SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_013011424.1 NCBI__GCF_000025725.1:WP_013011424.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 10 hits to proteins with known functional sites (download)

O50584 Low specificity L-threonine aldolase; Low specificity L-TA; EC 4.1.2.48 from Pseudomonas sp. (strain NCIMB 10558) (see paper)
41% identity, 98% coverage: 2:329/333 of query aligns to 5:336/346 of O50584

query
sites
O50584
N
 
S
E
 
Q
A
 
Q
F
 
F
M
 
A
S
 
S
D
 
D
N
 
N
T
 
Y
A
 
S
P
 
G
V
 
I
D
 
C
F
 
P
R
 
E
I
 
A
L
 
W
R
 
A
V
 
A
L
 
M
E
 
E
E
 
K
A
 
A
N
 
N
T
 
H
G
 
G
F
 
H
E
 
E
K
 
R
P
 
A
Y
 
Y
G
 
G
Y
 
D
D
 
D
K
 
Q
W
 
W
T
 
T
N
 
A
E
 
R
A
 
A
K
 
A
L
 
D
L
 
H
I
 
F
R
 
R
S
 
K
E
 
L
F
 
F
G
 
E
A
 
T
D
 
D
A
 
C
E
 
E
F
 
V
Y
 
F
P
 
F
V
 
A
M
 
F
N
 
N
G
 
G
T
 
T
G
 
A
A
 
A
N
 
N
V
 
S
I
 
L
S
 
A
L
 
L
A
 
S
S
 
S
V
 
L
L
 
C
S
 
Q
P
 
S
F
 
Y
Q
 
H
A
 
S
V
 
V
I
 
I
C
 
C
A
 
S
E
 
E
S
 
T
A
 
A
H
 
H
I
 
V
N
 
E
V
 
T
D
 
D
E
 
E
C
 
C
G
 
G
A
 
A
P
 
P
E
 
E
R
 
F
F
 
F
L
 
S
-
 
N
G
 
G
S
 
S
K
 
K
L
 
L
I
 
L
S
 
T
V
 
A
R
 
R
T
 
S
E
 
E
L
 
G
G
 
G
K
 
K
L
 
L
A
 
T
P
 
P
E
 
A
D
 
S
I
 
I
T
 
R
P
 
E
L
 
V
L
 
A
H
 
L
S
 
K
E
 
R
G
 
Q
F
 
D
E
 
I
H
 
H
H
 
Y
V
 
P
Q
 
K
P
 
P
Y
 
R
V
 
V
I
 
V
S
 
T
I
 
I
S
 
T
Q
 
Q
V
 
A
T
 
T
E
 
E
T
 
V
G
 
G
L
 
S
A
 
V
Y
 
Y
S
 
R
P
 
P
Q
 
D
E
 
E
V
 
L
S
 
K
A
 
A
L
 
I
S
 
S
K
 
A
F
 
T
A
 
C
S
 
K
E
 
E
H
 
L
N
 
G
L
 
L
L
 
N
L
 
L
H
 
H
I
 
M
D
 
D
G
 
G
S
 
A
R
 
R
L
 
F
A
 
S
N
 
N
A
 
A
A
 
C
V
 
A
H
 
F
L
 
L
G
 
G
C
 
C
S
 
T
M
 
P
G
 
A
E
 
E
A
 
L
V
 
T
-
 
W
-
 
K
K
 
A
G
 
G
A
 
I
D
 
D
L
 
V
V
 
L
S
 
C
F
 
F
G
 
G
G
 
G
T
 
T
K
|
K
N
 
N
G
 
G
M
 
M
L
 
A
M
 
V
G
 
G
E
 
E
A
 
A
V
 
I
L
 
L
L
 
F
L
 
F
N
 
N
P
 
R
E
 
K
I
 
L
G
 
A
Q
 
E
N
 
D
I
 
F
K
 
D
Y
 
Y
Y
 
R
R
 
C
K
 
K
Q
 
Q
G
 
A
M
 
G
Q
 
Q
L
 
L
F
 
A
S
 
S
K
 
K
M
 
M
R
 
R
Y
 
F
L
 
L
S
 
S
A
 
A
Q
 
P
F
 
W
I
 
V
P
 
G
Y
 
L
L
 
L
R
 
E
D
 
D
G
 
G
I
 
A
W
 
W
R
 
L
E
 
R
N
 
H
A
 
A
V
 
A
Q
 
H
A
 
A
N
 
N
S
 
H
M
 
C
A
 
A
A
 
Q
K
 
L
L
 
L
A
 
S
S
 
S
G
 
L
F
 
V
V
 
A
K
 
D
-
 
I
A
 
P
G
 
G
L
 
V
K
 
E
L
 
L
A
 
M
Y
 
F
P
 
P
V
 
V
N
 
E
S
 
A
N
 
N
G
 
G
V
 
V
F
 
F
V
 
L
Y
 
Q
L
 
M
P
 
S
D
 
E
S
 
P
L
 
A
I
 
L
S
 
E
K
 
A
I
 
L
E
 
-
R
 
R
N
 
N
F
 
K
G
 
G
-
 
W
-
 
R
F
 
F
Y
 
Y
V
 
T
W
 
F
D
 
I
E
 
G
E
 
S
T
 
G
G
 
G
L
 
A
C
 
-
R
 
R
F
 
F
M
 
M
C
 
C
S
 
S
F
 
W
A
 
D
T
 
T
T
 
E
E
 
E
Q
 
A
D
 
R
V
 
V
N
 
R
S
 
E
L
 
L

5vyeB Crystal structure of l-threonine aldolase from pseudomonas putida
40% identity, 98% coverage: 2:329/333 of query aligns to 3:334/344 of 5vyeB

query
sites
5vyeB
N
 
S
E
 
Q
A
 
Q
F
 
F
M
 
A
S
 
S
D
 
D
N
 
N
T
 
Y
A
 
S
P
 
G
V
 
I
D
 
C
F
 
P
R
 
E
I
 
A
L
 
W
R
 
A
V
 
A
L
 
M
E
 
E
E
 
K
A
 
A
N
 
N
T
 
H
G
 
G
F
 
H
E
 
D
K
 
R
P
 
A
Y
 
Y
G
 
G
Y
 
D
D
 
D
K
 
Q
W
 
W
T
 
T
N
 
E
E
 
R
A
 
A
K
 
S
L
 
E
L
 
Y
I
 
F
R
 
R
S
 
N
E
 
L
F
 
F
G
 
E
A
 
T
D
 
D
A
 
C
E
 
E
F
 
V
Y
 
F
P
 
F
V
 
A
M
 
F
N
|
N
G
|
G
T
|
T
G
 
A
A
 
A
N
 
N
V
 
S
I
 
L
S
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
S
V
 
L
L
 
C
S
 
Q
P
 
S
F
 
Y
Q
 
H
A
 
S
V
 
V
I
 
I
C
 
C
A
 
S
E
 
E
S
 
T
A
 
A
H
|
H
I
 
V
N
 
E
V
 
T
D
 
D
E
 
E
C
 
C
G
 
G
A
 
A
P
 
P
E
 
E
R
 
F
F
 
F
L
 
S
-
 
N
G
 
G
S
 
S
K
 
K
L
 
L
I
 
L
S
 
T
V
 
A
R
 
A
T
 
S
E
 
V
L
 
N
G
 
G
K
 
K
L
 
L
A
 
T
P
 
P
E
 
Q
D
 
S
I
 
I
T
 
R
P
 
E
L
 
V
L
 
A
H
 
L
S
 
K
E
 
R
G
 
Q
F
 
D
E
 
I
H
 
H
H
 
Y
V
 
P
Q
 
K
P
 
P
Y
 
R
V
 
V
I
 
V
S
 
T
I
 
I
S
 
T
Q
 
Q
V
 
A
T
 
T
E
 
E
T
 
V
G
 
G
L
 
T
A
 
V
Y
 
Y
S
 
R
P
 
P
Q
 
D
E
 
E
V
 
L
S
 
K
A
 
A
L
 
I
S
 
S
K
 
A
F
 
T
A
 
C
S
 
K
E
 
E
H
 
L
N
 
G
L
 
L
L
 
N
L
 
L
H
 
H
I
 
M
D
|
D
G
 
G
S
x
A
R
 
R
L
 
F
A
 
T
N
 
N
A
 
A
A
 
C
V
 
A
H
 
F
L
 
L
G
 
G
C
 
C
S
 
S
M
 
P
G
 
A
E
 
E
A
 
L
V
 
T
-
 
W
-
 
K
K
 
A
G
 
G
A
 
V
D
 
D
L
 
V
V
 
L
S
 
C
F
 
F
G
 
G
G
 
G
T
 
T
K
|
K
N
 
N
G
 
G
M
 
M
L
 
A
M
 
V
G
 
G
E
 
E
A
 
A
V
 
I
L
 
L
L
 
F
L
 
F
N
 
N
P
 
R
E
 
Q
I
 
L
G
 
A
Q
 
E
N
 
D
I
 
F
K
 
D
Y
 
Y
Y
 
R
R
 
C
K
 
K
Q
 
Q
G
 
A
M
 
G
Q
 
Q
L
 
L
F
 
A
S
 
S
K
 
K
M
 
M
R
 
R
Y
 
F
L
 
L
S
 
S
A
 
A
Q
 
P
F
 
W
I
 
V
P
 
G
Y
 
L
L
 
L
R
 
E
D
 
D
G
 
G
I
 
A
W
 
W
R
 
L
E
 
R
N
 
H
A
 
G
V
 
N
Q
 
H
A
 
A
N
 
N
S
 
H
M
 
C
A
 
A
A
 
Q
K
 
L
L
 
L
A
 
A
S
 
L
G
 
L
F
 
V
V
 
S
K
 
D
-
 
L
A
 
P
G
 
G
L
 
V
K
 
E
L
 
L
A
 
M
Y
 
F
P
 
P
V
 
V
N
 
E
S
 
A
N
 
N
G
 
G
V
 
V
F
 
F
V
 
L
Y
 
Q
L
 
M
P
 
P
D
 
E
S
 
H
L
 
A
I
 
I
S
 
E
K
 
A
I
 
L
E
 
R
-
 
A
R
 
K
N
 
G
F
 
W
G
 
R
F
 
F
Y
 
Y
V
 
T
W
 
F
D
 
I
E
 
G
E
 
S
T
 
G
G
 
G
L
 
A
C
 
-
R
 
R
F
 
F
M
 
M
C
 
C
S
 
S
F
 
W
A
 
D
T
 
T
T
 
E
E
 
E
Q
 
E
D
 
R
V
 
V
N
 
R
S
 
E
L
 
L

1v72A Crystal structure of phenylserine aldolase from pseudomonas putida
39% identity, 99% coverage: 5:333/333 of query aligns to 7:341/345 of 1v72A

query
sites
1v72A
F
 
F
M
 
S
S
 
S
D
 
D
N
 
N
T
 
I
A
 
A
P
 
G
V
 
A
D
 
S
F
 
P
R
 
E
I
 
V
L
 
A
R
 
Q
V
 
A
L
 
L
E
 
V
E
 
K
A
 
H
N
 
S
T
 
S
G
 
G
F
 
Q
E
 
A
K
 
G
P
 
P
Y
 
Y
G
 
G
Y
 
T
D
 
D
K
 
E
W
 
L
T
 
T
N
 
A
E
 
Q
A
 
V
K
 
K
L
 
R
L
 
K
I
 
F
R
 
C
S
 
E
E
 
I
F
 
F
G
 
E
A
 
R
D
 
D
A
 
V
E
 
E
F
 
V
Y
 
F
P
 
L
V
 
V
M
 
P
N
 
T
G
|
G
T
|
T
G
 
A
A
 
A
N
 
N
V
 
A
I
 
L
S
 
C
L
 
L
A
 
S
S
 
A
V
 
M
L
 
T
S
 
P
P
 
P
F
 
W
Q
 
G
A
 
N
V
 
I
I
 
Y
C
 
C
A
 
H
E
 
P
S
 
A
A
 
S
H
|
H
I
 
I
N
 
N
V
 
N
D
 
D
E
 
E
C
 
C
G
 
G
A
 
A
P
 
P
E
 
E
R
 
F
F
 
F
L
 
S
-
 
N
G
 
G
S
 
A
K
 
K
L
 
L
I
 
M
S
 
T
V
 
V
R
 
D
T
 
G
E
 
P
L
 
A
G
 
A
K
 
K
L
 
L
A
 
-
P
 
-
E
 
-
D
 
D
I
 
I
T
 
V
P
 
R
L
 
L
L
 
R
H
 
E
S
 
R
E
 
T
-
 
R
-
 
E
-
 
K
-
 
V
G
 
G
F
 
D
E
 
V
H
 
H
H
 
T
V
 
T
Q
 
Q
P
 
P
Y
 
A
V
 
C
I
 
V
S
 
S
I
 
I
S
 
T
Q
 
Q
V
 
A
T
 
T
E
|
E
T
 
V
G
 
G
L
 
S
A
 
I
Y
 
Y
S
 
T
P
 
L
Q
 
D
E
 
E
V
 
I
S
x
E
A
 
A
L
 
I
S
 
G
K
x
D
F
 
V
A
 
C
S
 
K
E
 
S
H
 
S
N
 
S
L
 
L
L
 
G
L
 
L
H
 
H
I
 
M
D
|
D
G
 
G
S
|
S
R
|
R
L
 
F
A
 
A
N
 
N
A
 
A
A
 
L
V
 
V
H
 
S
L
 
L
G
 
G
C
 
C
S
 
S
M
 
P
G
 
A
E
 
E
A
 
M
V
 
T
-
 
W
-
 
K
K
 
A
G
 
G
A
 
V
D
 
D
L
 
A
V
 
L
S
 
S
F
 
F
G
 
G
G
 
A
T
 
T
K
|
K
N
 
N
G
 
G
M
 
V
L
 
L
M
 
A
G
 
A
E
 
E
A
 
A
V
 
I
L
 
V
L
 
L
L
 
F
N
 
N
P
 
T
E
 
S
I
 
L
G
 
A
Q
 
T
N
 
E
I
 
M
K
 
S
Y
 
Y
Y
 
R
R
 
R
K
 
K
Q
 
R
G
 
A
M
 
G
Q
 
H
L
 
L
F
 
S
S
 
S
K
 
K
M
 
M
R
 
R
Y
 
F
L
 
L
S
 
S
A
 
A
Q
 
Q
F
 
I
I
 
D
P
 
A
Y
 
Y
L
 
L
R
 
T
D
 
D
G
 
D
I
 
L
W
 
W
R
 
L
E
 
R
N
 
N
A
 
A
V
 
R
Q
 
K
A
 
A
N
 
N
S
 
A
M
 
A
A
 
A
A
 
Q
K
 
R
L
 
L
A
 
A
S
 
Q
-
 
G
G
 
L
F
 
E
V
 
G
K
 
L
A
 
G
G
 
G
L
 
V
K
 
E
L
 
V
A
 
L
Y
 
G
P
 
G
V
 
T
N
 
E
S
 
A
N
 
N
G
 
I
V
 
L
F
 
F
V
 
C
Y
 
R
L
 
L
P
 
D
D
 
S
S
 
A
L
 
M
I
 
I
S
 
D
K
 
A
-
 
L
I
 
L
E
 
K
R
 
A
N
 
G
F
 
F
G
 
G
F
 
F
Y
 
Y
V
 
H
W
 
D
D
 
R
E
 
W
E
 
G
T
 
P
G
 
N
L
 
V
C
 
V
R
 
R
F
 
F
M
 
V
C
 
T
S
 
S
F
 
F
A
 
A
T
 
T
T
 
T
E
 
A
Q
 
E
D
 
D
V
 
V
N
 
D
S
 
H
L
 
L
L
 
L
N
 
N
L
 
Q
V
 
V

1jg8D Crystal structure of threonine aldolase (low-specificity)
27% identity, 57% coverage: 7:197/333 of query aligns to 7:196/344 of 1jg8D

query
sites
1jg8D
S
 
S
D
 
D
N
x
T
T
 
V
A
x
T
P
 
K
V
 
P
D
 
T
F
 
E
R
 
E
I
 
M
L
 
R
R
 
K
V
 
A
L
 
M
E
 
A
E
 
Q
A
 
A
N
 
E
T
 
V
G
 
G
F
 
-
E
 
D
K
 
D
P
 
V
Y
 
Y
G
 
G
Y
 
E
D
 
D
K
 
P
W
 
T
T
 
I
N
 
N
E
 
E
A
 
L
K
 
E
L
 
R
L
 
L
I
 
A
R
 
A
S
 
E
E
 
T
F
 
F
G
 
G
A
 
K
D
 
E
A
 
A
E
 
A
F
 
L
Y
 
F
P
 
-
V
 
V
M
 
P
N
 
S
G
 
G
T
 
T
G
 
M
A
 
G
N
 
N
V
 
Q
I
 
V
S
 
S
L
 
I
A
 
M
S
 
A
V
 
H
L
 
T
S
 
Q
P
 
R
F
 
G
Q
 
D
A
 
E
V
 
V
I
 
I
C
 
L
A
 
E
E
 
A
S
 
D
A
 
S
H
 
H
I
 
I
N
 
F
V
 
W
D
 
Y
E
 
E
C
 
V
G
 
G
A
 
A
P
 
M
E
 
A
R
 
V
F
 
L
L
 
S
G
 
G
S
 
V
K
 
M
L
 
P
I
 
H
S
 
P
V
 
V
R
 
P
T
 
G
E
 
K
L
 
N
G
 
G
K
 
A
L
 
M
A
 
D
P
 
P
E
 
D
D
 
D
I
 
V
T
 
R
P
 
K
L
 
A
L
 
I
H
 
R
S
 
P
E
 
R
G
 
N
F
 
I
E
 
-
H
 
H
H
 
F
V
 
P
Q
 
R
P
 
T
Y
 
S
V
 
L
I
 
I
S
 
A
I
 
I
S
 
E
Q
 
N
V
 
T
-
 
H
T
 
N
E
 
R
T
 
S
G
 
G
L
 
G
A
 
R
Y
 
V
S
 
V
P
 
P
Q
 
L
E
 
E
-
 
N
V
 
I
S
 
K
A
 
E
L
 
I
S
 
C
K
 
T
F
 
I
A
 
A
S
 
K
E
 
E
H
 
H
N
 
G
L
 
I
L
 
N
L
 
V
H
 
H
I
 
I
D
 
D
G
 
G
S
 
A
R
 
R
L
 
I
A
 
F
N
 
N
A
 
A
A
 
S
V
 
I
H
 
A
L
 
S
G
 
G
C
 
V
S
 
P
M
 
V
G
 
K
E
 
E
A
 
Y
V
 
A
K
 
G
G
 
Y
A
 
A
D
 
D
L
 
S
V
 
V
S
 
M
F
 
F

Sites not aligning to the query:

1lw5B X-ray structure of l-threonine aldolase (low-specificity) in complex with glycine (see paper)
27% identity, 57% coverage: 7:197/333 of query aligns to 6:195/343 of 1lw5B

query
sites
1lw5B
S
|
S
D
 
D
N
x
T
T
 
V
A
x
T
P
 
K
V
 
P
D
 
T
F
 
E
R
 
E
I
 
M
L
 
R
R
 
K
V
 
A
L
 
M
E
 
A
E
 
Q
A
 
A
N
 
E
T
 
V
G
 
G
F
 
-
E
 
D
K
 
D
P
 
V
Y
 
Y
G
 
G
Y
 
E
D
 
D
K
 
P
W
 
T
T
 
I
N
 
N
E
 
E
A
 
L
K
 
E
L
 
R
L
 
L
I
 
A
R
 
A
S
 
E
E
 
T
F
 
F
G
 
G
A
 
K
D
 
E
A
 
A
E
 
A
F
 
L
Y
 
F
P
 
-
V
 
V
M
 
P
N
 
S
G
|
G
T
|
T
G
 
M
A
 
G
N
 
N
V
 
Q
I
 
V
S
 
S
L
 
I
A
 
M
S
 
A
V
 
H
L
 
T
S
 
Q
P
 
R
F
 
G
Q
 
D
A
 
E
V
 
V
I
 
I
C
 
L
A
 
E
E
 
A
S
 
D
A
 
S
H
|
H
I
 
I
N
 
F
V
 
W
D
 
Y
E
 
E
C
 
V
G
 
G
A
 
A
P
 
M
E
 
A
R
 
V
F
 
L
L
 
S
G
 
G
S
 
V
K
 
M
L
 
P
I
 
H
S
 
P
V
 
V
R
 
P
T
 
G
E
 
K
L
 
N
G
 
G
K
 
A
L
 
M
A
 
D
P
 
P
E
 
D
D
 
D
I
 
V
T
 
R
P
 
K
L
 
A
L
 
I
H
 
R
S
 
P
E
 
R
G
 
N
F
 
I
E
 
-
H
 
H
H
 
F
V
 
P
Q
 
R
P
 
T
Y
 
S
V
 
L
I
 
I
S
 
A
I
 
I
S
x
E
Q
 
N
V
 
T
-
 
H
T
 
N
E
 
R
T
 
S
G
 
G
L
 
G
A
 
R
Y
 
V
S
 
V
P
 
P
Q
 
L
E
 
E
-
 
N
V
 
I
S
 
K
A
 
E
L
 
I
S
 
C
K
 
T
F
 
I
A
 
A
S
 
K
E
 
E
H
 
H
N
 
G
L
 
I
L
 
N
L
 
V
H
 
H
I
 
I
D
|
D
G
 
G
S
x
A
R
|
R
L
 
I
A
 
F
N
 
N
A
 
A
A
 
S
V
 
I
H
 
A
L
 
S
G
 
G
C
 
V
S
 
P
M
 
V
G
 
K
E
 
E
A
 
Y
V
 
A
K
 
G
G
 
Y
A
 
A
D
 
D
L
 
S
V
 
V
S
 
M
F
 
F

Sites not aligning to the query:

1lw4B X-ray structure of l-threonine aldolase (low-specificity) in complex with l-allo-threonine (see paper)
27% identity, 57% coverage: 7:197/333 of query aligns to 6:195/343 of 1lw4B

query
sites
1lw4B
S
|
S
D
 
D
N
x
T
T
 
V
A
x
T
P
 
K
V
 
P
D
 
T
F
 
E
R
 
E
I
 
M
L
 
R
R
 
K
V
 
A
L
 
M
E
 
A
E
 
Q
A
 
A
N
 
E
T
 
V
G
 
G
F
 
-
E
 
D
K
 
D
P
 
V
Y
 
Y
G
 
G
Y
 
E
D
 
D
K
 
P
W
 
T
T
 
I
N
 
N
E
 
E
A
 
L
K
 
E
L
 
R
L
 
L
I
 
A
R
 
A
S
 
E
E
 
T
F
 
F
G
 
G
A
 
K
D
 
E
A
 
A
E
 
A
F
 
L
Y
 
F
P
 
-
V
 
V
M
 
P
N
 
S
G
|
G
T
|
T
G
 
M
A
 
G
N
 
N
V
 
Q
I
 
V
S
 
S
L
 
I
A
 
M
S
 
A
V
 
H
L
 
T
S
 
Q
P
 
R
F
 
G
Q
 
D
A
 
E
V
 
V
I
 
I
C
 
L
A
 
E
E
 
A
S
 
D
A
 
S
H
|
H
I
 
I
N
 
F
V
 
W
D
 
Y
E
 
E
C
 
V
G
 
G
A
 
A
P
 
M
E
 
A
R
 
V
F
 
L
L
 
S
G
 
G
S
 
V
K
 
M
L
 
P
I
 
H
S
 
P
V
 
V
R
 
P
T
 
G
E
 
K
L
 
N
G
 
G
K
 
A
L
 
M
A
 
D
P
 
P
E
 
D
D
 
D
I
 
V
T
 
R
P
 
K
L
 
A
L
 
I
H
 
R
S
 
P
E
 
R
G
 
N
F
 
I
E
 
-
H
 
H
H
 
F
V
 
P
Q
 
R
P
 
T
Y
 
S
V
 
L
I
 
I
S
 
A
I
 
I
S
x
E
Q
 
N
V
 
T
-
 
H
T
 
N
E
 
R
T
 
S
G
 
G
L
 
G
A
 
R
Y
 
V
S
 
V
P
 
P
Q
 
L
E
 
E
-
 
N
V
 
I
S
 
K
A
 
E
L
 
I
S
 
C
K
 
T
F
 
I
A
 
A
S
 
K
E
 
E
H
 
H
N
 
G
L
 
I
L
 
N
L
 
V
H
 
H
I
 
I
D
|
D
G
 
G
S
x
A
R
|
R
L
 
I
A
 
F
N
 
N
A
 
A
A
 
S
V
 
I
H
 
A
L
 
S
G
 
G
C
 
V
S
 
P
M
 
V
G
 
K
E
 
E
A
 
Y
V
 
A
K
 
G
G
 
Y
A
 
A
D
 
D
L
 
S
V
 
V
S
 
M
F
 
F

Sites not aligning to the query:

3wlxA Crystal structure of low-specificity l-threonine aldolase from escherichia coli
24% identity, 49% coverage: 31:193/333 of query aligns to 24:189/331 of 3wlxA

query
sites
3wlxA
P
 
P
Y
 
V
G
 
G
Y
 
D
D
 
D
K
 
V
W
 
Y
T
 
G
N
 
D
E
 
D
A
 
P
K
 
T
L
 
V
L
 
N
I
 
A
R
 
L
S
 
Q
E
 
D
F
 
Y
G
 
A
A
 
A
D
 
E
-
 
L
-
 
S
-
 
G
-
 
K
-
 
E
-
 
A
A
 
A
E
 
I
F
 
F
Y
 
L
P
 
P
V
 
T
M
 
-
N
 
-
G
|
G
T
|
T
G
 
Q
A
 
A
N
 
N
V
 
L
I
 
V
S
 
A
L
 
L
A
 
L
S
 
S
V
 
H
L
 
C
S
 
E
P
 
R
F
 
G
Q
 
E
A
 
E
V
 
Y
I
 
I
C
 
V
A
 
G
E
 
Q
S
 
A
A
 
A
H
|
H
I
 
N
N
 
Y
V
 
L
D
 
F
E
 
E
C
 
A
G
 
G
A
 
G
-
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
L
-
 
G
-
 
S
-
 
I
-
 
Q
-
 
P
-
 
Q
P
 
P
E
 
I
R
 
D
F
 
A
L
 
A
G
 
A
S
 
D
K
 
G
L
 
T
I
 
L
S
 
P
V
 
L
R
 
D
T
 
K
E
 
V
L
 
A
G
 
M
K
 
K
L
 
I
A
 
K
P
 
P
E
 
D
D
 
D
I
 
I
T
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
-
H
 
-
S
 
-
E
 
-
G
 
-
F
 
-
E
 
-
H
 
H
H
 
F
V
 
A
Q
 
R
P
 
T
Y
 
K
V
 
L
I
 
L
S
 
S
I
 
L
S
x
E
Q
 
N
V
 
-
T
 
T
E
 
H
T
 
N
G
 
G
L
 
K
A
 
V
Y
 
L
S
 
P
P
 
R
Q
 
E
E
 
Y
V
 
L
S
 
K
A
 
E
L
 
A
S
 
W
K
 
E
F
 
F
A
 
T
S
 
R
E
 
E
H
 
R
N
 
N
L
 
L
L
 
A
L
 
L
H
 
H
I
 
V
D
|
D
G
 
G
S
x
A
R
|
R
L
 
I
A
 
F
N
 
N
A
 
A
A
 
V
V
 
V
H
 
A
L
 
Y
G
 
G
C
 
C
S
 
E
M
 
L
G
 
K
E
 
E
A
 
I
V
 
T
K
 
Q
G
 
Y
A
 
C
D
 
D

Sites not aligning to the query:

Q8RXU4 Low-specificity L-threonine aldolase 1; Threonine aldolase 1; EC 4.1.2.48 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 2 papers)
24% identity, 90% coverage: 33:331/333 of query aligns to 35:343/358 of Q8RXU4

query
sites
Q8RXU4
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
K
 
P
W
 
T
T
 
A
N
 
R
E
 
R
A
 
L
K
 
E
L
 
E
L
 
E
I
 
M
R
 
A
S
 
K
E
 
M
F
 
M
G
 
G
A
 
K
D
 
E
A
 
A
E
 
A
F
 
L
Y
 
F
P
 
-
V
 
V
M
 
P
N
 
S
G
 
G
T
 
T
G
 
M
A
 
G
N
 
N
V
 
L
I
 
I
S
 
S
-
 
V
L
 
M
A
 
V
S
 
H
V
 
C
L
 
D
S
 
V
P
 
R
F
 
G
Q
 
S
A
 
E
V
 
V
I
 
I
C
 
L
A
 
G
E
 
D
S
 
N
A
 
C
H
 
H
I
 
I
N
 
H
V
 
V
D
 
Y
E
 
E
C
 
N
G
 
G
A
 
G
P
 
I
E
 
S
R
 
T
F
 
I
L
 
G
G
 
G
S
 
V
K
 
H
L
 
P
I
 
K
S
 
T
V
 
V
R
 
K
T
 
N
E
 
E
L
 
E
-
 
D
G
|
G
K
 
T
L
 
M
A
 
D
P
 
L
E
 
E
D
 
A
I
 
I
T
 
E
P
 
A
L
 
A
L
 
I
H
 
R
S
 
D
-
 
P
E
 
K
G
 
G
F
 
S
E
 
T
H
 
F
H
 
Y
V
 
P
Q
 
S
P
 
T
Y
 
R
V
 
L
I
 
I
S
 
C
I
 
L
-
 
E
-
 
N
S
 
T
Q
 
H
V
 
A
T
 
N
E
 
S
T
 
G
G
 
G
L
 
R
A
 
C
Y
 
L
S
 
S
P
 
V
Q
 
E
E
 
Y
V
 
T
S
 
E
A
 
K
L
 
V
S
 
G
K
 
E
F
 
I
A
 
A
S
 
K
E
 
R
H
 
H
N
 
G
L
 
V
L
 
K
L
 
L
H
 
H
I
 
I
D
 
D
G
 
G
S
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
F
N
 
N
A
 
A
A
 
S
V
 
I
H
 
A
L
 
L
G
 
G
C
 
V
S
 
P
M
 
V
G
 
H
E
 
K
A
 
L
V
 
V
K
 
K
G
 
A
A
 
A
D
 
D
L
 
S
V
 
V
S
 
Q
F
 
V
G
 
C
G
 
L
T
 
S
K
 
K
N
 
G
-
 
L
G
 
G
M
 
A
L
 
P
M
 
V
G
 
G
E
 
-
A
 
S
V
 
V
L
 
I
L
 
V
L
 
G
N
 
S
P
 
Q
E
 
S
I
 
F
G
 
I
Q
 
E
N
 
K
I
 
A
K
 
K
Y
 
T
Y
 
V
R
 
R
K
 
K
Q
 
T
G
 
L
M
 
G
Q
 
G
L
 
G
F
 
M
S
 
R
K
 
Q
M
 
I
R
 
G
Y
 
V
L
 
L
S
 
C
A
 
A
Q
 
A
F
 
A
I
 
L
P
 
V
Y
 
A
L
 
L
R
 
Q
D
 
E
G
 
N
I
 
L
W
 
P
R
 
K
E
 
-
N
 
-
A
 
-
V
 
L
Q
 
Q
A
 
H
N
 
D
S
 
H
M
 
K
A
 
K
A
 
A
K
 
K
-
 
L
L
 
L
A
 
A
S
 
E
G
 
G
F
 
L
V
 
N
K
 
Q
-
 
M
A
 
K
G
 
G
L
 
I
K
 
R
L
 
V
-
 
N
A
 
V
Y
 
A
P
 
A
V
 
V
N
 
E
S
 
T
N
 
N
G
 
M
V
 
I
F
 
F
V
 
M
Y
 
D
L
 
M
P
 
E
D
 
D
S
 
G
-
 
S
-
 
R
-
 
L
L
 
T
I
 
A
S
 
E
K
 
K
I
 
L
E
 
R
R
 
K
N
 
N
F
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
N
G
 
G
F
 
I
Y
 
L
V
 
L
W
 
I
D
 
R
E
 
G
E
 
N
T
 
S
G
 
S
L
 
R
C
 
I
R
 
R
F
 
I
M
 
V
C
 
I
S
 
H
F
 
H
A
 
Q
T
 
I
T
 
T
E
 
T
Q
 
S
D
 
D
V
 
V
N
 
H
S
 
Y
L
 
T
L
 
L
N
 
S

3wgbD Crystal structure of aeromonas jandaei l-allo-threonine aldolase (see paper)
24% identity, 77% coverage: 32:289/333 of query aligns to 30:282/324 of 3wgbD

query
sites
3wgbD
Y
 
Y
G
 
G
Y
 
E
D
 
D
K
 
P
W
 
G
T
 
V
N
 
N
E
 
A
A
 
L
K
 
E
L
 
A
L
 
Y
I
 
G
R
 
A
S
 
D
E
 
L
F
 
L
G
 
G
A
 
K
D
 
E
A
 
A
E
 
A
F
 
L
Y
 
F
P
 
-
V
 
V
M
 
P
N
x
S
G
|
G
T
|
T
G
 
M
A
 
S
N
 
N
V
 
L
I
 
L
S
 
A
L
 
V
A
 
M
S
 
S
V
 
H
L
 
C
S
 
Q
P
 
R
F
 
G
Q
 
E
A
 
G
V
 
A
I
 
V
C
 
L
A
 
G
E
 
S
S
 
A
A
 
A
H
|
H
I
 
I
N
 
Y
V
 
R
D
 
Y
E
 
E
C
 
A
G
 
Q
A
 
G
P
 
S
E
 
A
R
 
-
F
 
V
L
 
L
G
 
G
S
 
S
K
 
V
L
 
A
I
 
L
S
 
Q
V
 
P
R
 
V
T
 
P
E
 
M
L
 
D
G
 
G
K
 
S
L
 
L
A
 
A
P
 
L
E
 
A
D
 
D
I
 
V
T
 
R
P
 
A
L
 
A
L
 
I
H
 
A
S
 
P
E
 
D
G
 
D
F
 
V
E
 
-
H
 
-
H
 
H
V
 
F
Q
 
T
P
 
P
Y
 
T
V
 
R
I
 
L
S
 
V
I
 
C
S
 
L
Q
x
E
V
 
N
T
 
T
E
 
H
T
 
N
G
 
G
L
 
K
A
 
V
Y
 
L
S
 
P
P
 
L
Q
 
P
E
 
Y
V
 
L
S
 
R
A
 
E
L
 
M
S
 
R
K
 
E
F
 
L
A
 
V
S
 
D
E
 
E
H
 
H
N
 
G
L
 
L
L
 
Q
L
 
L
H
 
H
I
 
L
D
|
D
G
 
G
S
x
A
R
|
R
L
 
L
A
 
F
N
 
N
A
 
A
A
 
V
V
 
V
H
 
A
L
 
S
G
 
G
C
 
H
S
 
T
M
 
V
G
 
R
E
 
E
A
 
L
V
 
V
K
 
A
G
 
P
A
 
F
D
 
D
L
 
S
V
 
V
S
 
S
-
 
I
-
x
C
-
x
L
-
 
S
-
x
K
-
x
G
F
x
L
G
 
G
G
 
A
T
 
P
K
 
V
N
 
G
G
 
S
M
 
L
L
 
L
M
 
V
G
 
G
-
 
S
E
 
H
A
 
A
V
 
F
L
 
I
L
 
A
L
 
R
N
 
A
P
 
R
E
 
R
I
 
L
G
 
R
Q
 
K
N
 
M
I
 
V
K
 
G
Y
 
G
Y
 
G
R
 
M
K
 
R
Q
 
Q
G
 
A
M
 
G
Q
 
I
L
 
L
F
 
A
S
 
Q
K
 
A
M
 
G
R
 
L
Y
 
F
L
 
A
S
 
L
A
 
Q
Q
 
Q
F
 
H
I
 
V
P
 
V
Y
 
R
L
 
L
R
 
A
D
 
D
G
 
D
I
 
H
W
 
R
R
 
R
E
 
-
N
 
-
A
 
-
V
 
-
Q
 
-
A
 
-
N
 
-
S
 
-
M
 
-
A
 
A
A
 
R
K
 
Q
L
 
L
A
 
A
S
 
E
G
 
G
F
 
L
V
 
A
K
 
L
A
 
P
G
 
G
L
 
I
K
 
R
L
 
L
A
 
D
Y
 
L
P
 
A
-
 
Q
V
 
V
N
 
Q
S
 
T
N
 
N
G
 
M
V
 
V
F
 
F
V
 
L
Y
 
Q
L
 
L

Sites not aligning to the query:

4lnmA Structure of escherichia coli threonine aldolase in complex with serine (see paper)
23% identity, 49% coverage: 31:193/333 of query aligns to 24:189/331 of 4lnmA

query
sites
4lnmA
P
 
P
Y
 
V
G
 
G
Y
 
D
D
 
D
K
 
V
W
 
Y
T
 
G
N
 
D
E
 
D
A
 
P
K
 
T
L
 
V
L
 
N
I
 
A
R
 
L
S
 
Q
E
 
D
F
 
Y
G
 
A
A
 
A
D
 
E
-
 
L
-
 
S
-
 
G
-
 
K
-
 
E
-
 
A
A
 
A
E
 
I
F
 
F
Y
 
L
P
 
P
V
x
T
M
 
-
N
 
-
G
|
G
T
|
T
G
 
Q
A
 
A
N
 
N
V
 
L
I
 
V
S
 
A
L
 
L
A
 
L
S
 
S
V
 
H
L
 
C
S
 
E
P
 
R
F
 
G
Q
 
E
A
 
E
V
 
Y
I
 
I
C
 
V
A
 
G
E
 
Q
S
 
A
A
 
A
H
|
H
I
 
N
N
 
Y
V
 
L
D
 
F
E
 
E
C
 
A
G
 
G
A
 
G
-
 
A
-
 
A
-
x
V
-
 
L
-
 
G
-
x
S
-
 
I
-
 
Q
-
 
P
-
 
Q
P
 
P
E
 
I
R
 
D
F
 
A
L
 
A
G
 
A
S
 
D
K
 
G
L
 
T
I
 
L
S
 
P
V
 
L
R
 
D
T
 
K
E
 
V
L
 
A
G
 
M
K
 
K
L
 
I
A
 
K
P
 
P
E
 
D
D
 
D
I
 
I
T
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
-
H
 
-
S
 
-
E
 
-
G
 
-
F
 
-
E
 
-
H
 
H
H
 
F
V
 
A
Q
 
R
P
 
T
Y
 
K
V
 
L
I
 
L
S
 
S
I
 
L
S
x
E
Q
 
N
V
 
-
T
 
T
E
 
H
T
 
N
G
 
G
L
 
K
A
 
V
Y
 
L
S
 
P
P
 
R
Q
 
E
E
 
Y
V
 
L
S
 
K
A
 
E
L
 
A
S
 
W
K
 
E
F
 
F
A
 
T
S
 
R
E
 
K
H
 
R
N
 
N
L
 
L
L
 
A
L
 
L
H
 
H
I
 
V
D
|
D
G
 
G
S
x
A
R
 
R
L
 
I
A
 
F
N
 
N
A
 
A
A
 
V
V
 
V
H
 
A
L
 
Y
G
 
G
C
 
C
S
 
E
M
 
L
G
 
K
E
 
E
A
 
I
V
 
T
K
 
Q
G
 
Y
A
 
C
D
 
D

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_013011424.1 NCBI__GCF_000025725.1:WP_013011424.1
MNEAFMSDNTAPVDFRILRVLEEANTGFEKPYGYDKWTNEAKLLIRSEFGADAEFYPVMN
GTGANVISLASVLSPFQAVICAESAHINVDECGAPERFLGSKLISVRTELGKLAPEDITP
LLHSEGFEHHVQPYVISISQVTETGLAYSPQEVSALSKFASEHNLLLHIDGSRLANAAVH
LGCSMGEAVKGADLVSFGGTKNGMLMGEAVLLLNPEIGQNIKYYRKQGMQLFSKMRYLSA
QFIPYLRDGIWRENAVQANSMAAKLASGFVKAGLKLAYPVNSNGVFVYLPDSLISKIERN
FGFYVWDEETGLCRFMCSFATTEQDVNSLLNLV

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory