SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_013257777.1 NCBI__GCF_000143965.1:WP_013257777.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 8 hits to proteins with known functional sites (download)

P0AEY3 Nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase; NTP-PPase; EC 3.6.1.8 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
44% identity, 90% coverage: 17:260/272 of query aligns to 6:257/263 of P0AEY3

query
sites
P0AEY3
R
 
R
L
 
L
V
 
L
A
 
T
L
 
I
A
 
M
A
 
Q
R
 
R
L
 
L
R
 
R
A
 
D
P
 
P
-
 
E
D
 
N
G
 
G
C
 
C
P
 
P
W
 
W
D
 
D
R
 
K
Q
 
E
Q
 
Q
T
 
T
V
 
F
Q
 
A
S
 
T
S
 
I
T
 
A
P
 
P
Y
 
Y
I
 
T
L
 
L
E
 
E
E
 
E
A
 
T
Y
 
Y
E
 
E
A
 
V
V
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
I
E
 
A
S
 
R
G
 
E
D
 
D
R
 
F
R
 
D
E
 
D
A
 
L
M
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
G
 
G
D
 
D
L
 
L
L
 
L
F
 
F
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
F
 
F
Q
 
Y
S
 
A
Q
 
Q
L
 
M
A
 
A
A
 
Q
E
 
E
A
 
E
G
 
G
D
 
R
F
 
F
D
 
D
A
 
F
R
 
N
A
 
D
V
 
I
I
 
C
E
 
A
A
 
A
V
 
I
E
 
S
A
 
D
K
 
K
M
 
L
I
 
E
R
 
R
R
|
R
H
 
H
P
 
P
H
 
H
V
 
V
F
 
F
G
 
A
Q
 
D
E
 
S
R
 
S
A
 
A
A
 
E
D
 
N
A
 
S
E
 
S
A
 
E
V
 
V
L
 
L
R
 
A
R
 
R
W
 
W
S
 
E
E
 
Q
I
 
I
K
|
K
R
 
T
D
 
E
E
 
E
R
 
R
G
 
A
-
 
Q
-
 
K
A
 
A
S
 
Q
Q
 
H
G
 
S
L
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
D
V
 
I
P
 
P
K
 
R
G
 
S
S
 
L
A
 
P
A
 
A
L
 
L
T
 
M
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
R
 
K
L
 
I
G
 
Q
Q
 
K
K
 
R
A
 
C
A
 
A
R
 
N
V
 
V
G
 
G
F
 
F
D
 
D
W
 
W
R
 
T
G
 
T
Q
 
L
A
 
G
D
 
P
V
 
V
L
 
V
A
 
D
K
|
K
V
|
V
A
x
Y
E
|
E
E
|
E
A
 
I
A
 
D
E
|
E
L
 
V
T
 
M
-
 
Y
-
 
E
-
 
A
-
 
R
-
 
Q
A
 
A
S
 
V
A
 
V
D
 
D
A
 
Q
A
 
A
Q
x
K
R
x
L
E
|
E
A
x
E
E
|
E
F
 
M
G
 
G
D
|
D
L
 
L
L
 
L
F
 
F
A
 
A
L
 
T
A
 
V
Q
 
N
W
 
L
A
 
A
R
 
R
H
 
H
G
 
L
K
 
G
I
 
T
D
 
K
A
 
A
E
 
E
A
 
I
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
R
 
K
A
 
A
C
 
N
E
 
E
R
x
K
F
|
F
Q
x
E
R
|
R
R
|
R
F
 
F
E
 
R
L
 
E
M
 
V
E
 
E
A
 
R
A
 
I
A
 
V
A
 
A
G
 
A
R
 
R
G
 
G
V
 
L
S
 
E
L
 
M
D
 
T
R
 
G
L
 
V
D
 
D
E
 
L
A
 
E
A
 
T
L
 
M
D
 
E
E
 
E
L
 
V
W
|
W
R
 
Q
E
 
Q
A
 
V
K
|
K

Q9X015 Nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase/pyrophosphatase MazG; NTP-PPase; EC 3.6.1.1; EC 3.6.1.9 from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) (see paper)
40% identity, 93% coverage: 11:262/272 of query aligns to 4:252/255 of Q9X015

query
sites
Q9X015
A
 
A
G
 
G
A
 
I
S
 
L
F
 
F
A
 
E
R
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
S
L
 
I
A
 
M
A
 
E
R
 
K
L
 
L
R
 
R
A
 
S
P
 
P
D
 
E
G
 
G
C
 
C
P
 
E
W
 
W
D
 
D
R
 
R
Q
 
K
Q
 
Q
T
 
T
V
 
H
Q
 
E
S
 
S
S
 
L
T
 
K
P
 
P
Y
 
Y
I
 
L
L
 
I
E
|
E
E
|
E
A
 
C
Y
 
Y
E
|
E
A
 
L
V
 
I
D
 
E
A
 
A
L
 
I
E
 
D
S
 
E
G
 
K
D
 
N
R
 
D
R
 
D
E
 
M
A
 
M
M
 
K
G
 
E
E
|
E
L
 
L
G
 
G
D
 
D
L
 
V
L
 
L
F
 
L
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
F
 
F
Q
 
H
S
 
A
Q
 
Q
L
 
I
A
 
A
A
 
R
E
 
E
A
 
R
G
 
G
D
 
A
F
 
F
D
 
T
A
 
I
R
 
E
A
 
D
V
 
V
I
 
I
E
 
R
A
 
T
V
 
L
E
 
N
A
 
E
K
 
K
M
 
L
I
 
I
R
|
R
R
|
R
H
 
H
P
 
P
H
 
H
V
 
V
F
 
F
G
 
G
Q
 
D
E
 
S
R
 
P
A
 
G
A
 
Y
D
 
S
A
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
Y
R
 
K
R
 
Q
W
 
W
S
 
E
E
 
D
I
 
I
K
|
K
R
 
A
D
 
Q
E
 
E
R
 
K
G
 
G
A
 
K
S
 
K
Q
 
K
G
 
S
L
 
S
-
 
R
L
 
I
D
 
G
S
 
E
V
 
I
P
 
N
K
 
P
G
 
L
S
 
V
A
 
P
A
 
A
L
 
L
T
 
S
R
 
M
A
 
A
Q
 
R
R
 
R
L
 
I
G
 
Q
Q
 
E
K
 
N
A
 
A
A
 
S
R
 
Q
V
 
V
G
 
G
F
 
F
D
 
D
W
 
W
R
 
K
G
 
D
Q
 
P
A
 
E
D
 
G
V
 
V
L
 
Y
A
 
E
K
 
K
V
 
I
A
 
E
E
 
E
E
 
E
A
 
L
A
 
K
E
|
E
L
 
L
T
 
K
A
x
E
S
 
A
A
 
K
D
 
D
A
 
P
A
 
R
Q
 
E
R
 
L
E
 
E
A
x
E
E
|
E
F
 
F
G
 
G
D
 
D
L
 
L
L
 
L
F
 
F
A
 
S
L
 
I
A
 
V
Q
 
N
W
 
L
A
 
S
R
 
R
H
 
F
G
 
L
K
 
N
I
 
V
D
 
D
A
 
P
E
 
E
A
 
S
A
 
A
L
 
L
R
 
R
R
 
K
A
 
A
C
 
T
E
 
R
R
 
K
F
 
F
Q
 
V
R
 
E
R
 
R
F
 
F
E
 
K
L
 
K
M
 
M
E
 
E
A
 
E
A
 
L
A
 
I
A
 
E
G
 
K
R
 
D
G
 
G
V
 
L
S
 
V
L
 
L
D
 
E
R
 
E
L
 
L
D
 
P
E
 
I
A
 
E
A
 
K
L
 
L
D
 
D
E
 
E
L
 
Y
W
 
W
R
 
E
E
 
K
A
 
A
K
 
K
A
 
G
A
 
G

3crcA Crystal structure of escherichia coli mazg, the regulator of nutritional stress response (see paper)
39% identity, 89% coverage: 17:259/272 of query aligns to 5:221/225 of 3crcA

query
sites
3crcA
R
 
R
L
 
L
V
 
L
A
 
T
L
 
I
A
 
M
A
 
Q
R
 
R
L
 
L
R
 
R
A
 
D
P
 
P
-
 
E
D
 
N
G
 
G
C
 
C
P
 
P
W
 
W
D
 
D
R
 
K
Q
 
E
Q
 
Q
T
 
T
V
 
F
Q
 
A
S
 
T
S
 
I
T
 
A
P
 
P
Y
 
Y
I
 
T
L
 
L
E
 
E
E
 
E
A
 
T
Y
 
Y
E
 
E
A
 
V
V
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
I
E
 
A
S
 
R
G
 
E
D
 
D
R
 
F
R
 
D
E
 
D
A
 
L
M
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
G
 
G
D
 
D
L
 
L
L
 
L
F
 
F
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
F
 
F
Q
 
Y
S
 
A
Q
 
Q
L
 
M
A
 
A
A
 
Q
E
 
E
A
 
E
G
 
G
D
 
R
F
 
F
D
 
D
A
 
F
R
 
N
A
 
D
V
 
I
I
 
C
E
 
A
A
 
A
V
 
I
E
 
S
A
 
D
K
 
K
M
 
L
I
 
E
R
 
R
R
 
R
H
 
H
P
 
P
H
 
S
V
 
A
F
 
-
G
 
-
Q
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
R
 
-
R
 
-
W
 
-
S
 
-
E
 
-
I
 
-
K
 
-
R
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
G
 
-
A
 
-
S
 
-
Q
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
L
D
 
D
S
 
D
V
 
I
P
 
P
K
 
R
G
 
S
S
 
L
A
 
P
A
 
A
L
 
L
T
 
M
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
R
 
K
L
 
I
G
 
Q
Q
 
K
K
 
R
A
 
C
A
 
A
R
 
N
V
 
V
G
 
G
F
 
F
D
 
D
W
 
W
R
 
T
G
 
T
Q
 
L
A
 
G
D
 
P
V
 
V
L
 
V
A
 
D
K
 
K
V
 
V
A
 
Y
E
 
E
E
 
E
A
 
I
A
 
D
E
 
E
L
 
V
T
 
M
-
 
Y
-
 
E
-
 
A
-
 
R
-
 
Q
A
 
A
S
 
V
A
 
V
D
 
D
A
 
Q
A
 
A
Q
 
K
R
 
L
E
 
E
A
 
E
E
 
E
F
 
M
G
 
G
D
 
D
L
 
L
L
 
L
F
 
F
A
 
A
L
 
T
A
 
V
Q
 
N
W
 
L
A
 
A
R
 
R
H
 
H
G
 
L
K
 
G
I
 
T
D
 
K
A
 
A
E
 
E
A
 
I
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
R
 
K
A
 
A
C
 
N
E
 
E
R
 
K
F
|
F
Q
 
E
R
 
R
R
|
R
F
 
F
E
 
R
L
 
E
M
 
V
E
 
E
A
 
R
A
 
I
A
 
V
A
 
A
G
 
A
R
 
R
G
 
G
V
 
L
S
 
E
L
 
M
D
 
T
R
 
D
L
 
L
D
 
E
E
 
-
A
 
-
A
 
T
L
 
M
D
 
E
E
 
E
L
 
V
W
|
W
R
 
Q
E
 
Q
A
 
V

3crcB Crystal structure of escherichia coli mazg, the regulator of nutritional stress response (see paper)
37% identity, 89% coverage: 17:259/272 of query aligns to 5:215/220 of 3crcB

query
sites
3crcB
R
 
R
L
 
L
V
 
L
A
 
T
L
 
I
A
 
M
A
 
Q
R
 
R
L
 
L
R
 
-
A
 
-
P
 
-
D
 
-
G
 
-
C
 
-
P
 
-
W
 
W
D
 
D
R
 
K
Q
 
E
Q
 
Q
T
 
T
V
 
F
Q
 
A
S
 
T
S
 
I
T
 
A
P
 
P
Y
 
Y
I
 
T
L
 
L
E
 
E
E
 
E
A
 
T
Y
 
Y
E
 
E
A
 
V
V
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
I
E
 
A
S
 
R
G
 
E
D
 
D
R
 
F
R
 
D
E
 
D
A
 
L
M
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
G
 
G
D
 
D
L
 
L
L
 
L
F
 
F
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
F
 
F
Q
 
Y
S
 
A
Q
 
Q
L
 
M
A
 
A
A
 
Q
E
 
E
A
 
E
G
 
G
D
 
R
F
 
F
D
 
D
A
 
F
R
 
N
A
 
D
V
 
I
I
 
C
E
 
A
A
 
A
V
 
I
E
 
S
A
 
D
K
 
K
M
 
L
I
 
E
R
 
R
R
 
-
H
 
-
P
 
-
H
 
-
V
 
-
F
 
-
G
 
-
Q
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
R
 
-
R
 
-
W
 
-
S
 
-
E
 
-
I
 
-
K
 
-
R
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
G
 
-
A
 
A
S
 
Q
Q
 
H
G
 
S
L
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
D
V
 
I
P
 
P
K
 
R
G
 
S
S
 
L
A
 
P
A
 
A
L
 
L
T
 
M
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
R
 
K
L
 
I
G
 
Q
Q
 
K
K
 
R
A
 
C
A
 
A
R
 
N
V
 
V
G
 
G
F
|
F
D
 
D
W
|
W
R
 
T
G
 
T
Q
 
L
A
 
G
D
 
P
V
 
V
L
 
V
A
 
D
K
|
K
V
 
V
A
 
Y
E
 
E
E
|
E
A
 
I
A
 
D
E
|
E
L
 
V
T
 
M
-
 
Y
-
 
E
-
 
A
-
 
R
-
 
Q
A
 
A
S
 
V
A
 
V
D
 
D
A
 
Q
A
 
A
Q
 
K
R
 
L
E
 
E
A
 
E
E
|
E
F
 
M
G
 
G
D
|
D
L
 
L
L
 
L
F
 
F
A
 
A
L
 
T
A
 
V
Q
 
N
W
 
L
A
 
A
R
 
R
H
 
H
G
 
L
K
 
G
I
 
T
D
 
K
A
 
A
E
 
E
A
 
I
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
R
 
K
A
 
A
C
 
N
E
 
E
R
 
K
F
 
F
Q
 
E
R
 
R
R
 
R
F
 
F
E
 
R
L
 
E
M
 
V
E
 
E
A
 
R
A
 
I
A
 
V
A
 
A
G
 
A
R
 
R
G
 
G
V
 
L
S
 
E
L
 
M
D
 
T
R
 
G
L
 
V
D
 
D
E
 
L
A
 
E
A
 
T
L
 
M
D
 
E
E
 
E
L
 
V
W
 
W
R
 
Q
E
 
Q
A
 
V

A0R3C4 Nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase; NTP-PPase; EC 3.6.1.8 from Mycolicibacterium smegmatis (strain ATCC 700084 / mc(2)155) (Mycobacterium smegmatis) (see paper)
36% identity, 54% coverage: 19:165/272 of query aligns to 91:238/324 of A0R3C4

query
sites
A0R3C4
V
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
M
A
 
D
R
 
K
L
 
L
R
 
R
A
 
T
P
 
-
D
 
-
G
 
S
C
 
G
P
 
P
W
 
W
D
 
E
R
 
S
Q
 
E
Q
 
Q
T
 
T
V
 
H
Q
 
D
S
 
S
S
 
L
T
 
R
P
 
R
Y
 
Y
I
 
L
L
 
L
E
 
E
E
 
E
A
 
T
Y
 
Y
E
 
E
A
 
L
V
 
F
D
 
D
A
 
A
L
 
V
E
 
R
S
 
S
G
 
G
D
 
N
R
 
A
R
 
D
E
 
E
A
 
L
M
 
R
G
 
E
E
 
E
L
 
L
G
 
G
D
 
D
L
 
V
L
 
L
F
 
L
Q
 
Q
V
 
V
V
 
L
F
 
F
Q
 
H
S
 
A
Q
 
R
L
 
I
A
 
A
A
 
E
E
 
D
A
 
A
G
 
P
-
 
H
-
 
H
D
 
P
F
 
F
D
 
S
A
 
I
R
 
D
A
 
D
V
 
V
I
 
A
E
 
D
A
 
A
V
 
L
E
 
V
A
 
R
K
 
K
M
 
L
I
 
G
R
 
N
R
 
R
H
 
V
P
 
P
H
 
A
V
 
V
F
 
L
G
 
A
Q
 
G
E
 
E
R
 
S
A
 
I
A
 
S
D
 
L
A
 
D
E
 
E
A
 
Q
V
 
-
L
 
L
R
 
A
R
 
Q
W
 
W
S
 
E
E
 
E
I
 
R
K
 
K
R
 
A
D
 
Q
E
 
E
R
 
K
-
 
K
-
 
V
G
 
K
A
 
A
S
 
R
Q
 
A
G
 
S
L
 
S
L
 
M
D
 
D
S
 
D
V
 
V
P
 
P
K
 
T
G
 
G
S
 
Q
A
 
P
A
|
A
L
 
L
T
 
A
R
 
L
A
 
A
Q
 
Q
R
 
K
L
 
V
G
 
L
Q
 
A
K
 
R
A
 
V
A
 
S
R
 
Q
V
 
A
G
 
G
F
 
L

P96379 Nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase; NTP-PPase; EC 3.6.1.8 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
31% identity, 86% coverage: 19:252/272 of query aligns to 91:295/325 of P96379

query
sites
P96379
V
 
V
A
 
A
L
 
M
A
 
M
A
 
D
R
 
K
L
 
L
R
 
R
A
 
T
P
 
-
D
 
-
G
 
A
C
 
G
P
 
P
W
 
W
D
 
E
R
 
S
Q
 
E
Q
 
Q
T
 
T
V
 
H
Q
 
D
S
 
S
S
 
L
T
 
R
P
 
R
Y
 
Y
I
 
L
L
 
L
E
 
E
E
 
E
A
 
T
Y
 
Y
E
 
E
A
 
L
V
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
V
E
 
R
S
 
S
G
 
G
D
 
S
R
 
V
R
 
D
E
 
Q
A
 
L
M
 
R
G
 
E
E
 
E
L
 
L
G
 
G
D
 
D
L
 
L
L
 
L
F
 
L
Q
 
Q
V
 
V
V
 
L
F
 
F
Q
 
H
S
 
A
Q
 
R
L
 
I
A
 
A
A
 
E
E
 
D
A
 
A
-
 
S
-
 
Q
G
 
S
D
 
P
F
 
F
D
 
T
A
 
I
R
 
D
A
 
D
V
 
V
I
 
A
E
 
D
A
 
T
V
 
L
E
 
M
A
 
R
K
 
K
M
 
L
I
 
G
R
 
N
R
 
R
H
 
A
P
 
P
H
 
G
V
 
V
F
 
L
G
 
A
Q
 
G
E
 
E
R
 
-
A
 
S
A
 
I
D
 
S
A
 
L
E
 
E
A
 
D
V
 
Q
L
 
L
R
 
A
R
 
Q
W
 
W
S
 
E
E
 
A
I
 
A
K
 
K
R
 
A
D
 
S
E
 
E
R
 
K
G
 
-
A
 
A
S
 
R
Q
 
K
G
 
S
L
 
V
L
 
A
D
 
D
S
 
D
V
 
V
P
 
H
K
 
T
G
 
G
S
 
Q
A
 
P
A
|
A
L
 
L
T
 
A
R
 
L
A
 
A
Q
 
Q
R
 
K
L
 
V
G
 
I
Q
 
Q
K
 
R
A
 
A
A
 
Q
R
 
K
V
 
A
G
 
G
F
 
L
D
 
P
W
 
A
R
 
H
G
 
-
Q
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
K
 
L
V
 
I
A
 
P
E
 
D
E
 
E
A
 
I
A
 
T
E
 
S
L
 
V
T
 
S
A
 
V
S
 
S
A
 
A
D
 
D
A
 
-
A
 
-
Q
 
-
R
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
-
F
 
-
G
 
-
D
 
-
L
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
W
 
-
A
 
-
R
 
-
H
 
-
G
 
-
K
 
-
I
 
V
D
 
D
A
 
A
E
 
E
A
 
N
A
 
T
L
 
L
R
 
R
R
 
T
A
 
A
C
 
V
E
 
L
R
 
D
F
 
F
Q
 
I
R
 
D
R
 
R
F
 
L
E
 
R
L
 
C
M
 
A
E
 
E
-
 
R
-
 
A
A
 
I
A
 
A
A
 
V
A
 
A
G
 
R
R
 
R
G
 
G
V
 
S
S
 
N
L
 
V
-
 
A
D
 
E
R
 
Q
L
 
L
D
 
D
E
 
V
A
 
T
A
 
P
L
 
L

7yh5B Mazg(mycobacterium tuberculosis) (see paper)
43% identity, 25% coverage: 19:87/272 of query aligns to 91:157/177 of 7yh5B

query
sites
7yh5B
V
 
V
A
 
A
L
 
M
A
 
M
A
 
D
R
 
K
L
 
L
R
 
R
A
 
T
P
 
-
D
 
-
G
 
A
C
 
G
P
 
P
W
 
W
D
 
E
R
 
S
Q
 
E
Q
 
Q
T
 
T
V
 
H
Q
 
D
S
 
S
S
 
L
T
 
R
P
 
R
Y
 
Y
I
 
L
L
 
L
E
 
E
E
|
E
A
 
T
Y
 
Y
E
|
E
A
 
L
V
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
V
E
 
R
S
 
S
G
 
G
D
 
S
R
 
V
R
 
D
E
 
Q
A
 
L
M
 
R
G
 
E
E
|
E
L
 
L
G
 
G
D
|
D
L
 
L
L
 
L
F
 
L
Q
 
Q
V
 
V
V
 
L
F
 
F
Q
 
H
S
 
A
Q
 
R
L
 
I
A
 
A
A
 
E
E
 
D
A
 
A
G
 
S

2yxhA Crystal structure of mazg-related protein from thermotoga maritima
25% identity, 39% coverage: 26:130/272 of query aligns to 11:114/114 of 2yxhA

query
sites
2yxhA
R
 
R
A
 
S
P
 
L
D
 
R
G
 
K
C
 
C
P
 
P
W
 
W
D
 
L
R
 
E
Q
 
K
Q
 
Q
T
 
S
V
 
I
Q
 
E
S
 
T
S
 
L
T
 
L
P
 
E
Y
 
A
I
 
L
L
 
A
E
 
S
E
|
E
A
 
I
Y
 
E
E
|
E
A
 
V
V
 
A
D
 
E
A
 
A
L
 
V
E
 
K
S
 
K
G
 
N
D
 
D
R
 
L
R
 
A
E
 
N
A
 
L
M
 
E
G
 
E
E
|
E
L
 
I
G
 
G
D
|
D
L
 
M
L
 
I
F
 
Y
Q
x
D
V
 
A
V
 
L
F
 
L
Q
 
V
S
 
A
Q
 
A
L
 
V
A
 
A
A
 
Q
E
 
R
A
 
D
G
 
Y
D
 
G
F
 
I
D
 
D
A
 
L
R
 
E
A
 
S
V
 
A
I
 
I
E
 
Q
A
 
K
V
 
V
E
 
V
A
 
E
K
 
K
M
 
I
I
 
S
R
 
H
R
 
R
H
 
K
P
 
P
H
 
W
V
 
L
F
 
F
G
 
W
Q
 
E
E
 
E
R
 
K
A
 
I
A
 
S
D
 
L
A
 
E
E
 
E
A
 
A
V
 
E
L
 
-
R
 
K
R
 
I
W
 
W
S
 
K
E
 
E
I
 
R
K
 
K
R
 
K

Query Sequence

>WP_013257777.1 NCBI__GCF_000143965.1:WP_013257777.1
MSDQHQQAALAGASFARLVALAARLRAPDGCPWDRQQTVQSSTPYILEEAYEAVDALESG
DRREAMGELGDLLFQVVFQSQLAAEAGDFDARAVIEAVEAKMIRRHPHVFGQERAADAEA
VLRRWSEIKRDERGASQGLLDSVPKGSAALTRAQRLGQKAARVGFDWRGQADVLAKVAEE
AAELTASADAAQREAEFGDLLFALAQWARHGKIDAEAALRRACERFQRRFELMEAAAAGR
GVSLDRLDEAALDELWREAKAALAARQGVGGK

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory