SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012977081.1 NCBI__GCF_000010725.1:WP_012977081.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q9KNV2 3-dehydroquinate synthase; DHQS; EC 4.2.3.4 from Vibrio cholerae serotype O1 (strain ATCC 39315 / El Tor Inaba N16961)
35% identity, 75% coverage: 94:390/397 of query aligns to 68:357/361 of Q9KNV2

query
sites
Q9KNV2
L
 
L
P
 
P
G
x
D
G
|
G
E
|
E
A
x
Q
V
x
Y
K
|
K
N
 
T
D
 
L
P
 
E
A
 
T
L
 
F
I
 
N
G
 
T
Q
 
V
M
 
M
H
 
-
D
 
S
A
 
F
I
 
L
L
 
L
G
 
E
H
 
H
G
 
N
I
 
Y
D
 
S
R
 
R
H
 
D
S
 
V
Y
 
V
V
 
V
L
 
I
A
 
A
V
 
L
G
 
G
G
 
G
G
|
G
A
x
V
F
x
I
L
x
G
D
|
D
A
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
F
A
 
A
A
 
A
S
 
A
T
 
C
A
 
Y
H
 
Q
R
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
D
L
 
F
V
 
I
R
 
Q
M
 
I
P
 
P
T
|
T
T
|
T
V
 
L
L
 
L
A
 
S
Q
 
Q
N
 
V
D
 
D
S
 
S
G
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
G
K
|
K
S
 
T
A
 
A
I
 
V
N
 
N
M
 
H
N
 
P
G
 
L
A
 
G
K
|
K
N
|
N
Q
 
M
I
 
I
G
 
G
T
 
A
F
 
F
A
 
Y
P
 
Q
P
 
P
W
 
K
A
 
A
V
 
V
V
 
V
N
 
I
D
 
D
A
 
T
A
 
D
F
x
C
L
|
L
D
x
T
S
x
T
L
 
L
P
 
P
Q
 
A
R
 
R
D
 
E
R
 
F
I
 
A
A
 
A
G
 
G
M
 
M
A
 
A
E
 
E
A
 
V
V
 
I
K
 
K
V
 
Y
A
 
G
L
 
I
I
 
I
R
 
Y
D
 
D
G
 
S
A
 
A
F
 
F
F
 
F
D
 
D
W
 
W
L
 
L
E
 
E
R
 
A
S
 
Q
A
 
M
D
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
Y
L
 
A
F
 
L
D
 
D
A
 
E
D
 
Q
A
 
A
V
 
L
A
 
T
H
 
Y
L
 
A
I
 
I
R
 
A
R
 
R
C
 
C
A
 
C
E
 
Q
L
 
I
H
 
K
M
 
A
R
 
E
Q
 
V
I
 
V
A
 
A
E
 
Q
G
 
-
G
 
-
D
 
D
P
 
E
F
 
K
E
 
E
Q
 
S
G
 
G
S
 
I
A
 
R
R
 
A
P
 
L
L
 
L
D
 
N
F
 
L
G
 
G
H
 
H
W
 
T
A
 
F
A
 
G
H
 
H
K
 
A
L
 
I
E
 
E
T
 
A
-
 
H
L
 
M
S
 
G
R
 
Y
N
 
G
H
 
N
L
 
W
R
 
L
H
 
H
G
 
G
E
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
S
I
 
A
G
 
G
I
 
T
A
 
V
L
 
M
D
 
A
T
 
A
R
 
K
Y
 
T
S
 
A
V
 
Q
L
 
L
A
 
Q
G
 
G
L
 
L
L
 
I
P
 
D
E
 
A
G
 
S
A
 
Q
D
 
F
L
 
E
R
 
R
V
 
I
A
 
L
V
 
A
L
 
I
L
 
L
E
 
K
-
 
K
-
 
A
H
 
H
L
 
L
G
 
P
F
 
V
R
 
R
L
 
-
W
 
-
H
 
-
P
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
R
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
R
 
T
P
 
P
Q
 
E
V
 
N
L
 
M
A
 
T
G
 
-
L
 
F
E
 
A
E
 
D
F
 
F
R
 
M
E
 
Q
H
 
H
-
 
M
-
 
M
-
 
R
-
 
D
-
 
K
-
 
K
-
 
V
L
 
L
G
 
A
G
 
G
R
 
E
L
 
L
T
 
R
I
 
L
T
 
V
L
 
L
L
 
P
A
 
T
G
 
S
I
 
I
G
 
G
R
 
T
G
 
S
I
 
A
E
 
V
V
 
V
N
 
K
T
 
G
M
 
V
D
 
P
A
 
E
A
 
A
L
 
V
V
 
I
E
 
A
S
 
Q
A
 
A
I
 
I
G
 
E
W
 
Y

Sites not aligning to the query:

6llaB Crystal structure of providencia alcalifaciens 3-dehydroquinate synthase (dhqs) in complex with mg2+ and NAD (see paper)
37% identity, 74% coverage: 94:388/397 of query aligns to 70:358/363 of 6llaB

query
sites
6llaB
L
 
L
P
 
P
G
x
D
G
 
G
E
|
E
A
 
Q
V
 
Y
K
|
K
N
 
S
D
 
-
P
 
L
A
 
F
L
 
I
I
 
M
G
 
N
Q
 
D
M
 
V
H
 
F
D
 
T
A
 
A
I
 
L
L
 
L
G
 
E
H
 
K
G
 
H
I
 
H
D
 
N
R
 
R
H
 
D
S
 
T
Y
 
T
V
 
L
L
 
I
A
 
A
V
 
L
G
 
G
G
|
G
G
|
G
A
x
V
F
 
I
L
 
G
D
|
D
A
 
L
V
 
T
G
 
G
L
 
F
A
 
A
A
 
A
S
 
A
T
 
S
A
 
Y
H
 
Q
R
|
R
G
 
G
V
 
V
R
 
R
L
 
F
V
 
I
R
 
Q
M
 
V
P
 
P
T
|
T
T
|
T
V
 
L
L
|
L
A
 
S
Q
 
Q
N
 
V
D
|
D
S
 
S
G
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
G
K
|
K
S
 
T
A
 
A
I
 
V
N
 
N
M
 
H
N
 
P
G
 
L
A
 
G
K
 
K
N
 
N
Q
 
M
I
 
I
G
 
G
T
 
A
F
 
F
A
 
Y
P
 
Q
P
 
P
W
 
A
A
 
S
V
 
V
V
 
V
N
 
I
D
 
D
A
 
L
A
 
D
F
 
C
L
 
L
D
 
K
S
x
T
L
|
L
P
 
P
Q
 
K
R
 
R
D
x
E
R
 
L
I
 
S
A
 
S
G
 
G
M
 
L
A
 
A
E
|
E
A
 
V
V
 
I
K
 
K
V
 
Y
A
 
G
L
 
I
I
 
I
R
 
L
D
 
D
G
 
G
A
 
E
F
 
F
F
 
F
D
 
S
W
 
W
L
 
L
E
 
E
R
 
E
S
 
N
A
 
I
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
M
L
 
A
F
 
L
D
 
D
A
 
N
D
 
Q
A
 
A
V
 
M
A
 
A
H
 
Y
L
 
C
I
 
I
R
 
R
R
 
R
C
 
C
A
 
C
E
 
E
L
 
L
H
x
K
M
 
A
R
 
Q
Q
 
V
I
 
V
A
 
A
E
 
-
G
 
-
G
 
A
D
 
D
P
 
E
F
 
K
E
|
E
Q
 
T
G
 
S
S
 
G
A
 
L
R
|
R
P
 
A
-
 
L
L
 
L
D
x
N
F
 
L
G
 
G
H
|
H
W
 
T
A
 
F
A
 
G
H
|
H
K
 
A
L
 
I
E
 
E
-
 
A
T
 
E
L
 
M
S
 
G
R
 
Y
N
 
G
H
 
V
L
 
W
R
 
L
H
|
H
G
 
G
E
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
A
I
 
A
G
 
G
I
 
M
A
 
V
L
 
M
D
 
A
T
 
A
R
 
K
Y
 
T
S
 
A
V
 
E
L
 
L
A
 
I
G
 
G
-
 
Q
L
 
F
L
 
T
P
 
P
E
 
E
G
 
Q
A
 
T
D
 
D
L
 
-
R
 
R
V
 
V
A
 
I
V
 
A
L
 
L
L
 
L
E
 
K
H
 
R
L
 
A
G
 
E
F
 
L
R
 
P
L
 
V
W
 
T
H
 
G
P
 
P
A
 
A
L
 
K
A
 
M
R
 
Q
R
 
P
D
 
D
G
 
-
E
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
Q
 
D
V
 
Y
L
 
L
A
 
P
G
 
H
L
 
M
E
 
M
E
 
R
F
 
D
R
 
K
E
 
K
H
 
V
L
 
M
G
 
G
G
 
G
R
 
K
L
 
L
T
 
H
I
 
L
T
 
I
L
 
L
L
 
P
A
 
T
G
 
T
I
 
I
G
 
G
R
 
H
G
 
S
I
 
E
E
 
M
V
 
R
N
 
S
T
 
D
M
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
S
L
 
T
V
 
V
E
 
T
S
 
A
A
 
A
I
 
I

Sites not aligning to the query:

3okfA 2.5 angstrom resolution crystal structure of 3-dehydroquinate synthase (arob) from vibrio cholerae
34% identity, 75% coverage: 94:390/397 of query aligns to 69:356/360 of 3okfA

query
sites
3okfA
L
 
L
P
 
P
G
x
D
G
 
G
E
|
E
A
 
Q
V
 
Y
K
|
K
N
 
T
D
 
L
P
 
E
A
 
T
L
 
F
I
 
N
G
 
T
Q
 
V
M
 
M
H
 
-
D
 
S
A
 
F
I
 
L
L
 
L
G
 
E
H
 
H
G
 
N
I
 
Y
D
 
S
R
 
R
H
 
D
S
 
V
Y
 
V
V
 
V
L
 
I
A
 
A
V
 
L
G
 
G
G
|
G
G
|
G
A
x
V
F
 
I
L
 
G
D
|
D
A
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
F
A
 
A
A
 
A
S
 
A
T
 
C
A
 
Y
H
 
Q
R
|
R
G
 
G
V
 
V
R
 
D
L
 
F
V
 
I
R
 
Q
M
 
I
P
 
P
T
|
T
T
|
T
V
 
L
L
|
L
A
 
S
Q
 
Q
N
 
V
D
|
D
S
 
S
G
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
G
K
|
K
S
 
T
A
 
A
I
 
V
N
 
N
M
 
H
N
 
P
G
 
L
A
 
G
K
 
K
N
 
N
Q
 
M
I
 
I
G
 
G
T
 
A
F
 
F
A
 
Y
P
 
Q
P
 
P
W
 
K
A
 
A
V
 
V
V
 
V
N
 
I
D
 
D
A
 
T
A
 
D
F
 
C
L
 
L
D
 
T
S
x
T
L
|
L
P
 
P
Q
 
A
R
 
R
D
x
E
R
 
F
I
 
A
A
 
A
G
 
G
M
 
M
A
 
A
E
|
E
A
 
V
V
 
I
K
 
K
V
 
Y
A
 
G
L
 
I
I
 
I
R
 
Y
D
 
D
G
 
S
A
 
A
F
 
F
F
 
F
D
 
D
W
 
W
L
 
L
E
 
E
R
 
A
S
 
Q
A
 
M
D
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
Y
L
 
A
F
 
L
D
 
D
A
 
E
D
 
Q
A
 
A
V
 
L
A
 
T
H
 
Y
L
 
A
I
 
I
R
 
A
R
 
R
C
 
C
A
 
C
E
 
Q
L
 
I
H
x
K
M
 
A
R
 
E
Q
 
V
I
 
V
A
 
A
E
 
Q
G
 
D
G
 
-
D
 
-
P
 
-
F
 
-
E
 
E
Q
 
K
G
 
G
S
 
I
A
x
R
R
 
A
P
 
L
L
 
L
D
x
N
F
 
L
G
 
G
H
|
H
W
 
T
A
 
F
A
 
G
H
|
H
K
 
A
L
 
I
E
 
E
T
 
A
-
 
H
L
 
M
S
 
G
R
 
Y
N
 
G
H
 
N
L
 
W
R
 
L
H
|
H
G
 
G
E
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
S
I
 
A
G
 
G
I
 
T
A
 
V
L
 
M
D
 
A
T
 
A
R
 
K
Y
 
T
S
 
A
V
 
Q
L
 
L
A
 
Q
G
 
G
L
 
L
L
 
I
P
 
D
E
 
A
G
 
S
A
 
Q
D
 
F
L
 
E
R
 
R
V
 
I
A
 
L
V
 
A
L
 
I
L
 
L
E
 
K
-
 
K
-
 
A
H
 
H
L
 
L
G
 
P
F
 
V
R
 
R
L
 
-
W
 
-
H
 
-
P
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
R
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
R
 
T
P
 
P
Q
 
E
V
 
N
L
 
M
A
 
T
G
 
-
L
 
F
E
 
A
E
 
D
F
 
F
R
 
M
E
 
Q
H
 
H
-
 
M
-
 
M
-
 
R
-
 
D
-
 
K
-
 
K
-
 
V
L
 
L
G
 
A
G
 
G
R
 
E
L
 
L
T
 
R
I
 
L
T
 
V
L
 
L
L
 
P
A
 
T
G
 
S
I
 
I
G
 
G
R
 
T
G
 
S
I
 
A
E
 
V
V
 
V
N
 
K
T
 
G
M
 
V
D
 
P
A
 
E
A
 
A
L
 
V
V
 
I
E
 
A
S
 
Q
A
 
A
I
 
I
G
 
E
W
 
Y

Sites not aligning to the query:

6lk2A Crystal structure of providencia alcalifaciens 3-dehydroquinate synthase (dhqs) in complex with mg2+, NAD and chlorogenic acid (see paper)
36% identity, 74% coverage: 94:388/397 of query aligns to 70:354/357 of 6lk2A

query
sites
6lk2A
L
 
L
P
 
P
G
x
D
G
 
G
E
|
E
A
 
Q
V
 
Y
K
|
K
N
 
S
D
 
-
P
 
L
A
 
F
L
 
I
I
 
M
G
 
N
Q
 
D
M
 
V
H
 
F
D
 
T
A
 
A
I
 
L
L
 
L
G
 
E
H
 
K
G
 
H
I
 
H
D
 
N
R
 
R
H
 
D
S
 
T
Y
 
T
V
 
L
L
 
I
A
 
A
V
 
L
G
 
G
G
|
G
G
|
G
A
x
V
F
 
I
L
 
G
D
|
D
A
 
L
V
 
T
G
 
G
L
 
F
A
 
A
A
 
A
S
 
A
T
 
S
A
 
Y
H
 
Q
R
|
R
G
 
G
V
 
V
R
 
R
L
 
F
V
 
I
R
 
Q
M
 
V
P
 
P
T
|
T
T
|
T
V
 
L
L
|
L
A
 
S
Q
 
Q
N
 
V
D
|
D
S
|
S
G
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
G
K
|
K
S
 
T
A
 
A
I
 
V
N
 
N
M
 
H
N
 
P
G
 
L
A
 
G
K
 
K
N
 
N
Q
 
M
I
 
I
G
 
G
T
 
A
F
 
F
A
 
Y
P
 
Q
P
 
P
W
 
A
A
 
S
V
 
V
V
 
V
N
 
I
D
 
D
A
 
L
A
 
D
F
x
C
L
 
L
D
 
K
S
x
T
L
|
L
P
|
P
Q
 
K
R
 
R
D
x
E
R
 
L
I
 
S
A
 
S
G
 
G
M
 
L
A
 
A
E
|
E
A
 
V
V
 
I
K
 
K
V
 
Y
A
 
G
L
 
I
I
 
I
R
 
L
D
 
D
G
 
G
A
 
E
F
 
F
F
 
F
D
 
S
W
 
W
L
 
L
E
 
E
R
 
E
S
 
N
A
 
I
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
M
L
 
A
F
 
L
D
 
D
A
 
N
D
 
Q
A
 
A
V
 
M
A
 
A
H
 
Y
L
 
C
I
 
I
R
 
R
R
 
R
C
 
C
A
 
C
E
 
E
L
 
L
H
x
K
M
 
A
R
 
Q
Q
 
V
I
 
V
A
 
A
E
 
A
G
 
-
G
 
-
D
 
-
P
 
-
F
 
-
E
 
D
Q
 
E
G
 
G
S
 
L
A
x
R
R
 
A
P
 
L
L
 
L
D
x
N
F
 
L
G
 
G
H
|
H
W
x
T
A
 
F
A
 
G
H
|
H
K
 
A
L
 
I
E
 
E
-
 
A
T
 
E
L
 
M
S
 
G
R
 
Y
N
 
G
H
 
V
L
 
W
R
 
L
H
|
H
G
 
G
E
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
A
I
 
A
G
 
G
I
 
M
A
 
V
L
 
M
D
 
A
T
 
A
R
 
K
Y
 
T
S
 
A
V
 
E
L
 
L
A
 
I
G
 
G
-
 
Q
L
 
F
L
 
T
P
 
P
E
 
E
G
 
Q
A
 
T
D
 
D
L
 
-
R
 
R
V
 
V
A
 
I
V
 
A
L
 
L
L
 
L
E
 
K
H
 
R
L
 
A
G
 
E
F
 
L
R
 
P
L
 
V
W
 
T
H
 
G
P
 
P
A
 
A
L
 
K
A
 
M
R
 
Q
R
 
P
D
 
D
G
 
-
E
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
Q
 
D
V
 
Y
L
 
L
A
 
P
G
 
H
L
 
M
E
 
M
E
 
R
F
 
D
R
 
K
E
 
K
H
 
V
L
 
M
G
 
G
G
 
G
R
 
K
L
 
L
T
 
H
I
 
L
T
 
I
L
 
L
L
 
P
A
 
T
G
 
T
I
 
I
G
 
G
R
 
H
G
 
S
I
 
E
E
 
M
V
 
R
N
 
S
T
 
D
M
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
S
L
 
T
V
 
V
E
 
T
S
 
A
A
 
A
I
 
I

Sites not aligning to the query:

U3KRF2 3-dehydroquinate synthase, chloroplastic; EC 4.2.3.4 from Actinidia chinensis var. chinensis (Chinese soft-hair kiwi) (see paper)
38% identity, 59% coverage: 94:326/397 of query aligns to 151:381/445 of U3KRF2

query
sites
U3KRF2
L
 
L
P
 
P
G
x
D
G
|
G
E
|
E
A
 
K
V
 
Y
K
|
K
N
 
N
D
 
M
P
 
D
A
 
T
L
 
L
I
 
M
G
 
-
Q
 
K
M
 
V
H
 
F
D
 
D
A
 
K
I
 
A
L
 
I
G
 
E
H
 
S
G
 
R
I
 
L
D
 
D
R
 
R
H
 
R
S
 
C
Y
 
T
V
 
F
L
 
V
A
 
A
V
 
L
G
 
G
G
|
G
G
|
G
A
x
V
F
x
I
L
x
G
D
|
D
A
 
M
V
 
C
G
 
G
L
 
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
T
 
S
A
 
F
H
 
L
R
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
N
L
 
F
V
 
I
R
 
Q
M
 
I
P
 
P
T
|
T
T
|
T
V
 
V
L
 
M
A
 
A
Q
 
Q
N
 
V
D
 
D
S
 
S
G
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
G
K
|
K
S
 
T
A
 
G
I
 
I
N
 
N
M
 
H
N
 
R
G
 
L
A
 
G
K
|
K
N
 
N
Q
 
L
I
 
I
G
 
G
T
 
A
F
 
F
A
 
Y
P
 
Q
P
 
P
W
 
Q
A
 
C
V
 
V
V
 
L
N
 
I
D
 
D
A
 
T
A
 
D
F
x
T
L
|
L
D
x
N
S
x
T
L
 
L
P
 
P
Q
 
D
R
 
R
D
 
E
R
 
L
I
 
A
A
 
S
G
 
G
M
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
V
V
 
V
K
 
K
V
 
Y
A
 
G
L
 
L
I
 
I
R
 
R
D
 
D
G
 
A
A
 
N
F
 
F
F
 
F
D
 
E
W
 
W
L
 
Q
E
 
E
R
 
K
S
 
N
A
 
M
D
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
M
L
 
A
F
 
R
D
 
D
A
 
P
D
 
S
A
 
A
V
 
L
A
 
A
H
 
Y
L
 
A
I
 
I
R
 
K
R
 
R
C
 
S
A
 
C
E
 
E
L
 
N
H
x
K
M
 
A
R
 
E
Q
 
V
I
 
V
A
 
S
E
 
L
G
 
-
G
 
-
D
 
D
P
 
E
F
 
K
E
 
E
Q
 
S
G
 
G
S
 
L
A
 
R
R
 
A
P
 
T
L
 
L
D
 
N
F
 
L
G
 
G
H
 
H
W
 
T
A
 
F
A
 
G
H
 
H
K
 
A
L
 
I
E
 
E
T
 
T
-
 
G
L
 
F
S
 
G
R
 
Y
N
 
G
H
 
Q
L
 
W
R
 
L
H
 
H
G
 
G
E
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
A
I
 
A
G
 
G
I
 
M
A
 
V
L
 
M
D
 
A
T
 
V
R
 
D
Y
 
M
S
 
S
V
 
Y
L
 
R
A
 
L
G
 
G
L
 
W
L
 
I
P
 
D
E
 
E
G
 
S
A
 
I
D
 
V
L
 
N
R
 
R
V
 
A
A
 
H
V
 
N
L
 
I
L
 
L
E
 
Q
H
 
Q

Sites not aligning to the query:

3zokA Structure of 3-dehydroquinate synthase from actinidia chinensis in complex with NAD (see paper)
37% identity, 61% coverage: 85:326/397 of query aligns to 62:301/365 of 3zokA

query
sites
3zokA
P
 
P
T
 
N
L
 
V
V
 
S
A
 
V
P
 
E
P
 
S
R
 
V
P
 
I
L
 
L
P
 
P
G
x
D
G
 
G
E
|
E
A
 
K
V
 
Y
K
|
K
N
 
N
D
 
M
P
 
D
A
 
T
L
 
L
I
 
M
G
 
-
Q
 
K
M
 
V
H
 
F
D
 
D
A
 
K
I
 
A
L
 
I
G
 
E
H
 
S
G
 
R
I
 
L
D
 
D
R
 
R
H
 
R
S
 
C
Y
 
T
V
 
F
L
 
V
A
 
A
V
 
L
G
 
G
G
|
G
G
|
G
A
x
V
F
 
I
L
 
G
D
|
D
A
 
M
V
 
C
G
 
G
L
 
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
T
 
S
A
 
F
H
 
L
R
|
R
G
 
G
V
 
V
R
 
N
L
 
F
V
 
I
R
 
Q
M
 
I
P
 
P
T
|
T
T
|
T
V
 
V
L
x
M
A
 
A
Q
 
Q
N
 
V
D
|
D
S
|
S
G
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
G
K
|
K
S
 
T
A
 
G
I
 
I
N
 
N
M
 
H
N
 
R
G
 
L
A
 
G
K
|
K
N
 
N
Q
 
L
I
 
I
G
 
G
T
 
A
F
 
F
A
 
Y
P
 
Q
P
 
P
W
 
Q
A
 
C
V
 
V
V
 
L
N
 
I
D
 
D
A
 
T
A
 
D
F
 
T
L
 
L
D
 
N
S
x
T
L
|
L
P
 
P
Q
 
D
R
 
R
D
x
E
R
 
L
I
 
A
A
 
S
G
 
G
M
 
L
A
 
A
E
|
E
A
 
V
V
 
V
K
 
K
V
 
Y
A
 
G
L
 
L
I
 
I
R
 
R
D
 
D
G
 
A
A
 
N
F
 
F
F
 
F
D
 
E
W
 
W
L
 
Q
E
 
E
R
 
K
S
 
N
A
 
M
D
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
M
L
 
A
F
 
R
D
 
D
A
 
P
D
 
S
A
 
A
V
 
L
A
 
A
H
 
Y
L
 
A
I
 
I
R
 
K
R
 
R
C
 
S
A
 
C
E
 
E
L
 
N
H
x
K
M
 
A
R
 
E
Q
 
V
I
 
V
A
 
S
E
 
L
G
 
-
G
 
-
D
 
D
P
 
E
F
 
K
E
|
E
Q
 
S
G
 
G
S
 
L
A
x
R
R
 
A
P
 
T
L
 
L
D
x
N
F
 
L
G
 
G
H
|
H
W
 
T
A
 
F
A
 
G
H
|
H
K
 
A
L
 
I
E
 
E
T
 
T
-
 
G
L
 
F
S
 
G
R
 
Y
N
 
G
H
 
Q
L
 
W
R
 
L
H
|
H
G
 
G
E
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
A
I
 
A
G
 
G
I
 
M
A
 
V
L
 
M
D
 
A
T
 
V
R
 
D
Y
 
M
S
 
S
V
 
Y
L
 
R
A
 
L
G
 
G
L
 
W
L
 
I
P
 
D
E
 
E
G
 
S
A
 
I
D
 
V
L
 
N
R
 
R
V
 
A
A
 
H
V
 
N
L
 
I
L
 
L
E
 
Q
H
 
Q

Sites not aligning to the query:

Q5NFS1 3-dehydroquinate synthase; DHQS; EC 4.2.3.4 from Francisella tularensis subsp. tularensis (strain SCHU S4 / Schu 4)
37% identity, 56% coverage: 94:314/397 of query aligns to 68:287/359 of Q5NFS1

query
sites
Q5NFS1
L
 
L
P
 
E
G
x
D
G
|
G
E
|
E
A
x
Q
V
x
Y
K
|
K
N
 
S
D
 
Q
P
 
Q
A
 
S
L
 
L
I
 
-
G
 
D
Q
 
K
M
 
I
H
 
L
D
 
S
A
 
T
I
 
L
L
 
L
G
 
E
H
 
N
G
 
H
I
 
F
D
 
T
R
 
R
H
 
N
S
 
S
Y
 
T
V
 
V
L
 
L
-
 
V
A
 
A
V
 
L
G
 
G
G
 
G
G
|
G
A
x
V
F
x
I
L
x
G
D
|
D
A
 
I
V
 
T
G
 
G
L
 
F
A
 
A
A
 
A
S
 
A
T
 
I
A
 
Y
H
 
Q
R
 
R
G
 
G
V
 
I
R
 
D
L
 
F
V
 
I
R
 
Q
M
 
I
P
 
P
T
|
T
T
|
T
V
 
L
L
 
L
A
 
S
Q
 
Q
N
 
V
D
 
D
S
 
S
G
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
G
K
|
K
S
 
T
A
 
A
I
 
I
N
 
N
M
 
H
N
 
Q
G
 
L
A
 
G
K
 
K
N
 
N
Q
 
M
I
 
I
G
 
G
T
 
A
F
 
F
A
 
Y
P
 
Q
P
 
P
W
 
K
A
 
V
V
 
V
V
 
Y
N
 
T
D
 
S
A
 
I
A
 
E
F
|
F
L
x
Y
D
x
K
S
x
T
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
R
 
R
D
 
E
R
 
Y
I
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
M
A
 
A
E
 
E
A
 
V
V
 
V
K
 
K
V
 
Y
A
 
A
L
 
F
I
 
I
R
 
S
D
 
K
G
 
D
A
 
-
F
 
F
F
 
Y
D
 
L
W
 
W
L
 
L
E
 
D
R
 
S
S
 
N
A
 
R
D
 
D
A
 
K
L
 
I
A
 
L
L
 
A
F
 
K
D
 
D
A
 
S
D
 
V
A
 
T
V
 
L
A
 
I
H
 
E
L
 
M
I
 
V
R
 
K
R
 
R
C
 
S
A
 
C
E
 
Q
L
 
I
H
 
K
M
 
A
R
 
Q
Q
 
V
I
 
V
A
 
A
E
 
-
G
 
-
G
 
M
D
 
D
P
 
E
F
 
K
E
 
E
Q
 
L
G
 
T
S
 
G
A
 
A
R
 
R
P
 
A
-
 
I
L
 
L
D
 
N
F
 
F
G
 
G
H
 
H
W
 
T
A
 
F
A
 
G
H
 
H
K
 
A
L
 
I
E
 
E
T
 
K
L
 
-
S
 
C
R
 
Q
N
 
N
H
 
Y
-
 
R
-
 
G
L
 
L
R
 
K
H
 
H
G
 
G
E
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
G
I
 
V
G
 
G
I
 
M
A
 
A
L
 
Q
D
 
A
T
 
I
R
 
D
Y
 
F
S
 
S
V
 
H
L
 
Y
A
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
I
P
 
S
E
 
Q

Sites not aligning to the query:

5hvnA 3.0 angstrom crystal structure of 3-dehydroquinate synthase (arob) from francisella tularensis in complex with NAD.
36% identity, 56% coverage: 94:314/397 of query aligns to 71:286/354 of 5hvnA

query
sites
5hvnA
L
 
L
P
 
E
G
x
D
G
 
G
E
|
E
A
 
Q
V
 
Y
K
|
K
N
 
S
D
 
Q
P
 
Q
A
 
S
L
 
L
I
 
-
G
 
D
Q
 
K
M
 
I
H
 
L
D
 
S
A
 
T
I
 
L
L
 
L
G
 
E
H
 
N
G
 
H
I
 
F
D
 
T
R
 
R
H
 
N
S
 
S
Y
 
T
V
 
V
L
 
L
-
 
V
A
 
A
V
 
L
G
 
G
G
|
G
G
|
G
A
x
V
F
 
I
L
 
G
D
|
D
A
 
I
V
 
T
G
 
G
L
 
F
A
 
A
A
 
A
S
 
A
T
 
I
A
 
Y
H
 
Q
R
|
R
G
 
G
V
 
I
R
 
D
L
 
F
V
 
I
R
 
Q
M
 
I
P
 
P
T
|
T
T
|
T
V
 
L
L
|
L
A
 
S
Q
 
Q
N
 
V
D
|
D
S
 
S
G
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
G
K
|
K
S
 
T
A
 
A
I
 
I
N
 
N
M
 
H
N
 
Q
G
 
L
A
 
G
K
 
K
N
 
N
Q
 
M
I
 
I
G
 
G
T
 
A
F
 
F
A
 
Y
P
 
Q
P
 
P
W
 
K
A
 
V
V
 
V
V
 
Y
N
 
T
D
 
S
A
 
I
A
 
E
F
|
F
L
 
Y
D
 
K
S
x
T
L
|
L
P
 
P
Q
 
Q
R
 
R
D
x
E
R
 
Y
I
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
M
A
 
A
E
|
E
A
 
V
V
 
V
K
 
K
V
 
Y
A
 
A
L
 
F
I
 
I
R
 
S
D
 
K
G
 
D
A
 
-
F
 
F
F
 
Y
D
 
L
W
 
W
L
 
L
E
 
D
R
 
S
S
 
N
A
 
R
D
 
D
A
 
K
L
 
I
A
 
L
L
 
A
F
 
K
D
 
D
A
 
S
D
 
V
A
 
T
V
 
L
A
 
I
H
 
E
L
 
M
I
 
V
R
 
K
R
 
R
C
 
S
A
 
C
E
 
Q
L
 
I
H
x
K
M
 
A
R
 
Q
Q
 
V
I
 
V
A
 
A
E
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
P
 
-
F
 
M
E
 
D
Q
 
T
G
 
G
S
 
A
A
x
R
R
 
A
P
 
I
L
 
L
D
x
N
F
 
F
G
 
G
H
|
H
W
 
T
A
 
F
A
 
G
H
|
H
K
 
A
L
 
I
E
 
E
T
 
K
L
 
-
S
 
C
R
 
Q
N
 
N
H
 
Y
-
 
R
-
 
G
L
 
L
R
 
K
H
|
H
G
 
G
E
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
G
I
 
V
G
 
G
I
 
M
A
 
A
L
 
Q
D
 
A
T
 
I
R
 
D
Y
 
F
S
 
S
V
 
H
L
 
Y
A
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
I
P
 
S
E
 
Q

Sites not aligning to the query:

5eksA Structure of 3-dehydroquinate synthase from acinetobacter baumannii in complex with NAD
33% identity, 74% coverage: 94:388/397 of query aligns to 69:349/355 of 5eksA

query
sites
5eksA
L
 
L
P
 
P
G
x
D
G
 
G
E
|
E
A
 
K
V
 
Y
K
|
K
N
 
-
D
 
D
P
 
I
A
 
Q
L
 
H
I
 
L
G
 
N
Q
 
L
M
 
I
H
 
F
D
 
D
A
 
A
I
 
L
L
 
L
G
 
E
H
 
A
G
 
G
I
 
F
D
 
N
R
 
R
H
 
D
S
 
C
Y
 
T
V
 
V
L
 
L
A
 
A
V
 
L
G
 
G
G
|
G
G
|
G
A
x
V
F
 
I
L
 
G
D
|
D
A
 
M
V
 
A
G
 
G
L
 
F
A
 
A
A
 
S
S
 
A
T
 
C
A
 
F
H
 
Q
R
|
R
G
 
G
V
 
V
R
 
Y
L
 
F
V
 
V
R
 
Q
M
 
V
P
 
P
T
|
T
T
|
T
V
 
L
L
 
L
A
 
S
Q
 
Q
N
 
V
D
|
D
S
|
S
G
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
G
K
|
K
S
 
T
A
 
G
I
 
I
N
 
N
M
 
H
N
 
P
G
 
L
A
 
G
K
 
K
N
 
N
Q
 
M
I
 
L
G
 
G
T
 
A
F
 
F
A
 
Q
P
 
Q
P
 
P
W
 
Q
A
 
V
V
 
V
V
 
L
N
 
A
D
 
D
A
 
M
A
 
A
F
 
Q
L
 
L
D
 
N
S
x
T
L
|
L
P
 
P
Q
 
E
R
 
R
D
x
E
R
 
L
I
 
S
A
 
A
G
 
G
M
 
L
A
 
A
E
|
E
A
 
V
V
 
I
K
 
K
V
 
Y
A
 
A
L
 
L
I
 
L
R
 
G
D
 
D
G
 
E
A
 
D
F
 
F
F
 
L
D
 
V
W
 
W
L
 
L
E
 
E
R
 
E
S
 
N
A
 
M
D
 
D
A
 
G
L
 
L
A
 
V
L
 
A
F
 
R
D
 
D
A
 
A
D
 
D
A
 
L
V
 
L
A
 
A
H
 
E
L
 
A
I
 
V
R
 
Y
R
 
R
C
 
S
A
 
C
E
 
A
L
 
H
H
x
K
M
 
A
R
 
R
Q
 
I
I
 
V
A
 
A
E
 
N
G
 
-
G
 
-
D
 
-
P
 
-
F
 
-
E
 
D
Q
 
E
G
 
K
S
 
E
A
x
R
R
 
A
P
 
L
L
 
L
D
x
N
F
 
L
G
 
G
H
|
H
W
 
T
A
 
F
A
 
G
H
|
H
K
 
A
L
 
I
E
 
E
T
 
S
-
 
Y
L
 
L
S
 
G
R
 
Y
N
 
G
H
 
T
L
 
W
R
 
L
H
|
H
G
 
G
E
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
A
I
 
T
G
 
G
I
 
M
A
 
V
L
 
M
D
 
A
T
 
A
R
 
D
Y
 
L
S
 
S
V
 
Q
L
 
R
A
 
L
G
 
G
L
 
W
L
 
I
P
 
S
E
 
N
G
 
E
A
 
D
D
 
V
L
 
A
R
 
R
V
 
T
A
 
K
V
 
K
L
 
I
L
 
I
E
 
Q
H
 
R
L
 
A
G
 
N
F
 
L
R
 
P
L
 
I
W
 
S
H
 
C
P
 
P
A
 
Q
L
 
I
A
 
P
R
 
L
R
 
D
D
 
D
G
 
F
E
 
L
G
 
G
R
 
-
P
 
-
Q
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
E
 
-
E
 
-
F
 
Y
R
 
M
E
 
A
H
 
H
L
 
D
G
 
K
G
 
K
-
 
V
R
 
Q
L
 
L
T
 
R
I
 
L
T
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
K
G
 
Q
I
 
L
G
 
G
R
 
Q
G
 
A
I
 
V
E
 
I
V
 
T
N
 
K
T
 
D
M
 
F
D
 
D
A
 
V
A
 
E
L
 
L
V
 
M
E
 
K
S
 
Q
A
 
A
I
 
I

Sites not aligning to the query:

P9WPX9 3-dehydroquinate synthase; DHQS; EC 4.2.3.4 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv)
34% identity, 70% coverage: 94:372/397 of query aligns to 71:340/362 of P9WPX9

query
sites
P9WPX9
L
 
I
P
 
P
G
x
D
G
x
A
E
|
E
A
|
A
V
x
G
K
|
K
N
 
D
D
 
L
P
 
P
A
 
-
L
 
V
I
 
V
G
 
G
Q
 
F
M
 
I
H
 
W
D
 
E
A
 
V
I
 
L
L
 
G
G
 
R
H
 
I
G
 
G
I
 
I
D
 
G
R
 
R
H
 
K
S
 
D
Y
 
A
V
 
L
L
 
V
A
 
S
V
 
L
G
 
G
G
 
G
G
|
G
A
|
A
F
x
A
L
x
T
D
|
D
A
 
V
V
 
A
G
 
G
L
 
F
A
 
A
A
 
A
S
 
A
T
 
T
A
 
W
H
 
L
R
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
S
L
 
I
V
 
V
R
 
H
M
 
L
P
 
P
T
|
T
T
|
T
V
 
L
L
 
L
A
 
G
Q
 
M
N
 
V
D
 
D
S
 
A
G
 
A
V
 
V
G
 
G
V
 
G
K
|
K
S
 
T
A
 
G
I
 
I
N
 
N
M
 
T
N
 
D
G
 
A
A
 
G
K
 
K
N
 
N
Q
 
L
I
 
V
G
 
G
T
 
A
F
 
F
A
 
H
P
 
Q
P
 
P
W
 
L
A
 
A
V
 
V
V
 
L
N
 
V
D
 
D
A
 
L
A
 
A
F
x
T
L
|
L
D
x
Q
S
x
T
L
 
L
P
 
P
Q
 
R
R
 
D
D
 
E
R
 
M
I
 
I
A
 
C
G
 
G
M
 
M
A
 
A
E
 
E
A
 
V
V
 
V
K
 
K
V
 
A
A
 
G
L
 
F
I
 
I
R
 
A
D
 
D
G
 
P
A
 
V
F
 
I
F
 
L
D
 
D
W
 
L
L
 
I
E
 
E
R
 
-
S
 
-
A
 
A
D
 
D
A
 
P
L
 
Q
A
 
A
L
 
A
F
 
L
D
 
D
-
 
P
-
 
A
A
 
G
D
 
D
A
 
V
V
 
L
A
 
P
H
 
E
L
 
L
I
 
I
R
 
R
R
 
R
C
 
A
A
 
I
E
 
T
L
 
V
H
 
K
M
 
A
R
 
E
Q
 
V
I
 
V
A
 
A
E
 
-
G
 
-
G
 
A
D
 
D
P
 
E
F
 
K
E
 
E
Q
 
S
G
 
E
S
 
L
A
 
R
R
 
E
P
 
I
L
 
L
D
 
N
F
 
Y
G
 
G
H
 
H
W
 
T
A
 
L
A
 
G
H
 
H
K
 
A
L
 
I
E
 
E
T
 
R
L
 
R
S
 
E
R
 
R
N
 
Y
H
 
R
L
 
W
R
 
R
H
 
H
G
 
G
E
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
S
I
 
V
G
 
G
I
 
L
A
 
V
L
 
F
D
 
A
T
 
A
R
 
E
Y
 
L
S
 
A
V
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
R
L
 
L
P
 
D
E
 
D
G
 
A
A
 
T
D
 
A
L
 
Q
R
 
R
V
 
H
A
 
R
V
 
T
L
 
I
L
 
L
E
 
S
H
 
S
L
 
L
G
 
G
F
 
L
R
 
P
L
 
V
W
 
S
H
 
Y
P
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
R
 
-
D
 
D
G
 
P
E
 
D
G
 
A
R
 
L
P
 
P
Q
 
Q
V
 
L
L
 
L
A
 
E
G
 
I
L
 
M
E
 
A
E
 
G
F
 
D
R
 
K
E
 
K
H
 
T
L
 
R
G
 
A
G
 
G
R
 
V
L
 
L
T
 
R
I
 
F
T
 
V
L
 
V
L
 
L
A
 
D
G
 
G
I
 
L
G
 
A
R
 
K

Sites not aligning to the query:

H2K887 2-epi-5-epi-valiolone synthase; EEVS; Sedoheptulose 7-phosphate cyclase; EC 4.2.3.152 from Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis (strain 5008) (see paper)
31% identity, 94% coverage: 24:395/397 of query aligns to 36:398/414 of H2K887

query
sites
H2K887
Y
 
Y
A
 
D
V
 
V
A
 
V
F
 
V
T
 
Q
R
 
P
N
 
R
A
 
L
F
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
A
N
 
N
S
 
P
T
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
D
A
 
A
M
 
L
G
 
-
T
 
S
A
 
S
G
 
G
A
 
T
V
 
T
P
 
P
R
 
-
P
 
A
R
 
R
C
 
R
L
 
L
A
 
I
F
 
V
V
 
I
D
|
D
M
 
A
G
 
T
V
 
V
L
 
-
A
 
-
G
 
-
R
 
R
P
 
S
T
 
L
L
 
Y
P
 
G
E
 
E
A
 
Q
I
 
L
A
 
A
A
 
A
H
 
Y
F
 
L
A
 
A
A
 
G
R
 
H
G
 
D
D
 
V
L
 
E
P
 
F
T
 
H
L
 
L
V
 
C
A
 
V
P
 
-
P
 
-
R
 
-
P
 
-
L
 
I
P
 
D
G
 
A
G
 
H
E
|
E
A
x
S
V
x
A
K
|
K
N
 
V
D
 
M
P
 
E
A
 
T
L
 
V
I
 
F
G
 
-
Q
 
E
M
 
V
H
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
M
L
 
D
G
 
A
H
 
F
G
 
G
I
 
V
-
 
P
D
 
R
R
 
R
H
 
H
S
 
A
Y
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
A
V
 
M
G
 
G
G
 
G
G
|
G
A
x
V
F
x
L
L
x
T
D
|
D
A
 
I
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
S
 
S
T
 
L
A
 
Y
H
 
R
R
 
R
G
 
A
V
 
T
R
 
P
L
 
Y
V
 
V
R
 
R
M
 
I
P
 
P
T
|
T
T
|
T
V
 
L
L
 
I
A
 
G
Q
 
M
N
 
I
D
 
D
S
 
A
G
 
G
V
 
I
G
 
G
V
 
A
K
|
K
S
 
T
A
 
G
I
 
V
N
 
N
M
 
F
N
 
R
G
 
E
A
 
H
K
|
K
N
 
N
Q
 
R
I
 
L
G
 
G
T
 
T
F
 
Y
A
 
H
P
 
P
P
 
S
W
 
S
A
 
L
V
 
T
V
 
L
N
 
I
D
 
D
A
 
P
A
 
G
F
|
F
L
|
L
D
x
A
S
x
T
L
 
L
P
 
D
Q
 
A
R
 
R
D
 
H
R
 
L
I
 
R
A
 
N
G
 
G
M
 
L
A
 
A
E
|
E
A
 
I
V
 
L
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
V
R
 
K
D
 
D
G
 
A
A
 
E
F
 
L
F
 
F
D
 
D
W
 
L
L
 
L
E
 
E
R
 
G
S
 
H
A
 
G
D
 
A
A
 
S
L
 
L
A
 
V
L
 
E
F
 
Q
D
 
R
A
 
M
D
 
Q
-
 
P
-
 
G
-
 
E
-
 
G
-
 
G
-
 
T
-
 
G
-
 
G
A
 
A
V
 
A
A
 
L
H
 
T
L
 
V
I
 
L
R
 
R
R
 
R
C
 
A
A
 
V
E
 
Q
L
 
G
H
 
M
M
 
L
R
 
E
Q
 
E
I
 
L
A
 
Q
E
 
P
G
 
-
G
 
-
D
 
N
P
 
L
F
 
W
E
 
E
Q
 
H
G
 
Q
S
 
L
A
 
R
R
 
R
P
 
L
L
 
V
D
 
D
F
 
F
G
 
G
H
|
H
W
 
S
A
 
F
A
 
S
H
 
P
K
 
S
L
 
V
E
 
E
T
 
M
L
 
A
S
 
A
R
 
L
N
 
P
H
 
E
L
 
L
R
 
L
H
|
H
G
 
G
E
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
C
I
 
I
G
 
D
I
 
M
A
 
A
L
 
L
D
 
S
T
 
S
R
 
V
Y
 
L
S
 
A
V
 
H
L
 
H
A
 
R
G
 
G
L
 
L
L
 
L
P
 
T
E
 
E
G
 
A
A
 
E
D
 
L
L
 
G
R
 
R
V
 
V
A
 
L
V
 
D
L
 
V
L
 
M
E
 
R
H
 
L
L
 
L
G
 
H
F
 
L
R
 
P
L
 
V
W
 
L
H
 
H
P
 
P
A
 
V
L
 
C
A
 
T
R
 
-
R
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
P
Q
 
D
V
 
L
L
 
M
-
 
R
A
 
A
G
 
A
L
 
L
E
 
A
E
 
D
F
 
T
R
 
V
E
 
K
H
 
H
L
 
R
G
 
D
G
 
G
R
 
W
L
 
Q
T
 
H
I
 
M
T
 
P
L
 
L
L
 
P
A
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
D
G
 
A
I
 
V
E
 
F
V
 
V
N
 
N
T
 
D
M
 
V
D
 
T
A
 
Q
A
 
R
L
 
E
V
 
I
E
 
E
S
 
A
A
 
A
I
 
L
G
 
L
W
 
T
L
 
L
S
 
A
A
 
E
R
 
R
E
 
D

3qbeA Crystal structure of the 3-dehydroquinate synthase (arob) from mycobacterium tuberculosis
33% identity, 70% coverage: 94:372/397 of query aligns to 66:331/352 of 3qbeA

query
sites
3qbeA
L
 
I
P
 
P
G
 
D
G
 
A
E
 
E
A
 
A
V
 
G
K
 
K
N
 
D
D
 
L
P
 
P
A
 
-
L
 
V
I
 
V
G
 
G
Q
 
F
M
 
I
H
 
W
D
 
E
A
 
V
I
 
L
L
 
G
G
 
R
H
 
I
G
 
G
I
 
I
D
 
G
R
 
R
H
 
K
S
 
D
Y
 
A
V
 
L
L
 
V
A
 
S
V
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
A
F
 
A
L
 
T
D
 
D
A
 
V
V
 
A
G
 
G
L
 
F
A
 
A
A
 
A
S
 
A
T
 
T
A
 
W
H
 
L
R
|
R
G
 
G
V
 
V
R
 
S
L
 
I
V
 
V
R
 
H
M
 
L
P
 
P
T
 
T
T
 
T
V
 
L
L
 
L
A
 
G
Q
 
M
N
 
V
D
 
D
S
 
A
G
 
A
V
 
V
G
 
G
V
 
G
K
|
K
S
 
T
A
 
G
I
 
I
N
 
N
M
 
T
N
 
D
G
 
A
A
 
G
K
 
K
N
 
N
Q
 
L
I
 
V
G
 
G
T
 
A
F
 
F
A
 
H
P
 
Q
P
 
P
W
 
L
A
 
A
V
 
V
V
 
L
N
 
V
D
 
D
A
 
L
A
 
A
F
 
T
L
 
L
D
 
Q
S
 
T
L
 
L
P
 
P
Q
 
R
R
 
D
D
 
E
R
 
M
I
 
I
A
 
C
G
 
G
M
 
M
A
 
A
E
|
E
A
 
V
V
 
V
K
 
K
V
 
A
A
 
G
L
 
F
I
 
I
R
 
A
D
 
D
G
 
P
A
 
V
F
 
I
F
 
L
D
 
D
W
 
L
L
 
I
E
 
E
R
 
-
S
 
-
A
 
A
D
 
D
A
 
P
L
 
Q
A
 
A
L
 
A
F
 
L
D
 
D
-
 
P
-
 
A
A
 
G
D
 
D
A
 
V
V
 
L
A
 
P
H
 
E
L
 
L
I
 
I
R
 
R
R
 
R
C
 
A
A
 
I
E
 
T
L
 
V
H
x
K
M
 
A
R
 
E
Q
 
V
I
 
V
A
 
A
E
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
P
 
-
F
 
-
E
 
A
Q
 
S
G
 
E
S
 
L
A
x
R
R
 
E
P
 
I
L
 
L
D
x
N
F
 
Y
G
 
G
H
|
H
W
 
T
A
 
L
A
 
G
H
|
H
K
 
A
L
 
I
E
 
E
T
 
R
L
 
R
S
 
E
R
 
R
N
 
Y
H
 
R
L
 
W
R
 
R
H
|
H
G
 
G
E
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
S
I
 
V
G
 
G
I
 
L
A
 
V
L
 
F
D
 
A
T
 
A
R
 
E
Y
 
L
S
 
A
V
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
R
L
 
L
P
 
D
E
 
D
G
 
A
A
 
T
D
 
A
L
 
Q
R
 
R
V
 
H
A
 
R
V
 
T
L
 
I
L
 
L
E
 
S
H
 
S
L
 
L
G
 
G
F
 
L
R
 
P
L
 
V
W
 
S
H
 
Y
P
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
R
 
-
D
 
D
G
 
P
E
 
D
G
 
A
R
 
L
P
 
P
Q
 
Q
V
 
L
L
 
L
A
 
E
G
 
I
L
 
M
E
 
A
E
 
G
F
 
D
R
 
K
E
 
K
H
 
T
L
 
R
G
 
A
G
 
G
R
 
V
L
 
L
T
 
R
I
 
F
T
 
V
L
 
V
L
 
L
A
 
D
G
 
G
I
 
L
G
 
A
R
 
K

3qbdA 3-dehydroquinate synthase (arob) from mycobacterium tuberculosis in complex with NAD
33% identity, 70% coverage: 94:372/397 of query aligns to 66:323/344 of 3qbdA

query
sites
3qbdA
L
 
I
P
 
P
G
x
D
G
x
A
E
|
E
A
 
A
V
 
G
K
|
K
N
 
D
D
 
L
P
 
P
A
 
-
L
 
V
I
 
V
G
 
G
Q
 
F
M
 
I
H
 
W
D
 
E
A
 
V
I
 
L
L
 
G
G
 
R
H
 
I
G
 
G
I
 
I
D
 
G
R
 
R
H
 
K
S
 
D
Y
 
A
V
 
L
L
 
V
A
 
S
V
 
L
G
 
G
G
|
G
G
|
G
A
|
A
F
 
A
L
 
T
D
|
D
A
 
V
V
 
A
G
 
G
L
 
F
A
 
A
A
 
A
S
 
A
T
 
T
A
 
W
H
 
L
R
|
R
G
 
G
V
 
V
R
 
S
L
 
I
V
 
V
R
 
H
M
 
L
P
 
P
T
|
T
T
|
T
V
 
L
L
|
L
A
 
G
Q
 
M
N
 
V
D
 
D
S
x
A
G
 
A
V
 
V
G
 
G
V
 
G
K
|
K
S
 
T
A
 
G
I
 
I
N
 
N
M
 
T
N
 
D
G
 
A
A
 
G
K
 
K
N
 
N
Q
 
L
I
 
V
G
 
G
T
 
A
F
 
F
A
 
H
P
 
Q
P
 
P
W
 
L
A
 
A
V
 
V
V
 
L
N
 
V
D
 
D
A
 
L
A
 
A
F
 
T
L
 
L
D
 
Q
S
x
T
L
|
L
P
 
P
Q
 
R
R
 
D
D
 
E
R
 
M
I
 
I
A
 
C
G
 
G
M
 
M
A
 
A
E
|
E
A
 
V
V
 
V
K
 
K
V
 
A
A
 
G
L
 
F
I
 
I
R
 
A
D
 
D
G
 
P
A
 
V
F
 
I
F
 
L
D
 
D
W
 
L
L
 
I
E
 
E
R
 
-
S
 
-
A
 
A
D
 
D
A
 
P
L
 
Q
A
 
A
L
 
A
F
 
L
D
 
D
-
 
P
-
 
A
A
 
G
D
 
D
A
 
V
V
 
L
A
 
P
H
 
E
L
 
L
I
 
I
R
 
R
R
 
R
C
 
A
A
 
I
E
 
T
L
 
V
H
x
K
M
 
A
R
 
E
Q
 
V
I
 
V
A
 
A
E
 
A
G
 
E
G
 
L
D
x
R
P
 
E
F
 
I
E
 
-
Q
 
-
G
 
-
S
 
-
A
 
-
R
 
-
P
 
-
L
 
L
D
x
N
F
 
Y
G
 
G
H
|
H
W
 
T
A
 
L
A
 
G
H
|
H
K
 
A
L
 
I
E
 
E
T
 
R
L
 
R
S
 
E
R
 
R
N
 
Y
H
 
R
L
 
W
R
 
R
H
|
H
G
 
G
E
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
S
I
 
V
G
 
G
I
 
L
A
 
V
L
 
F
D
 
A
T
 
A
R
 
E
Y
 
L
S
 
A
V
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
R
L
 
L
P
 
D
E
 
D
G
 
A
A
 
T
D
 
A
L
 
Q
R
 
R
V
 
H
A
 
R
V
 
T
L
 
I
L
 
L
E
 
S
H
 
S
L
 
L
G
 
G
F
 
L
R
 
P
L
 
V
W
 
S
H
 
Y
P
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
R
 
-
D
 
D
G
 
P
E
 
D
G
 
A
R
 
L
P
 
P
Q
 
Q
V
 
L
L
 
L
A
 
-
G
 
-
L
 
-
E
 
-
E
 
-
F
 
-
R
 
-
E
 
E
H
 
I
L
 
M
G
 
A
G
 
G
R
 
V
L
 
L
T
 
R
I
 
F
T
 
V
L
 
V
L
 
L
A
 
D
G
 
G
I
 
L
G
 
A
R
 
K

Sites not aligning to the query:

4p53A Vala (2-epi-5-epi-valiolone synthase) from streptomyces hygroscopicus subsp. Jinggangensis 5008 with NAD+ and zn2+ bound (see paper)
33% identity, 69% coverage: 121:395/397 of query aligns to 92:360/360 of 4p53A

query
sites
4p53A
R
 
R
H
 
H
S
 
A
Y
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
A
V
 
M
G
 
G
G
|
G
G
|
G
A
x
V
F
 
L
L
 
T
D
|
D
A
 
I
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
S
 
S
T
 
L
A
 
Y
H
 
R
R
|
R
G
 
A
V
 
T
R
 
P
L
 
Y
V
 
V
R
 
R
M
 
I
P
 
P
T
|
T
T
|
T
V
 
L
L
x
I
A
 
G
Q
 
M
N
 
I
D
|
D
S
x
A
G
 
G
V
 
I
G
 
G
V
 
A
K
|
K
S
 
T
A
 
G
I
 
V
N
 
N
M
 
F
N
 
R
G
 
E
A
 
H
K
|
K
N
 
N
Q
 
R
I
 
L
G
 
G
T
 
T
F
 
Y
A
 
H
P
 
P
P
 
S
W
 
S
A
 
L
V
 
T
V
 
L
N
 
I
D
 
D
A
 
P
A
 
G
F
 
F
L
 
L
D
 
A
S
x
T
L
|
L
P
 
D
Q
 
A
R
 
R
D
x
H
R
 
L
I
 
R
A
 
N
G
 
G
M
 
L
A
 
A
E
|
E
A
 
I
V
 
L
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
V
R
 
K
D
 
D
G
 
A
A
 
E
F
 
L
F
 
F
D
 
D
W
 
L
L
 
L
E
 
E
R
 
G
S
 
H
A
 
G
D
 
A
A
 
S
L
 
L
A
 
V
-
 
E
-
 
Q
L
 
R
F
 
M
D
 
Q
A
 
P
D
 
G
A
 
A
V
 
A
A
 
L
H
 
T
L
 
V
I
 
L
R
 
R
R
 
R
C
 
A
A
 
V
E
 
Q
L
 
G
H
x
M
M
 
L
R
 
E
Q
 
E
I
 
L
A
 
Q
E
 
P
G
 
-
G
 
-
D
 
N
P
 
L
F
 
W
E
|
E
Q
 
H
G
 
Q
S
 
L
A
x
R
R
 
R
P
 
L
L
 
V
D
|
D
F
 
F
G
 
G
H
|
H
W
 
S
A
 
F
A
 
S
H
x
P
K
 
S
L
 
V
E
 
E
T
 
M
L
 
A
S
 
A
R
 
L
N
 
P
H
 
E
L
 
L
R
 
L
H
|
H
G
 
G
E
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
C
I
 
I
G
 
D
I
 
M
A
 
A
L
 
L
D
 
S
T
 
S
R
 
V
Y
 
L
S
 
A
V
 
H
L
 
H
A
 
R
G
 
G
L
 
L
L
 
L
P
 
T
E
 
E
G
 
A
A
 
E
D
 
L
L
 
G
R
 
R
V
 
V
A
 
L
V
 
D
L
 
V
L
 
M
E
 
R
H
 
L
L
 
L
G
 
H
F
 
L
R
 
P
L
 
V
W
 
L
H
 
H
P
 
P
A
 
V
L
 
C
A
 
T
R
 
-
R
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
P
Q
 
D
V
 
L
L
 
M
-
 
R
A
 
A
G
 
A
L
 
L
E
 
A
E
 
D
F
 
T
R
 
V
E
 
K
H
 
H
L
 
R
G
 
D
G
 
G
R
 
W
L
 
Q
T
 
H
I
 
M
T
 
P
L
 
L
L
 
P
A
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
D
G
 
A
I
 
V
E
 
F
V
 
V
N
 
N
T
 
D
M
 
V
D
 
T
A
 
Q
A
 
R
L
 
E
V
 
I
E
 
E
S
 
A
A
 
A
I
 
L
G
 
L
W
 
T
L
 
L
S
 
A
A
 
E
R
 
R
E
 
D

Sites not aligning to the query:

6hqvA Pentafunctional arom complex from chaetomium thermophilum (see paper)
32% identity, 71% coverage: 94:375/397 of query aligns to 72:369/1555 of 6hqvA

query
sites
6hqvA
L
 
I
P
 
P
G
 
P
G
 
G
E
|
E
A
 
Y
V
 
S
K
|
K
N
 
S
D
 
R
P
 
E
A
 
T
L
 
K
I
 
-
G
 
A
Q
 
E
M
 
I
H
 
E
D
 
D
A
 
W
I
 
M
L
 
L
G
 
S
H
 
H
G
 
A
I
 
C
D
 
T
R
 
R
H
 
D
S
 
T
Y
 
V
V
 
I
L
 
I
A
 
A
V
 
L
G
 
G
G
|
G
G
|
G
A
x
V
F
 
I
L
 
G
D
|
D
A
 
M
V
 
I
G
 
G
L
 
Y
A
 
V
A
 
A
S
 
A
T
 
T
A
 
F
H
 
M
R
|
R
G
 
G
V
 
V
R
 
R
L
 
F
V
 
V
R
 
Q
M
 
V
P
 
P
T
|
T
T
|
T
V
 
L
L
|
L
A
 
A
Q
 
M
N
 
V
D
|
D
S
|
S
G
 
S
V
 
I
G
 
G
V
 
G
K
|
K
S
 
T
A
 
A
I
 
I
N
 
D
M
 
T
N
 
P
G
 
M
A
 
G
K
|
K
N
 
N
Q
 
L
I
 
I
G
 
G
T
 
A
F
 
F
A
 
W
P
 
Q
P
 
P
W
 
R
A
 
R
V
 
I
V
 
Y
N
 
I
D
 
D
A
 
L
A
 
A
F
 
F
L
 
L
D
 
E
S
x
T
L
|
L
P
|
P
Q
 
V
R
 
R
D
x
E
R
 
F
I
 
I
A
 
N
G
 
G
M
 
M
A
 
A
E
|
E
A
 
V
V
 
I
K
 
K
V
 
T
A
 
A
L
 
A
I
 
I
R
 
W
D
 
N
G
 
E
A
 
T
F
 
E
F
 
F
D
 
T
W
 
A
L
 
L
E
 
E
R
 
E
S
 
N
A
 
A
D
 
A
A
 
A
-
 
I
L
 
L
A
 
E
L
 
A
F
 
V
D
 
R
A
 
S
D
 
K
A
 
A
-
 
S
-
 
S
-
 
P
-
 
A
-
 
A
-
 
R
-
 
L
-
 
A
-
 
P
V
 
I
A
 
R
H
 
H
L
 
I
I
 
L
R
 
K
R
 
R
C
 
I
A
 
V
E
 
L
L
 
G
H
 
S
M
 
A
R
 
R
Q
 
V
I
x
K
A
 
A
E
 
E
-
 
V
-
 
V
G
 
S
G
 
A
D
 
D
P
 
E
F
 
R
E
|
E
Q
 
G
G
 
G
S
 
L
A
x
R
R
 
N
P
 
L
L
 
L
D
x
N
F
 
F
G
 
G
H
|
H
W
 
S
A
 
I
A
 
G
H
|
H
K
 
A
L
 
Y
E
 
E
T
 
A
L
 
I
S
 
L
R
 
A
N
 
P
H
 
Q
L
 
V
R
 
L
H
|
H
G
 
G
E
 
E
A
 
C
V
 
V
A
 
A
I
 
I
G
 
G
I
 
M
A
 
V
L
 
K
D
 
E
T
 
A
R
 
E
Y
 
L
S
 
A
V
 
R
L
 
Y
A
 
L
G
 
G
L
 
V
L
 
L
P
 
R
E
 
P
G
 
S
A
 
A
D
 
V
L
 
A
R
 
R
V
 
L
A
 
T
V
 
K
L
 
L
L
 
I
E
 
A
H
 
S
-
 
Y
-
 
D
L
 
L
G
 
P
F
 
T
R
 
S
L
 
V
W
 
H
H
 
D
P
 
K
A
 
R
L
 
I
A
 
A
R
 
K
R
 
L
D
 
S
G
 
A
E
 
G
G
 
K
R
 
E
P
 
C
Q
 
P
V
 
V
L
 
D
A
 
V
G
 
L
L
 
L
E
 
Q
E
 
K
F
 
M
-
 
A
-
 
V
-
 
D
R
 
K
E
 
K
H
 
N
L
 
E
G
 
G
G
 
R
R
 
K
L
 
K
T
 
K
I
 
I
T
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
S
G
 
A
I
 
I
G
 
G
R
 
K
G
 
T
I
 
Y
E
 
E

Sites not aligning to the query:

6c5cA Crystal structure of the 3-dehydroquinate synthase (dhqs) domain of aro1 from candida albicans sc5314 in complex with nadh (see paper)
36% identity, 62% coverage: 83:329/397 of query aligns to 60:319/385 of 6c5cA

query
sites
6c5cA
D
 
D
L
 
F
P
 
K
T
 
T
L
 
N
V
 
L
A
 
S
P
 
E
P
 
K
R
 
R
P
 
P
-
 
E
-
 
S
-
 
R
-
 
L
-
 
L
-
 
T
-
 
Y
-
 
C
L
 
V
P
 
S
G
 
P
G
 
G
E
|
E
A
 
N
V
 
N
K
|
K
N
 
N
D
 
R
P
 
-
A
 
A
L
 
T
I
 
K
G
 
A
Q
 
A
M
 
V
H
 
E
D
 
D
A
 
F
I
 
L
L
 
L
G
 
Q
H
 
Q
G
 
G
I
 
C
D
 
T
R
 
R
H
 
D
S
 
T
Y
 
V
V
 
I
L
 
L
A
 
A
V
 
V
G
 
G
G
|
G
G
|
G
A
x
V
F
 
I
L
 
G
D
|
D
A
 
M
V
 
I
G
 
G
L
 
F
A
 
V
A
 
A
S
 
A
T
 
T
A
 
F
H
 
M
R
|
R
G
 
G
V
 
V
R
 
R
L
 
V
V
 
V
R
 
Q
M
 
V
P
 
P
T
|
T
T
|
T
V
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
M
N
 
V
D
|
D
S
|
S
G
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
G
K
|
K
S
 
T
A
 
A
I
 
I
N
 
D
M
 
T
N
 
P
G
 
L
A
 
G
K
 
K
N
 
N
Q
 
F
I
 
I
G
 
G
T
 
A
F
 
F
A
 
H
P
 
Q
P
 
P
W
 
E
A
 
Y
V
 
V
V
 
F
N
 
C
D
 
D
A
 
V
A
 
S
F
|
F
L
 
L
D
 
E
S
x
T
L
|
L
P
 
P
Q
 
A
R
 
R
D
x
Q
R
 
F
I
 
I
A
 
N
G
 
G
M
 
M
A
 
A
E
|
E
A
 
V
V
 
V
K
 
K
V
 
T
A
 
A
L
 
A
I
 
I
R
 
W
D
 
N
G
 
E
A
 
E
F
 
E
F
 
F
D
 
T
W
 
R
L
 
L
E
 
E
R
 
N
-
 
F
S
 
S
A
 
K
D
 
K
A
 
F
L
 
L
A
 
S
L
 
V
F
 
V
-
 
T
-
 
S
-
 
K
-
 
K
-
 
P
D
 
D
A
 
L
D
 
Q
A
 
S
V
 
I
-
 
K
A
 
A
H
 
E
L
 
L
I
 
V
R
 
K
R
 
T
C
 
V
A
 
L
E
 
E
L
 
-
H
 
S
M
 
V
R
 
R
Q
 
V
I
x
K
A
 
A
E
 
G
G
 
V
G
 
V
D
 
S
P
 
S
F
 
D
E
|
E
Q
 
A
G
 
G
S
 
L
A
x
R
R
 
N
P
 
L
L
 
L
D
x
N
F
 
F
G
 
G
H
|
H
W
 
T
A
 
I
A
 
G
H
|
H
K
 
A
L
 
I
E
 
E
T
 
A
L
 
V
S
 
L
R
 
T
N
 
P
H
 
E
L
 
A
R
 
L
H
|
H
G
 
G
E
 
E
A
 
C
V
 
V
A
 
S
I
 
I
G
 
G
I
 
M
A
 
I
L
 
K
D
 
E
T
 
A
R
 
E
Y
 
L
S
 
S
V
 
R
L
 
Y
A
 
L
G
 
G
L
 
I
L
 
L
P
 
P
E
 
P
G
 
V
A
 
A
D
 
V
L
 
A
R
 
R
V
 
L
A
 
S
V
 
K
L
 
C
L
 
L
E
 
V
H
 
A
L
 
Y
G
 
G
F
 
L

Sites not aligning to the query:

P56081 3-dehydroquinate synthase; DHQS; EC 4.2.3.4 from Helicobacter pylori (strain ATCC 700392 / 26695) (Campylobacter pylori) (see paper)
32% identity, 61% coverage: 94:336/397 of query aligns to 59:293/343 of P56081

query
sites
P56081
L
 
I
P
 
E
G
x
S
G
|
G
E
|
E
A
x
K
V
x
Y
K
|
K
N
 
N
D
 
F
P
 
H
A
 
S
L
 
L
I
 
E
G
 
R
Q
 
I
M
 
L
H
 
N
D
 
N
A
 
A
I
 
-
L
 
F
G
 
E
H
 
M
G
 
Q
I
 
L
D
 
N
R
 
R
H
 
H
S
 
S
Y
 
L
V
 
M
L
 
I
A
 
A
V
 
L
G
 
G
G
 
G
G
|
G
A
x
V
F
 
I
L
 
S
D
 
D
A
 
M
V
 
V
G
 
G
L
 
F
A
 
A
A
 
S
S
 
S
T
 
I
A
 
Y
H
 
F
R
 
R
G
 
G
V
 
I
R
 
D
L
 
F
V
 
I
R
 
N
M
 
I
P
 
P
T
|
T
T
|
T
V
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
N
 
V
D
 
D
S
 
A
G
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
G
K
 
K
S
 
T
A
 
G
I
 
I
N
 
N
M
 
T
N
 
P
G
 
Y
A
 
G
K
 
K
N
|
N
Q
 
L
I
 
I
G
 
G
T
 
S
F
 
F
A
 
H
P
 
Q
P
 
P
W
 
K
A
 
A
V
 
V
V
 
Y
N
 
M
D
 
D
A
 
L
A
 
A
F
|
F
L
|
L
D
x
K
S
x
T
L
 
L
P
 
E
Q
 
K
R
 
R
D
 
E
R
 
F
I
 
Q
A
 
A
G
 
G
M
 
V
A
 
A
E
 
E
A
 
I
V
 
I
K
 
K
V
 
M
A
 
A
L
 
V
I
 
C
R
 
F
D
 
D
G
 
K
A
 
N
F
 
L
F
 
V
D
 
E
W
 
R
L
 
L
E
 
E
R
 
-
S
 
T
A
 
K
D
 
D
A
 
L
L
 
-
A
 
-
L
 
-
F
 
-
D
 
-
A
 
K
D
 
D
A
 
C
V
 
L
A
 
E
H
 
E
L
 
V
I
 
I
R
 
F
R
 
Q
C
 
S
A
 
V
E
 
N
L
 
I
H
 
K
M
 
A
R
 
Q
Q
 
V
I
 
V
A
 
V
E
 
Q
G
 
-
G
 
-
D
 
D
P
 
E
F
 
K
E
 
E
Q
 
Q
G
 
N
S
 
I
A
 
R
R
 
A
P
 
G
L
 
L
D
 
N
F
 
Y
G
 
G
H
 
H
W
 
T
A
 
F
A
 
G
H
 
H
K
 
A
L
 
I
E
 
E
T
 
K
L
 
E
S
 
T
-
 
D
R
 
Y
N
 
E
H
 
R
L
 
F
R
 
L
H
 
H
G
 
G
E
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
A
I
 
I
G
 
G
I
 
M
A
 
R
L
 
M
D
 
A
T
 
N
R
 
D
Y
 
L
S
 
A
V
 
L
L
 
S
A
 
L
G
 
G
L
 
M
L
 
L
P
 
T
E
 
L
G
 
K
A
 
E
D
 
Y
L
 
E
R
 
R
V
 
I
A
 
E
V
 
N
L
 
L
L
 
L
E
 
K
H
 
K
L
 
F
G
 
D
F
 
L
R
 
I
L
 
F
W
 
H
H
 
Y
P
 
K
A
 
I
L
 
L

Q9S5E2 2-deoxy-scyllo-inosose synthase; DOI synthase; DOIS; EC 4.2.3.124 from Niallia circulans (Bacillus circulans) (see paper)
29% identity, 64% coverage: 60:314/397 of query aligns to 35:285/368 of Q9S5E2

query
sites
Q9S5E2
D
 
D
M
 
Q
G
 
Y
V
 
I
L
 
M
A
 
I
G
 
S
R
x
D
P
 
S
T
 
G
L
 
V
P
 
P
E
 
D
A
 
S
I
 
I
A
 
V
A
 
-
H
 
H
F
 
Y
A
 
A
A
 
A
R
 
E
-
 
Y
-
 
F
G
 
G
D
 
K
L
 
L
P
 
-
T
 
-
L
 
-
V
 
-
A
 
A
P
 
P
P
 
V
R
 
H
P
 
I
L
 
L
-
 
R
-
 
F
P
 
Q
G
 
G
G
 
G
E
|
E
A
x
E
V
x
Y
K
|
K
N
 
T
D
 
-
P
 
L
A
 
S
L
 
T
I
 
V
G
 
T
Q
 
N
M
 
L
H
 
Q
D
 
E
A
 
R
I
 
A
L
 
I
G
 
A
H
 
L
G
 
G
I
 
A
D
 
N
R
 
R
H
 
R
S
 
T
Y
 
A
V
 
I
L
 
V
A
 
A
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
|
G
A
x
L
F
x
T
L
x
G
D
x
N
A
 
V
V
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
A
A
 
A
S
 
G
T
 
M
A
 
M
H
 
F
R
 
R
G
 
G
V
 
I
R
 
A
L
 
L
V
 
I
R
 
H
M
 
V
P
 
P
T
|
T
T
|
T
V
 
F
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
N
 
S
D
 
D
S
 
S
G
 
V
V
 
L
G
x
S
V
x
I
K
|
K
S
 
Q
A
 
A
I
 
V
N
 
N
M
 
L
N
 
T
G
 
S
A
 
G
K
|
K
N
|
N
Q
 
L
I
 
V
G
 
G
T
 
F
F
 
Y
A
 
Y
P
 
P
P
 
P
W
 
R
A
 
F
V
 
V
V
 
F
N
 
A
D
 
D
A
 
T
A
 
R
F
 
I
L
 
L
D
 
S
S
 
E
L
 
S
P
 
P
Q
 
P
R
 
R
D
x
Q
R
 
V
I
 
K
A
 
A
G
 
G
M
 
M
A
 
C
E
|
E
A
 
L
V
 
V
K
 
K
V
 
N
A
 
M
L
 
L
I
 
I
R
 
L
D
 
E
G
 
N
A
 
D
F
 
N
F
 
K
D
 
E
W
 
F
L
 
T
E
 
E
R
 
D
S
 
D
A
 
L
D
 
N
A
 
S
L
 
A
A
 
N
L
 
V
F
 
Y
D
 
S
A
 
P
D
 
K
A
 
Q
V
 
L
A
 
E
H
 
T
L
 
F
I
 
I
R
 
N
R
 
F
C
 
C
A
 
I
E
 
S
L
 
A
H
 
K
M
 
M
R
 
S
Q
 
V
I
 
L
A
 
S
E
 
E
G
 
-
G
 
-
D
 
D
P
 
I
F
 
Y
E
 
E
Q
 
K
G
 
K
S
 
K
A
 
G
R
 
L
P
 
I
L
 
F
D
 
E
F
 
Y
G
 
G
H
|
H
W
 
T
A
 
I
A
 
G
H
 
H
K
 
A
L
 
I
E
 
E
T
 
L
L
 
A
S
 
E
R
 
Q
N
 
G
H
 
G
L
 
I
R
 
T
H
|
H
G
 
G
E
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
A
I
 
V
G
 
G
I
 
M
A
 
I
L
 
Y
D
 
A
T
 
A
R
 
K
Y
 
I
S
 
A
V
 
N
L
 
R
A
 
M
G
 
N
L
 
L
L
 
M
P
 
P
E
 
E

2gruA Crystal structure of 2-deoxy-scyllo-inosose synthase complexed with carbaglucose-6-phosphate, NAD+ and co2+ (see paper)
29% identity, 64% coverage: 60:314/397 of query aligns to 34:284/367 of 2gruA

query
sites
2gruA
D
 
D
M
 
Q
G
 
Y
V
 
I
L
 
M
A
 
I
G
 
S
R
x
D
P
 
S
T
x
G
L
x
V
P
|
P
E
 
D
A
 
S
I
 
I
A
 
V
A
 
-
H
 
H
F
 
Y
A
 
A
A
 
A
R
 
E
-
 
Y
-
 
F
G
 
G
D
 
K
L
 
L
P
 
-
T
 
-
L
 
-
V
 
-
A
 
A
P
 
P
P
 
V
R
 
H
P
 
I
L
 
L
-
 
R
-
 
F
P
 
Q
G
 
G
G
 
G
E
|
E
A
 
E
V
 
Y
K
|
K
N
 
T
D
 
-
P
 
L
A
 
S
L
 
T
I
 
V
G
 
T
Q
 
N
M
 
L
H
 
Q
D
 
E
A
 
R
I
 
A
L
 
I
G
 
A
H
 
L
G
 
G
I
 
A
D
 
N
R
 
R
H
 
R
S
 
T
Y
 
A
V
 
I
L
 
V
A
 
A
V
 
V
G
 
G
G
|
G
G
|
G
A
x
L
F
 
T
L
 
G
D
x
N
A
 
V
V
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
A
A
 
A
S
 
G
T
 
M
A
 
M
H
 
F
R
|
R
G
 
G
V
 
I
R
 
A
L
 
L
V
 
I
R
 
H
M
 
V
P
 
P
T
|
T
T
|
T
V
 
F
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
N
 
S
D
|
D
S
|
S
G
 
V
V
 
L
G
x
S
V
 
I
K
|
K
S
 
Q
A
 
A
I
 
V
N
 
N
M
 
L
N
 
T
G
 
S
A
 
G
K
 
K
N
|
N
Q
 
L
I
 
V
G
 
G
T
 
F
F
 
Y
A
 
Y
P
 
P
P
 
P
W
 
R
A
 
F
V
 
V
V
 
F
N
 
A
D
 
D
A
 
T
A
 
R
F
 
I
L
 
L
D
 
S
S
 
E
L
 
S
P
|
P
Q
 
P
R
 
R
D
x
Q
R
 
V
I
 
K
A
 
A
G
 
G
M
 
M
A
 
C
E
|
E
A
 
L
V
 
V
K
|
K
V
 
N
A
 
M
L
 
L
I
 
I
R
 
L
D
 
E
G
 
N
A
 
D
F
 
N
F
 
K
D
 
E
W
 
F
L
 
T
E
 
E
R
 
D
S
 
D
A
 
L
D
 
N
A
 
S
L
 
A
A
 
N
L
 
V
F
 
Y
D
 
S
A
 
P
D
 
K
A
 
Q
V
 
L
A
 
E
H
 
T
L
 
F
I
 
I
R
 
N
R
 
F
C
 
C
A
 
I
E
 
S
L
 
A
H
x
K
M
 
M
R
 
S
Q
 
V
I
 
L
A
 
S
E
 
E
G
 
-
G
 
-
D
 
D
P
 
I
F
 
Y
E
|
E
Q
 
K
G
 
K
S
 
K
A
x
G
R
 
L
P
 
I
L
x
F
D
x
E
F
x
Y
G
|
G
H
|
H
W
x
T
A
 
I
A
 
G
H
|
H
K
 
A
L
 
I
E
 
E
T
 
L
L
 
A
S
 
E
R
 
Q
N
 
G
H
 
G
L
 
I
R
 
T
H
|
H
G
 
G
E
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
A
I
 
V
G
 
G
I
 
M
A
 
I
L
 
Y
D
 
A
T
 
A
R
 
K
Y
 
I
S
 
A
V
 
N
L
 
R
A
 
M
G
 
N
L
 
L
L
 
M
P
 
P
E
 
E

Sites not aligning to the query:

2gruB Crystal structure of 2-deoxy-scyllo-inosose synthase complexed with carbaglucose-6-phosphate, NAD+ and co2+ (see paper)
29% identity, 64% coverage: 60:314/397 of query aligns to 34:284/360 of 2gruB

query
sites
2gruB
D
 
D
M
 
Q
G
 
Y
V
 
I
L
 
M
A
 
I
G
 
S
R
x
D
P
 
S
T
x
G
L
 
V
P
|
P
E
 
D
A
 
S
I
 
I
A
 
V
A
 
-
H
 
H
F
 
Y
A
 
A
A
 
A
R
 
E
-
 
Y
-
 
F
G
 
G
D
 
K
L
 
L
P
 
-
T
 
-
L
 
-
V
 
-
A
 
A
P
 
P
P
 
V
R
 
H
P
 
I
L
 
L
-
 
R
-
 
F
P
 
Q
G
 
G
G
 
G
E
|
E
A
 
E
V
 
Y
K
|
K
N
 
T
D
 
-
P
 
L
A
 
S
L
 
T
I
 
V
G
 
T
Q
 
N
M
 
L
H
 
Q
D
 
E
A
 
R
I
 
A
L
 
I
G
 
A
H
 
L
G
 
G
I
 
A
D
 
N
R
 
R
H
 
R
S
 
T
Y
 
A
V
 
I
L
 
V
A
 
A
V
 
V
G
 
G
G
|
G
G
|
G
A
x
L
F
 
T
L
 
G
D
x
N
A
 
V
V
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
A
A
 
A
S
 
G
T
 
M
A
 
M
H
 
F
R
|
R
G
 
G
V
 
I
R
 
A
L
 
L
V
 
I
R
 
H
M
 
V
P
 
P
T
|
T
T
|
T
V
 
F
L
|
L
A
 
A
Q
 
A
N
 
S
D
|
D
S
|
S
G
 
V
V
 
L
G
 
S
V
 
I
K
|
K
S
 
Q
A
 
A
I
 
V
N
 
N
M
 
L
N
 
T
G
 
S
A
 
G
K
|
K
N
|
N
Q
 
L
I
 
V
G
 
G
T
 
F
F
 
Y
A
 
Y
P
 
P
P
 
P
W
 
R
A
 
F
V
 
V
V
 
F
N
 
A
D
 
D
A
 
T
A
 
R
F
 
I
L
 
L
D
 
S
S
 
E
L
 
S
P
 
P
Q
 
P
R
 
R
D
x
Q
R
 
V
I
 
K
A
 
A
G
 
G
M
 
M
A
 
C
E
|
E
A
 
L
V
 
V
K
|
K
V
 
N
A
 
M
L
 
L
I
 
I
R
 
L
D
 
E
G
 
N
A
 
D
F
 
N
F
 
K
D
 
E
W
 
F
L
 
T
E
 
E
R
 
D
S
 
D
A
 
L
D
 
N
A
 
S
L
 
A
A
 
N
L
 
V
F
 
Y
D
 
S
A
 
P
D
 
K
A
 
Q
V
 
L
A
 
E
H
 
T
L
 
F
I
 
I
R
 
N
R
 
F
C
 
C
A
 
I
E
 
S
L
 
A
H
x
K
M
 
M
R
 
S
Q
 
V
I
 
L
A
 
S
E
 
E
G
 
-
G
 
-
D
 
D
P
 
I
F
 
Y
E
|
E
Q
 
K
G
 
K
S
 
K
A
x
G
R
 
L
P
 
I
L
x
F
D
x
E
F
x
Y
G
|
G
H
|
H
W
x
T
A
 
I
A
 
G
H
|
H
K
 
A
L
 
I
E
 
E
T
 
L
L
 
A
S
 
E
R
 
Q
N
 
G
H
 
G
L
 
I
R
 
T
H
|
H
G
 
G
E
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
A
I
 
V
G
 
G
I
 
M
A
 
I
L
 
Y
D
 
A
T
 
A
R
 
K
Y
 
I
S
 
A
V
 
N
L
 
R
A
 
M
G
 
N
L
 
L
L
 
M
P
 
P
E
 
E

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_012977081.1 NCBI__GCF_000010725.1:WP_012977081.1
MTPTLHADVRPPILRRRFAVTFEYAVAFTRNAFDPANSTLAEAMGTAGAVPRPRCLAFVD
MGVLAGRPTLPEAIAAHFAARGDLPTLVAPPRPLPGGEAVKNDPALIGQMHDAILGHGID
RHSYVLAVGGGAFLDAVGLAASTAHRGVRLVRMPTTVLAQNDSGVGVKSAINMNGAKNQI
GTFAPPWAVVNDAAFLDSLPQRDRIAGMAEAVKVALIRDGAFFDWLERSADALALFDADA
VAHLIRRCAELHMRQIAEGGDPFEQGSARPLDFGHWAAHKLETLSRNHLRHGEAVAIGIA
LDTRYSVLAGLLPEGADLRVAVLLEHLGFRLWHPALARRDGEGRPQVLAGLEEFREHLGG
RLTITLLAGIGRGIEVNTMDAALVESAIGWLSAREAA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory