SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_013075381.1 NCBI__GCF_000092905.1:WP_013075381.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

8oooA Glutamine synthetase from methanothermococcus thermolithotrophicus in complex with 2-oxoglutarate and mgatp at 2.15 a resolution (see paper)
38% identity, 82% coverage: 84:466/467 of query aligns to 74:447/447 of 8oooA

query
sites
8oooA
L
 
L
Q
 
K
P
 
P
D
 
D
L
 
L
S
 
S
T
 
T
F
 
F
S
 
S
V
 
V
L
 
L
P
 
P
Y
 
W
A
x
R
P
 
P
G
 
S
-
 
E
-
 
K
-
 
S
V
|
V
A
 
A
R
 
R
V
 
V
I
 
I
A
 
C
D
 
D
P
 
V
F
 
Y
E
 
T
A
 
T
K
 
K
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
V
 
F
D
 
E
Y
 
G
A
 
D
P
 
P
R
 
R
H
 
G
V
 
C
L
 
L
R
 
K
R
 
R
V
 
V
L
 
M
E
 
E
R
 
E
A
 
F
R
 
K
A
 
K
A
 
-
G
 
-
F
 
-
Q
 
E
V
 
F
K
 
N
G
 
G
S
 
E
F
 
Y
-
 
F
-
 
V
-
 
G
-
 
P
E
|
E
F
 
P
E
 
E
F
 
F
Y
 
F
A
 
L
F
 
L
A
 
K
R
 
K
D
 
D
G
 
-
D
 
-
S
 
-
R
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
S
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
-
S
 
-
P
 
-
G
 
-
P
 
P
S
 
H
S
 
N
P
 
P
H
 
H
P
 
K
P
 
-
G
 
Y
V
 
I
P
 
P
A
 
A
W
 
D
T
 
D
G
 
G
L
 
G
Q
 
Y
C
 
F
F
 
D
S
 
L
E
 
E
I
 
P
K
 
M
Q
 
D
A
 
E
A
 
A
L
x
P
E
 
D
P
 
-
L
 
I
L
x
R
I
x
R
H
 
D
L
 
I
V
 
V
Q
 
F
T
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
N
M
 
L
G
 
G
A
 
F
R
 
H
P
 
V
E
|
E
V
 
A
A
x
S
N
 
H
T
 
H
E
 
E
Y
 
V
G
 
A
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
F
 
H
E
 
E
I
 
V
S
 
D
Y
x
F
A
x
K
P
x
F
Y
 
D
W
 
D
N
 
A
L
 
L
E
 
K
I
 
T
A
 
A
D
 
D
M
 
S
A
 
V
F
 
I
Y
 
T
Y
 
F
R
 
K
T
 
T
T
 
T
I
 
I
R
 
K
E
 
T
V
 
I
L
 
A
A
 
E
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
L
 
L
K
 
K
A
 
A
T
 
T
F
 
F
M
 
M
S
 
P
K
 
K
P
 
P
L
 
F
S
 
F
G
 
G
F
 
M
S
 
N
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
M
H
 
H
L
 
C
H
|
H
H
 
Q
V
x
S
L
 
I
H
 
W
G
 
-
S
 
L
D
 
N
G
 
G
A
 
E
N
 
P
A
 
S
F
 
F
A
 
Y
D
 
D
P
 
E
K
 
N
A
 
A
R
 
P
D
 
Y
G
 
Q
L
 
L
S
 
S
Q
 
E
L
 
T
C
 
C
R
 
M
W
 
N
F
 
Y
I
 
V
G
 
A
G
 
G
Q
 
I
L
 
L
A
 
K
H
 
H
A
 
A
R
 
K
T
 
A
V
 
I
S
 
V
A
 
A
L
 
I
M
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
T
I
 
V
N
 
N
G
 
S
Y
 
Y
K
 
K
R
 
R
L
 
L
Q
 
V
P
 
P
G
 
G
A
 
Y
F
 
E
A
 
A
P
 
P
H
 
V
W
 
N
I
 
I
T
 
A
W
 
W
G
 
A
Y
 
N
D
 
S
H
 
N
R
 
R
E
 
S
T
 
A
M
 
I
I
 
I
R
|
R
V
 
V
P
 
P
P
 
A
A
 
A
R
 
R
G
 
G
K
 
K
A
 
G
T
 
T
R
|
R
I
 
I
E
 
E
N
 
F
R
 
R
L
 
A
P
 
P
G
 
D
A
 
P
D
 
S
T
 
C
D
 
N
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
L
 
F
A
 
T
A
 
V
A
 
M
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
V
E
 
K
R
 
N
R
 
K
I
 
L
D
 
D
P
 
A
G
 
P
D
 
E
P
 
P
V
 
V
-
 
E
-
 
R
-
 
N
-
 
I
-
 
F
-
 
A
-
 
M
A
 
S
D
 
E
R
 
A
P
 
E
V
 
K
S
 
K
E
 
E
M
 
L
A
 
G
A
 
I
P
 
E
L
 
S
L
 
V
P
 
P
R
 
A
S
 
N
L
 
L
S
 
K
E
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
E
F
 
L
E
 
E
E
 
N
D
 
N
P
 
D
W
 
V
T
 
L
E
 
K
E
 
N
V
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
K
S
 
H
F
 
I
K
 
F
E
 
E
Q
 
S
F
 
F
L
 
L
R
 
E
L
 
I
R
 
K
R
 
N
A
 
A
E
 
E
V
 
W
E
 
D
R
 
S
F
 
F
F
 
R
R
 
T
H
 
S
V
 
V
T
 
T
D
 
D
W
 
W
E
 
E
W
 
T
M
 
T
E
 
A
Y
 
Y
E
 
L
D
 
K
I
 
I

Sites not aligning to the query:

8ooqB Glutamine synthetase from Methanothermococcus thermolithotrophicus (see paper)
38% identity, 82% coverage: 84:466/467 of query aligns to 73:446/446 of 8ooqB

query
sites
8ooqB
L
 
L
Q
 
K
P
 
P
D
 
D
L
 
L
S
 
S
T
 
T
F
 
F
S
 
S
V
 
V
L
 
L
P
 
P
Y
 
W
A
x
R
P
 
P
G
 
S
-
 
E
-
 
K
-
 
S
V
|
V
A
 
A
R
 
R
V
 
V
I
 
I
A
 
C
D
 
D
P
 
V
F
 
Y
E
 
T
A
 
T
K
 
K
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
V
 
F
D
 
E
Y
 
G
A
 
D
P
 
P
R
 
R
H
 
G
V
 
C
L
 
L
R
 
K
R
 
R
V
 
V
L
 
M
E
 
E
R
 
E
A
 
F
R
 
K
A
 
K
A
 
-
G
 
-
F
 
-
Q
 
E
V
 
F
K
 
N
G
 
G
S
 
E
F
 
Y
-
 
F
-
 
V
-
 
G
-
 
P
E
 
E
F
 
P
E
|
E
F
 
F
Y
 
F
A
 
L
F
 
L
A
 
K
R
 
K
D
 
D
G
 
-
D
 
-
S
 
-
R
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
S
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
-
S
 
-
P
 
-
G
 
-
P
 
P
S
 
H
S
 
N
P
 
P
H
 
H
P
 
K
P
 
-
G
 
Y
V
 
I
P
 
P
A
 
A
W
 
D
T
 
D
G
 
G
L
 
G
Q
 
Y
C
 
F
F
 
D
S
 
L
E
 
E
I
 
P
K
 
M
Q
 
D
A
 
E
A
 
A
L
x
P
E
 
D
P
 
-
L
 
I
L
x
R
I
x
R
H
 
D
L
 
I
V
 
V
Q
 
F
T
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
N
M
 
L
G
 
G
A
 
F
R
 
H
P
 
V
E
 
E
V
 
A
A
x
S
N
 
H
T
 
H
E
|
E
Y
 
V
G
 
A
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
F
 
H
E
|
E
I
 
V
S
 
D
Y
 
F
A
 
K
P
 
F
Y
 
D
W
 
D
N
 
A
L
 
L
E
 
K
I
 
T
A
 
A
D
 
D
M
 
S
A
 
V
F
 
I
Y
 
T
Y
 
F
R
 
K
T
 
T
T
 
T
I
 
I
R
 
K
E
 
T
V
 
I
L
 
A
A
 
E
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
L
 
L
K
 
K
A
 
A
T
 
T
F
 
F
M
 
M
S
 
P
K
 
K
P
 
P
L
 
F
S
 
F
G
 
G
F
 
M
S
 
N
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
M
H
 
H
L
 
C
H
 
H
H
 
Q
V
 
S
L
 
I
H
 
W
G
 
-
S
 
L
D
 
N
G
 
G
A
 
E
N
 
P
A
 
S
F
 
F
A
 
Y
D
 
D
P
 
E
K
 
N
A
 
A
R
 
P
D
 
Y
G
 
Q
L
 
L
S
 
S
Q
 
E
L
 
T
C
 
C
R
 
M
W
 
N
F
 
Y
I
 
V
G
 
A
G
 
G
Q
 
I
L
 
L
A
 
K
H
 
H
A
 
A
R
 
K
T
 
A
V
 
I
S
 
V
A
 
A
L
 
I
M
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
T
I
 
V
N
 
N
G
 
S
Y
 
Y
K
 
K
R
 
R
L
 
L
Q
 
V
P
 
P
G
 
G
A
 
Y
F
 
E
A
 
A
P
 
P
H
 
V
W
 
N
I
 
I
T
 
A
W
 
W
G
 
A
Y
 
N
D
 
S
H
 
N
R
 
R
E
 
S
T
 
A
M
 
I
I
 
I
R
 
R
V
 
V
P
 
P
P
 
A
A
 
A
R
 
R
G
 
G
K
 
K
A
 
G
T
 
T
R
 
R
I
 
I
E
 
E
N
 
F
R
 
R
L
 
A
P
 
P
G
 
D
A
 
P
D
 
S
T
 
C
D
 
N
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
L
 
F
A
 
T
A
 
V
A
 
M
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
V
E
 
K
R
 
N
R
 
K
I
 
L
D
 
D
P
 
A
G
 
P
D
 
E
P
 
P
V
 
V
-
 
E
-
 
R
-
 
N
-
 
I
-
 
F
-
 
A
-
 
M
A
 
S
D
 
E
R
 
A
P
 
E
V
 
K
S
 
K
E
 
E
M
 
L
A
 
G
A
 
I
P
 
E
L
 
S
L
 
V
P
 
P
R
 
A
S
 
N
L
 
L
S
 
K
E
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
E
F
 
L
E
 
E
E
 
N
D
 
N
P
 
D
W
 
V
T
 
L
E
 
K
E
 
N
V
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
K
S
 
H
F
 
I
K
 
F
E
 
E
Q
 
S
F
 
F
L
 
L
R
 
E
L
 
I
R
 
K
R
 
N
A
 
A
E
 
E
V
 
W
E
 
D
R
 
S
F
 
F
F
 
R
R
 
T
H
 
S
V
 
V
T
 
T
D
 
D
W
 
W
E
 
E
W
 
T
M
 
T
E
 
A
Y
 
Y
E
 
L
D
 
K
I
 
I

Sites not aligning to the query:

8oozA Glutamine synthetase (see paper)
32% identity, 97% coverage: 9:463/467 of query aligns to 5:426/430 of 8oozA

query
sites
8oozA
E
 
E
V
 
I
Q
 
F
Q
 
R
M
 
I
I
 
V
Q
 
E
A
 
E
H
 
K
Q
 
N
I
 
V
Q
 
R
L
 
F
V
 
V
R
 
R
V
 
L
C
 
Q
V
 
F
Q
 
V
D
 
D
L
 
V
G
 
Q
H
 
G
M
 
I
S
 
P
R
 
K
C
 
N
R
 
V
E
 
A
V
 
I
P
 
P
S
 
V
G
 
G
R
 
Q
F
 
-
L
 
L
E
 
E
R
 
K
M
 
A
A
 
L
T
 
G
D
 
P
G
 
G
L
 
I
S
 
H
F
 
F
P
 
D
S
 
G
A
 
S
L
 
-
F
 
-
A
 
S
F
 
I
D
 
E
S
 
G
S
 
S
A
 
D
R
 
M
I
 
V
V
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
P
 
-
G
 
-
P
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
Y
 
-
P
 
-
S
 
-
W
 
-
H
 
-
L
 
L
Q
 
R
P
 
P
D
 
D
L
 
P
S
 
D
T
 
T
F
 
F
S
 
R
V
 
V
L
 
L
P
 
P
Y
 
W
A
 
S
P
 
T
G
 
A
V
 
E
A
 
A
R
 
R
V
 
L
I
 
I
A
 
C
D
 
D
P
 
I
F
 
E
E
 
L
A
 
P
K
 
D
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
V
 
F
D
 
M
Y
 
G
A
 
C
P
 
P
R
 
R
H
 
Q
V
 
V
L
 
L
R
 
K
R
 
K
V
 
N
L
 
M
E
 
E
R
 
E
A
 
A
R
 
A
A
 
K
A
 
L
G
 
G
F
 
Y
Q
 
V
V
 
M
K
 
N
G
 
T
S
x
G
F
 
P
E
|
E
F
 
M
E
 
E
F
 
F
Y
 
F
A
 
L
F
 
F
A
 
K
R
 
R
-
 
Q
D
 
D
G
 
G
D
 
-
S
 
-
R
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
S
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
-
S
 
-
P
 
-
G
 
-
P
 
-
S
 
-
S
 
-
P
 
-
H
 
M
P
 
P
P
 
T
G
 
N
V
 
I
P
 
P
A
 
Q
W
 
D
T
 
R
G
 
G
-
 
G
-
 
Y
-
 
F
-
 
D
-
 
L
-
 
A
-
 
P
L
 
I
Q
 
D
C
 
L
F
 
A
S
 
E
E
 
E
I
 
I
K
 
K
Q
 
R
A
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
-
I
 
-
H
 
E
L
 
I
V
 
V
Q
 
L
T
 
V
L
 
L
E
 
E
A
 
E
M
 
M
G
 
G
A
 
F
R
 
E
P
 
V
E
|
E
V
 
A
A
 
A
N
 
H
T
 
H
E
 
E
Y
 
V
G
 
A
P
 
F
G
 
G
Q
 
Q
F
 
H
E
 
E
I
 
I
S
 
D
Y
x
F
A
x
K
P
x
Y
Y
 
D
W
 
N
N
 
A
L
 
L
E
 
A
I
 
T
A
 
A
D
 
D
M
 
N
A
 
V
F
 
I
Y
 
T
Y
 
L
R
 
K
T
 
Y
T
 
V
I
 
A
R
 
K
E
 
T
V
 
L
L
 
A
A
 
L
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
L
 
L
K
 
H
A
 
A
T
 
T
F
 
F
M
 
M
S
 
P
K
 
K
P
 
P
L
 
I
S
 
F
G
 
G
F
 
V
S
 
N
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
M
H
|
H
L
 
T
H
x
N
H
 
T
V
x
S
L
 
L
H
 
F
G
 
-
S
 
K
D
 
D
G
 
G
A
 
K
N
 
N
A
 
A
F
 
F
A
 
Y
D
 
D
P
 
P
K
 
D
A
 
A
R
 
P
D
 
D
G
 
Q
L
 
I
S
 
S
Q
 
D
L
 
T
C
 
L
R
 
R
W
 
Y
F
 
F
I
 
V
G
 
G
G
 
G
Q
 
V
L
 
L
A
 
K
H
 
H
A
 
I
R
 
R
T
 
A
V
 
I
S
 
T
A
 
A
L
 
I
M
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
L
I
 
V
N
 
N
G
 
S
Y
 
Y
K
 
K
R
 
R
L
 
L
Q
 
V
P
 
P
G
 
G
A
 
Y
F
 
E
A
 
A
P
 
P
H
 
V
W
 
Y
I
 
I
T
 
T
W
 
W
G
 
S
Y
 
G
D
 
P
H
 
N
R
 
R
E
 
S
T
 
S
M
 
L
I
 
I
R
 
R
V
 
V
P
 
P
P
 
A
A
 
P
R
 
R
G
 
G
K
 
N
A
x
S
T
 
T
R
|
R
I
 
I
E
|
E
N
 
I
R
 
R
L
 
S
P
 
P
G
 
D
A
 
P
D
 
S
T
 
C
D
 
N
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
L
 
F
A
 
A
A
 
A
A
 
I
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
V
E
 
K
R
 
N
R
 
K
I
 
I
D
 
E
P
 
P
G
 
P
D
 
E
P
 
R
V
 
V
-
 
E
-
 
K
-
 
N
-
 
I
-
 
Y
-
 
K
-
 
L
A
 
T
D
 
E
R
 
E
P
 
E
V
 
R
S
 
E
E
 
K
M
 
L
A
 
G
A
 
I
P
 
G
L
 
M
L
 
L
P
 
P
R
 
G
S
 
T
L
 
L
S
 
K
E
 
E
A
 
A
L
 
I
D
 
E
A
 
C
F
 
F
E
 
K
E
 
E
D
 
D
P
 
E
W
 
L
T
 
L
E
 
V
E
 
S
V
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
E
S
 
H
F
 
V
K
 
S
E
 
Q
Q
 
S
F
 
I
L
 
I
R
 
N
L
 
V
R
 
A
R
 
M
A
 
A
E
 
D
V
 
W
E
 
D
R
 
S
F
 
Y
F
 
R
R
 
T
H
 
Q
V
 
V
T
 
H
D
 
Q
W
 
W
E
 
E
W
 
L
M
 
D
E
 
R
Y
 
Y

8ooxB Glutamine synthetase (see paper)
32% identity, 97% coverage: 9:463/467 of query aligns to 5:434/438 of 8ooxB

query
sites
8ooxB
E
 
E
V
 
I
Q
 
F
Q
 
R
M
 
I
I
 
V
Q
 
E
A
 
E
H
 
K
Q
 
N
I
 
V
Q
 
R
L
 
F
V
 
V
R
 
R
V
 
L
C
 
Q
V
 
F
Q
 
V
D
 
D
L
 
V
G
 
Q
H
 
G
M
 
I
S
 
P
R
 
K
C
 
N
R
 
V
E
 
A
V
 
I
P
 
P
S
 
V
G
 
G
R
 
Q
F
 
-
L
 
L
E
 
E
R
 
K
M
 
A
A
 
L
T
 
G
D
 
P
G
 
G
L
 
I
S
 
H
F
 
F
P
 
D
S
 
G
A
 
S
L
 
-
F
 
-
A
 
S
F
 
I
D
 
E
S
 
G
S
 
F
A
 
V
R
 
R
I
 
I
V
 
E
P
 
E
G
 
S
A
 
-
G
 
-
P
 
-
G
 
-
P
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
Y
 
-
P
 
-
S
 
D
W
 
M
H
 
V
L
 
L
Q
 
R
P
 
P
D
 
D
L
 
P
S
 
D
T
 
T
F
 
F
S
 
R
V
 
V
L
 
L
P
 
P
Y
 
W
A
 
S
P
 
G
G
 
N
V
 
T
A
 
A
-
 
E
-
 
A
R
 
R
V
 
L
I
 
I
A
 
C
D
 
D
P
 
I
F
 
E
E
 
L
A
 
P
K
 
D
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
V
 
F
D
 
M
Y
 
G
A
 
C
P
 
P
R
 
R
H
 
Q
V
 
V
L
 
L
R
 
K
R
 
K
V
 
N
L
 
M
E
 
E
R
 
E
A
 
A
R
 
A
A
 
K
A
 
L
G
 
G
F
 
Y
Q
 
V
V
 
M
K
 
N
G
 
T
S
 
G
F
 
P
E
 
E
F
 
M
E
|
E
F
 
F
Y
 
F
A
 
L
F
 
F
A
 
K
R
 
R
-
 
Q
D
 
D
G
 
G
D
 
-
S
 
-
R
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
S
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
-
S
 
-
P
 
-
G
 
-
P
 
-
S
 
-
S
 
-
P
 
-
H
 
M
P
 
P
P
 
T
G
 
N
V
 
I
P
 
P
A
 
Q
W
 
D
T
 
R
G
 
G
-
 
G
-
 
Y
-
 
F
-
 
D
-
 
L
-
 
A
-
 
P
L
 
I
Q
 
D
C
 
L
F
 
A
S
 
E
E
 
E
I
 
I
K
 
K
Q
 
R
A
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
-
I
 
-
H
 
E
L
 
I
V
 
V
Q
 
L
T
 
V
L
 
L
E
 
E
A
 
E
M
 
M
G
 
G
A
 
F
R
 
E
P
 
V
E
 
E
V
 
A
A
 
A
N
 
H
T
 
H
E
|
E
Y
 
V
G
 
A
P
 
F
G
 
G
Q
 
Q
F
 
H
E
|
E
I
 
I
S
 
D
Y
 
F
A
 
K
P
 
Y
Y
 
D
W
 
N
N
 
A
L
 
L
E
 
A
I
 
T
A
 
A
D
 
D
M
 
N
A
 
V
F
 
I
Y
 
T
Y
 
L
R
 
K
T
 
Y
T
 
V
I
 
A
R
 
K
E
 
T
V
 
L
L
 
A
A
 
L
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
L
 
L
K
 
H
A
 
A
T
 
T
F
 
F
M
 
M
S
 
P
K
 
K
P
 
P
L
 
I
S
 
F
G
 
G
F
 
V
S
 
N
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
M
H
 
H
L
 
T
H
 
N
H
 
T
V
 
S
L
 
L
H
 
F
G
 
-
S
 
K
D
 
D
G
 
G
A
 
K
N
 
N
A
 
A
F
 
F
A
 
Y
D
 
D
P
 
P
K
 
D
A
 
A
R
 
P
D
 
D
G
 
Q
L
 
I
S
 
S
Q
 
D
L
 
T
C
 
L
R
 
R
W
 
Y
F
 
F
I
 
V
G
 
G
G
 
G
Q
 
V
L
 
L
A
 
K
H
 
H
A
 
I
R
 
R
T
 
A
V
 
I
S
 
T
A
 
A
L
 
I
M
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
L
I
 
V
N
 
N
G
 
S
Y
 
Y
K
 
K
R
 
R
L
 
L
Q
 
V
P
 
P
G
 
G
A
 
Y
F
 
E
A
 
A
P
 
P
H
 
V
W
 
Y
I
 
I
T
 
T
W
 
W
G
 
S
Y
 
G
D
 
P
H
 
N
R
 
R
E
 
S
T
 
S
M
 
L
I
 
I
R
 
R
V
 
V
P
 
P
P
 
A
A
 
P
R
 
R
G
 
G
K
 
N
A
 
S
T
 
T
R
 
R
I
 
I
E
 
E
N
 
I
R
 
R
L
 
S
P
 
P
G
 
D
A
 
P
D
 
S
T
 
C
D
 
N
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
L
 
F
A
 
A
A
 
A
A
 
I
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
V
E
 
K
R
 
N
R
 
K
I
 
I
D
 
E
P
 
P
G
 
P
D
 
E
P
 
R
V
 
V
-
 
E
-
 
K
-
 
N
-
 
I
-
 
Y
-
 
K
-
 
L
A
 
T
D
 
E
R
 
E
P
 
E
V
 
R
S
 
E
E
 
K
M
 
L
A
 
G
A
 
I
P
 
G
L
 
M
L
 
L
P
 
P
R
 
G
S
 
T
L
 
L
S
 
K
E
 
E
A
 
A
L
 
I
D
 
E
A
 
C
F
 
F
E
 
K
E
 
E
D
 
D
P
 
E
W
 
L
T
 
L
E
 
V
E
 
S
V
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
E
S
 
H
F
 
V
K
 
S
E
 
Q
Q
 
S
F
 
I
L
 
I
R
 
N
L
 
V
R
 
A
R
 
M
A
 
A
E
 
D
V
 
W
E
 
D
R
 
S
F
 
Y
F
 
R
R
 
T
H
 
Q
V
 
V
T
 
H
D
 
Q
W
 
W
E
 
E
W
 
L
M
 
D
E
 
R
Y
 
Y

7tdpA Structure of paenibacillus polymyxa gs bound to met-sox-p-adp (transition state complex) to 1.98 angstom (see paper)
31% identity, 99% coverage: 8:467/467 of query aligns to 5:439/439 of 7tdpA

query
sites
7tdpA
Q
 
E
E
 
D
V
 
I
Q
 
I
Q
 
R
M
 
I
I
 
A
Q
 
E
A
 
E
H
 
E
Q
 
N
I
 
V
Q
 
R
L
 
F
V
 
I
R
 
R
V
 
L
C
 
Q
V
 
F
Q
 
T
D
 
D
L
 
L
G
 
L
H
 
G
M
 
T
S
 
I
R
 
K
C
 
N
R
 
V
E
 
E
V
 
I
P
 
P
S
 
V
G
 
S
R
 
Q
F
 
-
L
 
L
E
 
E
R
 
K
M
 
A
A
 
L
T
 
D
D
 
N
G
 
K
L
 
M
S
 
M
F
 
F
P
 
D
S
 
G
A
 
S
L
 
-
F
 
-
A
 
S
F
 
I
D
 
E
S
 
G
S
 
Y
A
 
V
R
 
R
I
 
I
V
 
E
P
 
E
G
 
S
A
 
-
G
 
-
P
 
-
G
 
-
P
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
Y
 
-
P
 
-
S
 
D
W
 
M
H
 
Y
L
 
L
Q
 
Y
P
 
P
D
 
D
L
 
L
S
 
D
T
 
T
F
 
W
S
 
V
V
 
V
L
 
F
P
 
P
Y
 
W
A
 
S
P
 
D
G
 
R
V
 
V
A
 
A
R
 
R
V
 
L
I
 
I
A
 
C
D
 
D
P
 
I
F
 
Y
E
 
K
A
 
P
K
 
D
G
 
G
Q
 
S
P
 
P
V
 
F
D
 
A
Y
 
G
A
 
D
P
 
P
R
 
R
H
 
G
V
 
I
L
 
L
R
 
K
R
 
R
V
 
V
L
 
L
E
 
K
R
 
E
A
 
A
R
 
E
A
 
E
A
 
L
G
 
G
F
 
Y
-
 
T
Q
 
S
V
 
M
K
x
N
G
 
V
S
x
G
F
 
P
E
|
E
F
 
P
E
|
E
F
 
F
Y
 
F
A
 
L
F
 
F
A
 
K
R
 
T
D
 
D
-
 
E
-
 
K
G
 
G
D
 
D
S
 
P
R
 
T
G
 
T
Q
 
E
A
 
L
P
 
-
V
 
-
S
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
-
S
 
-
P
 
-
G
 
N
P
 
D
S
 
Q
S
 
G
P
 
G
H
 
Y
P
 
F
P
 
D
G
 
L
V
 
A
P
 
P
A
 
M
W
 
D
T
 
L
G
 
G
L
 
E
Q
 
N
C
 
C
F
 
R
S
 
R
E
 
E
I
 
I
K
 
-
Q
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
-
I
 
-
H
 
-
L
 
-
V
 
V
Q
 
L
T
 
K
L
 
L
E
 
E
A
 
E
M
 
M
G
 
G
A
 
F
R
 
E
P
 
I
E
|
E
V
 
A
A
 
S
N
 
H
T
 
H
E
|
E
Y
 
V
G
 
A
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
F
 
H
E
|
E
I
 
I
S
x
D
Y
 
F
A
 
K
P
x
Y
Y
 
A
W
 
D
N
 
A
L
 
V
E
 
K
I
 
A
A
 
A
D
 
D
M
 
Q
A
 
I
F
 
Q
Y
 
T
Y
 
F
R
 
K
T
 
L
T
 
V
I
 
V
R
 
K
E
 
T
V
 
I
L
 
A
A
 
R
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
L
 
L
K
 
H
A
 
A
T
 
T
F
 
F
M
 
M
S
 
P
K
 
K
P
 
P
L
 
L
S
 
F
G
 
G
F
 
V
S
 
N
G
|
G
S
 
S
G
 
G
A
 
M
H
|
H
L
 
C
H
x
N
H
 
Q
V
x
S
L
 
L
H
 
F
G
 
-
S
 
K
D
 
D
G
 
N
A
 
E
N
 
N
A
 
V
F
 
F
A
 
Y
D
 
D
P
 
E
K
 
T
A
 
D
R
 
E
D
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
S
Q
 
Q
L
 
T
C
 
A
R
 
R
W
 
H
F
 
Y
I
 
M
G
 
A
G
 
G
Q
 
I
L
 
L
A
 
K
H
 
H
A
 
A
R
 
R
T
 
A
V
 
M
S
 
A
A
 
A
L
 
I
M
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
T
I
 
V
N
 
N
G
 
S
Y
 
Y
K
 
K
R
|
R
L
 
L
Q
 
V
P
 
P
G
 
G
A
 
Y
F
x
E
A
 
A
P
 
P
H
 
C
W
 
Y
I
 
V
T
 
A
W
 
W
G
 
S
Y
 
A
D
 
S
H
 
N
R
|
R
E
 
S
T
 
P
M
 
M
I
 
I
R
|
R
V
 
I
P
 
P
P
 
A
A
 
S
R
 
R
G
 
G
K
 
L
A
 
S
T
 
T
R
|
R
I
 
V
E
|
E
N
 
V
R
|
R
L
 
N
P
 
P
G
 
D
A
 
P
D
 
A
T
 
A
D
 
N
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
V
A
 
M
L
 
L
A
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
I
E
 
K
R
 
R
R
 
Q
I
 
M
D
 
A
P
 
L
G
 
P
D
 
A
P
 
P
V
 
I
A
 
-
D
 
D
R
 
R
P
 
N
V
 
I
S
 
Y
E
 
V
M
 
M
A
 
S
-
 
E
-
 
E
-
 
E
-
 
R
-
 
I
-
 
E
-
 
E
-
 
G
A
 
I
P
 
P
L
 
S
L
 
L
P
 
P
R
 
A
S
 
D
L
 
L
S
 
K
E
 
E
A
 
A
L
 
L
D
 
S
A
 
E
F
 
L
E
 
I
E
 
R
D
 
S
P
 
E
W
 
V
T
 
I
E
 
S
E
 
D
V
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
D
S
 
H
F
 
A
K
 
L
E
 
A
Q
 
Y
F
 
F
L
 
Y
R
 
E
L
 
L
R
 
K
R
 
E
A
 
I
E
 
E
V
 
W
E
 
D
R
 
M
F
 
Y
F
 
R
R
 
T
H
 
Q
V
 
V
T
 
H
D
 
Q
W
 
W
E
 
E
W
 
R
M
 
D
E
 
Q
Y
 
Y
E
 
L
D
 
T
I
 
L
F
 
Y

7tfaB Glutamine synthetase (see paper)
31% identity, 99% coverage: 8:467/467 of query aligns to 5:441/441 of 7tfaB

query
sites
7tfaB
Q
 
E
E
 
D
V
 
I
Q
 
I
Q
 
R
M
 
I
I
 
A
Q
 
E
A
 
E
H
 
E
Q
 
N
I
 
V
Q
 
R
L
 
F
V
 
I
R
 
R
V
 
L
C
 
Q
V
 
F
Q
 
T
D
 
D
L
 
L
G
 
L
H
 
G
M
 
T
S
 
I
R
 
K
C
 
N
R
 
V
E
 
E
V
 
I
P
 
P
S
 
V
G
 
S
R
 
Q
F
 
-
L
 
L
E
 
E
R
 
K
M
 
A
A
 
L
T
 
D
D
 
N
G
 
K
L
 
M
S
 
M
F
 
F
P
 
D
S
 
G
A
 
S
L
 
-
F
 
-
A
 
S
F
 
I
D
 
E
S
 
G
S
x
Y
A
 
V
R
|
R
I
 
I
V
 
E
P
 
E
G
 
S
A
 
-
G
 
-
P
 
-
G
 
-
P
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
Y
 
-
P
 
-
S
 
D
W
 
M
H
 
Y
L
 
L
Q
 
Y
P
 
P
D
 
D
L
 
L
S
 
D
T
 
T
F
 
W
S
 
V
V
 
V
L
 
F
P
 
P
Y
 
W
A
 
V
P
 
T
G
 
S
-
 
D
-
 
R
V
 
V
A
 
A
R
 
R
V
 
L
I
 
I
A
 
C
D
 
D
P
 
I
F
 
Y
E
 
K
A
 
P
K
 
D
G
 
G
Q
 
S
P
 
P
V
 
F
D
 
A
Y
 
G
A
 
D
P
 
P
R
 
R
H
 
G
V
 
I
L
 
L
R
 
K
R
 
R
V
 
V
L
 
L
E
 
K
R
 
E
A
 
A
R
 
E
A
 
E
A
 
L
G
 
G
F
 
Y
-
 
T
Q
 
S
V
 
M
K
 
N
G
 
V
S
 
G
F
 
P
E
|
E
F
 
P
E
|
E
F
 
F
Y
 
F
A
 
L
F
 
F
A
 
K
R
 
T
D
 
D
-
 
E
-
 
K
G
 
G
D
 
D
S
 
P
R
 
T
G
 
T
Q
 
E
A
 
L
P
 
-
V
 
-
S
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
-
S
 
-
P
 
-
G
 
N
P
 
D
S
 
Q
S
 
G
P
 
G
H
x
Y
P
 
F
P
 
D
G
 
L
V
 
A
P
 
P
A
 
M
W
 
D
T
 
L
G
 
G
L
 
E
Q
 
N
C
 
C
F
 
R
S
 
R
E
 
E
I
 
I
K
 
-
Q
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
-
I
 
-
H
 
-
L
 
-
V
 
V
Q
 
L
T
 
K
L
 
L
E
 
E
A
 
E
M
 
M
G
 
G
A
 
F
R
 
E
P
 
I
E
 
E
V
 
A
A
 
S
N
 
H
T
 
H
E
|
E
Y
x
V
G
 
A
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
F
 
H
E
|
E
I
 
I
S
 
D
Y
 
F
A
 
K
P
 
Y
Y
 
A
W
 
D
N
 
A
L
 
V
E
 
K
I
 
A
A
 
A
D
 
D
M
 
Q
A
 
I
F
 
Q
Y
 
T
Y
 
F
R
 
K
T
 
L
T
 
V
I
 
V
R
 
K
E
 
T
V
 
I
L
 
A
A
 
R
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
L
 
L
K
 
H
A
 
A
T
 
T
F
 
F
M
 
M
S
 
P
K
 
K
P
 
P
L
 
L
S
 
F
G
 
G
F
 
V
S
x
N
G
|
G
S
 
S
G
 
G
A
 
M
H
|
H
L
 
C
H
 
N
H
 
Q
V
 
S
L
 
L
H
 
F
G
 
-
S
 
K
D
 
D
G
 
N
A
 
E
N
 
N
A
 
V
F
 
F
A
 
Y
D
 
D
P
 
E
K
 
T
A
 
D
R
 
E
D
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
S
Q
 
Q
L
 
T
C
 
A
R
 
R
W
 
H
F
 
Y
I
 
M
G
 
A
G
 
G
Q
 
I
L
 
L
A
 
K
H
 
H
A
 
A
R
 
R
T
 
A
V
 
M
S
 
A
A
 
A
L
 
I
M
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
T
I
 
V
N
 
N
G
 
S
Y
 
Y
K
 
K
R
|
R
L
 
L
Q
 
V
P
 
P
G
|
G
A
x
Y
F
x
E
A
 
A
P
 
P
H
 
C
W
 
Y
I
 
V
T
 
A
W
 
W
G
 
S
Y
 
A
D
 
S
H
 
N
R
|
R
E
 
S
T
 
P
M
 
M
I
 
I
R
 
R
V
 
I
P
 
P
P
 
A
A
 
S
R
 
R
G
 
G
K
 
L
A
 
S
T
 
T
R
 
R
I
 
V
E
|
E
N
 
V
R
 
R
L
 
N
P
 
P
G
 
D
A
 
P
D
 
A
T
 
A
D
 
N
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
V
A
 
M
L
 
L
A
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
I
E
 
K
R
 
R
R
 
Q
I
 
M
D
 
A
P
 
L
G
 
P
D
 
A
P
 
P
V
 
I
A
 
-
D
 
D
R
 
R
P
 
N
V
 
I
S
 
Y
E
 
V
M
 
M
A
 
S
-
 
E
-
 
E
-
 
E
-
 
R
-
 
I
-
 
E
-
 
E
-
 
G
A
 
I
P
 
P
L
 
S
L
 
L
P
 
P
R
 
A
S
 
D
L
 
L
S
 
K
E
 
E
A
 
A
L
 
L
D
 
S
A
 
E
F
 
L
E
 
I
E
 
R
D
 
S
P
 
E
W
 
V
T
 
I
E
 
S
E
 
D
V
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
D
S
 
H
F
 
A
K
 
L
E
 
A
Q
 
Y
F
 
F
L
 
Y
R
 
E
L
 
L
R
 
K
R
 
E
A
 
I
E
 
E
V
 
W
E
 
D
R
x
M
F
 
Y
F
 
R
R
 
T
H
 
Q
V
 
V
T
 
H
D
 
Q
W
 
W
E
 
E
W
 
R
M
 
D
E
 
Q
Y
 
Y
E
 
L
D
 
T
I
 
L
F
 
Y

8ufjB Glutamine synthetase (see paper)
30% identity, 98% coverage: 8:463/467 of query aligns to 8:440/444 of 8ufjB

query
sites
8ufjB
Q
 
E
E
 
D
V
 
V
Q
 
L
Q
 
E
M
 
A
I
 
V
Q
 
K
A
 
E
H
 
R
Q
 
D
I
 
V
Q
 
K
L
 
F
V
 
I
R
 
R
V
 
T
C
 
Q
V
 
F
Q
 
T
D
 
D
L
 
T
G
 
L
H
 
G
M
 
I
S
 
I
R
 
K
C
 
S
R
 
W
E
 
A
V
 
I
P
 
P
S
 
A
G
 
E
R
 
Q
F
 
-
L
 
L
E
 
E
R
 
E
M
 
A
A
 
F
T
 
E
D
 
N
G
 
G
L
 
V
S
 
M
F
 
F
P
 
D
-
 
G
S
 
S
A
 
S
L
 
I
F
 
Q
A
 
G
F
 
F
D
 
-
S
 
-
S
 
-
A
 
-
R
 
-
I
 
-
V
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
P
 
-
G
 
-
P
 
T
R
 
R
S
 
I
G
 
E
Y
 
E
P
 
S
S
 
D
W
 
M
H
 
K
L
 
L
Q
 
A
P
 
L
D
 
D
L
 
P
S
 
S
T
 
T
F
 
F
S
 
R
V
 
I
L
 
L
P
 
P
Y
 
W
A
 
R
P
 
P
G
 
A
-
 
T
-
 
G
-
 
A
V
 
V
A
 
A
R
 
R
V
 
I
I
 
L
A
 
G
D
 
D
P
 
V
F
 
Y
E
 
L
A
 
P
K
 
D
G
 
G
Q
 
N
P
 
P
V
 
F
D
 
K
Y
 
G
A
 
D
P
 
P
R
 
R
H
 
Y
V
 
V
L
 
L
R
 
K
R
 
T
V
 
A
L
 
I
E
 
K
R
 
E
A
 
A
R
 
E
A
 
K
A
 
M
G
 
G
F
 
F
Q
 
S
V
 
M
K
 
N
G
 
V
S
 
G
F
 
P
E
|
E
F
 
L
E
|
E
F
 
F
Y
 
F
A
 
L
F
 
F
A
 
K
R
 
L
D
 
D
G
 
A
D
 
N
S
 
G
R
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
S
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
-
S
 
N
P
 
P
G
 
T
P
 
T
S
 
E
S
 
L
P
 
T
H
 
D
P
 
Q
P
 
G
G
 
G
V
 
Y
P
 
F
A
 
D
W
 
F
T
 
A
G
 
P
L
 
L
Q
 
D
C
 
L
F
 
G
S
 
Q
E
 
D
I
 
V
K
 
R
Q
 
R
A
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
-
I
 
-
H
 
D
L
 
I
V
 
D
Q
 
Y
T
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
H
M
 
M
G
 
G
A
 
F
R
 
Q
P
 
I
E
 
E
V
 
A
A
 
S
N
 
H
T
 
H
E
|
E
Y
 
V
G
 
A
P
 
P
G
 
S
Q
 
Q
F
 
H
E
|
E
I
 
I
S
 
D
Y
 
F
A
 
R
P
 
F
Y
 
G
W
 
D
N
 
V
L
 
L
E
 
C
I
 
T
A
 
A
D
 
D
M
 
N
A
 
V
F
 
V
Y
 
T
Y
 
F
R
 
K
T
 
Y
T
 
V
I
 
V
R
 
K
E
 
S
V
 
I
L
 
A
A
 
Y
Q
 
H
H
 
K
G
 
G
L
 
Y
K
 
Y
A
 
A
T
 
S
F
 
F
M
 
M
S
 
P
K
 
K
P
 
P
L
 
L
S
 
F
G
 
G
F
 
V
S
 
N
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
M
H
|
H
L
 
S
H
 
N
H
 
Q
V
 
S
L
 
L
H
 
F
G
 
-
S
 
K
D
 
D
G
 
G
A
 
K
N
 
N
A
 
V
F
 
F
A
 
Y
D
 
D
P
 
P
K
 
D
A
 
T
R
 
P
D
 
T
G
 
K
L
 
L
S
 
S
Q
 
Q
L
 
D
C
 
A
R
 
M
W
 
Y
F
 
Y
I
 
I
G
 
G
G
 
G
Q
 
L
L
 
L
A
 
K
H
 
H
A
 
I
R
 
R
T
 
E
V
 
F
S
 
T
A
 
A
L
 
V
M
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
V
I
 
V
N
 
N
G
 
S
Y
 
Y
K
 
K
R
 
R
L
 
L
Q
 
V
P
 
P
G
 
G
A
 
Y
F
 
E
A
 
A
P
 
P
H
 
V
W
 
Y
I
 
I
T
 
S
W
 
W
G
 
S
Y
 
A
D
 
Q
H
 
N
R
 
R
E
 
S
T
 
S
M
 
L
I
 
I
R
 
R
V
 
I
P
 
P
P
 
A
A
 
T
R
 
R
G
 
G
K
 
N
A
 
G
T
 
T
R
 
R
I
 
I
E
|
E
N
 
L
R
 
R
L
 
C
P
 
P
G
 
D
A
 
P
D
 
A
T
 
C
D
 
N
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
L
 
F
A
 
A
A
 
L
A
 
M
L
 
L
A
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
E
G
 
G
I
 
I
E
 
K
R
 
N
R
 
K
I
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
G
D
 
E
P
 
P
-
 
T
-
 
N
-
 
V
-
 
N
-
 
I
-
 
F
-
 
H
V
 
L
A
 
S
D
 
D
R
 
K
P
 
E
V
 
R
S
 
E
E
 
E
M
 
R
A
 
G
A
 
I
P
 
R
L
 
S
L
 
L
P
 
P
R
 
A
S
 
D
L
 
L
S
 
K
E
 
E
A
 
A
L
 
I
D
 
D
A
 
E
F
 
M
E
 
K
E
 
G
D
 
S
P
 
K
W
 
F
T
 
V
E
 
K
E
 
E
V
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
E
S
 
H
F
 
V
K
 
F
E
 
S
Q
 
H
F
 
Y
L
 
L
R
 
C
L
 
A
R
 
K
R
 
E
A
 
M
E
 
E
V
 
W
E
 
D
R
 
E
F
 
Y
F
 
K
R
 
A
H
 
V
V
 
V
T
 
H
D
 
P
W
 
W
E
 
E
W
 
L
M
 
S
E
 
R
Y
 
Y

8tfkA Glutamine synthetase (see paper)
30% identity, 98% coverage: 8:463/467 of query aligns to 4:436/440 of 8tfkA

query
sites
8tfkA
Q
 
E
E
 
D
V
 
V
Q
 
L
Q
 
E
M
 
A
I
 
V
Q
 
K
A
 
E
H
 
R
Q
 
D
I
 
V
Q
 
K
L
 
F
V
 
I
R
 
R
V
 
T
C
 
Q
V
 
F
Q
 
T
D
 
D
L
 
T
G
 
L
H
 
G
M
 
I
S
 
I
R
 
K
C
 
S
R
 
W
E
 
A
V
 
I
P
 
P
S
 
A
G
 
E
R
 
Q
F
 
-
L
 
L
E
 
E
R
 
E
M
 
A
A
 
F
T
 
E
D
 
N
G
 
G
L
 
V
S
 
M
F
 
F
P
 
D
-
 
G
S
 
S
A
 
S
L
 
I
F
 
Q
A
 
G
F
 
F
D
 
-
S
 
-
S
 
-
A
 
-
R
 
-
I
 
-
V
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
P
 
-
G
 
-
P
 
T
R
 
R
S
 
I
G
 
E
Y
 
E
P
 
S
S
 
D
W
 
M
H
 
K
L
 
L
Q
 
A
P
 
L
D
 
D
L
 
P
S
 
S
T
 
T
F
 
F
S
 
R
V
 
I
L
 
L
P
 
P
Y
 
W
A
 
R
P
 
P
G
 
A
-
 
T
-
 
G
-
 
A
V
 
V
A
 
A
R
 
R
V
 
I
I
 
L
A
 
G
D
 
D
P
 
V
F
 
Y
E
 
L
A
 
P
K
 
D
G
 
G
Q
 
N
P
 
P
V
 
F
D
 
K
Y
 
G
A
 
D
P
 
P
R
 
R
H
 
Y
V
 
V
L
 
L
R
 
K
R
 
T
V
 
A
L
 
I
E
 
K
R
 
E
A
 
A
R
 
E
A
 
K
A
 
M
G
 
G
F
 
F
Q
 
S
V
 
M
K
 
N
G
 
V
S
 
G
F
 
P
E
|
E
F
 
L
E
|
E
F
 
F
Y
 
F
A
 
L
F
 
F
A
 
K
R
 
L
D
 
D
G
 
A
D
 
N
S
 
G
R
 
N
G
 
P
Q
 
T
A
 
T
P
 
E
V
 
L
S
 
T
P
 
D
D
 
Q
A
 
G
I
 
-
S
 
-
P
 
-
G
 
-
P
 
-
S
 
-
S
 
-
P
 
-
H
 
-
P
 
-
P
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
-
A
 
-
W
 
-
T
 
-
G
 
G
L
 
Y
Q
 
F
C
 
D
F
 
F
S
 
A
E
 
P
I
 
L
K
 
D
Q
 
R
A
 
A
A
 
-
L
 
-
E
 
Q
P
 
D
L
 
V
L
 
R
I
 
R
H
 
D
L
 
I
V
 
D
Q
 
Y
T
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
H
M
 
M
G
 
G
A
 
F
R
 
Q
P
 
I
E
 
E
V
 
A
A
 
S
N
 
H
T
 
H
E
|
E
Y
 
V
G
 
A
P
 
P
G
 
S
Q
 
Q
F
 
H
E
|
E
I
 
I
S
x
D
Y
x
F
A
 
R
P
x
F
Y
 
G
W
 
D
N
 
V
L
 
L
E
 
C
I
 
T
A
 
A
D
 
D
M
 
N
A
 
V
F
 
V
Y
 
T
Y
 
F
R
 
K
T
 
Y
T
 
V
I
 
V
R
 
K
E
 
S
V
 
I
L
 
A
A
 
Y
Q
 
H
H
 
K
G
 
G
L
 
Y
K
 
Y
A
 
A
T
 
S
F
 
F
M
 
M
S
 
P
K
 
K
P
 
P
L
 
L
S
 
F
G
 
G
F
 
V
S
 
N
G
|
G
S
 
S
G
 
G
A
 
M
H
|
H
L
 
S
H
x
N
H
 
Q
V
 
S
L
 
L
H
 
F
G
 
-
S
 
K
D
 
D
G
 
G
A
 
K
N
 
N
A
 
V
F
 
F
A
 
Y
D
 
D
P
 
P
K
 
D
A
 
T
R
 
P
D
 
T
G
 
K
L
 
L
S
 
S
Q
 
Q
L
 
D
C
 
A
R
 
M
W
 
Y
F
 
Y
I
 
I
G
 
G
G
 
G
Q
 
L
L
 
L
A
 
K
H
 
H
A
 
I
R
 
R
T
 
E
V
 
F
S
 
T
A
 
A
L
 
V
M
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
V
I
 
V
N
 
N
G
 
S
Y
 
Y
K
 
K
R
|
R
L
 
L
Q
 
V
P
 
P
G
 
G
A
 
Y
F
x
E
A
 
A
P
 
P
H
 
V
W
 
Y
I
 
I
T
 
S
W
 
W
G
 
S
Y
 
A
D
 
Q
H
 
N
R
|
R
E
 
S
T
 
S
M
 
L
I
 
I
R
|
R
V
 
I
P
 
P
P
 
A
A
 
T
R
 
R
G
 
G
K
 
N
A
x
G
T
 
T
R
|
R
I
 
I
E
|
E
N
 
L
R
|
R
L
 
C
P
 
P
G
 
D
A
 
P
D
 
A
T
 
C
D
 
N
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
L
 
F
A
 
A
A
 
L
A
 
M
L
 
L
A
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
E
G
 
G
I
 
I
E
 
K
R
 
N
R
 
K
I
 
I
D
 
D
P
 
P
G
 
G
D
 
E
P
 
P
-
 
T
-
 
N
-
 
V
-
 
N
-
 
I
-
 
F
-
 
H
V
 
L
A
 
S
D
 
D
R
 
K
P
 
E
V
 
R
S
 
E
E
 
E
M
 
R
A
 
G
A
 
I
P
 
R
L
 
S
L
 
L
P
 
P
R
 
A
S
 
D
L
 
L
S
 
K
E
 
E
A
 
A
L
 
I
D
 
D
A
 
E
F
 
M
E
 
K
E
 
G
D
 
S
P
 
K
W
 
F
T
 
V
E
 
K
E
 
E
V
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
E
S
 
H
F
 
V
K
 
F
E
 
S
Q
 
H
F
 
Y
L
 
L
R
 
C
L
 
A
R
 
K
R
 
E
A
 
M
E
 
E
V
 
W
E
 
D
R
 
E
F
 
Y
F
 
K
R
 
A
H
 
V
V
 
V
T
 
H
D
 
P
W
 
W
E
 
E
W
 
L
M
 
S
E
 
R
Y
 
Y

8wwvA Glutamine synthetase
32% identity, 84% coverage: 77:467/467 of query aligns to 92:490/490 of 8wwvA

query
sites
8wwvA
S
 
S
G
 
G
Y
 
N
P
 
P
S
 
T
W
 
V
H
 
V
L
 
M
Q
 
V
P
 
P
D
 
D
L
 
P
S
 
T
T
 
T
F
 
F
S
 
K
V
 
V
L
 
L
P
 
P
Y
 
W
A
 
A
P
 
D
G
 
K
V
 
T
A
 
G
R
 
W
V
 
M
I
 
L
A
 
A
D
 
D
P
 
L
F
 
H
E
 
W
A
 
K
K
 
S
G
 
G
Q
 
E
P
 
P
V
 
F
D
 
P
Y
 
L
A
 
C
P
 
P
R
 
R
H
 
G
V
 
I
L
 
M
R
 
K
R
 
K
V
 
A
L
 
V
E
 
K
R
 
S
A
 
L
R
 
S
A
 
D
A
 
E
G
 
G
F
 
Y
Q
 
L
V
 
F
K
 
K
G
 
C
S
x
G
F
 
I
E
|
E
F
 
L
E
|
E
F
 
W
Y
 
Y
A
 
L
F
 
T
-
 
K
-
 
I
-
 
V
-
 
D
-
 
R
A
 
S
R
 
L
D
 
S
G
 
P
D
 
E
S
 
S
R
 
L
G
 
G
Q
 
A
A
 
P
P
 
G
V
 
V
S
 
Q
P
 
P
D
 
D
A
 
A
I
 
I
S
 
Q
P
 
V
G
 
Q
P
 
P
S
 
V
S
 
A
P
 
-
H
 
-
P
 
-
P
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
-
A
 
-
W
 
-
T
 
Q
G
 
G
L
 
Y
Q
 
S
C
 
V
F
 
L
S
 
L
E
 
E
I
 
H
K
 
H
Q
 
L
A
 
D
A
 
Q
L
 
V
E
 
D
P
 
D
L
 
I
L
 
M
I
 
S
H
 
K
L
 
V
V
 
R
Q
 
K
T
 
G
L
 
L
E
 
L
A
 
E
M
 
L
G
 
N
A
 
L
R
 
P
P
 
L
E
x
R
V
 
S
A
 
I
N
 
E
T
 
D
E
|
E
Y
 
W
G
 
A
P
 
P
G
 
S
Q
 
Q
F
 
M
E
|
E
I
 
T
S
 
T
Y
x
F
A
x
D
P
x
V
Y
 
M
W
 
E
N
 
G
L
 
L
E
 
E
I
 
A
A
 
A
D
 
D
M
 
A
A
 
A
F
 
L
Y
 
L
Y
 
I
R
 
K
T
 
S
T
 
A
I
 
I
R
 
K
E
 
Q
V
 
I
L
 
C
A
 
S
Q
 
R
H
 
H
G
 
G
L
 
Y
K
 
H
A
 
A
T
 
T
F
 
F
M
 
M
S
 
C
K
 
K
P
 
P
-
 
A
L
 
I
S
 
N
G
 
G
F
 
F
S
 
F
G
x
A
S
 
S
G
 
G
A
 
W
H
|
H
L
 
M
H
|
H
H
 
Q
V
x
S
L
 
L
H
 
V
G
 
D
S
 
K
D
 
D
G
 
T
A
 
R
N
 
K
A
 
N
F
 
L
A
 
F
D
 
I
P
 
P
K
 
S
A
 
E
R
 
G
D
 
E
G
 
V
L
 
L
S
 
S
Q
 
P
L
 
L
C
 
G
R
 
R
W
 
A
F
 
Y
I
 
A
G
 
G
G
 
G
Q
 
L
L
 
L
A
 
A
H
 
N
A
 
G
R
 
S
T
 
A
V
 
A
S
 
S
A
 
S
L
 
F
M
 
T
N
 
T
P
 
P
T
 
T
I
 
V
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
K
 
R
R
|
R
L
 
R
Q
 
Q
P
 
P
G
 
Y
A
 
S
F
 
L
A
 
A
P
 
P
H
 
D
W
 
R
I
 
R
T
 
A
W
 
W
G
 
A
Y
 
K
D
 
D
H
 
N
R
x
K
E
 
A
T
 
A
M
 
M
I
 
V
R
 
R
V
 
V
P
 
V
P
 
S
A
 
A
R
 
T
G
 
G
K
 
D
-
 
P
A
 
A
T
 
S
R
|
R
I
 
I
E
|
E
N
 
N
R
 
R
L
 
I
P
 
G
G
 
E
A
 
P
D
 
G
T
 
A
D
 
N
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
A
 
Y
L
 
M
A
 
A
A
 
S
A
 
Q
L
 
I
A
 
V
A
 
S
G
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
I
E
 
K
R
 
N
R
 
K
I
 
K
D
 
D
P
 
P
G
 
G
D
 
E
P
 
-
V
 
L
A
 
Q
D
 
E
R
 
S
P
 
P
V
 
Y
S
 
-
E
 
D
M
 
A
A
 
Q
A
 
V
P
 
P
L
 
M
L
 
L
P
 
P
R
 
T
S
 
T
L
 
L
S
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
F
 
L
E
 
E
E
 
H
D
 
D
P
 
S
-
 
E
W
 
L
T
 
F
E
 
R
E
 
S
V
 
C
F
 
F
G
 
G
R
 
D
S
 
T
F
 
F
K
 
I
E
 
K
Q
 
Y
F
 
W
L
 
L
R
 
Q
L
 
L
R
 
R
R
 
R
A
 
S
E
 
E
V
 
W
E
 
A
R
 
R
F
 
F
F
 
L
R
 
D
-
 
A
-
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
E
-
 
P
-
 
T
-
 
G
H
 
A
V
 
V
T
 
T
D
 
Q
W
 
W
E
 
E
W
 
Q
M
 
K
E
 
E
Y
 
Y
E
 
F
D
 
N
I
 
L
F
 
L

4s0rD Structure of gs-tnra complex (see paper)
29% identity, 98% coverage: 8:463/467 of query aligns to 10:443/447 of 4s0rD

query
sites
4s0rD
Q
 
E
E
 
D
V
 
I
Q
 
E
Q
 
K
M
 
L
I
 
V
Q
 
K
A
 
E
H
 
E
Q
 
N
I
 
V
Q
 
K
L
 
Y
V
 
I
R
 
R
V
 
L
C
 
Q
V
 
F
Q
 
T
D
 
D
L
 
I
G
 
L
H
 
G
M
 
T
S
 
I
R
 
K
C
 
N
R
 
V
E
 
E
V
 
I
P
 
P
S
 
V
G
 
S
R
 
Q
F
 
L
L
 
G
E
 
K
R
 
A
M
 
L
A
 
D
T
 
N
D
 
K
G
 
V
L
 
M
S
 
F
F
x
D
P
 
G
S
 
S
A
 
S
L
 
I
F
 
E
A
 
G
F
|
F
D
 
-
S
 
-
S
 
-
A
 
-
R
 
-
I
 
-
V
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
P
 
-
G
 
-
P
x
V
R
|
R
S
x
I
G
 
E
Y
 
E
P
 
S
S
 
D
W
 
M
H
 
Y
L
 
L
Q
 
Y
P
 
P
D
 
D
L
 
L
S
 
N
T
 
T
F
 
F
S
 
V
V
 
I
L
 
F
P
 
P
Y
 
W
A
 
T
P
 
A
-
 
E
-
 
K
-
 
G
G
 
K
V
 
V
A
 
A
R
 
R
V
 
F
I
 
I
A
 
C
D
 
D
P
 
I
F
 
Y
E
 
N
A
 
P
K
 
D
G
 
G
Q
 
T
P
 
P
V
 
F
D
 
E
Y
 
G
A
 
D
P
 
P
R
 
R
H
 
N
V
 
N
L
 
L
R
 
K
R
 
R
V
 
I
L
 
L
E
 
K
R
 
E
A
 
M
R
 
E
A
 
D
A
 
L
G
 
G
F
 
F
Q
 
-
V
 
-
K
 
-
G
 
S
S
 
D
F
 
F
E
 
N
F
 
L
-
 
G
-
 
P
-
x
E
-
 
P
E
|
E
F
 
F
Y
 
F
A
 
L
F
 
F
A
 
K
R
 
L
D
 
D
G
 
-
D
 
-
S
 
E
R
 
K
G
 
G
Q
 
E
A
 
P
P
 
-
V
 
-
S
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
T
I
 
L
S
 
E
P
 
L
G
 
N
P
 
D
S
 
K
S
 
G
P
 
G
H
 
Y
P
 
F
P
x
D
G
 
L
V
 
A
P
 
P
A
 
T
W
 
D
T
 
L
G
 
G
L
 
E
Q
 
N
C
 
C
F
 
R
S
 
R
E
 
D
I
 
I
K
 
-
Q
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
-
I
 
-
H
 
-
L
 
-
V
 
V
Q
 
L
T
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
E
M
 
M
G
 
G
A
 
F
R
 
E
P
 
I
E
 
E
V
 
A
A
 
S
N
 
H
T
 
H
E
|
E
Y
 
V
G
 
A
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
F
 
H
E
|
E
I
 
I
S
 
D
Y
 
F
A
 
K
P
 
Y
Y
 
A
W
 
G
N
 
A
L
 
V
E
 
R
I
 
S
A
 
C
D
 
D
M
 
D
A
 
I
F
 
Q
Y
 
T
Y
 
F
R
 
K
T
 
L
T
 
V
I
 
V
R
 
K
E
 
T
V
 
I
L
 
A
A
 
R
Q
 
K
H
 
H
G
 
G
L
 
L
K
 
H
A
 
A
T
 
T
F
 
F
M
 
M
S
 
P
K
 
K
P
 
P
L
 
L
S
 
F
G
|
G
F
x
V
S
x
N
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
M
H
|
H
L
 
C
H
 
N
H
 
L
V
 
S
L
 
L
H
 
F
G
 
-
S
 
K
D
 
N
G
 
G
A
 
V
N
 
N
A
 
A
F
 
F
A
 
F
D
 
D
P
 
E
K
 
N
A
 
A
R
 
D
D
 
L
G
 
Q
L
 
L
S
 
S
Q
 
E
L
 
T
C
 
A
R
 
K
W
 
H
F
 
F
I
 
I
G
 
A
G
 
G
Q
 
I
L
 
V
A
 
K
H
 
H
A
 
A
R
 
T
T
 
S
V
 
F
S
 
T
A
 
A
L
 
V
M
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
T
I
 
V
N
 
N
G
 
S
Y
 
Y
K
 
K
R
|
R
L
 
L
Q
 
V
P
 
P
G
|
G
A
x
Y
F
x
E
A
 
A
P
 
P
H
 
C
W
 
Y
I
 
V
T
 
A
W
 
W
G
 
S
Y
 
A
D
 
Q
H
 
N
R
|
R
E
 
S
T
 
P
M
 
L
I
 
I
R
 
R
V
 
I
P
 
P
P
 
A
A
 
S
R
 
R
G
 
G
K
 
I
A
 
S
T
 
T
R
 
R
I
 
V
E
|
E
N
 
V
R
|
R
L
 
S
P
 
V
G
 
D
A
 
P
D
 
A
T
 
A
D
 
N
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
S
A
 
V
A
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
I
E
 
K
R
 
N
R
 
K
I
 
L
D
 
E
P
 
A
G
 
P
D
 
A
P
 
P
V
 
I
A
 
-
D
 
D
R
 
R
P
 
N
V
 
I
S
x
Y
E
 
V
M
 
M
A
 
S
A
 
K
P
 
E
L
 
E
-
 
R
-
 
M
-
 
E
-
 
N
-
 
G
-
 
I
-
 
V
-
 
D
L
 
L
P
 
P
R
 
A
S
 
T
L
 
L
S
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
D
 
E
A
 
E
F
 
F
E
 
K
E
 
S
D
 
N
P
 
E
W
 
V
T
 
M
E
 
V
E
 
K
V
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
E
S
 
H
F
 
L
K
 
F
E
 
E
Q
x
H
F
 
F
L
 
I
R
 
E
L
 
A
R
 
K
R
 
E
A
x
I
E
 
E
V
 
W
E
 
D
R
x
M
F
 
F
F
 
R
R
 
T
H
 
Q
V
 
V
T
 
H
D
 
P
W
 
W
E
 
E
W
 
R
M
 
E
E
 
Q
Y
 
Y

P12425 Glutamine synthetase; GS; Glutamate--ammonia ligase; Glutamine synthetase I alpha; GSI alpha; EC 6.3.1.2 from Bacillus subtilis (strain 168) (see 5 papers)
29% identity, 98% coverage: 8:463/467 of query aligns to 7:440/444 of P12425

query
sites
P12425
Q
 
E
E
 
D
V
 
I
Q
 
E
Q
 
K
M
 
L
I
 
V
Q
 
K
A
 
E
H
 
E
Q
 
N
I
 
V
Q
 
K
L
 
Y
V
 
I
R
 
R
V
 
L
C
 
Q
V
 
F
Q
 
T
D
 
D
L
 
I
G
 
L
H
 
G
M
 
T
S
 
I
R
 
K
C
 
N
R
 
V
E
 
E
V
 
I
P
 
P
S
 
V
G
 
S
R
 
Q
F
 
L
L
 
G
E
 
K
R
 
A
M
 
L
A
 
D
T
 
N
D
 
K
G
 
V
L
 
M
S
 
F
F
 
D
P
 
G
S
 
S
A
 
S
L
 
I
F
 
E
A
x
G
F
 
F
D
 
-
S
 
-
S
 
-
A
 
-
R
 
-
I
 
-
V
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
P
 
-
G
 
-
P
 
V
R
|
R
S
 
I
G
 
E
Y
 
E
P
 
S
S
 
D
W
 
M
H
 
Y
L
 
L
Q
 
Y
P
 
P
D
 
D
L
 
L
S
 
N
T
 
T
F
 
F
S
 
V
V
 
I
L
 
F
P
 
P
Y
 
W
A
 
T
P
 
A
-
 
E
-
 
K
-
 
G
G
 
K
V
 
V
A
 
A
R
 
R
V
 
F
I
 
I
A
 
C
D
 
D
P
 
I
F
 
Y
E
 
N
A
 
P
K
 
D
G
 
G
Q
 
T
P
 
P
V
 
F
D
 
E
Y
 
G
A
 
D
P
 
P
R
 
R
H
 
N
V
 
N
L
 
L
R
 
K
R
 
R
V
 
I
L
 
L
E
 
K
R
 
E
A
 
M
R
 
E
A
 
D
A
 
L
G
 
G
F
 
F
Q
 
-
V
 
-
K
 
-
G
 
S
S
 
D
F
 
F
E
 
N
F
 
L
-
 
G
-
 
P
-
x
E
-
 
P
E
|
E
F
 
F
Y
 
F
A
 
L
F
 
F
A
 
K
R
 
L
D
 
D
G
 
-
D
 
-
S
 
E
R
 
K
G
 
G
Q
 
E
A
 
P
P
 
-
V
 
-
S
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
T
I
 
L
S
 
E
P
 
L
G
 
N
P
 
D
S
 
K
S
 
G
P
 
G
H
 
Y
P
 
F
P
 
D
G
 
L
V
 
A
P
 
P
A
 
T
W
 
D
T
 
L
G
 
G
L
 
E
Q
 
N
C
 
C
F
 
R
S
 
R
E
 
D
I
 
I
K
 
-
Q
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
-
I
 
-
H
 
-
L
 
-
V
 
V
Q
 
L
T
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
E
M
 
M
G
 
G
A
 
F
R
 
E
P
 
I
E
 
E
V
 
A
A
 
S
N
 
H
T
 
H
E
|
E
Y
x
V
G
 
A
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
F
 
H
E
|
E
I
 
I
S
 
D
Y
 
F
A
 
K
P
 
Y
Y
 
A
W
 
G
N
 
A
L
 
V
E
 
R
I
 
S
A
 
C
D
 
D
M
 
D
A
 
I
F
 
Q
Y
 
T
Y
 
F
R
 
K
T
 
L
T
 
V
I
 
V
R
 
K
E
 
T
V
 
I
L
 
A
A
 
R
Q
 
K
H
 
H
G
 
G
L
 
L
K
 
H
A
 
A
T
 
T
F
 
F
M
 
M
S
 
P
K
 
K
P
 
P
L
 
L
S
 
F
G
 
G
F
 
V
S
 
N
G
|
G
S
 
S
G
 
G
A
 
M
H
|
H
L
 
C
H
 
N
H
 
L
V
 
S
L
 
L
H
 
F
G
 
-
S
 
K
D
 
N
G
 
G
A
 
V
N
 
N
A
 
A
F
 
F
A
 
F
D
 
D
P
 
E
K
 
N
A
 
A
R
 
D
D
 
L
G
 
Q
L
 
L
S
 
S
Q
 
E
L
 
T
C
 
A
R
 
K
W
 
H
F
 
F
I
 
I
G
 
A
G
 
G
Q
 
I
L
 
V
A
 
K
H
 
H
A
 
A
R
 
T
T
 
S
V
 
F
S
 
T
A
 
A
L
 
V
M
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
T
I
 
V
N
 
N
G
 
S
Y
 
Y
K
 
K
R
 
R
L
 
L
Q
 
V
P
 
P
G
|
G
A
 
Y
F
x
E
A
 
A
P
|
P
H
 
C
W
 
Y
I
 
V
T
 
A
W
 
W
G
 
S
Y
 
A
D
 
Q
H
 
N
R
 
R
E
 
S
T
 
P
M
 
L
I
 
I
R
 
R
V
 
I
P
 
P
P
 
A
A
 
S
R
 
R
G
 
G
K
 
I
A
 
S
T
 
T
R
 
R
I
 
V
E
|
E
N
 
V
R
 
R
L
 
S
P
 
V
G
 
D
A
 
P
D
 
A
T
 
A
D
 
N
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
S
A
 
V
A
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
I
E
 
K
R
 
N
R
 
K
I
 
L
D
 
E
P
 
A
G
 
P
D
 
A
P
 
P
V
 
I
A
 
-
D
 
D
R
 
R
P
 
N
V
 
I
S
 
Y
E
 
V
M
 
M
A
 
S
A
 
K
P
 
E
L
 
E
-
 
R
-
 
M
-
 
E
-
 
N
-
 
G
-
 
I
-
 
V
-
 
D
L
 
L
P
 
P
R
 
A
S
 
T
L
 
L
S
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
D
 
E
A
 
E
F
 
F
E
 
K
E
 
S
D
 
N
P
 
E
W
 
V
T
 
M
E
 
V
E
 
K
V
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
E
S
 
H
F
 
L
K
 
F
E
 
E
Q
 
H
F
 
F
L
 
I
R
 
E
L
 
A
R
 
K
R
 
E
A
 
I
E
|
E
V
 
W
E
 
D
R
 
M
F
 
F
F
 
R
R
 
T
H
 
Q
V
 
V
T
 
H
D
 
P
W
 
W
E
 
E
W
 
R
M
 
E
E
 
Q
Y
 
Y

Sites not aligning to the query:

8wwuB Glutamine synthetase
32% identity, 84% coverage: 77:467/467 of query aligns to 94:492/492 of 8wwuB

query
sites
8wwuB
S
 
S
G
 
G
Y
 
N
P
 
P
S
 
T
W
 
V
H
 
V
L
 
M
Q
 
V
P
 
P
D
 
D
L
 
P
S
 
T
T
 
T
F
 
F
S
 
K
V
 
V
L
 
L
P
 
P
Y
 
W
A
 
A
P
 
D
G
 
K
V
 
T
A
 
G
R
 
W
V
 
M
I
 
L
A
 
A
D
 
D
P
 
L
F
 
H
E
 
W
A
 
K
K
 
S
G
 
G
Q
 
E
P
 
P
V
 
F
D
 
P
Y
 
L
A
 
C
P
 
P
R
 
R
H
 
G
V
 
I
L
 
M
R
 
K
R
 
K
V
 
A
L
 
V
E
 
K
R
 
S
A
 
L
R
 
S
A
 
D
A
 
E
G
 
G
F
 
Y
Q
 
L
V
 
F
K
 
K
G
 
C
S
x
G
F
 
I
E
|
E
F
 
L
E
|
E
F
 
W
Y
 
Y
A
 
L
F
 
T
-
 
K
-
 
I
-
 
V
-
 
D
-
 
R
A
 
S
R
 
L
D
 
S
G
 
P
D
 
E
S
 
S
R
 
L
G
 
G
Q
 
A
A
 
P
P
 
G
V
 
V
S
 
Q
P
 
P
D
 
D
A
 
A
I
 
I
S
 
Q
P
 
V
G
 
Q
P
 
P
S
 
V
S
 
A
P
 
-
H
 
-
P
 
-
P
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
-
A
 
-
W
 
-
T
 
Q
G
 
G
L
 
Y
Q
 
S
C
 
V
F
 
L
S
 
L
E
 
E
I
 
H
K
 
H
Q
 
L
A
 
D
A
 
Q
L
 
V
E
 
D
P
 
D
L
 
I
L
 
M
I
 
S
H
 
K
L
 
V
V
 
R
Q
 
K
T
 
G
L
 
L
E
 
L
A
 
E
M
 
L
G
 
N
A
 
L
R
 
P
P
 
L
E
x
R
V
 
S
A
 
I
N
 
E
T
 
D
E
|
E
Y
 
W
G
 
A
P
 
P
G
 
S
Q
 
Q
F
 
M
E
|
E
I
 
T
S
 
T
Y
x
F
A
 
D
P
x
V
Y
 
M
W
 
E
N
 
G
L
 
L
E
 
E
I
 
A
A
 
A
D
 
D
M
 
A
A
 
A
F
 
L
Y
 
L
Y
 
I
R
 
K
T
 
S
T
 
A
I
 
I
R
 
K
E
 
Q
V
 
I
L
 
C
A
 
S
Q
 
R
H
 
H
G
 
G
L
 
Y
K
 
H
A
 
A
T
 
T
F
 
F
M
 
M
S
 
C
K
 
K
P
 
P
-
 
A
L
 
I
S
 
N
G
 
G
F
 
F
S
 
F
G
 
A
S
 
S
G
 
G
A
 
W
H
|
H
L
 
M
H
|
H
H
 
Q
V
x
S
L
 
L
H
 
V
G
 
D
S
 
K
D
 
D
G
 
T
A
 
R
N
 
K
A
 
N
F
 
L
A
 
F
D
 
I
P
 
P
K
 
S
A
 
E
R
 
G
D
 
E
G
 
V
L
 
L
S
 
S
Q
 
P
L
 
L
C
 
G
R
 
R
W
 
A
F
 
Y
I
 
A
G
 
G
G
 
G
Q
 
L
L
 
L
A
 
A
H
 
N
A
 
G
R
 
S
T
 
A
V
 
A
S
 
S
A
 
S
L
 
F
M
 
T
N
 
T
P
 
P
T
 
T
I
 
V
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
K
 
R
R
 
R
L
 
R
Q
 
Q
P
 
P
G
 
Y
A
 
S
F
 
L
A
 
A
P
 
P
H
 
D
W
 
R
I
 
R
T
 
A
W
 
W
G
 
A
Y
 
K
D
 
D
H
 
N
R
x
K
E
 
A
T
 
A
M
 
M
I
 
V
R
|
R
V
 
V
P
 
V
P
 
S
A
 
A
R
 
T
G
 
G
K
 
D
-
 
P
A
 
A
T
 
S
R
|
R
I
 
I
E
|
E
N
 
N
R
 
R
L
 
I
P
 
G
G
 
E
A
 
P
D
 
G
T
 
A
D
 
N
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
A
 
Y
L
 
M
A
 
A
A
 
S
A
 
Q
L
 
I
A
 
V
A
 
S
G
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
I
E
 
K
R
 
N
R
 
K
I
 
K
D
 
D
P
 
P
G
 
G
D
 
E
P
 
-
V
 
L
A
 
Q
D
 
E
R
 
S
P
 
P
V
 
Y
S
 
-
E
 
D
M
 
A
A
 
Q
A
 
V
P
 
P
L
 
M
L
 
L
P
 
P
R
 
T
S
 
T
L
 
L
S
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
F
 
L
E
 
E
E
 
H
D
 
D
P
 
S
-
 
E
W
 
L
T
 
F
E
 
R
E
 
S
V
 
C
F
 
F
G
 
G
R
 
D
S
 
T
F
 
F
K
 
I
E
 
K
Q
 
Y
F
 
W
L
 
L
R
 
Q
L
 
L
R
 
R
R
 
R
A
 
S
E
 
E
V
 
W
E
 
A
R
 
R
F
 
F
F
 
L
R
 
D
-
 
A
-
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
E
-
 
P
-
 
T
-
 
G
H
 
A
V
 
V
T
 
T
D
 
Q
W
 
W
E
 
E
W
 
Q
M
 
K
E
 
E
Y
 
Y
E
 
F
D
 
N
I
 
L
F
 
L

4lnkA B. Subtilis glutamine synthetase structures reveal large active site conformational changes and basis for isoenzyme specific regulation: structure of gs-glutamate-amppcp complex (see paper)
29% identity, 98% coverage: 8:463/467 of query aligns to 6:439/443 of 4lnkA

query
sites
4lnkA
Q
 
E
E
 
D
V
 
I
Q
 
E
Q
 
K
M
 
L
I
 
V
Q
 
K
A
 
E
H
 
E
Q
 
N
I
 
V
Q
 
K
L
 
Y
V
 
I
R
 
R
V
 
L
C
 
Q
V
 
F
Q
 
T
D
 
D
L
 
I
G
 
L
H
 
G
M
 
T
S
 
I
R
 
K
C
 
N
R
 
V
E
 
E
V
 
I
P
 
P
S
 
V
G
 
S
R
 
Q
F
 
L
L
 
G
E
x
K
R
 
A
M
 
L
A
 
D
T
 
N
D
 
K
G
 
V
L
x
M
S
 
F
F
x
D
P
 
G
S
 
S
A
 
S
L
 
I
F
 
E
A
 
G
F
 
F
D
 
-
S
 
-
S
 
-
A
 
-
R
 
-
I
 
-
V
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
P
 
-
G
 
-
P
 
V
R
 
R
S
 
I
G
 
E
Y
 
E
P
 
S
S
 
D
W
 
M
H
 
Y
L
 
L
Q
 
Y
P
 
P
D
 
D
L
 
L
S
 
N
T
 
T
F
 
F
S
 
V
V
 
I
L
 
F
P
 
P
Y
 
W
A
 
T
P
 
A
-
 
E
-
 
K
-
 
G
G
 
K
V
 
V
A
 
A
R
 
R
V
 
F
I
 
I
A
 
C
D
 
D
P
 
I
F
 
Y
E
 
N
A
 
P
K
 
D
G
 
G
Q
 
T
P
 
P
V
 
F
D
 
E
Y
 
G
A
 
D
P
 
P
R
 
R
H
 
N
V
 
N
L
 
L
R
 
K
R
 
R
V
 
I
L
 
L
E
 
K
R
 
E
A
 
M
R
 
E
A
 
D
A
 
L
G
 
G
F
 
F
Q
 
-
V
 
-
K
 
-
G
 
S
S
 
D
F
 
F
E
 
N
F
 
L
-
 
G
-
 
P
-
x
E
-
 
P
E
|
E
F
 
F
Y
 
F
A
 
L
F
 
F
A
 
K
R
 
L
D
 
D
G
 
-
D
 
-
S
 
E
R
 
K
G
 
G
Q
 
E
A
 
P
P
 
-
V
 
-
S
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
T
I
 
L
S
 
E
P
 
L
G
 
N
P
 
D
S
 
K
S
 
G
P
 
G
H
 
Y
P
 
F
P
 
D
G
 
L
V
 
A
P
 
P
A
 
T
W
 
D
T
 
L
G
 
G
L
 
E
Q
 
N
C
 
C
F
 
R
S
 
R
E
 
D
I
 
I
K
 
-
Q
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
-
I
 
-
H
 
-
L
 
-
V
 
V
Q
 
L
T
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
E
M
 
M
G
 
G
A
 
F
R
 
E
P
 
I
E
 
E
V
 
A
A
 
S
N
 
H
T
 
H
E
|
E
Y
x
V
G
 
A
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
F
 
H
E
|
E
I
 
I
S
 
D
Y
x
F
A
 
K
P
x
Y
Y
 
A
W
 
G
N
 
A
L
 
V
E
 
R
I
 
S
A
 
C
D
 
D
M
 
D
A
 
I
F
 
Q
Y
 
T
Y
 
F
R
 
K
T
 
L
T
 
V
I
 
V
R
 
K
E
 
T
V
 
I
L
 
A
A
 
R
Q
 
K
H
 
H
G
 
G
L
 
L
K
 
H
A
 
A
T
 
T
F
 
F
M
 
M
S
 
P
K
 
K
P
 
P
L
 
L
S
 
F
G
 
G
F
 
V
S
x
N
G
|
G
S
 
S
G
|
G
A
 
M
H
|
H
L
 
C
H
x
N
H
 
L
V
x
S
L
 
L
H
 
F
G
 
-
S
 
K
D
 
N
G
 
G
A
 
V
N
 
N
A
 
A
F
 
F
A
 
F
D
 
D
P
 
E
K
 
N
A
 
A
R
 
D
D
 
L
G
 
Q
L
 
L
S
 
S
Q
 
E
L
 
T
C
 
A
R
 
K
W
 
H
F
 
F
I
 
I
G
 
A
G
 
G
Q
 
I
L
 
V
A
 
K
H
 
H
A
 
A
R
 
T
T
 
S
V
 
F
S
 
T
A
 
A
L
 
V
M
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
T
I
 
V
N
 
N
G
 
S
Y
 
Y
K
 
K
R
 
R
L
 
L
Q
 
V
P
 
P
G
 
G
A
 
Y
F
x
E
A
 
A
P
 
P
H
 
C
W
 
Y
I
 
V
T
 
A
W
 
W
G
 
S
Y
 
A
D
 
Q
H
 
N
R
|
R
E
 
S
T
 
P
M
 
L
I
 
I
R
 
R
V
 
I
P
 
P
P
 
A
A
x
S
R
 
R
G
 
G
K
 
I
A
x
S
T
 
T
R
|
R
I
 
V
E
|
E
N
 
V
R
|
R
L
 
S
P
 
V
G
 
D
A
 
P
D
 
A
T
 
A
D
 
N
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
S
A
 
V
A
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
I
E
 
K
R
 
N
R
 
K
I
 
L
D
 
E
P
 
A
G
 
P
D
 
A
P
 
P
V
 
I
A
 
-
D
 
D
R
 
R
P
 
N
V
 
I
S
 
Y
E
 
V
M
 
M
A
 
S
A
 
K
P
 
E
L
 
E
-
 
R
-
 
M
-
 
E
-
 
N
-
 
G
-
 
I
-
 
V
-
 
D
L
 
L
P
 
P
R
 
A
S
 
T
L
 
L
S
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
D
 
E
A
 
E
F
 
F
E
 
K
E
 
S
D
 
N
P
 
E
W
 
V
T
 
M
E
 
V
E
 
K
V
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
E
S
 
H
F
 
L
K
 
F
E
 
E
Q
 
H
F
 
F
L
 
I
R
 
E
L
 
A
R
 
K
R
 
E
A
 
I
E
 
E
V
 
W
E
 
D
R
 
M
F
 
F
F
 
R
R
 
T
H
 
Q
V
 
V
T
 
H
D
 
P
W
 
W
E
 
E
W
 
R
M
 
E
E
 
Q
Y
 
Y

4lniA B. Subtilis glutamine synthetase structures reveal large active site conformational changes and basis for isoenzyme specific regulation: structure of the transition state complex (see paper)
29% identity, 98% coverage: 8:463/467 of query aligns to 6:439/443 of 4lniA

query
sites
4lniA
Q
 
E
E
 
D
V
 
I
Q
 
E
Q
 
K
M
 
L
I
 
V
Q
 
K
A
 
E
H
 
E
Q
 
N
I
 
V
Q
 
K
L
 
Y
V
 
I
R
 
R
V
 
L
C
 
Q
V
 
F
Q
 
T
D
 
D
L
 
I
G
 
L
H
 
G
M
 
T
S
 
I
R
 
K
C
 
N
R
 
V
E
 
E
V
 
I
P
 
P
S
 
V
G
 
S
R
 
Q
F
 
L
L
 
G
E
 
K
R
 
A
M
 
L
A
 
D
T
 
N
D
 
K
G
 
V
L
 
M
S
 
F
F
x
D
P
 
G
S
 
S
A
 
S
L
 
I
F
 
E
A
 
G
F
 
F
D
 
-
S
 
-
S
 
-
A
 
-
R
 
-
I
 
-
V
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
P
 
-
G
 
-
P
 
V
R
 
R
S
 
I
G
 
E
Y
 
E
P
 
S
S
 
D
W
 
M
H
 
Y
L
 
L
Q
 
Y
P
 
P
D
 
D
L
 
L
S
 
N
T
 
T
F
 
F
S
 
V
V
 
I
L
 
F
P
 
P
Y
 
W
A
 
T
P
 
A
-
 
E
-
 
K
-
 
G
G
 
K
V
 
V
A
 
A
R
 
R
V
 
F
I
 
I
A
 
C
D
 
D
P
 
I
F
 
Y
E
 
N
A
 
P
K
 
D
G
 
G
Q
 
T
P
 
P
V
 
F
D
 
E
Y
 
G
A
 
D
P
 
P
R
 
R
H
 
N
V
 
N
L
 
L
R
 
K
R
 
R
V
 
I
L
 
L
E
 
K
R
 
E
A
 
M
R
 
E
A
 
D
A
 
L
G
 
G
F
 
F
Q
 
-
V
 
-
K
 
-
G
 
S
S
 
D
F
 
F
E
 
N
F
 
L
-
 
G
-
 
P
-
x
E
-
 
P
E
|
E
F
 
F
Y
 
F
A
 
L
F
 
F
A
 
K
R
 
L
D
 
D
G
 
-
D
 
-
S
 
E
R
 
K
G
 
G
Q
 
E
A
 
P
P
 
-
V
 
-
S
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
T
I
 
L
S
 
E
P
 
L
G
 
N
P
 
D
S
 
K
S
 
G
P
 
G
H
 
Y
P
 
F
P
 
D
G
 
L
V
 
A
P
 
P
A
 
T
W
 
D
T
 
L
G
 
G
L
 
E
Q
 
N
C
 
C
F
 
R
S
 
R
E
 
D
I
 
I
K
 
-
Q
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
-
I
 
-
H
 
-
L
 
-
V
 
V
Q
 
L
T
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
E
M
 
M
G
 
G
A
 
F
R
 
E
P
 
I
E
|
E
V
 
A
A
 
S
N
 
H
T
 
H
E
|
E
Y
 
V
G
 
A
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
F
 
H
E
|
E
I
 
I
S
x
D
Y
 
F
A
 
K
P
x
Y
Y
 
A
W
 
G
N
 
A
L
 
V
E
 
R
I
 
S
A
 
C
D
 
D
M
 
D
A
 
I
F
 
Q
Y
 
T
Y
 
F
R
 
K
T
 
L
T
 
V
I
 
V
R
 
K
E
 
T
V
 
I
L
 
A
A
 
R
Q
 
K
H
 
H
G
 
G
L
 
L
K
 
H
A
 
A
T
 
T
F
 
F
M
 
M
S
 
P
K
 
K
P
 
P
L
 
L
S
 
F
G
 
G
F
 
V
S
 
N
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
M
H
|
H
L
 
C
H
x
N
H
 
L
V
x
S
L
 
L
H
 
F
G
 
-
S
 
K
D
 
N
G
 
G
A
 
V
N
 
N
A
 
A
F
 
F
A
 
F
D
 
D
P
 
E
K
 
N
A
 
A
R
 
D
D
 
L
G
 
Q
L
 
L
S
 
S
Q
 
E
L
 
T
C
 
A
R
 
K
W
 
H
F
 
F
I
 
I
G
 
A
G
 
G
Q
 
I
L
 
V
A
 
K
H
 
H
A
 
A
R
 
T
T
 
S
V
 
F
S
 
T
A
 
A
L
 
V
M
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
T
I
 
V
N
 
N
G
 
S
Y
 
Y
K
 
K
R
|
R
L
 
L
Q
 
V
P
 
P
G
 
G
A
 
Y
F
x
E
A
 
A
P
 
P
H
 
C
W
 
Y
I
 
V
T
 
A
W
 
W
G
 
S
Y
 
A
D
 
Q
H
 
N
R
|
R
E
 
S
T
 
P
M
 
L
I
 
I
R
|
R
V
 
I
P
 
P
P
 
A
A
 
S
R
 
R
G
 
G
K
 
I
A
 
S
T
 
T
R
|
R
I
 
V
E
|
E
N
 
V
R
|
R
L
 
S
P
 
V
G
 
D
A
 
P
D
 
A
T
 
A
D
 
N
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
S
A
 
V
A
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
I
E
 
K
R
 
N
R
 
K
I
 
L
D
 
E
P
 
A
G
 
P
D
 
A
P
 
P
V
 
I
A
 
-
D
 
D
R
 
R
P
 
N
V
 
I
S
 
Y
E
 
V
M
 
M
A
 
S
A
 
K
P
 
E
L
 
E
-
 
R
-
 
M
-
 
E
-
 
N
-
 
G
-
 
I
-
 
V
-
 
D
L
 
L
P
 
P
R
 
A
S
 
T
L
 
L
S
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
D
 
E
A
 
E
F
 
F
E
 
K
E
 
S
D
 
N
P
 
E
W
 
V
T
 
M
E
 
V
E
 
K
V
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
E
S
 
H
F
 
L
K
 
F
E
 
E
Q
 
H
F
 
F
L
 
I
R
 
E
L
 
A
R
 
K
R
 
E
A
 
I
E
 
E
V
 
W
E
 
D
R
 
M
F
 
F
F
 
R
R
 
T
H
 
Q
V
 
V
T
 
H
D
 
P
W
 
W
E
 
E
W
 
R
M
 
E
E
 
Q
Y
 
Y

7tdvC Glutamine synthetase (see paper)
30% identity, 98% coverage: 8:463/467 of query aligns to 6:439/443 of 7tdvC

query
sites
7tdvC
Q
 
E
E
 
D
V
 
I
Q
 
R
Q
 
K
M
 
F
I
 
V
Q
 
E
A
 
E
H
 
E
Q
 
N
I
 
V
Q
 
R
L
 
Y
V
 
L
R
 
R
V
 
L
C
 
Q
V
 
F
Q
 
T
D
 
D
L
 
I
G
 
L
H
 
G
M
 
T
S
 
I
R
 
K
C
 
N
R
 
V
E
 
E
V
 
V
P
 
P
S
 
V
G
 
S
R
 
Q
F
 
-
L
 
L
E
 
E
R
 
K
M
 
V
A
 
L
T
 
D
D
 
N
G
 
E
L
 
M
S
 
M
F
 
F
P
 
D
S
 
G
A
 
S
L
 
-
F
 
-
A
 
S
F
 
I
D
 
E
S
 
G
S
 
F
A
 
V
R
 
R
I
 
I
V
 
E
P
 
E
G
 
S
A
 
-
G
 
-
P
 
-
G
 
-
P
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
Y
 
-
P
 
-
S
 
D
W
 
M
H
 
Y
L
 
L
Q
 
H
P
 
P
D
 
D
L
 
L
S
 
D
T
 
T
F
 
W
S
 
V
V
 
I
L
 
F
P
 
P
Y
 
W
A
 
T
P
 
A
G
 
G
-
 
Q
-
 
G
-
 
K
V
 
V
A
 
A
R
 
R
V
 
L
I
 
I
A
 
C
D
 
D
P
 
V
F
 
Y
E
 
K
A
 
T
K
 
D
G
 
G
Q
 
T
P
 
P
V
 
F
D
 
E
Y
 
G
A
 
D
P
 
P
R
 
R
H
 
A
V
 
N
L
 
L
R
 
K
R
 
R
V
 
V
L
 
L
E
 
K
R
 
E
A
 
M
R
 
E
A
 
D
A
 
L
G
 
G
F
 
F
-
 
T
Q
 
D
V
 
F
K
 
N
G
 
L
S
x
G
F
 
P
E
|
E
F
 
P
E
|
E
F
 
F
Y
 
F
A
 
L
F
 
F
A
 
K
R
 
L
D
 
D
G
 
E
D
 
K
S
 
G
R
 
E
G
 
P
Q
 
T
A
 
L
P
 
E
V
 
L
S
 
N
P
 
D
D
 
D
A
 
G
I
 
-
S
 
-
P
 
-
G
 
-
P
 
-
S
 
-
S
 
-
P
 
G
H
 
Y
P
 
F
P
 
D
G
 
L
V
 
A
P
 
P
A
 
T
W
 
D
T
 
L
G
 
G
L
 
E
Q
 
N
C
 
C
F
 
R
S
 
R
E
 
D
I
 
I
K
 
-
Q
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
-
I
 
-
H
 
-
L
 
-
V
 
V
Q
 
L
T
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
D
M
 
M
G
 
G
A
 
F
R
 
D
P
 
I
E
|
E
V
 
A
A
 
S
N
 
H
T
 
H
E
|
E
Y
 
V
G
 
A
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
F
 
H
E
|
E
I
 
I
S
x
D
Y
x
F
A
x
K
P
x
Y
Y
 
A
W
 
D
N
 
A
L
 
V
E
 
T
I
 
A
A
 
C
D
 
D
M
 
N
A
 
I
F
 
Q
Y
 
T
Y
 
F
R
 
K
T
 
L
T
 
V
I
 
V
R
 
K
E
 
T
V
 
I
L
 
A
A
 
R
Q
 
K
H
 
H
G
 
N
L
 
L
K
 
H
A
 
A
T
 
T
F
 
F
M
 
M
S
 
P
K
 
K
P
 
P
L
 
L
S
 
F
G
 
G
F
 
V
S
 
N
G
|
G
S
 
S
G
 
G
A
 
M
H
|
H
L
 
F
H
x
N
H
x
V
V
x
S
L
 
L
H
 
F
G
 
K
S
 
G
D
 
K
G
 
-
A
 
E
N
 
N
A
 
A
F
 
F
A
 
F
D
 
D
P
 
P
K
 
N
A
 
T
R
 
E
D
 
M
G
 
G
L
 
L
S
 
T
Q
 
E
L
 
T
C
 
A
R
 
Y
W
 
Q
F
 
F
I
 
T
G
 
A
G
 
G
Q
 
V
L
 
L
A
 
K
H
 
N
A
 
A
R
 
R
T
 
G
V
 
F
S
 
T
A
 
A
L
 
V
M
 
C
N
 
N
P
 
P
T
 
L
I
 
V
N
 
N
G
 
S
Y
 
Y
K
 
K
R
|
R
L
 
L
Q
 
V
P
 
P
G
 
G
A
 
Y
F
x
E
A
 
A
P
 
P
H
 
C
W
 
Y
I
 
I
T
 
A
W
 
W
G
 
S
Y
 
G
D
 
K
H
 
N
R
|
R
E
 
S
T
 
P
M
 
L
I
 
I
R
|
R
V
 
V
P
 
P
P
 
S
A
 
S
R
 
R
G
 
G
K
 
L
A
x
S
T
 
T
R
|
R
I
 
I
E
|
E
N
 
V
R
 
R
L
 
S
P
 
V
G
 
D
A
 
P
D
 
A
T
 
A
D
 
N
P
 
P
Y
 
Y
L
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
I
L
 
L
A
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
I
E
 
K
R
 
N
R
 
K
I
 
L
D
 
K
P
 
V
G
 
P
D
 
E
P
 
P
V
 
V
A
 
-
D
 
N
R
 
Q
P
 
N
V
 
I
S
 
Y
E
 
E
M
 
M
-
 
N
-
 
R
-
 
E
-
 
E
-
 
R
-
 
E
-
 
A
-
 
V
A
 
G
A
 
I
P
 
Q
L
 
D
L
 
L
P
 
P
R
 
S
S
 
T
L
 
L
S
 
Y
E
 
T
A
 
A
L
 
L
D
 
K
A
 
A
F
 
M
E
 
R
E
 
E
D
 
N
P
 
E
W
 
V
T
 
I
E
 
K
E
 
K
V
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
N
S
 
H
F
 
I
K
 
Y
E
 
N
Q
 
Q
F
 
F
L
 
I
R
 
N
L
 
S
R
 
K
R
 
S
A
 
I
E
 
E
V
 
W
E
 
D
R
 
Y
F
 
Y
F
 
R
R
 
T
H
 
Q
V
 
V
T
 
S
D
 
E
W
 
W
E
 
E
W
 
R
M
 
D
E
 
Q
Y
 
Y

7tf6A Glutamine synthetase (see paper)
30% identity, 98% coverage: 8:463/467 of query aligns to 5:434/438 of 7tf6A

query
sites
7tf6A
Q
 
E
E
 
D
V
 
I
Q
 
R
Q
 
K
M
 
F
I
 
A
Q
 
E
A
 
E
H
 
E
Q
 
N
I
 
V
Q
 
R
L
 
Y
V
 
L
R
 
R
V
 
L
C
 
Q
V
 
F
Q
 
T
D
 
D
L
 
I
G
 
L
H
 
G
M
 
T
S
 
I
R
 
K
C
 
N
R
 
V
E
 
E
V
 
V
P
 
P
S
 
V
G
 
S
R
 
Q
F
 
-
L
 
L
E
 
E
R
 
K
M
 
V
A
 
L
T
 
D
D
 
N
G
 
E
L
 
M
S
 
M
F
 
F
P
 
D
S
 
G
A
 
S
L
 
-
F
 
-
A
 
S
F
 
I
D
 
E
S
 
G
S
x
F
A
 
V
R
|
R
I
 
I
V
 
E
P
 
E
G
 
S
A
 
-
G
 
-
P
 
-
G
 
-
P
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
Y
 
-
P
 
-
S
 
D
W
 
M
H
 
Y
L
 
L
Q
 
H
P
 
P
D
 
D
L
 
L
S
 
D
T
 
T
F
 
W
S
 
V
V
 
I
L
 
F
P
 
P
Y
 
W
A
 
G
P
 
K
G
 
-
V
 
V
A
 
A
R
 
R
V
 
L
I
 
I
A
 
C
D
 
D
P
 
V
F
 
Y
E
 
K
A
 
T
K
 
D
G
 
G
Q
 
T
P
 
P
V
 
F
D
 
E
Y
 
G
A
 
D
P
 
P
R
 
R
H
 
A
V
 
N
L
 
L
R
 
K
R
 
R
V
 
V
L
 
L
E
 
K
R
 
E
A
 
M
R
 
E
A
 
D
A
 
L
G
 
G
F
 
F
-
 
T
Q
 
D
V
 
F
K
 
N
G
 
L
S
 
G
F
 
P
E
|
E
F
 
P
E
|
E
F
 
F
Y
 
F
A
 
L
F
 
F
A
 
K
R
 
L
D
 
D
G
 
E
D
 
K
S
 
G
R
 
E
G
 
P
Q
 
T
A
 
L
P
 
E
V
 
L
S
 
N
P
 
D
D
 
D
A
 
G
I
 
-
S
 
-
P
 
-
G
 
-
P
 
-
S
 
-
S
 
-
P
 
G
H
 
Y
P
 
F
P
 
D
G
 
L
V
 
A
P
 
P
A
 
T
W
 
D
T
 
L
G
 
G
L
 
E
Q
 
N
C
 
C
F
 
R
S
 
R
E
 
D
I
 
I
K
 
-
Q
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
-
I
 
-
H
 
-
L
 
-
V
 
V
Q
 
L
T
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
D
M
 
M
G
 
G
A
 
F
R
 
D
P
 
I
E
 
E
V
 
A
A
 
S
N
 
H
T
 
H
E
|
E
Y
 
V
G
 
A
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
F
 
H
E
|
E
I
 
I
S
 
D
Y
 
F
A
 
K
P
 
Y
Y
 
A
W
 
D
N
 
A
L
 
V
E
 
T
I
 
A
A
 
C
D
 
D
M
 
N
A
 
I
F
 
Q
Y
 
T
Y
 
F
R
 
K
T
 
L
T
 
V
I
 
V
R
 
K
E
 
T
V
 
I
L
 
A
A
 
R
Q
 
K
H
 
H
G
 
N
L
 
L
K
 
H
A
 
A
T
 
T
F
 
F
M
 
M
S
 
P
K
 
K
P
 
P
L
 
L
S
 
F
G
|
G
F
 
V
S
x
N
G
|
G
S
 
S
G
 
G
A
 
M
H
|
H
L
 
F
H
 
N
H
 
V
V
 
S
L
 
L
H
 
F
G
 
K
S
 
G
D
 
K
G
 
-
A
 
E
N
 
N
A
 
A
F
 
F
A
 
F
D
 
D
P
 
P
K
 
N
A
 
T
R
 
E
D
 
M
G
 
G
L
 
L
S
 
T
Q
 
E
L
 
T
C
 
A
R
 
Y
W
 
Q
F
 
F
I
 
T
G
 
A
G
 
G
Q
 
V
L
 
L
A
 
K
H
 
N
A
 
A
R
 
R
T
 
G
V
 
F
S
 
T
A
 
A
L
 
V
M
 
C
N
 
N
P
 
P
T
 
L
I
 
V
N
 
N
G
 
S
Y
 
Y
K
 
K
R
|
R
L
 
L
Q
 
V
P
 
P
G
|
G
A
x
Y
F
x
E
A
 
A
P
 
P
H
 
C
W
 
Y
I
 
I
T
 
A
W
 
W
G
 
S
Y
 
G
D
 
K
H
 
N
R
|
R
E
 
S
T
 
P
M
 
L
I
 
I
R
 
R
V
 
V
P
 
P
P
 
S
A
 
S
R
 
R
G
 
G
K
 
L
A
 
S
T
 
T
R
 
R
I
 
I
E
|
E
N
 
V
R
 
R
L
 
S
P
 
V
G
 
D
A
 
P
D
 
A
T
 
A
D
 
N
P
 
P
Y
 
Y
L
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
I
L
 
L
A
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
I
E
 
K
R
 
N
R
 
K
I
 
L
D
 
K
P
 
V
G
 
P
D
 
E
P
 
P
V
 
V
A
 
-
D
 
N
R
 
Q
P
 
N
V
 
I
S
x
Y
E
 
E
M
 
M
-
 
N
-
 
R
-
 
E
-
 
E
-
 
R
-
 
E
-
 
A
-
 
V
A
 
G
A
 
I
P
 
Q
L
 
D
L
 
L
P
 
P
R
 
S
S
 
T
L
 
L
S
 
Y
E
 
T
A
 
A
L
 
L
D
 
K
A
 
A
F
 
M
E
 
R
E
 
E
D
 
N
P
 
E
W
 
V
T
 
I
E
 
K
E
 
K
V
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
N
S
 
H
F
 
I
K
 
Y
E
 
N
Q
 
Q
F
 
F
L
 
I
R
 
N
L
 
S
R
 
K
R
 
S
A
 
I
E
 
E
V
 
W
E
 
D
R
x
Y
F
 
Y
F
 
R
R
 
T
H
 
Q
V
 
V
T
 
S
D
 
E
W
 
W
E
 
E
W
 
R
M
 
D
E
x
Q
Y
 
Y

Sites not aligning to the query:

7tf9S L. Monocytogenes gs(14)-q-glnr peptide (see paper)
30% identity, 99% coverage: 8:467/467 of query aligns to 6:443/443 of 7tf9S

query
sites
7tf9S
Q
 
E
E
 
D
V
 
I
Q
 
F
Q
 
R
M
 
F
I
 
A
Q
 
D
A
 
E
H
 
Q
Q
 
N
I
 
V
Q
 
K
L
 
F
V
 
I
R
 
R
V
 
L
C
 
Q
V
 
F
Q
 
T
D
 
D
L
 
I
G
 
L
H
 
G
M
 
I
S
 
I
R
 
K
C
 
N
R
 
V
E
 
E
V
 
I
P
 
P
S
 
V
G
 
S
R
 
Q
F
 
-
L
 
L
E
 
K
R
 
K
M
 
A
A
 
L
T
 
D
D
 
N
G
 
K
L
 
I
S
 
M
F
 
F
P
 
D
S
 
G
A
 
S
L
 
-
F
 
-
A
 
S
F
 
I
D
 
E
S
 
G
S
x
F
A
x
V
R
 
R
I
 
I
V
 
E
P
 
E
G
 
S
A
 
-
G
 
-
P
 
-
G
 
-
P
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
Y
 
-
P
 
-
S
 
D
W
 
M
H
 
Y
L
 
L
Q
 
F
P
 
P
D
 
D
L
 
L
S
 
D
T
 
T
F
 
W
S
 
V
V
 
V
L
 
F
P
 
P
Y
 
W
A
 
T
P
 
A
-
 
E
-
 
K
-
 
G
G
 
K
V
 
V
A
 
A
R
 
R
V
 
M
I
 
I
A
 
C
D
 
D
P
 
I
F
 
Y
E
 
N
A
 
P
K
 
D
G
 
M
Q
 
T
P
 
P
V
 
F
D
 
A
Y
 
G
A
 
D
P
 
P
R
 
R
H
 
A
V
 
N
L
 
L
R
 
K
R
 
R
V
 
V
L
 
L
E
 
K
R
 
E
A
 
M
R
 
E
A
 
E
A
 
L
G
 
G
F
 
F
-
 
T
Q
 
E
V
 
F
K
 
N
G
 
L
S
 
G
F
 
P
E
|
E
F
 
P
E
|
E
F
 
F
Y
 
F
A
 
L
F
 
F
A
 
K
R
 
L
D
 
D
G
 
E
D
 
N
S
 
R
R
 
R
G
 
-
Q
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
S
 
-
P
 
-
D
 
P
A
 
T
I
 
L
S
 
E
P
 
L
G
 
N
P
 
D
S
 
S
S
 
G
P
 
G
H
x
Y
P
 
F
P
 
D
G
 
L
V
 
A
P
 
P
A
 
T
W
 
D
T
 
L
G
 
G
L
 
E
Q
 
N
C
 
C
F
 
R
S
 
R
E
 
D
I
 
I
K
 
-
Q
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
-
I
 
-
H
 
-
L
 
-
V
 
V
Q
 
L
T
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
E
M
 
M
G
 
G
A
 
F
R
 
E
P
 
I
E
 
E
V
 
A
A
 
S
N
 
H
T
 
H
E
|
E
Y
 
V
G
 
A
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
F
 
H
E
|
E
I
 
I
S
 
D
Y
 
F
A
 
K
P
 
Y
Y
 
E
W
 
D
N
 
A
L
 
I
E
 
T
I
 
A
A
 
C
D
 
D
M
 
S
A
 
I
F
 
Q
Y
 
T
Y
 
F
R
 
K
T
 
L
T
 
V
I
 
V
R
 
K
E
 
T
V
 
I
L
 
A
A
 
R
Q
 
K
H
 
H
G
 
G
L
 
L
K
 
H
A
 
A
T
 
T
F
 
F
M
 
M
S
 
P
K
 
K
P
 
P
L
 
L
S
 
F
G
 
G
F
 
V
S
 
N
G
|
G
S
 
S
G
|
G
A
 
M
H
|
H
L
 
F
H
 
N
H
 
M
V
 
S
L
 
L
H
 
F
G
 
N
S
 
E
D
 
K
G
 
G
A
 
-
N
 
N
A
 
A
F
 
F
A
 
F
D
 
D
P
 
E
K
 
S
A
 
G
R
 
E
D
 
L
G
 
E
L
 
L
S
 
S
Q
 
Q
L
 
T
C
 
A
R
 
Y
W
 
H
F
 
F
I
 
L
G
 
A
G
 
G
Q
 
M
L
 
L
A
 
K
H
 
H
A
 
A
R
 
R
T
 
G
V
 
Y
S
 
T
A
 
A
L
 
V
M
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
T
I
 
I
N
 
N
G
 
S
Y
 
F
K
 
K
R
|
R
L
 
L
Q
 
V
P
 
P
G
 
G
A
 
Y
F
x
E
A
 
A
P
 
P
H
 
C
W
 
Y
I
 
I
T
 
A
W
 
W
G
 
S
Y
 
G
D
 
K
H
 
N
R
 
R
E
 
S
T
 
P
M
 
L
I
 
V
R
 
R
V
 
V
P
 
P
P
 
S
A
 
S
R
 
R
G
 
G
K
 
L
A
 
S
T
 
T
R
 
R
I
 
L
E
|
E
N
 
L
R
 
R
L
 
S
P
 
V
G
 
D
A
 
P
D
 
S
T
 
A
D
 
N
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
L
 
M
A
 
A
A
 
V
A
 
L
L
 
L
A
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
S
G
 
G
I
 
I
E
 
K
R
 
D
R
 
E
I
 
L
D
 
T
P
 
P
G
 
P
D
 
A
P
 
P
V
 
V
A
 
-
D
 
D
R
 
R
P
 
N
V
 
I
S
 
Y
E
 
G
M
 
M
A
 
N
A
 
E
P
 
E
L
 
E
-
 
R
-
 
E
-
 
A
-
 
T
-
 
G
-
 
I
-
 
Y
-
 
D
L
 
L
P
 
P
R
 
E
S
 
S
L
 
L
S
 
G
E
 
H
A
 
A
L
 
L
D
 
I
A
 
E
F
 
L
E
 
E
E
 
K
D
 
N
P
 
E
W
 
I
T
 
I
E
 
K
E
 
D
V
 
G
F
 
L
G
 
G
R
 
E
S
 
H
F
 
I
K
 
F
E
 
E
Q
 
H
F
 
F
L
 
I
R
x
E
L
 
A
R
 
K
R
 
T
A
x
I
E
 
E
V
 
C
E
 
D
R
x
M
F
 
F
F
 
R
R
 
T
H
 
A
V
 
V
T
 
H
D
 
P
W
 
W
E
 
E
W
 
R
M
 
E
E
 
Q
Y
 
Y
E
 
L
D
 
E
I
 
I
F
 
Y

7tenA Glutamine synthetase (see paper)
30% identity, 99% coverage: 8:467/467 of query aligns to 5:442/442 of 7tenA

query
sites
7tenA
Q
 
E
E
 
D
V
 
I
Q
 
F
Q
 
R
M
 
F
I
 
A
Q
 
D
A
 
E
H
 
Q
Q
 
N
I
 
V
Q
 
K
L
 
F
V
 
I
R
 
R
V
 
L
C
 
Q
V
 
F
Q
 
T
D
 
D
L
 
I
G
 
L
H
 
G
M
 
I
S
 
I
R
 
K
C
 
N
R
 
V
E
 
E
V
 
I
P
 
P
S
 
V
G
 
S
R
 
Q
F
 
-
L
 
L
E
 
K
R
 
K
M
 
A
A
 
L
T
 
D
D
 
N
G
 
K
L
 
I
S
 
M
F
 
F
P
 
D
S
 
G
A
 
S
L
 
-
F
 
-
A
 
S
F
 
I
D
 
E
S
 
G
S
 
F
A
 
V
R
 
R
I
 
I
V
 
E
P
 
E
G
 
S
A
 
-
G
 
-
P
 
-
G
 
-
P
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
Y
 
-
P
 
-
S
 
D
W
 
M
H
 
Y
L
 
L
Q
 
F
P
 
P
D
 
D
L
 
L
S
 
D
T
 
T
F
 
W
S
 
V
V
 
V
L
 
F
P
 
P
Y
 
W
A
 
T
P
 
A
-
 
E
-
 
K
-
 
G
G
 
K
V
 
V
A
 
A
R
 
R
V
 
M
I
 
I
A
 
C
D
 
D
P
 
I
F
 
Y
E
 
N
A
 
P
K
 
D
G
 
M
Q
 
T
P
 
P
V
 
F
D
 
A
Y
 
G
A
 
D
P
 
P
R
 
R
H
 
A
V
 
N
L
 
L
R
 
K
R
 
R
V
 
V
L
 
L
E
 
K
R
 
E
A
 
M
R
 
E
A
 
E
A
 
L
G
 
G
F
 
F
-
 
T
Q
 
E
V
 
F
K
 
N
G
 
L
S
x
G
F
 
P
E
|
E
F
 
P
E
|
E
F
 
F
Y
 
F
A
 
L
F
 
F
A
 
K
R
 
L
D
 
D
G
 
E
D
 
N
S
 
R
R
 
R
G
 
-
Q
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
S
 
-
P
 
-
D
 
P
A
 
T
I
 
L
S
 
E
P
 
L
G
 
N
P
 
D
S
 
S
S
 
G
P
 
G
H
 
Y
P
 
F
P
 
D
G
 
L
V
 
A
P
 
P
A
 
T
W
 
D
T
 
L
G
 
G
L
 
E
Q
 
N
C
 
C
F
 
R
S
 
R
E
 
D
I
 
I
K
 
-
Q
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
-
I
 
-
H
 
-
L
 
-
V
 
V
Q
 
L
T
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
E
M
 
M
G
 
G
A
 
F
R
 
E
P
 
I
E
|
E
V
 
A
A
 
S
N
 
H
T
 
H
E
|
E
Y
 
V
G
 
A
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
F
 
H
E
|
E
I
 
I
S
x
D
Y
x
F
A
x
K
P
x
Y
Y
 
E
W
 
D
N
 
A
L
 
I
E
 
T
I
 
A
A
 
C
D
 
D
M
 
S
A
 
I
F
 
Q
Y
 
T
Y
 
F
R
 
K
T
 
L
T
 
V
I
 
V
R
 
K
E
 
T
V
 
I
L
 
A
A
 
R
Q
 
K
H
 
H
G
 
G
L
 
L
K
 
H
A
 
A
T
 
T
F
 
F
M
 
M
S
 
P
K
 
K
P
 
P
L
 
L
S
 
F
G
 
G
F
 
V
S
x
N
G
|
G
S
 
S
G
 
G
A
 
M
H
|
H
L
 
F
H
x
N
H
 
M
V
x
S
L
 
L
H
 
F
G
 
N
S
 
E
D
 
K
G
 
G
A
 
-
N
 
N
A
 
A
F
 
F
A
 
F
D
 
D
P
 
E
K
 
S
A
 
G
R
 
E
D
 
L
G
 
E
L
 
L
S
 
S
Q
 
Q
L
 
T
C
 
A
R
 
Y
W
 
H
F
 
F
I
 
L
G
 
A
G
 
G
Q
 
M
L
 
L
A
 
K
H
 
H
A
 
A
R
 
R
T
 
G
V
 
Y
S
 
T
A
 
A
L
 
V
M
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
T
I
 
I
N
 
N
G
 
S
Y
 
F
K
 
K
R
|
R
L
 
L
Q
 
V
P
 
P
G
 
G
A
 
Y
F
x
E
A
 
A
P
 
P
H
 
C
W
 
Y
I
 
I
T
 
A
W
 
W
G
 
S
Y
 
G
D
 
K
H
 
N
R
|
R
E
 
S
T
 
P
M
 
L
I
 
V
R
|
R
V
 
V
P
 
P
P
 
S
A
 
S
R
 
R
G
 
G
K
 
L
A
x
S
T
 
T
R
|
R
I
 
L
E
 
E
N
 
L
R
|
R
L
 
S
P
 
V
G
 
D
A
 
P
D
 
S
T
 
A
D
 
N
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
L
 
M
A
 
A
A
 
V
A
 
L
L
 
L
A
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
S
G
 
G
I
 
I
E
 
K
R
 
D
R
 
E
I
 
L
D
 
T
P
 
P
G
 
P
D
 
A
P
 
P
V
 
V
A
 
-
D
 
D
R
 
R
P
 
N
V
 
I
S
 
Y
E
 
G
M
 
M
A
 
N
A
 
E
P
 
E
L
 
E
-
 
R
-
 
E
-
 
A
-
 
T
-
 
G
-
 
I
-
 
Y
-
 
D
L
 
L
P
 
P
R
 
E
S
 
S
L
 
L
S
 
G
E
 
H
A
 
A
L
 
L
D
 
I
A
 
E
F
 
L
E
 
E
E
 
K
D
 
N
P
 
E
W
 
I
T
 
I
E
 
K
E
 
D
V
 
G
F
 
L
G
 
G
R
 
E
S
 
H
F
 
I
K
 
F
E
 
E
Q
 
H
F
 
F
L
 
I
R
 
E
L
 
A
R
 
K
R
 
T
A
 
I
E
 
E
V
 
C
E
 
D
R
 
M
F
 
F
F
 
R
R
 
T
H
 
A
V
 
V
T
 
H
D
 
P
W
 
W
E
 
E
W
 
R
M
 
E
E
 
Q
Y
 
Y
E
 
L
D
 
E
I
 
I
F
 
Y

A0R083 Glutamine synthetase; GS; Glutamate--ammonia ligase; Glutamine synthetase I alpha; GSI alpha; EC 6.3.1.2 from Mycolicibacterium smegmatis (strain ATCC 700084 / mc(2)155) (Mycobacterium smegmatis) (see paper)
32% identity, 97% coverage: 10:463/467 of query aligns to 8:443/446 of A0R083

query
sites
A0R083
V
 
V
Q
 
L
Q
 
R
M
 
T
I
 
L
Q
 
E
A
 
E
H
 
R
Q
 
D
I
 
I
Q
 
R
L
 
F
V
 
V
R
 
R
V
 
L
C
 
W
V
 
F
Q
 
T
D
 
D
-
 
V
L
 
L
G
 
G
H
 
Y
M
 
L
S
 
K
R
 
S
C
 
V
R
 
A
E
 
I
V
 
A
P
 
P
S
 
A
-
 
E
-
 
L
-
 
E
G
 
G
R
 
A
F
 
F
L
 
E
E
 
E
R
 
G
M
 
I
A
 
G
T
 
F
D
 
D
G
 
G
L
 
S
S
 
S
F
 
I
P
 
E
-
 
G
-
 
F
S
 
A
A
 
R
L
 
V
F
 
F
A
 
E
F
 
S
D
 
D
S
 
T
S
 
V
A
 
A
R
 
R
I
 
-
V
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
P
 
-
G
 
-
P
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
Y
 
-
P
 
-
S
 
-
W
 
-
H
 
-
L
 
-
Q
 
-
P
 
P
D
 
D
L
 
P
S
 
S
T
 
T
F
 
F
S
 
Q
V
 
V
L
 
L
P
 
P
Y
 
W
A
 
K
P
 
T
G
 
S
-
 
D
-
 
G
-
 
N
-
 
H
-
 
Y
V
 
S
A
 
A
R
 
R
V
 
M
I
 
F
A
 
C
D
 
D
P
 
I
F
 
T
E
 
M
A
 
P
K
 
D
G
 
G
Q
 
S
P
 
P
V
 
S
D
 
W
Y
 
A
A
 
D
P
 
S
R
 
R
H
 
H
V
 
V
L
 
L
R
 
R
R
 
R
V
 
Q
L
 
L
E
 
A
R
 
K
A
 
A
R
 
S
A
 
D
A
 
L
G
 
G
F
 
F
Q
 
T
V
 
C
K
 
Y
G
 
V
S
 
H
F
 
P
E
 
E
F
 
I
E
 
E
F
 
F
Y
 
F
A
 
L
F
 
-
A
 
-
R
 
-
D
 
-
G
 
-
D
 
-
S
 
-
R
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
S
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
L
S
 
K
P
 
P
G
 
G
P
 
P
S
 
N
S
 
D
P
 
G
H
 
T
P
 
P
P
 
P
G
 
E
V
 
-
P
 
P
A
 
A
W
 
D
T
 
N
G
 
G
L
 
-
Q
 
G
C
 
Y
F
 
F
S
 
D
E
 
Q
I
 
A
K
 
V
Q
 
H
A
 
D
A
 
A
L
 
A
E
 
P
P
 
N
L
 
F
L
 
R
I
 
R
H
 
H
L
 
A
V
 
I
Q
 
E
T
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
Q
M
 
M
G
 
G
A
 
I
R
 
S
P
 
V
E
 
E
V
 
F
A
 
S
N
 
H
T
 
H
E
 
E
Y
 
G
G
 
A
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
F
 
Q
E
 
E
I
 
I
S
 
D
Y
 
L
A
 
R
P
 
Y
Y
 
A
W
 
D
N
 
A
L
 
L
E
 
S
I
 
M
A
 
A
D
 
D
M
 
N
A
 
V
F
 
M
Y
 
T
Y
 
F
R
 
R
T
 
Y
T
 
L
I
 
V
R
 
K
E
 
E
V
 
V
L
 
A
A
 
L
Q
 
A
H
 
D
G
 
G
L
 
V
K
 
R
A
 
A
T
 
S
F
 
F
M
 
M
S
 
P
K
 
K
P
 
P
L
 
F
S
 
A
G
 
E
F
 
H
S
 
P
G
 
G
S
 
S
G
 
A
A
 
M
H
 
H
L
 
T
H
 
H
H
 
M
V
 
S
L
 
L
H
 
F
G
 
E
S
 
G
D
 
D
G
 
-
A
 
T
N
 
N
A
 
A
F
 
F
A
 
H
D
 
S
P
 
P
K
 
D
A
 
D
R
 
P
D
 
L
G
 
Q
L
 
L
S
 
S
Q
 
D
L
 
V
C
 
A
R
 
K
W
 
S
F
 
F
I
 
I
G
 
A
G
 
G
Q
 
I
L
 
L
A
 
E
H
 
H
A
 
A
R
 
N
T
 
E
V
 
I
S
 
S
A
 
A
L
 
V
M
 
T
N
 
N
P
 
Q
T
 
W
I
 
V
N
 
N
G
 
S
Y
 
Y
K
 
K
R
 
R
L
 
L
Q
 
V
P
 
H
G
 
G
A
 
G
F
 
E
A
 
A
P
 
P
H
 
T
W
 
A
I
 
A
T
 
S
W
 
W
G
 
G
Y
 
A
D
 
A
H
 
N
R
 
R
E
 
S
T
 
A
M
 
L
I
 
V
R
 
R
V
 
V
P
 
P
-
 
M
-
 
Y
-
 
T
P
 
P
A
 
H
R
 
K
G
 
V
K
 
S
A
 
S
T
 
R
R
 
R
I
 
V
E
 
E
N
 
V
R
 
R
L
 
S
P
 
P
G
 
D
A
 
S
D
 
A
T
 
C
D
 
N
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
A
 
T
L
 
F
A
 
A
A
 
V
A
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
R
G
 
G
I
 
V
E
 
E
R
x
K
R
 
G
I
 
Y
D
 
V
P
 
L
G
 
G
D
 
P
P
 
Q
V
 
A
A
 
E
D
 
D
R
 
N
P
 
V
V
 
W
S
 
S
-
 
L
-
 
T
-
 
Q
-
 
E
-
 
E
-
 
R
-
 
R
E
 
A
M
 
M
A
 
G
A
 
Y
P
 
R
L
 
E
L
 
L
P
 
P
R
 
T
S
 
S
L
 
L
S
 
G
E
 
N
A
 
A
L
 
L
D
 
E
A
 
S
F
 
M
E
 
E
E
 
N
D
 
S
P
 
E
W
 
L
T
 
V
E
 
A
E
 
E
V
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
E
S
 
H
F
 
V
K
 
F
E
 
D
Q
 
Y
F
 
F
L
 
L
R
 
R
L
 
N
R
 
K
R
 
R
A
 
S
E
 
E
V
 
W
E
 
E
R
 
N
F
 
Y
F
 
R
R
 
S
H
 
H
V
 
V
T
 
T
D
 
P
W
 
Y
E
 
E
W
 
L
M
 
K
E
 
N
Y
 
Y

P78061 Gamma-glutamylputrescine synthetase PuuA; Gamma-Glu-Put synthetase; Glutamate--putrescine ligase; EC 6.3.1.11 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
29% identity, 98% coverage: 6:461/467 of query aligns to 23:468/472 of P78061

query
sites
P78061
W
 
F
H
 
T
Q
 
Q
E
 
E
V
 
V
Q
 
K
Q
 
R
M
 
Y
I
 
L
Q
 
E
A
 
R
H
 
Y
-
 
P
Q
 
N
I
 
T
Q
 
Q
L
 
Y
V
 
V
R
 
D
V
 
V
C
 
L
V
 
L
Q
 
T
D
 
D
L
 
L
G
 
N
H
 
G
M
 
C
S
 
F
R
 
R
C
 
G
R
 
K
E
 
R
V
 
I
P
 
P
S
 
V
G
 
S
R
 
S
F
 
L
L
 
-
E
 
-
R
 
K
M
 
K
A
 
L
T
 
E
D
 
K
G
 
G
L
 
C
S
 
Y
F
 
F
P
 
P
S
 
A
A
 
S
L
 
V
F
 
F
A
 
A
F
 
M
D
 
D
S
 
I
S
 
L
A
 
G
R
 
N
I
 
V
V
 
V
P
 
E
G
 
E
A
 
A
G
 
G
P
 
L
G
 
G
P
 
Q
R
 
E
S
 
M
G
 
G
Y
 
E
P
 
P
S
 
D
W
 
R
H
 
T
L
 
C
Q
 
V
P
 
P
D
 
V
L
 
L
S
 
G
T
 
S
F
 
L
S
 
T
V
 
P
L
 
S
P
 
A
Y
 
A
A
 
D
P
 
P
G
 
E
-
 
F
V
 
I
A
 
G
R
 
Q
V
 
M
I
 
L
A
 
L
D
 
T
P
 
M
F
 
V
E
 
D
A
 
E
K
 
D
G
 
G
Q
 
A
P
 
P
V
 
F
D
 
D
Y
 
V
A
 
E
P
 
P
R
 
R
H
 
N
V
 
V
L
 
L
R
 
N
R
 
R
V
 
L
L
 
W
E
 
Q
R
 
Q
A
 
L
R
 
R
A
 
Q
A
 
R
G
 
G
F
 
L
Q
 
F
V
 
P
K
 
V
G
 
V
S
 
A
F
 
V
E
 
E
F
 
L
E
 
E
F
 
F
Y
 
Y
A
 
L
F
 
L
A
 
D
R
 
R
D
 
Q
G
 
R
D
 
D
S
 
A
R
 
E
G
 
G
-
 
Y
-
 
L
Q
 
Q
A
 
P
P
 
P
V
 
C
S
 
A
P
 
P
D
 
G
A
 
T
I
 
D
S
 
D
P
 
R
G
 
N
P
 
T
S
 
Q
S
 
S
P
 
Q
H
 
-
P
 
-
P
 
-
G
 
-
V
 
V
P
 
Y
A
 
S
W
 
V
T
 
D
G
 
N
L
 
L
Q
 
N
C
 
H
F
 
F
S
 
A
E
 
D
I
 
V
K
 
L
Q
 
N
A
 
D
A
 
I
L
 
D
E
 
E
P
 
-
L
 
-
L
 
-
I
 
L
H
 
A
L
 
Q
V
 
L
Q
 
Q
T
 
L
L
 
I
E
 
P
A
 
A
M
 
D
G
 
G
A
 
A
R
 
V
P
 
A
E
 
E
V
 
A
A
 
S
N
 
-
T
 
-
E
 
-
Y
 
-
G
 
-
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
E
 
E
I
 
I
S
 
N
Y
 
L
A
 
Y
P
 
H
Y
 
T
W
 
D
N
 
N
-
 
V
L
 
L
E
 
E
I
 
A
A
 
C
D
 
D
M
 
D
A
 
A
F
 
L
Y
 
A
Y
 
L
R
 
K
T
 
R
T
 
L
I
 
V
R
 
R
E
 
L
V
 
M
L
 
A
A
 
E
Q
 
K
H
 
H
G
 
K
L
 
M
K
 
H
A
 
A
T
 
T
F
 
F
M
 
M
S
 
A
K
 
K
P
 
P
L
 
Y
S
 
E
G
 
E
F
 
H
S
 
A
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
M
H
|
H
L
 
I
H
 
H
H
 
I
V
 
S
L
 
M
H
 
Q
G
 
N
S
 
N
D
 
R
G
 
G
A
 
E
N
 
N
A
 
V
F
 
L
A
 
S
D
 
D
P
 
A
K
 
E
A
 
G
R
 
E
D
 
D
G
 
-
L
 
-
S
 
S
Q
 
P
L
 
L
C
 
L
R
 
K
W
 
K
F
 
M
I
 
L
G
 
A
G
 
G
Q
 
M
L
 
I
A
 
D
H
 
L
A
 
M
R
 
P
T
 
S
V
 
S
S
 
M
A
 
A
L
 
L
M
 
L
N
 
A
P
 
P
T
 
N
I
 
V
N
 
N
G
 
S
Y
 
Y
K
 
R
R
 
R
L
 
F
Q
 
Q
P
 
P
G
 
G
A
 
M
F
 
Y
A
 
V
P
 
P
H
 
T
W
 
Q
I
 
A
T
 
S
W
 
W
G
 
G
Y
 
H
D
 
N
H
 
N
R
 
R
E
 
T
T
 
V
M
 
A
I
 
L
R
|
R
V
 
I
P
 
P
P
 
C
A
 
G
R
 
D
G
 
R
K
 
H
A
 
N
T
 
H
R
 
R
I
 
V
E
 
E
N
 
Y
R
 
R
L
 
V
P
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
T
 
A
D
 
N
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
A
 
V
L
 
M
A
 
A
A
 
A
A
 
I
L
 
F
A
 
A
A
 
G
G
 
I
L
 
L
D
 
H
G
 
G
I
 
L
E
 
D
R
 
N
R
 
E
I
 
L
D
 
P
P
 
L
G
 
Q
D
 
E
P
 
E
V
 
V
A
 
E
D
 
G
R
 
N
P
 
G
V
 
L
S
 
E
E
 
Q
M
 
E
A
 
G
A
 
L
P
 
P
L
 
-
L
 
F
P
 
P
R
 
I
S
 
R
L
 
Q
S
 
S
E
 
D
A
 
A
L
 
L
D
 
G
A
 
E
F
 
F
E
 
I
E
 
E
D
 
N
P
 
D
W
 
H
T
 
L
E
 
R
E
 
R
V
 
Y
F
 
L
G
 
G
R
 
E
S
 
R
F
 
F
K
 
C
E
 
H
Q
 
V
F
 
Y
L
 
H
R
 
A
L
 
C
R
 
K
R
 
N
A
 
D
E
 
E
V
 
L
E
 
L
R
 
Q
F
 
F
F
 
E
R
 
R
H
 
L
V
 
I
-
 
T
-
 
E
T
 
T
D
 
E
W
 
I
E
 
E
W
 
W
M
 
M

Query Sequence

>WP_013075381.1 NCBI__GCF_000092905.1:WP_013075381.1
MTPPDWHQEVQQMIQAHQIQLVRVCVQDLGHMSRCREVPSGRFLERMATDGLSFPSALFA
FDSSARIVPGAGPGPRSGYPSWHLQPDLSTFSVLPYAPGVARVIADPFEAKGQPVDYAPR
HVLRRVLERARAAGFQVKGSFEFEFYAFARDGDSRGQAPVSPDAISPGPSSPHPPGVPAW
TGLQCFSEIKQAALEPLLIHLVQTLEAMGARPEVANTEYGPGQFEISYAPYWNLEIADMA
FYYRTTIREVLAQHGLKATFMSKPLSGFSGSGAHLHHVLHGSDGANAFADPKARDGLSQL
CRWFIGGQLAHARTVSALMNPTINGYKRLQPGAFAPHWITWGYDHRETMIRVPPARGKAT
RIENRLPGADTDPYLALAAALAAGLDGIERRIDPGDPVADRPVSEMAAPLLPRSLSEALD
AFEEDPWTEEVFGRSFKEQFLRLRRAEVERFFRHVTDWEWMEYEDIF

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory