SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_013430927.1 NCBI__GCF_000166775.1:WP_013430927.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5f7qE Rok repressor lmo0178 from listeria monocytogenes bound to operator (see paper)
31% identity, 99% coverage: 2:398/399 of query aligns to 6:395/396 of 5f7qE

query
sites
5f7qE
G
 
G
N
 
N
H
x
K
T
 
D
L
 
L
L
 
I
K
|
K
Q
 
D
I
 
I
N
|
N
K
 
R
L
 
Y
L
 
T
V
 
V
L
 
L
K
 
N
T
 
L
I
 
I
L
 
R
D
 
E
N
 
K
K
 
G
I
 
E
I
 
I
S
 
T
R
 
R
A
x
T
K
 
E
I
 
I
S
 
A
R
 
K
L
 
K
V
 
C
D
 
D
L
 
F
N
 
G
K
 
M
A
x
S
T
|
T
V
 
L
S
 
T
N
 
Y
L
 
I
T
 
L
D
 
D
E
 
D
L
 
L
I
 
Q
K
 
Q
E
 
E
G
 
G
Y
 
I
I
 
I
V
 
L
E
 
E
K
 
G
G
 
A
Y
 
E
G
 
T
K
 
S
S
 
S
K
x
T
G
|
G
G
|
G
R
|
R
R
|
R
P
x
A
V
x
K
L
 
L
L
 
V
Q
 
R
V
 
F
N
 
N
K
 
K
D
 
D
V
 
Y
G
 
G
S
 
F
I
 
V
I
 
V
G
 
S
I
 
V
D
 
K
L
 
V
G
 
E
V
 
E
D
 
E
Y
 
Q
I
 
L
H
 
L
V
 
F
I
 
A
L
 
L
S
 
T
N
 
D
F
 
L
V
 
N
G
 
A
E
 
E
V
 
I
I
 
I
F
 
-
E
 
-
E
 
E
Y
 
N
A
 
T
E
 
S
M
 
I
K
 
P
M
 
F
G
 
S
E
 
S
D
 
E
K
 
K
D
 
K
K
 
P
L
 
-
F
 
-
D
 
E
L
 
E
L
 
A
F
 
I
D
 
E
L
 
L
I
 
I
E
 
A
K
 
K
A
 
N
I
 
V
D
 
K
R
 
K
-
 
M
-
 
C
A
 
G
P
 
N
H
 
R
T
 
D
P
 
M
K
 
N
G
 
H
I
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
A
V
 
I
P
 
S
G
 
G
I
 
L
V
 
V
E
 
N
K
 
R
E
 
K
S
 
K
G
 
G
I
 
T
V
 
V
L
 
I
I
 
R
A
 
S
P
 
T
N
 
M
L
 
L
K
 
G
W
 
W
K
 
E
N
 
N
V
 
V
H
 
A
L
 
L
K
 
E
S
 
A
I
 
M
V
 
L
Q
 
H
Q
 
A
R
 
H
F
 
F
-
 
P
N
 
D
L
 
I
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
I
 
V
D
 
D
N
 
K
E
 
N
A
 
I
N
 
N
A
 
C
G
 
Y
A
 
T
L
 
L
G
 
A
E
 
E
K
 
L
W
 
W
F
 
L
G
 
G
E
 
E
W
 
G
G
 
K
K
 
Q
V
 
S
S
 
N
D
 
N
L
 
F
I
 
A
Y
 
T
L
 
V
S
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
L
G
 
S
I
 
V
I
 
V
I
 
I
D
 
N
N
 
R
K
 
Q
L
 
I
F
 
Y
R
 
Y
G
 
G
A
 
A
A
 
Q
G
 
G
F
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
E
V
 
F
G
 
G
H
|
H
T
 
T
T
 
T
I
 
I
N
 
Q
F
 
P
Q
 
G
D
 
G
D
 
Y
V
 
K
C
|
C
S
 
H
C
|
C
G
 
G
N
 
Q
I
 
K
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
 
E
N
 
M
F
 
Y
A
 
A
S
 
S
E
 
E
R
 
F
A
 
Y
L
 
F
L
 
R
S
 
N
V
 
R
I
 
G
K
 
E
K
 
E
L
 
L
V
 
-
K
 
-
Q
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
K
D
 
E
R
 
A
Y
 
Y
I
 
P
S
 
T
C
 
S
E
 
E
N
 
-
V
 
L
H
 
N
E
 
D
I
 
F
T
 
H
P
 
F
S
 
D
R
 
K
I
 
V
I
 
A
Q
 
K
A
 
S
A
 
A
K
 
R
E
 
A
G
 
G
S
 
D
R
 
E
V
 
M
C
 
A
R
 
T
M
 
E
A
 
L
I
 
M
L
 
G
E
 
K
V
 
M
A
 
G
E
 
E
K
 
Y
M
 
L
G
 
G
I
 
Y
G
 
G
V
 
I
A
 
R
N
 
N
L
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
T
F
 
F
N
 
N
P
 
P
E
 
E
M
 
K
V
 
V
I
 
I
I
 
I
G
 
V
N
 
G
K
 
E
A
 
G
S
 
L
F
 
H
F
 
H
G
 
R
E
 
D
L
 
L
F
 
F
L
 
L
E
 
T
K
 
K
L
 
I
R
 
D
E
 
E
V
 
I
I
 
A
N
 
S
Q
 
Q
R
 
N
S
 
F
F
 
F
I
 
S
A
 
G
Q
 
A
F
 
G
Y
 
F
N
 
E
L
 
T
K
 
E
I
 
I
E
 
T
V
 
T
S
 
T
K
 
S
L
 
L
K
 
E
D
 
D
R
 
P
A
 
A
V
 
W
V
 
L
L
 
Q
G
 
G
C
 
A
I
 
A
A
 
L
M
 
L
V
 
V
I
 
I
S
 
H
D
 
Q
M
 
L
L
 
F
S
 
Q
F
 
V
P
 
P
E
 
I
Y
 
Y

Sites not aligning to the query:

1z05A Crystal structure of the rok family transcriptional regulator, homolog of e.Coli mlc protein.
31% identity, 95% coverage: 7:384/399 of query aligns to 3:377/396 of 1z05A

query
sites
1z05A
L
 
I
K
 
K
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
K
 
A
L
 
G
L
 
R
V
 
V
L
 
Y
K
 
K
T
 
L
I
 
I
L
 
D
D
 
Q
N
 
K
K
 
G
I
 
P
I
 
I
S
 
S
R
 
R
A
 
I
K
 
D
I
 
L
S
 
S
R
 
K
L
 
E
V
 
S
D
 
E
L
 
L
N
 
A
K
 
P
A
 
A
T
 
S
V
 
I
S
 
T
N
 
K
L
 
I
T
 
T
D
 
R
E
 
E
L
 
L
I
 
I
K
 
D
E
 
A
G
 
H
Y
 
L
I
 
I
V
 
H
E
 
E
K
 
T
G
 
T
Y
 
V
G
 
Q
K
 
E
S
 
A
K
 
I
G
 
S
G
 
R
R
 
G
R
 
R
P
 
P
V
 
A
L
 
V
-
 
G
L
 
L
Q
 
Q
V
 
T
N
 
N
K
 
N
D
 
L
V
 
G
G
 
W
S
 
Q
I
 
F
I
 
L
G
 
S
I
 
M
D
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
R
D
 
G
Y
 
Y
I
 
L
H
 
T
V
 
I
I
 
A
L
 
L
S
 
H
N
 
E
F
 
L
V
 
G
G
 
G
E
 
E
V
 
V
I
 
L
F
 
I
E
 
D
E
 
T
Y
 
K
A
 
I
E
 
D
M
 
I
K
 
H
M
 
E
G
 
I
E
 
D
D
 
Q
K
 
D
D
 
D
K
 
V
L
 
L
F
 
A
D
 
R
L
 
L
L
 
L
F
 
F
D
 
E
L
 
I
I
 
E
E
 
E
K
 
F
A
 
F
I
 
Q
D
 
T
R
 
Y
A
 
A
P
 
A
H
 
Q
T
 
L
P
 
D
K
 
R
G
 
-
I
 
V
L
 
T
G
 
S
I
 
I
G
 
A
I
 
I
G
 
T
V
 
L
P
 
P
G
 
G
I
 
L
V
 
V
E
 
N
K
 
S
E
 
E
S
 
Q
G
 
G
I
 
I
V
 
V
L
 
L
I
 
Q
A
 
M
P
 
P
N
 
H
L
 
Y
K
 
N
W
 
V
K
 
K
N
 
N
V
 
L
H
 
A
L
 
L
K
 
G
S
 
P
I
 
E
V
 
I
Q
 
Y
Q
 
K
R
 
A
F
 
T
N
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
F
I
 
V
D
 
A
N
 
N
E
 
D
A
 
T
N
 
R
A
 
A
G
 
W
A
 
A
L
 
L
G
 
A
E
 
E
K
 
K
W
 
L
F
 
F
G
 
G
E
 
H
W
 
S
G
 
Q
K
 
D
V
 
V
S
 
D
D
 
N
L
 
S
I
 
V
Y
 
L
L
 
I
S
 
S
V
 
I
G
 
H
I
 
H
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
I
I
 
V
I
 
L
D
 
D
N
 
G
K
 
R
L
 
V
F
 
L
R
 
Q
G
 
G
A
 
R
A
 
H
G
 
G
F
 
N
A
 
I
G
 
G
E
 
E
V
 
L
G
 
G
H
|
H
T
 
I
T
 
Q
I
 
I
N
 
D
F
 
P
Q
 
Q
D
 
G
D
 
K
V
 
R
C
|
C
S
 
H
C
|
C
G
 
G
N
 
N
I
 
Y
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
 
E
N
 
T
F
 
V
A
 
A
S
 
S
E
 
S
R
 
Q
A
 
A
L
 
I
L
 
R
S
 
D
V
 
Q
I
 
V
K
 
T
K
 
A
L
 
R
V
 
I
K
 
Q
Q
 
A
G
 
G
V
 
E
E
 
P
D
 
-
R
 
-
Y
 
-
I
 
-
S
 
S
C
 
C
-
 
L
E
 
A
N
 
T
V
 
V
H
 
E
E
 
E
I
 
I
T
 
S
P
 
I
S
 
E
R
 
D
I
 
I
I
 
C
Q
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
A
E
 
D
G
 
G
S
 
D
R
 
P
V
 
L
C
 
A
R
 
V
M
 
D
A
 
V
I
 
I
L
 
Q
E
 
Q
V
 
L
A
 
G
E
 
R
K
 
Y
M
 
L
G
 
G
I
 
A
G
 
A
V
 
I
A
 
A
N
 
I
L
 
V
V
 
I
N
 
N
I
 
L
F
 
F
N
 
N
P
 
P
E
 
E
M
 
K
V
 
I
I
 
L
I
 
I
G
 
G
N
 
G
K
 
V
A
 
I
S
 
N
F
 
Q
F
 
A
G
 
K
E
 
S
L
 
I
F
 
L
L
 
Y
E
 
P
K
 
S
L
 
I
R
 
E
E
 
Q
V
 
C
I
 
I
N
 
R
Q
 
E
R
 
Q
S
 
S
F
 
L
I
 
P
A
 
V
Q
 
Y
F
 
H
Y
 
Q
N
 
D
L
 
L
K
 
K
I
 
L
E
 
V
V
 
E
S
 
S
K
 
R
L
 
F
K
 
Y
D
 
K
R
 
Q
A
 
A
V
 
T
V
 
M
L
 
P
G
 
G
C
 
A

5f7rA Rok repressor lmo0178 from listeria monocytogenes bound to inducer (see paper)
32% identity, 64% coverage: 140:393/399 of query aligns to 61:306/306 of 5f7rA

query
sites
5f7rA
I
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
A
V
 
I
P
 
S
G
|
G
I
 
L
V
 
V
E
 
N
K
 
R
E
 
K
S
 
K
G
 
G
I
 
T
V
 
V
L
 
I
I
 
R
A
 
S
P
 
T
N
 
M
L
 
L
K
 
G
W
 
W
K
 
E
N
 
N
V
 
V
H
 
A
L
 
L
K
 
E
S
 
A
I
 
M
V
 
L
Q
 
H
Q
 
A
R
 
H
F
 
F
-
 
P
N
 
D
L
 
I
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
I
 
V
D
 
D
N
 
K
E
x
N
A
 
I
N
 
N
A
 
C
G
 
Y
A
 
T
L
 
L
G
 
A
E
 
E
K
 
L
W
 
W
F
 
L
G
 
G
E
 
E
W
 
G
G
 
K
K
 
Q
V
 
S
S
 
N
D
 
N
L
 
F
I
 
A
Y
 
T
L
 
V
S
|
S
V
|
V
G
 
G
I
 
A
G
|
G
L
|
L
G
|
G
A
 
L
G
 
S
I
 
V
I
 
V
I
 
I
D
 
N
N
 
R
K
 
Q
L
 
I
F
 
Y
R
 
Y
G
 
G
A
 
A
A
 
Q
G
 
G
F
 
G
A
 
A
G
 
G
E
|
E
V
 
F
G
 
G
H
|
H
T
 
T
T
 
T
I
 
I
N
 
Q
F
 
P
Q
 
G
D
 
G
D
 
Y
V
 
K
C
|
C
S
 
H
C
|
C
G
 
G
N
 
Q
I
 
K
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
|
E
N
 
M
F
 
Y
A
 
A
S
 
S
E
 
E
R
 
F
A
 
Y
L
 
F
L
 
R
S
 
N
V
 
R
I
 
G
K
 
E
K
 
E
L
 
L
V
 
-
K
 
-
Q
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
K
D
 
E
R
 
A
Y
 
Y
I
 
-
S
 
-
C
 
-
E
 
-
N
 
P
V
 
L
H
 
N
E
 
D
I
 
F
T
 
H
P
 
F
S
 
D
R
 
K
I
 
V
I
 
A
Q
 
K
A
 
S
A
 
A
K
 
R
E
 
A
G
 
G
S
 
D
R
 
E
V
 
M
C
 
A
R
 
T
M
 
E
A
 
L
I
 
M
L
 
G
E
 
K
V
 
M
A
 
G
E
 
E
K
 
Y
M
 
L
G
 
G
I
 
Y
G
 
G
V
 
I
A
 
R
N
 
N
L
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
T
F
 
F
N
 
N
P
 
P
E
 
E
M
 
K
V
 
V
I
 
I
I
 
I
G
 
V
N
 
G
K
x
E
A
 
G
S
 
L
F
 
H
F
 
H
G
 
R
E
 
D
L
 
L
F
 
F
L
 
L
E
 
T
K
 
K
L
 
I
R
 
D
E
 
E
V
 
I
I
 
A
N
 
S
Q
 
Q
R
 
N
S
 
F
F
 
F
I
 
S
A
 
G
Q
 
A
F
 
G
Y
 
F
N
 
E
L
 
T
K
 
E
I
 
I
E
 
T
V
 
T
S
 
T
K
 
S
L
 
L
K
 
E
D
 
D
R
 
P
A
 
A
V
x
W
V
 
L
L
 
Q
G
 
G
C
 
A
I
 
A
A
 
L
M
 
L
V
 
V
I
 
I
S
 
H
D
 
Q
M
 
L
L
 
F

Sites not aligning to the query:

2qm1B Crystal structure of glucokinase from enterococcus faecalis
31% identity, 78% coverage: 80:389/399 of query aligns to 8:320/325 of 2qm1B

query
sites
2qm1B
I
 
I
I
 
I
G
 
G
I
 
I
D
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
G
D
 
T
Y
 
T
I
 
I
H
 
K
V
 
F
I
 
A
L
 
I
S
 
L
N
 
T
F
 
T
V
 
D
G
 
G
E
 
V
V
 
V
I
 
Q
F
 
Q
E
 
K
E
 
W
Y
 
S
A
 
I
E
 
E
M
 
T
K
 
N
M
 
I
G
 
L
E
 
E
D
 
D
K
 
G
D
 
K
K
 
H
L
 
I
F
 
V
D
 
P
L
 
S
L
 
I
F
 
I
D
 
E
L
 
S
I
 
I
E
 
R
K
 
H
A
 
R
I
 
I
D
 
D
R
 
L
A
 
Y
P
 
N
H
 
M
T
 
K
P
 
K
K
 
E
G
 
D
I
 
F
L
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
G
I
 
M
G
 
G
V
 
T
P
 
P
G
 
G
I
 
S
V
 
V
E
 
D
K
 
I
E
 
E
S
 
K
G
 
G
I
 
T
V
 
V
L
 
V
I
 
G
A
 
A
P
 
Y
N
 
N
L
 
L
K
 
N
W
 
W
K
 
T
N
 
T
V
 
V
H
 
Q
-
 
P
L
 
V
K
 
K
S
 
E
I
 
Q
V
 
I
Q
 
E
Q
 
S
R
 
A
F
 
L
N
 
G
L
 
I
P
 
P
V
 
F
Y
 
A
I
 
L
D
 
D
N
|
N
E
 
D
A
 
A
N
|
N
A
 
V
G
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
G
E
 
E
K
 
R
W
 
W
F
 
K
G
 
G
E
 
A
W
 
G
G
 
E
K
 
N
V
 
N
S
 
P
D
 
D
L
 
V
I
 
I
Y
 
F
L
 
I
S
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
T
G
 
G
L
 
V
G
 
G
A
x
G
G
 
G
I
 
I
I
 
V
I
 
A
D
 
A
N
 
G
K
 
K
L
 
L
F
 
L
R
 
H
G
 
G
A
 
V
A
 
A
G
 
G
F
 
C
A
 
A
G
 
G
E
 
E
V
 
V
G
 
G
H
|
H
T
 
V
T
 
T
I
 
V
N
 
D
F
 
P
Q
 
N
D
 
G
D
 
F
V
 
D
C
|
C
S
 
T
C
|
C
G
 
G
N
 
K
I
 
R
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
 
E
N
 
T
F
 
V
A
 
S
S
 
S
E
 
A
R
 
T
A
 
G
L
 
V
L
 
V
S
 
R
V
 
V
I
 
A
K
 
R
K
 
H
L
 
L
V
 
S
K
 
E
Q
 
E
G
 
F
V
 
A
E
 
G
D
 
D
R
 
S
Y
 
E
I
 
L
-
 
K
-
 
Q
S
 
A
C
 
I
E
 
D
N
 
D
V
 
G
H
 
Q
E
 
D
I
 
V
T
 
S
P
 
S
S
 
K
R
 
D
I
 
V
I
 
F
Q
 
E
A
 
F
A
 
A
K
 
E
E
 
K
G
 
G
S
 
D
R
 
H
V
 
F
C
 
A
R
 
L
M
 
M
A
 
V
I
 
V
L
 
D
E
 
R
V
 
V
A
 
C
E
 
F
K
 
Y
M
 
L
G
 
G
I
 
L
G
 
A
V
 
T
A
 
G
N
 
N
L
 
L
V
 
G
N
 
N
I
 
T
F
 
L
N
 
N
P
 
P
E
 
D
M
 
S
V
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
N
 
G
K
 
G
A
 
V
S
 
S
F
 
A
F
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
F
F
 
L
L
 
R
E
 
S
K
 
R
L
 
V
R
 
E
E
 
K
V
 
Y
I
 
F
N
 
Q
Q
 
E
R
 
F
S
 
T
F
 
F
I
 
P
A
 
Q
Q
 
V
F
 
R
Y
 
N
N
 
S
L
 
T
K
 
K
I
 
I
E
 
K
V
 
L
S
 
A
K
 
E
L
 
L
K
 
G
D
 
N
R
 
E
A
 
A
V
 
G
V
 
V
L
 
I
G
 
G
C
 
A
I
 
A
A
 
S
M
 
L
V
 
A
I
 
L

P50456 DNA-binding transcriptional repressor Mlc; Making large colonies protein; Membrane linked control from Escherichia coli (strain K12) (see 4 papers)
26% identity, 95% coverage: 7:384/399 of query aligns to 13:387/406 of P50456

query
sites
P50456
L
 
I
K
 
K
Q
 
Q
I
 
T
N
 
N
K
 
A
L
 
G
L
 
A
V
 
V
L
 
Y
K
 
R
T
 
L
I
 
I
L
 
D
D
 
Q
N
 
L
K
 
G
I
 
P
I
 
V
S
 
S
R
 
R
A
 
I
K
 
D
I
 
L
S
 
S
R
 
R
L
 
L
V
 
A
D
 
Q
L
 
L
N
 
A
K
 
P
A
 
A
T
 
S
V
 
I
S
 
T
N
 
K
L
 
I
T
 
V
D
x
R
E
 
E
L
 
M
I
 
L
K
 
-
E
 
E
G
 
A
Y
 
H
I
 
L
V
 
V
E
 
Q
K
 
E
G
 
L
Y
 
E
G
 
I
K
 
K
S
 
E
K
 
A
G
 
G
G
 
N
R
 
R
-
 
G
R
 
R
P
 
P
V
 
A
L
 
V
-
 
G
L
 
L
Q
 
V
V
 
V
N
 
E
K
 
T
D
 
E
V
 
A
G
 
W
S
x
H
I
 
Y
I
 
L
G
 
S
I
 
L
D
 
R
L
 
I
G
 
S
V
 
R
D
 
G
Y
 
E
I
 
I
H
 
F
V
 
L
I
 
A
L
 
L
S
 
R
N
 
D
F
 
L
V
 
S
G
 
S
E
 
K
V
 
L
I
 
V
F
 
V
E
 
E
E
 
E
Y
 
S
A
 
Q
E
 
E
M
 
L
K
 
A
M
 
L
G
 
K
E
 
D
D
 
D
K
 
L
D
 
-
K
 
P
L
 
L
F
 
L
D
 
D
L
 
R
L
 
I
F
 
I
D
 
S
L
 
H
I
 
I
E
 
D
K
 
Q
A
 
F
I
x
F
D
 
I
R
 
R
A
 
H
P
 
Q
H
 
K
T
 
K
P
 
L
K
 
E
G
 
R
I
 
L
L
 
T
G
 
S
I
 
I
G
 
A
I
 
I
G
 
T
V
 
L
P
 
P
G
 
G
I
 
I
V
 
I
E
 
D
K
 
T
E
 
E
S
 
N
G
 
G
I
 
I
V
 
V
L
 
H
I
 
R
A
 
M
P
 
P
N
 
F
L
 
Y
K
 
E
-
 
D
W
 
V
K
 
K
N
 
E
V
 
M
H
 
P
L
 
L
K
 
G
S
 
E
I
 
A
V
 
L
Q
 
E
Q
 
Q
R
 
H
F
 
T
N
 
G
L
 
V
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
I
 
I
D
 
Q
N
 
H
E
 
D
A
 
I
N
 
S
A
 
A
G
 
W
A
 
T
L
 
M
G
 
A
E
 
E
K
 
A
W
 
L
F
 
F
G
 
G
E
 
A
W
 
S
G
 
R
K
 
G
V
 
A
S
 
R
D
 
D
L
 
V
I
 
I
Y
 
Q
L
 
V
S
 
V
V
 
I
G
 
D
I
 
H
G
 
N
L
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
V
I
 
I
I
 
T
D
 
D
N
 
G
K
 
H
L
 
L
F
 
L
R
 
H
G
 
A
A
 
G
A
 
S
G
 
S
F
 
S
A
 
L
G
 
V
E
 
E
V
 
I
G
 
G
H
|
H
T
 
T
T
 
Q
I
 
V
N
 
D
F
 
P
Q
 
Y
D
 
G
D
 
K
V
 
R
C
|
C
S
 
Y
C
|
C
G
 
G
N
 
N
I
 
H
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
 
E
N
 
T
F
 
I
A
 
A
S
 
S
E
 
V
R
 
D
A
 
S
L
 
I
L
 
L
S
 
E
V
 
L
I
 
A
K
 
Q
K
 
L
L
 
R
V
 
L
K
 
N
Q
 
Q
G
 
S
V
 
M
E
 
S
D
 
-
R
 
-
Y
 
-
I
 
-
S
 
S
C
 
M
E
 
L
N
 
H
V
 
G
H
 
Q
E
 
P
I
 
L
T
 
T
P
 
V
S
 
D
R
 
S
I
 
L
I
 
C
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
K
 
L
E
x
R
G
 
G
S
 
D
R
 
L
V
x
L
C
 
A
R
 
K
M
 
D
A
 
I
I
 
I
L
 
T
E
 
G
V
 
V
A
 
G
E
 
A
K
 
H
M
 
V
G
 
G
I
 
R
G
 
I
V
 
L
A
 
A
N
 
I
L
 
M
V
 
V
N
 
N
I
 
L
F
 
F
N
 
N
P
 
P
E
 
Q
M
 
K
V
 
I
I
 
L
I
 
I
G
 
G
N
 
S
K
 
P
A
 
L
S
 
S
F
 
K
F
 
A
G
 
A
E
 
D
L
 
I
F
 
L
L
 
F
E
 
P
K
 
V
L
 
I
R
 
S
E
 
D
V
 
S
I
 
I
N
 
R
Q
 
Q
R
 
Q
S
 
A
F
 
L
I
 
P
A
 
A
Q
 
Y
F
 
S
Y
 
Q
N
 
H
L
 
I
K
 
S
I
 
V
E
 
E
V
 
S
S
 
T
K
 
Q
L
 
F
K
 
S
D
 
N
R
 
Q
A
 
G
V
 
T
V
 
M
L
 
A
G
 
G
C
 
A

1z6rA Crystal structure of mlc from escherichia coli (see paper)
25% identity, 95% coverage: 7:384/399 of query aligns to 2:363/382 of 1z6rA

query
sites
1z6rA
L
 
I
K
 
K
Q
 
Q
I
 
T
N
 
N
K
 
A
L
 
G
L
 
A
V
 
V
L
 
Y
K
 
R
T
 
L
I
 
I
L
 
D
D
 
Q
N
 
L
K
 
G
I
 
P
I
 
V
S
 
S
R
 
R
A
 
I
K
 
D
I
 
L
S
 
S
R
 
R
L
 
L
V
 
A
D
 
Q
L
 
L
N
 
A
K
 
P
A
 
A
T
 
S
V
 
I
S
 
T
N
 
K
L
 
I
T
 
V
D
 
H
E
 
E
L
 
M
I
 
L
K
 
E
E
 
A
G
 
H
Y
 
L
I
 
V
V
 
Q
E
 
E
K
 
L
G
 
G
Y
 
-
G
 
-
K
 
-
S
 
-
K
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
R
 
-
P
 
-
V
 
-
L
 
-
L
 
L
Q
 
V
V
 
V
N
 
E
K
 
T
D
 
E
V
 
A
G
 
W
S
 
H
I
 
Y
I
 
L
G
 
S
I
 
L
D
 
R
L
 
I
G
 
S
V
 
R
D
 
G
Y
 
E
I
 
I
H
 
F
V
 
L
I
 
A
L
 
L
S
 
R
N
 
D
F
 
L
V
 
S
G
 
S
E
 
K
V
 
L
I
 
V
F
 
V
E
 
E
E
 
E
Y
 
S
A
 
Q
E
 
E
M
 
L
K
 
A
M
 
L
G
 
K
E
 
D
D
 
D
K
 
L
D
 
-
K
 
P
L
 
L
F
 
L
D
 
D
L
 
R
L
 
I
F
 
I
D
 
S
L
 
H
I
 
I
E
 
D
K
 
Q
A
 
F
I
 
F
D
 
I
R
 
R
A
 
H
P
 
Q
H
 
K
T
 
K
P
 
L
K
 
E
G
 
R
I
 
L
L
 
T
G
 
S
I
 
I
G
 
A
I
 
I
G
 
T
V
 
L
P
 
P
G
 
G
I
 
I
V
 
I
E
 
D
K
 
T
E
 
E
S
 
N
G
 
G
I
 
I
V
 
V
L
 
H
I
 
R
A
 
M
P
 
P
N
 
F
L
 
Y
K
 
E
-
 
D
W
 
V
K
 
K
N
 
E
V
 
M
H
 
P
L
 
L
K
 
G
S
 
E
I
 
A
V
 
L
Q
 
E
Q
 
Q
R
 
H
F
 
T
N
 
G
L
 
V
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
I
 
I
D
 
Q
N
 
H
E
 
D
A
 
I
N
 
S
A
 
A
G
 
W
A
 
T
L
 
M
G
 
A
E
 
E
K
 
A
W
 
L
F
 
F
G
 
G
E
 
A
W
 
S
G
 
R
K
 
G
V
 
A
S
 
R
D
 
D
L
 
V
I
 
I
Y
 
Q
L
 
V
S
 
V
V
 
I
G
 
D
I
 
H
G
 
N
L
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
V
I
 
I
I
 
T
D
 
D
N
 
G
K
 
H
L
 
L
F
 
L
R
 
H
G
 
A
A
 
G
A
 
S
G
 
S
F
 
S
A
 
L
G
 
V
E
 
E
V
 
I
G
 
G
H
|
H
T
 
T
T
 
Q
I
 
V
N
 
D
F
 
P
Q
 
Y
D
 
G
D
 
K
V
 
R
C
|
C
S
 
Y
C
|
C
G
 
G
N
 
N
I
 
H
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
 
E
N
 
T
F
 
I
A
 
A
S
 
S
E
 
V
R
 
D
A
 
S
L
 
I
L
 
L
S
 
E
V
 
L
I
 
A
K
 
Q
K
 
L
L
 
R
V
 
L
K
 
N
Q
 
Q
G
 
S
V
 
M
E
 
S
D
 
-
R
 
-
Y
 
-
I
 
-
S
 
S
C
 
M
E
 
L
N
 
H
V
 
G
H
 
Q
E
 
P
I
 
L
T
 
T
P
 
V
S
 
D
R
 
S
I
 
L
I
 
C
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
K
 
L
E
 
R
G
 
G
S
 
D
R
 
L
V
 
L
C
 
A
R
 
K
M
 
D
A
 
I
I
 
I
L
 
T
E
 
G
V
 
V
A
 
G
E
 
A
K
 
H
M
 
V
G
 
G
I
 
R
G
 
I
V
 
L
A
 
A
N
 
I
L
 
M
V
 
V
N
 
N
I
 
L
F
 
F
N
 
N
P
 
P
E
 
Q
M
 
K
V
 
I
I
 
L
I
 
I
G
 
G
N
 
S
K
 
P
A
 
L
S
 
S
F
 
K
F
 
A
G
 
A
E
 
D
L
 
I
F
 
L
L
 
F
E
 
P
K
 
V
L
 
I
R
 
S
E
 
D
V
 
S
I
 
I
N
 
R
Q
 
Q
R
 
Q
S
 
A
F
 
L
I
 
P
A
 
A
Q
 
Y
F
 
S
Y
 
Q
N
 
H
L
 
I
K
 
S
I
 
V
E
 
E
V
 
S
S
 
T
K
 
Q
L
 
F
K
 
S
D
 
N
R
 
Q
A
 
G
V
 
T
V
 
M
L
 
A
G
 
G
C
 
A

3vglA Crystal structure of a rok family glucokinase from streptomyces griseus in complex with glucose and amppnp (see paper)
36% identity, 61% coverage: 143:384/399 of query aligns to 59:305/312 of 3vglA

query
sites
3vglA
I
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
G
V
 
A
P
 
A
G
|
G
I
 
Y
V
 
V
E
 
D
K
 
D
E
 
K
S
 
R
G
 
A
I
 
T
V
 
V
L
 
L
I
 
F
A
 
A
P
|
P
N
 
N
L
 
I
K
 
D
W
 
W
K
 
R
N
 
H
V
 
E
H
 
P
L
 
L
K
 
K
S
 
D
I
 
K
V
 
V
Q
 
E
Q
 
Q
R
 
R
F
 
V
N
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
V
I
 
V
D
 
E
N
|
N
E
x
D
A
 
A
N
 
N
A
 
A
G
 
A
A
 
A
L
 
W
G
 
G
E
 
E
K
 
Y
W
 
R
F
 
F
G
 
G
E
 
A
W
 
G
G
 
Q
K
 
G
V
 
H
S
 
D
D
 
D
L
 
V
I
 
I
Y
 
C
L
 
I
S
 
T
V
 
L
G
|
G
I
x
T
G
 
G
L
|
L
G
|
G
A
 
G
G
 
G
I
 
I
I
 
I
I
 
I
D
 
G
N
 
N
K
 
K
L
 
L
F
 
R
R
 
R
G
 
G
A
 
R
A
 
F
G
 
G
F
 
V
A
 
A
G
 
A
E
|
E
V
 
F
G
 
G
H
|
H
T
 
I
T
 
R
I
 
V
N
 
V
F
 
P
Q
 
D
D
 
G
D
 
L
V
 
L
C
|
C
S
 
G
C
|
C
G
 
G
N
 
S
I
 
Q
G
 
G
C
|
C
L
 
W
E
|
E
N
 
Q
F
 
Y
A
 
A
S
 
S
E
x
G
R
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
V
S
 
R
V
 
Y
I
 
A
K
 
K
K
 
Q
L
 
R
V
 
A
K
 
N
Q
 
A
G
 
T
V
 
P
E
 
E
D
 
N
R
 
A
Y
 
A
I
 
V
-
 
L
-
 
L
-
 
G
-
 
L
S
 
G
C
 
D
E
 
G
N
 
S
V
 
V
H
 
D
E
 
G
I
 
I
T
 
E
P
x
G
S
 
K
R
 
H
I
 
I
I
x
S
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
K
 
R
E
 
Q
G
 
G
S
 
D
R
 
P
V
 
V
C
 
A
R
 
V
M
 
D
A
 
S
I
 
F
L
 
R
E
 
E
V
 
L
A
 
A
E
 
R
K
 
W
M
 
A
G
 
G
I
 
A
G
 
G
V
 
L
A
 
A
N
 
D
L
 
L
V
 
A
N
 
S
I
 
L
F
 
F
N
 
D
P
 
P
E
 
S
M
 
A
V
 
F
I
 
I
I
 
V
G
 
G
N
 
G
K
x
G
A
x
V
S
 
S
F
 
D
F
x
E
G
 
G
E
 
E
L
 
L
F
 
V
L
 
L
E
 
D
K
 
P
L
 
I
R
 
R
E
 
K
V
 
S
I
 
F
N
 
-
Q
 
R
R
 
R
S
 
W
F
 
L
I
 
I
A
 
G
Q
 
G
F
 
E
Y
 
W
N
 
R
L
 
P
K
 
H
I
 
A
E
 
Q
V
 
V
-
 
L
-
 
A
S
 
A
K
 
Q
L
 
L
K
 
G
D
 
G
R
 
K
A
 
A
V
 
G
V
 
L
L
 
V
G
 
G
C
 
A

Sites not aligning to the query:

3vgkB Crystal structure of a rok family glucokinase from streptomyces griseus (see paper)
36% identity, 61% coverage: 143:384/399 of query aligns to 59:305/312 of 3vgkB

query
sites
3vgkB
I
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
G
V
 
A
P
 
A
G
 
G
I
 
Y
V
 
V
E
 
D
K
 
D
E
 
K
S
 
R
G
 
A
I
 
T
V
 
V
L
 
L
I
 
F
A
 
A
P
 
P
N
 
N
L
 
I
K
 
D
W
 
W
K
 
R
N
 
H
V
 
E
H
 
P
L
 
L
K
 
K
S
 
D
I
 
K
V
 
V
Q
 
E
Q
 
Q
R
 
R
F
 
V
N
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
V
I
 
V
D
 
E
N
 
N
E
 
D
A
 
A
N
 
N
A
 
A
G
 
A
A
 
A
L
 
W
G
 
G
E
 
E
K
 
Y
W
 
R
F
 
F
G
 
G
E
 
A
W
 
G
G
 
Q
K
 
G
V
 
H
S
 
D
D
 
D
L
 
V
I
 
I
Y
 
C
L
 
I
S
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
T
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
G
G
 
G
I
 
I
I
 
I
I
 
I
D
 
G
N
 
N
K
 
K
L
 
L
F
 
R
R
 
R
G
 
G
A
 
R
A
 
F
G
 
G
F
 
V
A
 
A
G
 
A
E
 
E
V
 
F
G
 
G
H
|
H
T
 
I
T
 
R
I
 
V
N
 
V
F
 
P
Q
 
D
D
 
G
D
 
L
V
 
L
C
|
C
S
 
G
C
|
C
G
 
G
N
 
S
I
 
Q
G
 
G
C
|
C
L
 
W
E
 
E
N
 
Q
F
 
Y
A
 
A
S
 
S
E
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
V
S
 
R
V
 
Y
I
 
A
K
 
K
K
 
Q
L
 
R
V
 
A
K
 
N
Q
 
A
G
 
T
V
 
P
E
 
E
D
 
N
R
 
A
Y
 
A
I
 
V
-
 
L
-
 
L
-
 
G
-
 
L
S
 
G
C
 
D
E
 
G
N
 
S
V
 
V
H
 
D
E
 
G
I
 
I
T
 
E
P
 
G
S
 
K
R
 
H
I
 
I
I
 
S
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
K
 
R
E
 
Q
G
 
G
S
 
D
R
 
P
V
 
V
C
 
A
R
 
V
M
 
D
A
 
S
I
 
F
L
 
R
E
 
E
V
 
L
A
 
A
E
 
R
K
 
W
M
 
A
G
 
G
I
 
A
G
 
G
V
 
L
A
 
A
N
 
D
L
 
L
V
 
A
N
 
S
I
 
L
F
 
F
N
 
D
P
 
P
E
 
S
M
 
A
V
 
F
I
 
I
I
 
V
G
 
G
N
 
G
K
 
G
A
 
V
S
 
S
F
 
D
F
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
L
F
 
V
L
 
L
E
 
D
K
 
P
L
 
I
R
 
R
E
 
K
V
 
S
I
 
F
N
 
-
Q
 
R
R
 
R
S
 
W
F
 
L
I
 
I
A
 
G
Q
 
G
F
 
E
Y
 
W
N
 
R
L
 
P
K
 
H
I
 
A
E
 
Q
V
 
V
-
 
L
-
 
A
S
 
A
K
 
Q
L
 
L
K
 
G
D
 
G
R
 
K
A
 
A
V
 
G
V
 
L
L
 
V
G
 
G
C
 
A

2yi1A Crystal structure of n-acetylmannosamine kinase in complex with n- acetyl mannosamine 6-phosphate and adp. (see paper)
29% identity, 71% coverage: 79:361/399 of query aligns to 4:279/308 of 2yi1A

query
sites
2yi1A
S
 
S
I
 
A
I
 
L
G
 
A
I
 
V
D
 
D
L
 
L
G
|
G
V
x
G
D
x
T
Y
x
N
I
 
L
H
x
R
V
 
V
I
 
A
L
 
I
S
 
V
N
 
S
F
 
M
V
 
K
G
 
G
E
 
E
V
 
I
I
 
V
F
 
-
E
 
K
E
 
K
Y
 
Y
A
 
T
E
 
Q
M
 
F
K
 
N
M
 
P
G
 
K
E
 
T
D
 
Y
K
 
E
D
 
E
K
 
R
L
 
I
F
 
-
D
 
N
L
 
L
L
 
I
F
 
L
D
 
Q
L
 
M
I
 
C
E
 
V
K
 
E
A
 
A
I
 
A
D
 
A
R
 
E
A
 
A
P
 
V
H
 
K
T
 
L
P
 
N
K
 
C
G
 
R
I
 
I
L
 
L
G
 
G
I
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
S
V
 
T
P
x
G
G
|
G
I
x
R
V
 
V
E
 
N
K
 
P
E
 
R
S
 
E
G
 
G
I
 
I
V
 
V
L
 
L
I
 
H
A
x
S
P
x
T
N
 
K
L
|
L
-
 
I
-
 
Q
K
 
E
W
 
W
K
 
N
N
 
S
V
 
V
H
 
D
L
 
L
K
 
R
S
 
T
I
 
P
V
 
L
Q
 
S
Q
 
D
R
 
T
F
 
L
N
 
H
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
W
I
 
V
D
 
D
N
|
N
E
x
D
A
 
G
N
|
N
A
 
C
G
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
A
E
 
E
K
 
R
W
 
K
F
 
F
G
 
G
E
 
Q
W
 
G
G
 
K
K
 
G
V
 
L
S
 
E
D
 
N
L
 
F
I
 
V
Y
 
T
L
 
L
S
 
I
V
 
T
G
|
G
I
x
T
G
|
G
L
x
I
G
 
G
A
x
G
G
 
G
I
 
I
I
 
I
I
 
H
D
 
Q
N
 
H
K
 
E
L
 
L
F
 
I
R
 
H
G
 
G
A
 
S
A
 
S
G
 
F
F
 
C
A
 
A
G
x
A
E
|
E
V
 
L
G
 
G
H
|
H
T
 
L
T
 
V
I
 
V
N
 
S
F
 
L
Q
 
D
D
 
G
D
 
P
V
 
D
C
|
C
S
 
S
C
|
C
G
 
G
N
 
S
I
 
H
G
 
G
C
|
C
L
 
I
E
|
E
N
 
A
F
 
Y
A
 
A
S
 
S
E
x
G
R
 
M
A
 
A
L
 
L
L
 
Q
S
 
R
V
 
E
I
 
A
K
 
K
K
 
K
L
 
L
V
 
-
K
 
-
Q
 
-
G
 
-
V
 
H
E
 
D
D
 
E
R
 
D
Y
 
L
I
 
L
S
 
L
C
 
V
E
 
E
N
 
G
V
 
M
H
 
S
E
 
A
I
 
V
T
 
G
P
 
A
S
x
L
R
 
H
I
 
L
I
 
I
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
K
 
K
E
 
L
G
 
G
S
 
N
R
 
A
V
 
K
C
 
A
R
 
Q
M
 
S
A
 
I
I
 
L
L
 
R
E
 
T
V
 
A
A
 
G
E
 
T
K
 
A
M
 
L
G
 
G
I
 
L
G
 
G
V
 
V
A
 
V
N
 
N
L
 
I
V
 
L
N
 
H
I
 
T
F
 
M
N
 
N
P
 
P
E
 
S
M
 
L
V
 
V
I
 
I
I
 
L
G
 
-
N
 
-
K
 
-
A
 
S
S
 
G
F
x
V
F
 
L
G
 
A
E
 
S
L
 
H
F
 
Y
L
 
I
E
 
H
K
 
I
L
 
V
R
 
K
E
 
D
V
 
V
I
 
I
N
 
R
Q
 
Q
R
 
Q
S
 
A
F
 
L

2yhyA Structure of n-acetylmannosamine kinase in complex with n- acetylmannosamine and adp (see paper)
29% identity, 71% coverage: 79:361/399 of query aligns to 4:279/308 of 2yhyA

query
sites
2yhyA
S
 
S
I
 
A
I
 
L
G
 
A
I
 
V
D
 
D
L
 
L
G
|
G
V
x
G
D
x
T
Y
x
N
I
 
L
H
x
R
V
 
V
I
 
A
L
 
I
S
 
V
N
 
S
F
 
M
V
 
K
G
 
G
E
 
E
V
 
I
I
 
V
F
 
-
E
 
K
E
 
K
Y
 
Y
A
 
T
E
 
Q
M
 
F
K
 
N
M
 
P
G
 
K
E
 
T
D
 
Y
K
 
E
D
 
E
K
 
R
L
 
I
F
 
-
D
 
N
L
 
L
L
 
I
F
 
L
D
 
Q
L
 
M
I
 
C
E
 
V
K
 
E
A
 
A
I
 
A
D
 
A
R
 
E
A
 
A
P
 
V
H
 
K
T
 
L
P
 
N
K
 
C
G
 
R
I
 
I
L
 
L
G
 
G
I
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
S
V
 
T
P
 
G
G
 
G
I
 
R
V
 
V
E
 
N
K
 
P
E
 
R
S
 
E
G
 
G
I
 
I
V
 
V
L
 
L
I
 
H
A
 
S
P
 
T
N
 
K
L
 
L
-
 
I
-
 
Q
K
 
E
W
 
W
K
 
N
N
 
S
V
 
V
H
 
D
L
 
L
K
 
R
S
 
T
I
 
P
V
 
L
Q
 
S
Q
 
D
R
 
T
F
 
L
N
 
H
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
W
I
 
V
D
 
D
N
|
N
E
 
D
A
 
G
N
|
N
A
 
C
G
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
A
E
 
E
K
 
R
W
 
K
F
 
F
G
 
G
E
 
Q
W
 
G
G
 
K
K
 
G
V
 
L
S
 
E
D
 
N
L
 
F
I
 
V
Y
 
T
L
 
L
S
 
I
V
 
T
G
 
G
I
x
T
G
 
G
L
 
I
G
 
G
A
x
G
G
 
G
I
 
I
I
 
I
I
 
H
D
 
Q
N
 
H
K
 
E
L
 
L
F
 
I
R
 
H
G
 
G
A
 
S
A
 
S
G
 
F
F
 
C
A
 
A
G
x
A
E
 
E
V
 
L
G
 
G
H
|
H
T
 
L
T
 
V
I
 
V
N
 
S
F
 
L
Q
 
D
D
 
G
D
 
P
V
 
D
C
|
C
S
 
S
C
|
C
G
 
G
N
 
S
I
 
H
G
 
G
C
|
C
L
 
I
E
 
E
N
 
A
F
 
Y
A
 
A
S
 
S
E
x
G
R
 
M
A
 
A
L
 
L
L
 
Q
S
 
R
V
 
E
I
 
A
K
 
K
K
 
K
L
 
L
V
 
-
K
 
-
Q
 
-
G
 
-
V
 
H
E
 
D
D
 
E
R
 
D
Y
 
L
I
 
L
S
 
L
C
 
V
E
 
E
N
 
G
V
 
M
H
 
S
E
 
A
I
 
V
T
 
G
P
 
A
S
x
L
R
 
H
I
 
L
I
 
I
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
K
 
K
E
 
L
G
 
G
S
 
N
R
 
A
V
 
K
C
 
A
R
 
Q
M
 
S
A
 
I
I
 
L
L
 
R
E
 
T
V
 
A
A
 
G
E
 
T
K
 
A
M
 
L
G
 
G
I
 
L
G
 
G
V
 
V
A
 
V
N
 
N
L
 
I
V
 
L
N
 
H
I
 
T
F
 
M
N
 
N
P
 
P
E
 
S
M
 
L
V
 
V
I
 
I
I
 
L
G
 
-
N
 
-
K
 
-
A
 
S
S
 
G
F
x
V
F
 
L
G
 
A
E
 
S
L
 
H
F
 
Y
L
 
I
E
 
H
K
 
I
L
 
V
R
 
K
E
 
D
V
 
V
I
 
I
N
 
R
Q
 
Q
R
 
Q
S
 
A
F
 
L

2yhwA High-resolution crystal structures of n-acetylmannosamine kinase: insights about substrate specificity, activity and inhibitor modelling. (see paper)
29% identity, 71% coverage: 79:361/399 of query aligns to 4:280/309 of 2yhwA

query
sites
2yhwA
S
 
S
I
 
A
I
 
L
G
 
A
I
 
V
D
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
G
D
 
T
Y
 
N
I
 
L
H
 
R
V
 
V
I
 
A
L
 
I
S
 
V
N
 
S
F
 
M
V
 
K
G
 
G
E
 
E
V
 
I
I
 
V
F
 
-
E
 
K
E
 
K
Y
 
Y
A
 
T
E
 
Q
M
 
F
K
 
N
M
 
P
G
 
K
E
 
T
D
 
Y
K
 
E
D
 
E
K
 
R
L
 
I
F
 
-
D
 
N
L
 
L
L
 
I
F
 
L
D
 
Q
L
 
M
I
 
C
E
 
V
K
 
E
A
 
A
I
 
A
D
 
A
R
 
E
A
 
A
P
 
V
H
 
K
T
 
L
P
 
N
K
 
C
G
 
R
I
 
I
L
 
L
G
 
G
I
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
S
V
 
T
P
 
G
G
 
G
I
 
R
V
 
V
E
 
N
K
 
P
E
 
R
S
 
E
G
 
G
I
 
I
V
 
V
L
 
L
I
 
H
A
 
S
P
 
T
N
 
K
L
 
L
-
 
I
-
 
Q
K
 
E
W
 
W
K
 
N
N
 
S
V
 
V
H
 
D
L
 
L
K
 
R
S
 
T
I
 
P
V
 
L
Q
 
S
Q
 
D
R
 
T
F
 
L
N
 
H
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
W
I
 
V
D
 
D
N
|
N
E
 
D
A
 
G
N
|
N
A
 
C
G
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
A
E
 
E
K
 
R
W
 
K
F
 
F
G
 
G
E
 
Q
W
 
G
G
 
K
K
 
G
V
 
L
S
 
E
D
 
N
L
 
F
I
 
V
Y
 
T
L
 
L
S
 
I
V
 
T
G
 
G
I
 
T
G
 
G
L
 
I
G
 
G
A
x
G
G
 
G
I
 
I
I
 
I
I
 
H
D
 
Q
N
 
H
K
 
E
L
 
L
F
 
I
R
 
H
G
 
G
A
 
S
A
 
S
G
 
F
F
 
C
A
 
A
G
x
A
E
 
E
V
 
L
G
 
G
H
|
H
T
 
L
T
 
V
I
 
V
N
 
S
F
 
L
Q
 
N
D
 
G
D
 
P
V
 
D
C
|
C
S
 
S
C
|
C
G
 
G
N
 
S
I
 
H
G
 
G
C
|
C
L
 
I
E
 
E
N
 
A
F
 
Y
A
 
A
S
 
S
E
 
G
R
 
M
A
 
A
L
 
L
L
 
Q
S
 
R
V
 
E
I
 
A
K
 
K
K
 
K
L
 
L
V
 
H
K
 
D
Q
 
E
G
 
D
-
 
L
-
 
L
-
 
L
V
 
V
E
 
E
D
 
G
R
 
M
Y
 
S
I
 
V
S
 
A
C
 
V
E
 
G
N
 
A
V
 
L
H
 
H
E
 
-
I
 
-
T
 
-
P
 
-
S
 
-
R
 
-
I
 
L
I
 
I
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
K
 
K
E
 
L
G
 
G
S
 
N
R
 
A
V
 
K
C
 
A
R
 
Q
M
 
S
A
 
I
I
 
L
L
 
R
E
 
T
V
 
A
A
 
G
E
 
T
K
 
A
M
 
L
G
 
G
I
 
L
G
 
G
V
 
V
A
 
V
N
 
N
L
 
I
V
 
L
N
 
H
I
 
T
F
 
M
N
 
N
P
 
P
E
 
S
M
 
L
V
 
V
I
 
I
I
 
L
G
 
-
N
 
-
K
 
-
A
 
S
S
 
G
F
 
V
F
 
L
G
 
A
E
 
S
L
 
H
F
 
Y
L
 
I
E
 
H
K
 
I
L
 
V
R
 
K
E
 
D
V
 
V
I
 
I
N
 
R
Q
 
Q
R
 
Q
S
 
A
F
 
L

Q9Y223 Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase; UDP-GlcNAc-2-epimerase/ManAc kinase; EC 3.2.1.183; EC 2.7.1.60 from Homo sapiens (Human) (see 26 papers)
29% identity, 74% coverage: 68:361/399 of query aligns to 391:688/722 of Q9Y223

query
sites
Q9Y223
P
 
P
V
 
V
L
 
K
L
 
E
Q
 
N
V
 
I
N
 
S
K
 
Q
D
 
D
V
 
I
G
 
D
S
 
H
I
 
I
I
 
L
-
 
E
-
 
T
-
 
L
-
 
S
-
 
A
-
 
L
G
 
A
I
 
V
D
|
D
L
 
L
G
 
G
V
x
G
D
x
T
Y
x
N
I
 
L
H
x
R
V
|
V
I
x
A
L
x
I
S
x
V
N
x
S
F
x
M
V
x
K
G
|
G
E
|
E
V
x
I
I
x
V
F
 
-
E
x
K
E
x
K
Y
|
Y
A
x
T
E
x
Q
M
x
F
K
x
N
M
x
P
G
x
K
E
x
T
D
x
Y
K
x
E
D
x
E
K
x
R
L
x
I
F
 
-
D
x
N
L
|
L
L
x
I
F
x
L
D
x
Q
L
x
M
I
x
C
E
x
V
K
x
E
A
|
A
I
x
A
D
x
A
R
x
E
A
|
A
P
x
V
H
x
K
T
x
L
P
x
N
K
x
C
G
x
R
I
|
I
L
|
L
G
|
G
I
x
V
G
|
G
I
|
I
G
x
S
V
x
T
P
x
G
G
|
G
I
x
R
V
|
V
E
x
N
K
x
P
E
x
R
S
x
E
G
|
G
I
|
I
V
|
V
L
|
L
I
x
H
A
x
S
P
x
T
N
x
K
L
|
L
-
x
I
-
x
Q
K
x
E
W
|
W
K
x
N
N
x
S
V
|
V
H
x
D
L
|
L
K
x
R
S
x
T
I
x
P
V
x
L
Q
x
S
Q
x
D
R
x
T
F
x
L
N
x
H
L
|
L
P
|
P
V
|
V
Y
x
W
I
x
V
D
|
D
N
|
N
E
x
D
A
x
G
N
|
N
A
x
C
G
x
A
A
|
A
L
|
L
G
x
A
E
|
E
K
x
R
W
x
K
F
|
F
G
|
G
E
x
Q
W
x
G
G
x
K
K
x
G
V
x
L
S
x
E
D
x
N
L
x
F
I
x
V
Y
x
T
L
|
L
S
x
I
V
x
T
G
|
G
I
x
T
G
|
G
L
x
I
G
|
G
A
x
G
G
|
G
I
|
I
I
|
I
I
x
H
D
x
Q
N
x
H
K
x
E
L
|
L
F
x
I
R
x
H
G
|
G
A
x
S
A
x
S
G
x
F
F
x
C
A
|
A
G
x
A
E
|
E
V
x
L
G
|
G
H
|
H
T
x
L
T
x
V
I
x
V
N
x
S
F
x
L
Q
x
D
D
x
G
D
x
P
V
x
D
C
|
C
S
|
S
C
|
C
G
|
G
N
x
S
I
x
H
G
|
G
C
|
C
L
x
I
E
|
E
N
x
A
F
x
Y
A
|
A
S
|
S
E
x
G
R
x
M
A
|
A
L
|
L
L
x
Q
S
x
R
V
x
E
I
x
A
K
|
K
K
|
K
L
|
L
V
x
H
K
x
D
Q
x
E
G
x
D
-
x
L
-
x
L
-
x
L
V
|
V
E
|
E
D
x
G
R
 
-
Y
 
-
I
x
M
S
|
S
C
x
V
E
x
P
N
x
K
V
x
D
H
x
E
E
x
A
I
x
V
T
x
G
P
x
A
S
x
L
R
x
H
I
x
L
I
|
I
Q
|
Q
A
|
A
A
|
A
K
|
K
E
x
L
G
|
G
S
x
N
R
x
A
V
x
K
C
x
A
R
x
Q
M
x
S
A
x
I
I
x
L
L
x
R
E
x
T
V
x
A
A
x
G
E
x
T
K
x
A
M
x
L
G
|
G
I
x
L
G
|
G
V
|
V
A
x
V
N
|
N
L
x
I
V
x
L
N
x
H
I
x
T
F
x
M
N
|
N
P
|
P
E
x
S
M
x
L
V
|
V
I
|
I
I
x
L
G
 
-
N
 
-
K
 
-
A
x
S
S
x
G
F
x
V
F
x
L
G
x
A
E
x
S
L
x
H
F
x
Y
L
x
I
E
x
H
K
x
I
L
x
V
R
x
K
E
x
D
V
|
V
I
|
I
N
x
R
Q
|
Q
R
x
Q
S
x
A
F
x
L

Sites not aligning to the query:

O35826 Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase; UDP-GlcNAc-2-epimerase/ManAc kinase; EC 3.2.1.183; EC 2.7.1.60 from Rattus norvegicus (Rat) (see paper)
28% identity, 74% coverage: 68:361/399 of query aligns to 391:688/722 of O35826

query
sites
O35826
P
 
P
V
 
V
L
 
K
L
 
E
Q
 
N
V
 
I
N
 
S
K
 
Q
D
 
D
V
 
I
G
 
D
S
 
H
I
 
I
I
 
L
-
 
E
-
x
T
-
x
L
-
x
S
-
x
A
-
x
L
G
x
A
I
x
V
D
|
D
L
|
L
G
|
G
V
x
G
D
x
T
Y
x
N
I
x
L
H
x
R
V
|
V
I
x
A
L
x
I
S
x
V
N
x
S
F
x
M
V
x
K
G
|
G
E
|
E
V
x
I
I
x
V
F
 
-
E
x
K
E
x
K
Y
|
Y
A
x
T
E
x
Q
M
x
F
K
x
N
M
x
P
G
x
K
E
x
T
D
x
Y
K
x
E
D
x
E
K
x
R
L
x
I
F
 
-
D
x
S
L
|
L
L
x
I
F
x
L
D
x
Q
L
x
M
I
x
C
E
x
V
K
x
E
A
|
A
I
x
A
D
x
A
R
x
E
A
|
A
P
x
V
H
x
K
T
x
L
P
x
N
K
x
C
G
x
R
I
|
I
L
|
L
G
|
G
I
x
V
G
|
G
I
|
I
G
x
S
V
x
T
P
x
G
G
|
G
I
x
R
V
|
V
E
x
N
K
x
P
E
x
Q
S
x
E
G
|
G
I
x
V
V
|
V
L
|
L
I
x
H
A
x
S
P
x
T
N
x
K
L
|
L
-
x
I
-
x
Q
K
x
E
W
|
W
K
x
N
N
x
S
V
|
V
H
x
D
L
|
L
K
x
R
S
x
T
I
x
P
V
x
L
Q
x
S
Q
x
D
R
x
T
F
x
L
N
x
H
L
|
L
P
|
P
V
|
V
Y
x
W
I
x
V
D
|
D
N
|
N
E
x
D
A
x
G
N
|
N
A
x
C
G
x
A
A
|
A
L
x
M
G
x
A
E
|
E
K
x
R
W
x
K
F
|
F
G
|
G
E
x
Q
W
x
G
G
x
K
K
x
G
V
x
Q
S
x
E
D
x
N
L
x
F
I
x
V
Y
x
T
L
|
L
S
x
I
V
x
T
G
|
G
I
x
T
G
|
G
L
x
I
G
|
G
A
x
G
G
|
G
I
|
I
I
|
I
I
x
H
D
x
Q
N
x
H
K
x
E
L
|
L
F
x
I
R
x
H
G
|
G
A
x
S
A
x
S
G
x
F
F
x
C
A
|
A
G
x
A
E
|
E
V
x
L
G
|
G
H
|
H
T
x
L
T
x
V
I
x
V
N
x
S
F
x
L
Q
x
D
D
x
G
D
x
P
V
x
D
C
|
C
S
|
S
C
|
C
G
|
G
N
x
S
I
x
H
G
|
G
C
|
C
L
x
I
E
|
E
N
x
A
F
x
Y
A
|
A
S
|
S
E
x
G
R
x
M
A
|
A
L
|
L
L
x
Q
S
x
R
V
x
E
I
x
A
K
|
K
K
|
K
L
|
L
V
x
H
K
x
D
Q
x
E
G
x
D
-
x
L
-
x
L
-
x
L
V
|
V
E
|
E
D
x
G
R
 
-
Y
 
-
I
x
M
S
|
S
C
x
V
E
x
P
N
x
K
V
x
D
H
x
E
E
x
A
I
x
V
T
x
G
P
x
A
S
x
L
R
x
H
I
x
L
I
|
I
Q
|
Q
A
|
A
A
|
A
K
|
K
E
x
L
G
|
G
S
x
N
R
x
V
V
x
K
C
x
A
R
x
Q
M
x
S
A
x
I
I
x
L
L
x
R
E
x
T
V
x
A
A
x
G
E
x
T
K
x
A
M
x
L
G
|
G
I
x
L
G
|
G
V
|
V
A
x
V
N
|
N
L
x
I
V
x
L
N
x
H
I
x
T
F
x
M
N
|
N
P
|
P
E
x
S
M
x
L
V
|
V
I
|
I
I
x
L
G
 
-
N
 
-
K
 
-
A
x
S
S
x
G
F
x
V
F
x
L
G
x
A
E
x
S
L
x
H
F
x
Y
L
x
I
E
x
H
K
x
I
L
x
V
R
|
R
E
x
D
V
|
V
I
|
I
N
x
R
Q
|
Q
R
x
Q
S
x
A
F
x
L

Sites not aligning to the query:

Q91WG8 Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase; UDP-GlcNAc-2-epimerase/ManAc kinase; EC 3.2.1.183; EC 2.7.1.60 from Mus musculus (Mouse) (see paper)
28% identity, 74% coverage: 68:361/399 of query aligns to 391:688/722 of Q91WG8

query
sites
Q91WG8
P
 
P
V
 
V
L
 
K
L
 
E
Q
 
N
V
 
I
N
 
S
K
 
Q
D
 
D
V
 
I
G
 
D
S
 
H
I
 
I
I
 
L
-
 
E
-
 
T
-
 
L
-
 
S
-
 
A
-
 
L
G
 
A
I
 
V
D
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
G
D
 
T
Y
 
N
I
 
L
H
 
R
V
 
V
I
 
A
L
 
I
S
 
V
N
 
S
F
 
M
V
 
K
G
 
G
E
 
E
V
 
I
I
 
V
F
 
-
E
 
K
E
 
K
Y
 
Y
A
 
T
E
 
Q
M
 
F
K
 
N
M
 
P
G
 
K
E
 
T
D
 
Y
K
 
E
D
 
E
K
 
R
L
 
I
F
 
-
D
 
S
L
 
L
L
 
I
F
 
L
D
 
Q
L
 
M
I
 
C
E
 
V
K
 
E
A
 
A
I
 
A
D
 
A
R
 
E
A
 
A
P
 
V
H
 
K
T
 
L
P
 
N
K
 
C
G
 
R
I
 
I
L
 
L
G
 
G
I
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
S
V
 
T
P
 
G
G
 
G
I
 
R
V
 
V
E
 
N
K
 
P
E
 
Q
S
 
E
G
 
G
I
 
V
V
 
V
L
 
L
I
 
H
A
 
S
P
 
T
N
 
K
L
 
L
-
 
I
-
 
Q
K
 
E
W
 
W
K
 
N
N
 
S
V
 
V
H
 
D
L
 
L
K
 
R
S
 
T
I
 
P
V
 
L
Q
 
S
Q
 
D
R
 
T
F
 
L
N
 
H
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
W
I
 
V
D
 
D
N
 
N
E
 
D
A
 
G
N
 
N
A
 
C
G
 
A
A
 
A
L
 
M
G
 
A
E
 
E
K
 
R
W
 
K
F
 
F
G
 
G
E
 
Q
W
 
G
G
 
K
K
 
G
V
 
Q
S
 
E
D
 
N
L
 
F
I
 
V
Y
 
T
L
 
L
S
 
I
V
 
T
G
 
G
I
 
T
G
 
G
L
 
I
G
 
G
A
 
G
G
 
G
I
 
I
I
 
I
I
 
H
D
 
Q
N
 
H
K
 
E
L
 
L
F
 
I
R
 
H
G
 
G
A
 
S
A
 
S
G
 
F
F
x
C
A
 
A
G
 
A
E
 
E
V
 
L
G
 
G
H
 
H
T
 
L
T
 
V
I
 
V
N
 
S
F
 
L
Q
 
D
D
 
G
D
 
P
V
 
D
C
 
C
S
 
S
C
 
C
G
 
G
N
 
S
I
 
H
G
 
G
C
 
C
L
 
I
E
 
E
N
 
A
F
 
Y
A
 
A
S
 
S
E
 
G
R
 
M
A
 
A
L
 
L
L
 
Q
S
 
R
V
 
E
I
 
A
K
 
K
K
 
K
L
 
L
V
 
H
K
 
D
Q
 
E
G
 
D
-
 
L
-
 
L
-
 
L
V
 
V
E
 
E
D
 
G
R
 
-
Y
 
-
I
 
M
S
 
S
C
 
V
E
 
P
N
 
K
V
 
D
H
 
E
E
 
A
I
 
V
T
 
G
P
 
A
S
 
L
R
 
H
I
 
L
I
 
I
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
K
 
K
E
 
L
G
 
G
S
 
N
R
 
V
V
 
K
C
 
A
R
 
Q
M
 
S
A
 
I
I
 
L
L
 
R
E
 
T
V
 
A
A
 
G
E
 
T
K
 
A
M
 
L
G
 
G
I
 
L
G
 
G
V
 
V
A
 
V
N
 
N
L
 
I
V
 
L
N
 
H
I
 
T
F
 
M
N
 
N
P
 
P
E
 
S
M
 
L
V
 
V
I
 
I
I
 
L
G
 
-
N
 
-
K
 
-
A
 
S
S
 
G
F
 
V
F
 
L
G
 
A
E
 
S
L
 
H
F
 
Y
L
 
I
E
 
H
K
 
I
L
 
V
R
 
K
E
 
D
V
 
V
I
 
I
N
 
R
Q
 
Q
R
 
Q
S
 
A
F
 
L

Sites not aligning to the query:

7p9lAAA Ubiquitin-like protein SMT3,N-acetyl-D-glucosamine kinase
29% identity, 53% coverage: 143:352/399 of query aligns to 61:267/303 of 7p9lAAA

query
sites
7p9lAAA
I
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
G
V
 
I
P
|
P
G
|
G
I
 
I
V
 
A
E
 
D
K
 
V
E
 
E
S
 
T
G
 
G
I
 
K
V
 
L
L
 
L
I
 
T
A
x
S
P
 
-
N
 
N
L
 
I
K
 
P
W
 
A
K
 
A
N
 
M
V
 
G
H
 
H
-
 
T
L
 
L
K
 
Q
S
 
R
I
 
D
V
 
L
Q
 
E
Q
 
E
R
 
R
F
 
L
N
 
Q
L
 
R
P
 
P
V
 
V
Y
 
K
I
 
I
D
 
E
N
|
N
E
x
D
A
 
A
N
 
N
A
 
C
G
 
F
A
 
A
L
 
L
G
 
S
E
 
E
K
 
A
W
 
W
F
 
D
G
 
E
E
 
D
W
 
L
G
 
R
K
 
G
V
 
E
S
 
P
D
 
S
L
 
V
I
 
L
Y
 
G
L
 
L
S
 
I
V
 
L
G
|
G
I
x
T
G
|
G
L
x
V
G
|
G
A
 
G
G
 
G
I
 
L
I
 
I
I
 
F
D
 
N
N
 
G
K
 
K
L
 
V
F
 
H
R
 
S
G
 
G
A
 
R
A
 
A
G
 
N
F
 
I
A
 
A
G
 
G
E
|
E
V
 
I
G
 
G
H
|
H
T
 
T
T
 
R
I
 
L
N
 
P
F
 
Y
Q
 
D
D
 
A
-
 
L
-
 
K
-
 
L
-
 
L
-
 
G
-
 
M
-
 
E
-
 
N
-
 
A
-
 
P
-
 
I
D
 
F
V
 
P
C
|
C
S
 
G
C
|
C
G
 
K
N
 
N
I
 
S
G
 
G
C
|
C
L
 
I
E
x
D
N
 
N
F
 
Y
A
 
L
S
 
S
E
 
G
R
 
R
A
 
G
L
 
F
L
 
-
S
 
-
V
 
-
I
 
-
K
 
-
K
 
-
L
 
-
V
 
-
K
 
-
Q
 
E
G
 
Q
V
 
L
E
 
Y
D
 
D
R
 
H
Y
 
Y
I
 
F
S
 
S
C
 
-
E
 
-
N
 
-
V
 
-
H
 
E
E
 
K
I
 
L
T
 
S
P
 
A
S
 
P
R
x
E
I
 
I
I
 
I
Q
 
A
A
x
H
A
 
Y
K
 
E
E
 
Q
G
 
G
S
 
E
R
 
R
V
 
R
C
 
A
R
 
V
M
 
Q
A
 
H
I
 
V
L
 
E
E
 
R
V
 
F
A
 
M
E
 
E
K
 
L
M
 
L
G
 
A
I
 
I
G
 
C
V
 
L
A
 
A
N
 
N
L
 
I
V
 
F
N
 
T
I
 
C
F
 
L
N
 
D
P
 
P
E
 
H
M
 
V
V
 
V
I
 
V
I
 
L
G
 
G
N
 
G
K
 
G
A
 
L
S
 
S
F
 
N
F
 
F
G
 
-
E
 
E
L
 
L
F
 
I
L
 
Y
E
 
Q
K
 
E
L
 
L

7p9pAAA Ubiquitin-like protein SMT3,N-acetyl-D-glucosamine kinase
29% identity, 53% coverage: 143:352/399 of query aligns to 62:268/304 of 7p9pAAA

query
sites
7p9pAAA
I
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
G
V
 
I
P
 
P
G
 
G
I
 
I
V
 
A
E
 
D
K
 
V
E
 
E
S
 
T
G
 
G
I
 
K
V
 
L
L
 
L
I
 
T
A
 
S
P
 
-
N
 
N
L
 
I
K
 
P
W
 
A
K
 
A
N
 
M
V
 
G
H
 
H
-
 
T
L
 
L
K
 
Q
S
 
R
I
 
D
V
 
L
Q
 
E
Q
 
E
R
 
R
F
 
L
N
 
Q
L
 
R
P
 
P
V
 
V
Y
 
K
I
 
I
D
 
E
N
 
N
E
 
D
A
 
A
N
 
N
A
 
C
G
 
F
A
 
A
L
 
L
G
 
S
E
 
E
K
 
A
W
 
W
F
 
D
G
 
E
E
 
D
W
 
L
G
 
R
K
 
G
V
 
E
S
 
P
D
 
S
L
 
V
I
 
L
Y
 
G
L
 
L
S
 
I
V
 
L
G
|
G
I
x
T
G
 
G
L
 
V
G
 
G
A
 
G
G
 
G
I
 
L
I
 
I
I
 
F
D
 
N
N
 
G
K
 
K
L
 
V
F
 
H
R
 
S
G
 
G
A
 
R
A
 
A
G
 
N
F
 
I
A
 
A
G
 
G
E
 
E
V
 
I
G
 
G
H
|
H
T
 
T
T
 
R
I
 
L
N
 
P
F
 
Y
Q
 
D
D
 
A
-
 
L
-
 
K
-
 
L
-
 
L
-
 
G
-
 
M
-
 
E
-
 
N
-
 
A
-
 
P
-
 
I
D
 
F
V
 
P
C
|
C
S
 
G
C
|
C
G
 
K
N
 
N
I
 
S
G
 
G
C
|
C
L
 
I
E
 
D
N
 
N
F
 
Y
A
 
L
S
 
S
E
x
G
R
 
R
A
 
G
L
 
F
L
 
-
S
 
-
V
 
-
I
 
-
K
 
-
K
 
-
L
 
-
V
 
-
K
 
-
Q
x
E
G
 
Q
V
 
L
E
 
Y
D
 
D
R
 
H
Y
 
Y
I
 
F
S
 
S
C
 
-
E
 
-
N
 
-
V
 
-
H
 
E
E
 
K
I
 
L
T
 
S
P
x
A
S
 
P
R
x
E
I
 
I
I
 
I
Q
 
A
A
x
H
A
 
Y
K
 
E
E
 
Q
G
 
G
S
 
E
R
 
R
V
 
R
C
 
A
R
 
V
M
 
Q
A
 
H
I
 
V
L
 
E
E
 
R
V
 
F
A
 
M
E
 
E
K
 
L
M
 
L
G
 
A
I
 
I
G
 
C
V
 
L
A
 
A
N
 
N
L
 
I
V
 
F
N
 
T
I
 
C
F
 
L
N
 
D
P
 
P
E
 
H
M
 
V
V
 
V
I
 
V
I
 
L
G
 
G
N
x
G
K
x
G
A
 
L
S
 
S
F
x
N
F
 
F
G
 
-
E
 
E
L
 
L
F
 
I
L
 
Y
E
 
Q
K
 
E
L
 
L

Sites not aligning to the query:

7p7wBBB Ubiquitin-like protein SMT3,N-acetyl-D-glucosamine kinase
29% identity, 53% coverage: 143:352/399 of query aligns to 64:270/306 of 7p7wBBB

query
sites
7p7wBBB
I
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
G
V
 
I
P
 
P
G
 
G
I
 
I
V
 
A
E
 
D
K
 
V
E
 
E
S
 
T
G
 
G
I
 
K
V
 
L
L
 
L
I
 
T
A
 
S
P
 
-
N
 
N
L
 
I
K
 
P
W
 
A
K
 
A
N
 
M
V
 
G
H
 
H
-
 
T
L
 
L
K
 
Q
S
 
R
I
 
D
V
 
L
Q
 
E
Q
 
E
R
 
R
F
 
L
N
 
Q
L
 
R
P
 
P
V
 
V
Y
 
K
I
 
I
D
 
E
N
 
N
E
 
D
A
 
A
N
 
N
A
 
C
G
 
F
A
 
A
L
 
L
G
 
S
E
 
E
K
 
A
W
 
W
F
 
D
G
 
E
E
 
D
W
 
L
G
 
R
K
 
G
V
 
E
S
 
P
D
 
S
L
 
V
I
 
L
Y
 
G
L
 
L
S
 
I
V
 
L
G
|
G
I
x
T
G
 
G
L
 
V
G
 
G
A
 
G
G
 
G
I
 
L
I
 
I
I
 
F
D
 
N
N
 
G
K
 
K
L
 
V
F
 
H
R
 
S
G
 
G
A
 
R
A
 
A
G
 
N
F
 
I
A
 
A
G
 
G
E
 
E
V
 
I
G
 
G
H
|
H
T
 
T
T
 
R
I
 
L
N
 
P
F
 
Y
Q
 
D
D
 
A
-
 
L
-
 
K
-
 
L
-
 
L
-
 
G
-
 
M
-
 
E
-
 
N
-
 
A
-
 
P
-
 
I
D
 
F
V
 
P
C
|
C
S
 
G
C
|
C
G
 
K
N
 
N
I
 
S
G
 
G
C
|
C
L
 
I
E
 
D
N
 
N
F
 
Y
A
 
L
S
 
S
E
x
G
R
 
R
A
 
G
L
 
F
L
 
-
S
 
-
V
 
-
I
 
-
K
 
-
K
 
-
L
 
-
V
 
-
K
 
-
Q
x
E
G
 
Q
V
 
L
E
 
Y
D
 
D
R
 
H
Y
 
Y
I
 
F
S
 
S
C
 
-
E
 
-
N
 
-
V
 
-
H
 
E
E
 
K
I
 
L
T
 
S
P
 
A
S
 
P
R
 
E
I
 
I
I
 
I
Q
 
A
A
 
H
A
 
Y
K
 
E
E
 
Q
G
 
G
S
 
E
R
 
R
V
 
R
C
 
A
R
 
V
M
 
Q
A
 
H
I
 
V
L
 
E
E
 
R
V
 
F
A
 
M
E
 
E
K
 
L
M
 
L
G
 
A
I
 
I
G
 
C
V
 
L
A
 
A
N
 
N
L
 
I
V
 
F
N
 
T
I
 
C
F
 
L
N
 
D
P
 
P
E
 
H
M
 
V
V
 
V
I
 
V
I
 
L
G
 
G
N
x
G
K
x
G
A
 
L
S
 
S
F
x
N
F
 
F
G
 
-
E
 
E
L
 
L
F
 
I
L
 
Y
E
 
Q
K
 
E
L
 
L

3eo3A Crystal structure of the n-acetylmannosamine kinase domain of human gne protein (see paper)
26% identity, 71% coverage: 79:361/399 of query aligns to 3:259/288 of 3eo3A

query
sites
3eo3A
S
 
S
I
 
A
I
 
L
G
 
A
I
 
V
D
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
G
D
 
T
Y
 
N
I
 
L
H
 
R
V
 
V
I
 
A
L
 
I
S
 
V
N
 
S
F
 
M
V
 
K
G
 
G
E
 
E
V
 
I
I
 
V
F
 
-
E
 
K
E
 
K
Y
 
Y
A
 
T
E
 
Q
M
 
F
K
 
N
M
 
P
G
 
K
E
 
T
D
 
Y
K
 
E
D
 
E
K
 
R
L
 
I
F
 
-
D
 
N
L
 
L
L
 
I
F
 
L
D
 
Q
L
 
M
I
 
C
E
 
V
K
 
E
A
 
A
I
 
A
D
 
A
R
 
E
A
 
A
P
 
V
H
 
K
T
 
L
P
 
N
K
 
C
G
 
R
I
 
I
L
 
L
G
 
G
I
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
-
V
 
-
P
 
-
G
 
-
I
 
-
V
 
-
E
 
-
K
 
-
E
 
-
S
 
-
G
 
-
I
 
-
V
 
-
L
 
-
I
 
-
A
 
-
P
 
-
N
 
-
L
 
-
K
 
-
W
 
-
K
 
-
N
 
S
V
 
T
H
 
D
L
 
L
K
 
R
S
 
T
I
 
P
V
 
L
Q
 
S
Q
 
D
R
 
T
F
 
L
N
 
H
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
W
I
 
V
D
 
D
N
 
N
E
 
D
A
 
G
N
 
N
A
 
C
G
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
A
E
 
E
K
 
R
W
 
K
F
 
F
G
 
G
E
 
Q
W
 
G
G
 
K
K
 
G
V
 
L
S
 
E
D
 
N
L
 
F
I
 
V
Y
 
T
L
 
L
S
 
I
V
 
T
G
 
G
I
 
T
G
 
G
L
 
I
G
 
G
A
 
G
G
 
G
I
 
I
I
 
I
I
 
H
D
 
Q
N
 
H
K
 
E
L
 
L
F
 
I
R
 
H
G
 
G
A
 
S
A
 
S
G
 
F
F
 
C
A
 
A
G
 
A
E
 
E
V
 
L
G
 
G
H
|
H
T
 
L
T
 
V
I
 
V
N
 
S
F
 
L
Q
 
D
D
 
G
D
 
P
V
 
D
C
|
C
S
 
S
C
|
C
G
 
G
N
 
S
I
 
H
G
 
G
C
|
C
L
 
I
E
 
E
N
 
A
F
 
Y
A
 
A
S
 
S
E
 
G
R
 
M
A
 
A
L
 
L
L
 
Q
S
 
R
V
 
E
I
 
A
K
 
K
K
 
K
L
 
L
V
 
H
K
 
D
Q
 
E
G
 
D
-
 
L
-
 
L
-
 
L
V
 
V
E
 
E
D
 
G
R
 
-
Y
 
-
I
 
M
S
 
S
C
 
V
E
 
P
N
 
K
V
 
D
H
 
E
E
 
A
I
 
V
T
 
G
P
 
A
S
 
L
R
 
H
I
 
L
I
 
I
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
K
 
K
E
 
L
G
 
G
S
 
N
R
 
A
V
 
K
C
 
A
R
 
Q
M
 
S
A
 
I
I
 
L
L
 
R
E
 
T
V
 
A
A
 
G
E
 
T
K
 
A
M
 
L
G
 
G
I
 
L
G
 
G
V
 
V
A
 
V
N
 
N
L
 
I
V
 
L
N
 
H
I
 
T
F
 
M
N
 
N
P
 
P
E
 
S
M
 
L
V
 
V
I
 
I
I
 
L
G
 
-
N
 
-
K
 
-
A
 
S
S
 
G
F
 
V
F
 
L
G
 
A
E
 
S
L
 
H
F
 
Y
L
 
I
E
 
H
K
 
I
L
 
V
R
 
K
E
 
D
V
 
V
I
 
I
N
 
R
Q
 
Q
R
 
Q
S
 
A
F
 
L

Q93LQ8 Beta-glucoside kinase; EC 2.7.1.85 from Klebsiella pneumoniae (see paper)
27% identity, 49% coverage: 142:338/399 of query aligns to 56:241/297 of Q93LQ8

query
sites
Q93LQ8
G
 
G
I
 
I
G
 
A
I
 
I
G
 
S
V
 
A
P
 
P
G
 
G
I
 
Y
V
 
I
E
 
D
K
 
P
E
 
H
S
 
S
G
 
G
I
 
L
V
 
I
L
 
T
I
 
M
A
 
G
P
 
G
N
 
A
L
 
I
K
 
R
-
 
R
W
 
F
K
 
D
N
 
N
V
 
F
H
 
A
L
 
M
K
 
K
S
 
S
I
 
W
V
 
L
Q
 
E
Q
 
T
R
 
R
F
 
T
N
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
S
I
 
V
D
 
E
N
 
N
E
x
D
A
 
A
N
 
N
A
 
C
G
 
V
A
 
L
L
 
L
G
 
A
E
 
E
K
 
R
W
 
W
F
 
Q
G
 
G
E
 
K
W
 
A
G
 
A
K
 
E
V
 
M
S
 
A
D
 
N
L
 
F
I
 
L
Y
 
V
L
 
L
S
 
T
V
 
I
G
 
G
I
 
T
G
|
G
L
 
I
G
|
G
A
 
G
G
 
A
I
 
I
I
 
F
I
 
C
D
 
Q
N
 
H
K
 
Q
L
 
L
F
 
I
R
 
N
G
 
G
A
 
A
A
 
R
G
 
F
F
 
R
A
 
A
G
 
G
E
 
E
V
 
F
G
 
G
H
 
Y
T
 
M
T
 
L
I
 
T
N
 
D
F
 
-
Q
 
-
D
 
-
D
 
-
V
 
-
C
 
-
S
 
R
C
 
P
G
 
G
N
 
G
I
 
R
G
 
D
C
 
P
L
 
R
E
 
R
N
 
Y
F
 
S
A
 
M
S
 
N
E
 
E
R
 
N
A
 
C
L
 
T
L
 
L
S
 
R
V
 
V
I
 
L
K
 
R
K
 
H
L
 
R
V
 
Y
K
 
A
Q
 
Q
G
 
H
V
 
I
E
 
G
D
 
-
R
 
-
Y
 
-
I
 
-
S
 
-
C
 
-
E
 
A
N
 
P
V
 
L
H
 
D
E
 
S
I
 
V
T
 
T
P
 
G
S
 
E
R
 
L
I
 
I
I
 
F
Q
 
D
A
 
R
A
 
Y
K
 
D
E
 
A
G
 
G
S
 
D
R
 
P
V
 
V
C
 
C
R
 
Q
M
 
R
A
 
L
I
 
V
L
 
A
E
 
E
V
 
F
A
 
F
E
 
N
K
 
G
M
 
L
G
 
G
I
 
H
G
 
G
V
 
L
A
 
Y
N
 
N
L
 
L
V
 
V
N
 
H
I
 
I
F
 
F
N
 
D
P
 
P
E
 
Q
M
 
T
V
 
I
I
 
F
I
 
I
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3vovB Crystal structure of rok hexokinase from thermus thermophilus (see paper)
31% identity, 54% coverage: 143:357/399 of query aligns to 61:266/298 of 3vovB

query
sites
3vovB
I
 
I
G
 
G
I
 
L
G
 
G
V
 
T
P
 
P
G
 
G
I
 
P
V
 
L
E
 
D
K
 
F
E
 
R
S
 
R
G
 
G
I
 
V
V
 
-
L
 
-
I
 
I
A
 
R
P
 
P
N
 
N
L
 
I
K
 
P
W
 
G
-
 
V
K
 
Q
N
 
D
V
 
F
H
 
P
L
 
I
K
 
R
S
 
R
I
 
I
V
 
L
Q
 
E
Q
 
E
R
 
A
F
 
T
N
 
G
L
 
R
P
 
P
V
 
V
Y
 
F
I
 
L
D
 
E
N
 
N
E
 
D
A
 
A
N
 
N
A
 
A
G
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
A
E
 
E
K
 
H
W
 
H
F
 
L
G
 
G
E
 
A
W
 
A
G
 
Q
K
 
G
V
 
E
S
 
E
D
 
S
L
 
S
I
 
L
Y
 
Y
L
 
L
S
 
T
V
 
V
G
 
S
I
 
T
G
 
G
L
 
I
G
 
G
A
 
G
G
 
G
I
 
V
I
 
V
I
 
L
D
 
G
N
 
G
K
 
R
L
 
V
F
 
L
R
 
R
G
 
G
A
 
E
A
 
R
G
 
G
F
 
Q
A
 
G
G
 
G
E
 
E
V
 
L
G
 
G
H
|
H
T
 
L
T
 
T
I
 
L
N
 
L
F
 
P
Q
 
G
D
 
G
D
 
P
V
 
A
C
|
C
S
 
G
C
|
C
G
 
G
N
 
L
I
 
E
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
 
E
N
 
A
F
 
L
A
 
A
S
 
A
E
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
E
S
 
R
V
 
D
I
 
A
K
 
T
K
 
Y
L
 
A
V
 
F
K
 
Q
Q
 
R
G
 
P
V
 
V
E
 
D
D
 
T
R
 
R
Y
 
E
I
 
L
S
 
-
C
 
-
E
 
-
N
 
-
V
 
-
H
 
-
E
 
-
I
 
-
T
 
-
P
 
-
S
 
F
R
 
R
I
 
L
I
 
F
Q
 
Q
A
 
A
A
 
-
K
 
-
E
 
-
G
 
G
S
 
D
R
 
P
V
 
K
C
 
A
R
 
E
M
 
R
A
 
L
I
 
V
L
 
L
E
 
Q
V
 
A
A
 
A
E
 
R
K
 
Y
M
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
G
V
 
L
A
 
A
N
 
S
L
 
L
V
 
V
N
 
K
I
 
A
F
 
F
N
 
D
P
 
P
E
 
G
M
 
V
V
 
V
I
 
V
I
 
L
G
 
G
-
 
G
-
 
G
-
 
V
-
 
A
-
 
L
N
 
N
K
 
A
A
 
P
S
 
E
F
 
G
F
 
Y
G
 
W
E
 
E
L
 
A
F
 
L
L
 
L
E
 
E
K
 
A
L
 
Y
R
 
R
E
 
R
V
 
Y
I
 
L
N
 
Q

Query Sequence

>WP_013430927.1 NCBI__GCF_000166775.1:WP_013430927.1
MGNHTLLKQINKLLVLKTILDNKIISRAKISRLVDLNKATVSNLTDELIKEGYIVEKGYG
KSKGGRRPVLLQVNKDVGSIIGIDLGVDYIHVILSNFVGEVIFEEYAEMKMGEDKDKLFD
LLFDLIEKAIDRAPHTPKGILGIGIGVPGIVEKESGIVLIAPNLKWKNVHLKSIVQQRFN
LPVYIDNEANAGALGEKWFGEWGKVSDLIYLSVGIGLGAGIIIDNKLFRGAAGFAGEVGH
TTINFQDDVCSCGNIGCLENFASERALLSVIKKLVKQGVEDRYISCENVHEITPSRIIQA
AKEGSRVCRMAILEVAEKMGIGVANLVNIFNPEMVIIGNKASFFGELFLEKLREVINQRS
FIAQFYNLKIEVSKLKDRAVVLGCIAMVISDMLSFPEYA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory