SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_013012213.1 NCBI__GCF_000025725.1:WP_013012213.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4y96A Crystal structure of triosephosphate isomerase from gemmata obscuriglobus (see paper)
45% identity, 100% coverage: 2:253/253 of query aligns to 2:250/250 of 4y96A

query
sites
4y96A
R
 
R
K
 
K
P
 
K
Y
 
F
I
 
V
Y
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
L
 
T
D
 
T
M
 
L
H
 
A
G
 
E
S
 
A
S
 
K
D
 
A
L
 
L
I
 
G
S
 
A
S
 
A
I
 
V
L
 
A
S
 
K
V
 
G
K
 
V
I
 
T
D
 
D
Y
 
-
T
 
D
K
 
R
V
 
V
D
 
T
V
 
V
G
 
A
V
 
V
A
 
F
P
 
P
D
 
P
F
 
Y
S
 
P
S
 
W
L
 
L
Y
 
T
K
 
A
V
 
V
S
 
G
Q
 
E
T
 
V
I
 
L
K
 
K
Q
 
-
M
 
-
G
 
G
Y
 
S
P
 
P
I
 
V
S
 
A
V
 
L
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
D
I
 
V
S
 
S
A
 
S
E
 
E
E
 
K
K
 
K
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
V
S
 
S
A
 
P
A
 
A
M
 
M
V
 
L
F
 
L
A
 
E
A
 
T
G
 
G
A
 
C
D
 
K
S
 
Y
T
 
A
I
 
L
L
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
M
 
H
I
 
I
F
 
I
A
 
G
E
 
E
G
 
S
D
 
E
E
 
T
L
 
F
I
 
I
N
 
N
Q
 
H
K
 
K
V
 
V
K
 
H
T
 
T
A
 
A
L
 
L
R
 
E
N
 
E
N
 
G
L
 
L
D
 
S
V
 
V
I
 
V
L
 
L
C
 
C
V
 
M
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
D
 
A
E
 
E
R
 
R
E
 
E
S
 
R
G
 
G
V
 
L
A
 
Q
A
 
E
-
 
R
-
 
V
-
 
F
D
 
Q
R
 
R
V
 
Q
V
 
V
Y
 
Y
Q
 
A
V
 
A
G
 
C
M
 
A
G
 
G
L
 
L
K
 
T
D
 
D
I
 
-
G
 
-
M
 
-
D
 
E
R
 
Q
I
 
F
N
 
G
R
 
R
V
 
I
T
 
V
L
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
T
 
T
P
 
P
A
 
E
D
 
Q
A
 
A
E
 
Q
D
 
E
I
 
A
H
 
H
G
 
A
K
 
F
I
 
V
R
 
R
T
 
S
Q
 
K
L
 
L
S
 
R
K
 
L
M
 
L
Y
 
Y
G
 
G
P
 
D
V
 
K
V
 
I
A
 
A
E
 
D
K
 
S
I
 
T
R
 
P
I
 
I
L
 
V
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
P
 
P
D
 
D
N
 
N
V
 
T
S
 
V
A
 
G
L
 
L
M
 
M
M
 
S
R
 
Q
E
 
P
N
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
D
 
K
A
 
A
T
 
D
S
 
S
F
 
F
A
 
L
K
 
A
L
 
I
V
 
V
N
 
K
F
 
A
N
 
A
G
 
G

P36204 Bifunctional PGK/TIM; EC 2.7.2.3; EC 5.3.1.1 from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) (see paper)
46% identity, 98% coverage: 2:248/253 of query aligns to 402:645/654 of P36204

query
sites
P36204
R
 
R
K
 
K
P
 
L
Y
 
I
I
 
L
Y
 
A
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
M
N
 
H
L
 
K
D
 
T
M
 
I
H
 
S
G
 
E
S
 
A
S
 
K
D
 
K
L
 
F
I
 
V
S
 
S
S
 
L
I
 
L
L
 
V
S
 
N
V
 
E
K
 
L
I
 
H
D
 
D
Y
 
V
T
 
K
K
 
E
V
 
F
D
 
E
V
 
I
G
 
V
V
 
V
A
 
C
P
 
P
D
 
P
F
 
F
S
 
T
S
 
A
L
 
L
Y
 
S
K
 
E
V
 
V
S
 
G
Q
 
E
T
 
I
I
 
L
K
 
S
Q
 
-
M
 
-
G
 
G
Y
 
R
P
 
N
I
 
I
S
 
K
V
 
L
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
I
 
V
S
 
F
A
 
Y
E
 
E
E
 
D
K
 
Q
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
I
S
 
S
A
 
P
A
 
L
M
 
M
V
 
L
F
 
Q
A
 
E
A
 
I
G
 
G
A
 
V
D
 
E
S
 
Y
T
 
V
I
 
I
L
 
V
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
M
 
R
I
 
I
F
 
F
A
 
K
E
 
E
G
 
D
D
 
D
E
 
E
L
 
F
I
 
I
N
 
N
Q
 
R
K
 
K
V
 
V
K
 
K
T
 
A
A
 
V
L
 
L
R
 
E
N
 
K
N
 
G
L
 
M
D
 
T
V
 
P
I
 
I
L
 
L
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
D
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
S
 
K
G
 
G
V
 
L
A
 
T
A
 
F
D
 
C
R
 
V
V
 
V
V
 
E
Y
 
K
Q
 
Q
V
 
V
G
 
R
M
 
E
G
 
G
L
 
F
K
 
Y
D
 
G
I
 
L
G
 
D
M
 
K
D
 
E
R
 
E
I
 
A
N
 
K
R
 
R
V
 
V
T
 
V
L
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
R
T
 
V
A
 
A
T
 
T
P
 
P
A
 
Q
D
 
Q
A
 
A
E
 
Q
D
 
E
I
 
V
H
 
H
G
 
A
K
 
F
I
 
I
R
 
R
T
 
K
Q
 
L
L
 
L
S
 
S
K
 
E
M
 
M
Y
 
Y
G
 
D
P
 
E
V
 
E
V
 
T
A
 
A
E
 
G
K
 
S
I
 
I
R
 
R
I
 
I
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
I
K
 
K
P
 
P
D
 
D
N
 
N
V
 
F
S
 
L
A
 
G
L
 
L
M
 
I
M
 
V
R
 
Q
E
 
K
N
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
G
L
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
D
 
K
A
 
-
T
 
E
S
 
S
F
 
F
A
 
I
K
 
E
L
 
L

Sites not aligning to the query:

P27876 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
43% identity, 99% coverage: 1:250/253 of query aligns to 1:248/253 of P27876

query
sites
P27876
M
 
M
R
 
R
K
 
K
P
 
P
Y
 
I
I
 
I
Y
 
A
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
M
N
 
N
L
 
K
D
 
T
M
 
L
H
 
G
G
 
E
S
 
A
S
 
V
D
 
S
L
 
F
I
 
V
S
 
E
S
 
E
I
 
V
L
 
K
S
 
S
V
 
S
K
 
I
I
 
P
D
 
A
Y
 
A
T
 
D
K
 
K
V
 
A
D
 
E
V
 
A
G
 
V
V
 
V
A
 
C
P
 
A
D
 
P
F
 
A
S
 
L
S
 
F
L
 
L
Y
 
E
K
 
K
V
 
L
S
 
A
Q
 
S
T
 
A
I
 
V
K
 
K
Q
 
-
M
 
-
G
 
G
Y
 
T
P
 
D
I
 
L
S
 
K
V
 
V
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
I
 
M
S
 
H
A
 
F
E
 
E
E
 
E
K
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
I
S
 
S
A
 
P
A
 
V
M
 
A
V
 
L
F
 
K
A
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
V
D
 
D
S
 
Y
T
 
C
I
 
V
L
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
M
 
E
I
 
M
F
 
F
A
 
A
E
 
E
G
 
T
D
 
D
E
 
E
L
 
T
I
 
V
N
 
N
Q
 
K
K
 
K
V
 
A
K
 
H
T
 
A
A
 
A
L
 
F
R
 
K
N
 
H
N
 
G
L
 
I
D
 
V
V
 
P
I
 
I
L
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
D
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
S
 
A
G
 
G
V
 
K
A
 
T
A
 
N
D
 
D
R
 
L
V
 
V
V
 
A
Y
 
D
Q
 
Q
V
 
V
G
 
K
M
 
K
G
 
G
L
 
L
K
 
A
D
 
G
I
 
L
G
 
S
M
 
E
D
 
E
R
 
Q
I
 
V
N
 
A
R
 
A
V
 
S
T
 
V
L
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
S
A
 
S
T
 
T
P
 
A
A
 
K
D
 
D
A
 
A
E
 
N
D
 
D
I
 
V
H
 
C
G
 
A
K
 
H
I
 
I
R
 
R
T
 
K
Q
 
T
L
 
V
S
 
A
K
 
E
M
 
S
Y
 
F
G
 
S
P
 
Q
V
 
E
V
 
A
A
 
A
E
 
D
K
 
K
I
 
L
R
 
R
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
D
 
A
N
 
N
V
 
I
S
 
K
A
 
E
L
 
Y
M
 
M
M
 
A
R
 
E
E
 
S
N
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
D
 
E
A
 
P
T
 
Q
S
 
S
F
 
F
A
 
V
K
 
Q
L
 
L
V
 
L
N
 
E

P00943 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Geobacillus stearothermophilus (Bacillus stearothermophilus) (see 2 papers)
42% identity, 99% coverage: 1:250/253 of query aligns to 1:248/253 of P00943

query
sites
P00943
M
 
M
R
 
R
K
 
K
P
 
P
Y
 
I
I
 
I
Y
 
A
G
 
G
N
|
N
W
|
W
K
|
K
M
 
M
N
x
H
L
x
K
D
 
T
M
 
L
H
 
A
G
 
E
S
 
A
S
 
V
D
 
Q
L
 
F
I
 
V
S
 
E
S
 
D
I
 
V
L
 
K
S
 
G
V
 
H
K
 
V
I
 
P
D
 
P
Y
 
A
T
 
D
K
 
E
V
 
V
D
 
I
V
 
S
G
 
V
V
 
V
A
 
C
P
 
A
D
 
P
F
 
F
S
 
L
S
 
F
L
 
L
Y
 
D
K
 
R
V
 
L
S
 
V
Q
 
Q
T
 
A
I
 
A
K
 
D
Q
 
-
M
 
-
G
 
G
Y
 
T
P
 
D
I
 
L
S
 
K
V
 
I
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
T
I
 
M
S
 
H
A
 
F
E
 
A
E
 
D
K
 
Q
G
 
G
A
 
A
F
 
Y
T
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
V
S
 
S
A
 
P
A
 
V
M
 
M
V
 
L
F
 
K
A
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
V
D
 
T
S
 
Y
T
 
V
I
 
I
L
 
L
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
M
 
Q
I
 
M
F
 
F
A
 
A
E
 
E
G
 
T
D
 
D
E
 
E
L
 
T
I
 
V
N
 
N
Q
 
K
K
 
K
V
 
V
K
 
L
T
 
A
A
 
A
L
 
F
R
 
T
N
 
R
N
 
G
L
 
L
D
 
I
V
 
P
I
 
I
L
 
I
C
 
C
V
 
C
G
 
G
E
 
E
T
 
S
L
 
L
D
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
S
 
A
G
 
G
V
 
Q
A
 
T
A
 
N
D
 
A
R
 
V
V
 
V
V
 
A
Y
 
S
Q
 
Q
V
 
V
G
 
E
M
 
K
G
 
A
L
 
L
K
 
A
D
 
G
I
 
L
G
 
T
M
 
P
D
 
E
R
 
Q
I
 
V
N
 
K
R
 
Q
V
 
A
T
 
V
L
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
S
A
 
S
T
 
T
P
 
P
A
 
E
D
 
D
A
 
A
E
 
N
D
 
S
I
 
V
H
 
C
G
 
G
K
 
H
I
 
I
R
 
R
T
 
S
Q
 
V
L
 
V
S
 
S
K
 
R
M
 
L
Y
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
E
V
 
A
A
 
A
E
 
E
K
 
A
I
 
I
R
 
R
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
D
 
D
N
 
N
V
 
I
S
 
R
A
 
D
L
 
F
M
 
L
M
 
A
R
 
Q
E
 
Q
N
 
Q
I
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
P
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
D
 
E
A
 
P
T
 
A
S
 
S
F
 
F
A
 
L
K
 
Q
L
 
L
V
 
V
N
 
E

6neeB Crystal structure of a reconstructed ancestor of triosephosphate isomerase from eukaryotes (see paper)
46% identity, 98% coverage: 2:250/253 of query aligns to 4:249/252 of 6neeB

query
sites
6neeB
R
 
R
K
 
K
P
 
F
Y
 
F
I
 
V
Y
 
G
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
L
 
G
D
 
T
M
 
L
H
 
E
G
 
S
S
 
I
S
 
K
D
 
A
L
 
L
I
 
V
S
 
E
S
 
T
I
 
L
L
 
N
S
 
S
V
 
A
K
 
Q
I
 
L
D
 
D
Y
 
-
T
 
P
K
 
N
V
 
T
D
 
E
V
 
V
G
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
D
 
P
F
 
A
S
 
I
S
 
Y
L
 
L
Y
 
P
K
 
F
V
 
A
S
 
R
Q
 
S
T
 
K
I
 
L
K
 
K
Q
 
K
M
 
-
G
 
P
Y
 
K
P
 
E
I
 
I
S
 
Q
V
 
V
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
I
 
C
S
 
Y
A
 
T
E
 
K
E
 
P
K
 
N
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
I
S
 
S
A
 
A
A
 
E
M
 
M
V
 
L
F
 
K
A
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
V
D
 
P
S
 
W
T
 
V
I
 
I
L
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
M
 
T
I
 
I
F
 
F
A
 
G
E
 
E
G
 
S
D
 
D
E
 
E
L
 
L
I
 
I
N
 
A
Q
 
E
K
 
K
V
 
V
K
 
K
T
 
Y
A
 
A
L
 
L
R
 
D
N
 
Q
N
 
G
L
 
L
D
 
K
V
 
V
I
 
I
L
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
D
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
S
 
A
G
 
G
V
 
K
A
 
T
A
 
M
D
 
E
R
 
V
V
 
V
V
 
A
Y
 
R
Q
 
Q
V
 
I
G
 
L
M
 
K
G
 
A
L
 
I
K
 
A
D
 
D
I
 
K
G
 
I
M
 
K
D
 
D
R
 
W
I
 
S
N
 
N
R
 
-
V
 
V
T
 
V
L
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
T
 
T
P
 
P
A
 
E
D
 
Q
A
 
A
E
 
Q
D
 
E
I
 
V
H
 
H
G
 
A
K
 
A
I
 
L
R
 
R
T
 
K
Q
 
W
L
 
L
S
 
K
K
 
E
M
 
N
Y
 
V
G
 
S
P
 
P
V
 
E
V
 
V
A
 
A
E
 
E
K
 
S
I
 
T
R
 
R
I
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
K
 
N
P
 
A
D
 
A
N
 
N
V
 
C
S
 
K
A
 
E
L
 
L
M
 
A
M
 
K
R
 
Q
E
 
P
N
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
F
L
|
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
D
 
K
A
 
A
T
 
P
S
 
E
F
 
F
A
 
V
K
 
D
L
 
I
V
 
I
N
 
N

1btmA Triosephosphate isomerase (tim) complexed with 2-phosphoglycolic acid (see paper)
42% identity, 98% coverage: 2:250/253 of query aligns to 1:247/251 of 1btmA

query
sites
1btmA
R
 
R
K
 
K
P
 
P
Y
 
I
I
 
I
Y
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
H
L
 
K
D
 
T
M
 
L
H
 
A
G
 
E
S
 
A
S
 
V
D
 
Q
L
 
F
I
 
V
S
 
E
S
 
D
I
 
V
L
 
K
S
 
G
V
 
H
K
 
V
I
 
P
D
 
P
Y
 
A
T
 
D
K
 
E
V
 
V
D
 
I
V
 
S
G
 
V
V
 
V
A
 
C
P
 
A
D
 
P
F
 
F
S
 
L
S
 
F
L
 
L
Y
 
D
K
 
R
V
 
L
S
 
V
Q
 
Q
T
 
A
I
 
A
K
 
D
Q
 
-
M
 
-
G
 
G
Y
 
T
P
 
D
I
 
L
S
 
K
V
 
I
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
T
I
 
M
S
 
H
A
 
F
E
 
A
E
 
D
K
 
Q
G
 
G
A
 
A
F
 
Y
T
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
V
S
 
S
A
 
P
A
 
V
M
 
M
V
 
L
F
 
K
A
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
V
D
 
T
S
 
Y
T
 
V
I
 
I
L
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
M
 
Q
I
 
M
F
 
F
A
 
A
E
 
E
G
 
T
D
 
D
E
 
E
L
 
T
I
 
V
N
 
N
Q
 
K
K
 
K
V
 
V
K
 
L
T
 
A
A
 
A
L
 
F
R
 
T
N
 
R
N
 
G
L
 
L
D
 
I
V
 
P
I
 
I
L
 
I
C
 
C
V
 
C
G
 
G
E
 
E
T
 
S
L
 
L
D
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
S
 
A
G
 
G
V
 
Q
A
 
T
A
 
N
D
 
A
R
 
V
V
 
V
V
 
A
Y
 
S
Q
 
Q
V
 
V
G
 
E
M
 
K
G
 
A
L
 
L
K
 
A
D
 
G
I
 
L
G
 
T
M
 
P
D
 
E
R
 
Q
I
 
V
N
 
K
R
 
Q
V
 
A
T
 
V
L
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
S
A
 
S
T
 
T
P
 
P
A
 
E
D
 
D
A
 
A
E
 
N
D
 
S
I
 
V
H
 
C
G
 
G
K
 
H
I
 
I
R
 
R
T
 
S
Q
 
V
L
 
V
S
 
S
K
 
R
M
 
L
Y
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
E
V
 
A
A
 
A
E
 
E
K
 
A
I
 
I
R
 
R
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
D
 
D
N
 
N
V
 
I
S
 
R
A
 
D
L
 
F
M
 
L
M
 
A
R
 
Q
E
 
Q
N
 
Q
I
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
P
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
D
 
E
A
 
P
T
 
A
S
 
S
F
 
F
A
 
L
K
 
Q
L
 
L
V
 
V
N
 
E

P00940 Triosephosphate isomerase; TIM; Methylglyoxal synthase; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1; EC 4.2.3.3 from Gallus gallus (Chicken) (see 3 papers)
46% identity, 98% coverage: 2:250/253 of query aligns to 4:245/248 of P00940

query
sites
P00940
R
 
R
K
 
K
P
 
F
Y
 
F
I
 
V
Y
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
L
 
G
D
 
D
M
 
K
H
 
K
G
 
S
S
 
L
S
 
G
D
 
E
L
 
L
I
 
I
S
 
H
S
 
T
I
 
L
L
 
N
S
 
G
V
 
A
K
 
K
I
 
L
D
 
S
Y
 
A
T
 
D
K
 
T
V
 
E
D
 
V
V
 
V
G
 
C
V
 
G
A
 
A
P
 
P
D
 
-
F
 
-
S
 
-
S
 
S
L
 
I
Y
 
Y
K
 
-
V
 
L
S
 
D
Q
 
F
T
 
A
I
 
R
K
 
Q
Q
 
K
M
 
L
G
 
D
Y
 
A
P
 
K
I
 
I
S
 
G
V
 
V
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
I
 
C
S
 
Y
A
 
K
E
 
V
E
 
P
K
 
K
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
I
S
 
S
A
 
P
A
 
A
M
 
M
V
 
I
F
 
K
A
 
D
A
 
I
G
 
G
A
 
A
D
 
A
S
 
W
T
 
V
I
 
I
L
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
M
 
H
I
 
V
F
 
F
A
 
G
E
 
E
G
 
S
D
 
D
E
 
E
L
 
L
I
 
I
N
 
G
Q
 
Q
K
 
K
V
 
V
K
 
A
T
 
H
A
 
A
L
 
L
R
 
A
N
 
E
N
 
G
L
 
L
D
 
G
V
 
V
I
 
I
L
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
K
L
 
L
D
 
D
E
 
E
R
 
R
E
 
E
S
 
A
G
 
G
V
 
I
A
 
-
A
 
T
D
 
E
R
 
K
V
 
V
V
 
V
Y
 
F
Q
 
E
V
 
Q
G
 
T
M
 
K
G
 
A
L
 
I
K
 
A
D
 
D
I
 
N
G
 
V
M
 
K
D
 
D
R
 
-
I
 
W
N
 
S
R
 
K
V
 
V
T
 
V
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
T
A
 
A
T
 
T
P
 
P
A
 
Q
D
 
Q
A
 
A
E
 
Q
D
 
E
I
 
V
H
 
H
G
 
E
K
 
K
I
 
L
R
 
R
T
 
G
Q
 
W
L
 
L
S
 
K
K
 
S
M
 
H
Y
 
V
G
 
S
P
 
D
V
 
A
V
 
V
A
 
A
E
 
Q
K
 
S
I
 
T
R
 
R
I
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
V
K
 
T
P
 
G
D
 
G
N
 
N
V
 
C
S
 
K
A
 
E
L
 
L
M
 
A
M
 
S
R
 
Q
E
 
H
N
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
F
L
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
D
 
K
A
 
-
T
 
P
S
 
E
F
 
F
A
 
V
K
 
D
L
 
I
V
 
I
N
 
N

Sites not aligning to the query:

1tpb1 Offset of a catalytic lesion by a bound water soluble (see paper)
45% identity, 98% coverage: 2:250/253 of query aligns to 1:242/245 of 1tpb1

query
sites
1tpb1
R
 
R
K
 
K
P
 
F
Y
 
F
I
 
V
Y
 
G
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
L
 
G
D
 
D
M
 
K
H
 
K
G
 
S
S
 
L
S
 
G
D
 
E
L
 
L
I
 
I
S
 
H
S
 
T
I
 
L
L
 
N
S
 
G
V
 
A
K
 
K
I
 
L
D
 
S
Y
 
A
T
 
D
K
 
T
V
 
E
D
 
V
V
 
V
G
 
C
V
 
G
A
 
A
P
 
P
D
 
-
F
 
-
S
 
-
S
 
S
L
 
I
Y
 
Y
K
 
-
V
 
L
S
 
D
Q
 
F
T
 
A
I
 
R
K
 
Q
Q
 
K
M
 
L
G
 
D
Y
 
A
P
 
K
I
 
I
S
 
G
V
 
V
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
I
 
C
S
 
Y
A
 
K
E
 
V
E
 
P
K
 
K
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
I
S
 
S
A
 
P
A
 
A
M
 
M
V
 
I
F
 
K
A
 
D
A
 
I
G
 
G
A
 
A
D
 
A
S
 
W
T
 
V
I
 
I
L
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
M
 
H
I
 
V
F
 
F
A
 
G
E
 
E
G
 
S
D
 
D
E
 
E
L
 
L
I
 
I
N
 
G
Q
 
Q
K
 
K
V
 
V
K
 
A
T
 
H
A
 
A
L
 
L
R
 
A
N
 
E
N
 
G
L
 
L
D
 
G
V
 
V
I
 
I
L
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
K
L
 
L
D
 
D
E
 
E
R
 
R
E
 
E
S
 
A
G
 
G
V
 
I
A
 
-
A
 
T
D
 
E
R
 
K
V
 
V
V
 
V
Y
 
F
Q
 
E
V
 
Q
G
 
T
M
 
K
G
 
A
L
 
I
K
 
A
D
 
D
I
 
N
G
 
V
M
 
K
D
 
D
R
 
-
I
 
W
N
 
S
R
 
K
V
 
V
T
 
V
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
x
D
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
T
A
 
A
T
 
T
P
 
P
A
 
Q
D
 
Q
A
 
A
E
 
Q
D
 
E
I
 
V
H
 
H
G
 
E
K
 
K
I
 
L
R
 
R
T
 
G
Q
 
W
L
 
L
S
 
K
K
 
T
M
 
H
Y
 
V
G
 
S
P
 
D
V
 
A
V
 
V
A
 
A
E
 
Q
K
 
S
I
 
T
R
 
R
I
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
P
 
G
D
 
G
N
 
N
V
 
C
S
 
K
A
 
E
L
 
L
M
 
A
M
 
S
R
 
Q
E
 
H
N
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
F
L
|
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
D
 
K
A
 
-
T
 
P
S
 
E
F
 
F
A
 
V
K
 
D
L
 
I
V
 
I
N
 
N

A0A1L5YRA2 Triosephosphate isomerase; TIM; Allergen Scy p 8; Methylglyoxal synthase; Triose-phosphate isomerase; Allergen Scy p 8.0101; EC 5.3.1.1; EC 4.2.3.3 from Scylla paramamosain (Mud crab) (see paper)
46% identity, 98% coverage: 2:250/253 of query aligns to 5:245/248 of A0A1L5YRA2

query
sites
A0A1L5YRA2
R
 
R
K
 
K
P
 
F
Y
 
F
I
 
V
Y
 
G
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
M
N
 
N
L
 
G
D
 
D
M
 
K
H
 
A
G
 
A
S
 
I
S
 
D
D
 
G
L
 
I
I
 
I
S
 
S
S
 
F
I
 
M
L
 
K
S
 
G
V
 
P
K
 
L
I
 
N
D
 
A
Y
 
D
T
 
T
K
 
E
V
 
V
D
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
-
A
 
C
P
 
P
D
 
Q
F
 
C
S
 
Y
S
 
L
L
 
M
Y
 
Y
K
 
-
V
 
-
S
 
-
Q
 
-
T
 
T
I
 
R
K
 
E
Q
 
H
M
 
M
G
 
P
Y
 
A
P
 
N
I
 
I
S
 
G
V
 
V
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
I
 
C
S
 
Y
A
 
K
E
 
T
E
 
A
K
 
K
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
I
S
 
S
A
 
P
A
 
A
M
 
M
V
 
I
F
 
K
A
 
D
A
 
C
G
 
G
A
 
C
D
 
E
S
 
W
T
 
V
I
 
I
L
 
L
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
M
 
N
I
 
V
F
 
F
A
 
G
E
 
E
G
 
P
D
 
D
E
 
Q
L
 
L
I
 
I
N
 
S
Q
 
E
K
 
K
V
 
V
K
 
G
T
 
H
A
 
A
L
 
L
R
 
E
N
 
A
N
 
G
L
 
L
D
 
K
V
 
V
I
 
I
L
 
P
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
K
L
 
L
D
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
S
 
S
G
 
N
V
 
R
A
 
T
A
 
E
D
 
E
R
 
V
V
 
V
V
 
F
Y
 
A
Q
 
Q
V
 
M
G
 
K
M
 
A
G
 
L
L
 
V
K
 
P
D
 
N
I
 
I
G
 
-
M
 
-
D
 
S
R
 
D
I
 
W
N
 
S
R
 
R
V
 
V
T
 
V
L
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
V
W
|
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
|
T
G
 
G
K
 
K
T
 
T
A
 
A
T
 
T
P
 
P
A
 
E
D
x
Q
A
 
A
E
 
Q
D
 
D
I
 
V
H
 
H
G
 
A
K
 
K
I
 
L
R
 
R
T
 
Q
Q
 
W
L
 
L
S
 
R
K
 
D
M
 
N
Y
 
V
G
 
S
P
 
P
V
 
Q
V
 
V
A
 
A
E
 
E
K
 
S
I
 
T
R
 
R
I
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
V
K
 
S
P
 
A
D
 
G
N
 
N
V
 
C
S
 
K
A
 
E
L
 
L
M
 
A
M
 
K
R
 
T
E
 
G
N
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
F
L
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
D
x
K
A
 
-
T
 
P
S
 
D
F
 
F
A
 
V
K
 
T
L
 
I
V
 
I
N
 
N

6ooiC Crystal structure of triosephosphate isomerase from schistosoma mansoni in complex with 2pg (see paper)
45% identity, 94% coverage: 2:240/253 of query aligns to 8:243/255 of 6ooiC

query
sites
6ooiC
R
 
R
K
 
K
P
 
F
Y
 
F
I
 
V
Y
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
L
 
G
D
 
S
M
 
R
H
 
D
G
 
D
S
 
N
S
 
D
D
 
K
L
 
L
I
 
L
S
 
K
S
 
L
I
 
L
L
 
S
S
 
E
V
 
A
K
 
H
I
 
F
D
 
D
Y
 
-
T
 
D
K
 
N
V
 
T
D
 
E
V
 
V
G
 
L
V
 
I
A
 
A
P
 
P
D
 
P
F
 
S
S
 
V
S
 
F
L
 
L
Y
 
H
K
 
E
V
 
I
S
 
R
Q
 
K
T
 
S
I
 
L
K
 
K
Q
 
K
M
 
-
G
 
-
Y
 
-
P
 
E
I
 
I
S
 
H
V
 
V
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
I
 
C
S
 
Y
A
 
K
E
 
V
E
 
S
K
 
K
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
I
S
 
S
A
 
P
A
 
A
M
 
M
V
 
I
F
 
R
A
 
D
A
 
I
G
 
G
A
 
C
D
 
D
S
 
W
T
 
V
I
 
I
L
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
M
 
N
I
 
I
F
 
F
A
 
G
E
 
E
G
 
S
D
 
D
E
 
E
L
 
L
I
 
I
N
 
A
Q
 
E
K
 
K
V
 
V
K
 
Q
T
 
H
A
 
A
L
 
L
R
 
A
N
 
E
N
 
G
L
 
L
D
 
S
V
 
V
I
 
I
L
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
D
 
S
E
 
E
R
 
R
E
 
E
S
 
S
G
 
N
V
 
K
A
 
T
A
 
E
D
 
E
R
 
V
V
 
C
V
 
V
Y
 
R
Q
 
Q
V
 
L
-
 
K
G
 
A
M
 
I
G
 
A
L
 
N
K
 
K
D
 
I
I
 
K
G
 
S
M
 
A
D
 
D
R
 
E
I
 
W
N
 
K
R
 
R
V
 
V
T
 
V
L
 
V
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
T
 
T
P
 
P
A
 
Q
D
 
Q
A
 
A
E
 
Q
D
 
E
I
 
V
H
 
H
G
 
N
K
 
F
I
 
L
R
 
R
T
 
K
Q
 
W
L
 
F
S
 
K
K
 
T
M
 
N
Y
 
A
G
 
P
P
 
N
V
 
G
V
 
V
A
 
D
E
 
E
K
 
K
I
 
I
R
 
R
I
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
P
 
A
D
 
A
N
 
N
V
 
C
S
 
K
A
 
E
L
 
L
M
 
A
M
 
Q
R
 
Q
E
 
H
N
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
F
L
|
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L

1ssgA Understanding protein lids: structural analysis of active hinge mutants in triosephosphate isomerase (see paper)
45% identity, 98% coverage: 2:250/253 of query aligns to 3:244/247 of 1ssgA

query
sites
1ssgA
R
 
R
K
 
K
P
 
F
Y
 
F
I
 
V
Y
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
L
 
G
D
 
D
M
 
K
H
 
K
G
 
S
S
 
L
S
 
G
D
 
E
L
 
L
I
 
I
S
 
H
S
 
T
I
 
L
L
 
N
S
 
G
V
 
A
K
 
K
I
 
L
D
 
S
Y
 
A
T
 
D
K
 
T
V
 
E
D
 
V
V
 
V
G
 
C
V
 
G
A
 
A
P
 
P
D
 
-
F
 
-
S
 
-
S
 
S
L
 
I
Y
 
Y
K
 
-
V
 
L
S
 
D
Q
 
F
T
 
A
I
 
R
K
 
Q
Q
 
K
M
 
L
G
 
D
Y
 
A
P
 
K
I
 
I
S
 
G
V
 
V
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
I
 
C
S
 
Y
A
 
K
E
 
V
E
 
P
K
 
K
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
I
S
 
S
A
 
P
A
 
A
M
 
M
V
 
I
F
 
K
A
 
D
A
 
I
G
 
G
A
 
A
D
 
A
S
 
W
T
 
V
I
 
I
L
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
M
 
H
I
 
V
F
 
F
A
 
G
E
 
E
G
 
S
D
 
D
E
 
E
L
 
L
I
 
I
N
 
G
Q
 
Q
K
 
K
V
 
V
K
 
A
T
 
H
A
 
A
L
 
L
R
 
A
N
 
E
N
 
G
L
 
L
D
 
G
V
 
V
I
 
I
L
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
K
L
 
L
D
 
D
E
 
E
R
 
R
E
 
E
S
 
A
G
 
G
V
 
I
A
 
-
A
 
T
D
 
E
R
 
K
V
 
V
V
 
V
Y
 
F
Q
 
E
V
 
Q
G
 
T
M
 
K
G
 
A
L
 
I
K
 
A
D
 
D
I
 
N
G
 
V
M
 
K
D
 
D
R
 
-
I
 
W
N
 
S
R
 
K
V
 
V
T
 
V
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
Y
T
 
S
A
 
L
T
 
T
P
 
P
A
 
Q
D
 
Q
A
 
A
E
 
Q
D
 
E
I
 
V
H
 
H
G
 
E
K
 
K
I
 
L
R
 
R
T
 
G
Q
 
W
L
 
L
S
 
K
K
 
S
M
 
H
Y
 
V
G
 
S
P
 
D
V
 
A
V
 
V
A
 
A
E
 
Q
K
 
S
I
 
T
R
 
R
I
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
P
 
G
D
 
G
N
 
N
V
 
C
S
 
K
A
 
E
L
 
L
M
 
A
M
 
S
R
 
Q
E
 
H
N
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
F
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
D
 
K
A
 
-
T
 
P
S
 
E
F
 
F
A
 
V
K
 
D
L
 
I
V
 
I
N
 
N

3uwzA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with glycerol-2-phosphate (see paper)
39% identity, 98% coverage: 1:249/253 of query aligns to 2:250/254 of 3uwzA

query
sites
3uwzA
M
 
M
R
 
R
K
 
T
P
 
P
Y
 
I
I
 
I
Y
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
L
 
K
D
 
T
M
 
V
H
 
Q
G
 
E
S
 
A
S
 
K
D
 
D
L
 
F
I
 
V
S
 
N
S
 
A
I
 
L
L
 
P
S
 
T
V
 
L
K
 
P
I
 
-
D
 
D
Y
 
S
T
 
K
K
 
E
V
 
V
D
 
E
V
 
S
G
 
V
V
 
I
A
 
C
P
 
A
D
 
P
F
 
A
S
 
I
S
 
Q
L
 
L
Y
 
D
K
 
A
V
 
L
S
 
T
Q
 
T
T
 
A
I
 
V
K
 
K
Q
 
E
-
 
G
M
 
K
G
 
A
Y
 
Q
P
 
G
I
 
L
S
 
E
V
 
I
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
I
 
T
S
 
Y
A
 
F
E
 
E
E
 
D
K
 
N
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
T
S
 
S
A
 
P
A
 
V
M
 
A
V
 
L
F
 
A
A
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
V
D
 
K
S
 
Y
T
 
V
I
 
V
L
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
M
 
E
I
 
L
F
 
F
A
 
H
E
 
E
G
 
T
D
 
D
E
 
E
L
 
E
I
 
I
N
 
N
Q
 
K
K
 
K
V
 
A
K
 
H
T
 
A
A
 
I
L
 
F
R
 
K
N
 
H
N
 
G
L
 
M
D
 
T
V
 
P
I
 
I
L
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
D
D
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
S
 
S
G
 
G
V
 
K
A
 
A
A
 
N
D
 
D
R
 
V
V
 
V
V
 
G
Y
 
E
Q
 
Q
V
 
V
G
 
K
M
 
K
G
 
A
L
 
V
K
 
A
D
 
G
I
 
L
G
 
S
M
 
E
D
 
D
R
 
Q
I
 
L
N
 
K
R
 
S
V
 
V
T
 
V
L
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
S
A
 
S
T
 
T
P
 
S
A
 
E
D
 
D
A
 
A
E
 
N
D
 
E
I
 
M
H
 
C
G
 
A
K
 
F
I
 
V
R
 
R
T
 
Q
Q
 
T
L
 
I
S
 
A
K
 
D
M
 
L
Y
 
S
G
 
S
P
 
K
V
 
E
V
 
V
A
 
S
E
 
E
K
 
A
I
 
T
R
 
R
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
|
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
D
 
N
N
 
N
V
 
I
S
 
K
A
 
E
L
 
Y
M
 
M
M
 
A
R
 
Q
E
 
T
N
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
D
 
K
A
 
V
T
 
E
S
 
D
F
 
F
A
 
V
K
 
Q
L
 
L
V
 
L

3uwwA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with 3-phosphoglyceric acid (see paper)
39% identity, 98% coverage: 1:249/253 of query aligns to 2:250/254 of 3uwwA

query
sites
3uwwA
M
 
M
R
 
R
K
 
T
P
 
P
Y
 
I
I
 
I
Y
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
L
 
K
D
 
T
M
 
V
H
 
Q
G
 
E
S
 
A
S
 
K
D
 
D
L
 
F
I
 
V
S
 
N
S
 
A
I
 
L
L
 
P
S
 
T
V
 
L
K
 
P
I
 
-
D
 
D
Y
 
S
T
 
K
K
 
E
V
 
V
D
 
E
V
 
S
G
 
V
V
 
I
A
 
C
P
 
A
D
 
P
F
 
A
S
 
I
S
 
Q
L
 
L
Y
 
D
K
 
A
V
 
L
S
 
T
Q
 
T
T
 
A
I
 
V
K
 
K
Q
 
E
-
 
G
M
 
K
G
 
A
Y
 
Q
P
 
G
I
 
L
S
 
E
V
 
I
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
I
 
T
S
 
Y
A
 
F
E
 
E
E
 
D
K
 
N
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
T
S
 
S
A
 
P
A
 
V
M
 
A
V
 
L
F
 
A
A
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
V
D
 
K
S
 
Y
T
 
V
I
 
V
L
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
M
 
E
I
 
L
F
 
F
A
 
H
E
 
E
G
 
T
D
 
D
E
 
E
L
 
E
I
 
I
N
 
N
Q
 
K
K
 
K
V
 
A
K
 
H
T
 
A
A
 
I
L
 
F
R
 
K
N
 
H
N
 
G
L
 
M
D
 
T
V
 
P
I
 
I
L
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
D
D
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
S
 
S
G
 
G
V
 
K
A
 
A
A
 
N
D
 
D
R
 
V
V
 
V
V
 
G
Y
 
E
Q
 
Q
V
 
V
G
 
K
M
 
K
G
 
A
L
 
V
K
 
A
D
 
G
I
 
L
G
 
S
M
 
E
D
 
D
R
 
Q
I
 
L
N
 
K
R
 
S
V
 
V
T
 
V
L
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
S
A
 
S
T
 
T
P
 
S
A
 
E
D
 
D
A
 
A
E
 
N
D
 
E
I
 
M
H
 
C
G
 
A
K
 
F
I
 
V
R
 
R
T
 
Q
Q
 
T
L
 
I
S
 
A
K
 
D
M
 
L
Y
 
S
G
 
S
P
 
K
V
 
E
V
 
V
A
 
S
E
 
E
K
 
A
I
 
T
R
 
R
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
D
 
N
N
 
N
V
 
I
S
 
K
A
 
E
L
 
Y
M
 
M
M
 
A
R
 
Q
E
 
T
N
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
D
 
K
A
 
V
T
 
E
S
 
D
F
 
F
A
 
V
K
 
Q
L
 
L
V
 
L

3uwuA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with glycerol-3-phosphate (see paper)
39% identity, 98% coverage: 1:249/253 of query aligns to 1:249/253 of 3uwuA

query
sites
3uwuA
M
 
M
R
 
R
K
 
T
P
 
P
Y
 
I
I
 
I
Y
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
L
 
K
D
 
T
M
 
V
H
 
Q
G
 
E
S
 
A
S
 
K
D
 
D
L
 
F
I
 
V
S
 
N
S
 
A
I
 
L
L
 
P
S
 
T
V
 
L
K
 
P
I
 
-
D
 
D
Y
 
S
T
 
K
K
 
E
V
 
V
D
 
E
V
 
S
G
 
V
V
 
I
A
 
C
P
 
A
D
 
P
F
 
A
S
 
I
S
 
Q
L
 
L
Y
 
D
K
 
A
V
 
L
S
 
T
Q
 
T
T
 
A
I
 
V
K
 
K
Q
 
E
-
 
G
M
 
K
G
 
A
Y
 
Q
P
 
G
I
 
L
S
 
E
V
 
I
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
I
 
T
S
 
Y
A
 
F
E
 
E
E
 
D
K
 
N
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
T
S
 
S
A
 
P
A
 
V
M
 
A
V
 
L
F
 
A
A
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
V
D
 
K
S
 
Y
T
 
V
I
 
V
L
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
M
 
E
I
 
L
F
 
F
A
 
H
E
 
E
G
 
T
D
 
D
E
 
E
L
 
E
I
 
I
N
 
N
Q
 
K
K
 
K
V
 
A
K
 
H
T
 
A
A
 
I
L
 
F
R
 
K
N
 
H
N
 
G
L
 
M
D
 
T
V
 
P
I
 
I
L
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
D
D
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
S
 
S
G
 
G
V
 
K
A
 
A
A
 
N
D
 
D
R
 
V
V
 
V
V
 
G
Y
 
E
Q
 
Q
V
 
V
G
 
K
M
 
K
G
 
A
L
 
V
K
 
A
D
 
G
I
 
L
G
 
S
M
 
E
D
 
D
R
 
Q
I
 
L
N
 
K
R
 
S
V
 
V
T
 
V
L
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
S
A
 
S
T
 
T
P
 
S
A
 
E
D
 
D
A
 
A
E
 
N
D
 
E
I
 
M
H
 
C
G
 
A
K
 
F
I
 
V
R
 
R
T
 
Q
Q
 
T
L
 
I
S
 
A
K
 
D
M
 
L
Y
 
S
G
 
S
P
 
K
V
 
E
V
 
V
A
 
S
E
 
E
K
 
A
I
 
T
R
 
R
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
D
 
N
N
 
N
V
 
I
S
 
K
A
 
E
L
 
Y
M
 
M
M
 
A
R
 
Q
E
 
T
N
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
A
L
|
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
D
 
K
A
 
V
T
 
E
S
 
D
F
 
F
A
 
V
K
 
Q
L
 
L
V
 
L

Q6GIL6 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Staphylococcus aureus (strain MRSA252) (see paper)
39% identity, 98% coverage: 1:249/253 of query aligns to 1:249/253 of Q6GIL6

query
sites
Q6GIL6
M
 
M
R
 
R
K
 
T
P
 
P
Y
 
I
I
 
I
Y
 
A
G
 
G
N
|
N
W
|
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
L
 
K
D
 
T
M
 
V
H
 
Q
G
 
E
S
 
A
S
 
K
D
 
D
L
 
F
I
 
V
S
 
N
S
 
A
I
 
L
L
 
P
S
 
T
V
 
L
K
 
P
I
 
-
D
 
D
Y
 
S
T
 
K
K
 
E
V
 
V
D
 
E
V
 
S
G
 
V
V
 
I
A
 
C
P
 
A
D
 
P
F
 
A
S
 
I
S
 
Q
L
 
L
Y
 
D
K
 
A
V
 
L
S
 
T
Q
 
T
T
 
A
I
 
V
K
 
K
Q
 
E
-
 
G
M
 
K
G
 
A
Y
 
Q
P
 
G
I
 
L
S
 
E
V
 
I
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
I
 
T
S
 
Y
A
 
F
E
 
E
E
 
D
K
 
N
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
T
S
 
S
A
 
P
A
 
V
M
 
A
V
 
L
F
 
A
A
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
V
D
 
K
S
 
Y
T
 
V
I
 
V
L
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
M
 
E
I
 
L
F
 
F
A
 
H
E
 
E
G
 
T
D
 
D
E
 
E
L
 
E
I
 
I
N
 
N
Q
 
K
K
 
K
V
 
A
K
 
H
T
 
A
A
 
I
L
 
F
R
 
K
N
 
H
N
 
G
L
 
M
D
 
T
V
 
P
I
 
I
L
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
D
D
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
S
 
S
G
 
G
V
 
K
A
 
A
A
 
N
D
 
D
R
 
V
V
 
V
V
 
G
Y
 
E
Q
 
Q
V
 
V
G
 
K
M
 
K
G
 
A
L
 
V
K
 
A
D
 
G
I
 
L
G
 
S
M
 
E
D
 
D
R
 
Q
I
 
L
N
 
K
R
 
S
V
 
V
T
 
V
L
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
S
A
 
S
T
 
T
P
 
S
A
 
E
D
 
D
A
 
A
E
 
N
D
 
E
I
 
M
H
 
C
G
 
A
K
 
F
I
 
V
R
 
R
T
 
Q
Q
 
T
L
 
I
S
 
A
K
 
D
M
 
L
Y
 
S
G
 
S
P
 
K
V
 
E
V
 
V
A
 
S
E
 
E
K
 
A
I
 
T
R
 
R
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
D
 
N
N
 
N
V
 
I
S
 
K
A
 
E
L
 
Y
M
 
M
M
 
A
R
 
Q
E
 
T
N
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
D
 
K
A
 
V
T
 
E
S
 
D
F
 
F
A
 
V
K
 
Q
L
 
L
V
 
L

3uwvA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with 2-phosphoglyceric acid (see paper)
39% identity, 98% coverage: 1:249/253 of query aligns to 3:251/255 of 3uwvA

query
sites
3uwvA
M
 
M
R
 
R
K
 
T
P
 
P
Y
 
I
I
 
I
Y
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
L
 
K
D
 
T
M
 
V
H
 
Q
G
 
E
S
 
A
S
 
K
D
 
D
L
 
F
I
 
V
S
 
N
S
 
A
I
 
L
L
 
P
S
 
T
V
 
L
K
 
P
I
 
-
D
 
D
Y
 
S
T
 
K
K
 
E
V
 
V
D
 
E
V
 
S
G
 
V
V
 
I
A
 
C
P
 
A
D
 
P
F
 
A
S
 
I
S
 
Q
L
 
L
Y
 
D
K
 
A
V
 
L
S
 
T
Q
 
T
T
 
A
I
 
V
K
 
K
Q
 
E
-
 
G
M
 
K
G
 
A
Y
 
Q
P
 
G
I
 
L
S
 
E
V
 
I
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
I
 
T
S
 
Y
A
 
F
E
 
E
E
 
D
K
 
N
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
T
S
 
S
A
 
P
A
 
V
M
 
A
V
 
L
F
 
A
A
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
V
D
 
K
S
 
Y
T
 
V
I
 
V
L
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
M
 
E
I
 
L
F
 
F
A
 
H
E
 
E
G
 
T
D
 
D
E
 
E
L
 
E
I
 
I
N
 
N
Q
 
K
K
 
K
V
 
A
K
 
H
T
 
A
A
 
I
L
 
F
R
 
K
N
 
H
N
 
G
L
 
M
D
 
T
V
 
P
I
 
I
L
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
D
D
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
S
 
S
G
 
G
V
 
K
A
 
A
A
 
N
D
 
D
R
 
V
V
 
V
V
 
G
Y
 
E
Q
 
Q
V
 
V
G
 
K
M
 
K
G
 
A
L
 
V
K
 
A
D
 
G
I
 
L
G
 
S
M
 
E
D
 
D
R
 
Q
I
 
L
N
 
K
R
 
S
V
 
V
T
 
V
L
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
S
A
 
S
T
 
T
P
 
S
A
 
E
D
 
D
A
 
A
E
 
N
D
 
E
I
 
M
H
 
C
G
 
A
K
 
F
I
 
V
R
 
R
T
 
Q
Q
 
T
L
 
I
S
 
A
K
 
D
M
 
L
Y
 
S
G
 
S
P
 
K
V
 
E
V
 
V
A
 
S
E
 
E
K
 
A
I
 
T
R
 
R
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
|
K
P
 
P
D
 
N
N
 
N
V
 
I
S
 
K
A
 
E
L
 
Y
M
 
M
M
 
A
R
 
Q
E
 
T
N
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
D
 
K
A
 
V
T
 
E
S
 
D
F
 
F
A
 
V
K
 
Q
L
 
L
V
 
L

4owgA Crystal structure of rabbit muscle triosephosphate isomerase-pep complex
43% identity, 98% coverage: 2:250/253 of query aligns to 2:243/246 of 4owgA

query
sites
4owgA
R
 
R
K
 
K
P
 
F
Y
 
F
I
 
V
Y
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
L
 
G
D
 
R
M
 
K
H
 
K
G
 
N
S
 
L
S
 
G
D
 
E
L
 
L
I
 
I
S
 
T
S
 
T
I
 
L
L
 
N
S
 
A
V
 
A
K
 
K
I
 
V
D
 
P
Y
 
-
T
 
A
K
 
D
V
 
T
D
 
E
V
 
V
G
 
V
V
 
C
A
 
A
P
 
P
D
 
P
F
 
T
S
 
A
S
 
Y
L
 
I
Y
 
D
K
 
F
V
 
A
S
 
R
Q
 
Q
T
 
-
I
 
-
K
 
-
Q
 
K
M
 
L
G
 
D
Y
 
P
P
 
K
I
 
I
S
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
I
 
C
S
 
Y
A
 
K
E
 
V
E
 
T
K
 
N
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
I
S
 
S
A
 
P
A
 
G
M
 
M
V
 
I
F
 
K
A
 
D
A
 
C
G
 
G
A
 
A
D
 
T
S
 
W
T
 
V
I
 
V
L
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
M
 
H
I
 
V
F
 
F
A
 
G
E
 
E
G
 
S
D
 
D
E
 
E
L
 
L
I
 
I
N
 
G
Q
 
Q
K
 
K
V
 
V
K
 
A
T
 
H
A
 
A
L
 
L
R
 
S
N
 
E
N
 
G
L
 
L
D
 
G
V
 
V
I
 
I
L
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
K
L
 
L
D
 
D
E
 
E
R
 
R
E
 
E
S
 
A
G
 
G
V
 
I
A
 
-
A
 
T
D
 
E
R
 
K
V
 
V
V
 
V
Y
 
F
Q
 
E
V
 
Q
G
 
T
M
 
K
G
 
V
L
 
I
K
 
A
D
 
D
I
 
N
G
 
V
M
 
K
D
 
D
R
 
-
I
 
W
N
 
S
R
 
K
V
 
V
T
 
V
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
T
A
 
A
T
 
T
P
 
P
A
 
Q
D
 
Q
A
 
A
E
 
Q
D
 
E
I
 
V
H
 
H
G
 
E
K
 
K
I
 
L
R
 
R
T
 
G
Q
 
W
L
 
L
S
 
K
K
 
S
M
 
N
Y
 
V
G
 
S
P
 
D
V
 
A
V
 
V
A
 
A
E
 
Q
K
 
S
I
 
T
R
 
R
I
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
P
 
G
D
 
A
N
 
T
V
 
C
S
 
K
A
 
E
L
 
L
M
 
A
M
 
S
R
 
Q
E
 
P
N
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
F
L
|
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
D
 
K
A
 
P
T
 
-
S
 
E
F
 
F
A
 
V
K
 
D
L
 
I
V
 
I
N
 
N

3taoA Structure of mycobacterium tuberculosis triosephosphate isomerase bound to phosphoglycolohydroxamate (see paper)
42% identity, 98% coverage: 2:248/253 of query aligns to 2:250/256 of 3taoA

query
sites
3taoA
R
 
R
K
 
K
P
 
P
Y
 
L
I
 
I
Y
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
L
 
L
D
 
N
M
 
H
H
 
Y
G
 
E
S
 
A
S
 
I
D
 
A
L
 
L
I
 
V
S
 
Q
S
 
K
I
 
I
L
 
A
S
 
F
V
 
S
K
 
L
I
 
P
D
 
D
-
 
K
-
 
Y
Y
 
Y
T
 
D
K
 
R
V
 
V
D
 
D
V
 
V
G
 
A
V
 
V
A
 
I
P
 
P
D
 
P
F
 
F
S
 
T
S
 
D
L
 
L
Y
x
R
K
x
S
V
 
V
S
 
Q
Q
x
T
T
 
L
I
 
V
K
 
D
Q
 
G
M
 
D
G
 
K
Y
 
L
P
 
R
I
 
L
S
 
T
V
 
Y
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
D
I
 
L
S
 
S
A
 
P
E
 
H
E
 
D
K
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
Y
T
 
T
G
 
G
D
 
D
V
 
V
S
 
S
A
 
G
A
 
A
M
 
F
V
 
L
F
 
A
A
 
K
A
 
L
G
 
G
A
 
C
D
 
S
S
 
Y
T
 
V
I
 
V
L
 
V
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
M
 
T
I
 
Y
F
 
H
A
 
N
E
 
E
G
 
D
D
 
D
E
 
A
L
 
L
I
 
V
N
 
A
Q
 
A
K
 
K
V
 
A
K
 
A
T
 
T
A
 
A
L
 
L
R
 
K
N
 
H
N
 
G
L
 
L
D
 
T
V
 
P
I
 
I
L
 
V
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
H
L
 
L
D
 
D
E
 
V
R
 
R
E
 
E
S
 
A
G
 
G
V
 
N
A
 
H
A
 
V
D
 
A
R
 
H
V
 
N
V
 
I
Y
 
E
Q
 
Q
V
 
L
G
 
R
M
 
G
G
 
S
L
 
L
K
 
A
D
 
G
I
 
L
G
 
L
M
 
A
D
 
E
R
 
Q
I
 
I
N
 
G
R
 
S
V
 
V
T
 
V
L
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
R
T
 
V
A
 
A
T
 
S
P
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
A
E
 
Q
D
 
E
I
 
V
H
 
C
G
 
A
K
 
A
I
 
I
R
 
R
T
 
K
Q
 
E
L
 
L
S
 
A
K
 
S
M
 
L
Y
 
A
G
 
S
P
 
P
V
 
R
V
 
I
A
 
A
E
 
D
K
 
T
I
 
V
R
 
R
I
 
V
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
K
 
N
P
 
A
D
 
K
N
 
N
V
 
V
S
 
G
A
 
D
L
 
I
M
 
V
M
 
A
R
 
Q
E
 
D
N
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
G
L
|
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
D
 
D
A
 
G
T
 
E
S
 
H
F
 
F
A
 
A
K
 
T
L
 
L

1r2rB Crystal structure of rabbit muscle triosephosphate isomerase (see paper)
43% identity, 98% coverage: 2:250/253 of query aligns to 3:244/247 of 1r2rB

query
sites
1r2rB
R
 
R
K
 
K
P
 
F
Y
 
F
I
 
V
Y
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
L
 
G
D
 
R
M
 
K
H
 
K
G
 
N
S
 
L
S
 
G
D
 
E
L
 
L
I
 
I
S
 
T
S
 
T
I
 
L
L
 
N
S
 
A
V
 
A
K
 
K
I
 
V
D
 
P
Y
 
-
T
 
A
K
 
D
V
 
T
D
 
E
V
 
V
G
 
V
V
 
C
A
 
A
P
 
P
D
 
P
F
 
T
S
 
A
S
 
Y
L
 
I
Y
 
D
K
 
F
V
 
A
S
 
R
Q
 
Q
T
 
-
I
 
-
K
 
-
Q
 
K
M
 
L
G
 
D
Y
 
P
P
 
K
I
 
I
S
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
I
 
C
S
 
Y
A
 
K
E
 
V
E
 
T
K
 
N
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
I
S
 
S
A
 
P
A
 
G
M
 
M
V
 
I
F
 
K
A
 
D
A
 
C
G
 
G
A
 
A
D
 
T
S
 
W
T
 
V
I
 
V
L
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
M
 
H
I
 
V
F
 
F
A
 
G
E
 
E
G
 
S
D
|
D
E
 
E
L
 
L
I
 
I
N
 
G
Q
 
Q
K
 
K
V
 
V
K
 
A
T
 
H
A
 
A
L
 
L
R
 
S
N
 
E
N
 
G
L
 
L
D
 
G
V
 
V
I
 
I
L
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
K
L
 
L
D
 
D
E
 
E
R
 
R
E
 
E
S
 
A
G
 
G
V
 
I
A
 
-
A
 
T
D
 
E
R
 
K
V
 
V
V
 
V
Y
 
F
Q
 
E
V
x
Q
G
 
T
M
 
K
G
 
V
L
 
I
K
 
A
D
 
D
I
 
N
G
 
V
M
 
K
D
 
D
R
 
-
I
 
W
N
 
S
R
 
K
V
 
V
T
 
V
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
T
A
 
A
T
 
T
P
 
P
A
 
Q
D
 
Q
A
 
A
E
 
Q
D
 
E
I
 
V
H
 
H
G
 
E
K
 
K
I
 
L
R
 
R
T
 
G
Q
 
W
L
 
L
S
 
K
K
 
S
M
 
N
Y
 
V
G
 
S
P
 
D
V
 
A
V
 
V
A
 
A
E
 
Q
K
 
S
I
 
T
R
 
R
I
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
P
 
G
D
 
A
N
 
T
V
 
C
S
 
K
A
 
E
L
 
L
M
 
A
M
 
S
R
 
Q
E
 
P
N
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
F
L
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
D
 
K
A
 
P
T
 
-
S
 
E
F
 
F
A
 
V
K
 
D
L
 
I
V
 
I
N
 
N

P9WG43 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 2 papers)
42% identity, 98% coverage: 2:248/253 of query aligns to 3:251/261 of P9WG43

query
sites
P9WG43
R
 
R
K
 
K
P
 
P
Y
 
L
I
 
I
Y
 
A
G
 
G
N
|
N
W
|
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
L
 
L
D
 
N
M
 
H
H
 
Y
G
 
E
S
 
A
S
 
I
D
 
A
L
 
L
I
 
V
S
 
Q
S
 
K
I
 
I
L
 
A
S
 
F
V
 
S
K
 
L
I
 
P
D
 
D
-
 
K
-
 
Y
Y
 
Y
T
 
D
K
 
R
V
 
V
D
 
D
V
 
V
G
 
A
V
 
V
A
 
I
P
 
P
D
 
P
F
 
F
S
 
T
S
 
D
L
 
L
Y
 
R
K
 
S
V
 
V
S
 
Q
Q
 
T
T
 
L
I
 
V
K
 
D
Q
 
G
M
 
D
G
 
K
Y
 
L
P
 
R
I
 
L
S
 
T
V
 
Y
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
D
I
 
L
S
 
S
A
 
P
E
 
H
E
 
D
K
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
Y
T
 
T
G
 
G
D
 
D
V
 
V
S
 
S
A
 
G
A
 
A
M
 
F
V
 
L
F
 
A
A
 
K
A
 
L
G
 
G
A
 
C
D
 
S
S
 
Y
T
 
V
I
 
V
L
 
V
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
M
 
T
I
 
Y
F
 
H
A
 
N
E
 
E
G
 
D
D
 
D
E
 
A
L
 
L
I
 
V
N
 
A
Q
 
A
K
 
K
V
 
A
K
 
A
T
 
T
A
 
A
L
 
L
R
 
K
N
 
H
N
 
G
L
 
L
D
 
T
V
 
P
I
 
I
L
 
V
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
H
L
 
L
D
 
D
E
 
V
R
 
R
E
 
E
S
 
A
G
 
G
V
 
N
A
 
H
A
 
V
D
 
A
R
 
H
V
 
N
V
 
I
Y
 
E
Q
 
Q
V
 
L
G
 
R
M
 
G
G
 
S
L
 
L
K
 
A
D
 
G
I
 
L
G
 
L
M
 
A
D
 
E
R
 
Q
I
 
I
N
 
G
R
 
S
V
 
V
T
 
V
L
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
R
T
 
V
A
 
A
T
 
S
P
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
A
E
 
Q
D
 
E
I
 
V
H
 
C
G
 
A
K
 
A
I
 
I
R
 
R
T
 
K
Q
 
E
L
 
L
S
 
A
K
 
S
M
 
L
Y
 
A
G
 
S
P
 
P
V
 
R
V
 
I
A
 
A
E
 
D
K
 
T
I
 
V
R
 
R
I
 
V
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
N
P
 
A
D
 
K
N
 
N
V
 
V
S
 
G
A
 
D
L
 
I
M
 
V
M
 
A
R
 
Q
E
 
D
N
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
G
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
D
 
D
A
 
G
T
 
E
S
 
H
F
 
F
A
 
A
K
 
T
L
 
L

Query Sequence

>WP_013012213.1 NCBI__GCF_000025725.1:WP_013012213.1
MRKPYIYGNWKMNLDMHGSSDLISSILSVKIDYTKVDVGVAPDFSSLYKVSQTIKQMGYP
ISVAAQNISAEEKGAFTGDVSAAMVFAAGADSTILGHSERRMIFAEGDELINQKVKTALR
NNLDVILCVGETLDERESGVAADRVVYQVGMGLKDIGMDRINRVTLAYEPVWAIGTGKTA
TPADAEDIHGKIRTQLSKMYGPVVAEKIRILYGGSVKPDNVSALMMRENIDGALVGGASL
DATSFAKLVNFNG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory