SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_013257036.1 NCBI__GCF_000143965.1:WP_013257036.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7d0aB Acinetobacter mlafedb complex in adp-vanadate trapped vclose conformation (see paper)
46% identity, 98% coverage: 4:252/254 of query aligns to 1:249/263 of 7d0aB

query
sites
7d0aB
A
 
T
E
 
Q
N
 
S
I
 
L
I
 
I
E
 
E
L
 
V
R
 
K
D
 
N
L
 
L
V
 
S
K
 
F
N
 
N
F
 
R
G
 
G
R
 
E
Q
 
R
R
 
V
V
 
I
L
 
Y
D
 
D
G
 
N
L
 
I
N
 
S
L
 
L
T
 
N
I
 
I
P
 
R
R
 
R
G
 
G
R
 
Q
I
 
I
T
 
T
V
 
A
I
 
I
I
 
M
G
 
G
R
 
P
S
|
S
G
 
G
G
x
T
G
|
G
K
|
K
S
 
T
V
 
T
L
 
L
L
 
L
K
 
R
H
 
L
M
 
I
I
 
G
G
 
G
L
 
Q
I
 
L
K
 
V
P
 
P
D
 
D
A
 
Q
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
L
 
L
V
 
L
G
 
D
G
 
G
Q
 
K
D
 
D
I
 
I
G
 
A
H
 
Q
L
 
M
D
 
S
D
 
R
R
 
Q
Q
 
E
L
 
L
N
 
F
Q
 
A
I
 
A
R
 
R
R
 
A
R
 
R
F
 
M
G
 
G
M
 
M
L
 
L
F
 
F
Q
 
Q
D
 
S
A
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
F
D
 
T
S
 
D
M
 
M
S
 
S
V
 
V
F
 
Y
D
 
E
N
 
N
V
 
V
A
 
A
F
 
F
P
 
P
L
 
I
R
 
R
E
 
A
H
 
H
T
 
T
S
 
K
H
 
L
S
 
S
A
 
E
A
 
N
E
 
L
I
 
I
A
 
A
R
 
E
I
 
L
V
 
V
A
 
A
D
 
L
K
 
K
L
 
L
R
 
E
M
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
R
G
 
G
V
 
T
E
 
E
A
 
Q
K
 
L
M
 
M
P
 
P
S
 
T
Q
x
E
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
M
|
M
R
 
N
K
 
R
R
 
R
V
 
V
G
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
L
E
 
D
P
 
P
E
 
D
I
 
L
V
 
I
L
 
M
Y
 
Y
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
F
T
 
A
G
 
G
L
 
Q
D
 
D
P
 
P
L
 
I
M
 
V
T
 
K
E
 
G
A
 
V
I
 
L
N
 
T
R
 
R
L
 
L
I
 
I
A
 
R
D
 
S
T
 
L
Q
 
R
E
 
E
R
 
A
L
 
L
G
 
D
I
 
L
T
 
T
S
 
T
V
 
I
V
 
I
I
 
V
S
 
S
H
 
H
D
 
D
I
 
V
A
 
P
G
 
E
A
 
T
L
 
L
K
 
S
I
 
I
A
 
A
H
 
D
Q
 
Y
I
 
I
A
 
Y
M
 
V
L
 
V
Y
 
A
Q
 
E
G
 
G
R
 
K
I
 
I
I
 
Q
A
 
G
S
 
E
G
 
G
S
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
E
I
 
L
G
 
Q
D
 
A
S
 
Y
D
 
A
D
 
S
P
 
P
V
 
F
V
 
V
R
 
K
Q
 
Q
F
 
F
I
 
L
S
 
T
G
 
G
S
 
S
V
 
A
E
 
E
G
 
G
P
 
P
I
 
V
E
 
E

7d08B Acinetobacter mlafedb complex in atp-bound vtrans1 conformation (see paper)
46% identity, 98% coverage: 4:252/254 of query aligns to 1:249/263 of 7d08B

query
sites
7d08B
A
 
T
E
 
Q
N
 
S
I
 
L
I
 
I
E
 
E
L
 
V
R
 
K
D
 
N
L
 
L
V
 
S
K
 
F
N
 
N
F
x
R
G
 
G
R
 
E
Q
x
R
R
 
V
V
 
I
L
 
Y
D
 
D
G
 
N
L
 
I
N
 
S
L
 
L
T
 
N
I
 
I
P
 
R
R
 
R
G
 
G
R
 
Q
I
 
I
T
 
T
V
 
A
I
 
I
I
 
M
G
 
G
R
 
P
S
 
S
G
|
G
G
x
T
G
 
G
K
|
K
S
x
T
V
x
T
L
 
L
L
 
L
K
 
R
H
 
L
M
 
I
I
 
G
G
 
G
L
 
Q
I
 
L
K
 
V
P
 
P
D
 
D
A
 
Q
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
L
 
L
V
 
L
G
 
D
G
 
G
Q
 
K
D
 
D
I
 
I
G
 
A
H
 
Q
L
 
M
D
 
S
D
 
R
R
 
Q
Q
 
E
L
 
L
N
 
F
Q
 
A
I
 
A
R
 
R
R
 
A
R
 
R
F
 
M
G
 
G
M
 
M
L
 
L
F
 
F
Q
 
Q
D
 
S
A
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
F
D
 
T
S
 
D
M
 
M
S
 
S
V
 
V
F
 
Y
D
 
E
N
 
N
V
 
V
A
 
A
F
 
F
P
 
P
L
 
I
R
 
R
E
 
A
H
 
H
T
 
T
S
 
K
H
 
L
S
 
S
A
 
E
A
 
N
E
 
L
I
 
I
A
 
A
R
 
E
I
 
L
V
 
V
A
 
A
D
 
L
K
 
K
L
 
L
R
 
E
M
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
R
G
 
G
V
 
T
E
 
E
A
 
Q
K
 
L
M
 
M
P
 
P
S
 
T
Q
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
N
K
 
R
R
 
R
V
 
V
G
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
L
E
 
D
P
 
P
E
 
D
I
 
L
V
 
I
L
 
M
Y
 
Y
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
F
T
 
A
G
 
G
L
 
Q
D
 
D
P
 
P
L
 
I
M
 
V
T
 
K
E
 
G
A
 
V
I
 
L
N
 
T
R
 
R
L
 
L
I
 
I
A
 
R
D
 
S
T
 
L
Q
 
R
E
 
E
R
 
A
L
 
L
G
 
D
I
 
L
T
 
T
S
 
T
V
 
I
V
 
I
I
 
V
S
 
S
H
 
H
D
 
D
I
 
V
A
 
P
G
 
E
A
 
T
L
 
L
K
 
S
I
 
I
A
 
A
H
 
D
Q
 
Y
I
 
I
A
 
Y
M
 
V
L
 
V
Y
 
A
Q
 
E
G
 
G
R
 
K
I
 
I
I
 
Q
A
 
G
S
 
E
G
 
G
S
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
E
I
 
L
G
 
Q
D
 
A
S
 
Y
D
 
A
D
 
S
P
 
P
V
 
F
V
 
V
R
 
K
Q
 
Q
F
 
F
I
 
L
S
 
T
G
 
G
S
 
S
V
 
A
E
 
E
G
 
G
P
 
P
I
 
V
E
 
E

6z5uK Cryo-em structure of the a. Baumannii mlabdef complex bound to appnhp (see paper)
47% identity, 97% coverage: 6:252/254 of query aligns to 1:247/253 of 6z5uK

query
sites
6z5uK
N
 
S
I
 
L
I
 
I
E
 
E
L
 
V
R
 
K
D
 
N
L
 
L
V
 
S
K
 
F
N
 
N
F
x
R
G
 
G
R
 
E
Q
 
R
R
 
V
V
 
I
L
 
Y
D
 
D
G
 
N
L
 
I
N
 
S
L
 
L
T
 
N
I
 
I
P
 
R
R
 
R
G
 
G
R
 
Q
I
 
I
T
 
T
V
 
A
I
 
I
I
 
M
G
 
G
R
 
P
S
|
S
G
|
G
G
 
T
G
|
G
K
|
K
S
x
T
V
x
T
L
 
L
L
 
L
K
 
R
H
 
L
M
 
I
I
 
G
G
 
G
L
 
Q
I
 
L
K
 
V
P
 
P
D
 
D
A
 
Q
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
L
 
L
V
 
L
G
 
D
G
 
G
Q
 
K
D
 
D
I
 
I
G
 
A
H
 
Q
L
 
M
D
 
S
D
 
R
R
 
Q
Q
 
E
L
 
L
N
 
F
Q
 
A
I
 
A
R
 
R
R
 
A
R
 
R
F
 
M
G
 
G
M
 
M
L
 
L
F
 
F
Q
|
Q
D
 
S
A
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
F
D
 
T
S
 
D
M
 
M
S
 
S
V
 
V
F
 
Y
D
 
E
N
 
N
V
 
V
A
 
A
F
 
F
P
 
P
L
 
I
R
 
R
E
 
A
H
 
H
T
 
T
S
 
K
H
 
L
S
 
S
A
 
E
A
 
N
E
 
L
I
 
I
A
 
A
R
 
E
I
 
L
V
 
V
A
 
A
D
 
L
K
 
K
L
 
L
R
 
E
M
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
R
G
 
G
V
 
T
E
 
E
A
 
Q
K
 
L
M
 
M
P
 
P
S
 
T
Q
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
N
K
 
R
R
 
R
V
 
V
G
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
L
E
 
D
P
 
P
E
 
D
I
 
L
V
 
I
L
 
M
Y
 
Y
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
F
T
 
A
G
 
G
L
 
Q
D
 
D
P
 
P
L
 
I
M
 
V
T
 
K
E
 
G
A
 
V
I
 
L
N
 
T
R
 
R
L
 
L
I
 
I
A
 
R
D
 
S
T
 
L
Q
 
R
E
 
E
R
 
A
L
 
L
G
 
D
I
 
L
T
 
T
S
 
T
V
 
I
V
 
I
I
 
V
S
 
S
H
|
H
D
 
D
I
 
V
A
 
P
G
 
E
A
 
T
L
 
L
K
 
S
I
 
I
A
 
A
H
 
D
Q
 
Y
I
 
I
A
 
Y
M
 
V
L
 
V
Y
 
A
Q
 
E
G
 
G
R
 
K
I
 
I
I
 
Q
A
 
G
S
 
E
G
 
G
S
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
E
I
 
L
G
 
Q
D
 
A
S
 
Y
D
 
A
D
 
S
P
 
P
V
 
F
V
 
V
R
 
K
Q
 
Q
F
 
F
I
 
L
S
 
T
G
 
G
S
 
S
V
 
A
E
 
E
G
 
G
P
 
P
I
 
V
E
 
E

7chaI Cryo-em structure of p.Aeruginosa mlafebd with amppnp (see paper)
45% identity, 96% coverage: 8:251/254 of query aligns to 4:247/262 of 7chaI

query
sites
7chaI
I
 
V
E
 
E
L
 
L
R
 
K
D
 
G
L
 
L
V
 
T
K
 
F
N
 
K
F
x
R
G
 
G
R
 
S
Q
 
R
R
 
A
V
 
I
L
 
F
D
 
D
G
 
N
L
 
I
N
 
D
L
 
V
T
 
R
I
 
I
P
 
P
R
 
R
G
 
G
R
 
K
I
 
V
T
 
T
V
 
G
I
 
I
I
 
M
G
 
G
R
 
P
S
|
S
G
|
G
G
x
C
G
|
G
K
|
K
S
x
T
V
x
T
L
 
L
L
 
L
K
 
R
H
 
L
M
 
I
I
 
A
G
 
S
L
 
Q
I
 
L
K
 
R
P
 
P
D
 
S
A
 
K
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
L
 
W
V
 
V
G
 
N
G
 
G
Q
 
Q
D
 
N
I
 
L
G
 
P
H
 
Q
L
 
L
D
 
S
D
 
R
R
 
G
Q
 
D
L
 
L
N
 
F
Q
 
D
I
 
M
R
 
R
R
 
K
R
 
Q
F
 
F
G
 
G
M
 
V
L
 
L
F
 
F
Q
 
Q
D
 
S
A
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
F
D
 
T
S
 
D
M
 
L
S
 
D
V
 
V
F
 
F
D
 
E
N
 
N
V
 
V
A
 
A
F
 
F
P
 
P
L
 
L
R
 
R
E
 
V
H
 
H
T
 
T
S
 
Q
H
 
L
S
 
P
A
 
E
A
 
E
E
 
M
I
 
I
A
 
R
R
 
D
I
 
I
V
 
V
A
 
L
D
 
M
K
 
K
L
 
L
R
 
Q
M
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
R
G
 
G
V
 
A
E
 
V
A
 
E
K
 
L
M
 
M
P
 
P
S
 
D
Q
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
K
K
 
R
R
 
R
V
 
V
G
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
L
E
 
D
P
 
P
E
 
Q
I
 
I
V
 
L
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
F
T
 
V
G
 
G
L
 
Q
D
 
D
P
 
P
L
 
I
M
 
A
T
 
M
E
 
G
A
 
V
I
 
L
N
 
V
R
 
R
L
 
L
I
 
I
A
 
R
D
 
L
T
 
L
Q
 
N
E
 
D
R
 
A
L
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
T
S
 
S
V
 
I
V
 
V
I
 
V
S
 
S
H
 
H
D
 
D
I
 
L
A
 
A
G
 
E
A
 
T
L
 
A
K
 
S
I
 
I
A
 
A
H
 
D
Q
 
Y
I
 
I
A
 
Y
M
 
I
L
 
V
Y
 
G
Q
 
D
G
 
G
R
 
R
I
 
V
I
 
L
A
 
G
S
 
H
G
 
G
S
 
T
P
 
P
E
 
D
Q
 
V
I
 
L
G
 
K
D
 
E
S
 
T
D
 
D
D
 
D
P
 
P
V
 
R
V
 
I
R
 
R
Q
 
Q
F
 
F
I
 
V
S
 
K
G
 
G
S
 
I
V
 
P
E
 
D
G
 
G
P
 
P
I
 
V

7ch6C Cryo-em structure of e.Coli mlafeb with amppnp (see paper)
45% identity, 97% coverage: 6:251/254 of query aligns to 3:248/265 of 7ch6C

query
sites
7ch6C
N
 
N
I
 
L
I
 
V
E
 
D
L
 
M
R
 
R
D
 
D
L
 
V
V
 
S
K
 
F
N
 
T
F
x
R
G
 
G
R
 
N
Q
x
R
R
 
C
V
 
I
L
 
F
D
 
D
G
 
N
L
 
I
N
 
S
L
 
L
T
 
T
I
 
V
P
 
P
R
 
R
G
 
G
R
 
K
I
 
I
T
 
T
V
 
A
I
 
I
I
 
M
G
 
G
R
 
P
S
 
S
G
|
G
G
 
I
G
|
G
K
|
K
S
x
T
V
 
T
L
 
L
L
 
L
K
 
R
H
 
L
M
 
I
I
 
G
G
 
G
L
 
Q
I
 
I
K
 
A
P
 
P
D
 
D
A
 
H
G
 
G
Q
 
E
V
 
I
L
 
L
V
 
F
G
 
D
G
 
G
Q
 
E
D
 
N
I
 
I
G
 
P
H
 
A
L
 
M
D
 
S
D
 
R
R
 
S
Q
 
R
L
 
L
N
 
Y
Q
 
T
I
 
V
R
 
R
R
 
K
R
 
R
F
 
M
G
 
S
M
 
M
L
 
L
F
 
F
Q
 
Q
D
 
S
A
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
F
D
 
T
S
 
D
M
 
M
S
 
N
V
 
V
F
 
F
D
 
D
N
 
N
V
 
V
A
 
A
F
 
Y
P
 
P
L
 
L
R
 
R
E
 
E
H
 
H
T
 
T
S
 
Q
H
 
L
S
 
P
A
 
A
A
 
P
E
 
L
I
 
L
A
 
H
R
 
S
I
 
T
V
 
V
A
 
M
D
 
M
K
 
K
L
 
L
R
 
E
M
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
R
G
 
G
V
 
A
E
 
A
A
 
K
K
 
L
M
 
M
P
 
P
S
 
S
Q
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
A
K
 
R
R
 
R
V
 
A
G
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
L
E
 
E
P
 
P
E
 
D
I
 
L
V
 
I
L
 
M
Y
 
F
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
F
T
 
V
G
 
G
L
 
Q
D
 
D
P
 
P
L
 
I
M
 
T
T
 
M
E
 
G
A
 
V
I
 
L
N
 
V
R
 
K
L
 
L
I
 
I
A
 
S
D
 
E
T
 
L
Q
 
N
E
 
S
R
 
A
L
 
L
G
 
G
I
 
V
T
 
T
S
 
C
V
 
V
V
 
V
I
 
V
S
 
S
H
 
H
D
 
D
I
 
V
A
 
P
G
 
E
A
 
V
L
 
L
K
 
S
I
 
I
A
 
A
H
 
D
Q
 
H
I
 
A
A
 
W
M
 
I
L
 
L
Y
 
A
Q
 
D
G
 
K
R
 
K
I
 
I
I
 
V
A
 
A
S
 
H
G
 
G
S
 
S
P
 
A
E
 
Q
Q
 
A
I
 
L
G
 
Q
D
 
A
S
 
N
D
 
P
D
 
D
P
 
P
V
 
R
V
 
V
R
 
R
Q
 
Q
F
 
F
I
 
L
S
 
D
G
 
G
S
 
I
V
 
A
E
 
D
G
 
G
P
 
P
I
 
V

6xgyA Crystal structure of e. Coli mlafb abc transport subunits in the dimeric state (see paper)
45% identity, 97% coverage: 6:251/254 of query aligns to 3:248/264 of 6xgyA

query
sites
6xgyA
N
 
N
I
 
L
I
 
V
E
 
D
L
 
M
R
 
R
D
 
D
L
 
V
V
 
S
K
 
F
N
 
T
F
x
R
G
 
G
R
 
N
Q
 
R
R
 
C
V
 
I
L
 
F
D
 
D
G
 
N
L
 
I
N
 
S
L
 
L
T
 
T
I
 
V
P
 
P
R
 
R
G
 
G
R
 
K
I
 
I
T
 
T
V
 
A
I
 
I
I
 
M
G
 
G
R
 
P
S
 
S
G
|
G
G
 
I
G
|
G
K
|
K
S
x
T
V
x
T
L
 
L
L
 
L
K
 
R
H
 
L
M
 
I
I
 
G
G
 
G
L
 
Q
I
 
I
K
 
A
P
 
P
D
 
D
A
 
H
G
 
G
Q
 
E
V
 
I
L
 
L
V
 
F
G
 
D
G
 
G
Q
 
E
D
 
N
I
 
I
G
 
P
H
 
A
L
 
M
D
 
S
D
 
R
R
 
S
Q
 
R
L
 
L
N
 
Y
Q
 
T
I
 
V
R
 
R
R
 
K
R
 
R
F
 
M
G
 
S
M
 
M
L
 
L
F
 
F
Q
 
Q
D
 
S
A
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
F
D
 
T
S
 
D
M
 
M
S
 
N
V
 
V
F
 
F
D
 
D
N
 
N
V
 
V
A
 
A
F
 
Y
P
 
P
L
 
L
R
 
R
E
 
E
H
 
H
T
 
T
S
 
Q
H
 
L
S
 
P
A
 
A
A
 
P
E
 
L
I
 
L
A
 
H
R
 
S
I
 
T
V
 
V
A
 
M
D
 
M
K
 
K
L
 
L
R
 
E
M
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
R
G
 
G
V
 
A
E
 
A
A
 
K
K
 
L
M
 
M
P
 
P
S
 
S
Q
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
A
K
 
R
R
 
R
V
 
A
G
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
L
E
 
E
P
 
P
E
 
D
I
 
L
V
 
I
L
 
M
Y
 
F
D
|
D
E
|
E
P
 
P
T
 
F
T
 
V
G
 
G
L
 
Q
D
 
D
P
 
P
L
 
I
M
 
T
T
 
M
E
 
G
A
 
V
I
 
L
N
 
V
R
 
K
L
 
L
I
 
I
A
 
S
D
 
E
T
 
L
Q
 
N
E
 
S
R
 
A
L
 
L
G
 
G
I
 
V
T
 
T
S
 
C
V
 
V
V
 
V
I
 
V
S
 
S
H
 
H
D
 
D
I
 
V
A
 
P
G
 
E
A
 
V
L
 
L
K
 
S
I
 
I
A
 
A
H
 
D
Q
 
H
I
 
A
A
 
W
M
 
I
L
 
L
Y
 
A
Q
 
D
G
 
K
R
 
K
I
 
I
I
 
V
A
 
A
S
 
H
G
 
G
S
 
S
P
 
A
E
 
Q
Q
 
A
I
 
L
G
 
Q
D
 
A
S
 
N
D
 
P
D
 
D
P
 
P
V
 
R
V
 
V
R
 
R
Q
 
Q
F
 
F
I
 
L
S
 
D
G
 
G
S
 
I
V
 
A
E
 
D
G
 
G
P
 
P
I
 
V

7cgnB The overall structure of the mlafedb complex in atp-bound eqtall conformation (mutation of e170q on mlaf) (see paper)
44% identity, 97% coverage: 6:251/254 of query aligns to 3:248/263 of 7cgnB

query
sites
7cgnB
N
 
N
I
 
L
I
 
V
E
 
D
L
 
M
R
 
R
D
 
D
L
 
V
V
 
S
K
 
F
N
 
T
F
x
R
G
 
G
R
 
N
Q
 
R
R
 
C
V
 
I
L
 
F
D
 
D
G
 
N
L
 
I
N
 
S
L
 
L
T
 
T
I
 
V
P
 
P
R
 
R
G
 
G
R
 
K
I
 
I
T
 
T
V
 
A
I
 
I
I
 
M
G
 
G
R
 
P
S
 
S
G
|
G
G
x
I
G
 
G
K
|
K
S
x
T
V
x
T
L
 
L
L
 
L
K
 
R
H
 
L
M
 
I
I
 
G
G
 
G
L
 
Q
I
 
I
K
 
A
P
 
P
D
 
D
A
 
H
G
 
G
Q
 
E
V
 
I
L
 
L
V
 
F
G
 
D
G
 
G
Q
 
E
D
 
N
I
 
I
G
 
P
H
 
A
L
 
M
D
 
S
D
 
R
R
 
S
Q
 
R
L
 
L
N
 
Y
Q
 
T
I
 
V
R
 
R
R
 
K
R
 
R
F
 
M
G
 
S
M
 
M
L
 
L
F
 
F
Q
 
Q
D
 
S
A
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
F
D
 
T
S
 
D
M
 
M
S
 
N
V
 
V
F
 
F
D
 
D
N
 
N
V
 
V
A
 
A
F
 
Y
P
 
P
L
 
L
R
 
R
E
 
E
H
 
H
T
 
T
S
 
Q
H
 
L
S
 
P
A
 
A
A
 
P
E
 
L
I
 
L
A
 
H
R
 
S
I
 
T
V
 
V
A
 
M
D
 
M
K
 
K
L
 
L
R
 
E
M
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
R
G
 
G
V
 
A
E
 
A
A
 
K
K
 
L
M
 
M
P
 
P
S
 
S
Q
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
A
K
 
R
R
 
R
V
 
A
G
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
L
E
 
E
P
 
P
E
 
D
I
 
L
V
 
I
L
 
M
Y
 
F
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
F
T
 
V
G
 
G
L
 
Q
D
 
D
P
 
P
L
 
I
M
 
T
T
 
M
E
 
G
A
 
V
I
 
L
N
 
V
R
 
K
L
 
L
I
 
I
A
 
S
D
 
E
T
 
L
Q
 
N
E
 
S
R
 
A
L
 
L
G
 
G
I
 
V
T
 
T
S
 
C
V
 
V
V
 
V
I
 
V
S
 
S
H
 
H
D
 
D
I
 
V
A
 
P
G
 
E
A
 
V
L
 
L
K
 
S
I
 
I
A
 
A
H
 
D
Q
 
H
I
 
A
A
 
W
M
 
I
L
 
L
Y
 
A
Q
 
D
G
 
K
R
 
K
I
 
I
I
 
V
A
 
A
S
 
H
G
 
G
S
 
S
P
 
A
E
 
Q
Q
 
A
I
 
L
G
 
Q
D
 
A
S
 
N
D
 
P
D
 
D
P
 
P
V
 
R
V
 
V
R
 
R
Q
 
Q
F
 
F
I
 
L
S
 
D
G
 
G
S
 
I
V
 
A
E
 
D
G
 
G
P
 
P
I
 
V

7ch8I Cryo-em structure of p.Aeruginosa mlafebd with adp-v (see paper)
44% identity, 96% coverage: 8:251/254 of query aligns to 4:244/259 of 7ch8I

query
sites
7ch8I
I
 
V
E
 
E
L
 
L
R
 
K
D
 
G
L
 
L
V
 
T
K
 
F
N
 
K
F
x
R
G
 
G
R
 
S
Q
x
R
R
 
A
V
 
I
L
 
F
D
 
D
G
 
N
L
 
I
N
 
D
L
 
V
T
 
R
I
 
I
P
 
P
R
 
R
G
 
G
R
 
K
I
 
V
T
 
T
V
 
G
I
 
I
I
 
M
G
 
G
R
 
-
S
|
S
G
 
G
G
 
C
G
|
G
K
|
K
S
x
T
V
x
T
L
 
L
L
 
L
K
 
R
H
 
L
M
 
I
I
 
A
G
 
S
L
 
Q
I
 
L
K
 
R
P
 
P
D
 
S
A
 
K
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
L
 
W
V
 
V
G
 
N
G
 
G
Q
 
Q
D
 
N
I
 
L
G
 
P
H
 
Q
L
 
L
D
 
S
D
 
R
R
 
G
Q
 
D
L
 
L
N
 
F
Q
 
D
I
 
M
R
 
R
R
 
K
R
 
Q
F
 
F
G
 
G
M
 
V
L
 
L
F
 
F
Q
 
Q
D
 
S
A
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
F
D
 
T
S
 
D
M
 
L
S
 
D
V
 
V
F
 
F
D
 
E
N
 
N
V
 
V
A
 
A
F
 
F
P
 
P
L
 
L
R
 
R
E
 
V
H
 
H
T
 
T
S
 
Q
H
 
L
S
 
P
A
 
E
A
 
E
E
 
M
I
 
I
A
 
R
R
 
D
I
 
I
V
 
V
A
 
L
D
 
M
K
 
K
L
 
L
R
 
Q
M
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
R
G
 
G
V
 
A
E
 
V
A
 
E
K
 
L
M
 
M
P
 
P
S
 
D
Q
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
K
K
 
R
R
 
R
V
 
V
G
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
L
E
 
D
P
 
P
E
 
Q
I
 
I
V
 
L
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
E
 
E
P
 
F
T
 
V
T
 
G
G
 
-
L
 
-
D
 
Q
P
 
P
L
 
I
M
 
A
T
 
M
E
 
G
A
 
V
I
 
L
N
 
V
R
 
R
L
 
L
I
 
I
A
 
R
D
 
L
T
 
L
Q
 
N
E
 
D
R
 
A
L
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
T
S
 
S
V
 
I
V
 
V
I
 
V
S
 
S
H
 
H
D
 
D
I
 
L
A
 
A
G
 
E
A
 
T
L
 
A
K
 
S
I
 
I
A
 
A
H
 
D
Q
 
Y
I
 
I
A
 
Y
M
 
I
L
 
V
Y
 
G
Q
 
D
G
 
G
R
 
R
I
 
V
I
 
L
A
 
G
S
 
H
G
 
G
S
 
T
P
 
P
E
 
D
Q
 
V
I
 
L
G
 
K
D
 
E
S
 
T
D
 
D
D
 
D
P
 
P
V
 
R
V
 
I
R
 
R
Q
 
Q
F
 
F
I
 
V
S
 
K
G
 
G
S
 
I
V
 
P
E
 
D
G
 
G
P
 
P
I
 
V

Q9AT00 Protein TRIGALACTOSYLDIACYLGLYCEROL 3, chloroplastic; ABC transporter I family member 13; ABC transporter ABCI.13; AtABCI13; Non-intrinsic ABC protein 11; AtNAP11 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
39% identity, 96% coverage: 7:251/254 of query aligns to 84:343/345 of Q9AT00

query
sites
Q9AT00
I
 
L
I
 
I
E
 
E
L
 
C
R
 
R
D
 
D
L
 
V
V
 
Y
K
 
K
N
 
S
F
|
F
G
 
G
R
 
E
Q
 
K
R
 
H
V
 
I
L
 
L
D
 
K
G
 
G
L
 
V
N
 
S
L
 
F
T
 
K
I
 
I
P
 
R
R
 
H
G
 
G
R
 
E
I
 
A
T
 
V
V
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
P
S
 
S
G
 
G
G
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
S
V
 
T
L
 
I
L
 
L
K
 
K
H
 
I
M
 
M
I
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
L
K
 
A
P
 
P
D
 
D
A
 
K
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
L
 
Y
V
 
I
G
 
R
G
 
G
Q
 
K
D
 
K
-
 
R
I
 
A
G
 
G
H
 
L
L
 
I
D
 
S
D
 
D
R
 
E
Q
 
E
L
 
I
N
 
S
Q
 
G
I
 
L
R
 
R
R
 
-
R
 
-
F
 
I
G
 
G
M
 
L
L
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
S
A
 
A
A
 
A
L
 
L
F
 
F
D
 
D
S
 
S
M
 
L
S
 
S
V
 
V
F
 
R
D
 
E
N
 
N
V
 
V
A
 
G
F
 
F
P
 
L
L
 
L
R
 
Y
E
 
E
H
 
R
T
 
S
S
 
K
H
 
M
S
 
S
A
 
E
A
 
N
E
 
Q
I
 
I
A
 
S
R
 
E
I
 
L
V
 
V
A
 
T
D
 
Q
K
 
T
L
 
L
R
 
A
M
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
K
G
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
N
K
 
R
M
 
L
P
 
P
S
 
S
Q
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
K
K
 
K
R
 
R
V
 
V
G
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
S
I
 
L
-
 
I
-
 
F
-
 
D
-
 
T
-
 
T
-
 
K
-
 
E
A
 
V
L
 
I
E
 
E
P
 
P
E
 
E
I
 
V
V
 
L
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
T
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
P
 
P
L
 
I
M
 
A
T
 
S
E
 
T
A
 
V
I
 
V
N
 
E
R
 
D
L
 
L
I
 
I
A
 
R
D
 
S
T
 
V
-
 
H
-
 
M
-
 
T
-
 
D
Q
 
E
E
 
D
R
 
A
L
 
V
G
 
G
-
 
K
-
 
P
-
 
G
-
 
K
-
 
I
I
 
A
T
 
S
S
 
Y
V
 
L
V
 
V
I
 
V
S
 
T
H
 
H
D
 
Q
I
 
H
A
 
S
G
 
T
A
 
I
L
 
Q
K
 
R
I
 
A
A
 
V
H
 
D
Q
 
R
I
 
L
A
 
L
M
 
F
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
E
G
 
G
R
 
K
I
 
I
I
 
V
A
 
W
S
 
Q
G
 
G
S
 
M
P
 
T
E
 
H
Q
 
E
I
 
F
G
 
T
D
 
T
S
 
S
D
 
T
D
 
N
P
 
P
V
 
I
V
 
V
R
 
Q
Q
 
Q
F
 
F
I
 
A
S
 
T
G
 
G
S
 
S
V
 
L
E
 
D
G
 
G
P
 
P
I
 
I

P30750 Methionine import ATP-binding protein MetN; EC 7.4.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
37% identity, 95% coverage: 7:247/254 of query aligns to 1:245/343 of P30750

query
sites
P30750
I
 
M
I
 
I
E
 
K
L
 
L
R
 
S
D
 
N
L
 
I
V
 
T
K
 
K
N
 
V
F
 
F
G
 
H
R
 
Q
-
 
G
Q
 
T
R
 
R
V
 
T
L
 
I
D
 
Q
G
 
A
L
 
L
N
 
N
-
 
N
-
 
V
-
 
S
L
 
L
T
 
H
I
 
V
P
 
P
R
 
A
G
 
G
R
 
Q
I
 
I
T
 
Y
V
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
A
S
|
S
G
|
G
G
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
V
x
T
L
 
L
L
 
I
K
 
R
H
 
C
M
 
V
I
 
N
G
 
L
L
 
L
I
 
E
K
 
R
P
 
P
D
 
T
A
 
E
G
 
G
Q
 
S
V
 
V
L
 
L
V
 
V
G
 
D
G
 
G
Q
 
Q
D
 
E
I
 
L
G
 
T
H
 
T
L
 
L
D
 
S
D
 
E
R
 
S
Q
 
E
L
 
L
N
 
T
Q
 
K
I
 
A
R
 
R
R
 
R
R
 
Q
F
 
I
G
 
G
M
 
M
L
 
I
F
 
F
Q
 
Q
D
 
H
A
 
F
A
 
N
L
 
L
F
 
L
D
 
S
S
 
S
M
 
R
S
 
T
V
 
V
F
 
F
D
 
G
N
 
N
V
 
V
A
 
A
F
 
L
P
 
P
L
 
L
R
 
-
E
 
E
H
 
L
T
 
D
S
 
N
H
 
T
S
 
P
A
 
K
A
 
D
E
 
E
I
 
V
A
 
K
R
 
R
I
 
R
V
 
V
A
 
T
D
 
E
K
 
L
L
 
L
R
 
S
M
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
G
G
 
D
V
 
K
E
 
H
A
 
D
K
 
S
M
 
Y
P
 
P
S
 
S
Q
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
Q
R
 
K
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
L
A
 
A
L
 
S
E
 
N
P
 
P
E
 
K
I
 
V
V
 
L
L
 
L
Y
 
C
D
 
D
E
|
E
P
 
A
T
 
T
T
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
L
 
A
M
 
T
T
 
T
E
 
R
A
 
S
I
 
I
N
 
L
R
 
E
L
 
L
I
 
L
A
 
K
D
 
D
T
 
I
Q
 
N
E
 
R
R
 
R
L
 
L
G
 
G
I
 
L
T
 
T
S
 
I
V
 
L
V
 
L
I
 
I
S
 
T
H
 
H
D
 
E
I
 
M
A
 
D
G
 
V
A
 
V
L
 
K
K
 
R
I
 
I
A
 
C
H
 
D
Q
 
C
I
 
V
A
 
A
M
 
V
L
 
I
Y
 
S
Q
 
N
G
 
G
R
 
E
I
 
L
I
 
I
A
 
E
S
 
Q
G
 
D
S
 
T
-
 
V
P
 
S
E
 
E
Q
 
V
I
 
F
G
 
S
D
 
H
S
 
P
D
 
K
D
 
T
P
 
P
V
 
L
V
 
A
R
 
Q
Q
 
K
F
 
F
I
 
I
S
 
Q
G
 
S
S
 
T
V
 
L

Sites not aligning to the query:

6cvlD Crystal structure of the escherichia coli atpgs-bound metni methionine abc transporter in complex with its metq binding protein (see paper)
36% identity, 95% coverage: 6:247/254 of query aligns to 1:246/344 of 6cvlD

query
sites
6cvlD
N
 
H
I
 
M
I
 
I
E
 
K
L
 
L
R
 
S
D
 
N
L
 
I
V
 
T
K
 
K
N
 
V
F
|
F
G
 
H
R
x
Q
-
 
G
Q
 
T
R
 
R
V
 
T
L
x
I
D
 
Q
G
 
A
L
 
L
N
 
N
-
 
N
-
 
V
-
 
S
L
 
L
T
 
H
I
 
V
P
 
P
R
 
A
G
 
G
R
 
Q
I
 
I
T
 
Y
V
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
A
S
|
S
G
|
G
G
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
V
x
T
L
 
L
L
 
I
K
 
R
H
 
C
M
 
V
I
 
N
G
 
L
L
 
L
I
 
E
K
 
R
P
 
P
D
 
T
A
 
E
G
 
G
Q
 
S
V
 
V
L
 
L
V
 
V
G
 
D
G
 
G
Q
 
Q
D
 
E
I
 
L
G
 
T
H
 
T
L
 
L
D
 
S
D
 
E
R
 
S
Q
 
E
L
 
L
N
 
T
Q
 
K
I
 
A
R
 
R
R
 
R
R
 
Q
F
 
I
G
 
G
M
 
M
L
 
I
F
 
F
Q
 
Q
D
 
H
A
 
F
A
 
N
L
 
L
F
 
L
D
 
S
S
 
S
M
 
R
S
 
T
V
 
V
F
 
F
D
 
G
N
 
N
V
 
V
A
 
A
F
 
L
P
 
P
L
 
L
R
 
-
E
 
E
H
 
L
T
 
D
S
 
N
H
 
T
S
 
P
A
 
K
A
 
D
E
 
E
I
 
V
A
 
K
R
 
R
I
 
R
V
 
V
A
 
T
D
 
E
K
 
L
L
 
L
R
 
S
M
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
G
G
 
D
V
 
K
E
 
H
A
 
D
K
 
S
M
 
Y
P
 
P
S
 
S
Q
x
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
M
x
Q
R
 
K
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
L
A
 
A
L
 
S
E
 
N
P
 
P
E
 
K
I
 
V
V
 
L
L
 
L
Y
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
T
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
L
 
A
M
 
T
T
 
T
E
 
R
A
 
S
I
 
I
N
 
L
R
 
E
L
 
L
I
 
L
A
 
K
D
 
D
T
 
I
Q
 
N
E
 
R
R
 
R
L
 
L
G
 
G
I
 
L
T
 
T
S
 
I
V
 
L
V
 
L
I
 
I
S
 
T
H
|
H
D
 
E
I
 
M
A
 
D
G
 
V
A
 
V
L
 
K
K
 
R
I
 
I
A
 
C
H
 
D
Q
 
C
I
 
V
A
 
A
M
 
V
L
 
I
Y
 
S
Q
 
N
G
 
G
R
 
E
I
 
L
I
 
I
A
 
E
S
 
Q
G
 
D
S
 
T
-
 
V
P
 
S
E
 
E
Q
 
V
I
 
F
G
 
S
D
 
H
S
 
P
D
 
K
D
 
T
P
 
P
V
 
L
V
 
A
R
 
Q
Q
 
K
F
 
F
I
 
I
S
 
Q
G
 
S
S
 
T
V
 
L

3tuzC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 semet soak crystal form (see paper)
36% identity, 95% coverage: 6:247/254 of query aligns to 1:246/344 of 3tuzC

query
sites
3tuzC
N
 
H
I
 
M
I
 
I
E
 
K
L
 
L
R
 
S
D
 
N
L
 
I
V
 
T
K
 
K
N
 
V
F
|
F
G
 
H
R
x
Q
-
 
G
Q
 
T
R
 
R
V
 
T
L
 
I
D
 
Q
G
 
A
L
 
L
N
 
N
-
 
N
-
 
V
-
 
S
L
 
L
T
 
H
I
 
V
P
 
P
R
 
A
G
 
G
R
 
Q
I
 
I
T
 
Y
V
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
A
S
 
S
G
|
G
G
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
V
x
T
L
 
L
L
 
I
K
 
R
H
 
C
M
 
V
I
 
N
G
 
L
L
 
L
I
 
E
K
 
R
P
 
P
D
 
T
A
 
E
G
 
G
Q
 
S
V
 
V
L
 
L
V
 
V
G
 
D
G
 
G
Q
 
Q
D
 
E
I
 
L
G
 
T
H
 
T
L
 
L
D
 
S
D
 
E
R
 
S
Q
 
E
L
 
L
N
 
T
Q
 
K
I
 
A
R
 
R
R
 
R
R
 
Q
F
 
I
G
 
G
M
 
M
L
 
I
F
 
F
Q
 
Q
D
 
H
A
 
F
A
 
N
L
 
L
F
 
L
D
 
S
S
 
S
M
 
R
S
 
T
V
 
V
F
 
F
D
 
G
N
 
N
V
 
V
A
 
A
F
 
L
P
 
P
L
 
L
R
 
-
E
 
E
H
 
L
T
 
D
S
 
N
H
 
T
S
 
P
A
 
K
A
 
D
E
 
E
I
 
V
A
 
K
R
 
R
I
 
R
V
 
V
A
 
T
D
 
E
K
 
L
L
 
L
R
 
S
M
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
G
G
 
D
V
 
K
E
 
H
A
 
D
K
 
S
M
 
Y
P
 
P
S
 
S
Q
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
Q
R
 
K
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
L
A
 
A
L
 
S
E
 
N
P
 
P
E
 
K
I
 
V
V
 
L
L
 
L
Y
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
T
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
L
 
A
M
 
T
T
 
T
E
 
R
A
 
S
I
 
I
N
 
L
R
 
E
L
 
L
I
 
L
A
 
K
D
 
D
T
 
I
Q
 
N
E
 
R
R
 
R
L
 
L
G
 
G
I
 
L
T
 
T
S
 
I
V
 
L
V
 
L
I
 
I
S
 
T
H
 
H
D
 
E
I
 
M
A
 
D
G
 
V
A
 
V
L
 
K
K
 
R
I
 
I
A
 
C
H
 
D
Q
 
C
I
 
V
A
 
A
M
 
V
L
 
I
Y
 
S
Q
 
N
G
 
G
R
 
E
I
 
L
I
 
I
A
 
E
S
 
Q
G
 
D
S
 
T
-
 
V
P
 
S
E
 
E
Q
 
V
I
 
F
G
 
S
D
 
H
S
 
P
D
 
K
D
 
T
P
 
P
V
 
L
V
 
A
R
 
Q
Q
 
K
F
 
F
I
 
I
S
 
Q
G
 
S
S
 
T
V
 
L

Sites not aligning to the query:

3tuiC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 native crystal form (see paper)
36% identity, 95% coverage: 6:247/254 of query aligns to 1:246/344 of 3tuiC

query
sites
3tuiC
N
 
H
I
 
M
I
 
I
E
 
K
L
 
L
R
 
S
D
 
N
L
 
I
V
 
T
K
 
K
N
 
V
F
|
F
G
 
H
R
 
Q
-
 
G
Q
 
T
R
 
R
V
 
T
L
 
I
D
 
Q
G
 
A
L
 
L
N
 
N
-
 
N
-
 
V
-
 
S
L
 
L
T
 
H
I
 
V
P
 
P
R
 
A
G
 
G
R
 
Q
I
 
I
T
 
Y
V
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
A
S
 
S
G
|
G
G
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
V
x
T
L
 
L
L
 
I
K
 
R
H
 
C
M
 
V
I
 
N
G
 
L
L
 
L
I
 
E
K
 
R
P
 
P
D
 
T
A
 
E
G
 
G
Q
 
S
V
 
V
L
 
L
V
 
V
G
 
D
G
 
G
Q
 
Q
D
 
E
I
 
L
G
 
T
H
 
T
L
 
L
D
 
S
D
 
E
R
 
S
Q
 
E
L
 
L
N
 
T
Q
 
K
I
 
A
R
 
R
R
 
R
R
 
Q
F
 
I
G
 
G
M
 
M
L
 
I
F
 
F
Q
 
Q
D
 
H
A
 
F
A
 
N
L
 
L
F
 
L
D
 
S
S
 
S
M
 
R
S
 
T
V
 
V
F
 
F
D
 
G
N
 
N
V
 
V
A
 
A
F
 
L
P
 
P
L
 
L
R
 
-
E
 
E
H
 
L
T
 
D
S
 
N
H
 
T
S
 
P
A
 
K
A
 
D
E
 
E
I
 
V
A
 
K
R
 
R
I
 
R
V
 
V
A
 
T
D
 
E
K
 
L
L
 
L
R
 
S
M
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
G
G
 
D
V
 
K
E
 
H
A
 
D
K
 
S
M
 
Y
P
 
P
S
 
S
Q
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
Q
R
 
K
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
L
A
 
A
L
 
S
E
 
N
P
 
P
E
 
K
I
 
V
V
 
L
L
 
L
Y
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
T
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
L
 
A
M
 
T
T
 
T
E
 
R
A
 
S
I
 
I
N
 
L
R
 
E
L
 
L
I
 
L
A
 
K
D
 
D
T
 
I
Q
 
N
E
 
R
R
 
R
L
 
L
G
 
G
I
 
L
T
 
T
S
 
I
V
 
L
V
 
L
I
 
I
S
 
T
H
 
H
D
 
E
I
 
M
A
 
D
G
 
V
A
 
V
L
 
K
K
 
R
I
 
I
A
 
C
H
 
D
Q
 
C
I
 
V
A
 
A
M
 
V
L
 
I
Y
 
S
Q
 
N
G
 
G
R
 
E
I
 
L
I
 
I
A
 
E
S
 
Q
G
 
D
S
 
T
-
 
V
P
 
S
E
 
E
Q
 
V
I
 
F
G
 
S
D
 
H
S
 
P
D
 
K
D
 
T
P
 
P
V
 
L
V
 
A
R
 
Q
Q
 
K
F
 
F
I
 
I
S
 
Q
G
 
S
S
 
T
V
 
L

4ymuJ Crystal structure of an amino acid abc transporter complex with arginines and atps (see paper)
34% identity, 94% coverage: 7:244/254 of query aligns to 1:237/240 of 4ymuJ

query
sites
4ymuJ
I
 
M
I
 
I
E
 
F
L
 
V
R
 
N
D
 
D
L
 
V
V
 
Y
K
 
K
N
 
N
F
|
F
G
 
G
R
 
S
Q
 
L
R
 
E
V
|
V
L
 
L
D
 
K
G
 
G
L
 
V
N
 
T
L
 
L
T
 
K
I
 
V
P
 
N
R
 
K
G
 
G
R
 
E
I
 
V
T
 
V
V
 
V
I
 
I
I
 
I
G
 
G
R
 
P
S
|
S
G
|
G
G
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
V
x
T
L
 
L
L
 
L
K
 
R
H
 
C
M
 
I
I
 
N
G
 
L
L
 
L
I
 
E
K
 
E
P
 
P
D
 
T
A
 
K
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
L
 
F
V
 
I
G
 
D
G
 
G
Q
 
V
D
 
K
I
 
I
G
 
N
H
 
N
L
 
-
D
 
G
D
 
K
R
 
V
Q
 
N
L
 
I
N
 
N
Q
 
K
I
 
V
R
 
R
R
 
Q
R
 
K
F
 
V
G
 
G
M
 
M
L
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
H
A
 
F
A
 
N
L
 
L
F
 
F
D
 
P
S
 
H
M
 
L
S
 
T
V
 
A
F
 
I
D
 
E
N
 
N
V
 
I
A
 
T
F
 
L
P
 
A
L
 
P
R
 
V
E
 
K
H
 
V
T
 
K
S
 
K
H
 
M
S
 
N
A
 
K
A
 
K
E
 
E
I
 
A
A
 
E
R
 
E
I
 
L
V
 
A
A
 
V
D
 
D
K
 
L
L
 
L
R
 
A
M
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
L
G
 
D
V
 
K
E
 
K
A
 
D
K
 
Q
M
 
Y
P
 
P
S
 
I
Q
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
Q
R
 
K
K
 
Q
R
 
R
V
 
L
G
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
L
A
 
A
L
 
M
E
 
Q
P
 
P
E
 
E
I
 
V
V
 
M
L
 
L
Y
 
F
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
T
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
L
 
E
M
 
M
T
 
V
-
 
K
E
 
E
A
 
V
I
 
L
N
 
N
R
 
V
L
 
M
I
 
K
A
 
Q
D
 
L
T
 
A
Q
 
N
E
 
E
R
 
-
L
 
-
G
 
G
I
 
M
T
 
T
S
 
M
V
 
V
V
 
V
I
 
V
S
 
T
H
|
H
D
 
E
I
 
M
A
 
G
G
 
F
A
 
A
L
 
R
K
 
E
I
 
V
A
 
G
H
 
D
Q
 
R
I
 
V
A
 
I
M
 
F
L
 
M
Y
 
D
Q
 
D
G
 
G
R
 
V
I
 
I
I
 
V
A
 
E
S
 
E
G
 
G
S
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
E
I
 
I
-
 
F
G
 
Y
D
 
R
S
 
A
D
 
K
D
 
N
P
 
E
V
 
R
V
 
T
R
 
R
Q
 
E
F
 
F
I
 
L
S
 
S

4u00A Crystal structure of ttha1159 in complex with adp (see paper)
39% identity, 89% coverage: 7:231/254 of query aligns to 2:223/241 of 4u00A

query
sites
4u00A
I
 
I
I
 
I
E
 
R
L
 
I
R
 
R
D
 
N
L
 
L
V
 
H
K
 
K
N
 
W
F
|
F
G
 
G
R
 
P
Q
 
L
R
 
H
V
|
V
L
 
L
D
 
K
G
 
G
L
 
I
N
 
H
L
 
L
T
 
E
I
 
V
P
 
A
R
 
P
G
 
G
R
 
E
I
 
K
T
 
L
V
 
V
I
 
I
I
 
I
G
 
G
R
 
P
S
|
S
G
|
G
G
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
V
x
T
L
 
L
L
 
I
K
 
R
H
 
T
M
 
I
I
 
N
G
 
R
L
 
L
I
 
E
K
 
D
P
 
F
D
 
Q
A
 
E
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
L
 
V
V
 
V
G
 
D
G
 
G
Q
 
L
D
 
S
I
 
V
G
 
K
H
 
-
L
 
-
D
 
D
D
 
D
R
 
R
Q
 
A
L
 
L
N
 
R
Q
 
E
I
 
I
R
 
R
R
 
R
R
 
E
F
 
V
G
 
G
M
 
M
L
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
Q
A
 
F
A
 
N
L
 
L
F
 
F
D
 
P
S
 
H
M
 
M
S
 
T
V
 
V
F
 
L
D
 
E
N
 
N
V
 
V
A
 
T
F
 
L
-
 
A
P
 
P
L
 
M
R
 
R
-
 
V
-
 
R
-
 
R
-
 
W
-
 
P
-
 
R
E
 
E
H
 
K
T
 
A
S
 
E
H
 
K
S
 
K
A
 
A
A
 
L
E
 
E
I
 
L
A
 
-
R
 
-
I
 
-
V
 
-
A
 
-
D
 
-
K
 
-
L
 
L
R
 
E
M
 
R
V
 
V
G
 
G
L
 
I
P
 
L
G
 
D
V
 
Q
E
 
A
A
 
R
K
 
K
M
 
Y
P
 
P
S
 
A
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
Q
R
 
Q
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
L
A
 
A
L
 
M
E
 
E
P
 
P
E
 
K
I
 
I
V
 
M
L
 
L
Y
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
T
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
L
 
E
M
 
M
T
 
V
E
 
G
A
 
E
I
 
V
N
 
L
R
 
D
L
 
V
I
 
M
A
 
R
D
 
D
T
 
L
Q
 
A
E
 
Q
R
 
G
L
 
-
G
 
G
I
 
M
T
 
T
S
 
M
V
 
V
V
 
V
I
 
V
S
 
T
H
 
H
D
 
E
I
 
M
A
 
G
G
 
F
A
 
A
L
 
R
K
 
E
I
 
V
A
 
A
H
 
D
Q
 
R
I
 
V
A
 
V
M
 
F
L
 
M
Y
 
D
Q
 
G
G
 
G
R
 
Q
I
 
I
I
 
V
A
 
E
S
 
E
G
 
G
S
 
R
P
 
P
E
 
E
Q
 
E
I
 
I

P69874 Spermidine/putrescine import ATP-binding protein PotA; EC 7.6.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
36% identity, 90% coverage: 7:234/254 of query aligns to 17:238/378 of P69874

query
sites
P69874
I
 
L
I
 
V
E
 
Q
L
 
L
R
 
A
D
 
G
L
 
I
V
 
R
K
 
K
N
x
C
F
|
F
G
 
D
R
 
G
Q
 
K
R
 
E
V
 
V
L
 
I
D
 
P
G
 
Q
L
 
L
N
 
D
L
 
L
T
 
T
I
 
I
P
 
N
R
 
N
G
 
G
R
 
E
I
x
F
T
 
L
V
 
T
I
 
L
I
 
L
G
 
G
R
 
P
S
 
S
G
 
G
G
x
C
G
 
G
K
 
K
S
 
T
V
 
T
L
 
V
L
|
L
K
 
R
H
 
L
M
 
I
I
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
E
K
 
T
P
 
V
D
 
D
A
 
S
G
 
G
Q
 
R
V
 
I
L
 
M
V
x
L
G
 
D
G
 
N
Q
 
E
D
 
D
I
 
I
G
 
T
H
 
H
L
 
V
-
 
P
-
 
A
D
 
E
D
 
N
R
 
R
Q
 
Y
L
 
V
N
 
N
Q
 
T
I
 
V
R
 
-
R
 
-
R
 
-
F
 
-
G
 
-
M
 
-
L
 
-
F
 
F
Q
 
Q
D
 
S
A
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
F
D
 
P
S
 
H
M
 
M
S
 
T
V
 
V
F
 
F
D
 
E
N
 
N
V
 
V
A
 
A
F
 
F
P
 
G
L
 
L
R
 
R
E
 
M
H
 
Q
T
 
K
S
 
T
H
 
-
S
 
P
A
 
A
A
 
A
E
 
E
I
 
I
A
 
T
R
 
P
I
 
R
V
 
V
A
 
M
D
 
E
K
 
A
L
 
L
R
 
R
M
 
M
V
|
V
G
 
Q
L
 
L
P
 
E
G
 
T
V
 
F
E
 
A
A
 
Q
K
 
R
M
 
K
P
 
P
S
 
H
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
Q
R
 
Q
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
V
A
 
V
L
 
N
E
 
K
P
 
P
E
 
R
I
 
L
V
 
L
L
 
L
Y
 
L
D
|
D
E
 
E
P
 
S
T
 
L
T
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
Y
L
 
K
M
 
L
T
 
R
E
 
K
A
 
Q
I
 
M
N
 
Q
R
 
N
L
 
E
I
 
L
A
 
K
D
 
A
T
 
L
Q
 
Q
E
 
R
R
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
T
S
 
F
V
 
V
V
 
F
I
 
V
S
 
T
H
 
H
D
 
D
I
 
Q
A
 
E
G
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
T
I
 
M
A
 
S
H
 
D
Q
 
R
I
 
I
A
 
V
M
 
V
L
 
M
Y
 
R
Q
 
D
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
E
A
 
Q
S
 
D
G
 
G
S
 
T
P
 
P
E
 
R
Q
 
E
I
 
I
G
 
Y
D
 
E
S
 
E

Sites not aligning to the query:

8y5iA Cryo-em structure of e.Coli spermidine transporter potd-potabc in translocation intermidiate state (see paper)
35% identity, 90% coverage: 7:234/254 of query aligns to 2:223/358 of 8y5iA

query
sites
8y5iA
I
 
L
I
 
V
E
 
Q
L
 
L
R
 
A
D
 
G
L
 
I
V
 
R
K
 
K
N
 
C
F
|
F
G
 
D
R
 
G
Q
x
K
R
 
E
V
 
V
L
 
I
D
 
P
G
 
Q
L
 
L
N
 
D
L
 
L
T
 
T
I
 
I
P
 
N
R
 
N
G
 
G
R
 
E
I
 
F
T
 
L
V
 
T
I
 
L
I
 
L
G
 
G
R
 
P
S
 
S
G
|
G
G
 
C
G
 
G
K
|
K
S
x
T
V
x
T
L
 
V
L
 
L
K
 
R
H
 
L
M
 
I
I
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
E
K
 
T
P
 
V
D
 
D
A
 
S
G
 
G
Q
 
R
V
 
I
L
 
M
V
 
L
G
 
D
G
 
N
Q
 
E
D
 
D
I
 
I
G
 
T
H
 
H
L
 
V
-
 
P
-
 
A
D
 
E
D
 
N
R
 
R
Q
 
Y
L
 
V
N
 
N
Q
 
T
I
 
V
R
 
-
R
 
-
R
 
-
F
 
-
G
 
-
M
 
-
L
 
-
F
 
F
Q
 
Q
D
 
S
A
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
F
D
 
P
S
 
H
M
 
M
S
 
T
V
 
V
F
 
F
D
 
E
N
 
N
V
 
V
A
 
A
F
 
F
P
 
G
L
 
L
R
 
R
E
 
M
H
 
Q
T
 
K
S
 
T
H
 
-
S
 
P
A
 
A
A
 
A
E
 
E
I
 
I
A
 
T
R
 
P
I
 
R
V
 
V
A
 
M
D
 
E
K
 
A
L
 
L
R
 
R
M
 
M
V
 
V
G
 
Q
L
 
L
P
 
E
G
 
T
V
 
F
E
 
A
A
 
Q
K
x
R
M
 
K
P
 
P
S
 
H
Q
|
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
M
 
Q
R
 
Q
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
V
A
 
V
L
 
N
E
 
K
P
 
P
E
 
R
I
 
L
V
 
L
L
 
L
Y
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
S
T
 
L
T
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
Y
L
 
K
M
 
L
T
 
R
E
 
K
A
 
Q
I
 
M
N
 
Q
R
 
N
L
 
E
I
 
L
A
 
K
D
 
A
T
 
L
Q
 
Q
E
 
R
R
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
T
S
 
F
V
 
V
V
 
F
I
 
V
S
 
T
H
 
H
D
 
D
I
 
Q
A
 
E
G
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
T
I
 
M
A
 
S
H
 
D
Q
 
R
I
 
I
A
 
V
M
 
V
L
 
M
Y
 
R
Q
 
D
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
E
A
 
Q
S
 
D
G
 
G
S
 
T
P
 
P
E
 
R
Q
 
E
I
 
I
G
 
Y
D
 
E
S
 
E

1vciA Crystal structure of the atp-binding cassette of multisugar transporter from pyrococcus horikoshii ot3 complexed with atp (see paper)
33% identity, 88% coverage: 8:231/254 of query aligns to 7:216/353 of 1vciA

query
sites
1vciA
I
 
V
E
 
K
L
 
L
R
 
E
D
 
N
L
 
L
V
 
T
K
 
K
N
 
R
F
|
F
G
 
G
R
 
N
Q
x
F
R
 
T
V
 
A
L
 
V
D
 
N
G
 
K
L
 
L
N
 
N
L
 
L
T
 
T
I
 
I
P
 
K
R
 
D
G
 
G
R
 
E
I
 
F
T
 
L
V
 
V
I
 
L
I
 
L
G
 
G
R
 
P
S
|
S
G
|
G
G
 
C
G
|
G
K
|
K
S
x
T
V
x
T
L
 
T
L
 
L
K
 
R
H
 
M
M
 
I
I
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
E
K
 
E
P
 
P
D
 
T
A
 
E
G
 
G
Q
 
R
V
 
I
L
 
Y
V
 
F
G
 
G
G
 
D
Q
 
R
D
 
D
I
 
V
G
 
T
H
 
Y
L
 
L
D
 
P
D
 
P
R
 
K
Q
 
D
L
 
-
N
 
-
Q
 
-
I
 
-
R
 
-
R
 
R
R
 
N
F
 
I
G
 
S
M
 
M
L
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
F
 
-
D
 
-
S
 
H
M
 
M
S
 
T
V
 
V
F
 
Y
D
 
E
N
 
N
V
 
I
A
 
A
F
 
F
P
 
P
L
 
L
R
 
K
E
 
K
H
 
F
T
 
P
S
 
K
H
 
D
S
 
E
A
 
I
A
 
D
E
 
K
I
 
R
A
 
V
R
 
R
I
 
W
V
 
A
A
 
A
D
 
E
K
 
L
L
 
L
R
 
Q
M
 
I
V
 
E
G
 
E
L
 
L
P
 
L
G
 
N
V
 
-
E
 
-
A
 
-
K
 
R
M
 
Y
P
 
P
S
 
A
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
Q
R
 
R
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
L
 
V
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
V
L
 
V
E
 
E
P
 
P
E
 
D
I
 
V
V
 
L
L
 
L
Y
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
L
T
 
S
G
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
A
L
 
K
M
 
L
T
 
R
E
 
V
A
 
A
I
 
M
N
 
R
R
 
A
L
 
E
I
 
I
A
 
K
D
 
K
T
 
L
Q
 
Q
E
 
Q
R
 
K
L
 
L
G
 
K
I
 
V
T
 
T
S
 
T
V
 
I
V
 
Y
I
 
V
S
 
T
H
 
H
D
 
D
I
 
Q
A
 
V
G
 
E
A
 
A
L
 
M
K
 
T
I
 
M
A
 
G
H
 
D
Q
 
R
I
 
I
A
 
A
M
 
V
L
 
M
Y
 
N
Q
 
R
G
 
G
R
 
Q
I
 
L
I
 
L
A
 
Q
S
 
I
G
 
G
S
 
S
P
 
P
E
 
T
Q
 
E
I
 
V

8j5qD Cryo-em structure of mycobacterium tuberculosis oppabcd in the pre- translocation state (see paper)
33% identity, 97% coverage: 4:250/254 of query aligns to 345:605/611 of 8j5qD

query
sites
8j5qD
A
 
A
E
 
S
N
 
V
I
 
V
I
 
V
E
 
R
L
 
V
R
 
R
D
 
H
L
 
L
V
 
V
K
 
K
N
 
T
F
 
Y
-
 
R
-
 
L
-
 
A
-
 
K
-
 
G
-
 
V
-
 
V
-
 
L
-
 
R
-
 
R
-
 
A
-
 
I
G
 
G
R
 
E
Q
 
V
R
 
R
V
 
A
L
 
V
D
 
D
G
 
G
L
 
I
N
 
S
L
 
L
T
 
E
I
 
L
P
 
R
R
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
T
T
 
L
V
 
G
I
 
I
I
 
V
G
 
G
R
 
E
S
 
S
G
 
G
G
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
V
 
T
L
 
T
L
 
L
K
 
H
H
 
E
M
 
I
I
 
L
G
 
E
L
 
L
I
 
A
K
 
A
P
 
P
D
 
Q
A
 
S
G
 
G
Q
 
S
V
 
I
L
 
E
V
 
V
G
 
L
G
 
G
Q
 
T
D
 
D
I
 
V
G
 
A
H
 
T
L
 
L
D
 
G
D
 
T
R
 
A
Q
 
E
L
 
R
N
 
R
Q
 
S
I
 
L
R
 
R
R
 
R
R
 
D
F
 
I
G
 
Q
M
 
V
L
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
D
-
 
P
-
 
V
A
 
A
A
 
S
L
 
L
F
 
D
D
 
P
S
 
R
M
 
L
S
 
P
V
 
V
F
 
F
D
 
D
N
 
L
V
 
I
A
 
A
F
 
E
P
 
P
L
 
L
R
 
Q
E
 
A
H
 
N
T
 
G
S
 
F
H
 
G
S
 
K
A
 
N
A
 
E
E
 
T
I
 
H
A
 
A
R
 
R
I
 
-
V
 
V
A
 
A
D
 
E
K
 
L
L
 
L
R
 
D
M
 
I
V
 
V
G
 
G
L
 
L
-
 
R
P
 
H
G
 
G
V
 
D
E
 
A
A
 
S
K
 
R
M
 
Y
P
 
P
S
 
A
Q
 
E
L
 
F
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
Q
R
 
K
K
 
Q
R
 
R
V
 
I
G
 
G
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
P
 
P
E
 
K
I
 
I
V
 
L
L
 
A
Y
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
V
T
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
V
L
 
S
M
 
I
T
 
Q
E
 
A
A
 
G
I
 
I
N
 
I
R
 
N
L
 
L
I
 
L
A
 
L
D
 
D
T
 
L
Q
 
Q
E
 
E
R
 
Q
L
 
F
G
 
G
I
 
L
T
 
S
S
 
Y
V
 
L
V
 
F
I
 
V
S
 
S
H
 
H
D
 
D
I
 
L
A
 
S
G
 
V
A
 
V
L
 
K
K
 
H
I
 
L
A
 
A
H
 
H
Q
 
Q
I
 
V
A
 
A
M
 
V
L
 
M
Y
 
L
Q
 
A
G
 
G
R
 
T
I
 
V
I
 
V
A
 
E
S
 
Q
G
 
G
S
 
D
P
 
S
E
 
E
Q
 
E
I
 
V
-
 
F
G
 
G
D
 
N
S
 
P
D
 
K
D
 
H
P
 
E
V
 
Y
V
 
T
R
 
R
Q
 
R
F
 
L
I
 
L
S
 
-
G
 
G
S
 
A
V
 
V
E
 
P
G
 
Q
P
 
P

Sites not aligning to the query:

7ahhC Opua inhibited inward-facing, sbd docked (see paper)
36% identity, 88% coverage: 27:249/254 of query aligns to 46:269/382 of 7ahhC

query
sites
7ahhC
N
 
N
L
 
F
T
 
E
I
 
I
P
 
N
R
 
E
G
 
G
R
 
E
I
 
I
T
 
F
V
 
V
I
 
I
I
 
M
G
 
G
R
 
L
S
 
S
G
|
G
G
 
S
G
|
G
K
|
K
S
 
S
V
 
T
L
 
L
L
 
L
K
 
R
H
 
L
M
 
L
I
 
N
G
 
R
L
 
L
I
 
I
K
 
E
P
 
P
D
 
T
A
 
S
G
 
G
Q
 
K
V
 
I
L
 
F
V
 
I
G
 
D
G
 
N
Q
 
Q
D
 
D
I
 
V
G
 
A
H
 
T
L
 
L
D
 
N
D
 
K
R
 
E
Q
 
D
L
 
L
N
 
L
Q
 
Q
I
 
V
R
 
R
R
 
R
R
 
K
-
 
T
F
 
M
G
 
S
M
 
M
L
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
N
A
 
F
A
 
G
L
 
L
F
 
F
D
 
P
S
 
H
M
 
R
S
 
T
V
 
I
F
 
L
D
 
E
N
 
N
V
 
T
A
 
E
F
 
Y
P
 
G
L
 
L
R
 
-
E
 
-
H
 
E
T
 
V
S
 
Q
H
 
N
S
 
V
A
 
P
A
 
K
E
 
E
I
 
E
A
 
R
R
 
R
I
 
K
V
 
R
A
 
A
D
 
E
K
 
K
-
 
A
L
 
L
R
 
D
M
 
N
V
 
A
G
 
N
L
 
L
P
 
L
G
 
D
V
 
F
E
 
K
A
 
D
K
 
Q
M
 
Y
P
 
P
S
 
K
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
Q
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
L
A
 
A
L
 
N
E
 
D
P
 
P
E
 
E
I
 
I
V
 
L
L
 
L
Y
 
M
D
|
D
E
|
E
P
 
A
T
 
F
T
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
L
 
L
M
 
I
T
 
R
E
 
R
A
 
E
I
 
M
N
 
Q
R
 
D
L
 
E
I
 
L
A
 
L
D
 
E
T
 
L
Q
 
Q
E
 
A
R
 
K
L
 
F
G
 
Q
I
 
K
T
 
T
S
 
I
V
 
I
V
 
F
I
 
V
S
 
S
H
 
H
D
 
D
I
 
L
A
 
N
G
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
R
I
 
I
A
 
G
H
 
D
Q
 
R
I
 
I
A
 
A
M
 
I
L
 
M
Y
 
K
Q
 
D
G
 
G
R
 
K
I
 
I
I
 
M
A
 
Q
S
 
I
G
 
G
S
 
T
P
 
G
E
 
E
Q
 
E
I
 
I
-
 
L
G
 
T
D
 
N
S
 
P
D
 
A
D
 
N
P
 
D
V
 
Y
V
 
V
R
 
K
Q
 
T
F
 
F
I
 
V
S
 
E
G
 
D
S
 
T
V
 
A
E
 
E
G
 
N

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_013257036.1 NCBI__GCF_000143965.1:WP_013257036.1
MAAAENIIELRDLVKNFGRQRVLDGLNLTIPRGRITVIIGRSGGGKSVLLKHMIGLIKPD
AGQVLVGGQDIGHLDDRQLNQIRRRFGMLFQDAALFDSMSVFDNVAFPLREHTSHSAAEI
ARIVADKLRMVGLPGVEAKMPSQLSGGMRKRVGLARAIALEPEIVLYDEPTTGLDPLMTE
AINRLIADTQERLGITSVVISHDIAGALKIAHQIAMLYQGRIIASGSPEQIGDSDDPVVR
QFISGSVEGPIEVL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory