SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_013402867.1 NCBI__GCF_000166355.1:WP_013402867.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6z4wA Ftse structure from streptococcus pneumoniae in complex with adp (space group p 1) (see paper)
52% identity, 95% coverage: 1:227/239 of query aligns to 3:229/230 of 6z4wA

query
sites
6z4wA
M
 
I
V
 
I
K
 
E
F
 
M
I
 
R
N
 
D
V
 
V
S
 
V
K
 
K
R
 
K
Y
|
Y
P
 
D
N
 
N
G
 
G
V
x
T
L
 
T
A
|
A
L
 
L
T
 
R
N
 
G
I
 
V
N
 
S
L
 
V
T
 
S
I
 
V
E
 
Q
K
 
P
G
 
G
E
 
E
F
 
F
V
 
A
F
 
Y
L
 
I
V
 
V
G
 
G
S
 
P
S
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
I
 
F
V
 
I
K
 
R
L
 
S
L
 
L
L
 
Y
K
 
R
E
 
E
I
 
V
D
 
K
P
 
I
T
 
D
E
 
K
G
 
G
E
 
S
I
 
L
I
 
S
V
 
V
G
 
A
E
 
G
Y
 
F
K
 
N
L
 
L
T
 
V
Q
 
K
L
 
I
P
 
K
K
 
K
R
 
K
E
 
D
I
 
V
P
 
P
Y
 
L
Y
 
L
R
 
R
R
 
R
K
 
S
I
 
V
G
 
G
I
 
V
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
D
F
 
Y
R
 
K
L
 
L
L
 
L
P
 
P
N
 
K
K
 
K
T
 
T
V
 
V
Y
 
Y
E
 
E
N
 
N
V
 
I
E
 
A
F
 
Y
A
 
A
M
 
M
Q
 
E
I
 
V
T
 
I
G
 
G
A
 
E
P
 
N
A
 
R
K
 
R
I
 
N
I
 
I
R
 
K
R
 
R
Q
 
R
V
 
V
P
 
M
Y
 
E
V
 
V
L
 
L
S
 
D
L
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
K
H
 
H
K
 
K
A
 
V
K
 
R
C
 
S
Y
 
F
P
 
P
H
 
N
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
I
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
K
 
N
P
 
P
N
 
K
L
 
V
L
 
L
V
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
D
 
D
T
 
N
S
 
S
W
 
W
E
 
E
I
 
I
M
 
M
R
 
N
L
 
L
L
 
L
E
 
E
D
 
R
I
 
I
N
 
N
K
 
L
R
 
Q
G
 
G
T
 
T
T
 
T
V
 
I
L
 
L
V
 
M
A
 
A
T
 
T
H
 
H
A
 
N
K
 
S
E
 
Q
I
 
I
V
 
V
D
 
N
S
 
T
M
 
L
R
 
R
K
 
H
R
 
R
V
 
V
V
 
I
A
 
A
I
 
I
D
 
E
C
 
N
G
 
G
R
 
R
I
 
V
V
 
V
K
 
R
D
 
D
Q
 
E
P
 
S
K
 
K
G
 
G
V
 
E
Y
 
Y
S
 
G
Y
 
Y
E
 
D

A0A0H2ZM82 Cell division ATP-binding protein FtsE from Streptococcus pneumoniae serotype 2 (strain D39 / NCTC 7466) (see paper)
52% identity, 95% coverage: 1:227/239 of query aligns to 3:229/230 of A0A0H2ZM82

query
sites
A0A0H2ZM82
M
 
I
V
 
I
K
 
E
F
 
M
I
 
R
N
 
D
V
 
V
S
 
V
K
 
K
R
 
K
Y
 
Y
P
 
D
N
 
N
G
 
G
V
 
T
L
 
T
A
 
A
L
 
L
T
 
R
N
 
G
I
 
V
N
 
S
L
 
V
T
 
S
I
 
V
E
 
Q
K
 
P
G
 
G
E
 
E
F
 
F
V
 
A
F
 
Y
L
 
I
V
 
V
G
 
G
S
 
P
S
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
I
 
F
V
 
I
K
 
R
L
 
S
L
 
L
L
 
Y
K
 
R
E
 
E
I
 
V
D
 
K
P
 
I
T
 
D
E
 
K
G
 
G
E
 
S
I
 
L
I
 
S
V
 
V
G
 
A
E
 
G
Y
 
F
K
 
N
L
 
L
T
 
V
Q
 
K
L
 
I
P
 
K
K
 
K
R
 
K
E
 
D
I
 
V
P
 
P
Y
 
L
Y
 
L
R
 
R
R
 
R
K
 
S
I
 
V
G
 
G
I
 
V
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
D
F
 
Y
R
 
K
L
 
L
L
 
L
P
 
P
N
 
K
K
 
K
T
 
T
V
 
V
Y
 
Y
E
 
E
N
 
N
V
 
I
E
 
A
F
 
Y
A
 
A
M
 
M
Q
 
E
I
 
V
T
 
I
G
 
G
A
 
E
P
 
N
A
 
R
K
 
R
I
 
N
I
 
I
R
 
K
R
 
R
Q
 
R
V
 
V
P
 
M
Y
 
E
V
 
V
L
 
L
S
 
D
L
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
K
H
 
H
K
 
K
A
 
V
K
 
R
C
 
S
Y
 
F
P
 
P
H
 
N
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
I
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
K
 
N
P
 
P
N
 
K
L
 
V
L
 
L
V
 
I
A
 
A
D
|
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
D
 
D
T
 
N
S
 
S
W
 
W
E
 
E
I
 
I
M
 
M
R
 
N
L
 
L
L
 
L
E
 
E
D
 
R
I
 
I
N
 
N
K
 
L
R
 
Q
G
 
G
T
 
T
T
 
T
V
 
I
L
 
L
V
 
M
A
 
A
T
 
T
H
 
H
A
 
N
K
 
S
E
 
Q
I
 
I
V
 
V
D
 
N
S
 
T
M
 
L
R
 
R
K
 
H
R
 
R
V
 
V
V
 
I
A
 
A
I
 
I
D
 
E
C
 
N
G
 
G
R
 
R
I
 
V
V
 
V
K
 
R
D
 
D
Q
 
E
P
 
S
K
 
K
G
 
G
V
 
E
Y
 
Y
S
 
G
Y
 
Y
E
 
D

6z67B Ftse structure of streptococcus pneumoniae in complex with amppnp at 2.4 a resolution (see paper)
52% identity, 95% coverage: 1:227/239 of query aligns to 3:229/229 of 6z67B

query
sites
6z67B
M
 
I
V
 
I
K
 
E
F
 
M
I
 
R
N
 
D
V
 
V
S
 
V
K
 
K
R
 
K
Y
|
Y
P
 
D
N
 
N
G
|
G
V
 
T
L
 
T
A
|
A
L
 
L
T
 
R
N
 
G
I
 
V
N
 
S
L
 
V
T
 
S
I
 
V
E
 
Q
K
 
P
G
 
G
E
 
E
F
 
F
V
 
A
F
 
Y
L
 
I
V
 
V
G
 
G
S
 
P
S
|
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
I
 
F
V
 
I
K
 
R
L
 
S
L
 
L
L
 
Y
K
 
R
E
 
E
I
 
V
D
 
K
P
 
I
T
 
D
E
 
K
G
 
G
E
 
S
I
 
L
I
 
S
V
 
V
G
 
A
E
 
G
Y
 
F
K
 
N
L
 
L
T
 
V
Q
 
K
L
 
I
P
 
K
K
 
K
R
 
K
E
 
D
I
 
V
P
 
P
Y
 
L
Y
 
L
R
 
R
R
 
R
K
 
S
I
 
V
G
 
G
I
 
V
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
D
F
 
Y
R
 
K
L
 
L
L
 
L
P
 
P
N
 
K
K
 
K
T
 
T
V
 
V
Y
 
Y
E
 
E
N
 
N
V
 
I
E
 
A
F
 
Y
A
 
A
M
 
M
Q
 
E
I
 
V
T
 
I
G
 
G
A
 
E
P
 
N
A
 
R
K
 
R
I
 
N
I
 
I
R
 
K
R
 
R
Q
 
R
V
 
V
P
 
M
Y
 
E
V
 
V
L
 
L
S
 
D
L
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
K
H
 
H
K
 
K
A
 
V
K
 
R
C
 
S
Y
 
F
P
 
P
H
 
N
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
I
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
K
 
N
P
 
P
N
 
K
L
 
V
L
 
L
V
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
D
 
D
T
 
N
S
 
S
W
 
W
E
 
E
I
 
I
M
 
M
R
 
N
L
 
L
L
 
L
E
 
E
D
 
R
I
 
I
N
 
N
K
 
L
R
 
Q
G
 
G
T
 
T
T
 
T
V
 
I
L
 
L
V
 
M
A
 
A
T
 
T
H
 
H
A
 
N
K
 
S
E
 
Q
I
 
I
V
 
V
D
 
N
S
 
T
M
 
L
R
 
R
K
 
H
R
 
R
V
 
V
V
 
I
A
 
A
I
 
I
D
 
E
C
 
N
G
 
G
R
 
R
I
 
V
V
 
V
K
 
R
D
 
D
Q
 
E
P
 
S
K
 
K
G
 
G
V
 
E
Y
 
Y
S
 
G
Y
 
Y
E
 
D

A5U7B7 Cell division ATP-binding protein FtsE from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25177 / H37Ra) (see 2 papers)
55% identity, 95% coverage: 1:227/239 of query aligns to 1:228/229 of A5U7B7

query
sites
A5U7B7
M
 
M
V
 
I
K
 
T
F
 
L
I
 
D
N
 
H
V
 
V
S
 
T
K
 
K
R
 
Q
Y
 
Y
P
 
K
N
 
S
G
 
S
V
 
A
L
 
R
-
 
P
A
 
A
L
 
L
T
 
D
N
 
D
I
 
I
N
 
N
L
 
V
T
 
K
I
 
I
E
 
D
K
 
K
G
 
G
E
 
E
F
 
F
V
 
V
F
 
F
L
 
L
V
 
I
G
 
G
S
 
P
S
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
I
 
F
V
 
M
K
 
R
L
 
L
L
 
L
L
 
L
K
 
A
E
 
A
I
 
E
D
 
T
P
 
P
T
 
T
E
 
S
G
 
G
E
 
D
I
 
V
I
 
R
V
 
V
G
 
S
E
 
K
Y
 
F
K
 
H
L
 
V
T
 
N
Q
 
K
L
 
L
P
 
R
K
 
G
R
 
R
E
 
H
I
 
V
P
 
P
Y
 
K
Y
 
L
R
 
R
R
 
Q
K
 
V
I
 
I
G
 
G
I
x
C
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
D
F
 
F
R
 
R
L
 
L
L
 
L
P
 
Q
N
 
Q
K
 
K
T
 
T
V
 
V
Y
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
V
E
 
A
F
 
F
A
 
A
M
 
L
Q
 
E
I
 
V
T
 
I
G
 
G
A
 
K
P
 
R
A
 
T
K
 
D
I
 
A
I
 
I
R
 
N
R
 
R
Q
 
V
V
 
V
P
 
P
Y
 
E
V
 
V
L
 
L
S
 
E
L
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
S
H
 
G
K
 
K
A
 
A
K
 
N
C
 
R
Y
 
L
P
 
P
H
 
D
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
F
V
 
V
N
 
N
K
 
R
P
 
P
N
 
L
L
 
V
L
 
L
V
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
D
 
E
T
 
T
S
 
S
W
 
R
E
 
D
I
 
I
M
 
M
R
 
D
L
 
L
L
 
L
E
 
E
D
 
R
I
 
I
N
 
N
K
 
R
R
 
T
G
 
G
T
 
T
T
 
T
V
 
V
L
 
L
V
 
M
A
 
A
T
 
T
H
 
H
A
 
D
K
 
H
E
 
H
I
 
I
V
 
V
D
 
D
S
 
S
M
 
M
R
 
R
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
V
 
V
A
 
E
I
 
L
D
 
S
C
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
L
V
 
V
K
 
R
D
 
D
Q
 
E
P
 
Q
K
 
R
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
S
 
G
Y
 
M
E
 
D

8igqA Cryo-em structure of mycobacterium tuberculosis adp bound ftsex/ripc complex in peptidisc (see paper)
56% identity, 94% coverage: 1:224/239 of query aligns to 2:226/227 of 8igqA

query
sites
8igqA
M
 
M
V
 
I
K
 
T
F
 
L
I
 
D
N
 
H
V
 
V
S
 
T
K
 
K
R
 
Q
Y
|
Y
P
 
K
N
 
S
G
 
S
V
 
A
L
 
R
-
 
P
A
 
A
L
 
L
T
 
D
N
 
D
I
 
I
N
 
N
L
 
V
T
 
K
I
 
I
E
 
D
K
 
K
G
 
G
E
 
E
F
 
F
V
 
V
F
 
F
L
 
L
V
 
I
G
 
G
S
 
P
S
 
S
G
|
G
A
x
S
G
 
G
K
|
K
S
|
S
T
 
T
I
 
F
V
 
M
K
 
R
L
 
L
L
 
L
L
 
L
K
 
A
E
 
A
I
 
E
D
 
T
P
 
P
T
 
T
E
 
S
G
 
G
E
 
D
I
 
V
I
 
R
V
 
V
G
 
S
E
 
K
Y
 
F
K
 
H
L
 
V
T
 
N
Q
 
K
L
 
L
P
 
R
K
 
G
R
 
R
E
 
H
I
 
V
P
 
P
Y
 
K
Y
 
L
R
 
R
R
 
Q
K
 
V
I
 
I
G
 
G
I
 
C
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
D
F
 
F
R
 
R
L
 
L
L
 
L
P
 
Q
N
 
Q
K
 
K
T
 
T
V
 
V
Y
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
V
E
 
A
F
 
F
A
 
A
M
 
L
Q
 
E
I
 
V
T
 
I
G
 
G
A
 
K
P
 
R
A
 
T
K
 
D
I
 
A
I
 
I
R
 
N
R
 
R
Q
 
V
V
 
V
P
 
P
Y
 
E
V
 
V
L
 
L
S
 
E
L
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
S
H
 
G
K
 
K
A
 
A
K
 
N
C
 
R
Y
 
L
P
 
P
H
 
D
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
F
V
 
V
N
 
N
K
 
R
P
 
P
N
 
L
L
 
V
L
 
L
V
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
D
 
E
T
 
T
S
 
S
W
 
R
E
 
D
I
 
I
M
 
M
R
 
D
L
 
L
L
 
L
E
 
E
D
 
R
I
 
I
N
 
N
K
 
R
R
 
T
G
 
G
T
 
T
T
 
T
V
 
V
L
 
L
V
 
M
A
 
A
T
 
T
H
 
H
A
 
D
K
 
H
E
 
H
I
 
I
V
 
V
D
 
D
S
 
S
M
 
M
R
 
R
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
V
 
V
A
 
E
I
 
L
D
 
S
C
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
L
V
 
V
K
 
R
D
 
D
Q
 
E
P
 
Q
K
 
R
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y

8iddA Cryo-em structure of mycobacterium tuberculosis atp bound ftsex/ripc complex in peptidisc (see paper)
56% identity, 93% coverage: 1:223/239 of query aligns to 2:225/225 of 8iddA

query
sites
8iddA
M
 
M
V
 
I
K
 
T
F
 
L
I
 
D
N
 
H
V
 
V
S
 
T
K
 
K
R
 
Q
Y
|
Y
P
 
K
N
 
S
G
 
S
V
 
A
L
 
R
-
 
P
A
 
A
L
 
L
T
 
D
N
 
D
I
 
I
N
 
N
L
 
V
T
 
K
I
 
I
E
 
D
K
 
K
G
 
G
E
 
E
F
 
F
V
 
V
F
 
F
L
 
L
V
 
I
G
 
G
S
 
P
S
|
S
G
 
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
 
T
I
 
F
V
 
M
K
 
R
L
 
L
L
 
L
L
 
L
K
 
A
E
 
A
I
 
E
D
 
T
P
 
P
T
 
T
E
 
S
G
 
G
E
 
D
I
 
V
I
 
R
V
 
V
G
 
S
E
 
K
Y
 
F
K
 
H
L
 
V
T
 
N
Q
 
K
L
 
L
P
 
R
K
 
G
R
 
R
E
 
H
I
 
V
P
 
P
Y
 
K
Y
 
L
R
 
R
R
 
Q
K
 
V
I
 
I
G
 
G
I
 
C
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
D
F
 
F
R
 
R
L
 
L
L
 
L
P
 
Q
N
 
Q
K
 
K
T
 
T
V
 
V
Y
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
V
E
 
A
F
 
F
A
 
A
M
 
L
Q
 
E
I
 
V
T
 
I
G
 
G
A
 
K
P
 
R
A
 
T
K
 
D
I
 
A
I
 
I
R
 
N
R
 
R
Q
 
V
V
 
V
P
 
P
Y
 
E
V
 
V
L
 
L
S
 
E
L
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
S
H
 
G
K
 
K
A
 
A
K
 
N
C
 
R
Y
 
L
P
 
P
H
 
D
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
F
V
 
V
N
 
N
K
 
R
P
 
P
N
 
L
L
 
V
L
 
L
V
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
D
 
E
T
 
T
S
 
S
W
 
R
E
 
D
I
 
I
M
 
M
R
 
D
L
 
L
L
 
L
E
 
E
D
 
R
I
 
I
N
 
N
K
 
R
R
 
T
G
 
G
T
 
T
T
 
T
V
 
V
L
 
L
V
 
M
A
 
A
T
 
T
H
 
H
A
 
D
K
 
H
E
 
H
I
 
I
V
 
V
D
 
D
S
 
S
M
 
M
R
 
R
K
 
Q
R
 
R
V
 
V
V
 
V
A
 
E
I
 
L
D
 
S
C
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
L
V
 
V
K
 
R
D
 
D
Q
 
E
P
 
Q
K
 
R
G
 
G
V
 
V

8i6rB Cryo-em structure of pseudomonas aeruginosa ftse(e163q)x/envc complex with atp in peptidisc (see paper)
45% identity, 92% coverage: 1:219/239 of query aligns to 1:219/222 of 8i6rB

query
sites
8i6rB
M
 
M
V
 
I
K
 
R
F
 
F
I
 
E
N
 
Q
V
 
V
S
 
G
K
 
K
R
 
R
Y
|
Y
P
 
P
N
 
N
G
 
G
V
x
H
L
 
V
A
 
G
L
 
L
T
 
H
N
 
E
I
 
V
N
 
S
L
 
F
T
 
R
I
 
V
E
 
H
K
 
R
G
 
G
E
 
E
F
 
I
V
 
L
F
 
F
L
 
V
V
 
T
G
 
G
S
 
H
S
|
S
G
 
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
I
 
L
V
 
L
K
 
R
L
 
L
L
 
I
L
 
L
K
 
A
E
 
M
I
 
E
D
 
R
P
 
P
T
 
T
E
 
S
G
 
G
E
 
K
I
 
L
I
 
L
V
 
L
G
 
G
E
 
G
Y
 
Q
K
 
D
L
 
L
T
 
G
Q
 
R
L
 
I
P
 
T
K
 
T
R
 
A
E
 
Q
I
 
I
P
 
P
Y
 
F
Y
 
L
R
 
R
R
 
R
K
 
Q
I
 
I
G
 
G
I
 
V
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
N
F
 
H
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
T
N
 
D
K
 
R
T
 
T
V
 
V
Y
 
A
E
 
D
N
 
N
V
 
I
E
 
A
F
 
L
A
 
P
M
 
L
Q
 
Q
I
 
I
T
 
L
G
 
G
A
 
M
P
 
P
A
 
K
K
 
P
I
 
E
I
 
I
R
 
A
R
 
K
Q
 
R
V
 
V
P
 
A
Y
 
S
V
 
A
L
 
L
S
 
E
L
 
R
V
 
V
G
 
N
L
 
L
A
 
K
H
 
E
K
 
K
A
 
G
K
 
E
C
 
A
Y
 
L
P
 
P
H
 
S
E
x
D
L
 
L
S
|
S
G
x
T
G
|
G
E
x
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
G
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
H
K
 
Q
P
 
P
N
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
D
 
R
T
 
L
S
 
A
W
 
S
E
 
E
I
 
I
M
 
M
R
 
G
L
 
V
L
 
F
E
 
E
D
 
D
I
 
I
N
 
N
K
 
R
R
 
L
G
 
G
T
 
T
T
 
T
V
 
V
L
 
L
V
 
I
A
 
A
T
 
S
H
 
H
A
 
D
K
 
L
E
 
A
I
 
L
V
 
I
D
 
A
S
 
R
M
 
M
R
 
R
K
 
H
R
 
R
V
 
M
V
 
L
A
 
T
I
 
L
D
 
Q
C
 
R
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
K
 
A
D
 
D
Q
 
R

8tzjA Cryo-em structure of vibrio cholerae ftse/ftsx complex (see paper)
48% identity, 85% coverage: 1:202/239 of query aligns to 2:203/220 of 8tzjA

query
sites
8tzjA
M
 
V
V
 
I
K
 
R
F
 
F
I
 
Q
N
 
Q
V
 
V
S
 
S
K
 
K
R
 
A
Y
|
Y
P
 
R
N
 
G
G
 
G
V
x
R
L
 
Q
A
|
A
L
 
L
T
 
Q
N
 
K
I
 
V
N
 
D
L
 
F
T
 
H
I
 
L
E
 
R
K
 
R
G
 
G
E
 
E
F
 
M
V
 
A
F
 
F
L
 
L
V
 
G
G
 
G
S
 
H
S
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
 
T
I
 
L
V
 
L
K
 
K
L
 
L
L
 
I
L
 
C
K
 
A
E
 
I
I
 
E
D
 
R
P
 
P
T
 
T
E
 
D
G
 
G
E
 
K
I
 
I
I
 
S
V
 
F
G
 
N
E
 
G
Y
 
H
K
 
D
L
 
I
T
 
T
Q
 
R
L
 
I
P
 
P
K
 
N
R
 
K
E
 
D
I
 
I
P
 
P
Y
 
F
Y
 
L
R
 
R
R
 
R
K
 
N
I
 
I
G
 
G
I
 
I
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
D
F
 
H
R
 
R
L
 
L
L
 
L
P
 
M
N
 
D
K
 
R
T
 
S
V
 
I
Y
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
V
E
 
A
F
 
L
A
 
P
M
 
M
Q
 
R
I
 
I
T
 
E
G
 
S
A
 
I
P
 
S
A
 
E
K
 
N
I
 
E
I
 
I
R
 
K
R
 
R
Q
 
R
V
 
V
P
 
S
Y
 
A
V
 
A
L
 
L
S
 
D
L
 
K
V
 
T
G
 
G
L
 
L
A
 
L
H
 
D
K
 
K
A
 
A
K
 
R
C
 
C
Y
 
L
P
 
P
H
 
S
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
G
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
V
V
 
V
N
 
N
K
 
R
P
 
P
N
 
T
L
 
L
L
 
L
V
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
D
 
E
T
 
L
S
 
S
W
 
S
E
 
R
I
 
V
M
 
L
R
 
R
L
 
L
L
 
F
E
 
E
D
 
E
I
 
F
N
 
N
K
 
R
R
 
A
G
 
G
T
 
V
T
 
T
V
 
I
L
 
L
V
 
L
A
 
A
T
 
T
H
 
H
A
 
D
K
 
I
E
 
H
I
 
L
V
 
V
D
 
N
S
 
S

8w6iD Cryo-em structure of escherichia coli str k12 ftsex complex with atp- gamma-s in peptidisc
47% identity, 90% coverage: 1:215/239 of query aligns to 1:215/219 of 8w6iD

query
sites
8w6iD
M
 
M
V
 
I
K
 
R
F
 
F
I
 
E
N
 
H
V
 
V
S
 
S
K
 
K
R
 
A
Y
|
Y
P
 
L
N
 
G
G
 
G
V
 
R
L
 
Q
A
 
A
L
 
L
T
 
Q
N
 
G
I
 
V
N
 
T
L
 
F
T
 
H
I
 
M
E
 
Q
K
 
P
G
 
G
E
 
E
F
 
M
V
 
A
F
 
F
L
 
L
V
 
T
G
 
G
S
 
H
S
|
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
I
 
L
V
 
L
K
 
K
L
 
L
L
 
I
L
 
C
K
 
G
E
 
I
I
 
E
D
 
R
P
 
P
T
 
S
E
 
A
G
 
G
E
 
K
I
 
I
I
 
W
V
 
F
G
 
S
E
 
G
Y
 
H
K
 
D
L
 
I
T
 
T
Q
 
R
L
 
L
P
 
K
K
 
N
R
 
R
E
 
E
I
 
V
P
 
P
Y
 
F
Y
 
L
R
 
R
R
 
R
K
 
Q
I
 
I
G
 
G
I
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
|
Q
D
 
D
F
 
H
R
 
H
L
 
L
L
 
L
P
 
M
N
 
D
K
 
R
T
 
T
V
 
V
Y
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
V
E
 
A
F
 
I
A
 
P
M
 
L
Q
 
I
I
 
I
T
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
S
A
 
G
K
 
D
I
 
D
I
 
I
R
 
R
R
 
R
Q
 
R
V
 
V
P
 
S
Y
 
A
V
 
A
L
 
L
S
 
D
L
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
L
H
 
D
K
|
K
A
 
A
K
 
K
C
 
N
Y
 
F
P
 
P
H
 
I
E
x
Q
L
 
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
E
|
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
G
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
V
V
 
V
N
 
N
K
 
K
P
 
P
N
 
A
L
 
V
L
 
L
V
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
D
D
 
A
T
 
L
S
 
S
W
 
E
E
 
G
I
 
I
M
 
L
R
 
R
L
 
L
L
 
F
E
 
E
D
 
E
I
 
F
N
 
N
K
 
R
R
 
V
G
 
G
T
 
V
T
 
T
V
 
V
L
 
L
V
 
M
A
 
A
T
 
T
H
|
H
A
 
D
K
 
I
E
 
N
I
 
L
V
 
I
D
 
S
S
 
R
M
 
R
R
 
S
K
 
Y
R
 
R
V
 
M
V
 
L
A
 
T
I
 
L
D
 
S
C
 
D
G
 
G
R
 
H
I
 
L

P0A9R7 Cell division ATP-binding protein FtsE from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
47% identity, 90% coverage: 1:215/239 of query aligns to 1:215/222 of P0A9R7

query
sites
P0A9R7
M
 
M
V
 
I
K
 
R
F
 
F
I
 
E
N
 
H
V
 
V
S
 
S
K
 
K
R
 
A
Y
 
Y
P
 
L
N
 
G
G
 
G
V
 
R
L
 
Q
A
 
A
L
 
L
T
 
Q
N
 
G
I
 
V
N
 
T
L
 
F
T
 
H
I
 
M
E
 
Q
K
 
P
G
 
G
E
 
E
F
 
M
V
 
A
F
 
F
L
 
L
V
 
T
G
 
G
S
 
H
S
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
I
 
L
V
 
L
K
 
K
L
 
L
L
 
I
L
x
C
K
 
G
E
 
I
I
 
E
D
 
R
P
 
P
T
 
S
E
 
A
G
 
G
E
 
K
I
 
I
I
 
W
V
 
F
G
 
S
E
 
G
Y
 
H
K
 
D
L
 
I
T
 
T
Q
 
R
L
 
L
P
 
K
K
 
N
R
 
R
E
 
E
I
 
V
P
 
P
Y
 
F
Y
 
L
R
 
R
R
 
R
K
 
Q
I
 
I
G
 
G
I
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
D
 
D
F
 
H
R
 
H
L
 
L
L
 
L
P
 
M
N
 
D
K
 
R
T
 
T
V
 
V
Y
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
V
E
 
A
F
 
I
A
 
P
M
 
L
Q
 
I
I
 
I
T
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
S
A
 
G
K
 
D
I
 
D
I
 
I
R
 
R
R
 
R
Q
 
R
V
 
V
P
 
S
Y
 
A
V
 
A
L
 
L
S
 
D
L
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
L
H
 
D
K
 
K
A
 
A
K
 
K
C
 
N
Y
 
F
P
 
P
H
 
I
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
G
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
V
V
 
V
N
 
N
K
 
K
P
 
P
N
 
A
L
 
V
L
 
L
V
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
D
D
 
A
T
 
L
S
 
S
W
 
E
E
 
G
I
 
I
M
 
L
R
 
R
L
 
L
L
 
F
E
 
E
D
 
E
I
 
F
N
 
N
K
 
R
R
 
V
G
 
G
T
 
V
T
 
T
V
 
V
L
 
L
V
 
M
A
 
A
T
 
T
H
 
H
A
 
D
K
 
I
E
 
N
I
 
L
V
 
I
D
 
S
S
 
R
M
 
R
R
 
S
K
 
Y
R
 
R
V
 
M
V
 
L
A
 
T
I
 
L
D
 
S
C
 
D
G
 
G
R
 
H
I
 
L

8hd0A Cell divisome spg hydrolysis machinery ftsex-envc
47% identity, 90% coverage: 1:215/239 of query aligns to 1:215/218 of 8hd0A

query
sites
8hd0A
M
 
M
V
 
I
K
 
R
F
 
F
I
 
E
N
 
H
V
 
V
S
 
S
K
 
K
R
 
A
Y
|
Y
P
 
L
N
 
G
G
 
G
V
x
R
L
 
Q
A
|
A
L
 
L
T
 
Q
N
 
G
I
 
V
N
 
T
L
 
F
T
 
H
I
 
M
E
 
Q
K
 
P
G
 
G
E
 
E
F
 
M
V
 
A
F
 
F
L
 
L
V
 
T
G
 
G
S
 
H
S
 
S
G
 
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
I
 
L
V
 
L
K
 
K
L
 
L
L
 
I
L
 
C
K
 
G
E
 
I
I
 
E
D
 
R
P
 
P
T
 
S
E
 
A
G
 
G
E
 
K
I
 
I
I
 
W
V
 
F
G
 
S
E
 
G
Y
 
H
K
 
D
L
 
I
T
 
T
Q
 
R
L
 
L
P
 
K
K
 
N
R
 
R
E
 
E
I
 
V
P
 
P
Y
 
F
Y
 
L
R
 
R
R
 
R
K
 
Q
I
 
I
G
 
G
I
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
D
 
D
F
 
H
R
 
H
L
 
L
L
 
L
P
 
M
N
 
D
K
 
R
T
 
T
V
 
V
Y
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
V
E
 
A
F
 
I
A
 
P
M
 
L
Q
 
I
I
 
I
T
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
S
A
 
G
K
 
D
I
 
D
I
 
I
R
 
R
R
 
R
Q
 
R
V
 
V
P
 
S
Y
 
A
V
 
A
L
 
L
S
 
D
L
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
L
H
 
D
K
 
K
A
 
A
K
 
K
C
 
N
Y
 
F
P
 
P
H
 
I
E
 
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
G
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
V
V
 
V
N
 
N
K
 
K
P
 
P
N
 
A
L
 
V
L
 
L
V
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
D
D
 
A
T
 
L
S
 
S
W
 
E
E
 
G
I
 
I
M
 
L
R
 
R
L
 
L
L
 
F
E
 
E
D
 
E
I
 
F
N
 
N
K
 
R
R
 
V
G
 
G
T
 
V
T
 
T
V
 
V
L
 
L
V
 
M
A
 
A
T
 
T
H
 
H
A
 
D
K
 
I
E
 
N
I
 
L
V
 
I
D
 
S
S
 
R
M
 
R
R
 
S
K
 
Y
R
 
R
V
 
M
V
 
L
A
 
T
I
 
L
D
 
S
C
 
D
G
 
G
R
 
H
I
 
L

P30750 Methionine import ATP-binding protein MetN; EC 7.4.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
39% identity, 95% coverage: 1:226/239 of query aligns to 1:231/343 of P30750

query
sites
P30750
M
 
M
V
 
I
K
 
K
F
 
L
I
 
S
N
 
N
V
 
I
S
 
T
K
 
K
R
 
V
Y
 
F
P
 
H
N
 
Q
G
 
G
-
 
T
-
 
R
-
 
T
V
 
I
L
 
Q
A
 
A
L
 
L
T
 
N
N
 
N
I
 
V
N
 
S
L
 
L
T
 
H
I
 
V
E
 
P
K
 
A
G
 
G
E
 
Q
F
 
I
V
 
Y
F
 
G
L
 
V
V
 
I
G
 
G
S
 
A
S
|
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
I
 
L
V
 
I
K
 
R
L
 
C
L
 
V
L
 
N
K
 
L
E
 
L
I
 
E
D
 
R
P
 
P
T
 
T
E
 
E
G
 
G
E
 
S
I
 
V
I
 
L
V
 
V
G
 
D
E
 
G
Y
 
Q
K
 
E
L
 
L
T
 
T
Q
 
T
L
 
L
P
 
S
K
 
E
R
 
S
E
 
E
I
 
L
P
 
T
Y
 
K
Y
 
A
R
 
R
R
 
R
K
 
Q
I
 
I
G
 
G
I
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
D
 
H
F
 
F
R
 
N
L
 
L
L
 
L
P
 
S
N
 
S
K
 
R
T
 
T
V
 
V
Y
 
F
E
 
G
N
 
N
V
 
V
E
 
A
F
 
L
A
 
P
M
 
L
Q
 
E
I
 
L
T
 
D
G
 
N
A
 
T
P
 
P
A
 
K
K
 
D
I
 
E
I
 
V
R
 
K
R
 
R
Q
 
R
V
 
V
P
 
T
Y
 
E
V
 
L
L
 
L
S
 
S
L
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
G
H
 
D
K
 
K
A
 
H
K
 
D
C
 
S
Y
 
Y
P
 
P
H
 
S
E
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
L
V
 
A
N
 
S
K
 
N
P
 
P
N
 
K
L
 
V
L
 
L
V
 
L
A
 
C
D
 
D
E
|
E
P
 
A
T
 
T
G
 
S
N
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
D
 
A
T
 
T
S
 
T
W
 
R
E
 
S
I
 
I
M
 
L
R
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
K
D
 
D
I
 
I
N
 
N
K
 
R
R
 
R
-
 
L
G
 
G
T
 
L
T
 
T
V
 
I
L
 
L
V
 
L
A
 
I
T
 
T
H
 
H
A
 
E
K
 
M
E
 
D
I
 
V
V
 
V
D
 
K
S
 
R
M
 
I
R
 
C
K
 
D
R
 
C
V
 
V
V
 
A
A
 
V
I
 
I
D
 
S
C
 
N
G
 
G
R
 
E
I
 
L
V
 
I
-
 
E
K
 
Q
D
 
D
Q
 
T
P
 
V
K
 
S
G
 
E
V
 
V
Y
 
F
S
 
S
Y
 
H

Sites not aligning to the query:

6cvlD Crystal structure of the escherichia coli atpgs-bound metni methionine abc transporter in complex with its metq binding protein (see paper)
39% identity, 95% coverage: 1:226/239 of query aligns to 2:232/344 of 6cvlD

query
sites
6cvlD
M
 
M
V
 
I
K
 
K
F
 
L
I
 
S
N
 
N
V
 
I
S
 
T
K
 
K
R
 
V
Y
x
F
P
 
H
N
x
Q
G
 
G
-
 
T
-
 
R
-
 
T
V
x
I
L
 
Q
A
 
A
L
 
L
T
 
N
N
 
N
I
 
V
N
 
S
L
 
L
T
 
H
I
 
V
E
 
P
K
 
A
G
 
G
E
 
Q
F
 
I
V
 
Y
F
 
G
L
 
V
V
 
I
G
 
G
S
 
A
S
|
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
I
 
L
V
 
I
K
 
R
L
 
C
L
 
V
L
 
N
K
 
L
E
 
L
I
 
E
D
 
R
P
 
P
T
 
T
E
 
E
G
 
G
E
 
S
I
 
V
I
 
L
V
 
V
G
 
D
E
 
G
Y
 
Q
K
 
E
L
 
L
T
 
T
Q
 
T
L
 
L
P
 
S
K
 
E
R
 
S
E
 
E
I
 
L
P
 
T
Y
 
K
Y
 
A
R
 
R
R
 
R
K
 
Q
I
 
I
G
 
G
I
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
D
 
H
F
 
F
R
 
N
L
 
L
L
 
L
P
 
S
N
 
S
K
 
R
T
 
T
V
 
V
Y
 
F
E
 
G
N
 
N
V
 
V
E
 
A
F
 
L
A
 
P
M
 
L
Q
 
E
I
 
L
T
 
D
G
 
N
A
 
T
P
 
P
A
 
K
K
 
D
I
 
E
I
 
V
R
 
K
R
 
R
Q
 
R
V
 
V
P
 
T
Y
 
E
V
 
L
L
 
L
S
 
S
L
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
G
H
 
D
K
 
K
A
 
H
K
 
D
C
 
S
Y
 
Y
P
 
P
H
 
S
E
x
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
E
x
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
L
V
 
A
N
 
S
K
 
N
P
 
P
N
 
K
L
 
V
L
 
L
V
 
L
A
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
G
 
S
N
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
D
 
A
T
 
T
S
 
T
W
 
R
E
 
S
I
 
I
M
 
L
R
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
K
D
 
D
I
 
I
N
 
N
K
 
R
R
 
R
-
 
L
G
 
G
T
 
L
T
 
T
V
 
I
L
 
L
V
 
L
A
 
I
T
 
T
H
|
H
A
 
E
K
 
M
E
 
D
I
 
V
V
 
V
D
 
K
S
 
R
M
 
I
R
 
C
K
 
D
R
 
C
V
 
V
V
 
A
A
 
V
I
 
I
D
 
S
C
 
N
G
 
G
R
 
E
I
 
L
V
 
I
-
 
E
K
 
Q
D
 
D
Q
 
T
P
 
V
K
 
S
G
 
E
V
 
V
Y
 
F
S
 
S
Y
 
H

3tuzC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 semet soak crystal form (see paper)
39% identity, 95% coverage: 1:226/239 of query aligns to 2:232/344 of 3tuzC

query
sites
3tuzC
M
 
M
V
 
I
K
 
K
F
 
L
I
 
S
N
 
N
V
 
I
S
 
T
K
 
K
R
 
V
Y
x
F
P
 
H
N
x
Q
G
 
G
-
 
T
-
 
R
-
 
T
V
 
I
L
 
Q
A
 
A
L
 
L
T
 
N
N
 
N
I
 
V
N
 
S
L
 
L
T
 
H
I
 
V
E
 
P
K
 
A
G
 
G
E
 
Q
F
 
I
V
 
Y
F
 
G
L
 
V
V
 
I
G
 
G
S
 
A
S
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
I
 
L
V
 
I
K
 
R
L
 
C
L
 
V
L
 
N
K
 
L
E
 
L
I
 
E
D
 
R
P
 
P
T
 
T
E
 
E
G
 
G
E
 
S
I
 
V
I
 
L
V
 
V
G
 
D
E
 
G
Y
 
Q
K
 
E
L
 
L
T
 
T
Q
 
T
L
 
L
P
 
S
K
 
E
R
 
S
E
 
E
I
 
L
P
 
T
Y
 
K
Y
 
A
R
 
R
R
 
R
K
 
Q
I
 
I
G
 
G
I
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
D
 
H
F
 
F
R
 
N
L
 
L
L
 
L
P
 
S
N
 
S
K
 
R
T
 
T
V
 
V
Y
 
F
E
 
G
N
 
N
V
 
V
E
 
A
F
 
L
A
 
P
M
 
L
Q
 
E
I
 
L
T
 
D
G
 
N
A
 
T
P
 
P
A
 
K
K
 
D
I
 
E
I
 
V
R
 
K
R
 
R
Q
 
R
V
 
V
P
 
T
Y
 
E
V
 
L
L
 
L
S
 
S
L
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
G
H
 
D
K
 
K
A
 
H
K
 
D
C
 
S
Y
 
Y
P
 
P
H
 
S
E
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
L
V
 
A
N
 
S
K
 
N
P
 
P
N
 
K
L
 
V
L
 
L
V
 
L
A
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
G
 
S
N
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
D
 
A
T
 
T
S
 
T
W
 
R
E
 
S
I
 
I
M
 
L
R
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
K
D
 
D
I
 
I
N
 
N
K
 
R
R
 
R
-
 
L
G
 
G
T
 
L
T
 
T
V
 
I
L
 
L
V
 
L
A
 
I
T
 
T
H
 
H
A
 
E
K
 
M
E
 
D
I
 
V
V
 
V
D
 
K
S
 
R
M
 
I
R
 
C
K
 
D
R
 
C
V
 
V
V
 
A
A
 
V
I
 
I
D
 
S
C
 
N
G
 
G
R
 
E
I
 
L
V
 
I
-
 
E
K
 
Q
D
 
D
Q
 
T
P
 
V
K
 
S
G
 
E
V
 
V
Y
 
F
S
 
S
Y
 
H

Sites not aligning to the query:

3tuiC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 native crystal form (see paper)
39% identity, 95% coverage: 1:226/239 of query aligns to 2:232/344 of 3tuiC

query
sites
3tuiC
M
 
M
V
 
I
K
 
K
F
 
L
I
 
S
N
 
N
V
 
I
S
 
T
K
 
K
R
 
V
Y
x
F
P
 
H
N
 
Q
G
 
G
-
 
T
-
 
R
-
 
T
V
 
I
L
 
Q
A
 
A
L
 
L
T
 
N
N
 
N
I
 
V
N
 
S
L
 
L
T
 
H
I
 
V
E
 
P
K
 
A
G
 
G
E
 
Q
F
 
I
V
 
Y
F
 
G
L
 
V
V
 
I
G
 
G
S
 
A
S
 
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
I
 
L
V
 
I
K
 
R
L
 
C
L
 
V
L
 
N
K
 
L
E
 
L
I
 
E
D
 
R
P
 
P
T
 
T
E
 
E
G
 
G
E
 
S
I
 
V
I
 
L
V
 
V
G
 
D
E
 
G
Y
 
Q
K
 
E
L
 
L
T
 
T
Q
 
T
L
 
L
P
 
S
K
 
E
R
 
S
E
 
E
I
 
L
P
 
T
Y
 
K
Y
 
A
R
 
R
R
 
R
K
 
Q
I
 
I
G
 
G
I
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
D
 
H
F
 
F
R
 
N
L
 
L
L
 
L
P
 
S
N
 
S
K
 
R
T
 
T
V
 
V
Y
 
F
E
 
G
N
 
N
V
 
V
E
 
A
F
 
L
A
 
P
M
 
L
Q
 
E
I
 
L
T
 
D
G
 
N
A
 
T
P
 
P
A
 
K
K
 
D
I
 
E
I
 
V
R
 
K
R
 
R
Q
 
R
V
 
V
P
 
T
Y
 
E
V
 
L
L
 
L
S
 
S
L
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
G
H
 
D
K
 
K
A
 
H
K
 
D
C
 
S
Y
 
Y
P
 
P
H
 
S
E
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
L
V
 
A
N
 
S
K
 
N
P
 
P
N
 
K
L
 
V
L
 
L
V
 
L
A
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
G
 
S
N
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
D
 
A
T
 
T
S
 
T
W
 
R
E
 
S
I
 
I
M
 
L
R
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
K
D
 
D
I
 
I
N
 
N
K
 
R
R
 
R
-
 
L
G
 
G
T
 
L
T
 
T
V
 
I
L
 
L
V
 
L
A
 
I
T
 
T
H
 
H
A
 
E
K
 
M
E
 
D
I
 
V
V
 
V
D
 
K
S
 
R
M
 
I
R
 
C
K
 
D
R
 
C
V
 
V
V
 
A
A
 
V
I
 
I
D
 
S
C
 
N
G
 
G
R
 
E
I
 
L
V
 
I
-
 
E
K
 
Q
D
 
D
Q
 
T
P
 
V
K
 
S
G
 
E
V
 
V
Y
 
F
S
 
S
Y
 
H

2pclA Crystal structure of abc transporter with complex (aq_297) from aquifex aeolicus vf5
40% identity, 88% coverage: 9:218/239 of query aligns to 10:219/223 of 2pclA

query
sites
2pclA
K
 
K
R
 
K
Y
 
V
P
 
I
N
 
R
G
 
G
V
 
Y
L
 
E
A
 
I
L
 
L
T
 
K
N
 
G
I
 
I
N
 
S
L
 
L
T
 
S
I
 
V
E
 
K
K
 
K
G
 
G
E
 
E
F
 
F
V
 
V
F
 
S
L
 
I
V
 
I
G
 
G
S
 
A
S
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
I
 
L
V
 
L
K
 
Y
L
 
I
L
 
L
L
 
G
K
 
L
E
 
L
I
 
D
D
 
A
P
 
P
T
 
T
E
 
E
G
 
G
E
 
K
I
 
V
I
 
F
V
 
L
G
 
E
E
 
G
Y
 
K
K
 
E
L
 
V
T
 
D
Q
 
Y
L
 
T
P
 
N
K
 
E
R
 
K
E
 
E
I
 
L
P
 
S
Y
 
L
Y
 
L
R
 
R
-
 
N
R
 
R
K
 
K
I
 
L
G
 
G
I
 
F
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
F
F
 
H
R
 
Y
L
 
L
L
 
I
P
 
P
N
 
E
K
 
L
T
 
T
V
 
A
Y
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
V
E
 
I
F
 
V
A
 
P
M
 
M
Q
 
L
I
 
K
T
 
M
G
 
G
A
 
K
P
 
P
A
 
K
K
 
K
I
 
E
I
 
A
R
 
K
R
 
E
Q
 
R
V
 
G
P
 
E
Y
 
Y
V
 
L
L
 
L
S
 
S
L
 
E
V
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
G
H
 
D
K
 
K
A
 
L
K
 
S
C
 
R
Y
 
K
P
 
P
H
 
Y
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
L
V
 
A
N
 
N
K
 
E
P
 
P
N
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
F
A
 
A
D
 
D
E
|
E
P
|
P
T
|
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
S
D
 
A
T
 
N
S
 
T
W
 
K
E
 
R
I
 
V
M
 
M
R
 
D
L
 
I
L
 
F
E
 
L
D
 
K
I
 
I
N
 
N
K
 
E
R
 
G
G
 
G
T
 
T
T
 
S
V
 
I
L
 
V
V
 
M
A
 
V
T
|
T
H
 
H
A
 
E
K
 
R
E
 
E
I
 
L
V
 
A
D
 
E
S
 
-
M
 
L
R
 
T
K
 
H
R
 
R
V
 
T
V
 
L
A
 
E
I
 
M
D
 
K
C
 
D
G
 
G
R
 
K
I
 
V
V
 
V
K
 
G
D
 
E

5xu1B Structure of a non-canonical abc transporter from streptococcus pneumoniae r6 (see paper)
38% identity, 92% coverage: 1:221/239 of query aligns to 3:226/226 of 5xu1B

query
sites
5xu1B
M
 
L
V
 
I
K
 
S
F
 
L
I
 
K
N
 
N
V
 
I
S
 
F
K
 
R
R
 
S
Y
 
Y
P
 
R
N
 
N
G
 
G
-
 
D
-
 
Q
-
 
E
V
 
L
L
 
Q
A
 
V
L
 
L
T
 
K
N
 
N
I
 
I
N
 
N
L
 
L
T
 
E
I
 
V
E
 
N
K
 
E
G
 
G
E
 
E
F
 
F
V
 
V
F
 
A
L
 
I
V
 
M
G
 
G
S
 
P
S
 
S
G
 
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
 
T
I
 
L
V
 
M
K
 
N
L
 
T
L
 
I
L
 
G
K
 
M
E
 
L
I
 
D
D
 
T
P
 
P
T
 
T
E
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
Y
I
 
Y
V
 
L
G
 
E
E
 
G
Y
 
Q
K
 
E
L
 
V
T
 
A
Q
 
G
L
 
L
P
 
G
K
 
E
R
 
K
E
 
Q
I
 
L
P
 
A
Y
 
K
Y
 
V
R
 
R
-
 
N
R
 
Q
K
 
Q
I
 
I
G
 
G
I
 
F
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
Q
F
 
F
R
 
F
L
 
L
L
 
L
P
 
S
N
 
K
K
 
L
T
 
N
V
 
A
Y
 
L
E
 
Q
N
 
N
V
 
V
E
 
E
F
 
L
A
 
P
M
 
L
Q
 
I
I
 
Y
T
 
A
G
 
G
A
 
V
P
 
S
A
 
S
K
 
S
I
 
K
I
 
R
R
 
R
R
 
K
Q
 
L
V
 
A
P
 
E
Y
 
E
V
 
Y
L
 
L
S
 
D
L
 
K
V
 
V
G
 
E
L
 
L
A
 
T
H
 
E
K
 
R
A
 
S
K
 
H
C
 
H
Y
 
L
P
 
P
H
 
S
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
L
V
 
V
N
 
N
K
 
N
P
 
P
N
 
S
L
 
I
L
 
I
V
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
T
D
 
K
T
 
T
S
 
G
W
 
N
E
 
Q
I
 
I
M
 
M
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
E
 
V
D
 
D
I
 
L
N
 
N
K
 
K
R
 
E
G
 
G
T
 
K
T
 
T
V
 
I
L
 
I
V
 
M
A
 
V
T
 
T
H
 
H
A
 
E
K
 
P
E
 
E
I
 
I
V
 
A
D
 
-
S
 
A
M
 
Y
R
 
A
K
 
K
R
 
R
V
 
Q
V
 
I
A
 
V
I
 
I
D
 
R
C
 
D
G
 
G
R
 
V
I
 
I
V
 
S
K
 
S
D
 
D
Q
 
S
P
 
A
K
 
Q

1f3oA Crystal structure of mj0796 atp-binding cassette (see paper)
40% identity, 92% coverage: 1:219/239 of query aligns to 1:227/232 of 1f3oA

query
sites
1f3oA
M
 
M
V
 
I
K
 
K
F
 
L
I
 
K
N
 
N
V
 
V
S
 
T
K
 
K
R
 
T
Y
|
Y
P
 
K
N
 
M
G
 
G
-
 
E
-
 
E
-
 
I
V
 
I
L
 
Y
A
 
A
L
 
L
T
 
K
N
 
N
I
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
N
I
 
I
E
 
K
K
 
E
G
 
G
E
 
E
F
 
F
V
 
V
F
 
S
L
 
I
V
 
M
G
 
G
S
 
P
S
 
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
I
 
M
V
 
L
K
 
N
L
 
I
L
 
I
L
 
G
K
 
C
E
 
L
I
 
D
D
 
K
P
 
P
T
 
T
E
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
V
I
 
Y
V
 
I
G
 
D
E
 
N
Y
 
I
K
 
K
L
 
T
T
 
N
Q
 
D
L
 
L
P
 
D
K
 
D
R
 
D
E
 
E
I
 
L
P
 
T
Y
 
K
Y
 
I
R
 
R
R
 
R
-
 
D
K
 
K
I
 
I
G
 
G
I
 
F
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
D
 
Q
F
 
F
R
 
N
L
 
L
L
 
I
P
 
P
N
 
L
K
 
L
T
 
T
V
 
A
Y
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
V
E
 
E
F
 
L
A
 
P
M
 
L
-
 
I
-
 
F
Q
 
K
I
 
Y
T
 
R
G
 
G
A
 
A
P
 
M
A
 
S
K
 
G
I
 
E
I
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
K
V
 
R
P
 
A
Y
 
L
-
 
E
V
 
C
L
 
L
S
 
K
L
 
M
V
 
A
G
 
E
L
 
L
A
 
E
H
 
E
K
 
R
-
 
F
A
 
A
K
 
N
C
 
H
Y
 
K
P
 
P
H
 
N
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
L
V
 
A
N
 
N
K
 
N
P
 
P
N
 
P
L
 
I
L
 
I
V
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
S
D
 
K
T
 
T
S
 
G
W
 
E
E
 
K
I
 
I
M
 
M
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
E
 
K
D
 
K
I
 
L
N
 
N
K
 
E
R
 
E
-
 
D
G
 
G
T
 
K
T
 
T
V
 
V
L
 
V
V
 
V
A
 
V
T
 
T
H
 
H
A
 
D
K
 
I
E
 
N
I
 
V
V
 
A
D
 
-
S
 
R
M
 
F
R
 
G
K
 
E
R
 
R
V
 
I
V
 
I
A
 
Y
I
 
L
D
 
K
C
 
D
G
 
G
R
 
E
I
 
V
V
 
E
K
 
R
D
 
E
Q
 
E

P75957 Lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD; EC 7.6.2.- from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
39% identity, 91% coverage: 1:218/239 of query aligns to 5:226/233 of P75957

query
sites
P75957
M
 
L
V
 
L
K
 
Q
F
 
C
I
 
D
N
 
N
V
 
L
S
 
C
K
 
K
R
 
R
Y
 
Y
P
 
Q
N
 
E
G
 
G
V
 
S
L
 
V
-
 
Q
-
 
T
-
 
D
A
 
V
L
 
L
T
 
H
N
 
N
I
 
V
N
 
S
L
 
F
T
 
S
I
 
V
E
 
G
K
 
E
G
 
G
E
 
E
F
 
M
V
 
M
F
 
A
L
 
I
V
 
V
G
|
G
S
 
S
S
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
I
 
L
V
 
L
K
 
H
L
 
L
L
 
L
L
 
G
K
 
G
E
 
L
I
 
D
D
 
T
P
 
P
T
 
T
E
 
S
G
 
G
E
 
D
I
 
V
I
 
I
V
 
F
G
 
N
E
 
G
Y
 
Q
K
 
P
L
 
M
T
 
S
Q
 
K
L
 
L
P
 
S
K
 
S
R
 
A
E
 
A
I
 
K
P
 
A
Y
 
E
Y
 
L
R
 
R
-
 
N
R
 
Q
K
 
K
I
 
L
G
 
G
I
 
F
V
 
I
F
 
Y
Q
 
Q
D
 
F
F
 
H
R
 
H
L
 
L
L
 
L
P
 
P
N
 
D
K
 
F
T
 
T
V
 
A
Y
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
V
E
 
A
F
 
M
A
 
P
M
 
L
Q
 
L
I
 
I
-
 
G
T
 
K
G
 
K
A
 
K
P
 
P
A
 
A
K
 
E
I
 
I
I
 
N
R
 
S
R
 
R
Q
 
A
V
 
L
P
 
E
Y
 
-
V
 
M
L
 
L
S
 
K
L
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
D
H
 
H
K
 
R
A
 
A
K
 
N
C
 
H
Y
 
R
P
 
P
H
 
S
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
L
V
 
V
N
 
N
K
 
N
P
 
P
N
 
R
L
 
L
L
 
V
V
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
A
D
 
R
T
 
N
S
 
A
W
 
D
E
 
S
I
 
I
M
 
F
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
E
 
G
D
 
E
I
 
L
N
 
N
K
 
R
-
 
L
R
 
Q
G
 
G
T
 
T
T
 
A
V
 
F
L
 
L
V
 
V
A
 
V
T
 
T
H
 
H
A
 
D
K
 
L
E
 
Q
I
 
L
V
 
A
D
 
K
S
 
R
M
 
M
R
 
S
K
 
R
R
 
Q
V
 
L
V
 
E
A
 
M
I
 
R
D
 
D
C
 
-
G
 
G
R
 
R
I
 
L
V
 
T
K
 
A
D
 
E

7mdyC Lolcde nucleotide-bound
39% identity, 91% coverage: 1:218/239 of query aligns to 2:223/226 of 7mdyC

query
sites
7mdyC
M
 
L
V
 
L
K
 
Q
F
 
C
I
 
D
N
 
N
V
 
L
S
 
C
K
 
K
R
 
R
Y
|
Y
P
 
Q
N
 
E
G
 
G
V
 
S
L
 
V
-
 
Q
-
 
T
-
 
D
A
 
V
L
 
L
T
 
H
N
 
N
I
 
V
N
 
S
L
 
F
T
 
S
I
 
V
E
 
G
K
 
E
G
 
G
E
 
E
F
 
M
V
 
M
F
 
A
L
 
I
V
 
V
G
 
G
S
 
S
S
 
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
I
 
L
V
 
L
K
 
H
L
 
L
L
 
L
L
 
G
K
 
G
E
 
L
I
 
D
D
 
T
P
 
P
T
 
T
E
 
S
G
 
G
E
 
D
I
 
V
I
 
I
V
 
F
G
 
N
E
 
G
Y
 
Q
K
 
P
L
 
M
T
 
S
Q
 
K
L
 
L
P
 
S
K
 
S
R
 
A
E
 
A
I
 
K
P
 
A
Y
 
E
Y
 
L
R
 
R
-
 
N
R
 
Q
K
 
K
I
 
L
G
 
G
I
 
F
V
 
I
F
 
Y
Q
|
Q
D
 
F
F
 
H
R
 
H
L
 
L
L
 
L
P
 
P
N
 
D
K
 
F
T
 
T
V
 
A
Y
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
V
E
 
A
F
 
M
A
 
P
M
 
L
Q
 
L
I
 
I
-
 
G
T
 
K
G
 
K
A
 
K
P
 
P
A
 
A
K
 
E
I
 
I
I
 
N
R
 
S
R
 
R
Q
 
A
V
 
L
P
 
E
Y
 
-
V
 
M
L
 
L
S
 
K
L
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
D
H
 
H
K
 
R
A
 
A
K
 
N
C
x
H
Y
 
R
P
 
P
H
 
S
E
|
E
L
 
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
E
 
E
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
L
V
 
V
N
 
N
K
 
N
P
 
P
N
 
R
L
 
L
L
 
V
V
 
L
A
 
A
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
|
N
L
 
L
D
 
D
P
 
A
D
 
R
T
 
N
S
 
A
W
 
D
E
 
S
I
 
I
M
 
F
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
E
 
G
D
 
E
I
 
L
N
 
N
K
 
R
-
 
L
R
 
Q
G
 
G
T
 
T
T
 
A
V
 
F
L
 
L
V
 
V
A
 
V
T
 
T
H
|
H
A
 
D
K
 
L
E
 
Q
I
 
L
V
 
A
D
 
K
S
 
R
M
 
M
R
 
S
K
 
R
R
 
Q
V
 
L
V
 
E
A
 
M
I
 
R
D
 
D
C
 
-
G
 
G
R
 
R
I
 
L
V
 
T
K
 
A
D
 
E

Query Sequence

>WP_013402867.1 NCBI__GCF_000166355.1:WP_013402867.1
MVKFINVSKRYPNGVLALTNINLTIEKGEFVFLVGSSGAGKSTIVKLLLKEIDPTEGEII
VGEYKLTQLPKREIPYYRRKIGIVFQDFRLLPNKTVYENVEFAMQITGAPAKIIRRQVPY
VLSLVGLAHKAKCYPHELSGGEQQRVALARAIVNKPNLLVADEPTGNLDPDTSWEIMRLL
EDINKRGTTVLVATHAKEIVDSMRKRVVAIDCGRIVKDQPKGVYSYESSDNQVLLQRWI

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory