SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_013011561.1 NCBI__GCF_000025725.1:WP_013011561.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6fd9A Catalytic subunit hisg from psychrobacter arcticus atp phosphoribosyltransferase (hiszg atpprt) in complex with amp
45% identity, 96% coverage: 6:205/209 of query aligns to 4:202/209 of 6fd9A

query
sites
6fd9A
V
 
L
N
 
T
V
 
L
A
 
A
L
 
L
P
 
S
K
 
K
G
 
G
R
|
R
L
 
I
A
 
L
E
 
E
D
 
E
T
 
T
I
 
M
E
 
P
L
 
L
F
 
L
L
 
R
K
 
A
Q
 
A
G
 
G
I
 
V
T
 
-
N
 
-
E
 
E
G
 
L
V
 
L
V
 
E
D
 
D
F
 
P
N
 
E
-
 
A
S
 
S
R
 
R
R
 
K
L
 
L
T
 
I
F
 
F
Y
 
P
D
 
T
E
 
S
K
 
N
N
 
P
N
 
N
I
 
V
K
 
R
F
 
V
M
 
L
M
 
I
V
 
L
R
 
R
N
 
A
M
 
S
D
 
D
V
 
V
S
 
P
T
 
T
Y
 
Y
V
 
V
E
 
E
H
 
H
G
 
G
A
 
A
A
 
A
D
 
D
I
 
F
G
 
G
V
 
V
V
 
A
G
 
G
K
 
K
D
 
D
I
 
V
L
 
L
L
 
L
E
 
E
S
 
H
G
 
G
S
 
A
D
 
N
-
 
H
V
 
V
Y
 
Y
E
 
E
Y
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
G
 
K
F
 
I
G
x
A
F
 
Q
C
|
C
R
 
K
L
 
L
C
 
M
V
 
T
A
 
A
G
 
G
I
 
V
R
 
K
N
 
D
S
 
A
D
 
P
L
 
L
S
 
P
Y
 
N
R
 
R
H
 
R
D
 
-
M
 
L
V
 
R
V
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
K
Y
 
Y
P
 
V
M
 
N
L
 
V
T
 
A
K
 
R
N
 
A
F
 
Y
F
 
F
A
 
A
S
 
S
K
 
Q
G
 
G
V
 
Q
F
 
Q
V
 
V
E
 
D
T
 
V
I
 
I
K
 
K
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
S
 
S
I
 
M
E
 
E
L
 
L
S
 
A
P
 
P
I
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
G
D
 
D
F
 
L
I
 
I
V
 
V
D
 
D
L
x
V
V
|
V
S
x
D
T
|
T
G
 
G
Q
 
N
T
|
T
L
 
L
K
 
R
K
 
A
N
 
N
G
 
G
L
 
L
I
 
E
E
 
A
V
 
R
E
 
D
T
 
H
I
 
I
L
 
C
E
 
D
S
 
V
T
 
S
A
 
S
R
 
R
L
 
L
I
 
I
G
 
V
N
 
N
K
 
Q
S
 
V
M
 
S
A
 
Y
K
 
K
V
 
R
K
 
K
Y
 
F
D
 
A
R
 
L
I
 
L
K
 
E
E
 
P
I
 
I
I
 
L
E
 
D
T
 
S

6fcwA Catalytic subunit hisg from psychrobacter arcticus atp phosphoribosyltransferase (hiszg atpprt) in complex with pratp
45% identity, 96% coverage: 6:205/209 of query aligns to 4:202/209 of 6fcwA

query
sites
6fcwA
V
 
L
N
 
T
V
 
L
A
 
A
L
 
L
P
 
S
K
 
K
G
 
G
R
|
R
L
x
I
A
 
L
E
 
E
D
 
E
T
 
T
I
 
M
E
 
P
L
 
L
F
 
L
L
 
R
K
 
A
Q
 
A
G
 
G
I
 
V
T
 
-
N
 
-
E
 
E
G
 
L
V
 
L
V
 
E
D
 
D
F
 
P
N
 
E
-
 
A
S
 
S
R
 
R
R
 
K
L
 
L
T
 
I
F
 
F
Y
 
P
D
 
T
E
 
S
K
 
N
N
 
P
N
 
N
I
 
V
K
 
R
F
 
V
M
 
L
M
 
I
V
 
L
R
 
R
N
 
A
M
 
S
D
 
D
V
 
V
S
 
P
T
 
T
Y
 
Y
V
 
V
E
 
E
H
 
H
G
 
G
A
 
A
A
 
A
D
 
D
I
 
F
G
 
G
V
 
V
V
 
A
G
 
G
K
 
K
D
|
D
I
 
V
L
 
L
L
 
L
E
 
E
S
 
H
G
 
G
S
 
A
D
 
N
-
 
H
V
 
V
Y
 
Y
E
 
E
Y
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
G
 
K
F
 
I
G
 
A
F
 
Q
C
|
C
R
 
K
L
 
L
C
 
M
V
 
T
A
 
A
G
 
G
I
 
V
R
 
K
N
 
D
S
 
A
D
 
P
L
 
L
S
 
P
Y
 
N
R
 
R
H
 
R
D
 
-
M
 
L
V
 
R
V
 
I
A
 
A
T
 
T
K
|
K
Y
 
Y
P
 
V
M
 
N
L
 
V
T
 
A
K
 
R
N
 
A
F
 
Y
F
 
F
A
 
A
S
 
S
K
 
Q
G
 
G
V
 
Q
F
 
Q
V
 
V
E
 
D
T
 
V
I
 
I
K
 
K
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
S
 
S
I
 
M
E
 
E
L
 
L
S
 
A
P
 
P
I
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
G
D
 
D
F
 
L
I
 
I
V
 
V
D
|
D
L
x
V
V
 
V
S
x
D
T
|
T
G
|
G
Q
 
N
T
|
T
L
 
L
K
 
R
K
 
A
N
 
N
G
 
G
L
 
L
I
 
E
E
 
A
V
 
R
E
 
D
T
 
H
I
 
I
L
 
C
E
 
D
S
 
V
T
 
S
A
 
S
R
 
R
L
 
L
I
 
I
G
 
V
N
 
N
K
 
Q
S
 
V
M
 
S
A
 
Y
K
 
K
V
 
R
K
 
K
Y
 
F
D
 
A
R
 
L
I
 
L
K
 
E
E
 
P
I
 
I
I
 
L
E
 
D
T
 
S

6fctA Catalytic subunit hisg from psychrobacter arcticus atp phosphoribosyltransferase (hiszg atpprt) in complex with prpp and atp
45% identity, 96% coverage: 6:205/209 of query aligns to 4:202/209 of 6fctA

query
sites
6fctA
V
 
L
N
 
T
V
 
L
A
 
A
L
 
L
P
 
S
K
 
K
G
 
G
R
|
R
L
 
I
A
 
L
E
 
E
D
 
E
T
 
T
I
 
M
E
 
P
L
 
L
F
 
L
L
 
R
K
 
A
Q
 
A
G
 
G
I
 
V
T
 
-
N
 
-
E
 
E
G
 
L
V
 
L
V
 
E
D
 
D
F
 
P
N
 
E
-
 
A
S
 
S
R
 
R
R
 
K
L
 
L
T
 
I
F
 
F
Y
 
P
D
 
T
E
 
S
K
 
N
N
 
P
N
 
N
I
 
V
K
 
R
F
 
V
M
 
L
M
 
I
V
 
L
R
 
R
N
 
A
M
 
S
D
 
D
V
 
V
S
 
P
T
 
T
Y
 
Y
V
 
V
E
 
E
H
 
H
G
 
G
A
 
A
A
 
A
D
 
D
I
 
F
G
 
G
V
 
V
V
 
A
G
 
G
K
 
K
D
|
D
I
 
V
L
 
L
L
 
L
E
 
E
S
 
H
G
 
G
S
 
A
D
 
N
-
 
H
V
 
V
Y
 
Y
E
 
E
Y
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
G
 
K
F
 
I
G
x
A
F
 
Q
C
|
C
R
 
K
L
 
L
C
 
M
V
 
T
A
 
A
G
 
G
I
 
V
R
 
K
N
 
D
S
 
A
D
 
P
L
 
L
S
 
P
Y
 
N
R
 
R
H
 
R
D
 
-
M
 
L
V
 
R
V
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
K
Y
 
Y
P
 
V
M
 
N
L
 
V
T
 
A
K
 
R
N
 
A
F
 
Y
F
 
F
A
 
A
S
 
S
K
 
Q
G
 
G
V
 
Q
F
 
Q
V
 
V
E
 
D
T
 
V
I
 
I
K
 
K
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
S
 
S
I
 
M
E
 
E
L
 
L
S
 
A
P
 
P
I
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
G
D
 
D
F
 
L
I
 
I
V
 
V
D
 
D
L
x
V
V
|
V
S
x
D
T
|
T
G
|
G
Q
 
N
T
|
T
L
 
L
K
 
R
K
 
A
N
 
N
G
 
G
L
 
L
I
 
E
E
 
A
V
 
R
E
 
D
T
 
H
I
 
I
L
 
C
E
 
D
S
 
V
T
 
S
A
 
S
R
 
R
L
 
L
I
 
I
G
 
V
N
 
N
K
 
Q
S
 
V
M
 
S
A
 
Y
K
 
K
V
 
R
K
 
K
Y
 
F
D
 
A
R
 
L
I
 
L
K
 
E
E
 
P
I
 
I
I
 
L
E
 
D
T
 
S

6fcaA Catalytic subunit hisg from psychrobacter arcticus atp phosphoribosyltransferase (hiszg atpprt) in complex with prpp
45% identity, 96% coverage: 6:205/209 of query aligns to 4:202/209 of 6fcaA

query
sites
6fcaA
V
 
L
N
 
T
V
 
L
A
 
A
L
 
L
P
 
S
K
 
K
G
 
G
R
 
R
L
 
I
A
 
L
E
 
E
D
 
E
T
 
T
I
 
M
E
 
P
L
 
L
F
 
L
L
 
R
K
 
A
Q
 
A
G
 
G
I
 
V
T
 
-
N
 
-
E
 
E
G
 
L
V
 
L
V
 
E
D
 
D
F
 
P
N
 
E
-
 
A
S
 
S
R
 
R
R
 
K
L
 
L
T
 
I
F
 
F
Y
 
P
D
 
T
E
 
S
K
 
N
N
 
P
N
 
N
I
 
V
K
 
R
F
 
V
M
 
L
M
 
I
V
 
L
R
 
R
N
 
A
M
 
S
D
 
D
V
 
V
S
 
P
T
 
T
Y
 
Y
V
 
V
E
 
E
H
 
H
G
 
G
A
 
A
A
 
A
D
 
D
I
 
F
G
 
G
V
 
V
V
 
A
G
 
G
K
 
K
D
 
D
I
 
V
L
 
L
L
 
L
E
 
E
S
 
H
G
 
G
S
 
A
D
 
N
-
 
H
V
 
V
Y
 
Y
E
 
E
Y
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
G
 
K
F
 
I
G
 
A
F
 
Q
C
 
C
R
 
K
L
 
L
C
 
M
V
 
T
A
 
A
G
 
G
I
 
V
R
 
K
N
 
D
S
 
A
D
 
P
L
 
L
S
 
P
Y
 
N
R
 
R
H
 
R
D
 
-
M
 
L
V
 
R
V
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
K
Y
 
Y
P
 
V
M
 
N
L
 
V
T
 
A
K
 
R
N
 
A
F
 
Y
F
 
F
A
 
A
S
 
S
K
 
Q
G
 
G
V
 
Q
F
 
Q
V
 
V
E
 
D
T
 
V
I
 
I
K
 
K
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
S
 
S
I
 
M
E
 
E
L
 
L
S
 
A
P
 
P
I
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
G
D
 
D
F
 
L
I
 
I
V
 
V
D
|
D
L
x
V
V
|
V
S
x
D
T
|
T
G
|
G
Q
 
N
T
|
T
L
 
L
K
 
R
K
 
A
N
 
N
G
 
G
L
 
L
I
 
E
E
 
A
V
 
R
E
 
D
T
 
H
I
 
I
L
 
C
E
 
D
S
 
V
T
 
S
A
 
S
R
 
R
L
 
L
I
 
I
G
 
V
N
 
N
K
 
Q
S
 
V
M
 
S
A
 
Y
K
 
K
V
 
R
K
 
K
Y
 
F
D
 
A
R
 
L
I
 
L
K
 
E
E
 
P
I
 
I
I
 
L
E
 
D
T
 
S

6fcyA Catalytic subunit hisg from psychrobacter arcticus atp phosphoribosyltransferase (hiszg atpprt) in complex with prpp and adp
45% identity, 96% coverage: 6:205/209 of query aligns to 4:202/208 of 6fcyA

query
sites
6fcyA
V
 
L
N
 
T
V
 
L
A
 
A
L
 
L
P
 
S
K
 
K
G
 
G
R
|
R
L
 
I
A
 
L
E
 
E
D
 
E
T
 
T
I
 
M
E
 
P
L
 
L
F
 
L
L
 
R
K
 
A
Q
 
A
G
 
G
I
 
V
T
 
-
N
 
-
E
 
E
G
 
L
V
 
L
V
 
E
D
 
D
F
 
P
N
 
E
-
 
A
S
 
S
R
 
R
R
 
K
L
 
L
T
 
I
F
 
F
Y
 
P
D
 
T
E
 
S
K
 
N
N
 
P
N
 
N
I
 
V
K
 
R
F
 
V
M
 
L
M
 
I
V
 
L
R
 
R
N
 
A
M
 
S
D
 
D
V
 
V
S
 
P
T
 
T
Y
 
Y
V
 
V
E
 
E
H
 
H
G
 
G
A
 
A
A
 
A
D
 
D
I
 
F
G
 
G
V
 
V
V
 
A
G
 
G
K
 
K
D
|
D
I
 
V
L
 
L
L
 
L
E
 
E
S
 
H
G
 
G
S
 
A
D
 
N
-
 
H
V
 
V
Y
 
Y
E
 
E
Y
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
G
 
K
F
 
I
G
x
A
F
 
Q
C
|
C
R
 
K
L
 
L
C
 
M
V
 
T
A
 
A
G
 
G
I
 
V
R
 
K
N
 
D
S
 
A
D
 
P
L
 
L
S
 
P
Y
 
N
R
 
R
H
 
R
D
 
-
M
 
L
V
 
R
V
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
K
Y
 
Y
P
 
V
M
 
N
L
 
V
T
 
A
K
 
R
N
 
A
F
 
Y
F
 
F
A
 
A
S
 
S
K
 
Q
G
 
G
V
 
Q
F
 
Q
V
 
V
E
 
D
T
 
V
I
 
I
K
 
K
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
S
 
S
I
 
M
E
 
E
L
 
L
S
 
A
P
 
P
I
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
G
D
 
D
F
 
L
I
 
I
V
 
V
D
 
D
L
x
V
V
 
V
S
x
D
T
|
T
G
|
G
Q
 
N
T
|
T
L
 
L
K
 
R
K
 
A
N
 
N
G
 
G
L
 
L
I
 
E
E
 
A
V
 
R
E
 
D
T
 
H
I
 
I
L
 
C
E
 
D
S
 
V
T
 
S
A
 
S
R
 
R
L
 
L
I
 
I
G
 
V
N
 
N
K
 
Q
S
 
V
M
 
S
A
 
Y
K
 
K
V
 
R
K
 
K
Y
 
F
D
 
A
R
 
L
I
 
L
K
 
E
E
 
P
I
 
I
I
 
L
E
 
D
T
 
S

2vd3A The structure of histidine inhibited hisg from methanobacterium thermoautotrophicum
36% identity, 94% coverage: 6:202/209 of query aligns to 5:203/289 of 2vd3A

query
sites
2vd3A
V
 
I
N
 
R
V
 
I
A
 
A
L
 
V
P
 
P
-
 
S
K
 
K
G
 
G
R
 
R
L
 
I
A
 
S
E
 
E
D
 
P
T
 
A
I
 
I
E
 
R
L
 
L
F
 
L
L
x
E
K
 
N
Q
 
A
G
 
G
I
 
V
T
 
-
N
 
-
E
 
-
G
 
G
V
 
L
V
 
K
D
 
D
F
 
T
N
 
V
S
 
N
R
 
R
R
 
K
L
 
L
T
 
F
F
 
S
Y
 
K
D
 
T
E
x
Q
K
 
H
N
 
P
N
 
Q
I
 
I
K
 
E
F
 
V
M
 
M
M
 
F
V
 
S
R
 
R
N
 
A
M
 
A
D
 
D
V
 
I
S
 
P
T
 
E
Y
 
F
V
 
V
E
 
A
H
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
A
D
 
D
I
 
L
G
 
G
V
 
I
V
 
T
G
 
G
K
 
Y
D
 
D
I
 
L
L
 
I
L
 
V
E
 
E
S
 
R
G
 
G
S
 
S
D
 
D
V
 
V
Y
 
E
E
 
I
Y
 
L
L
 
E
D
 
D
L
 
L
G
 
K
F
 
Y
G
 
G
F
 
R
C
 
A
R
 
S
L
 
L
C
 
V
V
 
L
A
 
A
G
 
A
I
 
P
R
 
E
N
 
D
S
 
S
D
 
T
L
 
I
S
 
R
Y
 
G
R
 
P
H
 
E
D
 
D
M
 
I
-
 
P
-
 
R
-
 
G
-
 
A
V
 
V
V
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
E
Y
 
F
P
 
P
M
 
G
L
 
I
T
 
T
K
 
E
N
 
N
F
 
Y
F
 
L
A
 
R
S
 
E
K
 
H
G
 
G
V
 
I
F
 
D
V
 
A
E
 
E
T
 
V
I
 
V
K
 
E
L
 
L
Y
 
T
G
 
G
S
 
S
I
 
T
E
 
E
L
 
I
S
 
A
P
 
P
I
 
F
V
 
I
G
 
G
L
 
V
S
 
A
D
 
D
F
 
L
I
 
I
V
 
T
D
|
D
L
|
L
V
 
S
S
 
S
T
 
T
G
 
G
Q
 
T
T
 
T
L
 
L
K
 
R
K
 
M
N
 
N
G
 
H
L
 
L
I
 
R
E
 
V
V
 
I
E
 
D
T
 
T
I
 
I
L
 
L
E
 
E
S
 
S
T
 
S
A
 
V
R
 
K
L
 
L
I
 
I
G
 
A
N
 
N
K
 
R
S
 
E
M
 
S
A
 
Y
K
 
A
V
 
T
K
 
K
Y
 
S
D
 
G
R
 
I
I
 
I
K
 
E
E
 
E
I
 
L

Sites not aligning to the query:

1z7nF Atp phosphoribosyl transferase (hiszg atp-prtase) from lactococcus lactis with bound prpp substrate (see paper)
39% identity, 97% coverage: 6:208/209 of query aligns to 2:204/205 of 1z7nF

query
sites
1z7nF
V
 
I
N
 
K
V
 
I
A
 
A
L
 
I
P
 
T
K
 
K
G
 
G
R
 
R
L
 
I
A
 
Q
E
 
K
D
 
Q
T
 
V
I
 
T
E
 
K
L
 
L
F
 
L
L
 
E
K
 
N
Q
 
A
G
 
D
I
 
Y
T
 
D
N
 
V
E
 
E
G
 
P
V
 
I
V
 
L
D
 
N
F
 
L
N
 
-
S
 
G
R
 
R
R
 
E
L
 
L
T
 
Q
F
 
I
Y
 
-
D
 
K
E
 
T
K
 
K
N
 
D
N
 
D
I
 
L
K
 
Q
F
 
I
M
 
I
M
 
F
V
 
G
R
 
K
N
 
P
M
 
N
D
 
D
V
 
V
S
 
I
T
 
T
Y
 
F
V
 
L
E
 
E
H
 
H
G
 
G
A
 
I
A
 
V
D
 
D
I
 
I
G
 
G
V
 
F
V
 
V
G
 
G
K
 
K
D
 
D
I
 
T
L
 
L
L
 
D
E
 
E
S
 
N
G
 
D
-
 
F
S
 
D
D
 
D
V
 
Y
Y
 
Y
E
 
E
Y
 
L
L
 
L
D
 
Y
L
 
L
G
 
K
F
 
I
G
 
G
F
 
Q
C
 
C
R
 
I
L
 
F
C
 
A
V
 
L
A
 
A
G
 
S
I
 
Y
R
 
P
N
 
D
-
 
F
S
 
S
D
 
N
L
 
K
S
 
N
Y
 
F
R
 
Q
H
 
R
D
 
H
M
 
K
V
 
R
V
 
I
A
 
A
T
 
S
K
 
K
Y
 
Y
P
 
P
M
 
R
L
 
V
T
 
T
K
 
K
N
 
K
F
 
Y
F
 
F
A
 
A
S
 
Q
K
 
K
G
 
Q
V
 
E
F
 
D
V
 
I
E
 
E
T
 
I
I
 
I
K
 
K
L
 
L
Y
 
E
G
|
G
S
|
S
I
 
V
E
 
E
L
 
L
S
 
G
P
 
P
I
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
A
D
 
D
F
 
A
I
 
I
V
 
V
D
|
D
L
 
I
V
|
V
S
x
E
T
|
T
G
|
G
Q
 
N
T
|
T
L
 
L
K
 
S
K
 
A
N
 
N
G
 
G
L
 
L
I
 
E
E
 
V
V
 
I
E
 
E
T
 
K
I
 
I
L
 
S
E
 
D
S
 
I
T
 
S
A
 
T
R
 
R
L
 
M
I
 
I
G
 
V
N
 
N
K
 
K
S
 
S
M
 
S
A
 
F
K
 
K
V
 
F
K
 
K
Y
 
K
D
 
D
R
 
K
I
 
I
K
 
I
E
 
E
I
 
M
I
 
V
E
 
E
T
 
R
V
 
L
E
 
E
S
 
D

1z7mE Atp phosphoribosyl transferase (hiszg atp-prtase) from lactococcus lactis (see paper)
38% identity, 97% coverage: 6:208/209 of query aligns to 2:200/200 of 1z7mE

query
sites
1z7mE
V
 
I
N
 
K
V
 
I
A
 
A
L
 
I
P
 
T
K
 
K
G
 
G
R
 
R
L
 
I
A
 
Q
E
 
K
D
 
Q
T
 
V
I
 
T
E
 
K
L
 
L
F
 
L
L
 
E
K
 
N
Q
 
A
G
 
D
I
 
Y
T
 
D
N
 
V
E
 
E
G
 
P
V
 
I
V
 
R
D
 
E
F
 
L
N
 
Q
S
 
I
R
 
K
R
 
T
L
 
-
T
 
-
F
 
-
Y
 
-
D
 
-
E
 
-
K
 
K
N
 
D
N
 
D
I
 
L
K
 
Q
F
 
I
M
 
I
M
 
F
V
 
G
R
 
K
N
 
P
M
 
N
D
 
D
V
 
V
S
 
I
T
 
T
Y
 
F
V
 
L
E
 
E
H
 
H
G
 
G
A
 
I
A
 
V
D
 
D
I
 
I
G
 
G
V
 
F
V
 
V
G
 
G
K
 
K
D
 
D
I
 
T
L
 
L
L
 
D
E
 
E
S
 
N
G
 
D
-
 
F
S
 
D
D
 
D
V
 
Y
Y
 
Y
E
 
E
Y
 
L
L
 
L
D
 
Y
L
 
L
G
 
K
F
 
I
G
 
G
F
 
Q
C
 
C
R
 
I
L
 
F
C
 
A
V
 
L
A
 
A
G
 
S
I
 
Y
R
 
P
N
 
D
-
 
F
S
 
S
D
 
N
L
 
K
S
 
N
Y
 
F
R
 
Q
H
 
R
D
 
H
M
 
K
V
 
R
V
 
I
A
 
A
T
 
S
K
 
K
Y
 
Y
P
 
P
M
 
R
L
 
V
T
 
T
K
 
K
N
 
K
F
 
Y
F
 
F
A
 
A
S
 
Q
K
 
K
G
 
Q
V
 
E
F
 
D
V
 
I
E
 
E
T
 
I
I
 
I
K
 
K
L
 
L
Y
 
E
G
 
G
S
 
S
I
 
V
E
 
E
L
 
L
S
 
G
P
 
P
I
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
A
D
 
D
F
 
A
I
 
I
V
 
V
D
 
D
L
 
I
V
 
V
S
x
E
T
|
T
G
|
G
Q
 
N
T
|
T
L
 
L
K
 
S
K
 
A
N
 
N
G
 
G
L
 
L
I
 
E
E
 
V
V
 
I
E
 
E
T
 
K
I
 
I
L
 
S
E
 
D
S
 
I
T
 
S
A
 
T
R
 
R
L
 
M
I
 
I
G
 
V
N
 
N
K
 
K
S
 
S
M
 
S
A
 
F
K
 
K
V
 
F
K
 
K
Y
 
K
D
 
D
R
 
K
I
 
I
K
 
I
E
 
E
I
 
M
I
 
V
E
 
E
T
 
R
V
 
L
E
 
E
S
 
D

1usyG Atp phosphoribosyl transferase (hisg:hisz) complex from thermotoga maritima (see paper)
34% identity, 98% coverage: 6:209/209 of query aligns to 2:197/203 of 1usyG

query
sites
1usyG
V
 
L
N
 
K
V
 
L
A
 
A
L
 
I
P
 
P
K
 
K
G
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
E
E
 
E
D
 
K
T
 
V
I
 
M
E
 
T
L
 
Y
F
 
L
L
 
K
K
 
K
Q
 
T
G
 
G
I
 
V
T
 
I
N
 
F
E
 
E
G
 
-
V
 
-
V
 
-
D
 
-
F
 
-
N
 
-
S
 
-
R
 
R
R
 
E
L
 
S
T
 
S
F
 
I
Y
 
L
D
 
R
E
 
E
K
 
G
N
 
K
N
 
D
I
 
I
K
 
V
F
 
C
M
 
F
M
 
M
V
 
V
R
 
R
N
 
P
M
 
F
D
 
D
V
 
V
S
 
P
T
 
T
Y
 
Y
V
 
L
E
 
V
H
 
H
G
 
G
A
 
V
A
 
A
D
 
D
I
 
I
G
 
G
V
 
F
V
 
C
G
 
G
K
x
T
D
 
D
I
 
V
L
 
L
L
 
L
E
 
E
S
 
K
G
 
E
S
 
T
D
 
S
V
 
L
Y
 
I
E
x
Q
Y
x
P
L
 
F
D
 
F
L
 
I
G
 
P
F
 
T
G
 
N
F
 
I
C
 
S
R
 
R
L
 
M
C
 
V
V
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
P
R
 
K
N
 
G
S
 
R
D
 
G
L
 
I
S
 
P
Y
 
-
R
 
E
H
 
G
D
 
E
M
 
K
V
 
R
V
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
K
Y
 
F
P
 
P
M
 
N
L
 
V
T
 
T
K
 
Q
N
 
R
F
 
Y
F
 
C
A
 
E
S
 
S
K
 
K
G
 
G
V
 
W
F
 
H
V
 
C
E
 
R
T
 
I
I
 
I
K
 
P
L
 
L
Y
 
K
G
 
G
S
 
S
I
 
V
E
 
E
L
 
L
S
 
A
P
 
P
I
 
I
V
 
A
G
 
G
L
 
L
S
 
S
D
 
D
F
 
L
I
 
I
V
 
V
D
 
D
L
 
I
V
 
T
S
 
E
T
 
T
G
 
G
Q
 
R
T
 
T
L
 
L
K
 
K
K
 
E
N
 
N
G
 
N
L
 
L
I
 
E
E
 
I
V
 
L
E
 
D
T
 
E
I
 
I
L
 
F
E
 
V
S
 
I
T
x
R
A
 
T
R
x
H
L
 
V
I
 
V
G
 
V
N
 
N
K
 
P
S
 
V
M
 
S
A
x
Y
K
 
R
V
 
T
K
 
K
Y
 
R
D
 
E
R
 
E
I
 
V
K
 
V
E
 
S
I
 
F
I
 
L
E
 
E
T
 
K
V
 
L
E
 
Q
S
 
E
V
 
V

5u99A Transition state analysis of adenosine triphosphate phosphoribosyltransferase (see paper)
35% identity, 87% coverage: 6:186/209 of query aligns to 4:184/278 of 5u99A

query
sites
5u99A
V
 
L
N
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
V
P
 
P
-
 
N
K
 
K
G
 
G
R
 
A
L
 
L
A
 
S
E
 
E
D
 
P
T
 
A
I
 
T
E
 
E
L
 
I
F
 
L
L
 
A
K
 
E
Q
 
A
G
 
G
I
 
Y
T
 
R
N
 
R
E
 
R
G
 
-
V
 
-
V
 
-
D
 
-
F
 
T
N
 
D
S
 
S
R
 
K
R
 
D
L
 
L
T
 
T
F
 
V
Y
 
I
D
 
D
E
 
P
K
 
V
N
 
N
N
 
N
I
 
V
K
 
E
F
 
F
M
 
F
M
 
F
V
 
L
R
 
R
N
 
P
M
 
K
D
 
D
V
 
I
S
 
A
T
 
I
Y
 
Y
V
 
V
E
 
G
H
 
S
G
 
G
A
 
E
A
 
L
D
 
D
I
 
F
G
 
G
V
 
I
V
 
T
G
 
G
K
 
R
D
|
D
I
 
L
L
 
V
L
 
C
E
 
D
S
 
S
G
 
G
S
 
A
D
 
Q
V
 
V
Y
 
R
E
 
E
Y
 
R
L
 
L
D
 
A
L
 
L
G
 
G
F
 
F
G
 
G
F
 
S
C
x
S
-
 
S
-
 
F
R
 
R
L
 
Y
C
 
A
V
 
A
A
 
P
G
 
A
I
 
G
R
 
R
N
 
N
S
 
W
D
 
T
L
 
T
S
 
A
Y
 
D
R
 
L
H
 
A
D
 
G
M
 
M
V
 
R
V
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
A
Y
 
Y
P
 
P
M
 
N
L
 
L
T
 
V
K
 
R
N
 
K
F
 
D
F
 
L
A
 
A
S
 
T
K
 
K
G
 
G
V
 
I
F
 
E
V
 
A
E
 
T
T
 
V
I
 
I
K
 
R
L
 
L
Y
 
D
G
 
G
S
 
A
I
 
V
E
 
E
L
 
I
S
 
S
P
 
V
I
 
Q
V
 
L
G
 
G
L
 
V
S
 
A
D
 
D
F
 
A
I
 
I
V
 
A
D
 
D
L
x
V
V
 
V
S
 
G
T
 
S
G
 
G
Q
 
R
T
 
T
L
 
L
K
 
S
K
 
Q
N
 
H
G
 
D
L
 
L
I
 
V
E
 
A
V
 
F
-
 
G
E
 
E
T
 
P
I
 
L
L
 
C
E
 
D
S
 
S
T
 
E
A
 
A
R
 
V
L
 
L
I
 
I

5lhtA Atp phosphoribosyltransferase from mycobacterium tuberculosis in complex with the allosteric activator 3-(2-thienyl)-l-alanine (see paper)
35% identity, 87% coverage: 6:186/209 of query aligns to 2:182/284 of 5lhtA

query
sites
5lhtA
V
 
L
N
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
V
P
 
P
-
 
N
K
 
K
G
 
G
R
 
A
L
 
L
A
 
S
E
 
E
D
 
P
T
 
A
I
 
T
E
 
E
L
 
I
F
 
L
L
 
A
K
 
E
Q
 
A
G
 
G
I
 
Y
T
 
R
N
 
R
E
 
R
G
 
-
V
 
-
V
 
-
D
 
-
F
 
T
N
 
D
S
 
S
R
 
K
R
 
D
L
 
L
T
 
T
F
 
V
Y
 
I
D
 
D
E
 
P
K
 
V
N
 
N
N
 
N
I
 
V
K
 
E
F
 
F
M
 
F
M
 
F
V
 
L
R
 
R
N
 
P
M
 
K
D
 
D
V
 
I
S
 
A
T
 
I
Y
 
Y
V
 
V
E
 
G
H
 
S
G
 
G
A
 
E
A
 
L
D
 
D
I
 
F
G
 
G
V
 
I
V
 
T
G
 
G
K
 
R
D
 
D
I
 
L
L
 
V
L
 
C
E
 
D
S
 
S
G
 
G
S
 
A
D
 
Q
V
 
V
Y
 
R
E
 
E
Y
 
R
L
 
L
D
 
A
L
 
L
G
 
G
F
 
F
G
 
G
F
 
S
C
 
S
-
 
S
-
 
F
R
 
R
L
 
Y
C
 
A
V
 
A
A
 
P
G
 
A
I
 
G
R
 
R
N
 
N
S
 
W
D
 
T
L
 
T
S
 
A
Y
 
D
R
 
L
H
 
A
D
 
G
M
 
M
V
 
R
V
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
A
Y
 
Y
P
 
P
M
 
N
L
 
L
T
 
V
K
 
R
N
 
K
F
 
D
F
 
L
A
 
A
S
 
T
K
 
K
G
 
G
V
 
I
F
 
E
V
 
A
E
 
T
T
 
V
I
 
I
K
 
R
L
 
L
Y
 
D
G
 
G
S
 
A
I
 
V
E
 
E
L
 
I
S
 
S
P
 
V
I
 
Q
V
 
L
G
 
G
L
 
V
S
 
A
D
 
D
F
 
A
I
 
I
V
 
A
D
 
D
L
 
V
V
 
V
S
 
G
T
 
S
G
 
G
Q
 
R
T
 
T
L
 
L
K
 
S
K
 
Q
N
 
H
G
 
D
L
 
L
I
 
V
E
 
A
V
 
F
-
 
G
E
 
E
T
 
P
I
 
L
L
 
C
E
 
D
S
 
S
T
 
E
A
 
A
R
 
V
L
 
L
I
 
I

Sites not aligning to the query:

1nh8A Atp phosphoribosyltransferase (atp-prtase) from mycobacterium tuberculosis in complex with amp and histidine (see paper)
35% identity, 87% coverage: 6:186/209 of query aligns to 2:182/276 of 1nh8A

query
sites
1nh8A
V
 
L
N
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
V
P
 
P
-
 
N
K
 
K
G
 
G
R
 
A
L
 
L
A
 
S
E
 
E
D
 
P
T
 
A
I
 
T
E
 
E
L
 
I
F
 
L
L
 
A
K
 
E
Q
 
A
G
 
G
I
 
Y
T
 
R
N
 
R
E
 
R
G
 
-
V
 
-
V
 
-
D
 
-
F
 
T
N
 
D
S
 
S
R
 
K
R
 
D
L
 
L
T
 
T
F
 
V
Y
 
I
D
 
D
E
 
P
K
 
V
N
 
N
N
 
N
I
 
V
K
 
E
F
 
F
M
 
F
M
 
F
V
 
L
R
 
R
N
 
P
M
 
K
D
 
D
V
 
I
S
 
A
T
 
I
Y
 
Y
V
 
V
E
 
G
H
 
S
G
 
G
A
 
E
A
 
L
D
 
D
I
 
F
G
 
G
V
 
I
V
 
T
G
 
G
K
 
R
D
 
D
I
 
L
L
 
V
L
 
C
E
 
D
S
 
S
G
 
G
S
 
A
D
 
Q
V
 
V
Y
 
R
E
 
E
Y
 
R
L
 
L
D
 
A
L
 
L
G
 
G
F
 
F
G
 
G
F
 
S
C
 
S
-
 
S
-
 
F
R
 
R
L
 
Y
C
 
A
V
 
A
A
 
P
G
 
A
I
 
G
R
 
R
N
 
N
S
 
W
D
 
T
L
 
T
S
 
A
Y
 
D
R
 
L
H
 
A
D
 
G
M
 
M
V
 
R
V
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
A
Y
 
Y
P
 
P
M
 
N
L
 
L
T
 
V
K
 
R
N
 
K
F
 
D
F
 
L
A
 
A
S
 
T
K
 
K
G
 
G
V
 
I
F
 
E
V
 
A
E
 
T
T
 
V
I
 
I
K
 
R
L
 
L
Y
 
D
G
 
G
S
 
A
I
 
V
E
 
E
L
 
I
S
 
S
P
 
V
I
 
Q
V
 
L
G
 
G
L
 
V
S
 
A
D
 
D
F
 
A
I
 
I
V
 
A
D
 
D
L
x
V
V
 
V
S
x
G
T
x
S
G
|
G
Q
x
R
T
|
T
L
 
L
K
 
S
K
 
Q
N
 
H
G
 
D
L
 
L
I
 
V
E
 
A
V
 
F
-
 
G
E
 
E
T
 
P
I
 
L
L
 
C
E
 
D
S
 
S
T
 
E
A
 
A
R
 
V
L
 
L
I
 
I

Sites not aligning to the query:

7dahC Adenosine triphosphate phosphoribosyltransferase from vibrio cholerae in complex with atp and prpp
38% identity, 84% coverage: 12:186/209 of query aligns to 11:193/288 of 7dahC

query
sites
7dahC
K
 
K
G
 
G
R
|
R
L
 
L
A
 
S
E
 
Q
D
 
E
T
 
C
I
 
Q
E
 
E
L
 
L
F
 
L
L
 
K
K
 
K
Q
 
C
G
 
G
I
 
-
T
 
-
N
 
-
E
 
-
G
 
-
V
 
-
V
 
V
D
 
K
F
 
F
N
 
N
-
 
I
-
 
M
S
 
G
R
 
E
R
 
R
L
 
L
T
 
V
F
 
V
Y
 
H
D
 
S
E
 
L
K
 
N
N
 
M
N
 
P
I
 
I
K
 
D
F
 
L
M
 
L
M
 
L
V
 
V
R
|
R
N
x
D
M
x
D
D
 
D
V
 
I
S
 
P
T
 
G
Y
 
L
V
 
I
E
 
M
H
 
D
G
 
G
A
 
V
A
 
V
D
 
D
I
 
L
G
 
G
V
 
F
V
 
V
G
 
G
K
 
E
D
x
N
I
 
V
L
 
L
L
 
E
E
 
E
S
 
T
G
 
R
S
 
L
D
 
D
V
 
R
Y
 
L
-
 
A
-
 
L
-
 
N
-
 
Q
-
 
R
-
 
N
E
 
E
Y
 
F
L
 
T
D
 
T
L
 
L
-
 
R
-
 
R
-
 
M
G
 
D
F
 
F
G
 
G
F
x
G
C
|
C
R
 
R
L
 
L
C
 
S
V
 
I
A
 
A
G
 
I
I
 
E
R
 
K
N
 
D
S
 
A
D
 
E
L
 
Y
S
 
R
Y
 
G
R
 
P
H
 
Q
D
 
D
M
 
L
-
 
N
-
 
G
-
 
K
V
 
R
V
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
T
Y
 
Y
P
 
P
M
 
Q
L
 
L
T
 
L
K
 
K
N
 
A
F
 
Y
F
 
M
A
 
D
S
 
R
K
 
Q
G
 
G
V
 
V
F
 
D
V
 
F
E
 
S
T
 
T
I
 
C
K
 
M
L
 
L
Y
 
T
G
|
G
S
|
S
I
 
V
E
|
E
L
 
V
S
 
A
P
 
P
I
 
R
V
 
A
G
 
G
L
 
L
S
 
A
D
 
D
F
 
A
I
 
I
V
 
A
D
 
D
L
|
L
V
 
V
S
|
S
T
|
T
G
|
G
Q
x
A
T
|
T
L
 
L
K
 
E
K
 
A
N
 
N
G
 
G
L
 
L
I
 
K
E
 
E
V
 
V
E
 
E
T
 
V
I
 
I
L
 
F
E
 
E
S
 
S
T
 
K
A
 
A
R
 
T
L
 
L
I
 
I

Sites not aligning to the query:

1q1kA Structure of atp-phosphoribosyltransferase from e. Coli complexed with pr-atp (see paper)
34% identity, 98% coverage: 6:209/209 of query aligns to 3:216/288 of 1q1kA

query
sites
1q1kA
V
 
L
N
 
R
V
 
I
A
 
A
L
 
M
P
 
Q
K
 
K
-
 
S
G
 
G
R
|
R
L
 
L
A
 
S
E
 
D
D
 
D
T
 
S
I
 
R
E
 
E
L
 
L
F
 
L
L
 
A
K
 
R
Q
 
C
G
 
G
I
 
I
T
 
K
N
 
-
E
 
-
G
 
-
V
 
-
V
 
I
D
 
N
F
 
L
N
 
H
S
 
T
R
 
Q
R
 
R
L
 
L
T
 
I
F
 
A
Y
 
M
D
 
A
E
 
E
K
 
N
N
 
M
N
 
P
I
 
I
K
 
D
F
 
I
M
 
L
M
 
R
V
 
V
R
 
R
N
x
D
M
x
D
D
 
D
V
 
I
S
 
P
T
 
G
Y
 
L
V
 
V
E
 
M
H
 
D
G
 
G
A
 
V
A
 
V
D
 
D
I
 
L
G
 
G
V
 
I
V
 
I
G
 
G
K
 
E
D
x
N
I
x
V
L
 
L
L
 
E
E
 
E
-
 
E
-
 
L
-
 
L
-
 
N
-
 
R
-
 
R
-
 
A
S
 
Q
G
 
G
S
 
E
D
 
D
V
 
P
-
 
R
-
 
Y
Y
 
F
E
 
T
Y
 
L
L
 
R
D
 
R
L
 
L
G
 
D
F
 
F
G
 
G
F
 
G
C
|
C
R
 
R
L
 
L
C
 
S
V
 
L
A
 
A
G
 
T
-
 
P
-
 
V
-
 
D
-
 
E
I
 
A
R
 
W
N
 
D
S
 
G
D
 
P
L
 
L
S
 
S
Y
 
L
R
 
-
H
 
N
D
 
G
M
 
K
V
 
R
V
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
S
Y
|
Y
P
 
P
M
 
H
L
 
L
T
 
L
K
 
K
N
 
R
F
 
Y
F
 
L
A
 
D
S
 
Q
K
 
K
G
 
G
V
 
I
F
 
S
V
 
F
E
 
K
T
 
S
I
 
C
K
 
L
L
 
L
Y
 
N
G
 
G
S
 
S
I
 
V
E
|
E
L
 
V
S
 
A
P
 
P
I
 
R
V
 
A
G
 
G
L
 
L
S
 
A
D
 
D
F
 
A
I
 
I
V
 
C
D
 
D
L
|
L
V
 
V
S
|
S
T
|
T
G
|
G
Q
x
A
T
|
T
L
 
L
K
 
E
K
 
A
N
 
N
G
 
G
L
 
L
I
 
R
E
 
E
V
 
V
E
 
E
T
 
V
I
 
I
L
 
Y
E
 
R
S
 
S
T
 
K
A
 
A
R
 
C
L
 
L
I
 
I
G
 
Q
-
 
R
N
 
D
K
 
G
S
 
E
M
 
M
A
 
E
K
 
E
V
 
S
K
 
K
Y
 
Q
D
 
Q
R
 
L
I
 
I
K
 
D
E
 
K
I
 
L
I
 
L
E
 
T
T
 
R
V
 
I
E
 
Q
S
 
G
V
 
V

1h3dA Structure of the e.Coli atp-phosphoribosyltransferase (see paper)
34% identity, 98% coverage: 6:209/209 of query aligns to 3:216/288 of 1h3dA

query
sites
1h3dA
V
 
L
N
 
R
V
 
I
A
 
A
L
 
M
P
 
Q
K
 
K
-
 
S
G
 
G
R
|
R
L
 
L
A
 
S
E
 
D
D
 
D
T
 
S
I
 
R
E
 
E
L
 
L
F
 
L
L
 
A
K
 
R
Q
 
C
G
 
G
I
 
I
T
 
K
N
 
-
E
 
-
G
 
-
V
 
-
V
 
I
D
 
N
F
 
L
N
 
H
S
 
T
R
 
Q
R
 
R
L
 
L
T
 
I
F
 
A
Y
 
M
D
 
A
E
 
E
K
 
N
N
 
M
N
 
P
I
 
I
K
 
D
F
 
I
M
 
L
M
 
R
V
 
V
R
 
R
N
 
D
M
 
D
D
 
D
V
 
I
S
 
P
T
 
G
Y
 
L
V
 
V
E
 
M
H
 
D
G
 
G
A
 
V
A
 
V
D
 
D
I
 
L
G
 
G
V
 
I
V
 
I
G
 
G
K
 
E
D
 
N
I
 
V
L
 
L
L
 
E
E
 
E
-
 
E
-
 
L
-
 
L
-
 
N
-
 
R
-
 
R
-
 
A
S
 
Q
G
 
G
S
 
E
D
 
D
V
 
P
-
 
R
-
 
Y
Y
 
F
E
 
T
Y
 
L
L
 
R
D
 
R
L
 
L
G
 
D
F
 
F
G
 
G
F
 
G
C
 
C
R
 
R
L
 
L
C
 
S
V
 
L
A
 
A
G
 
T
-
 
P
-
 
V
-
 
D
-
 
E
I
 
A
R
 
W
N
 
D
S
 
G
D
 
P
L
 
L
S
 
S
Y
 
L
R
 
-
H
 
N
D
 
G
M
 
K
V
 
R
V
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
S
Y
 
Y
P
 
P
M
 
H
L
 
L
T
 
L
K
 
K
N
 
R
F
 
Y
F
 
L
A
 
D
S
 
Q
K
 
K
G
 
G
V
 
I
F
 
S
V
 
F
E
 
K
T
 
S
I
 
C
K
 
L
L
 
L
Y
 
N
G
 
G
S
 
S
I
 
V
E
|
E
L
 
V
S
 
A
P
 
P
I
 
R
V
 
A
G
 
G
L
 
L
S
 
A
D
 
D
F
 
A
I
 
I
V
 
C
D
|
D
L
|
L
V
 
V
S
|
S
T
|
T
G
|
G
Q
x
A
T
|
T
L
 
L
K
 
E
K
 
A
N
 
N
G
 
G
L
 
L
I
 
R
E
 
E
V
 
V
E
 
E
T
 
V
I
 
I
L
 
Y
E
 
R
S
 
S
T
 
K
A
 
A
R
 
C
L
 
L
I
 
I
G
 
Q
-
 
R
N
 
D
K
 
G
S
 
E
M
 
M
A
 
E
K
 
E
V
 
S
K
 
K
Y
 
Q
D
 
Q
R
 
L
I
 
I
K
 
D
E
 
K
I
 
L
I
 
L
E
 
T
T
 
R
V
 
I
E
 
Q
S
 
G
V
 
V

4yb7C Adenosine triphosphate phosphoribosyltransferase from campylobacter jejuni in complex with atp (see paper)
32% identity, 94% coverage: 13:209/209 of query aligns to 12:217/294 of 4yb7C

query
sites
4yb7C
G
|
G
R
|
R
L
 
L
A
 
S
E
 
K
D
 
E
T
 
S
I
 
I
E
 
E
L
 
L
F
 
L
L
 
S
K
 
E
Q
 
C
G
 
G
I
 
V
T
 
K
N
 
-
E
 
-
G
 
-
V
 
-
V
 
M
D
 
H
F
 
I
N
 
H
S
 
E
R
 
Q
R
 
S
L
 
L
T
 
I
F
 
A
Y
 
F
D
 
S
E
 
T
K
 
N
N
 
L
N
 
P
I
 
I
K
 
D
F
 
I
M
 
L
M
 
R
V
 
V
R
|
R
N
x
D
M
x
D
D
 
D
V
 
I
S
 
P
T
 
G
Y
 
L
V
 
I
E
 
F
H
 
D
G
 
G
A
 
V
A
 
V
D
 
D
I
 
L
G
 
G
V
 
I
V
 
I
G
 
G
-
 
E
-
x
N
-
 
V
-
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
N
-
 
E
-
 
L
-
 
E
K
 
R
D
 
Q
I
 
S
L
 
L
L
 
G
E
 
E
S
 
N
G
 
P
S
 
S
D
 
-
V
 
-
Y
 
Y
E
 
K
Y
 
L
L
 
L
D
 
K
-
 
K
L
 
L
G
 
D
F
 
F
G
 
G
F
 
Y
C
|
C
R
 
R
L
 
L
C
 
S
V
 
L
A
 
A
G
 
L
I
 
P
R
 
Q
N
 
E
S
 
N
D
 
K
L
 
F
S
 
Q
Y
 
N
R
 
L
H
 
K
D
 
D
-
 
F
-
 
E
-
 
G
M
 
L
V
 
R
V
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
S
Y
 
Y
P
 
P
M
 
Q
L
 
L
T
 
L
K
 
K
N
 
R
F
 
F
F
 
M
A
 
K
S
 
E
K
 
N
G
 
G
V
 
I
F
 
N
V
 
Y
E
 
K
T
 
N
I
 
C
K
 
T
L
 
L
Y
 
T
G
 
G
S
 
S
I
 
V
E
 
E
L
 
V
S
 
A
P
 
P
I
 
R
V
 
A
G
 
N
L
 
L
S
 
A
D
 
D
F
 
A
I
 
I
V
 
C
D
 
D
L
|
L
V
|
V
S
|
S
T
x
S
G
|
G
Q
 
A
T
|
T
L
 
L
K
 
Q
K
 
A
N
 
N
G
 
N
L
 
L
I
 
K
E
 
E
V
 
V
E
 
K
T
 
V
I
 
I
L
 
Y
E
 
E
S
 
S
T
 
R
A
 
A
R
 
C
L
 
L
I
 
I
G
 
Q
N
 
K
K
 
E
-
 
N
S
 
A
M
 
L
A
 
S
K
 
K
V
 
E
K
 
K
Y
 
Q
D
 
A
R
 
L
I
 
V
K
 
D
E
 
K
I
 
I
I
 
M
E
 
L
T
 
R
V
 
V
E
 
A
S
 
G
V
 
V

Sites not aligning to the query:

4yb7A Adenosine triphosphate phosphoribosyltransferase from campylobacter jejuni in complex with atp (see paper)
32% identity, 94% coverage: 13:209/209 of query aligns to 12:217/296 of 4yb7A

query
sites
4yb7A
G
|
G
R
|
R
L
|
L
A
 
S
E
 
K
D
 
E
T
 
S
I
 
I
E
 
E
L
 
L
F
 
L
L
 
S
K
 
E
Q
 
C
G
 
G
I
 
V
T
 
K
N
 
-
E
 
-
G
 
-
V
 
-
V
 
M
D
 
H
F
 
I
N
 
H
S
 
E
R
 
Q
R
 
S
L
 
L
T
 
I
F
 
A
Y
 
F
D
 
S
E
 
T
K
 
N
N
 
L
N
 
P
I
 
I
K
 
D
F
 
I
M
 
L
M
 
R
V
 
V
R
|
R
N
x
D
M
x
D
D
 
D
V
 
I
S
 
P
T
 
G
Y
 
L
V
 
I
E
 
F
H
 
D
G
 
G
A
 
V
A
 
V
D
 
D
I
 
L
G
 
G
V
 
I
V
 
I
G
 
G
-
 
E
-
x
N
-
 
V
-
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
N
-
 
E
-
 
L
-
 
E
K
 
R
D
 
Q
I
 
S
L
 
L
L
 
G
E
 
E
S
 
N
G
 
P
S
 
S
D
 
-
V
 
-
Y
 
Y
E
 
K
Y
 
L
L
 
L
D
 
K
-
 
K
L
 
L
G
 
D
F
 
F
G
|
G
F
 
Y
C
|
C
R
 
R
L
 
L
C
 
S
V
 
L
A
 
A
G
 
L
I
 
P
R
 
Q
N
 
E
S
 
N
D
 
K
L
 
F
S
 
Q
Y
 
N
R
 
L
H
 
K
D
 
D
-
 
F
-
 
E
-
 
G
M
 
L
V
 
R
V
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
S
Y
 
Y
P
 
P
M
 
Q
L
 
L
T
 
L
K
 
K
N
 
R
F
 
F
F
 
M
A
 
K
S
 
E
K
 
N
G
 
G
V
 
I
F
 
N
V
 
Y
E
 
K
T
 
N
I
 
C
K
 
T
L
 
L
Y
 
T
G
 
G
S
 
S
I
 
V
E
 
E
L
 
V
S
 
A
P
 
P
I
 
R
V
 
A
G
 
N
L
 
L
S
 
A
D
 
D
F
 
A
I
 
I
V
 
C
D
 
D
L
|
L
V
 
V
S
|
S
T
 
S
G
 
G
Q
 
A
T
 
T
L
 
L
K
 
Q
K
 
A
N
 
N
G
 
N
L
 
L
I
 
K
E
 
E
V
 
V
E
 
K
T
 
V
I
 
I
L
 
Y
E
 
E
S
 
S
T
 
R
A
 
A
R
 
C
L
 
L
I
 
I
G
 
Q
N
 
K
K
 
E
-
 
N
S
 
A
M
 
L
A
 
S
K
 
K
V
 
E
K
 
K
Y
 
Q
D
 
A
R
 
L
I
 
V
K
 
D
E
 
K
I
 
I
I
 
M
E
 
L
T
 
R
V
 
V
E
 
A
S
 
G
V
 
V

Sites not aligning to the query:

4yb6A Adenosine triphosphate phosphoribosyltransferase from campylobacter jejuni in complex with the inhibitors amp and histidine (see paper)
32% identity, 94% coverage: 13:209/209 of query aligns to 12:217/296 of 4yb6A

query
sites
4yb6A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
S
E
 
K
D
 
E
T
 
S
I
 
I
E
 
E
L
 
L
F
 
L
L
 
S
K
 
E
Q
 
C
G
 
G
I
 
V
T
 
K
N
 
-
E
 
-
G
 
-
V
 
-
V
 
M
D
 
H
F
 
I
N
 
H
S
 
E
R
 
Q
R
 
S
L
 
L
T
 
I
F
 
A
Y
 
F
D
 
S
E
 
T
K
 
N
N
 
L
N
 
P
I
 
I
K
 
D
F
 
I
M
 
L
M
 
R
V
 
V
R
 
R
N
 
D
M
 
D
D
 
D
V
 
I
S
 
P
T
 
G
Y
 
L
V
 
I
E
 
F
H
 
D
G
 
G
A
 
V
A
 
V
D
 
D
I
 
L
G
 
G
V
 
I
V
 
I
G
 
G
-
 
E
-
 
N
-
 
V
-
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
N
-
 
E
-
 
L
-
 
E
K
 
R
D
 
Q
I
 
S
L
 
L
L
 
G
E
 
E
S
 
N
G
 
P
S
 
S
D
 
-
V
 
-
Y
 
Y
E
 
K
Y
 
L
L
 
L
D
 
K
-
 
K
L
 
L
G
 
D
F
 
F
G
 
G
F
 
Y
C
 
C
R
 
R
L
 
L
C
 
S
V
 
L
A
 
A
G
 
L
I
 
P
R
 
Q
N
 
E
S
 
N
D
 
K
L
 
F
S
 
Q
Y
 
N
R
 
L
H
 
K
D
 
D
-
 
F
-
 
E
-
 
G
M
 
L
V
 
R
V
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
S
Y
 
Y
P
 
P
M
 
Q
L
 
L
T
 
L
K
 
K
N
 
R
F
 
F
F
 
M
A
 
K
S
 
E
K
 
N
G
 
G
V
 
I
F
 
N
V
 
Y
E
 
K
T
 
N
I
 
C
K
 
T
L
 
L
Y
 
T
G
 
G
S
 
S
I
 
V
E
 
E
L
 
V
S
 
A
P
 
P
I
 
R
V
 
A
G
 
N
L
 
L
S
 
A
D
 
D
F
 
A
I
 
I
V
 
C
D
 
D
L
|
L
V
 
V
S
|
S
T
x
S
G
|
G
Q
 
A
T
|
T
L
 
L
K
 
Q
K
 
A
N
 
N
G
 
N
L
 
L
I
 
K
E
 
E
V
 
V
E
 
K
T
 
V
I
 
I
L
 
Y
E
 
E
S
 
S
T
 
R
A
 
A
R
 
C
L
 
L
I
 
I
G
 
Q
N
 
K
K
 
E
-
 
N
S
 
A
M
 
L
A
 
S
K
 
K
V
 
E
K
 
K
Y
 
Q
D
 
A
R
 
L
I
 
V
K
 
D
E
 
K
I
 
I
I
 
M
E
 
L
T
 
R
V
 
V
E
 
A
S
 
G
V
 
V

Sites not aligning to the query:

5ubiA Catalytic core domain of adenosine triphosphate phosphoribosyltransferase from campylobacter jejuni with bound prpp (see paper)
31% identity, 98% coverage: 6:209/209 of query aligns to 4:217/218 of 5ubiA

query
sites
5ubiA
V
 
L
N
 
R
V
 
I
A
 
A
L
 
I
P
 
Q
K
 
K
-
 
S
G
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
S
E
 
K
D
 
E
T
 
S
I
 
I
E
 
E
L
 
L
F
 
L
L
 
S
K
 
E
Q
 
C
G
 
G
I
 
V
T
 
K
N
 
-
E
 
-
G
 
-
V
 
-
V
 
M
D
x
H
F
 
I
N
x
H
S
 
E
R
 
Q
R
 
S
L
 
L
T
 
I
F
 
A
Y
 
F
D
 
S
E
 
T
K
 
N
N
 
L
N
 
P
I
 
I
K
 
D
F
 
I
M
 
L
M
 
R
V
 
V
R
 
R
N
x
D
M
x
D
D
 
D
V
 
I
S
 
P
T
 
G
Y
 
L
V
 
I
E
 
F
H
 
D
G
 
G
A
 
V
A
 
V
D
 
D
I
 
L
G
 
G
V
 
I
V
 
I
G
 
G
-
 
E
-
 
N
-
 
V
-
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
N
-
 
E
-
 
L
-
 
E
K
 
R
D
 
Q
I
 
S
L
 
L
L
 
G
E
 
E
S
 
N
G
 
P
S
 
S
D
 
-
V
 
-
Y
 
Y
E
 
K
Y
 
L
L
 
L
D
 
K
-
 
K
L
 
L
G
 
D
F
 
F
G
 
G
F
 
Y
C
 
C
R
 
R
L
 
L
C
 
S
V
 
L
A
 
A
G
 
L
I
 
P
R
 
Q
N
 
E
S
 
N
D
 
K
L
 
F
S
 
Q
Y
 
N
R
 
L
H
 
K
D
 
D
-
 
F
-
 
E
-
 
G
M
 
L
V
 
R
V
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
S
Y
 
Y
P
 
P
M
 
Q
L
 
L
T
 
L
K
 
K
N
 
R
F
 
F
F
 
M
A
 
K
S
 
E
K
 
N
G
 
G
V
 
I
F
 
N
V
 
Y
E
 
K
T
 
N
I
 
C
K
 
T
L
 
L
Y
 
T
G
 
G
S
 
S
I
 
V
E
 
E
L
 
V
S
 
A
P
 
P
I
 
R
V
 
A
G
 
N
L
 
L
S
 
A
D
 
D
F
 
A
I
 
I
V
 
C
D
 
D
L
|
L
V
|
V
S
|
S
T
x
S
G
|
G
Q
 
A
T
|
T
L
 
L
K
 
Q
K
 
A
N
 
N
G
 
N
L
 
L
I
 
K
E
 
E
V
 
V
E
 
K
T
 
V
I
 
I
L
 
Y
E
 
E
S
 
S
T
 
R
A
 
A
R
 
C
L
 
L
I
 
I
G
 
Q
N
 
K
K
 
E
-
 
N
S
 
A
M
 
L
A
 
S
K
 
K
V
 
E
K
 
K
Y
 
Q
D
 
A
R
 
L
I
 
V
K
 
D
E
 
K
I
 
I
I
 
M
E
 
L
T
 
R
V
 
V
E
 
A
S
 
G
V
 
V

5ubgA Catalytic core domain of adenosine triphosphate phosphoribosyltransferase from campylobacter jejuni with bound phosphoribosyl-atp (see paper)
31% identity, 98% coverage: 6:209/209 of query aligns to 4:217/222 of 5ubgA

query
sites
5ubgA
V
 
L
N
 
R
V
 
I
A
 
A
L
 
I
P
x
Q
K
 
K
-
 
S
G
|
G
R
|
R
L
 
L
A
 
S
E
 
K
D
 
E
T
 
S
I
 
I
E
 
E
L
 
L
F
 
L
L
 
S
K
 
E
Q
 
C
G
 
G
I
 
V
T
 
K
N
 
-
E
 
-
G
 
-
V
 
-
V
 
M
D
x
H
F
 
I
N
x
H
S
 
E
R
 
Q
R
 
S
L
 
L
T
 
I
F
 
A
Y
 
F
D
 
S
E
 
T
K
 
N
N
 
L
N
 
P
I
 
I
K
 
D
F
 
I
M
 
L
M
 
R
V
 
V
R
|
R
N
x
D
M
x
D
D
 
D
V
 
I
S
 
P
T
 
G
Y
 
L
V
 
I
E
 
F
H
 
D
G
 
G
A
 
V
A
 
V
D
 
D
I
 
L
G
 
G
V
 
I
V
 
I
G
 
G
-
 
E
-
x
N
-
 
V
-
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
N
-
 
E
-
 
L
-
 
E
K
 
R
D
 
Q
I
 
S
L
 
L
L
 
G
E
 
E
S
 
N
G
 
P
S
 
S
D
 
-
V
 
-
Y
 
Y
E
 
K
Y
 
L
L
 
L
D
 
K
-
 
K
L
 
L
G
 
D
F
 
F
G
 
G
F
 
Y
C
|
C
R
 
R
L
 
L
C
 
S
V
 
L
A
 
A
G
 
L
I
 
P
R
 
Q
N
 
E
S
 
N
D
 
K
L
 
F
S
 
Q
Y
 
N
R
 
L
H
 
K
D
 
D
-
 
F
-
 
E
-
 
G
M
 
L
V
 
R
V
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
S
Y
 
Y
P
 
P
M
 
Q
L
 
L
T
 
L
K
 
K
N
 
R
F
 
F
F
 
M
A
 
K
S
 
E
K
 
N
G
 
G
V
 
I
F
 
N
V
 
Y
E
 
K
T
 
N
I
 
C
K
 
T
L
 
L
Y
 
T
G
 
G
S
 
S
I
 
V
E
 
E
L
 
V
S
 
A
P
 
P
I
 
R
V
 
A
G
 
N
L
 
L
S
 
A
D
 
D
F
 
A
I
 
I
V
 
C
D
 
D
L
|
L
V
 
V
S
|
S
T
x
S
G
|
G
Q
x
A
T
|
T
L
 
L
K
 
Q
K
 
A
N
 
N
G
 
N
L
 
L
I
 
K
E
 
E
V
 
V
E
 
K
T
 
V
I
 
I
L
 
Y
E
 
E
S
 
S
T
 
R
A
 
A
R
 
C
L
 
L
I
 
I
G
 
Q
N
 
K
K
 
E
-
 
N
S
 
A
M
 
L
A
 
S
K
 
K
V
 
E
K
 
K
Y
 
Q
D
 
A
R
 
L
I
 
V
K
 
D
E
 
K
I
 
I
I
 
M
E
 
L
T
 
R
V
 
V
E
 
A
S
 
G
V
 
V

Query Sequence

>WP_013011561.1 NCBI__GCF_000025725.1:WP_013011561.1
MKENCVNVALPKGRLAEDTIELFLKQGITNEGVVDFNSRRLTFYDEKNNIKFMMVRNMDV
STYVEHGAADIGVVGKDILLESGSDVYEYLDLGFGFCRLCVAGIRNSDLSYRHDMVVATK
YPMLTKNFFASKGVFVETIKLYGSIELSPIVGLSDFIVDLVSTGQTLKKNGLIEVETILE
STARLIGNKSMAKVKYDRIKEIIETVESV

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory