SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_013260052.1 NCBI__GCF_000143965.1:WP_013260052.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

8qhpA Cysteine tRNA ligase homodimer (see paper)
39% identity, 53% coverage: 309:719/775 of query aligns to 3:404/410 of 8qhpA

query
sites
8qhpA
L
 
L
K
 
K
F
 
V
F
 
Y
N
 
N
T
 
T
L
 
L
T
 
T
R
 
K
R
 
Q
I
 
K
D
 
E
E
 
E
L
 
F
R
 
K
P
 
P
V
 
L
R
 
R
P
 
E
G
 
G
R
 
E
V
 
V
G
 
K
I
 
M
Y
 
Y
A
 
V
C
|
C
G
 
G
P
 
P
S
 
T
L
 
V
D
 
Y
G
 
D
P
 
Y
P
 
P
D
 
H
L
 
L
G
 
G
L
 
H
C
 
A
R
 
R
R
 
T
M
 
Y
I
 
I
F
 
A
A
 
F
D
 
D
L
 
V
L
 
I
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
L
 
H
R
 
K
G
 
G
F
 
Y
E
 
T
V
 
V
K
 
L
L
 
M
V
 
V
V
 
M
N
 
N
I
 
F
A
 
T
D
 
D
I
 
I
D
 
D
D
 
D
R
 
K
T
 
I
V
 
I
N
 
K
Q
 
R
C
 
A
L
 
R
A
 
E
E
 
T
G
 
G
A
 
E
E
 
D
L
 
P
K
 
K
E
 
E
F
 
L
T
 
A
A
 
E
R
 
R
W
 
F
E
 
I
K
 
K
A
 
I
F
 
F
H
 
L
E
 
E
D
 
D
M
 
M
A
 
E
A
 
A
L
 
L
N
 
K
V
 
V
L
 
K
P
 
P
A
 
A
S
 
D
D
 
I
Y
 
Y
P
 
P
K
 
R
A
 
V
S
 
T
E
 
D
H
 
H
I
 
I
P
 
D
E
 
D
M
 
I
I
 
I
E
 
E
E
 
F
T
 
I
R
 
G
K
 
K
L
 
L
L
 
K
A
 
E
K
 
K
D
 
G
L
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
K
 
G
L
 
S
R
 
D
S
 
G
V
 
I
Y
 
Y
F
 
F
N
 
E
I
 
V
S
 
K
R
 
K
Y
 
F
P
 
P
N
 
E
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
K
L
 
L
S
 
S
H
 
G
V
 
V
D
 
K
L
 
I
N
 
E
A
 
D
I
 
L
Q
 
Q
K
 
G
G
 
-
K
 
-
T
 
-
V
 
-
D
 
-
F
 
-
D
 
-
Y
 
-
Y
 
-
E
 
-
K
 
K
E
 
K
N
 
N
P
 
P
S
 
E
D
 
D
F
 
F
T
 
A
L
 
L
F
 
W
K
 
K
R
 
K
A
 
A
S
 
K
L
 
P
Q
 
G
E
 
E
L
 
P
K
 
K
A
 
-
G
 
-
V
 
-
Y
 
-
W
 
W
P
 
D
T
 
S
P
 
P
W
 
W
G
 
G
N
 
E
C
 
G
R
 
R
P
 
P
G
 
G
W
 
W
H
 
H
V
 
I
E
 
E
C
|
C
A
 
S
C
 
V
M
 
M
S
 
S
A
 
S
G
 
K
H
 
Y
L
 
L
G
 
G
Q
 
E
P
 
S
F
 
F
D
 
D
I
 
I
H
 
H
L
 
G
A
 
G
S
 
G
S
 
N
D
 
D
L
 
L
I
 
I
F
 
F
P
 
P
H
|
H
G
 
H
D
 
E
N
 
N
E
|
E
I
 
I
A
 
A
I
 
Q
A
 
S
E
 
E
S
 
A
L
 
C
Y
 
F
G
 
G
K
 
H
P
 
E
L
 
W
A
 
V
N
 
K
L
 
Y
W
 
W
L
 
L
H
 
H
S
 
T
E
 
G
V
 
F
V
 
V
V
 
M
V
 
V
D
 
K
G
 
G
K
 
E
K
 
K
A
 
M
N
 
S
R
 
K
V
 
S
Q
 
L
G
 
G
N
 
N
D
 
F
V
 
V
S
 
T
L
 
I
R
 
R
E
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
K
Q
 
R
G
 
-
H
 
Y
S
 
E
P
 
P
Q
 
E
A
 
V
V
 
I
R
 
R
Y
 
F
W
 
F
M
 
V
L
 
L
S
 
Q
Q
 
K
H
 
H
Y
 
Y
R
 
R
R
 
S
A
 
P
L
 
L
R
 
E
F
 
Y
A
 
T
P
 
E
E
 
E
Q
 
G
L
 
L
D
 
Q
L
 
H
A
 
A
E
 
K
R
 
N
T
 
N
V
 
L
R
 
Q
R
 
R
L
 
L
N
 
Y
D
 
N
F
 
T
V
 
L
A
 
E
R
 
N
L
 
I
R
 
R
F
 
V
-
 
A
L
 
L
T
 
R
P
 
N
A
 
A
P
 
E
D
 
I
D
 
S
A
 
Y
Q
 
T
A
 
W
E
 
G
D
 
E
V
 
L
D
 
E
-
 
F
-
 
K
-
 
T
-
 
Y
Q
 
E
L
 
I
I
 
I
Y
 
R
E
 
E
T
 
G
R
 
K
Y
 
R
R
 
K
F
 
F
Q
 
Y
E
 
E
A
 
A
M
 
M
D
 
D
N
 
D
D
 
D
L
 
F
G
 
N
V
 
T
A
 
A
K
 
E
A
 
A
Q
 
L
G
 
K
H
 
A
I
 
V
F
 
F
A
 
E
F
 
V
I
 
A
K
 
N
A
 
A
I
 
I
N
 
N
R
 
K
-
 
Y
L
 
L
A
 
T
A
 
E
G
 
A
E
 
N
G
 
K
L
 
P
T
 
K
M
 
E
A
 
S
Q
 
I
I
 
L
Q
 
R
K
 
K
V
 
A
L
 
L
E
 
E
F
 
F
M
 
F
Q
 
K
R
 
I
L
 
V
D
 
S
S
 
E
V
 
V
L
 
F
G
 
G
V
 
V
M
 
F

Q06752 Cysteine--tRNA ligase; Cysteinyl-tRNA synthetase; CysRS; EC 6.1.1.16 from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
34% identity, 60% coverage: 309:775/775 of query aligns to 3:465/466 of Q06752

query
sites
Q06752
L
 
I
K
 
T
F
 
L
F
 
Y
N
 
N
T
 
T
L
 
L
T
 
T
R
 
R
R
 
Q
I
 
K
D
 
E
E
 
T
L
 
F
R
 
V
P
 
P
V
 
L
R
 
E
P
 
E
G
 
G
R
 
K
V
 
V
G
 
K
I
 
M
Y
 
Y
A
 
V
C
 
C
G
 
G
P
 
P
S
 
T
L
 
V
D
 
Y
G
 
N
P
 
Y
P
 
I
D
 
H
L
 
I
G
 
G
L
 
N
C
 
A
R
 
R
R
 
P
M
 
A
I
 
I
F
 
V
A
 
Y
D
 
D
L
 
T
L
 
V
R
 
R
R
 
N
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
L
 
Y
R
 
K
G
 
G
F
 
Y
E
 
D
V
 
V
K
 
Q
L
 
Y
V
 
V
V
 
S
N
 
N
I
 
F
A
 
T
D
 
D
I
 
V
D
 
D
D
 
D
R
 
K
T
 
L
V
 
I
N
 
K
Q
 
A
C
 
A
L
 
N
A
 
E
E
 
L
G
 
G
A
 
E
E
 
D
L
 
V
K
 
P
E
 
T
F
 
I
T
 
S
A
 
E
R
 
R
W
 
F
E
 
I
K
 
K
A
 
A
F
 
Y
H
 
F
E
 
E
D
 
D
M
 
V
A
 
G
A
 
A
L
 
L
N
 
G
V
 
C
L
 
R
P
 
K
A
 
A
S
 
D
D
 
L
Y
 
H
P
 
P
K
 
R
A
 
V
S
 
M
E
 
E
H
 
N
I
 
M
P
 
D
E
 
A
M
 
I
I
 
I
E
 
E
E
 
F
T
 
V
R
 
D
K
 
Q
L
 
L
L
 
V
A
 
K
K
 
K
D
 
G
L
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
K
 
S
L
 
E
R
 
G
S
 
D
V
 
V
Y
 
Y
F
 
F
N
 
K
I
 
T
S
 
R
R
 
A
Y
 
F
P
 
E
N
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
K
L
 
L
S
 
S
H
 
Q
V
 
Q
D
 
S
L
 
I
N
 
D
A
 
E
I
 
L
Q
 
R
K
 
S
G
 
G
K
 
A
T
 
R
V
 
I
D
 
R
F
 
V
D
 
G
Y
 
-
Y
 
E
E
 
K
K
 
K
E
 
E
N
 
D
P
 
A
S
 
L
D
 
D
F
 
F
T
 
A
L
 
L
F
 
W
K
 
K
R
 
A
A
 
A
S
 
K
L
 
E
Q
 
G
E
 
E
L
 
I
K
 
S
A
 
-
G
 
-
V
 
-
Y
 
-
W
 
W
P
 
D
T
 
S
P
 
P
W
 
W
G
 
G
N
 
K
C
 
G
R
 
R
P
 
P
G
 
G
W
 
W
H
 
H
V
 
I
E
 
E
C
 
C
A
 
S
C
 
A
M
 
M
S
 
V
A
 
K
G
 
K
H
 
Y
L
 
L
G
 
G
Q
 
D
P
 
Q
F
 
I
D
 
D
I
 
I
H
 
H
L
 
A
A
 
G
S
 
G
S
 
Q
D
 
D
L
 
L
I
 
T
F
 
F
P
 
P
H
 
H
G
 
H
D
 
E
N
 
N
E
 
E
I
 
I
A
 
A
I
 
Q
A
 
S
E
 
E
S
 
A
L
 
L
Y
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
T
L
 
F
A
 
A
N
 
K
L
 
Y
W
 
W
L
 
L
H
 
H
S
 
N
E
 
G
V
 
Y
V
 
I
V
 
N
V
 
I
D
 
D
G
 
N
K
 
E
K
 
K
A
 
M
N
 
S
R
 
K
V
x
S
Q
 
L
G
 
G
N
 
N
D
 
F
V
 
V
S
 
L
L
 
V
R
 
H
E
 
D
L
 
I
L
 
I
E
 
K
Q
 
Q
G
 
-
H
 
H
S
 
D
P
 
P
Q
 
Q
A
 
L
V
 
L
R
 
R
Y
 
F
W
 
F
M
 
M
L
 
L
S
 
S
Q
 
V
H
 
H
Y
 
Y
R
 
R
R
 
H
A
 
P
L
 
I
R
 
N
F
 
Y
A
 
S
P
 
E
E
 
E
Q
 
L
L
 
L
D
 
E
L
 
N
A
 
T
E
 
K
R
 
S
T
 
A
V
 
F
R
 
S
R
 
R
L
 
L
N
 
K
D
 
T
F
 
A
V
 
Y
A
 
S
R
 
N
L
 
L
R
 
Q
F
 
H
L
 
R
T
 
L
P
 
N
A
 
S
P
 
S
D
 
T
D
 
N
A
 
L
Q
 
-
A
 
T
E
 
E
D
 
D
V
 
D
D
 
D
Q
 
Q
L
 
W
-
 
L
-
 
E
-
 
K
I
 
V
Y
 
E
E
 
E
T
 
H
R
 
R
Y
 
K
R
 
A
F
 
F
Q
 
E
E
 
E
A
 
E
M
 
M
D
 
D
N
 
D
D
 
D
L
 
F
G
 
N
V
 
T
A
 
A
K
 
N
A
 
A
Q
 
I
G
 
S
H
 
V
I
 
L
F
 
F
A
 
D
F
 
L
I
 
A
K
 
K
A
 
H
I
 
A
N
 
N
R
 
Y
L
 
Y
A
 
L
A
 
Q
G
 
K
E
 
D
G
 
H
L
 
T
T
 
A
M
 
D
A
 
H
Q
 
V
I
 
I
Q
 
T
K
 
A
V
 
F
L
 
I
E
 
E
F
 
M
M
 
F
Q
 
D
R
 
R
L
 
I
D
 
V
S
 
S
V
 
V
L
 
L
G
 
G
V
 
F
M
 
S
N
 
L
F
 
G
D
 
E
G
 
Q
S
 
E
S
 
L
W
 
L
D
 
D
P
 
Q
A
 
E
I
 
I
E
 
E
E
 
D
L
 
L
V
 
I
Q
 
E
K
 
K
R
 
R
E
 
N
Q
 
E
A
 
A
R
 
R
A
 
R
D
 
N
G
 
R
D
 
D
F
 
F
A
 
A
L
 
L
A
 
S
D
 
D
R
 
Q
L
 
I
R
 
R
E
 
D
Q
 
Q
L
 
L
A
 
K
E
 
S
M
 
M
G
 
N
V
 
I
Q
 
I
V
 
L
A
 
E
D
 
D
T
 
T
P
 
A
S
 
Q
G
 
G
A
 
T
R
 
R
W
 
W
H
 
K
R
 
R
A
 
G

1u0bB Crystal structure of cysteinyl-tRNA synthetase binary complex with trnacys (see paper)
36% identity, 60% coverage: 309:774/775 of query aligns to 2:460/461 of 1u0bB

query
sites
1u0bB
L
 
L
K
 
K
F
 
I
F
 
F
N
 
N
T
 
T
L
 
L
T
 
T
R
|
R
R
 
Q
I
 
K
D
 
E
E
 
E
L
 
F
R
 
K
P
 
P
V
 
I
R
 
H
P
 
A
G
 
G
R
 
E
V
 
V
G
 
G
I
 
M
Y
 
Y
A
 
V
C
|
C
G
 
G
P
 
I
S
 
T
L
 
V
D
 
Y
G
 
D
P
 
L
P
 
C
D
x
H
L
 
I
G
|
G
L
x
H
C
 
G
R
 
R
R
x
T
M
 
F
I
 
V
F
 
A
A
 
F
D
 
D
L
 
V
L
 
V
R
 
A
R
 
R
Y
 
Y
L
 
L
E
 
R
L
 
F
R
 
L
G
 
G
F
 
Y
E
 
K
V
 
L
K
 
K
L
 
Y
V
 
V
V
 
R
N
 
N
I
 
I
A
 
T
D
 
D
I
 
I
D
 
D
D
 
D
R
 
K
T
 
I
V
 
I
N
 
K
Q
 
R
C
 
A
L
 
N
A
 
E
E
 
N
G
 
G
A
 
E
E
 
S
L
 
F
K
 
V
E
 
A
F
 
M
T
 
V
A
 
D
R
 
R
W
 
M
E
 
I
K
 
A
A
 
E
F
 
M
H
 
H
E
 
K
D
 
D
M
 
F
A
 
D
A
 
A
L
 
L
N
 
N
V
 
I
L
 
L
P
 
R
A
 
P
S
 
D
D
 
M
Y
 
E
P
 
P
K
 
R
A
 
A
S
 
T
E
 
H
H
 
H
I
 
I
P
 
A
E
 
E
M
 
I
I
 
I
E
 
E
E
 
L
T
 
T
R
 
E
K
 
Q
L
 
L
L
 
I
A
 
A
K
 
K
D
 
G
L
 
H
A
 
A
Y
 
Y
E
 
V
K
 
A
L
 
D
R
 
N
-
 
G
S
 
D
V
 
V
Y
 
M
F
 
F
N
 
D
I
 
V
S
 
P
R
 
T
Y
 
D
P
 
P
N
 
T
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
V
L
 
L
S
 
S
H
 
R
V
x
Q
D
 
D
L
 
L
N
 
D
A
 
Q
I
 
L
Q
 
Q
K
 
A
G
|
G
K
x
A
T
x
R
V
 
V
D
 
D
F
 
V
D
 
-
Y
 
V
Y
 
D
E
 
D
K
 
K
E
 
R
N
 
N
P
 
P
S
 
M
D
 
D
F
 
F
T
 
V
L
 
L
F
 
W
K
 
K
R
 
M
A
 
S
S
 
K
L
 
E
Q
 
G
E
 
E
L
 
P
K
 
S
A
 
-
G
 
-
V
 
-
Y
 
-
W
 
W
P
 
P
T
 
S
P
 
P
W
 
W
G
 
G
N
 
A
C
 
G
R
 
R
P
 
P
G
 
G
W
|
W
H
 
H
V
 
I
E
 
E
C
|
C
A
 
S
C
 
A
M
 
M
S
 
N
A
 
C
G
 
K
H
 
Q
L
 
L
G
 
G
Q
 
N
P
 
H
F
 
F
D
 
D
I
 
I
H
 
H
L
 
G
A
 
G
S
x
G
S
 
S
D
 
D
L
|
L
I
 
M
F
|
F
P
 
P
H
|
H
G
 
H
D
 
E
N
 
N
E
|
E
I
 
I
A
 
A
I
 
Q
A
 
S
E
 
T
S
 
C
L
 
A
Y
 
H
G
 
D
K
 
G
P
 
Q
L
 
Y
A
 
V
N
 
N
L
 
Y
W
 
W
L
 
M
H
 
H
S
 
S
E
 
G
V
x
M
V
|
V
V
x
M
V
 
V
D
 
D
G
 
R
K
 
E
K
 
K
A
x
M
N
 
S
R
 
K
V
 
S
Q
 
L
G
 
G
N
 
N
D
 
F
V
 
F
S
 
T
L
 
V
R
 
R
E
 
D
L
 
V
L
 
L
E
 
K
Q
 
Y
G
 
-
H
 
Y
S
 
D
P
 
A
Q
 
E
A
 
T
V
 
V
R
 
R
Y
 
Y
W
 
F
M
 
L
L
 
M
S
 
S
Q
x
G
H
|
H
Y
 
Y
R
 
R
R
 
S
A
x
Q
L
 
L
R
 
N
F
 
Y
A
 
S
P
 
E
E
 
E
Q
 
N
L
 
L
D
 
K
L
x
Q
A
 
A
E
 
R
R
 
A
T
x
A
V
 
L
R
 
E
R
|
R
L
 
L
N
 
Y
D
x
T
F
 
A
V
 
L
A
 
-
R
 
R
L
 
G
R
 
T
F
 
D
L
 
K
T
 
T
P
 
V
A
 
A
P
 
P
D
 
A
D
 
G
A
 
G
Q
 
E
A
 
A
E
 
F
D
 
E
V
 
A
D
 
-
Q
 
-
L
 
-
I
 
-
Y
 
-
E
 
-
T
 
-
R
 
-
Y
 
-
R
 
R
F
 
F
Q
 
I
E
 
E
A
 
A
M
 
M
D
 
D
N
 
D
D
 
D
L
 
F
G
x
N
V
 
T
A
x
P
K
x
E
A
 
A
Q
 
Y
G
x
S
H
 
V
I
 
L
F
|
F
A
 
D
F
 
M
I
 
A
K
x
R
A
 
E
I
 
V
N
|
N
R
 
R
L
 
L
A
 
K
A
 
A
G
 
E
E
 
D
G
 
-
L
 
-
T
 
-
M
 
M
A
 
A
Q
 
A
I
 
A
Q
 
N
K
 
A
V
 
M
L
 
A
E
 
S
F
 
H
M
 
L
Q
 
R
R
 
K
L
 
L
D
 
S
S
 
A
V
 
V
L
 
L
G
 
G
V
 
L
M
 
L
N
 
E
F
 
Q
D
 
E
-
 
P
-
 
E
-
 
A
-
 
F
-
 
L
-
 
Q
-
 
S
G
 
G
S
 
A
S
 
Q
W
 
A
D
 
D
P
 
D
A
 
S
-
 
E
-
 
V
-
 
A
-
 
E
I
 
I
E
 
E
E
 
A
L
 
L
V
 
I
Q
 
Q
K
 
Q
R
 
R
E
 
L
Q
 
D
A
 
A
R
|
R
A
 
K
D
 
A
G
 
K
D
 
D
F
x
W
A
 
A
L
 
A
A
 
A
D
|
D
R
 
A
L
 
A
R
|
R
E
 
D
Q
 
R
L
 
L
A
 
N
E
 
E
M
 
M
G
 
G
V
 
I
Q
 
V
V
x
L
A
x
E
D
|
D
T
 
G
P
 
P
S
 
Q
G
 
G
A
 
T
R
 
T
W
 
W
H
x
R
R
 
R

P21888 Cysteine--tRNA ligase; Cysteinyl-tRNA synthetase; CysRS; EC 6.1.1.16 from Escherichia coli (strain K12) (see 4 papers)
36% identity, 60% coverage: 309:774/775 of query aligns to 2:460/461 of P21888

query
sites
P21888
L
 
L
K
 
K
F
 
I
F
 
F
N
 
N
T
 
T
L
 
L
T
 
T
R
 
R
R
 
Q
I
 
K
D
 
E
E
 
E
L
 
F
R
 
K
P
 
P
V
 
I
R
 
H
P
 
A
G
 
G
R
 
E
V
 
V
G
 
G
I
 
M
Y
 
Y
A
 
V
C
|
C
G
|
G
P
 
I
S
 
T
L
 
V
D
 
Y
G
 
D
P
 
L
P
 
C
D
 
H
L
 
I
G
 
G
L
 
H
C
 
G
R
 
R
R
 
T
M
 
F
I
 
V
F
 
A
A
 
F
D
 
D
L
 
V
L
 
V
R
 
A
R
 
R
Y
 
Y
L
 
L
E
 
R
L
 
F
R
 
L
G
 
G
F
 
Y
E
 
K
V
 
L
K
 
K
L
 
Y
V
 
V
V
 
R
N
 
N
I
 
I
A
x
T
D
 
D
I
 
I
D
 
D
D
 
D
R
x
K
T
x
I
V
x
I
N
x
K
Q
 
R
C
 
A
L
 
N
A
 
E
E
 
N
G
 
G
A
 
E
E
 
S
L
 
F
K
 
V
E
 
A
F
 
M
T
 
V
A
 
D
R
 
R
W
 
M
E
 
I
K
 
A
A
 
E
F
 
M
H
 
H
E
 
K
D
 
D
M
 
F
A
 
D
A
 
A
L
 
L
N
 
N
V
 
I
L
 
L
P
 
R
A
 
P
S
 
D
D
 
M
Y
 
E
P
 
P
K
 
R
A
 
A
S
 
T
E
 
H
H
 
H
I
 
I
P
 
A
E
 
E
M
 
I
I
 
I
E
 
E
E
 
L
T
 
T
R
 
E
K
 
Q
L
 
L
L
 
I
A
 
A
K
 
K
D
 
G
L
 
H
A
 
A
Y
 
Y
E
 
V
K
 
A
L
 
D
R
 
N
-
 
G
S
 
D
V
 
V
Y
 
M
F
 
F
N
 
D
I
 
V
S
 
P
R
 
T
Y
 
D
P
 
P
N
 
T
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
V
L
 
L
S
 
S
H
 
R
V
 
Q
D
 
D
L
 
L
N
 
D
A
 
Q
I
 
L
Q
 
Q
K
 
A
G
 
G
K
 
A
T
 
R
V
 
V
D
 
D
F
 
V
D
 
-
Y
 
V
Y
 
D
E
 
D
K
 
K
E
 
R
N
 
N
P
 
P
S
 
M
D
 
D
F
 
F
T
 
V
L
 
L
F
 
W
K
 
K
R
 
M
A
 
S
S
 
K
L
 
E
Q
 
G
E
 
E
L
 
P
K
 
S
A
 
-
G
 
-
V
 
-
Y
 
-
W
 
W
P
 
P
T
 
S
P
 
P
W
 
W
G
 
G
N
 
A
C
 
G
R
 
R
P
 
P
G
 
G
W
|
W
H
 
H
V
 
I
E
 
E
C
|
C
A
 
S
C
 
A
M
 
M
S
 
N
A
 
C
G
 
K
H
 
Q
L
 
L
G
 
G
Q
 
N
P
 
H
F
 
F
D
 
D
I
 
I
H
 
H
L
 
G
A
 
G
S
 
G
S
 
S
D
 
D
L
 
L
I
 
M
F
 
F
P
 
P
H
|
H
G
 
H
D
 
E
N
 
N
E
|
E
I
 
I
A
 
A
I
 
Q
A
 
S
E
 
T
S
 
C
L
 
A
Y
 
H
G
 
D
K
 
G
P
 
Q
L
 
Y
A
 
V
N
 
N
L
 
Y
W
 
W
L
 
M
H
 
H
S
 
S
E
 
G
V
 
M
V
 
V
V
 
M
V
 
V
D
 
D
G
 
R
K
 
E
K
|
K
A
x
M
N
x
S
R
x
K
V
 
S
Q
 
L
G
 
G
N
 
N
D
 
F
V
 
F
S
 
T
L
 
V
R
 
R
E
 
D
L
 
V
L
 
L
E
 
K
Q
 
Y
G
 
-
H
 
Y
S
 
D
P
 
A
Q
 
E
A
 
T
V
 
V
R
 
R
Y
 
Y
W
 
F
M
 
L
L
 
M
S
 
S
Q
 
G
H
 
H
Y
 
Y
R
 
R
R
 
S
A
 
Q
L
 
L
R
 
N
F
 
Y
A
 
S
P
 
E
E
 
E
Q
 
N
L
 
L
D
 
K
L
 
Q
A
 
A
E
 
R
R
 
A
T
 
A
V
 
L
R
 
E
R
 
R
L
 
L
N
 
Y
D
 
T
F
 
A
V
 
L
A
 
-
R
 
R
L
 
G
R
 
T
F
 
D
L
 
K
T
 
T
P
 
V
A
 
A
P
 
P
D
 
A
D
 
G
A
 
G
Q
 
E
A
 
A
E
 
F
D
 
E
V
 
A
D
 
-
Q
 
-
L
 
-
I
 
-
Y
 
-
E
 
-
T
 
-
R
 
-
Y
 
-
R
 
R
F
 
F
Q
 
I
E
 
E
A
 
A
M
 
M
D
 
D
N
 
D
D
 
D
L
 
F
G
 
N
V
 
T
A
 
P
K
 
E
A
 
A
Q
 
Y
G
 
S
H
 
V
I
 
L
F
 
F
A
 
D
F
 
M
I
 
A
K
 
R
A
 
E
I
 
V
N
 
N
R
 
R
L
 
L
A
 
K
A
 
A
G
 
E
E
 
D
G
 
-
L
 
-
T
 
-
M
 
M
A
 
A
Q
 
A
I
 
A
Q
 
N
K
 
A
V
 
M
L
 
A
E
 
S
F
 
H
M
 
L
Q
 
R
R
 
K
L
 
L
D
 
S
S
 
A
V
 
V
L
 
L
G
 
G
V
 
L
M
 
L
N
 
E
F
 
Q
D
 
E
-
 
P
-
 
E
-
 
A
-
 
F
-
 
L
-
 
Q
-
 
S
G
 
G
S
 
A
S
 
Q
W
 
A
D
 
D
P
 
D
A
 
S
-
 
E
-
 
V
-
 
A
-
 
E
I
 
I
E
 
E
E
 
A
L
 
L
V
 
I
Q
 
Q
K
 
Q
R
 
R
E
 
L
Q
 
D
A
 
A
R
 
R
A
 
K
D
 
A
G
 
K
D
 
D
F
 
W
A
 
A
L
 
A
A
 
A
D
 
D
R
 
A
L
 
A
R
 
R
E
 
D
Q
 
R
L
 
L
A
 
N
E
 
E
M
 
M
G
 
G
V
 
I
Q
 
V
V
 
L
A
 
E
D
 
D
T
 
G
P
 
P
S
 
Q
G
 
G
A
 
T
R
 
T
W
 
W
H
 
R
R
 
R

1li7A Crystal structure of cysteinyl-tRNA synthetase with cysteine substrate bound (see paper)
35% identity, 53% coverage: 309:719/775 of query aligns to 2:378/386 of 1li7A

query
sites
1li7A
L
 
L
K
 
K
F
 
I
F
 
F
N
 
N
T
 
T
L
 
L
T
 
T
R
 
R
R
 
Q
I
 
K
D
 
E
E
 
E
L
 
F
R
 
K
P
 
P
V
 
I
R
 
H
P
 
A
G
 
G
R
 
E
V
 
V
G
 
G
I
 
M
Y
 
Y
A
 
V
C
|
C
G
|
G
P
x
I
S
x
T
L
 
V
D
 
Y
G
 
D
P
 
L
P
 
C
D
x
H
L
 
I
G
 
G
L
x
H
C
 
G
R
 
R
R
 
T
M
 
F
I
 
V
F
 
A
A
 
F
D
 
D
L
 
V
L
 
V
R
 
A
R
 
R
Y
 
Y
L
 
L
E
 
R
L
 
F
R
 
L
G
 
G
F
 
Y
E
 
K
V
 
L
K
 
K
L
 
Y
V
 
V
V
 
R
N
 
N
I
 
I
A
x
T
D
 
D
I
 
I
D
 
D
D
 
D
R
 
K
T
 
I
V
 
I
N
 
K
Q
 
R
C
 
A
L
 
N
A
 
E
E
 
N
G
 
G
A
 
E
E
 
S
L
 
F
K
 
V
E
 
A
F
 
M
T
 
V
A
 
D
R
 
R
W
 
M
E
 
I
K
 
A
A
 
E
F
 
M
H
 
H
E
 
K
D
 
D
M
 
F
A
 
D
A
 
A
L
 
L
N
 
N
V
 
I
L
 
L
P
 
R
A
 
P
S
 
D
D
 
M
Y
 
E
P
 
P
K
 
R
A
 
A
S
 
T
E
 
H
H
 
H
I
 
I
P
 
A
E
 
E
M
 
I
I
 
I
E
 
E
E
 
L
T
 
T
R
 
E
K
 
Q
L
 
L
L
 
I
A
 
A
K
 
K
D
 
G
L
 
H
A
 
A
Y
 
Y
E
 
V
K
 
A
L
 
D
R
 
N
-
 
G
S
 
D
V
 
V
Y
 
M
F
 
F
N
 
D
I
 
V
S
 
P
R
 
T
Y
 
D
P
 
P
N
 
T
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
V
L
 
L
S
 
S
H
 
R
V
 
-
D
 
-
L
 
-
N
 
-
A
 
-
I
 
-
Q
 
-
K
 
-
G
 
-
K
 
-
T
 
-
V
 
-
D
 
-
F
 
-
D
 
-
Y
 
-
Y
 
-
E
 
Q
K
 
K
E
 
R
N
 
N
P
 
P
S
 
M
D
 
D
F
 
F
T
 
V
L
 
L
F
 
W
K
 
K
R
 
M
A
 
S
S
 
K
L
 
E
Q
 
G
E
 
E
L
 
P
K
 
S
A
 
-
G
 
-
V
 
-
Y
 
-
W
 
W
P
 
P
T
 
S
P
 
P
W
 
W
G
 
G
N
 
A
C
 
G
R
 
R
P
 
P
G
 
G
W
|
W
H
 
H
V
 
I
E
 
E
C
|
C
A
 
S
C
 
A
M
 
M
S
 
N
A
 
C
G
 
K
H
 
Q
L
 
L
G
 
G
Q
 
N
P
 
H
F
 
F
D
 
D
I
 
I
H
 
H
L
 
G
A
 
G
S
 
G
S
 
S
D
 
D
L
|
L
I
 
M
F
 
F
P
 
P
H
|
H
G
 
H
D
 
E
N
 
N
E
 
E
I
 
I
A
 
A
I
 
Q
A
 
S
E
 
T
S
 
C
L
 
A
Y
 
H
G
 
D
K
 
G
P
 
Q
L
 
Y
A
 
V
N
 
N
L
 
Y
W
 
W
L
 
M
H
 
H
S
 
S
E
 
G
V
 
M
V
 
V
V
 
M
V
 
V
D
 
D
G
 
R
K
 
E
K
 
K
A
 
M
N
 
S
R
 
K
V
 
S
Q
 
L
G
 
G
N
 
N
D
 
F
V
 
F
S
 
T
L
 
V
R
 
R
E
 
D
L
 
V
L
 
L
E
 
K
Q
 
Y
G
 
-
H
 
Y
S
 
D
P
 
A
Q
 
E
A
 
T
V
 
V
R
 
R
Y
 
Y
W
 
F
M
 
L
L
 
M
S
 
S
Q
 
G
H
 
H
Y
 
Y
R
 
R
R
 
S
A
 
Q
L
 
L
R
 
N
F
 
Y
A
 
S
P
 
E
E
 
E
Q
 
N
L
 
L
D
 
K
L
 
Q
A
 
A
E
 
R
R
 
A
T
 
A
V
 
L
R
 
E
R
 
R
L
 
L
N
 
Y
D
 
T
F
 
A
V
 
L
A
 
-
R
 
R
L
 
G
R
 
T
F
 
D
L
 
K
T
 
T
P
 
V
A
 
A
P
 
P
D
 
A
D
 
G
A
 
G
Q
 
E
A
 
A
E
 
F
D
 
E
V
 
A
D
 
-
Q
 
-
L
 
-
I
 
-
Y
 
-
E
 
-
T
 
-
R
 
-
Y
 
-
R
 
R
F
 
F
Q
 
I
E
 
E
A
 
A
M
 
M
D
 
D
N
 
D
D
 
D
L
 
F
G
 
N
V
 
T
A
 
P
K
 
E
A
 
A
Q
 
Y
G
 
S
H
 
V
I
 
L
F
 
F
A
 
D
F
 
M
I
 
A
K
 
R
A
 
E
I
 
V
N
 
N
R
 
R
L
 
L
A
 
K
A
 
A
G
 
E
E
 
D
G
 
-
L
 
-
T
 
-
M
 
M
A
 
A
Q
 
A
I
 
A
Q
 
N
K
 
A
V
 
M
L
 
A
E
 
S
F
 
H
M
 
L
Q
 
R
R
 
K
L
 
L
D
 
S
S
 
A
V
 
V
L
 
L
G
 
G
V
 
L
M
 
L

2q3dA 2.2 a resolution crystal structure of o-acetylserine sulfhydrylase (oass) from mycobacterium tuberculosis in complex with the reaction intermediate alpha-aminoacrylate (see paper)
47% identity, 38% coverage: 3:300/775 of query aligns to 1:305/306 of 2q3dA

query
sites
2q3dA
L
 
M
R
 
S
M
 
I
V
 
A
D
 
E
N
 
D
V
 
I
L
 
T
E
 
Q
L
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
R
T
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
V
R
 
R
L
 
L
G
 
R
R
 
R
V
 
V
T
 
T
P
 
D
L
 
G
G
 
A
G
 
V
A
 
A
P
 
D
I
 
I
Y
 
V
A
 
A
K
 
K
L
 
L
E
 
E
Y
 
F
L
 
F
N
 
N
P
 
P
G
 
A
G
 
N
S
 
S
V
 
V
K
|
K
D
 
D
R
 
R
A
 
I
A
 
G
L
 
V
R
 
A
M
 
M
L
 
L
E
 
Q
A
 
A
A
 
A
E
 
E
V
 
Q
S
 
A
G
 
G
E
 
L
L
 
I
T
 
K
R
 
P
D
 
D
K
 
T
I
 
I
V
 
I
L
 
L
E
 
E
A
 
P
T
|
T
S
|
S
G
 
G
N
|
N
T
|
T
G
 
G
I
 
I
G
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
V
 
V
C
 
C
A
 
A
V
 
A
K
 
R
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
M
 
C
L
 
V
F
 
L
T
 
T
M
 
M
S
 
P
E
 
E
S
 
T
A
 
M
S
 
S
E
 
L
E
 
E
R
 
R
R
 
R
K
 
M
I
 
L
L
 
L
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
D
 
E
I
 
L
L
 
I
L
 
L
T
 
T
P
 
P
A
 
G
H
 
A
L
 
D
A
 
G
T
 
M
D
 
S
G
 
G
A
 
A
I
 
I
E
 
A
E
 
K
A
 
A
Y
 
E
R
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
T
E
 
D
P
 
-
E
 
Q
R
 
R
Y
 
Y
F
 
F
L
 
V
V
 
P
D
 
Q
Q
|
Q
F
 
F
N
 
E
N
 
N
Y
 
P
N
 
A
N
 
N
V
 
P
M
 
A
A
 
I
H
 
H
Y
 
-
Q
 
R
H
 
V
G
 
T
T
 
T
A
 
A
D
 
E
E
 
E
I
 
V
H
 
W
R
 
R
A
 
D
T
 
T
Q
 
D
G
 
G
R
 
K
A
 
V
R
 
D
V
 
I
V
 
V
V
 
V
A
 
A
T
 
G
L
x
V
G
|
G
T
|
T
S
x
G
G
 
G
T
|
T
A
 
I
M
 
T
G
 
G
L
 
V
A
 
A
K
 
Q
R
 
V
L
 
I
H
 
K
E
 
E
L
 
R
D
 
K
P
 
P
A
 
S
I
 
A
K
 
R
L
 
F
V
 
V
A
 
A
V
 
V
E
 
E
P
 
P
Y
 
A
Q
 
A
G
 
S
H
 
P
K
 
V
I
 
L
Q
 
S
G
 
G
-
 
G
-
 
Q
-
 
K
-
 
G
-
 
P
-
 
H
-
 
P
L
 
I
K
 
Q
N
x
G
M
x
I
K
 
G
E
 
A
S
 
G
L
 
F
R
 
V
P
 
P
G
 
P
I
 
V
F
 
L
D
 
D
P
 
Q
H
 
D
L
 
L
P
 
V
D
 
D
Q
 
E
I
 
I
V
 
I
N
 
T
V
 
V
D
 
G
D
 
N
D
 
E
A
 
D
A
 
A
Y
 
L
A
 
N
M
 
V
A
 
A
R
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
L
F
 
L
V
 
V
G
 
G
M
 
I
S
|
S
A
 
S
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
T
V
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
L
E
 
Q
Q
 
V
A
 
A
R
 
R
G
 
R
L
 
P
S
 
E
E
 
N
G
 
A
-
 
G
-
 
K
M
 
L
V
 
I
V
 
V
A
 
V
I
 
V
L
 
L
P
|
P
D
|
D
G
 
F
G
 
G
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
L
 
L
S
 
S
T
 
T
P
 
P
L
 
L
F
 
F

P9WP55 O-acetylserine sulfhydrylase; OAS sulfhydrylase; OASS; Cysteine synthase A; CSase A; O-acetylserine (thiol)-lyase A; OAS-TL A; O-acetylserine-specific cysteine synthase; Sulfide-dependent cysteine synthase; EC 2.5.1.47 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
47% identity, 38% coverage: 3:300/775 of query aligns to 1:305/310 of P9WP55

query
sites
P9WP55
L
 
M
R
 
S
M
 
I
V
 
A
D
 
E
N
 
D
V
 
I
L
 
T
E
 
Q
L
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
R
T
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
V
R
 
R
L
 
L
G
 
R
R
 
R
V
 
V
T
 
T
P
 
D
L
 
G
G
 
A
G
 
V
A
 
A
P
 
D
I
 
I
Y
 
V
A
 
A
K
 
K
L
 
L
E
 
E
Y
 
F
L
 
F
N
 
N
P
 
P
G
 
A
G
 
N
S
 
S
V
 
V
K
|
K
D
 
D
R
 
R
A
 
I
A
 
G
L
 
V
R
 
A
M
 
M
L
 
L
E
 
Q
A
 
A
A
 
A
E
 
E
V
 
Q
S
 
A
G
 
G
E
 
L
L
 
I
T
 
K
R
 
P
D
 
D
K
 
T
I
 
I
V
 
I
L
 
L
E
 
E
A
 
P
T
 
T
S
 
S
G
 
G
N
|
N
T
 
T
G
 
G
I
 
I
G
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
V
 
V
C
 
C
A
 
A
V
 
A
K
 
R
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
M
 
C
L
 
V
F
 
L
T
 
T
M
 
M
S
 
P
E
 
E
S
 
T
A
 
M
S
 
S
E
 
L
E
 
E
R
 
R
R
 
R
K
 
M
I
 
L
L
 
L
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
D
 
E
I
 
L
L
 
I
L
 
L
T
 
T
P
 
P
A
 
G
H
 
A
L
 
D
A
 
G
T
 
M
D
 
S
G
 
G
A
 
A
I
 
I
E
 
A
E
 
K
A
 
A
Y
 
E
R
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
T
E
 
D
P
 
-
E
 
Q
R
 
R
Y
 
Y
F
 
F
L
 
V
V
 
P
D
 
Q
Q
 
Q
F
 
F
N
 
E
N
 
N
Y
 
P
N
 
A
N
 
N
V
 
P
M
 
A
A
 
I
H
 
H
Y
 
-
Q
 
R
H
 
V
G
 
T
T
 
T
A
 
A
D
 
E
E
 
E
I
 
V
H
 
W
R
 
R
A
 
D
T
 
T
Q
 
D
G
 
G
R
 
K
A
 
V
R
 
D
V
 
I
V
 
V
V
 
V
A
 
A
T
 
G
L
 
V
G
|
G
T
|
T
S
x
G
G
|
G
T
|
T
A
 
I
M
 
T
G
 
G
L
 
V
A
 
A
K
 
Q
R
 
V
L
 
I
H
 
K
E
 
E
L
 
R
D
 
K
P
 
P
A
 
S
I
 
A
K
 
R
L
 
F
V
 
V
A
 
A
V
 
V
E
 
E
P
 
P
Y
 
A
Q
 
A
G
 
S
H
 
P
K
 
V
I
 
L
Q
 
S
G
 
G
-
 
G
-
 
Q
-
 
K
-
 
G
-
 
P
-
 
H
-
 
P
L
 
I
K
 
Q
N
 
G
M
 
I
K
 
G
E
 
A
S
 
G
L
 
F
R
 
V
P
 
P
G
 
P
I
 
V
F
 
L
D
 
D
P
 
Q
H
 
D
L
 
L
P
 
V
D
 
D
Q
 
E
I
 
I
V
 
I
N
 
T
V
 
V
D
 
G
D
 
N
D
 
E
A
 
D
A
 
A
Y
 
L
A
 
N
M
 
V
A
 
A
R
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
L
F
 
L
V
 
V
G
 
G
M
 
I
S
|
S
A
 
S
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
T
V
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
L
E
 
Q
Q
 
V
A
 
A
R
 
R
G
 
R
L
 
P
S
 
E
E
 
N
G
 
A
-
 
G
-
 
K
M
 
L
V
 
I
V
 
V
A
 
V
I
 
V
L
 
L
P
 
P
D
 
D
G
 
F
G
 
G
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
L
 
L
S
 
S
T
 
T
P
 
P
L
 
L
F
 
F

3tqoA Structure of the cysteinyl-tRNA synthetase (cyss) from coxiella burnetii. (see paper)
34% identity, 53% coverage: 309:721/775 of query aligns to 5:381/387 of 3tqoA

query
sites
3tqoA
L
 
V
K
 
K
F
 
I
F
 
F
N
 
N
T
 
S
L
 
L
T
 
T
R
 
K
R
 
Q
I
 
K
D
 
E
E
 
I
L
 
F
R
 
K
P
 
P
V
 
I
R
 
E
P
 
S
G
 
G
R
 
K
V
 
V
G
 
K
I
 
L
Y
 
Y
A
 
V
C
|
C
G
 
G
P
 
M
S
 
T
L
 
V
D
 
Y
G
 
D
P
 
Y
P
 
M
D
 
H
L
 
I
G
 
G
L
 
H
C
 
G
R
 
R
R
 
S
M
 
W
I
 
I
F
 
I
A
 
F
D
 
D
L
 
M
L
 
V
R
 
V
R
 
R
Y
 
Y
L
 
L
E
 
R
L
 
M
R
 
R
G
 
G
F
 
Y
E
 
E
V
 
V
K
 
T
L
 
F
V
 
V
V
 
R
N
 
N
I
 
I
A
 
T
D
 
D
I
 
I
D
 
D
D
 
D
R
 
K
T
 
I
V
 
I
N
 
K
Q
 
R
C
 
A
L
 
G
A
 
E
E
 
N
G
 
K
A
 
E
E
 
S
L
 
P
K
 
A
E
 
A
F
 
L
T
 
A
A
 
E
R
 
R
W
 
F
E
 
I
K
 
Q
A
 
I
F
 
L
H
 
H
E
 
E
D
 
D
M
 
E
A
 
K
A
 
A
L
 
L
N
 
R
V
 
V
L
 
L
P
 
S
A
 
P
S
 
D
D
 
Q
Y
 
E
P
 
P
K
 
R
A
 
A
S
 
T
E
 
Q
H
 
Y
I
 
V
P
 
P
E
 
E
M
 
I
I
 
I
E
 
K
E
 
L
T
 
I
R
 
Q
K
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
D
K
 
N
D
 
Q
L
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
E
 
T
K
 
G
L
 
Q
R
 
N
-
 
G
S
 
D
V
 
V
Y
 
F
F
 
F
N
 
D
I
 
V
S
 
R
R
 
R
Y
 
F
P
 
K
N
 
D
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
K
L
 
L
S
 
S
H
 
H
V
 
R
D
 
H
L
 
L
N
 
D
A
 
S
I
 
-
Q
 
-
K
 
-
G
 
-
K
 
-
T
 
-
V
 
-
D
 
-
F
 
-
D
 
-
Y
 
-
Y
 
-
E
 
-
K
 
K
E
 
R
N
 
D
P
 
P
S
 
L
D
 
D
F
 
F
T
 
V
L
 
L
F
 
W
K
 
K
R
 
K
A
 
A
S
 
K
L
 
P
Q
 
G
E
 
E
L
 
P
K
 
K
A
 
-
G
 
-
V
 
-
Y
 
-
W
 
W
P
 
D
T
 
S
P
 
P
W
 
W
G
 
G
N
 
E
C
 
G
R
 
R
P
 
P
G
 
G
W
 
W
H
 
H
V
 
I
E
 
E
C
|
C
A
 
S
C
 
A
M
 
M
S
 
S
A
 
S
G
 
S
H
 
I
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
F
 
F
D
 
D
I
 
I
H
 
H
L
 
G
A
 
G
S
 
G
S
 
L
D
 
D
L
 
L
I
 
K
F
 
F
P
 
P
H
|
H
G
 
H
D
 
E
N
 
N
E
 
E
I
 
I
A
 
A
I
 
Q
A
 
S
E
 
E
S
 
A
L
 
G
Y
 
E
G
 
E
K
 
K
P
 
P
L
 
F
A
 
V
N
 
K
L
 
L
W
 
W
L
 
M
H
 
H
S
 
A
E
 
G
V
 
L
V
 
L
V
 
E
V
 
I
D
 
N
G
 
K
K
 
E
K
 
K
A
 
M
N
 
S
R
 
K
V
 
S
Q
 
L
G
 
G
N
 
N
D
 
I
V
 
I
S
 
S
L
 
I
R
 
R
E
 
E
L
 
A
L
 
L
E
 
K
Q
 
E
G
 
S
H
 
-
S
 
D
P
 
V
Q
 
E
A
 
V
V
 
L
R
 
R
Y
 
Y
W
 
F
M
 
L
L
 
L
S
 
S
Q
 
G
H
 
H
Y
 
Y
R
 
R
R
 
N
A
 
P
L
 
L
R
 
S
F
 
Y
A
 
S
P
 
K
E
 
E
Q
 
N
L
 
L
D
 
E
L
 
N
A
 
G
E
 
R
R
 
L
T
 
A
V
 
L
R
 
E
R
 
R
L
 
-
N
 
-
D
 
-
F
 
F
V
 
Y
A
 
L
R
 
A
L
 
L
R
 
R
F
 
G
L
 
L
T
 
-
P
 
-
A
 
-
P
 
P
D
 
V
D
 
S
A
 
S
Q
 
Y
A
 
T
E
 
D
D
 
-
V
 
-
D
 
-
Q
 
-
L
 
-
I
 
-
Y
 
-
E
 
-
T
 
-
R
 
-
Y
 
-
R
 
R
F
 
F
Q
 
Y
E
 
E
A
 
A
M
 
M
D
 
D
N
 
D
D
 
D
L
 
F
G
 
N
V
 
T
A
 
P
K
 
I
A
 
A
Q
 
F
G
 
A
H
 
L
I
 
L
F
 
F
A
 
E
F
 
M
I
 
V
K
 
R
A
 
E
I
 
I
N
 
N
R
 
R
L
 
F
A
 
R
A
 
D
G
 
N
E
 
N
G
 
Q
L
 
I
T
 
E
M
 
K
A
 
A
Q
 
A
I
 
V
Q
 
-
K
 
-
V
 
L
L
 
A
E
 
A
F
 
E
M
 
L
Q
 
K
R
 
C
L
 
L
D
 
G
S
 
N
V
 
I
L
 
F
G
 
G
V
 
L
M
 
L
N
 
Q
F
 
Y

3zeiA Structure of the mycobacterium tuberculosis o-acetylserine sulfhydrylase (oass) cysk1 in complex with a small molecule inhibitor (see paper)
46% identity, 38% coverage: 3:295/775 of query aligns to 1:300/300 of 3zeiA

query
sites
3zeiA
L
 
M
R
 
S
M
 
I
V
 
A
D
 
E
N
 
D
V
 
I
L
 
T
E
 
Q
L
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
R
T
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
V
R
 
R
L
 
L
G
 
R
R
 
R
V
 
V
T
 
T
P
 
D
L
 
G
G
 
A
G
 
V
A
 
A
P
 
D
I
 
I
Y
 
V
A
 
A
K
 
K
L
 
L
E
 
E
Y
 
F
L
 
F
N
 
N
P
 
P
G
 
A
G
 
N
S
 
S
V
 
V
K
|
K
D
 
D
R
 
R
A
 
I
A
 
G
L
 
V
R
 
A
M
 
M
L
 
L
E
 
Q
A
 
A
A
 
A
E
 
E
V
 
Q
S
 
A
G
 
G
E
 
L
L
 
I
T
 
K
R
 
P
D
 
D
K
 
T
I
 
I
V
 
I
L
 
L
E
 
E
A
 
P
T
|
T
S
|
S
G
 
G
N
|
N
T
 
T
G
 
G
I
 
I
G
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
V
 
V
C
 
C
A
 
A
V
 
A
K
 
R
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
M
 
C
L
 
V
F
 
L
T
 
T
M
 
M
S
 
P
E
 
E
S
 
T
A
 
M
S
 
S
E
 
L
E
 
E
R
 
R
R
 
R
K
 
M
I
 
L
L
 
L
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
D
 
E
I
 
L
L
 
I
L
 
L
T
 
T
P
 
P
A
 
G
H
 
A
L
 
D
A
 
G
T
 
M
D
 
S
G
 
G
A
 
A
I
|
I
E
 
A
E
 
K
A
 
A
Y
 
E
R
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
T
E
 
D
P
 
-
E
 
Q
R
 
R
Y
 
Y
F
 
F
L
 
V
V
 
P
D
 
Q
Q
|
Q
F
|
F
N
 
E
N
 
N
Y
 
P
N
 
A
N
 
N
V
 
P
M
 
A
A
 
I
H
 
H
Y
 
-
Q
 
R
H
 
V
G
 
T
T
 
T
A
 
A
D
 
E
E
 
E
I
 
V
H
 
W
R
 
R
A
 
D
T
 
T
Q
 
D
G
 
G
R
 
K
A
 
V
R
 
D
V
 
I
V
 
V
V
 
V
A
 
A
T
 
G
L
x
V
G
|
G
T
|
T
S
x
G
G
 
G
T
|
T
A
 
I
M
 
T
G
 
G
L
 
V
A
 
A
K
 
Q
R
 
V
L
 
I
H
 
K
E
 
E
L
 
R
D
 
K
P
 
P
A
 
S
I
 
A
K
 
R
L
 
F
V
 
V
A
 
A
V
 
V
E
 
E
P
 
P
Y
 
A
Q
 
A
G
 
S
H
 
P
K
 
V
I
 
L
Q
 
S
G
 
G
-
 
G
-
 
Q
-
x
K
-
 
G
-
 
P
-
 
H
-
 
P
L
 
I
K
 
Q
N
x
G
M
 
I
K
 
G
E
x
A
S
 
G
L
x
F
R
 
V
P
 
P
G
 
P
I
 
V
F
 
L
D
 
D
P
 
Q
H
 
D
L
 
L
P
 
V
D
 
D
Q
 
E
I
 
I
V
 
I
N
 
T
V
 
V
D
 
G
D
 
N
D
 
E
A
 
D
A
 
A
Y
 
L
A
 
N
M
 
V
A
 
A
R
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
L
F
 
L
V
 
V
G
 
G
M
 
I
S
|
S
A
 
S
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
T
V
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
L
E
 
Q
Q
 
V
A
 
A
R
 
R
G
 
R
L
 
P
S
 
E
E
 
N
G
 
A
-
 
G
-
 
K
M
 
L
V
 
I
V
 
V
A
 
V
I
 
V
L
 
L
P
|
P
D
|
D
G
 
F
G
 
G
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
L
 
L

2q3cA 2.1 a resolution crystal structure of o-acetylserine sulfhydrylase (oass) holoenzyme from mycobacterium tuberculosis in complex with the inhibitory peptide dfsi (see paper)
46% identity, 38% coverage: 3:295/775 of query aligns to 1:300/300 of 2q3cA

query
sites
2q3cA
L
 
M
R
 
S
M
 
I
V
 
A
D
 
E
N
 
D
V
 
I
L
 
T
E
 
Q
L
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
R
T
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
V
R
 
R
L
 
L
G
 
R
R
 
R
V
 
V
T
 
T
P
 
D
L
 
G
G
 
A
G
 
V
A
 
A
P
 
D
I
 
I
Y
 
V
A
 
A
K
 
K
L
 
L
E
 
E
Y
 
F
L
 
F
N
 
N
P
 
P
G
 
A
G
 
N
S
 
S
V
 
V
K
|
K
D
 
D
R
 
R
A
 
I
A
 
G
L
 
V
R
 
A
M
 
M
L
 
L
E
 
Q
A
 
A
A
 
A
E
 
E
V
 
Q
S
 
A
G
 
G
E
 
L
L
 
I
T
 
K
R
 
P
D
 
D
K
 
T
I
 
I
V
 
I
L
 
L
E
 
E
A
 
P
T
|
T
S
|
S
G
|
G
N
 
N
T
|
T
G
 
G
I
 
I
G
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
V
 
V
C
 
C
A
 
A
V
 
A
K
 
R
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
M
 
C
L
 
V
F
 
L
T
 
T
M
 
M
S
 
P
E
 
E
S
 
T
A
 
M
S
 
S
E
 
L
E
 
E
R
 
R
R
 
R
K
 
M
I
 
L
L
 
L
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
D
 
E
I
 
L
L
 
I
L
 
L
T
 
T
P
 
P
A
 
G
H
 
A
L
 
D
A
 
G
T
x
M
D
 
S
G
 
G
A
 
A
I
 
I
E
 
A
E
 
K
A
 
A
Y
 
E
R
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
T
E
 
D
P
 
-
E
 
Q
R
 
R
Y
 
Y
F
 
F
L
 
V
V
 
P
D
 
Q
Q
|
Q
F
 
F
N
 
E
N
 
N
Y
 
P
N
 
A
N
 
N
V
 
P
M
 
A
A
 
I
H
 
H
Y
 
-
Q
 
R
H
 
V
G
 
T
T
 
T
A
 
A
D
 
E
E
 
E
I
 
V
H
 
W
R
 
R
A
 
D
T
 
T
Q
 
D
G
 
G
R
 
K
A
 
V
R
 
D
V
 
I
V
 
V
V
 
V
A
 
A
T
 
G
L
 
V
G
 
G
T
 
T
S
 
G
G
 
G
T
 
T
A
 
I
M
 
T
G
 
G
L
 
V
A
 
A
K
 
Q
R
 
V
L
 
I
H
 
K
E
 
E
L
 
R
D
 
K
P
 
P
A
 
S
I
 
A
K
 
R
L
 
F
V
 
V
A
 
A
V
 
V
E
 
E
P
 
P
Y
 
A
Q
 
A
G
 
S
H
 
P
K
 
V
I
 
L
Q
 
S
G
 
G
-
 
G
-
 
Q
-
x
K
-
 
G
-
 
P
-
 
H
-
 
P
L
 
I
K
 
Q
N
x
G
M
 
I
K
 
G
E
x
A
S
 
G
L
 
F
R
 
V
P
 
P
G
 
P
I
 
V
F
 
L
D
 
D
P
 
Q
H
 
D
L
 
L
P
 
V
D
 
D
Q
 
E
I
 
I
V
 
I
N
 
T
V
 
V
D
 
G
D
 
N
D
 
E
A
 
D
A
 
A
Y
 
L
A
 
N
M
 
V
A
 
A
R
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
L
F
 
L
V
 
V
G
 
G
M
 
I
S
|
S
A
 
S
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
T
V
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
L
E
 
Q
Q
 
V
A
 
A
R
 
R
G
 
R
L
 
P
S
 
E
E
 
N
G
 
A
-
 
G
-
 
K
M
 
L
V
 
I
V
 
V
A
 
V
I
 
V
L
 
L
P
|
P
D
 
D
G
 
F
G
 
G
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
L
 
L

1li7B Crystal structure of cysteinyl-tRNA synthetase with cysteine substrate bound (see paper)
35% identity, 53% coverage: 309:719/775 of query aligns to 2:367/375 of 1li7B

query
sites
1li7B
L
 
L
K
 
K
F
 
I
F
 
F
N
 
N
T
 
T
L
 
L
T
 
T
R
 
R
R
 
Q
I
 
K
D
 
E
E
 
E
L
 
F
R
 
K
P
 
P
V
 
I
R
 
H
P
 
A
G
 
G
R
 
E
V
 
V
G
 
G
I
 
M
Y
 
Y
A
 
V
C
|
C
G
|
G
P
x
I
S
x
T
L
 
V
D
 
Y
G
 
D
P
 
L
P
 
C
D
x
H
L
 
I
G
 
G
L
x
H
C
 
G
R
 
R
R
 
T
M
 
F
I
 
V
F
 
A
A
 
F
D
 
D
L
 
V
L
 
V
R
 
A
R
 
R
Y
 
Y
L
 
L
E
 
R
L
 
F
R
 
L
G
 
G
F
 
Y
E
 
K
V
 
L
K
 
K
L
 
Y
V
 
V
V
 
R
N
 
N
I
 
I
A
x
T
D
 
D
I
 
I
D
 
D
D
 
D
R
 
K
T
 
I
V
 
I
N
 
K
Q
 
R
C
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
-
K
 
E
E
 
S
F
 
F
T
 
V
A
 
A
-
 
M
-
 
V
-
 
D
R
 
R
W
 
M
E
 
I
K
 
A
A
 
E
F
 
M
H
 
H
E
 
K
D
 
D
M
 
F
A
 
D
A
 
A
L
 
L
N
 
N
V
 
I
L
 
L
P
 
R
A
 
P
S
 
D
D
 
M
Y
 
E
P
 
P
K
 
R
A
 
A
S
 
T
E
 
H
H
 
H
I
 
I
P
 
A
E
 
E
M
 
I
I
 
I
E
 
E
E
 
L
T
 
T
R
 
E
K
 
Q
L
 
L
L
 
I
A
 
A
K
 
K
D
 
G
L
 
H
A
 
A
Y
 
Y
E
 
V
K
 
A
L
 
D
R
 
N
-
 
G
S
 
D
V
 
V
Y
 
M
F
 
F
N
 
D
I
 
V
S
 
P
R
 
T
Y
 
D
P
 
P
N
 
T
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
V
L
 
L
S
 
S
H
 
-
V
 
-
D
 
-
L
 
-
N
 
-
A
 
-
I
 
-
Q
 
-
K
 
-
G
 
-
K
 
-
T
 
-
V
 
-
D
 
-
F
 
-
D
 
-
Y
 
-
Y
 
-
E
 
R
K
 
Q
E
 
R
N
 
N
P
 
P
S
 
M
D
 
D
F
 
F
T
 
V
L
 
L
F
 
W
K
 
K
R
 
M
A
 
S
S
 
K
L
 
E
Q
 
G
E
 
E
L
 
P
K
 
S
A
 
-
G
 
-
V
 
-
Y
 
-
W
 
W
P
 
P
T
 
S
P
 
P
W
 
W
G
 
G
N
 
A
C
 
G
R
 
R
P
 
P
G
 
G
W
|
W
H
 
H
V
 
I
E
 
E
C
|
C
A
 
S
C
 
A
M
 
M
S
 
N
A
 
C
G
 
K
H
 
Q
L
 
L
G
 
G
Q
 
N
P
 
H
F
 
F
D
 
D
I
 
I
H
 
H
L
 
G
A
 
G
S
 
G
S
 
S
D
 
D
L
 
L
I
 
M
F
 
F
P
 
P
H
|
H
G
 
H
D
 
E
N
 
N
E
 
E
I
 
I
A
 
A
I
 
Q
A
 
S
E
 
T
S
 
C
L
 
A
Y
 
H
G
 
D
K
 
G
P
 
Q
L
 
Y
A
 
V
N
 
N
L
 
Y
W
 
W
L
 
M
H
 
H
S
 
S
E
 
G
V
 
M
V
 
V
V
 
M
V
 
V
D
 
D
G
 
R
K
 
E
K
 
K
A
 
M
N
 
N
R
 
F
V
 
-
Q
 
-
G
 
-
N
 
-
D
 
-
V
 
F
S
 
T
L
 
V
R
 
R
E
 
D
L
 
V
L
 
L
E
 
K
Q
 
Y
G
 
-
H
 
Y
S
 
D
P
 
A
Q
 
E
A
 
T
V
 
V
R
 
R
Y
 
Y
W
 
F
M
 
L
L
 
M
S
 
S
Q
 
G
H
 
H
Y
 
Y
R
 
R
R
 
S
A
 
Q
L
 
L
R
 
N
F
 
Y
A
 
S
P
 
E
E
 
E
Q
 
N
L
 
L
D
 
K
L
 
Q
A
 
A
E
 
R
R
 
A
T
 
A
V
 
L
R
 
E
R
 
R
L
 
L
N
 
Y
D
 
T
F
 
-
V
 
A
A
 
L
R
 
R
L
 
G
R
 
T
F
 
D
L
 
K
T
 
T
P
 
V
A
 
A
P
 
P
D
 
A
D
 
G
A
 
G
Q
 
E
A
 
A
E
 
F
D
 
E
V
 
A
D
 
-
Q
 
-
L
 
-
I
 
-
Y
 
-
E
 
-
T
 
-
R
 
-
Y
 
-
R
 
R
F
 
F
Q
 
I
E
 
E
A
 
A
M
 
M
D
 
D
N
 
D
D
 
D
L
 
F
G
 
N
V
 
T
A
 
P
K
 
E
A
 
A
Q
 
Y
G
 
S
H
 
V
I
 
L
F
 
F
A
 
D
F
 
M
I
 
A
K
 
R
A
 
E
I
 
V
N
 
N
R
 
R
L
 
L
A
 
K
A
 
A
G
 
E
E
 
D
G
 
-
L
 
-
T
 
-
M
 
M
A
 
A
Q
 
A
I
 
A
Q
 
N
K
 
A
V
 
M
L
 
A
E
 
S
F
 
H
M
 
L
Q
 
R
R
 
K
L
 
L
D
 
S
S
 
A
V
 
V
L
 
L
G
 
G
V
 
L
M
 
L

P16703 Cysteine synthase B; CSase B; O-acetylserine (thiol)-lyase B; OAS-TL B; O-acetylserine sulfhydrylase B; EC 2.5.1.47 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
42% identity, 38% coverage: 11:303/775 of query aligns to 6:295/303 of P16703

query
sites
P16703
E
 
Q
L
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
N
T
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
V
R
 
K
L
 
L
G
 
Q
R
 
R
V
 
M
T
 
G
P
 
P
L
 
D
G
 
N
G
 
G
A
 
S
P
 
E
I
 
V
Y
 
W
A
 
L
K
 
K
L
 
L
E
 
E
Y
 
G
L
 
N
N
 
N
P
 
P
G
 
A
G
 
G
S
 
S
V
 
V
K
 
K
D
 
D
R
 
R
A
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
S
M
 
M
L
 
I
E
 
V
A
 
E
A
 
A
E
 
E
V
 
K
S
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
I
T
 
K
R
 
P
D
 
G
K
 
D
I
 
V
V
 
L
L
 
I
E
 
E
A
 
A
T
 
T
S
 
S
G
 
G
N
|
N
T
 
T
G
 
G
I
 
I
G
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
V
 
I
C
 
A
A
 
A
V
 
L
K
 
K
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
M
 
M
L
 
K
F
 
L
T
 
L
M
 
M
S
 
P
E
 
D
S
 
N
A
 
M
S
 
S
E
 
Q
E
 
E
R
 
R
R
 
R
K
 
A
I
 
A
L
 
M
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
D
 
E
I
 
L
L
 
I
L
 
L
T
 
V
P
 
T
A
 
K
H
 
E
L
 
Q
A
 
G
T
 
M
D
 
E
G
 
G
A
 
A
I
 
R
E
 
D
E
 
L
A
 
A
Y
 
L
R
 
E
L
 
M
A
 
A
R
 
N
E
 
R
E
 
G
P
 
E
E
 
G
R
 
K
Y
 
-
F
 
-
L
 
L
V
 
L
D
 
D
Q
 
Q
F
 
F
N
 
N
N
 
N
Y
 
P
N
 
D
N
 
N
V
 
P
M
 
Y
A
 
A
H
 
H
Y
 
Y
Q
 
T
H
 
T
G
 
-
T
 
T
A
 
G
D
 
P
E
 
E
I
 
I
H
 
W
R
 
Q
A
 
Q
T
 
T
Q
 
G
G
 
G
R
 
R
A
 
I
R
 
T
V
 
H
V
 
F
V
 
V
A
 
S
T
 
S
L
 
M
G
 
G
T
 
T
S
 
T
G
 
G
T
 
T
A
 
I
M
 
T
G
 
G
L
 
V
A
 
S
K
 
R
R
 
F
L
 
M
H
 
R
E
 
E
L
 
Q
D
 
S
P
 
K
A
 
P
I
 
V
K
 
T
L
 
I
V
 
V
A
 
G
V
 
L
E
 
Q
P
 
P
Y
 
E
Q
 
E
G
 
G
H
 
S
K
 
S
I
 
I
Q
 
P
G
 
G
L
 
I
K
 
R
N
 
R
M
 
W
K
 
P
E
 
T
S
 
E
L
 
Y
R
 
L
P
 
P
G
 
G
I
 
I
F
 
F
D
 
N
P
 
A
H
 
S
L
 
L
P
 
V
D
 
D
Q
 
E
I
 
V
V
 
L
N
 
D
V
 
I
D
 
H
D
 
Q
D
 
R
A
 
D
A
 
A
Y
 
E
A
 
N
M
 
T
A
 
M
R
 
R
R
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
V
E
 
R
E
 
E
G
 
G
I
 
I
F
 
F
V
 
C
G
 
G
M
 
V
S
|
S
A
 
S
G
 
G
A
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
A
A
 
G
A
 
A
V
 
L
E
 
R
Q
 
V
A
 
A
R
 
K
G
 
A
L
 
N
S
 
P
E
 
D
G
 
A
M
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
I
 
I
L
 
I
P
 
C
D
 
D
G
 
R
G
 
G
E
 
D
R
 
R
Y
 
Y
L
 
L
S
 
S
T
 
T
P
 
G
L
 
V
F
 
F
V
 
G
S
 
E
E
 
E

2bhtA Crystal structure of o-acetylserine sulfhydrylase b (see paper)
42% identity, 37% coverage: 11:300/775 of query aligns to 6:292/294 of 2bhtA

query
sites
2bhtA
E
 
Q
L
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
N
T
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
V
R
 
K
L
 
L
G
 
Q
R
 
R
V
 
M
T
 
G
P
 
P
L
 
D
G
 
N
G
 
G
A
 
S
P
 
E
I
 
V
Y
 
W
A
 
L
K
 
K
L
 
L
E
 
E
Y
 
G
L
 
N
N
 
N
P
 
P
G
 
A
G
 
G
S
 
S
V
 
V
K
|
K
D
 
D
R
 
R
A
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
S
M
 
M
L
 
I
E
 
V
A
 
E
A
 
A
E
 
E
V
 
K
S
 
R
G
 
G
E
 
R
L
 
I
T
 
K
R
 
P
D
 
G
K
 
D
I
 
V
V
 
L
L
 
I
E
 
E
A
 
A
T
 
T
S
|
S
G
 
G
N
|
N
T
 
T
G
 
G
I
 
I
G
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
V
 
I
C
 
A
A
 
A
V
 
L
K
 
K
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
M
 
M
L
 
K
F
 
L
T
 
L
M
 
M
S
 
P
E
 
D
S
 
N
A
 
M
S
 
S
E
 
Q
E
 
E
R
 
R
R
 
R
K
 
A
I
 
A
L
 
M
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
D
 
E
I
 
L
L
 
I
L
 
L
T
 
V
P
 
T
A
 
K
H
 
E
L
 
Q
A
 
G
T
 
M
D
 
E
G
 
G
A
 
A
I
 
R
E
 
D
E
 
L
A
 
A
Y
 
L
R
 
E
L
 
M
A
 
A
R
 
N
E
 
R
E
 
G
P
 
E
E
 
G
R
 
K
Y
 
-
F
 
-
L
 
L
V
 
L
D
 
D
Q
 
Q
F
 
F
N
 
N
N
 
N
Y
 
P
N
 
D
N
 
N
V
 
P
M
 
K
A
 
A
H
 
H
Y
 
Y
Q
 
T
H
 
T
G
 
-
T
 
T
A
 
G
D
 
P
E
 
E
I
 
I
H
 
W
R
 
Q
A
 
Q
T
 
T
Q
 
G
G
 
G
R
 
R
A
 
I
R
 
T
V
 
H
V
 
F
V
 
V
A
 
S
T
 
S
L
x
M
G
|
G
T
|
T
S
x
T
G
 
G
T
|
T
A
 
I
M
 
T
G
 
G
L
 
V
A
 
S
K
 
E
R
 
F
L
 
M
H
 
R
E
 
E
L
 
Q
D
 
S
P
 
K
A
 
P
I
 
V
K
 
T
L
 
I
V
 
V
A
 
G
V
 
L
E
x
Q
P
 
P
Y
 
E
Q
 
E
G
|
G
H
 
S
K
 
S
I
 
I
Q
 
P
G
|
G
L
 
I
K
 
R
N
 
R
M
 
W
K
 
P
E
 
T
S
 
E
L
 
Y
R
 
L
P
 
P
G
 
G
I
 
I
F
 
F
D
 
N
P
 
A
H
 
S
L
 
L
P
 
V
D
 
D
Q
 
E
I
 
V
V
 
L
N
 
D
V
 
I
D
 
H
D
 
Q
D
 
R
A
 
D
A
 
A
Y
 
E
A
 
N
M
 
T
A
 
M
R
 
R
R
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
V
E
 
R
E
 
E
G
 
G
I
 
I
F
 
F
V
 
C
G
 
G
M
 
V
S
|
S
A
 
S
G
 
G
A
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
A
A
 
G
A
 
A
V
 
L
E
 
R
Q
 
V
A
 
A
R
 
K
G
 
A
L
 
N
S
 
P
E
 
D
G
 
A
M
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
I
 
I
L
 
I
P
x
C
D
 
D
G
 
R
G
 
G
E
 
D
R
 
R
Y
 
Y
L
 
L
S
 
S
T
 
T
P
 
G
L
 
V
F
 
F

5xemA Crystal structure of a hydrogen sulfide-producing enzyme (fn1220) from fusobacterium nucleatum in complex with l-lanthionine-plp schiff base
41% identity, 38% coverage: 5:297/775 of query aligns to 2:302/302 of 5xemA

query
sites
5xemA
M
 
L
V
 
A
D
 
N
N
 
S
V
 
V
L
 
I
E
 
D
L
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
N
T
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
V
R
 
K
L
 
I
G
 
N
R
 
N
V
 
I
T
 
D
P
 
T
L
 
F
G
 
G
G
 
N
A
 
E
P
 
-
I
 
I
Y
 
Y
A
 
V
K
 
K
L
 
L
E
 
E
Y
 
G
L
 
S
N
 
N
P
 
P
G
 
G
G
 
R
S
 
S
V
 
T
K
|
K
D
 
D
R
 
R
A
 
I
A
 
A
L
 
L
R
 
K
M
 
M
L
 
I
E
 
E
A
 
E
A
 
A
E
 
E
V
 
K
S
 
E
G
 
G
E
 
L
L
 
I
T
 
D
R
 
K
D
 
D
K
 
T
I
 
V
V
 
I
L
 
I
E
 
E
A
 
A
T
|
T
S
|
S
G
 
G
N
|
N
T
|
T
G
 
G
I
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
M
 
M
V
 
I
C
 
C
A
 
A
V
 
V
K
 
K
G
 
N
Y
 
Y
R
 
K
M
 
L
L
 
K
F
 
I
T
 
V
M
 
M
S
 
P
E
 
D
S
 
T
A
 
M
S
 
S
E
 
I
E
 
E
R
 
R
R
 
I
K
 
Q
I
 
L
L
 
M
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
A
 
T
D
 
E
I
 
V
L
 
I
L
 
L
T
 
T
P
 
D
A
 
G
H
 
S
L
 
L
A
 
G
T
x
M
D
 
K
G
 
A
A
 
C
I
 
L
E
 
E
E
 
K
A
 
L
Y
 
E
R
 
E
L
 
L
A
 
K
R
 
K
E
 
N
E
 
E
P
 
-
E
 
K
R
 
K
Y
 
Y
F
 
F
L
 
V
V
 
P
D
 
N
Q
|
Q
F
 
F
N
 
T
N
 
N
Y
 
V
N
 
N
N
 
N
V
 
P
M
 
K
A
 
A
H
 
H
Y
 
Y
Q
 
E
H
 
T
G
 
-
T
 
T
A
 
A
D
 
E
E
 
E
I
 
I
H
 
L
R
 
K
A
 
D
T
 
L
Q
 
N
G
 
N
R
 
K
A
 
V
R
 
D
V
 
V
V
 
F
V
 
I
A
 
C
T
 
G
L
x
T
G
|
G
T
|
T
S
x
G
G
 
G
T
x
S
A
 
F
M
 
S
G
 
G
L
 
T
A
 
A
K
 
K
R
 
K
L
 
L
H
 
K
E
 
E
L
 
K
D
 
L
P
 
P
A
 
N
I
 
I
K
 
K
L
 
T
V
 
F
A
 
P
V
 
V
E
 
E
P
 
P
-
 
A
-
 
S
-
 
S
-
 
P
-
 
L
-
 
L
-
 
S
-
 
K
-
 
G
Y
 
Y
Q
 
I
G
 
G
-
 
P
H
 
H
K
 
K
I
 
I
Q
 
Q
G
|
G
L
x
M
K
 
-
N
x
G
M
 
M
K
x
S
E
 
I
S
 
G
L
 
G
R
 
I
P
 
P
G
 
A
I
 
V
F
 
Y
D
 
D
P
 
G
H
 
S
L
 
L
P
 
A
D
 
D
Q
 
D
I
 
I
V
 
L
N
 
V
V
 
C
D
 
E
D
 
D
D
 
D
A
 
D
A
 
A
Y
 
F
A
 
E
M
 
M
A
 
M
R
 
R
R
 
E
L
 
L
A
 
S
R
 
F
E
 
K
E
 
E
G
 
G
I
 
I
F
 
L
V
 
G
G
 
G
M
 
I
S
|
S
A
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
T
V
 
F
V
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
L
E
 
D
Q
 
Y
A
 
S
R
 
K
-
 
E
G
 
N
L
 
A
S
 
D
E
 
K
G
 
G
M
 
L
V
 
K
V
 
I
A
 
V
I
 
V
L
 
L
P
 
S
-
x
T
D
|
D
G
 
S
G
 
G
E
 
E
R
 
K
Y
 
Y
L
|
L
S
|
S
T
x
N

5xenA Crystal structure of a hydrogen sulfide-producing enzyme (fn1220) from fusobacterium nucleatum in complex with l-serine-plp schiff base
41% identity, 38% coverage: 5:295/775 of query aligns to 2:300/300 of 5xenA

query
sites
5xenA
M
 
L
V
 
A
D
 
N
N
 
S
V
 
V
L
 
I
E
 
D
L
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
N
T
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
V
R
 
K
L
 
I
G
 
N
R
 
N
V
 
I
T
 
D
P
 
T
L
 
F
G
 
G
G
 
N
A
 
E
P
 
-
I
 
I
Y
 
Y
A
 
V
K
 
K
L
 
L
E
 
E
Y
 
G
L
 
S
N
 
N
P
 
P
G
 
G
G
 
R
S
 
S
V
 
T
K
|
K
D
 
D
R
 
R
A
 
I
A
 
A
L
 
L
R
 
K
M
 
M
L
 
I
E
 
E
A
 
E
A
 
A
E
 
E
V
 
K
S
 
E
G
 
G
E
 
L
L
 
I
T
 
D
R
 
K
D
 
D
K
 
T
I
 
V
V
 
I
L
 
I
E
 
E
A
 
A
T
|
T
S
|
S
G
 
G
N
|
N
T
|
T
G
 
G
I
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
M
 
M
V
 
I
C
 
C
A
 
A
V
 
V
K
 
K
G
 
N
Y
 
Y
R
 
K
M
 
L
L
 
K
F
 
I
T
 
V
M
 
M
S
 
P
E
 
D
S
 
T
A
 
M
S
 
S
E
 
I
E
 
E
R
 
R
R
 
I
K
 
Q
I
 
L
L
 
M
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
A
 
T
D
 
E
I
 
V
L
 
I
L
 
L
T
 
T
P
 
D
A
 
G
H
 
S
L
 
L
A
 
G
T
 
M
D
 
K
G
 
A
A
 
C
I
 
L
E
 
E
E
 
K
A
 
L
Y
 
E
R
 
E
L
 
L
A
 
K
R
 
K
E
 
N
E
 
E
P
 
-
E
 
K
R
 
K
Y
 
Y
F
 
F
L
 
V
V
 
P
D
 
N
Q
|
Q
F
 
F
N
 
T
N
 
N
Y
 
V
N
 
N
N
 
N
V
 
P
M
 
K
A
 
A
H
 
H
Y
 
Y
Q
 
E
H
 
T
G
 
-
T
 
T
A
 
A
D
 
E
E
 
E
I
 
I
H
 
L
R
 
K
A
 
D
T
 
L
Q
 
N
G
 
N
R
 
K
A
 
V
R
 
D
V
 
V
V
 
F
V
 
I
A
 
C
T
 
G
L
x
T
G
|
G
T
|
T
S
x
G
G
 
G
T
x
S
A
 
F
M
 
S
G
 
G
L
 
T
A
 
A
K
 
K
R
 
K
L
 
L
H
 
K
E
 
E
L
 
K
D
 
L
P
 
P
A
 
N
I
 
I
K
 
K
L
 
T
V
 
F
A
 
P
V
 
V
E
 
E
P
 
P
-
 
A
-
 
S
-
 
S
-
 
P
-
 
L
-
 
L
-
 
S
-
 
K
-
 
G
Y
 
Y
Q
 
I
G
 
G
-
 
P
H
 
H
K
 
K
I
 
I
Q
 
Q
G
|
G
L
 
M
K
 
-
N
 
G
M
 
M
K
 
S
E
 
I
S
 
G
L
 
G
R
 
I
P
 
P
G
 
A
I
 
V
F
 
Y
D
 
D
P
 
G
H
 
S
L
 
L
P
 
A
D
 
D
Q
 
D
I
 
I
V
 
L
N
 
V
V
 
C
D
 
E
D
 
D
D
 
D
A
 
D
A
 
A
Y
 
F
A
 
E
M
 
M
A
 
M
R
 
R
R
 
E
L
 
L
A
 
S
R
 
F
E
 
K
E
 
E
G
 
G
I
 
I
F
 
L
V
 
G
G
 
G
M
 
I
S
|
S
A
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
T
V
 
F
V
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
L
E
 
D
Q
 
Y
A
 
S
R
 
K
-
 
E
G
 
N
L
 
A
S
 
D
E
 
K
G
 
G
M
 
L
V
 
K
V
 
I
A
 
V
I
 
V
L
 
L
P
 
S
-
x
T
D
|
D
G
 
S
G
 
G
E
 
E
R
 
K
Y
 
Y
L
 
L

2efyA Crystal structure of t.Th. Hb8 o-acetylserine sulfhydrylase complexed with 4-acetylbutyric acid
45% identity, 37% coverage: 13:300/775 of query aligns to 7:301/302 of 2efyA

query
sites
2efyA
I
 
I
G
 
G
E
 
K
T
 
T
P
 
P
L
 
V
V
 
V
R
 
R
L
 
L
G
 
A
R
 
K
V
 
V
T
 
V
P
 
E
L
 
P
G
 
D
G
 
M
A
 
A
P
 
E
I
 
V
Y
 
W
A
 
V
K
 
K
L
 
L
E
 
E
Y
 
G
L
 
L
N
 
N
P
 
P
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
I
K
|
K
D
 
D
R
 
R
A
 
P
A
 
A
L
 
W
R
 
Y
M
 
M
L
 
I
E
 
K
A
 
D
A
 
A
E
 
E
V
 
E
S
 
R
G
 
G
E
 
I
L
 
L
-
 
R
-
 
P
T
 
G
R
 
S
D
 
G
K
 
Q
I
 
V
V
 
I
L
 
V
E
 
E
A
 
P
T
|
T
S
|
S
G
|
G
N
|
N
T
|
T
G
 
G
I
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
M
 
M
V
 
I
C
 
A
A
 
A
V
 
S
K
 
R
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
M
 
L
L
 
I
F
 
L
T
 
T
M
 
M
S
 
P
E
 
A
S
 
Q
A
 
M
S
 
S
E
 
E
E
 
E
R
 
R
R
 
K
K
 
R
I
 
V
L
 
L
R
 
K
A
 
A
Y
 
F
G
 
G
A
 
A
D
 
E
I
 
L
L
 
V
L
 
L
T
 
T
P
 
D
A
 
P
H
 
E
L
 
R
A
 
R
T
 
M
D
 
L
G
 
A
A
 
A
I
 
R
E
 
E
E
 
E
A
 
A
Y
 
L
R
 
R
L
 
L
A
 
K
R
 
E
E
 
E
E
 
-
P
 
-
E
 
L
R
 
G
Y
 
A
F
 
F
L
 
M
V
 
P
D
 
D
Q
|
Q
F
 
F
N
 
K
N
 
N
Y
 
P
N
 
A
N
 
N
V
 
V
M
 
R
A
 
A
H
 
H
Y
 
Y
Q
 
E
H
 
T
G
 
-
T
 
T
A
 
G
D
 
P
E
 
E
I
 
L
H
 
Y
R
 
E
A
 
A
T
 
L
Q
 
E
G
 
G
R
 
R
A
 
I
R
 
D
V
 
A
V
 
F
V
 
V
A
x
Y
T
 
G
L
 
S
G
|
G
T
|
T
S
x
G
G
 
G
T
|
T
A
 
I
M
 
T
G
 
G
L
 
V
A
 
G
K
 
R
R
 
Y
L
 
L
H
 
K
E
 
E
L
 
R
D
 
I
P
 
P
A
 
H
I
 
V
K
 
K
L
 
V
V
 
I
A
 
A
V
 
V
E
|
E
P
 
P
Y
 
A
Q
 
R
G
x
S
H
 
N
K
 
V
I
 
L
-
 
S
-
 
G
-
 
G
-
 
K
-
 
M
-
 
G
-
 
Q
Q
 
H
G
 
G
L
 
F
K
 
Q
N
x
G
M
|
M
K
 
G
E
x
P
S
 
G
L
 
F
R
 
I
P
 
P
G
 
E
I
 
N
F
 
L
D
 
D
P
 
L
H
 
S
L
 
L
P
 
L
D
 
D
Q
 
G
I
 
V
V
 
I
N
 
Q
V
 
V
D
 
W
D
 
E
D
 
E
A
 
D
A
 
A
Y
 
F
A
 
P
M
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
L
F
 
F
V
 
L
G
 
G
M
 
M
S
|
S
A
 
S
G
 
G
A
 
G
A
 
I
V
 
V
V
 
W
A
 
A
A
 
A
V
 
L
E
 
Q
Q
 
V
A
 
A
R
 
R
G
 
E
L
 
L
S
 
G
E
 
P
G
 
G
M
 
K
V
 
R
V
 
V
A
 
A
-
 
C
I
 
I
L
 
S
P
|
P
D
|
D
G
 
G
G
 
G
E
 
W
R
 
K
Y
 
Y
L
 
L
S
 
S
T
 
T
P
 
P
L
 
L
F
 
Y

2ecqA Crystal structure of t.Th. Hb8 o-acetylserine sulfhydrylase complexed with 3-hydroxylactate
45% identity, 37% coverage: 13:300/775 of query aligns to 7:301/302 of 2ecqA

query
sites
2ecqA
I
 
I
G
 
G
E
 
K
T
 
T
P
 
P
L
 
V
V
 
V
R
 
R
L
 
L
G
 
A
R
 
K
V
 
V
T
 
V
P
 
E
L
 
P
G
 
D
G
 
M
A
 
A
P
 
E
I
 
V
Y
 
W
A
 
V
K
 
K
L
 
L
E
 
E
Y
 
G
L
 
L
N
 
N
P
 
P
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
I
K
|
K
D
 
D
R
 
R
A
 
P
A
 
A
L
 
W
R
 
Y
M
 
M
L
 
I
E
 
K
A
 
D
A
 
A
E
 
E
V
 
E
S
 
R
G
 
G
E
 
I
L
 
L
-
 
R
-
 
P
T
 
G
R
 
S
D
 
G
K
 
Q
I
 
V
V
 
I
L
 
V
E
 
E
A
 
P
T
 
T
S
|
S
G
|
G
N
|
N
T
|
T
G
 
G
I
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
M
 
M
V
 
I
C
 
A
A
 
A
V
 
S
K
 
R
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
M
 
L
L
 
I
F
 
L
T
 
T
M
 
M
S
 
P
E
 
A
S
 
Q
A
 
M
S
 
S
E
 
E
E
 
E
R
 
R
R
 
K
K
 
R
I
 
V
L
 
L
R
 
K
A
 
A
Y
 
F
G
 
G
A
 
A
D
 
E
I
 
L
L
 
V
L
 
L
T
 
T
P
 
D
A
 
P
H
 
E
L
 
R
A
 
R
T
 
M
D
 
L
G
 
A
A
 
A
I
 
R
E
 
E
E
 
E
A
 
A
Y
 
L
R
 
R
L
 
L
A
 
K
R
 
E
E
 
E
E
 
-
P
 
-
E
 
L
R
 
G
Y
 
A
F
 
F
L
 
M
V
 
P
D
 
D
Q
|
Q
F
 
F
N
 
K
N
 
N
Y
 
P
N
 
A
N
 
N
V
 
V
M
 
R
A
 
A
H
 
H
Y
 
Y
Q
 
E
H
 
T
G
 
-
T
 
T
A
 
G
D
 
P
E
 
E
I
 
L
H
 
Y
R
 
E
A
 
A
T
 
L
Q
 
E
G
 
G
R
 
R
A
 
I
R
 
D
V
 
A
V
 
F
V
 
V
A
x
Y
T
x
G
L
 
S
G
|
G
T
|
T
S
 
G
G
 
G
T
|
T
A
 
I
M
 
T
G
 
G
L
 
V
A
 
G
K
 
R
R
 
Y
L
 
L
H
 
K
E
 
E
L
 
R
D
 
I
P
 
P
A
 
H
I
 
V
K
 
K
L
 
V
V
 
I
A
 
A
V
 
V
E
|
E
P
 
P
Y
 
A
Q
 
R
G
x
S
H
 
N
K
 
V
I
 
L
-
 
S
-
 
G
-
 
G
-
 
K
-
 
M
-
 
G
-
 
Q
Q
 
H
G
 
G
L
 
F
K
 
Q
N
x
G
M
 
M
K
 
G
E
 
P
S
 
G
L
 
F
R
 
I
P
 
P
G
 
E
I
 
N
F
 
L
D
 
D
P
 
L
H
 
S
L
 
L
P
 
L
D
 
D
Q
 
G
I
 
V
V
 
I
N
 
Q
V
 
V
D
 
W
D
 
E
D
 
E
A
 
D
A
 
A
Y
 
F
A
 
P
M
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
L
F
 
F
V
 
L
G
 
G
M
 
M
S
|
S
A
 
S
G
 
G
A
 
G
A
 
I
V
 
V
V
 
W
A
 
A
A
 
A
V
 
L
E
 
Q
Q
 
V
A
 
A
R
 
R
G
 
E
L
 
L
S
 
G
E
 
P
G
 
G
M
 
K
V
 
R
V
 
V
A
 
A
-
 
C
I
 
I
L
 
S
P
|
P
D
 
D
G
 
G
G
 
G
E
 
W
R
 
K
Y
 
Y
L
 
L
S
 
S
T
 
T
P
 
P
L
 
L
F
 
Y

2ecoA Crystal structure of t.Th. Hb8 o-acetylserine sulfhydrylase complexed with 4-methylvalerate
45% identity, 37% coverage: 13:300/775 of query aligns to 7:301/302 of 2ecoA

query
sites
2ecoA
I
 
I
G
 
G
E
 
K
T
 
T
P
 
P
L
 
V
V
 
V
R
 
R
L
 
L
G
 
A
R
 
K
V
 
V
T
 
V
P
 
E
L
 
P
G
 
D
G
 
M
A
 
A
P
 
E
I
 
V
Y
 
W
A
 
V
K
 
K
L
 
L
E
 
E
Y
 
G
L
 
L
N
 
N
P
 
P
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
I
K
|
K
D
 
D
R
 
R
A
 
P
A
 
A
L
 
W
R
 
Y
M
 
M
L
 
I
E
 
K
A
 
D
A
 
A
E
 
E
V
 
E
S
 
R
G
 
G
E
 
I
L
 
L
-
 
R
-
 
P
T
 
G
R
 
S
D
 
G
K
 
Q
I
 
V
V
 
I
L
 
V
E
 
E
A
 
P
T
|
T
S
|
S
G
|
G
N
|
N
T
|
T
G
 
G
I
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
M
 
M
V
 
I
C
 
A
A
 
A
V
 
S
K
 
R
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
M
 
L
L
 
I
F
 
L
T
 
T
M
 
M
S
 
P
E
 
A
S
 
Q
A
 
M
S
 
S
E
 
E
E
 
E
R
 
R
R
 
K
K
 
R
I
 
V
L
 
L
R
 
K
A
 
A
Y
 
F
G
 
G
A
 
A
D
 
E
I
 
L
L
 
V
L
 
L
T
 
T
P
 
D
A
 
P
H
 
E
L
 
R
A
 
R
T
 
M
D
 
L
G
 
A
A
 
A
I
 
R
E
 
E
E
 
E
A
 
A
Y
 
L
R
 
R
L
 
L
A
 
K
R
 
E
E
 
E
E
 
-
P
 
-
E
 
L
R
 
G
Y
 
A
F
 
F
L
 
M
V
 
P
D
 
D
Q
|
Q
F
 
F
N
 
K
N
 
N
Y
 
P
N
 
A
N
 
N
V
 
V
M
 
R
A
 
A
H
 
H
Y
 
Y
Q
 
E
H
 
T
G
 
-
T
 
T
A
 
G
D
 
P
E
 
E
I
 
L
H
 
Y
R
 
E
A
 
A
T
 
L
Q
 
E
G
 
G
R
 
R
A
 
I
R
 
D
V
 
A
V
 
F
V
 
V
A
x
Y
T
 
G
L
 
S
G
|
G
T
|
T
S
 
G
G
 
G
T
|
T
A
 
I
M
 
T
G
 
G
L
 
V
A
 
G
K
 
R
R
 
Y
L
 
L
H
 
K
E
 
E
L
 
R
D
 
I
P
 
P
A
 
H
I
 
V
K
 
K
L
 
V
V
 
I
A
 
A
V
 
V
E
|
E
P
 
P
Y
 
A
Q
 
R
G
x
S
H
 
N
K
 
V
I
 
L
-
 
S
-
 
G
-
 
G
-
 
K
-
 
M
-
 
G
-
 
Q
Q
 
H
G
 
G
L
 
F
K
 
Q
N
x
G
M
 
M
K
 
G
E
 
P
S
 
G
L
 
F
R
 
I
P
 
P
G
 
E
I
 
N
F
 
L
D
 
D
P
 
L
H
 
S
L
 
L
P
 
L
D
 
D
Q
 
G
I
 
V
V
 
I
N
 
Q
V
 
V
D
 
W
D
 
E
D
 
E
A
 
D
A
 
A
Y
 
F
A
 
P
M
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
L
F
 
F
V
 
L
G
 
G
M
 
M
S
|
S
A
 
S
G
 
G
A
 
G
A
 
I
V
 
V
V
 
W
A
 
A
A
 
A
V
 
L
E
 
Q
Q
 
V
A
 
A
R
 
R
G
 
E
L
 
L
S
 
G
E
 
P
G
 
G
M
 
K
V
 
R
V
 
V
A
 
A
-
 
C
I
 
I
L
 
S
P
|
P
D
|
D
G
 
G
G
 
G
E
 
W
R
 
K
Y
 
Y
L
 
L
S
 
S
T
 
T
P
 
P
L
 
L
F
 
Y

6ujdA Crystal structure of cysteine-tRNA ligase from elizabethkingia sp.
33% identity, 50% coverage: 309:695/775 of query aligns to 3:377/406 of 6ujdA

query
sites
6ujdA
L
 
L
K
 
K
F
 
I
F
 
Y
N
 
N
T
 
S
L
 
L
T
 
T
R
 
G
R
 
E
I
 
K
D
 
E
E
 
D
L
 
F
R
 
K
P
 
P
V
 
I
R
 
L
P
 
E
G
 
G
R
 
N
V
 
V
G
 
G
I
 
M
Y
 
Y
A
 
V
C
|
C
G
 
G
P
 
P
S
 
T
L
 
V
D
 
Y
G
 
S
P
 
N
P
 
V
D
 
H
L
 
L
G
 
G
L
 
N
C
 
V
R
 
R
R
 
T
M
 
F
I
 
L
F
 
S
A
 
F
D
 
D
L
 
F
L
 
I
R
 
Y
R
 
R
Y
 
S
L
 
L
E
 
Q
L
 
Y
R
 
I
G
 
G
F
 
Y
E
 
K
V
 
V
K
 
R
L
 
Y
V
 
V
V
 
R
N
 
N
I
 
I
A
 
T
D
 
D
-
 
A
-
 
G
-
 
H
I
 
L
D
 
T
D
 
D
R
 
R
T
 
-
V
 
-
N
 
-
Q
 
-
C
 
-
L
 
-
A
 
L
E
 
E
G
 
K
A
 
L
E
 
E
L
 
P
K
 
M
E
 
E
F
 
I
T
 
V
A
 
Q
R
 
K
W
 
Y
E
 
T
K
 
V
A
 
D
F
 
F
H
 
H
E
 
E
D
 
V
M
 
L
A
 
K
A
 
K
L
 
F
N
 
N
V
 
L
L
 
L
P
 
P
A
 
P
S
 
T
D
 
I
Y
 
E
P
 
P
K
 
T
A
 
A
S
 
T
E
 
G
H
 
H
I
 
I
P
 
I
E
 
E
M
 
Q
I
 
I
E
 
E
E
 
L
T
 
T
R
 
K
K
 
K
L
 
L
L
 
I
A
 
D
K
 
T
D
 
G
L
 
F
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
K
 
S
L
 
N
R
 
G
S
 
S
V
 
V
Y
 
Y
F
 
F
N
 
D
I
 
V
S
 
L
R
 
E
Y
 
Y
P
 
N
-
 
A
-
 
R
-
 
G
-
 
L
N
 
N
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
E
L
 
L
S
 
S
H
 
R
V
 
R
D
 
N
L
 
-
N
 
-
A
 
-
I
 
I
Q
 
E
K
 
Q
G
 
G
K
 
-
T
 
-
V
 
-
D
 
-
F
 
-
D
 
-
Y
 
-
Y
 
-
E
 
E
K
 
K
E
 
K
N
 
N
P
 
P
S
 
Q
D
 
D
F
 
F
T
 
A
L
 
L
F
 
W
K
 
K
R
 
K
A
 
A
S
 
S
L
 
P
Q
 
Q
E
 
H
L
 
I
K
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
M
Y
 
R
W
 
W
P
 
I
T
 
S
P
 
P
W
 
W
G
 
G
N
 
E
C
 
G
R
 
F
P
 
P
G
 
G
W
 
W
H
 
H
V
 
L
E
 
E
C
|
C
A
 
T
C
 
A
M
 
M
S
 
S
A
 
T
G
 
K
H
 
Y
L
 
L
G
 
G
Q
 
D
P
 
K
F
 
F
D
 
D
I
 
I
H
 
H
L
 
G
A
 
G
S
 
G
S
 
M
D
 
D
L
 
L
I
 
K
F
 
F
P
 
P
H
|
H
G
 
H
D
 
E
N
 
C
E
 
E
I
 
I
A
 
A
I
 
Q
A
 
G
E
 
K
S
 
A
L
 
C
Y
 
N
G
 
G
K
 
T
P
 
E
L
 
P
A
 
V
N
 
N
L
 
Y
W
 
W
L
 
M
H
 
H
S
 
A
E
 
N
V
 
M
V
 
L
V
 
T
V
 
M
D
 
N
G
 
G
K
 
Q
K
 
R
A
 
M
N
 
S
R
 
K
V
 
S
Q
 
T
G
 
G
N
 
N
D
 
Y
V
 
I
S
 
L
L
 
P
R
 
M
E
 
E
L
 
L
L
 
I
-
 
T
-
 
G
-
 
N
-
 
N
-
 
S
-
 
F
-
 
F
E
 
E
Q
 
K
G
 
A
H
 
F
S
 
H
P
 
P
Q
 
S
A
 
V
V
 
L
R
 
R
Y
 
F
W
 
C
M
 
F
L
 
L
S
 
Q
Q
 
A
H
 
H
Y
 
Y
R
 
R
R
 
S
A
 
V
L
 
L
R
 
D
F
 
I
A
 
S
P
 
N
E
 
D
Q
 
A
L
 
M
D
 
L
L
 
A
A
 
S
E
 
E
R
 
K
T
 
G
V
 
F
R
 
S
R
 
R
L
 
L
N
 
M
D
 
D
F
 
A
V
 
V
A
 
K
R
 
L
L
 
V
R
 
-
F
 
-
L
 
-
T
 
-
P
 
-
A
 
-
P
 
-
D
 
D
D
 
E
A
 
L
Q
 
Q
A
 
V
E
 
S
D
 
E
V
 
K
D
 
S
-
 
T
-
 
V
-
 
N
-
 
V
Q
 
Q
L
 
E
I
 
W
Y
 
Y
E
 
E
T
 
K
R
 
A
Y
 
Y
R
 
-
F
 
-
Q
 
-
E
 
S
A
 
A
M
 
L
D
 
V
N
 
D
D
 
D
L
 
F
G
 
N
V
 
S
A
 
P
K
 
I
A
 
L
Q
 
I
G
 
S
H
 
H
I
 
L
F
 
F
A
 
E
F
 
A
I
 
V
K
 
K
A
 
W
I
 
V
N
 
F
R
 
L
L
 
L
A
 
K
A
 
D
G
 
G
E
 
K

4lmbA Crystal structure analysis of o-acetylserine sulfhydrylase cysk2 complexed with cystine from microcystis aeruginosa 7806 (see paper)
44% identity, 38% coverage: 8:300/775 of query aligns to 6:308/310 of 4lmbA

query
sites
4lmbA
N
 
D
V
 
I
L
 
T
E
 
Q
L
 
L
I
 
V
G
 
G
E
 
R
T
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
V
R
 
Q
L
 
L
G
 
N
R
 
R
V
 
I
T
 
P
P
 
V
L
 
A
G
 
E
G
 
G
-
 
V
-
 
K
A
 
A
P
 
R
I
 
I
Y
 
V
A
 
V
K
 
K
L
 
L
E
 
E
Y
 
S
L
 
M
N
 
N
P
 
P
G
 
A
G
 
A
S
 
S
V
 
V
K
|
K
D
 
D
R
 
R
A
 
I
A
 
G
L
 
V
R
 
S
M
 
M
L
 
V
E
 
E
A
 
D
A
 
A
E
 
E
V
 
A
S
 
A
G
 
G
E
 
L
L
 
I
T
 
H
R
 
P
D
 
D
K
 
K
I
 
T
V
 
I
L
 
L
-
 
V
E
 
E
A
 
P
T
|
T
S
|
S
G
 
G
N
|
N
T
|
T
G
 
G
I
 
I
G
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
V
 
V
C
 
A
A
 
A
V
 
A
K
 
K
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
M
 
L
L
 
V
F
 
L
T
 
T
M
 
M
S
 
P
E
 
E
S
 
T
A
x
M
S
 
S
E
 
L
E
 
E
R
 
R
R
 
R
K
 
A
I
 
M
L
 
L
R
 
K
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
D
 
Q
I
 
L
L
 
E
L
 
L
T
 
T
P
 
P
A
 
G
H
 
S
L
 
Q
A
 
G
T
x
M
D
 
E
G
 
G
A
 
A
I
 
I
E
 
T
E
 
R
A
 
A
Y
 
E
R
 
E
L
 
I
A
 
V
R
 
E
E
 
N
E
 
T
P
 
P
E
 
N
R
 
A
Y
 
Y
F
 
S
L
 
L
V
 
-
D
 
Q
Q
|
Q
F
|
F
N
 
R
N
 
N
Y
 
P
N
 
A
N
 
N
V
 
P
M
 
K
A
 
I
H
 
H
Y
 
R
Q
 
E
H
 
T
G
 
-
T
 
T
A
 
A
D
 
E
E
 
E
I
 
I
H
 
W
R
 
A
A
 
D
T
 
T
Q
 
D
G
 
G
R
 
L
A
 
V
R
 
D
V
 
I
V
 
V
V
 
I
A
 
G
T
 
G
L
x
V
G
|
G
T
|
T
S
x
G
G
 
G
T
|
T
A
 
I
M
 
T
G
 
G
L
 
I
A
 
A
K
 
E
R
 
T
L
 
I
H
 
K
E
 
P
L
 
R
D
 
R
P
 
P
A
 
Q
I
 
F
K
 
Q
L
 
A
V
 
I
A
 
A
V
 
V
E
 
E
P
 
P
Y
 
S
Q
 
N
G
 
S
-
 
P
-
 
V
-
 
L
-
 
S
-
 
G
-
 
G
-
 
Q
-
 
P
-
 
G
-
 
P
H
 
H
K
 
K
I
 
I
Q
|
Q
G
|
G
L
x
I
K
 
-
N
 
-
M
 
-
K
 
G
E
x
A
S
 
G
L
 
F
R
 
I
P
 
P
G
 
A
I
 
I
F
 
F
D
 
R
P
 
P
H
 
E
L
 
L
P
 
I
D
 
D
Q
 
E
I
 
V
V
 
I
N
 
I
V
 
V
D
 
D
D
 
D
D
 
T
A
 
E
A
 
A
Y
 
F
A
 
A
M
 
Y
A
 
A
R
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
L
F
 
L
V
 
S
G
 
G
M
 
I
S
|
S
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
L
V
 
W
A
 
A
A
 
A
V
 
I
E
 
Q
Q
 
V
A
 
G
R
 
K
G
 
R
L
 
P
-
 
E
-
 
N
S
 
E
E
 
D
G
 
K
M
 
L
V
 
I
V
 
V
A
 
M
I
 
I
L
 
Q
P
|
P
D
 
S
G
 
F
G
 
G
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
L
 
L
S
 
S
T
 
T
P
 
A
L
 
L
F
 
F

Query Sequence

>WP_013260052.1 NCBI__GCF_000143965.1:WP_013260052.1
MTLRMVDNVLELIGETPLVRLGRVTPLGGAPIYAKLEYLNPGGSVKDRAALRMLEAAEVS
GELTRDKIVLEATSGNTGIGLAMVCAVKGYRMLFTMSESASEERRKILRAYGADILLTPA
HLATDGAIEEAYRLAREEPERYFLVDQFNNYNNVMAHYQHGTADEIHRATQGRARVVVAT
LGTSGTAMGLAKRLHELDPAIKLVAVEPYQGHKIQGLKNMKESLRPGIFDPHLPDQIVNV
DDDAAYAMARRLAREEGIFVGMSAGAAVVAAVEQARGLSEGMVVAILPDGGERYLSTPLF
VSEKVPEPLKFFNTLTRRIDELRPVRPGRVGIYACGPSLDGPPDLGLCRRMIFADLLRRY
LELRGFEVKLVVNIADIDDRTVNQCLAEGAELKEFTARWEKAFHEDMAALNVLPASDYPK
ASEHIPEMIEETRKLLAKDLAYEKLRSVYFNISRYPNYGQLSHVDLNAIQKGKTVDFDYY
EKENPSDFTLFKRASLQELKAGVYWPTPWGNCRPGWHVECACMSAGHLGQPFDIHLASSD
LIFPHGDNEIAIAESLYGKPLANLWLHSEVVVVDGKKANRVQGNDVSLRELLEQGHSPQA
VRYWMLSQHYRRALRFAPEQLDLAERTVRRLNDFVARLRFLTPAPDDAQAEDVDQLIYET
RYRFQEAMDNDLGVAKAQGHIFAFIKAINRLAAGEGLTMAQIQKVLEFMQRLDSVLGVMN
FDGSSWDPAIEELVQKREQARADGDFALADRLREQLAEMGVQVADTPSGARWHRA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory