R
R
 
E
R
 
H
L
 
V
E
 
E
W
 
W
L
 
L
K
 
A
P
 
G
Y
 
Y
G
 
K
A
 
A
S
 
P
A
 
V
L
 
L
F
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
G
G
|
G
T
|
T
G
 
G
E
 
E
L
 
F
F
 
F
S
 
S
L
 
L
T
 
K
P
 
P
D
 
D
E
 
E
H
 
I
K
 
P
S
 
T
I
 
I
V
 
V
S
 
A
L
 
A
A
 
A
V
 
K
E
 
E
V
 
V
C
 
A
G
 
G
K
 
-
E
 
E
V
 
T
P
 
A
I
 
I
I
 
V
A
 
S
G
 
G
V
 
C
G
 
G
Y
 
Y
S
 
G
T
 
T
R
 
E
I
 
I
A
 
A
V
 
V
E
 
D
M
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
S
A
 
V
E
 
E
K
 
K
A
 
V
G
 
G
A
 
A
A
 
D
G
 
G
I
 
I
L
 
L
V
 
L
L
 
L
P
 
P
H
 
H
Y
 
Y
L
|
L
T
 
I
E
 
D
A
 
A
D
 
P
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
V
 
L
A
 
Y
A
 
A
H
 
H
V
 
I
E
 
K
A
 
K
I
 
V
C
 
C
K
 
Q
S
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
M
I
 
V
Y
|
Y
N
 
N
R
 
R
A
 
D
T
 
N
C
 
S
K
 
V
L
 
L
S
 
Q
A
 
A
D
 
D
R
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
R
L
 
L
A
 
C
E
 
D
R
 
E
C
 
C
P
 
P
N
 
N
L
 
L
I
 
V
G
 
G
F
 
F
K
|
K
D
 
D
G
 
G
L
 
T
G
 
G
D
 
D
I
 
I
E
 
G
L
 
L
M
 
V
T
 
R
T
 
Q
I
 
I
R
 
T
R
 
A
R
 
K
M
 
M
G
 
G
D
 
D
R
 
R
F
 
L
S
 
M
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
M
P
 
P
T
 
T
A
 
A
E
 
E
V
 
L
Y
 
F
A
 
A
A
 
E
A
 
A
Y
 
Y
R
 
L
A
 
G
I
 
A
G
 
G
V
 
F
P
 
T
V
 
T
Y
 
Y
S
|
S
S
 
S
A
 
A
V
 
V
F
 
F
N
 
N
F
 
F
I
 
V
P
 
P
R
 
G
T
 
L
A
 
A
M
 
N
E
 
E
F
 
F
Y
 
Y
H
 
A
A
 
A
V
 
L
S
 
R
A
 
A
G
 
G
D
 
E
T
 
R
A
 
A
T
 
T
T
 
C
D
 
E
R
 
R
L
 
I
L
 
L
D
 
V
Q
 
D
F
 
F
F
 
F
L
 
Y
P
 
P
Y
 
F
L
 
M
A
 
A
I
 
I
R
 
R
N
 
N
R
 
R
K
 
A
A
 
K
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
S
 
S
I
 
A
V
 
V
K
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
V
A
 
R
I
 
L
V
 
Q
G
 
G
R
 
F
S
 
N
A
 
A
G
 
G
P
 
P
V
 
V
R
 
R
A
 
A
P
 
P
L
 
L
T
 
K
D
 
D
C
 
L
A
 
T
P
 
N
A
 
E
E
 
E
V
 
I
E
 
G
E
 
M
L
 
L
R
 
E
V
 
A
L
 
L
I
 
I

5hwnB Crystal structure of keto-deoxy-d-galactarate dehydratase complexed with pyruvate (see paper)
56% identity, 98% coverage: 1:297/303 of query aligns to 1:296/310 of 5hwnB

query
sites
5hwnB
M
 
M
E
 
D
P
 
P
Q
 
E
A
 
Q
L
 
I
K
 
K
A
 
T
V
 
A
V
 
L
S
 
G
E
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
S
 
S
F
|
F
P
 
P
L
 
V
T
 
T
D
 
H
F
 
F
T
 
D
A
 
A
D
 
E
G
 
G
G
 
R
F
 
F
E
 
A
P
 
A
G
 
D
G
 
S
Y
 
Y
A
 
R
R
 
E
R
 
H
L
 
V
E
 
E
W
 
W
L
 
L
K
 
A
P
 
G
Y
 
Y
G
 
K
A
 
A
S
 
P
A
 
V
L
 
L
F
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
G
G
|
G
T
|
T
G
 
G
E
 
E
L
 
F
F
 
F
S
 
S
L
 
L
T
 
K
P
 
P
D
 
D
E
 
E
H
 
I
K
 
P
S
 
T
I
 
I
V
 
V
S
 
A
L
 
A
A
 
A
V
 
K
E
 
E
V
 
V
C
 
A
G
 
G
K
 
-
E
 
E
V
 
T
P
 
A
I
 
I
I
 
V
A
 
S
G
 
G
V
 
C
G
 
G
Y
 
Y
S
 
G
T
 
T
R
 
E
I
 
I
A
 
A
V
 
V
E
 
D
M
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
S
A
 
V
E
 
E
K
 
K
A
 
V
G
 
G
A
 
A
A
 
D
G
 
G
I
 
I
L
 
L
V
 
L
L
 
L
P
 
P
H
 
H
Y
 
Y
L
|
L
T
 
I
E
 
D
A
 
A
D
 
P
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
V
 
L
A
 
Y
A
 
A
H
 
H
V
 
I
E
 
K
A
 
K
I
 
V
C
 
C
K
 
Q
S
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
M
I
 
V
Y
|
Y
N
 
N
R
 
R
A
 
D
T
 
N
C
 
S
K
 
V
L
 
L
S
 
Q
A
 
A
D
 
D
R
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
R
L
 
L
A
 
C
E
 
D
R
 
E
C
 
C
P
 
P
N
 
N
L
 
L
I
 
V
G
 
G
F
 
F
K
|
K
D
 
D
G
 
G
L
 
T
G
 
G
D
 
D
I
 
I
E
 
G
L
 
L
M
 
V
T
 
R
T
 
Q
I
 
I
R
 
T
R
 
A
R
 
K
M
 
M
G
 
G
D
 
D
R
 
R
F
 
L
S
 
M
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
M
P
 
P
T
 
T
A
 
A
E
 
E
V
 
L
Y
 
F
A
 
A
A
 
E
A
 
A
Y
 
Y
R
 
L
A
 
G
I
 
A
G
 
G
V
 
F
P
 
T
V
 
T
Y
 
Y
S
|
S
S
 
S
A
 
A
V
 
V
F
 
F
N
 
N
F
 
F
I
 
V
P
 
P
R
 
G
T
 
L
A
 
A
M
 
N
E
 
E
F
 
F
Y
 
Y
H
 
A
A
 
A
V
 
L
S
 
R
A
 
A
G
 
G
D
 
E
T
 
R
A
 
A
T
 
T
T
 
C
D
 
E
R
 
R
L
 
I
L
 
L
D
 
V
Q
 
D
F
 
F
F
 
F
L
 
Y
P
 
P
Y
 
F
L
 
M
A
 
A
I
 
I
R
 
R
N
 
N
R
 
R
K
 
A
A
 
K
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
S
 
S
I
 
A
V
 
V
K
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
V
A
 
R
I
 
L
V
 
Q
G
 
G
R
 
F
S
 
N
A
 
A
G
 
G
P
 
P
V
 
V
R
 
R
A
 
A
P
 
P
L
 
L
T
 
K
D
 
D
C
 
L
A
 
T
P
 
N
A
 
E
E
 
E
V
 
I
E
 
G
E
 
M
L
 
L
R
 
E
V
 
A
L
 
L
I
 
I

4i7wA Agrobacterium tumefaciens dhdps with lysine and pyruvate
34% identity, 74% coverage: 19:242/303 of query aligns to 10:238/294 of 4i7wA

query
sites
4i7wA
L
 
I
T
 
T
D
 
P
F
 
F
T
 
T
A
 
D
D
 
N
G
 
G
G
 
A
F
 
V
E
 
D
P
 
E
G
 
Q
G
 
A
Y
 
F
A
 
A
R
 
A
R
 
H
L
 
V
E
 
E
W
 
W
L
 
Q
K
 
I
P
 
A
Y
 
E
G
 
G
A
 
S
S
 
N
A
 
G
L
 
L
F
 
V
A
 
P
A
 
V
G
 
G
G
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
L
x
S
F
x
P
S
 
T
L
|
L
T
 
S
P
 
H
D
 
D
E
 
E
H
|
H
K
 
K
S
 
R
I
 
V
V
 
V
S
 
E
L
 
L
A
 
C
V
 
I
E
 
E
V
 
V
C
 
A
G
 
A
K
 
K
E
 
R
V
 
V
P
 
P
I
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
A
G
 
G
-
 
S
Y
x
N
S
 
N
T
 
T
R
 
D
I
x
E
A
 
A
V
 
I
E
 
E
M
 
L
A
 
A
R
 
L
A
 
H
A
 
A
E
 
Q
K
 
D
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
D
G
 
A
I
 
L
L
 
L
V
 
V
L
 
V
P
 
T
H
 
P
Y
|
Y
L
x
Y
T
 
N
E
 
K
A
 
P
D
 
T
Q
 
Q
E
 
K
G
 
G
V
 
L
A
 
F
A
 
A
H
 
H
V
 
F
E
 
S
A
 
A
I
 
V
C
 
A
K
 
E
S
 
A
V
 
V
G
 
K
I
 
L
G
 
P
V
 
I
I
 
V
I
 
I
Y
|
Y
N
 
N
-
 
I
-
 
P
-
 
P
R
|
R
A
 
S
T
 
V
C
 
V
K
 
D
L
 
M
S
 
S
A
 
P
D
 
E
R
 
T
L
 
M
A
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
V
E
 
K
R
 
A
C
 
H
P
 
K
N
 
N
L
 
I
I
 
V
G
 
G
F
 
V
K
|
K
D
 
D
G
 
A
L
 
T
G
 
G
D
 
K
I
 
L
E
 
D
L
 
R
M
 
V
T
 
S
T
 
E
I
 
Q
R
 
R
R
 
I
R
 
S
M
 
C
G
 
G
D
 
K
R
 
D
F
 
F
S
 
I
Y
 
Q
L
 
L
G
 
S
G
 
G
L
 
E
P
 
D
T
 
S
A
 
T
E
 
A
V
 
L
Y
 
G
A
 
F
A
 
N
A
 
A
Y
 
H
R
 
G
A
 
G
I
 
V
G
 
G
V
 
C
P
x
I
V
 
S
Y
 
V
S
 
S
S
 
A
A
 
-
V
 
-
F
 
-
N
 
N
F
 
V
I
 
A
P
 
P
R
 
R
T
 
L
A
 
C
M
 
S
E
 
E
F
 
F
Y
 
Q
H
 
A
A
 
A
V
 
M
S
 
L
A
 
A
G
 
G
D
 
D
T
 
Y
A
 
A
T
 
K
-
 
A
-
 
L
-
 
E
-
 
Y
T
 
Q
D
 
D
R
 
R
L
 
L
L
 
M

Q8UGL3 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; EC 4.3.3.7 from Agrobacterium fabrum (strain C58 / ATCC 33970) (Agrobacterium tumefaciens (strain C58)) (see paper)
34% identity, 77% coverage: 19:252/303 of query aligns to 10:244/294 of Q8UGL3

query
sites
Q8UGL3
L
 
I
T
 
T
D
 
P
F
 
F
T
 
T
A
 
D
D
 
N
G
 
G
G
 
S
F
 
V
E
 
D
P
 
E
G
 
K
G
 
A
Y
 
F
A
 
A
R
 
A
R
 
H
L
 
V
E
 
E
W
 
W
L
 
Q
K
 
I
P
 
A
Y
 
E
G
 
G
A
 
S
S
 
N
A
 
G
L
 
L
F
 
V
A
 
P
A
 
V
G
 
G
G
 
T
T
|
T
G
 
G
E
 
E
L
 
S
F
x
P
S
 
T
L
 
L
T
 
S
P
 
H
D
 
D
E
 
E
H
|
H
K
 
K
S
 
R
I
 
V
V
 
V
S
 
E
L
 
L
A
 
C
V
 
I
E
 
E
V
 
V
C
 
A
G
 
A
K
 
K
E
 
R
V
 
V
P
 
P
I
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
A
G
 
G
-
 
S
Y
x
N
S
 
N
T
 
T
R
 
D
I
x
E
A
 
A
V
 
I
E
 
E
M
 
L
A
 
A
R
 
L
A
 
H
A
 
A
E
 
Q
K
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
D
G
 
A
I
 
L
L
 
L
V
 
V
L
 
V
P
 
T
H
 
P
Y
|
Y
L
 
Y
T
 
N
E
 
K
A
 
P
D
 
T
Q
 
Q
E
 
K
G
 
G
V
 
L
A
 
F
A
 
A
H
 
H
V
 
F
E
 
S
A
 
A
I
 
V
C
 
A
K
 
E
S
 
A
V
 
V
G
 
K
I
 
L
G
 
P
V
 
I
I
 
V
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
-
 
I
-
 
P
-
 
P
R
 
R
A
 
S
T
 
V
C
 
V
K
 
D
L
 
M
S
 
S
A
 
P
D
 
E
R
 
T
L
 
M
A
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
V
E
 
K
R
 
A
C
 
H
P
 
K
N
 
N
L
 
I
I
 
I
G
 
G
F
 
V
K
|
K
D
 
D
G
 
A
L
 
T
G
 
G
D
 
K
I
 
L
E
 
D
L
 
R
M
 
V
T
 
S
T
 
E
I
 
Q
R
 
R
R
 
I
R
 
S
M
 
C
G
 
G
D
 
K
R
 
D
F
 
F
S
 
V
Y
 
Q
L
 
L
G
 
S
G
 
G
L
 
E
P
 
D
T
 
G
A
 
T
E
 
A
V
 
L
Y
 
G
A
 
F
A
 
N
A
 
A
Y
 
H
R
 
G
A
 
G
I
 
V
G
 
G
V
 
C
P
 
-
V
 
-
Y
 
-
S
 
I
S
 
S
A
 
V
V
 
T
F
 
A
N
 
N
F
 
V
I
 
A
P
 
P
R
 
R
T
 
L
A
 
C
M
 
S
E
 
E
F
 
F
Y
 
Q
H
 
A
A
 
A
V
 
M
S
 
L
A
 
A
G
 
G
D
 
D
T
 
Y
A
 
A
T
 
K
T
 
A
D
 
L
R
 
E
L
 
Y
L
 
Q
D
 
D
Q
 
R
F
 
L
F
 
M
L
 
P
P
 
L
Y
 
H
L
 
R
A
 
A
I
 
I

7mjfA Crystal structure of candidatus liberibacter solanacearum dihydrodipicolinate synthase with pyruvate and succinic semi-aldehyde bound in active site
30% identity, 87% coverage: 19:282/303 of query aligns to 10:272/296 of 7mjfA

query
sites
7mjfA
L
 
I
T
 
T
D
 
P
F
 
F
T
 
T
A
 
K
D
 
D
G
 
N
G
 
L
F
 
I
E
 
D
P
 
E
G
 
D
G
 
S
Y
 
F
A
 
V
R
 
D
R
 
H
L
 
I
E
 
E
W
 
W
L
 
Q
K
 
I
P
 
S
Y
 
E
G
 
G
A
 
S
S
 
S
A
 
G
L
 
L
F
 
V
A
 
P
A
 
A
G
 
G
G
x
T
T
|
T
G
 
G
E
 
E
L
 
S
F
 
S
S
 
T
L
 
L
T
 
S
P
 
Y
D
 
E
E
 
E
H
 
H
K
 
C
S
 
R
I
 
V
V
 
V
S
 
E
L
 
L
A
 
C
V
 
V
E
 
K
V
 
T
C
 
A
G
 
A
K
 
G
E
 
R
V
 
V
P
 
P
I
 
V
I
 
M
A
 
A
G
 
G
V
 
A
G
 
G
-
 
S
Y
 
N
S
 
N
T
 
T
R
 
K
I
 
E
A
 
S
V
 
I
E
 
E
M
 
L
A
 
A
R
 
Q
A
 
Y
A
 
A
E
 
Q
K
 
N
A
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
D
G
 
A
I
 
L
L
 
L
V
 
V
L
 
V
P
 
V
H
 
P
Y
 
Y
L
 
Y
T
 
N
E
 
K
A
 
P
D
 
N
Q
 
K
E
 
K
G
 
G
V
 
L
A
 
L
A
 
A
H
 
H
V
 
F
E
 
G
A
 
S
I
 
I
C
 
A
K
 
N
S
 
A
V
 
V
G
 
S
I
 
L
G
 
P
V
 
I
I
 
Y
I
 
I
Y
|
Y
N
 
N
-
 
N
-
 
P
-
 
S
R
|
R
A
 
T
T
 
V
C
 
I
K
 
E
L
 
M
S
 
D
A
 
V
D
 
D
R
 
T
L
 
M
A
 
A
A
 
E
L
 
L
A
 
V
E
 
K
R
 
T
C
 
Y
P
 
S
N
 
N
L
 
I
I
 
V
G
 
G
F
 
V
K
|
K
D
 
D
G
 
A
L
 
T
G
 
G
D
 
R
I
 
I
E
 
E
L
 
L
M
 
A
T
 
S
T
 
G
I
 
Q
R
 
R
R
 
I
R
 
A
M
 
C
G
 
G
D
 
S
R
 
D
F
 
F
S
 
I
Y
 
Q
L
 
L
G
 
S
G
|
G
L
 
D
P
 
D
T
 
S
A
 
S
E
 
A
V
 
L
Y
 
G
A
 
F
A
 
N
A
 
V
Y
 
H
R
 
G
A
 
G
I
 
V
G
 
G
V
 
C
P
 
I
V
 
-
Y
 
-
S
 
-
S
 
S
A
 
V
V
 
T
F
 
A
N
 
N
F
 
V
I
 
A
P
 
P
R
 
R
T
 
I
A
 
C
M
 
A
E
 
E
F
 
F
Y
 
Q
H
 
K
A
 
A
V
 
I
S
 
S
A
 
E
G
 
G
D
 
D
T
 
Y
A
 
R
T
 
Q
T
 
A
D
 
L
R
 
E
L
 
Y
L
 
Q
D
 
D
Q
 
K
F
 
L
F
 
F
L
 
P
P
 
L
Y
 
H
L
 
Q
A
 
A
I
 
L
R
 
F
N
 
I
R
 
E
K
 
P
A
 
-
G
 
-
Y
 
-
A
 
S
V
 
I
S
 
S
I
 
S
V
 
V
K
 
K
A
 
Y
G
 
A
A
 
L
A
 
S
I
 
R
V
 
L
G
 
G
R
 
R
S
 
N
A
 
V
G
 
S
-
 
L
P
 
V
V
 
V
R
 
R
A
 
A
P
 
P
L
 
M

Sites not aligning to the query:

7lvlA Dihydrodipicolinate synthase bound with allosteric inhibitor (s)- lysine from candidatus liberibacter solanacearum
30% identity, 87% coverage: 19:282/303 of query aligns to 10:272/296 of 7lvlA

query
sites
7lvlA
L
 
I
T
 
T
D
 
P
F
 
F
T
 
T
A
 
K
D
 
D
G
 
N
G
 
L
F
 
I
E
 
D
P
 
E
G
 
D
G
 
S
Y
 
F
A
 
V
R
 
D
R
 
H
L
 
I
E
 
E
W
 
W
L
 
Q
K
 
I
P
 
S
Y
 
E
G
 
G
A
 
S
S
 
S
A
 
G
L
 
L
F
 
V
A
 
P
A
 
A
G
 
G
G
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
L
x
S
F
x
S
S
 
T
L
|
L
T
 
S
P
 
Y
D
 
E
E
 
E
H
 
H
K
 
C
S
 
R
I
 
V
V
 
V
S
 
E
L
 
L
A
 
C
V
 
V
E
 
K
V
 
T
C
 
A
G
 
A
K
 
G
E
 
R
V
 
V
P
 
P
I
 
V
I
 
M
A
 
A
G
 
G
V
 
A
G
 
G
-
 
S
Y
 
N
S
 
N
T
 
T
R
 
K
I
 
E
A
 
S
V
 
I
E
 
E
M
 
L
A
 
A
R
 
Q
A
 
Y
A
 
A
E
 
Q
K
 
N
A
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
D
G
 
A
I
 
L
L
 
L
V
 
V
L
 
V
P
 
V
H
 
P
Y
|
Y
L
x
Y
T
 
N
E
 
K
A
 
P
D
 
N
Q
 
K
E
 
K
G
 
G
V
 
L
A
 
L
A
 
A
H
 
H
V
 
F
E
 
G
A
 
S
I
 
I
C
 
A
K
 
N
S
 
A
V
 
V
G
 
S
I
 
L
G
 
P
V
 
I
I
 
Y
I
 
I
Y
|
Y
N
 
N
-
 
N
-
 
P
-
 
S
R
|
R
A
 
T
T
 
V
C
 
I
K
 
E
L
 
M
S
 
D
A
 
V
D
 
D
R
 
T
L
 
M
A
 
A
A
 
E
L
 
L
A
 
V
E
 
K
R
 
T
C
 
Y
P
 
S
N
 
N
L
 
I
I
 
V
G
 
G
F
 
V
K
|
K
D
 
D
G
 
A
L
 
T
G
 
G
D
 
R
I
 
I
E
 
E
L
 
L
M
 
A
T
 
S
T
 
G
I
 
Q
R
 
R
R
 
I
R
 
A
M
 
C
G
 
G
D
 
S
R
 
D
F
 
F
S
 
I
Y
 
Q
L
 
L
G
 
S
G
 
G
L
 
D
P
 
D
T
 
S
A
 
S
E
 
A
V
 
L
Y
 
G
A
 
F
A
 
N
A
 
V
Y
 
H
R
 
G
A
 
G
I
 
V
G
 
G
V
 
C
P
x
I
V
 
-
Y
 
-
S
 
-
S
 
S
A
 
V
V
 
T
F
 
A
N
 
N
F
 
V
I
 
A
P
 
P
R
 
R
T
 
I
A
 
C
M
 
A
E
 
E
F
 
F
Y
 
Q
H
 
K
A
 
A
V
 
I
S
 
S
A
 
E
G
 
G
D
 
D
T
 
Y
A
 
R
T
 
Q
T
 
A
D
 
L
R
 
E
L
 
Y
L
 
Q
D
 
D
Q
 
K
F
 
L
F
 
F
L
 
P
P
 
L
Y
 
H
L
 
Q
A
 
A
I
 
L
R
 
F
N
 
I
R
 
E
K
 
P
A
 
-
G
 
-
Y
 
-
A
 
S
V
 
I
S
 
S
I
 
S
V
 
V
K
 
K
A
 
Y
G
 
A
A
 
L
A
 
S
I
 
R
V
 
L
G
 
G
R
 
R
S
 
N
A
 
V
G
 
S
-
 
L
P
 
V
V
 
V
R
 
R
A
 
A
P
 
P
L
 
M

Q07607 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; Protein MosA; EC 4.3.3.7 from Rhizobium meliloti (Ensifer meliloti) (Sinorhizobium meliloti) (see paper)
30% identity, 93% coverage: 12:293/303 of query aligns to 3:281/292 of Q07607

query
sites
Q07607
E
 
E
G
 
G
L
 
S
L
 
I
S
 
T
F
 
A
P
 
L
L
 
V
T
 
T
D
 
P
F
 
F
T
 
-
A
 
A
D
 
D
G
 
D
G
 
R
F
 
I
E
 
D
P
 
E
G
 
V
G
 
A
Y
 
L
A
 
H
R
 
D
R
 
L
L
 
V
E
 
E
W
 
W
L
 
Q
K
 
I
P
 
E
Y
 
E
G
 
G
A
 
S
S
 
F
A
 
G
L
 
L
F
 
V
A
 
P
A
 
C
G
 
G
G
 
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
L
 
S
F
 
P
S
 
T
L
 
L
T
 
S
P
 
K
D
 
S
E
 
E
H
 
H
K
 
E
S
 
Q
I
 
V
V
 
V
S
 
E
L
 
I
A
 
T
V
 
I
E
 
K
V
 
T
C
 
A
G
 
N
K
 
G
E
 
R
V
 
V
P
 
P
I
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
A
G
 
G
-
 
S
Y
 
N
S
 
S
T
 
T
R
 
A
I
 
E
A
 
A
V
 
I
E
 
A
M
 
F
A
 
V
R
 
R
A
 
H
A
 
A
E
 
Q
K
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
D
G
 
G
I
 
V
L
 
L
V
 
I
L
 
V
P
 
S
H
 
P
Y
 
Y
L
 
Y
T
 
N
E
 
K
A
 
P
D
 
T
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
V
 
I
A
 
Y
A
 
Q
H
 
H
V
 
F
E
 
K
A
 
A
I
 
I
C
 
D
K
 
A
S
 
A
V
 
S
G
 
T
I
 
I
G
 
P
V
 
I
I
 
I
I
 
V
Y
 
Y
N
 
N
-
 
I
-
 
P
-
 
G
R
 
R
A
 
S
T
 
A
C
 
I
K
 
E
L
 
I
S
 
H
A
 
V
D
 
E
R
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
R
L
 
I
A
 
F
E
 
E
R
 
D
C
 
C
P
 
P
N
 
N
L
 
V
I
 
K
G
 
G
F
 
V
K
|
K
D
 
D
G
 
A
L
 
T
G
 
G
D
 
N
I
 
L
E
 
L
L
 
R
M
 
P
T
 
S
T
 
L
I
 
E
R
 
R
R
 
M
R
 
A
M
 
C
G
 
G
D
 
E
R
 
D
F
 
F
S
 
N
Y
 
L
L
 
L
G
 
T
G
 
G
L
 
-
P
 
-
T
 
-
A
 
E
E
 
D
V
 
G
Y
 
T
A
 
A
A
 
L
A
 
G
Y
 
Y
R
 
M
A
 
A
I
 
H
G
 
G
V
 
G
P
 
H
V
 
G
Y
 
C
S
 
I
S
 
S
A
 
V
V
 
T
F
 
A
N
 
N
F
 
V
I
 
A
P
 
P
R
 
A
T
 
L
A
 
C
M
 
A
E
 
D
F
 
F
Y
 
Q
H
 
Q
A
 
A
V
 
C
S
 
L
A
 
N
G
 
G
D
 
D
T
 
F
A
 
A
T
 
A
T
 
A
D
 
L
R
 
K
L
 
L
L
 
Q
D
 
D
Q
 
R
F
 
L
F
 
M
L
 
P
P
 
L
Y
 
H
-
 
R
-
 
A
L
 
L
A
 
F
I
 
L
R
 
E
N
 
T
R
 
N
K
 
P
A
 
A
G
 
G
Y
 
A
A
 
K
V
 
Y
S
 
A
I
 
L
V
 
Q
K
 
R
A
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
-
V
 
L
G
 
G
R
 
R
S
 
M
A
 
R
G
 
G
P
 
D
V
 
L
R
 
R
A
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
V
D
 
T
C
 
I
A
 
S
P
 
P
A
 
S
E
 
F
V
 
Q
E
 
E
E
 
E
L
 
I

4dxvA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii complexed with mg and cl ions at 1.80 a resolution
38% identity, 51% coverage: 19:173/303 of query aligns to 10:167/291 of 4dxvA

query
sites
4dxvA
L
 
V
T
 
T
D
 
P
F
 
M
T
 
L
A
 
K
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
V
E
 
D
P
 
W
G
 
K
G
 
S
Y
 
L
A
 
E
R
 
K
R
 
L
L
 
V
E
 
E
W
 
W
L
 
H
K
 
I
P
 
E
Y
 
Q
G
 
G
A
 
T
S
 
N
A
 
S
L
 
I
F
 
V
A
 
A
A
 
V
G
 
G
G
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
L
 
A
F
 
S
S
 
T
L
 
L
T
 
S
P
 
M
D
 
E
E
 
E
H
 
H
K
 
T
S
 
Q
I
 
V
V
 
I
S
 
K
L
 
E
A
 
I
V
 
I
E
 
R
V
 
V
C
 
A
G
 
N
K
 
K
E
 
R
V
 
I
P
 
P
I
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
-
 
A
Y
 
N
S
 
S
T
 
T
R
 
R
I
 
E
A
 
A
V
 
I
E
 
E
M
 
L
A
 
T
R
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
K
K
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
A
-
 
D
A
 
A
G
 
A
I
 
L
L
 
L
V
 
V
L
x
T
P
 
P
H
 
Y
Y
|
Y
L
 
-
T
 
N
E
 
K
A
 
P
D
 
T
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
V
 
L
A
 
Y
A
 
Q
H
 
H
V
 
Y
E
 
K
A
 
A
I
 
I
C
 
A
K
 
E
S
 
A
V
 
V
G
 
E
I
 
L
G
 
P
V
 
L
I
 
I
I
 
L
Y
|
Y
N
|
N
-
x
V
-
x
P
-
 
G
R
|
R
A
x
T
T
 
G
C
 
V
K
 
D
L
 
L
S
 
S
A
 
N
D
 
D
R
 
T
L
 
A
A
 
V
A
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
-
C
 
I
P
 
P
N
 
N
L
 
I
I
 
V
G
 
G
F
 
I
K
|
K
D
 
D
G
 
A
L
 
T
G
 
G
D
 
D
I
 
V

Sites not aligning to the query:

3u8gA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with oxalic acid at 1.80 a resolution
38% identity, 51% coverage: 19:173/303 of query aligns to 10:167/291 of 3u8gA

query
sites
3u8gA
L
 
V
T
 
T
D
 
P
F
 
M
T
 
L
A
 
K
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
V
E
 
D
P
 
W
G
 
K
G
 
S
Y
 
L
A
 
E
R
 
K
R
 
L
L
 
V
E
 
E
W
 
W
L
 
H
K
 
I
P
 
E
Y
 
Q
G
 
G
A
 
T
S
 
N
A
 
S
L
 
I
F
 
V
A
 
A
A
 
V
G
|
G
G
x
T
T
|
T
G
 
G
E
 
E
L
 
A
F
 
S
S
 
T
L
 
L
T
 
S
P
 
M
D
 
E
E
 
E
H
 
H
K
 
T
S
 
Q
I
 
V
V
 
I
S
 
K
L
 
E
A
 
I
V
 
I
E
 
R
V
 
V
C
 
A
G
 
N
K
 
K
E
 
R
V
 
I
P
 
P
I
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
-
 
A
Y
 
N
S
 
S
T
 
T
R
 
R
I
 
E
A
 
A
V
 
I
E
 
E
M
 
L
A
 
T
R
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
K
K
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
A
-
 
D
A
 
A
G
 
A
I
x
L
L
 
L
V
 
V
L
 
T
P
 
P
H
 
Y
Y
|
Y
L
 
-
T
 
N
E
 
K
A
 
P
D
 
T
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
V
 
L
A
 
Y
A
 
Q
H
 
H
V
 
Y
E
 
K
A
 
A
I
 
I
C
 
A
K
 
E
S
 
A
V
 
V
G
 
E
I
 
L
G
 
P
V
 
L
I
 
I
I
 
L
Y
|
Y
N
 
N
-
 
V
-
 
P
-
 
G
R
|
R
A
 
T
T
 
G
C
 
V
K
 
D
L
 
L
S
 
S
A
 
N
D
 
D
R
 
T
L
 
A
A
 
V
A
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
-
C
 
I
P
 
P
N
 
N
L
 
I
I
 
V
G
 
G
F
 
I
K
|
K
D
 
D
G
 
A
L
 
T
G
 
G
D
 
D
I
 
V

Sites not aligning to the query:

3tdfA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with 2-ketobutanoic acid at 1.99 a resolution
38% identity, 51% coverage: 19:173/303 of query aligns to 10:167/291 of 3tdfA

query
sites
3tdfA
L
 
V
T
 
T
D
 
P
F
 
M
T
 
L
A
 
K
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
V
E
 
D
P
 
W
G
 
K
G
 
S
Y
 
L
A
 
E
R
 
K
R
 
L
L
 
V
E
 
E
W
 
W
L
 
H
K
 
I
P
 
E
Y
 
Q
G
 
G
A
 
T
S
 
N
A
 
S
L
 
I
F
 
V
A
 
A
A
 
V
G
 
G
G
x
T
T
|
T
G
 
G
E
 
E
L
 
A
F
 
S
S
 
T
L
 
L
T
 
S
P
 
M
D
 
E
E
 
E
H
 
H
K
 
T
S
 
Q
I
 
V
V
 
I
S
 
K
L
 
E
A
 
I
V
 
I
E
 
R
V
 
V
C
 
A
G
 
N
K
 
K
E
 
R
V
 
I
P
 
P
I
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
-
 
A
Y
 
N
S
 
S
T
 
T
R
 
R
I
 
E
A
 
A
V
 
I
E
 
E
M
 
L
A
 
T
R
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
K
K
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
A
-
 
D
A
 
A
G
 
A
I
 
L
L
 
L
V
 
V
L
 
T
P
 
P
H
 
Y
Y
|
Y
L
 
-
T
 
N
E
 
K
A
 
P
D
 
T
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
V
 
L
A
 
Y
A
 
Q
H
 
H
V
 
Y
E
 
K
A
 
A
I
 
I
C
 
A
K
 
E
S
 
A
V
 
V
G
 
E
I
 
L
G
 
P
V
 
L
I
 
I
I
 
L
Y
|
Y
N
 
N
-
 
V
-
 
P
-
 
G
R
|
R
A
 
T
T
 
G
C
 
V
K
 
D
L
 
L
S
 
S
A
 
N
D
 
D
R
 
T
L
 
A
A
 
V
A
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
-
C
 
I
P
 
P
N
 
N
L
 
I
I
 
V
G
 
G
F
 
I
K
|
K
D
 
D
G
 
A
L
 
T
G
 
G
D
 
D
I
 
V

Sites not aligning to the query:

3tceA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with 5-hydroxylysine at 2.6 a resolution
38% identity, 51% coverage: 19:173/303 of query aligns to 10:167/291 of 3tceA

query
sites
3tceA
L
 
V
T
 
T
D
 
P
F
 
M
T
 
L
A
 
K
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
V
E
 
D
P
 
W
G
 
K
G
 
S
Y
 
L
A
 
E
R
 
K
R
 
L
L
 
V
E
 
E
W
 
W
L
 
H
K
 
I
P
 
E
Y
 
Q
G
 
G
A
 
T
S
 
N
A
 
S
L
 
I
F
 
V
A
 
A
A
 
V
G
 
G
G
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
L
 
A
F
x
S
S
 
T
L
|
L
T
 
S
P
 
M
D
 
E
E
 
E
H
|
H
K
 
T
S
 
Q
I
 
V
V
 
I
S
 
K
L
 
E
A
 
I
V
 
I
E
 
R
V
 
V
C
 
A
G
 
N
K
 
K
E
 
R
V
 
I
P
 
P
I
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
-
 
A
Y
 
N
S
 
S
T
 
T
R
 
R
I
 
E
A
 
A
V
 
I
E
 
E
M
 
L
A
 
T
R
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
K
K
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
A
-
 
D
A
 
A
G
 
A
I
 
L
L
 
L
V
 
V
L
 
T
P
 
P
H
x
Y
Y
|
Y
L
 
-
T
 
N
E
 
K
A
 
P
D
 
T
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
V
 
L
A
 
Y
A
 
Q
H
 
H
V
 
Y
E
 
K
A
 
A
I
 
I
C
 
A
K
 
E
S
 
A
V
 
V
G
 
E
I
 
L
G
 
P
V
 
L
I
 
I
I
 
L
Y
|
Y
N
 
N
-
 
V
-
 
P
-
 
G
R
|
R
A
 
T
T
 
G
C
 
V
K
 
D
L
 
L
S
 
S
A
 
N
D
 
D
R
 
T
L
 
A
A
 
V
A
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
-
C
 
I
P
 
P
N
 
N
L
 
I
I
 
V
G
 
G
F
 
I
K
|
K
D
 
D
G
 
A
L
 
T
G
 
G
D
 
D
I
 
V

Sites not aligning to the query:

3rk8A Crystal structure of the chloride inhibited dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii complexed with pyruvate at 1.8 a resolution
38% identity, 51% coverage: 19:173/303 of query aligns to 10:167/291 of 3rk8A

query
sites
3rk8A
L
 
V
T
 
T
D
 
P
F
 
M
T
 
L
A
 
K
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
V
E
 
D
P
 
W
G
 
K
G
 
S
Y
 
L
A
 
E
R
 
K
R
 
L
L
 
V
E
 
E
W
 
W
L
 
H
K
 
I
P
 
E
Y
 
Q
G
 
G
A
 
T
S
 
N
A
 
S
L
 
I
F
 
V
A
 
A
A
 
V
G
 
G
G
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
L
 
A
F
 
S
S
 
T
L
 
L
T
 
S
P
 
M
D
 
E
E
 
E
H
 
H
K
 
T
S
 
Q
I
 
V
V
 
I
S
 
K
L
 
E
A
 
I
V
 
I
E
 
R
V
 
V
C
 
A
G
 
N
K
 
K
E
 
R
V
 
I
P
 
P
I
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
-
 
A
Y
 
N
S
 
S
T
 
T
R
 
R
I
 
E
A
 
A
V
 
I
E
 
E
M
 
L
A
 
T
R
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
K
K
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
A
-
 
D
A
 
A
G
 
A
I
 
L
L
 
L
V
 
V
L
 
T
P
 
P
H
 
Y
Y
|
Y
L
 
-
T
 
N
E
 
K
A
 
P
D
 
T
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
V
 
L
A
 
Y
A
 
Q
H
 
H
V
 
Y
E
 
K
A
 
A
I
 
I
C
 
A
K
 
E
S
 
A
V
 
V
G
 
E
I
 
L
G
 
P
V
 
L
I
 
I
I
 
L
Y
|
Y
N
 
N
-
 
V
-
 
P
-
 
G
R
|
R
A
 
T
T
 
G
C
 
V
K
 
D
L
 
L
S
 
S
A
 
N
D
 
D
R
 
T
L
 
A
A
 
V
A
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
-
C
 
I
P
 
P
N
 
N
L
 
I
I
 
V
G
 
G
F
 
I
K
|
K
D
 
D
G
 
A
L
 
T
G
 
G
D
 
D
I
 
V

Sites not aligning to the query:

3pueB Crystal structure of the complex of dhydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with lysine at 2.6a resolution
38% identity, 51% coverage: 19:173/303 of query aligns to 10:167/291 of 3pueB

query
sites
3pueB
L
 
V
T
 
T
D
 
P
F
 
M
T
 
L
A
 
K
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
V
E
 
D
P
 
W
G
 
K
G
 
S
Y
 
L
A
 
E
R
 
K
R
 
L
L
 
V
E
 
E
W
 
W
L
 
H
K
 
I
P
 
E
Y
 
Q
G
 
G
A
 
T
S
 
N
A
 
S
L
 
I
F
 
V
A
 
A
A
 
V
G
 
G
G
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
L
 
A
F
 
S
S
 
T
L
 
L
T
 
S
P
 
M
D
 
E
E
 
E
H
 
H
K
 
T
S
 
Q
I
 
V
V
 
I
S
 
K
L
 
E
A
 
I
V
 
I
E
 
R
V
 
V
C
 
A
G
 
N
K
 
K
E
 
R
V
 
I
P
 
P
I
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
-
 
A
Y
 
N
S
 
S
T
 
T
R
 
R
I
 
E
A
 
A
V
 
I
E
 
E
M
 
L
A
 
T
R
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
K
K
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
A
-
 
D
A
 
A
G
 
A
I
 
L
L
 
L
V
 
V
L
 
T
P
 
P
H
 
Y
Y
|
Y
L
 
-
T
 
N
E
 
K
A
 
P
D
 
T
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
V
 
L
A
 
Y
A
 
Q
H
 
H
V
 
Y
E
 
K
A
 
A
I
 
I
C
 
A
K
 
E
S
 
A
V
 
V
G
 
E
I
 
L
G
 
P
V
 
L
I
 
I
I
 
L
Y
|
Y
N
 
N
-
 
V
-
 
P
-
 
G
R
|
R
A
 
T
T
 
G
C
 
V
K
 
D
L
 
L
S
 
S
A
 
N
D
 
D
R
 
T
L
 
A
A
 
V
A
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
-
C
 
I
P
 
P
N
 
N
L
 
I
I
 
V
G
 
G
F
 
I
K
|
K
D
 
D
G
 
A
L
 
T
G
 
G
D
 
D
I
 
V

Sites not aligning to the query:

4m19A Dihydrodipicolinate synthase from c. Jejuni with pyruvate bound to the active site and lysine bound to allosteric site (see paper)
35% identity, 53% coverage: 13:174/303 of query aligns to 6:171/296 of 4m19A

query
sites
4m19A
G
 
G
L
 
A
L
 
M
S
 
T
F
 
A
P
 
L
L
 
I
T
 
T
D
 
P
F
 
F
T
 
-
A
 
K
D
 
N
G
 
G
G
 
K
F
 
V
E
 
D
P
 
E
G
 
Q
G
 
S
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
R
 
L
L
 
I
E
 
K
W
 
R
L
 
Q
K
 
I
P
 
E
Y
 
N
G
 
G
A
 
I
S
 
D
A
 
A
L
 
V
F
 
V
A
 
P
A
 
V
G
 
G
G
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
L
x
S
F
x
A
S
 
T
L
|
L
T
 
T
P
x
H
D
 
E
E
 
E
H
|
H
K
 
R
S
 
T
I
 
C
V
 
I
S
 
E
L
 
I
A
 
A
V
 
V
E
 
E
V
 
T
C
 
C
-
 
K
G
 
G
K
 
T
E
 
K
V
 
V
P
 
K
I
 
V
I
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
A
G
 
G
Y
 
S
S
x
N
-
 
A
T
 
T
R
 
H
I
x
E
A
 
A
V
 
V
E
 
G
M
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
F
A
 
A
E
 
K
K
 
E
A
 
H
G
 
G
A
 
A
A
 
D
G
 
G
I
 
I
L
 
L
V
 
S
L
 
V
P
 
A
H
 
P
Y
|
Y
L
x
Y
T
 
N
E
 
K
A
 
P
D
 
T
Q
 
Q
E
 
Q
G
 
G
V
 
L
A
 
Y
A
 
E
H
 
H
V
 
Y
E
 
K
A
 
A
I
 
I
C
 
A
K
 
Q
S
 
S
V
 
V
G
 
D
I
 
I
G
 
P
V
 
V
I
 
L
I
 
L
Y
|
Y
N
 
N
-
 
V
-
 
P
-
 
G
R
|
R
A
 
T
T
 
G
C
 
C
K
 
E
L
 
I
S
 
S
A
 
T
D
 
D
R
 
T
L
 
I
A
 
I
A
 
K
L
 
L
A
 
F
E
 
R
R
 
D
C
 
C
P
 
E
N
 
N
L
 
I
I
 
Y
G
 
G
F
 
V
K
|
K
D
 
E
G
 
A
L
 
S
G
 
G
D
 
N
I
 
I
E
 
D

Sites not aligning to the query:

6u01B Dihydrodipicolinate synthase (dhdps) from c.Jejuni, n84d mutant with pyruvate bound in the active site (see paper)
35% identity, 53% coverage: 13:174/303 of query aligns to 6:171/296 of 6u01B

query
sites
6u01B
G
 
G
L
 
A
L
 
M
S
 
T
F
 
A
P
 
L
L
 
I
T
 
T
D
 
P
F
 
F
T
 
-
A
 
K
D
 
N
G
 
G
G
 
K
F
 
V
E
 
D
P
 
E
G
 
Q
G
 
S
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
R
 
L
L
 
I
E
 
K
W
 
R
L
 
Q
K
 
I
P
 
E
Y
 
N
G
 
G
A
 
I
S
 
D
A
 
A
L
 
V
F
 
V
A
 
P
A
 
V
G
 
G
G
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
L
 
S
F
 
A
S
 
T
L
 
L
T
 
T
P
 
H
D
 
E
E
 
E
H
 
H
K
 
R
S
 
T
I
 
C
V
 
I
S
 
E
L
 
I
A
 
A
V
 
V
E
 
E
V
 
T
C
 
C
-
 
K
G
 
G
K
 
T
E
 
K
V
 
V
P
 
K
I
 
V
I
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
A
G
 
G
Y
 
S
-
 
D
S
 
A
T
 
T
R
 
H
I
 
E
A
 
A
V
 
V
E
 
G
M
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
F
A
 
A
E
 
K
K
 
E
A
 
H
G
 
G
A
 
A
A
 
D
G
 
G
I
 
I
L
 
L
V
 
S
L
 
V
P
 
A
H
 
P
Y
 
Y
L
x
Y
T
 
N
E
 
K
A
 
P
D
 
T
Q
 
Q
E
 
Q
G
 
G
V
 
L
A
 
Y
A
 
E
H
 
H
V
 
Y
E
 
K
A
 
A
I
 
I
C
 
A
K
 
Q
S
 
S
V
 
V
G
 
D
I
 
I
G
 
P
V
 
V
I
 
L
I
 
L
Y
|
Y
N
 
N
-
 
V
-
 
P
-
 
G
R
|
R
A
 
T
T
 
G
C
 
C
K
 
E
L
 
I
S
 
S
A
 
T
D
 
D
R
 
T
L
 
I
A
 
I
A
 
K
L
 
L
A
 
F
E
 
R
R
 
D
C
 
C
P
 
E
N
 
N
L
 
I
I
 
Y
G
 
G
F
 
V
K
|
K
D
 
E
G
 
A
L
 
S
G
 
G
D
 
N
I
 
I
E
 
D

Sites not aligning to the query:

7kkdB Dihydrodipicolinate synthase (dhdps) from c.Jejuni, n84a mutant with pyruvate bound in the active site and r,r-bislysine bound at the allosteric site
35% identity, 53% coverage: 13:174/303 of query aligns to 16:181/306 of 7kkdB

query
sites
7kkdB
G
 
G
L
 
A
L
 
M
S
 
T
F
 
A
P
 
L
L
 
I
T
 
T
D
 
P
F
 
F
T
 
-
A
 
K
D
 
N
G
 
G
G
 
K
F
 
V
E
 
D
P
 
E
G
 
Q
G
 
S
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
R
 
L
L
 
I
E
 
K
W
 
R
L
 
Q
K
 
I
P
 
E
Y
 
N
G
 
G
A
 
I
S
 
D
A
 
A
L
 
V
F
 
V
A
 
P
A
 
V
G
 
G
G
 
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
L
x
S
F
 
A
S
 
T
L
|
L
T
 
T
P
 
H
D
 
E
E
 
E
H
|
H
K
 
R
S
 
T
I
 
C
V
 
I
S
 
E
L
 
I
A
 
A
V
 
V
E
 
E
V
 
T
C
 
C
-
 
K
G
 
G
K
 
T
E
 
K
V
 
V
P
 
K
I
 
V
I
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
A
G
 
G
Y
 
S
S
 
A
-
 
A
T
 
T
R
 
H
I
x
E
A
 
A
V
 
V
E
 
G
M
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
F
A
 
A
E
 
K
K
 
E
A
 
H
G
 
G
A
 
A
A
 
D
G
 
G
I
 
I
L
 
L
V
 
S
L
 
V
P
 
A
H
 
P
Y
|
Y
L
 
Y
T
 
N
E
 
K
A
 
P
D
 
T
Q
 
Q
E
 
Q
G
 
G
V
 
L
A
 
Y
A
 
E
H
 
H
V
 
Y
E
 
K
A
 
A
I
 
I
C
 
A
K
 
Q
S
 
S
V
 
V
G
 
D
I
 
I
G
 
P
V
 
V
I
 
L
I
 
L
Y
 
Y
N
 
N
-
 
V
-
 
P
-
 
G
R
 
R
A
 
T
T
 
G
C
 
C
K
 
E
L
 
I
S
 
S
A
 
T
D
 
D
R
 
T
L
 
I
A
 
I
A
 
K
L
 
L
A
 
F
E
 
R
R
 
D
C
 
C
P
 
E
N
 
N
L
 
I
I
 
Y
G
 
G
F
 
V
K
 
K
D
 
E
G
 
A
L
 
S
G
 
G
D
 
N
I
 
I
E
 
D

7kg2A Dihydrodipicolinate synthase (dhdps) from c.Jejuni, h59k mutant with pyruvate bound in the active site and l-histidine bound at the allosteric site
35% identity, 53% coverage: 13:174/303 of query aligns to 6:171/296 of 7kg2A

query
sites
7kg2A
G
 
G
L
 
A
L
 
M
S
 
T
F
 
A
P
 
L
L
 
I
T
 
T
D
 
P
F
 
F
T
 
-
A
 
K
D
 
N
G
 
G
G
 
K
F
 
V
E
 
D
P
 
E
G
 
Q
G
 
S
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
R
 
L
L
 
I
E
 
K
W
 
R
L
 
Q
K
 
I
P
 
E
Y
 
N
G
 
G
A
 
I
S
 
D
A
 
A
L
 
V
F
 
V
A
 
P
A
 
V
G
 
G
G
 
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
L
x
S
F
x
A
S
 
T
L
|
L
T
 
T
P
 
H
D
 
E
E
 
E
H
x
K
K
 
R
S
 
T
I
 
C
V
 
I
S
 
E
L
 
I
A
 
A
V
 
V
E
 
E
V
 
T
C
 
C
-
 
K
G
 
G
K
 
T
E
 
K
V
 
V
P
 
K
I
 
V
I
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
A
G
 
G
Y
 
S
S
x
N
-
 
A
T
 
T
R
 
H
I
x
E
A
 
A
V
 
V
E
 
G
M
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
F
A
 
A
E
 
K
K
 
E
A
 
H
G
 
G
A
 
A
A
 
D
G
 
G
I
 
I
L
 
L
V
 
S
L
 
V
P
 
A
H
 
P
Y
|
Y
L
 
Y
T
 
N
E
 
K
A
 
P
D
 
T
Q
 
Q
E
 
Q
G
 
G
V
 
L
A
 
Y
A
 
E
H
 
H
V
 
Y
E
 
K
A
 
A
I
 
I
C
 
A
K
 
Q
S
 
S
V
 
V
G
 
D
I
 
I
G
 
P
V
 
V
I
 
L
I
 
L
Y
 
Y
N
 
N
-
 
V
-
 
P
-
 
G
R
 
R
A
 
T
T
 
G
C
 
C
K
 
E
L
 
I
S
 
S
A
 
T
D
 
D
R
 
T
L
 
I
A
 
I
A
 
K
L
 
L
A
 
F
E
 
R
R
 
D
C
 
C
P
 
E
N
 
N
L
 
I
I
 
Y
G
 
G
F
 
V
K
 
K
D
 
E
G
 
A
L
 
S
G
 
G
D
 
N
I
 
I
E
 
D

1xxxA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase (dapa, rv2753c) from mycobacterium tuberculosis (see paper)
27% identity, 92% coverage: 14:293/303 of query aligns to 11:285/296 of 1xxxA

query
sites
1xxxA
L
 
L
L
 
L
S
 
T
F
 
A
P
 
M
L
 
V
T
 
T
D
 
P
F
 
F
T
 
S
A
 
G
D
 
D
G
 
G
G
 
S
F
 
L
E
 
D
P
 
T
G
 
A
G
 
T
Y
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
L
L
 
A
E
 
N
W
 
H
L
 
L
K
 
V
P
 
D
Y
 
Q
G
 
G
A
 
C
S
 
D
A
 
G
L
 
L
F
 
V
A
 
V
A
 
S
G
 
G
G
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
L
 
S
F
 
P
S
 
T
L
 
T
T
 
T
P
 
D
D
 
G
E
 
E
H
 
K
K
 
I
S
 
E
I
 
L
V
 
L
S
 
R
L
 
A
A
 
V
V
 
L
E
 
E
V
 
A
C
 
V
G
 
G
K
 
D
E
 
R
V
 
A
P
 
R
I
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
A
G
 
G
-
 
T
Y
 
Y
S
 
D
T
 
T
R
 
A
I
 
H
A
 
S
V
 
I
E
 
R
M
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
A
A
 
C
E
 
A
K
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
H
G
 
G
I
 
L
L
 
L
V
 
V
L
 
V
P
 
T
H
 
P
Y
 
Y
L
x
Y
T
 
S
E
 
K
A
 
P
D
 
P
Q
 
Q
E
 
R
G
 
G
V
 
L
A
 
Q
A
 
A
H
 
H
V
 
F
E
 
T
A
 
A
I
 
V
C
 
A
K
 
D
S
 
A
V
 
T
G
 
E
I
 
L
G
 
P
V
 
M
I
 
L
I
 
L
Y
|
Y
N
 
D
-
 
I
-
 
P
-
 
G
R
|
R
A
 
S
T
 
A
C
 
V
K
 
P
L
 
I
S
 
E
A
 
P
D
 
D
R
 
T
L
 
I
A
 
R
A
 
A
L
 
L
A
|
A
E
 
S
R
x
H
C
 
-
P
 
P
N
 
N
L
x
I
I
 
V
G
 
G
F
 
V
K
|
K
D
 
D
G
 
A
L
 
K
G
 
A
D
 
D
I
 
L
E
 
H
L
 
S
M
 
G
T
 
A
T
 
Q
I
 
I
R
 
M
R
 
A
R
 
D
M
 
T
G
 
G
D
 
-
R
 
-
F
 
L
S
 
A
Y
 
Y
L
 
Y
G
 
S
G
 
G
L
 
-
P
 
-
T
 
-
A
 
D
E
 
D
V
 
A
Y
 
L
A
 
N
A
 
L
A
 
P
Y
 
W
R
 
L
A
 
A
I
 
M
G
 
G
V
 
A
P
 
T
V
 
G
Y
 
F
S
x
I
S
 
S
A
 
V
V
 
I
F
 
A
N
 
H
F
 
L
I
 
A
P
 
A
R
 
G
T
 
Q
A
 
L
M
 
R
E
 
E
F
 
L
Y
 
L
H
 
S
A
 
A
V
 
F
S
 
G
A
 
S
G
 
G
D
 
D
T
 
I
A
 
A
T
 
T
T
 
A
D
 
-
R
 
R
L
 
K
L
 
I
D
 
N
Q
 
I
F
 
A
F
 
V
L
 
A
P
 
P
Y
 
L
L
 
C
A
 
N
I
 
A
R
 
M
N
 
S
R
 
R
K
 
L
A
 
G
G
 
G
Y
 
-
A
 
-
V
 
V
S
 
T
I
 
L
V
 
S
K
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
L
A
 
R
I
 
L
V
 
Q
G
 
G
R
 
I
S
 
D
A
 
V
G
 
G
P
 
D
V
 
P
R
 
R
A
 
L
P
 
P
L
 
Q
T
 
V
D
 
A
C
 
A
A
 
T
P
 
P
A
 
E
E
 
Q
V
 
I
E
 
D
E
 
A
L
 
L

5j5dA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase from mycobacterium tuberculosis in complex with alpha-ketopimelic acid (see paper)
27% identity, 92% coverage: 14:293/303 of query aligns to 12:286/297 of 5j5dA

query
sites
5j5dA
L
 
L
L
 
L
S
 
T
F
x
A
P
 
M
L
 
V
T
 
T
D
 
P
F
 
F
T
 
S
A
 
G
D
 
D
G
 
G
G
 
S
F
 
L
E
 
D
P
 
T
G
 
A
G
 
T
Y
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
L
L
 
A
E
 
N
W
 
H
L
 
L
K
 
V
P
 
D
Y
 
Q
G
 
G
A
 
C
S
 
D
A
 
G
L
 
L
F
 
V
A
 
V
A
 
S
G
 
G
G
x
T
T
|
T
G
 
G
E
 
E
L
 
S
F
 
P
S
 
T
L
 
T
T
 
T
P
 
D
D
 
G
E
 
E
H
 
K
K
 
I
S
 
E
I
 
L
V
 
L
S
 
R
L
 
A
A
 
V
V
 
L
E
 
E
V
 
A
C
 
V
G
 
G
K
 
D
E
 
R
V
 
A
P
 
R
I
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
A
G
 
G
-
 
T
Y
 
Y
S
 
D
T
 
T
R
 
A
I
 
H
A
 
S
V
 
I
E
 
R
M
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
A
A
 
C
E
 
A
K
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
H
G
 
G
I
 
L
L
 
L
V
 
V
L
 
V
P
 
T
H
 
P
Y
 
Y
L
x
Y
T
 
S
E
 
K
A
 
P
D
 
P
Q
 
Q
E
 
R
G
 
G
V
 
L
A
 
Q
A
 
A
H
 
H
V
 
F
E
 
T
A
 
A
I
 
V
C
 
A
K
 
D
S
 
A
V
 
T
G
 
E
I
 
L
G
 
P
V
 
M
I
 
L
I
 
L
Y
|
Y
N
 
D
-
 
I
-
 
P
-
 
G
R
|
R
A
 
S
T
 
A
C
 
V
K
 
P
L
 
I
S
 
E
A
 
P
D
 
D
R
 
T
L
 
I
A
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
S
R
 
H
C
 
-
P
 
P
N
 
N
L
 
I
I
 
V
G
 
G
F
 
V
K
|
K
D
 
D
G
 
A
L
 
K
G
 
A
D
 
D
I
 
L
E
 
H
L
 
S
M
 
G
T
 
A
T
 
Q
I
 
I
R
 
M
R
 
A
R
 
D
M
 
T
G
 
G
D
 
-
R
 
-
F
 
L
S
 
A
Y
 
Y
L
 
Y
G
 
S
G
|
G
L
 
-
P
 
-
T
 
-
A
 
D
E
 
D
V
 
A
Y
 
L
A
 
N
A
 
L
A
 
P
Y
 
W
R
 
L
A
 
A
I
 
M
G
 
G
V
 
A
P
 
T
V
 
G
Y
 
F
S
x
I
S
 
S
A
 
V
V
 
I
F
 
A
N
 
H
F
 
L
I
 
A
P
 
A
R
 
G
T
 
Q
A
 
L
M
 
R
E
 
E
F
 
L
Y
 
L
H
 
S
A
 
A
V
 
F
S
 
G
A
 
S
G
 
G
D
 
D
T
 
I
A
 
A
T
 
T
T
 
A
D
 
-
R
 
R
L
 
K
L
 
I
D
 
N
Q
 
I
F
 
A
F
 
V
L
 
A
P
 
P
Y
 
L
L
 
C
A
 
N
I
 
A
R
 
M
N
 
S
R
 
R
K
 
L
A
 
G
G
 
G
Y
 
-
A
 
-
V
 
V
S
 
T
I
 
L
V
 
S
K
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
L
A
 
R
I
 
L
V
 
Q
G
 
G
R
 
I
S
 
D
A
 
V
G
 
G
P
 
D
V
 
P
R
 
R
A
 
L
P
 
P
L
 
Q
T
 
V
D
 
A
C
 
A
A
 
T
P
 
P
A
 
E
E
 
Q
V
 
I
E
 
D
E
 
A
L
 
L

P9WP25 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; EC 4.3.3.7 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
27% identity, 92% coverage: 14:293/303 of query aligns to 15:289/300 of P9WP25

query
sites
P9WP25
L
 
L
L
 
L
S
 
T
F
 
A
P
 
M
L
 
V
T
 
T
D
 
P
F
 
F
T
 
S
A
 
G
D
 
D
G
 
G
G
 
S
F
 
L
E
 
D
P
 
T
G
 
A
G
 
T
Y
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
L
L
 
A
E
 
N
W
 
H
L
 
L
K
 
V
P
 
D
Y
 
Q
G
 
G
A
 
C
S
 
D
A
 
G
L
 
L
F
 
V
A
 
V
A
 
S
G
 
G
G
 
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
L
 
S
F
 
P
S
 
T
L
 
T
T
 
T
P
 
D
D
 
G
E
 
E
H
 
K
K
 
I
S
 
E
I
 
L
V
 
L
S
 
R
L
 
A
A
 
V
V
 
L
E
 
E
V
 
A
C
 
V
G
 
G
K
 
D
E
 
R
V
 
A
P
 
R
I
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
A
G
 
G
-
 
T
Y
 
Y
S
 
D
T
 
T
R
 
A
I
 
H
A
 
S
V
 
I
E
 
R
M
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
A
A
 
C
E
 
A
K
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
H
G
 
G
I
 
L
L
 
L
V
 
V
L
 
V
P
 
T
H
 
P
Y
 
Y
L
 
Y
T
 
S
E
 
K
A
 
P
D
 
P
Q
 
Q
E
 
R
G
 
G
V
 
L
A
 
Q
A
 
A
H
 
H
V
 
F
E
 
T
A
 
A
I
 
V
C
 
A
K
 
D
S
 
A
V
 
T
G
 
E
I
 
L
G
 
P
V
 
M
I
 
L
I
 
L
Y
 
Y
N
 
D
-
 
I
-
 
P
-
 
G
R
 
R
A
 
S
T
 
A
C
 
V
K
 
P
L
 
I
S
 
E
A
 
P
D
 
D
R
 
T
L
 
I
A
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
S
R
 
H
C
 
-
P
 
P
N
 
N
L
 
I
I
 
V
G
 
G
F
 
V
K
|
K
D
 
D
G
 
A
L
 
K
G
 
A
D
 
D
I
 
L
E
 
H
L
 
S
M
 
G
T
 
A
T
 
Q
I
 
I
R
 
M
R
 
A
R
 
D
M
 
T
G
 
G
D
 
-
R
 
-
F
 
L
S
 
A
Y
 
Y
L
 
Y
G
 
S
G
 
G
L
 
-
P
 
-
T
 
-
A
 
D
E
 
D
V
 
A
Y
 
L
A
 
N
A
 
L
A
 
P
Y
 
W
R
 
L
A
|
A
I
 
M
G
 
G
V
 
A
P
 
T
V
 
G
Y
 
F
S
 
I
S
 
S
A
 
V
V
 
I
F
 
A
N
 
H
F
 
L
I
 
A
P
 
A
R
 
G
T
 
Q
A
 
L
M
 
R
E
 
E
F
 
L
Y
 
L
H
 
S
A
 
A
V
 
F
S
 
G
A
 
S
G
 
G
D
 
D
T
 
I
A
 
A
T
 
T
T
 
A
D
 
-
R
 
R
L
 
K
L
 
I
D
 
N
Q
 
I
F
 
A
F
 
V
L
 
A
P
 
P
Y
 
L
L
 
C
A
 
N
I
 
A
R
 
M
N
 
S
R
 
R
K
 
L
A
 
G
G
 
G
Y
 
-
A
 
-
V
 
V
S
 
T
I
 
L
V
 
S
K
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
L
A
 
R
I
 
L
V
 
Q
G
 
G
R
 
I
S
 
D
A
 
V
G
 
G
P
 
D
V
 
P
R
 
R
A
 
L
P
 
P
L
 
Q
T
 
V
D
 
A
C
 
A
A
 
T
P
 
P
A
 
E
E
 
Q
V
 
I
E
 
D
E
 
A
L
 
L

Query Sequence

>WP_012976790.1 NCBI__GCF_000010725.1:WP_012976790.1
MEPQALKAVVSEGLLSFPLTDFTADGGFEPGGYARRLEWLKPYGASALFAAGGTGELFSL
TPDEHKSIVSLAVEVCGKEVPIIAGVGYSTRIAVEMARAAEKAGAAGILVLPHYLTEADQ
EGVAAHVEAICKSVGIGVIIYNRATCKLSADRLAALAERCPNLIGFKDGLGDIELMTTIR
RRMGDRFSYLGGLPTAEVYAAAYRAIGVPVYSSAVFNFIPRTAMEFYHAVSAGDTATTDR
LLDQFFLPYLAIRNRKAGYAVSIVKAGAAIVGRSAGPVRAPLTDCAPAEVEELRVLIEAL
GPQ

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory