SitesBLAST

SitesBLAST – Find functional sites

SitesBLAST

Comparing WP_013074537.1 NCBI__GCF_000092905.1:WP_013074537.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P77961 Glutamine synthetase; GS; Glutamate--ammonia ligase; Glutamine synthetase I beta; GSI beta; EC 6.3.1.2 from Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa)
56% identity, 100% coverage: 2:474/474 of query aligns to 4:473/473 of P77961

query
sites
P77961

T

T

V

P

Q

Q

D

E

V

V

L

L

D

K

L

W

I

I

R

Q

D

D

K

E

G

N

I

I

K

K

M

I

V

I

D

D

F

L

R

K

I

F

V

I

D

D

V

T

P

P

G

G

R

I

Q

W

H

Q

H

H

V

C

T

S

V

F

P

Y

A

Y

T

D

H

Q

V

L

D

D

E

E

E

N

T

S

L

F

R

T

R

E

G

G

L

I

P

P

F

F

D

D

G

G

S

S

I

I

Q

R

G

G

F

W

R

K

G

A

I

I

E

N

E

E

S

S

D

D

M

M

V

C

M

M

R

V

P

P

D

D

L

P

D

N

T

T

A

A

F

T

V

I

D

D

P

P

F

F

T

C

K

K

V

E

P

P

T

T

L

L

N

S

L

M

M

I

C

C

D

S

V

I

Y

K

E

E

P

P

-

R

S

T

G

G

I

E

R

W

Y

Y

D

N

R

R

D

D

P

P

R

R

F

T

I

I

A

A

Q

A

K

K

A

A

E

V

A

E

Y

Y

L

L

E

R

R

G

T

T

G

G

L

I

A

A

D

D

K

T

A

V

Y

Y

F

F

G

G

P

P

E

E

L

A

E
|
E

F

F

V

L

F

F

D

D

V

I

R

R

F

F

D

G

T

Q

G

T

Q

E

N

N

G

S

A

S

F

Y

Y

Y

S

F

V

A

D

D

S

S

E

V

E

E

G

G

I

R

W

W

N

N

S

T

G

G

K

R

S

E

G

E

E

E

A

G

-

G

N

N

L

L

G

G

Y

Y

K

K

I

P

R

G

N

Y

K

K

S

Q

G

G

Y

Y

F

F

P

P

V

V

A

A

P

P

S

T

D

D

T

T

Q

A

Q

Q

D

D

L

I

R

R

S

T

E

E

I

M

V

L

L

L

A

T

L

M

E

A

E

G

A

L

G

C

L

V

P

P

V

I

E

E

R

K

H

H

E
|
E

V

V

A

A

T

S

A

G

G

G

Q

Q

A

N

E
|
E

I

L

N

G

F

I

R

K

F

F

D

D

T

K

L

L

T

V

K

N

T

S

A

A

D

D

H

N

V

L

L

M

L

I

Y

Y

K

K

Y

Y

I

V

V

I

R

K

N

N

V

V

A

A

R

K

K

K

Y

Y

G

G

K

K

V

T

A

V

T

T

F

F

M

M

P

P

K

K

P

P

L

I

F

F

G

N

D

D

N

N

G

G

S

S

G

G

M

M

H

H

V

V

H

H

Q

Q

S

S

L

L

F

W

R

K

G

D

E

G

V

Q

P

P

L

L

F

F

Y

A

Q

G

E

D

G

-

A

K

Y

Y

A

A

S

G

L

F

S

S

E

Q

T

M

A

G

L

L

Q

W

Y

Y

I

I

A

G

G

G

I

I

L

L

Y

K

H

H

A

A

P

P

A

A

I

L

L

L

A

A

F

F

S

T

N

N

A

P

S

T

T

T

N

N

S

S

Y

Y

K

K

R

R

L

L

V

V

P

P

G

G

F

F

E

E

A

A

P

P

V

V

N

N

L

L

V

A

F

Y

S

S

Q

Q

G

G

N

N

R

R

S

S

A

A

A

S

I

V

R

R

V

I

P

P

V

L

A

S

G

G

V

G

T

N

P

P

K

K

A

A

A

K

R

R

I

L

E
|
E

F

F

R

R

T

C

P

P

D

D

S

A

T

T

S

S

N

N

P

P

Y

Y

L

L

A

A

F

F

A

A

M

M

L

L

M

C

A

A

G

G

L

I

D

D

G

G

I

I

Q

K

K

N

G

Q

M

I

D

D

P

P

K

G

A

E

L

-

G

-

Y

-

G

-

P

P

L

L

D

D

K

V

N

D

I

I

Y

Y

E

D

L

L

S

S

P

P

A

E

E

E

K

L

E

A

G

K

I

I

R

P

S

S

V

T

P

P

G

G

S

S

Y

L

A

E

E

A

A

A

L

L

A

E

A

A

L

L

E

E

A

K

D

D

H

H

E

E

F

F

L

L

L

T

A

G

G

T

D

G

V

V

F

F

S

S

E

P

D

D

F

F

I

V

H

E

N

S

W

W

I

I

A

E

L

Y

K

K

N

L

T

D

T

N

E

E

V

V

N

N

Q

P

V

M

A

R

I

L

R

R

P

P

H

H

P

P

Y

Y

E

E

F

F

H

S

L

L

Y

Y

F

Y

D

D

L

C

E134 (= E131) binding Mg(2+)
E215 (= E211) binding Mg(2+)
E223 (= E219) binding Mg(2+)
E361 (= E358) binding Mn(2+)

3ng0A Crystal structure of glutamine synthetase from synechocystis sp. Pcc 6803
56% identity, 100% coverage: 2:474/474 of query aligns to 2:465/465 of 3ng0A

query
sites
3ng0A

T

T

V

P

Q

Q

D

E

V

V

L

L

D

K

L

W

I

I

R

Q

D

D

K

E

G

N

I

I

K

K

M

I

V

I

D

D

F

L

R

K

I

F

V

I

D

D

V

T

P

P

G

G

R

I

Q

W

H

Q

H

H

V

C

T

S

V

F

P

Y

A

Y

T

D

H

Q

V

L

D

D

E

E

E

N

T

S

L

F

R

T

R

E

G

G

L

I

P

P

F

F

D
|
D

G

G

S

S

I

I

Q

R

G

G

F

W

R

K

G

A

I

I

E

N

E

E

S

S

D

D

M

M

V

C

M

M

R

V

P

P

D

D

L

P

D

N

T

T

A

A

F

T

V

I

D

D

P

P

F

F

T

C

K

K

V

E

P

P

T

T

L

L

N

S

L

M

M

I

C

C

D

S

V

I

Y

K

E

E

P

P

-

R

S

T

G

G

I

E

R

W

Y

Y

D

N

R

R

D

D

P

P

R

R

F

T

I

I

A

A

Q

A

K

K

A

A

E

A

A

E

Y

Y

L

L

E

R

R

G

T

T

G

G

L

I

A

A

D

D

K

T

A

V

Y
|
Y

F

F

G

G

P

P

E
|
E

L

A

E
|
E

F

F

V

L

F

F

D

D

V

I

R

R

F

F

D

G

T

Q

G

T

Q

E

N

N

G

S

A

S

F

Y

Y

Y

S

F

V

A

D

D

S

S

E

V

E

E

G

G

I

R

W

W

N

N

S

T

G

G

K

R

S

E

G

E

E

E

A

G

-

G

N

N

L

L

G

G

Y

Y

K

K

I

P

R

G

N

Y

K

K

S

Q

G

G

Y

Y

F

F

P

P

V

V

A

A

P

P

S

T

D

D

T

T

Q

A

Q

Q

D

D

L

I

R

R

S

T

E

E

I

M

V

L

L

L

A

T

L

M

E

A

A

F

G

G

L

V

P

P

V

I

E

E

R
x
K

H

H

E
|
E

V

V

A

A

T

S

A

G

G

G

Q

Q

A

N

E
|
E

I

L

N

G

F
x
I

R

K

F
|
F

D

D

T

K

L

L

T

V

K

N

T

S

A

A

D

D

H

N

V

L

L

M

L

I

Y

Y

K

K

Y

Y

I

V

V

I

R

K

N

N

V

V

A

A

R

K

K

K

Y

Y

G

G

K

K

V

T

A

V

T

T

F

F

M

M

P

P

K

K

P

P

L

I

F

F

G

N

D

D

N

N

G

G

S

S

G

G

M

M

H
|
H

V

V

H
|
H

Q

Q

S
|
S

L

L

F

W

R

K

G

D

E

G

V

Q

P

P

L

L

F

F

Y

A

Q

G

E

D

G

-

A

K

Y

Y

A

A

S

G

L

F

S

S

E

Q

T

M

A

G

L

L

Q

W

Y

Y

I

I

A

G

G

G

I

I

L

L

Y

K

H

H

A

A

P

P

A

A

I

L

L

L

A

A

F

F

S

T

N

N

A

P

S

T

T

T

N

N

S

S

Y

Y

K

K

R

R

L

L

V

V

P

P

G

G

F

F

E

E

A

A

P

P

V

V

N

N

L

L

V

A

F

Y

S

S

Q

Q

G

G

N

N

R
|
R

S

S

A

A

A

S

I

V

R
|
R

V

I

P

P

V

L

A

S

G

G

V

G

T

N

P

P

K

K

A

A

A

K

R
|
R

I

L

E
|
E

F

F

R
|
R

T

C

P

P

D

D

S

A

T

T

S

S

N

N

P

P

Y

Y

L

L

A

A

F

F

A

A

M

M

L

L

M

C

A

A

G

G

L

I

D

D

G

G

I

I

Q

K

K

N

G

Q

M

I

D

D

P

P

K

G

A

E

L

-

G

-

Y

-

G

-

P

P

L

L

D

D

K

V

N

D

I

I

Y

-

E

-

L

-

S

-

P

-

A

-

E

E

K

L

E

A

G

K

I

I

R

P

S

S

V

T

P

P

G

G

S

S

Y

L

A

E

E

A

A

A

L

L

A

E

A

A

L

L

E

E

A

K

D

D

H

H

E

E

F

F

L

L

L

T

A

G

G

T

D

G

V

V

F

F

S

S

E

P

D

D

F

F

I

V

H

E

N

S

W

W

I

I

A

E

L

Y

K

K

N

L

T

D

T

N

E

E

V

V

N

N

Q

P

V

M

A

R

I

L

R

R

P

P

H

H

P

P

Y

Y

E

E

F

F

H

S

L

L

Y

Y

F

Y

D

D

L

C

active site: D51 (= D51), E130 (= E129), E132 (= E131), E213 (= E211), E221 (= E219), H270 (= H268), R340 (= R339), E359 (= E358), R361 (= R360)
binding phosphoaminophosphonic acid-adenylate ester: Y126 (= Y125), E130 (= E129), K209 (≠ R207), I224 (≠ F222), F226 (= F224), H272 (= H270), S274 (= S272), R340 (= R339), R345 (= R344), R357 (= R356)
binding manganese (ii) ion: E130 (= E129), E132 (= E131), E213 (= E211), E221 (= E219), H270 (= H268), E359 (= E358), R361 (= R360)

A0R079 Glutamine synthetase; GS; Glutamate--ammonia ligase; Glutamine synthetase I beta; GSI beta; EC 6.3.1.2 from Mycolicibacterium smegmatis (strain ATCC 700084 / mc(2)155) (Mycobacterium smegmatis) (see paper)
55% identity, 100% coverage: 2:474/474 of query aligns to 5:478/478 of A0R079

query
sites
A0R079

T

T

V

S

Q

D

D

D

V

I

L

F

D

K

L

L

I

I

R
x
K

D

D

K

E

G

N

I

V

K

E

M

Y

V

V

D

D

F

I

R

R

I

F

V

C

D

D

V

L

P

P

G

G

R

V

Q

V

H

Q

H

H

V

F

T

S

V

I

P

P

A

A

T

S

H

A

V

F

D

D

E

E

E

S

T

V

L

F

R

E

R

D

G

G

L

L

P

A

F

F

D

D

G

G

S

S

I

V

Q

R

G

G

F

F

R

Q

G

S

I

I

E

H

E

E

S

S

D

D

M

M

V

M

M

L

R

L

P

P

D

D

L

P

D

N

T

T

A

A

F

R

V

I

D

D

P

P

F

F

T

R

K

A

V

A

P

K

T

T

L

L

N

N

L

M

M

N

C

F

D

F

V

V

Y

H

E

D

P

P

-

F

S

T

G

R

I

E

R

A

Y

Y

D

S

R

R

D

D

P

P

R

R

F

N

I

V

A

A

Q

R

K

K

A

A

E

E

A

N

Y

Y

L

L

E

A

R

S

T

T

G

G

L

I

A

A

D

D

K

T

A

A

Y

F

F

F

G

G

P

A

E

E

L

A

E

E

F

F

F

Y

V

I

F

F

D

D

D

S

V

V

R

S

F

F

D

D

T

S

G

K

Q

I

N

N

G

G

A

T

F

F

Y

Y

S

E

V

V

D

D

S

S

E

E

E

S

G

G

I

W

W

W

N

N

S

T

G

G

K

E

-

P

-

F

-

E

-

S

S

D

G

G

E

S

A

A

N

N

L

R

G

G

Y

Y

K

K

I

V

R

R

N

P

K

K

S

G

G

G

Y

Y

F

F

P

P

V

V

A

A

P

P

S

Y

D

D

T

H

Q

Y

Q

V

D

D

L

L

R

R

S

D

E

Q

I

M

V

A

L

T

A

N

L

L

E

Q

E

N

A

A

G

G

L

F

P

T

V

L

E

E

R

R

H

G

H

H

E

E

V

V

A

G

T

T

A

A

G

G

Q

Q

A

A

E

E

I

I

N

N

F

Y

R

K

F

F

D

N

T

T

L

L

T

L

K

A

T

A

A

A

D

D

H

D

V

V

L

L

Y

F

K

K

Y

Y

I

I

V

I

R

K

N

N

V

T

A

A

R

W

K

Q

Y

A

G

G

K

K

V

T

A

V

T

T

F

F

M

M

P

P

K

K

P

P

L

L

F

F

G

G

D

D

N

N

G

G

S

S

G

G

M

M

H

H

V

A

H

H

Q

Q

S

S

L

L

F

W

R

K

G

D

E

G

V

Q

P

P

L

L

F

F

Y

H

Q

D

E

E

G

S

A

G

Y

Y

A

A

S

G

L

L

S

S

E

D

T

I

A

A

L

R

Q

H

Y

Y

I

I

A

G

G

G

I

I

L

L

Y

H

H

H

A

A

P

P

A

S

I

L

L

L

A

A

F

F

S

T

N

N

A

P

S

T

T

V

N

N

S

S

Y

Y

K

K

R

R

L

L

V

V

P

P

G

G

F

Y

E

E

A

A

P

P

V

I

N

N

L

L

V

V

F

Y

S

S

Q

Q

G

R

N

N

R

R

S

S

A

A

A

C

I

V

R

R

V

I

P

P

V

I

A

T

G

G

V

N

T

N

P

P

K

K

A

A

A

K

R

R

I

L

E

E

F

F

R

R

T

C

P

P

D

D

S

S

T

S

S

G

N

N

P

P

Y

Y

L

L

A

A

F

F

A

A

M

M

L

L

M

M

A

A

G

G

L

I

D

D

G

G

I

I

Q

K

K

K

G

K

M

I

D

E

P

P

K

-

A

-

L

-

G

-

Y

L

G

Q

P

P

L

V

D

D

K

K

N

D

I

L

Y

Y

E

E

L

L

S

P

P

P

A

D

E

E

K

A

E

A

G

A

I

I

R

P

S

Q

V

A

P

P

G

T

S

S

Y

L

A

S

E

A

A

V

L

I

A

D

A

K

L

L

E

E

A

E

D

D

H

H

E

E

F

Y

L

L

L

T

A

E

G

G

D

G

V

V

F

F

S

T

E

E

D

D

F

L

I

I

H

E

N

T

W

W

I

I

A

S

L

Y

K

K

N

R

T

E

T

N

E

E

V

I

N

M

Q

P

V

I

A

Q

I

I

R

R

P

P

H

H

P

P

Y

Y

E

E

F

F

H

S

L

L

Y

Y

F

Y

D

D

L

V

K14 (≠ R11) modified: Isoglutamyl lysine isopeptide (Lys-Gln) (interchain with Q-Cter in protein Pup)

P9WN39 Glutamine synthetase; GS; Glutamate--ammonia ligase; Glutamine synthetase I beta; GSI beta; EC 6.3.1.2 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 5 papers)
54% identity, 100% coverage: 2:474/474 of query aligns to 5:478/478 of P9WN39

query
sites
P9WN39

T

T

V

P

Q

D

D

D

V

V

L

F

D

K

L

L

I

A

R

K

D

D

K

E

G

K

I

V

K

E

M

Y

V

V

D

D

F

V

R

R

I

F

V

C

D

D

V

L

P

P

G

G

R

I

Q

M

H

Q

H

H

V

F

T

T

V

I

P

P

A

A

T

S

H

A

V

F

D

D

E

K

E

S

T

V

L

F

R

D

G

G

L

L

P

A

F

F

D

D

G

G

S

S

I

I

Q

R

G

G

F

F

R

Q

G

S

I

I

E

H

E

E

S

S

D

D

M

M

V

L

M

L

R

L

P

P

D

D

L

P

D

E

T

T

A

A

F

R

V

I

D

D

P

P

F

F

T

R

K

A

V

A

P

K

T

T

L

L

N

N

L

I

M

N

C

F

D

F

V

V

Y

H

E

D

P

P

S

F

G

T

I

L

R

E

-

P

Y

Y

D

S

R

R

D

D

P

P

R

R

F

N

I

I

A

A

Q

R

K

K

A

A

E

E

A

N

Y

Y

L

L

E

I

R

S

T

T

G

G

L

I

A

A

D

D

K

T

A

A

Y

Y

F

F

G

G

P

A

E
|
E

L

A

E
|
E

F

F

F

Y

V

I

F

F

D

D

D

S

V

V

R

S

F

F

D

D

T

S

G

R

Q

A

N

N

G

G

A

S

F

F

Y

Y

S

E

V

V

D

D

S

A

E

I

E

S

G

G

I

W

W

W

N

N

S

T

G

G

K

A

S

A

G

T

E

E

A

A

-

D

-

G

-

S

-

P

N

N

L

R

G

G

Y

Y

K

K

I

V

R

R

N

H

K

K

S

G

G

G

Y

Y

F

F

P

P

V

V

A

A

P

P

S

N

D

D

T

Q

Q

Y

Q

V

D

D

L

L

R

R

S

D

E

K

I

M

V

L

L

T

A

N

L

L

E

I

E

N

A

S

G

G

L

F

P

I

V

L

E

E

R

K

H

G

H

H

E
|
E

V

V

A

G

T

S

A

G

G

G

Q

Q

A

A

E
|
E

I

I

N

N

F

Y

R

Q

F

F

D

N

T

S

L

L

T

L

K

H

T

A

A

A

D

D

H

D

V

M

L

Q

L

L

Y

Y

K

K

Y

Y

I

I

V

I

R

K

N

N

V

T

A

A

R

W

K

Q

Y

N

G

G

K

K

V

T

A

V

T

T

F

F

M

M

P

P

K

K

P

P

L

L

F

F

G

G

D

D

N

N

G

G

S

S

G

G

M

M

H
|
H

V

C

H

H

Q

Q

S

S

L

L

F

W

R

K

G

D

E

G

V

A

P

P

L

L

F

M

Y

Y

Q

D

E

E

G

T

A

G

Y

Y

A

A

S

G

L

L

S

S

E

D

T

T

A

A

L

R

Q

H

Y

Y

I

I

A

G

G

G

I

L

L

L

Y

H

H

H

A

A

P

P

A

S

I

L

L

L

A

A

F

F

S

T

N

N

A

P

S

T

T

V

N

N

S

S

Y

Y

K

K

R

R

L

L

V

V

P

P

G

G

F

Y

E

E

A

A

P

P

V

I

N

N

L

L

V

V

F

Y

S

S

Q

Q

G

R

N

N

R

R

S

S

A

A

A

C

I

V

R

R

V

I

P

P

V

I

A

T

G

G

V

S

T

N

P

P

K

K

A

A

A

K

R

R

I

L

E
|
E

F

F

R

R

T

S

P

P

D

D

S

S

T

S

S

G

N

N

P

P

Y

Y

L

L

A

A

F

F

A

S

A

A

M

M

L

L

M

M

A

A

G

G

L

L

D

D

G

G

I

I

Q

K

K

N

G

K

M

I

D

E

P

P

K

Q

A

A

L

-

G

-

Y

-

G

-

P

P

L

V

D

D

K

K

N

D

I

L

Y
|
Y

E

E

L

L

S

P

P

P

A

E

E

E

K

A

E

A

G

S

I

I

R

P

S

Q

V

T

P

P

G

T

S

Q

Y

L

A

S

E

D

A

V

L

I

A

D

A

R

L

L

E

E

A

A

D

D

H

H

E

E

F

Y

L

L

L

T

A

E

G

G

D

G

V

V

F

F

S

T

E

N

D

D

F

L

I

I

H

E

N

T

W

W

I

I

A

S

L

F

K

K

N

R

T

E

T

N

E

E

V

I

N

E

Q

P

V

V

A

N

I

I

R

R

P

P

H

H

P

P

Y

Y

E

E

F

F

H

A

L

L

Y

Y

F

Y

D

D

L

V

E133 (= E129) binding Mg(2+)
E135 (= E131) binding Mg(2+)
E219 (= E211) binding Mg(2+)
E227 (= E219) binding Mg(2+)
H276 (= H268) binding Mg(2+)
E366 (= E358) binding Mg(2+)
Y406 (= Y402) modified: O-AMP-tyrosine; mutation to F: Unable to be adenylylated.

Sites not aligning to the query:

1 modified: Initiator methionine, Removed

4acfA Crystal structure of mycobacterium tuberculosis glutamine synthetase in complex with imidazopyridine inhibitor ((4-(6-bromo-3- (butylamino)imidazo(1,2-a)pyridin-2-yl)phenoxy) acetic acid) and l- methionine-s-sulfoximine phosphate.
54% identity, 100% coverage: 2:474/474 of query aligns to 2:475/475 of 4acfA

query
sites
4acfA

T

T

V

P

Q

D

D

D

V

V

L

F

D

K

L

L

I

A

R

K

D

D

K

E

G

K

I

V

K

E

M

Y

V

V

D

D

F

V

R

R

I

F

V

C

D

D

V

L

P

P

G

G

R

I

Q

M

H

Q

H

H

V

F

T

T

V

I

P

P

A

A

T

S

H

A

V

F

D

D

E

K

E

S

T

V

L

F

R

D

G

G

L

L

P

A

F

F

D
|
D

G

G

S

S

I

I

Q

R

G

G

F

F

R

Q

G

S

I

I

E

H

E

E

S

S

D

D

M

M

V

L

M

L

R

L

P

P

D

D

L

P

D

E

T

T

A

A

F

R

V

I

D

D

P

P

F

F

T

R

K

A

V

A

P

K

T

T

L

L

N

N

L

I

M

N

C

F

D

F

V

V

Y

H

E

D

P

P

S

F

G

T

I

L

R

E

-

P

Y

Y

D

S

R

R

D

D

P

P

R

R

F

N

I

I

A

A

Q

R

K

K

A

A

E

E

A

N

Y

Y

L

L

E

I

R

S

T

T

G

G

L

I

A

A

D

D

K

T

A

A

Y
|
Y

F

F

G

G

P

A

E
|
E

L

A

E
|
E

F

F

F

Y

V

I

F

F

D

D

D

S

V

V

R

S

F

F

D

D

T

S

G

R

Q

A

N

N

G

G

A

S

F

F

Y

Y

S

E

V

V

D

D

S

A

E

I

E

S

G

G

I

W

W

W

N

N

S

T

G

G

K

A

S

A

G

T

E

E

A

A

-

D

-

G

-

S

-

P

N

N

L

R

G

G

Y

Y

K

K

I

V

R

R

N

H

K

K

S

G

G

G

Y

Y

F

F

P

P

V

V

A

A

P

P

S

N

D

D

T

Q

Q

Y

Q

V

D

D

L

L

R

R

S

D

E

K

I

M

V

L

L

T

A

N

L

L

E

I

E

N

A

S

G

G

L

F

P

I

V

L

E

E

R

K

H

G

H

H

E
|
E

V

V

A

G

T

S

A

G

G

G

Q

Q

A

A

E
|
E

I

I

N

N

F

Y

R

Q

F
|
F

D

N

T

S

L

L

T

L

K

H

T

A

A

A

D

D

H

D

V

M

L

Q

L

L

Y

Y

K

K

Y

Y

I

I

V

I

R

K

N

N

V

T

A

A

R

W

K

Q

Y

N

G

G

K

K

V

T

A

V

T

T

F

F

M

M

P

P

K

K

P

P

L

L

F

F

G

G

D

D

N

N

G
|
G

S

S

G

G

M

M

H
|
H

V

C

H
|
H

Q
|
Q

S

S

L

L

F
x
W

R

K

G

D

E

G

V

A

P

P

L

L

F

M

Y

Y

Q

D

E

E

G

T

A

G

Y

Y

A

A

S

G

L

L

S

S

E

D

T

T

A

A

L

R

Q

H

Y

Y

I

I

A

G

G

G

I

L

L

L

Y

H

H

H

A

A

P

P

A

S

I

L

L

L

A

A

F

F

S

T

N

N

A

P

S

T

T

V

N

N

S

S

Y

Y

K

K

R
|
R

L

L

V

V

P

P

G

G

F

Y

E
|
E

A

A

P

P

V

I

N

N

L

L

V

V

F

Y

S

S

Q

Q

G

R

N

N

R
|
R

S

S

A

A

A

C

I

V

R

R

V

I

P

P

V

I

A

T

G

G

V

S

T
x
N

P

P

K
|
K

A

A

A

K

R
|
R

I

L

E
|
E

F

F

R
|
R

T

S

P

P

D

D

S

S

T

S

S

G

N

N

P

P

Y

Y

L

L

A

A

F

F

A

S

A

A

M

M

L

L

M

M

A

A

G

G

L

L

D

D

G

G

I

I

Q

K

K

N

G

K

M

I

D

E

P

P

K

Q

A

A

L

-

G

-

Y

-

G

-

P

P

L

V

D

D

K

K

N

D

I

L

Y

Y

E

E

L

L

S

P

P

P

A

E

E

E

K

A

E

A

G

S

I

I

R

P

S

Q

V

T

P

P

G

T

S

Q

Y

L

A

S

E

D

A

V

L

I

A

D

A

R

L

L

E

E

A

A

D

D

H

H

E

E

F

Y

L

L

L

T

A

E

G

G

D

G

V

V

F

F

S

T

E

N

D

D

F

L

I

I

H

E

N

T

W

W

I

I

A

S

L

F

K

K

N

R

T

E

T

N

E

E

V

I

N

E

Q

P

V

V

A

N

I

I

R

R

P

P

H

H

P

P

Y

Y

E

E

F

F

H

A

L

L

Y

Y

F

Y

D

D

L

V

active site: D51 (= D51), E130 (= E129), E132 (= E131), E216 (= E211), E224 (= E219), H273 (= H268), R344 (= R339), E363 (= E358), R365 (= R360)
binding {4-[6-bromo-3-(butylamino)imidazo[1,2-a]pyridin-2-yl]phenoxy}acetic acid: Y126 (= Y125), F229 (= F224), H275 (= H270), Q276 (= Q271), W279 (≠ F274), N356 (≠ T351), K358 (= K353), R361 (= R356)
binding magnesium ion: E130 (= E129), E130 (= E129), E132 (= E131), E216 (= E211), E224 (= E219), E224 (= E219), H273 (= H268), E363 (= E358)
binding l-methionine-s-sulfoximine phosphate: E130 (= E129), E132 (= E131), E216 (= E211), E224 (= E219), G269 (= G264), H273 (= H268), R326 (= R321), E332 (= E327), R344 (= R339), R365 (= R360)

3zxvA Crystal structure of mycobacterium tuberculosis glutamine synthetase in complex with tri-substituted imidazole inhibitor (4-(2-tert-butyl- 4-(6-methoxynaphthalen-2-yl)-1h-imidazol-5-yl)pyridin-2-amine) and l- methionine-s-sulfoximine phosphate (see paper)
54% identity, 100% coverage: 2:474/474 of query aligns to 2:475/475 of 3zxvA

query
sites
3zxvA

T

T

V

P

Q

D

D

D

V

V

L

F

D

K

L

L

I

A

R

K

D

D

K

E

G

K

I

V

K

E

M

Y

V

V

D

D

F

V

R

R

I

F

V

C

D

D

V

L

P

P

G

G

R

I

Q

M

H

Q

H

H

V

F

T

T

V

I

P

P

A

A

T

S

H

A

V

F

D

D

E

K

E

S

T

V

L

F

R

D

G

G

L

L

P

A

F

F

D
|
D

G

G

S

S

I

I

Q

R

G

G

F

F

R

Q

G

S

I

I

E

H

E

E

S

S

D

D

M

M

V

L

M

L

R

L

P

P

D

D

L

P

D

E

T

T

A

A

F

R

V

I

D

D

P

P

F

F

T

R

K

A

V

A

P

K

T

T

L

L

N

N

L

I

M

N

C

F

D

F

V

V

Y

H

E

D

P

P

S

F

G

T

I

L

R

E

-

P

Y

Y

D

S

R

R

D

D

P

P

R

R

F

N

I

I

A

A

Q

R

K

K

A

A

E

E

A

N

Y

Y

L

L

E

I

R

S

T

T

G

G

L

I

A

A

D

D

K

T

A

A

Y
|
Y

F

F

G
|
G

P

A

E
|
E

L

A

E
|
E

F

F

F

Y

V

I

F

F

D

D

D

S

V

V

R

S

F

F

D

D

T

S

G

R

Q

A

N

N

G

G

A

S

F

F

Y

Y

S

E

V

V

D

D

S

A

E

I

E

S

G

G

I

W

W

W

N

N

S

T

G

G

K

A

S

A

G

T

E

E

A

A

-

D

-

G

-

S

-

P

N

N

L

R

G

G

Y

Y

K

K

I

V

R

R

N

H

K

K

S

G

G

G

Y

Y

F

F

P

P

V

V

A

A

P

P

S

N

D

D

T

Q

Q

Y

Q

V

D

D

L

L

R

R

S

D

E

K

I

M

V

L

L

T

A

N

L

L

E

I

E

N

A

S

G

G

L

F

P

I

V

L

E

E

R

K

H

G

H

H

E
|
E

V

V

A

G

T

S

A

G

G

G

Q

Q

A

A

E
|
E

I

I

N

N

F

Y

R

Q

F
|
F

D

N

T

S

L

L

T

L

K

H

T

A

A

A

D

D

H

D

V

M

L

Q

L

L

Y

Y

K

K

Y

Y

I

I

V

I

R

K

N

N

V

T

A

A

R

W

K

Q

Y

N

G

G

K

K

V

T

A

V

T

T

F

F

M

M

P

P

K

K

P

P

L

L

F

F

G

G

D

D

N

N

G
|
G

S

S

G

G

M

M

H
|
H

V

C

H
|
H

Q

Q

S
|
S

L

L

F

W

R

K

G

D

E

G

V

A

P

P

L

L

F

M

Y

Y

Q

D

E

E

G

T

A

G

Y

Y

A

A

S

G

L

L

S

S

E

D

T

T

A

A

L

R

Q

H

Y

Y

I

I

A

G

G

G

I

L

L

L

Y

H

H

H

A

A

P

P

A

S

I

L

L

L

A

A

F

F

S

T

N

N

A

P

S

T

T

V

N

N

S

S

Y

Y

K

K

R
|
R

L

L

V

V

P

P

G

G

F

Y

E
|
E

A

A

P

P

V

I

N

N

L

L

V

V

F

Y

S

S

Q

Q

G

R

N

N

R
|
R

S

S

A

A

A

C

I

V

R

R

V

I

P

P

V

I

A

T

G

G

V

S

T

N

P

P

K
|
K

A

A

A

K

R
|
R

I

L

E
|
E

F

F

R
|
R

T

S

P

P

D

D

S

S

T

S

S

G

N

N

P

P

Y

Y

L

L

A

A

F

F

A

S

A

A

M

M

L

L

M

M

A

A

G

G

L

L

D

D

G

G

I

I

Q

K

K

N

G

K

M

I

D

E

P

P

K

Q

A

A

L

-

G

-

Y

-

G

-

P

P

L

V

D

D

K

K

N

D

I

L

Y

Y

E

E

L

L

S

P

P

P

A

E

E

E

K

A

E

A

G

S

I

I

R

P

S

Q

V

T

P

P

G

T

S

Q

Y

L

A

S

E

D

A

V

L

I

A

D

A

R

L

L

E

E

A

A

D

D

H

H

E

E

F

Y

L

L

L

T

A

E

G

G

D

G

V

V

F

F

S

T

E

N

D

D

F

L

I

I

H

E

N

T

W

W

I

I

A

S

L

F

K

K

N

R

T

E

T

N

E

E

V

I

N

E

Q

P

V

V

A

N

I

I

R

R

P

P

H

H

P

P

Y

Y

E

E

F

F

H

A

L

L

Y

Y

F

Y

D

D

L

V

active site: D51 (= D51), E130 (= E129), E132 (= E131), E216 (= E211), E224 (= E219), H273 (= H268), R344 (= R339), E363 (= E358), R365 (= R360)
binding magnesium ion: E130 (= E129), E130 (= E129), E132 (= E131), E216 (= E211), E224 (= E219), E224 (= E219), H273 (= H268), E363 (= E358)
binding 4-(2-tert-butyl-4-(6-methoxynaphthalen-2-yl)-3h-imidazol-4-yl)pyridin-2-amine: Y126 (= Y125), G128 (= G127), F229 (= F224), H275 (= H270), S277 (= S272), K358 (= K353), R361 (= R356)
binding l-methionine-s-sulfoximine phosphate: E130 (= E129), E132 (= E131), E216 (= E211), E224 (= E219), G269 (= G264), H273 (= H268), R326 (= R321), E332 (= E327), R344 (= R339), R365 (= R360)

3zxrA Crystal structure of mycobacterium tuberculosis glutamine synthetase in complex with tri-substituted imidazole inhibitor (3-(2-tert-butyl- 5-(pyridin-4-yl)-1h-imidazol-4-yl)quinoline) and l-methionine-s- sulfoximine phosphate. (see paper)
54% identity, 100% coverage: 2:474/474 of query aligns to 2:475/475 of 3zxrA

query
sites
3zxrA

T

T

V

P

Q

D

D

D

V

V

L

F

D

K

L

L

I

A

R

K

D

D

K

E

G

K

I

V

K

E

M

Y

V

V

D

D

F

V

R

R

I

F

V

C

D

D

V

L

P

P

G

G

R

I

Q

M

H

Q

H

H

V

F

T

T

V

I

P

P

A

A

T

S

H

A

V

F

D

D

E

K

E

S

T

V

L

F

R

D

G

G

L

L

P

A

F

F

D
|
D

G

G

S

S

I

I

Q

R

G

G

F

F

R

Q

G

S

I

I

E

H

E

E

S

S

D

D

M

M

V

L

M

L

R

L

P

P

D

D

L

P

D

E

T

T

A

A

F

R

V

I

D

D

P

P

F

F

T

R

K

A

V

A

P

K

T

T

L

L

N

N

L

I

M

N

C

F

D

F

V

V

Y

H

E

D

P

P

S

F

G

T

I

L

R

E

-

P

Y

Y

D

S

R

R

D

D

P

P

R

R

F

N

I

I

A

A

Q

R

K

K

A

A

E

E

A

N

Y

Y

L

L

E

I

R

S

T

T

G

G

L

I

A

A

D

D

K

T

A

A

Y

Y

F

F

G
|
G

P

A

E
|
E

L

A

E
|
E

F

F

F

Y

V

I

F

F

D

D

D

S

V

V

R

S

F

F

D

D

T

S

G

R

Q

A

N

N

G

G

A

S

F

F

Y

Y

S

E

V

V

D

D

S

A

E

I

E

S

G

G

I

W

W

W

N

N

S

T

G

G

K

A

S

A

G

T

E

E

A

A

-

D

-

G

-

S

-

P

N

N

L

R

G

G

Y

Y

K

K

I

V

R

R

N

H

K

K

S

G

G

G

Y

Y

F

F

P

P

V

V

A

A

P

P

S

N

D

D

T

Q

Q

Y

Q

V

D

D

L

L

R

R

S

D

E

K

I

M

V

L

L

T

A

N

L

L

E

I

E

N

A

S

G

G

L

F

P

I

V

L

E

E

R

K

H

G

H

H

E
|
E

V

V

A

G

T

S

A

G

G

G

Q

Q

A

A

E
|
E

I

I

N

N

F

Y

R

Q

F
|
F

D

N

T

S

L

L

T

L

K

H

T

A

A

A

D

D

H

D

V

M

L

Q

L

L

Y

Y

K

K

Y

Y

I

I

V

I

R

K

N

N

V

T

A

A

R

W

K

Q

Y

N

G

G

K

K

V

T

A

V

T

T

F

F

M

M

P

P

K

K

P

P

L

L

F

F

G

G

D

D

N

N

G

G

S

S

G

G

M

M

H
|
H

V

C

H
|
H

Q

Q

S
|
S

L

L

F

W

R

K

G

D

E

G

V

A

P

P

L

L

F

M

Y

Y

Q

D

E

E

G

T

A

G

Y

Y

A

A

S

G

L

L

S

S

E

D

T

T

A

A

L

R

Q

H

Y

Y

I

I

A

G

G

G

I

L

L

L

Y

H

H

H

A

A

P

P

A

S

I

L

L

L

A

A

F

F

S

T

N

N

A

P

S

T

T

V

N

N

S

S

Y

Y

K

K

R
|
R

L

L

V

V

P

P

G

G

F

Y

E
|
E

A

A

P

P

V

I

N

N

L

L

V

V

F

Y

S

S

Q

Q

G

R

N

N

R
|
R

S

S

A

A

A

C

I

V

R

R

V

I

P

P

V

I

A

T

G

G

V

S

T

N

P

P

K

K

A

A

A

K

R
|
R

I

L

E
|
E

F

F

R
|
R

T

S

P

P

D

D

S

S

T

S

S

G

N

N

P

P

Y

Y

L

L

A

A

F

F

A

S

A

A

M

M

L

L

M

M

A

A

G

G

L

L

D

D

G

G

I

I

Q

K

K

N

G

K

M

I

D

E

P

P

K

Q

A

A

L

-

G

-

Y

-

G

-

P

P

L

V

D

D

K

K

N

D

I

L

Y

Y

E

E

L

L

S

P

P

P

A

E

E

E

K

A

E

A

G

S

I

I

R

P

S

Q

V

T

P

P

G

T

S

Q

Y

L

A

S

E

D

A

V

L

I

A

D

A

R

L

L

E

E

A

A

D

D

H

H

E

E

F

Y

L

L

L

T

A

E

G

G

D

G

V

V

F

F

S

T

E

N

D

D

F

L

I

I

H

E

N

T

W

W

I

I

A

S

L

F

K

K

N

R

T

E

T

N

E

E

V

I

N

E

Q

P

V

V

A

N

I

I

R

R

P

P

H

H

P

P

Y

Y

E

E

F

F

H

A

L

L

Y

Y

F

Y

D

D

L

V

active site: D51 (= D51), E130 (= E129), E132 (= E131), E216 (= E211), E224 (= E219), H273 (= H268), R344 (= R339), E363 (= E358), R365 (= R360)
binding 3-(2-tert-butyl-5-(pyridin-4-yl)-1h-imidazol-4-yl)quinoline: G128 (= G127), F229 (= F224), H275 (= H270), S277 (= S272), R361 (= R356)
binding magnesium ion: E130 (= E129), E130 (= E129), E132 (= E131), E216 (= E211), E224 (= E219), E224 (= E219), H273 (= H268), E363 (= E358)
binding l-methionine-s-sulfoximine phosphate: E130 (= E129), E132 (= E131), E216 (= E211), E224 (= E219), H273 (= H268), R326 (= R321), E332 (= E327), R344 (= R339), R365 (= R360)

2bvcA Crystal structure of mycobacterium tuberculosis glutamine synthetase in complex with a transition state mimic (see paper)
54% identity, 100% coverage: 2:474/474 of query aligns to 2:475/475 of 2bvcA

query
sites
2bvcA

T

T

V

P

Q

D

D

D

V

V

L

F

D

K

L

L

I

A

R

K

D

D

K

E

G

K

I

V

K

E

M

Y

V

V

D

D

F

V

R

R

I

F

V

C

D

D

V

L

P

P

G

G

R

I

Q

M

H

Q

H

H

V

F

T

T

V

I

P

P

A

A

T

S

H

A

V

F

D

D

E

K

E

S

T

V

L

F

R

D

G

G

L

L

P

A

F

F

D
|
D

G

G

S

S

I

I

Q

R

G

G

F

F

R

Q

G

S

I

I

E

H

E

E

S

S

D

D

M

M

V

L

M

L

R

L

P

P

D

D

L

P

D

E

T

T

A

A

F

R

V

I

D

D

P

P

F

F

T

R

K

A

V

A

P

K

T

T

L

L

N

N

L

I

M

N

C

F

D

F

V

V

Y

H

E

D

P

P

S

F

G

T

I

L

R

E

-

P

Y

Y

D

S

R

R

D

D

P

P

R

R

F

N

I

I

A

A

Q

R

K

K

A

A

E

E

A

N

Y

Y

L

L

E

I

R

S

T

T

G

G

L

I

A

A

D

D

K

T

A

A

Y

Y

F

F

G

G

P

A

E
|
E

L

A

E
|
E

F

F

F

Y

V

I

F

F

D

D

D

S

V

V

R

S

F

F

D

D

T

S

G

R

Q

A

N

N

G

G

A

S

F

F

Y

Y

S

E

V

V

D

D

S

A

E

I

E

S

G

G

I

W

W

W

N

N

S

T

G

G

K

A

S

A

G

T

E

E

A

A

-

D

-

G

-

S

-

P

N

N

L

R

G

G

Y

Y

K

K

I

V

R

R

N

H

K

K

S

G

G

G

Y

Y

F

F

P

P

V

V

A

A

P

P

S

N

D

D

T

Q

Q

Y

Q

V

D

D

L

L

R

R

S

D

E

K

I

M

V

L

L

T

A

N

L

L

E

I

E

N

A

S

G

G

L

F

P

I

V

L

E
|
E

R
x
K

H

G

H

H

E
|
E

V

V

A

G

T

S

A

G

G

G

Q

Q

A

A

E
|
E

I

I

N
|
N

F

Y

R

Q

F
|
F

D

N

T

S

L

L

T

L

K

H

T

A

A

A

D

D

H

D

V

M

L

Q

L

L

Y

Y

K

K

Y

Y

I

I

V

I

R

K

N

N

V

T

A

A

R

W

K

Q

Y

N

G

G

K

K

V

T

A

V

T

T

F

F

M

M

P

P

K

K

P

P

L

L

F

F

G

G

D

D

N

N

G
|
G

S

S

G

G

M

M

H
|
H

V

C

H
|
H

Q

Q

S
|
S

L

L

F

W

R

K

G

D

E

G

V

A

P

P

L

L

F

M

Y

Y

Q

D

E

E

G

T

A

G

Y

Y

A

A

S

G

L

L

S

S

E

D

T

T

A

A

L

R

Q

H

Y

Y

I

I

A

G

G

G

I

L

L

L

Y

H

H

H

A

A

P

P

A

S

I

L

L

L

A

A

F

F

S

T

N

N

A

P

S

T

T

V

N

N

S

S

Y

Y

K

K

R
|
R

L

L

V

V

P

P

G

G

F

Y

E
|
E

A

A

P

P

V

I

N

N

L

L

V

V

F

Y

S

S

Q

Q

G

R

N

N

R
|
R

S

S

A

A

A

C

I

V

R
|
R

V

I

P

P

V

I

A

T

G

G

V

S

T

N

P

P

K

K

A

A

A

K

R
|
R

I

L

E
|
E

F

F

R
|
R

T

S

P

P

D

D

S

S

T

S

S

G

N

N

P

P

Y

Y

L

L

A

A

F

F

A

S

A

A

M

M

L

L

M

M

A

A

G

G

L

L

D

D

G

G

I

I

Q

K

K

N

G

K

M

I

D

E

P

P

K

Q

A

A

L

-

G

-

Y

-

G

-

P

P

L

V

D

D

K

K

N

D

I

L

Y

Y

E

E

L

L

S

P

P

P

A

E

E

E

K

A

E

A

G

S

I

I

R

P

S

Q

V

T

P

P

G

T

S

Q

Y

L

A

S

E

D

A

V

L

I

A

D

A

R

L

L

E

E

A

A

D

D

H

H

E

E

F

Y

L

L

L

T

A

E

G

G

D

G

V

V

F

F

S

T

E

N

D

D

F

L

I

I

H

E

N

T

W

W

I

I

A

S

L

F

K

K

N

R

T

E

T

N

E

E

V

I

N

E

Q

P

V

V

A

N

I

I

R

R

P

P

H

H

P

P

Y

Y

E

E

F

F

H

A

L

L

Y

Y

F

Y

D

D

L

V

active site: D51 (= D51), E130 (= E129), E132 (= E131), E216 (= E211), E224 (= E219), H273 (= H268), R344 (= R339), E363 (= E358), R365 (= R360)
binding adenosine-5'-diphosphate: E130 (= E129), E211 (= E206), K212 (≠ R207), N226 (= N221), F229 (= F224), H275 (= H270), S277 (= S272), R344 (= R339), R349 (= R344), R361 (= R356), E363 (= E358)
binding magnesium ion: E130 (= E129), E130 (= E129), E132 (= E131), E216 (= E211), E224 (= E219), E224 (= E219), H273 (= H268), E363 (= E358)
binding l-methionine-s-sulfoximine phosphate: E130 (= E129), E132 (= E131), E216 (= E211), E224 (= E219), G269 (= G264), H273 (= H268), R326 (= R321), E332 (= E327), R344 (= R339), R365 (= R360)

1htoA Crystallographic structure of a relaxed glutamine synthetase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
54% identity, 100% coverage: 2:474/474 of query aligns to 4:477/477 of 1htoA

query
sites
1htoA

T

T

V

P

Q

D

D

D

V

V

L

F

D

K

L

L

I

A

R

K

D

D

K

E

G

K

I

V

K

E

M

Y

V

V

D

D

F

V

R

R

I

F

V

C

D

D

V

L

P

P

G

G

R

I

Q

M

H

Q

H

H

V

F

T

T

V

I

P

P

A

A

T

S

H

A

V

F

D

D

E

K

E

S

T

V

L

F

R

D

G

G

L

L

P

A

F

F

D
|
D

G

G

S

S

I

I

Q

R

G

G

F

F

R

Q

G

S

I

I

E

H

E

E

S

S

D

D

M

M

V

L

M

L

R

L

P

P

D

D

L

P

D

E

T

T

A

A

F

R

V

I

D

D

P

P

F

F

T

R

K

A

V

A

P

K

T

T

L

L

N

N

L

I

M

N

C

F

D

F

V

V

Y

H

E

D

P

P

S

F

G

T

I

L

R

E

-

P

Y

Y

D

S

R

R

D

D

P

P

R

R

F

N

I

I

A

A

Q

R

K

K

A

A

E

E

A

N

Y

Y

L

L

E

I

R

S

T

T

G

G

L

I

A

A

D

D

K

T

A

A

Y
|
Y

F

F

G
|
G

P

A

E
|
E

L

A

E
|
E

F

F

F

Y

V

I

F

F

D

D

D

S

V

V

R

S

F

F

D

D

T

S

G

R

Q

A

N

N

G

G

A

S

F

F

Y

Y

S

E

V

V

D

D

S

A

E

I

E

S

G

G

I

W

W

W

N

N

S

T

G

G

K

A

S

A

G

T

E

E

A

A

-

D

-

G

-

S

-

P

N

N

L

R

G

G

Y

Y

K

K

I

V

R

R

N

H

K

K

S

G

G

G

Y

Y

F

F

P

P

V

V

A

A

P

P

S

N

D

D

T

Q

Q

Y

Q

V

D

D

L

L

R

R

S

D

E

K

I

M

V

L

L

T

A

N

L

L

E

I

E

N

A

S

G

G

L

F

P

I

V

L

E

E

R

K

H

G

H

H

E
|
E

V

V

A

G

T

S

A

G

G

G

Q

Q

A

A

E
|
E

I

I

N

N

F

Y

R

Q

F
|
F

D

N

T

S

L

L

T

L

K

H

T

A

A

A

D

D

H

D

V

M

L

Q

L

L

Y

Y

K

K

Y

Y

I

I

V

I

R

K

N

N

V

T

A

A

R

W

K

Q

Y

N

G

G

K

K

V

T

A

V

T

T

F

F

M

M

P

P

K

K

P

P

L

L

F

F

G

G

D

D

N

N

G

G

S

S

G

G

M

M

H
|
H

V

C

H
|
H

Q

Q

S
|
S

L

L

F

W

R

K

G

D

E

G

V

A

P

P

L

L

F

M

Y

Y

Q

D

E

E

G

T

A

G

Y

Y

A

A

S

G

L

L

S

S

E

D

T

T

A

A

L

R

Q

H

Y

Y

I

I

A

G

G

G

I

L

L

L

Y

H

H

H

A

A

P

P

A

S

I

L

L

L

A

A

F

F

S

T

N

N

A

P

S

T

T

V

N

N

S

S

Y

Y

K

K

R

R

L

L

V

V

P

P

G

G

F

Y

E

E

A

A

P

P

V

I

N

N

L

L

V

V

F

Y

S

S

Q

Q

G

R

N

N

R
|
R

S

S

A

A

A

C

I

V

R

R

V

I

P

P

V

I

A

T

G

G

V

S

T

N

P

P

K

K

A

A

A

K

R
|
R

I

L

E
|
E

F

F

R
|
R

T

S

P

P

D

D

S

S

T

S

S

G

N

N

P

P

Y

Y

L

L

A

A

F

F

A

S

A

A

M

M

L

L

M

M

A

A

G

G

L

L

D

D

G

G

I

I

Q

K

K

N

G

K

M

I

D

E

P

P

K

Q

A

A

L

-

G

-

Y

-

G

-

P

P

L

V

D

D

K

K

N

D

I

L

Y

Y

E

E

L

L

S

P

P

P

A

E

E

E

K

A

E

A

G

S

I

I

R

P

S

Q

V

T

P

P

G

T

S

Q

Y

L

A

S

E

D

A

V

L

I

A

D

A

R

L

L

E

E

A

A

D

D

H

H

E

E

F

Y

L

L

L

T

A

E

G

G

D

G

V

V

F

F

S

T

E

N

D

D

F

L

I

I

H

E

N

T

W

W

I

I

A

S

L

F

K

K

N

R

T

E

T

N

E

E

V

I

N

E

Q

P

V

V

A

N

I

I

R

R

P

P

H

H

P

P

Y

Y

E

E

F

F

H

A

L

L

Y

Y

F

Y

D

D

L

V

active site: D53 (= D51), E132 (= E129), E134 (= E131), E218 (= E211), E226 (= E219), H275 (= H268), R346 (= R339), E365 (= E358), R367 (= R360)
binding adenosine monophosphate: Y128 (= Y125), G130 (= G127), E132 (= E129), F231 (= F224), H277 (= H270), S279 (= S272), R363 (= R356)
binding manganese (ii) ion: E132 (= E129), H275 (= H268), E365 (= E358)

2whiA Crystal structure of mycobacterium tuberculosis glutamine synthetase in complex with a purine analogue inhibitor and l-methionine-s- sulfoximine phosphate. (see paper)
54% identity, 100% coverage: 2:474/474 of query aligns to 3:476/476 of 2whiA

query
sites
2whiA

T

T

V

P

Q

D

D

D

V

V

L

F

D

K

L

L

I

A

R

K

D

D

K

E

G

K

I

V

K

E

M

Y

V

V

D

D

F

V

R

R

I

F

V

C

D

D

V

L

P

P

G

G

R

I

Q

M

H

Q

H

H

V

F

T

T

V

I

P

P

A

A

T

S

H

A

V

F

D

D

E

K

E

S

T

V

L

F

R

D

G

G

L

L

P

A

F

F

D
|
D

G

G

S

S

I

I

Q

R

G

G

F

F

R

Q

G

S

I

I

E

H

E

E

S

S

D

D

M

M

V

L

M

L

R

L

P

P

D

D

L

P

D

E

T

T

A

A

F

R

V

I

D

D

P

P

F

F

T

R

K

A

V

A

P

K

T

T

L

L

N

N

L

I

M

N

C

F

D

F

V

V

Y

H

E

D

P

P

S

F

G

T

I

L

R

E

-

P

Y

Y

D

S

R

R

D

D

P

P

R

R

F

N

I

I

A

A

Q

R