SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012977261.1 NCBI__GCF_000010725.1:WP_012977261.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 15 hits to proteins with known functional sites (download)

4kztA Structure mmnags bound with l-arginine (see paper)
43% identity, 96% coverage: 11:441/448 of query aligns to 1:429/431 of 4kztA

query
sites
4kztA
R
 
R
Q
 
Q
T
 
T
I
 
I
V
 
V
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
S
 
S
I
 
H
L
 
M
A
 
R
S
 
D
T
 
G
K
 
K
E
 
E
I
 
I
N
 
R
Q
 
E
Y
|
Y
L
 
L
K
 
H
R
 
R
F
 
F
S
 
S
Q
 
G
L
 
I
D
 
D
A
 
Q
K
 
E
R
 
R
F
 
F
A
 
A
V
 
V
V
 
I
N
x
K
I
 
V
N
 
G
D
x
G
A
 
A
I
 
V
L
 
I
R
 
Q
D
 
D
G
 
-
V
 
-
E
 
D
A
 
L
E
 
P
A
 
G
V
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
A
L
 
L
S
 
A
F
 
F
L
 
L
Q
 
Q
A
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
V
V
 
V
L
 
V
L
 
H
G
 
G
T
 
G
A
x
G
P
 
P
G
 
Q
S
 
L
R
 
D
E
 
A
E
 
A
P
 
L
P
 
E
A
 
A
S
 
A
G
 
D
V
 
I
D
 
P
E
 
T
E
 
E
S
 
R
G
 
V
D
 
D
G
 
G
P
 
L
D
 
R
R
 
V
E
 
T
A
 
R
P
 
D
A
 
E
G
 
A
P
 
M
A
 
P
F
 
I
P
 
I
Y
 
R
E
 
D
T
 
T
F
 
L
Q
 
T
A
 
Q
L
 
A
N
 
N
R
 
L
S
 
A
L
 
L
V
 
V
E
 
D
R
 
A
L
 
I
R
 
R
R
 
D
K
 
A
G
 
G
V
 
G
R
 
R
A
 
A
T
 
A
S
 
A
I
 
V
T
 
P
G
 
R
G
 
G
V
 
V
F
 
F
E
 
E
A
 
A
G
 
D
H
 
I
L
 
V
G
 
D
R
 
A
E
 
D
V
 
K
R
 
L
G
 
G
S
 
R
L
 
V
G
 
G
T
 
E
V
 
P
R
 
R
A
 
H
V
 
I
R
 
H
L
 
L
A
 
D
P
 
L
V
 
V
E
 
G
A
 
S
S
 
A
L
 
A
H
 
R
A
 
A
G
 
G
S
 
Q
I
 
A
P
 
A
V
 
I
I
 
L
S
 
A
S
 
C
L
 
L
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
P
G
 
D
G
 
G
Q
 
T
S
 
L
L
 
V
G
 
N
I
 
I
E
 
N
C
 
A
D
|
D
R
 
V
A
 
A
T
 
V
N
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
V
R
 
H
L
 
A
L
 
L
Q
 
Q
P
 
P
F
 
Y
K
|
K
I
 
V
I
 
V
F
 
F
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
T
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
E
N
 
D
G
 
G
R
 
D
V
 
I
I
 
L
D
x
S
A
 
S
I
 
I
N
 
N
L
 
L
S
 
A
T
 
T
E
 
D
Y
 
F
D
 
G
H
 
D
F
 
L
D
 
M
R
 
Q
D
 
A
S
 
D
C
 
W
L
 
V
R
 
N
S
 
G
A
 
G
I
 
M
T
 
R
F
 
L
T
x
K
V
 
L
E
 
E
Q
 
E
M
 
I
K
 
K
D
 
R
L
 
L
L
 
L
D
 
D
R
 
D
L
 
L
P
 
P
P
 
L
E
 
S
S
 
S
S
 
S
I
 
V
S
 
S
I
 
I
T
 
T
N
 
R
P
 
P
A
 
S
N
 
E
L
 
L
A
 
A
N
 
R
E
|
E
L
|
L
F
 
F
T
|
T
H
 
H
K
 
A
G
 
G
S
 
S
G
|
G
T
|
T
L
|
L
V
 
I
R
 
R
R
 
R
G
 
G
E
 
E
R
 
R
V
 
M
S
 
V
R
 
A
A
 
T
T
 
D
C
 
D
W
 
K
D
 
S
E
 
S
L
 
L
D
 
D
L
 
L
T
 
G
R
 
R
L
 
L
R
 
D
M
 
N
L
 
L
I
 
V
E
 
K
S
 
A
S
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
R
R
 
P
L
 
A
V
 
V
E
 
E
D
 
G
Y
 
Y
F
 
W
Q
 
D
R
 
R
T
 
L
R
 
R
L
 
V
L
 
D
R
 
R
A
 
A
Y
 
F
V
 
V
S
 
T
E
 
E
N
 
S
Y
 
Y
R
 
R
A
 
A
A
 
A
V
 
A
I
 
I
L
 
T
T
 
T
E
 
R
E
 
L
D
 
D
G
 
G
V
 
W
P
 
V
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
K
 
K
F
 
F
A
 
A
V
 
V
L
 
L
D
 
D
E
 
D
A
 
A
Q
 
R
G
 
G
E
 
E
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
R
A
 
T
V
 
V
W
 
W
K
 
N
V
 
R
M
 
M
R
 
V
K
 
D
E
 
Y
T
 
A
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
F
 
I
W
 
W
R
 
R
S
 
S
R
 
R
H
 
T
K
 
N
N
 
N
Q
 
P
I
 
V
N
 
N
I
 
G
F
 
F
Y
 
Y
Y
 
F
A
 
E
Q
 
E
S
 
C
D
 
D
G
 
G
C
 
A
F
 
V
K
 
R
Q
 
R
E
 
D
K
 
E
W
 
W
K
 
T
V
 
V
F
 
F
W
 
W
C
 
R
G
 
G
L
 
E
D
 
M
D
 
G
F
 
P
S
 
V
Q
 
E
I
 
V
E
 
A
K
 
D
C
 
V
V
 
V
A
 
E
H
 
K
C
 
A
A
 
F
V
 
A
R
 
L
R
 
P
P
 
P
T
 
T
L
 
L

3s6hA Crystal structure of native mmnags/k (see paper)
43% identity, 96% coverage: 10:441/448 of query aligns to 4:433/436 of 3s6hA

query
sites
3s6hA
T
 
V
R
 
R
Q
 
Q
T
 
T
I
 
I
V
 
V
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
S
 
S
I
 
H
L
 
M
A
 
R
S
 
D
T
 
G
K
 
K
E
 
E
I
 
I
N
 
R
Q
 
E
Y
 
Y
L
 
L
K
 
H
R
 
R
F
 
F
S
 
S
Q
 
G
L
 
I
D
 
D
A
 
Q
K
 
E
R
 
R
F
 
F
A
 
A
V
 
V
V
 
I
N
x
K
I
 
V
N
 
G
D
x
G
A
 
A
I
 
V
L
 
I
R
 
Q
D
 
D
G
 
-
V
 
-
E
 
D
A
 
L
E
 
P
A
 
G
V
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
A
L
 
L
S
 
A
F
 
F
L
 
L
Q
 
Q
A
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
V
V
 
V
L
 
V
L
 
H
G
 
G
T
 
G
A
x
G
P
 
P
G
 
Q
S
 
L
R
 
D
E
 
A
E
 
A
P
 
L
P
 
E
A
 
A
S
 
A
G
 
D
V
 
I
D
 
P
E
 
T
E
 
E
S
 
R
G
 
V
D
 
D
G
 
G
P
 
L
D
 
R
R
 
V
E
 
T
A
 
R
P
 
D
A
 
E
G
 
A
P
 
I
A
 
P
F
 
I
P
 
I
Y
 
R
E
 
D
T
 
T
F
 
L
Q
 
T
A
 
Q
L
 
A
N
 
N
R
 
L
S
 
A
L
 
L
V
 
V
E
 
D
R
 
A
L
 
I
R
 
R
R
 
D
K
 
A
G
 
G
V
 
G
R
 
R
A
 
A
T
 
A
S
 
A
I
 
V
T
 
P
G
 
R
G
 
G
V
 
V
F
 
F
E
 
E
A
 
A
G
 
D
H
 
I
L
 
V
G
 
D
R
 
A
E
 
D
V
 
K
R
 
L
G
 
G
S
 
R
L
 
V
G
 
G
T
 
E
V
 
P
R
 
R
A
 
H
V
 
I
R
 
H
L
 
L
A
 
D
P
 
L
V
 
V
E
 
G
A
 
S
S
 
A
L
 
A
H
 
R
A
 
A
G
 
G
S
 
Q
I
 
A
P
 
A
V
 
I
I
 
L
S
 
A
S
 
C
L
 
L
G
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
P
G
 
D
G
 
G
Q
 
T
S
 
L
L
 
V
G
 
N
I
 
I
E
 
N
C
 
A
D
|
D
R
 
V
A
 
A
T
 
V
N
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
V
R
 
H
L
 
A
L
 
L
Q
 
Q
P
 
P
F
 
Y
K
 
K
I
 
V
I
 
V
F
 
F
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
T
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
E
N
 
D
G
 
G
R
 
D
V
 
I
I
 
L
D
 
S
A
 
S
I
 
I
N
 
N
L
 
L
S
 
A
T
 
T
E
 
D
Y
 
F
D
 
G
H
 
D
F
 
L
D
 
M
R
 
Q
D
 
A
S
 
D
C
 
W
L
 
V
R
 
N
S
 
G
A
 
G
I
 
M
T
 
R
F
 
L
T
x
K
V
 
L
E
 
E
Q
 
E
M
 
I
K
 
K
D
 
R
L
 
L
L
 
L
D
 
D
R
 
D
L
 
L
P
 
P
P
 
L
E
 
S
S
 
S
S
 
S
I
 
V
S
 
S
I
 
I
T
 
T
N
 
R
P
 
P
A
 
S
N
 
E
L
 
L
A
 
A
N
 
R
E
 
E
L
 
L
F
 
F
T
 
T
H
 
H
K
 
A
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
L
 
L
V
 
I
R
 
R
R
 
R
G
 
G
E
 
E
R
 
R
V
 
I
S
 
V
R
 
A
A
 
T
T
 
D
C
 
D
W
 
K
D
 
S
E
 
S
L
 
L
D
 
D
L
 
L
T
 
G
R
 
R
L
 
L
R
 
D
M
 
N
L
 
L
I
 
V
E
 
K
S
 
A
S
 
A
F
|
F
G
 
G
R
 
R
R
 
P
L
 
A
V
 
V
E
 
E
D
 
G
Y
 
Y
F
 
W
Q
 
D
R
 
R
T
 
L
R
 
R
L
 
V
L
 
D
R
 
R
A
 
A
Y
 
F
V
 
V
S
 
T
E
 
E
N
 
S
Y
 
Y
R
 
R
A
 
A
A
 
A
V
 
A
I
 
I
L
 
T
T
 
T
E
 
R
E
 
L
D
 
D
G
 
G
V
 
W
P
 
V
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
K
|
K
F
|
F
A
 
A
V
 
V
L
 
L
D
 
D
E
 
D
A
 
A
Q
 
R
G
 
G
E
 
E
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
R
A
 
T
V
 
V
W
 
W
K
 
N
V
 
R
M
 
L
R
 
V
K
 
D
E
 
Y
T
 
A
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
F
 
I
W
 
W
R
|
R
S
 
S
R
 
R
H
 
T
K
 
N
N
 
N
Q
 
P
I
 
V
N
 
N
I
 
G
F
 
F
Y
 
Y
Y
 
F
A
 
E
Q
 
E
S
 
C
D
 
D
G
 
G
C
 
A
F
x
V
K
x
R
Q
x
R
E
x
D
K
 
E
W
 
W
K
 
T
V
 
V
F
 
F
W
 
W
C
 
R
G
 
G
L
 
E
D
 
M
D
 
G
F
 
P
S
 
V
Q
 
E
I
 
V
E
 
A
K
 
D
C
 
V
V
 
V
A
 
E
H
 
K
C
 
A
A
 
F
V
 
A
R
 
L
R
 
P
P
 
P
T
 
T
L
 
L

4ab7H Crystal structure of a tetrameric acetylglutamate kinase from saccharomyces cerevisiae complexed with its substrate n- acetylglutamate (see paper)
34% identity, 91% coverage: 25:433/448 of query aligns to 2:416/422 of 4ab7H

query
sites
4ab7H
K
 
R
E
 
E
I
 
V
N
 
E
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
K
 
K
R
 
Y
F
 
F
S
 
T
Q
 
S
L
 
V
D
 
S
A
 
Q
K
 
Q
R
 
Q
F
 
F
A
 
A
V
 
V
V
 
I
N
x
K
I
 
V
N
 
G
D
x
G
A
 
A
I
 
I
L
 
I
R
 
S
D
 
D
G
 
N
V
 
L
E
 
H
A
 
E
E
 
-
A
 
-
V
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
C
L
 
L
S
 
A
F
 
F
L
 
L
Q
 
Y
A
 
H
V
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
Y
P
 
P
I
 
I
V
 
V
L
 
L
L
 
H
G
|
G
T
|
T
A
x
G
P
 
P
G
 
Q
S
 
V
R
 
N
E
 
G
E
 
R
P
 
L
P
 
E
A
 
A
S
 
Q
G
 
G
V
 
I
D
 
E
E
 
P
E
 
D
S
 
Y
G
 
I
D
 
D
G
 
G
P
 
I
D
x
R
R
 
I
E
 
T
A
 
D
P
 
E
A
 
H
G
 
T
P
 
M
A
 
A
F
 
V
P
 
V
Y
 
R
E
 
K
T
 
C
F
 
F
Q
 
L
A
 
E
L
 
Q
N
 
N
R
 
L
S
 
K
L
 
L
V
 
V
E
 
T
R
 
A
L
 
L
R
 
E
R
 
Q
K
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
R
A
 
A
T
 
R
S
 
P
I
 
I
T
 
T
G
 
S
G
 
G
V
 
V
F
 
F
E
 
T
A
 
A
G
 
D
H
 
Y
L
 
L
G
 
D
R
 
K
E
 
D
V
 
K
R
 
Y
G
 
K
S
 
L
L
 
V
G
 
G
T
 
N
V
 
I
R
 
K
A
 
S
V
 
V
R
 
T
L
 
K
A
 
E
P
 
P
V
 
I
E
 
E
A
 
A
S
 
S
L
 
I
H
 
K
A
 
A
G
 
G
S
 
A
I
 
L
P
 
P
V
 
I
I
 
L
S
 
T
S
 
S
L
 
L
G
 
A
E
 
E
T
 
T
A
 
A
G
 
S
G
 
G
Q
 
Q
S
 
M
L
 
L
G
x
N
I
x
V
E
 
N
C
 
A
D
|
D
R
 
V
A
 
A
T
 
A
N
 
G
A
 
E
L
 
L
V
 
A
R
 
R
L
 
V
L
 
F
Q
 
E
P
 
P
F
 
L
K
 
K
I
 
I
I
 
V
F
 
Y
L
 
L
T
 
N
G
 
E
A
 
K
G
 
G
G
 
G
L
 
I
L
 
I
D
 
N
-
 
G
A
 
S
N
 
T
G
 
G
R
 
E
V
 
K
I
 
I
D
 
S
A
 
M
I
 
I
N
 
N
L
 
L
S
 
D
T
 
E
E
 
E
Y
 
Y
D
 
D
H
 
D
F
 
L
D
 
M
R
 
K
D
 
Q
S
 
S
C
 
W
L
 
V
R
 
K
S
 
Y
A
 
G
I
 
T
T
 
K
F
 
L
T
x
K
V
 
I
E
 
R
Q
 
E
M
 
I
K
 
K
D
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
D
R
 
Y
L
 
L
P
 
P
P
 
R
E
 
S
S
 
S
S
 
S
I
 
V
S
 
A
I
 
I
T
 
I
N
 
N
P
 
V
A
 
Q
N
 
D
L
 
L
A
 
Q
N
 
K
E
 
E
L
 
L
F
 
F
T
 
T
H
 
D
K
 
S
G
 
G
S
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
M
V
 
I
R
 
R
R
 
R
G
 
G
E
 
Y
R
 
K
-
 
L
V
 
V
S
 
K
R
 
R
A
 
S
T
 
S
C
 
I
W
 
G
D
 
E
E
 
F
L
 
P
D
 
S
L
 
A
T
 
D
R
 
A
L
 
L
R
 
R
M
 
K
L
 
A
I
 
L
E
 
Q
S
 
R
-
 
D
-
 
A
-
 
G
-
 
I
S
 
S
F
 
S
G
 
G
R
 
K
R
 
E
L
 
S
V
 
V
E
 
A
D
 
S
Y
 
Y
-
 
L
-
 
R
F
 
Y
Q
 
L
R
 
E
T
 
N
R
 
S
L
 
D
L
 
F
R
 
V
A
 
S
Y
 
Y
V
 
A
S
 
D
E
 
E
N
 
P
Y
 
L
R
 
E
A
 
A
A
 
V
V
 
A
I
 
I
L
 
V
T
 
K
E
 
K
E
 
D
D
 
T
G
 
N
V
 
V
P
 
P
Y
 
T
L
 
L
D
 
D
K
 
K
F
 
F
A
 
V
V
 
C
L
 
S
D
 
D
E
 
A
A
 
A
Q
 
W
G
 
L
E
 
N
G
 
N
L
 
V
G
 
T
R
 
D
A
 
N
V
 
V
W
 
F
K
 
N
V
 
V
M
 
L
R
 
R
K
 
R
E
 
D
T
 
F
P
 
P
Q
 
A
L
 
L
F
 
Q
W
 
W
R
 
V
S
 
V
R
 
S
H
 
E
K
 
N
N
 
D
Q
 
A
I
 
N
N
 
I
I
 
A
F
 
W
Y
 
H
Y
 
F
A
 
D
Q
 
K
S
 
S
D
 
Q
G
 
G
C
 
S
F
 
Y
K
 
L
Q
 
K
E
 
G
K
 
G
W
 
K
K
 
V
V
 
L
F
 
F
W
 
W
C
 
Y
G
 
G
L
 
I
D
 
D
D
 
D
F
 
I
S
 
N
Q
 
T
I
 
I
E
 
S
K
 
E
C
 
L
V
 
V
A
 
E
H
 
N

Q8N159 N-acetylglutamate synthase, mitochondrial; Amino-acid acetyltransferase; EC 2.3.1.1 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
35% identity, 92% coverage: 22:433/448 of query aligns to 115:517/534 of Q8N159

query
sites
Q8N159
A
 
A
S
 
S
T
 
P
K
 
G
E
 
E
I
 
A
N
 
R
Q
 
H
Y
 
W
L
 
L
K
 
T
R
 
Q
F
 
F
S
 
Q
Q
 
T
L
 
C
D
 
H
A
 
H
-
 
S
-
 
A
-
 
D
K
 
K
R
 
P
F
 
F
A
 
A
V
 
V
V
 
I
N
 
E
I
 
V
N
 
D
D
 
E
A
 
E
I
 
V
L
 
L
R
 
K
D
 
C
G
 
Q
V
 
Q
E
 
G
A
 
V
E
 
S
A
 
S
V
 
L
A
 
A
S
 
F
S
 
A
L
 
L
S
 
A
F
 
F
L
 
L
Q
 
Q
A
 
R
V
x
M
G
 
D
L
 
M
T
 
K
P
 
P
I
 
L
V
 
V
L
 
V
L
 
L
G
 
G
T
 
L
A
 
-
P
 
-
G
 
-
S
 
-
R
 
-
E
 
-
E
 
-
P
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
-
E
 
-
E
 
-
S
 
-
G
 
-
D
 
-
G
 
-
P
 
P
D
 
A
R
 
P
E
 
T
A
 
A
P
 
P
A
 
S
G
 
G
P
 
C
A
 
L
F
 
S
P
 
F
Y
 
W
E
 
E
T
 
A
F
 
K
Q
 
A
A
 
Q
L
 
L
N
 
A
R
 
K
S
 
S
-
x
C
-
 
K
-
 
V
L
 
L
V
 
V
E
 
D
R
 
A
L
 
L
R
 
R
R
 
H
K
 
N
G
 
A
V
 
A
R
 
A
A
 
A
T
 
V
S
 
P
I
 
F
T
 
F
G
 
G
G
 
G
-
 
G
-
 
S
V
 
V
F
 
L
E
 
R
A
 
A
G
 
A
H
 
E
L
 
P
G
 
A
R
 
P
E
 
H
V
 
-
R
 
-
G
 
A
S
 
S
L
 
Y
G
 
G
T
 
G
V
 
I
R
 
V
A
 
S
V
 
V
R
 
E
L
 
T
A
 
D
P
 
L
V
 
L
E
 
Q
A
 
W
S
 
C
L
 
L
H
 
E
A
 
S
G
 
G
S
 
S
I
 
I
P
 
P
V
 
I
I
 
L
S
 
C
S
x
P
L
 
I
G
 
G
E
 
E
T
|
T
A
 
A
G
 
A
G
 
R
Q
 
R
S
 
S
L
 
V
G
 
L
I
 
L
E
 
D
C
 
S
D
 
L
R
 
E
A
 
V
T
 
T
N
 
A
A
 
S
L
 
L
V
 
A
R
 
K
L
 
A
L
 
L
Q
 
R
P
 
P
F
 
T
K
 
K
I
 
I
I
|
I
F
 
F
L
 
L
T
 
N
G
 
N
A
 
T
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
R
D
 
D
A
 
S
N
 
S
G
 
H
R
 
K
V
 
V
I
 
L
D
 
S
A
 
N
I
 
V
N
 
N
L
 
L
S
 
P
T
 
A
E
 
D
Y
 
L
D
 
D
H
 
L
F
 
V
D
 
C
R
 
N
D
 
A
S
 
E
C
 
W
L
 
V
R
 
S
S
 
T
A
 
K
I
 
E
T
 
R
F
 
Q
T
 
Q
V
 
M
E
 
R
Q
 
L
M
 
I
K
 
V
D
 
D
L
 
V
L
 
L
D
 
S
R
 
R
L
 
L
P
 
P
P
 
H
E
 
H
S
 
S
S
 
S
I
 
A
S
 
V
I
 
I
T
 
T
N
 
A
P
 
A
A
 
S
N
 
T
L
 
L
A
 
L
N
 
T
E
 
E
L
 
L
F
 
F
T
 
S
H
 
N
K
 
K
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
L
 
L
V
 
F
R
 
K
R
 
N
G
 
A
E
 
E
R
 
R
V
 
M
S
 
L
R
 
R
A
 
V
T
 
R
C
 
S
W
 
L
D
 
D
E
 
K
L
 
L
D
 
D
L
 
Q
T
 
G
R
 
R
L
|
L
R
 
V
M
 
D
L
 
L
I
 
V
E
 
N
S
 
A
S
|
S
F
 
F
G
 
G
R
x
K
R
 
K
L
 
L
V
 
R
E
 
D
D
 
D
Y
 
Y
F
 
L
Q
 
A
-
x
S
-
 
L
R
 
R
T
 
P
R
 
R
L
 
L
L
 
H
R
 
S
A
 
I
Y
 
Y
V
 
V
S
 
S
E
 
E
N
 
G
Y
 
Y
R
 
N
A
 
A
A
 
A
V
 
A
I
 
I
L
|
L
T
 
T
E
 
M
E
 
E
D
 
P
-
 
V
-
 
L
-
 
G
G
 
G
V
 
T
P
 
P
Y
|
Y
L
 
L
D
 
D
K
|
K
F
 
F
A
 
V
V
 
V
L
 
S
D
 
S
E
 
S
A
 
R
Q
 
Q
G
 
G
E
 
Q
G
 
G
L
 
S
G
|
G
R
 
Q
A
 
M
V
 
L
W
 
W
K
 
E
V
 
C
M
 
L
R
 
R
K
 
R
E
 
D
T
 
L
P
 
Q
Q
 
T
L
 
L
F
 
F
W
 
W
R
|
R
S
|
S
R
|
R
H
x
V
K
x
T
N
|
N
Q
 
P
I
 
I
N
 
N
I
 
P
F
x
W
Y
|
Y
Y
 
F
A
 
K
Q
 
H
S
 
S
D
 
D
G
 
G
C
 
S
F
 
F
K
 
S
Q
 
N
E
 
K
K
 
Q
W
 
W
K
 
I
V
 
F
F
 
F
W
 
W
C
 
F
G
 
G
L
 
L
D
 
A
D
 
D
F
 
I
S
 
R
Q
 
D
I
 
S
E
x
Y
K
 
E
C
 
L
V
 
V
A
 
N
H
 
H

Sites not aligning to the query:

4nexA Structure of the n-acetyltransferase domain of x. Fastidiosa nags/k (see paper)
67% identity, 35% coverage: 287:443/448 of query aligns to 1:157/157 of 4nexA

query
sites
4nexA
G
 
S
S
 
S
G
 
G
T
 
L
L
 
V
V
 
P
R
 
R
R
 
G
G
 
S
E
 
H
R
 
M
V
 
V
S
 
I
R
 
R
A
 
A
T
 
T
C
 
T
W
 
W
D
 
K
E
 
D
L
 
L
D
 
D
L
 
L
T
 
P
R
 
R
L
 
L
R
 
Q
M
 
H
L
 
L
I
 
I
E
 
Q
S
 
S
S
 
S
F
 
F
G
 
R
R
 
R
R
 
T
L
 
L
V
 
I
E
 
P
D
 
H
Y
 
Y
F
 
F
Q
 
E
R
 
T
T
 
T
R
 
P
L
 
L
L
 
L
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
S
 
S
E
 
E
N
 
N
Y
 
Y
R
 
R
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
L
 
L
T
 
T
E
 
K
E
 
L
D
 
G
G
 
N
V
 
V
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
D
|
D
K
|
K
F
|
F
A
 
A
V
 
V
L
 
L
D
 
D
E
 
D
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
E
 
E
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
V
W
 
W
K
 
S
V
 
I
M
 
M
R
 
R
K
 
E
E
 
E
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
F
 
F
W
 
W
R
|
R
S
|
S
R
|
R
H
 
H
K
 
N
N
 
N
Q
 
Q
I
 
A
N
 
N
I
 
A
F
 
F
Y
|
Y
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
E
S
 
S
D
 
D
G
 
G
C
 
Y
F
 
Y
K
 
K
Q
 
Q
E
 
D
K
 
H
W
 
W
K
 
K
V
 
I
F
 
F
W
 
W
C
 
N
G
 
G
L
 
L
D
 
H
D
 
H
F
 
F
S
 
Q
Q
 
Q
I
 
I
E
 
Q
K
 
Q
C
 
C
V
 
V
A
 
A
H
 
H
C
 
C
A
 
T
V
 
Q
R
 
H
R
 
P
P
 
P
T
 
T
L
 
L
I
 
I
E
 
D

3zzhC Crystal structure of the amino acid kinase domain from saccharomyces cerevisiae acetylglutamate kinase in complex with its feed- back inhibitor l-arginine (see paper)
38% identity, 64% coverage: 8:294/448 of query aligns to 3:288/288 of 3zzhC

query
sites
3zzhC
S
 
S
E
 
A
T
 
T
R
 
R
Q
 
S
T
 
T
I
 
V
V
 
I
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
S
 
N
I
 
N
L
 
I
A
 
S
S
 
T
T
 
K
K
 
R
E
 
E
I
 
V
N
 
E
Q
 
Q
Y
|
Y
L
 
L
K
 
K
R
 
Y
F
 
F
S
 
T
Q
 
S
L
 
V
D
 
S
A
 
Q
K
 
Q
R
 
Q
F
 
F
A
 
A
V
 
V
V
 
I
N
x
K
I
 
V
N
 
G
D
x
G
A
 
A
I
 
I
L
 
I
R
 
S
D
 
D
G
 
N
V
 
L
E
 
H
A
 
E
E
 
-
A
 
-
V
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
C
L
 
L
S
 
A
F
 
F
L
 
L
Q
 
Y
A
 
H
V
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
Y
P
 
P
I
 
I
V
 
V
L
 
L
L
 
H
G
|
G
T
|
T
A
x
G
P
 
P
G
 
Q
S
 
V
R
 
N
E
 
G
E
 
R
P
 
L
P
 
E
A
 
A
S
 
Q
G
 
G
V
 
I
D
 
E
E
 
P
E
 
D
S
 
Y
G
 
I
D
 
D
G
 
G
P
 
I
D
x
R
R
 
I
E
 
T
A
 
D
P
 
E
A
 
H
G
 
T
P
 
M
A
 
A
F
 
V
P
 
V
Y
 
R
E
 
K
T
 
C
F
 
F
Q
 
L
A
 
E
L
 
Q
N
 
N
R
 
L
S
 
K
L
 
L
V
 
V
E
 
T
R
 
A
L
 
L
R
 
E
R
 
Q
K
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
R
A
 
A
T
 
R
S
 
P
I
 
I
T
 
T
G
 
S
G
 
G
V
 
V
F
 
F
E
 
T
A
 
A
G
 
D
H
 
Y
L
 
L
G
 
D
R
 
K
E
 
D
V
 
K
R
 
Y
G
 
K
S
 
L
L
 
V
G
 
G
T
 
N
V
 
I
R
 
K
A
 
S
V
 
V
R
 
T
L
 
K
A
 
E
P
 
P
V
 
I
E
 
E
A
 
A
S
 
S
L
 
I
H
 
K
A
 
A
G
 
G
S
 
A
I
 
L
P
 
P
V
 
I
I
 
L
S
 
T
S
 
S
L
 
L
G
 
A
E
 
E
T
 
T
A
 
A
G
 
S
G
 
G
Q
 
Q
S
 
M
L
 
L
G
x
N
I
x
V
E
 
N
C
x
A
D
|
D
R
 
V
A
 
A
T
 
A
N
 
G
A
 
E
L
 
L
V
 
A
R
 
R
L
 
V
L
 
F
Q
 
E
P
 
P
F
 
L
K
|
K
I
 
I
I
 
V
F
 
Y
L
 
L
T
 
N
G
 
E
A
 
K
G
 
G
G
 
G
L
 
I
L
 
I
D
 
N
-
 
G
A
 
S
N
 
T
G
 
G
R
 
E
V
 
K
I
 
I
D
x
S
A
 
M
I
 
I
N
 
N
L
 
L
S
 
D
T
 
E
E
 
E
Y
 
Y
D
 
D
H
 
D
F
 
L
D
 
M
R
 
K
D
 
Q
S
 
S
C
 
W
L
 
V
R
 
K
S
 
Y
A
 
G
I
 
T
T
 
K
F
 
L
T
x
K
V
 
I
E
 
R
Q
 
E
M
 
I
K
 
K
D
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
D
R
 
Y
L
 
L
P
 
P
P
 
R
E
 
S
S
 
S
S
 
S
I
 
V
S
 
A
I
 
I
T
 
I
N
 
N
P
 
V
A
 
Q
N
 
D
L
 
L
A
 
Q
N
 
K
E
|
E
L
|
L
F
 
F
T
|
T
H
x
D
K
x
S
G
 
G
S
 
A
G
|
G
T
 
T
L
x
M
V
 
I
R
 
R
R
 
R

4k30A Structure of the n-acetyltransferase domain of human n-acetylglutamate synthase (see paper)
46% identity, 29% coverage: 305:434/448 of query aligns to 10:144/153 of 4k30A

query
sites
4k30A
D
 
D
E
 
K
L
 
L
D
 
D
L
 
Q
T
 
G
R
 
R
L
 
L
R
 
V
M
 
D
L
 
L
I
 
V
E
 
N
S
 
A
S
 
S
F
|
F
G
 
G
R
x
K
R
 
K
L
 
L
V
 
R
E
 
D
D
 
D
Y
 
Y
F
 
L
Q
 
A
-
 
S
-
 
L
R
 
R
T
 
P
R
 
R
L
 
L
L
 
H
R
 
S
A
 
I
Y
 
Y
V
 
V
S
 
S
E
 
E
N
 
G
Y
 
Y
R
 
N
A
 
A
A
 
A
V
 
A
I
 
I
L
 
L
T
 
T
E
 
M
E
 
E
-
 
P
-
 
V
-
 
L
D
 
G
G
 
G
V
 
T
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
D
|
D
K
|
K
F
 
F
A
 
V
V
 
V
L
 
S
D
 
S
E
 
S
A
 
R
Q
 
Q
G
 
G
E
 
Q
G
 
G
L
 
S
G
 
G
R
 
Q
A
 
M
V
 
L
W
 
W
K
 
E
V
 
C
M
 
L
R
 
R
K
 
R
E
 
D
T
 
L
P
 
Q
Q
 
T
L
 
L
F
 
F
W
 
W
R
|
R
S
 
S
R
|
R
H
 
V
K
 
T
N
 
N
Q
 
P
I
 
I
N
 
N
I
 
P
F
 
W
Y
 
Y
Y
 
F
A
 
K
Q
 
H
S
 
S
D
 
D
G
 
G
C
 
S
F
 
F
K
 
S
Q
 
N
E
 
K
K
 
Q
W
 
W
K
 
I
V
 
F
F
 
F
W
 
W
C
 
F
G
 
G
L
 
L
D
 
A
D
 
D
F
 
I
S
 
R
Q
 
D
I
 
S
E
 
Y
K
 
E
C
 
L
V
 
V
A
 
N
H
 
H
C
 
A

2v5hB Controlling the storage of nitrogen as arginine: the complex of pii and acetylglutamate kinase from synechococcus elongatus pcc 7942 (see paper)
27% identity, 62% coverage: 15:292/448 of query aligns to 7:281/289 of 2v5hB

query
sites
2v5hB
V
 
V
R
 
R
L
 
I
L
 
L
S
 
S
I
 
-
L
 
-
A
 
-
S
 
-
T
 
-
K
 
-
E
 
E
I
 
A
N
 
L
Q
 
P
Y
 
Y
L
 
L
K
 
Q
R
 
Q
F
 
F
S
 
-
Q
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
A
K
 
G
R
 
R
F
 
T
A
 
V
V
 
V
V
 
V
N
x
K
I
 
Y
N
 
G
D
x
G
A
 
A
I
 
A
L
 
M
R
 
K
D
 
Q
G
 
E
V
 
E
E
 
L
A
 
K
E
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
M
S
 
R
S
 
D
L
 
I
S
 
V
F
 
F
L
 
L
Q
 
A
A
 
C
V
 
V
G
 
G
L
 
M
T
 
R
P
 
P
I
 
V
V
 
V
L
 
V
L
 
H
G
|
G
T
 
G
A
x
G
P
 
P
G
 
E
S
 
I
R
 
N
E
 
A
E
 
W
P
 
L
P
 
G
A
 
R
S
 
V
G
 
G
V
 
I
D
 
E
E
 
P
E
 
Q
S
 
F
G
 
H
D
 
N
G
 
G
P
 
L
D
x
R
-
 
V
R
 
T
E
 
D
A
 
A
P
 
D
A
 
T
G
 
M
P
 
E
A
 
V
F
 
V
P
 
E
Y
 
M
E
 
V
T
 
L
F
 
V
Q
 
G
A
 
R
L
 
V
N
 
N
R
 
K
S
 
D
L
 
I
V
 
V
E
 
S
R
 
R
L
 
I
R
 
N
R
 
T
K
 
T
G
 
G
V
 
G
R
 
R
A
 
A
T
 
V
S
 
G
I
 
F
T
 
C
G
 
G
G
 
T
-
 
D
-
 
G
-
 
R
-
 
L
V
 
V
F
 
L
E
 
A
A
 
R
G
 
P
H
 
H
L
 
-
G
 
D
R
 
Q
E
 
E
V
 
G
R
 
I
G
 
G
S
 
F
L
 
V
G
 
G
T
 
E
V
 
V
R
 
N
A
 
S
V
 
V
R
 
N
L
 
S
A
 
E
P
 
V
V
 
I
E
 
E
A
 
P
S
 
L
L
 
L
H
 
E
A
 
R
G
 
G
S
 
Y
I
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
S
 
S
S
 
S
L
 
V
G
 
A
E
 
A
T
 
D
A
 
E
G
 
N
G
 
G
Q
 
Q
S
 
S
L
 
F
G
x
N
I
 
I
E
 
N
C
x
A
D
|
D
R
 
T
A
 
V
T
 
A
N
 
G
A
 
E
L
 
I
V
 
A
R
 
A
L
 
A
L
 
L
Q
 
N
P
 
A
F
 
E
K
 
K
I
 
L
I
 
I
F
 
L
L
 
L
T
 
T
G
 
D
A
 
T
G
 
R
G
 
G
L
 
I
L
 
L
D
 
E
A
 
D
N
 
P
G
 
K
R
 
R
-
 
P
-
 
E
-
 
S
V
 
L
I
 
I
D
 
P
A
 
R
I
 
L
N
 
N
L
 
I
S
 
P
T
 
Q
E
 
S
Y
 
R
D
 
E
H
 
L
F
 
I
D
 
A
R
 
Q
D
 
G
S
 
I
C
 
V
L
 
G
R
 
G
S
 
G
A
 
M
I
 
I
T
 
P
F
x
K
T
 
V
V
 
D
E
 
C
Q
 
C
M
 
I
K
 
R
D
 
S
L
 
L
L
 
A
D
 
Q
R
 
G
L
 
V
P
 
R
P
 
A
E
 
A
S
 
H
S
 
I
I
 
I
S
 
D
I
 
G
T
 
R
N
 
I
P
 
P
A
 
H
N
 
A
L
 
L
A
 
L
N
 
L
E
 
E
L
 
I
F
 
F
T
 
T
H
 
D
K
 
A
G
 
G
S
 
I
G
 
G
T
 
T
L
 
M
V
 
I

2bufA Arginine feed-back inhibitable acetylglutamate kinase (see paper)
24% identity, 53% coverage: 62:297/448 of query aligns to 48:291/292 of 2bufA

query
sites
2bufA
A
 
A
S
 
R
S
 
D
L
 
V
S
 
V
F
 
L
L
 
M
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
I
T
 
N
P
 
P
I
 
V
V
 
V
L
 
V
L
 
H
G
|
G
T
x
G
A
x
G
P
 
P
G
 
Q
S
 
I
R
 
G
E
 
D
E
 
L
P
 
L
P
 
K
A
 
R
S
 
L
G
 
S
V
 
I
D
 
E
E
 
S
E
 
H
S
 
F
G
 
I
D
 
D
G
 
G
P
 
M
D
 
-
R
|
R
E
 
V
A
 
T
P
 
D
A
 
A
G
 
A
P
 
T
A
 
M
F
 
D
P
 
V
Y
 
V
E
 
E
T
 
M
F
 
V
Q
 
L
A
 
G
-
 
G
-
 
Q
L
 
V
N
 
N
R
 
K
S
 
D
L
 
I
V
 
V
E
 
N
R
 
L
L
 
I
R
 
N
R
 
R
K
 
H
G
 
G
V
 
G
R
 
S
A
 
A
T
 
I
S
 
G
I
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
K
-
 
D
-
 
A
-
 
E
V
 
L
F
 
I
E
 
R
A
 
A
G
 
K
H
 
K
L
 
L
G
 
T
-
 
V
-
 
T
R
 
R
E
 
Q
V
 
I
R
 
I
-
 
D
-
 
I
G
 
G
S
 
H
L
 
V
G
 
G
T
 
E
V
 
V
R
 
T
A
 
G
V
 
V
R
 
N
L
 
V
A
 
G
P
 
L
V
 
L
E
 
N
A
 
M
S
 
L
L
 
V
H
 
K
A
 
G
G
 
D
S
 
F
I
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
S
 
A
S
 
P
L
 
I
G
 
G
E
 
V
T
 
G
A
 
S
G
 
N
G
 
G
Q
 
E
S
 
S
L
 
Y
G
x
N
I
 
I
E
 
N
C
x
A
D
|
D
R
 
L
A
 
V
T
 
A
N
 
G
A
 
K
L
 
V
V
 
A
R
 
E
L
 
A
L
 
L
Q
 
K
P
 
A
F
 
E
K
 
K
I
 
L
I
 
M
F
 
L
L
 
L
T
 
T
G
 
N
A
 
I
G
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
M
D
 
D
A
 
K
N
 
Q
G
 
G
R
 
Q
V
 
V
I
 
L
D
 
T
A
 
G
I
 
-
N
 
-
L
 
L
S
 
S
T
 
T
E
 
E
-
 
Q
Y
 
V
D
 
N
H
 
E
F
 
L
D
 
I
R
 
A
D
 
D
S
 
G
C
 
T
L
 
I
R
 
Y
S
 
G
A
 
G
I
 
M
T
 
L
F
 
P
T
x
K
V
 
I
E
 
R
-
 
C
Q
 
A
M
 
L
K
 
E
D
 
A
L
 
V
L
 
Q
D
 
G
R
 
G
L
 
V
P
 
T
P
 
S
E
 
A
S
 
H
S
 
I
I
 
I
S
 
D
I
 
G
T
 
R
N
 
V
P
 
P
A
 
N
N
 
A
L
 
V
A
 
L
N
 
L
E
 
E
L
 
I
F
 
F
T
 
T
H
 
D
K
 
S
G
 
G
S
 
V
G
 
G
T
 
T
L
 
L
V
 
I
R
 
S
R
 
N
G
 
R
E
 
K
R
 
R

Sites not aligning to the query:

2bufK Arginine feed-back inhibitable acetylglutamate kinase (see paper)
23% identity, 52% coverage: 62:292/448 of query aligns to 48:271/273 of 2bufK

query
sites
2bufK
A
 
A
S
 
R
S
 
D
L
 
V
S
 
V
F
 
L
L
 
M
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
I
T
 
N
P
 
P
I
 
V
V
 
V
L
 
V
L
 
H
G
 
G
T
 
G
A
x
G
P
 
P
G
 
Q
S
 
I
R
 
G
E
 
D
E
 
L
P
 
L
P
 
K
A
 
R
S
 
L
G
 
S
V
 
I
D
 
E
E
 
S
E
 
H
S
 
-
G
 
-
D
 
-
G
 
-
P
 
-
D
 
-
R
|
R
E
 
V
A
 
T
P
 
D
A
 
A
G
 
A
P
 
T
A
 
M
F
 
D
P
 
V
Y
 
V
E
 
E
T
 
M
F
 
V
Q
 
L
A
 
G
-
 
G
-
 
Q
L
 
V
N
 
N
R
 
K
S
 
D
L
 
I
V
 
V
E
 
N
R
 
L
L
 
I
R
 
N
R
 
R
K
 
H
G
 
G
V
 
G
R
 
S
A
 
A
T
 
I
S
 
G
I
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
-
V
 
-
F
 
-
E
 
K
A
 
D
G
 
A
H
 
E
L
 
L
G
 
I
R
 
R
E
 
A
V
 
K
R
 
K
G
 
L
S
 
T
L
 
V
G
 
G
T
 
E
V
 
V
R
 
T
A
 
G
V
 
V
R
 
N
L
 
V
A
 
G
P
 
L
V
 
L
E
 
N
A
 
M
S
 
L
L
 
V
H
 
K
A
 
G
G
 
D
S
 
F
I
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
S
 
A
S
 
P
L
 
I
G
 
G
E
 
V
T
 
G
A
 
S
G
 
N
G
 
G
Q
 
E
S
 
S
L
 
Y
G
x
N
I
 
I
E
x
N
C
x
A
D
|
D
R
 
L
A
 
V
T
 
A
N
 
G
A
 
K
L
 
V
V
 
A
R
 
E
L
 
A
L
 
L
Q
 
K
P
 
A
F
 
E
K
 
K
I
 
L
I
 
M
F
 
L
L
 
L
T
 
T
G
 
N
A
 
I
G
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
M
D
 
D
A
 
K
N
 
Q
G
 
G
R
 
Q
V
 
V
I
 
L
D
 
T
A
 
G
I
 
-
N
 
-
L
 
L
S
 
S
T
 
T
E
 
E
-
 
Q
Y
 
V
D
 
N
H
 
E
F
 
L
D
 
I
R
 
A
D
 
D
S
 
G
C
 
T
L
 
I
R
 
Y
S
 
G
A
 
G
I
 
M
T
 
L
F
 
P
T
x
K
V
 
I
E
 
R
-
 
C
Q
 
A
M
 
L
K
 
E
D
 
A
L
 
V
L
 
Q
D
 
G
R
 
G
L
 
V
P
 
T
P
 
S
E
 
A
S
 
H
S
 
I
I
 
I
S
 
D
I
 
G
T
 
R
N
 
V
P
 
P
A
 
N
N
 
A
L
 
V
A
 
L
N
 
L
E
 
E
L
 
I
F
 
F
T
 
T
H
 
D
K
 
S
G
 
G
S
 
V
G
 
G
T
 
T
L
 
L
V
 
I

Sites not aligning to the query:

Q9HTN2 Acetylglutamate kinase; N-acetyl-L-glutamate 5-phosphotransferase; NAG kinase; NAGK; EC 2.7.2.8 from Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) (see 2 papers)
22% identity, 53% coverage: 62:297/448 of query aligns to 49:300/301 of Q9HTN2

query
sites
Q9HTN2
A
 
A
S
 
R
S
 
D
L
 
V
S
 
V
F
 
L
L
 
M
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
I
T
 
N
P
 
P
I
 
V
V
 
V
L
 
V
L
 
H
G
 
G
T
 
G
A
 
G
P
 
P
G
 
Q
S
 
I
R
 
G
E
 
D
E
 
L
P
 
L
P
 
K
A
 
R
S
 
L
G
 
S
V
 
I
D
 
E
E
 
S
E
 
H
S
 
F
G
 
I
D
 
D
G
 
G
P
 
M
D
 
-
R
|
R
E
 
V
A
 
T
P
 
D
A
 
A
G
 
A
P
 
T
A
 
M
F
 
D
P
 
V
Y
 
V
E
 
E
T
 
M
F
 
V
Q
 
L
A
 
G
-
 
G
-
 
Q
L
 
V
N
 
N
R
 
K
S
 
D
L
 
I
V
 
V
E
 
N
R
 
L
L
 
I
R
 
N
R
 
R
K
 
H
G
 
G
V
 
G
R
 
S
A
 
A
T
 
I
S
 
G
I
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
K
-
 
D
-
 
A
-
 
E
-
 
L
-
 
I
-
 
R
-
 
A
-
 
K
-
 
K
-
 
L
-
 
T
-
 
V
-
 
T
-
 
R
-
 
Q
-
 
T
-
 
P
-
 
E
-
 
M
-
 
T
-
 
K
-
 
P
-
 
E
V
 
I
F
 
I
E
 
D
A
 
I
G
 
G
H
 
H
L
 
V
G
 
G
R
 
E
E
 
-
V
 
-
R
 
-
G
 
-
S
 
-
L
 
-
G
 
-
T
 
-
V
 
V
R
 
T
A
 
G
V
 
V
R
 
N
L
 
V
A
 
G
P
 
L
V
 
L
E
 
N
A
 
M
S
 
L
L
 
V
H
 
K
A
 
G
G
 
D
S
 
F
I
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
S
 
A
S
 
P
L
 
I
G
 
G
E
 
V
T
 
G
A
 
S
G
 
N
G
 
G
Q
 
E
S
 
S
L
 
Y
G
x
N
I
 
I
E
 
N
C
 
A
D
 
D
R
 
L
A
 
V
T
 
A
N
 
G
A
 
K
L
 
V
V
 
A
R
 
E
L
 
A
L
 
L
Q
 
K
P
 
A
F
 
E
K
 
K
I
 
L
I
 
M
F
 
L
L
 
L
T
 
T
G
 
N
A
 
I
G
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
M
D
 
D
A
 
K
N
 
Q
G
 
G
R
 
Q
V
 
V
I
 
L
D
 
T
A
 
G
I
 
-
N
 
-
L
 
L
S
 
S
T
 
T
E
 
E
-
 
Q
Y
 
V
D
 
N
H
 
E
F
 
L
D
 
I
R
 
A
D
 
D
S
 
G
C
 
T
L
 
I
R
 
Y
S
 
G
A
 
G
I
 
M
T
 
L
F
 
P
T
 
K
V
 
I
E
 
R
-
 
C
Q
 
A
M
 
L
K
 
E
D
 
A
L
 
V
L
 
Q
D
 
G
R
 
G
L
 
V
P
 
T
P
 
S
E
 
A
S
 
H
S
 
I
I
 
I
S
 
D
I
 
G
T
 
R
N
 
V
P
 
P
A
 
N
N
 
A
L
 
V
A
 
L
N
 
L
E
 
E
L
 
I
F
 
F
T
 
T
H
 
D
K
 
S
G
 
G
S
 
V
G
 
G
T
 
T
L
 
L
V
 
I
R
 
S
R
 
N
G
 
R
E
 
K
R
 
R

Sites not aligning to the query:

2btyA Acetylglutamate kinase from thermotoga maritima complexed with its inhibitor arginine (see paper)
23% identity, 60% coverage: 30:296/448 of query aligns to 15:281/282 of 2btyA

query
sites
2btyA
Y
|
Y
L
 
I
K
 
K
R
 
E
F
|
F
S
 
Y
Q
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
G
K
 
K
R
 
T
F
 
F
A
 
-
V
 
V
V
 
I
N
x
K
I
 
F
N
x
G
D
x
G
A
 
S
I
 
A
L
 
M
R
 
K
D
 
Q
G
 
E
V
 
N
E
 
A
A
 
K
E
 
K
A
 
A
V
 
F
A
 
I
S
 
Q
S
 
D
L
 
I
S
 
I
F
 
L
L
 
L
Q
 
K
A
 
Y
V
 
T
G
 
G
L
 
I
T
 
K
P
 
P
I
 
I
V
 
I
L
 
V
L
 
H
G
|
G
T
x
G
A
x
G
P
 
P
G
 
A
S
 
I
R
 
S
E
 
Q
E
 
M
P
 
M
P
 
K
A
 
D
S
 
L
G
 
G
V
 
I
D
 
E
E
 
P
E
 
V
S
 
F
G
 
K
D
 
N
G
 
G
P
 
H
D
 
R
-
 
V
R
 
T
E
 
D
A
 
E
P
 
K
A
 
T
G
 
M
P
 
E
A
 
I
F
 
V
P
 
E
Y
 
M
E
 
V
T
 
L
F
 
V
Q
 
G
A
 
K
L
 
I
N
 
N
R
 
K
S
 
E
L
 
I
V
 
V
E
 
M
R
 
N
L
 
L
R
 
N
R
 
L
K
 
H
G
 
G
V
 
G
R
 
R
A
 
A
T
 
V
S
 
G
I
 
I
T
 
C
G
 
G
G
 
K
V
 
D
F
 
S
E
 
K
A
 
L
G
 
I
H
 
V
L
 
A
G
 
E
R
 
K
E
 
E
V
 
T
R
 
K
-
 
H
-
 
G
-
 
D
-
 
I
G
 
G
S
 
Y
L
 
V
G
 
G
T
 
K
V
 
V
R
 
K
A
 
K
V
 
V
R
 
N
L
 
P
A
 
E
P
 
I
V
 
L
E
 
H
A
 
A
S
 
L
L
 
I
H
 
E
A
 
N
G
 
D
S
 
Y
I
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
S
 
A
S
 
P
L
 
V
G
 
G
E
 
I
T
 
G
A
 
E
G
 
D
G
 
G
Q
 
H
S
 
S
L
 
Y
G
 
N
I
 
I
E
x
N
C
 
A
D
|
D
R
 
T
A
 
A
T
 
A
N
 
A
A
 
E
L
 
I
V
 
A
R
 
K
L
 
S
L
 
L
Q
 
M
P
 
A
F
 
E
K
|
K
I
 
L
I
 
I
F
 
L
L
 
L
T
 
T
G
 
D
A
 
V
G
 
D
G
 
G
L
 
V
L
 
L
D
 
K
A
 
-
N
 
D
G
 
G
R
 
K
V
 
L
I
 
I
D
x
S
A
 
T
I
 
L
N
 
T
L
 
-
S
 
P
T
 
D
E
 
E
Y
 
A
D
 
E
H
 
E
F
 
L
D
 
I
R
 
R
D
 
D
S
 
G
C
 
T
L
 
V
R
 
T
S
 
G
A
 
G
I
 
M
T
 
I
F
 
P
T
x
K
V
 
V
E
 
E
Q
 
C
M
 
A
K
 
V
D
 
S
L
 
A
L
 
V
D
 
R
R
 
G
L
 
-
P
 
-
P
 
G
E
 
V
S
 
G
S
 
A
I
 
V
S
 
H
I
 
I
T
 
I
N
 
N
P
 
G
A
 
G
-
 
L
-
 
E
-
 
H
N
 
A
L
 
I
A
 
L
N
 
L
E
|
E
L
x
I
F
 
F
T
 
S
H
x
R
K
|
K
G
 
G
S
 
I
G
|
G
T
 
T
L
x
M
V
 
I
R
 
K
R
 
E
G
 
L
E
 
E

Q9X2A4 Acetylglutamate kinase; N-acetyl-L-glutamate 5-phosphotransferase; NAG kinase; NAGK; EC 2.7.2.8 from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) (see paper)
23% identity, 60% coverage: 30:296/448 of query aligns to 15:281/282 of Q9X2A4

query
sites
Q9X2A4
Y
 
Y
L
 
I
K
 
K
R
 
E
F
 
F
S
 
Y
Q
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
G
K
 
K
R
 
T
F
 
F
A
 
-
V
 
V
V
 
I
N
 
K
I
 
F
N
 
G
D
 
G
A
 
S
I
 
A
L
 
M
R
 
K
D
 
Q
G
 
E
V
 
N
E
 
A
A
 
K
E
 
K
A
 
A
V
 
F
A
 
I
S
 
Q
S
 
D
L
 
I
S
 
I
F
 
L
L
 
L
Q
 
K
A
 
Y
V
 
T
G
 
G
L
 
I
T
 
K
P
 
P
I
 
I
V
 
I
L
 
V
L
 
H
G
 
G
T
 
G
A
 
G
P
 
P
G
 
A
S
 
I
R
 
S
E
 
Q
E
 
M
P
 
M
P
 
K
A
 
D
S
 
L
G
 
G
V
 
I
D
 
E
E
 
P
E
 
V
S
 
F
G
 
K
D
 
N
G
 
G
P
 
H
D
 
R
-
 
V
R
 
T
E
 
D
A
 
E
P
 
K
A
 
T
G
 
M
P
 
E
A
 
I
F
 
V
P
 
E
Y
 
M
E
 
V
T
 
L
F
 
V
Q
 
G
A
 
K
L
 
I
N
 
N
R
 
K
S
 
E
L
 
I
V
 
V
E
 
M
R
 
N
L
 
L
R
 
N
R
 
L
K
 
H
G
 
G
V
 
G
R
 
R
A
 
A
T
 
V
S
 
G
I
 
I
T
 
C
G
 
G
G
 
K
V
 
D
F
 
S
E
 
K
A
 
L
G
 
I
H
 
V
L
 
A
G
 
E
R
 
K
E
 
E
V
 
T
R
 
K
-
 
H
-
 
G
-
 
D
-
 
I
G
 
G
S
 
Y
L
 
V
G
 
G
T
 
K
V
 
V
R
 
K
A
 
K
V
 
V
R
 
N
L
 
P
A
 
E
P
 
I
V
 
L
E
 
H
A
 
A
S
 
L
L
 
I
H
 
E
A
 
N
G
 
D
S
 
Y
I
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
S
 
A
S
 
P
L
 
V
G
 
G
E
 
I
T
 
G
A
 
E
G
 
D
G
 
G
Q
 
H
S
 
S
L
 
Y
G
x
N
I
 
I
E
 
N
C
 
A
D
 
D
R
 
T
A
 
A
T
 
A
N
 
A
A
 
E
L
 
I
V
 
A
R
 
K
L
 
S
L
 
L
Q
 
M
P
 
A
F
 
E
K
|
K
I
 
L
I
 
I
F
 
L
L
 
L
T
 
T
G
 
D
A
 
V
G
 
D
G
 
G
L
 
V
L
 
L
D
 
K
A
 
-
N
 
D
G
 
G
R
 
K
V
 
L
I
 
I
D
x
S
A
 
T
I
 
L
N
 
T
L
 
-
S
 
P
T
 
D
E
 
E
Y
 
A
D
 
E
H
 
E
F
 
L
D
 
I
R
 
R
D
 
D
S
 
G
C
 
T
L
 
V
R
 
T
S
 
G
A
 
G
I
 
M
T
 
I
F
 
P
T
 
K
V
 
V
E
 
E
Q
 
C
M
 
A
K
 
V
D
 
S
L
 
A
L
 
V
D
 
R
R
 
G
L
 
-
P
 
-
P
 
G
E
 
V
S
 
G
S
 
A
I
 
V
S
 
H
I
 
I
T
 
I
N
 
N
P
 
G
A
 
G
-
 
L
-
 
E
-
 
H
N
 
A
L
 
I
A
 
L
N
 
L
E
|
E
L
x
I
F
|
F
T
x
S
H
 
R
K
 
K
G
 
G
S
 
I
G
 
G
T
 
T
L
 
M
V
 
I
R
 
K
R
 
E
G
 
L
E
 
E

2bufC Arginine feed-back inhibitable acetylglutamate kinase (see paper)
22% identity, 52% coverage: 62:292/448 of query aligns to 48:294/298 of 2bufC

query
sites
2bufC
A
 
A
S
 
R
S
 
D
L
 
V
S
 
V
F
 
L
L
 
M
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
I
T
 
N
P
 
P
I
 
V
V
 
V
L
 
V
L
 
H
G
 
G
T
 
G
A
x
G
P
 
P
G
 
Q
S
 
I
R
 
G
E
 
D
E
 
L
P
 
L
P
 
K
A
 
R
S
 
L
G
 
S
V
 
I
D
 
E
E
 
S
E
 
H
S
 
F
G
 
I
D
 
D
G
 
G
P
 
M
D
 
-
R
 
R
E
 
V
A
 
T
P
 
D
A
 
A
G
 
A
P
 
T
A
 
M
F
 
D
P
 
V
Y
 
V
E
 
E
T
 
M
F
 
V
Q
 
L
A
 
G
-
 
G
-
 
Q
L
 
V
N
 
N
R
 
K
S
 
D
L
 
I
V
 
V
E
 
N
R
 
L
L
 
I
R
 
N
R
 
R
K
 
H
G
 
G
V
 
G
R
 
S
A
 
A
T
 
I
S
 
G
I
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
K
-
 
D
-
 
A
-
 
E
-
 
L
-
 
I
-
 
R
-
 
A
-
 
K
-
 
K
-
 
L
-
 
T
-
 
V
-
 
T
-
 
R
-
 
Q
-
 
T
-
 
P
-
 
E
-
 
M
-
 
T
-
 
K
-
 
P
-
 
E
V
 
I
F
 
I
E
 
D
A
 
I
G
 
G
H
 
H
L
 
V
G
 
G
R
 
E
E
 
-
V
 
-
R
 
-
G
 
-
S
 
-
L
 
-
G
 
-
T
 
-
V
 
V
R
 
T
A
 
G
V
 
V
R
 
N
L
 
V
A
 
G
P
 
L
V
 
L
E
 
N
A
 
M
S
 
L
L
 
V
H
 
K
A
 
G
G
 
D
S
 
F
I
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
S
 
A
S
 
P
L
 
I
G
 
G
E
 
V
T
 
G
A
 
S
G
 
N
G
 
G
Q
 
E
S
 
S
L
 
Y
G
 
N
I
 
I
E
 
N
C
 
A
D
|
D
R
 
L
A
 
V
T
 
A
N
 
G
A
 
K
L
 
V
V
 
A
R
 
E
L
 
A
L
 
L
Q
 
K
P
 
A
F
 
E
K
 
K
I
 
L
I
 
M
F
 
L
L
 
L
T
 
T
G
x
N
A
 
I
G
 
A
G
 
G
L
|
L
L
x
M
D
 
D
A
 
K
N
 
Q
G
 
G
R
 
Q
V
 
V
I
 
L
D
 
T
A
 
G
I
 
-
N
 
-
L
 
L
S
 
S
T
 
T
E
 
E
-
 
Q
Y
 
V
D
 
N
H
 
E
F
 
L
D
 
I
R
 
A
D
 
D
S
 
G
C
x
T
L
x
I
R
x
Y
S
 
G
A
x
G
I
x
M
T
 
L
F
 
P
T
x
K
V
 
I
E
 
R
-
 
C
Q
 
A
M
 
L
K
 
E
D
 
A
L
 
V
L
 
Q
D
 
G
R
 
G
L
 
V
P
 
T
P
 
S
E
 
A
S
 
H
S
 
I
I
 
I
S
 
D
I
 
G
T
 
R
N
 
V
P
 
P
A
 
N
N
 
A
L
 
V
A
 
L
N
 
L
E
 
E
L
 
I
F
 
F
T
 
T
H
 
D
K
 
S
G
 
G
S
 
V
G
 
G
T
 
T
L
 
L
V
 
I

Sites not aligning to the query:

3l86A The crystal structure of smu.665 from streptococcus mutans ua159
30% identity, 25% coverage: 122:231/448 of query aligns to 83:194/245 of 3l86A

query
sites
3l86A
R
 
K
S
 
N
L
 
L
V
 
Q
E
 
E
R
 
K
L
 
L
R
 
R
R
 
Q
K
 
A
G
 
G
V
 
V
R
 
S
A
 
C
T
 
Q
S
 
Q
I
 
L
T
 
K
G
 
S
G
 
D
-
 
I
-
 
K
-
 
H
V
 
V
F
 
V
E
 
A
A
 
A
G
 
D
H
 
Y
L
 
L
G
 
D
R
 
K
E
 
D
V
 
T
R
 
Y
G
 
G
S
 
Y
L
 
V
G
 
G
T
 
D
V
 
V
R
 
T
A
 
H
V
 
I
R
 
N
L
 
K
A
 
R
P
 
V
V
 
I
E
 
E
A
 
E
S
 
F
L
 
L
H
 
E
A
 
N
G
 
R
S
 
Q
I
 
I
P
 
P
V
 
I
I
 
L
S
 
A
S
|
S
L
 
L
G
 
G
E
 
Y
T
 
S
A
 
K
G
 
E
G
 
G
Q
 
D
S
 
M
L
 
L
G
x
N
I
|
I
E
x
N
C
x
A
D
|
D
R
 
Y
A
 
L
T
 
A
N
 
T
A
 
A
L
 
V
V
 
A
R
 
V
L
 
A
L
 
L
Q
 
A
P
 
A
F
 
D
K
 
K
I
 
L
I
 
I
F
 
L
L
 
M
T
|
T
G
 
N
A
 
V
G
 
K
G
 
G
L
 
V
L
|
L
D
 
E
A
 
-
N
 
N
G
 
G
R
 
A
V
 
V
I
 
L
D
 
E
A
 
K
I
 
I

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_012977261.1 NCBI__GCF_000010725.1:WP_012977261.1
MTLPVLQSETRQTIVRLLSILASTKEINQYLKRFSQLDAKRFAVVNINDAILRDGVEAEA
VASSLSFLQAVGLTPIVLLGTAPGSREEPPASGVDEESGDGPDREAPAGPAFPYETFQAL
NRSLVERLRRKGVRATSITGGVFEAGHLGREVRGSLGTVRAVRLAPVEASLHAGSIPVIS
SLGETAGGQSLGIECDRATNALVRLLQPFKIIFLTGAGGLLDANGRVIDAINLSTEYDHF
DRDSCLRSAITFTVEQMKDLLDRLPPESSISITNPANLANELFTHKGSGTLVRRGERVSR
ATCWDELDLTRLRMLIESSFGRRLVEDYFQRTRLLRAYVSENYRAAVILTEEDGVPYLDK
FAVLDEAQGEGLGRAVWKVMRKETPQLFWRSRHKNQINIFYYAQSDGCFKQEKWKVFWCG
LDDFSQIEKCVAHCAVRRPTLIESEAGH

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory