SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_013403278.1 NCBI__GCF_000166355.1:WP_013403278.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2rcyA Crystal structure of plasmodium falciparum pyrroline carboxylate reductase (mal13p1.284) with NADP bound
37% identity, 99% coverage: 1:257/260 of query aligns to 5:258/262 of 2rcyA

query
sites
2rcyA
M
 
I
K
 
K
I
 
L
G
 
G
I
 
F
I
 
M
G
 
G
C
 
L
G
|
G
N
x
Q
M
|
M
A
 
G
S
 
S
S
 
A
I
 
L
A
 
A
H
 
H
S
 
G
I
 
I
K
 
A
Q
 
N
S
 
A
I
 
-
E
 
-
A
 
-
Q
 
-
L
 
-
F
 
-
C
 
-
Y
 
-
D
 
N
I
 
I
D
 
-
I
 
I
D
 
K
K
 
K
A
 
E
N
 
N
R
 
L
F
 
F
S
 
-
Q
 
-
V
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
A
x
P
T
 
S
K
 
K
M
 
K
N
 
N
S
 
T
E
 
T
I
 
L
E
 
N
T
 
Y
V
 
M
E
 
S
S
 
S
S
x
N
-
 
E
-
 
E
-
 
L
-
 
A
-
 
R
-
 
H
-
 
C
S
 
D
I
 
I
I
 
I
I
 
V
I
 
C
A
 
A
V
|
V
K
 
K
P
|
P
K
 
D
D
x
I
I
 
A
F
 
G
D
 
S
V
 
V
L
 
L
E
 
N
K
 
N
I
 
I
K
 
K
D
 
P
G
 
Y
I
 
L
S
 
S
E
 
S
K
 
K
I
 
L
I
 
L
V
 
I
S
 
S
I
|
I
A
x
C
A
x
G
G
 
G
I
 
L
S
 
N
I
 
I
S
 
G
K
 
K
I
 
L
K
 
E
E
 
E
V
 
M
V
 
V
G
 
G
-
 
S
D
 
E
K
 
N
K
 
K
I
 
I
V
 
V
R
 
W
V
 
V
M
|
M
P
 
P
N
 
N
I
 
T
N
 
P
I
 
C
S
 
L
V
 
V
Q
 
G
K
 
E
G
 
G
V
 
S
M
 
F
G
 
I
I
 
Y
C
 
C
F
 
S
S
 
N
E
 
K
T
 
N
V
 
V
A
 
N
A
 
S
D
 
T
E
 
D
K
 
K
E
 
K
K
 
Y
I
 
V
L
 
N
N
 
D
L
 
I
F
 
F
K
 
N
S
 
S
M
 
C
G
 
G
E
 
I
V
 
I
I
 
H
A
 
E
T
 
I
D
 
K
E
 
E
K
 
K
H
 
D
M
 
M
D
 
D
A
 
I
I
 
A
T
 
T
A
 
A
L
 
I
F
 
S
G
 
G
S
 
C
G
 
G
P
 
P
A
 
A
F
 
Y
V
 
V
A
 
Y
H
 
L
F
 
F
I
 
I
E
 
E
S
 
S
C
 
L
V
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
G
V
 
V
K
 
K
L
 
N
G
 
G
F
 
L
S
 
S
R
 
R
Q
 
E
E
 
L
S
 
S
L
 
K
K
 
N
L
 
L
I
 
V
L
 
L
A
 
Q
L
 
T
F
 
I
E
 
K
G
 
G
T
 
S
V
 
V
V
 
E
N
 
M
M
 
V
K
 
K
N
 
K
N
 
S
M
 
D
L
 
Q
T
 
P
T
 
V
Q
 
Q
Q
 
Q
I
 
L
K
 
K
D
 
D
M
 
N
V
x
I
T
 
V
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
I
T
 
T
I
 
A
E
 
V
G
 
G
L
 
L
V
 
Y
E
 
S
F
 
L
E
 
E
R
 
K
R
 
N
A
 
S
V
 
F
K
 
K
G
 
Y
A
 
T
I
 
V
I
 
M
D
 
N
G
 
A
I
 
V
L
 
E
K
 
A
A
 
A
F
 
C
E
 
E
R
 
K
A
 
S
K
 
K

5bshA Crystal structure of medicago truncatula (delta)1-pyrroline-5- carboxylate reductase (mtp5cr) in complex with l-proline (see paper)
32% identity, 99% coverage: 3:259/260 of query aligns to 11:271/272 of 5bshA

query
sites
5bshA
I
 
L
G
 
G
I
 
F
I
 
I
G
 
G
C
 
A
G
 
G
N
 
K
M
 
M
A
 
A
S
 
E
S
 
S
I
 
I
A
 
A
H
 
K
S
 
G
I
 
A
K
 
V
Q
 
R
S
 
S
-
 
G
-
 
V
I
 
L
E
 
S
A
 
P
Q
 
S
L
 
R
F
 
I
C
 
K
Y
 
T
D
 
A
I
 
I
D
 
H
I
 
S
D
 
N
K
 
P
A
 
A
N
 
R
R
 
R
F
 
T
S
 
A
-
 
F
Q
 
E
V
 
S
Y
 
I
G
 
G
A
 
I
T
 
T
K
 
V
M
 
L
N
 
S
S
 
S
E
 
N
I
 
D
E
 
D
T
 
V
V
 
V
E
 
R
S
 
D
S
 
S
S
 
N
I
 
V
I
 
V
I
 
V
I
 
F
A
 
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
K
 
Q
D
 
L
I
 
L
F
 
K
D
 
D
V
 
V
L
 
V
E
 
L
K
 
K
I
 
L
K
 
K
D
 
P
G
 
L
I
 
L
S
 
T
-
 
K
E
 
D
K
 
K
I
 
L
I
 
L
V
 
V
S
 
S
I
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
I
S
 
K
I
 
M
S
 
K
K
 
D
I
 
L
K
 
Q
E
 
E
V
 
W
V
 
A
G
 
G
D
 
H
K
 
E
K
 
R
I
 
F
V
 
I
R
 
R
V
 
V
M
 
M
P
 
P
N
 
N
I
 
T
N
 
A
I
 
A
S
 
T
V
 
V
Q
 
G
K
 
E
G
 
A
V
 
A
M
 
S
G
 
V
I
 
M
C
 
S
F
 
L
S
 
G
E
 
G
T
 
A
V
 
A
A
 
T
A
 
E
D
 
E
E
 
D
K
 
A
E
 
N
K
 
L
I
 
I
L
 
S
N
 
Q
L
 
L
F
 
F
K
 
G
S
 
S
M
 
I
G
 
G
E
 
K
V
 
I
I
 
W
A
 
K
T
 
A
D
 
D
E
 
D
K
 
K
H
 
Y
M
 
F
D
 
D
A
 
A
I
 
I
T
 
T
A
 
G
L
 
L
F
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
F
 
Y
V
 
I
A
 
Y
H
 
L
F
 
A
I
 
I
E
 
E
S
 
A
C
 
L
V
 
A
D
 
D
A
 
G
A
 
G
V
 
V
K
 
A
L
 
A
G
 
G
F
 
L
S
 
P
R
 
R
Q
 
D
E
 
L
S
 
A
L
 
L
K
 
S
L
 
L
I
 
A
L
 
S
A
 
Q
L
 
T
F
 
V
E
 
L
G
 
G
T
 
A
V
 
A
V
 
S
N
 
M
M
 
A
K
 
T
N
 
Q
N
 
S
M
 
G
L
 
K
T
 
H
T
 
P
Q
 
G
Q
 
Q
I
 
L
K
 
K
D
 
D
M
 
D
V
|
V
T
 
T
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
|
T
T
|
T
I
 
I
E
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
H
E
 
E
F
 
L
E
 
E
R
 
K
R
 
A
A
 
G
V
 
F
K
 
R
G
 
G
A
 
I
I
 
L
I
 
M
D
 
N
G
 
A
I
 
V
L
 
V
K
 
A
A
 
A
F
 
A
E
 
K
R
 
R
A
 
S
K
 
Q
N
 
E
I
 
L

5bsgA Crystal structure of medicago truncatula (delta)1-pyrroline-5- carboxylate reductase (mtp5cr) in complex with NADP+ (see paper)
32% identity, 99% coverage: 3:259/260 of query aligns to 11:271/272 of 5bsgA

query
sites
5bsgA
I
 
L
G
 
G
I
 
F
I
 
I
G
|
G
C
 
A
G
|
G
N
x
K
M
|
M
A
 
A
S
 
E
S
 
S
I
 
I
A
 
A
H
 
K
S
 
G
I
 
A
K
 
V
Q
 
R
S
 
S
-
 
G
-
 
V
I
 
L
E
 
S
A
 
P
Q
 
S
L
 
R
F
 
I
C
 
K
Y
 
T
D
 
A
I
 
I
D
x
H
I
x
S
D
x
N
K
 
P
A
 
A
N
 
R
R
 
R
F
 
T
S
 
A
-
 
F
Q
 
E
V
 
S
Y
 
I
G
 
G
A
 
I
T
 
T
K
 
V
M
 
L
N
 
S
S
 
S
E
x
N
I
 
D
E
 
D
T
 
V
V
 
V
E
 
R
S
 
D
S
 
S
S
 
N
I
 
V
I
 
V
I
 
V
I
 
F
A
x
S
V
|
V
K
|
K
P
 
P
K
 
Q
D
x
L
I
 
L
F
 
K
D
 
D
V
|
V
L
 
V
E
 
L
K
 
K
I
 
L
K
 
K
D
 
P
G
 
L
I
 
L
S
 
T
-
 
K
E
 
D
K
 
K
I
 
L
I
 
L
V
 
V
S
 
S
I
x
V
A
|
A
A
|
A
G
 
G
I
 
I
S
 
K
I
 
M
S
 
K
K
 
D
I
 
L
K
 
Q
E
 
E
V
 
W
V
 
A
G
 
G
D
 
H
K
 
E
K
 
R
I
 
F
V
 
I
R
 
R
V
 
V
M
 
M
P
|
P
N
 
N
I
 
T
N
 
A
I
 
A
S
 
T
V
 
V
Q
 
G
K
 
E
G
 
A
V
 
A
M
 
S
G
 
V
I
 
M
C
 
S
F
 
L
S
 
G
E
 
G
T
 
A
V
 
A
A
 
T
A
 
E
D
 
E
E
 
D
K
 
A
E
 
N
K
 
L
I
 
I
L
 
S
N
 
Q
L
 
L
F
 
F
K
 
G
S
 
S
M
 
I
G
 
G
E
 
K
V
 
I
I
 
W
A
 
K
T
 
A
D
 
D
E
 
D
K
 
K
H
 
Y
M
 
F
D
 
D
A
 
A
I
 
I
T
 
T
A
 
G
L
 
L
F
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
F
 
Y
V
 
I
A
 
Y
H
 
L
F
 
A
I
 
I
E
 
E
S
 
A
C
 
L
V
 
A
D
 
D
A
 
G
A
 
G
V
 
V
K
 
A
L
 
A
G
 
G
F
 
L
S
 
P
R
 
R
Q
 
D
E
 
L
S
 
A
L
 
L
K
 
S
L
 
L
I
 
A
L
 
S
A
 
Q
L
 
T
F
 
V
E
 
L
G
 
G
T
 
A
V
 
A
V
 
S
N
 
M
M
 
A
K
 
T
N
 
Q
N
 
S
M
 
G
L
 
K
T
 
H
T
 
P
Q
 
G
Q
 
Q
I
 
L
K
 
K
D
 
D
M
 
D
V
 
V
T
 
T
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
|
T
I
 
I
E
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
H
E
 
E
F
 
L
E
 
E
R
 
K
R
 
A
A
 
G
V
 
F
K
 
R
G
 
G
A
 
I
I
 
L
I
 
M
D
 
N
G
 
A
I
 
V
L
 
V
K
 
A
A
 
A
F
 
A
E
 
K
R
 
R
A
 
S
K
 
Q
N
 
E
I
 
L

5bsfA Crystal structure of medicago truncatula (delta)1-pyrroline-5- carboxylate reductase (mtp5cr) in complex with NAD+ (see paper)
32% identity, 99% coverage: 3:259/260 of query aligns to 11:271/272 of 5bsfA

query
sites
5bsfA
I
 
L
G
 
G
I
 
F
I
 
I
G
|
G
C
 
A
G
|
G
N
x
K
M
|
M
A
 
A
S
 
E
S
 
S
I
 
I
A
 
A
H
 
K
S
 
G
I
 
A
K
 
V
Q
 
R
S
 
S
-
 
G
-
 
V
I
 
L
E
 
S
A
 
P
Q
 
S
L
 
R
F
 
I
C
 
K
Y
 
T
D
 
A
I
 
I
D
x
H
I
 
S
D
 
N
K
 
P
A
 
A
N
 
R
R
 
R
F
 
T
S
 
A
-
 
F
Q
 
E
V
 
S
Y
 
I
G
 
G
A
 
I
T
 
T
K
 
V
M
 
L
N
 
S
S
 
S
E
x
N
I
 
D
E
 
D
T
 
V
V
 
V
E
 
R
S
 
D
S
 
S
S
 
N
I
 
V
I
 
V
I
 
V
I
 
F
A
x
S
V
|
V
K
|
K
P
 
P
K
 
Q
D
x
L
I
 
L
F
 
K
D
 
D
V
|
V
L
 
V
E
 
L
K
 
K
I
 
L
K
 
K
D
 
P
G
 
L
I
 
L
S
 
T
-
 
K
E
 
D
K
 
K
I
 
L
I
 
L
V
 
V
S
 
S
I
x
V
A
 
A
A
|
A
G
 
G
I
 
I
S
 
K
I
 
M
S
 
K
K
 
D
I
 
L
K
 
Q
E
 
E
V
 
W
V
 
A
G
 
G
D
 
H
K
 
E
K
 
R
I
 
F
V
 
I
R
 
R
V
 
V
M
 
M
P
|
P
N
 
N
I
 
T
N
 
A
I
 
A
S
 
T
V
 
V
Q
 
G
K
 
E
G
 
A
V
 
A
M
 
S
G
 
V
I
 
M
C
 
S
F
 
L
S
 
G
E
 
G
T
 
A
V
 
A
A
 
T
A
 
E
D
 
E
E
 
D
K
 
A
E
 
N
K
 
L
I
 
I
L
 
S
N
 
Q
L
 
L
F
 
F
K
 
G
S
 
S
M
 
I
G
 
G
E
 
K
V
 
I
I
 
W
A
 
K
T
 
A
D
 
D
E
 
D
K
 
K
H
 
Y
M
 
F
D
 
D
A
 
A
I
 
I
T
 
T
A
 
G
L
 
L
F
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
F
 
Y
V
 
I
A
 
Y
H
 
L
F
 
A
I
 
I
E
 
E
S
 
A
C
 
L
V
 
A
D
 
D
A
 
G
A
 
G
V
 
V
K
 
A
L
 
A
G
 
G
F
 
L
S
 
P
R
 
R
Q
 
D
E
 
L
S
 
A
L
 
L
K
 
S
L
 
L
I
 
A
L
 
S
A
 
Q
L
 
T
F
 
V
E
 
L
G
 
G
T
 
A
V
 
A
V
 
S
N
 
M
M
 
A
K
 
T
N
 
Q
N
 
S
M
 
G
L
 
K
T
 
H
T
 
P
Q
 
G
Q
 
Q
I
 
L
K
 
K
D
 
D
M
 
D
V
 
V
T
 
T
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
|
T
I
 
I
E
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
H
E
 
E
F
 
L
E
 
E
R
 
K
R
 
A
A
 
G
V
 
F
K
 
R
G
 
G
A
 
I
I
 
L
I
 
M
D
 
N
G
 
A
I
 
V
L
 
V
K
 
A
A
 
A
F
 
A
E
 
K
R
 
R
A
 
S
K
 
Q
N
 
E
I
 
L

5bseA Crystal structure of medicago truncatula (delta)1-pyrroline-5- carboxylate reductase (mtp5cr) (see paper)
32% identity, 99% coverage: 3:259/260 of query aligns to 11:271/272 of 5bseA

query
sites
5bseA
I
 
L
G
 
G
I
 
F
I
 
I
G
 
G
C
 
A
G
 
G
N
 
K
M
 
M
A
 
A
S
 
E
S
 
S
I
 
I
A
 
A
H
 
K
S
 
G
I
 
A
K
 
V
Q
 
R
S
 
S
-
 
G
-
 
V
I
 
L
E
 
S
A
 
P
Q
 
S
L
 
R
F
 
I
C
 
K
Y
 
T
D
 
A
I
 
I
D
 
H
I
 
S
D
 
N
K
 
P
A
 
A
N
 
R
R
 
R
F
 
T
S
 
A
-
 
F
Q
 
E
V
 
S
Y
 
I
G
 
G
A
 
I
T
 
T
K
 
V
M
 
L
N
 
S
S
 
S
E
 
N
I
 
D
E
 
D
T
 
V
V
 
V
E
 
R
S
 
D
S
 
S
S
 
N
I
 
V
I
 
V
I
 
V
I
 
F
A
 
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
K
 
Q
D
 
L
I
 
L
F
 
K
D
 
D
V
 
V
L
 
V
E
 
L
K
 
K
I
 
L
K
 
K
D
 
P
G
 
L
I
 
L
S
 
T
-
 
K
E
 
D
K
 
K
I
 
L
I
 
L
V
 
V
S
 
S
I
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
I
S
 
K
I
 
M
S
 
K
K
 
D
I
 
L
K
 
Q
E
 
E
V
 
W
V
 
A
G
 
G
D
 
H
K
 
E
K
 
R
I
 
F
V
 
I
R
 
R
V
 
V
M
 
M
P
 
P
N
 
N
I
 
T
N
 
A
I
 
A
S
 
T
V
 
V
Q
 
G
K
 
E
G
 
A
V
 
A
M
 
S
G
 
V
I
 
M
C
 
S
F
 
L
S
 
G
E
 
G
T
 
A
V
 
A
A
 
T
A
 
E
D
 
E
E
 
D
K
 
A
E
 
N
K
 
L
I
 
I
L
 
S
N
 
Q
L
 
L
F
 
F
K
 
G
S
 
S
M
 
I
G
 
G
E
 
K
V
 
I
I
 
W
A
 
K
T
 
A
D
 
D
E
 
D
K
 
K
H
 
Y
M
 
F
D
 
D
A
 
A
I
 
I
T
 
T
A
 
G
L
 
L
F
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
F
 
Y
V
 
I
A
 
Y
H
 
L
F
 
A
I
 
I
E
 
E
S
 
A
C
 
L
V
 
A
D
 
D
A
 
G
A
 
G
V
 
V
K
 
A
L
 
A
G
 
G
F
 
L
S
 
P
R
 
R
Q
 
D
E
 
L
S
 
A
L
 
L
K
 
S
L
 
L
I
 
A
L
 
S
A
 
Q
L
 
T
F
 
V
E
 
L
G
 
G
T
 
A
V
 
A
V
 
S
N
 
M
M
 
A
K
 
T
N
 
Q
N
 
S
M
 
G
L
 
K
T
 
H
T
 
P
Q
 
G
Q
 
Q
I
 
L
K
 
K
D
 
D
M
 
D
V
 
V
T
 
T
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
|
T
I
 
I
E
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
H
E
 
E
F
 
L
E
 
E
R
 
K
R
 
A
A
 
G
V
 
F
K
 
R
G
 
G
A
 
I
I
 
L
I
 
M
D
 
N
G
 
A
I
 
V
L
 
V
K
 
A
A
 
A
F
 
A
E
 
K
R
 
R
A
 
S
K
 
Q
N
 
E
I
 
L

2ahrE Crystal structures of 1-pyrroline-5-carboxylate reductase from human pathogen streptococcus pyogenes (see paper)
30% identity, 100% coverage: 1:259/260 of query aligns to 4:259/259 of 2ahrE

query
sites
2ahrE
M
 
M
K
 
K
I
 
I
G
 
G
I
 
I
I
 
I
G
 
G
C
 
V
G
|
G
N
x
K
M
|
M
A
 
A
S
 
S
S
 
A
I
 
I
A
 
I
H
 
K
S
 
G
I
 
L
K
 
K
Q
 
Q
S
 
T
I
 
P
E
 
H
A
 
-
Q
 
E
L
 
L
F
 
I
C
 
I
Y
 
S
D
x
G
I
x
S
D
 
S
I
 
L
D
 
E
K
x
R
A
 
S
N
 
K
R
 
E
F
 
I
S
 
A
Q
 
E
V
 
Q
Y
 
L
G
 
A
A
 
L
T
 
P
K
 
Y
M
 
A
N
 
M
S
 
S
E
x
H
I
 
Q
E
 
D
T
 
L
V
 
I
E
 
D
S
 
Q
S
 
V
S
 
D
I
 
L
I
 
V
I
 
I
I
 
L
A
 
G
V
x
I
K
 
K
P
|
P
K
 
Q
D
x
L
I
 
F
F
 
E
D
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
K
K
 
P
I
 
L
K
 
H
D
 
-
G
 
-
I
 
-
S
 
F
E
 
K
K
 
Q
I
 
P
I
 
I
V
 
I
S
 
S
I
x
M
A
|
A
A
|
A
G
 
G
I
 
I
S
 
S
I
 
L
S
 
Q
K
 
R
I
 
L
K
 
A
E
 
T
V
 
F
V
 
V
G
 
G
-
 
Q
D
 
D
K
 
L
K
 
P
I
 
L
V
 
L
R
 
R
V
 
I
M
|
M
P
|
P
N
 
N
I
 
M
N
 
N
I
 
A
S
 
Q
V
 
I
Q
 
L
K
 
Q
G
 
S
V
 
S
M
 
T
G
 
A
I
 
L
C
 
T
F
 
G
S
 
N
E
 
A
T
 
L
V
 
V
A
 
S
A
 
Q
D
 
E
E
 
L
K
 
Q
E
 
A
K
 
R
I
 
V
L
 
R
N
 
D
L
 
L
F
 
T
K
 
D
S
 
S
M
 
F
G
 
G
E
 
S
V
 
T
I
 
F
A
 
D
T
 
I
D
 
S
E
 
E
K
 
K
H
 
D
M
 
F
D
 
D
A
 
T
I
 
F
T
 
T
A
 
A
L
 
L
F
 
A
G
 
G
S
 
S
G
 
S
P
 
P
A
 
A
F
 
Y
V
 
I
A
 
Y
H
 
L
F
 
F
I
 
I
E
 
E
S
 
A
C
 
L
V
 
A
D
 
K
A
 
A
A
 
G
V
 
V
K
 
K
L
 
N
G
 
G
F
 
I
S
 
P
R
 
K
Q
 
A
E
 
K
S
 
A
L
 
L
K
 
E
L
 
I
I
 
V
L
 
T
A
 
Q
L
 
T
F
 
V
E
 
L
G
 
A
T
 
S
V
 
A
V
 
S
N
 
N
M
 
L
K
 
K
N
 
T
N
 
S
M
 
S
L
 
Q
T
 
S
T
 
P
Q
 
H
Q
 
D
I
 
F
K
 
I
D
 
D
M
 
A
V
 
I
T
 
C
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
 
T
I
 
I
E
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
M
E
 
E
F
 
L
E
 
E
R
 
R
R
 
L
A
 
G
V
 
L
K
 
T
G
 
A
A
 
T
I
 
V
I
 
S
D
 
S
G
 
A
I
 
I
L
 
D
K
 
K
A
 
T
F
 
I
E
 
D
R
 
K
A
 
A
K
 
K
N
 
S
I
 
L

2amfA Crystal structure of 1-pyrroline-5-carboxylate reductase from human pathogen streptococcus pyogenes (see paper)
30% identity, 100% coverage: 1:259/260 of query aligns to 2:257/257 of 2amfA

query
sites
2amfA
M
 
M
K
 
K
I
 
I
G
 
G
I
 
I
I
 
I
G
 
G
C
 
V
G
 
G
N
 
K
M
|
M
A
 
A
S
 
S
S
 
A
I
 
I
A
 
I
H
 
K
S
 
G
I
 
L
K
 
K
Q
 
Q
S
 
T
I
 
P
E
 
H
A
 
-
Q
 
E
L
 
L
F
 
I
C
 
I
Y
 
S
D
 
G
I
 
S
D
 
S
I
 
L
D
 
E
K
 
R
A
 
S
N
 
K
R
 
E
F
 
I
S
 
A
Q
 
E
V
 
Q
Y
 
L
G
 
A
A
 
L
T
 
P
K
 
Y
M
 
A
N
 
M
S
 
S
E
 
H
I
 
Q
E
 
D
T
 
L
V
 
I
E
 
D
S
 
Q
S
 
V
S
 
D
I
 
L
I
 
V
I
 
I
I
 
L
A
 
G
V
 
I
K
 
K
P
 
P
K
 
Q
D
 
L
I
 
F
F
 
E
D
 
T
V
 
V
L
 
L
E
 
K
K
 
P
I
 
L
K
 
H
D
 
-
G
 
-
I
 
-
S
 
F
E
 
K
K
 
Q
I
 
P
I
 
I
V
 
I
S
 
S
I
 
M
A
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
I
S
 
S
I
 
L
S
 
Q
K
 
R
I
 
L
K
 
A
E
 
T
V
 
F
V
 
V
G
 
G
-
 
Q
D
 
D
K
 
L
K
 
P
I
 
L
V
 
L
R
 
R
V
 
I
M
|
M
P
|
P
N
 
N
I
 
M
N
 
N
I
 
A
S
 
Q
V
 
I
Q
 
L
K
 
Q
G
 
S
V
 
S
M
 
T
G
 
A
I
 
L
C
 
T
F
 
G
S
 
N
E
 
A
T
 
L
V
 
V
A
 
S
A
 
Q
D
 
E
E
 
L
K
 
Q
E
 
A
K
 
R
I
 
V
L
 
R
N
 
D
L
 
L
F
 
T
K
 
D
S
 
S
M
 
F
G
 
G
E
 
S
V
 
T
I
 
F
A
 
D
T
 
I
D
 
S
E
 
E
K
 
K
H
 
D
M
 
F
D
 
D
A
 
T
I
 
F
T
 
T
A
 
A
L
 
L
F
 
A
G
 
G
S
 
S
G
 
S
P
 
P
A
 
A
F
 
Y
V
 
I
A
 
Y
H
 
L
F
 
F
I
 
I
E
 
E
S
 
A
C
 
L
V
 
A
D
 
K
A
 
A
A
 
G
V
 
V
K
 
K
L
 
N
G
 
G
F
 
I
S
 
P
R
 
K
Q
 
A
E
 
K
S
 
A
L
 
L
K
 
E
L
 
I
I
 
V
L
 
T
A
 
Q
L
 
T
F
 
V
E
 
L
G
 
A
T
 
S
V
 
A
V
 
S
N
 
N
M
 
L
K
 
K
N
 
T
N
 
S
M
 
S
L
 
Q
T
 
S
T
 
P
Q
 
H
Q
 
D
I
 
F
K
 
I
D
 
D
M
 
A
V
 
I
T
 
C
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
|
G
T
|
T
T
|
T
I
 
I
E
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
M
E
 
E
F
 
L
E
 
E
R
 
R
R
 
L
A
 
G
V
 
L
K
 
T
G
 
A
A
 
T
I
 
V
I
 
S
D
 
S
G
 
A
I
 
I
L
 
D
K
 
K
A
 
T
F
 
I
E
 
D
R
 
K
A
 
A
K
 
K
N
 
S
I
 
L

2ag8A NADP complex of pyrroline-5-carboxylate reductase from neisseria meningitidis (see paper)
29% identity, 100% coverage: 1:259/260 of query aligns to 1:258/263 of 2ag8A

query
sites
2ag8A
M
 
M
K
 
N
I
 
V
G
 
Y
I
 
F
I
x
L
G
|
G
C
 
G
G
|
G
N
|
N
M
|
M
A
 
A
S
 
A
S
 
A
I
 
V
A
 
A
H
 
G
S
 
G
I
 
L
K
 
V
Q
 
K
S
 
Q
I
 
G
E
 
G
A
 
Y
Q
 
R
L
 
I
F
 
Y
C
 
I
Y
x
A
D
x
N
I
x
R
D
x
G
I
 
A
D
 
E
K
|
K
A
 
R
N
 
E
R
 
R
F
 
L
S
 
E
Q
 
K
V
 
E
Y
 
L
G
 
G
A
 
-
T
 
V
K
 
E
M
 
T
N
 
S
S
 
A
E
 
T
I
 
L
E
 
P
T
 
E
V
 
L
E
 
H
S
 
S
S
 
D
S
 
D
I
 
V
I
 
L
I
 
I
I
 
L
A
|
A
V
|
V
K
|
K
P
 
P
K
 
Q
D
 
D
I
 
M
F
 
E
D
 
A
V
x
A
L
 
C
E
 
K
K
 
N
I
 
I
K
 
R
D
 
-
G
 
-
I
 
T
S
 
N
E
 
G
K
 
A
I
 
L
I
 
V
V
 
L
S
 
S
I
x
V
A
|
A
A
|
A
G
 
G
I
 
L
S
 
S
I
 
V
S
 
G
K
 
T
I
 
L
K
 
S
E
 
R
V
 
Y
V
 
L
G
 
G
D
 
G
-
 
T
K
 
R
K
 
R
I
 
I
V
 
V
R
 
R
V
 
V
M
|
M
P
|
P
N
 
N
I
 
T
N
 
P
I
 
G
S
 
K
V
 
I
Q
 
G
K
 
L
G
 
G
V
 
V
M
 
S
G
 
G
I
 
M
C
 
Y
F
 
A
S
 
E
E
 
A
T
 
E
V
 
V
A
 
S
A
 
E
D
 
T
E
 
D
K
 
R
E
 
R
K
 
I
I
 
A
L
 
D
N
 
R
L
 
I
F
 
M
K
 
K
S
 
S
M
 
V
G
 
G
-
 
L
E
 
T
V
 
V
I
 
W
A
 
L
T
 
D
D
 
D
E
 
E
K
 
E
H
 
K
M
 
M
D
 
H
A
 
G
I
 
I
T
 
T
A
 
G
L
 
I
F
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
F
 
Y
V
 
V
A
 
F
H
 
Y
F
 
L
I
 
L
E
 
D
S
 
A
C
 
L
V
 
Q
D
 
N
A
 
A
A
 
A
V
 
I
K
 
R
L
 
Q
G
 
G
F
 
F
S
 
D
R
 
M
Q
 
A
E
 
E
S
 
A
L
 
R
K
 
A
L
 
L
I
 
S
L
 
L
A
 
A
L
 
T
F
 
F
E
 
K
G
 
G
T
 
A
V
 
V
V
 
A
N
 
L
M
 
A
K
 
E
N
 
Q
N
 
T
M
 
G
L
 
E
T
 
D
T
 
F
Q
 
E
Q
 
K
I
 
L
K
 
Q
D
 
K
M
 
N
V
 
V
T
 
T
S
 
S
P
 
K
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
 
T
I
 
H
E
 
E
G
 
A
L
 
V
V
 
E
E
 
A
F
 
F
E
 
R
R
 
R
R
 
H
A
 
R
V
 
V
K
 
A
G
 
E
A
 
A
I
 
I
I
 
S
D
 
E
G
 
G
I
 
V
L
 
C
K
 
A
A
 
C
F
 
V
E
 
R
R
 
R
A
 
S
K
 
Q
N
 
E
I
 
M

3triA Structure of a pyrroline-5-carboxylate reductase (proc) from coxiella burnetii (see paper)
32% identity, 99% coverage: 3:259/260 of query aligns to 5:267/272 of 3triA

query
sites
3triA
I
 
I
G
 
T
I
 
F
I
 
I
G
|
G
C
 
G
G
|
G
N
|
N
M
|
M
A
 
A
S
 
R
S
 
N
I
 
I
A
 
V
H
 
V
S
 
G
-
 
L
I
 
I
K
 
A
Q
 
N
S
 
G
I
 
Y
E
 
D
A
 
P
Q
 
N
L
 
R
F
 
I
C
 
C
-
 
V
Y
 
T
D
x
N
I
x
R
D
x
S
I
 
L
D
 
D
K
|
K
A
 
L
N
 
D
R
 
F
F
 
F
S
 
K
Q
 
E
V
 
K
Y
 
C
G
 
G
A
 
V
T
 
H
K
 
T
M
 
T
N
 
Q
S
 
D
E
x
N
I
 
R
E
 
Q
T
 
G
V
 
A
E
 
L
S
 
N
S
 
A
S
 
D
I
 
V
I
 
V
I
 
V
I
 
L
A
|
A
V
|
V
K
|
K
P
 
P
K
 
H
D
x
Q
I
 
I
F
 
K
D
x
M
V
 
V
L
 
C
E
 
E
K
 
E
I
 
L
K
 
K
D
 
D
G
 
I
I
 
L
S
 
S
E
 
E
K
 
T
-
 
K
-
 
I
I
 
L
I
 
V
V
 
I
S
 
S
I
x
L
A
|
A
A
x
V
G
 
G
I
 
V
S
 
T
I
 
T
S
 
P
K
 
L
I
 
I
K
 
E
E
 
K
V
 
W
V
 
L
G
 
G
D
 
K
-
 
A
K
 
S
K
 
R
I
 
I
V
 
V
R
 
R
V
 
A
M
|
M
P
|
P
N
 
N
I
 
T
N
 
P
I
 
S
S
 
S
V
 
V
Q
 
R
K
 
A
G
 
G
V
 
A
M
 
T
G
 
G
I
 
L
C
 
F
F
 
A
S
 
N
E
 
E
T
 
T
V
 
V
A
 
D
A
 
K
D
 
D
E
 
Q
K
 
K
E
 
N
K
 
L
I
 
A
L
 
E
N
 
S
L
 
I
F
 
M
K
 
R
S
 
A
M
 
V
G
 
G
E
 
L
V
 
V
I
 
I
-
 
W
A
 
V
T
 
S
D
 
S
E
 
E
K
 
D
H
 
Q
M
 
I
D
 
E
A
 
K
I
 
I
T
 
A
A
 
A
L
 
L
F
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
F
 
Y
V
 
I
A
 
F
H
 
L
F
 
I
I
 
M
E
 
E
S
 
A
C
 
L
V
 
Q
D
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
E
K
 
Q
L
 
L
G
 
G
F
 
L
S
 
T
R
 
K
Q
 
-
E
 
E
S
 
T
L
 
A
K
 
E
L
 
L
I
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
L
F
 
T
E
 
E
G
 
Q
T
 
T
V
 
V
V
 
L
N
 
G
M
 
A
K
 
A
N
 
R
N
 
M
M
 
A
L
 
L
T
 
E
T
 
T
Q
 
E
-
 
Q
-
 
S
-
 
V
-
 
V
Q
 
Q
I
 
L
K
 
R
D
 
Q
M
 
F
V
 
V
T
 
T
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
T
 
T
I
 
E
E
 
Q
G
 
A
L
 
I
V
 
K
E
 
V
F
 
L
E
 
E
R
 
S
R
 
G
A
 
N
V
 
L
K
 
R
G
 
E
A
 
L
I
 
F
I
 
I
D
 
K
G
 
A
I
 
L
L
 
T
K
 
A
A
 
A
F
 
V
E
 
N
R
 
R
A
 
A
K
 
K
N
 
E
I
 
L

8td6B Structure of pycr1 complexed with nadh and 2-(methylthio)acetic acid (see paper)
27% identity, 100% coverage: 1:259/260 of query aligns to 7:274/281 of 8td6B

query
sites
8td6B
M
 
M
K
 
S
I
 
V
G
 
G
I
 
F
I
 
I
G
|
G
C
x
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
A
 
A
S
 
F
S
 
A
I
 
L
A
 
A
H
 
K
S
 
G
I
 
F
K
 
T
Q
 
A
S
 
A
-
 
G
-
 
V
-
 
L
I
 
A
E
 
A
A
 
H
Q
 
K
L
 
I
F
 
M
C
 
A
Y
 
S
D
 
S
I
x
P
D
 
D
I
 
M
D
 
D
K
 
L
A
 
A
N
 
T
R
 
-
F
 
-
S
 
-
Q
 
-
V
 
V
Y
 
S
G
 
A
A
 
L
T
 
R
K
 
K
M
 
M
N
 
G
S
 
V
E
 
K
I
 
L
-
 
T
-
 
P
-
 
H
-
x
N
-
 
K
E
 
E
T
 
T
V
 
V
E
 
Q
S
 
H
S
 
S
S
 
D
I
 
V
I
 
L
I
 
F
I
 
L
A
|
A
V
|
V
K
|
K
P
 
P
K
 
H
D
x
I
I
 
I
F
 
P
D
 
F
V
x
I
L
 
L
E
 
D
K
 
E
I
 
I
K
 
G
D
 
A
G
 
D
I
 
I
S
 
E
E
 
D
K
 
R
-
 
H
I
 
I
I
 
V
V
 
V
S
 
S
I
x
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
I
 
V
S
 
T
I
 
I
S
 
S
K
 
S
I
 
I
K
 
E
E
 
K
V
 
K
V
 
L
G
 
S
D
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
P
-
 
A
K
 
P
K
 
R
I
 
V
V
 
I
R
 
R
V
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
I
 
T
N
 
P
I
 
V
S
 
V
V
 
V
Q
 
R
K
 
E
G
 
G
V
 
A
M
 
T
G
 
V
I
 
Y
C
 
A
F
 
T
S
 
G
E
 
T
T
 
H
V
 
A
A
 
Q
A
 
V
D
 
E
E
 
D
K
 
G
E
 
R
K
 
L
I
 
M
L
 
E
N
 
Q
L
 
L
F
 
L
K
 
S
S
 
S
M
 
V
G
 
G
E
 
F
V
 
C
I
 
T
A
 
E
T
 
V
D
 
E
E
 
E
K
 
D
H
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
I
 
V
T
 
T
A
 
G
L
 
L
F
 
S
G
|
G
S
|
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
F
 
Y
V
 
A
A
 
F
H
 
T
F
 
A
I
 
L
E
 
D
S
 
A
C
 
L
V
 
A
D
 
D
A
 
G
A
 
G
V
 
V
K
 
K
L
 
M
G
 
G
F
 
L
S
 
P
R
 
R
Q
 
R
E
 
L
S
 
A
L
 
V
K
 
R
L
 
L
I
 
G
L
 
A
A
 
Q
L
 
A
F
 
L
E
 
L
G
 
G
T
 
A
V
 
A
V
 
K
N
 
M
M
 
L
K
 
L
N
 
H
N
 
S
M
 
E
L
 
Q
T
 
H
T
 
P
Q
 
G
Q
 
Q
I
 
L
K
 
K
D
 
D
M
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
I
 
I
E
 
H
G
 
A
L
 
L
V
 
H
E
 
V
F
 
L
E
 
E
R
 
S
R
 
G
A
 
G
V
 
F
K
 
R
G
 
S
A
 
L
I
 
L
I
 
I
D
 
N
G
 
A
I
 
V
L
 
E
K
 
A
A
 
S
F
 
C
E
 
I
R
 
R
A
 
T
K
 
R
N
 
E
I
 
L

8td3A Structure of pycr1 complexed with nadh and (s)-tetrahydro-2h-pyran-2- carboxylic acid (see paper)
27% identity, 100% coverage: 1:259/260 of query aligns to 7:274/281 of 8td3A

query
sites
8td3A
M
 
M
K
 
S
I
 
V
G
 
G
I
 
F
I
 
I
G
|
G
C
x
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
A
 
A
S
 
F
S
 
A
I
 
L
A
 
A
H
 
K
S
 
G
I
 
F
K
 
T
Q
 
A
S
 
A
-
 
G
-
 
V
-
 
L
I
 
A
E
 
A
A
 
H
Q
 
K
L
 
I
F
 
M
C
 
A
Y
 
S
D
x
S
I
x
P
D
 
D
I
 
M
D
 
D
K
 
L
A
 
A
N
 
T
R
 
-
F
 
-
S
 
-
Q
 
-
V
 
V
Y
 
S
G
 
A
A
 
L
T
 
R
K
 
K
M
 
M
N
 
G
S
 
V
E
 
K
I
 
L
-
 
T
-
 
P
-
 
H
-
x
N
-
 
K
E
 
E
T
 
T
V
 
V
E
 
Q
S
 
H
S
 
S
S
 
D
I
 
V
I
 
L
I
 
F
I
 
L
A
|
A
V
|
V
K
|
K
P
 
P
K
 
H
D
x
I
I
 
I
F
 
P
D
 
F
V
 
I
L
 
L
E
 
D
K
 
E
I
 
I
K
 
G
D
 
A
G
 
D
I
 
I
S
 
E
E
 
D
K
 
R
-
 
H
I
 
I
I
 
V
V
 
V
S
 
S
I
x
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
I
 
V
S
 
T
I
 
I
S
 
S
K
 
S
I
 
I
K
 
E
E
 
K
V
 
K
V
 
L
G
 
S
D
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
P
-
 
A
K
 
P
K
 
R
I
 
V
V
 
I
R
 
R
V
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
I
x
T
N
 
P
I
 
V
S
 
V
V
 
V
Q
 
R
K
 
E
G
 
G
V
 
A
M
 
T
G
 
V
I
 
Y
C
 
A
F
 
T
S
 
G
E
 
T
T
 
H
V
 
A
A
 
Q
A
 
V
D
 
E
E
 
D
K
 
G
E
 
R
K
 
L
I
 
M
L
 
E
N
 
Q
L
 
L
F
 
L
K
 
S
S
 
S
M
 
V
G
 
G
E
 
F
V
 
C
I
 
T
A
 
E
T
 
V
D
 
E
E
 
E
K
 
D
H
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
I
 
V
T
 
T
A
 
G
L
 
L
F
 
S
G
|
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
F
 
Y
V
 
A
A
 
F
H
 
T
F
 
A
I
 
L
E
 
D
S
 
A
C
 
L
V
 
A
D
 
D
A
 
G
A
 
G
V
 
V
K
 
K
L
 
M
G
 
G
F
 
L
S
 
P
R
 
R
Q
 
R
E
 
L
S
 
A
L
 
V
K
 
R
L
 
L
I
 
G
L
 
A
A
 
Q
L
 
A
F
 
L
E
 
L
G
 
G
T
 
A
V
 
A
V
 
K
N
 
M
M
 
L
K
 
L
N
 
H
N
 
S
M
 
E
L
 
Q
T
 
H
T
 
P
Q
 
G
Q
 
Q
I
 
L
K
 
K
D
 
D
M
 
N
V
|
V
T
 
S
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
|
T
I
 
I
E
 
H
G
 
A
L
 
L
V
 
H
E
 
V
F
 
L
E
 
E
R
 
S
R
 
G
A
 
G
V
 
F
K
 
R
G
 
S
A
 
L
I
 
L
I
 
I
D
 
N
G
 
A
I
 
V
L
 
E
K
 
A
A
 
S
F
 
C
E
 
I
R
 
R
A
 
T
K
 
R
N
 
E
I
 
L

8tcyA Structure of pycr1 complexed with 7-fluoro-2-oxo-1,2,3,4- tetrahydroquinoline-6-carboxylic acid (see paper)
27% identity, 100% coverage: 1:259/260 of query aligns to 8:275/281 of 8tcyA

query
sites
8tcyA
M
 
M
K
 
S
I
 
V
G
 
G
I
 
F
I
 
I
G
 
G
C
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
x
L
A
 
A
S
 
F
S
 
A
I
 
L
A
 
A
H
 
K
S
 
G
I
 
F
K
 
T
Q
 
A
S
 
A
-
 
G
-
 
V
-
 
L
I
 
A
E
 
A
A
 
H
Q
 
K
L
 
I
F
 
M
C
 
A
Y
 
S
D
 
S
I
 
P
D
 
D
I
 
M
D
 
D
K
 
L
A
 
A
N
 
T
R
 
-
F
 
-
S
 
-
Q
 
-
V
 
V
Y
 
S
G
 
A
A
 
L
T
 
R
K
 
K
M
 
M
N
 
G
S
 
V
E
 
K
I
 
L
-
 
T
-
 
P
-
 
H
-
 
N
-
 
K
E
 
E
T
 
T
V
 
V
E
 
Q
S
 
H
S
 
S
S
 
D
I
 
V
I
 
L
I
 
F
I
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
K
 
H
D
 
I
I
 
I
F
 
P
D
 
F
V
 
I
L
 
L
E
 
D
K
 
E
I
 
I
K
 
G
D
 
A
G
 
D
I
 
I
S
 
E
E
 
D
K
 
R
-
 
H
I
 
I
I
 
V
V
 
V
S
 
S
I
x
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
V
S
 
T
I
 
I
S
 
S
K
 
S
I
 
I
K
 
E
E
 
K
V
 
K
V
 
L
G
 
S
D
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
P
-
 
A
K
 
P
K
 
R
I
 
V
V
 
I
R
 
R
V
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
I
 
T
N
 
P
I
 
V
S
 
V
V
 
V
Q
 
R
K
 
E
G
 
G
V
 
A
M
 
T
G
 
V
I
 
Y
C
 
A
F
 
T
S
 
G
E
 
T
T
 
H
V
 
A
A
 
Q
A
 
V
D
 
E
E
 
D
K
 
G
E
 
R
K
 
L
I
 
M
L
 
E
N
 
Q
L
 
L
F
 
L
K
 
S
S
 
S
M
 
V
G
 
G
E
 
F
V
 
C
I
 
T
A
 
E
T
 
V
D
 
E
E
 
E
K
 
D
H
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
I
 
V
T
 
T
A
 
G
L
 
L
F
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
F
 
Y
V
 
A
A
 
F
H
 
T
F
 
A
I
 
L
E
 
D
S
 
A
C
 
L
V
 
A
D
 
D
A
 
G
A
 
G
V
 
V
K
 
K
L
 
M
G
 
G
F
 
L
S
 
P
R
 
R
Q
 
R
E
 
L
S
 
A
L
 
V
K
 
R
L
 
L
I
 
G
L
 
A
A
 
Q
L
 
A
F
 
L
E
 
L
G
 
G
T
 
A
V
 
A
V
 
K
N
 
M
M
 
L
K
 
L
N
 
H
N
 
S
M
 
E
L
 
Q
T
 
H
T
 
P
Q
 
G
Q
 
Q
I
 
L
K
 
K
D
 
D
M
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
I
 
I
E
 
H
G
 
A
L
 
L
V
 
H
E
 
V
F
 
L
E
 
E
R
 
S
R
 
G
A
 
G
V
 
F
K
 
R
G
 
S
A
 
L
I
 
L
I
 
I
D
 
N
G
 
A
I
 
V
L
 
E
K
 
A
A
 
S
F
 
C
E
 
I
R
 
R
A
 
T
K
 
R
N
 
E
I
 
L

5uauA Structure of human pycr-1 complexed with proline (see paper)
27% identity, 100% coverage: 1:259/260 of query aligns to 1:268/274 of 5uauA

query
sites
5uauA
M
 
M
K
 
S
I
 
V
G
 
G
I
 
F
I
 
I
G
 
G
C
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
A
 
A
S
 
F
S
 
A
I
 
L
A
 
A
H
 
K
S
 
G
I
 
F
K
 
T
Q
 
A
S
 
A
-
 
G
-
 
V
-
 
L
I
 
A
E
 
A
A
 
H
Q
 
K
L
 
I
F
 
M
C
 
A
Y
 
S
D
 
S
I
 
P
D
 
D
I
 
M
D
 
D
K
 
L
A
 
A
N
 
T
R
 
-
F
 
-
S
 
-
Q
 
-
V
 
V
Y
 
S
G
 
A
A
 
L
T
 
R
K
 
K
M
 
M
N
 
G
S
 
V
E
 
K
I
 
L
-
 
T
-
 
P
-
 
H
-
 
N
-
 
K
E
 
E
T
 
T
V
 
V
E
 
Q
S
 
H
S
 
S
S
 
D
I
 
V
I
 
L
I
 
F
I
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
K
 
H
D
 
I
I
 
I
F
 
P
D
 
F
V
 
I
L
 
L
E
 
D
K
 
E
I
 
I
K
 
G
D
 
A
G
 
D
I
 
I
S
 
E
E
 
D
K
 
R
-
 
H
I
 
I
I
 
V
V
 
V
S
 
S
I
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
V
S
 
T
I
 
I
S
 
S
K
 
S
I
 
I
K
 
E
E
 
K
V
 
K
V
 
L
G
 
S
D
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
P
-
 
A
K
 
P
K
 
R
I
 
V
V
 
I
R
 
R
V
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
I
 
T
N
 
P
I
 
V
S
 
V
V
 
V
Q
 
R
K
 
E
G
 
G
V
 
A
M
 
T
G
 
V
I
 
Y
C
 
A
F
x
T
S
 
G
E
 
T
T
 
H
V
 
A
A
 
Q
A
 
V
D
 
E
E
 
D
K
 
G
E
 
R
K
 
L
I
 
M
L
 
E
N
 
Q
L
 
L
F
 
L
K
 
S
S
 
S
M
 
V
G
 
G
E
 
F
V
 
C
I
 
T
A
 
E
T
 
V
D
x
E
E
|
E
K
 
D
H
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
I
 
V
T
 
T
A
 
G
L
 
L
F
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
F
 
Y
V
 
A
A
 
F
H
 
T
F
 
A
I
 
L
E
 
D
S
 
A
C
 
L
V
 
A
D
 
D
A
 
G
A
 
G
V
 
V
K
 
K
L
 
M
G
 
G
F
 
L
S
 
P
R
 
R
Q
 
R
E
 
L
S
 
A
L
 
V
K
 
R
L
 
L
I
 
G
L
 
A
A
 
Q
L
 
A
F
 
L
E
 
L
G
 
G
T
 
A
V
 
A
V
 
K
N
 
M
M
 
L
K
 
L
N
 
H
N
 
S
M
 
E
L
 
Q
T
 
H
T
 
P
Q
 
G
Q
 
Q
I
 
L
K
 
K
D
 
D
M
 
N
V
 
V
T
 
S
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
x
A
T
|
T
I
 
I
E
 
H
G
 
A
L
 
L
V
 
H
E
 
V
F
 
L
E
 
E
R
 
S
R
 
G
A
 
G
V
 
F
K
 
R
G
 
S
A
 
L
I
 
L
I
 
I
D
 
N
G
 
A
I
 
V
L
 
E
K
 
A
A
 
S
F
 
C
E
 
I
R
 
R
A
 
T
K
 
R
N
 
E
I
 
L

8tdbA Structure of pycr1 complexed with nadh and 1-hydroxyethane-1-sulfonate (see paper)
27% identity, 100% coverage: 1:259/260 of query aligns to 1:268/275 of 8tdbA

query
sites
8tdbA
M
 
M
K
 
S
I
 
V
G
 
G
I
 
F
I
 
I
G
|
G
C
x
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
A
 
A
S
 
F
S
 
A
I
 
L
A
 
A
H
 
K
S
 
G
I
 
F
K
 
T
Q
 
A
S
 
A
-
 
G
-
 
V
-
 
L
I
 
A
E
 
A
A
 
H
Q
 
K
L
 
I
F
 
M
C
 
A
Y
 
S
D
x
S
I
x
P
D
 
D
I
 
M
D
 
D
K
 
L
A
 
A
N
 
T
R
 
-
F
 
-
S
 
-
Q
 
-
V
 
V
Y
 
S
G
 
A
A
 
L
T
 
R
K
 
K
M
 
M
N
 
G
S
 
V
E
 
K
I
 
L
-
 
T
-
 
P
-
 
H
-
x
N
-
 
K
E
 
E
T
 
T
V
 
V
E
 
Q
S
 
H
S
 
S
S
 
D
I
 
V
I
 
L
I
 
F
I
 
L
A
 
A
V
|
V
K
|
K
P
|
P
K
 
H
D
 
I
I
 
I
F
 
P
D
 
F
V
x
I
L
 
L
E
 
D
K
 
E
I
 
I
K
 
G
D
 
A
G
 
D
I
 
I
S
 
E
E
 
D
K
 
R
-
 
H
I
 
I
I
 
V
V
 
V
S
 
S
I
 
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
I
 
V
S
 
T
I
 
I
S
 
S
K
 
S
I
 
I
K
 
E
E
 
K
V
 
K
V
 
L
G
 
S
D
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
P
-
 
A
K
 
P
K
 
R
I
 
V
V
 
I
R
 
R
V
 
C
M
 
M
P
x
T
N
 
N
I
x
T
N
 
P
I
 
V
S
 
V
V
 
V
Q
 
R
K
 
E
G
 
G
V
 
A
M
 
T
G
 
V
I
 
Y
C
 
A
F
 
T
S
 
G
E
 
T
T
 
H
V
 
A
A
 
Q
A
 
V
D
 
E
E
 
D
K
 
G
E
 
R
K
 
L
I
 
M
L
 
E
N
 
Q
L
 
L
F
 
L
K
 
S
S
 
S
M
 
V
G
 
G
E
 
F
V
 
C
I
 
T
A
 
E
T
 
V
D
 
E
E
 
E
K
 
D
H
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
I
 
V
T
 
T
A
 
G
L
 
L
F
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
F
 
Y
V
 
A
A
 
F
H
 
T
F
 
A
I
 
L
E
 
D
S
 
A
C
 
L
V
 
A
D
 
D
A
 
G
A
 
G
V
 
V
K
 
K
L
 
M
G
 
G
F
 
L
S
 
P
R
 
R
Q
 
R
E
 
L
S
 
A
L
 
V
K
 
R
L
 
L
I
 
G
L
 
A
A
 
Q
L
 
A
F
 
L
E
 
L
G
 
G
T
 
A
V
 
A
V
 
K
N
 
M
M
 
L
K
 
L
N
 
H
N
 
S
M
 
E
L
 
Q
T
 
H
T
 
P
Q
 
G
Q
 
Q
I
 
L
K
 
K
D
 
D
M
 
N
V
|
V
T
 
S
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
A
T
|
T
I
 
I
E
 
H
G
 
A
L
 
L
V
 
H
E
 
V
F
 
L
E
 
E
R
 
S
R
 
G
A
 
G
V
 
F
K
 
R
G
 
S
A
 
L
I
 
L
I
 
I
D
 
N
G
 
A
I
 
V
L
 
E
K
 
A
A
 
S
F
 
C
E
 
I
R
 
R
A
 
T
K
 
R
N
 
E
I
 
L

8td5A Structure of pycr1 complexed with nadh and tetrahydrothiophene-2- carboxylic acid (see paper)
27% identity, 100% coverage: 1:259/260 of query aligns to 8:275/280 of 8td5A

query
sites
8td5A
M
 
M
K
 
S
I
 
V
G
 
G
I
 
F
I
 
I
G
|
G
C
x
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
A
 
A
S
 
F
S
 
A
I
 
L
A
 
A
H
 
K
S
 
G
I
 
F
K
 
T
Q
 
A
S
 
A
-
 
G
-
 
V
-
 
L
I
 
A
E
 
A
A
 
H
Q
 
K
L
 
I
F
 
M
C
 
A
Y
 
S
D
x
S
I
x
P
D
 
D
I
 
M
D
 
D
K
x
L
A
 
A
N
 
T
R
 
-
F
 
-
S
 
-
Q
 
-
V
 
V
Y
 
S
G
 
A
A
 
L
T
 
R
K
 
K
M
 
M
N
 
G
S
 
V
E
 
K
I
 
L
-
 
T
-
 
P
-
 
H
-
x
N
-
 
K
E
 
E
T
 
T
V
 
V
E
 
Q
S
 
H
S
 
S
S
 
D
I
 
V
I
 
L
I
 
F
I
 
L
A
|
A
V
|
V
K
 
K
P
 
P
K
 
H
D
 
I
I
 
I
F
 
P
D
 
F
V
x
I
L
 
L
E
 
D
K
 
E
I
 
I
K
 
G
D
 
A
G
 
D
I
 
I
S
 
E
E
 
D
K
 
R
-
 
H
I
 
I
I
 
V
V
 
V
S
 
S
I
x
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
I
 
V
S
 
T
I
 
I
S
 
S
K
 
S
I
 
I
K
 
E
E
 
K
V
 
K
V
 
L
G
 
S
D
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
P
-
 
A
K
 
P
K
 
R
I
 
V
V
 
I
R
 
R
V
 
C
M
|
M
P
 
T
N
 
N
I
x
T
N
 
P
I
 
V
S
 
V
V
 
V
Q
 
R
K
 
E
G
 
G
V
 
A
M
 
T
G
 
V
I
 
Y
C
 
A
F
 
T
S
 
G
E
 
T
T
 
H
V
 
A
A
 
Q
A
 
V
D
 
E
E
 
D
K
 
G
E
 
R
K
 
L
I
 
M
L
 
E
N
 
Q
L
 
L
F
 
L
K
 
S
S
 
S
M
 
V
G
 
G
E
 
F
V
 
C
I
 
T
A
 
E
T
 
V
D
 
E
E
 
E
K
 
D
H
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
I
 
V
T
 
T
A
 
G
L
 
L
F
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
F
 
Y
V
 
A
A
 
F
H
 
T
F
 
A
I
 
L
E
 
D
S
 
A
C
 
L
V
 
A
D
 
D
A
 
G
A
 
G
V
 
V
K
 
K
L
 
M
G
 
G
F
 
L
S
 
P
R
 
R
Q
 
R
E
 
L
S
 
A
L
 
V
K
 
R
L
 
L
I
 
G
L
 
A
A
 
Q
L
 
A
F
 
L
E
 
L
G
 
G
T
 
A
V
 
A
V
 
K
N
 
M
M
 
L
K
 
L
N
 
H
N
 
S
M
 
E
L
 
Q
T
 
H
T
 
P
Q
 
G
Q
 
Q
I
 
L
K
 
K
D
 
D
M
 
N
V
 
V
T
 
S
S
|
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
x
A
T
|
T
I
 
I
E
 
H
G
 
A
L
 
L
V
 
H
E
 
V
F
 
L
E
 
E
R
 
S
R
 
G
A
 
G
V
 
F
K
 
R
G
 
S
A
 
L
I
 
L
I
 
I
D
 
N
G
 
A
I
 
V
L
 
E
K
 
A
A
 
S
F
 
C
E
 
I
R
 
R
A
 
T
K
 
R
N
 
E
I
 
L

8td1A Structure of pycr1 complexed with 3-(6-oxa-9-azaspiro(4.5)decane-9- carbonyl)benzoic acid (see paper)
27% identity, 100% coverage: 1:259/260 of query aligns to 8:275/280 of 8td1A

query
sites
8td1A
M
 
M
K
 
S
I
 
V
G
 
G
I
 
F
I
 
I
G
 
G
C
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
A
 
A
S
 
F
S
 
A
I
 
L
A
 
A
H
 
K
S
 
G
I
 
F
K
 
T
Q
 
A
S
 
A
-
 
G
-
 
V
-
 
L
I
 
A
E
 
A
A
 
H
Q
 
K
L
 
I
F
 
M
C
 
A
Y
 
S
D
 
S
I
 
P
D
 
D
I
 
M
D
 
D
K
 
L
A
 
A
N
 
T
R
 
-
F
 
-
S
 
-
Q
 
-
V
 
V
Y
 
S
G
 
A
A
 
L
T
 
R
K
 
K
M
 
M
N
 
G
S
 
V
E
 
K
I
 
L
-
 
T
-
 
P
-
 
H
-
 
N
-
 
K
E
 
E
T
 
T
V
 
V
E
 
Q
S
 
H
S
 
S
S
 
D
I
 
V
I
 
L
I
 
F
I
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
K
 
H
D
 
I
I
 
I
F
 
P
D
 
F
V
 
I
L
 
L
E
 
D
K
 
E
I
 
I
K
 
G
D
 
A
G
 
D
I
 
I
S
 
E
E
 
D
K
 
R
-
 
H
I
 
I
I
 
V
V
 
V
S
 
S
I
 
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
I
 
V
S
 
T
I
 
I
S
 
S
K
 
S
I
 
I
K
 
E
E
 
K
V
 
K
V
 
L
G
 
S
D
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
P
-
 
A
K
 
P
K
 
R
I
 
V
V
 
I
R
 
R
V
 
C
M
|
M
P
 
T
N
 
N
I
 
T
N
 
P
I
 
V
S
 
V
V
 
V
Q
 
R
K
 
E
G
 
G
V
 
A
M
 
T
G
 
V
I
 
Y
C
 
A
F
 
T
S
 
G
E
 
T
T
 
H
V
 
A
A
 
Q
A
 
V
D
 
E
E
 
D
K
 
G
E
 
R
K
 
L
I
 
M
L
 
E
N
 
Q
L
 
L
F
 
L
K
 
S
S
 
S
M
 
V
G
 
G
E
 
F
V
 
C
I
 
T
A
 
E
T
 
V
D
 
E
E
 
E
K
 
D
H
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
I
 
V
T
 
T
A
 
G
L
 
L
F
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
F
 
Y
V
 
A
A
 
F
H
 
T
F
 
A
I
 
L
E
 
D
S
 
A
C
 
L
V
 
A
D
 
D
A
 
G
A
 
G
V
 
V
K
 
K
L
 
M
G
 
G
F
 
L
S
 
P
R
 
R
Q
 
R
E
 
L
S
 
A
L
 
V
K
 
R
L
 
L
I
 
G
L
 
A
A
 
Q
L
 
A
F
 
L
E
 
L
G
 
G
T
 
A
V
 
A
V
 
K
N
 
M
M
 
L
K
 
L
N
 
H
N
 
S
M
 
E
L
 
Q
T
 
H
T
 
P
Q
 
G
Q
 
Q
I
 
L
K
 
K
D
 
D
M
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
G
 
G
G
|
G
T
x
A
T
|
T
I
 
I
E
 
H
G
 
A
L
 
L
V
 
H
E
 
V
F
 
L
E
 
E
R
 
S
R
 
G
A
 
G
V
 
F
K
 
R
G
 
S
A
 
L
I
 
L
I
 
I
D
 
N
G
 
A
I
 
V
L
 
E
K
 
A
A
 
S
F
 
C
E
 
I
R
 
R
A
 
T
K
 
R
N
 
E
I
 
L

8td0A Structure of pycr1 complexed with 5-oxo-7a-phenyl-hexahydropyrrolo[2, 1-b][1,3]thiazole-3-carboxylic acid (see paper)
27% identity, 100% coverage: 1:259/260 of query aligns to 8:275/280 of 8td0A

query
sites
8td0A
M
 
M
K
 
S
I
 
V
G
 
G
I
 
F
I
 
I
G
 
G
C
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
x
L
A
 
A
S
 
F
S
 
A
I
 
L
A
 
A
H
 
K
S
 
G
I
 
F
K
 
T
Q
 
A
S
 
A
-
 
G
-
 
V
-
 
L
I
 
A
E
 
A
A
 
H
Q
 
K
L
 
I
F
 
M
C
 
A
Y
 
S
D
 
S
I
 
P
D
 
D
I
 
M
D
 
D
K
 
L
A
 
A
N
 
T
R
 
-
F
 
-
S
 
-
Q
 
-
V
 
V
Y
 
S
G
 
A
A
 
L
T
 
R
K
 
K
M
 
M
N
 
G
S
 
V
E
 
K
I
 
L
-
 
T
-
 
P
-
 
H
-
 
N
-
 
K
E
 
E
T
 
T
V
 
V
E
 
Q
S
 
H
S
 
S
S
 
D
I
 
V
I
 
L
I
 
F
I
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
K
 
H
D
 
I
I
 
I
F
 
P
D
 
F
V
 
I
L
 
L
E
 
D
K
 
E
I
 
I
K
 
G
D
 
A
G