SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_012991686.1 NCBI__GCF_000025605.1:WP_012991686.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1isoA Isocitrate dehydrogenase: structure of an engineered NADP+--> NAD+ specificity-reversal mutant (see paper)
49% identity, 98% coverage: 11:419/419 of query aligns to 2:414/414 of 1isoA

query
sites
1isoA
K
 
K
A
 
V
V
 
V
L
 
V
P
 
P
Q
 
A
E
 
Q
G
 
G
S
 
K
F
 
K
I
 
I
K
 
T
L
 
L
L
 
-
P
 
Q
D
 
N
K
 
G
R
 
K
I
 
L
E
 
N
V
 
V
P
 
P
H
 
E
N
 
N
P
 
P
I
 
I
I
 
I
P
 
P
F
 
Y
I
 
I
E
 
E
G
 
G
D
 
D
G
 
G
I
|
I
G
 
G
P
 
V
E
 
D
I
 
V
A
 
T
P
 
P
A
 
A
M
 
M
I
 
L
L
 
K
V
 
V
V
 
V
N
 
D
R
 
A
A
 
A
V
 
V
E
 
E
K
 
K
A
 
A
Y
 
Y
G
 
K
G
 
G
S
 
E
R
 
R
L
 
K
I
 
I
Y
 
S
W
 
W
V
 
M
E
 
E
L
 
I
L
 
Y
A
 
T
G
 
G
D
 
E
K
 
K
A
 
S
E
 
T
A
 
Q
L
 
V
T
 
Y
G
 
G
K
 
Q
R
 
D
-
 
V
-
 
W
M
 
L
P
 
P
E
 
A
E
 
E
T
 
T
L
 
L
E
 
D
V
 
L
L
 
I
K
 
R
E
 
E
A
 
Y
V
 
R
V
 
V
S
 
A
I
 
I
K
 
K
G
 
G
P
 
P
L
 
L
G
 
T
T
 
T
P
 
P
V
 
V
G
 
G
K
 
G
G
 
G
G
 
I
K
 
R
S
 
S
L
 
L
N
 
N
A
 
V
I
 
A
L
 
L
R
 
R
Q
 
Q
S
 
E
M
 
L
D
 
D
F
 
L
Y
 
Y
S
 
I
A
 
C
I
 
L
R
 
R
P
 
P
V
 
V
-
 
R
Y
 
Y
W
 
Y
L
 
Q
G
 
G
Q
 
T
P
 
P
A
 
S
P
 
P
I
 
V
P
 
K
E
 
H
P
 
P
H
 
E
R
 
L
V
 
T
N
 
D
V
 
M
T
 
V
V
 
I
F
 
F
R
 
R
E
 
E
N
 
N
S
 
S
D
 
E
D
 
D
V
 
I
Y
|
Y
M
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
E
Y
 
W
M
 
K
P
 
A
G
 
D
S
 
S
Q
 
A
D
 
D
T
 
A
Q
 
E
K
 
K
V
 
V
R
 
I
K
 
K
F
 
F
F
 
L
L
 
R
E
 
E
E
 
E
M
 
M
G
 
G
V
 
V
S
 
K
P
 
K
Y
 
I
A
 
R
L
 
F
P
 
P
E
 
E
D
 
H
C
 
C
G
 
G
I
 
I
T
 
G
V
 
I
K
 
K
P
 
P
M
 
M
S
 
S
E
 
E
Y
 
E
K
 
G
T
 
T
K
 
K
R
 
R
H
 
L
V
 
V
R
 
R
K
 
A
A
 
A
L
 
I
R
 
E
Y
 
Y
A
 
A
L
 
I
E
 
A
K
 
N
G
 
D
L
 
R
K
 
D
V
 
S
V
 
V
A
 
T
V
 
L
V
 
V
G
 
H
K
|
K
G
 
G
N
 
N
I
 
I
M
 
M
K
 
K
A
 
F
T
 
T
E
 
E
G
 
G
A
 
A
F
 
F
M
 
K
N
 
D
W
 
W
A
 
G
F
 
Y
E
 
Q
V
 
L
A
 
A
K
 
R
E
 
E
P
 
-
E
 
E
F
 
F
E
 
G
G
 
G
R
 
E
V
 
L
I
 
I
T
 
D
E
 
G
G
 
G
-
 
P
-
 
W
-
 
L
-
 
K
-
 
V
-
 
K
E
 
N
P
 
P
K
 
N
D
 
T
G
 
G
-
 
K
Q
 
E
V
 
I
L
 
V
L
 
I
T
 
K
R
 
D
V
 
V
I
 
I
T
 
A
D
|
D
Q
 
A
M
 
F
L
 
L
M
 
Q
Q
 
Q
L
 
I
V
 
L
L
 
L
K
 
R
P
 
P
E
 
A
A
 
E
Y
 
Y
H
 
D
V
 
V
I
 
I
I
 
A
T
 
C
Q
 
M
N
 
N
L
 
L
N
 
N
G
 
G
D
|
D
Y
 
Y
I
 
I
S
 
S
D
|
D
L
 
A
A
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
Q
V
 
V
G
 
G
G
 
G
P
 
I
G
 
G
F
 
I
V
 
A
P
 
P
S
 
G
G
 
A
N
 
N
I
 
I
G
 
G
D
 
D
G
 
E
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
F
E
 
E
S
 
A
T
 
T
H
|
H
G
|
G
T
 
T
A
|
A
Y
 
P
D
|
D
I
 
I
A
 
A
G
 
G
K
 
Q
N
 
D
I
 
K
A
|
A
N
|
N
P
 
P
L
 
G
S
 
S
L
 
I
T
 
I
L
 
L
S
 
S
G
 
A
A
 
E
M
 
M
M
 
M
L
 
L
E
 
R
Y
 
H
L
 
M
G
 
G
W
 
W
K
 
T
E
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
D
L
 
L
I
 
I
Y
 
V
D
 
-
A
 
-
V
 
-
K
 
-
K
 
K
A
 
G
I
 
M
E
 
E
D
 
G
R
 
A
L
 
I
G
 
N
T
 
A
P
 
K
D
 
T
I
 
V
A
 
T
K
 
K
G
 
D
F
 
F
E
 
E
K
 
S
M
 
L
G
 
M
V
 
D
E
 
G
A
 
A
K
 
K
A
 
L
L
 
L
S
 
K
T
 
C
M
 
S
E
 
E
F
 
F
A
 
G
Q
 
D
A
 
A
I
 
I
A
 
I
E
 
E
R
 
N
I
 
M

Q02NB5 Isocitrate dehydrogenase [NADP]; IDH; IDP; NADP(+)-specific ICDH; Oxalosuccinate decarboxylase; EC 1.1.1.42 from Pseudomonas aeruginosa (strain UCBPP-PA14) (see 2 papers)
48% identity, 98% coverage: 11:419/419 of query aligns to 5:418/418 of Q02NB5

query
sites
Q02NB5
K
 
K
A
 
I
V
 
Q
L
 
V
P
 
P
Q
 
A
E
 
T
G
 
G
S
 
D
F
 
K
I
 
I
K
 
T
L
 
V
L
 
N
P
 
A
D
 
D
K
 
M
R
 
S
I
 
L
E
 
S
V
 
V
P
 
P
H
 
K
N
 
N
P
 
P
I
 
I
I
 
I
P
 
P
F
 
F
I
 
I
E
 
E
G
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
I
G
 
G
P
 
V
E
 
D
I
 
I
A
 
S
P
 
P
A
 
V
M
 
M
I
 
I
L
 
K
V
 
V
V
 
V
N
 
D
R
 
A
A
 
A
V
 
V
E
 
E
K
 
K
A
 
A
Y
 
Y
G
 
K
G
 
G
S
 
E
R
 
R
L
 
K
I
 
I
Y
 
A
W
 
W
V
 
M
E
 
E
L
 
V
L
 
Y
A
 
A
G
 
G
D
 
E
K
 
K
A
 
A
E
 
T
A
 
Q
L
 
V
T
 
Y
G
 
D
K
 
Q
R
 
D
-
 
T
-
 
W
M
 
L
P
 
P
E
 
Q
E
 
E
T
 
T
L
 
L
E
 
D
V
 
A
L
 
V
K
 
R
E
 
D
A
 
Y
V
 
V
V
 
V
S
 
S
I
 
I
K
 
K
G
 
G
P
 
P
L
 
L
G
 
T
T
 
T
P
 
P
V
 
V
G
 
G
K
 
G
G
 
G
G
 
I
K
 
R
S
|
S
L
 
L
N
 
N
A
 
V
I
 
A
L
 
L
R
 
R
Q
 
Q
S
 
Q
M
 
L
D
 
D
F
 
L
Y
 
Y
S
 
V
A
 
C
I
 
Q
R
 
R
P
 
P
V
 
V
Y
 
R
W
 
W
L
 
F
-
 
E
G
 
G
Q
 
V
P
 
P
A
 
S
P
 
P
I
 
V
P
 
K
E
 
K
P
 
P
H
 
G
R
 
D
V
 
V
N
 
D
V
 
M
T
 
V
V
 
I
F
 
F
R
 
R
E
 
E
N
 
N
S
 
S
D
 
E
D
 
D
V
 
I
Y
 
Y
M
 
A
G
 
G
I
 
V
E
 
E
Y
 
W
M
 
K
P
 
A
G
 
G
S
 
S
Q
 
P
D
 
E
T
 
A
Q
 
E
K
 
K
V
 
V
R
 
I
K
 
K
F
 
F
F
 
L
L
 
T
E
 
E
E
 
E
M
 
M
G
 
G
V
 
V
S
 
K
P
 
K
Y
 
I
A
 
R
L
 
F
P
x
T
E
 
E
D
 
N
C
 
C
G
 
G
I
 
I
T
 
G
V
 
I
K
 
K
P
 
P
M
 
V
S
 
S
E
 
Q
Y
 
E
K
 
G
T
 
T
K
 
K
R
 
R
H
 
L
V
 
V
R
 
R
K
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
L
 
V
E
 
D
K
 
N
G
 
D
L
 
R
K
 
S
V
 
S
V
 
V
A
 
T
V
 
L
V
 
V
G
 
H
K
 
K
G
 
G
N
 
N
I
 
I
M
 
M
K
 
K
A
 
F
T
 
T
E
 
E
G
 
G
A
 
A
F
 
F
M
 
K
N
 
D
W
 
W
A
 
G
F
 
Y
E
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
R
E
 
D
P
 
-
E
 
E
F
 
F
E
 
G
G
 
A
R
 
E
V
 
L
I
 
L
T
 
D
E
 
G
G
 
G
-
 
P
-
 
W
-
 
M
-
 
Q
-
 
F
-
 
K
E
 
N
P
 
P
K
 
K
D
 
T
G
 
G
Q
 
K
-
 
N
V
 
V
L
 
V
L
 
V
T
 
K
R
 
D
V
 
V
I
 
I
T
 
A
D
 
D
Q
 
A
M
 
M
L
 
L
M
 
Q
Q
 
Q
L
 
I
V
 
L
L
 
L
K
 
R
P
 
P
E
 
A
A
 
E
Y
 
Y
H
 
D
V
 
V
I
 
I
I
 
A
T
 
T
Q
 
L
N
 
N
L
 
L
N
 
N
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
I
 
L
S
 
S
D
 
D
L
 
A
A
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
E
V
 
V
G
 
G
G
 
G
P
 
I
G
 
G
F
 
I
V
 
A
P
 
P
S
 
G
G
 
A
N
 
N
I
 
L
G
 
S
D
 
D
G
 
S
Y
 
V
A
 
A
L
 
M
F
 
F
E
 
E
S
 
A
T
 
T
H
 
H
G
 
G
T
 
T
A
 
A
Y
 
P
D
 
K
I
 
Y
A
 
A
G
 
G
K
 
Q
N
 
D
I
 
K
A
 
V
N
 
N
P
 
P
L
 
G
S
 
S
L
 
L
T
 
I
L
 
L
S
 
S
G
 
A
A
 
E
M
 
M
M
 
M
L
 
L
E
 
R
Y
 
H
L
 
M
G
 
G
W
 
W
K
 
T
E
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
D
L
 
L
I
 
I
Y
 
I
D
 
K
A
 
G
V
 
T
K
 
N
K
 
G
A
 
A
I
 
I
E
 
A
D
 
A
R
 
K
L
 
T
G
 
V
T
 
T
P
 
Y
D
 
D
I
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
F
 
F
E
 
E
K
 
R
M
 
L
G
 
M
V
 
D
E
 
G
A
 
A
K
 
T
A
 
L
L
 
L
S
 
S
T
 
C
M
 
S
E
 
E
F
 
F
A
 
G
Q
 
D
A
 
A
I
 
M
A
 
I
E
 
A
R
 
K
I
 
M

4ajaA 3d structure of e. Coli isocitrate dehydrogenase in complex with isocitrate, calcium(ii) and thionadp (see paper)
48% identity, 98% coverage: 9:419/419 of query aligns to 1:415/415 of 4ajaA

query
sites
4ajaA
E
 
E
G
 
S
K
 
K
A
 
V
V
 
V
L
 
V
P
 
P
Q
 
A
E
 
Q
G
 
G
S
 
K
F
 
K
I
 
I
K
 
T
L
 
L
L
 
-
P
 
Q
D
 
N
K
 
G
R
 
K
I
 
L
E
 
N
V
 
V
P
 
P
H
 
E
N
 
N
P
 
P
I
 
I
I
 
I
P
 
P
F
 
Y
I
 
I
E
 
E
G
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
I
G
 
G
P
 
V
E
 
D
I
 
V
A
 
T
P
 
P
A
 
A
M
 
M
I
 
L
L
 
K
V
 
V
V
 
V
N
 
D
R
 
A
A
 
A
V
 
V
E
 
E
K
 
K
A
 
A
Y
 
Y
G
 
K
G
 
G
S
 
E
R
 
R
L
 
K
I
 
I
Y
 
S
W
 
W
V
 
M
E
 
E
L
 
I
L
 
Y
A
 
T
G
 
G
D
 
E
K
 
K
A
 
S
E
 
T
A
 
Q
L
 
V
T
 
Y
G
 
G
K
 
Q
R
 
D
-
 
V
-
 
W
M
 
L
P
 
P
E
 
A
E
 
E
T
 
T
L
 
L
E
 
D
V
 
L
L
 
I
K
 
R
E
 
E
A
 
Y
V
 
R
V
 
V
S
 
A
I
 
I
K
 
K
G
 
G
P
 
P
L
 
L
G
x
T
T
|
T
P
 
P
V
 
V
G
 
G
K
 
G
G
 
G
G
 
I
K
 
R
S
 
S
L
 
L
N
 
N
A
 
V
I
 
A
L
 
L
R
 
R
Q
 
Q
S
 
E
M
 
L
D
 
D
F
 
L
Y
 
Y
S
 
I
A
 
C
I
 
L
R
 
R
P
 
P
V
 
V
-
 
R
Y
 
Y
W
 
Y
L
 
Q
G
 
G
Q
 
T
P
 
P
A
 
S
P
 
P
I
 
V
P
 
K
E
 
H
P
 
P
H
 
E
R
 
L
V
 
T
N
 
D
V
 
M
T
 
V
V
 
I
F
 
F
R
 
R
E
 
E
N
 
N
S
 
S
D
 
E
D
 
D
V
 
I
Y
|
Y
M
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
E
Y
 
W
M
 
K
P
 
A
G
 
D
S
 
S
Q
 
A
D
 
D
T
 
A
Q
 
E
K
 
K
V
 
V
R
 
I
K
 
K
F
 
F
F
 
L
L
 
R
E
 
E
E
 
E
M
 
M
G
 
G
V
 
V
S
 
K
P
 
K
Y
 
I
A
 
R
L
 
F
P
 
P
E
 
E
D
 
H
C
 
C
G
 
G
I
 
I
T
 
G
V
 
I
K
 
K
P
 
P
M
 
C
S
 
S
E
 
E
Y
 
E
K
 
G
T
 
T
K
 
K
R
 
R
H
 
L
V
 
V
R
 
R
K
 
A
A
 
A
L
 
I
R
 
E
Y
 
Y
A
 
A
L
 
I
E
 
A
K
 
N
G
 
D
L
 
R
K
 
D
V
 
S
V
 
V
A
 
T
V
 
L
V
 
V
G
 
H
K
|
K
G
 
G
N
 
N
I
 
I
M
 
M
K
 
K
A
 
F
T
 
T
E
 
E
G
 
G
A
 
A
F
 
F
M
 
K
N
 
D
W
 
W
A
 
G
F
 
Y
E
 
Q
V
 
L
A
 
A
K
 
R
E
 
E
P
 
-
E
 
E
F
 
F
E
 
G
G
 
G
R
 
E
V
 
L
I
 
I
T
 
D
E
 
G
G
 
G
-
 
P
-
 
W
-
 
L
-
 
K
-
 
V
-
 
K
E
 
N
P
 
P
K
 
N
D
 
T
G
 
G
-
 
K
Q
 
E
V
 
I
L
 
V
L
 
I
T
 
K
R
 
D
V
 
V
I
 
I
T
 
A
D
|
D
Q
 
A
M
 
F
L
 
L
M
 
Q
Q
 
Q
L
 
I
V
 
L
L
 
L
K
 
R
P
 
P
E
 
A
A
 
E
Y
 
Y
H
 
D
V
 
V
I
 
I
I
 
A
T
 
C
Q
 
M
N
 
N
L
 
L
N
 
N
G
 
G
D
|
D
Y
 
Y
I
 
I
S
 
S
D
|
D
L
 
A
A
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
Q
V
 
V
G
 
G
G
 
G
P
 
I
G
 
G
F
 
I
V
 
A
P
 
P
S
 
G
G
 
A
N
 
N
I
 
I
G
 
G
D
 
D
G
 
E
Y
 
C
A
 
A
L
 
L
F
 
F
E
 
E
S
 
A
T
 
T
H
|
H
G
|
G
T
|
T
A
|
A
Y
 
P
D
 
K
I
x
Y
A
 
A
G
 
G
K
 
Q
N
 
D
I
 
K
A
 
V
N
|
N
P
 
P
L
 
G
S
 
S
L
 
I
T
 
I
L
 
L
S
 
S
G
 
A
A
 
E
M
 
M
M
 
M
L
 
L
E
 
R
Y
 
H
L
 
M
G
 
G
W
 
W
K
 
T
E
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
D
L
 
L
I
 
I
Y
 
V
D
 
K
A
 
G
V
 
M
K
 
E
K
 
G
A
 
A
I
 
I
E
 
N
D
 
A
R
 
K
L
 
T
G
 
V
T
 
T
P
x
Y
D
|
D
I
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
F
 
F
E
 
E
K
x
R
M
 
L
G
 
M
V
 
D
E
 
G
A
 
A
K
 
K
A
 
L
L
 
L
S
 
K
T
 
C
M
 
S
E
 
E
F
 
F
A
 
G
Q
 
D
A
 
A
I
 
I
A
 
I
E
 
E
R
 
N
I
 
M

4aj3A 3d structure of e. Coli isocitrate dehydrogenase in complex with isocitrate, calcium(ii) and NADP - the pseudo-michaelis complex (see paper)
48% identity, 98% coverage: 9:419/419 of query aligns to 2:416/416 of 4aj3A

query
sites
4aj3A
E
 
E
G
 
S
K
 
K
A
 
V
V
 
V
L
 
V
P
 
P
Q
 
A
E
 
Q
G
 
G
S
 
K
F
 
K
I
 
I
K
 
T
L
 
L
L
 
-
P
 
Q
D
 
N
K
 
G
R
 
K
I
 
L
E
 
N
V
 
V
P
 
P
H
 
E
N
 
N
P
 
P
I
 
I
I
 
I
P
 
P
F
 
Y
I
 
I
E
 
E
G
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
I
G
 
G
P
 
V
E
 
D
I
 
V
A
 
T
P
 
P
A
 
A
M
 
M
I
 
L
L
 
K
V
 
V
V
 
V
N
 
D
R
 
A
A
 
A
V
 
V
E
 
E
K
 
K
A
 
A
Y
 
Y
G
 
K
G
 
G
S
 
E
R
 
R
L
 
K
I
 
I
Y
 
S
W
 
W
V
 
M
E
 
E
L
 
I
L
 
Y
A
 
T
G
 
G
D
 
E
K
 
K
A
 
S
E
 
T
A
 
Q
L
 
V
T
 
Y
G
 
G
K
 
Q
R
 
D
-
 
V
-
 
W
M
 
L
P
 
P
E
 
A
E
 
E
T
 
T
L
 
L
E
 
D
V
 
L
L
 
I
K
 
R
E
 
E
A
 
Y
V
 
R
V
 
V
S
 
A
I
 
I
K
 
K
G
 
G
P
|
P
L
|
L
G
 
T
T
|
T
P
 
P
V
 
V
G
 
G
K
 
G
G
 
G
G
 
I
K
 
R
S
 
S
L
 
L
N
|
N
A
 
V
I
 
A
L
 
L
R
 
R
Q
 
Q
S
 
E
M
 
L
D
 
D
F
 
L
Y
 
Y
S
 
I
A
 
C
I
 
L
R
 
R
P
 
P
V
 
V
-
 
R
Y
 
Y
W
 
Y
L
 
Q
G
 
G
Q
 
T
P
 
P
A
 
S
P
 
P
I
 
V
P
 
K
E
 
H
P
 
P
H
 
E
R
 
L
V
 
T
N
 
D
V
 
M
T
 
V
V
 
I
F
 
F
R
 
R
E
 
E
N
 
N
S
 
S
D
 
E
D
 
D
V
 
I
Y
|
Y
M
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
E
Y
 
W
M
 
K
P
 
A
G
 
D
S
 
S
Q
 
A
D
 
D
T
 
A
Q
 
E
K
 
K
V
 
V
R
 
I
K
 
K
F
 
F
F
 
L
L
 
R
E
 
E
E
 
E
M
 
M
G
 
G
V
 
V
S
 
K
P
 
K
Y
 
I
A
 
R
L
 
F
P
 
P
E
 
E
D
 
H
C
 
C
G
 
G
I
 
I
T
 
G
V
 
I
K
 
K
P
 
P
M
 
C
S
 
S
E
 
E
Y
 
E
K
 
G
T
 
T
K
 
K
R
 
R
H
 
L
V
 
V
R
 
R
K
 
A
A
 
A
L
 
I
R
 
E
Y
 
Y
A
 
A
L
 
I
E
 
A
K
 
N
G
 
D
L
 
R
K
 
D
V
 
S
V
 
V
A
 
T
V
 
L
V
 
V
G
 
H
K
|
K
G
 
G
N
 
N
I
 
I
M
 
M
K
 
K
A
 
F
T
 
T
E
 
E
G
 
G
A
 
A
F
 
F
M
 
K
N
 
D
W
 
W
A
 
G
F
 
Y
E
 
Q
V
 
L
A
 
A
K
 
R
E
 
E
P
 
-
E
 
E
F
 
F
E
 
G
G
 
G
R
 
E
V
 
L
I
 
I
T
 
D
E
 
G
G
 
G
-
 
P
-
 
W
-
 
L
-
 
K
-
 
V
-
 
K
E
 
N
P
 
P
K
 
N
D
 
T
G
 
G
-
 
K
Q
 
E
V
 
I
L
 
V
L
 
I
T
 
K
R
 
D
V
 
V
I
 
I
T
 
A
D
|
D
Q
 
A
M
 
F
L
 
L
M
 
Q
Q
 
Q
L
 
I
V
 
L
L
 
L
K
 
R
P
 
P
E
 
A
A
 
E
Y
 
Y
H
 
D
V
 
V
I
 
I
I
 
A
T
 
C
Q
 
M
N
 
N
L
 
L
N
 
N
G
 
G
D
|
D
Y
 
Y
I
 
I
S
 
S
D
|
D
L
 
A
A
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
Q
V
 
V
G
 
G
G
 
G
P
x
I
G
 
G
F
 
I
V
 
A
P
 
P
S
 
G
G
 
A
N
 
N
I
 
I
G
 
G
D
 
D
G
 
E
Y
 
C
A
 
A
L
 
L
F
 
F
E
|
E
S
 
A
T
 
T
H
|
H
G
|
G
T
|
T
A
|
A
Y
 
P
D
 
K
I
x
Y
A
 
A
G
 
G
K
 
Q
N
 
D
I
 
K
A
x
V
N
|
N
P
 
P
L
 
G
S
 
S
L
 
I
T
 
I
L
 
L
S
 
S
G
 
A
A
 
E
M
 
M
M
 
M
L
 
L
E
 
R
Y
 
H
L
 
M
G
 
G
W
 
W
K
 
T
E
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
D
L
 
L
I
 
I
Y
 
V
D
 
K
A
 
G
V
 
M
K
 
E
K
 
G
A
 
A
I
 
I
E
 
N
D
 
A
R
 
K
L
 
T
G
 
V
T
 
T
P
x
Y
D
|
D
I
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
F
 
F
E
 
E
K
 
R
M
 
L
G
 
M
V
 
D
E
 
G
A
 
A
K
 
K
A
 
L
L
 
L
S
 
K
T
 
C
M
 
S
E
 
E
F
 
F
A
 
G
Q
 
D
A
 
A
I
 
I
A
 
I
E
 
E
R
 
N
I
 
M

P08200 Isocitrate dehydrogenase [NADP]; IDH; IDP; NADP(+)-dependent isocitric dehydrogenase; NADP(+)-specific ICDH; Oxalosuccinate decarboxylase; EC 1.1.1.42 from Escherichia coli (strain K12) (see 9 papers)
48% identity, 98% coverage: 9:419/419 of query aligns to 2:416/416 of P08200

query
sites
P08200
E
 
E
G
 
S
K
 
K
A
 
V
V
 
V
L
 
V
P
 
P
Q
 
A
E
 
Q
G
 
G
S
 
K
F
 
K
I
 
I
K
 
T
L
 
L
L
 
-
P
 
Q
D
 
N
K
 
G
R
 
K
I
 
L
E
 
N
V
 
V
P
 
P
H
 
E
N
 
N
P
 
P
I
 
I
I
 
I
P
 
P
F
 
Y
I
 
I
E
 
E
G
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
I
G
 
G
P
 
V
E
 
D
I
 
V
A
 
T
P
 
P
A
 
A
M
 
M
I
 
L
L
 
K
V
 
V
V
 
V
N
 
D
R
 
A
A
 
A
V
 
V
E
 
E
K
 
K
A
 
A
Y
 
Y
G
 
K
G
 
G
S
 
E
R
 
R
L
 
K
I
 
I
Y
 
S
W
 
W
V
 
M
E
 
E
L
 
I
L
 
Y
A
 
T
G
 
G
D
 
E
K
 
K
A
 
S
E
 
T
A
 
Q
L
 
V
T
 
Y
G
 
G
K
 
Q
R
 
D
-
 
V
-
 
W
M
 
L
P
 
P
E
 
A
E
 
E
T
 
T
L
 
L
E
 
D
V
 
L
L
 
I
K
 
R
E
 
E
A
 
Y
V
 
R
V
 
V
S
 
A
I
 
I
K
|
K
G
 
G
P
 
P
L
 
L
G
x
T
T
 
T
P
 
P
V
 
V
G
 
G
K
 
G
G
 
G
G
 
I
K
 
R
S
|
S
L
 
L
N
|
N
A
 
V
I
 
A
L
 
L
R
|
R
Q
 
Q
S
 
E
M
 
L
D
 
D
F
 
L
Y
 
Y
S
 
I
A
 
C
I
 
L
R
|
R
P
 
P
V
 
V
-
 
R
Y
 
Y
W
 
Y
L
 
Q
G
 
G
Q
 
T
P
 
P
A
 
S
P
 
P
I
 
V
P
x
K
E
 
H
P
 
P
H
 
E
R
 
L
V
 
T
N
 
D
V
 
M
T
 
V
V
 
I
F
 
F
R
|
R
E
 
E
N
 
N
S
 
S
D
 
E
D
 
D
V
 
I
Y
|
Y
M
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
E
Y
 
W
M
 
K
P
 
A
G
 
D
S
 
S
Q
 
A
D
 
D
T
 
A
Q
 
E
K
 
K
V
 
V
R
 
I
K
 
K
F
 
F
F
 
L
L
 
R
E
 
E
E
 
E
M
 
M
G
 
G
V
 
V
S
 
K
P
 
K
Y
 
I
A
 
R
L
 
F
P
 
P
E
 
E
D
 
H
C
 
C
G
 
G
I
 
I
T
 
G
V
 
I
K
 
K
P
 
P
M
 
C
S
 
S
E
 
E
Y
 
E
K
 
G
T
 
T
K
 
K
R
 
R
H
 
L
V
 
V
R
 
R
K
 
A
A
 
A
L
 
I
R
 
E
Y
 
Y
A
 
A
L
 
I
E
 
A
K
 
N
G
 
D
L
 
R
K
 
D
V
 
S
V
 
V
A
 
T
V
 
L
V
 
V
G
 
H
K
|
K
G
 
G
N
 
N
I
 
I
M
 
M
K
 
K
A
 
F
T
 
T
E
 
E
G
 
G
A
 
A
F
 
F
M
x
K
N
 
D
W
 
W
A
 
G
F
 
Y
E
 
Q
V
 
L
A
 
A
K
 
R
E
 
E
P
 
-
E
 
E
F
 
F
E
 
G
G
 
G
R
 
E
V
 
L
I
 
I
T
 
D
E
 
G
G
 
G
-
 
P
-
 
W
-
 
L
-
 
K
-
 
V
-
 
K
E
 
N
P
 
P
K
 
N
D
 
T
G
 
G
-
 
K
Q
 
E
V
 
I
L
 
V
L
 
I
T
 
K
R
 
D
V
 
V
I
 
I
T
 
A
D
 
D
Q
 
A
M
 
F
L
 
L
M
 
Q
Q
 
Q
L
 
I
V
 
L
L
 
L
K
 
R
P
 
P
E
 
A
A
 
E
Y
 
Y
H
 
D
V
 
V
I
 
I
I
 
A
T
 
C
Q
 
M
N
 
N
L
 
L
N
 
N
G
 
G
D
|
D
Y
 
Y
I
 
I
S
 
S
D
|
D
L
 
A
A
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
Q
V
 
V
G
 
G
G
 
G
P
 
I
G
 
G
F
 
I
V
 
A
P
 
P
S
 
G
G
 
A
N
 
N
I
 
I
G
 
G
D
 
D
G
 
E
Y
 
C
A
 
A
L
 
L
F
 
F
E
 
E
S
 
A
T
 
T
H
|
H
G
|
G
T
|
T
A
|
A
Y
x
P
D
x
K
I
x
Y
A
 
A
G
 
G
K
 
Q
N
 
D
I
 
K
A
 
V
N
|
N
P
 
P
L
 
G
S
 
S
L
 
I
T
 
I
L
 
L
S
 
S
G
 
A
A
 
E
M
 
M
M
 
M
L
 
L
E
 
R
Y
 
H
L
 
M
G
 
G
W
 
W
K
 
T
E
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
D
L
 
L
I
 
I
Y
 
V
D
 
K
A
 
G
V
 
M
K
 
E
K
 
G
A
 
A
I
 
I
E
 
N
D
 
A
R
 
K
L
 
T
G
 
V
T
 
T
P
x
Y
D
 
D
I
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
F
 
F
E
 
E
K
x
R
M
 
L
G
 
M
V
 
D
E
 
G
A
 
A
K
 
K
A
 
L
L
 
L
S
 
K
T
 
C
M
 
S
E
 
E
F
 
F
A
 
G
Q
 
D
A
 
A
I
 
I
A
 
I
E
 
E
R
 
N
I
 
M

1bl5A Isocitrate dehydrogenase from e. Coli single turnover laue structure of rate-limited product complex, 10 msec time resolution (see paper)
48% identity, 98% coverage: 11:419/419 of query aligns to 2:414/414 of 1bl5A

query
sites
1bl5A
K
 
K
A
 
V
V
 
V
L
 
V
P
 
P
Q
 
A
E
 
Q
G
 
G
S
 
K
F
 
K
I
 
I
K
 
T
L
 
L
L
 
-
P
 
Q
D
 
N
K
 
G
R
 
K
I
 
L
E
 
N
V
 
V
P
 
P
H
 
E
N
 
N
P
 
P
I
 
I
I
 
I
P
 
P
F
 
Y
I
 
I
E
 
E
G
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
I
G
 
G
P
 
V
E
 
D
I
 
V
A
 
T
P
 
P
A
 
A
M
 
M
I
 
L
L
 
K
V
 
V
V
 
V
N
 
D
R
 
A
A
 
A
V
 
V
E
 
E
K
 
K
A
 
A
Y
 
Y
G
 
K
G
 
G
S
 
E
R
 
R
L
 
K
I
 
I
Y
 
S
W
 
W
V
 
M
E
 
E
L
 
I
L
 
Y
A
 
T
G
 
G
D
 
E
K
 
K
A
 
S
E
 
T
A
 
Q
L
 
V
T
 
Y
G
 
G
K
 
Q
R
 
D
-
 
V
-
 
W
M
 
L
P
 
P
E
 
A
E
 
E
T
 
T
L
 
L
E
 
D
V
 
L
L
 
I
K
 
R
E
 
E
A
 
Y
V
 
R
V
 
V
S
 
A
I
 
I
K
 
K
G
 
G
P
 
P
L
 
L
G
 
T
T
 
T
P
 
P
V
 
V
G
 
G
K
 
G
G
 
G
G
 
I
K
 
R
S
|
S
L
 
L
N
|
N
A
 
V
I
 
A
L
 
L
R
|
R
Q
 
Q
S
 
E
M
 
L
D
 
D
F
 
L
Y
 
Y
S
 
I
A
 
C
I
 
L
R
|
R
P
 
P
V
 
V
-
 
R
Y
 
Y
W
 
Y
L
 
Q
G
 
G
Q
 
T
P
 
P
A
 
S
P
 
P
I
 
V
P
 
K
E
 
H
P
 
P
H
 
E
R
 
L
V
 
T
N
 
D
V
 
M
T
 
V
V
 
I
F
 
F
R
 
R
E
 
E
N
 
N
S
 
S
D
 
E
D
 
D
V
 
I
Y
|
Y
M
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
E
Y
 
W
M
 
K
P
 
A
G
 
D
S
 
S
Q
 
A
D
 
D
T
 
A
Q
 
E
K
 
K
V
 
V
R
 
I
K
 
K
F
 
F
F
 
L
L
 
R
E
 
E
E
 
E
M
 
M
G
 
G
V
 
V
S
 
K
P
 
K
Y
 
I
A
 
R
L
 
F
P
 
P
E
 
E
D
 
H
C
 
C
G
 
G
I
 
I
T
 
G
V
 
I
K
 
K
P
 
P
M
 
C
S
 
S
E
 
E
Y
 
E
K
 
G
T
 
T
K
 
K
R
 
R
H
 
L
V
 
V
R
 
R
K
 
A
A
 
A
L
 
I
R
 
E
Y
 
Y
A
 
A
L
 
I
E
 
A
K
 
N
G
 
D
L
 
R
K
 
D
V
 
S
V
 
V
A
 
T
V
 
L
V
 
V
G
 
H
K
|
K
G
 
G
N
 
N
I
 
I
M
 
M
K
 
K
A
 
F
T
 
T
E
 
E
G
 
G
A
 
A
F
 
F
M
 
K
N
 
D
W
 
W
A
 
G
F
 
Y
E
 
Q
V
 
L
A
 
A
K
 
R
E
 
E
P
 
-
E
 
E
F
 
F
E
 
G
G
 
G
R
 
E
V
 
L
I
 
I
T
 
D
E
 
G
G
 
G
-
 
P
-
 
W
-
 
L
-
 
K
-
 
V
-
 
K
E
 
N
P
 
P
K
 
N
D
 
T
G
 
G
-
 
K
Q
 
E
V
 
I
L
 
V
L
 
I
T
 
K
R
 
D
V
 
V
I
 
I
T
 
A
D
|
D
Q
 
A
M
 
F
L
 
L
M
 
Q
Q
 
Q
L
 
I
V
 
L
L
 
L
K
 
R
P
 
P
E
 
A
A
 
E
Y
 
Y
H
 
D
V
 
V
I
 
I
I
 
A
T
 
C
Q
 
M
N
 
N
L
 
L
N
 
N
G
 
G
D
|
D
Y
 
Y
I
 
I
S
 
S
D
|
D
L
 
A
A
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
Q
V
 
V
G
 
G
G
 
G
P
 
I
G
 
G
F
 
I
V
 
A
P
 
P
S
 
G
G
 
A
N
 
N
I
 
I
G
 
G
D
 
D
G
 
E
Y
 
C
A
 
A
L
 
L
F
 
F
E
 
E
S
 
A
T
 
T
H
|
H
G
|
G
T
 
T
A
|
A
Y
 
P
D
 
K
I
x
Y
A
 
A
G
 
G
K
 
Q
N
 
D
I
 
K
A
 
V
N
|
N
P
 
P
L
 
G
S
 
S
L
 
I
T
 
I
L
 
L
S
 
S
G
 
A
A
 
E
M
 
M
M
 
M
L
 
L
E
 
R
Y
 
H
L
 
M
G
 
G
W
 
W
K
 
T
E
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
D
L
 
L
I
 
I
Y
 
V
D
 
K
A
 
G
V
 
M
K
 
E
K
 
G
A
 
A
I
 
I
E
 
N
D
 
A
R
 
K
L
 
T
G
 
V
T
 
T
P
x
Y
D
 
D
I
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
F
 
F
E
 
E
K
 
R
M
 
L
G
 
M
V
 
D
E
 
G
A
 
A
K
 
K
A
 
L
L
 
L
S
 
K
T
 
C
M
 
S
E
 
E
F
 
F
A
 
G
Q
 
D
A
 
A
I
 
I
A
 
I
E
 
E
R
 
N
I
 
M

1ai3A Orbital steering in the catalytic power of enzymes: small structural changes with large catalytic consequences (see paper)
48% identity, 98% coverage: 11:419/419 of query aligns to 2:414/414 of 1ai3A

query
sites
1ai3A
K
 
K
A
 
V
V
 
V
L
 
V
P
 
P
Q
 
A
E
 
Q
G
 
G
S
 
K
F
 
K
I
 
I
K
 
T
L
 
L
L
 
-
P
 
Q
D
 
N
K
 
G
R
 
K
I
 
L
E
 
N
V
 
V
P
 
P
H
 
E
N
 
N
P
 
P
I
 
I
I
 
I
P
 
P
F
 
Y
I
 
I
E
 
E
G
 
G
D
 
D
G
 
G
I
|
I
G
 
G
P
 
V
E
 
D
I
 
V
A
 
T
P
 
P
A
 
A
M
 
M
I
 
L
L
 
K
V
 
V
V
 
V
N
 
D
R
 
A
A
 
A
V
 
V
E
 
E
K
 
K
A
 
A
Y
 
Y
G
 
K
G
 
G
S
 
E
R
 
R
L
 
K
I
 
I
Y
 
S
W
 
W
V
 
M
E
 
E
L
 
I
L
 
Y
A
 
T
G
 
G
D
 
E
K
 
K
A
 
S
E
 
T
A
 
Q
L
 
V
T
 
Y
G
 
G
K
 
Q
R
 
D
-
 
V
-
 
W
M
 
L
P
 
P
E
 
A
E
 
E
T
 
T
L
 
L
E
 
D
V
 
L
L
 
I
K
 
R
E
 
E
A
 
Y
V
 
R
V
 
V
S
 
A
I
 
I
K
 
K
G
|
G
P
|
P
L
|
L
G
x
T
T
 
T
P
 
P
V
 
V
G
 
G
K
 
G
G
 
G
G
 
I
K
 
R
S
 
S
L
 
L
N
 
N
A
 
V
I
 
A
L
 
L
R
 
R
Q
 
Q
S
 
E
M
 
L
D
 
D
F
 
L
Y
 
Y
S
 
I
A
 
C
I
 
L
R
 
R
P
 
P
V
 
V
-
 
R
Y
 
Y
W
 
Y
L
 
Q
G
 
G
Q
 
T
P
 
P
A
 
S
P
 
P
I
 
V
P
 
K
E
 
H
P
 
P
H
 
E
R
 
L
V
 
T
N
 
D
V
 
M
T
 
V
V
 
I
F
 
F
R
 
R
E
 
E
N
 
N
S
 
S
D
 
E
D
 
D
V
 
I
Y
|
Y
M
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
E
Y
 
W
M
 
K
P
 
A
G
 
D
S
 
S
Q
 
A
D
 
D
T
 
A
Q
 
E
K
 
K
V
 
V
R
 
I
K
 
K
F
 
F
F
 
L
L
 
R
E
 
E
E
 
E
M
 
M
G
 
G
V
 
V
S
 
K
P
 
K
Y
 
I
A
 
R
L
 
F
P
 
P
E
 
E
D
 
H
C
 
C
G
 
G
I
 
I
T
 
G
V
 
I
K
 
K
P
 
P
M
 
C
S
 
S
E
 
E
Y
 
E
K
 
G
T
 
T
K
 
K
R
 
R
H
 
L
V
 
V
R
 
R
K
 
A
A
 
A
L
 
I
R
 
E
Y
 
Y
A
 
A
L
 
I
E
 
A
K
 
N
G
 
D
L
 
R
K
 
D
V
 
S
V
 
V
A
 
T
V
 
L
V
 
V
G
 
H
K
|
K
G
 
G
N
 
N
I
 
I
M
 
M
K
 
K
A
 
F
T
 
T
E
 
E
G
 
G
A
 
A
F
 
F
M
 
K
N
 
D
W
 
W
A
 
G
F
 
Y
E
 
Q
V
 
L
A
 
A
K
 
R
E
 
E
P
 
-
E
 
E
F
 
F
E
 
G
G
 
G
R
 
E
V
 
L
I
 
I
T
 
D
E
 
G
G
 
G
-
 
P
-
 
W
-
 
L
-
 
K
-
 
V
-
 
K
E
 
N
P
 
P
K
 
N
D
 
T
G
 
G
-
 
K
Q
 
E
V
 
I
L
 
V
L
 
I
T
 
K
R
 
D
V
 
V
I
 
I
T
 
A
D
|
D
Q
 
A
M
 
F
L
 
L
M
 
Q
Q
 
Q
L
 
I
V
 
L
L
 
L
K
 
R
P
 
P
E
 
A
A
 
E
Y
 
Y
H
 
D
V
 
V
I
 
I
I
 
A
T
 
C
Q
 
M
N
 
N
L
 
L
N
 
N
G
 
G
D
|
D
Y
 
Y
I
 
I
S
 
S
D
|
D
L
 
A
A
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
Q
V
 
V
G
 
G
G
 
G
P
 
I
G
 
G
F
 
I
V
 
A
P
 
P
S
 
G
G
 
A
N
 
N
I
 
I
G
 
G
D
 
D
G
 
E
Y
 
C
A
 
A
L
 
L
F
 
F
E
 
E
S
x
A
T
|
T
H
|
H
G
|
G
T
|
T
A
 
A
Y
x
P
D
 
K
I
 
Y
A
 
A
G
 
G
K
 
Q
N
 
D
I
 
K
A
x
V
N
|
N
P
 
P
L
 
G
S
 
S
L
 
I
T
 
I
L
 
L
S
 
S
G
 
A
A
 
E
M
 
M
M
 
M
L
 
L
E
 
R
Y
 
H
L
 
M
G
 
G
W
 
W
K
 
T
E
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
D
L
 
L
I
 
I
Y
 
V
D
 
K
A
 
G
V
 
M
K
 
E
K
 
G
A
 
A
I
 
I
E
 
N
D
 
A
R
 
K
L
 
T
G
 
V
T
 
T
P
x
Y
D
|
D
I
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
F
 
F
E
 
E
K
x
R
M
 
L
G
 
M
V
 
D
E
 
G
A
 
A
K
 
K
A
 
L
L
 
L
S
 
K
T
 
C
M
 
S
E
 
E
F
 
F
A
 
G
Q
 
D
A
 
A
I
 
I
A
 
I
E
 
E
R
 
N
I
 
M

1ai2A Isocitrate dehydrogenase complexed with isocitrate, NADP+, and calcium (flash-cooled) (see paper)
48% identity, 98% coverage: 11:419/419 of query aligns to 2:414/414 of 1ai2A

query
sites
1ai2A
K
 
K
A
 
V
V
 
V
L
 
V
P
 
P
Q
 
A
E
 
Q
G
 
G
S
 
K
F
 
K
I
 
I
K
 
T
L
 
L
L
 
-
P
 
Q
D
 
N
K
 
G
R
 
K
I
 
L
E
 
N
V
 
V
P
 
P
H
 
E
N
 
N
P
 
P
I
 
I
I
 
I
P
 
P
F
 
Y
I
 
I
E
 
E
G
 
G
D
 
D
G
 
G
I
|
I
G
 
G
P
 
V
E
 
D
I
 
V
A
 
T
P
 
P
A
 
A
M
 
M
I
 
L
L
 
K
V
 
V
V
 
V
N
 
D
R
 
A
A
 
A
V
 
V
E
 
E
K
 
K
A
 
A
Y
 
Y
G
 
K
G
 
G
S
 
E
R
 
R
L
 
K
I
 
I
Y
 
S
W
 
W
V
 
M
E
 
E
L
 
I
L
 
Y
A
 
T
G
 
G
D
 
E
K
 
K
A
 
S
E
 
T
A
 
Q
L
 
V
T
 
Y
G
 
G
K
 
Q
R
 
D
-
 
V
-
 
W
M
 
L
P
 
P
E
 
A
E
 
E
T
 
T
L
 
L
E
 
D
V
 
L
L
 
I
K
 
R
E
 
E
A
 
Y
V
 
R
V
 
V
S
 
A
I
 
I
K
 
K
G
 
G
P
 
P
L
|
L
G
x
T
T
 
T
P
 
P
V
 
V
G
 
G
K
 
G
G
 
G
G
 
I
K
 
R
S
|
S
L
 
L
N
|
N
A
 
V
I
 
A
L
 
L
R
|
R
Q
 
Q
S
 
E
M
 
L
D
 
D
F
 
L
Y
 
Y
S
 
I
A
 
C
I
 
L
R
|
R
P
 
P
V
 
V
-
 
R
Y
 
Y
W
 
Y
L
 
Q
G
 
G
Q
 
T
P
 
P
A
 
S
P
 
P
I
 
V
P
 
K
E
 
H
P
 
P
H
 
E
R
 
L
V
 
T
N
 
D
V
 
M
T
 
V
V
 
I
F
 
F
R
 
R
E
 
E
N
 
N
S
 
S
D
 
E
D
 
D
V
 
I
Y
|
Y
M
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
E
Y
 
W
M
 
K
P
 
A
G
 
D
S
 
S
Q
 
A
D
 
D
T
 
A
Q
 
E
K
 
K
V
 
V
R
 
I
K
 
K
F
 
F
F
 
L
L
 
R
E
 
E
E
 
E
M
 
M
G
 
G
V
 
V
S
 
K
P
 
K
Y
 
I
A
 
R
L
 
F
P
 
P
E
 
E
D
 
H
C
 
C
G
 
G
I
 
I
T
 
G
V
 
I
K
 
K
P
 
P
M
 
C
S
 
S
E
 
E
Y
 
E
K
 
G
T
 
T
K
 
K
R
 
R
H
 
L
V
 
V
R
 
R
K
 
A
A
 
A
L
 
I
R
 
E
Y
 
Y
A
 
A
L
 
I
E
 
A
K
 
N
G
 
D
L
 
R
K
 
D
V
 
S
V
 
V
A
 
T
V
 
L
V
 
V
G
 
H
K
|
K
G
 
G
N
 
N
I
 
I
M
 
M
K
 
K
A
 
F
T
 
T
E
 
E
G
 
G
A
 
A
F
 
F
M
 
K
N
 
D
W
 
W
A
 
G
F
 
Y
E
 
Q
V
 
L
A
 
A
K
 
R
E
 
E
P
 
-
E
 
E
F
 
F
E
 
G
G
 
G
R
 
E
V
 
L
I
 
I
T
 
D
E
 
G
G
 
G
-
 
P
-
 
W
-
 
L
-
 
K
-
 
V
-
 
K
E
 
N
P
 
P
K
 
N
D
 
T
G
 
G
-
 
K
Q
 
E
V
 
I
L
 
V
L
 
I
T
 
K
R
 
D
V
 
V
I
 
I
T
 
A
D
|
D
Q
 
A
M
 
F
L
 
L
M
 
Q
Q
 
Q
L
 
I
V
 
L
L
 
L
K
 
R
P
 
P
E
 
A
A
 
E
Y
 
Y
H
 
D
V
 
V
I
 
I
I
 
A
T
 
C
Q
 
M
N
 
N
L
 
L
N
 
N
G
 
G
D
|
D
Y
 
Y
I
 
I
S
 
S
D
|
D
L
 
A
A
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
Q
V
 
V
G
 
G
G
 
G
P
 
I
G
 
G
F
 
I
V
 
A
P
 
P
S
 
G
G
 
A
N
 
N
I
 
I
G
 
G
D
 
D
G
 
E
Y
 
C
A
 
A
L
 
L
F
 
F
E
 
E
S
 
A
T
|
T
H
|
H
G
|
G
T
|
T
A
|
A
Y
x
P
D
 
K
I
x
Y
A
 
A
G
 
G
K
 
Q
N
 
D
I
 
K
A
x
V
N
|
N
P
 
P
L
 
G
S
 
S
L
 
I
T
 
I
L
 
L
S
 
S
G
 
A
A
 
E
M
 
M
M
 
M
L
 
L
E
 
R
Y
 
H
L
 
M
G
 
G
W
 
W
K
 
T
E
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
D
L
 
L
I
 
I
Y
 
V
D
 
K
A
 
G
V
 
M
K
 
E
K
 
G
A
 
A
I
 
I
E
 
N
D
 
A
R
 
K
L
 
T
G
 
V
T
 
T
P
x
Y
D
|
D
I
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
F
 
F
E
 
E
K
x
R
M
 
L
G
 
M
V
 
D
E
 
G
A
 
A
K
 
K
A
 
L
L
 
L
S
 
K
T
 
C
M
 
S
E
 
E
F
 
F
A
 
G
Q
 
D
A
 
A
I
 
I
A
 
I
E
 
E
R
 
N
I
 
M

4ajcA 3d structure of e. Coli isocitrate dehydrogenase k100m mutant in complex with alpha-ketoglutarate, calcium(ii) and adenine nucleotide phosphate (see paper)
48% identity, 98% coverage: 9:419/419 of query aligns to 1:415/415 of 4ajcA

query
sites
4ajcA
E
 
E
G
 
S
K
 
K
A
 
V
V
 
V
L
 
V
P
 
P
Q
 
A
E
 
Q
G
 
G
S
 
K
F
 
K
I
 
I
K
 
T
L
 
L
L
 
-
P
 
Q
D
 
N
K
 
G
R
 
K
I
 
L
E
 
N
V
 
V
P
 
P
H
 
E
N
 
N
P
 
P
I
 
I
I
 
I
P
 
P
F
 
Y
I
 
I
E
 
E
G
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
I
G
 
G
P
 
V
E
 
D
I
 
V
A
 
T
P
 
P
A
 
A
M
 
M
I
 
L
L
 
K
V
 
V
V
 
V
N
 
D
R
 
A
A
 
A
V
 
V
E
 
E
K
 
K
A
 
A
Y
 
Y
G
 
K
G
 
G
S
 
E
R
 
R
L
 
K
I
 
I
Y
 
S
W
 
W
V
 
M
E
 
E
L
 
I
L
 
Y
A
 
T
G
 
G
D
 
E
K
 
K
A
 
S
E
 
T
A
 
Q
L
 
V
T
 
Y
G
 
G
K
 
Q
R
 
D
-
 
V
-
 
W
M
 
L
P
 
P
E
 
A
E
 
E
T
 
T
L
 
L
E
 
D
V
 
L
L
 
I
K
 
R
E
 
E
A
 
Y
V
 
R
V
 
V
S
 
A
I
 
I
K
 
M
G
 
G
P
 
P
L
 
L
G
 
T
T
 
T
P
 
P
V
 
V
G
 
G
K
 
G
G
 
G
G
 
I
K
 
R
S
|
S
L
 
L
N
 
N
A
 
V
I
 
A
L
 
L
R
|
R
Q
 
Q
S
 
E
M
 
L
D
 
D
F
 
L
Y
 
Y
S
 
I
A
 
C
I
 
L
R
 
R
P
 
P
V
 
V
-
 
R
Y
 
Y
W
 
Y
L
 
Q
G
 
G
Q
 
T
P
 
P
A
 
S
P
 
P
I
 
V
P
 
K
E
 
H
P
 
P
H
 
E
R
 
L
V
 
T
N
 
D
V
 
M
T
 
V
V
 
I
F
 
F
R
|
R
E
 
E
N
 
N
S
 
S
D
 
E
D
 
D
V
 
I
Y
|
Y
M
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
E
Y
 
W
M
 
K
P
 
A
G
 
D
S
 
S
Q
 
A
D
 
D
T
 
A
Q
 
E
K
 
K
V
 
V
R
 
I
K
 
K
F
 
F
F
 
L
L
 
R
E
 
E
E
 
E
M
 
M
G
 
G
V
 
V
S
 
K
P
 
K
Y
 
I
A
 
R
L
 
F
P
 
P
E
 
E
D
 
H
C
 
C
G
 
G
I
 
I
T
 
G
V
 
I
K
 
K
P
 
P
M
 
C
S
 
S
E
 
E
Y
 
E
K
 
G
T
 
T
K
 
K
R
 
R
H
 
L
V
 
V
R
 
R
K
 
A
A
 
A
L
 
I
R
 
E
Y
 
Y
A
 
A
L
 
I
E
 
A
K
 
N
G
 
D
L
 
R
K
 
D
V
 
S
V
 
V
A
 
T
V
 
L
V
 
V
G
 
H
K
|
K
G
 
G
N
 
N
I
 
I
M
 
M
K
 
K
A
 
F
T
 
T
E
 
E
G
 
G
A
 
A
F
 
F
M
 
K
N
 
D
W
 
W
A
 
G
F
 
Y
E
 
Q
V
 
L
A
 
A
K
 
R
E
 
E
P
 
-
E
 
E
F
 
F
E
 
G
G
 
G
R
 
E
V
 
L
I
 
I
T
 
D
E
 
G
G
 
G
-
 
P
-
 
W
-
 
L
-
 
K
-
 
V
-
 
K
E
 
N
P
 
P
K
 
N
D
 
T
G
 
G
-
 
K
Q
 
E
V
 
I
L
 
V
L
 
I
T
 
K
R
 
D
V
 
V
I
 
I
T
 
A
D
|
D
Q
 
A
M
 
F
L
 
L
M
 
Q
Q
 
Q
L
 
I
V
 
L
L
 
L
K
 
R
P
 
P
E
 
A
A
 
E
Y
 
Y
H
 
D
V
 
V
I
 
I
I
 
A
T
 
C
Q
 
M
N
 
N
L
 
L
N
 
N
G
 
G
D
|
D
Y
 
Y
I
 
I
S
 
S
D
|
D
L
 
A
A
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
Q
V
 
V
G
 
G
G
 
G
P
 
I
G
 
G
F
 
I
V
 
A
P
 
P
S
 
G
G
 
A
N
 
N
I
 
I
G
 
G
D
 
D
G
 
E
Y
 
C
A
 
A
L
 
L
F
 
F
E
 
E
S
 
A
T
 
T
H
|
H
G
|
G
T
 
T
A
|
A
Y
 
P
D
 
K
I
x
Y
A
 
A
G
 
G
K
 
Q
N
 
D
I
 
K
A
x
V
N
|
N
P
 
P
L
 
G
S
 
S
L
 
I
T
 
I
L
 
L
S
 
S
G
 
A
A
 
E
M
 
M
M
 
M
L
 
L
E
 
R
Y
 
H
L
 
M
G
 
G
W
 
W
K
 
T
E
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
D
L
 
L
I
 
I
Y
 
V
D
 
K
A
 
G
V
 
M
K
 
E
K
 
G
A
 
A
I
 
I
E
 
N
D
 
A
R
 
K
L
 
T
G
 
V
T
 
T
P
x
Y
D
|
D
I
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
F
 
F
E
 
E
K
 
R
M
 
L
G
 
M
V
 
D
E
 
G
A
 
A
K
 
K
A
 
L
L
 
L
S
 
K
T
 
C
M
 
S
E
 
E
F
 
F
A
 
G
Q
 
D
A
 
A
I
 
I
A
 
I
E
 
E
R
 
N
I
 
M

1cw4A Crystal structure of k230m isocitrate dehydrogenase in complex with alpha-ketoglutarate (see paper)
48% identity, 98% coverage: 9:419/419 of query aligns to 1:415/415 of 1cw4A

query
sites
1cw4A
E
 
E
G
 
S
K
 
K
A
 
V
V
 
V
L
 
V
P
 
P
Q
 
A
E
 
Q
G
 
G
S
 
K
F
 
K
I
 
I
K
 
T
L
 
L
L
 
-
P
 
Q
D
 
N
K
 
G
R
 
K
I
 
L
E
 
N
V
 
V
P
 
P
H
 
E
N
 
N
P
 
P
I
 
I
I
 
I
P
 
P
F
 
Y
I
 
I
E
 
E
G
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
I
G
 
G
P
 
V
E
 
D
I
 
V
A
 
T
P
 
P
A
 
A
M
 
M
I
 
L
L
 
K
V
 
V
V
 
V
N
 
D
R
 
A
A
 
A
V
 
V
E
 
E
K
 
K
A
 
A
Y
 
Y
G
 
K
G
 
G
S
 
E
R
 
R
L
 
K
I
 
I
Y
 
S
W
 
W
V
 
M
E
 
E
L
 
I
L
 
Y
A
 
T
G
 
G
D
 
E
K
 
K
A
 
S
E
 
T
A
 
Q
L
 
V
T
 
Y
G
 
G
K
 
Q
R
 
D
-
 
V
-
 
W
M
 
L
P
 
P
E
 
A
E
 
E
T
 
T
L
 
L
E
 
D
V
 
L
L
 
I
K
 
R
E
 
E
A
 
Y
V
 
R
V
 
V
S
 
A
I
 
I
K
 
K
G
 
G
P
 
P
L
 
L
G
 
T
T
 
T
P
 
P
V
|
V
G
|
G
K
 
G
G
|
G
G
 
I
K
 
R
S
|
S
L
 
L
N
|
N
A
 
V
I
 
A
L
 
L
R
|
R
Q
 
Q
S
 
E
M
 
L
D
 
D
F
 
L
Y
 
Y
S
 
I
A
 
C
I
 
L
R
 
R
P
 
P
V
 
V
-
 
R
Y
 
Y
W
 
Y
L
 
Q
G
 
G
Q
 
T
P
 
P
A
 
S
P
 
P
I
 
V
P
 
K
E
 
H
P
 
P
H
 
E
R
 
L
V
 
T
N
 
D
V
 
M
T
 
V
V
 
I
F
 
F
R
|
R
E
 
E
N
 
N
S
 
S
D
 
E
D
 
D
V
 
I
Y
|
Y
M
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
E
Y
 
W
M
 
K
P
 
A
G
 
D
S
 
S
Q
 
A
D
 
D
T
 
A
Q
 
E
K
 
K
V
 
V
R
 
I
K
 
K
F
 
F
F
 
L
L
 
R
E
 
E
E
 
E
M
 
M
G
 
G
V
 
V
S
 
K
P
 
K
Y
 
I
A
 
R
L
 
F
P
 
P
E
 
E
D
 
H
C
 
C
G
 
G
I
 
I
T
 
G
V
 
I
K
 
K
P
 
P
M
 
C
S
 
S
E
 
E
Y
 
E
K
 
G
T
 
T
K
 
K
R
 
R
H
 
L
V
 
V
R
 
R
K
 
A
A
 
A
L
 
I
R
 
E
Y
 
Y
A
 
A
L
 
I
E
 
A
K
 
N
G
 
D
L
 
R
K
 
D
V
 
S
V
 
V
A
 
T
V
 
L
V
 
V
G
 
H
K
x
M
G
 
G
N
 
N
I
 
I
M
 
M
K
 
K
A
 
F
T
 
T
E
 
E
G
 
G
A
 
A
F
 
F
M
 
K
N
 
D
W
 
W
A
 
G
F
 
Y
E
 
Q
V
 
L
A
 
A
K
 
R
E
 
E
P
 
-
E
 
E
F
 
F
E
 
G
G
 
G
R
 
E
V
 
L
I
 
I
T
 
D
E
 
G
G
 
G
-
 
P
-
 
W
-
 
L
-
 
K
-
 
V
-
 
K
E
 
N
P
 
P
K
 
N
D
 
T
G
 
G
-
 
K
Q
 
E
V
 
I
L
 
V
L
 
I
T
 
K
R
 
D
V
 
V
I
 
I
T
 
A
D
|
D
Q
 
A
M
 
F
L
 
L
M
 
Q
Q
 
Q
L
 
I
V
 
L
L
 
L
K
 
R
P
 
P
E
 
A
A
 
E
Y
 
Y
H
 
D
V
 
V
I
 
I
I
 
A
T
 
C
Q
 
M
N
 
N
L
 
L
N
 
N
G
 
G
D
|
D
Y
 
Y
I
 
I
S
 
S
D
|
D
L
 
A
A
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
Q
V
 
V
G
 
G
G
 
G
P
 
I
G
 
G
F
 
I
V
 
A
P
 
P
S
 
G
G
 
A
N
 
N
I
 
I
G
 
G
D
 
D
G
 
E
Y
 
C
A
 
A
L
 
L
F
 
F
E
 
E
S
 
A
T
 
T
H
 
H
G
 
G
T
 
T
A
 
A
Y
 
P
D
 
K
I
 
Y
A
 
A
G
 
G
K
 
Q
N
 
D
I
 
K
A
 
V
N
 
N
P
 
P
L
 
G
S
 
S
L
 
I
T
 
I
L
 
L
S
 
S
G
 
A
A
 
E
M
 
M
M
 
M
L
 
L
E
 
R
Y
 
H
L
 
M
G
 
G
W
 
W
K
 
T
E
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
D
L
 
L
I
 
I
Y
 
V
D
 
K
A
 
G
V
 
M
K
 
E
K
 
G
A
 
A
I
 
I
E
 
N
D
 
A
R
 
K
L
 
T
G
 
V
T
 
T
P
 
Y
D
 
D
I
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
F
 
F
E
 
E
K
 
R
M
 
L
G
 
M
V
 
D
E
 
G
A
 
A
K
 
K
A
 
L
L
 
L
S
 
K
T
 
C
M
 
S
E
 
E
F
 
F
A
 
G
Q
 
D
A
 
A
I
 
I
A
 
I
E
 
E
R
 
N
I
 
M

1cw1A Crystal structure of isocitrate dehydrogenase mutant k230m bound to isocitrate and mn2+ (see paper)
48% identity, 98% coverage: 9:419/419 of query aligns to 1:415/415 of 1cw1A

query
sites
1cw1A
E
 
E
G
 
S
K
 
K
A
 
V
V
 
V
L
 
V
P
 
P
Q
 
A
E
 
Q
G
 
G
S
 
K
F
 
K
I
 
I
K
 
T
L
 
L
L
 
-
P
 
Q
D
 
N
K
 
G
R
 
K
I
 
L
E
 
N
V
 
V
P
 
P
H
 
E
N
 
N
P
 
P
I
 
I
I
 
I
P
 
P
F
 
Y
I
 
I
E
 
E
G
 
G
D
 
D
G
 
G
I
 
I
G
 
G
P
 
V
E
 
D
I
 
V
A
 
T
P
 
P
A
 
A
M
 
M
I
 
L
L
 
K
V
 
V
V
 
V
N
 
D
R
 
A
A
 
A
V
 
V
E
 
E
K
 
K
A
 
A
Y
 
Y
G
 
K
G
 
G
S
 
E
R
 
R
L
 
K
I
 
I
Y
 
S
W
 
W
V
 
M
E
 
E
L
 
I
L
 
Y
A
 
T
G
 
G
D
 
E
K
 
K
A
 
S
E
 
T
A
 
Q
L
 
V
T
 
Y
G
 
G
K
 
Q
R
 
D
-
 
V
-
 
W
M
 
L
P
 
P
E
 
A
E
 
E
T
 
T
L
 
L
E
 
D
V
 
L
L
 
I
K
 
R
E
 
E
A
 
Y
V
 
R
V
 
V
S
 
A
I
 
I
K
 
K
G
 
G
P
 
P
L
 
L
G
 
T
T
 
T
P
 
P
V
 
V
G
|
G
K
 
G
G
|
G
G
 
I
K
 
R
S
 
S
L
 
L
N
 
N
A
 
V
I
 
A
L
 
L
R
 
R
Q
 
Q
S
 
E
M
 
L
D
 
D
F
 
L
Y
 
Y
S
 
I
A
 
C
I
 
L
R
 
R
P
 
P
V
 
V
-
 
R
Y
 
Y
W
 
Y
L
 
Q
G
 
G
Q
 
T
P
 
P
A
 
S
P
 
P
I
 
V
P
 
K
E
 
H
P
 
P
H
 
E
R
 
L
V
 
T
N
 
D
V
 
M
T
 
V
V
 
I
F
 
F
R
 
R
E
 
E
N
 
N
S
 
S
D
 
E
D
 
D
V
 
I
Y
|
Y
M
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
E
Y
 
W
M
 
K
P
 
A
G
 
D
S
 
S
Q
 
A
D
 
D
T
 
A
Q
 
E
K
 
K
V
 
V
R
 
I
K
 
K
F
 
F
F
 
L
L
 
R
E
 
E
E
 
E
M
 
M
G
 
G
V
 
V
S
 
K
P
 
K
Y
 
I
A
 
R
L
 
F
P
 
P
E
 
E
D
 
H
C
 
C
G
 
G
I
 
I
T
 
G
V
 
I
K
 
K
P
 
P
M
 
C
S
 
S
E
 
E
Y
 
E
K
 
G
T
 
T
K
 
K
R
 
R
H
 
L
V
 
V
R
 
R
K
 
A
A
 
A
L
 
I
R
 
E
Y
 
Y
A
 
A
L
 
I
E
 
A
K
 
N
G
 
D
L
 
R
K
 
D
V
 
S
V
 
V
A
 
T
V
 
L
V
 
V
G
 
H
K
x
M
G
 
G
N
 
N
I
 
I
M
 
M
K
 
K
A
 
F
T
 
T
E