SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_013258530.1 NCBI__GCF_000143965.1:WP_013258530.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1g6hA Crystal structure of the adp conformation of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
37% identity, 96% coverage: 1:255/267 of query aligns to 2:254/254 of 1g6hA

query
sites
1g6hA
M
 
M
P
 
E
I
 
I
F
 
L
E
 
R
I
 
T
K
 
E
N
 
N
L
 
I
S
 
V
M
 
K
V
 
Y
F
|
F
G
 
G
G
 
E
L
x
F
T
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
D
N
 
G
V
 
V
S
 
S
L
 
I
S
 
S
V
 
V
E
 
N
K
 
K
G
 
G
S
 
D
T
 
V
T
 
T
A
 
L
V
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
F
 
I
N
 
N
C
 
V
I
 
I
S
 
T
G
 
G
L
 
F
Y
 
L
K
 
K
P
 
A
S
 
D
S
 
E
G
 
G
E
 
R
V
 
V
V
 
Y
F
 
F
K
 
E
G
 
N
Q
 
K
R
 
D
L
 
I
T
 
T
D
 
N
K
 
K
K
 
E
P
 
P
H
 
A
Q
 
E
I
 
L
A
 
Y
N
 
H
L
 
Y
G
 
G
V
 
I
G
 
V
R
 
R
T
 
T
F
 
F
Q
 
Q
N
 
T
I
 
P
E
 
Q
L
 
P
F
 
L
N
 
K
N
 
E
M
 
M
T
 
T
T
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
L
M
 
L
L
 
I
G
 
G
R
 
E
H
 
I
M
 
C
H
 
P
M
 
G
K
 
E
T
 
S
G
 
P
L
 
L
W
 
-
A
 
-
S
 
N
C
 
S
T
 
L
W
 
F
W
 
Y
R
 
K
R
 
-
G
 
-
S
 
-
K
 
K
A
 
W
C
 
I
R
 
P
L
 
K
E
 
E
I
 
E
D
 
E
H
 
M
R
 
V
A
 
E
R
 
K
V
 
A
E
 
F
R
 
K
I
 
I
I
 
L
D
 
E
F
 
F
L
 
L
D
 
K
L
 
L
Q
 
S
S
 
H
A
 
L
R
 
Y
N
 
D
R
 
R
F
 
K
V
 
A
G
 
G
G
 
E
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
T
 
Q
Q
 
M
K
 
K
V
 
L
V
 
V
E
 
E
L
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
M
T
 
T
E
 
N
P
 
P
E
 
K
L
 
M
L
 
I
L
 
V
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
V
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
A
L
 
P
E
 
G
E
 
L
K
 
A
Q
 
H
D
 
D
L
 
I
L
 
F
F
 
N
W
 
H
L
 
V
Q
 
L
D
 
E
I
 
L
K
 
K
D
 
A
Q
 
K
F
 
-
G
 
G
V
 
I
T
 
T
L
 
F
L
 
L
I
 
I
I
 
I
E
 
E
H
 
H
D
 
R
M
 
L
R
 
D
V
 
I
V
 
V
M
 
L
E
 
N
I
 
Y
S
 
I
D
 
D
K
 
H
V
 
L
M
 
Y
V
 
V
L
 
M
N
 
F
Y
 
N
G
 
G
K
 
Q
P
 
I
I
 
I
A
 
A
Y
 
E
G
 
G
A
 
R
P
 
G
D
 
E
E
 
E
V
 
E
Q
 
I
K
 
K
N
 
N
-
 
V
-
 
L
-
 
S
-
 
D
P
 
P
D
 
K
V
 
V
L
 
V
A
 
E
A
 
I
Y
 
Y
I
 
I
G
 
G
D
 
E

1g9xB Characterization of the twinning structure of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
37% identity, 95% coverage: 1:254/267 of query aligns to 2:253/253 of 1g9xB

query
sites
1g9xB
M
 
M
P
 
E
I
 
I
F
 
L
E
 
R
I
 
T
K
 
E
N
 
N
L
 
I
S
 
V
M
 
K
V
 
Y
F
|
F
G
 
G
G
 
E
L
x
F
T
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
D
N
 
G
V
 
V
S
 
S
L
 
I
S
 
S
V
 
V
E
 
C
K
 
K
G
 
G
S
 
D
T
 
V
T
 
T
A
 
L
V
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
F
 
I
N
 
N
C
 
V
I
 
I
S
 
T
G
 
G
L
 
F
Y
 
L
K
 
K
P
 
A
S
 
D
S
 
E
G
 
G
E
 
R
V
 
V
V
 
Y
F
 
F
K
 
E
G
 
N
Q
 
K
R
 
D
L
 
I
T
 
T
D
 
N
K
 
K
K
 
E
P
 
P
H
 
A
Q
 
E
I
 
L
A
 
Y
N
 
H
L
 
Y
G
 
G
V
 
I
G
 
V
R
 
R
T
 
T
F
 
F
Q
 
Q
N
 
T
I
 
P
E
 
Q
L
 
P
F
 
L
N
 
K
N
 
E
M
 
M
T
 
T
T
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
L
M
 
L
L
 
I
G
 
G
R
 
E
H
 
I
M
 
N
H
 
P
M
 
G
K
 
E
T
 
S
G
 
P
L
 
L
W
 
-
A
 
-
S
 
N
C
 
S
T
 
L
W
 
F
W
 
Y
R
 
K
R
 
-
G
 
-
S
 
-
K
 
K
A
 
W
C
 
I
R
 
P
L
 
K
E
 
E
I
 
E
D
 
E
H
 
M
R
 
V
A
 
E
R
 
K
V
 
A
E
 
F
R
 
K
I
 
I
I
 
L
D
 
E
F
 
F
L
 
L
D
 
K
L
 
L
Q
 
S
S
 
H
A
 
L
R
 
Y
N
 
D
R
 
R
F
 
K
V
 
A
G
 
G
G
 
E
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
T
 
Q
Q
 
M
K
 
K
V
 
L
V
 
V
E
 
E
L
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
M
T
 
T
E
 
N
P
 
P
E
 
K
L
 
M
L
 
I
L
 
V
L
 
M
D
 
D
E
|
E
P
 
P
V
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
A
L
 
P
E
 
G
E
 
L
K
 
A
Q
 
H
D
 
D
L
 
I
L
 
F
F
 
N
W
 
H
L
 
V
Q
 
L
D
 
E
I
 
L
K
 
K
D
 
A
Q
 
K
F
 
-
G
 
G
V
 
I
T
 
T
L
 
F
L
 
L
I
 
I
I
 
I
E
 
E
H
 
H
D
 
R
M
 
L
R
 
D
V
 
I
V
 
V
M
 
L
E
 
N
I
 
Y
S
 
I
D
 
D
K
 
H
V
 
L
M
 
Y
V
 
V
L
 
M
N
 
F
Y
 
N
G
 
G
K
 
Q
P
 
I
I
 
I
A
 
A
Y
 
E
G
 
G
A
 
R
P
 
G
D
 
E
E
 
E
V
 
E
Q
 
I
K
 
K
N
 
N
-
 
V
-
 
L
-
 
S
-
 
D
P
 
P
D
 
K
V
 
V
L
 
V
A
 
E
A
 
I
Y
 
Y
I
 
I
G
 
G

1oxvD Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
35% identity, 90% coverage: 6:246/267 of query aligns to 6:232/353 of 1oxvD

query
sites
1oxvD
I
 
V
K
 
K
N
 
N
L
 
V
S
 
S
M
 
K
V
 
V
F
|
F
-
 
K
-
 
K
G
 
G
G
 
K
L
 
V
T
 
V
A
 
A
L
 
L
D
 
D
N
 
N
V
 
V
S
 
N
L
 
I
S
 
N
V
 
I
E
 
E
K
 
N
G
 
G
S
 
E
T
 
R
T
 
F
A
 
G
V
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
F
F
 
M
N
 
R
C
 
I
I
 
I
S
 
A
G
 
G
L
 
L
Y
 
D
K
 
V
P
 
P
S
 
S
S
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
L
V
 
Y
F
 
F
K
 
D
G
 
-
Q
 
D
R
 
R
L
 
L
T
 
V
D
 
A
K
 
S
K
 
N
P
 
G
H
 
K
Q
 
L
I
 
I
A
 
V
-
 
P
-
 
P
-
 
E
N
 
D
L
 
R
G
 
K
V
 
I
G
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
|
Q
N
 
T
I
 
W
E
 
A
L
 
L
F
 
Y
N
 
P
N
 
N
M
 
L
T
 
T
T
 
A
L
 
F
E
 
E
N
 
N
L
 
I
M
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
H
 
-
M
 
-
H
 
-
M
 
-
K
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
-
W
 
-
A
 
-
S
 
-
C
 
-
T
 
A
W
 
F
W
 
P
R
 
L
R
 
T
G
 
N
S
 
M
K
 
K
A
 
M
C
 
S
R
 
K
L
 
E
E
 
E
I
 
I
D
 
-
H
 
-
R
 
R
A
 
K
R
 
R
V
 
V
E
 
E
R
 
E
I
 
V
I
 
A
D
 
K
F
 
I
L
 
L
D
 
D
L
 
I
Q
 
H
S
 
H
A
 
V
R
 
L
N
 
N
R
 
H
F
 
F
V
 
P
G
 
R
G
 
E
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
T
 
Q
Q
 
Q
K
 
Q
V
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
L
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
V
T
 
K
E
 
D
P
 
P
E
 
S
L
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
V
 
F
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
L
 
A
E
 
R
E
 
M
K
 
R
Q
 
D
D
 
S
L
 
A
L
 
R
F
 
A
W
 
L
L
 
V
Q
 
K
D
 
E
I
 
V
K
 
Q
D
 
S
Q
 
R
F
 
L
G
 
G
V
 
V
T
 
T
L
 
L
L
 
L
I
 
V
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
P
R
 
A
V
 
D
V
 
I
M
 
F
E
 
A
I
 
I
S
 
A
D
 
D
K
 
R
V
 
V
M
 
G
V
 
V
L
 
L
N
 
V
Y
 
K
G
 
G
K
 
K
P
 
L
I
 
V
A
 
Q
Y
 
V
G
 
G
A
 
K
P
 
P
D
 
E
E
 
D
V
 
L
Q
 
Y
K
 
D
N
 
N
P
 
P

1oxvA Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
35% identity, 90% coverage: 6:246/267 of query aligns to 6:232/353 of 1oxvA

query
sites
1oxvA
I
 
V
K
 
K
N
 
N
L
 
V
S
 
S
M
 
K
V
 
V
F
|
F
-
 
K
-
 
K
G
 
G
G
 
K
L
 
V
T
 
V
A
 
A
L
 
L
D
 
D
N
 
N
V
 
V
S
 
N
L
 
I
S
 
N
V
 
I
E
 
E
K
 
N
G
 
G
S
 
E
T
 
R
T
 
F
A
 
G
V
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
F
F
 
M
N
 
R
C
 
I
I
 
I
S
 
A
G
 
G
L
 
L
Y
 
D
K
 
V
P
 
P
S
 
S
S
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
L
V
 
Y
F
 
F
K
 
D
G
 
-
Q
 
D
R
 
R
L
 
L
T
 
V
D
 
A
K
 
S
K
 
N
P
 
G
H
 
K
Q
 
L
I
 
I
A
 
V
-
 
P
-
 
P
-
 
E
N
 
D
L
 
R
G
 
K
V
 
I
G
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
T
I
 
W
E
 
A
L
 
L
F
 
Y
N
 
P
N
 
N
M
 
L
T
 
T
T
 
A
L
 
F
E
 
E
N
 
N
L
 
I
M
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
H
 
-
M
 
-
H
 
-
M
 
-
K
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
-
W
 
-
A
 
-
S
 
-
C
 
-
T
 
A
W
 
F
W
 
P
R
 
L
R
 
T
G
 
N
S
 
M
K
 
K
A
 
M
C
 
S
R
 
K
L
 
E
E
 
E
I
 
I
D
 
-
H
 
-
R
 
R
A
 
K
R
 
R
V
 
V
E
 
E
R
 
E
I
 
V
I
 
A
D
 
K
F
 
I
L
 
L
D
 
D
L
 
I
Q
 
H
S
 
H
A
 
V
R
 
L
N
 
N
R
 
H
F
 
F
V
 
P
G
 
R
G
 
E
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
T
 
Q
Q
 
Q
K
 
Q
V
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
L
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
V
T
 
K
E
 
D
P
 
P
E
 
S
L
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
V
 
F
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
L
 
A
E
 
R
E
 
M
K
 
R
Q
 
D
D
 
S
L
 
A
L
 
R
F
 
A
W
 
L
L
 
V
Q
 
K
D
 
E
I
 
V
K
 
Q
D
 
S
Q
 
R
F
 
L
G
 
G
V
 
V
T
 
T
L
 
L
L
 
L
I
 
V
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
P
R
 
A
V
 
D
V
 
I
M
 
F
E
 
A
I
 
I
S
 
A
D
 
D
K
 
R
V
 
V
M
 
G
V
 
V
L
 
L
N
 
V
Y
 
K
G
 
G
K
 
K
P
 
L
I
 
V
A
 
Q
Y
 
V
G
 
G
A
 
K
P
 
P
D
 
E
E
 
D
V
 
L
Q
 
Y
K
 
D
N
 
N
P
 
P

1oxuA Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
35% identity, 90% coverage: 6:246/267 of query aligns to 6:232/353 of 1oxuA

query
sites
1oxuA
I
 
V
K
 
K
N
 
N
L
 
V
S
 
S
M
 
K
V
 
V
F
|
F
-
 
K
-
 
K
G
 
G
G
 
K
L
 
V
T
 
V
A
|
A
L
 
L
D
 
D
N
 
N
V
 
V
S
 
N
L
 
I
S
 
N
V
 
I
E
 
E
K
 
N
G
 
G
S
 
E
T
 
R
T
 
F
A
 
G
V
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
F
F
 
M
N
 
R
C
 
I
I
 
I
S
 
A
G
 
G
L
 
L
Y
 
D
K
 
V
P
 
P
S
 
S
S
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
L
V
 
Y
F
 
F
K
 
D
G
 
-
Q
 
D
R
 
R
L
 
L
T
 
V
D
 
A
K
 
S
K
 
N
P
 
G
H
 
K
Q
 
L
I
 
I
A
 
V
-
 
P
-
 
P
-
 
E
N
 
D
L
 
R
G
 
K
V
 
I
G
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
T
I
 
W
E
 
A
L
 
L
F
 
Y
N
 
P
N
 
N
M
 
L
T
 
T
T
 
A
L
 
F
E
 
E
N
 
N
L
 
I
M
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
H
 
-
M
 
-
H
 
-
M
 
-
K
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
-
W
 
-
A
 
-
S
 
-
C
 
-
T
 
A
W
 
F
W
 
P
R
 
L
R
 
T
G
 
N
S
 
M
K
 
K
A
 
M
C
 
S
R
 
K
L
 
E
E
 
E
I
 
I
D
 
-
H
 
-
R
 
R
A
 
K
R
 
R
V
 
V
E
 
E
R
 
E
I
 
V
I
 
A
D
 
K
F
 
I
L
 
L
D
 
D
L
 
I
Q
 
H
S
 
H
A
 
V
R
 
L
N
 
N
R
 
H
F
 
F
V
 
P
G
 
R
G
 
E
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
T
 
Q
Q
 
Q
K
 
Q
V
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
L
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
V
T
 
K
E
 
D
P
 
P
E
 
S
L
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
V
 
F
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
L
 
A
E
 
R
E
 
M
K
 
R
Q
 
D
D
 
S
L
 
A
L
 
R
F
 
A
W
 
L
L
 
V
Q
 
K
D
 
E
I
 
V
K
 
Q
D
 
S
Q
 
R
F
 
L
G
 
G
V
 
V
T
 
T
L
 
L
L
 
L
I
 
V
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
P
R
 
A
V
 
D
V
 
I
M
 
F
E
 
A
I
 
I
S
 
A
D
 
D
K
 
R
V
 
V
M
 
G
V
 
V
L
 
L
N
 
V
Y
 
K
G
 
G
K
 
K
P
 
L
I
 
V
A
 
Q
Y
 
V
G
 
G
A
 
K
P
 
P
D
 
E
E
 
D
V
 
L
Q
 
Y
K
 
D
N
 
N
P
 
P

Q97UY8 Glucose import ATP-binding protein GlcV; EC 7.5.2.- from Saccharolobus solfataricus (strain ATCC 35092 / DSM 1617 / JCM 11322 / P2) (Sulfolobus solfataricus) (see paper)
35% identity, 90% coverage: 6:246/267 of query aligns to 6:232/353 of Q97UY8

query
sites
Q97UY8
I
 
V
K
 
K
N
 
N
L
 
V
S
 
S
M
 
K
V
 
V
F
 
F
-
 
K
-
 
K
G
 
G
G
 
K
L
 
V
T
 
V
A
 
A
L
 
L
D
 
D
N
 
N
V
 
V
S
 
N
L
 
I
S
 
N
V
 
I
E
 
E
K
 
N
G
 
G
S
 
E
T
 
R
T
 
F
A
 
G
V
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
L
 
F
F
 
M
N
 
R
C
 
I
I
 
I
S
 
A
G
 
G
L
 
L
Y
 
D
K
 
V
P
 
P
S
 
S
S
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
L
V
 
Y
F
 
F
K
 
D
G
 
-
Q
 
D
R
 
R
L
 
L
T
 
V
D
 
A
K
 
S
K
 
N
P
 
G
H
 
K
Q
 
L
I
 
I
A
 
V
-
 
P
-
 
P
-
 
E
N
 
D
L
 
R
G
 
K
V
 
I
G
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
T
I
 
W
E
 
A
L
 
L
F
 
Y
N
 
P
N
 
N
M
 
L
T
 
T
T
 
A
L
 
F
E
 
E
N
 
N
L
 
I
M
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
H
 
-
M
 
-
H
 
-
M
 
-
K
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
-
W
 
-
A
 
-
S
 
-
C
 
-
T
 
A
W
 
F
W
 
P
R
 
L
R
 
T
G
 
N
S
 
M
K
 
K
A
 
M
C
 
S
R
 
K
L
 
E
E
 
E
I
 
I
D
 
-
H
 
-
R
 
R
A
 
K
R
 
R
V
 
V
E
 
E
R
 
E
I
 
V
I
 
A
D
 
K
F
 
I
L
 
L
D
 
D
L
 
I
Q
 
H
S
 
H
A
 
V
R
 
L
N
 
N
R
 
H
F
 
F
V
 
P
G
 
R
G
 
E
L
 
L
P
x
S
Y
 
G
G
|
G
T
 
Q
Q
 
Q
K
 
Q
V
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
L
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
V
T
 
K
E
 
D
P
 
P
E
 
S
L
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
V
 
F
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
L
 
A
E
 
R
E
 
M
K
 
R
Q
 
D
D
 
S
L
 
A
L
 
R
F
 
A
W
 
L
L
 
V
Q
 
K
D
 
E
I
 
V
K
 
Q
D
 
S
Q
 
R
F
 
L
G
 
G
V
 
V
T
 
T
L
 
L
L
 
L
I
 
V
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
P
R
 
A
V
 
D
V
 
I
M
 
F
E
 
A
I
 
I
S
 
A
D
 
D
K
 
R
V
 
V
M
 
G
V
 
V
L
 
L
N
 
V
Y
 
K
G
 
G
K
 
K
P
 
L
I
 
V
A
 
Q
Y
 
V
G
 
G
A
 
K
P
 
P
D
 
E
E
 
D
V
 
L
Q
 
Y
K
 
D
N
 
N
P
 
P

4u00A Crystal structure of ttha1159 in complex with adp (see paper)
32% identity, 92% coverage: 2:246/267 of query aligns to 1:227/241 of 4u00A

query
sites
4u00A
P
 
P
I
 
I
F
 
I
E
 
R
I
 
I
K
 
R
N
 
N
L
 
L
S
 
H
M
 
K
V
 
W
F
|
F
G
 
G
G
 
P
L
 
L
T
 
H
A
x
V
L
 
L
D
 
K
N
 
G
V
 
I
S
 
H
L
 
L
S
 
E
V
 
V
E
 
A
K
 
P
G
 
G
S
 
E
T
 
K
T
 
L
A
 
V
V
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
F
 
I
N
 
R
C
 
T
I
 
I
S
 
N
G
 
R
L
 
L
Y
 
E
K
 
D
P
 
F
S
 
Q
S
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
V
V
 
V
F
 
V
K
 
D
G
 
G
Q
 
L
R
 
S
L
 
V
T
 
K
D
 
D
K
 
D
K
 
R
P
 
A
H
 
L
Q
 
R
I
 
E
A
 
I
N
 
R
L
 
R
G
 
E
V
 
V
G
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
Q
I
 
F
E
 
N
L
 
L
F
 
F
N
 
P
N
 
H
M
 
M
T
 
T
T
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
V
M
 
T
L
 
L
G
 
A
R
 
-
H
 
P
M
 
M
H
 
R
M
 
V
K
 
R
T
 
-
G
 
-
L
 
-
W
 
-
A
 
-
S
 
-
C
 
-
T
 
R
W
 
W
W
 
P
R
 
R
R
 
E
G
 
K
S
 
A
K
 
E
A
 
K
C
 
K
R
 
A
L
 
L
E
 
E
I
 
L
D
 
L
H
 
E
R
 
R
A
 
V
R
 
G
V
 
I
E
 
-
R
 
-
I
 
-
I
 
-
D
 
-
F
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
L
Q
 
D
S
 
Q
A
 
A
R
 
R
N
 
-
R
 
K
F
 
Y
V
 
P
G
 
A
G
 
Q
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
T
 
Q
Q
 
Q
K
 
Q
V
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
M
E
 
E
P
 
P
E
 
K
L
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
V
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
N
 
D
L
 
P
E
 
E
E
 
M
K
 
V
Q
 
G
D
 
E
L
 
V
L
 
L
F
 
D
W
 
V
L
 
M
Q
 
R
D
 
D
I
 
L
K
 
A
D
 
-
Q
 
Q
F
 
G
G
 
G
V
 
M
T
 
T
L
 
M
L
 
V
I
 
V
I
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
R
 
G
V
 
F
V
 
A
M
 
R
E
 
E
I
 
V
S
 
A
D
 
D
K
 
R
V
 
V
M
 
V
V
 
F
L
 
M
N
 
D
Y
 
G
G
 
G
K
 
Q
P
 
I
I
 
V
A
 
E
Y
 
E
G
 
G
A
 
R
P
 
P
D
 
E
E
 
E
V
 
I
Q
 
F
K
 
T
N
 
R
P
 
P

1ji0A Crystal structure analysis of the abc transporter from thermotoga maritima
29% identity, 94% coverage: 3:254/267 of query aligns to 6:238/240 of 1ji0A

query
sites
1ji0A
I
 
V
F
 
L
E
 
E
I
 
V
K
 
Q
N
 
S
L
 
L
S
 
H
M
 
V
V
 
Y
F
x
Y
G
 
G
G
 
A
L
 
I
T
 
H
A
 
A
L
 
I
D
 
K
N
 
G
V
 
I
S
 
D
L
 
L
S
 
K
V
 
V
E
 
P
K
 
R
G
 
G
S
 
Q
T
 
I
T
 
V
A
 
T
V
 
L
I
 
I
G
 
G
P
 
A
N
 
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
T
F
 
L
N
 
S
C
 
A
I
 
I
S
 
A
G
 
G
L
 
L
Y
 
V
K
 
R
P
 
A
S
 
Q
S
 
K
G
 
G
E
 
K
V
 
I
V
 
I
F
 
F
K
 
N
G
 
G
Q
 
Q
R
 
D
L
 
I
T
 
T
D
 
N
K
 
K
K
 
P
P
 
A
H
 
H
Q
 
V
I
 
I
A
 
N
N
 
R
L
 
M
G
 
G
V
 
I
G
 
A
R
 
L
T
 
V
F
 
P
Q
x
E
N
 
G
I
 
R
E
 
R
L
 
I
F
 
F
N
 
P
N
 
E
M
 
L
T
 
T
T
 
V
L
 
Y
E
 
E
N
 
N
L
 
L
M
 
M
L
 
M
G
 
G
R
 
A
H
 
Y
M
 
N
H
 
R
M
 
K
-
 
D
K
 
K
T
 
E
G
 
G
L
 
I
W
 
K
A
 
R
S
 
D
C
 
L
T
 
E
W
 
W
W
 
-
R
 
-
R
 
-
G
 
-
S
 
-
K
 
-
A
 
-
C
 
-
R
 
-
L
 
-
E
 
-
I
 
-
D
 
-
H
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
V
 
-
E
 
-
R
 
-
I
 
I
I
 
F
D
 
S
F
 
L
L
 
F
D
 
P
L
 
R
Q
 
L
S
 
K
A
 
E
R
 
R
N
 
L
R
 
K
F
 
Q
V
 
L
G
 
G
G
 
G
-
 
T
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
T
 
E
Q
 
Q
K
 
Q
V
 
M
V
 
L
E
 
A
L
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
M
T
 
S
E
 
R
P
 
P
E
 
K
L
 
L
L
 
L
L
 
M
L
 
M
D
 
D
E
|
E
P
 
P
V
 
S
A
 
L
G
 
G
M
 
L
N
 
A
L
 
P
E
 
I
E
 
L
K
 
V
Q
 
S
D
 
E
L
 
V
L
 
F
F
 
E
W
 
V
L
 
I
Q
 
Q
D
 
K
I
 
I
K
 
-
D
 
N
Q
 
Q
F
 
E
G
 
G
V
 
T
T
 
T
L
 
I
L
 
L
I
 
L
I
 
V
E
 
E
H
 
Q
D
 
N
M
 
A
R
 
L
V
 
G
V
 
A
M
 
L
E
 
K
I
 
V
S
 
A
D
 
H
K
 
Y
V
 
G
M
 
Y
V
 
V
L
 
L
N
 
E
Y
 
T
G
 
G
K
 
Q
P
 
I
I
 
V
A
 
L
Y
 
E
G
 
G
A
 
K
P
 
A
D
 
S
E
 
E
V
 
L
Q
 
L
K
 
D
N
 
N
P
 
E
D
 
M
V
 
V
L
 
R
A
 
K
A
 
A
Y
 
Y
I
 
L
G
 
G

6mjpA Lptb(e163q)fgc from vibrio cholerae (see paper)
27% identity, 95% coverage: 3:256/267 of query aligns to 2:237/240 of 6mjpA

query
sites
6mjpA
I
 
I
F
 
L
E
 
K
I
 
A
K
 
Q
N
 
H
L
 
L
S
 
A
M
 
K
V
 
S
F
 
Y
G
 
K
G
 
K
L
 
R
T
 
K
A
 
V
L
 
V
D
 
S
N
 
D
V
 
V
S
 
S
L
 
L
S
 
Q
V
 
V
E
 
E
K
 
S
G
 
G
S
 
Q
T
 
I
T
 
V
A
 
G
V
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
L
 
S
F
 
F
N
 
Y
C
 
M
I
 
I
S
 
V
G
 
G
L
 
L
Y
 
V
K
 
A
P
 
R
S
 
D
S
 
E
G
 
G
E
 
T
V
 
I
V
 
T
F
 
I
K
 
D
G
 
D
Q
 
N
R
 
D
L
 
I
T
 
S
D
 
I
K
 
L
K
 
P
P
 
M
H
 
H
Q
 
S
I
 
R
A
 
S
N
 
R
L
 
M
G
 
G
V
 
I
G
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
 
Q
N
 
E
I
 
A
E
 
S
L
 
I
F
 
F
N
 
R
N
 
K
M
 
L
T
 
S
T
 
V
L
 
E
E
 
D
N
 
N
L
 
I
M
 
M
L
 
-
G
 
-
R
 
-
H
 
-
M
 
-
H
 
-
M
 
-
K
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
-
W
 
-
A
 
-
S
 
-
C
 
-
T
 
-
W
 
-
W
 
-
R
 
-
R
 
-
G
 
A
S
 
V
K
 
L
A
 
Q
C
 
T
R
 
R
L
 
E
E
 
E
I
 
L
D
 
T
H
 
H
R
x
E
A
 
E
R
 
R
V
 
Q
E
x
D
R
 
K
I
 
L
I
 
E
D
 
D
F
 
L
L
 
L
D
 
E
-
 
E
-
 
F
-
 
H
L
 
I
Q
 
Q
S
 
H
A
 
I
R
 
R
N
 
K
R
 
S
F
 
A
V
 
G
G
 
M
G
 
A
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
T
 
E
Q
 
R
K
 
R
V
 
R
V
 
V
E
 
E
L
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
A
E
 
N
P
 
P
E
 
Q
L
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
V
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
V
N
 
D
L
 
P
E
 
I
E
 
S
K
 
V
Q
 
I
D
 
D
L
 
I
L
 
K
F
 
K
W
 
I
L
 
I
Q
 
E
D
 
H
I
 
L
K
 
R
D
 
D
Q
 
R
F
 
-
G
 
G
V
 
L
T
 
G
L
 
V
L
 
L
I
 
I
I
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
M
 
V
R
 
R
V
 
E
V
 
T
M
 
L
E
 
D
I
 
V
S
 
C
D
 
E
K
 
K
V
 
A
M
 
Y
V
 
I
L
 
V
N
 
S
Y
 
Q
G
 
G
K
 
R
P
 
L
I
 
I
A
 
A
Y
 
E
G
 
G
A
 
T
P
 
P
D
 
Q
E
 
D
V
 
V
Q
 
L
K
 
N
N
 
N
P
 
E
D
 
Q
V
 
V
L
 
K
A
 
Q
A
 
V
Y
 
Y
I
 
L
G
 
G
D
 
E
E
 
Q

1g291 Malk (see paper)
30% identity, 91% coverage: 12:254/267 of query aligns to 12:241/372 of 1g291

query
sites
1g291
V
 
V
F
 
F
G
 
G
G
 
E
L
 
V
T
 
T
A
 
A
L
 
V
D
 
R
N
 
E
V
 
M
S
 
S
L
 
L
S
 
E
V
 
V
E
 
K
K
 
D
G
 
G
S
 
E
T
 
F
T
 
M
A
 
I
V
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
T
F
 
L
N
 
R
C
 
M
I
 
I
S
 
A
G
 
G
L
 
L
Y
 
E
K
 
E
P
 
P
S
 
S
S
 
R
G
 
G
E
 
Q
V
 
I
V
 
-
F
 
Y
K
 
I
G
 
G
Q
 
D
R
 
K
L
 
L
T
 
V
D
 
A
K
x
D
K
 
P
P
x
E
H
x
K
Q
 
G
I
 
I
-
 
F
-
 
V
-
 
P
-
 
P
A
x
K
N
x
D
L
 
R
G
 
D
V
 
I
G
 
A
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
S
I
 
Y
E
 
A
L
 
L
F
 
Y
N
 
P
N
 
H
M
 
M
T
 
T
T
 
V
L
 
Y
E
 
D
N
 
N
L
 
I
M
 
A
L
 
F
G
 
P
R
 
L
H
 
K
M
 
L
H
 
R
M
 
-
K
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
-
W
 
-
A
 
-
S
 
-
C
 
-
T
 
-
W
 
-
W
 
-
R
 
-
R
 
-
G
 
-
S
 
-
K
 
K
A
 
V
C
 
P
R
 
R
L
 
Q
E
 
E
I
 
I
D
 
D
H
 
Q
R
 
R
A
 
V
R
 
R
V
 
-
E
 
-
R
 
E
I
 
V
I
 
A
D
 
E
F
 
L
L
 
L
D
 
G
L
 
L
Q
 
T
S
 
E
A
 
L
R
 
L
N
 
N
R
 
R
F
 
K
V
 
P
G
 
R
G
 
E
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
T
 
Q
Q
 
R
K
 
Q
V
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
V
T
 
R
E
 
K
P
 
P
E
 
Q
L
 
V
L
 
F
L
 
L
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
V
 
L
A
 
S
G
 
N
M
 
L
N
 
D
L
 
A
E
 
K
E
 
L
K
 
R
Q
 
V
D
 
R
L
 
M
L
 
R
F
 
A
W
 
E
L
 
L
Q
 
K
D
 
K
I
 
L
K
 
Q
D
 
R
Q
 
Q
F
 
L
G
 
G
V
 
V
T
 
T
L
 
T
L
 
I
I
 
Y
I
 
V
E
 
T
H
 
H
D
 
D
M
 
Q
R
 
V
V
 
E
V
 
A
M
 
M
E
 
T
I
 
M
S
 
G
D
 
D
K
 
R
V
 
I
M
 
A
V
 
V
L
 
M
N
 
N
Y
 
R
G
 
G
K
 
V
P
 
L
I
 
Q
A
 
Q
Y
 
V
G
 
G
A
 
S
P
 
P
D
 
D
E
 
E
V
 
V
Q
 
Y
K
 
D
N
 
K
P
 
P
-
 
A
-
 
N
D
 
T
V
 
F
L
 
V
A
 
A
A
 
G
Y
 
F
I
 
I
G
 
G

Sites not aligning to the query:

4ymuJ Crystal structure of an amino acid abc transporter complex with arginines and atps (see paper)
30% identity, 86% coverage: 13:242/267 of query aligns to 11:223/240 of 4ymuJ

query
sites
4ymuJ
F
|
F
G
 
G
G
 
S
L
 
L
T
 
E
A
x
V
L
 
L
D
 
K
N
 
G
V
 
V
S
 
T
L
 
L
S
 
K
V
 
V
E
 
N
K
 
K
G
 
G
S
 
E
T
 
V
T
 
V
A
 
V
V
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
F
 
L
N
 
R
C
 
C
I
 
I
S
 
N
G
 
L
L
 
L
Y
 
E
K
 
E
P
 
P
S
 
T
S
 
K
G
 
G
E
 
E
V
 
V
V
 
F
F
 
I
K
 
D
G
 
G
Q
 
V
R
 
K
L
 
I
T
 
N
D
 
N
K
 
G
K
 
K
P
 
V
H
 
N
-
 
I
Q
 
N
I
 
K
A
 
V
N
 
R
L
 
Q
G
 
K
V
 
V
G
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
H
I
 
F
E
 
N
L
 
L
F
 
F
N
 
P
N
 
H
M
 
L
T
 
T
T
 
A
L
 
I
E
 
E
N
 
N
L
 
I
M
 
T
L
 
L
G
 
-
R
 
-
H
 
-
M
 
-
H
 
-
M
 
-
K
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
-
W
 
-
A
 
A
S
 
P
C
 
V
T
 
K
W
 
V
W
 
K
R
 
K
R
 
M
G
 
N
S
 
K
K
 
K
-
 
E
A
 
A
C
 
E
R
 
E
L
 
L
E
 
A
I
 
V
D
 
D
H
 
L
R
 
L
A
 
A
R
 
K
V
 
V
E
 
-
R
 
-
I
 
-
I
 
-
D
 
-
F
 
-
L
 
-
D
 
G
L
 
L
Q
 
L
S
 
D
A
 
K
R
 
K
N
 
D
R
 
Q
F
 
Y
V
 
P
G
 
I
G
 
K
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
T
 
Q
Q
 
K
K
 
Q
V
 
R
V
 
L
E
 
A
L
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
M
E
 
Q
P
 
P
E
 
E
L
 
V
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
|
E
P
 
P
V
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
N
 
D
L
 
P
E
 
E
E
 
M
K
 
V
Q
 
K
D
 
E
L
 
V
L
 
L
F
 
N
W
 
V
L
 
M
Q
 
K
D
 
Q
I
 
L
K
 
A
D
 
N
Q
 
E
F
 
-
G
 
G
V
 
M
T
 
T
L
 
M
L
 
V
I
 
V
I
 
V
E
 
T
H
|
H
D
 
E
M
 
M
R
 
G
V
 
F
V
 
A
M
 
R
E
 
E
I
 
V
S
 
G
D
 
D
K
 
R
V
 
V
M
 
I
V
 
F
L
 
M
N
 
D
Y
 
D
G
 
G
K
 
V
P
 
I
I
 
V
A
 
E
Y
 
E
G
 
G
A
 
T
P
 
P
D
 
E
E
 
E
V
 
I

P30750 Methionine import ATP-binding protein MetN; EC 7.4.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
30% identity, 91% coverage: 3:246/267 of query aligns to 1:232/343 of P30750

query
sites
P30750
I
 
M
F
 
I
E
 
K
I
 
L
K
 
S
N
 
N
L
 
I
S
 
T
M
 
K
V
 
V
F
 
F
G
 
H
-
 
Q
-
 
G
-
 
T
-
 
R
G
 
T
L
 
I
T
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
N
N
 
N
V
 
V
S
 
S
L
 
L
S
 
H
V
 
V
E
 
P
K
 
A
G
 
G
S
 
Q
T
 
I
T
 
Y
A
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
A
N
x
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
F
 
I
N
 
R
C
 
C
I
 
V
S
 
N
G
 
L
L
 
L
Y
 
E
K
 
R
P
 
P
S
 
T
S
 
E
G
 
G
E
 
S
V
 
V
V
 
L
F
 
V
K
 
D
G
 
G
Q
 
Q
R
 
E
L
 
L
T
 
T
D
 
T
K
 
L
K
 
S
P
 
E
H
 
S
Q
 
E
I
 
L
-
 
T
-
 
K
A
 
A
N
 
R
L
 
R
G
 
Q
V
 
I
G
 
G
R
 
M
T
 
I
F
 
F
Q
 
Q
N
 
H
I
 
F
E
 
N
L
 
L
F
 
L
N
 
S
N
 
S
M
 
R
T
 
T
T
 
V
L
 
F
E
 
-
N
 
-
L
 
-
M
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
H
 
-
M
 
-
H
 
-
M
 
-
K
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
-
W
 
-
A
 
-
S
 
-
C
 
-
T
 
-
W
 
-
W
 
-
R
 
-
R
 
-
G
 
G
S
 
N
K
 
V
A
 
A
C
 
L
R
 
P
L
 
L
E
 
E
I
 
L
D
 
D
H
 
N
-
 
T
-
 
P
-
 
K
-
 
D
-
 
E
-
 
V
R
 
K
A
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
T
R
 
E
I
 
L
I
 
L
D
 
S
F
 
L
L
 
V
D
 
G
L
 
L
Q
 
G
S
 
D
A
 
K
R
 
H
N
 
D
R
 
S
F
 
Y
V
 
P
G
 
S
G
 
N
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
T
 
Q
Q
 
K
K
 
Q
V
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
S
E
 
N
P
 
P
E
 
K
L
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
|
E
P
 
A
V
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
N
 
D
L
 
P
E
 
A
E
 
T
K
 
T
Q
 
R
D
 
S
L
 
I
L
 
L
F
 
E
W
 
L
L
 
L
Q
 
K
D
 
D
I
 
I
K
 
N
D
 
R
Q
 
R
F
 
L
G
 
G
V
 
L
T
 
T
L
 
I
L
 
L
I
 
L
I
 
I
E
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
R
 
D
V
 
V
V
 
V
M
 
K
E
 
R
I
 
I
S
 
C
D
 
D
K
 
C
V
 
V
M
 
A
V
 
V
L
 
I
N
 
S
Y
 
N
G
 
G
K
 
E
P
 
L
I
 
I
A
 
E
Y
 
Q
G
 
D
A
 
T
P
 
V
D
 
S
E
 
E
V
 
V
Q
 
F
K
 
S
N
 
H
P
 
P

Sites not aligning to the query:

6cvlD Crystal structure of the escherichia coli atpgs-bound metni methionine abc transporter in complex with its metq binding protein (see paper)
29% identity, 91% coverage: 3:246/267 of query aligns to 2:233/344 of 6cvlD

query
sites
6cvlD
I
 
M
F
 
I
E
 
K
I
 
L
K
 
S
N
 
N
L
 
I
S
 
T
M
 
K
V
 
V
F
|
F
G
 
H
-
x
Q
-
 
G
-
 
T
-
 
R
G
 
T
L
x
I
T
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
N
N
 
N
V
 
V
S
 
S
L
 
L
S
 
H
V
 
V
E
 
P
K
 
A
G
 
G
S
 
Q
T
 
I
T
 
Y
A
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
A
N
x
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
F
 
I
N
 
R
C
 
C
I
 
V
S
 
N
G
 
L
L
 
L
Y
 
E
K
 
R
P
 
P
S
 
T
S
 
E
G
 
G
E
 
S
V
 
V
V
 
L
F
 
V
K
 
D
G
 
G
Q
 
Q
R
 
E
L
 
L
T
 
T
D
 
T
K
 
L
K
 
S
P
 
E
H
 
S
Q
 
E
I
 
L
-
 
T
-
 
K
A
 
A
N
 
R
L
 
R
G
 
Q
V
 
I
G
 
G
R
 
M
T
 
I
F
 
F
Q
 
Q
N
 
H
I
 
F
E
 
N
L
 
L
F
 
L
N
 
S
N
 
S
M
 
R
T
 
T
T
 
V
L
 
F
E
 
G
N
 
N
L
 
V
M
 
A
L
 
L
G
 
P
R
 
-
H
 
-
M
 
-
H
 
-
M
 
-
K
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
-
W
 
-
A
 
-
S
 
-
C
 
-
T
 
-
W
 
-
W
 
-
R
 
-
R
 
-
G
 
-
S
 
-
K
 
-
A
 
-
C
 
-
R
 
-
L
 
L
E
 
E
I
 
L
D
 
D
H
 
N
-
 
T
-
 
P
-
 
K
-
 
D
-
 
E
-
 
V
R
 
K
A
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
T
R
 
E
I
 
L
I
 
L
D
 
S
F
 
L
L
 
V
D
 
G
L
 
L
Q
 
G
S
 
D
A
 
K
R
 
H
N
 
D
R
 
S
F
 
Y
V
 
P
G
 
S
G
x
N
L
 
L
P
x
S
Y
 
G
G
 
G
T
x
Q
Q
 
K
K
 
Q
V
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
S
E
 
N
P
 
P
E
 
K
L
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
V
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
N
 
D
L
 
P
E
 
A
E
 
T
K
 
T
Q
 
R
D
 
S
L
 
I
L
 
L
F
 
E
W
 
L
L
 
L
Q
 
K
D
 
D
I
 
I
K
 
N
D
 
R
Q
 
R
F
 
L
G
 
G
V
 
L
T
 
T
L
 
I
L
 
L
I
 
L
I
 
I
E
 
T
H
|
H
D
 
E
M
 
M
R
 
D
V
 
V
V
 
V
M
 
K
E
 
R
I
 
I
S
 
C
D
 
D
K
 
C
V
 
V
M
 
A
V
 
V
L
 
I
N
 
S
Y
 
N
G
 
G
K
 
E
P
 
L
I
 
I
A
 
E
Y
 
Q
G
 
D
A
 
T
P
 
V
D
 
S
E
 
E
V
 
V
Q
 
F
K
 
S
N
 
H
P
 
P

P04983 Ribose import ATP-binding protein RbsA; EC 7.5.2.7 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
28% identity, 87% coverage: 3:235/267 of query aligns to 4:221/501 of P04983

query
sites
P04983
I
 
L
F
 
L
E
 
Q
I
 
L
K
 
K
N
 
G
L
 
I
S
 
D
M
 
K
V
 
A
F
 
F
G
 
P
G
 
G
L
 
V
T
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
S
N
 
G
V
 
A
S
 
A
L
 
L
S
 
N
V
 
V
E
 
Y
K
 
P
G
 
G
S
 
R
T
 
V
T
 
M
A
 
A
V
 
L
I
 
V
G
 
G
P
 
E
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
|
K
T
 
S
T
 
T
L
 
M
F
 
M
N
 
K
C
 
V
I
 
L
S
 
T
G
 
G
L
 
I
Y
 
Y
K
 
T
P
 
R
S
 
D
S
 
A
G
 
G
E
 
T
V
 
L
V
 
L
F
 
W
K
 
L
G
 
G
Q
 
K
R
 
E
L
 
T
T
 
T
D
 
F
K
 
T
K
 
G
P
 
P
H
 
K
Q
 
S
I
 
S
A
 
Q
N
 
E
L
 
A
G
 
G
V
 
I
G
 
G
R
 
I
T
 
I
F
 
H
Q
 
Q
N
 
E
I
 
L
E
 
N
L
 
L
F
 
I
N
 
P
N
 
Q
M
 
L
T
 
T
T
 
I
L
 
A
E
 
E
N
 
N
L
 
I
M
 
F
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
E
M
 
F
H
 
V
M
 
N
K
 
R
T
 
F
G
 
G
L
 
K
W
 
I
A
 
D
S
 
W
C
 
K
T
 
T
W
 
M
W
 
Y
R
 
-
R
 
-
G
 
-
S
 
-
K
 
-
A
 
-
C
 
-
R
 
-
L
 
-
E
 
-
I
 
-
D
 
-
H
 
-
R
 
-
A
 
A
R
 
E
V
 
A
E
 
D
R
 
K
I
 
L
I
 
L
D
 
A
F
 
K
L
 
L
D
 
N
L
 
L
Q
 
R
S
 
F
A
 
K
R
 
S
N
 
D
R
 
K
F
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
D
L
 
L
P
 
S
Y
 
I
G
 
G
T
 
D
Q
 
Q
K
 
Q
V
 
M
V
 
V
E
 
E
L
 
I
G
 
A
R
 
K
A
 
V
L
 
L
A
 
S
T
 
F
E
 
E
P
 
S
E
 
K
L
 
V
L
 
I
L
 
I
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
V
 
T
A
 
D
G
 
A
M
 
L
N
 
T
L
 
D
E
 
T
E
 
E
K
 
T
Q
 
E
D
 
S
L
 
L
L
 
F
F
 
R
W
 
V
L
 
I
Q
 
R
D
 
E
I
 
L
K
 
K
D
 
S
Q
 
Q
F
 
-
G
 
G
V
 
R
T
 
G
L
 
I
L
 
V
I
 
Y
I
 
I
E
 
S
H
 
H
D
 
R
M
 
M
R
 
K
V
 
E
V
 
I
M
 
F
E
 
E
I
 
I
S
 
C
D
 
D
K
 
D
V
 
V
M
 
T
V
 
V
L
 
F
N
 
R
Y
 
D
G
 
G
K
 
Q
P
 
F
I
 
I
A
 
A

3tuzC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 semet soak crystal form (see paper)
29% identity, 91% coverage: 3:246/267 of query aligns to 2:233/344 of 3tuzC

query
sites
3tuzC
I
 
M
F
 
I
E
 
K
I
 
L
K
 
S
N
 
N
L
 
I
S
 
T
M
 
K
V
 
V
F
|
F
G
 
H
-
x
Q
-
 
G
-
 
T
-
 
R
G
 
T
L
 
I
T
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
N
N
 
N
V
 
V
S
 
S
L
 
L
S
 
H
V
 
V
E
 
P
K
 
A
G
 
G
S
 
Q
T
 
I
T
 
Y
A
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
A
N
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
F
 
I
N
 
R
C
 
C
I
 
V
S
 
N
G
 
L
L
 
L
Y
 
E
K
 
R
P
 
P
S
 
T
S
 
E
G
 
G
E
 
S
V
 
V
V
 
L
F
 
V
K
 
D
G
 
G
Q
 
Q
R
 
E
L
 
L
T
 
T
D
 
T
K
 
L
K
 
S
P
 
E
H
 
S
Q
 
E
I
 
L
-
 
T
-
 
K
A
 
A
N
 
R
L
 
R
G
 
Q
V
 
I
G
 
G
R
 
M
T
 
I
F
 
F
Q
 
Q
N
 
H
I
 
F
E
 
N
L
 
L
F
 
L
N
 
S
N
 
S
M
 
R
T
 
T
T
 
V
L
 
F
E
 
-
N
 
-
L
 
-
M
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
H
 
-
M
 
-
H
 
-
M
 
-
K
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
-
W
 
-
A
 
-
S
 
-
C
 
-
T
 
-
W
 
-
W
 
-
R
 
-
R
 
-
G
 
G
S
 
N
K
 
V
A
 
A
C
 
L
R
 
P
L
 
L
E
 
E
I
 
L
D
 
D
H
 
N
-
 
T
-
 
P
-
 
K
-
 
D
-
 
E
-
 
V
R
 
K
A
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
T
R
 
E
I
 
L
I
 
L
D
 
S
F
 
L
L
 
V
D
 
G
L
 
L
Q
 
G
S
 
D
A
 
K
R
 
H
N
 
D
R
 
S
F
 
Y
V
 
P
G
 
S
G
 
N
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
T
 
Q
Q
 
K
K
 
Q
V
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
S
E
 
N
P
 
P
E
 
K
L
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
V
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
N
 
D
L
 
P
E
 
A
E
 
T
K
 
T
Q
 
R
D
 
S
L
 
I
L
 
L
F
 
E
W
 
L
L
 
L
Q
 
K
D
 
D
I
 
I
K
 
N
D
 
R
Q
 
R
F
 
L
G
 
G
V
 
L
T
 
T
L
 
I
L
 
L
I
 
L
I
 
I
E
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
R
 
D
V
 
V
V
 
V
M
 
K
E
 
R
I
 
I
S
 
C
D
 
D
K
 
C
V
 
V
M
 
A
V
 
V
L
 
I
N
 
S
Y
 
N
G
 
G
K
 
E
P
 
L
I
 
I
A
 
E
Y
 
Q
G
 
D
A
 
T
P
 
V
D
 
S
E
 
E
V
 
V
Q
 
F
K
 
S
N
 
H
P
 
P

Sites not aligning to the query:

3tuiC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 native crystal form (see paper)
29% identity, 91% coverage: 3:246/267 of query aligns to 2:233/344 of 3tuiC

query
sites
3tuiC
I
 
M
F
 
I
E
 
K
I
 
L
K
 
S
N
 
N
L
 
I
S
 
T
M
 
K
V
 
V
F
|
F
G
 
H
-
 
Q
-
 
G
-
 
T
-
 
R
G
 
T
L
 
I
T
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
N
N
 
N
V
 
V
S
 
S
L
 
L
S
 
H
V
 
V
E
 
P
K
 
A
G
 
G
S
 
Q
T
 
I
T
 
Y
A
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
A
N
 
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
L
 
L
F
 
I
N
 
R
C
 
C
I
 
V
S
 
N
G
 
L
L
 
L
Y
 
E
K
 
R
P
 
P
S
 
T
S
 
E
G
 
G
E
 
S
V
 
V
V
 
L
F
 
V
K
 
D
G
 
G
Q
 
Q
R
 
E
L
 
L
T
 
T
D
 
T
K
 
L
K
 
S
P
 
E
H
 
S
Q
 
E
I
 
L
-
 
T
-
 
K
A
 
A
N
 
R
L
 
R
G
 
Q
V
 
I
G
 
G
R
 
M
T
 
I
F
 
F
Q
 
Q
N
 
H
I
 
F
E
 
N
L
 
L
F
 
L
N
 
S
N
 
S
M
 
R
T
 
T
T
 
V
L
 
F
E
 
-
N
 
-
L
 
-
M
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
H
 
-
M
 
-
H
 
-
M
 
-
K
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
-
W
 
-
A
 
-
S
 
-
C
 
-
T
 
-
W
 
-
W
 
-
R
 
-
R
 
-
G
 
G
S
 
N
K
 
V
A
 
A
C
 
L
R
 
P
L
 
L
E
 
E
I
 
L
D
 
D
H
 
N
-
 
T
-
 
P
-
 
K
-
 
D
-
 
E
-
 
V
R
 
K
A
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
T
R
 
E
I
 
L
I
 
L
D
 
S
F
 
L
L
 
V
D
 
G
L
 
L
Q
 
G
S
 
D
A
 
K
R
 
H
N
 
D
R
 
S
F
 
Y
V
 
P
G
 
S
G
 
N
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
T
 
Q
Q
 
K
K
 
Q
V
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
S
E
 
N
P
 
P
E
 
K
L
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
V
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
N
 
D
L
 
P
E
 
A
E
 
T
K
 
T
Q
 
R
D
 
S
L
 
I
L
 
L
F
 
E
W
 
L
L
 
L
Q
 
K
D
 
D
I
 
I
K
 
N
D
 
R
Q
 
R
F
 
L
G
 
G
V
 
L
T
 
T
L
 
I
L
 
L
I
 
L
I
 
I
E
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
R
 
D
V
 
V
V
 
V
M
 
K
E
 
R
I
 
I
S
 
C
D
 
D
K
 
C
V
 
V
M
 
A
V
 
V
L
 
I
N
 
S
Y
 
N
G
 
G
K
 
E
P
 
L
I
 
I
A
 
E
Y
 
Q
G
 
D
A
 
T
P
 
V
D
 
S
E
 
E
V
 
V
Q
 
F
K
 
S
N
 
H
P
 
P

7d0aB Acinetobacter mlafedb complex in adp-vanadate trapped vclose conformation (see paper)
29% identity, 90% coverage: 3:243/267 of query aligns to 4:229/263 of 7d0aB

query
sites
7d0aB
I
 
L
F
 
I
E
 
E
I
 
V
K
 
K
N
 
N
L
 
L
S
 
S
M
 
F
V
 
N
F
 
R
G
 
G
G
 
E
L
 
R
T
 
V
A
 
I
L
 
Y
D
 
D
N
 
N
V
 
I
S
 
S
L
 
L
S
 
N
V
 
I
E
 
R
K
 
R
G
 
G
S
 
Q
T
 
I
T
 
T
A
 
A
V
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
 
G
A
x
T
G
|
G
K
|
K
T
 
T
T
 
T
L
 
L
F
 
L
N
 
R
C
 
L
I
 
I
S
 
G
G
 
G
L
 
Q
Y
 
L
K
 
V
P
 
P
S
 
D
S
 
Q
G
 
G
E
 
E
V
 
V
V
 
L
F
 
L
K
 
D
G
 
G
Q
 
K
R
 
D
L
 
I
T
 
A
D
 
Q
K
 
M
K
 
S
P
 
R
H
 
Q
Q
 
E
I
 
L
-
 
F
-
 
A
A
 
A
N
 
R
L
 
A
G
 
R
V
 
M
G
 
G
R
 
M
T
 
L
F
 
F
Q
 
Q
N
 
S
I
 
G
E
 
A
L
 
L
F
 
F
N
 
T
N
 
D
M
 
M
T
 
S
T
 
V
L
 
Y
E
 
E
N
 
N
L
 
V
M
 
A
L
 
F
G
 
P
R
 
I
H
 
R
M
 
A
H
 
H
M
 
T
K
 
K
T
 
L
G
 
S
-
 
E
-
 
N
L
 
L
W
 
I
A
 
A
S
 
E
C
 
L
T
 
V
W
 
A
W
 
L
R
 
K
R
 
-
G
 
-
S
 
-
K
 
-
A
 
-
C
 
-
R
 
-
L
 
-
E
 
-
I
 
-
D
 
-
H
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
V
 
-
E
 
-
R
 
-
I
 
-
I
 
L
D
 
E
F
 
S
L
 
V
D
 
G
L
 
L
Q
 
R
S
 
G
A
 
T
R
 
E
N
 
Q
R
 
L
F
 
M
V
 
P
G
 
T
G
x
E
L
 
L
P
x
S
Y
 
G
G
 
G
T
x
M
Q
 
N
K
 
R
V
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
L
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
A
T
 
L
E
 
D
P
 
P
E
 
D
L
 
L
L
 
I
L
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
 
E
P
 
P
V
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
Q
N
 
D
L
 
P
E
 
I
E
 
V
K
 
K
Q
 
G
D
 
V
L
 
L
L
 
T
F
 
R
W
 
L
L
 
I
Q
 
R
D
 
S
I
 
L
K
 
R
D
 
E
Q
 
A
F
 
L
G
 
D
V
 
L
T
 
T
L
 
T
L
 
I
I
 
I
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
V
R
 
P
V
 
E
V
 
T
M
 
L
E
 
S
I
 
I
S
 
A
D
 
D
K
 
Y
V
 
I
M
 
Y
V
 
V
L
 
V
N
 
A
Y
 
E
G
 
G
K
 
K
P
 
I
I
 
Q
A
 
G
Y
 
E
G
 
G
A
 
T
P
 
P
D
 
E
E
 
E
V
 
L
Q
 
Q

7d08B Acinetobacter mlafedb complex in atp-bound vtrans1 conformation (see paper)
29% identity, 90% coverage: 3:243/267 of query aligns to 4:229/263 of 7d08B

query
sites
7d08B
I
 
L
F
 
I
E
 
E
I
 
V
K
 
K
N
 
N
L
 
L
S
 
S
M
 
F
V
 
N
F
x
R
G
 
G
G
 
E
L
x
R
T
 
V
A
 
I
L
 
Y
D
 
D
N
 
N
V
 
I
S
 
S
L
 
L
S
 
N
V
 
I
E
 
R
K
 
R
G
 
G
S
 
Q
T
 
I
T
 
T
A
 
A
V
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
|
G
A
x
T
G
 
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
L
F
 
L
N
 
R
C
 
L
I
 
I
S
 
G
G
 
G
L
 
Q
Y
 
L
K
 
V
P
 
P
S
 
D
S
 
Q
G
 
G
E
 
E
V
 
V
V
 
L
F
 
L
K
 
D
G
 
G
Q
 
K
R
 
D
L
 
I
T
 
A
D
 
Q
K
 
M
K
 
S
P
 
R
H
 
Q
Q
 
E
I
 
L
-
 
F
-
 
A
A
 
A
N
 
R
L
 
A
G
 
R
V
 
M
G
 
G
R
 
M
T
 
L
F
 
F
Q
 
Q
N
 
S
I
 
G
E
 
A
L
 
L
F
 
F
N
 
T
N
 
D
M
 
M
T
 
S
T
 
V
L
 
Y
E
 
E
N
 
N
L
 
V
M
 
A
L
 
F
G
 
P
R
 
I
H
 
R
M
 
A
H
 
H
M
 
T
K
 
K
T
 
L
G
 
S
-
 
E
-
 
N
L
 
L
W
 
I
A
 
A
S
 
E
C
 
L
T
 
V
W
 
A
W
 
L
R
 
K
R
 
-
G
 
-
S
 
-
K
 
-
A
 
-
C
 
-
R
 
-
L
 
-
E
 
-
I
 
-
D
 
-
H
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
V
 
-
E
 
-
R
 
-
I
 
-
I
 
L
D
 
E
F
 
S
L
 
V
D
 
G
L
 
L
Q
 
R
S
 
G
A
 
T
R
 
E
N
 
Q
R
 
L
F
 
M
V
 
P
G
 
T
G
 
E
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
T
 
M
Q
 
N
K
 
R
V
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
L
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
A
T
 
L
E
 
D
P
 
P
E
 
D
L
 
L
L
 
I
L
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
|
E
P
 
P
V
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
Q
N
 
D
L
 
P
E
 
I
E
 
V
K
 
K
Q
 
G
D
 
V
L
 
L
L
 
T
F
 
R
W
 
L
L
 
I
Q
 
R
D
 
S
I
 
L
K
 
R
D
 
E
Q
 
A
F
 
L
G
 
D
V
 
L
T
 
T
L
 
T
L
 
I
I
 
I
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
V
R
 
P
V
 
E
V
 
T
M
 
L
E
 
S
I
 
I
S
 
A
D
 
D
K
 
Y
V
 
I
M
 
Y
V
 
V
L
 
V
N
 
A
Y
 
E
G
 
G
K
 
K
P
 
I
I
 
Q
A
 
G
Y
 
E
G
 
G
A
 
T
P
 
P
D
 
E
E
 
E
V
 
L
Q
 
Q

6z5uK Cryo-em structure of the a. Baumannii mlabdef complex bound to appnhp (see paper)
29% identity, 90% coverage: 3:243/267 of query aligns to 2:227/253 of 6z5uK

query
sites
6z5uK
I
 
L
F
 
I
E
 
E
I
 
V
K
 
K
N
 
N
L
 
L
S
 
S
M
 
F
V
 
N
F
x
R
G
 
G
G
 
E
L
 
R
T
 
V
A
 
I
L
 
Y
D
 
D
N
 
N
V
 
I
S
 
S
L
 
L
S
 
N
V
 
I
E
 
R
K
 
R
G
 
G
S
 
Q
T
 
I
T
 
T
A
 
A
V
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
T
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
L
 
L
F
 
L
N
 
R
C
 
L
I
 
I
S
 
G
G
 
G
L
 
Q
Y
 
L
K
 
V
P
 
P
S
 
D
S
 
Q
G
 
G
E
 
E
V
 
V
V
 
L
F
 
L
K
 
D
G
 
G
Q
 
K
R
 
D
L
 
I
T
 
A
D
 
Q
K
 
M
K
 
S
P
 
R
H
 
Q
Q
 
E
I
 
L
-
 
F
-
 
A
A
 
A
N
 
R
L
 
A
G
 
R
V
 
M
G
 
G
R
 
M
T
 
L
F
 
F
Q
|
Q
N
 
S
I
 
G
E
 
A
L
 
L
F
 
F
N
 
T
N
 
D
M
 
M
T
 
S
T
 
V
L
 
Y
E
 
E
N
 
N
L
 
V
M
 
A
L
 
F
G
 
P
R
 
I
H
 
R
M
 
A
H
 
H
M
 
T
K
 
K
T
 
L
G
 
S
-
 
E
-
 
N
L
 
L
W
 
I
A
 
A
S
 
E
C
 
L
T
 
V
W
 
A
W
 
L
R
 
K
R
 
-
G
 
-
S
 
-
K
 
-
A
 
-
C
 
-
R
 
-
L
 
-
E
 
-
I
 
-
D
 
-
H
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
V
 
-
E
 
-
R
 
-
I
 
-
I
 
L
D
 
E
F
 
S
L
 
V
D
 
G
L
 
L
Q
 
R
S
 
G
A
 
T
R
 
E
N
 
Q
R
 
L
F
 
M
V
 
P
G
 
T
G
 
E
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
T
 
M
Q
 
N
K
 
R
V
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
L
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
A
T
 
L
E
 
D
P
 
P
E
 
D
L
 
L
L
 
I
L
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
|
E
P
 
P
V
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
Q
N
 
D
L
 
P
E
 
I
E
 
V
K
 
K
Q
 
G
D
 
V
L
 
L
L
 
T
F
 
R
W
 
L
L
 
I
Q
 
R
D
 
S
I
 
L
K
 
R
D
 
E
Q
 
A
F
 
L
G
 
D
V
 
L
T
 
T
L
 
T
L
 
I
I
 
I
I
 
V
E
 
S
H
|
H
D
 
D
M
 
V
R
 
P
V
 
E
V
 
T
M
 
L
E
 
S
I
 
I
S
 
A
D
 
D
K
 
Y
V
 
I
M
 
Y
V
 
V
L
 
V
N
 
A
Y
 
E
G
 
G
K
 
K
P
 
I
I
 
Q
A
 
G
Y
 
E
G
 
G
A
 
T
P
 
P
D
 
E
E
 
E
V
 
L
Q
 
Q

3d31A Modbc from methanosarcina acetivorans (see paper)
33% identity, 95% coverage: 3:256/267 of query aligns to 1:231/348 of 3d31A

query
sites
3d31A
I
 
M
F
 
I
E
 
E
I
 
I
K
 
E
N
 
S
L
 
L
S
 
S
M
 
R
V
 
K
F
 
W
G
 
K
G
 
N
L
 
F
T
 
S
A
 
-
L
 
L
D
 
D
N
 
N
V
 
L
S
 
S
L
 
L
S
 
K
V
 
V
E
 
E
K
 
S
G
 
G
S
 
E
T
 
Y
T
 
F
A
 
V
V
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
L
L
 
F
F
 
L
N
 
E
C
 
L
I
 
I
S
 
A
G
 
G
L
 
F
Y
 
H
K
 
V
P
 
P
S
 
D
S
 
S
G
 
G
E
 
R
V
 
I
V
 
L
F
 
L
K
 
D
G
 
G
Q
 
K
R
 
D
L
 
V
T
 
T
D
 
D
K
 
L
K
 
S
P
 
P
-
 
E
-
 
K
H
 
H
Q
 
D
I
 
I
A
 
A
N
 
F
L
 
V
G
 
-
V
 
-
G
 
-
R
 
-
T
 
-
F
 
Y
Q
 
Q
N
 
N
I
 
Y
E
 
S
L
 
L
F
 
F
N
 
P
N
 
H
M
 
M
T
 
N
T
 
V
L
 
K
E
 
K
N
 
N
L
 
L
M
 
E
L
 
F
G
 
G
R
 
-
H
 
-
M
 
M
H
 
R
M
 
M
K
 
K
T
 
-
G
 
-
L
 
-
W
 
-
A
 
-
S
 
K
C
 
I
T
 
K
W
 
D
W
 
P
R
 
K
R
 
R
G
 
V
S
 
L
K
 
D
A
 
T
C
 
A
R
 
R
-
 
D
L
 
L
E
 
K
I
 
I
D
 
E
H
 
H
R
 
-
A
 
-
R
 
-
V
 
-
E
 
-
R
 
-
I
 
-
I
 
-
D
 
-
F
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
-
Q
 
-
S
 
-
A
 
-
R
 
R
N
 
N
R
 
P
F
 
L
V
 
T
G
 
-
G
 
-
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
T
 
E
Q
 
Q
K
 
Q
V
 
R
V
 
V
E
 
A
L
 
L
G
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
V
T
 
T
E
 
N
P
 
P
E
 
K
L
 
I
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
V
 
L
A
 
S
G
 
A
M
 
L
N
 
D
L
 
P
E
 
R
E
 
T
K
 
Q
Q
 
E
D
 
N
L
 
A
L
 
R
F
 
E
W
 
M
L
 
L
Q
 
S
D
 
V
I
 
L
K
 
H
D
 
K
Q
 
K
F
 
N
G
 
K
V
 
L
T
 
T
L
 
V
L
 
L
I
 
H
I
 
I
E
 
T
H
 
H
D
 
D
M
 
Q
R
 
T
V
 
E
V
 
A
M
 
R
E
 
I
I
 
M
S
 
A
D
 
D
K
 
R
V
 
I
M
 
A
V
 
V
L
 
V
N
 
M
Y
 
D
G
 
G
K
 
K
P
 
L
I
 
I
A
 
Q
Y
 
V
G
 
G
A
 
K
P
 
P
D
 
E
E
 
E
V
 
I
Q
 
F
K
 
E
N
 
K
P
 
P
-
 
V
-
 
E
D
 
G
V
 
R
L
 
V
A
 
A
A
 
S
Y
 
F
I
 
V
G
 
G
D
 
F
E
 
E

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_013258530.1 NCBI__GCF_000143965.1:WP_013258530.1
MPIFEIKNLSMVFGGLTALDNVSLSVEKGSTTAVIGPNGAGKTTLFNCISGLYKPSSGEV
VFKGQRLTDKKPHQIANLGVGRTFQNIELFNNMTTLENLMLGRHMHMKTGLWASCTWWRR
GSKACRLEIDHRARVERIIDFLDLQSARNRFVGGLPYGTQKVVELGRALATEPELLLLDE
PVAGMNLEEKQDLLFWLQDIKDQFGVTLLIIEHDMRVVMEISDKVMVLNYGKPIAYGAPD
EVQKNPDVLAAYIGDEQAAAQAGGQHA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory