SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_013258035.1 NCBI__GCF_000143965.1:WP_013258035.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5bshA Crystal structure of medicago truncatula (delta)1-pyrroline-5- carboxylate reductase (mtp5cr) in complex with l-proline (see paper)
40% identity, 97% coverage: 7:268/270 of query aligns to 11:272/272 of 5bshA

query
sites
5bshA
L
 
L
G
 
G
L
 
F
V
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
K
M
 
M
G
 
A
A
 
E
A
 
S
L
 
I
L
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
A
L
 
V
A
 
R
K
 
S
A
 
G
V
 
V
I
 
L
E
 
S
P
 
P
G
 
S
R
 
R
V
 
I
-
 
K
V
 
T
V
 
A
V
 
I
E
 
H
K
 
S
D
 
N
A
 
P
A
 
A
K
 
R
A
 
R
A
 
T
A
 
A
L
 
F
G
 
-
E
 
E
R
 
S
F
 
I
G
 
G
V
 
I
E
 
T
T
 
V
R
 
L
A
 
S
E
 
S
L
 
N
A
 
D
A
 
D
M
 
V
G
 
V
R
 
R
-
 
D
V
 
S
N
 
N
V
 
V
A
 
V
I
 
V
L
 
F
A
 
S
I
 
V
K
 
K
P
 
P
A
 
Q
D
 
L
V
 
L
A
 
K
A
 
D
C
 
V
A
 
V
K
 
L
A
 
K
L
 
L
G
 
K
P
 
P
L
 
L
V
 
L
G
 
T
E
 
K
G
 
D
G
 
K
L
 
L
V
 
L
I
 
V
S
 
S
L
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
I
S
 
K
S
 
M
Q
 
K
T
 
D
V
 
L
A
 
Q
A
 
-
E
 
E
L
 
W
P
 
A
P
 
G
N
 
H
L
 
E
A
 
R
V
 
F
V
 
I
R
 
R
A
 
V
M
 
M
P
 
P
N
 
N
T
 
T
P
 
A
A
 
A
L
 
T
I
 
V
G
 
G
R
 
E
G
 
A
A
 
A
T
 
S
A
 
V
I
 
M
C
 
S
P
 
L
G
 
G
R
 
G
G
 
A
A
 
A
D
 
T
A
 
E
A
 
E
A
 
D
M
 
A
Q
 
N
T
 
L
A
 
I
A
 
S
T
 
Q
I
 
L
F
 
F
E
 
G
A
 
S
A
 
I
G
 
G
R
 
K
V
 
I
V
 
W
V
 
K
V
 
A
A
 
D
E
 
D
R
 
K
Q
 
Y
M
 
F
E
 
D
A
 
A
V
 
I
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
G
 
A
Y
 
Y
V
 
I
Y
 
Y
L
 
L
I
 
A
I
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
G
G
 
G
V
 
V
R
 
A
L
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
P
R
 
R
P
 
D
T
 
L
A
 
A
L
 
L
S
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
S
A
 
Q
T
 
T
V
 
V
G
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
A
E
 
S
M
 
M
V
 
A
M
 
T
R
 
Q
S
 
S
G
 
G
Q
 
K
H
 
H
P
 
P
A
 
G
A
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
Q
 
D
V
|
V
T
 
T
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
|
T
T
|
T
M
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
H
V
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
F
R
 
R
G
 
G
L
 
I
L
 
L
M
 
M
D
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
K
R
 
R
G
 
S
A
 
Q
E
 
E
L
 
L
A
 
S

5bsgA Crystal structure of medicago truncatula (delta)1-pyrroline-5- carboxylate reductase (mtp5cr) in complex with NADP+ (see paper)
40% identity, 97% coverage: 7:268/270 of query aligns to 11:272/272 of 5bsgA

query
sites
5bsgA
L
 
L
G
 
G
L
 
F
V
 
I
G
|
G
G
 
A
G
|
G
N
x
K
M
|
M
G
 
A
A
 
E
A
 
S
L
 
I
L
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
A
L
 
V
A
 
R
K
 
S
A
 
G
V
 
V
I
 
L
E
 
S
P
 
P
G
 
S
R
 
R
V
 
I
-
 
K
V
 
T
V
 
A
V
 
I
E
x
H
K
x
S
D
x
N
A
 
P
A
 
A
K
 
R
A
 
R
A
 
T
A
 
A
L
 
F
G
 
-
E
 
E
R
 
S
F
 
I
G
 
G
V
 
I
E
 
T
T
 
V
R
 
L
A
 
S
E
 
S
L
x
N
A
 
D
A
 
D
M
 
V
G
 
V
R
 
R
-
 
D
V
 
S
N
 
N
V
 
V
A
 
V
I
 
V
L
 
F
A
x
S
I
x
V
K
|
K
P
 
P
A
 
Q
D
x
L
V
 
L
A
 
K
A
 
D
C
x
V
A
 
V
K
 
L
A
 
K
L
 
L
G
 
K
P
 
P
L
 
L
V
 
L
G
 
T
E
 
K
G
 
D
G
 
K
L
 
L
V
 
L
I
 
V
S
 
S
L
x
V
A
|
A
A
|
A
G
 
G
V
 
I
S
 
K
S
 
M
Q
 
K
T
 
D
V
 
L
A
 
Q
A
 
-
E
 
E
L
 
W
P
 
A
P
 
G
N
 
H
L
 
E
A
 
R
V
 
F
V
 
I
R
 
R
A
 
V
M
 
M
P
|
P
N
 
N
T
 
T
P
 
A
A
 
A
L
 
T
I
 
V
G
 
G
R
 
E
G
 
A
A
 
A
T
 
S
A
 
V
I
 
M
C
 
S
P
 
L
G
 
G
R
 
G
G
 
A
A
 
A
D
 
T
A
 
E
A
 
E
A
 
D
M
 
A
Q
 
N
T
 
L
A
 
I
A
 
S
T
 
Q
I
 
L
F
 
F
E
 
G
A
 
S
A
 
I
G
 
G
R
 
K
V
 
I
V
 
W
V
 
K
V
 
A
A
 
D
E
 
D
R
 
K
Q
 
Y
M
 
F
E
 
D
A
 
A
V
 
I
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
G
 
A
Y
 
Y
V
 
I
Y
 
Y
L
 
L
I
 
A
I
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
G
G
 
G
V
 
V
R
 
A
L
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
P
R
 
R
P
 
D
T
 
L
A
 
A
L
 
L
S
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
S
A
 
Q
T
 
T
V
 
V
G
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
A
E
 
S
M
 
M
V
 
A
M
 
T
R
 
Q
S
 
S
G
 
G
Q
 
K
H
 
H
P
 
P
A
 
G
A
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
Q
 
D
V
 
V
T
 
T
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
|
T
M
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
H
V
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
F
R
 
R
G
 
G
L
 
I
L
 
L
M
 
M
D
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
K
R
 
R
G
 
S
A
 
Q
E
 
E
L
 
L
A
 
S

5bsfA Crystal structure of medicago truncatula (delta)1-pyrroline-5- carboxylate reductase (mtp5cr) in complex with NAD+ (see paper)
40% identity, 97% coverage: 7:268/270 of query aligns to 11:272/272 of 5bsfA

query
sites
5bsfA
L
 
L
G
 
G
L
 
F
V
 
I
G
|
G
G
 
A
G
|
G
N
x
K
M
|
M
G
 
A
A
 
E
A
 
S
L
 
I
L
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
A
L
 
V
A
 
R
K
 
S
A
 
G
V
 
V
I
 
L
E
 
S
P
 
P
G
 
S
R
 
R
V
 
I
-
 
K
V
 
T
V
 
A
V
 
I
E
x
H
K
 
S
D
 
N
A
 
P
A
 
A
K
 
R
A
 
R
A
 
T
A
 
A
L
 
F
G
 
-
E
 
E
R
 
S
F
 
I
G
 
G
V
 
I
E
 
T
T
 
V
R
 
L
A
 
S
E
 
S
L
x
N
A
 
D
A
 
D
M
 
V
G
 
V
R
 
R
-
 
D
V
 
S
N
 
N
V
 
V
A
 
V
I
 
V
L
 
F
A
x
S
I
x
V
K
|
K
P
 
P
A
 
Q
D
x
L
V
 
L
A
 
K
A
 
D
C
x
V
A
 
V
K
 
L
A
 
K
L
 
L
G
 
K
P
 
P
L
 
L
V
 
L
G
 
T
E
 
K
G
 
D
G
 
K
L
 
L
V
 
L
I
 
V
S
 
S
L
x
V
A
 
A
A
|
A
G
 
G
V
 
I
S
 
K
S
 
M
Q
 
K
T
 
D
V
 
L
A
 
Q
A
 
-
E
 
E
L
 
W
P
 
A
P
 
G
N
 
H
L
 
E
A
 
R
V
 
F
V
 
I
R
 
R
A
 
V
M
 
M
P
|
P
N
 
N
T
 
T
P
 
A
A
 
A
L
 
T
I
 
V
G
 
G
R
 
E
G
 
A
A
 
A
T
 
S
A
 
V
I
 
M
C
 
S
P
 
L
G
 
G
R
 
G
G
 
A
A
 
A
D
 
T
A
 
E
A
 
E
A
 
D
M
 
A
Q
 
N
T
 
L
A
 
I
A
 
S
T
 
Q
I
 
L
F
 
F
E
 
G
A
 
S
A
 
I
G
 
G
R
 
K
V
 
I
V
 
W
V
 
K
V
 
A
A
 
D
E
 
D
R
 
K
Q
 
Y
M
 
F
E
 
D
A
 
A
V
 
I
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
G
 
A
Y
 
Y
V
 
I
Y
 
Y
L
 
L
I
 
A
I
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
G
G
 
G
V
 
V
R
 
A
L
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
P
R
 
R
P
 
D
T
 
L
A
 
A
L
 
L
S
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
S
A
 
Q
T
 
T
V
 
V
G
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
A
E
 
S
M
 
M
V
 
A
M
 
T
R
 
Q
S
 
S
G
 
G
Q
 
K
H
 
H
P
 
P
A
 
G
A
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
Q
 
D
V
 
V
T
 
T
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
|
T
M
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
H
V
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
F
R
 
R
G
 
G
L
 
I
L
 
L
M
 
M
D
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
K
R
 
R
G
 
S
A
 
Q
E
 
E
L
 
L
A
 
S

5bseA Crystal structure of medicago truncatula (delta)1-pyrroline-5- carboxylate reductase (mtp5cr) (see paper)
40% identity, 97% coverage: 7:268/270 of query aligns to 11:272/272 of 5bseA

query
sites
5bseA
L
 
L
G
 
G
L
 
F
V
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
K
M
 
M
G
 
A
A
 
E
A
 
S
L
 
I
L
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
A
L
 
V
A
 
R
K
 
S
A
 
G
V
 
V
I
 
L
E
 
S
P
 
P
G
 
S
R
 
R
V
 
I
-
 
K
V
 
T
V
 
A
V
 
I
E
 
H
K
 
S
D
 
N
A
 
P
A
 
A
K
 
R
A
 
R
A
 
T
A
 
A
L
 
F
G
 
-
E
 
E
R
 
S
F
 
I
G
 
G
V
 
I
E
 
T
T
 
V
R
 
L
A
 
S
E
 
S
L
 
N
A
 
D
A
 
D
M
 
V
G
 
V
R
 
R
-
 
D
V
 
S
N
 
N
V
 
V
A
 
V
I
 
V
L
 
F
A
 
S
I
 
V
K
 
K
P
 
P
A
 
Q
D
 
L
V
 
L
A
 
K
A
 
D
C
 
V
A
 
V
K
 
L
A
 
K
L
 
L
G
 
K
P
 
P
L
 
L
V
 
L
G
 
T
E
 
K
G
 
D
G
 
K
L
 
L
V
 
L
I
 
V
S
 
S
L
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
I
S
 
K
S
 
M
Q
 
K
T
 
D
V
 
L
A
 
Q
A
 
-
E
 
E
L
 
W
P
 
A
P
 
G
N
 
H
L
 
E
A
 
R
V
 
F
V
 
I
R
 
R
A
 
V
M
 
M
P
 
P
N
 
N
T
 
T
P
 
A
A
 
A
L
 
T
I
 
V
G
 
G
R
 
E
G
 
A
A
 
A
T
 
S
A
 
V
I
 
M
C
 
S
P
 
L
G
 
G
R
 
G
G
 
A
A
 
A
D
 
T
A
 
E
A
 
E
A
 
D
M
 
A
Q
 
N
T
 
L
A
 
I
A
 
S
T
 
Q
I
 
L
F
 
F
E
 
G
A
 
S
A
 
I
G
 
G
R
 
K
V
 
I
V
 
W
V
 
K
V
 
A
A
 
D
E
 
D
R
 
K
Q
 
Y
M
 
F
E
 
D
A
 
A
V
 
I
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
G
 
A
Y
 
Y
V
 
I
Y
 
Y
L
 
L
I
 
A
I
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
G
G
 
G
V
 
V
R
 
A
L
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
P
R
 
R
P
 
D
T
 
L
A
 
A
L
 
L
S
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
S
A
 
Q
T
 
T
V
 
V
G
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
A
E
 
S
M
 
M
V
 
A
M
 
T
R
 
Q
S
 
S
G
 
G
Q
 
K
H
 
H
P
 
P
A
 
G
A
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
Q
 
D
V
 
V
T
 
T
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
|
T
M
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
H
V
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
F
R
 
R
G
 
G
L
 
I
L
 
L
M
 
M
D
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
K
R
 
R
G
 
S
A
 
Q
E
 
E
L
 
L
A
 
S

3triA Structure of a pyrroline-5-carboxylate reductase (proc) from coxiella burnetii (see paper)
38% identity, 98% coverage: 5:268/270 of query aligns to 3:268/272 of 3triA

query
sites
3triA
G
 
S
R
 
N
L
 
I
G
 
T
L
 
F
V
 
I
G
|
G
G
 
G
G
|
G
N
|
N
M
|
M
G
 
A
A
 
R
A
 
N
L
 
I
L
 
V
G
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
I
A
 
A
K
 
N
A
 
G
V
 
Y
I
 
-
E
 
D
P
 
P
G
 
N
R
 
R
V
 
I
V
 
C
V
 
V
V
 
T
E
x
N
K
x
R
D
x
S
A
 
L
A
 
D
K
|
K
A
 
L
A
 
D
A
 
F
L
 
F
G
 
K
E
 
E
R
 
K
F
 
C
G
 
G
V
 
V
E
 
H
T
 
T
R
 
T
A
 
Q
E
 
D
L
 
-
A
x
N
A
 
R
M
 
Q
G
 
G
R
 
A
V
 
L
N
 
N
-
 
A
-
 
D
V
 
V
A
 
V
I
 
V
L
 
L
A
|
A
I
x
V
K
|
K
P
 
P
A
 
H
D
x
Q
V
 
I
A
 
K
A
x
M
C
 
V
A
 
C
K
 
E
A
 
E
L
 
L
G
 
K
P
 
D
L
 
I
V
 
L
G
 
S
E
 
E
G
 
T
G
 
K
-
 
I
L
 
L
V
 
V
I
 
I
S
 
S
L
|
L
A
|
A
A
x
V
G
 
G
V
 
V
S
 
T
S
 
T
Q
 
P
T
 
L
V
 
I
A
 
E
A
 
K
E
 
W
L
 
L
P
 
G
P
 
K
N
 
A
L
 
S
A
 
R
V
 
I
V
 
V
R
 
R
A
 
A
M
|
M
P
|
P
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
S
L
 
S
I
 
V
G
 
R
R
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
T
A
 
G
I
 
L
C
 
F
P
 
A
G
 
N
R
 
E
G
 
T
A
 
V
D
 
D
A
 
K
A
 
D
A
 
Q
M
 
K
Q
 
N
T
 
L
A
 
A
A
 
E
T
 
S
I
 
I
F
 
M
E
 
R
A
 
A
A
 
V
G
 
G
R
 
L
V
 
V
V
 
I
V
 
W
V
 
V
A
 
S
-
 
S
E
 
E
R
 
D
Q
 
Q
M
 
I
E
 
E
A
 
K
V
 
I
T
 
A
G
 
A
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
G
 
A
Y
 
Y
V
 
I
Y
 
F
L
 
L
I
 
I
I
 
M
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
Q
D
 
E
A
 
A
G
 
A
V
 
E
R
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
T
R
 
K
P
 
E
T
 
T
A
 
A
L
 
E
S
 
L
L
 
L
A
 
T
A
 
E
A
 
Q
T
 
T
V
 
V
G
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
A
E
 
R
M
 
M
V
 
A
M
 
L
R
 
E
S
 
T
G
 
E
Q
 
Q
H
 
S
P
 
V
A
 
V
A
 
Q
L
 
L
K
 
R
D
 
Q
Q
 
F
V
 
V
T
 
T
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
 
T
M
 
E
A
 
Q
G
 
A
L
 
I
A
 
K
V
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
S
A
 
G
G
 
N
L
 
L
R
 
R
G
 
E
L
 
L
L
 
F
M
 
I
D
 
K
A
 
A
V
 
L
A
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
V
A
 
N
R
 
R
G
 
A
A
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
S

Q96C36 Pyrroline-5-carboxylate reductase 2; P5C reductase 2; P5CR 2; EC 1.5.1.2 from Homo sapiens (Human) (see paper)
36% identity, 97% coverage: 7:267/270 of query aligns to 3:268/320 of Q96C36

query
sites
Q96C36
L
 
V
G
 
G
L
 
F
V
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
G
 
A
A
 
Y
A
 
A
L
 
L
L
 
A
G
 
R
G
 
G
L
 
F
L
 
T
A
 
A
K
 
A
A
 
G
V
 
I
I
 
L
E
 
S
P
 
A
G
 
H
R
 
K
V
 
I
V
 
I
V
 
A
V
 
S
-
 
S
-
 
P
E
 
E
K
 
M
D
 
N
A
 
L
A
 
P
K
 
T
A
 
V
A
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
-
E
 
R
R
 
K
F
 
M
G
 
G
V
 
V
E
 
N
-
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
S
E
 
N
L
 
K
A
 
E
A
 
T
M
 
V
G
 
K
R
 
H
V
 
S
N
 
D
V
 
V
A
 
L
I
 
F
L
 
L
A
 
A
I
 
V
K
 
K
P
 
P
A
 
H
D
 
I
V
 
I
A
 
P
A
 
F
C
 
I
A
 
L
K
 
D
A
 
E
L
 
I
G
 
G
P
 
A
L
 
D
V
 
V
G
 
Q
E
 
A
G
 
R
G
 
H
L
 
I
V
 
V
I
 
V
S
 
S
L
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
S
 
T
S
 
I
Q
 
S
T
 
S
V
 
V
A
 
E
A
 
K
E
 
K
L
 
L
-
 
M
-
 
A
-
 
F
P
 
Q
P
 
P
N
 
A
L
 
P
A
 
K
V
 
V
V
 
I
R
|
R
A
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
V
L
 
V
I
 
V
G
 
Q
R
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
T
A
 
V
I
 
Y
C
 
A
P
 
T
G
 
G
R
 
T
G
 
H
A
 
A
D
 
L
A
 
V
A
 
E
A
 
D
M
 
G
Q
 
Q
T
 
L
A
 
L
A
 
E
T
 
Q
I
 
L
F
 
M
E
 
S
A
 
S
A
 
V
G
 
G
R
 
F
V
 
C
V
 
T
V
 
E
V
 
V
A
 
E
E
 
E
R
 
D
Q
 
L
M
 
I
E
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
G
 
A
Y
 
Y
V
 
A
Y
 
F
L
 
M
I
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
G
G
 
G
V
 
V
R
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
D
 
P
R
 
R
P
 
R
T
 
L
A
 
A
L
 
I
S
 
Q
L
 
L
A
 
G
A
 
A
A
 
Q
T
 
A
V
 
L
G
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
A
E
 
K
M
 
M
V
 
L
M
 
L
R
 
D
S
 
S
G
 
E
Q
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
C
A
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
Q
 
N
V
 
V
T
 
C
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
M
 
I
A
 
H
G
 
A
L
 
L
A
 
H
V
 
F
L
 
L
E
 
E
R
 
S
A
 
G
G
 
G
L
 
F
R
|
R
G
 
S
L
 
L
L
 
L
M
 
I
D
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
A
 
C
A
 
I
R
 
R
G
 
T
A
 
R
E
 
E
L
 
L

Sites not aligning to the query:

8td6B Structure of pycr1 complexed with nadh and 2-(methylthio)acetic acid (see paper)
36% identity, 97% coverage: 7:267/270 of query aligns to 9:274/281 of 8td6B

query
sites
8td6B
L
 
V
G
 
G
L
 
F
V
 
I
G
|
G
G
x
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
G
 
A
A
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
F
L
 
T
A
 
A
K
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
L
E
 
A
P
 
A
G
 
H
R
 
K
V
 
I
V
 
M
V
 
A
V
 
S
-
 
S
-
x
P
E
 
D
K
 
M
D
 
D
A
 
L
A
 
A
K
 
T
A
 
V
A
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
-
E
 
R
R
 
K
F
 
M
G
 
G
V
 
V
E
 
K
-
 
L
T
 
T
R
 
P
A
 
H
E
x
N
L
 
K
A
 
E
A
 
T
M
 
V
G
 
Q
R
 
H
V
 
S
N
 
D
V
 
V
A
 
L
I
 
F
L
 
L
A
|
A
I
x
V
K
|
K
P
 
P
A
 
H
D
x
I
V
 
I
A
 
P
A
 
F
C
x
I
A
 
L
K
 
D
A
 
E
L
 
I
G
 
G
P
 
A
L
 
D
V
 
I
G
 
E
E
 
D
G
 
R
G
 
H
L
 
I
V
 
V
I
 
V
S
 
S
L
x
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
V
 
V
S
 
T
S
 
I
Q
 
S
T
 
S
V
 
I
A
 
E
A
 
K
E
 
K
L
 
L
P
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
R
P
 
P
N
 
A
L
 
P
A
 
R
V
 
V
V
 
I
R
 
R
A
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
V
L
 
V
I
 
V
G
 
R
R
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
T
A
 
V
I
 
Y
C
 
A
P
 
T
G
 
G
R
 
T
G
 
H
A
 
A
D
 
Q
A
 
V
A
 
E
A
 
D
M
 
G
Q
 
R
T
 
L
A
 
M
A
 
E
T
 
Q
I
 
L
F
 
L
E
 
S
A
 
S
A
 
V
G
 
G
R
 
F
V
 
C
V
 
T
V
 
E
V
 
V
A
 
E
E
 
E
R
 
D
Q
 
L
M
 
I
E
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
|
G
S
|
S
G
 
G
P
 
P
G
 
A
Y
 
Y
V
 
A
Y
 
F
L
 
T
I
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
G
G
 
G
V
 
V
R
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
D
 
P
R
 
R
P
 
R
T
 
L
A
 
A
L
 
V
S
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
A
A
 
Q
T
 
A
V
 
L
G
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
A
E
 
K
M
 
M
V
 
L
M
 
L
R
 
H
S
 
S
G
 
E
Q
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
A
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
Q
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
M
 
I
A
 
H
G
 
A
L
 
L
A
 
H
V
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
S
A
 
G
G
 
G
L
 
F
R
 
R
G
 
S
L
 
L
L
 
L
M
 
I
D
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
A
 
C
A
 
I
R
 
R
G
 
T
A
 
R
E
 
E
L
 
L

8td3A Structure of pycr1 complexed with nadh and (s)-tetrahydro-2h-pyran-2- carboxylic acid (see paper)
36% identity, 97% coverage: 7:267/270 of query aligns to 9:274/281 of 8td3A

query
sites
8td3A
L
 
V
G
 
G
L
 
F
V
 
I
G
|
G
G
x
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
G
 
A
A
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
F
L
 
T
A
 
A
K
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
L
E
 
A
P
 
A
G
 
H
R
 
K
V
 
I
V
 
M
V
 
A
V
 
S
-
x
S
-
x
P
E
 
D
K
 
M
D
 
D
A
 
L
A
 
A
K
 
T
A
 
V
A
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
-
E
 
R
R
 
K
F
 
M
G
 
G
V
 
V
E
 
K
-
 
L
T
 
T
R
 
P
A
 
H
E
x
N
L
 
K
A
 
E
A
 
T
M
 
V
G
 
Q
R
 
H
V
 
S
N
 
D
V
 
V
A
 
L
I
 
F
L
 
L
A
|
A
I
x
V
K
|
K
P
 
P
A
 
H
D
x
I
V
 
I
A
 
P
A
 
F
C
 
I
A
 
L
K
 
D
A
 
E
L
 
I
G
 
G
P
 
A
L
 
D
V
 
I
G
 
E
E
 
D
G
 
R
G
 
H
L
 
I
V
 
V
I
 
V
S
 
S
L
x
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
V
 
V
S
 
T
S
 
I
Q
 
S
T
 
S
V
 
I
A
 
E
A
 
K
E
 
K
L
 
L
P
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
R
P
 
P
N
 
A
L
 
P
A
 
R
V
 
V
V
 
I
R
 
R
A
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
T
|
T
P
 
P
A
 
V
L
 
V
I
 
V
G
 
R
R
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
T
A
 
V
I
 
Y
C
 
A
P
 
T
G
 
G
R
 
T
G
 
H
A
 
A
D
 
Q
A
 
V
A
 
E
A
 
D
M
 
G
Q
 
R
T
 
L
A
 
M
A
 
E
T
 
Q
I
 
L
F
 
L
E
 
S
A
 
S
A
 
V
G
 
G
R
 
F
V
 
C
V
 
T
V
 
E
V
 
V
A
 
E
E
 
E
R
 
D
Q
 
L
M
 
I
E
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
|
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
G
 
A
Y
 
Y
V
 
A
Y
 
F
L
 
T
I
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
G
G
 
G
V
 
V
R
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
D
 
P
R
 
R
P
 
R
T
 
L
A
 
A
L
 
V
S
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
A
A
 
Q
T
 
A
V
 
L
G
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
A
E
 
K
M
 
M
V
 
L
M
 
L
R
 
H
S
 
S
G
 
E
Q
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
A
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
Q
 
N
V
|
V
T
 
S
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
|
T
M
 
I
A
 
H
G
 
A
L
 
L
A
 
H
V
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
S
A
 
G
G
 
G
L
 
F
R
 
R
G
 
S
L
 
L
L
 
L
M
 
I
D
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
A
 
C
A
 
I
R
 
R
G
 
T
A
 
R
E
 
E
L
 
L

8tcyA Structure of pycr1 complexed with 7-fluoro-2-oxo-1,2,3,4- tetrahydroquinoline-6-carboxylic acid (see paper)
36% identity, 97% coverage: 7:267/270 of query aligns to 10:275/281 of 8tcyA

query
sites
8tcyA
L
 
V
G
 
G
L
 
F
V
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
x
L
G
 
A
A
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
F
L
 
T
A
 
A
K
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
L
E
 
A
P
 
A
G
 
H
R
 
K
V
 
I
V
 
M
V
 
A
V
 
S
-
 
S
-
 
P
E
 
D
K
 
M
D
 
D
A
 
L
A
 
A
K
 
T
A
 
V
A
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
-
E
 
R
R
 
K
F
 
M
G
 
G
V
 
V
E
 
K
-
 
L
T
 
T
R
 
P
A
 
H
E
 
N
L
 
K
A
 
E
A
 
T
M
 
V
G
 
Q
R
 
H
V
 
S
N
 
D
V
 
V
A
 
L
I
 
F
L
 
L
A
 
A
I
 
V
K
 
K
P
 
P
A
 
H
D
 
I
V
 
I
A
 
P
A
 
F
C
 
I
A
 
L
K
 
D
A
 
E
L
 
I
G
 
G
P
 
A
L
 
D
V
 
I
G
 
E
E
 
D
G
 
R
G
 
H
L
 
I
V
 
V
I
 
V
S
 
S
L
x
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
S
 
T
S
 
I
Q
 
S
T
 
S
V
 
I
A
 
E
A
 
K
E
 
K
L
 
L
P
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
R
P
 
P
N
 
A
L
 
P
A
 
R
V
 
V
V
 
I
R
 
R
A
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
V
L
 
V
I
 
V
G
 
R
R
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
T
A
 
V
I
 
Y
C
 
A
P
 
T
G
 
G
R
 
T
G
 
H
A
 
A
D
 
Q
A
 
V
A
 
E
A
 
D
M
 
G
Q
 
R
T
 
L
A
 
M
A
 
E
T
 
Q
I
 
L
F
 
L
E
 
S
A
 
S
A
 
V
G
 
G
R
 
F
V
 
C
V
 
T
V
 
E
V
 
V
A
 
E
E
 
E
R
 
D
Q
 
L
M
 
I
E
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
G
 
A
Y
 
Y
V
 
A
Y
 
F
L
 
T
I
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
G
G
 
G
V
 
V
R
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
D
 
P
R
 
R
P
 
R
T
 
L
A
 
A
L
 
V
S
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
A
A
 
Q
T
 
A
V
 
L
G
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
A
E
 
K
M
 
M
V
 
L
M
 
L
R
 
H
S
 
S
G
 
E
Q
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
A
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
Q
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
M
 
I
A
 
H
G
 
A
L
 
L
A
 
H
V
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
S
A
 
G
G
 
G
L
 
F
R
 
R
G
 
S
L
 
L
L
 
L
M
 
I
D
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
A
 
C
A
 
I
R
 
R
G
 
T
A
 
R
E
 
E
L
 
L

8td7A Structure of pycr1 complexed with 2s-hydroxy-3-methylbutyric acid (see paper)
36% identity, 97% coverage: 7:267/270 of query aligns to 10:275/282 of 8td7A

query
sites
8td7A
L
 
V
G
 
G
L
 
F
V
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
G
 
A
A
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
F
L
 
T
A
 
A
K
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
L
E
 
A
P
 
A
G
 
H
R
 
K
V
 
I
V
 
M
V
 
A
V
 
S
-
 
S
-
 
P
E
 
D
K
 
M
D
 
D
A
 
L
A
 
A
K
 
T
A
 
V
A
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
-
E
 
R
R
 
K
F
 
M
G
 
G
V
 
V
E
 
K
-
 
L
T
 
T
R
 
P
A
 
H
E
 
N
L
 
K
A
 
E
A
 
T
M
 
V
G
 
Q
R
 
H
V
 
S
N
 
D
V
 
V
A
 
L
I
 
F
L
 
L
A
 
A
I
 
V
K
 
K
P
 
P
A
 
H
D
 
I
V
 
I
A
 
P
A
 
F
C
 
I
A
 
L
K
 
D
A
 
E
L
 
I
G
 
G
P
 
A
L
 
D
V
 
I
G
 
E
E
 
D
G
 
R
G
 
H
L
 
I
V
 
V
I
 
V
S
 
S
L
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
S
 
T
S
 
I
Q
 
S
T
 
S
V
 
I
A
 
E
A
 
K
E
 
K
L
 
L
P
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
R
P
 
P
N
 
A
L
 
P
A
 
R
V
 
V
V
 
I
R
 
R
A
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
V
L
 
V
I
 
V
G
 
R
R
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
T
A
 
V
I
 
Y
C
 
A
P
 
T
G
 
G
R
 
T
G
 
H
A
 
A
D
 
Q
A
 
V
A
 
E
A
 
D
M
 
G
Q
 
R
T
 
L
A
 
M
A
 
E
T
 
Q
I
 
L
F
 
L
E
 
S
A
 
S
A
 
V
G
 
G
R
 
F
V
 
C
V
 
T
V
 
E
V
 
V
A
 
E
E
 
E
R
 
D
Q
 
L
M
 
I
E
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
G
 
A
Y
 
Y
V
 
A
Y
 
F
L
 
T
I
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
G
G
 
G
V
 
V
R
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
D
 
P
R
 
R
P
 
R
T
 
L
A
 
A
L
 
V
S
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
A
A
 
Q
T
 
A
V
 
L
G
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
A
E
 
K
M
 
M
V
 
L
M
 
L
R
 
H
S
 
S
G
 
E
Q
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
A
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
Q
 
N
V
 
V
T
 
S
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
|
T
M
 
I
A
 
H
G
 
A
L
 
L
A
 
H
V
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
S
A
 
G
G
 
G
L
 
F
R
 
R
G
 
S
L
 
L
L
 
L
M
 
I
D
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
A
 
C
A
 
I
R
 
R
G
 
T
A
 
R
E
 
E
L
 
L

8tcwA Structure of pycr1 complexed with 2-methyl-3-(2-oxoimidazolidin-1-yl) benzoic acid (see paper)
36% identity, 97% coverage: 7:267/270 of query aligns to 10:275/282 of 8tcwA

query
sites
8tcwA
L
 
V
G
 
G
L
 
F
V
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
G
 
A
A
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
F
L
 
T
A
 
A
K
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
L
E
 
A
P
 
A
G
 
H
R
 
K
V
 
I
V
 
M
V
 
A
V
 
S
-
 
S
-
 
P
E
 
D
K
 
M
D
 
D
A
 
L
A
 
A
K
 
T
A
 
V
A
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
-
E
 
R
R
 
K
F
 
M
G
 
G
V
 
V
E
 
K
-
 
L
T
 
T
R
 
P
A
 
H
E
 
N
L
 
K
A
 
E
A
 
T
M
 
V
G
 
Q
R
 
H
V
 
S
N
 
D
V
 
V
A
 
L
I
 
F
L
 
L
A
 
A
I
x
V
K
 
K
P
|
P
A
 
H
D
 
I
V
 
I
A
 
P
A
 
F
C
 
I
A
 
L
K
 
D
A
 
E
L
 
I
G
 
G
P
 
A
L
 
D
V
 
I
G
 
E
E
 
D
G
 
R
G
 
H
L
 
I
V
 
V
I
 
V
S
 
S
L
 
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
V
 
V
S
 
T
S
 
I
Q
 
S
T
 
S
V
 
I
A
 
E
A
 
K
E
 
K
L
 
L
P
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
R
P
 
P
N
 
A
L
 
P
A
 
R
V
 
V
V
 
I
R
 
R
A
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
V
L
 
V
I
 
V
G
 
R
R
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
T
A
 
V
I
 
Y
C
 
A
P
 
T
G
 
G
R
 
T
G
 
H
A
 
A
D
 
Q
A
 
V
A
 
E
A
 
D
M
 
G
Q
 
R
T
 
L
A
 
M
A
 
E
T
 
Q
I
 
L
F
 
L
E
 
S
A
 
S
A
 
V
G
 
G
R
 
F
V
 
C
V
 
T
V
 
E
V
 
V
A
 
E
E
 
E
R
 
D
Q
 
L
M
 
I
E
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
G
 
A
Y
 
Y
V
 
A
Y
 
F
L
 
T
I
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
G
G
 
G
V
 
V
R
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
D
 
P
R
 
R
P
 
R
T
 
L
A
 
A
L
 
V
S
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
A
A
 
Q
T
 
A
V
 
L
G
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
A
E
 
K
M
 
M
V
 
L
M
 
L
R
 
H
S
 
S
G
 
E
Q
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
A
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
Q
 
N
V
 
V
T
 
S
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
|
G
T
x
A
T
|
T
M
 
I
A
 
H
G
 
A
L
 
L
A
 
H
V
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
S
A
 
G
G
 
G
L
 
F
R
 
R
G
 
S
L
 
L
L
 
L
M
 
I
D
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
A
 
C
A
 
I
R
 
R
G
 
T
A
 
R
E
 
E
L
 
L

6xp3A Structure of human pycr1 complexed with cyclopentanecarboxylic acid (see paper)
36% identity, 97% coverage: 7:267/270 of query aligns to 6:271/276 of 6xp3A

query
sites
6xp3A
L
 
V
G
 
G
L
 
F
V
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
G
 
A
A
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
F
L
 
T
A
 
A
K
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
L
E
 
A
P
 
A
G
 
H
R
 
K
V
 
I
V
 
M
V
 
A
V
 
S
-
 
S
-
 
P
E
 
D
K
 
M
D
 
D
A
 
L
A
 
A
K
 
T
A
 
V
A
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
-
E
 
R
R
 
K
F
 
M
G
 
G
V
 
V
E
 
K
-
 
L
T
 
T
R
 
P
A
 
H
E
 
N
L
 
K
A
 
E
A
 
T
M
 
V
G
 
Q
R
 
H
V
 
S
N
 
D
V
 
V
A
 
L
I
 
F
L
 
L
A
 
A
I
 
V
K
 
K
P
 
P
A
 
H
D
 
I
V
 
I
A
 
P
A
 
F
C
 
I
A
 
L
K
 
D
A
 
E
L
 
I
G
 
G
P
 
A
L
 
D
V
 
I
G
 
E
E
 
D
G
 
R
G
 
H
L
 
I
V
 
V
I
 
V
S
 
S
L
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
S
 
T
S
 
I
Q
 
S
T
 
S
V
 
I
A
 
E
A
 
K
E
 
K
L
 
L
P
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
R
P
 
P
N
 
A
L
 
P
A
 
R
V
 
V
V
 
I
R
 
R
A
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
V
L
 
V
I
 
V
G
 
R
R
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
T
A
 
V
I
 
Y
C
 
A
P
 
T
G
 
G
R
 
T
G
 
H
A
 
A
D
 
Q
A
 
V
A
 
E
A
 
D
M
 
G
Q
 
R
T
 
L
A
 
M
A
 
E
T
 
Q
I
 
L
F
 
L
E
 
S
A
 
S
A
 
V
G
 
G
R
 
F
V
 
C
V
 
T
V
 
E
V
 
V
A
 
E
E
 
E
R
 
D
Q
 
L
M
 
I
E
 
D
A
 
A
V
 
V
T
|
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
|
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
G
 
A
Y
 
Y
V
 
A
Y
 
F
L
 
T
I
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
G
G
 
G
V
 
V
R
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
D
 
P
R
 
R
P
 
R
T
 
L
A
 
A
L
 
V
S
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
A
A
 
Q
T
 
A
V
 
L
G
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
A
E
 
K
M
 
M
V
 
L
M
 
L
R
 
H
S
 
S
G
 
E
Q
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
A
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
Q
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
M
 
I
A
 
H
G
 
A
L
 
L
A
 
H
V
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
S
A
 
G
G
 
G
L
 
F
R
 
R
G
 
S
L
 
L
L
 
L
M
 
I
D
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
A
 
C
A
 
I
R
 
R
G
 
T
A
 
R
E
 
E
L
 
L

8tdbA Structure of pycr1 complexed with nadh and 1-hydroxyethane-1-sulfonate (see paper)
36% identity, 97% coverage: 7:267/270 of query aligns to 3:268/275 of 8tdbA

query
sites
8tdbA
L
 
V
G
 
G
L
 
F
V
 
I
G
|
G
G
x
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
G
 
A
A
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
F
L
 
T
A
 
A
K
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
L
E
 
A
P
 
A
G
 
H
R
 
K
V
 
I
V
 
M
V
 
A
V
 
S
-
x
S
-
x
P
E
 
D
K
 
M
D
 
D
A
 
L
A
 
A
K
 
T
A
 
V
A
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
-
E
 
R
R
 
K
F
 
M
G
 
G
V
 
V
E
 
K
-
 
L
T
 
T
R
 
P
A
 
H
E
x
N
L
 
K
A
 
E
A
 
T
M
 
V
G
 
Q
R
 
H
V
 
S
N
 
D
V
 
V
A
 
L
I
 
F
L
 
L
A
 
A
I
x
V
K
|
K
P
|
P
A
 
H
D
 
I
V
 
I
A
 
P
A
 
F
C
x
I
A
 
L
K
 
D
A
 
E
L
 
I
G
 
G
P
 
A
L
 
D
V
 
I
G
 
E
E
 
D
G
 
R
G
 
H
L
 
I
V
 
V
I
 
V
S
 
S
L
 
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
V
 
V
S
 
T
S
 
I
Q
 
S
T
 
S
V
 
I
A
 
E
A
 
K
E
 
K
L
 
L
P
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
R
P
 
P
N
 
A
L
 
P
A
 
R
V
 
V
V
 
I
R
 
R
A
 
C
M
 
M
P
x
T
N
 
N
T
|
T
P
 
P
A
 
V
L
 
V
I
 
V
G
 
R
R
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
T
A
 
V
I
 
Y
C
 
A
P
 
T
G
 
G
R
 
T
G
 
H
A
 
A
D
 
Q
A
 
V
A
 
E
A
 
D
M
 
G
Q
 
R
T
 
L
A
 
M
A
 
E
T
 
Q
I
 
L
F
 
L
E
 
S
A
 
S
A
 
V
G
 
G
R
 
F
V
 
C
V
 
T
V
 
E
V
 
V
A
 
E
E
 
E
R
 
D
Q
 
L
M
 
I
E
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
G
 
A
Y
 
Y
V
 
A
Y
 
F
L
 
T
I
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
G
G
 
G
V
 
V
R
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
D
 
P
R
 
R
P
 
R
T
 
L
A
 
A
L
 
V
S
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
A
A
 
Q
T
 
A
V
 
L
G
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
A
E
 
K
M
 
M
V
 
L
M
 
L
R
 
H
S
 
S
G
 
E
Q
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
A
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
Q
 
N
V
|
V
T
 
S
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
|
T
M
 
I
A
 
H
G
 
A
L
 
L
A
 
H
V
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
S
A
 
G
G
 
G
L
 
F
R
 
R
G
 
S
L
 
L
L
 
L
M
 
I
D
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
A
 
C
A
 
I
R
 
R
G
 
T
A
 
R
E
 
E
L
 
L

5uatC Structure of human pycr-1 complexed with NADPH (see paper)
36% identity, 97% coverage: 7:267/270 of query aligns to 7:272/277 of 5uatC

query
sites
5uatC
L
 
V
G
 
G
L
 
F
V
 
I
G
 
G
G
x
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
G
 
A
A
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
F
L
 
T
A
 
A
K
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
L
E
 
A
P
 
A
G
 
H
R
 
K
V
 
I
V
 
M
V
 
A
V
 
S
-
x
S
-
x
P
E
x
D
K
 
M
D
 
D
A
 
L
A
 
A
K
 
T
A
 
V
A
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
-
E
 
R
R
 
K
F
 
M
G
 
G
V
 
V
E
 
K
-
 
L
T
 
T
R
 
P
A
 
H
E
x
N
L
 
K
A
 
E
A
 
T
M
 
V
G
 
Q
R
 
H
V
 
S
N
 
D
V
 
V
A
 
L
I
 
F
L
 
L
A
|
A
I
x
V
K
|
K
P
|
P
A
 
H
D
 
I
V
 
I
A
 
P
A
 
F
C
x
I
A
 
L
K
 
D
A
 
E
L
 
I
G
 
G
P
 
A
L
 
D
V
 
I
G
 
E
E
 
D
G
 
R
G
 
H
L
 
I
V
 
V
I
 
V
S
 
S
L
x
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
V
 
V
S
 
T
S
 
I
Q
 
S
T
 
S
V
 
I
A
 
E
A
 
K
E
 
K
L
 
L
P
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
R
P
 
P
N
 
A
L
 
P
A
 
R
V
 
V
V
 
I
R
 
R
A
 
C
M
|
M
P
 
T
N
 
N
T
|
T
P
 
P
A
 
V
L
 
V
I
 
V
G
 
R
R
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
T
A
 
V
I
 
Y
C
 
A
P
 
T
G
 
G
R
 
T
G
 
H
A
 
A
D
 
Q
A
 
V
A
 
E
A
 
D
M
 
G
Q
 
R
T
 
L
A
 
M
A
 
E
T
 
Q
I
 
L
F
 
L
E
 
S
A
 
S
A
 
V
G
 
G
R
 
F
V
 
C
V
 
T
V
 
E
V
 
V
A
 
E
E
 
E
R
 
D
Q
 
L
M
 
I
E
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
G
 
A
Y
 
Y
V
 
A
Y
 
F
L
 
T
I
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
G
G
 
G
V
 
V
R
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
D
 
P
R
 
R
P
 
R
T
 
L
A
 
A
L
 
V
S
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
A
A
 
Q
T
 
A
V
 
L
G
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
A
E
 
K
M
 
M
V
 
L
M
 
L
R
 
H
S
 
S
G
 
E
Q
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
A
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
Q
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
M
 
I
A
 
H
G
 
A
L
 
L
A
 
H
V
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
S
A
 
G
G
 
G
L
 
F
R
 
R
G
 
S
L
 
L
L
 
L
M
 
I
D
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
A
 
C
A
 
I
R
 
R
G
 
T
A
 
R
E
 
E
L
 
L

2graA Crystal structure of human pyrroline-5-carboxylate reductase complexed with NADP (see paper)
36% identity, 97% coverage: 7:267/270 of query aligns to 5:270/277 of 2graA

query
sites
2graA
L
 
V
G
 
G
L
 
F
V
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
G
 
A
A
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
F
L
 
T
A
 
A
K
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
L
E
 
A
P
 
A
G
 
H
R
 
K
V
 
I
V
 
M
V
 
A
V
 
S
-
 
S
-
 
P
E
 
D
K
 
M
D
 
D
A
 
L
A
 
A
K
 
T
A
 
V
A
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
-
E
 
R
R
 
K
F
 
M
G
 
G
V
 
V
E
 
K
-
 
L
T
 
T
R
 
P
A
 
H
E
 
N
L
 
K
A
 
E
A
 
T
M
 
V
G
 
Q
R
 
H
V
 
S
N
 
D
V
 
V
A
 
L
I
 
F
L
 
L
A
 
A
I
 
V
K
 
K
P
 
P
A
 
H
D
 
I
V
 
I
A
 
P
A
 
F
C
 
I
A
 
L
K
 
D
A
 
E
L
 
I
G
 
G
P
 
A
L
 
D
V
 
I
G
 
E
E
 
D
G
 
R
G
 
H
L
 
I
V
 
V
I
 
V
S
 
S
L
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
S
 
T
S
 
I
Q
 
S
T
 
S
V
 
I
A
 
E
A
 
K
E
 
K
L
 
L
P
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
R
P
 
P
N
 
A
L
 
P
A
 
R
V
 
V
V
 
I
R
 
R
A
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
V
L
 
V
I
 
V
G
x
R
R
x
E
G
 
G
A
 
A
T
 
T
A
 
V
I
 
Y
C
 
A
P
 
T
G
 
G
R
 
T
G
 
H
A
 
A
D
 
Q
A
 
V
A
 
E
A
 
D
M
 
G
Q
 
R
T
 
L
A
 
M
A
 
E
T
 
Q
I
 
L
F
 
L
E
x
S
A
x
S
A
 
V
G
|
G
R
x
F
V
 
C
V
 
T
V
 
E
V
 
V
A
 
E
E
 
E
R
 
D
Q
 
L
M
 
I
E
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
G
 
A
Y
 
Y
V
 
A
Y
 
F
L
 
T
I
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
G
G
 
G
V
 
V
R
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
D
 
P
R
 
R
P
 
R
T
 
L
A
 
A
L
 
V
S
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
A
A
 
Q
T
 
A
V
 
L
G
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
A
E
 
K
M
 
M
V
 
L
M
x
L
R
x
H
S
|
S
G
 
E
Q
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
A
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
Q
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
M
 
I
A
 
H
G
 
A
L
 
L
A
 
H
V
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
S
A
 
G
G
 
G
L
 
F
R
 
R
G
 
S
L
 
L
L
 
L
M
 
I
D
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
A
 
C
A
 
I
R
 
R
G
 
T
A
 
R
E
 
E
L
 
L

2gr9A Crystal structure of p5cr complexed with nadh (see paper)
36% identity, 97% coverage: 7:267/270 of query aligns to 5:270/277 of 2gr9A

query
sites
2gr9A
L
 
V
G
 
G
L
 
F
V
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
G
 
A
A
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
F
L
 
T
A
 
A
K
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
L
E
 
A
P
 
A
G
 
H
R
 
K
V
 
I
V
 
M
V
 
A
V
 
S
-
 
S
-
 
P
E
 
D
K
 
M
D
 
D
A
 
L
A
 
A
K
 
T
A
 
V
A
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
-
E
 
R
R
 
K
F
 
M
G
 
G
V
 
V
E
 
K
-
 
L
T
 
T
R
 
P
A
 
H
E
 
N
L
 
K
A
 
E
A
 
T
M
 
V
G
 
Q
R
 
H
V
 
S
N
 
D
V
 
V
A
 
L
I
 
F
L
 
L
A
 
A
I
 
V
K
 
K
P
 
P
A
 
H
D
 
I
V
 
I
A
 
P
A
 
F
C
 
I
A
 
L
K
 
D
A
 
E
L
 
I
G
 
G
P
 
A
L
 
D
V
 
I
G
 
E
E
 
D
G
 
R
G
 
H
L
 
I
V
 
V
I
 
V
S
 
S
L
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
S
 
T
S
 
I
Q
 
S
T
 
S
V
 
I
A
 
E
A
 
K
E
 
K
L
 
L
P
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
R
P
 
P
N
 
A
L
 
P
A
 
R
V
 
V
V
 
I
R
 
R
A
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
V
L
 
V
I
 
V
G
x
R
R
x
E
G
 
G
A
 
A
T
 
T
A
 
V
I
 
Y
C
 
A
P
 
T
G
 
G
R
 
T
G
 
H
A
 
A
D
 
Q
A
 
V
A
 
E
A
 
D
M
 
G
Q
 
R
T
 
L
A
 
M
A
 
E
T
 
Q
I
 
L
F
 
L
E
x
S
A
 
S
A
 
V
G
|
G
R
x
F
V
 
C
V
 
T
V
 
E
V
 
V
A
 
E
E
 
E
R
 
D
Q
 
L
M
 
I
E
 
D
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
G
 
A
Y
 
Y
V
 
A
Y
 
F
L
 
T
I
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
G
G
 
G
V
 
V
R
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
D
 
P
R
 
R
P
 
R
T
 
L
A
 
A
L
 
V
S
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
A
A
 
Q
T
 
A
V
 
L
G
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
A
E
 
K
M
 
M
V
 
L
M
x
L
R
x
H
S
 
S
G
 
E
Q
 
Q
H
 
H
P
 
P
A
 
G
A
 
Q
L
 
L
K
 
K
D
 
D
Q
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
M
 
I
A
 
H
G
 
A
L
 
L
A
 
H
V
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
S
A
 
G
G
 
G
L
 
F
R
 
R
G
 
S
L
 
L
L
 
L
M
 
I
D
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
A
 
C
A
 
I
R
 
R
G
 
T
A
 
R
E
 
E
L
 
L

5uauA Structure of human pycr-1 complexed with proline (see paper)
36% identity, 97% coverage: 7:267/270 of query aligns to 3:268/274 of 5uauA

query
sites
5uauA
L
 
V
G
 
G
L
 
F
V
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
G
 
A
A
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
F
L
 
T
A
 
A
K
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
L
E
 
A
P
 
A
G
 
H
R
 
K
V
 
I
V
 
M
V
 
A
V
 
S
-
 
S
-
 
P
E
 
D
K
 
M
D
 
D
A
 
L
A
 
A
K
 
T
A
 
V
A
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
-
E
 
R
R
 
K
F
 
M
G
 
G
V
 
V
E
 
K
-
 
L
T
 
T
R
 
P
A
 
H
E
 
N
L
 
K
A
 
E
A
 
T
M
 
V
G
 
Q
R
 
H
V
 
S
N
 
D
V
 
V
A
 
L
I
 
F
L
 
L
A
 
A
I
 
V
K
 
K
P
 
P
A
 
H
D
 
I
V
 
I
A
 
P
A
 
F
C
 
I
A
 
L
K
 
D
A
 
E
L
 
I
G
 
G
P
 
A
L
 
D
V
 
I
G
 
E
E
 
D
G
 
R
G
 
H
L
 
I
V
 
V
I
 
V
S
 
S
L
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
S
 
T
S
 
I
Q
 
S
T
 
S
V
 
I
A
 
E
A
 
K
E
 
K
L
 
L
P
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
R
P
 
P
N
 
A
L
 
P
A
 
R
V
 
V
V
 
I
R
 
R
A
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
V
L
 
V
I
 
V
G
 
R
R
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
T
A
 
V
I
 
Y
C
 
A
P
x
T
G
 
G
R
 
T
G
 
H
A
 
A
D
 
Q
A
 
V
A
 
E
A
 
D
M
 
G
Q
 
R
T
 
L
A
 
M
A
 
E
T
 
Q
I
 
L
F
 
L
E