SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_013093107.1 NCBI__GCF_000092885.1:WP_013093107.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P33160 Formate dehydrogenase; FDH; NAD-dependent formate dehydrogenase; EC 1.17.1.9 from Pseudomonas sp. (strain 101) (Achromobacter parvulus T1) (see 3 papers)
73% identity, 100% coverage: 1:386/386 of query aligns to 1:385/401 of P33160

query
sites
P33160
M
|
M
A
 
A
K
 
K
I
 
V
L
 
L
C
 
C
A
 
V
L
 
L
F
 
Y
P
 
D
D
 
D
P
 
P
V
 
V
T
 
D
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
P
 
K
S
 
T
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
T
 
D
D
 
D
V
 
L
P
 
P
S
 
K
I
 
I
A
 
D
S
 
H
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
T
P
 
L
P
 
P
S
 
T
P
 
P
K
 
K
G
 
A
P
 
-
L
 
I
G
 
D
F
 
F
K
 
T
P
 
P
G
 
G
E
 
Q
L
 
L
V
 
L
G
 
G
S
 
S
V
 
V
S
 
S
G
 
G
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
R
 
R
H
 
K
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
S
 
S
Q
 
N
G
 
G
H
 
H
E
 
T
L
 
L
I
 
V
V
 
V
T
 
T
S
 
S
D
 
D
K
 
K
D
 
D
G
 
G
P
 
P
D
 
D
S
 
S
I
 
V
F
 
F
E
 
E
R
 
R
H
 
E
L
 
L
C
 
V
D
 
D
A
 
A
D
 
D
I
 
V
V
 
V
I
 
I
S
 
S
Q
 
Q
P
 
P
F
 
F
W
 
W
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
T
 
T
R
 
P
E
 
E
R
 
R
I
 
I
A
 
A
K
 
K
A
 
A
K
 
K
K
 
N
L
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
A
L
 
L
T
 
T
A
 
A
G
 
G
I
|
I
G
 
G
S
 
S
D
 
D
H
 
H
V
 
V
D
 
D
L
 
L
Q
 
Q
A
 
S
A
 
A
A
 
I
E
 
D
R
 
R
D
 
N
I
 
V
T
 
T
V
 
V
A
 
A
E
 
E
V
 
V
T
 
T
F
 
Y
S
 
C
N
|
N
S
|
S
I
 
I
S
 
S
V
 
V
A
 
A
E
 
E
H
 
H
V
 
V
V
 
V
M
 
M
T
 
M
V
 
I
L
 
L
A
 
S
L
 
L
V
 
V
R
 
R
N
 
N
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
S
 
S
H
 
H
Q
 
E
Y
 
W
A
 
A
V
 
R
N
 
K
G
 
G
G
 
G
W
 
W
N
 
N
I
 
I
A
 
A
D
 
D
C
 
C
V
 
V
A
 
S
R
 
H
S
 
A
Y
 
Y
D
 
D
L
 
L
E
 
E
G
 
A
M
 
M
H
 
H
F
 
V
G
 
G
T
 
T
I
 
V
G
 
A
A
 
A
G
 
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
V
L
 
L
R
 
R
R
 
R
L
 
L
K
 
A
P
 
P
F
 
F
D
 
D
V
 
V
H
 
H
L
 
L
H
 
H
Y
 
Y
Y
 
T
D
|
D
P
 
R
H
 
H
R
 
R
L
 
L
S
 
P
P
 
E
E
 
S
L
 
V
E
 
E
R
 
K
E
 
E
L
 
L
N
 
N
V
 
L
T
 
T
F
 
W
H
 
H
S
 
A
S
 
T
A
 
R
E
 
E
S
 
D
L
 
M
V
 
Y
R
 
P
V
 
V
C
 
C
D
 
D
V
 
V
I
 
V
N
 
T
L
 
L
Q
 
N
S
x
C
P
|
P
L
|
L
Y
x
H
P
|
P
S
x
E
T
 
T
E
 
E
H
 
H
M
 
M
F
 
I
N
 
N
D
 
D
A
 
E
M
 
T
L
 
L
A
 
K
Q
 
L
I
 
F
K
 
K
P
 
R
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
L
 
I
I
 
V
N
 
N
C
x
T
A
 
A
R
 
R
G
 
G
K
 
K
L
 
L
C
 
C
D
 
D
A
 
R
D
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
E
S
 
S
G
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
G
 
A
G
 
G
D
|
D
V
 
V
W
 
W
F
 
F
P
 
P
Q
 
Q
P
 
P
A
 
A
P
 
P
A
 
K
E
 
D
H
 
H
P
 
P
W
 
W
R
 
R
S
 
T
M
 
M
P
 
P
N
 
Y
E
 
N
G
 
G
M
 
M
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
|
I
S
|
S
G
|
G
A
 
T
S
 
T
L
 
L
S
 
T
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
T
R
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
L
E
 
E
C
 
C
F
 
F
L
 
F
E
 
E
G
 
G
R
 
R
A
 
P
I
 
I
R
 
R
A
 
D
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
I
 
I
V
 
V
N
 
Q
G
 
G
G
 
G
K
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
H
S
|
S
Y
 
Y
K
 
S
L
 
K
G
 
G

2nadA High resolution structures of holo and apo formate dehydrogenase (see paper)
73% identity, 100% coverage: 2:386/386 of query aligns to 1:384/391 of 2nadA

query
sites
2nadA
A
 
A
K
 
K
I
 
V
L
 
L
C
 
C
A
 
V
L
 
L
F
 
Y
P
 
D
D
 
D
P
 
P
V
 
V
T
 
D
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
P
 
K
S
 
T
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
T
 
D
D
 
D
V
 
L
P
 
P
S
 
K
I
 
I
A
 
D
S
 
H
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
T
P
 
L
P
 
P
S
 
T
P
 
P
K
 
K
G
 
A
P
 
-
L
 
I
G
 
D
F
 
F
K
 
T
P
 
P
G
 
G
E
 
Q
L
 
L
V
 
L
G
 
G
S
 
S
V
 
V
S
 
S
G
 
G
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
R
 
R
H
 
K
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
S
 
S
Q
 
N
G
 
G
H
 
H
E
 
T
L
 
L
I
 
V
V
 
V
T
 
T
S
 
S
D
 
D
K
 
K
D
 
D
G
 
G
P
 
P
D
 
D
S
 
S
I
 
V
F
 
F
E
 
E
R
 
R
H
 
E
L
 
L
C
 
V
D
 
D
A
 
A
D
 
D
I
 
V
V
 
V
I
 
I
S
 
S
Q
 
Q
P
|
P
F
|
F
W
 
W
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
T
 
T
R
 
P
E
 
E
R
 
R
I
 
I
A
 
A
K
 
K
A
 
A
K
 
K
K
 
N
L
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
A
L
 
L
T
 
T
A
 
A
G
 
G
I
|
I
G
 
G
S
 
S
D
 
D
H
 
H
V
 
V
D
 
D
L
 
L
Q
 
Q
A
 
S
A
 
A
A
 
I
E
 
D
R
 
R
D
 
N
I
 
V
T
 
T
V
 
V
A
 
A
E
 
E
V
 
V
T
 
T
F
 
Y
S
 
C
N
|
N
S
 
S
I
 
I
S
 
S
V
|
V
A
 
A
E
 
E
H
 
H
V
 
V
V
 
V
M
 
M
T
 
M
V
 
I
L
 
L
A
 
S
L
 
L
V
 
V
R
 
R
N
 
N
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
S
 
S
H
 
H
Q
 
E
Y
 
W
A
 
A
V
 
R
N
 
K
G
 
G
G
 
G
W
 
W
N
 
N
I
 
I
A
 
A
D
 
D
C
 
C
V
 
V
A
 
S
R
 
H
S
 
A
Y
 
Y
D
 
D
L
 
L
E
 
E
G
 
A
M
 
M
H
 
H
F
 
V
G
 
G
T
 
T
I
 
V
G
x
A
A
 
A
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
V
L
 
L
R
 
R
R
 
R
L
 
L
K
 
A
P
 
P
F
 
F
D
 
D
V
 
V
H
 
H
L
 
L
H
 
H
Y
 
Y
Y
 
T
D
|
D
P
 
R
H
 
H
R
 
R
L
 
L
S
 
P
P
 
E
E
 
S
L
 
V
E
 
E
R
 
K
E
 
E
L
 
L
N
 
N
V
 
L
T
 
T
F
 
W
H
 
H
S
 
A
S
 
T
A
 
R
E
 
E
S
 
D
L
 
M
V
 
Y
R
 
P
V
 
V
C
 
C
D
 
D
V
 
V
I
 
V
N
 
T
L
 
L
Q
 
N
S
 
C
P
|
P
L
 
L
Y
 
H
P
 
P
S
x
E
T
|
T
E
 
E
H
 
H
M
 
M
F
 
I
N
 
N
D
 
D
A
 
E
M
 
T
L
 
L
A
 
K
Q
 
L
I
 
F
K
 
K
P
 
R
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
L
 
I
I
 
V
N
 
N
C
x
T
A
|
A
R
|
R
G
 
G
K
 
K
L
 
L
C
 
C
D
 
D
A
 
R
D
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
E
S
 
S
G
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
G
 
A
G
 
G
D
|
D
V
 
V
W
 
W
F
 
F
P
 
P
Q
|
Q
P
 
P
A
 
A
P
 
P
A
 
K
E
 
D
H
 
H
P
 
P
W
 
W
R
 
R
S
 
T
M
 
M
P
 
P
N
 
Y
E
 
N
G
 
G
M
 
M
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
S
|
S
G
|
G
A
 
T
S
 
T
L
 
L
S
 
T
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
T
R
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
L
E
 
E
C
 
C
F
 
F
L
 
F
E
 
E
G
 
G
R
 
R
A
 
P
I
 
I
R
 
R
A
 
D
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
I
 
I
V
 
V
N
 
Q
G
 
G
G
 
G
K
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
H
S
|
S
Y
 
Y
K
 
S
L
 
K
G
 
G

6jujA Crystal structure of formate dehydrogenase mutant v198i/c256i/p260s/e261p/s381n/s383f from pseudomonas sp. 101in complex with non-natural cofactor nicotinamide cytosine dinucleotide (see paper)
73% identity, 99% coverage: 2:383/386 of query aligns to 1:381/381 of 6jujA

query
sites
6jujA
A
 
A
K
 
K
I
 
V
L
 
L
C
 
C
A
 
V
L
 
L
F
 
Y
P
 
D
D
 
D
P
 
P
V
 
V
T
 
D
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
P
 
K
S
 
T
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
T
 
D
D
 
D
V
 
L
P
 
P
S
 
K
I
 
I
A
 
D
S
 
H
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
T
P
 
L
P
 
P
S
 
T
P
 
P
K
 
K
G
 
A
P
 
-
L
 
I
G
 
D
F
 
F
K
 
T
P
 
P
G
 
G
E
 
Q
L
 
L
V
 
L
G
 
G
S
 
S
V
 
V
S
 
S
G
 
G
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
R
 
R
H
 
K
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
S
 
S
Q
 
N
G
 
G
H
 
H
E
 
T
L
 
L
I
 
V
V
 
V
T
 
T
S
 
S
D
 
D
K
 
K
D
 
D
G
 
G
P
 
P
D
 
D
S
 
S
I
 
V
F
 
F
E
 
E
R
 
R
H
 
E
L
 
L
C
 
V
D
 
D
A
 
A
D
 
D
I
 
V
V
 
V
I
 
I
S
 
S
Q
 
Q
P
 
P
F
|
F
W
 
W
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
T
 
T
R
 
P
E
 
E
R
 
R
I
 
I
A
 
A
K
 
K
A
 
A
K
 
K
K
 
N
L
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
A
L
 
L
T
 
T
A
 
A
G
 
G
I
 
I
G
 
G
S
 
S
D
 
D
H
 
H
V
 
V
D
 
D
L
 
L
Q
 
Q
A
 
S
A
 
A
A
 
I
E
 
D
R
 
R
D
 
N
I
 
V
T
 
T
V
 
V
A
 
A
E
 
E
V
 
V
T
 
T
F
 
Y
S
 
C
N
|
N
S
 
S
I
 
I
S
 
S
V
|
V
A
 
A
E
 
E
H
 
H
V
 
V
V
 
V
M
 
M
T
 
M
V
 
I
L
 
L
A
 
S
L
 
L
V
 
V
R
 
R
N
 
N
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
S
 
S
H
 
H
Q
 
E
Y
 
W
A
 
A
V
 
R
N
 
K
G
 
G
G
 
G
W
 
W
N
 
N
I
 
I
A
 
A
D
 
D
C
 
C
V
 
V
A
 
S
R
 
H
S
 
A
Y
 
Y
D
 
D
L
 
L
E
 
E
G
 
A
M
 
M
H
 
H
F
 
V
G
 
G
T
 
T
I
 
I
G
 
A
A
 
A
G
|
G
R
 
R
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
V
L
 
L
R
 
R
R
 
R
L
 
L
K
 
A
P
 
P
F
 
F
D
 
D
V
 
V
H
 
H
L
 
L
H
 
H
Y
 
Y
Y
 
T
D
|
D
P
x
R
H
 
H
R
 
R
L
 
L
S
 
P
P
 
E
E
 
S
L
 
V
E
 
E
R
 
K
E
 
E
L
 
L
N
 
N
V
 
L
T
 
T
F
 
W
H
 
H
S
 
A
S
 
T
A
 
R
E
 
E
S
 
D
L
 
M
V
 
Y
R
 
P
V
 
V
C
 
C
D
 
D
V
 
V
I
 
V
N
 
T
L
 
L
Q
 
N
S
x
I
P
|
P
L
 
L
Y
x
H
P
 
S
S
 
P
T
 
T
E
 
E
H
 
H
M
 
M
F
 
I
N
 
N
D
 
D
A
 
E
M
 
T
L
 
L
A
 
K
Q
 
L
I
 
F
K
 
K
P
 
R
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
L
 
I
I
 
V
N
 
N
C
x
T
A
|
A
R
 
R
G
 
G
K
 
K
L
 
L
C
 
C
D
 
D
A
 
R
D
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
E
S
 
S
G
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
G
 
A
G
 
G
D
|
D
V
 
V
W
 
W
F
 
F
P
 
P
Q
 
Q
P
 
P
A
 
A
P
 
P
A
 
K
E
 
D
H
 
H
P
 
P
W
 
W
R
 
R
S
 
T
M
 
M
P
 
P
N
 
Y
E
 
N
G
 
G
M
 
M
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
S
|
S
G
|
G
A
 
T
S
 
T
L
 
L
S
 
T
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
T
R
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
L
E
 
E
C
 
C
F
 
F
L
 
F
E
 
E
G
 
G
R
 
R
A
 
P
I
 
I
R
 
R
A
 
D
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
I
 
I
V
 
V
N
 
Q
G
 
G
G
 
G
K
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
H
S
 
N
Y
 
Y

6t9wB Crystal structure of formate dehydrogenase fdh2 d222a/q223r enzyme from granulicella mallensis mp5actx8 in complex with NADP and azide.
71% identity, 99% coverage: 2:385/386 of query aligns to 1:383/383 of 6t9wB

query
sites
6t9wB
A
 
A
K
 
K
I
 
I
L
 
L
C
 
C
A
 
V
L
 
L
F
 
Y
P
 
D
D
 
D
P
 
P
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
P
 
K
S
 
S
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
T
 
A
D
 
D
V
 
V
P
 
P
S
 
K
I
 
I
A
 
D
S
 
H
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
T
P
 
A
P
 
P
S
 
T
P
 
P
K
 
K
G
 
-
P
 
Q
L
 
I
G
 
D
F
 
F
K
 
T
P
 
P
G
 
G
E
 
E
L
 
L
V
 
L
G
 
G
S
 
S
V
 
V
S
 
S
G
 
G
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
R
 
R
H
 
K
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
S
 
G
Q
 
L
G
 
G
H
 
H
E
 
T
L
 
L
I
 
V
V
 
V
T
 
T
S
 
S
D
 
D
K
 
K
D
 
E
G
 
G
P
 
E
D
 
D
S
 
S
I
 
V
F
 
F
E
 
E
R
 
R
H
 
E
L
 
L
C
 
P
D
 
D
A
 
A
D
 
E
I
 
I
V
 
V
I
 
I
S
 
S
Q
 
Q
P
|
P
F
|
F
W
 
W
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
T
 
T
R
 
P
E
 
E
R
 
R
I
 
I
A
 
A
K
 
K
A
 
A
K
 
K
K
 
K
L
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
A
L
 
V
T
 
T
A
 
A
G
|
G
I
|
I
G
 
G
S
 
S
D
 
D
H
 
H
V
 
V
D
 
D
L
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
I
E
 
K
R
 
N
D
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
A
 
A
E
 
E
V
 
V
T
 
T
F
 
Y
S
 
S
N
|
N
S
|
S
I
 
I
S
 
S
V
|
V
A
 
S
E
 
E
H
 
H
V
 
V
V
 
V
M
 
M
T
 
M
V
 
I
L
 
L
A
 
S
L
 
L
V
 
V
R
 
R
N
 
N
Y
 
Y
L
 
I
P
 
P
S
 
S
H
 
Y
Q
 
Q
Y
 
W
A
 
V
V
 
I
N
 
K
G
 
G
G
 
G
W
 
W
N
 
N
I
 
I
A
 
A
D
 
D
C
 
C
V
 
V
A
 
E
R
 
R
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
L
 
L
E
 
E
G
 
A
M
 
M
H
 
H
F
 
V
G
 
G
T
 
T
I
 
V
G
x
A
A
 
A
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
V
L
 
L
R
 
K
R
 
R
L
 
L
K
 
K
P
 
P
F
 
F
D
 
D
V
 
V
H
 
K
L
 
L
H
 
H
Y
 
Y
Y
x
F
D
 
A
P
x
R
H
 
H
R
 
R
L
 
L
S
 
P
P
 
E
E
 
S
L
 
V
E
 
E
R
 
N
E
 
E
L
 
L
N
 
G
V
 
L
T
 
T
F
 
Y
H
 
H
S
 
P
S
 
S
A
 
V
E
 
E
S
 
D
L
 
M
V
 
V
R
 
K
V
 
V
C
 
C
D
 
D
V
 
V
I
 
V
N
 
T
L
 
I
Q
 
N
S
 
A
P
|
P
L
 
L
Y
x
H
P
 
P
S
 
G
T
|
T
E
 
L
H
 
D
M
 
L
F
 
F
N
 
N
D
 
D
A
 
E
M
 
L
L
 
I
A
 
S
Q
 
K
I
 
M
K
 
K
P
 
R
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
I
 
V
N
 
N
C
x
T
A
|
A
R
|
R
G
 
G
K
 
K
L
 
I
C
 
C
D
 
N
A
 
R
D
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
V
R
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
E
S
 
S
G
 
G
R
 
Q
L
 
L
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
G
 
A
G
 
G
D
|
D
V
 
V
W
 
W
F
 
F
P
 
P
Q
 
Q
P
 
P
A
 
A
P
 
P
A
 
K
E
 
D
H
 
H
P
 
P
W
 
W
R
 
R
S
 
T
M
 
M
P
 
P
N
 
H
E
 
H
G
 
G
M
 
M
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
S
|
S
G
|
G
A
 
T
S
 
S
L
 
L
S
 
S
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
T
R
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
L
E
 
E
C
 
C
F
 
W
L
 
F
E
 
E
G
 
E
R
 
R
A
 
P
I
 
I
R
 
R
A
 
E
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
I
 
I
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G
K
 
K
L
 
L
A
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
H
S
|
S
Y
 
Y
K
 
T
L
 
V

2gsdA NAD-dependent formate dehydrogenase from bacterium moraxella sp.C2 in complex with NAD and azide (see paper)
71% identity, 100% coverage: 2:386/386 of query aligns to 1:384/399 of 2gsdA

query
sites
2gsdA
A
 
A
K
 
K
I
 
V
L
 
V
C
 
C
A
 
V
L
 
L
F
 
Y
P
 
D
D
 
D
P
 
P
V
 
I
T
 
N
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
P
 
T
S
 
S
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
T
 
D
D
 
D
V
 
L
P
 
P
S
 
R
I
 
I
A
 
D
S
 
K
Y
 
Y
P
 
P
G
 
D
G
 
G
Q
 
Q
R
 
T
P
 
L
P
 
P
S
 
T
P
 
P
K
 
K
G
 
A
P
 
-
L
 
I
G
 
D
F
 
F
K
 
T
P
 
P
G
 
G
E
 
A
L
 
L
V
 
L
G
 
G
S
 
S
V
 
V
S
 
S
G
 
G
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
R
 
R
H
 
K
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
S
 
S
Q
 
Q
G
 
G
H
 
H
E
 
E
L
 
L
I
 
V
V
 
V
T
 
T
S
 
S
D
 
S
K
 
K
D
 
D
G
 
G
P
 
P
D
 
D
S
 
S
I
 
E
F
 
L
E
 
E
R
 
K
H
 
H
L
 
L
C
 
H
D
 
D
A
 
A
D
 
E
I
 
V
V
 
I
I
 
I
S
 
S
Q
 
Q
P
|
P
F
|
F
W
 
W
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
T
 
T
R
 
A
E
 
E
R
 
R
I
 
I
A
 
A
K
 
K
A
 
A
K
 
P
K
 
K
L
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
A
L
 
L
T
 
T
A
 
A
G
 
G
I
|
I
G
 
G
S
 
S
D
 
D
H
 
H
V
 
V
D
 
D
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
I
E
 
D
R
 
N
D
 
N
I
 
I
T
 
T
V
 
V
A
 
A
E
 
E
V
 
V
T
 
T
F
 
Y
S
 
C
N
|
N
S
 
S
I
 
N
S
 
S
V
|
V
A
 
A
E
 
E
H
 
H
V
 
V
V
 
V
M
 
M
T
 
M
V
 
V
L
 
L
A
 
G
L
 
L
V
 
V
R
 
R
N
 
N
Y
 
Y
L
 
I
P
 
P
S
 
S
H
 
H
Q
 
D
Y
 
W
A
 
A
V
 
R
N
 
N
G
 
G
G
 
G
W
 
W
N
 
N
I
 
I
A
 
A
D
 
D
C
 
C
V
 
V
A
 
A
R
 
R
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
L
 
V
E
 
E
G
 
G
M
 
M
H
 
H
F
 
V
G
 
G
T
 
T
I
 
V
G
x
A
A
 
A
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
R
V
 
V
L
 
L
R
 
R
R
 
L
L
 
L
K
 
A
P
 
P
F
 
F
D
 
D
V
 
M
H
 
H
L
 
L
H
 
H
Y
 
Y
Y
 
T
D
|
D
P
x
R
H
 
H
R
 
R
L
 
L
S
 
P
P
 
E
E
 
A
L
 
V
E
 
E
R
 
K
E
 
E
L
 
L
N
 
N
V
 
L
T
 
T
F
 
W
H
 
H
S
 
A
S
 
T
A
 
R
E
 
E
S
 
D
L
 
M
V
 
Y
R
 
G
V
 
A
C
 
C
D
 
D
V
 
V
I
 
V
N
 
T
L
 
L
Q
 
N
S
 
C
P
|
P
L
 
L
Y
x
H
P
 
P
S
 
E
T
|
T
E
 
E
H
 
H
M
 
M
F
 
I
N
 
N
D
 
D
A
 
E
M
 
T
L
 
L
A
 
K
Q
 
L
I
 
F
K
 
K
P
 
R
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
I
 
V
N
 
N
C
x
T
A
|
A
R
|
R
G
 
G
K
 
K
L
 
L
C
 
C
D
 
D
A
 
R
D
 
D
A
 
A
V
 
I
A
 
V
R
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
E
S
 
S
G
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
G
 
A
G
 
G
D
|
D
V
 
V
W
 
W
F
 
F
P
 
P
Q
|
Q
P
 
P
A
 
A
P
 
P
A
 
N
E
 
D
H
 
H
P
 
P
W
 
W
R
 
R
S
 
T
M
 
M
P
 
P
N
 
H
E
 
N
G
 
G
M
 
M
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
S
|
S
G
|
G
A
 
T
S
 
S
L
 
L
S
 
S
A
 
A
Q
 
Q
A
 
T
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
T
R
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
L
E
 
E
C
 
C
F
 
Y
L
 
F
E
 
E
G
 
G
R
 
R
A
 
P
I
 
I
R
 
R
A
 
D
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
I
 
I
V
 
V
N
 
Q
G
 
G
G
 
G
K
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
G
T
 
V
G
 
G
A
 
A
A
 
H
S
|
S
Y
 
Y
K
 
S
L
 
K
G
 
G

3wr5A Structural basis on the efficient co2 reduction of acidophilic formate dehydrogenase
70% identity, 100% coverage: 1:386/386 of query aligns to 5:389/401 of 3wr5A

query
sites
3wr5A
M
 
M
A
 
A
K
 
K
I
 
I
L
 
L
C
 
C
A
 
V
L
 
L
F
 
Y
P
 
D
D
 
D
P
 
P
V
 
V
T
 
D
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
P
 
K
S
 
T
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
T
 
D
D
 
D
V
 
L
P
 
P
S
 
K
I
 
I
A
 
D
S
 
H
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
T
P
 
L
P
 
P
S
 
T
P
 
P
K
 
K
G
 
A
P
 
-
L
 
I
G
 
D
F
 
F
K
 
T
P
 
P
G
 
G
E
 
Q
L
 
L
V
 
L
G
 
G
S
 
S
V
 
V
S
 
S
G
 
G
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
R
 
R
H
 
K
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
S
 
A
Q
 
N
G
 
G
H
 
H
E
 
T
L
 
F
I
 
V
V
 
V
T
 
T
S
 
S
D
 
D
K
 
K
D
 
D
G
 
G
P
 
P
D
 
D
S
 
S
I
 
V
F
 
F
E
 
E
R
 
K
H
 
E
L
 
L
C
 
V
D
 
D
A
 
A
D
 
D
I
 
V
V
 
V
I
 
I
S
 
S
Q
 
Q
P
 
P
F
 
F
W
 
W
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
T
 
T
R
 
P
E
 
E
R
 
R
I
 
I
A
 
A
K
 
K
A
 
A
K
 
K
K
 
N
L
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
A
L
 
L
T
 
T
A
 
A
G
 
G
I
 
I
G
 
G
S
 
S
D
 
D
H
 
H
V
 
V
D
 
D
L
 
L
Q
 
Q
A
 
S
A
 
A
A
 
I
E
 
D
R
 
R
D
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
A
 
A
E
 
E
V
 
V
T
 
T
F
 
Y
S
 
C
N
|
N
S
 
S
I
 
I
S
 
S
V
|
V
A
 
A
E
 
E
H
 
H
V
 
V
V
 
V
M
 
M
T
 
M
V
 
I
L
 
L
A
 
G
L
 
L
V
 
V
R
 
R
N
 
N
Y
 
Y
L
 
I
P
 
P
S
 
S
H
 
H
Q
 
D
Y
 
W
A
 
A
V
 
R
N
 
K
G
 
G
G
 
G
W
 
W
N
 
N
I
 
I
A
 
A
D
 
D
C
 
C
V
 
V
A
 
E
R
 
H
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
L
 
L
E
 
E
G
 
G
M
 
M
H
 
T
F
 
V
G
 
G
T
 
S
I
 
V
G
x
A
A
 
A
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
V
L
 
L
R
 
R
R
 
R
L
 
L
K
 
A
P
 
P
F
 
F
D
 
D
V
 
V
H
 
K
L
 
L
H
 
H
Y
 
Y
Y
 
T
D
|
D
P
x
R
H
 
H
R
 
R
L
 
L
S
 
P
P
 
E
E
 
A
L
 
V
E
 
E
R
 
K
E
 
E
L
 
L
N
 
G
V
 
L
T
 
V
F
 
W
H
 
H
S
 
D
S
 
T
A
 
R
E
 
E
S
 
D
L
 
M
V
 
Y
R
 
P
V
 
H
C
 
C
D
 
D
V
 
V
I
 
V
N
 
T
L
 
L
Q
 
N
S
x
V
P
|
P
L
 
L
Y
 
H
P
 
P
S
 
E
T
 
T
E
 
E
H
 
H
M
 
M
F
 
I
N
 
N
D
 
D
A
 
E
M
 
T
L
 
L
A
 
K
Q
 
L
I
 
F
K
 
K
P
 
R
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
L
 
I
I
 
V
N
 
N
C
x
T
A
|
A
R
|
R
G
 
G
K
 
K
L
 
L
C
 
A
D
 
D
A
 
R
D
 
D
A
 
A
V
 
I
A
 
V
R
 
R
A
 
A
L
 
I
Q
 
E
S
 
S
G
 
G
R
 
Q
L
 
L
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
G
 
A
G
 
G
D
|
D
V
 
V
W
 
W
F
 
F
P
 
P
Q
|
Q
P
 
P
A
 
A
P
 
P
A
 
K
E
 
D
H
 
H
P
 
P
W
 
W
R
 
R
S
 
T
M
 
M
P
 
K
N
 
W
E
 
E
G
 
G
M
 
M
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
S
|
S
G
|
G
A
 
T
S
 
S
L
 
L
S
 
S
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
T
R
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
L
E
 
E
C
 
C
F
 
F
L
 
F
E
 
E
G
 
G
R
 
R
A
 
P
I
 
I
R
 
R
A
 
D
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
I
 
I
V
 
V
N
 
Q
G
 
G
G
 
G
K
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
H
S
|
S
Y
 
Y
K
 
S
L
 
K
G
 
G

8bxxAA Formate dehydrogenase
71% identity, 96% coverage: 2:372/386 of query aligns to 1:370/370 of 8bxxAA

query
sites
8bxxAA
A
 
A
K
 
K
I
 
I
L
 
L
C
 
C
A
 
V
L
 
L
F
 
Y
P
 
D
D
 
D
P
 
P
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
P
 
K
S
 
S
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
T
 
A
D
 
D
V
 
V
P
 
P
S
 
K
I
 
I
A
 
D
S
 
H
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
T
P
 
A
P
 
P
S
 
T
P
 
P
K
 
K
G
 
Q
P
 
-
L
 
I
G
 
D
F
 
F
K
 
T
P
 
P
G
 
G
E
 
E
L
 
L
V
 
L
G
 
G
S
 
S
V
 
V
S
 
S
G
 
G
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
R
 
R
H
 
K
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
S
 
G
Q
 
L
G
 
G
H
 
H
E
 
T
L
 
L
I
 
V
V
 
V
T
 
T
S
 
S
D
 
D
K
 
K
D
 
E
G
 
G
P
 
E
D
 
D
S
 
S
I
 
V
F
 
F
E
 
E
R
 
R
H
 
E
L
 
L
C
 
P
D
 
D
A
 
A
D
 
E
I
 
I
V
 
V
I
 
I
S
 
S
Q
 
Q
P
|
P
F
|
F
W
 
W
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
T
 
T
R
 
P
E
 
E
R
 
R
I
 
I
A
 
A
K
 
K
A
 
A
K
 
K
K
 
K
L
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
A
L
 
V
T
 
T
A
 
A
G
 
G
I
|
I
G
 
G
S
 
S
D
 
D
H
 
H
V
 
V
D
 
D
L
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
I
E
 
K
R
 
N
D
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
A
 
A
E
 
E
V
 
V
T
 
T
F
 
Y
S
 
S
N
|
N
S
 
S
I
 
I
S
 
S
V
|
V
A
 
S
E
 
E
H
 
H
V
 
V
V
 
V
M
 
M
T
 
M
V
 
I
L
 
L
A
 
S
L
 
L
V
 
V
R
 
R
N
 
N
Y
 
Y
L
 
I
P
 
P
S
 
S
H
 
Y
Q
 
Q
Y
 
W
A
 
V
V
 
I
N
 
K
G
 
G
G
 
G
W
 
W
N
 
N
I
 
I
A
 
A
D
 
D
C
 
C
V
 
V
A
 
E
R
 
R
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
L
 
L
E
 
E
G
 
A
M
 
M
H
 
H
F
 
V
G
 
G
T
 
T
I
 
V
G
x
A
A
 
A
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
V
L
 
L
R
 
K
R
 
R
L
 
L
K
 
K
P
 
P
F
 
F
D
 
D
V
 
V
H
 
K
L
 
L
H
 
H
Y
 
Y
Y
x
F
D
|
D
P
x
Q
H
 
H
R
 
R
L
 
L
S
 
P
P
 
E
E
 
S
L
 
V
E
 
E
R
 
N
E
 
E
L
 
L
N
 
G
V
 
L
T
 
T
F
 
Y
H
 
H
S
 
P
S
 
S
A
 
V
E
 
E
S
 
D
L
 
M
V
 
V
R
 
K
V
 
V
C
 
C
D
 
D
V
 
V
I
 
V
N
 
T
L
 
I
Q
 
N
S
 
A
P
|
P
L
 
L
Y
x
H
P
 
P
S
 
G
T
 
T
E
 
L
H
 
D
M
 
L
F
 
F
N
 
N
D
 
D
A
 
E
M
 
L
L
 
I
A
 
S
Q
 
K
I
 
M
K
 
K
P
 
R
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
I
 
V
N
 
N
C
x
T
A
|
A
R
|
R
G
 
G
K
 
K
L
 
I
C
 
C
D
 
N
A
 
R
D
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
V
R
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
E
S
 
S
G
 
G
R
 
Q
L
 
L
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
G
 
A
G
 
G
D
|
D
V
 
V
W
 
W
F
 
F
P
 
P
Q
 
Q
P
 
P
A
 
A
P
 
P
A
 
K
E
 
D
H
 
H
P
 
P
W
 
W
R
 
R
S
 
T
M
 
M
P
 
P
N
 
H
E
 
H
G
 
G
M
 
M
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
S
|
S
G
|
G
A
 
T
S
 
S
L
 
L
S
 
S
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
T
R
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
L
E
 
E
C
 
C
F
 
W
L
 
F
E
 
E
G
 
E
R
 
R
A
 
P
I
 
I
R
 
R
A
 
E
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
I
 
I
V
 
V
N
 
D
G
 
G

8oq2A Binding of NADP to a formate dehydrogenase from starkeya novella.
71% identity, 98% coverage: 2:380/386 of query aligns to 2:379/381 of 8oq2A

query
sites
8oq2A
A
 
A
K
 
K
I
 
I
L
 
L
C
 
C
A
 
V
L
 
L
F
 
Y
P
 
D
D
 
D
P
 
P
V
 
V
T
 
D
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
P
 
K
S
 
T
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
T
 
D
D
 
D
V
 
L
P
 
P
S
 
K
I
 
I
A
 
D
S
 
H
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
T
P
 
L
P
 
P
S
 
T
P
 
P
K
 
K
G
 
A
P
 
-
L
 
I
G
 
D
F
 
F
K
 
T
P
 
P
G
 
G
E
 
A
L
 
L
V
 
L
G
 
G
S
 
S
V
 
V
S
 
S
G
 
G
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
R
 
R
H
 
K
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
S
 
A
Q
 
N
G
 
G
H
 
H
E
 
T
L
 
F
I
 
V
V
 
V
T
 
T
S
 
S
D
 
D
K
 
K
D
 
D
G
 
G
P
 
P
D
 
D
S
 
S
I
 
V
F
 
F
E
 
E
R
 
R
H
 
E
L
 
L
C
 
V
D
 
D
A
 
A
D
 
D
I
 
V
V
 
V
I
 
I
S
 
S
Q
 
Q
P
 
P
F
 
F
W
 
W
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
T
 
T
R
 
P
E
 
E
R
 
R
I
 
I
A
 
A
K
 
K
A
 
A
K
 
K
K
 
N
L
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
A
L
 
L
T
 
T
A
 
A
G
 
G
I
|
I
G
 
G
S
 
S
D
 
D
H
 
H
V
 
V
D
 
D
L
 
L
Q
 
Q
A
 
S
A
 
A
A
 
I
E
 
D
R
 
R
D
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
A
 
A
E
 
E
V
 
V
T
 
T
F
 
Y
S
 
C
N
|
N
S
 
S
I
 
I
S
 
S
V
|
V
A
 
A
E
 
E
H
 
H
V
 
V
V
 
V
M
 
M
T
 
M
V
 
I
L
 
L
A
 
G
L
 
L
V
 
V
R
 
R
N
 
N
Y
 
Y
L
 
I
P
 
P
S
 
S
H
 
H
Q
 
D
Y
 
W
A
 
A
V
 
R
N
 
K
G
 
G
G
 
G
W
 
W
N
 
N
I
 
I
A
 
A
D
 
D
C
 
C
V
 
V
A
 
E
R
 
H
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
L
 
L
E
 
E
G
 
G
M
 
M
H
 
T
F
 
V
G
 
G
T
 
S
I
 
V
G
 
G
A
 
A
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
V
L
 
L
R
 
R
R
 
R
L
 
L
K
 
A
P
 
P
F
 
F
D
 
D
V
 
V
H
 
K
L
 
L
H
 
H
Y
 
Y
Y
 
T
D
x
Q
P
x
R
H
|
H
R
 
R
L
 
L
S
 
P
P
 
E
E
 
A
L
 
V
E
 
E
R
 
K
E
 
E
L
 
L
N
 
G
V
 
L
T
 
V
F
 
W
H
 
H
S
 
D
S
 
T
A
 
R
E
 
E
S
 
D
L
 
M
V
 
Y
R
 
P
V
 
H
C
 
C
D
 
D
V
 
V
I
 
V
N
 
T
L
 
L
Q
 
N
S
x
V
P
|
P
L
 
L
Y
x
H
P
 
P
S
 
E
T
|
T
E
 
E
H
 
H
M
 
M
F
 
I
N
 
N
D
 
D
A
 
E
M
 
T
L
 
L
A
 
K
Q
 
L
I
 
F
K
 
K
P
 
R
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
L
 
I
I
 
V
N
 
N
C
x
T
A
|
A
R
|
R
G
 
G
K
 
K
L
 
L
C
 
A
D
 
D
A
 
R
D
 
D
A
 
A
V
 
I
A
 
V
R
 
R
A
 
A
L
 
I
Q
 
E
S
 
S
G
 
G
R
 
Q
L
 
L
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
G
 
A
G
 
G
D
|
D
V
 
V
W
 
W
F
 
F
P
 
P
Q
 
Q
P
 
P
A
 
A
P
 
P
A
 
K
E
 
D
H
 
H
P
 
P
W
 
W
R
 
R
S
 
T
M
 
M
P
 
K
N
 
W
E
 
E
G
 
G
M
 
M
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
S
|
S
G
|
G
A
 
T
S
 
S
L
 
L
S
 
S
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
T
R
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
L
E
 
E
C
 
C
F
 
F
L
 
F
E
 
E
G
 
G
R
 
R
A
 
P
I
 
I
R
 
R
A
 
D
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
I
 
I
V
 
V
N
 
Q
G
 
G
G
 
G
K
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
A
 
A

Sites not aligning to the query:

7ya4A Formate dehydrogenase from novosphingobium sp. Ap12 with NAD and azide
68% identity, 99% coverage: 2:385/386 of query aligns to 1:383/384 of 7ya4A

query
sites
7ya4A
A
 
A
K
 
K
I
 
I
L
 
L
C
 
C
A
 
V
L
 
L
F
 
Y
P
 
P
D
 
D
P
 
P
V
 
V
T
 
N
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
P
 
K
S
 
T
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
T
 
D
D
 
E
V
 
I
P
 
P
S
 
N
I
 
I
A
 
T
S
 
V
Y
 
Y
P
 
D
G
 
N
G
 
G
Q
 
Q
R
 
T
P
 
A
P
 
P
S
 
T
P
 
P
K
 
K
G
 
A
P
 
-
L
 
I
G
 
D
F
 
F
K
 
K
P
 
P
G
 
G
E
 
E
L
 
L
V
 
L
G
 
G
S
 
S
V
 
V
S
 
S
G
 
G
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
R
 
R
H
 
K
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
S
 
G
Q
 
L
G
 
G
H
 
H
E
 
E
L
 
F
I
 
I
V
 
V
T
 
T
S
 
S
D
 
D
K
 
K
D
 
E
G
 
G
P
 
P
D
 
D
S
 
S
I
 
E
F
 
F
E
 
E
R
 
K
H
 
H
L
 
L
C
 
P
D
 
D
A
 
A
D
 
E
I
 
I
V
 
I
I
 
I
S
 
S
Q
 
Q
P
|
P
F
|
F
W
 
W
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
T
 
G
R
 
P
E
 
E
R
 
R
I
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
A
K
 
K
K
 
K
L
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
A
L
 
L
T
 
T
A
 
A
G
 
G
I
|
I
G
 
G
S
 
S
D
 
D
H
 
H
V
 
V
D
 
D
L
 
L
Q
 
E
A
 
S
A
 
A
A
 
I
E
 
K
R
 
H
D
 
G
I
 
V
T
 
T
V
 
V
A
 
A
E
 
E
V
 
V
T
 
T
F
 
G
S
 
S
N
|
N
S
|
S
I
 
I
S
 
S
V
|
V
A
 
S
E
 
E
H
 
H
V
 
A
V
 
V
M
 
M
T
 
M
V
 
I
L
 
L
A
 
S
L
 
L
V
 
V
R
 
R
N
 
N
Y
 
Y
L
 
I
P
 
P
S
 
A
H
 
H
Q
 
E
Y
 
W
A
 
A
V
 
E
N
 
K
G
 
G
G
 
G
W
 
W
N
 
N
I
 
I
A
 
A
D
 
D
C
 
C
V
 
V
A
 
E
R
 
R
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
L
 
V
E
 
E
G
 
G
M
 
M
H
 
H
F
 
V
G
 
G
T
 
T
I
 
V
G
x
A
A
 
A
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
I
L
 
L
R
 
K
R
 
R
L
 
M
K
 
K
P
 
P
F
 
F
D
 
D
V
 
V
H
 
H
L
 
L
H
 
H
Y
 
Y
Y
|
Y
D
 
A
P
x
R
H
 
H
R
 
R
L
 
L
S
 
S
P
 
K
E
 
E
L
 
E
E
 
E
R
 
E
E
 
E
L
 
L
N
 
G
V
 
L
T
 
T
F
 
F
H
 
H
S
 
E
S
 
N
A
 
V
E
 
E
S
 
D
L
 
M
V
 
V
R
 
K
V
 
V
C
 
C
D
 
D
V
 
V
I
 
V
N
 
T
L
 
I
Q
 
N
S
 
A
P
|
P
L
 
L
Y
x
H
P
 
P
S
x
E
T
|
T
E
 
H
H
 
H
M
 
M
F
 
F
N
 
D
D
 
E
A
 
A
M
 
M
L
 
I
A
 
K
Q
 
K
I
 
M
K
 
K
P
 
R
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
L
 
I
I
 
V
N
 
N
C
x
T
A
|
A
R
|
R
G
 
A
K
 
E
L
 
I
C
 
C
D
 
D
A
 
R
D
 
D
A
 
A
V
 
I
A
 
V
R
 
R
A
 
A
L
 
V
Q
 
E
S
 
S
G
 
G
R
 
H
L
 
L
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
G
 
A
G
 
G
D
|
D
V
 
V
W
 
W
F
 
N
P
 
P
Q
 
Q
P
 
P
A
 
A
P
 
P
A
 
A
E
 
D
H
 
H
P
 
P
W
 
W
R
 
R
S
 
T
M
 
M
P
 
P
N
 
W
E
 
N
G
 
G
M
 
M
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
M
S
|
S
G
|
G
A
 
T
S
 
S
L
 
L
S
 
S
A
 
G
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
Y
 
Y
A
 
T
A
 
A
G
 
G
T
 
T
R
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
L
E
 
E
C
 
C
F
 
W
L
 
F
E
 
E
G
 
G
R
 
R
A
 
P
I
 
I
R
 
R
A
 
E
E
 
D
Y
 
Y
L
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G
K
 
K
L
 
L
A
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
L
S
|
S
Y
 
Y
K
 
T
L
 
V

7ya3B Formate dehydrogenase from novosphingobium sp. Ap12 with NADP and azide
68% identity, 99% coverage: 2:385/386 of query aligns to 1:383/384 of 7ya3B

query
sites
7ya3B
A
 
A
K
 
K
I
 
I
L
 
L
C
 
C
A
 
V
L
 
L
F
 
Y
P
 
P
D
 
D
P
 
P
V
 
V
T
 
N
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
P
 
K
S
 
T
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
T
 
D
D
 
E
V
 
I
P
 
P
S
 
N
I
 
I
A
 
T
S
 
V
Y
 
Y
P
 
D
G
 
N
G
 
G
Q
 
Q
R
 
T
P
 
A
P
 
P
S
 
T
P
 
P
K
 
K
G
 
A
P
 
-
L
 
I
G
 
D
F
 
F
K
 
K
P
 
P
G
 
G
E
 
E
L
 
L
V
 
L
G
 
G
S
 
S
V
 
V
S
 
S
G
 
G
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
R
 
R
H
 
K
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
S
 
G
Q
 
L
G
 
G
H
 
H
E
 
E
L
 
F
I
 
I
V
 
V
T
 
T
S
 
S
D
 
D
K
 
K
D
 
E
G
 
G
P
 
P
D
 
D
S
 
S
I
 
E
F
 
F
E
 
E
R
 
K
H
 
H
L
 
L
C
 
P
D
 
D
A
 
A
D
 
E
I
 
I
V
 
I
I
 
I
S
 
S
Q
 
Q
P
 
P
F
 
F
W
 
W
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
T
 
G
R
 
P
E
 
E
R
 
R
I
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
A
K
 
K
K
 
K
L
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
A
L
 
L
T
 
T
A
 
A
G
 
G
I
|
I
G
 
G
S
 
S
D
 
D
H
 
H
V
 
V
D
 
D
L
 
L
Q
 
E
A
 
S
A
 
A
A
 
I
E
 
K
R
 
H
D
 
G
I
 
V
T
 
T
V
 
V
A
 
A
E
 
E
V
 
V
T
 
T
F
 
G
S
 
S
N
|
N
S
 
S
I
 
I
S
 
S
V
|
V
A
 
S
E
 
E
H
 
H
V
 
A
V
 
V
M
 
M
T
 
M
V
 
I
L
 
L
A
 
S
L
 
L
V
 
V
R
 
R
N
 
N
Y
 
Y
L
 
I
P
 
P
S
 
A
H
 
H
Q
 
E
Y
 
W
A
 
A
V
 
E
N
 
K
G
 
G
G
 
G
W
 
W
N
 
N
I
 
I
A
 
A
D
 
D
C
 
C
V
 
V
A
 
E
R
 
R
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
L
 
V
E
 
E
G
 
G
M
 
M
H
 
H
F
 
V
G
 
G
T
 
T
I
 
V
G
x
A
A
 
A
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
I
L
 
L
R
 
K
R
 
R
L
 
M
K
 
K
P
 
P
F
 
F
D
 
D
V
 
V
H
 
H
L
 
L
H
 
H
Y
 
Y
Y
 
Y
D
 
A
P
x
R
H
|
H
R
 
R
L
 
L
S
 
S
P
 
K
E
 
E
L
 
E
E
 
E
R
 
E
E
 
E
L
 
L
N
 
G
V
 
L
T
 
T
F
 
F
H
 
H
S
 
E
S
 
N
A
 
V
E
 
E
S
 
D
L
 
M
V
 
V
R
 
K
V
 
V
C
 
C
D
 
D
V
 
V
I
 
V
N
 
T
L
 
I
Q
 
N
S
 
A
P
|
P
L
 
L
Y
x
H
P
 
P
S
x
E
T
 
T
E
 
H
H
 
H
M
 
M
F
 
F
N
 
D
D
 
E
A
 
A
M
 
M
L
 
I
A
 
K
Q
 
K
I
 
M
K
 
K
P
 
R
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
L
 
I
I
 
V
N
 
N
C
x
T
A
|
A
R
|
R
G
 
A
K
 
E
L
 
I
C
 
C
D
 
D
A
 
R
D
 
D
A
 
A
V
 
I
A
 
V
R
 
R
A
 
A
L
 
V
Q
 
E
S
 
S
G
 
G
R
 
H
L
 
L
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
G
 
A
G
 
G
D
|
D
V
 
V
W
 
W
F
 
N
P
 
P
Q
 
Q
P
 
P
A
 
A
P
 
P
A
 
A
E
 
D
H
 
H
P
 
P
W
 
W
R
 
R
S
 
T
M
 
M
P
 
P
N
 
W
E
 
N
G
 
G
M
 
M
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
M
S
|
S
G
|
G
A
 
T
S
 
S
L
 
L
S
 
S
A
 
G
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
Y
 
Y
A
 
T
A
 
A
G
 
G
T
 
T
R
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
L
E
 
E
C
 
C
F
 
W
L
 
F
E
 
E
G
 
G
R
 
R
A
 
P
I
 
I
R
 
R
A
 
E
E
 
D
Y
 
Y
L
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G
K
 
K
L
 
L
A
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
L
S
|
S
Y
 
Y
K
 
T
L
 
V

4xyeA Granulicella m. Formate dehydrogenase (fdh) in complex with NAD(+) (see paper)
69% identity, 100% coverage: 2:386/386 of query aligns to 1:384/384 of 4xyeA

query
sites
4xyeA
A
 
A
K
 
K
I
 
V
L
 
L
C
 
C
A
 
V
L
 
L
F
 
Y
P
 
D
D
 
D
P
 
P
V
 
T
T
 
S
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
P
 
P
S
 
L
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
T
 
N
D
 
A
V
 
I
P
 
P
S
 
K
I
 
I
A
 
E
S
 
R
Y
 
Y
P
 
P
G
 
D
G
 
G
Q
 
Q
R
 
T
P
 
V
P
 
P
S
 
N
P
 
P
K
 
K
G
 
H
P
 
-
L
 
I
G
 
D
F
 
F
K
 
V
P
 
P
G
 
G
E
 
E
L
 
L
V
 
L
G
 
G
S
 
C
V
 
V
S
 
S
G
 
G
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
R
 
R
H
 
S
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
S
 
D
Q
 
L
G
 
G
H
 
H
E
 
T
L
 
F
I
 
I
V
 
V
T
 
T
S
 
S
D
 
D
K
 
K
D
 
E
G
 
G
P
 
P
D
 
N
S
 
S
I
 
V
F
 
F
E
 
E
R
 
K
H
 
E
L
 
L
C
 
P
D
 
D
A
 
A
D
 
D
I
 
I
V
 
V
I
 
I
S
 
S
Q
 
Q
P
 
P
F
|
F
W
 
W
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
T
 
T
R
 
A
E
 
E
R
 
R
I
 
I
A
 
A
K
 
K
A
 
A
K
 
K
K
 
K
L
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
A
L
 
L
T
 
T
A
 
A
G
 
G
I
|
I
G
 
G
S
 
S
D
 
D
H
 
H
V
 
V
D
 
D
L
 
L
Q
 
N
A
 
A
A
 
A
A
 
I
E
 
K
R
 
A
D
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
A
 
A
E
 
E
V
 
E
T
 
T
F
 
F
S
 
S
N
|
N
S
 
G
I
 
I
S
 
C
V
|
V
A
 
A
E
 
E
H
 
H
V
 
A
V
 
V
M
 
M
T
 
M
V
 
I
L
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
V
R
 
R
N
 
N
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
S
 
S
H
 
H
Q
 
K
Y
 
I
A
 
A
V
 
E
N
 
E
G
 
G
G
 
G
W
 
W
N
 
N
I
 
I
A
 
A
D
 
D
C
 
C
V
 
V
A
 
S
R
 
R
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
L
 
L
E
 
E
G
 
G
M
 
M
H
 
H
F
 
V
G
 
G
T
 
T
I
 
V
G
x
A
A
 
A
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
V
L
 
L
R
 
R
R
 
R
L
 
L
K
 
K
P
 
P
F
 
F
D
 
D
V
 
V
H
 
K
L
 
L
H
 
H
Y
 
Y
Y
 
T
D
x
A
P
x
R
H
 
H
R
 
R
L
 
S
S
 
P
P
 
R
E
 
A
L
 
I
E
 
E
R
 
D
E
 
E
L
 
L
N
 
G
V
 
L
T
 
T
F
 
Y
H
 
H
S
 
A
S
 
T
A
 
A
E
 
E
S
 
E
L
 
M
V
 
A
R
 
E
V
 
V
C
 
C
D
 
D
V
 
V
I
 
I
N
 
S
L
 
I
Q
 
H
S
x
A
P
|
P
L
 
L
Y
|
Y
P
 
P
S
 
A
T
 
T
E
 
E
H
 
H
M
 
L
F
 
F
N
 
N
D
 
A
A
 
K
M
 
V
L
 
L
A
 
N
Q
 
K
I
 
M
K
 
R
P
 
H
G
 
G
A
 
S
Y
 
Y
L
 
L
I
 
V
N
 
N
C
 
T
A
 
A
R
|
R
G
 
A
K
 
E
L
 
I
C
 
C
D
 
D
A
 
R
D
 
D
A
 
D
V
 
I
A
 
V
R
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
E
S
 
S
G
 
G
R
 
Q
L
 
L
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
G
 
A
G
 
G
D
|
D
V
 
V
W
 
W
F
 
F
P
 
P
Q
|
Q
P
 
P
A
 
A
P
 
P
A
 
A
E
 
N
H
 
H
P
 
P
W
 
W
R
 
R
S
 
N
M
 
M
P
 
P
N
 
H
E
 
N
G
 
G
M
 
M
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
M
S
 
S
G
|
G
A
 
S
S
 
S
L
 
L
S
 
S
A
 
G
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
T
R
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
L
E
 
E
C
 
C
F
 
W
L
 
F
E
 
E
G
 
N
R
 
R
A
 
P
I
 
I
R
 
R
A
 
D
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
I
 
I
V
 
V
N
 
S
G
 
N
G
 
G
K
 
K
L
 
L
A
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
K
S
|
S
Y
 
Y
K
 
G
L
 
V
G
 
G

4xybA Granulicella m. Formate dehydrogenase (fdh) in complex with NADP(+) and nan3 (see paper)
69% identity, 100% coverage: 2:386/386 of query aligns to 1:384/384 of 4xybA

query
sites
4xybA
A
 
A
K
 
K
I
 
V
L
 
L
C
 
C
A
 
V
L
 
L
F
 
Y
P
 
D
D
 
D
P
 
P
V
 
T
T
 
S
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
P
 
P
S
 
L
Y
 
Y
A
 
A
R
 
R
T
 
N
D
 
A
V
 
I
P
 
P
S
 
K
I
 
I
A
 
E
S
 
R
Y
 
Y
P
 
P
G
 
D
G
 
G
Q
 
Q
R
 
T
P
 
V
P
 
P
S
 
N
P
 
P
K
 
K
G
 
H
P
 
-
L
 
I
G
 
D
F
 
F
K
 
V
P
 
P
G
 
G
E
 
E
L
 
L
V
 
L
G
 
G
S
 
C
V
 
V
S
 
S
G
 
G
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
R
 
R
H
 
S
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
S
 
D
Q
 
L
G
 
G
H
 
H
E
 
T
L
 
F
I
 
I
V
 
V
T
 
T
S
 
S
D
 
D
K
 
K
D
 
E
G
 
G
P
 
P
D
 
N
S
 
S
I
 
V
F
 
F
E
 
E
R
 
K
H
 
E
L
 
L
C
 
P
D
 
D
A
 
A
D
 
D
I
 
I
V
 
V
I
 
I
S
 
S
Q
 
Q
P
|
P
F
|
F
W
 
W
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
T
 
T
R
 
A
E
 
E
R
 
R
I
 
I
A
 
A
K
 
K
A
 
A
K
 
K
K
 
K
L
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
A
L
 
L
T
 
T
A
 
A
G
 
G
I
|
I
G
 
G
S
 
S
D
 
D
H
 
H
V
 
V
D
 
D
L
 
L
Q
 
N
A
 
A
A
 
A
A
 
I
E
 
K
R
 
A
D
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
A
 
A
E
 
E
V
 
E
T
 
T
F
 
F
S
 
S
N
|
N
S
 
G
I
 
I
S
 
C
V
|
V
A
 
A
E
 
E
H
 
H
V
 
A
V
 
V
M
 
M
T
 
M
V
 
I
L
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
V
R
 
R
N
 
N
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
S
 
S
H
 
H
Q
 
K
Y
 
I
A
 
A
V
 
E
N
 
E
G
 
G
G
 
G
W
 
W
N
 
N
I
 
I
A
 
A
D
 
D
C
 
C
V
 
V
A
 
S
R
 
R
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
L
 
L
E
 
E
G
 
G
M
 
M
H
 
H
F
 
V
G
 
G
T
 
T
I
 
V
G
x
A
A
 
A
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
V
L
 
L
R
 
R
R
 
R
L
 
L
K
 
K
P
 
P
F
 
F
D
 
D
V
 
V
H
 
K
L
 
L
H
 
H
Y
 
Y
Y
 
T
D
 
A
P
x
R
H
|
H
R
 
R
L
 
S
S
 
P
P
 
R
E
 
A
L
 
I
E
 
E
R
 
D
E
 
E
L
 
L
N
 
G
V
 
L
T
 
T
F
 
Y
H
 
H
S
 
A
S
 
T
A
 
A
E
 
E
S
 
E
L
 
M
V
 
A
R
 
E
V
 
V
C
 
C
D
 
D
V
 
V
I
 
I
N
 
S
L
 
I
Q
 
H
S
 
A
P
|
P
L
 
L
Y
|
Y
P
 
P
S
 
A
T
|
T
E
 
E
H
 
H
M
 
L
F
 
F
N
 
N
D
 
A
A
 
K
M
 
V
L
 
L
A
 
N
Q
 
K
I
 
M
K
 
R
P
 
H
G
 
G
A
 
S
Y
 
Y
L
 
L
I
 
V
N
 
N
C
x
T
A
|
A
R
|
R
G
 
A
K
 
E
L
 
I
C
 
C
D
 
D
A
 
R
D
 
D
A
 
D
V
 
I
A
 
V
R
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
E
S
 
S
G
 
G
R
 
Q
L
 
L
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
G
 
A
G
 
G
D
|
D
V
 
V
W
 
W
F
 
F
P
 
P
Q
|
Q
P
 
P
A
 
A
P
 
P
A
 
A
E
 
N
H
 
H
P
 
P
W
 
W
R
 
R
S
 
N
M
 
M
P
 
P
N
 
H
E
 
N
G
 
G
M
 
M
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
M
S
|
S
G
|
G
A
 
S
S
 
S
L
 
L
S
 
S
A
 
G
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
T
R
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
L
E
 
E
C
 
C
F
 
W
L
 
F
E
 
E
G
 
N
R
 
R
A
 
P
I
 
I
R
 
R
A
 
D
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
I
 
I
V
 
V
N
 
S
G
 
N
G
 
G
K
 
K
L
 
L
A
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
K
S
|
S
Y
 
Y
K
 
G
L
 
V
G
 
G

7arzA Ternary complex of NAD-dependent formate dehydrogenase from physcomitrium patens
50% identity, 85% coverage: 50:376/386 of query aligns to 30:357/361 of 7arzA

query
sites
7arzA
E
 
E
L
 
F
V
 
L
G
 
G
S
 
C
V
 
V
S
 
E
G
 
N
E
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
I
R
 
R
H
 
E
Y
 
W
L
 
L
E
 
E
S
 
S
Q
 
K
G
 
G
H
 
H
E
 
K
L
 
Y
I
 
V
V
 
V
T
 
T
S
 
S
D
 
D
K
 
K
D
 
D
G
 
G
P
 
P
D
 
D
S
 
S
I
 
E
F
 
L
E
 
D
R
 
K
H
 
E
L
 
L
C
 
A
D
 
D
A
 
A
D
 
H
I
 
I
V
 
L
I
 
I
S
x
T
Q
 
T
P
|
P
F
|
F
W
 
H
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
L
 
M
T
 
T
R
 
K
E
 
E
R
 
R
I
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
A
K
 
K
K
 
N
L
 
L
K
 
E
L
 
L
A
x
L
L
x
V
T
|
T
A
 
A
G
|
G
I
x
V
G
 
G
S
 
S
D
 
D
H
 
H
V
 
I
D
 
D
L
 
L
Q
 
H
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
E
R
 
K
D
 
G
I
 
L
T
 
T
V
 
V
A
 
S
E
 
E
V
 
V
T
 
T
F
 
G
S
 
S
N
|
N
S
 
V
I
 
T
S
 
S
V
|
V
A
 
A
E
 
E
H
 
D
V
 
E
V
 
V
M
 
L
T
 
R
V
 
I
L
 
L
A
 
V
L
 
L
V
 
V
R
 
R
N
 
N
Y
 
F
L
 
A
P
 
P
S
 
G
H
 
W
Q
 
K
Y
 
Q
A
 
V
V
 
S
N
 
E
G
 
G
G
 
G
W
 
W
N
 
N
I
 
V
A
 
A
D
 
A
C
 
V
V
 
V
A
 
H
R
 
H
S
 
A
Y
 
Y
D
 
D
L
 
L
E
 
I
G
 
D
M
 
R
H
 
T
F
 
V
G
 
G
T
 
T
I
 
V
G
 
G
A
 
G
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
L
 
Q
A
 
E
V
 
L
L
 
M
R
 
K
R
 
R
L
 
L
K
 
K
P
 
G
F
 
F
D
 
G
V
 
L
-
 
K
H
 
E
L
 
M
H
 
L
Y
 
Y
Y
 
Y
D
|
D
P
x
R
H
 
N
R
 
S
L
 
L
S
 
G
P
 
A
E
 
E
L
 
R
E
 
E
R
 
K
E
 
E
L
 
L
N
 
G
V
 
C
T
 
K
F
 
R
H
 
E
S
 
T
S
 
D
A
 
L
E
 
D
S
 
T
L
 
M
V
 
L
R
 
S
V
 
K
C
 
C
D
 
D
V
 
V
I
 
V
N
 
V
L
 
V
Q
 
N
S
x
T
P
|
P
L
 
L
Y
 
T
P
 
D
S
x
Q
T
 
T
E
 
R
H
 
G
M
 
L
F
 
F
N
 
N
D
 
K
A
 
E
M
 
R
L
 
I
A
 
A
Q
 
K
I
 
M
K
 
K
P
 
K
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
I
 
V
N
 
N
C
x
N
A
|
A
R
|
R
G
 
G
K
 
A
L
 
I
C
 
A
D
 
D
A
 
T
D
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
K
R
 
E
A
 
A
L
 
C
Q
 
E
S
 
S
G
 
G
R
 
H
L
 
L
A
 
G
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
D
|
D
V
 
V
W
 
W
F
 
N
P
 
A
Q
 
Q
P
 
P
A
 
A
P
 
G
A
 
K
E
 
D
H
 
H
P
 
P
W
 
W
R
 
R
S
 
Y
M
 
M
P
 
P
N
 
N
E
 
H
G
 
A
M
 
M
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
S
|
S
G
|
G
A
 
T
S
 
T
L
 
L
S
 
D
A
 
A
Q
 
Q
A
 
K
R
 
R
Y
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
T
R
 
K
E
 
D
I
 
M
L
 
I
E
 
D
C
 
R
F
 
W
L
 
L
E
 
K
G
 
H
R
 
E
A
 
A
I
 
F
R
 
P
A
 
E
E
 
Q
Y
 
N
L
 
Y
I
 
I
V
 
V
N
 
R
G
 
E
G
 
G
K
 
K
L
 
L
A
 
A

Sites not aligning to the query:

6t8zAAA Formate dehydrogenase (see paper)
54% identity, 85% coverage: 48:376/386 of query aligns to 24:360/373 of 6t8zAAA

query
sites
6t8zAAA
P
 
P
G
 
G
E
 
-
L
 
L
V
 
L
G
 
G
S
 
T
V
 
T
S
 
E
G
 
N
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
R
 
R
H
 
K
Y
 
W
L
 
L
E
 
E
S
 
D
Q
 
Q
G
 
G
H
 
H
E
 
T
L
 
L
I
 
V
V
 
T
T
 
T
S
 
S
D
 
D
K
 
K
D
 
D
G
 
R
P
 
E
D
 
G
S
 
S
I
 
T
F
 
F
E
 
D
R
 
R
H
 
E
L
 
L
C
 
E
D
 
D
A
 
A
D
 
E
I
 
I
V
 
I
I
 
I
S
 
T
Q
 
T
P
 
P
F
 
F
W
 
H
P
 
P
A
 
G
Y
 
Y
L
 
L
T
 
T
R
 
A
E
 
E
R
 
R
I
 
L
A
 
A
K
 
R
A
 
A
K
 
K
K
 
K
L
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
A
L
 
V
T
 
T
A
 
A
G
 
G
I
|
I
G
 
G
S
 
S
D
 
D
H
 
H
V
 
V
D
 
D
L
 
L
Q
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
N
E
 
K
R
 
T
D
 
N
-
 
G
-
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
A
 
A
E
 
E
V
 
V
T
 
T
F
 
G
S
 
S
N
|
N
S
 
V
I
 
V
S
 
S
V
|
V
A
 
A
E
 
E
H
 
H
V
 
V
V
 
V
M
 
M
T
 
T
V
 
I
L
 
L
A
 
V
L
 
L
V
 
V
R
 
R
N
 
N
Y
 
F
L
 
V
P
 
P
S
 
A
H
 
H
Q
 
E
Y
 
Q
A
 
I
V
 
E
N
 
A
G
 
G
G
 
R
W
 
W
N
 
D
I
 
V
A
 
A
D
 
E
C
 
V
V
 
A
A
 
K
R
 
D
S
 
E
Y
 
Y
D
 
D
L
 
L
E
 
E
G
 
G
M
 
K
H
 
V
F
 
V
G
 
G
T
 
T
I
 
V
G
|
G
A
 
V
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
L
 
E
A
 
R
V
 
V
L
 
L
R
 
R
R
 
R
L
 
L
K
 
K
P
 
G
F
 
F
D
 
D
V
 
C
-
 
K
H
 
E
L
 
L
H
 
L
Y
 
Y
Y
|
Y
D
|
D
P
x
Y
H
x
Q
R
 
P
L
 
L
S
 
S
P
 
P
E
 
E
L
 
K
E
 
E
R
 
K
E
 
E
L
 
I
N
 
G
V
 
C
T
 
R
F
 
R
H
 
V
S
 
E
S
 
N
A
 
L
E
 
E
S
 
E
L
 
M
V
 
L
R
 
A
V
 
Q
C
 
C
D
 
D
V
 
V
I
 
V
N
 
T
L
 
I
Q
 
N
S
x
C
P
|
P
L
 
L
Y
x
H
P
 
E
S
 
S
T
 
T
E
 
R
H
 
G
M
 
L
F
 
F
N
 
N
D
 
K
A
 
D
M
 
L
L
 
I
A
 
S
Q
 
K
I
 
M
K
 
K
P
 
R
G
 
G
A
 
S
Y
 
W
L
 
L
I
 
V
N
 
N
C
x
T
A
|
A
R
|
R
G
 
G
K
 
A
L
 
I
C
 
V
D
 
V
A
 
K
D
 
E
A
 
D
V
 
V
A
 
A
R
 
E
A
 
A
L
 
L
Q
 
R
S
 
T
G
 
G
R
 
H
L
 
L
A
 
R
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
D
|
D
V
 
V
W
 
W
F
 
F
P
 
P
Q
 
Q
P
 
P
A
 
A
P
 
P
A
 
A
E
 
D
H
 
H
P
 
V
W
 
L
R
 
R
S
 
T
M
 
A
P
 
K
N
 
N
-
 
P
-
 
F
-
 
G
-
 
G
-
 
G
E
 
N
G
 
A
M
 
M
T
 
V
P
 
P
H
|
H
I
 
M
S
|
S
G
|
G
A
 
T
S
 
S
L
 
L
S
 
D
A
 
A
Q
 
Q
A
 
K
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
A
 
E
G
 
G
T
 
V
R
 
K
E
 
R
I
 
I
L
 
L
E
 
D
C
 
S
F
 
Y
L
 
L
E
 
S
G
 
G
R
 
R
-
 
F
A
 
D
I
 
Y
R
 
R
A
 
P
E
 
E
Y
 
D
L
 
L
I
 
I
V
 
V
N
 
H
G
 
Q
G
 
G
K
 
K
L
 
Y
A
 
A

Sites not aligning to the query:

6t8yBBB Formate dehydrogenase (see paper)
54% identity, 85% coverage: 48:376/386 of query aligns to 25:361/375 of 6t8yBBB

query
sites
6t8yBBB
P
 
P
G
 
G
E
 
-
L
 
L
V
 
L
G
 
G
S
 
T
V
 
T
S
 
E
G
 
N
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
R
 
R
H
 
K
Y
 
W
L
 
L
E
 
E
S
 
D
Q
 
Q
G
 
G
H
 
H
E
 
T
L
 
L
I
 
V
V
 
T
T
 
T
S
 
S
D
 
D
K
 
K
D
 
D
G
 
R
P
 
E
D
 
G
S
 
S
I
 
T
F
 
F
E
 
D
R
 
R
H
 
E
L
 
L
C
 
E
D
 
D
A
 
A
D
 
E
I
 
I
V
 
I
I
 
I
S
 
T
Q
 
T
P
 
P
F
 
F
W
 
H
P
 
P
A
 
G
Y
 
Y
L
 
L
T
 
T
R
 
A
E
 
E
R
 
R
I
 
L
A
 
A
K
 
R
A
 
A
K
 
K
K
 
K
L
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
A
L
 
V
T
 
T
A
 
A
G
 
G
I
|
I
G
 
G
S
 
S
D
 
D
H
 
H
V
 
V
D
 
D
L
 
L
Q
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
N
E
 
K
R
 
T
D
 
N
-
 
G
-
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
A
 
A
E
 
E
V
 
V
T
 
T
F
 
G
S
 
S
N
|
N
S
 
V
I
 
V
S
 
S
V
|
V
A
 
A
E
 
E
H
 
H
V
 
V
V
 
V
M
 
M
T
 
T
V
 
I
L
 
L
A
 
V
L
 
L
V
 
V
R
 
R
N
 
N
Y
 
F
L
 
V
P
 
P
S
 
A
H
 
H
Q
 
E
Y
 
Q
A
 
I
V
 
E
N
 
A
G
 
G
G
 
R
W
 
W
N
 
D
I
 
V
A
 
A
D
 
E
C
 
V
V
 
A
A
 
K
R
 
D
S
 
E
Y
 
Y
D
 
D
L
 
L
E
 
E
G
 
G
M
 
K
H
 
V
F
 
V
G
 
G
T
 
T
I
 
V
G
|
G
A
 
V
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
L
 
E
A
 
R
V
 
V
L
 
L
R
 
R
R
 
R
L
 
L
K
 
K
P
 
G
F
 
F
D
 
D
V
 
C
-
 
K
H
 
E
L
 
L
H
 
L
Y
 
Y
Y
|
Y
D
|
D
P
x
Y
H
x
Q
R
 
P
L
 
L
S
 
S
P
 
P
E
 
E
L
 
K
E
 
E
R
 
K
E
 
E
L
 
I
N
 
G
V
 
C
T
 
R
F
 
R
H
 
V
S
 
E
S
 
N
A
 
L
E
 
E
S
 
E
L
 
M
V
 
L
R
 
A
V
 
Q
C
 
C
D
 
D
V
 
V
I
 
V
N
 
T
L
 
I
Q
 
N
S
x
C
P
|
P
L
 
L
Y
x
H
P
 
E
S
 
S
T
 
T
E
 
R
H
 
G
M
 
L
F
 
F
N
 
N
D
 
K
A
 
D
M
 
L
L
 
I
A
 
S
Q
 
K
I
 
M
K
 
K
P
 
R
G
 
G
A
 
S
Y
 
W
L
 
L
I
 
V
N
 
N
C
x
T
A
|
A
R
|
R
G
 
G
K
 
A
L
 
I
C
 
V
D
 
V
A
 
K
D
 
E
A
 
D
V
 
V
A
 
A
R
 
E
A
 
A
L
 
L
Q
 
R
S
 
T
G
 
G
R
 
H
L
 
L
A
 
R
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
D
|
D
V
 
V
W
 
W
F
 
F
P
 
P
Q
 
Q
P
 
P
A
 
A
P
 
P
A
 
A
E
 
D
H
 
H
P
 
V
W
 
L
R
 
R
S
 
T
M
 
A
P
 
K
N
 
N
-
 
P
-
 
F
-
 
G
-
 
G
-
 
G
E
 
N
G
 
A
M
 
M
T
 
V
P
 
P
H
|
H
I
 
M
S
|
S
G
|
G
A
 
T
S
 
S
L
 
L
S
 
D
A
 
A
Q
 
Q
A
 
K
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
A
 
E
G
 
G
T
 
V
R
 
K
E
 
R
I
 
I
L
 
L
E
 
D
C
 
S
F
 
Y
L
 
L
E
 
S
G
 
G
R
 
R
-
 
F
A
 
D
I
 
Y
R
 
R
A
 
P
E
 
E
Y
 
D
L
 
L
I
 
I
V
 
V
N
 
H
G
 
Q
G
 
G
K
 
K
L
 
Y
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3n7uA NAD-dependent formate dehydrogenase from higher-plant arabidopsis thaliana in complex with NAD and azide
52% identity, 84% coverage: 51:376/386 of query aligns to 22:347/351 of 3n7uA

query
sites
3n7uA
L
 
F
V
 
L
G
 
G
S
 
C
V
 
V
S
 
E
G
 
N
E
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
I
R
 
R
H
 
D
Y
 
W
L
 
L
E
 
E
S
 
S
Q
 
Q
G
 
G
H
 
H
E
 
Q
L
 
Y
I
 
I
V
 
V
T
 
T
S
 
D
D
 
D
K
 
K
D
 
E
G
 
G
P
 
P
D
 
D
S
 
C
I
 
E
F
 
L
E
 
E
R
 
K
H
 
H
L
 
I
C
 
P
D
 
D
A
 
L
D
 
H
I
 
V
V
 
L
I
 
I
S
 
S
Q
 
T
P
|
P
F
|
F
W
 
H
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
L
 
V
T
 
T
R
 
A
E
 
E
R
 
R
I
 
I
A
 
K
K
 
K
A
 
A
K
 
K
K
 
N
L
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
L
L
 
L
T
 
T
A
 
A
G
 
G
I
|
I
G
 
G
S
 
S
D
 
D
H
 
H
V
 
I
D
 
D
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
A
R
 
A
D
 
G
I
 
L
T
 
T
V
 
V
A
 
A
E
 
E
V
 
V
T
 
T
F
 
G
S
 
S
N
|
N
S
 
V
I
 
V
S
 
S
V
|
V
A
 
A
E
 
E
H
 
D
V
 
E
V
 
L
M
 
M
T
 
R
V
 
I
L
 
L
A
 
I
L
 
L
V
 
M
R
 
R
N
 
N
Y
 
F
L
 
V
P
 
P
S
 
G
H
 
Y
Q
 
N
Y
 
Q
A
 
V
V
 
V
N
 
K
G
 
G
G
 
E
W
 
W
N
 
N
I
 
V
A
 
A
D
 
G
C
 
I
V
 
A
A
 
Y
R
 
R
S
 
A
Y
 
Y
D
 
D
L
 
L
E
 
E
G
 
G
M
 
K
H
 
T
F
 
I
G
 
G
T
 
T
I
 
V
G
 
G
A
 
A
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
L
 
K
A
 
L
V
 
L
L
 
L
R
 
Q
R
 
R
L
 
L
K
 
K
P
 
P
F
 
F
D
 
G
V
 
C
H
 
N
L
 
L
H
 
L
Y
 
Y
Y
 
H
D
|
D
P
x
R
H
 
L
R
 
Q
L
 
M
S
 
A
P
 
P
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
K
E
 
E
L
 
T
N
 
G
V
 
A
T
 
K
F
 
F
H
 
V
S
 
E
S
 
D
A
 
L
E
 
N
S
 
E
L
 
M
V
 
L
R
 
P
V
 
K
C
 
C
D
 
D
V
 
V
I
 
I
N
 
V
L
 
I
Q
 
N
S
x
M
P
|
P
L
 
L
Y
 
T
P
 
E
S
 
K
T
 
T
E
 
R
H
 
G
M
 
M
F
 
F
N
 
N
D
 
K
A
 
E
M
 
L
L
 
I
A
 
G
Q
 
K
I
 
L
K
 
K
P
 
K
G
 
G
A
 
V
Y
 
L
L
 
I
I
 
V
N
 
N
C
x
N
A
|
A
R
|
R
G
 
G
K
 
A
L
 
I
C
 
M
D
 
E
A
 
R
D
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
V
R
 
D
A
 
A
L
 
V
Q
 
E
S
 
S
G
 
G
R
 
H
L
 
I
A
 
G
G
 
G
Y
 
Y
G
 
S
G
 
G
D
|
D
V
 
V
W
 
W
F
 
D
P
 
P
Q
|
Q
P
 
P
A
 
A
P
 
P
A
 
K
E
 
D
H
 
H
P
 
P
W
 
W
R
 
R
S
 
Y
M
 
M
P
 
P
N
 
N
E
 
Q
G
 
A
M
 
M
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
T
S
|
S
G
|
G
A
 
T
S
 
T
L
 
I
S
 
D
A
 
A
Q
 
Q
A
 
L
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
T
R
 
K
E
 
D
I
 
M
L
 
L
E
 
E
C
 
R
F
 
Y
L
 
F
E
 
K
G
 
G
R
 
E
A
 
D
I
 
F
R
 
P
A
 
T
E
 
E
Y
 
N
L
 
Y
I
 
I
V
 
V
N
 
K
G
 
D
G
 
G
K
 
E
L
 
L
A
 
A

3jtmA Structure of recombinant formate dehydrogenase from arabidopsis thaliana
52% identity, 84% coverage: 51:376/386 of query aligns to 22:347/351 of 3jtmA

query
sites
3jtmA
L
 
F
V
 
L
G
 
G
S
 
C
V
 
V
S
 
E
G
 
N
E
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
I
R
 
R
H
 
D
Y
 
W
L
 
L
E
 
E
S
 
S
Q
 
Q
G
 
G
H
 
H
E
 
Q
L
 
Y
I
 
I
V
 
V
T
 
T
S
 
D
D
 
D
K
 
K
D
 
E
G
 
G
P
 
P
D
 
D
S
 
C
I
 
E
F
 
L
E
 
E
R
 
K
H
 
H
L
 
I
C
 
P
D
 
D
A
 
L
D
 
H
I
 
V
V
 
L
I
 
I
S
 
S
Q
 
T
P
 
P
F
 
F
W
 
H
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
L
 
V
T
 
T
R
 
A
E
 
E
R
 
R
I
 
I
A
 
K
K
 
K
A
 
A
K
 
K
K
 
N
L
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
L
L
 
L
T
 
T
A
 
A
G
 
G
I
 
I
G
 
G
S
 
S
D
 
D
H
 
H
V
 
I
D
 
D
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
A
R
 
A
D
 
G
I
 
L
T
 
T
V
 
V
A
 
A
E
 
E
V
 
V
T
 
T
F
 
G
S
 
S
N
|
N
S
 
V
I
 
V
S
 
S
V
 
V
A
 
A
E
 
E
H
 
D
V
 
E
V
 
L
M
 
M
T
 
R
V
 
I
L
 
L
A
 
I
L
|
L
V
 
M
R
 
R
N
 
N
Y
 
F
L
 
V
P
 
P
S
 
G
H
 
Y
Q
 
N
Y
 
Q
A
 
V
V
 
V
N
 
K
G
 
G
G
 
E
W
 
W
N
 
N
I
 
V
A
 
A
D
 
G
C
 
I
V
 
A
A
 
Y
R
 
R
S
 
A
Y
 
Y
D
 
D
L
 
L
E
 
E
G
 
G
M
 
K
H
 
T
F
 
I
G
 
G
T
 
T
I
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
I
G
 
G
L
 
K
A
 
L
V
 
L
L
 
L
R
 
Q
R
 
R
L
 
L
K
 
K
P
 
P
F
 
F
D
 
G
V
 
C
H
 
N
L
 
L
H
 
L
Y
 
Y
Y
 
H
D
 
D
P
 
R
H
 
L
R
 
Q
L
 
M
S
 
A
P
 
P
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
K
E
 
E
L
 
T
N
 
G
V
 
A
T
 
K
F
 
F
H
 
V
S
 
E
S
 
D
A
 
L
E
 
N
S
 
E
L
 
M
V
 
L
R
 
P
V
 
K
C
 
C
D
 
D
V
 
V
I
 
I
N
 
V
L
 
I
Q
 
N
S
 
M
P
 
P
L
 
L
Y
 
T
P
 
E
S
 
K
T
 
T
E
 
R
H
 
G
M
 
M
F
 
F
N
 
N
D
 
K
A
 
E
M
 
L
L
 
I
A
 
G
Q
 
K
I
 
L
K
 
K
P
 
K
G
 
G
A
 
V
Y
 
L
L
 
I
I
 
V
N
 
N
C
 
N
A
 
A
R
|
R
G
 
G
K
 
A
L
 
I
C
 
M
D
 
E
A
 
R
D
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
V
R
 
D
A
 
A
L
 
V
Q
 
E
S
 
S
G
 
G
R
 
H
L
 
I
A
x
G
G
 
G
Y
 
Y
G
 
S
G
 
G
D
|
D
V
 
V
W
 
W
F
 
D
P
 
P
Q
|
Q
P
 
P
A
 
A
P
 
P
A
 
K
E
 
D
H
 
H
P
 
P
W
 
W
R
 
R
S
 
Y
M
 
M
P
 
P
N
 
N
E
 
Q
G
 
A
M
 
M
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
T
S
 
S
G
 
G
A
 
T
S
 
T
L
 
I
S
 
D
A
 
A
Q
 
Q
A
 
L
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
T
R
 
K
E
 
D
I
 
M
L
 
L
E
 
E
C
 
R
F
 
Y
L
 
F
E
 
K
G
 
G
R
 
E
A
 
D
I
 
F
R
 
P
A
 
T
E
 
E
Y
 
N
L
 
Y
I
 
I
V
 
V
N
 
K
G
 
D
G
 
G
K
 
E
L
 
L
A
 
A

Q9S7E4 Formate dehydrogenase, chloroplastic/mitochondrial; FDH; NAD-dependent formate dehydrogenase; EC 1.17.1.9 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress)
52% identity, 84% coverage: 51:376/386 of query aligns to 55:380/384 of Q9S7E4

query
sites
Q9S7E4
L
 
F
V
 
L
G
 
G
S
 
C
V
 
V
S
 
E
G
 
N
E
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
I
R
 
R
H
 
D
Y
 
W
L
 
L
E
 
E
S
 
S
Q
 
Q
G
 
G
H
 
H
E
 
Q
L
 
Y
I
 
I
V
 
V
T
 
T
S
 
D
D
 
D
K
 
K
D
 
E
G
 
G
P
 
P
D
 
D
S
 
C
I
 
E
F
 
L
E
 
E
R
 
K
H
 
H
L
 
I
C
 
P
D
 
D
A
 
L
D
 
H
I
 
V
V
 
L
I
 
I
S
 
S
Q
 
T
P
 
P
F
 
F
W
 
H
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
L
 
V
T
 
T
R
 
A
E
 
E
R
 
R
I
 
I
A
 
K
K
 
K
A
 
A
K
 
K
K
 
N
L
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
L
L
 
L
T
 
T
A
 
A
G
 
G
I
 
I
G
 
G
S
 
S
D
 
D
H
 
H
V
 
I
D
 
D
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
A
R
 
A
D
 
G
I
 
L
T
 
T
V
 
V
A
 
A
E
 
E
V
 
V
T
 
T
F
 
G
S
 
S
N
 
N
S
 
V
I
 
V
S
 
S
V
 
V
A
 
A
E
 
E
H
 
D
V
 
E
V
 
L
M
 
M
T
 
R
V
 
I
L
 
L
A
 
I
L
 
L
V
 
M
R
 
R
N
 
N
Y
 
F
L
 
V
P
 
P
S
 
G
H
 
Y
Q
 
N
Y
 
Q
A
 
V
V
 
V
N
 
K
G
 
G
G
 
E
W
 
W
N
 
N
I
 
V
A
 
A
D
 
G
C
 
I
V
 
A
A
 
Y
R
 
R
S
 
A
Y
 
Y
D
 
D
L
 
L
E
 
E
G
 
G
M
 
K
H
 
T
F
 
I
G
 
G
T
 
T
I
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
L
 
K
A
 
L
V
 
L
L
 
L
R
 
Q
R
 
R
L
 
L
K
 
K
P
 
P
F
 
F
D
 
G
V
 
C
H
 
N
L
 
L
H
 
L
Y
 
Y
Y
 
H
D
|
D
P
 
R
H
 
L
R
 
Q
L
 
M
S
 
A
P
 
P
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
K
E
 
E
L
 
T
N
 
G
V
 
A
T
 
K
F
 
F
H
 
V
S
 
E
S
 
D
A
 
L
E
 
N
S
 
E
L
 
M
V
 
L
R
 
P
V
 
K
C
 
C
D
 
D
V
 
V
I
 
I
N
 
V
L
 
I
Q
 
N
S
 
M
P
|
P
L
|
L
Y
x
T
P
x
E
S
x
K
T
 
T
E
 
R
H
 
G
M
 
M
F
 
F
N
 
N
D
 
K
A
 
E
M
 
L
L
 
I
A
 
G
Q
 
K
I
 
L
K
 
K
P
 
K
G
 
G
A
 
V
Y
 
L
L
 
I
I
 
V
N
 
N
C
x
N
A
 
A
R
 
R
G
 
G
K
 
A
L
 
I
C
 
M
D
 
E
A
 
R
D
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
V
R
 
D
A
 
A
L
 
V
Q
 
E
S
 
S
G
 
G
R
 
H
L
 
I
A
 
G
G
 
G
Y
 
Y
G
 
S
G
 
G
D
|
D
V
 
V
W
 
W
F
 
D
P
 
P
Q
 
Q
P
 
P
A
 
A
P
 
P
A
 
K
E
 
D
H
 
H
P
 
P
W
 
W
R
 
R
S
 
Y
M
 
M
P
 
P
N
 
N
E
 
Q
G
 
A
M
 
M
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
x
T
S
|
S
G
|
G
A
 
T
S
 
T
L
 
I
S
 
D
A
 
A
Q
 
Q
A
 
L
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
T
R
 
K
E
 
D
I
 
M
L
 
L
E
 
E
C
 
R
F
 
Y
L
 
F
E
 
K
G
 
G
R
 
E
A
 
D
I
 
F
R
 
P
A
 
T
E
 
E
Y
 
N
L
 
Y
I
 
I
V
 
V
N
 
K
G
 
D
G
 
G
K
 
E
L
 
L
A
 
A

Sites not aligning to the query:

6d4bA Crystal structure of candida boidinii formate dehydrogenase v123a mutant complexed with NAD+ and azide
50% identity, 81% coverage: 50:361/386 of query aligns to 19:338/361 of 6d4bA

query
sites
6d4bA
E
 
K
L
 
L
V
 
Y
G
 
G
S
 
C
V
 
T
S
 
E
G
 
N
E
 
K
L
 
L
G
 
G
L
 
I
R
 
A
H
 
N
Y
 
W
L
 
L
E
 
K
S
 
D
Q
 
Q
G
 
G
H
 
H
E
 
E
L
 
L
I
 
I
V
 
T
T
 
T
S
 
S
D
 
D
K
 
K
D
 
E
G
 
G
P
 
G
D
 
N
S
 
S
I
 
V
F
 
L
E
 
D
R
 
Q
H
 
H
L
 
I
C
 
P
D
 
D
A
 
A
D
 
D
I
 
I
V
 
I
I
 
I
S
 
T
Q
 
T
P
|
P
F
|
F
W
 
H
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
L
 
I
T
 
T
R
 
K
E
 
E
R
 
R
I
 
I
A
 
D
K
 
K
A
 
A
K
 
K
K
 
K
L
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
V
L
 
V
T
 
V
A
 
A
G
 
G
I
x
V
G
 
G
S
 
S
D
 
D
H
 
H
V
 
I
D
 
D
L
 
L
Q
 
D
A
 
Y
A
 
I
A
 
N
E
 
Q
-
 
T
-
 
G
R
 
K
D
 
K
I
 
I
T
 
S
V
 
V
A
 
L
E
 
E
V
 
V
T
 
T
F
 
G
S
 
S
N
|
N
S
 
V
I
 
V
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
H
V
 
V
V
 
L
M
 
M
T
 
T
V
 
M
L
 
L
A
 
V
L
 
L
V
 
V
R
 
R
N
 
N
Y
 
F
L
 
V
P
 
P
S
 
A
H
 
H
Q
 
E
Y
 
Q
A
 
I
V
 
I
N
 
N
G
 
H
G
 
D
W
 
W
N
 
E
I
 
V
A
 
A
D
 
A
C
 
I
V
 
A
A
 
K
R
 
D
S
 
A
Y
 
Y
D
 
D
L
 
I
E
 
E
G
 
G
M
 
K
H
 
T
F
 
I
G
 
A
T
 
T
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
L
 
Y
A
 
R
V
 
V
L
 
L
R
 
E
R
 
R
L
 
L
K
 
V
P
 
P
F
 
F
D
 
N
-
 
P
V
 
K
H
 
E
L
 
L
H
 
L
Y
 
Y
Y
|
Y
D
|
D
P
x
Y
H
 
Q
R
 
A
L
 
L
S
 
P
P
 
K
E
 
D
L
 
A
E
 
E
R
 
E
E
 
K
L
 
V
N
 
G
V
 
A
T
 
R
F
 
R
H
 
V
S
 
E
S
 
N
A
 
I
E
 
E
S
 
E
L
 
L
V
 
V
R
 
A
V
 
Q
C
 
A
D
 
D
V
 
I
I
 
V
N
 
T
L
 
I
Q
 
N
S
x
A
P
|
P
L
 
L
Y
x
H
P
 
A
S
 
G
T
|
T
E
 
K
H
 
G
M
 
L
F
 
I
N
 
N
D
 
K
A
 
E
M
 
L
L
 
L
A
 
S
Q
 
K
I
 
F
K
 
K
P
 
K
G
 
G
A
 
A
Y
 
W
L
 
L
I
 
V
N
 
N
C
x
T
A
|
A
R
|
R
G
 
G
K
 
A
L
 
I
C
 
C
D
 
V
A
 
A
D
 
E
A
 
D
V
 
V
A
 
A
R
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
E
S
 
S
G
 
G
R
 
Q
L
 
L
A
 
R
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
D
|
D
V
 
V
W
 
W
F
 
F
P
 
P
Q
 
Q
P
 
P
A
 
A
P
 
P
A
 
K
E
 
D
H
 
H
P
 
P
W
 
W
R
 
R
S
 
D
M
 
M
P
 
R
N
 
N
E
 
K
-
 
Y
-
 
G
-
 
A
-
 
G
-
 
N
G
 
A
M
 
M
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
Y
S
|
S
G
|
G
A
 
T
S
 
T
L
 
L
S
 
D
A
 
A
Q
 
Q
A
 
T
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
A
 
E
G
 
G
T
 
T
R
 
K
E
 
N
I
 
I
L
 
L
E
 
E
C
 
S
F
 
F
L
 
F
E
 
T
G
 
G
R
 
K

Sites not aligning to the query:

O13437 Formate dehydrogenase; FDH; NAD-dependent formate dehydrogenase; EC 1.17.1.9 from Candida boidinii (Yeast) (see 4 papers)
50% identity, 81% coverage: 50:361/386 of query aligns to 19:338/364 of O13437

query
sites
O13437
E
 
K
L
 
L
V
 
Y
G
 
G
S
x
C
V
 
T
S
 
E
G
 
N
E
 
K
L
 
L
G
 
G
L
 
I
R
 
A
H
 
N
Y
 
W
L
 
L
E
 
K
S
 
D
Q
 
Q
G
 
G
H
 
H
E
 
E
L
 
L
I
 
I
V
 
T
T
 
T
S
 
S
D
 
D
K
|
K
D
 
E
G
 
G
P
 
E
D
 
T
S
 
S
I
 
E
F
 
L
E
 
D
R
 
K
H
 
H
L
 
I
C
 
P
D
 
D
A
 
A
D
 
D
I
 
I
V
 
I
I
 
I
S
 
T
Q
 
T
P
 
P
F
|
F
W
 
H
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
L
 
I
T
 
T
R
 
K
E
 
E
R
 
R
I
 
L
A
 
D
K
 
K
A
 
A
K
 
K
K
 
N
L
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
V
L
 
V
T
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
V
G
 
G
S
 
S
D
 
D
H
 
H
V
 
I
D
 
D
L
 
L
Q
 
D
A
 
Y
A
 
I
A
 
N
E
 
Q
-
 
T
-
 
G
R
 
K
D
 
K
I
 
I
T
 
S
V
 
V
A
 
L
E
 
E
V
 
V
T
 
T
F
 
G
S
 
S
N
|
N
S
 
V
I
 
V
S
 
S
V
 
V
A
 
A
E
 
E
H
 
H
V
 
V
V
 
V
M
 
M
T
 
T
V
 
M
L
 
L
A
 
V
L
 
L
V
 
V
R
 
R
N
 
N
Y
 
F
L
 
V
P
 
P
S
 
A
H
 
H
Q
 
E
Y
 
Q
A
 
I
V
 
I
N
 
N
G
 
H
G
 
D
W
 
W
N
 
E
I
 
V
A
 
A
D
 
A
C
 
I
V
 
A
A
 
K
R
 
D
S
 
A
Y
 
Y
D
 
D
L
 
I
E
 
E
G
 
G
M
 
K
H
 
T
F
 
I
G
 
A
T
 
T
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
R
 
R
I
|
I
G
 
G
L
 
Y
A
 
R
V
 
V
L
 
L
R
 
E
R
 
R
L
 
L
K
 
L
P
 
P
F
 
F
D
 
N
-
 
P
V
 
K
H
 
E
L
 
L
H
 
L
Y
 
Y
Y
 
Y
D
 
D
P
 
Y
H
x
Q
R
 
A
L
 
L
S
 
P
P
 
K
E
 
E
L
 
A
E
 
E
R
 
E
E
 
K
L
 
V
N
 
G
V
 
A
T
 
R
F
 
R
H
 
V
S
 
E
S
 
N
A
 
I
E
 
E
S
 
E
L
 
L
V
 
V
R
 
A
V
 
Q
C
 
A
D
 
D
V
 
I
I
 
V
N
 
T
L
 
V
Q
 
N
S
 
A
P
 
P
L
 
L
Y
 
H
P
 
A
S
 
G
T
 
T
E
 
K
H
 
G
M
 
L
F
 
I
N
 
N
D
 
K
A
 
E
M
 
L
L
 
L
A
 
S
Q
 
K
I
 
F
K
 
K
P
 
K
G
 
G
A
 
A
Y
 
W
L
 
L
I
 
V
N
 
N
C
 
T
A
 
A
R
|
R
G
 
G
K
 
A
L
 
I
C
|
C
D
 
V
A
 
A
D
 
E
A
 
D
V
 
V
A
 
A
R
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
E
S
 
S
G
 
G
R
 
Q
L
 
L
A
 
R
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
D
 
D
V
 
V
W
 
W
F
 
F
P
 
P
Q
|
Q
P
|
P
A
 
A
P
 
P
A
 
K
E
 
D
H
 
H
P
 
P
W
 
W
R
 
R
S
 
D
M
 
M
P
 
R
N
 
N
E
 
K
-
 
Y
-
 
G
-
 
A
-
 
G
-
 
N
G
 
A
M
 
M
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
Y
S
 
S
G
 
G
A
 
T
S
 
T
L
 
L
S
 
D
A
 
A
Q
 
Q
A
 
T
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
A
 
E
G
 
G
T
 
T
R
x
K
E
 
N
I
 
I
L
 
L
E
 
E
C
 
S
F
 
F
L
 
F
E
 
T
G
 
G
R
 
K

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_013093107.1 NCBI__GCF_000092885.1:WP_013093107.1
MAKILCALFPDPVTGYPPSYARTDVPSIASYPGGQRPPSPKGPLGFKPGELVGSVSGELG
LRHYLESQGHELIVTSDKDGPDSIFERHLCDADIVISQPFWPAYLTRERIAKAKKLKLAL
TAGIGSDHVDLQAAAERDITVAEVTFSNSISVAEHVVMTVLALVRNYLPSHQYAVNGGWN
IADCVARSYDLEGMHFGTIGAGRIGLAVLRRLKPFDVHLHYYDPHRLSPELERELNVTFH
SSAESLVRVCDVINLQSPLYPSTEHMFNDAMLAQIKPGAYLINCARGKLCDADAVARALQ
SGRLAGYGGDVWFPQPAPAEHPWRSMPNEGMTPHISGASLSAQARYAAGTREILECFLEG
RAIRAEYLIVNGGKLAGTGAASYKLG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory